一、恶意旷工怎么扣工资
1. 关于恶意旷工扣工资，首先要依据劳动合同和公司合法的规章制度。如果劳动合同和规章制度明确规定了旷工的扣薪标准，且该标准合理合法，那么就按照此标准执行。比如规定旷工一天扣当天工资的一定比例，或者旷工达到一定天数额外扣除相应绩效等。
2. 但需注意，扣除工资不能违反法律规定。根据法律，每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
3. 若公司没有相关明确规定，不能随意扣工资。此时应与劳动者协商确定合理的处理方式，也可通过民主程序制定相关的旷工扣薪制度。同时，公司需确保制度的制定和实施符合法定程序，保障劳动者的知情权和参与权。
二、工厂里请假不批算旷工吗
1.一般情况，若员工请假未获批准仍不来上班，算旷工。员工请假需遵循单位的请假制度，若未经允许擅自离岗，单位按旷工处理具有一定合理性。比如工厂明确规定请假需提前申请，经领导签字同意，员工未按此流程操作就不来上班，通常会被认定为旷工。
2.特殊情况，请假不批不算旷工。如果员工遇到紧急且合理的事由，如突发重大疾病、直系亲属病危等，即便未获批准也不能算旷工。此时员工应尽快向单位说明情况，并提供相关证明。例如员工突发急病住院，事后提交了医院诊断证明等材料，单位不应认定为旷工。
3.单位请假制度应合法合理。若单位请假制度苛刻，故意不批准合理请假，损害员工权益，则不合法。员工可与单位协商，或向劳动监察部门反映。
三、对于旷工的员工如何处理
处理旷工员工可按以下步骤进行：
1.查看规章制度：企业应先查看自身的规章制度，确认其中对于旷工的定义、旷工时间与对应处理措施等是否有明确规定。制度需是合法制定且已向员工公示的，这样后续处理才具有合法性。
2.调查核实：发现员工旷工后，及时与员工取得联系，了解旷工原因。若员工因不可抗力或合理原因旷工，可根据实际情况处理；若无故旷工，要保留好相关证据，如考勤记录、沟通记录等。
3.按规处理：依据规章制度进行处理。对于旷工时间较短的员工，可给予警告、批评教育等；对于旷工时间较长、情节严重的，可根据规定解除劳动合同。解除劳动合同要遵循法定程序，提前通知员工，并出具解除劳动合同证明。
4.后续跟进：处理完毕后，要对该事件进行总结，完善企业的考勤管理制度，避免类似情况再次发生。
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