[go: up one dir, main page]

RU2699985C2 - Композиции и способы модулирования экспрессии аполипопротеина (а) - Google Patents

Композиции и способы модулирования экспрессии аполипопротеина (а) Download PDF

Info

Publication number
RU2699985C2
RU2699985C2 RU2015151200A RU2015151200A RU2699985C2 RU 2699985 C2 RU2699985 C2 RU 2699985C2 RU 2015151200 A RU2015151200 A RU 2015151200A RU 2015151200 A RU2015151200 A RU 2015151200A RU 2699985 C2 RU2699985 C2 RU 2699985C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
modified
group
compound
apo
nucleoside
Prior art date
Application number
RU2015151200A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2015151200A3 (ru
RU2015151200A (ru
Inventor
Тхажа П. Пракаш
Пунит П. Сет
Эрик Е. Свейз
Марк Дж. ГРЭХАМ
Original Assignee
Ионис Фармасьютикалз, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=51843959&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=RU2699985(C2) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Ионис Фармасьютикалз, Инк. filed Critical Ионис Фармасьютикалз, Инк.
Publication of RU2015151200A3 publication Critical patent/RU2015151200A3/ru
Publication of RU2015151200A publication Critical patent/RU2015151200A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2699985C2 publication Critical patent/RU2699985C2/ru

Links

Images

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/7105Natural ribonucleic acids, i.e. containing only riboses attached to adenine, guanine, cytosine or uracil and having 3'-5' phosphodiester links
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/7125Nucleic acids or oligonucleotides having modified internucleoside linkage, i.e. other than 3'-5' phosphodiesters
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/713Double-stranded nucleic acids or oligonucleotides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/54Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an organic compound
    • A61K47/549Sugars, nucleosides, nucleotides or nucleic acids
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/56Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an organic macromolecular compound, e.g. an oligomeric, polymeric or dendrimeric molecule
    • A61K47/59Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an organic macromolecular compound, e.g. an oligomeric, polymeric or dendrimeric molecule obtained otherwise than by reactions only involving carbon-to-carbon unsaturated bonds, e.g. polyureas or polyurethanes
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00Drugs for disorders of the nervous system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C07H21/04Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with deoxyribosyl as saccharide radical
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/111General methods applicable to biologically active non-coding nucleic acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1137Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against enzymes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y301/00Hydrolases acting on ester bonds (3.1)
    • C12Y301/03Phosphoric monoester hydrolases (3.1.3)
    • C12Y301/03048Protein-tyrosine-phosphatase (3.1.3.48)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/11Antisense
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/11Antisense
    • C12N2310/113Antisense targeting other non-coding nucleic acids, e.g. antagomirs
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/14Type of nucleic acid interfering nucleic acids [NA]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/17Immunomodulatory nucleic acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/31Chemical structure of the backbone
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/31Chemical structure of the backbone
    • C12N2310/315Phosphorothioates
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/32Chemical structure of the sugar
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/32Chemical structure of the sugar
    • C12N2310/3212'-O-R Modification
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/32Chemical structure of the sugar
    • C12N2310/3222'-R Modification
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/32Chemical structure of the sugar
    • C12N2310/323Chemical structure of the sugar modified ring structure
    • C12N2310/3231Chemical structure of the sugar modified ring structure having an additional ring, e.g. LNA, ENA
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/33Chemical structure of the base
    • C12N2310/334Modified C
    • C12N2310/33415-Methylcytosine
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/34Spatial arrangement of the modifications
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/34Spatial arrangement of the modifications
    • C12N2310/341Gapmers, i.e. of the type ===---===
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/34Spatial arrangement of the modifications
    • C12N2310/346Spatial arrangement of the modifications having a combination of backbone and sugar modifications
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/35Nature of the modification
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/35Nature of the modification
    • C12N2310/351Conjugate
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/35Nature of the modification
    • C12N2310/351Conjugate
    • C12N2310/3511Conjugate intercalating or cleaving agent
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/35Nature of the modification
    • C12N2310/351Conjugate
    • C12N2310/3513Protein; Peptide
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/35Nature of the modification
    • C12N2310/351Conjugate
    • C12N2310/3515Lipophilic moiety, e.g. cholesterol
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/35Nature of the modification
    • C12N2310/352Nature of the modification linked to the nucleic acid via a carbon atom
    • C12N2310/3525MOE, methoxyethoxy
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/35Nature of the modification
    • C12N2310/353Nature of the modification linked to the nucleic acid via an atom other than carbon
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2320/00Applications; Uses
    • C12N2320/30Special therapeutic applications
    • C12N2320/32Special delivery means, e.g. tissue-specific

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Neurosurgery (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Medicinal Preparation (AREA)
  • Polysaccharides And Polysaccharide Derivatives (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Steroid Compounds (AREA)
  • Liquid Crystal Substances (AREA)

Abstract

Изобретение относится к области биотехнологии. Описана группа изобретений, включающая соединение, специфически ингибирующее экспрессию нуклеиновой кислоты аро(а) и/или белка аро(а), композиция для лечения, предупреждения или замедления прогрессирования заболевания, связанного с повышенной экспрессией аро(а) и/или повышенной экспрессией Lp(a), содержащая терапевтически эффективное количество соединения, cпособ предупреждения, лечения, облегчения или замедления прогрессирования заболевания, связанного с повышенной экспрессией аро(а) и/или повышенной экспрессией Lp(a), включающий введение животному вышеуказанного соединения или композиции. В одном из вариантов изобретения соединение содержит модифицированный олигонуклеотид и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов, нацеленных на аро(а). Изобретение расширяет арсенал средств для ингибирования экспрессии нуклеиновой кислоты аро(а) и/или белка аро(а). 5 н. и 32 з.п. ф-лы, 185 табл., 124 пр.

Description

Настоящее изобретение зарегистрировано вместе с перечнем последовательностей в электронном формате. Перечень последовательностей представлен в виде файла под названием BIOL0250WOSEQ_ST25.txt, созданного 1 мая 2014 года, размером 432 Кб. Информация о перечне последовательностей в электронном формате в полном объеме включена в настоящий документ посредством ссылки.
УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ
Принцип, лежащий в основе антисмысловой технологии, заключается в том, что антисмысловое соединение гибридизуется с целевой нуклеиновой кислотой и модулирует количество, активность и/или функцию целевой нуклеиновой кислоты. Например, в некоторых случаях антисмысловые соединения приводят к изменению транскрипции или трансляции мишени. Такое модулирование экспрессии может быть достигнуто, например, разрушением мРНК-мишени или ингибированием на основании оккупации. Пример модулирования целевой функции РНК за счет разрушения представляет собой разрушение за счет РНКазы Н целевой РНК при гибридизации с ДНК-подобным антисмысловым соединением. Другой пример модулирования генной экспрессии за счет разрушения мишени представляет собой РНК-интерференция (РНКи). РНКи относится к антисмысл-опосредованному сайленсингу гена по механизму, в котором применяется РНК-индуцируемый комплекс сайленсинга (RISC). Дополнительный пример модулирования целевой функции РНК представляет собой механизм на основании оккупации, такой как использует в естественных условиях микроРНК. МикроРНК представляют собой небольшие некодирующие РНК, которые регулируют экспрессию РНК, кодирующих белки. Связывание антисмыслового соединения с микроРНК препятствует связыванию микроРНК с ее матричными РНК мишенями, и, следовательно, затрудняет функцию микроРНК. МикроРНК-миметики могут усиливать естественную функцию микроРНК. Некоторые антисмысловые соединения изменяют сплайсинг пре-мРНК. Независимо от конкретного механизма, специфичность в отношении последовательностей делает антисмысловые соединения перспективными в качестве средств для подтверждения нацеленности и функционализации генов, а также в качестве терапевтических средств для селективного модулирования
экспрессии генов, участвующих в патогенезе заболеваний.
Антисмысловая технология представляет собой эффективный способ модулирования экспрессии одного или более специфических генных продуктов и, следовательно, может быть признана исключительно подходящей в ряде терапевтических, диагностических и исследовательских применений. Химически модифицированные нуклеозиды могут быть внедрены в антисмысловые соединения для усиления одного или более свойств, таких как устойчивость к нуклеазе, фармакокинетика или аффинность к целевой нуклеиновой кислоте. В 1998 году антисмысловое соединение Vitravene® (фомивирсен; разработанный компанией Isis Pharmaceuticals Inc., Карлсбад, штат Калифорния) стал первым антисмысловым лекарством, получившим разрешение на продажу от Администрации США по пищевым продуктам и лекарственным веществам (FDA), и в настоящее время представляет собой средство для лечения вызванного цитомегаловирусом (CMV) ретинита у пациентов со СПИДом.
Новые химические модификации обладают улучшенной активностью и эффективностью антисмысловых соединений, раскрывая потенциал для пероральной доставки, а также для усовершенствования подкожного введения, снижения возможных побочных эффектов, и являются более удобными для пациента. Химические модификации, усиливающие активность антисмысловых соединений, позволяют осуществлять введение более низких доз, что снижает возможность токсичности, а также уменьшает общую стоимость лечения. Модификации, увеличивающие устойчивость к разрушению, приводят к более медленному выведению из организма, обеспечивая возможность менее частого введения доз. Различные типы химических модификаций могут быть комбинированы в одном соединении для дальнейшей оптимизации эффективности соединения.
Липопротеины представляют собой глобулярные мицеллоподобные частицы, которые состоят из неполярного ядра из ацилглицеринов и холестериловых сложных эфиров, окруженного амфифильной оболочкой из белков, фосфолипидов и холестерина. Липопротеины классифицируют на пять крупных категорий по их функциональным и физическим свойствам: хиломикроны, липопротеины очень низкой плотности (VLDL), липопротеины средней плотности (IDL), липопротеины низкой плотности (LDL) и липопротеины высокой плотности (HDL). Хиломикроны переносят пищевые липиды из кишечника к ткани. VLDL, IDL и LDL переносят триацилглицерины и холестерин из печени к тканям. HDL переносят эндогенный холестерин от тканей к печени.
Частицы липопротеинов подвергаются непрерывной метаболической переработке и имеют различные свойства и состав. Плотность липопротеинов увеличивается без увеличения диаметра частицы, поскольку плотность их внешней оболочки меньше, чем плотность внутреннего ядра. Белковые компоненты липопротеинов известны также как аполипопротеины. В различных липопротеинах человека в значительных количествах содержатся по меньшей мере девять аполипопротеинов.
Частица липопротеина (a) [Lp(a)] была идентифицирована около 50 лет назад, и она состоит из весьма уникальной частицы LDL, в которой один белок аполипопротеина В (ароВ) связан дисульфидной связью с одним белком аполипопротеина (а) [аро(а)]. Белок аро(а) имеет высокую степень гомологии с плазминогеном, особенно в повторяющемся крингл домене IV 2 типа. Уровни циркулирующего Lp(a) обратно пропорциональны количеству вариабельных повторов крингл IV 2 типа в молекуле и, поскольку у индивидуума совместно экспрессируются обе аллели, могут демонстрировать гетерозиготные профили изоформ плазмы (Kraft et al., Eur J Hum Genet, 1996; 4(2): 74-87). Предполагают, что этот повторяющийся крингл домен в аро(а) может отвечать за его протромботические и антифибринолитические свойства, потенциально усиливая атеросклеротическое прогрессирование.
Аро(а) транскрипционно регулируется IL-6, а в исследованиях на пациентах с ревматоидным артритом, которых лечили ингибитором IL-6 (тоцилизумабом), уровни в плазме были снижены на 30% спустя 3 месяца лечения (Schultz et al., PLoS One 2010; 5:el4328).
Было показано, что apo(a) предпочтительно связывает окисленные фосфолипиды и потенцирует сосудистое воспаление (Bergmark et al., J Lipid Res 2008; 49:2230-2239; Tsimikas et al., Circulation. 2009; 119(13):1711-1719).
Кроме того, выполненные исследования позволяют предположить, что частица Lp(a) также может стимулировать эндотелиальную проницаемость, инициировать экспрессию ингибитора плазминогенного активатора типа 1 и активировать секрецию макрофагального интерлейкина-8 (Koschinsky and Marcovina, Curr Opin Lipidol 2004; 15:167-174). Важно отметить, что в недавних исследованиях генетической связи было выявлено, что Lp(a) представляет собой независимый фактор риска для инфаркта миокарда, инсульта, болезни периферических сосудов и аневризмы брюшной аорты (Rifai et al., Clin Chem 2004; 50:1364-71; Erqou et al., JAMA 2009;302:412-23; Kamstrup et al., Circulation 2008; 117:176-84). Более того, в недавнем исследовании преждевременной болезни коронарных артерий
(PROCARDIS), Clarke et al. (Clarke et al., NEJM (2009)361; 2518-2528), описаны прочные и независимые связи между коронарной болезнью серца и концентрациями Lp(a) в плазме. Кроме того, ученые Solfrizzi et al., предположили, что повышенное содержание Lp(а) в сыворотке может быть связано с повышенным риском болезни Альцгеймера (AD) (Solfrizzi et al., J Neurol Neurosurg Psychiatry 2002, 72:732-736. В настоящее время, в клинических, условиях примеры косвенных ингибиторов аро(а) для лечения сердечно-сосудистых. заболеваний включают аспирин, ниаспан, мипомерсен, анацетрапиб, эпиротиром и ломитапид, которые снижают уровни Lp(a) в плазме на 18%, 39%, 32%, 36%, 43% и 17%, соответственно. Кроме того, в клинических условиях может быть использован аферез Lp(a) для снижения содержания аро(а)-содержащих частиц Lp(a).
В настоящее время существует ограниченное число терапевтических стратегий для лечения сердечно-сосудистых заболеваний, прямо нацеленных на уровни аро(а).. Были разработаны рибозимные олигонуклеотиды (патент США 5877022) и антисмысловые олигонуклеотиды (WO 2005/000201; WO 2003/014397; WO 2013/177468; US 20040242516; патенты США №8138328, 8673632 и 7259150; Merki et al., J Am Coll Cardiol 2011; 57:1611-1621; каждая публикация включена в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме), но ни один из них не был одобрен для промышленного применения.
Следовательно, сохраняется очевидная неудовлетворенная медицинская потребность в новых агентах, которые могут эффективно и селективно снижать уровни аро(а) у пациентов с повышенным риском сердечно-сосудистых явлений из-за хронически повышенных уровней Lp(a) в плазме.
СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ
В настоящем документе представлены композиции и способы модулирования экспрессии мРНК и белка аро(а). В некоторых вариантах реализации изобретения специфический ингибитор аро(а) снижает экспрессию мРНК и белка аро(а). В настоящем документе представлены композиции и способы модулирования экспрессии уровней Lp(a).
В некоторых вариантах реализации изобретения композиция представляет собой специфический ингибитор аро(а). В некоторых вариантах реализации специфический ингибитор аро(а) представляет собой нуклеиновую кислоту, белок или небольшую молекулу. В некоторых вариантах реализации специфический ингибитор аро(а) представляет собой антисмысловый олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгат. В некоторых вариантах реализации специфический ингибитор аро(а) представляет собой модифицированный
олигонуклеотид и конъюгат, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов и содержит последовательность азотистых оснований, содержащую часть из по меньшей мере 8 смежных азотистых оснований, комплементарную равной по длине части азотистых оснований3901-3920 в SEQ ID NO:1, причем указанная последовательность азотистых оснований модифицированного олигонуклеотида поменьшей мере на 80% комплементарна SEQ ID NO:1. В некоторых вариантах реализации специфический ингибитор аро(а) представляет собой модифицированный олигонуклеотид и конъюгат, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов и имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по меньшей мере 18, по меньшей мере 19 или 20 смежных азотистых основанийпоследовательности азотистых оснований SEQ ID NO: 1-130, 133, 134. В некоторых вариантах реализации специфический ингибитор аро(а) представляет собой модифицированный олигонуклеотид и конъюгат, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов и имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8 смежных азотистых основанийлюбой из SEQ ID NO: 58, при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: (а) сегмент гэп состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; (b) сегмент 5'-крыла, состоящий из пяти связанных нуклеозидов; (с) сегмент 3'-крыла, состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и при этом, сегмент гэп находится между сегментом 5'-крыла и сегментом 3'-крыла, и каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, и по меньшей мере одна межнуклеозидных связей представляет собой тиофосфатную связь, а каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации изобретения приведена композиция, содержащая конъюгированное антисмысловое соединение, описанное в настоящем документе, или его соль и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.
В некоторых вариантах реализации модулирование экспрессии аро(а) происходит в клетке или ткани. В некоторых вариантах реализации модулирование происходит в клетке или ткани животного. В некоторых вариантах реализации животное представляет собой человека. В некоторых вариантах реализации модулирование представляет собой снижение уровня мРНК аро(а). В некоторых вариантах реализации модулирование представляет собой снижение уровня белка аро(а). В некоторых вариантах реализации снижаются и уровни
мРНК, и уровни белка аро(а). В некоторых вариантах реализации модулирование представляет собой снижение уровня Lp(a). Такое снижение может происходить в зависимости от времени или в зависимости от дозы.
В некоторых вариантах реализации приведены конъюгированные антисмысловые композиции и способы их применения в терапии. В некоторых вариантах реализации приведены композиции и способы предупреждения, лечения, отсрочки, замедления прогрессирования и/или облегчения заболеваний, расстройств и состояний, связанных с аро(а). В некоторых вариантах реализации приведены композиции и способы предупреждения, лечения, отсрочки, замедления прогрессирования и/или облегчения заболеваний, расстройств и состояний, связанных с Lp(a). В некоторых вариантах реализации такие заболевания, расстройства и состояния представляют собой воспалительные, сердечнососудистые и/или метаболические заболевания, расстройства и состояния. В некоторых вариантах реализации композиции и способы терапии включают введение аро(а)-специфического ингибитора индивидууму, нуждающемуся в этом. В некоторых вариантах реализации аро(а)-специфический ингибитор представляет собой нуклеиновую кислоту. В некоторых вариантах реализации нуклеиновая кислота представляет собой антисмысловое соединение. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение представлявляет собой модифицированный олигонуклеотид. В некоторых вариантах реализации, антисмысловое соединение представляет собой модифицированный олигонуклеотид с конъюгатом.
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены конъюгированные антисмысловые соединения. В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены конъюгированные антисмысловые соединения, содержащие антисмысловый олигонуклеотид, комплементарный транскрипту нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены способы, включающие контакт клетки с конъюгированным антисмысловым соединением, содержащим антисмысловый олигонуклеотид, комплементарный транскрипту нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены способы, включающие контакт клетки с конъюгированным антисмысловым соединением, содержащим антисмысловый олигонуклеотид, и уменьшение количества или активности транскрипта нуклеиновой кислоты в клетке.
Ранее был описан асиалогликопротеиновый рецептор (ASGP-R). См., например, Park et al., PNAS, том 102, №47, cc. 17125-17129 (2005). Такие рецепторы экспрессируются на
клетках печени, в частности, гепатоцитах. Кроме того, было показано, что соединения, содержащие кластеры трех N-ацетилгалактозаминовых (GalNAc) лигандов, способны связываться с ASGP-R, приводя к захвату указанного соединения в клетку. См., например, Khorev et al., Bioorganic and Medicinal Chemistry, 16, 9, cc. 5216-5231 (май, 2008). Соответственно, конъюгаты, содержащие такие кластеры GalNAc, применяли для облегчения захвата некоторых соединений в клетки печени, в частности, гепатоциты. Например, было показано, что некоторые GalNAc-содержащие конъюгаты увеличивают активность дуплексных миРНК соединений в клетках печени in vivo. В таких случаях GalNAc-содержащий конъюгат, как правило, прикрепляется к смысловой спирали дуплекса миРНК. Поскольку смысловая спираль отбрасывается перед окончательной гибридизацией антисмысловой спирали с целевой нуклеиновой кислотой, то маловероятно, что такси конъюгат будет влиять на активность. Как правило, конъюгат присоединяется к 3'-концу смысловой спирали миРНК. См., например, патент США 8106022. Некоторые конъюгирующие группы, описанные в настоящем документе, более активны и/или синтезируются легче, чем конъюгирующие группы, описанные ранее.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения конъюгаты присоединяются к односпиральным антисмысловым соединениям, включая, но не ограничиваясь ими, антисмысловые соединения на основе РНКазы Н и антисмысловые соединения, которые изменяют сплайсинг целевой нуклеиновой кислоты пре-мРНК. В такик вариантах реализации конъюгат должен оставаться присоединенным к антисмысловому соединению достаточно долго для обеспечения преимущества (улучшенного захвата в клетки), но затем он должен либо расщепляться, либо иным образом не препятствовать последующим стадиям, необходимым для активности, таким как гибридизация с целевой нуклеиновой кислотой и взаимодействие с РНКазой Н или ферментами, связанными со сплайсингом или модулированием сплайсинга. Такой баланс свойств более важен при осаждении односпиральных антисмысловых соединений, чем соединений миРНК, где конъюгат может быть просто присоединен к смысловой спирали. В настоящем документе описаны односпиральные антисмысловые соединения, обладающие улучшенной активностью в клетках печени in vivo, по сравнению с таким же антисмысловым соединением, не имеющим конъюгата. Учитывая необходимый баланс свойств для этих соединений, такая улучшенная активность является неожиданной.
В некоторых вариантах реализации конъюгирующие группы по настоящему документу содержат расщепляемый фрагмент. Как было отмечено, не ограничиваясь каким-либо
механизмом, логично, что конъюгат должен сохраняться у соединения достаточно долго для обеспечения усиления захвата, но после этого желательно, чтобы некоторая его часть или, в идеале, весь конъюгат расщеплялся, выделяя исходное соединение (например, антисмысловое соединение) в его наиболее активной форме. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент представляет собой расщепляемый нуклеозид. Такие варианты реализации обладают преимуществом эндогенных нуклеаз в клетке за счет присоединения остальной части конъюгата (кластера) к антисмысловому олигонуклеотиду через нуклеозид при помощи одной или более расщепляемых связей, таких как фосфодиэфирные связи. В некоторых вариантах реализации кластер связан с расщепляемым нуклеозидом через фосфодиэфирную связь. В некоторых вариантах реализации расщепляемый нуклеозид присоединен к антисмысловому олигонуклеотиду (антисмысловому соединению) фосфодиэфирной связью. В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа может содержать два или три расщепляемых нуклеозида. В таких вариантах реализации указанные расщепляемые нуклеозиды связаны друг с другом, с антисмысловым соединением и/или с кластером посредством расщепляемых связей (таких как фосфодиэфирная связь). Некоторые конъюгаты по настоящему документу не содержат расщепляемый нуклеозид, а вместо этого содержат расщепляемую связь. Показано, что достаточное расщепление конъюгата из олигонуклеотида обеспечивается по меньшей мере за счет одной связи, которая легко поддается расщеплению в клетке (расщепляемая связь).
В некоторых вариантах реализации конъюгированные антисмысловые соединения представляют собой пролекарства. Такие пролекарства вводят животному, и они в конечном итоге метаболизируются до более активной формы. Например, конъюгированные антисмысловые соединения расщепляются с удалением всего или части конъюгата, приводя к активной (или более активной) форме антисмыслового соединения, не содержащего всего или части конъюгата.
В некоторых вариантах реализации конъюгаты присоединены на 5'-конце олигонуклеотида. Некоторые такие 5'-конъюгаты расщепляются более эффективно, чем аналоги, имеющие такую же конъюгирующую группу, присоединенную на 3'-конце. В некоторых вариантах реализации улучшенная активность может коррелировать с улучшенным расщеплением. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды, содержащие конъюгат на 5'-конце, обладают более высокой эффективностью, чем олигонуклеотиды, содержащие конъюгат на 3'-конце (см., например, Примеры 56, 81, 83 и 84). Кроме того, 5'-присоединение обеспечивает более простой синтез олигонуклеотида. Как
правило, олигонуклеотиды синтезируют на твердой подложке в направлении от 3' к 5'. Для получения 3'-конъюгированного олигонуклеотида, как правило присоединяют предварительно конъюгированный 3'-нуклеозид к твердой подложке, а затем обычным путем создают олигонуклеотид. Однако присоединение такого конъюгированного нуклеозида к твердой подложке усложняет синтез. Кроме того, применяя такой подход, конъюгат затем присутствует в ходе всего синтеза олигонуклеотида и может разрушаться во время последующих стадий или может ограничивать типы реакций и реагентов, которые можно применять. Применяя структуры и методики, описанные в настоящем документе для 5'-конъюгированных олигонуклеотидов, можно синтезировать олигонуклеотид при помощи стандартных автоматизированных методик и внедрять в конъюгат окончательный (5'-ближайший) нуклеозид или после отделения олигонуклеотида от твердой подложки.
С учетом известного уровня техники и настоящего описания, специалисты в данной области техники могут легко получить любые из конъюгатов и конъюгированных олигонуклеотидов, описанных в настоящем документе. Кроме того, синтез некоторых таких конъюгатов и конъюгированных олигонуклеотидов, описанных в настоящем документе, проще и/или требует меньше стадий и, следовательно, менее дорогой, чем синтез ранее описанных конъюгатов, что дает преимущество при производстве. Например, синтез некоторых конъюгирующих групп состоит из меньшего количество синтетических стадий, что приводит к увеличению выхода, по сравнению с ранее описанными конъюгирующими группами. Конъюгирующие группы, такие как GalNAc3-10 в Примере 46 и GalNAc3-7 в Примере 48, гораздо проще, чем ранее описанные конъюгаты, такие как описаны в публикациях U.S. 8106022 или U.S. 7262177, для которых необходима сборка большего количества химических промежуточных соединений. Соответственно, эти и другие конъюгаты, описанные в настоящем документе, обладают преимуществом по сравнению с ранее описанными соединениями для применения с любым олигонуклеотидом, включая односпиральные олигонуклеотиды и любую спираль двухспиральных олигонуклеотидов (например, миРНК).
Точно так же в настоящем документе описаны конъюгирующие группы, имеющие только один или два лиганда GalNAc. Как показано, такие конъюгированные группы усиливают активность антисмысловых соединений. Такие соединения гораздо проще получить, чем конъюгаты, содержащие три лиганда GalNAc. Конъюгирующие группы, содержащие один или два лиганда GalNAc, могут быть присоединены к любым антисмысловым соединениям, включая односпиральные олигонуклеотиды и любую спираль
двухспиральных олигонуклеотидов (например, миРНК).
В некоторых вариантах реализации конъюгаты, описанные в настоящем документе, существенно не изменяют некоторые показатели переносимости. Например, в настоящем документе показано, что конъюгированные антисмысловые соединения являются не более иммуногенными, чем не конъюгированные исходные соединения. Поскольку активность улучшается, то варианты реализации, в которых переносимость остается такой же (или, в действительности, если даже переносимость ухудшается лишь незначительно, по сравнению с приростом активности), обладают улучшенными характеристиками для терапии.
В некоторых вариантах реализации конъюгация позволяет изменять антисмысловые соединения так, чтобы они обладали менее выраженными последствиями в отсутствие конъюгации. Например, в некоторых вариантах реализации замена одной или более тиофосфатных связей полностью тиофосфатного антисмыслового соединения на фосфодиэфирные связи приводит к улучшению некоторых показателей переносимости. Например, в некоторых случаях такие антисмысловые соединения, имеющие один или более фосфодиэфиров, являются менее иммуногенными, чем такие же соединения, в которых каждая связь представляет собой тиофосфат. Однако в некоторых случаях, как показано в Примере 26, такое же замещение одной или более тиофсофатных связей на фосфодиэфирные связи приводит также к снижению клеточного захвата и/или к снижению активности. В некоторых вариантах реализации конъюгированные антисмысловые соединения, описанные в настоящем документе, допускают такое изменение связей с небольшим снижением или без снижения захвата и активности, по сравнению с конъюгированным полностью тиофосфатным аналогом. В действительности, в некоторых вариантах реализации, например, в Примерах 44, 57, 59 и 86, олигонуклеотиды, содержащие конъюгат и по меньшей мере одну фосфодиэфирную межнуклеозидную связь, фактически демонстрируют повышенную активность in vivo даже по сравнению с полностью тиофосфатным аналогом, также содержащим такой же конъюгат. Более того, поскольку конъюгация приводит к значительному увеличению захвата/активности, то небольшое снижение такого существенного прироста может быть приемлемым для достижения улучшенной переносимости. Соответственно, в некоторых вариантах реализации конъюгированные антисмысловые соединения содержат по меньшей мере одну фосфодиэфирную связь.
В некоторых вариантах реализации конъюгация антисмысловых соединений по настоящему документу приводит к улучшенной доставке, захвату и активности в гепатоцитах. Следовательно, в ткань печени доставляется большее количество соединения.
Однако в некоторых вариантах реализации изобретения такая улучшенная доставка сама по себе не объясняет общего увеличения активности. В некоторых таких вариантах реализации изобретения большее количество соединения поступает в гепатоциты. В некоторых вариантах реализации изобретения даже такой улучшенный захват гепатоцитов сам по себе не объясняет общего увеличения активности. В таких вариантах реализации изобретения увеличивается продуктивный захват конъюгированного соединения. Например, как показано в Примере 102, некоторые варианты реализации GalNAc-содержащих конъюгатов увеличивают обогащение антисмысловых олигонуклеотидов в гепатоцитах, по сравнению с не паренхимальными клетками. Такое обогащение преимущественно для олигонуклеотидов, которые нацелены на гены, экспрессируемые в гепатоцитах.
В некоторых вариантах реализации конъюгированные антисмысловые соединения по настоящему документу приводят к уменьшению воздействия на почки. Например, как показано в Примере 20, концентрации антисмысловых олигонуклеотидов, содержащих некоторые варианты реализации GalNAc-содержащих конъюгатов, в почках ниже, чем концентрации антисмысловых олигонуклеотидов, не имеющих GalNAc-содержащего конъюгата. Это имеет несколько преимущественных терапевтических применений. Для терапевтических показаний, в которых не требуется проявление активности в почках, воздействие на почки подвергает их риску токсичности без соответствующей пользы. Более того, высокая концентрация в почках обычно приводит к выводу соединения с мочой, обеспечивая более быстрое выведение. Соответственно, для внепочечных мишеней накопление в почках является нежелательным.
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены конъюгированные антисмысловые соединения, представленные формулой:
Figure 00000001
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
В представляет собой расщепляемый фрагмент;
С представляет собой конъюгирующий линкер;
D представляет собой группу ветвления;
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
На представленной выше схеме и в аналогичных схемах в настоящем документе группа ветвления «D» разветвляется такое количество раз, которое необходимо для соответствия количеству групп (E-F), указанному количеством «q». Так, если q=1, то формула представляет собой:
Figure 00000002
если q=2, то формула представляет собой:
Figure 00000003
если q=3, то формула представляет собой:
Figure 00000004
если q=4, то формула представляет собой:
Figure 00000005
если q=5, то формула представляет собой:
Figure 00000006
В некоторых вариантах реализации изобретения приведены конъюгированные антисмысловые соединения, имеющие структуру:
Figure 00000007
.
В некоторых вариантах реализации изобретения приведены конъюгированные антисмысловые соединения, имеющие структуру:
Figure 00000008
.
В некоторых вариантах реализации изобретения приведены конъюгированные антисмысловые соединения, имеющие структуру:
Figure 00000009
.
В некоторых вариантах реализации изобретения приведены конъюгированные антисмысловые соединения, имеющие структуру:
Figure 00000010
В настоящем описании представлены следующие не ограниченные нумерованные варианты реализации изобретения:
В вариантах реализации, имеющих более одной конкретной переменной (например, более одного «m» или «n»), если не указано иное, каждая такая конкретная переменная выбрана независимо. Следовательно, для структуры, имеющей более одного n, каждый n выбран независимо, так что они могут быть или не быть одинаковыми между собой.
В некоторых вариантах реализации настоящего описания приведены конъюгированные антисмысловые соединения, представленные следующей структурой. В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение содержит модифицированный олигонуклеотид ISIS 494372 с 5'-Х, где X представляет собой конъюгированную группу, содержащую GalNAc. В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение состоит из модифицированного олигонуклеотида ISIS 494372 с 5'-Х, где X представляет собой конъюгированную группу, содержащую GalNAc.
Figure 00000011
В некоторых вариантах реализации настоящего описания приведены конъюгированные антисмысловые соединения, представленные следующей структурой. В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение содержит конъюгированный модифицированный олигонуклеотид ISIS 681251. В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение состоит из конъюгированного модифицированного олигонуклеотида ISIS 681251.
Figure 00000012
В некоторых вариантах реализации изобретения в настоящем описании приведены конъюгированные антисмысловые соединения, представленные следующей структурой. В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение содержит конъюгированный модифицированный олигонуклеотид ISIS 681257. В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение состоит из конъюгированного модифицированного олигонуклеотида ISIS 681257.
Figure 00000013
В некоторых вариантах реализации изобретения в настоящем описании приведены конъюгированные антисмысловые соединения, представленные следующей структурой. В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение содержит модифицированный олигонуклеотид с SEQ ID NO: 58 с 5'-GalNAc с вариабельностью в сахарных структурах крыльев. В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение состоит из модифицированного олигонуклеотида с SEQ ID NO: 58 с 5'-GalNAc с вариабельностью в сахарных структурах крыльев.
Figure 00000014
где либо R1 представляет собой -ОСН2СН2ОСН3 (МОЕ), и R2 представляет собой Н; либо R1 и R2 вместе образуют мостик, где R1 представляет собой -О-, и R2 представляет собой -СН2-, -СН(СН3)- или -СН2СН2-, и R1 и R2 связаны напрямую, так что образующийся мостик выбран из: -O-СН2-, -O-СН(СН3)- и -O-СН2СН2-;
и для каждой пары R3 и R4 у одного кольца, независимо для каждого кольца: либо R3 выбран из Н и -ОСН2СН2ОСН3, и R4 представляет собой Н; либо R3 и R4 вместе образуют мостик, где R3 представляет собой -О-, и R4 представляет собой -СН2-, -СН(СН3)- или -СН2СН2-, и R3 и R4 связаны напрямую, так что образующийся мостик выбран из: -О-СН2-, -О-СН(СН3)- и -O-СН2СН2-;
и R5 выбран из Н и - СН3;
и Z выбран из S- и О-.
В настоящем описании приведены следующие неограничивающие нумерованные варианты реализации изобретения:
Подробное описание
Следует понимать, что и представленное выше общее описание, и следующее подробное описание являются лишь типичными и пояснительными, и они не ограничивают настоящее описание. В настоящем документе использование единственного числа включает множественное число, если специально не указано иное. При использовании в настоящем документе, термин «или» означает «и/или», если не указано иное. Кроме того, использование термина «включая», а также других форм, таких как «включает» и «включенный», не является ограничивающим. Также, такие термины как «элемент» или «компонент» охватывают как элементы и компоненты, содержащие одну единицу, так и элементы и компоненты, которые содержат более одной субъединицы, если специально не указано иное.
Названия разделов, используемые в настоящем документе, предназначены лишь для организационных целей, и их не следует толковать как ограничение описанного объекта изобретения. Все документы или части документов, цитируемые в настоящей заявке, включая, но не ограничиваясь ими, патенты, патентные заявки, статьи, книги и монографии, в явной форме включены в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме для всех целей.
А. Определения
При отсутствии конкретных определений, номенклатура, используемая в связи с ними, а также в связи с приемами и методиками аналитической химии, синтетической органической химии, а также медицинской и фармацевтической химии, описанная в настоящем документе, является общеизвестной и общепринятой в данной области техники. Для химического синтеза и химического анализа могут быть использованы стандартные методики. Некоторые такие методики и приемы представлены, например, в публикациях "Carbohydrate Modifications in Antisense Research" под редакцией Sangvi и Cook, American Chemical Society, федеральный округ Вашингтон, 1994; "Remington's Pharmaceutical Sciences," Mack Publishing Co.; Истон, штат Пенсильвания, 21е издание, 2005; и "Antisense Drug Technology, Principles, Strategies, and Applications" под
редакцией Stanley Т. Crooke, CRC Press, Бока-Ратон, штат Флорида; а также в книге Sambrook et al., "Molecular Cloning, A laboratory Manual," 2е издание, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989, которые включены в настоящий документ посредством ссылки для всех целей.
Если это допустимо, все патенты, заявки, опубликованные заявки и другие публикации, а также другие данные, упоминаемые в тексте настоящего описания, включены в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме. Если не указано иное, следующие термины имеют следующие значения:
При использовании в настоящем документе, «нуклеозид» означает соединение, содержащее фрагмент азотистого основанияи сахарный фрагмент. Нуклеозиды включают, но не ограничиваются ими, природные нуклеозиды (которые находятся в ДНК и РНК) и модифицированные нуклеозиды. Нуклеозиды могут быть связаны с фосфатным фрагментом.
При использовании в настоящем документе, «химическая модификация» означает химическое отличие в соединении, по сравнению с природным аналогом. Химические модификации олигонуклеотидов включают нуклеозидные модификации (включая модификации сахарного фрагмента и модификации азотистого основания) и модификации межнуклеозидных связей. В отношении олигонуклеотида химическая модификация включает не только отличия в последовательности азотистых оснований.
При использовании в настоящем документе, «фуранозил» означает структуру, содержащую 5-членное кольцо, содержащее четыре атома углерода и один атом кислорода.
При использовании в настоящем документе, «природный сахарный фрагмент» означает рибофуранозил, встречающийся в природной РНК, или дезоксирибофуранозил, встречающийся в природной ДНК.
При использовании в настоящем документе, «сахарный фрагмент» означает природный сахарный фрагмент или модифицированный сахарный фрагмент нуклеозида.
При использовании в настоящем документе, «модифицированный сахарный фрагмент» означает замещенный сахарный фрагмент или заменитель сахара.
При использовании в настоящем документе, «замещенный сахарный фрагмент» означает фуранозил, который не является природным сахарным фрагментом. Замещенные сахарные фрагменты включают, но не ограничиваются ими, фуранозилы, содержащие заместители в 2'-положении, 3'-положении, 5'-положении и/или 4'-положении. Некоторые замещенные сахарные фрагменты представляют собой бициклические сахарные фрагменты.
При использовании в настоящем документе, «2'-замещенный сахарный фрагмент» означает фуранозил, содержащий заместитель в 2'-положении, отличный от Н или ОН. Если не указано иное, то 2'-замещенный сахарный фрагмент не является бициклическим сахарным фрагментом (т.е. 2'-заместитель 2'-замещенного сахарного фрагмента не образует мостик с другим атомом радикала фуранозного кольца).
При использовании в настоящем документе, «МОЕ» означает -ОСН2СН2ОСН3.
При использовании в настоящем документе, «2'-F нуклеозид» относится к нуклеозиду, содержащему сахар, который содержит фтор в 2'-положении. Если не указано иное, то фтор в 2'-F нуклеозиде находится в рибо-положении (заменяя ОН природной рибозы).
При использовании в настоящем документе, термин «заменитель сахара» означает структуру, которая не содержит фуранозила и способна заменять природный сахарный
фрагмент нуклеозида, так что образующиеся нуклеозидные субъединицы могут связываться вместе и/или связываться с другими нуклеозидами с образованием олигомерного соединения, которое может гибридизоваться с комплементарным олигомерным соединением. Такие струтуры включают кольца, содержащие другое количество атомов, чем фуранозил (например, 4, 6 или 7-членные кольца); замену кислорода фуранозила некислородным атомом (например, углеродом, серой или азотом); или одновременное изменение количество атомов и замену кислорода. Такие структуры также могут содержать замещения, соответствующие замещениям, описанным для замещенных сахарных фрагментов (например, 6-членные карбоциклические бициклические заменители сахара, необязательно содержащие дополнительные заместители). Заменители сахара включают также более сложные сахарные заместители (например, некольцевые системы пептидной нуклеиновой кислоты). Заменители сахара включают, без ограничения, морфолино, циклогексенилы и циклогекситолы.
При использовании в настоящем документе, «бициклический сахарный фрагмент» означает модифицированный сахарный фрагмент, содержащий 4-7-членное кольцо (включая, но не ограничиваясь фуранозилом), содержащее мостик, связывающий два атома 4-7-членного кольца с образованием второго кольца, что приводит к получению бициклической структуры. В некоторых вариантах реализации 4-7-членное кольцо представляет собой сахарное кольцо. В некоторых вариантах реализации 4-7-членное кольцо представляет собой фуранозил. В некоторых таких вариантах реализации мостик соединяет 2'-углерод и 4'-углерод фуранозила.
Используемый в настоящем документе термин «нуклеиновая кислота» относится к молекулам, состоящим из мономерных нуклеотидов. «Нуклеиновая кислота» включает рибонуклеиновые кислоты (РНК), дезоксирибонуклеиновые кислоты (ДНК), одноцепочечные нуклеиновые кислоты (оцДНК), двухцепочечные нуклеиновые кислоты (дцДНК), малые интерферирующие рибонуклеиновые кислоты (миРНК) и микроРНК (микроРНК). Нуклеиновая кислота может также содержать любую комбинацию этих элементов в одной молекуле.
При использовании в настоящем документе, «нуклеотид» означает нуклеозид, дополнительно содержащий фосфатную связывающую группу. При использовании в настоящем документе, «связанные нуклеозиды» могут быть или не быть связаны фосфатными связями и, следовательно, включают, но не ограничиваются ими, «связанные нуклеотиды». При использовании в настоящем документе; «связанные нуклеозиды» представляют собой нуклеозиды, которые связаны в непрерывную последовательность (т.е. между связанными нуклеозидами нет дополнительных нуклеозидов).
При использовании в настоящем документе, «азотистое основание» означает группу атомов, которая может быть связана с сахарным фрагментом с образованием нуклеозида, который может быть внедрен в олигонуклеотид, и при этом указанная группа атомов может связываться с комплементарным природным азотистым основанием другого олигонуклеотида или нуклеиновой кислоты. Азотистые основания могут быть природными или могут быть модифицированными. При использовании в настоящем документе
«последовательность азотистых оснований» обозначает порядок смежных азотистых оснований, независимый от какого-либо сахара, связи или модификации азотистого основания.
При использовании в настоящем документ, термины «немодифицированное азотистое основание» или «природное азотистое основание» означают природные гетероциклические азотистые основания РНК или ДНК: пуриновые основания аденин (А) и гуанин (G) и пиримидиновые основания тимин (Т), цитозин (С) (включая 5-метил С) и урацил (U).
При использовании в настоящем документе, «модифицированное азотистое основание» означает любое азотистое основание, которое не является природным азотистым основанием.
При использовании в настоящем документе, «модифицированный нуклеозид» означает нуклеозид, содержащий по меньшей мере одну химическую модификацию, по сравнению с природными нуклеозидами РНК или ДНК. Модифицированные нуклеозиды содержат модифицированный сахарный фрагмент и/или модифицированное азотистое основание.
При использовании в настоящем документе, «бициклический нуклеозид» или «BNA» означает нуклеозид, содержащий бициклический сахарный фрагмент.
При использовании в настоящем документе, «стерически затрудненный этил-нуклеозид» или «cEt» означает нуклеозид, содержащий бициклический сахарный фрагмент, который содержит мостик 4'-СН(СН3)-O-2'.
При использовании в настоящем документе, «нуклеозид закрытой нуклеиновой кислоты» или «LNA» означает нуклеозид, содержащий бициклический сахарный фрагмент, который содержит мостик 4'-СН2-O-2'.
При использовании в настоящем документе, «2'-замещенный нуклеозид» означает нуклеозид, содержащий заместитель в 2'-положении, отличный от Н или ОН. Если не указано иное, то 2'-замещенный нуклеозид не является бициклическим нуклеозидом.
При использовании в настоящем документе, «дезоксинуклеозид» означает нуклеозид, содержащий 2'-Н фуранозильный сахарный фрагмент, находящийся в природных дезоксирибонуклеозидах (ДНК). В некоторых вариантах реализации 2'-дезоксинуклеозид может содержать модифицированное азотистое основание или может содержать азотистое основание РНК (например, урацил).
При использовании в настоящем документе, «олигонуклеотид» означает соединение, содержащее множество связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит один или более немодифицированных рибонуклеозидов (РНК) и/или немодифицированных дезоксирибонуклеозидов (ДНК), и/или один или более модифицированных нуклеозидов.
При использовании в настоящем документе, «олигонуклеозид» означает олигонуклеотид, в котором ни один из межнуклеозидных связей не содержит атом фосфора. При использовании в настоящем документе, олигонуклеотиды включают олигонуклеозиды.
При использовании в настоящем документе, «модифицированный олигонуклеотид» означает олигонуклеотид, содержащий по меньшей мере один модифицированный нуклеозид и/или по меньшей мере одну модифицированную межнуклеозидную связь.
При использовании в настоящем документе, «связь» или «связывающая группа» означает группу атомов, которая связывает вместе две или более других групп атомов.
При использовании в настоящем документе, «межнуклеозидная связь» означает ковалентную связь между соседними нуклеозидами в олигонуклеотиде.
При использовании в настоящем документе, «природная межнуклеозидная связь» означает фосфодиэфирную связь 3' с 5'.
При использовании в настоящем документе, «модифицированная межнуклеозидная связь» означает любую межнуклеозидную связь, отличную от природной межнуклеозидной связи.
При использовании в настоящем документе, «концевая межнуклеозидная связь» означает связь между последними двумя нуклеозидами олигонуклеотида или его определенной области.
При использовании в настоящем документе, «фосфорная связывающая группа» означает связывающую группу, содержащую атом фосфора. Фосфорные связывающие группы включают, без ограничения, группы, имеющие формулу:
Figure 00000015
где:
Ra и Rd, каждый независимо, представляют собой О, S, СН2, NH или NJ1, где J1 представляет собой С16 алкил или замещенный С16 алкил;
Rb представляет собой О или S;
Rc представляет собой ОН, SH, C16 алкил, замещенный C16 алкил, C16 алкокси, замещенный C16 алкокси, амино или замещенный амино; и
J1 представляет собой R6 представляет собой О или S.
Фосфорные связывающие группы включают, без ограничения, фосфодиэфир, тиофосфат, дитиофосфат, фосфонат, фосфорамидат, фосфортиоамидат, тионоалкил-фосфонат, фосфотриэфиры, тионоалкил-фосфотриэфиры и боранофосфат.
При использовании в настоящем документе, «межнуклеозидная фосфорная связывающая группа» означает фосфорную связывающую группу, которая напрямую связывает два нуклеозида.
При использовании в настоящем документе, «не межнуклеозидная фосфорная связывающая группа» означает фосфорную связывающую группу, которая не связывает напрямую два нуклеозида. В некоторых вариантах реализации не межнуклеозидная
фосфорная связывающая группа связывает нуклеозид с группой, отличной от нуклеозида. В некоторых вариантах реализации не межнуклеозидная фосфорная связывающая группа связывает две группы, ни одна из которых не является нуклеозидом.
При использовании в настоящем документе, «нейтральная связывающая группа» означает связывающую группу, которая не имеет заряда. Нейтральные связывающие группы включают, без ограничения, фосфотриэфиры, метилфосфонаты, MMI (-СН2-N(СН3)-O-), амид-3 (-CH2-C(=O)-N(H)-), амид-4 (-CH2-N(H)-C(=O)-), формацеталь (-O-СН2-O-) и тиоформацеталь (-S-CH2-O-). Дополнительные нейтральные связывающие группы включают неионные связи, содержащие силоксан (диалкилсилоксан), карбоксильный эфир, карбоксамид, сульфид, сульфоновый эфир и амиды (см., например: Carbohydrate Modifications in Antisense Research; под ред. Y.S. Sanghvi и P.D. Cook, ACS Symposium, серия 580; главы 3 и 4, (cc. 40-65)). Дополнительные нейтральные связывающие группы включают неионные связи, содержащие смешанные составные части N, О, S и СН2.
При использовании в настоящем документе, «межнуклеозидная нейтральная связывающая группа» означает нейтральную связывающую группу, которая напрямую связывает два нуклеозида.
При использовании в настоящем документе, «не межнуклеозидная нейтральная связывающая группа» означает нейтральную связывающую группу, которая не связывает напрямую два нуклеозида. В некоторых вариантах реализации не межнуклеозидная нейтральная связывающая группа связывает нуклеозид с группой, отличной от нуклеозида. В некоторых вариантах реализации не межнуклеозидная нейтральная связывающая группа связывает две группы, ни одна из которых не является нуклеозидом.
При использовании в настоящем документе, «олигомерное соединение» означает полимерную структуру, содержащую две или более субструктур. В некоторых вариантах реализации олигомерное соединение содержит олигонуклеотид. В некоторых вариантах реализации олигомерное соединение содержит одну или более конъюгированных групп и/или концевых групп. В некоторых вариантах реализации олигомерное соединение состоит из олигонуклеотида. Олигомерные соединения включают также природные нуклеиновые кислоты. В некоторых вариантах реализации олигомерное соединение содержит скелет одной или более связанных мономерных субъединиц, при этом каждая связанная мономерная субъединица прямо или косвенно присоединена к гетероциклическому основному фрагменту. В некоторых вариантах реализации олигомерные соединения могут содержать также мономерные субъединицы, которые не связаны с гетероциклическим основным фрагментом, обеспечивая таким образом сайты с удаленными основаниями. В
некоторых вариантах реализации связи, соединяющие мономерные субъединицы, сахарные фрагменты или заменители и гетероциклические основные фрагменты, могут быть независимо модифицированы. В некоторых вариантах реализации единица связь-сахар, которая может содержать или не содержать гетероциклическое основание, может быть замещена миметиком, таким как мономеры в пептидных нуклеиновых кислотах.
При использовании в настоящем документе, «концевая группа» означает один или более атомов, присоединенных к любому или к обоим 3'- или 5'-концам олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации концевая группа представляет собой конъюгирующую группу. В некоторых вариантах реализации концевая группа содержит один или более нуклеозидов концевой группы.
При использовании в настоящем документе, «конъюгат» или «конъюгирующая группа» означает атом или группу атомов, связанную с олигонуклеотидом или олигомерным соединением. Как правило, конъюгирующие группы модифицируют одно или более свойств соединения, к которому они присоединены, включая, но не ограничиваясь ими, свойства фармакодинамики, фармакокинетики, связывания, поглощения, клеточного распределения, клеточного захвата, заряда и/или выведения.
При использовании в настоящем документе, «конъюгирующий линкер» или «линкер» в контексте конъюгирующие группы означает часть конъюгирующие группы, содержащую любой атом или группу атомов и ковалентно связывающую (1) олигонуклеотид с другой частью конъюгирующие группы или (2) две или более частей конъюгирующие группы.
Конъюгирующие группы показаны в настоящем документе как радикалы, обеспечивающие связь для образования ковалентного присоединения к олигомерному соединению, такому как антисмысловый олигонуклеотид. В некоторых вариантах реализации точка присоединения у олигомерного соединения представляет собой 3'-атом кислорода 3'-гидроксильной группы 3'-концевого нуклеозида олигомерного соединения. В некоторых вариантах реализации точка присоединения у олигомерного соединения представляет собой 5'-атом кислорода 5'-гидроксильной группы 5'-концевого нуклеозида олигомерного соединения. В некоторых вариантах реализации связь для образования присоединения к олигомерному соединению представляет собой расщепляемую связь. В некоторых таких вариантах реализации такая расщепляемая связь составляет весь или часть расщепляемого фрагмента.
В некоторых вариантах реализации конъюгирующие группы содержат расщепляемый фрагмент (например, расщепляемую связь или расщепляемый нуклеозид) и часть углеводного кластера, такую как часть кластера GalNAc. Такая часть углеводного кластера содержит: нацеливающий фрагмент и, необязательно, конъюгирующий линкер. В некоторых вариантах реализации часть углеводного кластера определяют по количеству и сущности лиганда. Например, в некоторых вариантах реализации часть углеводного кластера содержит три группы GalNAc и обозначена «GalNAc3». В некоторых вариантах реализации часть углеводного кластера содержит 4 группы GalNAc и обозначена «GalNAc4». Конкретные части углеводных кластеров (имеющие конкретную связку, группы ветвления и конъюгирующего линкера) описаны в настоящем документе
и обозначены римской цифрой с последующим нижним индексом «а». Соответственно, «GalNac3-1a» относится к конкретной части углеводного кластера конъюгирующие группы, имеющей 3 группы GalNac и конкретно определенную связку, группы ветвления и линкера. Такой фрагмент углеводного кластера присоединен к олигомерному соединению через расщепляемый фрагмент, такой как расщепляемая связь или расщепляемый нуклеозид.
При использовании в настоящем документе, «расщепляемый фрагмент» означает связь или группу, которая может быть расщеплена при физиологических условиях. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент расщепляется внутри клетки или во внутриклеточных отделах, таких как лизосома. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент расщепляется эндогенными ферментами, такими как нуклеазы. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент содержит группу атомов, имеющую один, два, три, четыре или более четырех расщепляемых связей.
При использовании в настоящем документе, «расщепляемая связь» означает любую химическую связь, которая может быть расщеплена. В некоторых вариантах реализации расщепляемая связь выбрана из: амида, полиамида, сложного эфира, эфира, одного или обоих сложных эфиров фосфодиэфира, фосфатного сложного эфира, карбамата, дисульфида или пептида.
При использовании в настоящем документе, «углеводный кластер» означает соединение, имеющее один или более углеводных остатков, присоединенных к скелету или связывающей группе, (см., например, публикацию Maier et al., "Synthesis of Antisense Oligonucleotides Conjugated to a Multivalent Carbohydrate Cluster for Cellular Targeting," Bioconjugate Chemistry, 2003, (14): 18-29, которая в полном объеме включена в настоящий документ посредством ссылки, или Rensen et al., "Design and Synthesis of Novel N-Acetylgalactosamine-Terminated Glycolipids for Targeting of Lipoproteins to the Hepatic Asiaglycoprotein Receptor," J. Med. Chem. 2004, (47): 5798-5808, где представлены примеры углеводных конъюгированных кластеров).
При использовании в настоящем документе, «модифицированный углевод» означает любой углевод, имеющий одну или более модификаций, по сравнению с природными углеводами.
При использовании в настоящем документе, «производное углевода» означает любое соединение, которое может быть синтезировано с использованием углевода в качестве исходного материала или промежуточного соединения.
При использовании в настоящем документе, «углевод» означает природный углевод, модифицированный углевод или производное углевода.
При использовании в настоящем документе, «защитная группа» означает любое соединение или защитную группу, известную специалистам в данной области техники. Не ограничивающие примеры защитных групп представлены в публикации "Protective Groups in Organic Chemistry", Т. W. Greene, P. G. M. Wuts, ISBN 0-471-62301-6, John Wiley & Sons, Inc Нью-Йорк, полное содержание которой включено в настоящий документ посредством ссылки.
При использовании в настоящем документе, «односпиральное» означает олигомерное соединение, которое не гибридизовано с его комплементом и которое не имеет достаточной самокомплементарностью для образования усточивого собственного дуплекса.
При использовании в настоящем документе, «двухспиральное» означает пару олигомерных соединений, которые гибридизованы друг с другом, или одно самокомплементарное олигомерное соединение, которое образует шпилечную структуру. В некоторых вариантах реализации двухспиральное олигомерное соединение содержит первое и второе олигомерное соединение.
При использовании в настоящем документе, «антисмысловое соединение» означает соединение, содержащее или состоящее из олигонуклеотида, по меньшей мере часть которого комплементарна целевой нуклеиновой кислоте, с которой возможна его гибридизация, что приводит к получению по меньшей мере одной антисмысловой активности.
При использовании в настоящем документе, «антисмысловая активность» означает любое обнаруживаемое и/или измеримое изменение, обусловленное гибридизацией антисмыслового соединения с его целевой нуклеиновой кислотой. В некоторых вариантах реализации антисмысловая активность включает модулирование количества или активности транскрипта целевой нуклеиновой кислоты (например, мРНК). В некоторых вариантах реализации антисмысловая активность включает модулирование сплайсинга пре-мРНК.
При использовании в настоящем документе, «антисмысловое соединение на основе РНКазы Н» означает антисмысловое соединение, в котором по меньшей мере часть антисмысловой активности антисмыслового соединения обусловлена гибридизацией антисмыслового соединения с целевой нуклеиновой кислотой и последующим расщеплением целевой нуклеиновой кислоты под действием РНКазы Н.
При использовании в настоящем документе, «антисмысловое соединение на основе RISC» означает антисмысловое соединение, в котором по меньшей мере часть антисмысловой активности антисмыслового соединения обусловлена РНК-индуцируемым комплексом сайленсинга (RISC).
При использовании в настоящем документе, «обнаружение» или «измерение» означает, что выполнено испытание или анализ для обнаружения или измерения. Такое обнаружение и/или измерение может приводить к результату с нулевым значением. Следовательно, даже если испытание для обнаружения или измерения приводит к обнаружению отсутствия активности (нулевой активности), то стадия обнаружения или измерения активности была выполнена.
При использовании в настоящем документе, «обнаруживаемая и/или измеримая активность» означает статистически значимую активность, которая не является нулевой.
При использовании в настоящем документе, «по существу не измененный» означает небольшое или
отсутствие изменения конкретного параметра, в частности, по сравнению с другим параметром, который изменился гораздо больше. В некоторых вариантах реализации параметр является по существу не измененным, если его изменение составило менее 5%. В некоторых вариантах реализации параметр является по существу не измененным, если его изменение составило менее двух раз, тогда как изменение другого параметра составило по меньшей мере десять раз. Например, в некоторых вариантах реализации антисмысловая активность представляет собой изменение количества целевой нуклеиновой кислоты. В некоторых таких вариантах реализации количество нецелевой нуклеиновой кислоты является по существу не измененным если оно изменяется гораздо меньше, чем изменяется количество целевой нуклеиновой кислоты, но это изменение не обязательно должно быть нулевым.
При использовании в настоящем документе, «экспрессия» означает процесс, посредством которого ген в конечном итоге преобразуется в белок. Экспрессия включает, но не ограничивается этим, транскрипцию, посттранскрипционную модификацию (например, сплайсинг, полиаденилирование, добавление 5'-кэпа) и трансляцию.
При использовании в настоящем документе, «целевая нуклеиновая кислота» означает молекулу нуклеиновой кислоты, с которой предполагается гибридизация антисмыслового соединения с получением желаемой антисмысловой активности. Антисмысловые олигонуклеотиды обладают достаточной комплементарностью с их целевыми нуклеиновыми кислотами для обеспечения гибридизации при физиологических условиях.
При использовании в настоящем документе, «комплементарность азотистого основания» или «комплементарность» в отношении азотистых оснований означает азотистое основание, которое способно к спариванию оснований с другим азотистое основанием. Например, в ДНК аденин (А) комплементарен тимину (Т). Например, в РНК аденин (А) комплементарен урацилу (U). В некоторых вариантах реализации комплементарное азотистое основание означает азотистое основание антисмыслового соединения, которое способно к спариванию оснований с азотистым основанием его целевой нуклеиновой кислоты. Например, если азотистое основание в определенном положении антисмыслового соединения способно к водородному связыванию с азотистым основанием в определенном положении целевой нуклеиновой кислоты, то это положение водородного связывания между олигонуклеотидом и целевой нуклеиновой кислотой считается комплементарным по этой паре азотистых оснований. Азотистые основания, содержащие определенные модификации, могут сохранять способность к спариванию с противоположным азотистым основанием и, следовательно, все еще могут обладать комплементарностью азотистых оснований.
При использовании в настоящем документе, «не комплементарные» в отношении азотистых оснований означает пару азотистых оснований, которые не образуют водородные связи друг с другом.
При использовании в настоящем документе, «комплементарные» в отношении олигомерных соединений (например, связанных нуклеозидов, олигонуклеотидов или нуклеиновых кислот) означает способность таких олигомерных соединений или их областей к гибридизации с другим олигомерным соединением или его областью за счет комплементарности азотистых оснований. Комплементарные олигомерные соединения не обязательно должны обладать комплементарностью азотистых оснований в каждом нуклеозиде. До не которой степени допустимы некоторые несоответствия. В некоторых вариантах реализации
комплементарные олигомерные соединения или области комплементарны по 70% азотистых оснований (комплементарность 70%). В некоторых вариантах реализации комплементарные олигомерные соединения или области комплементарны на 80%. В некоторых вариантах реализации комплементарные олигомерные соединения или области комплементарны на 90%. В некоторых вариантах реализации комплементарные олигомерные соединения или области комплементарны на 95%. В некоторых вариантах реализации комплементарные олигомерные соединения или области комплементарны на 100%.
При использовании в настоящем документе, «несоответствие» означает азотистое основание первого олигомерного соединения, которое не способно спариваться с азотистым основанием в соответствующем положении второго олигомерного соединения при выравнивании первого и второго олигомерного соединения. Любое или оба первое и второе олигомерные соединения могут быть олигонуклеотидами.
При использовании в настоящем документе, «гибридизация» означает спаривание комплементарных олигомерных соединений (например, антисмыслового соединения и его целевой нуклеиновой кислоты). Не ограничиваясь конкретным механизмом, наиболее распространенный механизм спаривания включает водородное связывание, которое может представлять собой уотсон-криковское, хугстиновское или обратное хугстиновское водородное связывание между комплементарными азотистыми основаниями.
При использовании в настоящем документе, «специфически гибридизуется» означает способность олигомерного соединения гибридизоваться с одним сайтом нуклеиновой кислоты с большей аффинностью, чем оно гибридизуется с другим сайтом нуклеиновой кислоты.
При использовании в настоящем документе, «полностью комплементарный» в отношении олигонуклеотида или его части означает, что каждое азотистое основание олигонуклеотида или его части способно к спариванию с азотистым основанием комплементарной нуклеиновой кислоты или ее непрерывной частью. Следовательно, полностью комплементарная область не содержит несоответствий или не гибридизованных азотистых оснований в обеих спиралях.
При использовании в настоящем документе, «процент комплементарности» означает процент азотистых оснований олигомерного соединения, которые комплементарны равной по длине части целевой нуклеиновой кислоты. Процент комплементарности рассчитывают делением количества азотистых оснований олигомерного соединения, которые комплементарны азотистым основаниям в соответствующих положениях целевой нуклеиновой кислоты, на общую длину олигомерного соединения.
При использовании в настоящем документе, «процент идентичности» означает количество азотистых оснований в первой нуклеиновой кислоте, которые относятся к тому же типу (независимо от химической модификации), что и азотистые основания в соответствующих положениях второй нуклеиновой кислоты, деленное на общее количество азотистых оснований в первой нуклеиновой кислоте.
При использовании в настоящем документе, «модулирование» означает изменение количества или качества молекулы, функции или активности, по сравнению с количеством или качеством молекулы, функции или активности до модулирования. Например, модулирование включает изменение, как увеличение (стимуляцию или индукцию), так и снижение (ингибирование или уменьшение) генной экспрессии. В качестве дополнительного примера, модулирование экспрессии может включать изменение выбора сайта сплайсинга при процессинге пре-мРНК, что приводит к изменению абсолютного или относительного количества определенного сплайс-варианта, по сравнению с его количеством в отсутствие модулирования.
При использовании в настоящем документе, «химический мотив» означает характерный участок химических модификаций в олигонуклеотиде или его области. Мотивы могут быть определены по модификациям в определенных нуклеозидах и/или в определенных связывающих группах олигонуклеотида.
При использовании в настоящем документе, «нуклеозидный мотив» означает характерный участок нуклеозидных модификаций в олигонуклеотиде или его области. Связи такого олигонуклеотида могут быть модифицированными или немодифицированными. Если не указано иное, мотивы, описывающие в настоящем документе только нуклеозиды, представляют собой нуклеозидные мотивы. Следовательно, в таких случаях связи не ограничены.
При использовании в настоящем документе, «сахарный мотив» означает характерный участок сахарных модификаций в олигонуклеотиде или его области.
При использовании в настоящем документе, «связывающий мотив» означает характерный участок связывающих модификаций в олигонуклеотиде или его области. Нуклеозиды такого олигонуклеотида могут быть модифицированными или немодифицированными. Если не указано иное, мотивы, описывающие в настоящем документе только связи, представляют собой связывающие мотивы. Следовательно, в таких случаях нуклеозиды не ограничены.
При использовании в настоящем документе, «мотив модификации азотистого основания» означает характерный участок модификаций азотистых оснований вдоль олигонуклеотида. Если не указано иное, то мотив модификации азотистого основания не зависит от последовательности азотистых оснований.
При использовании в настоящем документе, «мотив последовательности» означает характерный участок азотистых оснований, расположенных вдоль олигонуклеотида или его
части. Если не указано иное, то мотив последовательности не зависит от химических модификаций и, следовательно, может иметь любую комбинацию химических модификация, включая отсутствие химических модификаций.
При использовании в настоящем документе, «тип модификации» в отношении нуклеозида или нуклеозида определенного «типа» означает химическую модификацию нуклеозида и включает модифицированные и немодифицированные нуклеозиды. Соответственно, если не указано иное, «нуклеозид, имеющий модификацию первого типа» может быть немодифицированным нуклеозидом.
При использовании в настоящем документе, «по-разному модифицированные» означает химические модификации или химические заместители, которые отличны друг от друга, включая их отсутствие или модификации. Так, например, МОЕ нуклеозид и немодифицированный нуклеозид ДНК являются «по-разному модифицированными», даже несмотря на то, что нуклеозид ДНК является немодифицированным. Точно так же ДНК и РНК являются «по-разному модифицированными», даже несмотря на то, что оба представляют собой природные немодифицированные нуклеозиды. Нуклеозиды, которые являются одинаковыми но содержат различные азотистые основания, не являются по-разному модифицированными. Например, нуклеозид, содержащий 2'-ОМе модифицированный сахар и немодифицированное адениновое азотистое основание, и нуклеозид, содержащий 2'-ОМе модифицированный сахар и немодифицированное тиминовое азотистое основание, не являются по-разному модифицированными.
При использовании в настоящем документе, «модификации одного типа» относится к модификациям, которые являются одинаковыми друг относительно друга, включая отсутствие модификаций. Так, например, два немодифицированных нуклеозида ДНК имеют «модификацию одного типа», даже несмотря на то, что нуклеозид ДНК является немодифицированным. Такие нуклеозиды, имеющие модификацию одного типа, могут содержать различные азотистые основания.
При использовании в настоящем документе, «отдельные области» означает части олигонуклеотида, в которых химические модификации или мотив химических модификаций любой из соседних частей содержит по меньшей мере одно отличие для обеспечения возможности различать области друг от друга.
При использовании в настоящем документе, «фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель» означает любое вещество, подходящее для использования при введении животному. В некоторых вариантах реализации фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель представляет собой стерильный соленой раствор. В некоторых вариантах реализации такой стерильный солевой раствор представляет собой солевой раствор фармацевтической марки.
При использовании в настоящем документе, термин «метаболическое расстройство» означает заболевание или состояние, которое характеризуется, прежде всего, дисрегуляцией метаболизма - сложного набора химических реакций, связанных с расщеплением пищи с выработкой энергии.
При использовании в настоящем документе, термин «сердечно-сосудистое расстройство» означает заболевание или состояние, которое характеризуется, прежде всего, ухудшенной функцией сердца или кровеносных сосудов.
При использовании в настоящем документе, термин «моно- или полициклическая кольцевая система» включает все кольцевые системы, выбранные из одиночных или
полициклических радикальных кольцевых систем, в которых указанные кольца конденсированы или связаны, и включает одиночные или смешанные кольцевые системы, индивидуально выбранные из алифатических, алициклических, арильных, гетероарильных, аралкильных, арилалкильных, гетероциклических, гетероарильных, гетероароматических и гетероарилалкильных. Такие моно- и полициклические структуры могут содержать кольца, каждое из которых имеет одинаковую степень насыщенности, или каждое независимо имеет переменные степени насыщенности, включая полностью насыщенные, частично насыщенные или полностью ненасыщенные. Каждое кольцо может содержать кольцевые атомы, выбранные из С, N, О и S с образованием гетероциклических колец, а также колец, содержащих только кольцевые атомы С, которые могут быть представлены в смешанном мотиве, как, например, в бензимидазоле, в котором одно кольцо имеет только кольцевые атомы углерода, а конденсированное кольцо имеет два атома азота. Моно- или полициклическая кольцевая система может быть дополнительно замещена группами заместителей, как, например, фталимид, который имеет две группы=O, присоединенные к одному из колец. Моно- или полициклические кольцевые системы могут быть присоединены к исходным молекулам при помощи различных способов, таких как непосредственно через кольцевой атом, путем конденсации через несколько кольцевых атомов, через группу заместителя или через бифункциональный связывающий фрагмент.
При использовании в настоящем документе, «пролекарство» означает неактивную или менее активную форму соединения, которая при введении субъекту метаболизируется с образованием активного или более активного соединения (например, лекарства).
При использовании в настоящем документе, «заместитель» и «группа заместителя» означает атом или группу, которая вытесняет атом или группу указанного исходного соединения. Например, заместитель модифицированного нуклеозида представляет собой любой атом или группу, которая отлична от атома или группы, находящейся в природном нуклеозиде (например, модифицированный 2'-заместитель представляет собой любой атом или группу в 2'-положении нуклеозида, отличную от Н или ОН). Группы заместителей могут быть защищенными или не защищенными. В некоторых вариантах реализации соединения настоящего описания имеют заместители в одном или более чем в одном положении исходного соединения. Заместители также могут быть дополнительно замещены другими группами заместителей и могут быть присоединены напрямую или через связывающую группу, такую как алкильная или углеводородная группа, к исходному соединению.
Точно так же, при использовании в настоящем документе, «заместитель» в отношении химической функциональной группы означает атом или группу атомов, которая отлична от атома или группы атомов, обычно содержащихся в указанной функциональной группе. В некоторых вариантах реализации заместитель вытесняет атом водорода функциональной группы (например, в некоторых вариантах реализации заместитель замещенной метильной группы представляет собой атом или группу, отличную от водорода, которая вытесняет один или более атомов водорода незамещенной метильной группы). Если не указано иное, группы, которые могут быть использованы в качестве заместителей, включают, без ограничения, галоген, гидроксил, алкил, алкенил, алкинил, ацил (-C(O)Raa), карбоксил (-C(O)O-Raa), алифатические группы, алициклические группы, алкокси, замещенный окси (-O-Raa), арил, аралкил, гетероциклический радикал, гетероарил, гетероарилалкил, амино (-N(Rbb)(Rcc)), имино (=NRbb), амидо (-C(O)N(Rbb)(Rcc) или -N(Rbb)C(O)Raa), азидо (-N3), нитро (-NO2), циано (-CN), карбамидо (-OC(O)N(Rbb)(Rcc) или -N(Rbb)C(O)ORaa), уреидо (-N(Rbb)C(O)N(Rbb)(Rcc)), тиоуреидо (-N(Rbb)C(S)N(Rbb)(Rcc)), гуанидинил (-N(Rbb)C(=NRbb)N(Rbb)(Rcc)), амидинил (-C(=NRbb)N(Rbb)(Rcc) или -N(Rbb)C(=NRbb)(Raa)), тиол (-SRbb), сульфинил (-S(O)Rbb), сульфонил (-S(O)2Rbb) и сульфонамидил (-S(O)2N(Rbb)(Rcc) или -N(Rbb)S(O)2Rbb). Где каждый Raa, Rbb и Rcc независимо представляет собой Н, необязательно связанную химическую функциональную группу или дополнительную группу заместителя, при этом предпочтительный перечень включает, без ограничения, алкил, алкенил, алкинил, алифатические, алококси, ацил, арил, аралкил, гетероарил, алициклические, гетероциклические и гетероарилалкил. Выбранные заместители с соединениями, описанными в настоящем документе, находятся в рекурсивной степени.
При использовании в настоящем документе, «алкил», используемый в настоящем документе, означает насыщенный прямой или разветвленный углеводородный радикал, содержащий до двадцати четырех атомов углерода. Примеры алкильных групп включают, без ограничения, метил, этил, пропил, бутил, изопропил, н-гексил, октил, децил, додецил и т.п. Алкильные группы обычно содержат от 1 до около 24 атомов углерода, более часто от 1 до около 12 атомов углерода (С112 алкил), при этом более предпочтительно от 1 до около 6 атомов углерода.
При использовании в настоящем документе, «алкенил» означает прямой или разветвленный углеводородный радикал, содержащий до двадцати четырех атомов углерода и имеющий по меньшей мере одну двойную углерод-углеродную связь. Примеры
алкенильных групп включают, без ограничения, этенил, пропенил, бутенил, 1-метил-2-бутен-1-ил, диены, такие как 1,3-бутадиен и т.п. Алкенильные группы обычно содержат от 2 до около 24 атомов углерода, более часто от 2 до около 12 атомов углерода, при этом более предпочтительно от 2 до около 6 атомов углерода. Алкенильные группы, используемые в настоящем документе, могут необязательно содержать одну или более дополнительных групп заместителей.
При использовании в настоящем документе, «алкинил» означает прямой или разветвленный углеводородный радикал, содержащий до двадцати четырех атомов углерода и имеющий по меньшей мере одну тройную углерод-углеродную связь. Примеры алкинильных групп включают, без ограничения, этинил, 1-пропинил, 1-бутинил и т.п. Алкинильные группы обычно содержат от 2 до около 24 атомов углерода, более часто от 2 до около 12 атомов углерода, при этом более предпочтительно от 2 до около 6 атомов углерода. Алкинильные группы, используемые в настоящем документе, могут необязательно содержать одну или более дополнительных групп заместителей.
При использовании в настоящем документе, «ацил» означает радикал, образованный за счет удаления гидроксильной группы от органической кислоты, и имеет общую формулу -С(O)-Х, где X обычно является алифатическим, алициклическим или ароматическим. Примеры включают алифатические карбонилы, ароматические карбонилы, алифатические сульфонилы, ароматические сульфинилы, алифатические сульфинилы, ароматические фосфаты, алифатические фосфаты и т.п. Ацильные группы, используемые в настоящем документе, могут необязательно содержать дополнительные группы заместителей.
При использовании в настоящем документе, «алициклическая» означает циклическую кольцевую систему, в которой кольцо является алифатическим. Кольцевая система может содержать одно или более колец, при этом по меньшей мере одно кольцо является алифатическим. Предпочтительные алициклические системы включают кольца, имеющие от около 5 до около 9 атомов углерода в кольце. Алициклические группы, используемые в настоящем документе, могут необязательно содержать дополнительные группы заместителей.
При использовании в настоящем документе, «алифатический» означает прямой или разветвленный углеводородный радикал, содержащий до двадцати четырех атомов углерода, в котором насыщенность между любыми двумя атомами углерода представляет собой
одинарную, двойную или тройную связь. Алифатическая группа предпочтительно содержит от 1 до около 24 атомов углерода, более часто от 1 до около 12 атомов углерода, при этом более предпочтительно от 1 до около 6 атомов углерода. Прямая или разветвленная цепь алифатической группы может быть прервана одним или более гетероатомами, которые включают азот, кислород, серу и фосфор. Такие алифатические группы, прерванные гетероатомами, включают, без ограничения, полиалкокси, такие как полиалкиленгликоли, полиамины и полиимины. Алифатические группы, используемые в настоящем документе, могут необязательно содержать дополнительные группы заместителей.
При использовании в настоящем документе, «алкокси» означает радикал, образованный между алкильной группой и атомом кислорода, при этом атом кислорода используется для присоединения алкокси-группы к исходной молекуле. Примеры алкокси-групп включают, без ограничения, метокси, этокси, пропокси, изопропокси, н-бутокси, втор-бутокси, трет-бутокси, н-пентокси, неопентокси, н-гексокси и т.п. Алкокси-группы, используемые в настоящем документе, могут необязательно содержать дополнительные группы заместителей.
При использовании в настоящем документе, «аминоалкил» означает аминезамещенный С112алкильный радикал. Алкильная часть указанного радикала образует ковалентную связь с исходной молекулой. Аминогруппа может быть расположена в любом положении, и аминоалкильная группа может быть замещена дополнительной группой заместителя в алкильной и/или амино-части.
При использовании в настоящем документе, «аралкил» и «арилалкил» означает ароматическую группу, которая ковалентно связана с С112 алкильным радикалом. Часть алкильного радикала образовавшейся аралкильной (или арилалкильной) группы образует ковалентную связь с исходной молекулой. Примеры включают, без ограничения, бензил, фенетил и т.п. Аралкильные группы, используемые в настоящем документе, могут необязательно содержать дополнительные группы заместителей, присоединенные к алкильной, арильной или к обеим группам, которые образуют указанную радикальную группу.
При использовании в настоящем документе, «арил» и «ароматический» означат, радикалы моно- или полициклической карбоциклической кольцевой системы, имеющие одно или более ароматических колец. Примеры арильных групп включают, без ограничения,
фенил, нафтил, тетрагидронафтил, инданил, инденил и т.п. Предпочтительные арильные кольцевые системы имеют от около 5 до около 20 атомов углерода в одном или более кольцах. Арильные группы, используемые в настоящем документе, могут необязательно содержать дополнительные группы заместителей.
При использовании в настоящем документе, «галогено» и «галоген» означает атом, выбранный из фтора, хлора, брома и йода.
При использовании в настоящем документе, «гетероарил» и «гетероароматический» означает радикал, содержащий моно- или полициклическое ароматическое кольцо, кольцевую систему или конденсированную кольцевую систему, в котором по меньшей мере одно из колец является ароматическим и содержит один или более гетероатомов. Гетероарил включает также конденсированные кольцевые системы, включая системы, в которых одно или более из конденсированных колец не содержат гетероатомов. Гетероарильные группы, как правило, содержат один кольцевой атом, выбранный из серы, азота или кислорода. Примеры гетероарильных групп включают, без ограничения, пиридинил, пиразинил, пиримидинил, пирролил, пиразолил, имидазолил, тиазолил, оксазолил, изооксазолил, тиадиазолил, оксадиазолил, тиофенил, фуранил, хинолинил, изохинолинил, бензимидазолил, бензоксазолил, хиноксалинил и т.п. Гетероарильные радикалы могут быть присоединены к исходной молекуле напрямую или через связывающий фрагмент, такой как алифатическая группа или гетероатом. Гетероарильные группы, используемые в настоящем документе могут необязательно содержать дополнительные группы заместителей.
При использовзании в настоящем документе, «конъюгированное соединение» означает любые атомы, группы атомов или группу связанных атомов, подходящую для применения в качестве конъюгирующие группы. В некоторых вариантах реализации конъюгированные соединения могут обладать или влиять на одно или более свойств, включая, но не ограничиваясь этим, свойства фармакодинамики, фармакокинетики, связывания, адсорбции, клеточного распределения, клеточного захвата, заряда и/или выведения.
При использовании в настоящем документе, если не указано или немодифицировано иным образом, «двухспиральные» относится к двум отдельным олигомерным соединениям, которые гибридизованы друг с другом. Такие двухспиральные соединения могут иметь один или более не гибридизованных нуклеозидов у одного или обоих концов одной или обеих спиралей (выступы) и/или один или более внутреннийх не
гибридизованных нуклеозидов (несоответствий), при условии, что существует достаточная комплементарность для сохранения гибридизации при физиологически релевантных условиях.
При использовании в настоящем документе «5'-сайт-мишень» относится к нуклеотиду целевой нуклеиновой кислоты, который комплементарен 5'-основному нуклеотиду конкретного антисмыслового соединения.
При использовании в настоящем документе термин «около» обозначает в пределах ± 10% от значения. Например, если указано, что «маркер может быть увеличен на около 50%», то подразумевается, что маркер может быть увеличен на значение в диапазоне 45%-55%.
При использовании в настоящем документе выражение «введенные параллельно» относится к совместному введению двух средств любым способом, при котором фармакологическое действие обоих средств проявляется у пациента одновременно. При параллельном введении не требуется, чтобы оба агенты были введены в одной фармацевтической композиции, в одной лекарственной форме или одним способом введения. Действие обоих средств не обязательно должно проявляться одновременно. Их действие должно лишь перекрываться в течение определенного периода времени, и оно не обязательно должно иметь одинаковую протяженность по времени.
При использовании в настоящем документе термин «введение» обозначает предоставление фармацевтического агента индивидууму, и включает, но не ограничивается этим, введение медицинским специалистом или самостоятельное введение. Введение фармацевтического агента индивидууму может быть непрерывным, хроническим, кратковременным или периодическим. Введение может быть парентеральным или не парентеральным.
При использовании в настоящем документе «агент» обозначает активное вещество, которое может обеспечивать благоприятный терапевтический эффект при введении животному. «Первый агент» обозначает терапевтическое соединение согласно настоящему изобретению. Например, первое средство может быть антисмысловым олигонуклеотидом, нацеленным на аро(а). «Второй агент» обозначает второе терапевтическое соединение согласно настоящему изобретению (например, второй антисмысловый олигонуклеотид, нацеленный на аро(а)) и/или не-аро(а) терапевтическое соединение.
При использовании в настоящем документе «улучшение» или «улучшать», или «улучшающий» относится к снижению по меньшей мере одного показателя, признака или симптома ассоциированного заболевания, расстройства или состояния. Тяжесть показателей может быть определена при помощи субъективных или объективных оценок, известных специалистам в данной области.
Используемый в настоящем документе термин «животное» относится к человеку или животному, не являющемуся человеком, включая, но не ограничиваясь ими, мышей, крыс, кроликов, собак, котов, свиней и приматов, не являющихся человеком, включая, но не ограничиваясь ими, обезьян и шимпанзе.
При использовании в настоящем документе «apo(a)» означает любую последовательность нуклеиновых кислот или белковую последовательность, кодирующую аро(а). Например, в некоторых вариантах реализации аро(а) включает последовательность ДНК, кодирующую аро(а), последовательность РНК, транскрибированную из ДНК, кодирующей аро(а) (включая геномную ДНК, содержащую интроны и экзоны), последовательность мРНК, кодирующую аро(а), или пептидную последовательность, кодирующую аро(а).
При использовании в настоящем документе «нуклеиновая кислота аро(а)» означает любую нуклеиновую кислоту, кодирующую аро(а). Например, в некоторых вариантах реализации нуклеиновая кислота аро(а) включает последовательность ДНК, кодирующую аро(а), последовательность РНК, транскрибированную из ДНК, кодирующей аро(а) (включая геномную ДНК, содержащую интроны и экзоны), и последовательность мРНК, кодирующую аро(а).
При использовании в настоящем документе «мРНК аро(а)» означает мРНК, кодирующую белок аро(а).
При использовании в настоящем документе «белок аро(а)» означает любую белковую последовательность, кодирующую Аро(а).
При использовании в настоящем документе «специфический ингибитор аро(а)» относится к любому агенту, способному специфически ингибировать экспрессию нуклеиновой кислоты аро(а) и/или белка аро(а). Например, специфические ингибиторы аро(а) включают нуклеиновые кислоты (в том числе антисмысловые соединения), пептиды, антитела, небольшие молекулы и другие агенты, способные ингибировать экспрессию нуклеиновую кислоту аро(а) и/или белка аро(а). В некоторых вариантах реализации изобретения за счет специфического модулирования экспрессии нуклеиновой кислоты аро(а)
и/или экспрессии белка аро(а), специфические ингибиторы аро(а) могут влиять на другие компоненты липидной транспортной системы, включая последующие компоненты. Точно так же, в некоторых вариантах реализации специфические ингибиторы аро(а) могут влиять на другие молекулярные процессы у животного.
При использовании в настоящем документе «атеросклероз» означает затвердевание артерий, поражающее крупные и средние артерии, и характеризуется наличием жировых отложений. Жировые отложения называют «атеромами» или «бляшками», которые состоят, в основном, из холестерина и других жиров, кальция и рубцовой ткани, и они повреждают выстилку артерий.
При использовании в настоящем документе «коронарная болезнь сердца (CHD)» означает сужение мелких кровяных сосудов, которые поставляют кровь и кислород в сердце, что зачастую приводит к атеросклерозу.
При использовании в настоящем документе «сахарный диабет» или «диабет» представляет собой синдром, характеризующийся нарушенным метаболизмом и патологически высоким содержанием сахара в крови (гипергликемией) из-за недостаточного содержания инсулина или сниженной чувствительности к инсулину. Характерные симптомы представляют собой избыточное выделение мочи (полиурия) из-за высокого содержания глюкозы в крови, избыточную жажду и повышенное потребление жидкости (полидипсия) в попытке компенсировать усиленное мочевыделение, расплывчатое зрение из-за того, что высокое содержание глюкозы в крови влияет на оптические свойства глаз, необъяснимую потерю веса и летаргию.
При использовании в настоящем документе «диабетическая дислипидемия» или «диабет 2 типа с дислипидемией» означает состояние, характеризующееся диабетом 2 типа, сниженным содержанием HDL-C, повышенным уровнем триглицеридов (TG) и повышенным уровнем мелких, плотных частиц LDL.
При использовании в настоящем документе «разбавитель» обозначает ингредиент в композиции, который не обладает фармакологической активностью, но является фармацевтически необходимым или желательным. Например, разбавитель в композиции для инъекций может быть жидкостью, например, солевым раствором.
При использовании в настоящем документе «дислипидемия» относится к нарушению метаболизма липидов и/или липопротеинов, включая избыточную выработку или дефицит липидов и/или липопротеинов. Дислипидемия может проявляться в повышении содержания
липидов, таких как хиломикрон, холестерин и триглицериды, а также липопротеинов, таких как холестерин липопротеинов низкой плотности (LDL).
При использовании в настоящем документе «лекарственная форма» означает форму, в которой представлен фармацевтический агент, например, пилюлю, таблетку или другую лекарственную форму, известную в данной области техники. В некоторых вариантах реализации изобретения лекарственная форма представляет собой ампулу, содержащую лиофилизированный антисмысловый олигонуклеотид. В некоторых вариантах реализации лекарственная форма представляет собой ампулу, содержащую восстановленный антисмысловый олигонуклеотид.
При использовании в настоящем документе «доза» обозначает определенное количество фармацевтического агента, которое обеспечивается при разовом введении или в течение определенного периода времени. В некоторых вариантах реализации доза может быть введена одним, двумя или более болюсами, таблетками или инъекциями. Например, в некоторых вариантах реализации, в которых желательно подкожное введение, для требуемой дозы необходим объем, который трудно ввести за одну инъекцию, поэтому можно использовать две или более инъекций для достижения требуемой дозы. В некоторых вариантах реализации фармацевтический агент вводят инфузией в течение продолжительного периода времени или непрерывно. Дозы могут быть определены как количество фармацевтического средства в час, день, неделю или месяц. Дозы также могут быть указаны в мг/кг или г/кг.
При использовании в настоящем документе «эффективное количество» или «терапевтически эффективное количество» означает количество активного фармацевтического агента, достаточное для достижения желаемого физиологического результата у индивидуума, нуждающегося в таком агенте. Эффективное количество может варьироваться у различных индивидуумов в зависимости от состояния здоровья и физического состояния индивидуума, подлежащего лечению, таксономической группы индвидуумов, подлежащих лечению, состава композиции, оценки индивидуального, состояния здоровья и других релевантных факторов.
При использовании в настоящем документе «полная комплементарность» или «100% комплементарность» означает, что каждое азотистое основание последовательности азотистых оснований первой нуклеиновой кислоты имеет комплементарное азотистое основание во второй последовательности азотистых оснований второй нуклеиновой кислоты В некоторых вариантах реализации первая нуклеиновая кислота представляет собой
антисмысловое соединение, а вторая нуклеиновая кислота представляет собой целевую нуклеиновую кислоту.
При использовании в настоящем документе «глюкоза» представляет собой моносахарид, используемый клетками в качестве источника энергии и воспалительного посредника. «Глюкоза в плазме» относится к содержанию глюкозы в плазме.
При использовании в настоящем документе «холестерин липопротеина высокой плотности» или «HDL-С» означает холестерин, связанный с частицами липопротеина высокой плотности. Концентрацию HDL-С в сыворотке (или в плазме) обычно определяют в мг/дл или в нмоль/л. «HDL-С в сыворотке» и «HDL-С в плазме» означает содержание HDL-С в сыворотке и плазме, соответственно.
При использовании в настоящем документе «ингибитор редуктазы HMG-СоА» означает агент, который действует за счет ингибирования фермента редуктазы HMG-CoA, такой как аторвастатин, розувастатин, флувастатин, ловастатин, правастатин и симвастатин.
При использовании в настоящем документе «гиперхолестеринемия» означает патологическое состояние, характеризующееся повышенным холестерином или циркулирующим холестерином (в плазме), LDL-холестерином и VLDL-холестерином, согласно указаниям Заключения экспертной группы Национальной холестериновой образовательной программы (NCEP) по определению, оценке и лечению высокого уровня холестерина у взрослых людей (см., Arch. Int. Med. (1988) 148, 36-39).
При использовании в настоящем документе «гиперлипидемия» или «гиперлипемия» представляет собой патологическое состояние, характеризующееся повышенным, содержанием липидов в сыворотке или циркулирующих липидов (в плазме). Это состояние проявляется в патологически высоких концентрациях жиров. Липидная фракция в циркулирующей крови представляет собой холестерин, липопротеины низкой плотности, липопротеины очень низкой плотности, хиломикроны и триглицериды. Классификация гиперлипидемий по Фредриксону основана на каскаде TG и содержании богатых на холестерин липопротеиновых частиц, измеренном электрофорезом или ультрацентрифугированием и обычно используемом для характеристики основных причин гиперлипидемий, таких как гипертриглицеридемия (Fredrickson and Lee, Circulation. 1965, 31:321-327; Fredrickson et al., New Eng J Med, 1967,276 (1): 34-42).
При использовании в настоящем документе «гипертриглицеридемия» означает состояние, характеризующееся повышенными уровнями триглицеридов. Ее этиология включает первичные (т.е. генетические причины) и вторичные (другие первопричины, такие
как диабет, метаболический синдром/инсулинорезистентность, ожирение, физическая инертность, табакокурение, избыточное употребление алкоголя и пищи с очень высоким содержанием углеводов) факторы или, более часто, комбинацию обоих факторов (Yuan et al. CMAJ, 2007, 176:1113-1120).
При использовании в настоящем документе «идентификация» или «выбор животного с метаболическим или сердечно-сосудистым заболеванием» означает определение или выбор субъекта, предрасположенного или диагностированного с метаболическим заболеванием, сердечно-сосудистым заболеванием или метаболическим синдромом; или определение или выбор субъекта, имеющего любой симптом метаболического заболевания, сердечно-сосудистого заболевания или метаболического синдрома, включая, но не ограничиваясь ими, гиперхолестеринемию, гипергликемию, гиперлипидемию, гипертриглицеридемию, гипертонию, повышенную инсулинорезистентность, пониженную чувствительность к инсулину, увеличенную массу тела и/или увеличенное содержание жира у, или любую их комбинацию. Такая идентификация может быть выполнена любым способом, включая, но не ограничиваясь ими, стандартные клинические испытания или оценки, такие как измерение холестерина в сыворотке или циркулирующего холестерина (в плазме), измерение глюкозы в сыворотке или циркулирующей глюкозы (в плазме), измерение триглицеридов в сыворотке или циркулирующих триглицеридов (в плазме), измерение кровяного давления, измерение содержания жира у, измерение массы тела и т.п.
При использовании в настоящем документе, «улучшенный сердечно-сосудистый результат» означает снижение возникновения неблагоприятных сердечно-сосудистых явлений или их риска. Примеры неблагоприятных сердечно-сосудистых явлений включают, без ограничения, смерть, повторный инфаркт, инсульт, кардиогенный шок, отек легких, остановку сердца и атриальную аритмию.
При использовании в настоящем документе «непосредственно рядом» означает, что между элементами, расположенными непосредственно рядом, не существует промежуточных элементов, например, между областями, сегментами, нуклеотидами и/или нуклеозидами.
При использовании в настоящем документе «увеличение HDL» или «повышение HDL» означает повышение уровня HDL у животного после введения по меньшей мере одного соединения согласно настоящему изобретению, по сравнению с уровнем HDL у животного, которому не вводили ни одного соединения.
При использовании в настоящем документе «индивидуум» или «субъект», или «животное» означает человека или животное, не являющееся человеком, выбранное для лечения или терапии.
При использовании в настоящем документе «индивидуум, нуждающийся в этом» относится к человеку или животному, не являющемуся человеком, выбранному для лечения или терапии, которое нуждается в таком лечении или терапии.
При использовании в настоящем документе «вызывает», «ингибирует», «потенцирует», «повышает», «увеличивает», «снижает», «уменьшает» или подобные термины означают количественное различие между двумя состояниями. Например, «количество, эффективное для ингибирования активности или экспрессии аро(а)», обозначает, что уровень активности или экспрессии аро(а) в обработанном образце отличается от уровня активности или экспрессии аро(а) в необработанном образце. Такие термины применяют, например, к уровням экспрессии и уровням активности.
При использовании в настоящем документе «воспалительное состояние» относится к заболеванию, болезненному состоянию, синдрому или другому состоянию, приводящему к воспалению. Например, ревматоидный артрит и фиброз печени представляют собой воспалительные состояния. Другие примеры воспалительных состояний включают сепсис, ишемию миокарда/реперфузионное повреждение, респираторный дистресс-синдром взрослых, нефрит, отторжение трансплантата, воспалительную болезнь кишечника, рассеянный склероза, артериосклероз, атеросклероз и васкулит.
При использовании в настоящем документе «ингибирование экспрессии или активности» относится к снижению или блокированию экспрессии или активности РНК или белка и не обязательно обозначает полное исключение экспрессии или активности.
При использовании в настоящем документе «инсулинорезистентность» определяется как состояние, при котором нормальные количества инсулина недостаточны для получения нормального ответа на инсулин от жировых, мышечных и печеночных клеток. Инсулинорезистентность в жировых клетках приводит к гидролизу запасенных триглицеридов, что повышает содержание свободных жирных кислот в плазме крови. Инсулинорезистентность в мышцах снижает поглощение глюкозы, а инсулинорезистентность в печени снижает запас глюкозы, и оба эффекта приводят к повышению глюкозы в крови. Высокие уровни инсулина и глюкозы в плазме из-за инсулинорезистентности зачастую приводят к метаболическому синдрому и диабету 2 типа.
При использовании в настоящем документе «чувствительность к инсулину» представляет собой меру эффективности переработки глюкозы у индивидуума. Индивидуум
с высокой чувствительностью к инсулину эффективно перерабатывает глюкозу, тогда как индивидумм с низкой чувствительностью к инсулину перерабатывает глюкозу неэффективно.
При использовании в настоящем документе «понижение содержания липидов» означает уменьшение содержания одного или более липидов (например, LDL, VLDL) у субъекта. «Повышение содержания липидов» означает увеличение содержания липидов (например, HDL) у субъекта. Понижение или повышение уровня липидов может возникать при введении одной или более доз с течением времени.
При использовании в настоящем документе «терапия для понижения содержания липидов» или «агент для понижения содержания липидов» означает терапевтический режим, предоставленный субъекту для снижения содержания одного или более липидов у субъекта. В некоторых вариантах реализации терапия для понижения содержания липидов предоставлена для снижения одного или более из аро(а), СЕТР, ароВ, общего холестерина, LDL-C, VLDL-C, IDL-C, не-HDL-C, триглицеридов, мелких плотных частиц LDL и Lp(a) у субъекта. Примеры терапии для понижения содержания липидов включают, но не ограничиваются ими, ингибиторы ароВ, статины, фибраты и ингибиторы МТР.
При использовании в настоящем документе «липопротеин», такой как VLDL, LDL и HDL, относится к группе белков, находящихся в сыворотке, плазме и лимфе, которые важны для транспорта липидов. Химический состав каждого липопротеина различен, например, HDL имеет более высокое содержание белка по сравнению с липидом, a VLDL имеет более низкое содержание белка по сравнению с липидом.
При использовании в настоящем документе термин «Lp(a)» включает аро(а) и LDL-подобные частицы, содержащие ароВ. Аро(а) связан с ароВ дисульфидной связью.
При использовании в настоящем документе «холестерин липопротеина низкой плотности (LDL-C)» означает холестерин, содержащийся в частицах липопротеина низкой плотности. Концентрацию LDL-C в сыворотке (или в плазме) обычно определяют в м.г/дл или в нмоль/л. «LDL-С в сыворотке» и «LDL-С в плазме» означает содержание LDL-C в сыворотке и плазме, соответственно.
При использовании в настоящем документе «основные факторы риска» относится к факторам, которые способствуют высокому риску конкретного заболевания или состояния. В некоторых вариантах реализации изобретения основные факторы риска для коронарной болезни сердца включают, без ограничения, табакокурение, гипертонию, высокое содержание LDL, низкое содержание HDL-C, семейный анамнез коронарной болезни сердца, возраст и другие факторы, описанные в настоящем документе.
При использовании в настоящем документе «метаболическое расстройство» или «метаболическое заболевание» относится к состоянию, характеризующемуся изменением или
нарушением метаболической функции. «Метаболический» и «метаболизм» представляют собой термины, общеизвестные в данной области техники, и обычно включают весь диапазон биохимических процессов, происходящих в живом организме. Метаболические расстройства включают, но не ограничиваются ими, гипергликемию, преддиабет, диабет (типа 1 и типа 2), ожирение, инсулинорезистентность, метаболический синдром и дислипидемию на фоне диабета 2 типа.
При использовании в настоящем документе «метаболический синдром» означает состояние, характеризующееся кластерообразование липидных и нелипидных сердечно-сосудистых факторов риска метаболического происхождения. В некоторых вариантах реализации изобретения метаболический синдром определяют по наличию любых 3 из следующих факторов: окружность талии более 102 см у мужчин или более 88 см у женщин; содержание триглицеридов в сыворотке по меньшей мере 150 мг/дл; содержание HDL-C менее 40 мг/дл у мужчин или менее 50 мг/дл у женщин; кровяное давление по меньшей мере 130/85 мм рт. ст.; и содержание глюкозы натощак по меньшей мере 110 мг/дл. Эти детерминанты могут быть легко измерены в клинической практике (JAMA, 2001, 285: 2486 - 2497).
«Парентеральное введение» обозначает введение инъекцией или инфузией. Парентеральное введение включает подкожное введение, внутривенное введение, внутримышечное введение, внутриартериальное введение, внутрибрюшинное введение или внутричерепное введение, например, интратекальное или интрацеребровентрикулярное введение. Введение может быть непрерывным, хроническим, кратковременным или периодическим.
При использовании в настоящем документе «пептид» обозначает молекулу, образованную связыванием по меньшей мере двух аминокислот амидными связями. Пептид относится к полипептидам и белкам.
При использовании в настоящем документе «фармацевтический агент» обозначает вещество, которое обеспечивает благоприятный терапевтический эффект при введении индивидууму. Например, в некоторых вариантах реализации изобретения антисмысловый олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), представляет собой фармацевтический агент.
При использовании в настоящем документе «фармацевтическая композиция» или «композиция» означает смесь веществ, подходящая для введения индивидууму. Например, фармацевтическая композиция может содержать один или более активных агентов и фармацевтический носитель, например, стерильный водный раствор.
При использовании в настоящем документе «фармацевтически приемлемое производное» включает производные соединений, описанных в настоящем документе, такие как сольваты, гидраты, сложные эфиры, пролекарства, полиморфы, изомеры, меченные изотопами разновидности, фармацевтически приемлемые соли и другие производные, известные в данной области техники.
При использовании в настоящем документе «фармацевтически приемлемые соли» обозначает физиологически и фармацевтически приемлемые соли антисмысловых соединений, то есть соли, которые сохраняют желаемую биологическую активность исходного соединения и не наделяют его нежелательным токсикологическим действием. Термин «фармацевтически приемлемая соль» или «соль» включает соль, полученную из фармацевтически приемлемых нетоксичных кислот или оснований, включая неорганические или органические кислоты и основания. «Фармацевтически приемлемые соли» соединений, описанных в настоящем документе, могут быть получены по общеизвестным в данной области техники способам. Обзор фармацевтически приемлемых солей представлен в публикации Stahl и Wermuth, Handbook of Pharmaceutical Salts: Properties, Selection and Use (Wiley-VCH, Вайнхайм, Германия, 2002). Натриевые соли антисмысловых олигонуклеотидов являются пригодными и приемлемыми для терапевтического введения людям. Соответственно, в одном из вариантов реализации соединения, описанные в настоящем документе, представлены в форме натриевой соли.
При использовании в настоящем документе «часть» обозначает определенное количество смежных (то есть связанных) азотистых оснований нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации часть является определенным количеством смежных азотистых оснований целевой нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации часть является определенным количеством смежных азотистых оснований антисмыслового соединения.
При использовании в настоящем документе «предупреждать» или «предупреждение» относится к отсрочке или предотвращению возникновения или развития заболевания, расстройства или состояния в течение периода времени от нескольких минут до бесконечности. Предупреждение означает также снижение риска развития заболевания, расстройства или состояния.
При использовании в настоящем документе «повышение» означает увеличение количества. Например, повышение уровня HDL в плазме означает увеличение количества HDL в плазме.
При использовании в настоящем документе «снижение» означает уменьшение до меньшей степени, размера, количества или числа. Например, снижение уровня триглицеридов в плазме означает уменьшение количества триглицеридов в плазме.
При использовании в настоящем документе «область» или «целевая область» определяют как часть целевой нуклеиновой кислоты, имеющую по меньшей мере одну идентифицируемую структуру, функцию или характеристику. Например, целевая область может охватывать 3' нетранслируемую область (UTR), 5' нетранслируемую область, экзон, интрон, экзон-интронное сочленение, кодирующую область, область инициации трансляции, область обрыва трансляции или другую определенную область нуклеиновой кислоты. Структурно определенные области для аро(а) могут быть получены по номеру доступа из базы данных последовательностей, такой как NCBI, и такая информация включена в настоящий документ путем ссылки. В некоторых вариантах реализации целевая область может охватывать последовательность от 5' сайта-мишени любого целевого сегмента в пределах целевой области от 3' сайта-мишени другого целевого сегмента в пределах целевой области.
При использовании в настоящем документе «второй агент» или «второй терапевтический агент» означает агент, который может быть использован в комбинации с «первым агентом». Второй терапевтический агент может включать, но не ограничивается ими, антисмысловые олигонуклеотиды, нацеленные на аро(а) или ароВ. Второй агент также может включать анти-аро(а) антитела, ингибиторы пептида аро(а), агенты для понижения холестерина, агенты для понижения липидов, агенты для понижения глюкозы и противовоспалительные агенты.
При использовании в настоящем документе «сегменты» определяют как более мелкие или субфрагменты областей нуклеиновой кислоты. Например, «целевой сегмент» обозначает последовательность нуклеотидов целевой нуклеиновой кислоты, на которую нацелено одно или несколько антисмысловых соединений. «Сайт-мишень 5'» относится к 5'-основному нуклеотиду целевого сегмента.«Сайт-мишень 3'» относится к 3'-основному нуклеотиду целевого сегмента. Альтернативно, «сайт инициации» может относиться к 5'-основному нуклеотиду целевого сегмента, а «терминирующий сайт» относится к 3'-основному нуклеотиду целевого сегмента. Целевой сегмент также может начинаться с «сайта инициации» одной последовательности и заканчиваться у «терминирующего сайта» другой последовательности.
При использовании в настоящем документе «статин» означает агент, который подавляет активность редуктазы HMG-CoA.
При использовании в настоящем документе «подкожное введение» обозначает введение непосредственно под кожу.
При использовании в настоящем документе «субъект» обозначает человека или животное, не являющееся человеком, выбранное для лечения или терапии.
При использовании в настоящем документе «симптом сердечно-сосудистого заболевания или расстройства» означает явление, которое возникает в результате и сопутствует сердечно-сосудистому заболеванию или расстройству и служит его признаком. Например, симптомы сердечно-сосудистого заболевания или расстройства представляют собой стенокардия; боль в груди, одышка, учащенное сердцебиение; слабость; головокружение; тошнота; потоотделение; тахикардия; брадикардия; аритмия; мерцательная аритмия; опухание нижних конечностей; цианоз; усталость; обморок; онемение лица; онемение конечностей, хромота или судороги мышц; вздутие живота; или лихорадка.
При использовании в настоящем документе «нацеливание» или «нацеленный» обозначает процесс разработки и выбора антисмыслового соединения, которое будет специфически гибридизоваться с целевой нуклеиновой кислотой и вызывать требуемый эффект.
При использовании в настоящем документе «терапевтически эффективное количество» обозначает количество фармацевтического агента, которое обеспечивает индивидууму благоприятный терапевтический эффект.
При использовании в настоящем документе «терапевтическое изменение образа жизни» означает изменение питания и образа жизни, направленное на снижение массы жировой/адипозной ткани и/или холестерина. Такое изменение может снижать риск развития сердечного заболевания и может включать рекомендации по диетическому употреблению общих суточных калорий, общих жиров, насыщенных жиров, полиненасыщенных жиров, мононенасыщенных жиров, углеводов, белков, холестерина, нерастворимых волокон, а также рекомендации по физической активности.
При использовании в настоящем документе «лечить» или «лечение» относится к введению соединения, описанного в настоящем документе, для обеспечения изменения или облегчения заболевания, расстройства или состояния.
При использовании в настоящем документе «триглицерид» или «TG» обозначает липид или нейтральный жир, состоящий из глицерина, связанного с тремя молекулами жирной кислоты.
При использовании в настоящем документе «диабет 2 типа» (известный также как «сахарный диабет 2 типа», «сахарный диабет, 2 тип», «инсулинонезависимый диабет», «NIDDM», «диабет на фоне ожирения» или «диабет взрослого возраста») представляет, собой метаболическое расстройство, которое характеризуется, главным образом, инсулинорезистентностью, относительным дефицитом инсулина и гипергликемией.
Некоторые варианты реализации изобретения
В некоторых вариантах реализации соединение содержит миРНК или антисмысловый олигонуклеотид, нацеленный на аполипопротеин (а) (аро(а)), известный в данной области техники, и конъюгирующую группу, описанную в настоящем документе. Примеры антисмысловых олигонуклеотидов, нацеленных на аро(а), которые подходят для конъюгации, включают, но не ограничиваются ими, те, которые описаны в WO 2013/177468; US 8,673,632; US 7,259,150; и публикации заявки на патент США №US 2004/0242516; полное содержание которых включено в настоящий документ посредством ссылки. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность азотистых оснований любой из SEQ ID NO 12-130, 133, 134, описанных в WO 2013/177468, и конъюгирующую группу, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность азотистых оснований любой из SEQ ID NO 11-45 и 85-96, описанных в US 8673632, и конъюгирующую группу, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность азотистых оснований любой из SEQ ID NO 11-45, описанных в US 7259150, и конъюгирующую группу, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность азотистых оснований любой из SEQ ID NO 7-41, описанных в публикации заявки на патент США №US 2004/0242516, и конъюгирующую группу, описанную в настоящем документе. Последовательности азотистых оснований всех вышеупомянутых справочных SEQ ID NO включены в настоящий документ посредством ссылки.
В некоторых вариантах реализации изобретения приведены соединения и способы снижения экспрессии мРНК и белка аро(а). В некоторых вариантах реализации соединение представляет собой специфический ингибитор аро(а) для лечения, предупреждения или облегчения заболевания, связанного с аро(а). В некоторых вариантах реализации соединение представляет собой антисмысловый олигонуклеотид, нацеленный на аро(а). В некоторых вариантах реализации соединение представляет собой антисмысловый олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу.
В некоторых вариантах реализации приведены соединения и способы снижения уровней Lp(a). В некоторых вариантах реализации соединение представляет собой специфический ингибитор аро(а) для лечения, предупреждения или облегчения заболевания, связанного с Lp(a). В некоторых вариантах реализации соединение представляет собой антисмысловый олигонуклеотид, нацеленный на аро(а). В некоторых вариантах реализации соединение представляет собой антисмысловый олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации модифицированный олигонуклеотид с конъюгирующей группой состоит из 15-30, 18-24, 19-22, 13-25, 14-25, 15-25 связанных нуклеозидов, в некоторых вариантах реализации модифицированный олигонуклеотид с конъюгирующей группой содержит по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по меньшей мере 18, по меньшей мере 19, по меньшей мере 20, по меньшей мере 21, по меньшей мере 22, по меньшей мере 23, по меньшей мере 24, по меньшей мере 25, по меньшей мере 26, по меньшей мере 27, по меньшей мере 28, по меньшей мере 29 или 30 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации модифицированный олигонуклеотид с конъюгирующей группой состоит из 20 связанных нуклеозидов.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а) и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по меньшей
мере 18, по меньшей мере 19 или 20 смежных азотистых оснований, комплементарных равной по длине части любой из SEQ ID NO: 1-4.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на сегмент аро(а), и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по меньшей мере 18, по меньшей мере 19 или 20 смежных азотистых оснований, комплементарных равной по длине части любого из целевых сегментов, представленных, например, в Примерах 114 и 117. В этих таблицах «сайт инициации» относится к 5'-основному нуклеотиду целевого сегмента, а «терминирующий сайт» относится к 3'-основному нуклеотиду целевого сегмента. Целевой сегмент может иметь длину от сайта инициации до терминирующего сайта каждой последовательности, перечисленной в таблицах. Альтернативно, целевой сегмент может иметь длину от сайта инициации одной последовательности до конца терминирующего сайта другой последовательности. Например, как показано в Таблице 125, целевой сегмент может иметь длину от 3901 до 3920, от сайта инициации до терминирующего сайта SEQ ID NO: 58. В другом примере, как показано в Таблице 125, целевой сегмент может иметь длину от 3900 до 3923, от сайта инициации SEQ ID NO: 57 до терминирующего сайта SEQ ID NO: 61.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом последовательность азотистых оснований модифицированного олигонуклеотида по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% комплементарна любой из SEQ ID NO: 1-4. В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом последовательность азотистых оснований модифицированного олигонуклеотида по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% комплементарна любому из целевых сегментов, представленных, например, в Примерах 114 и 117.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов и содержит последовательность азотистых оснований, содержащую часть из по меньшей мере
8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по меньшей мере 18, по меньшей мере 19 или 20 смежных азотистых оснований, комплементарных равной по длине части азотистых оснований 3901-3920 SEQ ID NO:1, причем указанная последовательность азотистых оснований модифицированного олигонуклеотида по меньшей мере на 80% комплементарна к SEQ ID NO:1.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов и содержит последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по меньшей мере 18, по меньшей мере 19, по меньшей мере 20, по меньшей мере 21, по меньшей мере 22, по меньшей мере 23, по меньшей мере 24, по меньшей мере 25, по меньшей мере 26, по меньшей мере 27, по меньшей мере 28, по меньшей мере 29 или 30 смежных азотистых оснований, комплементарных равной по длине части азотистых оснований 3900-3923 SEQ ID NO:1, причем указанная последовательность азотистых оснований модифицированного олигонуклеотида по меньшей мере на 80% комплементарна к SEQ ID NO:1.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов и имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по меньшей мере 18, по меньшей мере 19 или 20 смежных азотистых оснований любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO: 12-130, 133, 134. В некоторых вариантах реализации модифицированный олигонуклеотид имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8 смежных азотистых оснований любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO:12-130, 133,134. В некоторых вариантах реализации соединение состоит из любой из SEQ ID NO:12-130, 133, 134 и конъюгирующие группы.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов и имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по меньшей мере 18, по меньшей мере 19 или 20 смежных азотистых оснований любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO:12-20, 22-33, 35-44, 47-50, 51, 53, 57-62, 65-66, 68, 70-79, 81, 85-86, 89-90, 92-94, 97, 105-110, 103-104, 133-134. В некоторых вариантах реализации соединение состоит из любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO:12-20, 22-33, 35-44, 47-50, 51, 53, 57-62, 65-66, 68, 70-79, 81, 85-86, 89-90, 92-94, 97, 105-110, 103-104, 133-134 и конъюгирующие группы.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов и имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по меньшей мере 18, по меньшей мере 19 или 20 смежных азотистых оснований любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO:12-19, 26-30, 32, 35, 38-44, 46-47, 50, 57-58, 61, 64-66, 68, 72-74, 76-77, 92-94, 103-110. В некоторых вариантах реализации соединение состоит из любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO:12-19, 26-30, 32, 35, 38-44, 46-47, 50, 57-58, 61, 64-66, 68, 72-74, 76-77, 92-94, 103-110 и конъюгирующие группы.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов и имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по меньшей мере 18, по меньшей мере 19 или 20 смежных азотистых оснований любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO:111, 114-121, 123-129. В некоторых
вариантах реализации соединение состоит из любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO:111, 114-121, 123-129 и конъюгирующие группы.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов и имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по меньшей мере 18, по меньшей мере 19 или 20 смежных азотистых оснований любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO:14, 17, 18, 26-28, 39, 71, 106-107. В некоторых вариантах реализации соединение состоит из любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO:14, 17, 18, 26-28, 39, 71, 106-107 и конъюгирующие группы.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов и имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по меньшей мере 18, по меньшей мере 19 или 20 смежных азотистых оснований любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO:14,26-29, 39-40, 82. В некоторых вариантах реализации соединение состоит из любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO: 14,26-29, 39-40, 82 и конъюгирующие группы.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов и имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей море 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по меньшей мере 18, по меньшей мере 19 или 20 смежных азотистых оснований любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO:14, 16-18. В некоторых вариантах реализации соединение состоит из любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO:14, 16-18 и конъюгирующие группы.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов и имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по меньшей мере 18, по меньшей мере 19 или 20 смежных азотистых оснований любой из ' последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO: 26-27, 107. В некоторых вариантах реализации соединение состоит из любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO:26-27, 107 и конъюгирующие группы.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов и имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по, меньшей мере 18, по меньшей мере 19 или 20 смежных азотистых оснований любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO:28-29, 39-40, 47. В некоторых вариантах реализации соединение состоит из любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO::28-29, 39-40, 47 и конъюгирующие группы.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов и имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по меньшей мере 18, по меньшей мере 19 или 20 смежных азотистых оснований любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO:28, 93, 104, 134. В некоторых вариантах реализации соединение состоит из любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO:28, 93, 104, 134 и конъюгирующие группы.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов и имеет
последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 11, по меньшей мере 12, по меньшей мере 13, по меньшей мере 14, по меньшей мере 15, по меньшей мере 16, по меньшей мере 17, по меньшей мере 18, по меньшей мере 19 или 20 смежных азотистых оснований последовательности азотистых оснований SEQ ID NO:58. В некоторых вариантах реализации модифицированный олигонуклеотид с конъюгирующей группой имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8 смежных азотистых оснований последовательности азотистых оснований SEQ ID NO: 58. В некоторых вариантах реализации соединение состоит из SEQ ID NO: 58 и конъюгирующие группы.
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены конъюгированные антисмысловые соединения, представленные следующей структурой. В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение содержит модифицированный олигонуклеотид ISIS 494372 с 5'-Х, где X представляет собой конъюгирующую группу, содержащую GalNAc. В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение состоит из модифицированного олигонуклеотида ISIS 494372 с 5'-Х, где X представляет собой конъюгирующую группу, содержащую GalNAc.
Figure 00000016
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены конъюгированные антисмысловые соединения, представленные следующей структурой. В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение содержит конъюгированный модифицированный олигонуклеотид ISIS 681251. В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение состоит из конъюгированного модифицированного олигонуклеотида ISIS 681251.
Figure 00000017
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены конъюгированные антисмысловые соединения, представленные следующей структурой. В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение содержит конъюгированный модифицированный олигонуклеотид ISIS 681257. В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение состоит из конъюгированного модифицированного олигонуклеотида ISIS 681257.
Figure 00000018
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены конъюгированные антисмысловые соединения, представленные следующей структурой. В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение содержит модифицированный олигонуклеотид с последовательностью азотистых оснований SEQ ID NO: 58 с 5'-GalNAc с вариабельностью в сахарных структурах крыльев. В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение состоит из модифицированного олигонуклеотида с последовательностью азотистых оснований SEQ ID NO:58 с 5'-GalNAc с вариабельностью в сахарных структурах крыльев.
Figure 00000019
где либо R1 представляет собой -ОСН2СН2ОСН3 (МОЕ), и R2 представляет собой Н; либо R1 и R2 вместе образуют мостик, где R1 представляет собой -О-, и R2 представляет собой -СН2-, -СН(СН3)- или -СН2СН2-, и R1 и R2 связаны напрямую, так что образующийся мостик выбран из: -O-СН2-, -O-СН(СН3)- и -O-СН2СН2-;
и для каждой пары R3 и R4 у одного кольца, независимо для каждого кольца: либо R3 выбран из Н и -ОСН2СН2ОСН3, и R4 представляет собой Н; либо R3 и R4 вместе образуют мостик, где R3 представляет собой -О-, и R4 представляет собой -СН2-, -СН(СН3)- или -СН2СН2-, и R3 и R4 связаны напрямую, так что образующийся мостик выбран из: -О-СН2-, -О-СН(СН3)- и -О-СН2СН2-;
и R5 выбран из Н и -СН3;
и Z выбран из S- и О-.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид является одноцепочечным.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом по меньшей мере одна межнуклеозидная связь представляет собой модифицированную межнуклеозидную связь. В некоторых вариантах реализации, модифицированная межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь. В некоторых вариантах реализации по меньшей мере 1, по меньшей мере 2, по меньшей мере 3, по меньшей мере 4, по меньшей мере 5, по меньшей мере 6, по меньшей мере 7, по меньшей мере 8, по меньшей мере 9 или по меньшей мере 10 межнуклеозидных связей указанного модифицированного олигонуклеотида представляют собой тиофосфатные межнуклеозидные связи. В некоторых вариантах реализации каждая межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь. В некоторых вариантах реализации модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 1, по меньшей мере 2, по меньшей мере 3, по меньшей мере 4, по меньшей мере 5, по меньшей мере 6, по меньшей мере 7, по меньшей мере 8, по меньшей мере 9 или по меньшей мере 10 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации каждая межнуклеозидная связь модифицированного олигонуклеотида выбрана из фосфодиэфирной межнуклеозидной связи и тиофосфатной межнуклеозидной связи.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при
этом по меньшей мере один нуклеозид содержит модифицированное азотистое основание. В некоторых вариантах реализации, модифицированнле азотистое основание представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный сахар. В некоторых вариантах реализации модифицированный сахар представляет собой бициклический сахар. В некоторых вариантах реализации модифицированный сахар содержит 2'-O-метоксиэтиловый, стерически затрудненный этиловый, 3'-фтор-ГНК (hexitol nucleic acid (HNA)) или 4'-(CH2)n-O-2' мостик, где n равен 1 или 2.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов и содержит: (а) сегмент гэп, состоящий из связанных дезоксинуклеозидов; (b) сегмент 5'-крыла, состоящий из связанных нуклеозидов; (с) сегмент 3'-крыла, состоящий из связанных нуклеозидов; и при этом сегмент гэп находится между сегментом 5'-крыла и сегментом 3'-крыла, и каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит модифицированный сахар.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов и содержит: (а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; (b) сегмент 5'-крыла, состоящий из пяти связанных нуклеозидов; (с) сегмент 3'-крыла, состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и при этом сегмент гэп находится между сегментом 5'-крыла и сегментом 3'-крыла, и каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, и по меньшей мере одна межнуклеозидных связей представляет собой тиофосфатную связь, а каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгированную группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов и имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8 смежных
азотистых оснований любой из SEQ ID NO:12-130, 133, 134, при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: (а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; (b) сегмент 5'-крыла, состоящий из пяти связанных нуклеозидов; (с) сегмент 3'-крыла, состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и при этом сегмент гэп находится между сегментом 5'-крыла и сегментом 3'-крыла, и каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, и по меньшей мере одна межнуклеозидных связей представляет собой тиофосфатную связь, а каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации приведено соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгированную группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов и имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8 смежных азотистых оснований SEQ ID NO:58, при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: (а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; (b) сегмент 5'-крыла, состоящий из пяти связанных нуклеозидов; (с) сегмент 3'-крыла, состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и при этом сегмент гэп находится между сегментом 5'-крыла и сегментом 3'-крыла, и каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, и по меньшей мере одна межнуклеозидных связей представляет собой тиофосфатную связь, а каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации приведен модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и конъюгирующая группа, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов с последовательностью азотистых оснований SEQ ID NO:58, при этом модифицированный олигонуклеотид содержит: (а) сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов; (b) сегмент 5'-крыла, состоящий из пяти связанных нуклеозидов; (с) сегмент 3'-крыла, состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и при этом сегмент гэп находится между сегментом 5'-крыла и сегментом 3'-крыла, и каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O- метоксиэтиловый сахар, и по меньшей мере одна межнуклеозидных связей представляет собой тиофосфатную связь, а каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа связана с модифицированным олигонуклеотидом на 5'-конце модифицированного олигонуклеотида. В
некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа связана с модифицированным олигонуклеотидом на 3'-конце модифицированного олигонуклеотида.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующая группа содержит один или более лигандов. В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующая группа содержит два или более лигандов. В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующая группа содержит три или более лигандов. В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующая группа содержит три лиганда. В некоторых вариантах реализации каждый лиганд выбран из: полисахарида, модифицированного полисахарида, маннозы, галактозы, производного маннозы, производного галактозы, D-маннопиранозы, L-маннопиранозы, D-арабинозы, L-галактозы, D-ксилофуранозы, L-ксилофуранозы, D-глюкозы, L-глюкозы, D-галактозы, L-галактозы, α-D-маннофуранозы, β-D-маннофуранозы, α-D-маннопиранозы, β-D-маннопиранозы, α-D-глюкопиранозы, β-D-глюкопиранозы, α-D-глюкофуранозы, β-D-глюкофуранозы, α-D-фруктофуранозы, α-D-фруктопиранозы, α-D-галактопиранозы, β-D-галактопиранозы, α-D-галактофуранозы, β-D-галактофуранозы, глюкозамина, сиаловой кислоты, α-D-галактозамина, N-ацетилгалактозамина, 2-амино-3-O-[(R)-1-карбоксиэтил]-2-дезокси-β-D-глюкопиранозы, 2-дезокси-2-метиламино-L-глюкопиранозы, 4,6-дидезокси-4-формамидо-2,3-ди-O-метил-D-маннопиранозы, 2-дезокси-2-сульфоамино-D-глюкопиранозы, N-гликолоил-α-нейраминовой кислоты, 5-тио-β-D-глюкопиранозы, метил-2,3,4-три-O-ацетил-1-тио-6-O-тритил-α-D-глюкопиранозида, 4-тио-β-D-галактопиранозы, этил-3,4,6,7-тетра-O-ацетил-2-дезокси-1,5-дитио-α-D-глюко-гептопиранозида, 2,5-ангидро-D-аллононитрила, рибозы, D-рибозы, D-4-тиорибозы, L-рибозы, L-4-тиорибозы. В некоторых вариантах реализации каждый лиганд представляет собой N-ацетилгалактозамин.
В некоторых вариантах реализации каждый лиганд представляет собой N-ацетилгалактозамин.
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит:
Figure 00000020
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит:
Figure 00000021
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит:
Figure 00000022
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит:
Figure 00000023
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит:
Figure 00000024
.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующая группа содержит по меньшей мере одну фосфорную связывающую группу или нейтральную связывающую группу.
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит структуру, выбранную из:
Figure 00000025
,
Figure 00000026
Figure 00000027
и
Figure 00000028
Figure 00000029
;
Figure 00000030
;
Figure 00000031
;
где n равен от 1 до 12; и
где m равен от 1 до 12.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующая группа содержит связку, имеющую структуру, выбранную из:
Figure 00000032
и
Figure 00000033
где L представляет собой либо фосфорную связывающую группу, либо нейтральную связывающую группу;
Z1 представляет собой C(=O)O-R2;
Z2 представляет собой Н, С1-С6 алкил или замещенный С1-С6 алкил;
R2 представляет собой Н, С1-С6 алкил или замещенный С1-С6 алкил;
и каждый m1 независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m1 больше 0 для каждой связки.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующая группа содержит связку, имеющую структуру, выбранную из:
Figure 00000034
и
Figure 00000035
где Z2 представляет собой Н или СН3; и
каждый m1 независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m1 больше 0 для каждой связки.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующая группа содержит связку, имеющую структуру, выбранную из:
Figure 00000036
;
Figure 00000037
;
Figure 00000038
;
где n равен от 1 до 12; и
где m равен от 1 до 12.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующая группа ковалентно связана с модифицированным олигонуклеотидом.
В некоторых вариантах реализации соединение имеет структуру, представленную формулой:
Figure 00000039
где
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид;
В представляет собой расщепляемый фрагмент
С представляет собой конъюгирующий линкер
D представляет собой группу ветвления
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых вариантах реализации соединение имеет структуру, представленную формулой:
Figure 00000040
где:
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид;
В представляет собой расщепляемый фрагмент
С представляет собой конъюгирующий линкер
D представляет собой группу ветвления
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд;
каждый n независимо равен 0 или 1; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых вариантах реализации соединение имеет структуру, представленную формулой:
Figure 00000041
где
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид;
В представляет собой расщепляемый фрагмент;
С представляет собой конъюгирующий линкер;
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых вариантах реализации соединение имеет структуру, представленную формулой:
Figure 00000042
где
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид;
С представляет собой конъюгирующий линкер;
D представляет собой группу ветвления;
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых вариантах реализации соединение имеет структуру, представленную формулой:
Figure 00000043
где
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид;
С представляет собой конъюгирующий линкер;
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых вариантах реализации соединение имеет структуру, представленную формулой:
Figure 00000044
где
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид;
В представляет собой расщепляемый фрагмент;
D представляет собой группу ветвления;
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых вариантах реализации соединение имеет структуру, представленную формулой:
Figure 00000045
где
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид;
В представляет собой расщепляемый фрагмент;
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых вариантах реализации соединение имеет структуру, представленную формулой:
Figure 00000046
где
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид;
D представляет собой группу ветвления;
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующий линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000047
;
Figure 00000048
;
Figure 00000049
;
Figure 00000050
;
Figure 00000051
;
Figure 00000052
;
Figure 00000053
и
Figure 00000054
.
где каждый L независимо представляет собой либо фосфорную связывающую группу, либо нейтральную связывающую группу; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующий линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000055
;
Figure 00000056
;
Figure 00000057
;
Figure 00000058
;
Figure 00000059
;
Figure 00000060
;
Figure 00000061
Figure 00000062
;
Figure 00000063
;
Figure 00000064
;
Figure 00000065
;
Figure 00000066
;
Figure 00000067
;
Figure 00000068
и
Figure 00000069
.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующий линкер имеет следующую структуру:
Figure 00000070
.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующий линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000071
;
Figure 00000072
; и
Figure 00000073
.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующий линкер имеет структуру, выбранную
из:
Figure 00000074
и
Figure 00000075
.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующий линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000076
;
Figure 00000077
; и
Figure 00000078
В некоторых вариантах реализации конъюгирующий линкер содержит пирролидин. В некоторых вариантах реализации конъюгирующий линкер не содержит пирролидин. В некоторых вариантах реализации конъюгирующий линкер содержит ПЭГ. В некоторых вариантах реализации конъюгирующий линкер содержит амид. В некоторых вариантах реализации конъюгирующий линкер содержит по меньшей мере два амида. В некоторых вариантах реализации конъюгирующий линкер не содержит амид. В некоторых вариантах реализации конъюгирующий линкер содержит полиамид. В некоторых вариантах реализации конъюгирующий линкер содержит амин. В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующий линкер содержит одну или более дисульфидных связей. В некоторых
вариантах реализации конъюгирующий линкер содержит белок-связывающий фрагмент. В некоторых вариантах реализации белок-связывающий фрагмент содержит липид.
В некоторых вариантах реализации каждый белок-связывающий фрагмент выбран из: холестерина, холевой кислоты, адамантан-уксусной кислоты, 1-пиренмасляной кислоты, дигидротестостерона, 1,3-бис-O(гексадецил)глицерина, геранилоксигексиловой группы, гексадецилглицерина, борнеола, ментола, 1,3-пропандиола, гептадециловой группы, пальмитиновой кислоты, миристиновой кислоты, O3-(олеоил)литохолевой кислоты, O3-(олеил)холеновой кислоты, диметокситритила или феноксазина, витамина (например, фолата, витамина А, витамина Е, биотина, пиридоксаля), пептида, углевода (например, моносахарида, дисахарида, трисахарида, тетрасахарида, олигосахарида, полисахарида), эндосомолитического компонента, стероида (например, уваола, гецигенина, диосгенина), терпена (например, тритерпена, например, сарсасапогенина, фриделина, эпифриделанол-дериватизованной литохолевой кислоты) или катионного липида.
В некоторых вариантах реализации каждый белок-связывающий фрагмент выбран из: насыщенной или ненасыщенной жирной кислоты с длиной цепи С16-С22, холестерина, холевой кислоты, витамина Е, адамантана или 1-пентафторпропила.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующий линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000079
;
Figure 00000080
;
Figure 00000081
;
Figure 00000082
;
Figure 00000083
;
Figure 00000084
; и
Figure 00000085
.
где каждый n независимо равен от 1 до 20; и р равен от 1 до 6.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующий линкер имеет структуру, выбранную
из:
Figure 00000086
;
Figure 00000087
;
Figure 00000088
;
Figure 00000089
;
Figure 00000090
;
Figure 00000091
;
Figure 00000092
;
Figure 00000093
; и
Figure 00000094
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующий линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000095
;
Figure 00000096
;
Figure 00000097
;
Figure 00000098
;
Figure 00000099
; и
Figure 00000100
.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующий линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000101
и
Figure 00000102
где n равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующий линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000103
и
Figure 00000104
.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующий линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000105
и
Figure 00000106
;
где каждый n независимо равен 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6 или 7.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующий линкер имеет следующую структуру:
Figure 00000107
.
В некоторых вариантах реализации изобретения группа ветвления имеет одну из следующих структур:
Figure 00000108
;
Figure 00000109
и
Figure 00000110
где каждый A1 независимо представляет собой О, S, С=O или NH; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации изобретения группа ветвления имеет одну из следующих структур:
Figure 00000111
и
Figure 00000112
где каждый А1 независимо представляет собой О, S, С=O или NH; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации изобретения группа ветвления имеет следующую структуру:
Figure 00000113
.
В некоторых вариантах реализации изобретения группа ветвления имеет следующую структуру:
Figure 00000114
.
В некоторых вариантах реализации изобретения группа ветвления имеет следующую структуру:
Figure 00000115
.
В некоторых вариантах реализации изобретения группа ветвления имеет следующую структуру:
Figure 00000116
.
В некоторых вариантах реализации изобретения группа ветвления содержит простой эфир.
В некоторых вариантах реализации изобретения группа ветвления имеет следующую структуру:
Figure 00000117
;
Figure 00000118
;
Figure 00000119
; и
каждый n независимо равен от 1 до 20; и
m равен от 2 до 6.
В некоторых вариантах реализации изобретения группа ветвления имеет следующую структуру:
Figure 00000120
;
Figure 00000121
; и
Figure 00000122
В некоторых вариантах реализации изобретения грауппа ветвления имеет следующую структуру:
Figure 00000123
.
В некоторых вариантах реализации группа ветвления содержит:
Figure 00000124
,
Figure 00000125
или
Figure 00000126
;
где каждый j представляет собой целое число от 1 до 3; и
где каждый n представляет собой целое число от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации группа ветвления содержит:
Figure 00000127
,
Figure 00000128
,
Figure 00000129
,
Figure 00000130
или
Figure 00000131
.
В некоторых вариантах реализации каждая связка выбрана из:
Figure 00000132
и
Figure 00000133
где L выбран из фосфорной связывающей группы и нейтральной связывающей группы;
Z1 представляет собой C(=O)O-R2;
Z2 представляет собой Н, С1-С6 алкил или замещенный С1-С6 алкил;
R2 представляет собой Н, С1-С6 алкил или замещенный С1-С6 алкил; и
каждый m1 независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m1 больше 0 для каждой связки.
В некоторых вариантах реализации каждая связка выбрана из:
Figure 00000134
и
Figure 00000135
где Z2 представляет собой Н или СН3; и
каждый m2 независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m2 больше 0 для каждой связки.
В некоторых вариантах реализации каждая связка выбрана из:
Figure 00000136
;
Figure 00000137
;
Figure 00000138
;
где n равен от 1 до 12; и
где m равен от 1 до 12.
В некоторых вариантах реализации изобретения по меньшей мере одна связка содержит этиленгликоль. В некоторых вариантах реализации изобретения по меньшей мере одна связка содержит амид. В некоторых вариантах реализации изобретения по меньшей мере одна связка содержит полиамид. В некоторых вариантах реализации изобретения по меньшей мере одна связка содержит амин. В некоторых вариантах реализации по меньшей мере две связки отличны друг от друга. В некоторых вариантах реализации все связки являются одинаковыми.В некоторых вариантах реализации каждая связка выбрана из:
Figure 00000139
;
Figure 00000140
;
Figure 00000141
Figure 00000142
; и
Figure 00000143
где каждый n независимо равен от 1 до 20; и
каждый р равен от 1 до около 6.
В некоторых вариантах реализации каждая связка выбрана из:
Figure 00000144
;
Figure 00000145
; и
Figure 00000146
.
В некоторых вариантах реализации изобретения каждая связка имеет следующую структуру:
Figure 00000147
где каждый n независимо равен от 1 до 20. В некоторых вариантах реализации изобретения каждая связка имеет следующую структуру:
Figure 00000148
.
В некоторых вариантах реализации изобретения связка имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000149
или
Figure 00000150
, где каждый n независимо равен 0, 1,2, 3, 4, 5, 6 или 7.
В некоторых вариантах реализации изобретения связка имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000151
.
В некоторых вариантах реализации изобретения лиганд представляет собой галактозу. В некоторых вариантах реализации изобретения лиганд представляет собой манноза-6-фосфат.
В некоторых вариантах реализации каждый лиганд выбран из:
Figure 00000152
и
Figure 00000153
где каждый R1 выбран из ОН и NHCOOH.
В некоторых вариантах реализации каждый лиганд выбран из:
Figure 00000154
;
Figure 00000155
; и
Figure 00000156
.
В некоторых вариантах реализации изобретения каждый лиганд имеет следующую структуру:
Figure 00000157
.
В некоторых вариантах реализации изобретения каждый лиганд имеет следующую структуру:
Figure 00000158
.
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит фрагмент, нацеливающий на клетку.
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит фрагмент, нацеливающий на клетку, имеющий следующую структуру:
Figure 00000159
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000160
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000161
.
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000162
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000163
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000164
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000165
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000166
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000167
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000168
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000169
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000170
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000171
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000172
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000173
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000174
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000175
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000176
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000177
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000178
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000179
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000180
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000181
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000182
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000183
.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит:
Figure 00000184
;
где каждый Y выбран из О, S, замещенного или незамещенного С1-С10 алкила, амино, замещенного амино, азидо, алкенила или алкинила.
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит:
Figure 00000185
;
где каждый Y выбран из О, S, замещенного или незамещенного С1-С10 алкила, амино, замещенного амино, азидо, алкенила или алкинила.
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит:
Figure 00000186
;
где каждый Y выбран из О, S, замещенного или незамещенного С1-С10 алкила, амино, замещенного амино, азидо, алкенила или алкинила.
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит:
Figure 00000187
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит:
Figure 00000188
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит:
Figure 00000189
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит:
Figure 00000190
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит фрагмент, выбранный из: фосфодиэфира, амида или сложного эфира.
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит фосфодиэфирный расщепляемый фрагмент.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгирующая группа не содержит расщепляемого фрагмента, и при этом конъюгирующая группа содержит тиофосфатную связь между конъюгирующей группой и олигонуклеотидом. В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит амидный расщепляемый фрагмент.В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит сложноэфирный расщепляемый фрагмент.
В некоторых вариантах реализации изобретения соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000191
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-ОСН3;
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид; и
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания.
В некоторых вариантах реализации изобретения соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000192
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-ОСН3;
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид; и
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания.
В некоторых вариантах реализации изобретения соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000193
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-ОСН3;
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид;
Z представляет собой Н или связанную твердую подложку; и
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания.
В некоторых вариантах реализации изобретения соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000194
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-ОСН3;
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид;
Z представляет собой Н или связанную твердую подложку; и
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания.
В некоторых вариантах реализации изобретения соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000195
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид; и
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания.
В некоторых вариантах реализации изобретения соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000196
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид; и
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания.
В некоторых вариантах реализации изобретения соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000197
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид; и
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания.
В некоторых вариантах реализации изобретения соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000198
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид; и
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания.
В некоторых вариантах реализации изобретения соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000199
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид; и
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания.
В некоторых вариантах реализации изобретения соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000200
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид; и
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания.
В некоторых вариантах реализации изобретения соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000201
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид; и
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания.
В некоторых вариантах реализации изобретения соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000202
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид; и
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания.
В некоторых вариантах реализации изобретения соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000203
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид; и
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания.
В некоторых вариантах реализации изобретения соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000204
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид; и
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания.
В некоторых вариантах реализации изобретения соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000205
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид; и
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания.
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит:
Figure 00000206
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид; и
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания.
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит:
Figure 00000207
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид; и
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания.
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит:
Figure 00000208
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой модифицированный олигонуклеотид; и
Вх представляет собой фрагмент гетероциклического основания.
В некоторых вариантах реализации изобретения Вх выбран из аденина, гуанина, тимина, урацила или цитозина, или 5-метилцитозина. В некоторых вариантах реализации Вх представляет собой аденин. В некоторых вариантах реализации Вх представляет собой тимин. В некоторых вариантах реализации Q13 представляет собой O(СН2)2-OCH3. В некоторых вариантах реализации Q13 представляет собой Н.
В некоторых вариантах реализации соединение представлено в форме соли. В дополнительных вариантах реализации соединение дополнительно содержит фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель. В некоторых вариантах реализации соединение содержит модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), и
конъюгирующую группу, или его соль, и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.
В некоторых вариантах реализации приведен а композиция, содержащая конъюгированное антисмысловое соединение, описанное в настоящем документе, при этом степень вязкости указанного соединения составляет менее 40 сантипуаз (сП). В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгированные антисмысловые соединения, описанные в настоящем документе, являются эффективными благодаря вязкости менее 40 сП, менее 35 сП, менее 30 сП, менее 25 сП, менее 20 сП, менее 15 сП, измеренной по таким параметрам, как описано в Примере 125.
В некоторых вариантах реализации приведены композиции и способы, включающие введение животному конъюгированного антисмыслового соединения или композиции, описанной в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации введение конъюгированного антисмыслового соединения предупреждает, лечит, облегчает или замедляет прогрессирование сердечно-сосудистого, метаболического и/или воспалительного заболевания.
В некоторых вариантах реализации приведены композиции и способы применил в терапии для лечения заболевания, расстройства или состояния, связанного с аро(а). В некоторых вариантах реализации приведены композиции и способы применил в терапии для лечения заболевания, расстройства или состояния, связанного с Lp(а). В некоторых вариантах реализации у животного повышены уровни аро(а) и/или Lp(а). В некоторых вариантах реализации композиция представляет собой соединение, содержащее аро(а)-специфический ингибитор. В некоторых вариантах реализации аро(а)-специфический ингибитор представляет собой нуклеиновую кислоту. В некоторых вариантах реализации нуклеиновая кислота представляет собой антисмысловое соединение. В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение представляет собой модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а). В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение представляет собой модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), с конъюгирующей группой. В некоторых вариантах реализации модифицированный олигонуклеотид, нацеленный на аро(а), с конъюгирующей группой используют при лечении, предупреждении, замедлении прогрессирования, облегчении сердечно-сосудистого и/или метаболического заболевания, расстройства или состояния. В некоторых вариантах реализации композиции и способы терапии включают введение аро(а)-специфического ингибитора индивидууму, нуждающемуся в этом.
В некоторых вариантах реализации приведены композиции и способы снижения уровней аро(а). В некоторых вариантах реализации приведены композиции и способы снижения уровней Lp(а). В некоторых вариантах реализации изобретения снижение уровней аро(а) в ткани, органе или организме субъекта улучшает соотношение LDL к HDL или соотношение TG к HDL. В некоторых вариантах реализации изобретения приведены композиции и способы снижения экспрессии мРНК или белка аро(а) у животного, включающие введение указанному животному конъюгированного антисмыслового соединения или композиции, описанной в настоящем документе, для снижения экспрессии мРНК или белка аро(а) у животного. В некоторых вариантах реализации изобретения приведены композиции и способы уровней Lp(а) у животного, включающие введение указанному животному конъюгированного антисмыслового соединения или композиции, описанной в настоящем документе, для снижения экспрессии мРНК или белка аро(а) у животного.
В некоторых вариантах реализации приведены композиции и способы предупреждения, лечения, отсрочки, замедления прогрессирования и/или облегчения, заболеваний, расстройств и состояний, связанных с аро(а), у субъекта, нуждающегося в этом. В некоторых вариантах реализации приведены композиции и способы предупреждения, лечения, отсрочки, замедления прогрессирования и/или облегчения заболеваний, расстройств и состояний, связанных с Lp(а), у субъекта, нуждающегося в этом. В некоторых вариантах реализации такие заболевания, расстройства и состояния включают воспалительные, сердечно-сосудистые и/или метаболические заболевания, расстройства и состояния. Некоторые такие сердечно-сосудистые заболевания, расстройства или состояния включают, но не ограничиваются ими, стеноз аортального отверстия, аневризму (например, аневризма брюшной аорты), стенокардию, аритмию, атеросклероз, церебро-сосудистое заболевание, коронарно-артериальное заболевание, коронарную болезнь сердца, дислипидемию, гиперхолестеринемию, гиперлипидемию, гипертонию, гипертриглицеридемию, инфаркт миокада, болезнь периферических сосудов (например, болезнь периферической артерии, окклюзионная болезнь периферической артерии), окклюзию сосудов сетчатки или инсульт. Некоторые такие метаболические заболевания, расстройства или состояния включают, но не ограничиваются ими, гипергликемию, преддиабет, диабет (типа I и типа II), ожирение, инсулинорезистентность, метаболический синдром и диабетическую дислипидемию. Некоторые такие воспалительные заболевания, расстройства или состояния включают, но не ограничиваются ими, стеноз аортального отверстия, коронарно-артериальную болезнь
(CAD), болезнь Альцгеймера и тромбоэмболические заболевания, расстройства или состояния. Некоторые тромбоэмболические заболевания, расстройства или состояния включают, но не ограничиваются ими, инсульт, тромбоз (например, венозный тромбоэмболизм), инфаркт миокарда и болезнь периферических сосудов. В некоторых вариантах реализации приведены композиции и способы предупреждения, лечения, отсрочки, замедления прогрессирования и/или улучшения стеноза аортального отверстия.
В некоторых вариантах реализации изобретения приведен способ уменьшения по меньшей мере одного симптома сердечно-сосудистого заболевания, расстройства или состояния. В некоторых вариантах реализации симптомы включают, но не ограничиваются ими, стенокардию, боль в груди, одышку, учащенное сердцебиение, слабость, головокружение, тошноту, потоотделение, тахикардию, брадикардию, аритмию, мерцательную аритмию, опухание нижних конечностей, цианоз, усталость, обморок, онемение лица, онемение конечностей, хромоту или судороги мышц, вздутие живота и лихорадку. В некоторых вариантах реализации приведен способ ослабления по меньшей мере одного симптома стеноза аортального отверстия.
В некоторых вариантах реализации модулирование экспрессии аро(а) или Lp(а) происходит в клетке, ткани или органе. В некоторых вариантах реализации модулирование происходит в клетке, ткани или органе животного. В некоторых вариантах реализации модулирование представляет собой снижение уровня мРНК аро(а). В некоторых вариантах реализации модулирование представляет собой снижение уровня белка аро(а). С некоторых вариантах реализации снижаются и уровни мРНК, и уровни белка аро(а). В некоторых вариантах реализации модулирование представляет собой снижение уровня Lp(а). Такое снижение может происходить в зависимости от времени или в зависимости от дозы.
В некоторых вариантах реализации субъект или животное представляет собой человека.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгированное антисмысловое соединение вводят парентерально. В дополнительных вариантах реализации парентеральное введение является подкожным.
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгированное антисмысловое соединение или композицию вводят вместе со вторым агентом или терапией. В некоторых вариантах реализации конъюгированное антисмысловое соединение или композицию и второй агент вводят параллельно.
В некоторых вариантах реализации изобретения второй агент представляет собой агент, понижающий уровень глюкозы. В некоторых вариантах реализации второй агент представляет собой агент, понижающий уровень LDL, TG или холестерина. В некоторых вариантах реализации изобретения второй агент представляет собой противовоспалительный агент. В некоторых вариантах реализации изобретения второй агент представляет собой противовоспалительный агент. В некоторых вариантах реализации второй агент может быть, но не ограничиваясь этим, нестероидным противовоспалительным лекарством (NSAID, например, аспирин), ниацином (например, ниаспан), никотиновой кислотой, ингибитором ароВ (например, мипомерсен), ингибитором СЕТР (например, анасетрапиб), ингибитором аро(а), аналогом гормона щитовиной железы (например, эпротиром), ингибитором редуктазы HMG-СоА (например, статин), фибратом (например, гемфиброзил) и ингибитором микросомального белка-переносчика триглицеридов (например, ломитапид). Терапия может быть, но не ограничивается этим, аферез Lp(а). Агенты или терапии могут быть введены совместно или параллельно. Агенты или терапии могут быть введены последовательно или позже.
В некоторых вариантах реализации приведено применение конъюгированного антисмыслового соединения, нацеленного на аро(а), для снижения уровней аро(а) у животного. В некоторых вариантах реализации приведено применение конъюгированного антисмыслового соединения, нацеленного на аро(а), для снижения уровней Lp(а) у животного. В некоторых вариантах реализации приведено применение конъюгированных: антисмысловых соединений, нацеленных на аро(а), для лечения, предупреждения или облегчения заболевания, расстройства или состояния, связанного с аро(а). В некоторых вариантах реализации приведено применение конъюгированных антисмысловых соединений, нацеленных на аро(а), для лечения, предупреждения или облегчения заболевания, расстройства или состояния, связанного с Lp(а).
В некоторых вариантах реализации приведено применение конъюгированного антисмыслового соединения, нацеленного на аро(а), для получения лекарственного средства для снижения уровней аро(а) у животного. В некоторых вариантах реализации приведено применение конъюгированного антисмыслового соединения, нацеленного на аро(а), для получения лекарственного средства для снижения уровней Lp(а) у животного. В некоторых вариантах реализации приведено применение конъюгированного антисмыслового соединения для получения лекарственного средства для лечения, предупреждения или облегчения заболевания, расстройства или состояния, связанного с аро(а). В некоторых
вариантах реализации приведено применение конъюгированного антисмыслового соединения для получения лекарственного средства для лечения, предупреждения или облегчения заболевания, расстройства или состояния, связанного с Lp(а).
В некоторых вариантах реализации приведено применение конъюгированного антисмыслового соединения, описанного в настоящем документе, в производстве лекарственного средства для лечения, облегчения, отсрочки или предупреждения одного или более заболеваний, связанных с аро(а) и/или Lp(а).
В некоторых вариантах реализации приведен набор для лечения, предупреждения или облегчения заболевания, расстройства или состояния, описанного в настоящем документе, который содержит: (i) аро(а)-специфический ингибитор, описанный в настоящем документе; и необязательно (ii) второй агент или терапию, описанную в настоящем документе.
Набор согласно настоящему изобретению может дополнительно содержать инструкции по применению набора для лечения, предупреждения, облегчения заболевания, расстройства или состояния, описанного в настоящем документе, при помощи комплексной терапии, описанной в настоящем документе.
В. Некоторые соединения
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены конъюгированные антисмысловые соединения, содержащие антисмысловые олигонуклеотиды и конъюгат.
а. Некоторые антисмыловые олигонуклеотиды
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены антисмысловые олигонуклеотиды. Такие антисмысловые олигонуклеотиды содержат связанные нуклеозиды, и каждый нуклеозид содержит сахарный фрагмент и азотистое основание. Структура таких антисмысловых олигонуклеотидов может быть рассмотрена с точки зрения химических особенностей (например, модификаций и характерных участков модификаций) и последовательности азотистых оснований (например, последовательность антисмыслового олигонуклеотида, сущность и последовательность целезой нуклеиновой кислоты).
i. Некоторые химические особенности
В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид содержит одну или более модификаций. В некоторых таких вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды содержат один или более модифицированных нуклеозидов и/или модифицированных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации модифицированные нуклеозиды содержат модифицированный сахарный фрагмент и/или модифицированное азотистое основание.
1. Некоторые сахарные фрагменты
В некоторых вариантах реализации соединения настоящего описания содержат один или более модифицированных нуклеозидов, содержащих модифицированный сахарный фрагмент. Такие соединения, содержащие один или более модифицированных по сахару
нуклеозидов, могут обладать желаемыми свойствами, такими как улучшенная стабильность к нуклеазе или увеличенная связывающая аффинность к целевой нуклеиновой кислоте, по сравнению с олигонуклеотидом, содержащим только нуклеозиды, которые содержат природные сахарные фрагменты. В некоторых вариантах реализации модифицированные сахарные фрагменты представляют собой замещенные сахарные фрагменты. В некоторых вариантах реализации модифицированные сахарные фрагменты представляют собой заменители сахара. Такие заменители сахара могут содержать одно или более замещений, соответствующих замещениям замещенных сахарных фрагментов.
В некоторых вариантах реализации модифицированные сахарные фрагменты представляют собой замещенные сахарные фрагменты, содержащие один или более немостиковых сахарных заместителей, включая, но не ограничиваясь этим, заместители в 2' и/или 5'-положениях. Примеры заместителей сахара, подходящих для 2'-положения, включают, но не ограничиваются ими: 2'-F, 2'-ОСН3 («ОМе» или «О-метил») и 2'-O(СН2)2OCH3 («МОЕ»). В некоторых вариантах реализации заместитель сахара в 2'-положении выбран из аллила, амино, азидо, тио, О-аллила, О-С110 алкила, О-С110 замещенного алкила; OCF3, O(СН2)2SCH3, O(СН2)2-O-N(Rm)(Rn) и O-СН2-С(=O)-N(Rm)(Rn), где каждый Rm и Rn независимо представляет собой Н или замещенный или незамещенный С110 алкил. Примеры заместителей сахара в 5'-положении включают, но не ограничиваются ими: 5'-метил (R или S), 5'-винил и 5'-метокси. В некоторых вариантах реализации замещенные сахара содержат более одного немостикового сахарного заместителя, например, 2'-F-5'-метил-сахарные фрагменты (см., например, Международную заявку РСТ WO 2008/101157, где представлены дополнительные 5', 2'-бис-замещенные сахарные фрагменты и нуклеозиды).
Нуклеозиды, содержащие 2'-замещенные сахарные фрагменты, упоминаются как 2'-замещенные нуклеозиды. В некоторых вариантах реализации 2'-замещенный нуклеозид содержит 2'-группу заместителя, выбранную из галогена, аллила, амино, азидо, SH, CN, OCN, CF3, OCF3, О, S или N(Rm)-алкила; О, S или N(Rm)-алкенила; О, S или N(Rm)-алкинила; О-алкиленил-О-алкила, алкинила, алкарила, аралкила, О-алкарила, О-аралкила; O(СН2)2SCH3, O-(СН2)2-O-N(Rm)(Rn) или O-СН2-С(=O)-N(Rm)(Rn), где каждый Rm и Rn независимо представляет собой Н, аминозащитную группу или замещенный или незамещенный С110 алкил. Эти 2'-группы заместителей могут быть дополнительно замещены одной или более группами заместителей, независимо выбранными из гидроксила,
амино, алкокси, карбокси, бензила, фенила, нитро (NO2), тиола, тиоалкокси (S-алкила), галогена, алкила, арила, алкенила и алкинила.
В некоторых вариантах реализации 2'-замещенный нуклеозид содержит 2'-группу заместителя, выбранную из F, NH2, N3, OCF3, O-СН3, O(СН2)3NH2, СН2-СН=СН2, О-СН2-СН=СН2, ОСН2СН2ОСН3, O(СН2)2SCH3, O-(СН2)2-O-N(Rm)(Rn), O(СН2)2O(СН2)2N(СН3)2 и N-замещенного ацетамида (O-СН2-С(=O)-N(Rm)(Rn), где каждый Rm и Rn независимо представляет собой Н, аминозащитную группу или замещенный или незамещенный С110 алкил.
В некоторых вариантах реализации 2'-замещенный нуклеозид содержит сахарный фрагмент, содержащий 2'-группу заместителя, выбранную из F, OCF3, О-CH3, ОСН2СН2ОСН3, O(СН2)2SCH3, O-(СН2)2-O-N(СН3)2, -O(СН2)2O(СН2)2N(СН3)2 и O-СН2-С(=O)-N(Н)СН3.
В некоторых вариантах реализации 2'-замещенный нуклеозид содержит сахарный фрагмент, содержащий 2'-группу заместителя, выбранную из F, O-СН3 и OCH2CH2OCH3.
Некоторые модифицированные сахарные фрагменты содержат мостиковый сахарный заместитель, который образует второе кольцо, что приводит к получению бициклического сахарного фрагмента. В некоторых таких вариантах реализации бициклический сахарный фрагмент содержит мостик между 4' и 2' атомами фуранозного кольца. Примеры таких 4'-2' сахарных заместителей включают, но не ограничиваются ими: -[С(Ra)(Rb)]n-, -[С(Ra)(Rb)]n-O-, -С(RaRb)-N(R)-O- или -С(RaRb)-O-N(R)-; 4'-СН2-2', 4'-(СН2)2-2', 4'-(СН2)3-2', 4'-(СН2)-O-2' (LNA); 4'-(СН2)-S-2'; 4'-(СН2)2-O-2' (ENA); 4'-СН(СН3)-O-2' (cEt) и 4'-СН(CH2OCH3)-O-2', и его аналоги (см., например, патент США 7399845, выданный 15 июля 2008 года); 4'-С(СН3)(СН3)-O-2' и его аналоги (см., например, WO 2009/006478, опубликованный 8 января 2009 года); 4'-СН2-N(OCH3)-2' и его аналоги (см., например, WO 2008/150729, опубликованный 11 декабря 2008 года); 4'-СН2-O-N(СН3)-2' (см., например, US 2004/0171570, опубликованный 2 сентября 2004 года); 4'-СН2-O-N(R)-2' и 4'-СН2-N(R)-O-2'-, где каждый R независимо представляет собой Н, защитную группу или С112 алкил; 4'-СН2-N(R)-O-2', где R представляет собой Н, С112 алкил или защитную группу (см., например, патент США 7427672, выданный 23 сентября 2008 года); 4'-СН2-С(Н)(CH3)-2' (см., например, Chattopadhyaya, et al., J. Org. Chem., 2009, 74, 118-134); и 4'-СН2-С(=СН2)-2' и его аналоги (см.
опубликованную Международную заявку РСТ WO 2008/154401, опубликованную 8 декабря 2008 года).
В некоторых вариантах реализации такие мостики 4'-2' независимо содержат от 1 до 4 связанных групп, независимо выбранных из -[C(Ra)(Rb)]n-, -C(Ra)=C(Rb)-, -C(Ra)=N-, -C(=NRa)-, -С(=O)-, -C(=S)-, -О-, -Si(Ra)2-, -S(=O)x- и -N(Ra)-;
где:
x равен 0, 1 или 2;
n равен 1, 2, 3 или 4;
каждый Ra и Rb независимо представляет собой Н, защитную группу, гидроксил, C112 алкил, замещенный С112 алкил, С212 алкенил, замещенный С212 алкенил, С212 алкинил, замещенный C2-C12 алкинил, С520 арил, замещенный С520 арил, гетероциклический радикал, замещенный гетероциклический радикал, гетероарил, замещенный гетероарил, С57 алициклический радикал, замещенный С57 алициклический радикал, галоген, OJ1, NJ1J2, SJ1, N3, COOJ1, ацил (C(=O)-H), замещенный ацил, CN, сульфонил (S(=O)2-J1) или сульфоксил (S(=O)-J1); и
каждый J1 и J2 независимо представляет собой Н, С112 алкил, замещенный С112 алкил, С212 алкенил, замещенный C2-C12 алкенил, С212 алкинил, замещенный C2-C12 алкинил, С520 арил, замещенный С520 арил, ацил (С(=O)-Н), замещенный ацил, гетероциклический радикал, замещенный гетероциклический радикал, С112 аминоалкил, замещенный С112 аминоалкил или защитную группу.
Нуклеозиды, содержащие бициклические сахарные фрагменты, упоминаются как бициклические нуклеозиды или BNA. Бициклические нуклеозиды включают, но не ограничиваются ими, (А) α-L-метиленокси (4'-СН2-O-2') BNA, (В) β-D-метиленокси (4'-СН2-O-2') BNA (также упоминаемый как закрытая нуклеиновая кислота или LNA), (С) этиленокси (4'-(СН2)2-O-2') BNA, (D) аминоокси (4'-CH2-O-N(R)-2') BNA, (Е) оксиамино (4'-CH2-N(R)-O-2') BNA, (F) метил(метиленокси) (4'-СН(СН3)-O-2') BNA (также упоминаемый как стерически затрудненный этил или cEt), (G) метилен-тио (4'-CH2-S-2') BNA, (Н) метилен-амино (4'-CH2-N(R)-2') BNA, (I) метил-карбоциклический (4'-СН2-СН(СН3)-2') BNA и (J) пропилен-карбоциклический (4'-(СН2)3-2') BNA, как показано ниже.
Figure 00000209
Figure 00000210
Figure 00000211
где Вх представляет собой фрагмент азотистого основания, a R независимо представляет собой Н, защитную группу или С112 алкил.
В данной области техники известны дополнительные бициклические сахарные фрагменты, например: Singh et al., Chem. Commun., 1998, 4, 455-456; Koshkin et al., Tetrahedron, 1998, 54, 3607-3630; Wahlestedt et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2000, 97, 5633-5638; Kumar et al., Bioorg. Med. Chem. Lett., 1998, 8, 2219-2222; Singh et al., J. Org. Chem., 1998, 63, 10035-10039; Srivastava et al., J. Am. Chem. Soc, 129(26) 8362-8379 (4 июля 2007 года); Elayadi et al, Curr. Opinion Invens. Drugs, 2001, 2, 558-561; Braasch et al., Chem. Biol., 2001, 8, 1-7; Orum et al., Curr. Opinion Mol. Ther., 2001, 3, 239-243; патенты США №7053207 6268490 6770748 6794499 7034133 6525191 6670461 и 7399845; WO 2004/106356, WO 1994/14226, WO 2005/021570 и WO 2007/134181; публикации патентов США № US 2004/0171570, US 2007/0287831 и US 2008/0039618; патенты США с серийными номерами 12/129154 60/989574 61/026995 61/026998 61/056564 61/086231 61/097787 и 61/099844; и Международные заявки РСТ № PCT/US 2008/064591, PCT/US 2008/066154 и PCT/US 2008/068922.
В некоторых вариантах реализации бициклические сахарные фрагменты и
нуклеозиды, содержащие такие бициклические сахарные фрагменты, дополнительно определяют по изомерной конфигурации. Например, нуклеозид, содержащий мостик 4'-2'-метилен-окси, может быть в α-L конфигурации или в β-D конфигурации. Ранее α-L-метиленокси (4'-СН2-O-2') бициклические нуклеозиды были внедрены в антисмысловые олигонуклеотиды, которые обладают антисмысловой активностью (Frieden et al., Nucleic Acids Research, 2003, 21, 6365-6372).
В некоторых вариантах реализации замещенные сахарные фрагменты содержат один или более немостиковых сахарных заместителей и один или более мостиковых сахарных заместителей (например, 5'-замещенные и 4'-2'-мостиковые сахара), (см., например, Международную заявку РСТ WO 2007/134181, опубликованную 11/22/07, в которой замещена, например, 5'-метильной или 5'-виниловой группой).
В некоторых вариантах реализации модифицированные сахарные фрагменты представляют собой заменители сахара. В некоторых таких вариантах реализации атом кислорода природного сахара является замещенным, например, атомом серы, углерода или азота. В некоторых таких вариантах реализации такой модифицированный сахарный фрагмент содержит также мостиковые и/или немостиковые заместители, как описало выше. Например, некоторые заменители сахара содержат 4'-атом серы и замещение в 2'-положении (см., например, опубликованную патентную заявку США US 2005/0130923, опубликованную 16 июня 2005 года) и/или 5'-положении. В качестве дополнительного примера, были описаны карбоциклические бициклические нуклеозиды, имеющие мостик 4'-2' (см., например, Freier et al., Nucleic Acids Research, 1997, 25(22), 4429-4443 и Albaek et al., J. Org. Chem., 2006, 71, 7731-7740).
В некоторых вариантах реализации заменители сахара содержат кольца, имеющие не 5 атомов. Например, в некоторых вариантах реализации заменитель сахара содержит морфолино. Морфолино-соединения и их применение в олигомерных соединениях было описано в многочисленных патентах и опубликованных статьях (см., например: Braasch et al., Biochemistry, 2002, 41, 4503-4510; и патенты США 5698685; 5166315; 5185444; и 5034506). При использовании в настоящем документе, термин «морфолино» означает заменитель сахара, имеющий следующую структуру:
Figure 00000212
В некоторых вариантах реализации морфолино могут быть модифицированными, например, добавлением или изменением различных групп заместителей в представленной выше структуре морфолино. Такие заменители сахара упомянуты в настоящем документе как «модифицированные морфолино».
В качестве другого примера, в некоторых вариантах реализации заменитель сахара содержит шестичленный тетрагидропиран. Такие тетрагидропираны могут быть дополнительно модифицированы или замещены. Нуклеозиды, содержащие такие модифицированные тетрагидропираны, включают, но не ограничиваются ими, гекситоловую нуклеиновую кислоту (HNA), анитоловую нуклеиновую кислоту (ANA), манитоловую нуклеиновую кислоту (MNA) (см. Leumann, CJ. Bioorg. & Med. Chem. (2002) 10:841-854), фтор-HNA (F-HNA) и соединения, имеющие Формулу VI:
Figure 00000213
где независимо для каждого из указанного по меньшей мере одного тетрагидропиранового нуклеозидного аналога Формулы VI:
Вх представляет собой фрагмент азотистого основания;
Т3 и Т4, каждый независимо, представляют собой межнуклеозидную связывающую группу, связывающую тетрагидропирановый нуклеозидный аналог с антисмысловым соединением, или один из Т3 и T4 представляет собой межнуклеозидную связывающую группу, связывающую тетрагидропирановый нуклеозидный аналог с антисмысловым соединением, а другой из Т3 и T4 представляет собой Н, гидроксил-защитную группу, связанную конъюгирующую группу или 5' или 3'-концевую группу;
q1, q2, q3, q4, q5, q6 и q7, каждый независимо, представляют собой Н, С16 алкил, замещенный С16 алкил, С26 алкенил, замещенный С26 алкенил, С26 алкинил или
замещенный С26 алкинил; и
каждый из R1 и R2 независимо выбран из: водорода, галогена, замещенного или незамещенного алкокси, NJ1J2, SJ1, N3, ОС(=Х)J1, ОС(=Х)NJ1J2, NJ3C(=Х)NJ1J2 и CN, где X представляет собой О, S или NJ1, и каждый J1, J2 и J3 независимо представляет собой Н или C16 алкил.
В некоторых вариантах реализации приведены модифицированные ТНР нуклеозиды Формулы VI, в которых каждый q1, q2, q3, q4, q5, q6 и q7 представляет собой Н. В некоторых вариантах реализации по меньшей мере один из q1, q2, q3, q4, q5, q6 и q7 отличен от Н. В некоторых вариантах реализации по меньшей мере один из q1, q2, q3, q4, q5, q6 и q7 представляет собой метил. В некоторых вариантах реализации приведены ТНР нуклеозиды Формулы VI, в которых один из R1 и R2 представляет собой F. В некоторых вариантах реализации R1 представляет собой фтор, а R2 представляет собой Н, R1 представляет собой метокси, а R2 представляет собой Н, и R1 представляет собой метоксиэтокси, а R2 представляет собой Н.
В данной области техники известны также мноие другие бициклические и три циклические кольцевые системы заменителей сахара, которые могут быть использованы для модификации нуклеозидов для внедрения в антисмысловые соединеия (см., например, обзорную статью: Leumann, J.С, Bioorganic & Medicinal Chemistry, 2002, 10, 841-854).
Без ограничения, представлены также комбинации модификаций, такие как 2'-F-5' метил-замещенные нуклеозиды (см. Международную заявку РСТ 2008/101157, опубликованную 8/21/08, где описаны другие 5', 2'-бис-замещенные нуклеозиды) и замена атома кислорода рибозильного кольца на S и дополнительное замещение в 2'-положении (см. опубликованную заявку на патент США US 2005-0130923, опубликованную 16 июня 2005 года) или, альтернативно, 5'-замещение бициклической нуклеиновой кислоты (см. Международную заявку РСТ WO 2007/134181, опубликованную 11/22/07, в которой 4'-СН2-O-2' бициклический нуклеозид дополнительно замещен в 5'-положении 5'-метильной или 5'-виниловой группой). Был описан также синтез и получение карбоциклических бициклических нуклеозидов вместе с их олигомеризацией и биохимическими исследованиями (см., например, Srivastava et al., J. Am. Chem. Soc. 2007, 129(26), 8362-8379).
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены олигонуклеотиды, содержащие модифицированные нуклеозиды. Такие модифицированные нуклеотиды могут содержать модифицированные сахара, модифицированные азотистые основания и/или модифицированные связи. Конкретные модификации
выбирают так, чтобы полученные олигонуклеотиды обладали желаемыми характеристиками. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат один или более РНК-подобных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат один или более ДНК-подобных нуклеотидов.
2. Некоторые модификации азотистых оснований
В некоторых вариантах реализации нуклеозиды настоящего описания содержат одно или более немодифицированных азотистых оснований. В некоторых вариантах реализаций нуклеозиды настоящего описания содержат одно или более модифицированных азотистых оснований.
В некоторых вариантах реализации модифицированные азотистые основания выбраны из: универсальных оснований, гидрофобных оснований, смещанных оснований, увеличенных в размере оснований и фторированных оснований, описанных в настоящем документе. 5-замещенные пиримидины, 6-азапиримидины и N-2, N-6 и О-6-замещенные пурины, включая 2-аминопропиладенин, 5-пропинилурацил; 5-пропинилцитозин; 5-гидроксиметил-цитозин, ксантин, гипоксантин, 2-аминоаденин, 6-метил и другие алкильные производные аденина и гуанина, 2-пропил и другие алкильные производные аденина и гуанина, 2-тиоурацил, 2-тиотимин и 2-тиоцитозин, 5-галогенурацил и цитозин, 5-пропинил (-С≡С-CH3) урацил и цитозин и другие алкинильные производные пиримидиновых оснований, 6-азоурацил, цитозин и тимин, 5-урацил (псевдоурацил), 4-тиоурацил, 8-галоген, 8-амино, 8-тиол, 8-тиоалкил, 8-гидроксил и другие 8-замещенные аденины и гуанины, 5-галоген, в частности, 5-бром, 5-трифторметил и другие 5-замещенные урацилы и цитозины, 7-метилгуанин и 7-метиладенин, 2-F-аденин, 2-аминоаденин, 8-азагуанин и 8-азааденин, 7-деазагуанин и 7-деазааденин, 2-деазагуанин и 3-деазааденин, универсальные основания, гидрофобные основания, смешанные основания, увеличенные в размере основания и фторированные основания, описанные в настоящем документе. Допонительные модифицированные азотистые основания включают трициклические пиримидины, такие как феноксазина цитидин ([5,4-b][1,4]бензоксазин-2(3H)-он), фенотиазина цитидин (1Н-пиримидо[5,4-b][1,4]бензотиазин-2(3H)-он), так называемые G-clamp, такие как замещенный феноксазина цитидин (например, 9-(2-аминоэтокси)-Н-пиримидо[5,4-b][1,4]бензоксазин-2(3H)-он), карбазола цитидин (2Н-пиримидо[4,5-b]индол-2-он), пиридоиндола цитидин (Н-пиридо[3',2':4,5]пирроло[2,3-d]пиримидин-2-он). Модифицированные азотистые основания также могут включать азотистые основания, в которых пуриновое или пиримидиновое основание заменено другими гетероциклами, например, 7-деаза-аденин, 7-деазагуанозин, 2-аминопиридин и 2-пиридон. Дополнительные азотистые основания включают азотистые
основания, описанные в патенте США №3687808, описанные в публикации The Concise Encyclopedia Of Polymer Science And Engineering, Kroschwitz, J.I., ред., John Wiley & Sons, 1990, 858-859; описанные авторами English et al., Angewandte Chemie, Международное издание, 1991, 30, 613; и описанные в публикации Sanghvi, Y.S., глава 15, Antisense Research and Application, Crooke, S.Т. и Lebleu, В., ред., СRС Press, 1993, 273-288.
Типичные патенты США, в которых описано получение некоторых из вышеупомянутых модифицированных азотистых оснований, а также других модифицированных азотистых оснований, включают, без ограничения, U.S. 3687808; 4845205; 5130302; 5134066; 5175273; 5367066; 5432272; 5457187; 5459255; 5484908; 5502177; 5525711; 5552540; 5587469; 5594121; 5596091; 5614617; 5645985; 5681941; 5750692; 5763588; 5830653 и 6005096, некоторые из которых находятся на рассмотрении одновременно с настоящей заявкой, и каждый из которых включен в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме.
3. Некоторые межнуклеозидные связи
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены олигонуклеотиды, содержащие связанные нуклеозиды. В таких вариантах реализации нуклеозиды могут быть связаны вместе при помощи любой межнуклеозидной связи. Два основных класса межнуклеозидных связывающих групп определяются по наличию пли отсутствию атома фосфора. Типичные фосфорсодержащие межнуклеозидные связи включают, но не ограничиваются мими, фосфодиэфиры (РО), фосфотриэфиры, метилфосфонаты, фосфорамидаты и тиофосфаты (PS). Типичные не содержащие фосфора межнуклеозидные связывающие группы включают, но не ограничиваются ими, метиленметилимино (-СН2-N(СН3)-O-СН2-), тиодиэфир (-O-С(O)-S-), тионокарбамат (-O-С(O)(NH)-S-); силоксан (-O-Si(Н)2-O-); и N,N’-диметилгидразин (-СН2-N(СН3)-N(СН3)-). Модифицированные связи, в сравнении с природными фосфодиэфирными связями, могут быть использованы для изменения, обычно увеличения устойчивости олигонуклеотида к нуклеазе. В некоторых вариантах реализации межнуклеозидные связи, имеющие хиральный атом, могут быть получены в виде рацемической смеси или в виде отдельных энантиомеров. Типичные хиральные связи включают, но не ограничиваются ими, алкилфосфонаты и тиофосфаты. Способы получения фосфорсодержащих и не содержащих фосфора межнуклеозидных связей хорошо известны специалистам в данной области техники.
Олигонуклеотиды, описанные в настоящем документе, содержат один или более асимметричных центров и, следовательно, могут образовывать энантиомеры, диастереомеры и другие стереоизомерные конфигурации, которые в соответствии с абсолютной стереохимией могут быть определены как (R) или (S), или, как для аномеров сахара, или как
(D) или (L), как для аминокислот и т.д. В антисмысловые соединения, представленные в настоящем документе, включены все такие возможные изомеры, а также их рацемические и оптически чистые формы.
Нейтральные связывающие линкеры включают, без ограничения, фосфотриэфиры, метилфосфонаты, MMI (3'-СН2-N(CH3)-О-5'), амид-3 (3'-СН2-С(=O)-N(H)-5'), амид-4 (3'-СН2-N(Н)-С(=O)-5'), формацеталь (3'-О-СН2-O-5') и тиоформацеталь (3'-S-СН2-O-5'). Дополнительные нейтральные межнуклеозидные связи включают неионные связи, содержащие силоксан (диалкилсилоксан), карбоксильный эфир, карбоксамид, сульфид, сульфоновый эфир и амиды (см., например: Carbohydrate Modifications in Antisense Research; Y.S. Sanghvi и Р.D. Cook, ред., ACS Symposium Series 580; главы 3 и 4, 40-65). Дополнительные нейтральные межнуклеозидные связи включают неионные связи, содержащие смешанные составные части N, О, S и СН2.
4. Некоторые мотивы
В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды содержат один или более модифицированных нуклеозидов (например, нуклеозид, содержащий модифицированный сахар и/или модифицированное азотистое основание) и/или один или более модифицированных межнуклеозидных связей. Характерный участок таких модификаций в олигонуклеотиде упоминается в настоящем документе как мотив. В некоторых вариантах реализации мотивы сахара, азотистого основания и линкера не зависят друг от друга.
а. Некоторые сахарные мотивы
В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат один или более типов модифицированных сахарных фрагментов и/или природных сахарных фрагментов, расположенных вдоль олигонуклеотида или его области определенным образом или в виде мотива сахарной модификации. Такие мотивы могут содержать любые сахарные модификации, рассмотренные в настоящем документе и/или другие известные модификации сахара.
В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат или состоят из области, имеющей сахарный мотив гэпмера, который содержит две внешних области или «крыла» и центральную или внутреннюю область, или «гэп». Эти три области сахарного мотива гэпмера (5'-крыло, гэп и 3'-крыло) образуют непрерывную последовательность азотистых оснований, в которой по меньшей мере некоторые из сахарных фрагментов нуклеозидов в каждом крыле отличаются по меньшей мере от некоторых сахарных фрагментов нуклеозидов в гэпе. В частности, по меньшей мере те сахарные фрагменты нуклеозидов каждого крыла, которые расположены ближе всего к гэпу (3'-ближайший нуклеозид 5'-крыла и 5'-ближайший нуклеозид 3'-крыла), отличаются от сахарного фрагмента соседних нуклеозидов в гэпе, определяя таким образом границу между крыльями и гэпом. В некоторых вариантах реализации сахарные фрагменты в гэпе являются
одинаковыми между собой. В некоторых вариантах реализации гэп содержит один или более нуклеозидов, имеющих сахарный фрагмент, который отличается от сахарного фрагмента одного или более других нуклеозидов в гэпе. В некоторых вариантах реализации сахарные мотивы двух крыльев являются одинаковыми между собой (симметричный сахарный гэпмер). В некоторых вариантах реализации сахарные мотивы 5'-крыла отличаются от сахарного мотива 3'-крыла (асимметричный сахарный гэпмер).
1. Некоторые 5'-крылья
В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 1-8 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 1-7 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 1-6 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 1-5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 2-5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 3-5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 4 или 5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 1-4 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 1-3 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 1 или 2 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 2-4 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 2 или 3 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 3 или 4 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 1 нуклеозида. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 2 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 3 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 4 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 6 связанных нуклеозидов.
В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере два бициклических нуклеозида. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере три бициклических нуклеозида. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере четыре бициклических нуклеозида.
В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один стерически затрудненный этил-нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 5'-крыла гэпмера представляет собой бициклический нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 5'-крыла гэпмера представляет, собой стерически затрудненный этил-нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 5'-крыла гэпмера представляет собой LNA нуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один 2'-ОМе нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 5'-крыла гэпмера представляет собой не бициклический модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 5'-крыла гэпмера представляет собой 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 5'-крыла гэпмера представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 5'-крыла гэпмера представляет собой 2'-ОМе нуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 5'-крыла гэпмера представляет собой 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один рибонуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 5'-крыла гэпмера представляет собой рибонуклеозид. В некоторых вариантах реализации один, более одного или каждый из нуклеозидов 5'-крыла представляет собой РНК-подобный нуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых
вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один 2'-ОМе нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один стерически затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один стерически затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один стерически затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один стерически затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один 2'-ОМе нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один стерически затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид.
ii. Некоторые 3'-крылья
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 1-8 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 1-7 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 1-6 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 1-5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 2-5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 3-5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 4 или 5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 1-4 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 1-3 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 1 или 2 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 2-4 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 2 или 3 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 3 или 4 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 1 нуклеозида. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 2 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера
состоит из 3 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 4 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 6 связанных нуклеозидов.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один стерически затрудненный этил-нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 3'-крыла гэпмера представляет собой бициклический нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 3'-крыла гэпмера представляет собой стерически затрудненный этил-нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 3'-крыла гэпмера представляет собой LNA нуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере два не бициклических модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере три не бициклических модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализаций 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере четыре не бициклических модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один 2'-ОМе нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 3'-крыла гэпмера представляет собой не бициклический модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 3'-крыла гэпмера представляет собой 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 3'-крыла гэпмера представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 3'-крыла гэпмера представляет собой 2'-ОМе нуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 3'-крыла
гэпмера представляет собой 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один рибонуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 3'-крыла гэпмера представляет собой рибонуклеозид. В некоторых вариантах реализации один, более одного или каждый из нуклеозидов 5'-крыла представляет собой РНК-подобный нуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один 2'-ОМе нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один стерически затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один стерически затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один стерически затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один стерически затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один 2'-ОМе нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один стерически затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один LNA нуклеозид и по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один LNA нуклеозид и по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один LNA нуклеозид и по меньшей
мере один 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один LNA нуклеозид и по меньшей мере один 2'-ОМе нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид, по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один стерически затрудненный этил-нуклеозид, по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один LNA нуклеозид, по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид, по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один стерически затрудненный этил-нуклеозид, по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один LNA нуклеозид, по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид, по меньшей мере один 2'-МОЕ нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один стерически затрудненный этил-нуклеозид, по меньшей мере один 2'-МОЕ нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один LNA нуклеозид, по меньшей мере один 2'-МОЕ нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид, по меньшей мере один 2'-ОМе нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один стерически затрудненный этил-нуклеозид, по меньшей мере один 2'-ОМе нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации
3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один LNA нуклеозид, по меньшей мере один 2'-ОМе нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид.
iii. Некоторые центральные области (гэпы)
В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 6-20 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 6-15 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 6-12 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 6-10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 6-9 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 6-8 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 6 или 7 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 7-10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 7-9 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 7 или 8 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 8-10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 8 или 9 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 6 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 7 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 8 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 9 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 11 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 12 связанных нуклеозидов.
В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид гэпа гэпмера представляет собой 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации гэп содержит один или более модифицированных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид гэпа гэпмера представляет собой 2'-дезоксинуклеозид или представляет собой модифицированный «ДНК-подобный» нуклеозид. В таких вариантах реализации «ДНК-подобный» означает, что нуклеозид имеет такие же характеристики, что и ДНК, то есть что дуплекс, содержащий гэпмер и молекулу РНК может активировать РНКазу Н. Например, было показано, что при некоторых условиях 2'-(ara)-Р поддерживает активацию РНКазы Н и, следовательно, является ДНК-подобным. В некоторых вариантах реализации один или более
нуклеозидов гэпа гэпмера не представляет собой 2'-дезоксинуклеозид и не является ДНК-подобным. В некоторых таких вариантах реализации гэпмер тем не менее поддерживает активацию РНКазы Н (например, за счет количества или положения не-ДНК нуклеозидов).
В некоторых вариантах реализации гэпы содержат участок немодифицированного 2'-дезоксинуклеозида, прерванный одним или более модифицированными нуклеозидамй, что приводит к образованию трех субрайонов (двух участков одного или более 2'-дезоксинуклеозидов и участка одного или более прерывающих модифицированных нуклеозидов). В некоторых вариантах реализации ни один участок немодифицированных 2'-дезоксинуклеозидов не длиннее 5, 6 или 7 нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации такие короткие участки образуются за счет использования коротких гэп-областей. В некоторых вариантах реализации короткие участки образуются за счет прерывания более длинной области гэп.
В некоторых вариантах реализации гэп содержит один или более модифицированных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп содержит один или более модифицированных нуклеозидов, выбранных из cEt, FHNA, LNA и 2-тиотимидина. В некоторых вариантах реализации гэп содержит один модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации гэп содержит 5'-замещенный сахарный фрагмент, выбранный из 5'-Ме и 5'-(R)-Ме. В некоторых вариантах реализации гэп содержит два модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализации гэп содержит три модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализации гэп содержит четыре модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализации гэп содержит два или более модифицированных нуклеозидов, и каждый модифицированный нуклеозид является таким же. В некоторых вариантах реализации гэп содержит два или более модифицированных нуклеозидов, и каждый модифицированный нуклеозид является другим.
В некоторых вариантах реализации гэп содержит одну или более модифицированных связей. В некоторых вариантах реализации гэп содержит одну или более метилфосфонатных связей. В некоторых вариантах реализации гэп содержит две или более модифицированных связей. В некоторых вариантах реализации гэп содержит одну или более модифицированных связей и один или более модифицированных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп содержит одну модифицированную связь и один модифицированный
нуклеозид. В некоторых вариантах реализации гэп содержит две модифицированных связи и два или более модифицированных нуклеозидов.
b. Некоторые мотивы межнуклеозидных связей
В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат модифицированные межнуклеозидные связи, расположенные вдоль олигонуклеотида или его области определенным образом или в виде мотива модифицированной межнуклеозидной связи. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат область, имеющую мотив чередующихся межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды по настоящему описанию содержат область одинаково модифицированных межнуклеозидных связей. В некоторых таких вариантах реализации олигонуклеотид содержит область, которая равномерно связана тиофосфатными межнуклеозидными связями. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид равномерно связан тиофосфатными межнулеозидными связями. В некоторых вариантах реализации каждая межнуклеозидная связь олигонуклеотида выбран из фосфодиэфира и тиофосфата. В некоторых вариантах реализации каждая межнуклеозидная связь олигонуклеотида выбран из фосфодиэфира и тиофосфата, и по меньшей мере одна межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфат.
В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере 6 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере 7 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере 8 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере 9 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере 10 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере 11 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере 12 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере 13 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере 14 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере один блок по меньшей мере из 6 последовательных тиофосфатных межнуклеозидных связей. В
некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере один блок по меньшей мере из 7 последовательных тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере один блок по меньшей мере из 8 последовательных тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере один блок по меньшей мере из 9 последовательных тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере один блок по меньшей мере из 10 последовательных тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере один блок по меньшей мере из 12 последовательных тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых таких вариантах реализации по меньшей мере один такой блок расположен на 3'-конце олигонуклеотида. В некоторых таких вариантах реализации по меньшей мере один такой блок расположен в пределах 3 нуклеозидов 3'-конца олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 15 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 14 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 13 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 12 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 11 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 10 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 9 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 8 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 7 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 6 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 5 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
с. Некоторые мотивы модификаций азотистых оснований
В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат химические модификации азотистых оснований, расположенные вдоль олигонуклеотида или его области определенным образом или в виде мотива модификации азотистых оснований. В некоторых таких вариантах реализации модификации азотистых оснований расположены в разорванном
мотиве. В некоторых вариантах реализации модификации азотистых оснований расположены в чередующемся мотиве. В некоторых вариантах реализации каждое азотистое основание является модифицированным. В некоторых вариантах реализации ни одно из азотистых оснований не является химически модифицированным.
В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат блок модифицированных азотистых оснований. В некоторых таких вариантах реализации блок находится на 3'-конце олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации блок находится в пределах 3 нуклеотидов 3'-конца олигонуклеотида. В некоторых таких вариантах реализации блок находится на 5'-конце олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации блок находится в пределах 3 нуклеотидов 5'-конца олигонуклеотида.
В некоторых вариантах реализации модификации азотистых оснований зависят от природного основания в конкретном положении олигонуклеотида. Например, в некоторых вариантах реализации каждый пурин или каждый пиримидин в олигонуклеотиде является модифицированным. В некоторых вариантах реализации модифицированным является каждый аденин. В некоторых вариантах реализации модифицированным является каждый гуанин. В некоторых вариантах реализации модифицированным является каждый тимин. В некоторых вариантах реализации модифицированным является каждый цитозин. В некоторых вариантах реализации модифицированным является каждый урацил.
В некоторых вариантах реализации некоторые, все или никакие из цитозиновых фрагментов в олигонуклеотиде не представляют собой 5-метилцитозиновые фрагменты. В настоящем документе 5-метилцитозин не является «модифицированным азотистым основанием». Соответственно, если не указано иное, то немодифицированные азотистые основания включают как цитозиновые остатки, содержащие 5-метил, так и те, которые не содержат 5-метил. В некоторых вариантах реализации оговорено состояние метилирования всех или некоторых цитозиновых азотистых оснований.
В некоторых вариантах реализации химические модификации азотистых оснований включают присоединение некоторых конъюгирующих групп к азотистым основаниям. В некоторых вариантах реализации каждый пурин или каждый пиримидин в олигонуклеотиде может быть необязательно модифицирован так, чтобы он содержал конъюгирующую группу.
d. Некоторые общие длины
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены олигонуклеотиды любого из различных диапазонов длин. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат от X до Y связанных нуклеозидов, где X представляет собой наименьшее количество нуклеозидов в диапазоне, а Y представляет собой наибольшее количество нуклеозидов в диапазоне. В некоторых таких вариантах реализации каждый X и Y независимо выбран из 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49 и 50; при условии, что Х≤Y. Например, в некоторых вариантах реализации олигонуклеотид может состоять из 8-9, 8-10, 8-11, 8-12, 8-13, 8-14, 8-15, 8-16, 8-17, 8-18, 8-19, 8-20, 8-21, 8-22, 8-23, 8-24, 8-25, 8-26, 8-27, 8-28, 8-29, 8-30, 9-10, 9-11, 9-12, 9-13, 9-14, 9-15, 9-16, 9-17, 9-18, 9-19, 9-20, 9-21, 9-22, 9-23, 9-24, 9-25, 9-26, 9-27, 9-28, 9-29, 9-30, 10-11, 10-12, 10-13, 10-14, 10-15, 10-16, 10-17, 10-18, 10-19, 10-20, 10-21, 10-22, 10-23, 10-24, 10-25, 10-26, 10-27, 10-28, 10-29, 10-30, 11-12, 11-13, 11-14, 11-15, 11-16, 11-17, 11-18, 11-19, 11-20, 11-21, 11-22, 11-23, 11-24, 11-25, 11-26, 11-27, 11-28, 11-29, 11-30, 12-13, 12-14, 12-15, 12-16, 12-17, 12-18, 12-19, 12-20, 12-21, 12-22, 12-23, 12-24, 12-25, 12-26, 12-27, 12-28, 12-29, 12-30, 13-14, 13-15, 13-16, 13-17, 13-18, 13-19, 13-20, 13-21, 13-22, 13-23, 13-24, 13-25, 13-26, 13-27, 13-28, 13-29, 13-30, 14-15, 14-16, 14-17, 14-18, 14-19, 14-20, 14-21, 14-22, 14-23, 14-24, 14-25, 14-26, 14-27, 14-28, 14-29, 14-30, 15-16, 15-17, 15-18, 15-19, 15-20, 15-21, 15-22, 15-23, 15-24, 15-25, 15-26, 15-27, 15-28, 15-29, 15-30, 16-17, 16-18, 16-19, 16-20, 16-21, 16-22, 16-23, 16-24, 16-25, 16-26, 16-27, 16-28, 16-29, 16-30, 17-18, 17-19, 17-20, 17-21, 17-22, 17-23, 17-24, 17-25, 17-26, 17-27, 17-28, 17-29, 17-30, 18-19, 18-20, 18-21, 18-22, 18-23, 18-24, 18-25, 18-26, 18-27, 18-28, 18-29, 18-30, 19-20, 19-21, 19-22, 19-23, 19-24, 19-25, 19-26, 19-29, 19-28, 19-29, 19-30, 20-21, 20-22, 20-23, 20-24, 20-25, 20-26, 20-27, 20-28, 20-29, 20-30, 21-22, 21-23, 21-24, 21-25, 21-26, 21-27, 21-28, 21-29, 21-30, 22-23, 22-24, 22-25, 22-26, 22-27, 22-28, 22-29, 22-30, 23-24, 23-25, 23-26, 23-27, 23-28, 23-29, 23-30, 24-25, 24-26, 24-27, 24-28, 24-29, 24-30, 25-26, 25-27, 25-28, 25-29, 25-30, 26-27, 26-28, 26-29, 26-30, 27-28, 27-29, 27-30, 28-29, 28-30 или 29-30 связанных нуклеозидов. В тех вариантах реализации, в которых количество нуклеозидов в олигонуклеотиде соединения является ограниченным, либо до диапазона, либо до определенного числа, то соединение может, тем не менее, дополнительно содержать другие дополнительные заместители. Например, олигонуклеотид, содержащий 8-30 нуклеозидов, исключает олигонуклеотиды, имеющие 31 нуклзозид, но, если не указано иное, такой олигонуклеотид может дополнительно содержать, например, одну или более конъюгирующих групп, концевых групп или других заместителей.
Более того, если олигонуклеотид описан общим диапазоном длины и областями, имеющими определенную длину, и если сумма указанных длин областей меньше, чем верхняя граница диапазона общей длины, то олигонуклеотид может иметь дополнительные нуклеозиды, помимо тех, которые находятся в указанных областях, при условии, что общее количество нуклеозидов не превышает верхнюю границу диапазона общей длины.
5. Некторые химические мотивы антисмысловых олигонуклеотидов
В некоторых вариантах реализации химические структурные особенности антисмысловых олигонуклеотидов описываются их сахарным мотивом, мотивом межнуклеозидной связи, мотивом модификации азотистого основания и общей длиной. В некоторых вариантах реализации такие параметры не зависят друг от друга. Так, каждая межнуклеозидная связь олигонуклеотида, имеющий сахарный мотив гэпмера, может быть модифицированным или немодифицированным и может повторять или не повторять характер модификации сахарных модификаций гэпмера. Следовательно, межнуклеозидные связи в областях крыльев
сахара-гэпмера могут быть одинаковыми или отличными друг от друга и могут быть одинаковыми или отличными от межнуклеозидных связей области гэп. Точно так же, такие сахар-гэпмерные олигонуклеотиды могут содержать одно или более модифицированных азотистых оснований, независимо от характера сахарных модификаций гэпмера. Специалистам в данной области техники понятно, что такие мотивы могут быть комбинированы с получением множества олигонуклеотидов.
В некоторых вариантах реализации выбор межнуклеозидной связи и модификации нуклеозида не зависят друг от друга.
i. Некоторые последовательности и мишени
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены антисмысловые олигонуклеотиды, имеющие последовательность, комплементарную целевой нуклеиновой кислоте. Такие антисмысловые соединения могут гибридизоваться с целевой нуклеиновой кислотой с получением по меньшей мере одной антисмысловой активности. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения специфически гибридизуются с одной или более целевыми нуклеиновыми кислотами. В некоторых вариантах реализации специфически гибридизующееся антисмысловое соединение имеет последовательность азотистых оснований, содержащую область с достаточной комплементарностью целевой нуклеиновой кислоте для обеспечения возможности гибридизации и получению антисмысловой активности, и недостаточной комплементарностью любой нецелевой нуклеиновой кислоте для предотвращения или снижения неспецифической гибридизации с последовательностями нецелевых нуклеиновых кислот в условиях, в которых необходима специфическая гибридизация (например, в физиологических условиях для in vivo или терапевтических применений и в условиях выполнения анализов - в случае in vitro анализов). В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды являются селективными между мишенью и не мишенью, даже если мишень и не мишень содержат целевую последовательность. В таких вариантах реализации селективность может быть результатом относительной доступности целевой области одной молекулы нуклеиновой кислоты, по сравнению с другой.
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены антисмысловые соединения, содержащие олигонуклеотиды, которые полностью комплементарны целевой нуклеиновой кислоте по всей длине олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды на 99% комплементарны целевой нуклеиновой кислоте. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды на 95% комплементарны
целевой нуклеиновой кислоте. В некоторых вариантах реализации такие олигонуклеотиды на 90% комплементарны целевой нуклеиновой кислоте.
В некоторых вариантах реализации такие олигонуклеотиды на 85% комплементарны целевой нуклеиновой кислоте. В некоторых вариантах реализации такие олигонуклеотиды на 80% комплементарны целевой нуклеиновой кислоте. В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение содержит область, которая полностью комплементарна целевой нуклеиновой кислоте, и по меньшей мере на 80% комплементарно целевой нуклеиновой кислоте по всей длине олигонуклеотида. В некоторых таких вариантах реализации область полной комплементарности имеет от 6 до 14 нуклеозидов в длину.
В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат область гибридизации и концевую область. В некоторых таких вариантах реализации область гибридизации состоит из 12-30 связанных нуклеозидов и полностью комплементарна целевой нуклеиновой кислоте. В некоторых вариантах реализации область гибридизации содержит одно несоответствие в сравнении с целевой нуклеиновой кислотой. В некоторых вариантах реализации область гибридизации содержит два несоответствия в сравнении с целевой нуклеиновой кислотой. В некоторых вариантах реализации область гибридизации содержит три несоответствия в сравнении с целевой нуклеиновой кислотой. В некоторых вариантах реализации концевая область состоит из 1-4 концевых нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации концевые нуклеозиды находятся на 3'-конце. В некоторых вариантах реализации один или более концевых нуклеозидов не комплементарны целевой нуклеиновой кислоте.
Антисмысловые механизмы включают любой механизм, затрагивающий гибридизацию олигонуклеотида с целевой нуклеиновой кислотой, при этом гибридизация приводит к биологическому эффекту. В некоторых вариантах реализации такая гибридизация приводит либо к разрушению, либо к применению целевой нуклеиновой кислоты с сопутствующим подавлением или стимулированием клеточного механизма, затрагивающего, например, трансляцию, транскрипцию или сплайсинг целевой нуклеиновой кислоты.
Один из типов антисмыслового механизма, затрагивающий разрушение целевой РНК представляет собой антисмысл, опосредованный РНКазой Н. РНКаза Н представляет собой клеточную эндонуклеазу, которая расщепляет спираль РНК дуплекса РНК:ДНК. В данной области техники известно, что односпиральные антисмысловые соединения, которые являются «ДНК-подобными», вызывают активность РНКазы Н в клетках млекопитающих.
Следовательно, активация РНКазы Н приводит к расщеплению РНК-мишени, посредством этого в значительной степени усиливая эффективность подавления генной экспрессии, опосредованного ДНК-подобным олигонуклеотидом.
В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит расщепляемый фрагмент. В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит одну или более расщепляемых связей. В некоторых вариантах реализаций конъюгирующая группа содержит линкер. В некоторых вариантах реализации линкер содержит белковый связывающий фрагмент. В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит фрагмент, нацеливающий на клетку (упоминаемый также как группа, нацеливающая на клетку). В некоторых вариантах реализации фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит группу ветвления. В некоторых вариантах реализации фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит одну или более связок. В некоторых вариантах реализации фрагмент, нацеливающий на клетку, содержит углевод или углеводный кластер.
ii. Некоторые расщепляемые фрагменты
В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент представляет собой расщепляемую связь. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент содержит расщепляемую связь. В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа содержит расщепляемый фрагмент. В некоторых таких вариантах реализации расщепляемый фрагмент присоединяется к антисмысловому олигонуклеотиду. В некоторых таких вариантах реализации расщепляемый фрагмент присоединяется непосредственно к фрагменту, нацеливающему на клетку. В некоторых таких вариантах реализации расщепляемый фрагмент присоединяется к конъюгирующему линкеру. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент содержит фосфат или фосфодиэфир. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент представляет собой расщепляемый нуклеозид или нуклеозидный аналог. В некоторых вариантах реализации нуклеозид или нуклеозидный аналог содержит необязательно защищенное гетероциклическое основание, выбранное из пурина, замещенного пурина, пиримидина или замещенного пиримидина. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент представляет собой нуклеозид, содержащий необязательно защищенное гетероциклическое основание, выбранное из урацила, тимина, цитозина, 4-N-бензоилцитозина, 5-метилцитозина, 4-N-бензоил-5-метилцитозина, аденина, 6-N-бензоиладенина, гуанина и 2-N-изобутирилгуанина. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент представляет собой 2'-дезоксинуклеозид, который присоединен к
3'-положению антисмыслового олигонуклеотида фосфодиэфирной связью и присоединен к линкеру фосфодиэфирной или тиофосфатной связью. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент представляет собой 2'-дезоксиаденозин, который присоединен к 3'-положению антисмыслового олигонуклеотида фосфодиэфирной связью и присоединен к линкеру фосфодиэфирной или тиофосфатной связью. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент представляет собой 2'-дезоксиаденозин, который присоединен к 3'-положению антисмыслового олигонуклеотида фосфодиэфирной связью и присоединен к линкеру фосфодиэфирной связью.
В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент присоединен к 3'-положению антисмыслового олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент присоединен к 5'-положению антисмыслового олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент присоединен к 2'-положению антисмыслового олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент присоединен к антисмысловому олигонуклеотиду фосфодиэфирной связью. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент присоединен к указанному линкеру либо фосфодиэфирной, либо тиофосфатной связью. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент присоединен к указанному линкеру фосфодиэфирной связью. В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа не содержит расщепляемый фрагмент.
В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент расщепляется после введения указанного комплекса животному только после его поглощения целевой клеткой. Внутри клетки расщепляемый фрагмент расщепляется, высвобождая таким образом активный антисмысловый олигонуклеотид. Не ограничиваясь теорией, предполагается, что расщепляемый фрагмент расщепляется под действием одной или более нуклеаз внутри клетки. В некоторых вариантах реализации одна или более нуклеаз расщепляют фосфодиэфирную связь между расщепляемым фрагментом и линкером. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент имеет структуру, выбранную из следующих:
Figure 00000214
и
Figure 00000215
где каждый из Вх, Вх1, Вх2 и Вх3 независимо представляет собой фрагмент гетероциклического основания. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент имеет структуру, выбранную из следующих:
Figure 00000216
iii. Некоторые линкеры
В некоторых вариантах реализации конъюгирующие группы содержат линкер. В некоторых таких вариантах реализации линкер ковалентно связан с расщепляемым фрагментом. В некоторых таких вариантах реализации линкер ковалентно связан с антисмысловым олигонуклеотидом. В некоторых вариантах реализации линкер ковалентно связан с фрагментом, нацеливающим на клетку. В некоторых вариантах реализации линкер дополнительно содержит ковалентное присоединение к твердой подложке. В некоторых вариантах реализации линкер дополнительно содержит ковалентное присоединение к белковому связывающему фрагменту. В некоторых вариантах реализации линкер дополнительно содержит ковалентное присоединение к твердой подложке и дополнительно содержит ковалентное присоединение к белковому связывающему фрагменту. В некоторых
вариантах реализации линкер содержит несколько положений для присоединения связанных лигандов. В некоторых вариантах реализации линкер содержит несколько положений для присоединения связанных лигандов и не присоединен к группе ветвления. В некоторых вариантах реализации линкер дополнительно содержит одну или более расщепляемых связей. В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа не содержит линкер.
В некоторых вариантах реализации линкер содержит по меньшей мере одну. линейную группу, содержащую группы, выбранные из алкильных, амидных, дисульфидных, полиэтиленгликолевых, тиоэфирных (-S-) и гидроксиламино (-О-N(Н)-) групп. В некоторых вариантах реализации линейная группа содержит группы, выбранные из алкильных, амидных и простых эфирных групп. В некоторых вариантах реализации линейная группа содержит группы, выбранные из алкильных и простых эфирных групп. В некоторых вариантах реализации линейная группа содержит по меньшей мере одну фосфорную связывающую группу. В некоторых вариантах реализации линейная группа содержит по меньшей мере одну фосфодиэфирную группу. В некоторых вариантах реализации линейная группа содержит по меньшей мере одну нейтральную связывающую группу. В некоторых вариантах реализации линейная группа ковалентно присоединена к фрагменту, нацеливающему на клетку, и к расщепляемому фрагменту. В некоторых вариантах реализации линейная группа ковалентно присоединена к фрагменту, нацеливающему на клетку, и к антисмысловому олигонуклеотиду. В некоторых вариантах реализации линейная группа ковалентно присоединена к фрагменту, нацеливающему на клетку, к расщепляемому фрагменту и к твердой подложке. В некоторых вариантах реализации линейная группа ковалентно присоединена к фрагменту, нацеливающему на клетку, к расщепляемому фрагменту, к твердой подложке и к белковому связывающему фрагменту. В некоторых вариантах реализации линейная группа содержит одну или более расщепляемых связей.
В некоторых вариантах реализации линкер содержит линейную группу, ковалентно присоединенную к группе скелета. В некоторых вариантах реализации скелет содержит разветвленную алифатическую группу, которая содержит группы, выбранные из алкильных, амидных, дисульфидных, полиэтиленгликолевых, простых эфирных, тиоэфирных и гидроксиламино-групп. В некоторых вариантах реализации скелет содержит разветвленную алифатическую группу, которая содержит группы, выбранные из алкильных, амидных и простых эфирных групп. В некоторых вариантах реализации скелет содержит по меньшей мере одну моно- или полициклическую кольцевую систему. В некоторых вариантах
реализации скелет содержит по меньшей мере две моно- или полициклические кольцевые системы. В некоторых вариантах реализации линейная группа ковалентно присоединена к группе скелета, а группа скелета ковалентно присоединена к расщепляемому фрагменту и линкеру. В некоторых вариантах реализации линейная группа ковалентно присоединена к группе скелета, а группа скелета ковалентно присоединена к расщепляемому фрагменту, линкеру и твердой подложке. В некоторых вариантах реализации линейная группа ковалентно присоединена к группе скелета, а группа скелета ковалентно присоединена к расщепляемому фрагменту, линкеру и белковому связывающему фрагменту. В некоторых вариантах реализации линейная группа ковалентно присоединена к группе скелета, а группа скелета ковалентно присоединена к расщепляемому фрагменту, линкеру, белковому связывающему фрагменту и твердой подложке. В некоторых вариантах реализации группа скелета содержит одну или более расщепляемых связей.
В некоторых вариантах реализации линкер содержит белковый связывающий фрагмент. В некоторых вариантах реализации белковый связывающий фрагмент представляет собой липид, такой как, например, включая, но не ограничиваясь ими, холестерин, холевая кислота, адамантан-уксусная кислота, 1-пирен-масляная кислота, дигидротестостерон, 1,3-бис-O(гексадецил)глицерин, геранилоксигексиловая группа, гексадецилглицерин, борнеол, ментол, 1,3-пропандиол, гептадециловая группа, пальмитиновая кислота, миристиновая кислота, O3-(олеоил)литохолевая кислота, О3-(олеоил)холеновая кислота, диметокситритил или феноксазин, витамин (например, фолат, витамин А, витамин Е, биотин, пиридоксаль), пептид, углевод (например, моносахарид, дисахарид, трисахарид, тетрасахарид, олигосахарид, полисахарид), эндосомолитический компонент, стероид (например, уваол, гецигенин, диосгенин), терпен (например, тритерпен, например, сарсасапогенин, фриделин, литохолевая кислота, дериватизованная эпифриделанолом) или катионный липид. В некоторых вариантах реализации белковый связывающий фрагмент представляет собой насыщенную или ненасыщенную жирную кислоту с длиной цепи от С16 до С22, холестерин, холевую кислоту, витамин Е, адамантан или 1-пентафторпропил.
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000217
Figure 00000218
Figure 00000219
и
Figure 00000220
где каждый n независимо равен от 1 до 20; и р равен от 1 до 6.
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000221
Figure 00000222
Figure 00000223
и
Figure 00000224
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000225
Figure 00000226
Figure 00000227
Figure 00000228
Figure 00000229
и
Figure 00000230
где n равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000231
Figure 00000232
Figure 00000233
Figure 00000234
Figure 00000235
Figure 00000236
Figure 00000237
и
Figure 00000238
где каждый L независимо представляет собой фосфорную связывающую группу или нейтральную связывающую группу; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000239
Figure 00000240
Figure 00000241
и
Figure 00000242
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000243
Figure 00000244
Figure 00000245
Figure 00000246
Figure 00000247
и
Figure 00000248
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000249
Figure 00000250
Figure 00000251
Figure 00000252
Figure 00000253
Figure 00000254
Figure 00000255
Figure 00000256
и
Figure 00000257
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000258
и
Figure 00000259
где n равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000260
и
Figure 00000261
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000262
и
Figure 00000263
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000264
и
Figure 00000265
В некоторых вариантах реализации конъюгирующий линкер имеет структуру:
Figure 00000266
В некоторых вариантах реализации конъюгирующий линкер имеет структуру:
Figure 00000267
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000268
и
Figure 00000269
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000270
и
Figure 00000271
где каждый n независимо равен 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6 или 7.
iv. Некоторые фрагменты, нацеливающие на клетку
В некоторых вариантах реализации конъюгирующие группы содержат фрагменты, нацеливающие на клетку. Некоторые такие фрагменты, нацеливающие на клетку, увеличивают клеточный захват антисмысловых соединений. В некоторых вариантах реализации фрагменты, нацеливающие на клетку, содержат группу ветвления, одну или более связок и один или более лигандов. В некоторых вариантах реализации фрагменты, нацеливающие на клетку, содержат группу ветвления, одну или более связок, один или более лигандов и одну или более расщепляемых связей.
1. Некоторые группы ветвления
В некоторых вариантах реализации конъюгирующие группы содержат нацеливающий фрагмент, содержащий группу ветвления и по меньшей мере два связанных лиганда. В некоторых вариантах реализации группа ветвления присоединяет конъюгирующий линкер. В некоторых вариантах реализации группа ветвления присоединяет расщепляемый фрагмент. В некоторых вариантах реализации группа ветвления присоединяет антисмысловый олигонуклеотид. В некоторых вариантах реализации группа ветвления ковалентно присоединена к линкеру и каждому из связанных лигандов. В некоторых вариантах реализации группа ветвления содержит разветвленную алифатическую группу, которая содержит группы, выбранные из алкильных, амидных, дисульфидных, полиэтиленгликолевых, простых эфирных, тиоэфирных и гидроксиламино-групп. В некоторых вариантах реализации группа ветвления содержит группы, выбранные из алкильных, амидных и простых эфирных групп. В некоторых вариантах реализации группа ветвления содержит группы, выбранные из алкильных и простых эфирных групп. В некоторых вариантах реализации группа ветвления содержит моно- или полициклическую кольцевую систему. В некоторых вариантах реализации группа ветвления содержит одну или
более расщепляемых связей. В некоторых вариантах реализации конъюгирующая группа не содержит группу ветвления.
В некоторых вариантах реализации группа ветвления имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000272
Figure 00000273
Figure 00000274
Figure 00000275
Figure 00000276
; и
Figure 00000277
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
j равен от 1 до 3; и
m равен от 2 до 6.
В некоторых вариантах реализации группа ветвления имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000278
Figure 00000279
Figure 00000280
и
где каждый n независимо равен от 1 до 20; и
m равен от 2 до 6.
В некоторых вариантах реализации группа ветвления имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000281
Figure 00000282
;
Figure 00000283
и
Figure 00000284
.
В некоторых вариантах реализации группа ветвления имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000285
и
Figure 00000286
где каждый А1 независимо представляет собой О, S, С=O или NH; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации группа ветвления имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000287
и
Figure 00000288
где каждый А1 независимо представляет собой О, S, С=O или NH; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации группа ветвления имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000289
и
Figure 00000290
где А1 представляет собой О, S, С=O или NH; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации группа ветвления имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000291
В некоторых вариантах реализации группа ветвления имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000292
В некоторых вариантах реализации группа ветвления имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000293
2. Некоторые связки
В некоторых вариантах реализации конъюгирующие группы содержат одну или более связок, ковалентно присоединенных к группе ветвления. В некоторых вариантах реализации конъюгирующие группы содержат одну или более связок, ковалентно присоединенных к связывающей группе. В некоторых вариантах реализации каждая связка представляет собой линейную алифатическую группу, содержащую одну или более групп, выбранных из алкильных, простых эфирных, тиоэфирных, дисульфидных, амидных и полиэтиленгликолевых групп в любой комбинации. В некоторых вариантах реализации каждая связка представляет собой линейную алифатическую группу, содержащую одну или более групп, выбранных из алкильных, замещенных алкильных, простых эфирных, тиоэфирных, дисульфидных, амидных, фосфодиэфирных и полиэтиленгликолевых групп в любой комбинации. В некоторых вариантах реализации каждая связка представляет собой линейную алифатическую группу, содержащую одну или более групп, выбранных из алкильных, простых эфирных и амидных групп в любой комбинации. В некоторых вариантах реализации каждая связка представляет собой линейную алифатическую группу, содержащую одну или более групп, выбранных из алкильных, замещенных алкильных, фосфодиэфирных, простых эфирных и амидных групп в любой комбинации. В некоторых вариантах реализации каждая связка представляет собой линейную алифатическую группу, содержащую одну или более групп, выбранных из алкила и фосфодиэфира в любой комбинации. В некоторых вариантах реализации каждая связка содержит по меньшей мере одну фосфорную связывающую группу или нейтральную связывающую группу.
В некоторых вариантах реализации связка содержит одну или более расщепляемых связей. В некоторых вариантах реализации связка присоединена к группе ветвления через амидную или простую эфирную группу. В некоторых вариантах реализации связка присоединена к группе ветвления через фосфордиэфирную группу. В некоторых вариантах реализации связка присоединена к группе ветвления через фосфорную связывающую группу или через нейтральную связывающую группу. В некоторых вариантах реализации связка присоединена к группе ветвления через простую эфирную группу. В некоторых вариантах
реализации связка присоединена к лиганду либо через амидную, либо через простую эфирную группу. В некоторых вариантах реализации связка присоединена к лиганду через простую эфирную группу. В некоторых вариантах реализации связка присоединена к лиганду либо через амидную, либо через простую эфирную группу. В некоторых вариантах реализации связка присоединена к лиганду через простую эфирную группу.
В некоторых вариантах реализации каждая связка имеет длину от около 8 до около 20 атомов в цепи между лигандом и группой ветвления. В некоторых вариантах реализации каждая связка имеет длину от около 10 до около 18 атомов в цепи между лигандом и группой ветвления. В некоторых вариантах реализации каждая связка имеет длину около 13 атомов в цепи.
В некоторых вариантах реализации связка имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000294
Figure 00000295
Figure 00000296
Figure 00000297
и
Figure 00000298
где каждый n независимо равен от 1 до 20; и
каждый р равен от 1 до около 6.
В некоторых вариантах реализации связка имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000299
Figure 00000300
и
Figure 00000301
В некоторых вариантах реализации связка имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000302
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации связка имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000303
и
Figure 00000304
где L представляет собой либо фосфорную связывающую группу, либо нейтральную связывающую группу;
Z1 представляет собой С(=O)O-R2;
Z2 представляет собой Н, С16 алкил или замещенный С16 алкил;
R2 представляет собой Н, С16 алкил или замещенный С16 алкил; и
каждый m1 независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m1 больше 0 для каждой связки.
В некоторых вариантах реализации связка имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000305
В некоторых вариантах реализации связка имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000306
и
Figure 00000307
где Z2 представляет собой Н или СН3; и
каждый m1 независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m1 больше 0 для каждой связки.
В некоторых вариантах реализации связка имеет структуру, выбранную из:
Figure 00000308
или
Figure 00000309
; где каждый n независимо равен 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6 или 7.
В некоторых вариантах реализации связка содержит фосфорную связывающую группу. В некоторых вариантах реализации связка не содержит ни одной амидной связи. В некоторых вариантах реализации связка содержит фосфорную связывающую группу и не содержит ни одной амидной связи.
3. Некоторые лиганды
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены лиганды, при этом каждый лиганд ковалентно присоединен к связке. В некоторых вариантах реализации каждый лиганд выбран так, чтобы он обладал аффинностью по меньшей мере к одному типу рецептора на клетке-мишени. В некоторых вариантах реализации лиганды выбраны так, чтобы они обладали аффинностью по меньшей мере к одному типу рецептора на поверхности клетки печени млекопитающего. В некоторых вариантах реализации лиганды выбраны так, чтобы они обладали аффинностью к печеночному асиалогликопротеиновому рецептору (ASGP-R). В некоторых вариантах реализации каждый лиганд представляет собой углевод. В некоторых вариантах реализации каждый лиганд независимо выбран из галактозы, 14-ацетилгалактозамина, маннозы, глюкозы, глюкозамина и фукозы. В некоторых вариантах реализации каждый лиганд представляет собой N-ацетилгалактозамин (GalNAc). В некоторых вариантах реализации нацеливающий фрагмент содержит 2-6 лигандов. В некоторых вариантах реализации нацеливающий фрагмент содержит 3 лиганда. В некоторых вариантах реализации нацеливающий фрагмент содержит 3 N-ацетилгалактозаминовых лиганда.
В некоторых вариантах реализации лиганд представляет собой углевод, углеводное производное, модифицированный углевод, поливалентный углеводный кластер, полисахарид, модифицированный полисахарид или полисахаридное производное. В некоторых вариантах
реализации лиганд представляет собой аминосахар или тиосахар. Например, аминосахара могут быть выбраны из любого количества соединений, известных в данной области техники, например, глюкозамина, сиаловой кислоты, α-D-галактозамина, N-ацетилгалактозамина, 2-ацетамидо-2-дезокси-D-галактопиранозы (GalNAc), 2-амино-3-O-[(R)-1-карбоксиэтил]-2-дезокси-β-D-глюкопиранозы (β-мурамовой кислоты), 2-дезокси-2-метиламино-L-глюкопиранозы, 4,6-дидезокси-4-формамидо-2,3-ди-O-метил-D-маннопиранозы, 2-дезокси-2-сульфоамино-D-глюкопиранозы и N-сульфо-D-глюкозамина, и N-гликолоил-α-нейраминовой кислоты. Например, тиосахара могут быть выбраны из группы, состоящей из 5-тио-β-D-глюкопиранозы, метил 2,3,4-три-O-ацетил-1-тио-6-O-тритил-α-D-глюкопиранозида, 4-тио-β-D-галактопиранозы и этил 3,4,6,7-тетра-O-ацетил-2-дезокси-1,5-дитио-α-D-глюко-гептопиранозида.
В некоторых вариантах реализации «GalNAc» или «Gal-NAc» относится к 2-(ацетиламино)-2-дезокси-D-галактопиранозе, обычно упоминаемой в литературе как N-ацетилгалактозамин. В некоторых вариантах реализации «N-ацетилгалактозамин» относится к 2-(ацетиламино)-2-дезокси-D-галактопиранозе. В некоторых вариантах реализации «GalNAc» или «Gal-NAc» относится к 2-(ацетиламино)-2-дезокси-D-галактопиранозе. В некоторых вариантах реализации «GalNAc» или «Gal-NAc» относится к 2-(ацетиламино)-2-дезокси-D-галактопиранозе, которая включает и β-форму: 2-(ацетиламино)-2-дезокси-β-D-галактопиранозу, и α-форму: 2-(ацетиламино)-2-дезокси-D-галактопиранозу: В некоторых вариантах реализации обе формы, β-форма: 2-(ацетиламино)-2-дезокси-β-D-галактопираноза, и α-форма: 2-(ацетиламино)-2-дезокси-D-галактопираноза, могут быть использованы взаимозаменяемо. Соответственно, в структурах, в которых изображена одна форма, подразумевается, что эти структуры включают также и другую форму. Например, если показана структура для α-формы: 2-(ацетиламино)-2-дезокси-D-галактопиранозы, то подразумевается, что эта структура включает также и другую форму. В некоторых предпочтительных вариантах реализации β-форма 2-(ацетиламино)-2-дезокси-D-галактопиранозы является предпочтительным вариантом реализации.
Figure 00000310
2-(Ацетиламино)-2-дезокси-D-галактопираноза
Figure 00000311
2-(Ацетиламино)-2-дезокси-β-D-галактопираноза
Figure 00000312
2-(Ацетиламино)-2-дезокси-α-D-галактопираноза
В некоторых вариантах один или более лигандов имеют структуру, выбранную из:
Figure 00000313
и
Figure 00000314
где каждый R1 выбран из OH и NHCOOH.
В некоторых вариантах один или более лигандов имеют структуру, выбранную из:
Figure 00000315
Figure 00000316
и
Figure 00000317
В некоторых вариантах один или более лигандов имеют структуру, выбранную из:
Figure 00000318
В некоторых вариантах один или более лигандов имеют структуру, выбранную из:
Figure 00000319
i. Некоторые конъюгаты
В некоторых вариантах реализации конъюгирующие группы содержат структурные особенности, представленные выше. В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000320
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000321
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000322
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
Z представляет собой Н или связанную твердую подложку;
Q представляет собой антисмысловое соединение;
X представляет собой О или S; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000323
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000324
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000325
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000326
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000327
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000328
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000329
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000330
В некоторых вариантах реализации конъюгаты не содержат пирролидин.
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000331
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000332
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000333
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000334
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000335
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000336
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000337
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000338
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000339
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000340
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующие группы имеют следующую структуру:
Figure 00000341
В некоторых вариантах реализации фрагмент конъюгирующей группы, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000342
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из шести-одиннадцати последовательно связанных атомов.
В некоторых вариантах реализации фрагмент конъюгирующей группы, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000343
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из десяти последовательно связанных атомов.
В некоторых вариантах реализации фрагмент конъюгирующей группы, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000344
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из четырех-одиннадцати последовательно связанных атомов, и при этом указанная связка содержит только одну амидную связь.
В некоторых вариантах реализации фрагмент конъюгирующей группы, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000345
где Y и Z независимо выбраны из С112 замещенной или незамещенной алкильной, алкенильной или алкинильной группы или группы, содержащей эфир, кетон, амид, сложный эфир, карбамат, амин, пиперидин, фосфат, фосфодиэфир, тиофосфат, триазол, пирролидин, дисульфид или тиоэфир.
В некоторых таких вариантах реализации фрагмент конъюгирующей группы, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000346
где Y и Z независимо выбраны из С112 замещенной или незамещенной алкильной группы или группы, содержащей только один эфир или только два эфира, амид, амин, пиперидин, фосфат, фосфодиэфир или тиофосфат.
В некоторых таких вариантах реализации фрагмент конъюгирующей группы, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000347
где Y и Z независимо выбраны из С112 замещенной или незамещенной алкильной группы.
В некоторых таких вариантах реализации фрагмент конъюгирующей группы, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000348
где тип независимо выбраны из 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 и 12.
В некоторых таких вариантах реализации фрагмент конъюгирующей группы, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000349
где m равен 4, 5, 6, 7 или 8, и n равен 1, 2, 3 или 4.
В некоторых вариантах реализации фрагмент конъюгирующей группы, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000350
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из четырех-тринадцати последовательно связанных атомов, и при этом X не содержит эфирную группу.
В некоторых вариантах реализации фрагмент конъюгирующей группы, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000351
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из восьми последовательно связанных атомов, и при этом X не содержит простую эфирную группу.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент конъюгирующей группы, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000352
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из от четырех до тринадцати последовательно связанных атомов, и при этом указанная связка содержит толькс одну амидную связь, и X не содержит простую эфирную группу.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент конъюгирующей группы, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000353
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из от четырех до тринадцати последовательно связанных атомов, и при этом указанная связка состоит из амидной связи и замещенной или незамещенной С211 алкильной группы.
В некоторых вариантах реализации изобретения фрагмент конъюгирующей группы, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000354
где Y выбран из С112 замещенной или незамещенной алкильной, алкенильной или алкинильной группы или группы, содержащей простой эфир, кетон, амид, сложный эфир, карбамат, амин, пиперидин, фосфат, фосфодиэфир, тиофосфат, триазол, пирролидин, дисульфид или тиоэфир.
В некоторых таких вариантах реализации изобретения фрагмент конъюгирующей группы, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000355
где Y выбран из С112 замещенной или незамещенной алкильной группы или группы, содержащей простой эфир, амин, пиперидин, фосфат, фосфодиэфир или тиофосфат.
В некоторых таких вариантах реализации изобретения фрагмент конъюгирующей группы, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000356
где Y выбран из С112 замещенной или незамещенной алкильной группы.
В некоторых таких вариантах реализации изобретения фрагмент конъюгирующей группы, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000357
где n равен 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12.
В некоторых таких вариантах реализации изобретения фрагмент конъюгирующей группы, нацеливающий на клетку, имеет следующую структуру:
Figure 00000358
где n равен 4, 5, 6, 7 или 8.
b. Некоторые конъюгированные антисмысловые соединения
В некоторых вариантах реализации конъюгаты связаны с нуклеозидом антисмыслового олигонуклеотида в 2', 3' или 5' положении нуклеозида. В некоторых вариантах реализации конъюгированное антисмысловое соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000359
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
В представляет собой расщепляемый фрагмент
С представляет собой конъюгирующий линкер
D представляет собой группу ветвления
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых вариантах реализации конъюгированное антисмысловое соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000360
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
С представляет собой конъюгирующий линкер
D представляет собой группу ветвления
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующий линкер содержит по меньшей мере одну расщепляемую связь.
В некоторых таких вариантах реализации группа ветвления содержит по меньшей мере одну расщепляемую связь.
В некоторых вариантах реализации каждая связка содержит по меньшей мере одну расщепляемую связь.
В некоторых вариантах реализации конъюгаты связаны с нуклеозидом антисмыслового олигонуклеотида в 2', 3' или 5' положении нуклеозида.
В некоторых вариантах реализации конъюгированное антисмысловое соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000361
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
В представляет собой расщепляемый фрагмент
С представляет собой конъюгирующий линкер
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых вариантах реализации конъюгаты связаны с нуклеозидом антисмыслового олигонуклеотида в 2', 3' или 5' положении нуклеозида. В некоторых вариантах реализаиии конъюгированное антисмысловое соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000362
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
С представляет собой конъюгирующий линкер
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых вариантах реализации конъюгированное антисмысловое соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000363
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
В представляет собой расщепляемый фрагмент
D представляет собой группу ветвления
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых вариантах реализации конъюгированное антисмысловое соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000364
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
D представляет собой группу ветвления
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых таких вариантах реализации конъюгирующий линкер содержит по меньшей мере одну расщепляемую связь.
В некоторых вариантах реализации каждая связка содержит по меньшей мере одну расщепляемую связь.
В некоторых вариантах реализации конъюгированное антисмысловое соединение имеет структуру, выбранную из следующих:
Figure 00000365
В некоторых вариантах реализации конъюгированное антисмысловое соединение имеет структуру, выбранную из следующих:
Figure 00000366
В некоторых вариантах реализации конъюгированное антисмысловое соединение имеет структуру, выбранную из следующих:
Figure 00000367
В некоторых вариантах реализации конъюгированное антисмысловое соединение имеет следующую структуру:
Figure 00000368
Типичные патенты Соединенных штатов Америки, публикации патентных заявок Соединенных штатов Америки и публикации международных патентных заявок, в которых описано получение некоторых из указанных выше конъюгатов, конъюгированных антисмысловых соединений, связок, линкеров, групп ветвления, лигандов, расщепляемых фрагментов, а также других модификаций, включают, без ограничения, US 5994517, US 6300319, US 6660720, US 6906182, US 7262177, US 7491805, US 8106022, US 7723509, US 2006/0148740, US 2011/0123520, WO 2013/033230 и WO 2012/037254, каждая из которых включена в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме.
Типичные публикации, в которых описано получение некоторых из указанных выше конъюгатов, конъюгированных антисмысловых соединений, связок, линкеров, групп ветвления, лигандов, расщепляемых фрагментов, а также других модификаций, включают, без ограничения, BIESSEN et al., "The Cholesterol Derivative of a Triantennary Galactoside with High Affinity for the Hepatic Asialoglycoprotein Receptor: a Potent Cholesterol Lowering Agent" J. Med. Chem. (1995) 38:1846-1852, BIESSEN et al., "Synthesis of Cluster Galactosides with High Affinity for the Hepatic Asialoglycoprotein Receptor" J. Med. Chem. (1995) 38:1538-1546, LEE et al., "New and more efficient multivalent glyco-ligands for asialoglycoprotein receptor of mammalian hepatocytes" Bioorganic & Medicinal Chemistry (2011) 19:2494-2500, RENSEN et al., "Determination of the Upper Size Limit for Uptake and Processing of Ligands by the Asialoglycoprotein Receptor on Hepatocytes in Vitro and in Vivo" J. Biol. Chem. (2001) 276(40):37577-37584, RENSEN et al., "Design and Synthesis of Novel N-Acetylgalactosamine-Terminated Glycolipids for Targeting of Lipoproteins to the Hepatic Asialoglycoprotein Receptor" J. Med. Chem. (2004) 47:5798-5808, SLIEDREGT et al., "Design and Synthesis of Novel Amphiphilic Dendritic Galactosides for Selective Targeting of Liposomes to the Hepatic Asialoglycoprotein Receptor" J. Med. Chem. (1999) 42:609-618 и Valentijn et al., "Solid-phase synthesis of lysine-based cluster galactosides with high affinity for the Asialoglycoprotein Receptor" Tetrahedron, 1997, 53(2), 759-770, каждая из которых включена в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме.
В некоторых вариантах реализации конъюгированные антисмысловые соединения содержат олигонуклеотид на основе РНКазы Н (такой как гэпмер) или сплайс-модулирующий олигонуклеотид (такой как полностью модифицированный олигонуклеотид) и любую конъюгирующую группу, содержащую по меньшей мере одну, две или три группы GalNAc. В некоторых вариантах реализации конъюгированное антисмысловое Соединение содержит любую конъюгирующую группу, представленную в следующих ссылках: Lee, Carbohydr Res, 1978, 67, 509-514; Connolly et al., J Biol Chem, 1982, 257, 939-945; Pavia et al., Int J Pep Protein Res, 1983, 22, 539-548; Lee et al., Biochem, 1984, 23, 4255-4261; Lee et al., Glycoconjugate J, 1987, 4, 317-328; Toyokuni et al., Tetrahedron Lett, 1990, 31, 2673-2676; Biessen et al., J Med Chem, 1995, 38, 1538-1546; Valentijn et al., Tetrahedron, 1997, 53, 759-770; Kim et al., Tetrahedron Lett, 1997, 38, 3487-3490; Lee et al., Bioconjug Chem, 1997, 8, 762-765; Kato et al., Glycobiol, 2001, 11, 821-829; Rensen et al., J Biol Chem, 2001, 276, 37577-37584; Lee et al., Methods Enzymol, 2003, 362, 38-43; Westerlind et al., Glycoconj J, 2004, 21, 227-241; Lee et
al., Bioorg Med Chem Lett, 2006, 16(19), 5132-5135; Maierhofer et al., Bioorg Med Cherrt, 2007, 15, 7661-7676; Khorev et al., Bioorg Med Chem, 2008, 16, 5216-5231; Lee et al., Bidorg Med Chem, 2011, 19, 2494-2500; Kornilova et al., Analyt Biochem, 2012, 425, 43-46; Pujol et al., Angew Chemie Int Ed Engl, 2012, 51, 7445-7448; Biessen et al., J Med Chem, 1995, 38, 1846-1852; Sliedregt et al., J Med Chem, 1999, 42, 609-618; Rensen et al., J Med Chem, 2004, 47, 5798-5808; Rensen et al., Arterioscler Thromb Vasc Biol, 2006, 26, 169-175; van Rossenberg et al., Gene Ther, 2004, 11, 457-464; Sato et al., J Am Chem Soc, 2004, 126, 14013-14022; Lee et al., J Org Chem, 2012, 77, 7564-7571; Biessen et al., FASEB J, 2000, 14, 1784-1792; Rajur et al., Bioconjug Chem, 1997, 8, 935-940; Duff et al., Methods Enzymol, 2000, 313, 297-321; Maier et al., Bioconjug Chem, 2003, 14, 18-29; Jayaprakash et al., Org Lett, 2010, 12, 5410-5413; Manoharan, Antisense Nucleic Acid Drug Dev, 2002, 12, 103-128; Merwin et al., Bioconjug Chem, 1994, 5, 612-620; Tomiya et al., Bioorg Med Chem, 2013, 21, 5275-5281; Международные заявки WO 1998/013381; WO 2011/038356; WO 1997/046098; WO 2008/098788; WO 2004/101619; WO 2012/037254; WO 2011/120053; WO 2011/100131; WO 2011/163121; WO 2012/177947; WO 2013/033230; WO 2013/075035; WO 2012/083185; WO 2012/083046; WO 2009/082607; WO 2009/134487; WO 2010/144740; WO 2010/148013; WO 1997/020563; WO 2010/088537; WO 2002/043771; WO 2010/129709; WO 2012/068187; WO 2009/126933; WO 2004/024757; WO2010/054406; WO 2012/089352; WO 2012/089602; WO 2013/166121; WO 2013/165816; патенты США 4751219; 8552163; 6908903; 7262177; 5994517; 6300319; 8106022; 7491805; 7491805; 7582744; 8137695; 6383812;6525031; 6660720; 7723509; 8541548; 8344125; 8313772; 8349308; 8450467; 8501930; 8158601; 7262177; 6906182; 6620916; 8435491; 8404862; 7851615; опубликованные заявки на патент США US 2011/0097264; US 2011/0097265; US 2013/0004427; US 2005/0164235; US 2006/0148740; US 2008/0281044; US 2010/0240730; US 2003/0119724; US 2006/0183886; US 2008/0206869; US 2011/0269814; US 2009/0286973; US 2011/0207799; US 2012/0136042; US 2012/0165393; US 2008/0281041; US 2009/0203135; US 2012/0035115; US 2012/0095075; US 2012/0101148; US 2012/0128760; US 2012/0157509; US 2012/0230938; US 2013/0109817; US 2013/0121954; US 2013/0178512; US 2013/0236968; US 2011/0123520; US 2003/0077829; US 2008/0108801; и US 2009/0203132; каждая из которых включена посредством ссылки в полном объеме.
С. Некоторые применения и особенности
В некоторых вариантах реализации конъюгированные антисмысловые соединения демонстрируют эффективное снижение целевой РНК in vivo. В некоторых вариантах
реализации неконъюгированные антисмысловые соединения накапливаются в почках; В некоторых вариантах реализации конъюгированные антисмысловые соединения накапливаются в печени. В некоторых вариантах реализации конъюгированные антисмысловые соединения являются хорошо переносимыми. Такие свойства делают конъюгированные антисмысловые соединения особенно пригодными для ингибирования многих целевых РНК, включая, но не ограничиваясь ими, те, которые участвуют в метаболических, сердечно-сосудистых и других заболеваниях, расстройства или состояниях. Таким образом, в настоящем документе представлены способы лечения таких заболеваний, расстройств или состояний приведением тканей печени в контакт с конъюгированными антисмысловыми соединениями, нацеленными на РНК, связанные с такими заболеваниями, расстройствами или состояниями. Следовательно, представлены также способы улучшения любых из множества метаболических, сердечно-сосудистых и других заболеваний, расстройств или состояний при помощи конъюгированных антисмысловых соединений настоящего изобретения.
В некоторых вариантах реализации конъюгированные антисмысловые соединения являются более эффективными, чем неконъюгированные аналоги при определенной концентрации в ткани. Не ограничиваясь какой-либо теорией или механизмом, в некоторых вариантах реализации конъюгат может обеспечивать возможность более эффективного вхождения конъюгированного антисмыслового соединения в клетку или возможность более продуктивного вхождения в клетку. Например, в некоторых вариантах реализации конъюгированные антисмысловые соединения могут демонстрировать более значительное снижение мишени, по сравнению с неконъюгированным аналогом, при этом и конъюгированное антисмысловое соединение, и его неконъюгированный аналог находятся в ткани в одинаковых концентрациях. Например, в некоторых вариантах реализации конъюгированные антисмысловые соединения могут демонстрировать более значительное снижение мишени, по сравнению с их неконъюгированным и аналогами, при этом и конъюгированное антисмысловое соединение, и его неконъюгированный аналог находятся в печени в одинаковых концентрациях.
Ранее был рассмотрен продуктивный и непродуктивный захват олигонуклеотидов (см., например, Geary, R.S., Е. Wancewicz, et al. (2009). "Effect of Dose and Plasma Concentration on Liver Uptake and Pharmacologic Activity of а 2'-Methoxyethyl Modified Chimeric Antisense Oligonucleotide Targeting PTEN." Biochem. Pharmacol. 78(3): 284-91; и
Koller, Е., Т.М. Vincent, et al. (2011). "Mechanism of single-stranded phosphorothioate modified antisense oligonucleotide accumulation in hepatocytes." Nucleic Acids Res. 39(11): 4795-807). Конъюгирующие группы, описанные в настоящем документе, могут улучшать продуктивный захват.
В некоторых вариантах реализации конъюгирующие группы, описанные в настоящем документе, могут дополнительно усиливать эффективность за счет увеличения аффинности конъюгированного антисмыслового соединения к конкретному типу клетки или ткани. В некоторых вариантах реализации конъюгирующие группы, описанные в настоящем документе, могут дополнительно усиливать эффективность за счет увеличения распознавания конъюгированного антисмыслового соединения одним или более рецепторами клеточной поверхности. В некоторых вариантах реализации конъюгирующие группы, описанные в настоящем документе, могут дополнительно усиливать эффективность за счет облегчения эндоцитоза конъюгированного антисмыслового соединения.
В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент может дополнительно усиливать эффективность за счет обеспечения возможности расщепления конъюгата из антисмыслового олигонуклеотида после попадания конъюгированного антисмыслового соединения в клетку. Соответственно, в некоторых вариантах реализации конъюгированные антисмысловые соединения могут быть введены в более низких дозах, чем необходимы для неконъюгированных антисмысловых олигонуклеотидов.
Ранее в антисмысловые олигонуклеотиды уже были внедрены тиофосфатные связи. Такие тиофосфатные связи являются устойчивыми к нуклеазам и за счет этого улучшают стабильность олигонуклеотида. Кроме того, тиофосфатные связи связывают также некоторые белки, что приводит к накоплению антисмыслового олигонуклеотида в печени. Олигонуклеотиды с меньшим количеством тиофосфатных связей меньше накапливаются в печени и больше - в почках (см., например, Geary, R., "Pharmacokinetic Properties of 2'-O-(2-Methoxyethyl)-Modified Oligonucleotide Analogs in Rats," Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics, том 296, №3, 890-897; и Pharmacological Properties of 2'-O-Methoxyethyl Modified Oligonucleotides in Antisense а Drug Technology, глава 10, Crooke, S.Т., ред., 2008). В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды с меньшим количеством тиофсофатных межнуклеозидных связей и с большим количеством фосфодиэфирных межнуклеозидных связей меньше накапливаются в печени и больше - в почках. При лечении
заболеваний печени это нежелательно по нескольким причинам: (1) меньше лекарства попадает в центр желаемого действия (печень); (2) лекарство выводится с мочой; (3) почки подвергаются воздействию относительно высокой концентрации лекарства, что может приводить к токсичности в почках. Следовательно, для заболеваний печени тиофсофатные связи обеспечивают важное преимущество.
Однако в некоторых вариантах реализации введение олигонуклеотидов, равномерно связанных тиофсофатными межнуклеозидными связями, вызывает одну или более провоспалительных реакций. (См., например: J Lab Clin Med. 1996 Sep; 128(3):329-38. "Amplification of antibody production by phosphorothioate oligodeoxynucleotides". Branda et al.; и см. также, например: Toxicologic Properties in Antisense а Drug Technology, глава 12, страницы 342-351, Crooke, S.Т., ред., 2008). В некоторых вариантах реализации введение олигонуклеотидов, в которых большая часть межнуклеозидных связей содержит тиофосфатные межнуклеозидные связи, вызывает одну или более провоспалительных реакций.
В некоторых вариантах реализации степень провоспалительного эффекта может зависеть от нескольких переменных (например, модификация скелета, нецелевое действие, модификации азотистых оснований и/или модификации нуклеозида), см., например: Toxicologic Properties in Antisense а Drug Technology, глава 12, страницы 342-351, Crooke, S.Т., ред., 2008). В некоторых вариантах реализации степень провоспалительного эффекта может быть ослаблена за счет подбора одной или более переменных. Например, степень провоспалительного эффекта данного олигонуклеотида может быть ослаблена за счет замены любого количества тиофосфатных межнуклеозидных связей на фосфодиэфирные межнуклеозидные связи с уменьшением посредством этого общего количества тиофосфатных межнуклеозидных связей.
В некоторых вариантах реализации может быть желательно снизить количество тиофосфатных связей, если это может быть выполнено без потери стабильности и без сдвига распределения из печени в почки. Например, в некоторых вариантах реализации количество тиофосфатных связей может быть уменьшено за счет замены тиофосфатных связей на фосфодиэфирные связи. В таком варианте реализации антисмысловое соединение, имеющее меньшее количество тиофосфатных связей и большее количество фосфодиэфирных связей, может вызывать меньшее количество провоспалительных реакций или не вызывать
провоспалительных реакций. Хотя антисмысловое соединение, имеющее меньшее количество тиофосфатных связей и большее количество фосфодиэфирных связей, может вызывать меньшее количество провоспалительных реакций, антисмысловое соединение, имеющее меньшее количество тиофосфатных связей и большее количество фосфодиэфирных связей, может не накапливаться в печени и может быть менее эффективным в такси же или аналогичной дозе, по сравнению с антисмысловым соединением, имеющим большее количество тиофосфатных связей. Поэтому в некоторых вариантах реализации желательно разработать антисмысловое соединение, которое имеет множество фосфодиэфирных связей и множество тиофосфатных связей, но которое при этом обладает также стабильностью и хорошим распределением в печени.
В некоторых вариантах реализации конъюгированные антисмысловые соединения больше накапливаются в печени и меньше - в почках, чем неконъюгированные аналоги, даже если некоторые тиофосфатные связи заменены менее провоспалительными фосфодиэфирными межнуклеозидными связями. В некоторых вариантах реализации конъюгированные антисмысловые соединения больше накапливаются в печени и не так сильно выводятся с мочой, как их неконъюгированные аналоги, даже если некоторые тиофосфатные связи заменены менее провоспалительными фосфодиэфирными межнуклеозидными связями. В некоторых вариантах реализации применение конъюгата обеспечивает возможность разрабатывать более эффективные и лучше переносимые антисмысловые лекарства. Действительно, в некоторых вариантах реализации конъюгированные антисмысловые соединения имеют более широкий терапевтический индекс, чем неконъюгированные аналоги. Это позволяет вводить конъюгированное антисмысловое соединение в более высокой абсолютной дозе благодаря меньшему риску провоспалительной реакции и меньшему риску токсичности для почек. Такая более высокая доза дает возможность вводить дозу реже, поскольку ожидается такой же коэффициент очищения (метаболизм). Кроме того, поскольку соединение является более эффективным, как описано выше, то можно допускать снижение концентрации перед введением следующей дозы, без потери терапевтической активности, что обеспечивает еще более продолжительные периоды между введениями доз.
В некоторых вариантах реализации сохраняется необходимость во внедрении некоторого количества тиофосфатных связей. Например, концевые связи легко подвергаются действию экзонуклеаз, и поэтому в некоторых вариантах реализации эти связи представляют
собой тиофосфатные или другие модифицированные связи. Межнуклеозидные связи, соединяющие два дезоксинуклеозида, легко подвергаются действию эндонуклеаз, и поэтому в некоторых вариантах реализации эти связи представляют собой тиофосфатные или другие модифицированные связи. Межнуклеозидные связи между модифицированным нуклеозидом и дезоксинуклеозидом, где дезоксинуклеозид расположен на 5'-стороне связывающего дезоксинуклеозида, легко подвергаются действию эндонуклеаз, и поэтому в некоторых вариантах реализации эти связи представляют собой тиофосфатные или другие модифицированные связи. Межнуклеозидные связи между двумя модифицированными нуклеозидами определенных типов и между дезоксинуклеозидом и модифицированным нуклеозидом определенного типа, где модифицированный нуклеозид расположен на 5'-стороне линкера, являются достаточно устойчивыми к нуклеазному расщеплению, поэтому связь может быть фосфодиэфиром.
В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид конъюгированного антисмыслового соединения содержит менее 16 тиофосфатных связей, В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид конъюгированного антисмыслового соединения содержит менее 15 тиофосфатных связей. В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид конъюгированного антисмыслового соединения содержит менее 14 тиофосфатных связей. В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид конъюгированного антисмыслового соединения содержит менее 13 тиофосфатных связей. В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид конъюгированного антисмыслового соединения содержит менее 12 тиофосфатных связей. В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид конъюгированного антисмыслового соединения содержит менее 11 тиофосфатных связей. В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид конъюгированного антисмыслового соединения содержит менее 10 тиофосфатных связей. В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид конъюгированного антисмыслового соединения содержит менее 9 тиофосфатных связей. В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид конъюгированного антисмыслового соединения содержит менее 8 тиофосфатных связей.
В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения, содержащие одну или более конъюгирующих групп, описанных в настоящем документе, обладают повышенной активностью и/или эффективностью, и/или переносимостью, по сравнению с
исходным антисмысловым соединением, не имеющим такой одной или нескольких конъюгирующих групп. Соответственно, в некоторых вариантах реализации присоединение таких конъюгирующих групп к олигонуклеотиду является желательным. Такие конъюгирующие группы могут быть присоединены на 5'- и/или 3'-конце олигонуклеотида. В некоторых случаях синтетически желательно присоединение на 5'-конце. Как правило, олигонуклеотиды синтезируют присоединением 3'-концевого нуклеозида к твердой подложке с последующим связыванием нуклеозидов от 3' к 5' при помощи методик, общеизвестных в данной области техники. Соответственно, если конъюгирующая группа необходима на 3'-конце, то можно (1) присоединить конъюгирующую группу к 3'-концевому нуклеозиду и присоединить этот конъюгированный нуклеозид к твердой подложке для последующего получения олигонуклеотида или (2) присоединить конъюгирующую группу к 3'-концевому нуклеозиду готового олигонуклеотида после синтеза. Ни один из этих подходов не является особенно эффективным, и поэтому оба они затратны. В частности, присоединение конъюгированного нуклеозида к твердой подложке, хотя и представлено в настоящем документе в разделе «Примеры», не является эффективным способом. В некоторых вариантах реализации присоединение конъюгирующие группы к 5'-концевому нуклеозиду синтетически проще, чем присоединение к 3'-концу. Можно присоединить неконъюгированный 3'-концевой нуклеозид к твердой подложке и получить олигонуклеотид по стандартным и хорошо описанным реакциям. Затем нужно лишь присоединить 5'-нуклеозид, имеющий конъюгирующую группу, на последней стадии связывания. В некоторых вариантах реализации это более эффективно, чем присоединение конъюгированного нуклеозида непосредственно к твердой подложке, как это обычно делают для получения 3'-конъюгированного олигонуклеотида. В представленных в настоящем документе Примерах показано присоединение к 5'-концу. Кроме того, некоторые конъюгирующие группы имеют синтетические преимущества. Например, некоторые конъюгирующие группы, содержащие фосфорные связывающие группы, получают синтетически проще и более эффективно, чем другие конъюгирующие группы, включая конъюгирующие группы, описанные ранее (например, WO/2012/037254).
В некоторых вариантах реализации конъюгированные антисмысловые соединения вводят субъекту. В таких вариантах реализации антисмысловые соединения, содержащие одну или более конъюгирующих групп, описанных в настоящем документе, обладают повышенной активностью и/или эффективностью, и/или переносимостью, по сравнению с
исходным антисмысловым соединением, не имеющим такой одной или нескольких конъюгирующих групп. Не ограничиваясь механизмом, предполагается, что конъюгирующая группа способствует распределению, доставке и/или поглощению в целевой клетке или ткани. В некоторых вариантах реализации, после попадания в целевую клетку или ткань желательно, чтобы вся или часть конъюгирующие группы расщеплялась с высвобождением активного олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации не обязательно, чтобы из олигонуклеотида расщеплялась вся конъюгирующая группа. Например, в Примере 20а конъюгированный олигонуклеотид вводили мышам и обнаруживали множество различных химических частиц, каждая из которых содержала различные части конъюгирующие группы, оставшиеся на олигонуклеотиде (Таблица 23а). Это конъюгированное антисмысловое соединение показало хорошую эффективность (Таблица 23). Так, в некоторых вариантах реализации такой метаболитный профиль многократного частичного расщепления конъюгирующие группы не влияет на активность/эффективность. Тем не менее, в некоторых вариантах реализации желательно, чтобы пролекарство (конъюгированный олигонуклеотид) давало одно активное соединение. В некоторых случаях, при обнаружении многочисленных форм активного соединения, может быть необходимо определить относительные количества и действие для каждой из них. В некоторых вариантах реализации, при необходимости регуляционного тестирования (например, FDA США или другого органа), желательно иметь одну (или преимущественно одну) активную частицу. В некоторых таких вариантах реализации желательно, чтобы такая одна активная частица представляла собой антисмысловый олигонуклеотид, не содержащий никаких частей конъюгирующие группы. В некоторых вариантах реализации конъюгирующие группы на 5'-конце более вероятно приводят к полному метаболизму конъюгирующие группы. Не ограничиваясь механизмом, может быть, что эндогенные ферменты, отвечающие за метаболизм на 5'-конце (например, 5'-нуклеазы), более активны/эффективны, чем 3'-аналоги. В некоторых вариантах реализации определенные конъюгирующие группы более подвержены метаболизму до одной активной частицы. В некоторых вариантах реализации некоторые конъюгирующие группы более подвержены метаболизму до олигонуклеотида.
D. Антисенс
В некоторых вариантах реализации олигомерные соединения настоящего изобретения представляют собой антисмысловые соединения. В таких вариантах реализации олигомерное соединение комплементарно целевой нуклеиновой кислоте. В некоторых
вариантах реализации целевая нуклеиновая кислота представляет собой РНК. В некоторых вариантах реализации целевая нуклеиновая кислота представляет собой некодирующую РНК. В некоторых вариантах реализации целевая нуклеиновая кислота кодирует белок. В некоторых вариантах реализации целевая нуклеиновая кислота выбрана из мРНК, пре-мРНК, микроРНК, некодирующей РНК, включая малую некодирующую РНК, и промотор-направляемой РНК. В некоторых вариантах реализации олигомерные соединения по меньшей мере частично комплементарны более чем одной целевой нуклеиновой кислоте. Например, олигомерные соединения настоящего изобретения могут представлять собой миметики микроРНК, которые обычно связываются с несколькими мишенями.
В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения содержат часть, имеющую последовательность азотистых оснований, которая по меньшей мере на 70% комплементарна последовательности азотистых оснований целевой нуклеиновой кислоты. 3 некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения содержат часть, имеющую последовательность азотистых оснований, которая по меньшей мере на 80% комплементарна последовательности азотистых оснований целевой нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения содержат часть, имеющую последовательность азотистых оснований, которая по меньшей мере на 90% комплементарна последовательности азотистых оснований целевой нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения содержат часть, имеющую последовательность азотистых оснований, которая по меньшей мере на 95% комплементарна последовательности азотистых оснований целевой нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения содержат часть, имеющую последовательность азотистых оснований, которая по меньшей мере на 98% комплементарна последовательности азотистых оснований целевой нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения содержат часть, имеющую последовательность азотистых оснований, которая на 100% комплементарна последовательности азотистых оснований целевой нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95%, 98% или 100% комплементарны последовательности азотистых оснований целевой нуклеиновой кислоты по всей длине антисмыслового соединения.
Антисмысловые механизмы включают любой механизм, затрагивающий гибридизацию олигомерного соединения с целевой нуклеиновой кислотой, при этом
гибридизация приводит к биологическому эффекту. В некоторых вариантах реализации такая гибридизация приводит либо к разрушению, либо к применению целевой нуклеиновой кислоты с сопутствующим подавлением или стимулированием клеточного механизма, затрагивающего, например, трансляцию, транскрипцию или полиаденилированией целевой нуклеиновой кислоты или нуклеиновой кислоты, с которой целевая кислота может взаимодействовать иным образом.
Один из типов антисмыслового механизма, затрагивающий разрушение целевой РНК представляет собой антисмысл, опосредованный РНКазой Н. РНКаза Н представляет собой клеточную эндонуклеазу, которая расщепляет спираль РНК дуплекса РНК:ДНК. В данной области техники известно, что односпиральные антисмысловые соединения, которые являются «ДНК-подобными», вызывают активность РНКазы Н в клетках млекопитающих. Следовательно, активация РНКазы Н приводит к расщеплению РНК-мишени, посредством этого в значительной степени усиливая эффективность подавления генной экспрессии, опосредованного ДНК-подобным олигонуклеотидом.
Антисмысловые механизмы включают также, без ограничения, РНКи механизмы, в которых используется путь RISC. Такие РНКи механизмы включают, без ограничения, миРНК, оцРНК и микроРНК механизмы. Такие механизмы включают создание миметика микроРНК и/или анти-микро РНК.
Антисмысловые механизмы включают также, без ограничения, механизмы, которые гибридизуют или имитируют некодирующую РНК, отличную от микроРНК или мРНК. Такие некодирующие РНК включают, но не ограничиваются ими, промотор-нацеленную РНК и малую и длинную РНК, которая влияет на транскрипцию или трансляцию одной или более нуклеиновых кислот.
В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды, содержащие описанное в настоящем документе конъюгаты, представляют собой РНКи соединения. В некоторых вариантах реализации олигомерные олигонуклеотиды, содержащие описанные в настоящем документе конъюгаты, представляют собой оцРНК соединения. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды, содержащие описанные в настоящем документе конъюгаты, спарены со вторым олигомерным соединением с образованием миРНК. В некоторых таких вариантах реализации второе олигомерное соединение также содержит конъюгат. В некоторых вариантах реализации второе олигомерное соединение представляет собой любую
модифицированную или немодифицированную нуклеиновую кислоту. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды, содержащие описанные в настоящем документе конъюгаты, представляют собой антисмысловую цепь в миРНК соединении. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды, содержащие описанные в настоящем документе конъюгаты, представляют собой смысловую цепь в миРНК соединении. В тех вариантах реализации, в которых конъюгированное олигомерное соединение представляет собой двухцепочечную миРНК, конъюгат может находиться на смысловой цепи, антисмысловой цепи или и на смысловой цепи, и на антисмысловой цепи.
С. Аполипопротеин (а) (аро(а))
В некоторых вариантах реализации конъюгированные антисмысловые соединения нацелены на любую нуклеиновую кислоту аро(а). В некоторых вариантах реализации целевая нуклеиновая кислота кодирует белок-мишень аро(а), который является клинически значимым. В таких вариантах реализации модулирование целевой нуклеиновой кислоты приводит к клиническому преимуществу.
Процесс нацеливания обычно включает определение по меньшей мере одной целевой области, сегмента или сайта в целевой нуклеиновой кислоте для антисмыслового взаимодействия с возникновением в результате такого желаемого эффекта.
В некоторых вариантах реализации целевая область представляет собой структурно определенную область нуклеиновой кислоты. Например, в некоторых таких вариантах реализации целевая область может охватывать 3' UTR, 5' UTR, экзон, интрон, кодирующую область, область инициации трансляции, область терминации трансляции или другую определенную область или целевой сегмент нуклеиновой кислоты.
В некоторых вариантах реализации целевой сегмент представляет собой часть целевой области по меньшей мере примерно из 8 азотистых оснований, на которую нацелено конъюгированное антисмысловое соединение. Целевые сегменты могут содержать последовательности ДНК или РНК, которые содержат по меньшей мере 8 смежных азотистых оснований от 5'-конца одного из целевых сегментов (остальные азотистые основания тянутся друг за другом из той же ДНК или РНК, начинаясь сразу перед 5'-концом целевого сегмента и продолжаясь до момента, когда ДНК или РНК будет содержать от около 8 до около 30 азотистых оснований). Целевые сегменты представлены также последовательности ДНК или РНК, которые содержат по меньшей мере 8 смежных
азотистых оснований от 3'-конца одного из целевых сегментов (остальные азотистые основания тянутся друг за другом из той же ДНК или РНК, начинаясь сразу после 3'-конца целевого сегмента и продолжаясь до момента, когда ДНК или РНК будет содержать от около 8 до около 30 азотистых оснований). Целевые сегменты также могут быть представлены последовательностями ДНК или РНК, которые содержат по меньшей мере 8 смежных азотистых оснований из внутренней части последовательности целевого сегмента, и могут тянуться в любом или в обоих направлениях до момента, когда конъюгированное антисмысловое соединение будет содержать от около 8 до около 30 азотистых оснований.
В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения, нацеленные на нуклеиновую кислоту аро(а), могут быть модифицированы так, как описано в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения могут иметь модифицированный сахарный фрагмент, модифицированный сахарный фрагмент или смесь модифицированных и немодифицированных сахарных фрагментов, как описано в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения могут иметь модифицированная межнуклеозидная связь, немодифицированная межнуклеозидная связь или смесь модифицированных и немодифицированных межнуклеозидных связей, как описано в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения могут иметь модифицированное азотистое основание, немодифицированное азотистое основание или смесь модифицированных и немодифицированных азотистых оснований, как описано в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения могут иметь мотив, описанный в настоящем документе.
В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения, нацеленные на нуклеиновые кислоты аро(а), могут быть конъюгированы так, как описано в настоящем документе.
Один белок аро(а) связан дисульфидной связью с одним белком аполипопротеина В (ароВ) с образованием частицы липопротеина (а) (Lp(а)). Белок аро(а) имеет высокую степень гомологии с плазминогеном, в частности, в повторяющемся крингл домене IV типа 2. Предполагается, что повторяющийся крингл домен в аро(а) может отвечать за его протромботические и антифибринолитические свойства, потенциально усиливая атеросклеротическое прогрессирование. Аро(а) транскрипционно регулируется посредством IL-6, и в исследованиях пациентов с ревматоидным артритом, проходивших лечение
ингибитором IL-6 (тоцилизумаб), уровни в плазме были снижены на 30% через 3 месяца лечения. Было показано, что Аро(а) предпочтительно связывает окисленные фосфолипиды и усиливает васкулярное воспаление. Кроме того, исследования позволяют предположить, что частица Lp(а) может также стимулировать эндотелиальную проницаемость, вызывать экспрессию ингибитора плазминогенного активатора типа 1 и активировать секрецию макрофагального интерлейкина-8. Важно, что в недавних исследованиях генетических ассоциаций было выявлено, что Lp(а) представляет собой независимый фактор риска для инфаркта миокарда, инсульта, болезни периферических сосудов и аневризма брюшной аорты. Кроме того, в исследовании ранней ишемической болезни сердца (PROCARDIS) ученые Clarke et al. описали достоверные и независимые связи между ишемической болезнью сердца и концентрациями Lp(а) в плазме. Кроме того, Solfrizzi et al. предположили, что повышенная концентрация Lp(а) в сыворотке может быть связана с повышенным риском болезни Альцгеймера (AD). Антисмысловые соединения, нацеленные на аро(а), были ранее описаны в WO 2005/000201 и US 2010-0331390, полное содержание которых включено в настоящий документ посредством ссылки. Антисмысловое олигонуклеиновое основание, нацеленное на Аро(а), ISIS-APOARx, было испытано на I фазе клинических испытаний, выполненных для изучения профиля его безопасности.
Некоторые конъюгированные антисмысловые соединения, нацеленные на нуклеиновую кислоту Аро(а)
В некоторых вариантах реализации изобретения конъюгированные антисмысловые соединения нацелены на нуклеиновую кислоту Аро(а), имеющую последовательность с номером доступа GENBANK® NM_005577.2, включенную в настоящий документ как SEQ ID NO: 1, с номером доступа GENBANK NT_007422.12, усеченную по нуклеотидам с 3230000 по 3380000, включенную в настоящий документ как SEQ ID NO: 2, с номером доступа GENBANK NT_025741.15, усеченную по нуклеотидам с 65120000 по 65258000, обозначенную в настоящем документе как SEQ ID NO: 3, и GENBANK с номером доступа NM_005577.1, включенную в настоящий документ как SEQ ID NO: 4. В некоторых таких вариантах реализации изобретения конъюгированное антисмысловое соединение по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% комплементарно любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO: 1-4.
В некоторых вариантах реализации конъюгированное антисмысловое соединение, нацеленное на любую из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO: 1-4, содержит по меньшей мере 8 смежных последовательностей азотистых оснований, выбранных из любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO: 12-130, 133, 134. В некоторых вариантах реализации конъюгированное антисмысловое соединение, нацеленное на любую из SEQ ID NO: 1-4, содержит последовательность азотистых оснований, выбранную из любой из последовательностей азотистых оснований SEQ ID NO: 12-130, 133, 134.
Figure 00000369
Figure 00000370
Терапевтические показания для Аро(а)
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения конъюгированного антисмыслового соединения, нацеленного на нуклеиновую кислоту аро(а), для модулирования экспрессии аро(а) у субъекта. В некоторых вариантах реализации экспрессия аро(а) снижена.
В некоторых вариантах реализации в настоящем документе представлены способы лечения субъекта, включающие введение одной или более фармацевтических композиций, описанных в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения конъюгированного антисмыслового соединения, нацеленного на нуклеиновую кислоту аро(а), в фармацевтической композиции для лечения субъекта. В некоторых вариантах реализации изобретения индивидуум страдает от заболевания, связанного с аро(а). В некоторых вариантах реализации изобретения индивидуум страдает от заболевания, связанного с Lp(a). В некоторых вариантах реализации индивидуум страдает от воспалительного, сердечно-сосудистого и/или метаболического заболевания, расстройства или состояния.
В некоторых вариантах реализации субъект страдает от воспалительного, сердечнососудистого и/или метаболического заболевания, расстройства или состояния.
В некоторых вариантах реализации изобретения сердечно-сосудистые заболевания, расстройства или состояния включают, но не ограничиваются ими, стеноз аортального отверстия, аневризму (например, аневризма брюшной аорты), стенокардию, аритмию, атеросклероз, церебро-сосудистое заболевание, коронарно-артериальное заболевание, коронарную болезнь сердца, дислипидемию, гиперхолестеринемию, гиперлипидемию, гипертонию, гипертриглицеридемию, инфаркт миокада, болезнь периферических сосудов (например, болезнь периферической артерии), инсульт и т.п.
В некоторых вариантах реализации соединения, нацеленные на аро(а) и описанные в настоящем документе, модулируют физиологические маркеры или фенотипы сердечнососудистого заболевания, расстройства или состояния. Например, введение указанных
соединений животным может снижать уровни LDL и холестерина у этих животных, по сравнению с животными, не получавшими лечения. В некоторых вариантах реализации изобретения модулирование физологических маркеров или фенотипов может быть связано с ингибированием аро(а) указанными соединениями.
В некоторых вариантах реализации физиологические маркеры сердечно-сосудистого заболевания, расстройса или состояния могут быть определены количественно. Например, могут быть измерены и количественно определены уровни LDL или холестерина, например, стандартными тестами липидов. Для таких маркеров в некоторых вариантах реализации маркер может быть снижен на около 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95 или 99%, или на значение в диапазоне между любыми двумя из указанных значений.
В настоящем документе представлены также способы предупреждения, лечения или облегчения симптома, связанного с сердечно-сосудистым заболеванием, расстройством или состоянием, у субъекта, нуждающегося в этом. В некоторых вариантах реализации приведен способ снижения скорости возникновения симптома, связанного с сердечно-сосудистым заболеванием, расстройством или состоянием. В некоторых вариантах реализации приведен способ уменьшения тяжести симптома, связанного с сердечно-сосудистым заболеванием, расстройством или состоянием. В таких вариантах реализации указанные способы включают введение терапевтически эффективного количества соединения, нацеленного на нуклеиновую кислоту аро(а), индивидууму, нуждающемуся в этом.
Сердечно-сосудистое заболевание, расстройство или состояние может характеризоваться множеством физических симптомов. Любой симптом, известный специалистам в данной области, связанный с сердечно-сосудистым заболеванием, расстройством или состоянием, может быть предупрежден, вылечен, облегчен или иным образом изменен при помощи соединений и способов, описанных в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации симптом быть любым из, но не ограничивается ими, стенокардии, боли в груди, одышки, учащенного сердцебиения, слабости, головокружение, тошноту, потоотделение, тахикардию, брадикардию, аритмию, мерцательной аритмии, опухания нижних конечностей, цианоза, усталости, обморока, онемения лица, онемения конечностей, хромоты или судорог мышц, вздутия живота или лихорадки.
В некоторых вариантах реализации метаболические заболевания, расстройства или состояния включают, но не ограничиваются ими, гипергликемию, преддиабет, диабет (I типа
и II типа), ожирение, инсулинорезистентность, метаболический синдром и диабетическую дислипидемию.
В некоторых вариантах реализации соединения, нацеленные на аро(а) и описанные в настоящем документе, модулируют физиологические маркеры или фенотипы метаболического заболевания, расстройства или состояния. Например, введение указанных соединений животным может снижать уровни глюкозы и инсулинорезистентность у этих животных, по сравнению с животными, не получавшими лечения. В некоторых вариантах реализации изобретения модулирование физологических маркеров или фенотипов может быть связано с ингибированием аро(а) указанными соединениями.
В некоторых вариантах реализации физиологические маркеры метаболического заболевания, расстройса или состояния могут быть определены количественно. Например, уровни глюкозы или инсулинорезистентность могут быть измерены и количественно определены стандартными тестами, известными в данной области техники. Для таких маркеров в некоторых вариантах реализации маркера может быть снижен на около 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95 или 99%, или на значение в диапазоне между любыми двумя из указанных значений. В другом примере чувствительность к инсулину может быть измерена и количественно определена стандартными тестами, известными в данной области техники. Для таких маркеров в некоторых вариантах реализации маркер может быть повышен на около 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95 или 99%, или на значение в диапазоне между любыми двумя из указанных значений.
В настоящем документе представлены также способы предупреждения, лечения или облегчения симптома, связанного с метаболическим заболеванием, расстройством или состоянием, у субъекта, нуждающегося в этом. В некоторых вариантах реализации приведен способ снижения скорости возникновения симптома, связанного с метаболическим заболеванием, расстройством или состоянием. В некоторых вариантах реализации приведен способ уменьшения тяжести симптома, связанного с метаболическим заболеванием, расстройством или состоянием. В таких вариантах реализации указанные способы включают введение терапевтически эффективного количества соединения, нацеленного на нуклеиновую кислоту аро(а), индивидууму, нуждающемуся в этом.
Метаболическое заболевание, расстройство или состояние может характеризоваться множеством физических симптомов. Любой симптом, известный специалистам в данной области, связанный с метаболическим заболеванием, расстройством или состоянием, может
быть предупрежден, вылечен, облегчен или иным образом изменен при помощи соединений и способов, описанных в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации симптом может быть любым из, но не ограничивается ими, избыточного выделения мочи (полиурии), избыточной жажды и повышенного потребления жидкости (полидипсии), расплывчатого зрения, необъяснимой потери веса и летаргии.
В некоторых вариантах реализации воспалительные заболевания, расстройства или состояния включают, но не ограничиваются ими, стеноз аортального отверстия, коронарно-артериальную болезнь (CAD), болезнь Альцгеймера и тромбоэмболические заболевания, расстройства или состояния. Некоторые тромбоэмболические заболевания, расстройства или состояния включают, но не ограничиваются ими, инсульт, тромбоз, инфаркт миокарда и болезнь периферических сосудов.
В некоторых вариантах реализации соединения, нацеленные на аро(а) и описанные в настоящем документе, модулируют физиологические маркеры или фенотипы воспалительного заболевания, расстройства или состояния. Например, введение указанных соединений животным может снижать уровни воспалительных цитокинов или других воспалительных маркеров у этих животных, по сравнению с животными, не получавшими лечения. В некоторых вариантах реализации изобретения модулирование физологических маркеров или фенотипов может быть связано с ингибированием аро(а) указанными соединениями.
В некоторых вариантах реализации физиологические маркеры воспалительногозаболевания, расстройса или состояния могут быть определены количественно. Например, уровни цитокина могут быть измерены и определены количественно стандартными тестами, известными в данной области техники. Для таких маркеров в некоторых вариантах реализации маркер может быть снижен по меньшей мере на около 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99%, или на любое значение между двумя указанными значениями.
В настоящем документе представлены также способы предупреждения, лечения или облегчения симптома, связанного с воспалительным заболеванием, расстройством или состоянием, у субъекта, нуждающегося в этом. В некоторых вариантах реализации приведен способ снижения скорости возникновения симптома, связанного с воспалительным заболеванием, расстройством или состоянием. В некоторых вариантах реализации приведен способ уменьшения тяжести симптома, связанного с воспалительным заболеванием, расстройством или состоянием. В таких вариантах реализации указанные способы включают
введение терапевтически эффективного количества соединения, нацеленного на нуклеиновую кислоту аро(а), индивидууму, нуждающемуся в этом.
В некоторых вариантах реализации изобретения приведены способы лечения индивидуума с заболеванием, расстройством или состоянием, связанным с аро(а), включающие введение терапевтически эффективного количества одной или более фармацевтических композиций, описанных в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации изобретения индивидуум страдает от повышенных уровней аро(а). В некоторых вариантах реализации изобретения приведены способы лечения индивидуума с заболеванием, расстройством или состоянием, связанным с Lp(a), включающие введение терапевтически эффективного количества одной или более фармацевтических композиций, описанных в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации изобретения индивидуум страдает от повышенных уровней Lp(a). В некоторых вариантах реализации индивидуум страдает от воспалительного, сердечно-сосудистого и/или метаболического заболевания, расстройства или состояния. В некоторых вариантах реализации введение терапевтически эффективного количества антисмыслового соединения, нацеленного на нуклеиновую кислоту аро(а), сопровождают наблюдением уровней аро(а) или Lp(a) В некоторых вариантах реализации изобретения введение терапевтически эффективного количества антисмыслового соединения, нацеленного на нуклеиновую кислоту аро(а), сопровождают наблюдением маркеров воспалительного, сердечно-сосудистого и/или метаболического заболевания, или другого болезненного процесса, связанного с экспрессией аро(а), для определения реакции индивидуума на антисмысловое соединение. Реакцию индивидуума на введение антисмыслового соединения, нацеленного на аро(а), врач может использовать для определения количества и продолжительности терапевтического вмешательствас применением указанного соединения.
В некоторых вариантах реализации изобретения введение антисмыслового соединения, нацеленного на нуклеиновую кислоту аро(а), приводит к снижению экспрессии аро(а) по меньшей мере на около 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99%, или на любое значение в диапазоне между двумя указанными значениями. В некоторых вариантах реализации экспрессия аро(а) снижается до по меньшей мере ≤100 мг/дл, ≤90 мг/дл, ≤80 мг/дл, ≤70 мг/дл, ≤60 мг/дл, ≤50 мг/дл, ≤40 мг/дл, ≤30 мг/дл, ≤20 мг/дл или ≤10 мг/дл.
В некоторых вариантах реализации изобретения введение антисмыслового соединения, нацеленного на нуклеиновую кислоту Lp(a), приводит к снижению экспрессии аро(а) по меньшей мере на около 15%, 20%, 25%,
30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99%, или на любое значение в диапазоне между двумя указанными значениями. В некоторых вариантах реализации экспрессия Lp(a) снижается до по меньшей мере ≤200 мг/дл, ≤190 мг/дл, ≤180 мг/дл, ≤175 мг/дл, ≤170 мг/дл, ≤160 мг/дл, ≤150 мг/дл, ≤140 мг/дл, ≤130 мг/дл, ≤120 мг/дл, ≤110 мг/дл, ≤100 мг/дл, ≤90 мг/дл, ≤80 мг/дл, ≤70 мг/дл, ≤60 мг/дл, ≤55 мг/дл, ≤50 мг/дл, ≤45 мг/дл, ≤40 мг/дл, ≤35 мг/дл, ≤30 мг/дл, ≤25 мг/дл, ≤20 мг/дл, ≤15 мг/дл или ≤10 мг/дл.
В некоторых вариантах реализации изобретения приведены способы применения конъюгированного антисмыслового соединения, нацеленного на нуклеиновую кислоту аро(а), при получении лекарственного средства. В некоторых вариантах реализации фармацевтические композиции, содержащие конъюгированное антисмысловое соединение, нацеленное на аро(а), используют для получения лекарственного средства для лечения пациента, страдающего или предрасположенного к воспалительному, сердечно-сосудистому и/илиметаболическому заболеванию, расстройству или состоянию.
Группы лечения аро(а)
Некоторые субъекты с высокими уровнями Lp(a) имеют значительный риск различных заболеваний (Lippi et al., Clinica Chimica Acta, 2011, 412:797-801; Solfrizz et al.). У многих субъектов с высокими уровнями Lp(a) текущее лечение не может обеспечивать снижение уровней Lp(a) до безопасных значений. Аро(а) играет важную роль в образовании Lp(a), поэтому снижение аро(а) может приводить к снижению Lp(a) и предотвращать, лечить или улучшать заболевание, связанное с Lp(a).
В некоторых вариантах реализации изобретения лечение при помощи соединений и способов, описанных в настоящем документе, показано для животных и людей с повышенными уровнями аро(а) и/или уровнями Lp(a). В некоторых вариантах реализации уровни аро(а) у человека составляют ≥10 мг/дл, ≥20 мг/дл, ≥30 мг/дл, ≥40 мг/дл, ≥50 мг/дл, ≥60 мг/дл, ≥70 мг/дл, ≥80 мг/дл, ≥90 мг/дл или ≥100 мг/дл. В некоторых вариантах реализации уровни Lp(a) у человека составляют ≥10 мг/дл, ≥15 мг/дл, ≥20 мг/дл, ≥25 мг/дл, ≥30 мг/дл, ≥35 мг/дл, ≥40 мг/дл, ≥50 мг/дл, ≥60 мг/дл, ≥70 мг/дл, ≥80 мг/дл, ≥90 мг/дл, ≥100 мг/дл, ≥110 мг/дл, ≥120 мг/дл, ≥130 мг/дл, ≥140 мг/дл, ≥150 мг/дл, ≥160 мг/дл, ≥170 мг/дл, ≥175 мг/дл, ≥180 мг/дл, ≥190 мг/дл, ≥200 мг/дл.
D. Некоторые Фармацевтические композиции
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены фармацевтические композиции, содержащие одно или более антисмысловых соединений. В некоторых вариантах реализации такая фармацевтическая композиция содержит подходящий фармацевтически приемлемый разбавитель или носитель. В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция содержит стерильный солевой раствор и одно или более
антисмысловых соединений. В некоторых вариантах реализации такая фармацевтическая композиция состоит из стерильного солевого раствора и одного или более антисмысловых соединений. В некоторых вариантах реализации стерильный солевой раствор представляет собой солевой раствор фармацевтической марки. В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция содержит одно или более антисмысловых соединений и стерильную воду. В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция состоит из одного или более антисмысловых соединений и стерильной воды. В некоторых вариантах реализации стерильный солевой раствор представляет собой воду фармацевтической марки. В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция содержит одно или более антисмысловых соединений и фосфатно-солевой буферный раствор (PBS). В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция состоит из одного или более антисмысловых соединений и фосфатно-солевого буферного раствора (PBS). В некоторых вариантах реализации стерильный солевой раствор представляет собой PBS фармацевтической марки.
В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения могут быть смешаны с фармацевтически приемлемыми активными и/или инертными веществами для получения фармацевтических композиций или составов. Композиции и способы составления фармацевтических композиций зависят от множества критериев, включая, но не ограничиваясь этим, способ введения, тяжесть заболевания или дозу, подлежащую введению.
Фармацевтические композиции, содержащие антисмысловые соединения, охватывают любые фармацевтически приемлемые соли, сложные эфиры или соли таких сложных эфиров. В некоторых вариантах реализации фармацевтические композиции, содержащие антисмысловые соединения, содержат один или более олигонуклеотидов, которые при введении млекопитающему, включая человека, могут обеспечивать (прямо или косвенно) его биологически активный метаболит или остаток. Соответственно, например, настоящее описание относится также к фармацевтически приемлемым солям антисмысловых соединений, пролекарствам, фармацевтически приемлемым солям таких пролекарств и к другим биоэквивалентам. Подходящие фармацевтически приемлемые соли включают, но не ограничиваются ими, соли натрия и калия.
Пролекарство может включать внедрение дополнительных нуклеозидов у одного или обоих концов олигонуклеотида, которые расщепляются в организме под действием эндогенных нуклеаз с образованием активного антисмыслового олигонуклеотида.
В многочисленных способах в терапиях с нуклеиновыми кислотами были применены липидные фрагменты. В некоторых таких способах нуклеиновую кислоту вводят в предварительно сформированные липосомы или липоплексы, полученные из смесей катионных липидов и нейтральных липидов. В некоторых способах получают ДНК комплексы с моно- или поликатионными липидами без участия нейтрального липида. В некоторых вариантах реализации липидный фрагмент выбиран для улучшения распределения фармацевтического агента в определенной клетке или ткани. В некоторых вариантах реализации липидный фрагмент выбиран для улучшения распределения фармацевтического агента в жировой ткани. В некоторых вариантах реализации липидный фрагмент выбиран для улучшения распределения фармацевтического агента в мышечной ткани.
В некоторых вариантах реализации фармацевтические композиции, представленные в настоящем документе, содержат один или более модифицированных олигонуклеотидов и одно или более вспомогательных веществ. В некоторых таких вариантах реализации вспомогательные вещества выбраны из воды, солевых растворов, спирта, полиэтиленгликолей, желатина, лактозы, амилазы, стеарата магния, талька, кремниевой кислоты, вязкого парафина, гидроксиметилцеллюлозы и поливинилпирролидона.
В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция, представленная в настоящем документе, содержит систему доставки. Примеры систем доставки включают, но не ограничиваются ими, липосомы и эмульсии. Некоторые системы доставки подходят для получения некоторых фармацевтических композиций, включая композиции, содержащие гидрофобные соединения. В некоторых вариантах реализации применяют некоторые органические растворители, такие как диметилсульфоксид.
В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция, представленная в настоящем документе, содержит одну или более тканеспецифичных молекул доставки, предназначенных для доставки одного или более фармацевтических агентов настоящего описания в определенную ткань или типы клеток. Например, в некоторых вариантах реализации фармацевтические композиции включают липосомы, покрытые тканеспецифичным антителом.
В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция, представленная в настоящем документе, содержит систему совместного растворителя. Некоторые такие системы совместных растворителей содержат, например, бензиловый спирт, неполярное поверхностно-активное вещество, смешиваемый с водой органический полимер и водную фазу. В некоторых вариантах реализации такие системы совместных растворителей применяют для гидрофобных соединений. Не ограничивающий пример такой системы совместных растворителей представляет собой система совместных растворителей VPD, которая представляет собой раствор абсолютного этанола, содержащего 3% масс./об. бензилового спирта, 8% масс./об. неполярного поверхностно-активного вещества Polysorbate 80™ и 65% масс./об. полиэтиленгликоля 300. Пропорции таких систем совместных растворителей могут существенно варьироваться без значителного изменения их характеристик растворимости и токсичности. Кроме того, может варьироваться сущность компонентов совместных растворителей: например, вместо Polysorbate 80™ могут быть применены другие поверхностно-активные вещества; может варьироваться размер фракции полиэтиленгликоля; вместо полиэтиленгликоля могут быть применены другие биосовместимые полимеры, например, поливинилпирролидон; и вместо декстрозы могут быть применены другие сахара или полисахариды.
В некоторых вариантах реализации фармацевтическую композицию, представленную в настоящем документе, получают для перорального введения. В некоторых вариантах реализации фармацевтические композиции получают для буккального введения.
В некоторых вариантах реализации фармацевтическую композицию получают для введения инъекцией (например, внутривенной, подкожной, внутримышечной и т.д.). В некоторых таких вариантах реализации фармацевтическая композиция содержит носитель и составлена в водном растворе, таком как вода или физиологически совместимые буферы, такие как раствор Хэнкса, раствор Рингера или физиологический солевой буфер. В некоторых вариантах реализации включены другие ингредиенты (например, ингредиенты, улучшающие растворимость или служащие консервантами). В некоторых вариантах реализации суспензии для инъекций получают при помощи подходящих жидких носителей, суспендирующих агентов и т.п. Некоторые фармацевтические композиции для инъекций представлены в форме разовой дозы, например, в ампулах, или в многодозовых контейнерах. Некоторые фармацевтические композиции для инъекций представляют собой суспензии, растворы или эмульсии в масляных или водных жидких носителях, и они могут содержать
вспомогательные агенты, такие как суспендирующие, стабилизирующие и/или диспергирующие агенты. Некоторые растворители, подходящие для применения в фармацевтических композициях для инъекций, включают, но не ограничиваются ими, липофильные растворители и жирные масла, такие как кунжутное масло, синтетические сложные эфиры жирных кислот, такие как этилолеат или триглицериды, и липосомы. Водные суспензии для инъекций могут содержать вещества, которые увеличивают вязкость суспензии, такие как карбоксиметилцеллюлоза натрия, сорбит или декстран. Такие суспензии могут также необязательно содержать подходящие стабилизаторы или агенты, которые увеличивают растворимость фармацевтических агентов с обеспечением возможности получения высококонцентрированных растворов.
В некоторых вариантах реализации фармацевтическую композицию получают для трансмукозального введения. В некоторых таких вариантах реализации в составе применяют пенетранты, соответствующие барьеру, через который необходимо проникнуть. Такие пенетранты общеизвестны в данной области техники.
В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция, представленная в настоящем документе, содержит олигонуклеотид в терапевтически эффективном количестве. В некоторых вариантах реализации терапевтически эффективное количество является достаточным для предотвращения, облегчения или улучшения симптомов заболевания или для увеличения продолжительности жизни субъекта, подлежащего лечению. Определение терапевтически эффективного количества находится в пределах возможностей специалистов в данной области техники.
В некоторых вариантах реализации один или более модифицированных олигонуклеотидов, представленных в настоящем документе, составляют в виде пролекарства. В некоторых вариантах реализации при введении in vivo пролекарство химически превращается в биологически, фармацевтически или терапевтически более активную форму олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации пролекарства пригодны благодаря тому, что их проще вводить, чем соответствующую активную форму. Например, в некоторых случаях пролекарство может быть более биодоступным (например, при пероральном введении), чем соответствующая активная форма. В некоторых случаях пролекарство может обладать улучшенной растворимостью, по сравнению с соответствующей активной формой. В некоторых вариантах реализации пролекарства менее растворимы в воде, чем
соответствующая активная форма. В некоторых случаях такие пролекарства обладают превосходной передачей через клеточные мембраны, при этом растворимость в воде ухудшает их подвижность. В некоторых вариантах реализации пролекарство представляет собой сложный эфир. В некоторых таких вариантах реализации сложный эфир при введении метаболически гидролизуется до карбоновой кислоты. В некоторых случаях соединение, содержащее карбоновую кислоту, представляет собой соответствующую активную форму. В некоторых вариантах реализации пролекарство содержит короткий пептид (полиаминокислоту), связанный с кислотной группой. В некоторых таких вариантах реализации пептид расщепляется при введении с образованием соответствующей активной формы.
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены композиции и способы снижения количества или активности целевой нуклеиновой кислоты в клетке. В некоторых вариантах реализации клетка находится у животного. В некоторых вариантах реализации животное представляет собой млекопитающее. В некоторых вариантах реализации животное представляет собой грызуна. В некоторых вариантах реализации животное представляет собой примата. В некоторых вариантах реализации животное представляет собой примата, не являющегося человеком. В некоторых вариантах реализации животное представляет собой человека.
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены способы введения животному фармацевтической композиции, содержащей олигонуклеотид настоящего описания. Подходящие способы введения включают, но не ограничиваются ими, пероральный, ректальный, трансмукозальный, интестинальный, энтеральный, местный, суппозитории, через ингаляции, интратекальный, интрацеребровентрикулярный, внутрибрюшинный, интраназальный, интраокулярный, внутриопухолевый и парентеральный (например, внутривенный, внутримышечный, интрамедуллярный и подкожный). В некоторых вариантах реализации вводят фармацевтические интратекальные средства для достижения местного, а не системного воздействия. Например, фармацевтические композиции могут быть введены инъекцией непосредственно в область желаемого эффекта (например, в печень).
Неограничивающее описание и включение посредством ссылки
Несмотря на то, что некоторые соединения, композиции и способы, описанные в настоящем документе, были подробно описаны в соответствии с некоторыми вариантами реализации изобретения, следующие примеры служат лишь для иллюстрации соединений, описанных в настоящем документе, и их не следует считать их ограничением. Каждая из ссылок, номера доступа GenBank и подобные ссылки, упоминаемые в настоящей заявке, включены в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме.
Несмотря на то, что перечень последовательностей, сопровождающий этот файл, указывает каждую последовательность либо как «РНК», либо как «ДНК», по необходимости, в действительности эти последовательности могут быть модифицированы любой комбинацией химических модификаций. Специалистам в данной области техники понятно, что такое обозначение как «РНК» или «ДНК» для описания
модифицированных олигонуклеотидов, является в некоторых случаях произвольным. Например олигонуклеотид, содержащий нуклеозид, содержащий 2'-ОН сахарный фрагмент и тиминовое основание, может быть описан как ДНК, имеющая модифицированный сахар (2'-ОН вместо природного 2'-Н в ДНК) или как РНК, имеющая модифицированное основание (тимин (метилированный урацил) вместо природного урацила в РНК).
Соответственно, последовательности нуклеиновых кислот, представленные в настоящем документе, включая, но не ограничиваясь ими, последовательности в перечне последовательностей, предназначены для охвата нуклеиновых кислот, содержащих любую комбинацию природных или модифицированных РНК и/или ДНК, включая, но не ограничиваясь ими, такие нуклеиновые кислоты, которые содержат модифицированные азотистые основания. В качестве дополнительного примера и без ограничения, олигонуклеотид, содержащий последовательность азотистых оснований «ATCGATCG», хватывает любые олигонуклеотиды, имеющие такую последовательность азотистых оснований, модифицированных или немодифицированных, включая, но не ограничиваясь ими, такие соединения, которые содержат РНК основания, такие как те, которые имеют последовательность «AUCGAUCG», и те, которые имеют некоторые ДНК основания и некоторые РНК основания, такие как «AUCGATCG», а также олигонуклеотиды, имеющие другие модифицированные основания, такие как «ATmeCGAUCG», где meС означает цитозиновое основание, содержащее метиловую группу в 5-положении.
Примеры
Следующие примеры иллюстрируют некоторые варианты реализации настоящего описания и не являются ограничивающими. Более того, если представлены конкретные варианты реализации, авторы изобретения подразумевают общее применение указанных конкретных вариантов реализации. Например, описание олигонуклеотида, содержащего конкретный мотив, дает обоснованное основание для дополнительных олигонуклеотидов, содержащих такой же или похожий мотив. И, например, если конкретная высокоаффинная модификация возникает в определенном положении, то в этом же положении считаются подходящими другие высокоаффинные модификации, если не указано иное.
Пример 1. Общий способ получения фосфорамидитов, Соединений 1, 1а и 2
Figure 00000371
Вх представляет собой гетероциклическое основание
Соединения 1, 1a и 2 получили по методикам, общеизвестным в данной области техники, описанным в данном описании (см. Seth et al., Bioorg. Med. Chem., 2011, 21(4), 1122-1125, J. Org. Chem., 2010, 75(5), 1569-1581, Nucleic Acids Symposium Series, 2008, 52(1), 553-554); и см. также опубликованные Международные заявки РСТ (WO 2011/115818, WO 2010/077578, WO 2010/036698, WO 2009/143369, WO 2009/006478 и WO 2007/090071) и патент США 7569686).
Пример 2. Получение Соединения 7
Figure 00000372
Соединение 3 (2-ацетамидо-1,3,4,6-тетра-O-ацетил-2-дезокси-β-D-галактопираноза или галактозамина пентаацетат) коммерчески доступно. Соединение 5 получили по опубликованным методикам (Weber et al., J. Med. Chem., 1991, 34, 2692).
Пример 3. Получение Соединения 11
Figure 00000373
Соединения 8 и 9 коммерчески доступны.
Пример 1. Получение Соединения 18
Figure 00000374
Соединение 11 получили по методикам, описанным в Примере 3. Соединение 14 коммерчески доступно. Соединение 17 получили по такому же способу, как описан в публикации Rensen et al., J. Med. Chem., 2004, 47, 5798-5808.
Пример 1. Получение Соединения 23
Figure 00000375
Соединения 19 и 21 коммерчески доступны.
Пример 6. Получение Соединения 24
Figure 00000376
Соединения 18 и 23 получили так, как описано в способах в Примерах 4 и 5.
Пример 7. Получение Соединения 25
Figure 00000377
Соединение 24 получили по способам, представленным в Примере 6.
Figure 00000378
Соединение 24 получили по способам, представленным в Примере 6.
Пример 9. Общее получение конъюгированных ASO, содержащих GalNAc3-1 на 3'-конце, Соединения 29
Figure 00000379
Figure 00000380
Где защищенный GalNAc3-1 имеет структуру:
Figure 00000381
Кластерная часть GalNAc3 конъюгирующие группы GalNAc3-1 (GalNAc3-1a) может быть комбинирована с любым расщепляемым фрагментом с получением различных конъюгирующих групп. При этом GalNAc3-1a имеет формулу:
Figure 00000382
Твердую подложку, связывающую защищенный GalNAc3-1, Соединение 25, получили по способам, представленным в Примере 7. Олигомерное Соединение 29, содержащее GalNAc3-1 на 3'-конце, получили по стандартным методика в автоматическом синтезаторе ДНК/РНК (см. Dupouy et al., Angew. Chem. Int. ред., 2006, 45, 3623-3627). Фосфорамидитные строительные блоки, Соединения 1 и 1a, получили по способам, представленным в Примере 1. Изображенные фосфорамидиты являются типичными и не предназначены для ограничения, поскольку могут быть применены другие фосфорамидитные строительные блоки для получения олигомерных соединений, имеющих желаемую последовательность и состав. Порядок и количество фосфорамидитов, добавляемых к твердой подложке, может быть подобрано для получения разорванных олигомерных соединений, описанных в настоящем документе. Такие разорванные олигомерные соединения могут иметь заданный состав и последовательность оснований, продиктованную любой данной мишенью.
Пример 10. Общее получение конъюгированных ASO, содержащих GalNAc3-1 на 5'-конце, Соединения 34
Figure 00000383
Figure 00000384
Unylinker™ 30 коммерчески доступно. Олигомерное соединение 34, содержащее кластер GalNAc3-1 на 5'-конце, получили по стандартным способам в автоматическом синтезаторе ДНК/РНК (см. Dupouy et al., Angew. Chem. Int. Ed., 2006, 45, 3623-3627). Фосфорамидитные строительные блоки, Соединения 1 и 1a, получили по способам, представленным в Примере 1. Изображенные фосфорамидиты являются типичными и не предназначены для ограничения, поскольку могут быть применены другие фосфорамидитные строительные блоки для получения олигомерного соединения, имеющего желаемую последовательность и состав. Порядок и количество фосфорамидитов, добавляемых к твердой подложке, может быть подобрано для получения разорванных олигомерных соединений, описанных в настоящем документе. Такие разорванные олигомерные соединения могут иметь заданный состав и последовательность оснований, продиктованную любой данной мишенью.
Пример 11. Получение Соединения 39
Figure 00000385
Соединения 4, 13 и 23 получили по способам, описанным в Примерах 2, 4 и 5. Соединение 35 получили по таким же способам, как описаны в публикации Rouchaud et al., Eur. J. Org. Chem., 2011, 12, 2346-2353.
Пример 12. Получение Соединения 40
Figure 00000386
Соединение 38 получили по способам, представленным в Примере 11.
Пример 13. Получение Соединения 44
Figure 00000387
Figure 00000388
Соединения 23 и 36 получили по способам, представленным в Примерах 5 и 11. Соединение 41 получили по таким же способам, как описаны в публикации WO 2009082607.
Figure 00000389
Соединение 43 получили по способам, представленным в Примере 13.
Пример 15. Получение Соединения 47
Figure 00000390
Соединение 46 коммерчески доступно.
Пример 16. Получение Соединения 53
Figure 00000391
Соединения 48 и 49 коммерчески доступны. Соединения 17 и 47 получили так, как описано в способах в Примерах 4 и 15.
Пример 17. Получение Соединения 54
Figure 00000392
Соединение 53 получили по способам, представленным в Примере 16.
Пример 18. Получение Соединения 55
Figure 00000393
Соединение 53 получили по способам, представленным в Примере 16.
Пример 19. Общий способ получения конъюгированных ASO, содержащих GalNAc3-1 в 3'-положении, при помощи твердофазных методик (получение ISIS 647535, 647536 и 651900)
Если не указано иное, все реагенты и растворы, применяемые для синтеза олигомерных соединений, приобретены у коммерческих поставщиков. Стандартные фосфорамидитные строительные блоки и твердую подложку применили для внедрения нуклеозидных остатков, которые включают, например, остатки Т, A, G и mС. 0,1 М раствор фосфорамидита в безводном ацетонитриле применили для β-D-2'-дезоксирибонуклеозида и 2'-МОЕ.
Синтез антисмысловых олигонуклеотидов (ASO) выполнили на синтезаторе ABI 394 (в масштабе 1-2 мкмоль) или на синтезаторе
Figure 00000394
Oligopilot производства GE Healthcare Bioscience (в масштабе 40-200 мкмоль) по способу фосфорамидитного связывания на твердой подложке VIMAD, наполненной GalNAc3-1 (110 мкмоль/г, Guzaev et al., 2003), упакованной в колонку. Для стадии связывания фосфорамидиты вводили в 4-кратном избытке по сравнению с загрузкой на твердой подложке, а конденсацию фосфорамидита выполняли в течение 10 минут. Все остальные стадии выполняли по протоколам, предоставленным производителем. Для удаления диметокситритильной (DMT) группы с 5'-гидроксильной группы нуклеотида применили 6% раствор дихлоруксусной кислоты в толуоле. На стадии связывания в качестве активатора применили 4,5-дицианоимидазол (0,7 М) в безводном CH3CN. Тиофосфатные связи внедряли сульфированием при помощи 0,1 М раствора гидрида ксантана в 1:1 смеси пиридина/СН3СN в течение 3 минут времени контакта. В качестве окислительного агента для обеспечения фосфодиэфирных межнуклеозидных связей применили 20% раствор трет-бутилгидропероксида в CH3CN, содержащий 6% воды, в течение 12 минут времени контакта.
После сборки требуемой последовательности цианоэтил-фосфатные защитные группы снимали при помощи 1:1 (об./об.) смеси триэтиламина и ацетонитрила в течение 45 минут времени контакта. Связанные с твердой подложкой ASO суспендировали в водном растворе аммиака (28-30 масс. %) и нагревали при 55°С в течение 6 часов.
Затем отфильтровывали не связанные ASO и выпаривали аммиак кипячением. Остаток очищали жидкостной хроматографией высокого давления на сильной анионообменной колонке (GE Healthcare Bioscience, Source 30Q, 30 мкм, 2,54×8 см, А=100 мМ ацетата аммония в 30% водном CH3CN, В=1,5 М NaBr в А, 0-40% В за 60 мин., скорость потока 14 мл.мин-1, λ=260 нм). Остаток обессоливали при помощи ВЭЖХ на обращенно-фазовой колонке с получением заданных ASO с выделенным выходом 15-30% относительно первоначальной загрузки на твердую подложку. ASO характеризовали при помощи ион-парной ВЭЖХ, совмещенной с МС-анализом на системе Agilent 1100 MSD.
Антисмысловые олигонуклеотиды, не содержащие конъюгат, синтезировали по стандартным способам синтеза олигонуклеотидов, общеизвестным в данной области техники.
Применяя эти способы, получили три отдельных антисмысловых соединения, нацеленных на АроС III. Как показано ниже в Таблице 17, каждое из трех антисмысловых соединений, нацеленных на АроС III, имеет одну и ту же последовательность азотистых
оснований. ISIS 304801 представляет собой 5-10-5 МОЕ гэпмер, содержащий только тиофосфатные связи; ISIS 647535 является таким же, как ISIS 304801, за исключением того, что он содержит GalNAc3-1, конъюгированный у его 3'-конца; и ISIS 647536 является таким же, как ISIS 647535, за исключением того, что некоторые межнуклеозидные связи этого соединения представляют собой фосфодиэфирные связи. Как дополнительно показано в Таблице 17, были синтезированы два отдельных антисмысловых соединения, нацеленных на SRB-1. ISIS 440762 представляет собой 2-10-2 cEt гэпмер, содержащий только тиофосфатные межнуклеозидные связи; ISIS 651900 является таким же, как ISIS 440762, за исключением того, что он содержит GalNAc3-1 у его 3'-конца.
Figure 00000395
Нижние индексы: «е» означает 2'-МОЕ модифицированный нуклеозид; «d» означает β-D-2'-дезоксирибонуклеозид; «k» означает 6'-(S)-СН3 бициклический нуклеозид (например, сЕt); «s» означает тиофосфатные межнуклеозидные связи (PS); «о» означает фосфодиэфирные межнуклеозидные связи (РО); и «o'» означает -O-Р(=O)(ОН)-. Верхний индекс «m» означает 5-метилцитозины. «GalNAc3-1» означает конъюгирующую группу, имеющую структуру, изображенную ранее в Примере 9. Следует отметить, что GalNAc3-1 содержит расщепляемый аденозин, который связывает ASO с остальной частью конъюгата, который обозначен как «GalNAc3-1a». Номенклатура, используемая в представленной выше таблице, показывает полную последовательность азотистых оснований, включая аденозин, который является частью конъюгата. Следовательно, в представленной выше таблице последовательности
также могут быть перечислены с окончанием «GalNAc3-1», без «Аdo». Такое условное применение нижнего индекса «а» для обозначения части конъюгирующие группы, не содержащей расщепляемого нуклеозида или расщепляемого фрагмента, используется во всех представленных Примерах. Эта часть конъюгирующие группы, не содержащая расщепляемого фрагмента, упоминается в настоящем документе как «кластер» или «кластер конъюгата» или «кластер GalNAc3». В некоторых случаях конъюгирующая группа для удобства описана путем отдельного представления ее кластера и ее расщепляемого фрагмента.
Пример 20. Дозозависимое антисмысловое ингибирование человеческого АроС III у huApoC III трансгенных мышей
ISIS 304801 и ISIS 647535, каждый из которых нацелен на человеческий АроС III и описан выше, отдельно испытывали и оценивали в дозозависимом исследовании на их способность ингибировать человеческий АроС III у трансгенных мышей с человеческим АроС III.
Лечение
Трансгенных мышей с человеческим АроСIII содержали при 12-часовом цикле освещения/темноты и обеспечивали свободный доступ к пище Teklad lab. До начала эксперимента животных акклиматизировали по меньшей мере в течение 7 дней в исследовательской лаборатории. Приготовили ASO в PBS и стерилизовали фильтрованием через фильтр 0,2 микрона. ASO растворили в 0,9% PBS для инъекций.
Трансгенным мышам с человеческим АроС III один раз в неделю в течение двух неделю внутрибрюшинно вводили инъекции ISIS 304801 или 647535 при 0,08, 0,25, 0,75, 2,25 или 6,75 мкмоль/кг или PBS в качестве контрольного образца. Каждая экспериментальная группа состояла из 4 животных. Через сорок восемь часов после введения последней дозы каждую мышь обескровили и усыпили, и собрали ткани.
Анализ мРНК АроС III
Уровни мРНК АроС III в печени мышей определили при помощи ПЦР в реальном времени и реагента для количественного определения РНК RIBOGREEN® (Molecular Probes, Inc. Юджин, штат Орегон) по стандартным протоколам. Уровни мРНК АроС III определяли
относительно общей РНК (при помощи Ribogreen), затем нормализовали к контрольному образцу, обработанному PBS. Результаты, показанные ниже, представлены как средний процент уровней мРНК АроС III для каждой экспериментальной группы, нормализованных к контрольному образцу, обработанному PBS, и обозначены как «% PBS». Ниже в Таблице 18 представлена также полумаксимальная эффективная доза (ED50) для каждого ASO.
Показано, что оба антисмысловых соединения снижают РНК АроС III, по сравнению с контрольным образцом, обработанным PBS. Кроме того, антисмысловое соединение, конъюгированное с GalNAc3-1 (ISIS 647535), было значительно более эффективным, чем антисмысловое соединение, не содержащее конъюгат GalNAc3-1 (ISIS 304801).
Figure 00000396
Анализ белка АроС III (турбидиметрический анализ)
Анализ белка АроС III в плазме выполнили по способам, описанным в работе Graham et al, Circulation Research, до печати опубликованной онлайн 29 марта 2013 года.
Приблизительно 100 мкл плазмы, выделенной из мышей, анализировали без разбавления, применяя клинический анализатор Olympus и имеющийся в продаже турбидиметрический аналитический набор АроС III (Kamiya, кат. № KAI-006, Kamiya Biomedical, Сиэтл, штат Вашингтон). Протокол анализа выполняли по описанию поставщика.
Как показано ниже в Таблице 19, оба антисмысловых соединения снижают белок АроС III, по сравнению с PBS контрольным образцом. Кроме того, антисмысловое соединение, конъюгированное с GalNAc3-1 (ISIS 647535), было значительно более эффективным, чем антисмысловое соединение, не содержащее конъюгат GalNAc3-1 (ISIS 304801).
Figure 00000397
Триглицериды и холестерин плазмы выделили по способу Bligh и Dyer (Bligh, E.G. аnd Dyer, W.J. Can. J. Biochem. Physiol. 37: 911-917, 1959) (Bligh, E and Dyer, W, Can J Biochem Physiol, 37, 911-917, 1959) (Bligh, E and Dyer, W, Can J Biochem Physiol, 37, 911-917, 1959) и измерили при помощи клинического анализатора Beckmann Coulter и имеющихся в продаже реагентов.
Уровни триглицеридов измерили относительно мышей, инъецированных PBS, и выразили как «% PBS». Результаты представлены в Таблице 20. Показано, что оба антисмысловых соединения снижают уровни триглицеридов. Кроме того, антисмысловое соединение, конъюгированное с GalNAc3-1 (ISIS 647535), было значительно, более эффективным, чем антисмысловое соединение, не содержащее конъюгат GalNAc3-1 (ISIS 304801).
Figure 00000398
Образцы плазмы анализировали при помощи ВЭЖХ для определения количества общего холестерина и различных фракций холестерина (HDL и LDL). Результаты представлены в Таблицах 21 и 22. Показано, что оба антисмысловых соединения снижают общие уровни холестерина; оба снижают LDL; и оба повышают HDL. Кроме того, антисмысловое соединение, конъюгированное с GalNAc3-1 (ISIS 647535), было значительно более эффективным, чем антисмысловое соединение, не содержащее конъюгат GalNAc3-1 (ISIS 304801). Увеличение уровней HDL и снижение уровней LDL представляет собой преимущественный сердечно-сосудистый эффект антисмыслового ингибирования-АроС III.
Figure 00000399
Figure 00000400
Figure 00000401
Фармакокинетический анализ (ФК)
Оценили также ФК ASO. Образцы печени и почек измельчили и экстрагировали по стандартным протоколам. Образцы анализировали на MSD1 при помощи ИП-ВЭЖХ-МС. Определили содержание (мкг/г) в ткани ISIS 304801 и 647535 полной длины, и результаты представлены в Таблице 23. Показано, что концентрации в печени антисмысловых соединений полной длины были схожими для двух антисмысловых соединений. Следовательно, даже несмотря на то, что GаINАс3-1-конъюгированное антисмысловое соединение является более активным в печени (как показано по данным РНК и белка, представленным выше), его содержание в печени не намного выше. Действительно, рассчитанное значение ЕС50 (представленное в Таблице 23) подтверждает, что наблюдаемое увеличение эффективности конъюгированного соединения не может быть приписано исключительно повышенному накоплению. Такой результат позволяет предположить, что конъюгат улучшает эффективность по другому механизму, чем простое накопление в печени, возможно за счет увеличения продуктивного захвата антисмыслового соединения в клетки.
Эти результаты показывают также, что концентрация GalNAc3-1-конъюгированного антисмыслового соединения почках ниже, чем концентрация антисмыслового соединения, не содержащего конъюгат GalNAc. Это имеет несколько преимущественных терапевтически, применений. Для терапевтических показаний, в которых не требуется проявление активности в почках, воздействие на почки подвергает их риску токсичности без соответствующей пользы. Более того, высокая концентрация в почках обычно приводит к выводу соединения с мочой, обеспечивая более быстрое выведение. Соответственно, для внепочечных мишеней накопление в почках является нежелательным. Эти данные позволяют предположить, что конъюгация с GalNAc3-1 снижает накопление в почках.
Figure 00000402
Figure 00000403
Идентифицировали также метаболиты ISIS 647535 и подтвердили их массы при помощи масс-спектрометрического анализа высокого разрешения. Сайты расщепления и структуры наблюдаемых метаболитов представлены ниже. Относительный % от общей длины ASO рассчитали по стандартным приемам, а результаты представлены в Таблице 23а. Основной метаболит ISIS 647535 представляет собой ASO полной длины без всего конъюгата (то есть ISIS 304801), который образуется в результате расщепления по сайту расщепления А, представленному ниже. Кроме того, наблюдали также дополнительные метаболиты, образующиеся из других сайтов расщепления. Эти результаты позволяют предположить, что может быть пригодным также внедрение других расщепляемых связей, таких как сложные эфиры, пептиды, дисульфиды, фосфорамидаты или ацил-гидразоны, между caxapoм. GalNAc3-1 и ASO, которые могут расщепляться под действием ферментов внутри клетки или которые могут расщепляться в восстановительной среде цитозоля, или которые лабильны в кислотном pН внутри эндосом и лизосом.
Figure 00000404
Figure 00000405
Figure 00000406
Figure 00000407
Пример 21. Антисмысловое ингибирование человеческого АроС III у трансгенных мышей с АроС III в исследовании одного введения
ISIS 304801, 647535 и 647536, каждый из которых нацелен на человеческий АроС III и описан в Таблице 17, дополнительно оценивали в исследовании однокраного введения на их способность ингибировать человеческий АроС III у трансгенных мышей с человеческим АроС III.
Лечение
Трансгенных мышей с человеческим АроСIII содержали при 12-часовом цикле освещения/темноты и обеспечивали свободный доступ к пище Teklad lab. До начала эксперимента животных акклиматизировали по меньшей мере в течение 7 дней в исследовательской лаборатории. Приготовили ASO в PBS и стерилизовали фильтрованием через фильтр 0,2 микрона. ASO растворили в 0,9% PBS для инъекций.
Трансгенным мышам с человеческим АроС III внутрибрюшинно ввели однократную инъекцию дозы, представленной ниже, соединения ISIS 304801, 647535 или 647536 (описанных выше), или PBS в качестве контрольного образца. Экспериментальная группа состояла из 3 животных, а контрольная группа состояла из 4 животных. Перед лечением, а также после последней дозы у каждой мыши брали кровь и анализировали образцы плазмы. Мышей усыпили через 72 часа после последнего введения.
Образцы собрали и анализировали для определения уровней мРНК АроС III и белка в печени; триглицеридов в плазме; и холестерина, включая фракции HDL и LDL, которые анализировали так, как описано выше (Пример 20). Данные этих анализов представлены ниже в Таблицах 24-28. Уровни трансаминазы в печени, аланин-аминотрансферазы (ALT) и аспартат-аминотрансферазы (AST) в сыворотке измеряли относительно мышей, инъецированных солевым раствором, применяя стандартные протоколы. Уровни ALT и AST показали, что антисмысловые соединения хорошо переносятся при всех введенных дозах.
Эти результаты демонстрируют усиление эффективности антисмысловых соединений, содержащих конъюгат GalNAc3-1 на 3'-конце (ISIS 647535 и 647536), по сравнению с антисмысловым соединением, не содаржащим конъюгат GalNAc3-1 (ISIS 304801). Кроме того, ISIS 647536, который содержит конъюгат GalNAc3-1 и несколько
фосфодиэфирных связей, был таким же эффективным, как ISIS 647535, который содержит тот же конъюгат, и все межнуклеозидные связи в этом ASO являются тиофосфатными.
Figure 00000408
Figure 00000409
Figure 00000410
Figure 00000411
Figure 00000412
Figure 00000413

Claims (52)

1. Соединение, специфически ингибирующее экспрессию нуклеиновой кислоты аро(а) и/или белка аро(а), содержащее модифицированный олигонуклеотид и конъюгирующую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов, причем модифицированный олигонуклеотид является комплементарным нуклеиновой кислоте аро(а), и причем конъюгирующая группа содержит:
Figure 00000414
где модифицированный олигонуклеотид представляет собой олигонуклеотид, содержащий по меньшей мере один модифицированный сахарный фрагмент, модифицированную межнуклеозидную связь и/или модифицированное азотистое основание.
2. Соединение по п. 1, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8 смежных азотистых оснований, комплементарных равной по длине части любой из SEQ ID NO: 1-4.
3. Соединение по п. 1, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид имеет последовательность азотистых оснований, содержащую часть из по меньшей мере 8 смежных азотистых оснований, комплементарных равной по длине части азотистых оснований 3901-3920 SEQ ID NO: 1, причем указанная последовательность азотистых оснований модифицированного олигонуклеотида по меньшей мере на 80% комплементарна SEQ ID NO: 1.
4. Соединение по п. 1, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8 смежных азотистых оснований последовательности азотистых оснований, выбранной из любой из SEQ ID NO: 11-130, 133 и 134.
5. Соединение по п. 4, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8 смежных азотистых оснований последовательности азотистых оснований SEQ ID NO: 58.
6. Соединение по любому из пп. 1-5, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид является одноцепочечным или двухцепочечным.
7. Соединение по любому из пп. 1-5, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну модифицированную межнуклеозидную связь.
8. Соединение по п. 7, отличающееся тем, что модифицированная межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
9. Соединение по п. 7, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
10. Соединение по п. 9, отличающееся тем, что каждая межнуклеозидная связь модифицированного олигонуклеотида выбрана из фосфодиэфирной межнуклеозидной связи и тиофосфатной межнуклеозидной связи.
11. Соединение по п. 7, отличающееся тем, что каждая межнуклеозидная связь модифицированного олигонуклеотида представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
12. Соединение по любому из пп. 1-5 и 8-11, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный сахар.
13. Соединение по п. 12, отличающееся тем, что по меньшей мере один модифицированный сахар представляет собой бициклический сахар, необязательно стерически затрудненный этил или бициклический сахар имеют 4'-(СН2)n-O-2' мостик, где n равен 1 или 2.
14. Соединение по п. 12, отличающееся тем, что по меньшей мере один модифицированный сахар содержит 2'-O-метоксиэтил, 3'-фтор-ГНК (гекситоловая нуклеиновая кислота).
15. Соединение по любому из пп. 1-5 и 8-11, отличающееся тем, что по меньшей мере один нуклеозид содержит модифицированное азотистое основание.
16. Соединение по п. 15, отличающееся тем, что модифицированное азотистое основание представляет собой 5-метилцитозин.
17. Соединение по любому из пп. 1-5 и 8-11, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит:
сегмент гэп, состоящий из связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент крыла 5', состоящий из связанных нуклеозидов;
сегмент крыла 3', состоящий из связанных нуклеозидов;
причем сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', и при этом каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит модифицированный сахар.
18. Соединение по любому из пп. 1-5 и 8-11, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид состоит из 15-30, 18-24, 19-22, 13-25, 14-25, 15-25, 16 или 20 связанных нуклеозидов.
19. Соединение по п. 1, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов и имеет последовательность азотистых оснований, содержащую по меньшей мере 8 смежных азотистых оснований из SEQ ID NO: 58, при этом модифицированный олигонуклеотид содержит:
сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов;
сегмент крыла 3', состоящий из пяти связанных нуклеозидов;
при этом сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', и каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, и по меньшей мере одна межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
20. Соединение по п. 1, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид состоит из 20 связанных нуклеозидов и имеет последовательность азотистых оснований SEQ ID NO: 58 и содержит:
сегмент гэп, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент крыла 5', состоящий из пяти связанных нуклеозидов;
сегмент крыла 3', состоящий из пяти связанных нуклеозидов;
при этом сегмент гэп расположен между сегментом крыла 5' и сегментом крыла 3', и каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтиловый сахар, и по меньшей мере одна межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфатную связь, и каждый цитозиновый остаток представляет собой 5-метилцитозин.
21. Соединение по любому из пп. 1-5, 8-11, 19 и 20, отличающееся тем, что конъюгирующая группа связана с модифицированным олигонуклеотидом на 5'-конце модифицированного олигонуклеотида.
22. Соединение по любому из пп. 1-5, 8-11, 19 и 20, отличающееся тем, что конъюгирующая группа связана с модифицированным олигонуклеотидом на 3'-конце модифицированного олигонуклеотида.
23. Соединение по п. 1, отличающееся тем, что соединение содержит конъюгированный модифицированный олигонуклеотид ISIS 681257 или состоит из него.
24. Соединение, специфически ингибирующее экспрессию нуклеиновой кислоты аро(а) и/или белка аро(а), имеющее следующую формулу:
Figure 00000415
25. Соединение по любому из 1-5, 8-11, 19, 20, 23 и 24, отличающееся тем, что соединение представлено в форме соли, необязательно при этом соединение представлено в форме соли натрия.
26. Композиция для лечения, предупреждения или замедления прогрессирования заболевания, связанного с повышенной экспрессией аро(а) и/или повышенной экспрессией Lp(a), содержащая терапевтически эффективное количество соединения по п. 1 и по меньшей мере один фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.
27. Способ предупреждения, лечения, облегчения или замедления прогрессирования заболевания, связанного с повышенной экспрессией аро(а) и/или повышенной экспрессией Lp(a), включающий введение животному соединения по любому из пп. 1-25 или композиции по п. 26.
28. Способ по п. 27, отличающийся тем, что животным является человек.
29. Способ по п. 28, отличающийся тем, что заболевание представляет собой воспалительное, сердечно-сосудистое или метаболическое заболевание, расстройство или состояние.
30. Способ по п. 29, отличающийся тем, что сердечно-сосудистое заболевание, расстройство или состояние представляет собой стенокардию или стеноз аортального отверстия.
31. Способ по п. 28, включающий совместное введение указанного соединения или композиции и второго агента, причем второй агент представляет собой ниацин, никотиновую кислоту, ингибитор ароВ, ингибитор СЕТР, ингибитор аро(а), аналог гормона щитовидной железы, ингибитор редуктазы HMG-CoA, фибрат, ингибитор микросомального белка-переносчика триглицеридов, агент, понижающий уровень аро(а), агент, понижающий уровень Lp(a), агент для лечения болезни Альцгеймера, агент, понижающий уровень холестерина, агент, понижающий уровень липидов не-HDL, агент, понижающий уровень триглицеридов, агент, повышающий уровень HDL, статин, агент, понижающий уровень глюкозы или противовоспалительный агент, такой как нестероидное противовоспалительное лекарственное средство.
32. Способ по п. 31, отличающийся тем, что указанное соединение или композицию и второй агент вводят совместно.
33. Способ по п. 26, отличающийся тем, что введение является парентеральным.
34. Способ по п. 26, отличающийся тем, что введение является подкожным.
35. Композиция, содержащая терапевтически эффективное количество соединения по п. 24 или 25 для применения для лечения, предупреждения или замедления прогрессирования заболевания, связанного с повышенной экспрессией аро(а) и/или повышенной экспрессией Lp(a).
36. Композиция по п. 35, отличающаяся тем, что заболевание представляет собой сердечно-сосудистое и/или метаболическое заболевание, расстройство или состояние.
37. Композиция по п. 36, отличающаяся тем, что сердечно-сосудистое заболевание, расстройство или состояние представляет собой стенокардию или стеноз аортального отверстия.
RU2015151200A 2013-05-01 2014-05-01 Композиции и способы модулирования экспрессии аполипопротеина (а) RU2699985C2 (ru)

Applications Claiming Priority (15)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201361818442P 2013-05-01 2013-05-01
US61/818,442 2013-05-01
US201361823826P 2013-05-15 2013-05-15
US61/823,826 2013-05-15
US201361843887P 2013-07-08 2013-07-08
US61/843,887 2013-07-08
US201361871673P 2013-08-29 2013-08-29
US61/871,673 2013-08-29
US201361880790P 2013-09-20 2013-09-20
US61/880,790 2013-09-20
US201461976991P 2014-04-08 2014-04-08
US61/976,991 2014-04-08
US201461986867P 2014-04-30 2014-04-30
US61/986,867 2014-04-30
PCT/US2014/036460 WO2014179625A1 (en) 2013-05-01 2014-05-01 COMPOSITIONS AND METHODS FOR MODULATING APOLIPOPROTEIN (a) EXPRESSION

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2019128126A Division RU2824214C1 (ru) 2013-05-15 2014-05-01 Композиции и способы модулирования экспрессии аполипопротеина (a)

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2015151200A3 RU2015151200A3 (ru) 2019-01-14
RU2015151200A RU2015151200A (ru) 2019-01-14
RU2699985C2 true RU2699985C2 (ru) 2019-09-11

Family

ID=51843959

Family Applications (8)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2015151204A RU2686080C2 (ru) 2013-05-01 2014-05-01 Композиции и способы
RU2018112167A RU2018112167A (ru) 2013-05-01 2014-05-01 Композиции и способы модулирования экспрессии аполипопротеина c-iii
RU2015151200A RU2699985C2 (ru) 2013-05-01 2014-05-01 Композиции и способы модулирования экспрессии аполипопротеина (а)
RU2019110030A RU2019110030A (ru) 2013-05-01 2014-05-01 Композиции и способы
RU2019124314A RU2019124314A (ru) 2013-05-01 2014-05-01 Сопряженные антисмысловые соединения и их применение
RU2015151203A RU2650510C2 (ru) 2013-05-01 2014-05-01 Композиции и способы модулирования экспрессии аполипопротеина c-iii
RU2015151199A RU2697152C2 (ru) 2013-05-01 2014-05-01 Сопряженные антисмысловые соединения и их применение
RU2015151202A RU2670614C9 (ru) 2013-05-01 2014-05-01 Композиции и способы модулирования экспрессии hbv и ttr

Family Applications Before (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2015151204A RU2686080C2 (ru) 2013-05-01 2014-05-01 Композиции и способы
RU2018112167A RU2018112167A (ru) 2013-05-01 2014-05-01 Композиции и способы модулирования экспрессии аполипопротеина c-iii

Family Applications After (5)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2019110030A RU2019110030A (ru) 2013-05-01 2014-05-01 Композиции и способы
RU2019124314A RU2019124314A (ru) 2013-05-01 2014-05-01 Сопряженные антисмысловые соединения и их применение
RU2015151203A RU2650510C2 (ru) 2013-05-01 2014-05-01 Композиции и способы модулирования экспрессии аполипопротеина c-iii
RU2015151199A RU2697152C2 (ru) 2013-05-01 2014-05-01 Сопряженные антисмысловые соединения и их применение
RU2015151202A RU2670614C9 (ru) 2013-05-01 2014-05-01 Композиции и способы модулирования экспрессии hbv и ttr

Country Status (40)

Country Link
US (27) US9714421B2 (ru)
EP (13) EP3828275A1 (ru)
JP (23) JP6387084B2 (ru)
KR (17) KR102482890B1 (ru)
CN (13) CN111593051A (ru)
AU (20) AU2014259759B2 (ru)
BR (6) BR112015027319A8 (ru)
CA (5) CA2921509C (ru)
CL (2) CL2015003217A1 (ru)
CR (2) CR20190269A (ru)
CY (2) CY1121879T1 (ru)
DK (4) DK3524680T3 (ru)
DO (3) DOP2015000268A (ru)
EA (2) EA036584B1 (ru)
ES (4) ES2730015T3 (ru)
FI (1) FIC20250028I1 (ru)
FR (1) FR25C1033I1 (ru)
HR (2) HRP20190987T1 (ru)
HU (2) HUE050394T2 (ru)
IL (19) IL315582A (ru)
LT (2) LT2992009T (ru)
MA (1) MA60161B1 (ru)
ME (1) ME03390B (ru)
MX (12) MX373306B (ru)
MY (2) MY178929A (ru)
NL (1) NL301341I2 (ru)
NO (1) NO2025037I1 (ru)
NZ (5) NZ631537A (ru)
PE (2) PE20152002A1 (ru)
PH (3) PH12015502493B1 (ru)
PL (2) PL2992098T3 (ru)
PT (3) PT3524680T (ru)
RS (2) RS60796B1 (ru)
RU (8) RU2686080C2 (ru)
SG (5) SG10201906382QA (ru)
SI (2) SI2992009T1 (ru)
SM (1) SMT201900316T1 (ru)
UA (2) UA120287C2 (ru)
WO (5) WO2014179620A1 (ru)
ZA (2) ZA201507216B (ru)

Families Citing this family (504)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN104212799B (zh) 2008-10-15 2018-11-23 Ionis制药公司 因子11表达的调节
RU2015151857A (ru) 2008-12-02 2019-01-15 Уэйв Лайф Сайенсес Джапан, Инк. Способ синтеза модифицированных по атому фосфора нуклеиновых кислот
MX342945B (es) 2009-07-06 2016-10-18 Ontorii Inc * Profármacos de ácido nucleico novedosos y métodos de uso de los mismos.
US10428019B2 (en) 2010-09-24 2019-10-01 Wave Life Sciences Ltd. Chiral auxiliaries
AU2011329777B2 (en) 2010-11-17 2016-06-09 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of alpha synuclein expression
EP3248982A1 (en) 2011-07-19 2017-11-29 Wave Life Sciences Ltd. Thiosulfonate reagents for the synthesis of functionalized nucleic acids
EP2751270B1 (en) 2011-08-29 2018-08-22 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Oligomer-conjugate complexes and their use
WO2013148260A1 (en) 2012-03-30 2013-10-03 Washington University Methods for modulating tau expression for reducing seizure and modifying a neurodegenerative syndrome
EP2839006B1 (en) * 2012-04-20 2018-01-03 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleotides and uses thereof
WO2013173789A2 (en) 2012-05-17 2013-11-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense oligonucleotide compositions
US9574193B2 (en) 2012-05-17 2017-02-21 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for modulating apolipoprotein (a) expression
HRP20201426T1 (hr) * 2012-05-24 2020-11-27 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Postupci i pripravci za moduliranje ekspresije apolipoproteina (a)
CA2879023C (en) 2012-07-13 2017-03-28 Wave Life Sciences Japan Asymmetric auxiliary group
CN104661664B (zh) 2012-07-13 2020-07-03 波涛生命科学有限公司 手性控制
CA2879066C (en) 2012-07-13 2019-08-13 Shin Nippon Biomedical Laboratories, Ltd. Chiral nucleic acid adjuvant
SG11201503821YA (en) 2012-11-15 2015-06-29 Roche Innovation Ct Copenhagen As Oligonucleotide conjugates
RU2649367C2 (ru) * 2013-01-30 2018-04-02 Ф. Хоффманн-Ля Рош Аг Конъюгаты углевода и lna-олигонуклеотида
CA3170716A1 (en) * 2013-02-14 2014-08-21 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of apolipoprotein c-iii (apociii) expression in lipoprotein lipase deficient (lpld) populations
TW201446791A (zh) 2013-05-01 2014-12-16 Regulus Therapeutics Inc 用於調節mir-122之微小rna化合物及方法
CA2909868C (en) 2013-05-01 2021-10-19 Regulus Therapeutics Inc. Compounds and methods for enhanced cellular uptake
KR102482890B1 (ko) 2013-05-01 2022-12-30 아이오니스 파마수티컬즈, 인코포레이티드 아포지질단백질 (a) 발현을 조절하는 조성물 및 방법
DK3013959T3 (da) * 2013-06-27 2020-02-17 Roche Innovation Ct Copenhagen As Antisense-oligomerer og konjugater målrettet pcsk9
DK3019200T3 (da) * 2013-07-11 2022-06-20 Alnylam Pharmaceuticals Inc Oligonukleotid-ligand-konjugater og fremgangsmåde til fremstiling deraf
JP6617702B2 (ja) 2013-07-15 2019-12-11 ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア Fty720のアザサイクリック拘束アナログ
TW202246503A (zh) 2013-07-19 2022-12-01 美商百健Ma公司 用於調節τ蛋白表現之組合物
US9943604B2 (en) 2013-09-20 2018-04-17 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Targeted therapeutic nucleosides and their use
US10077444B2 (en) * 2013-10-02 2018-09-18 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for inhibiting expression of the LECT2 gene
US11162096B2 (en) 2013-10-14 2021-11-02 Ionis Pharmaceuticals, Inc Methods for modulating expression of C9ORF72 antisense transcript
WO2015061536A1 (en) 2013-10-25 2015-04-30 Regulus Therapeutics Inc. Microrna compounds and methods for modulating mir-21 activity
JP2017501684A (ja) * 2013-11-14 2017-01-19 ロシュ・イノベーション・センター・コペンハーゲン・アクティーゼルスカブRoche Innovation Center Copenhagen A/S Apobアンチセンスコンジュゲート化合物
WO2015105083A1 (ja) * 2014-01-07 2015-07-16 塩野義製薬株式会社 アンチセンスオリゴヌクレオチド及び糖誘導体を含む二本鎖オリゴヌクレオチド
US10144933B2 (en) 2014-01-15 2018-12-04 Shin Nippon Biomedical Laboratories, Ltd. Chiral nucleic acid adjuvant having immunity induction activity, and immunity induction activator
JPWO2015108048A1 (ja) 2014-01-15 2017-03-23 株式会社新日本科学 抗腫瘍作用を有するキラル核酸アジュバンド及び抗腫瘍剤
US10322173B2 (en) 2014-01-15 2019-06-18 Shin Nippon Biomedical Laboratories, Ltd. Chiral nucleic acid adjuvant having anti-allergic activity, and anti-allergic agent
MX2016009290A (es) 2014-01-16 2017-02-28 Wave Life Sciences Ltd Diseño quiral.
EA201691587A1 (ru) 2014-02-11 2017-01-30 Элнилэм Фармасьютикалз, Инк. КОМПОЗИЦИИ НА ОСНОВЕ iRNA ДЛЯ КЕТОГЕКСОКИНАЗЫ (KHK) И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ
US10006027B2 (en) 2014-03-19 2018-06-26 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods for modulating Ataxin 2 expression
WO2015143246A1 (en) 2014-03-19 2015-09-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions for modulating ataxin 2 expression
MY192634A (en) 2014-04-01 2022-08-29 Biogen Ma Inc Compositions for modulating sod-1 expression
CN110903337A (zh) 2014-05-01 2020-03-24 Ionis制药公司 用于调节生长激素受体表达的组合物和方法
US10098959B2 (en) * 2014-05-01 2018-10-16 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Method for synthesis of reactive conjugate clusters
PE20170010A1 (es) * 2014-05-01 2017-03-04 Ionis Pharmaceuticals Inc Composiciones y metodos para modular la expresion del factor b del complemento
SI3137605T1 (sl) 2014-05-01 2021-02-26 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Sestavki in metode za modulacijo ekspresije angiopoetin 3-podobnega
CN106232125B (zh) 2014-05-01 2020-10-16 Ionis制药公司 用于调节pkk表达的组合物和方法
GB201408623D0 (en) * 2014-05-15 2014-07-02 Santaris Pharma As Oligomers and oligomer conjugates
JP6811094B2 (ja) 2014-05-22 2021-01-13 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッドAlnylam Pharmaceuticals, Inc. アンジオテンシノーゲン(AGT)iRNA組成物およびその使用
GB201410693D0 (en) 2014-06-16 2014-07-30 Univ Southampton Splicing modulation
RU2017105342A (ru) 2014-08-07 2018-09-13 Регулус Терапьютикс Инк. НАЦЕЛИВАНИЕ НА микроРНК ПРИ РАССТРОЙСТВАХ ОБМЕНА ВЕЩЕСТВ
US10436802B2 (en) 2014-09-12 2019-10-08 Biogen Ma Inc. Methods for treating spinal muscular atrophy
EP3201339A4 (en) 2014-10-03 2018-09-19 Cold Spring Harbor Laboratory Targeted augmentation of nuclear gene output
KR20170068469A (ko) 2014-10-10 2017-06-19 에프. 호프만-라 로슈 아게 GalNAc 포스포라미다이트, 그의 핵산 컨쥬게이트 및 그의 용도
WO2016061487A1 (en) * 2014-10-17 2016-04-21 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Polynucleotide agents targeting aminolevulinic acid synthase-1 (alas1) and uses thereof
JOP20200092A1 (ar) * 2014-11-10 2017-06-16 Alnylam Pharmaceuticals Inc تركيبات iRNA لفيروس الكبد B (HBV) وطرق لاستخدامها
EP3221451A1 (en) * 2014-11-17 2017-09-27 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Apolipoprotein c3 (apoc3) irna compositions and methods of use thereof
WO2016100716A1 (en) 2014-12-18 2016-06-23 Vasant Jadhav Reversirtm compounds
WO2016112132A1 (en) 2015-01-06 2016-07-14 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions for modulating expression of c9orf72 antisense transcript
WO2016115490A1 (en) 2015-01-16 2016-07-21 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulation of dux4
CA2976445A1 (en) 2015-02-13 2016-08-18 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Patatin-like phospholipase domain containing 3 (pnpla3) irna compositions and methods of use thereof
CA2976688A1 (en) 2015-02-15 2016-08-18 Ribo Task Aps Acyl-amino-lna and/or hydrocarbyl-amino-lna oligonucleotides
US11129844B2 (en) 2015-03-03 2021-09-28 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for modulating MECP2 expression
JP6833705B2 (ja) * 2015-04-03 2021-02-24 アイオーニス ファーマシューティカルズ, インコーポレーテッドIonis Pharmaceuticals,Inc. Tmprss6発現を調節するための化合物及び方法
WO2016161388A1 (en) 2015-04-03 2016-10-06 University Of Massachusetts Fully stabilized asymmetric sirna
US10745702B2 (en) 2015-04-08 2020-08-18 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for inhibiting expression of the LECT2 gene
US10407678B2 (en) 2015-04-16 2019-09-10 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions for modulating expression of C9ORF72 antisense transcript
EP3286310A4 (en) 2015-04-24 2019-01-09 California Institute of Technology REACTIVATION OF X-CHROMOSOME GENES
EP3310918B1 (en) 2015-06-18 2020-08-05 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Polynucleotide agents targeting hydroxyacid oxidase (glycolate oxidase, hao1) and methods of use thereof
WO2016209862A1 (en) 2015-06-23 2016-12-29 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Glucokinase (gck) irna compositions and methods of use thereof
CA2990699A1 (en) 2015-06-29 2017-01-05 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modified crispr rna and modified single crispr rna and uses thereof
US10494632B2 (en) 2015-07-10 2019-12-03 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Insulin-like growth factor binding protein, acid labile subunit (IGFALS) compositions and methods of use thereof
PE20180800A1 (es) 2015-07-10 2018-05-09 Ionis Pharmaceuticals Inc Moduladores de diaciglicerol aciltransferasa 2 (dgat2)
US20180193471A1 (en) * 2015-07-16 2018-07-12 Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd. ß2GPI GENE EXPRESSION-SUPPRESSING NUCLEIC ACID CONJUGATE
MA43072A (fr) 2015-07-22 2018-05-30 Wave Life Sciences Ltd Compositions d'oligonucléotides et procédés associés
PL3331892T3 (pl) 2015-08-06 2019-11-29 Hoffmann La Roche Sposób wytwarzania pochodnych kwasu GalNAc
CN105111118B (zh) * 2015-08-14 2017-04-12 天津小新医药科技有限公司 L‑薄荷醇类p2y12受体拮抗剂、制备方法及其用途
WO2017030973A1 (en) 2015-08-14 2017-02-23 University Of Massachusetts Bioactive conjugates for oligonucleotide delivery
CN105111119B (zh) * 2015-08-14 2017-04-12 天津小新医药科技有限公司 一类卤代苯l‑薄荷醇类p2y12受体拮抗剂及其用途
DK3341479T3 (da) 2015-08-24 2020-02-24 Roche Innovation Ct Copenhagen As LNA-G-Proces
SG10202007937SA (en) 2015-09-02 2020-09-29 Alnylam Pharmaceuticals Inc PROGRAMMED CELL DEATH 1 LIGAND 1 (PD-L1) iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
EP3352753A4 (en) 2015-09-24 2019-03-13 The Regents of The University of California SYNTHETIC SPHINGOLIPIDE-SIMILAR MOLECULES, MEDICAMENTS, METHODS FOR THEIR SYNTHESIS AND TREATMENT PROCEDURES
TW201723176A (zh) 2015-09-24 2017-07-01 Ionis製藥公司 Kras表現之調節劑
US10533175B2 (en) 2015-09-25 2020-01-14 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for modulating Ataxin 3 expression
WO2017053720A1 (en) * 2015-09-25 2017-03-30 Tarveda Therapeutics, Inc. RNAi CONJUGATES, PARTICLES AND FORMULATIONS THEREOF
US11116843B2 (en) 2015-09-25 2021-09-14 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Conjugated antisense compounds and their use
US20210052631A1 (en) * 2015-09-25 2021-02-25 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Conjugated antisense compounds and their use
JOP20210043A1 (ar) * 2015-10-01 2017-06-16 Arrowhead Pharmaceuticals Inc تراكيب وأساليب لتثبيط تعبير جيني للـ lpa
EP3355932B1 (en) 2015-10-02 2023-04-12 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotide conjugation process
CA2998898A1 (en) 2015-10-08 2017-04-13 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulating angiotensinogen expression
EP3359685A1 (en) 2015-10-09 2018-08-15 University Of Southampton Modulation of gene expression and screening for deregulated protein expression
US10955407B2 (en) 2015-10-22 2021-03-23 Roche Innovation Center Copenhagen A/S In vitro toxicity screening assay
WO2017068087A1 (en) 2015-10-22 2017-04-27 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotide detection method
DK4119569T3 (da) 2015-11-06 2024-08-12 Ionis Pharmaceuticals Inc Konjugerede antisense-forbindelser til anvendelse i behandling
CA2999341A1 (en) * 2015-11-06 2017-05-11 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulating apolipoprotein (a) expression
ES2848122T3 (es) * 2015-11-16 2021-08-05 Hoffmann La Roche Fosforamidita de agrupación de GalNAc
WO2017096395A1 (en) 2015-12-04 2017-06-08 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods of treating breast cancer
KR102604132B1 (ko) 2015-12-14 2023-11-17 콜드스프링하버러보러토리 상염색체 우성 정신 지체 5 및 드라베 증후군의 치료를 위한 안티센스 올리고머
US11096956B2 (en) 2015-12-14 2021-08-24 Stoke Therapeutics, Inc. Antisense oligomers and uses thereof
EP3397288A4 (en) 2015-12-31 2019-09-11 Ionis Pharmaceuticals, Inc. PROCESS FOR REDUCING ATAXIN-2 EXPRESSION
EP3400300A4 (en) 2016-01-05 2019-08-07 Ionis Pharmaceuticals, Inc. PROCESS FOR REDUCING LRRK2 EXPRESSION
CA3011363A1 (en) 2016-01-12 2017-07-20 Interleukin Genetics, Inc. Methods for predicting response to treatment
BR112018015164A2 (pt) 2016-01-26 2018-12-26 Nissan Chemical Corp oligonucleotídeo de fita simples
ES2858090T3 (es) * 2016-01-29 2021-09-29 Kyowa Kirin Co Ltd Complejo de ácidos nucleicos
JP7749201B6 (ja) * 2016-01-31 2025-10-21 ユニバーシティー オブ マサチューセッツ 分岐オリゴヌクレオチド
CN109069529B (zh) 2016-03-07 2021-08-20 箭头药业股份有限公司 用于治疗性化合物的靶向配体
EP3426349A4 (en) 2016-03-09 2020-01-01 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for inhibiting pmp22 expression
AR108038A1 (es) 2016-03-14 2018-07-11 Roche Innovation Ct Copenhagen As Oligonucleótidos para reducir la expresión de pd-l1 (ligando de muerte programada-1)
US10577607B2 (en) 2016-03-16 2020-03-03 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of DYRK1B expression
EP3429690A4 (en) 2016-03-16 2019-10-23 Ionis Pharmaceuticals, Inc. METHOD FOR MODULATING KEAP1
EP3228326A1 (en) 2016-04-05 2017-10-11 Silence Therapeutics GmbH Nucleic acid linked to a trivalent glycoconjugate
MA45478A (fr) 2016-04-11 2019-02-20 Arbutus Biopharma Corp Compositions de conjugués d'acides nucléiques ciblés
WO2017180835A1 (en) 2016-04-13 2017-10-19 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods for reducing c9orf72 expression
EP3442983A1 (en) 2016-04-14 2019-02-20 H. Hoffnabb-La Roche Ag TRITYL-MONO-Ga1NAc COMPOUNDS AND THEIR USE
MA45295A (fr) 2016-04-19 2019-02-27 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composition d'arni de protéine de liaison de lipoprotéines haute densité (hdlbp/vigiline) et procédés pour les utiliser
SG11201809002RA (en) 2016-04-29 2018-11-29 Univ Nanyang Tech G-quadruplex-containing antisense oligonucleotides
MA45270A (fr) 2016-05-04 2017-11-09 Wave Life Sciences Ltd Compositions d'oligonucléotides et procédés associés
KR102608220B1 (ko) 2016-05-06 2023-11-29 아이오니스 파마수티컬즈, 인코포레이티드 Glp-1 수용체 리간드 모이어티 컨쥬게이트된 올리고뉴클레오티드 및 이의 용도
WO2017219017A1 (en) 2016-06-17 2017-12-21 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of gys1 expression
MA45496A (fr) 2016-06-17 2019-04-24 Hoffmann La Roche Molécules d'acide nucléique pour la réduction de l'arnm de padd5 ou pad7 pour le traitement d'une infection par l'hépatite b
EP3472348B1 (en) 2016-06-17 2022-06-29 F. Hoffmann-La Roche AG In vitro nephrotoxicity screening assay
JP7012033B2 (ja) 2016-06-17 2022-02-10 エフ.ホフマン-ラ ロシュ アーゲー インビトロ腎毒性スクリーニングアッセイ
WO2017220751A1 (en) 2016-06-22 2017-12-28 Proqr Therapeutics Ii B.V. Single-stranded rna-editing oligonucleotides
WO2018004004A1 (ja) * 2016-06-30 2018-01-04 協和発酵キリン株式会社 核酸複合体
WO2018013525A1 (en) 2016-07-11 2018-01-18 Translate Bio Ma, Inc. Nucleic acid conjugates and uses thereof
US10781175B2 (en) 2016-07-15 2020-09-22 Am Chemicals Llc Solid supports and phosphoramidite building blocks for oligonucleotide conjugates
EP3484524B1 (en) 2016-07-15 2022-11-09 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulation of smn2
CA3033368A1 (en) 2016-08-12 2018-02-15 University Of Massachusetts Conjugated oligonucleotides
KR20190058477A (ko) * 2016-08-17 2019-05-29 솔스티스 바이올로직스, 리미티드 폴리뉴클레오티드 구축물
ES2837076T3 (es) 2016-09-01 2021-06-29 Proqr Therapeutics Ii Bv Oligonucleótidos para la edición de ARN de cadena sencilla modificados químicamente
CN109462981B (zh) * 2016-09-02 2023-07-07 箭头药业股份有限公司 靶向配体
US20190275171A1 (en) * 2016-09-23 2019-09-12 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Gene therapy and targeted delivery of conjugated compounds
JOP20190065A1 (ar) 2016-09-29 2019-03-28 Ionis Pharmaceuticals Inc مركبات وطرق لتقليل التعبير عن tau
CN109661233A (zh) * 2016-10-06 2019-04-19 Ionis 制药公司 缀合低聚化合物的方法
JP2019537427A (ja) 2016-10-27 2019-12-26 カリフォルニア インスティチュート オブ テクノロジー X染色体の再活性化のためのhdac阻害剤組成物
JOP20190104A1 (ar) 2016-11-10 2019-05-07 Ionis Pharmaceuticals Inc مركبات وطرق لتقليل التعبير عن atxn3
CN110234763A (zh) * 2016-11-11 2019-09-13 詹森生物制药有限公司 针对hbv cccdna的寡核苷酸靶向策略
TW202313978A (zh) 2016-11-23 2023-04-01 美商阿尼拉製藥公司 絲胺酸蛋白酶抑制因子A1 iRNA組成物及其使用方法
AU2017368050A1 (en) 2016-11-29 2019-06-20 Puretech Lyt, Inc. Exosomes for delivery of therapeutic agents
WO2018102745A1 (en) 2016-12-02 2018-06-07 Cold Spring Harbor Laboratory Modulation of lnc05 expression
CA3047076A1 (en) * 2016-12-13 2018-06-21 Am Sciences Inc Pharmaceutical composition for preventing or treating hepatitis b
KR20190098181A (ko) 2016-12-16 2019-08-21 알닐람 파마슈티칼스 인코포레이티드 트랜스티레틴(TTR) iRNA 조성물을 사용하여 TTR-관련 질병을 치료하거나 예방하는 방법
CN108239644B (zh) * 2016-12-23 2021-05-28 苏州瑞博生物技术股份有限公司 一种小干扰核酸和药物组合物及其用途
US10329620B2 (en) 2017-01-12 2019-06-25 Cardioforecast Ltd. Methods and kits for treating cardiovascular disease
EP3568480A1 (en) 2017-01-13 2019-11-20 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides for modulating nfkb2 expression
WO2018130581A1 (en) 2017-01-13 2018-07-19 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides for modulating rela expression
US20190338286A1 (en) 2017-01-13 2019-11-07 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides for modulating rel expression
EP3568481A1 (en) 2017-01-13 2019-11-20 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides for modulating relb expression
US20190367920A1 (en) 2017-01-13 2019-12-05 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides for modulating nfkb1 expression
US11572558B2 (en) 2017-02-06 2023-02-07 Nissan Chemical Corporation Single-stranded oligonucleotide
WO2018165564A1 (en) * 2017-03-09 2018-09-13 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Morpholino modified oligomeric compounds
CN110536964A (zh) 2017-03-10 2019-12-03 国立研究开发法人国立成育医疗研究中心 反义寡核苷酸和糖原贮积病Ia型预防或治疗用组合物
JOP20190215A1 (ar) * 2017-03-24 2019-09-19 Ionis Pharmaceuticals Inc مُعدّلات التعبير الوراثي عن pcsk9
EP3385272A1 (en) 2017-04-05 2018-10-10 Silence Therapeutics GmbH Further novel oligonucleotide-ligand conjugates
LT3607069T (lt) * 2017-04-05 2023-01-10 Silence Therapeutics Gmbh Produktai ir kompozicijos
KR20250145702A (ko) 2017-04-11 2025-10-13 아뷰터스 바이오파마 코포레이션 표적화 조성물
SG11201909572QA (en) 2017-04-18 2019-11-28 Alnylam Pharmaceuticals Inc Methods for the treatment of subjects having a hepatitis b virus (hbv) infection
WO2018215049A1 (en) 2017-05-23 2018-11-29 F. Hoffmann-La Roche Ag Process for galnac oligonucleotide conjugates
EP3633036A4 (en) * 2017-05-26 2021-03-17 National Cerebral and Cardiovascular Center NUCLEIC ACID TARGETING ANTI-SENSES PCSK9
WO2018223073A1 (en) * 2017-06-02 2018-12-06 Wave Life Sciences Ltd. Oligonucleotide compositions and methods of use thereof
WO2018223056A1 (en) 2017-06-02 2018-12-06 Wave Life Sciences Ltd. Oligonucleotide compositions and methods of use thereof
WO2018226788A1 (en) 2017-06-07 2018-12-13 University Of Massachusetts Anti-adam33 oligonucleotides and related methods
CN110799647A (zh) 2017-06-23 2020-02-14 马萨诸塞大学 双尾自递送sirna及相关的方法
WO2019006455A1 (en) 2017-06-30 2019-01-03 Solstice Biologics, Ltd. AUXILIARIES OF CHIRAL PHOSPHORAMIDITIS AND METHODS OF USE THEREOF
AU2018301477A1 (en) 2017-07-13 2020-02-27 Alnylam Pharmaceuticals Inc. Lactate dehydrogenase a (LDHA) iRNA compositions and methods of use thereof
EP3660153A4 (en) 2017-07-26 2021-04-21 Nissan Chemical Corporation SINGLE-STRANDED OLIGONUCLEOTIDE
WO2019027009A1 (ja) * 2017-08-02 2019-02-07 協和発酵キリン株式会社 核酸複合体
WO2019027015A1 (ja) * 2017-08-02 2019-02-07 協和発酵キリン株式会社 核酸複合体
WO2019030313A2 (en) 2017-08-11 2019-02-14 Roche Innovation Center Copenhagen A/S OLIGONUCLEOTIDES FOR MODULATION OF UBE3C EXPRESSION
WO2019036612A1 (en) 2017-08-17 2019-02-21 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. ADJUSTABLE REVERSIR TM COMPOUNDS
US11197884B2 (en) 2017-08-18 2021-12-14 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of the notch signaling pathway for treatment of respiratory disorders
WO2019038228A1 (en) 2017-08-22 2019-02-28 Roche Innovation Center Copenhagen A/S OLIGONUCLEOTIDES FOR MODULATION OF TOM1 EXPRESSION
SI3673080T1 (sl) 2017-08-25 2024-03-29 Stoke Therapeutics, Inc. Protismiselni oligomeri za zdravljenje bolezenskih stanj in bolezni
US10517889B2 (en) 2017-09-08 2019-12-31 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulators of SMAD7 expression
CN111527207B (zh) * 2017-09-14 2024-04-26 詹森生物制药有限公司 GalNAc衍生物
WO2019067872A1 (en) 2017-09-29 2019-04-04 Intellia Therapeutics, Inc. COMPOSITIONS AND METHODS FOR EDITING THE TTR GENE AND TREATING AMYLOID DOSE ATTR
EP3585162B1 (en) 2017-09-29 2023-08-30 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Rodents comprising a humanized ttr locus and methods of use
JP2021502059A (ja) 2017-10-13 2021-01-28 ロシュ イノベーション センター コペンハーゲン エーエス 部分的に立体定義されたオリゴヌクレオチドのサブライブラリーを使用することによる、アンチセンスオリゴヌクレオチドの、改良された立体定義されたホスホロチオエートオリゴヌクレオチド変異体を同定するための方法
AU2018350693B2 (en) 2017-10-16 2021-03-04 F. Hoffmann-La Roche Ag Nucleic acid molecule for reduction of PAPD5 and PAPD7 mRNA for treating hepatitis B infection
AU2018360697A1 (en) 2017-11-01 2020-05-14 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Complement component C3 iRNA compositions and methods of use thereof
TWI809004B (zh) 2017-11-09 2023-07-21 美商Ionis製藥公司 用於降低snca表現之化合物及方法
US20200385719A1 (en) 2017-11-16 2020-12-10 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Kisspeptin 1 (kiss1) irna compositions and methods of use thereof
WO2019100039A1 (en) 2017-11-20 2019-05-23 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Serum amyloid p component (apcs) irna compositions and methods of use thereof
CN111050807B (zh) * 2017-12-01 2024-05-28 苏州瑞博生物技术股份有限公司 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途
WO2019105418A1 (zh) 2017-12-01 2019-06-06 苏州瑞博生物技术有限公司 双链寡核苷酸、含双链寡核苷酸的组合物与缀合物及制备方法和用途
WO2019105403A1 (zh) * 2017-12-01 2019-06-06 苏州瑞博生物技术有限公司 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途
US11414665B2 (en) 2017-12-01 2022-08-16 Suzhou Ribo Life Science Co., Ltd. Nucleic acid, composition and conjugate comprising the same, and preparation method and use thereof
KR102834361B1 (ko) 2017-12-01 2025-07-17 쑤저우 리보 라이프 사이언스 컴퍼니, 리미티드 핵산, 이를 포함하는 조성물과 컨쥬게이트, 및 그의 제조 방법과 용도
JP7365052B2 (ja) 2017-12-01 2023-10-19 スーチョウ リボ ライフ サイエンス カンパニー、リミテッド 核酸、当該核酸を含む組成物及び複合体ならびに調製方法と使用
US11414661B2 (en) 2017-12-01 2022-08-16 Suzhou Ribo Life Science Co., Ltd. Nucleic acid, composition and conjugate containing nucleic acid, preparation method therefor and use thereof
CN111344408A (zh) 2017-12-11 2020-06-26 哥本哈根罗氏创新中心 用于调控fndc3b表达的寡核苷酸
WO2019115417A2 (en) 2017-12-12 2019-06-20 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides for modulating rb1 expression
JP2021506239A (ja) 2017-12-14 2021-02-22 アイオーニス ファーマシューティカルズ, インコーポレーテッドIonis Pharmaceuticals,Inc. 複合アンチセンス化合物及びその使用
WO2019126097A1 (en) 2017-12-18 2019-06-27 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. High mobility group box-1 (hmgb1) irna compositions and methods of use thereof
CN111512160B (zh) 2017-12-21 2024-04-09 豪夫迈·罗氏有限公司 Htra1 rna拮抗剂的伴随诊断
WO2019126641A2 (en) 2017-12-21 2019-06-27 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of frataxin expression
US20200332289A1 (en) 2017-12-22 2020-10-22 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Gapmer oligonucleotides comprising a phosphorodithioate internucleoside linkage
CN111757936B (zh) 2017-12-22 2025-07-04 罗氏创新中心哥本哈根有限公司 包含二硫代磷酸酯核苷间连接的寡核苷酸
US11597926B2 (en) 2017-12-22 2023-03-07 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Thiophosphoramidites
JP7011080B2 (ja) * 2017-12-26 2022-02-10 クワンチョウ リボバイオ カンパニー リミテッド 修飾オリゴヌクレオチドおよび修飾オリゴヌクレオチドの合成に使用可能な化合物
CN109957566B (zh) * 2017-12-26 2023-08-25 广州市锐博生物科技有限公司 修饰的寡核苷酸和可用于合成修饰的寡核苷酸的化合物
CA3087106A1 (en) 2017-12-29 2019-07-04 Suzhou Ribo Life Science Co., Ltd. Conjugates and preparation and use thereof
WO2019137883A1 (en) 2018-01-10 2019-07-18 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides for modulating pias4 expression
WO2019140102A1 (en) 2018-01-10 2019-07-18 Translate Bio Ma, Inc. Compositions and methods for facilitating delivery of synthetic nucleic acids to cells
CA3088112A1 (en) 2018-01-12 2019-07-18 Bristol-Myers Squibb Company Antisense oligonucleotides targeting alpha-synuclein and uses thereof
JP2021511027A (ja) 2018-01-12 2021-05-06 ロシュ・イノベーション・センター・コペンハーゲン・アクティーゼルスカブRoche Innovation Center Copenhagen A/S アルファ−シヌクレインアンチセンスオリゴヌクレオチド及びその使用
JP2021510295A (ja) 2018-01-12 2021-04-22 ロシュ イノベーション センター コペンハーゲン エーエス Gsk3b発現を調節するためのオリゴヌクレオチド
KR102839166B1 (ko) 2018-01-12 2025-07-28 브리스톨-마이어스 스큅 컴퍼니 알파-시누클레인을 표적화하는 안티센스 올리고뉴클레오티드 및 그의 용도
AU2019206731A1 (en) 2018-01-15 2020-07-30 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulators of DNM2 expression
EP3740574A1 (en) 2018-01-17 2020-11-25 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides for modulating erc1 expression
WO2019141723A1 (en) 2018-01-18 2019-07-25 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting srebp1
WO2019145386A1 (en) 2018-01-26 2019-08-01 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides for modulating csnk1d expression
AU2019218987B2 (en) 2018-02-12 2025-04-24 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modified compounds and uses thereof
AU2019222767A1 (en) 2018-02-14 2020-08-27 Deep Genomics Incorporated Oligonucleotide therapy for Wilson disease
IL320427A (en) 2018-02-21 2025-06-01 Bristol Myers Squibb Co CAMK2D antisense oligonucleotides and their uses
TWI840345B (zh) 2018-03-02 2024-05-01 美商Ionis製藥公司 Irf4表現之調節劑
EP3759127A4 (en) 2018-03-02 2022-03-30 Ionis Pharmaceuticals, Inc. COMPOUNDS AND METHODS FOR MODULATING AMYLOID BETA PRECURSOR PROTEIN
CN115976028B (zh) * 2018-03-09 2025-03-25 第一三共株式会社 糖原病Ia型治疗药
WO2019183440A1 (en) 2018-03-22 2019-09-26 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods for modulating fmr1 expression
EP3775208A1 (en) 2018-04-05 2021-02-17 F. Hoffmann-La Roche AG Use of fubp1 inhibitors for treating hepatitis b virus infection
US11365416B2 (en) 2018-04-11 2022-06-21 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulators of EZH2 expression
EP3788065B1 (en) 2018-04-30 2025-08-27 The Children's Hospital Of Philadelphia Improving anemias by combining agents
BR112020022512A2 (pt) 2018-05-04 2021-05-04 Stoke Therapeutics, Inc. métodos e composições para tratamento de doença de armazenamento de éster de colesteril
EP3790990A1 (en) 2018-05-07 2021-03-17 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Quality control of lna oligonucleotide therapeutics using massively parallel sequencing
CN112400020B (zh) 2018-05-08 2024-11-19 莱古路斯治疗法股份有限公司 作为具有hcv抗病毒活性与降低的高胆红素血症副作用的mir-122抑制剂的galnac缀合的经修饰的寡核苷酸
WO2019217708A1 (en) 2018-05-09 2019-11-14 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for reducing atxn3 expression
US20210355497A1 (en) * 2018-05-09 2021-11-18 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for reducing fxi expression
CA3098624A1 (en) 2018-05-11 2019-11-14 Wave Life Sciences Ltd. Oligonucleotide compositions and methods of use thereof
TWI851574B (zh) 2018-05-14 2024-08-11 美商阿尼拉製藥公司 血管收縮素原(AGT)iRNA組成物及其使用方法
GB201808146D0 (en) 2018-05-18 2018-07-11 Proqr Therapeutics Ii Bv Stereospecific Linkages in RNA Editing Oligonucleotides
WO2019241648A1 (en) 2018-06-14 2019-12-19 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for increasing stmn2 expression
TWI833770B (zh) 2018-06-27 2024-03-01 美商Ionis製藥公司 用於減少 lrrk2 表現之化合物及方法
MY206038A (en) 2018-07-03 2024-11-26 Hoffmann La Roche Oligonucleotides for modulating tau expression
WO2020007826A1 (en) 2018-07-05 2020-01-09 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting mbtps1
WO2020011744A2 (en) 2018-07-11 2020-01-16 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting cers5
WO2020011745A2 (en) 2018-07-11 2020-01-16 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting cers6
MX2021000404A (es) 2018-07-13 2021-03-25 Hoffmann La Roche Oligonucleotidos para modular la expresion de rtel1.
MX2021000922A (es) 2018-07-25 2021-03-31 Ionis Pharmaceuticals Inc Compuestos y metodos para reducir la expresion de la atxn2.
CN112513060B (zh) 2018-07-31 2024-08-06 罗氏创新中心哥本哈根有限公司 包含三硫代磷酸酯核苷间键的寡核苷酸
US20210221837A1 (en) 2018-07-31 2021-07-22 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides comprising a phosphorotrithioate internucleoside linkage
EP3833397A4 (en) 2018-08-08 2023-06-14 Arcturus Therapeutics, Inc. COMPOSITIONS AND AGENTS AGAINST NON-ALCOHOLIC STEATOHEPATITIS
EP3833763A4 (en) 2018-08-10 2023-07-19 University of Massachusetts MODIFIED OLIGONUCLEOTIDES FOR TARGETING SNPS
UA127745C2 (uk) 2018-08-13 2023-12-20 Альнілам Фармасьютікалз, Інк. КОМПОЗИЦІЇ, ЩО МІСТЯТЬ ЗАСІБ НА ОСНОВІ dsRNA ВІРУСУ ГЕПАТИТУ В (HBV), ТА СПОСОБИ ЇХ ВИКОРИСТАННЯ
JP2021533800A (ja) * 2018-08-21 2021-12-09 スーチョウ リボ ライフ サイエンス カンパニー、リミテッドSuzhou Ribo Life Science Co., Ltd. 核酸、当該核酸を含む薬物組成物及び複合体ならびにその使用
US11279930B2 (en) 2018-08-23 2022-03-22 University Of Massachusetts O-methyl rich fully stabilized oligonucleotides
EP3844274A1 (en) 2018-08-28 2021-07-07 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Neoantigen engineering using splice modulating compounds
CA3105385A1 (en) 2018-09-18 2020-03-26 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Ketohexokinase (khk) irna compositions and methods of use thereof
TWI869213B (zh) 2018-09-19 2025-01-01 美商Ionis製藥公司 Pnpla3表現之調節劑
CN111655297A (zh) * 2018-09-30 2020-09-11 苏州瑞博生物技术有限公司 一种siRNA缀合物及其制备方法和用途
CN113383076B (zh) * 2018-10-18 2025-11-18 普罗吉尼斯私人有限公司 用于ptp1b相关病症的反义疗法
US10913951B2 (en) 2018-10-31 2021-02-09 University of Pittsburgh—of the Commonwealth System of Higher Education Silencing of HNF4A-P2 isoforms with siRNA to improve hepatocyte function in liver failure
EP3877523A1 (en) 2018-11-09 2021-09-15 Novartis AG Method for reducing the risk of a cardiovascular event with conjugated antisense compounds targeting apo(a)
TW202028222A (zh) 2018-11-14 2020-08-01 美商Ionis製藥公司 Foxp3表現之調節劑
WO2020102630A1 (en) 2018-11-15 2020-05-22 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulators of irf5 expression
MY205095A (en) 2018-11-21 2024-10-01 Ionis Pharmaceuticals Inc Compounds and methods for reducing prion expression
US12416004B2 (en) 2018-11-23 2025-09-16 Sanofi RNA compositions and methods for inhibiting ANGPTL8
US20220127605A1 (en) 2018-11-30 2022-04-28 Kyowa Kirin Co., Ltd. Nucleic acid conjugate
US12485136B2 (en) 2018-12-03 2025-12-02 Takeda Pharmaceuticals U.S.A., Inc. Methods for the treatment of trinucleotide repeat expansion disorders associated with MLH3 activity
CN113631709A (zh) 2018-12-20 2021-11-09 普拉克西斯精密药物股份有限公司 用于治疗kcnt1相关病症的组合物和方法
UA128236C2 (uk) 2018-12-21 2024-05-15 Айоніс Фармасутікалз, Інк. Модулятори експресії hsd17b13
GB201821269D0 (en) 2018-12-28 2019-02-13 Nippon Shinyaku Co Ltd Myostatin signal inhibitor
JP7507495B2 (ja) * 2018-12-28 2024-06-28 スーチョウ リボ ライフ サイエンス カンパニー、リミテッド 核酸、当該核酸を含む組成物及び複合体ならびに調製方法と使用
CN111377985B (zh) * 2018-12-29 2023-11-10 苏州瑞博生物技术股份有限公司 化合物和缀合物及其制备方法和用途
JP2022523467A (ja) 2019-01-18 2022-04-25 ユニバーシティ・オブ・マサチューセッツ 動的な薬物動態を修飾するアンカー
CN118562796A (zh) * 2019-01-18 2024-08-30 苏州瑞博生物技术股份有限公司 一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途
US11214803B2 (en) 2019-01-31 2022-01-04 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulators of YAP1 expression
CN113490742A (zh) 2019-02-20 2021-10-08 罗氏创新中心哥本哈根有限公司 膦酰基乙酸酯缺口聚物寡核苷酸
CA3129646A1 (en) 2019-02-20 2020-08-27 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Novel phosphoramidites
CN109799330B (zh) * 2019-02-22 2021-03-02 华中科技大学同济医学院附属同济医院 神经氨酸及神经氨酸酶抑制剂在慢性心力衰竭中的应用
CN113474633A (zh) 2019-02-26 2021-10-01 罗氏创新中心哥本哈根有限公司 寡核苷酸配制方法
KR20210134686A (ko) 2019-02-27 2021-11-10 아이오니스 파마수티컬즈, 인코포레이티드 Malat1 발현의 조절인자
US20220145292A1 (en) * 2019-02-28 2022-05-12 Deep Genomics Incorporated Ligand clusters and methods of their use and preparation
JP2022527569A (ja) * 2019-03-21 2022-06-02 ミトセラピューティクス・エルエルシー 治療剤の標的化送達のための多価リガンドクラスター
CN117431244A (zh) 2019-03-29 2024-01-23 Ionis制药公司 用于调节ube3a-ats的化合物和方法
CA3132178A1 (en) 2019-04-02 2020-10-08 Aliye Seda Yilmaz-Elis Antisense oligonucleotides for immunotherapy
BR112021019182A2 (pt) 2019-04-03 2022-05-31 Bristol Myers Squibb Co Oligonucleotídeos angptl2 antissenso e seus usos
EP3972983A4 (en) * 2019-05-17 2023-05-24 Ionis Pharmaceuticals, Inc. SYNTHESIS OF OLIGOMERIC COMPOUNDS COMPRISING PHOSPHOROTHIOATE DIESTER AND PHOSPHATE DIESTER BONDS
EP3974529A4 (en) 2019-05-22 2024-02-07 Suzhou Ribo Life Science Co., Ltd. NUCLEIC ACID, PHARMACEUTICAL COMPOSITION, CONJUGATE, PROCESS OF PREPARATION AND USE
CN113614230B (zh) 2019-05-22 2024-04-09 苏州瑞博生物技术股份有限公司 核酸、药物组合物与缀合物及制备方法和用途
CN118256498A (zh) 2019-05-22 2024-06-28 苏州瑞博生物技术股份有限公司 核酸、药物组合物与缀合物及制备方法和用途
EP3974530A4 (en) 2019-05-22 2023-07-12 Suzhou Ribo Life Science Co., Ltd. NUCLEIC ACID, PHARMACEUTICAL COMPOSITION, CONJUGATE, METHOD FOR PREPARATION AND USE
US20220186221A1 (en) 2019-05-24 2022-06-16 Suzhou Ribo Life Science Co., Ltd. Nucleic acid, pharmaceutical composition and conjugate, preparation method and use
CN113891939B (zh) 2019-05-24 2024-04-02 苏州瑞博生物技术股份有限公司 核酸、药物组合物与缀合物及制备方法和用途
US20220235359A1 (en) 2019-05-24 2022-07-28 Suzhou Ribo Life Science Co., Ltd. Nucleic acid, pharmaceutical composition, conjugate, preparation method, and use
LT3976791T (lt) 2019-05-28 2025-07-25 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Junginiai ir būdai fus raiškai mažinti
SG11202112741XA (en) 2019-05-31 2021-12-30 Aligos Therapeutics Inc Modified gapmer oligonucleotides and methods of use
WO2020247452A1 (en) 2019-06-04 2020-12-10 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Non-human animals comprising a humanized ttr locus with a beta-slip mutation and methods of use
WO2020264055A1 (en) 2019-06-25 2020-12-30 Amgen Inc. Purification methods for carbohydrate-linked oligonucleotides
EP4660307A2 (en) 2019-07-26 2025-12-10 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulating gfap
EP4007811A2 (en) 2019-08-01 2022-06-08 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Carboxypeptidase b2 (cpb2) irna compositions and methods of use thereof
EP4007812A1 (en) 2019-08-01 2022-06-08 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Serpin family f member 2 (serpinf2) irna compositions and methods of use thereof
CN114502730A (zh) 2019-08-09 2022-05-13 马萨诸塞大学 经化学修饰的靶向snp的寡核苷酸
WO2021030522A1 (en) 2019-08-13 2021-02-18 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. SMALL RIBOSOMAL PROTEIN SUBUNIT 25 (RPS25) iRNA AGENT COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
WO2021030778A1 (en) * 2019-08-15 2021-02-18 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Linkage modified oligomeric compounds and uses thereof
EP4022061A1 (en) 2019-08-27 2022-07-06 Sanofi Compositions and methods for inhibiting pcsk9
TW202122093A (zh) 2019-08-29 2021-06-16 大陸商蘇州瑞博生物技術股份有限公司 化合物、藥物綴合物、試劑盒及其用途
EP4022062A1 (en) 2019-08-30 2022-07-06 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Neurofilament light chain (nfl) as a biomarker for transthyretin amyloidosis polyneuropathy
KR20220058578A (ko) 2019-09-03 2022-05-09 아크투루스 쎄라퓨틱스, 인크. 치료 활성 접합체의 아시알로당단백질 수용체 매개 전달
CA3150715A1 (en) * 2019-09-10 2021-03-18 Makoto Koizumi Conjugate of galnac-oligonucleotide for delivery to liver and manufacturing method thereof
US12365894B2 (en) 2019-09-16 2025-07-22 University Of Massachusetts Branched lipid conjugates of siRNA for specific tissue delivery
TW202126304A (zh) 2019-09-20 2021-07-16 瑞士商赫孚孟拉羅股份公司 使用核心蛋白異位調節劑治療hbv感染之方法
JP7757277B2 (ja) 2019-10-14 2025-10-21 アストラゼネカ・アクチエボラーグ Pnpla3発現のモジュレーター
EP4045652A1 (en) 2019-10-18 2022-08-24 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Solute carrier family member irna compositions and methods of use thereof
JP7676377B2 (ja) 2019-10-22 2025-05-14 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド 補体成分C3 iRNA組成物およびその使用方法
WO2021087036A1 (en) 2019-11-01 2021-05-06 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. HUNTINGTIN (HTT) iRNA AGENT COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
WO2021096763A1 (en) 2019-11-13 2021-05-20 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for treating an angiotensinogen- (agt-) associated disorder
WO2021102373A1 (en) 2019-11-22 2021-05-27 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Ataxin3 (atxn3) rnai agent compositions and methods of use thereof
CN112876534B (zh) * 2019-11-29 2024-02-09 苏州瑞博生物技术股份有限公司 肝靶向化合物及缀合物
BR112022011417A2 (pt) 2019-12-13 2022-08-30 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composições do agente de irna da fase de leitura aberta 72 do cromossomo humano 9 (c9orf72) e métodos de uso das mesmas
TW202138559A (zh) 2019-12-16 2021-10-16 美商阿尼拉製藥公司 含類PATATIN磷脂酶結構域3(PNPLA3)iRNA組成物及其使用方法
CN111041025B (zh) * 2019-12-17 2021-06-18 深圳市瑞吉生物科技有限公司 基于结合N-乙酰半乳糖胺多肽的mRNA靶向分子及其制备方法
EP4077670A1 (en) 2019-12-19 2022-10-26 F. Hoffmann-La Roche AG Use of cops3 inhibitors for treating hepatitis b virus infection
JP2023506550A (ja) 2019-12-19 2023-02-16 エフ. ホフマン-ラ ロシュ エージー. B型肝炎ウイルス感染症を処置するためのsbds阻害剤の使用
JP2023506954A (ja) 2019-12-19 2023-02-20 エフ. ホフマン-ラ ロシュ エージー. B型肝炎ウイルス感染を処置するためのsaraf阻害剤の使用
CN114829599A (zh) 2019-12-19 2022-07-29 豪夫迈·罗氏有限公司 Scamp3抑制剂用于治疗乙型肝炎病毒感染的用途
CN114901821A (zh) 2019-12-19 2022-08-12 豪夫迈·罗氏有限公司 Sept9抑制剂用于治疗乙型肝炎病毒感染的用途
JP2023509869A (ja) 2019-12-24 2023-03-10 エフ. ホフマン-ラ ロシュ アーゲー Tlr7アゴニストを用いたウイルス感染症の処置方法
CA3163490A1 (en) 2019-12-24 2021-07-01 F. Hoffman-La Roche Ag Pharmaceutical combination of a therapeutic oligonucleotide targeting hbv and a tlr7 agonist for treatment of hbv
WO2021130270A1 (en) 2019-12-24 2021-07-01 F. Hoffmann-La Roche Ag Pharmaceutical combination of antiviral agents targeting hbv and/or an immune modulator for treatment of hbv
TWI877296B (zh) * 2020-01-30 2025-03-21 日商衛材R&D企管股份有限公司 核酸複合體及包含其之醫藥組合物
TW202140786A (zh) 2020-02-10 2021-11-01 美商艾爾妮蘭製藥公司 用於靜默vegf-a表現之組合物及方法
AU2021224778A1 (en) 2020-02-18 2022-09-29 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Apolipoprotein C3 (APOC3) iRNA compositions and methods of use thereof
AR121446A1 (es) 2020-02-28 2022-06-08 Ionis Pharmaceuticals Inc Compuestos y métodos para modular smn2
MX2022010980A (es) 2020-03-04 2022-12-02 Verve Therapeutics Inc Composiciones y metodos para el suministro de arn dirigido.
EP4114947A1 (en) 2020-03-05 2023-01-11 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Complement component c3 irna compositions and methods of use thereof for treating or preventing complement component c3-associated diseases
JP2023516748A (ja) 2020-03-06 2023-04-20 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド トランスサイレチン(ttr)の発現を阻害するための組成物および方法
AU2021232014A1 (en) 2020-03-06 2022-10-06 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Ketohexokinase (KHK) IRNA compositions and methods of use thereof
WO2021188611A1 (en) 2020-03-18 2021-09-23 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for treating subjects having a heterozygous alanine-glyoxylate aminotransferase gene (agxt) variant
WO2021194999A1 (en) 2020-03-23 2021-09-30 Amgen Inc. Monoclonal antibodies to chemically-modified nucleic acids and uses thereof
WO2021195307A1 (en) 2020-03-26 2021-09-30 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Coronavirus irna compositions and methods of use thereof
EP4130266A4 (en) * 2020-03-26 2025-10-08 Nat Cerebral & Cardiovascular Ct ANTISENSE NUCLEIC ACID TARGETING APOC3
BR112022020145A2 (pt) 2020-04-06 2023-01-03 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composições e métodos para silenciamento da expressão de myoc
WO2021206917A1 (en) 2020-04-07 2021-10-14 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. ANGIOTENSIN-CONVERTING ENZYME 2 (ACE2) iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
BR112022020227A2 (pt) 2020-04-07 2022-11-22 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composições e métodos para silenciamento da expressão de scn9a
WO2021206922A1 (en) 2020-04-07 2021-10-14 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Transmembrane serine protease 2 (tmprss2) irna compositions and methods of use thereof
EP4138858A4 (en) 2020-04-21 2024-07-03 Flagship Pioneering, Inc. BIFUNCTIONAL MOLECULES AND METHODS OF USE THEREOF
CN111575279A (zh) * 2020-04-27 2020-08-25 江苏为真生物医药技术股份有限公司 利用asgpr小分子配体特异性捕获肝细胞外囊泡或循环肿瘤细胞的方法
IL297702A (en) 2020-04-27 2022-12-01 Alnylam Pharmaceuticals Inc Apolipoprotein e (apoe) irna agent compositions and methods of use thereof
KR20230017789A (ko) 2020-04-30 2023-02-06 알닐람 파마슈티칼스 인코포레이티드 보체 인자 B (CFB) iRNA 조성물 및 이의 사용 방법
JP7738573B2 (ja) 2020-05-01 2025-09-12 アイオーニス ファーマシューティカルズ, インコーポレーテッド Atxn1を調節するための化合物及び方法
AU2021270720A1 (en) 2020-05-11 2022-12-08 Stoke Therapeutics, Inc. OPA1 antisense oligomers for treatment of conditions and diseases
WO2021231692A1 (en) 2020-05-15 2021-11-18 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for the adar-mediated editing of otoferlin (otof)
WO2021231680A1 (en) 2020-05-15 2021-11-18 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for the adar-mediated editing of methyl-cpg binding protein 2 (mecp2)
CA3162416C (en) 2020-05-15 2023-07-04 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for the adar-mediated editing of argininosuccinate synthetase (ass1)
EP4150089A1 (en) 2020-05-15 2023-03-22 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for the adar-mediated editing of retinoschisin 1 (rs1)
EP4150077A1 (en) 2020-05-15 2023-03-22 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for the adar-mediated editing of transmembrane channel-like protein 1 (tmc1)
WO2021231698A1 (en) 2020-05-15 2021-11-18 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for the adar-mediated editing of argininosuccinate lyase (asl)
EP4150086A1 (en) 2020-05-15 2023-03-22 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for the adar-mediated editing of leucine rich repeat kinase 2 (lrrk2)
EP4150087A1 (en) 2020-05-15 2023-03-22 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for the adar-mediated editing of gap junction protein beta 2 (gjb2)
CN113683651A (zh) * 2020-05-19 2021-11-23 上海京新生物医药有限公司 一种GalNAc中间体的制备方法
AR122534A1 (es) 2020-06-03 2022-09-21 Triplet Therapeutics Inc Métodos para el tratamiento de los trastornos de expansión por repetición de nucleótidos asociados con la actividad de msh3
EP4649951A2 (en) 2020-06-09 2025-11-19 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Sirna compositions and methods for silencing gpam (glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, mitochondrial) expression
EP4162050A1 (en) 2020-06-09 2023-04-12 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Rnai compositions and methods of use thereof for delivery by inhalation
US20240033278A9 (en) * 2020-06-10 2024-02-01 Medshine Discovery Inc. Conjugate group and conjugate
WO2021257782A1 (en) 2020-06-18 2021-12-23 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. XANTHINE DEHYDROGENASE (XDH) iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
JP2023532040A (ja) * 2020-06-24 2023-07-26 サプリーム テクノロジーズ,ベー.フェー. GalNAc及びサポニンのコンジュゲート、前記コンジュゲート及びGalNAc-オリゴヌクレオチドコンジュゲートを含む治療組成物
AR122731A1 (es) 2020-06-26 2022-10-05 Hoffmann La Roche Oligonucleótidos mejorados para modular la expresión de fubp1
CN116096899A (zh) 2020-06-29 2023-05-09 Ionis制药公司 调节plp1的化合物和方法
CN111744019B (zh) 2020-07-01 2023-08-04 深圳瑞吉生物科技有限公司 基于甘露糖的mRNA靶向递送系统及其应用
IL299771A (en) 2020-07-10 2023-03-01 Inst Nat Sante Rech Med Methods and compounds for the treatment of epilepsy
UY39344A (es) 2020-07-28 2022-02-25 Ionis Pharmaceuticals Inc Compuestos y métodos para reducir la expresión de app
CA3186935A1 (en) 2020-08-07 2022-02-10 Paymaan JAFAR-NEJAD Compounds and methods for modulating scn2a
CN116194119A (zh) * 2020-08-13 2023-05-30 美国安进公司 用于抑制MARC1表达的RNAi构建体和方法
EP4200419A2 (en) 2020-08-21 2023-06-28 F. Hoffmann-La Roche AG Use of a1cf inhibitors for treating hepatitis b virus infection
WO2022066847A1 (en) 2020-09-24 2022-03-31 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Dipeptidyl peptidase 4 (dpp4) irna compositions and methods of use thereof
WO2022076291A1 (en) 2020-10-05 2022-04-14 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. G protein-coupled receptor 75 (gpr75) irna compositions and methods of use thereof
JP2023545502A (ja) 2020-10-16 2023-10-30 サノフイ リポタンパク質(a)を阻害するためのrna組成物および方法
JP2023546103A (ja) 2020-10-16 2023-11-01 サノフイ Angptl3を阻害するための新規のrna組成物および方法
EP4232582A1 (en) 2020-10-23 2023-08-30 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Mucin 5b (muc5b) irna compositions and methods of use thereof
CA3200595A1 (en) 2020-11-13 2022-05-19 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Coagulation factor v (f5) irna compositions and methods of use thereof
TW202227101A (zh) 2020-11-18 2022-07-16 美商Ionis製藥公司 用於調節血管收縮素原表現之化合物及方法
WO2022106695A1 (en) 2020-11-23 2022-05-27 Alpha Anomeric Sas Nucleic acid duplexes
EP4259795A1 (en) 2020-12-08 2023-10-18 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Coagulation factor x (f10) irna compositions and methods of use thereof
GB2603454A (en) 2020-12-09 2022-08-10 Ucl Business Ltd Novel therapeutics for the treatment of neurodegenerative disorders
TW202242111A (zh) 2020-12-18 2022-11-01 美商Ionis製藥公司 用於調節因子xii之化合物及方法
WO2022136466A1 (en) 2020-12-23 2022-06-30 Argonaute RNA Limited Treatment of cardiovascular disease
CN116669746B (zh) 2020-12-29 2025-09-09 苏州瑞博生物技术股份有限公司 一种核酸、含有该核酸的药物组合物与siRNA缀合物及制备方法和用途
WO2022150260A1 (en) 2021-01-05 2022-07-14 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. COMPLEMENT COMPONENT 9 (C9) iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
WO2022162161A1 (en) * 2021-01-30 2022-08-04 E-Therapeutics Plc Conjugated oligonucleotide compounds, methods of making and uses thereof
JP2024504505A (ja) 2021-01-30 2024-01-31 イー セラピューティクス パブリック リミテッド カンパニー コンジュゲートオリゴヌクレオチド化合物、その作製方法及び使用
CN117355534A (zh) * 2021-01-30 2024-01-05 e-生物有限公司 缀合寡核苷酸化合物、其制备方法和用途
CA3204317A1 (en) * 2021-01-30 2022-08-04 Ahmad Ali MORTAZAVI Conjugated oligonucleotide compounds, methods of making and uses thereof
WO2022162157A1 (en) * 2021-01-30 2022-08-04 E-Therapeutics Plc Conjugated oligonucleotide compounds, methods of making and uses thereof
TW202246500A (zh) 2021-02-02 2022-12-01 瑞士商赫孚孟拉羅股份公司 用於抑制 rtel1 表現之增強型寡核苷酸
EP4291654A2 (en) 2021-02-12 2023-12-20 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Superoxide dismutase 1 (sod1) irna compositions and methods of use thereof for treating or preventing superoxide dismutase 1- (sod1-) associated neurodegenerative diseases
WO2022175749A1 (en) * 2021-02-18 2022-08-25 Oneglobe Holdings Limited Compositions for conjugating oligonucleotides and carbohydrates
CN117222739A (zh) 2021-02-25 2023-12-12 阿尔尼拉姆医药品有限公司 朊病毒蛋白(prnp)irna组合物和其使用方法
TW202302847A (zh) 2021-02-26 2023-01-16 美商艾拉倫製藥股份有限公司 己酮糖激酶(KHK)iRNA組成物及其使用方法
WO2022187435A1 (en) 2021-03-04 2022-09-09 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Angiopoietin-like 3 (angptl3) irna compositions and methods of use thereof
WO2022189861A1 (en) 2021-03-08 2022-09-15 Tollys Carbohydrate conjugates of tlr3 ligands and uses thereof
AU2022234522A1 (en) 2021-03-08 2023-10-26 Les Laboratoires Servier Antisense oligonucleotides for inhibiting alpha-synuclein expression
EP4305169A1 (en) 2021-03-12 2024-01-17 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Glycogen synthase kinase 3 alpha (gsk3a) irna compositions and methods of use thereof
BR112023019981A2 (pt) 2021-03-29 2023-12-12 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composições do agente irna de huntingtina (htt) e métodos de uso das mesmas
EP4314293A1 (en) 2021-04-01 2024-02-07 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Proline dehydrogenase 2 (prodh2) irna compositions and methods of use thereof
WO2022221430A1 (en) 2021-04-14 2022-10-20 Dicerna Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for modulating pnpla3 expression
TW202309280A (zh) 2021-04-26 2023-03-01 美商艾拉倫製藥股份有限公司 跨膜絲胺酸蛋白酶6(TMPRSS6)iRNA組成物及其使用方法
WO2022232343A1 (en) 2021-04-29 2022-11-03 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Signal transducer and activator of transcription factor 6 (stat6) irna compositions and methods of use thereof
WO2022232650A1 (en) * 2021-04-30 2022-11-03 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods for reducing agt expression
JP2024522068A (ja) 2021-05-18 2024-06-11 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド ナトリウム-グルコース共輸送体2(sglt2)irna組成物およびその使用方法
EP4341405A1 (en) 2021-05-20 2024-03-27 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for adar-mediated editing
WO2022256283A2 (en) 2021-06-01 2022-12-08 Korro Bio, Inc. Methods for restoring protein function using adar
JP2024522996A (ja) 2021-06-02 2024-06-25 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド パタチン様ホスホリパーゼドメイン含有3(PNPLA3)iRNA組成物およびその使用方法
CN117561334A (zh) 2021-06-04 2024-02-13 阿尔尼拉姆医药品有限公司 人染色体9开放阅读框72(C9ORF72)iRNA药剂组合物和其使用方法
JP2024523000A (ja) 2021-06-08 2024-06-25 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド シュタルガルト病及び/又は網膜結合タンパク質4(rbp4)関連障害を治療又は予防するための組成物及び方法
MX2023015230A (es) 2021-06-18 2024-01-18 Ionis Pharmaceuticals Inc Compuestos y metodos para reducir la expresion de ifnar1.
EP4359539A4 (en) 2021-06-23 2025-05-14 University Of Massachusetts ANTI-FLT1 OLIGONUCLEOTIDE COMPOUNDS OPTIMIZED FOR THE TREATMENT OF PREECLAMPSIA AND OTHER ANGIOGENIC DISORDERS
IL309503A (en) * 2021-06-24 2024-02-01 Lilly Co Eli Novel therapeutic delivery moieties and uses thereof
KR20240023630A (ko) * 2021-06-24 2024-02-22 일라이 릴리 앤드 캄파니 신규 rna 치료제 및 그의 용도
US20230194709A9 (en) 2021-06-29 2023-06-22 Seagate Technology Llc Range information detection using coherent pulse sets with selected waveform characteristics
WO2023278410A1 (en) 2021-06-29 2023-01-05 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for adar-mediated editing
MX2023015489A (es) 2021-06-30 2024-01-19 Alnylam Pharmaceuticals Inc Metodos y composiciones para tratar un trastorno asociado al angiotensinogeno (agt).
AU2022304946A1 (en) * 2021-07-02 2024-02-15 Tuojie Biotech (Shanghai) Co., Ltd. Nucleic acid ligand and conjugate thereof, and preparation method therefor and use thereof
IL310001A (en) 2021-07-08 2024-03-01 Nippon Shinyaku Co Ltd Precipitation suppressing agent
JPWO2023282344A1 (ru) 2021-07-08 2023-01-12
EP4368186A4 (en) 2021-07-08 2025-06-25 Nippon Shinyaku Co., Ltd. NEPHROTOXICITY REDUCING AGENT
JP2024528659A (ja) 2021-07-19 2024-07-30 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド 非原発性高シュウ酸尿症疾患または障害を有するまたは発症するリスクがある対象を治療するための方法および組成物
AU2022316139A1 (en) 2021-07-23 2024-01-18 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Beta-catenin (ctnnb1) irna compositions and methods of use thereof
EP4377458A1 (en) 2021-07-29 2024-06-05 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coa reductase (hmgcr) irna compositions and methods of use thereof
EP4380576A2 (en) * 2021-08-03 2024-06-12 Verve Therapeutics, Inc. Compositions and methods for targeted rna delivery
MX2024001194A (es) 2021-08-03 2024-02-27 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composiciones de acido ribonucleico de interferencia (arni) de transtiretina (ttr) y sus metodos de uso.
PE20241132A1 (es) 2021-08-04 2024-05-24 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composiciones de arni y metodos para silenciar el angiotensinogeno (agt)
CA3228733A1 (en) 2021-08-13 2023-02-16 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Factor xii (f12) irna compositions and methods of use thereof
US20250034567A1 (en) 2021-08-31 2025-01-30 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Cell death-inducing dffa-like effector b (cideb) irna compositions and methods of use thereof
JP2024531728A (ja) 2021-09-14 2024-08-29 アルゴノート アールエヌエー リミテッド 心血管疾患の処置
JP2024535850A (ja) 2021-09-17 2024-10-02 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド 補体成分(C3)をサイレンシングするためのiRNA組成物および方法
EP4403633A1 (en) * 2021-09-18 2024-07-24 Genoval Therapeutics Co., Ltd. Lpa inhibitor and use thereof
AU2022345881A1 (en) 2021-09-20 2024-03-21 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Inhibin subunit beta e (inhbe) modulator compositions and methods of use thereof
IL310844A (en) * 2021-09-23 2024-04-01 Shanghai Argo Biopharmaceutical Co Ltd Multivalent ligand clusters with a diamine scaffold for targeted delivery of therapeutic agents
CA3233755A1 (en) 2021-10-01 2023-04-06 Adarx Pharmaceuticals, Inc. Prekallikrein-modulating compositions and methods of use thereof
CA3234835A1 (en) 2021-10-22 2023-04-27 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for disrupting nrf2-keap1 protein interaction by adar mediated rna editing
EP4423273A1 (en) 2021-10-29 2024-09-04 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Complement factor b (cfb) irna compositions and methods of use thereof
WO2023076450A2 (en) 2021-10-29 2023-05-04 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. HUNTINGTIN (HTT) iRNA AGENT COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
KR20240101580A (ko) 2021-11-11 2024-07-02 에프. 호프만-라 로슈 아게 Hbv 치료를 위한 약학 조합물
CA3241316A1 (en) 2021-12-03 2023-06-08 Quralis Corporation Gapmer antisense oligonucleotides with modified backbone chemistries
GB202117758D0 (en) 2021-12-09 2022-01-26 Ucl Business Ltd Therapeutics for the treatment of neurodegenerative disorders
CN118355121A (zh) * 2021-12-16 2024-07-16 上海拓界生物医药科技有限公司 一种dsRNA、其制备方法及应用
EP4450624A4 (en) * 2021-12-16 2025-03-26 Tuojie Biotech (Shanghai) Co., Ltd. LPA-TARGETTING SIRNA AND CONJUGATE
JP2024546993A (ja) 2021-12-17 2024-12-26 エフ. ホフマン-ラ ロシュ アーゲー Rtel1及びfubp1を調節するためのオリゴヌクレオチドの組み合わせ
WO2023138659A1 (zh) * 2022-01-20 2023-07-27 上海拓界生物医药科技有限公司 一种dsRNA、其应用及制备方法
TW202345865A (zh) * 2022-01-24 2023-12-01 大陸商上海舶望製藥有限公司 抑制LPA(Apo(a))蛋白表達的組合物和方法
WO2023141314A2 (en) 2022-01-24 2023-07-27 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Heparin sulfate biosynthesis pathway enzyme irna agent compositions and methods of use thereof
CN116917477B (zh) * 2022-01-30 2024-04-09 大睿生物医药科技(上海)有限公司 含有n-乙酰半乳糖胺的靶向配体
AR128558A1 (es) 2022-02-21 2024-05-22 Hoffmann La Roche Oligonucleótido antisentido
CN120129745A (zh) 2022-03-10 2025-06-10 日本新药株式会社 抗病毒反义低聚物
CN114703184B (zh) * 2022-03-11 2024-06-18 厦门甘宝利生物医药有限公司 Lpa抑制剂及其用途
WO2023178144A2 (en) 2022-03-16 2023-09-21 Empirico Inc. Galnac compositions for improving sirna bioavailability
CN118871585A (zh) 2022-03-16 2024-10-29 第一三共株式会社 具有RNAi活性的化学-修饰的寡核苷酸
CN118891366A (zh) 2022-03-16 2024-11-01 第一三共株式会社 抑制转铁蛋白受体2的表达的siRNA
AU2023245603A1 (en) 2022-03-28 2024-11-07 Empirico Inc. Modified oligonucleotides
CN115028670B (zh) * 2022-06-24 2023-07-28 四川大学华西医院 一种n-乙酰基-d-半乳糖胺三聚体前体的制备方法
CN119654412A (zh) * 2022-06-27 2025-03-18 中美瑞康核酸技术(南通)研究院有限公司 激活补体因子h表达的寡核苷酸调节剂
WO2024013360A1 (en) 2022-07-15 2024-01-18 Proqr Therapeutics Ii B.V. Chemically modified oligonucleotides for adar-mediated rna editing
WO2024013361A1 (en) 2022-07-15 2024-01-18 Proqr Therapeutics Ii B.V. Oligonucleotides for adar-mediated rna editing and use thereof
CN116814621B (zh) * 2022-08-05 2025-09-09 厦门甘宝利生物医药有限公司 一种抑制apoc3基因表达的rna抑制剂及其应用
WO2024039776A2 (en) 2022-08-18 2024-02-22 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Universal non-targeting sirna compositions and methods of use thereof
EP4569113A1 (en) 2022-09-15 2025-06-18 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. 17b-hydroxysteroid dehydrogenase type 13 (hsd17b13) irna compositions and methods of use thereof
KR20250075637A (ko) 2022-09-23 2025-05-28 아이오니스 파마수티컬즈, 인코포레이티드 Mecp2 발현을 감소시키기 위한 화합물 및 방법(compounds and methods for reducing mecp2 expression)
WO2024098061A2 (en) 2022-11-04 2024-05-10 Genkardia Inc. Oligonucleotide-based therapeutics targeting cyclin d2 for the treatment of heart failure
WO2024106539A1 (ja) * 2022-11-18 2024-05-23 株式会社ボナック リガンドコンジュゲート物質及びそれを含む核酸並びにその用途
AU2023383571A1 (en) 2022-11-18 2025-07-03 Genkardia Inc. Methods and compositions for preventing, treating, or reversing cardiac diastolic dysfunction
EP4622652A2 (en) * 2022-11-23 2025-10-01 Pretzel Therapeutics, Inc. Compositions and methods for treatment of cancer and metabolic disease
AU2023404700A1 (en) 2022-12-02 2025-07-10 Shanghai Argo Biopharmaceutical Co., Ltd. Bicyclic abasic nucleic acid analogs and oligomeric compounds prepared therefrom
EP4592432A3 (en) 2022-12-19 2025-10-29 Arnatar Therapeutics Arnatar compounds and methods for enhanced cellular uptake
CN120712352A (zh) 2022-12-19 2025-09-26 昂拓生物医药有限公司 高级rna靶向(arnatar)
AR131419A1 (es) * 2022-12-21 2025-03-19 Lilly Co Eli TERAPÉUTICOS NOVEDOSOS DE iARN DE FAS Y USOS DE ESTOS
AU2024208393A1 (en) * 2023-01-10 2025-07-10 Ausperbio Therapeutics Inc. Modified multi-segmented antisense oligonucleotides for use
KR20250144467A (ko) 2023-02-09 2025-10-10 알닐람 파마슈티칼스 인코포레이티드 Reversir 분자 및 이의 사용 방법
WO2024175113A1 (zh) * 2023-02-24 2024-08-29 南京明德新药研发有限公司 包含R和E的双链siRNA类似物及其缀合物
TW202448484A (zh) 2023-04-20 2024-12-16 美商雅迪克斯製藥公司 Mapt調節組合物及其使用方法
WO2024220746A2 (en) 2023-04-21 2024-10-24 Flagship Pioneering Innovations Vii, Llc Rnai agents targeting fatty acid synthase and related methods
WO2024221135A1 (en) * 2023-04-23 2024-10-31 Ausper Biopharma Co., Ltd. Oligonucleotides for use in modulating immune responses against hepatitis b viral infection
US20240374741A1 (en) * 2023-05-11 2024-11-14 Synerk Biotech Limited Compound, a conjugate and uses thereof
WO2024238396A1 (en) 2023-05-12 2024-11-21 Adarx Pharmaceuticals, Inc. Nmda ligand conjugated compounds and uses thereof
UY40743A (es) * 2023-05-19 2024-12-13 Shanghai Argo Biopharmaceutical Co Ltd COMPOSICIONES Y MÉTODOS PARA INHIBIR LA EXPRESIÓN DEL factor de coagulación XI (FXI)
WO2024249328A2 (en) 2023-05-26 2024-12-05 Adarx Pharmaceuticals, Inc. Sod1-modulating compositions and methods of use thereof
CN121079106A (zh) * 2023-05-31 2025-12-05 上海拓界生物医药科技有限公司 一种靶向LPA的dsRNA及其应用
WO2024255761A1 (zh) * 2023-06-12 2024-12-19 大睿生物 包含糖的寡核苷酸递送配体
EP4562158A1 (en) 2023-06-13 2025-06-04 Arnatar Therapeutics, Inc Advanced rna targeting (arnatar) for angiotensinogen
TW202506137A (zh) 2023-06-20 2025-02-16 美商雅迪克斯製藥公司 Lrrk2調節組合物及其使用方法
CN119219716A (zh) * 2023-06-30 2024-12-31 上海维申医药有限公司 新型GalNAc的靶向递送片段及其制备和应用
WO2025015335A1 (en) 2023-07-13 2025-01-16 Korro Bio, Inc. Rna-editing oligonucleotides and uses thereof
WO2025015338A1 (en) 2023-07-13 2025-01-16 Korro Bio, Inc. Rna-editing oligonucleotides and uses thereof
GB202311334D0 (en) 2023-07-24 2023-09-06 Astrazeneca Ab Multivalent cargo-carrying complexes and uses thereof
US20250051771A1 (en) 2023-07-24 2025-02-13 Astrazeneca Ab Multivalent cargo-carrying complexes and uses thereof
GB202311324D0 (en) 2023-07-24 2023-09-06 Astrazeneca Ab Multivalent cargo-carrying complexes and uses thereof
WO2025034422A1 (en) 2023-08-04 2025-02-13 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for treating ctnnb1-associated disorders
WO2025036916A1 (en) 2023-08-16 2025-02-20 Les Laboratoires Servier Oligonucleotides for modulating kcnt1 expression
WO2025045194A1 (zh) * 2023-08-31 2025-03-06 正大天晴药业集团股份有限公司 靶向凝血因子xi的双链核糖核酸
US20250243487A1 (en) * 2023-09-14 2025-07-31 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and Methods for Reducing APOCIII Expression
CN116925160B (zh) * 2023-09-15 2023-12-08 天津全和诚科技有限责任公司 一种GalNAc含糖环中间体及其制备方法
WO2025064819A1 (en) * 2023-09-21 2025-03-27 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for inhibiting lpa
WO2025064821A2 (en) 2023-09-21 2025-03-27 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for inhibiting lpa
GB202314724D0 (en) 2023-09-26 2023-11-08 Astrazeneca Ab compounds and methods for reducing psd3 expression
TW202530408A (zh) * 2023-09-29 2025-08-01 美商英西特羅公司 用於治療非酒精性脂肪肝病的組合物與方法
CN118680948B (zh) * 2023-10-20 2025-08-22 思合基因(北京)生物科技有限公司 寡核苷酸及其在抗乙型肝炎病毒中的应用
WO2025096809A1 (en) 2023-10-31 2025-05-08 Korro Bio, Inc. Oligonucleotides comprising phosphoramidate internucleotide linkages
WO2025113470A1 (en) * 2023-11-27 2025-06-05 Shanghai Argo Biopharmaceutical Co., Ltd. Compositions and methods for inhibiting expression of transthyretin (ttr)
CN120098993A (zh) * 2023-12-05 2025-06-06 广东东阳光药业股份有限公司 一种新型的双链siRNA、其缀合物及其用途
CN120309684A (zh) * 2024-01-15 2025-07-15 武汉人福创新药物研发中心有限公司 靶向化合物及其用途
CN117568313B (zh) * 2024-01-15 2024-04-26 上海贝斯昂科生物科技有限公司 基因编辑组合物及其用途
WO2025155911A1 (en) 2024-01-18 2025-07-24 Proqr Therapeutics Ii B.V. Antisense oligonucleotides for the treatment of hurler syndrome
WO2025165891A1 (en) 2024-01-29 2025-08-07 Arnatar Therapeutics, Inc Translation enhancing nucleic acid compounds: aso coupled translation - upregulation 1 (act-up1) and uses thereof
WO2025196505A2 (en) 2024-03-22 2025-09-25 Takeda Pharmaceutical Company Limited Compositions and methods for inhibiting cytochrome p450 family 7 subfamily a member 1 (cyp7a1) expression
GB202404661D0 (en) 2024-04-02 2024-05-15 Proqr Therapeutics Ii Bv Antisense oligoncleotides for the treatment of liver disease
WO2025224230A1 (en) 2024-04-25 2025-10-30 Proqr Therapeutics Ii B.V. Antisense oligonucleotides for the treatment of fatty liver disease
CN118146284B (zh) * 2024-05-08 2024-07-26 北京悦康科创医药科技股份有限公司 一种GalNAc化合物、其与寡核苷酸缀合物及制备方法
WO2025242702A1 (en) * 2024-05-23 2025-11-27 Glaxosmithkline Intellectual Property Development Limited Enzymatic process for producing n-acetyl galactosamine clusters

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU97108591A (ru) * 1994-11-02 1999-05-20 Ай-Си-Эн ФАРМАСЬЮТИКАЛЗ Нуклеозиды с модифицированными сахарами и их применение для синтеза олигонуклеотидов
US20040038274A1 (en) * 1991-12-24 2004-02-26 Isis Pharmaceuticals, Inc. Gapped 2' modified oligonucleotides

Family Cites Families (379)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US3687808A (en) 1969-08-14 1972-08-29 Univ Leland Stanford Junior Synthetic polynucleotides
US4500707A (en) 1980-02-29 1985-02-19 University Patents, Inc. Nucleosides useful in the preparation of polynucleotides
US4458066A (en) 1980-02-29 1984-07-03 University Patents, Inc. Process for preparing polynucleotides
US5132418A (en) 1980-02-29 1992-07-21 University Patents, Inc. Process for preparing polynucleotides
US4469863A (en) 1980-11-12 1984-09-04 Ts O Paul O P Nonionic nucleic acid alkyl and aryl phosphonates and processes for manufacture and use thereof
US4415732A (en) 1981-03-27 1983-11-15 University Patents, Inc. Phosphoramidite compounds and processes
US4973679A (en) 1981-03-27 1990-11-27 University Patents, Inc. Process for oligonucleo tide synthesis using phosphormidite intermediates
US4668777A (en) 1981-03-27 1987-05-26 University Patents, Inc. Phosphoramidite nucleoside compounds
US5023243A (en) 1981-10-23 1991-06-11 Molecular Biosystems, Inc. Oligonucleotide therapeutic agent and method of making same
US4476301A (en) 1982-04-29 1984-10-09 Centre National De La Recherche Scientifique Oligonucleotides, a process for preparing the same and their application as mediators of the action of interferon
DE3329892A1 (de) 1983-08-18 1985-03-07 Köster, Hubert, Prof. Dr., 2000 Hamburg Verfahren zur herstellung von oligonucleotiden
US5118800A (en) 1983-12-20 1992-06-02 California Institute Of Technology Oligonucleotides possessing a primary amino group in the terminal nucleotide
USRE34036E (en) 1984-06-06 1992-08-18 National Research Development Corporation Data transmission using a transparent tone-in band system
US5550111A (en) 1984-07-11 1996-08-27 Temple University-Of The Commonwealth System Of Higher Education Dual action 2',5'-oligoadenylate antiviral derivatives and uses thereof
FR2567892B1 (fr) 1984-07-19 1989-02-17 Centre Nat Rech Scient Nouveaux oligonucleotides, leur procede de preparation et leurs applications comme mediateurs dans le developpement des effets des interferons
US5367066A (en) 1984-10-16 1994-11-22 Chiron Corporation Oligonucleotides with selectably cleavable and/or abasic sites
FR2575751B1 (fr) 1985-01-08 1987-04-03 Pasteur Institut Nouveaux nucleosides de derives de l'adenosine, leur preparation et leurs applications biologiques
US4751219A (en) 1985-02-05 1988-06-14 Nederlandse Centrale Organisatie Voor Toegepast-Natuur-Wetenschappelijk Onderzoek Synthetic glycolipides, a process for the preparation thereof and several uses for these synthetic glycolipides
US5405938A (en) 1989-12-20 1995-04-11 Anti-Gene Development Group Sequence-specific binding polymers for duplex nucleic acids
US5034506A (en) 1985-03-15 1991-07-23 Anti-Gene Development Group Uncharged morpholino-based polymers having achiral intersubunit linkages
US5235033A (en) 1985-03-15 1993-08-10 Anti-Gene Development Group Alpha-morpholino ribonucleoside derivatives and polymers thereof
US5185444A (en) 1985-03-15 1993-02-09 Anti-Gene Deveopment Group Uncharged morpolino-based polymers having phosphorous containing chiral intersubunit linkages
US5506337A (en) 1985-03-15 1996-04-09 Antivirals Inc. Morpholino-subunit combinatorial library and method
US5166315A (en) 1989-12-20 1992-11-24 Anti-Gene Development Group Sequence-specific binding polymers for duplex nucleic acids
EP0260032B1 (en) 1986-09-08 1994-01-26 Ajinomoto Co., Inc. Compounds for the cleavage at a specific position of RNA, oligomers employed for the formation of said compounds, and starting materials for the synthesis of said oligomers
US5276019A (en) 1987-03-25 1994-01-04 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Inhibitors for replication of retroviruses and for the expression of oncogene products
US5264423A (en) 1987-03-25 1993-11-23 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Inhibitors for replication of retroviruses and for the expression of oncogene products
GB8712540D0 (en) * 1987-05-28 1987-07-01 Ucb Sa Expression of human proapolipoprotein a-i
DE3851889T2 (de) 1987-06-24 1995-04-13 Florey Howard Inst Nukleosid-derivate.
US4924624A (en) 1987-10-22 1990-05-15 Temple University-Of The Commonwealth System Of Higher Education 2,',5'-phosphorothioate oligoadenylates and plant antiviral uses thereof
US5188897A (en) 1987-10-22 1993-02-23 Temple University Of The Commonwealth System Of Higher Education Encapsulated 2',5'-phosphorothioate oligoadenylates
US5403711A (en) 1987-11-30 1995-04-04 University Of Iowa Research Foundation Nucleic acid hybridization and amplification method for detection of specific sequences in which a complementary labeled nucleic acid probe is cleaved
JP3019994B2 (ja) 1987-11-30 2000-03-15 ユニバーシティ オブ アイオワ リサーチ ファウンデーション 新規なオリゴデオキシヌクレオチド、それを使用した標的遺伝子の発現をブロックする方法、及び新規なオリゴデオキシヌクレオチド並びにそれを使用した標的遺伝子の発現を阻止する方法
WO1989009221A1 (en) 1988-03-25 1989-10-05 University Of Virginia Alumni Patents Foundation Oligonucleotide n-alkylphosphoramidates
US5278302A (en) 1988-05-26 1994-01-11 University Patents, Inc. Polynucleotide phosphorodithioates
US5216141A (en) 1988-06-06 1993-06-01 Benner Steven A Oligonucleotide analogs containing sulfur linkages
US5175273A (en) 1988-07-01 1992-12-29 Genentech, Inc. Nucleic acid intercalating agents
US5194599A (en) 1988-09-23 1993-03-16 Gilead Sciences, Inc. Hydrogen phosphonodithioate compositions
US5256775A (en) 1989-06-05 1993-10-26 Gilead Sciences, Inc. Exonuclease-resistant oligonucleotides
US5134066A (en) 1989-08-29 1992-07-28 Monsanto Company Improved probes using nucleosides containing 3-dezauracil analogs
US5591722A (en) 1989-09-15 1997-01-07 Southern Research Institute 2'-deoxy-4'-thioribonucleosides and their antiviral activity
US5399676A (en) 1989-10-23 1995-03-21 Gilead Sciences Oligonucleotides with inverted polarity
US5721218A (en) 1989-10-23 1998-02-24 Gilead Sciences, Inc. Oligonucleotides with inverted polarity
DE69033495T2 (de) 1989-10-24 2000-07-20 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2'-modifizierte nukleotide
US5264564A (en) 1989-10-24 1993-11-23 Gilead Sciences Oligonucleotide analogs with novel linkages
US5264562A (en) 1989-10-24 1993-11-23 Gilead Sciences, Inc. Oligonucleotide analogs with novel linkages
US5177198A (en) 1989-11-30 1993-01-05 University Of N.C. At Chapel Hill Process for preparing oligoribonucleoside and oligodeoxyribonucleoside boranophosphates
US5130302A (en) 1989-12-20 1992-07-14 Boron Bilogicals, Inc. Boronated nucleoside, nucleotide and oligonucleotide compounds, compositions and methods for using same
US5646265A (en) 1990-01-11 1997-07-08 Isis Pharmceuticals, Inc. Process for the preparation of 2'-O-alkyl purine phosphoramidites
US5587361A (en) 1991-10-15 1996-12-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides having phosphorothioate linkages of high chiral purity
US5623065A (en) 1990-08-13 1997-04-22 Isis Pharmaceuticals, Inc. Gapped 2' modified oligonucleotides
US5459255A (en) 1990-01-11 1995-10-17 Isis Pharmaceuticals, Inc. N-2 substituted purines
US7101993B1 (en) 1990-01-11 2006-09-05 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides containing 2′-O-modified purines
US5681941A (en) 1990-01-11 1997-10-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. Substituted purines and oligonucleotide cross-linking
US5859221A (en) 1990-01-11 1999-01-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2'-modified oligonucleotides
US5457191A (en) 1990-01-11 1995-10-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. 3-deazapurines
US5587470A (en) 1990-01-11 1996-12-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. 3-deazapurines
US5670633A (en) 1990-01-11 1997-09-23 Isis Pharmaceuticals, Inc. Sugar modified oligonucleotides that detect and modulate gene expression
US6005087A (en) 1995-06-06 1999-12-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2'-modified oligonucleotides
US5220007A (en) 1990-02-15 1993-06-15 The Worcester Foundation For Experimental Biology Method of site-specific alteration of RNA and production of encoded polypeptides
US5149797A (en) 1990-02-15 1992-09-22 The Worcester Foundation For Experimental Biology Method of site-specific alteration of rna and production of encoded polypeptides
US5321131A (en) 1990-03-08 1994-06-14 Hybridon, Inc. Site-specific functionalization of oligodeoxynucleotides for non-radioactive labelling
US5470967A (en) 1990-04-10 1995-11-28 The Dupont Merck Pharmaceutical Company Oligonucleotide analogs with sulfamate linkages
GB9009980D0 (en) 1990-05-03 1990-06-27 Amersham Int Plc Phosphoramidite derivatives,their preparation and the use thereof in the incorporation of reporter groups on synthetic oligonucleotides
EP0455905B1 (en) 1990-05-11 1998-06-17 Microprobe Corporation Dipsticks for nucleic acid hybridization assays and methods for covalently immobilizing oligonucleotides
US5602240A (en) 1990-07-27 1997-02-11 Ciba Geigy Ag. Backbone modified oligonucleotide analogs
US5610289A (en) 1990-07-27 1997-03-11 Isis Pharmaceuticals, Inc. Backbone modified oligonucleotide analogues
US5386023A (en) 1990-07-27 1995-01-31 Isis Pharmaceuticals Backbone modified oligonucleotide analogs and preparation thereof through reductive coupling
US5489677A (en) 1990-07-27 1996-02-06 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleoside linkages containing adjacent oxygen and nitrogen atoms
US5541307A (en) 1990-07-27 1996-07-30 Isis Pharmaceuticals, Inc. Backbone modified oligonucleotide analogs and solid phase synthesis thereof
CA2088258C (en) 1990-07-27 2004-09-14 Phillip Dan Cook Nuclease resistant, pyrimidine modified oligonucleotides that detect and modulate gene expression
US5618704A (en) 1990-07-27 1997-04-08 Isis Pharmacueticals, Inc. Backbone-modified oligonucleotide analogs and preparation thereof through radical coupling
US5623070A (en) 1990-07-27 1997-04-22 Isis Pharmaceuticals, Inc. Heteroatomic oligonucleoside linkages
US5608046A (en) 1990-07-27 1997-03-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Conjugated 4'-desmethyl nucleoside analog compounds
US5223618A (en) 1990-08-13 1993-06-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. 4'-desmethyl nucleoside analog compounds
US5378825A (en) 1990-07-27 1995-01-03 Isis Pharmaceuticals, Inc. Backbone modified oligonucleotide analogs
US5677437A (en) 1990-07-27 1997-10-14 Isis Pharmaceuticals, Inc. Heteroatomic oligonucleoside linkages
KR100211552B1 (ko) 1990-08-03 1999-08-02 디. 꼬쉬 유전자 발현 억제용 화합물 및 방법
US5177196A (en) 1990-08-16 1993-01-05 Microprobe Corporation Oligo (α-arabinofuranosyl nucleotides) and α-arabinofuranosyl precursors thereof
US5214134A (en) 1990-09-12 1993-05-25 Sterling Winthrop Inc. Process of linking nucleosides with a siloxane bridge
US5561225A (en) 1990-09-19 1996-10-01 Southern Research Institute Polynucleotide analogs containing sulfonate and sulfonamide internucleoside linkages
JPH06505704A (ja) 1990-09-20 1994-06-30 ギリアド サイエンシズ,インコーポレイテッド 改変ヌクレオシド間結合
US5432272A (en) 1990-10-09 1995-07-11 Benner; Steven A. Method for incorporating into a DNA or RNA oligonucleotide using nucleotides bearing heterocyclic bases
US6582908B2 (en) 1990-12-06 2003-06-24 Affymetrix, Inc. Oligonucleotides
US5948903A (en) 1991-01-11 1999-09-07 Isis Pharmaceuticals, Inc. Synthesis of 3-deazapurines
US5672697A (en) 1991-02-08 1997-09-30 Gilead Sciences, Inc. Nucleoside 5'-methylene phosphonates
US7015315B1 (en) 1991-12-24 2006-03-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. Gapped oligonucleotides
US5571799A (en) 1991-08-12 1996-11-05 Basco, Ltd. (2'-5') oligoadenylate analogues useful as inhibitors of host-v5.-graft response
DE59208572D1 (de) 1991-10-17 1997-07-10 Ciba Geigy Ag Bicyclische Nukleoside, Oligonukleotide, Verfahren zu deren Herstellung und Zwischenprodukte
US5594121A (en) 1991-11-07 1997-01-14 Gilead Sciences, Inc. Enhanced triple-helix and double-helix formation with oligomers containing modified purines
CA2122365C (en) 1991-11-26 2010-05-11 Brian Froehler Enhanced triple-helix and double-helix formation with oligomers containing modified pyrimidines
US5484908A (en) 1991-11-26 1996-01-16 Gilead Sciences, Inc. Oligonucleotides containing 5-propynyl pyrimidines
TW393513B (en) 1991-11-26 2000-06-11 Isis Pharmaceuticals Inc Enhanced triple-helix and double-helix formation with oligomers containing modified pyrimidines
US5792608A (en) 1991-12-12 1998-08-11 Gilead Sciences, Inc. Nuclease stable and binding competent oligomers and methods for their use
US5359044A (en) 1991-12-13 1994-10-25 Isis Pharmaceuticals Cyclobutyl oligonucleotide surrogates
US5700922A (en) 1991-12-24 1997-12-23 Isis Pharmaceuticals, Inc. PNA-DNA-PNA chimeric macromolecules
FR2687679B1 (fr) 1992-02-05 1994-10-28 Centre Nat Rech Scient Oligothionucleotides.
US5633360A (en) 1992-04-14 1997-05-27 Gilead Sciences, Inc. Oligonucleotide analogs capable of passive cell membrane permeation
US5434257A (en) 1992-06-01 1995-07-18 Gilead Sciences, Inc. Binding compentent oligomers containing unsaturated 3',5' and 2',5' linkages
EP0577558A2 (de) 1992-07-01 1994-01-05 Ciba-Geigy Ag Carbocyclische Nukleoside mit bicyclischen Ringen, Oligonukleotide daraus, Verfahren zu deren Herstellung, deren Verwendung und Zwischenproduckte
US5652355A (en) 1992-07-23 1997-07-29 Worcester Foundation For Experimental Biology Hybrid oligonucleotide phosphorothioates
WO1994002499A1 (en) 1992-07-27 1994-02-03 Hybridon, Inc. Oligonucleotide alkylphosphonothioates
JPH08504559A (ja) 1992-12-14 1996-05-14 ハネウエル・インコーポレーテッド 個別に制御される冗長巻線を有するモータシステム
NZ262254A (en) 1993-01-25 1997-10-24 Hybridon Inc Oligonucleotide analogue containing a ribonucleotide alkylphosphon(ate or thioate), gene repression
US5476925A (en) 1993-02-01 1995-12-19 Northwestern University Oligodeoxyribonucleotides including 3'-aminonucleoside-phosphoramidate linkages and terminal 3'-amino groups
GB9304618D0 (en) 1993-03-06 1993-04-21 Ciba Geigy Ag Chemical compounds
GB9304620D0 (en) 1993-03-06 1993-04-21 Ciba Geigy Ag Compounds
CA2159631A1 (en) 1993-03-30 1994-10-13 Sanofi Acyclic nucleoside analogs and oligonucleotide sequences containing them
WO1994022891A1 (en) 1993-03-31 1994-10-13 Sterling Winthrop Inc. Oligonucleotides with amide linkages replacing phosphodiester linkages
US5502177A (en) 1993-09-17 1996-03-26 Gilead Sciences, Inc. Pyrimidine derivatives for labeled binding partners
US5801154A (en) 1993-10-18 1998-09-01 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense oligonucleotide modulation of multidrug resistance-associated protein
US5457187A (en) 1993-12-08 1995-10-10 Board Of Regents University Of Nebraska Oligonucleotides containing 5-fluorouracil
US5446137B1 (en) 1993-12-09 1998-10-06 Behringwerke Ag Oligonucleotides containing 4'-substituted nucleotides
KR100386337B1 (ko) 1993-12-09 2004-03-24 토마스 제퍼슨 대학교 진핵세포에서부위-특이적돌연변이를위한화합물과그방법
US5519134A (en) 1994-01-11 1996-05-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. Pyrrolidine-containing monomers and oligomers
US5728518A (en) 1994-01-12 1998-03-17 The Immune Response Corporation Antiviral poly-and oligonucleotides
US5596091A (en) 1994-03-18 1997-01-21 The Regents Of The University Of California Antisense oligonucleotides comprising 5-aminoalkyl pyrimidine nucleotides
US5627053A (en) 1994-03-29 1997-05-06 Ribozyme Pharmaceuticals, Inc. 2'deoxy-2'-alkylnucleotide containing nucleic acid
US5625050A (en) 1994-03-31 1997-04-29 Amgen Inc. Modified oligonucleotides and intermediates useful in nucleic acid therapeutics
US5646269A (en) 1994-04-28 1997-07-08 Gilead Sciences, Inc. Method for oligonucleotide analog synthesis
US5525711A (en) 1994-05-18 1996-06-11 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Pteridine nucleotide analogs as fluorescent DNA probes
US5597909A (en) 1994-08-25 1997-01-28 Chiron Corporation Polynucleotide reagents containing modified deoxyribose moieties, and associated methods of synthesis and use
US5599706A (en) 1994-09-23 1997-02-04 Stinchcomb; Dan T. Ribozymes targeted to apo(a) mRNA
US5681940A (en) 1994-11-02 1997-10-28 Icn Pharmaceuticals Sugar modified nucleosides and oligonucleotides
US6172045B1 (en) 1994-12-07 2001-01-09 Neorx Corporation Cluster clearing agents
US6908903B1 (en) 1994-12-07 2005-06-21 Aletheon Pharmaceuticals, Inc. Cluster clearing agents
US5652356A (en) 1995-08-17 1997-07-29 Hybridon, Inc. Inverted chimeric and hybrid oligonucleotides
US20030119724A1 (en) 1995-11-22 2003-06-26 Ts`O Paul O.P. Ligands to enhance cellular uptake of biomolecules
EP0862439A4 (en) 1995-11-22 2001-01-10 O Paul O P Ts LIGANDS FOR INCREASING THE CELLULAR UPtake OF BIOMOLECULES
US5998203A (en) 1996-04-16 1999-12-07 Ribozyme Pharmaceuticals, Inc. Enzymatic nucleic acids containing 5'-and/or 3'-cap structures
EP0950665A4 (en) 1996-09-26 2004-05-06 Ajinomoto Kk PHYSIOLOGICALLY ACTIVE MODIFIED PROTEINS AND DRUG COMPOSITIONS CONTAINING THEM
USRE44779E1 (en) 1997-03-07 2014-02-25 Santaris Pharma A/S Bicyclonucleoside and oligonucleotide analogues
JP3756313B2 (ja) 1997-03-07 2006-03-15 武 今西 新規ビシクロヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体
US6770748B2 (en) 1997-03-07 2004-08-03 Takeshi Imanishi Bicyclonucleoside and oligonucleotide analogue
KR100414936B1 (ko) 1997-09-12 2004-01-13 엑시콘 에이/에스 이환 및 삼환 뉴클레오시드, 뉴클레오타이드 및올리고뉴클레오타이드 동족체
US7572582B2 (en) 1997-09-12 2009-08-11 Exiqon A/S Oligonucleotide analogues
US6794499B2 (en) 1997-09-12 2004-09-21 Exiqon A/S Oligonucleotide analogues
US20040171564A1 (en) 1997-11-20 2004-09-02 Honkanen Richard E. Antisense oligonucleotide modulation of human serine/threonine protein phosphatase gene expression
US20030228597A1 (en) 1998-04-13 2003-12-11 Cowsert Lex M. Identification of genetic targets for modulation by oligonucleotides and generation of oligonucleotides for gene modulation
US6300319B1 (en) 1998-06-16 2001-10-09 Isis Pharmaceuticals, Inc. Targeted oligonucleotide conjugates
US6043352A (en) 1998-08-07 2000-03-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2'-O-Dimethylaminoethyloxyethyl-modified oligonucleotides
PL346645A1 (en) * 1998-08-19 2002-02-25 North American Vaccine IMMUNOGENIC β-PROPIONAMIDO-LINKED POLYSACCHARIDE PROTEIN CONJUGATE USEFUL AS A VACCINE PRODUCED USING AN N-ACRYLOYLATED POLYSACCHARIDE
CA2340692A1 (en) 1998-08-19 2000-03-02 North American Vaccine, Inc. Immunogenic .beta.-propionamido-linked polysaccharide protein conjugate useful as a vaccine produced using an n-acryloylated polysaccharide
US6166239A (en) 1998-09-04 2000-12-26 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotide protecting groups
NZ513402A (en) 1999-02-12 2003-06-30 Sankyo Co Novel nucleosides and oligonucleotide analogues
US20030170249A1 (en) 1999-02-19 2003-09-11 Hakomori Sen-Itiroh Vaccines directed to cancer-associated carbohydrate antigens
US7084125B2 (en) 1999-03-18 2006-08-01 Exiqon A/S Xylo-LNA analogues
US7098192B2 (en) 1999-04-08 2006-08-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense oligonucleotide modulation of STAT3 expression
US6159694A (en) 1999-04-08 2000-12-12 Isis Pharmaceuticals Inc. Antisense modulation of stat3 expression
WO2000063364A2 (en) 1999-04-21 2000-10-26 American Home Products Corporation Methods and compositions for inhibiting the function of polynucleotide sequences
PT1178999E (pt) 1999-05-04 2007-06-26 Santaris Pharma As Análogos de l-ribo-lna
US6525191B1 (en) 1999-05-11 2003-02-25 Kanda S. Ramasamy Conformationally constrained L-nucleosides
US6383812B1 (en) 1999-05-28 2002-05-07 Academia Sinica Anti liver disease drug R-YEEE and method of synthesizing branched galactose-terminal glycoproteins
US8541548B2 (en) 1999-06-07 2013-09-24 Arrowhead Madison Inc. Compounds and methods for reversible modification of biologically active molecules
US20080281041A1 (en) 1999-06-07 2008-11-13 Rozema David B Reversibly Masked Polymers
US6656730B1 (en) 1999-06-15 2003-12-02 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides conjugated to protein-binding drugs
WO2001005825A2 (en) 1999-07-16 2001-01-25 Hyseq, Inc. Nucleic acid sequences encoding putative angiopoietin proteins
JP4151751B2 (ja) 1999-07-22 2008-09-17 第一三共株式会社 新規ビシクロヌクレオシド類縁体
DE19935303A1 (de) 1999-07-28 2001-02-08 Aventis Pharma Gmbh Oligonukleotide zur Inhibierung der Expression von humanem eg5
US20020082227A1 (en) 1999-09-30 2002-06-27 Scott Henry Use of oligonucleotides for inhibition of complement activation
US20050112118A1 (en) 1999-12-02 2005-05-26 Myriad Genetics, Incorporated Compositions and methods for treating inflammatory disorders
MXPA02005758A (es) 1999-12-09 2002-09-18 Sankyo Co Metodo para evaluar un remedio o agente preventivo para hiperlipidemia.
ES2261270T3 (es) 1999-12-30 2006-11-16 K.U. LEUVEN RESEARCH & DEVELOPMENT Acidos nucleicos que contienen ciclohexeno.
US20020055479A1 (en) 2000-01-18 2002-05-09 Cowsert Lex M. Antisense modulation of PTP1B expression
US6602857B1 (en) 2000-01-18 2003-08-05 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of PTP1B expression
US6261840B1 (en) 2000-01-18 2001-07-17 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of PTP1B expression
US7179796B2 (en) 2000-01-18 2007-02-20 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of PTP1B expression
US8202979B2 (en) 2002-02-20 2012-06-19 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of gene expression using chemically modified short interfering nucleic acid
US7833992B2 (en) 2001-05-18 2010-11-16 Merck Sharpe & Dohme Conjugates and compositions for cellular delivery
US7491805B2 (en) 2001-05-18 2009-02-17 Sirna Therapeutics, Inc. Conjugates and compositions for cellular delivery
WO2001060860A2 (en) 2000-02-17 2001-08-23 Millennium Predictive Medicine, Inc. Genes differentially expressed in human prostate cancer and their use
US7053199B2 (en) 2000-08-29 2006-05-30 Takeshi Imanishi Nucleoside analogs and oligonucleotide derivatives containing these analogs
US6426220B1 (en) 2000-10-30 2002-07-30 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of calreticulin expression
US6906182B2 (en) 2000-12-01 2005-06-14 Cell Works Therapeutics, Inc. Conjugates of glycosylated/galactosylated peptide, bifunctional linker, and nucleotidic monomers/polymers, and related compositions and method of use
WO2002087541A1 (en) 2001-04-30 2002-11-07 Protiva Biotherapeutics Inc. Lipid-based formulations for gene transfer
EP1403367A4 (en) 2001-06-08 2005-08-17 Sankyo Co A MEDICAMENT TEST METHOD FOR TREATING OR PREVENTING DISEASES SUCH AS HYPERLIPEMIA
US20030158403A1 (en) 2001-07-03 2003-08-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. Nuclease resistant chimeric oligonucleotides
US20030175906A1 (en) 2001-07-03 2003-09-18 Muthiah Manoharan Nuclease resistant chimeric oligonucleotides
CA2452458A1 (en) 2001-07-03 2003-01-16 Isis Pharmaceuticals, Inc. Nuclease resistant chimeric oligonucleotides
US7425545B2 (en) 2001-07-25 2008-09-16 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of C-reactive protein expression
US6964950B2 (en) 2001-07-25 2005-11-15 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of C-reactive protein expression
US7227014B2 (en) 2001-08-07 2007-06-05 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of apolipoprotein (a) expression
US7259150B2 (en) * 2001-08-07 2007-08-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of apolipoprotein (a) expression
WO2003014397A1 (en) 2001-08-09 2003-02-20 Biomedlab Corporation Probe for detection of enteric virus detection kit and method for enteric virus with the same
WO2003020739A2 (en) 2001-09-04 2003-03-13 Exiqon A/S Novel lna compositions and uses thereof
US7439043B2 (en) 2001-10-10 2008-10-21 Neose Technologies, Inc. Galactosyl nucleotide sugars
ES2429034T3 (es) 2001-11-16 2013-11-12 Genentech, Inc. Uso de antagonistas de ANGPTL3 para el tratamiento de enfermedades hepáticas
US20100240730A1 (en) 2002-02-20 2010-09-23 Merck Sharp And Dohme Corp. RNA Interference Mediated Inhibition of Gene Expression Using Chemically Modified Short Interfering Nucleic Acid (siNA)
EP1540004A4 (en) 2002-07-31 2007-10-03 Nucleonics Inc DOUBLE-STRING RNA STRUCTURES AND CONSTRUCTS AND METHOD FOR THE PRODUCTION AND USE THEREOF
WO2004014933A1 (en) 2002-08-07 2004-02-19 University Of Massachusetts Compositions for rna interference and methods of use thereof
WO2004024757A2 (en) 2002-09-11 2004-03-25 Santaris Pharma A/S Modified pna molecules
AU2003284323A1 (en) 2002-10-18 2004-05-04 Alnylam Pharmaceuticals Inc Double-stranded rna structures and constructs, and methods for generating and using the same
EP1560840B1 (en) 2002-11-05 2015-05-06 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions comprising alternating 2'-modified nucleosides for use in gene modulation
CA2504694C (en) 2002-11-05 2013-10-01 Isis Pharmaceuticals, Inc. Polycyclic sugar surrogate-containing oligomeric compounds and compositions for use in gene modulation
US7511131B2 (en) 2002-11-13 2009-03-31 Genzyme Corporation Antisense modulation of apolipoprotein B expression
US20060009410A1 (en) 2002-11-13 2006-01-12 Crooke Rosanne M Effects of apolipoprotein B inhibition on gene expression profiles in animals
EP1569695B1 (en) 2002-11-13 2013-05-15 Genzyme Corporation Antisense modulation of apolipoprotein b expression
DK2284266T3 (da) 2002-11-14 2014-01-13 Thermo Fisher Scient Biosciences Inc sIRNA-MOLEKYLE MOD TP53
EP2474630B1 (en) 2002-12-20 2016-04-27 Celera Corporation Genetic polymorphisms associated with myocardial infarction, methods of detection and uses thereof
US6673661B1 (en) 2002-12-20 2004-01-06 Taiwan Semiconductor Manufacturing Co., Ltd. Self-aligned method for forming dual gate thin film transistor (TFT) device
US20070015927A1 (en) 2003-01-09 2007-01-18 Kim Byeang H New phosphoramidite compounds
WO2004072046A2 (en) 2003-02-12 2004-08-26 Carex S.A. Quinoline derivatives and their use for modulation of lxr activity
US7803781B2 (en) 2003-02-28 2010-09-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of growth hormone receptor expression and insulin-like growth factor expression
EP3450559A1 (en) 2003-03-07 2019-03-06 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Therapeutic compositions
EP1608735A4 (en) * 2003-04-03 2008-11-05 Alnylam Pharmaceuticals RNAI CONJUGATES
US7598227B2 (en) 2003-04-16 2009-10-06 Isis Pharmaceuticals Inc. Modulation of apolipoprotein C-III expression
US7851615B2 (en) 2003-04-17 2010-12-14 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Lipophilic conjugated iRNA agents
US7723509B2 (en) 2003-04-17 2010-05-25 Alnylam Pharmaceuticals IRNA agents with biocleavable tethers
ES2702942T3 (es) 2003-04-17 2019-03-06 Alnylam Pharmaceuticals Inc Agentes de ARNi modificados
US7750142B2 (en) 2003-04-28 2010-07-06 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of glucagon receptor expression
US7399853B2 (en) 2003-04-28 2008-07-15 Isis Pharmaceuticals Modulation of glucagon receptor expression
WO2004101619A1 (ja) 2003-05-15 2004-11-25 Shionogi Co., Ltd. 機能的糖ペプチドの合理的設計および合成
WO2004106356A1 (en) 2003-05-27 2004-12-09 Syddansk Universitet Functionalized nucleotide derivatives
JP4731324B2 (ja) 2003-08-28 2011-07-20 武 今西 N−o結合性架橋構造型新規人工核酸
BRPI0413930A (pt) 2003-09-18 2006-10-24 Isis Pharmaceuticals Inc composto oligomérico ou sal farmaceuticamente aceitável deste, composição farmacêutica ou veterinária, métodos para inibir a expressão de eif4e em uma célula, tecido ou órgão, para diminuir a proliferação de uma célula em que eif4e é expressado, e para prevenir ou tratar uma condição ou doença métodos para prevenir ou diminuir a angiogênese, e o crescimento de tumor em um paciente, oligonucleotìdeo de anti-sentido, composição farmacêutica ou veterinária, e, uso de um composto oligomérico ou sal farmaceuticamente aceitável deste
WO2005027962A1 (en) 2003-09-18 2005-03-31 Isis Pharmaceuticals, Inc. 4’-thionucleosides and oligomeric compounds
EP1687410A4 (en) * 2003-10-07 2008-04-09 Isis Pharmaceuticals Inc ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDE OPTIMIZED FOR KIDNEY TARGETING
US7959919B2 (en) 2003-11-19 2011-06-14 Novelmed Therapeutics, Inc. Method of inhibiting factor B-mediated complement activation
WO2005065686A1 (en) 2004-01-07 2005-07-21 Adipogen Pharmaceuticals Pty Limited Differentiation modulating agents and uses therefor
JP2007520222A (ja) 2004-01-20 2007-07-26 アイシス ファーマシューティカルズ インコーポレイテッド グルココルチコイドレセプター発現の調節
CN1918143B (zh) * 2004-02-05 2012-01-11 独立行政法人科学技术振兴机构 连接子化合物、配体络合物和它们的制备方法
US20050244869A1 (en) 2004-04-05 2005-11-03 Brown-Driver Vickie L Modulation of transthyretin expression
WO2005097155A1 (ja) 2004-04-08 2005-10-20 Takara Bio Inc. 神経突起伸長誘導剤
AU2005248147A1 (en) 2004-05-11 2005-12-08 Alphagen Co., Ltd. Polynucleotides for causing RNA interference and method for inhibiting gene expression using the same
CA2568735A1 (en) 2004-06-03 2005-12-22 Isis Pharmaceuticals, Inc. Double strand compositions comprising differentially modified strands for use in gene modulation
AU2005269716B2 (en) 2004-07-20 2011-01-27 Genentech, Inc. Inhibitors of angiopoietin-like 4 protein, combinations, and their use
MX2007000783A (es) 2004-07-20 2007-04-09 Genentech Inc Inhibidores de proteina angiopoietina tipo 4, combinaciones y su uso.
EP2990410A1 (en) 2004-08-10 2016-03-02 Alnylam Pharmaceuticals Inc. Chemically modified oligonucleotides
AU2005272912A1 (en) * 2004-08-10 2006-02-23 Genzyme Corporation Antisense modulation of apolipoprotein B expression
US20090203132A1 (en) 2004-09-09 2009-08-13 Swayze Eric E Pyrrolidinyl groups for attaching conjugates to oligomeric compounds
EP1807093A2 (en) 2004-10-13 2007-07-18 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of ptp1b expression
WO2006047842A2 (en) 2004-11-08 2006-05-11 K.U. Leuven Research And Development Modified nucleosides for rna interference
US20060148740A1 (en) 2005-01-05 2006-07-06 Prosensa B.V. Mannose-6-phosphate receptor mediated gene transfer into muscle cells
JP2008527993A (ja) 2005-01-24 2008-07-31 アヴァリス・アクチエボラーグ 特異性及び送達の改善のためのsiRNA分子、shRNA分子又はアンチセンス分子及び機能的実体を含む複合体
KR20080068019A (ko) * 2005-09-15 2008-07-22 산타리스 팔마 에이/에스 아포지단백질-b100 발현 억제용 rna 길항제 화합물
CA2623762A1 (en) 2005-09-19 2007-03-29 Johnson & Johnson Pharmaceutical Research & Development, L.L.C. Modulation of glucagon receptor expression
CA2623772A1 (en) 2005-09-19 2007-03-29 Johnson & Johnson Pharmaceutical Research & Development, L.L.C. Modulation of glucocorticoid receptor expression
EP2161038B1 (en) * 2006-01-26 2013-12-25 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and their uses directed to Huntingtin
ES2516815T3 (es) 2006-01-27 2014-10-31 Isis Pharmaceuticals, Inc. Análogos de ácidos nucleicos bicíclicos modificados en la posición 6
US7569686B1 (en) 2006-01-27 2009-08-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for synthesis of bicyclic nucleic acid analogs
WO2007136989A2 (en) 2006-05-05 2007-11-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulating expression of dgat2
ES2366974T3 (es) * 2006-05-05 2011-10-27 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compuestos y procedimientos para modular la expresión de sglt2.
CA2651453C (en) 2006-05-11 2014-10-14 Isis Pharmaceuticals, Inc. 5'-modified bicyclic nucleic acid analogs
US7666854B2 (en) 2006-05-11 2010-02-23 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bis-modified bicyclic nucleic acid analogs
WO2008017081A1 (en) 2006-08-04 2008-02-07 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for the modulation of jnk proteins
BRPI0715375A2 (pt) 2006-08-18 2013-06-18 Hoffmann La Roche policonjugados para distribuiÇço in vivo de polinucleotÍdeos
US8658211B2 (en) 2006-08-18 2014-02-25 Arrowhead Madison Inc. Polyconjugates for in vivo delivery of polynucleotides
EP2064223B1 (en) 2006-09-22 2013-04-24 Dharmacon, Inc. Duplex oligonucleotide complexes and methods for gene silencing by RNA interference
JP5665317B2 (ja) 2006-10-18 2015-02-04 アイシス ファーマシューティカルズ, インコーポレーテッド アンチセンス化合物
US8093222B2 (en) 2006-11-27 2012-01-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. Methods for treating hypercholesterolemia
JP2010510807A (ja) 2006-11-27 2010-04-08 アイシス ファーマシューティカルズ, インコーポレーテッド 高コレステロール血症を治療するための方法
CA2672049C (en) 2006-12-08 2016-05-10 Lexicon Pharmaceuticals, Inc. Monoclonal antibodies against angptl3
CA2839162A1 (en) * 2006-12-20 2008-06-26 Xoma Technology Ltd. Methods for the treatment of il-1-.beta. related diseases
US20100190837A1 (en) 2007-02-15 2010-07-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. 5'-Substituted-2-F' Modified Nucleosides and Oligomeric Compounds Prepared Therefrom
EP2129402A2 (en) 2007-02-16 2009-12-09 KTB Tumorforschungsgesellschaft mbH Receptor and antigen targeted prodrug
KR20090122465A (ko) 2007-03-01 2009-11-30 어드벤스드 비젼 테라피스, 인코포레이티드 염증성 질환의 치료
WO2009029293A2 (en) 2007-03-02 2009-03-05 Mdrna, Inc. Nucleic acid compounds for inhibiting myc gene expression and uses thereof
WO2008131419A2 (en) 2007-04-23 2008-10-30 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Glycoconjugates of rna interference agents
WO2008150729A2 (en) 2007-05-30 2008-12-11 Isis Pharmaceuticals, Inc. N-substituted-aminomethylene bridged bicyclic nucleic acid analogs
EP2173760B2 (en) 2007-06-08 2015-11-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Carbocyclic bicyclic nucleic acid analogs
US20090004140A1 (en) 2007-06-26 2009-01-01 Yao-Ling Qiu 4-substituted pyrrolidine as anti-infectives
AU2008272918B2 (en) 2007-07-05 2012-09-13 Isis Pharmaceuticals, Inc. 6-disubstituted bicyclic nucleic acid analogs
EP2188298B1 (en) 2007-08-15 2013-09-18 Isis Pharmaceuticals, Inc. Tetrahydropyran nucleic acid analogs
BRPI0815324A2 (pt) * 2007-08-20 2015-07-14 Protalix Ltd "conjugado protêico que contém sacarídeos, processo de separação do conjugado protêico que contém sacarídeos, composição farmacêutica do conjugado protêico que contém sacarídeos, uso do conjugado protêico que contém sacarídeos e composto do conjugado protêico que contém sacarídeos"
WO2009046141A2 (en) * 2007-10-01 2009-04-09 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of fibroblast growth factor receptor 4 expression
NZ585250A (en) 2007-11-09 2012-06-29 Isis Pharmaceuticals Inc Antisense modulation of factor 7 expression
US8546556B2 (en) 2007-11-21 2013-10-01 Isis Pharmaceuticals, Inc Carbocyclic alpha-L-bicyclic nucleic acid analogs
EP3705125B1 (en) * 2007-12-04 2023-07-05 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Carbohydrate conjugates as delivery agents for oligonucleotides
JP4585611B2 (ja) 2007-12-27 2010-11-24 株式会社ステリック再生医科学研究所 糖鎖関連遺伝子、およびその利用
EP2245039A4 (en) 2008-01-31 2012-06-06 Alnylam Pharmaceuticals Inc OPTIMIZED METHODS FOR EXPORING DSRNA TO TARGET THE PCSK9 GEN
US8530640B2 (en) 2008-02-07 2013-09-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic cyclohexitol nucleic acid analogs
WO2009142822A2 (en) 2008-03-26 2009-11-26 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. 2-f modified rna interference agents
AU2009234266B2 (en) 2008-04-11 2015-08-06 Tekmira Pharmaceuticals Corporation Site-specific delivery of nucleic acids by combining targeting ligands with endosomolytic components
WO2009143369A2 (en) 2008-05-22 2009-11-26 Isis Pharmaceuticals, Inc. Method of preparing nucleosides and analogs thereof without using chromatography
WO2009148605A2 (en) 2008-06-04 2009-12-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. Methods for treating hypercholesterolemia
US8216786B2 (en) 2008-07-09 2012-07-10 Celera Corporation Genetic polymorphisms associated with cardiovascular diseases, methods of detection and uses thereof
WO2010017509A1 (en) 2008-08-07 2010-02-11 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of transthyretin expression for the treatment of cns related disorders
WO2010039548A2 (en) 2008-09-23 2010-04-08 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Chemical modifications of monomers and oligonucleotides with cycloaddition
WO2010036696A1 (en) 2008-09-24 2010-04-01 Isis Pharmaceuticals, Inc. Cyclohexenyl nucleic acid analogs
WO2010036698A1 (en) 2008-09-24 2010-04-01 Isis Pharmaceuticals, Inc. Substituted alpha-l-bicyclic nucleosides
CN104212799B (zh) 2008-10-15 2018-11-23 Ionis制药公司 因子11表达的调节
HRP20150796T1 (hr) * 2008-10-20 2015-09-11 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Pripravci i postupci za inhibiciju ekspresije transtiretina
WO2010048585A2 (en) 2008-10-24 2010-04-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds and methods
US8883752B2 (en) 2008-10-24 2014-11-11 Isis Pharmaceuticals, Inc. 5′ and 2′ BIS-substituted nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
CN105152939A (zh) 2008-11-10 2015-12-16 阿尔尼拉姆医药品有限公司 用于递送治疗剂的脂质和组合物
WO2010083615A1 (en) 2009-01-26 2010-07-29 Protiva Biotherapeutics, Inc. Compositions and methods for silencing apolipoprotein c-iii expression
EP3243504A1 (en) 2009-01-29 2017-11-15 Arbutus Biopharma Corporation Improved lipid formulation
EP2669290A1 (en) 2009-03-02 2013-12-04 Alnylam Pharmaceuticals Inc. Nucleic Acid Chemical Modifications
FR2943060B1 (fr) 2009-03-13 2013-01-04 Commissariat Energie Atomique Agents chelatants d'ions metalliques, leurs procedes de preparation et leurs applications
EP2419146A4 (en) 2009-04-15 2013-11-27 Isis Pharmaceuticals Inc MODULATION OF IGNITION REACTIONS BY FACTOR XI
KR20210031549A (ko) 2009-05-05 2021-03-19 알닐람 파마슈티칼스 인코포레이티드 지질 조성물
WO2010141511A2 (en) 2009-06-01 2010-12-09 Halo-Bio Rnai Therapeutics, Inc. Polynucleotides for multivalent rna interference, compositions and methods of use thereof
KR20230098713A (ko) 2009-06-10 2023-07-04 알닐람 파마슈티칼스 인코포레이티드 향상된 지질 조성물
EP2442792A4 (en) 2009-06-15 2015-12-23 Alnylam Pharmaceuticals Inc TESTING GENE PCSK9 LIPID-FORMULATED DSRNA
CA2767225A1 (en) 2009-07-06 2011-01-13 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for enhancing production of a biological product
WO2011005861A1 (en) 2009-07-07 2011-01-13 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotide end caps
WO2011005860A2 (en) 2009-07-07 2011-01-13 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. 5' phosphate mimics
EP2454369A4 (en) 2009-07-16 2013-07-03 Isis Pharmaceuticals Inc MODULATION OF FACTOR 7 EXPRESSION
US9012421B2 (en) 2009-08-06 2015-04-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic cyclohexose nucleic acid analogs
US8901072B2 (en) * 2009-08-12 2014-12-02 The Medicines Company Glycopeptide and lipoglycopeptide antibiotics with improved solubility
WO2011038356A2 (en) 2009-09-25 2011-03-31 Johns Hopkins University Novel liver-targeting agents and their synthesis
EP2512491B1 (en) 2009-10-16 2017-10-11 Glaxo Group Limited Hbv antisense inhibitors
TWI388338B (zh) 2009-10-26 2013-03-11 Iner Aec Executive Yuan 對聚合醣鏈進行放射標誌以作為肝受體造影劑之方法
TWI391144B (zh) 2009-10-26 2013-04-01 Iner Aec Executive Yuan 一種定量肝殘餘功能的檢驗方法與其新穎肝受體造影檢驗藥劑
JP5723378B2 (ja) * 2009-11-03 2015-05-27 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッドAlnylam Pharmaceuticals, Inc. トランスサイレチン(ttr)を阻害する脂質製剤化組成物及び方法
WO2011072290A2 (en) 2009-12-11 2011-06-16 The Regents Of The University Of Michigan Targeted dendrimer-drug conjugates
CN106146591B (zh) 2010-01-08 2020-07-31 Ionis制药公司 血管生成素样3表达的调节
US9198972B2 (en) 2010-01-28 2015-12-01 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Monomers and oligonucleotides comprising cycloaddition adduct(s)
ES2562817T3 (es) * 2010-02-24 2016-03-08 Arrowhead Research Corporation Composiciones para el suministro dirigido de ARNip
WO2011115818A1 (en) 2010-03-17 2011-09-22 Isis Pharmaceuticals, Inc. 5'-substituted bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
US20130109817A1 (en) 2010-03-26 2013-05-02 Mersana Therapeutics, Inc. Modified Polymers for Delivery of Polynucleotides, Method of Manufacture, and Methods of Use Thereof
WO2011120053A1 (en) 2010-03-26 2011-09-29 Mersana Therapeutics, Inc. Modified polymers for delivery of polynucleotides, method of manufacture, and methods of use thereof
US9102938B2 (en) 2010-04-01 2015-08-11 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. 2′ and 5′ modified monomers and oligonucleotides
WO2011133876A2 (en) 2010-04-22 2011-10-27 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides comprising acyclic and abasic nucleosides and analogs
US9725479B2 (en) 2010-04-22 2017-08-08 Ionis Pharmaceuticals, Inc. 5′-end derivatives
EP3173419A1 (en) 2010-04-28 2017-05-31 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modified nucleosides, analogs thereof and oligomeric compounds prepared therefrom
WO2011139699A2 (en) 2010-04-28 2011-11-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. 5' modified nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
NZ603339A (en) * 2010-04-29 2015-01-30 Isis Pharmaceuticals Inc Modulation of transthyretin expression
US20130236968A1 (en) 2010-06-21 2013-09-12 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Multifunctional copolymers for nucleic acid delivery
EP2616543A1 (en) 2010-09-15 2013-07-24 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. MODIFIED iRNA AGENTS
WO2012067970A2 (en) 2010-11-11 2012-05-24 Ted M Dawson Transcriptional repression leading to parkinson's disease
US8987377B2 (en) 2010-11-19 2015-03-24 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Poly(amide) polymers for the delivery of oligonucleotides
US8501930B2 (en) 2010-12-17 2013-08-06 Arrowhead Madison Inc. Peptide-based in vivo siRNA delivery system
KR20130132475A (ko) 2010-12-17 2013-12-04 애로우헤드 리서치 코오포레이션 siRNA의 갈락토오스 클러스터-약동학적 조절제 표적 물질
RU2582235C2 (ru) 2010-12-29 2016-04-20 Ф.Хоффманн-Ля Рош Аг Низкомолекулярные конъюгаты для внутриклеточной доставки нуклеиновых кислот
EP2673361B1 (en) 2011-02-08 2016-04-13 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleotides and uses thereof
MY163004A (en) 2011-04-01 2017-07-31 Ionis Pharmaceuticals Inc Modulation of signal transducer and activator of transcription 3 (stat3) expression
JP5951752B2 (ja) * 2011-04-13 2016-07-13 アイオーニス ファーマシューティカルズ, インコーポレーテッドIonis Pharmaceuticals,Inc. Ptp1b発現のアンチセンス調節
TW201303013A (zh) 2011-04-21 2013-01-16 Isis Pharmaceuticals Inc B型肝炎病毒(hbv)表現之調節
JP6042871B2 (ja) * 2011-04-21 2016-12-14 アイオーニス ファーマシューティカルズ, インコーポレーテッドIonis Pharmaceuticals,Inc. B型肝炎ウイルス(hbv)発現の調節
KR20190062511A (ko) 2011-04-27 2019-06-05 아이오니스 파마수티컬즈, 인코포레이티드 아포지방단백질 ciii (apociii) 발현의 조정
WO2012174154A1 (en) 2011-06-13 2012-12-20 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of inflammatory responses by factor vii
CA2839437A1 (en) 2011-06-16 2012-12-20 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of fibroblast growth factor receptor 4 expression
AU2012272970A1 (en) 2011-06-21 2014-02-06 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Angiopoietin-like 3 (ANGPTL3) iRNA compositions and methods of use thereof
MX344807B (es) 2011-06-21 2017-01-09 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composiciones y metodos para inhibicion de genes para alipoproteina c-iii (apoc3).
WO2012177639A2 (en) 2011-06-22 2012-12-27 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Bioprocessing and bioproduction using avian cell lines
US20130017250A1 (en) 2011-07-15 2013-01-17 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Methods For High Density Lipoprotein Cholesterol Regulation
MX2014001971A (es) 2011-08-26 2014-03-31 Arrowhead Res Corp Polimeros de poli(vinilester) para suministro de acido nucleico in vivo.
EP2751270B1 (en) * 2011-08-29 2018-08-22 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Oligomer-conjugate complexes and their use
CN108410868A (zh) * 2011-09-20 2018-08-17 Ionis制药公司 Gcgr表达的反义调节
MX350944B (es) 2011-10-25 2017-09-26 Ionis Pharmaceuticals Inc Modulación antisentido de la expresión de gccr.
MY167390A (en) 2011-11-18 2018-08-16 Alnylam Pharmaceuticals Inc Rnai agents, compositions and methods of use thereof for treating transthyretin (ttr) associated diseases
EP2812433A4 (en) 2012-02-08 2016-01-20 Isis Pharmaceuticals Inc METHOD AND COMPOSITIONS FOR MODULATING THE FACTOR VII EXPRESSION
WO2013142514A1 (en) 2012-03-19 2013-09-26 Isis Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for modulating alpha-1-antitrypsin expression
WO2013142571A2 (en) 2012-03-20 2013-09-26 Cornell University Assays for the identification of compounds that modulate lipid homeostasis
US9133461B2 (en) * 2012-04-10 2015-09-15 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for inhibiting expression of the ALAS1 gene
WO2013159109A1 (en) 2012-04-20 2013-10-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of hepatitis b virus (hbv) expression
EP2839006B1 (en) 2012-04-20 2018-01-03 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleotides and uses thereof
EP3919620A1 (en) 2012-05-02 2021-12-08 Sirna Therapeutics, Inc. Short interfering nucleic acid (sina) compositions
AR090906A1 (es) 2012-05-02 2014-12-17 Merck Sharp & Dohme Conjugados que contienen tetragalnac y procedimientos para la administracion de oligonucleotidos
US9574193B2 (en) 2012-05-17 2017-02-21 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for modulating apolipoprotein (a) expression
WO2013173789A2 (en) 2012-05-17 2013-11-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense oligonucleotide compositions
HRP20201426T1 (hr) 2012-05-24 2020-11-27 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Postupci i pripravci za moduliranje ekspresije apolipoproteina (a)
US20150322428A1 (en) 2012-06-18 2015-11-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for improved cellular uptake of antisense compounds
DK2879718T3 (da) 2012-08-06 2023-06-19 Alnylam Pharmaceuticals Inc Proces til fremstilling af kulhydratkonjugerede RNA-stoffer
EP2906699A4 (en) 2012-10-11 2016-06-08 Ionis Pharmaceuticals Inc OLIGOMER COMPOUNDS WITH BICYCLIC NUCLEOSIDES AND USES THEREOF
SG11201503821YA (en) 2012-11-15 2015-06-29 Roche Innovation Ct Copenhagen As Oligonucleotide conjugates
WO2014118272A1 (en) 2013-01-30 2014-08-07 Santaris Pharma A/S Antimir-122 oligonucleotide carbohydrate conjugates
RU2649367C2 (ru) 2013-01-30 2018-04-02 Ф. Хоффманн-Ля Рош Аг Конъюгаты углевода и lna-олигонуклеотида
KR102482890B1 (ko) 2013-05-01 2022-12-30 아이오니스 파마수티컬즈, 인코포레이티드 아포지질단백질 (a) 발현을 조절하는 조성물 및 방법
AU2013389474B2 (en) 2013-05-16 2018-11-15 Racthera Co., Ltd. Transplantation adjuvant in cell therapy using neural progenitor cells
AU2014284152B2 (en) 2013-06-21 2020-01-23 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for modulation of target nucleic acids
DK3013959T3 (da) 2013-06-27 2020-02-17 Roche Innovation Ct Copenhagen As Antisense-oligomerer og konjugater målrettet pcsk9
EP3730614A3 (en) 2013-07-02 2020-12-30 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulators of growth hormone receptor
DK3019200T3 (da) 2013-07-11 2022-06-20 Alnylam Pharmaceuticals Inc Oligonukleotid-ligand-konjugater og fremgangsmåde til fremstiling deraf
EP3043827B1 (en) 2013-09-13 2019-07-03 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulators of complement factor b
US9943604B2 (en) 2013-09-20 2018-04-17 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Targeted therapeutic nucleosides and their use
JP2017501684A (ja) 2013-11-14 2017-01-19 ロシュ・イノベーション・センター・コペンハーゲン・アクティーゼルスカブRoche Innovation Center Copenhagen A/S Apobアンチセンスコンジュゲート化合物
WO2015085158A1 (en) 2013-12-06 2015-06-11 Dicerna Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for the specific inhibition of transthyretin (ttr) by double-stranded rna
WO2015105083A1 (ja) * 2014-01-07 2015-07-16 塩野義製薬株式会社 アンチセンスオリゴヌクレオチド及び糖誘導体を含む二本鎖オリゴヌクレオチド
CN106232125B (zh) 2014-05-01 2020-10-16 Ionis制药公司 用于调节pkk表达的组合物和方法
PE20170010A1 (es) 2014-05-01 2017-03-04 Ionis Pharmaceuticals Inc Composiciones y metodos para modular la expresion del factor b del complemento
CN110903337A (zh) 2014-05-01 2020-03-24 Ionis制药公司 用于调节生长激素受体表达的组合物和方法
SI3137605T1 (sl) 2014-05-01 2021-02-26 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Sestavki in metode za modulacijo ekspresije angiopoetin 3-podobnega
US10098959B2 (en) 2014-05-01 2018-10-16 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Method for synthesis of reactive conjugate clusters
WO2015179693A1 (en) 2014-05-22 2015-11-26 Isis Pharmaceuticals, Inc. Conjugated antisense compounds and their use
EP3151839A4 (en) 2014-06-06 2018-02-28 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for enhanced intestinal absorption of conjugated oligomeric compounds
CA2999341A1 (en) * 2015-11-06 2017-05-11 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulating apolipoprotein (a) expression
DK4119569T3 (da) * 2015-11-06 2024-08-12 Ionis Pharmaceuticals Inc Konjugerede antisense-forbindelser til anvendelse i behandling

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20040038274A1 (en) * 1991-12-24 2004-02-26 Isis Pharmaceuticals, Inc. Gapped 2' modified oligonucleotides
RU97108591A (ru) * 1994-11-02 1999-05-20 Ай-Си-Эн ФАРМАСЬЮТИКАЛЗ Нуклеозиды с модифицированными сахарами и их применение для синтеза олигонуклеотидов
RU2002105021A (ru) * 1999-07-28 2003-11-10 Авентис Фарма Дойчланд Гмбх ОЛИГОНУКЛЕОТИДЫ ДЛЯ ИНГИБИРОВАНИЯ ЭКСПРЕССИИ eg5 ЧЕЛОВЕКА

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
A. *
A1. *

Also Published As

Publication number Publication date
US12291709B2 (en) 2025-05-06
JP2016522817A (ja) 2016-08-04
CN108064162A (zh) 2018-05-22
US20150126720A1 (en) 2015-05-07
US20150126718A1 (en) 2015-05-07
AU2019200820B2 (en) 2020-04-30
AU2017203436B2 (en) 2018-10-18
HK1221403A1 (en) 2017-06-02
IL242125B (en) 2019-02-28
US9163239B2 (en) 2015-10-20
JP2016522683A (ja) 2016-08-04
EP2992009A1 (en) 2016-03-09
CN111593051A (zh) 2020-08-28
IL284593B (en) 2022-10-01
IL315582A (en) 2024-11-01
ES2885174T3 (es) 2021-12-13
IL264241B (en) 2020-04-30
EP4529927A3 (en) 2025-06-18
IL261901A (en) 2018-10-31
IL296543B2 (en) 2025-02-01
CL2016002262A1 (es) 2017-06-09
EP4529927A2 (en) 2025-04-02
CA2921162A1 (en) 2014-11-06
ES2819213T3 (es) 2021-04-15
MX381034B (es) 2025-04-01
RU2015151204A (ru) 2017-06-02
ES2730015T3 (es) 2019-11-07
AU2020207820A1 (en) 2020-08-06
PT3524680T (pt) 2021-01-04
AU2019202598A1 (en) 2019-05-02
EP2991656A2 (en) 2016-03-09
JP2023113843A (ja) 2023-08-16
WO2014179629A8 (en) 2016-06-02
JP2016523515A (ja) 2016-08-12
MX2020002184A (es) 2020-07-14
KR20210037752A (ko) 2021-04-06
CA2921167A1 (en) 2014-11-06
CN110079524B (zh) 2024-09-24
US20240247260A1 (en) 2024-07-25
KR20220108195A (ko) 2022-08-02
US20150176007A1 (en) 2015-06-25
US9181549B2 (en) 2015-11-10
AU2017200365C1 (en) 2019-04-18
PH12015502493B1 (en) 2019-09-25
WO2014179629A2 (en) 2014-11-06
EP2991656B1 (en) 2019-12-18
WO2014179627A9 (en) 2015-02-26
US20210087566A1 (en) 2021-03-25
US11299736B1 (en) 2022-04-12
JP7429103B2 (ja) 2024-02-07
MX2020004209A (es) 2020-08-13
EP2992098A4 (en) 2017-01-11
IL270464B (en) 2021-07-29
CA2921514A1 (en) 2014-11-06
CL2015003217A1 (es) 2016-07-08
SI2992098T1 (sl) 2019-06-28
PL2992009T3 (pl) 2020-11-30
RU2018112167A (ru) 2019-03-07
EP2992009B1 (en) 2020-06-24
MX384824B (es) 2025-04-01
KR20160002976A (ko) 2016-01-08
ES2778442T3 (es) 2020-08-10
AU2019204784A1 (en) 2019-07-25
NZ728517A (en) 2021-12-24
AU2014259757A1 (en) 2015-10-22
CN105392488A (zh) 2016-03-09
JP2016526018A (ja) 2016-09-01
JP2018027091A (ja) 2018-02-22
US20160090596A1 (en) 2016-03-31
BR112015027377B1 (pt) 2023-01-10
EP2992098B1 (en) 2019-03-27
PE20152002A1 (es) 2016-01-21
BR112015027321A8 (pt) 2018-01-02
AU2021204244B2 (en) 2023-10-19
CN110042098A (zh) 2019-07-23
RU2650510C2 (ru) 2018-04-16
US20230151365A1 (en) 2023-05-18
KR20230006933A (ko) 2023-01-11
RU2018136140A3 (ru) 2022-04-27
KR102138781B1 (ko) 2020-07-28
US20220275365A9 (en) 2022-09-01
KR102712053B1 (ko) 2024-10-02
FIC20250028I1 (fi) 2025-08-18
IL296543B1 (en) 2024-10-01
RU2670614C2 (ru) 2018-10-24
PH12015502493A1 (en) 2016-02-22
US20200224198A1 (en) 2020-07-16
AU2017200365A1 (en) 2017-02-23
WO2014179629A3 (en) 2015-01-22
AU2019204784B2 (en) 2022-01-27
US20180273953A1 (en) 2018-09-27
CA2921167C (en) 2025-05-20
SG10201801507RA (en) 2018-03-28
RU2019124314A (ru) 2019-08-21
ZA201507218B (en) 2023-09-27
AU2022202770B2 (en) 2024-10-03
WO2014179626A2 (en) 2014-11-06
HK1221404A1 (en) 2017-06-02
MX2021008901A (es) 2021-08-19
KR102558571B1 (ko) 2023-07-21
CR20150612A (es) 2016-03-03
NZ631512A (en) 2016-10-28
BR112015027369A2 (pt) 2017-09-26
RU2015151199A (ru) 2017-06-05
US20190367914A1 (en) 2019-12-05
IL242124B (en) 2019-02-28
EP3690049A1 (en) 2020-08-05
NO2025037I1 (no) 2025-08-13
AU2017203436A1 (en) 2017-06-08
PH12019501191A1 (en) 2021-03-01
US20160090595A1 (en) 2016-03-31
AU2017200365B2 (en) 2018-11-08
AU2014259755A1 (en) 2015-10-22
US20150126719A1 (en) 2015-05-07
HUE050394T2 (hu) 2020-11-30
UA120287C2 (uk) 2019-11-11
EP2991661A1 (en) 2016-03-09
HRP20190987T1 (hr) 2019-09-20
JP2016526874A (ja) 2016-09-08
LT2992009T (lt) 2020-11-10
JP2025174962A (ja) 2025-11-28
RU2015151204A3 (ru) 2018-03-27
US20180273952A1 (en) 2018-09-27
KR20240147701A (ko) 2024-10-08
EP4438129A3 (en) 2025-01-15
KR20190084138A (ko) 2019-07-15
IL261901B (en) 2020-05-31
DK2991656T3 (da) 2020-03-23
AU2024200296A1 (en) 2024-02-08
KR20160002977A (ko) 2016-01-08
IL284593A (en) 2021-08-31
US20160017323A1 (en) 2016-01-21
IL273184B (en) 2021-07-29
CN105378085A (zh) 2016-03-02
EP2992009A4 (en) 2016-12-28
MX2015015263A (es) 2016-12-16
SG10201906382QA (en) 2019-08-27
CN110042098B (zh) 2023-02-24
IL263843A (en) 2019-01-31
CN114058617A (zh) 2022-02-18
RU2015151199A3 (ru) 2018-03-27
JP6769866B2 (ja) 2020-10-14
NZ740338A (en) 2022-04-29
PT2992098T (pt) 2019-07-05
AU2021204244A1 (en) 2021-07-22
CN105377887A (zh) 2016-03-02
US9932581B2 (en) 2018-04-03
BR112015027319A8 (pt) 2018-01-02
US20140343123A1 (en) 2014-11-20
MA60161B1 (fr) 2025-02-28
RU2018136140A (ru) 2018-12-17
DOP2016000287A (es) 2017-02-15
JP6866459B2 (ja) 2021-04-28
JP2020039354A (ja) 2020-03-19
MA60161A1 (fr) 2024-09-30
JP6592486B2 (ja) 2019-10-16
JP6387084B2 (ja) 2018-09-05
EA031393B1 (ru) 2018-12-28
EA201891479A1 (ru) 2018-11-30
HK1221486A1 (en) 2017-06-02
CN105378082A (zh) 2016-03-02
HK1221475A1 (en) 2017-06-02
WO2014179625A1 (en) 2014-11-06
IL274064B (en) 2021-06-30
IL272617A (en) 2020-03-31
US9181550B2 (en) 2015-11-10
MX2015015220A (es) 2016-01-12
MY198359A (en) 2023-08-28
CN112921036A (zh) 2021-06-08
KR101857707B1 (ko) 2018-05-14
PH12018501963A1 (en) 2020-07-20
JP2024116224A (ja) 2024-08-27
UA121017C2 (uk) 2020-03-25
US10927372B2 (en) 2021-02-23
CY1123369T1 (el) 2021-12-31
JP2020039355A (ja) 2020-03-19
EP3828275A1 (en) 2021-06-02
CN110066795A (zh) 2019-07-30
AU2019200820A1 (en) 2019-02-28
PL2992098T3 (pl) 2019-09-30
JP7177127B2 (ja) 2022-11-22
RU2015151203A (ru) 2017-06-02
CR20190269A (es) 2019-09-13
RS60796B1 (sr) 2020-10-30
EP3546579A1 (en) 2019-10-02
RU2015151202A (ru) 2017-06-06
AU2020233603A1 (en) 2020-10-01
JP2022017514A (ja) 2022-01-25
CA2921514C (en) 2023-10-24
KR102235678B1 (ko) 2021-04-05
JP6639629B2 (ja) 2020-02-05
CA2921518A1 (en) 2014-11-06
KR20180051678A (ko) 2018-05-16
ME03390B (me) 2020-01-20
DK2992009T3 (da) 2020-09-14
SG11201508870VA (en) 2015-11-27
KR102212275B1 (ko) 2021-02-05
RU2686080C2 (ru) 2019-04-24
US10844379B2 (en) 2020-11-24
EP2991661A4 (en) 2017-02-15
KR20160003723A (ko) 2016-01-11
CN112921036B (zh) 2025-08-19
EP3524680B1 (en) 2020-11-11
EP2992098A2 (en) 2016-03-09
SI2992009T1 (sl) 2020-10-30
KR20240042220A (ko) 2024-04-01
WO2014179627A2 (en) 2014-11-06
BR112015027369A8 (pt) 2018-01-02
MX373306B (es) 2020-05-20
MX2021008899A (es) 2021-08-19
JP7633311B2 (ja) 2025-02-19
CN105392488B (zh) 2021-04-30
JP6456362B2 (ja) 2019-01-23
KR20160002974A (ko) 2016-01-08
AU2014259759B2 (en) 2020-06-18
RU2015151200A3 (ru) 2019-01-14
EA036584B1 (ru) 2020-11-26
JP2020058370A (ja) 2020-04-16
JP2025072530A (ja) 2025-05-09
AU2014259750B2 (en) 2019-02-28
US20210130823A1 (en) 2021-05-06
AU2019203674B2 (en) 2021-03-25
AU2014259757B2 (en) 2017-03-02
EP2992097A2 (en) 2016-03-09
EP3633039A1 (en) 2020-04-08
US20240401038A1 (en) 2024-12-05
BR112015027377A2 (pt) 2017-08-29
MX2019010441A (es) 2019-10-17
CN119913147A (zh) 2025-05-02
AU2018267625B2 (en) 2020-09-10
BR122018009831B1 (pt) 2021-12-21
JP2021074021A (ja) 2021-05-20
NZ725538A (en) 2021-02-26
MX373334B (es) 2020-05-04
US20180002693A1 (en) 2018-01-04
HUE043697T2 (hu) 2019-09-30
SG10201801813YA (en) 2018-04-27
AU2022202770A1 (en) 2022-05-19
CN108064162B (zh) 2021-12-03
US20190055554A1 (en) 2019-02-21
NZ631537A (en) 2017-05-26
JP2018183184A (ja) 2018-11-22
DOP2021000095A (es) 2021-09-15
US10683499B2 (en) 2020-06-16
JP2023012548A (ja) 2023-01-25
AU2014259755B2 (en) 2018-08-30
US11851655B2 (en) 2023-12-26
WO2014179620A1 (en) 2014-11-06
US20210024923A1 (en) 2021-01-28
MX2015015234A (es) 2016-10-03
KR102651423B1 (ko) 2024-03-27
AU2020217347A1 (en) 2020-08-27
CN105378082B (zh) 2020-06-09
IL284593B2 (en) 2023-02-01
JP6652602B2 (ja) 2020-02-26
BR112015027322A8 (pt) 2018-01-02
EP2991656A4 (en) 2017-02-22
US10883104B2 (en) 2021-01-05
AU2014259750A1 (en) 2015-10-22
FR25C1033I1 (fr) 2025-11-21
DK3524680T3 (da) 2020-12-14
EP2992097B1 (en) 2019-11-06
EP4155403A1 (en) 2023-03-29
KR20230113835A (ko) 2023-08-01
DOP2015000268A (es) 2015-11-30
WO2014179627A3 (en) 2015-04-16
US20160076032A1 (en) 2016-03-17
US9714421B2 (en) 2017-07-25
JP2020074787A (ja) 2020-05-21
RU2015151200A (ru) 2019-01-14
IL284000A (en) 2021-07-29
AU2017200950A1 (en) 2017-03-02
AU2018267625A1 (en) 2018-12-13
LT2992098T (lt) 2019-07-10
CN113293163A (zh) 2021-08-24
CA2921509A1 (en) 2014-11-06
EP4438129A2 (en) 2024-10-02
EP2991661B1 (en) 2019-03-13
HRP20201378T1 (hr) 2020-11-27
PE20161430A1 (es) 2017-01-06
IL264241A (en) 2019-02-28
BR112015027377A8 (pt) 2017-10-03
IL263843B (en) 2020-03-31
IL296543A (en) 2022-11-01
US9145558B2 (en) 2015-09-29
AU2014259756B2 (en) 2017-02-23
US20240352455A1 (en) 2024-10-24
MX2015015264A (es) 2016-08-12
NZ753018A (en) 2022-01-28
US9957504B2 (en) 2018-05-01
CN110079524A (zh) 2019-08-02
JP6216444B2 (ja) 2017-10-18
RS58981B1 (sr) 2019-08-30
ZA201507216B (en) 2017-08-30
MX2015015239A (es) 2016-10-03
KR102424855B1 (ko) 2022-07-26
AU2014259756A1 (en) 2015-10-22
KR20200090966A (ko) 2020-07-29
BR112015027369B1 (pt) 2021-06-08
RU2019110030A (ru) 2019-05-06
NZ712737A (en) 2021-08-27
PT2992009T (pt) 2020-09-21
NL301341I2 (nl) 2025-10-02
MY178929A (en) 2020-10-23
DK2992098T3 (da) 2019-06-17
RU2015151202A3 (ru) 2018-03-27
BR112015027321A2 (pt) 2017-09-26
BR112015027319A2 (pt) 2017-09-26
NZ631552A (en) 2017-02-24
SMT201900316T1 (it) 2019-07-11
WO2014179626A3 (en) 2015-02-26
IL264580B (en) 2020-04-30
IL273184A (en) 2020-04-30
US20210395734A1 (en) 2021-12-23
MX2019010443A (es) 2019-10-17
SG11201508800WA (en) 2015-11-27
US9127276B2 (en) 2015-09-08
AU2019204784C1 (en) 2022-11-03
KR20210014758A (ko) 2021-02-09
CN105377887B (zh) 2020-11-03
RU2697152C2 (ru) 2019-08-12
JP2021107408A (ja) 2021-07-29
US20250346899A1 (en) 2025-11-13
IL242132B (en) 2018-10-31
CN105378085B (zh) 2019-02-15
JP2019056001A (ja) 2019-04-11
JP2021020901A (ja) 2021-02-18
JP2024010070A (ja) 2024-01-23
IL274064A (en) 2020-06-30
US20160076030A1 (en) 2016-03-17
AU2017200950B2 (en) 2019-01-17
AU2019203674A1 (en) 2019-06-27
KR20210129257A (ko) 2021-10-27
BR112015027322A2 (pt) 2017-09-26
IL283660A (en) 2021-07-29
RU2670614C9 (ru) 2018-11-23
HK1221485A1 (en) 2017-06-02
JP2020007361A (ja) 2020-01-16
EP3524680A1 (en) 2019-08-14
JP6995478B2 (ja) 2022-01-14
CA2921509C (en) 2025-10-07
KR102315836B1 (ko) 2021-10-22
KR20210151260A (ko) 2021-12-13
KR102482890B1 (ko) 2022-12-30
KR20160002975A (ko) 2016-01-08
US9932580B2 (en) 2018-04-03
EP2992097A4 (en) 2017-01-04
US20180044676A1 (en) 2018-02-15
AU2014259759A1 (en) 2015-10-22
AU2024266799A1 (en) 2024-12-12
IL264580A (en) 2019-02-28
JP7339294B2 (ja) 2023-09-05
IL273312A (en) 2020-04-30
IL242126B (en) 2019-01-31
IL273205A (en) 2020-04-30
EA201592093A1 (ru) 2016-06-30
CY1121879T1 (el) 2020-10-14

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2699985C2 (ru) Композиции и способы модулирования экспрессии аполипопротеина (а)
JP6694382B2 (ja) 標的核酸を調節するための組成物および方法
RU2824214C1 (ru) Композиции и способы модулирования экспрессии аполипопротеина (a)
RU2782034C2 (ru) Композиции и способы модулирования экспрессии hbv и ttr
EA046363B1 (ru) Олигомерные соединения для модулирования экспрессии ttr
HK1221403B (en) Compositions and methods for modulating apolipoprotein c-iii expression