RU2018101710A - Мутации фермента crispr, уменьшающие нецелевые эффекты - Google Patents
Мутации фермента crispr, уменьшающие нецелевые эффекты Download PDFInfo
- Publication number
- RU2018101710A RU2018101710A RU2018101710A RU2018101710A RU2018101710A RU 2018101710 A RU2018101710 A RU 2018101710A RU 2018101710 A RU2018101710 A RU 2018101710A RU 2018101710 A RU2018101710 A RU 2018101710A RU 2018101710 A RU2018101710 A RU 2018101710A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- protein
- crispr
- cell
- modification
- paragraphs
- Prior art date
Links
- 108091033409 CRISPR Proteins 0.000 title claims 95
- 238000010354 CRISPR gene editing Methods 0.000 title claims 36
- 230000000694 effects Effects 0.000 title claims 27
- 230000035772 mutation Effects 0.000 title claims 25
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 title 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 59
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims 52
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 claims 50
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims 50
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 46
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims 34
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims 34
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims 29
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims 29
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims 29
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims 24
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims 24
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims 24
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 claims 14
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims 12
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 claims 11
- 230000007017 scission Effects 0.000 claims 11
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims 10
- 239000002245 particle Substances 0.000 claims 7
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims 7
- 102220485935 ATP-dependent DNA/RNA helicase DHX36_R63A_mutation Human genes 0.000 claims 6
- MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N N-acetyl-D-galactosamine Natural products CC(=O)NC(C=O)C(O)C(O)C(O)CO MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 6
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 claims 6
- 108010077850 Nuclear Localization Signals Proteins 0.000 claims 5
- 241000589941 Azospirillum Species 0.000 claims 4
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims 4
- 241000032681 Gluconacetobacter Species 0.000 claims 4
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- OVRNDRQMDRJTHS-KEWYIRBNSA-N N-acetyl-D-galactosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-KEWYIRBNSA-N 0.000 claims 4
- 241000588653 Neisseria Species 0.000 claims 4
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 claims 4
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims 4
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims 3
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 3
- 108020005004 Guide RNA Proteins 0.000 claims 3
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 claims 3
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 claims 3
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 claims 3
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 claims 3
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims 3
- 230000008685 targeting Effects 0.000 claims 3
- 238000013518 transcription Methods 0.000 claims 3
- 230000035897 transcription Effects 0.000 claims 3
- 230000037426 transcriptional repression Effects 0.000 claims 3
- 241000589876 Campylobacter Species 0.000 claims 2
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 claims 2
- OVRNDRQMDRJTHS-CBQIKETKSA-N N-Acetyl-D-Galactosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@@H](O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-CBQIKETKSA-N 0.000 claims 2
- 241000135938 Nitratifractor Species 0.000 claims 2
- 241001386753 Parvibaculum Species 0.000 claims 2
- 230000007022 RNA scission Effects 0.000 claims 2
- 241000605947 Roseburia Species 0.000 claims 2
- 241000191940 Staphylococcus Species 0.000 claims 2
- 230000004913 activation Effects 0.000 claims 2
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 claims 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims 2
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims 2
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 claims 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims 2
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims 2
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 claims 2
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 claims 2
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 claims 1
- 230000007018 DNA scission Effects 0.000 claims 1
- 241000702421 Dependoparvovirus Species 0.000 claims 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 claims 1
- 108010033040 Histones Proteins 0.000 claims 1
- 101000615488 Homo sapiens Methyl-CpG-binding domain protein 2 Proteins 0.000 claims 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 claims 1
- 125000000998 L-alanino group Chemical group [H]N([*])[C@](C([H])([H])[H])([H])C(=O)O[H] 0.000 claims 1
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 claims 1
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims 1
- 241000713666 Lentivirus Species 0.000 claims 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 claims 1
- 102100021299 Methyl-CpG-binding domain protein 2 Human genes 0.000 claims 1
- 108060004795 Methyltransferase Proteins 0.000 claims 1
- 208000009869 Neu-Laxova syndrome Diseases 0.000 claims 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims 1
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 claims 1
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 claims 1
- 101000910035 Streptococcus pyogenes serotype M1 CRISPR-associated endonuclease Cas9/Csn1 Proteins 0.000 claims 1
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 claims 1
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 claims 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 claims 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims 1
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 claims 1
- 210000001808 exosome Anatomy 0.000 claims 1
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 claims 1
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 claims 1
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 claims 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 claims 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 claims 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 claims 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 claims 1
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 claims 1
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 claims 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 claims 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 claims 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 claims 1
- 102000035118 modified proteins Human genes 0.000 claims 1
- 108091005573 modified proteins Proteins 0.000 claims 1
- 230000029279 positive regulation of transcription, DNA-dependent Effects 0.000 claims 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 claims 1
- 230000008929 regeneration Effects 0.000 claims 1
- 238000011069 regeneration method Methods 0.000 claims 1
- 102220229936 rs1064795830 Human genes 0.000 claims 1
- 102200006539 rs121913529 Human genes 0.000 claims 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims 1
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
- C12N9/22—Ribonucleases [RNase]; Deoxyribonucleases [DNase]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/36—Adaptation or attenuation of cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/102—Mutagenizing nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/111—General methods applicable to biologically active non-coding nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
- C12N15/86—Viral vectors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
- C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
- C12N15/902—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y301/00—Hydrolases acting on ester bonds (3.1)
-
- G—PHYSICS
- G09—EDUCATION; CRYPTOGRAPHY; DISPLAY; ADVERTISING; SEALS
- G09B—EDUCATIONAL OR DEMONSTRATION APPLIANCES; APPLIANCES FOR TEACHING, OR COMMUNICATING WITH, THE BLIND, DEAF OR MUTE; MODELS; PLANETARIA; GLOBES; MAPS; DIAGRAMS
- G09B23/00—Models for scientific, medical, or mathematical purposes, e.g. full-sized devices for demonstration purposes
- G09B23/28—Models for scientific, medical, or mathematical purposes, e.g. full-sized devices for demonstration purposes for medicine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/01—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
- C07K2319/09—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a nuclear localisation signal
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/10—Type of nucleic acid
- C12N2310/20—Type of nucleic acid involving clustered regularly interspaced short palindromic repeats [CRISPR]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
- C12N2750/00011—Details
- C12N2750/14011—Parvoviridae
- C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
- C12N2750/14141—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
- C12N2750/14143—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Virology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Mycology (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Algebra (AREA)
- Mathematical Analysis (AREA)
- Mathematical Physics (AREA)
- Pure & Applied Mathematics (AREA)
- Business, Economics & Management (AREA)
- Educational Administration (AREA)
- Educational Technology (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Mathematical Optimization (AREA)
- Computational Mathematics (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Bakery Products And Manufacturing Methods Therefor (AREA)
Claims (112)
1. Сконструированный белок CRISPR, где:
белок объединяется в комплекс с молекулой нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, с образованием комплекса CRISPR,
где, находясь в комплексе CRISPR, молекула нуклеиновой кислоты нацеливается на один или несколько целевых полинуклеотидных локусов,
причем белок содержит по меньшей мере одну модификацию по сравнению с немодифицированным белком,
где комплекс CRISPR, содержащий модифицированный белок, характеризуется измененной активностью по сравнению с комплексом, содержащим немодифицированный белок.
2. Сконструированный белок CRISPR по п. 1, где измененная активность предусматривает измененное свойство связывания в отношении молекулы нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, или целевых полинуклеотидных локусов, измененную кинетику связывания в отношении молекулы нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, или целевых полинуклеотидных локусов, или измененную специфичность связывания в отношении молекулы нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, или целевых полинуклеотидных локусов по сравнению с нецелевыми полинуклеотидными локусами.
3. Сконструированный белок CRISPR по п. 1 или 2, где измененная активность предусматривает повышенную эффективность нацеливания или сниженное нецелевое связывание.
4. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 1-3, где измененная активность предусматривает модифицированную активность расщепления.
5. Сконструированный белок CRISPR по п. 4, где модифицированная активность расщепления предусматривает повышенную активность расщепления в отношении целевых полинуклеотидных локусов.
6. Сконструированный белок CRISPR по п. 4, где модифицированная активность расщепления предусматривает сниженную активность расщепления в отношении целевых полинуклеотидных локусов.
7. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 4-6, где модифицированная активность расщепления предусматривает сниженную активность расщепления в отношении нецелевых полинуклеотидных локусов.
8. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 4-6, где модифицированная активность расщепления предусматривает повышенную активность расщепления в отношении нецелевых полинуклеотидных локусов.
9. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где измененная активность предусматривает измененные кинетические свойства хеликазы.
10. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где модифицированный белок CRISPR содержит модификацию, которая изменяет связывание белка с молекулой нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, или нитью, содержащей целевые полинуклеотидные локусы, или нитью, содержащей нецелевые полинуклеотидные локусы.
11. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где модифицированный белок CRISPR содержит модификацию, которая изменяет образование комплекса CRISPR.
12. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где модифицированный белок CRISPR содержит модификацию, которая изменяет нацеливание молекулы нуклеиновой кислоты на полинуклеотидные локусы.
13. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-12, где модификация предусматривает мутацию в участке белка, который связывается с молекулой нуклеиновой кислоты.
14. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-12, где модификация предусматривает мутацию в участке белка, который связывается с нитью, содержащей целевые полинуклеотидные локусы.
15. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-12, где модификация предусматривает мутацию в участке белка, который связывается с нитью, содержащей нецелевые полинуклеотидные локусы.
16. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-15, где модификация или мутация предусматривают сниженный положительный заряд в участке белка, который связывается с молекулой нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, или нитью, содержащей целевые полинуклеотидные локусы, или нитью, содержащей нецелевые полинуклеотидные локусы.
17. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-15, где модификация или мутация предусматривают сниженный отрицательный заряд в участке белка, который связывается с молекулой нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, или нитью, содержащей целевые полинуклеотидные локусы, или нитью, содержащей нецелевые полинуклеотидные локусы.
18. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-15, где модификация или мутация предусматривают повышенный положительный заряд в участке белка, который связывается с молекулой нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, или нитью, содержащей целевые полинуклеотидные локусы, или нитью, содержащей нецелевые полинуклеотидные локусы.
19. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-15, где модификация или мутация предусматривают повышенный отрицательный заряд в участке белка, который связывается с молекулой нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, или нитью, содержащей целевые полинуклеотидные локусы, или нитью, содержащей нецелевые полинуклеотидные локусы.
20. Cконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-19, где модификация или мутация повышают стерическое несоответствие между белком и молекулой нуклеиновой кислоты, предусматривающей РНК, или нитью, содержащей целевые полинуклеотидные локусы, или нитью, содержащей нецелевые полинуклеотидные локусы.
21. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-19, где модификация или мутация предусматривают замену Lys, His, Arg, Glu, Asp, Ser, Gly или Thr.
22. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-19, где модификация или мутация предусматривают замену на Gly, Ala, Ile, Glu или Asp.
23. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-19, где модификация или мутация предусматривают аминокислотную замену в связывающей бороздке.
24. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-19, где связывающая бороздка находится между доменами RuvC и HNH.
25. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-19, где модификация или мутация предусматривают мутацию в домене RuvCI, RuvCIII, RuvCIII или HNH.
26. Сконструированный белок CRISPR по любому из пп. 10-19, где модификация или мутация предусматривают аминокислотную замену в одном или нескольких из положений 12, 13, 63, 415, 610, 775, 779, 780, 810, 832, 848, 855, 861, 862, 866, 961, 968, 974, 976, 982, 983, 1000, 1003, 1014, 1047, 1060, 1107, 1108, 1109, 1114, 1129, 1240, 1289, 1296, 1297, 1300, 1311 и 1325 в соответствии с нумерацией аминокислотных положений SpCas9.
27. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация в положении 63, 415, 775, 779, 780, 810, 832, 848, 855, 861, 862, 866, 961, 968, 974, 976, 982, 983, 1000, 1003, 1014, 1047, 1060, 1107, 1108, 1109, 1114, 1129, 1240, 1289, 1296, 1297, 1300, 1311 или 1325 предусматривают замену на аланин.
28. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация в положении 12 предусматривают замену на аспарагиновую кислоту.
29. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация в положении 13 предусматривают замену на изолейцин.
30. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация в положении 610 предусматривают замену на глицин.
31. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация в положении 799 предусматривают замену на лейцин.
32. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация в положении 1129 предусматривают замену на глутаминовую кислоту.
33. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация предусматривают K775A, E779L, Q807A, R780A, K810A, R832A, K848A, K855A, K862A, K961A, K968A, K974A, R976A, H983A, K1000A, K1014A, K1047A, K1060A, K1003A, S1109A, H1240A, K1289A, K1296A, H1297A, K1300A, H1311A или K1325A.
33. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация предусматривают R783A и A1322T, или R780A и K810A, или R780A и K855A, или R780A и R976A, или K848A и R976A, или K855A и R976A, или R780A и K848A, или K810A и K848A, или K848A и K855A, или K810A и K855A, или H982A и R1060A, или H982A и R1003A, или K1003A и R1060A, или R780A и H982A, или K810A и H982A, или K848A и H982A, или K855A и H982A, или R780A и K1003A, или K810A и R1003A, или K848A и K1003A, или K848A и K1007A, или R780A и R1060A, или K810A и R1060A, или K848A и R1060A, или R780A и R1114A, или K848A и R1114A, или R63A и K855A, или R63A и H982A, или H415A и R780A, или H415A и K848A, или K848A и E1108A, или K810A и K1003A, или R780A и R1060A, или K810A и R1060A, или K848A и R1060A.
35. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация предусматривают H982A, K1003A и K1129E, или R780A, K1003A и R1060A, или K810A, K1003A и R1060A, или K848A, K1003A и R1060A, или K855A, K1003A и R1060A, или H982A, K1003A и R1060A, или R63A, K848A и R1060A, или T13I, R63A и K810A, или G12D, R63A и R1060A.
36. Сконструированный белок CRISPR по п. 26, где модификация или мутация предусматривают R63A, E610G, K855A и R1060A, или R63A, K855A, R1060A и E610G.
37. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где белок предусматривает белок CRISPR II типа.
38. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где белок CRISPR предусматривает белок CRISPR от организма из рода, включающего Streptococcus, Campylobacter, Nitratifractor, Staphylococcus, Parvibaculum, Roseburia, Neisseria, Gluconacetobacter, Azospirillum, Sphaerochaeta, Lactobacillus, Eubacterium или Corynebacter.
39. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где белок предусматривает белок Cas9.
40. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где белок CRISPR предусматривает химерный белок Cas9, содержащий первый фрагмент от первого ортолога Cas9 и второй фрагмент от второго ортолога Cas9, и при этом первый и второй ортологи Cas9 являются различными.
41. Сконструированный белок CRISPR по п. 40, где по меньшей мере один из первого и второго ортологов Cas9 предусматривает Cas9 от организма, включающего Streptococcus, Campylobacter, Nitratifractor, Staphylococcus, Parvibaculum, Roseburia, Neisseria, Gluconacetobacter, Azospirillum, Sphaerochaeta, Lactobacillus, Eubacterium или Corynebacter.
42. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где белок CRISPR содержит один или несколько доменов, представляющих собой сигнал ядерной локализации (NLS).
43. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где белок CRISPR содержит по меньшей мере два или более NLS.
44. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где белок CRISPR содержит один или несколько гетерологичных функциональных доменов.
45. Сконструированный белок CRISPR по п. 44, где один или несколько гетерологичных функциональных доменов предусматривают один или несколько доменов активации транскрипции.
46. Сконструированный белок CRISPR по п. 45, где домен активации транскрипции предусматривает VP64.
47. Сконструированный белок CRISPR по п. 44, где один или несколько гетерологичных функциональных доменов предусматривают один или несколько доменов репрессии транскрипции.
48. Сконструированный белок CRISPR по п. 47, где домен репрессии транскрипции предусматривает домен KRAB или домен SID.
49. Сконструированный белок CRISPR по п. 44, где один или несколько гетерологичных функциональных доменов предусматривают один или несколько нуклеазных доменов.
50. Сконструированный белок CRISPR по п. 49, где нуклеазный домен предусматривает Fok1.
51. Сконструированный белок CRISPR по п. 44, где один или несколько гетерологичных функциональных доменов характеризуются одной или несколькими из следующих видов активности: метилазной активностью, деметилазной активностью, активностью в отношении активации транскрипции, активностью в отношении репрессии транскрипции, активностью фактора освобождения транскрипта, активностью в отношении модификации гистонов, нуклеазной активностью, активностью расщепления однонитевой РНК, активностью расщепления двухнитевой РНК, активностью расщепления однонитевой ДНК, активностью расщепления двухнитевой ДНК и активностью связывания нуклеиновой кислоты.
52. Сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов, где белок CRISPR кодируется нуклеотидной последовательностью, которая является кодон-оптимизированной для экспрессии в эукариотическом организме.
53. Композиция, содержащая сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов.
54. Система, содержащая сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов и молекулу нуклеиновой кислоты, предусматривающую РНК.
55. Векторная система, содержащая один или несколько векторов, где один или несколько векторов содержат:
a) первый регуляторный элемент, функционально связанный с нуклеотидной последовательностью, кодирующей сконструированный белок CRISPR по любому из предыдущих пунктов; и
b) второй регуляторный элемент, функционально связанный с одной или несколькими нуклеотидными последовательностями, кодирующими одну или несколько молекул нуклеиновой кислоты, предусматривающих направляющую РНК, содержащую направляющую последовательность, tracr-последовательность и парную tracr-последовательность, где компоненты (a) и (b) находятся в одном и том же или в разных векторах.
56. Выделенная эукариотическая клетка, содержащая систему по п. 54 или 55.
57. Способ модулирования экспрессии гена, где способ включает введение сконструированного белка CRISPR или системы по любому из предыдущих пунктов в клетку.
58. Способ по п. 59, где клетка является эукариотической или прокариотической клеткой.
59. Способ по п. 59, где способ осуществляют ex vivo или in vitro.
60. Способ лечения заболевания, нарушения или инфекции у индивидуума, нуждающегося в этом, включающий введение эффективного количества сконструированного белка CRISPR или композиции по любому из предыдущих пунктов.
61. Способ изменения экспрессии представляющего интерес локуса генома в клетке млекопитающего, включающий
приведение клетки в контакт с композицией по любому из пп. 1-55, и за счет чего осуществляется доставка вектора и обеспечивается образование комплекса CRISPR-Cas и его связывание с мишенью, и
определение того, была ли изменена экспрессия локуса генома.
62. Способ по п. 6, который предусматривает обеспечение расщепления геномной ДНК, что приводит в результате к сниженной транскрипции гена.
63. Способ по п. 6, где изменение экспрессии предусматривает редактирование генома.
64. Способ по п. 6, где изменение экспрессии предусматривает повышение экспрессии продукта гена.
65. Способ по п. 6, где изменение экспрессии предусматривает модификацию продукта гена.
66. Выделенная клетка, характеризующаяся экспрессией локуса генома, измененной в результате осуществления способа по любому из пп. 6-10, где экспрессия является измененной в сравнении с клеткой, в отношении которой не осуществляли способ изменения экспрессии локуса генома.
67. Выделенная линия клеток, полученная исходя из клетки по п. 11.
68. Способ модифицирования представляющего интерес целевого локуса, причем способ включает доставку в указанный локус не встречающейся в природе или сконструированной композиции, содержащей белок Cas9 по любому из пп. 1-52 и один или несколько компонентов на основе нуклеиновой кислоты, где белок Cas9 образует комплекс с одним или несколькими компонентами на основе нуклеиновой кислоты, и после связывания комплекса с представляющим интерес целевым локусом белок Cas9 индуцирует модификацию представляющего интерес целевого локуса.
69. Способ по п. 13, где представляющий интерес целевой локус находится в клетке.
70. Способ по п. 14, где клетка является эукариотической клеткой.
71. Способ по п. 14, где клетка является клеткой животного или человека.
72. Способ по п. 14, где клетка является растительной клеткой.
73. Способ по п. 13, где представляющий интерес целевой локус содержится в молекуле ДНК in vitro.
74. Способ по любому из пп. 13-18, где указанную не встречающуюся в природе или сконструированную композицию, содержащую белок Cas9 и один или несколько компонентов на основе нуклеиновой кислоты, доставляют в клетку в виде одной или нескольких полинуклеотидных молекул.
75. Способ по любому из пп. 13-18, где белок Cas9 содержит один или несколько сигналов ядерной локализации (NLS).
76. Способ по любому из пп. 19-20, где одна или несколько полинуклеотидных молекул содержатся в одном или нескольких векторах.
77. Способ по любому из пп. 19-21, где одна или несколько полинуклеотидных молекул содержат один или несколько регуляторных элементов, функционально сконфигурированных для обеспечения экспрессии белка Cas9 и/или компонента(компонентов) на основе нуклеиновой кислоты, где один или несколько регуляторных элементов необязательно предусматривают индуцируемые промоторы.
78. Способ по любому из пп. 19-22, где одна или несколько полинуклеотидных молекул или один или несколько векторов содержатся в системе доставки.
79. Способ по любому из пп. 19-23, где систему или одну или несколько полинуклеотидных молекул доставляют посредством частиц, везикул или одного или нескольких вирусных векторов.
80. Способ по п.24, где частицы предусматривают липид, сахар, металл или белок.
81. Способ по п.24, где везикулы предусматривают экзосомы или липосомы.
82. Способ по п.24, где один или несколько вирусных векторов предусматривают одно или несколько из аденовируса, одного или нескольких лентивирусов или одного или нескольких аденоассоциированных вирусов.
83. Способ по любому из пп. 13-24, который представляет собой способ модифицирования клетки, линии клеток или организма путем манипуляции с одной или несколькими целевыми последовательностями в представляющих интерес локусах генома.
84. Клетка, полученная в результате осуществления способа по п.28, или ее потомство, где клетка содержит модификацию, не присутствующую в клетке, в отношении которой не осуществляли способ.
85. Клетка по п. 29 или ее потомство, где клетка, в отношении которой не осуществляли способ, содержит аномалию, а клетка, полученная в результате осуществления способа, характеризуется устраненной или скорректированной аномалией.
86. Продукт клетки, полученный из клетки или ее потомства по п.29, где продукт является модифицированным по своей природе или количеству по сравнению с продуктом клетки, полученным из клетки, в отношении которой не осуществляли способ.
87. Продукт клетки по п.31, где клетка, в отношении которой не осуществляли способ, содержит аномалию, и при этом продукт клетки отражает аномалию, которая устраняется или корректируется с помощью способа.
88. In vitro, ex vivo или in vivo клетка-хозяин или линия клеток или их потомство, содержащие систему, содержащую белок Cas9 по любому из пп. 1-52 и один или несколько компонентов на основе нуклеиновой кислоты, где белок Cas9 образует комплекс с одним или несколькими компонентами на основе нуклеиновой кислоты, и после связывания комплекса с представляющим интерес целевым локусом белок Cas9 индуцирует модификацию представляющего интерес целевого локуса.
89. Клетка-хозяин или линия клеток или их потомство по п.33, где клетка является эукариотической клеткой.
90. Клетка-хозяин или линия клеток или их потомство по п.34, где клетка является клеткой животного.
91. Клетка-хозяин или линия клеток или их потомство по п.34, где клетка является клеткой человека.
92. Клетка-хозяин, линия клеток или их потомство по п.34, предусматривающие стволовую клетку или линию стволовых клеток.
93. Клетка-хозяин или линия клеток или их потомство по п.34, где клетка является растительной клеткой.
94. Способ получения растения с модифицированным представляющим интерес признаком, кодируемым представляющим интерес геном, причем указанный способ включает приведение растительной клетки в контакт с системой по любому из пп. 54-55 или осуществление в отношении растительной клетки способа по любому из пп. 68-83, за счет чего обеспечивается либо модифицирование, либо введение указанного представляющего интерес гена, и регенерацию растения из указанной растительной клетки.
95. Способ идентификации представляющего интерес признака у растения, причем указанный представляющий интерес признак кодируется представляющим интерес геном, причем указанный способ включает приведение растительной клетки в контакт с системой по любому из пп. 54-55 или осуществление в отношении растительной клетки способа по любому из пп. 68-83, за счет чего обеспечивается идентификация указанного представляющего интерес гена.
96. Способ по п.40, дополнительно включающий введение идентифицированного представляющего интерес гена в растительную клетку, или линию растительных клеток, или растительную идиоплазму и получение из них растения, в результате чего растение содержит представляющий интерес ген.
97. Способ по п.41, где у растения проявляется представляющий интерес признак.
98. Частица, содержащая систему по любому из пп. 54-55.
99. Частица по п.43, где частица содержит белок Cas9 по любому из пп. 1-52, причем белок находится в комплексе с направляющей РНК.
100. Частица по п.43, где частица содержит eSpCas9(1.1) в комплексе с направляющей РНК.
101. Комплекс, молекула нуклеиновой кислоты, предусматривающая РНК, или белок по п. 1, где комплекс, молекула нуклеиновой кислоты, предусматривающая РНК, или белок конъюгированы по меньшей мере с одним сахарным фрагментом, необязательно N-ацетилгалактозамином (GalNAc), в частности, с трехразветвленным GalNAc.
102. Комплекс, компонент на основе нуклеиновой кислоты или белок по п. 68, где комплекс, компонент на основе нуклеиновой кислоты или белок конъюгированы по меньшей мере с одним сахарным фрагментом, необязательно N-ацетилгалактозамином (GalNAc), в частности, с трехразветвленным GalNAc.
103. Способ улучшения специфичности системы CRISPR путем обеспечения сконструированного белка CRISPR с модификацией по любому из пп. 1-36.
104. Применение сконструированного белка CRISPR для улучшения специфичности системы CRISPR, где белок CRISPR является модифицированным согласно любому из пп. 1-36.
Applications Claiming Priority (11)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201562181453P | 2015-06-18 | 2015-06-18 | |
| US62/181,453 | 2015-06-18 | ||
| US201562207312P | 2015-08-19 | 2015-08-19 | |
| US62/207,312 | 2015-08-19 | ||
| US201562237360P | 2015-10-05 | 2015-10-05 | |
| US62/237,360 | 2015-10-05 | ||
| US201562255256P | 2015-11-13 | 2015-11-13 | |
| US62/255,256 | 2015-11-13 | ||
| US201562269876P | 2015-12-18 | 2015-12-18 | |
| US62/269,876 | 2015-12-18 | ||
| PCT/US2016/038034 WO2016205613A1 (en) | 2015-06-18 | 2016-06-17 | Crispr enzyme mutations reducing off-target effects |
Related Child Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2021120582A Division RU2845909C2 (ru) | 2015-06-18 | 2016-06-17 | Мутации фермента crispr, уменьшающие нецелевые эффекты |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2018101710A true RU2018101710A (ru) | 2019-07-19 |
| RU2018101710A3 RU2018101710A3 (ru) | 2019-11-20 |
| RU2752834C2 RU2752834C2 (ru) | 2021-08-09 |
Family
ID=56345216
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2018101710A RU2752834C2 (ru) | 2015-06-18 | 2016-06-17 | Мутации фермента crispr, уменьшающие нецелевые эффекты |
Country Status (14)
| Country | Link |
|---|---|
| US (4) | US10876100B2 (ru) |
| EP (2) | EP3129393B1 (ru) |
| JP (3) | JP7107683B2 (ru) |
| KR (2) | KR102840885B1 (ru) |
| CN (2) | CN109536474A (ru) |
| AU (2) | AU2016280893B2 (ru) |
| CA (1) | CA2989830A1 (ru) |
| IL (3) | IL284808B (ru) |
| MX (2) | MX392008B (ru) |
| RU (1) | RU2752834C2 (ru) |
| SG (1) | SG10201912329YA (ru) |
| TW (1) | TWI813532B (ru) |
| WO (1) | WO2016205613A1 (ru) |
| ZA (1) | ZA201708498B (ru) |
Families Citing this family (219)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CA2853829C (en) | 2011-07-22 | 2023-09-26 | President And Fellows Of Harvard College | Evaluation and improvement of nuclease cleavage specificity |
| US10704021B2 (en) | 2012-03-15 | 2020-07-07 | Flodesign Sonics, Inc. | Acoustic perfusion devices |
| KR20230065381A (ko) * | 2012-07-25 | 2023-05-11 | 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 | 유도 dna 결합 단백질 및 게놈 교란 도구 및 이의 적용 |
| EP2931892B1 (en) | 2012-12-12 | 2018-09-12 | The Broad Institute, Inc. | Methods, models, systems, and apparatus for identifying target sequences for cas enzymes or crispr-cas systems for target sequences and conveying results thereof |
| BR112015013784A2 (pt) | 2012-12-12 | 2017-07-11 | Massachusetts Inst Technology | aplicação, manipulação e otimização de sistemas, métodos e composições para manipulação de sequência e aplicações terapêuticas |
| WO2014093701A1 (en) | 2012-12-12 | 2014-06-19 | The Broad Institute, Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems, compositions, methods, knock out libraries and applications thereof |
| US9828582B2 (en) | 2013-03-19 | 2017-11-28 | Duke University | Compositions and methods for the induction and tuning of gene expression |
| AU2014281026B2 (en) | 2013-06-17 | 2020-05-28 | Massachusetts Institute Of Technology | Delivery, engineering and optimization of tandem guide systems, methods and compositions for sequence manipulation |
| WO2014204727A1 (en) | 2013-06-17 | 2014-12-24 | The Broad Institute Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems, compositions methods, screens and applications thereof |
| CA2915795C (en) | 2013-06-17 | 2021-07-13 | The Broad Institute, Inc. | Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for targeting disorders and diseases using viral components |
| KR20240172759A (ko) | 2013-06-17 | 2024-12-10 | 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 | 간의 표적화 및 치료를 위한 CRISPRCas 시스템, 벡터 및 조성물의 전달 및 용도 |
| EP3011030B1 (en) | 2013-06-17 | 2023-11-08 | The Broad Institute, Inc. | Optimized crispr-cas double nickase systems, methods and compositions for sequence manipulation |
| US20150044192A1 (en) | 2013-08-09 | 2015-02-12 | President And Fellows Of Harvard College | Methods for identifying a target site of a cas9 nuclease |
| US9359599B2 (en) | 2013-08-22 | 2016-06-07 | President And Fellows Of Harvard College | Engineered transcription activator-like effector (TALE) domains and uses thereof |
| US9388430B2 (en) | 2013-09-06 | 2016-07-12 | President And Fellows Of Harvard College | Cas9-recombinase fusion proteins and uses thereof |
| US9526784B2 (en) | 2013-09-06 | 2016-12-27 | President And Fellows Of Harvard College | Delivery system for functional nucleases |
| US9228207B2 (en) | 2013-09-06 | 2016-01-05 | President And Fellows Of Harvard College | Switchable gRNAs comprising aptamers |
| WO2015089364A1 (en) | 2013-12-12 | 2015-06-18 | The Broad Institute Inc. | Crystal structure of a crispr-cas system, and uses thereof |
| SG10201804973TA (en) | 2013-12-12 | 2018-07-30 | Broad Inst Inc | Compositions and Methods of Use of Crispr-Cas Systems in Nucleotide Repeat Disorders |
| JP6793547B2 (ja) | 2013-12-12 | 2020-12-02 | ザ・ブロード・インスティテュート・インコーポレイテッド | 最適化機能CRISPR−Cas系による配列操作のための系、方法および組成物 |
| KR20160089530A (ko) * | 2013-12-12 | 2016-07-27 | 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 | Hbv 및 바이러스 질병 및 질환을 위한 crisprcas 시스템 및 조성물의 전달,용도 및 치료적 적용 |
| WO2015089473A1 (en) | 2013-12-12 | 2015-06-18 | The Broad Institute Inc. | Engineering of systems, methods and optimized guide compositions with new architectures for sequence manipulation |
| US20150165054A1 (en) | 2013-12-12 | 2015-06-18 | President And Fellows Of Harvard College | Methods for correcting caspase-9 point mutations |
| IL289736B2 (en) | 2013-12-12 | 2025-09-01 | Massachusetts Inst Technology | Administration, use and therapeutic applications of CRISPR–Cas gene editing systems and gene editing preparations |
| CN105939767B (zh) | 2014-01-08 | 2018-04-06 | 弗洛设计声能学公司 | 具有双声电泳腔的声电泳装置 |
| DE212015000061U1 (de) | 2014-02-11 | 2017-09-03 | The Regents Of The University Of Colorado, A Body Corporate | CRISPR-ermöglichtes Multiplex Genom Engineering |
| EP3177718B1 (en) | 2014-07-30 | 2022-03-16 | President and Fellows of Harvard College | Cas9 proteins including ligand-dependent inteins |
| WO2016057961A1 (en) | 2014-10-10 | 2016-04-14 | Editas Medicine, Inc. | Compositions and methods for promoting homology directed repair |
| EP3215617B1 (en) | 2014-11-07 | 2024-05-08 | Editas Medicine, Inc. | Systems for improving crispr/cas-mediated genome-editing |
| WO2016094867A1 (en) | 2014-12-12 | 2016-06-16 | The Broad Institute Inc. | Protected guide rnas (pgrnas) |
| WO2016094872A1 (en) * | 2014-12-12 | 2016-06-16 | The Broad Institute Inc. | Dead guides for crispr transcription factors |
| EP3237615B2 (en) | 2014-12-24 | 2023-07-26 | The Broad Institute, Inc. | Crispr having or associated with destabilization domains |
| WO2016130600A2 (en) | 2015-02-09 | 2016-08-18 | Duke University | Compositions and methods for epigenome editing |
| KR20230156800A (ko) | 2015-03-03 | 2023-11-14 | 더 제너럴 하스피탈 코포레이션 | 변경된 PAM 특이성을 갖는 조작된 CRISPR-Cas9 뉴클레아제 |
| US11708572B2 (en) | 2015-04-29 | 2023-07-25 | Flodesign Sonics, Inc. | Acoustic cell separation techniques and processes |
| US11377651B2 (en) | 2016-10-19 | 2022-07-05 | Flodesign Sonics, Inc. | Cell therapy processes utilizing acoustophoresis |
| WO2016182959A1 (en) | 2015-05-11 | 2016-11-17 | Editas Medicine, Inc. | Optimized crispr/cas9 systems and methods for gene editing in stem cells |
| WO2016201047A1 (en) | 2015-06-09 | 2016-12-15 | Editas Medicine, Inc. | Crispr/cas-related methods and compositions for improving transplantation |
| AU2016280893B2 (en) * | 2015-06-18 | 2021-12-02 | Massachusetts Institute Of Technology | CRISPR enzyme mutations reducing off-target effects |
| WO2016205759A1 (en) | 2015-06-18 | 2016-12-22 | The Broad Institute Inc. | Engineering and optimization of systems, methods, enzymes and guide scaffolds of cas9 orthologs and variants for sequence manipulation |
| CA2990699A1 (en) | 2015-06-29 | 2017-01-05 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Modified crispr rna and modified single crispr rna and uses thereof |
| CN114875012B (zh) * | 2015-08-28 | 2025-02-18 | 通用医疗公司 | 工程化的CRISPR-Cas9核酸酶 |
| CA2999500A1 (en) | 2015-09-24 | 2017-03-30 | Editas Medicine, Inc. | Use of exonucleases to improve crispr/cas-mediated genome editing |
| WO2017070633A2 (en) | 2015-10-23 | 2017-04-27 | President And Fellows Of Harvard College | Evolved cas9 proteins for gene editing |
| EP3377626A1 (en) * | 2015-11-20 | 2018-09-26 | Life Technologies Corporation | Stabilized reagents for genome modification |
| WO2017095967A2 (en) | 2015-11-30 | 2017-06-08 | Duke University | Therapeutic targets for the correction of the human dystrophin gene by gene editing and methods of use |
| EP3433364A1 (en) | 2016-03-25 | 2019-01-30 | Editas Medicine, Inc. | Systems and methods for treating alpha 1-antitrypsin (a1at) deficiency |
| US11597924B2 (en) | 2016-03-25 | 2023-03-07 | Editas Medicine, Inc. | Genome editing systems comprising repair-modulating enzyme molecules and methods of their use |
| US20190127713A1 (en) | 2016-04-13 | 2019-05-02 | Duke University | Crispr/cas9-based repressors for silencing gene targets in vivo and methods of use |
| US11236313B2 (en) | 2016-04-13 | 2022-02-01 | Editas Medicine, Inc. | Cas9 fusion molecules, gene editing systems, and methods of use thereof |
| US11214789B2 (en) | 2016-05-03 | 2022-01-04 | Flodesign Sonics, Inc. | Concentration and washing of particles with acoustics |
| US10337051B2 (en) | 2016-06-16 | 2019-07-02 | The Regents Of The University Of California | Methods and compositions for detecting a target RNA |
| WO2017223538A1 (en) | 2016-06-24 | 2017-12-28 | The Regents Of The University Of Colorado, A Body Corporate | Methods for generating barcoded combinatorial libraries |
| WO2018005873A1 (en) * | 2016-06-29 | 2018-01-04 | The Broad Institute Inc. | Crispr-cas systems having destabilization domain |
| JP7490211B2 (ja) | 2016-07-19 | 2024-05-27 | デューク ユニバーシティ | Cpf1に基づくゲノム編集の治療適用 |
| US11078481B1 (en) | 2016-08-03 | 2021-08-03 | KSQ Therapeutics, Inc. | Methods for screening for cancer targets |
| WO2018027078A1 (en) | 2016-08-03 | 2018-02-08 | President And Fellows Of Harard College | Adenosine nucleobase editors and uses thereof |
| JP7201153B2 (ja) | 2016-08-09 | 2023-01-10 | プレジデント アンド フェローズ オブ ハーバード カレッジ | プログラム可能cas9-リコンビナーゼ融合タンパク質およびその使用 |
| KR101710026B1 (ko) | 2016-08-10 | 2017-02-27 | 주식회사 무진메디 | Cas9 단백질 및 가이드 RNA의 혼성체를 함유하는 나노 리포좀 전달체 조성물 |
| WO2018035387A1 (en) | 2016-08-17 | 2018-02-22 | The Broad Institute, Inc. | Novel crispr enzymes and systems |
| US11542509B2 (en) | 2016-08-24 | 2023-01-03 | President And Fellows Of Harvard College | Incorporation of unnatural amino acids into proteins using base editing |
| US11078483B1 (en) | 2016-09-02 | 2021-08-03 | KSQ Therapeutics, Inc. | Methods for measuring and improving CRISPR reagent function |
| KR20230170126A (ko) | 2016-09-30 | 2023-12-18 | 더 리젠츠 오브 더 유니버시티 오브 캘리포니아 | Rna-가이드된 핵산 변형 효소 및 이의 사용 방법 |
| US11371062B2 (en) | 2016-09-30 | 2022-06-28 | The Regents Of The University Of California | RNA-guided nucleic acid modifying enzymes and methods of use thereof |
| CN118726313A (zh) | 2016-10-07 | 2024-10-01 | 综合Dna技术公司 | 化脓链球菌cas9突变基因和由其编码的多肽 |
| US11242542B2 (en) * | 2016-10-07 | 2022-02-08 | Integrated Dna Technologies, Inc. | S. pyogenes Cas9 mutant genes and polypeptides encoded by same |
| EP3526320A1 (en) | 2016-10-14 | 2019-08-21 | President and Fellows of Harvard College | Aav delivery of nucleobase editors |
| WO2018074979A1 (en) * | 2016-10-17 | 2018-04-26 | Nanyang Technological University | Truncated crispr-cas proteins for dna targeting |
| US12286727B2 (en) | 2016-12-19 | 2025-04-29 | Editas Medicine, Inc. | Assessing nuclease cleavage |
| WO2018119359A1 (en) | 2016-12-23 | 2018-06-28 | President And Fellows Of Harvard College | Editing of ccr5 receptor gene to protect against hiv infection |
| US12110545B2 (en) | 2017-01-06 | 2024-10-08 | Editas Medicine, Inc. | Methods of assessing nuclease cleavage |
| IT201700016321A1 (it) | 2017-02-14 | 2018-08-14 | Univ Degli Studi Di Trento | Mutanti di cas9 ad alta specificita' e loro applicazioni. |
| KR20190123328A (ko) | 2017-03-09 | 2019-10-31 | 프레지던트 앤드 펠로우즈 오브 하바드 칼리지 | 암 백신 |
| EP3592853A1 (en) | 2017-03-09 | 2020-01-15 | President and Fellows of Harvard College | Suppression of pain by gene editing |
| JP2020510439A (ja) | 2017-03-10 | 2020-04-09 | プレジデント アンド フェローズ オブ ハーバード カレッジ | シトシンからグアニンへの塩基編集因子 |
| EP3596217A1 (en) | 2017-03-14 | 2020-01-22 | Editas Medicine, Inc. | Systems and methods for the treatment of hemoglobinopathies |
| KR102687373B1 (ko) | 2017-03-23 | 2024-07-23 | 프레지던트 앤드 펠로우즈 오브 하바드 칼리지 | 핵산 프로그램가능한 dna 결합 단백질을 포함하는 핵염기 편집제 |
| EP3601568A1 (en) * | 2017-03-31 | 2020-02-05 | Agenovir Corporation | Antiviral therapeutic |
| CN110891965A (zh) | 2017-04-24 | 2020-03-17 | 杜邦营养生物科学有限公司 | 植物中使用的抗crispr蛋白的方法和组合物 |
| CN108795989A (zh) * | 2017-04-26 | 2018-11-13 | 哈尔滨工业大学 | SpyCas9的基因编辑活性抑制位点及其抑制剂 |
| EP3615672A1 (en) | 2017-04-28 | 2020-03-04 | Editas Medicine, Inc. | Methods and systems for analyzing guide rna molecules |
| WO2018204777A2 (en) | 2017-05-05 | 2018-11-08 | The Broad Institute, Inc. | Methods for identification and modification of lncrna associated with target genotypes and phenotypes |
| EP3622070A2 (en) | 2017-05-10 | 2020-03-18 | Editas Medicine, Inc. | Crispr/rna-guided nuclease systems and methods |
| US11560566B2 (en) | 2017-05-12 | 2023-01-24 | President And Fellows Of Harvard College | Aptazyme-embedded guide RNAs for use with CRISPR-Cas9 in genome editing and transcriptional activation |
| EP3625338A4 (en) * | 2017-05-19 | 2021-01-20 | Tsinghua University | ENGINEERING OF A SACAS9 MINIMUM CRISPR / CAS SYSTEM FOR GENE EDITING AND TRANSCRIPTIONAL REGULATION OPTIMIZED BY AN IMPROVED GUIDE RNA |
| KR102151064B1 (ko) * | 2017-05-24 | 2020-09-02 | 기초과학연구원 | 매칭된 5' 뉴클레오타이드를 포함하는 가이드 rna를 포함하는 유전자 교정용 조성물 및 이를 이용한 유전자 교정 방법 |
| GB201708662D0 (en) * | 2017-05-31 | 2017-07-12 | Tropic Biosciences Uk Ltd | Compositions and methods for increasing shelf-life of banana |
| EA201992795A1 (ru) * | 2017-06-08 | 2020-04-21 | Осака Юниверсити | Способ получения эукариотических клеток с отредактированной днк и набор, используемый в этом способе |
| EP3635104A1 (en) | 2017-06-09 | 2020-04-15 | Editas Medicine, Inc. | Engineered cas9 nucleases |
| CN107365793A (zh) * | 2017-06-19 | 2017-11-21 | 百格基因科技(江苏)有限公司 | 一种适用于植物的大规模基因组编辑的方法 |
| US10011849B1 (en) | 2017-06-23 | 2018-07-03 | Inscripta, Inc. | Nucleic acid-guided nucleases |
| US9982279B1 (en) | 2017-06-23 | 2018-05-29 | Inscripta, Inc. | Nucleic acid-guided nucleases |
| US20200140896A1 (en) * | 2017-06-30 | 2020-05-07 | Novartis Ag | Methods for the treatment of disease with gene editing systems |
| BR112020000310A2 (pt) | 2017-07-07 | 2020-07-14 | Toolgen Incorporated | variantes de crispr alvo específicas |
| EP3652312A1 (en) | 2017-07-14 | 2020-05-20 | Editas Medicine, Inc. | Systems and methods for targeted integration and genome editing and detection thereof using integrated priming sites |
| JP7159288B2 (ja) | 2017-07-28 | 2022-10-24 | ローカス アイピー カンパニー、エルエルシー | 皮膚、毛髪及び頭皮の健康を改善する酵母ベースのマスク |
| EP3658573A1 (en) | 2017-07-28 | 2020-06-03 | President and Fellows of Harvard College | Methods and compositions for evolving base editors using phage-assisted continuous evolution (pace) |
| WO2019027789A1 (en) | 2017-08-04 | 2019-02-07 | Syngenta Participations Ag | METHODS AND COMPOSITIONS FOR TARGETED GENOMIC INSERTION |
| WO2019040650A1 (en) | 2017-08-23 | 2019-02-28 | The General Hospital Corporation | GENETICALLY MODIFIED CRISPR-CAS9 NUCLEASES HAVING MODIFIED PAM SPECIFICITY |
| US11319532B2 (en) | 2017-08-30 | 2022-05-03 | President And Fellows Of Harvard College | High efficiency base editors comprising Gam |
| US11713452B2 (en) * | 2017-09-08 | 2023-08-01 | University Of North Texas Health Science Center | Engineered CAS9 variants |
| DK3684930T3 (da) | 2017-09-19 | 2022-06-07 | Tropic Biosciences Uk Ltd | Modificering af ikke-kodende plante-RNA-molekylers specificitet for inaktivering af genekspression |
| US11572574B2 (en) | 2017-09-28 | 2023-02-07 | Toolgen Incorporated | Artificial genome manipulation for gene expression regulation |
| CN107630018B (zh) * | 2017-09-30 | 2018-10-12 | 深圳三智医学科技有限公司 | 一种用于编辑或修复hbb基因的试剂盒 |
| EP3697906A1 (en) | 2017-10-16 | 2020-08-26 | The Broad Institute, Inc. | Uses of adenosine base editors |
| WO2019079462A1 (en) * | 2017-10-17 | 2019-04-25 | President And Fellows Of Harvard College | TRANSCRIPTION MODULATION SYSTEMS BASED ON CAS9 |
| US12227753B2 (en) | 2017-11-01 | 2025-02-18 | The Regents Of The University Of California | CasY compositions and methods of use |
| WO2019089808A1 (en) * | 2017-11-01 | 2019-05-09 | The Regents Of The University Of California | Class 2 crispr/cas compositions and methods of use |
| CN117487776A (zh) | 2017-11-01 | 2024-02-02 | 加利福尼亚大学董事会 | Casz组合物和使用方法 |
| CN111727251B (zh) | 2017-11-21 | 2024-09-20 | 克里斯珀医疗股份公司 | 用于治疗常染色体显性色素性视网膜炎的材料和方法 |
| SG11202004691WA (en) * | 2017-11-22 | 2020-06-29 | Univ Kobe Nat Univ Corp | Complex for genome editing having stability and few side-effects, and nucleic acid coding same |
| AU2018385759B2 (en) | 2017-12-14 | 2021-10-21 | Flodesign Sonics, Inc. | Acoustic transducer driver and controller |
| US12406749B2 (en) | 2017-12-15 | 2025-09-02 | The Broad Institute, Inc. | Systems and methods for predicting repair outcomes in genetic engineering |
| US20210371877A1 (en) * | 2017-12-18 | 2021-12-02 | Spark Therapeutics, Inc. | Adeno-associated virus (aav) vector lipid nanoparticle compositions and methods of use |
| CN108048405A (zh) * | 2018-01-15 | 2018-05-18 | 上海市东方医院 | 稳定表达人内源性INav的细胞模型及其制备方法和用途 |
| KR20200124702A (ko) | 2018-02-23 | 2020-11-03 | 파이어니어 하이 부렛드 인터내쇼날 인코포레이팃드 | 신규한 cas9 오르소로그 |
| MX2020009487A (es) | 2018-03-14 | 2020-12-10 | Editas Medicine Inc | Sistemas y metodos para el tratamiento de hemoglobinopatias. |
| CN112424348B (zh) | 2018-03-19 | 2024-12-31 | 克里斯珀医疗股份公司 | 新颖的rna-可编程的内切核酸酶系统及其用途 |
| JP2021519073A (ja) * | 2018-03-29 | 2021-08-10 | ジェネンテック, インコーポレイテッド | 哺乳動物細胞におけるラクトジェニック活性の制御 |
| CN112313241B (zh) * | 2018-04-17 | 2025-04-15 | 总医院公司 | 核酸结合、修饰、和切割试剂的底物偏好和位点的灵敏体外试验 |
| US20190336585A1 (en) * | 2018-05-03 | 2019-11-07 | John Lawrence Mee | Method for sustainable human cognitive enhancement |
| WO2019222423A1 (en) * | 2018-05-15 | 2019-11-21 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | Compositions and methods related to tumor cell killers and vaccines |
| EP3797160A1 (en) | 2018-05-23 | 2021-03-31 | The Broad Institute Inc. | Base editors and uses thereof |
| RU2763449C1 (ru) | 2018-06-04 | 2021-12-29 | Телефонактиеболагет Лм Эрикссон (Пабл) | Индикатор базовой сети и обработка обеспечения безопасности для передачи обслуживания |
| WO2019235907A1 (ko) * | 2018-06-08 | 2019-12-12 | 충남대학교 산학협력단 | Crispr/cas9 시스템을 이용하여 플라보노이드 생합성 유전체를 편집하기 위한 조성물 및 이의 이용 |
| KR20190139756A (ko) | 2018-06-08 | 2019-12-18 | 충남대학교산학협력단 | 페튜니아 원형질체에서 CRISPR/Cas9 시스템을 이용한 플라보노이드 생합성 유전자 교정세포를 배양하여 형질교정 재분화체를 유도하는 방법 |
| SG11202012228QA (en) * | 2018-06-08 | 2021-01-28 | Modalis Therapeutics Corp | MODIFIED Cas9 PROTEIN AND USE THEREOF |
| AU2019291918B2 (en) | 2018-06-29 | 2025-06-12 | Editas Medicine, Inc. | Synthetic guide molecules, compositions and methods relating thereto |
| CN110684755B (zh) * | 2018-07-05 | 2021-12-31 | 清华大学 | 基于进化信息构建嵌合SaCas9用于增强和扩展PAM位点的识别 |
| WO2020012335A1 (en) | 2018-07-10 | 2020-01-16 | Alia Therapeutics S.R.L. | Vesicles for traceless delivery of guide rna molecules and/or guide rna molecule/rna-guided nuclease complex(es) and a production method thereof |
| WO2020028729A1 (en) | 2018-08-01 | 2020-02-06 | Mammoth Biosciences, Inc. | Programmable nuclease compositions and methods of use thereof |
| CN108949830B (zh) * | 2018-08-03 | 2021-11-26 | 福州大学 | 一种在鱼类中实现基因组编辑、精确定点基因敲入的方法 |
| BR112021003236A2 (pt) * | 2018-08-24 | 2021-05-18 | Flagship Pioneering Innovations Vi, Llc | métodos e composições para a modificação de plantas |
| CN120795059A (zh) | 2018-08-27 | 2025-10-17 | 瑞泽恩制药公司 | 拉曼光谱在下游纯化中的应用 |
| CN109402115B (zh) * | 2018-09-06 | 2024-02-02 | 广州普世利华科技有限公司 | 靶向Rett突变基因RNA的gRNA及Rett突变基因的检测方法、检测试剂盒 |
| EP3847251A1 (en) * | 2018-09-07 | 2021-07-14 | Astrazeneca AB | Compositions and methods for improved nucleases |
| WO2020051562A2 (en) | 2018-09-07 | 2020-03-12 | Beam Therapeutics Inc. | Compositions and methods for improving base editing |
| US12312584B2 (en) | 2018-10-02 | 2025-05-27 | Exosome Therapeutics, Inc. | cGMP exosome loaded therapeutics for treating sickle cell disease |
| AU2019359276A1 (en) * | 2018-10-09 | 2021-04-29 | The University Of North Carolina At Chapel Hill | Regulated gene editing system |
| WO2020092453A1 (en) | 2018-10-29 | 2020-05-07 | The Broad Institute, Inc. | Nucleobase editors comprising geocas9 and uses thereof |
| CN118497276A (zh) * | 2018-11-07 | 2024-08-16 | 阿库斯股份有限公司 | 腺相关病毒载体用于在内耳中的毛细胞和支持细胞中校正基因缺陷/表达蛋白质的用途 |
| CN113330023A (zh) * | 2018-11-08 | 2021-08-31 | 代表亚利桑那州立大学的亚利桑那校董会 | 体内具有crispr超级阻遏子的合成免疫调控 |
| CN109385425A (zh) * | 2018-11-13 | 2019-02-26 | 中山大学 | 一种高特异性ABE碱基编辑系统及其在β血红蛋白病中的应用 |
| WO2020106771A1 (en) * | 2018-11-19 | 2020-05-28 | Exosome Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for producing exosome loaded therapeutics for the treatment of multiple oncological disorders |
| AU2019387219B2 (en) | 2018-11-28 | 2025-04-24 | Bayer Healthcare Llc | Optimized mRNA encoding CAS9 for use in LNPs |
| JP2022514493A (ja) | 2018-12-14 | 2022-02-14 | パイオニア ハイ-ブレッド インターナショナル, インコーポレイテッド | ゲノム編集のための新規なcrispr-casシステム |
| CN111321171A (zh) * | 2018-12-14 | 2020-06-23 | 江苏集萃药康生物科技有限公司 | 一种应用CRISPR/Cas9介导ES打靶技术制备基因打靶动物模型的方法 |
| WO2020142754A2 (en) | 2019-01-04 | 2020-07-09 | Mammoth Biosciences, Inc. | Programmable nuclease improvements and compositions and methods for nucleic acid amplification and detection |
| WO2020154500A1 (en) | 2019-01-23 | 2020-07-30 | The Broad Institute, Inc. | Supernegatively charged proteins and uses thereof |
| KR20210121113A (ko) * | 2019-01-31 | 2021-10-07 | 빔 테라퓨틱스, 인크. | 비-표적 탈아미노화가 감소된 핵염기 편집기 및 핵염기 편집기를 특성규명하기 위한 분석 |
| US10982200B2 (en) | 2019-02-14 | 2021-04-20 | Metagenomi Ip Technologies, Llc | Enzymes with RuvC domains |
| WO2020182941A1 (en) * | 2019-03-12 | 2020-09-17 | MAX-PLANCK-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. | Cas9 variants with enhanced specificity |
| SG11202109882VA (en) | 2019-03-19 | 2021-10-28 | Broad Inst Inc | Methods and compositions for editing nucleotide sequences |
| CN110009626A (zh) * | 2019-04-11 | 2019-07-12 | 北京百度网讯科技有限公司 | 用于生成图像的方法和装置 |
| EP3956349A1 (en) | 2019-04-17 | 2022-02-23 | The Broad Institute, Inc. | Adenine base editors with reduced off-target effects |
| EP3976785A1 (en) * | 2019-05-28 | 2022-04-06 | Astellas Pharma Inc. | Method for treating muscular dystrophy by targeting dmpk gene |
| CN114502575A (zh) * | 2019-06-10 | 2022-05-13 | 同源药物公司 | 用于arsa基因转移的腺相关病毒组合物和其使用方法 |
| AU2020297451A1 (en) | 2019-06-17 | 2022-01-06 | Vertex Pharmaceuticals Incorporated | Compositions and methods for editing beta-globin for treatment of hemaglobinopathies |
| CN110272881B (zh) * | 2019-06-29 | 2021-04-30 | 复旦大学 | 核酸内切酶SpCas9高特异性截短变异体TSpCas9-V1/V2及其应用 |
| AU2020310837A1 (en) * | 2019-07-08 | 2022-02-24 | Inscripta, Inc. | Increased nucleic acid-guided cell editing via a LexA-Rad51 fusion protein |
| WO2021007177A1 (en) * | 2019-07-08 | 2021-01-14 | The Regents Of The University Of California | Variant type v crispr/cas effector polypeptides and methods of use thereof |
| CN110600075B (zh) * | 2019-08-14 | 2021-08-03 | 浙江工业大学 | 一种基于配体生长策略的蛋白质atp对接方法 |
| CN110402852A (zh) * | 2019-08-28 | 2019-11-05 | 浙江海洋大学 | 利于提高虎斑乌贼产卵数量与质量的养殖方法 |
| US12297426B2 (en) | 2019-10-01 | 2025-05-13 | The Broad Institute, Inc. | DNA damage response signature guided rational design of CRISPR-based systems and therapies |
| US12435330B2 (en) | 2019-10-10 | 2025-10-07 | The Broad Institute, Inc. | Methods and compositions for prime editing RNA |
| CN118901567A (zh) | 2019-11-01 | 2024-11-08 | 先正达农作物保护股份公司 | 杂草控制方法和相关组合物及植物 |
| KR102493904B1 (ko) * | 2019-12-13 | 2023-01-31 | 한국생명공학연구원 | EeCpf1에 의해 IL2Rg 유전자가 돌연변이된 면역부전 동물모델 및 그 제조방법 |
| US12264341B2 (en) | 2020-01-24 | 2025-04-01 | The General Hospital Corporation | CRISPR-Cas enzymes with enhanced on-target activity |
| WO2021151073A2 (en) | 2020-01-24 | 2021-07-29 | The General Hospital Corporation | Unconstrained genome targeting with near-pamless engineered crispr-cas9 variants |
| WO2021163515A1 (en) * | 2020-02-12 | 2021-08-19 | Temple University - Of The Commonwealth System Of Higher Education | Crispr-cas9 mediated disruption of alcam gene inhibits adhesion and trans-endothelial migration of myeloid cells |
| CN111337666B (zh) * | 2020-02-12 | 2021-04-02 | 山东大学 | I-motif重组介导的FRET探针及其原位成像癌细胞表面蛋白质同源二聚化的应用 |
| EP4114952A4 (en) * | 2020-03-05 | 2024-05-08 | Board of Regents of the University of Nebraska | Crispr/cas9 system for multistrain hiv-1 treatment |
| WO2021183771A1 (en) * | 2020-03-11 | 2021-09-16 | Sigma-Aldrich Co. Llc | High fidelity spcas9 nucleases for genome modification |
| EP4118203A4 (en) * | 2020-03-11 | 2024-03-27 | The Broad Institute, Inc. | NOVEL CAS ENZYMES AND METHODS FOR PROFILING SPECIFICITY AND ACTIVITY |
| EP4127156B1 (en) | 2020-03-31 | 2025-09-10 | Metagenomi, Inc. | Class ii, type ii crispr systems |
| WO2021202559A1 (en) * | 2020-03-31 | 2021-10-07 | Metagenomi Ip Technologies, Llc | Class ii, type ii crispr systems |
| WO2021216772A1 (en) * | 2020-04-21 | 2021-10-28 | Mammoth Biosciences, Inc. | Casy programmable nucleases and rna component systems |
| WO2021215897A1 (ko) * | 2020-04-24 | 2021-10-28 | 기초과학연구원 | Cas9 또는 cas9 변이체를 이용한 유전체 교정 |
| KR20230019843A (ko) | 2020-05-08 | 2023-02-09 | 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 | 표적 이중 가닥 뉴클레오티드 서열의 두 가닥의 동시 편집을 위한 방법 및 조성물 |
| WO2022018638A1 (en) | 2020-07-21 | 2022-01-27 | Crispr Therapeutics Ag | Genome-editing compositions and methods to modulate faah for treatment of neurological disorders |
| CN111904973B (zh) * | 2020-07-27 | 2021-12-03 | 中国农业科学院兰州兽医研究所 | ssc-miR-122在制备调节猪繁殖与呼吸综合征病毒复制的药物中的应用 |
| CN111979273B (zh) * | 2020-08-24 | 2022-05-27 | 苏州启辰生物科技有限公司 | 一种制备人源化ace2小鼠模型的方法 |
| WO2022047194A1 (en) * | 2020-08-28 | 2022-03-03 | Rau Bio Limited | Approaches to simulating the interactions of biological systems through the use of modular computational workflows |
| JP2023546694A (ja) * | 2020-10-21 | 2023-11-07 | エメンドバイオ・インコーポレイテッド | 新規のomni56、58、65、68、71、75、78及び84crisprヌクレアーゼ |
| WO2022109058A1 (en) * | 2020-11-18 | 2022-05-27 | Entrada Therapeutics, Inc. | Nucleases comprising cell penetrating peptide sequences |
| EP4256045A4 (en) * | 2020-12-02 | 2025-01-08 | The Regents of the University of California | Crispr-cas effector polypeptides and methods of use thereof |
| WO2022133246A1 (en) | 2020-12-17 | 2022-06-23 | Vertex Pharmaceuticals Incorporated | Compositions and methods for editing beta-globin for treatment of hemaglobinopathies |
| CN114807240B (zh) * | 2021-01-21 | 2024-02-06 | 深圳市第二人民医院(深圳市转化医学研究院) | 一种连接有适配体的模板分子及其试剂盒 |
| US20240425885A1 (en) * | 2021-02-08 | 2024-12-26 | Emendobio Inc. | OMNI 90-99, 101, 104-110, 114, 116, 118-123, 125, 126, 128, 129, and 131-138 CRISPR NUCLEASE |
| EP4304663A4 (en) * | 2021-03-11 | 2025-04-16 | Emendobio Inc. | STRATEGIES FOR KNOCK-INS AT C3 SAFE HBOR SITES |
| CN113249384A (zh) * | 2021-04-27 | 2021-08-13 | 重庆医科大学 | 可靶向编辑HBV cccDNA的特异sgRNA序列及其应用 |
| WO2022238958A1 (en) | 2021-05-12 | 2022-11-17 | Crispr Therapeutics Ag | Multiplex gene editing |
| WO2023275892A1 (en) * | 2021-06-29 | 2023-01-05 | Council Of Scientific & Industrial Research | Engineered fncas9 and uses thereof |
| CN113584049B (zh) * | 2021-07-27 | 2023-02-03 | 杭州师范大学 | Vdac1基因在调控植物开花期中的应用 |
| WO2023028348A1 (en) | 2021-08-27 | 2023-03-02 | Metagenomi, Inc. | Enzymes with ruvc domains |
| CN113755498A (zh) * | 2021-09-27 | 2021-12-07 | 赛业(苏州)生物科技有限公司 | 靶向小鼠Ube3a基因的gRNA及构建AS疾病小鼠模型的方法 |
| IL312452A (en) | 2021-11-01 | 2024-06-01 | Tome Biosciences Inc | A transformant has a single structure for the simultaneous transfer of a gene editing mechanism and a nucleic acid cargo |
| AU2022396533A1 (en) | 2021-11-24 | 2024-05-02 | Metagenomi, Inc. | Endonuclease systems |
| CN114214330A (zh) * | 2021-12-20 | 2022-03-22 | 杭州百凌生物科技有限公司 | 一种检测脊索瘤的质控品及其制备方法和应用 |
| AU2022420615A1 (en) | 2021-12-22 | 2024-07-04 | Tome Biosciences, Inc. | Co-delivery of a gene editor construct and a donor template |
| WO2023205744A1 (en) | 2022-04-20 | 2023-10-26 | Tome Biosciences, Inc. | Programmable gene insertion compositions |
| WO2023215831A1 (en) | 2022-05-04 | 2023-11-09 | Tome Biosciences, Inc. | Guide rna compositions for programmable gene insertion |
| EP4522221A1 (en) | 2022-05-09 | 2025-03-19 | Entrada Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for delivery of nucleic acid therapeutics |
| WO2023225670A2 (en) | 2022-05-20 | 2023-11-23 | Tome Biosciences, Inc. | Ex vivo programmable gene insertion |
| CN119998446A (zh) | 2022-06-07 | 2025-05-13 | 斯克里贝治疗公司 | 用于靶向pcsk9的组合物和方法 |
| WO2024020587A2 (en) | 2022-07-22 | 2024-01-25 | Tome Biosciences, Inc. | Pleiopluripotent stem cell programmable gene insertion |
| WO2024138194A1 (en) | 2022-12-22 | 2024-06-27 | Tome Biosciences, Inc. | Platforms, compositions, and methods for in vivo programmable gene insertion |
| CN116376975B (zh) * | 2023-02-27 | 2024-05-14 | 中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心 | 激活异染色质基因的方法及应用 |
| WO2024206565A1 (en) | 2023-03-29 | 2024-10-03 | Scribe Therapeutics Inc. | Repressor fusion protein systems |
| WO2024206555A1 (en) | 2023-03-29 | 2024-10-03 | Scribe Therapeutics Inc. | Compositions and methods for the targeting of pcsk9 |
| WO2024234006A1 (en) | 2023-05-11 | 2024-11-14 | Tome Biosciences, Inc. | Systems, compositions, and methods for targeting liver sinusodial endothelial cells (lsecs) |
| WO2025007140A2 (en) | 2023-06-30 | 2025-01-02 | Christiana Care Gene Editing Institute, Inc. | Nras gene knockout for treatment of cancer |
| WO2025050069A1 (en) | 2023-09-01 | 2025-03-06 | Tome Biosciences, Inc. | Programmable gene insertion using engineered integration enzymes |
| CN116987730B (zh) * | 2023-09-22 | 2023-12-01 | 西北农林科技大学深圳研究院 | 硫氧还蛋白StCDSP32在植物抗病中的应用 |
| WO2025184523A2 (en) * | 2024-02-28 | 2025-09-04 | Trustees Of Tufts College | Method for improving the overall performance of cas9-based genetic editors |
| US20250319206A1 (en) | 2024-04-04 | 2025-10-16 | Christina Care Gene Editing Institute, Inc. | Crispr/cas gene editing of neh4 and/or neh5 domains in nrf2 |
| WO2025224107A1 (en) | 2024-04-22 | 2025-10-30 | Basecamp Research Ltd | Method and compositions for detecting off-target editing |
| WO2025226816A1 (en) | 2024-04-23 | 2025-10-30 | Christiana Care Gene Editing Institute, Inc. | Methods of identifying and correlating crispr-induced exon skipping to phenotypic outcomes |
| WO2025224182A2 (en) | 2024-04-23 | 2025-10-30 | Basecamp Research Ltd | Single construct platform for simultaneous delivery of gene editing machinery and nucleic acid cargo |
Family Cites Families (202)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JPS501A (ru) | 1973-04-28 | 1975-01-06 | ||
| JPS6395765U (ru) | 1986-12-11 | 1988-06-21 | ||
| US5703055A (en) | 1989-03-21 | 1997-12-30 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Generation of antibodies through lipid mediated DNA delivery |
| US7150982B2 (en) | 1991-09-09 | 2006-12-19 | Third Wave Technologies, Inc. | RNA detection assays |
| US5593972A (en) | 1993-01-26 | 1997-01-14 | The Wistar Institute | Genetic immunization |
| US5543158A (en) | 1993-07-23 | 1996-08-06 | Massachusetts Institute Of Technology | Biodegradable injectable nanoparticles |
| US6007845A (en) | 1994-07-22 | 1999-12-28 | Massachusetts Institute Of Technology | Nanoparticles and microparticles of non-linear hydrophilic-hydrophobic multiblock copolymers |
| US7745416B2 (en) | 1995-04-11 | 2010-06-29 | The Regents Of The University Of California | Method for in vivo regulation of cardiac muscle contractility |
| US5622856A (en) | 1995-08-03 | 1997-04-22 | Avigen | High efficiency helper system for AAV vector production |
| US5855913A (en) | 1997-01-16 | 1999-01-05 | Massachusetts Instite Of Technology | Particles incorporating surfactants for pulmonary drug delivery |
| US5985309A (en) | 1996-05-24 | 1999-11-16 | Massachusetts Institute Of Technology | Preparation of particles for inhalation |
| US5846946A (en) | 1996-06-14 | 1998-12-08 | Pasteur Merieux Serums Et Vaccins | Compositions and methods for administering Borrelia DNA |
| US5944710A (en) | 1996-06-24 | 1999-08-31 | Genetronics, Inc. | Electroporation-mediated intravascular delivery |
| US5869326A (en) | 1996-09-09 | 1999-02-09 | Genetronics, Inc. | Electroporation employing user-configured pulsing scheme |
| GB9907461D0 (en) | 1999-03-31 | 1999-05-26 | King S College London | Neurite regeneration |
| GB9710049D0 (en) | 1997-05-19 | 1997-07-09 | Nycomed Imaging As | Method |
| US6251677B1 (en) | 1997-08-25 | 2001-06-26 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Hybrid adenovirus-AAV virus and methods of use thereof |
| GB9720465D0 (en) | 1997-09-25 | 1997-11-26 | Oxford Biomedica Ltd | Dual-virus vectors |
| CA2307016A1 (en) | 1997-10-24 | 1999-05-06 | Life Technologies, Inc. | Recombinational cloning using nucleic acids having recombination sites |
| US7868149B2 (en) | 1999-07-20 | 2011-01-11 | Monsanto Technology Llc | Plant genome sequence and uses thereof |
| US6603061B1 (en) | 1999-07-29 | 2003-08-05 | Monsanto Company | Agrobacterium-mediated plant transformation method |
| GB0024550D0 (ru) | 2000-10-06 | 2000-11-22 | Oxford Biomedica Ltd | |
| JP3454818B1 (ja) | 2001-03-16 | 2003-10-06 | 直哉 小林 | 肝臓細胞の増殖方法、該方法により得られる肝臓細胞、およびその用途 |
| DK1385538T3 (da) | 2001-04-05 | 2013-04-29 | Univ Johns Hopkins | Kimære vacciner omfattende det lumenale domæne fra LAMP-1 eller LAMP-2 |
| WO2003006477A1 (en) | 2001-07-12 | 2003-01-23 | University Of Massachusetts | IN VIVO PRODUCTION OF SMALL INTERFERING RNAs THAT MEDIATE GENE SILENCING |
| AU2002327430A1 (en) | 2001-08-08 | 2003-02-24 | Genzyme Corporation | Methods for treating diabetes and other blood sugar disorders |
| WO2003016338A1 (en) | 2001-08-15 | 2003-02-27 | Parker Hughes Institute | Crystal structure of the btk kinase domain |
| GB0125216D0 (en) | 2001-10-19 | 2001-12-12 | Univ Strathclyde | Dendrimers for use in targeted delivery |
| US20090100536A1 (en) | 2001-12-04 | 2009-04-16 | Monsanto Company | Transgenic plants with enhanced agronomic traits |
| WO2003056022A2 (en) | 2001-12-21 | 2003-07-10 | Oxford Biomedica (Uk) Limited | Method for producing a transgenic organism using a lentiviral expression vector such as eiav |
| US7539579B2 (en) | 2002-04-09 | 2009-05-26 | Beattie Kenneth L | Oligonucleotide probes for genosensor chips |
| WO2003104414A2 (en) | 2002-06-11 | 2003-12-18 | The Scripps Research Institute | Artificial transcription factors |
| EP2338478B1 (en) | 2002-06-28 | 2014-07-23 | Protiva Biotherapeutics Inc. | Method for producing liposomes |
| GB0220467D0 (en) | 2002-09-03 | 2002-10-09 | Oxford Biomedica Ltd | Composition |
| WO2004029219A2 (en) | 2002-09-27 | 2004-04-08 | Cold Spring Harbor Laboratory | Cell-based rna interference and related methods and compositions |
| US9534224B2 (en) | 2002-11-15 | 2017-01-03 | Trustees Of Boston University | Cis/trans riboregulators |
| US20060178297A1 (en) | 2003-01-28 | 2006-08-10 | Troy Carol M | Systems and methods for silencing expression of a gene in a cell and uses thereof |
| KR20060052710A (ko) | 2003-07-03 | 2006-05-19 | 더 리전트 오브 더 유니버시티 오브 캘리포니아 | 기능성 dna 요소와 세포 단백질의 게놈 지도작성 |
| CA2532228C (en) | 2003-07-16 | 2017-02-14 | Protiva Biotherapeutics, Inc. | Lipid encapsulated interfering rna |
| AU2004263865B2 (en) | 2003-08-08 | 2007-05-17 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Methods and compositions for targeted cleavage and recombination |
| US8409861B2 (en) | 2003-08-08 | 2013-04-02 | Sangamo Biosciences, Inc. | Targeted deletion of cellular DNA sequences |
| WO2005026372A1 (en) | 2003-09-15 | 2005-03-24 | Protiva Biotherapeutics, Inc. | Polyethyleneglycol-modified lipid compounds and uses thereof |
| GB0325379D0 (en) | 2003-10-30 | 2003-12-03 | Oxford Biomedica Ltd | Vectors |
| FR2862659B1 (fr) | 2003-11-21 | 2006-02-10 | Pasteur Institut | Genome de legionella pneumophila souche paris- applications diagnostiques et epidemiologiques |
| US8053232B2 (en) | 2004-01-23 | 2011-11-08 | Virxsys Corporation | Correction of alpha-1-antitrypsin genetic defects using spliceosome mediated RNA trans splicing |
| WO2005074511A2 (en) | 2004-01-27 | 2005-08-18 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Methods and compositions for homozygous gene inactivation using collections of pre-defined nucleotide sequences complementary to chromosomal transcripts |
| US20050220796A1 (en) | 2004-03-31 | 2005-10-06 | Dynan William S | Compositions and methods for modulating DNA repair |
| EP1781593B1 (en) | 2004-06-07 | 2011-12-14 | Protiva Biotherapeutics Inc. | Cationic lipids and methods of use |
| ATE536418T1 (de) | 2004-06-07 | 2011-12-15 | Protiva Biotherapeutics Inc | Lipidverkapselte interferenz-rna |
| FR2872170B1 (fr) | 2004-06-25 | 2006-11-10 | Centre Nat Rech Scient Cnrse | Lentivirus non interactif et non replicatif, preparation et utilisations |
| WO2006020071A2 (en) | 2004-07-16 | 2006-02-23 | The Government Of The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services | Vaccines against aids comprising cmv/r-nucleic acid constructs |
| GB0422877D0 (en) | 2004-10-14 | 2004-11-17 | Univ Glasgow | Bioactive polymers |
| US7404969B2 (en) | 2005-02-14 | 2008-07-29 | Sirna Therapeutics, Inc. | Lipid nanoparticle based compositions and methods for the delivery of biologically active molecules |
| CA2606002A1 (en) | 2005-04-28 | 2006-11-02 | Benitec Limited | Multiple-rnai expression cassettes for simultaneous delivery of rnai agents related to heterozygotic expression patterns |
| US7892224B2 (en) | 2005-06-01 | 2011-02-22 | Brainlab Ag | Inverse catheter planning |
| JP2009502170A (ja) | 2005-07-26 | 2009-01-29 | サンガモ バイオサイエンシズ インコーポレイテッド | 外来核酸配列の標的化された組込み及び発現 |
| AU2006282983B2 (en) | 2005-08-26 | 2012-08-02 | Dupont Nutrition Biosciences Aps | Use |
| WO2007048046A2 (en) | 2005-10-20 | 2007-04-26 | Protiva Biotherapeutics, Inc. | Sirna silencing of filovirus gene expression |
| ES2377660T3 (es) | 2005-10-28 | 2012-03-29 | Mitsubishi Tanabe Pharma Corporation | Nuevo péptido que penetra en las células |
| CA2628300C (en) | 2005-11-02 | 2018-04-17 | Protiva Biotherapeutics, Inc. | Modified sirna molecules and uses thereof |
| GB0526211D0 (en) | 2005-12-22 | 2006-02-01 | Oxford Biomedica Ltd | Viral vectors |
| EP1989307B1 (en) | 2006-02-08 | 2012-08-08 | Quark Pharmaceuticals, Inc. | NOVEL TANDEM siRNAS |
| EP1994182B1 (en) | 2006-03-15 | 2019-05-29 | Siemens Healthcare Diagnostics Inc. | Degenerate nucleobase analogs |
| NZ572666A (en) | 2006-05-11 | 2010-11-26 | Alnylam Pharmaceuticals Inc | Compositions comprising double stranded rna and methods for inhibiting expression of the pcsk9 gene |
| WO2008054544A2 (en) | 2006-05-22 | 2008-05-08 | Immune Disease Institute, Inc. | Method for delivery across the blood brain barrier |
| US7915399B2 (en) | 2006-06-09 | 2011-03-29 | Protiva Biotherapeutics, Inc. | Modified siRNA molecules and uses thereof |
| JP2008078613A (ja) | 2006-08-24 | 2008-04-03 | Rohm Co Ltd | 窒化物半導体の製造方法及び窒化物半導体素子 |
| WO2008093152A1 (en) | 2007-02-01 | 2008-08-07 | Cellectis | Obligate heterodimer meganucleases and uses thereof |
| NZ592231A (en) | 2007-03-02 | 2012-07-27 | Danisco | Methods to generate bacteriophage resistant bacterial strains and produce bacteriophage CRISPR loci phage mutants |
| PE20090064A1 (es) | 2007-03-26 | 2009-03-02 | Novartis Ag | Acido ribonucleico de doble cadena para inhibir la expresion del gen e6ap humano y composicion farmaceutica que lo comprende |
| WO2008149176A1 (en) | 2007-06-06 | 2008-12-11 | Cellectis | Meganuclease variants cleaving a dna target sequence from the mouse rosa26 locus and uses thereof |
| EP2225002A4 (en) | 2007-12-31 | 2011-06-22 | Nanocor Therapeutics Inc | RNA INTERFERENCE FOR THE TREATMENT OF CARDIAC SUFFICIENCIES |
| WO2009105690A2 (en) | 2008-02-21 | 2009-08-27 | Targeted Genetics Corporation | Devices and methods for delivering polynucleotides into retinal cells of the macula and fovea |
| PL2279254T3 (pl) | 2008-04-15 | 2017-11-30 | Protiva Biotherapeutics Inc. | Nowe preparaty lipidowe do dostarczania kwasów nukleinowych |
| WO2009147368A1 (en) | 2008-06-04 | 2009-12-10 | Medical Research Council | Peptides |
| AU2009265170A1 (en) | 2008-06-30 | 2010-01-07 | Silenseed Ltd | Methods, compositions and systems for local delivery of drugs |
| US20110117189A1 (en) | 2008-07-08 | 2011-05-19 | S.I.F.I. Societa' Industria Farmaceutica Italiana S.P.A. | Ophthalmic compositions for treating pathologies of the posterior segment of the eye |
| US8546553B2 (en) | 2008-07-25 | 2013-10-01 | University Of Georgia Research Foundation, Inc. | Prokaryotic RNAi-like system and methods of use |
| US20100076057A1 (en) | 2008-09-23 | 2010-03-25 | Northwestern University | TARGET DNA INTERFERENCE WITH crRNA |
| MX344354B (es) | 2008-10-20 | 2016-12-14 | Alnylam Pharmaceuticals Inc | Composiciones y metodos para inhibir la expresion de transtiretina. |
| US9404098B2 (en) | 2008-11-06 | 2016-08-02 | University Of Georgia Research Foundation, Inc. | Method for cleaving a target RNA using a Cas6 polypeptide |
| KR101734955B1 (ko) | 2008-11-07 | 2017-05-12 | 메사추세츠 인스티튜트 오브 테크놀로지 | 아미노알콜 리피도이드 및 그의 용도 |
| US20110016540A1 (en) | 2008-12-04 | 2011-01-20 | Sigma-Aldrich Co. | Genome editing of genes associated with trinucleotide repeat expansion disorders in animals |
| SG172760A1 (en) | 2008-12-04 | 2011-08-29 | Sangamo Biosciences Inc | Genome editing in rats using zinc-finger nucleases |
| EP3225281A1 (en) | 2008-12-10 | 2017-10-04 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Gnaq targeted dsrna compositions and methods for inhibiting expression |
| WO2010075424A2 (en) | 2008-12-22 | 2010-07-01 | The Regents Of University Of California | Compositions and methods for downregulating prokaryotic genes |
| US20110239315A1 (en) | 2009-01-12 | 2011-09-29 | Ulla Bonas | Modular dna-binding domains and methods of use |
| EP2206723A1 (en) | 2009-01-12 | 2010-07-14 | Bonas, Ulla | Modular DNA-binding domains |
| DK2417262T3 (da) | 2009-04-07 | 2015-06-22 | Dow Agrosciences Llc | Nanopartikelmedieret tilførsel af sekvensspecifikke nukleaser |
| WO2011036510A1 (en) | 2009-09-24 | 2011-03-31 | Cellectis | Meganuclease variants cleaving the genome of the herpes simplex virus and uses thereof |
| WO2010143917A2 (en) | 2009-06-11 | 2010-12-16 | Toolgen Incorporation | Targeted genomic rearrangements using site-specific nucleases |
| EP2449106B1 (en) | 2009-07-01 | 2015-04-08 | Protiva Biotherapeutics Inc. | Compositions and methods for silencing apolipoprotein b |
| US8283333B2 (en) | 2009-07-01 | 2012-10-09 | Protiva Biotherapeutics, Inc. | Lipid formulations for nucleic acid delivery |
| AU2010275432A1 (en) | 2009-07-24 | 2012-02-02 | Sigma-Aldrich Co. Llc. | Method for genome editing |
| CA2769262C (en) | 2009-07-28 | 2019-04-30 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for treating trinucleotide repeat disorders |
| US8889394B2 (en) | 2009-09-07 | 2014-11-18 | Empire Technology Development Llc | Multiple domain proteins |
| CA2782014C (en) | 2009-11-27 | 2021-08-31 | Basf Plant Science Company Gmbh | Optimized endonucleases and uses thereof |
| KR102110725B1 (ko) | 2009-12-10 | 2020-05-13 | 리전츠 오브 더 유니버스티 오브 미네소타 | Tal 이펙터-매개된 dna 변형 |
| US8933046B2 (en) | 2009-12-23 | 2015-01-13 | Max-Planck-Gesellschaft Zur Foerderung Der Wissenschaften E.V. | Influenza targets |
| AU2011215557B2 (en) | 2010-02-09 | 2016-03-10 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Targeted genomic modification with partially single-stranded donor molecules |
| US10087431B2 (en) | 2010-03-10 | 2018-10-02 | The Regents Of The University Of California | Methods of generating nucleic acid fragments |
| US9567573B2 (en) | 2010-04-26 | 2017-02-14 | Sangamo Biosciences, Inc. | Genome editing of a Rosa locus using nucleases |
| US8927514B2 (en) | 2010-04-30 | 2015-01-06 | City Of Hope | Recombinant adeno-associated vectors for targeted treatment |
| AU2011253222B2 (en) | 2010-05-10 | 2014-08-21 | The Regents Of The University Of California | Endoribonuclease compositions and methods of use thereof |
| US8372951B2 (en) | 2010-05-14 | 2013-02-12 | National Tsing Hua University | Cell penetrating peptides for intracellular delivery |
| EP2571512B1 (en) | 2010-05-17 | 2017-08-23 | Sangamo BioSciences, Inc. | Novel dna-binding proteins and uses thereof |
| DK2575894T3 (en) | 2010-05-28 | 2015-05-26 | Oxford Biomedica Ltd | FEED lentiviral vectors FOR BRAIN |
| EP2596101B1 (en) | 2010-07-23 | 2018-12-05 | Sigma-Aldrich Co., LLC | Genome editing using targeting endonucleases and single-stranded nucleic acids |
| WO2012018697A1 (en) | 2010-08-02 | 2012-02-09 | Integrated Dna Technologies, Inc. | Methods for predicting stability and melting temperatures of nucleic acid duplexes |
| WO2012027675A2 (en) | 2010-08-26 | 2012-03-01 | Massachusetts Institute Of Technology | Poly(beta-amino alcohols), their preparation, and uses thereof |
| US9549901B2 (en) | 2010-09-03 | 2017-01-24 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | Lipid-polymer hybrid particles |
| CN103270046B (zh) | 2010-10-12 | 2016-05-11 | 费城儿童医院 | 治疗b型血友病的方法和组合物 |
| EP2691443B1 (en) | 2011-03-28 | 2021-02-17 | Massachusetts Institute of Technology | Conjugated lipomers and uses thereof |
| WO2012135805A2 (en) | 2011-03-31 | 2012-10-04 | modeRNA Therapeutics | Delivery and formulation of engineered nucleic acids |
| EP4005603B1 (en) | 2011-04-22 | 2024-09-25 | The Regents of The University of California | Adeno-associated virus virions with variant capsid and methods of use thereof |
| CA2834375C (en) | 2011-04-27 | 2020-07-14 | Amyris, Inc. | Methods for genomic modification |
| US20120295960A1 (en) | 2011-05-20 | 2012-11-22 | Oxford Biomedica (Uk) Ltd. | Treatment regimen for parkinson's disease |
| WO2012164565A1 (en) | 2011-06-01 | 2012-12-06 | Yeda Research And Development Co. Ltd. | Compositions and methods for downregulating prokaryotic genes |
| EP3498833B1 (en) | 2011-09-21 | 2023-08-16 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Methods and compositions for regulation of transgene expression |
| CA2849920A1 (en) | 2011-10-06 | 2013-04-11 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for regulating hiv infection |
| EP2591770B1 (en) | 2011-11-14 | 2016-03-16 | Silenseed Ltd | Compositions for siRNA delivery and methods of manufacturing and using same |
| CA2855653A1 (en) | 2011-11-18 | 2013-05-23 | Universite Laval | Methods and products for increasing frataxin levels and uses thereof |
| EP3539568A1 (en) | 2011-11-22 | 2019-09-18 | The Children's Hospital of Philadelphia | Virus vectors for highly efficient transgene delivery |
| US8450107B1 (en) | 2011-11-30 | 2013-05-28 | The Broad Institute Inc. | Nucleotide-specific recognition sequences for designer TAL effectors |
| US20130156849A1 (en) | 2011-12-16 | 2013-06-20 | modeRNA Therapeutics | Modified nucleoside, nucleotide, and nucleic acid compositions |
| GB201122458D0 (en) | 2011-12-30 | 2012-02-08 | Univ Wageningen | Modified cascade ribonucleoproteins and uses thereof |
| CA2865011C (en) | 2012-02-29 | 2021-06-15 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for treating huntington's disease |
| WO2013141680A1 (en) | 2012-03-20 | 2013-09-26 | Vilnius University | RNA-DIRECTED DNA CLEAVAGE BY THE Cas9-crRNA COMPLEX |
| US9637739B2 (en) | 2012-03-20 | 2017-05-02 | Vilnius University | RNA-directed DNA cleavage by the Cas9-crRNA complex |
| AU2013204327B2 (en) | 2012-04-20 | 2016-09-01 | Aviagen | Cell transfection method |
| PE20190844A1 (es) | 2012-05-25 | 2019-06-17 | Emmanuelle Charpentier | Modulacion de transcripcion con arn de direccion a adn generico |
| WO2013181584A2 (en) | 2012-06-01 | 2013-12-05 | Guo, Ju-Tao | Modulation of hepatitis b virus cccdna transcription |
| US8614194B1 (en) | 2012-07-25 | 2013-12-24 | Kaohsiung Medical University | Anionic cell penetrating peptide and its use for intracellular delivery |
| WO2014059173A2 (en) | 2012-10-10 | 2014-04-17 | Sangamo Biosciences, Inc. | T cell modifying compounds and uses thereof |
| DE202013012597U1 (de) | 2012-10-23 | 2017-11-21 | Toolgen, Inc. | Zusammensetzung zum Spalten einer Ziel-DNA, umfassend eine für die Ziel-DNA spezifische guide-RNA und eine Cas-Protein-codierende Nukleinsäure oder ein Cas-Protein, sowie deren Verwendung |
| CA3034794A1 (en) | 2012-12-06 | 2014-06-12 | Sigma-Aldrich Co. Llc | Crispr-based genome modification and regulation |
| WO2014093479A1 (en) | 2012-12-11 | 2014-06-19 | Montana State University | Crispr (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) rna-guided control of gene regulation |
| MX380562B (es) | 2012-12-12 | 2025-03-12 | Broad Inst Inc | Modificaciones de sistemas, métodos y composiciones guía optimizadas para la manipulación de secuencias. |
| BR112015013784A2 (pt) | 2012-12-12 | 2017-07-11 | Massachusetts Inst Technology | aplicação, manipulação e otimização de sistemas, métodos e composições para manipulação de sequência e aplicações terapêuticas |
| WO2014093701A1 (en) | 2012-12-12 | 2014-06-19 | The Broad Institute, Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems, compositions, methods, knock out libraries and applications thereof |
| EP2921557B1 (en) | 2012-12-12 | 2016-07-13 | The Broad Institute, Inc. | Engineering of systems, methods and optimized guide compositions for sequence manipulation |
| EP4570817A3 (en) | 2012-12-12 | 2025-09-24 | The Broad Institute Inc. | Crispr-cas component systems, methods and compositions for sequence manipulation |
| EP2931892B1 (en) | 2012-12-12 | 2018-09-12 | The Broad Institute, Inc. | Methods, models, systems, and apparatus for identifying target sequences for cas enzymes or crispr-cas systems for target sequences and conveying results thereof |
| EP2931898B1 (en) | 2012-12-12 | 2016-03-09 | The Broad Institute, Inc. | Engineering and optimization of systems, methods and compositions for sequence manipulation with functional domains |
| US8697359B1 (en) | 2012-12-12 | 2014-04-15 | The Broad Institute, Inc. | CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products |
| WO2014093694A1 (en) | 2012-12-12 | 2014-06-19 | The Broad Institute, Inc. | Crispr-cas nickase systems, methods and compositions for sequence manipulation in eukaryotes |
| DK2898075T3 (en) | 2012-12-12 | 2016-06-27 | Broad Inst Inc | CONSTRUCTION AND OPTIMIZATION OF IMPROVED SYSTEMS, PROCEDURES AND ENZYME COMPOSITIONS FOR SEQUENCE MANIPULATION |
| JP6700788B2 (ja) | 2012-12-17 | 2020-05-27 | プレジデント アンド フェローズ オブ ハーバード カレッジ | Rna誘導性ヒトゲノム改変 |
| WO2014113493A1 (en) | 2013-01-16 | 2014-07-24 | Emory University | Cas9-nucleic acid complexes and uses related thereto |
| WO2014118272A1 (en) | 2013-01-30 | 2014-08-07 | Santaris Pharma A/S | Antimir-122 oligonucleotide carbohydrate conjugates |
| US11135273B2 (en) | 2013-02-07 | 2021-10-05 | The Rockefeller University | Sequence specific antimicrobials |
| US10660943B2 (en) | 2013-02-07 | 2020-05-26 | The Rockefeller University | Sequence specific antimicrobials |
| US9163837B2 (en) | 2013-02-27 | 2015-10-20 | Siemens Aktiengesellschaft | Flow conditioner in a combustor of a gas turbine engine |
| RU2018122288A (ru) | 2013-03-14 | 2019-03-06 | Карибо Биосайенсиз, Инк. | Композиции и способы с участием нуклеиновых кислот, нацеленных на нуклеиновые кислоты |
| CN113563476A (zh) | 2013-03-15 | 2021-10-29 | 通用医疗公司 | 遗传和表观遗传调节蛋白至特定基因组基因座的rna引导的靶向 |
| ES2645931T3 (es) | 2013-03-27 | 2017-12-11 | Wilco Ag | Método de inspección y/o de prueba en línea de dispositivos y aparato para realizar tal método |
| EP4286517A3 (en) | 2013-04-04 | 2024-03-13 | President and Fellows of Harvard College | Therapeutic uses of genome editing with crispr/cas systems |
| CA2908253C (en) | 2013-04-04 | 2024-01-09 | Trustees Of Dartmouth College | Compositions and methods for in vivo excision of hiv-1 proviral dna |
| JP2016521975A (ja) | 2013-05-15 | 2016-07-28 | サンガモ バイオサイエンシーズ, インコーポレイテッド | 遺伝的状態の処置のための方法および組成物 |
| US20160122774A1 (en) | 2013-05-29 | 2016-05-05 | Cellectis | A method for producing precise dna cleavage using cas9 nickase activity |
| AU2014274939B2 (en) | 2013-06-04 | 2020-03-19 | President And Fellows Of Harvard College | RNA-guideded transcriptional regulation |
| US9267135B2 (en) | 2013-06-04 | 2016-02-23 | President And Fellows Of Harvard College | RNA-guided transcriptional regulation |
| KR20230136697A (ko) | 2013-06-05 | 2023-09-26 | 듀크 유니버시티 | Rna-가이드 유전자 편집 및 유전자 조절 |
| EP3011030B1 (en) | 2013-06-17 | 2023-11-08 | The Broad Institute, Inc. | Optimized crispr-cas double nickase systems, methods and compositions for sequence manipulation |
| KR20240172759A (ko) | 2013-06-17 | 2024-12-10 | 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 | 간의 표적화 및 치료를 위한 CRISPRCas 시스템, 벡터 및 조성물의 전달 및 용도 |
| WO2014204727A1 (en) | 2013-06-17 | 2014-12-24 | The Broad Institute Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems, compositions methods, screens and applications thereof |
| AU2014281026B2 (en) | 2013-06-17 | 2020-05-28 | Massachusetts Institute Of Technology | Delivery, engineering and optimization of tandem guide systems, methods and compositions for sequence manipulation |
| CA2915795C (en) | 2013-06-17 | 2021-07-13 | The Broad Institute, Inc. | Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for targeting disorders and diseases using viral components |
| BR112015031611A2 (pt) | 2013-06-17 | 2017-12-12 | Massachusetts Inst Technology | aplicação, manipulação e otimização de sistemas, métodos e composições para direcionamento e modelação de doenças e distúrbios de células pós-mitóticas |
| CN103343120B (zh) * | 2013-07-04 | 2015-03-04 | 中国科学院遗传与发育生物学研究所 | 一种小麦基因组定点改造方法 |
| US11027025B2 (en) | 2013-07-11 | 2021-06-08 | Modernatx, Inc. | Compositions comprising synthetic polynucleotides encoding CRISPR related proteins and synthetic sgRNAs and methods of use |
| CN103388006B (zh) | 2013-07-26 | 2015-10-28 | 华东师范大学 | 一种基因定点突变的构建方法 |
| US10563225B2 (en) | 2013-07-26 | 2020-02-18 | President And Fellows Of Harvard College | Genome engineering |
| US9925248B2 (en) | 2013-08-29 | 2018-03-27 | Temple University Of The Commonwealth System Of Higher Education | Methods and compositions for RNA-guided treatment of HIV infection |
| US9526784B2 (en) | 2013-09-06 | 2016-12-27 | President And Fellows Of Harvard College | Delivery system for functional nucleases |
| US9388430B2 (en) | 2013-09-06 | 2016-07-12 | President And Fellows Of Harvard College | Cas9-recombinase fusion proteins and uses thereof |
| WO2015048690A1 (en) * | 2013-09-27 | 2015-04-02 | The Regents Of The University Of California | Optimized small guide rnas and methods of use |
| US20160237455A1 (en) | 2013-09-27 | 2016-08-18 | Editas Medicine, Inc. | Crispr-related methods and compositions |
| WO2015065964A1 (en) * | 2013-10-28 | 2015-05-07 | The Broad Institute Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems, compositions, methods, screens and applications thereof |
| CN106459995B (zh) | 2013-11-07 | 2020-02-21 | 爱迪塔斯医药有限公司 | 使用统治型gRNA的CRISPR相关方法和组合物 |
| AU2014350051A1 (en) * | 2013-11-18 | 2016-07-07 | Crispr Therapeutics Ag | CRISPR-Cas system materials and methods |
| SG10201804973TA (en) | 2013-12-12 | 2018-07-30 | Broad Inst Inc | Compositions and Methods of Use of Crispr-Cas Systems in Nucleotide Repeat Disorders |
| CA2932439A1 (en) | 2013-12-12 | 2015-06-18 | The Broad Institute, Inc. | Crispr-cas systems and methods for altering expression of gene products, structural information and inducible modular cas enzymes |
| WO2015089364A1 (en) | 2013-12-12 | 2015-06-18 | The Broad Institute Inc. | Crystal structure of a crispr-cas system, and uses thereof |
| WO2015089419A2 (en) | 2013-12-12 | 2015-06-18 | The Broad Institute Inc. | Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for targeting disorders and diseases using particle delivery components |
| CN103668472B (zh) | 2013-12-31 | 2014-12-24 | 北京大学 | 利用CRISPR/Cas9系统构建真核基因敲除文库的方法 |
| WO2015113063A1 (en) | 2014-01-27 | 2015-07-30 | Georgia Tech Research Corporation | Methods and systems for identifying crispr/cas off-target sites |
| CA2951707A1 (en) | 2014-06-10 | 2015-12-17 | Massachusetts Institute Of Technology | Method for gene editing |
| JP6323228B2 (ja) | 2014-07-18 | 2018-05-16 | 富士電機株式会社 | 電力変換装置 |
| WO2016022866A1 (en) | 2014-08-07 | 2016-02-11 | Agilent Technologies, Inc. | Cis-blocked guide rna |
| ES2780904T3 (es) | 2014-08-17 | 2020-08-27 | Broad Inst Inc | Edición genómica usando nickasas Cas9 |
| WO2016049024A2 (en) | 2014-09-24 | 2016-03-31 | The Broad Institute Inc. | Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for modeling competition of multiple cancer mutations in vivo |
| US12180263B2 (en) | 2014-11-06 | 2024-12-31 | President And Fellows Of Harvard College | Cells lacking B2M surface expression and methods for allogeneic administration of such cells |
| KR20230156800A (ko) * | 2015-03-03 | 2023-11-14 | 더 제너럴 하스피탈 코포레이션 | 변경된 PAM 특이성을 갖는 조작된 CRISPR-Cas9 뉴클레아제 |
| ES2905525T3 (es) | 2015-05-06 | 2022-04-11 | Snipr Tech Ltd | Alteración de poblaciones microbianas y modificación de la microbiota |
| WO2016205759A1 (en) | 2015-06-18 | 2016-12-22 | The Broad Institute Inc. | Engineering and optimization of systems, methods, enzymes and guide scaffolds of cas9 orthologs and variants for sequence manipulation |
| AU2016280893B2 (en) | 2015-06-18 | 2021-12-02 | Massachusetts Institute Of Technology | CRISPR enzyme mutations reducing off-target effects |
| US9512446B1 (en) | 2015-08-28 | 2016-12-06 | The General Hospital Corporation | Engineered CRISPR-Cas9 nucleases |
| JP6186470B2 (ja) | 2016-04-20 | 2017-08-23 | パイオニア株式会社 | 音響装置、音量制御方法、音量制御プログラム及び記録媒体 |
| EP3585898A1 (en) | 2017-02-22 | 2020-01-01 | CRISPR Therapeutics AG | Materials and methods for treatment of spinocerebellar ataxia type 1 (sca1) and other spinocerebellar ataxia type 1 protein (atxn1) gene related conditions or disorders |
| KR20210143718A (ko) | 2019-01-17 | 2021-11-29 | 조지아 테크 리서치 코포레이션 | 산화된 콜레스테롤을 함유하는 약물 전달 시스템 |
| CN114502542A (zh) | 2019-07-29 | 2022-05-13 | 佐治亚技术研究公司 | 包含限制性脂质的纳米材料及其用途 |
-
2016
- 2016-06-17 AU AU2016280893A patent/AU2016280893B2/en active Active
- 2016-06-17 WO PCT/US2016/038034 patent/WO2016205613A1/en not_active Ceased
- 2016-06-17 KR KR1020237029777A patent/KR102840885B1/ko active Active
- 2016-06-17 CA CA2989830A patent/CA2989830A1/en active Pending
- 2016-06-17 IL IL284808A patent/IL284808B/en unknown
- 2016-06-17 CN CN201811302886.XA patent/CN109536474A/zh active Pending
- 2016-06-17 EP EP16734795.4A patent/EP3129393B1/en active Active
- 2016-06-17 IL IL293323A patent/IL293323B2/en unknown
- 2016-06-17 KR KR1020187001739A patent/KR102575342B1/ko active Active
- 2016-06-17 TW TW105119140A patent/TWI813532B/zh active
- 2016-06-17 MX MX2017016289A patent/MX392008B/es unknown
- 2016-06-17 JP JP2017565296A patent/JP7107683B2/ja active Active
- 2016-06-17 RU RU2018101710A patent/RU2752834C2/ru active
- 2016-06-17 EP EP21178220.6A patent/EP3929287A3/en active Pending
- 2016-06-17 CN CN201680035804.2A patent/CN108290933A/zh active Pending
- 2016-06-17 SG SG10201912329YA patent/SG10201912329YA/en unknown
-
2017
- 2017-12-14 ZA ZA2017/08498A patent/ZA201708498B/en unknown
- 2017-12-14 MX MX2022005304A patent/MX2022005304A/es unknown
- 2017-12-16 US US15/844,528 patent/US10876100B2/en active Active
- 2017-12-17 IL IL256368A patent/IL256368B/en unknown
-
2018
- 2018-10-11 US US16/158,295 patent/US10494621B2/en active Active
- 2018-10-11 JP JP2018192321A patent/JP6793699B2/ja active Active
-
2019
- 2019-11-26 US US16/697,018 patent/US12123032B2/en active Active
-
2022
- 2022-02-21 AU AU2022201165A patent/AU2022201165B2/en active Active
- 2022-07-13 JP JP2022112170A patent/JP7589196B2/ja active Active
-
2024
- 2024-10-03 US US18/905,630 patent/US20250179453A1/en active Pending
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2018101710A (ru) | Мутации фермента crispr, уменьшающие нецелевые эффекты | |
| JP7469433B2 (ja) | 変異cas9タンパク質 | |
| CN111770992A (zh) | CRISPR-Cas12j酶和系统 | |
| JP6929791B2 (ja) | エピゲノム編集のための組成物および方法 | |
| CN111757889A (zh) | 新型CRISPR/Cas12f酶和系统 | |
| CN113015798B (zh) | CRISPR-Cas12a酶和系统 | |
| KR20240011120A (ko) | 후성유전학적 편집을 위한 조성물 및 방법 | |
| IL309801A (en) | Use of protein domains interacting with the nucleosome to enhance targeted genome modification | |
| RU2018101666A (ru) | Новые ферменты и системы crispr | |
| TWI723363B (zh) | 用於治療癌症之包含引導rna及內切酶的藥學組成物 | |
| RU2022103641A (ru) | Искусственная модификация генома для регуляции экспрессии гена | |
| RU2020104969A (ru) | Способы и продукты для получения и доставки нуклеиновых кислот | |
| FI3352776T3 (fi) | Htt-repressoreita ja niiden käyttötapoja | |
| JP2017510542A5 (ru) | ||
| US12146152B2 (en) | Systems, methods, and compositions for correction of frameshift mutations | |
| RU2016101198A (ru) | Доставка, применение и применения в терапии систем crispr-cas и композиций для целенаправленного воздействия на нарушения и заболевания с использованием вирусных компонентов | |
| RU2016101178A (ru) | Доставка, конструирование и оптимизация систем, способы и композиции для целенаправленного воздействия и моделирования заболеваний и нарушений постмитотических клеток | |
| CN109689677A (zh) | 用于基因组编辑分子的细胞内递送的肽和纳米颗粒 | |
| WO2020018918A1 (en) | Methods for exon skipping and gene knockout using base editors | |
| KR102067675B1 (ko) | CRISP/Cas 시스템에 사용하기 위한 융합 단백질, 그를 포함하는 복합체 및 그의 용도 | |
| WO2019089910A1 (en) | Highly compact cas9-based transcriptional regulators for in vivo gene regulation | |
| WO2022045169A1 (ja) | エンジニアリングされたCjCas9タンパク質 | |
| CN113474454A (zh) | 可控的基因组编辑系统 | |
| CN117062912A (zh) | 用于基于crispr的转录抑制的融合蛋白 | |
| RU2804665C2 (ru) | Композиции и способы редактирования генов |