RU2019116874A - Амплификация библиотек нуклеиновых кислот с применением кинетического исключения - Google Patents
Амплификация библиотек нуклеиновых кислот с применением кинетического исключения Download PDFInfo
- Publication number
- RU2019116874A RU2019116874A RU2019116874A RU2019116874A RU2019116874A RU 2019116874 A RU2019116874 A RU 2019116874A RU 2019116874 A RU2019116874 A RU 2019116874A RU 2019116874 A RU2019116874 A RU 2019116874A RU 2019116874 A RU2019116874 A RU 2019116874A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- solution
- nucleic acids
- target nucleic
- amplification sites
- flow cell
- Prior art date
Links
- 230000003321 amplification Effects 0.000 title claims 41
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 title claims 41
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title claims 31
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title claims 31
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title claims 31
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 title claims 2
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims 29
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims 29
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 16
- 108091093088 Amplicon Proteins 0.000 claims 14
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims 7
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims 7
- 230000010076 replication Effects 0.000 claims 6
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims 5
- 239000012530 fluid Substances 0.000 claims 4
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims 3
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 claims 3
- -1 nucleoside triphosphates Chemical class 0.000 claims 3
- 239000001226 triphosphate Substances 0.000 claims 3
- 235000011178 triphosphate Nutrition 0.000 claims 3
- 238000009739 binding Methods 0.000 claims 2
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 claims 2
- 239000000376 reactant Substances 0.000 claims 2
- 108060004795 Methyltransferase Proteins 0.000 claims 1
- 102000018120 Recombinases Human genes 0.000 claims 1
- 108010091086 Recombinases Proteins 0.000 claims 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 claims 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 claims 1
- 230000036647 reaction Effects 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6848—Nucleic acid amplification reactions characterised by the means for preventing contamination or increasing the specificity or sensitivity of an amplification reaction
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
- B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
- B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
- B01L3/5025—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures for parallel transport of multiple samples
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J19/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J19/0046—Sequential or parallel reactions, e.g. for the synthesis of polypeptides or polynucleotides; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making molecular arrays
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
- B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
- B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
- B01L3/5027—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip
- B01L3/50273—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip characterised by the means or forces applied to move the fluids
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
- B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
- B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
- B01L3/5027—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip
- B01L3/502738—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip characterised by integrated valves
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L7/00—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices
- B01L7/52—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices with provision for submitting samples to a predetermined sequence of different temperatures, e.g. for treating nucleic acid samples
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6869—Methods for sequencing
- C12Q1/6874—Methods for sequencing involving nucleic acid arrays, e.g. sequencing by hybridisation
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00279—Features relating to reactor vessels
- B01J2219/00281—Individual reactor vessels
- B01J2219/00286—Reactor vessels with top and bottom openings
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00351—Means for dispensing and evacuation of reagents
- B01J2219/00353—Pumps
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00351—Means for dispensing and evacuation of reagents
- B01J2219/00389—Feeding through valves
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00351—Means for dispensing and evacuation of reagents
- B01J2219/00418—Means for dispensing and evacuation of reagents using pressure
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00497—Features relating to the solid phase supports
- B01J2219/00527—Sheets
- B01J2219/00529—DNA chips
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00585—Parallel processes
- B01J2219/00587—High throughput processes
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00603—Making arrays on substantially continuous surfaces
- B01J2219/00675—In-situ synthesis on the substrate
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00718—Type of compounds synthesised
- B01J2219/0072—Organic compounds
- B01J2219/00722—Nucleotides
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2200/00—Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
- B01L2200/14—Process control and prevention of errors
- B01L2200/141—Preventing contamination, tampering
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/06—Auxiliary integrated devices, integrated components
- B01L2300/0627—Sensor or part of a sensor is integrated
- B01L2300/0636—Integrated biosensor, microarrays
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/08—Geometry, shape and general structure
- B01L2300/0861—Configuration of multiple channels and/or chambers in a single devices
- B01L2300/0877—Flow chambers
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2400/00—Moving or stopping fluids
- B01L2400/04—Moving fluids with specific forces or mechanical means
- B01L2400/0475—Moving fluids with specific forces or mechanical means specific mechanical means and fluid pressure
- B01L2400/0487—Moving fluids with specific forces or mechanical means specific mechanical means and fluid pressure fluid pressure, pneumatics
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2521/00—Reaction characterised by the enzymatic activity
- C12Q2521/50—Other enzymatic activities
- C12Q2521/507—Recombinase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2521/00—Reaction characterised by the enzymatic activity
- C12Q2521/50—Other enzymatic activities
- C12Q2521/513—Winding/unwinding enzyme, e.g. helicase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2527/00—Reactions demanding special reaction conditions
- C12Q2527/101—Temperature
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2565/00—Nucleic acid analysis characterised by mode or means of detection
- C12Q2565/50—Detection characterised by immobilisation to a surface
- C12Q2565/537—Detection characterised by immobilisation to a surface characterised by the capture oligonucleotide acting as a primer
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Clinical Laboratory Science (AREA)
- Hematology (AREA)
- Dispersion Chemistry (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
Claims (31)
1. Способ, включающий:
реакцию на проточной ячейке первого раствора и отличающегося от него второго раствора, проводимую посредством протекания первого раствора по массиву сайтов амплификации, находящихся на проточной ячейке, и затем посредством протекания второго раствора по массиву сайтов амплификации;
где первый раствор включает совокупность нуклеиновых кислот-мишеней и первую смесь реагентов, которая включает нуклеозидтрифосфаты (НТФ) и один или более ферментов репликации, причем находящиеся в первом растворе нуклеиновые кислоты-мишени переносятся к сайтам амплификации и связываются с сайтами амплификации со скоростью переноса, и под действием первой смеси реагентов происходит амплификация нуклеиновых кислот-мишеней, которые прикреплены к сайтам амплификации, в результате чего получают клональные популяции ампликонов, полученных из соответствующих нуклеиновых кислот-мишеней, и при этом ампликоны образуются со скоростью амплификации, которая превышает скорость переноса;
и второй раствор включает вторую смесь реагентов и не содержит нуклеиновых кислот-мишеней, причем второй раствор предназначен для увеличения количества ампликонов в клональных популяциях, находящихся на сайтах амплификации.
2. Способ по п. 1, в котором вторая смесь реагентов включает НТФ и один или более ферментов репликации первой смеси реагентов.
3. Способ по п. 1, в котором проточная ячейка включает совокупность праймеров, присоединенных к проточной ячейке в сайтах амплификации, и в проточной ячейке первый раствор вступает в реакцию связывания нуклеиновых кислот-мишеней и ампликонов с первой подгруппой праймеров, и также в проточной ячейке второй раствор вступает в реакцию образования дополнительных ампликонов и связывания дополнительных ампликонов с по меньшей мере некоторыми праймерами, содержащимися в подгруппе праймеров, доступных для взаимодействия и отличающихся от праймеров первой подгруппы.
4. Способ по п. 1, дополнительно включающий удаление первого раствора из проточной ячейки перед пропусканием второго раствора по массиву сайтов амплификации, находящихся на проточной ячейке, в результате чего единственные нуклеиновые кислоты-мишени, присутствующие в проточной ячейке во время протекания второго раствора по массиву сайтов амплификации, связаны с проточной ячейкой и не представляют собой нуклеиновые кислоты-мишени, свободно перемещаются в первом растворе.
5. Способ по п. 1, в котором массив сайтов амплификации расположен на поверхности проточной ячейки, и первый раствор пропускают через впускное отверстие проточной ячейки по поверхности проточной ячейки, а затем второй раствор пропускают через впускное отверстие по поверхности проточной ячейки.
6. Способ по п. 1, в котором проточная ячейка включает совокупность праймеров, присоединенных к проточной ячейке в сайтах амплификации, и по меньшей мере некоторые из праймеров связываются с нуклеиновыми кислотами-мишенями, находящимися в первом растворе, под воздействием первого раствора, протекающего по массиву сайтов амплификации, после чего протекание второго раствора, который не содержит нуклеиновых кислот-мишеней, по массиву сайтов амплификации не приводит к дополнительному связыванию праймеров с нуклеиновыми кислотами-мишенями.
7. Способ по п. 1, в котором нуклеиновые кислоты-мишени пропускают по массиву сайтов амплификации, находящихся на проточной ячейке, только в первом растворе.
8. Способ по п. 1, в котором вторая смесь реагентов включает НТФ и полимеразу.
9. Способ по п. 1, в котором вторая смесь реагентов включает один или более из следующих ферментов: геликазу и рекомбиназу.
10. Способ по п. 1, в котором вторая смесь реагентов включает праймер, содержащий по меньшей мере одну из следующих последовательностей: последовательность праймера Р5 или последовательность праймера Р7.
11. Способ по п. 1, в котором сайты амплификации представляют собой лунки на поверхности проточной ячейки, где лунки отделены друг от друга промежуточными участками на поверхности.
12. Способ по п. 1, дополнительно включающий регулирование скорости переноса нуклеиновых кислот-мишеней к сайтам амплификации с помощью одного или более следующих воздействий: регулирования концентрации нуклеиновых кислот-мишеней в первом растворе, регулирования вязкости первого раствора, регулирования среднего размера нуклеиновых кислот-мишеней и наличия или отсутствия реагента фазового исключения в первом растворе.
13. Способ по п. 1, дополнительно включающий регулирование скорости амплификации нуклеиновых кислот-мишеней с помощью одного или более следующих воздействий: регулирования концентрации НТФ в первой смеси реагентов, регулирования концентрации одного или более ферментов репликации в первой смеси реагентов и регулирования температуры на сайтах амплификации.
14. Способ по п. 1, в котором первый раствор и второй раствор пропускают по массиву сайтов амплификации в изотермических условиях.
15. Жидкостная система, включающая:
распределитель реагентов, включающий по меньшей мере один клапан, находящийся в гидравлическом взаимодействии с впускным отверстием проточной ячейки, которая включает массив сайтов амплификации, где распределитель реагентов дополнительно включает совокупность каналов, соединяющих посредством гидравлического взаимодействия по меньшей мере один клапан и соответствующие резервуары для реагентов; и
контроллер, включающий один или более процессоров, где контроллер предназначен для управления по меньшей мере одним клапаном и насосом, направляющими первый раствор через впускное отверстие по массиву сайтов амплификации, находящихся на проточной ячейке, и затем направляющими второй, отличающийся от первого раствор через впускное отверстие по массиву сайтов амплификации, находящихся на проточной ячейке;
где первый раствор включает совокупность нуклеиновых кислот-мишеней и первую смесь реагентов, которая включает нуклеозидтрифосфаты (НТФ) и один или более ферментов репликации; количество нуклеиновых кислот-мишеней в первом растворе превышает количество сайтов амплификации в массиве; первый раствор вступает на проточной ячейке в реакцию, приводящую к образованию на сайтах амплификации клональных популяций ампликонов, полученных из соответствующих нуклеиновых кислот-мишеней; находящиеся в первом растворе нуклеиновые кислоты-мишени переносятся к сайтам амплификации и связываются с сайтами амплификации со скоростью переноса, и под действием первой смеси реагентов происходит амплификация нуклеиновых кислот-мишеней, которые прикреплены к сайтам амплификации, что приводит к образованию ампликонов со скоростью амплификации, которая превышает скорость переноса;
при этом второй раствор включает вторую смесь реагентов и не содержит нуклеиновых кислот-мишеней, и второй раствор вступает на проточной ячейке в реакцию, приводящую к увеличению количества ампликонов в клональных популяциях ампликонов, находящихся на сайтах амплификации.
16. Жидкостная система по п. 15, в которой вторая смесь реагентов имеет такой же состав, что и первая смесь реагентов.
17. Жидкостная система по п. 15, в которой контроллер предназначен для управления по меньшей мере одним клапаном и насосом, с помощью которых производят смешивание анализируемой матрицы, которая включает нуклеиновые кислоты-мишени, с первой смесью реагентов с образованием первого раствора, и контроллер также предназначен для управления по меньшей мере одним клапаном и насосом, с помощью которых получают второй раствор путем смешивания друг с другом второй смеси реагентов, в которую не добавляют анализируемой матрицы.
18. Жидкостная система по п. 15, в которой контроллер предназначен для управления по меньшей мере одним клапаном и насосом, с помощью которых перед пропусканием второго раствора по массиву сайтов амплификации, находящихся на проточной ячейке, из проточной ячейки удаляют первый раствор, в результате чего единственные нуклеиновые кислоты-мишени, присутствующие в проточной ячейке во время протекания второго раствора по массиву сайтов амплификации, связаны с проточной ячейкой, а не свободно перемещаются в первом растворе.
19. Способ, включающий:
смешивание в резервуаре первой смеси реагентов с таким количеством нуклеиновых кислот-мишеней, которое подходит для получения первого раствора, причем первая смесь реагентов включает нуклеозидтрифосфаты (НТФ) и один или более ферментов репликации;
течение первого раствора из резервуара по массиву сайтов амплификации, находящихся на проточной ячейке, и при этом находящиеся в первом растворе нуклеиновые кислоты-мишени переносятся к сайтам амплификации и связываются с сайтами амплификации со скоростью переноса, причем под действием первой смеси реагентов происходит амплификация нуклеиновых кислот-мишеней, которые прикреплены к сайтам амплификации, что приводит к образованию клональных популяций ампликонов, полученных из соответствующих нуклеиновых кислот-мишеней, где ампликоны образуются со скоростью амплификации, которая превышает скорость переноса;
после вытекания первого раствора из резервуара, смешивание второй смеси реагентов в резервуаре без добавления в резервуар дополнительного количества нуклеиновых кислот-мишеней, что приводит к получению второго раствора, где вторая смесь реагентов включает добавочные количества свежих НТФ и один или более ферментов репликации; и
протекание второго раствора из резервуара по массиву сайтов амплификации, находящихся на проточной ячейке, где вторая смесь реагентов вступает в реакцию с ампликонами, что приводит к повышению количества ампликонов в клональных популяциях, находящихся на сайтах амплификации.
20. Способ по п. 19, в котором как первая смесь реагентов, так и вторая смесь реагентов включает буферный компонент, причем вторая смесь реагентов включает большее количество буферного компонента, чем первая смесь реагентов, для компенсации не добавленного во второй раствор дополнительного количества нуклеиновых кислот-мишеней.
Applications Claiming Priority (5)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201762442680P | 2017-01-05 | 2017-01-05 | |
| US62/442,680 | 2017-01-05 | ||
| GB1704754.9 | 2017-03-24 | ||
| GBGB1704754.9A GB201704754D0 (en) | 2017-01-05 | 2017-03-24 | Kinetic exclusion amplification of nucleic acid libraries |
| PCT/US2017/066751 WO2018128777A1 (en) | 2017-01-05 | 2017-12-15 | Kinetic exclusion amplification of nucleic acid libraries |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2019116874A true RU2019116874A (ru) | 2021-02-05 |
| RU2019116874A3 RU2019116874A3 (ru) | 2021-02-05 |
| RU2759690C2 RU2759690C2 (ru) | 2021-11-16 |
Family
ID=58688040
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2019116874A RU2759690C2 (ru) | 2017-01-05 | 2017-12-15 | Амплификация библиотек нуклеиновых кислот с применением кинетического исключения |
Country Status (16)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US10808277B2 (ru) |
| EP (1) | EP3565901B1 (ru) |
| JP (2) | JP7022754B2 (ru) |
| KR (1) | KR102292759B1 (ru) |
| CN (1) | CN110268070A (ru) |
| AU (2) | AU2017390190A1 (ru) |
| BR (1) | BR112019012497A2 (ru) |
| CA (1) | CA3046028C (ru) |
| ES (1) | ES3030504T3 (ru) |
| GB (1) | GB201704754D0 (ru) |
| IL (1) | IL267742B2 (ru) |
| MX (2) | MX392656B (ru) |
| MY (2) | MY200303A (ru) |
| RU (1) | RU2759690C2 (ru) |
| TW (1) | TWI776830B (ru) |
| WO (1) | WO2018128777A1 (ru) |
Families Citing this family (18)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US11219570B2 (en) | 2018-03-26 | 2022-01-11 | Augustine Biomedical + Design, LLC | Relocation module and methods for surgical equipment |
| US11291602B2 (en) | 2018-03-26 | 2022-04-05 | Augustine Biomedical + Design, LLC | Relocation module and methods for surgical equipment |
| US11432982B2 (en) | 2018-03-26 | 2022-09-06 | Augustine Biomedical + Design, LLC | Relocation module and methods for surgical equipment |
| US10507153B2 (en) | 2018-03-26 | 2019-12-17 | Augustine Biomedical + Design, LLC | Relocation modules and methods for surgical field |
| US11426318B2 (en) | 2020-05-20 | 2022-08-30 | Augustine Biomedical + Design, LLC | Medical module including automated dose-response record system |
| US10869800B2 (en) | 2018-03-26 | 2020-12-22 | Augustine Biomedical + Design, LLC | Relocation module and methods for surgical equipment |
| US11160710B1 (en) | 2020-05-20 | 2021-11-02 | Augustine Biomedical + Design, LLC | Relocation module and methods for surgical equipment |
| CN112689751A (zh) * | 2019-05-31 | 2021-04-20 | 伊鲁米那股份有限公司 | 具有一个或更多个屏障特征的流通池 |
| TWI860366B (zh) | 2019-06-19 | 2024-11-01 | 美商伊路米納有限公司 | 儀器中的試劑交換 |
| FI3931355T3 (fi) * | 2019-12-02 | 2023-04-26 | Illumina Cambridge Ltd | Genomisen dna:n amplifioitujen säilyneen vierekkäisyyden kirjastofragmenttien aikaperusteinen klusterikuvaus |
| WO2021168097A1 (en) * | 2020-02-19 | 2021-08-26 | Genapsys, Inc. | Methods and systems for nucleic acid processing |
| EP4164784B1 (en) * | 2020-06-16 | 2025-06-25 | DNA Script | Method for enzymatic polynucleotide synthesis |
| US11913067B2 (en) * | 2020-09-14 | 2024-02-27 | Illumina, Inc. | Compositions and methods for amplifying polynucleotides |
| CN114517145A (zh) * | 2020-11-20 | 2022-05-20 | 京东方科技集团股份有限公司 | 生物分子捕获机构和微流控芯片 |
| IL299526A (en) | 2021-02-02 | 2023-02-01 | Illumina Inc | Gasket assemblies and related systems and methods |
| US20250333786A1 (en) * | 2022-06-18 | 2025-10-30 | Nanogami GmbH | Methods for single cell sequencing and error rate reduction |
| CN117542391A (zh) * | 2022-08-01 | 2024-02-09 | 上海交通大学 | 一种数据存储介质及其应用 |
| US20240110221A1 (en) * | 2022-09-30 | 2024-04-04 | Illumina, Inc. | Methods of modulating clustering kinetics |
Family Cites Families (85)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| GB8810400D0 (en) | 1988-05-03 | 1988-06-08 | Southern E | Analysing polynucleotide sequences |
| US5130238A (en) | 1988-06-24 | 1992-07-14 | Cangene Corporation | Enhanced nucleic acid amplification process |
| WO1991006678A1 (en) | 1989-10-26 | 1991-05-16 | Sri International | Dna sequencing |
| US5223414A (en) | 1990-05-07 | 1993-06-29 | Sri International | Process for nucleic acid hybridization and amplification |
| US5455166A (en) | 1991-01-31 | 1995-10-03 | Becton, Dickinson And Company | Strand displacement amplification |
| US5556773A (en) | 1993-08-06 | 1996-09-17 | Yourno; Joseph | Method and apparatus for nested polymerase chain reaction (PCR) with single closed reaction tubes |
| JPH09510351A (ja) | 1994-03-16 | 1997-10-21 | ジェン−プローブ・インコーポレイテッド | 等温鎖置換核酸増幅法 |
| US5552278A (en) | 1994-04-04 | 1996-09-03 | Spectragen, Inc. | DNA sequencing by stepwise ligation and cleavage |
| US5641658A (en) | 1994-08-03 | 1997-06-24 | Mosaic Technologies, Inc. | Method for performing amplification of nucleic acid with two primers bound to a single solid support |
| US5750341A (en) | 1995-04-17 | 1998-05-12 | Lynx Therapeutics, Inc. | DNA sequencing by parallel oligonucleotide extensions |
| GB9620209D0 (en) | 1996-09-27 | 1996-11-13 | Cemu Bioteknik Ab | Method of sequencing DNA |
| GB9626815D0 (en) | 1996-12-23 | 1997-02-12 | Cemu Bioteknik Ab | Method of sequencing DNA |
| US6327410B1 (en) | 1997-03-14 | 2001-12-04 | The Trustees Of Tufts College | Target analyte sensors utilizing Microspheres |
| US6023540A (en) | 1997-03-14 | 2000-02-08 | Trustees Of Tufts College | Fiber optic sensor with encoded microspheres |
| EP1498494A3 (en) | 1997-04-01 | 2007-06-20 | Solexa Ltd. | Method of nucleic acid sequencing |
| US6391622B1 (en) | 1997-04-04 | 2002-05-21 | Caliper Technologies Corp. | Closed-loop biochemical analyzers |
| US6511803B1 (en) | 1997-10-10 | 2003-01-28 | President And Fellows Of Harvard College | Replica amplification of nucleic acid arrays |
| AR021833A1 (es) | 1998-09-30 | 2002-08-07 | Applied Research Systems | Metodos de amplificacion y secuenciacion de acido nucleico |
| US20050244870A1 (en) | 1999-04-20 | 2005-11-03 | Illumina, Inc. | Nucleic acid sequencing using microsphere arrays |
| HK1046156B (en) | 1999-04-20 | 2009-01-23 | Illumina, Inc. | Detection of nucleic acid reactions on bead arrays |
| US6355431B1 (en) | 1999-04-20 | 2002-03-12 | Illumina, Inc. | Detection of nucleic acid amplification reactions using bead arrays |
| US20060275782A1 (en) | 1999-04-20 | 2006-12-07 | Illumina, Inc. | Detection of nucleic acid reactions on bead arrays |
| US7244559B2 (en) | 1999-09-16 | 2007-07-17 | 454 Life Sciences Corporation | Method of sequencing a nucleic acid |
| US6274320B1 (en) | 1999-09-16 | 2001-08-14 | Curagen Corporation | Method of sequencing a nucleic acid |
| EP1259643B1 (en) | 2000-02-07 | 2008-10-15 | Illumina, Inc. | Nucleic acid detection methods using universal priming |
| US6913884B2 (en) | 2001-08-16 | 2005-07-05 | Illumina, Inc. | Compositions and methods for repetitive use of genomic DNA |
| US7582420B2 (en) | 2001-07-12 | 2009-09-01 | Illumina, Inc. | Multiplex nucleic acid reactions |
| US6770441B2 (en) | 2000-02-10 | 2004-08-03 | Illumina, Inc. | Array compositions and methods of making same |
| JP2004513619A (ja) | 2000-07-07 | 2004-05-13 | ヴィジゲン バイオテクノロジーズ インコーポレイテッド | リアルタイム配列決定 |
| WO2002044425A2 (en) | 2000-12-01 | 2002-06-06 | Visigen Biotechnologies, Inc. | Enzymatic nucleic acid synthesis: compositions and methods for altering monomer incorporation fidelity |
| AR031640A1 (es) | 2000-12-08 | 2003-09-24 | Applied Research Systems | Amplificacion isotermica de acidos nucleicos en un soporte solido |
| GB0127564D0 (en) | 2001-11-16 | 2002-01-09 | Medical Res Council | Emulsion compositions |
| US7057026B2 (en) | 2001-12-04 | 2006-06-06 | Solexa Limited | Labelled nucleotides |
| US7399590B2 (en) | 2002-02-21 | 2008-07-15 | Asm Scientific, Inc. | Recombinase polymerase amplification |
| US20040002090A1 (en) | 2002-03-05 | 2004-01-01 | Pascal Mayer | Methods for detecting genome-wide sequence variations associated with a phenotype |
| SI3363809T1 (sl) | 2002-08-23 | 2020-08-31 | Illumina Cambridge Limited | Modificirani nukleotidi za polinukleotidno sekvenciranje |
| US7595883B1 (en) | 2002-09-16 | 2009-09-29 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Biological analysis arrangement and approach therefor |
| AU2003272438B2 (en) | 2002-09-20 | 2009-04-02 | New England Biolabs, Inc. | Helicase dependent amplification of nucleic acids |
| CA2513535C (en) | 2003-01-29 | 2012-06-12 | 454 Corporation | Bead emulsion nucleic acid amplification |
| WO2005003304A2 (en) | 2003-06-20 | 2005-01-13 | Illumina, Inc. | Methods and compositions for whole genome amplification and genotyping |
| WO2005010145A2 (en) | 2003-07-05 | 2005-02-03 | The Johns Hopkins University | Method and compositions for detection and enumeration of genetic variations |
| JP2007525571A (ja) | 2004-01-07 | 2007-09-06 | ソレクサ リミテッド | 修飾分子アレイ |
| WO2006044078A2 (en) | 2004-09-17 | 2006-04-27 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Apparatus and method for analysis of molecules |
| EP1907571B1 (en) | 2005-06-15 | 2017-04-26 | Complete Genomics Inc. | Nucleic acid analysis by random mixtures of non-overlapping fragments |
| US7405281B2 (en) | 2005-09-29 | 2008-07-29 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Fluorescent nucleotide analogs and uses therefor |
| GB0522310D0 (en) | 2005-11-01 | 2005-12-07 | Solexa Ltd | Methods of preparing libraries of template polynucleotides |
| EP2021503A1 (en) | 2006-03-17 | 2009-02-11 | Solexa Ltd. | Isothermal methods for creating clonal single molecule arrays |
| SG170802A1 (en) | 2006-03-31 | 2011-05-30 | Solexa Inc | Systems and devices for sequence by synthesis analysis |
| EP2032686B1 (en) | 2006-06-23 | 2022-01-12 | Illumina, Inc. | System and method for creation of dna cluster arrays |
| AU2007309504B2 (en) | 2006-10-23 | 2012-09-13 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Polymerase enzymes and reagents for enhanced nucleic acid sequencing |
| AU2007334393A1 (en) | 2006-12-14 | 2008-06-26 | Life Technologies Corporation | Methods and apparatus for measuring analytes using large scale FET arrays |
| US8349167B2 (en) | 2006-12-14 | 2013-01-08 | Life Technologies Corporation | Methods and apparatus for detecting molecular interactions using FET arrays |
| US8262900B2 (en) | 2006-12-14 | 2012-09-11 | Life Technologies Corporation | Methods and apparatus for measuring analytes using large scale FET arrays |
| WO2008093098A2 (en) | 2007-02-02 | 2008-08-07 | Illumina Cambridge Limited | Methods for indexing samples and sequencing multiple nucleotide templates |
| BRPI0813718A2 (pt) | 2007-07-13 | 2014-12-30 | Univ Leland Stanford Junior | Método e aparelho que utilizam um campo elétrico para ensaios biológicos aperfeiçoados |
| US20090226975A1 (en) | 2008-03-10 | 2009-09-10 | Illumina, Inc. | Constant cluster seeding |
| CN107385040B (zh) * | 2008-04-03 | 2022-02-15 | 艾瑞普特公司 | 用于扩增多个靶标的扩增子拯救多重聚合酶链式反应 |
| US20100035252A1 (en) | 2008-08-08 | 2010-02-11 | Ion Torrent Systems Incorporated | Methods for sequencing individual nucleic acids under tension |
| US20100137143A1 (en) | 2008-10-22 | 2010-06-03 | Ion Torrent Systems Incorporated | Methods and apparatus for measuring analytes |
| AP2016009410A0 (en) | 2008-12-19 | 2016-08-31 | Xyleco Inc | Processing biomass |
| US8716467B2 (en) | 2010-03-03 | 2014-05-06 | Gen9, Inc. | Methods and devices for nucleic acid synthesis |
| US20110312759A1 (en) * | 2010-06-17 | 2011-12-22 | Geneasys Pty Ltd | Genetic analysis loc with reagent reservoir |
| US9353412B2 (en) | 2010-06-18 | 2016-05-31 | Illumina, Inc. | Conformational probes and methods for sequencing nucleic acids |
| KR20130113447A (ko) * | 2010-09-24 | 2013-10-15 | 더 보드 어브 트러스티스 어브 더 리랜드 스탠포드 주니어 유니버시티 | 고정된 프라이머들을 이용하여 표적 dna의 직접적인 캡쳐, 증폭 및 서열화 |
| US8753816B2 (en) | 2010-10-26 | 2014-06-17 | Illumina, Inc. | Sequencing methods |
| EP3928867B1 (en) | 2010-10-27 | 2024-07-17 | Illumina, Inc. | Microdevices and biosensor cartridges for biological or chemical analysis and systems and methods for the same |
| US8951781B2 (en) | 2011-01-10 | 2015-02-10 | Illumina, Inc. | Systems, methods, and apparatuses to image a sample for biological or chemical analysis |
| WO2012106072A2 (en) * | 2011-02-03 | 2012-08-09 | Illumina, Inc. | Methods for minimizing sequence specific bias |
| EP2718465B1 (en) | 2011-06-09 | 2022-04-13 | Illumina, Inc. | Method of making an analyte array |
| US10378051B2 (en) | 2011-09-29 | 2019-08-13 | Illumina Cambridge Limited | Continuous extension and deblocking in reactions for nucleic acids synthesis and sequencing |
| US8778849B2 (en) * | 2011-10-28 | 2014-07-15 | Illumina, Inc. | Microarray fabrication system and method |
| US9279154B2 (en) | 2011-12-21 | 2016-03-08 | Illumina, Inc. | Apparatus and methods for kinetic analysis and determination of nucleic acid sequences |
| US9803239B2 (en) * | 2012-03-29 | 2017-10-31 | Complete Genomics, Inc. | Flow cells for high density array chips |
| US9012022B2 (en) | 2012-06-08 | 2015-04-21 | Illumina, Inc. | Polymer coatings |
| US8895249B2 (en) * | 2012-06-15 | 2014-11-25 | Illumina, Inc. | Kinetic exclusion amplification of nucleic acid libraries |
| US9512422B2 (en) | 2013-02-26 | 2016-12-06 | Illumina, Inc. | Gel patterned surfaces |
| PT3030645T (pt) | 2013-08-08 | 2023-02-16 | Illumina Inc | Sistema de fluidos para entrega de reagente a uma célula de fluxo |
| US9944924B2 (en) | 2014-01-16 | 2018-04-17 | Illumina, Inc. | Polynucleotide modification on solid support |
| EP2921556A1 (en) | 2014-03-21 | 2015-09-23 | Lexogen GmbH | Copy number preserving RNA analysis method |
| EP3143161B1 (en) | 2014-05-16 | 2021-04-21 | Illumina, Inc. | Nucleic acid synthesis techniques |
| CA3172086A1 (en) | 2014-06-13 | 2015-12-17 | Illumina Cambridge Limited | Methods and compositions for preparing sequencing libraries |
| CN107208075B (zh) | 2014-09-29 | 2021-08-24 | 伊卢米纳剑桥有限公司 | 重组酶突变体 |
| CN107208019B (zh) | 2014-11-11 | 2021-01-01 | 伊鲁米纳剑桥有限公司 | 用于核酸单克隆簇的产生和测序的方法和阵列 |
| DK3234187T3 (da) | 2014-12-15 | 2021-05-25 | Illumina Inc | Fremgangsmåde til enkeltmolekyleanbringelse på et substrat |
| CA2985545C (en) * | 2015-05-29 | 2021-02-09 | Illumina Cambridge Limited | Enhanced utilization of surface primers in clusters |
-
2017
- 2017-03-24 GB GBGB1704754.9A patent/GB201704754D0/en not_active Ceased
- 2017-12-07 TW TW106142960A patent/TWI776830B/zh active
- 2017-12-15 MY MYPI2022004910A patent/MY200303A/en unknown
- 2017-12-15 MY MYPI2019003188A patent/MY193199A/en unknown
- 2017-12-15 ES ES17890676T patent/ES3030504T3/es active Active
- 2017-12-15 KR KR1020197022875A patent/KR102292759B1/ko active Active
- 2017-12-15 MX MX2019006365A patent/MX392656B/es unknown
- 2017-12-15 US US15/844,051 patent/US10808277B2/en active Active
- 2017-12-15 EP EP17890676.4A patent/EP3565901B1/en active Active
- 2017-12-15 IL IL267742A patent/IL267742B2/en unknown
- 2017-12-15 BR BR112019012497A patent/BR112019012497A2/pt active Search and Examination
- 2017-12-15 RU RU2019116874A patent/RU2759690C2/ru active
- 2017-12-15 WO PCT/US2017/066751 patent/WO2018128777A1/en not_active Ceased
- 2017-12-15 AU AU2017390190A patent/AU2017390190A1/en not_active Abandoned
- 2017-12-15 CA CA3046028A patent/CA3046028C/en active Active
- 2017-12-15 CN CN201780086213.2A patent/CN110268070A/zh active Pending
- 2017-12-15 JP JP2019535305A patent/JP7022754B2/ja active Active
-
2019
- 2019-05-30 MX MX2022006265A patent/MX2022006265A/es unknown
-
2020
- 2020-09-25 US US17/033,133 patent/US11661627B2/en active Active
-
2021
- 2021-10-12 AU AU2021250878A patent/AU2021250878B2/en active Active
- 2021-10-28 JP JP2021176818A patent/JP2022033726A/ja active Pending
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2019116874A (ru) | Амплификация библиотек нуклеиновых кислот с применением кинетического исключения | |
| JP2022033726A5 (ru) | ||
| US20240309425A1 (en) | Multi-primer amplification method for barcoding of target nucleic acids | |
| Hyde et al. | General principles and strategies for salting-out informed by the Hofmeister series | |
| US9790546B2 (en) | Microfluidic chip, device and system for the generation of aqueous droplets in emulsion oil for nucleic acid amplification | |
| US20140273101A1 (en) | Nucleic acid amplification reaction device and nucleic acid amplification method | |
| CN103343092A (zh) | 基于矿物油饱和pdms材料的数字pcr芯片的制作方法 | |
| US20200086321A1 (en) | Method and Device for Encapsulating Cell in Liquid Droplet for Single-Cell Analysis | |
| JP2017506877A5 (ru) | ||
| US11117113B2 (en) | High-level multiplex amplification | |
| RU2019108270A (ru) | Способы дискретной амплификации полного генома | |
| JP2013527769A5 (ru) | ||
| CN106754245A (zh) | 基于海藻胶液滴的数字pcr芯片及其应用 | |
| KR102389800B1 (ko) | 액체 순환 경로를 조절할 수 있는 핵산 증폭 반응 튜브 | |
| WO2016131030A4 (en) | Methods for highly parallel and accurate measurement of nucleic acids | |
| JP2012522517A5 (ru) | ||
| EP2265375A1 (en) | Integrated microfluidic device and methods | |
| WO2013028643A1 (en) | Preparation of polynucleotides on a solid substrate for sequencing | |
| RU2018144299A (ru) | Способ амплификации кольцевой днк | |
| CN109678727A (zh) | 一种微通道硝化反应合成2-乙基-5-硝基苯胺的方法 | |
| Li et al. | Precise definition of starting time by capillary-based chemical initiation of digital isothermal DNA amplification | |
| EP2947156A1 (en) | Optimization of sequencing reactions | |
| US10858696B2 (en) | Methods of reducing density-dependent GC bias in amplification | |
| US20060035243A1 (en) | Multi-step bioassays on modular microfluidic application platforms | |
| DE102006027675B4 (de) | Verfahren zur Bestimmung der Konzentration von Nukleinsäuren |