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JP6599497B2 - アンドロゲン受容体発現の調節 - Google Patents

アンドロゲン受容体発現の調節 Download PDF

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Description

配列表
本出願は、電子形式の配列表とともに出願されている。配列表は、ほぼ５５６ＫＢのサイズである、200157WOSEQ.txt と題したファイル（２０１３年１０月１日作成）として提供される。電子形式の配列表の情報は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
技術分野
特定の態様が、細胞中のアンドロゲン受容体レベルを阻害するためにヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向される化合物及び組成物へ向けられ、これらは、癌を治療する方法と癌細胞の成長又は増殖を阻害する方法に有用であり得る。
アンドロゲン受容体（ＡＲ）は、核内受容体のスーパーファミリーに属して、そのホルモンリガンドであるアンドロゲン、テストステロン、又はＤＨＴへ結合することによって活性化される。細胞質中のホルモンリガンドへ結合するとすぐに、アンドロゲン受容体は、核へ移動して、そこでＤＮＡと結合して、前立腺特異抗原（ＰＳＡ）やＴＭＰＲＳＳ２のようないくつかの標的遺伝子の発現を調節する転写因子として機能する。Knudsen et al. (Trends Endocrinol Metab 21: 315-24, 2010)，Bennett et al. (Int J Biochem Cell Biol. 42: 813-827, 201)。
アンドロゲン受容体（ＡＲ）シグナル伝達は、前立腺癌細胞に必須の生存経路であって、「化学的去勢」としても知られるアンドロゲン除去療法（ＡＤＴ）は、循環アンドロゲンレベルを低下させてそれによってＡＲ活性を阻害する、ホルモン感受性でアンドロゲン依存性の前立腺癌に対する第一選択の治療戦略である。大多数の患者が初めはＡＤＴへ応答するが、ほとんどの患者が結局は、テストステロンが去勢レベルであっても疾患が進行する去勢抵抗性を発現する。この種の癌は、去勢抵抗性前立腺癌（ＣＲＰＣ）として知られている。去勢（去勢術）抵抗性の発現の根底にはいくつかの機序があって、低レベルのアンドロゲンに対しても細胞を感受性にし得るＡＲタンパク質の発現の増加、トランス活性化を変化させるか又は代わりのリガンドに対してＡＲを感受性にすることを可能にするＡＲ突然変異、及び（リガンド結合ドメインを欠損するが、それでもリガンド刺激の非存在下で腫瘍成長を促進するように作用し得る）オルタナティブスプライシング型（alternatively spliced forms）のＡＲの出現が含まれる。加えて、前立腺腫瘍は、それ自身のアンドロゲンを合成して、それによってＡＲを活性化するのに利用可能な局所の腫瘍内テストステロンレベルを増加させる場合もある。
アンドロゲン受容体（ＡＲ）シグナル伝達は、前立腺癌細胞に必須の生存経路であって、アンドロゲン除去療法（ＡＤＴ）は、依然として、局所的に進行した転移性の疾患を担う患者にとって第一の治療法である。大多数の患者が初めはＡＤＴへ応答するが、ほとんどの患者が結局は、テストステロンが去勢レベルであっても疾患が進行する去勢抵抗性を発現する。この種の癌は、去勢抵抗性前立腺癌（ＣＲＰＣ）として知られている（Karantos et al., Oncogene advance online: 1-13, 2013）。去勢抵抗性の発現の根底にはいくつかの機序があって、低レベルのアンドロゲンに対しても細胞を感受性にし得るＡＲタンパク質の発現の増加（Gregory et al., Cancer Res 61: 2892-2898, 2001; Linja et al., Cancer Res 61: 3550-3555, 2001）、トランス活性化を変化させるか又は代わりのリガンドに対してＡＲを感受性にすることを可能にするＡＲ突然変異（Scher et al., J Clin Oncol 23: 8253-8261, 2005）、及び（リガンド結合ドメインを欠損するが、それでもリガンド刺激の非存在下で腫瘍増殖を促進するように作用し得る）オルタナティブスプライシング型のＡＲの出現（Yingming et al., Cancer Res 73: 483-489, 2013）が含まれる。加えて、前立腺腫瘍は、それ自身のアンドロゲンを合成して、それによってＡＲを活性化するのに利用可能な局所の腫瘍内テストステロンレベルを増加させる場合もある（Attard et al., Cancer Cell 16: 458-462, 2009）。
去勢抵抗性前立腺癌ではアンドロゲン受容体が依然として活動的であるという事実は、アンドロゲンリガンドの産生を阻害するか又はこれらリガンドのＡＲに対する作用を妨害する新しい薬剤の開発をもたらした。これらの新しい薬剤には、１７−α−ヒドロキシラーゼ／１７，２０−リアーゼ（ＣＹＰ１７）活性を阻害して、副腎によって合成される残留アンドロゲンと前立腺腫瘍それ自体の低下をもたらす酢酸アビラテロン（deBono et al., N Engl J Med 364: 1995-2006, 2011）と、アンドロゲンリガンドがＡＲへ結合し、核へ移動して、ＤＮＡへ結合することを妨げるエンザルタミド（Scher et al., N Engl J Med 367:1187-1197, 2012）が含まれる。いくつかの他のアンドロゲン合成阻害剤又はアンドロゲン受容体ブロッカーが前臨床開発又は臨床開発下にあって、例えば、ＡＲＮ５０９、ＯＤＭ２０１、ＴＯＫ００１、ＶＴ４６４が含まれる。
エンザルタミドやアビラテロンのような薬剤のＣＲＰＣにおける活性は非常に励みになるが、いずれもすべての患者において作用するわけではなくて、いずれにも、上記の機序によるＡＲの再活性化を介したさらなる抵抗性の発現が付随する（Yingming et al., Cancer Res 73:483-489, 2013）。従って、ＣＲＰＣの治療への代わりの療法、特に、例えば、野生型、突然変異型、及びスプライス変異体のＡＲが含まれるすべての形態のＡＲを除去する、及び／又はその活性を阻害することができる療法を明確にすることへの不断のニーズがある。
本発明は、その設計と作用形式（ＡＲ ＲＮＡ標的と塩基対合して、ＲＮアーゼＨ［ＤＮＡ／ＲＮＡ二重鎖中のＲＮＡを破壊する酵素］によるその破壊に媒介する）によってＡＲの主形態を阻害することを目的とする、アンチセンスオリゴヌクレオチドを提供する。このアンチセンスオリゴヌクレオチドは、ＡＲ ｍＲＮＡの適正な領域に標的指向することによって、アンドロゲン受容体タンパク質の主形態（全長、スプライス変異体、及び突然変異型）の阻害をもたらして、それ故に、ＣＲＰＣのある患者の治療に適していよう。
前立腺癌とは別に、ＡＲは、乳癌のような他の腫瘍の進行における１つの因子としても示唆されている。乳癌では、ＥＲ陽性でもある腫瘍の７０〜８０％において、そしてトリプルネガティブ（ＥＲ、ＰＲ、及びＨＥＲ２の発現無し）として知られる１２％の症例においてＡＲが発現されている（Hickey et al., Molecular Endocrinology 26: 1252-1267, 2012）。前臨床試験において、アンドロゲン受容体アンタゴニストのビカルタミドは、乳癌細胞において試験管内で（in vitro）抗増殖応答を引き起こして、これは、Ｐｉ３Ｋ／ｍＴＯＲ阻害剤の添加によって増強される（Ni et al., Cancer Cell 20: 119-131, 2011）。第二世代の抗アンドロゲンであるエンザルタミドは、ＥＲ＋／ＡＲ＋乳癌細胞においてジヒドロテストステロン（ＤＨＴ）媒介性の増殖を阻害して、生体内の（in vivo）前臨床モデルにおいてエストロゲン刺激型乳癌腫瘍の成長を阻害するのに、タモキシフェンと同様に有効である（Cochrane et al., Cancer Res 72 (24 補遺): P2-14-02, 2012）。エンザルタミドは、ＨＥＲ２＋及びトリプルネガティブの乳癌細胞において増殖を阻害する。エストロゲン作用が低下している状況（例、長期のエストロゲン除去又はＥＲの非存在）では、ＡＲレベルが増加して、発癌性になる可能性があるらしい。このことから、トリプルネガティブ又はホルモン抵抗性乳癌の状況では、ＡＲアンタゴニストが最も良好に位置付けられる場合があることが示唆されよう（Hickey et al., Molecular Endocrinology 26: 1252-1267, 2012）。現在、乳癌に関する臨床試験では、ＡＲ標的指向療法が検討されている（ＮＣＴ００４６８７１５，ＮＣＴ０１５９７１９３，ＮＣＴ０１３８１８７４，ＮＣＴ００７５５８８６）。
ＡＲは、限定されないが、膀胱癌、卵巣癌、胃癌、肺癌、及び肝臓癌が含まれる、様々な他の腫瘍においても発現されている。前臨床データは、腫瘍細胞の増殖及び生存を促進する、乳癌での役割と同様の役割を裏付けているので、これらの腫瘍においてＡＲを遮断することは、療法上の治療利益を有する可能性がある（Chang et al., Oncogene advance online: 1-10, 2013）。
本発明で提供されるいくつかの態様は、細胞中のアンドロゲン受容体レベルを阻害するための化合物及び組成物の発見に関するが、これらは、前立腺、乳房、卵巣、胃、又は膀胱の癌のような癌を治療して、そのような癌細胞の増殖又は成長を阻害する方法に有用であり得る。
上述の一般的な記載と以下の詳細な記載は、いずれも例示で説明に他ならず、特許請求される本発明を限定するものではないことを理解されたい。本明細書において、単数形の使用には、他に具体的に述べなければ、複数形が含まれる。本明細書に使用するように、「又は」の使用は、他に述べなければ、「及び／又は」を意味する。さらに、「〜を包含して」という用語、並びに「〜が含まれる」及び「〜を含めて」のような他の形態の使用は、限定的ではない。また、「要素」又は「成分」のような用語には、他に具体的に述べなければ、１つのユニットと要素（複数）を含んでなる要素（複数）及び成分（複数）と、１より多いサブユニットを含む要素（複数）及び成分（複数）がともに含まれる。
本明細書に使用するセクション見出しは、構成目的用にすぎず、記載する主題を限定するものと解釈してはならない。本出願において引用される、限定されないが、特許、特許出願、論文、書籍、及び条約が含まれる、すべての文書又は文書の一部は、本明細書において考察される文書の一部のために、並びにその全体が参照により本明細書に明確に組み込まれる。
諸定義
特定の定義が提供されなければ、本明細書において記載される分析化学、合成有機化学、及び医薬化学に関連して利用される命名法とその手順及び技術は、当該技術分野で公知であって、普通に使用されるものである。化学合成と化学分析には、標準技術を使用してよい。許容される場合、本開示全体を通して参照される、すべての特許、特許出願、公開公報出願、及び他の公報、ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号、及び国立生物工学情報センター（ＮＣＢＩ）のようなデータベースより入手可能な関連配列情報と他のデータは、本明細書において考察される文書の一部のために、並びにその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
他に示さなければ、以下の用語は、以下の意味を有する：
「２’−Ｏ−メトキシエチル」（又は、２’−ＭＯＥ及び２’−Ｏ（ＣＨ２）２−ＯＣＨ３）は、糖環（例、フラノース環）の２’位でのＯ−メトキシエチル修飾に言及する。２’−Ｏ−メトキシエチル修飾糖は、修飾（された）糖である。
「２’−ＭＯＥヌクレオシド」（又は、２’−Ｏ−メトキシエチルヌクレオシド）は、２’−ＭＯＥ修飾糖部分を含んでなるヌクレオシドを意味する。
「２’−置換ヌクレオシド」は、フラノシル環の２’位にＨ又はＯＨ以外の置換基を含んでなるヌクレオシドを意味する。特定の態様では、２’置換ヌクレオシドに、二環式糖修飾のあるヌクレオシドが含まれる。
「３’標的部位」は、特別なアンチセンス化合物の３’端ヌクレオチドに相補的である、標的核酸のヌクレオチドに言及する。
「５’標的部位」は、特別なアンチセンス化合物の５’端ヌクレオチドに相補的である、標的核酸のヌクレオチドに言及する。
「５−メチルシトシン」は、メチル基が５’位へ付加して修飾されたシトシンを意味する。５−メチルシトシンは、修飾（された）ヌクレオ塩基である。
「約」は、数値の±７％以内を意味する。例えば、「該化合物は、アンドロゲン受容体の少なくとも約７０％の阻害に影響を及ぼした」と述べられるならば、アンドロゲン受容体レベルが６３％と７７％の範囲以内で阻害されることを意味する。
「投与」又は「投与すること」は、本発明で提供されるアンチセンス化合物を被験者へ導入してその企図される機能を発揮させる経路に言及する。使用し得る投与の経路の例には、限定されないが、皮下、静脈内、又は筋肉内の注射又は注入のような非経口投与が含まれる。
乳癌又は乳癌細胞に関する「アンドロゲン受容体陽性」は、アンドロゲン受容体を発現する乳癌又は乳癌細胞に言及する。
「動物」は、ヒト又は非ヒト動物に言及し、限定されないが、マウス、ラット、ウサギ、イヌ、ネコ、ブタ、及び非ヒト霊長動物（限定されないが、サル及びチンパンジーが含まれる）が含まれる。
「抗アンドロゲン剤」は、アンドロゲン合成阻害剤又はアンドロゲン受容体ブロッカーである、治療化合物又は薬物に言及する。
「アンチセンス活性」は、アンチセンス化合物のその標的核酸へのハイブリダイゼーションに起因する、検出可能又は測定可能なあらゆる活性を意味する。特定の態様では、アンチセンス活性が、標的核酸又はそのような標的核酸によってコードされるタンパク質の量又は発現における減少である。
「アンチセンス化合物」は、水素結合を介した標的核酸へのハイブリダイゼーションを受けることが可能であるオリゴマー化合物を意味する。アンチセンス化合物の例には、アンチセンスオリゴヌクレオチド、ｓｉＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ、ｓｓＲＮＡ、及び占有ベース化合物のような、一本鎖化合物と二本鎖化合物が含まれる。
「アンチセンス阻害」は、アンチセンス化合物の非存在下での標的核酸レベルと比較した、標的核酸に相補的なアンチセンス化合物の存在下での標的核酸レベルの低下を意味する。
「アンチセンス機序」は、標的核酸と化合物のハイブリダイゼーションが関与するあらゆる機序のことであって、ここでは、ハイブリダイゼーションの結果又は効果が標的分解又は標的占有のいずれかであって、例えば、転写又はスプライシングに関与する細胞機構の同時停止（stalling）を伴う。
「アンチセンスオリゴヌクレオチド」は、対応する標的核酸の領域又はセグメントへのハイブリダイゼーションを可能にするヌクレオ塩基配列を有する一本鎖オリゴヌクレオチ
ドを意味する。
「塩基相補性」は、アンチセンスオリゴヌクレオチドのヌクレオ塩基の、標的核酸中の対応するヌクレオ塩基との正確な塩基対合（即ち、ハイブリダイゼーション）についての能力に言及して、対応するヌクレオ塩基間のワトソン−クリック型、フーグスティーン型、又は逆フーグスティーン型の水素結合によって媒介される。
「二環式糖部分」は、４〜７員環の２つの原子を連結して第二の環を形成して二環式構造を生じる架橋を含んでなる４〜７員環（限定されないが、フラノシルが含まれる）を含んでなる修飾糖部分を意味する。特定の態様において、４〜７員環は、糖環である。特定の態様において、４〜７員環は、フラノシルである。特定のそのような態様において、架橋は、フラノシルの２’−炭素と４’−炭素を連結する。
本発明によるＬＮＡの定義内にまた含まれるのは、リボシル糖環の２’−ヒドロキシル基がその糖環の４’炭素原子へ連結して、それによってメチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）架橋を形成して二環式糖部分を形成する、ＬＮＡである。架橋は、２’酸素原子と４’炭素原子を連結するメチレン（−ＣＨ２−）基でも有り得て、これに対してはメチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）ＬＮＡという用語が使用される。さらに、エチレン架橋形成基をこの位置に有する二環式糖部分の場合は、エチレンオキシ（４’−ＣＨ２ＣＨ２−Ｏ−２’）ＬＮＡという用語が使用される。メチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）ＬＮＡの異性体であるα−Ｌ−メチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）も、本明細書に使用するように、ＬＮＡの定義内に含まれる。
「キャップ構造」又は「末端キャップ部分」は、アンチセンス化合物のいずれかの末端で取り込まれた化学修飾を意味する。
「去勢（castrate）抵抗性前立腺癌」又は「去勢術（castration）抵抗性前立腺癌」及び前立腺癌細胞は、アンドロゲン除去療法又は抗アンドロゲン剤に対する前立腺癌及び前立腺癌細胞の感受性の低下に言及する。
「ｃＥｔ」又は「拘束エチル」は、４’−炭素と２’−炭素を連結する架橋（ここでこの架橋は、式：４’−ＣＨ（ＣＨ３）−Ｏ−２’を有する）を含んでなる二環式糖部分を意味する。
「拘束エチルヌクレオシド」（又は、ｃＥｔヌクレオシド）は、４’−ＣＨ（ＣＨ３）−Ｏ−２’架橋を含んでなる二環式糖部分を含んでなるヌクレオシドを意味する。
「化学的に異なる領域」は、同じアンチセンス化合物の別の領域とは何らかの点で化学的に異なる、アンチセンス化合物の領域に言及する。例えば、２’−Ｏ−メトキシエチルヌクレオチドを有する領域は、２’−Ｏ−メトキシエチル修飾の無いヌクレオチドを有する領域とは化学的に異なる。
「キメラアンチセンス化合物」は、少なくとも２つの化学的に異なる領域を有して、それぞれの位置に複数のサブユニットを有するアンチセンス化合物を意味する。
「相補性」は、第一核酸のヌクレオ塩基と第二核酸のヌクレオ塩基の間で対合するための能力を意味する。
「〜を含む」、「〜を含む（３人称単数）」、及び「〜を含んでなる」は、陳述される工程又は要素又は工程（複数）又は要素（複数）の群の包含を含意するが、他のあらゆる
工程又は要素又は工程（複数）又は要素（複数）の群の除外を含意しないと理解されよう。
「隣接ヌクレオ塩基」は、互いにすぐ隣にあるヌクレオ塩基を意味する。
「デオキシリボヌクレオチド」は、そのヌクレオチドの糖部分の２’位に水素を有するヌクレオチドを意味する。デオキシリボヌクレオチドは、多様な置換基のいずれでも修飾されてよい。
「〜を設計すること」又は「〜ように設計された」は、選択される核酸分子と特異的にハイブリダイズするオリゴマー化合物を設計する方法に言及する。
「下流」は、核酸の３’端又はＣ末端へ向かう相対的な方向に言及する。
「効力」は、所望される効果をもたらす能力を意味する。
乳癌又は乳癌細胞に関する「エストロゲン受容体（ＥＲ）陽性」は、エストロゲン受容体（ＥＲ）を発現する乳癌又は乳癌細胞に言及する。
乳癌又は乳癌細胞に関する「エストロゲン受容体（ＥＲ）陰性」は、エストロゲン受容体（ＥＲ）を発現しない乳癌又は乳癌細胞に言及する。
「発現」には、遺伝子のコードされた情報が細胞中に存在して機能する構造へ変換される機能がすべて含まれる。そのような構造には、限定されないが、転写の産物と翻訳の産物が含まれる。
「完全に相補的な」又は「１００％相補的な」は、第一核酸の各ヌクレオ塩基が第二核酸中の相補的なヌクレオ塩基を有することを意味する。特定の態様では、第一核酸がアンチセンス化合物であって、標的核酸が第二核酸である。
「ギャップマー」は、ＲＮアーゼＨ切断を支援する複数のヌクレオシドを有する内部領域が１以上のヌクレオシドを有する外部領域の間に位置しているキメラアンチセンス化合物を意味して、ここで内部領域を含んでなるヌクレオシドは、外部領域を含んでなる単数又は複数のヌクレオシドから化学的に異なっている。内部領域は、「ギャップ」と呼ばれる場合があって、外部領域は、「ウィング」と呼ばれる場合がある。
乳癌又は乳癌細胞に関する「Ｈｅｒ２／ｎｅｕ陰性」は、Ｈｅｒ２／ｎｅｕを発現しない乳癌又は乳癌細胞に言及する。
「ハイブリダイゼーション」は、相補的な核酸分子のアニーリングを意味する。特定の態様では、相補的な核酸分子に、限定されないが、アンチセンス化合物と核酸標的が含まれる。特定の態様では、相補的な核酸分子に、限定されないが、アンチセンスオリゴヌクレオチドと核酸標的が含まれる。
「すぐ隣にある」は、すぐ隣にある要素の間に介在要素が無いことを意味する。
「個体」は、治療又は療法のために選択されるヒト又は非ヒト動物を意味する。
「引き起こす」、「阻害する」、「増強する」、「上昇させる」、「増加させる」、「減少させる」、「上方調節する」、「下方調節する」、等は、一般に、２つの状態間の定
量的な差異を示す。
「発現又は活性を阻害すること」は、発現又は活性の低下、妨害に言及して、必ずしも発現又は活性の完全な消失を示さない。
「ヌクレオシド間連結」は、ヌクレオシド間の化学結合に言及する。
「延長した」アンチセンスオリゴヌクレオチドとは、本明細書に開示するアンチセンスオリゴヌクレオチドと比べて１以上の追加のヌクレオシドを有するものである。
「連結デオキシヌクレオシド」は、リン酸エステルによって連結されてヌクレオチドを形成する、デオキシリボースによって置換された核酸塩基（Ａ、Ｇ、Ｃ、Ｔ、Ｕ）を意味する。
「連結ヌクレオシド」は、ヌクレオシド間連結によって一緒に連結した隣接ヌクレオシドを意味する。
「ミスマッチ」又は「非相補的なヌクレオ塩基」は、第一核酸のヌクレオ塩基が第二核酸又は標的核酸の対応するヌクレオ塩基と対合することが可能でない場合に言及する。
「修飾ヌクレオシド間連結」は、天然に存在するヌクレオシド間結合（即ち、ホスホジエステルヌクレオシド間結合）からの置換又はあらゆる変化に言及する。
「修飾ヌクレオ塩基」は、アデニン、シトシン、グアニン、チミジン、又はウラシル以外のあらゆるヌクレオ塩基を意味する。「非修飾ヌクレオ塩基」は、プリン塩基のアデニン（Ａ）及びグアニン（Ｇ）とピリミジン塩基のチミン（Ｔ）、シトシン（Ｃ）、及びウラシル（Ｕ）を意味する。
「修飾ヌクレオシド」は、修飾糖部分及び／又は修飾ヌクレオ塩基を独立して有するヌクレオシドを意味する。
「修飾ヌクレオチド」は、修飾糖部分、修飾ヌクレオシド間連結、又は修飾ヌクレオ塩基を独立して有するヌクレオチドを意味する。
「修飾オリゴヌクレオチド」は、少なくとも１つの修飾ヌクレオシド間連結、修飾糖、及び／又は修飾ヌクレオ塩基を含んでなるオリゴヌクレオチドを意味する。
「修飾糖」は、天然の糖部分からの置換及び／又はあらゆる変化を意味する。
「モノマー」は、オリゴマーの単一ユニットに言及する。モノマーには、限定されないが、天然に存在するか又は修飾されている、ヌクレオシドとヌクレオチドが含まれる。
「モチーフ」は、アンチセンス化合物中の非修飾ヌクレオシドと修飾ヌクレオシドのパターンを意味する。
「天然の糖部分」は、ＤＮＡ（２’−Ｈ）又はＲＮＡ（２’−ＯＨ）に見出される糖部分を意味する。
「天然に存在するヌクレオシド間連結」は、３’→５’ホスホジエステル連結を意味する。
「非相補的なヌクレオ塩基」は、互いとの水素結合を形成しないか又は他のやり方でもハイブリダイゼーションを支援しないヌクレオ塩基の対に言及する。
「核酸」は、モノマーヌクレオチドから構成される分子に言及する。核酸には、限定されないが、リボ核酸（ＲＮＡ）、デオキシリボ核酸（ＤＮＡ）、一本鎖核酸、及び二本鎖核酸が含まれる。
「ヌクレオ塩基」は、別の核酸の塩基と対合することが可能な複素環式部分を意味する。
「ヌクレオ塩基相補性」は、別のヌクレオ塩基と塩基対合することが可能であるヌクレオ塩基に言及する。例えば、ＤＮＡでは、アデニン（Ａ）がチミン（Ｔ）に相補的である。例えば、ＲＮＡでは、アデニン（Ａ）がウラシル（Ｕ）に相補的である。特定の態様において、相補的なヌクレオ塩基は、その標的核酸のヌクレオ塩基と塩基対合することが可能である、アンチセンス化合物のヌクレオ塩基に言及する。例えば、アンチセンス化合物のある位置にあるヌクレオ塩基が標的核酸のある位置にあるヌクレオ塩基と水素結合することが可能であるならば、そのオリゴヌクレオチドとその標的核酸の間の水素結合の位置は、そのヌクレオ塩基対で相補的であるとみなされる。
「ヌクレオ塩基配列」は、あらゆる糖、連結、及び／又はヌクレオ塩基修飾とは無関係な、隣接ヌクレオ塩基の順序を意味する。
「ヌクレオシド」は、糖へ連結したヌクレオ塩基を意味する。
「ヌクレオシド模倣体」には、オリゴマー化合物の１以上の位置で糖又は糖及び塩基を置き換える（必ずしも連結は置き換えない）ために使用される、例えば、モルホリノ、シクロヘキセニル、シクロヘキシル、テトラヒドロピラニル、二環又は三環糖模倣体（例、非フラノース糖単位）を有するヌクレオシド模倣体のような構造が含まれる。ヌクレオチド模倣体には、オリゴマー化合物の１以上の位置でヌクレオシドや連結を置き換えるために使用される、例えば、ペプチド核酸又はモルホリノ類（−Ｎ（Ｈ）−Ｃ（＝Ｏ）−Ｏ−又は他の非ホスホジエステル連結によって連結されたモルホリノ類）のような構造が含まれる。糖代用物（surrogate）は、やや広義の用語であるヌクレオシド模倣体と重複する
が、糖単位（フラノース環）だけの置き換えを示すと企図される。本発明で提供するテトラヒドロピラニル環は、フラノース糖基がテトラヒドロピラニル環系で置き換えられた、糖代用物の１例を例示する。「模倣体」は、糖、ヌクレオ塩基、及び／又はヌクレオシド間連結が置換されている基に言及する。一般に、模倣体は、糖又は糖−ヌクレオシド間連結の組合せの代わりに使用されて、ヌクレオ塩基は、選択された標的へのハイブリダイゼーションのために維持される。
「ヌクレオチド」は、ヌクレオシドの糖部分へリン酸基が共有結合したヌクレオシドを意味する。
「オリゴマー化合物」は、核酸分子の少なくとも１つの領域へハイブリダイズすることが可能である、連結モノマーサブユニットのポリマーを意味する。
「オリゴヌクレオシド」は、ヌクレオシド間連結がリン原子を含有しないオリゴヌクレオチドを意味する。
「オリゴヌクレオチド」は、そのそれぞれが互いから独立して修飾され得るか又は非修
飾であり得る連結ヌクレオシドのポリマーを意味する。
「ホスホロチオエート連結」は、非架橋酸素原子の１つをイオウ原子で置き換えることによってホスホジエステル結合が修飾された、ヌクレオシド間の連結を意味する。ホスホロチオエート連結は、修飾（された）ヌクレオシド間連結である。
「部分」は、核酸の一定数の隣接（即ち、連結）ヌクレオ塩基を意味する。特定の態様では、部分が標的核酸の一定数の隣接ヌクレオ塩基である。特定の態様では、部分がアンチセンス化合物の一定数の隣接ヌクレオ塩基である。
乳癌又は乳癌細胞に関する「プロゲステロン受容体（ＰＲ）陰性」は、プロゲステロン受容体（ＰＲ）を発現しない乳癌又は乳癌細胞に言及する。
「領域」は、少なくとも１つの同定可能な構造、機能、又は特徴を有する、標的核酸の部分として定義される。
「リボヌクレオチド」は、ヌクレオチドの糖部分の２’位にヒドロキシを有するヌクレオチドを意味する。リボヌクレオチドは、多様な置換基のいずれでも修飾されてよい。
「セグメント」は、標的核酸内の領域のより小さな部分又はサブ部分として定義される。
「部位」は、本明細書に使用するように、標的核酸内の特異的な（unique）ヌクレオ塩基位置として定義される。
「特異的にハイブリダイズ可能な」は、アンチセンスオリゴヌクレオチドと標的核酸の間で、所望される効果を引き起こすのに十分な度合いの相補性を有する一方で、特異的な結合が所望される条件下（即ち、生体内アッセイや療法的治療の場合の生理学的条件下）では非標的核酸に対してほとんど又は全く効果を示さないアンチセンス化合物に言及する。「ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件」又は「ストリンジェントな条件」は、オリゴマー化合物がその標的配列へハイブリダイズするが、他の配列へはほとんどハイブリダイズしない条件に言及する。
「被験者」は、治療又は療法のために選択されるヒト又は非ヒト動物を意味する。
「シナジー」又は「相乗作用する」は、各成分単独の効果の相加より大きい、組合せの効果に言及する。
「標的」は、その調節が所望されるタンパク質に言及する。
「標的遺伝子」は、標的をコードする遺伝子に言及する。
「標的指向する」は、標的核酸へ特異的にハイブリダイズして所望される効果を引き起こすアンチセンス化合物の設計及び選択の方法を意味する。
「標的核酸」、「標的ＲＮＡ」、「標的ＲＮＡ転写物」、及び「核酸標的」は、アンチセンス化合物によって標的指向されることが可能な核酸をいずれも意味する。
「標的領域」は、１以上のアンチセンス化合物が標的指向される標的核酸の部分を意味する。
「標的セグメント」は、アンチセンス化合物が標的指向される標的核酸のヌクレオチドの配列を意味する。「５’標的部位」は、標的セグメントの５’端ヌクレオチドに言及する。「３’標的部位」は、標的セグメントの３’端ヌクレオチドに言及する。
「癌を治療すること」は、癌又はそれに付随する症状の改善をもたらす行為を実施することに言及する。前記行為の組合せは、「治療」という用語に含まれる。癌の改善には、限定されないが、被験者中の癌細胞の数を低下させること、又は該被験者において癌細胞の数を抑制することが含まれる。本明細書に使用するような前記治療には、癌に関する健康の完全な回復も含まれる。本発明で提供される態様に従って使用されるような治療は、治療されるすべての被験者において有効なわけではないと理解されたい。しかしながら、本明細書で言及される癌に罹患している被験者のある集団は、成功裡に治療される可能性がある。特定の態様では、「癌を治療すること」を、限定されないが、癌を有する被験者における腫瘍のサイズの低下、癌を有する被験者における腫瘍の成長又は増殖の抑制、転移を予防すること又は転移の程度を抑えること、及び／又は癌を有する被験者の生存を対照に比較して延長させることが含まれる、いくつかの異なるパラメータによって記載することができる。この定義において言及される癌は、前立腺癌、乳癌、卵巣癌、胃癌、及び膀胱癌より選択されるものを含めて、どんな癌でもよい。
「非修飾」ヌクレオ塩基は、プリン塩基のアデニン（Ａ）及びグアニン（Ｇ）と、ピリミジン塩基のチミン（Ｔ）、シトシン（Ｃ）及びウラシル（Ｕ）を意味する。
「非修飾ヌクレオチド」は、天然に存在するヌクレオ塩基、糖部分、及びヌクレオシド間連結より構成されるヌクレオチドを意味する。特定の態様では、非修飾ヌクレオチドがＲＮＡヌクレオチド（即ち、β−Ｄ−リボヌクレオシド）又はＤＮＡヌクレオチド（即ち、β−Ｄ−デオキシリボヌクレオシド）である。
「上流」は、核酸の５’端又はＮ末端へ向かう相対的な方向に言及する。
特定の態様
特定の態様は、アンドロゲン受容体（ＡＲ）ｍＲＮＡ発現を阻害するための方法、化合物、及び組成物を提供する。
特定の態様は、アンドロゲン受容体核酸へ標的指向されるアンチセンス化合物又は組成物を提供する。特定の態様において、アンドロゲン受容体核酸は、ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＮＴ＿０１１６６９．１７＿ＴＲＵＮＣ＿５０７９０００＿５２７００００（本明細書では配列番号１として組み込まれる）、ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＮＭ＿００００４４．３（本明細書では配列番号２として組み込まれる）、ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＮＭ＿００１０１１６４５．２（本明細書では配列番号３として組み込まれる）、ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＦＪ２３５９１６．１（本明細書では配列番号４として組み込まれる）、ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＦＪ２３５９１７．１（本明細書では配列番号５として組み込まれる）、ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＦＪ２３５９１８．１（本明細書では配列番号６として組み込まれる）、ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＦＪ２３５９１９．１（本明細書では配列番号７として組み込まれる）、又はＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＦＪ２３５９２０．１（本明細書では配列番号８として組み込まれる）に示される配列である。
特定の態様において、該化合物又は組成物は、ＡＲへ標的指向される、長さ１０〜３０個の連結ヌクレオシドの修飾オリゴヌクレオチドを含む。ＡＲ標的は、配列番号１〜配列番号８のいずれの１つにも引用される配列、又はその一部、又はその変異体を有し得る。
特定の態様において、ＡＲ標的は、既知のＡＲスプライシング変異体の配列を有し得て、これには、限定されないが、ＡＲ−Ｖ１、ＡＲ−Ｖ２、ＡＲ−Ｖ３、ＡＲ−Ｖ４、ＡＲ−Ｖ５、ＡＲ−Ｖ６、及びＡＲ−Ｖ７（ＡＲ３とも呼ばれる）が含まれ、これらは、エクソン１〜エクソン３を含有するが、エクソン４〜エクソン８を欠損する。本発明で提供される化合物によって標的指向され得るＡＲ−Ｖ１、ＡＲ−Ｖ２、ＡＲ−Ｖ３、ＡＲ−Ｖ４、ＡＲ−Ｖ５、ＡＲ−Ｖ６、ＡＲ−Ｖ７、及び追加のスプライシング変異体については、Hu et al., Cancer Res 2009; 69: 16-22 と米国特許出願公開公報番号ＵＳ２０１０／００６８８０２（このそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる）に記載されている。
特定の態様において、該化合物又は組成物は、１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれもの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、又は２０個の隣接ヌクレオ塩基を含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様では、ウィングセグメント中の１以上の修飾ヌクレオシドが修飾糖を有する。特定の態様において、修飾糖は、二環式糖である。特定の態様において、修飾ヌクレオシドは、ＬＮＡヌクレオシドである。特定の態様において、修飾ヌクレオシドは、２’−置換ヌクレオシドである。特定の態様では、２’置換ヌクレオシドに、二環式糖修飾のあるヌクレオシドが含まれる。特定の態様において、修飾ヌクレオシドは、２’−ＭＯＥヌクレオシドである。特定の態様において、修飾ヌクレオシドは、拘束エチル（ｃＥｔ）ヌクレオシドである。
特定の態様において、該化合物又は組成物は、１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれものヌクレオ塩基配列からなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様では、ウィングセグメント中の１以上の修飾ヌクレオシドが修飾糖を有する。特定の態様において、修飾糖は、二環式糖である。特定の態様において、修飾ヌクレオシドは、ＬＮＡヌクレオシドである。特定の態様において、修飾ヌクレオシドは、２’−置換ヌクレオシドである。特定かの態様では、２’置換ヌクレオシドに、二環式糖修飾のあるヌクレオシドが含まれる。特定の態様において、修飾ヌクレオシドは、２’−ＭＯＥヌクレオシドである。特定の態様において、修飾ヌクレオシドは、拘束エチル（ｃＥｔ）ヌクレオシドである。
特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向される化合物又は組成物、又はその医薬的に許容される塩は、配列番号３５、３９、４３、１２４、１５０、１５５、１６９、又は１７５の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、ヒトＡＲへ標的指向されるアンチセンス化合物は、ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５６９２１３、ＩＳＩＳ ５６９２１６、ＩＳＩＳ ５６９２２１、ＩＳＩＳ ５６９２３６、ＩＳＩＳ ５７９６７１、ＩＳＩＳ ５８６１２４、ＩＳＩＳ ５８３９１８、ＩＳＩＳ ５８４１４９、ＩＳＩＳ ５８４１６３、ＩＳＩＳ ５８４２６９、又はＩＳＩＳ ５８４４６８である。
特定の態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、ａ）連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；ｂ）連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及びｃ）連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含む。ギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて、それぞれのウィングセグメントの各ヌクレオシドは、修飾糖を含む。
特定の態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、２０個の連結ヌクレオシド、つまり１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、５個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、５個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグ
メントからなり、それぞれのウィングセグメントの各ヌクレオシドは、２’−Ｏ−メトキシエチル糖を含み、それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり、そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、１６個の連結ヌクレオシド、つまり１０個の連結デオキシヌクレオシからなるギャップセグメント、３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントからなり；それぞれのウィングセグメントの各ヌクレオシドは拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み、それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり、そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、１６個の連結ヌクレオシド、つまり９個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントからなり；５’ウィングセグメントの３個の連結ヌクレオシドは、それぞれ拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び２’−Ｏ−メトキシエチル糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、１６個の連結ヌクレオシド、つまり８個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、５個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントからなり；５’ウィングセグメントの５個の連結ヌクレオシドは、それぞれ拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの３個の連結ヌクレオシドは、それぞれ拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、１６個の連結ヌクレオシド、つまり８個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントからなり；５’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び２’−Ｏ−メトキシエチル糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、１６個の連結ヌクレオシド、つまり８個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、５個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントからなり；５’ウィングセグメントの５個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの３個の連結ヌクレオシドは、それぞれ拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、１６個の連結ヌクレオシド、つまり７個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、７個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、２個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントからなり；５’ウィングセグメントの７個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの２個の連結ヌクレオシドは、それぞれ拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、１６個の連結ヌクレオシド、つまり７個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、６個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントからなり；５’ウィングセグメントの６個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの３個の連結ヌクレオシドは、それぞれ拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、１６個の連結ヌクレオシド、つまり７個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、５個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントからなり；５’ウィングセグメントの５個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び２’−Ｏ−メトキシエチル糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、１６個の連結ヌクレオシド、つまり７個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント、４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント、５個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントからなり；５’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの５個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、及び２’−Ｏ−メトキシエチル糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向される化合物又は組成物、又はその医薬的に許容される塩は、配列番号３５、３９、４３、１２４、１５０、１５５、１６９、又は１７５の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含み、ここで修飾オリゴヌクレオチドは、デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；５’ウィングセグメント；及び３’ウィングセグメントを含み、ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて、それぞれのウィングセグメントの各ヌクレオシドは、
修飾糖を含む。特定の態様において、修飾オリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結である。特定の態様において、修飾オリゴヌクレオチドのそれぞれのシトシンは、５’−メチルシトシンである。
特定の態様では、アンドロゲン受容体へ標的指向される化合物、又はその医薬的に許容される塩が、配列番号３５の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含み、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
９個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み；
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；５’ウィングセグメントの３個の連結ヌクレオシドは、それぞれ拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び２’−Ｏ−メトキシエチル糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様では、アンドロゲン受容体へ標的指向される化合物、又はその医薬的に許容される塩が、配列番号３９の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含み、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
９個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み；
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；５’ウィングセグメントの３個の連結ヌクレオシドは、それぞれ拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び２’−Ｏ−メトキシエチル糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様では、アンドロゲン受容体へ標的指向される化合物、又はその医薬的に許容される塩が、配列番号３９の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含み、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
８個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み；
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；５’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び２’−Ｏ−メトキシエチル糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様では、アンドロゲン受容体へ標的指向される化合物、又はその医薬的に許容される塩が、配列番号３９の配列からなる１６個の連結ヌクレオシドからなるヌクレオ塩基配列を有する一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含み、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
８個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
５個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み；
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；５’ウィングセグメントの５個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの３個の連結ヌクレオシドは、それぞれ拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様では、アンドロゲン受容体へ標的指向される化合物、又はその医薬的に許容される塩が、配列番号３９の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含み、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
７個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
５個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み；
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；５’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの５個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、及び２’−Ｏ−メトキシエチル糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様では、アンドロゲン受容体へ標的指向される化合物、又はその医薬的に許容される塩が、配列番号３５の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含み、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
７個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
６個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み；
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；５’ウィングセグメントの６個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの３個の連結ヌクレオシドは、それぞれ拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様では、アンドロゲン受容体へ標的指向される化合物、又はその医薬的に許容される塩が、配列番号４３の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含み、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み；
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；それぞれのウィングセグメントの各ヌクレオシドは、拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様では、アンドロゲン受容体へ標的指向される化合物、又はその医薬的に許容される塩が、配列番号１２４の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含み、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み；
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；それぞれのウィングセグメントの各ヌクレオシドは、拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様では、アンドロゲン受容体へ標的指向される化合物、又はその医薬的に許容される塩が、配列番号１５０の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含み、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み；
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；それぞれのウィングセグメントの各ヌクレオシドは、拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様では、アンドロゲン受容体へ標的指向される化合物、又はその医薬的に許容される塩が、配列番号１５５の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含み、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み；
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；それぞれのウィングセグメントの各ヌクレオシドは、拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様では、アンドロゲン受容体へ標的指向される化合物、又はその医薬的に許容される塩が、配列番号１６９の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含み、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み；
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；それぞれのウィングセグメントの各ヌクレオシドは、拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様では、アンドロゲン受容体へ標的指向される化合物、又はその医薬的に許容される塩が、る配列番号１７５の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからな一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含み、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み；
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；それぞれのウィングセグメントの各ヌクレオシドは、拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである。
特定の態様では、アンドロゲン受容体核酸へ標的指向されるアンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチドが配列番号１の以下のヌクレオチド領域内で相補的である：２９５７〜２９７２、３０７９〜３０９４、３０９９〜３１１４、３１０９〜３１２４、３１１３〜３１２８、３１２０〜３１３５、３１３３〜３１４８、３２２４〜３２３９、３２２６〜３２４１、３３５１〜３３６６、３３５３〜３３６８、３３６１〜３３７６、３３８８〜３４０３、３５１３〜３５２８、３５１７〜３５３２、３５１９〜３５３４、３６４１〜３６５６、３７３５〜３７５０、３７６４〜３７７９、３７６８〜３７８３、３７９８〜３８１３、３７９９〜３８１４、３８５１〜３８６６、３８７０〜３８８５、３８７４〜３８８９、３８７６〜３８９１、３８７８〜３８９３、３８８４〜３８９９、３８８６〜３９０１、３８８８〜３９０３、３９０１〜３９１６、３９５６〜３９７１、３９６２〜３９７７、３９６４〜３９７９、３９６７〜３９８２、４０１９〜４０３４、４０３８〜４０５３、４０４９〜４０６４、４０５６〜４０７１、４０５９〜４０７４、４０６２〜４０７７、４０６６〜４０８１、４０７０〜４０８５、４１０１〜４１１６、４１０３〜４１１８、４１０５〜４１２０、４１０９〜４１２４、４３０５〜４３２０、４４０５〜４４２０、４５３２〜４５４７、４５３４〜４５４９、４５３７〜４５５２、４５３９〜４５５４、４５５５〜４５７０、４５７１〜４５８６、４５７３〜４５８８、４５７８〜４５９３、４５９７〜４６１２、４６３２〜４６４７、４６５５〜４６７０、４６５６〜４６７１、４６６２〜４６７７、４６９９〜４７１４、４７４７〜４７６２、４７５０〜４７６５、４７５２〜４７６７、４７５４〜４７６９、４７５５〜４７７０、４７６９〜４７８４、４７９８〜４８１３、４８０４〜４８１９、４８０７〜４８２２、４８３３〜４８４８、４８３７〜４８５２、４８３９〜４８５４、４８６５〜４８８０、４８６８〜４８８３、４８７２〜４８８７、４８７４〜４８８９、４８７６〜４８９１、４８８７〜４９０２、４８８９〜４９０４、４９１６〜４９３１、４９１８〜４９３３、４９３８〜４９５３、４９４２〜４９５７、４９４４〜４９５９、４９５１〜４９６６、５０５０〜５０６５、５０５２〜５０６７、５０５４〜５０６９、５０５６〜５０７１、５０６０〜５０７５、５０６１〜５０７６、５０６２〜５０７７、５１３３〜５１４８、５１４１〜５１５６、５１５５〜５１７０、５２６５〜５２８０、５２９３〜５３０８、５３０８〜５３２３、５３９２〜５４０７、５４４８〜５４６３、５４６９〜５４８４、５４８１〜５４９６、５４８３〜５４９８、５４８６〜５５０１、５４８８〜５５０３、５４９４〜５５０９、５５２１〜５５３６、５６６６〜５６８１、６２２２〜６２３７、６７０１〜６７１６、７５４３〜７５５８、８４７１〜８４８６、８６３８〜８６５３、９４６４〜９４７９、１０２１７〜１０２３２、１０２５０〜１０２６５、１０８６５
〜１０８８０、１１１９７〜１１２１２、１１８５５〜１１８７０、１３１８９〜１３２０４、１３３２１〜１３３３６、１３３４６〜１３３６１、１６５５５〜１６５７０、１６７９３〜１６８０８、１６９６８〜１６９８３、１７２０６〜１７２２１、１８８６５〜１８８８０、２９３２９〜２９３４４、３２２９０〜３２３０５、３３３１５〜３３３３０、３９０５５〜３９０７０、４０６１５〜４０６３０、４２０１７〜４２０３２、５６０５０〜５６０６５、５８７１９〜５８７３４、５８７２０〜５８７３９、５８７２０〜５８７３５、５８７２１〜５８７３６、５８７２２〜５８７３７、５８７２３〜５８７３８、５８７２４〜５８７３９、５８７２４〜５８７３９、５８７２５〜５８７４０、５８７２５〜５８７４０、５８７２５〜５８７４０、５８７５０〜５８７６９、５８７５０〜５８７６５、５８７５１〜５８７６６、５８７５２〜５８７６７、５８７５３〜５８７６８、５８７５４〜５８７６９、５８７５５〜５８７７０、６０９０２〜６０９１７、６７４５４〜６７４６９、１０２１５６〜１０２１７１、１１４８７４〜１１４８８９、１１５２７２〜１１５２８７、１１５３６５〜１１５３８０、１３４９７１〜１３４９８６、１３９６８２〜１３９６９７、１３９７６２〜１３９７７７、１３９７８２〜１３９７９７、１４４８５６〜１４４８７１、１４４９３８〜１４４９５３、１４８４０６〜１４８４２１、１４８４４３〜１４８４５８、１４８５２０〜１４８５３５、１８１６９５〜１８１７１０、１８２９５８〜１８２９７３、又は１８３０４９〜１８３０６４。
特定の態様では、アンドロゲン受容体核酸へ標的指向されるアンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチドが配列番号１の以下のヌクレオチド領域に標的指向する：２９５７〜２９７２、３０７９〜３０９４、３０９９〜３１１４、３１０９〜３１２４、３１１３〜３１２８、３１２０〜３１３５、３１３３〜３１４８、３２２４〜３２３９、３２２６〜３２４１、３３５１〜３３６６、３３５３〜３３６８、３３６１〜３３７６、３３８８〜３４０３、３５１３〜３５２８、３５１７〜３５３２、３５１９〜３５３４、３６４１〜３６５６、３７３５〜３７５０、３７６４〜３７７９、３７６８〜３７８３、３７９８〜３８１３、３７９９〜３８１４、３８５１〜３８６６、３８７０〜３８８５、３８７４〜３８８９、３８７６〜３８９１、３８７８〜３８９３、３８８４〜３８９９、３８８６〜３９０１、３８８８〜３９０３、３９０１〜３９１６、３９５６〜３９７１、３９６２〜３９７７、３９６４〜３９７９、３９６７〜３９８２、４０１９〜４０３４、４０３８〜４０５３、４０４９〜４０６４、４０５６〜４０７１、４０５９〜４０７４、４０６２〜４０７７、４０６６〜４０８１、４０７０〜４０８５、４１０１〜４１１６、４１０３〜４１１８、４１０５〜４１２０、４１０９〜４１２４、４３０５〜４３２０、４４０５〜４４２０、４５３２〜４５４７、４５３４〜４５４９、４５３７〜４５５２、４５３９〜４５５４、４５５５〜４５７０、４５７１〜４５８６、４５７３〜４５８８、４５７８〜４５９３、４５９７〜４６１２、４６３２〜４６４７、４６５５〜４６７０、４６５６〜４６７１、４６６２〜４６７７、４６９９〜４７１４、４７４７〜４７６２、４７５０〜４７６５、４７５２〜４７６７、４７５４〜４７６９、４７５５〜４７７０、４７６９〜４７８４、４７９８〜４８１３、４８０４〜４８１９、４８０７〜４８２２、４８３３〜４８４８、４８３７〜４８５２、４８３９〜４８５４、４８６５〜４８８０、４８６８〜４８８３、４８７２〜４８８７、４８７４〜４８８９、４８７６〜４８９１、４８８７〜４９０２、４８８９〜４９０４、４９１６〜４９３１、４９１８〜４９３３、４９３８〜４９５３、４９４２〜４９５７、４９４４〜４９５９、４９５１〜４９６６、５０５０〜５０６５、５０５２〜５０６７、５０５４〜５０６９、５０５６〜５０７１、５０６０〜５０７５、５０６１〜５０７６、５０６２〜５０７７、５１３３〜５１４８、５１４１〜５１５６、５１５５〜５１７０、５２６５〜５２８０、５２９３〜５３０８、５３０８〜５３２３、５３９２〜５４０７、５４４８〜５４６３、５４６９〜５４８４、５４８１〜５４９６、５４８３〜５４９８、５４８６〜５５０１、５４８８〜５５０３、５４９４〜５５０９、５５２１〜５５３６、５６６６〜５６８１、６２２２〜６２３７、６７０１〜６７１６、７５４３〜７５５８、８４７１〜８４８６、８６３８〜８６５３、９４６４〜９４７９、１０２１７〜１０２３２、１０２５０〜１０２６５、１０８６５〜
１０８８０、１１１９７〜１１２１２、１１８５５〜１１８７０、１３１８９〜１３２０４、１３３２１〜１３３３６、１３３４６〜１３３６１、１６５５５〜１６５７０、１６７９３〜１６８０８、１６９６８〜１６９８３、１７２０６〜１７２２１、１８８６５〜１８８８０、２９３２９〜２９３４４、３２２９０〜３２３０５、３３３１５〜３３３３０、３９０５５〜３９０７０、４０６１５〜４０６３０、４２０１７〜４２０３２、５６０５０〜５６０６５、５８７１９〜５８７３４、５８７２０〜５８７３９、５８７２０〜５８７３５、５８７２１〜５８７３６、５８７２２〜５８７３７、５８７２３〜５８７３８、５８７２４〜５８７３９、５８７２４〜５８７３９、５８７２５〜５８７４０、５８７２５〜５８７４０、５８７２５〜５８７４０、５８７５０〜５８７６９、５８７５０〜５８７６５、５８７５１〜５８７６６、５８７５２〜５８７６７、５８７５３〜５８７６８、５８７５４〜５８７６９、５８７５５〜５８７７０、６０９０２〜６０９１７、６７４５４〜６７４６９、１０２１５６〜１０２１７１、１１４８７４〜１１４８８９、１１５２７２〜１１５２８７、１１５３６５〜１１５３８０、１３４９７１〜１３４９８６、１３９６８２〜１３９６９７、１３９７６２〜１３９７７７、１３９７８２〜１３９７９７、１４４８５６〜１４４８７１、１４４９３８〜１４４９５３、１４８４０６〜１４８４２１、１４８４４３〜１４８４５８、１４８５２０〜１４８５３５、１８１６９５〜１８１７１０、１８２９５８〜１８２９７３、又は１８３０４９〜１８３０６４。
特定の態様では、アンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチドがアンドロゲン受容体核酸のある領域に標的指向する。特定の態様では、アンドロゲン受容体核酸のある領域へ標的指向されるそのような化合物又はオリゴヌクレオチドが、その領域の等しい長さのヌクレオ塩基部分に相補的である隣接ヌクレオ塩基部分を有する。例えば、その部分は、本明細書で引用される領域の等しい長さ部分に相補的な、少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、又は１６個の隣接ヌクレオ塩基部分であり得る。特定の態様では、そのような化合物又はオリゴヌクレオチドが配列番号１の以下のヌクレオチド領域に標的指向する：２９５７〜２９７２、３０７９〜３０９４、３０９９〜３１１４、３１０９〜３１２４、３１１３〜３１２８、３１２０〜３１３５、３１３３〜３１４８、３２２４〜３２３９、３２２６〜３２４１、３３５１〜３３６６、３３５３〜３３６８、３３６１〜３３７６、３３８８〜３４０３、３５１３〜３５２８、３５１７〜３５３２、３５１９〜３５３４、３６４１〜３６５６、３７３５〜３７５０、３７６４〜３７７９、３７６８〜３７８３、３７９８〜３８１３、３７９９〜３８１４、３８５１〜３８６６、３８７０〜３８８５、３８７４〜３８８９、３８７６〜３８９１、３８７８〜３８９３、３８８４〜３８９９、３８８６〜３９０１、３８８８〜３９０３、３９０１〜３９１６、３９５６〜３９７１、３９６２〜３９７７、３９６４〜３９７９、３９６７〜３９８２、４０１９〜４０３４、４０３８〜４０５３、４０４９〜４０６４、４０５６〜４０７１、４０５９〜４０７４、４０６２〜４０７７、４０６６〜４０８１、４０７０〜４０８５、４１０１〜４１１６、４１０３〜４１１８、４１０５〜４１２０、４１０９〜４１２４、４３０５〜４３２０、４４０５〜４４２０、４５３２〜４５４７、４５３４〜４５４９、４５３７〜４５５２、４５３９〜４５５４、４５５５〜４５７０、４５７１〜４５８６、４５７３〜４５８８、４５７８〜４５９３、４５９７〜４６１２、４６３２〜４６４７、４６５５〜４６７０、４６５６〜４６７１、４６６２〜４６７７、４６９９〜４７１４、４７４７〜４７６２、４７５０〜４７６５、４７５２〜４７６７、４７５４〜４７６９、４７５５〜４７７０、４７６９〜４７８４、４７９８〜４８１３、４８０４〜４８１９、４８０７〜４８２２、４８３３〜４８４８、４８３７〜４８５２、４８３９〜４８５４、４８６５〜４８８０、４８６８〜４８８３、４８７２〜４８８７、４８７４〜４８８９、４８７６〜４８９１、４８８７〜４９０２、４８８９〜４９０４、４９１６〜４９３１、４９１８〜４９３３、４９３８〜４９５３、４９４２〜４９５７、４９４４〜４９５９、４９５１〜４９６６、５０５０〜５０６５、５０５２〜５０６７、５０５４〜５０６９、５０５６〜５０７１、５０６０〜５０７５、５０６１〜５０７６、５０６２〜５０７７、５１３３〜５１４８、５１４１〜５１５６、５１５５〜５１７０、５２６５〜５２８
０、５２９３〜５３０８、５３０８〜５３２３、５３９２〜５４０７、５４４８〜５４６３、５４６９〜５４８４、５４８１〜５４９６、５４８３〜５４９８、５４８６〜５５０１、５４８８〜５５０３、５４９４〜５５０９、５５２１〜５５３６、５６６６〜５６８１、６２２２〜６２３７、６７０１〜６７１６、７５４３〜７５５８、８４７１〜８４８６、８６３８〜８６５３、９４６４〜９４７９、１０２１７〜１０２３２、１０２５０〜１０２６５、１０８６５〜１０８８０、１１１９７〜１１２１２、１１８５５〜１１８７０、１３１８９〜１３２０４、１３３２１〜１３３３６、１３３４６〜１３３６１、１６５５５〜１６５７０、１６７９３〜１６８０８、１６９６８〜１６９８３、１７２０６〜１７２２１、１８８６５〜１８８８０、２９３２９〜２９３４４、３２２９０〜３２３０５、３３３１５〜３３３３０、３９０５５〜３９０７０、４０６１５〜４０６３０、４２０１７〜４２０３２、５６０５０〜５６０６５、５８７１９〜５８７３４、５８７２０〜５８７３９、５８７２０〜５８７３５、５８７２１〜５８７３６、５８７２２〜５８７３７、５８７２３〜５８７３８、５８７２４〜５８７３９、５８７２４〜５８７３９、５８７２５〜５８７４０、５８７２５〜５８７４０、５８７２５〜５８７４０、５８７５０〜５８７６９、５８７５０〜５８７６５、５８７５１〜５８７６６、５８７５２〜５８７６７、５８７５３〜５８７６８、５８７５４〜５８７６９、５８７５５〜５８７７０、６０９０２〜６０９１７、６７４５４〜６７４６９、１０２１５６〜１０２１７１、１１４８７４〜１１４８８９、１１５２７２〜１１５２８７、１１５３６５〜１１５３８０、１３４９７１〜１３４９８６、１３９６８２〜１３９６９７、１３９７６２〜１３９７７７、１３９７８２〜１３９７９７、１４４８５６〜１４４８７１、１４４９３８〜１４４９５３、１４８４０６〜１４８４２１、１４８４４３〜１４８４５８、１４８５２０〜１４８５３５、１８１６９５〜１８１７１０、１８２９５８〜１８２９７３、又は１８３０４９〜１８３０６４。
特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチドが、エクソン１内で、例えば配列番号１のヌクレオチド領域：２８６３〜５５９３（エクソン１）又は２７６７２〜２７８５３（エクソン１Ｂ）内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、ＡＲのエクソン１へ標的指向される、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、配列番号１の以下のヌクレオチド領域のいずれの内でも相補的である：２９５７〜２９７２、３０７９〜３０９４、３０９９〜３１１４、３１０９〜３１２４、３１１３〜３１２８、３１２０〜３１３５、３１３３〜３１４８、３２２４〜３２３９、３２２６〜３２４１、３３５１〜３３６６、３３５３〜３３６８、３３６１〜３３７６、３３８８〜３４０３、３５１３〜３５２８、３５１７〜３５３２、３５１９〜３５３４、３６４１〜３６５６、３７３５〜３７５０、３７６４〜３７７９、３７６８〜３７８３、３７９８〜３８１３、３７９９〜３８１４、３８５１〜３８６６、３８７０〜３８８５、３８７４〜３８８９、３８７６〜３８９１、３８７８〜３８９３、３８８４〜３８９９、３８８６〜３９０１、３８８８〜３９０３、３９０１〜３９１６、３９５６〜３９７１、３９６２〜３９７７、３９６４〜３９７９、３９６７〜３９８２、４０１９〜４０３４、４０３８〜４０５３、４０４７〜４０６２、４０４９〜４０６４、４０５６〜４０７１、４０５９〜４０７４、４０６２〜４０７７、４０６６〜４０８１、４０７０〜４０８５、４１０１〜４１１６、４１０３〜４１１８、４１０５〜４１２０、４１０９〜４１２４、４３０５〜４３２０、４４０５〜４４２０、４５３２〜４５４７、４５３４〜４５４９、４５３７〜４５５２、４５３９〜４５５４、４５５５〜４５７０、４５７１〜４５８６、４５７３〜４５８８、４５７８〜４５９３、４５９７〜４６１２、４６３２〜４６４７、４６５５〜４６７０、４６５６〜４６７１、４６６２〜４６７７、４６９９〜４７１４、４７４７〜４７６２、４７５０〜４７６５、４７５２〜４７６７、４７５４〜４７６９、４７５５〜４７７０、４７６９〜４７８４、４７９８〜４８１３、４８０４〜４８１９、４８０７〜４８２２、４８３３〜４８４８、４８３７〜４８５２、４８３９〜４８５４、４８６５〜４８８０、４８６８〜４８８３、４８７２〜４８８７、４８７４〜４８８９、４８７６〜４８９１、４８８７〜４９０２、４８８９〜４９０４、４９１６〜４９３１、４９
１８〜４９３３、４９３８〜４９５３、４９４２〜４９５７、４９４４〜４９５９、４９５１〜４９６６、５０５０〜５０６５、５０５２〜５０６７、５０５４〜５０６９、５０５６〜５０７１、５０６０〜５０７５、５０６１〜５０７６、５０６２〜５０７７、５１３３〜５１４８、５１４１〜５１５６、５１５５〜５１７０、５２６５〜５２８０、５２９３〜５３０８、５３０８〜５３２３、５３９２〜５４０７、５４４８〜５４６３、５４６９〜５４８４、５４８１〜５４９６、５４８３〜５４９８、５４８６〜５５０１、５４８８〜５５０３、５４９４〜５５０９、又は５５２１〜５５３６。
特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチドが、エクソン２内で、例えば配列番号１のヌクレオチド領域：１０２０８７〜１０２２３８（エクソン２）又は１３９５５１〜１３９８３４（エクソン２ｃ）内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、ＡＲのエクソン２へ標的指向される、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、配列番号１の以下のヌクレオチド領域のいずれの内でも相補的である：１０２１５５〜１０２１７０、１０２１５６〜１０２１７１、１３９６８２〜１３９６９７、１３９７６２〜１３９７７７、又は１３９７８２〜１３９７９７。
特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチドが、エクソン３内で、例えば配列番号１のヌクレオチド領域：１４４８４１〜１４４９５７（エクソン３）、１４８３８０〜１４８５９４（エクソン３ｂ）、又は１５３５０４〜１５４９０８（エクソン３ｄ）内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、ＡＲのエクソン３へ標的指向される、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、配列番号１の以下のヌクレオチド領域のいずれの内でも相補的である：１４４８５６〜１４４８７１、１４４９３８〜１４４９５３、１４８４０６〜１４８４２１、１４８４４３〜１４８４５８、又は１４８５２０〜１４８５３５。
特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチドが、エクソン７内で、例えば配列番号１のヌクレオチド領域：１８１６５８〜１８１８１５内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、ＡＲのエクソン７へ標的指向される、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、配列番号１のヌクレオチド領域：１８１６９５〜１８１７１０内で相補的である。
特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチドが、エクソン８内で、例えば配列番号１のヌクレオチド領域：１８２５１７〜１８９４５５内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、ＡＲのエクソン８へ標的指向される、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、配列番号１のヌクレオチド領域：１８２９５８〜１８２９７３又は１８３０４９〜１８３０６４内で相補的である。
特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチドが、イントロン１内で、例えば配列番号１のヌクレオチド領域：５５９４〜２７６７１又は２７８５４〜１０２０８６内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、ＡＲのイントロン１へ標的指向される、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、配列番号１の以下のヌクレオチド領域のいずれの内でも相補的である：５６６６〜５６８１、６２２２〜６２３７、６７０１〜６７１６、７５４３〜７５５８、８４７１〜８４８６、８６３８〜８６５３、９４６４〜９４７９、１０２１７〜１０２３２、１０２５０〜１０２６５、１０８６５〜１０８８０、１１１９７〜１１２１２、１１８５５〜１１８７０、１３１８９〜１３２０４、１３３２１〜１３３３６、１３３４６〜１３３６１、１６５５５〜１６５７０、１６７９３〜１６８０８、１６９６８〜１６９８３、１７２０６〜１７２２１、１８８６５〜１８８８０、２９３２９〜２９３４４、３２２９０〜３２３０５、３３３１５〜３３３３０、３９０５５〜３９０７０、４０６１５〜４０６３０、４２０１７〜４２０３２、５６０５０〜５６０６５、５８７１９〜５８７３４、５８７２０〜５８７３９
、５８７２０〜５８７３５、５８７２１〜５８７３６、５８７２２〜５８７３７、５８７２３〜５８７３８、５８７２４〜５８７３９、５８７２４〜５８７３９、５８７２５〜５８７４０、５８７２５〜５８７４０、５８７２５〜５８７４０、５８７５０〜５８７６９、５８７５０〜５８７６５、５８７５１〜５８７６６、５８７５２〜５８７６７、５８７５３〜５８７６８、５８７５４〜５８７６９、５８７５５〜５８７７０、６０９０２〜６０９１７、又は６７４５４〜６７４６９。
特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチドが、イントロン２内で、例えば配列番号１のヌクレオチド領域：１０２２３９〜１３９５５０又は１３９８３５〜１４４８４０内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、ＡＲのイントロン２へ標的指向される、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、配列番号１の以下のヌクレオチド領域のいずれの内でも相補的である：１１４８７４〜１１４８８９、１１５２７２〜１１５２８７、１１５３６５〜１１５３８０、又は１３４９７１〜１３４９８６。
特定の態様において、配列番号１の以下のヌクレオチド領域は、アンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチドによって標的指向される場合、少なくとも５０％の阻害を示す：３０９９〜３１１４、３１２０〜３１３５、３３５１〜３３６６、３３５３〜３３６８、３３６１〜３３７６、３５１３〜３５２８、３５１９〜３５３４、３７６８〜３７８３、３７９９〜３８１４、３８５１〜３８６６、３８８８〜３９０３、４０５９〜４０７４、４５３４〜４５４９、４５５５〜４５７０、４５７１〜４５８６、４５７８〜４５９３、４６５５〜４６７０、４６９９〜４７１４、４７５０〜４７６５、４７５５〜４７７０、４８６５〜４８８０、５０５４〜５０６９、５０６０〜５０７５、５０６１〜５０７６、５０６２〜５０７７、５１５５〜５１７０、５２６５〜５２８０、５３９２〜５４０７、５４４８〜５４６３、５４８３〜５４９８、７５４３〜７５５８、８４７１〜８４８６、８６３８〜８６５３、９４６４〜９４７９、１０２１７〜１０２３２、１０２５０〜１０２６５、１０８６５〜１０８８０、１１１９７〜１１２１２、１１８５５〜１１８７０、１３１８９〜１３２０４、１３３２１〜１３３３６、１３３４６〜１３３６１、１６５５５〜１６５７０、１６７９３〜１６８０８、１６９６８〜１６９８３、１７２０６〜１７２２１、１８８６５〜１８８８０、２９３２９〜２９３４４、３２２９０〜３２３０５、３３３１５〜３３３３０、３９０５５〜３９０７０、４０６１５〜４０６３０、４２０１７〜４２０３２、５６０５０〜５６０６５、５８７１９〜５８７３４、５８７２０〜５８７３５、５８７２０〜５８７３９、５８７２１〜５８７３６、５８７２２〜５８７３７、５８７２３〜５８７３８、５８７２４〜５８７３９、５８７２５〜５８７４０、５８７５０〜５８７６５、５８７５０〜５８７６９、５８７５１〜５８７６６、５８７５２〜５８７６７、５８７５３〜５８７６８、５８７５４〜５８７６９、５８７５５〜５８７７０、６０９０２〜６０９１７、６７４５４〜６７４６９、１０２１５６〜１０２１７１、１１４８７４〜１１４８８９、１１４８７４〜１１４８８９、１１５２７２〜１１５２８７、１１５３６５〜１１５３８０、１３４９７１〜１３４９８６、１４４８５６〜１４４８７１、１８１６９５〜１８１７１０、１８２９５８〜１８２９７３、及び１８３０４９〜１８３０６４。
特定の態様において、配列番号１の以下のヌクレオチド領域は、アンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチドによって標的指向される場合、少なくとも６０％の阻害を示す：３７９９〜３８１４、３８５１〜３８６６、３８８８〜３９０３、４０５９〜４０７４、４５３４〜４５４９、４５５５〜４５７０、４５７１〜４５８６、４５７８〜４５９３、４６５５〜４６７０、４６９９〜４７１４、４７５５〜４７７０、４８６５〜４８８０、５０６０〜５０７５、５０６１〜５０７６、５０６２〜５０７７、５１５５〜５１７０、５２６５〜５２８０、５３９２〜５４０７、５４４８〜５４６３、５４８３〜５４９８、７５４３〜７５５８、８４７１〜８４８６、８６３８〜８６５３、９４６４〜
９４７９、１０２１７〜１０２３２、１０２５０〜１０２６５、１０８６５〜１０８８０、１１１９７〜１１２１２、１１８５５〜１１８７０、１３１８９〜１３２０４、１３３２１〜１３３３６、１３３４６〜１３３６１、１６５５５〜１６５７０、１６７９３〜１６８０８、１６９６８〜１６９８３、１７２０６〜１７２２１、１８８６５〜１８８８０、２９３２９〜２９３４４、３２２９０〜３２３０５、３３３１５〜３３３３０、４２０１７〜４２０３２、５６０５０〜５６０６５、５８７１９〜５８７３４、５８７２０〜５８７３５、５８７２０〜５８７３９、５８７２１〜５８７３６、５８７２２〜５８７３７、５８７２３〜５８７３８、５８７２４〜５８７３９、５８７２５〜５８７４０、５８７５０〜５８７６５、５８７５０〜５８７６９、５８７５１〜５８７６６、５８７５２〜５８７６７、５８７５３〜５８７６８、５８７５４〜５８７６９、５８７５５〜５８７７０、６７４５４〜６７４６９、１０２１５６〜１０２１７１、１１５２７２〜１１５２８７、１１５３６５〜１１５３８０、１４４８５６〜１４４８７１、１８１６９５〜１８１７１０、１８２９５８〜１８２９７３、及び１８３０４９〜１８３０６４。
特定の態様において、配列番号１の以下のヌクレオチド領域は、アンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチドによって標的指向される場合、少なくとも７０％の阻害を示す：３７９９〜３８１４、３８５１〜３８６６、３８８８〜３９０３、４０５９〜４０７４、４５３４〜４５４９、４６５５〜４６７０、４６９９〜４７１４、４７５５〜４７７０、４８６５〜４８８０、５０６０〜５０７５、５０６２〜５０７７、５１５５〜５１７０、５２６５〜５２８０、５３９２〜５４０７、５４４８〜５４６３、５４８３〜５４９８、７５４３〜７５５８、８４７１〜８４８６、８６３８〜８６５３、９４６４〜９４７９、１０８６５〜１０８８０、１１１９７〜１１２１２、１１８５５〜１１８７０、１３１８９〜１３２０４、１３３２１〜１３３３６、１３３４６〜１３３６１、１６５５５〜１６５７０、１６７９３〜１６８０８、１６９６８〜１６９８３、１７２０６〜１７２２１、１８８６５〜１８８８０、３３３１５〜３３３３０、４２０１７〜４２０３２、５８７１９〜５８７３４、５８７２０〜５８７３９、５８７２０〜５８７３５、５８７２１〜５８７３６、５８７２２〜５８７３７、５８７２３〜５８７３８、５８７２４〜５８７３９、５８７２５〜５８７４０、５８７５０〜５８７６９、５８７５０〜５８７６５、５８７５１〜５８７６６、５８７５２〜５８７６７、５８７５３〜５８７６８、５８７５４〜５８７６９、５８７５５〜５８７７０、１０２１５６〜１０２１７１、１１５３６５〜１１５３８０、１４４８５６〜１４４８７１、１８１６９５〜１８１７１０、１８２９５８〜１８２９７３、及び１８３０４９〜１８３０６４。
特定の態様において、配列番号１の以下のヌクレオチド領域は、アンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチドによって標的指向される場合、少なくとも８０％の阻害を示す：３７９９〜３８１４、３８５１〜３８６６、３８８８〜３９０３、４０５９〜４０７４、４５３４〜４５４９、４６５５〜４６７０、４６９９〜４７１４、４７５５〜４７７０、４８６５〜４８８０、５０６０〜５０７５、５０６２〜５０７７、５１５５〜５１７０、５２６５〜５２８０、５３９２〜５４０７、５４４８〜５４６３、５４８３〜５４９８、８４７１〜８４８６、８６３８〜８６５３、９４６４〜９４７９、１０８６５〜１０８８０、１１１９７〜１１２１２、１３１８９〜１３２０４、１６７９３〜１６８０８、５８７１９〜５８７３４、５８７２０〜５８７３５、５８７２１〜５８７３６、５８７２２〜５８７３７、５８７２３〜５８７３８、５８７２４〜５８７３９、５８７２５〜５８７４０、５８７５０〜５８７６５、５８７５１〜５８７６６、５８７５２〜５８７６７、５８７５３〜５８７６８、５８７５４〜５８７６９、５８７５５〜５８７７０、１０２１５６〜１０２１７１、１４４８５６〜１４４８７１、１８１６９５〜１８１７１０、１８２９５８〜１８２９７３、及び１８３０４９〜１８３０６４。
特定の態様において、配列番号１の以下のヌクレオチド領域は、アンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチドによって標的指向される場合、少なくとも９０％の阻
害を示す：４５３４〜４５４９、５０６０〜５０７５、５０６２〜５０７７、５１５５〜５１７０、５２６５〜５２８０、５４４８〜５４６３、５８７２０〜５８７３５、５８７２１〜５８７３６、５８７２２〜５８７３７、５８７２３〜５８７３８、５８７２４〜５８７３９、５８７２５〜５８７４０、５８７５０〜５８７６５、５８７５１〜５８７６６、５８７５２〜５８７６７、５８７５３〜５８７６８、５８７５４〜５８７６９、５８７５５〜５８７７０、１８２９５８〜１８２９７３、及び１８３０４９〜１８３０６４。
特定の態様において、以下のアンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチド：ＩＳＩＳ ＩＤ：５４９３３２、５４９３３４、５４９３３８、５４９３４７、５４９３５８、５４９３６０、５４９３６１、５４９３６２、５４９３６６、５４９３７１、５４９３７２、５４９３７４、５４９３７７、５４９３７９、５４９３８０、５４９３８１、５４９３８７、５４９３９０、５４９４１４、５４９４３２、５４９４３４、５４９４５７、５４９４５８、５４９４５９、５６００７１、５６００９８、５６００９９、５６０１００、５６０１３１、５６０１３２、５６０１３３、５６０１３７、５６９２１３、５６９２１５、５６９２１６、５６９２２０、５６９２２２、５６９２２３、５６９２２７、５６９２２８、５６９２２９、５６９２３６、５６９２３８、５８３５５９、５８３５６７、５８３６０８、５８３６０９、５８３６１３、５８３６３５、５８３６３８、５８３６６２、５８３７９５、５８３７９６、５８３７９９、５８３８３４、５８３９１９、５８４１４５、５８４１４８、５８４１４９、５８４１５２、５８４１５７、５８４１５８、５８４１６２、５８４１６３、５８４１６５、５８４１６６、５８４１６７、５８４１６８、５８４１７９、５８４１８０、５８４１８３、５８４１８４、５８４１９２、５８４２３３、５８４２４２、５８４２４５、５８４２６３、５８４２６９、５８４２７４、５８４３１２、５８４３２９、５８４３６１、５８４４６５、５８４４６５、５８４４６８、５８４４６９、５８４４６９、５８４４９５、５８４４９５、５８５２３３、５８５２５９、５８５２６２、５８５２６３、５８５２６４、５８５２６５、５８５２６８、５８５２６９、５８５２７１、５８５２７４、５８６１２４、５８６２２４、５８６２２４、５８６２２５、５８６２２５、５８６２２７、及び５８６２２７は、アンドロゲン受容体核酸のある領域へ標的指向して、アンドロゲン受容体ｍＲＮＡの少なくとも５０％の阻害をもたらす。
特定の態様において、以下のアンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチド：配列番号１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２９、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４６、４９、５３、５４、５５、５７、５９、６３、９２、９３、９５、１０１、１２５、１４８、１４９、１５０、１５１、１５２、１５３、１５４、１５５、１５６、１５７、１５８、１５９、１６０、１６１、１６２、１６３、１６４、１６５、１６６、１６７、１６８、１６９、１７０、１７１、１７２、１７３、１７４、１７５、１７６、及び１７７は、アンドロゲン受容体核酸のある領域へ標的指向して、アンドロゲン受容体ｍＲＮＡの少なくとも５０％の阻害をもたらす。
特定の態様において、以下のアンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチド：ＩＳＩＳ ＩＤ：５４９３３２、５４９３３４、５４９３３８、５４９３４７、５４９３５８、５４９３６０、５４９３６１、５４９３６２、５４９３６６、５４９３７１、５４９３７２、５４９３７４、５４９３７７、５４９３７９、５４９３８０、５４９３８１、５４９３８７、５４９３９０、５４９４１４、５４９４３２、５４９４３４、５４９４５７、５４９４５８、５４９４５９、５６００７１、５６００９８、５６００９９、５６０１００、５６０１３１、５６０１３７、５６９２１３、５６９２１６、５６９２２２、５６９２２８、５６９２３６、５８３７９５、５８３７９６、５８３７９９、５８４１４５、５８４１４８、５８４１４９、５８４１５２、５８４１５７、５８４１５８、５８４１６２、５８４１６３、５８４１６５、５８４１６６、５８４１６７、５８４１６８、５
８４１７９、５８４１８０、５８４１８３、５８４１８４、５８４１９２、５８４２３３、５８４２４２、５８４２４５、５８４２７４、５８４３１２、５８４３６１、５８４４６８、５８４４６９、５８５２３３、５８５２５９、５８５２６２、５８５２６３、５８５２６４、５８５２６５、５８５２６８、５８５２６９、５８５２７４、５８６１２４、５８６２２４、５８６２２５、及び５８６２２７は、アンドロゲン受容体核酸のある領域へ標的指向して、アンドロゲン受容体ｍＲＮＡの少なくとも６０％の阻害をもたらす。
特定の態様において、以下のアンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチド：配列番号１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２９、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３８、３９、４０、４１、４２、４３、９２、９３、９５、１４８、１４９、１５０、１５１、１５２、１５３、１５４、１５５、１５６、１５７、１５８、１５９、１６０、１６１、１６２、１６３、１６４、１６５、１６６、１６７、１７０、１７１、１７３、１７５、及び１７６は、アンドロゲン受容体核酸のある領域へ標的指向して、アンドロゲン受容体ｍＲＮＡの少なくとも６０％の阻害をもたらす。
特定の態様において、以下のアンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチド：ＩＳＩＳ ＩＤ：５４９３３２、５４９３３４、５４９３３８、５４９３４７、５４９３５８、５４９３６０、５４９３６１、５４９３６２、５４９３６６、５４９３７１、５４９３７２、５４９３７４、５４９３７７、５４９３７９、５４９３８０、５４９３８１、５４９３８７、５４９３９０、５４９４１４、５４９４３２、５４９４３４、５４９４５７、５４９４５８、５４９４５９、５６００７１、５６００９８、５６００９９、５６０１００、５６０１３１、５６０１３７、５６９２２２、５８４１４５、５８４１４８、５８４１４９、５８４１５２、５８４１６２、５８４１６３、５８４１６５、５８４１６６、５８４１６７、５８４１６８、５８４１７９、５８４１８０、５８４１８３、５８４１８４、５８４１９２、５８４２４５、５８４２７４、５８４４６９、５８５２５９、５８５２６２、５８５２６８、５８５２６９、５８６１２４、５８６２２４、５８６２２５、及び５８６２２７は、アンドロゲン受容体核酸のある領域へ標的指向して、アンドロゲン受容体ｍＲＮＡの少なくとも７０％の阻害をもたらす。
特定の態様において、以下のアンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチド：配列番号１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２９、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４３、１４８、１４９、１５０、１５１、１５４、１５５、１５６、１５７、１５８、１５９、１６０、１６１、１６２、１６３、１６４、１６７、１７０、及び１７６は、アンドロゲン受容体核酸のある領域へ標的指向して、アンドロゲン受容体ｍＲＮＡの少なくとも７０％の阻害をもたらす。
特定の態様において、以下のアンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチド：ＩＳＩＳ ＩＤ：５４９３３２、５４９３３４、５４９３３８、５４９３４７、５４９３５８、５４９３６０、５４９３６１、５４９３６２、５４９３６６、５４９３７１、５４９３７２、５４９３７４、５４９３７７、５４９３７９、５４９３８０、５４９３８１、５４９３８７、５４９３９０、５４９４１４、５４９４３２、５４９４３４、５４９４５７、５４９４５８、５４９４５９、５６００９８、５６００９９、５６０１００、５６０１３７、５８４１４８、５８４１４９、５８４１５２、５８４１６２、５８４１６３、５８４１６６、５８４１８０、５８６１２４、５８６２２４、５８６２２５、及び５８６２２７は、アンドロゲン受容体核酸のある領域へ標的指向して、アンドロゲン受容体ｍＲＮＡの少なくとも８０％の阻害をもたらす。
特定の態様において、以下のアンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチド
：配列番号１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２９、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３９、４０、４１、４３、１４９、１５０、１５１、１５４、１５５、１５７、及び１６１は、アンドロゲン受容体核酸のある領域へ標的指向して、アンドロゲン受容体ｍＲＮＡの少なくとも８０％の阻害をもたらす。
特定の態様において、以下のアンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチド：ＩＳＩＳ ＩＤ：５４９３５８、５４９３７１、５４９３７２、５４９３７４、５４９３７７、５４９３８０、５４９４３２、５４９４３４、５４９４５７、５４９４５８、５４９４５９、５６００９８、５６００９９、５６０１００、５６０１３７、及び５８６２２４は、アンドロゲン受容体核酸のある領域へ標的指向して、アンドロゲン受容体ｍＲＮＡの少なくとも９０％の阻害をもたらす。
特定の態様において、以下のアンチセンス化合物又はアンチセンスオリゴヌクレオチド：配列番号１６、２１、２２、２３、２４、２６、３３、３４、３５、３６、３７、３９、４０、及び４１は、アンドロゲン受容体核酸のある領域へ標的指向して、アンドロゲン受容体ｍＲＮＡの少なくとも９０％の阻害をもたらす。
アンドロゲン受容体ｍＲＮＡの阻害パーセントは、実施例１に記載されるような、当業者に知られた標準法を使用して、決定することができる。
本明細書に含まれる実施例中のそれぞれの配列番号に示される配列は、糖部分、ヌクレオシド間連結、又はヌクレオ塩基に対するあらゆる修飾とは無関係であると理解される。このように、配列番号によって規定されるアンチセンス化合物は、独立して、糖部分、ヌクレオシド間連結、又はヌクレオ塩基に対する１以上の修飾を含み得る。ＩＳＩＳ番号（ＩＳＩＳ ＃）によって記載されるアンチセンス化合物は、ヌクレオ塩基配列、化学修飾、及びモチーフの組合せを示す。
特定の態様において、本明細書に記載される化合物又は組成物は、ＨｕＶＥＣ細胞へ送達されるとき、２５０ｎＭ未満、２００ｎＭ未満、１５０ｎＭ未満、１００ｎＭ未満、９０ｎＭ未満、８０ｎＭ未満、７０ｎＭ未満、６５ｎＭ未満、６０ｎＭ未満、５５ｎＭ未満、５０ｎＭ未満、４５ｎＭ未満、４０ｎＭ未満、３５ｎＭ未満、３０ｎＭ未満、２５ｎＭ、又は２０ｎＭ未満の試験管内（in vitro）ＩＣ５０の少なくとも１つを有することによって有効である。特定の態様では、本明細書に記載されるように、プライマープローブセットのＲＴＳ３５５９で阻害を測定する。
特定の態様において、本明細書に記載される化合物又は組成物は、生理食塩水処理動物に対する４倍、３倍、又は２倍以下のＡＬＴ又はＡＳＴ値の増加、又は肝臓、脾臓、又は腎臓重量の３０％、２０％、１５％、１２％、１０％、５％、又は２％以下の増加の少なくとも１つを有することによって実証されるように、きわめて忍容可能である。特定の態様において、本明細書に記載される化合物又は組成物は、生理食塩水処理動物に優るＡＬＴ又はＡＳＴの増加を有さないことによって実証されるように、きわめて忍容可能である。特定の態様において、本明細書に記載される化合物又は組成物は、生理食塩水処理動物に優る肝臓、脾臓、又は腎臓重量の増加を有さないことによって実証されるように、きわめて忍容可能である。
特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、Ｎ末端ドメインをコードするエクソン１とＤＮＡ結合ドメインをコードするエクソン２及びエクソン３を包含するが、ショートヒンジ領域をコードするエクソン４の少なくとも一部もリガンド結合ドメインをコードするエクソン４〜エクソン８の少なくとも一部も包含しない、ＡＲスプライシ
ング変異体に標的指向する。そのようなＡＲスプライシング変異体の例には、限定されないが、エクソン１〜エクソン３を含有するがエクソン４〜エクソン８を欠損する、ＡＲ−Ｖ７が含まれる。そのようなＡＲスプライシング変異体の追加の例には、例えば、ＡＲ３、ＡＲ４、ＡＲ４ｂ、ＡＲ５、及びＡＲ６（それぞれ、配列番号４〜配列番号８）が含まれる。特定の態様では、エクソン３の３’端の上流及び／又はリガンド結合ドメインの上流でＡＲへ標的指向されるアンチセンス化合物が、ＥＺＮ−４１７６（これは、エクソン４へ標的指向されて、米国特許第７，７３７，１２５号に記載される配列番号５８に対応する）のような、リガンド結合ドメインへ標的指向されるアンチセンス化合物より大きな程度でアンドロゲン受容体レベルを阻害することが可能である。
特定の態様では、アンチセンス化合物が、機能的なＤＮＡ結合ドメインを有するが機能的なリガンド結合ドメインを有さないＡＲスプライシング変異体に標的指向する。特定の態様では、Ｎ末端ドメインをコードするエクソン１の全体又は少なくとも機能的な部分と、ＤＮＡ結合ドメインをコードするエクソン２及びエクソン３の全体又は少なくとも機能的な部分を包含するが、ショートヒンジ領域をコードするエクソン４の少なくとも機能的な部分も、リガンド結合ドメインをコードするエクソン４〜エクソン８の少なくとも機能的な部分も包含しないＡＲスプライシング変異体へアンチセンス化合物が標的指向し得ることが理解されよう。実質的にエクソン１〜エクソン３からなる、本発明で提供されるアンチセンス化合物によって標的指向される特定のＡＲスプライシング変異体には、ゲノム領域又はエクソン４〜エクソン８からの核酸配列の非機能的な部分も含まれる場合があると考慮される。スプライシングプロセスは、ＤＮＡ結合機能を保持するがリガンド結合機能は保持しない、そのようなＡＲスプライシング変異体を生じる場合があると考慮される。特定の態様では、機能的なＤＮＡ結合ドメインを有するが機能的なリガンド結合ドメインを有さないＡＲスプライシング変異体へ標的指向されるアンチセンス化合物が、去勢抵抗性である前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害することが可能である。特定の態様では、機能的なＤＮＡ結合ドメインを有するが機能的なリガンド結合ドメインを有さないＡＲスプライシング変異体へ標的指向されるアンチセンス化合物が、式ＸＩのジアリールヒダントインＡＲ阻害剤へ抵抗する前立腺癌細胞の成長又は増殖を、ＥＺＮ−４１７６（これは、エクソン４へ標的指向されて、米国特許第７，７３７，１２５号に記載される配列番号５８に対応する）のような、リガンド結合ドメインへ標的指向されるアンチセンス化合物より大きな程度で阻害することが可能である。特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、エクソン３の３’端の上流及び／又はリガンド結合ドメインの上流にあるエクソン１内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、エクソン３の３’端の上流及び／又はリガンド結合ドメインの上流にあるエクソン２内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、エクソン３の３’端の上流及び／又はリガンド結合ドメインの上流にあるイントロン１内でＡＲに標的指向する。
特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、全長ＡＲと、Ｎ末端ドメインをコードするエクソン１とＤＮＡ結合ドメインをコードするエクソン２及びエクソン３を包含するが、ショートヒンジ領域をコードするエクソン４の少なくとも一部もリガンド結合ドメインをコードするエクソン４〜エクソン８のいずれもの少なくとも一部も包含しないＡＲスプライシング変異体の両方の発現を低下させることが可能である。特定の態様では、そのようなアンチセンス化合物がヒトアンドロゲン受容体へリガンド結合ドメインの上流で標的指向する。特定の態様では、そのようなアンチセンス化合物がヒトアンドロゲン受容体へエクソン３の３’端の上流で標的指向する。特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、エクソン３の３’端の上流及び／又はリガンド結合ドメインの上流にあるエクソン１内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、エクソン３の３’端の上流及び／又はリガンド結合ドメインの上流にあるエクソン２内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、本発明で提供される
アンチセンス化合物が、エクソン３の３’端の上流及び／又はリガンド結合ドメインの上流にあるイントロン１内でＡＲに標的指向する。
特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、Ｎ末端ドメインをコードするエクソン１とＤＮＡ結合ドメインをコードするエクソン２及びエクソン３を包含するが、ショートヒンジ領域をコードするエクソン４の少なくとも一部もリガンド結合ドメインをコードするエクソン４〜エクソン８の少なくとも一部も包含しない、ＡＲスプライシング変異体に標的指向する。そのようなＡＲスプライシング変異体の例には、限定されないが、エクソン１〜エクソン３を含有するがエクソン４〜エクソン８を欠損するＡＲ−Ｖ７が含まれる。
特定の態様が、ＥＺＮ−４１７６（これは、エクソン４へ標的指向されて、米国特許第７，７３７，１２５号に記載される配列番号５８に対応する）のような、リガンド結合ドメインへ標的指向されるアンチセンス化合物より大きな程度で抵抗性前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害することが可能である、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へリガンド結合ドメインの上流で標的指向されるアンチセンス化合物へ引用される。特定の態様では、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へリガンド結合ドメインの上流で標的指向されるアンチセンス化合物が、エクソン３の３’端の上流にあるＡＲの領域へ標的指向される。特定の態様では、本明細書で提供されるアンチセンス化合物が、エクソン３の３’端の上流及び／又はリガンド結合ドメインの上流にあるエクソン１内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、エクソン３の３’端の上流及び／又はリガンド結合ドメインの上流にあるエクソン２内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、エクソン３の３’端の上流及び／又はリガンド結合ドメインの上流にあるイントロン１内でＡＲに標的指向する。
特定の態様において、本発明で提供される修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオ塩基配列は、修飾オリゴヌクレオチドの全体にわたって測定される場合、配列番号１〜配列番号８のいずれにも少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％又は１００％相補的である。
特定の態様では、アンチセンス化合物が、１２〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、前記修飾オリゴヌクレオチドの全体にわたって測定される場合、配列番号１〜配列番号８のいずれにも少なくとも９０％相補的なヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドである。
特定の態様では、アンチセンス化合物が、１２〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、前記修飾オリゴヌクレオチドの全体にわたって測定される場合、配列番号１〜配列番号８のいずれにも１００％相補的なヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドである。特定の態様では、本発明で提供される化合物又は修飾オリゴヌクレオチドが一本鎖である。
特定の態様では、本発明で提供される修飾オリゴヌクレオチドが、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９又は３０個の連結ヌクレオシドからなる。特定の態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、２０個の連結ヌクレオシドからなる。特定の態様において、修飾オリゴヌクレオチドは、１６個の連結ヌクレオシドからなる。
特定の態様では、本発明で提供される修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオシド間連結が修飾ヌクレオシド間連結である。特定の態様では、それぞれのヌクレオシド間連結がホスホロチオエートヌクレオシド間連結である。
特定の態様では、修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオシドが修飾糖を含む。特定の態様では、少なくとも１つの修飾糖が２’−Ｏ−メトキシエチル基（２’−Ｏ（ＣＨ２）２−ＯＣＨ３）を含む。特定の態様において、修飾糖は、２’−Ｏ−ＣＨ３基を含む。
特定の態様では、少なくとも１つの修飾糖が二環式糖である。特定の態様において、二環式糖は、４’−（ＣＨ２）ｎ−Ｏ−２’架橋（式中、ｎは、１又は２である）を含む。特定の態様において、二環式糖は、４’−ＣＨ２−Ｏ−２’架橋を含む。特定の態様において、二環式糖は、４’−ＣＨ（ＣＨ３）−Ｏ−２’架橋を含む。
特定の態様では、本発明で提供される修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオシドが修飾ヌクレオ塩基を含む。特定の態様において、修飾ヌクレオ塩基は、５−メチルシトシンである。
特定の態様では、本発明で提供される修飾オリゴヌクレオチドが一本鎖修飾オリゴヌクレオチドからなる。
特定の態様では、本発明で提供される化合物又は組成物が修飾オリゴヌクレオチドの塩を含む。
医薬組成物を製剤化するための組成物及び方法
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、医薬組成物又は製剤の調製のために、医薬的に許容される活性又は不活性物質と混合してよい。医薬組成物の製剤化のための組成物及び方法は、限定されないが、投与の経路、疾患の程度、又は投与される用量が含まれる、いくつかの判断基準に依存する。
アンドロゲン受容体核酸へ標的指向されるアンチセンス化合物は、そのアンチセンス化合物を好適な医薬的に許容される希釈剤又は担体と組み合わせることによって、医薬組成物において利用することができる。特定の態様では、医薬的に許容される希釈剤が、注射に適した滅菌水のような水である。従って、１つの態様において、本明細書に記載される方法に利用されるのは、アンドロゲン受容体核酸へ標的指向されるアンチセンス化合物と医薬的に許容される希釈剤を含んでなる医薬組成物である。特定の態様において、医薬的に許容される希釈剤は、水である。特定の態様において、アンチセンス化合物は、本発明で提供されるアンチセンスオリゴヌクレオチドである。
アンチセンス化合物を含んでなる医薬組成物には、ヒトが含まれる動物への投与時に、生理活性のある代謝産物又はその残基を（直接的又は間接的に）提供することが可能である、あらゆる医薬的に許容される塩、エステル、又はそのようなエステルの塩、又は他のあらゆるオリゴヌクレオチドが含まれる。従って、例えば、本開示はまた、アンチセンス化合物の医薬的に許容される塩、プロドラッグ、そのようなプロドラッグの医薬的に許容される塩、及び他の生物学的同等物へ引用される。好適な医薬的に許容される塩には、限定されないが、ナトリウム塩とカリウム塩が含まれる。
プロドラッグには、アンチセンス化合物の片端又は両端に、生体内で内因性ヌクレアーゼによって切断されて、活性のあるアンチセンス化合物を生成する追加のヌクレオシドの取込みを含めることができる。
特定の態様において、該化合物又は組成物は、医薬的に許容される担体又は希釈剤をさらに含む。
特定の適応症
本発明の特定の側面は、本発明で提供される、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物を投与することを含む、癌を治療する方法へ向けられる。特定の態様において、癌は、ＡＲ陽性である。特定の態様において、癌は、前立腺癌、乳癌、卵巣癌、膀胱癌、又は胃癌である。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれもの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、又は２０個の隣接ヌクレオ塩基を含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれも含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれものヌクレオ塩基配列からなる修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１６個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号３５、３９、４３、１２４、１５０、１５５、１６９、又は１７５からなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンチセンス化合物は、一本鎖である。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５６９２１３、ＩＳＩＳ ５６９２１６、ＩＳＩＳ ５６９２２１、ＩＳＩＳ ５６９２３６、ＩＳＩＳ ５７９６７１、ＩＳＩＳ ５８６１２４、ＩＳＩＳ ５８３９１８、ＩＳＩＳ ５８４１４９、ＩＳＩＳ ５８４１６３、ＩＳＩＳ ５８４２６９、又はＩＳＩＳ ５８４４６８である。
特定の側面が、癌を治療することに使用の、本発明で提供される、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物へ向けられる。特定の態様において、癌は、ＡＲ陽性である。特定の態様において、癌は、前立腺癌、乳癌、卵巣癌、膀胱癌、又は胃癌である。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれもの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、又は２０個の隣接ヌクレオ塩基を含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれも含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれものヌクレオ塩基配列からなる修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１６個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号３５、３９、４３、１２４、１５０、１５５、１６９、又は１７５からなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンチセンス化合物は、一本鎖である。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５６９２１３、ＩＳＩＳ ５６９２１６、ＩＳＩＳ ５６９２２１、ＩＳＩＳ ５６９２３６、ＩＳＩＳ ５７９６７１、ＩＳＩＳ ５８６１２４、ＩＳＩＳ ５８３９１８、ＩＳＩＳ ５８４１４９、ＩＳＩＳ ５８４１６３、ＩＳＩＳ ５８４２６９、又はＩＳＩＳ ５８４４６８である。
特定の側面が、本発明で提供される、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物の、癌を治療するための医薬品の製造への使用へ向けられる。特定の態様において、癌は、ＡＲ陽性である。特定の態様において、癌は、前立腺癌、乳癌、卵巣癌、膀胱癌、又は胃癌である。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチ
センス化合物は、１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれもの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、又は２０個の隣接ヌクレオ塩基を含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれも含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれものヌクレオ塩基配列からなる修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１６個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号３５、３９、４３、１２４、１５０、１５５、１６９、又は１７５からなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンチセンス化合物は、一本鎖である。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５６９２１３、ＩＳＩＳ ５６９２１６、ＩＳＩＳ ５６９２２１、ＩＳＩＳ ５６９２３６、ＩＳＩＳ ５７９６７１、ＩＳＩＳ ５８６１２４、ＩＳＩＳ ５８３９１８、ＩＳＩＳ ５８４１４９、ＩＳＩＳ ５８４１６３、ＩＳＩＳ ５８４２６９、又はＩＳＩＳ ５８４４６８である。
本発明の特定の側面は、本明細書に記載されるような、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向されるアンチセンス化合物の、その癌が抗アンドロゲン剤（例、化合物又は薬物）での治療に対して抵抗性になった癌患者を治療するための使用へ向けられる。特定の態様では、前記癌が前立腺癌である。特定の態様では、前記患者が、その当人又はその癌が、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、酢酸アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される薬剤での治療への抵抗性を発現した患者である。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれもの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、又は２０個の隣接ヌクレオ塩基を含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれも含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれものヌクレオ塩基配列からなる修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１６個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号３５、３９、４３、１２４、１５０、１５５、１６９、又は１７５からなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンチセンス化合物は、エクソン１内で、例えば配列番号１のヌクレオチド領域：２８６３〜５５９３（エクソン１）又は２７６７２〜２７８５３（エクソン１Ｂ）内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、本発明で提供される、ＡＲのエクソン１へ標的指向されるアンチセンス化合物が、配列番号１の以下のヌクレオチド領域のいずれの内でも相補的である：２９５７〜２９７２、３０７９〜３０９４、３０９９〜３１１４、３１０９〜３１２４、３１１３〜３１２８、３１２０〜３１３５、３１３３〜３１４８、３２２４〜３２３９、３２２６〜３２４１、３３５１〜３３６６、３３５３〜３３６８、３３６１〜３３７６、３３８８〜３４０３、３５１３〜３５２８、３５１７〜３５３２、３５１９〜３５３４、３６４１〜３６５６、３７３５〜３７５０、３７６４〜３７７９、３７６８〜３７８３、３７９８〜３８１３、３７９９〜３８１４、３８５１〜３８６６、３８７０〜３８８５、３８７４〜３８８９、３８７６〜３８９１、３８７８〜３８９３、３８８４〜３８９９、３８８６〜３９０１、３８８８〜３９０３、３９０１〜３９１６、３９５６〜３９７１、３９６２〜３９７７、３９６４〜３９７９、３９６７〜３９８２、４０１９〜４０３４、４０３８〜４０５３、４０４９〜４０６４、
４０５６〜４０７１、４０５９〜４０７４、４０６２〜４０７７、４０６６〜４０８１、４０７０〜４０８５、４１０１〜４１１６、４１０３〜４１１８、４１０５〜４１２０、４１０９〜４１２４、４３０５〜４３２０、４４０５〜４４２０、４５３２〜４５４７、４５３４〜４５４９、４５３７〜４５５２、４５３９〜４５５４、４５５５〜４５７０、４５７１〜４５８６、４５７３〜４５８８、４５７８〜４５９３、４５９７〜４６１２、４６３２〜４６４７、４６５５〜４６７０、４６５６〜４６７１、４６６２〜４６７７、４６９９〜４７１４、４７４７〜４７６２、４７５０〜４７６５、４７５２〜４７６７、４７５４〜４７６９、４７５５〜４７７０、４７６９〜４７８４、４７９８〜４８１３、４８０４〜４８１９、４８０７〜４８２２、４８３３〜４８４８、４８３７〜４８５２、４８３９〜４８５４、４８６５〜４８８０、４８６８〜４８８３、４８７２〜４８８７、４８７４〜４８８９、４８７６〜４８９１、４８８７〜４９０２、４８８９〜４９０４、４９１６〜４９３１、４９１８〜４９３３、４９３８〜４９５３、４９４２〜４９５７、４９４４〜４９５９、４９５１〜４９６６、５０５０〜５０６５、５０５２〜５０６７、５０５４〜５０６９、５０５６〜５０７１、５０６０〜５０７５、５０６１〜５０７６、５０６２〜５０７７、５１３３〜５１４８、５１４１〜５１５６、５１５５〜５１７０、５２６５〜５２８０、５２９３〜５３０８、５３０８〜５３２３、５３９２〜５４０７、５４４８〜５４６３、５４６９〜５４８４、５４８１〜５４９６、５４８３〜５４９８、５４８６〜５５０１、５４８８〜５５０３、５４９４〜５５０９、又は５５２１〜５５３６。特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、エクソン２内で、例えば配列番号１のヌクレオチド領域：１０２０８７〜１０２２３８（エクソン２）又は１３９５５１〜１３９８３４（エクソン２ｃ）内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、本発明で提供される、ＡＲのエクソン２へ標的指向されるアンチセンス化合物が、配列番号１の以下のヌクレオチド領域：１０２１５５〜１０２１７０、１０２１５６〜１０２１７１、１３９６８２〜１３９６９７、１３９７６２〜１３９７７７、又は１３９７８２〜１３９７９７のいずれの内でも相補的である。特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、エクソン３内で、例えば配列番号１のヌクレオチド領域：１４４８４１〜１４４９５７（エクソン３）、１４８３８０〜１４８５９４（エクソン３ｂ）、又は１５３５０４〜１５４９０８（エクソン３ｄ）内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、本発明で提供される、ＡＲのエクソン３へ標的指向されるアンチセンス化合物が、配列番号１の以下のヌクレオチド領域：１４４８５６〜１４４８７１、１４４９３８〜１４４９５３、１４８４０６〜１４８４２１、１４８４４３〜１４８４５８、又は１４８５２０〜１４８５３５のいずれの内でも相補的である。態様の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、イントロン１内で、例えば配列番号１のヌクレオチド領域：５５９４〜２７６７１又は２７８５４〜１０２０８６内でＡＲに標的指向する。態様の態様では、本発明で提供される、ＡＲのイントロン１へ標的指向されるアンチセンス化合物が、配列番号１の以下のヌクレオチド領域のいずれの内でも相補的である：５６６６〜５６８１、６２２２〜６２３７、６７０１〜６７１６、７５４３〜７５５８、８４７１〜８４８６、８６３８〜８６５３、９４６４〜９４７９、１０２１７〜１０２３２、１０２５０〜１０２６５、１０８６５〜１０８８０、１１１９７〜１１２１２、１１８５５〜１１８７０、１３１８９〜１３２０４、１３３２１〜１３３３６、１３３４６〜１３３６１、１６５５５〜１６５７０、１６７９３〜１６８０８、１６９６８〜１６９８３、１７２０６〜１７２２１、１８８６５〜１８８８０、２９３２９〜２９３４４、３２２９０〜３２３０５、３３３１５〜３３３３０、３９０５５〜３９０７０、４０６１５〜４０６３０、４２０１７〜４２０３２、５６０５０〜５６０６５、５８７１９〜５８７３４、５８７２０〜５８７３９、５８７２０〜５８７３５、５８７２１〜５８７３６、５８７２２〜５８７３７、５８７２３〜５８７３８、５８７２４〜５８７３９、５８７２４〜５８７３９、５８７２５〜５８７４０、５８７２５〜５８７４０、５８７２５〜５８７４０、５８７５０〜５８７６９、５８７５０〜５８７６５、５８７５１〜５８７６６、５８７５２〜５８７６７、５８７５３〜５８７６８、５８７５４〜５８７６９、５８７５５〜５８７７０、６０９０２〜６０９１７、又は６７４５４〜６７４６９。態様の態様では、本発明で提供されるア
ンチセンス化合物が、イントロン２内で、例えば配列番号１のヌクレオチド領域：１０２２３９〜１３９５５０又は１３９８３５〜１４４８４０内でＡＲに標的指向する。態様の態様では、本発明で提供される、ＡＲのイントロン２へ標的指向されるアンチセンス化合物が、配列番号１の以下のヌクレオチド領域：１１４８７４〜１１４８８９、１１５２７２〜１１５２８７、１１５３６５〜１１５３８０、又は１３４９７１〜１３４９８６のいずれの内でも相補的である。特定の態様において、アンチセンス化合物は、一本鎖である。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５６９２１３、ＩＳＩＳ ５６９２１６、ＩＳＩＳ ５６９２２１、ＩＳＩＳ ５６９２３６、ＩＳＩＳ ５７９６７１、ＩＳＩＳ ５８６１２４、ＩＳＩＳ ５８３９１８、ＩＳＩＳ ５８４１４９、ＩＳＩＳ ５８４１６３、ＩＳＩＳ ５８４２６９、又はＩＳＩＳ ５８４４６８である。
「特別な薬剤（例、化合物又は薬物）での治療へ抵抗する」とは、その薬剤が癌の成長又は拡散を止めるのにさほど有効でないか又はもはや有効でないので、患者又はその癌のそれに対する応答性又は感受性が経時的に低くなったことを意味する。典型的には、そのような患者は、前記薬剤へ抵抗すると分類されて、そのような薬剤ではもはや治療されないだろう。ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、酢酸アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される薬剤へ抵抗する前立腺癌を有する被験者には、例えば、前記薬剤をかつて服用したが、その前立腺癌の薬剤に対する応答性又は感受性が低下した患者を含めることができる。例えば、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、酢酸アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤へ抵抗する前立腺癌には、その薬剤での治療にも拘らず、腫瘍体積、転移、又は進行が増加した前立腺癌を含めることができる。特定の態様では、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、酢酸アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤へ抵抗する前立腺癌には、該薬剤に対して不応性であって、治療に拘らず、腫瘍体積、転移、又は進行が減少していない前立腺癌を含めることができる。いくつかの態様は、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、酢酸アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤へ抵抗する前立腺癌を被験者において治療する方法に関し、該方法は、その薬剤へ抵抗する前立腺癌を有するとして被験者を同定することと、本明細書に記載されるように、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へエクソン３の３’端の上流及び／又はリガンド結合ドメインの上流で標的指向されるアンチセンス化合物を該被験者へ投与することを含んでなる。いくつかの態様は、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、酢酸アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤へ抵抗する前立腺癌を被験者において治療する方法に関し、該方法は、前記抗アンドロゲン剤へ抵抗する前立腺癌を有すると確定又は診断された被験者へ、本明細書に記載されるように、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へエクソン３の３’端の上流及び／又はリガンド結合ドメインの上流で標的指向されるアンチセンス化合物を投与することを含んでなる。特定の態様では、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、酢酸アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤へ抵抗する前立腺癌細胞が、全長ＡＲに優ってＡＲスプライシング変異体を選好的に発現する。
本発明の特定の側面は、前立腺癌に罹患している患者（ここで該患者、又はその癌は、抗アンドロゲン剤（化合物又は薬物）での治療への抵抗性を発現したか又は抵抗性になった）を治療する方法へ向けられ、該方法は、本明細書に記載されるような、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向されるアンチセンス化合物を前記患者へ投与することを含んでなる。特定の態様において、前記患者は、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、酢酸アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される薬剤での治療への抵抗性を発現した患者である。特定の態様において、アンドロゲン
受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれもの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、又は２０個の隣接ヌクレオ塩基を含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれも含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれものヌクレオ塩基配列からなる修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１６個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号３５、３９、４３、１２４、１５０、１５５、１６９、又は１７５からなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンチセンス化合物は、一本鎖である。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５６９２１３、ＩＳＩＳ ５６９２１６、ＩＳＩＳ ５６９２２１、ＩＳＩＳ ５６９２３６、ＩＳＩＳ ５７９６７１、ＩＳＩＳ ５８６１２４、ＩＳＩＳ ５８３９１８、ＩＳＩＳ ５８４１４９、ＩＳＩＳ ５８４１６３、ＩＳＩＳ ５８４２６９、又はＩＳＩＳ ５８４４６８である。
抗アンドロゲン剤での治療への抵抗性を発現したか又は抵抗性になった前立腺癌は去勢抵抗性前立腺癌（ＣＲＰＣ）と呼ばれる。従って、いくつかの態様では、ＭＤＶ３１００のような抗アンドロゲン剤へ抵抗する前立腺癌細胞が、かつてその阻害剤へ曝露されて、それに対する応答性又は感受性が経時的に低下している。例えば、ＭＤＶ３１００は、患者において前立腺癌細胞の成長又は増殖を初めは阻害するかもしれないが、時間の経過とともに、そのような阻害効果は、その細胞がその阻害剤に対して抵抗性になったときに減衰する場合がある。
本発明の特定の側面は、本発明で提供される、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物の、その癌が抗アンドロゲン剤（例、化合物又は薬物）での治療に対して抵抗性になった患者において癌を治療するための医薬品の製造への使用へ向けられる。特定の態様において、癌は、前立腺癌である。特定の態様において、前記患者は、その当人又はその癌が、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、酢酸アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される薬剤での治療への抵抗性を発現した患者である。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれもの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、又は２０個の隣接ヌクレオ塩基を含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれも含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれものヌクレオ塩基配列からなる修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１６個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号３５、３９、４３、１２４、１５０、１５５、１６９、又は１７５からなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンチセンス化合物は、一本鎖である。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５６９２１３、ＩＳＩＳ ５６９２１６、ＩＳＩＳ ５６９２２１、ＩＳＩＳ ５６９２３６、ＩＳＩＳ ５７９６７１、ＩＳＩＳ ５８６１２４、ＩＳＩＳ ５８３９１８、ＩＳＩＳ ５８４１４９、ＩＳＩＳ ５８４１６３、ＩＳＩＳ ５８４２６９、又はＩＳＩＳ ５８４４６８である。
エンザルタミド：
ＭＤＶ３１００は、エンザルタミド（ＸｔａｎｄｉＴＭ）として、そして４−（３−（４−シアノ−３−（トリフルオロメチル）フェニル）−５，５−ジメチル−４−オキソ−２−チオキソイミダゾリジン−１−イル）−２−フルオロ−Ｎ−メチルベンズアミドというＩＵＰＡＣ名によっても知られる、式ＸＩによって表される、アンドロゲン受容体阻害剤のジアリールヒダントイン群へ属するアンドロゲン受容体リガンド結合阻害剤である。ＭＤＶ３１００は、以下の化学式：
Figure 0006599497
を有する。
ＭＤＶ３１００と、本発明で提供される特定の態様における使用に適した追加のジアリールヒダントインのアンドロゲン受容体阻害剤については、その全体が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第７，７０９，５１７号、米国特許出願公開公報番号ＵＳ２０１００１７２９７５、及び米国特許出願公開公報番号ＵＳ２０１００２１０６６５に記載されている。
ＡＲＮ−５０９：
Figure 0006599497
ＡＲＮ−５０９として、そして４−（７−（６−シアノ−５−（トリフルオロメチル）ピリジン−３−イル）−６，８−ジオキソ−５，７−ジアザスピロ［３．４］オクタン−５−イル）−２−フルオロ−Ｎ−メチルベンズアミドというＩＵＰＡＣ名によっても知られる、式ＸＩＩの化合物は、アンドロゲン受容体リガンド結合阻害剤である。ＡＲＮ−５０９と、本発明で提供される特定の態様における使用に適した追加のアンドロゲン受容体阻害剤については、その全体が参照により本明細書に組み込まれる、ＷＯ２００７１２６
７６５、ＷＯ２００８１１９０１５、及び米国特許出願公開公報番号２０１３／０１１６２５８に記載されている。
酢酸アビラテロン
酢酸アビラテロン及びＺＹＴＩＧＡ（登録商標）として、そして［（３Ｓ，８Ｒ，９Ｓ，１０Ｒ，１３Ｓ，１４Ｓ）−１０，１３−ジメチル−１７−（３−ピリジル）−２，３，４，７，８，９，１１，１２，１４，１５−デカヒドロ−１Ｈ−シクロペンタ［ａ］フェナントレン−３−イル］アセテートというＩＵＰＡＣ名によっても知られる、式ＸＩＩＩの化合物は、アンドロゲン生合成阻害剤であって、以下の化学式：
Figure 0006599497
を有する。酢酸アビラテロンの構造及び合成については、その全体が参照により本明細書に組み込まれる、Potter et al., Journal of Medicinal Chemistry (38(13), 2463-71, 1995) に記載されている。
ガレテロン：
ＴＯＫ−００１及びガレテロンとして、そして（３Ｓ，１０Ｒ，１３Ｓ）−１７−（１Ｈ−ベンゾ［ｄ］イミダゾール−１−イル）−１０，１３−ジメチル−２，３，４，７，８，９，１０，１１，１２，１３，１４，１５−ドデカヒドロ−１Ｈ−シクロペンタ［ａ］フェナントレン−３−オールというＩＵＰＡＣ名によっても知られる、式ＸＩＶの化合物は、以下の化学式を有する：
Figure 0006599497
ＴＯＫ−００１の構造及び合成については、その全体が参照により本明細書に組み込まれる、Handratta et al., (Journal of Medicinal Chemistry (2005), 48(8), 2972-84, 2005) に記載されている。
オルテロネル：
ＴＡＫ−７００及びオルテロネルとして、そして６−［７（Ｓ）−ヒドロキシ−６，７−ジヒドロ−５Ｈ−ピロロ［１，２−ｃ］イミダゾール−７−イル］−Ｎ−メチルナフタレン−２−カルボキサミドというＩＵＰＡＣ名によっても知られる、式ＸＶの化合物は、アンドロゲン生合成阻害剤であって、以下の化学式：
Figure 0006599497
を有する。ＴＡＫ−７００の構造及び合成については、Kaku et al., Bioorganic and Medicinal Chemistry (19(21), 6383-99, 2011) に記載されている。
Yinet al., (Int. J. Mol. Sci., 14(7): 13958-13978, 2013) では、去勢抵抗性前立
腺癌に対する、ＯＤＭ−２１、ＶＴ４６４、ＡＲＮ５０９、ＴＡＫ７００、及びＴＯＫ−００１が含まれる様々な薬物療法を用いた最新の進歩について考察されている。
特定の組合せと併用療法
特定の態様では、本明細書に記載される化合物を含んでなる第一薬剤を１以上の第二薬剤と同時投与する。特定の態様では、本明細書に記載される第一薬剤と同じ疾患、障害、又は状態を治療するためにそのような第二薬剤を設計する。特定の態様では、本明細書に記載される第一薬剤と異なる疾患、障害、又は状態を治療するためにそのような第二薬剤を設計する。特定の態様では、第二薬剤の望まれない副作用を治療するために第一薬剤を設計する。特定の態様では、第一薬剤の望まれない効果を治療するために第二薬剤を第一薬剤と同時投与する。特定の態様では、本明細書に記載されるような１以上の医薬組成物の望まれない副作用を治療するためにそのような第二薬剤を設計する。特定の態様では、組合せ効果をもたらすために第二薬剤を第一薬剤と同時投与する。特定の態様では、相乗効果をもたらすために第二薬剤を第一薬剤と同時投与する。特定の態様において、第一薬剤と第二薬剤の同時投与は、両剤を独立した療法として投与する場合の治療又は予防効果を達成するのに必要とされるより低い投与量の使用を可能にする。
特定の態様では、本発明で提供される１以上の化合物又は組成物を１以上の抗アンドロゲン剤と同時投与する。特定の態様では、本発明で提供される１以上の化合物又は組成物と１以上の抗アンドロゲン剤を異なる時間で投与する。特定の態様では、本発明で提供される１以上の化合物又は組成物と１以上の抗アンドロゲン剤を単一の製剤において一緒に調製する。特定の態様では、本発明で提供される１以上の化合物又は組成物と１以上の抗アンドロゲン剤を別々に調製する。特定の態様では、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、
ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より抗アンドロゲン剤を選択する。
本発明の特定の側面は、本明細書に記載されるようなヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向されるアンチセンス化合物の、抗アンドロゲン剤との組合せにおける使用へ向けられる。特別な態様では、癌に罹患している患者を治療する方法において、又は癌を治療するための医薬品の製造において、そのような使用がある。特定の態様において、癌は、前立腺癌、乳癌、卵巣癌、膀胱癌、又は胃癌より選択される。特別な抗アンドロゲン剤の群は、エンザルタミド（ＭＤＶ３１００）、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、酢酸アビラテロン、ガレテロン（ＴＯＫ００１）、オルテロネル（ＴＡＫ７００）、及びＶＴ４６４（Yin et al. 同上を参照のこと）のような第二世代の抗ホルモン剤である。
特定の側面は、本明細書に記載されるようなヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向されるアンチセンス化合物と、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される第二世代の抗ホルモン剤のような抗アンドロゲン剤の組合せへ注目する。
特定の態様において、本明細書に記載されるようなアンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向されるアンチセンス化合物と、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される第二世代の抗ホルモン剤のような抗アンドロゲン剤のそのような組合せは、癌細胞の成長又は増殖を阻害する、及び／又は癌を治療するのに有用である。特定の態様において、癌は、前立腺癌、乳癌、卵巣癌、膀胱癌、又は胃癌より選択される。特定の態様において、癌は、前立腺癌である。特定の態様において、癌は、乳癌である。特定の態様では、本明細書に記載されるようなＡＲへ標的指向されるアンチセンス化合物と、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される第二世代の抗ホルモン剤のような抗アンドロゲン剤が組合せにおいて相乗作用して、癌細胞の成長又は増殖を阻害する。いくつかの態様において、癌細胞は、去勢抵抗性であるか又は去勢抵抗性になった前立腺癌細胞である。様々な態様において、癌細胞は、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される第二世代抗のホルモン剤へ抵抗するか又は抵抗するようになった前立腺癌細胞である。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれもの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、又は２０個の隣接ヌクレオ塩基を含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれも含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれものヌクレオ塩基配列からなる修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、１６個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号３５、３９、４３、１２４、１５０、１５５、１６９、又は１７５からなるヌクレオチドレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様において、アンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５６９２１３、ＩＳＩＳ ５６９２１６、ＩＳＩＳ ５６９２２１、ＩＳＩＳ ５６９２３６、ＩＳＩＳ ５７９６７１、ＩＳＩＳ ５８６１２４、ＩＳＩＳ ５８３９１８、ＩＳＩＳ ５８４１４９、ＩＳＩＳ ５８４１６３、ＩＳＩＳ ５８４２６９、又はＩＳＩＳ ５８４４６８である。
いくつかの態様は、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向されるアンチセンス化合物と、ＭＤＶ３１００のような、式ＸＩのジアリールヒダントインＡＲ阻害剤の組合せへ注目する。いくつかの態様では、ジアリールヒダントインのアンドロゲン受容体（ＡＲ）阻害剤が、式ＸＶＩ：
Figure 0006599497
［式中、Ｘは、トリフルオロメチル及びヨードからなる群より選択され、ここでＷは、Ｏ及びＮＲ５からなる群より選択され、ここでＲ５は、Ｈ、メチル、及び
Figure 0006599497
｛式中、Ｄは、Ｓ又はＯであって、Ｅは、Ｎ又はＯであって、Ｇは、アルキル、アリール、置換アルキル、又は置換アリールである；又は、Ｄは、Ｓ又はＯであって、Ｅ−Ｇは、一緒に、Ｃ１−Ｃ４低級アルキルである｝からなる群より選択され、
式中、Ｒ１とＲ２は、一緒に、８個以下の炭素原子を含んで、アルキル、置換アルキル（ハロアルキルが含まれる）、及び（それらが連結する炭素と一緒になる場合の）シクロアルキル又は置換シクロアルキル基からなる群より選択され、
式中、Ｒ３は、水素、ハロゲン、メチル、Ｃ１−Ｃ４アルコキシ、ホルミル、ハロアセトキシ、トリフルオロメチル、シアノ、ニトロ、ヒドロキシル、フェニル、アミノ、メチルカルバモイル、メトキシカルボニル、アセトアミド、メタンスルホンアミノ、メタンスルホニル、４−メタンスルホニル−１−ピペラジニル、ピペラジニル、及びヒドロキシル、メトキシカルボニル、シアノ、アミノ、アミド、ニトロ、カルバモイル、又は置換カルバモイル（メチルカルバモイル、ジメチルカルバモイル、及びヒドロキシエチルカルバモイルが含まれる）で置換されていてもよいＣ１−Ｃ６アルキル若しくはアルケニルからなる群より選択され、
式中、Ｒ４は、水素、ハロゲン、アルキル、及びハロアルキルからなる群より選択され、そしてここでＲ３は、メチルアミノメチルでもジメチルアミノメチルでもなく；
Ｒ５は、
Figure 0006599497
であってよい］の化合物である。
特定の態様では、アンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向されるアンチセンス化合物と、ＭＤＶ３１００のような、式ＸＶＩのジアリールヒダントインＡＲ阻害剤のそのような組合せが、前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害する、及び／又は前立腺癌を治療するのに有用である。特定の態様では、ＡＲへ標的指向されるアンチセンス化合物と、ＭＤＶ３１００のような、式ＸＶＩのジアリールヒダントインＡＲ阻害剤が組合せにおいて相乗作用して、前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害する。いくつかの態様において、前立腺癌細胞は去勢抵抗性である。様々な態様において、前立腺癌細胞は、ＭＤＶ３１００のような、式ＸＶＩのジアリールヒダントインＡＲ阻害剤へ抵抗する。特定の態様において、前立腺癌細胞又は去勢抵抗性前立腺癌細胞は、全長ＡＲに優ってＡＲスプライシング変異体を選好的に発現する。特定の態様において、本明細書に記載されるようなＡＲへ標的指向されるアンチセンス化合物と他の抗アンドロゲン剤は、２つの薬剤を同時的、分離的、又は連続的に投与することによって、組合せ治療において使用される。特定の態様において、２つの薬剤は、一定用量の組合せ品として製剤化される。他の態様において、２つの薬剤は、患者へ別々の単位として提供されてから、同時的にも、一続きで（連続的に）も投与することができる。
特定の態様では、前立腺癌細胞及び／又は去勢抵抗性前立腺癌細胞の成長又は増殖を、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される第二世代の抗ホルモン剤のような別の抗アンドロゲン剤との組合せにおいて阻害するのに有用なアンチセンス化合物が、エクソン３の３’端の上流、及び／又はリガンド結合ドメインの上流でヒトアンドロゲン受容体に標的指向する。特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、本明細書に記載されるようなエクソン１、エクソン２、エクソン３、イントロン１、又はイントロン２内でＡＲに標的指向する。
特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、Ｎ末端ドメインをコードするエクソン１とＤＮＡ結合ドメインをコードするエクソン２及びエクソン３を包含するが、ショートヒンジ領域をコードするエクソン４の少なくとも一部もリガンド結合ドメインをコードするエクソン４〜エクソン８の少なくとも一部も包含しない、ＡＲスプライシング変異体に標的指向する。そのようなＡＲスプライシング変異体の例には、限定されないが、エクソン１〜エクソン３を含有するがエクソン４〜エクソン８を欠損する、ＡＲ−Ｖ７が含まれる。そのようなＡＲスプライシング変異体の追加の例には、例えば、ＡＲ３
、ＡＲ４、ＡＲ４ｂ、ＡＲ５、及びＡＲ６（それぞれ、配列番号４〜配列番号８）が含まれる。特定の態様において、前立腺癌細胞は、去勢抵抗性で有り得て、全長ＡＲに優ってＡＲスプライシング変異体を選好的に発現する。特別な態様において、前立腺癌細胞は、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤に対して去勢抵抗性である。特定の態様では、エクソン３の３’端の上流、及び／又はリガンド結合ドメインの上流でＡＲへ標的指向されるアンチセンス化合物が、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤との組合せにおいて、エクソン４へ標的指向されて、ＵＳ７，７３７，１２５に記載される配列番号５８に対応する、ＥＺＮ−４１７６のような、リガンド結合ドメインへ標的指向されるアンチセンス化合物のＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される同じ抗アンドロゲン剤との組合せより大きな程度で、去勢抵抗性前立腺癌細胞が含まれる前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害することが可能である。特定の態様において、本明細書に記載されるようなアンチセンス化合物と、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤の組合せは、去勢抵抗性前立腺癌細胞のような前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害することにおいて、アンチセンス化合物単独、又はＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤単独と比較して、相乗的な（例えば、相加より大きな）効果を提供する。従って、特定の態様において、アンチセンス化合物、及び／又はＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤の一方又は両方の量は、組合せにおいて使用される場合、前立腺癌細胞の成長又は増殖阻害の同等レベルを達成するのに必要な、アンチセンス化合物単独又はＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤単独のいずれか一方の対応量より少なくなり得る。
特定の態様では、前立腺癌細胞及び／又は去勢抵抗性前立腺癌細胞の成長又は増殖を、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤との組合せにおいて阻害するのに有用な、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、機能的なＤＮＡ結合ドメインを有するが機能的なリガンド結合ドメインを有さないＡＲスプライシング変異体に標的指向する。特定の態様では、アンチセンス化合物が、Ｎ末端ドメインをコードするエクソン１の全体又は少なくとも機能的な部分と、ＤＮＡ結合ドメインをコードするエクソン２及びエクソン３の全体又は少なくとも機能的な部分を包含するが、ショートヒンジ領域をコードするエクソン４の少なくとも機能的な部分も、リガンド結合ドメインをコードするエクソン４〜エクソン８の少なくとも機能的な部分も包含しないＡＲスプライシング変異体へ標的指向し得ることが理解されよう。本発明で提供されるアンチセンス化合物によって標的指向される、実質的にエクソン１〜エクソン３からなる特定のＡＲスプライシング変異体は、ゲノム領域又はエクソン４〜エクソン８由来の核酸配列の非機能的な部分も包含する場合があると考慮される。スプライシングプロセスは、ＤＮＡ結合機能を保持するがリガンド結合機能は保持しない、そのようなＡＲスプライシング変異体を生じる場合があると考慮される。特定の態様において、前立腺癌細胞は、去勢抵抗性で有り得て、全長ＡＲに優ってＡＲスプライシング変異体を選好的に発現する。特定の態様において、前立腺癌細胞は、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤に対して去勢抵抗性である。特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、エクソン３の３’端の上流、及び／又はリガンド結合ドメインの上流にあるエクソン１内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、本明細書に記載され
るようなエクソン１、エクソン２、エクソン３、イントロン１、又はイントロン２内でＡＲに標的指向する。
特定の態様では、機能的なＤＮＡ結合ドメインを有するが機能的なリガンド結合ドメインを有さないＡＲスプライシング変異体へ標的指向されるアンチセンス化合物が、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤との組合せにおいて、エクソン４へ標的指向されて、ＵＳ７，７３７，１２５に記載される配列番号５８に対応する、ＥＺＮ−４１７６のような、リガンド結合ドメインへ標的指向されるアンチセンス化合物のＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される同じ抗アンドロゲン剤との組合せより大きな程度で、去勢抵抗性前立腺癌細胞が含まれる前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害することが可能である。特定の態様において、アンチセンス化合物と、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤の組合せは、去勢抵抗性前立腺癌細胞のような前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害することにおいて、アンチセンス化合物単独、又は抗アンドロゲン剤単独と比較して、相乗的な（例えば、相加より大きな）効果を提供する。従って、特定の態様において、アンチセンス化合物、及び／又はＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤の一方又は両方の量は、組合せにおいて使用される場合、前立腺癌細胞の成長又は増殖阻害の同等レベルを達成するのに必要な、アンチセンス化合物単独又は抗アンドロゲン剤単独のいずれか一方の対応量より少なくなり得る。
特定の態様では、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤との組合せにおいて、前立腺癌細胞及び／又は去勢抵抗性前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害するのに有用な、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、全長ＡＲと、Ｎ末端ドメインをコードするエクソン１とＤＮＡ結合ドメインをコードするエクソン２及びエクソン３を包含するが、ショートヒンジ領域をコードするエクソン４の少なくとも一部もリガンド結合ドメインをコードするエクソン４〜エクソン８のいずれもの少なくとも一部も包含しないＡＲスプライシング変異体の両方の発現を低下させることが可能である。特定の態様では、そのようなアンチセンス化合物が、ヒトアンドロゲン受容体へリガンド結合ドメインの上流で標的指向する。特定の態様では、そのようなアンチセンス化合物が、ヒトアンドロゲン受容体へエクソン３の３’端の上流で標的指向する。特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、エクソン３の３’端の上流、及び／又はリガンド結合ドメインの上流にある、エクソン１内でＡＲに標的指向する。
特定の態様では、本明細書に記載されるようなヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向されるアンチセンス化合物と、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤の組合せを提供し、ここでアンチセンス化合物は、１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれもの少なくとも８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、又は２０個の隣接ヌクレオ塩基を含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様では、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向されるアンチセンス化合物と、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤の組合せを提供し、ここでアンチセンス化合物は、１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれも含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様では、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向されるアンチセンス化合物と、Ｍ
ＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤の組合せを提供し、ここでアンチセンス化合物は、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれものヌクレオ塩基配列からなる修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様では、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向されるアンチセンス化合物と、ＭＤＶ３１００のような、式ＸＩのジアリールヒダントインＡＲ阻害剤の組合せを提供し、ここでアンチセンス化合物は、１６個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号３５、３９、４３、１２４、１５０、１５５、１６９、又は１７５からなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の態様では、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向されるアンチセンス化合物と、ＭＤＶ３１００のような、式ＸＩのジアリールヒダントインＡＲ阻害剤の組合せを提供し、ここでアンドロゲン受容体へ標的指向されるアンチセンス化合物は、ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５６９２１３、ＩＳＩＳ ５６９２１６、ＩＳＩＳ ５６９２２１、ＩＳＩＳ ５６９２３６、ＩＳＩＳ ５７９６７１、ＩＳＩＳ ５８６１２４、ＩＳＩＳ ５８３９１８、ＩＳＩＳ ５８４１４９、ＩＳＩＳ ５８４１６３、ＩＳＩＳ ５８４２６９、又はＩＳＩＳ ５８４４６８である。
いくつかの態様は、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向されるアンチセンス化合物とＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤と前立腺癌細胞を接触させることを含んでなる、前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害する方法へ注目する。特定の態様において、アンチセンス化合物とＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤は、組合せにおいて相乗作用して、前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害する。いくつかの態様において、前立腺癌細胞は、去勢抵抗性である。様々な態様において、前立腺癌細胞は、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤へ抵抗することによって去勢抵抗性である。特定の態様において、前立腺癌細胞又は去勢抵抗性前立腺癌細胞は、全長ＡＲに優ってＡＲスプライシング変異体を選好的に発現する。
先述の態様のいずれもの特定の側面では、ＭＤＶ３１００のような、式ＸＶＩのジアリールヒダントインＡＲ阻害剤との組合せにおいて前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害するのに有用なアンチセンス化合物が、（ｉ）エクソン３の３’端の上流で、及び／又はリガンド結合ドメインの上流でヒトアンドロゲン受容体に、又は（ｉｉ）機能的なＤＮＡ結合ドメインを有するが機能的なリガンド結合ドメインを有さないＡＲスプライシング変異体に標的指向することができる；及び／又は、（ｉ）全長ＡＲと、Ｎ末端ドメインをコードするエクソン１とＤＮＡ結合ドメインをコードするエクソン２及びエクソン３を包含するが、ショートヒンジ領域をコードするエクソン４の少なくとも一部もリガンド結合ドメインをコードするエクソン４〜エクソン８のいずれもの少なくとも一部も包含しない、ＡＲスプライシング変異体の両方の発現を低下させることが可能である；但し、このアンチセンス化合物は、下記の表Ａにおいて確定される配列番号９４〜配列番号２１５のいずれからもなるヌクレオ塩基配列を有さないことが条件である。
表Ａ
Figure 0006599497
先述の態様のいずれもの特定の側面では、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤へ抵抗する前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害するのに有用なアンチセンス化合物が、ＥＺＮ−４１７６のような、リガンド結合ドメインへ標的指向されるアンチセンス化合物より大きな程度で、（ｉ）エクソン３の３’端の上流で、及び／又はリガンド結合ドメインの上流でヒトアンドロゲン受容体に、又は（ｉｉ）機能的なＤＮＡ結合ドメインを有するが機能的なリガンド結合ドメインを有さないＡＲスプライシング変異体に標的指向することができる；及び／又は、（ｉ）全長ＡＲと、Ｎ末端ドメインをコードするエクソン１とＤＮＡ結合ドメインをコードするエクソン２及びエクソン３を包含するが、ショートヒンジ領域をコードするエクソン４の少なくとも一部もリガンド結合ドメインをコードするエクソン４〜エクソン８のいずれもの少なくとも一部も包含しない、ＡＲスプライシング変異体の両方の発現を低下させること；又は（ｉｉ）抵抗性前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害することが可能である；但し、このアンチセンス化合物は、配列番号２〜９、４９〜５０、５２〜５３、５５〜５６、及び８６〜９３（参照により本明細書に組み込まれる）としてＵＳ７，７３７，１２５に記載されて、表Ａにおいて確定された、
配列番号１９４〜配列番号２１５のいずれからもなるヌクレオ塩基配列を有さないことが条件である。
特定の側面は、本明細書に記載されるようなヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向されるアンチセンスオリゴヌクレオチドで乳癌を治療する方法と乳癌細胞の成長又は増殖を阻害する方法へ向けられる。特定の態様において、乳癌は、以下の特徴の１以上を有する：アンドロゲン受容体陽性（成長をアンドロゲンに依存する）、エストロゲン受容体（ＥＲ）陰性（成長をエストロゲンに依存しない）、プロゲステロン受容体（ＰＲ）陰性（成長をプロゲステロンに依存しない）、又はＨｅｒ２／ｎｅｕ陰性。特定の態様において、乳癌又は乳癌細胞は、アポクリンである。
特定の態様は、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向されるアンチセンス化合物を被験者へ投与することを含んでなる、該被験者において乳癌を治療する方法へ注目する。特定の態様は、乳癌を有する被験者を同定することと、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向されるアンチセンス化合物を該被験者へ投与すること、それによって被験者の乳癌を治療することを含んでなる、該被験者において乳癌を治療する方法へ注目する。特定の態様は、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向されるアンチセンス化合物と乳癌細胞を接触させることを含んでなる、乳癌細胞の成長又は増殖を阻害する方法へ向けられる。特定の態様は、被験者の乳癌を同定することと、ヒトＡＲへ標的指向されるアンチセンス化合物を該被験者へ投与する（ここでアンチセンス化合物は、被験者においてＡＲ発現を阻害する）ことを含んでなる、乳癌を有するか又は有するリスク状態にある被験者においてＡＲ発現を阻害する方法に関する。
特定の態様において、乳癌又は乳癌細胞は、以下の特徴の１以上を有する：アンドロゲン受容体陽性（成長をアンドロゲンに依存する）、エストロゲン受容体（ＥＲ）陰性（成長をエストロゲンに依存しない）、プロゲステロン受容体（ＰＲ）陰性（成長をプロゲステロンに依存しない）、又はＨｅｒ２／ｎｅｕ陰性。特定の態様において、乳癌又は乳癌細胞は、ＥＲ、ＰＲ、及びＨＥＲ２トリプルネガティブであってＡＲ陽性（ＥＲ−、ＰＲ−、ＨＥＲ２−、ＡＲ＋）である。特定の態様において、乳癌又は乳癌細胞は、ＥＲ陰性でＡＲ陽性（ＥＲ−、ＡＲ＋）である。特定の態様において、乳癌又は乳癌細胞は、ＥＲ陽性でＡＲ陽性（ＥＲ＋、ＡＲ＋）である。
特定の態様において、乳癌又は乳癌細胞は、アポクリンである。アポクリン乳癌は、しばしば「トリプルネガティブ」であり、その細胞がＥＲ、ＰＲ、又はＨＥＲ２受容体も発現せず、そして、必ずというわけではないが、通常はＡＲ陽性であることを意味する。特定の態様では、アポクリン乳癌又は乳癌細胞がＥＲ、ＰＲ、及びＨＥＲ２トリプルネガティブであってＡＲ陽性（ＥＲ−、ＰＲ−、ＨＥＲ２−、ＡＲ＋）である。特定の態様では、アポクリン乳癌又は乳癌細胞がＥＲ陰性でＡＲ陽性（ＥＲ−、ＡＲ＋）である。特定の態様では、アポクリン乳癌又は乳癌細胞が乳房の汗腺に由来する。いくつかの態様では、アポクリン乳癌又は乳癌細胞が乳房の乳管癌又は癌細胞である。特定の態様では、アポクリン乳癌が以下の特徴のいずれか１以上を有する可能性がある：大量の顆粒状の好酸性細胞質、明瞭な辺縁、大きな胞核、約１：２の核：細胞質比、及び／又は頂部突出像として知られる、頂端細胞質に分泌される顆粒の蓄積。
特定の態様において、乳癌又は乳癌細胞は、ＥＲ陰性でＡＲ陽性（ＥＲ−、ＡＲ＋）の分子アポクリン乳癌又は乳癌細胞である。特定の側面では、ＥＲ陰性でＡＲ陽性（ＥＲ−、ＡＲ＋）の分子アポクリン乳癌又は乳癌細胞が、さらにＰＲ陽性、ＰＲ陰性、ＨＥＲ２陰性、又はＨＥＲ２陽性であり得る。
乳癌は、標準的な組織学的技術によって、ＥＲ、ＰＲ、又はＨＥＲ２のようなホルモン
受容体に関して、陽性又は陰性と同定することができる。例えば、組織学的乳癌試料は、エストロゲン受容体とプロゲステロン受容体の核染色を示す細胞が１％未満であって、ＨＥＲ２の免疫組織化学染色が、関連のＡＳＣＯ及びＣＡＰガイドライン（Meyer, P. et al., PLoS ONE7(5): e38361 (2012)）に従って、０、１倍、又は２倍の陽性スコアと１．
８未満のＦＩＳＨ比（第１７染色体シグナルに対するＨＥＲ２遺伝子シグナル）を示す場合、「トリプルネガティブ」（ＥＲ−、ＰＲ−、ＨＥＲ２−）と分類することができる。
特定の態様では、本発明で提供される、乳癌を治療するか又は乳癌細胞標的の成長又は増殖を阻害するのに有用なアンチセンス化合物が、エクソン３の３’端の上流、及び／又はリガンド結合ドメインの上流にあるエクソン１内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、エクソン１内で、例えば配列番号１のヌクレオチド領域：２８６３〜５５９３（エクソン１）又は２７６７２〜２７８５３（エクソン１Ｂ）内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、ＡＲのエクソン１へ標的指向される、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、配列番号１の以下のヌクレオチド領域のいずれの内でも相補的である：３３５３〜３３６８、３３６１〜３３７６、３５１９〜３５３４、３７３５〜３７５０、３７６８〜３７８３、３７９８〜３８１３、３７９９〜３８１４、３８５１〜３８６６、３８７０〜３８８５、３８７４〜３８８９、３８８８〜３９０３、４０４７〜４０６２、４０６２〜４０７７、４１０９〜４１２４、４５３４〜４５４９、４５３７〜４５５２、４５５５〜４５７０、４５７１〜４５８６、４５７３〜４５８８、４５７８〜４５９３、４６５５〜４６７０、４７５０〜４７６５、４７５２〜４７６７、４８３３〜４８４８、４８３７〜４８５２、４８３９〜４８５４、４８６５〜４８８０、４８７２〜４８８７、４８７４〜４８８９、４８７６〜４８９１、４９１６〜４９３１、４９１８〜４９３３、５０５２〜５０６７、５０５４〜５０６９、５０６０〜５０７５、５０６１〜５０７６、５０６１〜５０７６、５０６２〜５０７７、５１５５〜５１７０、５２６５〜５２８０、５２９３〜５３０８、５３９２〜５４０７、５４４８〜５４６３、５４８３〜５４９８、５４８６〜５５０１、又は５４９４〜５５０９。
特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、エクソン３の３’端の上流、及び／又はリガンド結合ドメインの上流にあるエクソン２内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、本発明で提供される、乳癌を治療するか又は乳癌細胞標的の成長又は増殖を阻害するのに有用なアンチセンス化合物が、エクソン２内で、例えば配列番号１のヌクレオチド領域：１０２０８７〜１０２２３８（エクソン２）又は１３９５５１〜１３９８３４（エクソン２ｃ）内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、本発明で提供される、ＡＲのエクソン２へ標的指向されるアンチセンス化合物が、配列番号１の以下のヌクレオチド領域のいずれの内でも相補的である：１０２１５５〜１０２１７０又は１０２１５６〜１０７１７１。
特定の側面では、本発明で提供される、乳癌を治療するか又は乳癌細胞の成長又は増殖を阻害するのに有用なアンチセンス化合物が、エクソン３の３’端の上流、及び／又はリガンド結合ドメインの上流にあるイントロン１内でＡＲに標的指向する。特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、イントロン１内で、例えば配列番号１のヌクレオチド領域：５５９４−２７６７１又は２７８５４−１０２０８６内でＡＲに標的指向する。特定の側面では、ＡＲのイントロン１へ標的指向される、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、配列番号１の以下のヌクレオチド領域のいずれの内でも相補的である：５６６６〜５６８１、６７０１〜６７１６、７５４３〜７５５８、８４７１〜８４８６、８６３８〜８６５３、９４６４〜９４７９、１０８６５〜１０８８０、１１１９７〜１１２１２、１１８５５〜１１８７０、１３１８９〜１３２０４、１３３２１〜１３３３６、１３３４６〜１３３６１、１６７９３〜１６８０８、１６９６８〜１６９８３、１７２０６〜１７２２１、１８８６５〜１８８８０、３２２９０〜３２３０５、３３３１５〜３３３３０、３９０５５〜３９０７０、４０６１５〜４０６３０、４２０１７〜４２０３
２、５６０５０〜５６０６５、５８７１９〜５８７３４、５８７２０〜５８７３５、５８７２１〜５８７３６、５８７２２〜５８７３７、５８７２３〜５８７３８、５８７２５〜５８７４０、５８７５０〜５８７６５、５８７５１〜５８７６６、５８７５２〜５８７６７、５８７５３〜５８７６８、５８７５４〜５８７６９、又は５８７５５〜５８７７０。
先述の態様のいずれものいくつかの側面では、乳癌を治療するか又は乳癌細胞の成長又は増殖を阻害するのに有用なアンチセンス化合物が、エクソン３の３’端の上流、及び／又はリガンド結合ドメインの上流でヒトアンドロゲン受容体に標的指向する。特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物が、限定されないが、エクソン３の３’端の上流、及び／又はリガンド結合ドメインの上流でヒトアンドロゲン受容体に標的指向するものを含めて、ＥＺＮ−４１７６のような、リガンド結合ドメインへ標的指向されるアンチセンス化合物より大きな程度で、乳癌を治療するか又は乳癌細胞の成長又は増殖を阻害することができる；但し、このアンチセンス化合物は、配列番号２〜９、４９〜５０、５２〜５３、５５〜５６、及び８６〜９３（参照により本明細書に組み込まれる）としてＵＳ７，７３７，１２５に記載されて、表Ａにおいて確定された、配列番号１９４〜配列番号２１５のいずれからもなるヌクレオ塩基配列を有さないことが条件である。
アンチセンス化合物
オリゴマー化合物には、限定されないが、オリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオシド、オリゴヌクレオチド類似体、オリゴヌクレオチド模倣体、アンチセンス化合物、アンチセンスオリゴヌクレオチド、及びｓｉＲＮＡが含まれる。オリゴマー化合物は、標的核酸に対して「アンチセンス」であり得て、それが標的核酸へのハイブリダイゼーションを水素結合を介して行うことが可能であることを意味する。
特定の態様では、アンチセンス化合物が、５’→３’方向で書くときに、それが標的指向される標的核酸の標的セグメントの逆相補配列（reverse complement）を含むヌクレオ塩基配列を有する。そのような特定の態様では、アンチセンスオリゴヌクレオチドが、５’→３’方向で書くときに、それが標的指向される標的核酸の標的セグメントの逆相補配列を含むヌクレオ塩基配列を有する。
特定の態様では、アンチセンス化合物が１０〜３０個のサブユニットの長さである。特定の態様では、アンチセンス化合物が１２〜３０個のサブユニットの長さである。特定の態様では、アンチセンス化合物が１２〜２２個のサブユニットの長さである。特定の態様では、アンチセンス化合物が１４〜３０個のサブユニットの長さである。特定の態様では、アンチセンス化合物が１４〜２０個のサブユニットの長さである。特定の態様では、アンチセンス化合物が１５〜３０個のサブユニットの長さである。特定の態様では、アンチセンス化合物が１５〜２０個のサブユニットの長さである。特定の態様では、アンチセンス化合物が１６〜３０個のサブユニットの長さである。特定の態様では、アンチセンス化合物が１６〜２０個のサブユニットの長さである。特定の態様では、アンチセンス化合物が１７〜３０個のサブユニットの長さである。特定の態様では、アンチセンス化合物が１７〜２０個のサブユニットの長さである。特定の態様では、アンチセンス化合物が１８〜３０個のサブユニットの長さである。特定の態様では、アンチセンス化合物が１８〜２１個のサブユニットの長さである。特定の態様では、アンチセンス化合物が１８〜２０個のサブユニットの長さである。特定の態様では、アンチセンス化合物が２０〜３０個のサブユニットの長さである。換言すると、そのようなアンチセンス化合物は、それぞれ、１２〜３０個の連結サブユニット、１４〜３０個の連結サブユニット、１４〜２０個のサブユニット、１５〜３０個のサブユニット、１５〜２０個のサブユニット、１６〜３０個のサブユニット、１６〜２０個のサブユニット、１７〜３０個のサブユニット、１７〜２０個のサブユニット、１８〜３０個のサブユニット、１８〜２０個のサブユニット、１８〜２１個のサブユニット、２０〜３０個のサブユニット、又は１２〜２２個の連結サブユニッ
トである。特定の態様では、アンチセンス化合物が１４個のサブユニットの長さである。特定の態様では、アンチセンス化合物が１６個のサブユニットの長さである。特定の態様では、アンチセンス化合物が１７個のサブユニットの長さである。特定の態様では、アンチセンス化合物が１８個のサブユニットの長さである。特定の態様では、アンチセンス化合物が２０個のサブユニットの長さである。他の態様において、アンチセンス化合物は、８〜８０、１２〜５０、１３〜３０、１３〜５０、１４〜３０、１４〜５０、１５〜３０、１５〜５０、１６〜３０、１６〜５０、１７〜３０、１７〜５０、１８〜２２、１８〜２４、１８〜３０、１８〜５０、１９〜２２、１９〜３０、１９〜５０、又は２０〜３０個の連結サブユニットである。そのような特定の態様において、アンチセンス化合物は、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１、７２、７３、７４、７５、７６、７７、７８、７９、又は８０個の連結サブユニットの長さであるか又は、上記の数値の任意の２つによって確定される範囲である。いくつかの態様において、アンチセンス化合物は、アンチセンスオリゴヌクレオチドであって、連結サブユニットは、ヌクレオチドである。
特定の態様では、アンチセンスオリゴヌクレオチドが短縮化又は先端切断（truncated
）されてよい。例えば、単一のサブユニットを５’端から欠失（５’トランケーション）させても、あるいは３’端から欠失（３’トランケーション）させてもよい。アンドロゲン受容体核酸へ標的指向される、短縮化又は先端切断されるアンチセンス化合物では、２個のサブユニットがアンチセンス化合物の５’端から欠失しても、あるいは２個のサブユニットがその３’端から欠失してもよい。あるいは、欠失したヌクレオシドは、アンチセンス化合物全体に分散してよく、例えば、あるアンチセンス化合物では、１個のヌクレオシドが５’端から欠失して、１個のヌクレオシドが３’端から欠失している。
延長されたアンチセンス化合物に単一の追加サブユニットが存在する場合、この追加サブユニットは、アンチセンス化合物の５’端又は３’端に位置してよい。２個以上の追加サブユニットが存在する場合、付加したサブユニットは、互いに隣接してよく、例えば、あるアンチセンス化合物では、２個のサブユニットがアンチセンス化合物の５’端へ付加される（５’付加）、またあるいは、その３’端へ付加される（３’付加）。あるいは、付加したサブユニットは、アンチセンス化合物全体に分散してよく、例えば、あるアンチセンス化合物では、１個のサブユニットが５’端へ付加されて、１個のサブユニットが３’端へ付加される。
活性を消失させることなく、アンチセンスオリゴヌクレオチドのようなアンチセンス化合物の長さを増やすか又は減らすこと、及び／又はミスマッチ塩基を導入することが可能である。例えば、Woolf et al．（Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89: 7305-7309, 1992）では、１３〜２５個のヌクレオ塩基の長さである一連のアンチセンスオリゴヌクレオチドについて、卵母細胞注入モデルにおいて、標的ＲＮＡの切断を誘導するその能力が試験された。その末端付近に８又は１１個のミスマッチ塩基がある、２５個のヌクレオ塩基の長さであるアンチセンスオリゴヌクレオチドは、ミスマッチを含有しないアンチセンスオリゴヌクレオチドより少ない程度であったものの、標的ｍＲＮＡ特異的な切断を指令することができた。同様に、１又は３個のミスマッチがあるものを含めて、１３個のヌクレオ塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチドを使用して、標的特異的な切断が達成された。
Gautschi et al.（J. Natl. Cancer Inst. 93:463-471, March 2001）は、ｂｃｌ−２ ｍＲＮＡに対して１００％の相補性を有して、ｂｃｌ−ｘＬ ｍＲＮＡに対して３個の
ミスマッチを有するオリゴヌクレオチドの、ｂｃｌ−２とｂｃｌ−ｘＬの両方の発現を試験管内と生体内で低下させる能力を実証した。さらに、このオリゴヌクレオチドは、強力な抗腫瘍活性を生体内で明示した。
Maher and Dolnick（Nuc. Acid. Res. 16: 3341-3358, 1988）は、一連のタンデムな１４個のヌクレオ塩基アンチセンスオリゴヌクレオチドと、このタンデムアンチセンスオリゴヌクレオチドの２又は３個の配列を含む２８及び４２個のヌクレオ塩基アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれについて、ウサギ網状赤血球アッセイにおいて、ヒトＤＨＦＲの翻訳を阻むその能力を試験した。３種の１４個ヌクレオ塩基アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれが、２８又は４２個のヌクレオ塩基アンチセンスオリゴヌクレオチドより控えめなレベルであったものの、単独で翻訳を阻害することができた。
特定のアンチセンス化合物のモチーフ及び機序
特定の態様では、アンチセンス化合物が、阻害活性の増強、標的核酸への結合親和性の増加、又は生体内ヌクレアーゼによる分解への抵抗性といった特性をそのアンチセンス化合物へ付与するパターン又はモチーフで配置される、化学修飾サブユニットを有する。
キメラアンチセンス化合物は、典型的には、ヌクレアーゼ分解への抵抗性の増加、細胞取込みの増加、標的核酸への結合親和性の増加、及び／又は阻害活性の増加を付与するように修飾された少なくとも１つの領域を含有する。キメラアンチセンス化合物の第二領域は、別の所望される特性（例えば、ＲＮＡ：ＤＮＡ二重鎖のＲＮＡ鎖を切断する、細胞内エンドヌクレアーゼ、ＲＮアーゼＨへの基質として役立つこと）を付与してよい。
アンチセンス活性は、アンチセンス化合物（例、オリゴヌクレオチド）の標的核酸とのハイブリダイゼーションが関与するどの機序より生じてよく、ここでハイブリダイゼーションは、最終的に、生物学的効果をもたらす。特定の態様において、標的核酸の量及び／又は活性は、調節される。特定の態様において、標的核酸の量及び／又は活性は、低下する。特定の態様では、アンチセンス化合物の標的核酸へのハイブリダイゼーションが、最終的に標的核酸の分解をもたらす。特定の態様では、アンチセンス化合物の標的核酸へのハイブリダイゼーションが標的核酸の分解をもたらさない。そのような特定の態様において、標的核酸とハイブリダイズしたアンチセンス化合物の存在（占有）は、アンチセンス活性の調節をもたらす。特定の態様では、化学修飾の特別な化学モチーフ又はパターンを有するアンチセンス化合物が、１以上の機序を利用するのに特に適している。特定の態様では、アンチセンス化合物が、１より多い機序により、及び／又は解明されていない機序により機能する。従って、本明細書に記載されるアンチセンス化合物は、特別な機序によって限定されない。
アンチセンス機序には、限定無しに、ＲＮアーゼＨ媒介性のアンチセンス；ＲＮＡｉ機序（これは、ＲＩＳＣ経路を利用して、限定無しに、ｓｉＲＮＡ、ｓｓＲＮＡ、及びマイクロＲＮＡの機序が含まれる）；及び、占有ベースの機序が含まれる。特定のアンチセンス化合物は、１より多いそのような機序により、及び／又は追加の機序により機能する場合がある。
ＲＮアーゼＨ媒介性のアンチセンス
特定の態様では、アンチセンス活性が、少なくとも一部は、標的ＲＮＡのＲＮアーゼＨによる分解より生じる。ＲＮアーゼＨは、ＲＮＡ：ＤＮＡ二重鎖のＲＮＡ鎖を切断する細胞内エンドヌクレアーゼである。当該技術分野では、「ＤＮＡ様」である一本鎖アンチセンス化合物が哺乳動物細胞においてＲＮアーゼＨ活性を誘発することが知られている。従って、ＤＮＡ又はＤＮＡ様ヌクレオシドの少なくとも一部を含んでなるアンチセンス化合物は、ＲＮアーゼＨを活性化して、標的核酸の切断をもたらす場合がある。特定の態様では
、ＲＮアーゼＨを利用するアンチセンス化合物が１以上の修飾ヌクレオシドを含む。特定の態様では、そのようなアンチセンス化合物が１〜８個の修飾ヌクレオシドの少なくとも１つのブロックを含む。そのような特定の態様において、修飾ヌクレオシドは、ＲＮアーゼＨ活性を支援しない。特定の態様では、そのようなアンチセンス化合物が、本明細書に記載されるようなギャップマーである。そのような特定の態様において、ギャップマーのギャップは、ＤＮＡヌクレオシドを含む。そのような特定の態様において、ギャップマーのギャップは、ＤＮＡ様ヌクレオシドを含む。そのような特定の態様において、ギャップマーのギャップは、ＤＮＡヌクレオシドとＤＮＡ様ヌクレオシドを含む。
ギャップマーモチーフを有する特定のアンチセンス化合物は、キメラアンチセンス化合物とみなされる。ギャップマーでは、ＲＮアーゼＨ切断を支援する複数のヌクレオチドを有する内部領域が、内部領域のヌクレオシドとは化学的に異なる複数のヌクレオチドを有する外部領域の間に位置している。ギャップマーモチーフを有するアンチセンスオリゴヌクレオチドの場合、ギャップセグメントは、概してエンドヌクレアーゼ切断の基質として役立ち、一方ウィングセグメントは、修飾ヌクレオシドを含む。特定の態様において、ギャップマーの領域は、それぞれの異なる領域を含んでなる糖部分の種類によって区別される。ギャップマーの領域を区別するのに使用される糖部分の種類には、特定の態様において、β−Ｄ−リボヌクレオシド、β−Ｄ−デオキシリボヌクレオシド、２’−修飾ヌクレオシド（このような２’−修飾ヌクレオシドには、とりわけ、２’−ＭＯＥと２’−Ｏ−ＣＨ３が含まれ得る）、及び二環式糖修飾ヌクレオシド（このような二環式糖修飾ヌクレオシドには、拘束エチルを有するものが含まれ得る）が含まれ得る。特定の態様では、ウィング中のヌクレオシドに、例えば、２’−ＭＯＥと拘束エチル又はＬＮＡのような二環式糖部分を含めて、いくつかの修飾糖部分が含まれ得る。特定の態様では、ウィングにいくつかの修飾及び非修飾糖部分が含まれ得る。特定の態様では、ウィングに２’−ＭＯＥヌクレオシド、拘束エチルヌクレオシド又はＬＮＡヌクレオシドのような二環式糖部分、及び２’−デオキシヌクレオシドの様々な組合せが含まれ得る。
それぞれの個別領域は、均一の糖部分、変異体、又は交互の糖部分を含み得る。ウィング−ギャップ−ウィングモチーフは、しばしば「Ｘ−Ｙ−Ｚ」と記載され、ここで「Ｘ」は、５’−ウィングの長さを表し、「Ｙ」は、ギャップの長さを表し、そして「Ｚ」は、３’−ウィングの長さを表す。「Ｘ」と「Ｚ」は、均一、変異体、又は交互の糖部分を含み得る。特定の態様では、「Ｘ」と「Ｙ」に１以上の２’−デオキシヌクレオシドが含まれ得る。「Ｙ」は、２’−デオキシヌクレオシドを含み得る。本明細書に使用するように、「Ｘ−Ｙ−Ｚ」として記載されるギャップマーは、ギャップが５’−ウィングと３’−ウィングのそれぞれに対してすぐ隣に位置しているような配置を有する。従って、５’−ウィングとギャップの間にも、ギャップと３’−ウィングの間にも、介在するヌクレオチドが存在しない。本明細書に記載されるアンチセンス化合物のいずれも、ギャップマーモチーフを有する可能性がある。特定の態様では、「Ｘ」と「Ｚ」が同じであり；他の態様では、それらが異なっている。特定の態様では、「Ｙ」が８個と１５個の間のヌクレオシドである。Ｘ、Ｙ、又はＺは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２５、３０個以上のヌクレオシドのいずれでもあり得る。
特定の態様において、アンドロゲン受容体核酸へ標的指向されるアンチセンス化合物は、ギャップが６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、又は１６個の連結ヌクレオシドからなる、ギャップマーモチーフを有する。
特定の態様において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、以下のような式Ａによって記載される糖モチーフを有する：（Ｊ）ｍ−（Ｂ）ｎ−（Ｊ）ｐ−（Ｂ）ｒ−（Ａ）ｔ−（Ｄ）ｇ−（Ａ）ｖ−（Ｂ）ｗ−（Ｊ）ｘ−（Ｂ）ｙ−（Ｊ）ｚ
［式中：
それぞれのＡは、独立して、２’−置換ヌクレオシドであり；
それぞれのＢは、独立して、二環式ヌクレオシドであり；
それぞれのＪは、独立して、２’−置換ヌクレオシド又は２’−デオキシヌクレオシドのいずれかであり；
それぞれのＤは、２’−デオキシヌクレオシドであり；
ｍは、０〜４であり；ｎは、０〜２であり；ｐは、０〜２であり；ｒは、０〜２であり；ｔは、０〜２であり；ｖは、０〜２であり；ｗは、０〜４であり；ｘは、０〜２であり；ｙは、０〜２であり；ｚは、０〜４であり；ｇは、６〜１４である；
但し：
ｍ、ｎ、及びｒの少なくとも１つは、０以外であり；
ｗとｙの少なくとも１つは、０以外であり；
ｍ、ｎ、ｐ、ｒ、及びｔの合計は、２〜５であり；そして
ｖ、ｗ、ｘ、ｙ、及びｚの合計は、２〜５である］。
ＲＮＡｉ化合物
特定の態様では、アンチセンス化合物が、干渉性ＲＮＡ化合物（ＲＮＡｉ）でありこれには、二本鎖ＲＮＡ化合物（短鎖干渉性ＲＮＡ又はｓｉＲＮＡとも呼ばれる）と一本鎖ＲＮＡｉ化合物（又はｓｓＲＮＡ）が含まれる。そのような化合物は、少なくとも一部はＲＩＳＣ経路を介して作用して、標的核酸を分解する、及び／又は捕捉する（従って、マイクロＲＮＡ／マイクロＲＮＡ模倣化合物が含まれる）。特定の態様では、アンチセンス化合物が、それらをそのような機序へ特に適したものとする修飾を含む。
ｉ ｓｓＲＮＡ化合物
特定の態様では、アンチセンス化合物が、一本鎖ＲＮＡｉ化合物（ｓｓＲＮＡ）としての使用に特に適したものを含めて、修飾された５’末端を含む。そのような特定の態様において、５’末端は、修飾リン酸部分を含む。特定の態様では、そのような修飾リン酸が安定化されている（例えば、非修飾５’−リン酸に比べて、分解／切断へ抵抗する）。特定の態様では、そのような５’末端ヌクレオシドが５’−リン部分を安定化する。当該技術分野では、例えばＷＯ／２０１１／１３９７０２に、特定の修飾された５’末端ヌクレオシドを見出し得る。
特定の態様において、ｓｓＲＮＡ化合物の５’−ヌクレオシドは、式ＩＩｃ：
Figure 0006599497
［式中：
Ｔ１は、保護化されていてもよいリン部分であり；
Ｔ２は、式ＩＩｃの化合物をオリゴマー化合物へ連結するヌクレオシド間連結基であり；
Ａは、以下の式：
Figure 0006599497
の一つを有し、
Ｑ１とＱ２は、それぞれ独立して、Ｈ、ハロゲン、Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、Ｃ１−Ｃ６アルコキシ、置換Ｃ１−Ｃ６アルコキシ、Ｃ２−Ｃ６アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルケニル、Ｃ２−Ｃ６アルキニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルキニル、又はＮ（Ｒ３）（Ｒ４）であり；
Ｑ３は、Ｏ、Ｓ、Ｎ（Ｒ５）、又はＣ（Ｒ６）（Ｒ７）であり；
それぞれのＲ３、Ｒ４、Ｒ５、Ｒ６、及びＲ７は、独立して、Ｈ、Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、又はＣ１−Ｃ６アルコキシである｝の１つを有し；
Ｍ３は、Ｏ、Ｓ、ＮＲ１４、Ｃ（Ｒ１５）（Ｒ１６）、Ｃ（Ｒ１５）（Ｒ１６）Ｃ（Ｒ１７）（Ｒ１８）、Ｃ（Ｒ１５）＝Ｃ（Ｒ１７）、ＯＣ（Ｒ１５）（Ｒ１６）、又はＯＣ（Ｒ１５）（Ｂｘ２）であり；
Ｒ１４は、Ｈ、Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、Ｃ１−Ｃ６アルコキシ、置換Ｃ１−Ｃ６アルコキシ、Ｃ２−Ｃ６アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルケニル、Ｃ２−Ｃ６アルキニル、又は置換Ｃ２−Ｃ６アルキニルであり；
Ｒ１５、Ｒ１６、Ｒ１７、及びＲ１８は、それぞれ独立して、Ｈ、ハロゲン、Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、Ｃ１−Ｃ６アルコキシ、置換Ｃ１−Ｃ６アルコキシ、Ｃ２−Ｃ６アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルケニル、Ｃ２−Ｃ６アルキニル、又は置換Ｃ２−Ｃ６アルキニルである；
Ｂｘ１は、複素環式塩基部分である；
又はＢｘ２が存在するならば、Ｂｘ２が複素環式塩基部分であって、Ｂｘ１は、Ｈ、ハロゲン、Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、Ｃ１−Ｃ６アルコキシ、置換Ｃ１−Ｃ６アルコキシ、Ｃ２−Ｃ６アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルケニル、Ｃ２−Ｃ６アルキニル、又は置換Ｃ２−Ｃ６アルキニルであり；
Ｊ４、Ｊ５、Ｊ６、及びＪ７は、それぞれ独立して、Ｈ、ハロゲン、Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、Ｃ１−Ｃ６アルコキシ、置換Ｃ１−Ｃ６アルコキシ、Ｃ２−Ｃ６アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルケニル、Ｃ２−Ｃ６アルキニル、又は置換Ｃ２−Ｃ６アルキニルである；
又はＪ４は、Ｊ５又はＪ７の１つと架橋を形成し、ここで前記架橋は、Ｏ、Ｓ、ＮＲ１９、Ｃ（Ｒ２０）（Ｒ２１）、Ｃ（Ｒ２０）＝Ｃ（Ｒ２１）、Ｃ［＝Ｃ（Ｒ２０）（Ｒ２１）］、及びＣ（＝Ｏ）より選択される１〜３個の連結二端遊離基を含んで、Ｊ５、Ｊ６、及びＪ７の他の２つは、それぞれ独立して、Ｈ、ハロゲン、Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、Ｃ１−Ｃ６アルコキシ、置換Ｃ１−Ｃ６アルコキシ、Ｃ２−Ｃ６アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルケニル、Ｃ２−Ｃ６アルキニル、又は置換Ｃ２−Ｃ６アルキニルであり；
それぞれのＲ１９、Ｒ２０、及びＲ２１は、独立して、Ｈ、Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、Ｃ１−Ｃ６アルコキシ、置換Ｃ１−Ｃ６アルコキシ、Ｃ２−Ｃ６アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルケニル、Ｃ２−Ｃ６アルキニル、又は置換Ｃ２−Ｃ６アルキニルであり；
Ｇは、Ｈ、ＯＨ、ハロゲン、又はＯ−［Ｃ（Ｒ８）（Ｒ９）］ｎ−［（Ｃ＝Ｏ）ｍ−Ｘ１］ｊ−Ｚであり；
それぞれのＲ８とＲ９は、独立して、Ｈ、ハロゲン、Ｃ１−Ｃ６アルキル、又は置換Ｃ１−Ｃ６アルキルであり；
Ｘ１は、Ｏ、Ｓ、又はＮ（Ｅ１）であり；
Ｚは、Ｈ、ハロゲン、Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、Ｃ２−Ｃ６アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルケニル、Ｃ２−Ｃ６アルキニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルキニル、又はＮ（Ｅ２）（Ｅ３）であり；
Ｅ１、Ｅ２、及びＥ３は、それぞれ独立して、Ｈ、Ｃ１−Ｃ６アルキル、又は置換Ｃ１−Ｃ６アルキルであり；
ｎは、１〜約６であり；
ｍは、０又は１であり；
ｊは、０又は１であり；
それぞれの置換基は、ハロゲン、ＯＪ１、Ｎ（Ｊ１）（Ｊ２）、＝ＮＪ１、ＳＪ１、Ｎ３、ＣＮ、ＯＣ（＝Ｘ２）Ｊ１、ＯＣ（＝Ｘ２）Ｎ（Ｊ１）（Ｊ２）、及びＣ（＝Ｘ２）Ｎ（Ｊ１）（Ｊ２）より独立して選択される、１以上の保護化されていてもよい置換基を含み；
Ｘ２は、Ｏ、Ｓ、又はＮＪ３であり；
それぞれのＪ１、Ｊ２、及びＪ３は、独立して、Ｈ又はＣ１−Ｃ６アルキルであり；
ｊが１であるとき、このときＺは、ハロゲン又はＮ（Ｅ２）（Ｅ３）以外である］を有し；そして
ここで前記オリゴマー化合物は、８〜４０個のモノマーサブユニットを含んで、標的核酸の少なくとも一部へハイブリダイズ可能である。
特定の態様では、Ｍ３が、Ｏ、ＣＨ＝ＣＨ、ＯＣＨ２、又はＯＣ（Ｈ）（Ｂｘ２）である。特定の態様では、Ｍ３がＯである。
特定の態様では、Ｊ４、Ｊ５、Ｊ６、及びＪ７がそれぞれＨである。特定の態様では、Ｊ４がＪ５又はＪ７の１つと架橋を形成する。
特定の態様では、Ａが式：
Figure 0006599497
［式中：
Ｑ１とＱ２は、それぞれ独立して、Ｈ、ハロゲン、Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、Ｃ１−Ｃ６アルコキシ、又は置換Ｃ１−Ｃ６アルコキシである］の１つを有する。特定の態様では、Ｑ１とＱ２がそれぞれＨである。特定の態様では、Ｑ１とＱ２がそれぞれ独立して、Ｈ又はハロゲンである。特定の態様では、Ｑ１とＱ２の一方がＨであって、Ｑ１とＱ２の他方が、Ｆ、ＣＨ３、又はＯＣＨ３である。
特定の態様では、Ｔ１が式：
Figure 0006599497
［式中：
ＲａとＲｃは、それぞれ独立して、保護化ヒドロキシル、保護化チオール、Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、Ｃ１−Ｃ６アルコキシ、置換Ｃ１−Ｃ６アルコキシ、保護化アミノ、又は置換アミノであり；そして
Ｒｂは、Ｏ又はＳである］を有する。特定の態様では、ＲｂがＯであって、ＲａとＲｃが、それぞれ独立して、ＯＣＨ３、ＯＣＨ２ＣＨ３、又はＣＨ（ＣＨ３）２である。
特定の態様では、Ｇが、ハロゲン、ＯＣＨ３、ＯＣＨ２Ｆ、ＯＣＨＦ２、ＯＣＦ３、ＯＣＨ２ＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２Ｆ、ＯＣＨ２ＣＨＦ２、ＯＣＨ２ＣＦ３、ＯＣＨ２−ＣＨ＝ＣＨ２、Ｏ（ＣＨ２）２−ＯＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２−ＳＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２−ＯＣＦ３、Ｏ（ＣＨ２）３−Ｎ（Ｒ１０）（Ｒ１１）、Ｏ（ＣＨ２）２−ＯＮ（Ｒ１０）（Ｒ１１）、Ｏ（ＣＨ２）２−Ｏ（ＣＨ２）２−Ｎ（Ｒ１０）（Ｒ１１）、ＯＣＨ２Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｒ１０）（Ｒ１１）、ＯＣＨ２Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｒ１２）−（ＣＨ２）２−Ｎ（Ｒ１０）（Ｒ１１）、又はＯ（ＣＨ２）２−Ｎ（Ｒ１２）−Ｃ（＝ＮＲ１３）［Ｎ（Ｒ１０）（Ｒ１１）］であり、ここでＲ１０、Ｒ１１、Ｒ１２、及びＲ１３は、それぞれ独立して、Ｈ又はＣ１−Ｃ６アルキルである。特定の態様では、Ｇが、ハロゲン、ＯＣＨ３、ＯＣＦ３、ＯＣＨ２ＣＨ３、ＯＣＨ２ＣＦ３、ＯＣＨ２−ＣＨ＝ＣＨ２、Ｏ（ＣＨ２）２−ＯＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２−Ｏ（ＣＨ２）２−Ｎ（ＣＨ３）２、ＯＣＨ２Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｈ）ＣＨ３、ＯＣＨ２Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｈ）−（ＣＨ２）２−Ｎ（ＣＨ３）２、又はＯＣＨ２−Ｎ（Ｈ）−Ｃ（＝ＮＨ）ＮＨ２である。特定の態様では、Ｇが、Ｆ、ＯＣＨ３、又はＯ（ＣＨ２）２−ＯＣＨ３である。特定の態様では、ＧがＯ（ＣＨ２）２−ＯＣＨ３である。
特定の態様において、５’−末端ヌクレオシドは、式ＩＩｅ：
Figure 0006599497
を有する。
特定の態様では、アンチセンス化合物が、ｓｓＲＮＡに特に適しているものを含めて、オリゴヌクレオチド又はその領域に沿って配置される１以上の種類の修飾糖部分及び／又は天然に存在する糖部分を明確に定義されたパターン又は糖修飾モチーフにおいて含む。そのようなモチーフには、本明細書において考察される糖修飾、及び／又は他の既知の糖修飾のいずれも含まれ得る。
特定の態様において、オリゴヌクレオチドは、均一の糖修飾を有する領域を含むか又はそれからなる。そのような特定の態様では、この領域のそれぞれのヌクレオシドが同一のＲＮＡ様糖修飾を含む。特定の態様では、その領域のそれぞれのヌクレオシドが２’−Ｆヌクレオシドである。特定の態様では、その領域のそれぞれのヌクレオシドが２’−ＯＭ
ｅヌクレオシドである。特定の態様では、その領域のそれぞれのヌクレオシドが２’−ＭＯＥヌクレオシドである。特定の態様では、その領域のそれぞれのヌクレオシドがｃＥｔヌクレオシドである。特定の態様では、その領域のそれぞれのヌクレオシドがＬＮＡヌクレオシドである。特定の態様において、均一の領域は、そのオリゴヌクレオチドの全部又はほとんど全部を構成する。特定の態様において、その領域は、１〜４個の末端ヌクレオシドを除く、全体のオリゴヌクレオチドを構成する。
特定の態様では、オリゴヌクレオチドが交互の糖修飾の１以上の領域を含み、ここでヌクレオシドは、第一型の糖修飾を有するヌクレオチドと第二型の糖修飾を有するヌクレオチドを交互に繰り返す。特定の態様では、両型のヌクレオシドがＲＮＡ様ヌクレオシドである。特定の態様において、交互のヌクレオシドは、２’−ＯＭｅ、２’−Ｆ、２’−ＭＯＥ、ＬＮＡ、及びｃＥｔより選択される。特定の態様において、交互の修飾は、２’−Ｆと２’−ＯＭｅである。そのような領域は、隣接していても、差示的に修飾されたヌクレオシド又はコンジュゲートされたヌクレオシドによって中断されてもよい。
特定の態様において、交互の修飾の交互の領域は、それぞれ単一のヌクレオシドからなる（即ち、このパターンは、（ＡＢ）ｘＡｙであり、ここでＡは、第一型の糖修飾を有するヌクレオシドであって、Ｂは、第二型の糖修飾を有するヌクレオシドであり；ｘは、１〜２０であり、そしてｙは、０又は１である）。特定の態様では、交互モチーフ中の１以上の交互の領域に、ある型の単一ヌクレオシドより多くが含まれる。例えば、オリゴヌクレオチドには、以下のヌクレオシドモチーフのいずれもの１以上の領域が含まれ得る：
ＡＡＢＢＡＡ；
ＡＢＢＡＢＢ；
ＡＡＢＡＡＢ；
ＡＢＢＡＢＡＡＢＢ；
ＡＢＡＢＡＡ；
ＡＡＢＡＢＡＢ；
ＡＢＡＢＡＡ；
ＡＢＢＡＡＢＢＡＢＡＢＡＡ；
ＢＡＢＢＡＡＢＢＡＢＡＢＡＡ；又は
ＡＢＡＢＢＡＡＢＢＡＢＡＢＡＡ；
ここでＡは、第一型のヌクレオシドであって、Ｂは、第二型のヌクレオシドである。特定の態様では、ＡとＢがそれぞれ２’−Ｆ、２’−ＯＭｅ、ＢＮＡ、及びＭＯＥより選択される。
特定の態様では、そのような交互モチーフを有するオリゴヌクレオチドが、式ＩＩｃ又はＩＩｅのそれのような修飾５’末端ヌクレオシドも含む。
特定の態様では、オリゴヌクレオチドが２−２−３モチーフを有する領域を含む。そのような領域は、以下のモチーフ：
−（Ａ）２−（Ｂ）ｘ−（Ａ）２−（Ｃ）ｙ−（Ａ）３−
［式中：Ａは、第一型の修飾ヌクレオシドであり；
ＢとＣは、Ａとは異なって修飾されるヌクレオシドであるが、ＢとＣは、同じ修飾を有しても、互いに異なる修飾を有してもよく；
ｘとｙは、１〜１５である］を含む。
特定の態様では、Ａが２’−ＯＭｅ修飾ヌクレオシドである。特定の態様では、ＢとＣがともに２’−Ｆ修飾ヌクレオシドである。特定の態様では、Ａが２’−ＯＭｅ修飾ヌクレオシドであって、ＢとＣがともに２’−Ｆ修飾ヌクレオシドである。
特定の態様では、オリゴヌクレオシドが以下の糖モチーフ：
５’−（Ｑ）−（ＡＢ）ｘＡｙ−（Ｄ）ｚ
［式中：
Ｑは、安定化リン酸部分を含んでなるヌクレオシドであり、特定の態様では、Ｑが式ＩＩｃ又はＩＩｅを有するヌクレオシドであり；
Ａは、第一型の修飾ヌクレオシドであり；
Ｂは、第二型の修飾ヌクレオシドであり；
Ｄは、それへ隣接するヌクレオシドとは異なる修飾を含んでなる修飾ヌクレオシドである。従って、ｙが０であれば、このときＤは、Ｂとは異なって修飾されなければならず、そしてｙが１であれば、このときＤは、Ａとは異なって修飾されなければならない。特定の態様では、ＤがＡとＢの両方と異なる。
Ｘは、５〜１５であり；
Ｙは、０又は１であり；
Ｚは、０〜４である］を有する。
特定の態様では、オリゴヌクレオシドが以下の糖モチーフ：
５’−（Ｑ）−（Ａ）ｘ−（Ｄ）ｚ
［式中：
Ｑは、安定化リン酸部分を含んでなるヌクレオシドであり、特定の態様では、Ｑが式ＩＩｃ又はＩＩｅを有するヌクレオシドであり；
Ａは、第一型の修飾ヌクレオシドであり；
Ｄは、Ａとは異なる修飾を含んでなる修飾ヌクレオシドであり；
Ｘは、１１〜３０であり；
Ｚは、０〜４である］を有する。
特定の態様では、上記のモチーフ中のＡ、Ｂ、Ｃ、及びＤが、２’−ＯＭｅ、２’−Ｆ、２’−ＭＯＥ、ＬＮＡ、及びｃＥｔより選択される。特定の態様では、Ｄが末端ヌクレオシドを表す。特定の態様において、そのような末端ヌクレオシドは、標的核酸へハイブリダイズするように設計されない（もっとも、１以上のヌクレオシドが偶然ハイブリダイズする可能性はある）。特定の態様において、それぞれのＤヌクレオシドのヌクレオ塩基は、標的核酸の対応部分でのヌクレオ塩基の実体に拘らず、アデニンである。特定の態様において、それぞれのＤヌクレオシドのヌクレオ塩基は、チミンである。
特定の態様では、アンチセンス化合物が、ｓｓＲＮＡとしての使用に特に適しているものを含めて、オリゴヌクレオチド又はその領域に沿って一定のパターンで配置された修飾ヌクレオシド間連結又は修飾ヌクレオシド間連結モチーフを含む。特定の態様では、オリゴヌクレオチドが、交互のヌクレオシド間連結モチーフを有する領域を含む。特定の態様では、オリゴヌクレオチドが、均一に修飾されたヌクレオシド間連結の領域を含む。そのような特定の態様において、オリゴヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオシド間連結によって均一に連結された領域を含む。特定の態様において、オリゴヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオシド間連結によって均一に連結されている。特定の態様では、オリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結がホスホジエステルとホスホロチオエートより選択される。特定の態様では、オリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結がホスホジエステルとホスホロチオエートより選択されて、少なくとも１つのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエートである。
特定の態様において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも６個のホスホロチオエートヌクレオシド間連結を含む。特定の態様において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも８個のホスホロチオエートヌクレオシド間連結を含む。特定の態様において、オリゴヌクレオ
チドは、少なくとも１０個のホスホロチオエートヌクレオシド間連結を含む。特定の態様において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも６個の連続したホスホロチオエートヌクレオシド間連結の少なくとも１つのブロックを含む。特定の態様において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも８個の連続したホスホロチオエートヌクレオシド間連結の少なくとも１つのブロックを含む。特定の態様において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも１０個の連続したホスホロチオエートヌクレオシド間連結の少なくとも１つのブロックを含む。特定の態様において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも１２個の連続したホスホロチオエートヌクレオシド間連結の少なくとも１つのブロックを含む。そのような特定の態様では、少なくとも１つのそのようなブロックがオリゴヌクレオチドの３’端に位置している。そのような特定の態様では、少なくとも１つのそのようなブロックがオリゴヌクレオチドの３’端の３個のヌクレオシド内に位置している。
本明細書に記載される様々な糖モチーフのいずれも有するオリゴヌクレオチドは、どの連結モチーフも有してよい。例えば、オリゴヌクレオチドは、限定されないが、上記に記載されるものを含めて、下記の非限定的な表より選択される連結モチーフを有し得る：
Figure 0006599497
ｉｉ．ｓｉＲＮＡ化合物
特定の態様では、アンチセンス化合物が二本鎖ＲＮＡｉ化合物（ｓｉＲＮＡ）である。そのような態様では、一方又は両方の鎖が、ｓｓＲＮＡについて上記に記載したどの修飾モチーフも含んでよい。特定の態様では、ｓｓＲＮＡ化合物が非修飾ＲＮＡであってよい。特定の態様では、ｓｉＲＮＡ化合物が、非修飾ＲＮＡヌクレオシドを含み得るが、修飾ヌクレオシド間連結を含み得ない。
いくつかの態様は、１以上の修飾又は非修飾ヌクレオシドの位置によって規定されるモチーフを各鎖が含む、二本鎖組成物に関する。特定の態様では、完全に又は少なくとも一部ハイブリダイズして二重鎖領域を形成する第一及び第二のオリゴマー化合物を含んでなり、そして核酸標的に相補的でそれへハイブリダイズする領域をさらに含んでなる組成物が提供される。そのような組成物は、核酸標的に対して完全又は一部の相補性を有するアンチセンス鎖である第一のオリゴマー化合物と、第一のオリゴマー化合物に相補的な１以上の領域を有してそれと少なくとも１つの二重鎖領域を形成するセンス鎖である第二のオリゴマー化合物を含むことが好適である。
いくつかの態様の組成物は、核酸標的へハイブリダイズしてその正常な機能の損失をもたらすことによって、遺伝子発現を調節する。ある態様において、標的核酸は、アンドロゲン受容体である。特定の態様において、標的指向されたアンドロゲン受容体の分解は、本発明の組成物とともに形成される活性化ＲＩＳＣ複合体によって促進される。
いくつかの態様は、両鎖の一方が、例えば、反対鎖のＲＩＳＣ（又は切断）複合体中への選好的ローディングに影響を及ぼすのに有用である、二本鎖組成物へ向けられる。この
組成物は、選択された核酸分子に標的指向して、１以上の遺伝子の発現を調節するのに有用である。ある態様において、本発明の組成物は、標的ＲＮＡのある部分へハイブリダイズして、標的ＲＮＡの正常な機能の損失をもたらす。
特定の態様は、両方の鎖が、ヘミマーモチーフ、完全修飾モチーフ、位置的修飾モチーフ、又は交互モチーフを含む、二本鎖組成物へ注目する。本発明の組成物の各鎖は、例えばｓｉＲＮＡ経路において特別な役割を達成するように修飾することができる。異なるモチーフを各鎖に使用すること、又は化学修飾が異なる同じモチーフを各鎖に使用することによって、センス鎖の取込みを阻害する一方で、アンチセンス鎖をＲＩＳＣ複合体に標的指向することが可能になる。このモデル内では、各鎖がその特別な役割のために強化されるように、それを独立的に修飾することができる。アンチセンス鎖は、ＲＩＳＣの１つの領域におけるその役割を強化するように５’端で修飾することが可能であり、一方３’端は、ＲＩＳＣの異なる領域におけるその役割を強化するように差示的に修飾することが可能である。
二本鎖オリゴヌクレオチド分子は、自己相補的なセンス及びアンチセンス領域を含んでなる二本鎖ポリヌクレオチド分子であり得て、ここでアンチセンス領域は、標的核酸分子中のヌクレオチド配列又はその一部に相補的であるヌクレオチド配列を含み、そしてセンス領域は、標的核酸配列に対応するヌクレオチド配列又はその一部を有する。二本鎖オリゴヌクレオチド分子は、２つの別々のオリゴヌクレオチドから組み立てることができて、ここでは一方の鎖がセンス鎖で、他方がアンチセンス鎖であり、ここでアンチセンス鎖とセンス鎖は、自己相補的である（即ち、各鎖は、他の鎖中のヌクレオチド配列に相補的であるヌクレオチド配列を含む；アンチセンス鎖とセンス鎖が二重鎖又は二本鎖構造を形成する場合のように。例えばここで二本鎖領域は、約１５〜約３０個、例えば、約１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、又は３０個の塩基対である）；アンチセンス鎖は、標的核酸分子中のヌクレオチド配列又はその一部に相補的であるヌクレオチド配列を含み、そしてセンス鎖は、標的核酸配列に対応するヌクレオチド配列又はその一部を含む（例えば、二本鎖オリゴヌクレオチド分子の約１５〜約２５個以上のヌクレオチドが標的核酸又はその一部に相補的である）。あるいは、二本鎖オリゴヌクレオチドは、単一のオリゴヌクレオチドより組み立てられ、ここではｓｉＲＮＡの自己相補的なセンス及びアンチセンス領域が核酸ベース又は非核酸ベースのリンカー（複数）によって連結されている。
二本鎖オリゴヌクレオチドは、自己相補的なセンス及びアンチセンス領域を有する、二重鎖、非対称二重鎖、ヘアピン又は非対称ヘアピン二次構造のあるポリヌクレオチドであり得て、ここでアンチセンス領域は、別の標的核酸分子中のヌクレオチド配列又はその一部に相補的であるヌクレオチド配列を含み、そしてセンス領域は、標的核酸配列に対応するヌクレオチド配列又はその一部を有する。二本鎖オリゴヌクレオチドは、２個以上のループ構造と自己相補的なセンス及びアンチセンス領域を含んでなるステムを有する環状の一本鎖ポリヌクレオチドであり得て、ここでアンチセンス領域は、標的核酸分子中のヌクレオチド配列又はその一部に相補的であるヌクレオチド配列を含み、そしてセンス領域は、標的核酸配列に対応するヌクレオチド配列又はその一部を有し、そしてここで環状のポリヌクレオチドは、生体内でも試験管内でもプロセシングを受けて、ＲＮＡｉに媒介することが可能な活性ｓｉＲＮＡ分子を産生することができる。
特定の態様において、二本鎖オリゴヌクレオチドは、別々のセンス及びアンチセンス配列又は領域を含み、ここでセンス領域とアンチセンス領域は、当該技術分野で知られているようなヌクレオチド又は非ヌクレオチドリンカー分子によって共有結合的に連結されているか又は、代わりに、イオン性相互作用、水素結合、ファンデルワールス相互作用、疎水性相互作用、及び／又はスタッキング相互作用によって非共有結合的に連結している。
特定の態様において、二本鎖オリゴヌクレオチドは、標的遺伝子のヌクレオチド配列に相補的であるヌクレオチド配列を含む。別の態様において、二本鎖オリゴヌクレオチドは、標的遺伝子の発現の阻害を引き起こすやり方で、標的遺伝子のヌクレオチド配列と相互作用する。
本明細書に使用するように、二本鎖オリゴヌクレオチドは、ＲＮＡだけを含有する分子に限定される必要はなくて、化学修飾ヌクレオチド及び非ヌクレオチドがさらに含まれる。特定の態様において、短鎖の干渉性核酸分子は、２’−ヒドロキシ（２’−ＯＨ）含有ヌクレオチドを欠損する。特定の態様では、短鎖干渉性核酸にリボヌクレオチド（例、２’−ＯＨ基を有するヌクレオチド）が含まれてなくてもよい。しかしながら、ＲＮＡｉを支援するのに分子内のリボヌクレオチドの存在を必要としない、そのような二本鎖オリゴヌクレオチドには、２’−ＯＨ基のある１以上のヌクレオチドを含有する、単数又は複数の付着リンカー又は他の付着基又は結合基、部分、又は鎖を有する可能性がある。あるいは、二本鎖オリゴヌクレオチドは、ヌクレオチド位置の約５、１０、２０、３０、４０、又は５０％でリボヌクレオチドを含んでもよい。本明細書に使用するように、ｓｉＲＮＡという用語は、配列特異的なＲＮＡｉに媒介することが可能である核酸分子について記載するために使用される他の用語、例えば、短鎖干渉性ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）、短鎖ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）、短鎖干渉性オリゴヌクレオチド、短鎖干渉性核酸、短鎖干渉性修飾オリゴヌクレオチド、化学修飾ｓｉＲＮＡ、転写後遺伝子サイレンシングＲＮＡ（ｐｔｇｓＲＮＡ）、等と同等であることを意味する。加えて、本明細書に使用するように、ＲＮＡｉという用語は、転写後遺伝子サイレンシング、翻訳阻害、又はエピジェネティクスのような、配列特異的なＲＮＡ干渉について記載するために使用される他の用語と同等であることを意味する。例えば、二本鎖オリゴヌクレオチドを使用して、転写後レベルと転写前レベルの両方で、遺伝子を後成的に沈静化することができる。非限定的な実施例では、本発明のｓｉＲＮＡ分子による遺伝子発現の後成的な制御は、クロマチン構造又はメチル化パターンのｓｉＲＮＡ媒介性の修飾より生じて、遺伝子発現を改変させる可能性がある（例えば, Verdel et al., 2004, Science, 303, 672-676; Pal-Bhadra et al., 2004, Science, 303, 669-672; Allshire, 2002, Science, 297, 1818-1819; Volpe et al., 2002, Science, 297, 1833-1837; Jenuwein, 2002, Science, 297, 2215-2218; 及び Hall et al., 2002, Science, 297, 2232-2237 を参照のこと）。
本発明で提供されるいくつかの態様の化合物及び組成物は、例えば、自己相補的な配列のある単一のＲＮＡ鎖が二本鎖コンホメーションをとることが可能である「ヘアピン」又はステム−ループ二本鎖ＲＮＡエフェクター分子、又は２本の別々のＲＮＡ鎖を含んでなる二重鎖ｄｓＲＮＡエフェクター分子を含めて、ｄｓＲＮＡ媒介性遺伝子サイレンシング又はＲＮＡｉ機序によってアンドロゲン受容体に標的指向することができると考慮される。様々な態様において、ｄｓＲＮＡは、完全にリボヌクレオチドからなるか又は、例えば、ＷＯ００／６３３６４（２０００年４月１９日出願）、又はＵ．Ｓ．シリアル番号６０／１３０，３７７（１９９９年４月２１日出願）によって開示されるＲＮＡ／ＤＮＡハイブリッドのようなリボヌクレオチドとデオキシヌクレオチドの混合物からなる。ｄｓＲＮＡ又はｄｓＲＮＡエフェクター分子は、その分子の一方のセグメント中のヌクレオチドがその分子の別のセグメント中のヌクレオチドと塩基対合するような自己相補性の領域がある単一分子であってよい。様々な態様において、単一分子からなるｄｓＲＮＡは、完全にリボヌクレオチドからなるか、又はデオキシリボヌクレオチドの領域に相補的であるリボヌクレオチドの領域を包含する。あるいは、ｄｓＲＮＡには、互いへの相補性の領域を有する２本の異なる鎖が含まれ得る。
様々な態様では、両鎖が完全にリボヌクレオチドからなる、一方の鎖が完全にリボヌクレオチドからなって一方の鎖が完全にデオキシリボヌクレオチドからなる、又は一方又は
両方の鎖がリボヌクレオチドとデオキシリボヌクレオチドの混合物を含有する。特定の態様において、相補性の領域は、互いに対して、そして標的核酸配列に少なくとも７０、８０、９０、９５、９８、又は１００％相補的である。特定の態様において、二本鎖コンホメーションで存在するｄｓＲＮＡの領域には、少なくとも１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、５０、７５、１００、２００、５００、１０００、２０００、又は５０００個のヌクレオチドが含まれるか又はｃＤＮＡ中のヌクレオチドのすべて、又はｄｓＲＮＡに表されている他の標的核酸配列が含まれる。ある態様において、ｄｓＲＮＡは、一本鎖の端のような一本鎖領域を含有しないか又はｄｓＲＮＡは、ヘアピンである。他の態様において、ｄｓＲＮＡは、１以上の一本鎖領域又はオーバーハングを有する。特定の態様では、ＲＮＡ／ＤＮＡハイブリッドに、アンチセンス鎖又は領域である（例えば、標的核酸に対して少なくとも７０、８０、９０、９５、９８、又は１００％の相補性を有する）ＤＮＡ鎖又は領域と、センス鎖又は領域である（例えば、標的核酸に対して少なくとも７０、８０、９０、９５、９８、又は１００％の同一性を有する）ＲＮＡ鎖又は領域、及びその逆のものが含まれる。
様々な態様において、ＲＮＡ／ＤＮＡハイブリッドは、本明細書に記載される方法、又はＷＯ００／６３３６４（２０００年４月１９日出願）、又はＵ．Ｓ．シリアル番号６０／１３０，３７７（１９９９年４月２１日出願）に記載される方法のような酵素法又は化学合成法を使用して試験管内で作製される。他の態様では、試験管内で合成されるＤＮＡ鎖を、そのＤＮＡ鎖の細胞中への形質転換の前、後、又はそれと同時に、生体内又は試験管内で作製されるＲＮＡ鎖と複合する。なお他の態様において、ｄｓＲＮＡは、センス領域とアンチセンス領域を含有する単一の環状核酸であるか又は、ｄｓＲＮＡには、環状の核酸と、第二の環状核酸又は線状核酸のいずれかが含まれる（例えば、ＷＯ００／６３３６４（２０００年４月１９日出願）、又はＵ．Ｓ．シリアル番号６０／１３０，３７７（１９９９年４月２１日出願）を参照のこと）。例示の環状核酸には、ヌクレオチドのフリーの５’ホスホリル基が別のヌクレオチドの２’ヒドロキシル基へループバック形式で連結するようになる、ラリアット構造が含まれる。
他の態様において、ｄｓＲＮＡには、糖中の２’位がハロゲン（フッ素基のような）を含有するか又はアルコキシ基（メトキシ基のような）を含有して、対応する２’位が水素又はヒドロキシル基を含有する対応するｄｓＲＮＡと比較して、ｄｓＲＮＡの試験管内又は生体内での半減期を増加させる、１以上の修飾ヌクレオチドが含まれる。なお他の態様において、ｄｓＲＮＡには、天然に存在するホスホジエステル連結とは異なる、隣接ヌクレオチド間の１以上の連結が含まれる。そのような連結の例には、リンアミド連結、ホスホロチオエート連結、及びホスホロジチオエート連結が含まれる。ｄｓＲＮＡは、米国特許第６，６７３，６６１号に教示されるような、化学修飾核酸分子であってもよい。他の態様において、ｄｓＲＮＡは、例えば、ＷＯ００／６３３６４（２０００年４月１９日出願）、又はＵ．Ｓ．シリアル番号６０／１３０，３７７（１９９９年４月２１日出願）によって開示されるような、１又は２個のキャップ鎖を含有する。
他の態様において、ｄｓＲＮＡは、ＷＯ００／６３３６４に開示される、少なくとも一部がｄｓＲＮＡ分子であるもののいずれであっても、米国仮特許出願６０／３９９，９９８；及び米国仮特許出願６０／４１９，５３２、及びＰＣＴ／ＵＳ２００３／０３３４６６に記載されるｄｓＲＮＡ分子のいずれであってもよい（これらの教示は、参照により本明細書に組み込まれる）。ｄｓＲＮＡのいずれも、本明細書に記載される方法又はＷＯ００／６３３６４に記載されるような標準法を使用して、試験管内又は生体内で発現させることができる。
占有
特定の態様では、アンチセンス化合物が、ＲＮアーゼＨを介した標的核酸の切断をもたら
すことも、ＲＩＳＣ経路を介した切断又は捕捉をもたらすことも予測されない。そのような特定の態様では、アンチセンス活性が占有より生じる場合があり、ここでは、ハイブリダイズしたアンチセンス化合物の存在により、標的核酸の活性が妨げられる。そのような特定の態様において、アンチセンス化合物は、均一に修飾されても、修飾のミックス、及び／又は修飾及び非修飾ヌクレオシドを含んでもよい。
標的核酸、標的領域、及びヌクレオチド配列
ヒトアンドロゲン受容体をコードするヌクレオチド配列には、限定無しに、以下が含まれる：ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＮＴ＿０１１６６９．１７＿ＴＲＵＮＣ＿５０７９０００＿５２７００００（本明細書では配列番号１として組み込まれる）、ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＮＭ＿００００４４．３（本明細書では配列番号２として組み込まれる）、ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＮＭ＿００１０１１６４５．２（本明細書では配列番号３として組み込まれる）、ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＦＪ２３５９１６．１（本明細書では配列番号４として組み込まれる）、ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＦＪ２３５９１７．１（本明細書では配列番号５として組み込まれる）、ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＦＪ２３５９１８．１（本明細書では配列番号６として組み込まれる）、ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＦＪ２３５９１９．１（本明細書では配列番号７として組み込まれる）、及びＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＦＪ２３５９２０．１（本明細書では配列番号８として組み込まれる）。
アンドロゲン受容体ｍＲＮＡは、いくつかの機能的なドメインをコードする。特定の態様では、全長アンドロゲン受容体ｍＲＮＡに、Ｎ末端ドメインをコードするエクソン１、ＤＮＡ結合ドメインをコードするエクソン２及びエクソン３、ショートヒンジ領域をコードするエクソン４、及びリガンド結合ドメインをコードするエクソン４〜エクソン８が含まれる。
特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物によって標的指向可能なアンドロゲン受容体スプライシング変異体は、Ｎ末端ドメインをコードするエクソン１とＤＮＡ結合ドメインをコードするエクソン２及びエクソン３又はそれらの機能性部分を包含するが、ショートヒンジ領域をコードするエクソン４の少なくとも一部もリガンド結合ドメインをコードするエクソン４〜エクソン８の少なくとも一部も包含しない。そのようなＡＲスプライシング変異体の例には、限定されないが、エクソン１〜エクソン３を含有するがエクソン４〜エクソン８を欠損する、ＡＲ−Ｖ１、ＡＲ−Ｖ２、ＡＲ−Ｖ３、ＡＲ−Ｖ４、ＡＲ−Ｖ５、ＡＲ−Ｖ６、及びＡＲ−Ｖ７（ＡＲ３とも呼ばれる）が含まれる。ＡＲ−Ｖ１、ＡＲ−Ｖ２、ＡＲ−Ｖ３、ＡＲ−Ｖ４、ＡＲ−Ｖ５、ＡＲ−Ｖ６、ＡＲ−Ｖ７と、本発明で提供されるアンチセンス化合物によって標的指向される追加のスプライシング変異体については、Hu et al., Cancer Res 2009; 69: 16-22 と米国特許出願公開公報番号：ＵＳ２０１０／００６８８０２（このそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる）に記載されている。本発明で提供されるアンチセンス化合物によって標的指向されるそのようなＡＲスプライシング変異体のさらなる例には、限定されないが、その全体が参照により本明細書に組み込まれる、Guo et al., Cancer Res. 2009; 69: 2305-13 に記載されるような、ＡＲ３、ＡＲ４、ＡＲ４ｂ、ＡＲ５、及びＡＲ６（それぞれ、配列番号４〜配列番号８）が含まれる。
ハイブリダイゼーション
ある態様では、本明細書に開示するアンチセンス化合物とアンドロゲン受容体の間でハイブリダイゼーションが起こる。最もよくあるハイブリダイゼーションの機序には、核酸分子の相補的なヌクレオ塩基間の水素結合（例、ワトソン−クリック型、フーグスティーン型、又は逆フーグスティーン型の水素結合）が関与する。
ハイブリダイゼーションは、多様な条件の下で起こり得る。ストリンジェントな条件は、配列依存的で、ハイブリダイズされる核酸分子の性質及び組成によって決定される。
当該技術分野では、ある配列が標的核酸へ特異的にハイブリダイズ可能であるかどうかを判定する方法が公知である。特定の態様において、本発明で提供されるアンチセンス化合物は、アンドロゲン受容体と特異的にハイブリダイズ可能である。
相補性
アンチセンス化合物と標的核酸が互いに相補的であるのは、アンチセンス化合物の十分数のヌクレオ塩基が標的核酸の対応するヌクレオ塩基と水素結合し得て、所望される効果（例えば、アンドロゲン受容体核酸のような標的核酸のアンチセンス阻害）が生じるような場合である。
アンチセンス化合物が標的核酸へ特異的にハイブリダイズすることが可能なままである限りは、アンチセンス化合物とアンドロゲン受容体核酸の間の非相補的なヌクレオ塩基が許容され得る。さらに、アンチセンス化合物は、介在又は隣接セグメント（例、ループ構造、ミスマッチ、又はヘアピン構造）がハイブリダイゼーション事象に関与しないように、アンドロゲン受容体核酸の１以上のセグメントにわたってハイブリダイズしてよい。
特定の態様において、本発明で提供されるアンチセンス化合物、又はその特定部分は、アンドロゲン受容体核酸、標的領域、標的セグメント、又はその特定部分に少なくとも７０％、８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％相補的である。アンチセンス化合物の標的核酸とのパーセント相補性は、定型法を使用して決定することができる。
例えば、アンチセンス化合物の２０個のヌクレオ塩基のうち１８個が標的領域に相補的で、それ故に特異的にハイブリダイズするアンチセンス化合物は、９０パーセントの相補性を表すことになる。この例において、残る非相補的なヌクレオ塩基は、相補的なヌクレオ塩基とともに密集していても散在していてもよくて、互いにも相補的なヌクレオ塩基にも隣接する必要はない。従って、標的核酸に完全に相補的な２つの領域が両側にある４個非相補的なヌクレオ塩基を有する、長さ１８個のヌクレオ塩基であるアンチセンス化合物は、標的核酸と７７．８％の全体相補性を有することになるので、本発明の範囲内に含まれよう。標的核酸の領域とアンチセンス化合物の相補性パーセントは、当該技術分野で知られているＢＬＡＳＴプログラム（ベーシックローカルアライメント検索ツール）及びＰｏｗｅｒＢＬＡＳＴプログラム（Altschul et al., J. Mol. Biol., 1990, 215, 403410；Zhang and Madden, Genome Res., 1997, 7, 649656）を使用して、定型的に決定することができる。パーセント相同性、配列同一性又は相補性は、例えば、Smith 及び Waterman のアルゴリズム（Adv. Appl. Math., 1981, 2, 482 489）を使用するデフォルト設定を使用する、Ｇａｐプログラム（ウィスコンシン配列解析パッケージ、Ｕｎｉｘ用バージョン８、Genetics Computer Group, University Research Park, ウィスコンシン州マジソン）によって決定することができる。
特定の態様において、本発明で提供されるアンチセンス化合物又はその特定部分は、標的核酸又はその特定部分に完全に相補的（即ち、１００％相補的）である。例えば、あるアンチセンス化合物は、アンドロゲン受容体核酸、又は標的領域、又は標的セグメント、又はその標的配列に完全に相補的であり得る。本明細書に使用するように、「完全に相補的」は、アンチセンス化合物のそれぞれのヌクレオ塩基が標的核酸の対応するヌクレオ塩基と正確な塩基対合をすることが可能であることを意味する。例えば、２０個のヌクレオ塩基のアンチセンス化合物は、アンチセンス化合物に完全に相補的である、標的核酸の対
応する２０個のヌクレオ塩基部分がある限りにおいて、４００個のヌクレオ塩基の長さである標的配列に完全に相補的である。「完全に相補的」は、第一及び／又は第二核酸の特定部分への言及においても使用することができる。例えば、３０個のヌクレオ塩基のアンチセンス化合物のうち２０個のヌクレオ塩基部分は、４００個のヌクレオ塩基の長さである標的配列に「完全に相補的」であり得る。３０個のヌクレオ塩基オリゴヌクレオチドの２０個のヌクレオ塩基部分は、標的配列が対応する２０個のヌクレオ塩基部分を有して、ここでそれぞれのヌクレオ塩基がアンチセンス化合物の２０個のヌクレオ塩基部分に相補的であるならば、標的配列に完全に相補的である。同時に、この全３０個のヌクレオ塩基のアンチセンス化合物は、アンチセンス化合物の残る１０個のヌクレオ塩基も標的配列に相補的であるかどうかに依って、標的配列に完全に相補的である場合とない場合がある。
非相補的なヌクレオ塩基の位置は、アンチセンス化合物の５’端でも３’端でもよい。あるいは、非相補的な単数又は複数のヌクレオ塩基は、アンチセンス化合物の内部位置にあってもよい。２個以上の非相補的なヌクレオ塩基が存在するとき、それらは、隣接（即ち、連結）していても非隣接であってもよい。１つの態様では、非相補的なヌクレオ塩基がギャップマーアンチセンスオリゴヌクレオチドのウィングセグメントに位置している。
特定の態様では、長さが１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、又は２０個のヌクレオ塩基であるか又はそれら以下のヌクレオ塩基であるアンチセンス化合物が、アンドロゲン受容体核酸のような標的核酸又はその特定部分に対して、４個以下、３個以下、２個以下、又は１個以下の非相補的なヌクレオ塩基（複数）を含む。
特定の態様では、長さが１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、又は３０個のヌクレオ塩基であるか又はそれら以下のヌクレオ塩基であるアンチセンス化合物が、アンドロゲン受容体核酸のような標的核酸又はその特定部分に対して、６個以下、５個以下、４個以下、３個以下、２個以下、又は１個以下の非相補的なヌクレオ塩基（複数）を有する。
提供されるアンチセンス化合物には、標的核酸の一部に相補的であるものも含まれる。本明細書に使用するように、「部分」は、標的核酸の領域又はセグメント内にある一定数の隣接（即ち、連結）ヌクレオ塩基に言及する。「部分」はまた、アンチセンス化合物の一定数の隣接ヌクレオ塩基へ言及し得る。特定の態様において、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも８個のヌクレオ塩基部分に相補的である。特定の態様において、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも９個のヌクレオ塩基部分に相補的である。特定の態様において、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも１０個のヌクレオ塩基部分に相補的である。特定の態様において、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも１１個のヌクレオ塩基部分に相補的である。特定の態様において、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも１２個のヌクレオ塩基部分に相補的である。特定の態様において、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも１３個のヌクレオ塩基部分に相補的である。特定の態様において、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも１４個のヌクレオ塩基部分に相補的である。特定の態様において、アンチセンス化合物は、標的セグメントの少なくとも１５個のヌクレオ塩基部分に相補的である。また考慮されるのは、標的セグメントの少なくとも９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０個以上のヌクレオ塩基部分、又は上記の数値の任意の２つによって規定される範囲に相補的であるアンチセンス化合物である。
同一性
本発明で提供されるアンチセンス化合物はまた、特別なヌクレオチド配列、配列番号、又は特定のＩｓｉｓ番号によって表される化合物、又はその一部に対して一定のパーセント
同一性を有し得る。本明細書に使用するように、アンチセンス化合物は、それが同じヌクレオ塩基対合能力を有するならば、本明細書に開示する配列と同一である。例えば、開示されるＤＮＡ配列においてチミジンの代わりにウラシルを含有するＲＮＡは、ウラシルとチミジンの両方がアデニンと対合するので、そのＤＮＡ配列に対しては同一とみなされよう。本明細書に記載されるアンチセンス化合物の短縮バージョンと延長バージョン、並びに本発明で提供されるアンチセンス化合物に対して非同一の塩基を有する化合物も考慮される。この非同一塩基は、互いに隣接していても、アンチセンス化合物全体に分散していてもよい。アンチセンス化合物のパーセント同一性は、それが比較される配列に対する、同一の塩基対合を有する塩基の数に従って計算される。
特定の態様において、アンチセンス化合物又はその部分は、本明細書に開示するアンチセンス化合物又は配列番号の１以上又はその一部に対して、少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％同一である。
特定の態様では、アンチセンス化合物の一部を標的核酸の等しい長さ部分へ比較する。特定の態様では、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、又は２５個のヌクレオ塩基部分を標的核酸の等しい長さ部分へ比較する。
特定の態様では、アンチセンスオリゴヌクレオチドの一部を標的核酸の等しい長さ部分へ比較する。特定の態様では、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、又は２５個のヌクレオ塩基部分を標的核酸の等しい長さ部分へ比較する。
修飾
ヌクレオシドは、塩基−糖の組合せである。ヌクレオシドのヌクレオ塩基（塩基としても知られる）部分は、通常は、複素環式塩基部分である。ヌクレオチドは、ヌクレオシドの糖部分へ共有結合的に連結したリン酸基がさらに含まれるヌクレオシドである。ペントフラノシル糖が含まれるヌクレオシドでは、リン酸基は、その糖の２’、３’又は５’ヒドロキシル部分へ連結することができる。オリゴヌクレオチドは、隣接ヌクレオシドの互いへの共有結合を介して形成されて、線状のポリマーオリゴヌクレオチドを形成する。オリゴヌクレオチド構造の内部では、リン酸基は、通常、オリゴヌクレオチドのヌクレオシド間連結を形成するものとして言及される。
アンチセンス化合物への修飾には、ヌクレオシド間連結、糖部分、又はヌクレオ塩基に対する置換又は変化が含まれる。修飾アンチセンス化合物は、例えば、細胞取込みの強化、核酸標的への親和性の強化、ヌクレアーゼの存在下での安定性の増加、又は阻害活性の増加のような望ましい特性の故に、ネイティブ型に優って好ましいことが多い。
化学修飾ヌクレオシドはまた、短縮化又は先端切断されたアンチセンスオリゴヌクレオチドのその標的核酸への結合親和性を高めるために利用し得る。従って、そのような化学修飾ヌクレオシドを有するより短いアンチセンス化合物を用いて、同等の結果をしばしば入手することができる。
修飾ヌクレオシド間連結
ＲＮＡとＤＮＡの天然に存在するヌクレオシド間連結は、３’→５’ホスホジエステル連結である。１以上の修飾された、即ち天然に存在しないヌクレオシド間連結を有するアンチセンス化合物は、例えば、細胞取込みの強化、標的核酸への親和性の強化、及びヌクレアーゼの存在下での安定性の増加のような望ましい特性の故に、天然に存在するヌクレオ
シド間連結を有するアンチセンス化合物に優ってしばしば選択される。
修飾ヌクレオシド間連結を有するオリゴヌクレオチドには、リン原子を保持するヌクレオシド間連結、並びにリン原子を有さないヌクレオシド間連結が含まれる。代表的なリン含有ヌクレオシド間連結には、限定されないが、ホスホジエステル、ホスホトリエステル、メチルホスホネート、ホスホロアミデート、及びホスホロチオエートが含まれる。リン含有連結とリン非含有連結の製造法は、公知である。
特定の態様では、アンドロゲン受容体核酸へ標的指向されるアンチセンス化合物が１以上の修飾ヌクレオシド間連結を含む。特定の態様において、修飾ヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結である。特定の態様では、アンチセンス化合物のそれぞれのヌクレオシド間連結がホスホロチオエートヌクレオシド間連結である。
修飾糖部分
アンチセンス化合物は、糖基が修飾された１以上のヌクレオシドを含有してもよい。そのような糖修飾ヌクレオシドは、ヌクレアーゼ安定性の強化、結合親和性の増加、又は他の有益な生物学的特性をそのアンチセンス化合物へ付与する場合がある。特定の態様では、ヌクレオシドが化学修飾リボフラノース環部分を含む。化学修飾リボフラノース環の例には、限定無しに、置換基（５’及び２’置換基が含まれる）の付加、非ジェミナル環原子の架橋形成による二環式核酸（ＢＮＡ）の生成、リボシル環酸素原子のＳ、Ｎ（Ｒ）、又はＣ（Ｒ１）（Ｒ２）（Ｒ、Ｒ１、及びＲ２は、それぞれ独立して、Ｈ、Ｃ１−Ｃ１２アルキル、又は保護基である）での置き換え、及びこれらの組合せが含まれる。化学修飾糖の例には、２’−Ｆ−５’−メチル置換ヌクレオシド（他の開示された５’，２’−ビス置換ヌクレオシドについては、ＰＣＴ国際特許出願ＷＯ２００８／１０１１５７［２００８年８月２１日公開］を参照のこと）、又は２’位でのさらなる置換を伴う、リボシル環酸素原子のＳでの置き換え（公開中の米国特許出願ＵＳ２００５−０１３０９２３［２００５年６月１６日公開］を参照のこと）、またあるいは、ＢＮＡの５’−置換（ＰＣＴ国際特許出願ＷＯ２００７／１３４１８１［２００７年１１月２２日公開］を参照のこと、ここで４’−（ＣＨ２）−Ｏ−２’（ＬＮＡ）は、例えば５’−メチル又は５’−ビニル基で置換されている）が含まれる。
修飾糖部分を有するヌクレオシドの例には、限定無しに、５’−ビニル、５’−メチル（Ｒ又はＳ）、４’−Ｓ、２’−Ｆ、２’−ＯＣＨ３、２’−ＯＣＨ２ＣＨ３、２’−ＯＣＨ２ＣＨ２Ｆ、及び２’−Ｏ（ＣＨ２）２ＯＣＨ３置換基を含んでなるヌクレオシドが含まれる。２’位での置換基はまた、アリル、アミノ、アジド、チオ、Ｏ−アリル、Ｏ−Ｃ１−Ｃ１０アルキル、ＯＣＦ３、ＯＣＨ２Ｆ、Ｏ（ＣＨ２）２ＳＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２−Ｏ−Ｎ（Ｒｍ）（Ｒｎ）、Ｏ−ＣＨ２−Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｒｍ）（Ｒｎ）、及びＯ−ＣＨ２−Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｒｌ）−（ＣＨ２）２−Ｎ（Ｒｍ）（Ｒｎ）［ここでそれぞれのＲｌ、Ｒｍ、及びＲｎは、独立して、Ｈ、又は置換若しくは未置換Ｃ１−Ｃ１０アルキルである］より選択され得る。
本明細書に使用するように、「二環式ヌクレオシド」は、二環式糖部分を含んでなる修飾ヌクレオシドへ言及する。二環式ヌクレオシドの例には、限定無しに、４’リボシル環原子と２’リボシル環原子の間に架橋を含んでなるヌクレオシドが含まれる。特定の態様では、本発明で提供されるアンチセンス化合物に、４’→２’架橋を含んでなる１以上の二環式ヌクレオシドが含まれる。そのような４’→２’架橋形成された二環式ヌクレオシドの例には、限定されないが、式：４’−（ＣＨ２）−Ｏ−２’（ＬＮＡ）；４’−（ＣＨ２）−Ｓ−２’；４’−（ＣＨ２）２−Ｏ−２’（ＥＮＡ）；４’−ＣＨ（ＣＨ３）−Ｏ−２’（拘束エチル又はｃＥｔとも呼ばれる）及び４’−ＣＨ（ＣＨ２ＯＣＨ３）−Ｏ−２’（並びにこれらの類似体、米国特許第７，３９９，８４５［２００８年７月１５日
発行］を参照のこと）；４’−Ｃ（ＣＨ３）（ＣＨ３）−Ｏ−２’（並びにこの類似体、公開中の国際特許出願ＷＯ／２００９／００６４７８［２００９年１月８日公開］を参照のこと）；４’−ＣＨ２−Ｎ（ＯＣＨ３）−２’（並びにこの類似体、公開中の国際特許出願ＷＯ／２００８／１５０７２９［２００８年１２月１１日公開］を参照のこと）；４’−ＣＨ２−Ｏ−Ｎ（ＣＨ３）−２’（公開中の米国特許出願ＵＳ２００４−０１７１５７０［２００４年９月２日公開］を参照のこと）；４’−ＣＨ２−Ｎ（Ｒ）−Ｏ−２’（ここでＲは、Ｈ、Ｃ１−Ｃ１２アルキル、又は保護基である。米国特許第７，４２７，６７２号［２００８年９月２３日発行］を参照のこと）；４’−ＣＨ２−Ｃ-（Ｈ）（ＣＨ３）−２’（Chattopadhyaya et al., J. Org. Chem., 2009, 74, 118-134 を参照のこと）；及び４’−ＣＨ２−Ｃ（＝ＣＨ２）−２’（並びにこの類似体、公開中の国際特許出願ＷＯ２００８／１５４４０１［２００８年１２月８日公開］を参照のこと）の１つが含まれる。
二環式ヌクレオシドに関するさらなる報告は、公表文献にも見出すことができる（例えば、Singh et al., Chem. Commun., 1998, 4, 455-456；Koshkin et al., Tetrahedron, 1998, 54, 3607-3630；Wahlestedt et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2000, 97, 5633-5638；Kumar et al., Bioorg. Med. Chem. Lett., 1998, 8, 2219-2222；Singh et al., J. Org. Chem., 1998, 63, 10035-10039；Srivastava et al., J. Am. Chem. Soc., 2007, 129(26) 8362-8379；Elayadi et al., Curr. Opinion Invest. Drugs,2001, 2, 558-561；Braasch et al., Chem. Biol., 2001, 8, 1-7；及び Orum et al., Curr. Opinion Mol. Ther., 2001, 3, 239-243；米国特許第６，２６８，４９０号；６，５２５，１９１号；６，６７０，４６１号；６，７７０，７４８号；６，７９４，４９９号；７，０３４，１３３号；７，０５３，２０７号；７，３９９，８４５号；７，５４７，６８４号；及び７，６９６，３４５号；米国特許公開公報番号ＵＳ２００８−００３９６１８；ＵＳ２００９−００１２２８１；米国特許シリアル番号６０／９８９，５７４；６１／０２６，９９５；６１／０２６，９９８；６１／０５６，５６４；６１／０８６，２３１；６１／０９７，７８７；及び６１／０９９，８４４；ＰＣＴ国際公開特許出願ＷＯ１９９４／０１４２２６；ＷＯ２００４／１０６３５６；ＷＯ２００５／０２１５７０；ＷＯ２００７／１３４１８１；ＷＯ２００８／１５０７２９；ＷＯ２００８／１５４４０１；及びＷＯ２００９／００６４７８を参照のこと）。先述の二環式ヌクレオシドのそれぞれは、例えばα−Ｌ−リボフラノースとβ−Ｄ−リボフラノースが含まれる１以上の立体化学糖配置を有して、製造することができる（ＰＣＴ国際特許出願ＰＣＴ／ＤＫ９８／００３９３［ＷＯ９９／１４２２６として１９９９年３月２５日公開］を参照のこと）。
特定の態様では、ＢＮＡヌクレオシドの二環式糖部分に、限定されないが、ペントフラノシル糖部分の４’位と２’位の間に少なくとも１つの架橋を有する化合物が含まれ、ここでそのような架橋は、独立して、［Ｃ（Ｒａ）（Ｒｂ）］ｎ−、−Ｃ（Ｒａ）＝Ｃ（Ｒｂ）−、−Ｃ（Ｒａ）＝Ｎ−、−Ｃ（＝Ｏ）−、−Ｃ（＝ＮＲａ）−、−Ｃ（＝Ｓ）−、−Ｏ−、−Ｓｉ（Ｒａ）２−、−Ｓ（＝Ｏ）ｘ−、及び−Ｎ（Ｒａ）−より独立して選択される１個又は２〜４個の連結基を含み；
ここで：
ｘは、０、１、又は２であり；
ｎは、１、２、３、又は４であり；
それぞれのＲａとＲｂは、独立して、Ｈ、保護基、ヒドロキシル、Ｃ１−Ｃ１２アルキル、置換Ｃ１−Ｃ１２アルキル、Ｃ２−Ｃ１２アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ１２アルケニル、Ｃ２−Ｃ１２アルキニル、置換Ｃ２−Ｃ１２アルキニル、Ｃ５−Ｃ２０アリール、置換Ｃ５−Ｃ２０アリール、複素環ラジカル、置換複素環ラジカル、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、Ｃ５−Ｃ７脂環式ラジカル、置換Ｃ５−Ｃ７脂環式ラジカル、ハロゲン、ＯＪ１、ＮＪ１Ｊ２、ＳＪ１、Ｎ３、ＣＯＯＪ１、アシル（Ｃ（＝Ｏ）−Ｈ）、置換アシル、ＣＮ、スルホニル（Ｓ（＝Ｏ）２−Ｊ１）、又はスルホキシル（Ｓ（＝Ｏ）−Ｊ１）
であり；そして
それぞれのＪ１とＪ２は、独立して、Ｈ、Ｃ１−Ｃ１２アルキル、置換Ｃ１−Ｃ１２アルキル、Ｃ２−Ｃ１２アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ１２アルケニル、Ｃ２−Ｃ１２アルキニル、置換Ｃ２−Ｃ１２アルキニル、Ｃ５−Ｃ２０アリール、置換Ｃ５−Ｃ２０アリール、アシル（Ｃ（＝Ｏ）−Ｈ）、置換アシル、複素環ラジカル、置換複素環ラジカル、Ｃ１−Ｃ１２アミノアルキル、置換Ｃ１−Ｃ１２アミノアルキル、又は保護基である。
特定の態様において、二環式糖部分の架橋は、−［Ｃ（Ｒａ）（Ｒｂ）］ｎ−、−［Ｃ（Ｒａ）（Ｒｂ）］ｎ−Ｏ−、−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｎ（Ｒ）−Ｏ−、又は−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｏ−Ｎ（Ｒ）−である。特定の態様において、架橋は、４’−ＣＨ２−２’、４’−（ＣＨ２）２−２’、４’−（ＣＨ２）３−２’、４’−ＣＨ２−Ｏ−２’、４’−（ＣＨ２）２−Ｏ−２’、４’−ＣＨ２−Ｏ−Ｎ（Ｒ）−２’、及び４’−ＣＨ２−Ｎ（Ｒ）−Ｏ−２’−であり、ここでそれぞれのＲは、独立して、Ｈ、保護基、又はＣ１−Ｃ１２アルキルである。
特定の態様では、二環式ヌクレオシドが異性体の配置によってさらに明確化される。例えば、４’−２’メチレンオキシ架橋を含んでなるヌクレオシドは、α−Ｌ配置であるか又はβ−Ｄ配置であり得る。以前は、α−Ｌ−メチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）ＢＮＡが、アンチセンス活性を示すアンチセンスオリゴヌクレオチドへ組み込まれた（Frieden et al., Nucleic Acids Research, 2003, 21, 6365-6372）。
特定の態様において、二環式ヌクレオシドには、限定されないが、下記に図示されるような、（Ａ）α−Ｌ−メチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）ＢＮＡ、（Ｂ）β−Ｄ−メチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）ＢＮＡ、（Ｃ）エチレンオキシ（４’−（ＣＨ２）２−Ｏ−２’）ＢＮＡ、（Ｄ）アミノオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−Ｎ（Ｒ）−２’）ＢＮＡ、（Ｅ）オキシアミノ（４’−ＣＨ２−Ｎ（Ｒ）−Ｏ−２’）ＢＮＡ、及び（Ｆ）メチル（メチレンオキシ）（４’−ＣＨ（ＣＨ３）−Ｏ−２’）ＢＮＡ、（Ｇ）メチレン−チオ（４’−ＣＨ２−Ｓ−２’）ＢＮＡ、（Ｈ）メチレン−アミノ（４’−ＣＨ２−Ｎ（Ｒ）−２’）ＢＮＡ、（Ｉ）メチル炭素環式（４’−ＣＨ２−ＣＨ（ＣＨ３）−２’）ＢＮＡ、（Ｊ）プロピレン炭素環式（４’−（ＣＨ２）３−２’）ＢＮＡ、及び（Ｋ）ビニルＢＮＡが含まれる：
Figure 0006599497
式中、Ｂｘは塩基部分であって、Ｒは、独立して、Ｈ、保護基、Ｃ１−Ｃ１２アルキル、又はＣ１−Ｃ１２アルコキシである。
特定の態様では、式Ｉ：
Figure 0006599497
［式中：
Ｂｘは、複素環式塩基部分であり；
−Ｑａ−Ｑｂ−Ｑｃ−は、−ＣＨ２−Ｎ（Ｒｃ）−ＣＨ２−、−Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｒｃ）−ＣＨ２−、−ＣＨ２−Ｏ−Ｎ（Ｒｃ）−、−ＣＨ２−Ｎ（Ｒｃ）−Ｏ−、又は−Ｎ（Ｒｃ）−Ｏ−ＣＨ２であり；
Ｒｃは、Ｃ１−Ｃ１２アルキル又はアミノ保護基であり；そして
ＴａとＴｂは、それぞれ独立して、Ｈ、ヒドロキシル保護基、コンジュゲート基、反応性リン基、リン部分、又は支持体への共有付加基である］を有する二環式ヌクレオシドが提供される。
特定の態様では、式ＩＩ：
Figure 0006599497
［式中：
Ｂｘは、複素環式塩基部分であり；
ＴａとＴｂは、それぞれ独立して、Ｈ、ヒドロキシル保護基、コンジュゲート基、反応性リン基、リン部分、又は支持体への共有付加基であり；
Ｚａは、Ｃ１−Ｃ６アルキル、Ｃ２−Ｃ６アルケニル、Ｃ２−Ｃ６アルキニル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ２−Ｃ６アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルキニル、アシル、置換アシル、置換アミド、チオール、又は置換チオである］を有する二環式ヌクレオシドが提供される。
１つの態様において、置換される基のそれぞれは、独立して、ハロゲン、オキソ、ヒドロキシル、ＯＪｃ、ＮＪｃＪｄ、ＳＪｃ、Ｎ３、ＯＣ（＝Ｘ）Ｊｃ、及びＮＪｅＣ（＝Ｘ）ＮＪｃＪｄより独立して選択される置換基でモノ置換又はポリ置換され、ここでそれぞれのＪｃ、Ｊｄ、及びＪｅは、独立して、Ｈ、Ｃ１−Ｃ６アルキル、又は置換Ｃ１−Ｃ６アルキルであって、Ｘは、Ｏ又はＮＪｃである。
特定の態様では、式ＩＩＩ：
Figure 0006599497
［式中：Ｂｘは、複素環式塩基部分であり；
ＴａとＴｂは、それぞれ独立して、Ｈ、ヒドロキシル保護基、コンジュゲート基、反応性リン基、リン部分、又は支持体への共有付加基であり；
Ｚｂは、Ｃ１−Ｃ６アルキル、Ｃ２−Ｃ６アルケニル、Ｃ２−Ｃ６アルキニル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ２−Ｃ６アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルキニル、又は置換アシル（Ｃ（＝Ｏ）−）である］を有する二環式ヌクレオシドが提供される。
特定の態様では、式ＩＶ：
Figure 0006599497
［式中：
Ｂｘは、複素環式塩基部分であり；
ＴａとＴｂは、それぞれ独立して、Ｈ、ヒドロキシル保護基、コンジュゲート基、反応性リン基、リン部分、又は支持体への共有付加基であり；
Ｒｄは、Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、Ｃ２−Ｃ６アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルケニル、Ｃ２−Ｃ６アルキニル、又は置換Ｃ２−Ｃ６アルキニルであり；
それぞれのｑａ、ｑｂ、ｑｃ、及びｑｄは、独立して、Ｈ、ハロゲン、Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、Ｃ２−Ｃ６アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルケニル、Ｃ２−Ｃ６アルキニル又は置換Ｃ２−Ｃ６アルキニル、Ｃ１−Ｃ６アルコキシル、置換Ｃ１−Ｃ６アルコキシル、アシル、置換アシル、Ｃ１−Ｃ６アミノアルキル、又は置換Ｃ１−Ｃ６アミノアルキルである］を有する二環式ヌクレオシドが提供される。
特定の態様では、式Ｖ：
Figure 0006599497
［式中：
Ｂｘは、複素環式塩基部分であり；
ＴａとＴｂは、それぞれ独立して、Ｈ、ヒドロキシル保護基、コンジュゲート基、反応性リン基、リン部分、又は支持体への共有付加基であり；
ｑａ、ｑｂ、ｑｅ、及びｑｆは、それぞれ独立して、水素、ハロゲン、Ｃ１−Ｃ１２アルキル、置換Ｃ１−Ｃ１２アルキル、Ｃ２−Ｃ１２アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ１２アルケニル、Ｃ２−Ｃ１２アルキニル、置換Ｃ２−Ｃ１２アルキニル、Ｃ１−Ｃ１２アルコキシ、置換Ｃ１−Ｃ１２アルコキシ、ＯＪｊ、ＳＪｊ、ＳＯＪｊ、ＳＯ２Ｊｊ、ＮＪｊＪｋ、Ｎ３、ＣＮ、Ｃ（＝Ｏ）ＯＪｊ、Ｃ（＝Ｏ）ＮＪｊＪｋ、Ｃ（＝Ｏ）Ｊｊ、Ｏ−Ｃ（＝Ｏ）ＮＪｊＪｋ、Ｎ（Ｈ）Ｃ（＝ＮＨ）ＮＪｊＪｋ、Ｎ（Ｈ）Ｃ（＝Ｏ）ＮＪｊＪｋ、又はＮ（Ｈ）Ｃ（＝Ｓ）ＮＪｊＪｋである；
又はｑｅとｑｆは、一緒に＝Ｃ（ｑｇ）（ｑｈ）であり；
ｑｇとｑｈは、それぞれ独立して、Ｈ、ハロゲン、Ｃ１−Ｃ１２アルキル、又は置換Ｃ１−Ｃ１２アルキルである］を有する二環式ヌクレオシドが提供される。
メチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）ＢＮＡモノマーである、アデニン、シトシ
ン、グアニン、５−メチル−シトシン、チミン、及びウラシルの合成及び製造については、それらのオリゴマー化と、核酸認識特性とともに記載されている（Koshkin et al., Tetrahedron, 1998, 54, 3607-3630）。二環式核酸（ＢＮＡ）とその製造については、ＷＯ９８／３９３５２とＷＯ９９／１４２２６にも記載されている。
メチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）ＢＮＡと２’−チオ−ＢＮＡの類似体も、製造されたことがある（Kumar et al., Bioorg. Med. Chem. Lett., 1998, 8, 2219-2222）。オリゴデオキシリボヌクレオチド二重鎖を核酸ポリメラーゼの基質として含んでなるロックド（locked）ヌクレオシド類似体の製造についても記載されている（Wengel et al., ＷＯ９９／１４２２６）。さらに、当該技術分野では、コンホメーションが拘束された新規の高親和性オリゴヌクレオチド類似体である２’−アミノ−ＢＮＡの合成について記載されている（Singh et al., J. Org. Chem., 1998, 63, 10035-10039）。加えて、２’−アミノ−及び２’−メチルアミノ−ＢＮＡはすでに製造されて、相補的なＲＮＡ及びＤＮＡ鎖のあるその二重鎖の熱安定性もすでに報告されたことがある。
特定の態様では、式ＶＩ：
Figure 0006599497
［式中：
Ｂｘは、複素環式塩基部分であり；
ＴａとＴｂは、それぞれ独立して、Ｈ、ヒドロキシル保護基、コンジュゲート基、反応性リン基、リン部分、又は支持体への共有付加基であり；
それぞれのｑｉ、ｑｊ、ｑｋ、及びｑｌは、独立して、Ｈ、ハロゲン、Ｃ１−Ｃ１２アルキル、置換Ｃ１−Ｃ１２アルキル、Ｃ２−Ｃ１２アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ１２アルケニル、Ｃ２−Ｃ１２アルキニル、置換Ｃ２−Ｃ１２アルキニル、Ｃ１−Ｃ１２アルコキシル、置換Ｃ１−Ｃ１２アルコキシル、ＯＪｊ、ＳＪｊ、ＳＯＪｊ、ＳＯ２Ｊｊ、ＮＪｊＪｋ、Ｎ３、ＣＮ、Ｃ（＝Ｏ）ＯＪｊ、Ｃ（＝Ｏ）ＮＪｊＪｋ、Ｃ（＝Ｏ）Ｊｊ、Ｏ−Ｃ（＝Ｏ）ＮＪｊＪｋ、Ｎ（Ｈ）Ｃ（＝ＮＨ）ＮＪｊＪｋ、Ｎ（Ｈ）Ｃ（＝Ｏ）ＮＪｊＪｋ、又はＮ（Ｈ）Ｃ（＝Ｓ）ＮＪｊＪｋであり；そして
ｑｉとｑｊ又はｑｌとｑｋは、一緒に、＝Ｃ（ｑｇ）（ｑｈ）（ここでｑｇとｑｈは、それぞれ独立して、Ｈ、ハロゲン、Ｃ１−Ｃ１２アルキル、又は置換Ｃ１−Ｃ１２アルキルである）である］を有する二環式ヌクレオシドが提供される。
４’−（ＣＨ２）３−２’架橋とアルケニル類似体架橋の４’−ＣＨ＝ＣＨ−ＣＨ２−２’を有する１つの炭素環式二環式ヌクレオシドについては、記載されたことがある（Freier et al., Nucleic Acids Research, 1997, 25(22), 4429-4443 及び Albaek et al., J. Org. Chem., 2006, 71, 7731-7740）。炭素環式二環式ヌクレオシドの合成と製造についても、そのオリゴマー化と生化学試験とともに記載されたことがある（Srivastava et al., J. Am. Chem. Soc., 2007, 129(26), 8362-8379）。
本明細書に使用するように、「４’−２’二環式ヌクレオシド」又は「４’→２’二環式ヌクレオシド」は、フラノース環の２個の炭素原子を連結する架橋を含んでなるフラノ
ース環を含んでなり、その糖環の２’炭素原子と４’炭素原子を連結する、二環式ヌクレオシドに言及する。
本明細書に使用するように、「単環式ヌクレオシド」は、二環式糖部分ではない修飾糖部分を含んでなるヌクレオシドに言及する。特定の態様において、ヌクレオシドの糖部分又は糖部分類似体は、どの位置でも修飾又は置換されてよい。
本明細書に使用するように、「２’−修飾糖」は、２’位で修飾されたフラノシル糖を意味する。特定の態様において、そのような修飾には、限定されないが、ハロゲン化物、置換及び未置換アルコキシ、置換及び未置換チオアルキル、置換及び未置換アミノアルキル、置換及び未置換アルキル、置換及び未置換アリル、並びに置換及び未置換アルキニルより選択される置換基が含まれる。特定の態様では、２’修飾が、限定されないが、Ｏ［（ＣＨ２）ｎＯ］ｍＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）ｎＮＨ２、Ｏ（ＣＨ２）ｎＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）ｎＦ、Ｏ（ＣＨ２）ｎＯＮＨ２、ＯＣＨ２Ｃ（＝Ｏ）Ｎ（Ｈ）ＣＨ３、及びＯ（ＣＨ２）ｎＯＮ［（ＣＨ２）ｎＣＨ３］２（ここでｎとｍは、１〜約１０である）が含まれる置換基より選択される。他の２’−置換基はまた、Ｃ１−Ｃ１２アルキル、置換アルキル、アルケニル、アルキニル、アルカリール、アラルキル、Ｏ−アルカリール又はＯ−アラルキル、ＳＨ、ＳＣＨ３、ＯＣＮ、Ｃｌ、Ｂｒ、ＣＮ、Ｆ、ＣＦ３、ＯＣＦ３、ＳＯＣＨ３、ＳＯ２ＣＨ３、ＯＮＯ２、ＮＯ２、Ｎ３、ＮＨ２、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルカリール、アミノアルキルアミノ、ポリアルキルアミノ、置換シリル、ＲＮＡ切断基、レポーター基、インターカレーター、アンチセンス化合物の薬物動態特性を改善する基又はその薬力学特性を改善する基、並びに類似の特性を有する他の置換基より選択され得る。特定の態様では、修飾ヌクレオシドが、２’−ＭＯＥ側鎖を含む（Baker et al., J. Biol. Chem., 1997, 272, 11944-12000）。そのような２’−ＭＯＥ置換については、非修飾ヌクレオシドと、２’−Ｏ−メチル、Ｏ−プロピル、及びＯ−アミノプロピルのような他の修飾ヌクレオシドと比較して、改善された結合親和性を有するとして記載されてきた。２’−ＭＯＥ置換基を有するオリゴヌクレオチドも、生体内使用に有望な特徴がある、遺伝子発現のアンチセンス阻害剤であることが示された（Martin, Helv. Chim. Acta, 1995, 78, 486-504; Altmann et al., Chimia, 1996, 50, 168-176; Altmann et al., Biochem. Soc. Trans., 1996, 24, 630-637; 及び Altmann et al., Nucleosides Nucleotides, 1997, 16, 917-926）。
本明細書に使用するように、「修飾テトラヒドロピランヌクレオシド」又は「修飾ＴＨＰヌクレオシド」は、６員のテトラヒドロピラン「糖」が正常なヌクレオシド中のペントフラノシル残基（糖代用物）に置換されたヌクレオシドを意味する。修飾ＴＨＰヌクレオシドには、限定されないが、当該技術分野において、ヘキシトール核酸（ＨＮＡ）、アニトール核酸（ＡＮＡ）、マニトール核酸（ＭＮＡ）（Leumann, Bioorg. Med. Chem., 2002, 10, 841-854 を参照のこと）として言及されるもの、又は下記に図示するようなテトラヒドロピラン環系を有するフルオロＨＮＡ（Ｆ−ＨＮＡ）が含まれる：
Figure 0006599497
特定の態様では、糖代用物が式ＶＩＩ：
Figure 0006599497
［式中、式ＶＩＩの前記少なくとも１つのテトラヒドロピランヌクレオシド類似体のそれぞれについて独立して：
Ｂｘは、複素環式塩基部分であり；
ＴａとＴｂは、それぞれ独立して、テトラヒドロピランヌクレオシド類似体をアンチセンス化合物へ連結するヌクレオシド間連結基であるか又は、ＴａとＴｂの一方は、テトラヒドロピランヌクレオシド類似体をアンチセンス化合物へ連結するヌクレオシド間連結基であって、ＴａとＴｂの他方は、Ｈ、ヒドロキシル保護基、連結コンジュゲート基、又は５’若しくは３’−末端基であり；
ｑ１、ｑ２、ｑ３、ｑ４、ｑ５、ｑ６、及びｑ７は、それぞれ独立して、Ｈ、Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、Ｃ２−Ｃ６アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルケニル、Ｃ２−Ｃ６アルキニル、又は置換Ｃ２−Ｃ６アルキニルであり；そしてＲ１とＲ２のそれぞれは、水素、ヒドロキシル、ハロゲン、置換又は未置換アルコキシ、ＮＪ１Ｊ２、ＳＪ１、Ｎ３、ＯＣ（＝Ｘ）Ｊ１、ＯＣ（＝Ｘ）ＮＪ１Ｊ２、ＮＪ３Ｃ（＝Ｘ）ＮＪ１Ｊ２、及びＣＮより選択され、ここでＸは、Ｏ、Ｓ、又はＮＪ１であって、それぞれのＪ１、Ｊ２、及びＪ３は、独立して、Ｈ又はＣ１−Ｃ６アルキルである］より選択される。
特定の態様では、ｑ１、ｑ２、ｑ３、ｑ４、ｑ５、ｑ６、及びｑ７がそれぞれＨである、式ＶＩＩの修飾ＴＨＰヌクレオシドが提供される。特定の態様では、ｑ１、ｑ２、ｑ３、ｑ４、ｑ５、ｑ６、及びｑ７の少なくとも１つが、Ｈ以外である。特定の態様では、ｑ１、ｑ２、ｑ３、ｑ４、ｑ５、ｑ６、及びｑ７の少なくとも１つがメチルである。特定の態様では、Ｒ１とＲ２の一方がフルオロである、式ＶＩＩのＴＨＰヌクレオシドが提供される。特定の態様では、Ｒ１がフルオロであってＲ２がＨである；Ｒ１がメトキシであってＲ２がＨである、そしてＲ１がメトキシエトキシであってＲ２がＨである。
特定の態様では、糖代用物が、５個より多い原子と１個より多いヘテロ原子を有する環を含む。例えば、モルホリノ糖部分を含んでなるヌクレオシドとオリゴマー化合物におけるそれらの使用について報告されたことがある（例えば、Braasch et al., Biochemistry, 2002, 41, 4503-4510；及び米国特許第５，６９８，６８５；５，１６６，３１５；５，１８５，４４４；及び５，０３４，５０６号を参照のこと）。本明細書に使用するように、「モルホリノ」という用語は、以下の式：
Figure 0006599497
を有する糖代用物を意味する。
特定の態様では、例えば上記のモルホリノ構造由来の様々な置換基を付加するか又は改変させることによって、モルホリノを修飾し得る。そのような糖代用物は、本明細書において「修飾モルホリノ」と呼ばれる。
２’−Ｆ−５’−メチル置換ヌクレオシド（他の開示される５’，２’−ビス置換ヌクレオシドについては、ＰＣＴ国際特許出願ＷＯ２００８／１０１１５７［２００８年８月２１日公開］を参照のこと）と、リボシル環酸素原子のＳでの置き換えと２’位でのさらなる置換（公開済みの米国特許出願ＵＳ２００５−０１３０９２３［２００５年６月１６日公開］を参照のこと）、またあるいは、二環式核酸の５’−置換（ＰＣＴ国際特許出願ＷＯ２００７／１３４１８１［２００７年１１月２２日発行］を参照のこと。ここでは、４’−ＣＨ２−Ｏ−２’二環式ヌクレオシドが５’位で、５’−メチル又は５’−ビニル基でさらに置換される）とった種々の修飾の組合せも、限定無しに提供される。炭素環式二環式ヌクレオシドの合成と製造についても、そのオリゴマー化と生化学試験とともに記載されたことがある（例えば、Srivastava et al., J. Am. Chem. Soc., 2007, 129(26),
8362-8379 を参照のこと）。
特定の態様では、アンチセンス化合物が１以上の修飾シクロヘキセニルヌクレオシドを含むが、これは、天然に存在するヌクレオシド中のペントフラノシル残基の代わりに６員のシクロヘキセニルを有するヌクレオシドである。修飾シクロヘキセニルヌクレオシドには、限定されないが、当該技術分野において記載されたものが含まれる（例えば、共有される、公開済みのＰＣＴ出願ＷＯ２０１０／０３６６９６［２０１０年４月１０日公開］、Robeyns et al., J. Am. Chem. Soc., 2008, 130(6), 1979-1984；Horvath et al., Tetrahedron Letters, 2007, 48, 3621-3623；Nauwelaerts et al., J. Am. Chem. Soc., 2007, 129(30), 9340-9348；Gu et al., Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids, 2005, 24(5-7), 993-998；Nauwelaerts et al., Nucleic Acids Research, 2005, 33(8), 2452-2463；Robeyns et al., Acta Crystallographica, Section F: Structural Biology and Crystallization Communications, 2005, F61(6), 585-586；Gu et al., Tetrahedron, 2004, 60(9), 2111-2123；Gu et al., Oligonucleotides, 2003, 13(6), 479-489；Wang et al., J. Org. Chem., 2003, 68, 4499-4505; Verbeure et al., Nucleic Acids Research, 2001, 29(24), 4941-4947；Wang et al., J. Org. Chem., 2001, 66, 8478-82；Wang et al., Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acid, 2001, 20(4-7), 785-788； Wang et al., J. Am. Chem., 2000, 122, 8595-8602；公開済みＰＣＴ出願、ＷＯ０６／０４７８４２；及び公開済みＰＣＴ出願ＷＯ０１／０４９６８７を参照のこと；それぞれのテキストは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる）。特定の修飾シクロヘキセニルヌクレオシドは、式Ｘ：
Figure 0006599497
［式中、式Ｘの前記少なくとも１つのシクロヘキセニルヌクレオシド類似体のそれぞれについて独立して：
Ｂｘは、複素環式塩基部分であり；
Ｔ３とＴ４は、それぞれ独立して、シクロヘキセニルヌクレオシド類似体をアンチセンス化合物へ連結するヌクレオシド間連結基であるか又は、Ｔ３とＴ４の一方は、テトラヒドロピランヌクレオシド類似体をアンチセンス化合物へ連結するヌクレオシド間連結基であって、Ｔ３とＴ４の他方は、Ｈ、ヒドロキシル保護基、連結コンジュゲート基、又は５’若しくは３’−末端基であり；そして
ｑ１、ｑ２、ｑ３、ｑ４、ｑ５、ｑ６、ｑ７、ｑ８、及びｑ９は、それぞれ独立して、Ｈ、Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、Ｃ２−Ｃ６アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルケニル、Ｃ２−Ｃ６アルキニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルキニル、又は他の糖置換基である］を有する。
本明細書に使用するように、「２’−修飾」又は「２’−置換」は、２’位にＨ又はＯＨ以外の置換基を含んでなる糖を含んでなるヌクレオシドに関連する。２’−修飾ヌクレオシドには、限定されないが、糖環の２個の炭素原子を連結している架橋がその糖環の２’炭素と別の炭素を連結する二環式ヌクレオシド；並びに、アリル、アミノ、アジド、チオ、Ｏ−アリル、Ｏ−Ｃ１−Ｃ１０アルキル、−ＯＣＦ３、Ｏ−（ＣＨ２）２−Ｏ−ＣＨ３、２’−Ｏ（ＣＨ２）２ＳＣＨ３、Ｏ−（ＣＨ２）２−Ｏ−Ｎ（Ｒｍ）（Ｒｎ）、又はＯ−ＣＨ２−Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｒｍ）（Ｒｎ）（ここでそれぞれのＲｍとＲｎは、独立して、Ｈ又は置換若しくは未置換Ｃ１−Ｃ１０アルキルである）のような非架橋性の２’置換基があるヌクレオシドが含まれる。２’−修飾ヌクレオシドは、例えば、糖の他の位置に、及び／又はヌクレオ塩基に他の修飾をさらに含んでよい。
本明細書に使用するように、「２’−Ｆ」は、糖環の２’位にフルオロ基を含んでなる糖を含んでなるヌクレオシドに関連する。
本明細書に使用するように、「２’−ＯＭｅ」又は「２’−ＯＣＨ３」又は「２’−Ｏ−メチル」は、糖環の２’位に−ＯＣＨ３基を含んでなる糖を含んでなるヌクレオシドにそれぞれ関連する。
本明細書に使用するように、「オリゴヌクレオチド」は、複数の連結ヌクレオシドを含んでなる化合物を意味する。特定の態様では、その複数のヌクレオシドの１以上が修飾される。特定の態様では、オリゴヌクレオチドが１以上のリボヌクレオシド（ＲＮＡ）及び／又はデオキシリボヌクレオシド（ＤＮＡ）を含む。
当該技術分野では、ヌクレオシドをアンチセンス化合物への取込みのために修飾するのに使用し得る、多くの他の二環及び三環糖代用物の環系も知られている（例えば、概説：Leumann, Bioorg. Med. Chem., 2002, 10, 841-854 を参照のこと）。そのような環系は、様々な追加の置換を受けて、活性を高めることができる。
当業者には、修飾糖の製造の方法がよく知られている。そのような修飾糖の製造を教示する数件の代表的な米国特許には、限定無しに、米国特許第４，９８１，９５７；５，１１８，８００；５，３１９，０８０；５，３５９，０４４；５，３９３，８７８；５，４４６，１３７；５，４６６，７８６；５，５１４，７８５；５，５１９，１３４；５，５６７，８１１；５，５７６，４２７；５，５９１，７２２；５，５９７，９０９；５，６１０，３００；５，６２７，０５３；５，６３９，８７３；５，６４６，２６５；５，６７０，６３３；５，７００，９２０；５，７９２，８４７、及び６，６００，０３２号と国際特許出願ＰＣＴ／ＵＳ２００５／０１９２１９（２００５年６月２日に出願されて、ＷＯ２００５／１２１３７１として２００５年１２月２２日に公開）が含まれて、このそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
修飾糖部分を有するヌクレオチドにおいて、ヌクレオ塩基部分（天然、修飾、又はこれらの組合せ）は、適正な核酸標的とのハイブリダイゼーションのために維持される。
特定の態様では、アンチセンス化合物が、修飾糖部分を有する１以上のヌクレオシドを含む。特定の態様において、修飾糖部分は、２’−ＭＯＥである。特定の態様において、２’−ＭＯＥ修飾ヌクレオシドは、ギャップマーモチーフで配置される。特定の態様において、修飾糖部分は、（４’−ＣＨ（ＣＨ３）−Ｏ−２’）架橋形成基を有する二環式ヌクレオシドである。特定の態様において、（４’−ＣＨ（ＣＨ３）−Ｏ−２’）修飾ヌクレオシドは、ギャップマーモチーフのウィング全体に配置される。
修飾ヌクレオ塩基
ヌクレオ塩基（又は塩基）の修飾又は置換は、天然に存在するか又は合成の非修飾ヌクレオ塩基より構造的に識別可能であるが、機能的にはそれと交換可能である。天然ヌクレオ塩基と修飾ヌクレオ塩基は、ともに水素結合に参画することが可能である。そのようなヌクレオ塩基修飾は、ヌクレアーゼ安定性、結合親和性、又は他の何らかの有益な生物学的特性をアンチセンス化合物へ付与することができる。修飾ヌクレオ塩基には、例えば、５−メチルシトシン（５−ｍｅ−Ｃ）のような、合成ヌクレオ塩基と天然ヌクレオ塩基が含まれる。５−メチルシトシン置換を含めて、特定のヌクレオ塩基置換は、アンチセンス化合物の標的核酸への結合親和性を高めるのに特に有用である。例えば、５−メチルシトシン置換については、核酸二重鎖の安定性を０．６〜１．２℃高めることが示された（Sanghvi, Y.S., Crooke, S.T. and Lebleu, B. 監修「アンチセンスの研究及び応用（Antisense Research and Applications）」ＣＲＣプレス、ボカラトン（1993）276-278 頁）。
追加の修飾ヌクレオ塩基には、５−ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、２−アミノアデニン、アデニンとグアニンの６−メチルと他のアルキル誘導体、アデニンとグアニンの２−プロピルと他のアルキル誘導体、２−チオウラシル、２−チオチミン及び２−チオシトシン、５−ハロウラシル及びシトシン、５−プロピニル（−Ｃ≡Ｃ−ＣＨ３）ウラシル及びシトシンとピリミジン塩基の他のアルキニル誘導体、６−アゾウラシル、シトシン及びチミン、５−ウラシル（シュードウラシル）、４−チオウラシル、８−ハロ、８−アミノ、８−チオール、８−チオアルキル、８−ヒドロキシルと他の８−置換アデニン及びグアニン、５−ハロ、特に５−ブロモ、５−トリフルオロメチル、及び他の５−置換ウラシル及びシトシン、７−メチルグアニンと７−メチルアデニン、２−Ｆ−アデニン、２−アミノ−アデニン、８−アザグアニンと８−アザアデニン、７−デアザグアニンと７−デアザアデニン、及び３−デアザグアニンと３−デアザアデニンが含まれる。
複素環式塩基部分には、プリン又はピリミジン塩基が他の複素環、例えば、７−デアザ−アデニン、７−デアザグアノシン、２−アミノピリジン、及び２−ピリドンで置き換わっているものも含まれ得る。アンチセンス化合物の結合親和性を高めるのに特に有用であるヌクレオ塩基には、２−アミノプロピルアデニン、５−プロピニルウラシル、及び５−プロピニルシトシンが含まれる、５−置換ピリミジン、６−アザピリミジン、及びＮ−２、Ｎ−６、及びＯ−６置換プリンが含まれる。
特定の態様では、アンドロゲン受容体核酸へ標的指向されるアンチセンス化合物が１以上の修飾ヌクレオ塩基を含む。特定の態様では、アンドロゲン受容体核酸へ標的指向される、短縮化又はギャップ拡張化アンチセンスオリゴヌクレオチドが１以上の修飾ヌクレオ塩基を含む。特定の態様において、修飾ヌクレオ塩基は、５−メチルシトシンである。特定の態様では、それぞれのシトシンが５−メチルシトシンである。
コンジュゲートされたアンチセンス化合物
アンチセンス化合物は、生じるアンチセンスオリゴヌクレオチドの活性、細胞分布又は細胞取込みを増強する１以上の部分又はコンジュゲートへ共有結合されてよい。典型的なコンジュゲート基には、コレステロール部分と脂質部分が含まれる。追加のコンジュゲート基には、炭水化物、リン脂質、ビオチン、フェナジン、葉酸、フェナントリジン、アントラキノン、アクリジン、フルオレセイン、ローダミン、クマリン、及び色素が含まれる。
アンチセンス化合物はまた、概してアンチセンス化合物の一方又は両方の末端へ付いて、例えば、ヌクレアーゼ安定性のような特性を増強する１以上の安定化基を有するように修飾することができる。安定化基に含まれるのは、キャップ構造である。これらの末端修飾は、末端核酸を有するアンチセンス化合物をエクソヌクレアーゼ分解から防護して、細胞内での送達及び／又は局在化に役立つ可能性がある。キャップは、５’末端（５’−キャップ）又は３’−末端（３’−キャップ）に存在することも、両方の末端に存在することもできる。キャップ構造は、当該技術分野で公知であり、例えば、逆位無塩基デオキシキャップが含まれる。アンチセンス化合物の片端又は両端にキャップしてヌクレアーゼ安定性を付与するために使用され得るさらなる３’及び５’−安定化基には、ＷＯ０３／００４６０２［２００３年１月１６日公開］に開示されるものが含まれる。
特定の態様では、アンチセンス化合物が、限定されないが、ｓｓＲＮＡとしての使用に特に適しているものを含めて、１以上のコンジュゲート基の付加によって修飾される。一般に、コンジュゲート基は、限定されないが、薬力学、薬物動態、安定性、結合、吸収、細胞分布、細胞取込み、荷電、及びクリアランスが含まれる、付加されたオリゴヌクレオチド１以上の特性を修飾する。コンジュゲート基は、化学技術分野で定型的に使用されて、オリゴヌクレオチドのような親化合物へ直接的に、又は任意選択のコンジュゲート連結部分又はコンジュゲート連結基を介して連結される。コンジュゲート基には、限定無しに、インターカレーター、レポーター分子、ポリアミン、ポリアミド、ポリエチレングリコール、チオエーテル、ポリエーテル、コレステロール、チオコレステロール、コリン酸部分、葉酸、脂質、リン脂質、ビオチン、フェナジン、フェナントリジン、アントラキノン、アダマンタン、アクリジン、フルオレセイン、ローダミン、クマリン、及び色素が含まれる。特定のコンジュゲート基については、これまでに記載されたことがある。例えば：コレステロール部分（Letsinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1989, 86, 6553-6556）、コリン酸（Manoharan et al., Bioorg. Med. Chem. Let., 1994, 4, 1053-1060）、チオエーテル、例えば、ヘキシル−Ｓ−トリチルチオール（Manoharan et al., Ann. N.Y. Acad. Sci., 1992, 660, 306-309；Manoharan et al., Bioorg. Med. Chem. Let., 1993, 3, 2765-2770）、チオコレステロール（Oberhauser et al., Nucl. Acids Res., 1992, 20, 533-538）、脂肪族鎖、例えば、ドデカンジオール又はウンデシル残基（Saison-Behmoaras et al., EMBO J., 1991, 10, 1111-1118；Kabanov et al., FEBS Lett., 1990, 259, 327-330；Svinarchuk et al., Biochimie, 1993, 75, 49-54）、リン脂質、例えば、ジヘキサデシル−ｒａｃ−グリセロール又は１，２−ジ−Ｏ−ヘキサデシル−ｒａｃ−グリセロ−３−Ｈ−ホスホン酸トリエチルアンモニウム（Manoharan et al., Tetrahedron Lett., 1995, 36, 3651-3654；Shea et al., Nucl. Acids Res., 1990, 18, 3777-3783）、ポリアミン又はポリエチレングリコール鎖（Manoharan et al., Nucleosides & Nucleotides, 1995, 14, 969-973）、又はアダマンタン酢酸（Manoharan et al., Tetrahedron Lett., 1995, 36, 3651-3654）、パルミチル部分（Mishra et al., Biochim. Biophys. Acta, 1995, 1264, 229-237）、又はオクタデシルアミン又はヘキシルアミノ−カルボニル−オキシコレステロール部分（Crooke et al., J. Pharmacol. Exp. Ther., 1996, 277, 923-937）。
ｓｓＲＮＡに有用なものが含まれる追加のコンジュゲートとアンチセンス化合物内におけるそれらの配置については、例えばＰＣＴ公開公報番号；ＷＯ２０１３／０３３２３０を参照のこと。
医薬組成物を製剤化するための組成物及び方法
医薬組成物又は製剤の調製のために、アンチセンスオリゴヌクレオチドを医薬的に許容される活性物質又は不活性物質と混合してよい。医薬組成物の製剤化のための組成物及び方法は、限定されないが、投与経路、疾患の程度、又は投与される用量が含まれる、いくつかの判断基準に依存する。
アンドロゲン受容体核酸へ標的指向されるアンチセンス化合物は、該アンチセンス化合物を好適な医薬的に許容される希釈剤又は担体と組み合わせることによって、医薬組成物において利用することができる。特定の態様では、医薬的に許容される希釈剤が、注射に適した無菌水のような、水である。従って、１つの態様において、本明細書に記載される方法において利用されるのは、アンドロゲン受容体核酸へ標的指向されるアンチセンス化合物と医薬的に許容される希釈剤を含んでなる医薬組成物である。特定の態様において、医薬的に許容される希釈剤は、水である。特定の態様において、アンチセンス化合物は、本発明で提供されるアンチセンスオリゴヌクレオチドである。
アンチセンス化合物を含んでなる医薬組成物には、ヒトが含まれる動物への投与時に、生理活性のある代謝産物又はその残基を（直接的又は間接的に）提供することが可能である、あらゆる医薬的に許容される塩、エステル、又はそのようなエステルの塩、又はあらゆる他のオリゴヌクレオチドが含まれる。従って、例えば、本開示はまた、アンチセンス化合物の医薬的に許容される塩、そのプロドラッグ、そのようなプロドラッグの医薬的に許容される塩、及び他の生物学的同等物へ向けられる。好適な医薬的に許容される塩には、限定されないが、ナトリウム塩とカリウム塩が含まれる。
プロドラッグには、アンチセンス化合物の片端又は両端での追加のヌクレオシドの取込みを含めることができて、これは身体内の内因性ヌクレアーゼによって切断されて、活性のあるアンチセンス化合物を生成する。
アンチセンスオリゴヌクレオチドの試験管内試験
本明細書に記載されるのは、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの細胞の処理の方法であって、これは、他のアンチセンス化合物での処理のために適宜修飾することができる。
細胞が培養時にほぼ６０〜８０％の集密度に達したときに、この細胞をアンチセンスオリゴヌクレオチドで処理し得る。
アンチセンスオリゴヌクレオチドを培養細胞へ導入するためによく使用される１つの試薬には、カチオン性脂質のトランスフェクション試薬、ＬＩＰＯＦＥＣＴＩＮ（Invitrogen，カリフォルニア州カールスバッド）が含まれる。アンチセンスオリゴヌクレオチドをＯＰＴＩ−ＭＥＭ１（Invitrogen，カリフォルニア州カールスバッド）中でＬＩＰＯＦＥＣＴＩＮと混合して、アンチセンスオリゴヌクレオチドの所望される最終濃度と、１００ｎＭアンチセンスオリゴヌクレオチドにつき２〜１２μｇ／ｍＬの範囲に及び得るＬＩＰＯＦＥＣＴＩＮ濃度を達成し得る。
アンチセンスオリゴヌクレオチドを培養細胞へ導入するために使用される別の試薬には、ＬＩＰＯＦＥＣＴＡＭＩＮＥ（Invitrogen，カリフォルニア州カールスバッド）が含まれる。アンチセンスオリゴヌクレオチドをＯＰＴＩ−ＭＥＭ１低血清培地（Invitrogen，カリフォルニア州カールスバッド）中でＬＩＰＯＦＥＣＴＡＭＩＮＥと混合して、アンチセンスオリゴヌクレオチドの所望される濃度と、１００ｎＭアンチセンスオリゴヌクレオチドにつき２〜１２μｇ／ｍＬの範囲に及び得るＬＩＰＯＦＥＣＴＡＭＩＮＥ濃度を達成する。
アンチセンスオリゴヌクレオチドを培養細胞中へ導入するために使用される別の技術には、エレクトロポレーションが含まれる。
アンチセンスオリゴヌクレオチドを培養細胞中へ導入するために使用されるなお別の技術には、該細胞によるオリゴヌクレオチドの自由な取込みが含まれる。
定型的な方法によって、細胞をアンチセンスオリゴヌクレオチドで処理する。アンチセンスオリゴヌクレオチド処理後１６〜２４時間で細胞を採取してよく、この時点で標的核酸のＲＮＡレベル又はタンパク質レベルを当該技術分野で知られていて本明細書に記載される方法によって測定する。一般に、処理を多数の反復試験（replicates）で実施する場合、データは反復処理の平均値として提示される。
使用するアンチセンスオリゴヌクレオチドの濃度は、細胞系ごとに変動する。特別な細胞系に最適なアンチセンスオリゴヌクレオチド濃度を決定するための方法は、当該技術分野で公知である。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ＬＩＰＯＦＥＣＴＡＭＩＮＥとともにトランスフェクトされる場合、典型的には１ｎＭ〜３００ｎＭに及ぶ濃度で使用される。エレクトロポレーションを使用してトランスフェクトされる場合、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、６２５〜２０，０００ｎＭに及ぶより高い濃度で使用される。
ＲＮＡ単離
全細胞ＲＮＡ又はポリ（Ａ）＋ｍＲＮＡについてＲＮＡ分析を実施することができる。ＲＮＡ単離の方法は、当該技術分野で公知である。当該技術分野で公知の方法を使用して、例えば、ＴＲＩＺＯＬ試薬（Invitrogen，カリフォルニア州カールスバッド）を製造業者のプロトコールに従って使用して、ＲＮＡを調製する。
実施態様：
Ｅ１．１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のヌクレオ塩基配列のいずれかの少なくとも８個の隣接ヌクレオ塩基を含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物。
Ｅ２．１６〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号１２〜配列番号１７９のいずれか１つのヌクレオ塩基配列を含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物。
Ｅ３．配列番号１２〜配列番号１７９のいずれか１つのヌクレオ塩基配列からなる修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物。
Ｅ４．１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号３５、３９、４３、１２４、１５０、１５５、１６９、又は１７５のヌクレオ塩基配列のいずれかの少なくとも８個の隣接ヌクレオ塩基を含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物。
Ｅ５．１６〜３０個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号３５、３９、４３、１２４、１５０、１５５、１６９、又は１７５のヌクレオ塩基配列を含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物。
Ｅ６．１６個の連結ヌクレオシドからなって、配列番号３５、３９、４３、１２４、１５０、１５５、１６９、又は１７５のヌクレオ塩基配列からなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物。
Ｅ７．配列番号１のヌクレオチド：２９５７〜２９７２、３０７９〜３０９４、３０９９〜３１１４、３１０９〜３１２４、３１１３〜３１２８、３１２０〜３１３５、３１３３〜３１４８、３２２４〜３２３９、３２２６〜３２４１、３３５１〜３３６６、３３５３〜３３６８、３３６１〜３３７６、３３８８〜３４０３、３５１３〜３５２８、３５１７〜３５３２、３５１９〜３５３４、３６４１〜３６５６、３７３５〜３７５０、３７６４〜３７７９、３７６８〜３７８３、３７９８〜３８１３、３７９９〜３８１４、３８５１〜３８６６、３８７０〜３８８５、３８７４〜３８８９、３８７６〜３８９１、３８７８〜３８９３、３８８４〜３８９９、３８８６〜３９０１、３８８８〜３９０３、３９０１〜３９１６、３９５６〜３９７１、３９６２〜３９７７、３９６４〜３９７９、３９６７〜３９８２、４０１９〜４０３４、４０３８〜４０５３、４０４９〜４０６４、４０５６〜４０７１、４０５９〜４０７４、４０６２〜４０７７、４０６６〜４０８１、４０７０〜４０８５、４１０１〜４１１６、４１０３〜４１１８、４１０５〜４１２０、４１０９〜４１２４、４３０５〜４３２０、４４０５〜４４２０、４５３２〜４５４７、４５３４〜４５４９、４５３７〜４５５２、４５３９〜４５５４、４５５５〜４５７０、４５７１〜４５８６、４５７３〜４５８８、４５７８〜４５９３、４５９７〜４６１２、４６３２〜４６４７、４６５５〜４６７０、４６５６〜４６７１、４６６２〜４６７７、４６９９〜４７１４、４７４７〜４７６２、４７５０〜４７６５、４７５２〜４７６７、４７５４〜４７６９、４７５５〜４７７０、４７６９〜４７８４、４７９８〜４８１３、４８０４〜４８１９、４８０７〜４８２２、４８３３〜４８４８、４８３７〜４８５２、４８３９〜４８５４、４８６５〜４８８０、４８６８〜４８８３、４８７２〜４８８７、４８７４〜４８８９、４８７６〜４８９１、４８８７〜４９０２、４８８９〜４９０４、４９１６〜４９３１、４９１８〜４９３３、４９３８〜４９５３、４９４２〜４９５７、４９４４〜４９５９、４９５１〜４９６６、５０５０〜５０６５、５０５２〜５０６７、５０５４〜５０６９、５０５６〜５０７１、５０６０〜５０７５、５０６１〜５０７６、５０６２〜５０７７、５１３３〜５１４８、５１４１〜５１５６、５１５５〜５１７０、５２６５〜５２８０、５２９３〜５３０８、５３０８〜５３２３、５３９２〜５４０７、５４４８〜５４６３、５４６９〜５４８４、５４８１〜５４９６、５４８３〜５４９８、５４８６〜５５０１、５４８８〜５５０３、５４９４〜５５０９、５５２１〜５５３６、５６６６〜５６８１、６２２２〜６２３７、６７０１〜６７１６、７５４３〜７５５８、８４７１〜８４８６、８６３８〜８６５３、９４６４〜９４７９、１０２１７〜１０２３２、１０２５０〜１０２６５、１０８６５〜１０８８０、１１１９７〜１１２１２、１１８５５〜１１８７０、１３１８９〜１３２０４、１３３２１〜１３３３６、１３３４６〜１３３６１、１６５５５〜１６５７０、１６７９３〜１６８０８、１６９６８〜１６９８３、１７２０６〜１７２２１、１８８６５〜１８８８０、２９３２９〜２９３４４、３２２９０〜３２３０５、３３３１５〜３３３３０、３９０５５〜３９０７０、４０６１５〜４０６３０、４２０１７〜４２０３２、５６０５０〜５６０６５、５８７１９〜５８７３４、５８７２０〜５８７３９、５８７２１〜５８７３６、５８７２２〜５８７３７、５８７２３〜５８７３８、５８７２４〜５８７３９、５８７２５〜５８７４０、５８７５０〜５８７６９、５８７５１〜５８７６６、５８７５２〜５８７６７、５８７５３〜５８７６８、５８７５４〜５８７６９、５８７５５〜５８７７０、６０９０２〜６０９１７、６７４５４〜６７４６９、１１４８７４〜１１４８８９、１１５２７２〜１１５２８７、１１５３６５〜１１５３８０、１３４９７１〜１３４９８６、１０２１５６〜１０２１７１、１３９６８２〜１３９６９７、１３９７６２〜１３９７７７、１３９７８２〜１３９７９７、１４４８５６〜１４４８７１、１４４９３８〜１４４９５３、１４８４０６〜１４８４２１、１４８４４３〜１４８４５８、１４８５２０〜１４８５３５、１８１６９５〜１８１７１０、１８２９５８〜１８２９７３、又は１８３０４９〜１８３０６４内で相補的な１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物であって、ここで前記修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号１に少なくとも９０％相補的である、前記化合物。
Ｅ８．配列番号１のヌクレオ塩基：２９５７〜２９７２、３０７９〜３０９４、３０９９〜３１１４、３１０９〜３１２４、３１１３〜３１２８、３１２０〜３１３５、３１３３〜３１４８、３２２４〜３２３９、３２２６〜３２４１、３３５１〜３３６６、３３５３〜３３６８、３３６１〜３３７６、３３８８〜３４０３、３５１３〜３５２８、３５１７〜３５３２、３５１９〜３５３４、３６４１〜３６５６、３７３５〜３７５０、３７６４〜３７７９、３７６８〜３７８３、３７９８〜３８１３、３７９９〜３８１４、３８５１〜３８６６、３８７０〜３８８５、３８７４〜３８８９、３８７６〜３８９１、３８７８〜３８９３、３８８４〜３８９９、３８８６〜３９０１、３８８８〜３９０３、３９０１〜３９１６、３９５６〜３９７１、３９６２〜３９７７、３９６４〜３９７９、３９６７〜３９８２、４０１９〜４０３４、４０３８〜４０５３、４０４９〜４０６４、４０５６〜４０７１、４０５９〜４０７４、４０６２〜４０７７、４０６６〜４０８１、４０７０〜４０８５、４１０１〜４１１６、４１０３〜４１１８、４１０５〜４１２０、４１０９〜４１２４、４３０５〜４３２０、４４０５〜４４２０、４５３２〜４５４７、４５３４〜４５４９、４５３７〜４５５２、４５３９〜４５５４、４５５５〜４５７０、４５７１〜４５８６、４５７３〜４５８８、４５７８〜４５９３、４５９７〜４６１２、４６３２〜４６４７、４６５５〜４６７０、４６５６〜４６７１、４６６２〜４６７７、４６９９〜４７１４、４７４７〜４７６２、４７５０〜４７６５、４７５２〜４７６７、４７５４〜４７６９、４７５５〜４７７０、４７６９〜４７８４、４７９８〜４８１３、４８０４〜４８１９、４８０７〜４８２２、４８３３〜４８４８、４８３７〜４８５２、４８３９〜４８５４、４８６５〜４８８０、４８６８〜４８８３、４８７２〜４８８７、４８７４〜４８８９、４８７６〜４８９１、４８８７〜４９０２、４８８９〜４９０４、４９１６〜４９３１、４９１８〜４９３３、４９３８〜４９５３、４９４２〜４９５７、４９４４〜４９５９、４９５１〜４９６６、５０５０〜５０６５、５０５２〜５０６７、５０５４〜５０６９、５０５６〜５０７１、５０６０〜５０７５、５０６１〜５０７６、５０６２〜５０７７、５１３３〜５１４８、５１４１〜５１５６、５１５５〜５１７０、５２６５〜５２８０、５２９３〜５３０８、５３０８〜５３２３、５３９２〜５４０７、５４４８〜５４６３、５４６９〜５４８４、５４８１〜５４９６、５４８３〜５４９８、５４８６〜５５０１、５４８８〜５５０３、５４９４〜５５０９、５５２１〜５５３６、５６６６〜５６８１、６２２２〜６２３７、６７０１〜６７１６、７５４３〜７５５８、８４７１〜８４８６、８６３８〜８６５３、９４６４〜９４７９、１０２１７〜１０２３２、１０２５０〜１０２６５、１０８６５〜１０８８０、１１１９７〜１１２１２、１１８５５〜１１８７０、１３１８９〜１３２０４、１３３２１〜１３３３６、１３３４６〜１３３６１、１６５５５〜１６５７０、１６７９３〜１６８０８、１６９６８〜１６９８３、１７２０６〜１７２２１、１８８６５〜１８８８０、２９３２９〜２９３４４、３２２９０〜３２３０５、３３３１５〜３３３３０、３９０５５〜３９０７０、４０６１５〜４０６３０、４２０１７〜４２０３２、５６０５０〜５６０６５、５８７１９〜５８７３４、５８７２０〜５８７３９、５８７２１〜５８７３６、５８７２２〜５８７３７、５８７２３〜５８７３８、５８７２４〜５８７３９、５８７２５〜５８７４０、５８７５０〜５８７６９、５８７５１〜５８７６６、５８７５２〜５８７６７、５８７５３〜５８７６８、５８７５４〜５８７６９、５８７５５〜５８７７０、６０９０２〜６０９１７、６７４５４〜６７４６９、１１４８７４〜１１４８８９、１１５２７２〜１１５２８７、１１５３６５〜１１５３８０、１３４９７１〜１３４９８６、１０２１５６〜１０２１７１、１３９６８２〜１３９６９７、１３９７６２〜１３９７７７、１３９７８２〜１３９７９７、１４４８５６〜１４４８７１、１４４９３８〜１４４９５３、１４８４０６〜１４８４２１、１４８４４３〜１４８４５８、１４８５２０〜１４８５３５、１８１６９５〜１８１７１０、１８２９５８〜１８２９７３、又は１８３０４９〜１８３０６４の等しい長さ部分に１００％相補的な少なくとも８個の隣接ヌクレオ塩基の一部を含んでなるヌクレオ塩基配列を有する１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物であって、ここでこの修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオ塩基配列は、配列番
号１に相補的である、前記化合物。
Ｅ９．配列番号１のエクソン１ヌクレオチド：２９５７〜２９７２、３０７９〜３０９４、３０９９〜３１１４、３１０９〜３１２４、３１１３〜３１２８、３１２０〜３１３５、３１３３〜３１４８、３２２４〜３２３９、３２２６〜３２４１、３３５１〜３３６６、３３５３〜３３６８、３３６１〜３３７６、３３８８〜３４０３、３５１３〜３５２８、３５１７〜３５３２、３５１９〜３５３４、３６４１〜３６５６、３７３５〜３７５０、３７６４〜３７７９、３７６８〜３７８３、３７９８〜３８１３、３７９９〜３８１４、３８５１〜３８６６、３８７０〜３８８５、３８７４〜３８８９、３８７６〜３８９１、３８７８〜３８９３、３８８４〜３８９９、３８８６〜３９０１、３８８８〜３９０３、３９０１〜３９１６、３９５６〜３９７１、３９６２〜３９７７、３９６４〜３９７９、３９６７〜３９８２、４０１９〜４０３４、４０３８〜４０５３、４０４９〜４０６４、４０５６〜４０７１、４０５９〜４０７４、４０６２〜４０７７、４０６６〜４０８１、４０７０〜４０８５、４１０１〜４１１６、４１０３〜４１１８、４１０５〜４１２０、４１０９〜４１２４、４３０５〜４３２０、４４０５〜４４２０、４５３２〜４５４７、４５３４〜４５４９、４５３７〜４５５２、４５３９〜４５５４、４５５５〜４５７０、４５７１〜４５８６、４５７３〜４５８８、４５７８〜４５９３、４５９７〜４６１２、４６３２〜４６４７、４６５５〜４６７０、４６５６〜４６７１、４６６２〜４６７７、４６９９〜４７１４、４７４７〜４７６２、４７５０〜４７６５、４７５２〜４７６７、４７５４〜４７６９、４７５５〜４７７０、４７６９〜４７８４、４７９８〜４８１３、４８０４〜４８１９、４８０７〜４８２２、４８３３〜４８４８、４８３７〜４８５２、４８３９〜４８５４、４８６５〜４８８０、４８６８〜４８８３、４８７２〜４８８７、４８７４〜４８８９、４８７６〜４８９１、４８８７〜４９０２、４８８９〜４９０４、４９１６〜４９３１、４９１８〜４９３３、４９３８〜４９５３、４９４２〜４９５７、４９４４〜４９５９、４９５１〜４９６６、５０５０〜５０６５、５０５２〜５０６７、５０５４〜５０６９、５０５６〜５０７１、５０６０〜５０７５、５０６１〜５０７６、５０６２〜５０７７、５１３３〜５１４８、５１４１〜５１５６、５１５５〜５１７０、５２６５〜５２８０、５２９３〜５３０８、５３０８〜５３２３、５３９２〜５４０７、５４４８〜５４６３、５４６９〜５４８４、５４８１〜５４９６、５４８３〜５４９８、５４８６〜５５０１、５４８８〜５５０３、５４９４〜５５０９、又は５５２１〜５５３６内で相補的な１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む、Ｅ１、Ｅ７、又はＥ８のいずれか１つの化合物。
Ｅ１０．配列番号１のエクソン１のヌクレオチド：５０５２〜５０６７内で相補的な１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む、Ｅ９の化合物。
Ｅ１１．配列番号１のイントロン１のヌクレオチド：５６６６〜５６８１、６２２２〜６２３７、６７０１〜６７１６、７５４３〜７５５８、８４７１〜８４８６、８６３８〜８６５３、９４６４〜９４７９、１０２１７〜１０２３２、１０２５０〜１０２６５、１０８６５〜１０８８０、１１１９７〜１１２１２、１１８５５〜１１８７０、１３１８９〜１３２０４、１３３２１〜１３３３６、１３３４６〜１３３６１、１６５５５〜１６５７０、１６７９３〜１６８０８、１６９６８〜１６９８３、１７２０６〜１７２２１、１８８６５〜１８８８０、２９３２９〜２９３４４、３２２９０〜３２３０５、３３３１５〜３３３３０、３９０５５〜３９０７０、４０６１５〜４０６３０、４２０１７〜４２０３２、５６０５０〜５６０６５、５８７１９〜５８７３４、５８７２０〜５８７３９、５８７２１〜５８７３６、５８７２２〜５８７３７、５８７２３〜５８７３８、５８７２４〜５８７３９、５８７２５〜５８７４０、５８７５０〜５８７６９、５８７５１〜５８７６６、５８７５２〜５８７６７、５８７５３〜５８７６８、５８７５４〜５８７６９、５８７５５〜５８７７０、６０９０２〜６０９１７、６７４５４〜６７４６９、１１４８７４〜１１４８８９、１１５２７２〜１１５２８７、１１５３６５〜１１５３８０、又は１
３４９７１〜１３４９８６内で相補的な１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む、Ｅ１、Ｅ７、又はＥ８のいずれか１つの化合物。
Ｅ１２．配列番号１のイントロン１のヌクレオチド：８６３８〜８６５３、１１１９７〜１１２１２、４０６１５〜４０６３０、５８７１９〜５８７３４、５８７２０〜５８７３５、又は５８７２１〜５８７３６内で相補的な１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む、Ｅ１１の化合物。
Ｅ１３．修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも１つの修飾糖を含む、Ｅ１〜Ｅ１２のいずれか１つの化合物。
Ｅ１４．少なくとも１つの修飾糖が２’−Ｏ−メトキシエチル基を含む、Ｅ１３の化合物。
Ｅ１５．少なくとも１つの修飾糖が二環式糖である、Ｅ１３の化合物。
Ｅ１６．二環式糖が４’−ＣＨ（ＣＨ３）−Ｏ−２’基を含む、Ｅ１５の化合物。
Ｅ１７．二環式糖が４’−ＣＨ２−Ｏ−２’又は４’−（ＣＨ２）２−Ｏ−２’基を含む、Ｅ１５の化合物。
Ｅ１８．修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも１つの修飾ヌクレオシド間連結を含む、Ｅ１〜Ｅ１７のいずれか１つの化合物。
Ｅ１９．アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結がホスホロチオエートヌクレオシド間連結である、Ｅ１８の化合物。
Ｅ２０．修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも１つの修飾ヌクレオ塩基を含む、Ｅ１〜Ｅ１９のいずれか１つの化合物。
Ｅ２１．修飾ヌクレオ塩基が５−メチルシトシンである、Ｅ２０の化合物。
Ｅ２２．修飾オリゴヌクレオチドが：
連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて、ここでそれぞれのウィングセグメントのそれぞれのヌクレオシドは修飾糖を含む、Ｅ１〜Ｅ２１のいずれか１つの化合物。
Ｅ２３．修飾オリゴヌクレオチドが：
１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて、ここでそれぞれのウィングセグメントのそれぞれのヌクレオシドは、２’−Ｏ−メトキシエチル糖又は拘束エチル糖を含み；そしてここで、それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結である、Ｅ２２の化合物。
Ｅ２４．配列番号３５の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオ
シドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物、又はその医薬的に許容される塩であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
９個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；５’ウィングセグメントの３個の連結ヌクレオシドは、それぞれ拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び２’−Ｏ−メトキシエチル糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである、前記化合物又はその医薬的に許容される塩。
Ｅ２５．配列番号３９の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物、又はその医薬的に許容される塩であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
９個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；５’ウィングセグメントの３個の連結ヌクレオシドは、それぞれ拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び２’−Ｏ−メトキシエチル糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである、前記化合物又はその医薬的に許容される塩。
Ｅ２６．配列番号３９の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物、又はその医薬的に許容される塩であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
８個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；５’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び２’−Ｏ−メトキシエチル糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである、前記化合物又はその医薬的に許容される塩。
Ｅ２７．配列番号３９の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物、又はその医薬的に許容される塩であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
８個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
５個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；５’ウィングセグメントの５個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向
において、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの３個の連結ヌクレオシドは、それぞれ拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである、前記化合物又はその医薬的に許容される塩。
Ｅ２８．配列番号３９の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物、又はその医薬的に許容される塩であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
７個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
５個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；５’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの５個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、及び２’−Ｏ−メトキシエチル糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである、前記化合物又はその医薬的に許容される塩。
Ｅ２９．配列番号３５の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物、又はその医薬的に許容される塩であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
７個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
６個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；５’ウィングセグメントの６個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの３個の連結ヌクレオシドは、それぞれ拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである、前記化合物又はその医薬的に許容される塩。
Ｅ３０．配列番号４３の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物、又はその医薬的に許容される塩であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；それぞれのウィングセグメントのそれぞれのヌクレオシドは、拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである、前記化合物又はその医薬的に許容される塩。
Ｅ３１．配列番号１２４の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレ
オシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物、又はその医薬的に許容される塩であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；それぞれのウィングセグメントのそれぞれのヌクレオシドは、拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである、前記化合物又はその医薬的に許容される塩。
Ｅ３２．配列番号１５０の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物、又はその医薬的に許容される塩であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；それぞれのウィングセグメントのそれぞれのヌクレオシドは、拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである、前記化合物又はその医薬的に許容される塩。
Ｅ３３．配列番号１５５の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物、又はその医薬的に許容される塩であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；それぞれのウィングセグメントのそれぞれのヌクレオシドは、拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである、前記化合物又はその医薬的に許容される塩。
Ｅ３４．配列番号１６９の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物、又はその医薬的に許容される塩であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；それぞれのウィングセグメントのそれぞれのヌクレオシドは、拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである、前記化合物又はその医薬的に許容される塩。
Ｅ３５０．配列番号１７５の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物、又はその医薬的に許容される塩であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
１０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；それぞれのウィングセグメントのそれぞれのヌクレオシドは、拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである、前記化合物又はその医薬的に許容される塩。
Ｅ３６．修飾オリゴヌクレオチドがアンドロゲン受容体をコードする核酸に少なくとも９０％相補的である、Ｅ１〜Ｅ３５のいずれか１つの化合物。
Ｅ３７．アンチセンスオリゴヌクレオチドがアンドロゲン受容体をコードする核酸に１００％相補的である、Ｅ１〜Ｅ３６のいずれか１つの化合物。
Ｅ３８．アンドロゲン受容体をコードする核酸が配列番号１〜配列番号８のいずれか１つのヌクレオチド配列を含む、Ｅ３７の化合物。
Ｅ３９．Ｅ１〜Ｅ３８のいずれか１つの化合物又はその医薬的に許容される塩と、医薬的に許容される希釈剤又は担体を含んでなる組成物。
Ｅ４０．Ｅ１〜Ｅ３８のいずれか１つの化合物と式ＸＶＩ：
Figure 0006599497
［式中、Ｘは、トリフルオロメチル及びヨードからなる群より選択され、式中Ｗは、Ｏ及びＮＲ５からなる群より選択され、ここでＲ５は、Ｈ、メチル、及び
Figure 0006599497
｛式中、Ｄは、Ｓ又はＯであって、Ｅは、Ｎ又はＯであって、Ｇは、アルキル、アリール、置換アルキル、又は置換アリールである；又は、Ｄは、Ｓ又はＯであって、Ｅ−Ｇは、一緒に、Ｃ１−Ｃ４低級アルキルである｝からなる群より選択され、
式中、Ｒ１とＲ２は、一緒に、８個以下の炭素原子を含んで、アルキル、置換アルキル（ハロアルキルが含まれる）、及び（それらが連結する炭素と一緒になる場合の）シクロアルキル又は置換シクロアルキル基からなる群より選択され、
式中、Ｒ３は、水素、ハロゲン、メチル、Ｃ１−Ｃ４アルコキシ、ホルミル、ハロアセトキシ、トリフルオロメチル、シアノ、ニトロ、ヒドロキシル、フェニル、アミノ、メチルカルバモイル、メトキシカルボニル、アセトアミド、メタンスルホンアミノ、メタンスルホニル、４−メタンスルホニル−１−ピペラジニル、ピペラジニル、及びヒドロキシル、メトキシカルボニル、シアノ、アミノ、アミド、ニトロ、カルバモイル、又は置換カルバモイル（メチルカルバモイル、ジメチルカルバモイル、及びヒドロキシエチルカルバモイルが含まれる）で置換されていてもよいＣ１−Ｃ６アルキル若しくはアルケニルからなる群より選択され、
式中、Ｒ４は、水素、ハロゲン、アルキル、及びハロアルキルからなる群より選択され、そしてここでＲ３は、メチルアミノメチルでもジメチルアミノメチルでもなく；
Ｒ５は、
Figure 0006599497
であってよい］のジアリールヒダントインのアンドロゲン受容体（ＡＲ）阻害剤を含んでなる組成物。
Ｅ４１．ジアリールヒダントインのアンドロゲン受容体（ＡＲ）阻害剤がＭＤＶ３１００である、Ｅ４０の組成物。
Ｅ４２．Ｅ１〜Ｅ３８のいずれか１つの化合物と、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤を含んでなる組成物。
Ｅ４３．癌を有する被験者へＥ１〜Ｅ３８のいずれか１つの化合物又はＥ３９〜Ｅ４２のいずれか１つの組成物を投与して、それによって該被験者において癌を治療することを含んでなる、癌を治療する方法。
Ｅ４４．癌を治療することにおける使用のための、Ｅ１〜Ｅ３８のいずれか１つのアンチセンス化合物又はＥ３９〜Ｅ４２のいずれか１つの組成物。
Ｅ４５．癌が、前立腺癌、乳癌、卵巣癌、胃癌、又は膀胱癌である、Ｅ４４の化合物又は組成物。
Ｅ４６．癌が去勢抵抗性前立腺癌である、Ｅ４５の化合物又は組成物。
Ｅ４７．去勢抵抗性前立腺癌が、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤へ抵抗する、Ｅ４６の化合物又は組成物。
Ｅ４８．癌が、前立腺癌、乳癌、卵巣癌、胃癌、又は膀胱癌である、Ｅ４３の方法。
Ｅ４９．癌が去勢抵抗性前立腺癌である、Ｅ４８の方法。
Ｅ５０．去勢抵抗性前立腺癌が、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤へ抵抗する、Ｅ４９の方法。
Ｅ５１．アンチセンス化合物がＡＲスプライシング変異体に標的指向する、Ｅ４４〜Ｅ４７の化合物又はＥ４９又はＥ５０の方法。
Ｅ５２．ＡＲスプライシング変異体が機能的なリガンド結合ドメインを欠損する、Ｅ５１の化合物又は方法。
Ｅ５３．アンチセンス化合物が、全長ＡＲとエクソン４〜エクソン８のいずれか１つを欠損するＡＲスプライシング変異体の発現を低下させることが可能である、Ｅ４４〜Ｅ４７の化合物又はＥ４９〜Ｅ５２のいずれか１つの方法。
Ｅ５４．ＡＲスプライシング変異体がエクソン１〜エクソン３からなる、Ｅ５１の化合物又は方法。
Ｅ５５．アンチセンス化合物がエクソン３の３’端の上流でＡＲへ標的指向されて、エクソン３の３’端の下流にあるＡＲの領域へ標的指向されるアンチセンス化合物より大きな程度で前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害することが可能である、Ｅ４４〜Ｅ４７の化合物又はＥ４９〜Ｅ５２のいずれか１つの方法。
Ｅ５６．エクソン３の３’端の下流にあるＡＲの領域へ標的指向されるアンチセンス化合物が、全長ＡＲのレベルを低下させることは可能であるが、エクソン１〜エクソン３からなるＡＲスプライシング変異体のレベルを低下させることは可能でない、Ｅ５５の化合物又は方法。
Ｅ５７．エクソン３の３’端の下流にある領域がエクソン４を含む、Ｅ５６の化合物又は方法。
Ｅ５８．前立腺癌細胞が全長ＡＲに優ってＡＲスプライシング変異体を選好的に発現する、Ｅ４４〜Ｅ４７の化合物又はＥ４９〜Ｅ５２のいずれか１つの方法。
Ｅ５９．ＡＲスプライシング変異体が機能的なリガンド結合ドメインを欠損する、Ｅ５８の化合物又は方法。
Ｅ６０．ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へエクソン３の３’端の上流で標的指向され
るアンチセンス化合物を被験者へ投与して、それによって前立腺癌を治療することを含んでなる、該被験者において、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤へ抵抗する前立腺癌を治療する方法。
Ｅ６１．被験者が、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤へ抵抗する前立腺を有すると診断されている、Ｅ６０の方法。
Ｅ６２．アンチセンス化合物がＡＲスプライシング変異体に標的指向する、Ｅ６０又はＥ６１の方法。
Ｅ６３．ＡＲスプライシング変異体が機能的なリガンド結合ドメインを欠損する、Ｅ６２の方法。
Ｅ６４．アンチセンス化合物が、全長ＡＲとエクソン４〜エクソン８のいずれか１つを欠損するＡＲスプライシング変異体の発現を低下させることが可能である、Ｅ６０〜Ｅ６３のいずれか１つの方法。
Ｅ６５．ＡＲスプライシング変異体がエクソン１〜エクソン３からなる、Ｅ６４の方法。
Ｅ６６．アンチセンス化合物がエクソン３の３’端の上流でＡＲへ標的指向されて、エクソン３の３’端の下流にあるＡＲの領域へ標的指向されるアンチセンス化合物より大きな程度で、ジアリールヒダントインのアンドロゲン受容体（ＡＲ）阻害剤へ抵抗する前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害することが可能である、Ｅ６０〜Ｅ６５のいずれか１つの方法。
Ｅ６７．エクソン３の３’端の下流にあるＡＲの領域へ標的指向されるアンチセンス化合物が、全長ＡＲのレベルを低下させることは可能であるが、エクソン４〜エクソン８のいずれか１つを欠損するＡＲスプライシング変異体のレベルを低下させることは可能でない、Ｅ６６の方法。
Ｅ６８．ＡＲスプライシング変異体がエクソン１〜エクソン３からなる、Ｅ６７の方法。
Ｅ６９．エクソン３の３’端の下流にある領域がエクソン４を含む、Ｅ６８の方法。
Ｅ７０．前立腺癌が去勢抵抗性である、Ｅ６０〜Ｅ６９のいずれか１つの方法。
Ｅ７１．前立腺癌が全長ＡＲに優ってＡＲスプライシング変異体を選好的に発現する細胞を含む、Ｅ６０〜Ｅ７０のいずれか１つの方法。
Ｅ７２．ＡＲスプライシング変異体がエクソン４〜エクソン８のいずれか１つを欠損する、Ｅ７１の方法。
Ｅ７３．ＡＲスプライシング変異体がエクソン１〜エクソン３からなる、Ｅ７２の方法。
Ｅ７４．ＡＲスプライシング変異体が機能的なリガンド結合ドメインを欠損する、Ｅ７
２の方法。
Ｅ７５．ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向されるアンチセンス化合物、及びＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤と前立腺癌細胞を接触させることを含んでなる、該前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害する方法であって、ここでアンチセンス化合物と抗アンドロゲン剤は、組合せにおいて相乗作用して該前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害する、前記方法。
Ｅ７６．アンチセンス化合物がエクソン３の３’端の上流でＡＲへ標的指向される、Ｅ７５の方法。
Ｅ７７．前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害するのに有効なアンチセンス化合物又は抗アンドロゲン剤のいずれか単独の量よりそれぞれ又はともに少ないアンチセンス化合物の量と抗アンドロゲン剤の量を組み合わせて前記前立腺癌細胞と接触させる、Ｅ７５又はＥ７６の方法。
Ｅ７８．アンチセンス化合物と抗アンドロゲン剤が、前記前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害することにおいて、アンチセンス化合物単独又は抗アンドロゲン剤単独と比較して、相加より大きな効果を提供する、Ｅ７５〜Ｅ７７のいずれか１つの方法。
Ｅ７９．アンチセンス化合物がＡＲスプライシング変異体に標的指向する、Ｅ７５〜Ｅ７８のいずれか１つの方法。
Ｅ８０．ＡＲスプライシング変異体が機能的なリガンド結合ドメインを欠損する、Ｅ７９の方法。
Ｅ８１．アンチセンス化合物が全長ＡＲとエクソン１〜エクソン３からなるＡＲスプライシング変異体の発現を低下させることが可能である、Ｅ７５〜Ｅ８０のいずれか１つの方法。
Ｅ８２．アンドロゲン受容体（ＡＲ）陽性乳癌細胞の成長又は増殖を阻害する方法であって、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）に標的指向するアンチセンス化合物と該乳癌細胞を接触させることを含んでなり、ここで該乳癌細胞の成長又は増殖は阻害される、前記方法。
Ｅ８３．アンドロゲン受容体（ＡＲ）陽性乳癌を有するか又は有するリスク状態にある被験者においてＡＲ発現を阻害する方法であって：
ＡＲ陽性乳癌を有するか又は有するリスク状態にある被験者を同定すること、及び
ヒトＡＲへ標的指向されるアンチセンス化合物を該被験者へ投与することを含んでなり、
ここでアンチセンス化合物は、該被験者においてＡＲ発現を阻害する、前記方法。
Ｅ８４．被験者においてＡＲ陽性乳癌を治療する方法であって、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へ標的指向されるアンチセンス化合物を該被験者へ投与して、それによって該被験者において乳癌を治療することを含んでなる、前記方法。
Ｅ８５．ＡＲ陽性乳癌又は乳癌細胞がその成長をアンドロゲン発現に依存する、Ｅ８２〜Ｅ８４のいずれか１つの方法。
Ｅ８６．乳癌又は乳癌細胞が、エストロゲン受容体（ＥＲ）陰性、プロゲステロン受容体（ＰＲ）陰性、又はＨｅｒ２／ｎｅｕ陰性である、Ｅ８２〜Ｅ８５のいずれか１つの方法。
Ｅ８７．乳癌又は乳癌細胞がＥＲ陽性でＡＲ陽性である、Ｅ８２〜Ｅ８５のいずれか１つの方法。
Ｅ８８．乳癌又は乳癌細胞がＥＲ陰性でＡＲ陽性である、Ｅ８２〜Ｅ８５のいずれか１つの方法。
Ｅ８９．乳癌又は乳癌細胞がアポクリン乳癌又は乳癌細胞である、Ｅ８２〜Ｅ８８のいずれか１つの方法。
Ｅ９０．アンチセンス化合物がＥ１〜Ｅ３８のいずれか１つの化合物、又はその医薬的に許容される塩である、Ｅ６０〜Ｅ８８のいずれか１つの方法。
Ｅ９１．アンチセンス化合物がＥ２４〜Ｅ３５のいずれか１つの化合物、又はその医薬的に許容される塩である、Ｅ６０〜Ｅ８８のいずれか１つの方法。
出願時の請求の範囲の記載：
〔１〕 １０〜３０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドであって、配列番号１２〜配列番号１７９のヌクレオ塩基配列のいずれかの少なくとも８個の隣接ヌクレオ塩基を含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物。
〔２〕 １０〜３０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドであって、配列番号３５、３９、４３、１２４、１５０、１５５、１６９、又は１７５のヌクレオ塩基配列のいずれかの少なくとも８個の隣接ヌクレオ塩基を含んでなるヌクレオ塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物。
〔３〕 配列番号１のヌクレオチド：２９５７〜２９７２、３０７９〜３０９４、３０９９〜３１１４、３１０９〜３１２４、３１１３〜３１２８、３１２０〜３１３５、３１３３〜３１４８、３２２４〜３２３９、３２２６〜３２４１、３３５１〜３３６６、３３５３〜３３６８、３３６１〜３３７６、３３８８〜３４０３、３５１３〜３５２８、３５１７〜３５３２、３５１９〜３５３４、３６４１〜３６５６、３７３５〜３７５０、３７６４〜３７７９、３７６８〜３７８３、３７９８〜３８１３、３７９９〜３８１４、３８５１〜３８６６、３８７０〜３８８５、３８７４〜３８８９、３８７６〜３８９１、３８７８〜３８９３、３８８４〜３８９９、３８８６〜３９０１、３８８８〜３９０３、３９０１〜３９１６、３９５６〜３９７１、３９６２〜３９７７、３９６４〜３９７９、３９６７〜３９８２、４０１９〜４０３４、４０３８〜４０５３、４０４９〜４０６４、４０５６〜４０７１、４０５９〜４０７４、４０６２〜４０７７、４０６６〜４０８１、４０７０〜４０８５、４１０１〜４１１６、４１０３〜４１１８、４１０５〜４１２０、４１０９〜４１２４、４３０５〜４３２０、４４０５〜４４２０、４５３２〜４５４７、４５３４〜４５４９、４５３７〜４５５２、４５３９〜４５５４、４５５５〜４５７０、４５７１〜４５８６、４５７３〜４５８８、４５７８〜４５９３、４５９７〜４６１２、４６３２〜４６４７、４６５５〜４６７０、４６５６〜４６７１、４６６２〜４６７７、４６９９〜４７１４、４７４７〜４７６２、４７５０〜４７６５、４７５２〜４７６７、４７５４〜４７６９、４７５５〜４７７０、４７６９〜４７８４、４７９８〜４８１３、４８０４〜４８１９、４８０７〜４８２２、４８３３〜４８４８、４８３７〜４８５２、４８３９〜４８５４、４８６５〜４８８０、４８６８〜４８８３、４８７２〜４８８７、４８７４〜４８８９、４８７６〜４８９１、４８８７〜４９０２、４８８９〜４９０４、４９１６〜４９３１、４９１８〜４９３３、４９３８〜４９５３、４９４２〜４９５７、４９４４〜４９５９、４９５１〜４９６６、５０５０〜５０６５、５０５２〜５０６７、５０５４〜５０６９、５０５６〜５０７１、５０６０〜５０７５、５０６１〜５０７６、５０６２〜５０７７、５１３３〜５１４８、５１４１〜５１５６、５１５５〜５１７０、５２６５〜５２８０、５２９３〜５３０８、５３０８〜５３２３、５３９２〜５４０７、５４４８〜５４６３、５４６９〜５４８４、５４８１〜５４９６、５４８３〜５４９８、５４８６〜５５０１、５４８８〜５５０３、５４９４〜５５０９、５５２１〜５５３６、５６６６〜５６８１、６２２２〜６２３７、６７０１〜６７１６、７５４３〜７５５８、８４７１〜８４８６、８６３８〜８６５３、９４６４〜９４７９、１０２１７〜１０２３２、１０２５０〜１０２６５、１０８６５〜１０８８０、１１１９７〜１１２１２、１１８５５〜１１８７０、１３１８９〜１３２０４、１３３２１〜１３３３６、１３３４６〜１３３６１、１６５５５〜１６５７０、１６７９３〜１６８０８、１６９６８〜１６９８３、１７２０６〜１７２２１、１８８６５〜１８８８０、２９３２９〜２９３４４、３２２９０〜３２３０５、３３３１５〜３３３３０、３９０５５〜３９０７０、４０６１５〜４０６３０、４２０１７〜４２０３２、５６０５０〜５６０６５、５８７１９〜５８７３４、５８７２０〜５８７３９、５８７２１〜５８７３６、５８７２２〜５８７３７、５８７２３〜５８７３８、５８７２４〜５８７３９、５８７２５〜５８７４０、５８７５０〜５８７６９、５８７５１〜５８７６６、５８７５２〜５８７６７、５８７５３〜５８７６８、５８７５４〜５８７６９、５８７５５〜５８７７０、６０９０２〜６０９１７、６７４５４〜６７４６９、１１４８７４〜１１４８８９、１１５２７２〜１１５２８７、１１５３６５〜１１５３８０、１３４９７１〜１３４９８６、１０２１５６〜１０２１７１、１３９６８２〜１３９６９７、１３９７６２〜１３９７７７、１３９７８２〜１３９７９７、１４４８５６〜１４４８７１、１４４９３８〜１４４９５３、１４８４０６〜１４８４２１、１４８４４３〜１４８４５８、１４８５２０〜１４８５３５、１８１６９５〜１８１７１０、１８２９５８〜１８２９７３、又は１８３０４９〜１８３０６４内で相補的な１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物であって、ここで前記修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号１に少なくとも９０％相補的である、前記化合物。
〔４〕 配列番号１のイントロン１のヌクレオチド：５６６６〜５６８１、６２２２〜６２３７、６７０１〜６７１６、７５４３〜７５５８、８４７１〜８４８６、８６３８〜８６５３、９４６４〜９４７９、１０２１７〜１０２３２、１０２５０〜１０２６５、１０８６５〜１０８８０、１１１９７〜１１２１２、１１８５５〜１１８７０、１３１８９〜１３２０４、１３３２１〜１３３３６、１３３４６〜１３３６１、１６５５５〜１６５７０、１６７９３〜１６８０８、１６９６８〜１６９８３、１７２０６〜１７２２１、１８８６５〜１８８８０、２９３２９〜２９３４４、３２２９０〜３２３０５、３３３１５〜３３３３０、３９０５５〜３９０７０、４０６１５〜４０６３０、４２０１７〜４２０３２、５６０５０〜５６０６５、５８７１９〜５８７３４、５８７２０〜５８７３９、５８７２１〜５８７３６、５８７２２〜５８７３７、５８７２３〜５８７３８、５８７２４〜５８７３９、５８７２５〜５８７４０、５８７５０〜５８７６９、５８７５１〜５８７６６、５８７５２〜５８７６７、５８７５３〜５８７６８、５８７５４〜５８７６９、５８７５５〜５８７７０、６０９０２〜６０９１７、６７４５４〜６７４６９、１１４８７４〜１１４８８９、１１５２７２〜１１５２８７、１１５３６５〜１１５３８０、又は１３４９７１〜１３４９８６内で相補的な１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物。
〔５〕 配列番号１のイントロン１のヌクレオチド：８６３８〜８６５３、１１１９７〜１１２１２、４０６１５〜４０６３０、５８７１９〜５８７３４、５８７２０〜５８７３５、又は５８７２１〜５８７３６内で相補的な１０〜３０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む、請求項４の化合物。
〔６〕 修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも１つの修飾糖を含む、請求項１〜５のいずれか１項の化合物。
〔７〕 少なくとも１つの修飾糖が２’−Ｏ−メトキシエチル基を含む、請求項６の化合物。
〔８〕 少なくとも１つの修飾糖が二環式糖である、請求項６の化合物。
〔９〕 二環式糖が、４’−ＣＨ（ＣＨ３）−Ｏ−２’、４’−ＣＨ２−Ｏ−２’、及び４’−（ＣＨ２）２−Ｏ−２’より選択される基を含む、請求項８の化合物。
〔１０〕 修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも１つの修飾ヌクレオシド間連結を含む、請求項１〜９のいずれか１項の化合物。
〔１１〕 アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結がホスホロチオエートヌクレオシド間連結である、請求項１０の化合物。
〔１２〕 修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも１つの修飾ヌクレオ塩基を含む、請求項１〜１１のいずれか１項の化合物。
〔１３〕 修飾ヌクレオ塩基が５−メチルシトシンである、請求項１２の化合物。
〔１４〕 修飾オリゴヌクレオチドが：
連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて、ここでそれぞれのウィングセグメントのそれぞれのヌクレオシドは修飾糖を含む、請求項１〜１３のいずれか１項の化合物。
〔１５〕 配列番号３５の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物、又はその医薬的に許容される塩であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
９個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；５’ウィングセグメントの３個の連結ヌクレオシドは、それぞれ拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び２’−Ｏ−メトキシエチル糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである、前記化合物又はその医薬的に許容される塩。
〔１６〕 配列番号３９の配列からなるヌクレオ塩基配列を有する１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物、又はその医薬的に許容される塩であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
７個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
５個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、
ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；５’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び拘束エチル（ｃＥｔ）糖であり；３’ウィングセグメントの５個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、及び２’−Ｏ−メトキシエチル糖であり；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである、前記化合物又はその医薬的に許容される塩。
〔１７〕 修飾オリゴヌクレオチドがアンドロゲン受容体をコードする核酸に少なくとも９０％相補的である、請求項１〜１６のいずれか１項の化合物。
〔１８〕 アンドロゲン受容体をコードする核酸が配列番号１〜配列番号８のいずれか１つのヌクレオチド配列を含む、請求項１７の化合物。
〔１９〕 請求項１〜１８のいずれか１項の化合物又はその医薬的に許容される塩と、医薬的に許容される希釈剤又は担体を含んでなる組成物。
〔２０〕 請求項１〜１８のいずれか１項の化合物と、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤を含んでなる組成物。
〔２１〕 抗アンドロゲン剤がＭＤＶ３１００である、請求項２０の組成物。
〔２２〕 癌を有する被験者へ請求項１〜１８のいずれか１項の化合物又は請求項１９〜２１のいずれか１項の組成物を投与して、それによって該被験者において癌を治療することを含んでなる、癌を治療する方法。
〔２３〕 癌が、前立腺癌、乳癌、卵巣癌、胃癌、又は膀胱癌である、請求項２２の方法。
〔２４〕 癌が去勢抵抗性前立腺癌である、請求項２２の方法。
〔２５〕 去勢抵抗性前立腺癌が、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤へ抵抗する、請求項２４の方法。
〔２６〕 癌を治療することにおける使用のための、請求項１〜１８のいずれか１項のアンチセンス化合物又は請求項１９〜２１のいずれか１項の組成物。
〔２７〕 癌が、前立腺癌、乳癌、卵巣癌、胃癌、又は膀胱癌である、請求項２６の化合物又は組成物。
〔２８〕 癌が去勢抵抗性前立腺癌である、請求項２７の化合物又は組成物。
〔２９〕 去勢抵抗性前立腺癌が、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤へ抵抗する、請求項２８の化合物又は組成物。
〔３０〕 ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤へ抵抗する前立腺癌細胞をヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へエクソン３の３’端の上流で標的指向されるアンチセンス化合物と接触させることを含んでなる、該前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害する方法。
〔３１〕 抗アンドロゲン剤がＭＤＶ３１００である、請求項３０の方法。
〔３２〕 ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）へエクソン３の３’端の上流で標的指向されるアンチセンス化合物を被験者へ投与することを含んでなる、該被験者において、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤へ抵抗する前立腺癌を治療する方法。
〔３３〕 被験者が、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤へ抵抗する前立腺癌を有すると診断されている、請求項３２の方法。
〔３４〕 前立腺癌を治療することの必要な患者へ請求項１〜１８のいずれか１項のアンチセンス化合物又は請求項１９〜２１のいずれか１項の組成物と抗アンドロゲン剤を投与することを含んでなる、該患者において前立腺癌を治療する方法。
〔３５〕 抗アンドロゲン剤が、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される、請求項３４に記載の方法。
〔３６〕 アンチセンス化合物と抗アンドロゲン剤が組合せにおいて相乗作用して前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害する、請求項３４又は３５の方法。
〔３７〕 前立腺癌細胞の成長又は増殖を阻害するのに有効なアンチセンス化合物又は抗アンドロゲン剤のいずれか単独の量よりそれぞれ又はともに少ないアンチセンス化合物の量と抗アンドロゲン剤の量を組み合わせて前記前立腺癌細胞と接触させる、請求項３４〜３６のいずれか１項の方法。
〔３８〕 ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）に標的指向するアンチセンス化合物とアンドロゲン受容体（ＡＲ）陽性乳癌細胞を接触させることを含んでなり、ここで該乳癌細胞の成長又は増殖は阻害される、該乳癌細胞の成長又は増殖を阻害する方法。
〔３９〕 アンチセンス化合物が請求項１〜１８のいずれか１項の化合物又はその医薬的に許容される塩である、請求項３０〜３８のいずれか１項の方法。
〔４０〕 アンチセンス化合物が請求項１５又は１６のいずれか１項の化合物又はその医薬的に許容される塩である、請求項３０〜３８のいずれか１項の方法。
非限定的な開示と参照による組込み
本明細書に記載される特定の化合物、組成物、及び方法について、特定の態様に従って特に記載したが、以下の実施例は、本明細書に記載される化合物を例示するためにのみ役立つのであって、それを限定することを企図しない。本出願において引用される参考文献のそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
実施例１：ＨｕＶＥＣ細胞におけるヒトＡＲのアンチセンス阻害
ＡＲ核酸に標的指向するアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計して、ＡＲ ｍＲＮＡに対するそれらの効果を試験管内で試験した。このアンチセンスオリゴヌクレオチドは、類似の培養条件を有する一連の実験において試験した。各実験の結果は、下記に示す別々の表に提示する。２０，０００個の細胞／ウェルの密度で培養したＨｕＶＥＣ細胞を、エレクトロポレーションを使用して、５００ｎＭアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。ほぼ２４時間の処理時間の後で、この細胞よりＲＮＡを単離して、定量的リアルタイムＰＣＲによって、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを測定した。ヒトのプライマープローブセットＲＴＳ３５５９（フォワード配列：ＴＣＣＴＴＣＡＣＣＡＡＴＧＴＣＡＡＣＴＣＣ、本明細書では配列番号９と呼称される；リバース配列：ＧＡＧＣＣＡＴＣＣＡＡＡＣＴＣＴＴＧＡＧＡ、本明細書では配列番号１０と呼称される；プローブ配列：ＡＧＴＡＣＣＧＣＡＴＧＣＡＣＡＡＧＴＣＣＣＧ、本明細書では配列番号１１と呼称される）を使用して、ｍＲＮＡレベルを測定した。ＲＩＢＯＧＲＥＥＮ（登録商標）によって測定される全ＲＮＡ含量に従って、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを補正した。結果を、未処理対照細胞に対するＡＲの阻害パーセントとして提示する。全部で１５５種のオリゴヌクレオチドについて試験した。さらなる試験のために選択したオリゴヌクレオチドだけを表１と表２に示す。
表１と表２中の新たに設計したキメラアンチセンスオリゴヌクレオチドは、３−１０−３（Ｓ）−ｃＥＴギャップマーとして設計された。このギャップマーは、１６個のヌクレオシドの長さで、ここで中央のギャップセグメントは、１０個の２’−デオキシヌクレオシドを含み、その両側に３個のヌクレオシドを含んでなるウィングセグメントが５’方向と３’方向の両方にある。５’ウィングセグメント中のそれぞれのヌクレオシドと３’ウィングセグメント中のそれぞれのヌクレオシドは、（Ｓ）−ｃＥｔ修飾を有する。それぞ
れのギャップマー全体のヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結である。それぞれのギャップマー全体のシトシン残基は、いずれも５−メチルシトシンである。「開始部位」は、ギャップマーがヒト遺伝子配列において標的指向される５’端ヌクレオシドを示す。「停止部位」は、ギャップマーがヒト遺伝子配列において標的指向される３’端ヌクレオシドを示す。表１と表２に収載されるそれぞれのギャップマーは、本明細書では配列番号１と呼称されるヒトＡＲゲノム配列（ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＮＴ＿０１１６６９．１７、ヌクレオチド５０７９０００〜５２７００００より先端切断されたもの）又は本明細書では配列番号２と呼称されるヒトＡＲ ｍＲＮＡ配列（ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＮＭ＿００００４４．３）のいずれか一方又はその両方へ標的指向される。「ｎ／ａ」は、そのオリゴヌクレオチドがその特別な遺伝子配列に標的指向しないことを示す。
表１
Figure 0006599497
表２
Figure 0006599497
実施例２：ＨｕＶＥＣ細胞におけるヒトＡＲの用量依存的なアンチセンス阻害
ＡＲ ｍＲＮＡの有意な試験管内阻害を示す、上記に記載した試験からのギャップマーを選択して、ＨｕＶＥＣ細胞において様々な用量で試験した。細胞を２０，０００個の細胞／ウェルの密度で蒔いて、エレクトロポレーションを使用して、表３と表４に特記されるように、１８．５ｎＭ、５５．６ｎＭ、１６６．７ｎＭ、５００．０ｎＭ、及び１５００．０ｎＭ濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。ほぼ１６時間の処理時間の後で、この細胞からＲＮＡを単離して、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを定量的リアルタイムＰＣＲによって測定した。ヒトＡＲプライマープローブセット、ＲＴＳ３５５９を使用して、ｍＲＮＡレベルを測定した。ＲＩＢＯＧＲＥＥＮ（登録商標）によって測定される全ＲＮＡ含量に従って、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを補正した。結果を、未処理対照細胞に対するＡＲの阻害パーセントとして提示する。このアンチセンスオリゴヌクレオチドについて、類似の培養条件を有する一連の実験において試験した。各実験の結果は、下記に示す別々の表に提示する。
表３と表４には、それぞれのオリゴヌクレオチドの半最大阻害濃度（ＩＣ５０）も提示する。明示されるように、ＡＲ ｍＲＮＡレベルは、アンチセンスオリゴヌクレオチド処理細胞において、用量依存的なやり方で低下した。
表３
Figure 0006599497
表４
Figure 0006599497
実施例３：ＨｕＶＥＣ細胞におけるヒトＡＲのアンチセンス阻害
ＡＲ核酸に標的指向する追加のアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計して、ＡＲ ｍＲＮＡに対するそれらの効果を試験管内で試験した。２０，０００個の細胞／ウェルの密度で培養したＨｕＶＥＣ細胞を、エレクトロポレーションを使用して、５００ｎＭアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。ほぼ２４時間の処理時間の後で、この細胞からＲＮＡを単離して、定量的リアルタイムＰＣＲによってＡＲ ｍＲＮＡレベルを測定した。ヒトのプライマープローブセット、ＲＴＳ３５５９を使用して、ｍＲＮＡレベルを測定した。ＲＩＢＯＧＲＥＥＮ（登録商標）によって測定される全ＲＮＡ含量に従って、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを補正した。結果を、未処理対照細胞に対するＡＲの阻害パーセントとして提示する。全部で８２種のオリゴヌクレオチドについて試験した。さらなる試験のために選択したオリゴヌクレオチドだけを表５に示す。
表５中の新たに設計したキメラアンチセンスオリゴヌクレオチドは、３−１０−３（Ｓ）−ｃＥＴギャップマー又は５−１０−５ＭＯＥギャップマーとして設計された。３−１０−３（Ｓ）−ｃＥＴギャップマーは、１６個のヌクレオシドの長さで、ここで中央のギャップセグメントは、１０個の２’−デオキシヌクレオシドを含み、その両側に３個のヌクレオシドを含んでなるウィングセグメントが５’方向と３’方向の両方にある。５’ウィングセグメント中のそれぞれのヌクレオシドと３’ウィングセグメント中のそれぞれのヌクレオシドは、（Ｓ）−ｃＥｔ修飾を有する。５−１０−５ＭＯＥギャップマーは、２０個のヌクレオシドの長さで、ここで中央のギャップセグメントは、１０個の２’−デオキシヌクレオシドを含み、その両側に５個のヌクレオシドをそれぞれ含んでなるウィングセグメントが５’方向と３’方向にある。５’ウィングセグメント中のそれぞれのヌクレオシドと３’ウィングセグメント中のそれぞれのヌクレオシドは、２’−ＭＯＥ修飾を有する。それぞれのギャップマー全体のヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結である。それぞれのギャップマー全体のシトシン残基は、いずれも５−メチルシトシンであ
る。「開始部位」は、ギャップマーがヒト遺伝子配列において標的指向される５’端ヌクレオシドを示す。「停止部位」は、ギャップマーがヒト遺伝子配列において標的指向される３’端ヌクレオシドを示す。表５に収載されるそれぞれのギャップマーは、本明細書では配列番号１と呼称されるヒトＡＲゲノム配列（ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＮＴ＿０１１６６９．１７、ヌクレオチド５０７９０００〜５２７００００より先端切断されたもの）へ標的指向される。
表５
Figure 0006599497
実施例４：ＨｕＶＥＣ細胞におけるヒトＡＲの用量依存的なアンチセンス阻害
ＡＲ ｍＲＮＡの有意な試験管内阻害を示す、上記に記載した試験からのギャップマーを選択して、ＨｕＶＥＣ細胞において様々な用量で試験した。細胞を２０，０００個の細胞／ウェルの密度で蒔いて、エレクトロポレーションを使用して、表６に特記されるように、３１．３ｎＭ、６２．５ｎＭ、１２５．０ｎＭ、２５０．０ｎＭ、５００．０ｎＭ、及び１０００．０ｎＭ濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。ほぼ１６時間の処理時間の後で、この細胞からＲＮＡを単離して、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを定量的リアルタイムＰＣＲによって測定した。ヒトＡＲプライマープローブセット、ＲＴＳ３５５９を使用して、ｍＲＮＡレベルを測定した。ＲＩＢＯＧＲＥＥＮ（登録商標）によって測定される全ＲＮＡ含量に従って、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを補正した。結果を、
未処理対照細胞に対するＡＲの阻害パーセントとして提示する。このアンチセンスオリゴヌクレオチドは、類似の培養条件を有する一連の実験において試験した。各実験の結果は、下記に示す別々の表に提示する。
表６には、それぞれのオリゴヌクレオチドの半最大阻害濃度（ＩＣ５０）も提示する。明示されるように、ＡＲ ｍＲＮＡレベルは、アンチセンスオリゴヌクレオチド処理細胞において、用量依存的なやり方で低下した。
表６
Figure 0006599497
実施例５：ＨｕＶＥＣ細胞におけるヒトＡＲのアンチセンス阻害
ＡＲ核酸に標的指向する追加のアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計して、ＡＲ ｍＲＮＡに対するそれらの効果を試験管内で試験した。２０，０００個の細胞／ウェルの密度で培養したＨｕＶＥＣ細胞を、エレクトロポレーションを使用して、２５０ｎＭアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。ほぼ２４時間の処理時間の後で、この細胞からＲＮＡを単離して、定量的リアルタイムＰＣＲによってＡＲ ｍＲＮＡレベルを測定した。ヒトのプライマープローブセット、ＲＴＳ３５５９を使用して、ｍＲＮＡレベルを測定した。ＲＩＢＯＧＲＥＥＮ（登録商標）によって測定される全ＲＮＡ含量に従って、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを補正した。結果を、未処理対照細胞に対するＡＲの阻害パーセントとして提示する。全部で４０種のオリゴヌクレオチドについて試験した。さらなる試験のために選択したオリゴヌクレオチドだけを表７に示す。
表７中の新たに設計したキメラアンチセンスオリゴヌクレオチドは、３−１０−３（Ｓ）−ｃＥＴギャップマー又はデオキシ、ＭＯＥ及び（Ｓ）−ｃＥＴオリゴヌクレオチドとして設計された。３−１０−３（Ｓ）−ｃＥＴギャップマーは、１６個のヌクレオシドの長さで、ここで中央のギャップセグメントは、１０個の２’−デオキシヌクレオシドを含み、その両側に３個のヌクレオシドを含んでなるウィングセグメントが５’方向と３’方向の両方にある。５’ウィングセグメント中のそれぞれのヌクレオシドと３’ウィングセグメント中のそれぞれのヌクレオシドは、（Ｓ）−ｃＥｔ修飾を有する。デオキシ、ＭＯＥ及び（Ｓ）−ｃＥＴオリゴヌクレオチドは、１６個のヌクレオシドの長さで、ここでヌクレオシドは、ＭＯＥ糖修飾、（Ｓ）−ｃＥｔ糖修飾、又はデオキシ修飾のいずれか１つ
を有する。「化学」カラムは、それぞれのオリゴヌクレオチドの糖修飾について記載する。「ｋ」は、（Ｓ）−ｃＥｔ糖修飾を示し；数字は、デオキシヌクレオシドの数を示し；そして「ｅ」は、ＭＯＥ修飾を示す。それぞれのギャップマー全体のヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結である。それぞれのギャップマー全体のシトシン残基は、いずれも５−メチルシトシンである。表中に収載する「配列番号」は、オリゴヌクレオチド配列に言及する。「開始部位」は、ギャップマーがヒト遺伝子配列において標的指向される５’端ヌクレオシドを示す。「停止部位」は、ギャップマーがヒト遺伝子配列において標的指向される３’端ヌクレオシドを示す。表７に収載されるそれぞれのギャップマーは、本明細書では配列番号１と呼称されるヒトＡＲゲノム配列（ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＮＴ＿０１１６６９．１７、ヌクレオチド５０７９０００〜５２７００００より先端切断されたもの）へ標的指向される。
表７
Figure 0006599497
実施例６：ＨｕＶＥＣ細胞におけるヒトＡＲの用量依存的なアンチセンス阻害
ＡＲ ｍＲＮＡの有意な試験管内阻害を示す、上記に記載した試験からのギャップマーを選択して、ＨｕＶＥＣ細胞において様々な用量で試験した。細胞を２０，０００個の細胞／ウェルの密度で蒔いて、エレクトロポレーションを使用して、表８に特記されるように、３１．３ｎＭ、６２．５ｎＭ、１２５．０ｎＭ、２５０．０ｎＭ、５００．０ｎＭ、及び１０００．０ｎＭ濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。ほぼ１６時間の処理時間の後で、この細胞からＲＮＡを単離して、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを定量的リアルタイムＰＣＲによって測定した。ヒトＡＲプライマープローブセット、ＲＴＳ３５５９を使用して、ｍＲＮＡレベルを測定した。ＲＩＢＯＧＲＥＥＮ（登録商標）によって測定される全ＲＮＡ含量に従って、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを補正した。結果を、未処理対照細胞に対するＡＲの阻害パーセントとして提示する。このアンチセンスオリゴヌクレオチドは、類似の培養条件を有する一連の実験において試験した。各実験の結果は、下記に示す別々の表に提示する。
表８には、それぞれのオリゴヌクレオチドの半最大阻害濃度（ＩＣ５０）も提示する。明示されるように、ＡＲ ｍＲＮＡレベルは、アンチセンスオリゴヌクレオチド処理細胞において、用量依存的なやり方で低下した。
表８
Figure 0006599497
実施例７：ＨｕＶＥＣ細胞におけるヒトＡＲの用量依存的なアンチセンス阻害
ＡＲ遺伝子配列に標的指向する追加のアンチセンスオリゴヌクレオチドをデオキシ、ＭＯＥ及び（Ｓ）−ｃＥｔオリゴヌクレオチドとして設計して、ＨｕＶＥＣ細胞において様々な用量で試験した。このオリゴヌクレオチドは、１６個のヌクレオシドの長さで、ここでヌクレオシドは、ＭＯＥ糖修飾、（Ｓ）−ｃＥｔ糖修飾、又はデオキシ修飾のいずれか１つを有する。「化学」カラムは、それぞれのオリゴヌクレオチドの糖修飾について記載する。「ｋ」は、（Ｓ）−ｃＥｔ糖修飾を示し；数字は、デオキシヌクレオシドの数を示
し；他に「ｄ」は、デオキシリボースを示し；そして「ｅ」は、ＭＯＥ修飾を示す。それぞれのギャップマー全体のヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結である。それぞれのギャップマー全体のシトシン残基は、いずれも５−メチルシトシンである。表中に収載する「配列番号」は、オリゴヌクレオチド配列に言及する。「開始部位」は、ギャップマーがヒト遺伝子配列において標的指向される５’端ヌクレオシドを示す。「停止部位」は、ギャップマーがヒト遺伝子配列において標的指向される３’端ヌクレオシドを示す。表９に収載されるそれぞれのギャップマーは、本明細書では配列番号１と呼称されるヒトＡＲゲノム配列（ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＮＴ＿０１１６６９．１７、ヌクレオチド５０７９０００〜５２７００００より先端切断されたもの）へ標的指向される。
表９
Figure 0006599497
細胞を２０，０００個の細胞／ウェルの密度で蒔いて、エレクトロポレーションを使用して、表１０〜表１２に特記されるように、６２．５ｎＭ、１２５．０ｎＭ、２５０．０ｎＭ、５００．０ｎＭ、及び１０００．０ｎＭ濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。ほぼ１６時間の処理時間の後で、この細胞からＲＮＡを単離して、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを定量的リアルタイムＰＣＲによって測定した。ヒトＡＲプライ
マープローブセット、ＲＴＳ３５５９を使用して、ｍＲＮＡレベルを測定した。ＲＩＢＯＧＲＥＥＮ（登録商標）によって測定される全ＲＮＡ含量に従って、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを補正した。結果を、未処理対照細胞に対するＡＲの阻害パーセントとして提示する。このアンチセンスオリゴヌクレオチドは、類似の培養条件を有する一連の実験において試験した。各実験の結果は、下記に示す別々の表に提示する。
表１０〜表１２には、それぞれのオリゴヌクレオチドの半最大阻害濃度（ＩＣ５０）も提示する。明示されるように、ＡＲ ｍＲＮＡレベルは、アンチセンスオリゴヌクレオチド処理細胞のいくつかで、用量依存的なやり方で低下した。
表１０
Figure 0006599497
表１１
Figure 0006599497
表１２
Figure 0006599497
実施例８：ＨｕＶＥＣ細胞におけるヒトＡＲのアンチセンス阻害
ＡＲ核酸に標的指向する追加のアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計して、ＡＲ ｍＲＮＡに対するそれらの効果を試験管内で試験した。２０，０００個の細胞／ウェルの密度で培養したＨｕＶＥＣ細胞を、エレクトロポレーションを使用して、１，０００ｎＭアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。ほぼ２４時間の処理時間の後で、この細胞からＲＮＡを単離して、定量的リアルタイムＰＣＲによってＡＲ ｍＲＮＡレベルを測定した。ヒトのプライマープローブセット、ＲＴＳ３５５９を使用して、ｍＲＮＡレベルを測定した。ＲＩＢＯＧＲＥＥＮ（登録商標）によって測定される全ＲＮＡ含量に従って、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを補正した。結果を、未処理対照細胞に対するＡＲの阻害パーセントとして提示する。全部で７５種のオリゴヌクレオチドについて試験した。さらなる試験のために選択したオリゴヌクレオチドだけを表１３に示す。
表１３中の新たに設計したキメラアンチセンスオリゴヌクレオチドは、３−１０−３（Ｓ）−ｃＥＴギャップマー、３−９−４（Ｓ）−ｃＥｔギャップマー、４−８−４（Ｓ）−ｃＥｔギャップマー、４−９−３（Ｓ）−ｃＥｔギャップマー、５−７−４（Ｓ）−ｃＥｔギャップマー、５−８−３（Ｓ）−ｃＥｔギャップマー、６−７−３（Ｓ）−ｃＥｔギャップマー、又はデオキシ、ＭＯＥ及び（Ｓ）−ｃＥｔオリゴヌクレオチドとして設計された。３−１０−３（Ｓ）−ｃＥｔギャップマーは、１６個のヌクレオシドの長さで、ここで中央のギャップセグメントは、１０個の２’−デオキシヌクレオシドを含み、その両側に３個のヌクレオシドを含んでなるウィングセグメントが５’方向と３’方向の両方にある。３−９−４（Ｓ）−ｃＥｔギャップマーは、１６個のヌクレオシドの長さで、ここで中央のギャップセグメントは、９個の２’−デオキシヌクレオシドを含み、その両側に、３個のヌクレオチドを含んでなる５’方向のウィングセグメントと、４個のヌクレオシドを含んでなる３’方向のウィングセグメントがある。４−８−４（Ｓ）−ｃＥｔギャップマーは、１６個のヌクレオシドの長さで、ここで中央のギャップセグメントは、８個の２’−デオキシヌクレオシドを含み、その両側に４個のヌクレオシドを含んでなるウィングセグメントが５’方向と３’方向の両方にある。４−９−３（Ｓ）−ｃＥｔギャップマーは、１６個のヌクレオシドの長さで、ここで中央のギャップセグメントは、９個の２’−デオキシヌクレオシドを含み、その両側に、４個のヌクレオチドを含んでなる５’方向のウィングセグメントと、３個のヌクレオシドを含んでなる３’方向のウィングセグメントがある。５−７−４（Ｓ）−ｃＥｔギャップマーは、１６個のヌクレオシドの長さで、ここで中央のギャップセグメントは、７個の２’−デオキシヌクレオシドを含み、その両側に、５個のヌクレオチドを含んでなる５’方向のウィングセグメントと、４個のヌクレオチドを含んでなる３’方向のウィングセグメントがある。５−８−３（Ｓ）−ｃＥｔギャップマーは、１６個のヌクレオシドの長さで、ここで中央のギャップセグメントは、８個の２’−デオキシヌクレオシドを含み、その両側に、５個のヌクレオチドを含んでなる５’方向のウィングセグメントと、３個のヌクレオシドを含んでなる３’方向のウィングセグメントがある。６−７−３（Ｓ）−ｃＥｔギャップマーは、１６個のヌクレオシド
の長さで、ここで中央のギャップセグメントは、７個の２’−デオキシヌクレオシドを含み、その両側に、６個のヌクレオチドを含んでなる５’方向のウィングセグメントと、３個のヌクレオシドを含んでなる３’方向のウィングセグメントがある。５’ウィングセグメント中のそれぞれのヌクレオシドと３’ウィングセグメント中のそれぞれのヌクレオシドは、（Ｓ）−ｃＥｔ修飾を有する。デオキシ、ＭＯＥ及び（Ｓ）−ｃＥｔオリゴヌクレオチドは、１６個のヌクレオシドの長さで、ここでヌクレオシドは、ＭＯＥ糖修飾、（Ｓ）−ｃＥｔ糖修飾、又はデオキシ修飾のいずれか１つを有する。「化学」カラムは、それぞれのオリゴヌクレオチドの糖修飾について記載する。「ｋ」は、（Ｓ）−ｃＥｔ糖修飾を示し；数字は、デオキシヌクレオシドの数を示し；他に「ｄ」は、デオキシリボースを示し；そして「ｅ」は、ＭＯＥ修飾を示す。それぞれのギャップマー全体のヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結である。それぞれのギャップマー全体のシトシン残基は、いずれも５−メチルシトシンである。
表中に収載する「配列番号」は、オリゴヌクレオチド配列に言及する。「開始部位」は、ギャップマーがヒト遺伝子配列において標的指向される５’端ヌクレオシドを示す。「停止部位」は、ギャップマーがヒト遺伝子配列において標的指向される３’端ヌクレオシドを示す。表１３に収載されるそれぞれのギャップマーは、本明細書では配列番号１と呼称されるヒトＡＲゲノム配列（ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＮＴ＿０１１６６９．１７、ヌクレオチド５０７９０００〜５２７００００より先端切断されたもの）へ標的指向される。
表１３
Figure 0006599497
Figure 0006599497
実施例９：ＨｕＶＥＣ細胞におけるヒトＡＲの用量依存的なアンチセンス阻害
ＡＲ ｍＲＮＡの有意な試験管内阻害を示す、上記に記載した試験からのアンチセンスオリゴヌクレオチドを選択して、ＨｕＶＥＣ細胞において様々な用量で試験した。細胞を２０，０００個の細胞／ウェルの密度で蒔いて、エレクトロポレーションを使用して、表１４に特記されるように、３１．２５ｎＭ、６２．５ｎＭ、１２５．０ｎＭ、２５０．０ｎＭ、５００．０ｎＭ、及び１０００．０ｎＭ濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。ほぼ１６時間の処理時間の後で、この細胞からＲＮＡを単離して、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを定量的リアルタイムＰＣＲによって測定した。ヒトＡＲプライマープローブセット、ＲＴＳ３５５９を使用して、ｍＲＮＡレベルを測定した。ＲＩＢＯＧＲＥＥＮ（登録商標）によって測定される全ＲＮＡ含量に従って、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを補正した。結果を、未処理対照細胞に対するＡＲの阻害パーセントとして提示する。このアンチセンスオリゴヌクレオチドは、類似の培養条件を有する一連の実験において試験した。各実験の結果は、下記に示す別々の表に提示する。
表１４には、それぞれのオリゴヌクレオチドの半最大阻害濃度（ＩＣ５０）も提示する。明示されるように、ＡＲ ｍＲＮＡレベルは、アンチセンスオリゴヌクレオチド処理細胞において、用量依存的なやり方で低下した。
表１４
Figure 0006599497
実施例１０：ＨｕＶＥＣ細胞におけるヒトＡＲの用量依存的なアンチセンス阻害
ＡＲ ｍＲＮＡの有意な試験管内阻害を示す、実施例８からのギャップマーを選択して、ＨｕＶＥＣ細胞において様々な用量で試験した。細胞を２０，０００個の細胞／ウェルの密度で蒔いて、エレクトロポレーションを使用して、表１５に特記されるように、４６．９ｎＭ、１８７．５ｎＭ、７５０．０ｎＭ、及び３０００．０ｎＭ濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。ほぼ１６時間の処理時間の後で、この細胞からＲＮＡを単離して、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを定量的リアルタイムＰＣＲによって測定した。ヒトＡＲプライマープローブセット、ＲＴＳ３５５９を使用して、ｍＲＮＡレベルを測定した。ＲＩＢＯＧＲＥＥＮ（登録商標）によって測定される全ＲＮＡ含量に従って、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを補正した。結果を、未処理対照細胞に対するＡＲの阻害パーセントとして提示する。
表１５には、それぞれのオリゴヌクレオチドの半最大阻害濃度（ＩＣ５０）も提示する。明示されるように、ＡＲ ｍＲＮＡレベルは、アンチセンスオリゴヌクレオチド処理細胞において、用量依存的なやり方で低下した。
表１５
Figure 0006599497
実施例１１：ＨｕＶＥＣ細胞におけるヒトＡＲのアンチセンス阻害
ＡＲ核酸に標的指向する追加のアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計して、ＡＲ ｍＲＮＡに対するそれらの効果を試験管内で試験した。２０，０００個の細胞／ウェルの密度で培養したＨｕＶＥＣ細胞を、エレクトロポレーションを使用して、５００ｎＭアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。ほぼ２４時間の処理時間の後で、この細胞からＲＮＡを単離して、定量的リアルタイムＰＣＲによってＡＲ ｍＲＮＡレベルを測定した。ヒトのプライマープローブセット、ＲＴＳ３５５９を使用して、ｍＲＮＡレベルを測定した。ＲＩＢＯＧＲＥＥＮ（登録商標）によって測定される全ＲＮＡ含量に従って、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを補正した。結果を、未処理対照細胞に対するＡＲの阻害パーセントとして提示する。全部で６１６種のオリゴヌクレオチドについて試験した。さらなる試験のために選択したオリゴヌクレオチドだけを表１６〜表２３に示す。
表１６〜表２３中の新たに設計したキメラアンチセンスオリゴヌクレオチドは、３−１０−３（Ｓ）−ｃＥＴギャップマーとして設計された。このギャップマーは、１６個のヌクレオシドの長さで、ここで中央のギャップセグメントは、１０個の２’−デオキシヌクレオシドを含み、その両側に３個のヌクレオシドを含んでなるウィングセグメントが５’方向と３’方向の両方にある。５’ウィングセグメント中のそれぞれのヌクレオシドと３’ウィングセグメント中のそれぞれのヌクレオシドは、（Ｓ）−ｃＥｔ修飾を有する。それぞれのギャップマー全体のヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結である。それぞれのギャップマー全体のシトシン残基は、いずれも５−メチルシトシンである。
表中に収載する「配列番号」は、オリゴヌクレオチド配列に言及する。「開始部位」は、ギャップマーがヒト遺伝子配列において標的指向される５’端ヌクレオシドを示す。「停止部位」は、ギャップマーがヒト遺伝子配列において標的指向される３’端ヌクレオシドを示す。表１６〜表２３に収載されるそれぞれのギャップマーは、本明細書では配列番号１と呼称されるヒトＡＲゲノム配列（ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＮＴ＿０１１６６９．１７、ヌクレオチド５０７９０００〜５２７００００より先端切断されたもの）又は本明細書では配列番号２と呼称されるヒトＡＲ ｍＲＮＡ配列（ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＮＭ＿００００４４．３）のいずれか一方又はその両方へ標的指向される。「ｎ／ａ」は、そのオリゴヌクレオチドがその特別な遺伝子配列に標的指向しないことを示す。
表１６
Figure 0006599497
表１７
Figure 0006599497
表１８
Figure 0006599497
表１９
Figure 0006599497
表２０
Figure 0006599497
表２１
Figure 0006599497
表２２
Figure 0006599497
表２３
Figure 0006599497
実施例１２：ＨｕＶＥＣ細胞におけるヒトＡＲのアンチセンス阻害
ＡＲ核酸に標的指向する追加のアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計して、ＡＲ ｍＲＮＡに対するそれらの効果を試験管内で試験した。２０，０００個の細胞／ウェルの密度で培養したＨｕＶＥＣ細胞を、エレクトロポレーションを使用して、１，０００ｎＭアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。ほぼ２４時間の処理時間の後で、この細胞からＲＮＡを単離して、定量的リアルタイムＰＣＲによってＡＲ ｍＲＮＡレベルを測定した。ヒトのプライマープローブセット、ＲＴＳ３５５９を使用して、ｍＲＮＡレベルを測定した。ＲＩＢＯＧＲＥＥＮ（登録商標）によって測定される全ＲＮＡ含量に従って、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを補正した。結果を、未処理対照細胞に対するＡＲの阻害パーセントとして提示する。全部で３８５種のオリゴヌクレオチドについて試験した。さらなる試験のために選択したオリゴヌクレオチドだけを表２４〜表２８に示す。
表２４〜表２８中の新たに設計したキメラアンチセンスオリゴヌクレオチドは、３−１０−３（Ｓ）−ｃＥＴギャップマーとして設計された。このギャップマーは、１６個のヌクレオシドの長さで、ここで中央のギャップセグメントは、１０個の２’−デオキシヌクレオシドを含み、その両側に３個のヌクレオシドを含んでなるウィングセグメントが５’方向と３’方向の両方にある。５’ウィングセグメント中のそれぞれのヌクレオシドと３’ウィングセグメント中のそれぞれのヌクレオシドは、（Ｓ）−ｃＥｔ修飾を有する。それぞれのギャップマー全体のヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結である。それぞれのギャップマー全体のシトシン残基は、いずれも５−メチルシトシンである。
表中に収載する「配列番号」は、オリゴヌクレオチド配列に言及する。「開始部位」は
、ギャップマーがヒト遺伝子配列において標的指向される５’端ヌクレオシドを示す。「停止部位」は、ギャップマーがヒト遺伝子配列において標的指向される３’端ヌクレオシドを示す。表２４〜表２８に収載されるそれぞれのギャップマーは、本明細書では配列番号１と呼称されるヒトＡＲゲノム配列（ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＮＴ＿０１１６６９．１７、ヌクレオチド５０７９０００〜５２７００００より先端切断されたもの）へ標的指向される。
表２４
Figure 0006599497
表２５
Figure 0006599497
表２６
Figure 0006599497
表２７
Figure 0006599497
表２８
Figure 0006599497
実施例１３：ＨｕＶＥＣ細胞におけるヒトＡＲの用量依存的なアンチセンス阻害
ＡＲ ｍＲＮＡの有意な試験管内阻害を示す、上記に記載した試験からのギャップマーを選択して、ＨｕＶＥＣ細胞において様々な用量で試験した。細胞を２０，０００個の細胞／ウェルの密度で蒔いて、エレクトロポレーションを使用して、表２９〜表３７に特記されるように、４６．９ｎＭ、１８７．５ｎＭ、７５０．０ｎＭ、及び３０００．０ｎＭ濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。ほぼ１６時間の処理時間の後で、この細胞からＲＮＡを単離して、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを定量的リアルタイムＰＣＲによって測定した。ヒトＡＲプライマープローブセット、ＲＴＳ３５５９を使用して、ｍＲＮＡレベルを測定した。ＲＩＢＯＧＲＥＥＮ（登録商標）によって測定される全ＲＮＡ含量に従って、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを補正した。結果を、未処理対照細胞に対するＡＲの阻害パーセントとして提示する。
表２９〜表３７には、それぞれのオリゴヌクレオチドの半最大阻害濃度（ＩＣ５０）も提示する。明示されるように、ＡＲ ｍＲＮＡレベルは、アンチセンスオリゴヌクレオチド処理細胞のいくつかにおいて、用量依存的なやり方で低下した。
表２９
Figure 0006599497
表３０
Figure 0006599497
表３１
Figure 0006599497
表３２
Figure 0006599497
表３３
Figure 0006599497
表３４
Figure 0006599497
表３５
Figure 0006599497
表３６
Figure 0006599497
表３７
Figure 0006599497
実施例１４：ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）ｍＲＮＡに標的指向するアンチセンスオリゴヌクレオチドの、前立腺癌細胞系でのアッセイのための選択
ヒトＡＲゲノム配列の異なる領域に標的指向する、上記の試験において提示したものからのアンチセンスオリゴヌクレオチドを、前立腺癌細胞系におけるさらなる試験のために選択した。Hornberg, E. et al., PLoS One 2011. Vol.6 に記載されるように、ＡＲ−Ｖ７とＡＲ−Ｖ５６７ｅｓは、癌患者において検出される主要なＡＲスプライス変異体である。
さらなる試験のために以下のＩＳＩＳオリゴヌクレオチドを選択した：ＩＳＩＳ ５４９３７２（ヒトＡＲゲノム配列にエクソン１で標的指向する）；ＩＳＩＳ ５４９４３４（ヒトＡＲゲノム配列にＡＲ停止コドンを越えたエクソン８の３’端で標的指向する）；ＩＳＩＳ ５６０１３１（ヒトＡＲゲノム配列にイントロン１で標的指向する）；及びＩＳＩＳ ５６９２３６（ヒトＡＲゲノム配列にイントロン１で標的指向する）。ベンチマークとしての使用のために、ＵＳ７，７３７，１２５の配列番号５８として呼称されるア
ンチセンスオリゴヌクレオチドと同一である、別のアンチセンスオリゴヌクレオチド、ＩＳＩＳ ５５４２２１（ＡＣＣＡＡＧＴＴＴＣＴＴＣＡＧＣ、本明細書では配列番号１７８と呼称される）を、ＡＲのエクソン４（即ち、リガンド結合ドメイン）へ標的指向される、ホスホロチオエート骨格のある３−１０−３ＬＮＡギャップマーとして設計した。
実施例１５：ＭＤＶ３１００抵抗性Ｃ４−２Ｂ細胞における、アンドロゲン受容体タンパク質レベルに対するヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）ｍＲＮＡのアンチセンス阻害の効果
Ｃ４−２Ｂ細胞は、腫瘍学の分野でよく使用されるアンドロゲン非依存性のヒト前立腺癌細胞であって、臨床に関連した培養細胞として確立されてきた（Thalmann, G. N. et al., Cancer Res. 1994. 54: 2577）。ＭＤＶ３１００又はエンザルタミドは、去勢抵抗性前立腺癌の治療のために Medivation によって開発された、実験的なアンドロゲン受容体アンタゴニストである。ＭＤＶ３１００抵抗性（ＭＲ）Ｃ４−２Ｂ細胞において、ＩＳＩＳ ５４９３７２、ＩＳＩＳ ５５４２２１、及びＩＳＩＳ ５４９４３４を試験した。
この細胞を５μＭ濃度のＭＤＶ３１００の存在下に２ヶ月にわたって培養して、ＭＤＶ３１００抵抗性を誘導した。ＩＳＩＳ ５４９３７２、ＩＳＩＳ ５４９４３４、及びＩＳＩＳ ５５４２２１をアンチセンスオリゴヌクレオチドの１μＭ濃度で、この細胞による自由取込みのために１μＭ濃度でこの培養基へそれぞれ加えた。２日の処理時間の後で、プロテアーゼ阻害剤を含有するＲＩＰＡ緩衝液に細胞を採取した。全長ＡＲ、並びに変異型、ＡＲ−Ｖ７のバンドの存在は、ＡＲ抗体（Ｎ−２０，SantaCruz）を使用するウェスタンブロットによって検出した。ＩＳＩＳ ５４９３７２での細胞の処理は、ＩＳＩＳ ５５４２２１又はＩＳＩＳ ５４９４３４のいずれかでの処理より広汎に全長ＡＲとＡＲ−Ｖ７を低下させた。
実施例１６：ＭＤＶ３１００抵抗性Ｃ４−２Ｂ細胞における、ＡＲ標的遺伝子に対する、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）ｍＲＮＡのアンチセンス阻害の効果 ＡＲ標的遺伝子に対するＡＲのアンチセンス阻害の効果について分析した。Ｃ４−２Ｂ ＭＲ細胞において、ＩＳＩＳ ５４９３７２、ＩＳＩＳ ５４９４５８、ＩＳＩＳ ５５４２２１、及びＩＳＩＳ ５４９４３４を試験した。
細胞を９６ウェルプレートにおいて４０，０００個の細胞／ウェルの密度で蒔いて、１０％ウシ胎仔血清入りのＲＰＭＩ１６４０培地で培養した。この細胞を５μＭ濃度のＭＤＶ３１００の存在下に２ヶ月の経過にわたって培養して、ＭＤＶ３１００抵抗性を誘導した。ＩＳＩＳ ５４９３７２、ＩＳＩＳ ５４９４５８、ＩＳＩＳ ５４９４３４、及びＩＳＩＳ ５５４２２１をこの培養基へこの細胞による自由取込みのためにアンチセンスオリゴヌクレオチドの０．０４μＭ、０．２０μＭ、１．００μＭ、及び５．００μＭの濃度でそれぞれ加えた。ヒト遺伝子配列に既知の標的領域がない対照オリゴヌクレオチド、ＩＳＩＳ ３４７５２６（配列：ＴＣＴＴＡＴＧＴＴＴＣＣＧＡＡＣＣＧＴＴ（配列番号１７９）５−１０−５ＭＯＥギャップマー）を陰性対照として含めた。２４時間の処理時間の後で、プライマープローブセットＲＴＳ３５５９を使用する定量的リアルタイムＰＣＲによって、全ＡＲ ｍＲＮＡレベルを測定した。ヒトＡＲプライマープローブセットのｈＡＲ＿ＬＴＳ００９４３（フォワード配列：ＧＣＣＣＣＴＧＧＡＴＧＧＡＴＡＧＣＴＡＣＴ、本明細書では配列番号１８０と呼称される；リバース配列：ＣＣＡＣＡＧＡＴＣＡＧＧＣＡＧＧＴＣＴＴＣ、本明細書では配列番号１８１と呼称される；プローブ配列：ＡＣＴＧＣＣＡＧＧＧＡＣＣＡＴＧＴＴＴＴＧＣＣＣ、本明細書では配列番号１８２と呼称される）を使用して、ＡＲ−Ｖ７ ｍＲＮＡレベルを測定した。ヒトのアクチンｍＲＮＡレベルに対してＡＲ ｍＲＮＡレベルを補正した。結果を、未処理対照細胞に対する全ＡＲの阻害パーセントとして表３８に提示する。ＩＳＩＳ ５４９３７２、ＩＳＩＳ ５４９４５８、及びＩＳＩＳ ５４９４３４での細胞の処理は、ＩＳＩＳ ５５４２２１で
の処理より広汎に用量依存的なやり方で全ＡＲ転写物レベルを低下させた。
上記に記載したアッセイに類似したやり方で、全長ＡＲ、並びにＡＲ−Ｖ７変異体のウェスタン分析も実施した。このアッセイは、ＩＳＩＳ ５４９３７２とＩＳＩＳ ５４９４５８での処理が全長ＡＲとＡＲ−Ｖ７のレベルを低下させることを示した。ＩＳＩＳ ５４９４３４での処理は、全長ＡＲのレベルを低下させたが、ＡＲ−Ｖ７のそれを低下させなかった。ＩＳＩＳ ５５４２２１での処理は、ＩＳＩＳ ５４９３７２と比べて全長ＡＲのレベルをさほど広汎に低下させず、ＡＲ−Ｖ７のレベルを低下させなかった。対照オリゴヌクレオチドのＩＳＩＳ ３４７５２６は、予測されるように、タンパク質レベルを低下させなかった。
ＡＲ標的遺伝子、ＫＬＫ２のｍＲＮＡレベルは、プライマープローブセットｈＫＬＫ２＿ＬＴＳ００９６３（フォワード配列：ＣＴＴＧＣＧＣＣＣＣＡＧＧＡＧＴＣＴ、本明細書では配列番号１８３と呼称される；リバース配列：ＣＴＣＡＧＡＧＴＡＡＧＣＴＣＴＡＧＣＡＣＡＣＡＴＧＴＣ、本明細書では配列番号１８４と呼称される；プローブ配列：ＡＧＴＧＴＧＴＧＡＧＣＣＴＣＣＡＴＣＴＣＣＴＧＴＣＣＡＡ、本明細書では配列番号１８５と呼称される）を使用して測定した。ＡＲ標的遺伝子、ＫＬＫ３のｍＲＮＡレベルは、プライマープローブセットＲＴＳ１０７２（フォワード配列：ＧＣＣＡＡＧＧＡＧＧＧＡＧＧＧＴＣＴＴ、本明細書では配列番号１８６と呼称される；リバース配列：ＣＣＣＣＣＣＡＴＡＧＴＧＡＡＴＣＡＧＣＴＴ、本明細書では配列番号１８７と呼称される；プローブ配列：ＡＴＧＡＡＧＴＡＡＧＧＡＧＡＧＧＧＡＣＴＧＧＡＣＣＣＣＣ、本明細書では配列番号１８８と呼称される）を使用して測定した。表３９と表４０に提示されるように、ＩＳＩＳ ５４９３７２、ＩＳＩＳ ５４９４５８、及びＩＳＩＳ ５４９４３４での処理は、ＩＳＩＳ ５５４２２１での処理より広汎に用量依存的なやり方で標的遺伝子レベルを低下させた。
表３８
Ｃ４−２Ｂ ＭＲ細胞における全長ＡＲ ｍＲＮＡの阻害パーセント
Figure 0006599497
表３９
Ｃ４−２Ｂ ＭＲ細胞におけるＫＬＫ３ ｍＲＮＡの阻害パーセント
Figure 0006599497
表４０
Ｃ４−２Ｂ ＭＲ細胞におけるＫＬＫ２ ｍＲＮＡの阻害パーセント
Figure 0006599497
実施例１７：ＭＤＶ３１００抵抗性Ｃ４−２Ｂ細胞の増殖能力に対する、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）ｍＲＮＡのアンチセンス阻害の効果
癌細胞の増殖能力に対する、ＡＲのアンチセンス阻害の効果について分析した。Ｃ４−２Ｂ ＭＲ細胞において、ＩＳＩＳ ５４９３７２、ＩＳＩＳ ５４９４５８、ＩＳＩＳ ５５４２２１、及びＩＳＩＳ ５４９４３４を試験した。
ＩＳＩＳ ５４９３７２、ＩＳＩＳ ５４９４３４、ＩＳＩＳ ５４９４５８、及びＩＳＩＳ ５５４２２１をアンチセンスオリゴヌクレオチドの０．０４μＭ、０．２０μＭ、１．００μＭ、及び５．００μＭの濃度でそれぞれ培養基へ加えた。ＩＳＩＳ ３４７５２６を陰性対照として含めた。６日の処理時間の後で、ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ９６（登録商標）AQueous One Solution Cell Proliferation キット（プロメガ）を製造業者の説明書に従って使用して、この癌細胞の増殖能を測定した。結果を、未処理細胞に対する増殖の阻害パーセントとして表４１に提示する。ＩＳＩＳ ５４９３７２、ＩＳＩＳ ５４９４３４、及びＩＳＩＳ ５４９４５８での細胞の処理は、ＩＳＩＳ ５５４２２１での処理より広汎に用量依存的なやり方でこの細胞の増殖を低下させた。
表４１
Ｃ４−２Ｂ ＭＲ細胞増殖の阻害パーセント
Figure 0006599497
実施例１８：ＭＤＶ３１００抵抗性ＬＭＲ２０細胞に対する、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）ｍＲＮＡのアンチセンス阻害の効果
ＬＭＲ２０と呼称される、ＭＤＶ３１００抵抗性細胞系を創出した。ＬＭＲ２０細胞の増殖能力とＡＲ ｍＲＮＡレベルに対する、ＡＲのアンチセンス阻害の効果について分析した。ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５４９４５８、及びＩＳＩＳ ５６９２３６について、ＬＮＡギャップマーのＩＳＩＳ ５５４２２１とともに試験した。
ＬｎＣａＰ細胞を増加濃度のＭＤＶ３１００とともにほぼ６ヶ月間インキュベートした。２０μＭ ＭＤＶ３１００の存在下での広汎な培養の後で単一のクローンを選択した。このクローン、ＬＭＲ２０は、脂質媒介性トランスフェクションを伴わない、アンチセン
スオリゴヌクレオチドの自由取込みを可能にする能力を維持する一方で、ＭＤＶ３１００で処理されるとき、元のＬｎＣａＰ細胞と比べてほぼ１０倍増加したＩＣ５０を示した。
試験１
ＬＭＲ２０細胞を活性炭処理済みウシ胎仔血清（ＣＳＳ）入りのフェノールレッドフリー培地において１，５００個の細胞／ウェルで蒔いて、この培地（Life Technologies）よりアンドロゲンを除去した。この培養基へＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５４９４５８、ＩＳＩＳ ５６９２３６、及びＩＳＩＳ ５５４２２１を０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭの濃度で個別に加えた。既知のヒトの標的配列がないＩＳＩＳ ５４９１４８を対照として含めた。アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれでも処理した１つの細胞セットへ合成アンドロゲンアゴニスト、Ｒ１８８１（Takeda, A. N. et al., Mol. Pharmacol. 2007. 71: 473-82）を１日目に１ｎＭ用量で加えた。アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれでも処理した別の細胞セットへＤＨＴを１日目に１０ｎＭの用量で加えた。アンチセンスオリゴヌクレオチドで未処理の別の細胞セットへＭＤＶ３１００を１日目に１０ｎＭの用量で加え、これを対照として役立てた。５日の処理時間の後で、標準のＭＴＴアッセイによって、この癌細胞の増殖能力を測定した。結果を、未処理細胞に対する増殖の阻害パーセントとして表４２に提示する。
表４２に提示されるように、アンドロゲンアゴニストのＲ１８８１又はＤＨＴの存在下で、ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５４９４５８、及びＩＳＩＳ ５６９２３６は、ＩＳＩＳ ５５４２２１より広汎に用量依存的なやり方で、ＭＤＶ３１００抵抗性前立腺癌細胞の増殖を有意に阻害した。アンチセンスオリゴヌクレオチドによる増殖の阻害は、ＭＤＶ３１００での処理と同等であるか又はそれより強力であった。
表４２
ＬＭＲ２０細胞増殖の阻害パーセント
Figure 0006599497
試験２
ＬＭＲ２０細胞をＣＳＳ入りのフェノールレッドフリー培地において１，５００個の細胞／ウェルで蒔いた。この培養基へＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５４９４５８、
ＩＳＩＳ ５６９２３６、及びＬＮＡギャップマーのＩＳＩＳ ５５４２２１を０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭの濃度で個別に加えた。既知のヒトの標的配列がないＩＳＩＳ ５４９１４８を対照として含めた。アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれ又はＭＤＶ３１００でも処理した１つの細胞セットへＤＨＴを１日目に１０ｎＭの用量で７２時間加えた。アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれ又はＭＤＶ３１００でも処理した別の細胞セットへＲ１８８１を１日目に１０ｎＭの用量で７２時間加えた。ＡＲ、前立腺特異抗原（ＰＳＡ）、及びＴＭＰＲＳＳ２［アンドロゲン調節遺伝子］（Lin, B., et al., Cancer Res. 1999. 59: 4180）のｍＲＮＡレベルを測定した。結果を、ベースライン値の百分率として表されるｍＲＮＡレベルとして表４３〜表４５に提示する。ｍＲＮＡレベルは、処理後に低下する場合もあれば、増加する場合もある。
表４３〜表４５に提示されるように、ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５４９４５８、及びＩＳＩＳ ５６９２３６は、いずれかのＡＲアゴニストで処理されるか又は処理されなかったＬＭＲ細胞において、ベースラインに対して用量依存的なやり方で、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを低下させた。ＬＮＡギャップマー、ＩＳＩＳ ５５４２２１での処理は、ＡＲ ｍＲＮＡレベルを変化させなかった。ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５４９４５８、及びＩＳＩＳ ５６９２３６は、ＬＮＡギャップマーのＩＳＩＳ ５５４２２１又はＭＤＶ３１００より広汎にＰＳＡレベルとＴＭＰＲＳＳ２を低下させた。ＭＤＶ３１００での処理は、ＡＲアゴニストで処理した細胞においてＡＲ ｍＲＮＡのレベルを増加させて、ＰＳＡ又はＴＭＰＲＳＳ２のｍＲＮＡレベルをいずれも低下させなかった。
表４３
ＡＲアゴニスト処理無しの細胞のｍＲＮＡレベル（％ベースライン値）
Figure 0006599497
表４４
ＤＨＴでの処理後のｍＲＮＡレベル（％ベースライン値）
Figure 0006599497
表４５
Ｒ１８８１での処理後のｍＲＮＡレベル（％ベースライン値）
Figure 0006599497
実施例１９：Ｃ４−２Ｂ細胞の増殖能力に対する、ＭＤＶ３１００と組み合わせた、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）ｍＲＮＡのアンチセンス阻害の効果
癌細胞の増殖能力に対する、異なる用量のＭＤＶ３１００と組み合わせた、ＡＲのアンチセンス阻害の効果について分析した。Ｃ４−２Ｂ細胞において、ＩＳＩＳ ５４９３７２、ＩＳＩＳ ５４９４３４、ＩＳＩＳ ５４９４５８、及びＩＳＩＳ ５５４２２１を試験した。
Ｃ４−２Ｂ細胞を１，５００個の細胞／ウェルで蒔いた。この培養基へＩＳＩＳ ５４９３７２、ＩＳＩＳ ５４９４３４、ＩＳＩＳ ５４９４５８、又はＩＳＩＳ ５５４２２１を０．１μＭ濃度で個別に加えた。ＩＳＩＳ ３４７５２６を陰性対照として含めた。ＭＤＶ３１００も、１日目に０．２５μＭ又は１．００μＭの用量で加えた。６日の処理時間の後で、ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ９６（登録商標）AQueous One Solution Cell Proliferation キット（プロメガ）を製造業者の説明書に従って用いて、この癌細胞の増殖能を測定した。結果を、未処理細胞に対する増殖の阻害パーセントとして表４６に提示する。ＩＳＩＳ ５４９３７２又はＩＳＩＳ ５４９４５８での細胞の処理は、ＩＳＩＳ ５５４２２１での処理より広汎にこの細胞の増殖を低下させた。例えば、表４６に提示されるように、ＩＳＩＳ ５４９３７２単独での処理は、細胞増殖を５９％低下させて、ＩＳＩＳ ５４９４５８での処理は、ＩＳＩＳ ５５４２２１単独（これは、細胞増殖を２３％低下させる）に比較して、細胞増殖を７４％低下させた。
表４６と表４７に提示されるように、ＭＤＶ３１００と組み合わせたＩＳＩＳ ５４９３７２又はＩＳＩＳ ５４９４５８は、ＭＤＶ３１００と組み合わせた等しいモル濃度のＩＳＩＳ ５５４２２１より大きな程度で、前立腺癌細胞の増殖を阻害した。
ＩＳＩＳ ５４９３７２又はＩＳＩＳ ５４９４５８での細胞の処理がＭＤＶ３１００と相乗的であるかどうかを見出すために、このアッセイを０．１μＭ ＡＳＯで繰り返した。表４６に提示されるように、ＩＳＩＳ ５４９３７２又はＩＳＩＳ ５４９４５８での処理は、ＭＤＶ３１００と相乗的であった。例えば、０．２５μＭでのＭＤＶ３１００単独は、増殖を４％阻害し；０．１μＭでのＩＳＩＳ ５４９３７２単独は、細胞増殖を２３％阻害し；組合せにおいて、細胞増殖は６６％阻害された。同様に、０．１μＭでのＩＳＩＳ ５４９４５８単独は、細胞増殖を３９％阻害し；組合せにおいて、細胞増殖は７５％阻害された。従って、ＩＳＩＳ ５４９３７２又はＩＳＩＳ ５４９４５８とＭＤＶ３１００の組合せは、前立腺癌細胞増殖の阻害に関して、相乗的（即ち、相加より大きい）であった。
表４６
Ｃ４−２Ｂ細胞増殖の０．１μＭ ＡＳＯでの阻害パーセント
Figure 0006599497
表４７
Ｃ４−２Ｂ細胞増殖の０．２μＭ ＡＳＯでの阻害パーセント
Figure 0006599497
実施例２０：ＬＮＣａＰ細胞の増殖能力に対する、ＭＤＶ３１００と組み合わせた、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）ｍＲＮＡのアンチセンス阻害の効果
癌細胞の増殖能力に対する、異なる用量のＭＤＶ３１００と組み合わせた、ＡＲのアンチセンス阻害の効果について分析した。ＬＮＣａＰ細胞において、ＩＳＩＳ ５６０１３１とＩＳＩＳ ５６９２３６を試験した。
ＬＮＣａＰ細胞を１，０００個の細胞／ウェルで蒔いた。この培養基へＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６を０．０８μＭ、０．０４μＭ、０．２μＭ、又は１．０μＭ濃度で個別に加えた。ＩＳＩＳ ５４９１４８を陰性対照として含めた。このＩＳＩＳオリゴヌクレオチド処理細胞へＭＤＶ３１００を２日目に０．０１６μＭ、０．０８μＭ、０．４μＭ、又は２．０μＭの用量で加えた。５日の処理時間の後で、ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ９６（登録商標）AQueous One Solution Cell Proliferation キット（プロメガ）を製造業者の説明書に従って用いて、この癌細胞の増殖能を測定した。結果を、未処理細胞に対する増殖の阻害パーセントとして表４８〜表５２に提示する。
これらの表に提示されるように、ＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６での処理は、ＭＤＶ３１００と相乗的であった。例えば、ＭＤＶ３１００と対照オリゴヌクレオチド、ＩＳＩＳ ５４９１４８が０．０８μＭで増殖を平均して７％阻害したのに対し、０．０４μＭでのＩＳＩＳ ５６０１３１単独は、細胞増殖を２４％阻害し；組合せにおいて、細胞増殖は４１％阻害された。同様に、０．０４μＭでのＩＳＩＳ ５６９２３６単独は、細胞増殖を９％阻害し；組合せにおいて、細胞増殖は２６％阻害された。従って、ＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６とＭＤＶ３１００の組合せは、前立腺癌細胞増殖の阻害に関して、相乗的（即ち、相加より大きい）であった。
表４８
ＭＤＶ−３１００無しでのＬＮＣａＰの増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
表４９
０．０１６μＭ ＭＤＶ−３１００でのＬＮＣａＰの増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
表５０
０．０８μＭ ＭＤＶ−３１００でのＬＮＣａＰの増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
表５１
０．４μＭ ＭＤＶ−３１００でのＬＮＣａＰの増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
表５２
２．０μＭ ＭＤＶ−３１００を含む、ＬＮＣａＰの増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
実施例２１：Ｃ４−２Ｂ細胞の増殖能力に対する、ＭＤＶ３１００と組み合わせた、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）ｍＲＮＡのアンチセンス阻害の効果
癌細胞の増殖能力に対する、異なる用量のＭＤＶ３１００と組み合わせた、ＡＲのアンチセンス阻害の効果について分析した。Ｃ４−２Ｂ細胞において、ＩＳＩＳ ５６０１３１とＩＳＩＳ ５６９２３６を試験した。
Ｃ４−２Ｂ細胞を１，０００個の細胞／ウェルで蒔いた。この培養基へＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６を０．０８μＭ、０．０４μＭ、０．２μＭ、又は１．０μＭ濃度で個別に加えた。ＩＳＩＳ ５４９１４８を陰性対照として含めた。このＩＳＩＳオリゴヌクレオチド処理細胞へＭＤＶ３１００を２日目に０．０１６μＭ、０．０８μＭ、０．４μＭ、又は２．０μＭの用量で加えた。５日の処理時間の後で、ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ９６（登録商標）AQueous One Solution Cell Proliferation キット（プロメガ）を製造業者の説明書に従って用いて、この癌細胞の増殖能を測定した。結果を、未処理細胞に対する増殖の阻害パーセントとして表５３〜表５７に提示する。
これらの表に提示されるように、ＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６での処理は、ＭＤＶ３１００と相乗的であった。例えば、ＭＤＶ３１００と対照オリゴヌクレオチド、ＩＳＩＳ ５４９１４８が０．４μＭで増殖を平均して６％阻害したのに対し、０．０８μＭでのＩＳＩＳ ５６０１３１単独は、細胞増殖を１６％阻害し；組合せにおいて、細胞増殖は３１％阻害された。同様に、ＭＤＶ３１００と対照オリゴヌクレオチド、ＩＳＩＳ ５４９１４８が０．０８μＭで増殖を阻害しなかった（０％）のに対し、０．２μＭでのＩＳＩＳ ５６９２３６単独は、細胞増殖を３７％阻害し；組合せにおいて、細胞増殖は５２％阻害された。従って、ＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６とＭＤＶ３１００の組合せは、前立腺癌細胞増殖の阻害に関して、相乗的（即ち、相加より大きい）であった。
表５３
ＭＤＶ−３１００無しでのＣ４−２Ｂの増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
表５４
０．０１６μＭ ＭＤＶ−３１００でのＣ４−２Ｂの増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
表５５
０．０８μＭ ＭＤＶ−３１００でのＣ４−２Ｂの増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
表５６
０．４μＭ ＭＤＶ−３１００でのＣ４−２Ｂの増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
表５７
２．０μＭ ＭＤＶ−３１００でのＣ４−２Ｂの増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
実施例２２：２２ＲＶ１細胞の増殖能力に対する、ＭＤＶ３１００と組み合わせた、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）ｍＲＮＡのアンチセンス阻害の効果
癌細胞の増殖能力に対する、異なる用量のＭＤＶ３１００と組み合わせた、ＡＲのアンチセンス阻害の効果について分析した。２２ＲＶ１細胞において、ＩＳＩＳ ５６０１３１とＩＳＩＳ ５６９２３６を試験した。
２２ＲＶ１細胞を５％ ＣＳＳ培地において２，０００個の細胞／ウェルで４８時間蒔いた。ＲＮＡｉＭＡＸ試薬を０．４ｎＭ、１．３４ｎＭ、４ｎＭ、又は１３．４ｎＭ濃度のＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６とともに使用して、細胞をトランスフェクトした。ＩＳＩＳ ５４９１４８を陰性対照として含めた。１ｎＭでのＤＨＴ、及び／又は０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭの用量でのＭＤＶ３１００を４時間後に加えた。３日の処理時間の後で、ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ９６（登録商標）AQueous One Solution Cell Proliferation キット（プロメガ）を製造業者の説明書に従って用いて、この癌細胞の増殖能を測定した。結果を、未処理細胞に対する増殖の阻害パーセントとして表５８〜表６２に提示する。
これらの表に提示されるように、ＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６
での処理は、ＭＤＶ３１００と相乗的であった。例えば、ＭＤＶ３１００と対照オリゴヌクレオチド、ＩＳＩＳ ５４９１４８が１．０μＭで増殖を平均して５％阻害したのに対し、１．３４ｎＭでのＩＳＩＳ ５６０１３１単独は、細胞増殖を３％阻害し；組合せにおいて、細胞増殖は２３％阻害された。同様に、ＭＤＶ３１００と対照オリゴヌクレオチド、ＩＳＩＳ ５４９１４８が１．０μＭで増殖を５％阻害したのに対し、１．０μＭでのＩＳＩＳ ５６９２３６単独は、細胞増殖を１７％阻害し；組合せにおいて、細胞増殖は３０％阻害された。従って、ＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６とＭＤＶ３１００の組合せは、前立腺癌細胞増殖の阻害に関して、相乗的（即ち、相加より大きい）であった。
表５８
ＭＤＶ−３１００無しでの２２ＲＶ１の増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
表５９
０．０４μＭ ＭＤＶ−３１００での２２ＲＶ１の増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
表６０
０．２μＭ ＭＤＶ−３１００での２２ＲＶ１の増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
表６１
１．０μＭ ＭＤＶ−３１００での２２ＲＶ１の増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
表６２
５．０μＭ ＭＤＶ−３１００での２２ＲＶ１の増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
実施例２３：ＣＷＲ２２−ＲＶ１細胞に対する、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）ｍＲＮＡのアンチセンス阻害の効果
癌細胞の増殖能力に対する、ＡＲのアンチセンス阻害の効果について分析した。ＣＷＲ２２−ＲＶ１細胞において、ＩＳＩＳ ５４９３７２、ＩＳＩＳ ５４９４３４、ＩＳＩＳ ５４９４５８、及びＩＳＩＳ ５５４２２１を試験した。
ＣＷＲ２２−ＲＶ１細胞を蒔いて、ＲＮＡｉＭａｘ試薬（Life Technologies）を１．７ｎＭ、５．０ｎＭ、１６．７ｎＭ、又は５０ｎＭ濃度のＩＳＩＳオリゴヌクレオチドとともに使用して、トランスフェクトした。ＩＳＩＳ ３４７５２６を陰性対照として含めた。６日の処理時間の後で、癌細胞の標的低下と増殖能を測定した。
ＡＲ全長ｍＲＮＡのアンチセンス阻害をＲＴＳ３５５９プライマープローブセットで測定した。この結果を未処理細胞に対する阻害パーセントとして表６３に提示する。ＳＹＢＲ Ｇｒｅｅｎ染色（Hu, R. et al., Cancer Res. 2009. 69: 16-22）を使用するＲＴ−ＰＣＲによって、ＡＲ ｍＲＮＡのＶ７スプライス変異体の低下も測定した。この結果を、未処理細胞に対するパーセント低下として表６４に提示する。ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ９６（登録商標）AQueous One Solution Cell Proliferation キット（プロメガ）を製造業者の説明書に従って用いて、細胞増殖を測定した。結果を、未処理細胞に対する増殖の阻害パーセントとして表６５に提示する。
表６３
ＡＲ全長ｍＲＮＡの阻害パーセント
Figure 0006599497
表６４
ＡＲスプライス変異体、Ｖ７の阻害パーセント
Figure 0006599497
表６５
細胞増殖の阻害パーセント
Figure 0006599497
実施例２４：Ｃ４−２Ｂ細胞によるアンチセンスオリゴヌクレオチドの自由取込みによる、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）ｍＲＮＡのアンチセンス阻害の効果
ＡＲ ｍＲＮＡレベルに対する、アンチセンスオリゴヌクレオチドの自由取込みの効果について検討した。ＩＳＩＳ ５４９３７２、ＩＳＩＳ ５４９４３４、ＩＳＩＳ ５４９４５８、及びＩＳＩＳ ５５４２２１を試験した。
細胞を９６ウェルプレートにおいて１，０００個の細胞／ウェルの濃度で蒔いて細胞増殖を測定して、４，０００個の細胞／ウェルで標的低下を測定した。ＩＳＩＳ ５４９４５８、ＩＳＩＳ ５４９３７２、ＩＳＩＳ ５４９４３４、及びＩＳＩＳ ５５４２２１を０．０４μＭ、０．２０μＭ、１．００μＭ、又は５．００μＭで個別に加えた。２４時間のインキュベーション時間の後で、ｈＡＲ＿ＬＴＳ００９４３を使用してｍＲＮＡレベルを測定した。このデータを表６６に提示する。この結果は、ＩＳＩＳ ５４９４５８、ＩＳＩＳ ５４９３７２、及びＩＳＩＳ ５４９４３４がＩＳＩＳ ５５４２２１より強力にＡＲ ｍＲＮＡ発現を阻害したことを示す。
６日目に、増殖を測定するために蒔いた細胞をＭＴＴ試薬とともにインキュベートして、発色させた。分光光度計を４９０ｎｍで使用して、色強度を測定した。このデータを表６７に提示する。
表６６
ＡＲ全長ｍＲＮＡの阻害パーセント
Figure 0006599497
表６７
細胞増殖の阻害パーセント
Figure 0006599497
実施例２５：ＬｎＣａＰ細胞によるアンチセンスオリゴヌクレオチドの自由取込みによる、ヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）ｍＲＮＡのアンチセンス阻害の効果
ＡＲ ｍＲＮＡレベルに対する、アンチセンスオリゴヌクレオチドの自由取込みの効果について検討した。
細胞を９６ウェルプレートにおいて４，０００個の細胞／ウェルの濃度で蒔いた。表６８に特記したＩＳＩＳオリゴヌクレオチドを０．０２μＭ、０．１０μＭ、０．５０μＭ、２．５０μＭ、又は１０．００μＭで個別に加えた。２４時間のインキュベーション時間の後で、プライマープローブセット、ｈＡＲ＿ＬＴＳ００９４３を使用してｍＲＮＡレベルを測定した。このデータを表６８に提示する。この結果は、このＩＳＩＳオリゴヌクレオチドのほとんどが各濃度でＩＳＩＳ ５５４２２１より強力にＡＲ ｍＲＮＡ発現を阻害したことを示す。
表６８
ＡＲ ｍＲＮＡの阻害パーセント
Figure 0006599497
実施例２６：２２ＲＶ１細胞の増殖能力に対する、ＤＨＴの存在下でのヒトアンドロゲン受容体（ＡＲ）ｍＲＮＡのアンチセンス阻害の効果
ジヒドロテストステロン（ＤＨＴ）は、アンドロゲンホルモンであって、ＡＲアクチベータである。ＤＨＴで処理した癌細胞の増殖能力に対する、ＡＲのアンチセンス阻害の効果について分析した。ヒトの前立腺癌細胞系、２２ＲＶ１においてＩＳＩＳ ５６０１３１とＩＳＩＳ ５６９２３６を試験した。
２２ＲＶ１細胞を１，５００個の細胞／ウェルで蒔いた。ＲＮＡｉＭＡＸＴＭ試薬（Life Technologies）を１．３４ｎＭ、４．００ｎＭ、１３．４ｎＭ、又は４０．０ｎＭ濃度で使用して、この細胞中へＩＳＩＳ ５６０１３１とＩＳＩＳ ５６９２３６を個別にトランスフェクトした。既知のヒトの標的配列がないＩＳＩＳ ５４９１４８を対照として含めた。アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれでも処理した別々の細胞セットを、１日目に１ｎＭの最終濃度で加えたＤＨＴで処理した。５日の処理時間の後で、標準のＭＴＴアッセイを使用して、この癌細胞の増殖能力を測定した。結果を、未処理細胞に対する増殖の阻害パーセントとして表６９に提示する。
表６９に提示されるように、ＩＳＩＳ ５６０１３１とＩＳＩＳ ５６９２３６はともに、ＡＲアクチベータ、ＤＨＴの存在下でも、対照に比較して、前立腺癌細胞増殖を有意に阻害した。対照オリゴヌクレオチドは、予測されるように、増殖に対して全く効果を示さなかった。
表６９
２２ＲＶ１細胞増殖の阻害パーセント
Figure 0006599497
実施例２７：ＡＲに標的指向するＩＳＩＳオリゴヌクレオチドでのＣ４−２Ｂ細胞処理の時間経過試験
遺伝子発現に対する、Ｃ４−２Ｂ癌細胞でのアンチセンス阻害の効果について分析した。ＩＳＩＳ ５６０１３１とＩＳＩＳ ５６９２３６を試験した。
ＡＲ ｍＲＮＡ分析
Ｃ４−２Ｂ細胞を完全培地において１，０００個の細胞／ウェルで蒔いた。この培養基へＩＳＩＳ ５６０１３１又はＳＩＳ ５６９２３６を０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭ濃度の最終濃度まで、トランスフェクション試薬を使用せずに、個別に加えた。ＩＳＩＳ ５４９１４８を陰性対照として含めた。ＭＤＶ３１００を別々の細胞セットに０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ又は５．０μＭの用量で加えた。８時間、２４時間、及び４８時間の処理時間の後で、プライマープローブセット、ｈＡＲ−ＬＴＳ００９４３でＡＲ発現を測定した。結果を、未処理細胞に対するＡＲの発現パーセントとして、表７０〜表７２に提示する。ＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６での細胞の処理は、対照セットに対して、細胞中のＡＲ発現を低下させた。ＭＤＶ−３１００での処理は、ＡＲ発現を４８時間の時点で増加させた。
表７０
対照群と比較した、８時間でのＡＲの発現パーセント
Figure 0006599497
表７１
対照群と比較した、２４時間でのＡＲの発現パーセント
Figure 0006599497
表７２
対照群と比較した、４８時間でのＡＲの発現パーセント
Figure 0006599497
ＡＲタンパク質分析
上記細胞中のタンパク質レベルについても分析した。プロテアーゼ阻害剤を含有するＲＩＰＡ緩衝液において細胞を採取した。ＡＲ抗体（Ｎ−２０，ＳＣ−８１６，Santa Cruz Biotechnology）を使用するウェスタンブロットによって、全長ＡＲのバンドの存在を検出した。ＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６で２４時間及び４８時間処理した細胞では、ハウスキーピング遺伝子、ＧＡＰＤＨのレベルへ正規化すると、全長ＡＲが有意に低下した。
下流遺伝子のｍＲＮＡ発現分析
前立腺特異抗原（ＰＳＡ）とＴＭＰＲＳＳ２の発現分析についても分析した。結果を、未処理細胞に対するＰＳＡ発現の阻害パーセントとして表７３〜表７５に、そしてＴＭＰＲＳＳ２発現の阻害パーセントとして表７６〜表７８に提示する。ＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６での細胞の処理は、対照セットに対して細胞中のＰＳＡ及びＴＭＰＲＳＳ２発現を２４時間と４８時間の時点で低下させた。ＭＤＶ−３１００での処理も下流遺伝子の発現を低下させたが、ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドでのそれほど強力ではなかった。
表７３
対照群と比較した、８時間でのＰＳＡ発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
表７４
対照群と比較した、２４時間でのＰＳＡ発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
表７５
対照群と比較した、４８時間でのＰＳＡ発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
表７６
対照群と比較した、８時間でのＴＭＰＲＳＳ２発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
表７７
対照群と比較した、２４時間でのＴＭＰＲＳＳ２発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
表７８
対照群と比較した、４８時間でのＴＭＰＲＳＳ２発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
実施例２８：完全培地とＣＳＳ培地で培養したＬＮＣａＰ細胞におけるＡＲ ｍＲＮＡのアンチセンス阻害
完全培地、並びにＤＨＴ入りのＣＳＳ培地で培養したＬＮＣａＰ細胞におけるＡＲのアンチセンス阻害の効果について検討した。
完全培地中の遺伝子発現
細胞を１，０００個の細胞／ウェルで蒔いた。ＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６を０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭで個別に加えた。ＩＳＩＳ ５４９１４８を陰性対照として含めた。ＭＤＶ３１００を別々の細胞セットに０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭの用量で加えた。４８時間のインキュベーション時間の後で、ＡＲ、ＰＳＡ、及びＴＭＰＲＳＳ２のＲＮＡレベルを測定した。このデータを表７９〜表８１に提示する。
全長ＡＲのタンパク質分析も、ハウスキーピング遺伝子、ＧＡＰＤＨのレベルへ正規化すると、用量依存的な発現の減少を示した。
表７９
完全培地で培養したＬＮＣａＰ細胞におけるＡＲの発現パーセント
Figure 0006599497
表８０
完全培地で培養したＬＮＣａＰ細胞におけるＰＳＡ発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
表８１
完全培地で培養したＬＮＣａＰ細胞におけるＴＭＰＲＳＳ２発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
ＣＳＳ培地とＣＳＳ＋ＤＨＴ培地における遺伝子発現
細胞を２，０００個の細胞／ウェルで蒔いて、５％活性炭処理済み血清（Gibco）培地を補充したフェノールレッドフリーＲＰＭＩにおいて１６時間培養した。ＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６をそれぞれの細胞セットへ０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭで個別に加えた。ＩＳＩＳ ５４９１４８を陰性対照として含めた。ＭＤＶ３１００を別々の細胞セットに０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭで加えた。４時間のインキュベーション時間の後で、この培地へＤＨＴを指定のように１ｎＭの最終濃度で加えた。４８時間後にＲＮＡを採取して、ＡＲ、ＰＳＡ、及びＴＭＰＲＳＳ２のレベルを測定した。このデータを表８２〜表８５に提示する。ＤＨＴの非存在下で、未処理対照に比較して、ＬＮＣａＰ細胞におけるＡＲ発現は９５％、ＰＳＡ発現は７％、そしてＴＭＰＲＳＳ２発現は２４％であった。
表８２
ＣＳＳ培地で培養したＬＮＣａＰ細胞におけるＡＲの発現パーセント
Figure 0006599497
表８３
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養したＬＮＣａＰ細胞におけるＡＲの発現パーセント
Figure 0006599497
表８４
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養したＬＮＣａＰ細胞におけるＰＳＡ発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
表８５
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養したＬＮＣａＰ細胞におけるＴＭＰＲＳＳ２発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
ＣＳＳ培地とＣＳＳ＋ＤＨＴ培地における増殖に対する効果
完全培地又はＣＳＳ＋１ｎＭ ＤＨＴ培地における５日の処理時間の後で、ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ９６（登録商標）AQueous One Solution 又はＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登
録商標）solution Cell Proliferation キット（プロメガ）を製造業者の説明書に従って使用して、この癌細胞の増殖能を測定した。結果を、未処理細胞に対する増殖の阻害パーセントとして表８６と表８７に提示する。ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５６９２３６、及びＭＤＶ−３１００での細胞の処理は、対照に比較して、この細胞の増殖を用量依存的なやり方で低下させた。ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地におけるＩＳＩＳオリゴヌクレオチドでの処理は、ＭＶＤ−３１００での処理より大きな程度で増殖能を低下させた。ＤＨＴ無しのＣＳＳ培地で培養した細胞の増殖能は、未処理対照レベルの１７％である。
表８６
完全培地で培養したＬＮＣａＰ細胞における増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
表８７
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養したＬＮＣａＰ細胞における増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
実施例２９：完全培地とＣＳＳ培地で培養したＣ４−２細胞におけるＡＲ ｍＲＮＡのアンチセンス阻害
完全培地、並びにＤＨＴ入りのＣＳＳ培地で培養したＣ４−２細胞におけるＡＲ ｍＲＮＡレベルのアンチセンス阻害の効果について検討した。
完全培地における遺伝子発現
細胞を１，０００個の細胞／ウェルで蒔いた。ＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６を０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭで個別に加えた。ＩＳＩＳ ５４９１４８を陰性対照として含めた。別々の細胞セットにＭＤＶ３１００を０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭで加えた。４８時間のインキュベーション時間の後で、ＡＲ、ＰＳＡ、及びＴＭＰＲＳＳ２のＲＮＡレベルを測定した。このデータを表８８〜表９０に提示する。この細胞においてＭＤＶ−３１００での処理がＡＲ発現を増加させる一方で、ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドでの処理は、ＡＲ発現を阻害した。
全長ＡＲとＰＳＡのタンパク質分析も、ハウスキーピング遺伝子、ＧＡＰＤＨのレベルへ正規化すると、用量依存的な発現の減少を示した。
表８８
完全培地で培養したＣ４−２細胞におけるＡＲの発現パーセント
Figure 0006599497
表８９
完全培地で培養したＣ４−２細胞におけるＰＳＡ発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
表９０
完全培地で培養したＣ４−２細胞におけるＴＭＰＲＳＳ２発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地における遺伝子発現
細胞を２，０００個の細胞／ウェルで蒔いて、１ｎＭ ＤＨＴ入りのＣＳＳ培地で培養した。それぞれの細胞セットへＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６を０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭで個別に加えた。ＩＳＩＳ ５４９１４８を陰性対照として含めた。別々の細胞セットにＭＤＶ３１００を０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭで加えた。４８時間のインキュベーション時間の後で、ＡＲ、ＰＳＡ、及びＴＭＰＲＳＳ２のＲＮＡレベルを測定した。このデータを表９１〜表９３に提示する。ＤＨＴの非存在下で、未処理対照に比較して、Ｃ４−２細胞におけるＡＲ発現は１５３％、ＰＳＡ発現は４２％、そしてＴＭＰＲＳＳ２発現は２３％であった。この細胞においてＭＤＶ−３１００での処理がＡＲ発現を増加させる一方で、ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドでの処理は、ＡＲ発現を阻害した。
表９１
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養したＣ４−２細胞におけるＡＲの発現パーセント
Figure 0006599497
表９２
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養したＣ４−２細胞におけるＰＳＡ発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
表９３
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養したＣ４−２細胞におけるＴＭＰＲＳＳ２発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
ＣＳＳ培地とＣＳＳ＋ＤＨＴ培地における増殖に対する効果
完全培地又はＣＳＳ＋１ｎＭ ＤＨＴ培地における５日の処理時間の後で、ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ９６（登録商標）AQueous One Solution 又はＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登録商標）Cell Proliferation キット（プロメガ）を製造業者の説明書に従って使用して、この癌細胞の増殖能を測定した。結果を、未処理細胞に対する増殖の阻害パーセントとして表９４と表９５に提示する。ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５６９２３６、及びＭＤＶ−３１００での細胞の処理は、対照に比較して、この細胞の増殖を用量依存的なやり方で低下させた。ＤＨＴ無しのＣＳＳ培地で培養した細胞の増殖能は、未処理対照レベルの１７％である。
表９４
完全培地で培養したＣ４−２細胞における増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
表９５
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養したＣ４−２細胞における増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
実施例３０：完全培地とＣＳＳ培地で培養したＣ４−２Ｂ細胞におけるＡＲ ｍＲＮＡのアンチセンス阻害
完全培地、並びにＤＨＴ入りのＣＳＳ培地で培養したＣ４−２Ｂ細胞におけるＡＲ
ｍＲＮＡレベルのアンチセンス阻害の効果について検討した。
完全培地中の遺伝子発現
細胞を１，０００個の細胞／ウェルで蒔いた。ＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６を０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭで個別に加えた。ＩＳＩＳ ５４９１４８を陰性対照として含めた。ＭＤＶ３１００を別々の細胞セットに０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭの用量で加えた。４８時間のインキュベーション時間の後で、ＡＲ、ＰＳＡ、及びＴＭＰＲＳＳ２のＲＮＡレベルを測定した。このデータを表９６〜表９８に提示する。この細胞においてＭＤＶ−３１００での処理がＡＲ発現を増加させる一方で、ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドでの処理は、ＡＲ発現を阻害した。
全長ＡＲのタンパク質分析も、ハウスキーピング遺伝子、ＧＡＰＤＨのレベルへ正規化すると、用量依存的な発現の減少を示した。
表９６
完全培地で培養したＣ４−２Ｂ細胞におけるＡＲの発現パーセント
Figure 0006599497
表９７
完全培地で培養したＣ４−２Ｂ細胞におけるＰＳＡ発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
表９８
完全培地で培養したＣ４−２Ｂ細胞におけるＴＭＰＲＳＳ２発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地における遺伝子発現
細胞を２，０００個の細胞／ウェルで蒔いて、１ｎＭ ＤＨＴ入りのＣＳＳ培地で培養した。それぞれの細胞セットへＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６を０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭで個別に加えた。ＩＳＩＳ ５４９１４８を陰性対照として含めた。別々の細胞セットにＭＤＶ３１００を０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭで加えた。４８時間のインキュベーション時間の後で、ＡＲ、ＰＳＡ、及びＴＭＰＲＳＳ２のＲＮＡレベルを測定した。このデータを表９９〜表１０１に提示する。ＤＨＴの非存在下で、未処理対照に比較して、Ｃ４−２細胞におけるＡＲ発現は１８８％、ＰＳＡ発現は４３％、そしてＴＭＰＲＳＳ２発現は２７％であった。この細胞においてＭＤＶ−３１００での処理がＡＲ発現を増加させる一方で、ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドでの処理は、ＡＲ発現を阻害した。
表９９
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養したＣ４−２Ｂ細胞におけるＡＲの発現パーセント
Figure 0006599497
表１００
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養したＣ４−２Ｂ細胞におけるＰＳＡ発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
表１０１
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養したＣ４−２Ｂ細胞におけるＴＭＰＲＳＳ２発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
ＣＳＳ培地とＣＳＳ＋ＤＨＴ培地における増殖に対する効果
完全培地又はＣＳＳ＋１ｎＭ ＤＨＴ培地における５日の処理時間の後で、ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ９６（登録商標）AQueous One 又はＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登録商標）Solution Cell Proliferation キット（プロメガ）を製造業者の説明書に従って使用して、この癌細胞の増殖能を測定した。結果を、未処理細胞に対する増殖の阻害パーセントとして表１０２と表１０３に提示する。ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５６９２３６、及びＭＤＶ−３１００での細胞の処理は、対照に比較して、この細胞の増殖を用量依存的なやり方で低下させた。ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地におけるＩＳＩＳオリゴヌクレオチドでの処理は、ＭＶＤ−３１００での処理より大きな程度で増殖能を低下させた。ＤＨＴ無しのＣＳＳ培地で培養した細胞の増殖能は、未処理対照レベルの１２％である。
表１０２
完全培地で培養したＣ４−２Ｂ細胞における増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
表１０３
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養したＣ４−２Ｂ細胞における増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
実施例３１：完全培地とＣＳＳ培地で培養したＶＣａＰ細胞におけるＡＲ ｍＲＮＡのアンチセンス阻害
完全培地、並びにＤＨＴ入りのＣＳＳ培地で培養したＶＣａＰ前立腺癌細胞（Korenchu
k, S. et al., In Vivo. 2001. 15: 163-168）におけるＡＲのアンチセンス阻害の効果について検討した。ＶＣａＰ細胞は、全長ＡＲだけでなく、Ｖ７変異体も発現する。
完全培地における遺伝子発現
細胞を１０，０００個の細胞／ウェルで蒔いた。RNAiMax トランスフェクション試薬を使用して、ＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６を１．３４ｎＭ、４ｎＭ、１３．４ｎＭ、又は４０ｎＭで個別に加えた。ＩＳＩＳ ５４９１４８を陰性対照として含めた。４８時間のインキュベーション時間の後で、全長ＡＲ、Ｖ７変異体、ＰＳＡ、及びＴＭＰＲＳＳ２のＲＮＡレベルを測定した。このデータを表１０４〜表１０７に提示する。
全長ＡＲとＶ７変異体のタンパク質分析も、ハウスキーピング遺伝子、ＧＡＰＤＨのレベルへ正規化すると、両者の用量依存的な発現の減少を示した。
表１０４
完全培地で培養したＶＣａＰ細胞における全長ＡＲの阻害パーセント
Figure 0006599497
表１０５
完全培地で培養したＶＣａＰ細胞におけるＡＲ Ｖ７変異体の阻害パーセント
Figure 0006599497
表１０６
完全培地で培養したＶＣａＰ細胞におけるＰＳＡ発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
表１０７
完全培地で培養したＶＣａＰ細胞におけるＴＭＰＲＳＳ２発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
別々の細胞セットを０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭのＭＤＶ−３１００で処理した。４８時間のインキュベーション時間の後で、全長ＡＲ、Ｖ７変異体、ＰＳＡ、及びＴＭＰＲＳＳ２のＲＮＡレベルを測定した。このデータを、未処理対照と比較した遺伝子レベルの発現パーセントとして表して、表１０８に提示する。
表１０８
ＭＤＶ−３１００で処理して完全培地で培養したＶＣａＰ細胞における遺伝子発現のパーセント
Figure 0006599497
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地における遺伝子発現
細胞を１５，０００個の細胞／ウェルで蒔いて、ＣＳＳ培地において１６時間培養した。次いで、RNAiMax 試薬をそれぞれの細胞セットへ１．３４ｎＭ、４ｎＭ、１３．４ｎＭ、又は４０ｎＭのＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６とともに使用して、細胞をトランスフェクトした。ＩＳＩＳ ５４９１４８を陰性対照として含めた。４時間後、１ｎＭ ＤＨＴを加えた。別々の細胞セットにＭＤＶ３１００を０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭの用量で加えた。４８時間のインキュベーション時間の後で、ＡＲ、ＰＳＡ、及びＴＭＰＲＳＳ２のＲＮＡレベルを測定した。このデータを、表１０９〜表１１３に提示する。ＤＨＴの非存在下で、未処理対照と比較して、ＶＣａＰ細胞におけるＡＲ発現は５５５％、Ｖ７変異体発現は６５６％、ＰＳＡ発現は１１％、そしてＴＭＰＲＳＳ２発現は２２％であった。
表１０９
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養したＶＣａＰ細胞における全長ＡＲの阻害パーセント
Figure 0006599497
表１１０
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養したＶＣａＰ細胞におけるＡＲ Ｖ７変異体の阻害パーセント
Figure 0006599497
表１１１
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養したＶＣａＰ細胞におけるＰＳＡ発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
表１１２
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養したＶＣａＰ細胞におけるＴＭＰＲＳＳ２発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
表１１３
ＭＤＶ−３１００で処理してＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養したＶＣａＰ細胞における遺伝子発現のパーセント
Figure 0006599497
増殖に対する効果
完全培地又はＣＳＳ＋１ｎＭ ＤＨＴ培地における５日の処理時間の後で、ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ９６（登録商標）AQueous One 又はＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登録商標）So
lution Cell Proliferation キット（プロメガ）を製造業者の説明書に従って使用して、この癌細胞の増殖能を測定した。結果を、未処理細胞に対する増殖の阻害パーセントとして表１１４〜表１１６に提示する。ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５６９２３６、及びＭＤＶ−３１００での細胞の処理は、対照に比較して、この細胞の増殖を用量依存的なやり方で低下させた。ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地におけるＩＳＩＳオリゴヌクレオチドでの処理は、ＭＶＤ−３１００での処理より大きな程度で増殖能を低下させた。ＤＨＴ無しのＣＳＳ培地で培養した細胞の増殖能は、未処理対照レベルの１２％である。
表１１４
完全培地で培養したＶＣａＰ細胞における増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
表１１５
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養したＶＣａＰ細胞における増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
表１１６
ＭＤＶ−３１００で処理したＶＣａＰ細胞における増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
アポトーシスに対する効果
完全培地での７２時間の処理時間の後で、カスパーゼ−Ｇｌｏ３／７アッセイ（プロメガ）で、癌細胞のアポトーシスを測定した。結果を、未処理細胞に対する細胞のアポトーシスパーセントとして表１１７と表１１８に提示する。ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５６９２３６、及びＭＤＶ−３１００での細胞の処理は、対照と比較して、この細胞のアポトーシスを用量依存的に増加させた。
切断されたＰＡＲＰレベルのタンパク質ウェスタンブロット分析によってもアポトーシスを測定すると、ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５６９２３６、及びＭＤＶ−３１００で処理した細胞において用量依存的なやり方で増加していることが示された。
表１１７
完全培地で培養したＶＣａＰ細胞におけるアポトーシス（％未処理対照）
Figure 0006599497
表１１８
ＭＤＶ−３１００で処理したＶＣａＰ細胞におけるアポトーシス（％未処理対照）
Figure 0006599497
実施例３２：完全培地とＣＳＳ培地で培養した２２ＲＶ１細胞におけるＡＲ ｍＲＮＡのアンチセンス阻害
完全培地、並びにＤＨＴ入りのＣＳＳ培地で培養した２２ＲＶ１細胞におけるＡＲのアンチセンス阻害の効果について検討した。
完全培地における遺伝子発現
細胞を１，０００個の細胞／ウェルで蒔いた。RNAiMax トランスフェクション試薬を使用して、ＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６を１．３４ｎＭ、４ｎＭ、１３．４ｎＭ、又は４０ｎＭで個別に加えた。ＩＳＩＳ ５４９１４８を陰性対照として含めた。４８時間のインキュベーション時間の後で、全長ＡＲ、Ｖ７変異体、ＰＳＡ、及びＴＭＰＲＳＳ２のＲＮＡレベルを測定した。このデータを、表１１９〜表１２２に提示する。全長ＡＲとＶ７変異体のタンパク質分析も、ハウスキーピング遺伝子、ＧＡＰＤＨのレベルと比較して、用量依存的な発現の減少を示した。
表１１９
完全培地で培養した２２ＲＶ１細胞における全長ＡＲの阻害パーセント
Figure 0006599497
表１２０
完全培地で培養した２２ＲＶ１細胞におけるＡＲ Ｖ７変異体の阻害パーセント
Figure 0006599497
表１２１
完全培地で培養した２２ＲＶ１細胞におけるＰＳＡ発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
表１２２
完全培地で培養した２２ＲＶ１細胞におけるＴＭＰＲＳＳ２発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
別々の細胞セットを０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭのＭＤＶ−３１００で処理した。４８時間のインキュベーション時間の後で、全長ＡＲ、Ｖ７変異体、ＰＳＡ、及びＴＭＰＲＳＳ２のＲＮＡレベルを測定した。このデータを、未処理対照に比較した遺伝子レベルの発現パーセントとして表して、表１２３に提示する。
表１２３
ＭＤＶ−３１００で処理して完全培地で培養した２２ＲＶ１細胞における遺伝子発現のパーセント
Figure 0006599497
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地における遺伝子発現
細胞を２，０００個の細胞／ウェルで蒔いて、ＣＳＳ培地において１６時間培養した。次いで、RNAiMax 試薬をそれぞれの細胞セットへ１．３４ｎＭ、４ｎＭ、又は１３．４ｎＭのＩＳＩＳ ５６０１３１又はＩＳＩＳ ５６９２３６とともに使用して、細胞をトランスフェクトした。ＩＳＩＳ ５４９１４８を陰性対照として含めた。４時間後、１ｎＭ ＤＨＴを加えた。別々の細胞セットにＭＤＶ３１００を０．０４μＭ、０．２μＭ、１．０μＭ、又は５．０μＭの用量で加えた。４８時間のインキュベーション時間の後で、ＡＲ、ＡＲ Ｖ７変異体、ＰＳＡ、及びＴＭＰＲＳＳ２のＲＮＡレベルを測定した。このデータを表１２４〜表１２８に提示する。ＤＨＴの非存在下で、未処理対照と比較して、２２ＲＶ１細胞におけるＡＲ発現は５５５％、Ｖ７変異体発現は６５６％、ＰＳＡ発現は１１％、そしてＴＭＰＲＳＳ２発現は２２％であった。
ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドでの処理は、全長ＡＲとＶ７変異体、並びに下流遺伝子の発現の有意な阻害をもたらした。ＩＳＩＳオリゴヌクレオチドでの処理は、ＭＶＤ−３１００での処理より大きな程度で、遺伝子発現の阻害をもたらした。
表１２４
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養した２２ＲＶ１細胞における全長ＡＲの阻害パーセント
Figure 0006599497
表１２５
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養した２２ＲＶ１細胞におけるＡＲ Ｖ７変異体の阻害パーセント
Figure 0006599497
表１２６
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養した２２ＲＶ１細胞におけるＰＳＡ発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
表１２７
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養した２２ＲＶ１細胞におけるＴＭＰＲＳＳ２発現の阻害パーセント
Figure 0006599497
表１２８
ＭＤＶ−３１００で処理してＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養した２２ＲＶ１細胞における遺伝子発現のパーセント
Figure 0006599497
増殖に対する効果
完全培地における５日の処理時間の後で、ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ９６（登録商標）AQueous One 又はＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登録商標）Solution Cell Proliferation キット（プロメガ）を製造業者の説明書に従って使用して、この癌細胞の増殖能を測定した。結果を、未処理細胞に対する増殖の阻害パーセントとして表１２９と表１３０に提示する。ＩＳＩＳ ５６０１３１、ＩＳＩＳ ５６９２３６、及びＭＤＶ−３１００での細胞の処理は、対照に比較して、この細胞の増殖を用量依存的なやり方で低下させた。ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地におけるＩＳＩＳオリゴヌクレオチドでの処理は、ＭＶＤ−３１００での処理より大きな程度で増殖能を低下させた。ＤＨＴ無しのＣＳＳ培地で培養した細胞の増殖能は、未処理対照レベルの１２％である。
表１２９
完全培地で培養した２２ＲＶ１細胞における増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
表１３０
ＭＤＶ−３１００で処理した２２ＲＶ１細胞における増殖（％未処理対照）
Figure 0006599497
アポトーシスに対する効果
完全培地又はＣＳＳ＋ＤＨＴ培地での７２時間の処理時間の後で、カスパーゼ−ｇｌｏ３／７アッセイキット（プロメガ）で、この癌細胞のアポトーシスを測定した。結果を、未処理細胞に対する細胞のアポトーシスパーセントとして表１３１と表１３２に提示する。ＩＳＩＳ ５６０１３１とＩＳＩＳ ５６９２３６での細胞の処理は、対照と比較して、この細胞のアポトーシスを用量依存的に増加させた。
表１３１
完全培地で培養した２２ＲＶ１細胞におけるアポトーシス（％未処理対照）
Figure 0006599497
表１３２
ＣＳＳ＋ＤＨＴ培地で培養した２２ＲＶ１細胞におけるアポトーシス（％未処理対照）
Figure 0006599497
実施例３３：ヒトアンドロゲン受容体に標的指向するＩＳＩＳアンチセンスオリゴヌクレオチドのカニクイザルにおける効果
上記に記載した試験より選択されるＩＳＩＳアンチセンスオリゴヌクレオチドでカニクイザルを処理した。アンチセンスオリゴヌクレオチドの効力と忍容性について評価した。試験したヒトのアンチセンスオリゴヌクレオチドは、アカゲザルゲノム配列（ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＮＷ＿００１２１８１３１．１、ヌクレオチド１３４００１〜３０８０００より先端切断されたもので、本明細書では配列番号１８９と呼称される）と交差反応する。それぞれのオリゴヌクレオチドの配列番号１８９に対する標的開始部位と標的領域、並びにそれらの化学と配列の詳細を表１３３に提示する。
表１３３
配列番号１８９に相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチド
Figure 0006599497
処理
試験に先立って、このサルを隔離状態に３０日間保って、この間にその動物の健康状態を毎日観察した。このサルは、２〜４年齢で、２〜４ｋｇの体重であった。４匹の無作為に割り付けた雄性カニクイザルの１３群へＩＳＩＳオリゴヌクレオチド又はＰＢＳを皮下注射した。ＰＢＳ溶液又はＩＳＩＳオリゴヌクレオチド（４０ｍｇ／ｋｇの用量）を、試験の第一週に４回（１、３、５、及び７日目）の投薬からなるローディング処方に続く、１４日目に開始する週１回投与（２〜６週）からなる維持処方で投与した。皮下注射は、背中の４部位に時計回りの回転で実施し、１回の投薬につき１部位とした。注射部位は、ケタミンを使用して鎮静化しながら、入れ墨で輪郭を描いて、少なくとも３ｃｍは離した。
試験期間の間、このサルについて、病気や不安の徴候を少なくとも１日１回観察した。本実施例に記載したプロトコールは、動物実験委員会（Institutional Animal Care and Use Committee：ＩＡＣＵＣ）によって承認された。
標的低下
ＲＮＡ分析
プライマープローブセット、ＲＴＳ３５５９を使用するＡＲのリアルタイムＰＣＲ分析のために、肝臓、心臓、骨格筋、腎臓、及び前立腺の組織よりＲＮＡを抽出した。この結果は、ＲＩＢＯＧＲＥＥＮ（登録商標）へ正規化した。結果を、ＰＢＳ対照に対するＡＲ
ｍＲＮＡの阻害パーセントとして提示する。表１３４に示すように、ＩＳＩＳアンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、ＰＢＳ対照に比べて、ＡＲ ｍＲＮＡの有意な低下をもたらした。「ｎ／ａ」は、その臓器においてｍＲＮＡレベルを測定しなかったことを示す。
表１３４
ＰＢＳ対照に対する、カニクイザルにおけるＡＲ ｍＲＮＡの阻害パーセント
Figure 0006599497
タンパク質分析
ＥＬＩＳＡキット（Enzo Life Sciences）を製造業者の説明書に従って用いて、血漿中の血清テストステロンタンパク質レベルを測定した。この結果を、ｎｇ／ｍＬで表して、表１３５に提示する。この結果は、このＩＳＩＳオリゴヌクレオチドのいくつかがテストステロンタンパク質レベルを低下させたことを示す。
表１３５
カニクイザルにおけるテストステロンタンパク質レベル
Figure 0006599497
忍容性試験
体重及び臓器重量の測定
動物の健康全般に対するＩＳＩＳオリゴヌクレオチドの効果について評価するために、
体重と臓器重量を測定した。４２日目に体重を測定して、表１３６に提示する。安楽死の時点で臓器重量を測定して、このデータも表１３６に提示する。明確にも、ＩＳＩＳ ５６０１３１での処理は、このサルの体重及び臓器重量の観点からは、十分に忍容された。
表１３６
カニクイザルにおける最終の体重及び臓器重量
Figure 0006599497
肝機能
肝機能に対するＩＳＩＳオリゴヌクレオチドの効果について評価するために、このサルを一晩絶食させた。４４日目にすべての試験群よりほぼ１．５ｍＬの血液試料を採取した。血清分離のために、抗凝固剤無しの試験管に血液を採取した。この試験管を室温に少なくとも９０分間保ってから、３，０００ｒｐｍで１０分間遠心分離した。東芝 120FR NEO 化学分析機（東芝株式会社、日本）を使用して、様々な肝機能マーカーのレベルを測定した。この結果を表１３７に提示する。明確にも、ＩＳＩＳ ５６０１３１での処理は、肝機能マーカーの観点からは、十分に忍容された。
表１３７
カニクイザル血漿中の肝機能マーカー
Figure 0006599497
血液学
血液学的パラメータに対するカニクイザル中のＩＳＩＳオリゴヌクレオチドの効果について評価するために、４４日目に利用可能な試験動物のそれぞれより、Ｋ２−ＥＤＴＡを含有する試験管に、ほぼ０．５ｍＬの血液の血液試料を採取した。ADVIA2120i 血液分析計（ジーメンス、アメリカ）を使用して、試料について、赤血球（ＲＢＣ）数、白血球（ＷＢＣ）数、血小板数、ヘモグロビン含量、及びヘマトクリットを分析した。このデータを表１３８に提示する。
このデータは、ほとんどのオリゴヌクレオチドでの処理が、この用量でのアンチセンスオリゴヌクレオチドについて予測される範囲を超えた血液学的パラメータの変化を引き起こさなかったことを示す。明確にも、ＩＳＩＳ ５６０１３１での処理は、このサルの血液学の観点からは、十分に忍容された。
表１３８
カニクイザルにおける血液学的変数
Figure 0006599497
腎機能
腎機能に対するＩＳＩＳオリゴヌクレオチドの効果について評価するために、このサルを一晩絶食させた。４４日目にすべての試験群よりほぼ１．５ｍＬの血液試料を採取した。血清分離のために、抗凝固剤無しの試験管に血液を採取した。この試験管を室温に少なくとも９０分間保ってから、３，０００ｒｐｍで１０分間遠心分離した。東芝 120FR NEO 化学分析機（東芝株式会社、日本）を使用して、ＢＵＮとクレアチニンのレベルを測定した。この結果をｍｇ／ｄＬで表して、表１３９に提示する。この血漿化学データは、ほとんどのＩＳＩＳオリゴヌクレオチドが、アンチセンスオリゴヌクレオチドについて予測される範囲を超えた腎機能に対する効果を及ぼさなかったことを示す。明確にも、ＩＳＩＳ ５６０１３１での処理は、このサルの腎機能の観点からは、十分に忍容された。
尿分析によっても腎機能を評価した。４４日目に、清潔なケージパンを湿った氷上で使用して、すべての動物より新鮮な尿を採取した。新鮮尿採取の前日は食餌を一晩断ったが、水は供給した。東芝 120FR NEO 自動化学分析機（東芝株式会社、日本）を使用して、全タンパク質レベルとクレアチニンレベルを測定して、タンパク質対クレアチニン比を計算した。この結果を表１４０に提示する。
表１３９
カニクイザルにおける血漿ＢＵＮレベルとクレアチニンレベル（ｍｇ／ｄＬ）
Figure 0006599497
表１４０
カニクイザルにおける尿タンパク質／クレアチニン比
Figure 0006599497
Ｃ反応性タンパク質レベル分析
カニクイザルにおけるＩＳＩＳオリゴヌクレオチドの炎症効果について評価するために、このサルを一晩絶食させた。４４日目にすべての試験群よりほぼ１．５ｍＬの血液試料を採取した。血清分離のために、抗凝固剤無しの試験管に血液を採取した。この試験管を室温に少なくとも９０分間保ってから、３，０００ｒｐｍで１０分間遠心分離した。４３日目に、東芝 120FR NEO 化学分析機（東芝株式会社、日本）を使用して、肝臓中で合成されて炎症のマーカーとして役立つＣ反応性タンパク質（ＣＲＰ）を測定した。同様に、補体Ｃ３も測定して、このデータをベースライン値の百分率として提示する。この結果は表１４１に提示されて、ほとんどのＩＳＩＳオリゴヌクレオチドでの処理が、サルに炎症を引き起こさなかったことを示す。
表１４１
カニクイザル血漿におけるＣ反応性タンパク質レベルとＣ３レベル
Figure 0006599497
薬物動態試験
選択処理群の腎臓及び肝臓中の全長オリゴヌクレオチドの濃度を測定した。使用した方法は、フェノール−クロロホルム（液体−液体）抽出に続く固相抽出からなる、すでに公表された方法（Leeds et al., 1996; Geary et al., 1999）の修飾法である。抽出に先立って、内部標準（ＩＳＩＳ３５５８６８，２７マーの２’−Ｏ−メトキシエチル修飾ホスホロチオエートオリゴヌクレオチド、ＧＣＧＴＴＴＧＣＴＣＴＴＣＴＴＣＴＴＧＣＧＴＴＴＴＴＴ、本明細書では配列番号１９０と呼称される）を加えた。定量下限濃度（ＬＬＯＱ）がほぼ１．１４μｇ／ｇである検量線を使用して、組織試料濃度を計算した。
この結果を、μｇ／ｇ（組織）として表して、表１４２に提示する。腎臓対肝臓比も計算して、表１４２に提示する。
表１４２
カニクイザル中のオリゴヌクレオチド濃度
Figure 0006599497
実施例３４：アンドロゲン受容体依存性乳癌同所性移植モデルに対するアンドロゲン受容体（ＡＲ）のアンチセンス阻害の効果
ＭＤＡ−ＭＢ−４５３細胞は、エストロゲン受容体とプロゲステロン受容体の非存在下でＡＲを発現する（Hall, R. E. et al., Eur. J. Cancer 1994. 30: 484-490）。ＭＤＡ−ＭＢ−４５３担腫瘍マウスにおいて、ＡＲ ｍＲＮＡ発現のアンチセンスオリゴヌクレオチドでの阻害の効果について検証した。
試験１
本アッセイにおいて試験されるアンチセンスオリゴヌクレオチドであるＩＳＩＳ ５６９２１６（ＴＧＡＴＴＴＡＡＴＧＧＴＴＧＣＡ；配列番号３９）は、デオキシ、ＭＯＥ、及び（Ｓ）ｃＥｔオリゴヌクレオチドとして設計されて、１６個のヌクレオシドの長さである。このオリゴヌクレオチドの化学は、５’−Ｔｅ Ｇｋ Ａｋ Ｔｋ Ｔｄ Ｔｄ Ａｄ Ａｄ Ｔｄ Ｇｄ Ｇｄ Ｔｄ Ｔｋ Ｇｋ Ｃｋ Ａである（ここで、「ｅ」は、２’−Ｏ−メトキシエチルリボースを意味し；「ｋ」は、（Ｓ）−ｃＥｔを意味し；「ｄ」は、２’−デオキシリボースを意味する）。このオリゴヌクレオチド全体のヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）連結である。このオリゴヌクレオチド全体のシトシン残基は、いずれも５−メチルシトシンである。ＩＳＩＳ ５６９２１６は、ヒトＡＲゲノム配列（ＧＥＮＢＡＮＫアセッション番号ＮＴ＿０１１６６９．１７、ヌクレオシド５０７９０００〜５２７００００より先端切断されたもの、配列番号１）上に２つの標的開始部位（５８７２０と５８７５０）を有する。
処理
ＭＤＡ−ＭＢ−４５３乳癌細胞（５ｘ１０６個）を５０％マトリゲル（Matrigel）と混合して、１０匹の雌性ＮＳＧマウスの乳房脂肪体へ注射した。同時に、ジヒドロテストステロン（ＤＨＴ）ペレット［主要な循環アンドロゲンであるテストステロンの活性型］を皮下移植した。腫瘍が１００ｍｍ３のサイズに達したらすぐに、このマウスを２つの処理群へ無作為に分けた。第一処理群には、ＩＳＩＳ ５６９２１６を５０ｍｇ／ｋｇの用量で週５回、４週間の皮下注射によって投与して注射した。第二処理群には、担体だけを週５回、４週間の皮下注射によって投与して注射して、対照群として役立てた。腫瘍成長を週１回モニターして、マウスを処理後３２日目に犠牲にした。腫瘍組織とＴＢ−インターフェイス用試料を採取して、さらなる分析のために処理した。
ＲＮＡ分析
腫瘍を切り出して、その組織をＲＮＡ抽出とｑＰＣＲ分析のために処理した。ＡＲ ｍＲＮＡ発現についてＴＢ−インターフェイスで評価して、アクチンｍＲＮＡ発現に対して正規化した。ＩＳＩＳ ５６９２１６で処理したマウス中のＡＲ ｍＲＮＡ発現は、対照群に比較して４８％阻害された。
腫瘍体積の測定
ノギスを使用して、試験期間を通して定期的に腫瘍体積を測定した。表１４３に示すように、ＩＳＩＳ ５６９２１６で処理したマウスでは、対照群に比較して、腫瘍体積が有意に減少した。
表１４３
ＭＤＡ＿ＭＢ−４５３癌同所性移植モデルにおける、異なる日数での腫瘍体積
Figure 0006599497
試験２
処理
ＡＴＣＣより入手したＭＤＡ−ＭＢ−４５３細胞を、１０％ ＦＢＳを含むレイボビッツ（Leibovitz's）Ｌ−１５培地に維持した。雌性ＮＳＧマウス（Jackson Laboratories
）の乳房脂肪体に増殖因子低減マトリゲル（１：１）中５ｘ１０６個の腫瘍細胞を移植した。このマウスの肩甲骨の間に、ＤＨＴペレットも同時に移植した。
次いで、２０日後、このマウスを処理群へ無作為に分けた。数群のマウスに５０ｍｇ／ｋｇのＩＳＩＳ ５６９２３６又はＩＳＩＳ ５６０１３１を週５日で２週間、皮下投与した。同様に、１群のマウスを対照オリゴヌクレオチド、ＩＳＩＳ ５４９１４８（配列：ＧＧＣＴＡＣＴＡＣＧＣＣＧＴＣＡを有する３−１０−３（Ｓ）−ｃＥｔギャップマー、本明細書では配列番号１９３と呼称される、既知のヒト配列を含まない）で処理した。別のマウスの対照群をＰＢＳで同様に処理した。
腫瘍成長の測定
ノギスを使用して、試験期間を通して定期的に腫瘍体積を測定した。表１４４に示すように、ＡＲに標的指向するアンチセンスオリゴヌクレオチドで処理したマウスでは、対照群に比較して、腫瘍体積が減少した。
表１４４
ＭＤＡ−ＭＢ−４５３モデルにおける腫瘍体積
Figure 0006599497
ＲＮＡ分析
Qiagen 社のＲＮＡ抽出キットを使用して、ＲＮＡ抽出を実施した。プライマープローブセットＬＴＳ００９４３を使用してＡＲ ＲＮＡ発現を測定して、ヒトのアクチンｍＲＮＡ発現に対して正規化した。
腫瘍組織において、ヒトＡＲ ＲＮＡの発現について評価した。対照群と比較して、ＩＳＩＳ ５６０１３１で処理したマウスにおけるＡＲ ＲＮＡ発現は、３５％阻害されて、ＩＳＩＳ ５６９２３６で処理したマウスにおけるＡＲ発現は、１９％阻害された。

Claims (11)

  1. 配列番号３５のヌクレオ塩基配列からなるヌクレオ塩基配列を有する、１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
    ９個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
    ３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
    ４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメント
    を有し、
    ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；５’ウィングセグメントの３個の連結ヌクレオシドは、それぞれ拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み；３’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び２’−Ｏ−メトキシエチル糖を含み；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである、化合物。
  2. 配列番号３９のヌクレオ塩基配列からなるヌクレオ塩基配列を有する、１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
    ７個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
    ４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
    ５個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメント
    を有し、
    ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置していて；５’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み；３’ウィングセグメントの５個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、及び２’−Ｏ−メトキシエチル糖を含み；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである、化合物。
  3. 配列番号３９のヌクレオ塩基配列からなるヌクレオ塩基配列を有する、１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
    ９個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
    ３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
    ４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメント
    を有し；
    ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に
    位置し；５’ウィングセグメントの３個の連結ヌクレオシドは、それぞれ拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み；３’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び２’−Ｏ−メトキシエチル糖を含み；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである、化合物。
  4. 配列番号３９のヌクレオ塩基配列からなるヌクレオ塩基配列を有する、１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
    ８個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
    ４個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
    ４個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを有し；
    ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置し；５’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み；３’ウィングセグメントの４個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び２’−Ｏ−メトキシエチル糖を含み；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである、化合物。
  5. 配列番号３９のヌクレオ塩基配列からなるヌクレオ塩基配列を有する、１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
    ８個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
    ５個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
    ３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメント
    を有し；
    ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に
    位置し；５’ウィングセグメントの５個の連結ヌクレオシドは、５’→３’方向において、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、２’−Ｏ−メトキシエチル糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、拘束エチル（ｃＥｔ）糖、及び拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み；３’ウィングセグメントの３個の連結ヌクレオシドは、それぞれ拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み；それぞれのヌクレオシド間連結は、ホスホロチオエート連結であり；そしてそれぞれのシトシンは、５−メチルシトシンである、化合物。
  6. 配列番号４３のヌクレオ塩基配列からなるヌクレオ塩基配列を有する、１６個の連結ヌクレオシドからなる一本鎖修飾オリゴヌクレオチドを含んでなる化合物であって、ここで修飾オリゴヌクレオチドは：
    １０個の連結デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
    ３個の連結ヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
    ３個の連結ヌクレオシドからなる３’ウィングセグメント
    を有し、
    ここでギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置し；それぞれのウィングセグメントの各ヌクレオシドは拘束エチル（ｃＥｔ）糖を含み；修飾オリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり；そして、修飾オリゴヌクレオチドのそれぞれのシトシンは５−メチルシトシンである、化合物。
  7. 化合物が修飾オリゴヌクレオチドからなる、請求項１〜６のいずれか１項の化合物。
  8. 請求項１〜７のいずれか１項の化合物、又はその医薬的に許容される塩を含んでなる組成物。
  9. 請求項１〜７のいずれか１項の化合物、又は請求項８の組成物と、ＭＤＶ３１００、ＡＲＮ−０５９、ＯＤＭ−２０１、アビラテロン、ＴＯＫ００１、ＴＡＫ７００、及びＶＴ４６４より選択される抗アンドロゲン剤とを組み合わせてなる医薬。
  10. 請求項１〜７のいずれか１項の化合物、請求項８の組成物、又は請求項９の組み合わせ医薬を含む癌の治療剤。
  11. 癌が、前立腺癌、又は去勢抵抗性前立腺癌である、請求項１０の治療剤。
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