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WO2006038695A1 - 塩基性物質の製造法 - Google Patents

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WO2006038695A1
WO2006038695A1 PCT/JP2005/018657 JP2005018657W WO2006038695A1 WO 2006038695 A1 WO2006038695 A1 WO 2006038695A1 JP 2005018657 W JP2005018657 W JP 2005018657W WO 2006038695 A1 WO2006038695 A1 WO 2006038695A1
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WO
WIPO (PCT)
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medium
ions
basic substance
concentration
ion
Prior art date
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PCT/JP2005/018657
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English (en)
French (fr)
Inventor
Ryo Takeshita
Shinichi Sugimoto
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Ajinomoto Co Inc
Original Assignee
Ajinomoto Co Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
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Priority to JP2006539347A priority patent/JP4844396B2/ja
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Priority to ES05790247T priority patent/ES2718638T3/es
Priority to EP05790247.0A priority patent/EP1813677B1/en
Priority to EP14182095.1A priority patent/EP2818556B1/en
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Priority to PL05790247T priority patent/PL1813677T3/pl
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    • C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
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    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
    • C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
    • C12P13/24—Proline; Hydroxyproline; Histidine

Definitions

  • the present invention relates to the microbial industry, and specifically relates to a method for producing a basic substance by fermentation.
  • Basic substances that can be produced by fermentation such as L-lysine, are useful as animal feed additives, and L-arginine and L-histidine are useful as pharmaceutical products such as infusions.
  • a microorganism capable of producing a basic substance is cultured, a basic substance is produced and accumulated in the culture solution, and a basic amino acid is collected from the culture solution.
  • the culture method is performed in a batch system, a fed-batch system, or a continuous system.
  • the collection of basic substances of culture fluid power is often performed by ion exchange when purification is required.
  • the fermented liquor is adjusted to weak acidity, L-lysine is adsorbed on the ion-exchange resin, then desorbed from the coconut resin with ammonia ions, and used as it is as a lysine base, or hydrochloric acid. Is used to crystallize as L-lysine hydrochloride.
  • L-lysine hydrochloride can be obtained directly by concentrating the culture solution. Since ions corrode metal fermenters and the like, it is preferable that they be present in a high concentration in the culture medium.
  • the fermented liquid is concentrated as it is, or the fermented liquid is spray-granulated after adjusting the fermented liquid to be weakly acidic with hydrochloric acid or sulfuric acid.
  • the strength added during cultivation also becomes a residual component, and the content of basic substances in the obtained fermentation product is reduced. Reduce.
  • the present invention relates to the growth of microorganisms in fermentation production of basic substances using carbonate ions or bicarbonate ions as counteranions of basic substances using microorganisms capable of producing the target basic substances. It is an object of the present invention to provide a method capable of avoiding a decrease in speed and production capacity of a target substance, and achieving both reduction of sulfate ions and efficient production of the target substance.
  • the inventor of the present invention lies in ammonia added to the culture medium as a nitrogen source for the production or growth of basic substances or as a counter ion source for basic substances, and the total ammonia concentration is appropriately set. It has been found that fermenting while adjusting the concentration range can significantly reduce the growth rate of microorganisms and the ability to produce target substances under high pH conditions.
  • the present invention has been completed based on the above findings.
  • the present invention is as follows.
  • a method for producing a basic substance by a fermentation method a microorganism having the ability to produce a basic substance is cultured in a fermenter containing a liquid medium, and the basic substance is produced and accumulated in the medium.
  • sulfate ions used as the counter ions of the basic substance, and Z or salt A method characterized by reducing the amount of ions used.
  • Ammonium ion concentration in the medium is the total power of bicarbonate ions and Z or carbonate ions dissolved in the medium, and other ion equivalents.
  • the basic substance accumulated in the medium A concentration that is greater than the ion equivalent of the ionized one, and
  • the microorganisms are cultured while changing the pH of the medium and the total ammonia concentration, and the productivity of the basic substance is measured, and the productivity of the basic substance is more than 50% productivity under the optimum conditions. Determine the total ammonia concentration at the pH.
  • the predetermined range of the total ammonia concentration is determined in advance by the following method (1):
  • ⁇ ' As a counter ion source of the target basic substance, a medium containing a sufficient amount of sulfate ion and ⁇ or chloride ion for culturing at ⁇ 7.2 or less, ammonia gas, ammonia water and urea By adding at least one of the above, the culture medium is maintained in the range of ⁇ 6.5 to ⁇ 7.2, and the productivity of the basic substance is measured.
  • ( ⁇ ') Cultivation is performed using a medium in which sulfate ions and ⁇ or chloride ions are reduced by a desired amount from the medium components used in the above step 1 ( ⁇ '). Culturing by changing the total ammonia concentration during a period when it is impossible to keep the ⁇ of the medium at 7.2 or less due to lack of counter ions such as sulfate ions and ⁇ or salt ions, Total ammonia yielding more than 50% productivity measured in ( ⁇ ') Determine the concentration range.
  • the counter ion is insufficient with respect to the accumulation of the target basic substance, so that the pH of the medium increases, and the pH increases by adding a cation to the medium.
  • Adjustment of the total ammonia concentration in the medium is based on the dissolved oxygen concentration in the medium, the consumption rate of the carbon source in the medium, the turbidity of the medium, the productivity of the basic substance, and the pH change of the medium.
  • the method according to (1) which is performed by adding ammonia or urea to the culture medium when the activity of the microorganism is reduced or stopped.
  • a microorganism having the ability to produce a basic substance is cultured in a fermenter containing a liquid medium, and the basic substance is produced and accumulated in the same medium.
  • the method of the present invention by adjusting the total ammonia concentration in the medium to a certain concentration range during at least a part of the whole culture step, sulfate ions used as counter ions of the basic substance, and Z Or, it is characterized by reducing the amount of chloride ions used.
  • the present invention secures a total amount of ammonia necessary for the growth of microorganisms or the production of target substances as a nitrogen source, while maintaining a concentration such that the total ammonia concentration does not inhibit the growth of microorganisms or the production of target substances. In this way, a basic substance is produced in a medium in which sulfate ions and salt ions are reduced.
  • the predetermined range of the total ammonia concentration includes a range that satisfies the following conditions.
  • Ammonium ion concentration in the medium is the total power of bicarbonate ions and Z or carbonate ions dissolved in the medium, and other ion equivalents. Of the basic substances accumulated in the medium, The concentration should be greater than the ionic equivalent of the habit, and
  • the total ammonia concentration in the medium is a concentration determined in advance by the following method, which does not inhibit the production of the basic substance of the microorganisms:
  • the microorganisms are cultured while changing the pH of the medium and the total ammonia concentration, and the productivity of the basic substance is measured, and the productivity of the basic substance is more than 50% productivity under the optimum conditions. Determine the total ammonia concentration at the pH.
  • the certain range of the total ammonia concentration is determined in advance by the following method:
  • ⁇ ' (Procedure 1: Evaluation of fermentation performance under neutral conditions)
  • At least one of ammonia gas, aqueous ammonia and urea is added. Cultivate and maintain the pH of the medium in the range of pH 6.5 to pH 7.2, and measure the productivity of basic substances.
  • Cultivation is performed using a medium in which sulfate ions and salt or salt ions are reduced by the desired amount from the medium components used in step 1 ( ⁇ '), and accumulating the desired basic substance.
  • culture is performed while changing the total ammonia concentration. Determine the range of total ammonia concentration at which productivity of 50% or more of the productivity measured in ( ⁇ ') is obtained.
  • the total ammonia concentration can be adjusted to a predetermined range without determining a predetermined range of the total ammonia concentration in advance.
  • the total ammonia concentration in the medium is adjusted by adjusting the dissolved oxygen concentration in the medium, the consumption rate of the carbon source in the medium, the turbidity of the medium, the productivity of the basic substance, and the pH change of the medium.
  • the medium is supplemented with ammonia or urea.
  • the sulfate ion and ⁇ or salt A medium with the desired amount of chloride ions reduced is used.
  • the at least part of the period includes a period in which the pH cannot be maintained at 7.2 or less due to a shortage of counter ions with respect to the basic substance accumulated in the medium.
  • Examples of the other ions include salt ions, sulfate ions, phosphate ions, organic acids (acetic acid, lactic acid, succinic acid), and the like.
  • bicarbonate ions and soot or carbonate ions dissolved in the medium act as a counter-on for basic substances.
  • the ion equivalent is a value obtained by multiplying the molar concentration of each ion by the respective valence, and is expressed in units of eq / 1. That is, the monovalent ion ImM is lmeq / 1, and the divalent ion 1 mM is 2 meq / l.
  • the adjustment of the total ammonia concentration includes a total amount of ammonia that is necessary for the growth of microorganisms or the production of basic substances in the medium and that does not inhibit the production of basic substances of the microorganisms. Therefore, it is automatically adjusted to a pH suitable for dissolving bicarbonate ions and z or carbonate ions required as a counter-on of a basic substance.
  • total ammonia means undissociated ammonia (NH 2) and ammonia.
  • It can be dissociated, ammonia, ammonia ions, or both.
  • ammonium sulfate or ammonium chloride is generally added to the medium as a supply source and nitrogen source of a basic material counter-on.
  • ammonia and urea are usually used to adjust the pH of the medium, high concentrations of ammonia and ammonia ions are present in the medium.
  • the nitrogen source corresponding to the amount to be reduced should be reduced. For example, it is necessary to supply as ammonia.
  • Adjustment of the total ammonia concentration in the medium is performed by adding at least one of ammonia gas, an ammonia solution, and urea to the medium so that the total ammonia concentration in the medium becomes an allowable amount.
  • an ammonium salt such as ammonium sulfate or ammonium sulfate may be added as long as the effects of the present invention are not impaired.
  • bicarbonate ions that can be easily removed as a gas after completion of the culture and / or ammonium salts using carbonate ions as counter ions may be used.
  • the total ammonia concentration can be adjusted by measuring the concentration of ammonium ions or ammonia in the medium or exhaust gas and using the measured value as an index.
  • the pH is set in advance so that the total ammonia concentration becomes an allowable value, and the total ammonia concentration is adjusted by adding ammonia so that such a pH is reached. Good. In this case, if necessary, the pH set as described above may be changed during the culture.
  • the adjustment of the total ammonia concentration in the medium is carried out by adjusting the dissolved oxygen concentration in the medium, the consumption rate of the carbon source in the medium, the turbidity of the medium, the productivity of the basic substance, and the pH change of the medium. It can also be carried out by adding ammonia or urea to the culture medium when the activity of the microorganisms with the index is decreased or stopped. That is, when the nitrogen source in the medium is insufficient or withered, the activity of microorganisms such as the growth of microorganisms or the production of target substances is reduced or stopped.
  • Microbial activity usually involves the consumption of dissolved oxygen and carbon sources in the medium, increased medium turbidity, production of the target substance, consumption of ammonia and the release of diacid carbon by breathing and the pH of the medium. Appears as a decline. Therefore, when the activity of microorganisms is reduced or stopped, the dissolved oxygen concentration in the medium increases when the aeration rate per unit time and the stirring speed are constant, and the consumption of ammonia and carbon dioxide gas As the discharge decreases, the pH of the medium increases. Furthermore, the consumption rate of the carbon source, the increase rate of the turbidity of the medium, and the production rate of the target substance are reduced.
  • the nitrogen source is insufficient or depleted.
  • an amount of ammonia or urea necessary for growth of microorganisms or production of the target substance is added to the medium.
  • the total ammonia concentration in the medium is kept within a certain range.
  • urea is added to the medium and cultured, urea is assimilated by microorganisms and ammonia is released into the medium.
  • the pH of the medium gradually increases.
  • the amount of ammonia or urea added the final concentration of total ammonia in the medium can be determined at one time.
  • the dissolved oxygen concentration in a culture medium can be measured with a dissolved oxygen electrode, for example.
  • the bicarbonate ion and Z or carbonate ion dissolved in the medium and the ion equivalent of other anions are higher than the ion equivalent equivalent of the basic substance accumulated in the medium. It can be confirmed by measuring the concentration of ions and other ions and the concentration of the basic substance. In addition, by conducting a preliminary experiment, setting the pH and Z or ammonia addition amount satisfying the above conditions, and culturing at such pH and Z or ammonia addition amount, the above condition is also satisfied. be able to.
  • the culture pH may or may not be constant! /.
  • the pH when controlling the pH of the medium, the pH may be controlled using the pH itself as an index, or not directly, but may be controlled indirectly by controlling the total ammonia concentration. Good.
  • the total ammonia concentration in the medium when using as an index the activity of microorganisms adding ammonia or urea, the total ammonia concentration in the medium is adjusted to an appropriate concentration range and accompanied connection gradually higher P H to the accumulation of the basic substance Will change.
  • the total ammonia concentration when the total ammonia concentration is controlled within a certain range, the pH changes as a result of the change in the accumulation balance of various cations and ions in the medium.
  • “does not inhibit the production of a basic substance” means that the microorganism used in the present invention grows well and a basic substance is produced. If the growth of the microorganism is poor, and even if the microorganism grows well, if the basic substance is not efficiently produced, it can be said that the production of the basic substance is inhibited.
  • the microorganism used in the present invention is changed by changing the pH of the medium and the total ammonia concentration. And measure the productivity of the basic substance accumulated in the medium, and preferably 50% or more of the productivity of the basic substance under the optimum conditions, for example, conventional conditions in neutrality.
  • the total ammonia concentration at which a result of 70% or more, particularly preferably 90% or more, is obtained at each pH is a concentration that “does not inhibit the production of basic substances”.
  • “productivity” refers to yield, production rate, or total production.
  • Yield refers to the amount of basic substance produced relative to an assimitable carbon source in the medium
  • production rate refers to the amount produced per unit time.
  • production amount simply refers to the amount of basic substances accumulated in the medium when the carbon source is completely consumed.
  • the productivity of the basic substance that accumulates in the medium when the microorganism used in the present invention is cultured under the optimum conditions, for example, general conditions in the conventional neutrality is measured. Cultivate the medium and measure the productivity by culturing it using a medium with sulfate ions and Z or salt ions reduced by the desired amount.
  • the target basic substance accumulates, there is a period in which the pH in the medium rises due to a shortage of counter ions such as sulfate ions and Z or chloride ions.
  • the total ammonia concentration during that period is controlled within a certain concentration range and cultured.
  • Cultivation is performed by setting various concentration ranges from ImM to 500 mM as the concentration range to be controlled, and the productivity is preferably 50% or more, more preferably 70% or more, especially compared to the optimal conditions.
  • the concentration range that achieves a result of 90% or higher is defined as “do not inhibit the production of basic substances!”.
  • Examples of the medium used in the above-mentioned “conventional general conditions for neutrality” include a medium containing a sufficient amount of sulfate ions and Z or chloride ions for culturing at pH 7.2 or lower.
  • the desired amount for reducing sulfate ions and Z or salt ions is not particularly limited as long as the desired productivity of the basic substance can be obtained.
  • the concentration of total ammonia that "does not inhibit the production of basic substances” can also be determined, for example, as follows.
  • the microorganism used in the present invention is cultured while changing the pH and total ammonia concentration of the medium, and the amount of the basic substance accumulated in the medium is measured. Compare the amount of basic substance accumulated under each condition with the amount accumulated under optimum conditions. In this way, the total ammonia concentration can be determined without inhibiting the production of basic substances.
  • Optimum conditions are sufficient to cultivate in neutrality, for example, conventional conditions in neutrality.
  • the conditions for culturing using uteron ions are as follows.
  • the concentration of total ammonia that "does not inhibit the production of basic substances" can also be determined, for example, as follows.
  • the productivity of basic substances that accumulate in the medium is measured. Cultivate the medium with the desired amount of sulfate ion and Z or salt ion, and examine the productivity.
  • the target basic substance accumulates, there is a period in which the pH in the medium rises due to a shortage of counter ions such as sulfate ions and / or salt ions.
  • Incubate by controlling the total ammonia concentration during the period to a certain concentration range. Culturing is performed with various concentration ranges from ImM to 500 mM as the concentration range to be controlled, and compared with the conditions under which the productivity is optimal.
  • the productivity is preferably 50% or more, more preferably 70% when producing basic substances under optimum conditions! %, Particularly preferably 90% or more.
  • the total ammonia concentration in the medium is preferably 300 mM or less, more preferably 200 mM, and particularly preferably lOO mM or less.
  • the degree of ammonia dissociation decreases with increasing pH. Undissociated ammonia is more toxic to fungi than ammonia ions. Therefore, the upper limit of the total ammonia concentration also depends on the pH of the culture solution. That is, the higher the pH of the culture solution, the lower the allowable total ammonia concentration. Therefore, the total ammonia concentration, which does not inhibit the production of basic substances, is defined as the range of total ammonia concentration throughout the culture period, which is the highest ammonia concentration range that can be tolerated at pH. Good.
  • the total ammonia concentration as a nitrogen source necessary for the growth of microorganisms and the production of basic substances is not particularly limited as long as the productivity of the target substance by the microorganisms does not decrease due to a shortage of nitrogen sources during culture.
  • the ammonia concentration may be measured over time during the culture, and a small amount of ammonia may be added to the medium when the ammonia in the medium is depleted.
  • the concentration when ammonia is added is not particularly limited.
  • the total ammonia concentration is preferably ImM or more, more preferably 5 m.
  • a concentration of M or more, particularly preferably 10 mM or more is mentioned.
  • the method of the present invention may include a culturing step for mainly growing a microorganism having the ability to produce a basic substance, and a culturing step for causing the microorganism to produce a basic substance.
  • the growth of microorganisms and the production of basic substances may be performed in parallel. Sarako, culture as described above, these are sometimes called main fermentation or main culture, but pre-culture may be performed separately.
  • an operation is performed so that bicarbonate ions and Z or carbonate ions are dissolved in the medium. Also good.
  • Such operations include supplying a culture medium, carbon dioxide gas or a mixed gas containing carbon dioxide gas, which is controlled so that the pressure in the fermenter during the fermentation becomes positive, to the culture medium, or bicarbonate in the culture medium. Restrict the inhalation to the fermentor so that ions and Z or carbonate ions dissolve, or increase the pH by adding cations other than ammonia ions, such as sodium or potassium ions, to the medium. Etc.
  • the supply air pressure to the fermenter may be set higher than the exhaust pressure.
  • the pressure in the fermenter carbon dioxide produced by fermentation dissolves in the culture solution, producing bicarbonate ions or carbonate ions.
  • the fermenter internal pressure is 0.13 to 0.3 MPa, preferably 0.15 to 0.25 MPa.
  • carbon dioxide gas may be dissolved in the culture solution by supplying carbon dioxide gas or a mixed gas containing carbon dioxide gas to the culture solution.
  • carbon dioxide generated by fermentation can also be dissolved in the culture solution by restricting aeration to the fermenter.
  • a suitable aeration rate can be determined, for example, by measuring bicarbonate ions or carbonate ions in the medium, or by measuring pH or ammonia concentration.
  • carbon dioxide is supplied to the culture solution, for example, pure carbon dioxide or a mixed gas containing 5% by volume or more of carbon dioxide may be blown.
  • the above-described methods for dissolving bicarbonate ions and Z or carbonate ions in the medium may be used alone or in combination.
  • the "at least part of the period” is not particularly limited as long as the desired productivity is obtained. Specifically, for example, at least lZio of the whole culture step in the main culture, preferably 1Z
  • the medium used in the present invention is not particularly limited as long as the total ammonia concentration falls within the above range when performing an operation for adjusting the total ammonia concentration, and organic and inorganic nutrients such as a carbon source and a nitrogen source.
  • a medium containing a source and other micronutrients can be appropriately used depending on the microorganism used.
  • the carbon source may be any carbon source that can be assimilated by microorganisms, for example, sugars such as sucrose, glucose, fructose, molasses, starch hydrolysate, organic acids such as acetic acid, alcohols such as ethanol, And hydrocarbons such as methane.
  • sugars such as sucrose, glucose, fructose, molasses, starch hydrolysate
  • organic acids such as acetic acid
  • alcohols such as ethanol
  • hydrocarbons such as methane.
  • nitrogen sources include inorganic substances such as ammonia, protein hydrolysates, and yeast extracts.
  • micronutrients include amino acids, vitamins, and trace metal elements.
  • Bicarbonate ions and other ions other than Z or carbonate ions contained in the culture medium include salt ions, sulfate ions, phosphate ions, ionized organic acids, hydroxide ions, and the like. Can be mentioned.
  • the total ion equivalent of these other ions is usually 900 meq / l or less, preferably 700 meq / l or less, more preferably 500 meq / l or less, further preferably 300 meq / 1 or less, and particularly preferably 200 meq / l or less. is there.
  • one of the objects is to reduce the amount of sulfate ion, Z or salt ion used, and the sulfate ion or salt ion contained in the medium, or the equivalent of these ions.
  • the total is usually 700 meq / l or less, preferably 500 meq / l or less, more preferably 300 meq / l or less, further preferably 200 meq / l or less, particularly preferably lOOmeq / 1 or less.
  • a batch method without feeding the medium a fed-batch method in which the medium is further fed from the time when the charged sugar is consumed, and when the medium exceeds the allowable capacity of the fermenter.
  • Any of the continuous method of pulling out the medium from the point and the cell recycling method of re-recovering the cells may be used. What is necessary is just to set culture
  • cultivation temperature suitably according to the microorganisms to be used. Usually, it is 25 to 45 ° C, preferably 30 to 40 ° C. In addition, it is preferable to supply sufficient stirring and oxygen during fermentation.
  • the culture for producing the target basic substance is performed as follows, for example.
  • a medium in which some or all of the ammonium salt such as ammonium sulfate ammonium salt is deleted is prepared from the commonly used medium components.
  • This medium is inoculated with separately cultured microorganisms, and cultured in a controlled range of total ammonia concentration determined as described above and suitable for the microorganisms to be used.
  • the ammonia concentration in the culture solution in the fermenter or the sampled culture solution can be measured using, for example, a commercially available ion meter.
  • the total ammonia concentration may be controlled using the measured value as an index.
  • Ammonia gas, aqueous ammonia, or urea may be added to the culture solution so that the total ammonia concentration falls within a predetermined concentration range.
  • the total ammonia concentration in the medium can also be indirectly measured by measuring the ammonia concentration in the exhaust gas from the fermenter with a general ammonia electrode.
  • the adjustment of the total ammonia concentration in the medium can be performed by using the pH of the medium as an index by the following method.
  • sulfate ions and Z or salt ions are used as a counter ion source of the basic substance of interest. Cultivate the medium with the desired amount of ions reduced by adding a desired amount of ammonia gas, aqueous ammonia, and urea while changing the pH of the medium.
  • the basic substance produced by the present invention includes basic amino acids, specifically L-lysine. , L-arginine and L-histidine. Of these, L-lysine is preferred.
  • Any microorganism can be used as long as it can produce a basic substance by a fermentation method without any particular restriction on the microorganism having the ability to produce a basic substance.
  • microorganisms that produce basic substances satisfactorily if the total ammonia concentration in the medium is low are preferably used. Examples of such microorganisms include coryneform bacteria, bacteria belonging to the genus Escherichia, Serratia, and Bacillus.
  • Coryneform bacteria used in the present invention include bacteria belonging to the genus Corynebataterium and bacteria that have been conventionally classified into the genus Brevibaterium but are now integrated into the genus Corynebataterium (Int. J Syst. BacterioL, 41, 255 (1991)), and Brevibaterium bacteria closely related to the genus Corynebataterium. Specifically, the following are exemplified.
  • Corynebatterium 'Lilium Corynebacterium' Dartamicam
  • Ginoreterum-Gnoretamicam ATCC 13020, 13032, 13060
  • Corynebataterium 'Lilium Corynebacterium' Glutamicum ATCC15990 Corynebataterum 'Merasecola ATCC17965
  • Brevipacterum 'Flavum (Corynepacterum' Glutamicum) ATCC13826, AT CC14067
  • Examples of bacteria belonging to the genus Escherichia include Escherichia coli.
  • Escherichia coli When breeding Escherichia coli using genetic engineering techniques, E. coli K12 and its derivatives, Escherichia coli MG1655 (ATCC No. 47076), and W3110 (ATCC No. 27325) are used. Can be used.
  • Escherichia coli K12 strain was isolated at Stanford University in 1922. It is a lysogen of ⁇ phage, has F factor, and can make genetic recombinants such as conjugation. This is a Takatsuki strain. The genome sequence of Escherichia coli K12 strain has already been determined, and genetic information can be freely used.
  • ATCC American 'Type' Culture 1 Collection
  • L-lysine-producing coryneform bacteria include S- (2 aminoethyl) cystine (hereinafter abbreviated as AEC) resistant mutants, and require amino acids such as L-homoserine for their growth.
  • AEC S- (2 aminoethyl) cystine
  • Mutant strain Japanese Patent Publication No. 48-28078, Japanese Examination Publication No. 56-6499
  • resistant to AEC resistant to AEC, and requires amino acids such as L leucine, L homoserine, L proline, L serine, L arginine, L alanine and L parin Mutants (US Pat. Nos.
  • Brevibaterium ratatofamentum ATCC13869 / pVK-C *, plysE described in the examples is also a preferred L-lysine-producing coryneform bacterium.
  • This strain consists of a plasmid pVK-C * containing a gene (lysC *) that codes for desensitized asphalt kinase desensitized to feedback inhibition by L-lysine and L-threonine, and a bacterium belonging to the genus Corynepacteria.
  • the plasmid plysE US Patent Application Publication No.
  • lysE gene which is a homologous gene of L-lysine that promotes the elimination of L-lysine (International Publication Pamphlet No. 9723597A2), is known as Brevibaterium 'Ratato This strain was introduced into ATCC13869, which is a wild strain of Fermentum.
  • the lysC * gene can be isolated from, for example, the L-lysine-producing mutant AJ3463 (FERM P-1987) (see Japanese Patent Publication No. 51-34477) derived from ATCC13869 by mutation treatment. it can. Since March 22, 1973, AJ3463 shares have been incorporated into the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Patent Biological Deposit Center (formerly the Institute of Biotechnology, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology) (address: 305-85 66 Tsukuba Sakai Higashi, Ibaraki, Japan) Deposited at FERM P-1987 at 1-chome 1-address 1-center 6).
  • the lysC * gene fragment can also isolate the strain of Brevibaterium ratatofarmentum AJ12691 that carries the plasmid p399AK9B containing the gene.
  • AJ12691 was deposited on April 10, 1992 at the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Patent Biological Depositary under the deposit number FERM P-12918, and on February 10, 1995, an international deposit based on the Budapest Treaty. And has been deposited with a deposit number of FERM BP-4999.
  • the plasmid P399AK9B is a plasmid p399AK9 obtained by inserting lysC from the AJ3463 strain into the cloning vector pHSG399 (see Takeshita, S et al; Gene (1987), 61, 63-74). And obtained by inserting a DNA fragment having the ability to make the plasmid self-replicating (US Pat. No. 5,766,925).
  • the desensitized type asphalt kinase described above is a wild type aspartokinase (alanine residue at position 279 of X subunit and alanine residue at position 30 of j8 subunit, respectively)
  • the ⁇ subunit and j8 subunit are both lysC genes.
  • the child is coded in the same frame.
  • the nucleotide sequence of the lysC * gene and the ⁇ subunit of desensitized aspartokinase are shown in SEQ ID NOs: 5 and 6, and the amino acid sequence of the ⁇ subunit of the same gene and desensitized aspartokinase is shown in SEQ ID NOs: 7 and 8. .
  • the lysE gene of coryneform bacteria has been reported! Using primers prepared based on the nucleotide sequence (GenBank accession X96471), for example, the primers shown in SEQ ID NOs: 3 and 4, The lysE gene can be obtained by PCR using a chromosomal DNA as a saddle type (PCR: polymerase chain reaction; see White. TJ et al, Trends Genet. 5, 185 (1989)).
  • the nucleotide sequence (GenBank accession X96471) of the DNA fragment containing the Corynebataterum dartamicum lysG and lysE genes is shown in SEQ ID NO: 9, and the amino acid sequence of the LysE protein encoded by the same gene is shown in SEQ ID NO: 10. LysG is encoded by a complementary strand at a position corresponding to base numbers 1723 to 2352 of SEQ ID NO: 8.
  • the DNA encoding the ⁇ subunit, ⁇ subunit, and LysE protein of asphalt kinase has 1 or more positions at one or more positions of each protein, as long as the activity of these proteins is not lost. Included is DNA that encodes a protein that may contain multiple amino acid deletions, substitutions, insertions, or additions.
  • the number of amino acids in the “plurality” depends on the position or type of amino acid residue in the three-dimensional structure of the protein, preferably 2-30, more preferably 2-20, especially for each protein Preferably it is 2-10. This is due to the following reason. Some amino acids are highly homologous to each other, and differences in such amino acids do not significantly affect the three-dimensional structure of the protein and its activity.
  • each protein has 50% or more, preferably 70% or more, more preferably 90% or more, particularly preferably 95% or more homology to the amino acid residues described in SEQ ID NO: 6, 8, or And having activity of aspartokinase or LysE protein.
  • the modification of the protein as described above is a conservative mutation that maintains the activity of each protein.
  • a substitution is a change in which at least one residue in the amino acid sequence is removed and another residue is inserted therein.
  • the amino acids that replace the original amino acids of each protein and are considered conservative substitutions are ala to ser or thr, arg to Substitution to gln, his or lys, asn force, glu, gln, lys, substitution to his or asp, asp force, substitution to asn, glu or gin, cys force, substitution to ser or ala, gin force, etc. Substitution for asn, glu, lys, his, asp or arg, glu force et al.
  • substitution for asn, gln, lys or asp gly force et al. substitution for pro, his force et al asn, 1 ys, gln, arg or tyr
  • substitution, ile force et al. Substitution to leu, met, val or phe, leu force et al.
  • DNA encoding substantially the same protein as the protein having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 6, 8, or 10 for example, one or more amino acid residues are deleted, substituted, inserted, Alternatively, it can be obtained by modifying the nucleotide sequence encoding the protein having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 6, 8 or 10 using site-directed mutagenesis as added.
  • modified DNA can be obtained by conventional methods using treatments with reagents and conditions that generate mutations.
  • Such treatment includes treatment of the DNA encoding the protein of the present invention with hydroxylamine, or UV irradiation of bacteria carrying the DNA, or N-methyl-N '-tro-N--trosoguani. Treatment with reagents such as gin or nitrous acid.
  • the DNA encoding the modified protein as described above is a protein that hybridizes with the lycC gene or lysE gene or a part of these genes under stringent conditions, and has the activity of aspartokinase activity or LysE protein. Can be obtained by isolating DNA encoding.
  • stringent conditions includes conditions under which so-called specific hybrids are formed and non-specific hybrids are not formed. For example, under stringent conditions, highly homologous DNAs, for example, 70% or more, preferably 80% or more, more preferably 90% or more, particularly preferably 95% or more of DNA, hybridize to each other. Conditions are included. Alternatively, stringent conditions include normal washing conditions with Southern hybridization, eg 60. C, 1 X SSC, 0.1% SDS, preferably 0.1 X SSC, 0.1% SDS.
  • L-lysine-producing bacteria belonging to the genus Escherichia are resistant to L-lysine analogs.
  • a mutant strain having This L-lysine analog is such that it inhibits the growth of Escherichia bacteria, and its suppression is such that it is released in whole or in part if L-lysine is present in the medium.
  • Mutants having resistance to these lysine analogs can be obtained by subjecting microorganisms belonging to the genus Escherichia to normal artificial mutation procedures.
  • Specific examples of strains used in the production of L-lysine include Escherichia coli AJ11442 (FERM BP-1543, NRRL B-12185; see JP-A-56-18596 and US Pat. No. 4,346,170), and Escherichia coli VL611. Can be mentioned. On May 1, 1981, AJ11442 shares were incorporated by the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Patent Biological Deposit Center (formerly the Institute of Biotechnology, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology).
  • a bacterium that has enhanced expression of a gene encoding an enzyme involved in the L-lysine biosynthesis system other than desensitized asphalt kinase can also be used as a suitable L-lysine-producing bacterium.
  • dihydrodipicolinate synthase, dihydrodipicolinate reductase, diaminopimelate decarboxylase, diaminopimelate dehydrogenase international publication 96/40934 pamphlet
  • phosphoenolpyruvate carboxylase Japanese publication 96/40934 pamphlet
  • Aspartate aminotransferase Japanese Patent Laid-Open No. 60-87 788)
  • Aspartate aminotransferase Japanese Patent Publication No.
  • diaminopimelate epimerase gene Japanese Patent Laid-Open No. 2003-135066
  • aspartate semialdehyde dehydrogenase International Publication No. 00/61723 pamphlet
  • examples include enzymes of the diaminopimelate pathway, and enzymes of the aminoadipate pathway such as homoaconite hydratase (Japanese Patent Laid-Open No. 2000-157276).
  • Escherichia coli having L-lysine producing ability include Escherichia coli W3110 (tyrA) / pCABD2 (described in International Publication No. WO95 / 16042).
  • Escherichia coli W3110 (tyrA) / pCABD2 is a tyr A deficient strain of Escherichia coli W3110 (tyrA) (named AJ12604, the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Patent Biological Deposit Center, formerly the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (formerly the National Institute of Biotechnology, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology) on 28 January 1991 (address: 305-8566 Japan FERM BP-3579 was deposited at Tsukuba Sakai Higashi, 1-chome, 1-chome, Central Ibaraki, Japan under the deposit number of FERM P-11975 and transferred to an international deposit based on the Budapest Treaty on September 26, 1991.
  • pCABD2 is a gene encoding a mutant dihydrodipicolinate synthase in which the histidine residue at position 118 is mutated to a tyrosine residue and feedback inhibition by L-lysine is released.
  • the threonine residue at position 352 is It retains a gene encoding mutant Asvalt kinase III that has been mutated to an isoleucine residue and desensitized to feedback inhibition by L-lysine, and a gene encoding dihydrodipicolinate reductase and diaminopimelate dehydrogenase.
  • the E. coli W3110 (tyrA) strain can be obtained as follows.
  • European Patent Publication No. 488424 discloses many strains formed by introducing a plasmid into the W3110 (tyrA) strain.
  • the strain obtained by introducing the plasmid pHATerm is named E. coli W3110 (tyrA) / pHATerm strain, deposited at the Institute of Biotechnology, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, and given the registration number FERM BP-3653 Has been.
  • the W3110 (tyrA) strain can be obtained.
  • the plasmid can be removed by a conventional method.
  • WC196 strain As an L-lysine-producing bacterium of Escherichia coli, WC196 strain (see WO96 / 17930 international pamphlet) can also be used.
  • the WC196 strain was bred by conferring AEC (S— (2 aminoethyl) monocysteine) resistance to the W3110 strain derived from Escherichia coli K-12.
  • This strain was named Escherichia coli AJ13069, and on December 6, 1994, the National Institute of Biotechnology, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (currently the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), T 305-8566 Deposited as FERM P-14690 at Tsukuba Sakai Higashi, 1-chome, 1-chome, 1-chome, Ibaraki, Japan, and transferred to an international deposit under the Budapest Treaty on September 29, 1995. -5252 is granted.
  • the microorganism that can be used in the present invention is an enzyme that catalyzes a reaction that produces a compound other than L-lysine by branching the biosynthetic pathway of L-lysine, or an enzyme that functions negatively for L-lysine production.
  • the activity may be reduced or deficient.
  • examples of such enzymes include homoserine dehydrogenase, lysine decarboxylase (cadA, IdcC), and malicenzyme.
  • a strain in which the activity of the enzyme is reduced or absent is disclosed in WO W095 / 23864. No., WO96 / 17930 pamphlet, WO2005 / 010175 pamphlet and the like.
  • a mutation that reduces or eliminates the activity of the enzyme in the cell is performed on the gene of the enzyme on the chromosome by an ordinary mutation treatment method. What is necessary is just to introduce. For example, it can be achieved by deleting a gene encoding an enzyme on a chromosome by genetic recombination or by modifying an expression regulatory sequence such as a promoter or Shine-Dalgarno (SD) sequence. Also, introduce amino acid substitutions (missense mutations) into the enzyme-encoding region on the chromosome, introduce codons throughout (nonsense mutations), and introduce frameshift mutations that delete one or two bases.
  • a partial gene of the target gene is modified to produce a mutant gene that does not produce a normally functioning enzyme, and a coryneform bacterium is transformed with the DNA containing the gene.
  • a coryneform bacterium is transformed with the DNA containing the gene.
  • Site-directed mutagenesis by gene replacement using homologous recombination can also be performed using a plasmid that does not have replication ability on the host.
  • Microorganisms modified so as to enhance the expression level of ybjE, an L-lysine and L-arginine excretion gene, can also be used in the present invention (International Publication WO2005 / 073390 pamphlet).
  • L-lysine-producing bacteria belonging to the genus Serratia include Serratia bacteria that have been transformed by introducing DNA encoding a dihydrodipicolinate synthase having a mutation that cancels feedback inhibition by L-lysine, Further, Serratia spp. Bacteria that retain Asvaltokinase that has been desensitized to feedback inhibition by L-lysine (International Publication No. W096 / 41871).
  • Coryneform bacteria having L-arginine-producing ability include coryneform bacterium wild strains; coryneform bacteria resistant to drugs such as sulfa drugs, 2-thiazolalanin or hyamino- ⁇ -hydroxyvaleric acid; Coryneform bacterium having L-histidine, L-proline, L-threonine, L-isoleucine, L-methionine or L-tryptophan requirement in addition to 2-thiazolealanine resistance (Japanese Patent Laid-Open No.
  • Coryneform bacterium resistant to ketomalonic acid, fluoromalonic acid or monofluoroacetic acid Japanese Patent Laid-Open No. 57-18989
  • coryneform bacterium resistant to arginol Japanese Patent Laid-Open No. 62-24075
  • -Coryneform bacteria JP-A-2-186995 having resistance to gin (X is a fatty acid or fatty chain derivative).
  • coryneform bacteria lacking the L-arginine ribores US Patent Application Publication 2002-0045233
  • coryneform bacteria with increased glutamate dehydrogenase activity European Patent Application Publication No. 1057893
  • L is a suitable strain for arginine production.
  • Brevibaterium 'Flavum AJ11169 (FERM BP-6892), Corynebacterium' Glutamicum AJ12092 (FERM BP-6906), Brevibaterium 'Flavum AJ11336 (FERM BP-6893), Brevivata Terium 'Flavum AJ11345 (FERM BP-6894), Brevi Batterium. Ratatofamentum AJ12430 (FERM BP-2228).
  • AJ11169 and AJ12092 strains are 2-thiazolealanin-resistant strains described in JP-A-54-44096, and A J11336 strain is arginol-resistant and sulfadiadi described in Japanese Patent Publication No. 62-24075.
  • AJ11345 strain is a strain having resistance to arginol, 2-thiazolealanin resistance, sulfaguanidine resistance, and histidine requirement described in JP-B-62-24075. — The strain described in No. 186995 having resistance to octyldarazine and 2-thiazolalanine.
  • Corynebataterum 'Glutamicum AJ12092 (FERM BP-6906) was named Corynebataterum' Glutamicum AJ12092 strain, and on December 6, 1994, National Institute of Biotechnology, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (currently National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Patent Biological Depositary Center, Deposited as FERM P-12 092 at Tsukuba Satohi, 1-chome, 1-chome, Ibaraki, Japan 30 5-8566, Japan, October 1999 It was transferred to an international deposit based on the Budapest Treaty on the 01st and given the accession number FERM BP-6906.
  • Bacteria belonging to the genus Escherichia having L-arginine-producing ability include Escherichia coli introduced with the argA gene (see JP-A-57-5693) and L-arginine-producing derivatives of acetic acid-assimilating mutants. There is an Escherichia coli 237 strain (Russian patent application No. 2000117677).
  • Serratia genus bacteria having L-arginine-producing ability include Serratia marcescens that lacks L-arginine resolution, is resistant to arginine antagonists and canavanines, and requires lysine (Japanese Patent Laid-Open No. 52-8729) Reference).
  • Coryneform bacteria having the ability to produce L histidine include microorganisms belonging to the genus Brevibaterium and resistant to thiamine antagost, specifically Brevibaterium 'Latatomentumum FERM P— 2170, FERM P— 2316, FERM P— 6478, FERM P— 6479, FER Examples include M P-6480 and FERM P-6481 (Japanese Patent Laid-Open No. 59-63194).
  • mutant strains belonging to the genus Brevibacterium or Corynebataterium, resistant to polyketides, and capable of producing L histidine specifically FERM P-4161, FERM P-7273, FERM P-837 1, FERM P-8372, ATCC14067.
  • bacteria belonging to the genus Escherichia having the ability to produce L-histidine include mutant strains belonging to the genus Escherichia and resistant to histidine analogs, such as Escherichia coli R-344, and synthesis of L-histidine extracted from the same.
  • bacteria belonging to the genus Escherichia into which a system enzyme gene has been introduced include Escherichia coli NRRL-12116, NRRL-12118, NRRL-12119, NRRL-12120, and NRRL-12121 (Japanese Patent Laid-Open No. 56-5099).
  • Bacillus bacteria having the ability to produce L-histidine include mutant strains belonging to the genus Bacillus and resistant to histidine analogs, and genes involved in histidine antagonist resistance obtained from the mutant strains.
  • the fermented liquor containing a basic substance obtained by the present invention or a treated product thereof contains carbonate ions or bicarbonate ions as a counter-on for the dissociated basic substance.
  • This carbonate ion or bicarbonate ion is released as carbon dioxide gas by heating the culture solution, concentrating the culture solution, or adding a strong acid such as hydrochloric acid to lower the pH. Therefore, the content of basic substances that can be solid components in the fermentation broth or fermentation product is increased.
  • the amount of salt ions used can be reduced to a level that does not cause corrosion of the equipment, or Sulfate ions can be reduced.
  • lysine hydrochloride can be obtained without ion exchange. It is possible to obtain lysine hydrochloride crystals directly.
  • the “fermented product” includes a concentrated solution obtained from the fermentation broth, a dried product, and a product obtained by processing the fermented broth or the dried product.
  • a gene encoding a desensitized aspartokinase and a gene encoding a lysin excretion factor were introduced into a wild-type coryneform bacterium to construct an L-lysine-producing bacterium.
  • the AJ3463 strain was cultured in a CM-Dex medium, and chromosomal DNA was extracted from the obtained cells by a conventional method (Biochem. Biophys. Acta., 72, 619-629 (1963)).
  • a conventional method Biochem. Biophys. Acta., 72, 619-629 (1963)
  • the oligonucleotide ASK-F SEQ ID NO: 1 that introduces the restriction enzyme BamHI site at the 5 'end of the target DNA fragment, and the restriction enzyme Kpnl site as the target DNA fragment 3
  • the oligonucleotide ASK-R SEQ ID NO: 2
  • a PCR primer a gene DNA fragment containing the target gene lysC * was amplified.
  • Amplification conditions are: Denaturation process 98 ° C: 10 seconds, Pairing (annealing) process 55 ° C: 30 seconds, Extension process 72 ° C: 2 cycles I went 25 times.
  • the enzyme used was Pyrobest DNA polymerase (Takara Shuzo), which was used according to the manufacturer's instructions.
  • the amplified DNA fragment was purified by phenol / chloroform treatment and ethanol precipitation, and then digested with restriction enzymes BamHI and Kpnl.
  • the obtained reaction solution was developed by agarose gel electrophoresis, the band containing the lysC * gene was cut out, and the gene fragment was purified according to a conventional method.
  • p VK7 (see US Pat. No. 6,004,773), which is a shuttle vector of Escherichia coli and Corynebaterum glutamicum, was similarly treated with restriction enzymes BamHI and Kpnl, and then the above lysC * fragment. And ligation. Using this ligation reaction solution, E. col i JM109 strain competent cells (Takara Shuzo) were transformed according to the manufacturer's protocol, and several kanamycin-resistant colonies were selected.
  • pVK7 is prepared as described below by using brevibata in pHSG299 (Kmr; Takeshita, S. et al., Gene, 61, 63-74, (1987)), which is a vector for Escherichia coli. This was constructed by ligating PAM330, a Tari boutum plasmid Tari boutum (see JP-A-11-266881 and WO99 / 07853 international pamphlets). pAM330 was prepared from Brevibacterium 'Ratofamentum ATCC13869 strain.
  • pHSG299 was cleaved with Avail (Takara Shuzo Co., Ltd.), blunt-ended with T4 DNA polymerase, then cut with Hindlll (Takara Shuzo Co., Ltd.), and blunt-ended with T4 DNA polymerase. Connected to a pAM330. In this way, pVK7 was obtained. pVK7 is capable of autonomous replication in E. coli and Brevibaterium lactofermentum cells, and has a multiple cloning site derived from pHSG299, lacZ, and a kanamycin resistance gene as a marker.
  • Plasmid DNA was extracted from the kanamycin-resistant colony obtained as described above according to a conventional method, and the plasmid containing the desired lysC * gene was named pVK-C *.
  • the lysE gene a gene that promotes L-lysine excretion (international pamphlet No. 9723597A2) known from Corynebacterium spp. was isolated by PCR (see US Patent Application Publication No. 2003113899). Chromosomal DNA of the strain was prepared as described above.
  • LysE-F (SEQ ID NO: 3) and LysE-R (SEQ ID NO: 4) were used as DNA primers.
  • PCR reaction was performed using Pyrobest (Takara Shuzo Co., Ltd.), heat treatment at 94 ° C. for 90 seconds, and denaturation 94. C, 20 seconds, annealing 55 ° C, 30 seconds, extension reaction 72 ° C, 60 seconds, 30 cycles, followed by incubation at 72 ° C for 10 minutes. Through this reaction, a DNA fragment of the desired size was obtained. This DNA fragment was purified and cloned into a cloning vector pCR2.1 (Invitro gene) according to the manufacturer's protocol. Using this ligation reaction solution, E.
  • pCRlysE was digested with restriction enzymes BamHI and Xbal, and subjected to agarose gel electrophoresis to obtain a fragment containing the lysE gene.
  • pKC see US Patent Application Publication No. 2003113899
  • a shuttle vector of Escherichia coli and Corynepacterum dartamicum was similarly treated with restriction enzymes BamHI and Xbal, followed by agarose gel electrophoresis.
  • a gene fragment containing the chloramphee-chol resistance gene was obtained, purified, and ligated with the lysE fragment. Using this ligation reaction solution, E.
  • coli JM109 strain competent cells (Takara Shuzo Co., Ltd.) were transformed according to the manufacturer's protocol, and several colonies resistant to chloramphe-col were selected. By preparing a plasmid from the thus obtained colonies, a LysE expression plasmid plysE was obtained.
  • pKC4 was prepared as follows. Plasmid pHK4 having an origin of replication derived from a previously obtained plasmid pHM1519 (Agric. Biol. Chem., 48, 2901-2903 (198 4)) that can replicate autonomously in coryneform bacteria (see Japanese Patent Laid-Open No. 5-7491) ) was digested with restriction enzymes BamHI and Kpnl to obtain a gene fragment containing the origin of replication.
  • the resulting fragment was blunt-ended using a DNA blunt end kit (Takara Shuzo), and then the Kpnl linker ( Using Takara Shuzo, it was inserted into the Kpnl site of pHSG399 (Takara Shuzo) by ligation.
  • a DNA blunt end kit (Takara Shuzo)
  • the Kpnl linker Using Takara Shuzo, it was inserted into the Kpnl site of pHSG399 (Takara Shuzo) by ligation.
  • E. coli JM109 strain competent cells (Takara Shuzo Co., Ltd.) were transformed according to the manufacturer's protocol, and several chloramphecol-resistant colonies were selected.
  • PKC4 was obtained by preparing a plasmid for the colony strength thus obtained.
  • the electoral position was a Gene Pulser manufactured by BIO-RAD.
  • the cuvette electrode spacing was 0.1 cm, and the pulse conditions were 25 ⁇ F, 200 ⁇ , and 1.8 kV.
  • the obtained plasmid-introduced strain was selected on a CM-Dex agar plate (see below for medium composition) containing chloramphee-col 5 ⁇ g / 1 and kanamycin 25 ⁇ g / 1.
  • the obtained plasmid-introduced strain was cultured overnight at 31.5 ° C. in a CM-Dex liquid medium containing 5 g / 1 of chloramphee-chol and 25 g / 1 of strength namicin.
  • Cultivation was performed in 3 ml culture using test tubes.
  • CM-Dex medium was prepared as follows. All the components in Table 1 were mixed and adjusted to pH 7.5 with force K OH, and then sterilized by autoclaving at 120 ° C for 20 minutes. In the case of an agar medium, agar was added to a final concentration of 20 g / L.
  • Tono (1.2% in terms of nitrogen weight) 1.2g
  • Example 1 Using the L-lysine-producing bacterium constructed in Example 1, the total ammonia concentration at which the productivity of L-lysine in an alkaline medium was not inhibited was examined.
  • a conventional general culture method that is, a medium in which A medium (the composition is shown in Table 2) is supplemented with 55% (w / w) ammonium sulfate relative to glucose.
  • L-lysine fermentation was carried out using (B medium) by keeping the pH of the culture solution constant with ammonia gas during culture.
  • the pH was 7.0 or 8.0.
  • the culture was performed as follows. The strain is inoculated into 3 ml of CM-Dex liquid medium, cultured at 31.5 ° C with shaking, and then the culture solution 200 1 is evenly applied to CM-Dex agar medium, and at 31.5 ° C. The culture was stationary. Thereafter, L-lysine-producing bacteria grown on the same agar medium were inoculated into a jar fermenter containing 300 ml of B medium for culturing by the amount corresponding to 1/3 of one plate. During the culture, 300 ml of air sterilized by the filter was aerated, the stirring speed was maintained at 700 rpm, and the temperature of the culture solution was maintained at 31.5 ° C. The results are shown in Figure 1.
  • the L-lysine-producing bacterium was used for fermentation in a medium not containing ammonium sulfate.
  • the L-lysine-producing bacterium was inoculated into 3 ml of CM-Dex liquid medium and cultured at 31.5 ° C with shaking.
  • the culture solution 200 1 was evenly applied to CM-Dex agar medium, left at 31.5 ° C, and 300 ml of A medium (without ammonium sulfate added) was placed in the jar mentor, and the ammonia gas was added.
  • the pH was adjusted to pH 7.8, pH 8.2, and pH 8.9.
  • lysine-producing bacteria grown on the above-mentioned agar medium were inoculated in an amount corresponding to 1/3 of one medium, and cultured.
  • L-lysine production culture was performed under the pH conditions of pH7.8, pH8.2, and pH8.9, with the total ammonia concentration in the medium being controlled to 10 mM or less.
  • the strain was inoculated into 3 ml of CM-Dex liquid medium and cultured at 31.5 ° C with shaking.
  • the culture solution 200 1 was evenly applied to a CM-Dex agar medium, and incubated at 31.5 ° C for 1 hour.
  • Medium A (without ammonium sulfate addition) 300 ml was put into a jar mentor, and ammonia gas was blown into the same medium to adjust the pH to pH 7.5, pH 7.8, pH 8.2 or pH 8.9. It was adjusted.
  • an amount corresponding to 1/3 of one plate of L-lysine-producing bacteria grown on the agar medium was inoculated and cultured.
  • the total ammonia concentration in the culture solution was measured by sampling the culture solution over time, using an ammonia electrode and an ion meter (manufactured by Orion), and adding a 10% aqueous ammonia solution as necessary. , And controlled to be between 0 and lOOmM.
  • a 10% aqueous ammonia solution By observing the dissolved oxygen concentration in the culture solution, it is detected that the dissolved oxygen concentration rises rapidly when the ammonia is depleted. At that time, by adding a 10% aqueous ammonia solution, Ammo inside I tried to keep Your from going dry. The result is shown in figure 2.
  • the L-lysine-producing bacterium was inoculated into 3 ml of CM-Dex liquid medium and cultured overnight at 31.5 ° C with shaking.
  • the culture broth 200 1 was evenly applied to CM-Dex agar medium and cultured at 31.5 ° C for 1 hour.
  • 300 ml of A medium (without ammonium sulfate added) was placed in a jar mentor, and ammonia gas was blown into the medium to adjust the total ammonia concentration to 23.8 mM.
  • L-lysine-producing bacteria grown on the agar medium were inoculated in an amount corresponding to 1/3 of one plate.
  • a lysine decarboxylase non-producing strain was constructed. Lysine decarboxylase is encoded by the cadA gene (Genbank Accession No. NP_418555. SEQ ID NO: 15) and the IdcC gene (Genbank Accession No. NP.414728. SEQ ID NO: 17) (see International Publication WO96 / 17930 pamphlet). ).
  • WC196 strain was used as the parent strain.
  • PMW118-attL—Cm-attR is a plasmid in which attL and attR genes, which are attachment sites for phages, and cat gene, which is an antibiotic resistance gene, are inserted into pMW118 (manufactured by Takara Bio Inc.). Insert in order!
  • Synthetic oligonucleotides shown in SEQ ID NOs: 11 and 12 having sequences corresponding to both ends of attL and attR at the 3 'end of the primer and at the 5' end of the primer corresponding to a part of the target gene cadA gene PCR was performed using as a primer.
  • the amplified PCR product was purified on an agarose gel, and introduced into Escherichia coli WC196 strain containing plasmid PKD46 having temperature-sensitive replication ability, by electoral positioning.
  • Plasmid pKD46 (Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2000, vol. 97, No. 12, p6640— 6645) encodes the red recombinase of the ⁇ Red homologous recombination system controlled by the arabinose-inducible ParaB promoter.
  • plasmid pKD46 is required to get the PCR product into the WC196 chromosome.
  • a suitable cell for the electo-portion was prepared as follows. Specifically, Escherichia coli WC196 strain cultured at 30 ° C in LB medium containing 1 OOmgZL of ampicillin was transformed into 5 mL of SOB medium (molecular molecular) containing ampicillin (20 mg / L) and L arabinose (ImM). Cloning: Lab Manual, Second Edition, Sambrook, J. et al., Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989)). Pass the resulting dilution at 30 ° C. The OD600 was grown until the OD600 was approximately 0.6, then concentrated 100 times, and washed 3 times with 10% glycerol so that it could be used for electoral position.
  • the electoral position was performed using 70 ⁇ L of a competent cell and about lOOng of PCR product.
  • the cell after electoral positioning was prepared at 37 ° C with the addition of lmL of SOC medium (Molecular Cloning: Laboratory Manual Second Edition, Sambrook, J. et al., Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989;)).
  • SOC medium Molecular Cloning: Laboratory Manual Second Edition, Sambrook, J. et al., Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989;)
  • the plate was plated on L-agar medium containing Cm (chloramphee-coal) (25 mg / L) at 37 ° C to select Cm-resistant recombinants.
  • Cm chloramphee-coal
  • cadA gene in the mutant that could be identified by the chloramphee-chol resistance gene was confirmed by PCR.
  • the obtained cadA-deficient strain was named WC196 A cadA :: att-cat strain.
  • pMW-intxis-ts is a plasmid with a temperature-sensitive replication ability that carries a gene encoding ⁇ fuzzy integrase (Int) and gene encoding echionase (Xis).
  • the above-obtained WC196 ⁇ cadA att-cat strained competent cell was prepared according to a conventional method, transformed with the helper plasmid pMW-intxis-ts, and 50 mg / L at 30 ° C. Plated on L-agar medium containing ampicillin and selected ampicillin resistant strains.
  • the WC196 ⁇ cadA ⁇ ldcC strain was transformed with the Lys production plasmid PCABD2 (International Publication No. WO01 / 53459 pamphlet) carrying the dapA, dapB and LysC genes according to a conventional method, and the WC196 ⁇ cadA ⁇ ldcC / pCABD2 strain (WC196LC / pCABD2).
  • WC196 A cadA AldcC / pCABD2 was used as the L-lysine producing strain, and the culture was carried out in a jar mentor containing 300 ml of the L-lysine production medium for E. coli shown in Table 3. Was used, and the total ammonia concentration was adjusted to 95 mM. To this medium, the L-lysine producing strain was applied to the entire surface of the LB agar medium containing 20 ⁇ g / L of streptomycin, and the bacteria cultured at 37 ° C for 24 hours were inoculated. The amount of inoculum is the amount of bacteria grown on three agar media.
  • Incubation was performed at a temperature of 37 ° C, 50 mL of air sterilized by a filter was aerated for 1 minute, and the stirring speed was 700 rpm.
  • the aeration volume was changed to lOOmL per minute when the dissolved oxygen concentration in the culture solution dropped to 20% of saturation.
  • the feed solution for E. coli shown in Table 4 was appropriately added dropwise to the medium so that glucose in the medium did not wither and not exceed 30 g / L. Finally, the culture was stopped when 36 g of glucose was consumed.
  • Soybean pod (in terms of nitrogen weight) 0.77g
  • GD-113 Antifoaming agent
  • O.OImL Glucose and MgS0 4 '7H 2 0 were adjusted as section A, and others were adjusted as section B.
  • section A was adjusted as it was, and section B was adjusted to pH 5.0 with ammonia. After that, it was sterilized separately in 115 ⁇ , 10 minutes-incubator, and then mixed.
  • Streptomycin 20 ig 8 was added and used.
  • Streptomycin 20 was added and used.
  • L-arginine was produced using the same production strain by adding ammonium sulfate and controlling the total ammonia concentration without controlling the total ammonia concentration, as in the general method for producing basic amino acids. The result of performing is shown. Adjust pH to 7.0 by blowing ammonia gas into a jar mentor containing 300 ml of medium with a composition in which ammonium sulfate was added to the L-arginine production medium composition in Table 6 and glucose concentration was changed to 40 g / L. did.
  • Corynebacterium 'Glutamicum AJ 12092 strain was applied to the entire surface of CM-Dex agar medium, cultured at 31.5 ° C for 24 hours, and then the amount of bacteria grown on two agar mediums was inoculated on a jar armor.
  • the culture was performed at a temperature of 31.5 ° C, 150 mL of air sterilized with a filter was aerated for 1 minute, and the stirring speed was 700 rpm.
  • the pH of the culture was controlled at 6.9 by adding a 6N KOH solution separately sterilized. As the culture progressed, a separately sterilized 692 g / L glucose solution was appropriately added so that the glucose concentration in the decreasing medium was maintained at 30-40 g / L.
  • the culture solution Sampling the culture solution over time and measuring the total ammonia concentration, or using the ammonia concentration control device to control the total ammonia in the culture solution at various concentrations and culturing, the culture solution If ammonia gas is added and controlled as necessary, the total ammonia concentration in the inside will be about 20 mM. It was confirmed. Based on the above, the culture in which the total ammonia concentration in the culture solution was controlled to about 20 mM proceeded smoothly. After 51 hours, L-arginine accumulated 24.2 g / L, and L-arginine fermentation was established (Fig. 4).
  • the glucose consumed during this period was 35.1 g per batch, the production yield of L-arginine was 20.6% of the consumed glucose, and the production rate was 0.47 g / L / hr.
  • the pH of the culture increased from 7.92 at the start of culture to 8.02 at the end of culture.
  • Vitamin B1 hydrochloride 0.5mg
  • SEQ ID NO: 1 primer sequence for cloning lysC gene
  • SEQ ID NO: 2 Primer sequence for cloning lysC gene
  • SEQ ID NO: 3 Primer sequence for cloning lysE gene
  • SEQ ID NO: 4 Primer sequence for lysE gene cloning
  • SEQ ID NO: 5 base sequence of lycC * gene and amino acid sequence of oc subunit of deinhibited Asvalt kinase
  • SEQ ID NO: 6 Amino acid sequence of the a subunit of the deinhibited Asvalto kinase
  • SEQ ID NO: 7 nucleotide sequence of lycC * gene and amino acid sequence of 13 subunits of deinhibited Asvalt kinase
  • SEQ ID NO: 8 Amino acid sequence of 13 subunits of deinhibited Asvalt kinase
  • SEQ ID NO: 9 Base sequence of lysE gene and amino acid sequence of LysE protein
  • SEQ ID NO: 10 amino acid sequence of LysE protein
  • SEQ ID NO: 11 primer for cadA gene disruption
  • SEQ ID NO: 12 Primer for cadA gene disruption
  • SEQ ID NO: 13 primer for ldc gene disruption
  • SEQ ID NO: 14 primer for ldc gene disruption
  • SEQ ID NO: 15 nucleotide sequence of cadA gene and amino acid sequence of lysine decarboxylase
  • SEQ ID NO: 16 amino acid sequence of lysine decarboxylase (cadA)
  • SEQ ID NO: 17 gene sequence of ldc gene and amino acid sequence of lysine decarboxylase
  • SEQ ID NO: 18 amino acid sequence of lysine decarboxylase (ldc)
  • the fermentation broth obtained by the method of the present invention contains carbonate ions and Z or bicarbonate ions, but these are easily released into the atmosphere by heating, so that the basic substances in the solid components.
  • a fermentation broth or fermentation product with a high content can be obtained.
  • carbonic acid can be easily replaced with carbonic acid by adding an acid stronger than carbonic acid to the fermentation broth without performing ion exchange, which is usually performed in the conventional production method.
  • lysine hydrochloride crystals can be obtained directly by concentrating the fermentation broth.
  • FIG. 1 is a diagram showing the results of L-lysine production culture in a general medium and culture method.
  • FIG. 2 is a diagram showing the results of L-lysine production culture in a medium with a limited ammonia concentration.
  • FIG. 3 is a diagram showing the results of L-lysine production culture when only the total ammonia concentration is controlled and the pH is not controlled.
  • FIG. 4 is a graph showing changes in total ammonia concentration and pH over time in a general medium and a medium without addition of ammonium sulfate or ammonium salt.
  • FIG. 5 is a graph showing changes over time in growth, total ammonia concentration, pH, and residual sugar in L-arginine fermentation in a medium with a limited ammonia concentration.
  • FIG. 6 Diagram showing the results of L-arginine production culture in a medium with limited ammonia concentration.

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Abstract

　塩基性物質を生産する能力を有する微生物を液体培地を含む発酵槽中で培養し、同培地中に前記塩基性物質を生成、蓄積させる、発酵法による塩基性物質の製造法において、全培養工程の内少なくとも一部の期間、培地中のアンモニア濃度を一定の濃度範囲に調整することにより、前記塩基性物質のカウンタイオンとして使用する硫酸イオン、及び／又は塩化物イオンの使用量を削減することを特徴とする方法。

Description

明 細 書
塩基性物質の製造法
技術分野
[0001] 本発明は微生物工業に関連したものであり、詳しくは、発酵法による塩基性物質の 製造方法に関するものである。発酵法により製造できる塩基性物質、例えば Lーリジ ンは動物飼料用の添加物として、 L アルギニン及び L ヒスチジンは輸液等の医薬 品として有用である。
背景技術
[0002] 発酵法による塩基性物質の製造方法では、塩基性物質の生産能を有する微生物 を培養し、培養液中に塩基性物質を生成、蓄積させ、培養液から塩基性アミノ酸を採 取する。その際、培養方法は、回分方式、流加方式、又は連続方式で行われる。
[0003] このような塩基性物質の発酵生産にお!、ては、従来、培地の pHを中性に保っため に、培養液中で解離して陽イオンとなる目的物質に対して、カウンタァ-オンとして、 硫酸イオン又は塩ィ匕物イオンが培地に添加される（特開平 5— 30985号公報、特開 平 5— 24969号公報）。
[0004] 培養液力 の塩基性物質の採取は、精製を必要とする場合は、イオン交換によって 行われることが多い。例えば、 L リジンの場合では、発酵液を弱酸性に調整し、 L- リジンをイオン交換樹脂に吸着させた後、アンモ-ゥムイオンで榭脂から脱離させ、リ ジンベースとしてそのまま用いる力、あるいは塩酸を用いて L リジン塩酸塩として結 晶化する。
[0005] 前記の L リジンの精製において、培養液中のカウンタァ-オンとして塩化物イオン を用いる場合、培養液を濃縮すれば直接 L リジン塩酸塩が得られるが、現実的に は塩ィ匕物イオンは金属製の発酵槽等を腐食するため、培地中に高濃度に存在させ ることは好ましくな 、。
[0006] 一方、精製しな!ヽ場合は、発酵液をそのまま濃縮するか、ある!、は、発酵液を塩酸 又は硫酸で弱酸性に調整した後、噴霧造粒する。この場合は、培養中に添加した力 ゥンタァ-オンも残留成分となり、得られる発酵生産物中の塩基性物質の含有率を 低下させる。
[0007] ところで、特開 2002— 65287 (米国特許出願公開第 2002025564号）では、塩基 性アミノ酸の発酵にぉ 、て、炭酸イオンや重炭酸イオンを塩基性アミノ酸のカウンタ ァ-オンとして利用し、硫酸イオンや塩ィ匕物イオンの一部を代替する方法が示されて いる。培養液中の炭酸イオンや重炭酸イオンは、 pHを酸性にする力、又は濃縮する 力 或いはその両方により、比較的容易に除くことが可能である。該文献には、炭酸 イオンや重炭酸イオンを培養液中に添加する方法として、発酵中の発酵槽内圧力を 正になるように制御するカゝ、又は、炭酸ガスもしくは、炭酸ガスを含む混合ガスを培地 に供給する方法が示されている。しかしながら、炭酸ガスは、通常の培地条件である 中性付近の pHでは殆ど培養液に溶解しない。したがって、硫酸イオンや塩化物ィォ ンの削減効果を高めるために、それに見合った重炭酸イオンや炭酸イオンを培養液 中に存在させるには、アルカリ性の pHで培養する必要がある。しかし、 pHが高くなる と、一般に細菌の生育速度や目的物質の生産能力は低下する。
発明の開示
[0008] 本発明は、目的の塩基性物質の生産能を有する微生物を用いて、炭酸イオンや重 炭酸イオンを塩基性物質のカウンタァニオンとして利用する塩基性物質の発酵生産 において、微生物の生育速度や目的物質の生産能力の低下を回避して、硫酸ィォ ンゃ塩ィ匕物イオンの削減と効率的な目的物質の生産を両立することができる方法を 提供することを課題とする。
[0009] 通常、コリネ型細菌やエシ リヒア属細菌を用いる発酵法による塩基性物質の製造 においては、 pHが高くなると生育速度や目的物質の生産能力は低下する。本発明 者は、その主要因は塩基性物質の生成、あるいは生育のための窒素源として、又は 塩基性物質のカウンタイオン源として培地に添加されるアンモニアにあり、総アンモ- ァ濃度を適切な濃度範囲に調整しながら発酵することにより、高 pH条件における微 生物の生育速度や目的物質の生産能力の低下を大幅に抑制することが可能である ことを見出した。
本発明は、上記知見に基づいて完成するに至ったものである。
[0010] すなわち本発明は、以下のとおりである。 (1)塩基性物質を生産する能力を有する微生物を液体培地を含む発酵槽中で培養 し、同培地中に前記塩基性物質を生成、蓄積させる、発酵法による塩基性物質の製 造法において、全培養工程の内少なくとも一部の期間、培地中の総アンモニア濃度 を一定の濃度範囲に調整することにより、前記塩基性物質のカウンタイオンとして使 用する硫酸イオン、及び Z又は塩ィ匕物イオンの使用量を削減することを特徴とする 方法。
(2)前記総アンモニア濃度の一定範囲が、次の条件を満たす範囲である（1)の方法
(A)培地中のアンモニゥムイオン濃度が、培地中に溶存する重炭酸イオン及び Zま たは炭酸イオン、並びに他のァ-オンのイオン当量の合計力 培地中に蓄積した前 記塩基性物質のうちイオンィ匕しているもののイオン当量よりも大きくなるような濃度で あること、及び
(B)培地中の総アンモニア濃度力 予め以下の方法により決定された、前記微生物 の塩基性物質の生産を阻害しな!、濃度であること：
前記微生物を、培地の pH及び総アンモニア濃度を変えて培養して、塩基性物質 の生産性を測定し、最適な条件での塩基性物質の生産性の 50%以上の生産性をそ れぞれの pHで示す総アンモニア濃度を決定する。
(3)前記総アンモニア濃度の一定範囲が、以下の方法によって予め決定される（1) の方法：
(Α' )目的の塩基性物質のカウンタイオン源として、 ρΗ7.2以下で培養するのに充分 な量の硫酸イオン及び Ζ又は塩化物イオンを含む培地で、アンモニアガス、アンモ- ァ水及び尿素の少なくとも 、ずれかを添カ卩することで培地の ρΗを ρΗ6.5から ρΗ7.2の 範囲に保って培養し、塩基性物質の生産性を測定し、
(Β' )前記手順 1 (Α' )で用いた培地成分から、硫酸イオン及び Ζ又は塩化物イオン を所望する量だけ削減した培地を用いて培養を行い、目的の塩基性物質の蓄積に 伴 、、カウンタイオンである硫酸イオン及び Ζ又は塩ィ匕物イオンが不足することにより 培地の ρΗを 7. 2以下に保つことが不可能な期間に総アンモニア濃度を変化させて 培養を行 、、 (Α' )で測定された生産性の 50%以上の生産性が得られる総アンモ- ァ濃度の範囲を決定する。
(4)前記少なくとも一部の期間が、目的の塩基性物質の蓄積に対してカウンタイオン が不足することにより、培地の pHが上昇する期間、及び培地にカチオンを添加するこ とで pHが上昇する期間の少なくともいずれかを含む（1)の方法。
(5)前記培地中の総アンモニア濃度の調整を、培地中の溶存酸素濃度、培地中の 炭素源の消費速度、培地の濁度、前記塩基性物質の生産性、及び培地の pH変化 を指標とする前記微生物の活動が低下又は停止したときに培地にアンモニア又は尿 素を添加することにより行うことを特徴とする、 (1)の方法。
(6)前記培地として、前記塩基性物質のカウンタイオン源として pH7. 2以下で培養 するのに充分な量の硫酸イオン及び Z又は塩ィ匕物イオンを含む培地の組成から、硫 酸イオン及び Z又は塩化物イオンを所望する量だけ減らした培地を用い、かつ、 前記少なくとも一部の期間が、前記培地に蓄積する前記塩基性物質に対してカウン タイオンが不足することにより pHを 7. 2以下に保つことが不可能な期間であることを 特徴とする、（1)の方法。
(7)前記他のァ-オンが、硫酸イオン、塩ィ匕物イオン、リン酸イオン及びイオンィ匕した 有機酸から選ばれる (2)の方法。
(8)前記他のァ-オンの合計が 900meq/l以下であることを特徴とする、 (2)又は（7) の方法。
(9)培養液中の総アンモニア濃度を 200mM以下に調整することを特徴とする（1)の 方法。
(10)前記微生物を増殖させる工程を含む（1)の方法。
(11)前記微生物を増殖させる工程においては、前記総アンモニア濃度の調整を行 わないことを特徴とする（10)の方法。
( 12)前記塩基性物質が L—リジン、 L アルギニン及び L -ヒスチジンカゝら選ばれる (1)の方法。
(13)塩基性物質が L リジンである（ 12)の方法。
(14)塩基性物質が L アルギニンである（ 12)の方法。
(15)発酵後に培地又はその処理物を加熱して、重炭酸イオン及び炭酸イオンを除 去することを特徴とする、（1)の方法。
(16)前記微生物がコリネ型細菌又はエシ リヒア属細菌である（1)の方法。
(17) (15)の方法により得られる、塩基性物質を含む発酵液又は発酵生産物。 発明を実施するための最良の形態
[0011] 以下、本発明を詳細に説明する。
本発明の方法は、塩基性物質を生産する能力を有する微生物を液体培地を含む 発酵槽中で培養し、同培地中に前記塩基性物質を生成、蓄積させる、発酵法による 塩基性物質の製造法である。本発明の方法は、全培養工程の内少なくとも一部の期 間、培地中の総アンモニア濃度を一定の濃度範囲に調整することにより、前記塩基 性物質のカウンタイオンとして使用する硫酸イオン、及び Z又は塩化物イオンの使用 量を削減することを特徴とする。すなわち、本発明は、窒素源として微生物の生育又 は目的物質の生産に必要な量の総アンモニアを確保しつつ、総アンモニア濃度が微 生物の生育又は目的物質の生産を阻害しないような濃度とすることにより、硫酸ィォ ン及び塩ィ匕物イオンを削減した培地で塩基性物質を生産する方法である。
[0012] 前記総アンモニア濃度の一定範囲としては、次の条件を満たす範囲が挙げられる
(A)培地中のアンモニゥムイオン濃度が、培地中に溶存する重炭酸イオン及び Z または炭酸イオン、並びに他のァ-オンのイオン当量の合計力 培地中に蓄積した 前記塩基性物質のうちイオンィ匕しているもののイオン当量よりも大きくなるような濃度 であること、及び、
(B)培地中の総アンモニア濃度が、予め以下の方法により決定された、前記微生 物の塩基性物質の生産を阻害しな!、濃度であること：
前記微生物を、培地の pH及び総アンモニア濃度を変えて培養して、塩基性物質 の生産性を測定し、最適な条件での塩基性物質の生産性の 50%以上の生産性をそ れぞれの pHで示す総アンモニア濃度を決定する。
[0013] また、本発明の他の態様では、前記総アンモニア濃度の一定範囲は、以下の方法 によって予め決定される：
(Α' ) (手順 1：中性条件における発酵成績の評価） 目的の塩基性物質のカウンタイオン源として、 pH7.2以下で培養するのに充分な量 の硫酸イオン及び Z又は塩化物イオンを含む培地で、アンモニアガス、アンモニア水 及び尿素の少なくともいずれかを添カ卩することで培地の pHを pH6.5から pH7.2の範囲 に保って培養し、塩基性物質の生産性を測定する。
(Β' ) (手順 2 :硫酸アンモ-ゥムゃ塩ィ匕アンモ-ゥムの使用量を削減し、制御するァ ンモニゥムイオンの濃度を変化させて発酵成績を評価）
前記手順 1 (Α' )で用いた培地成分から、硫酸イオン及び Ζ又は塩ィ匕物イオンを所 望する量だけ削減した培地を用いて培養を行 、、目的の塩基性物質の蓄積に伴!ヽ 、カウンタイオンである硫酸イオン及び Ζ又は塩ィ匕物イオンが不足することにより培地 の pHを 7. 2以下に保つことが不可能な期間に総アンモニア濃度を変化させて培養 を行 、、 (Α' )で測定された生産性の 50%以上の生産性が得られる総アンモニア濃 度の範囲を決定する。
[0014] また、本発明の他の態様では、前記総アンモニア濃度の一定範囲を予め決定しな くても、総アンモニア濃度を所定の範囲に調整することができる。具体的には、前記 培地中の総アンモニア濃度の調整を、培地中の溶存酸素濃度、培地中の炭素源の 消費速度、培地の濁度、前記塩基性物質の生産性、及び培地の pH変化を指標とす る前記微生物の活動が低下又は停止したときに培地にアンモニア又は尿素を添カロ すること〖こより行う。、前記培地として、前記塩基性物質のカウンタイオン源として ρΗ7 . 2以下で培養するのに充分な量の硫酸イオン及び Ζ又は塩ィヒ物イオンを含む培地 の組成から、硫酸イオン及び Ζ又は塩ィ匕物イオンを所望する量だけ減らした培地が 用いられる。また、前記少なくとも一部の期間としては、前記培地に蓄積する前記塩 基性物質に対してカウンタイオンが不足することにより pHを 7. 2以下に保つことが不 可能な期間が挙げられる。
[0015] 前記他のァ-オンとしては、塩ィ匕物イオン、硫酸イオン、リン酸イオン、及び有機酸 ( 酢酸、乳酸、コハク酸)等が挙げられる。また、前記培地中に溶存する重炭酸イオン 及び Ζまたは炭酸イオンは、塩基性物質のカウンタァ-オンとして働く。
[0016] 本発明において、イオン当量とは各イオンのモル濃度にそれぞれの価数を乗じた 値であり、 eq/1の単位で表される。即ち 1価のイオン ImMは lmeq/1であり、 2価のィォ ン 1 mMは 2meq/lである。
[0017] 上記総アンモニア濃度の調整は、培地に、微生物の生育又は塩基性物質の生成 に必要な量であって、かつ、前記微生物の塩基性物質の生産を阻害しない濃度の 総アンモニアを存在させるためのものであり、それによつて、自動的に塩基性物質の カウンタァ-オンとして必要な重炭酸イオン及び z又は炭酸イオンを溶解させるのに 適した pHに調整される。
本発明において、「総アンモニア」とは、解離していないアンモニア（NH )及びアン
3 モ -ゥムイオン (NH +)の合計をいう。尚、総アンモニア濃度の調整においては、測定
4
するのは解離して ヽな 、アンモニアであってもよ 、し、アンモ-ゥムイオンであっても よぐさらにはこれらの両方であってもよい。
[0018] 従来、一般的には、塩基性物質のカウンタァ-オンの供給源及び窒素源として、硫 酸アンモ-ゥムゃ塩化アンモ-ゥムが培地に添加される。また、通常、培地の pHの 調整にはアンモニアや尿素が使用されるため、培地中には高濃度のアンモニア及び アンモ-ゥムイオンが存在する。培地に添加する硫酸イオンや塩ィ匕物イオンの量を削 減する為に硫酸アンモ-ゥムゃ塩ィ匕アンモ-ゥムの量を削減する場合、削減する分 に相当する窒素源を、例えばアンモニア等として供給する必要がある。その際に、目 的の塩基性物質などのように、菌によって生成され、培養が進むに従って増加してい くカチオンや添カ卩したアンモニアのうちイオン化して 、るカチオン、及びナトリウムィォ ンゃカリウムイオンなどのように培地に添加しされたカチオンと、重炭酸イオン及び Z 又は炭酸イオンのように、菌の呼吸により発生したり培地に添加することで培地中に 増加していくァ-オンとのバランスが考慮されたアンモニアの供給方法を開発する必 要があった。このバランスが保たれなければ、アンモニアが高濃度になりすぎたり、 p Hが過剰に高くなつたり、逆にアンモニアが枯渴することにより発酵が成立しない。本 発明においては、総アンモニアの濃度を一定の範囲に調整するアンモニアの添加方 法を開発したことによって、上記のようなカチオンとァ-オンのバランスを良好に保つ ことが出来るようになり、培地に含まれる硫酸イオンやムゃ塩ィ匕物イオンの量を削減し た条件においても良好な微生物の生育及び塩基性物質の生成を実現することがで きる。 [0019] 培地中の総アンモニア濃度の調整は、培地中の総アンモニア濃度が許容量となる ように、培地にアンモニアガス、アンモニア溶液、又は尿素の少なくともいずれかを添 加することにより行われる。また、本発明の効果を損わない限り、塩ィ匕アンモ-ゥムゃ 硫酸アンモ-ゥムなどのアンモ-ゥム塩をカ卩えてもよい。また、培養終了後に気体とし て容易に除くことが出来る重炭酸イオン及び又は炭酸イオンを対イオンとするアンモ -ゥム塩は使用しても良い。総アンモニア濃度は、培地中又は排気ガス中のアンモ ニゥムイオン又はアンモニアの濃度を測定し、その測定値を指標として調節すること ができる。また、アンモニアで pHを調整したときに、総アンモニア濃度が許容値となる ような pHを予め設定し、そのような pHとなるようにアンモニアを添加することによって 、総アンモニア濃度を調整してもよい。この場合、必要に応じて、培養中に、前記のよ うにして設定された pHを変化させてもょ 、。
[0020] また、培地中の総アンモニア濃度の調整は、培地中の溶存酸素濃度、培地中の炭 素源の消費速度、培地の濁度、前記塩基性物質の生産性、及び培地の pH変化を 指標とする前記微生物の活動が低下又は停止したときに培地にアンモニア又は尿素 を添加することによつても行うことができる。すなわち、培地中の窒素源が不足又は枯 渴すると、微生物の増殖又は目的物質の生産のような微生物の活動が低下又は停 止する。通常、微生物の活動は、培地中の溶存酸素及び炭素源の消費、培地の濁 度の上昇、目的物質の生産、アンモニアの消費や呼吸による二酸ィ匕炭素の放出に 起因する培地の pHの低下として表れる。よって微生物の活動が低下又は停止した場 合には、単位時間当たりの通気量や攪拌速度が一定の場合には、培地中の溶存酸 素濃度が上昇し、また、アンモニアの消費と炭酸ガスの排出が低下することにより培 地の pHは上昇する。更に、炭素源の消費速度や培地の濁度の上昇速度、及び目的 物質の生産速度が低下する。したがって、窒素源以外の培地成分が充足している状 態において、これらを指標として微生物の活動の停滞が観察されたときは、窒素源が 不足又は枯渴しているときである。その際に、微生物の生育又は目的物質の生産に 必要な量のアンモニア又は尿素を培地に添加する。これを繰り返すことにより、結果 的に培地中の総アンモニア濃度が一定範囲に保たれる。培地に尿素を添加して培 養すると、微生物によって尿素が資化され、アンモニアが培地に放出される。上記の ようにしてアンモニア又は尿素の添力卩を繰返すと、培地の pHは徐々に上昇する。ァ ンモ-ァ又は尿素の添カ卩量としては、培地中の総アンモニアの終濃度として一回に、
300mM、好ましくは 200mM、より好ましくは lOOmMが挙げられる。あるいは、アンモ ユア又は尿素を添カ卩した後の pHの上昇が 0. 3、好ましくは 0. 15、より好ましくは 0. 1以内となるようにアン-モア又は尿素を添カ卩してもょ 、。
尚、培地中の溶存酸素濃度は、例えば溶存酸素電極により測定することができる。
[0021] 培地中に溶存する重炭酸イオン及び Zまたは炭酸イオン、並びに他のァニオンの イオン当量の合計が、培地中に蓄積した塩基性物質のイオン当量当量よりも高いこと は、重炭酸イオン炭酸イオン、及び他のァ-オンの濃度、並びに前記塩基性物質の 濃度を測定することによって確認することができる。また、予備実験を行って、上記条 件を満たす pH及び Z又はアンモニアの添加量を設定し、そのような pH及び Z又は アンモニアの添加量で培養を行うことによつても、上記条件を満たすことができる。
[0022] 本発明にお!/、ては、培養 pHは一定であってもよ!/、し、一定でなくてもよ!/、。また、培 地の pHを制御する場合、 pHの制御は pH自体を指標として行ってもよいし、直接的 には制御せず、総アンモニア濃度を制御することによって、間接的に制御されてもよ い。また、前記のように、微生物の活動を指標にしてアンモニアや尿素を添加すると、 培地中の総アンモニア濃度が適正な濃度範囲に調節され、塩基性物質の蓄積に伴 つて徐々に高い PHに変化させることになる。また、総アンモニア濃度を一定の範囲内 に制御して培養すると、培地中に種々のカチオンとァ-オンの蓄積バランスが変化し ていく結果として pHが変化する。どちらの手段を選択しても、結果として培地中の総 アンモニア濃度が一定の濃度範囲に調整され、前記塩基性物質のカウンタイオンと して使用する硫酸イオン、及び Z又は塩化物イオンの使用量を削減することが出来 る。
[0023] 本発明において、「塩基性物質の生産を阻害しない」とは、本発明に用いる微生物 が良好に生育し、かつ、塩基性物質が生産されることを意味する。微生物の生育が 悪い場合、及び、微生物が良好に生育したとしても、塩基性物質が効率よく生産され な 、場合は、塩基性物質の生産は阻害されたと 、える。
[0024] 具体的には、本発明に用いる微生物を、培地の pH及び総アンモニア濃度を変え て培養して、培地に蓄積する塩基性物質の生産性を測定し、最適な条件、例えば従 来の中性における一般的な条件での塩基性物質の生産性の好ましくは 50%以上、 より好ましくは 70%以上、特に好ましくは 90%以上の成績がそれぞれの pHで得られ るような総アンモニア濃度は、「塩基性物質の生産を阻害しない」濃度である。尚、本 発明において、「生産性」とは、収率、生産速度、又は総生産量をいう。「収率」とは、 培地中の資化可能な炭素源に対する塩基性物質の生産量をいい、「生産速度」とは 、単位時間当りの生産量をいう。また、単に「生産量」というときは、炭素源を完全に消 費したときの培地中の塩基性物質の蓄積量をいう。
[0025] また、本発明に用いる微生物を、最適な条件、例えば従来の中性における一般的 な条件で培養した場合に培地に蓄積する塩基性物質の生産性を測定し、次に、同じ 組成の培地力 硫酸イオン及び Z又は塩ィ匕物イオンを所望する量だけ削減した培 地を用いて培養を行い、生産性を測定する。この場合、目的の塩基性物質の蓄積に 伴 、、カウンタイオンである硫酸イオン及び Z又は塩ィ匕物イオンが不足することにより 培地中の pHが上昇する期間が存在する。その期間の総アンモニア濃度を一定の濃 度範囲に制御して培養する。制御する濃度範囲として ImMから 500mMの範囲の種々 の濃度範囲に設定して培養を行い、その生産性が最適な条件の場合に比べて好ま しくは 50%以上、より好ましくは 70%以上、特に好ましくは 90%以上の成績を得るよ うな濃度範囲を「塩基性物質の生産を阻害しな!、」濃度とする。前記「従来の中性に おける一般的な条件」に用いる培地としては、 pH7.2以下で培養するのに充分な量の 硫酸イオン及び Z又は塩化物イオンを含む培地が挙げられる。
[0026] 尚、硫酸イオン及び Z又は塩ィ匕物イオンを削減する所望の量は、塩基性物質の目 的とする生産性が得られる限り、特に制限されない。
[0027] 「塩基性物質の生産を阻害しない」総アンモニアの濃度は、例えば、以下のようにし ても決定することができる。本発明に用いる微生物を、培地の pH及び総アンモニア 濃度を変えて培養して、培地に蓄積する塩基性物質の量を測定する。各々の条件で の塩基性物質の蓄積量を、最適な条件での蓄積量と比較する。このようにして、塩基 性物質の生産を阻害しな 、総アンモニア濃度を決定することができる。最適な条件と は、例えば従来の中性における一般的な条件のように中性で培養するのに充分な力 ゥンターイオンを使用して培養する条件を 、う。
[0028] さらに、「塩基性物質の生産を阻害しない」総アンモニアの濃度は、例えば、以下の ようにしても決定することができる。本発明に用いる微生物を、最適な条件、例えば従 来の中性における一般的な条件で培養した場合に培地に蓄積する塩基性物質の生 産性を測定し、次に、同じ組成の培地力も硫酸イオン及び Z又は塩ィ匕物イオンを所 望する量だけ削減した培地を用いて培養を行い、生産性を調べる。この場合、目的 の塩基性物質の蓄積に伴 、、カウンタイオンである硫酸イオン及び/又は塩ィ匕物ィ オンが不足することにより培地中の pHが上昇する期間が存在する。その期間の総ァ ンモニァ濃度を一定の濃度範囲に制御して培養する。制御する濃度範囲として ImM から 500mMの範囲の種々の濃度範囲に設定して培養を行い、その生産性が最適な 条件の場合と比較する。
[0029] 「塩基性物質の生産を阻害しな!、」には、例えば、最適な条件にお!、て塩基性物質 を生産する場合の生産性の好ましくは 50%以上、より好ましくは 70%以上、特に好 ましくは 90%以上の生産性が得られる条件が含まれる。具体的には、培地中の総ァ ンモ-ァ濃度としては、好ましくは 300mM以下、より好ましくは 200mM、特に好まし くは lOOmM以下の濃度が挙げられる。アンモニアの解離度は pHが高くなると低下 する。解離していないアンモニアは、アンモ-ゥムイオンよりも菌に対して毒性が強い 。そのため、総アンモニア濃度の上限は、培養液の pHにも依存する。すなわち、培 養液の pHが高いほど、許容される総アンモニア濃度は低くなる。したがって、前記「 塩基性物質の生産を阻害しな 、」総アンモニア濃度は、培養中の最も高 、pHにお いて許容される総アンモニア濃度範囲を、培養期間を通じての総アンモニア濃度の 範囲としてもよい。
[0030] 一方、微生物の生育及び塩基性物質の生産に必要な窒素源としての総アンモニア 濃度としては、培養中に窒素源が不足することにより微生物による目的物質の生産 性が低下しない限り特に制限されず、適宜設定することができる。例えば、培養中に アンモニア濃度を経時的に測定し、培地中のアンモニアが枯渴したら少量のアンモ ユアを培地に添加してもよい。アンモニアを添加したときの濃度としては、特に制限さ れないが、例えば、総アンモニア濃度として好ましくは ImM以上、より好ましくは 5m M以上、特に好ましくは lOmM以上の濃度が挙げられる。
[0031] 本発明の方法は、主として塩基性物質を生産する能力を有する微生物を増殖させ る培養工程と、主として前記微生物に塩基性物質を生産させる培養工程とを含んで いてもよい。また、本発明の方法は、微生物の増殖と塩基性物質の産生とが並行して 行われてもよい。さら〖こ、上記のような培養、これらは主発酵あるいは本培養等と呼ば れることがあるが、これとは別に、前培養を行ってもよい。
[0032] 本発明においては、上記したように、培地中の総アンモニア濃度を調整することに 加えて、培地中に重炭酸イオン及び Zまたは炭酸イオンが溶存しゃすくなるような操 作を行ってもよい。このような操作としては、前記発酵中の発酵槽内圧力が正となるよ うに制御するカゝ、炭酸ガスもしくは炭酸ガスを含む混合ガスを培地に供給するか、又 は、培地中に重炭酸イオン及び Zまたは炭酸イオンが溶存するように発酵槽への吸 気を制限することか、又はアンモ-ゥムイオン以外のカチオン、例えばナトリウムィォ ンゃカリウムイオンなどを培地に添加することで pHを上昇させることなどが挙げられる
[0033] 発酵槽内圧力が正となるようにするには、例えば、発酵槽への給気圧を排気圧より 高くすればよい。発酵槽内圧力を高くすることによって、発酵により生成する炭酸ガス が培養液に溶解し、重炭酸イオン又は炭酸イオンを生じる。発酵槽内圧力として具体 的には、 0. 13〜0. 3MPa、好ましくは 0. 15〜0. 25MPa力 ^挙げられる。
[0034] また、培養液に炭酸ガス又は炭酸ガスを含む混合ガスを供給することによって、培 養液に炭酸ガスを溶解させてもよい。あるいは、発酵槽への通気を制限することによ つても、発酵により生成する炭酸ガスを培養液に溶解させることができる。好適な通気 量は、例えば培地中の重炭酸イオン又は炭酸イオンを測定することや、 pHやアンモ ユア濃度を測定することによって、決定することができる。培養液に炭酸ガスを供給 する場合は、例えば、純炭酸ガス又は炭酸ガスを 5体積％以上含む混合ガスを吹き 込めばよい。尚、培地に重炭酸イオン及び Z又は炭酸イオンを溶解させる上記の方 法は、単独でもよいし、複数を組み合わせてもよい。
[0035] 前記培地中の総アンモニア濃度を調整する操作、及び必要に応じて培地中に重 炭酸イオン及び Zまたは炭酸イオンが溶存しゃすくなるような操作は、全培養工程の 内少なくとも一部の期間行えばょ 、。
[0036] 前記「少なくとも一部の期間」とは、所望の生産性が得られる限り特に制限されない 力 具体的には、例えば、本培養における全培養工程の lZio以上、好ましくは 1Z
5以上が上げられる。より具体的には目的の塩基性物質の蓄積に対して、培地に使 用する硫酸イオン及び Z又は塩ィ匕物イオン等のカウンタイオンが不足することにより 、培地の pHが上昇する期間、培地にカチオンを添加することで pHが上昇する期間、 及びこれらの両方の期間が含まれる。
[0037] 本発明に用いる培地は、少なくとも総アンモニア濃度を調整する操作を行う際に、 総アンモニア濃度が上記の範囲となる限り、特に制限されず、炭素源、窒素源などの 有機、無機栄養源及びその他の微量栄養素を含む培地を、使用する微生物に応じ て適宜使用することができる。
[0038] 炭素源は微生物が資化できる炭素源であればいずれでもよぐ例えば、サッカロー ス、グルコース、フルクトース、糖蜜、澱粉加水分解物などの糖、酢酸などの有機酸、 エタノールなどのアルコール、メタンなどの炭化水素が挙げられる。
[0039] 窒素源としては、アンモニアなどの無機物ゃ蛋白加水分解物や、酵母エキスなどが 挙げられる。微量栄養素としては、アミノ酸やビタミン、微量金属元素が挙げられる。
[0040] 培地に含まれる重炭酸イオン及び Zまたは炭酸イオン以外の他のァ-オンには、 塩ィ匕物イオン、硫酸イオン、リン酸イオン、イオン化した有機酸、及び水酸化物イオン 等が挙げられる。これらの他のイオンのイオン当量の合計は、通常は 900meq/l以下 、好ましくは 700meq/l以下、より好ましくは 500meq/l以下、さらに好ましくは 300meq /1以下、特に好ましくは 200meq/l以下である。
本発明においては、硫酸イオン、及び Z又は塩ィ匕物イオンの使用量を削減すること が目的の一つであり、培地に含まれる硫酸イオンもしくは塩ィ匕物イオン、又はこれら のイオン当量の合計は、通常、 700meq/l以下、好ましくは 500meq/l以下、より好まし くは 300meq/l以下、さらに好ましくは 200meq/l以下、特に好ましくは lOOmeq/1以下 である。
[0041] 発酵形態については、特別な制限はなぐ培地を流加しない回分法、仕込み糖が 消費した時点から、更に培地を流加する流加法、培地が発酵槽の許容量を超える時 点から培地を引く抜く連続法、菌体を再回収するセルリサイクル法などのいずれでも 構わない。培養温度は、使用する微生物に応じて適宜設定すればよい。通常、 25〜 45°C、好ましくは 30〜40°Cである。また、発酵中は十分な攪拌と酸素を供給すること が好ましい。
[0042] 目的の塩基性物質を生産するための培養は、具体的には、例えば以下のようにし て行う。通常の一般的に用いられる培地成分から、硫酸アンモ-ゥムゃ塩ィ匕アンモ- ゥム等のアンモ-ゥム塩を一部、又は全て削除した培地を作製する。この培地に、別 途培養した微生物を接種し、前記のようにして決定した、使用する微生物に好適な総 アンモニア濃度範囲に制御して培養する。発酵槽中の培養液又はサンプリングした 培養液中のアンモニア濃度は、例えば、市販されているイオンメーター等を用いて測 定することができる。その測定値を指標として、総アンモニア濃度を制御すればよい。 総アンモニア濃度が所定の濃度範囲になるように、アンモニアガス又はアンモニア水 又は尿素を培養液に添加すればよい。発酵槽からの排気ガス中のアンモニア濃度を 一般的なアンモニア電極によって測定することによつても、培地中の総アンモニア濃 度を間接的に測定することができる。
また、本発明において、前記培地中の総アンモニア濃度の調整は、前記したように 、以下に示す方法によって培地の pHを指標に行うことができる。
目的の塩基性物質のカウンタイオン源として、 pH7.2以下で培養するのに充分な量 の硫酸イオン及び Z又は塩ィ匕物イオンを含む培地の組成から、硫酸イオン及び Z又 は塩ィ匕物イオンを所望する量だけ削減した培地で、アンモニアガス、アンモニア水及 び尿素の少なくともいずれかを添カ卩して培地の pHを変化させながら培養し、
培地に蓄積する目的の塩基性物質に対して、カウンタイオンが不足することにより p Hを 7. 2以下に保つことが不可能な期間に、培地中の溶存酸素濃度の経時変化、培 地中の炭素源の消費速度の経時変化、培地の濁度の経時変化、または培地の pH 変化などを指標とし、アンモニアガス、アンモニア水及び尿素の少なくともいずれかを 添加することによって、間接的に培地中の総アンモニア濃度を好適な濃度範囲に保 つて培養する。
[0043] 本発明により製造する塩基性物質としては、塩基性アミノ酸、具体的には L リジン 、 L—アルギニン及び L—ヒスチジンが挙げられる。これらの中では L—リジンが好まし い。
[0044] 塩基性物質生産能を有する微生物には特別の制限はなぐ発酵法により塩基性物 質を生産することが可能である限り、いずれの微生物も使用できる。特に、培地の pH が高くても、培地中の総アンモニア濃度が低ければ塩基性物質を良好に生産する微 生物が好適に用いられる。このような微生物としては、コリネ型細菌、ェシエリヒア属、 セラチア属、バチルス属に属する細菌を挙げることができる。
[0045] 以下に、コリネ型細菌及びエシ リヒア属細菌について説明する力 本発明の方法 に用いられる微生物は、これらの細菌に制限されない。
[0046] 本発明に用いるコリネ型細菌には、コリネバタテリゥム属細菌、及び、従来ブレビバ クテリウム属に分類されていたが現在コリネバタテリゥム属に統合された細菌が含まれ (Int. J. Syst. BacterioL, 41, 255 (1991))、またコリネバタテリゥム属と非常に近縁なブ レビバタテリゥム属細菌も含まれる。具体的には以下のものが例示される。
[0047] コリネバクテリウム*ァセトァシドフィラム
コリネバタテリゥム ·ァセトグルタミカム
コリネバタテリゥム ·アル力ノリティカム
コリネバタテリゥム ·カルナェ
コリネバタテリゥム ·ダルタミカム
コリネバタテリゥム 'リリウム (コリネバクテリゥム 'ダルタミカム）
コリネバタテリゥム 'メラセコーラ
コリネバタテリゥム ·サーモアミノゲネス
コリネバタテリゥム ·エフイシエンス
コリネバタテリゥム 'ノヽーキユリス
ブレビバタテリゥム ·ディノくリカタム（コリネバクテリゥム ·グルタミカム）
ブレビバタテリゥム ·フラバム（コリネバクテリゥム ·グノレタミカム）
ブレビバタテリゥム ·インマリオフィラム
ブレビバタテリゥム ·ラタトフアーメンタム（コリネバクテリゥム ·ダルタミカム） ブレビバタテリゥム 'ロゼゥム ブレビバクテリウム'サッカロリティカム
ブレビバタテリゥム ·チォゲ二タリス
ブレビバタテリゥム ·ァノレバム
ブレビパクテリゥム .セリヌム
ミクロパクテリゥム 'アンモニアフィラム
具体的には、下記のような菌株を例示することができる。
コリネバタテリゥム 'ァセトァシドフィラム ATCC13870
コリネバタテリゥム 'ァセトグルタミカム ATCC15806
コリネバクテリゥム 'アル力ノリティカム ATCC21511
コリネパクテリゥム 'カルナェ ATCC 15991
ジ ノ クテリゥム -グノレタミカム ATCC13020, 13032、 13060
コリネバタテリゥム 'リリウム（コリネバクテリゥム 'グルタミカム） ATCC15990 コリネバタテリゥム 'メラセコーラ ATCC17965
コリネバクテリゥム 'サーモアミノゲネス AJ12340 (FERM BP— 1539) コリネパクテリゥム.ノヽーキユリス ATCC13868
ブレビパクテリゥム ·ディバリカタム（コリネバクテリゥム ·グノレタミカム） ATCC1402
0
ブレビパクテリゥム 'フラバム（コリネパクテリゥム 'グルタミカム） ATCC13826、 AT CC14067
ブレビバクテリウム'インマリオフィラム ATCC 14068
ブレビバタテリゥム ·ラタトフエノレメンタム（コリネバタテリゥム ·グノレタミカム） ATCC 1 3665、 ATCC13869
ブレビパクテリゥム.ロゼゥム ATCC13825
ブレビパクテリゥム 'サッカロリティカム ATCC14066
ブレビパクテリゥム.チォゲ二タリス ATCC19240
ブレビバタテリゥム ·アンモニアゲネス（コリネバクテリゥム ·アンモニアゲネス） ATC C6871
ブレビパクテリゥム 'アルバム ATCC15111 ブレビバタテリゥム 'セリヌム ATCC15112
ミクロバタテリゥム.アンモニアフィラム ATCC15354
[0049] また、ェシエリヒア属に属する細菌としては、ェシエリヒア'コリが挙げられる。ェシエリ ヒア'コリを遺伝子工学的手法にて育種する場合には、 E. coli K12株及びその誘導 体であるェシエリヒア'コリ MG1655株（ATCC No.47076)、及び W3110株（ATCC No. 27325)を用いることができる。ェシエリヒア'コリ K12株は、 1922年にスタンフォード大 学で分離されたものであり、 λファージの溶原菌であるとともに、 F因子を持ち、接合 等遺伝的組み換え体の作成が可能である汎用性の高 ヽ菌株である。またエシ リヒ ァ 'コリ K12株のゲノム配列は既に決定されており、遺伝子情報も自由に利用出来る 。ェシエリヒア'コリ K12株や、誘導株を入手するには、例えばアメリカン'タイプ'カル チヤ一'コレクション (ATCC)より分譲を受けることができる（住所 ATCC, Address: P.O . Box 1549, Manassas, VA 20108, United States of America)。
[0050] L リジン生産能を有するコリネ型細菌としては、 S—（2 アミノエチル） システィ ン（以下、 AECと略記する）耐性変異株、その成長に L—ホモセリン等のアミノ酸を必 要とする変異株 (特公昭 48-28078号、特公昭 56-6499号）、 AECに耐性を示し、更に L ロイシン、 L ホモセリン、 L プロリン、 L セリン、 L アルギニン、 L ァラニン 、 L パリン等のアミノ酸を要求する変異株 (米国特許第 3708395号及び第 3825472 号）、 DL— a—ァミノ一 ε—力プロラタタム、 α—ァミノ一ラウリルラタタム、ァスパラギ ン酸一アナログ、スルファ剤、キノイド、 Ν ラウロイルロイシンに耐性を示す L リジ ン生産変異株、ォキザ口酢酸脱炭酸酵素 (デカルボキシラーゼ)または呼吸系酵素 阻害剤に耐性を示す L リジン生産変異株 (特開昭 50-53588号、特開昭 50-31093 号、特開昭 52-102498号、特開昭 53-9394号、特開昭 53-86089号、特開昭 55-9783 号、特開昭 55-9759号、特開昭 56-32995号、特開昭 56-39778号、特公昭 53-43591 号、特公昭 53-1833号）、ィノシトールまたは酢酸を要求する L リジン生産変異株（ 特開昭 55-9784号、特開昭 56-8692号）、フルォロピルビン酸または 34°C以上の温度 に対して感受性を示す L リジン生産変異株 (特開昭 55-9783号、特開昭 53-86090 号）、エチレングリコールに耐性を示し、 L—リジンを生産するブレビバタテリゥム属ま たはコリネパクテリゥム属の生産変異株 (米国特許出願第 333455号)が挙げられる。 [0051] 具体的には、例えば、ブレビバタテリゥム 'ラタトフアーメンタム ATCC31269、ブレビ バタテリゥム.フラバム ATCC21475、コリネバタテリゥム 'ァセトグルタミクム ATCC21491 が挙げられる。
[0052] また、実施例に記載したブレビバタテリゥム 'ラタトフアーメンタム ATCC13869/pVK- C*,plysEも、好ましい L リジン生産コリネ型細菌である。同株は、 L リジン及び L— スレオニンによるフィードバック阻害が解除された脱感作型ァスバルトキナーゼをコ一 ドする遺伝子 (lysC*)を含むプラスミド pVK-C*と、コリネパクテリゥム属細菌で知られて いる L—リジンの排出を促進する遺伝子（国際公開パンフレット第 9723597A2号)の相 同遺伝子である lysE遺伝子を含むプラスミド plysE (米国特許出願公開第 2003113899 )を、ブレビバタテリゥム 'ラタトフアーメンタムの野生株である ATCC13869株に導入し た株である。
[0053] lysC*遺伝子は、例えば、 ATCC13869株より変異処理により誘導された L リジン生 産性変異株 AJ3463 (FERM P-1987) (特公昭 51-34477号公報参照）から単離するこ とができる。 AJ3463株は、 1973年 3月 22日より、独立行政法人産業技術総合研究所 特許生物寄託センター（旧工業技術院生命工学工業技術研究所）（住所干 305-85 66 日本国茨城県つくば巿東 1丁目 1番地 1中央第 6)に、 FERM P-1987の受託番号 で寄託されている。また、 lysC*遺伝子断片は、同遺伝子を含むプラスミド p399AK9B を保持するブレビバタテリゥム ·ラタトフアーメンタム AJ12691株力も単離することもでき る。 AJ12691株は、 1992年 4月 10日に独立行政法人産業技術総合研究所特許生物 寄託センターに受託番号 FERM P-12918として寄託され、 1995年 2月 10日にブダぺス ト条約に基づく国際寄託に移管され、 FERM BP-4999の受託番号で寄託されている 。前記プラスミド P399AK9Bは、 AJ3463株由来の lysCをクローユングベクター pHSG399 (Takeshita, S et al;Gene(1987),61,63- 74参照）に挿入した得たプラスミド p399AK9に 、コリネバクテリゥム属細菌中でプラスミドを自昝複製可能にする能力をもつ DNA断 片を挿入することにより、得たものである (米国特許第 5,766,925号)。
[0054] 上記脱感作型ァスバルトキナーゼは、野生型ァスバルトキナーゼの (Xサブユニット の 279位のァラニン残基、及び j8サブユニットの 30位のァラニン残力 それぞれスレ ォニン残基に置換されている。 αサブユニット及び j8サブユニットは、ともに lysC遺伝 子に同一のフレームでコードされている。 lysC*遺伝子の塩基配列と脱感作型ァスパ ルトキナーゼの αサブユニットを配列番号 5及び 6に、同遺伝子及び脱感作型ァスパ ルトキナーゼの βサブユニットのアミノ酸配列を、配列番号 7及び 8に示す。
[0055] コリネ型細菌の lysE遺伝子は、報告されて!、るその塩基配列（GenBank accession X96471)に基づいて作製したプライマー、例えば配列番号 3および 4に示すプライマ 一を用いて、コリネ型細菌の染色体 DNAを铸型とする PCR法（PCR: polymerase chain reaction ; White.T.J. et al, Trends Genet. 5, 185 (1989)参照）によって、 lysE遺伝 子を取得することができる。コリネバタテリゥム 'ダルタミカム lysGおよび lysE遺伝子を 含む DNA断片の塩基配列（GenBank accession X96471)を配列番号 9に、同遺伝子 によってコードされる LysEタンパク質のアミノ酸配列を配列番号 10に示す。尚、 LysG は、配列番号 8の塩基番号 1723〜2352に相当する位置の相補鎖にコードされている
[0056] ァスバルトキナーゼの αサブユニット、 βサブユニット、及び LysEタンパク質をコード する DNAには、それらのタンパク質の活性が失われない限り、各々のタンパク質の 1 または複数の位置での 1または複数のアミノ酸の欠失、置換、挿入、または付加を含 む可能性のあるタンパク質をコードする DNAが含まれる。「複数」のアミノ酸の数は、 タンパク質の三次元構造中のアミノ酸残基の位置または種類よつて異なる力、それぞ れのタンパク質に対して好ましくは 2〜30、より好ましくは 2〜20、特に好ましくは 2〜 10である。これは以下の理由による。いくつかのアミノ酸は互いに高い相同性を有し 、そしてそのようなアミノ酸における差異はタンパク質の三次元構造およびその活性 に大きくは影響しないからである。したがって、それぞれのタンパク質は、配列番号 6 、 8、又はに記載のアミノ酸残基に対して 50%以上、好ましくは 70%以上、より好まし くは 90%以上、特に好ましくは 95%以上の相同性を有し、かつァスバルトキナーゼ 又は LysEタンパク質の活性を有するものであり得る。
[0057] 上記のようなタンパク質の改変は、それぞれのタンパク質の活性が維持されるような 保存的変異である。置換は、アミノ酸配列中の少なくとも 1残基が除去され、そこに他 の残基が挿入される変化である。それぞれのタンパク質の元々のアミノ酸を置換し、 かつ、保存的置換とみなされるアミノ酸としては、 alaから ser又は thrへの置換、 argから gln、 his又は lysへの置換、 asn力ら glu、 gln、 lys、 his又は aspへの置換、 asp力ら asn、 glu 又は ginへの置換、 cys力ら ser又は alaへの置換、 gin力ら asn、 glu、 lys、 his、 asp又は arg への置換、 glu力ら asn、 gln、 lys又は aspへの置換、 gly力ら proへの置換、 his力ら asn、 1 ys、 gln、 arg又は tyrへの置換、 ile力ら leu、 met、 val又は pheへの置換、 leu力ら ile、 met 、 val又は pheへの置換、 lys力ら asn、 glu、 gln、 his又は argへの置換、 met力ら ile、 leu、 v al又は pheへの置換、 phe力ら trp、 tyr、 met、 ile又は leuへの置換、 serから thr又は alaへ の置換、 thrから ser又は alaへの置換、 trpから phe又は tyrへの置換、 tyrから his、 phe又 は trpへの置換、及び、 valから met、 ile又は leuへの置換が挙げられる。
[0058] 配列番号 6、 8又は 10に示すアミノ酸配列を有するタンパク質と実質的に同じタン ノ ク質をコードする DNAは、例えば、 1または複数のアミノ酸残基が欠失、置換、挿 入、または付加されるように部位特異的突然変異法を使用して、配列番号 6、 8又は 1 0に示すアミノ酸配列を有するタンパク質をコードするヌクレオチド配列を改変するこ とにより、得ることができる。そのような改変 DNAは、変異を発生させる試薬および条 件での処理を用いる従来法により得られ得る。そのような処理として、本発明のタンパ ク質をコードする DNAのヒドロキシルァミンでの処理、または DNAを保持する細菌の UV照射、または N—メチル— N'— -トロ— N— -トロソグァ二ジンまたは亜硝酸など の試薬での処理が挙げられる。
[0059] 上記のような改変タンパク質をコードする DNAは、ストリンジェントな条件下で lycC 遺伝子もしくは lysE遺伝子またはこれらの遺伝子の一部分とハイブリダィズし、かつァ スパルトキナーゼ活性又は LysEタンパク質の活性を有するタンパク質をコードする D NAを単離することにより得られ得る。用語「ストリンジヱントな条件」には、いわゆる特 異的ハイブリッドが形成され、かつ、非特異的ハイブリッドが形成されないような条件 を含む。例えば、ストリンジェントな条件には、高い相同性を有する DNA、例えば 70 %以上、好ましくは 80%以上、より好ましくは 90%以上、特に好ましくは 95%以上の 相同性を有する DNAが互いにハイブリダィズする条件が含まれる。あるいは、ストリ ンジェントな条件には、サザンンハイブリダィゼーシヨンでの通常の洗浄の条件、例え ば、 60。C、 1 X SSC、 0. 1%SDS、好ましくは 0. 1 X SSC、 0. 1%SDS、を含む。
[0060] また、ェシエリヒア属に属する L—リジン生産菌としては、 L—リジンアナログに耐性 を有する変異株が例示できる。この L リジンアナログは、ェシエリヒア属細菌の増殖 を阻害するようなものである力 その抑制は L リジンが培地中に共存すれば、全体 的または部分的に解除されるようなものである。例えば、ォキサリジン、リジンノヽイド口 キサメート、 （S)— 2—アミノエチル一 L システィン (AEC)、 γ—メチルリジン、 oc— クロロカプロラタタム等がある。これらのリジンアナログに耐性を有する変異株は、通常 の人工変異操作をェシエリヒア属の微生物に施すことにより得られる。 L—リジン製造 に用いる菌株として、具体的には、ェシエリヒア'コリ AJ11442 (FERM BP— 1543 、 NRRL B— 12185 ;特開昭 56— 18596号及び米国特許第 4346170号参照）、 ェシエリヒア'コリ VL611が挙げられる。 AJ11442株は、 1981年 5月 1日に、独立行 政法人産業技術総合研究所特許生物寄託センター（旧工業技術院生命工学ェ 業技術研究所）（住所干305-8566 日本国茨城県つくば巿東 1丁目 1番地 1中央第 6 )に、受託番号 FERM P-5084として寄託されており、 1987年 10月 29日に、この原 寄託からブダペスト条約に基づく国際寄託へ移管され、 FERM BP-1543として寄託さ れている。以上の微生物のァスバルトキナーゼは、 L リジンによるフィードバック阻 害が解除されている。
[0061] また、例えば、脱感作型ァスバルトキナーゼ以外の、 L リジン生合成系に関与す る酵素をコードする遺伝子の発現を増強した細菌も好適な L リジン生産菌として利 用できる。例えば、ジヒドロジピコリン酸合成酵素、ジヒドロジピコリン酸レダクターゼ、 ジアミノピメリン酸脱炭酸酵素、ジアミノピメリン酸デヒドロゲナーゼ (以上、国際公開 9 6/40934号パンフレット）、ホスホェノールピルビン酸カルボキシラーゼ（特開昭 60-87 788号公報）、ァスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ (特公平 6-102028号公報）、ジァ ミノピメリン酸ェピメラーゼ遺伝子 (特開 2003-135066号公報）、ァスパラギン酸セミア ルデヒド脱水素酵素（国際公開 00/61723号パンフレット）等のジアミノピメリン酸経路 の酵素、あるいはホモアコニット酸ヒドラターゼ（特開 2000-157276号公報）等のアミノ アジピン酸経路の酵素等が挙げられる。
[0062] L—リジン生産能を有するェシエリヒア'コリとして具体的には、例えば、ェシエリヒア' コリ W3110(tyrA)/pCABD2 (国際公開第 WO95/16042号記載)等を挙げることができ る。ェシエリヒア'コリ W3110(tyrA)/pCABD2は、ェシエリヒア'コリの tyr A欠損株である W3110(tyrA) (AJ12604と命名され、平成 3年 1月 28日に独立行政法人産業技術総 合研究所特許生物寄託センター（旧工業技術院生命工学工業技術研究所）（住所 〒 305-8566日本国茨城県つくば巿東 1丁目 1番地 1中央第 6)に FERM P-11975の 受託番号で寄託され、平成 3年 9月 26日にブダペスト条約に基づく国際寄託に移管 されて、 FERM BP-3579の受託番号で寄託されている）に、 L リジン生合成系酵素 遺伝子を保持するプラスミド PCABD2を導入した株である。
[0063] pCABD2は、 118位のヒスチジン残基がチロシン残基に変異し、 L—リジンによるフィ ードバック阻害が解除された変異型ジヒドロジピコリン酸合成酵素をコードする遺伝子 、 352位のスレオニン残基がイソロイシン残基に変異し、 L リジンによるフィードバック 阻害が解除された変異型ァスバルトキナーゼ IIIをコードする遺伝子、及び、ジヒドロジ ピコリン酸レダクターゼ、ジアミノピメリン酸デヒドロゲナーゼをコードする遺伝子を保 持している。
[0064] また、 E. coliW3110(tyrA)株は、以下のようにして得ることができる。ところで、欧州 特許公開 92年 488424号公報には、 W3110(tyrA)株にプラスミドを導入して形成され る株が多く記載されている。例えば、プラスミド pHATermを導入して得られる株は、 E. coli W3110(tyrA)/pHATerm株と命名され、工業技術院生命工学工業技術研究所に 寄託されており、登録番号 FERM BP-3653が付与されている。この E. coli W3110(tyr A)/pHATerm株からプラスミド pHATermを脱落させることによって、 W3110(tyrA)株を 取得することができる。プラスミドの脱落は常法によって行うことができる。
[0065] また、ェシエリヒア'コリの L—リジン生産菌としては、 WC196株（WO96/17930号国 際公開パンフレット参照）を用いることもできる。 WC196株は、ェシエリヒア'コリ K-12由 来の W3110株に AEC (S— (2 アミノエチル）一システィン)耐性を付与することによ つて育種されたものである。同株は、エシ リヒア 'コリ AJ13069株と命名され、平成 6 年 12月 6日付で工業技術院生命工学工業技術研究所 (現独立行政法人産業技術 総合研究所特許生物寄託センター、 T 305-8566日本国茨城県つくば巿東 1丁目 1 番地 1 中央第 6)に受託番号 FERM P-14690として寄託され、平成 7年 9月 29日にブ ダペスト条約に基づく国際寄託に移管され、受託番号 FERM BP-5252が付与されて いる。 [0066] 本発明に用いることができる微生物は、 L リジンの生合成経路力 分岐して L リ ジン以外の化合物を生成する反応を触媒する酵素の活性や、 L リジン生産に負に 機能する酵素活性が低下または欠損していてもよい。 L リジン生産において、この ような酵素としては、ホモセリンデヒドロゲナーゼ、リジンデカルボキシラーゼ（cadA, Id cC)、マリックェンザィムがあり、該酵素の活性が低下または欠損した株は国際公開 第 W095/23864号、第 WO96/17930号パンフレット、第 WO2005/010175号パンフレツ トなどに記載されている。
[0067] これらの酵素活性を低下あるいは欠損させる方法としては、通常の変異処理法によ つて、染色体上の上記酵素の遺伝子に、細胞中の当該酵素の活性が低下または欠 損するような変異を導入すればよい。例えば、遺伝子組換えによって、染色体上の酵 素をコードする遺伝子を欠損させたり、プロモーターやシャインダルガルノ（SD)配列 等の発現調節配列を改変したりすることなどによって達成される。また、染色体上の 酵素をコードする領域にアミノ酸置換 (ミスセンス変異)を導入すること、また終始コド ンを導入すること (ナンセンス変異）、一〜二塩基付加'欠失するフレームシフト変異 を導入すること、遺伝子の一部分を欠失させることによつても達成出来る (Journal of b iological Chemistry 272:8611-8617 (1997)。また、コード領域が欠失したような変異 酵素をコードする遺伝子を構築し、相同組換えなどによって、該遺伝子で染色体上 の正常遺伝子を置換すること、トランスポゾン、 IS因子を該遺伝子に導入することによ つても酵素活性を低下または欠損させることができる。
[0068] 例えば、上記の酵素の活性を低下または欠損させるような変異を遺伝子組換えに より導入する為には、以下のような方法が用いられる。 目的遺伝子の部分配列を改 変し、正常に機能する酵素を産生しないようにした変異型遺伝子を作製し、該遺伝 子を含む DNAでコリネ型細菌を形質転換し、変異型遺伝子と染色体上の遺伝子で 組換えを起こさせることにより、染色体上の目的遺伝子を変異型に置換することが出 来る。このような相同組換えを利用した遺伝子置換による部位特異的変異導入は既 に確立しており、直鎖上 DNAを用いる方法や温度感受性複製起点を含むプラスミド を用いる方法などがある（Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2000, vol. 97, No. 12, p6640- 6645、米国特許第 6303383号、又は特開平 05-007491号公報)。また、上述のような 相同組換えを利用した遺伝子置換により部位特異的変異導入は、宿主上で複製能 力を持たな 、プラスミドを用いても行うことが出来る。
[0069] また、 L—リジン、 L—アルギニンの排出遺伝子である ybjEの発現量を増強するよう に改変した微生物も本発明に用いることができる（国際公開 WO2005/073390号パン フレット）。
[0070] セラチア属に属する L リジン生産菌としては、 L リジンによるフィードバック阻害 が解除される変異を有するジヒドロジピコリン酸合成酵素をコードする DNAが細胞内 に導入されて形質転換されたセラチア属細菌、さらに L リジンによるフィードバック 阻害が解除されたァスバルトキナーゼを保持するセラチア属細菌が挙げられる（国際 公開第 W096/41871号)。
[0071] L アルギニン生産能を有するコリネ型細菌としては、コリネ型細菌野生株;サルフ ァ剤、 2—チアゾールァラニン又はひ—アミノー βーヒドロキシ吉草酸等の薬剤に耐 性を有するコリネ型細菌； 2—チアゾールァラニン耐性に加えて、 L—ヒスチジン、 L- プロリン、 Lースレオ-ン、 L—イソロイシン、 L—メチォニンまたは L—トリプトファン要 求性を有するコリネ型細菌（特開昭 54— 44096号）；ケトマロン酸、フルォロマロン酸 又はモノフルォロ酢酸に耐性を有するコリネ型細菌（特開昭 57— 18989号）；アルギ 二ノールに耐性を有するコリネ型細菌（特開昭 62— 24075号）；Χ—グァ-ジン (Xは 脂肪酸又は脂肪鎖の誘導体)に耐性を有するコリネ型細菌 (特開平 2— 186995号） 等が挙げられる。また、 L アルギニンのリブレッサーを欠損したコリネ型細菌（米国 特許出願公開 2002-0045233号明細書）、及び、グルタミン酸デヒドロゲナー活性を上 昇させたコリネ型細菌（欧州特許出願公開 1057893号明細書)も、 L アルギニン生 産に好適な菌株である。
[0072] 具体的には、ブレビバタテリゥム 'フラバム AJ11169 (FERM BP-6892)、コリネバクテ リウム 'グルタミカム AJ12092 (FERM BP- 6906)、ブレビバタテリゥム 'フラバム AJ11336 (FERM BP-6893)、ブレビバタテリゥム 'フラバム AJ11345 (FERM BP-6894)、ブレビ バタテリゥム.ラタトフアーメンタム AJ12430 (FERM BP-2228)が挙げられる。 AJ11169 株及び AJ12092株は特開昭 54— 44096号記載の 2 チアゾールァラニン耐性株、 A J11336株は特公昭 62— 24075号記載のアルギ-ノール耐性及びサルファダイアジ ン耐性を有する株、 AJ11345株は特公昭 62— 24075号記載のアルギ-ノール耐性 、 2—チアゾールァラニン耐性、サルファグァ-ジン耐性、及びヒスチジン要求性を有 する株、及び AJ12430株は特開平 2— 186995号記載のオタチルダァ-ジン耐性及 び 2 -チアゾールァラニン耐性を有する株である。
[0073] コリネバタテリゥム 'グルタミカム AJ12092 (FERM BP- 6906)は、コリネバタテリゥム 'グ ルタミカム AJ12092株と命名され、平成 6年 12月 6日付で工業技術院生命工学工業 技術研究所 (現独立行政法人産業技術総合研究所特許生物寄託センター、〒30 5-8566 日本国茨城県つくば巿東 1丁目 1番地 1 中央第 6)に受託番号 FERM P-12 092として寄託され、 1999年 10月 01日にブダペスト条約に基づく国際寄託に移管され 、受託番号 FERM BP-6906が付与されている。
[0074] L アルギニン生産能を有すェシエリヒア属細菌としては、 argA遺伝子を導入され たェシエリヒア'コリ（特開昭 57-5693号参照）や、酢酸資化性変異株の L アルギニン 生産性誘導体であるエシ リヒア 'コリ 237株（ロシア特許出願第 2000117677号）が 挙げられる。 237株は、 2000年 4月 10日にロシアン 'ナショナル 'コレクション'ォブ 'ィ ンダストリアル'マイクロオーガ-ズムス（Russian National Collection of Industrial Mic roorganisms (VKPM), GNU Genetika、任所： Russia, 117545, Moscow, 1 Dorozhnypr oezd, 1)に VKPM B-7925の番号で寄託され、 2001年 5月 18日にブダペスト条約に基 づく国際寄託に移管された。 237株の誘導体である L アルギニンによるフィードバ ック阻害に耐性な変異を有する株である 382株 (特開 2002-017342号公報）を用いる こともできる。ェシエリヒア'コリ 382株は、 2000年 4月 10日にロシアン 'ナショナル'コレ クシヨン'ォブ ·インダストリアル ·マイクロオーガニズムスに VKPM B-7926の番号で寄 託され、 2001年 5月 18日にブダペスト条約に基づく国際寄託に移管された。
[0075] L アルギニン生産能を有するセラチア属細菌としては、 L アルギニン分解能を 欠損し、アルギニンのアンタゴ-スト及びカナバニンに耐性を有し、リジンを要求する セラチア.マルセッセンス（特開昭 52-8729号参照）が挙げられる。
[0076] L ヒスチジン生産能を有するコリネ型細菌としては、ブレビバタテリゥム属に属し、 サイアミンアンタゴ-ストに耐性を有する微生物、具体的にはブレビバタテリゥム 'ラタ トフアーメンタム FERM P— 2170、 FERM P— 2316、 FERM P— 6478、 FERM P— 6479、 FER M P-6480、 FERM P-6481が挙げられる（特開昭 59— 63194号）。また、ブレビバクテ リウム属またはコリネバタテリゥム属に属し、ポリケタイド類に耐性を有し、 L ヒスチジ ン生産能を有する変異株、具体的には FERM P-4161、 FERM P-7273, FERM P-837 1、 FERM P-8372, ATCC14067が挙げられる。
[0077] L ヒスチジン生産能を有するェシエリヒア属細菌としては、ェシエリヒア属に属しヒ スチジンアナログに耐性を有する変異株、例えばェシエリヒア'コリ R-344株、及び、同 株より抽出した L—ヒスチジン合成系酵素遺伝子が導入されたェシエリヒア属細菌が 挙げられる。具体的には、ェシエリヒア'コリ NRRL- 12116、 NRRL- 12118、 NRRL- 1211 9、 NRRL- 12120、 NRRL- 12121が挙げられる（特開昭 56— 5099号）。
[0078] また、 L ヒスチジン生産能を有するバチルス属細菌としては、バチルス属に属しヒ スチジンアナログに耐性を有する変異株、及び、同変異株より得たヒスチジンアンタゴ 二スト耐性に関与する遺伝子が導入されたバチルス属細菌が挙げられる。具体的に は、 FERM BP- 218、 FERM BP- 224、 FERM BP- 219 (特開昭 58— 107192号）力挙 げられる。
[0079] 本発明により得られる塩基性物質を含む発酵液又はその処理物は、炭酸イオン又 は重炭酸イオンを、解離した塩基性物質に対するカウンタァ-オンとして含んで 、る 。この炭酸イオン又は重炭酸イオンは、培養液を加熱することや、培養液を濃縮する ことや、塩酸などの強酸を添加して pHを低下させることによって、炭酸ガスとして放出 される。従って発酵液又は発酵生産物中の固形成分にしめる塩基性物質の含量が 高められる。
[0080] 本発明によって、塩化物イオンや硫酸イオンを重炭酸イオンや炭酸イオンなどで置 き換えることにより、塩ィ匕物イオンの使用量を設備の腐食を起こさないレベルにまで 削減し、あるいは硫酸イオンを削減することができる。また、発酵後、培養液に塩酸を 加えるだけで、重炭酸イオンや炭酸イオンを塩ィ匕物イオンに置き換えることが可能で あり、更に濃縮するだけで、イオン交換を行わなくともリジン塩酸塩を得ることができ、 さらには直接リジン塩酸塩の結晶を分取することが可能である。
本発明において、「発酵生産物」とは、前記発酵液から得られる濃縮液、乾燥物、 及び、発酵液又はその乾燥物を加工した製品を含む。 実施例
[0081] 以下、本発明を実施例により更に具体的に説明する。
[0082] 〔実施例 1〕コリネ型 L リジン生産菌の構築
野生型コリネ型細菌に、脱感作型ァスバルトキナーゼをコードする遺伝子と、及びリ ジン排出因子をコードする遺伝子を導入し、 L リジン生産菌を構築した。
[0083] (1)脱感作型ァスバルトキナーゼをコードする遺伝子の取得
L—リジン及び L—スレオニンによるフィードバック阻害が解除された脱感作型ァス バルトキナーゼ (Ask*)をコードする遺伝子 (lysC*)は、コリネバタテリゥム'ダルタミカム (ブレビバタテリゥム 'ラタトフアーメンタム) ATCC13869株より変異処理により誘導され た L リジン生産性変異株 AJ3463 (FERM P-1987) (特公昭 51-34477号公報参照）か ら PCR法により単離した。
[0084] AJ3463株を CM- Dex培地で培養し、得られた菌体より染色体 DNAを通常の方法（Bi ochem. Biophys. Acta., 72, 619-629 (1963))により抽出した。この染色体 DNAを铸型 にして、制限酵素 BamHI部位を、 目的 DNA断片の 5'末端に持つように導入するよう なオリゴヌクレオチド ASK-F (配列番号 1)、制限酵素 Kpnl部位を、 目的 DNA断片の 3 ，末端に持つように導入するようなオリゴヌクレオチド ASK-R (配列番号 2)を PCRのプ ライマーとして、 目的遺伝子である lysC*を含む遺伝子 DNA断片を増幅した。増幅の 条件は、変性 (デナチユレーシヨン）工程 98°C： 10秒、対合 (アニーリング）工程 55°C： 3 0秒、伸長 (イクステンション）工程 72°C : 2分力もなるサイクルを 25回行った。使用した 酵素は Pyrobest DNAポリメラーゼ (宝酒造製)で、メーカーの使用指示書に従って使 用した。
[0085] 増幅された DNA断片をフエノール'クロロフォルム処理とエタノール沈殿により精製 した後、制限酵素 BamHIと Kpnlにて消化した。得られた反応液をァガロースゲル電気 泳動にて展開し、 lysC*遺伝子を含むバンドを切り出し、定法に従って遺伝子断片を 精製した。
[0086] 一方、ェシエリヒア'コリとコリネバタテリゥム 'グルタミカムのシャトルベクターである p VK7 (米国特許第 6,004,773号参照）を、同様に制限酵素 BamHIと Kpnlにて処理した 後、上記の lysC*断片とライゲーシヨンした。このライゲーシヨン反応液を用いて、 E. col i JM109株のコンビテントセル（宝酒造製）を、製造元のプロトコールに従い形質転換 し、カナマイシン耐性のコロニーを数個選択した。
[0087] 前記の pVK7は、以下のようにして、ェシエリヒア'コリ用ベクターである pHSG299 (Km r;Takeshita, S. et al.， Gene, 61, 63-74, (1987)参照)にブレビバタテリゥム'ラタトファ ーメンタムのタリブティックプラスミドである PAM330を結合することによって構築した（ 特開平 11-266881号、 WO99/07853号国際公開パンフレット参照）。 pAM330は、ブレ ビバクテリウム 'ラタトフアーメンタム ATCC13869株より調製した。 pHSG299を Avail (宝 酒造 (株)製）にて切断し、 T4 DNAポリメラーゼにて平滑末端ィ匕したのち、 Hindlll (宝 酒造 (株)製）にて切断し、 T4 DNAポリメラーゼにて平滑末端ィ匕した pAM330と接続し た。こうして pVK7を取得した。 pVK7は、 E. coli及びブレビバタテリゥム'ラクトファーメ ンタムの細胞中で自律複製可能であり、かつ、 pHSG299由来のマルチプルクロー- ングサイトと、 lacZ，及びマーカーとしてカナマイシン耐性遺伝子を保持して 、る。
[0088] 前記のようにして得られたカナマイシン耐性のコロニーから、定法に従ってプラスミ ド DNAを抽出し、 目的の lysC*遺伝子を含むプラスミドを pVK- C*と命名した。
[0089] (2)リジン排出因子 lysEをコードする遺伝子の取得
ブレビバタテリゥム 'ラタトフアーメンタム ATCC13869株の染色体 DNAを铸型として 、コリネバクテリゥム属細菌で知られている L—リジンの排出を促進する遺伝子（国際 公開パンフレット第 9723597A2号)である lysE遺伝子を、 PCR法によって単離した（ 米国特許出願公開第 2003113899号参照)。前記菌株の染色体 DNAは、上記と同様 にして調製した。
[0090] DNAプライマーには、 LysE- F (配列番号 3)及び LysE-R (配列番号 4)を用いた。ま た PCR反応は、 Pyrobest (宝酒造 (株)製）を用い、 94°C、 90秒の熱処理の後、変性 94 。C、 20秒、アニーリング 55°C、 30秒、伸長反応 72°C、 60秒のサイクルを 30サイクル行 い、その後 72°Cで 10分間保温することにより行った。この反応により、 目的の大きさの DNA断片を取得した。この DNA断片を精製後、クロー-ングベクター pCR2.1 (Invitro gene社製）に、製造元のプロトコールに従いクローユングした。このライゲーシヨン反 応液を用いて、 E. coli JM109株のコンビテントセル（宝酒造製）を、製造元のプロトコ ールに従い形質転換し、アンピシリン耐性のコロニーを数個選択した。これらのコロニ 一からプラスミド DNAを抽出し、 目的の構造を有しているプラスミドを pCRlysEと命名し た。
[0091] 次に、 pCRlysEを、制限酵素 BamHIと Xbalにより消化し、ァガロースゲル電気泳動を 行い、 lysE遺伝子を含む断片を取得した。一方、ェシエリヒア'コリとコリネパクテリゥム •ダルタミカムのシャトルベクターである pKC (米国特許出願公開第 2003113899号参 照）を、同様に制限酵素 BamHIと Xbalにて処理した後、ァガロースゲル電気泳動を行 い、クロラムフエ-コール耐性遺伝子を含む遺伝子断片を取得し、精製した後、上記 の lysE断片とライゲーシヨンした。このライゲーシヨン反応液を用いて、 E. coli JM109 株のコンビテントセル (宝酒造製)を、製造元のプロトコールに従い形質転換し、クロラ ムフエ-コール耐性のコロニーを数個選択した。そうして得られたコロニーからプラス ミドを調製することで、 LysE発現プラスミド plysEを取得した。
[0092] 尚、 pKC4は、以下のようにして作製されたものである。既に取得されているコリネ型 細菌で自律複製可能なプラスミド pHM1519 (Agric. Biol. Chem., 48, 2901-2903 (198 4))由来の複製起点を持つプラスミド pHK4 (特開平 5-7491号公報参照)を制限酵素 B amHIおよび Kpnlで消化して、複製起点を含む遺伝子断片を取得し、得られた断片を DNA平滑末端ィ匕キット（宝酒造)を用い平滑末端ィ匕した後、 Kpnlリンカ一（宝酒造)を 用いて、 pHSG399 (宝酒造）の Kpnl部位にライゲーシヨンにより挿入した。このライゲ ーシヨン反応液を用いて、 E.coli JM109株のコンビテントセル（宝酒造製）を、製造元 のプロトコールに従い形質転換し、クロラムフエ-コール耐性のコロニーを数個選択し た。そうして得られたコロニー力もプラスミドを調製することで、 pKC4を取得した。
[0093] (3) L—リジン生産性コリネ型細菌の構築
上記の 2つのプラスミド、 pVK- C*及び plysEを、エレクト口ポレーシヨン法により、ブレ ビバクテリウム 'ラタトフアーメンタム ATCC13869株に導入した。エレクト口ポレーシヨン は、 BIO- RAD社製 Gene Pulserを用い、キュベットの電極間隔は 0.1cm、パルス条件 は、 25 μ F, 200 Ω , 1.8kVの条件で行った。尚、得られたプラスミド導入株は、クロラム フエ-コール 5 μ g/1とカナマイシン 25 μ g/1を含む CM- Dex寒天プレート（培地組成は 下記参照）で選択した。得られたプラスミド導入株を、クロラムフエ-コール 5 g/1と力 ナマイシン 25 g/1含む CM- Dex液体培地で、 31.5°Cで一晩振とう培養した。尚、振と う培養は、試験管を用いて 3mlの培養液中で行った。
[0094] CM-Dex培地は、以下のようにして調製した。表 1の成分を全て混ぜ合わせて力 K OHで pH7.5に調整し、その後、 120°Cで 20分間オートクレーブして滅菌した。また、寒 天培地の場合は、寒天を最終濃度で 20g/Lとなるように添加した。
[0095] [表 1] 表 1 CM- Dex培地の組成（1 L当たり) グルコース 5g
ポリペプトン 10g
酵母エキス 10g
KH2P04 1 g
MgS04-7H20 0.4g
FeS04- 7H20 0.01 g
MnS04-4-5H20 0.01 g
尿素 3g
豆濃 (窒素重量換算で） 1.2g
「大豆タンパク質加水分解物」
Biotin 10 i g
滅菌水にてメスアップ 1し
[0096] 上記のようにして、 L リジン生産性コリネ型細菌 ATCC13869/pVK- C*,plysEを得 た。
[0097] 〔実施例 2〕アルカリ性の培地における L リジン生産菌の生育及び L リジン生産に 対する総アンモニア濃度の影響
実施例 1で構築した L—リジン生産菌を用いて、アルカリ性の培地における Lーリジ ンの生産性が阻害されない総アンモニア濃度を調べた。
[0098] まず、従来の一般的な培養方法、即ち、 A培地 (組成を表 2に示した）にグルコース に対して 55% (w/w)の硫酸アンモ-ゥムを添カ卩した培地（B培地）を使用して、培養 中、アンモニアガスにより培養液の pHを一定に保つ方法で、 L—リジン発酵を行った
。前記 pHは、 7.0又は 8.0とした。
[0099] [表 2] 表 2 A培地の組成（1 L当たり) グルコース 100g
酵母エキス 10g
KH2P04 1 g
MgS04- 7H20 1 g
ビタミン B1塩酸塩 2mg
ビォチン 0.5mg
ニコチン酸アミド 5mg
FeS04- 7H20 10mg
MnS04'4〜5H20 10mg
10% GD- 1 13 (消泡剤） 0.05mL
[0100] 具体的には以下のようにして培養を行った。前記菌株を 3mlの CM-Dex液体培地に 植菌し、 31.5°Cでー晚振盪培養した後、その培養液 200 1を CM-Dex寒天培地に均 一に塗布し、 31.5°Cで一晚静置培養した。その後、同寒天培地に生育した L—リジン 生産菌を 1枚のプレートの 1/3に相当する分を、 300mlの B培地を入れたジャーファー メンターに植菌して培養を行った。培養中、フィルターによって除菌した空気を 1分間 に 300ml通気し、攪拌速度は 700rpmに、培養液の温度は 31.5°Cに保った。結果を図 1に示す。
[0101] その結果、 pH7.0では L—リジンが 17.4g/L蓄積し、生産速度は、 0.725g/L/hrであ つた。一方、 pH8.0では殆ど増殖が認められず、発酵は成立しなかった。（図 1)
[0102] 次に、前記 L—リジン生産菌を用いて、硫酸アンモ-ゥムを含まない培地で発酵を 行った。
[0103] 前記 L—リジン生産菌を 3mlの CM- Dex液体培地に植菌し、 31.5°Cでー晚振盪培養 した。その培養液 200 1を CM- Dex寒天培地に均一に塗布し、 31.5°Cでー晚放置し 、 A培地（硫酸アンモ-ゥム無添加）に 300mlをジャーフアーメンターに入れ、アンモ- ァガスを吹き込んで、 pH7.8, pH8.2, pH8.9の各 pH条件に調整した。この培地に、上 記の寒天培地に生育したリジン生産菌を 1枚の培地の 1/3に相当する分を植菌して 培養を行った。培養中は、フィルターによって除菌した空気を 1分間に 300ml通気し、 攪拌速度は 700rpmに、培養液の温度は 31.5°Cで一定に保った。培養中は、アンモ- ァガスを培養液に吹き込むことによって pHを一定に調整した。その結果、 pH8.9の条 件では培養液中の総アンモニア濃度が lOOmMを超えた後、特に生育や L リジン生 産が強く阻害されることが確認された。
[0104] 上記の培養方法では、培養時間が経過するに従って L リジン生産菌が発生する 炭酸ガスが、炭酸イオンや重炭酸イオンとして培養液中に溶け込み pHを下げるため 、 pHを設定値に調整するために添加されるアンモニアの量が多くなる。また、制御す る pHが高いほど炭酸イオンや重炭酸イオンの溶け込む濃度が高くなるため、 pHを設 定値に調整するために添加されるアンモニアの濃度やより高くなる。
[0105] 解離していないアンモニアは細胞内に容易に浸透し、菌体に害を与える。 pHが高 いほどアンモニアの解離度が低くなることから、総アンモニア濃度が同じであっても、 pHが高いほど菌が受ける生育阻害はより大きい。したがって、 pH8.9以下では総アン モ-ァ濃度を低濃度に、例えば lOOmM以下に制御すれば、菌の生育や L リジン蓄 積の悪ィヒは少な 、と判断した。
[0106] 次に、培地中の総アンモニア濃度を lOOmM以下に制御して、 pH7.8, pH8.2, pH8.9 の各 pH条件において L—リジン生産培養を行った。
[0107] 前記菌株を 3mlの CM-Dex液体培地に植菌し、 31.5°Cでー晚振盪培養した。その培 養液 200 1を CM- Dex寒天培地に均一に塗布し、 31.5°Cで一晚静置培養した。 A培 地（硫酸アンモ-ゥム無添加） 300mlをジャーフアーメンターに入れ、同培地にアンモ -ァガスを吹き込んで、 pH7.5、 pH7.8、 pH8.2又は pH8.9の各 pH条件に調整した。こ の培地に、上記の寒天培地に生育した L リジン生産菌を 1枚のプレートの 1/3に相 当する分を植菌して培養を行った。培養中、フィルターによって除菌した空気を 1分 間に 300ml通気し、攪拌速度は 700rpmに、培養液の温度は 31.5°Cに保った。培養中 の pHは、アンモニアの代わりに 6規定の濃度の水酸ィ匕カリウムを用いて各設定値に った。
[0108] 培養液中の総アンモニア濃度は、培養液を経時的にサンプリングして、アンモニア 電極とイオン計（Orion社製）を用いて測定し、必要に応じて 10%アンモニア水溶液を 添加して、 0から lOOmMの間になるように制御した。また、培養液中の溶存酸素濃度 を観察することによって、アンモニアが枯渴した時に溶存酸素濃度が急激に上昇す ることを検知し、その際、 10%アンモニア水溶液を添加することで、培養液中のアンモ ユアが継続して枯渴しな 、ようにした。結果を図 2に示す。
[0109] その結果、 pH7.8から pH8.9までの間のどの pH条件でも、良好な生育及び L リジン 生産がみられた。また、従来の一般的な培養方法で PH7.0で発酵を行った場合に比 ベて、生産速度では 115%以上の成績が得られた。
[0110] 〔実施例 3〕 L リジンの生産
本実施例では、総アンモニア濃度のみを制御し、 pHの制御は行わずに、 L リジン 発酵を行った。総アンモニア濃度を制御する範囲は、実施例 2の結果より lOOmM以 下の範囲を選択した。
[0111] 前記 L—リジン生産菌を 3mlの CM-Dex液体培地に植菌し、 31.5°Cで一晩振盪培養 した。その培養液 200 1を CM- Dex寒天培地に均一に塗布し、 31.5°Cで一晚静置培 養した。 A培地 (硫酸アンモ-ゥム無添加） 300mlをジャーフアーメンターに入れ、同培 地にアンモニアガスを吹き込んで、総アンモニア濃度を 23.8mMに調整した。この培 地に、上記の寒天培地に生育した L リジン生産菌を 1枚のプレートの 1/3に相当す る分を植菌して培養を行った。培養中、フィルターによって除菌した空気を 1分間に 3 00ml通気し、攪拌速度は 700rpmに、培養液の温度は 31.5°Cに保った。培養液を経 時的にサンプリングして総アンモニア濃度を測定し、 0から lOOmMの間になるように、 必要に応じて 10%アンモニア水を適量培地に添カ卩した。その結果、 15.9g/Lのリジンを 蓄積し、 L—リジン発酵が成立した（図 3)。
[0112] 〔実施例 4〕ェシエリヒア 'コリ L リジン生産菌の構築
< 1 >リジンデカルボキシラーゼをコードする cadA,ldcC遺伝子破壊株の構築 まずリジンデカルボキシラーゼ非産生株の構築を行った。リジンデカルボキシラー ゼは、 cadA遺伝子（Genbank Accession No. NP_418555.配列番号 15)、 IdcC遺伝子 (Genbank Accession No. NP.414728.配列番号 17)によってコードされている（国際 公開 WO96/17930号パンフレット参照）。ここで親株は、 WC196株を用いた。
[0113] リジンデカルボキシラーゼをコードする cadA、 IdcC遺伝子の欠失は、 Datsenkoと Wa nnerによって最初に開発された「Red- driven integrationjと呼ばれる方法（Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2000, vol. 97, No. 12, p6640- 6645)とえファージ由来の切り出 しシステム（J. Bacteriol. 2002 Sep; 184(18): 5200-3. Interactions between integrase and excisionase in the phage lambda excisive nucleoprotein complex. Cho EH, Gum port RI, Gardner JF.)によって行った。「Red— driven integration方法によれば、 目 的とする遺伝子の一部を合成オリゴヌクレオチドの 5 '側に、抗生物質耐性遺伝子の 一部を 3 '側にデザインした合成オリゴヌクレオチドをプライマーとして用いて得られた PCR産物を用いて、一段階で遺伝子破壊株を構築することができる。さらにえファー ジ由来の切り出しシステムを組合わせることにより、遺伝子破壊株に組み込んだ抗生 物質耐性遺伝子を除去することが出来る（特開 2005-058227)。
[0114] (l) cadA遺伝子の破壊
PCRの铸型として PCRの铸型として、プラスミド pMWl 18- attL— Cm- attR (特開 2005 -058827)を使用した。 PMW118- attL— Cm- attRは、 pMW118(宝バイオ社製)にえフ ァージのアタッチメントサイトである attL及び attR遺伝子と抗生物質耐性遺伝子である cat遺伝子を挿入したプラスミドであり、 attL cat- attRの順で挿入されて!、る
[0115] この attLと attRの両端に対応する配列をプライマーの 3 '末端に、 目的遺伝子である cadA遺伝子の一部に対応するプライマーの 5 '末端に有する配列番号 11及び 12に 示す合成オリゴヌクレオチドをプライマーに用いて PCRを行った。
[0116] 増幅した PCR産物をァガロースゲルで精製し、温度感受性の複製能を有するプラス ミド PKD46を含むェシエリヒア'コリ WC196株にエレクト口ポレーシヨンにより導入した。 プラスミド pKD46 (Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2000, vol. 97, No. 12, p6640— 6645 )は、ァラビノース誘導性 ParaBプロモーターに制御される λ Red相同組換えシステム の Redレコンビナーゼをコードする遺伝子 ( γ、 β、 exo遺伝子）を含む λファージの 合計 2154塩基の DNAフラグメント（GenBank/EMBLァクセッション番号 J02459、 第 3 1088番目〜33241番目）を含む。プラスミド pKD46は PCR産物を WC196株の染色体に 糸且み込むために必要である。
[0117] エレクト口ポレーシヨン用のコンビテントセルは次のようにして調製した。すなわち、 1 OOmgZLのアンピシリンを含んだ LB培地中で 30°C、ー晚培養したェシエリヒア'コリ W C196株を、アンピシリン（20mg/L)と L ァラビノース（ImM)を含んだ 5mLの SOB培地 (モレキュラークロー-ング：実験室マニュアル第 2版、 Sambrook, J.ら， Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989年））で 100倍希釈した。得られた希釈物を 30°Cで通 気しながら OD600が約 0. 6になるまで生育させた後、 100倍に濃縮し、 10%グリセロー ルで 3回洗浄することによってエレクト口ポレーシヨンに使用できるようにした。エレクト 口ポレーシヨンは 70 μ Lのコンビテントセルと約 lOOngの PCR産物を用いて行った。 エレクト口ポレーシヨン後のセルは lmLの SOC培地（モレキュラークローユング：実験 室マニュアル第 2版、 Sambrook, J.ら， Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989年 ；) )をカ卩えて 37°Cで 2. 5時間培養した後、 37°Cで Cm (クロラムフエ-コール） (25mg/ L)を含む L—寒天培地上で平板培養し、 Cm耐性組換え体を選択した。次に、 pKD4 6プラスミドを除去するために、 Cmを含む L—寒天培地上、 42°Cで 2回継代し、得ら れたコロニーのアンピシリン耐性を試験し、 PKD46が脱落して 、るアンピシリン感受性 株を取得した。
[0118] クロラムフエ-コール耐性遺伝子によって識別できた変異体の cadA遺伝子の欠失 を、 PCRによって確認した。得られた cadA欠損株を WC196 A cadA::att-cat株と名づ けた。
[0119] 次に、 cadA遺伝子内に導入された att- cat遺伝子を除去するために、ヘルパーブラ スミド上述の pMW- intxis- ts (特開 2005- 058827)を使用した。 pMW- intxis- tsは、 λフ ァージのインテグラーゼ（Int)をコードする遺伝子、ェクシジョナーゼ (Xis)をコードする 遺伝子を搭載し、温度感受性の複製能を有するプラスミドである
[0120] 上記で得られた WC196 Δ cadA::att-cat株のコンビテントセルを常法に従って作製 し、ヘルパープラスミド pMW-intxis-tsにて形質転換し、 30°Cで 50 mg/Lのアンピシリ ンを含む L—寒天培地上にて平板培養し、アンピシリン耐性株を選択した。
次に、 pMW-intxis-tsプラスミドを除去するために、 L—寒天培地上、 42°Cで 2回継 代し、得られたコロニーのアンピシリン耐性、及びクロラムフエ-コール耐性を試験し、 att-cat、及び pMW-intxis-tsが脱落して!/、る cadA破壊株であるクロラムフエ-コール 、アンピシリン感受性株を取得した。この株を WC196 A cadAと名づけた。
[0121] (2) WC196 A cadA株の ldcC遺伝子の欠失
WC196 A cadA株における ldcC遺伝子の欠失は、上記手法に則って、 ldcC破壊用 プライマーとして、配列番号 13、 14のプライマーを使用して行った。これによつて、 ca dA ldcC破壊株である WC196 Δ cadA Δ ldcCを得た。 [0122] < 2> WC196 A cadA A ldcC株の lys生産用プラスミド導入
WC196 Δ cadA Δ ldcC株を dapA、 dapB及び LysC遺伝子を搭載した Lys生産用プラ スミド PCABD2 (国際公開第 WO01/53459号パンフレット）で常法に従い形質転換し、 WC196 Δ cadA Δ ldcC /pCABD2株 (WC196LC/pCABD2)を得た。
[0123] 〔実施例 5〕ェシエリヒア'コリを用いた L-リジン生産
本実施例ではェシエリヒア 'コリによる L-リジンの生産に応用した例を示す。本実施 例では、一般的に、 L-リジンを発酵生産する場合に、窒素と L-リジンに対する対ィォ ンの供給のために培地に添加される硫酸アンモ-ゥム (硫安）や塩ィ匕アンモ-ゥム（ 塩安）を添加せずに L-リジンを発酵生産した。具体的には、 pHの制御は行わず、培 地中のアンモニア濃度を制御して培養を行った。事前に培地中のアンモニア濃度の 制御範囲を検討した結果、総アンモニア濃度として 50mMから lOOmMの範囲が好まし V、ことが確認された。よって実際の本培養では総アンモニア濃度として lOOmMを超え ないようにアンモニアガスを吹き込むことにより制御した。また、総アンモニア濃度が 5 OmMまで低下した後は、その濃度を維持するようにアンモニアガスにより制御した。
[0124] L-リジン生産株としては、 WC196 A cadA A ldcC /pCABD2を用い、培養には、表 3 に示した E. coli用 L-リジン生産培地 300mlを入れたジャーフアーメンターにアンモ- ァガスを吹き込み、総アンモニア濃度を 95mMに調整したものを用いた。この培地に、 ストレプトマイシンを 20 μ g/L含む LB寒天培地全面に L-リジン生産株を塗布し、 37°C で 24時間培養した菌を植菌した。植菌量は寒天培地 3枚分に生育した菌量である。 培養は温度を 37°Cに保ち、フィルターで除菌した空気を 1分間に 50mL通気し、攪拌 速度は 700rpmにして行った。尚、通気量は培養液中の溶存酸素濃度が飽和の 20% に低下した時点で、 1分間に lOOmLに変更した。培地中のグルコースが枯渴しないよ うに、また 30g/L以上にはならないように表 4に示した E. coli用 Feed液を適宜培地に 滴下した。最終的には 36gのグルコースを消費した時点で培養を停止した。その結果 、培養は順調に行われ、 33時間後に添加したグルコースは全て消費され、 L-リジン が 13.4g蓄積し、 L-リジンの生産速度は 1.2g/L/hrであった。この際の収率は、 37%で めつに。
[0125] 対照として、一般的な塩基性アミノ酸の製造方法と同様に、硫安を添加し、総アン モ-ァ濃度は制御せず、 pHの制御を行って同じ生産株を用いて L-リジンの生産を行 つた場合の結果を示す。表 3に示した E. coli用 L-リジン生産培地に硫酸アンモ-ゥム を 1リットルあたり 13g添カ卩した培地を用い同じ菌を同様に植菌してアンモニアガスを 適宜吹き込むことで PH6.7で一定に制御して培養した。培養温度、通気量の設定、及 び攪拌速度は上記と同様に行った。この場合には、表 4に示した E. coli用 Feed液に 代えて、硫安を 1リットルあたり 112.5gカ卩えた E. coli用 Feed液 (硫安を含む。表 4)を添 加して、培地中のグルコースが枯渴しないように、また 30g/L以上にはならないように 調節しながら最終的には 36gのグルコースを消費させた。その結果、 33時間後に添加 した全てのグルコースを消費し、 L-リジンが 14.7g蓄積し、 L-リジンの生産速度は 1.3g /L/hrであった。その際の収率は、 40%であった。
[0126] 尚、ここで示したリジンの濃度は、どれもリジン塩酸塩に換算した濃度である。また、 上記の培養における総アンモニア濃度及び pHの経時的変化を図 4に示す。これら の結果の比較から、本特許に示した方法を用いれば、 L-リジンの発酵生産において 、硫安や塩安を添加しなくても、硫安を添加した一般的な発酵生産に比べて、約 92% の生産速度で、約 93%の収率にて、かつ、約 91%の L-リジンの生産量を得ることが可 能であると確認された。
[0127] [表 3]
表 3 E. co I i用 L-リジン生産培地の組成（ 当たり） グルコース 30g
KH2P04 lg
MgS04.7H20 1.2g
豆濂 （窒素重量換算で） 0.77g
「大豆タンパク質加水分解物」
FeS04-7H20 30mg
nS04-4~5H20 30mg
P-ァミノ安息香酸 2mg
L -スレ才ニン 300mg
DL-メチ才ニン 200mg
シスチン 150mg
ベタイン 3.5g
GD-113 (消泡剤） O.OImL グルコースと MgS04'7H20を A区、 その他を B区として調整した後、 A区はそのまま、 B区は pHをアンモニアによって PH5.0に合わせた後、 別々に 115^、 10分間才ー卜クレーブで滅菌した後混合した。
ストレプトマイシン 20 ig八を添加して使用した。
表 4 E. co l i用 Feed液の組成（1L当たり) グルコース 561g
GD-113 7μ,\
KH2P04 1.48g
L-Thr 0.44g
120°C、 20分間才ー卜クレーブで滅菌し、
ストレプトマイシン 20 を添加して使用した。
表 5 E. col i用 Feed液 （硫安を含む） の組成（1L当たり) グルコース 561g
GD-113 Ίμ. I
KH2P04 1.48g
L-Thr 0.44g
(NH4)2S04 112.5g/L
120°C、 20分間オートクレープで滅菌し、
ストレプトマイシン 20 g/Lを添加して使用した。 [0130] 〔実施例 6〕 L-アルギニンの生産
本実施例ではコリネ型細菌による L-アルギニンの生産に応用した例を示す。 L-ァ ルギニン生産株としては、コリネバタテリゥム 'グルタミカム AJ12092(FERM BP-6906) を使用した。
[0131] 先ず対照として、一般的な塩基性アミノ酸の製造方法と同様に、硫安を添加し、総 アンモニア濃度は制御せず、 pHの制御を行って同じ生産株を用いて L-アルギニン の生産を行った場合の結果を示す。表 6の L-アルギニン生産培地組成に、硫安を 65 g/L追加し、さらにグルコース濃度を 40g/Lに変更した組成の培地 300mlを入れたジャ ーフアーメンターにアンモニアガスを吹き込み、 pHを 7.0に調整した。コリネバクテリウ ム 'グルタミクム AJ 12092株を CM- Dex寒天培地全面に塗布し、 31.5°Cで 24時間培養 した後、ジャーフアーメンターに寒天培地 2枚分に生育した菌量を植菌した。培養は 温度を 31.5°Cに保ち、フィルターで除菌した空気を 1分間に 150mL通気し、攪拌速度 は 700rpmにして行った。また培養の pHは別に殺菌した 6Nの KOH溶液を添カ卩し 6.9に 制御した。培養の進行とともに、低下する培地中のグルコース濃度を 30〜40g/Lに保 つように、別に殺菌した 692g/Lのグルコース溶液を適宜添加した。培養は 54時間行 つた。その結果、 L-アルギニンが 23.4g/L蓄積し、 L-アルギニンの生成収率は消費し たグルコースの 26.7%であり、生産速度は 0.43g/L/hrであった。なおこの間に消費さ れたグルコース量はバッチ当たり 29.1gであった。
[0132] 次に硫安を添加せず、総アンモニア濃度のみを制御し、 pHの制御を行わな 、L -ァ ルギニンの生産の結果を示す。表 6に示した硫酸アンモ-ゥムを含まな 、L-アルギ- ン生産培地 300mlを入れたジャーフアーメンターにアンモニアガスを吹き込み、総アン モ-ァ濃度を 12.6mMに調整した。この培地に、対照と同様にして培養した L-アルギ ニン生産菌を、寒天培地 2枚分に生育した菌量で植菌した。培養は対照と同様に、 温度を 31.5°Cに保ち、フィルターで除菌した空気を 1分間に 150mL通気し、攪拌速度 は 700rpmにして行った。培養液を経時的にサンプリングして総アンモニア濃度を測 定するか、またはアンモニア濃度制御装置を用いて、培養液中の総アンモニアを種 々の濃度で制御して培養を行った結果、培養液中の総アンモニア濃度は、約 20mM となるように必要に応じてアンモニアガスを添加し制御するのが良好な結果を与える ことを確認した。以上より、培養液中の総アンモニア濃度を約 20mMに制御した培養 は、順調に進行し、 51時間後に L-アルギニンが 24.2g/L蓄積し、 L-アルギニン発酵が 成立した (図 4)。なおこの間に消費されたグルコースはバッチ当たり 35.1gであり、 L-ァ ルギニンの生成収率は消費したグルコースの 20.6%でり、生産速度は 0.47g/L/hrであ つた。また培養液の pHは培養開始時の 7.92より、培養終了時には 8.02まで上昇した
[0133] この結果は対照の実験と比較し、 L-アルギニンの発酵生産において、硫安や塩安を 添加しなくても、硫安を添加した一般的な発酵生産に比べて、約 77%の収率で、また 生産速度は約 9%高く生産可能であることが示された。
[0134] [表 6]
表 6 L-アルギニン生産培地の組成（1L当たり） グルコース 150g
KH2P04 1g
MgS04-7H20 0.4g
豆遘 （窒素重量換算で） 0.23g
「大豆タンパク質加水分解物」
ビタミン B1塩酸塩 0.5mg
ビ才チン 0.5mg
FeS04-7H20 lOmg
MnS04'4〜5H20 lOmg
GD-113 (消泡剤） 0.05mL
PHを水酸化力リゥ厶水溶液で 7.0に調整後、
1Lとし、 115°C、 10分間オートクレープで滅菌した。
[0135] ほ S列表の説明〕
配列番号 1 :lysC遺伝子クローニング用のプライマー配列
配列番号 2: lysC遺伝子クローニング用のプライマー配列
配列番号 3： lysE遺伝子クローニング用のプライマー配列
配列番号 4： lysE遺伝子クローニング用のプライマー配列
配列番号 5 :lycC*遺伝子の塩基配列と阻害解除型ァスバルトキナーゼの ocサブュ- ットのアミノ酸配列
配列番号 6：阻害解除型ァスバルトキナーゼの aサブユニットのアミノ酸配列 配列番号 7 : lycC*遺伝子の塩基配列と阻害解除型ァスバルトキナーゼの 13サブュ- ットのアミノ酸配列
配列番号 8：阻害解除型ァスバルトキナーゼの 13サブユニットのアミノ酸配列 配列番号 9： lysE遺伝子の塩基配列及び LysEタンパク質のアミノ酸配列
配列番号 10： LysEタンパク質のアミノ酸配列
配列番号 11： cadA遺伝子破壊用プライマー
配列番号 12： cadA遺伝子破壊用プライマー
配列番号 13 :ldc遺伝子破壊用プライマー
配列番号 14： ldc遺伝子破壊用プライマー
配列番号 15： cadA遺伝子の塩基配列及びリジンデカルボキシラーゼのアミノ酸配列 配列番号 16：リジンデカルボキシラーゼ（cadA)のアミノ酸配列
配列番号 17： ldc遺伝子の遺伝子配列及びリジンデカルボキシラーゼのアミノ酸配列 配列番号 18：リジンデカルボキシラーゼ（ldc)のアミノ酸配列
産業上の利用可能性
[0136] 本発明によれば、従来の一般的な培養法にぉ 、て得られる生産性など本来の性能 を大きく損なうことなぐ硫酸アンモ-ゥムなどの工業原料の使用量を低減できるよう な高 pHにお ヽても、塩基性物質を発酵法で製造することができる。
[0137] 本発明の方法により得られた発酵液は、炭酸イオン及び Z又は重炭酸イオンを含 むが、これらは加熱により容易に大気中に放出されるため、固形成分中の塩基性物 質含量が高い発酵液又は発酵生産物を得ることができる。また、精製を必要とする場 合、従来の製造方法では通常行われているイオン交換を行わなくとも、発酵液に炭 酸より強い酸を加えれば、容易に炭酸と置換できる。更に、発酵液を濃縮すること〖こ より直接リジン塩酸塩の結晶を得ることが出来る。
図面の簡単な説明
[0138] [図 1]一般的な培地及び培養法での L リジン生産培養の結果を示す図。
[図 2]アンモ-ゥム濃度を制限した培地での L リジン生産培養の結果を示す図。
[図 3]総アンモニア濃度のみを制御し、 pHの制御は行わない場合の L—リジン生産 培養の結果を示す図。 [図 4]一般的な培地、並びに硫安及び塩安無添加の培地における総アンモニア濃度 と pHの経時的変化を示す図。
[図 5]アンモ-ゥム濃度を制限した培地での L アルギニン発酵における生育、総ァ ンモユア濃度、 pH、残糖の経時変化を示す図。
[図 6]アンモ-ゥム濃度を制限した培地での L アルギニン生産培養の結果を示す図

Claims

請求の範囲
[1] 塩基性物質を生産する能力を有する微生物を液体培地を含む発酵槽中で培養し
、同培地中に前記塩基性物質を生成、蓄積させる、発酵法による塩基性物質の製造 法において、全培養工程の内少なくとも一部の期間、培地中の総アンモニア濃度を 一定の濃度範囲に調整することにより、前記塩基性物質のカウンタイオンとして使用 する硫酸イオン、及び Z又は塩化物イオンの使用量を削減することを特徴とする方 法。
[2] 前記総アンモニア濃度の一定範囲が、次の条件を満たす範囲である請求項 1に記 載の方法。
(A)培地中のアンモニゥムイオン濃度が、培地中に溶存する重炭酸イオン及び Zま たは炭酸イオン、並びに他のァ-オンのイオン当量の合計力 培地中に蓄積した前 記塩基性物質のうちイオンィ匕しているもののイオン当量よりも大きくなるような濃度で あること、及び
(B)培地中の総アンモニア濃度力 予め以下の方法により決定された、前記微生物 の塩基性物質の生産を阻害しな!、濃度であること：
前記微生物を、培地の pH及び総アンモニア濃度を変えて培養して、塩基性物質 の生産性を測定し、最適な条件での塩基性物質の生産性の 50%以上の生産性をそ れぞれの pHで示す総アンモニア濃度を決定する。
[3] 前記総アンモニア濃度の一定範囲が、以下の方法によって予め決定される請求項 1に記載の方法：
(Α' )目的の塩基性物質のカウンタイオン源として、 ρΗ7.2以下で培養するのに充分 な量の硫酸イオン及び Ζ又は塩化物イオンを含む培地で、アンモニアガス、アンモ- ァ水及び尿素の少なくとも 、ずれかを添カ卩することで培地の ρΗを ρΗ6.5から ρΗ7.2の 範囲に保って培養し、塩基性物質の生産性を測定し、
(Β' )前記手順 1 (Α' )で用いた培地成分から、硫酸イオン及び Ζ又は塩化物イオン を所望する量だけ削減した培地を用いて培養を行い、目的の塩基性物質の蓄積に 伴 、、カウンタイオンである硫酸イオン及び Ζ又は塩ィ匕物イオンが不足することにより 培地の ρΗを 7. 2以下に保つことが不可能な期間に総アンモニア濃度を変化させて 培養を行 、、 (Α' )で測定された生産性の 50%以上の生産性が得られる総アンモ- ァ濃度の範囲を決定する。
[4] 前記少なくとも一部の期間が、目的の塩基性物質の蓄積に対してカウンタイオンが 不足することにより、培地の ρΗが上昇する期間、及び培地にカチオンを添加すること で ρΗが上昇する期間の少なくとも 、ずれかを含む請求項 1に記載の方法。
[5] 前記培地中の総アンモニア濃度の調整を、培地中の溶存酸素濃度、培地中の炭 素源の消費速度、培地の濁度、前記塩基性物質の生産性、及び培地の ρΗ変化を 指標とする前記微生物の活動が低下又は停止したときに培地にアンモニア又は尿素 を添加することにより行うことを特徴とする、請求項 1に記載の方法。
[6] 前記培地として、前記塩基性物質のカウンタイオン源として ρΗ7. 2以下で培養す るのに充分な量の硫酸イオン及び Ζ又は塩ィ匕物イオンを含む培地の組成から、硫酸 イオン及び Ζ又は塩化物イオンを所望する量だけ減らした培地を用い、かつ、 前記少なくとも一部の期間が、前記培地に蓄積する前記塩基性物質に対してカウ ンタイオンが不足することにより ρΗを 7. 2以下に保つことが不可能な期間であること を特徴とする、請求項 1に記載の方法。
[7] 前記他のァ-オンが、硫酸イオン、塩ィ匕物イオン、リン酸イオン及びイオン化した有 機酸力 選ばれる請求項 2に記載の方法。
[8] 前記他のァ-オンの合計が 900meq/l以下であることを特徴とする、請求項 2又は 7 に記載の方法。
[9] 培養液中の総アンモニア濃度を 200mM以下に調整することを特徴とする請求項 1 に記載の方法。
[10] 前記微生物を増殖させる工程を含む請求項 1に記載の方法。
[11] 前記微生物を増殖させる工程においては、前記総アンモニア濃度の調整を行わな いことを特徴とする請求項 10に記載の方法。
[12] 前記塩基性物質が L—リジン、 L—アルギニン及び L—ヒスチジン力 選ばれる請求 項 1に記載の方法。
[13] 塩基性物質力 —リジンである請求項 12に記載の方法。
[14] 塩基性物質力 —アルギニンである請求項 12に記載の方法。
[15] 発酵後に培地又はその処理物を加熱して、重炭酸イオン及び炭酸イオンを除去す ることを特徴とする、請求項 1に記載の方法。
[16] 前記微生物がコリネ型細菌又はエシ リヒア属細菌である請求項 1に記載の方法。
[17] 請求項 15の方法により得られる、塩基性物質を含む発酵液又は発酵生産物。
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