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TW202146645A - 擴增 t 細胞治療癌症和相關惡性腫瘤的方法 - Google Patents

擴增 t 細胞治療癌症和相關惡性腫瘤的方法 Download PDF

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TW202146645A
TW202146645A TW110106497A TW110106497A TW202146645A TW 202146645 A TW202146645 A TW 202146645A TW 110106497 A TW110106497 A TW 110106497A TW 110106497 A TW110106497 A TW 110106497A TW 202146645 A TW202146645 A TW 202146645A
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cancer
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tumor
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梅林達 瑪塔
曼塔 卡爾拉
阿里 莫罕默德
史蒂芬 華特
陽尼克 布里亞德
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美商英麥提克斯股份有限公司
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Abstract

一種擴增 γδ T 細胞的體外方法,包括從人體受試者的血液樣本中分離 γδ T 細胞、在存在氨基二膦酸鹽和/或飼養細胞和至少一種細胞因子的情況下激活分離的 γδ T 細胞、擴增激活的 γδ T 細胞,以及任選地重新刺激擴增的 γδ T 細胞。

Description

擴增 T 細胞治療癌症和相關惡性腫瘤的方法
1. 領域
本公開內容涉及 T 細胞的擴增和激活。一方面,本公開內容涉及可用於轉基因表達的 γδ T 細胞的擴增和激活。另一方面,本公開內容涉及 γδ T 細胞的擴增和激活,同時耗盡 α-和/或 β-TCR 陽性細胞。本公開內容還提供了包含擴增的 γδ T 細胞和耗盡或減少 α-和/或 β-TCR 陽性細胞的 T 細胞群。本公開還提供了使用所公開 T 細胞群的方法。
2. 背景
γδ T 細胞代表表達 γδ TCR 而非 αβ TCR的T細胞子集。γδ T 細胞可分為兩個主要子集-組織結合的 Vδ2 陰性細胞和外周循環的 Vδ2 陽性細胞,更具體地說是 Vγ9δ2。兩個子集已被證明都具有抗病毒和抗腫瘤活性。與常規表達 αβ TCR 的細胞不同,表達 γδ TCR 的細胞識別其靶標而不依賴於經典的 MHC I 和 II。與自然殺傷 (NK) T 細胞相似,γδ T 細胞表達NKG2D,其結合於非經典 MHC 分子,即,存在於受壓細胞和/或腫瘤細胞上的 MHC I 類多肽相關序列 A (MICA) 和 MHC I 類多肽相關序列 B (MICB)。γδ TCR 識別多種配體,例如,應激和/或腫瘤相關的磷酸抗原。γδ T 細胞通過多種機制(即 TRAIL、FasL、穿孔素和顆粒酶分泌)介導其靶標的直接細胞溶解。此外,表達 CD16 的 γδ T 細胞增強抗體依賴性細胞介導的細胞毒性 (ADCC)。
γδ Τ 細胞(外周血中可能通常僅存在 1% 至 5% 的量)的一個問題是不能確保有足以用於醫學治療的 γδ Τ 細胞的純度和數量,尤其是收集少量血液,然後自其激活和/或增殖細胞時。增加患者採集血液量以確保足以用於醫學治療的 γδ Τ 細胞的純度和數量也帶來了一個問題,即它給患者帶來了很大的負擔。
仍然需要能夠製備足夠數量的 γδ T 細胞作為商業上可行的治療產品的方法。申請專利範圍中描述的實施方案提供了該技術問題的解決方案。
簡要概述
本申請提供了一種擴增 γδ T 細胞的方法,包括從人體受試者的血液樣本中分離 γδ T 細胞、在存在飼養細胞和至少一種細胞因子的情況下激活分離的 γδ T 細胞、以及擴增激活的 γδ T 細胞。
本公開進一步提供了一種擴增 γδ T 細胞的方法,包括從人體受試者的血液樣本中分離 γδ T 細胞、在存在至少一種細胞因子和 1) 氨基二膦酸鹽,2) 飼養細胞或 3) 氨基二膦酸鹽和飼養細胞其中之一或多項的情況下激活分離的 γδ T 細胞、擴增激活的 γδ T 細胞、以及重新刺激擴增的 γδ T 細胞。
一方面,血液樣本包含白細胞分離產物。
一方面,血液樣本包含外周血單核細胞 (PBMC)。
在某些方面,激活在存在氨基二膦酸鹽的情況下進行。
在某些方面,氨基二膦酸鹽包括帕米膦酸、阿侖膦酸、唑來膦酸、利塞膦酸、伊班膦酸、恩加膦酸、其鹽和/或其水合物。
在某些方面,氨基二膦酸鹽包括唑來膦酸。
在某些方面,所述至少一種細胞因子選自白介素 (IL)-1、IL-2、IL-12、IL-18、IL-15、IL-21、干擾素 (IFN)-α 和 IFN-β 組成的組。
在某些方面,所述至少一種細胞因子包括 IL-2 和 IL-15。
一方面,分離包括使血液樣本與抗 α 和抗 β T 細胞受體 (TCR) 抗體接觸,並從血液樣本中耗盡 α-和/或 β-TCR 陽性細胞。
一方面,飼養細胞為腫瘤細胞或類淋巴母細胞系。
在某些方面,腫瘤細胞為 K562 細胞。
在某些方面,腫瘤細胞為包含至少一種重組蛋白的工程改造腫瘤細胞。
在某些方面,至少一種重組蛋白選自 CD86、4-1BBL、IL-15 及其任何組合組成的組。
在某些方面,IL-15 為膜結合 IL-15。
在某些方面,所述至少一種重組蛋白為 4-1BBL 和/或膜結合 IL-15。
在某些方面,飼養細胞接受輻照。
在某些方面,分離的 γδ T 細胞和飼養細胞以約 1:1 至約 50:1(飼養細胞:分離的 γδ T 細胞)的比例混合。在某些方面,分離的 γδ T 細胞和飼養細胞以約 2:1 至約 20:1(飼養細胞:分離的 γδ T 細胞)的比例存在。在某些方面,分離的 γδ T 細胞和飼養細胞以約 1:1、約 1:5:1、約 2:1、約 3:1、約 4:1、約 5:1、約 6:1、約 7:1、約 8:1、約 9:1、約 10:1、約 11:1、約 12:1、約 13:1、約 14:1、約 15:1、約 20:1、約 25:1、約 30:1、約 35:1、約 40:1、約 45:1 或約 50:1(飼養細胞:分離的 γδ T 細胞)的比例存在。
一方面,本申請的方法進一步包括在擴增之前,用重組病毒載體轉導激活的 γδ T 細胞。
一方面,擴增在不存在氨基二膦酸鹽且存在至少一種細胞因子(例如 IL-2 和/或 IL-15)的情況下進行。
在某些方面,本公開的方法包括重新刺激擴增的 γδ T 細胞。
在某些方面,重新刺激包括使擴增的 γδ T 細胞與另外的飼養細胞接觸,所述另外的飼養細胞可與激活期間使用的飼養細胞相同或不同(如果存在)。
在某些方面,擴增的 γδ T 細胞和另外的飼養細胞以約 1:1 至約 50:1(另外的飼養細胞:擴增的 γδ T 細胞)的比例混合。在某些方面,擴增的 γδ T 細胞和另外的飼養細胞以約 2:1 至約 20:1(另外的飼養細胞:擴增的 γδ T 細胞)的比例存在。在某些方面,擴增的 γδ T 細胞和另外的飼養細胞以約 1:1、約 1.5:1、約 2:1、約 3:1、約 4:1、約 5:1、約 6:1、約 7:1、約 8:1、約 9:1、約 10:1、約 11:1、約 12:1、約 13:1、約 14:1、約 15:1、約 20:1、約 25:1、約 30:1、約 35:1、約 40:1、約 45:1 或約 50:1(另外的飼養細胞:擴增的 γδ T 細胞)的比例存在。
一方面,另外的飼養細胞選自由單核細胞、PBMC 及其組合組成的組。
在某些方面,另外的飼養細胞對人體受試者為自體細胞。
在某些方面,另外的飼養細胞對人體受試者為同種異體細胞。
在某些方面,另外的飼養細胞經耗盡 αβ T 細胞。
在某些方面,另外的飼養細胞在重新刺激之前與氨基二膦酸鹽(例如唑來膦酸)接觸或用其進行脈衝處理。
一方面,另外的飼養細胞為腫瘤細胞或類淋巴母細胞細胞系。
在某些方面,腫瘤細胞為 K562 細胞。
在某些方面,腫瘤細胞為包含至少一種重組蛋白的工程改造腫瘤細胞。
在某些方面,至少一種重組蛋白選自由 CD86、4-1BBL、IL-15 及其任何組合組成的組。
在某些方面,IL-15 為膜結合 IL-15。
在某些方面,另外的飼養細胞接受輻照。
一方面,本申請涉及通過本公開的方法製備的擴增 γδ T 細胞群,其中擴增 γδ T 細胞的濃度為至少約 1 x 105 個細胞/ml、至少約 1 x 106 個細胞/ml、至少約 1 x 107 個細胞/ml、至少約 1 x 108 個細胞/ml 或至少約 1 x 109 個細胞/ml。
一方面,本申請涉及一種治療癌症的方法,其包括向有此需要的患者給予有效量的通過本公開內容的方法製備的擴增 γδ T 細胞。
一方面,癌症選自由急性淋巴細胞白血病、急性髓性白血病、腎上腺皮質癌、AIDS 相關癌症、AIDS 相關淋巴瘤、肛門癌、闌尾癌、星形細胞瘤、神經母細胞瘤、基底細胞癌、膽管癌、膀胱癌、骨癌、腦腫瘤(如:小腦星形細胞瘤、腦星形細胞瘤/惡性膠質瘤、室管膜瘤、成神經管細胞瘤、幕上原始神經外胚層腫瘤、視覺通路和下丘腦膠質瘤)、乳腺癌、支氣管腺瘤、伯基特淋巴瘤、原發性未知癌、中樞神經系統淋巴瘤、小腦星形細胞瘤、宮頸癌、兒童癌症、慢性淋巴細胞白血病、慢性骨髓性白血病、慢性骨髓增生性疾病、結腸癌、皮膚 T 細胞淋巴瘤、結締組織增生性小圓細胞瘤、子宮內膜癌、室管膜瘤、食道癌、尤因氏肉瘤、生殖細胞腫瘤、膽囊癌、胃癌、胃腸道類癌腫瘤、胃腸道間質瘤、膠質瘤、毛細胞白血病、頭頸癌、心臟癌、肝細胞癌(肝癌)、霍奇金淋巴瘤、咽下癌、眼內黑色素瘤、胰島細胞癌、卡波西肉瘤、腎癌、喉癌、唇癌和口腔癌、脂肪肉瘤、肝癌、肺癌(如:非小細胞和小細胞肺癌)、淋巴瘤、白血病、巨球蛋白血症、骨惡性纖維組織細胞瘤/骨肉瘤、成神經管細胞瘤、黑色素瘤、間皮瘤、原發灶隱匿的轉移性鱗狀頸癌、口腔癌、多發性內分泌腫瘤綜合症、骨髓增生異常綜合症、骨髓性白血病、鼻腔和副鼻竇癌、鼻咽癌、神經母細胞瘤、非霍奇金淋巴瘤、非小細胞肺癌、口腔癌、口咽癌、骨肉瘤/骨惡性纖維組織細胞瘤、卵巢癌、卵巢上皮癌、卵巢生殖細胞腫瘤、胰腺癌、胰腺癌胰島細胞、副鼻竇和鼻腔癌、甲狀旁腺癌、陰莖癌、咽癌、嗜鉻細胞瘤、松果體星形細胞瘤、松果體生殖細胞瘤、垂體腺瘤、胸膜肺母細胞瘤、漿細胞瘤、原發性中樞神經系統淋巴瘤、前列腺癌、直腸癌、腎細胞癌、腎盂和輸尿管移行細胞癌、視網膜母細胞瘤、橫紋肌肉瘤、唾液腺癌、肉瘤、皮膚癌、默克爾細胞皮膚癌、小腸癌、軟組織肉瘤、鱗狀細胞癌、胃癌、T 細胞淋巴瘤、咽喉癌、胸腺瘤、胸腺癌、甲狀腺癌、滋養細胞腫瘤(妊娠)、原發部位未知癌、尿道癌、子宮肉瘤、陰道癌、外陰癌、瓦爾登斯特倫巨球蛋白血症和威爾姆斯瘤組成的組。
一方面,癌症是黑色素瘤。
一方面,本申請涉及一種治療傳染性疾病的方法,其包括向有此需要的患者給予有效量的通過本公開內容的方法製備的擴增 γδ T 細胞。
一方面,傳染性疾病選自由登革熱、埃博拉、馬爾堡病毒、結核病 (TB)、腦膜炎和梅毒組成的組。
一方面,本申請涉及一種治療自體免疫性疾病的方法,其包括向有此需要的患者給予有效量的通過本公開內容的方法製備的擴增 γδ T 細胞。
一方面,自體免疫性疾病選自由關節炎、慢性阻塞性肺疾病、強直性脊柱炎、克羅恩病(兩種特發性炎症性腸道疾病「IBD」中的一種)、皮肌炎、1 型糖尿病、子宮內膜異位症、Goodpasture 氏綜合症、Graves 氏病、格林-巴厘綜合症 (GBS)、橋本氏病、化膿性汗腺炎、川崎病、IgA 腎病、原發性血小板減少性紫癜、間質性膀胱炎、紅斑狼瘡、混合性結締組織病、硬斑病、重症肌無力、嗜睡症、神經性肌強直、尋常型天皰瘡、惡性貧血、銀屑病、銀屑病關節炎、多發性肌炎、原發性膽汁性肝硬化、復發性多軟骨炎、類風濕關節炎、精神分裂症、硬皮病、乾燥綜合症、僵人綜合症、顳動脈炎(也稱作為「巨細胞動脈炎」)、潰瘍性結腸炎(兩種特發性炎症性腸道疾病「IBD」中的一種)、脈管炎、白斑病以及韋格納肉芽腫組成的組。
一方面,本申請涉及一種製備 γδ T 細胞的方法,其包括從人體受試者的血液樣本中分離 γδ T 細胞,在不存在飼養細胞的情況下激活分離的 γδ T 細胞,將含有編碼 T 細胞受體 (TCR) 或嵌合抗原受體 (CAR) 的核酸的載體引入激活的 γδ T 細胞中,以及在存在飼養細胞的情況下擴增轉導的 γδ T 細胞。
另一方面,可以在存在至少一種選自白介素 (IL)-1、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、干擾素 (IFN)-α 和 IFN-β 組成的組中的細胞因子的情況下,進行激活、轉導和/或擴增。
另一方面,飼養細胞可以為人細胞、非人細胞、病毒感染細胞、非病毒感染細胞、細胞提取物、顆粒、珠、絲或其組合。
另一方面,飼養細胞可以包括外周血單核細胞 (PBMC) 和/或類淋巴母細胞 (LCL)。
另一方面,可在存在 OKT3 的情況下進行激活、轉導和/或擴增。
另一方面,擴增的 γδ T 細胞可以包括 δ1 和/或 δ2 T 細胞。
另一方面,載體可以為病毒載體或非病毒載體。
另一方面,載體可以包括編碼 TCR 的核酸和編碼 CD8αβ 或 CD8α 的核酸。
詳細說明
同種異體 T 細胞療法可能基於遺傳工程同種異體 γδ T 細胞以表達外源 TCR。除了通過異位 TCR 或 CAR 的特異性腫瘤識別之外,γδ T 細胞可能具有針對如本文所述多種腫瘤類型的活性。
本文所用的術語「γδ T 細胞」是指在其表面上表達獨特的 T 細胞受體 (TCR)——γδ TCR 的 T 細胞子集,其由 1 條 γ 鏈和 1 條 δ 鏈組成。術語「γδ T 細胞」具體包括 γδ T 細胞的所有子集,包括但不限於 Vδ1、Vδ2、Vδ3 γδ T 細胞,以及幼稚、效應記憶、中央記憶和終末分化的 γδ T 細胞。作為另一示例,術語「γδ T 細胞」包括 Vδ4、Vδ5、Vδ7 和 Vδ8 γδ T 細胞,以及 Vγ2、Vγ3、Vγ5、Vγ8、Vγ9、Vγ10 和 Vγ11 γδ T 細胞。
「富集」細胞群或製劑系指衍生自起始混合細胞群的細胞群,其包含的特定細胞類型百分比大於所述起始細胞群中該細胞類型的百分比。例如,起始混合細胞群可以針對特定 γδ T 細胞群進行富集。在一實施方案中,富集 γδ T 細胞群包含的 δ1 細胞百分比高於起始群中的該細胞類型百分比。作為另一示例,富集 γδ T 細胞群包含的 δ1 細胞百分比和 δ3 細胞百分比均高於起始群中的該細胞類型百分比。作為再一示例,富集 γδ T 細胞群包含的 δ1 細胞百分比和 δ4 細胞百分比均高於起始群中的該細胞類型百分比。作為再一示例,富集 γδ T 細胞群包含的 δ1 T 細胞、δ3 T 細胞、δ4 T 細胞和 δ5 T 細胞百分比高於起始群中的該細胞類型百分比。在另一實施方案中,富集 γδ T 細胞群包含的 δ2 細胞百分比高於起始群中的該細胞類型百分比。在再一實施方案中,富集 γδ T 細胞群包含的 δ1 細胞和 δ2 細胞百分比高於起始群中的該細胞類型百分比。在所有實施方案中,富集的 γδ T 細胞群包含的 αβ T 細胞群百分比較低。
本文所用的「擴增」系指富集製劑中所需或靶細胞類型(例如,δ1 和/或 δ2 T 細胞)的數目可高於初始或起始細胞群的數目。「選擇性擴增」系指靶細胞類型(例如,δ1 或 δ2 T 細胞)可以優先於其他非靶細胞類型(例如,αβ T 細胞或 NK 細胞)進行擴增。在某些實施方案中,例如,本申請的激活劑可以選擇性地擴增工程改造或非工程改造 δ1 T 細胞,而不會顯著擴增 δ2 T 細胞。在其他的實施方案中,例如,本申請的激活劑可以選擇性地擴增工程改造或非工程改造 δ2 T 細胞,而不會顯著擴增 δ1 T 細胞。在某些實施方案中,例如,本申請的激活劑可以選擇性地擴增工程改造或非工程改造 δ1 和 δ3 細胞,而不會顯著擴增 δ2 T 細胞。在某些實施方案中,例如,本申請的激活劑可以選擇性地擴增工程改造或非工程改造 δ1 和 δ4 細胞,而不會顯著擴增 δ2 T 細胞。在某些實施方案中,例如,本申請的激活劑可以選擇性地擴增工程改造或非工程改造 δ1、δ3、δ4 和 δ5 細胞,而不會顯著擴增 δ2 T 細胞。在本文背景下,術語「不會顯著擴增」是指優先擴增的細胞群的擴增高於參考細胞群的至少 10 倍,優選為 100 倍,更優選為 1,000 倍。擴增的 T 細胞群可以,例如通過用於區分不同群細胞表面標誌物的磁激活細胞分選 (MACS) 和/或螢光激活細胞分選 (FACS) 染色來表徵。
γδ T 細胞的分離
在某些方面,本申請可以提供用於擴增工程改造或非工程改造的 γδ T 細胞的離體方法。在某些情況下,所述方法可以採用一個或多個(例如,第一和/或第二)擴增步驟,其可能不包括有利於特定 γδ T 細胞群擴增的細胞因子(例如 IL-4、IL-2 或 IL-15 或其組合)。在一些實施方案中,本申請可以提供用於從分離的混合細胞群中產生富集 γδ T 細胞群的離體方法,包括使混合細胞群與一種或多種試劑接觸,所述試劑選擇地擴增 δ1 T 細胞;δ1 T 細胞和 δ3 T 細胞;δ1 T 細胞和 δ4 T 細胞;或 δ1、δ3、δ4 和 δ5 T 細胞,方式是通過分別與 δ1 TCR;δ1 和 δ4 TCR;或 δ1、δ3、δ4 和 δ5 TCR 的特異性表位結合,以提供富集 γδ T 細胞群。在其他方面,本申請可以提供用於從分離的混合細胞群中產生富集 γδ T 細胞群的離體方法,包括使混合細胞群與一種或多種試劑接觸,所述試劑選擇地擴增 δ2 T 細胞,方式是通過與 δ2 TCR 的特異性表位結合,以提供富集 γδ T 細胞群。
一方面,本公開內容涉及 T 細胞的擴增和/或激活。另一方面,本公開內容涉及在不存在與 γδ TCR 的特異性表位結合的試劑(例如,針對 γδ TCR的抗體)的情況下擴增和/或激活 γδ T 細胞。另一方面,本公開內容涉及可用於轉基因表達的 γδ T 細胞的擴增和/或激活。
本公開內容還涉及 γδ T 細胞的擴增和激活,同時耗盡 α-和/或 β-TCR 陽性細胞。本公開內容還提供了包含擴增的 γδ T 細胞和耗盡或減少 α-和/或 β-TCR 陽性細胞的 T 細胞群。本公開還提供了使用所公開 T 細胞群的方法。
一方面,本文提供了用於生產大規模藥品生產品質管制規範 (GMP) 級 TCR 工程改造 Vγ9δ2 T 細胞的方法。
在不存在飼養細胞的情況下,向純化的 T 細胞中添加 IL-18 增強了 γδ T 細胞的擴增,其具有明顯增加量的 IL-2 表面高親和力受體(CD25 或 IL-2Ra)。此外,兩性黴素 B(一種 Toll 樣受體 2 (TLR2) 配體)可激活 γδ T 細胞、CD8+ T 細胞和 NK 細胞,並增強 CD25(高親和力 IL-2Rα)表面表達的檢測。總之,這些觀察結果強調了 IL-2 信號傳導在唑來膦酸鹽介導的 Vγ9δ2 T 細胞激活和擴增中的關鍵作用。因此,為了最大化 IL-2 通過 IL-2 信號傳導對於 γδ T 細胞增殖的可用性(或最小化由大量 αβ T 細胞所進行的 IL-2 隔離),本公開的方法可能包括使用抗 αβ TCR 市售 GMP 試劑耗盡來自正常 PBMC 的 αβ T 細胞。由於重組 IL-18 目前並無作為市售 GMP 試劑提供,本公開的方法可能用低劑量兩性黴素 B 補充培養以增加 CD25 表面表達以增強 IL-2 結合和信號傳導,繼而可以增強在激活/擴增期間的 IL-2 反應性。此外,可以加入 IL-15,因為 IL-15 已被證明可增加經 IPP 處理的 Vγ9δ2 T細胞的增殖和存活。
圖 1 顯示了過繼同種異體 T 細胞療法的方法,其可遞送「即用型」T 細胞產物,例如,γδ T 細胞產物,用於快速治療其腫瘤中表達相關靶標的特定癌症的合格患者。這種方法可能包括從健康供體收集 γδ T 細胞,通過病毒轉導相關外源基因(如外源性 TCR)進行 γδ T 細胞工程改造,然後進行細胞擴增、收穫擴增的工程改造 γδ T 細胞,這些細胞在輸注入患者之前可冷凍保存為「即用型」 T 細胞產品。因此,該方法可消除個人化 T 細胞製造的需要。
為了分離 γδ T 細胞,一方面, γδ T 細胞可從受試者或受試者的複雜樣本中分離。一方面,複雜樣本可能是外周血樣本、臍帶血樣本、腫瘤、幹細胞前體、腫瘤活組織檢查物、組織、淋巴,或直接接觸外部環境的受試者的上皮部位樣本或源自幹前體細胞的樣本。γδ T 細胞可能直接從受試者的複雜樣本中分離,例如,通過用流式細胞技術分選表達一種或多種細胞表面標誌物的 γδ T 細胞。野生型 γδ T 細胞可表現出許多可與 γδ T 細胞相關的抗原識別、抗原呈遞、共刺激和黏附分子。一種或多種細胞表面標誌物,例如,特異性 γδ TCR、抗原識別、抗原呈遞、配體、黏附分子或共刺激分子可用於從複雜樣本中分離野生型 γδ T 細胞。與 γδ T 細胞相關或由其表達的各種分子可用於從複雜樣本中分離 γδ T 細胞。另一方面,本公開內容提供了分離 Vδ1+、Vδ2+、Vδ3+ 細胞或其任意組合的混合群的方法。
例如,可從受試者中收集外周血單核細胞,例如,採用血液成分單採機(包括 Ficoll-Paque™ PLUS (GE Healthcare) 系統或其他合適的裝置/系統。例如,可採用流式細胞技術從收集的樣本中純化 γδ T 細胞或所需亞群的 γδ T 細胞。臍帶血細胞也可在受試者出生期間從臍帶血中獲得。
在收集的 γδ T細胞上表達的細胞表面標誌物的陽性和/或陰性選擇可用於直接自外周血樣本、臍帶血樣本、腫瘤、腫瘤活組織檢查、組織、淋巴或來自受試者的上皮樣本分離 γδ T細胞或表達相似細胞表面標誌物的 γδ T 細胞群。例如,可以基於 CD2、CD3、CD4、CD8、CD24、CD25、CD44、Kit、TCR α、TCR β、TCR α、TCR δ、NKG2D、CD70、CD27、CD30、CD16、CD337 (NKp30)、CD336 (NKp46)、OX40、CD46、CCR7 和其他合適的細胞表面標誌物的陽性或陰性表達從複雜樣本中分離 γδ T 細胞。
一方面,γδ T 細胞可從體外培養的複雜樣本中分離。另一方面,在沒有預先耗盡特定細胞群(例如,單核細胞、αβ T 細胞、B 細胞和 NK 細胞)的情況下可激活和擴增全部的 PBMC 群。另一方面,可以在特異性激活和擴增之前產生富集的 γδ T 細胞群。另一方面,可以在不存在天然或工程改造 APC 的情況下進行 γδ T 細胞的激活和擴增。另一方面,可以使用固定的 γδ T 細胞有絲分裂原(包括 γδ TCR 特異的抗體)和其他 γδ TCR 激活劑(包括凝集素)對來自腫瘤樣本的 γδ T 細胞進行分離和擴增。另一方面,可以在沒有 γδ T 細胞有絲分裂原(包括 γδ TCR 特異的抗體)和其他 γδ TCR 激活劑(包括凝集素)的情況下對來自腫瘤樣本的 γδ T 細胞進行分離和擴增。
一方面, γδ T 細胞分離自受試者(例如人受試者)的白細胞分離產物。另一方面,γδ T 細胞不是從外周血單核細胞 (PBMC) 中分離的。
圖 2 顯示了根據本公開內容實施方案的 γδ T 細胞製造。該過程可能包括從白細胞分離產物中收集或獲得白細胞或 PBMC。白細胞分離術可能包括從供體收集全血並使用血液成分單採機分離組分。血液成分單採機分離出所需的血液組分,並將其餘部分返回供體的血液循環。例如,可以使用血液成分單採設備收集白細胞、血漿和血小板,並將紅細胞和中性粒細胞返回供體的血液循環。市售白細胞分離術產品可用於該程序。另一種方法是從血沉棕黃層獲得白細胞。為了分離血沉棕黃層,從供體獲得抗凝全血並離心。離心後,將血液分離成血漿、紅細胞和血沉棕黃層。血沉棕黃層是位於血漿和紅細胞層之間的層。與血沉棕黃層收集相比,白細胞分離收集可以獲得更高的純度和顯著增加的單核細胞含量。白細胞分離術可能獲得的單核細胞含量通常比血沉棕黃層獲得的單核細胞含量高 20 倍。為了富集單核細胞,可能需要使用 Ficoll 梯度進行進一步分離。
為了從 PBMC 中耗盡 αβ T 細胞,可通過磁分離將表達 αβ TCR 的細胞與 PBMC 分離,例如,使用塗覆有抗 αβ TCR 抗體的 CliniMACS® 磁珠,然後冷凍保存αβ TCR-T 細胞耗盡的PBMC。為了製造「即用型」T 細胞產品,可在存在氨基二膦酸鹽和/或異戊烯焦磷酸鹽 (IPP) 和/或細胞因子(例如白細胞介素2 (IL-2)、白細胞介素15 (IL-15) 和/或白細胞介素18 (IL-18))和/或其他激活劑(例如,Toll 樣受體2 (TLR2) 配體)的情況下小/中等規模(例如,在 24 至 4-6 孔板或 T75/T175 燒瓶中)或大規模(例如,在 50ml-100 升袋中)解凍和激活冷凍保存的 αβ TCR-T 細胞耗盡的PBMC,持續 1-10 天,例如 2-6 天。
一方面,分離的 γδ T 細胞可回應於與一種或多種抗原接觸而快速擴增。一些 γδ T 細胞(例如 Vγ9Vδ2+ T 細胞)可以在組織培養期間回應於與一些抗原(如:異戊二烯基焦磷酸鹽、烷基胺和代謝物或微生物提取物)接觸而在體外快速擴增。經刺激的 γδ T 細胞可以表現出許多抗原呈遞、共刺激和黏附分子,其可以促進從複雜樣本中分離 γδ T 細胞。複雜樣本中的 γδ T 細胞可以用至少一種抗原在體外刺激 1 天、2 天、3 天、4 天、5 天、6 天、7 天或其他合適的時間段。用合適的抗原刺激 γδ T 細胞可以在體外擴增 γδ T 細胞群。
可用於在體外刺激複雜樣本中 γδ T 細胞擴增的抗原非限制性實例可包括異戊烯-焦磷酸鹽,例如異戊烯焦磷酸鹽 (IPP)、烷基胺、人微生物病原體代謝物、共生細菌代謝物、甲基-3-丁烯基-1-焦磷酸鹽 (2M3B1PP)、(E)-4-羥基-3-甲基-丁-2-烯基焦磷酸鹽 (HMB-PP)、焦磷酸乙酯 (EPP)、法呢基焦磷酸鹽 (FPP)、二甲基烯丙基磷酸鹽 (DMAP)、二甲基烯丙基焦磷酸鹽 (DMAPP)、乙基三磷酸腺苷 (EPPPA)、香葉基焦磷酸鹽 (GPP)、香葉基香葉基焦磷酸鹽 (GGPP)、異戊烯基三磷酸腺苷 (IPPPA)、磷酸單乙基酯 (MEP)、焦磷酸單乙酯 (MEPP)、3-甲醯基-1-丁基焦磷酸鹽 (TUBAg 1)、X-焦磷酸鹽 (TUBAg 2)、3-甲醯基-1-丁基-尿苷三磷酸鹽 (TUBAg 3)、3-甲醯基-1-丁基-去氧胸苷三磷酸 (TUBAg 4)、單乙基烷基胺、烯丙基焦磷酸鹽、巴豆基焦磷酸鹽、二甲基烯丙基-γ-尿苷三磷酸鹽、巴豆基-γ-尿苷三磷酸鹽、烯丙基-γ-尿苷三磷酸鹽、乙胺、異丁胺、仲丁胺、異戊胺和含氮二膦酸鹽。
可以使用本文所述的激活和共刺激劑進行 γδ T 細胞的激活和擴增,以觸發特異性 γδ T 細胞增殖和持久群。一方面,來自不同培養物的 γδ T 細胞的激活和擴增可以實現不同的克隆或混合多克隆群亞群。另一方面,不同的激動劑可用於鑒定提供特異性 γδ 激活信號的藥劑。另一方面,提供特異性 γδ 激活信號的試劑可以是針對 γδ TCR 的不同單克隆抗體 (MAb)。另一方面,可以使用伴隨共刺激劑以幫助觸發特異性 γδ T 細胞增殖而不誘導細胞能量和細胞凋亡。這些共刺激劑可包括與 γδ 細胞上表達的受體結合的配體,如NKG2D、CD161、CD70、JAML、DNAX 輔助分子-1 (DNAM-1)、ICOS、CD27、CD137、CD30、HVEM、SLAM、CD122、DAP 和 CD28。另一方面,共刺激劑可以是對 CD2 和 CD3 分子上的獨特表位特異的抗體。當在 αβ 或 γδ T 細胞上表達時,CD2 和 CD3 可具有不同的構象結構。另一方面,CD3 和 CD2 的特異性抗體可導致 γδ T 細胞的不同激活。
在某些方面,可以在存在諸如腫瘤細胞,例如 K562 細胞或類淋巴母細胞 (LCL) 的飼養細胞的情況下進行 γδ T 細胞激活和/或擴增。在某些方面,對飼養細胞進行修飾,以表達一種或多種共刺激劑,例如 CD86、4-1BBL、IL-15 和膜結合 IL-15 (mbIL-15)。在某些方面,飼養細胞可以為自體細胞,例如單核細胞或 PBMC。飼養細胞可以為經輻照的飼養細胞,例如 γ 輻照的飼養細胞。在某些方面,激活期間將飼養細胞與 γδ T 細胞共培養。在某些方面,擴增期間,例如在一個或多個重新刺激步驟中,將飼養細胞與 γδ T 細胞共培養。激活期間使用的飼養細胞與擴增期間使用的飼養細胞可以相同,也可以不同。
在某些方面,γδ T 細胞和飼養細胞以約 1:1 至約 50:1(飼養細胞:γδ T 細胞)的比例存在。在某些方面,γδ T 細胞和飼養細胞以約 2:1 至約 20:1(飼養細胞:γδ T 細胞)的比例存在。在某些方面,γδ T 細胞和飼養細胞以約 1:1、約 1:5:1、約 2:1、約 3:1、約 4:1、約 5:1、約 6:1、約 7:1、約 8:1、約 9:1、約 10:1、約 11:1、約 12:1、約 13:1、約 14:1、約 15:1、約 20:1、約 25:1、約 30:1、約 35:1、約 40:1、約 45:1 或約 50:1(飼養細胞:γδ T 細胞)的比例存在。
在 γδ T 細胞工程改造之前,可以離體擴增 γδ T 細胞群。可用於促進體外 γδ T 細胞群擴增的試劑非限制性實例可能包括抗 CD3 或抗 CD2、抗 CD27、抗 CD30、抗 CD70、抗 OX40 抗體、IL-2、IL-15、IL-12、IL-9、IL-33、IL-18 或 IL-21、CD70(CD27 配體)、植物血凝素 (PHA)、刀豆蛋白 A (ConA)、商陸 (PWM)、蛋白質花生凝集素 (PNA)、大豆凝集素 (SBA)、扁豆凝集素 (LCA)、豌豆凝集素 (PSA)、蝸牛凝集素 (HPA)、蠶豆凝集素 (VGA) 或其他能夠刺激 T 細胞增殖的合適有絲分裂原。
通過 γδ T 細胞的基因工程改造可以增強 γδ T 細胞識別廣譜抗原的能力。一方面,可以工程改造 γδ T 細胞以提供識別體內首選抗原的通用同種異體療法。γδ T 細胞的基因工程改造可能包括穩定整合表達腫瘤識別部分(例如:αβ TCR、γδ TCR、嵌合抗原受體 (CAR)(其將抗原結合和 T 細胞激活功能組合為單一的受體)、其抗原結合片段或淋巴細胞激活結構域)的構建體至分離 γδ T 細胞的基因組,細胞因子(IL-15、IL-12、IL-2、IL-7、IL-21、IL-18、IL-19、IL-33、IL-4、IL-9、IL-23、IL1β),以在體外和體內增強 T 細胞增殖、存活和功能。分離 γδ T 細胞的基因工程改造還可能包括從分離 γδ T 細胞的基因組中的一個或多個內源基因中(例如,MHC 基因座)刪除或破壞基因表達。
本文公開的 T 細胞製造方法可用於擴增經修飾以可靠和可再現方式表達高親和力 T 細胞受體(工程改造 TCR)或嵌合抗原受體 (CAR) 的 T 細胞。在一實施方案中,可對 T 細胞進行基因學修飾以表達一種或多種工程改造的 TCR 或 CAR。本文所用的 T 細胞可以為 αβ T 細胞、γδ T 細胞或天然殺傷 T 細胞。
工程改造的 TCR
天然存在的 T 細胞受體包含兩個亞基——一個 α 亞基和一個 β 亞基,每個都是通過在每個 T 細胞基因組中發生重組事件而產生的獨特蛋白質。可篩選 TCR 庫針對特定靶抗原的選擇性。以這種方式,可以選擇、克隆對靶抗原具有高親和力和反應性的天然 TCR,然後將其引入用於過繼免疫療法的 T 細胞群中。
在一實施方案中,可以通過引入編碼 TCR 的亞基的多核苷酸來修飾 T 細胞,所述 TCR 的亞基具有形成 TCR的能力,以賦予 T 細胞針對表達靶抗原的腫瘤細胞的特異性。在特別的實施方案中,與所述天然存在的亞基相比,所述亞基可以經過一次或多次氨基酸取代、缺失、插入或修飾,只要所述亞基保留形成 TCR 的能力,從而賦予轉染 T 細胞歸向靶細胞並參與免疫相關的細胞因子信號傳導的能力。工程改造的 TCR 優選還以高親和力結合展示相關腫瘤相關肽的靶細胞,並且任選地介導在體內有效殺傷提呈相關肽的靶細胞。
編碼工程改造 TCR 的核酸可優選地自它們在 T 細胞的(天然存在的)染色體的天然環境中分離出來,並且可以摻入本文所述的合適載體中。有用的核酸和包含它們的載體都可以轉移到細胞中,所述細胞可以優選為 T 細胞,更優選為 γδ T 細胞。然後,經修飾的 T 細胞可能能夠表達由轉導的一種或多種核酸編碼的 TCR 兩條鏈。在優選實施方案中,工程改造的 TCR 可以是外源性 TCR,因為它被引入通常不表達特定 TCR 的 T 細胞中。工程改造 TCR 的基本方面是,其對由主要組織相容性複合體 (MHC) 或類似免疫學成分提呈的腫瘤抗原可能具有高親和力。與工程改造的 TCR 相反,CAR 可被工程改造為以 MHC 非依賴性方式與靶抗原結合。
一方面,工程改造的 TCR 可以以 CD8(CD8αβ 異二聚體和/或 CD8αα 同二聚體)非依賴方式在 γδ T 細胞中起作用。另一方面,工程改造的 TCR 可以以 CD8(CD8αβ 異二聚體和/或 CD8αα 同二聚體)依賴性方式在 γδ T 細胞中起作用。在後一種情況下,可以通過表達編碼 TCR 和 CD8(CD8α 和 CD8β 鏈或 CD8α 鏈)的外源核酸來修飾 γδ T 細胞。一方面,可以用編碼 TCR 和 CD8(CD8α 和 CD8β 鏈或 CD8α 鏈)的核酸(其可以駐留在相同載體上或在單獨的載體上)轉導或轉染 γδ T 細胞。
核酸編碼的蛋白質可以與附著至 TCR 的 α 鏈或 β 鏈的氨基末端或羧基末端部分的其他多肽一起表達,只要該附著的其他多肽不干擾 α 鏈或 β 鏈形成功能性 T 細胞受體和 MHC 依賴性抗原識別的能力即可。
被工程改造的 TCR 識別的抗原可包括但不限於癌症抗原,包括血液系統癌症和實體瘤上的抗原。示例性抗原包括但不限於 α 葉酸受體、5T4、ανβ6 整合蛋白、BCMA、B7-H3、B7-H6、CAIX、CD19、CD20、CD22、CD30、CD33、CD44、CD44v6、CD44v7/8、CD70、CD79a、CD79b、CD123、CD138、CD171、CEA、CSPG4、EGFR、EGFR 家族,包括 ErbB2 (HER2)、EGFRvIII、EGP2、EGP40、EPCAM、EphA2、EpCAM、FAP、胎兒 AchR、FRα、GD2、GD3、*Glypican-3 (GPC3)、HLA-A1+MAGE1、HLA-A2+MAGE1 、HLA-A3+MAGE1、HLA-A1+NY-ESO-1、HLA-A2+NY-ESO-1、HLA-A3+NY-ESO-1、IL-11Rα、IL-13Rα2、Lambda、Lewis-Y、Kappa、間皮素、Muc1、Muc16、NCAM、NKG2D 配體、NY-ESO-1、PRAME、PSCA、PSMA、ROR1、SSX、生存素、TAG72、TEMs 和 VEGFR2。
一方面,本公開的 T 細胞可以表達美國專利申請公開號 2017/0267738、美國專利申請公開號 2017/0312350、美國專利申請公開號 2018/0051080、美國專利申請公開號 2018/0164315、美國專利申請公開號 2018/0161396、美國專利申請公開號 2018/0162922、美國專利申請公開號 2018/0273602、美國專利申請公開號 2019/0016801、美國專利申請公開號 2019/0002556、美國專利申請公開號 2019/0135914、美國專利 10,538,573、美國專利 10,626,160、美國專利申請公開號 2019/0321478、美國專利申請公開號 2019/0256572、美國專利 10,550,182、美國專利 10,526,407、美國專利申請公開號 2019/0284276、美國專利申請公開號 2019/0016802、美國專利申請公開號 2019/0016803、美國專利申請公開號 2019/0016804、美國專利 10,583,573、美國專利申請公開號 2020/0339652、美國專利 10,537,624、美國專利 10,596,242、美國專利申請公開號 2020/0188497、美國專利 10,800,845、美國專利申請公開號 2020/0385468、美國專利 10,527,623、美國專利 10,725,044、美國專利申請公開號 2020/0249233、美國專利 10,702,609、美國專利申請公開號 2020/0254106、美國專利 10,800,832、美國專利申請公開號 2020/0123221、美國專利 10,590,194、美國專利 10,723,796、美國專利申請公開號 2020/0140540、美國專利 10,618,956、美國專利申請公開號 2020/0207849、美國專利申請公開號 2020/0088726、和美國專利申請公開號 2020/0384028 中所述的 TCR 和抗原結合蛋白;本文所述的這些專利公開內容和序列表透過引用整體併入本文。T 細胞可以為 αβ T 細胞、γδ T 細胞或天然殺傷 T 細胞。在一實施方案中,本文所述的 TCR 可以為單鏈 TCR 或可溶性 TCR。
嵌合抗原受體 (CAR)
本文公開的 T 細胞製造方法可包括修飾 T 細胞以表達一個或多個 CAR。T 細胞可以為 αβ T 細胞、γδ T 細胞或天然殺傷 T 細胞。在各種實施方案中,本公開提出了採用設計用於表達將細胞毒性重定向至腫瘤細胞的 CAR 的載體進行基因學工程改造的 T 細胞。CAR 分子將針對靶抗原(例如,腫瘤抗原)的基於抗體的特異性與激活 T 細胞受體的細胞內結構域相組合,以產生表現出特異性抗腫瘤細胞性免疫活性的嵌合蛋白。本文所用的術語「嵌合」描述由不同蛋白質或不同來源 DNA 的部分組成。
CAR 可以包含與特異性靶抗原結合的細胞外結構域(也稱為結合結構域或抗原特異性結合結構域)、跨膜結構域和細胞內信號傳導結構域。CAR 的主要特徵可能是其能夠重新定向免疫效應細胞特異性,從而觸發增殖、細胞因子產生、吞噬作用或產生以主要組織相容性 (MHC) 非依賴方式介導靶抗原表達細胞的細胞死亡的分子,充分利用單克隆抗體、可溶性配體或細胞特異性共受體的細胞特異性靶向作用能力。
在特定的實施方案中,CAR 可以包含細胞外結合結構域,其包括但不限於抗體或其抗原結合片段、束縛配體、或共受體的細胞外結構域,其與系為腫瘤相關抗原 (TAA) 或腫瘤特異性抗原 (TSA) 的靶抗原特異性結合。在某些實施方案中,TAA 或 TSA 可以在血液癌細胞上表達。在另一實施方案中,TAA 或 TSA 可以在實體瘤細胞上表達。在特定的實施方案中,實體瘤可以是膠質母細胞瘤、非小細胞肺癌、除非小細胞肺癌以外的肺癌、乳腺癌、前列腺癌、胰腺癌、肝癌、結腸癌、胃癌、脾癌、皮膚癌、除膠質母細胞瘤以外的腦癌、腎癌、甲狀腺癌等等。
在特定實施方案中,TAA 或 TSA 可以選自由 α 葉酸受體、5T4、ανβ6 整合蛋白、BCMA、B7-H3、B7-H6、CAIX、CD19、CD20、CD22、CD30、CD33、CD44、CD44v6、CD44v7/8、CD70、CD79a、CD79b、CD123、CD138、CD171、CEA、CSPG4、EGFR、EGFR 家族,包括 ErbB2 (HER2)、EGFRvIII、EGP2、EGP40、EPCAM、EphA2、EpCAM、FAP、胎兒 AchR、FRα、GD2、GD3、*Glypican-3 (GPC3)、HLA-A1+MAGE1、HLA-A2+MAGE1 、HLA-A3+MAGE1、HLA-A1+NY-ESO-1、HLA-A2+NY-ESO-1、HLA-A3+NY-ESO-1、IL-11Rα、IL-13Rα2、Lambda、Lewis-Y、Kappa、間皮素、Muc1、Muc16、NCAM、NKG2D 配體、NY-ESO-1、PRAME、PSCA、PSMA、ROR1、SSX、生存素、TAG72、TEMs 和 VEGFR2 組成的組。
一方面,能夠與本文所述的方法和實施方案一起使用的腫瘤相關抗原 (TAA) 肽包括,例如,美國專利公開號 20160187351、美國專利公開號 20170165335、美國專利公開號 20170035807、美國專利公開號 20160280759、美國專利公開號 20160287687、美國專利公開號 20160346371、美國專利公開號 20160368965、美國專利公開號 20170022251、美國專利公開號 20170002055、美國專利公開號 20170029486、美國專利公開號 20170037089、美國專利公開號 20170136108、美國專利公開號 20170101473、美國專利公開號 20170096461、美國專利公開號 20170165337、美國專利公開號 20170189505、美國專利公開號 20170173132、美國專利公開號 20170296640、美國專利公開號 20170253633、美國專利公開號 20170260249、美國專利公開號 20180051080 和美國專利公開號 20180164315 所述的 TAA 肽,本文所述的這些專利公開內容和序列表透過引用整體併入本文。
一方面,本文所述的 T 細胞選擇性地識別提呈上述一個或多個專利和公開內容中所述 TAA 肽的細胞。
另一方面,能夠與本文所述的方法和實施方案一起使用的 TAA 包括選自 SEQ ID NO: 6 至 SEQ ID NO: 166 的至少一種。一方面,T 細胞選擇性地識別提呈 SEQ ID NO: 6-166 或本文所述任何專利或申請中所述 TAA 肽的細胞。
SEQ ID NO: 氨基酸序列 SEQ ID NO: 氨基酸序列 SEQ ID NO: 氨基酸序列
6 YLYDSETKNA 59 LLWGHPRVALA 111 VLLNEILEQV
7 HLMDQPLSV 60 VLDGKVAVV 112 SLLNQPKAV
8 GLLKKINSV 61 GLLGKVTSV 113 KMSELQTYV
9 FLVDGSSAL 62 KMISAIPTL 114 ALLEQTGDMSL
10 FLFDGSANLV 63 GLLETTGLLAT 115 VIIKGLEEITV
11 FLYKIIDEL 64 TLNTLDINL 116 KQFEGTVEI
12 FILDSAETTTL 65 VIIKGLEEI 117 KLQEEIPVL
13 SVDVSPPKV 66 YLEDGFAYV 118 GLAEFQENV
14 VADKIHSV 67 KIWEELSVLEV 119 NVAEIVIHI
15 IVDDLTINL 68 LLIPFTIFM 120 ALAGIVTNV
16 GLLEELVTV 69 ISLDEVAVSL 121 NLLIDDKGTIKL
17 TLDGAAVNQV 70 KISDFGLATV 122 VLMQDSRLYL
18 SVLEKEIYSI 71 KLIGNIHGNEV 123 KVLEHVVRV
19 LLDPKTIFL 72 ILLSVLHQL 124 LLWGNLPEI
20 YTFSGDVQL 73 LDSEALLTL 125 SLMEKNQSL
21 YLMDDFSSL 74 VLQENSSDYQSNL 126 KLLAVIHEL
22 KVWSDVTPL 75 HLLGEGAFAQV 127 ALGDKFLLRV
23 LLWGHPRVALA 76 SLVENIHVL 128 FLMKNSDLYGA
24 KIWEELSVLEV 77 YTFSGDVQL 129 KLIDHQGLYL
25 LLIPFTIFM 78 SLSEKSPEV 130 GPGIFPPPPPQP
26 FLIENLLAA 79 AMFPDTIPRV 131 ALNESLVEC
27 LLWGHPRVALA 80 FLIENLLAA 132 GLAALAVHL
28 FLLEREQLL 81 FTAEFLEKV 133 LLLEAVWHL
29 SLAETIFIV 82 ALYGNVQQV 134 SIIEYLPTL
30 TLLEGISRA 83 LFQSRIAGV 135 TLHDQVHLL
31 ILQDGQFLV 84 ILAEEPIYIRV 136 SLLMWITQC
32 VIFEGEPMYL 85 FLLEREQLL 137 FLLDKPQDLSI
33 SLFESLEYL 86 LLLPLELSLA 138 YLLDMPLWYL
34 SLLNQPKAV 87 SLAETIFIV 139 GLLDCPIFL
35 GLAEFQENV 88 AILNVDEKNQV 140 VLIEYNFSI
36 KLLAVIHEL 89 RLFEEVLGV 141 TLYNPERTITV
37 TLHDQVHLL 90 YLDEVAFML 142 AVPPPPSSV
38 TLYNPERTITV 91 KLIDEDEPLFL 143 KLQEELNKV
39 KLQEKIQEL 92 KLFEKSTGL 144 KLMDPGSLPPL
40 SVLEKEIYSI 93 SLLEVNEASSV 145 ALIVSLPYL
41 RVIDDSLVVGV 94 GVYDGREHTV 146 FLLDGSANV
42 VLFGELPAL 95 GLYPVTLVGV 147 ALDPSGNQLI
43 GLVDIMVHL 96 ALLSSVAEA 148 ILIKHLVKV
44 FLNAIETAL 97 TLLEGISRA 149 VLLDTILQL
45 ALLQALMEL 98 SLIEESEEL 150 HLIAEIHTA
46 ALSSSQAEV 99 ALYVQAPTV 151 SMNGGVFAV
47 SLITGQDLLSV 100 KLIYKDLVSV 152 MLAEKLLQA
48 QLIEKNWLL 101 ILQDGQFLV 153 YMLDIFHEV
49 LLDPKTIFL 102 SLLDYEVSI 154 ALWLPTDSATV
50 RLHDENILL 103 LLGDSSFFL 155 GLASRILDA
51 YTFSGDVQL 104 VIFEGEPMYL 156 ALSVLRLAL
52 GLPSATTTV 105 ALSYILPYL 157 SYVKVLHHL
53 GLLPSAESIKL 106 FLFVDPELV 158 VYLPKIPSW
54 KTASINQNV 107 SEWGSPHAAVP 159 NYEDHFPLL
55 SLLQHLIGL 108 ALSELERVL 160 VYIAELEKI
56 YLMDDFSSL 109 SLFESLEYL 161 VHFEDTGKTLLF
57 LMYPYIYHV 110 KVLEYVIKV 162 VLSPFILTL
58 KVWSDVTPL     163 HLLEGSVGV
        164 ALREEEEGV
        165 KEADPTGHSY
        166 TLDEKVAEL
CAR 的結合結構域
在特定的實施方案中,本文考慮的 CAR 包含與腫瘤細胞上表達的靶多肽(例如,靶抗原)特異性結合的細胞外結合結構域。本文所用的術語「結合結構域」、「細胞外結構域」、
「細胞外結合結構域」、「抗原特異性結合結構域」和「細胞外抗原特異性結合結構域」可以互換使用,並提供能與目的靶抗原特異性結合的 CAR。結合結構域可以包括具有特異性識別並結合生物分子(例如,細胞表面受體或腫瘤蛋白、脂質、多糖或其他細胞表面靶分子或其組分)能力的任何蛋白、多肽、寡肽或肽。結合結構域可包括用於目的生物分子的任何天然存在、合成、半合成或重組產生的結合伴侶。
在特定實施方案中,CAR 的細胞外結合結構域可包括抗體或其抗原結合片段。「抗體」系指結合劑,其為至少包含一條輕鏈或重鏈免疫球蛋白可變區的多肽,其特異性地識別並結合靶抗原的表位,例如肽、脂質、多糖或含有抗原決定簇的核酸,例如被免疫細胞識別的那些核酸。抗體可包括其抗原結合片段。所述術語還可以包括基因工程改造的形式,如嵌合抗體(例如,人源化鼠抗體)、異源綴合物抗體(例如,雙特異性抗體)及其抗原結合片段。另請參閱 Pierce Catalog and Handbook, 1994-1995 (Pierce Chemical Co., Rockford, IL); Kuby, J., Immunology, 3rd Ed., W. H. Freeman & Co., New York, 1997。
在特定實施方案中,靶抗原可以為 α 葉酸受體、5T4、ανβ6 整合蛋白、BCMA、B7-H3、B7-H6、CAIX、CD19、CD20、CD22、CD30、CD33、CD44、CD44v6、CD44v7/8、CD70、CD79a、CD79b、CD123、CD138、CD171、CEA、CSPG4、EGFR、EGFR 家族,包括 ErbB2 (HER2)、EGFRvIII、EGP2、EGP40、EPCAM、EphA2、EpCAM、FAP、胎兒 AchR、FRα、GD2、GD3、*Glypican-3 (GPC3)、HLA-A1+MAGE1、HLA-A2+MAGE1 、HLA-A3+MAGE1、HLA-A1+NY-ESO-1、HLA-A2+NY-ESO-1、HLA-A3+NY-ESO-1、IL-11Rα、IL-13Rα2、Lambda、Lewis-Y、Kappa、間皮素、Muc1、Muc16、NCAM、NKG2D 配體、NY-ESO-1、PRAME、PSCA、PSMA、ROR1、SSX、生存素、TAG72、TEMs 或 VEGFR2 多肽的表位。
輕鏈和重鏈可變區可以包含被三個高變區,也稱為「互補決定區」或「CDR」打斷的「框架」區。CDR 可通過常規方法定義或鑒定,例如通過根據 Kabat et al (Wu, TT and Kabat, E. A., J Exp Med. 132(2):211-50, (1970); Borden, P. and Kabat E. A., PNAS, 84: 2440-2443 (1987) 所述的序列;(請參閱 Kabat et al, Sequences of Proteins of Immunological Interest, U.S. Department of Health and Human Services, 1991,其透過引用併入本文),或通過根據 Chothia et al (Choithia, C. and Lesk, A.M., J Mol. Biol, 196(4): 901-917 (1987), Choithia, C. et al, Nature, 342: 877 - 883 (1989)) 所述的結構。上述參考文獻的內容通過引用整體併入本文。不同輕鏈或重鏈的框架區序列在諸如人之類的物種中可能是相對保守的。系為組成輕鏈和重鏈的組合框架區之抗體的框架區可用於在三維空間中定位和排列 CDR。CDR 主要負責與抗原表位結合。每條鏈的 CDR 通常可以稱為 CDR1、CDR2 和 CDR3,從 N 端開始依次編號,並且通常還可以通過特定 CDR 所在位置的鏈來識別。因此,位於抗體重鏈可變結構域中的 CDR 可以稱為 CDRH1、CDRH2 和 CDRH3,而位於抗體輕鏈可變結構域中的 CDR 稱為 CDRL1、CDRL2 和 CDRL3。具有不同特異性的抗體(即,針對不同抗原的不同組合位點)可能具有不同的 CDR。儘管不同的抗體之間 CDR 不同,但 CDR 內僅有限數量的氨基酸位置直接參與抗原結合。CDR 內的這些位置稱為特異性決定殘基 (SDR)。
提及「VH」或「VH」系指免疫球蛋白重鏈的可變區,包括抗體、Fv、scFv、dsFv、Fab 或其他抗體片段的可變區。提及「VL」或「VL」系指免疫球蛋白輕鏈的可變區,包括抗體、Fv、scFv、dsFv、Fab 或其他抗體片段的可變區。
「單克隆抗體」是由 B 淋巴細胞的單個克隆或由轉染了單個抗體輕鏈和重鏈基因的細胞產生的抗體。單克隆抗體可以通過本領域技術人員已知的方法來產生,例如,通過將骨髓瘤細胞與免疫脾細胞融合而製備雜交抗體形成細胞。單克隆抗體可以包括人源化單克隆抗體。
「嵌合抗體」具有來自一種物種(例如人)的框架殘基和來自另一物種(諸如小鼠)的 CDR(通常賦予抗原結合特性)。在特定優選的實施方案中,本文公開的 CAR 可以包含系為嵌合抗體或其抗原結合片段的抗原特異性結合結構域。
在某些實施方案中,抗體可以是與腫瘤細胞上表面蛋白特異性結合的人源化抗體(例如人源化單克隆抗體)。「人源化」抗體為免疫球蛋白,包括人框架區和來自非人(例如小鼠、大鼠或合成的)免疫球蛋白的一個或多個 CDR。人源化抗體可以通過基因工程改造構建(例如,參見美國專利號 5,585,089,其內容通過引用整體併入本文)。
在實施方案中,CAR 的細胞外結合結構域可包含抗體或其抗原結合片段,包括但不限於駱駝 Ig(駱駝科動物抗體 (VHH))、Ig NAR、Fab 片段、Fab' 片段、F(ab)'2 片段、F(ab)'3 片段、Fv、單鏈 Fv 抗體(「scFv」)、bis-scFv、(scFv)2、微型抗體、雙抗體、三抗體、四抗體、二硫鍵穩定的 Fv 蛋白(「dsFv」)和單結構域抗體(sdAb、納米抗體)。
本文所用的「駱駝Ig」或「駱駝VHH」系指重鏈抗體的最小已知抗原結合單位(Koch-Nolte, et al, FASEB J., 21:3490-3498 (2007),其內容通過引用整體併入本文)。「重鏈抗體」或「駱駝科抗體」系指含有兩個 VH 結構域且無輕鏈的抗體(Riechmann L. et al, J. Immunol. Methods 231:25-38 (1999);WO94/04678;W094/25591;美國專利號 6,005,079;其內容通過引用整體併入本文)。
「IgNAR」或「免疫球蛋白新抗原受體」系指來自鯊魚免疫庫的一類抗體,其由一個可變新抗原受體 (VNAR) 結構域和五個恒定新抗原受體 (CNAR) 結構域的同二聚體組成。
抗體的木瓜蛋白酶消化產生兩種相同的抗原結合片段,稱為「Fab」片段,每個片段都有一個抗原結合位點和殘餘「Fc」片段,其名稱反映了其能夠容易結晶。Fab 片段包含重鏈和輕鏈可變結構域,還包含輕鏈的恒定結構域和重鏈的第一恒定結構域 (CH1)。Fab' 片段與 Fab 片段的區別在於,在重鏈 CH1 結構域的羧基末端添加了一些殘基,包括來自抗體鉸鏈區的一個或多個半胱氨酸。Fab′-SH 在本文中是指恒定結構域的半胱氨酸殘基帶有游離硫醇基的 Fab′。F(ab')2 抗體片段最初生成為成對 Fab' 片段,在它們之間有鉸鏈半胱氨酸。抗體片段的其他化學偶聯也是已知的。
「Fv」是包含完整抗原結合位點的最小抗體片段。在單鏈 Fv (scFv) 物種中,一個重鏈和一個輕鏈可變結構域可以通過柔性肽接頭共價連接,這樣,輕鏈和重鏈就可以締合成類似於兩鏈 Fv 物種的「二聚體」結構。
術語「雙抗體」是指具有兩個抗原結合位點的抗體片段,該片段包含與相同多肽鏈 (VH-VL) 內的輕鏈可變結構域 (VL) 連接的重鏈可變結構域 (VH)。通過使用太短以至於無法允許同一條鏈上兩個結構域之間配對的接頭,所述結構域被迫與另一條鏈的互補結構域配對並產生兩個抗原結合位點。雙抗體可以是二價的或雙特異性的。雙抗體在,例如, EP 404,097;WO 1993/01161;Hudson et al, Nat. Med. 9:129-134 (2003);和 Hollinger et al, PNAS USA 90: 6444-6448 (1993) 中有更充分的描述。三抗體和四抗體也在 Hudson et al, Nat. Med. 9:129-134 (2003) 中進行了描述。上述參考文獻的內容通過引用整體併入本文。
「單結構域抗體」或「sdAb」或「納米抗體」系指由抗體重鏈的可變區(VH 結構域)或抗體輕鏈的可變區(VL 結構域)組成的抗體片段(Holt, L., et al, Trends in Biotechnology, 21(11): 484-490,該文中的內容通過引用整體併入本文)。
「單鏈Fv」或「scFv」抗體片段包含抗體的 VH 和 VL 結構域,其中這些結構域以單個多肽鏈和任一方向(例如 VL-VH 或 VH-VL)存在。通常情況下,scFv 多肽進一步包括 VH 和 VL 結構域之間的多肽接頭,其使得 scFv 能夠形成所需的抗原結合結構。有關 scFv 的綜述,請參見,例如,Pluckthun, in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg and Moore eds., (Springer-Verlag, New York, 1994), pp. 269-315,該文中的內容通過引用整體併入本文。
在某些實施方案中,scFv 與 α 葉酸受體、5T4、ανβ6 整合蛋白、BCMA、B7-H3、B7-H6、CALX、CD19、CD20、CD22、CD30、CD33、CD44、CD44v6、CD44v7/8、CD70、CD79a、CD79b、CD123、CD138、CD171、CEA、CSPG4、EGFR、EGFR 家族,包括 ErbB2 (HER2)、EGFRvIII、EGP2、EGP40、EPCAM、EphA2、EpCAM、FAP、胎兒 AchR、FRα、GD2、GD3、*Glypican-3 (GPC3)、HLA-A1+MAGE1、HLA-A2+MAGE1 、HLA-A3+MAGE1、HLA-A1+NY-ESO-1、HLA-A2+NY-ESO-1、HLA-A3+NY-ESO-1、IL-11Rα、IL-13Rα2、Lambda、Lewis-Y、Kappa、間皮素、Muc1、Muc16、NCAM、NKG2D 配體、NY-ESO-1、PRAME、PSCA、PSMA、ROR1、SSX、生存素、TAG72、TEMs 或 VEGFR2 多肽結合。
CAR 的接頭
在某些實施方案中,CAR 可以在各個結構域之間,例如在 VH 和 VL 結構域之間包含接頭殘基,其被添加以適當地間隔和構象分子。CAR 可以包含一個、兩個、三個、四個或五個或五個以上的接頭。在特定實施方案中,接頭的長度可以為約 1 至約 25 個氨基酸、約 5 至約 20 個氨基酸或約 10 至約 20 個氨基酸,或任何中間的氨基酸長度。在一些實施方案中,接頭的長度可以為 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25 個或更多氨基酸。接頭的說明性示例包括甘氨酸聚合物 (G)n;甘氨酸-絲氨酸聚合物 (Gi_sSi_5)n,其中 n 為至少一、兩、三、四或五的整數;甘氨酸-丙氨酸聚合物;丙氨酸-絲氨酸聚合物;和本領域已知的其他柔性接頭。甘氨酸和甘氨酸-絲氨酸聚合物相對而言是非結構化的,因此可能能夠充當融合蛋白(例如 CAR)的結構域之間的中性系鏈。甘氨酸可能比丙氨酸進入顯著更多的 phi-psi 空間,並且與具有較長側鏈的殘基相比受限制的可能性要少得多(請參閱 Scheraga, Rev. Computational Chem. 11173-142 (1992),該文中的內容通過引用整體併入本文)。普通技術人員可認識到,在特定實施例中,CAR 的設計可以包括可能是全部或部分柔性的接頭,使得所述接頭可以包括柔性接頭以及賦予柔性較差結構的一個或多個部分,以提供所需的 CAR 結構。
在特定實施方案中,CAR 可以包括 scFV,其可以進一步包含可變區連接序列。「可變區連接序列」是一個氨基酸序列,其將重鏈可變區連接至輕鏈可變區,並提供與兩個亞結合結構域相互作用相容的間隔子功能,從而獲得的多肽與可能包含相同輕鏈和重鏈可變區的抗體一樣,對同一靶分子保留特異性結合親和力。在一實施方案中,可變區連接序列的長度可以為 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25 個或更多個氨基酸。在一特定實施方案中,可變區連接序列可以包含甘氨酸-絲氨酸聚合物 (Gi_sSi_5)n,其中 n 為至少 1、2、3、4 或 5 的整數。在另一實施方案中,可變區連接序列包含一個 (G4 S)3 氨基酸接頭。
CAR 的間隔子結構域
在特定實施方案中,CAR 的結合結構域可跟隨一個或多個「間隔子結構域」,其是指使抗原結合結構域移動遠離效應細胞表面以實現適當的細胞/細胞接觸、抗原結合和激活的區域(Patel et al, Gene Therapy, 1999; 6: 412-419,該文中的內容通過引用整體併入本文)。間隔子結構域可以來自天然、合成、半合成或重組來源。在某些實施方案中,間隔子結構域可以為免疫球蛋白的一部分,包括但不限於一個或多個重鏈恒定區,例如,CH2 和 CH3。間隔子結構域可以包括天然存在的免疫球蛋白鉸鏈區或改變的免疫球蛋白鉸鏈區的氨基酸序列。在一實施方案中,間隔子結構域可以包括 IgG1 的 CH2 和 CH3。
CAR 的鉸鏈結構域
CAR 的結合結構域通常可跟隨一個或多個「鉸鏈結構域」,其可以在使抗原結合結構域遠離效應細胞表面定位以實現適當的細胞/細胞接觸、抗原結合和激活中起作用。CAR 通常可以包括結合結構域和跨膜結構域 (TM) 之間的一個或多個鉸鏈結構域。鉸鏈結構域可以來自天然、合成、半合成或重組來源。鉸鏈結構域可以包括天然存在的免疫球蛋白鉸鏈區或改變的免疫球蛋白鉸鏈區的氨基酸序列。適用於 CAR 的示例性鉸鏈結構域可能包括源自 1 型膜蛋白(例如,CD8a、CD4、CD28 和 CD7)的細胞外區的鉸鏈區,其可能為這些分子的野生型鉸鏈區,也可能被改變。在另一實施方案中,鉸鏈結構域可以包括 CD8α 鉸鏈區。
CAR 的跨膜 (TM) 結構域
「跨膜結構域」可以是 CAR 的一部分,其可以融合細胞外結合部分和細胞內信號傳導結構域,並且將 CAR 錨定至免疫效應細胞的質膜。TM 結構域可以來自天然、合成、半合成或重組來源。示例性 TM 結構域可以衍生自 T 細胞受體的 α、β 或 ζ 鏈、CD3ε、CD3ζ、CD4、CD5、CD9、CD16、CD22、CD27、CD28、CD33、CD37、CD45、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137 和 CD154(至少包括其跨膜區)。在一實施方案中,CAR 可以包含衍生自 CD8a 的 TM 結構域。在另一實施方案中,本文考慮的 CAR 包含衍生自 CD8α 的 TM 結構域和短寡肽或多肽接頭,優選長度為 1、2、3、4、5、6、7、8、9 或 10 個氨基酸,其連接 CAR 的 TM 結構域和細胞內信號傳導結構域。甘氨酸-絲氨酸接頭提供了特別合適的接頭。
CAR 的細胞內信號傳導結構域
在特定實施方案中,CAR 可以包含細胞內信號傳導結構域。「細胞內信號傳導結構域」系指 CAR 的一部分,其參與結合於靶抗原的有效 CAR 的資訊轉導至免疫效應細胞內部以引發效應細胞功能,例如激活、細胞因子產生、增殖和細胞毒性活性,包括向 CAR 結合的靶細胞釋放細胞毒性因子,或用結合於細胞外 CAR 結構域的抗原引發其他細胞反應。
術語「效應子功能」是指細胞的專門功能。例如,T 細胞的效應子功能可以是溶細胞活性或幫助或包括細胞因子分泌的活性。因此,術語「細胞內信號傳導結構域」是指蛋白質的一部分,其可以轉導效應子功能信號並指導細胞執行專門的功能。雖然通常可以使用整個細胞內信號傳導結構域,但是在很多情況下,不必使用整個結構域。就可以使用細胞內信號傳導結構域的截短部分程度而言,可使用此類截短部分代替整個結構域,只要可以轉導效應子功能信號即可。術語細胞內信號傳導結構域可指包括足以轉導效應子功能信號的細胞內信號傳導結構域的任何截短部分。
已知僅通過 TCR 產生的信號不足以完全激活 T 細胞,並且還可能需要次級或共刺激信號。因此,可以說 T 細胞激活是由以下兩類不同細胞內信號傳導結構域介導的: 通過 TCR(例如,TCR/CD3 複合體)起始抗原依賴性一級激活的一級信號傳導結構域;以抗原非依賴性方式作用從而提供次級或共刺激信號的共刺激信號傳導結構域。在優選實施方案中,CAR 可以包括細胞內信號傳導結構域,其可包含一個或多個「共刺激信號傳導結構域」和「一級信號傳導結構域」。一級信號傳導結構域可以以刺激性方式或抑制性方式調節 TCR 複合體的一級激活。以刺激方式起作用的一級信號傳導結構域可能包含信號傳導基序,稱為基於免疫受體酪氨酸的激活基序或 ITAM。在本發明中特別使用且包含 ITAM 的一級信號傳導結構域的說明性示例可以包括衍生自 TCRζ、FcRγ、FcRβ、CD3γ、CD3δ、CD3ε、CD3ζ、CD22、CD79a、CD79b 和 CD66d 的結構域。在特定優選實施方案中,CAR 可以包括 CD3ζ 一級信號傳導結構域和一個或多個共刺激信號傳導結構域。細胞內一級信號傳導和共刺激信號傳導結構域可以以任何順序串聯連接至跨膜結構域的羧基末端。
CAR 可以包含一個或多個共刺激信號傳導結構域,以增強表達 CAR 受體的 T 細胞的療效和擴增。本文所用的術語「共刺激信號結構域」或「共刺激結構域」系指共刺激分子的細胞內信號結構域。此類共刺激分子的說明性示例可以包括 CD27、CD28、4-1BB (CD137)、OX40 (CD134)、CD30、CD40、PD-1、ICOS (CD278)、CTLA4、LFA-1、CD2、CD7、LIGHT、TRIM、LCK3、SLAM、DAP10、LAG3、HVEM、NKD2C 和 CD83。在一實施方案中,CAR 可以包含一個或多個選自由 CD28、CD137 和 CD134 組成組的共刺激信號傳導結構域以及一個 CD3ζ 一級信號傳導結構域。
在一實施方案中,CAR 可以包含:scFv,其與 α 葉酸受體、5T4、ανβ6 整合蛋白、BCMA、B7-H3、B7-H6、CALX、CD19、CD20、CD22、CD30、CD33、CD44、CD44v6、CD44v7/8、CD70、CD79a、CD79b、CD123、CD138、CD171、CEA、CSPG4、EGFR、EGFR 家族,包括 ErbB2 (HER2)、EGFRvIII、EGP2、EGP40、EPCAM、EphA2、EpCAM、FAP、胎兒 AchR、FRα、GD2、GD3、*Glypican-3 (GPC3)、HLA-A1+MAGE1、HLA-A2+MAGE1、HLA-A3+MAGE1、HLA-Al+NY-ESO-1、HLA-A2+NY-ESO-1、HLA-A3+NY-ESO-1、IL-11Rα、IL-13Rα2、Lambda、Lewis-Y、Kappa、間皮素、Muc1、Muc16、NCAM、NKG2D 配體、NY-ESO-1、PRAME、PSCA、PSMA、ROR1、SSX、生存素、TAG72、TEMs 或 VEGFR2 多肽結合;源於選自以下組成組的多肽的跨膜結構域: CD8α;CD4、CD45、PD1 和 CD152;以及一個或多個細胞內共刺激信號傳導結構域,其選自由以下組成的組: CD28、CD54、CD134、CD137、CD152、CD273、CD274 和 CD278;和 CD3ζ 以及信號傳導結構域。
在另一實施方案中,CAR 可以包含:scFv,其與 α 葉酸受體、5T4、ανβ6 整合蛋白、BCMA、B7-H3、B7-H6、CALX、CD19、CD20、CD22、CD30、CD33、CD44、CD44v6、CD44v7/8、CD70、CD79a、CD79b、CD123、CD138、CD171、CEA、CSPG4、EGFR、EGFR 家族,包括 ErbB2 (HER2)、EGFRvIII、EGP2、EGP40、EPCAM、EphA2、EpCAM、FAP、胎兒 AchR、FRα、GD2、GD3、*Glypican-3 (GPC3)、HLA-A1+MAGE1、HLA-A2+MAGE1、HLA-A3+MAGE1、HLA-A1+NY-ESO-1、HLA-A2+NY-ESO-1、HLA-A3+NY-ESO-1、IL-11Rα、IL-13Rα2、Lambda、Lewis-Y、Kappa、間皮素、Muc1、Muc16、NCAM、NKG2D 配體、NY-ESO-1、PRAME、PSCA、PSMA、ROR1、SSX、生存素、TAG72、TEMs 或 VEGFR2 多肽結合;鉸鏈結構域,其選自由以下組成的組: IgG1 鉸鏈/CH2/CH3 和 CD8α 以及 CD8α;源於選自由以下組成組的多肽的跨膜結構域: CD8α;CD4、CD45、PD1 和 CD152;以及一個或多個細胞內共刺激信號傳導結構域,其選自由以下組成的組: CD28、CD 134 和 CD 137;和 CD3ζ 一級信號傳導結構域。
在再一實施方案中,CAR 可以包含:進一步包括接頭之 scFv,其與 α 葉酸受體、5T4、ανβ6 整合蛋白、BCMA、B7-H3、B7-H6、CAIX、CD19、CD20、CD22、CD30、CD33、CD44、CD44v6、CD44v7/8、CD70、CD79a、CD79b、CD123、CD138、CD171、CEA、CSPG4、EGFR、EGFR 家族,包括 ErbB2 (HER2)、EGFRvIII、EGP2、EGP40、EPCAM、EphA2、EpCAM、FAP、胎兒 AchR、FRα、GD2、GD3、*Glypican-3 (GPC3)、HLA-A1+MAGE1、HLA-A2+MAGE1、HLA-A3+MAGE1、HLA-A1+NY-ESO-1、HLA-A2+NY-ESO-1、HLA-A3+NY-ESO-1、IL-11Rα、IL-13Rα2、Lambda、Lewis-Y、Kappa、間皮素、Muc1、Muc16、NCAM、NKG2D 配體、NY-ESO-1、PRAME、PSCA、PSMA、ROR1、SSX、生存素、TAG72、TEMs 或 VEGFR2 多肽結合;鉸鏈結構域,其選自由以下組成的組: IgG1 鉸鏈/CH2/CH3 和 CD8α 以及 CD8α;跨膜結構域,其包含源自選自由以下組成組的多肽的 TM 結構域: CD8a;CD4、CD45、PD1 和 CD 152,以及一個短寡肽或多肽接頭,優選長度為 1、2、3、4、5、6、7、8、9 或 10 個氨基酸之間,其將 TM 結構域連接至 CAR 的細胞內信號傳導結構域;以及一個或多個細胞內共刺激信號傳導結構域,選自由以下組成的組: CD28、CD 134 和 CD137;和 CD3ζ 一級信號傳導結構域。
在一特定實施方案中,CAR 可以包含:scFv,其與 α 葉酸受體、5T4、ανβ6 整合蛋白、BCMA、B7-H3、B7-H6、CAIX、CD19、CD20、CD22、CD30、CD33、CD44、CD44v6、CD44v7/8、CD70、CD79a、CD79b、CD123、CD138、CD171、CEA、CSPG4、EGFR、EGFR 家族,包括 ErbB2 (HER2)、EGFRvIII、EGP2、EGP40、EPCAM、EphA2、EpCAM、FAP、胎兒 AchR、FRα、GD2、GD3、*Glypican-3 (GPC3)、HLA-A1+MAGE1、HLA-A2+MAGE1、HLA-A3+MAGE1、HLA-A1+NY-ESO-1、HLA-A2+NY-ESO-1、HLA-A3+NY-ESO-1、IL-11Rα、IL-13Rα2、Lambda、Lewis-Y、Kappa、間皮素、Muc1、Muc16、NCAM、NKG2D 配體、NY-ESO-1、PRAME、PSCA、PSMA、ROR1、SSX、生存素、TAG72、TEMs 或 VEGFR2 多肽結合;含有 CD8α 多肽的鉸鏈結構域;含有約 3 個氨基酸的多肽接頭的 CD8α 跨膜結構域;一個或多個細胞內共刺激信號傳導結構域,其選自由以下組成的組: CD28、CD134 和 CD137;和 CD3ζ 一級信號傳導結構域。
病毒
一方面,「病毒」是指天然存在的病毒以及人造病毒。根據本公開一些實施方案的病毒可能是包膜病毒或無包膜病毒。細小病毒(例如 AAV)是無包膜病毒的實例。在一優選實施方案中,病毒可能是包膜病毒。在優選實施方案中,病毒可能是逆轉錄病毒,特別是慢病毒。可以促進真核細胞病毒感染的病毒包膜蛋白可能包括 HIV-1 衍生慢病毒載體 (LV),這些載體用來自水皰性口炎病毒 (VSV-G)、修飾的貓內源性逆轉錄病毒 (RD114TR) 和修飾的長臂猿白血病病毒 (GALVTR) 的包膜糖蛋白 (GP) 處理成為假型。這些包膜蛋白可以有效地促進其他病毒的進入,例如細小病毒,包括腺相關病毒 (AAV),從而證明它們的廣泛效率。例如,可使用其他病毒包膜蛋白,包括莫洛尼鼠白血病病毒 (MLV) 4070 env(如 Merten et al.,J. Virol . 79:834-840, 2005 一文中所述;其通過引用併入本文)、RD114 env (SEQ ID NO: 2)、嵌合包膜蛋白 RD114pro 或 RDpro(通過用 HIV-1 基質/衣殼 (MA/CA) 切割序列取代 RD114 的 R 肽切割序列構建的 RD114-HIV嵌合體,如 Bell et al.Experimental Biology and Medicine 2010; 235: 1269–1276 一文中所述;其通過引用併入本文)、桿狀病毒 GP64 env(如 Wang et al.J. Virol . 81:10869-10878, 2007 一文中所述;其通過引用併入本文)或 GALV env(如 Merten et al.,J. Virol . 79:834-840, 2005 一文中所述;其通過引用併入本文)或其衍生物。
RD114TR
RD114TR 是嵌合包膜糖蛋白,其由貓白血病病毒 RD114 的細胞外和跨膜結構域和雙嗜性小鼠白血病病毒包膜的細胞質尾部 (TR) 構成。RD114TR 假型載體可介導基因有效轉移入人造血祖細胞和 NOD/SCID 再生細胞中。Di Nunzio et al.,Hum. Gene Ther : 811-820 (2007) 一文的內容通過引用整體併入本文。RD114 假型載體還可以在大型動物模型中介導有效的基因轉移 (Neff et al.,Mal. Ther. 2:157-159 (2004); Hu et al.,Mal. Ther : 611-617 (2003) 和 Kelly et al.,Blood Cells, Molecules, & Diseases 30:132-143 (2003)) 各參考文獻的內容通過引用整體併入本文。
本公開可內容可能包括具有與 SEQ ID NO: 1 或 SEQ ID NO: 5 的氨基酸序列至少約 50%、至少約 60%、至少約 70%、至少約 80%、至少約 90%、至少約 95%、至少約 99% 或 100% 序列同一性的 RD114TR 變體。例如,可能使用與 RD114TR (SEQ ID NO: 1) 具有至少約 95%、至少約 96%、至少約 97%、至少約 98% 或至少約 99% 序列同一性的 RD114TR 變體 (RD114TRv1 (SEQ ID NO: 5))。一方面,本公開內容提供了具有修飾氨基酸殘基的 RD114TR 變體。修飾的氨基酸殘基可能選自氨基酸插入、缺失或取代基。一方面,本文描述的取代是保守氨基酸取代。也就是說,RD114TR 的氨基酸可以被具有相似性質的其他氨基酸取代(保守變化,例如,相似的疏水性、親水性、抗原性、形成或破壞 α-螺旋結構或 3-片結構的傾向)。一方面,RD114TR 可以具有 1、2、3、4、5、6、7、8、9 或 10 個氨基酸修飾。另一方面,RD114TR 可以具有至多 1、2、3、4、5、6、7、8、9 或 10 個氨基酸修飾。再一方面,RD114TR 可以具有至少 1、2、3、4、5、6、7、8、9 或 10 個氨基酸修飾。保守取代的非限制性實例可見,例如, Creighton (1984)Proteins . W.H. Freeman and Company,其內容通過引用整體併入。
另一方面,本公開內容可能包括與 SEQ ID NO: 1、2、3、4 或 5 的氨基酸序列具有至少約 50%、至少約 60%、至少約 70%、至少約 80%、至少約 90%、至少約 95%、至少約 98%、至少約 99% 或 100% 序列同一性的變體。
一方面,保守取代可能包括由 Dayhoff 在「The Atlas of Protein Sequence and Structure. Vol. 5」,Natl. Biomedical Research 中所述的取代,其內容通過引用整體併入本文。例如,一方面,屬於以下組之一的氨基酸可彼此交換,因此構成保守交換: 第 1 組: 丙氨酸 (A)、脯氨酸 (P)、甘氨酸 (G)、天冬醯胺 (N)、絲氨酸 (S)、蘇氨酸 (T);第 2 組: 半胱氨酸 (C)、絲氨酸 (S)、酪氨酸 (Y)、蘇氨酸 (T);第 3 組: 纈氨酸 (V)、異亮氨酸 (I)、亮氨酸 (L)、甲硫氨酸 (M)、丙氨酸 (A)、苯丙氨酸 (F);第 4 組: 賴氨酸 (K)、精氨酸 (R)、組氨酸 (H);第 5 組: 苯丙氨酸 (F)、酪氨酸 (Y)、色氨酸 (W)、組氨酸 (H);和第 6 組: 天冬氨酸 (D)、谷氨酸 (E)。
一方面,保守氨基酸取代可包括用相同類別中的另一個取代氨基酸,例如,(1) 非極性: Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Met、Phe、Trp;(2) 不帶電的極性: Gly、Ser、Thr、Cys、Tyr、Asn、Gln;(3) 酸性: Asp、Glu;和 (4) 鹼性: Lys、Arg、His。其他保守氨基酸取代也可以按如下進行: (1) 芳香族: Phe、Tyr、His;(2) 質子供體: Asn、Gln、Lys、Arg、His、Trp;和 (3) 質子受體: Glu、Asp、Thr、Ser、Tyr、Asn、Gln(參見美國專利號 10106805)。
另一方面,保守取代可以根據表 A 進行。用於預測蛋白質修飾耐受性的方法可參見,例如,Guo et al.,Proc. Natl. Acad. Sci., USA , 101(25):9205-9210 (2004),其內容通過引用整體併入。
表 A
Figure 02_image001
一方面,RD114TR 假型逆轉錄病毒載體在轉導後約 10 天的轉基因表達為約 20% 至約 60%、約 30% 至約 50% 或約 35% 至約 45%。一方面,在相同條件下,轉導後 10 天 RD114TR 假型逆轉錄病毒載體的轉基因表達為約 20% 至約 60%、約 30% 至約 50% 或約 35% 至約 45%,而轉導後 10 天 VSV-G 假型載體的轉基因表達為約 5% 至約 25%、約 2% 至約 20%、約 3% 至約 15% 或約 5% 至約 12%。再一方面,轉導後 10 天 RD114TR 假型逆轉錄病毒載體的轉基因表達為約 40%,而轉導後 10 天 VSV-G 假型載體的轉基因表達為約 3.6%。
再一方面,RD114TR 假型逆轉錄病毒載體在轉導後約 5 天的轉基因表達為約 20% 至約 50%、約 15% 至約 30% 或約 20% 至約 30%。一方面,在相同條件下,轉導後 5 天 RD114TR 假型逆轉錄病毒載體的轉基因表達為約 20% 至約 50%、約 15% 至約 30% 或約 20% 至約 30%,而轉導後 5 天 VSV-G 假型載體的轉基因表達為約 10% 至約 20%、約 15% 至約 25% 或約 17.5% 至約 20%。再一方面,轉導後 5 天 RD114TR 假型逆轉錄病毒載體的轉基因表達為約 24%,而轉導後 5 天 VSV-G 假型載體的轉基因表達為約 19%。
另一方面,轉導後 10 天 RD114TR 假型逆轉錄病毒載體的轉基因表達為轉導後 10 天 VSV-G 假型載體的轉基因表達的約 2 倍、約 3 倍、約 4 倍、約 5 倍或約 10 倍、約 11 倍或約 12 倍或更多。
一方面,本公開內容提供了使用具有 RD114TR 假型(例如,SEQ ID NO: 1、SEQ ID NO: 5 或其變體)的逆轉錄病毒來轉導 T 細胞的方法。另一方面,與具有 VSV-G 假型(例如,SEQ ID NO: 3)的逆轉錄病毒相比,具有 RD114TR 假型(例如,SEQ ID NO: 1、SEQ ID NO: 5 或其變體)的逆轉錄病毒可更有效地轉導 T 細胞。另一方面,RD114TR 包膜用於假型化慢病毒載體,然後用於以極高的效率轉導 T 細胞。
可用各種方法產生工程改造的 γδ T 細胞。例如,編碼包含腫瘤識別或其他類型識別部分的表達盒的多核苷酸可通過轉座子/轉座酶系統或基於病毒的基因轉移系統(例如,慢病毒或逆轉錄病毒系統)或其他合適的方法,如:轉染、電穿孔、轉導、脂質轉染、磷酸鈣 (CaPO4 )、納米工程改造物質(如 Ormosil),病毒傳遞方法,包括腺病毒、逆轉錄病毒、慢病毒、腺相關病毒或其他合適的方法穩定地引入 γδ T 細胞。許多病毒方法已用於人基因治療,例如 WO 1993020221 中描述的方法,其內容通過引用整體併入本文。可用於工程改造 γδ T 細胞的病毒方法的非限制性實例可包括 γ-逆轉錄病毒、腺病毒、慢病毒、單純皰疹病毒、痘苗病毒、痘病毒或腺病毒相關病毒方法。
圖 2 顯示了激活 T 細胞可以通過用病毒載體(例如:RD114TR γ-逆轉錄病毒載體和 RD114TR 慢病毒載體)轉導,將相關外源基因(例如:針對特定癌抗原的 αβ TCR 和 CD8)表達到分離 γδ T 細胞中來進行工程改造。病毒載體還可含有轉錄後調控元件 (PRE),例如:土撥鼠 PRE (WPRE),以通過增加細胞核和細胞質 mRNA 水準來增強轉基因的表達。還可使用一種或多種調節元件,包括小鼠 RNA 轉運元件 (RTE)、猿猴逆轉錄病毒 1 型 (SRV-1) 的組成型轉運元件 (CTE) 和人熱休克蛋白 70 的5' 非翻譯區 (Hsp70 5′UTR) 和/或與 WPRE 組合使用以增加轉基因表達。轉導可以進行一次或多次以實現小規模(例如 24 至 4-6 孔板)或中/大規模的穩定轉基因表達 1/2 至 5 天,例如 1 天。
RD114TR是嵌合糖蛋白,其含有與鼠白血病病毒的細胞質尾 (TR) 融合的貓內源病毒 (RD114) 的細胞外和跨膜結構域。一方面,轉導後 10 天 RD114TR 假型逆轉錄病毒載體的轉基因表達相對於 VSV-G 假型載體更高。
還可以使用其他病毒包膜蛋白,例如 VSV-G env、MLV 4070 env、RD114 env、嵌合包膜蛋白 RD114pro、桿狀病毒 GP64 env 或 GALV env 或其衍生物。
非病毒載體
所述載體為非病毒載體,因為其不基於病毒。它不包含為了使載體進入細胞的任何病毒成分。非病毒載體可以選自質粒、微環、黏性質粒、人工染色體(例如、BAC)、線性共價封閉 (LCC) DNA 載體(例如、微環、微載體和微結)、線性共價封閉 (LCC) 載體(例如、MIDGE、MiLV、輔助、微質粒)、微型內含子質粒、pDNA 表達載體或核酸酶介導遺傳編輯(例如鋅指核酸酶 (ZFN)、轉錄激活子樣效應子核酸酶 (TALEN))以及成簇規律間隔短回文重複序列 (CRISPR)。
在一些實施方案中,用於遞送核酸的非病毒載體系統可包括由聚乙二醇 (PEG)、聚乙烯亞胺 (PEI) 和具有 PTD/CPP 功能的肽序列組成的聚合物綴合物。例如,具有 PTD/CPP 功能的蛋白質可以為 TAT-肽或與 TAT-肽有關的肽序列。例如,與 TAT 肽有關的序列可以為十肽序列 GRKKKRRQRC (SEQ ID NO: 167)。可以替代地使用其他熟知的 TAT-肽相關序列。除了對於細胞內酶(例如,在內核體、溶酶體中)的穩定性之外,根據本申請所述的用於遞送核酸的非病毒載體系統在細胞外環境中也可能非常穩定。例如,與 PEI 相比,在存在高濃度肝素、Alveofact®、BALF 和 DNase I 下,TAT-PEG-PEI-多聚體的穩定性可能顯著更高。
在一些實施方案中,還可使用基於非病毒遞送系統,例如「睡美人 (SB) 轉座子系統」(是指將 DNA 序列引入脊椎動物染色體的合成 DNA 轉座子系統)將本文所述的多肽(例如 TCR 和 CAR)引入效應細胞,例如 T 細胞。該系統的描述,例如可參見美國專利號 6,489,458 和 8,227,432,其內容通過引用整體併入本文。
睡美人轉座子系統可以由睡美人(SB) 轉座酶和 SB 轉座子組成。DNA 轉座子以簡單的剪切和粘貼方式從一個 DNA 位點轉移至另一個 DNA 位點。轉位可能是一個精確的過程,其中可以從一個 DNA 分子中切除定義的 DNA 片段,然後移至相同或不同 DNA 分子或基因組中的另一位點。與其他 Tc1/水手型轉座酶一樣,SB 轉座酶將轉座子插入受體 DNA 序列的 TA 二核苷酸鹼基對中。插入位點可以在同一 DNA 分子中的其他位置,也可以在另一 DNA 分子(或染色體)中。在包括人類在內的哺乳動物基因組中,大約有 2 億個 TA 位點。TA 插入位點可以在轉座子整合過程中複製。TA 序列的這種複製可能是轉位的標誌,可在某些實驗中用於確定機制。轉座酶可以在轉座子內編碼,或者轉座酶可以由另一種來源提供,在這種情況下,轉座子成為非自主元件。非自主轉座子可用作基因工具,因為插入後它們不能獨立繼續切除和重新插入。設想將 SB 轉座子用作非病毒載體,以將基因引入脊椎動物基因組並進行基因治療。
簡言之,使睡美人 (SB) 系統 (Hackett et al., Mol Ther 18:674-83, (2010)) 適於基因修飾 T 細胞 (Cooper et al., Blood 105:1622-31, (2005))。這涉及兩個步驟: (i) 表達 SB 轉座子 [即,嵌合抗原受體 (CAR) 以重新定向 T 細胞特異性 (Jin et al., Gene Ther 18:849-56, (2011); Kebriaei et al., Hum Gene Ther 23:444-50, (2012))] 和 SB 轉座酶的 DNA 質粒電轉移,以及 (ii) 源自 K562 細胞系(也稱為 AaPC(激活和繁殖細胞))的設計人工抗原提呈細胞 (AaPC) 上穩定表達整合子 T 細胞的繁殖和擴增。以上引用的參考文獻的內容通過引用整體併入本文。在一實施方案中,SB 轉座子系統可包括編碼 mbIL-15、細胞標籤和/或 CAR 的編碼序列。在一實施方案中,SB 轉座子系統可包括編碼 mbIL-15、細胞標籤和/或 TCR 的編碼序列。在另一實施方案中,消除第二步驟 (ii),並且可以將基因修飾的 T 細胞冷凍保存或立即注入患者體內。在一些實施方案中,基因修飾的 T 細胞在輸注到患者體內之前可不冷凍保存。在一些實施方案中,睡美人轉座酶可以為 SB11、SB100X 或 SB110。
根據本申請所述的用於遞送核酸的非病毒載體系統可以作為藥學上可接受組合物的一部分通過吸入、口服、直腸、腸胃外靜脈內、肌肉內或皮下、腦池內、陰道內、腹膜內、血管內、局部(粉劑、軟膏或滴劑)、通過氣管內插管、氣管內滴注或噴霧劑施用至患者。
一方面,工程改造(或轉導)的 γδ T 細胞可以離體擴增而不受抗原呈遞細胞或氨基二膦酸鹽的刺激。本公開的抗原反應性工程改造 T 細胞可以離體和體內擴增。另一方面,本公開內容的工程改造 γδ T 細胞活性群可以離體擴增,而無需抗原呈遞細胞、抗原肽、非肽分子或小分子化合物(例如,氨基二膦酸鹽)的抗原刺激,但是使用某些抗體、細胞因子、有絲分裂原或融合蛋白,例如:IL-17 Fc 融合、MICA Fc 融合和 CD70 Fc 融合。可用於擴增 γδ T 細胞群的抗體實例可能包括抗 CD3、抗 CD27、抗 CD30、抗 CD70、抗 OX40、抗 NKG2D 或抗CD2 抗體,細胞因子的實例可能包括 IL-2、IL-15、IL-12、IL-21、IL-18、IL-9、IL-7 和/或 IL-33,有絲分裂原的實例可能包括CD70 人 CD27 的配體、植物血凝素 (PHA)、刀豆蛋白 A (ConA)、商陸有絲分裂原 (PWM)、蛋白質花生凝集素 (PNA)、大豆凝集素 (SBA)、扁豆凝集素 (LCA)、豌豆凝集素 (PSA)、蝸牛凝集素 (HPA)、蠶豆凝集素 (VGA) 或其他能夠刺激 T 細胞增殖的合適有絲分裂原。另一方面,工程改造的 γδ T 細胞群可在少於 60 天、少於 48 天、36天、少於 24 天、少於 12 天或少於 6 天內擴增。
另一方面,本公開內容提供了用於離體擴增用於過繼轉移療法的工程改造 γδ T 細胞群的方法。本公開內容的工程改造 γδ T 細胞可離體擴增。本公開內容的工程改造 γδ T 細胞可在體外擴增而不經 APC 激活 或不與 APC 和氨基磷酸鹽共培養。
另一方面, γδ T 細胞群可在體外擴增少於36 天、少於 35 天、少於 34 天、少於 33 天、少於 32 天、少於 31 天、少於 30 天、少於 29 天、少於 28 天、少於 27 天、少於 26 天、少於 25 天、少於 24 天、少於 23 天、少於 22 天、少於 21 天、少於 20 天、少於 19 天、少於 18 天、少於 17 天、少於 16 天、少於 15 天、少於 14 天、少於 13 天、少於 12 天、少於 11 天、少於 10 天、少於 9 天、少於 8 天、少於 7 天、少於 6 天、少於 5 天、少於 4 天或少於 3 天。
圖 2 顯示了轉導或工程改造的 γδ T 細胞的擴增可在存在細胞因子(例如:IL-2、IL-15、IL-18 等)的情況下以小/中等規模(例如:燒瓶/G-Rex)或大規模(例如:50ml-100 升袋)進行,持續 7-35 天,例如 14-28 天。
在某些方面,在擴增期間可將 γδ T 細胞群重新刺激一次或多次。例如,可以將工程改造的(或轉導的)γδ T 細胞群離體擴增一段時間,然後通過使擴增 γδ T 細胞與飼養細胞接觸來重新刺激。例如,飼養細胞可以為單核細胞、PBMC 或單核細胞和 PBMC 的組合。在其他方面,在擴增期間不會重新刺激 γδ T 細胞群。
在某些方面,飼養細胞對人體受試者為自體細胞。一方面,飼養細胞對人體受試者為同種異體細胞。
在某些方面,飼養細胞經耗盡 αβ T 細胞。
在某些方面,在向 γδ T 細胞群添加之前,飼養細胞用氨基二膦酸鹽(例如唑來膦酸)進行脈衝處理。
另一方面,飼養細胞可以為細胞系,例如腫瘤細胞系或類淋巴母細胞系。另一方面,飼養細胞可以為腫瘤細胞,例如自體腫瘤細胞。一方面,腫瘤細胞可以為 K562 細胞。在某些方面,飼養細胞為工程改造的腫瘤細胞,其包含至少一種重組蛋白,例如細胞因子。例如,細胞因子可以為 CD86、4-1BBL、IL-15 及其任何組合。在某些方面,IL-15 為膜結合 IL-15。
在某些方面,飼養細胞為本文所述的任何飼養細胞組合。例如,飼養細胞可以為選自自體單核細胞、同種異體單核細胞、自體 PBMC、同種異體 PBMC、腫瘤細胞、自體腫瘤細胞、工程改造腫瘤細胞、K562 細胞、腫瘤細胞系和類淋巴母細胞系的兩種或更多種飼養細胞的組合。在某些方面,飼養細胞為 PBMC 和類淋巴母細胞系的組合。
在某些方面,飼養細胞接受輻照,例如,γ 輻照。
在某些方面,擴增的 γδ T 細胞和飼養細胞以約 1:1 至約 50:1(飼養細胞:擴增的 γδ T 細胞)的比例存在。例如,擴增的 γδ T 細胞和飼養細胞以約 2:1 至約 20:1(飼養細胞:擴增的 γδ T 細胞)的比例存在。在某些方面,擴增的 γδ T 細胞和飼養細胞以約 1:1、約 1:5:1、約 2:1、約 3:1、約 4:1、約 5:1、約 6:1、約 7:1、約 8:1、約 9:1、約 10:1、約 11:1、約 12:1、約 13:1、約 14:1、約 15:1、約 20:1、約 25:1、約 30:1、約 35:1、約 40:1、約 45:1 或約 50:1(飼養細胞:擴增的 γδ T 細胞)的比例存在。
在某些方面,可以使用某些抗體、細胞因子、有絲分裂原或融合蛋白(例如,IL-17 Fc 融合蛋白、MICA Fc 融合蛋白和 CD70 Fc 融合蛋白)來重新刺激本公開的擴增 γδ T 細胞群。可用於重新刺激擴增 γδ T 細胞群抗體的實例可能包括抗 CD3、抗 CD27、抗 CD30、抗 CD70、抗 OX40、抗 NKG2D 或抗CD2 抗體,細胞因子的實例可能包括 IL-2、IL-15、IL-12、IL-21、IL-18、IL-9、IL-7 和/或 IL-33,有絲分裂原的實例可能包括CD70(人 CD27 的配體)、植物血凝素 (PHA)、刀豆蛋白 A (ConA)、商陸有絲分裂原 (PWM)、蛋白質花生凝集素 (PNA)、大豆凝集素 (SBA)、扁豆凝集素 (LCA)、豌豆凝集素 (PSA)、蝸牛凝集素 (HPA)、蠶豆凝集素 (VGA) 或其他能夠刺激 T 細胞增殖的合適有絲分裂原。
擴增 γδ T 細胞的重新刺激可以通過使擴增 γδ T 細胞與本文所述的重新刺激劑(例如,飼養細胞、抗體、細胞因子、有絲分裂原、融合蛋白等)的任何組合接觸來進行。
在某些方面,在擴增期間,對擴增的 γδ T 細胞進行一次重新刺激。在其他方面,在擴增期間,對擴增的 γδ T 細胞重新刺激一次以上。例如,在擴增期間,可以對擴增的 γδ T 細胞重新刺激兩次、三次、四次、五次、六次、七次、八次、九次或十次或更多次。根據擴增的條件和長度,本領域技術人員可以容易地優化擴增期間執行的重新刺激次數。
在某些方面,在擴增期間,對擴增的 γδ T 細胞每天進行重新刺激。在某些方面,在擴增期間,對擴增的 γδ T 細胞每天重新刺激一次以上。在其他方面,對擴增的 γδ T 細胞每兩天一次、每三天一次、每四天一次、每五天一次、每六天一次、每七天一次、每八天一次、每九天一次、每十天一次、每十一天一次、每十二天一次、每十三天一次、每十四天一次等進行重新刺激。在其他方面,對擴增的 γδ T 細胞每週一次、每週兩次、每週三次、每週四次、每週五次、每週六次等進行重新刺激。在其他方面,對擴增的 γδ T 細胞每兩週一次、每三週一次、每四週一次等進行重新刺激。根據擴增的條件和長度,本領域技術人員可以容易地優化擴增期間執行重新刺激之間的時間長度。
應當理解的是,在擴增期間執行多個重新刺激時,每次重新刺激可以相同或不同。例如,可以使用任何量的本文所述重新刺激劑的任何組合來進行每次重新刺激。對於每次重新刺激,所使用的特定重新刺激劑及其用量可以相同或不同。
然後可將擴增轉導的 T 細胞產物冷凍保存為「即用型」T 細胞產物,用於輸注到患者體內。
治療方法
可以給予含有本文所述的工程改造 γδ T 細胞的組合物用於預防性和/或治療性治療。在治療應用中,藥物組合物可以以足以治癒或至少部分阻止疾病或病症症狀的量給予已患有疾病或病症的受試者。還可給予工程改造 γδ T 細胞以減少病症發展、感染或惡化的可能性。用於治療用途的有效量工程改造 γδ T 細胞群可能根據疾病或病症的嚴重程度和病程、先前療法、受試者的健康狀況、體重和/或對藥物的反應和/或治療醫師的判斷而不同。
本公開內容的工程改造 γδ T 細胞可用於治療需要治療病症(例如,本文所述的癌症、傳染病和/或免疫性疾病)的受試者。
用 γδ T 細胞治療受試者病症(例如,疾病)的方法可能包括給予受試者治療有效量的工程改造 γδ T 細胞。本公開內容的 γδ T 細胞可以以各種方案(例如,時間、濃度、劑量、治療之間的間隔和/或製劑)施用。在接受本公開的工程改造 γδ T 細胞之前,還可以用,例如,化學療法、放射療法或兩者的組合對受試者進行預處理。在施用於受試者之前,還可以冷凍或冷凍保存工程改造的 γδ T 細胞群。工程改造的 γδ T 細胞群可包括表達相同、不同或相同和不同腫瘤識別部分組合的兩種或更多種細胞。例如,工程改造的 γδ T 細胞群可包括幾種不同的工程改造 γδ T 細胞,其被設計用於識別不同抗原或相同抗原的不同表位。
本公開內容的 γδ T 細胞可用於治療各種病症。一方面,本公開內容的工程改造 γδ T 細胞可用於治療癌症,包括實體瘤和惡性血液病。癌症的非限制性實例包括: 急性淋巴細胞白血病、急性髓性白血病、腎上腺皮質癌、AIDS 相關癌症、AIDS 相關淋巴瘤、肛門癌、闌尾癌、星形細胞瘤、神經母細胞瘤、基底細胞癌、膽管癌、膀胱癌、骨癌、腦腫瘤(如:小腦星形細胞瘤、腦星形細胞瘤/惡性膠質瘤、室管膜瘤、成神經管細胞瘤、幕上原始神經外胚層腫瘤、視覺通路和下丘腦膠質瘤)、乳腺癌、支氣管腺瘤、伯基特淋巴瘤、原發性未知癌、中樞神經系統淋巴瘤、小腦星形細胞瘤、宮頸癌、兒童癌症、慢性淋巴細胞白血病、慢性骨髓性白血病、慢性骨髓增生性疾病、結腸癌、皮膚 T 細胞淋巴瘤、結締組織增生性小圓細胞瘤、子宮內膜癌、室管膜瘤、食道癌、尤因氏肉瘤、生殖細胞腫瘤、膽囊癌、胃癌、胃腸道類癌腫瘤、胃腸道間質瘤、膠質瘤、毛細胞白血病、頭頸癌、心臟癌、肝細胞癌(肝癌)、霍奇金淋巴瘤、咽下癌、眼內黑色素瘤、胰島細胞癌、卡波西肉瘤、腎癌、喉癌、唇癌和口腔癌、脂肪肉瘤、肝癌、肺癌(如:非小細胞和小細胞肺癌)、淋巴瘤、白血病、巨球蛋白血症、骨惡性纖維組織細胞瘤/骨肉瘤、成神經管細胞瘤、黑色素瘤、間皮瘤、原發灶隱匿的轉移性鱗狀頸癌、口腔癌、多發性內分泌腫瘤綜合症、骨髓增生異常綜合症、骨髓性白血病、鼻腔和副鼻竇癌、鼻咽癌、神經母細胞瘤、非霍奇金淋巴瘤、非小細胞肺癌、口腔癌、口咽癌、骨肉瘤/骨惡性纖維組織細胞瘤、卵巢癌、卵巢上皮癌、卵巢生殖細胞腫瘤、胰腺癌、胰腺癌胰島細胞、副鼻竇和鼻腔癌、甲狀旁腺癌、陰莖癌、咽癌、嗜鉻細胞瘤、松果體星形細胞瘤、松果體生殖細胞瘤、垂體腺瘤、胸膜肺母細胞瘤、漿細胞瘤、原發性中樞神經系統淋巴瘤、前列腺癌、直腸癌、腎細胞癌、腎盂和輸尿管移行細胞癌、視網膜母細胞瘤、橫紋肌肉瘤、唾液腺癌、肉瘤、皮膚癌、默克爾細胞皮膚癌、小腸癌、軟組織肉瘤、鱗狀細胞癌、胃癌、T 細胞淋巴瘤、咽喉癌、胸腺瘤、胸腺癌、甲狀腺癌、滋養細胞腫瘤(妊娠)、原發部位未知癌、尿道癌、子宮肉瘤、陰道癌、外陰癌、瓦爾登斯特倫巨球蛋白血症和威爾姆斯瘤。
一方面,本公開的工程改造 γδ T 細胞可以用於治療傳染性疾病,例如:病毒或細菌感染,如:登革熱、埃博拉病毒、馬爾堡病毒,結核病 (TB)、腦膜炎或梅毒,優選情況是,該方法用於傳染性生物體的抗生素耐藥菌株、自體免疫性疾病、寄生蟲感染(例如,瘧疾)和其他疾病,如:MS和Morbus 帕金森,只要免疫方面給出的答案是 MHC-I 類分子。
再一方面,本公開內容的工程改造 γδ T 細胞可用於治療免疫性疾病,例如,自體免疫性疾病。自體免疫性疾病的實例(包括未正式宣佈為自體免疫性疾病的疾病)有關節炎、慢性阻塞性肺疾病、強直性脊柱炎、克羅恩病(兩種特發性炎症性腸道疾病「IBD」中的一種)、皮肌炎、1 型糖尿病、子宮內膜異位症、Goodpasture 氏綜合症、Graves 氏病、格林-巴厘綜合症 (GBS)、橋本氏病、化膿性汗腺炎、川崎病、IgA 腎病、原發性血小板減少性紫癜、間質性膀胱炎、紅斑狼瘡、混合性結締組織病、硬斑病、重症肌無力、嗜睡症、神經性肌強直、尋常型天皰瘡、惡性貧血、銀屑病、銀屑病關節炎、多發性肌炎、原發性膽汁性肝硬化、復發性多軟骨炎、類風濕關節炎、精神分裂症、硬皮病、乾燥綜合症、僵人綜合症、顳動脈炎(也稱作為「巨細胞動脈炎」)、潰瘍性結腸炎(兩種特發性炎症性腸道疾病「IBD」中的一種)、脈管炎、白斑病以及韋格納肉芽腫。
可以在病症臨床發作之前、發作期間和發作之後向受試者提供本公開內容的 γδ T 細胞治療。在疾病臨床發作後 1 天、1 週、6 個月、12 個月或 2 年後,可向受試者提供治療。在疾病臨床發作後可能提供給受試者治療超過 1 天、1 週、1 個月、6 個月、12 個月、2 年、3 年、4 年、5 年、6 年、7 年、8 年、9 年、10 年或更長時間。在疾病臨床發作後可能提供給受試者治療少於 1 天、1 週、1 個月、6 個月、12 個月或 2 年。治療還可能包括在臨床試驗中治療人受試者。治療可包括向受試者施用包含本公開內容的工程改造 γδ T 細胞的藥物組合物。
另一方面,向受試者施用本公開內容的工程改造 γδ T 細胞可以調節受試者體內內源性淋巴細胞的活性。另一方面,向受試者施用工程改造 γδ T 細胞可以向內源性 T 細胞提供抗原並且可增強免疫應答。另一方面,記憶 T 細胞可以為 CD4+ T 細胞。另一方面,記憶 T 細胞可以為 CD8+ T 細胞。另一方面,向受試者施用本公開內容的工程改造 γδ T 細胞可激活另一種免疫細胞的細胞毒性。另一方面,其他免疫細胞可以為 CD8+ T 細胞。另一方面,其他免疫細胞可以為天然殺傷 T 細胞。另一方面,向受試者施用本公開內容的工程改造 γδ T 細胞可抑制調節性 T 細胞。另一方面,調節性 T 細胞可以為 FOX3+ Treg 細胞。另一方面,調節性 T 細胞可以為 FOX3- Treg 細胞。其活性可通過本公開內容的工程改造 γδ T 細胞調節的細胞非限制性實例可能包括: 造血幹細胞;B 細胞;CD4;CD8;紅血球;白血球;樹突細胞,包括樹突抗原呈遞細胞;白細胞;巨噬細胞;記憶 B 細胞;記憶 T 細胞;單核細胞;自然殺傷細胞;中性粒細胞;T 輔助細胞;和 T 殺傷細胞。
在大多數骨髓移植期間,環磷醯胺與全身照射組合可常規用於防止受試者免疫系統對移植體的造血幹細胞 (HSC) 產生排斥。一方面,可以進行供體骨髓與白細胞介素-2 (IL-2) 離體孵育以增強供體骨髓中殺傷性淋巴細胞的產生。白細胞介素-2 (IL-2) 是野生型淋巴細胞生長、增殖和分化所必需的細胞因子。目前關於將 γδ T 細胞過繼轉移到人體中的研究可能需要共同施用 γδ T 細胞和白細胞介素-2。然而,低劑量和高劑量的 IL-2 都可能具有高度的毒副作用。IL-2 毒性可在多個器官/系統中表現出來,最顯著的是心臟、肺、腎和中樞神經系統。另一方面,本公開內容提供了用於向受試者施用工程改造 γδ T 細胞而不共同施用天然細胞因子或其修飾形式(例如 IL-2、IL-15、IL-12、IL-21)的方法。另一方面,工程改造的 γδ T 細胞可以在不與 IL-2 共同施用的情況下施用於受試者。另一方面,工程改造的 γδ T 細胞可以在手術期間施用於受試者,例如,骨髓移植而不共同施用 IL-2。
給藥方法
可以以任何順序或同時向受試者施用一種或多種工程改造的 γδ T 細胞群。如果同時施用,多重工程改造的 γδ T 細胞可以為單次統一的劑量,例如:靜脈內注射,或以多劑量提供,例如,多次靜脈內輸注、皮下注射或丸劑。工程改造的 γδ T 細胞可以一起包裝或單獨包裝在單個包裝中或在多個包裝中。可以以多劑量給予一種或所有工程改造的 γδ T 細胞。如果不是同時施用,多次劑量之間的時間間隔可能不同而至多為大約一週、一個月、兩個月、三個月、四個月、五個月、六個月或大約一年。另一方面,工程改造的 γδ T 細胞可以在施用於受試者後在受試者體內擴增。可以冷凍工程改造 γδ T 細胞以提供細胞以相同的細胞製劑進行多次治療。本公開內容的工程改造 γδ T 細胞和包含該細胞的藥物組合物可以作為套件包裝。套件可包括使用工程改造 γδ T 細胞和包含該細胞的組合物的說明書(例如,書面說明書)。
另一方面,治療癌症、傳染病或免疫性疾病的方法包括向受試者施用治療有效量的工程改造 γδ T 細胞,其中所述給藥治療癌症、傳染病或免疫性疾病。在另一實施方案中,治療有效量的工程改造 γδ T 細胞可以施用至少約 10 秒、30 秒、1 分鐘、10 分鐘、30 分鐘、1 小時、2 小時、3 小時、4 小時、5 小時、6 小時、12 小時、24 小時、2 天、3 天、4 天、5 天、6 天、1 週、2 週、3 週、1 個月、2 個月、3 個月、4 個月、5 個月、6 個月或 1 年。另一方面,治療有效量的工程改造 γδ T 細胞可以施用至少一週。另一方面,治療有效量的工程改造 γδ T 細胞可以施用至少二週。
本文所述的工程改造 γδ T 細胞可以在疾病或病症發生之前、發生期間或發生之後施用,並且施用含有工程改造 γδ T 細胞的藥物組合物的時間可能不同。例如,工程改造的 γδ T 細胞可以用作預防劑,並且可以連續給予有病症或疾病傾向的受試者,以減少疾病或病症發生的可能性。可以在症狀發作期間或症狀發作之後盡可能快地給予受試者工程改造的 γδ T 細胞。工程改造 γδ T 細胞可以在症狀發作後立即、症狀發作後的前 3 小時內、症狀發作後的前 6 小時內、症狀發作後的前 24 小時內、症狀發作後的前 48 小時內或症狀發作後的任何一段時間內給予。初始施用可通過任何實用的途徑,例如:通過本文描述的任何途徑使用本文描述的任何製劑給予。另一方面,本公開內容的工程改造 γδ T 細胞可以是靜脈內施用。一種或多種劑量的工程改造 γδ T 細胞可在癌症、傳染病、免疫性疾病、敗血症或骨髓移植開始後儘快施用,並持續一段用於治療免疫性疾病所必需的時間,例如,從約 24 小時到約 48小時、從約 48 小時到約 1 週、從約 1 週到約 2 週、從約 2 週到約 1 個月、從約 1 個月到約 3 個月。對於癌症治療,可以在癌症發作後數年和其他治療之前或之後施用一劑或多劑量的工程改造 γδ T 細胞。另一方面,工程改造的 γδ T 細胞可以施用至少約 10 分鐘、30 分鐘、1 小時、2 小時、3 小時、4 小時、5 小時、6 小時、12 小時、24 小時、至少 48 小時、至少 72 小時、至少 96 小時、至少 1 週、至少 2 週、至少 3 週、至少 4 週、至少 1 個月、至少 2 個月、至少 3 個月、至少 4 個月、至少 5 個月、至少 6 個月、至少 7 個月、至少 8 個月、至少 9 個月、至少 10 個月、至少 11 個月、至少 12 個月、至少 1 年、至少 2 年、至少 3 年、至少 4 年或至少 5 年。每個受試者的治療時間可能不同。
保存
一方面, γδ T 細胞可以在冷凍介質中配製並置於低溫儲存裝置例如:液氮冷凍器(-196℃)或超低溫冷凍器(-65℃、-80℃、-120℃ 或 -150℃)中長期儲存至少約 1 個月、2 個月、3 個月、4 個月、5 個月、6 個月、1 年、2 年、3 年或至少 5 年。冷凍培養基可以含有二甲基亞碸 (DMSO) 和/或氯化鈉 (NaCl) 和/或右旋糖和/或硫酸葡聚糖和/或羥乙基澱粉 (HES) 以及生理pH緩衝劑,以將 pH 保持在約 6.0 至約 6.5、約 6.5 至約 7.0、約 7.0 至約 7.5、約 7.5 至約 8.0 或約 6.5 至約 7.5 之間。冷凍保存的 γδ T 細胞可以解凍並通過用本文所述的抗體、蛋白質、肽和/或細胞因子刺激進行進一步加工。冷凍保存的 γδ T 細胞可以解凍並用本文所述的病毒載體(包括逆轉錄病毒、腺相關病毒 (AAV) 和慢病毒載體)或非病毒手段(包括 RNA、DNA,例如轉座子和蛋白質)進行基因修飾。可以進一步以每 mL 冷凍介質中至少約 101 、102 、103 、104 、105 、106 、107 、108 、109 或至少約 1010 個細胞冷凍保存修飾的 γδ T 細胞以產生至少約 1、5、10、100、150、200、500 個小瓶量的細胞庫。冷凍保存的細胞庫可以保留其功能並且可以解凍並進一步刺激和擴增。另一方面,可以在合適的封閉容器(例如:細胞培養袋和/或生物反應器)中刺激和擴增解凍的細胞,以產生大量細胞作為同種異體細胞產物。冷凍保存的 γδ T 細胞可以在低溫儲存條件下維持其生物學功能至少約 6 個月、7 個月、8 個月、9 個月、10 個月、11 個月、12 個月、13 個月、15 個月、18 個月、20 個月、24 個月、30 個月、36 個月、40 個月、50 個月或至少約 60 個月。另一方面,製劑中不使用防腐劑。冷凍保存的 γδ T 細胞可以解凍並作為同種異體即用型細胞產物輸注到多個患者中。
一方面,本文所述的工程改造 γδ T 細胞可能存在於組合物中,含量為至少 1×103 個細胞/ml、至少 2×103 個細胞/ml、至少 3×103 個細胞/ml、至少 4×103 個細胞/ml、至少 5×103 個細胞/ml、至少 6×103 個細胞/ml、至少 7×103 個細胞/ml、至少 8×103 個細胞/ml、至少 9×103 個細胞/ml、至少 1×104 個細胞/ml、至少 2×104 個細胞/ml、至少 3×104 個細胞/ml、至少 4×104 個細胞/ml、至少 5×104 個細胞/ml、至少 6×104 個細胞/ml、至少 7×104 個細胞/ml、至少 8×104 個細胞/ml、至少 9×104 個細胞/ml、至少 1×105 個細胞/ml、至少 2×105 個細胞/ml、至少 3×105 個細胞/ml、至少 4×105 個細胞/ml、至少 5×105 個細胞/ml、至少 6×105 個細胞/ml、至少 7×105 個細胞/ml、至少 8×105 個細胞/ml、至少 9×105 個細胞/ml、至少 1×106 個細胞/ml、至少 2×106 個細胞/ml、至少 3×106 個細胞/ml、至少 4×106 個細胞/ml、至少 5×106 個細胞/ml、至少 6×106 個細胞/ml、至少 7×106 個細胞/ml、至少 8×106 個細胞/ml、至少 9×106 個細胞/ml、至少 1×107 個細胞/ml、至少 2×107 個細胞/ml、至少 3×107 個細胞/ml、至少 4×107 個細胞/ml、至少 5×107 個細胞/ml、至少 6×107 個細胞/ml、至少 7×107 個細胞/ml、至少 8×107 個細胞/ml、至少 9×107 個細胞/ml、至少 1×108 個細胞/ml、至少 2×108 個細胞/ml、至少 3×108 個細胞/ml、至少 4×108 個細胞/ml、至少 5×108 個細胞/ml、至少 6×108 個細胞/ml、至少 7×108 個細胞/ml、至少 8×108 個細胞/ml、至少 9×108 個細胞/ml、至少 1×109 個細胞/ml 或更多、從約 1×103 個細胞/ml 至約至少 1×108 個細胞/ml、從約 1×105 個細胞/ml 至約至少 1×108 個細胞/ml 或從約 1×106 個細胞/ml 至約至少 1×108 個細胞/ml。
為了開發可存活的同種異體 T 細胞產物,例如,其可以被工程改造以表達腫瘤抗原特異性 TCR,例如嵌合 CD8α-CD4tm/細胞內蛋白,本公開的實施方案可能包括可以最大限度地提高 γδ T 細胞產量,同時最大限度地減少最終同種異體產物中存在殘留 αβ T 細胞的方法。例如,本公開內容的實施方案可能包括通過耗盡 αβ T 細胞並用分子(例如:兩性黴素 B、N-乙醯半胱氨酸 (NAC)(或高劑量穀氨醯胺/谷氨酸)、IL-2和/或IL-15 補充生長培養物來擴增和激活 γδ T 細胞的方法。
一方面,根據本公開內容的一個方面,本文描述的方法可以用於產生自體或同種異體產物。
通過參考以下實施例可以更好地理解本發明,這些實施例不用來限制申請專利範圍。 實施例
實施例 1
擴增期間用自體細胞重新刺激 γδ T 細胞導致擴增增強和延長。
圖 3A 和 3B 顯示了用自體單核細胞重新刺激對 γδ T 細胞擴增的影響。圖 3A 顯示了用於生成圖 3B 中所呈列資料的擴增過程。簡言之,在第 0 天,在存在唑來膦酸鹽 (ZOL) (5 µM)、IL-2 (100 U/ml) 和 IL-15 (100 ng/ml) 的情況下,激活 αβ-TCR 表達 T 細胞(包括 CD4+ 和 CD8+ T 細胞)耗盡的外周血單核細胞 (PBMC)(「γδ T 細胞」)。第 3 天,模擬轉導激活的 γδ T 細胞。第 4 天,擴增模擬轉導的細胞。第 7 天,擴增細胞用自體單核細胞(從 PBMC (Miltenyi) 進行 CD14+ 選擇並用 ZOL (100 µM) 脈衝處理 4 小時而獲得)重新刺激,比例為 10(單核細胞):1(γδ T 細胞)。第 14 天冷凍擴增細胞。
圖 3B 顯示了與無重新刺激的情況相比,用自體單核細胞重新刺激增加了從兩個供體(D1 和 D2)獲得的 γδ T 細胞的倍數擴增。10 天後,重新刺激的細胞倍數擴增減少。到 14 天時,重新刺激細胞的倍數擴增降至類似無重新刺激的倍數擴增。
圖 4A 和 4B 顯示了用經輻照的自體 αβ 耗盡的 PBMC 重新刺激對 γδ T 細胞擴增的影響。圖 4A 顯示了用於生成圖 4B 中所呈列資料的擴增過程。簡言之,在第 0 天,在存在唑來膦酸鹽 (ZOL) (5 µM)、IL-2 (100 U/ml) 和 IL-15 (100 ng/ml) 的情況下,激活 αβ-TCR 表達 T 細胞(包括 CD4+ 和 CD8+ T 細胞)耗盡的外周血單核細胞 (PBMC)(「γδ T 細胞」)。第 2 天,模擬轉導激活的 γδ T 細胞。第 3 天,擴增模擬轉導的細胞。第 7 天,用經輻照 (100 Gy) 的自體 αβ-TCR 表達 T 細胞耗盡的 PBMC(用 ZOL (100 µM) 脈衝處理 4 小時)重新刺激擴增的細胞,比例為 5:1 或 10:1(αβ 耗盡的 PBMC:γδ T 細胞)。
圖 4B 顯示了與無重新刺激的情況相比,用 αβ 耗盡的 PBMC 以 5:1 和 10:1 的比例重新刺激,增加了從兩個供體(D1 和 D2)獲得的 γδ T 細胞的倍數擴增。
圖 5-11 顯示了用自體單核細胞或經輻照的自體 αβ 耗盡的 PBMC 多次重新刺激對 γδ T 細胞擴增的影響。
圖 5 顯示了用於生成圖 6-11 中所呈列資料的擴增過程。簡言之,在第 0 天,在存在唑來膦酸鹽 (ZOL) (5 µM)、IL-2 (100 U/ml) 和 IL-15 (100 ng/ml) 的情況下,激活 αβ-TCR 表達 T 細胞(包括 CD4+ 和 CD8+ T 細胞)耗盡的外周血單核細胞 (PBMC)(「γδ T 細胞」)。第 2 天,模擬轉導激活的 γδ T 細胞。第 3 天,擴增模擬轉導的細胞。第 7 天和第 14 天,用以下其中之一重新刺激擴增細胞:1) 自體單核細胞(通過從 PBMC (Miltenyi) 進行 CD14+ 選擇以及用 ZOL (100 µM) 脈衝處理 4 小時而獲得),比例 5:1 或 10:1(單核細胞:γδ T 細胞);或 2) 經輻照 (100 Gy) 的自體 αβ-TCR 表達 T 細胞耗盡的 PBMC(用 ZOL (100 µM) 脈衝處理 4 小時),比例 10:1 或 20:1(αβ 耗盡的 PBMC:γδ T 細胞)。
圖 6A 和 6B 顯示了用自體單核細胞或經輻照的自體 αβ 耗盡 的 PBMC 多次重新刺激對來自兩個供體的 γδ T 細胞擴增的影響。圖 6A 顯示了來自供體 1 的資料。在對照樣本和低比例單核細胞:γδ T 細胞中,擴增在大約第 14 天達到平穩期。但是,第 7 天和第 14 天用單核細胞以 10:1(單核細胞: γδ T 細胞)的比例或用經輻照 αβ 耗盡的 PBMC 以 20:1(αβ 耗盡的 PBMC:γδ T 細胞)的比例重新刺激 γδ T 細胞可以防止出現這種平穩期,從而顯著增強擴增至少 17 天。例如,在第 7 天和第 14 天用經輻照 αβ 耗盡的 PBMC 以 20:1(αβ 耗盡的 PBMC:γδ T 細胞)的比例重新刺激時,δ2 細胞在第 17 天達到 2498 倍擴增,而沒有達到平穩期。
圖 6B 顯示了用自體單核細胞或經輻照的自體 αβ 耗盡的 PBMC 多次重新刺激對來自第二個供體的 γδ T 細胞擴增的影響。與圖 5B 所示的資料類似,在對照樣本和低比例單核細胞: γδ T 細胞中,擴增在大約第 14 天達到平穩期。但是,第 7 天和第 14 天用單核細胞以 5:1 或 10:1(單核細胞:γδ T 細胞)的比例或用經輻照 αβ 耗盡的 PBMC 以 10:1 或 20:1(αβ 耗盡的 PBMC:γδ T 細胞)的比例重新刺激 γδ T 細胞可以防止出現這種平穩期,從而顯著增強擴增至少 17 天。例如,在第 7 天和第 14 天用經輻照 αβ 耗盡的 PBMC 以 20:1(αβ 耗盡的 PBMC:γδ T 細胞)的比例重新刺激時,δ2 細胞在第 17 天達到 305 倍擴增,而沒有達到平穩期。
圖 7A-C 和 8A-C 顯示了用自體單核細胞或經輻照的自體 αβ 耗盡的 PBMC 多次重新刺激對來自兩個供體的 γδ T 細胞擴增的影響。這些資料也匯總於下面的表 1 中。 表 1. 第 21 天與對照條件相比擴增的倍數變化。
供體 飼養細胞 γδ T 細胞 δ 2 T 細胞
D1 單核細胞 10:1 1.2 1.2
單核細胞 5:1 0.5 0.5
單核細胞 1:1 0.4 0.4
PBMC 20:1 12.2 13.2
PBMC 10:1 - -
D2 單核細胞 10:1 5.5 5.6
單核細胞 5:1 2.6 2.6
單核細胞 1:1 1.7 1.7
PBMC 20:1 18.8 19.2
PBMC 10:1 15.6 67.8
如表 1 和圖 7A-C 所示,供體 1 的倍數擴增低於供體 2(參見圖 8A-C)。此結果可歸因於第 21 天觀察到的對照樣本擴增突然增加。儘管如此,在兩個供體中都很明顯,用經輻照自體 αβ 耗盡的 PMBC 進行重新刺激會導致總 γδ T 細胞的倍數擴增度高於用自體單核細胞重新刺激時。這種作用似乎主要歸因於 δ2 T 細胞的增加。
圖 9 和 10 顯示了用自體單核細胞或經輻照的自體 αβ 耗盡的 PBMC 多次重新刺激不會顯著改變擴增 γδ T 細胞的記憶表型。在兩個供體中用 10:1 單核細胞重新刺激的擴增 γδ T 細胞中均檢測到 CD27 表達略有增加。
圖 11A 和 11B 顯示了用自體單核細胞或經輻照的自體 αβ 耗盡的 PBMC 多次重新刺激對擴增 γδ T 細胞生存力的影響。在重新刺激條件下觀察到擴增 γδ T 細胞生存力降低。這種影響在用經輻照自體 αβ 耗盡的 PBMC 重新刺激的 γδ T 細胞(20 個 PBMC:1 個 γδ T 細胞)中最為明顯。重新刺激後,生存力趨於下降,並在一週內反彈。
實施例 2
用腫瘤衍生細胞刺激 γδ T 細胞可增強並延長擴增。
圖 12A 和 12B 顯示了工程改造腫瘤衍生細胞的共培養對 γδ T 細胞的影響。簡言之,在第 0 天,在存在唑來膦酸鹽 (ZOL) (5 µM)、IL-2 (100 U/ml) 和 IL-15 (100 ng/ml) 的情況下,激活 αβ-TCR 表達 T 細胞(包括 CD4+ 和 CD8+ T 細胞)耗盡的外周血單核細胞 (PBMC)(「γδ T 細胞」)。經輻照的腫瘤衍生細胞 (K562) 以 2:1 的比例(腫瘤衍生細胞:γδ T 細胞)被添加至一些樣本中。其他樣本在抗 CD28 或抗 CD27 mAb 包被的平板上培養。第 3 天,模擬轉導激活的 γδ T 細胞。第 4 天,擴增模擬轉導的細胞。第 21 天冷凍擴增的細胞。
圖 12A 和圖 12B 顯示了從兩個供體(D1(圖 12A)和 D2(圖 12B))獲得的 γδ T 細胞用經輻照的腫瘤衍生細胞 +/- ZOL 刺激具有比用抗 CD28 抗體+ZOL、抗 CD27 抗體+ ZOL 和 ZOL 單獨(對照)刺激的細胞具有更高的倍數擴增。
實施例 3
用腫瘤衍生細胞刺激 γδ T 細胞並重新刺激可增強並延長 γδ T 細胞的擴增。
表 2 匯總了該實驗中測試的條件。簡言之,從兩個供體獲得的 γδ T 細胞於第 0 天在存在 IL-2 (100 U/ml) 和 IL-15 (100 ng/ml) +/- 唑來膦酸鹽 (ZOL) (5 µM) +/- 腫瘤衍生細胞(2 個腫瘤衍生細胞:1 個 T 細胞)+/- 重新刺激的情況下激活如下: a) 沒有腫瘤衍生細胞的情況下(對照);b) 用野生型經輻照的腫瘤衍生細胞 (K562 WT);c) 在不存在 ZOL 的情況下用經輻照的修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 2);c-重新刺激) 在不存在 ZOL 的情況下用經輻照的修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 2)並於第 7 天和第 14 天重新刺激; d) 用經輻照的修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 2);和 e) 用經輻照的修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 1)。第 2 天模擬轉導細胞,並於第 3 天擴增。第 7、10、14 和 17 天餵養細胞,並在第 7 和 14 天任選重新刺激。第 21 天冷凍細胞。 表 2.
供體 樣本編號 飼養細胞 (D0) 唑來膦酸鹽 (5uM; D0) 重新刺激 (D7) 重新刺激 (D14)
D1 1a N/A + - -
1b K562 WT   + - -
1c K562 變體 2 - - -
1c_Restim K562 變體 2 - K562 變體 2 K562 變體 2
1d K562 變體 2 + - -
1e K562 變體 1 + - -
D2 2a N/A + - -
2b K562 WT + - -
2c K562 變體 2 - - -
2c_Restim K562 變體 2 - K562 變體 2 K562 變體 2
2d K562 變體 2 + - -
2e K562 變體 1 + - -
圖 13A-C 顯示了 γδ T 細胞激活期間各種腫瘤衍生細胞共培養的結果。圖 13A 顯示了從兩個供體(D1(左圖)和 D2(右圖))獲得的 γδ T 細胞於第 0 天在存在唑來膦酸鹽 (ZOL) (5 µM)、IL-2 (100 U/ml) 和 IL-15 (100 ng/ml) 的情況下激活的倍數擴增,激活方式如下: 1) 沒有腫瘤衍生細胞的情況下(對照);2) 用野生型經輻照的腫瘤衍生細胞 (K562 WT);3) 用經輻照的修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 1);4) 用經輻照的修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 2);5) 在不存在 ZOL 的情況下用經輻照的修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 2);和 6) 在不存在 ZOL 的情況下用經輻照的修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 2)並於第 7 天和第 14 天重新刺激。
圖 13B 和 13C 顯示了供體 1(圖 13B)和供體 2(圖 13C)中的 δ1(左圖)和 δ2(右圖)T 細胞的擴增。
圖 14A 和 14B 顯示了供體 1(圖 14A)和供體 2(圖 14B)的整個活細胞群中存在 γδ T 細胞的百分比。
圖 15 顯示,與唑來膦酸鹽在培養物中的條件相比,培養物中缺乏唑來膦酸鹽導致多克隆群(δ1 和 δ2 γδ T 細胞皆然)。第 21 天收穫細胞,並通過流式細胞術分析,以確定 δ1 和 δ2 群。
圖 16 顯示,腫瘤衍生的細胞共培養物不會改變擴增 γδ T 細胞的記憶表型。第 21 天收穫細胞,並通過流式細胞儀分析,以通過檢測細胞表面上的 CD45、CD27 和 CCR7 來確定記憶表型。
實施例 4
擴增期間用同種異體細胞重新刺激 γδ T 細胞導致擴增增強和延長。
圖 17A 和 17B 顯示了用經輻照的同種異體 PBMC 重新刺激對 γδ T 細胞擴增的影響。簡言之,在第 0 天,在存在唑來膦酸鹽 (ZOL) (5 µM)、IL-2 (100 U/ml) 和 IL-15 (100 ng/ml) 的情況下,激活 αβ-TCR 表達 T 細胞(包括 CD4+ 和 CD8+ T 細胞)耗盡的外周血單核細胞 (PBMC)(「γδ T 細胞」)。第 2 天,模擬轉導激活的 γδ T 細胞。第 3 天,擴增模擬轉導的細胞。第 7 天,擴增 γδ T 細胞被分為五個獨立的組,以檢查同種異體飼養細胞的重新刺激作用。具體而言,2x106 個擴增 γδ T 細胞置於每個治療組中。治療組如下: 1) IL-2 + IL-15(對照);2) PBMC + LCL + OKT3 + IL-2;3) PBMC + IL-2;4) LCL + IL-2;5) OKT3 + IL-2。對於每個組,PBMC = 匯集自 2-3 個供體的同種異體 PBMC,輻照並以 25x106 個細胞的量添加。LCL = 經輻照的類淋巴母細胞,並以 5x106 個細胞的量添加。OKT3 = 可溶性 OKT3,一種激活抗 CD3 抗體,添加量為 30 ng/ml。IL-2 的添加量為 50U/ml。
第 14 天重複每種重新刺激處理,於第 21 天收穫細胞並進行分析。
圖 17A-B 顯示了與無重新刺激的情況相比,用同種異體 PBMC和/或 LCL 重新刺激增加了從兩個供體(D1 和 D2)獲得的 γδ T 細胞的倍數擴增,而沒有生長平穩期。
圖 18A-C 顯示了用同種異體 PBMC 和/或 LCL 重新刺激產生多克隆(δ1 和 δ2 γδ T 細胞)群。圖 18A 和 18B 顯示了兩個供體的 δ1 細胞存在占活細胞的百分比。此資料表明,δ1 細胞的存在具有供體依賴性。圖 18C 顯示了第 21 天兩個供體對照治療 (IL-2 + IL-15) 和 PBMC+LCL+OKT3 治療(存在 IL-2)的結果。
圖 19A-B 顯示了用 PBMC 和/或 LCL 重新刺激後,擴增 γδ T 細胞群的記憶表型。在第 14 天而不是第 21 天測量記憶表型,因此僅在第 7 天重新刺激一次。擴增 γδ T 細胞群通過流式細胞術分析,以通過檢測細胞表面上的 CD45、CD27 和 CCR7 來確定記憶表型。圖 19A 顯示了在擴增 γδ T 細胞群上的 CD27 檢測。用 PBMC+LCL+OKT3 重新刺激的擴增 γδ T 細胞中,CD27 的百分比似乎略有下降。圖 19B 顯示了 CD45 和 CCR7 表達。在用 PBMC 和用 PBMC+LCL+OKT3 重新刺激的擴增 γδ T 細胞中,CCR7 的百分比增加。
實施例 5
產生用唑來膦酸鹽脈衝處理的同種異體 PBMC 用於激活 γδ T 細胞。
如以上實施例 1 中所示,用唑來膦酸鹽 (ZOL) 脈衝處理、然後進行輻照的新鮮自體 PBMC 可用於在第 7 天和任選地在其他重新刺激步驟(例如,第 14 天等)用於重新刺激 γδ T 細胞。但是,此方法需要從臨床供體處收集數次樣本。
為了避免需要多次收集,可以產生經 ZOL 脈衝處理的 PBMC 同種異體庫,以用於一次或多次重新刺激。這些 PBMC 同種異體庫按以下方式生成: 從供體中收集的冷凍同種異體 PBMC(包括 αβ T 細胞)解凍,並用 100 µM ZOL 脈衝處理 4 小時。然後,這些經 ZOL 處理的同種異體 PBMC 進行洗滌並冷凍。含有 ZOL 處理的同種異體 PBMC 的冷凍小瓶以 50 Gy 輻照,並保存以備將來使用。在製造過程的第 7 天,這些經 ZOL 處理的經輻照同種異體 PBMC 解凍進行重新刺激。
實施例 6
轉導γδ T 細胞的肽特異性殺傷活性
通過表 3 中所示的擴增方法製備轉導γδ T 細胞。 表 3
  工藝 1 工藝 2 工藝 3 對照
飼養細胞 經輻照的 K562-41BBL-mbIL15(即,表達膜結合 IL15 和 4-1 BB 配體的 K562 細胞) 唑來膦酸鹽脈衝處理的經輻照同種異體 PBMC 匯集的經輻照同種異體 PBMC(2-3 個供體)+ LCL + OKT3
添加飼養細胞至培養物的天數 第 0 天 第 7 天和第 14 天 第 7 天和第 14 天
飼養細胞:γδ T 細胞比例 2 K562:1 總細胞(PBMC + γδ T 細胞)比例 20 PBMC:1 γδ T 細胞比例 1 γδ T 細胞:2.5 LCL:12.5 PBMC 比例
細胞因子 細胞在整個 21 天製造過程中生長於 IL15 + IL2 中 細胞在整個 21 天製造過程中生長於 IL15 + IL2 中 細胞在製造的最初 7 天生長於 IL15 + IL2 中、然後在第 7 天後直至第 21 天轉為僅在 IL2 中 細胞在整個 21 天製造過程中生長於 IL15 + IL2 中
以上工藝從工藝 1 產生了 6.8% 的肽/MHC-特異性 TCR 轉導 γδ T (Tet+) 細胞,從工藝 2 產生了 21.9% 的 Tet+ 細胞,從工藝 3 產生了 47.4% 的 Tet+ 細胞,從對照工藝產生了 28.8% 的Tet+ 細胞。為了確定 TCR 轉導的 γδ T 細胞 (TCR-T) 的肽特異性殺傷活性,效應 T 細胞(即,通過工藝 1、2、3 或對照工藝擴增的 γδ T 細胞)與腫瘤細胞(例如,肽陽性 U2OS 細胞,其中每個細胞可提呈約 242 個拷貝,和肽陰性 MCF-7 細胞)以 3:1(效應細胞:腫瘤細胞)的比例進行共培養。非轉導 γδ T 細胞 (NT) 用作陰性對照。使用 Incucyte 活細胞分析系統即時分析腫瘤細胞的生存力/死亡。圖 20A 顯示,針對肽陽性 U2OS 細胞,通過工藝 3 擴增的 γδ T 細胞 (TCR-T) 的殺傷活性顯著高於通過工藝 1 或工藝 2 擴增的殺傷活性,並且與通過對照工藝 (TCR-T) 擴增的殺傷活性相似。通過工藝 2、工藝 3 和對照工藝擴增的 γδ TCR- T 細胞顯示出比其各自 γδ NT 細胞更高的殺傷活性。通過工藝 1 擴增的 γδ TCR-T 細胞和 γδ NT 細胞的殺傷活性之間似乎無顯著差異。圖 20B 顯示,針對肽陰性 MCF-7,通過各種工藝擴增的 γδ T 細胞 (TCR-T) 的殺傷活性似乎與各自的未轉導 γδ T 細胞 (NT) 細胞的殺傷活性相似。這些結果表明,通過工藝 2、工藝 3 和對照工藝擴增的 TCR 轉導 γδ T 細胞可以以肽特異性方式識別和殺死腫瘤細胞。
實施例 7
γδ T 細胞製造的優化
圖 21 顯示了 γδ T 細胞的製造工藝,例如對照工藝和工藝 1-3(表 3),其中可在存在飼養細胞和/或激動劑 I 或 II(例如,抗 CD3、抗 CD28、抗 41BB、抗 ICOS、抗 CD40 和抗 OX40 抗體)的情況下解凍、激活和/或擴增細胞。飼養細胞於第 0 天(工藝 1)或第 7 天(重新刺激)和第 14 天(重新刺激)(工藝 2 和工藝 3)添加。圖 22A-22D 顯示,通過對照工藝(無飼養細胞)(圖 22A)製備的 γδ T 細胞中觀察到的生長平穩期通過飼養細胞刺激(例如,工藝 1(圖 22B)、工藝 2(圖 22C)和工藝 3(圖22D))克服。通過對照工藝、工藝 2 和工藝 3 產生的細胞中觀察到激活後 γδ T 細胞損失在工藝 1 產生細胞時得到改善。另一方面,工藝 2 和工藝 3 產生的 γδ T 細胞比工藝 1 產生的 γδ T 細胞表現出更高的倍數擴增。通過工藝 3 產生的 γδ T 細胞至少擴增了 10,000 倍。
通過工藝 3 產生的 γδ T 細胞表現出「更年輕的」T 細胞表型
分析了由對照工藝和工藝 1-3 產生的 γδ T 細胞的表型。圖 23A 顯示了由工藝 3 在第 14 天和第 21 天產生的 γδ T 細胞比由對照工藝、工藝 1 和工藝 2 產生的 γδ T 細胞具有更高 % 的 γδ T 細胞表現出 Tcm 表型,例如,CD27+CD45RA-。同樣地,通過工藝 3 在第 14 天和第 21 天產生的 γδ T 細胞比對照工藝、工藝 1 和工藝 2 產生的 γδ T 細胞具有更高 % 的 γδ T 細胞表現出 Tcm 表型,例如 CD62L+(圖 23B),以及更低 % 的 γδ T 細胞表現出非 Tcm 表型,例如 CD57+(圖 23C)。(n=4;平均值+ SD;與對照相比採用圖基事後檢驗法的 ANOVA;****p<0.0001;***p<0.001;**p<0.01;*p<0.5)
對通過各種工藝產生的 γδ T 細胞中免疫檢查點蛋白表達的影響
為了確定通過各種工藝產生的 γδ T 細胞中免疫檢查點蛋白表達,確定了 PD1+(圖 24A)、LAG3+(圖 24B)、TIM3+(圖 24C)和 TIGIT+(圖 24D)γδ T 細胞百分比。圖 24A 顯示,在第 14 天,與對照工藝 (C) 相比,工藝 1-3 所產生的 PD1+ γδ T 細胞百分比降低。另一方面,由工藝 1 產生的 PD1+ γδ T 細胞的百分比從第 14 天到第 21 天呈增加狀態。由工藝 2 和工藝 3 產生的PD1+ γδ T 細胞的百分比從第 14 天到第 21 天似乎相當。圖 24B 顯示,第 14 天由工藝 2 和 3 產生的 LAG3+ γδ T 細胞百分比與對照工藝(C) 相比增加。雖然從第 14 天到第 21 天由工藝 2 和工藝 3 產生的 LAG3+ γδ T 細胞百分比似乎相當,但是從第 14 天到第 21 天由工藝 1 產生的 LAG3+ γδ T 細胞百分比增加。圖 24C 顯示,從第 14 天到第 21 天由工藝 1-3 產生的 TIM3+ γδ T 細胞 % 降低。圖 24D 顯示,從第 14 天到第 21 天由工藝 1-3 產生的 TIGIT+ γδ T 細胞 % 降低。
對通過各種工藝產生的 γδ T 細胞的轉基因表達的影響
由工藝 1-3 和對照工藝 (C) 產生的 γδ T 細胞通過編碼 CD8αβ 和 TCRαβ 的病毒載體 (PTE.CD8.TCR.WPRE) 轉導,接著進行靶肽 (PRAME)/MHC 四聚體 (Tet) 染色。圖 25A 顯示,第一次重新刺激後第 14 天,由工藝 3 產生的 PTE.CD8.TCR.WPRE 轉導的 Tet+ γδ T 細胞 % 高於工藝 1、工藝 2 和對照工藝產生的 %。非轉導 (NT) 細胞用作陰性對照。通過工藝 3 產生的 PTE.CD8.TCR.WPRE 轉導的 γδ T 細胞比對照工藝(18.4%,圖 26A)和工藝 2(12.1%,圖 26B)產生的 γδ T 細胞可產生更多的 CD8+ PRAME Tet+ γδ T 細胞(39%,圖 26C)。MFI 在各轉導條件下相似。圖 25B 顯示,通過工藝 3 產生的摻入 γδ T 細胞的轉基因拷貝數為約 2 拷貝/細胞,這與對照工藝產生的拷貝數相當,並且高於工藝 1 和工藝 2 產生的拷貝數。
工藝 1 中初始 K562 刺激對轉導和擴增的影響
為了確定初始 K562 刺激對通過工藝 1 製備的 γδ T 細胞產物的影響,如圖 27A 所示,在第 2 天用 PTE.CD8.TCR.WPRE 轉導之前於第 0 天刺激 γδ T 細胞,或在第 2 天用 PTE.CD8.TCR.WPRE 轉導後於第 4 天刺激 γδ T 細胞。圖 27B 顯示在有或沒有轉導的情況下於第 4 天刺激的 γδ T 細胞的倍數擴增比在第 0 天刺激的低。圖 28A-28C 顯示,對於在第 0 天用 K562 細胞刺激的 γδ T 細胞,用 60 µl、120 µl 和 240 µl PTE.CD8.TCR.WPRE 轉導的 γδ T 細胞分別產生 8.62%、17.5% 和 31.1% 的 CD8+PRAME Tet+ 細胞。圖 28D 顯示了整合轉基因的拷貝數。儘管用 240 µl PTE.CD8.TCR.WPRE 轉導的 γδ T 細胞產生了 31.1% 的 CD8+ PRAME Tet+ 細胞(圖 28C),但整合轉基因的拷貝數為 7.53拷貝/細胞,其超過了 5 拷貝/細胞的安全極限。相比之下,圖 28E 顯示,用 60 μl PTE.CD8.TCR.WPRE 轉導、然後在第 4 天用 K562 細胞刺激的 γδ T 細胞產生了 31.8% 的 CD8+ PRAME Tet+ 細胞,整合轉基因的拷貝數為 1.71拷貝/細胞。這些資料表明,雖然轉導後第 4 天的 K562 刺激可產生足夠的轉導,從而比轉導前第 0 天刺激的 T 細胞產物更好、更安全,但它可能會限制擴增。
重新刺激對轉基因表達的影響
圖 29 顯示,轉基因 (PTE.CD8.TCR.WPRE) 表達,例如,CD8+PRAME Tet+ γδ 細胞 % (1) 對於由工藝 1 (n = 2) 在第 4 天刺激產生的細胞,從第 14 天到第 21 天增加;(2) 對於由工藝 2 (n = 4) 在第 7 天和第 14 天重新刺激產生的細胞,從第 7 天到第 21 天降低;(3) 對於由工藝 3 (n = 4) 在第 7 天和第 14 天重新刺激產生的細胞,從第 7 天到第 14 天增加,然後從 14 天到第 21 天降低。對於由對照工藝產生的細胞,轉基因表達保持在相似的水準。
對通過各種工藝產生的 γδ T 細胞功能的影響 圖 30 顯示了在第 7 天第一次重新刺激後於第 14 天進行的功能評估。由工藝 2 和3 以及對照工藝 (C) 產生的 γδ T 細胞用 PTE.CD8.TCR.WPRE 轉導(分別為 2-T、3-T 和 C-T),也可以不轉導(分別為 2-NT、3-NT 和 C-NT)。用相同 TCR 進行轉導或不進行轉導的 CD8+ αβ T 細胞作為陽性對照(P-T 和 P-NT)。如此製備的細胞與靶細胞,例如 UACC257(每個細胞約 1081 個目標肽)、U2OS(每個細胞約 242 個目標肽)、A375(每個細胞約 51 個目標肽)和 MCF-7(每個細胞 0 個目標肽)一起孵育,效應子/靶標比例為 3:1,然後進行細胞毒性試驗。將效應細胞對轉導效率標準化。圖 31A-31C 分別顯示,在第一次重新刺激之後,由工藝 2 (2-T) 和工藝 3 (3-T) 產生的 γδ T 細胞針對 UACC257、U2OS 和 A375 細胞的溶細胞活性低於CT 和 PT 的溶細胞活性。圖 31D 顯示,由工藝 2 (2-T) 和工藝 3 (3-T) 產生的 γδ T 細胞針對非靶 MCF7 細胞的溶細胞活性最小。(與對照相比,採用圖基事後檢驗法的 ANOVA;n = 4 個供體;**p<0.01;*p<0.5)
圖 32A 和 32B 分別顯示,在第一次重新刺激之後,由工藝 2 (2) 和工藝 3 (3) 產生的 γδ T 細胞針對 UACC257 和 U2OS 細胞的 IFNγ 分泌與對照工藝 (C) 產生的 IFNγ 分泌相當,效應子/靶標比例為 3:1。將效應細胞對轉導效率標準化。圖 32C 顯示,由工藝 2 (2) 和工藝 3 (3) 產生的 γδ T 細胞針對非靶 MCF7 細胞的 IFNγ 分泌最小。未轉導 (NT) 細胞作為陰性對照。用相同 TCR 進行轉導的 CD8+ αβ T 細胞作為陽性對照 (P)。(n = 2 個供體; 2 個技術重複/供體)
圖 33A 和 33B 分別顯示,在第一次重新刺激之後,由工藝 2 (2) 和工藝 3 (3) 產生的 γδ T 細胞針對 UACC257 和 U2OS 細胞的 TNFα 分泌與對照工藝 (C) 產生的 TNFα 分泌相比下降,效應子/靶標比例為 3:1。將效應細胞對轉導效率標準化。圖 33C 顯示,由工藝 2 (2) 和工藝 3 (3) 產生的 γδ T 細胞針對非靶 MCF7 細胞的 TNFα 分泌最小。未轉導 (NT) 細胞作為陰性對照。用相同 TCR 進行轉導的 CD8+ αβ T 細胞作為陽性對照 (P)。(n = 2 個供體; 2 個技術重複/供體)
圖 34A 顯示,在第一次重新刺激之後,由工藝 3 (3) 產生的 γδ T 細胞針對 UACC257 的 GM-CSF 分泌與工藝 2 (2) 和對照工藝 (C) 產生的 GM-CSF 分泌相比增加,效應子/靶標比例為 3:1。將效應細胞對轉導效率標準化。圖 34B 顯示,針對表達較少數目靶肽的 U2OS 細胞未觀察到 GM-CSF 的這種增加。圖 34C 顯示,由工藝 2 (2) 和工藝 3 (3) 產生的 γδ T 細胞針對非靶 MCF7 細胞的 GM-CSF 分泌最小。未轉導 (NT) 細胞作為陰性對照。用相同 TCR 進行轉導的 CD8+ αβ T 細胞作為陽性對照 (P)。(n = 2 個供體; 2 個技術重複/供體)此外,未轉導細胞與轉導細胞之間在 IL-6、穿孔素和顆粒酶 B 的表達水準上無差異。經過測試但低於檢測限制的其他分析物包括 IL-2、IL-4、IL-5、IL-10、IL-12p70 和 IL-17a。
通過各種工藝產生的 γδ T 細胞殺死腫瘤細胞
腫瘤細胞殺傷測定以 5:1 的效應子/靶標比例進行。使用 UACC257 細胞(每個細胞約 1081 個靶肽)將效應細胞對轉導效率標準化。如圖所示,UACC257 細胞在三個不同的時間點添加進行測定。圖 35A 顯示,UACC257 腫瘤細胞生長受到由工藝 1(第 4 天刺激)、工藝 2 和對照工藝產生的獲自供體 1 的 γδ T 細胞的抑制。用相同 TCR 進行轉導的 CD8+ αβ T 細胞作為陽性對照 (P)。圖 35B 顯示,UACC257 腫瘤細胞生長受到由工藝 2、工藝 3 和對照工藝產生的獲自供體 2 的 γδ T 細胞的抑制。用相同 TCR 進行轉導的 CD8+ αβ T 細胞作為陽性對照 (P)。
免疫檢查點分子(例如 LAG3、PD-1、TIGIT 和 TIM3)在通過各種工藝經過多達 3 次腫瘤刺激後(1、2 和 3)產生的 PTE.CD8.TCR.WPRE 所轉導的 γδ T 細胞中的表達被確定。圖 36 顯示,通過工藝 1、工藝 2 和對照工藝產生的 γδ T 細胞中,LAG3、PD-1、TIGIT 和 TIM3 的表達似乎相當。用相同 TCR 進行轉導的 CD8+ αβ T 細胞作為陽性對照(陽性)。
實施例 8
組蛋白脫乙醯基酶抑制劑 (HDACi) 和 IL-21 對 γδ T 細胞製造的影響
Wang 等人的文獻顯示,HDACi 和 IL21 可以合作將人類效應子 CD8+ T 細胞重新編程為記憶 T 細胞。(Cancer Immunol Res June 1 2020 (8) (6) 794-805;其內容在此通過引用整體併入)。例如,用 HDACi(例如,辛二醯苯胺異羥肟酸 (SAHA) 或帕比司他 (Pano))預處理腫瘤浸潤淋巴細胞,培養 2 週後,在IL-21存在的情況下,可以增加 Tcm αβ T 細胞 (CD28+CD62L+)。
為了測試 HDACi + IL-21 對由工藝 3 飼養細胞製備的 T 細胞產物的影響,圖 37 顯示了實驗設計,例如在條件 4 下,γδ T 細胞可以在第 0 天在存在唑來膦酸鹽 + IL-2 + IL-15 的情況下激活,從第 0 天到第 6 天在存在 IL-2 + IL-15 的情況下擴增,然後在第 7 天由工藝 3 飼養細胞在沒有細胞因子的情況下再次刺激,接著從第 8 天到第 14 天在存在 HDACi + IL-21 + IL-2 + IL-15 的情況下進行擴增。在條件 5 下,γδ T 細胞可以在第 0 天在存在唑來膦酸鹽 + IL-2 + IL-15 的情況下激活,從第 0 天到第 6 天在存在 HDACi + IL-21 + IL-2 + IL-15 的情況下擴增,然後在第 7 天由工藝 3 飼養細胞在沒有細胞因子的情況下再次刺激,接著從第 8 天到第 14 天在存在 IL-2 + IL-15 的情況下進行擴增。
圖 38 顯示,在不存在 HDACi 和 IL-21 的情況下,在第 7 天和第 14 天通過工藝 3 飼養細胞(匯集的經輻照同種異體 PBMC + LCL + OKT3)重新刺激與工藝 1 飼養細胞(輻照的 K562-41BBL-mbIL15)、工藝 2 飼養細胞(唑來膦酸鹽脈衝處理的經輻照同種異體 PBMC)和對照工藝(無飼養細胞)再次刺激相比,前者在第 14 天和第 21 天產生更多的CD28+CD62L+ γδ T 細胞。對於所有工藝,在第 14 天第二次重新刺激後,CD28+CD62L+ γδ T 細胞數量減少。(n = 4;平均值+ SD;與對照組相比,經多次比較的 ANOVA;*** p<0.0005;*p<0.5)
考察了第 7 天通過工藝 3 飼養細胞(匯集的輻照同種異體 PBMC + LCL + OKT3)首次重新刺激後,在條件 4 (IL-21 + HDACi (w2)) 和條件 5 (IL-21 + HDACi (w1)) 下的 γδ T 細胞倍數擴增。圖 39A-39C 顯示了,從用對照工藝(無 IL-21 + HDACi)、第 1 週 (w1) 期間用 IL-21 + HDACi(條件 5)和第 2 週 (w2) 期間用 IL-21 + HDACi(條件 4)處理的 3 個不同供體(SD01004687(圖 39A)、D155410(圖 39B)和 SD01000256(圖 39C)獲得的 γδ T 細胞的倍數擴增。結果顯示,第 1 週 (w1) 期間用 IL-21 + HDACi(條件 5)製備的 γδ T 細胞倍數擴增低於第 2 週 (w2) 期間用 IL-21 + HDACi(條件 4)和對照工藝製備的 γδ T 細胞。但是,這種減少在存在 IL-2 + IL-15 的情況下擴增細胞後,於第 14 天恢復(** 表示工藝 3 飼養細胞重新刺激)。
考察了第 7 天通過工藝 3 飼養細胞首次重新刺激後,在條件 4 (IL-21 + HDACi (w2)) 和條件 5 (IL-21 + HDACi (w1)) 下的 δ2 和 δ1 T 細胞。圖 40A-40C 顯示了,用對照工藝(圖 40A)、IL-21 + HDACi (w1)(圖 40B)和 IL-21 + HDACi (w2)(圖 40C)處理的活 δ2 和 δ1 T 細胞的百分比。圖 40B 顯示了與通過對照工藝(圖 40A)製備相比,在存在 HDACi + IL21 (IL-21 + HDACi (w1)) 的情況下第一週培養期間,δ2 T 細胞數量減少。圖 40C 顯示,在存在 HDACi + IL21 (IL-21 + HDACi (w2)) 的情況下第二週培養期間,δ2 和 δ1 T 細胞與通過對照工藝(圖 40A)製備的相當。(** 表示工藝 3 飼養細胞重新刺激)
圖 41A 顯示,在第一週培養期間 (IL-21 + HDACi (w1))(條件5)的 HDACi + IL-21 在第二週期間改為 IL-2 + IL-15 導致 CD28+CD62L+ Tcm γδ T 細胞減少。另一方面,在第一週培養期間的 IL-2 + IL-15 在第二週期間改為 IL-21 + HDACi (w2)(條件 4)導致 CD28+CD62L+ Tcm γδ T 細胞增加。(n = 3;平均值+SD;與對照組相比,經多次比較的 ANOVA;****p<0.0001,**p<0.005)
類似地,圖 41B 顯示,在第一週培養期間 (IL-21 + HDACi (w1))(條件5)的 HDACi + IL-21 在第二週期間改為 IL-2 + IL-15 導致 CD27+CD45RA- Tcm γδ T 細胞減少。另一方面,在第一週培養期間的 IL-2 + IL-15 在第二週期間改為 IL-21 + HDACi (w2)(條件 4)導致 CD27+CD45RA- Tcm γδ T 細胞增加。(n = 3;平均值+SD;與對照組相比,經多次比較的 ANOVA;****p<0.0001,**p<0.005)
圖 41C 顯示,在第一週培養期間 (IL-21 + HDACi (w1))(條件5)或第二週培養期間 (IL-21 + HDACi (w2))(條件 4)的 HDACi + IL-21 對 CD57+ γδ T 細胞幾乎沒有影響。(n = 3;平均值+ SD;與對照組相比,經多次比較的 ANOVA;**p<0.0005;*p<0.5)
總之,HDACi + IL-21 可以促進 γδ T 細胞中的 Tcm。但是,在去除 HDACi + IL-21 之後,可以恢復這種 Tcm 表型。此外,如果在第一週培養期間(第 0 天至第 7 天)使用 HDACi + IL-21,則 HDACi + IL-21 可能會影響擴增以及 δ1 和 δ2 T 細胞亞群的百分比。
實施例 9
在存在 IL-12 和 IL-18 的情況下重新刺激對 γδ T 細胞製造的影響
圖 42 顯示,在第 0 天,將 PBMC 中表達 αβTCR 的 T 細胞耗盡,隨後在存在唑來膦酸鹽 (ZOL) (5 µM)、IL-2 和 IL-15 的情況下激活。然後在存在 IL-2 和 IL-15 的情況下擴增細胞。第 7 天,在存在 IL-2 和 IL-15 的情況下連續擴增細胞,或者在存在 IL-12 和 IL-18 且沒有 IL-2 和 IL-15 的情況下從第 7 天至第 14 天擴增細胞(細胞因子轉換)。細胞因子轉換降低了 γδ T 細胞擴增,這表明用 IL-12 和 IL-18 長期培養可能會對 γδ T 細胞的生長產生負面影響。在第 0、7、10 和 14 天,測定表達 IL-2 受體(例如,IL-2Rα、IL-2Rβ 和 IL-2γ)、IL-7 受體(例如,IL-7Rα)和 IL-21 受體 (IL-21R) 的 γδ T 細胞 %。結果顯示,從第 7 天到第 14 天,細胞因子從 IL-2 + IL-15 轉換為在沒有 IL-2 和 IL-15 的情況下的 IL-12 + IL-18,增加了從兩個供體(D155410(圖 43A)和 SD010004867(圖 43B))獲得的細胞中表達 IL-2Rα、IL-2Rγ 和 IL-21R 的 γδ T 細胞 %。虛線表示 IL-12 + IL-18 的條件(細胞因子轉換)。細胞因子轉換對表達 IL-2Rβ 和 IL-7Rα 的 γδ T 細胞 % 幾乎沒有影響。
為了測試在條件 3(第 7 天重新刺激的 IL-12 + IL-18 啟動和重新刺激後的 IL-2 + IL-15)對 γδ T 細胞擴增的影響,對通過條件 1(對照)、條件 2 (IL-2 + IL-15) 和條件 3(圖 37 所示)產生的細胞倍數擴增進行了比較。與對照和條件 2 (IL-2 + IL-15) 相比,IL-12 + IL-18 啟動(條件 3)對 γδ T 細胞擴增幾乎沒有影響。從 3 個供體(SD01004687(圖 44A)、D155410(圖 44B)和 SD010000256(圖 44C))獲得的細胞中,用 IL-12 + IL-18 啟動和不用 IL-12 + IL-18 啟動 (IL-2 + IL-15) 的 γδ T 細胞之間的倍數擴增無顯著差異。此外,與對照工藝(圖 45C)相比,用 IL-12 + IL-18 啟動(圖45A)和不用 IL-12 + IL-18 啟動 (IL-2 + IL-15)(圖 45B)製備的 δ1 T 細胞 % 和 δ2 T 細胞 % 之間無顯著差異。通過如圖 37 所示之條件 1(對照)、條件 2 (IL-2 + IL-15) 和條件 3(IL-12 + IL-18 啟動)製備的 δ2 T 細胞表型於第 14 天(IL-12 + IL-18 啟動後 7 天)進行了評估,n = 3 個供體。圖 46A 顯示,與對照和 IL-2 + IL-15 相比,通過 IL-12 + IL-18 啟動製備的 γδ T 細胞的 Tcm 表型(例如,CD27+CD45RA-)顯著降低。圖 46B 顯示,與對照和 IL-12 + IL-18 啟動相比,通過 IL-2 + IL-15 製備的 γδ T 細胞的 Tcm 表型(例如,CD28+CD62L+)顯著降低。圖 46C 顯示,在通過對照、IL-2 + IL-15 和 IL-12 + IL-18 啟動產生的細胞中,γδ T 細胞的非 Tcm 表型(例如,CD57+)最少。
總之,細胞因子轉換或 IL-12 + IL-18 啟動可能不會影響擴增或 δ1 和 δ2 T 細胞亞群的百分比。與對照方法相比,截至第 14 天,細胞因子轉換或 IL-12 + IL-18 啟動可減少 Tcm γδ T 細胞。
實施例 10
使用野生型 (WT) K562 與 K562-41BBL-mbIL15 進行初始刺激對 γδ T 細胞製造的影響
表 4
供體 工藝 初始刺激飼養細胞 初始唑來膦酸鹽(5 µM) 第7天重新刺激 第14天重新刺激
D148960 a
b K562 WT
c K562-41BB-mbIL15
d K562-41BB-mbIL15 K562-41BB-mbIL15 K562-41BB-mbIL15
e K562-41BB-mbIL15
f K562-CD86
SD01000723 a
b K562 WT
c K562-41BB-mbIL15
d K562-41BB-mbIL15 K562-41BB-mbIL15 K562-41BB-mbIL15
e K562-41BB-mbIL15
f K562-CD86
從兩個供體(D148960 和 SD01000723)獲得的 γδ T 細胞使用根據表 4 所示工藝的 K562 WT、K562-41BB-mbIL15 或 K562-CD86(工程改造為表達 CD86 的 K562 細胞)飼養細胞進行初始刺激而製備。
結果表明,通常情況下,通過工藝 b-f 製備的獲自兩個供體(D148960(圖 47A)和 SD01000723(圖 47B))的泛 γδ T 細胞的倍數擴增高於工藝 a(對照)製備的。用 K562 WT(工藝 b)或 K562-41BB-mbIL15(工藝 c、d 和 e)進行初始刺激產生相當的結果。通常情況下,通過工藝 b-f 製備的獲自兩個供體(D148960(圖 48A 和 48B)和 SD01000723(圖 49A 和 49B))的 δ1 和 δ2 亞群 T 細胞的倍數擴增高於工藝 a(對照)製備的。
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圖 1 顯示了根據本公開內容實施方案的同種異體 T 細胞療法。同種異體 T 細胞療法可能包括從健康供體收集 γδ T 細胞,通過病毒轉導相關外源基因(如外源性 TCR)進行 γδ T 細胞工程改造,然後進行細胞擴增、收穫擴增的工程改造 γδ T 細胞,這些細胞在輸注入患者之前可冷凍保存為 T 細胞產品。
圖 2 顯示了根據本公開內容實施方案的 γδ T細胞製造。γδ T 細胞的製造可能包括收集或獲得白細胞或 PBMC(例如,白細胞分離產物),從 PBMC 或白細胞分離產物中耗盡 αβ T細胞,然後激活、轉導、擴增 γδ T 細胞,可選為重新刺激 γδ T 細胞。
圖 3A 和 3B 顯示了用自體單核細胞重新刺激對 γδ T 細胞擴增的影響。圖 3A 顯示了重新刺激過程。簡言之,在第 0 天,在存在唑來膦酸鹽 (ZOL) (5 µM)、IL-2 (100 U/ml) 和 IL-15 (100 ng/ml) 的情況下,激活 αβ-TCR 表達 T 細胞(包括 CD4+ 和 CD8+ T 細胞)耗盡的外周血單核細胞 (PBMC)(「γδ T 細胞」)。第 3 天,模擬轉導激活的 γδ T 細胞。第 4 天,擴增模擬轉導的細胞。第 7 天,用在存在 ZOL (100 µM) 的情況下從 PBMC (Miltenyi) 進行 CD14+ 選擇而獲得的自體單核細胞以10(單核細胞):1(γδ T 細胞)的比例重新刺激擴增細胞 4 小時。
圖 3B 顯示了與無重新刺激的情況相比,用單核細胞重新刺激增加了從兩個供體(D1 和 D2)獲得的 γδ T 細胞的倍數擴增。10 天後,重新刺激的細胞倍數擴增減少。到 14 天時,重新刺激細胞的倍數擴增降至類似無重新刺激的倍數擴增。
圖 4A 和 4B 顯示了用經輻照的自體單核細胞重新刺激對 γδ T 細胞擴增的影響。圖 4A 顯示了重新刺激過程。簡言之,在第 0 天,在存在唑來膦酸鹽 (ZOL) (5 µM)、IL-2 (100 U/ml) 和 IL-15 (100 ng/ml) 的情況下,激活 αβ-TCR 表達 T 細胞(包括 CD4+ 和 CD8+ T 細胞)耗盡的外周血單核細胞 (PBMC)(「γδ T 細胞」)。第 2 天,模擬轉導激活的 γδ T 細胞。第 3 天,擴增模擬轉導的細胞。第 7 天,用在存在 ZOL (100 µM) 4 小時的情況下經輻照 (100 Gy) 的自體 αβ-TCR 表達 T 細胞耗盡的 PBMC 重新刺激擴增的細胞,比例為 5:1 或 10:1(αβ-TCR 表達 T 細胞耗盡的 PBMC:γδ T 細胞)。
圖 4B 顯示了與無重新刺激的情況相比,用 αβ-TCR 表達 T 細胞耗盡的 PBMC 以 5:1 和 10:1 的比例重新刺激,增加了從兩個供體(D1 和 D2)獲得的 γδ T 細胞的倍數擴增。
圖 5 顯示了用於生成圖 6-11 中所呈列資料的擴增過程。簡言之,在第 0 天,在存在唑來膦酸鹽 (ZOL) (5 µM)、IL-2 (100 U/ml) 和 IL-15 (100 ng/ml) 的情況下,激活 αβ-TCR 表達 T 細胞(包括 CD4+ 和 CD8+ T 細胞)耗盡的外周血單核細胞 (PBMC)(「γδ T 細胞」)。第 2 天,模擬轉導激活的 γδ T 細胞。第 3 天,擴增模擬轉導的細胞。第 7 天和第 14 天,用以下其中之一重新刺激擴增細胞:1) 自體單核細胞(通過從 PBMC (Miltenyi) 進行 CD14+ 選擇以及用 ZOL (100 µM) 脈衝處理 4 小時而獲得),比例 5:1 或 10:1(單核細胞:γδ T 細胞);或 2) 經輻照 (100 Gy) 的自體 αβ-TCR 表達 T 細胞耗盡的 PBMC(用 ZOL (100 µM) 脈衝處理 4 小時),比例 10:1 或 20:1(αβ 耗盡的 PBMC:γδ T 細胞)。
圖 6A 和 6B 顯示了用自體單核細胞或經輻照的自體 αβ 耗盡的 PBMC 多次重新刺激對來自兩個供體(D1(圖 6A)和 D2(圖 6B))的 γδ T 細胞擴增的影響。γδ T 細胞的激活和擴增如圖 5 所示。
圖 7A-7C 顯示了用自體單核細胞或經輻照的自體 αβ 耗盡的 PBMC 多次重新刺激對來自一個供體的 γδ T 細胞擴增的影響。γδ T 細胞的激活和擴增如圖 5 所示。圖 7A 顯示了總 γδ T 細胞的倍數擴增,圖 7B 顯示了δ2 T 細胞的倍數擴增,圖 7C 顯示了 δ1 T 細胞的倍數擴增。
圖 8A-8C 顯示了用自體單核細胞或經輻照的自體 αβ 耗盡 的 PBMC 多次重新刺激對來自第二個供體的 γδ T 細胞擴增的影響。γδ T 細胞的激活和擴增如圖 5 所示。圖 8A 顯示了總 γδ T 細胞的倍數擴增,圖 8B 顯示了 δ2 T 細胞的倍數擴增,圖 8C 顯示了 δ1 T 細胞的倍數擴增。
圖 9 顯示了用自體單核細胞或經輻照的自體 αβ 耗盡的 PBMC 多次重新刺激不會顯著改變擴增 γδ T 細胞的記憶表型。來自一個供體的 γδ T 細胞的激活和擴增如圖 5 所示,於第 21 天收穫,並通過流式細胞儀分析,以通過檢測細胞表面上的 CD45、CD27 和 CCR7 來確定記憶表型。在用 10:1 單核細胞重新刺激的擴增 γδ T 細胞中檢測到 CD27 表達略有增加。
圖 10 顯示了用自體單核細胞或經輻照的自體 αβ 耗盡的 PBMC 多次重新刺激不會顯著改變擴增 γδ T 細胞的記憶表型。來自第二個供體的 γδ T 細胞的激活和擴增如圖 5 所示,於第 21 天收穫,並通過流式細胞儀分析,以通過檢測細胞表面上的 CD45、CD27 和 CCR7 來確定記憶表型。在用 10:1 單核細胞重新刺激的擴增 γδ T 細胞中檢測到 CD27 表達略有增加。
圖 11A 和 11B 顯示了用自體單核細胞或經輻照的自體 αβ 耗盡的 PBMC 多次重新刺激對擴增 γδ T 細胞的生存力影響。來自兩個供體的 δ T 細胞的激活和擴增如圖 5 所示,於第 21 天收穫,並通過流式細胞儀分析,以確定活細胞在總 γδ T 細胞群中所占的百分比。來自供體 1 的結果見圖 11A,供體 2 的結果見圖 11B。
圖 12A 和 12B 顯示了工程改造腫瘤衍生細胞的共培養對 γδ T 細胞的影響。簡言之,在第 0 天,在存在唑來膦酸鹽 (ZOL) (5 µM)、IL-2 (100 U/ml) 和 IL-15 (100 ng/ml) 的情況下,激活 αβ-TCR 表達 T 細胞(包括 CD4+ 和 CD8+ T 細胞)耗盡的外周血單核細胞 (PBMC)(「γδ T 細胞」)。在存在或不存在 ZOL 的情況下,經輻照的腫瘤衍生細胞 (K562) 以 2:1 的比例(腫瘤衍生細胞:γδ T 細胞)被添加至一些樣本中。其他樣本在抗 CD28 或抗 CD27 mAb 包被的平板上培養。第 3 天,模擬轉導激活的 γδ T 細胞。第 4 天,擴增模擬轉導的細胞。第 21 天,冷凍擴增的細胞。圖 12A 和圖 12B 顯示了從兩個供體(D1(圖 12A)和 D2(圖 12B))獲得的 γδ T 細胞用經輻照的腫瘤衍生細胞 +/- ZOL 刺激具有比用抗 CD28 抗體+ZOL、抗 CD27 抗體+ ZOL 和 ZOL 單獨(對照)刺激的細胞具有更高的倍數擴增。
圖 13A-C 顯示了 γδ T 細胞激活期間各種腫瘤衍生細胞共培養的結果。圖 13A 顯示了從兩個供體(D1(上圖)和 D2(下圖))獲得的 γδ T 細胞於第 0 天在存在唑來膦酸鹽 (ZOL) (5 µM)、IL-2 (100 U/ml) 和 IL-15 (100 ng/ml) 的情況下激活的倍數擴增,激活方式如下: 1) 沒有腫瘤衍生細胞的情況下(對照);2) 用野生型腫瘤衍生細胞 (K562 WT);3) 用修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 1);4) 用修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 2);5) 在不存在 ZOL 的情況下用修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 2);和 6) 在不存在 ZOL 的情況下用修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 2)並於第 7 天和第 14 天重新刺激(K562 變體 2 + IL-2 + IL-15)。圖 13B 和 13C 顯示了供體 1(圖 13B)和供體 2(圖 13C)中的 δ1(左圖)和 δ2(右圖)T 細胞的擴增。
圖 14A 和 14B 顯示了 γδ T 細胞激活期間各種腫瘤衍生細胞的共培養結果。圖 14A 和 14B 顯示了在整個活細胞群中存在 γδ T 細胞的百分比。簡言之,從兩個供體(D1(圖 14A)和 D2(圖 14B))獲得的細胞於第 0 天在存在唑來膦酸鹽 (ZOL) (5 µM)、IL-2 (100 U/ml) 和 IL-15 (100 ng/ml) 的情況下激活,激活方式如下: 1) 沒有腫瘤衍生細胞的情況下(對照);2) 用野生型腫瘤衍生細胞 (K562 WT);3) 用修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 1);4) 用修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 2);5) 在不存在 ZOL 的情況下用修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 2);和 6) 在不存在 ZOL 的情況下用修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 2)並於第 7 天和第 14 天重新刺激(K562 變體 2 + IL-2 + IL-15)。
圖 15 顯示,與唑來膦酸鹽在培養物中的條件相比,培養物中缺乏唑來膦酸鹽導致多克隆群(δ1 和 δ2 γδ T 細胞皆然)。簡言之,從兩個供體(D1(上圖)和 D2(下圖))獲得的細胞於第 0 天在存在唑來膦酸鹽 (ZOL) (5 µM)、IL-2 (100 U/ml) 和 IL-15 (100 ng/ml) 的情況下激活,激活方式如下: 1) 沒有腫瘤衍生細胞的情況下(對照);2) 用野生型腫瘤衍生細胞 (K562);3) 在不存在 ZOL 的情況下用修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 2);4) 在不存在 ZOL 的情況下用修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 2)並於在第 7 天和第 14 天重新刺激(K562 變體 2 + IL-2 + IL-15);5) 用修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 2);和 6) 用修飾的腫瘤衍生細胞(K562 變體 1)。第 21 天收穫細胞,並通過流式細胞術分析,以確定 δ1 和 δ2 群。
圖 16 顯示,腫瘤衍生的共培養物不會改變擴增 γδ T 細胞的記憶表型。簡言之,從兩個供體(D1(上圖)和 D2(下圖))獲得的細胞於第 0 天在存在唑來膦酸鹽 (ZOL) (5 µM)、IL-2 (100 U/ml) 和 IL-15 (100 ng/ml) 的情況下激活,激活方式如下: 1) 沒有腫瘤衍生細胞的情況下(對照);2) 用野生型腫瘤衍生細胞;3) 在不存在 ZOL 的情況下,用工程改造為表達 4-1BBL 和膜結合 IL-15 (mbIL15) 的腫瘤衍生細胞;4) 在不存在 ZOL 的情況下,用表達 4-1BBL 和 mbIL15 的腫瘤衍生細胞並於第 7 天和第 14 天重新刺激(表達 4-1BBL 和 mbIL15 + IL-2 + IL-15 的腫瘤衍生細胞);5) 用表達 4-1BBL 和 mbIL15 的腫瘤衍生細胞;和 6) 用表達 CD86 的腫瘤衍生細胞。第 21 天收穫細胞,並通過流式細胞儀分析,以通過檢測細胞表面上的 CD45、CD27 和 CCR7 來確定記憶表型。
圖 17A 和 17B 顯示了用經輻照的同種異體 PBMC +/- LCL 進行多次重新刺激對來自兩個供體(D1(圖 17A)和 D2(圖 17B))的 γδ T 細胞擴增的影響。簡言之,從兩個供體(D1 和 D2)獲得的細胞於第 0 天在存在唑來膦酸鹽 (ZOL) (5 µM)、IL-2 (100 U/ml) 和 IL-15 (100 ng/ml) 的情況下激活,第 2 天模擬轉導並在第 3 天擴增。在第 7 天和第 14 天,用以下重新刺激擴增的細胞: 1) 對照物 (100U/ml IL-2 + 100ng/ml IL-15);2) PBMC+LCL+OKT3(匯集自 2-3 個供體的 25x106 個經輻照的同種異體 PBMC + 5x106 個經輻照的 LCL + 30ng/ml sOTK3 + 50U/ml IL-2);3) PBMC(匯集自 2-3 個供體的 25x106 個經輻照的同種異體 PBMC + 50U/ml IL-2);4) LCL(5x106 個經輻照的 LCL + 50U/ml IL-2)或 5) OKT3 (30ng/ml sOTK3 + 50U/ml IL-2)。
圖 18A-C 顯示了用經輻照的同種異體 PBMC +/- LCL 進行多次重新刺激對來自兩個供體的 γδ T 細胞擴增的影響。γδ T 細胞如圖 17A-B 所述進行激活和擴增。圖 18A 和 18B 顯示了來自兩個供體的 δ1 T 細胞倍數擴增。圖 18C 顯示了來自對照治療 (IL-2 + IL-15) 和 PBMC+LCL+OKT3 重新刺激治療的兩個供體第 21 天的流式細胞術結果。
圖 19A 和 19B 顯示了用 PBMC +/- LCL 重新刺激的兩個供體的擴增 γδ T 細胞的記憶表型。簡言之,從兩個供體(D1 和 D2)獲得的細胞於第 0 天在存在唑來膦酸鹽 (ZOL) (5 µM)、IL-2 (100 U/ml) 和 IL-15 (100 ng/ml) 的情況下激活,第 2 天模擬轉導並在第 3 天擴增。第 7 天,用以下重新刺激擴增的細胞: 1) 對照物 (100U/ml IL-2 + 100ng/ml IL-15);2) PBMC+LCL+OKT3(匯集自 2-3 個供體的 25x106 個經輻照的同種異體 PBMC + 5x106 個經輻照的 LCL + 30ng/ml OTK3 + 50U/ml IL-2);3) PBMC(匯集自 2-3 個供體的 25x106 個經輻照的同種異體 PBMC + 50U/ml IL-2);或 4) LCL(5x106 個經輻照的 LCL + 50U/ml IL-2)。第 14 天收穫細胞,並通過流式細胞儀分析,以通過檢測細胞表面上的 CD45、CD27 和 CCR7 來確定記憶表型。
圖 20A 和 20B 顯示了用各種工藝製備的經 TCR 轉導 (TCR-T) 或未經轉導 (NT) 的γδ T 細胞針對肽陽性 U2OS 細胞(圖 20A)或肽陰性 MCF7細胞(圖 20B)的殺傷活性。
圖 21 顯示了根據本公開一實施方案所述的 T 細胞製造工藝。
圖 22A-22D 顯示了通過對照工藝(圖 22A)、工藝 1(圖 22B)、工藝 2(圖 22C)和工藝 3(圖 22D)製備的 γδ T 細胞的倍數擴增。
圖 23A-23C 顯示了通過各種工藝製備的 γδ T 細胞的表型 CD27+CD45RA-(圖 23A)、CD62L+(圖 23B)和 CD57+(圖 23C)。
圖 24A-24D 顯示了通過各種工藝製備的表達 PD1(圖 24A)、LAG3(圖 24B)、TIM3(圖 24C)和 TIGIT(圖 24D)的 γδ T 細胞 %。
圖 25A 和 25B 顯示了通過各種工藝製備的 γδ T 細胞的表達轉基因(例如 TCR)的 γδ T 細胞 %(圖25A)以及整合 TCR 拷貝數(圖 25B)。
圖 26A-26C 顯示了通過對照工藝(圖 26A)、工藝 2(圖 26B)和工藝 3(圖 26C)製備的表達轉基因(例如,CD8 和與 PRAME 肽/MHC 複合體結合的TCR)的 γδ T 細胞 %。
圖 27A 顯示了根據本公開另一實施方案所述的 T 細胞製造工藝。
圖 27B 顯示了通過各種工藝製備的 γδ T 細胞的倍數擴增。
圖 28A-28C 顯示了通過在第 0 天用 K562 細胞刺激、然後在第 2 天以 60 μl(圖 28A)、120 μl(圖 28B)和 240 µl(圖 28C)編碼轉基因的病毒載體轉導而製備的表達轉基因(例如 CD8 和 TCR)的 γδ T 細胞 %。
圖 28D 顯示了通過圖 28A-28C 所示工藝製備的 γδ T 細胞中整合轉基因的拷貝數。
圖 28E 顯示了通過在第 2 天以 60 μl 編碼轉基因的病毒載體轉導、然後在第 4 天用 K562 細胞刺激而製備的表達轉基因(例如 CD8 和 TCR)的 γδ T 細胞 %。
圖 28F 顯示了通過圖 28E 所示工藝製備的 γδ T 細胞中整合轉基因的拷貝數。
圖 29 顯示了通過各種工藝製備的表達轉基因(例如 CD8 和 TCR)的 γδ T 細胞 %。
圖 30 顯示了根據本公開另一實施方案所述的 γδ T 細胞製造工藝。
圖 31A-31D 顯示了通過各種工藝製備的 γδ T 細胞對 UACC257 細胞(圖 31A)、U2OS 細胞(圖 31B)、A375 細胞(圖 31C)和 MCF7 細胞(圖 31D)的殺傷活性。
圖 32A-32C 顯示了通過各種工藝製備的 γδ T 細胞中針對 UACC257 細胞(圖 32A)、U2OS 細胞(圖 32B)和 MCF7 細胞(圖 32C)的 IFNγ 分泌。
圖 33A-33C 顯示了通過各種工藝製備的 γδ T 細胞中針對 UACC257 細胞(圖 33A)、U2OS 細胞(圖 33B)和 MCF7 細胞(圖 33C)的 TNFα 分泌。
圖 34A-34C 顯示了通過各種工藝製備的 γδ T 細胞中針對 UACC257 細胞(圖 34A)、U2OS 細胞(圖 34B)和 MCF7 細胞(圖 34C)的 GM-CSF 分泌。
圖 35A 和 35B 顯示了由通過各種工藝製備的獲得自 2 個供體(供體 1(圖 35A)和供體 2(圖 35B))的 γδT 所誘導的 UACC257 細胞生長抑制。
圖 36 顯示了通過各種工藝製備的表達 PD1、LAG3、TIM3 或 TIGIT 的 γδ T 細胞表達轉基因(CD8 和 TCR)的 %。
圖 37 顯示了根據本公開某些實施方案所述的 γδ T 細胞製造工藝。
圖 38 顯示了通過各種方法製備的 CD28+CD62L+ γδ T 細胞。
圖 39A-39C 顯示了通過各種工藝製備的獲得自 3 個供體(SD01004687(圖 39A)、D155410(圖 39B)和 SD010000256(圖 39C))的 γδ T 細胞倍數擴增。
圖 40A-40C 顯示了通過對照工藝(圖 40A)、HDACi + IL-21 (w1)(圖 40B)和 HDACi + IL-21 (w2)(圖 40C)製備的 δ1 和 δ2 T 細胞 %。
圖 41A 顯示了通過各種工藝製備的 CD28+CD62L+ γδ T 細胞 %。
圖 41B 顯示了通過各種工藝製備的 CD27+CD45RA- γδ T 細胞 %。
圖 41C 顯示了通過各種工藝製備的 CD57+ γδ T 細胞 %。
圖 42 顯示了根據本公開某些實施方案所述的 γδ T 細胞製造工藝。
圖 43A 和 43B 顯示了獲自 2 個供體(D155410(圖 43A)和 SD010004867(圖 43B))的表達 IL-2Rα、IL-2Rβ、IL-2Rγ、IL-7Rα 和 IL-21R 的 γδ T 細胞 %。
圖 44A-44C 顯示了通過各種工藝製備的獲自 3 個供體(SD010004867(圖 44A)、D155410(圖 44B)和 SD010000256(圖 44C))的 γδ T 細胞倍數擴增。
圖 45A-45C  顯示了通過 IL-12 + IL-18 啟動(圖 45A)、IL-2 + IL-15(圖 45B)和對照工藝(圖 45C)製備的 δ1 和 δ2 T 細胞 %。
圖 46A 顯示了通過各種工藝製備的 CD27+CD45RA- γδ T 細胞 %。
圖 46B 顯示了通過各種工藝製備的 CD28+CD62L+ γδ T 細胞 %。
圖 46C 顯示了通過各種工藝製備的 CD57+ γδ T 細胞 %。
圖 47A 和 47B 顯示了通過各種工藝製備的獲自 2 個供體(D148960(圖 47A)和 SD010000723(圖 47B))的 δ1 和 δ2 T 細胞 %。
圖 48A 和 48B 顯示了通過各種工藝製備的獲自供體 SD010000723 的 δ1(圖 48A)和 δ2(圖 48B)T 細胞 %。
圖 49A 和 49B 顯示了通過各種工藝製備的獲自供體 D148960 的 δ1(圖 49A)和 δ2(圖 49B)T 細胞 %。
國內寄存資訊 (請依寄存機構、日期、號碼順序註記) 無
國外寄存資訊 (請依寄存國家、機構、日期、號碼順序註記) 無
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Claims (80)

  1. 一種製備 γδ T 細胞的方法,其包括: 從人體受試者的血液樣本中分離 γδ T 細胞,在存在飼養細胞以及至少一種選自白介素 (IL)-1、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、干擾素 (IFN)-α 和 IFN-β 組成的組中的細胞因子的情況下,激活分離的 γδ T 細胞,將含有編碼 T 細胞受體 (TCR) 或嵌合抗原受體 (CAR) 的核酸的載體引入激活的 γδ T 細胞中,以及擴增引入的 γδ T 細胞。
  2. 請求項 1 所述的方法,其中,血液樣本包含白細胞分離產物。
  3. 請求項 1 或 2 所述的方法,其中,血液樣本包含外周血單核細胞 (PBMC)。
  4. 請求項 1 至 3 任一項中所述的方法,其中,所述激活進一步在存在氨基二膦酸鹽的情況下進行。
  5. 請求項 4 所述的方法,其中氨基二膦酸鹽包括帕米膦酸、阿侖膦酸、唑來膦酸、利塞膦酸、伊班膦酸、恩加膦酸、其鹽和/或其水合物。
  6. 請求項 4 或 5 所述的方法,其中氨基二膦酸鹽包含唑來膦酸。
  7. 請求項 1 至 6 任一項中所述的方法,其中,所述至少一種細胞因子包括 IL-2 和 IL-15。
  8. 請求項 1 至 7 任一項中所述的方法,其中,所述分離包括使血液樣本與抗 α 和抗 β T 細胞受體 (TCR) 抗體接觸,並從血液樣本中耗盡 α-和/或 β-TCR 陽性細胞。
  9. 請求項 1 至 8 任一項中所述的方法,其中,所述飼養細胞為人細胞、非人細胞、病毒感染細胞、非病毒感染細胞、細胞提取物、顆粒、珠、絲或其組合。
  10. 請求項 9 的方法,其中,人細胞為 K562 細胞。
  11. 請求項 9 或 10 所述的方法,其中,所述人細胞為包含至少一種重組蛋白的工程改造腫瘤細胞。
  12. 請求項 11 所述的方法,其中,所述至少一種重組蛋白選自由 CD86、4-1BBL、IL-15 及其任何組合組成的組。
  13. 請求項 12 所述的方法,其中,所述 IL-15 為膜結合 IL-15。
  14. 請求項 1 至 13 任一項中所述的方法,其中,所述飼養細胞接受輻照。
  15. 請求項 1 至 14 任一項中所述的方法,其中,所述分離的 γδ T 細胞和飼養細胞以約 1:1 至約 50:1(飼養細胞:分離的 γδ T 細胞)的比例混合。
  16. 請求項 1 至 15 任一項中所述的方法,其中,所述載體為病毒載體或非病毒載體。
  17. 請求項 1 至 16 任一項中所述的方法,其中,所述擴增在不存在氨基二膦酸鹽的情況下以及存在至少一種細胞因子的情況下進行。
  18. 請求項 1 至 17 任一項中所述的方法,其進一步包括重新刺激擴增的 γδ T 細胞。
  19. 請求項 18 所述的方法,其中,所述重新刺激包括使擴增的 γδ T 細胞與另外的飼養細胞接觸。
  20. 請求項 19 所述的方法,其中,所述另外的飼養細胞可與飼養細胞相同或不同。
  21. 請求項 19 或 20 所述的方法,其中,所述擴增的 γδ T 細胞和另外的飼養細胞以約 1:1 至約 50:1(另外的飼養細胞:擴增的 γδ T 細胞)的比例混合。
  22. 請求項 19 至 21 任一項中所述的方法,其中,所述另外的飼養細胞選自由單核細胞、PBMC 及其組合組成的組。
  23. 請求項 19 至 22 任一項中所述的方法,其中,所述另外的飼養細胞對人體受試者為自體細胞。
  24. 請求項 19 至 23 任一項中所述的方法,其中,所述另外的飼養細胞對人體受試者為同種異體細胞。
  25. 請求項 19 至 24 任一項中所述的方法,其中,所述另外的飼養細胞經耗盡 αβ T 細胞。
  26. 請求項 19 至 25 任一項中所述的方法,其中,所述另外的飼養細胞與氨基二膦酸鹽接觸。
  27. 請求項 26 所述的方法,其中氨基二膦酸鹽包含唑來膦酸。
  28. 請求項 19 所述的方法,其中,所述另外的飼養細胞為人細胞、非人細胞、病毒感染細胞、非病毒感染細胞、細胞提取物、顆粒、珠、絲或其組合。
  29. 請求項 28 的方法,其中,人細胞為 K562 細胞。
  30. 請求項 28 或 29 所述的方法,其中,所述人細胞為包含至少一種重組蛋白的工程改造腫瘤細胞。
  31. 請求項 30 所述的方法,其中,所述至少一種重組蛋白選自由 CD86、4-1BBL、IL-15 及其任何組合組成的組。
  32. 請求項 31 所述的方法,其中,所述 IL-15 為膜結合 IL-15。
  33. 請求項 19 至 32 任一項中所述的方法,其中,所述另外的飼養細胞接受輻照。
  34. 一種擴增 γδ T 細胞的體外方法,包括 從人體受試者的血液樣本中分離 γδ T 細胞, 在存在至少一種選自白介素 (IL)-1、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、干擾素 (IFN)-α 和 IFN-β 組成的組中的細胞因子以及一個或多個氨基二膦酸鹽或飼養細胞的情況下,激活分離的 γδ T 細胞, 擴增激活的 γδ T 細胞,以及 重新刺激擴增的 γδ T 細胞。
  35. 請求項 34 所述的方法,其中,血液樣本包含白細胞分離產物。
  36. 請求項 34 或 35 所述的方法,其中,血液樣本包含外周血單核細胞 (PBMC)。
  37. 請求項 34 至 36 任一項中所述的方法,其中,所述氨基二膦酸鹽存在,並包括帕米膦酸、阿侖膦酸、唑來膦酸、利塞膦酸、伊班膦酸、恩加膦酸、其鹽和/或其水合物。
  38. 請求項 34 至 37 任一項中所述的方法,其中,所述氨基二膦酸鹽存在,並包括唑來膦酸。
  39. 請求項 34 至 38 任一項中所述的方法,其中,所述至少一種細胞因子包括 IL-2 和 IL-15。
  40. 請求項 34 至 39 任一項中所述的方法,其中,所述分離包括使血液樣本與抗 α 和抗 β T 細胞受體 (TCR) 抗體接觸,並從血液樣本中耗盡 α-和/或 β-TCR 陽性細胞。
  41. 請求項 34 至 40 任一項中所述的方法,其中,所述飼養細胞存在,並且為人細胞、非人細胞、病毒感染細胞、非病毒感染細胞、細胞提取物、顆粒、珠、絲或其組合。
  42. 請求項 41 的方法,其中,人細胞為 K562 細胞。
  43. 請求項 41 或 42 所述的方法,其中,所述人細胞為包含至少一種重組蛋白的工程改造腫瘤細胞。
  44. 請求項 43 所述的方法,其中,所述至少一種重組蛋白選自由 CD86、4-1BBL、IL-15 及其任何組合組成的組。
  45. 請求項 44 所述的方法,其中,所述 IL-15 為膜結合 IL-15。
  46. 請求項 41 至 45 任一項中所述的方法,其中,所述飼養細胞接受輻照。
  47. 請求項 41 至 46 任一項中所述的方法,其中,所述分離的 γδ T 細胞和飼養細胞以約 1:1 至約 50:1(飼養細胞:分離的 γδ T 細胞)的比例混合。
  48. 請求項 34 至 47 任一項中所述的方法,其進一步包括在擴增之前用重組病毒載體轉導激活的 γδ T 細胞。
  49. 請求項 34 至 48 任一項中所述的方法,其中,所述擴增在不存在氨基二膦酸鹽的情況下以及存在至少一種細胞因子的情況下進行。
  50. 請求項 34 至 49 任一項中所述的方法,其中,所述重新刺激包括使擴增的 γδ T 細胞與另外的飼養細胞接觸。
  51. 請求項 50 所述的方法,其中,所述另外的飼養細胞可與飼養細胞相同或不同。
  52. 請求項 50 或 51 所述的方法,其中,所述擴增的 γδ T 細胞和另外的飼養細胞以約 1:1 至約 50:1(另外的飼養細胞:擴增的 γδ T 細胞)的比例混合。
  53. 請求項 50 至 52 任一項中所述的方法,其中,所述另外的飼養細胞選自由單核細胞、PBMC 及其組合組成的組。
  54. 請求項 50 至 53 任一項中所述的方法,其中,所述另外的飼養細胞對人體受試者為自體細胞。
  55. 請求項 50 至 54 任一項中所述的方法,其中,所述另外的飼養細胞對人體受試者為同種異體細胞。
  56. 請求項 50 至 55 任一項中所述的方法,其中,所述另外的飼養細胞經耗盡 αβ T 細胞。
  57. 請求項 50 至 56 任一項中所述的方法,其中,所述另外的飼養細胞與氨基二膦酸鹽接觸。
  58. 請求項 57 所述的方法,其中氨基二膦酸鹽包含唑來膦酸。
  59. 請求項 50 所述的方法,其中,所述另外的飼養細胞為人細胞、非人細胞、病毒感染細胞、非病毒感染細胞、細胞提取物、顆粒、珠、絲或其組合。
  60. 請求項 59 的方法,其中,人細胞為 K562 細胞。
  61. 請求項 59 或 60 所述的方法,其中,所述人細胞為包含至少一種重組蛋白的工程改造腫瘤細胞。
  62. 請求項 61 所述的方法,其中,所述至少一種重組蛋白選自由 CD86、4-1BBL、IL-15 及其任何組合組成的組。
  63. 請求項 62 所述的方法,其中,所述 IL-15 為膜結合 IL-15。
  64. 請求項 50 至 63 任一項中所述的方法,其中,所述另外的飼養細胞接受輻照。
  65. 一種通過請求項 1 至 64 任一項中所述的方法製備的擴增 γδ T 細胞群,其中擴增 γδ T 細胞的密度為至少約 1 x 105 個細胞/ml、至少約 1 x 106 個細胞/ml、至少約 1 x 107 個細胞/ml、至少約 1 x 108 個細胞/ml 或至少約 1 x 109 個細胞/ml。
  66. 一種治療癌症的方法,其包括向有此需要的患者給予有效量的通過請求項 1 至 64 任一項中所述的方法製備的擴增 γδ T 細胞或請求項 65 的擴增 γδ T 細胞群。
  67. 請求項 66 所述的方法,其中,所述癌症選自由急性淋巴細胞白血病、急性髓性白血病、腎上腺皮質癌、AIDS 相關癌症、AIDS 相關淋巴瘤、肛門癌、闌尾癌、星形細胞瘤、神經母細胞瘤、基底細胞癌、膽管癌、膀胱癌、骨癌、腦腫瘤(如:小腦星形細胞瘤、腦星形細胞瘤/惡性膠質瘤、室管膜瘤、成神經管細胞瘤、幕上原始神經外胚層腫瘤、視覺通路和下丘腦膠質瘤)、乳腺癌、支氣管腺瘤、伯基特淋巴瘤、原發性未知癌、中樞神經系統淋巴瘤、小腦星形細胞瘤、宮頸癌、兒童癌症、慢性淋巴細胞白血病、慢性骨髓性白血病、慢性骨髓增生性疾病、結腸癌、皮膚 T 細胞淋巴瘤、結締組織增生性小圓細胞瘤、子宮內膜癌、室管膜瘤、食道癌、尤因氏肉瘤、生殖細胞腫瘤、膽囊癌、胃癌、胃腸道類癌腫瘤、胃腸道間質瘤、膠質瘤、毛細胞白血病、頭頸癌、心臟癌、肝細胞癌(肝癌)、霍奇金淋巴瘤、咽下癌、眼內黑色素瘤、胰島細胞癌、卡波西肉瘤、腎癌、喉癌、唇癌和口腔癌、脂肪肉瘤、肝癌、肺癌(如:非小細胞和小細胞肺癌)、淋巴瘤、白血病、巨球蛋白血症、骨惡性纖維組織細胞瘤/骨肉瘤、成神經管細胞瘤、黑色素瘤、間皮瘤、原發灶隱匿的轉移性鱗狀頸癌、口腔癌、多發性內分泌腫瘤綜合症、骨髓增生異常綜合症、骨髓性白血病、鼻腔和副鼻竇癌、鼻咽癌、神經母細胞瘤、非霍奇金淋巴瘤、非小細胞肺癌、口腔癌、口咽癌、骨肉瘤/骨惡性纖維組織細胞瘤、卵巢癌、卵巢上皮癌、卵巢生殖細胞腫瘤、胰腺癌、胰腺癌胰島細胞、副鼻竇和鼻腔癌、甲狀旁腺癌、陰莖癌、咽癌、嗜鉻細胞瘤、松果體星形細胞瘤、松果體生殖細胞瘤、垂體腺瘤、胸膜肺母細胞瘤、漿細胞瘤、原發性中樞神經系統淋巴瘤、前列腺癌、直腸癌、腎細胞癌、腎盂和輸尿管移行細胞癌、視網膜母細胞瘤、橫紋肌肉瘤、唾液腺癌、肉瘤、皮膚癌、默克爾細胞皮膚癌、小腸癌、軟組織肉瘤、鱗狀細胞癌、胃癌、T 細胞淋巴瘤、咽喉癌、胸腺瘤、胸腺癌、甲狀腺癌、滋養細胞腫瘤(妊娠)、原發部位未知癌、尿道癌、子宮肉瘤、陰道癌、外陰癌、瓦爾登斯特倫巨球蛋白血症和威爾姆斯瘤組成的組。
  68. 請求項 67 的方法,其中癌症是黑色素瘤。
  69. 一種治療傳染性疾病的方法,其包括向有此需要的患者給予有效量的通過請求項 1 至 64 任一項中所述的方法製備的擴增 γδ T 細胞或請求項 65 的擴增 γδ T 細胞群。
  70. 請求項 69 的方法,其中,所述傳染性疾病選自由登革熱、埃博拉、馬爾堡病毒、結核病 (TB)、腦膜炎和梅毒組成的組。
  71. 一種治療自體免疫性疾病的方法,其包括向有此需要的患者給予有效量的通過請求項 1 至 64 任一項中所述的方法製備的擴增 γδ T 細胞或請求項 65 的擴增 γδ T 細胞群。
  72. 請求項 71 的方法,其中,所述自體免疫性疾病選自由關節炎、慢性阻塞性肺疾病、強直性脊柱炎、克羅恩病(兩種特發性炎症性腸道疾病「IBD」中的一種)、皮肌炎、1 型糖尿病、子宮內膜異位症、Goodpasture 氏綜合症、Graves 氏病、格林-巴厘綜合症 (GBS)、橋本氏病、化膿性汗腺炎、川崎病、IgA 腎病、原發性血小板減少性紫癜、間質性膀胱炎、紅斑狼瘡、混合性結締組織病、硬斑病、重症肌無力、嗜睡症、神經性肌強直、尋常型天皰瘡、惡性貧血、銀屑病、銀屑病關節炎、多發性肌炎、原發性膽汁性肝硬化、復發性多軟骨炎、類風濕關節炎、精神分裂症、硬皮病、乾燥綜合症、僵人綜合症、顳動脈炎(也稱作為「巨細胞動脈炎」)、潰瘍性結腸炎(兩種特發性炎症性腸道疾病「IBD」中的一種)、脈管炎、白斑病以及韋格納肉芽腫組成的組。
  73. 一種製備 γδ T 細胞的方法,其包括: 從人體受試者的血液樣本中分離 γδ T 細胞, 在不存在飼養細胞的情況下激活分離的 γδ T 細胞, 將含有編碼 T 細胞受體 (TCR) 或嵌合抗原受體 (CAR) 的核酸的載體引入激活的 γδ T 細胞中,以及 在存在飼養細胞的情況下擴增轉導的 γδ T 細胞。
  74. 請求項 73 所述的方法,其中,所述激活、轉導和/或擴增在存在至少一種選自白介素 (IL)-1、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、干擾素 (IFN)-α 和 IFN-β 組成的組中的細胞因子的情況下進行。
  75. 請求項 73 或 74 所述的方法,其中,所述飼養細胞為人細胞、非人細胞、病毒感染細胞、非病毒感染細胞、細胞提取物、顆粒、珠、絲或其組合。
  76. 請求項 73 至 75 任一項中所述的方法,其中,所述飼養細胞包含外周血單核細胞 (PBMC) 和/或類淋巴母細胞 (LCL)。
  77. 請求項 73 至 76 任一項中所述的方法,其中,所述激活、轉導和/或擴增在存在 OKT3 的情況下進行。
  78. 請求項 73 至 77 任一項中所述的方法,其中,所述載體為病毒載體或非病毒載體。
  79. 請求項 1 至 64 任一項中所述的方法,其中,所述擴增 γδ T 細胞包含 δ1 和/或 δ2 T 細胞。
  80. 請求項 1 至 64 以及 73 至 79 任一項中所述的方法,其中,所述載體包含編碼 TCR 的核酸和編碼 CD8αβ 或 CD8α 的核酸。
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