TARIFNAME SITOTOKSISITEYI INDÜKLEYEN TERAPÖTIK MADDE Teknik Alan Mevcut bulus, hedef kanser hücrelerine yakI T hücrelerine sahip olmasIZi/e T hücrelerinin sitotoksisite aktivitesini hedef kanser hücrelerine karsElkulIanmasElile kanser tedavisini mümkün kllân polipeptit kompleksleri ile ilgilidir. Mevcut bulus ayrlîla, bir aktif içerik maddesi olarak hücresel sitotoksisitenin indüklenmesi için yukarlâh bahsedilen terapötik maddeyi içeren, çesitli kanserlerin tedavi edilmesi veya önlenmesine yönelik farmasötik bilesimler ile Önceki Teknik Bugüne kadar, oldukça iyi bir anti-tümör etkisine sahip birçok terapötik antikor, kanserin tedavi edilmesine yönelik farmasötikler olarak gelistirilmistir (Patent Olmayan Doküman 1). Bu terapötik antikorlarlEJ, kanser hücresinin büyümesi için gerekli sinyallerin Inhibe edilmesi, hücre ölümü sinyallerinin indüklenmesi, antikora baglÇlhücre arac[l]]3itotoksisite (ADCC) veya tamamlaylîlîda bagIiIElsitotoksisite (CDC) vasüslýla kanser hücreleri üzerinde anti-tümör etkisini uygulad[gil:lbilinmektedir (Patent Olmayan Doküman 2). ADCC, bir antikorun Fc bölgesi, efektör hücreler üzerindeki bir Fc reseptörüne baglandlgiütla, antikora bagIiIElhedef kanser hücrelerine karsElNK hücreleri gibi efektör hücreler ve makrofajlar tarafIan uygulanan bir sitotoksisitedir. Bu zaman zarfIda, bir tamamlaylEElkompleks, bir antikor yaplîEl içerisindeki tamamlaylîElbaglaylEElyere baglanmaktadlrîl CDC, kompleks içerisindeki bir tamamlaylîlîlbilesen, bir antikora bagllühücrenin hücre zarEliçerisinden bir gözenek olusturarak, hücrenin içerisine su veya iyon aklglElEl artlEiliglIa meydana gelen sitotoksisitedir. Koncansiyonel terapötik antikorlarI oldukça iyi aktiviteler sergilemesine ragmen, bugüne kadar, bu tür antikorlarI uygulanmasüyalnlîta umuldugu gibi olmayan çlthIra sebep olmustur. Dolaylîlýla, kansere karsEIdaha iyi bir hücre öldürme aktivitesi uygulayan terapötik antikorlarI gelistirilmesi arzu edilmektedir. NK hücrelerini veya makrofaklarEEfektör hücreler olarak temin ederek ADCC'yi anti-tümör mekanizmasüolarak benimseyen, yukar- bahsedilen antikorlara ilaveten, T hücrelerini efektör hücreler olarak temin ederek sitotoksisiteyi anti-tümör mekanizmaslîl olarak benimseyen, T hücresi temin eden antikorlar (TR antikorlarLIl 1980'lerden beri bilinmektedir (Patent Olmayan Dokümanlar 3 ila 5). Bir TR antikoru, T hücreleri üzerinde bir T-hücresi reseptör (TCR) kompleksi meydana getiren alt birimlerin herhangi birine karsEbir antikor, özellikle CD3 epsilon zincirine baglanan bir antikor ve hedef kanser hücreleri üzerindeki bir antijene baglanan bir antikora sahip bir bi-spesifik antikordur. TR antikoru aynlîamanda hem CD3 epsilon zincirine hem de kanser antijenine baglandlgiIa bir T hücresi bir kanser hücresine yaklasmaktadiEl ve bu, T hücresinin sitotoksisite aktivitesinden kaynaklEioIarak kanser hücresine karsEHJIr anti-tümör etkisine sebep olmaktadlü (Patent Olmayan Dokümanlar 6 ve 7). Üç islevli bir antikor, bir kolun bir kanser antijenine baglanan bir Fab içerdigi ve diger kolun ise CD3 epsilon zincirine baglanan bir Fab içerdigi bir tüm, IgG-türü bi-spesifik antikordur. Kötücül asitlere karsEterapötik etki, EpCAM'a karsEüç islevli bir antikor olan katumaksomabEi, EpCAM ekspresyonu pozitif olan kanser hücrelerine sahip, kötücül asitleri olan hastalar. peritoneal kavitelerine uygulanmasüvasißslýia gösterilmistir. KatumaksomabI kullanIi-üyukarki tedavi için EU'da onaylanmISIiEI DahasÇi"bi-spesifik T hücresi baglaylEigEQBiTEY' olarak adlandlEiIân bir TR antikorunun, güçlü bir anti-tümör etkisini inhibe ettigi yakI dönemde kesfedilmistir (Patent Olmayan Dokümanlar 8 ve 9). BiTE, bir kanser antijenine karsübir antikorun scFv'sinin, bir kü polipeptit baglaylîigiîlasßsiýia CD3 epsilon zincirine karsEibir antikorun scFv'sine baglandgiü bir moleküler forma sahip bir TR antikorudur. BiTE'nin, bilinen çesitli TR antikorlarEia klýbsla daha iyi bir anti-tümör aktivitesine sahip oldugu belirtilmistir (Patent Olmayan Dokümanlar 9 ve 10). Belirgin sekilde, diger TR antikorlar. klýiasla, BiTE, ciddi oranda düsük bir konsantrasyonda ve düsük efektör hücre/kanser hücresi oraniEUa (ET oranD] bile bir anti- tümör etkisi uygulamaktadlEi Ayriîh, etkinin, IL-2, bir CDZS agonistik antikorunun veya benzerinin hemen kullanilBiasEi/asitâslsîla efektör hücrelerinin aktive edilmesi gerekmeksizin uygulanabildigi gösterilmistir. CD19'a karsEbir BiTE olan blinatumomab (MT103), çok iyi bir klinik etki ürettigi bilinen Rituksan'a klýbsla in vitro kanser hücrelerine karsü;0k daha güçlü bir sitotoksik aktivite sergilemektedir. DahasÇi bIinatumomabiEl, yakI zamanda gerçeklestirilen evre I ve II klinik denemelerde fazlaca üstün bir anti-tümör etki gösterdigi belirtilmistir (Patent Olmayan Doküman 11). KatumaksomabiEl klinik ilaç etkisi sergileyen bir terapötik madde olarak onaylanmasEive blinatumomab da dahil olmak üzere birçok BiTE'nin güçlü bir anti-tümör etkisi uygulamasi: efektör hücreler olarak T hücrelerini temin eden TR antikorlarIlEl, faaliyet mekanizmasü olarak ADCC kullanan konvansiyonel antikorlara klîilasla bir anti tümör maddesi olarak büyük oranda daha yüksek bir potansitele sahip oldugunu göstermektedir. Ancak, bir üç islevli antikorun hem bir T hücresine hem de bir NK hücresi gibi bir hücreye veya aynüamanda kanser antijenine bagllEbir sekilde makrofaja baglandigiü/e bunun bir sonucu olarak, hücreler üzerinde eksprese edilen reseptörler çapraz baglanmaktadlüve çesitli sitokinlerin ekspresyonu, kanser antijenine bagIiIElbir sekilde indüklenmektedir. Üç islevli bir antikorun sistemik sekilde uygulanmasIlEl, sitokin ekspresyonunun bu sekilde indüklenmesinin bir sonucu olarak sitokin flIllEbsDbenzeri yan etkilere sebep oldugu düsünülmektedir. Asl a, evre I klinik denemesinde, küçük olmayan hücreli akciger kanserine sahip hastalara karumaksomabI sistemin uygulanmasEiçin 5 ug/vücutluk oldukça düsük bir dozun maksimum tolerans dozu oldugu ve daha yüksek bir dozun uygulanmasIIEl, çesitli ciddi yan etkilere sebep oldugu belirtilmistir (Patent Olmayan Doküman 12). Bu sekildeki bir düsük dozda uygulandlglia, katumaksomab asla etkili kan seviyesine erisememektedir. Yani, beklenen anti tümör etkisi, katumaksomab. bu denli düsük bir dozda uygulanmasMa elde edilememektedir. Bu zaman zarfIa, katumaksomabdan farklßekilde, BiTE'nin bir Fcy-reseptörü baglama yeri bulunmamaktadEve dolaylîlîla bu, kanser antijenine bagilEbir sekilde T hücreleri ve NK hücreleri gibi hücreler ve makrofajlar üzerinde eksprese edilen reseptörleri çapraz baglamamaktadE Dolaylêlýla, BiTE'nin, katumaksomab uygulandig'lEtla gözlemlenen kanser antijenine bagIiIElsitokin indüklemesine sebep 0Imad[gl:lgösterilmistir. Ancak, BiTE Fc bölgesine sahip olmayan modifiyeli düsük moleküler ag ama Übir antikor molekülü oldugundan dolayü problem sudur ki bir hastaya uygulanmaletlan sonra bunun kandaki yarlîlömrü, terapötik antikorlar olarak konvansiyonel sekilde kullanllân IgG-türü antikorlardan ciddi oranda daha klgdLEl AsIIa, i'n V/'vo sekilde uygulanan BiTE'nin kandaki yarElömrünün, yaklaslKl birkaç saat oldugu belirtilmistir (Patent Olmayan Dokümanlar 13 ve 14). BlinatumomabI klinik denemelerinde, bu, bir mini pompa kullanilârak kesintisiz intravenöz infüzyon vasitâslýla uygulanmaktadE Bu uygulama yöntemi, hastalar için fazlaca uygunsuz olmalelI yanEtlE, ayrlEb, cihazI arlîb çHZbrmasü/eya benzerinden kaynakIIJJIarak medikal kazalara yönelik bir risk potansiyeli tasIiaktadlB Dolaylglýla, bu tür bir uygulama yönteminin arzu edildigi söylenememektedir. Patent Olmayan Doküman 15, bispesifik antikorlar. gelisiminde, bunlarI verimini ve stabilitesini artübilen anahtar modifikasyonlarüçllîlamaktadE Patent Olmayan Doküman 16, peritoneal karsinomatoza sahip hastalardaki üç islevli antikorlar tarafldan anti tümör immünitesinin indüklenmesini açlKlamaktadlEl Patent Dokümanü, gelistirilmis antikor sabit bölgelerini açllîlamaktadlü Önceki Teknik Dokümanlari] Bulusun Klgla AçlEJamasEl Mevcut bulus, yukarIki durumlardan dolayürsivlenmistir. Mevcut bulusun bir amacühedef kanser hücrelerine yaklEl T hücrelerine sahip olmasEi'e T hücrelerinin sitotoksisite aktivitesini hedef kanser hücrelerine karsElkullanmasElile kanser tedavisini mümkün kIIân polipeptit komplekslerin saglanmasIlEl Mevcut bulusun bir baska amacElse, bir aktif içerik maddesi olarak hücresel sitotoksisitenin indüklenmesi için yukarlElla bahsedilen terapötik maddeyi içeren, çesitli kanserlerin tedavi edilmesi veya önlenmesine yönelik farmasötik bilesimlerin saglanmasIB Mevcut bulus sahipleri, BiTE'nin sahip oldugu güçlü anti tümör aktivitesini tutan ve kanda uzun bir yarlZlömrün yanlleü kanser antijenine bagIilElsitokin fIIsElveya benzerinin indüklenmemesi ile sonuçlanan oldukça iyi güvenlik niteliklerine sahip olan yeni polipeptit kompleksleri kesfetmislerdir. Mevcut bulus sahipleri, ayrEla, polipeptit komplekslerinin antijen baglama alanlarlîikame edildiginde polipeptit komplekslerinin çesitli hedef hücrelere zarar verebildigini bulmuslardlü Yukarlki bulgular temelindei mevcut bulus sahipleri, mevcut bulusun polipeptit komplekslerinin kanser hücrelerine zarar verdigini göstermislerdir. Mevcut bulus sahipleri, ayrEla, daha etkili hücresel sitotoksisitenin, CHl/CL arayüz birlesmesinin regüle edilmesi ve polipeptit komplekslerinin içerisine delik-içi-nob (KiH) modifikasyonlarII verilmesi vasitîlislîla elde edildigini ortaya çilZlarmlglardE Ilaveten, mevcut bulus sahipleri, aktif içerik maddesi olarak mevcut bulusun bir polipeptit kompleksini içeren, hücresel sitotoksisitenin indüklenmesine yönelik terapötik maddelerin kullanliîhaslsîla çesitli kanserlerin tedavi edilebildigini veya önlenebildigini göstermislerdir. Daha belirgin sekilde, mevcut bulus asaglâlakileri saglamaktadE (1) bir kanser antijen baglama alanlîl (2) Fc alanIlîlneydana getiren amino asitlerin mutasyona ugradigIJSEKANS KIMLIK NUMARALARI:23, 24, 25 ve 26'nI Fc alanlar-an herhangi biri, burada Fc alanEl mutantÇlSEKANS KIMLIK NUMARALARI:23, 24, 25 ve 26'dan seçilen aynEizotipin Fc alanIEiçeren kontrol polipeptit komleksine kliasla söz konusu mutasyon vasithslsîla Fcy reseptörü-baglama aktivitesini indirgemistir ve burada Fc alanlZl mutantÇl indirgenmis FcyRI, FcyRIIA, FcyRIIB, FcyRIIIA, ve/veya FcyRIIIB'ye baglanma aktivitesine sahiptir; ve (3)bir CDB-baglama alanÇi burada antijen baglama alanEl/e CD3 baglama alariIiE] her ikisi de tek degerli bir Fab'dir, ve burada (i) antijen baglama alanIlIilneydana getiren bir tek degerli Fab'nin aglEzincirli Fv fragmenti, bir CH1 alanEi/aslfâsMa, Fc alanIEmeydana getiren polipeptitlerden birine baglanmaktadlîi ve Fab'nin hafif zincirli Fv fragmenti ise bir CL alan. baglanmaktadß ve CD3 baglama alanlElüneydana getiren Fab'nin agEzincirli Fv fragmenti bir CH1 alanEIvasitâslîla, Fc alanIlIimeydana getiren bir baska polipeptite baglanmaktadlElve Fab'nin hafif zincirli Fv fragmenti ise bir CL alan- baglanmaktadlü (ii) antijen baglama alanIlIrlneydana getiren bir tek degerli Fab'nin aglElzincirli Fv fragmenti, bir CH1 alanIIi/asltâislýla, Fc alanIElneydana getiren polipeptitlerden birine baglanmaktadE ve Fab'nin hafif zincirli Fv fragmenti ise bir CL alan. baglanmaktadlü ve CD3 baglama alanllîiineydana getiren Fab'nin hafif zincirli Fv fragmenti bir CH1 alanüvaslfâslîla, Fc alanIümeydana getiren bir baska polipeptite baglanmaktadlElve Fab'nin aglElzincirli Fv fragmenti ise bir CL alanlEla baglanmaktadlü (iii) antijen baglama alanlüneydana getiren bir tek degerli Fab'nin aglEizincirli Fv fragmenti, bir CH1 alanD/asiiâslýla, Fc alanIEineydana getiren polipeptitlerden birine baglanmaktadlB Fab'nin hafif zincirli Fv fragmenti ise bir CL alanEla baglanmaktadlü CD3 baglama alanIIZineydana getiren Fab'nin aglEzincirli Fv fragmenti bir CL alanüasißaüa, Fc alan [Elüineydana getiren bir baska polipeptite baglanmaktadE ve Fab'nin hafif zincirli Fv fragmenti ise bir CH1 alan- baglanmaktadiB (iv) CD3 baglama alanIElneydana getiren bir tek degerli Fab'nin aglElzincirli Fv fragmenti, bir CH1 alanEi/asliîiilea, Fc alanIEineydana getiren polipeptitlerden birine baglanmaktadlü Fab'nin bir hafif zincirli Fv fragmenti bir CL alan- baglanmaktadlB antijen baglama alanIÜneydana getiren Fab'nin hafif zincirli Fv fragmenti, bir CH1 alanüvaslûslýla, Fc alanIElmeydana getiren bir baska polipeptite baglanmaktadlü ve Fab'nin aglElzincirli Fv fragmenti ise bir CL alan. baglanmaktadlB (v) CD3 baglama alanIlZhieydana getiren bir tek degerli Fab'nin aglEizincirIi Fv fragmenti, bir CH1 alanEl/asitîiislîla, Fc alanIElneydana getiren polipeptitlerden birine baglanmaktadE Fab'nin hafif zincirli Fv fragmenti bir CL alanlEla baglanmaktadlü antijen baglama alanIlIineydana getiren Fab'nin aglElzincirli Fv fragmenti, bir CL alanülasßslýla, Fc alanlülneydana getiren bir baska polipeptite baglanmaktadß ve Fab'nin hafif zincirli Fv fragmenti ise bir CH1 alan. baglanmaktadlB birini içermektedir: pozisyonlar 118 ila 260'daki (EU numaralandlünastil amino asit sekansÇl SEKANS KIMLIK NUMARASI:24'te açllZlanan sekanstlîl veya pozisyonlar 261 ila 447'deki (EU numaralandlülnasD] amino asit sekansü SEKANS KIMLIK NUMARASI:26'da açllZlanan sekanstlg KIMLIK NUMARASI: 23'teki amino asitlerin bir mutasyonunu içermektedir ve burada Fc alanIElmeydana getiren amino asitler, asaglâlaki pozisyonlardan herhangi birinde bir 330, 331, ve 332 (EU numaralandlElnasD] 330, veya 331'deki EU numaralandlElnasmamino asitin, ilgili IgG2 veya IgG4 içindeki bir ilgili pozisyondaki (EU numaralandHnasmbir amino asit tarafndan bir ikamesini içeren bir Fc alanIEl veya ii) burada Fc alanÇlpozisyon 234, 235, ve/veya 297'deki (EU numaralandlîilnastîl bir amino asit mutasyonunu içermektedir; ve pozisyon 234, 235, ve/veya 297'deki amino asitler alanin ile ikame edilmektedir; iki polipeptitin sekanslarEbirbirinden farklIlEl ve burada pozisyon 349'daki amino asit sistein ile ikame edilmektedir ve pozisyon 366'daki (EU numaralandlûlnasDZlamino asit, Fc alanIÜneydana getiren iki polipeptitten birinin amino asit kallEtllârEiarasIan triptofan ile ikame edilmektedir; ve burada pozisyon 356'daki amino asit sistein ile ikame edilmektedir, pozisyon 366'daki amino asit serin ile ikame edilmektedir, pozisyon 368'deki amino asit alanin ile ikame edilmektedir ve pozisyon 407'deki (EU numaralandlElnasm amino asit ise, bir baska polipeptitin amino asit kalIEtllârElarasIan valin ile ikame edilmektedir; iki polipeptitin sekanslarlîl birbirinden farkIIlEl ve burada pozisyon 356'daki (EU numaralandlünasmamino asit, Fc alanlElüneydana getiren iki polipeptitten birinin amino asit kallEtllârlZJ arasIan Iisin ile ikame edilmektedir; pozisyon 439'daki (EU numaralandlElnasDJamino asit bir baska polipeptitteki glutamik asit ile ikame edilmektedir; ve pozisyon 435'teki (EU numaralandlElnasDîlamino asit, iki polipeptitten birinin amino asit kaIlEtllârljrasIan arjinin ile ikame edilmektedir. iki polipeptitin karboksik terminisinden silinmektedir; içeren, kanserin tedavi edilmesi ve önlenmesinde kullanIia yönelik bir terapötik madde; ve özellikle burada, kanser karaciger kanseri veya akciger kanseridir. Mevcut bulus, BiTE'nin sahip oldugu güçlü anti tümör aktivitesini tutan ve kanda uzun bir yarü ömrün yanlis& kanser antijenine baglilßitokin fEli-süieya benzerinin indüklenmemesi ile sonuçlanan oldukça iyi güvenlik niteliklerine sahip olan yeni polipeptit kompleksleri sunmaktadlEl Mevcut bulusun bir polipeptit kompleksinin antijen baglama alanElikame edildiginde, hücresel sitotoksisitenin indüklenmesine yönelik bir aktif içerik maddesi olarak polipeptit kompleksi içeren terapötik maddeler, kanser hücreleri de dahil olmak üzere çesitli hücreleri hedefleyebilmektedir ve bunlara zarar verebilmektedir. DolayElýla, birçok kanser tedavi edilebilmekte veya önlenebilmektedir. Bu, fazlaca güvenli ve uygun olan, arzu edilen tedavileri mümkün kllîhaktad lElve hastalara yönelik fiziksel yükü de azaltmaktadlEl Sekilleri K& Açllîlamaslîl Sekil 1, GPC3 ERY1 (GPC3 BiTE), GPC3 ERY2, ve bir IgG-tipi anti-GPC3 antikorunun sitotoksik aktivitelerinin karsllâstlîlliiasllîgösteren bir grafiktir. KapaIEkare (i), kapaIEI üçgen (A), ve açllZl kare (in), slîehsüla GPC3 ERY1 (GPC3 BiTE), GPC3 ERY2, IgG-tipi anti- GPC3 antikorunun sitotoksik aktivitelerini temsil etmektedir. Sekil 2, GPC3 BiTE ve GPC3 ERY5'in sitotoksik aktivitelerinin karsllâstlîlmiaslîgösteren bir grafiktir. KapalEkare (I) ve açlKl daire (0), slîehslýla GPC3 BiTE ve GPC3 ERY5'in sitotoksik aktivitelerini temsil etmektedir. Sekil 3, GPC3 BiTE ve GPC3 ERY6'nlEl sitotoksik aktivitelerinin karsllâstlülßiaslöllîgösteren bir grafiktir. KapalD sitotoksik aktivitelerini temsil etmektedir. Sekil 4, GPC3 BiTE ve GPC3 ERY7'nin sitotoksik aktivitelerinin karsllâstElEialelülgösteren bir grafiktir. KapaIEkare (I) ve kapalEéImas (o) sßaslýla GPC3 BiTE ve GPC3 ERY7'nin sitotoksik aktivitelerini temsil etmektedir. aktivitelerinin karsüâstlElBiasIügösteren bir grafiktir. KapalEkare (i), kapaIEl'içgen (A), açllîldaire (o) ve açlEl kare (u) slßslýla GPC3 GPC3 BiTE, GPC3 ERY8-2, GPC3 ERY9-1, ve GPC3 ERY10-1'in sitotoksik aktivitelerini temsil etmektedir. Sekil 6, PC-10 ön karlglEJi modelinde GPC3 ERY8-2'nin in VIVO anti-tümör etkisini gösteren bir grafiktir. AçlEJ kare (o) ve kapalEélmas (o), süsü-da GPC3 ERY7 uygulama gurubu ve kontrol (PBS uygulamasmgrubunun tümör hacmindeki degisimleri göstermektedir. Sekil 7, PC-10 ön karlglEJi modelinde GPC3 ERY10-1'in I'n Viva anti-tümör etkisini gösteren bir grafiktir. Aç[El kare (u) ve kapaIEélmas (o), slßsüa GPC3 ERY10-1 uygulama gurubu ve kontrol (PBS uygulamasmgrubunun tümör hacmindeki degisimleri göstermektedir. Sekil 8, PC-10 T hücresi transfer modelinde GPC3 ERY10-1'in in i/i'i/o anti-tümör etkisini gösteren bir grafiktir. AçlKl kare (m) ve kapalßlmas (o), slBaslîLla GPC3 ERY10-1 uygulama gurubu ve kontrol (PBS uygulamasi] grubunun tümör hacmindeki degisimleri göstermektedir. Sekil 9, GPC3'ü eksprese eden Ba/F3 hücreleri kullanilarak belirlenen, GPC3 ERY9-1 ve GPC3 ERY10-1 plazma konsantrasyonlarII süreçlerini gösteren bir grafiktir. Kapalßlmas (o) ve adli! kare (ci), sBislýla GPC3 ERY9-1 ve GPC3 ERY10-1 için plazma konsantrasyonu sürecini göstermektedir. Sekil 10, CD3'ü eksprese eden Ba/F3 hücreleri kullanilârak belirlenen, GPC3 ERY9-1 ve GPC3 ERY10-1 plazma konsantrasyonlarII süreçlerini gösteren bir grafiktir. Kapallllmas (o) ve aç[Ei kare (ci), leilea GPC3 ERY9-1 ve GPC3 ERY10-1 için plazma konsantrasyonu sürecini göstermektedir. kanser antijeninden bagnsm sekilde sitokinleri Indükleme yetilerine yönelik olarak degerlendirilmesini gösteren bir grafiktir. ERY18Sl'in in vitro sitotoksisitelerini gösteren bir grafiktir. KapalEiliçgen (A), kapalülaire (o), kapalEkare (i), açiKJ kare (m) ve açik] elmas (o), süsüia, GPC3 ERY18 L1, GPC3 temsil etmektedir. gösteren bir grafiktir. Kapalmaire (I) ve açlKl kare (i:i), slîasMa GPC3 ERY18 L3 ve GPC3 ERY10-1'in sitotoksik aktivitelerini temsil etmektedir. Sekil 14, GPC3 ERY19-3 ve GPC3 BiTE'nin in vitro sitotoksisitelerinin karsilâstlîllîhasllîl gösteren bir grafiktir. AçilZl kare (u) ve kapalljkare (i), süslýla, GPC3 ERY19-3 ve GPC3 BiTE'nin sitotoksik aktivitelerini temsil etmektedir. Sekil 15A, NTA1L/NTA1R/GC33-k0'I eksprese edildigi CM'nin boyut dlSlamaIIZI kromatografi analizinin sonuçlarIEl göstren bir kromatograde Sekil 15B, NTA2L/NTA2R/GC33-k0'I eksprese edildigi CM'nin boyut dlSIamalEikromatografi analizinin sonuçlarülügöstren bir kromatogramdiû Sekil 16, buradaki Örneklerde açliZlanan yandaki polipeptit komplekslerini meydana getiren alanlarEtemsil eden diyagramlarlîgöstermektedir: GPC3 BiTE, GPC3 ERY2, GPC3 ERY15, GPC3 ERY18, ve GPC3 ERY19-3. Çapraz çizgili hatlarI oldugu alan, anti-kanser antijeni (GPC3, EpCAM, EGFR) antikorunun H zinciri degisken bölgesini temsil etmektedir; diyagonal hatlarI oldugu alan, anti-kanser antijen (GPC3, EpCAM, EGFR) antikorunun L zinciri degisken bölgesini temsil etmektedir; noktaIElhatlarI oldugu alan, anti-CD3 antikorunun H zinciri degisken bölgesini temsil etmektedir; kapalElalan, anti-CD3 antikorunun L zinciri degisken bölgesini temsil etmektedir; açik] alan, antikor sabit bölgesini temsil etmektedir; çarpübir sessiz Fc mutasyonunu temsil etmektedir; ve yIE ise heteromerik Fc birlesmesini tesvik eden bir mutasyonu temsil etmektedir. ERY15 (J); GPC3 ERY18 (K); ve GPC3 ERY'nin diyagramlarlügiöstermektedir. Sekil 18, IgG1, IgG2, IgG3, ve IgG4'ün Fc alanlarIEImeydana getiren amino asit kaIlEtllârIElve bunlarI Kabat EU numaralandlülnasIEl(burada, ayrlEla "EU INDEKSI" olarak adland lülîhaktadlî) göstermektedir. Sekil 19, buradaki Örneklerde açllZIanan yandaki polipeptit komplekslerini meydana getiren alanlarEtemsiI eden diyagramlarlîgöstermektedir. GPC3 ERY17-2, GPC3 ERY17-3, EpCAM ERY17-2, ve EpCAM ERY17-3. Çapraz çizgili hatlarI oldugu alan, anti-kanser antijeni (GPC3, EpCAM, EGFR) antikorunun H zinciri degisken bölgesini temsil etmektedir; diyagonal hatlarI oldugu alan, anti-kanser antijen (GPC3, EpCAM, EGFR) antikorunun L zinciri degisken bölgesini temsil etmektedir; noktalElhatlarI oldugu alan, anti-CD3 antikorunun H zinciri degisken bölgesini temsil etmektedir; kapalüalan, anti-CD3 antikorunun L zinciri degisken bölgesini temsil etmektedir; açûg alan, antikor sabit bölgesini temsil etmektedir; çarpübir sessiz Fc mutasyonunu temsil etmektedir; ve yIE ise heteromerik Fc birlesmesini tesvik eden bir mutasyonu temsil etmektedir. aktivitelerinin karsliâstlîlllüiasllîgösteren bir grafiktir. KapaIEkare (i), kapaIEüçgen (A), GPC3 ERY10-1'in sitotoksik aktivitelerini temsil etmektedir. Sekil 21, PC-10 T hücresi transfer modelinde GPC3 ERY17-2'nin /n w'i/o anti-tümör etkisini gösteren bir grafiktir. AçlKl kare (i:i) ve kapallîlmas (o), süslîla GPC3 ERY17-2 uygulama gurubu ve kontrol (PBS uygulamasDîl grubunun tümör hacmindeki degisimleri göstermektedir. karsilâstlîllfhaslgösteren bir grafiktir. Kapallîiliçgen (A) ve açilg daire (0) sßslýla GPC3 ERY17-2 ve GPC3 ERY17-2-M20'nin sitotoksik aktivitelerini temsil etmektedir. Sekil 23, EpCAM ERY17-2 ve EpCAM ERY17-3'nin sitotoksik aktivitelerinin karsHâstlEllBiasIElgösteren bir grafiktir. Kapalüüçgen (A) ve açiE kare (m) sßsEla EpCAM ERY17-2 ve EpCAM ERY17-3'ün sitotoksik aktivitelerini temsil etmektedir. Sekil 24, buradaki Örneklerde açllZIanan yandaki polipeptit komplekslerini meydana getiren alanlarEltemsiI eden diyagramlarEIgöstermektedir: GM1, GM2, ve GMO. "A", CHl/CL arayüz birlesmesinin regüle edildigi ve Delik-içi-Nob (KiH) modifikasyonlarII verildigi bir polipeptit kompleksini göstermektedir. "B" ise, CH1/CL arayüz birlesmesinin veya KiH modifikasyonlarII verilmesinin gerçeklesmedigi bir polipeptit kompleksini göstermektedir. Çapraz çizgili hatlarI oldugu alan, anti-kanser antijeni (GPC3 veya EpCAM) antikorunun H zinciri degisken bölgesini temsil etmektedir; diyagonal hatlarI oldugu alan, anti-kanser antijen (GPC3 veya EpCAM) antikorunun L zinciri degisken bölgesini temsil etmektedir; n0ktalü1atlarI oldugu alan, anti-CD3 antikorunun H zinciri degisken bölgesini temsil etmektedir; kapalülan, anti-CD3 antikorunun L zinciri degisken bölgesini temsil etmektedir; açiEl alan, antikor sabit bölgesini temsil etmektedir; çarpübir sessiz Fc mutasyonunu temsil etmektedir; yIlîJ heteromerik Fc birlesmesini tesvik eden bir mutasyonu temsil etmektedir; ve halka seklindeki sembol ise CHl/CL arayüz interaksiyonunu regüle eden bir mutasyonu temsil etmektedir. Sekil 25, GM1, GM2, ve GMO'I sitotoksik aktivitelerinin karsllâstlîllüiasllîgösteren bir grafiktir. KapaIEiliçgen (A), aç[El kare (m) ve açllZJ daire (0) slüslîla GM1, GM2, ve GMO'I sitotoksik aktivitelerini temsil etmektedir. Sekil 26, EGFR ERY17-2'nin sitotoksik aktivitesini gösteren bir grafiktir. Kapallîüçgen (A) EGFR ERY17-2'nin sitotoksik aktivitesini temsil etmektedir. Bulusun Uvqulanmasühin Mod Asaglöhki tannlar, mevcut bulusun anlasmaslüla yardIi edilmesi için saglanmaktadiB Antikor Burada, "antikor", dogal bir immünoglobulin veya kismi veya bütün bir sentez vasltöslîla üretilen bir immünoglobuline isaret etmektedir. Antikorlar, dogal olarak meydana gelen plazma veya serum gibi dogal kaynakalrdan veya antikor üreten hibridomlarI kültür süpernatantlarldan izole edilebilmektedir. Alternatif olarak, antikorlar, genetik rekombinasyon gibi tekniklerin kullanilîhaslîla kismen veya tamamen sentezlenebilmektedir. Tercih edilen antikorlar, örnegin, immünoglobulin izotiginin veya buna ait bir alt sI- antikorlarIEltapsamaktadE Bilinen insan immünoglobulinleri, yandaki dokuz S.- (izotipler) antikorlarIleapsamaktadlE IgGl, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1, IgA2, IgD, IgE, ve IgM. Bu izotipler araleL'lan, mevcut bulusun antikorlarÇiIgGl, IgG2, IgG3, ve IgG4'ü kapsamaktadlü Arzu edilen baglama aktivitesine sahip bir antikorun üretilmesine yönelik yöntemler, teknikte uzman kisiler tarafian bilinmektedir. Asagi, GPI'ye tutulan reseptör ailesine ait olan, GPC3'e baglanan bir antikorun (anti-GPC3 antikoru) üretilmesine yönelik bir yöntemi antijene baglanan antikorlar da asagi açlKIanan örnege göre üretilebilmektedir. Anti-GPC3 antikorlar, bilinen yöntemlerin kullanllBiaslîLIa poliklonal veya monoklonal antikorlar olarak elde edilebilmektedir. Tercihen üretilen anti-GPC3 antikorlarÇlmemeIilerden elde edilen monoklonal antikorlardlEl Memelilerden elde edilen bu tür antikorlar, genetik mühendisligi teknikleri vasltâslýla, bir antikor geni taslîlan bir ekspresyon vektörü ile dönüstürülen hibdiromlar veya konak hücreler tarafükjan üretilen antikorlarütapsamaktadlü Monoklonal antikor üreten hibridomlar, örnegin asagi açlElandiglEüzere bilinen tekniklerin kullanllîhaslýla üretilebilmektedir. Spesifik olarak, memeliler, duyarlllâstlElna proteini olarak bir GPC3 proteininin kullanI[g]l:lk0nvansiyonel immünizasyon yöntemleri ile immünize edilmektedir. Elde edilen immün hücreler, konvansiyonel hücre füzyon yöntemleri vaslßslýla, bilinen parental hücreler ile füzyonlanmaktadlEI Ardian, bir anti-GPC3 antikorunu üreten hibridomlar, konvansiyonel tarama yöntemleri kullanllârak monoklonal antikor üretim hücreleri için taranarak seçilebilmektedir. Spesifik olarak, monoklonal antikorlar, asagi bahsedildigi üzere halelanmaktadlB Ilk olarak, NM_ nükleotit sekanslîaçilîlanan GPC3 geni, antikor preparasyonu için bir duyarlllâstlÜna sntijeni NUMARASI:2) gösterilen bir GPC3 geninin üretilmesi için eksprese edilebilmektedir. Yani, GPC3'ü kodlayan bir gen sekansÇIbilinen bir ekspresyon vektörünün içerisine eklenmektedir ve uygun konak hücreleri ise bu vektör ile dönüstürülmektedir. Arzu edilen insan GPC3 proteini, bilinen yöntemler vasltâslýla konak hücrelerden veya bunlari kültür süpernatantlarldan saflastlEllÜiaktadE Örnegin, kültür süpernatantlarldan çözünebilir GPC3'ün hazülanmaslîlamaclîla, GPC3'ün hücre zarlîüzerinde tutulmasüçin kullanllân GPI- tutma sekans- karslglîl gelen hidrofonik bölgeyi meydana getiren pozisyonlar 564 ila 580'deki amino asitler, SEKANS KIMLIK NUMARASI:2'deki GPC3 polipeptit sekansIan silinmektedir ve ardiiian, elde edilen prorein ise SEKANS KIMLIK NUMARASI:2'deki GPC3 proteini yerine eksprese edilmektedir. Alternatif olarak, bir duyarlllâstüna antijeni olarak bir saflastlüßîgdogal GPC3 proteininin kullanllBwasljlnümkündür. Saflastlîllân GPC3 proteini, memelilerin immünizasyonu için bir duyarlllâstlElna antijeni olarak kullanllâbilmektedir. Bir kElnEl GPC3 peptiti de bir duyarlllâstlîilna antijeni olarak kullanllâbilmektedir. Bu durumda, insan GPC3'ün amino asit sekanlela dayalEkimyasal sentez vaslßslýla veya bir kismi GPC3 geninin ekspresyon için bir ekspresyon vektörünün içerisine eklenmesi vaslßislîla bir kismi peptit hazlEIlanabilmektedir. Alternatif olarak, bir kisim peptit, bir GPC3 proteininin bir proteaz ile indirgenmesi vaslüsMa meydana getirilebilmektedir. Klîlni GPC3 peptitinin uzunlugu ve bölgesi, belirli yapilândlElnalar ile sIlEllEdegildir. Tercih edilen bir bölge, SEKANS KIMLIK NUMARASI:2'deki amino asit sekansIaki amino asit pozisyonlarE564 ila 580'de bulunan amino asit sekansIan rastgele seçilebilmektedir. Bir duyarlllâstlüna antijeni olarak kullanüâcak olan bir peptiti meydana getiren amino asitlerin sayEJtercihen en az bes veya daha fazla, altü/eya daha fazla veya yedi veya daha fazladlEI Daha belirgin sekilde, 8 ila 50 kallEtllârIlE, daha tercihen 10 ila 30 kallEtlErIlEl bir peptiti, bir duyarlllâstlîilna antijeni olarak kullanllâbilmektedir. DuyarlllâstlElna antijeni için, alternatif olarak, arzu edilen bir kismi polipeptitin veya GPC3 proteininin peptitinin farklEbir polipeptit ile füzyonlanmasEl/aslßsüla hazlEllanan bir füzyon proteininin kullanllÜiasEtnümkündür. Örnegin, antikor Fc fragmentleri ve peptit etiketleri, tercihen, duyarlllâstlElna antijenleri olarak kullanllâcak olan füzyon proteinlerinin üretilmesi için kullanilIhaktadlEl Bu tür füzyon proteinlerinin ekspresyonuna yönelik vektörler, arzu edilen iki veya daha fazla polipeptit fragmentini kodlayan çerçeve genlerinin içerisinde füzyonlama ve füzyon geninin yukari açlElandLglEilizere bir ekspresyon vektörünün içerisine eklenmesi vasltâslîla meydana getirilebilmektedir. Füzyon proteinlerinin üretilmesine yönelik yöntemler, Molecular Cloning 2'inci basklIQSambrook, J ve meslektaslarlÇlMolecular Cloning 2. duyarlilâstlülna antijeni olarak kullanilâcak olan GPC3'ün hazlîlianmasl yönelik yöntemler ve Duyarliiâstüna antijeni ile immünize edilecek olan memelilere dair belirli bir sIlEiiandlIiina mevcut degildir. Ancak, memelilerin, hücre füzyonu için kullanüâcak olan ana hücreler ile uyumu göz önüne aI-rak seçilmesi tercih edilmektedir. Genel olarak, fareler, slglanlar ve hamsterlar, fareler gibi kemirgenler ve maymunlar tercihen kullanilEiaktadlEl Yukarlöhki hayvanlar, bilinen yöntemlerle bir duyarlHâstlBlna antijeni ile immünize edilmektedir. Genel olarak gerçeklestirilen immünizasyon yöntemleri, örnegin, bir duyarlilâstiîiina antijeninin memelilere intraperitoneal veya subkütanöz enjeksiyonunu kapsamaktadlEl Spesifik olarak, bir duyarlilâstlEina antijeni, PBS (Fosfat-Tamponlu Salin), fizyolojik salin veya benzeri ile uygun bir sekilde seyreltilmektedir. Arzu edilmesi halinde, Freund'un bütün adjuvantEgibi bir konvansiyonel adjuvant, antijen ile karßtiîllüiaktadlîlve karlglüi emülsiyon haline getirilmektedir. ArdiEUan, duyarlilâstlülna antijeni, 4 ila 21 günlük arallElarIa birkaç kez bir memeliye uygulanmaktadlE] Uygun taslîlößr, duyarlilâstlîiina antijeni ile immünizasyonda kullaniiâbilmektedir. Özellikle, düsük moleküler aglElIilZlElbir kismi peptitin duyarlilâstlElna antijeni olarak kullanilüiaslîldurumunda, kimi zaman, immünizasyon için duyarlliâstlîiina antijeninin albümin veya anahtar deligi Iimpet hemosiyanin gibi bir taslsîIEZI proteine baglanmasßrzu edilmektedir. Alternatif olarak, arzu edilen bir antikoru üreten hibridomlar, asagi bahsedildigi üzere DNA immünizasyonu kullanilârak hazlîiianabilmektedir. DNA immünizasyonu, hayvandaki bir antijen proteini kodlama geninin ekspresyonunun mümkün klIJEtnasEiçin meydana getirilen bir vektör DNA'nI uygulanmasi. bir sonucu olarak immünize edilen bir hayvanda, bir duyarlilâstlEina antikeninin eksprese edilmesi vasißslýla immünostimülsyonu saglayan bir immünizasyon yöntemidir. Bir protein antijeninin immünize edilecek olan hayvanlara uygulandigilîkonvansiyonel immünizasyon yöntemlerine kElasla, DNA immünizasyonunun su bakIidan daha üstün olmaslîlbeklenmektedir: - GPC3 gibi bir zar proteininin yaplgiîtlutulurken immünostimülsayonun saglanabilmektedir; - immünizasyon Için antijenin saflastlEIllIhas- gerek yoktur. DNA immünizasyonu kullanlßrak mevcut bulusun bir monoklonal antikorunun hazlfllanmaslîl için, ilk olarak, GPC3 proteinini eksprese eden bir DNA immünize edilecek olan bir hayvana uygulanmaktadlB GPC3'ü kodlayan DNA, PCR gibi bilinen yöntemlerle sentezlenebilmektedir. Elde edilen DNA, uygun bir ekspresyon vektörünün içerisine eklenmektedir ve ardIan, bu, immünize edilecek olan bir hayvana uygulanmaktadlü Tercihen, kullanIn ekspresyon vektörleri, örnegin pcDNA3.1 gibi piyasada mevcut ekspresyon vektörlerini kapsamaktadlü Vektörler, konvansiyonel yöntemlerin kullanilmasMa bir organizmaya uygulanabilmektedir. Örnegin, DNA immünizasyonu, immünize edilecek olan bir hayvani vücuduna, ekspresyon vektörü ile kaplElaltI partiküllerinin uygulanmaslZliçin bir gen silahII kullanllüiaslîla doküman a açlEJanan yöntemleri vasltâslwa üretilebilmektedir. Bir memelinin yukar- açlKlanan sekilde immünize edilmesinden sonra, bir GPC3 baglama antikorunun titresindeki bir art& serum içerisinde dogrulanmaktadlE ArdlEUan, immün hücreleri memeliden aIlEmaktadIElve ard Idan hücre füzyonuna tabi kllülnaktadß Özellikle, splenositler immün hücreleri olarak kullanllîhaktadlEI Bir memeli myelomu, yukarlEIh bahsedilen immünosit ile füzyonlanacak olan bir hücre olarak kullanliîhaktadlü Myelom hücresi, tercihen, tarama için uygun bir seçim isaretçisi içermektedir. Bir seçim isaretçisi, spesifik bir kültür kosulu aItIa hücrelere, bunlarI hayatta kaIIiE(veya ölümü) için özellikler saglamaktadlü Hipoksantin-guanin fosforiboziltransferaz eksikligi (buradan itibaren HGPRT eksikligi olarak klîlaltllBiaktadIE) ve timidin kinazlîleksikligi (buradan itibaren TK eksikligi olarak kEialtllüiaktadlE) seçim isaretçileri olarak bilinmektedir. HGPRT veya TK eksikligi olan hücreler, hipoksantim-aminopretin-timidin duyarlmîgllüb (buradan itibaren HAT duyarIUJEüblarak adlandßllüiaktadlî) sahiptir. HAT'ye duyarlEliücreIer, bir HAT seçim ortamEliçerisinde DNA'yElsentezIeyememektedir ve dolaylêlýla ölmektedir. Ancak, hücrelerin normal hücreler ile füzyonlanmasEtlurumunda, bunlar, normal hücrelerin salvaj yolaklarIElkullanarak DNA sentezine devam edememektedir ve dolaylîlîla bunlar, HAT seçim ortam a bile yetisebilmektedir. HGPRT'si eksik ve TK'si eksik hücreler, leislSLla 6-tiyoguanin, 8-azaguanin (buradan itibaren 8AG olarak klglaltllöîaktadur), veya 5'-brom0de0ksiüridin içeren bir ortam içerisinde seçilebilmektedir. Normal hücreler öldürülmektedir, zira bu pirimidin analoglarlEJEIkendi DNA'IarlEb katmaktadE Bu zaman zarflEUa, bu enzimler bak"an eksikligi olan hücreler seçim ortamIa hayatta kalabilmektedir, zira bunlar, bu pirimidin analoglarIEkendilerine katamamaktadE Ilaveten, neomisine dirençli gen tarafIan saglanan G418 direnci olarak adlandlEiilân bir seçim isaretçisi, 2-deoksistreptamin antibiyotiklerine (gentamisin analoglarDîl direnç saglamaktadlü Hücre infüzyonu için uygun olan çesitli myelom türleri bilinmektedir. Örnegin, asagidhki hücreleri içeren myelom hücreleri tercihen kullanüâbilmektedir: Immünositler ve myelom hücreleri arasIaki hücre füzyonlarüesasen, bilinen yöntemlerin, örnegin Kohler ve Milstein ve meslektaslarEi (Methods Enzymol. (1981) 73: 3-46) referanletlaki yöntemin kullanilüiaslsîla gerçeklestirilmektedir. Daha belirgin sekilde, hücre füzyonu, örnegin, bir hüzre füzyonu destekleme maddesinin var oldugu bir konvansiyonel kültür ortamlEda gerçeklestirilebilmektedir. Füzyon destekleme maddeleri, örnegin polietilen glikol (PEG) ve Sendai virüsünü (HVJ) kapsamaktadlE Gerekmesi durumunda, dimetil sülfoksit gibi bir yarnd Ünadde de füzyon veriminin artiEllB1aslZl için ilave edilebilmektedir. Immünositlerin myelom hücrelerine orani: kisinin kendi takdirince belirlenebilmekte olup, örnegin her bir ila on imünosit bas. bir myelom hücresi seklinde olabilmektedir. Hücre füzyonlarElçin kullanüâcak olan kültür ortamlarlÇlörnegin, RPM11640 oramEi/e MEM ortamEl gibi myelom hücre hatlarII yetistirilmesi için uygun ortamlarEi/e bu tür hücre kültüründe kullanilân diger konvansiyonel kültür ortamlarIEkapsamaktadlîl Ilaveten, fetal sigilîiserumu (FCS) gibi serum takviyeleri, kültür ortamlEb tercihen ilave edilebilmektedir. Hücre füzyonu için, yukarlîliaki immün hücreleri ve myelom hücrelerinin önceden belirlenen miktarlarlÇlyukar-ki kültür ortamunda iyice karigtlElIBmktadlEi ArdIan, yaklaslEJ 37°C'ye önceden @filan bir PEG çözeltisi (örnegin ortalama moleküler agiEIiiiZl yaklas[iîi 1,000 ila 6,000'dlE), genellikle aglHiiiZJ/hacim cinsinden %30 ila %60 arasEibir konsantrasyonda buraya ilave edilmektedir. Arzu edilen füzyon hücrelerinin (hibridomlar) üretilmesi için bu hafifçe karlgtiEilßiaktadE ArdiEtlan, yukariöh bahsedilen uygun bir kültür ortamüücrelere asamaIEi sekilde ilave edilmektedir ve bu, süpernatantI giderilmesi için tekrar tekrar santrifüjlenmektedir. Dolaylgiîcla, hücre füzyon maddeleri ve hibridom yetistirilmesi bakliian istenmeyen diger maddeler giderilebilmektedir. Bu sekilde elde edilen hibridomlar, konsansiyonel bir seçici ortam, örnegin HAT ortami] (hipoksantin, aminopterin ve timidin Içeren bir kültür ortamlIl kullanilârak kültürleme vasiüislýla seçilebilmektedir. Arzu edilen hibridomlardan farklljblan hücreler (füzyonlanmamlgi hücreler), yeterli bir süre boyunca yukr-ki HAT ortamEiçerisinde devam eden kültürleme vasitîhsüia öldürülebilmektedir. Tipik olarak süre birkaç gün ila birkaç hafta arasIadlE ArdIan, arzu edilen antikoru üreten hibridomlar taranmaktadlEi ve konvansiyonel sIIEIiand EEIEeyreltme yöntemleri vasiüsiýla tek tek klonlanmaktadE Bu sekilde elde edilen hibridomlar, hücre füzyonu iin kullanliân myelomun sahip oldugu seçim isaretçisine dayanarak bir seçim ortam Ekullanllârak seçilebilmektedir. Örnegin, HGPRT- veya TK'si eksik hücreler, HAT ortamIZI(hipoksantin, aminopterin ve timidin Içeren bir ortam) kullanilârak kültürleme vasiüslýia seçilebilmektedir. Spesifik olarak, HAT'ye duyarlünyelom hücreleri hücre füzyonu için kullanIigiIa, normal hücreler ile basaril]]]bir sekilde füzyonlanan hücreler, HAT ortamiükja seçici bir sekilde çogaltHâbilmektedir. Arzu edilen hibridomlardan farkIEIoIan hücreler (füzyonlanmamlîl hücreler), yeterli bir süre boyunca yukr-ki HAT ortamüiçerisinde devam eden kültürleme vasißsiýia öldürülebilmektedir. Spesifik olarak, arzu edilen hibridomlar, genellikle birkaç gün ila birkaç hafta boyunca kültürleme vasifâsiýla seçilebilmektedir. Ardüdan, arzu edilen antikoru üreten hibridomlar taranmaktadlîi ve konvansiyonel sIiEliandlEiEEiseyreltme yöntemleri vasßslýia tek tek klonlanmaktadiü Arzu edilen antikorlar, tercihen, bilinen antijen/antikor reaksiyonuna dayanan tarama yöntemleri vasiüsiýla seçilebilmektedir ve tek tek klonlanabilmektedir. Örnegin, bir GPC3 baglama monoklonal antikoru, hücre yüzeyinde eksprese edilen GPC3'e baglanabilmektedir. Bu tür bir monoklonal antikor, aklgla aktive edilen hücre ölçümü (FACS) vasitâsiîila taranabilmektedir. FACS, lazer Elülükullanilârak bir floresan antikoru ile temas ettirilen hücrelerin analiz edilmesi ve bireysel hücreler tarafiEUan yayllân floresan. ölçülmesi vasiEisEia, bir antikorun bir hücre yüzeyine baglanmasllîdlegerlendiren bir sistemdir. FACS vasltâslýia, mevcut bulusun bir monoklonal antikorunu üreten hibridomlar. taranmaslZI için, ilk olarak GPC3 eksprese eden hücreler hazlElanmaktadlEl Tercihen tarama için kullanilân hücreler, GPC3'ün zorla eksprese edildigi memeli hücreleridir. Kontrol olarak, bir antikorun hücre yüzeyi GPC3'üne baglanma aktivitesi, konak hücreler olarak dönüstürülmemis memeli hücrelerinin kullanilîhaslsîla seçici bir sekilde tespit edilebilmektedir. Spesifik olarak, bir anti- GPC3 monoklonal aktivite üreten hibridomlar, konak hücrelerden ziyade GPC3'ü eksprese etmeye zorlanan hücrelere baglanan bir antikoru üreten hibridomlariEl seçikmesi vasßsüla izole edilebilmektedir. Alternatif olarak, bir antikorun, immobilize edilmis, GPC3 eksprese eden hücrelere baglanma aktivitesi, ELISA ilkesine dayanarak ifade edilebilmektedir. Örnegin, GPC3 eksprese eden hücreler, bir ELISA plakasII çukurcuklar- immobilize edilebilmektedir. HibridomlarI kültür süpernatantlarÇiçukurcuklarl içerisindeki immobilize edilmis hücreler ile temas ettirilmektedir ve immobilize edilmis hücrelere baglanan antikorlar tespit edilmektedir. Monoklonal antikorlar. fareden elde edilmesi durumunda, hücrelere baglanan antikorlar, bir anti-fare immünoglobulin antikorunun kullanilüiaslýla tespit edilebilmektedir. Antijen baglama yetisine sahip, arzu edilen bir antikoru üreten hibridomlar yukari tarama vasitâslýla seçilmektedir ve bir sIIEllandIEiEIEeyreltme yöntemi veya benzeri vasiüslîla klonlanabilmektedir. Bu sekilde hazlEIlanan, monoklonal antikor üreten hibridomlar, konvansiyonel bir kültür ortamIEUan geçirilebilmektedir ve uzun bir süre boyunca SMZI nitrojen içerisinde saklanabilmektedir. Yukarlki hibridomlar bir konvansiyonel yöntem vasitâislîla kültürlenmektedir ve arzu edilen monoklonal antikorlar ise kültür süpernatantlarEUan hazIEllanabilmektedir. Alternatif olarak, hibridomlar uygun memelilere uygulanmaktadlElve bunlarda büyütülmektedir ve monoklonal antikorlar asitlerden haziElianmaktadiEi Önceki yöntem, yüksek safliEtaki antikorlarlEi haziîlanmasüçin uygundur. YukarIki hibridomlar gibi antikor üreten hücrelerden klonlanan antikor genleri tarafIan kodlanan antikorlar da tercihen kullanilâbilmektedir. Klonlanmlg bir antikor geni uygun bir vektörün içerisine eklenmektedir ve bu, gen tarafIan kodlanan antikorun eksprese edilmesi için bir konak içerisine verilmektedir. AntikorlarI izole edilmesi, genlerin vektörlerin içerisine eklenmesi ve konak hücrelerin dönüstürülmesine yönelik yöntemler halihazüla örnegin kanlflbnmßtü Rekombinant antikorlarI üretilmesine yönelik yöntemler ayrlEla asag- açlEIand[gl3ekiIde bilinmektedir. Örnegin, bir anti-GPC3 antikorunun bir degisken bölgesini (V bölgesi) kodlayan bir cDNA, anti-GPC3 antikorunu eksprese eden hibridom hücrelerinden hazlîllanmaktadlrîl Bu amaçla, toplam RNA ilk olarak hibridomlardan özütlenmektedir. Hücrelerden mRNA'larI özütlenmesine yönelik yöntemler örnegin asag-kileri içermektedir: Özütlenen mRNA'lar, mRNA Saflastlîilna Kiti (GE Healthcare Bioscience) veya benzeri kullanllârak saflastlEllâbilmektedir. Alternatif olarak, toplam mRNA'nI dogrudan hücrelerden özütlenmesine yönelik kitler, örnegin QuickPrep mRNA SaflastlElna Kiti (GE Healthcare Bioscience) de piyasada mevcuttur. Bu tür kitler kullanllârak mRNA'lar hibridomlardan hazlîllanabilmektedir. Antikor V bölgesini kodlayan cDNA'lar, bir revers transkriptaz kullanllârak mRNA'lardan sentezlenebilmektedir. AMV Revers Transkriptaz Birinci-Zincirli cDNA Sentez Kiti (Seikagaku C0.) veya benzeri kullanilârak cDNA'Iar sentezlenebilmektedir. DahasÇl SMART RACE cDNA amplifikasyon kiti (Clontech) ve PCR bazlEB'-RACE yöntemi (Proc. Natl. cDNA'larI sentezlenmesi ve yükseltilmesi için kullanHâbilmektedir. Bu tür bir cDNA sentez prosesinde, asaglElh açllZIanan uygun restriksiyon enzimi yerleri, bir cDNA'nI her iki ucuna verilebilmektedir. Ilgili cDNA fragmenti, elde edilen PCR ürününden saflastElIBiaktadlEl ve ardlEUan, bu bir vektör DNA'ya Iigatlanmaktadß Bir rekombinant vektör bu sekilde meydana getirilmektedir ve Eco/i' veya benzerine verilebilmektedir. Koloni seçiminden sonra, ilgili rekombinant vektörü, koloni olusturan E. co//den hazlülanabilmektedir. ArdIan, rekombinant vektörün ilgili cDNA nükleotit sekans. sahip olup olmadgü dideoksi nükleotit zinciri terminasyon yöntemi gibi bilinen bir yöntem vasltâslîla test edilmektedir. Degisken bölge geninin yükseltilmesi için primerleri kullanan 5'-RACE yöntemi, degisken bölgeyi kodlayan genin izole edilmesi için uygun bir sekilde kullanllßîaktadü Ilk olarak, bir 5'- RACE cDNA kütüphanesi, bir kalLöl olarak hibridom hücrelerinden özütlenen RNA'IarI kullanllîhaslîzla cDNA sentezi valeisEla meydana getirilmektedir. SMART RACE cDNA amplifikasyon kiti gibi piyasada mevcut olan bir kit, 5'-RACE cDNA kütüphanesinin sentezlenmesi için uygun bir sekilde kullanHBiaktadlEl Antikor geni, bir kal& olarak 5'-RACE cDNA kütüphanesinin kullanllîhaslýla PCR vaslßaslýla yükseltilmektedir. Fare antikor geninin yükseltilmesine yönelik primerler, bilinen antikor geni sekanslarlEla dayanarak tasarlanabilmektedir. Primerlerin nükleotit sekanslarÇl immünoglobulin ait 5.- baglEblarak degisebilmektedir. DolaylgMa, alt SIEJEÜEL Iso Strip fare monoklonal antikor izotipleme kiti (Roche Diagnostics) gibi piyasada mecvut bir kitin kullanllfhaslýla önceden belirlenmektedir. -Spesifik olarak, örnegin, y1, y2a, y2b, ve y3 aglüzincirleri ve K ve A hafif Zincirlerini kodlayan genlerin yükseltilmesini mümkün kllân primerler, fare IgG kodlama genlerinin izole edilmesi için kullanlIIhaktadlEI Genel olarak, degisken bölgeye yakI olan bir sabit bölge yerine tavlanan bir primer, bir IgG degisken bölge geninin yükseltilmesi için 3'taraflîprimeri olarak kullanllîhaktadß Bu zaman zarfIa, bir 5' RACE cDNA kütüphane yap_ tutturulan bir primer, bir 5'taraflîil›rimeri olarak kullanllîhaktadlü Bu sekilde yükseltilen PCR ürünleri, aglElve hafif zincirlerin bir kombinasyonundan olusan immünoglobulinlerin yeniden sekillendirilmesi için kullanllüiaktadlîl Arzu edilen bir antikor, bir belirteç olarak, yeniden sekillendirilen bir immünoglobulinin GPC3 baglama aktivitesinin kullanIIIhasIQa seçilebilmektedir. Örnegin, amaç GPC3'e karsEbir antikorun izole edilmesi oldugunda, antikorun GPC3'e baglanmasi. spesifik olmasEtercih edilmektedir. Bir GPC3 baglama antikoru, asag .ki adlar vaslüslýla taranabilmektedir: (1) bir GPC3 eksprese eden hücrenin, bir hibridomdan izole edilen bir cDNA tarafEldan kodlanan V bölgesini içeren bir antikor ile temas ettirilmesi; (2) antikorun GPC3 eksprese eden hücreye baglanlglEI tespit edilmesi; ve (3) GPC3 eksprese eden hücreye baglanan bir antikorun seçilmesi. Bir antikorun, GPC3 eksprese eden hücrelere baglanlglElI tespit eidlmesine yönelik yöntemler bilinmektedir. Spesifik olarak, bir antikorun GPC3 eksprese eden hücrelere baglanlglIJFACS gibi, yukari açllZlanan teknikler vaslfâslýla tespit edilebilmektedir. GPC3 eksprese eden hücrelerin immobilize edilmis numuneleri, bir antikorun baglama aktivitesinin degerlendirilmesi Için uygun sekilde kullanlIB1aktadlEl Baglama aktivitesinin bir belirteç olarak kullanI[gll,__ltercih edilen antikor tarama yöntemleri, ayrlEia, faj vektörlerinin kullanliglükaydlîilna yöntemlerini de kapsamaktadlE Faj vektörlerinin kullanIlglEllarama yöntemleri, antikor genlerinin, bir poliklonal antikoru eksprese eden hücre popülasyonundaki aglEl zincirli ve hafif zincirli alt sI[Ü kütüphanelerinden izole edilmesi duruunda avantajlßlmaktadß AgIElzincirIi ve hafif zincirli degisken bölgeleri kodlayan genler, bir tek zincirli Fv'nin (scFv) meydana getirilmesi için uygun bir baglayIEEisekansEi/asßslîla baglanabilmektedir. Yüzeylerinde scFv sergileyen fajlar, scFv kodlayan bir genin bir faj vektörü içerisinde eklenmesi vasllîlaslýla üretilebilmektedir. Fajlar, ilgili bir antijene temas ettirilmektedir. Ardian, ilgili baglama aktivitesine sahip olan, scFv kodlayan bir DNA, antijene baglanan fajlarI toplanmaslýla izole edilebilmektedir. Bu proses, ilgili baglama aktivitesine sahip scFv'nin zenginlestirilmesi için gerekli oldugunda tekrarlanabilmektedir. Ilgili anti-GPC3 antikorunun V bölgesini kodlayan cDNA'nIEl izolasyonundan sonra, cDNA'nI her iki ucuna verilen restriksiyon bölgelerini tanlýbn restriksiyon enzimleri ile cDNA sindirilmektedir. Tercih edilen restriksiyon enzimleri, düsük bir frekansta antikorun nükleotit sekansIa meydana gelen bir nükleotit sekansIIiEltanakta ve bölmektedir. Dahasü yaplgkan bir ucu üreten bir enzime yönelik bir restriksiyon yeri, tercihen, tek kopyalEbir sindirilmis fragmentin dogru yönelimde eklenmesi için bir vektörün içerisine verilmektedir. Anti-GPC3 antikorunun V bölgesini kodlayan cDNA yukar- açilZlandiglü sekilde sindirilmektedir ve bu, bir antikor ekspresyon vektörünün meydana getirilmesi için uygun bit ekspresyon vektörünün içerisine eklenmektedir. Bu durumda, antikor sabit bölgesini (C bölgesi) kodlayan bir genin ve yukariEIhki V bölgesini kodlayan bir genin çerçeve içerisinde füzyonlanmaslîdurumunda, bir kimerik antikor elde edilmektedir. Burada, "kimerik antikor", sabit bölgenin kaynagII degisken bölgenin kaynag Idan farkllîcblmasüinlamlüb gelmektedir. Dolaylîlýla, fare/insan heterokimerik antikorlar- ilaveten, insan/insan allokimerik antikorlarü mevcut bulusun kimerik antikorlarlEla dahil edilmektedir. Bir kimerik antikor ekspresyon vektörü, yukarlki V bölgesinin, halihazElia sabit bölgeye sahip olan bir ekspresyon vektörünün içerisine eklenmesi vasifâsMa meydana getirilebilmektedir. Spesifik olarak, örnegin, yukarülaki V bölgesi genini eksize eden bir restriksiyon enzimine yönelik bir tanIiasekansÇlarzu edilen bir antikor sabit bölgesini (C bölgesi) kodlayan bir DNA'yEliaslýlan bir ekspresyon vektörünün 5' tarafIa uygun bir sekilde konumlandlEllâbilmektedir. Bir kimerik antikor ekspresyon vektörü, aynErestriksiyon enzimi kombinasyonu ile sindirilen iki genin çerçeve içerisinde füzyonlanmasülaslßsüla meydana getirilmektedir. Bir anti-GPC3 monoklonal antikorun meydana getirilmesi amaclýla, antikor genleri bir ekspresyon vektörü içerisine eklenmektedir, böylelikle genler, bir ekspresyon düzenleyici bölgenin kontrolü altlEUa eksprese edilmektedir. Antikor ekspresyonuna yönelik ekspresyon düzenleyici bölge, örnegin artlEEllârÜ/e baslatlalârllapsamaktadlü Dahasüuygun bir sinyal sekansllmino terminusa tutturulabilmektedir, böylelikle eksprese edilen antikor, hücrelerin dEIEla salgllânabilmektedir. Yukarlîlb açllZlanan Örnekler'de, MGWSCIILFLVATATGVHS (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 72) amino asit sekanleb sahip bir peptit bir sinyal sekansü olarak kullanIIBiaktadIE Bu zaman zarfIa, uygun olan diger sinyal sekanslarü da tutturulabilmektedir. Eksprese edilen polipeptit, yukarIki sekansI karboksil terminusunda bölünmektedir ve elde edilen polipeptit ise bir olgun polipeptit olarak hücrelerin dElEla salgllânmaktadß ArdIan, uygun konak hücreleri ekspresyon vektörü ile dönüstürülmektedir ve anti-GPC3 antikoru kodlayan DNA'yEl eksprese eden rekombinant hücreler elde edilmektedir. Antikor agEzincirini (H zinciri) ve hafif zincirini (L zinciri) kodlayan DNA'Iar, antikor geninin eksprese edilmesi için farkllîdekspresyon vektörlerine eklenmektedir. H ve L zincirlerine sahip bir antikor molekülü, aynEkonak hücrenin, içerisine H zinciri ve L zinciri genlerinin süslsîla eklendigi vektörler ile birlikte transfekte edilebilmektedir. Alternatif olarak, konak hücreleri, içerisine H ve L Zincirlerini kodlayan DNA'IarI eklendigi bir tek ekspresyon vektörü ile dönüstürülebilmektedir (bakIlîlWO 94/11523). Izole edilmis antikor genlerinin uygun konaklara verilmesi vasEislSLla antikor preparasyonuna yönelik bilinen çesitli konak hücre/ekspresyon vektörü kombinasyonlarlîlmevcuttur. Bu ekspresyon sistemlerinin hepsi, mevcut bulusun antijen baglama alanlarlEllEl ve CD3 baglama alanlarlEllEl izolasyonu için uygulanabilmektedir. Uygun ökaryotik hücreler, hayvan hücreleri, bitki hücreleri ve fungal hücreler de dahil olmak üzere konak hücreler olarak kullanlEhaktadE Spesifik olarak, hayvan hücreleri örnegin asaglêlhki hücreleri kapsamaktadE (1) memeli hücreleri: CHO, COS, myelom, yavru hamster böbregi (BHK), HeLa, Vero, veya benzeri; (2) amfibi hücreler: Ksenopus oositleri veya benzeri; ve (3) böcek hücreleri: sf9, sf21, Tn5, veya benzeri. Ilaveten, bir bitki hücresi olarak, Meat/'ana tabacum gibi bir Meat/'ana genusundan elde edilen hücrelerin kullan-[glElbir antikor geni ekspresyon sistemi bilinmektedir. Kallus kültürlü hücreler, bitki hücrelerinin dönüstürülmesi için uygun sekilde kullanüâbilmektedir. DahasÇlasag-ki hücreler fungal hücreleri olarak kullan ilâbilmektedir: mayala r: Saccharomyces cerev/si'ae gibi Saccharomyces cinsi ve P/Chia pastori's gibi P/ch/a ipliksi fu ngi: Asperg/l/us Niger gibi Asperg/I/us cinsi. DahasÇI prokaryotik hücrelerden faydalanan antikor geni ekspresyon sistemleri de bilinmektedir. Örnegin, bakteriye hücreler kullanIlgiia, E. ca/i' hücreleri, Bad/us subti//s hücreleri ve benzerinden, mevcut bulusta uygun sekilde faydalanüâbilmektedir. Ilgili antikor genlerini taslýhn ekspresyon vektörleri, transfeksiyon vaslßalýla bu hücrelere verilmektedir. Transfekte edilen hücreler in vitro sekilde kültürlenmektedir ve arzu edilen antikor, dönüstürülen hücrelerin kültürü ile hazlEllanabilmektedir. Yukarlilh açilZJanan konak hücrelerine ilaveten, bir rekombinant antikorun üretilmesi için transgenik hayvanlar da kullanilâbilmektedir. Yani, antikor, ilgili antikoru kodlayan genin verildigi bir hayvandan elde edilebilmektedir. Örnegin, antikor geni, özellikle süt içerisinde üretilen bir proteini kodlayan bir gen içerisine çerçeve içi sekilde eklenmesi vasiüslýla bir füzyon geni olarak meydana getirilebilmektedir. Keçi ß-kazein veya benzeri, örnegin, süt içerisinde salgilânan protein olarak kullanllâbilmektedir. Antikor geni ile birlikte eklenen füzyonlanmlg geni içeren DNA fragmentleri, bir keçi embriyosuna enjekte edilmektedir ve ardlEUan u embriyo, bir disi keçiye verilmektedir. Arzu edilen antikorlar, ambriyonun verildigi keçiden (veya bunun silsilesi) dogan transgenik keçi araciIJgilîla üretilen sütten alin süt proteini ile füzyonlananan bir protein olarak elde edilebilmektedir. Ilaveten, transgenik keçi aracUJgllýla üretilen, arzu edilen antikoru içeren sütün hacminin artlElIIhasEiçin, hormonlar gerekli sekilde transgenik keçiye verilebilmektedir (Ebert, K. M. ve meslektaslarlÇl Burada açlElanan bir polipeptit kompleksinin bir insana uygulanmaslîcllurumunda, insana karsEI heterolog antijenisitenin indirgenmesi için yapay olarak modifiye edilmis olan genetik olarak rekombinant bir antikordan elde edilen bir antijen baglama alan ükompleksin antijen baglama alanEblarak uygun bir sekilde kullanllâbilmektedir. Genetik olarak rekombinant olan bu tür antikorlar, örnegin insansllâstlîllßîEantikorlarükapsamaktadlü Bu modifiye edilmis antikorlar, bilinen yöntemler ile uygun sekilde üretilmektedir. Burada açllZlanan bir polipeptit kompleksinin antijen baglama alanII üretilmesi için kullanilân bir antijen degisken bölgesi, genellikle, dört çatElböIgesi (FR'Ier) vasftâslsîla ayrllân tamamlaylEJJJglEbelirleyen üç bölge (CDR'Ier) vasltâslîla meydana getirilmektedir. CDR, bir antikorun baglama spesifitesini büyük oranda belirleyen bir bölgedir. CDR'Ierin amino asit sekanslarüfazlaca çesitlidir. Diger yandan, FR'yi meydana getiren amino asit sekanslarÇl sllZJHZlar, farklEbaglama spesifitelerine sahip antikorlar arasIa bile yüksek bir özdeslige sahiptir. DolaylgEa, genel olarak, belirli bir antikorun baglama spesifitesi, CDR aslßma vasiEislýla bir baska antikora verilebilmektedir. InsansllâstlEllBrE bir antikor, ayrlEla, yeniden sekillendirilmis bir Insan antikoru olarak adlandlElllEhaktadlEl Spesifik olarak, bir fare antikoru gibi insan olmayan bir hayvan antikorunun CDR'sinin bir insan antikoru ve benzerine asüânmasüvasüslîla hazlîllanan insansllâstlElBrlSlantikorlar bilinmektedir. Insansllâstlîlüglantikorlarl elde edilmesine yönelik yayg genetik teknikler de bilinmektedir. Spesifik olarak, örnegin, kesisme uzantEElPCR'sinin, bir fare antikoru CDR'sinin bir insan FR'sine allglanmaslüb yönelik bir yöntem olarak bilinmektedir. Kesisme uzantlîElPCR'sinde, asüânacak olan bir fare antikoru CDR'sini kodlayan bir nükleotit sekansl:l bir insan antikoru FR'sinin sentezlenmesi için primerlere ilave edilmektedir. Primerler, dört FR'den her biri için hazlEllainmaktadlEl Bir fare CDR'sinin bir insan FR'sine asllânmasljlurumunda, bir fare FR'sine yüksek derecede özdes olan bir insan FR'sinin seçilmesinin, genellikle, CDR islevinin korunmasEiçin avantajlßldugu düsünülmektedir. YanÇl genellikle, asüânacak olan fare CDR'sine bitisik olan FR'nin amino asit sekans- yüksek derecede özdes olan bir amino asit sekansIlIIçeren bir insan FR'sinin kullanllüiaslîtercih edilmektedir. Ligatlanacak olan nükleotit sekansllârübirbirlerine çerçeve içerisinde baglanacaklarESekilde tasarlanmaktadlîl Insan FR'Ieri, ilgili primerlerin kullanllüraslýla bireysel olarak sentezlenmektedir. Sonuç olarak, insan CDR'sini kodlayan DNA'nlEl, bireysel FR'yi kodlayan DNA'Iara tutturuldugu Ürünler elde edilmektedir. Her bir ürünün fare CDR'sini koslayan nükleotit sekanslarü bunlar. birbiriyle kesisecegi sekilde tasarlanmaktadß ArdIan, tamamlaylîßarman sentezi reaksiyonu, kallßl olarak bir insan antikoru geninin kullanüîhasüla sentezlenen ürünlerin kesisen CDR bölgelerinin tavlanmasEiçin gerçeklestirilmektedir. Insan FR'leri, bu reaksiyon yoluyla fare CDR'si vaslüsüa IigatlanmaktadlE Üç CDR'nin ve dört FR'nin nihai olarak Iigatland[g]l,`_ltam uzunluktaki V bölgesi geni, uygun restriksiyon enzimi tanIia sekanslarEliIe birlikte ilave edilen, bunun 5' veya 3' ucunda tavlanan primerlerin kullanllîhaslýla yükseltilmektedir. Insanlastßlöîg antikora yönelik bir ekspresyon vektörü, yukarlElla açlElandlglEsekilde elde edilen DNA'nI ve bir insan antikoru C bölgesini kodlayan bir DNA'nI bir ekspresyon vektörüne eklenmesi vasltâlea üretilebilmektedir, böylelikle bunlar çerçeve içerisinde Iigatlanacaktß Rekombinant hücrelerin meydana getirikmesi için rekombinant vektörün bir konaga transfekte edilmesinden sonra, rekombinant hücreler kültürlenmektedir ve insansllâstlîllüilgantikoru kodlayan DNA, hücre kültürü içerisinde insansUâstlElBuglantikorun üretilmesi için eksprese edilmektedir (bakIlZl EP Yukar- açlklanan sekilde üretilen insansllâstlüllüilgantikorun antijen baglama aktivitesinin niteliksel ve niceliksel olarak ölçülmesi ve degerlendirilmesi vasßslýla, CDR'Ier vaslßslýla ligatlandlgllEUa faydalElbir antijen baglama yerinin olusturulmasIElmümkün kllân insan antikoru FR'Ieri uygun bir sekilde seçilebilmektedir. FR'IerIn içerisindeki amino asit kallEtllârEl gerekli oldugunda ikame edilebilmektedir, böylelikle yeniden sekillendirilmis bir insan antikorunun CDR'leri, uygun bir antijen baglama yeri olusturmaktadE Örnegin, amino asit sekansÜnutasyonlarü bir fare CDR'dinin bir insan FR'sine asüânmasl için kullanllân PCR yönteminin uygulanmaslsîla FR'Iere verilebilmektedir. Daha spesifik olarak, klîini nükleotit sekanslZlmutasyonIarD FR'Iere tavlanan primerlere verilebilmektedir. Nükleotit sekansIZI mutasyonlarÇl bu tür primerlerin kullanllîhasüla sentezlenen FR'lere verilebilmektedir. Arzu edilen özelliklere sahip mutant FR sekanslarüyukarldh açllîlanan yöntem vaslßslýla antijene baglanmalela yönelik olarak amino asit ikameli mutant antikorunun aktivitesinin ölçülmesi ve degerlendirilmesiyle seçilebilmektedir (Sato, K. ve meslektaslarlZlCancer Res. (1993) 53: 851- 856). Alternatif olarak, arzu edilen insan antikorlarÇlDNA Immünizasyonu vaslßslîla, insan antikoru numaralüiatent dokümanlarDZlimmünize edilmesi ile elde edilebilmektedir. DahasÇl Insan antikoru kütüphanelerinin kullanlßiaslýda kaydüna vasltâslýla insan antikorlarII hazlElanamas- yönelik teknikler de bilinmektedir. Örnegin, bir insan antikorunun V bölgesi, faz görüntüleme yöntemi vaslüslîla faz yüzeyi üzerinde bir tek Zincirli antikor (scFv) olarak eksprese edilmektedir. Antijene baglanan bir scFv'yi eksprese eden fajlar seçilebilmektedir. Insan antikoru V bölgesini kodlayan DNA sekansÇlseçilen fajlarI genlerinin analiz edilmesi vasiüslýla belirlenebilmektedir. Antijene baglanan scFv'nin DNA sekansEbeIirlenmektedir. Arzu edilen bir insan antikorunun C bölgesi sekansElle birlikte V bölgesi sekanlellEl çerçeve içerisinde füzyonlanmasÜ/e bunun, uygun bi ekspresyon vektörü içerisine eklenmesi vasßslýla bir ekspresyon vektörü hazlEIlanabiImektedir. Ekspresyon vektörü, yukariEIla açiKIananlar gibi, ekspresyon için uygun olan hücrelere verilebilmektedir. Insan antikoru, insan antikorunu kodlayan genin hücrelerin içerisine eksprese edilmesiyle Antjen baglama alanEI Burada "antijen baglama alanE] bir antijenin tamami veya bir kElnlEla sapesîfik olarak baglanan veya bunun tamamlaylEEElolan bir bölge Içeren bir antikor kElnlEla Isaret etmektedir. Bir antijenin moleküler aglîll[g]II büyük olmasüdurumunda, bir antikor, aantijenin yalnlîta belirli bir klîin. baglanabilmektedir. Bu belirli k-i "epitop" olarak adlandlElllIhaktadlE Bir antijen baglama alanübir veya daha fazla antikor degisken alanIan elde edilebilmektedir. Tercihen, antijen baglama alanlarÇlhem antikor hafif zincirli degisken bölgesini (VL) hem de antikor ag lElzincirIi degisken bölgesini (VH) içermektedir. Tercih edilen bu tür antijen baglama alanlarÇlörnegin "tek zincirli Fv (scFv)", "tek zincirli antikor" "Fv", "tek zincirli Fv2 (scFv2)", "Fab" ve "F (ab')2"yi kapsamaktadlü Mevcut bulusun polipeptit komplekslerinina ntijen baglama alanlarlZI aynü epitopa baglanabilmektedir. Epitop, SEKANS KIMLIK NUMARASI:2 veya 4'teki amino asit sekansIlZI içeren bir protein içerisinde bulunabilmektedir. Alternatif olarak, mevcut bulusun polipeptitinin antijen baglama alanlarÇIfarkIEbpitoplara bireysel olarak baglanabilmektedir. Epitop, SEKANS KIMLIK NUMARASI:2 veya 4'teki amino asit sekansIlZlçeren bir protein içerisinde bulunabilmektedir. Spesifite molekülün, partnerler dlSlEUaki moleküllere ciddi bir baglanma sergilememesi anlam. gelmektedir. Dahasü"spesiûk" ifadesi ayrlîla, bir antijen baglama alanIlEl, bir antijen içerisinde bulunan birçok epitopun belirli bir epitopuna spesink olmasiîldurumunda kullanllüiaktadlü Bir antijen baglama alanEtarafIan baglanan bir epitopun birçok farkli] antijen içerisinde bulunmasEldurumunda, antijen baglama alanIEIiçeren bir polipeptit kompleksi, epitopa sahip birçok antijene baglanabilmektedir. Antijen Burada, antijen üzerinde belirli bir klgt] bulunmamaktadlîl ve CD3 dSIEUaki herhangi bir antijenin kullanllüwasljnümkündür. Bu tür antijenler, örnegin reseptörler, kanser antijenleri, MHC antijenleri ve farklilâsma antijenlerini kapsamaktadB Reseptörler, örnegin, hematopoietik büyüme faktörü reseptörü ailesi, sitokin reseptörü ailesi, tirozin kinazlIl reseptörü ailesi, serin/treonin kinazüeseptörü ailesi, TNF reseptörü ailesi, G proteini ile birlestirilen reseptör ailesi, GPI tarafIan tutulan reseptör ailesi, tirozin fosfataz reseptörü ailesi, yaplgma faktörü ailesi ve hormon reseptörü ailesine ait olanlarEkapsamaktadIE Bu reseptör ailelerine ait olan reseptörler ve bunlar. özellikleri, çesitli dokümanlarda, örnegin Cooke BA., King RJB., van der Molen HJ. ed. New Comprehensive Biochemistry Vol. 18B SAIBO KOGAKU (Cell Technology) Supplementary Volume Handbook Series "Secchaku Inshi Handbook (Handbook for Adhesion factors)" M. Miyasaka Ed. (1994) Shujunsha, Tokyo, Spesifik olarak, yukariEllaki reseptör ailelerine ait olan reseptörler, tercihen, örnegin insan ve insan ve fare granülosit klonisini stimüle eden faktör (G-CSF) reseptörleri (Proc. Natl. Acad. Sci. USA. (, insan ve fare reseptörleri (Proc. Natl. Acad. Sci. USA. (-d ve -[3 reseptörleri, insan ve fare büyüme hormonu (GH) reseptörleri, insan ve fare interlökin (IL)- reseptörleri, insan ve fare insulin-benzeri büyüme faktörü (IGF)-I reseptörleri, insan ve fare lösemisi inhibitör faktörü (LIF) reseptörleri ve Insan ve fare siliyer nörotrofik faktör (CNTF) reseptörlerini kapsamaktadlîl Kanser antijenleri, hücreler kötü huylu olmaya basladlElsa eksprese edilen antijenlerdir ve ayrlEla "tümör spesifik antijenler" olarak da adlandlEllB1aktadlB DahasÇlhücreler kanserli hale geldiginde hücre yüzeyi veya protein molekülleri üzerinde eksprese edilen anormal seker zincirleri de kanser antijenleridir ve "kanser ile iliskili karbohidrat antijeni" olarak sialil SSEA-l'i (SLX) kapsamaktadlEl GPC3, yukari bajsedilen GPI tarafIan tutulan reseptör ailesine aittir ve karaciger kanseri de daihl olmak üzere çesitli kanser türlerinde eksprese edilmektedir. EpCAM akciger kanseri de dahil olmak üzere çesitli kanser türlerinde eksprese edilmektedir ve bunun polinükleotit ve polipeptit sekansllârÇlsülea, NM_002354.2 erisim numaraIE(SEKANS KIMLIK NUMARASI:3) ve NP_002345.2 erisim numarall:[SEKANS KIMLIK NUMARASI:4) RefSeq'te açlKlanmaktadlE Genel olarak, MHC antijenleri, MHC sIlEl I ve sIilîi II antijenleri olarak kategorize edilmektedir. MHC sIEElI antijenleri HLA-A, -B, -C, -E, -F, -G, ve -H'yi kapsarken, MHC sIlElII antijenleri HLA-DR, -DQ, ve -DP'yi kapsamaktadlü CD122, CD126, ve CDw130'u kapsamaktadE açlEIanan bir polipeptit kompleksinin antijen baglama alanII baglandlgilîbir antijen yerine Isaret etmektedir. Dolaylâlsîla, örnegin, epitop, bunun yap_ göre tanIilanabilmektedir. Alternatif olarak, epitop, epitopu tanlýan bir polipeptit kompleksinin antijen baglama aktivitesine göre tanIilanabilmektedir. Antijenin bir peptit veya polipeptit olmasülurumunda, epitop, epitopu meydana getiren amino asit kallîitüârlîltarafian belirlenebilmektedir. Alternatif olarak, epitopun bir seker zinciri olmasEdurumunda, epitop, kendi spesifik seker zinciri yapEEtlarafIan belirlenebilmektedir. Bir lineer epitop, birincil amino asit sekansII tanIEtllglElbir epitop içeren bir epitoptur. Tipik olarak bu tür bir lineer epitop, spesifik sekansIia, en az üç ve en yayglEl sekilde en az bes, örnegin yaklasilZlS ila 10 veya 6 ila 20 amino asit içermektedir. Lineer epitopun aksine, "uyusumsal epitop", epitopu içeren birincil amino asit sekansIE, tan-n epitopun tek belirleyicisi olmadlglEbir epitoptur (örnegin, bir uyusumsal epitopun birincil amino asit sekanslÇI bir epitop belirleyici antikor tarafIan tanlErnasEl gerekmemektedir). Uyusumsal epitoplar, lineer epitoplara göre daha fazla amino asit say- sahip olabilmektedir. Bir uyusumsal epitopu tanülan antikor, bir peptit veya proteinin üç boyutlu yap-!Ellanaktadlîl Örnegin, bir protein molekülünün katlanmasüle üç boyutlu bir yapElolusturmasEldurumunda, bir uyusumsal epitogu olusturan amino asitler ve/veya polipeptit ana zincirleri hizaIEhale gelmektedir ve epitop, antikor tarafian tanIlEl hale getirilmektedir. Epitop uyusumlarII belirlenmesine yönelik yöntemler, örnegin X @HIZI kristalografisi, iki boyutlu nükleer manyetik rezonans, yere özgü spin isaretleme ve elektron paramanyetik rezonansIEkapsamaktadiîl ancak bunlarla sIlEllEldegildir. Bakliîl örnegin, Epitope Mapping Protocols in Methods in Molecular Biology (1996), Cilt 66, Morris (ed.) referansü Bir GPC3 antijen baglama alanEliçeren bir test polipeptit kompleksi tarafIan epitop baglanmasi. degerlendirilmesine yönelik bir yöntemi örnekleri asaglâia açlEIanmaktadE Asaglâlaki örneklere göre, GPC3'ten baika bir antijen için bir antijen baglama alanljlçeren bir test polipeptit kompleksi tarafIan epitop baplanmasII degerlendirilmesine yönelik yöntemler de uygun bir sekilde gerçeklestirilebilmektedir. Örnegin, bir GPC3 antijen baglama alan. sahip bir test polipeptit kompleksinin GPC3 molekülündeki bir lineer epitopu tanlîlîii tanIiadlglü örnegin asag- bahsedildigi sekilde dogrulanabilmektedir. GPC3'ün hücre dlglllanllîblusturan bir amino asit sekansEiçeren bir lineer peptit, yukaridaki amaç dogrultusunda sentezlenmektedir. Peptit kimyasal olarak sentezlenebilmektedir veya bir GPC3 cDNA'sIaki hücre dlgüalana karsiElEl gelen amino asit sekansIlZi kodlayan bir bölgenin kullanigEl genetik mühendisligi teknikleri ile elde edilebilmektedir. ArdIan, bir GPC3 antijen baglama alanEliçeren bir test polipeptit kompleksi, hücre dlgElalanEblusturan amino asit sekansIIZlçeren bir lineer peptite yönelik baglama aktivitesi bakIilEUan degerlendirilmektedir. Örnegin, immobilize edilmis bir lineer peptit, peptine yönelik olarak polipeptit kompleksinin baglama aktivitesinin degerlendirilmesi için ELISA vaslßslýla bir antijen olarak kullanllâbilmektedir. Alternatif olarak, bir lineer peptite yönelik baglama aktivitesi, lineer peptitin, GPC3 eksprese eden hücrelere polipeptit kompleksinin baglanmalelEilnhibe etme seviyesine bagIEsekiIde degerlendirilebilmektedir. Bu testler, polipeptit kompleksinin lineer peptite yönelik baglama aktivitesini göstermektedir. Bir GPC3 antijen baglama alanEla sahip bir test polipeptit kompleksinin bir uyusumsal epitopu tanlýlü tanIiad[g]Elasag-ki gibi degerlendiriIebilmektedir. GPC3 eksprese eden hücreler, yukar-ki amaç için hazIEiianmaktadE Bir GPC3 antijen baglama alanIZIiçeren bir test polipeptit kompleksi, bir uyusumsal epitopun temas üzerine GPC3 eksprese eden hücrelere güçlü sekilde baglanmasüancak GPC3'ün hücre dmlanllîilusturan bir amino asit sekansEI içeren, immobilize edilmis bir lineer polipeptite büyük oranda baglanmamasülurumunda, bu uyusumsal epitopun tanlEmasüçin belirlenebilmektedir. Burada "büyük oranda baglanmama" ifadesi, insan GPC3 eksprese eden hücrelere yönelik baglama aktivitesine klýlasla, baglama aktivitesinin %80 veya daha az, genel olarak %50 veya daha az, tercihen %30 veya daha az ve özellikle tercihen %15 veya daha az oldugu anlam. gelmektedir. GPC3 eksprese eden hücrelere yönelik olak bir GPC3 antijen baglama alan. sahip bir test polipeptit kompleksinin baglama aktivitesinin denenmesine yönelik yöntemler, örnegin, Antibodies: A Laboratory Manual (Ed Harlow, David Lane, Cold Spring Harbor Laboratory degerlendirme, antijen olarak GPC3 eksprese eden hücrelerin kullanIigiEELISA veya floresan aktiveli hücre ölçümünün (FACS) ilkelerine dayanarak gerçeklestirilebilmektedir. ELISA formatIia, GPC3 eksprese eden hücrelere yönelik olarak bir GPC3 antijen baglama alanüçeren bir test polipeptit kompleksinin baglama aktivitesi, enzimatik reaksiyon tarafIan üretilen sinyal seviyelerinin karsilâstlîllüiaslýla niceliksel olarak degerlendirilebilmektedir. Spesifik olarak, bir test polipeptit kompleksi, üzerinde GPC3 eksprese eden hücrelerin immobilize ediligi bir ELISA plakas. ilave edilmektedir. ArdIan, hücreye baglanan test polipeptit kompleksi, test polipeptit kompleksini tanülan bir enzim isaretli antikor kullanilârak tespit edilmektedir. Alternatif olarak, FACS kullanllüiaslîldurumunda, bir test polipeptit kompleksinin bir seyrelti serisi haziEIbnmaktadlEl ve GPC3 eksprese eden hücrelere yönelik antikor baglama titresi, GPC3 eksprese eden hücrelere yönelik olarak test polipeptit kompleksinin baglama aktivitesinin karsHâstIEllBwaslîÇIn belirlenebilmektedir. Tampon veya benzeri içerisinde asklýla alin hücrelerin yüzeyinde eksprese edilen bir antijene bir test polipeptit kompleksinin baglanmasübir aklgl sitometresi kullanilârak tespit edilebilmektedir. Bilinen aklgsitometreleri, örnegin asag-ki cihazlarERapsamaktadB FACSCantoTM II FACSAriaT'V' FACSArrayTM FACSArrayTM FACSCaIiburTM (tümü BD Biosciences' ticari markalarIlE) EPICS ALTRA HyPerSort Cytomics FC 500 EPICS XL-MCL ADC EPICS XL ADC Cell Lab Quanta/Cell Lab Quanta SC (tümü Beckman Coulter'in ticari markalarIlE) Bir antijene yönelik olraak bir GPC3 antijen baglama alanIEla sahip bir test polipeptit kompleksinin baglama aktivitesinin denenmesine yönelik tercih edilen yöntemler, örnegin, asag-ki yöntemi kapsamaktadE Ilk olarak, GPC3 eksprese eden hücreler bir test polipeptit kompleksi ile reaksiyona aIlErnaktadlEve ardlrîban, polipeptit kompleksini tanlýlan bir FITC- isaretli ikincil antikor ile bu Iekelenmektedir. Test polipeptit kompleksi, kompleksin arzu edilen bir konsantrasyonda hazlEllanmasEliçin uygun bir tampon ile seyreltilmektedir. Örnegin, kompleks, 10 pg/ml ila 10 ng/ml araligllüldaki bir konsantrasyonda kullanllâbilmektedir. ArdlEUan, floresan yogunlugu ve hücre sayEÇIFACSCaIibur (BD) kullanilarak belirlenmektedir. CELL QUEST Software (BD), yani Geometrik Ortalama deger kullanilârak analiz gerçeklestirilmesi vasßslsîla elde edilen floresan yogunlugu, hücrelere baglanan antikorun miktarIEh/ansünaktadß Yani, test polipeptit kompleks bagII miktartharafIan temsil edilen bir test polipeptit kompleksinin baglama aktivitesi, Geometrik Ortalama degerinin ölçülmesiyle belirlenebilmekedir. Bir GPC3 antijen baglama alan. sahip bir test polipeptit kompleksinin bir baska polipeptit kompleksi ile ortak bir epitopu paylaslîil paylasmadlgiü aynElepitopa yönelik iki kompleks araleUaki yarlgla dayanarak degerlendirilebilmektedir. Polipeptit kompleksleri arasIaki yarlgl çapraz bloklama denemesi veya benzeri ile belirlenebilmektedir. Örnegin, kompetitif ELISA denemesi, tercih edilen bir çapraz bloklama denemesidir. Spesifik olarak, çapraz bloklama denemesinde, bir mikrotitre plakalasiEliEi çukurcuklar- immobilize edilen GPC3 proteini, bir aday kompetitif polipeptit kompleksinin varl[ghda veya yoklugunda önceden inkübe edilmektedir ve ardIan bir test polipeptit kompleksi buraya Ilave edilmektedir. Çukurcuklardaki GPC3 proteininine baglanan test polipeptit kompleksinin miktarü aynDepitopa baglanma için yarlglan bir aday rekabetçi polipeptit kompleksinin baglama yetisi ile dolaylEloIarak iliskilidir. Yani, aynElepitop için rekabetçi polipeptit kompleksinin afinitesi arttiKça, GPC3 proteini ile kaplanmlgçukurcuklara yönelik olarak test polipeptit kompleksinin baglama aktivitesi azalmaktadlü GPC3 proteini vasitâsiýla çukurcuklara baglanan test polipeptit kompleksinin miktarÇi polipeptit kompleksinin önceden isaretlenmesi ile kolayca belirlenebilmektedir. Örnegin, bir biyotin ile isaretlenmis polipeptit kompleksi, bir avidin/peroksidaz konjugatu ve uygun substratI kullanilüiasüla ölçülmektedir. Özellikle, peroksidaz gibi enzim isaretlerini kullanan çarpaz blokalma denemesi, "kompetitif ELISA denemesi" olarak adlandIEilmaktadE Polipeptit kompleksi aynüamanda, tespiti ve ölçümü mümkün kilân diger isaretleme maddeleri ile de isaretlenebilmektedir. Spesifik olarak, radyoaktif isaretler, floresan isaretleri ve benzeri bilinmektedir. Rekabetçi polipeptit kompleksinin yoklugunda gerçeklestirilen bir kontrol deneyindeki baglama aktivitesine kübsla, aday rekabetçi polipeptit kompleksinin, bir GPC3 antijen baglama alanIEilçeren bir test polipeptit kompleksinin baglanmasllln az %20, tercihen en az %20 ila 50 arasIa bIokIamasEldurumunda, test polipeptit kompleksinin, rekabetçi polipeptit kompleksi tarafIdan baglanan epitopa büyük oranda bagland[gil]eya aynülzpitopa baglanmak için yarlSHgiEIbelirlenmektedir. Bir GPC3 antijen baglama alanEiçeren bir test polipeptit kompleksi tarafIan balanan bir epitopun yap-I halihazEla tanIilanmlgi olmasEldurumunda, test ve kontrol polipeptit komplekslerinin ortak bir epitopu paylaslül paylasmamasüamino asit mutasyonlarII epitopu olusturan peptite verilmesi vasitâsüa haziîiianan bir peptite yönelik olarak iki polipeptit kompleksinin baglanmaslîikvititelerinin karsilâstlElIIhaslýia belirlenebilmektedir. Yukarldiaki baglama aktivitelerinin ölçülmesi için, örnegin, bir mutasyoun verildigi bir lineer peptite yönelik olarak test ve kontrol polipeptit komplekslerinin baglanma aktiviteleri, yukarlki ELISA format-a kiýlaslanmaktadiîi ELISA yöntemlerinin dlgiüha, bir kolona baglanan mutant peptite yönelik baglama aktivitesi, test ve kontrol polipeptit komplekslerinin kolon içerisine akllilihaslîlve ardlEUan, elüsyon çözeltisi içerisinde ayrlStlEllân polipeptit kompleksinin nicellestirilmesi vaslûislýla belirlenebilmektedir. Bir mutant peptitinin, örnegin bir GST füzyon peptiti formunda bir kolona adsorbe edilmesine yönelik yöntemler bilinmektedir. Alternatif olarak, tanIilanan epitopun bir uyusumsal epitop olmasEldurumunda, test ve kontrol polipeptit komlekslerinin ortak bir epitopu paylaslöl paylasmadllîlarü asaglki yöntemle belirlenebilmektedir. Ilk olarak, GPC3 eksprese eden hücreler ve epitop içerisine verilen bir mutasyon ile GPC3 eksprese eden hücreler hazEllanmaktadE Test ve kontrol polipeptit kompleksleri, bu hücrelerin PBS gibi uygun bir tampon içerisinde ask. tutulmaslj vasißslýla hazlîllanan bir hücre süspansiyonuna ilave edilmektedir. ArdIan, hücre süspansiyonlarlî.] bir tampon ile uygun sekilde yllZbnmaktadlE ve test ve kontrol polipeptit komplekslerini tanlýlan bir FITC Isaretli antikor buraya ilave edilmektedir. Floresan yogunlugu ve isaretli antikor ila Iekelenen hücre saylgîlFACSCalibur (BD) kullanllflak belirlenmektedir. Test ve kontrol polipeptit kompleksleri, uygun bir tampon kullanllârak uygun sekilde seyreltilmektedir ve arzu edilen konsantrasyonlarda kullanüßîaktadlü Örnegin, bunlar, 10 ug/ml ila 10 ng/ml aralgßdaki bir konsantrasyonda kullanilâbilmektedir. CELL QUEST Software (BD), yani Geometrik Ortalama deger kullanüârak analiz gerçeklestirilmesi vasltâslsîla elde edilen floresan yogunlugu, hücrelere baglanan isaretli antikorun miktarlElü yansltîlnaktadß Yani, isaretli antikor baglanmasEltaraflEhan temsil edilen test ve kontrol polipeptit komplekslerinin baglama aktiviteleri, Geometrik Ortalama degerin ölçülmesiyle belirlenebilmekedir. Yukarlâlaki yöntemde, bir polipeptit kompleksinin "mutant GPC3 eksprese eden hücrelere büyük oranda" baglanlöl baglanmadlgilîbrnegin asaglElhki yöntemle belirlenebilmektedir. Ilk olarak, mutant GPC3 eksprese eden hücrelere baglanan test ve kontrol polipeptit kompleksleri bir isaretli antikor ile Iekelenmektedir. ArdIan, hücrelerin floresan yogunlugu belirlenmektedir. Aklgl sitometresi vaslüslîla FACSCaIibur floresan. tespit edilmesi için kullan.[glIa, belirlenen floresan yogunlugu, CELL QUEST Software kullanüârak analiz edilebilmektedir. Polipeptit kompleksinin varllgiüve yoklugundaki Geometrik Ortalama degerlerden, polipeptit kompleksi tarafIdan baglanmanI bir sonucu olarak floresan yogunlugundaki artlSIEI oranII belirlenmesi için asagüiaki formüle göre karsllâstüina degeri (AGeo-Ort) hesaplanabilmektedir. AGeo-Ort = Geo-Ort (polipeptit kompleksinin varllgiia)/Ge0-Ort (polipeptit kompleksinin yoklugunda) Mutant GPC3 eksprese eden hücrelere baglanan bir test polipeptit kompleksinin miktarIEl yanstân, yukarlEllaki analizle belirlenen Geometrik Ortalama karsllâstülna degeri (AGeo-Ort deger, mutant GPC3 molekülü için), GPC3 eksprese eden hücrelere baglanan test polipeptit kompleksinin miktarIElyansltân AGeo-Ort karsuâstlüna degeri ile karsllâstlElBraktadlü Bu durumda, GPC3 eksprese eden hücreler ve mutant GPC3 eksprese eden hücrelere yönelik AGeo-Ort karsllâstlîrlna degerlerinin belirlenmesi için kullanllân test polipeptit kompleksinin konsantrasyonlarü özellikle tercihen, esit veya büyük oranda esit olacak sekilde ayarlanmaktadlü GPC3'te bir epitopu tanlgEdogrulanmlS olan bir polipeptit kompleksi, bir kontrol polipeptit kompleksi olarak kullanlliiaktadlü Mutant GPC3 eksprese eden hücrelere yönelik bir test polipeptit kompleksinin AGeo-Ort karsllâstülna degerinin, GPC3 eksprese eden hücrelere yönelik test polipeptit kompleksinin AGeo-Ort karsllâstlülna degerinden en az %80, tercihen %50, daha tercihen %30 ve özellikle tercihen %15 oranIa daha az olmasüjurumunda, test polipeptit kompleksi "mutant GPC3 eksprese eden hücrelere büyük oranda baglanmaaktadlE'l. Geo-Ort (Geometrik Ortalama) degerinin belirlenmesine yönelik formül, CELL QUEST Software User's Guide (BD biosciences) referansIa açlKlanmaktadlB Karsllâstlîilnanlül, karsllâstülna degerlerinin büyük oranda esit oldugunu göstermesi durumunda, test ve kontrol polipeptit komplekslerine yönelik epitop da ayri Ehlacak sekilde belirlenebilmektedir. Degisken fragment (Fv) Burada, "degisken fragment (Fv)" terimi, bir çift antikor hafif zincirli degisken bölge (VL) ve antikor agIElzincirli degisken bölgeden (VH) olusan bir antikor türevli antijen baglama alanII minimum birimine isaret etmektedir. 1988'de, Skerra ve Pluckthun, homojen ve aktif antikorlarlEl, bir antikor geninin bir bakteriyel sinyal sekansII akEasag-a eklenmesi ve genin E. 60"' içerisinde indüklenmesi vasßslîla E. co/i periplazma fraksiyonu ile ile hazlEllanan Fv'de, bir antijene baglanacagßekilde VH, VL ile iliskilenmektedir. Burada, Fv tercihen, örnegin asaglöhkileri içeren bir polipeptit kompleksi veya benzeri olan bir çift Fv'ye sahiptir: (1)iki degerlikli bir scFv olan iki degerlikli bir antijen baglama alanüburada iki degerlikli scFv'nIn tek degerlikli bir scFv'si, bir CDB baglama alanIEqusturan agEzincirIik bir Fv fragmenti vasEtâlea bir Fc alanIüolusturan bir polipeptite baglanmaktadlEl ve tek degerlikli diger scFv, bir CD3 baglama alanIEblusturan hafif zincirli bir Fv fragmenti vasitâslîla bir Fc alan ßlusturan diger polipeptite baglanmaktadlîi (2) hiçbir Fcy reseptörü baglama aktivitesine sahip olmayan ve IgGl, IgGZa, 1963, veya (3) tek degerlikli en az bir CD3 baglama alanü burada hafif zincirli ve aglEIzincirIi Fv fragmentleri, CD3 antijenine baglanacaglîlsekilde bir CD3 baglama alanII meydana getirilmesi için birbiriyle iliskilenmektedir. scFv, tek zincirli antikor ve sc(Fv)2 Burada, "scFv", "tek zincirli antikor" ve "sc(Fv)2" terimlerinin tamamÇlsabit bölgeden ziyade, hafif ve agEzincirIerden elde edilen degisken bölgeler içeren bir tek polipeptit zincirinin bir antikor fragmentine isaret etmektedir. Genel oarak, bir tek zincirli antikor ayrlîla, VH ve VL alanlarürasia bir polipeptit baglaylîlgîiçermekte olup, bu, antijen baglanmalelÜnümkün kIIgllîlüsünülen, arzu edilen bir yapi. olusumunu mümkün kllBiaktadlEl Tek zincirli antikor, Pluckthun tarafIan, "The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, Cilt 113, Rosenburg ve zincirli antikor bispesifik ve/veya insansllâstlîlliilglolabilmektedir. scFv, Fv'yi olusturan VH ve VL'nin bir peptit baglayEIîlîiIIaslßslýla birbirine baglantilând-[glîl VL, peptit baglaylEIgEiiarafIan yakIa tutulabilmektedir. sc(Fv)2, iki VL ve iki VH'nin dört degisken bölgesinin bir tek zincirin olusturulmasEilçin peptit baglaylîliâr gibi baglaylîllâr vasißislýla baglantllând-[glübir tek zincirli antikorudur (J antikorlarIan elde edilebilmektedir. Bu tür bir sc(Fv)2, örnegin tercihen, Journal of Içerisinde mevcut olan iki epitopu tanlýhn bir bispesifik sc(Fv)2'yi kapsamaktadlEl sc(Fv)2, teknikte uzman kisiler tarafIan bilinen yöntemlerle üretilebilmektedir. Örnegin, sc(Fv)2, bir peptit baglaylEEIgibi bir baglaylîüvaslßslýla scFv'nin baglantüândmasüvasltâslýla üretilebilmektedir. Burada, bir sc(Fv)2'yi olusturan bir antijen baglama alanII formu, iki VH birimi ve iki VL biriminin, bir tek zincirli polipeptitin N terminusundan baslayarak VH, VL, VH, ve VL ([VH]- baglayEEIlVL]-baglaylEüVH]-baglaylüBjVLD sßsia düzenlendigi bir antikoru kapsamaktadlü Iki VH birimi ve iki VL biriminin slüsEyukar-ki form ile sIlBllZdegildir ve herhangi bir slüda düzenlenebilmektedir. Formun örnek bir süsüsag- Iistelenmektedir. açlElanmaktadlÜ Bu tarifnamelere göre, teknikte uzman kisiler, burada açllZlanan polipeptit komplekslerinin üretilmesi için arzu edilen sc(Fv)2'yi uygun bir sekilde hazlIllayabilmektedir. DahasÇI mevcut bulusun polipeptit kompleksleri, PEG gibi bir tasElEElpolimer veya bir antikanser maddesi gibi bir organik bilesik ile konjugatlanabilmektedir. Alternatif olarak, bir seker zinciri ilave sekansütercihen, seker zincirinin arzu edilen bir etkiyi saglayacaglISekilde polipeptit komplekslerine eklenmektedir. Bir antikorun degisken bölgelerinin baglantüândElliias- yönelik baglaylîllâr, genetik mühendisligi ile üretilebilen yapay peptit baglaylîHârÇbentetik baglaylîllârlîl'e örnegin Protein peptit baglaylEllârElmevcut bulusta tercih edilmektedir. Peptit baglaylEllârII uzunlugu özellikle sIEllandlülßîamaktadlE ve amaca baglElolarak teknikte uzman kisiler tarafIan uygun sekilde seçilebilmektedir. Uzunluk tercihen bes amino asit veya daha fazla (belirli bir lellElhndlEilna olmakslîlü, üst limit genellikle 30 amino asit veya daha azÇltercihen 20 amino asit veya daha aleE) ve özellikle tercihen 15 amino asittir. sc(Fv)2 üç peptit baglaylîlg] içerdiginde, bunlarI uzunlugu aynüleya farklIJJIabilmektedir. Örnegin bu tür peptit baglaylEllârEalsagIkileri kapsamaktadlîi GIy-Ser GIy-Gly-Ser Ser-Gly-Gly GIy-GIy-GIy-Ser (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 5) SerGIyGlyGly (SEKANS KIMLIK NUMARASI:6) GlyGlyGIyGlySer (SEKANS KIMLIK NUMARASI:7) SerGlyGlyGlyGly (SEKANS KIMLIK NUMARASI:8) GlyGlyGIyGlyGIySer (SEKANS KIMLIK NUMARASI:9) SerGlyGlyGlyGlyGly (SEKANS KIMLIK NUMARASI:10) GlyGlyGIyGlyGlyGlySer (SEKANS KIMLIK NUMARASI:11) SerGlyGlyGlyGlyGlyGly (SEKANS KIMLIK NUMARASI:12) (GlyGlyGIyGlySer (SEKANS KIMLIK NUMARASI:7))n (SerGlyGlyGlyGly (SEKANS KIMLIK NUMARASI:8))n burada n, 1 veya daha büyük olan bir tamsayIlü Peptit baglaylElârII uzunlugu veya sekanslarlTJ amaca baglEIoIarak teknikte uzman kisiler taraflEtlan uygun bir sekilde seçilebilmektedir. Sentetik baglayElIâr (kimyasal çapraz baglama maddeleri) peptitlerin ve örnegin asaglElhkilerin çapraz baglanmaslîtin rutin sekilde kullanilBIaktadB N-hidroksi süksinimid (NHS), disüksinimidil süberat (DSS), bis(sülfosüksinimidil) süberat (853), ditiyobis(süksinimidil propiyonat) (DSP), ditiyobis(sülfosüksinimidil propiyonat) (DTSSP), etilen glikol bis(süksinimidil süksinat) (EGS), etilen glikol bis(sülfosüksinimidil süksinat) (sülfo-EGS), disüksinimidil tartrat (DST), disülfosüksinimidil tartrat (sülfo-DST), bis[2-(süksinimidoksikarbonil0ksi)etil] sülfon (BSOCOES), ve bis[2-(sülfosüksinimidoksikarboniloksi)etiI] sülfon (sülfo-BSOCOES). Bu çapraz baglama maddeleri piyasada mevcuttur. Genel olarak, bu baglaylîllârlöl, dört antikor degisken bölgesini birbirine baglamasEl gerekmektedir. Kullan Hâcak olan baglayiîllâr, ayn Eilürde veya farkIEüürde olabilmektedir. olusmaktadlB Fab molekülünün aglEIzinciri, bir baska aglüzincirli molekül ile disülfür baglarEl olusturamamaktadE proteaz ile islenmesi vasltâslýla üretilmektedir ve iki H zincirinden her birindeki reze bölgeleri arasIa mevcut olan disülfür baglarII yakIIa bir immünoglobulinin (monoklonal antikor) sindirilmesi vasltâsüa meydana getirilen bir antikora isaret etmektedir. Örnegin, iki homoloh antikor fragmentinin meydana getirilmesi için papain, ki H zincirinden her birinin reze bölgeleri aras'a mevcut olan disülfür baglarII akIîsZl yukar-a IgG'yi bölmektedir, burada VL (L zinciri degisken bölgesi) ve CL ( L zinciri sabit bölgesi ) içeren bir L zinciri, bunlarIC terminal bölgelerindeki bir disülfür bagülasßslüa, VH (H zinciri degisken bölgesi) ve CHyl (bir H zinciri sabit bölgesindeki y1 bölgesi) içeren bir H zinciri fragmentine baglantllândlîllmaktadlîl Bu iki homolog antikor fragmentinden her biri Fab' olarak adlandülîhaktadE alanlarlEllEl bir klîinIan olusmaktadlü böylelikle disülfür baglarüiki aglEl zincir arasIa olusturulmaktadlü Burada açilZlanan bir polipeptit kompleksini olusturan F(ab')2, tercihen asagübki sekilde üretilebilmektedir. Arzu edilen antijen baglama alanIEiçeren bir bütün monoklonal antikor veya benzeri, pepsin gibi bir proteaz ile klg'nen sindirilmektedir; ve Fc fragmentleri, bir Protein A kolonuna adsorbe edilmesi vasitâslýla giderilmektedir. pH gibi uygun bir kurulum enzim reaksiyonu aItIda F(ab')2'nin Üretilmesi için seçici bir sekilde bütün antikoru bölebildigi sürece, proteaz özellikle sIlEllandEIIBiamaktadE Bu tür proteazlar, örnegin pepsin ve fisini kapsamaktadIEl Fc alanEl Burada açllZlanan bir polipeptit kompleksini olusturan bir Fc alanEtercihen asag-ki sekilde üretilebilmektedir. Bir monoklonal antikor gibi bir antikor, pepsin gibi bir proteaz ile klginen sindirilmektedir. Arcl Idan, elde edilen fragment bir Protein A veya Protein G kolonu üzerine absorbe edilmektedir ve uygun bir elüsyon tamponu ile ayrigtlElliBiaktadlE pH gibi uygun bir kurulum enzim reaksiyonu aItIEUa monoklonal antikorlar gibi antikorlarEböIebildigi sürece, proteaz özellikle sIlEiIand iEiiIhamaktadlEi Bu tür proteazlar, örnegin pepsin ve fisini kapsamaktadß Burada açlk`lanan polipeptit kompleksleri, IgG1, IgG2, IgG3, veya IgG4'ün Fc alanIEl olusturan amino asitler içeren, indirgenmis Fcy reseptörü baglama aktivitesine sahip bir Fc alan üçerebilmektedir. Antikor izotipi, sabit bölgenin yap_ göre belirlenmektedir. IgG1, IgG2, IgG3, ve IgG4 izotiplerinin sabit bölgeleri, süslýla Cvl, Cy2, Cy3, ve Cv4 olarak adlandiEilBwaktadlü Insan Cyl, Cy2, Cy3, ve Cy4'ü olusturan Fc alanEboIipeptitlerinin amino asit sekanslarlÇislBisEIa SEKANS KIMLIK NUMARASI: 23, 24, 25 ve 26'da örneklendirilmektedir. Her bir amino asit sekansIiZqusturan amino asit kaliEtHârEhrasIdaki iliski ve Kabat'I EU numaralandlElnasEl (burada ayriîb EU INDEKSI olarak adlandiîllmaktadlî) Sekil 18'de gösterilmektedir. Fc alanü bir CH1 alanIü/e CH1 ve CH2 alanlarIlEla arasiîidaki bir bölgeyi Içeren sabit bölgenin bir klgmIEiçeren iki hafif zincir ve iki agiElzincir içeren, F(ab')2 dlSiEtlaki bölgeye isaret etmektedir, böylelikle disülfür baglarüiki agIEizincir arasIa olusturulmaktadB Burada açüîlanan bir polipeptit kompleksini olusturan Fc alanEi tercihen asaglöiaki sekilde üretilebilmektedir. Bir monoklonal IgG1, IgG2, IgG3, veya IgG4 antikoru veya benzeri, pepsin gibi bir proteaz ile kEinen sindirilmektedir, ardIan bir Protein A kolonu üzerinde adsorbe edilen fraksyon ayrlgtlîimiaktadlü pH gibi uygun bir kurulum enzim reaksiyonu alt-a F(ab')2'nin üretilmesi için seçici bir sekilde bütün antikoru bölebildigi sürece, proteaz özellikle sIiEiiandiEllüiamaktadB Bu tür proteazlar, örnegin pepsin ve fisini kapsamaktadiEi Fcy reseptörü Fcy reseptörü, monoklonal IgG1, IgG2, IgG3, veya IgG4 antikorlarII Fc alanlEia baglanabilen bir reseptöre isaret etmektedir ve büyük oranda bir Fcy reseptör geni taraf-an kodlanan protein ailesine ait tüm üyeleri kapsamaktadiB Insanda, aile FcyRIa, FcyRIb ve FcyRIc izoformlarIZIdahil FcyRI (CD64); FcyRIIa (allotip H131 ve R131 dahil), FcyRIIb (FcyRIIb-l ve FcyRIIb-2 dahil), ve FcyRIIc izoformlarlîiahil FcyRII (CD32); FcyRIIIa (allotip V izoformlarEl dahil FcyRIII (CD16); ve ayrlîa tanIilanmamEl tüm insan FcyR'ler, FcvR izoformlarlZlve bunlarI allotiplerini kapsamaktadlû Ancak, Fcy reseptörü bu örnekler ile sIIEIlEldegildir. Bunlarla sIlEllandlBanakslZlE, FcyR, insanlar, fareler, slglanlar, tavsanlar ve maymunlardan elde edilenleri kapsamaktadm FcvR, herhangi bir organizmadan elde edilebilmektedir. Fare FcyR'si, bunlarla sIlEllandlElilBiakslîlîil, FcyRI (CD64), FcyRII (CD32), FcyRIII (CD16), ve FcyRIII-Z'nin (CD16-2) yanElsÜ, tanIilanmamlgl tüm fare FcyR'leri, FcyR izoformlarIZIve bunlarI allotiplerini kapsamaktadLEl Tercih edilen bu tür Fcy reseptörleri, örnegin, insan FcyI kapsamaktadiîl FcvI'nI polinükleotit sekansüie amino asit sekansßüislýia SEKANS KIMLIK polinükleotit sekansElve amino asit sekansüslüslýla SEKANS KIMLIK NUMARASI:15 (BC gösterilmektedir; FcvIIB'nin polinükleotit sekansIZl/e (AAI46679.1) gösterilmektedir; FcvIIIA'nI polinükleotit sekanslîlve amino asit sekanslII sßslýla SEKANS KIMLIK NUMARASI:19 (BC gösterilmektedir; FcyIIIB'nin polinükleotit sekansEl/e amino asit sekansElleislîla SEKANS numarasEher parantez içinde gösterilmektedir). Bir Fcv reseptörünün, bir monoklonal IgGl, taramaslîlYükseltilmis ParlakI[El Proksimitesi Homojen Denemesi), yüzey plazmon rezonansEl (SPR) temelli BIACORE yöntemi ve digerlerinin (Proc. Natl. Acad. Sci. USA (2006) 103(11), 4005-4010) yanlII SÜ yukarlêlh açlKIanan FACS ve ELISA formatlarEI vasltßisûla degerlendirilebilmektedir. Bu zaman zarflEUa, "Fc ligandlîiveya "efektör IigandIZ] bir antikor Fc alan. baglanarak bir Fc/Fc Iigand kompleksini olusturan bir moleküle ve tercihen bir polipeptite isaret etmektedir. Molekül herhangi bir organizmadan elde edilebilmektedir. Fc ligandIlEl Fc'ye baglanmasü tercihen bir veya daha fazla efektör islevine sahiptir. Bu tür Fc Iigandlarü bunlarla lellEllEl olmamak üzere, Fc reseptörleri, FcvR, FcoR, FcsR, FcRn, cm ve C3, mannan baglama lektini, mannoz reseptörü, Staphy/ococcus Protein A, Staphy/ococcus Protein G, ve viral FcyR'leri kapsamaktadlB Fc ligandlarüayrü, FcyR'ye estürel olan Fc reseptörlerinin bir ailesi olan Fc reseptörü homologlarIEaFcRH) (Davis ve meslektaslarü(2002) Immunological Reviews 190, 123-136) kapsamaktadlE Fc Iigandlarüyrlîla, Fc'ye baglanan, tanlanmamlg molekülleri de kapsamaktadlEi Fcy reseptörü baglama aktivitesi Fc alanII Fcy reseptörleri FcyI, FcyIIA, FcyIIB, FcyIIIA, ve/veya FcyIIIB'den herhangi birine yönelik bozuk baglanmaslZIyukarI açlElanan FACS ve ELISA formatlarII yanlîsüi, ALPHA taramasEQYükseItiImis ParlaklllaProksimitesi Homojen Denemesi) ve yüzey plazmon rezonansEl vaslliislsîle degerlendirilebilmektedir. ALPHA taramasÇl asaglâla açllZlanan ilkeye dayaIEl olarak ALPHA teknolojisi ile gerçeklestirilmekte olup, iki tür boncuk kullanüBiaktadlB donör ve allEElboncuklarlZlBir parlak sinyal, yalnlîta, donör boncuklarüile baglantllândlEllân moleküllerin, allEDboncuklarElile baglantllândlîllân molekülleri ile biyolojik olarak etkilesime girmesi ve iki boncugun yakI sekilde konumlanmasülurumunda tespit edilmektedir. Lazer ElElEllarafIan kesilmis olan, bir donör boncugndaki fotosensitizör, boncugun öevresindeki oksijeni kesilmis tekli oksijene dönüstürmektedir. Tekli oksijen donör boncugu çevresinde yayIIglIa ve yakIa konumlandlEllân allEElboncuklar- eristiginde, aIlEElboncuklarEliçerisindeki bir kimyasal parlakllla reaksiyonu indüklenmektedir. Bu reaksiyon, nihai olarak, lglKl yayll]]îlil3ile sonuçlanmaktadE Donör boncuklarljle baglantllândlîllân moleküllerin, aIIEIZboncuklarEiIe baglantllândlîllân moleküller ile etkilesime girmemesi durumunda, donör boncuklarlZl tarafIan üretilen tekli oksijen, allîüboncuklarl erismemektedir ve kimyasal parlakllE] reaksiyonu ise meydana gelmemektedir. Örnegin, bir biyotin ile isaretlenmis polipeptit kompleksi donör boncuklar. immobilize edilmektedir ve glutatiyonin S-transferazEl(GST) etiketli Fcy reseptörü allEElboncuklar- immobilize edilmektedir. Bir rekabetçi mutant Fc alanIElçeren bir polipeptit kompleksinin yoklugunda, Fcy reseptçrü, bir yaban tipi Fc alanlîçeren bir polipeptit kompleksi ile etkilesime girerek, sonuç olarak 520 ila 620 nm'Iik bir sinyali indüklemektedir. Etiketlenmemis bir mutant Fc alan. sahip polipeptit kompleksi, Fcy reseptörü ile etkilesim için bir yaban tipi Fc alanEiçeren polipeptit kompleksi ile yarglnaktadß Ilgili baglama afinitesi, yarlglEl sonucu olarak floresandaki azalmanI nicellestirilmesi ile belirlenebilmektedir. Antikorlar gibi polipeptit komplekslerinin, Sülfo-NHS-biyotin veya benzeri kullanilarak biyotinlenmesine yönelik yöntemler bilinmektedir. GST etiketinin bir Fcy reseptörüne eklenmesine yönelik uygun yöntemler, Fcy ve GST içeren polipeptitlerin çerçeve Içi füzyonlanmasüfüzyonlanan genin, geni taslýbn bir vektörün verildigi hücrelerin kullanlßîaslsîla eksprese edilmesi ve ard-an bir gluratiyonin kolonunun kullanllBiaslýla saflastlEllEiasIEl kapsamaktadlEI Indüklenen sinyal, tercihen örnegin, GRAPHPAD PRISM (GraphPad; San Diego) gibi bir yazil].iîii kullanilmk lineer olmayan regresyon analizine dayanarak, tek tarafli bir rekabet modeline yerlestirilmesi vasßslîda analiz edilebilmektedir. BunlarI etkilesiminin gözlemlenmesine yönelik maddelerden biri, bir Iigand olarak bir sensör çipinin altlEl ince tabakasEIjzerine immobilize edilmektedir. Toplam yansIianlEl, altlEI ince tabaka ve cam araleldaki arayüzde meydana gelmesi için lglEl sensör çipinin arka yüzeyi üzerine verildiginde, yansifllân Sigil yogunlugu, belirli bir yerde kismen indirgenmektedir (SPR sinyali). Bunlar. etkilesiminin gözlemlenmesine yönelik diger madde, sensör çipinin yüzeyi üzerine bir analit olarak enjekte edilmektedir. Immobilize edilmis molekülün kütlesi, analit Iiganda baglandlglIa artmaktadlEl Bu, sensör çipinin yüzeyi üzerinde, çözücünün k-Ii indeksini degistirmektedir. K-n indeksindeki bu degisim, SPR sinyalinin bir pozisyonel kaymaleia sebep olmaktadlEl (tam tersi sekilde, ayrlglna, sinyali orijinal pozisyonuna dogru tekrar kaydiElnaktadlE). Biacore sisteminde, yukarlöh açllZlanan kaymanI miktarE(yani, sensör çipi yüzeyindeki kütle degisimi), dik eksende çizilmistir ve dolaylglýla zamanla kütledeki degisim, ölçülen veri (gösterilmemistir) olarak gösterilmektedir. Kinetik parametreler (birlesme 0rani3abiti (ka) ve ayrigma oranlîsabiti (kd)), sensörgram egrisinden belirlenmektdir ve afinite (KD), bu iki sabit araleUaki orandan belirlenmektedir. Inhibisyon denemesi tercihen BIACORE yöntemlerinde kullanüBmktadlEl Bu tür inhibisyon denemelerinin Burada, "Fcy reseptörü baglama aktivitesi indirgenmektedir" ifadesi, örnegin, yukariElh açiKlanan analiz yöntemine dayanarak, bir test polipeptit kompleksinin kompetitif aktivitesiin, bir kontrol polipeptit kompleksinin kompetitif aktivitesine klýlasla, %50 veya daha az, tercihen daha az veya %15 veya daha az ve özellikle tercihen %10 veya daha az, %9 veya daha az, Bir monoklonal IgGl, IgG2, IgG3, veya IgG4 antikorunun Fc alanIEIiçeren polipeptit kompleksleri, kontrol polipeptit kompleksleri olarak uygun sekilde kullanliâbilmektedir. Fc alanEyapHârESEKANS KIMLIK NUMARASI:23 (A, RefSeq erisim numarasÜâAC82527.1 olan N terminusa eklenmektedir), 24, (A, RefSeq erisim numarasElAABS9393.1 olan N terminusa eklenmektedir, 25 (A, RefSeq erisim numaraslIAA27268.1 olan N terminusa eklenmektedir) ve 26'da (A, RefSeq erisim numarasElAABS9394.1 olan N terminusa eklenmektedir) gösterilmektedir. Dahasübelirli bir izotipin bir antikoruna ait bir Fc alanlîilnutantlülçeren bir polipeptit kompleksi bir test maddesi olarak kullanllfnaktadlü Fcy reseptörü baglama aktivitesi üzerindeki mutantlE] mutasyon etkisi, aynElzotipin Fc alanIElçeren bir polipeptit kompleksinin bir kontrol olarak kullanüÜiaslýla degerlendirilmektedir. Yukari açlEIandiglEl üzere, Fcy reseptörü baglama aktivitesinin azaldiglEtlüsünülen bir Fc alanEmutantEiçeren polipeptit kompleksleir uygun sekilde hazlHbnmaktadlB amino asitlerinin bir kopmasi. sahip mutantlar. yanElsü, mutantlar C226S, C229S, 1192) da kapsamaktadlEl Spesifik olarak, tercih edilen polipeptit kompleksleri, belirli bir izotipin bir antikoruna ait Fc PC alanIEliçerenIeri kapsamaktadlEl Fc alanII kökeni olan antikor izotipi özellikle sIlEliandlEilBîamaktadlîlve bir monoklonal IgGl, IgG2, IgG3, veya IgG4 antikorundan elde edilen uygun bir Fc alanII kullanllBiasElnümkündür. IgGl antikorlarldan elde edilen Fc alanlarlEllEl kullanilBwasEllercih edilmektedir. Tercih edilen polipeptit kompleksleri, örnegin, asagi gösterilen ikamelerden herhangi birine sahip bir Fc alanlüiçeren, IgGl antikorunun Fc alanIElolusturan amino asitlerde, pozisyonlarIlEl, EU numaralandüinas- (her bir numara, EU numaralandülnasliîüaki bir amino asit kallEt-I pozisyonunu temsil etmektedir; ve numaradan önceki tek harfli amino asit sembolü, ikameden önceki amino asit kaIlEt-Eltemsil etmektedir, aynlZlzamanda numaradan sonraki tek harfli amino asit sembolü ikameden önceki amino asit kallEt-EI temsil etmektedir) göre belirlendigi kompleksleri kapsamaktadlîi (c) C2268, C2295; veya aynüamanda, pozisyonlar 231 ila 238'deki amino asit sekansII bir kopmasi sahip bir Fc alani sahip olanlar. DahasÇitercih edilen polipeptit kompleksleri, ayrlîla, asagi gösterilen ikamelerden herhangi birine sahip bir Fc alanIEiçeren, IgG2 antikorunun Fc alanIEblusturan amino asitlerde, pozisyonlarIlEI, EU numaralandlîilnasi göre belirlendigi kompleksleri kapsamaktadlîi (h) V234A ve G237A; (i) A235E ve G237A; veya (j) V234A, A235E, ve G237A. Her bir numara, EU numaralandlElnasIdaki bir amino asit kalEt-I pozisyonunu temsil etmektedir; ve numaradan önceki tek harfli amino asit sembolü, ikameden önceki amino asit kaIlEt-Eltemsil etmektedir, aynüzamanda numaradan sonraki tek harfli amino asit sembolü ikameden önceki amino asit kaIlEt-El temsil etmektedir. DahasÇitercih edilen polipeptit kompleksleri, ayrlîia, asagi gösterilen ikamelerden herhangi birine sahip bir Fc alanIEiçeren, IgG3 antikorunun Fc alanIlZblusturan amino asitlerde, pozisyonlarlül, EU numaralandlünasi göre belirlendigi kompleksleri kapsamaktadlîi (l) 0265A; veya (m) V264A. Her bir numara, EU numaralandlîiinaleUaki bir amino asit kaIIEt-I pozisyonunu temsil etmektedir; ve numaradan önceki tek harfli amino asit sembolü, ikameden önceki amino asit kaIlEtlglüEltemsil etmektedir, aynlZlzamanda numaradan sonraki tek harfli amino asit sembolü ikameden önceki amino asit kaIlEt-Eltemsil etmektedir. DahasÇltercih edilen polipeptit kompleksleri, ayrlEla, asagi gösterilen ikamelerden herhangi birine sahip bir Fc alanIElçeren, IgG4 antikorunun Fc alanIEblusturan amino asitlerde, pozisyonlarIEl, EU numaralandlünasi göre belirlendigi kompleksleri kapsamaktadB (n) L235A, G237A, ve E318A; (0) L235E; veya (p) F234A ve L235A. Her bir numara, EU numaralandlElnasIaki bir amino asit kallEt-lEl pozisyonunu temsil etmektedir; ve numaradan önceki tek harfli amino asit sembolü, ikameden önceki amino asit kallEt-Eltemsil etmektedir, aynüzamanda numaradan sonraki tek harfli amino asit sembolü ikameden önceki amino asit kalüt-El temsil etmektedir. Tercih edilen diger polipeptit kompleksleri, örnegin, bir IgGl antikorunun Fc alanlüblusturan numaralandlElnasDIl herhangi bir amino asitin, ilgili IgG2 veya IgG4'te bulunan, EU numaralandlElnasIaki ilgili pozisyonun bir amino asiti ile ikame edildigi bir Fc alanID içerenleri kapsamaktadß Tercih edilen polipeptit kompleksleri, ayrlEla, örnegin, bir IgGl antikorunun Fc alanIü olusturan amino asitlerde pozisyon 234, 235, ve 297'deki (EU numaralandlElnasEIl bir veya daha fazla amino asitlerden herhangi birinin, diger amino asitler ile ikame edildigi bir Fc alanIEl içerenleri kapsamaktadlü Ikameden sonraki amino asit türü özellikle sIIEIlandElIBiamaktadB ancak, pozisyonlar 234, 235 ve 297'deki bir veya birden fazla ehrhangi bir amino asitin alanin ile ikame edildigi bir Fc alanlülçeren polipeptit kompleksleri Tercih edilen polipeptit kompleksleri, ayrlEb, örnegin, bir IgGl antikorunun Fc alanIEI olusturan amino asitlerde pozisyon 265'teki (EU numaralandiElnaSDJ bir amino asitin, bir baska amino asit ile ikame edildigi bir Fc alanIEilçerenleri kapsamaktadlEi Ikameden sonraki amino asit türü özellikle sIlEIlandElüîamaktadIEj ancak, pozisyonlar 265'teki bir amino asitin alanin ile ikame edildigi bir Fc alanIEIiçeren polipeptit kompleksleri özellikle tercih edilmektedir. Bispesifik antikordan elde edilen Fc alanEI Burada, bispesifik antikordan elde edilen uygun Fc alanlarÇlayrlEia, indirgenmis Fcy reseptörü baglama aktivitesine sahip olan bir PC alanljblarak kullanllBiaktadlEI Bir bispesifik antikor, iki farklßpesifiteye sahip bir antikordur. IgG türü bispesifik antikor, iki tür IgG antikoru üreten hibridomun füzyonlanmasElile üretilen hibrit hibridomdan (kuadrom) salgllânabilmektedir Alternatif olarak, IgG türü bispesifik antikor, ilgili IgG'nin iki türünü olusturan L zinciri ve H zinciri genleri olan toplamda dört genin, hücrelerin içerisinde verilmesi ve bunlar. birlikte eksprese edilmesi vasißslýla da salgiiânabilmektedir. Ancak, teoride, bu tür yöntemleri ile Üretilen on adet IgG H zinciri ve L zinciri kombinasyonu mevcuttur. On tür IgG'den H zinciri ve L zincirinin arzu edilen bir kombinasyonundan olusan IgG'nin aaflastlElIIhasElzordur. Ilaveten, teoride, arzu edilen bir kombinasyona sahip, salgUânmlSIgG'nin miktarlîdja önemli derecede azaltiiB1akta olup, bu, genis çaplEkültür gerektirmektedir. Bu üretim maaliyetini daha da artlElnaktadE Bu durumda, H zincirlerinin bir heterolog kombinasyonuna sahip IgG'nin tercih edildigi üzere salgilânmasülçin, uygun bir amino asit ikamesi, bir H zinciri Fc alanIlJJIusturan CH3 alan. verilebilmektedir. Spesifik olarak, bu yöntem, H zincirlerinden birinin CH3 alanIaki amino asite yönelik olarak daha büyük bir yan zincire (nob ("ç-üanlamlEUa» sahip bir amino asitin ikame edilmesi ve diger H zincirinin CH3 alanlEUaki bir amino asite yönelik olan daha küçük bir yan zincire (delik "bosluk" anlamIa)) sahip bir amino asitin ikame edilmesi, bötlelikle nobun delik içerisinde konumlandlEIlIhasElvaslüslýla gerçeklestirilmektedir. Bu, heteromerik H zincirini baslatmaktadlîl ve aynElzamanda homomerik H zinciri olusumunu 681). Diger yandan, L zincirine göre, L zinciri degisken bölgesi, H zinciri degisken bölgesinden daha az polimorfiktir, dolayElýla her iki H zincirine de baglanma yetisini saglayan ortak bir L zincirinin elde edilmesi beklenmektedir. Bir bispesifik IgG'nin etkili ekspresyonu, bu tür bir ortak L zincirinin ve iki H zincirinin genlerinin, IgG'nin eksprese edilmesi için hücrelere bu fikrin gerçeklestirilmesi zordur, zira aynil zincirini içeren iki antikor türünün, rastlantgl sekilde seçilmesi olasUJgJEdüsüktür. DolayEîLIa, farkllîblan herhangi bir H zincirine güçlü bir baglanma yetisi gösteren bir ortak L zincirinin seçilmesine yönelik bir yöntem öne DahasÇI ayrlEla, polipeptit birlesmesinin veya polipeptitin olusturdugu heterometik multimerlerin, bir Fc alanIElolusturan iki polipeptit arasIaki birlesime birlestirilmesinin kontrol edilmesine yönelik yöntemleri uygulanmasüla bir bispesifik antikorun üretilmesine yönelik bilinen teknikler mevcuttur. Spesifik olarak, polipeptit birlesmesinin kontrol edilmesine yönelik yöntemler, bir bispesifik antikorun üretilmesinde kullanllâbilmektedir, burada Fc alanlüilusturan iki polipeptit araleUaki arayüzü olusturan amino asitler, aynlîtekansa sahip Fc alanlarEiarasIaki birlesmenin inhibe edilmesi ve farklElsekanslara sahip iki Fc alanEl taraflEidan olusturulan polipeptit komplekslerinin olusumunun mümkün kllih'inasüiçin degistirilmektedir. Bir bispesifik antikordan elde edilen bir Fc alanlüilusturan, yukari açllZlanan iki polipeptit, mevcut bulusun bir Fc alanIEkapsayan bir alan olarak uygun sekilde kullaniiâbilmektedir. Daha spesifik olarak, bir Fc alanIlIblusturan, tercih edilen bu iki polipeptit, bir polipeptitin amino asit sekansIaki pozisyonlar 349 ve 366'da (EU numaralandlElnaslB bulunan amino asitlerin süslýla sistein ve triptofan oldugu ve diger polipeptitin amino asit sekansIaki süislsîla sistein, serin, alanin ve valin oldugu polipeptitleri kapsamaktadB Bir baska yapllândlîilnada, mevcut bulusun bir Fc alanIEevreleyen, tercih edilen alanlar, bir PC alanIEiolusturan iki polipeptiti kapsamaktadlü burada bir polipeptitin amino asit sekanleUaki pozisyon 409'da (EU numaralandiûinasDîl bulunan amino asit aspartik asittir ve diger polipeptitin amino asit sekansIaki poziston 399'da (EU numaralandlîilnasm bulunan amino asit ise lisindir. Yukarlki yapiiândünada, pozisyon 409'da bulunan amino asit, aspartik asit yerine glutamik asit olabilmekteyken, pozisyon 399'da bulunan amino asit ise lisin yerine arjinin olabilmektedir. Dahasüpozisyon 360 veya 392'deki aspartik asit, ayrlEla, pozisyon 399'daki lisin ile terichen kombine edilebilmektedir. Bir baska yapllândlünada, mevcut bulusun bir Fc alanIEevreleyen, tercih edilen alanlar, bir PC alanIEiolusturan iki polipeptiti kapsamaktadlEl burada bir polipeptitin amino asit sekansIaki pozisyon 370'de (EU numaralandünasbjbulunan amino asit glutamik asittir ve diger polipeptitin amino asit sekansiaki poziston 357'de (EU numaralandlElnasDIl bulunan amino asit ise lisindir. Bir diger yapllândlElnada, mevcut bulusun bir Fc alanIEevreleyen, tercih edilen alanlar, bir PC alanIDolusturan iki polipeptiti kapsamaktadB burada bir polipeptitin amino asit sekanleUaki pozisyon 439'da (EU numaralandünasbîlbulunan amino asit glutamik asittir ve diger polipeptitin amino asit sekansIaki poziston 356'da (EU numaralandlElnasEl bulunan amino asit ise lisindir. Ilaveten, mevcut bulusun bir PC alanIElçevreleyen, tercih edilen alanlar, buradaki bir kombinasyona sahip yapilândlElnalarleapsamaktadlB bir Fc alanIEblusturan iki polipeptit, burada bir polipeptitin amino asit sekansIaki pozisyonlar 409 ve 370'de (EU numaralandlElnasDJbulunan amino asitler süsMa aspartik asit ve glutamik asittir ve diger polipeptitin amino asit sekansIaki pozisyonlar 399 ve 357'de (EU numaralandlElnasD] bulunan amino asitlerin her ikisi de Iisindir (bu yapllândlîilnada, pozisyon 370'deki glutamik asit aspartik asit ile degistirilebilmektedir ve pozisyon 370'deki glutamik asit, pozisyon 392'deki aspartik asit ile degistirilebilmektedir); bir Fc alanIEblusturan iki polipeptit, burada bir polipeptitin amino asit sekansIaki pozisyonlar 409 ve 439'da (EU numaralandlîilnasDîlbulunan amino asitler süslîla aspartik asit ve glutamik asittir ve diger polipeptitin amino asit sekansiaki pozisyonlar 399 ve 356'da (EU numaralandßnasm bulunan amino asitlerin her Ikisi de Iisindir (bu aspartik asit ile degistirilebilmektedir); bir Fc alanIlZblusturan iki polipeptit, burada bir polipeptitin amino asit sekanleUaki pozisyonlar 370 ve 439'da (EU numaralandlElnaslIl bulunan amino asitlerin her ikisi de glutamik asittir ve diger polipeptitin amino asit sekansIaki pozisyonlar 357 ve 356'da (EU numaralandlünasD] bulunan amino asitlerin her ikisi de Iisindir; ve bir Fc alanIIZblusturan iki polipeptit, burada bir polipeptitin amino asit sekanslrîhaki pozisyonlar 409, 370, ve 439'da (EU numaralandlEnasDîl bulunan amino asitler süsMa aspartik asit, glutamik asit ve glutamik asittir ve diger polipeptitin amino asit sekansIaki pozisyonlar 399, 357, ve 356'da (EU numaralandlîilnastîlbulunan amino asitlerin her ikisi de Iisindir (bu yapllândünada, pozisyon 370'deki amino asit glutamik asit ile degistirilebilmektedir; alternatif olarak, pozisyon 370'teki amino asitin glutamik asit ile ikame edilmesi yerinde, 439'daki glutamik asit aspartik asit ile degistirilebilmektedir veya pozisyon 439'daki glutamik asit, pozisyon 392'deki aspartik asit ile degistirilebilmektedir). Bir diger yapllândlElnada, mevcut bulusun bir PC alanIEevreleyen, tercih edilen alanlar, bir Fc alanIlIlolusturan iki polipeptiti kapsamaktadlîl burada bir polipeptitin amino asit sekansldaki pozisyon 356'da (EU numaralandlîiinaslll bulunan amino asit Iisindir ve diger polipeptitin amino asit sekanslüdaki pozisyonlar 435 ve 439'da (EU numaralandülnasDZl bulunan amino asitler slßslýla arjinin ve glutamik asittir. Bir bispesifik antikordan elde edilen bir Fc alanIElusturan, yukari açiEIanan iki polipeptit, mevcut bulusun bir PC alanIEiçevreleyen bir alan olarak kullanI[g]lElda, mevcut bulusun antijen baglama alanlariZlve/veya CD3 baglama alanlarElarzu edilen bir kombinasyonda düzenlenmektedir` Indirgenmis C terminali heterojenligine sahip Fc alanlZl Burada, yukar- açlKlanan özelliklere ilaveten, artElÜilglFc alanEC terminal heterojenligine sahip Fc alanlarüindirgenmis Fcy reseptörü baglama aktivitesine sahip Fc alanlarEblarak kullanllIhaktadB Daha spesifik olarak, mevcut bulus, IgG 1, IgG2, IgG3, veya IgG4'den elde edilen bir Fc alanIÜqusturan iki polipeptitin amino asit sekanslarIaki, slûslýla, pozisyonlar 446 ve 447'de (EU numaralandlElnaslIl bulunan glisin ve lisinin koparI[g]l:lFc alanlarEl saglamaktadlü T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanlari] Burada "T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanIZ] bir T hücresi reseptörü kompleksinin tamamlEla veya bir klglnlüla spesifik olarak baglanan veya bunun tamamlaylEEIßlan bir bölge içeren, bir T hücresi reseptörü kompleksi antikorunun bir kismi isaret etmektedir. Bu tür bir T hücresi reseptörü kompleksi, T hücresi reseptörünün kendisi olabilmektedir veya T hücresi reseptörü ile birlikte T hücresi reseptörü kompleksini olusturan bir adaptör molekül olabilmektedir. Tercih edilen bir adaptör CD3'tür. T hücresi reseptörü baglama alanEl Burada "T hücresi reseptörü baglama alanE] bir T hücresi reseptörünün tamamlEla veya bir klim- spesifik olarak baglanan veya bunun tamamlaylEEEblan bir bölge içeren, bir T hücresi reseptörü antikorunun bir klîtn. isaret etmektedir. Bir T hücresi reseptörünün degisken bölgesinin veya sabit bölgesinin kullanllfhasü mümkündür. Ancak, bir CD3 baglama alanII baglandIglEltercih edilen epitoplar, sabit bölgede bulunanlardiü Sabit bölge sekanslariZlörnegin, T hücresi reseptörü d zinciri (RefSeq erisim numaraslIAA, T hücresi reseptörü ß zinciri (RefSeq erisim numarasEC, T hücresi reseptörü y1 zinciri (RefSeq erisim numarasElA, T hücresi reseptörü y2 zinciri (RefSeq erisim numarasÜAAB, ve T hücresi reseptörü ö zinciri (RefSeq erisim numarasElAAA61033.1; SEKANS KIMLIK NUMARASI: 71) olanlarükapsamaktadlü CD3 baglama alanü Burada "CD3 baglama alanlZJ bir CD3'ün tamam. veya bir kisin- sapesifik olarak baglanan veya bunun tamamlaylEEEblan bir bölge içeren, bir CD3 antikorunun bir klîin. isaret etmektedir. Bir CD3 baglama alanl,`_lbir veya daha fazla antikor degisken alanIan elde edilebilmektedir. Tercihen, CD3 baglama alanühem CD3 hafif zincirli degisken bölgesini (VL) hem de CD3 aglElzincirli degisken bölgesini (VH) içermektedir. Tercih edilen bu tür CD3 baglama baglama alanlarÇiörnegin "tek zincirli Fv (scFv)", "tek zincirli antikor" "Fv", "tek zincirli Fv2 (scFv2)", "Fab" ve "F(ab')2"yi kapsamaktadB Mevcut bulusun CD3 baglama alanÇlepitop insan CD3'ü olusturan y zinciri, ö zinciri veya 8 zinciri sekanslîlçerisinde konumland-[glîlsürece herhangi bir epitopa baglanabilmektedir. Mevcut bulusta, tercih edilen CD3 baglama alanlarÇlbir CD3 antikoru hafif zincirli degisken bölge (VL) ve bir CD3 antikoru aglElzincirli degisken bölge (VH) içerenleri kapsamakta olup, bu, bir insan CD3 kompleksinin e zincirinin hücre dlglllaniaki bir epitopa baglanmaktadlEI Tercih edilen bu tür CD3 baglama alanlarÇlbir bir OKT3 antikorunun (Proc. Natl. Acad. Sci. zincirli degisken bölge (VL) ve bir CD3 antikoru aglEzincirli degisken bölge (VH) içerenleri kapsamaktadlü Dahasüuygun olan bu tür CD3 baglama alanlarüarzu edilen özelliklere sahip olan bir CD3 antikorundan elde edilenleri kapsamakta olup, bunlar, yukar- açliZIanan yöntemelr vasllîislýla, arzu edilen bir hayvanli-Ji, insan CD3'ünü olusturan y zinciri, ö zinciri veya 8 zinciri ile immünize edilmesiyle elde edilmektedir. Bir CD3 baglama alanII elde edildigi uygun anti-CD3 antikorlarÇlinsan antikorlarIElve yukar- açlklandlgllîgibi uygun sekilde insansüâstlîllân antikorlarlîkapsamaktadlü CD3'ü olusturan y zinciri, ö zinciri ve E sekanslarljilarak gösterilmektedir (RefSeq erisim numarasüiarantezlerde gösterilmektedir. Polipeptit kompleksi Mevcut bulusun bir polipeptit kompleksinin yapElZlistemler taraflEUan tanIilanmaktadlElve genel olarak asagidakileri içermektedir (1) bir kanser antjeni baglama alanlîl (2) tanIilandiglEüzere indirgenmis Fcy reseptörü baglama aktivitesine sahip bir Fc alanEl içeren bir alan; ve (3) tanland[g]l:üzere bir CD3 baglama alanEblan bir T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanü Burada açllîlanan diger polipeptit kompleksleri, istenen bulusun arka plan.. ve alan.. tamamen anlasliüiaslîl/e gerekli olmasEdurumunda teknikte uzman kisi için yönlendirmenin saglanmasüislevi görmektedir. YukarIEIh açllZlanan alanlardan her biri peptit bagEI vasißslýla dogrudan baglantllândlEllâbilmektedir. Örnegin, (1) F(ab')2 antijen baglama alanlîl olarak kullanHBwaktadlElve (2) indirgenmis Fcy reseptörü baglama aktivitesine sahip bir Fc alanEilse indirgenmis Fcy reseptörü baglama aktivitesine sahip bir Fc alanüiçeren alan olarak kullanilBraktadlEl Bu durumda, antijen baglama alanEQl), bir peptit baglîil'aslüislýla (2)'nin Fc alanIülçeren alana baglandlgllda, baglanan polipeptit bir antikor yaplglîcblusturmaktadlîl Bu tür bir antikor, yukari aç[lZ]anan hibridomun kültür ortamII saflastlElllB1asEi/eya antikor olusturan polinükleotiti koslayan polinükleotiti stabil sekilde taslýan, arzu edilen konak hücrelerin kültür ortamII asflastlEIlB'iaslsîla hazlEIianabilmektedir. Genel olarak, (3)'ün CDB baglama alanII antikor yap- baglanmasEUurumunda, CD3 baglama alanl,__l peptit bagEIvaleislýla antikor yap-I sabit bölgesine ait C terminusa baglanabilmektedir. Bir baska yapllândlîilnada, CD3 baglama alanÇl antikor yap-I hafif zincirli degisken bölgesinin veya aglEIzincirli degisken bölgesinin N terminusuna peptit bagEl vasßsüa baglanmaktadlEl Diger yapllândIElnada, CD3 baglama alanÇlantikor yap-I hafif zincirli sabit bölgesnin C terminusuna peptit bagülasltâslýla baglanmaktadlB Baglanacak olan CD3 baglama alanüarzu edilen herhangi bir yaplýh sahip olabilmektedir, ancak, uygun olan bu tür bir CD3 baglama alanütercihen Fv ve daha terc scFv içermektedir. Antikor yap- baglanan CD3 baglama alanIlEl degerligi lellEllandlEllE1amaktadlü Bir iki degerlikli CD3 baglama alanII antikor yap_ baglanmasübin, CD3 baglama alanüpeptit bagülaslßislîla, antikor yap-I sabit bölgesini olusturan iki Fc alanII ilgili C terminisine baglanabilmektedir. Alternatif olarak, bir iki degerlikli CD3 baglama alanII antikor yap- baglanmasüçin, bir iki degerlikli scFv (yani sc(Fv)2), iki Fc alanII C terminusuna peprtit bagEl/asfriislîda baglanabilmektedir. Bu durumda, bir iki degerlikli scFv'nin (yani sc(Fv)2), antikor yaplîlßllîa] sabit bölgesini olusturan iki Fc alanIan yalnlîta birinin C terminusuna baglandlglEpolipeptit kompleksi, bir bispesifik antikordan elde edilen, yukar- açlKlanan bir PC alanII kullanllüîaslîla etkili sekilde üretilebilmektedir. Alternatif olarak, bir tek degerlikli CD3 baglama alanII antikor yap_ baglanmasEilçin, bir tek degerlikli scFv, iki Fc alanII C terminusuna peprtit bagEl/asltâsMa baglanabilmektedir. Bu durumda, bir tek degerlikli scFv'nin, antikor yap-I sabit bölgesini olusturan iki Fc alanIdan yalnlîta birinin C terminusuna baglandlgllîbolipeptit kompleksi, bir bispesifik antikordan elde edilen, yukarüla açllZlanan bir Fc alanII kullanllîhaslsîla etkili sekilde üretilebilmektedir. DahaslÇI (3)'ün CD3 baglama alanIII peptit bagElvaleislîila, antikor yap-I sabit bölgesinin C terminusuna baglanmasüdurumunda, uygun polipeptit kompleksleri, CD3 baglama alanlüilusturan agEzincirli Fv fragmentinin, Fc alanlüilusturan bir sabit bölgenin (CH3 alanDJC terminusuna baglandlglEl/e CD3 baglama alanIEblusturan hafif zincirli Fv fragmentinin, Fc alanIElolusturan sabir bölgenin (CH3 alanDîlC terminusuna baglandlgllîl kompleksleri kapsamaktadlü Bu durumda, GIy-GIy-GIy-Gly-Ser (SEKANS KIMLIK NUMARASI:7) gibi uygun bir baglaylEÇlhafif zincirli veya agElzincirli Fv fragmentinin, sabit bölgenin (CH3 alanmc terminusuna baglanmasüçin eklenmektedir. BaglaylîEiçerisindeki tekrar saylgßllîllandlîlli'iamaktadü ancak, 1 ila 10, tercihen 2 ila 8 veya daha tercihen 2 ila 6'dan seçilmektedir. Spesifik olarak, [GIy-GIy-GIy-GIy-Ser] (SEKANS KIMLIK NUMARASI:7) mümkündür. Alternatif olarak, CD3 baglama alanIIZblusturan aglElzincirli Fv fragmentinin, Fc alanIEl olusturan bir sabit bölgenin (CH3 alanDîlC terminusuna baglandiglEl/e CD3 baglama alanIEl olusturan hafif zincirli Fv fragmentinin, Fc alanIEblusturan sabit bölgenin (CH3 alanLIlC terminusuna baglandlglEbir polipeptit kompleksi üretildiginde, agEzincirli Fv fragmenti ve hafif zincirli Fv fragmenti araleUaki disülfür baglari& olusumunu mümkün kllân amino asit kallEtHârII uygun degisimleri, aglEl zincirli Fv fragmenti ve haûf zincirli Fv fragmenti aralehaki birlesmenin genisletilmesinde kullanllâbilmektedir. Bir baska yapllândlElnada, CD3 baglama alanIlZblusturan agElzincirli Fv fragmentinin, Fc alanIlZblusturan bir sabit bölgenin (CH3 alanmC terminusuna baglandlglüie CD3 baglama alanIlîrblusturan hafif zincirli Fv fragmentinin, Fc alanIlîcblusturan sabit bölgenin (CH3 alanm C terminusuna baglandigiEbir polipeptit kompleksi üretildiginde, aglElzincirli Fv fragmenti ve hafif zincirli Fv fragmenti arasIaki birlesmenin genisletilmesi için antikor CH1 ve CL alanlari: aglEIzincirli Fv fragmenti ve hafif zincirli Fv fragmeninden her birine baglanabilmektdir. Bir baska yapüândlîilnada, bir iki degerlikli CD3 baglama alanII antikor yap_ baglanmasü için, bir tek degerlikli CD3 baglama alanüpeptit bag Üasßsüa, iki hafif zincirli sabit bölgenin ilgili C terminisine veyaantikor yap-I hafif zincirli degisken bölgelerinin ilgili N terminisine baglanabilmektedir. Alternatif olarak, bir iki degerlikli CD3 baglama alanII antikor yap- baglanmasüçin, bir iki degerlikli scFv (yani sc(Fv)2), peptit bagÜ/asißsüla, iki hafif zincirli sabit bölgenin ilgili C terminisine veya hafif zincirli degisken bölgelerin ilgili N terminisine baglanabilmektedir. Bu durumda, bir iki degerlikli scFv'nin (yani sc(Fv)2), antikor yap-I iki hafif zincirli degisken bölgelerinden birinin C veya N terminusuna baglandogüpolipeptit kompleksleri, bir bispesifik antikordan elde edilen, yukari açiElanan bir Fc alanII kullanllîhasüla etkili sekilde üretilebilmektedir. Alternatif olarak, bir tek degerlikli CD3 baglama alanII antikor yap_ baglanmasüçin, bir tek degerlikli scFv, iki hafif zincirli degisken bölgeden birinin C veya N terminusuna peptit bagü/asitîhslýla baglanabilmektedir. Bu durumda, bir tek degerlikli scFv'nin, antikor yap-IE] iki hafif zincirli degisken bölgelerinden bir hafif zinvirli degisken bölgesinin C veya N terminusuna baglandglgmevcut bulusun polipeptit kompleksleri, bir bispesifik antikordan elde edilen, yukarlîilb açilZIanan bir Fc alanII kullanilmaslsîla etkili sekilde üretilebilmektedir. Bir baska yapilândßnada, bir iki degerlikli CD3 baglama alanII antikor yap_ baglanmaslîl için, bir tek degerlikli CD3 baglama alanüpeptit bagEl/asitjislsîla, iki agEzincirli degisken bölgenin ilgili N terminisine baglanabilmektedir. Alternatif olarak, bir iki degerlikli CD3 baglama alanII antikor yap_ baglanmasüçin, bir iki degerlikli scFv (yani sc(Fv)2), iki agEl zincirli degisken alandan birinin N terminusuna peptit bagIZI vasfâhslýla baglanabilmektedir. Bu durumda, bir iki degerlikli scFv'nin (yani sc(Fv)2), antikor yap-I iki aülElzincirli degisken bölgelerinden birinin N terminusuna baglandlgilîpolipeptit kompleksleri, bispesifik antikordan elde edilen, yukari açiEIanan bir Fc alanII kullanHBnasMa etkili sekilde üretilebilmektedir. Alternatif olarak, bir tek degerlikli CD3 baglama alanII antikor yap_ baglanmasüçin, bir tek degerlikli scFv, iki agIEzincirli degisken bölgeden birinin N terminusuna peptit bagüvasüslýla baglanabilmektedir. Bu durumda, bir tek degerlikli scFv'nin, antikor yap-I iki agIE zincirli degisken bölgelerinden birinin N terminusuna baglandigiü mevcut bulusun polipeptit kompleksleri, bir bispesifik antikordan elde edilen, yukar- açlEIanan bir Fc alanII kullanlEnasEla etkili sekilde üretilebilmektedir. DahasÇlyukarI açlKlanan bir polipeptit kompleksi, her bir alan. peptit bagEl/asltâslîla baglanmasEl/eya bir peptit baglaylEEi/asüâslýla peptit baglamasElle üretilebilmektedir. Bu durumda, kullanllâcak olan baglaym bir örnek olarak yukarldh açlKlanan baglaylEIîLDve örnegin His-etiketi, HA-etiketi, myc-etiketi, veya FLAG-etiketi gibi bir peptit etiketine sahip uygun baglaylîllârlîkapsamaktadß Ilaveten, hidrojen baglamasüdisülfür baglantlgükovalent bag veya iyonik etkiletsim veya bunlari bir kombinasyonuna dayanarak, ortak baglama özelliginin kullanHBwasEltercih edilmektedir. Örnegin, CH1 ve CL arasIaki afinitenin kullanilîhasümümkündür ve bir bispesifik antikordan elde edilen, yukar- açiElanan Fc alanlarÇIFc alanlarII hetermomerik birlesmesi için kullan Hâbilmektedir. DahasÇIalanIar arasEl disülfür baglarütercihen Örnekler'de açlEIand @Emzere kullan Hâbilmektedir. Polipeptit kompleksinin bir baska yap-a, örnegin, bir tek degerlikli Fv ve bir tek degerlikli Fab, (1) antijen baglama alanlîblaral tercihen kullanllüiaktadE Bu durumda, asag-ki yapü kullanilB1aktadlE Tek degerlikli Fv'nin aglEIzincirli Fv fragmenti (VH) veya hafif zincirli Fv fragmenti (VL), aglîlzincirli CH1 alan. peptit bagEi/asltaslîla baglanmaktadB AgIElzincirIi CH1 alanü mevcut bulusun polipeptit kompleksini olusturan, indirgenmis Fcy reseptörü baglama aktivitesine sahip olan iki Fc alanIan (2) birine, peptit bagüvasltâslýla baglanmaktadlEI Tek degerlikli Fv'nin diger VL veya VH fragmenti ise, disülfür bagüasfûslýla aglEl zincirli CH1 alan. baglanan hafif zincirli CH alan. peptit bagüvaslßslýla baglanmaktadlEI Dolaylîlîila, süslîla aglElzincirli CH1 alan. ve hafif zincirli CL alan- baglanan VH ve VL, bir antikor baglama alanEblusturmaktadB Hem (1) antikor baglama alanIEhem de (3) CD3 baglama alanlülusturan sc(Fv)2, yukarlEIh açllZIanan ikisinin diger Fc aIanII N terminusuna, peptit bagENasEislýla baglanabilmektedir. Bu durumda, agEl zincirli CH1 alanIIEI, peptit baglîlasßslýla, polipeptit kompleksini olusturulan iki Fc alan-an birine baglandlIIlÜ/e sc(Fv)2'nin diger Fc alan. peptit bagEi/asliiislýla bagland[gl|:lbir yaplýla sahip olan bir polipeptit kompleksi, bir bispesifik antikordan elde edilen, yukarlîtlla açilZIanan Fc alanII kullanmaslîla üretilebilmektedir. Yukar- açlElanan polipeptit kompleksi, her bir alani peptit bagüasßslýla baglanmasül'eya bir peptit baglaymaslüslýla peptit baglamasEl ile Üretilebilmektedir. Bu durumda, kullanilâcak olan baglayEZI bir örnek olarak yukarEIia açllZIanan baglayIEMBl/e örnegin His-etiketi, HA-etiketi, myc-etiketi, veya FLAG-etiketi gibi bir peptit etiketine sahip uygun baglaylElErEkapsamaktadlE Polipeptit kompleksinin tercih edilen bir baska yap-a, örnegin, bir iki degerlikli scFv de (1) antijen baglama alanEbIarak kullan[lIJ'1aktad|EI YapII bir yapüândlîmasia, iki degerlikli scFv'lerden birinin, indirgenmis Fcy reseptörü aktivitesine sahip iki (2) Fc alanIan birine, peptit bagllracümilýla, (3) CD3 baglama alanIüJIusturan VH vasißslýla baglandigiüle diger iki degerlikli scFv'nin ise, indirgenmis Fcy reseptörü baglama aktivitesine sahip iki (2) Fc alanlEhlan birine, peptit bagEbracIDgIEa, (3) CD3 baglama alanIEblusturan VL vasßslîla baglantiglllir polipeptit kompleksinin üretilmesi de mümkündür. Bu durumda, bir bispesifik antikordan elde edilen, yukari açklanan Fc alanII kullanilBiasünümkündür. Yukarlah açlklanan polipeptit kompleksi, her bir alanlEJ peptit bagEi/asitâslîla baglanmasEl veya bir peptit baglaylîljvasltâslîla peptit baglamasEile üretilebilmektedir. Bu durumda, kullanilâcak olan baglayiELîlbir örnek olarak yukari açiElanan baglaylîlýÜ/e örnegin His- etiketi, HA-etiketi, myc-etiketi, veya FLAG-etiketi gibi bir peptit etiketine sahip uygun baglaylEllârEkapsamaktadB Bir iki degerlikli scFv'nin (1) antijen baglama alanEblarak kullan[gü yap bir baska yapilândlîrlnaslütla, iki degerlikli scFv'lerden birinin, indirgenmis Fcy reseptörü aktivitesine sahip iki (2) Fc alanEUan birine, (3) CD3 baglama alanIEIqusturan peptit bagEIscFv vasßslýla baglandigiÜ/e diger iki degerlikli scFv'nin ise, indirgenmis Fcv reseptörü baglama aktivitesine sahip iki (2) Fc alanIan digerine, diger peptit bagEi/asißislîla baglandigilîbir polipeptit kompleksinin üretilmesi mümkündür. Bu durumda, antijen baglama alanIEl olusturan scFv'nin, polipeptit kompleksini olusturan iki Fc alanlütlan birine, CD3 baglama alanlßlusturan scFv vasißslýla peptit bagüracUJgilîla baglandlglül/e antijen baglama alanIEI olusturan scFv'nin, diger Fc alan. peptit bag Dasiüslîla bagland [giElbir polipeptit kompleksi, bir bispesifik antikordan elde edilen, yukarlî'lh açilîlanan bir Fc alanII kullanllüiaslîla üretilebilmektedir. YukarlEIh açiElanan polipeptit kompleksi, her bir alan. peptit bagEI vasitâslýla baglanmasi: veya bir peptit baglaylEEI vasltâslýla peptit baglamasEl ile üretilebilmektedir. Bu durumda, kullanilâcak olan baglaylîü bir örnek olarak yukar- açilZIanan baglaylîlîüe örnegin His-etiketi, HA-etiketi, myc-etiketi, veya FLAG-etiketi gibi bir peptit etiketine sahip uygun baglaylîllârEkapsamaktadlE Mevcut bulusun polipeptit kompleksine göre, hem antijen baglama alanljiem de T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanü tek degerlikli Fab yap-E YapEI bir yapilând Elnasia, antijen baglama alanlüneydana getiren bir tek degerlikli Fab'nin bir aglîl zincirli Fv fragmentinin, bir Fc alanIlIrIneydana getiren bir polipeptite bir CH1 alanüiasüislîda baglant[gll:l/e Fab'nin bir hafif zincirli Fv fragmenti bir CL alanlEia baglanlHken, T hücresi reseptörü baglama alanIEIqusturan Fab'nin bir aglEl zincirli Fv fragmentinin, Fc alanIü olusturan diger polipeptite bir CH1 alanÜ/asißslýla baglandigiü/e Fab'nin bir hafif zincirli Fv fragmentinin bir CL alan. baglandlgiEliiir polipeptit kompleksinin üretilmesi mümkündür. YaplEllEl bir baska yapllândlElnaletla, antijen baglama alanlElElmeydana getiren bir tek degerlikli Fab'nin bir aglE zincirli Fv fragmentinin, bir PC alanIDmeydana getiren bir polipeptite bir CH1 alanEl/aslßslýla baglandlglü/e Fab'nin bir hafif zincirli Fv'si bir CL alan. baglanlEiken, T hücresi reseptörü baglama alanIEIolusturan Fab'nin bir hafif zincirli Fv fragmentinin, Fc alanIIZblusturan diger polipeptite bir CH1 alanüiaslûsüa baglandfgEl/e Fab'nin bir aglElzincirli Fv fragmentinin bir CL alan. baglandlglüiir polipeptit kompleksinin üretilmesi de mümkündür. Alternatif olarak, T hücresi reseptörü baglama alanIEmeydana getiren bir tek degerlikli Fab'nin bir aglElzincirli Fv fragmentinin, bir Fc alanIElneydana getiren bir polipeptite bir CH1 alanEl/asßsMa baglandlg'lEl/e Fab'nin bir hafif zincirli Fv fragmenti bir CL alan. baglanlElken, antijen baglama alanIEblusturan Fab'nin bir hafif zincirli Fv fragmentinin, Fc alanIIZlolusturan diger polipeptite bir CH1 alanüvaslßslýla baglandlglÜ/e Fab'nin bir aglElzincirli Fv fragmentinin bir CL alan. baglandlglübir polipeptit kompleksinin üretilmesi de mümkündür. YaplElI bir baska yapllândlîilnasia, antijen baglama alanlElümeydana getiren bir tek degerlikli Fab'nin bir aglü zincirli Fv fragmentinin, bir Fc alanIElmeydana getiren bir polipeptite bir CH1 alanü/aslßslýla baglandlglü/e Fab'nin bir hafif zincirli Fv fragmenti bir CL alan. baglanlEken, T hücresi reseptörü baglama alanIlIrl)lusturan Fab'nin bir aglEzincirli Fv fragmentinin, Fc alanIEblusturan diger polipeptite bir CL alanEl/asßslîcla baglandlgllîlie Fab'nin bir hafif zincirli Fv fragmentinin bir CH1 alan. baglandlglübir polipeptit kompleksinin üretilmesi de mümkündür. Alternatif olarak, T hücresi reseptörü baglama alanIEmeydana getiren bir tek degerlikli Fab'nin bir aglîlzincirli Fv fragmentinin, bir Fc alanIErneydana getiren bir polipeptite bir CH1 alanEli/asßslîla baglandlglEl/e Fab'nin bir hafif zincirli Fv fragmenti bir CL alan. baglanElken, antijen baglama alanIIIcblusturan Fab'nin bir agEzincirli Fv fragmentinin, bir Fc alanlßlusturan diger polipeptite bir CL alanlîxl'aslüslýla bagland @Ele Fab'nin bir haüf zincirli Fv fragmentinin bir CH1 alan. baglandl'gllîlbir polipeptit kompleksinin üretilmesi de mümkündür. Ayrüa, hem antijen baglama alanlJiem de T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanIlEl, tek degerlikli Fab'nin bir yaplglîbldugu ve tercih edilen polipeptitlerin, asaglöhkilere sahip olanlarllapsadgllîiliolipeptit kompleksinin bir baska yaplîlîclla burada açlEanmaktadlE (1) bir antijene baglanan bir tek degerlikli Fab yap-[El bir aglElzincirli Fv fragmentinin, bir Fc alanljblusturan, yukar- açiklanan polipeptitlerden birine bir CH1 alanü/aslßslýla baglandlgüie Fab yap-I bir hafif zincirli Fv fragmentinin ise bir CL alan. baglandlglEl bir antijen baglama alanElve (2) bir T hücresi reseptörü kompleksine baglanan bir tek degerlikli Fab yapElüllEl bir hafif zincirli Fv fragmentinin bir Fc alanIüblusturan diger polipeptite bir CH1 alanüiasllîiislîla baglandlglElIe Fab yap-I bir hafif zincirli Fv fragmentinin ise bir CL alan. bagland[gll:l bir T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanlî.] ve burada, CH1 ve CL alanlarI elektrik yükleri kontrol edilmektedir, böylelikle antijen baglama alanlElI aglElzincirli Fv fragmenti, antijen baglama alanII hafif zincirli Fv fragmenti Ile birlestirilmektedir veya T hücresi reseptörü baglama alanII aglEzincirli Fv fragmenti, T hücresi reseptörü baglama alanIlfil hafif zincirli Fv fragmenti ile birlestirilmektedir. Bu yapllândlîilnada, CH1 ve CL alanlarII elektrik yükleri kontrol edildigi, böylelikle antijen baglama alanII aglElzincirli Fv fragmentinin, antijen baglama alanII hafif zincirli Fv fragmenti ile birlestirildigi veya T hücresi reseptörü baglama alanII agE zincirli Fv fragmentinin, T hücresi reseptörü baglama alanII hafif zincirli Fv fragmenti ile birlestirildigi sürece, polipeptit kompleksinin yapEleontrollü birlesime sahip yapLIJ belirli bir yapEile sIlEllandlElIEnamaktadlEl Kontrollü birlesime sahip yapII bir yapllândlElnasIa, T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanII aglElzincirli Fv fragmentine baglanan CH1 alanII amino asit kaIlEtllârIIEl, antijen baglama alanII hafif zincirli Fv fragmentine baglanan CL alanII amino asit kalEtllârElile aynEIelektrik yüklerine sahip oldugu bir polipeptit kompleksinin üretilmesi mümkündür. Kontrollü birlesime sahip yapII bir yapllând lEinaleUa, antijen baglama aIanII agEzincirli Fv fragmentine baglanan CH1 alanII amino asit kallEtllârIlEl, T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanII hafif zincirli Fv fragmentine baglanan CL alanIlEl amino asit kallEtllârElle aynlîlektrik yüklerine sahip oldugu bir polipeptit kompleksinin üretilmesi mümkündür. Kontrollü birlesime sahip yapII bir yapilândlElnasIa, T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanII aglElzincirli Fv fragmentine baglanan CH1 alanII amino asit kallEtUârIlEl, antijen baglama alanII hafif zincirli Fv fragmentine baglanan CL alanII amino asit kalütllârüle aynlllektrik yüklerine sahip oldugu ve antijen baglama alanII agEzincirli Fv fragmentine baglanan CH1 alanII amino asit kallEtllârlEllEl, T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanII haüf zincirli Fv fragmentine baglanan CL alanIlEl amino asit kallEtllârElle ayri Elektrik yüklerine sahip oldugu bir polipeptit kompleksinin üretilmesi mümkündür. Kontrollü birlesime sahip yaplElI bir baska yapllândlünaslüba, T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanII aglîlzincirli Fv fragmentine baglanan CH1 alanII amino asit kallEtllârIlEl, antijen baglama alanII hafif zincirli Fv fragmentine baglanan CL alanII amino asit kallEtHârEile aynlîêlektrik yüklerine sahip oldugu ve T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanII aglEzincirli Fv fragmentine baglanan CH1 alanII amino asit kallEtHârIlEl, T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanII hafif zincirli Fv fragmentine baglanan CL alanII amino asit kallEtllâr- zlîl elektrik yüklerine sahip oldugu bir polipeptit kompleksinin üretilmesi mümkündür. Kontrollü birlesime sahip yapII bir diger yapllând lîilnasIa, T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanII aglElzincirli Fv fragmentine baglanan CH1 alanII amino asit kallîitllârIlEl, antijen baglama alanII hafif zincirli Fv fragmentine baglanan CL alanII amino asit kallEtllârElle aynElelektrik yüklerine sahip oldugu; antijen baglama alanII aglElzincirIi Fv fragmentine baglanan CH1 alanII amino asit kallEtllârIE, T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanII hafif zincirli Fv fragmentine baglanan CL alanIlEl amino asit kalIEtllârEiIe aynßlektrik yüklerine sahip oldugu; ve T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanII aglEl zincirli Fv fragmentine baglanan CH1 alanII amino asit kallEtIErIlEl, T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanlEllEl hafif zincirli Fv fragmentine bagsanan CL alanII amino asit kallîitllâr- z[t] olan elektrik yüklerine sahip oldugu bir polipeptit kompleksinin üretilmesi mümkündür. Kontrollü birlesime sahip yapIlEl bir baska yapllândlîilnasIa, antijen baglama alanII aglEl zincirli Fv fragmentine baglanan CH1 alanII amino asit kallîitllârIIEl, T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanII hafif zincirli Fv fragmentine baglanan CL alanII amino asit kallEtllârEile aynEéIektrik yüklerine sahip oldugu veantijen baglama alanlElI aglElzincirIi Fv fragmentine baglanan CH1 alanII amino asit kallEtllârIlEl, antijen baglama alanII hafif zincirli Fv fragmentine baglanan CL alanII amino asit kalütllârl zlfîlelektrik yüklerine sahip oldugu bir polipeptit kompleksinin üretilmesi mümkündür. Kontrollü birlesime sahip yapII bir alternatif yapHândlElnasIa, T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanII aglElzincirli Fv fragmentine baglanan CH1 alanII amino asit kallEtllârIE, antijen baglama alanlEllEl hafif zincirli Fv fragmentine baglanan CL alanII amino asit kallEtHârEile aynlZlalektrik yüklerine sahip oldugu; antijen baglama alanIlEI aglEl zincirli Fv fragmentine baglanan CH1 alanII amino asit kallEtllârIlEl, T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanII hafif zincirli Fv fragmentine baglanan CL alanII amino asit kallEtilârEille aynlîêalektrik yüklerine sahip oldugu; ve antijen baglama alanII aglEzincirli Fv fragmentine baglanan CH1 alanII amino asit kallûtllârllûl, antijen baglama alanII hafif zincirli Fv fragmentine bagsanan CL alanII amino asit kallEtilâr- ziEloIan elektrik yüklerine sahip oldugu bir polipeptit kompleksinin üretilmesi mümkündür. Kontrollü birlesime sahip yapII bir diger yapllând lîilnasIa, T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanII agIElzincirli Fv fragmentine baglanan CH1 alanII amino asit kalEtilârIIEl, antijen baglama alanII hafif zincirli Fv fragmentine baglanan CL alanII amino asit kallEtllârElle aynEblektrik yüklerine sahip oldugu; antijen baglama alanII aglElzincirIi Fv fragmentine baglanan CH1 alanII amino asit kallEtiiârIlEl, T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanII hafif zincirli Fv fragmentine baglanan CL alanIIEl amino asit kallEtllârElIe aynEblektrik yüklerine sahip oldugu; T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanII agB zincirli Fv fragmentine baglanan CH1 alanII amino asit kallEtlErIlEl, T hücresi reseptörü kompleksi baglama alanlElI hafif zincirli Fv fragmentine bagsanan CL alanII amino asit kaliîitllâr. ziElolan elektrik yüklerine sahip oldugu; ve antijen baglama alanII hafif zincirli Fv fragmentine baglanan CH1 alanII amino asit kaliEtilârIlEl, antijen baglama alanII hafif zincirli Fv fragmentine baglanan CL alanII amino asit kallEtilârI zllîlolan elektrik yüklerine sahip oldugu bir polipeptit kompleksinin üretilmesi mümkündür. CH1 ve CL alanlarII elektrik yüklerinin kontrolü T hücresi reseptörü baglama alanII aglîlve hafif zincirleri vasfglislýla T hücresi reseptörü baglama alan.. bir epitopunu tanlýlan bir bispesifik polipeptit kompleksinin ve antijen baglama alanII hafif ve aglîlzincirleri vasüslýla bir antijenin bir epitopunun elde edilmesi için, teorik olarak, polipeptit kompleksi üretilirken dört zincirden her birinin eksprese edilmesi durumunda, on tip polipeptit kompleksi molekülü üretilmektedir. Bununla birlikte, örnegin, T hücresi reseptörü baglama alanII aglEl zinciri ve antijen baglama alanlEJE] hafif zinciri araleblaki birlesmenin ve/veya antijen baglama alanII aglEl zinciri ve T hücresi reseptörü baglama alanlElEl hafif zinciri arasIaki birlesmenin inhibe edilmesi için alanlarI kontrol edilmesi vasißislýla, arzu edilen polipeptit kompleksi tercihen elde edilebilmektedir. Örnekler; T hücresi reseptörü baglama alanII ag Ezincirli CH1'i ve antijen baglama alanII hafif zincirli CL'si arasIaki bir arayüzü olusturan amino asit kallEtiIârIlEJ, pozitif olarak yüklenmis amino asit kallEtHârlIrblarak degistirilmesini ve antijen baglama alanII aglElzincirIi CH1'i ve T hücresi reseptörü baglama alanII hafif zincirli CL'si arasIiaki bir arayüzü olusturan amino asit kalßtüârlßl, negatif olarak yüklenmis amino asit kalütllârüolarak degistirilmesini kapsamaktadlEl Bu tür degisimlerin bir sonucu olarak, T hücresi reseptörü baglama alanlElI aglEzincirli CH1'i ve antijen baglama alanII haûf zincirli CL'si arasIaki istenmeyen bir birlesme önlenmektedir, zira, amino asit kallEtllârII elektrik yüklerinin ikisi de pozitiftir ve antijen baglama alanlElI aglEIzincirli CH1'i ve T hücresi reseptörü baglama alanII hafif zincirli CL'si arasIaki istenmeyen birlesme de önlenmektedir, zira arayüzü olusturan amino asit kallEtllârIlEl ikisi de negatiftir. Mevcut bulusun arzu edilen polipeptit kompleksi, T hücresi reseptörü baglama alanII aglElzincirIi CH1'i ve T hücresi reseptörü baglama alanII hafif zincirli CL'si arasIaki arzu edilen birlesmenin yanüslü, antijen baglama alanII aglElzincirli CH1'i ve antijen baglama alanII hafif zincirli CL'si araleUaki arzu edilen birlesmenin bir sonucu olarak etkili bir sekilde üretilebilmektedir. DahaslÇlT hücresi reseptörü baglama aIanII aglîlve hafif zincirleri arasIaki arzu edilen birlesme, tercihen desteklenmektedir, zira arayüzü olusturan amino asit kallEtlIârEbirbirinden farklü elektrik yüklerine sahiptir. Antijen baglama alanII aglEI ve hafif zincirleri araletlaki arzu edilen birlesme de tercihen desteklenmektedir, zira arayüzü olusturan amino asit kallEtllârlîl birbirinden farklEblektrik yüklerine sahiptir. Bu, mevcut bulusun bir polipeptit kompleksinin, arzu edilen birlesme ile etkili sekilde üretilmesini mümkün küüîaktadlü DahasÇlmevcut bulustaki birlesmenin kontrolü, ayrlEa, CHI'Ier (T hücresi reseptörü baglama alanü/e antijen baglama alanIlEl aglElzincirleri) araletIaki veya CL'Ier (T hücresi reseptörü baglama alanIZi/e antijen baglama alanII hafif zincirleri) arasEUaki birlesmenin önlenmesi için de kullanllâbilmektedir. Teknikte uzman kisiler, mevcut bulusa göre birlesmesinin kontrol edildigi arzu edilen polipeptit komplekslerinde, birlesme üzerinde CH1/CL arayüzünde birbirine yakI sekilde konumlandlîllân amino asit türlerini uygun bir sekilde bulabilmektedir. DahasÇIhalka adla veri tabanlari. veya benzerinin kullanllüîaslîda, teknikte uzman kisiler, Insan, maymun, fare veya tavsan gibi bir organizmadaki kullanllâbilen antikor CH1 ve CL'yi uygun bir sekilde bulabilmektedir. Daha spesifik olarak, CH1 ve CL'nin amino asit sekanslZl bilgisi, asag. Örnekler'de açlKlanan yöntemleri vaslüislwa elde edilebilmektedir. Spesifik olarak, asagthki açlKlanan Örnekler'de gösterildigi üzere, T hücresi reseptörü baglama alanljl'eya antijen baglama alanlßlusturan VH ve VL'ye süsüla baglanan CH1 ve CL arasIaki birlesme üzerine CH1/CL arayüzünde birbirine yakI sekilde (birbirine bakan veya temas eden) konumlandlîllân amino asit kallEtllârII kombinasyonlari. spesifik örnekleri asag-kileri ka psamaktadlü - CHl'deki (örnegin, SEKANS KIMLIK NUMARASlzl'deki amino asit sekansiiia bulunan pozisyon 147) pozisyon 147'de (EU numaralandlElnasDîl bulunan lisin (K) ve buna bakan (temas eden) CL'deki pozisyon 180'de (EU numaraland lElnasmbulunan treonin (T); - CHl'deki pozisyon 147'de (EU numaralandlünaslllbulunan lisin (K) ve buna bakan (temas eden) CL'deki pozisyon 131'de (EU numaralandlîilnasmbulunan serin (5); - CH1'deki pozisyon 147'de (EU numaralandlElnasmbulunan lisin (K) ve buna bakan (temas eden) CL'deki pozisyon 164'te (EU numaralandlElnasmbulunan treonin (T); - CH1'dekI pozisyon 147'de (EU numaralandlElnasEIl bulunan lisin (K) ve birbirine bakan (temas eden), CL'deki pozisyon 138'de (EU numaralandlElnasDJbulunan asparajin (N); - CH1'deki pozisyon 147'de (EU numaralandlElnasDIlbulunan lisin (K) ve buna bakan (temas eden) CL'deki pozisyon 123'te (EU numaralandlElnasEIlbulunan glutamik asit (E); - CHl'deki pozisyon 175'te (EU numaralandlülnasD] bulunan glutamin (Q) ve buna bakan (temas eden) CL'deki pozisyon 160'ta (EU numaralandlElnasLIlbulunan glutamin (Q); - CH1'deki pozisyon 213'te (EU numaralandlîilnasmbulunan Iisin (K) ve buna bakan (temas eden) CL'deki pozisyon 123'te (EU numaralandlEinasmbulunan glutamik asit (E); Bu pozisyonlar, Kabat i/e mes/ektas/arÜKabat EA ve meslektaslarlÇI 1991. Sequence of Proteins of Immunological Interest. NIH) referanledaki dokümana göre numaralandlElllBiaktadlEl Burada, EU numaralandlîllüiaslîlile gösterilen numaralar, EU numaralandlElnas- göre atanmaktadEI(Sequences of proteins of immunological interest, NIH YayI No:91-3242). Mevcut bulusta, "pozisyon X'teki (EU numaralandlElnasD] amino asit kallEtElZl ve "pozisyon X'teki (EU numaralandlîilnasLIl amino asit" (burada X rastgele bir numaradlE) ifadeleri, numaralandülnasDZlkarslüß gelen amino asit" ile degisimli sekilde kullanilBiaktadB Asaglki Örnekler'de açlEIandigllZlüzere, arzu edilen bir polipeptit kompleksi, amino asit kallEtilârII degistirilmesi ve mevcut bulusun yöntemlerinin uygulanmaslýla tercihen elde edilebilmektedir. Yukari açllZIanan amino asit kallütllârIlEl, insan ve maymunda fazlaca bulundugu polipeptit komplekslerinden farkIEloIan mevcut bulusun bir polipeptit kompleksinin sabit bölgesindeki CH1 ve CL arasIdaki birlesme, ayrlEla, yukari açllîlanan amino asit kallEtllârI karslIiIZl gelen amino asit kallEtüârII degistirilmesiyle de kontrol edilebilmektedir. Spesifik olarak, aglElzincirIi ve hafif zincirli arasIaki kontrollü birlesmeye sahip polipeptit kompleksleri açlElanmakta olup, burada asag-ki (a) ila (f)'de açllZIanan amino asit kallütllârEl çiflerinden seçilen biri, ikisi veya daha fazlasüiynßlektrik yüklerine sahiptir: (a) CHl'deki pozisyon 147'deki (EU numaralandlElnasDZl amino asit kallEtlîElve CL'deki pozisyon 180'deki (EU numaralandlîilnasDglamino asit kallîîtlîlü (b) CH1'deki pozisyon 147'deki (EU numaralandlElnastIl amino asit kaIlEtlgElve CL'deki pozisyon 131'deki (EU numaralandlûnasmamino asit kallEtEE (c)CH1'deki pozisyon 147'deki (EU numaralandlEinasDJ amino asit kallEtIîElve CL'deki pozisyon 164'deki (EU numaralandlîilnasiîlamino asit kallEtlglîl (d)CH1'deki pozisyon 147'deki (EU numaralandünasiîl amino asit kallEtlEDve CL'deki pozisyon 138'deki (EU numaralandlülnasmamino asit kaIlEtElîl (e) CHl'deki pozisyon 147'deki (EU numaralandlEnasDîl amino asit kallEtlîElve CL'deki pozisyon 123'deki (EU numaralandlîilnasmamino asit kaIlEtEE (f) CHl'deki pozisyon 175'deki (EU numaralandlElnasD] amino asit kallEtlgElve CL'deki pozisyon 160'daki (EU numaralandlîilnasmamino asit kallEtEü DahasÇl bir baska yapilândünada antikorlar açlk`]anmakta olup, burada asagIki (g)'de açlElanan amino asit kallEtlEEÇiftindeki amino asit kallEtUârüsununla aynElelektrik yüküne sahiptir: (9) CHl'deki pozisyon 213'teki (EU numaralandlElnasDZlamino asit kallEtlîIJe CL'deki pozisyon 123'teki (EU numaralandlElnasDJamino asit kaIlEtlgD Yukari açlElanan çiftlerden her birindeki amino asit kallEtUârÇl asag-ki Örnekler'de açllZIandlgEüzere birlesme üzerine birbirine yaklEl sekilde konumlandlEIIBiaktadE Homoloji modellemesi veya piyasada mevcut olan yazHJEiI kullan-[glîtliger yöntemleri vasltâslgla, teknikte uzman kisiler, yukar-ki (a) ila (g)'de aç[Elanan amino asit kallEtilârI karslHEJ gelen, arzu edilen bir CH1 veya CL'de amino asit pozisyonlarIEIbulabilmektedir ve uygun bir sekilde, bu pozisyonlardaki amino asit kallEtilârllîcliegistirebilmektedir. Yukari açiIZianan antikordaki b u tür bir "elektrik yüklü amino asit kaIlEtlîiZiörnegin, asagi açilZlanan (X) veya (Y) grubuna ait olan amino asit kaliEtiiârIan seçilebilmektedir: (X) glutamik asit (E) ve aspartik asit (D); ve (Y) ise lisin (K), arjinin (R) ve hidtidin (H). Yukarlöh açiiZlanan poiipeptit komplekslerinde, "aynlîlelektrik yüküne sahip" ifadesi, örnegin, iki veya daha fazla amino asit kallEt-I yukar- açiKJanan gruplar (X) veya (Y)'den birine ait oldugu anlam. gelmektedir. Diger yandan, "ziEeIektrik yüküne sahip" ifadesi, örnegin, iki veya daha fazla amino asit kaIlEtiEü/ukariâa açiiZIanan gruplar (X) veya (Y)'den birine ait olan amino asit kaliEtilârlEia sahip iken, diger amino asit kaliEtilârIlEi, diger gruba ait olan amino asit kaliEtHârlEb sahip oldugu anlamIa gelmektedir. kaliEtiiârElile sIlEIlEldegildir. Homoloji modellemesi veya piyasada mevcut olan yaziIJEII kullanI[gil:tliger yöntemleri vasißslýla, teknikte uzman kisiler, bir mutant poiipeptit veya heterometik multimerde bir arayüz olusturan amino asit kallütilâriüiüuygun bir sekilde tanIiIayabiImektedir ve birlesmenin kontrol edilmesi için bu pozisyonlardaki amino asit kalEtilârIlîiliygun bir sekilde degistirebilmektedir. Hafif zincirli ve aglElzincirli degisken bölgeleri arasIdaki arayüze yük itmesinin verilmesi vasßslýia, ag lEIzincir ve hafif zincir araslîida arzu edilmeyen birlesmenin önlenmesine yönelik tekniklerde, aglîizincirli degisken bölge (VH) ve hafif zincirli degisken bölgesi (VL) araletlaki arayüzde birbiriyle temas halindeki amino asit kaliEtiiârÇl örnegin, agiEi zincirli degisken SEKANS KIMLIK NUMARASIzö'da bulunan amino asit sekansia pozisyon 39) bulunan glutamin (Q) ve buna bakan (temas eden) hafif zincirli degisken bölgede (FR2) pozisyon NUMARASI:8'de bulunan amino asit sekansIda pozisyon 44) bulunan glutamin (Q) içermektedir. Bu tür tercih edilen amino asit kalliîtiiârüayriîia, örnegin, aglEzincirli degisken SEKANS KIMLIK NUMARASIzö'da bulunan amino asit sekansIda pozisyon 45) bulunan lösin (L) ve buna bakan hafif zincirli degisken bölgede (FR2) pozisyon 44'de (örnegin WO asit sekanslBUa pozisyon 44) bulunan prolin (P) içermektedir. Bu pozisyonlar, Kabat ve mes/ektas/arQKabat EA ve meslektaslarEI1991. Sequence of Proteins of Immunological Yukari açlElanan amino asit kallEtHârIlEJ, insan ve maymunda fazlaca bulundugu polipeptit komplekslerinden farkllîblan antikor degisken bölgelerindeki VH ve VL araleUaki birlesme, ayrEla, yukar- açllZIanan amino asit kalEtElârlEla karsEIJKI gelen amino asit kallEtllârII degistirilmesiyle de kontrol edilebilmektedir. Daha spesifik olarak, aglBzincirli ve hafif zincirli degisken bölgelere sahip bu tür antikorlar, asagüla açilZlanan (1) ve (2), veya (3) ve (4)'deki amino asit kalEtllârII aynElelektrik yüklerine sahip oldugu antikorlarükapsamaktadE (1) aglBzincirli degisken bölgedeki pozisyon 39'a (EU numaralandlEnasDZl karsÜIKl gelen amino asit kallEtiîü (2) hafif zincirli degisken bölgedeki pozisyon 38'e (EU numaralandlElnasm kars[l]]ZJ gelen amino asit kallütßîl (3) agBzincirli degisken bölgedeki pozisyon 45'e (EU numaralandiElnasEl karsüllg gelen amino asit kallEtEII (4) hafif zincirli degisken bölgedeki pozisyon 45'e (EU numaralandiîilnasm kars[l]]Zl gelen amino asit kaIlEtlîlîl Yukarlâb açllZlanan (1) ve (2), veya (3) ve (4)'deki amino asit kaliEtllârÇIbirlesme üzerine birbirine yakI sekilde konumlandlüilBwaktadlEl Homoloji modellemesi veya piyasada mevcut olan yaz[[liîliI kullanIlglEdiger yöntemleri vaslüsüa, teknikte uzman kisiler, yukar-ki (1) ila (4)'te açllZJanan amino asit kallEtliâr- karsiIJKlgelen, arzu edilen bir agEzincirli veya hafif zincirli degisken bölgeyi uygun bir sekilde tanIiIayabiImektedir ve uygun bir sekilde, bu pozisyonlardaki amino asit kallEtllârIlîllegistirebilmektedir. Yukarüia açüîlanan antikorda, tercihen, "elektrik yüklü amino asit kallmörnegin, asaglîlia açlKlanan (X) veya (Y) grubuna ait olan amino asit kallEtHârIan seçilebilmektedir: (X) glutamik asit (E) ve aspartik asit (D); ve (Y) ise Iisin (K), arjinin (R) ve histidin (H). Genel olarak insan ve farede, yukari açlKIanan (1) ila (4)'ün amino asit kallEtllârßunlardlîi (1) glutamin (Q); (2) glutamin (Q); (3) Iösin (L); ve (4) prolin (P), slßslýla. Tercih edilen bir yapilândlülnada, yukar- açllZlanan amino asit kallilârEdegistirilmektedir (örnegin, yüklü bir amino asit grubuyla ikame). Yukari açllZlanan amino asit kallEtilârEU) ila (4) türleri, yukar- açllZlananlar ile sIlElllîrllegildir. Bu amino asitler, yukarElh açlKIananlara karsllîlEl gelen herhangi bir baska amino asit olabilmektedir. Örnegin, insan olmasEI durumunda, hafif zincirli degisken bölgedeki pozisyon 38'de (EU numaralandlElnasD] bulunan amino aside karslülîl gelen amino asit histidin (H) olabilmektedir. YayIanan dokümanlara teknikte uzman kisiler, hafif zincirde rastgele bir pozisyona karsllîllîl gelen amino asit kallEtEEI türünü bulabilmektedir ve dolayisiyla amino asit kallEt-ljliygun sekilde degistirebilmektedir (örnegin, yüklü bir amino asit ile ikame). AglEl zincirli ve hafif zincirli degisken bölgelerin araletlaki arayüzde hidrofobik merkezi olusturan amino asit kallEtllârElçin elektriksel olarak yüklü amino asitlerin ikame edilmesi vaslliisüla, agEzincir ve hafif zincir arasIaki istenmeyen birlesmenin önlenmesine yönelik tekniklerde, aglElzincirli degisken bölge (VH) ve hafif zincirli degisken bölge (VL) arasüdaki arayüzde hidrofobik merkezi olusturabilen, tercih edilen amino asit kallEtüârÇlörnegin, aglEl zincirli degisken bölgede pozisyon 45'teki Iösin (L) ve hafif zincirli degisken bölgede pozisyon 44'deki prolini (P) kapsamaktadlEI Genel olarak, bir "hidrofobik merkez" hidrofobik amino asitlerin yari zincirlerinin iliskili polipeptit içerisinde bir araya geldigi bir klgma isaret etmektedir. Hidrofobik amino asitler, örnegin alanin, izolösin, Iösin, metiyonin, fenilalanin, prolin, triptofan ve valini kapsamaktadlü Bu zaman zarflEUa, hidrofobik amino asitlerden (örnegin tirozin) farklElolan amino asit kallEtllârÇl ayrlEla, hidrofobik merkezin meydana getirilmesine de dahil edilebilmektedir. Hidrofilik amino asitlerin yan zincirlerinin dlgbrlýla maruz büklmnasian elde edilen hidrofilik yüzey ile birlikte, hidrofobik merkez, suda çözünen polipeptitlerin birlesmesinin baslatiiîhaslîl için bir itici güç olarak islev görmektedir. Iki farkllîialanl hidrofonik amino asitlerinin moleküler yüzeyde mevcut olmasül'e su moleküllerine maruz biEakHB1aslZd1urumunda, entropi artmakta olup, bu, serbest enerjideki bir artlgi ile sonuçlanmaktadlEi Dolayiglýla, iki alan, stabilizasyon için serbest eneijinin azaltilüiaslîbmacisîla birbiriyle birlesmektedir. Yüzeydeki hidrofobik amit asitler, bir hidrofobik merkezin olusturulmasEliçin molekülün içerisine gömülmektedir. Polipeptit birlesmesinde bir hidrofobik merkezi olusturan hidrofobik amino asitlerin, elektrik yüküne sahip polar amino asitler olarak degistirilmesi durumunda, hidrofobik merkezin meydana gelmesinin önlendigi düsünülmektedir. Bu, polipeptit birlesmesinin önlenmesi ile sonuçlanmaktad lü Bilinen diger teknolojiler de mevcut bulusun polipeptit komplekslerine uygulanabilmektedir. Örnegin, mevcut bulusun "degisimlerine" ilaveten, birinci VH (VH1) ve birinci VL (VL1) ve/veya ikinci VH (VH2) ve ikinci VL'nin (VL2) birlesmesinin baslatüîhasüiçin, H zinciri degisken bölgelerinden birinde bulunan amino asitler, daha genis bir yan zincire (nob; ç-D] sahip olanlar ile ikame edilmektedir ve diger H zinciri degisken bölgedeki amino asitler ise daha küçük bir yan zincire (delik; bosluk) sahip olanlar ile ikame edilmektedir, böylelikle nob deligin içerisinde konumlandülîhaktadü Bu, VH1 ve VL1 ve/veya VH2 veya VL2'nin birlesmesini baslatarak, VH1 ve VL2 arasEUaki ve/veya VH2 ve VL1 arasiEkjaki birlesmenin Yukarlâb açiiZJanan bir polipeptit kompleksinin üretiminde, her bir alan peptit bagÜ/asitîlisiýia veya bir peptit baglayßglîvasitîlisiýla peptit baglanmasEile baglanabilmektedir. Bu durumda, kullaniiâcak olan baglayiEJJbir örnek olarak yukar. açiKianan baglaylEJîEi/e örnegin His- etiketi, HA-etiketi, myc-etiketi, veya FLAG-etiketi gibi bir peptit etiketine sahip uygun baglaylîllârü veya bunlari bir kombinasyonuna dayanarak ortak baglanma özelliginin kullanilBiasEtercih edilmektedir. Örnegin, CH1 ve CL arasIdaki afinitenin kullanllfnasiîlmümkündür veya yukariîlia açiElanan, bir bîspesifik antikordan elde edilen Fc alanlarüFc alanlarII heteromerik birlesmesi için kullanliâbilmektedir. DahasÇl alanlar arasEl disülfür baglarü tercihen ÖRNEKLER'de açiiZlandiglEiDzere kullanilâbilmektedir. Mevcut bulusun polipeptit kompleksleri, örnegin, Sekiller 17, 19 ve 24'te gösterilen yapllândlElnalarERapsamaktadlE Mevcut bulusun polipeptit kompleksleri, rekombinant antikorlar. üretilmesine yönelik yukar- açlKlanan yöntemler ile aynlJöntemler vasltâslüa üretilebilmektedir. DahasÇI mevcut bulus, mevcut bulusun polipeptit kompleksini kodlayan polinükleotitler ile ilgilidir. Mevcut bulusun bir polipeptit kompleksi, herhangi bir ekspresyon vektörüne eklenebilmektedir. Uygun bir konak, polipeptit kompleksini eksprese eden hücrelerin elde edilmesi için ekspresyon vektör ile dönüstürülmektedir. Polinükleotit taraf-an kodlanan polipeptit kompleksi, polipeptit kompleksini eksprese eden hücrelerin kültürlenmesi ve kültür süpernatantldan ekspresyon ürününün toplanmasü'asltâslîla elde edilebilmektedir. Spesifik olarak, mevcut tarifname, mevcut bulusun polipeptit kompleksini kodlayan bir polinükleotit taslýlan vektörler, vektörleri içeren hücreler ve mevcut bulusun polipeptit kompleksinin üretilmesine yönelik yöntemler ile ilgilidir, burada hücreler kültürlenmektedir ve polipeptit kompleksi kültür süpernatantIan toplanmaktadlü Yukarlâla açllîlananlar, rekombinant antikorlar için yukarlöla açllîlanan teknolojiler vasltâslsîla elde edilmektedir. Farmasötik bilesim Mevcut bulus ayrIEla, kanserin tedavi edilmesi veya önlenmesinde kullanIia yönelik terapötik maddeler ile ilgili olup, bir aktif içerik maddesi olarak mevcut bulusun polipeptit kompleksini içermektedir ve mevcut bulusun terapötik maddeleri tercihen kanser olan veya kanserin tekrar etmesi olaslllglII oldugu sujelere uygulanmaktadE Burada "bir aktif içerik maddesi olarak içermektedir" ifadesi, bir ana aktif içerik maddesi olarak polipeptit kompleksini içerme anlam- gelmektedir; ancak polipeptit kompleksinin içerik oran Blîllülegildir. Mevcut bulusa göre kanserin tedavi edilmesi veya önlenmesinde kullanllâm yönelik bir terapötik madde, gerekli olmasEldurumunda farklEbolipeptit kompleksi türleri ile formüle edilebilmektedir. Örnegin, bir antijeni eksprese eden hücrelere karsßitotoksik faaliyet, aynEl antijene baglanan mevcut bulusun çoklu polipeptit komplekslerinin bir kokteyli vasltBisMa gelistirilebilmektedir. Alternatif olarak, terapötik etki farklElbir antijene karsElbir antijen baglama alanEliçeren diger polipeptit komplekslerî ile kombinasyon halinde bir kanser antijenine baglanan bir antijen baglama alanüiçeren mevcut bulusun bir polipeptit kompleksinin formüle edilmesi vasißslýla artlülâbilmektedir. Gerekli olmaslîl durumunda, mevcut bulusun polipeptit komplekslerî, mikrokapsüllerin (hidroksimetilselüloz, jelatin, poli[metilmetaktilat] ve benzerinden meydana getirilen mikrokapsüller) içerisinde kapsüllenebilmektedir ve kolloidal ilaç tasIia sistemlerinin bilesenleri (Iipozomlar, albümin mikrosferleri, mikroemülsiyonlar, nano-partiküller ve nano- kapsüller) haline getirilebilmektedir (örnegin, bakIlîl Remington's Pharmaceutical Science 16th edition", Oslo Ed. (1980)). Dahasü yavas saIIiIEImaddeIer olarak maddelerin haziEIbnmas- yönelik yöntemler bilinmektedir ve bunlar, mevcut bulusun polipeptit Mevcut bulusa göre kanserin tedavi edilmesi veya önlenmesinde kullanIia yönelik antikanser maddeler, hastalara oral yoldan veya parenteral olarak uygulanabilmektedir. Parental uygulama tercih edilmektedir. Spesifik olarak, bu tür uygulama yöntemleri enjeksiyon, nazal uygulama, transpulmoner uygulama ve perkütanöz uygulamayElkapsamaktadlEI Enjeksiyonlar örnegin, intravenöz enjeksiyonlar, intramüsküler enjeksiyonlar, intraperitoneal enjeksiyonlar ve subkütanöz enjeksiyonlarERapsamaktadB Örnegin, mevcut bulusa göre kanserin tedavi edilmesi veya önlenmesinde kullanIia yönelik maddeler, enjeksiyon yoluyla lokal veya sistemik olarak uygulanabilmektedir. DahasÇiuygun uygulama yöntemleri hastanI yas. ve semptomlara göre seçilebilmektedir. Uygulanan doz, örnegin her bir uygulama için vücut aglEliigiEkg bas. 0.0001 mg ila 1,000 mg aral[gllrîk:lan seçilebilmektedir. Alternatif seçilebilmektedir. Ancak, mevcut bulusa göre kanserin tedavi edilmesi veya önlenmesinde kullanla yönelik bir terapötik madde bu dozlar ile sIlHiiIrliegildir. Mevcut bulusa göre kanserin tedavi edilmesi veya önlenmesinde kullanIia yönelik terapötik madde konvansiyonel yöntemlere göre formüle edilebilmektedir (örnegin Remington's Pharmaceutical Science, son baskiZl Mark Publishing Company, Easton, U.S.A.) ve ayrlîia, farmasötik olarak kabul edilebilir taslsîIEEr ve katkEmaddeleri içerebilmektedir. Örnekler, bunlarla sIiEIIIJJImamak üzere, yüzey etkin maddeleri, eksipiyanlar, renklendirme maddeleri, tatlandiEIEEmaddeler, koruyucular, stabilizörler, tamponlar, süspansiyon maddeleri, izotonik maddeler, baglaylîEimaddeler, daglEiEilâr, kaydlEiEliâr, aklgkanlllîi artlElna maddeleri ve korrigentleri kapsamaktadr ve yaygI olarak kullaniiân diger taslEEIlâr da uygun bir sekilde kullaniiâbilmektedir. TasMEBrI spesifik örnekleri, hafif anhidröz silisik asit, Iaktoz, kristalin selüllîl mannital, nisasta, karmelloz kalsiyum, karmelloz sodyum, hidroksipropil selüloz, hidroksipropil metil selüloz, polivinilasetal dietilaminoasetat, polivinilpirrolidon, jelatin, orta zincirli trigliserit, polioksietilen sertlestirilmis kastor yagEßO, sakkaroz, karboksimetil selüloz, migîlnisastasüinorganik tuz ve benzerini kapsamaktadE Mevcut bulus, ayrlîti, bir kanser antijeninin eksprese edilmesi için hücrelere zarar verilmesine yönelik ve kanser antijenini eksprese eden hücrelerin, kanser antijenine baglanan mevcut bulusun bir polipeptit kompleksi ile temas ettirilmesi vaslßslýla hücre büyümesinin basküânmas. yönelik yöntemler saglamaktadlîi Kanser antijenine baglanan monoklonal antikorlar, mevcut bulusun bir kanser antijeni baglama polipeptiti kompleksi olarak yukar. aç[EIanmakta olup, bu, kanserin tedavi edilmesi veya önlenmesinde kullanIia yönelik terapötik maddelerin içerisine dahil edilmektedir. Mevcut bulusun bir kanser antijeni baglama polipeptiti kompleksinin baglandglîihücreler, kanser antijenini eksprese ettikleri sürece sIlEllandlElIEnamaktadlEl Spesifik olarak, tercih edilen kanser antijenini eksprese eden hücreler, yumurtaIIEl kanseri hücreleri, prostat kanseri hücreleri, meme kanseri hücreleri, rahim kanseri hücreleri, karaciger kanseri hücreleri, akciger kanseri hücreleri, pankreatik kanser hücreleri, mide kanseri hücreleri, idrar torbasEkanseri hücreleri ve kolon kanseri hücrelerini kapsamaktadlEi Kanser antijeninin GPC3 olmasüdurumunda, hücreleri, GPC3 eksprese eden kanser hücreleri oldugu sürece sIiEIbndEiiBwamaktadlEi Ancak, tercih edilen kanser hücreleri, hepatokarsinom hücreleri, akciger kanseri hücreleri ve yumurtalllîl kanseri hücrelerini kapsamaktadlB vitro sekilde kültürlenen kanser antijenini eksprese eden hücrelerin kültür ortam. ilave edilmesi vasüâslýla gerçeklestiriIebilmektedir. Bu durumda, ilave edilecek olan bir polipeptit kompleksi, Iiyofilizasyon veya benzeri vasißisüla hazlîilanan bir çözelti veya bir katügiibi uygun bir formda kullanilâbilmektedir. Mevcut bulusun polipeptit kompleksinin bir sulu çözelti olarak ilave edilmesi durumunda, yalnlîca polipeptit kompleksini içeren bir saf sulu çözelti veya örnegin yukari açlElanan yüzey etkin maddesi, eksipiyan, renklendirme maddesi, tatland [Bina maddesi, koruyucu, stabilizör, tampon maddesi, asklîlla bßkma maddesi, Izotonize edici madde, baglayiîüinadde, parçalayiîlgikaydlümakigkanl[EiartiEiEüeya korrigent içeren bir çözelti olabilmektedir. Ilave edilen konsantrasyon özellikle sIiHiandlElE1amaktadiîi ancak, bir kültür ortamIiaki bir nihai konsantrasyon, 1 pg/ml ila 1 g/ml, daha tercihen 1 ng/ml ila 1 mg/ml ve daha tercihen 1 ug/ml ila 1 mg/ml arallgllEtladlEl yapIlglEinsan olmayan hayvanlara veya endojen olarak kanser antijenini eksprese eden kanser hücrelerine sahip hayvanlara uygulama vasllîlisMa gerçeklestirilebilmektedir. Uygulama yöntemi oral veya parenteral olabilmektedir. Parenteral uygulama özellike tercih edilmektedir. Spesifik olarak, parenteral uygulama yöntemi enjeksiyon, nazal uygulama, transpulmoner uygulama ve perkütanöz uygulamaylîkapsamaktadü Enjeksiyonlar örnegin, intravenöz enjeksiyonlar, intramüsküler enjeksiyonlar, intraperitoneal enjeksiyonlar ve subkütanöz enjeksiyonlarElkapsamaktadlEl Örnegin, mevcut bulusa göre kanserin tedavi edilmesi veya önlenmesinde kullanma yönelik maddeler, enjeksiyon yoluyla lokal veya sistemik olarak uygulanabilmektedir. Dahasü uygun bir uygulama yöntemi, bir hayvan sujenin yaslîila veya semptomlarIEla göre seçilebilmektedir. Polipeptit kompleksinin bir sulu çözelti olarak uygulanmasmurumunda, çözelti, yalnlîta polipeptit kompleksini içeren bir saf sulu çözelti veya örnegin yukari aç[lZlanan yüzey etkin maddesi, eksipiyan, renklendirme maddesi, tatlandlElna maddesi, koruyucu, stabilizör, tampon maddesi, asklâla bEakma maddesi, izotonize edici madde, baglaylîülnadde, parçalaylEÇIkaydlElEÇIaklgkanlllZJartIElEÜeya korrigent içeren bir çözelti olabilmektedir. Uygulanan doz, örnegin her bir uygulama için vücut aglîlilglükg'si baslEb 0.0001 ila 1,000 mg arallglIan seçilebilmektedir. Alternatif olarak mevcut bulusun bir polipeptit kompleksinin dozu bu örnekler ile sIEllBlegildir. Asag- açlElanan yöntemler, tercihen, mevcut bulusun bir polipeptit kompleksinin, mevcut bulusun polipeptit kompleksini olusturan antijen baglama alanII baglandlglÇl antijen eksprese eden hücreler ile temas ettirilmesinden dolayEl meydana gelen hücresel sitotoksisitenin degerlendirilmesi veya belirlenmesi için bir yöntem olarak kullanllBîaktadlEl Sitotoksik aktivitenin in vitro sekilde degerlendirilmesi veya belirlenmesine yönelik yöntemler, sitotoksik T hücrelerin veya benzerinin aktivitesinin belirlenmesine yönelik yöntemleri kapsamaktadlEl Mevcut bulusun bir polipeptit kompleksinin T hücresi arac[[l]]hücresel sitotoksisiteyi indükleme aktivitesine sahip olup olmadlglü bilinen yöntemlerle belirlenebilmektedir (bakIlZJ örnegin, Current protocols in Immunology, Chapter 7. kompleksinin antijen baglama alantharafIan tanlndan farklljblan bir antijene baglandlgIEl ve hücrelerin içerisinde eksprese edilmeyen bir polipeptit kompleksi, bir kontrol polipeptit kompleksi olarak kullanilIhaktadlE Kontrol polipeptit kompleksi, aynu sekilde denenmektedir. Ardian, aktivite, mevcut bulusun bir polipeptit kompleksinin, bir kontrol polipeptit kompleksine klýlasla daha güçlü bir sitotoksik aktivite sergileyip sergilemediginin test edilmesi vasltâslýla degerlendirilmektedir. Bu zaman zarfIia, in w'vo sitotoksik aktivite, örnegin asaglâbki prosedür vasßslîla degerlendirilmekte veya belirlenmektedir. Mevcut bulusun bir polipeptit kompleksini olusturan antijen baglama alanII bagland[gll:lantijeni eksprese eden hücrelerin, insan olmayan bir hayvan sujeye Intrakütanöz veya subkütanöz sekilde transplasyonu gerçeklestirilmektedir. Ard-an, transplayon gününden itibaren veya bundan sonra, bir test polipeptit kompleksi, her gün veya birkaç gün aralllZlarla damara veya peritonel kaviteye uygulanmaktadE Tümör boyutu zamanla ölçülmektedir. Tümör boyutundaki degisimdeki farklll]k`1 sitotoksik aktivite olarak tanIilanabilmektedir. Bir in vitro denemede oldugu gibi, bir kontrol polipeptit kompleksi uygulanmaktadlEl Kontrol polipeptit kompleksinin uyguland[gll:lgruba klýhsla, mevcut bulusun polipeptit kompleksinin uygulandlgllîgrupta tümör boyutunun daha küçük olmasülurumunda, mevcut bulusun polipeptit kompleksinin sitotoksik aktiviteye sahip oldugu düsü nülebilmektedir. Izotop ile isaretlenmis timidinin hücrelere tutulumumun ölçülmesi ve bir MTT yöntemi, tercihen, polipeptit kompleksini olusturan antijen baglama alanII baglandlglEbir antijeni eksprese eden hücrelerin büyümesinin baskllânmaslîliçin mevcut bulusun bir polipeptit kompleksi ile temalel etkisinin degerlendirilmesi veya belirlenmesi için kullanllhiaktadlEI Bu zaman zarfIda, in w'i/o sitotoksik aktivitenin degerlendirilmesi veya belirlenmesine yönelik yukarüia açlKlanan yöntemler, tercihen, hücre büyümesinin i'n i/i'vo sekilde baskliânmas- yönelik aktivitenin degerlendirilmesi veya belirlenmesi için kullanüâbilmektedir. Mevcut tarifname ayrlEla, mevcut bulusun bir polipeptit kompleksini içeren kitleri de açlEIamaktadB Kitler, farmasötik olarak kabul edilebilen ilave bir tasIILIED/eya ortam, veya kitlerin kullanIiIBçlKlayan bir kullanma talimatüle benzeri ile birlikte paketlenebilmektedir. Buradan itibaren, mevcut bulus, Örnekler'e referansla spesifik sekilde açllZlanmaktadlîl ancak bunlarla sIlEIllIdJIdugu düsünülmemelidir. (1) Taslak In V/VO sekilde uygulanan bir proteinin kandaki yarEömrünün uzatUBias- yönelik iyi bilinen bir yöntem mevcuttur, bu yöntem, bir antikor Fc alanlEb konjugatlanan bir ilgili protein kullanilârak FcRn-aracEIJJZlgeri dönüstürmeye dayanmaktadlü Ancak, bir dogal tip Fc'nin BiTE'ye konjugatlanmasÇlçesitli sitokinlerin indüklenmesine yol açabilmektedir, zira bir tek molekül, BITE klginII anti-CD3 scFv'si vasüslýla bir T hücresine ve es zamanIEblarak örnegin bir NK hücresi veya makrofajI hücresel zarEüzerinde, Fc alanEl/asltîiisIEa Fch'ye (Fcy reseptörü) baglanabilmektedir ve elde edilen çapraz baglama, bir kanser antijenine bagIiIElsekiIde bu hücreleri aktive edebilmektedir. Dolaylglsîla, bir BiTE'nin, bir polipeptit baglaylEü/asiüslgla, indirgenis Fcy reseptörü baglama aktivitesine (sessiz Fc) sahip olan bir Fc alan. baglandigilZI ERY2 olarak adlandlîllân bir molekül hazlîlhnmlgtlîl ve ERY2'nin aktivitesi, bunun BiTE'nin aktivitesi ile karsllâstlEllBiasEl/asßslîla degerlendirilmektedir. Bir anti-CD3 epsilon antikorunun scFv'si, bir kisa peptit baglaylîlîü/asißslýla, Glipikan 3'e (G) karsüiiir antikorun scFv'sine baglanmlglolup, bu, GPC3'e karslIQGPC3 BITE) BiTE'nin üretilmesi için karaciger kanseri hücrelerinde yüksek bir seviyede eksprese ediligi bilinen, GPI'ya tutunmus bir proteindir (Sekil 17A). ArdIdan bu, GPC3'e (GPC3 ERY2) karsEbir ERY2'nin üretilmesi için bir sessiz Fc'ye baglanmigtlEI(SekiI 17C). Dahasübir normal IgG tipi anti-GPC3 antikoru karsilâstlElna için meydana getirilmistir. IgG tipi anti-GPC3 antikoru, seker zinciri klginIa indirgenmis fukoz içerigine sahip olan bir antikor, yani artlEIlBilgI bir ADCC aktivitesine sahip oldugu bilinen bir düsük fukoz antikoru olarak hazlEllanmlStlü (2) GPC3 BiTE'nin meydana getirilmesi Bir kallöl olarak bir anti-GPC3 antikoru için bir ekspresyon vektörünün kullanI[gll:|PCR amplifikasyonu vasltiislýla, her birinin bir H zinciri degisken bölgesini (anti GPC3 VH) veya bir L zinciri degisken bölgesini (anti-GPC3 VL) kodladigEtDNA'Iar elde edilmistir. Anti-GPC3 VH ve anti-GPC3 VL'nin, bir baglaylîljvasßslîla GIy-GIy-GIy-GIy-Ser'nin (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 7) üç tekrarEile birbirine baglandigiEbir amino asit sekans. sahip bir anti-GPC3 scFv'yi kodlayan bir cDNA fragmentinin meydana getirilmesi için kalülar olarak, uygun ilave sekanslarEi'beren primerlerin ve yukarlöhki cDNA'IarI kullan UBiaslýla PCR gerçeklestirilmistir. DahasÇlbir oligonükleotit serisi hazlîllanmlglolup, bunlardan her biri, bir anti-CD3 antikorunun (M12) H zinciri degisken bölgesinin (M12 VH) veya L zinciri degisken bölgesinin (M12 VL) bir klîlni sekansIEkodlayan bir nükleotit sekanlela sahipti ve uçlarda tamamlaylEDsekanslara sahipti. Oligonükleotitler; H zinciri degisken bölgesine (M12 VH) ve L zinciri degisken bölgesine (M12 VL) karsllIEl gelen bir polinükleotitin sentezlenmesi için polimeraz reaksiyonu vaslliisüla, tamamlayEElsekans kilarlîlaraclüglîla birbirine baglanabilecekleri sekilde tasarlanmaktadlEl Oligonükleotitler karßtmßtlîlve ardIan, ilgili degisken bölgelerin amino asit sekanslarIEl kodlayan iki cDNA'nI elde edilmesi için PCR vasiûslýla bir araya toplanmlStE M12 VL ve M12 VH'nin, Gly-Gly-Gly-GIy-Ser'nin (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 7) üç tekrarlEb sahip bir baglaylîüiasltâsüla birbirine baglandfglîlhir amino asit sekans- sahip bir M12 scFv'yi kodlayan bir cDNA fragmentinin meydana getirilmesi için kallüar olarak, uygun ilave sekanslarEliçeren primerlerin ve yukarlki cDNA'larI kullanilüîaslîla PCR gerçeklestirilmistir. ArdIan, kallülar olarak her birinin anti-GPC3 scFv veya M12 scFv'yi kodladiglEchNA fragmentleri ve uygun ilave sekanslarEilçeren primerlerin kullanIlgllîlPCR vaslmsüla bir cDNA fragmenti meydana getirilmis olup, bu, anti-GPC3 scFv ve M12 scFv'nin GIy-Gly-GIy-Gly- Ser'den (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 7) olusan bir baglayEEl/aslüslîla birbirine baglandlgllîl bir amino asit sekansIEkodlamEtlEve bunun C terminusu, bir His etiketine sahip olmustur (sekiz histidin) (amino terminal 19 amino asidi olmakslîlEl, SEKANS KIMLIK NUMARASI:33'ün sekansDJ Uygun ilave sekanslarlZliçeren primerlerin ve amino terminal 19 amino asidi eksik olan SEKANS KIMLIK NUMARASI:33'ün amino asit sekansIElkodlayan cDNA fragmentinin bir kallül olarak kullanllüîaslýla, bir EcaRI bölünme sekansIEl, kozak sekansII ve bir salgllâma sinyali sekansIElkodlayan bir nükleotit sekansIlEI, yukarlEIhki cDNA fragmentinin 5' ucuna tutturuldugu ve bir Nod sekanlellEl ise 3' ucuna tutturuldupu bir cDNA fragmentinin üretilmesi için PCR gerçeklestirilmistir. Elde edilen cDNA fragmenti EcoRI ve Nod ile bölünmüstür ve GPC3 BITE için bir ekspresyon vektörünün elde edilmesi için bir memeli hücresi ekspreson ventörünün içine eklenmistir (SEKANS KIMLIK NUMARASI:33; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansüilarak islev görmektedir). Vektör, elektroporasyon vaslßslîla CHO DG44 hücrelerine verilmistir. Seyreltinin sIlEIlandlEllB1asIan sonra, ilaca dirençli hücre hatlarII izole edilmesi için hücreler 1 mg/ml Genetisinin varl[g]Ia kültürlenmistir. Elde edilen hücre hatlarII kültür süpernatantüGPC3 BiTE eksprese eden bir hücre hattII seçilmesi için bir anti-His etiketi antikorunun kullan-@El Western blot ile analiz edilmistir. Yukarlîlla açüZianan hücre hattII genis çapIEhücre kültürü vaslßslýla elde edilen hücre süpernatantübir SP Sepharose FF kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. Kolon ylElandHZtan sonra, GPC3 BiTE içeren bir fraksiyon bir NaCI konsantrasyonu gradyanEile ayrlgtlîlllBiligtlEl Fraksiyon, bir HisTrap HP kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. Kolon yHZlandHZtan sonra, GPC3 BiTE içeren bir fraksiyon bir imidazol konsantrasyonu gradyanEile ayrlSIlEllBIIStE Fraksiyon ultrafiltrasyon vaslßsgla konsantre edilmistir ve konsantre, bir Superdex 200 kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. Yalnlîta bir monomerik GPC3 BiTE fraksiyonu, saflastlEllEilglGPC3 BiTE'nin elde edilmesi için toplanmlStE (3) GPC3 ERY2'nin meydana getirilmesi Yukar- açllZlanan yöntemde oldugu gibi uygun ilave sekanslarEIlçeren primerlerin kullan-[gl] PCR ve QuikChange Bölge Yönelimli Mutajenez Kitinin (Stratagene) kullanIiglEbir yöntem gibi teknikte uzman kisilerce iyi bilinen bir yöntem, GPC3 ERY2_Hk (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 34; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslîblarak islev görmektedir) veya GPC3 ERY2_Hh'yi (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 35; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslllarak islev görmektedir) kodlayan bir polinükleotitin eklendigi ekspresyon vektörlerinin üretilmesi için gerçeklestirilmistir. Bu ekspresyon vektörleri, GPC3 ERY2'nin etkili bir sekilde eksprese edilmesi için FreeSter293-F hücrelerine (Invitrogen) birlikte verilmistir. Elde edilen kültür süpernatantÇlbir Anti FLAG M2 kolonu (Sigma) üzerine yüklenmistir. YlEiamadan sonra, kolon 0.1 mg/ml FLAG peptiti (Sigma) ile ayrlgtlülmlgtlîl GPC3 ERY2 içeren bir fraksiyon, bir HisTrap HP kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. YlElamadan sonra, kolon, bir imidazol konsantrasyon gradyanEliIe ayrlStlEllIhlStE GPC3 ERY2 içeren bir fraksiyon ultrafiltrasyon vasltâslýla konsantre edilmistir ve konsantre, bir Superdex 200 kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. Yalnlîta bir monomerik GPC3 ERY2 fraksiyonu, saflastßllîhlgl GPC3 ERY2'nin elde edilmesi için eluattan toplanmlgtß (4) Düsük fukozlu anti-GPC3 antikorunun meydana getirilmesi antikoru olarak adlandlEllIhaktadIB yönelik bir ekspresyon vektörü, elektroporasyon verilmistir. Seyreltinin sIlEllandEllIhasIan sonra, ilaca dirençli hatlarI seçilmesi için hücreler 0.5 mg/ml Genetisinin varllglia kültürlenmistir ve bir düsük fukozlu anti-GPC3 antikorunu eksprese eden bir hücre hattlîelde edilmistir. Bu hücrelerin kültürlenmesiyle edle edilen kültür süpernatantIan, Hitrap® Protein A (Pharmacia) kullanilârak konvansiyonel afinite sflastlElnasEl/aslüslýla bir antikor fraksiyonu hazEllanmlgtE ArdIan, Superdex 2 kullanüârak antikor fraksiyonu jel filtrasyonu saflastlEnasEb maruz blßklliilgtlîl Bir monomer fraksiyonu, bir düsük fukozlu anti-GPC3 antikorunun elde edilmesi için eluattan toplanmlgtß (5) Insan periferal kan mononükleer hücrelerinin kullan-@Sitotoksisite denemesi ( süspansiyonunun haziElbnmasEl SaglllZJEgönüllülerden (yetiskin) önceden 100 pl 1,000 birim/ml heparin çözeltisinin (Novo- Heparin 5000 birimleri, enjeksiyon için; Novo Nordisk) Ilave edildigi slElElgalarI kullanllîhaslgla 50 ml periferal kan toplanmlgtlEI Periferal kan PBS(-) ile iki kat seyreltilmistir, dört esit alikota ayrllßîlgtEl ve 15 ml FicolI-Paque PLUS'I enjekte edildigi ve önceden santrifüjlenen Leucosep Ienfosit aylElna tüplerine (Kat. No: 227290; Greiner bio-one) ilave edilmistir. AylElna tüplerinin santrifüjlenmesinden (2,150 dds (rpm), 10 dakika, oda lelakIEgID] sonra, bir mononükleer hücre fraksiyonu tabakasEltoplanmlstlB Mononükleer hücre fraksiyonu içerisindeki hücreler %10 FBS (buradan itibaren %10FBS/D-MEM olarak adlandEllân) içeren Dulbecco'nun Modifiye edilmis Eagle OrtamEI(SIGMA) ile bir kez yllZlanmlStlElve ardIan hücre yogunlugu %10FBS/D-MEM kullanüârak 4 x 106 hücre/ml'ye ayarlanmlStlEI Bu sekilde elde edilen hücre süspansiyonu, sonraki deneylerden bir insan PBMC süspansiyonu olarak kullanilmlStB (5-2) Sitotoksik aktivite denemesi Sitotoksik aktivite, xCELLigence gerçek zamanlElanalizör (Roche Diagnostics) kullanilarak belirlenen hücre büyümesi inhibisyon oran. dayanarak degerlendirilmistir. Kullanilân hedef hücre, insan GPC3'ün SK-HEP-l hücre hattlîlçerisinde zorla eksprese edilmesiyle meydana getirilen SK-pca13a hücre hattlsîdlîlSK-pca13a hücreleri, kaplardan ayrilBilgtlEl ve 1 x 104 hücre/çukurcuktaki ( plakasEüzerinde tohumlanmlStlE ArdIan yasayabilir hücre denemesi, xCELLigence gerçek zamanlEhücre analizörünün kullanilBiaslýla baslatllBilStlEl Sonraki gün, plaka xCELLigence gerçek zamanlEl hazEllanan her bir antikordan 50 ul, plakaya ilave edilmistir. Oda slîlakllgiia 15 dakikalllâ reaksiyondan sonra, (5-1)'de hazlElanan 50 pl insan PBMC süspansiyonu (2 x 105 hücre/çukurcuk) ilave edilmistir. Plaka, yasayabilir hücre denemesinin baslatllßîasülçin tekrar xCELLigence gerçek zamanlühücre analizörünün içerisine koyulmustur. Reaksiyon, 37°C'deki insan PBMC'Ierinin ilave edilmesinden 72 saat sonra Hücre Indeksi degeri kullanllârak, asagi gösterilen formüle göre belirlenmistir. Hesaplamada kullanilan Hücre Indeksi degeri, antikorun ilave edilmesinden hemen önce Hücre Indeksi degerinin 1 olarak alicaglîsekilde normalize edilmistir. Hücre büyümesi inhibisyon oranEQS) = (A-B) x 100/(A-1) A, antikorsuz çukurcuk (yalnlîta hede hücre ve insan PBMC) için ortalama Hücre Indeks degerini göstermekteyken, B, her bir çukurcuk için ortalama Hücre Indeks degerini göstermektedir. Bu ölçüm üç kopya halinde gerçeklestirilmistir. GPC3 BiTE, GPC3 ERY2, ve IgG-tipi anti-GPC3 antikorunun sitotoksik aktivitesi, efektör hücreler olarak insan kanElle hazlEllanan PBMC'Ierin (periferal kari mononükleer hücreleri) kullanllüiaslsîla ölçülmüstür. GPC3 BiTE oldukça güçlü bir aktivite sergilemistir (Sekil 1). Bu aktivite, düsük fukozlu anti-GPC3 antikoruna klýlasla çok daha güçlüydü. Dolaylîlîda, GPC3 BiTE, IgG-tipi antikoru asan, oldukça iyi bir kanser terapmtik maddesi olarak islev görebilmektedir. Diger yandan, GPC3 ERY2'nin aktivitesi, GPC3 BiTE'ninki kadar güçlü degildi, ancak IgG tipi anti-GPC3 antikorundan daha fazlaydlZI Bu, yalnlîta Fc'nin BiTE'ye ilave edilmesinin, arzu edilen molekülün meydana getirilmesini saglamad [gllügöstermektedin degerlendirilmesi Ardian, spesifik aktivitenin aktarllIhasEiçin, kanser antijeni (GPC3) baglama alanükanser hücresi baglama aktivitesinin artlîllE'iasEbmaclýla iki degerlikli hale getirilmistir. Bir baska anti-GPC3 scFv, GPC3 ERY5'in meydana getirilmesi için GPC3 ERY2'ye ilave edilmistir (Sekil 170). DahasÇiscFv yerine, bir Fab-tipi GPC3 baglama alanüGPC3 ERY7'nin üretilmesi için ilave edilmistir (Sekil 17F). Ilaveten, GPC3 ERY6 (Sekil 17E) da meydana getirilmis olup, burada GPC3 ERY5'in anti-CD3 epsilon scFv'si iki kola ayrllßnlgtß Spesifik olarak, yukarlfiiaki yöntemde oldugu gibi uygun ilave sekanslarljçeren primerleirin kullanIEgElPCR gibi teknikte uzman kisilerce bilinen bir yöntem, GPC3 ERY5_Hh, GPC3 ERY6_Hk, GPC3 ERY6_Hh, GPC3 ERY7_Hh, veya GPC3 ERY7 L'yi kodlayan bir polinükleotitin eklendigi ekspresyon vektörlerinin bir serisinin üretilmesi için gerçeklestirilmistir. Ekspresyon vektörlerinin asaglahki kombinasyonlarütasarlanan her bir moleküsün klEla süreli olarak eksprese edilmesi için FreeSter293-F hücrelerine verilmistir. A. Tasarlanan molekül: GPC3 ERY5 Ekspresyon vektörlerinin içine eklenen polinükleotitler tarafIan kodlayanan polipeptitler: GPC3 ERY5 (SEKANS KIMLIK NUMARASI:36; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansßlarak islev görmektedir) ve GPC3 ERY2_Hk B.Tasarlanan molekül: GPC3 ERY6 Ekspresyon vektörlerinin içine eklenen polinükleotitler taraflikjan kodlayanan polipeptitler: GPC3 ERY6_Hk (SEKANS KIMLIK NUMARASI:37; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansEblarak islev görmektedir) ve GPC3 ERY6_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 38; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslîilarak islev görmektedir) C.Tasarlanan molekül: GPC3 ERY7 Ekspresyon vektörlerinin içine eklenen polinükleotitler tarafüldan kodlayanan polipeptitler: GPC3 ERY7_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI:39; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslZloIarak islev görmektedir), GPC3 ERY7_L (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 40; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansüblarak islev görmektedir) ve GPC3 ERY2_Hk Elde edilen kültür süpernatantü bir Anti FLAG M2 kolonu (Sigma) üzerine yüklenmistir. YiiZlamadan sonra, kolon ile ayrEtlEllißîlgtlEl Tasarlanan molekülü içeren bir fraksiyon, bir HisTrap HP kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. YiElamadan sonra, kolon, bir imidazol konsantrasyon gradyanEiIe ayrigtlElIhlStlEl Tasarlanan molekülü içeren bir fraksiyon, ultrafiltrasyon vasiüslîla konsantre edilmistir. ArdIan, fraksiyon bir Superdex 200 kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. Yalnlîta bir monomer fraksiyonu, tasarlanan, saflastlEllIhlSl her bir molekülün elde edilmesi için eluattan toplanmlgtlEl Bu polipeptit kompleksleri, sitotoksik aktivite bakIiIan GPC3 BITE ile karsHâstlEllBilStE Sonuç, bu polipeptit komplekslerinin sitotoksik aktivitesinin, GPC3 BiTE'ninki kadar fazla olmad[giIElgöstermektedir (Sekiller 2 ila 4). Bu bulgu, Fc'nin BITE yap_ veya bunun mimetik yap_ ilave edilmesinin ve bir kanser antijenine iki degerlikli baglanmayülnümkün kilân konfigüarsyonun, arzu edilen molekülün meydana getirilmesini saglamadigllü göstermektedir. degerlendirilmesi ArdEUan, hiçbir BITE yapisi& sahip olmayan, ancak arzu edilen aktiviteye sahip olan moleküller tasarlanmlgtE Bir anti kanser antijeni (GPC3) IgG, bir omurga olarak kullanilBilgEl ve bir anti-CD3 epsilonu scFv'nin bu omurgaya ilave edildigi bir molekül meydana getirilmistir. Bir omurga olarak kullanilân IgG Fc, yukari açüîlanan durumlarda oldugu gibi, indirgenmis Fch (Fcy reseptörü) baglama aktivitesine sahip olan bir sessiz Fc idi. GPC3 ERY meydana getirilmis olup, burada, anti-CD3 epsilonu scFv'si, süsüla, anti-GPC3 antikoru IgG'nin H zincirinin N terminusuna, H zincirinin C terminusuna ve L zincirinin C terminusuna tuttu rulmustur. Spesifik olarak, yukarlöla açHZlanan yöntemde oldugu gibi uygun ilave sekanslarEIiçeren primerlerin kullanIEgiüPCR gibi, teknikte uzman kisilerce bilinen bir yöntem vaiûislýla, ekspresyon vektörlerinin bir serisi meydana getirilmis olup, buraya, GPC3 ERY8-2_Hk (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 41; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansEblarak islev görmektedir), GPC3 ERY8-2_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 42; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslîblarak islev görmektedir), GPC3 ERY9-1_H (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 43; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslîblarak islev görmektedir), GPC3 ERY9-1_L-His (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 44, olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansEblarak Islev görmektedir), GPC3 ERY9-1_L-FLAG (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 45; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslZblarak islev görmektedir) veya GPC3 ERY10-1_Hh'yi (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 46; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansljblarak islev görmektedir) kodlayan bir polinükleotit eklenmistir. Ekspresyon vektörlerinin asaglki kombinasyonlarütasarlanan her bir molekülün kisa süreli olarak eksprese edilmesi için FreeStyle293-F hücrelerine verilmistir. D.Tasarlanan molekül: GPC3 ERY8-2 Ekspresyon vektörlerinin içine eklenen polinükleotitler tarafIdan kodlayanan polipeptitler: GPC3 ERY8-2_Hk (SEKANS KIMLIK NUMARASI:41; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansEblarak islev görmektedir), GPC3 ERY8-2_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 42; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslîcblarak islev görmektedir) ve GPC3 ERY7_L E.Tasarlanan molekül: GPC3 ERY9-1 0249 Ekspresyon vektörlerinin içine eklenen polinükleotitler taraflîitlan kodlayanan polipeptitler: GPC3 ERY9-1_H (SEKANS KIMLIK NUMARASI:43; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansEblarak islev görmektedir), GPC3 ERY9-1_L-His (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 44; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslîolarak islev görmektedir) ve GPC3 ERY9-1_L- FLAG (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 45; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslîrlilarak islev görmektedir) F. Tasarlanan molekül: GPC3 ERYlO-l Ekspresyon vektörlerinin içine eklenen polinükleotitler tarafIdan kodlayanan polipeptitler: GPC3 ERY10-1_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI:46; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansüilarak islev görmektedir) ve GPC3 ERY8-2_Hk, GPC3 ERY7_L Elde edilen kültür süpernatantü bir Anti FLAG M2 kolonu (Sigma) üzerine yüklenmistir. Y[lZlamadan sonra, kolon ile ayrlgtlElllBilgtlB Tasarlanan molekülü içeren bir fraksiyon, bir HisTrap HP kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. YiElamadan sonra, kolon, bir imidazol konsantrasyon gradyanEile ayrlgtlîllHiIStEI Tasarlanan molekülü içeren bir fraksiyon, ultrafiltrasyon vaslßslýla konsantre edilmistir. ArdIan, fraksiyon bir Superdex 200 kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. Yalnlîta bir monomer fraksiyonu, tasarlanan, saflastlEIlIhlS her bir molekülün elde edilmesi için eluattan toplanmlgtß Bu moleküller, in vitro sitotoksik aktiviteye yönelik olarak degerlendirilmistir. Sonuç, tüm moleküllerin, GPC3 BiTE ile karsilâstlEllâbilir olan veya bundan daha fazla olan bir sitotoksik aktiviteyi sergiledigini göstermektedir (Sekil 5). Özellikle, GPC3 ERY9-1 ve GPC3 ERY10-1'in, GPC3 BiTE'den açllZl sekilde daha fazla olan bir sitotoksik aktivite sergiledigi bulunmustur. Ilk kez mevcut bulus, bir anti-CD3 epsilon scFv'sinin, bir anti kanser antijeni IgG'ye ilave edilmesiyle olusturulan moleküllerin de BiTE'ninki ile karsllâstlîllâbilir olan veya bundan daha fazla olan bir sitotoksik aktiviteye sahip oldugunu göstermistir. Özellikle, GPC3 ERY9-1 ve GPC3 ERY10-1 gibi moleküllerin, bunlarlEJ kanser antijeni baglama alanEl/e CD3 epsilonu baglama alanElaraletla büyük bir uzakl[lZ| olmaleIa ragmen BiTE'den daha fazla olan bir sitotoksik aktivite sergilemesi sasi-IE! (2) GPC3 ERY8-2 ve GPC3 ERY10-1'in in Viva etkinliginin degerlendirilmesi (1)'de açilZlanan in vitro denemede GPC3 BiTE ile karsilâstlîllâbilir veya bundan daha fazla olan bir sitotoksik aktivite sergileyen GPC3 ERY8-2 ve GPC3 ERY10-1, in i/ii/o etkinlik için degerlendirilmistir. Insan akciger kanseri hücre hattEIPC-lO'u eksprese eden GPC3'ün hücreleri, insan PBMC'Ieri ile karStlEllB'iIStlEl ve ardIan bunun, NOD scid (ciddi kombine baglgEllKl yetmezligi) farelerine transplasyonu gerçeklestirilmistir. Fareler, GPC3 ERY8-2 veya GPC3 ERY10-1'nin (ön-karlglEii modeli olarak adlandmaktadlî) uygulanmasElile tedavi edilmistir. Spesiûk olarak, PC-10 ön karElEli modelinin kullanlJIhaslîla GPC3 ERY8-2 için etkinlik testi asaglîlhki gibi gerçeklestirilmistir. PBMC'ler, sagllElügönüllülerden alin kandan izole edilmistir. NK hücreleri, CD56 MicroBead'Ierin, insan (MCAS Miltenyi biotec), kullanllîhaslsîla PBMC'lerden giderilmistir. Insan akciger skuamöz karsinom hücre hattEPC-IO (Immuno- Biological Laboratories Co., Ltd.) (5 x 106 hücre), yani NK hücrelerinin olmadlgiüinsan PBMC'leri(4.5 x 106 hücre), ve Matrigel TabanlEZar Matrisi (BD) karlStEIlBügtElve ardIan, bunun, NOD scid farelerinin (CLEA Japonya Inc. ; disi, 7W) kaleJ bölgesine subkütanöz olarak transplasyonu gerçeklestirilmistir. Transplasyon günü, gün 0 olarak belirlenmistir. Transplasyondan önceki gün, bir anti-asiyalo GM1 antikoru (Wako Pure Chemical Industries), 0.2 mg/kafa miktarlEtla farelere intraperitoneal sekilde uygulanmlgtlE Transplasyondan 2 saat sonra, GPC ERY8-2, 30 iJg/kafa miktarIa intraperitoneal sekilde uygulanmlStlEl GPC ERY8-2, günler 0 ila 4 süresince toplamda bes kez uygulanmlgtlEl DahaslZIPC-lû ön karm modelinin kullanilIhasEla GPC3 ERY10-1 için etkinlik testi asag-ki gibi gerçeklestirilmistir. PBMC'ler, saglllZIEgönüllülerden allElan kandan izole edilmistir. NK hücreleri, CD56 MicroBead'Ierin, insan (MCAS Miltenyi biotec), kullanHÜiaslýla PBMC'lerden giderilmistir. Insan akciger skuamöz karsinom hücre hattlîl PC-10 (Immuno-Biological Laboratories Co., Ltd.) (5 x 106 hücre), yani NK hücrelerinin olmadlglElnsan PBMC'leri (4.5 x 106 hücre), ve Matrigel TabanlEZar Matrisi (BD) karlStlElIBüStlElve ard Edan, bunun, NOD scid farelerinin (CLEA Japonya Inc.; disi, 7W) kasllZl bölgesine subkütanöz olarak transplasyonu gerçeklestirilmistir. Transplasyon günü, gün 0 olarak belirlenmistir. Transplasyondan önceki gün, bir anti-asiyalo GMl antikoru (Wako Pure Chemical Industries), 0.2 mg/kafa miktarlrîbla farelere intraperitoneal sekilde uygulanmlgtlîl Transplasyondan 2 saat sonra, GPC ERY10-1, ug/kafa miktarIa intraperitoneal sekilde uygulanmßtß GPC ERY10-1, günler 0 ila 4, günler 7 ila 11 ve günler 14 ila 16 süresince toplamda 13 kez uygulanmlgtlü Sonuçlar, GPC3 ERY uygulama gruplar. klýbsla, tümör büyümesinin açik] sekilde baskllând[g]I|:göstermektedir (Sekiller 6 ve 7). DahaslZl GPC3 ERY10-1 ayrlEla, alternatif bir model kullanllârak in Viva etkinlik için de degerlendirilmistir. Spesihk olarak, T hücreleri, insan PBMC'lerinin in vitro sekilde kültürlenmesi ile büyütülmüstür ve ardIan, transplasyonu gerçeklestirilen PC-10'dan dolayü tümör gelistiren NOD scid farelerine verilmistir. Fareler, GPC3 ERY10-1'in (T hücresi transfer olarak adlandlEllBiaktadlE) uygulanmasüle tedavi edilmistir. Spesifik olarak, PC-10 T hücresi transfer modelinin kullanllüiaslýla GPC3 ERY10-1 için etkinlik testi asaglöhki gibi gerçeklestirilmistir. T hücresi genisletme kültürü, T hücresi aktivasyon/genisletme kiti/insan (MACS Miltenyi biotec) ve sagllkllîlgönüllülerden aIIElan kandan izole edilen PBMC'Ierin kullanllüiasüla gerçeklestirilmistir. Insan akciger skuamöz karsinom hücre hattEPC-lO (Immuno-Biological Laboratories Co., Ltd.) (1 x 107 hücre), Matrigel TabanIEZar Matrisi (BD) ile karlgtlElIhlStlEIve ardIan, bunun, NOD scid farelerinin (CLEA Japonya Inc.; disi, 7W) kasllZl bölgesine subkütanöz olarak transplasyonu gerçeklestirilmistir. Transplasyon günü, gün 0 olarak belirlenmistir. Transplasyondan önceki gün ve günler 6, 8, 12, 16 ve 20'de, bir anti-asiyalo GMl antikoru (Wako Pure Chemical Transplasyonun 6'lEicEl gününde, fareler tümör boyutu ve vücut aglEIl[gll:l bak"an gruplanmlgtlîl ve ardIdan, yukari açlElandiglEl üzere genisletme kültürü vasißslýla hazlîllanan T hücrelerinin, peritoneal kavite içerisine 1 x 107 hücre/kafa miktarIda transplasyonu saglanmlStEl Transplasyondan 2 saat sonra, GPC ERY10-1, 30 ug/kafa toplamda bes kez uygulanmlgtlîl Sonuç, bu modelin GPC3 ERY10-1 uygulama grubunun, çözücü uygulama grubuna klýbsla, açliîl bir anti-tümör etkisi sergiledigini göstermektedir (Sekil 8). Yukari açlElanan bulgu, bir anti-CD3 epsilonu antikorunun bir scFv'sinin, bir sessiz Fc'ye sahip bir IgG omurgas- ilave edildigi bir molekül serisinin, açlE bir in Viva anti-tümör etkisi sergiledigini göstermektedir. (3) Plazma tutulumunun degerlendirilmesi plazma içerisinde ciddi oranda daha uzun bir yarü ömre sahip olup olmad[glII degerlendirilmesi için, GPC3 ERY9-1 ve GPC3 ERY10-1, hiçbir kanser hücresinin transplasyonunun gerçeklestirilmedigi NOD scid farelerine 30 tig/kafa miktarIa uygulanmlgtiîlve bunlarI plazma konsantrasyonlarlîamanla ölçülmüstür. Spesifik olarak, PK analizi asaglki sekilde gerçeklestirilmistir. GPC3 ERY9-1 ve GPC3 ERY10- 1, NOD scid farelerine (CLEA Japonya Inc.; disi, 8W) 30 tig/kafa miktarlîilja intraperitoneal sekilde uygulanmlâtlEl Uygulamadan sonraki 15 dakika, iki saat, 1 gün, 2 gün ve 7 günde, hematokrit kIal damarlari kullanllüiaslýla (Terumo) farelerin agiz damarIan kan allEtnlgtlEl Plazma kandan hazlîllanmlgtlrîl ERY10-1'in GPC3/BaF ve CD3/BaF ile reaksiyona girmesinin mümkün kHJEmasElçin GPC3 eksprese eden Ba/F3 hücrelerine (GPC3/BaF) veya insan CD3 epsilonu eksprese eden Ba/F3 hücrelerine (CD3/BaF) ilave edilmistir. Bu hücrelerin ylEanmasIan sonra, bir FITC isaretli ikincil antikor ileri reaksiyon için ilave edilmistir. Hücrelerin y[lZlanmasIan sonra, her bir antikor için bir kalibrasyon egrisinin hazlEIlanmaslZlçin, hücreler üzerindeki etiketin floresan yogunlugu, Epics XL aklsîlsitometresi (Beckman coulter) kullanilârak ölçülmüstür. GPC3 ERY9-1 veya GPC3 ERY10-1'in verildigi farelerden zamanla kan aIlEmlgtlEl Plazma kandan hazlEIlanmlStIE] ve uygun sekilde seyreltilmistir. Yukari açiKIanan kalibrasyon egrilerinin hazlEllanmasüle aynDsekilde, her bir hücreye baglanan plazma GPC3 ERY9-1 ve GPC3 ERY10-1 miktarII belirlenmesi için plazma numuneleri GPC3/BaF veya CD3/BaF ile reaksiyona allümlgtlîl Her bir antikorun plazma konsantrasyonu, yukar- açlKlanan, belirlenmis degerler ve kalibrasyon egrileri kullanIrak hesaplanmlgtlü Sonuç, hem GPC3 ERY9-1 hem de GPC3 ERY10-1'in kan konsantrasyonunun, iki uygulama gününden sonra 10 nM'den fazla oldugunu göstermistir (Sekiller 9 ve 10). Bu bulgu, GPC3 ERY9-1 ve GPC3 ERY10-1 gibi moleküllerin, BiTE'ye klýbsla büyük oranda artmEl bir plazma yarEömrüne sahip oldugunu göstermektedir. (4) Sessiz Fc'nin, kanser antijenine baglilßitokin indüksiyonu üzerindeki etkisi (4-1) Fch baglama Fc'sine sahip GPC3 ERY15-1'in meydana getirilmesi ve GPC3 ERY10-1 gibi moleküllerin, kanser antijenine bagIiIEliiir sekilde sitokinleri indükleyip indüklemediginin test edilmesi için meydana getirilmistir. Spesiük olarak, yukar- açilZIanan yöntemde oldugu gibi uygun ilave sekanslarEliçeren primerlerin kullanIiglEPCR ve QuikChange Bölge Yönelimli Mutajenez Kitinin (Stratagene) kullanIiglElbir yöntem gibi teknikte uzman kisilerce iyi bilinen bir yöntem, GPC3 ERY15-1_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 47; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansEblarak islev görmektedir) veya GPC3 ERY15-1_Hk'yi (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 48; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansljblarak islev görmektedir) kodlayan bir polinükleotitin eklendigi ekspresyon vektörlerinin meydana getirilmesi için gerçeklestirilmistir. GPC3 ERY15-1_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI:47; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslîblarak islev görmektedir), GPC3 ERY15-1_Hk (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 48; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansüblarak islev görmektedir) ve GPC3 ERY7_L'ye yönelik ekspresyon vektörleri, GPC3 ERY15-1'in kia süreli olarak eksprese edilmesi için FreeSter293-F hücrelerine birlikte verilmistir. Elde edilen kültür süpernatantÇl bir Anti FLAG M2 kolonu (Sigma) üzerine yüklenmistir. Y[Elamadan sonra, kolon ile ayrlgtlElllIhlgtlEl GPC3 ERY15-1 içeren bir fraksiyon, bir HisTrap HP kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. YllZamadan sonra, kolon, bir imidazol konsantrasyon gradyanElile ayriStlEIllIhlStlB GPC3 ERY15-1 içeren bir fraksiyon, ultrafiltrasyon vasltâslîla konsantre edilmistir. ArdEUan, fraksiyon bir Superdex 200 kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. YaInEta bir monomerik GPC3 ERY15-1 fraksiyonu, saflastlîllîhlgl GPC3 ERY15-1'in elde edilmesi için eluattan toplanmEtE (4-2) Kanser antijenden bag Iislîlsekilde sitokin indükleme yetisine yönelik deneme GPC3 ERY15-1'in kanser antijenin bagnslîisekilde sitokin indükleme yetisi, GPC3 BiTE, GPC3 ERY9-1, GPC3 ERY10-1 ve katumaksomablEkiler ile karsllâstlîllßilgtü Yukar- açllZIanan yöntemler kullanilarak, PBMC'Ier, sagllkllîgönüllülerden aI-n kandan hazlEllanmlgtE 40 nM'ye ayarlanan her bir antikorun elli ml'si, 50 ul insan PBMS süspansiyonuna (2 x 105 hücre/çukurcuk) ilave edilmistir ve ardIan 100 pl %10FBS/D-MEM de buraya ilave edilmistir. Reaksiyon karmü37°0deki %5 karbon dioksit gazültlda inkübe edilmistir. 72 saatlik inkübasyondan sonra, kültür süpernatantlîl toplanmlStE ve kültür süpernatantlîl içerisinde salgllânan sitokinler, Insan Th1/Th2/Th17 Kiti (BD) kullanllârak Sitometrik Boncuk Denemesi (CBA) vaslüslîla nicellestirilmistir. Deneme, ekli protokole göre yöntem vasltâslýla üç kopya halinde gerçeklestirilmistir. Sonuç olarak, bir Fch baglama Fc'sine sahip GPC3 ERY15-1 ve katumaksomab, açÜZJ sitokin indüksiyonu sergilemistir. Bunun aksine, Fc'ye sahip olmayan GPC3 BITE ve bir sessiz Fc'ye sahip olan GPC3 ERY9-1 ve GPC3 ERY10-1 için sitokin indüksiyonu gözlemlenmemistir (Sekil moleküllerin, kanser antijenine bagIiIEbir sekilde sitokinleri indüklemeyen, fazlaca güvenilir moleküller oldugunu göstermektedir. scFv yap-dan farklEbir CD3-baglama alan. sahip moleküller degerlendirilmistir. GPC3 ERY18 (Sekil 17K) meydana getirilmis olup, burada bir anti CD3 antikorunun VH ve VL alanlarübir anti kanser antijeni (GPC3) IgG'sinin H zincirlerinin C terminisine baglanmlStlE] Bu yapi, birlesim yerinde bir ila dört baglayIEÜJIrimine (GIy-GIy-GIy-GIy-Ser) sahip bir molekül serisi (PC3 ERY18 L1, L2, L3, ve L4) üretilmistir. AynEtamanda, bir baska molekül (GPC3 ERY18 Sl) de meydana getirilmis olup, burada uygun pozisyonlardaki amino asitler, bir disülfür bagII verilmesine olanak saglanmaslîçin Cys ile ikame edilmistir. Spesifik olarak, yukari açilZianan yöntemde oldugu gibi uygun ilave sekanslarEliçeren primerlerin kullanI[g]i:lPCR gibi, teknikte uzman kisilerce bilinen bir yöntem vatÜisiîLla, ekspresyon vektörlerinin bir serisi meydana getirilmis olup, buraya, GPC3 ERY18 L1_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 49; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslîblarak islev görmektedir), GPC3 ERY18 L1_Hk (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 50; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslîblarak islev görmektedir), GPC3 ERY18 L2_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 51; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansüblarak islev görmektedir), GPC3 ERY18 L2_Hk (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 52, olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslZbIarak islev görmektedir), GPC3 ERY18 L3_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 53; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansüblarak islev görmektedir), GPC3 ERY18 L3_Hk (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 54; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansEbIarak islev görmektedir), GPC3 ERY18 L4_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 55; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslZbIarak islev görmektedir), GPC3 ERY18 L4_Hk (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 56; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansülarak islev görmektedir), GPC3 ERY18 Sl_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 57; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansüolarak islev görmektedir) veya GPC3 ERY18 Sl_Hk'yi (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 58; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansEiolarak islev görmektedir) kodlayan bir polinükleotit eklenmistir. Ekspresyon vektörlerinin asag-ki kombinasyonlarütasarlanan her bir molekülün kEtsi süreli olarak eksprese edilmesi için FreeStyle293-F hücrelerine verilmistir. G. Tasarlanan molekül: GPC3 ERY18 L1 Ekspresyon vektörleri: GPC3 ERY18 L1_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI:49; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi Içermemekte olup, bu bir sinyal sekansElolarak islev görmektedir), GPC3 ERY18 L1_Hk (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 50; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansüilarak islev görmektedir) ve GPC3 ERY7 L H. Tasarlanan molekül: GPC3 ERY18 L2 Ekspresyon vektörleri: GPC3 ERY18 L2_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI:51; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansEIolarak islev görmektedir), GPC3 ERY18 L2_Hk (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 52; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansüblarak islev görmektedir) ve GPC3 ERY7 L Ekspresyon vektörleri: GPC3 ERY18 L3_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI:53; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansEIolarak islev görmektedir), GPC3 ERY18 L3_Hk (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 54; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslîrblarak islev görmektedir) ve GPC3 ERY7 L J. Tasarlanan molekül: GPC3 ERY18 L4 Ekspresyon vektörleri: GPC3 ERY18 L4_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI:55; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansElolarak islev görmektedir), GPC3 ERY18 L4_Hk (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 56; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansüblarak islev görmektedir) ve GPC3 ERY7 L K. Tasarlanan molekül: GPC3 ERY18 51 Ekspresyon vektörleri: GPC3 ERY18 51_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI:57; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansEiolarak islev görmektedir), GPC3 ERY18 Sl_Hk (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 58; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansßlarak islev görmektedir) ve GPC3 ERY7 L Elde edilen kültür süpernatantü bir Anti FLAG M2 kolonu (Sigma) üzerine yüklenmistir. YllZlamadan sonra, kolon ile ayrlgtlElllIhiStB Tasarlanan molekülü içeren bir fraksiyon, bir HisTrap HP kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. YlIZlamadan sonra, kolon, bir imidazol konsantrasyon gradyanEiIe ayrlgtliilîhlgtiîl Tasarlanan molekülü içeren bir fraksiyon, ultrafiltrasyon vaslßslîla konsantre edilmistir. ArdIan, fraksiyon bir Superdex 200 kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. Yalnlîta bir monomer fraksiyonu, tasarlanan, saflastlEllIhlgl her bir molekülün elde edilmesi için eluattan toplanmlgtlEl moleküllerinden her biri, in vitro sitotoksik aktivite için degerlendirilmistir (Sekiller 12 ve 13). Sonuç, GPC3 ERY18 L1 hariç tüm moleküllerin, GPC3 ERY10-1'inki ile klýhslanabilen bir aktiviteye sahip oldugunu göstermektedir. Bu sonuç, scFv olmayan bir yapüla sahip molekülleirn, klýbslanabilir bir sitotoksik aktiviteye sahip oldugunu göstermektedir. CD3 antikorunun VH ve VL alanlarIan her birinin, anti-kanser antijeni (GPC3) IgG'sinin H zincirlerinin C terminisine baglandigiElyapIIEI, mevcut bulusun polipeptit komplekslerinin stabilizasyonuna katkBaglamaslîliieklenmektedir. ArdIian, bir Fab-benzeri CD3 baglama alan. sahip moleküller degerlendirilmistir. GPC3 ERY19-3 (Sekil 17L) meydana getirilmis olup, burada bir anti CD3 antikorunun VH ve CH1 alanlarElve VL ve CL alanlari: bir anti kanser antijeni (GPC3) IgG'sinin H zincirlerinin C terminisine baglanmlgtlü Spesifik olarak, yukar-ki yöntemde oldugu gibi uygun ilave sekanslarEiçeren primerlerin kullanIIgiElPCR gibi teknikte uzman kisilerce bilinen bir yöntem vaslüslsîla ekspresyon vektörleri meydana getirilmis olup, buraya GPC3 ERY19-3_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI:59; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansEblarak islev görmektedir) veya GPC3 ERY19-3_Hk'yi (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 60; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansßlarak Islev görmektedir) kodlayan bir polinükleotit eklenmistir. GPC3 ERY19-3_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI:59; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslîblarak islev görmektedir), GPC3 ERY19-3_Hk (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 60; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslîblarak islev görmektedir) ve GPC3 ERY7_L'ye yönelik ekspresyon vektörleri, GPC3 ERY19-3'ün kisa süreli olarak eksprese edilmesi için FreeSter293-F hücrelerine birlikte verilmistir. Elde edilen kültür süpernatantÇlbir HiTrap rProtein A FF kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. Y[Elamadan sonra, kolon, bir asit ile ayrlgtlBlBilgtlEl GPC3 ERY19-3 içeren bir fraksiyon ultrafiltrasyon vasltâeslýla konsantre edilmistir ve ardIan, bir Superdex 200 kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. Yalnlîta bir monomerik GPC3 ERY19-3 fraksiyonu, saflastlEIlBrlglGPC3 ERY19-3'ün elde edilmesi için eluattan toplanmlgtlEl GPC3 ERY19-3 molekülü, in vitro sitotoksik aktiviteye yönelik olarak degerlendirilmistir. Sonuç, molekülün, GPC3 BiTE ile klýbslanabilen bir aktiviteye sahip oldugunu göstermektedir (Sekil 14). Fab-benzeri bir yaplîla sahip CD3 baglama alanIlEl, mevcut bulusun polipeptit kompleksi moleküllerinin stabilizasyonuna katkEêaglamasEibeklenmektedir. Protein A saflastlEna adIiERullanlIârak polipeptit komplekslerinin hazlEIlanmasD (1) Taslak Örnek 3'te hazEIlanan GPC3 ERY10-1'de, CH3, delik-içi-nob yap_ sahiptir. Iki H zincirinin heteromerik olarak birbiriyle birlestirildigi arzu edilen GPC3 ERY10-1 molekülü, her bir H zincirinin C terminusuna tutturulan His etiketi ve FLAG etiketi kullanllârak iki tür afinite saflastlElnasEi/aslüsMa saflastlElllB'ilgtE GPC3 ERY10-1 molekülünün bir farmasötik olarka üretilmesi durumunda, Polipeptit A kromatografisi ilk olarak, bir Fc alan. sahip bir polipeptit kompleksinin saflastlîllîhasljbin GPC3 ERY-10-1 eksprese eden hücrelerin kültür süpernatantEl üzerinde gerçeklestirilmektedir. Bu adllEJ, His etiketi afinite kromatografisi ve FLAG etiketi afinite kromatograûsinin kullanI[glDbir ilave kromatografik saflastlüria adHEliarafan takip edilmesi gerekmektedir. Bu, saflastlEna prosesinin maliyetinin artmasEile sonuçlanmaktadlE Dolaylîlýla, bu Örnek, bir His etiketi ve FLAG etiketi kullanllhiaks- yalnlîta Protein A kromatografisi vasßslýla, heteromerik olarak birlestirilen iki H zincirine sahip, arzu edilen GPC3 ERY10-1 molekülünün saflastlîlllîhaslßaglayan moleküler modifikasyonlarEihcelemistir. Spesifik olarak, iki H zincirinden birindeki Protein A baglanmalellEl elimine edilmesi için modifikasyonlar incelenmistir. Bu tür modifikasyonlarI bir sonucu olarak, Protein A baglaylEEI olmayan H zincirlerinin homomerik olarak birlestirilmesi durumunda, molekül Protein A'ya baglanamamaktadßve dolayEMa Protein A kromatografisinden geçmektedir. Diger yandan, Protein A baglaylEÜJImayan bir H zincirinin bir Protein A baglaylEZH-I zinciri ile birlestirildigi bir molekül ve Protein A baglaylîlZH zincirlerinin homomerik olarak birlestirildigi bir molekül, Protein A'ya yönelik afinite farkIÜJgil dayanarak, Protein A kromatografisi kullanilârak ayrlßbilmektedir. Ancak, antikor Fc alanIa, Protein A için baglama yeri, FcRn için baglama yeri ile kesismekte olup, bu, antikorun plazma tutulumu için gereklidir. DolaylgEa, FcRn- baglama aktivitesi korunurken, yalnlîta Protein A baglama aktivitesinin seçici sekilde indirgenmesi gerekmektedir. Bu sekildeki bir modifikasyon olarak, pozisyon 435'teki (EU numaralandlEinasEIl His'in Arg ile ikamesi kesfedilmistir. Iki H zincirinin heteromerik açilZIanan mutasyonlarI kombinasyonu (H zincirlerinden birindeki pozisyon 356'da (EU numaralandlElnasDJ bulunan Asp'nin Lys ile ikamesi, ve diger H zincirindeki pozisyon 439'da (EU numaralandülnasßgl bulunan Lys'nin Glu ile ikamesi), bunun, yalnlîta Protein A kromatografisi kullanilârak GPC3 ERY10-1 gibi polipeptit komplekslerinin saflastlEliIhasIlZl saglaylül saglamad [gll yönelik olarak test edilmistir. (2) Antikor geni ekspresyon vektörlerinin meydana getirilmesi ve ilgili antikorlarI ekspresyonu Antikor H zinciri degisken bölgesin için, GC33(2)H'yi (anti-insan GIipikan-3 antikoru H zinciri degisken bölgesi, SEKANS KIMLIK NUMARASI:61; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslZblarak islev görmektedir) kodlayan bir gen, teknikte uzman kisiler tarafldan bilinen bir yöntem ile meydana getirilmistir. Benzer sekilde, antikor L zinciri için, GC33-k0'l:|(anti-insan Glipikan-3 antikoru L zinciri, SEKANS KIMLIK NUMARASI:62; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslZioIarak islev görmektedir) kodlayan bir gen de teknikte uzman kisiler tarafIan bilinen bir yöntem ile meydana getirilmistir. Ard Idan, antikor H zinciri degisken bölgesi için, asagEIia açilîlanan genler, teknikte uzman kisiler taraflEldan bilinen bir yöntem ile meydana getirilmektedir. L. Tasarlanan molekül: LALA-Gld Pozisyonlar 234 ve 235'teki (EU numaralandlEinaslIlLeu'nun Ala ile ikame edildigi ve pozisyon 297'deki Asn'nin, Ala ile ikame edildigi ve C terminaldeki Ala ve Gly'nin IgGI sekansIa çÜZbrIIgiÇiLALA-Gld (SEKANS KIMLIK NUMARASI:63; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansljilarak islev görmektedir) M. Tasarlanan molekül: LALA-GId-CD3 Bir CF3 scFv'nin (anti-insan CD3 antikoru H bölgesi zinciri degisken bölgesi ve anti insan CD3 antikoru L zinciri degisken bölgesi bir polipeptit baglaymasltâsüla birbirine baglanmaktadlE) LALA-Gld'nin (SEKANS KIMLIK NUMARASI:63; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansÜJlarak islev görmektedir) C terminusuna baglandigiü LALA-Gld-CD3 (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 64; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansßlarak islev görmektedir) N. Tasarlanan molekül: LALA-G3S3E-Gld LALA-Gld sekansIa (SEKANS KIMLIK NUMARASI:63; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansEblarak islev görmektedir) posizyon 435'teki (EU numaralandlElnasD] His'nin Arg ile ikame edildigi ve pozisyon 439'daki (EU numaralandlElnasDgl Lys'nin Glu ile ikame edildigi LALA-G3S3E-Gld (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 65; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslîblarak islev görmektedir) O. Tasarlanan molekül: LALA-S3K-GId-CD3 LALA-GId-CD3 sekansIa (SEKANS KIMLIK NUMARASI:64; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansElolarak islev görmektedir) pozisyon 356'daki (EU numaralandlElnasDJAsp'nin Lys ile ikame edildigi LALA-S3K-GId-CD3 (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 66; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansßlarak islev görmektedir) Anti-insan GPC3 antikoru H zinciri genleri NTAlL ve NTA1R, GC33(2)H'nin aklg asagi-a süslîla LALA-GId-CD3 veya LALA-Gld'nin baglantilândlîiliiaslýla meydana getirilmistir. Bu zaman zarfIda, anti-insan GPC3 antikoru H zinciri genleri NTA2L ve NTAZR, GC33(2)H'nin aklgl asag-a leislîLIa LALA-S3K-GId-CD3 veya LALA-G3S3E-Gld'nin baglantüândlEllIhasMa meydana getirilmistir. NTA1L, NTA1R, NTA2L, NTA2R (H zincirleri), ve GC33-k0 (L zinciri) için ekspresyon vektörleri, her bir genin bir hayvan hücresi ekspresyon vektörü içerisine eklenmesiyle meydana getirilmistir. Bu vektörler asagi gösterildigi üzere kombine edilmistir ve asagi aç[Elanan polipeptit komplekslerinin kisa süreli olarak eksprese edilmesi için teknikte uzman kisiler tarafian bilinen bir yöntem vasliiislsîla FreeStyle293 hücrelerine (Invitrogen) verilmistir. Asaglîih gösterildigi üzere, polipeptit komplekslerine, [birinci H zinciri/ikinci H zinciri/L zinciri] sßsia kombine edilen, verilmis genlerin isimleri ile referans verilmektedir. NTA1L/NTA1R/GC33-k0 NTA2L/NTA2R/GC33-k0 (3) Eksprese edilen numunelerin saflastlîlilBwasEl ve heteromerik kompleks olusumu bakIiian degerlendirme Asagi gösterildigi üzere bir polipeptit kompleksi içeren FreeStyle293 hücrelerinin kültür süpernatantlîliburadan itibaren CM olarak adlandlEllIhaktadlE) bir numune olarak kullanilB1lStlEl NTA1L/NTA1R/GC33-k0 NTA2L/NTA2R/GC33-k0 CM, bir cpO.22-i.im filtreden geçirilmistir ve D-PBS ile dengelenen bir rProtein A Sepharose HlîllîAklSt] kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. Yikama adilarlîll ve 2 ve elüsyon adIiEll, Tablo 1'de gösterilen tampon kullanüârak gerçeklestirilmistir. CM'nin yüklenme miktar|:l antikorun yüklenme miktari. 20 mg/ml reçine olacaglîlsekilde ayarlanmlgtE Ayrigtlîllân fraksiyonlar toplanmlgtlîlve fraksiyonlardaki bilesenlerin tanIilanmasEiçin boyut dßlamallîllromatografi ile analiz edilmistir. DENGE D-PBS YIKAMA 1 lmM sodyum asetat, 150mM NaCI, pH6.5 YIKAMA 2 0. 3mM HCI, 150mM NaCI, pH3. 7 ELÜSYON 1 2mM HCl, pH2. 7 Her bir ayrlgtlEiiÜilglfraksiyonun boyut dlîslamallîkromatografi analizinin donucu Sekil 15 ve Tablo 2'de gösterilmektedir. Degerler, elüsyon tepe noktasII yüzde alanlgöstermektedir. NTAlL/NTAlR/GC33-k0 veya NTA2L/NTA2R/GC33-k0 eksprese edildiginde, anti-GPC3 homomerik antikor (NTAlL/GC33-k0 veya NTA2L/GC33-k0) CM içerisinde neredeyse tespit edilememistir. Bu zaman zarfIa, anti-GPC3 homomerik antikor (NTA2R/GC33-k0) NTA2L/NTA2R/GC33-k0'I eksprese edildigi CM içerisinde yalnlîta yaklaslKl %2 iken, NTAIL/NTAIR/GC33-k0'I eksprese edildigi CM içerisinde yaklaslKl°/o76 idi. Bu sonuç, pozisyon 435'teki (EU numaralandlEnasDJ His'nin Arg ile ikame edilmesi durumunda ve ilgili H zincirlerinin heteromerik molekülünün etkili olusumunun mümkün klIJEhiasEl için H zincirlerinden birinceki polipeptit sekanslda bulunan pozisyon 356'daki (EU numaralandlîinasDJAsp'nin Lys ile ikame edilmesi ve diger H zincirindeki polipeptit sekansia bulunan pozisyon 439'daki (EU numaralandlîilnasDîl Lys'nin ise Glu ile ikame edilmesi durumunda, GPC3 ERY10-1 ile aynEl moleküler forma sahip heteromerik polipeptit kompleksleri, yalnlîta, Protein A'nI kullanI[g]El;aflastlElna adnEl/asitiisüla %98'den daha fazla olan bir safllElile birlikte etkili bir sekilde saflastlElâbilmektedir. CD3 homomerik antikor Heteromerik antikor GPC3 homomerik antikor (1) GPC3 ERY 17-2 ve GPC3 ERY 17-3'ün meydana getirilmesi ArdlEtlan, bir omurga olarak bir anti kanser antijeninin (GPC3) kullanilBiasEla ve Fab'lerden birinin bir CD3 epsilon baglama alanElile ikame edilmesiyle bir molekül meydana getirilmektedir. Yukarlah aç[lZlanan durumlarda oldugu gibi, omurga IgG'nin Fc'si, indirgenmis bir Fch (Fcv reseptörü) baglama aktivitesine sahip olan bir sessiz Fc idi. CD3 epsilon baglama alanlarülçin, anti-CD3 epsilon Fab'nin VH ve VL alanlarüGPC3 ERY17-2 üretimi için degistirilmistir (Sekil 19A) ve CH1 ve CL alanlarülse GPC3 ERY17-3 üretimi için degistirilmistir Spesifik olarak, yukarlâb açlKlanan yöntemde oldugu gibi uygun ilave sekanslarEliçeren primerlerin kullanIlgiElPCR gibi, teknikte uzman kisilerce bilinen bir yöntem valüslîtla, ekspresyon vektörlerinin bir serisi meydana getirilmis olup, buraya, ERY17-2_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 73; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansEblarak islev görmektedir), ERY17-2_L (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 74; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansüblarak islev görmektedir), ERY17-3_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 75; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansEblarak islev görmektedir), veya ERY17-3_L'yi (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 76; olgun sekans amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansüolarak islev görmektedir) kodlayan bir polinükleotit eklenmistir. Ekspresyon vektörlerinin asaglki kombinasyonlarütasarlanan her bir molekülün k& süreli olarak eksprese edilmesi için FreeSter293-F hücrelerine verilmistir. P. Tasarlanan molekül: GPC3 ERY17-2 Ekspresyon vektörlerinin içine eklenen polinükleotitler tarafldan kodlayanan polipeptitler: sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansElblarak islev görmektedir), ve ERY17-2_L (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 74; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslIcMarak islev görmektedir) Q. Tasarlanan molekül: GPC3 ERY17-3 Ekspresyon vektörlerinin içine eklenen polinükleotitler taraflikjan kodlayanan polipeptitler: sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslîolarak islev görmektedir), ve ERY17-3_L (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 76; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansmlarak islev görmektedir) (2) GPC3 ERY 17-2 ve GPC3 ERY 17-3'ün saflastlîlßîaslîl Elde edilen kültür süpernatantü bir Anti FLAG M2 kolonu (Sigma) üzerine yüklenmistir. YlKlamadan sonra, kolon ile ayrStlEllB'iIStlE Tasarlanan molekülü içeren bir fraksiyon, bir HisTrap HP kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. YllZlamadan sonra, kolon, bir imidazol konsantrasyon gradyanEile ayrigtlEllIhlStlEl Tasarlanan molekülü içeren bir fraksiyon, ultrafiltrasyon vasIBisEIa konsantre edilmistir. ArdIan, fraksiyon bir Superdex 200 kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. Yalnlîta bir monomer fraksiyonu, tasarlanan, saflastlEllhllgl her bir molekülün elde edilmesi için eluattan toplanmlStE (3) GPC3 ERY 17-2 ve GPC3 ERY 17-3'ün sitotoksik aktivitesi GPC3 ERY 17-2 ve GPC3 ERY 17-3, in vitro sitotoksik aktivite için degerlendirilmistir (Sekil ). Sonuç, her iki molekülün de GPC3 BiTE'den daha fazla olan bir sitotoksik aktivite sergiledigini göstermistir. DolaylîlEa, ilk kez mevcut bulus, bir anti-kanser antijeni IgG'sinin bir omurga olarak kullanIlglEve Fab'lerden birinin bir CD3 epsilonu baglama alanlEa ikame edildigi moleküllerin, BiTE'ninki ile karsllâstlîllâbilir olan veya bundan daha fazla olan bir sitotoksik aktivite sergiledigini göstermistir. (4) PC-10 T hücresi transfer modelinin kullan-[glüGPCB ERY17-2'ye yönelik etkinlik testi In vitro denemede GPC3 BITE ile karsllâstlîliiâbilir veya bundan daha fazla olan bir sitotoksik aktivite sergiledigi gösterlen GPC3 ERY17-2, PC-10 T hücresi transfer modeli kullanlßrak in w'i/o etkinlik için degerlendirilmistir. Spesifik olarak, PC-10 T hücresi transfer modelinin kullanllîhasüla GPC3 ERY17-2 için etkinlik testi asag-ki gibi gerçeklestirilmistir. T hücresi genisletme kültürü, T hücresi aktivasyon/genisletme kiti/insan (MACS Miltenyi biotec) ve saglllZlÜgJönüllülerden alin kandan izole edilen PBMC'Ierin kullanllîhaslîla gerçeklestirilmistir. Insan akciger skuamöz karsinom hücre hattEPC-IO (Immuno-Biological Laboratories Co., Ltd.) (1 x ile karlStlElllBilstEve ardlfitlan, bunun, NOD scid farelerinin (CLEA Japonya Inc.; disi, 7W) kasllZl bölgesine subkütanöz olarak transplasyonu gerçeklestirilmistir. Transplasyon günü, gün 0 olarak belirlenmistir. Transplasyondan önceki günde ve günler 13, 17, 21 ve 25'te, bir anti-asiyalo GMl antikoru (Wako Pure Chemical Industries), 0.2 mg/kafa miktarlîida farelere intraperitoneal sekilde uygulanmlgtlü Transplasyondan sonraki gün 13'te, fareler tümör boyutu ve vücut aglHl[glEl bakIilEUan gruplanmlStlE Transplasyondan sonraki gün 14'te, yukar- açlElandEglEüzere genisletme kültürü vasiûslýla hazlîlbnan T hücrelerinin, peritoneal kavite içerisine 3 x 107 hücre/kafa miktarlEtia transplasyonu saglanmEtEl Transplasyondan iki saat sonra, GPC ERY17-2, 30 ug/kafa miktarIa intraperitoneal sekilde uygulanmStlE GPC ERY17-2, günler Sonuç, bu modelin GPC3 ERY17-2 uygulama grubunda, çözücü uygulama grubuna klibsla, açlKl bir anti-tümör etkisi gözlemlendigini göstermektedir (Sekil 21). Yukari açiEIanan bulgu, bir anti-kanser antijeni IgG'sinin bir omurga olarak kullanIIgiEl/e Fab'lerden birinin bir CD3 epsilonu baglama alanlEa ikame edildigi moleküller, I'n V/'Vo sekilde açllZJ bir anti-tümör etkisi ürettigini göstermektedir. (1) GPC3 ERY17-2-M20'nin meydana getirilmesi ArdIan, CD3 epsilonu baglama alanEhaIine dönük degisimlerden sonra bile arzu edilen aktiviteyi koruyan bir molekül meydana getirilmistir. GPC3 ERY17-2-M20 (Sekil 19A) meydana getirilmis olup, burada CD3 epsilonu baglama alanIlEi sekansEidegistiriImistir. Spesifik olarak, bir anti-CD3 antikoru (M20) için bir ekspresyon vektörünün bir kallîil olarak kullanliîhasüla, yukarlâhki yöntemde oldugu gibi uygun ilave sekanslarEiçeren primerlerin kullanIlg'lEPCR gibi teknikte uzman kisilerce bilinen bir yöntem, bir ekspresyon vektörü serisinin üretilmesi için gerçeklestirilmis olup, buraya ERY17-2-M20_Hh (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 77; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslZblarak islev görmektedir) veya ERY17-2-M20_L'yi (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 78; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansÜJIarak islev görmektedir) kodlayan bir polinükleotit eklenmistir. (2) GPC3 ERY17-2-M20'nin saflastiEllIhaslZl GPC3 ERY ve ERY için ekspresyon vektörleri, GPC3 ERY17- 2-M20'nin klgia süreli olarak eksprese edilmesi için FreeSter293-F hücrelerine birlikte verilmistir. Elde edilen kültür süpernatant bir (p0.22-um filtresinden geçirilmistir ve arlEtlan dengelenmis bir rProtein A Sepharose Fast Flow kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. SaflastIEIIhlgl GPC3 ERY17-2-M20, Tablo 3'te gösterilen tamponlar kullanüârak yiEiama adIiIarlZI ve 2 ve elüsyon adIiEI vasitîisûla elde edilmistir. DENGE Serbest Stil 293 Ekspresyon OrtamIIQInvitrogen), %1 Pen Strep (Invitrogen) YIKAMA 1 1mM sodyum asetat, 150mM NaCI, pH6.5 YIKAMA 2 0. 3mM HCl, 150mM NaCI, pH3. 7 ELÜSYON 1 2mM HCl, pH2. 7 (3) GPC3 ERY17-2-M20'nin sitotoksik aktivitesi klýhslanabilir bir sitotoksik aktivite göstermistir (Sekil 22). Bu bulgu, CD3 epsilonu baglama alanIda degistirilmis bir sekansa sahip olan moleküllerin bile klýlaslanabilir bir sitotoksik aktiviteye sahip oldugunu göstermektedir. Ard-an, farklübir kanser antijenini hedef alan, ancak arzu eidlen aktiviteyi koruyan moleküller meydana getirilmistir. GPC3 ERY17-2 içindeki anti-GPC3 Fab'nin bir anti-EpCAM bir anti-EpCAM Fab ile degistirildigi EpCAM ERY17-3 (Sekil 19B) üretilmistir. Spesifik olarak, bir anti-EpCAM antikoru için bir ekspresyon vektörünün bir kaIlEl olarak kullanilîhalea, yukar-ki yöntemde oldugu gibi uygun ilave sekanslarEiçeren primerleirin kullanI[g]l:PCR gibi teknikte uzman kisilerce bilinen bir yöntem, bir ekspresyon vektörü serisinin üretilmesi için gerçeklestirilmis olup, buraya EpCAM ERY17_Hk (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 79; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanleJIarak islev görmektedir) veya EpCAM ERY17_L'yi (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 80; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansEbIarak islev görmektedir) kodlayan bir polinükleotit eklenmistir. Ekspresyon vektörlerinin asag-ki kombinasyonlarÇltasarIanan her bir molekülün klgla süreli olarak eksprese edilmesi için FreeSter293-F hücrelerine verilmistir. R. Tasarlanan molekül: EpCAM ERY17-2 Ekspresyon vektörlerinin içine eklenen polinükleotitler tarafüldan kodlayanan polipeptitler: EpCAM ERY17_Hk (SEKANS KIMLIK NUMARASI:79; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslZbIarak islev görmektedir), EpCAM ERY17_L (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 80; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansüblarak islev görmektedir) ERY17-2_Hh, ve ERY17-2_L S. Tasarlanan molekül: EpCAM ERY17-3 Ekspresyon vektörlerinin içine eklenen polinükleotitler tarafIan kodlayanan polipeptitler: (2) EpCAM ERY17-2 ve EpCAM ERY17-3'ün safiastiîimiasü Elde edilen kültür süpernatantü bir Anti FLAG M2 kolonu (Sigma) üzerine yüklenmistir. YlElamadan sonra, kolon ile ayrlgtlElIBîlStEl Tasarlanan molekülü içeren bir fraksiyon, bir HisTrap HP kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. YllZlamadan sonra, kolon, bir imidazol konsantrasyon gradyanljle ayrlStlEliilgtlEl Tasarlanan molekülü içeren bir fraksiyon, ultrafiltrasyon vasltâslýla konsantre edilmistir. Ard-an, fraksiyon bir Superdex 200 kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. YalnEta bir monomer fraksiyonu, tasarlanan, saflastlElliilgl her bir molekülün elde edilmesi için eluattan toplanmlStB (3) EpCAM ERY17-2 ve EpCAM ERY17-3'ün sitotoksik aktivitesi EpCAM ERY17-2 ve EpCAM ERY17-3 in vitro sitotoksik aktivite için test edilmistir ve her ikisi de güçlü bir sitotoksik aktivite göstermistir (Sekil 23). Dolaylgsîla, mevcut bulus, bir anti- kanser antijeni IgG'sinin bir omurga olarak kullanIiglül'e Fab'lerden birinin bir CD3 epsilonu baglama alanlîLla ikame edildigi moleküllerin, kanser antijeni türü degistirildiginde bile bir sitotoksik aktiviteye sahip oldugunu göstermistir. meydana getirilmesi ve degerlendirilmesi (1) Bispesifik antikorun tasarlanmaslîl Bir bispesifik antikorun CH1 ve CL alanlarlEUan her birine mutasyonlarl verilmesi ve böylelikle CH1/CL arayüzünde elektrik yükü itiminin kullanIlýla CH1/CL arayüzey birlesmesnin modüle edilmesi vasltâslsîla, spesifik birlesmenin, anti-GPC3 H zinciri ve L zinciri arasIa ve anti-CD3 H zinciri ve L zinciri arasIa meydana gelmesine olanak saglanabilmektedir. Elektrik yükü itiminin kullanIiEla CH1/CL arayüzey birlesmesinin modüle edilmesi içn, H zincirlerindeki CH1 veya L zincirlerindeki CL'deki amino asit kallEtllârlîpozitif yüklü Lys ile veya negatif yüklü Glu ile ikame edilmistir. (2) Antikor genlerine yönelik ekspresyon vektörlerinin meydana getirilmesi ve ilgili antikorlarI ekspresyonu Bir spesifik antikor (Sekil 24A), anti-CD3 antikoru M12 (H zinciri, SEKANS KIMLIK NUMARASI: 81; L zinciri, SEKANS KIMLIK NUMARASI: 82) ve anti-GPC3 antikoru GC33(2)'nin (H zinciri, SEKANS KIMLIK NUMARASI: 83; L zinciri, SEKANS KIMLIK NUMARASI: 84) CH 1/CL arayüzey birlesmesinin modüle edilmesi ve ayrlîia H zincirlerinin birbirleriyle birlesmesinin önlenmesi için delik-içi-nob (KiH) modifikasyonlarII bunlara verilmesi vasißslýla meydana getirilmistir birlesmesi modülasyonu veya delik-içi-nob (KiH) modifikasyonlarIan hiç birinin verilmedigi bir kontrol bispesifik antikoru (Sekil 24B) da meydana getirilmistir. Spesifik olarak, M12'nin H zincirinin CH1'i içerisindeki birkaç amino asitin (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 81) Lys ile ikame edildigi M12_TH2h (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 85) veya L zincirinin VL'sindeki birkaç amino asitin (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 82) Glu ile ikamed edildigi M12_TL17'yi (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 86) kodlayan bir polinükleotite bir eklenti olarak sahip olan ekspresyon vektörleri, teknikte uzman kisiler taraflEtlan bilinen bir yöntem ile meydana getirilmistir. Benzer sekilde, GC33(2)'nin H zincirinin CHl'i içerisindeki birkaç amino asitin (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 83) GIU ile ikame edildigi GC33(2)_TH13k (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 87) veya GC veya L zincirinin CL'sindeki birkaç amino asitin (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 84) Lys ile ikame edildigi GC33(2)_TL16 (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 89) veya GC kodlayan bir polinükleotite bir eklenti olarak sahip olan ekspresyon vektörleri, teknikte uzman kisiler taraflEUan bilinen bir yöntem ile meydana getirilmistir. Ekspresyon vektörlerinin asag-ki kombinasyonlarütasarlanan her bir molekülün kEia süreli olarak eksprese edilmesi için FreeSter293-F hücrelerine verilmistir. T. Tasarlanan molekül: GM1 Ekspresyon vektörleri: M12_TH2h (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 85), M12_TL17 (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 86), GC, ve U. Tasarlanan molekül: GM2 Ekspresyon vektörleri: M12_TH2h (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 85), M12_TL17 (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 86), GC, ve V. Tasarlanan molekül: GMO Ekspresyon vektörleri: M12'nin H zinciri (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 81), M12'nin L zinciri (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 82), GC, ve Elde edilen kültür süpernatantldan, rProtein A SepharoseTM Fast Flow (GE Healthcare) kullanIlg'lÇI teknikte uzman kisiler taraflEUan bilinen bir yöntem vaslßslîla antikorlar saflastlElIBilgtlü (3) GM 1, GM2, ve GMO'I sitotoksik aktivitesi Polipeptit kompleksleri GM1, GM2, ve GMO, in vitro sitotoksik aktiviteye yönelik olarak degerlendirilmistir. Sonuç, GM1 ve GM2'nin, klýbslanabilir bir sitotoksik aktivite sergiledigini ve bu aktivitenin, GMO'IEkinden açüg sekilde daha fazla oldugunu göstermistir (Sekil 25). Dolayßýla, mevcut bulus, CHl/CL arayüzey birlesmesinin modülasyonunun ve KiH modifikasyonlarII kombinasyonunun, bispesifik antikorlar. etkili bir sekilde üretilmesini mümkün kIIlgllîgJöstermektedir. (1) EGFR ERY17-2'nin meydana getirilmesi DahaslZl bir baska kanser antijenini hedefleyen, arzu edilen aktiviteye sahip bir molekül Fab'si ile degistirilmesiyle meydana getirilmistir. Spesifik olarak, bir kallü olarak, bir anti-EGFR antikorunun bir ekspresyon vektörünün kullanllüiasüla, yukarlîlbki yöntemde oldugu gibi uygun Ilave sekanslarüberen primerleirin kullanIlglüPCR gibi teknikte uzman kisilerce bilinen bir yöntem, bir ekspresyon vektörü serisinin üretilmesi için gerçeklestirilmis olup, buraya EGFR ERY17_Hk (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 91; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi Içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslîrblarak islev görmektedir) veya EGFR ERY17_L'yi (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 90; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansIJJIarak islev görmektedir) kodlayan bir polinükleotit eklenmistir. Ekspresyon vektörlerinin asag-ki kombinasyonlarütasarlanan her bir molekülün klgla süreli olarak eksprese edilmesi için FreeStyle293-F hücrelerine verilmistir. W. Tasarlanan molekül: EGFR ERY17-2 Ekspresyon vektörlerinin içine eklenen polinükleotitler tarafIian kodlayanan polipeptitler: EGFR ERY17_Hk (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 91; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekansElolarak islev görmektedir), EGFR ERY17_L (SEKANS KIMLIK NUMARASI: 92; olgun sekans, amino terminal 19 amino asidi içermemekte olup, bu bir sinyal sekanslîcblarak islev görmektedir) ERY17-2_Hh, ve ERY17-2_L. (2) EGFR ERY17-2'nin saflastlEIlßîasEl Elde edilen kültür süpernatantlarÇlbir Anti FLAG M2 kolonu (Sigma) üzerine yüklenmistir. YllZlamadan sonra, kolon ile ayrlgtlEllBilstE Tasarlanan molekülü içeren bir fraksiyon, bir HisTrap HP kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. YllZlamadan sonra, kolon, bir imidazol konsantrasyon gradyanEile ayrStEllBîlgIE Tasarlanan molekülü içeren bir fraksiyon, ultrafiltrasyon vasltâslýla konsantre edilmistir. ArdIdan, fraksiyon bir Superdex 200 kolonu (GE Healthcare) üzerine yüklenmistir. Yalnlîta bir monomer fraksiyonu, tasarlanan, saflastmlgl her bir molekülün elde edilmesi için eluattan toplanmlgtm (3) EGFR ERY17-2'nin sitotoksik aktivitesi EGFR ERY17-2 in vitro sitotoksik aktivite Için test edilmistir ve her ikisi de güçlü bir sitotoksik aktivite göstermistir (Sekil 26). Dolaylgsîla, mevcut bulus, bir anti-kanser antijeni IgG'sinin bir omurga olarak kullanIl'g'lEl/e Fab'lerden birinin bir CD3 epsilonu baglama alanlEa ikame edildigi moleküllerin, kanser antijeni GPC3 veya EpCAM veya daha fa degistirilen bir kanser antijeni türü oldugunda bile bir sitotoksik aktiviteye sahip oldugunu göstermistir. Endüstriyel Uygulanabilirlik Mevcut bulus, BiTE'nin sahip oldugu güçlü anti tümör aktivitesini tutan ve kanda uzun bir yarD ömrün yanlis& kanser antijenine baglill3itokin flIü-sEveya benzerinin indüklenmemesi ile sonuçlanan oldukça iyi güvenlik niteliklerine sahip olan yeni polipeptit kompleksleri sunmaktadE Mevcut bulusun bir polipeptit kompleksinin antijen baglama alanElikame edildiginde, hücresel sitotoksisitenin indüklenmesine yönelik bir aktif içerik maddesi olarak polipeptit kompleksi içeren terapötik maddeler çesitli hücreleri hedefleyebilmektedir ve bunlara zarar verebilmektedir. Dolaylglîla, birçok kanser tedavi edilebilmekte veya önlenebilmektedir. Bu, fazlaca güvenli ve uygun olan, arzu edilen tedavileri mümkün kilîhaktad iElve hastalara yönelik fiziksel yükü de azaltmaktadlEI TR TR TR TR TR TR TR