RU2008135114A - Генетически запрограммированная экспрессия белков, содержащих не встречающуюся в природе аминокислоту фенилселеноцистеин - Google Patents
Генетически запрограммированная экспрессия белков, содержащих не встречающуюся в природе аминокислоту фенилселеноцистеин Download PDFInfo
- Publication number
- RU2008135114A RU2008135114A RU2008135114/13A RU2008135114A RU2008135114A RU 2008135114 A RU2008135114 A RU 2008135114A RU 2008135114/13 A RU2008135114/13 A RU 2008135114/13A RU 2008135114 A RU2008135114 A RU 2008135114A RU 2008135114 A RU2008135114 A RU 2008135114A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- trna
- amino acid
- protein
- phenylselenocysteine
- selected position
- Prior art date
Links
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 title claims abstract 31
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract 31
- -1 PHENYLSELENOCYSTEIN AMINO ACID Chemical class 0.000 title 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims abstract 32
- FXTLFZWJXBBXGX-QMMMGPOBSA-N (2R)-2-anilino-3-selanylpropanoic acid Chemical compound OC(=O)[C@H](C[SeH])NC1=CC=CC=C1 FXTLFZWJXBBXGX-QMMMGPOBSA-N 0.000 claims abstract 28
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims abstract 17
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims abstract 17
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims abstract 17
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims abstract 13
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims abstract 13
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims abstract 13
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 claims abstract 12
- 102000052866 Amino Acyl-tRNA Synthetases Human genes 0.000 claims abstract 11
- 108700028939 Amino Acyl-tRNA Synthetases Proteins 0.000 claims abstract 11
- 108020005038 Terminator Codon Proteins 0.000 claims abstract 4
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 16
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims 10
- UQBOJOOOTLPNST-UHFFFAOYSA-N Dehydroalanine Chemical compound NC(=C)C(O)=O UQBOJOOOTLPNST-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 6
- MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N Hydrogen peroxide Chemical compound OO MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 6
- ZADHKSJXSZBQFB-HHHXNRCGSA-N lipid fragment Chemical compound CC(C)CCCCCCCCCCCC[C@@H](C)CCCCCCCC(C)C ZADHKSJXSZBQFB-HHHXNRCGSA-N 0.000 claims 4
- 238000007248 oxidative elimination reaction Methods 0.000 claims 3
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims 3
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims 3
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims 3
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 claims 2
- 241000186394 Eubacterium Species 0.000 claims 2
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 claims 2
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 claims 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims 2
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims 2
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 claims 2
- CJWPDADGDASKGI-YFVJMOTDSA-N (2e,6e)-3,7,11-trimethyldodeca-2,6,10-triene-1-thiol Chemical compound CC(C)=CCC\C(C)=C\CC\C(C)=C\CS CJWPDADGDASKGI-YFVJMOTDSA-N 0.000 claims 1
- CFISTOPZXSTQOS-SFHVURJKSA-N (2r)-2-amino-3-hexadecylsulfanylpropanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCSC[C@H](N)C(O)=O CFISTOPZXSTQOS-SFHVURJKSA-N 0.000 claims 1
- 238000006845 Michael addition reaction Methods 0.000 claims 1
- YYHOQQKJSHXDEN-KRWDZBQOSA-N N-palmitoyl-L-cysteine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O YYHOQQKJSHXDEN-KRWDZBQOSA-N 0.000 claims 1
- SYSLNQMKLROGCL-BCYUYYMPSA-N S-[(2E,6E)-farnesyl]-L-cysteine zwitterion Chemical compound CC(C)=CCC\C(C)=C\CC\C(C)=C\CSC[C@H](N)C(O)=O SYSLNQMKLROGCL-BCYUYYMPSA-N 0.000 claims 1
- 125000000266 alpha-aminoacyl group Chemical group 0.000 claims 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims 1
- KPUXJBYSYFEKKB-UHFFFAOYSA-N hexadecanethioic s-acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(S)=O KPUXJBYSYFEKKB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims 1
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims 1
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 abstract 3
- 108091060545 Nonsense suppressor Proteins 0.000 abstract 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1025—Acyltransferases (2.3)
- C12N9/104—Aminoacyltransferases (2.3.2)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/67—General methods for enhancing the expression
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/74—Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/93—Ligases (6)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P21/00—Preparation of peptides or proteins
- C12P21/02—Preparation of peptides or proteins having a known sequence of two or more amino acids, e.g. glutathione
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P21/00—Preparation of peptides or proteins
- C12P21/06—Preparation of peptides or proteins produced by the hydrolysis of a peptide bond, e.g. hydrolysate products
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Abstract
1. Система трансляции, включающая ! (a) первую не встречающуюся в природе аминокислоту, которая является фенилселеноцистеином; ! (b) первую ортогональную аминоацил-тРНК синтетазу (O-РС); и ! (c) первую ортогональную тРНК (O-тРНК), ! причем указанная первая O-РС избирательно аминоацилирует указанную первую O-тРНК указанным фенилселеноцистеином. ! 2. Система трансляции по п.1, в которой указанная первая O-РС избирательно аминоацилирует указанную первую O-тРНК указанным фенилселеноцистеином с эффективностью, которая составляет по меньшей мере 50% эффективности, которую наблюдают у системы трансляции, включающей указанную O-тРНК, указанный фенилселеноцистеин и аминоацил-тРНК синтетазу, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 4, 6 или 8, или в которой указанная первая O-РС содержит последовательность аминокислот, выбранную из группы, состоящей из последовательностей аминокислот, обозначенных SEQ ID NOS: 4, 6, 8 и их консервативных вариантов. ! 3. Система трансляции по п.1, в которой указанная первая O-тРНК представляет собой тРНК, являющуюся супрессором амбер-кодона, или в которой указанная первая O-тРНК содержит последовательность полинуклеотида, обозначенную в SEQ ID NO: 1, или кодируется указанной последовательностью. ! 4. Система трансляции по п.1, содержащая дополнительно нуклеиновую кислоту, кодирующую представляющий интерес белок, причем указанная нуклеиновая кислота содержит по меньшей мере один селекторный кодон, который распознает указанная первая O-тРНК, или содержащая дополнительно вторую O-РС и вторую O-тРНК, причем вторая O-РС предпочтительно аминоацилирует вторую O-тРНК второй не встречающейся в природе аминокислот
Claims (26)
1. Система трансляции, включающая
(a) первую не встречающуюся в природе аминокислоту, которая является фенилселеноцистеином;
(b) первую ортогональную аминоацил-тРНК синтетазу (O-РС); и
(c) первую ортогональную тРНК (O-тРНК),
причем указанная первая O-РС избирательно аминоацилирует указанную первую O-тРНК указанным фенилселеноцистеином.
2. Система трансляции по п.1, в которой указанная первая O-РС избирательно аминоацилирует указанную первую O-тРНК указанным фенилселеноцистеином с эффективностью, которая составляет по меньшей мере 50% эффективности, которую наблюдают у системы трансляции, включающей указанную O-тРНК, указанный фенилселеноцистеин и аминоацил-тРНК синтетазу, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 4, 6 или 8, или в которой указанная первая O-РС содержит последовательность аминокислот, выбранную из группы, состоящей из последовательностей аминокислот, обозначенных SEQ ID NOS: 4, 6, 8 и их консервативных вариантов.
3. Система трансляции по п.1, в которой указанная первая O-тРНК представляет собой тРНК, являющуюся супрессором амбер-кодона, или в которой указанная первая O-тРНК содержит последовательность полинуклеотида, обозначенную в SEQ ID NO: 1, или кодируется указанной последовательностью.
4. Система трансляции по п.1, содержащая дополнительно нуклеиновую кислоту, кодирующую представляющий интерес белок, причем указанная нуклеиновая кислота содержит по меньшей мере один селекторный кодон, который распознает указанная первая O-тРНК, или содержащая дополнительно вторую O-РС и вторую O-тРНК, причем вторая O-РС предпочтительно аминоацилирует вторую O-тРНК второй не встречающейся в природе аминокислотой, которая отличается от первой не встречающейся в природе аминокислоты, и вторая O-тРНК распознает селекторный кодон, который отличается от селекторного кодона, распознаваемого первой O-тРНК.
5. Система трансляции по п.1, отличающаяся тем, что указанная система содержит клетку-хозяин, содержащую указанную первую не встречающуюся в природе аминокислоту, указанную первую O-РС и указанную первую O-тРНК.
6. Система трансляции по п.5, отличающаяся тем, что указанная клетка-хозяин представляет собой клетку эубактерии или клетку E. соli.
7. Система трансляции по п.5, отличающаяся тем, что указанная клетка-хозяин содержит полинуклеотид, кодирующий указанную первую O-РС, или указанный полинуклеотид содержит последовательность нуклеотидов, обозначенную SEQ ID NOS: 5, 7 или 9, или указанная клетка-хозяин содержит полинуклеотид, кодирующий указанную первую O-тРНК.
8. Способ получения в системе трансляции белка, содержащего не встречающуюся в природе аминокислоту в выбранном положении, который включает
(а) обеспечение системы трансляции, включающей
(i) первую не встречающуюся в природе аминокислоту, которая является фенилселеноцистеином;
(ii) первую ортогональную аминоацил-тРНК синтетазу (O-РС);
(iii) первую ортогональную тРНК (O-тРНК), причем указанная первая O-РС избирательно аминоацилирует указанную первую O-тРНК указанным фенилселеноцистеином; и
(iv) нуклеиновую кислоту, кодирующую указанный белок, причем указанная нуклеиновая кислота содержит по меньшей мере один селекторный кодон, который распознает упомянутая первая O-тРНК; и
(b) введение указанной не встречающейся в природе аминокислоты в указанном выбранном положении в указанном белке в процессе трансляции указанного белка в ответ на указанный селекторный кодон с получением указанного белка, содержащего указанную не встречающуюся в природе аминокислоту в выбранном положении.
9. Способ по п.8, в котором указанная первая O-РС избирательно аминоацилирует указанную первую O-тРНК указанным фенилселеноцистеином с эффективностью, которая составляет по меньшей мере 50% эффективности, наблюдаемой для системы трансляции, содержащей указанную O-тРНК, указанный фенилселеноцистеин, и аминоацил-тРНК синтетазу, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 4, 6 или 8, или в котором указанная система трансляции содержит полинуклеотид кодирующий указанную O-РС, или в котором указанное обеспечение системы трансляции включает обеспечение O-РС, содержащей последовательность аминокислот, выбранную из группы, состоящей из последовательностей аминокислот, обозначенных SEQ ID NOS: 4, 6, 8 и их консервативных вариантов.
10. Способ по п.8, в котором указанное обеспечение первой ортогональной аминоацил-тРНК синтетазы включает осуществление мутации кармана связывания аминокислоты аминоацил-тРНК синтетазы дикого типа способом сайт-направленного мутагенеза и отбором получившихся O-РС, которые избирательно аминоацилируют указанную O-тРНК указанной не встречающейся в природе аминокислотой, с получением указанной первой ортогональной аминоацил-тРНК синтетазы.
11. Способ по п.10, в котором указанная стадия отбора включает положительный отбор и отрицательный отбор указанной O-РС из пула, включающего множество молекул мутантной аминоацил-тРНК синтетазы, полученной в результате указанного сайт-направленного мутагенеза.
12. Способ по п.8, в котором указанное обеспечение системы трансляции включает обеспечение полинуклеотида, кодирующего указанную O-тРНК, или в котором указанное обеспечение системы трансляции включает обеспечение O-тРНК, которая представляет собой тРНК, являющуюся супрессором амбер-кодона, или в котором указанное обеспечение системы трансляции включает обеспечение нуклеиновой кислоты, которая кодирует или содержит указанную O-тРНК, причем указанная нуклеиновая кислота содержит последовательность полинуклеотида, обозначенную SEQ ID NO: 1, или в котором указанное обеспечение системы трансляции включает обеспечение нуклеиновой кислоты, которая кодирует указанную O-РС, причем указанная нуклеиновая кислота содержит последовательность полинуклеотида, обозначенную SEQ ID NOS: 5, 7 или 9, или в котором указанное обеспечение системы трансляции включает обеспечение нуклеиновой кислоты, содержащей селекторный амбер-кодон.
13. Способ по п.8, в котором указанный белок дополнительно содержит вторую не встречающуюся в природе аминокислоту, которая отличается от указанной первой не встречающейся в природе аминокислоты, и в котором указанная система трансляции содержит дополнительно вторую O-РС и вторую O-тРНК, причем вторая O-РС избирательно аминоацилирует вторую O-тРНК второй не встречающейся в природе аминокислотой, которая отличается от первой не встречающейся в природе аминокислоты, и вторая O-тРНК распознает селекторный кодон в нуклеиновой кислоте, который отличается от селекторного кодона, распознаваемого первой O-тРНК.
14. Способ по п.8, в котором указанное обеспечение системы трансляции включает обеспечение клетки-хозяина, причем указанная клетка-хозяин содержит указанную первую не встречающуюся в природе аминокислоту, указанную первую O-РС, указанную первую O-тРНК и указанную нуклеиновую кислоту, причем указанная стадия встраивания включает культивирование указанной клетки-хозяина, причем указанная клетка-хозяин представляет собой клетку-хозяина эубактерии или клетку-хозяин E. соli.
15. Способ по п.8, который дополнительно включает стадию (с): проведения реакции указанного фенилселеноцистеина в указанном выбранном положении в указанном белке с получением белка, содержащего дегидроаланин в указанном выбранном положении.
16. Способ по п.15, в котором указанная реакция представляет собой окислительное отщепление, или в котором указанная реакция включает приведение указанного фенилселеноцистеина в контакт с перекисью водорода.
17. Способ получения в системе трансляции белка, содержащего липидный фрагмент в выбранном положении, причем указанный способ включает
(a) обеспечение системы трансляции, включающей
(i) не встречающуюся в природе аминокислоту фенилселеноцистеин;
(ii) ортогональную аминоацил-тРНК (O-РС) синтетазу;
(iii) ортогональную тРНК (O-тРНК), причем указанная O-РС избирательно аминоацилирует указанную O-тРНК указанным фенилселеноцистеином; и
(iv) нуклеиновую кислоту, кодирующую указанный белок, причем указанная нуклеиновая кислота содержит селекторный кодон в указанном выбранном положении, распознаваемом указанной O-тРНК;
(b) встраивание фенилселеноцистеина в указанном выбранном положении в указанный белок в процессе трансляции указанного белка в ответ на указанный селекторный кодон;
(c) осуществление реакции указанного фенилселеноцистеина в выбранном положении в указанном белке с получением белка, содержащего дегидроаланин в выбранном положении; и
(d) осуществление реакции указанного дегидроаланина в выбранном положении в указанном белке с липидным фрагментом с образованием белка, включающего липидированный фрагмент аминокислоты в выбранном положении в белке.
18. Способ по п.17, в котором указанная реакция указанного фенилселеноцистеина в выбранном положении в указанном белке представляет собой окислительное отщепление, или в котором указанная реакция указанного фенилселеноцистеина в выбранном положении в указанном белке включает приведение указанного фенилселеноцистеина в контакт с перекисью водорода, или в котором указанная реакция указанного дегидроаланина в выбранном положении в указанном белке представляет собой реакцию присоединения Майкла.
19. Способ по п.18, в котором указанный липидный фрагмент выбран из группы, состоящей из тиопальмитиновой кислоты, фарнезилмеркаптана и 1-гексадекантиола, или в котором указанный липидированный фрагмент аминокислоты выбран из группы, состоящей из пальмитоилцистеина, фарнезилцистеина и S-гексадецилцистеина.
20. Способ получения в системе трансляции белка, содержащего не встречающуюся в природе аминокислоту дегидроаланин в выбранном положении, причем указанный способ включает
(a) обеспечение системы трансляции, включающей
(i) не встречающуюся в природе аминокислоту фенилселеноцистеин;
(ii) ортогональную аминоацил-тРНК синтетазу (O-РС);
(iii) ортогональную тРНК (O-тРНК), причем указанная O-РС избирательно аминоацилирует указанную O-тРНК указанным фенилселеноцистеином; и
(iv) нуклеиновую кислоту, кодирующую указанный белок, причем указанная нуклеиновая кислота содержит селекторный кодон в указанном выбранном положении, распозначаемый указанной O-тРНК;
(b) встраивание указанной не встречающейся в природе аминокислоты фенилселеноцистеина в указанное выбранное положение в указанном белке в процессе трансляции указанного белка в ответ на указанный селекторный кодон,
(c) осуществление реакции упомянутого фенилселеноцистеина в выбранном положении в указанном белке с получением указанного белка, содержащего указанную не встречающуюся в природе аминокислоту дегидроаланин в выбранном положении.
21. Способ по п.20, в котором указанная реакция указанного фенилселеноцистеина в выбранном положении в указанном белке представляет собой окислительное отщепление, или указанная реакция указанного фенилселеноцистеина в выбранном положении в указанном белке включает приведение указанного фенилселеноцистеина в контакт с перекисью водорода.
22. Композиция, включающая полипептид, содержащий последовательность аминокислот, выбранную из группы, состоящей из последовательностей аминокислот, обозначенных SEQ ID NO: 4, 6, 8 и их консервативные варианты.
23. Композиция по п.22, отличающаяся тем, что указанная композиция содержит клетку, содержащую полипептид.
24. Полинуклеотид, кодирующий полипептид по п.22.
25. Полинуклеотид по п.24, отличающийся тем, что указанный полинуклеотид содержит последовательность нуклеотидов SEQ ID NO: 5, 7 или 9.
26. Клетка, вектор или вектор экспрессии, содержащий полинуклеотид по п.24.
Applications Claiming Priority (4)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US78327206P | 2006-03-16 | 2006-03-16 | |
| US60/783,272 | 2006-03-16 | ||
| US86145606P | 2006-11-28 | 2006-11-28 | |
| US60/861,456 | 2006-11-28 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2008135114A true RU2008135114A (ru) | 2010-04-27 |
| RU2464315C2 RU2464315C2 (ru) | 2012-10-20 |
Family
ID=38522926
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2008135114/10A RU2464315C2 (ru) | 2006-03-16 | 2007-03-13 | Генетически запрограммированная экспрессия белков, содержащих не встречающуюся в природе аминокислоту фенилселеноцистеин |
Country Status (12)
| Country | Link |
|---|---|
| US (3) | US7790847B2 (ru) |
| EP (1) | EP1994165B1 (ru) |
| JP (1) | JP5249194B2 (ru) |
| KR (1) | KR20080113226A (ru) |
| CN (1) | CN101405401B (ru) |
| AU (1) | AU2007227592B2 (ru) |
| BR (1) | BRPI0709603A2 (ru) |
| CA (1) | CA2638772A1 (ru) |
| IL (1) | IL193722A0 (ru) |
| MX (1) | MX2008011669A (ru) |
| RU (1) | RU2464315C2 (ru) |
| WO (1) | WO2007109035A2 (ru) |
Families Citing this family (33)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| MXPA03009566A (es) * | 2001-04-19 | 2004-12-06 | Scripps Research Inst | Metodos y composicion para la produccion de pares trna-aminoaciltrna sintetasa ortogonales. |
| KR20050073559A (ko) * | 2002-10-16 | 2005-07-14 | 더 스크립스 리서치 인스티튜트 | 당단백질 합성 |
| KR101171397B1 (ko) * | 2003-04-17 | 2012-08-07 | 더 스크립스 리서치 인스티튜트 | 진핵 유전자 코드의 확장 |
| ATE386133T1 (de) * | 2003-07-07 | 2008-03-15 | Scripps Research Inst | Zusammensetzungen der orthogonalen lysyl-trna und aminoacyl-trna synthetase paaren und ihre verwendungen |
| WO2006110182A2 (en) | 2004-10-27 | 2006-10-19 | The Scripps Research Institute | Orthogonal translation components for the in vivo incorporation of unnatural amino acids |
| EP1991680B1 (en) | 2006-03-09 | 2013-08-21 | The Scripps Research Institute | System for the expression of orthogonal translation components in eubacterial host cells |
| US7790847B2 (en) | 2006-03-16 | 2010-09-07 | The Scripps Research Institute | Genetically programmed expression of proteins containing the unnatural amino acid phenylselenocysteine |
| CA2652894A1 (en) * | 2006-05-23 | 2007-12-06 | The Scripps Research Institute | Genetically encoded fluorescent coumarin amino acids |
| WO2008036392A2 (en) | 2006-09-21 | 2008-03-27 | The Scripps Research Institute | Genetically programmed expression of selectively sulfated proteins in eubacteria |
| RU2009112104A (ru) | 2006-10-18 | 2010-11-27 | Зе Скрипс Ресеч Инститьют (Us) | Генетическое встраивание не встречающихся в природе аминокислот в белки клеток млекопитающих |
| MX2010004464A (es) | 2007-10-25 | 2010-06-07 | Scripps Research Inst | Incorporacion genetica de 3-aminotirosina a reductasas. |
| US20090148887A1 (en) * | 2007-11-02 | 2009-06-11 | The Scripps Research Institute | Genetically encoded boronate amino acid |
| US9249408B2 (en) * | 2007-11-02 | 2016-02-02 | The Scripps Research Institute | Directed evolution using proteins comprising unnatural amino acids |
| BRPI0819929A2 (pt) | 2007-12-11 | 2014-10-14 | Scripps Research Inst | Expressão de amino ácido não natural em vivo na levedura pichia pastoris metilotrófica |
| WO2009086497A2 (en) * | 2007-12-28 | 2009-07-09 | Ardell David H | Genetic encryption |
| JP5563990B2 (ja) | 2008-01-03 | 2014-07-30 | ヴェレニウム コーポレイション | トランスフェラーゼおよびオキシドレダクターゼ、それらをコードする核酸並びにそれらを製造および使用する方法 |
| US8318172B2 (en) * | 2008-02-08 | 2012-11-27 | The Scripps Research Institute | Breaking immunological tolerance with a genetically encoded unnatural amino acid |
| US8609383B2 (en) | 2008-12-10 | 2013-12-17 | The Scripps Research Institute | Production of carrier-peptide conjugates using chemically reactive unnatural amino acids |
| US20090197339A1 (en) * | 2008-12-10 | 2009-08-06 | The Scripps Research Institute | In vivo unnatural amino acid expression in the methylotrophic yeast pichia pastoris |
| US8658394B2 (en) * | 2011-02-02 | 2014-02-25 | Waterstone Pharmaceuticals | Methods, cells and systems for incorporating non-canonical amino acids into proteins |
| CN103215235B (zh) * | 2012-01-18 | 2014-11-05 | 中国科学院生物物理研究所 | 3-咪唑基酪氨酸翻译系统及其应用 |
| CN103571804B (zh) * | 2012-08-10 | 2015-08-12 | 中国科学院生物物理研究所 | 3-吡唑基酪氨酸翻译系统及其应用 |
| SG11201502875VA (en) | 2012-10-12 | 2015-06-29 | Sutro Biopharma Inc | Proteolytic inactivation of select proteins in bacterial extracts for improved expression |
| CN103820410B (zh) * | 2012-11-16 | 2016-03-30 | 中国科学院生物物理研究所 | 3-甲硫酪氨酸翻译系统及其应用 |
| CN104004723B (zh) * | 2013-02-22 | 2016-08-17 | 中国科学院生物物理研究所 | 3,5-二氟代酪氨酸翻译系统及其应用 |
| CN106047846B (zh) * | 2013-03-22 | 2020-02-04 | 中国科学院生物物理研究所 | 8-羟基喹啉丙氨酸翻译系统及其应用 |
| CA2924109A1 (en) | 2013-09-13 | 2015-03-19 | The California Institute For Biomedical Research | Modified therapeutic agents and compositions thereof |
| JP6572497B2 (ja) | 2013-12-18 | 2019-09-11 | ザ・スクリップス・リサーチ・インスティテュート | 修飾された治療剤、ステープル留めされたペプチド脂質複合体、及びそれらの組成物 |
| CA3024135C (en) * | 2016-05-16 | 2024-09-24 | Univ Texas | Compositions intended for the administration of RNA in the form of nanoparticles and associated method of use |
| AU2017386533B2 (en) | 2016-12-29 | 2024-05-09 | Illumina, Inc. | Analysis system for orthogonal access to and tagging of biomolecules in cellular compartments |
| CN114644581B (zh) * | 2021-01-04 | 2024-07-16 | 北京惠大生物科技有限公司 | 含芳基硫酚或芳基硒酚经修饰的氨基酸、重组蛋白及其生物合成方法及应用 |
| CA3221611A1 (en) | 2021-06-09 | 2022-12-15 | Weijun Shen | Long-acting dual gip/glp-1 peptide conjugates and methods of use |
| CN118389493B (zh) * | 2024-05-10 | 2025-04-11 | 北京大学 | 一种定点修饰的工程化tRNA及其应用 |
Family Cites Families (22)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| FI941169A7 (fi) * | 1992-07-13 | 1994-05-04 | Eukarion Inc | Lipidisoitujen proteiinien transvaskulaarinen ja intracellulaarinen an taminen |
| MXPA03009566A (es) | 2001-04-19 | 2004-12-06 | Scripps Research Inst | Metodos y composicion para la produccion de pares trna-aminoaciltrna sintetasa ortogonales. |
| ATE526414T1 (de) * | 2002-10-16 | 2011-10-15 | Scripps Research Inst | Ortsspezifische einbindung von ketoaminosäuren in proteine |
| KR20050073559A (ko) | 2002-10-16 | 2005-07-14 | 더 스크립스 리서치 인스티튜트 | 당단백질 합성 |
| US7642085B2 (en) | 2002-12-22 | 2010-01-05 | The Scripps Research Institute | Protein arrays |
| KR101171397B1 (ko) | 2003-04-17 | 2012-08-07 | 더 스크립스 리서치 인스티튜트 | 진핵 유전자 코드의 확장 |
| CA2527877A1 (en) * | 2003-06-18 | 2005-01-13 | The Scripps Research Institute | Unnatural reactive amino acid genetic code additions |
| ATE386133T1 (de) | 2003-07-07 | 2008-03-15 | Scripps Research Inst | Zusammensetzungen der orthogonalen lysyl-trna und aminoacyl-trna synthetase paaren und ihre verwendungen |
| WO2005007870A2 (en) | 2003-07-07 | 2005-01-27 | The Scripps Research Institute | COMPOSITIONS OF ORTHOGONAL LEUCYL-tRNA AND AMINOACYL-tRNA SYNTHETASE PAIRS AND USES THEREOF |
| US7527943B2 (en) | 2003-07-07 | 2009-05-05 | The Scripps Research Institute | Compositions of orthogonal glutamyl-tRNA and aminoacyl-tRNA synthetase pairs and uses thereof |
| BRPI0415308A (pt) | 2003-10-14 | 2006-12-05 | Scripps Research Inst | incorporação especìfica de local de aminoácidos redox ativos em proteìnas |
| US7741071B2 (en) * | 2003-12-18 | 2010-06-22 | The Scripps Research Institute | Selective incorporation of 5-hydroxytryptophan into proteins in mammalian cells |
| US20050287639A1 (en) | 2004-05-17 | 2005-12-29 | California Institute Of Technology | Methods of incorporating amino acid analogs into proteins |
| US7399619B2 (en) | 2004-05-25 | 2008-07-15 | The Scripps Research Institute | Site specific incorporation of heavy atom-containing unnatural amino acids into proteins for structure determination |
| WO2006034410A2 (en) | 2004-09-21 | 2006-03-30 | The Scripps Resarch Institute | Adding photoregulated amino acids to the genetic code |
| BRPI0515547A (pt) | 2004-09-21 | 2008-07-29 | Scripps Research Inst | incorporação in vivo de aminoácidos alquinil em proteìnas em eubacterias |
| US20060110784A1 (en) | 2004-09-22 | 2006-05-25 | The Scripps Research Institute | Site-specific labeling of proteins for NMR studies |
| WO2006045116A2 (en) | 2004-10-20 | 2006-04-27 | The Scripps Research Institute | In vivo site-specific incorporation of n-acetyl-galactosamine amino acids in eubacteria |
| WO2006110182A2 (en) | 2004-10-27 | 2006-10-19 | The Scripps Research Institute | Orthogonal translation components for the in vivo incorporation of unnatural amino acids |
| BRPI0617191A2 (pt) | 2005-10-12 | 2011-07-19 | Scripps Research Inst | modificação pós-traducional de polipeptìdeos expressos em fagos |
| EP1991680B1 (en) | 2006-03-09 | 2013-08-21 | The Scripps Research Institute | System for the expression of orthogonal translation components in eubacterial host cells |
| US7790847B2 (en) | 2006-03-16 | 2010-09-07 | The Scripps Research Institute | Genetically programmed expression of proteins containing the unnatural amino acid phenylselenocysteine |
-
2007
- 2007-03-13 US US11/724,039 patent/US7790847B2/en active Active
- 2007-03-13 RU RU2008135114/10A patent/RU2464315C2/ru not_active IP Right Cessation
- 2007-03-13 JP JP2009500449A patent/JP5249194B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2007-03-13 US US12/225,261 patent/US8217145B2/en active Active
- 2007-03-13 MX MX2008011669A patent/MX2008011669A/es active IP Right Grant
- 2007-03-13 EP EP07753037.6A patent/EP1994165B1/en not_active Not-in-force
- 2007-03-13 BR BRPI0709603-8A patent/BRPI0709603A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2007-03-13 CN CN2007800092529A patent/CN101405401B/zh not_active Expired - Fee Related
- 2007-03-13 AU AU2007227592A patent/AU2007227592B2/en not_active Ceased
- 2007-03-13 WO PCT/US2007/006382 patent/WO2007109035A2/en not_active Ceased
- 2007-03-13 KR KR1020087024575A patent/KR20080113226A/ko not_active Ceased
- 2007-03-13 CA CA002638772A patent/CA2638772A1/en not_active Abandoned
-
2008
- 2008-08-27 IL IL193722A patent/IL193722A0/en unknown
-
2012
- 2012-06-08 US US13/492,240 patent/US8394605B2/en not_active Expired - Fee Related
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| US8394605B2 (en) | 2013-03-12 |
| AU2007227592A1 (en) | 2007-09-27 |
| CN101405401B (zh) | 2013-03-27 |
| CA2638772A1 (en) | 2007-09-27 |
| WO2007109035A3 (en) | 2008-10-16 |
| RU2464315C2 (ru) | 2012-10-20 |
| US7790847B2 (en) | 2010-09-07 |
| AU2007227592B2 (en) | 2011-11-24 |
| JP2009529877A (ja) | 2009-08-27 |
| MX2008011669A (es) | 2008-09-22 |
| US20120282668A1 (en) | 2012-11-08 |
| JP5249194B2 (ja) | 2013-07-31 |
| EP1994165B1 (en) | 2014-11-05 |
| EP1994165A4 (en) | 2012-11-07 |
| CN101405401A (zh) | 2009-04-08 |
| IL193722A0 (en) | 2011-08-01 |
| US8217145B2 (en) | 2012-07-10 |
| US20090209000A1 (en) | 2009-08-20 |
| KR20080113226A (ko) | 2008-12-29 |
| EP1994165A2 (en) | 2008-11-26 |
| BRPI0709603A2 (pt) | 2011-07-19 |
| US20070238152A1 (en) | 2007-10-11 |
| WO2007109035A2 (en) | 2007-09-27 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2008135114A (ru) | Генетически запрограммированная экспрессия белков, содержащих не встречающуюся в природе аминокислоту фенилселеноцистеин | |
| JP6294368B2 (ja) | 直交ｔＲＮＡ−アミノアシルｔＲＮＡシンテターゼ対を生産するための方法及び組成物 | |
| JP5709754B2 (ja) | 非天然アミノ酸による複製に依存する微生物およびワクチン | |
| JP2009529877A5 (ru) | ||
| RU2009110152A (ru) | Генетически закодированная формула селективно-сульфатных белков в эубактерии | |
| JP4990792B2 (ja) | アミノアシル−ｔＲＮＡシンテターゼの組成物およびこの使用 | |
| CN103103238B (zh) | 一种在细胞中制造在特定位置处具有所选氨基酸的抗体或抗体片段多肽的方法 | |
| RU2473690C2 (ru) | Генетически кодируемые флюоресцентные кумариновые аминокислоты | |
| AU2002303431A1 (en) | Methods and composition for the production of orthoganal tRNA-aminoacyltRNA synthetase pairs | |
| RU2009112104A (ru) | Генетическое встраивание не встречающихся в природе аминокислот в белки клеток млекопитающих | |
| JP2008516637A5 (ru) | ||
| JP2009538136A5 (ru) | ||
| JP2007127631A (ja) | 定量的プロテオミクスに適用可能な多重荷電されたペプチドの選択的分離方法 | |
| RU2008133028A (ru) | Система экспрессии компонентов ортогональной трансляции в эубактериальной клетке-хозяине | |
| KR20160025661A (ko) | 디제너러시 리프로그래밍을 통한 비천연 단백질 합성 방법 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20140314 |