JP7004073B2 - イメージングデータ処理装置 - Google Patents
イメージングデータ処理装置 Download PDFInfo
- Publication number
- JP7004073B2 JP7004073B2 JP2020522475A JP2020522475A JP7004073B2 JP 7004073 B2 JP7004073 B2 JP 7004073B2 JP 2020522475 A JP2020522475 A JP 2020522475A JP 2020522475 A JP2020522475 A JP 2020522475A JP 7004073 B2 JP7004073 B2 JP 7004073B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- image
- imaging data
- unit
- data processing
- imaging
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Images
Classifications
-
- H—ELECTRICITY
- H01—ELECTRIC ELEMENTS
- H01J—ELECTRIC DISCHARGE TUBES OR DISCHARGE LAMPS
- H01J49/00—Particle spectrometers or separator tubes
- H01J49/0027—Methods for using particle spectrometers
- H01J49/0036—Step by step routines describing the handling of the data generated during a measurement
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/483—Physical analysis of biological material
-
- H—ELECTRICITY
- H01—ELECTRIC ELEMENTS
- H01J—ELECTRIC DISCHARGE TUBES OR DISCHARGE LAMPS
- H01J49/00—Particle spectrometers or separator tubes
- H01J49/0004—Imaging particle spectrometry
-
- H—ELECTRICITY
- H01—ELECTRIC ELEMENTS
- H01J—ELECTRIC DISCHARGE TUBES OR DISCHARGE LAMPS
- H01J49/00—Particle spectrometers or separator tubes
- H01J49/26—Mass spectrometers or separator tubes
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Hematology (AREA)
- Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Electrochemistry (AREA)
Description
a)前記測定イメージングデータの全体又は一部である第1のイメージングデータと、それに空間的に対応付けられる前記参照イメージングデータの全体又は一部である第2のイメージングデータとについて、該第1のイメージングデータを説明変数、該第2のイメージングデータを被説明変数とする回帰分析を実行して回帰モデルを作成する回帰分析実行部と、
b)前記回帰モデルに前記第1のイメージングデータを適用することで、回帰分析結果に基づく予測画像を作成する予測画像作成部と、
を備えることを特徴としている。
前記予測画像と前記参照画像との間で空間的に対応付けられる画素単位での相関性を示す相関係数を算出する相関係数算出部と、
前記相関係数算出部により算出された相関係数を表示部の画面上に表示する表示処理部と、
をさらに備える構成とするとよい。
前記予測画像と前記参照画像との間で空間的に対応付けられる画素毎に画素値の減算又は除算を実施して計算値を算出する回帰分析結果評価部と、
前記回帰分析結果評価部により算出された画素毎の計算値に基づく画像を作成して表示部の画面上に表示する差分画像作成部と、
をさらに備える構成とするとよい。
図1は本実施例のイメージング質量分析装置の概略構成図である。本装置は、試料に対して質量分析イメージング法による測定を実施するイメージング質量分析部1と、試料上の光学画像を撮影する光学顕微撮像部2と、データ処理部3と、ユーザインターフェイスである入力部4及び表示部5と、を含む。
まず作業者が目的試料を光学顕微撮像部2の所定の測定位置にセットし、入力部4で所定の操作を行うと、光学顕微撮像部2は該試料の表面を撮影し、光学画像データを光学画像データ格納領域322に保存する。また、画像作成部33は光学画像を作成し、表示処理部39はその画像を表示部5の画面上に表示する。作業者はその画像上でその試料全体又は試料の一部である測定領域を入力部4で指示する。
データ処理部3において画像作成部33は、データ格納部32のスペクトルデータ格納領域321から処理対象である一つの試料についてのプロファイルデータを読み出し、微小領域毎に、予め定められている複数の目的質量電荷比における信号強度を算出し、その質量電荷比毎に信号強度の2次元分布を示す質量分析イメージング画像を作成する。
回帰モデルが得られると、画像作成部33は、説明変数、即ち、質量分析イメージングデータの各画素における質量電荷比値毎の信号強度値を回帰モデルに適用して、回帰分析結果に基づく予測画像を作成する。回帰モデルの精度が高ければ、即ち、回帰モデルが説明変数に基づき被説明変数をよく説明可能なものであれば、予測画像の2次元分布は参照画像の2次元分布に類似したものとなる。そこで、表示処理部39は、図3中の[a]に示すように、一つの予測画像と参照画像とを画面内に並べて配置して表示部5に表示させる。もちろん、並べる以外に、一方を画像を半透明化して重ねて表示してもよい。
回帰モデルが得られると、画像作成部33は、説明変数、即ち、質量分析イメージングデータの各画素における質量電荷比値毎の信号強度値を回帰モデルに適用して、回帰分析結果に基づく予測画像を作成する。相関係数算出部37は、予測画像と参照画像とについて画素単位で相関係数を計算する。それにより、予測画像毎に参照画像との2次元分布の類似性を反映した相関係数が求まる。表示処理部39は、図3中の[b]に示すように、例えば予測画像と相関係数とを表示部5に表示させる。なお、このときに参照画像も併せて表示してもよい。
回帰モデルが得られると、画像作成部33は、説明変数、即ち、質量分析イメージングデータの各画素における質量電荷比値毎の信号強度値を回帰モデルに適用して、回帰分析結果に基づく予測画像を作成する。画素値減算・除算部38は、予測画像における各画素値と参照画像における各画素値とについて規格化を行うことにより、画素値を大まかに揃える。例えば画像毎に全ての画素値の平均値を計算してその平均値が同じになるように各画素値を規格化したり、或いは、各画像における全ての画素値の中で最大の画素値が同じになるように各画素値を規格化したりするといった方法が考えられる。なお、この画素値の規格化は必須ではない。
回帰モデルが得られると、画像作成部33は、説明変数、即ち、質量分析イメージングデータの各画素における質量電荷比値毎の信号強度値を回帰モデルに適用して、回帰分析結果に基づく予測画像を作成する。予測残差算出部36は予測画像に基づいて画素毎に予測残差を算出する。この予測残差の算出はPLS等の回帰分析において周知の方法で求めることができる。この予測残差は回帰が精度良く行われている画素では小さな値になる。画像作成部33はその予測残差に基づく画像を作成する。表示処理部39は、図3中の[d]に示すように、作成された予測残差画像を表示部5に表示させる。
2…光学顕微撮像部
22…データ格納部
3…データ処理部
31…データ収集部
32…データ格納部
321…スペクトルデータ格納領域
322…光学画像データ格納領域
33…画像作成部
34…画像位置合わせ処理部
35…回帰分析実行部
36…予測残差算出部
37…相関係数算出部
38…画素値減算・除算部
39…表示処理部
4…入力部
5…表示部
Claims (7)
- 試料上の2次元的な測定領域内の微小領域毎にスペクトルを取得する所定の測定手法により得られたデータの集合である測定イメージングデータと、試料上の微小領域毎の強度情報の2次元分布である参照画像を構成する参照イメージングデータと、に基づく解析処理によって、前記試料についての情報を求めるイメージングデータ処理装置であって、
a)前記測定イメージングデータの全体又は一部である第1のイメージングデータと、それに空間的に対応付けられる前記参照イメージングデータの全体又は一部である第2のイメージングデータとについて、該第1のイメージングデータを説明変数、該第2のイメージングデータを被説明変数とする回帰分析を実行して回帰モデルを作成する回帰分析実行部と、
b)前記回帰モデルに前記第1のイメージングデータを適用することで、回帰分析結果に基づく予測画像を作成する予測画像作成部と、
を備えることを特徴とするイメージングデータ処理装置。
- 請求項1に記載のイメージングデータ処理装置であって、
前記予測画像に基づいて微小領域毎の予測残差を算出し残差画像を作成して表示部の画面上に表示する残差画像作成部、をさらに備えることを特徴とするイメージングデータ処理装置。
- 請求項1に記載のイメージングデータ処理装置であって、
前記予測画像と前記参照画像とを共に表示部の画面上に表示する分析結果画像作成部をさらに備えることを特徴とするイメージングデータ処理装置。 - 請求項1に記載のイメージングデータ処理装置であって、
前記予測画像と前記参照画像との間で空間的に対応付けられる画素単位での相関性を示す相関係数を算出する相関係数算出部と、
前記相関係数算出部により算出された相関係数を表示部の画面上に表示する表示処理部と、
をさらに備えることを特徴とするイメージングデータ処理装置。 - 請求項1に記載のイメージングデータ処理装置であって、
前記予測画像と前記参照画像との間で空間的に対応付けられる画素毎に画素値の減算又は除算を実施して計算値を算出する回帰分析結果評価部と、
前記回帰分析結果評価部により算出された画素毎の計算値に基づく画像を作成して表示部の画面上に表示する差分画像作成部と、
をさらに備えることを特徴とするイメージングデータ処理装置。 - 請求項1~5のいずれか1項に記載のイメージングデータ処理装置であって、
前記所定の測定手法は質量分析法であり、前記測定イメージングデータは、質量分析により得られたプロファイルスペクトルにおける各ピークについて、使用した質量分析装置の装置精度程度以内の範囲における信号強度を積算してそのピークの信号強度としたものであることを特徴とするイメージングデータ処理装置。 - 請求項6に記載のイメージングデータ処理装置であって、
前記回帰分析は部分最小二乗回帰分析であることを特徴とするイメージングデータ処理装置。
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| PCT/JP2018/020836 WO2019229900A1 (ja) | 2018-05-30 | 2018-05-30 | イメージングデータ処理装置 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPWO2019229900A1 JPWO2019229900A1 (ja) | 2021-03-11 |
| JP7004073B2 true JP7004073B2 (ja) | 2022-01-21 |
Family
ID=68697054
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2020522475A Active JP7004073B2 (ja) | 2018-05-30 | 2018-05-30 | イメージングデータ処理装置 |
Country Status (4)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US11276566B2 (ja) |
| JP (1) | JP7004073B2 (ja) |
| CN (1) | CN112136041B (ja) |
| WO (1) | WO2019229900A1 (ja) |
Families Citing this family (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20240282561A1 (en) * | 2021-09-06 | 2024-08-22 | Shimadzu Corporation | Mass Spectrometry Data Analysis Method and Imaging Mass Spectrometer |
| TW202347550A (zh) * | 2022-03-29 | 2023-12-01 | 日商東京威力科創股份有限公司 | 基板處理裝置、其檢查方法及基板處理系統 |
| CN115452929B (zh) * | 2022-09-30 | 2023-04-21 | 上海立迪生物技术股份有限公司 | 一种成像质谱流式的信号校准方法 |
| CN120672751B (zh) * | 2025-08-20 | 2025-11-21 | 大连奥托股份有限公司 | 一种基于加权轮廓匹配的汽车工件包边质量检测方法 |
Citations (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20150131888A1 (en) | 2012-05-21 | 2015-05-14 | Vanderbilt University | Predictive modeling relating molecular imaging modalities |
Family Cites Families (6)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP5348029B2 (ja) * | 2010-03-16 | 2013-11-20 | 株式会社島津製作所 | 質量分析データ処理方法及び装置 |
| CN102495005B (zh) * | 2011-11-17 | 2013-05-08 | 江苏大学 | 高光谱图像技术诊断作物水分亏缺的方法 |
| CN104270640B (zh) * | 2014-09-09 | 2018-07-31 | 西安电子科技大学 | 基于支持向量回归的光谱图像无损压缩方法 |
| JP6477878B2 (ja) * | 2015-07-01 | 2019-03-06 | 株式会社島津製作所 | データ処理装置 |
| JP6477833B2 (ja) * | 2017-11-06 | 2019-03-06 | 株式会社島津製作所 | データ処理装置 |
| WO2019150573A1 (ja) | 2018-02-05 | 2019-08-08 | 株式会社島津製作所 | データ解析装置 |
-
2018
- 2018-05-30 US US17/055,808 patent/US11276566B2/en active Active
- 2018-05-30 WO PCT/JP2018/020836 patent/WO2019229900A1/ja not_active Ceased
- 2018-05-30 CN CN201880093329.3A patent/CN112136041B/zh active Active
- 2018-05-30 JP JP2020522475A patent/JP7004073B2/ja active Active
Patent Citations (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20150131888A1 (en) | 2012-05-21 | 2015-05-14 | Vanderbilt University | Predictive modeling relating molecular imaging modalities |
Non-Patent Citations (2)
| Title |
|---|
| DE PLAS, Raf van,Image fusion of mass spectrometry and microscopy: a multimodality paradigm for molecular tissue mapp,NATURE METHODS,2015年04月,Vol.12/No.4,PP.366-372 |
| ROMPP, Andreas,Mass spectrometry imaging with high resolution in mass and space,Histochem Cell Biol,2013年,Vol.139/Iss.6,PP.759-783 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| JPWO2019229900A1 (ja) | 2021-03-11 |
| US11276566B2 (en) | 2022-03-15 |
| US20210210318A1 (en) | 2021-07-08 |
| CN112136041B (zh) | 2023-06-16 |
| CN112136041A (zh) | 2020-12-25 |
| WO2019229900A1 (ja) | 2019-12-05 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US20220059331A1 (en) | Data processing device | |
| JP7004073B2 (ja) | イメージングデータ処理装置 | |
| JP6908136B2 (ja) | データ解析装置 | |
| JP6927416B2 (ja) | イメージングデータ処理装置及びイメージングデータ処理プログラム | |
| JP5565810B2 (ja) | 質量分析データ処理方法及び装置 | |
| JP6465121B2 (ja) | 分析データ処理方法及び装置 | |
| JP6207036B2 (ja) | 質量分析データ処理方法及び装置 | |
| JP2011191222A (ja) | 質量分析データ処理方法及び装置 | |
| WO2019150575A1 (ja) | イメージング質量分析データ解析装置 | |
| JP6179600B2 (ja) | 質量分析データ解析装置 | |
| CN112805559B (zh) | 成像数据解析装置 | |
| JP6939912B2 (ja) | イメージング質量分析用データ処理装置 | |
| JP7001157B2 (ja) | イメージング質量分析データ処理装置 | |
| US11211235B2 (en) | Imaging mass spectrometry data processing device | |
| US12190517B2 (en) | Imaging analysis device and imaging data analysis method | |
| JP6973638B2 (ja) | イメージングデータ処理装置 | |
| WO2019150574A1 (ja) | イメージング質量分析装置 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20200923 |
|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20200923 |
|
| TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
| A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20211130 |
|
| A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20211213 |
|
| R151 | Written notification of patent or utility model registration |
Ref document number: 7004073 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R151 |