JP6465121B2 - 分析データ処理方法及び装置 - Google Patents

Description

本発明は、分析装置で得られたデータを処理する方法及び装置に関し、さらに詳しくは、試料上の２次元領域内の多数の測定点についてそれぞれ質量分析を行って該測定点付近の試料に関するデータを取得することが可能なイメージング質量分析装置で得られたデータを処理する方法及び装置に関する。

質量分析イメージングは、生体組織切片などの試料の２次元領域内の複数の測定点（微小領域）に対しそれぞれ質量分析を行うことにより、特定の質量を有する物質の分布を調べる手法であり、創薬やバイオマーカ探索、各種疾病・疾患の原因究明などへの応用が進められている。質量分析イメージングを実施するための質量分析装置は一般にイメージング質量分析装置と呼ばれている（非特許文献１など参照）。また、通常、試料上の任意の２次元領域について顕微観察を行い、その顕微観察画像に基づいて分析対象領域を定めて該領域のイメージング質量分析を実行することから、顕微質量分析装置や質量顕微鏡などと呼ばれることもあるが、本明細書では「イメージング質量分析装置」と呼ぶこととする。

図５はイメージング質量分析装置により得られるデータとそれに基づくイメージング画像表示の概略説明図である。イメージング質量分析装置では、サンプル１００上の２次元的な測定対象領域１０１内に設定された多数の測定点（微小領域）１０２それぞれにおいて、所定の質量電荷比m/z範囲における質量電荷比と強度値（イオン強度値）との関係を示すマススペクトルデータが取得される。本明細書では、測定対象領域内の全ての測定点から得られたマススペクトルデータの集合を質量分析イメージングデータという。

こうして収集された質量分析イメージングデータに基づいて、特定の質量を有する成分の２次元分布を観測したい場合には、分析者は、該成分由来のイオンの質量電荷比（図５の例ではm/z＝Ｍ₁）におけるイメージング画像の作成・表示を指示する。すると、各測定点１０２において得られたマススペクトルからm/z＝Ｍ₁における強度値が抽出され、その強度値をカラースケールやグレイスケールで表した画素が各測定点１０２のｘ軸、ｙ軸の二軸方向の位置に対応付けて配置されることで所望のマッピング画像、つまり質量分析イメージング画像が作成される。一つの質量分析イメージングデータから、質量電荷比方向のデータ点数分の枚数の質量分析イメージング画像を作成することができる。

イメージング質量分析装置に通常利用されるマトリックス支援レーザー脱離イオン化（ＭＡＬＤＩ）イオン源は生体試料等に適したイオン化法であるものの、測定毎（つまりはレーザー光照射毎）のイオン強度のばらつきが比較的大きい。そこで、通常、一つの測定点に対するマススペクトルを取得する際に、複数回の繰り返し測定を行い、その複数回の測定でそれぞれ得られたイオン強度信号を積算する。しかしながら、そうした信号の積算を行っても測定点毎のイオン強度のばらつきの影響を十分に解消できないことがある。そのため、各測定点において得られた特定の質量電荷比に対する強度値からそのままイメージング画像を作成しても、必ずしも物質の分布を正確に反映しているとは限らない。そこで、イメージング画像を作成する際に、各測定点における強度値をそのまま用いるのではなく、所定の基準に従って規格化した強度値が用いられることがしばしばある。

例えば非特許文献２には、一つの試料から得られた質量分析イメージングデータに対してＴＩＣ規格化やＸＩＣ規格化を行ったうえでイメージング画像の作成・表示を行ったり統計解析を行ったりすることが有効であることが示されている。ＴＩＣは「Total Ion Current」の略称であり、各測定点で取得したマススペクトルにおける全質量電荷比範囲のイオン強度値の和のことである。ＴＩＣ規格化を行えば、各測定点のＴＩＣが同じになるように各質量電荷比における強度値が規格化される。一方、ＸＩＣは「Extract Ion Current」の略称であり、各測定点で取得したマススペクトルにおける特定の質量電荷比のイオン強度値又は特定の質量電荷比範囲のイオン強度値の和のことである。ＸＩＣ規格化を行えば、各測定点のＸＩＣが同じになるように各質量電荷比における強度値が規格化されるから、例えば特定の質量電荷比におけるピークの高さを全ての測定点間で揃えることができる。また、特許文献２には、ＴＩＣ基準による規格化をより拡張したｐノルムに基づいてマススペクトルの強度値を規格化することが開示されているが、これも、マススペクトルに現れる一つのピークの強度値又は複数のピークの強度値の和を基準とする規格化である。

ところで、イメージング質量分析を利用した試料の解析では、複数の試料からそれぞれ得られた質量分析イメージングデータを比較することで、特定の成分の有無を判定したり、そうした成分の空間分布の類似性を判定したり、或いはそうした成分の含有量を或る程度定量的に比較したりしたいという強い要望がある。比較したい複数の質量分析イメージングデータは異なる日時に測定されたものであったり、異なる測定条件の下で測定されたものだったりすることも多々ある。イメージング質量分析装置では、ＭＡＬＤＩイオン源のレーザー光の照射径、該レーザー光のエネルギー、イオン源におけるサンプル表面付近からのイオンの引き出し電圧、イオン検出器の印加電圧、さらには、試料の種類や前処理の条件の相違など、様々な要因によって、得られる信号の強度値が大きく異なる傾向にある。そのため、複数の試料からそれぞれ得られた質量分析イメージングデータを正確に比較するには、それらデータの間でも同じ基準に従って強度値を規格化する必要がある。

しかしながら、上述した従来の規格化の方法は、それぞれの質量分析イメージングデータ内でのＴＩＣやＸＩＣの最大値を基準として規格化を行うものであるため、複数の質量分析イメージングデータを適切に規格化するような共通の基準値を求めることはできない。この共通の基準値を分析者が適宜に決め、その基準値に基づいて規格化を行うことも可能ではあるものの、基準値が適切でないと規格化演算の際にデータのオーバーフローや大きな丸め誤差が発生するおそれがある。

即ち、コンピュータ上で上述したような規格化演算を行う場合、通常、質量分析により得られた強度値は１６bitや３２bitなど所定のビット長の変数に格納されるため、そのダイナミックレンジは限られる。そのため、規格化の基準値が大きすぎると、一部の強度値が規格化によって大きくなりすぎ、オーバーフローが発生することがある。逆に規格化の基準値が小さすぎると、規格化後の強度値に大きな丸め誤差が発生し、解析精度の低下に繋がる。こうした事態を避けるには、規格化の際の基準となる共通の基準値を適切に設定することが重要である。

上記のような規格化のための共通の基準値を求めることなしに複数の質量分析イメージングデータを適切に規格化する一つの方法として、特許文献１に記載のデータ処理方法がある。このデータ処理方法では、複数の質量分析イメージングデータを一つの質量分析イメージングデータとして取り扱えるように、まず比較対象の複数の質量分析イメージングデータを空間的に結合する。そうした結合を行うために、複数の質量分析イメージングデータにおける空間分解能（つまりは一つ測定点のサイズ又は間隔）及び質量分解能を揃えるように、データの補間処理を行う。そして、結合によって得られた一つの質量分析イメージングデータに対し、ＴＩＣ規格化又はＸＩＣ規格化を実施することで各測定点の強度値を修正する。

ただし、単にＴＩＣやＸＩＣの最大値を基準として規格化を行うと、規格化演算においてオーバーフローが生じるおそれがある。そこで、特許文献１に記載のデータ処理方法では、規格化を行う際に、さらに、強度値が格納される変数の最大許容値を超えないように全測定点の強度値に対し１よりも小さい定数を乗じるスケーリング処理を同時に行い、オーバーフローを回避するようにしている。

特開２０１４−２１５０４３号公報 米国特許公開第２０１２／００１６５９８号明細書

「iMScope TRIO イメージング質量顕微鏡」、株式会社島津製作所、［平成２６年１２月５日検索］、インターネット＜URL: http://www.an.shimadzu.co.jp/bio/imscope/index.htm＞ 杉浦（Y. Sugiura）ほか６名、「ビジュアライゼイション・オブ・ザ・セル-セレクティブ・ディストリビューション・オブ・ピーユーエフエー-コンテイニング・フォスファティダイルコリンズ・イン・マウス・ブレイン・バイ・イメージング・マス・スペクトロメトリ（Visualization of the cell-selective distribution of PUFA-containing phosphatidylcholines in mouse brain by imaging mass spectrometry）」、ジャーナル・オブ・リピッド・リサーチ（Journal of Lipid Research）、Vol.50、2009年、pp.1766-1788

上述した特許文献１に記載のデータ処理方法は、比較対象である複数の質量分析イメージングデータを適切に規格化できる優れた方法の一つではあるものの、複数の質量分析イメージングデータを結合する処理には時間が掛かる。この処理に要する時間は、質量分析イメージングデータの質量分解能や空間分解能が高くなりデータサイズが大きくなるほど長くなる。また、そうした処理を短時間で行うためには高い性能のコンピュータが必要になることもある。また上記手法では、結合したデータ内の最大値に合わせて規格化を行うため、結合していないデータ間では同じ基準の下で規格化を行うことができない。複数の質量分析イメージングデータ間で空間分解能や質量分解能を揃える必要がある場合には、上記のような結合処理は有効であるものの、空間分解能等を揃える必要がなく複数の質量分析イメージングデータをより簡便に効率良く比較したい場合には、それら複数の質量分析イメージングデータにおける強度値の規格化をより簡単な処理で効率的に行えるようにすることが必要である。

本発明は上記課題に鑑みて成されたものであり、イメージング質量分析装置によって、例えば異なる試料からそれぞれ得られた複数の分析データをより簡便に効率良く比較できるようにするために、上記従来技術のような複数の分析データの結合処理を行うことなく、それら複数の分析データ間での強度値の規格化をより簡単な処理で効率的に行えるようにすることをその主たる目的としている。

上記課題を解決するために成された本発明に係る分析データ処理方法の第１の態様は、試料上に設定された所定の測定対象領域内の複数の測定点に対しそれぞれ質量分析を実行することで収集された、質量電荷比とイオン強度値との関係を示すマススペクトルデータが前記測定点の空間位置情報に関連付けられてなるスペクトルデータ集合を扱う分析データ処理方法であって、含まれるマススペクトルデータの質量分解能及び／又は空間分解能が互いに異なる複数のスペクトルデータ集合について、
a)一つのスペクトルデータ集合毎に、各測定点のマススペクトルデータ中の全て又は一部の質量電荷比値に対する強度値を基準値に基づいて規格化する際に、その規格化後の強度値が所定の許容値を超えない基準値を求める個別基準値取得ステップと、
b)全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得ステップにより得られた複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出ステップと、
c)各スペクトルデータ集合に含まれるマススペクトルデータ中の全て又は一部の質量電荷比値に対する強度値を、前記共通基準値選出ステップにより選出された共通の基準値に基づいて規格化する規格化実行ステップと、
を有することを特徴としている。

また上記課題を解決するために成された本発明に係る分析データ処理方法の第２の態様は、試料上に設定された所定の測定対象領域内の複数の測定点に対しそれぞれ質量分析を実行することで収集された、質量電荷比とイオン強度値との関係を示すマススペクトルデータが前記測定点の空間位置情報に関連付けられてなるスペクトルデータ集合を扱う分析データ処理方法であって、含まれるマススペクトルデータの質量分解能及び／又は空間分解能が互いに異なる複数のスペクトルデータ集合について、
a)一つのスペクトルデータ集合毎に、一つの測定点におけるマススペクトルデータ中の全て又は一部の質量電荷比値に対する強度値の積算値と最大強度値との比が全ての測定点の中で最大であるものを規格化のための基準値として求める個別基準値取得ステップと、
b)全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得ステップにより得られた複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出ステップと、
c)各スペクトルデータ集合に含まれるマススペクトルデータ中の全て又は一部の質量電荷比値に対する強度値を、前記共通基準値選出ステップにより選出された共通の基準値に基づいて、規格化後の強度値が所定の許容値を超えないように規格化する規格化実行ステップと、
を有することを特徴としている。

また上記課題を解決するために成された本発明に係る分析データ処理装置の第１の態様は、本発明に係る分析データ処理方法の第１の態様を実施するための装置であり、試料上に設定された所定の測定対象領域内の複数の測定点に対しそれぞれ質量分析を実行することで収集された、質量電荷比とイオン強度値との関係を示すマススペクトルデータが前記測定点の空間位置情報に関連付けられてなるスペクトルデータ集合を扱う分析データ処理装置において、含まれるマススペクトルデータの質量分解能及び／又は空間分解能が互いに異なる複数のスペクトルデータ集合について、
a)一つのスペクトルデータ集合毎に、各測定点のマススペクトルデータ中の全て又は一部の質量電荷比値に対する強度値を基準値に基づいて規格化する際に、その規格化後の強度値が所定の許容値を超えない基準値を求める個別基準値取得部と、
b)全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得部により得られた複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出部と、
c)各スペクトルデータ集合に含まれるマススペクトルデータ中の全て又は一部の質量電荷比値に対する強度値を、前記共通基準値選出部により選出された共通の基準値に基づいて規格化する規格化実行部と、
を備えることを特徴としている。

また上記課題を解決するために成された本発明に係る分析データ処理装置の第２の態様は、本発明に係る分析データ処理方法の第２の態様を実施するための装置であり、試料上に設定された所定の測定対象領域内の複数の測定点に対しそれぞれ質量分析を実行することで収集された、質量電荷比とイオン強度値との関係を示すマススペクトルデータが前記測定点の空間位置情報に関連付けられてなるスペクトルデータ集合を扱う分析データ処理装置であって、含まれるマススペクトルデータの質量分解能及び／又は空間分解能が互いに異なる複数のスペクトルデータ集合について、
a)一つのスペクトルデータ集合毎に、一つの測定点におけるマススペクトルデータ中の全て又は一部の質量電荷比値に対する強度値の積算値と最大強度値との比が全ての測定点の中で最大であるものを規格化のための基準値として求める個別基準値取得部と、
b)全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得部により得られた複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出部と、
c)各スペクトルデータ集合に含まれるマススペクトルデータ中の全て又は一部の質量電荷比値に対する強度値を、前記共通基準値選出部により選出された共通の基準値に基づいて、規格化後の強度値が所定の許容値を超えないように規格化する規格化実行部と、
を備えることを特徴としている。

本発明で対象とするデータは、質量電荷比とイオン強度値との関係を示すマススペクトルデータであるが、飛行時間型質量分析装置ではまず飛行時間とイオン強度値との関係を示す飛行時間スペクトルが作成され、該飛行時間スペクトル上の各イオンの飛行時間が質量電荷比に換算されることでマススペクトルが作成される。したがって、「マススペクトルデータ」は、質量電荷比に換算する前の飛行時間で表された「飛行時間スペクトルデータ」でも構わない。

本発明に係る分析データ処理方法及び装置において、規格化の手法は例えば、上述したＴＩＣ規格化、ＸＩＣ規格化、又はｐノルム基準による規格化である。当然、これら規格化の手法によって規格化のための基準値は異なり、それによって、その基準値を求める際に用いられるスペクトルデータ中の強度値も相違する。即ち、例えばＴＩＣ規格化を行う場合であれば、基準値を求めるためにスペクトルデータ中の全てパラメータ値に対する強度値の積算値が用いられるし、ＸＩＣ規格化を行う場合であれば、スペクトルデータ中の特定の一つのパラメータ値に対する強度値又は所定のパラメータ値範囲に入る複数のパラメータ値に対する強度値の積算値が用いられる。

本発明の第１の態様による分析データ処理装置により実施される本発明の第１の態様による分析データ処理方法では、個別基準値取得ステップにおいて、一つのスペクトルデータ集合に含まれる各測定点のスペクトルデータ中の例えば全てのパラメータ値に対する強度値を基準値に基づいて規格化する際に、その規格化後の強度値が所定の許容値を超えない基準値が求められる。そして、例えば比較解析したい複数のスペクトルデータ集合について、それぞれ同じように基準値が求められる。

ここで「所定の許容値」は、典型的には、コンピュータにより規格化演算を実行する際に強度値が格納される変数が採り得る最大値、つまりはコンピュータによる演算に際しデータのオーバーフローが生じないことが保証される最大値である。この場合、個別基準値取得ステップにおいて求まる基準値に基づいて、その一つのスペクトルデータ集合に含まれる複数のスペクトルデータ中の強度値を規格化した場合には、その規格化演算の際のオーバーフローを確実に回避できる。また、演算の際の丸め誤差も最小に抑えられる。

複数のスペクトルデータ集合に対してそれぞれ得られる基準値は異なるから、共通基準値選出ステップでは、その複数の基準値の中で最小のものを共通の基準値として選出するか、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する。これは、全てのスペクトルデータ集合に含まれる規格化対象の強度値に対して、規格化演算時にオーバーフローが生じないことが保証される基準値である。ただし、基準値を小さくするほど丸め誤差は大きくなるから、複数の基準値の中の最小値よりも小さい値ではなくその最小値自体を共通の基準値として選出することが望ましい。

そして、規格化実行ステップでは、複数のスペクトルデータ集合それぞれに含まれるスペクトルデータ中の全て又は一部のパラメータ値に対する強度値を、上述した共通の基準値に基づいて規格化する。その結果、複数のスペクトルデータ集合における全ての測定点で同一の基準に従って、例えばＴＩＣ値が揃うように強度値を修正することができる。また、その演算の際にオーバーフローが生じることを回避しつつ、丸め誤差もできるだけ小さくすることができる。したがって、異なるスペクトルデータ集合間での強度値の規格化を精度良く行うことができ、それらスペクトルデータ集合同士の比較が正確に行える。

本発明の第１の態様による分析データ処理方法及び装置では、スペクトルデータ集合毎の規格化の基準値を求める際に、規格化後の強度値が所定の許容値を超えないという条件が織り込まれている。つまり、その基準値に基づいた規格化を行えば、少なくともその一つのスペクトルデータ集合に含まれる規格化対象の強度値はオーバーフローすることがない。これに対し、本発明の第２の態様による分析データ処理方法及び装置では、スペクトルデータ集合毎の規格化の基準値を求める際には、規格化後の強度値が所定の許容値を超えないという条件は課されない。したがって、そうして求まった基準値に基づいて単に規格化を行った場合には、その一つのスペクトルデータ集合に含まれる規格化対象の強度値は基準値に合うように適切に規格化されるものの、演算上でオーバーフローする可能性がある。それは、共通基準値選出ステップにより選出された共通の基準値を用いた場合でも同様である。

そこで、本発明の第２の態様による分析データ処理方法及び装置では、規格化実行ステップにおいて各強度値を規格化する際に、規格化後の強度値が所定の許容値を超えないという条件を織り込んだ規格化の演算処理を行う。そのため、上記本発明の第１の態様による分析データ処理方法及び装置と同様に本発明の第２の態様による分析データ処理方法及び装置によっても、その規格化演算の際にオーバーフローが生じることを回避しつつ、丸め誤差もできるだけ小さくすることができる。また、複数のスペクトルデータ集合における全ての測定点で同一の基準に従って、例えばＴＩＣ値が揃うように強度値を修正することができ、それらスペクトルデータ集合同士の比較が正確に行える。

本発明の第１の態様、第２の態様のいずれの分析データ処理方法及び装置においても、個別基準値取得ステップによる一つのスペクトルデータ集合毎の基準値の取得は、例えば比較解析を行いたい複数のスペクトルデータ集合が分析者により指定され、それら複数のスペクトルデータ集合の間での規格化が必要になったときに行えばよい。ただし、基準値を取得するには、スペクトルデータ集合が保存されている外部記憶装置等から多くのデータを読み出す必要があり、その処理には或る程度の時間が掛かる。また、比較解析の度にそうした基準値を求める処理を実行するのも時間の無駄である。

一つのスペクトルデータ集合に対する規格化のための基準値は、該データの強度値に依存するから、強度値が決まれば一義的に決まる。そこで、基準値の取得は必ずしも規格化の直前に行う必要はなく、測定によりデータが取得された時点以降、いつ行ってもよい。

そこで、本発明に係る分析データ処理方法において、好ましくは、個別基準値取得ステップは所定の測定対象領域内の複数の測定点に対しそれぞれ所定の分析を実行することでそのスペクトルデータ集合に含まれるスペクトルデータが収集されるときに行われるようにするとよい。そうして得られた基準値は、例えば測定により得られたデータと同じデータファイル内に格納したり、該データファイルと関連付けられた別のファイル内に格納したりしておけばよい。

これにより、複数のスペクトルデータ集合に含まれるデータの規格化を行う際には改めて個別の基準値を算出する必要はなく、そのために要する時間を短縮して効率的な規格化処理が行える。

また、上述したように、規格化のための基準値を小さくするほど丸め誤差は大きくなるが、ユーザが介在することなく自動的に共通の基準値が決まるのではなく、共通の基準値の決定についてユーザが関与したい場合もある。そこで、本発明に係る分析データ処理方法において、上記共通基準値選出ステップでは、全てのスペクトルデータ集合に対し個別基準値取得ステップにより得られた複数の基準値をユーザに提示し、その提示された情報に基づくユーザの指示に応じた値を共通の基準値として設定するようにしてもよい。

本発明に係る分析データ処理方法及び装置によれば、例えば複数の試料からそれぞれ得られた分析データを比較したい場合に、従来の一手法のように比較したいデータ同士を結合することなく、そのまま、必要なデータを規格化して比較することができる。そのため、そうしたデータの結合などの余分な処理に要する時間が不要になり、比較解析を効率的に進めることができる。また、本発明に係る分析データ処理方法及び装置によれば、演算に用いられる変数のダイナミックレンジを有効に利用することができ、規格化の演算の際にオーバーフローが生じることを回避しつつ、丸め誤差も抑えることができる。それによって、異なるスペクトルデータ集合間での強度値の規格化を精度が向上し、それらスペクトルデータ集合同士の比較解析も正確に行えるようになる。また、変数のビット長を無駄に長くしておく必要もないので、コンピュータのリソースの有効活用を図ることができる。

本発明に係る分析データ処理装置の一実施例であるイメージング質量分析装置の概略構成図。 本実施例のイメージング質量分析装置における測定実行時の特徴的なデータ処理のフローチャート。 本実施例のイメージング質量分析装置における複数のイメージング質量分析データに対する規格化処理のフローチャート。 本実施例のイメージング質量分析装置において実行される複数のイメージング質量分析データに対する規格化処理の概略説明図。 イメージング質量分析により得られるデータとそれに基づく２次元イメージング画像作成・表示の概略説明図。

以下、イメージング質量分析装置で得られる質量分析イメージングデータを例に挙げて、本発明に係る分析データ処理方法及び装置を説明する。
まず、本発明の特徴の一つである、複数の質量分析イメージングデータに対する規格化処理方法について、図４を参照して説明する。

ここでは、図４（ａ）、（ｂ）、（ｃ）に示すような異なる三つの試料Ａ、Ｂ、Ｃから得られた質量分析イメージングデータを規格化する場合を例に挙げる。図５により説明したように、一つの質量分析イメージングデータは、試料１００上の所定の測定対象領域１０１内の多数の測定点１０２における所定の質量電荷比範囲のマススペクトルデータの集合である。三つの質量分析イメージングデータにおいて、測定点のサイズ（測定点の間隔）、測定点の数、質量電荷比範囲、質量分解能などは揃っている必要はない。

一つの質量分析イメージングデータにおいて、ｉ番目（ｉ＝１〜Ｎ：Ｎは測定対象領域１０１内の測定点１０２の総数）の測定点におけるマススペクトルの中で最大の強度値をＩ_i、該マススペクトル上の全ての強度値の和であるＴＩＣ値をＰ_iとする。また、この質量分析イメージングデータにおける規格化の基準となるＴＩＣ値、つまりは個別基準値をＰs_jとする。ここで、ｊは質量分析イメージングデータに付された連番であり、図４中に示したように試料Ａはｊ＝１、試料Ｂはｊ＝２、試料Ｃはｊ＝３であるとする。さらに、コンピュータにおいて規格化の演算処理を行う際に、強度値を格納する変数が採ることができる最大許容値をlong_Maxとする。
この場合、一つ質量分析イメージングデータ内の全ての測定点について、次の(1)式を満たせば、規格化の演算の際にオーバーフローは生じない。
Ｉ_i×（Ｐs_j／Ｐ_i）≦long_Max …(1)
この(1)式を変形すると、
Ｐs_j ≦long_Max×（Ｐ_i／Ｉ_i） …(2)
となる。
図４（ａ）では、ｉ＝８、ｉ＝１６の二つの測定点に対するマススペクトルを例示しており、前者からＩ₈、Ｐ₈が求まり、後者からＩ₁₆、Ｐ₁₆が求まる。

ＴＩＣ規格化の際に用いる個別基準値Ｐs_jが(2)式を満たせば、規格化演算の際にオーバーフローは生じない。即ち、ＴＩＣ規格化の際に、全てのｉに対するlong_Max×（Ｐ_i／Ｉ _i ）の値のうちの最大値以下の適宜の値を個別基準値Ｐs_jに定め、各測定点におけるＴＩＣ値をその個別基準値Ｐs_jに揃えるように規格化を行えばオーバーフローを生じることなく規格化することができる。ただし、個別基準値Ｐs_jの値を小さくしすぎると規格化演算の際の丸め誤差が大きくなる。そのため、個別基準値Ｐs_jは可能な限りlong_Max×（Ｐ_i／Ｉ_i）の最大値に近い値に定めることが望ましい。したがって、通常はlong_Max×（Ｐ_i／Ｉ_i）の最大値を個別基準値Ｐs_jとすればよい。この場合、個別基準値Ｐs_jにはlong_Maxの要素が織り込まれており、これに基づく規格化ではオーバーフローが起きないことが保証される。

互いに比較したい複数の質量分析イメージングデータについてそれぞれ、上記(2)式に基づき、規格化演算におけるオーバーフローが生じるおそれのない個別基準値Ｐs_jを求める。図４の例では、三つの個別基準値Ｐs₁、Ｐs₂、Ｐs₃が求まる。通常、それら個別基準値Ｐs_jは互いに相違する。そこで、その複数の質量分析イメージングデータに対してそれぞれ得られた個別基準値Ｐs_jを比較し、その中で値が最小のものを選択する。選択した個別基準値を共通基準値Ｐminとする。この共通基準値Ｐminは、比較対象である複数の質量分析イメージングデータについて全ての測定点におけるＴＩＣ値及び最大強度値を考慮したものである。そのため、比較対象である全ての質量分析イメージングデータにおいて、各測定点のＴＩＣ値が共通基準値Ｐminとなるようにマススペクトルの各強度値を規格化することで、複数の質量分析イメージングデータを同一の基準で且つ、オーバーフローが発生しないように規格化することができる。また、規格化演算の際に生じる丸め誤差もできるだけ小さく抑えることができる。具体的には、各測定点におけるマススペクトルの強度値にそれぞれ、次の(3)式で求まる規格化係数Ｇを乗じることで、強度値を修正すればよい。
Ｇ＝Ｐmin／Ｐ_i …(3)

なお、上記説明はＴＩＣ規格化を行う場合を前提としているが、ＸＩＣ規格化を行う場合でも原理は同様である。規格化を行う際の基準値は、ＴＩＣ規格化の場合にはマススペクトルの全質量電荷比範囲に亘る強度値の積算値、ＸＩＣ規格化の場合には特定の質量電荷比における強度値又は特定の質量電荷比範囲の強度値の積算値である。したがって、質量電荷比やその範囲を限定したうえで上述した説明に基づき共通基準値を定め、その共通基準値に基づいた規格化を行えばよい。さらにまた、特許文献２に開示されているようなｐノルムを基準とする規格化の場合も同様であり、ＴＩＣ値Ｐ_iをｐノルムに置き換えればよい。

上述した演算処理をコンピュータ上で行うためには、比較したい複数の質量分析イメージングデータを例えば外部記憶装置からコンピュータ内のメインメモリやＣＰＵ内部のレジスタなどに読み込み、上記(2)式に従って、質量分析イメージングデータ毎にlong_Max×（Ｐ_i／Ｉ_i）の最大値を求めることで個別基準値Ｐs_jを取得する。そして、複数の質量分析イメージングデータに対する個別基準値Ｐs_jのうち値が最小であるＰminを求め、それを基準とし(3)式に従ってそれぞれの強度値を規格化すればよい。ただし、こうした処理手順では、次のような実用上の問題がある。

即ち、上述したように質量分析イメージングデータの総データ量は数十GB以上になる場合がある。コンピュータのメインメモリの容量には制約があるため、データを比較する際に、比較したい複数の質量分析イメージングデータの全てをメインメモリに読み込むことは通常困難である。そのため、複数の質量分析イメージングデータを一つずつメインメモリに読み込んで個別基準値Ｐs_jを求め、これを繰り返して複数の個別基準値Ｐs_jを求める。そして、共通基準値Ｐminを選出し、その後に再び複数の質量分析イメージングデータを一つずつメインメモリに読み込んで共通基準値Ｐminを基準とした規格化を行う必要がある。この場合、個別基準値Ｐs_jの算出時と各強度値の規格化時とで同じデータをメインメモリに読み込む作業が必要となる。つまり、同じデータを読み込む作業が２回生じるため、データ解析に時間が掛かることになる。

そこで、こうした問題を避けるためには次のような手順で処理を行うとよい。即ち、イメージング質量分析装置において試料に対する測定を実行してデータを収集する際や、解析のためにデータに対しノイズ除去などの前処理を行う際に、質量分析イメージングデータ毎に個別基準値Ｐs_jを算出する。そして、その個別基準値Ｐs_jを例えば、質量分析イメージングデータと同じデータファイル内又は該データファイルと関連付けられた別のファイルなどに保存しておく。複数の質量分析イメージングデータに対する比較解析を行う際には、比較したい複数の質量分析イメージングデータに対する個別基準値Ｐs_jが保存されているファイルを読み込むか、或いは、そうしたファイルから個別基準値Ｐs_jのみを読み込み、共通基準値Ｐminを決定する。そのあと、個々の質量分析イメージングデータをメインメモリに読み込んで共通基準値Ｐminを基準とした規格化を行う。これにより、規格化の個別基準値Ｐs_jを求めるために質量分析イメージングデータをメインメモリに読み込む作業は必要なくなり、少なくとも規格化演算処理に要する時間を短縮することができる。

次に、上述したデータの規格化処理を実施するイメージング質量分析装置の一実施例の構成及び動作を説明する。図１は本実施例のイメージング質量分析装置の要部の構成図である。

このイメージング質量分析装置は、イメージング質量分析部１と、得られたデータに対し後述するような様々なデータ処理を実行するデータ処理部２と、イメージング質量分析部１で取得されたマススペクトルデータ等を保存する例えばハードディスクドライブ（ＨＤＤ）やソリッドステートドライブ（ＳＳＤ）などの大容量の外部記憶装置３と、分析者が操作する操作部４と、分析結果等を表示する表示部５と、を備える。

イメージング質量分析部１は、図示しないものの、サンプル上の光学顕微画像を観察するための顕微観察部と、大気圧ＭＡＬＤＩイオン源、イオントラップ、及び飛行時間型質量分析計（ＴＯＦＭＳ）を含む質量分析部と、を備える。このイメージング質量分析部１では、図５によりすでに説明したように、分析者により指定されたサンプル１００上の測定対象領域１０１内の多数の測定点（微小領域）１０２に対しそれぞれ質量分析を実施し、測定点毎に所定の質量電荷比範囲に亘るマススペクトルデータを得ることができる。このマススペクトルデータは、イオンの解離を伴わない質量分析によって得られたもの以外に、例えばマススペクトル上に現れる任意のピークに対応するイオンをイオントラップにおいて解離させ、それにより生成されたイオンを質量分析することで得られたＭＳ／ＭＳスペクトル（さらにはｎが３以上のＭＳⁿスペクトル）データでもよい。

データ処理部２は機能ブロックとして、データ収集部２０、個別基準値算出部２１、共通基準値決定部２２、規格化演算処理部２３、ピーク行列作成部２４、イメージング画像作成部２５、統計解析演算部２６、データファイル作成部２７、メインメモリ２８、表示処理部２９、などを含む。このデータ処理部２の実体はＣＰＵ、ＲＡＭ、ＲＯＭなどを含むパーソナルコンピュータ（又はより高性能なワークステーション）であり、このコンピュータに予めインストールされた専用のデータ解析用ソフトウエアを実行することで、メインメモリ２８を除く上記各ブロックの機能が実現される。

図２は本実施例のイメージング質量分析装置において一つの試料に対して測定を行う際の特徴的なデータ処理のフローチャート、図３は複数のイメージング質量分析データに対する規格化処理のフローチャートである。これらの図を参照しつつ、本実施例のイメージング質量分析装置における特徴的なデータ処理動作を説明する。

測定対象であるサンプルがイメージング質量分析部１にセットされると、図示しない顕微観察部はサンプル上の高解像の顕微画像を撮影し、その画像がデータ処理部２を介して表示部５の画面上に表示される。分析者は、この画像を参照して操作部４によりサンプル上の測定対象領域を指定する。すると、図示しない制御部は、指定された測定対象領域内の多数の測定点に対する質量分析を順次実行するようにイメージング質量分析部１を制御する。即ち、測定点を指定する変数ｉをまず１にセットし（ステップＳ１１）、ｉ番目の測定点に対する測定を実行する（ステップＳ１２）。これによって、ｉ番目の測定点におけるマススペクトルデータが得られるから、データ収集部２０はこのデータをメインメモリ２８に一旦格納する（ステップＳ１３）。

データ処理部２においては、これと並行して個別基準値算出部２１が、ｉ番目の測定点に対して得られたマススペクトルデータから、最大の強度値Ｉ_iと質量電荷比全体に亘る強度値を積算したＴＩＣ値Ｐ_iとを算出し、ｉの値に対応付けて内部に一時的に記憶する（ステップＳ１４）。したがって、ｉ＝１のときには、最大強度値Ｉ₁とＴＩＣ値Ｐ₁とが記憶される。

次に、制御部では変数ｉがその測定対象領域内の測定点総数であるＮに達したか否かが判定され（ステップＳ１５）、変数ｉが測定点総数Ｎに達していなければｉの値をインクリメント（ステップＳ１６）してステップＳ１２へ戻る。一方、変数ｉが測定点総数Ｎに達していればステップＳ１５からＳ１７へ進む。したがって、変数ｉが測定点総数ＮになるまでステップＳ１２〜Ｓ１６の処理を繰り返す。これによって、分析者により指定された測定対象領域内の全ての測定点に対する質量分析が実施され、メインメモリ２８には全測定点に対するマススペクトルデータ、つまりはその試料に対する質量分析イメージングデータが格納される。一方、個別基準値算出部２１には、ｉ＝１〜Ｎについての最大強度値Ｉ_iとＴＩＣ値Ｐ_iとが記憶される。そのあと、個別基準値算出部２１は、それら全ての測定点（つまりｉ＝１〜Ｎ）についてＰ_i／Ｉ_iを計算し、その中の最大値を未スケーリング個別基準値Ｆ_jとして選択する（ステップＳ１７）。この未スケーリング個別基準値Ｆ_jは上記個別基準値Ｐs_jとは異なりlong_Maxの要素が織り込まれていない。

データファイル作成部２７は、メインメモリ２８に格納されている一つの試料に対する質量分析イメージングデータ、個別基準値算出部２１により得られた未スケーリング個別基準値Ｆ_j、及び、ｉ＝１〜Ｎの全ての測定点において得られたＴＩＣ値Ｐ_iを一つのデータファイルに格納し、このデータファイルを外部記憶装置３に保存する。

また、図２には示していないが、質量分析イメージングデータに対して主成分分析（ＰＣＡ）、主成分回帰分析（ＰＣＲ）、部分的最小二乗法（ＰＬＳ）、階層的クラスタ分析（ＨＣＡ）、仮説検定、サポートベクターマシーン（ＳＶＭ）などの多変量解析を行う場合には、マススペクトルから抽出したピーク情報（ピークの質量電荷比値と強度値）に基づくピーク行列を作成しておくと都合がよい。そこで、必要に応じて、試料に対する測定によって得られたデータをメインメモリ２８に格納するのと並行して、ピーク行列作成部２４は、マススペクトルデータに対してピーク検出を行い、検出された各ピークの強度値を質量電荷比値に並べたピーク行列を作成する。そして、データファイル作成部２７は、そのピーク行列も質量分析イメージングデータと同じデータファイルに格納するとよい。

マススペクトルに対してピーク検出を行う際に、強度値が所定の閾値以上のピーク、或いは、特定の質量電荷比範囲内に現れるピークなど、ピーク検出の条件を絞ることで、検出されるピークの数は少なくなり、ピーク行列データのサイズは小さくなる。したがって、後述する比較解析のための多変量解析に要する処理時間を短くしたり、或いは、多変量解析の際にメインメモリ２８に読み込むデータの量を少なくしたりしたい場合には、上述のようなピーク検出条件を厳しくしてピーク行列データのサイズを抑えるとよい。

また、ＴＩＣ規格化ではなくＸＩＣ規格化を行う場合には、上述したように、ＴＩＣ値Ｐ_iに代えて、得られたマススペクトルの中で特定の質量電荷比における強度値又は特定の質量電荷比範囲の強度値の積算値を用いて同様に未スケーリング個別基準値を算出し、それをデータファイル内に格納しておけばよい。また、特許文献２に開示されているようなｐノルムに基づく規格化を行う場合でも同様である。さらにまた、比較解析の際にＴＩＣ規格化とＸＩＣ規格化とを選択的に行いたい場合やＸＩＣ規格化でも着目する質量電荷比値や質量電荷比範囲を切り替えたい場合には、それぞれの条件に対応した未スケーリング個別基準値を算出して、それらをまとめてデータファイル内に格納しておけばよい。

図２に示したフローチャートは一つの試料に対する測定を行う際のものであり、別の試料に対しては図２に示したフローチャートに従った処理が別途実施される。したがって、試料を測定する毎に、また同じ試料でも別の測定対象領域に対する測定が実施される毎に、その試料又は測定対象領域に対する質量分析イメージングデータや未スケーリング個別基準値、各測定点のＴＩＣ値を格納したデータファイルが作成され、それが外部記憶装置３に保存される。

次に、上述のようにして複数の試料に対するデータファイルが外部記憶装置３に保存されている状態で、複数の質量分析イメージングデータの比較解析を行う場合に実行されるデータ処理について図３を参照して説明する。
この場合、分析者は操作部４により比較したい複数の質量分析イメージングデータを指定する（ステップＳ２１）。すでに述べた図４は、三つの試料Ａ、Ｂ、Ｃに対する質量分析イメージングデータが指定された例である。それらの比較解析を行うに先立って、共通基準値決定部２２は外部記憶装置３に保存されている、それら複数の質量分析イメージングデータに対応するデータファイルから未スケーリング個別基準値Ｆ_jを読み出す（ステップＳ２２）。そして、読み出された複数の未スケーリング個別基準値Ｆ_j中で最小の値を見つけ未スケーリング共通基準値Ｆminとして内部に記憶する（ステップＳ２３）。

引き続き、規格化演算処理部２３は外部記憶装置３に保存されているデータファイルから質量分析イメージングデータと各測定点におけるＴＩＣ値Ｐ_iとを読み出す（ステップＳ２４）。そして、未スケーリング共通基準値Ｆmin、各測定点におけるＴＩＣ値Ｐ_i、及び装置に特有の値である変数の最大許容値long_Maxから、次の(4)式に従って規格化係数Ｇ’を計算する。
Ｇ’＝long_Max×（Ｆmin／Ｐ_i） …(4)
そして、この規格化係数Ｇ’を質量分析イメージングデータに含まれる各測定点におけるマススペクトルの強度値に乗じることで、該強度値を修正してメインメモリ２８に格納する（ステップＳ２５）。この場合には、上述した規格化処理方法の説明とは異なり、未スケーリング個別基準値Ｆ_jにlong_Maxの要素が織り込まれておらず、当然、未スケーリング共通基準値Ｆminにもlong_Maxの要素が織り込まれていないが、(4)式で求める規格化係数Ｇ’にはlong_Maxの要素が織り込まれるため、規格化演算の際にオーバーフローが生じないようにスケーリングが同時に実施される。したがって、上述した規格化方法と同様の規格化が達成されることになる。

上記のような規格化係数Ｇ’をそれぞれの強度値に乗じることで、未スケーリング共通基準値Ｆminに基づいて全ての強度値が規格化された質量分析イメージングデータがメインメモリ２８に格納される。異なるデータファイルに格納されている別の質量分析イメージングデータについてもステップＳ２４、Ｓ２５の処理が行われ、同じ未スケーリング共通基準値Ｆminに基づいてそれぞれの強度値が規格化されることになる。

また、複数の試料について得られた特定の質量電荷比を持つイオンの２次元分布を比較したい場合には、各質量分析イメージングデータの中からその特定の質量電荷比における強度値を示すデータのみを抽出し、その強度値を規格化してメインメモリ２８に格納すればよい。こうして同一の共通基準値の下に強度値が規格化された複数の質量分析イメージングデータがメインメモリ２８に用意されたならば、例えば統計解析演算部２６は強度値が規格化されたデータに基づく所定の統計解析を行い、その結果を表示処理部２９を介して表示部５の画面上に出力する。また、視覚上で比較したい複数のイメージング画像を表示する場合には、イメージング画像作成部２５がメインメモリ２８に格納されているデータに基づいてイメージング画像を再現し、その画像を表示処理部２９を介して表示部５の画面上に出力する。

上述したように、外部記憶装置３に保存されている各データファイル内にそれぞれピーク行列データが格納されており、ピーク行列データを用いた主成分分析等の多変量解析を行うことで複数の質量分析イメージングデータの比較解析を行いたい場合には、規格化演算処理部２３は外部記憶装置３に保存されているデータファイル内のマススペクトルデータではなくピーク行列データを読み出し、そのピーク行列データ中の各要素である強度値に対し上述した規格化係数を乗じればよい。そうして得られた複数の規格化されたピーク行列データを用いた多変量解析を行えば、複数の試料を測定する際の測定条件のばらつき等の影響を軽減した、精度の高い多変量解析が行える。

また、上述したようにピーク検出条件を厳しくしてもともとのピーク行列データのサイズを小さくしておくことで、メインメモリ２８に格納する規格化済みのピーク行列データのデータ量は少なくて済む。したがって、メインメモリ２８の占有容量を抑えることができるとともに、多変量解析に要する時間も短くなる。

また、本実施例のイメージング質量分析装置では、試料に対する測定を実行してデータを収集する際に並行して個別基準値を算出し、その個別基準値をデータファイル内に格納しているが、本実施例のイメージング質量分析装置で取得した質量分析イメージングデータと別の装置で取得した質量分析イメージングデータとの比較解析を行いたい場合、その別の装置において作成されたデータファイルには各測定点におけるマススペクトルデータしか格納されていないことがあり得る。即ち、場合によっては、個別基準値が格納されていないデータファイルを取り扱う必要がある。

そこで、例えばコンピュータに別途インストールしたデータ変換用ソフトウエアなどを用い、該ソフトウエアによる処理によってメインメモリにデータを読み込んでピーク検出を行い、ピーク行列を作成してそれをデータが格納されているデータファイルに格納するとともに、個別基準値も算出して同じデータファイルに格納しておく。このようにしてピーク行列と個別基準値とが追加されたデータファイルを作成することで、上記実施例のイメージング質量分析装置において図３で説明したような処理が可能となる。もちろん、こうしたデータ変換用ソフトウエアの機能を上述したような規格化処理を行うデータ解析用ソフトウエアに組み込むようにしてもよい。

また、上記実施例のイメージング質量分析装置では、各質量分析イメージングデータから決定された個別基準値に基づいて共通基準値が自動的に決まっていたが、共通基準値の設定に分析者の判断の余地を加えるようにしてもよい。そのためには例えば、複数の質量分析イメージングデータの比較解析の際に、共通基準値決定部２２はデータファイルから読み出した複数の未スケーリング個別基準値Ｆ_j（又は個別基準値Ｐs_j）を表示処理部２９を介して表示部５の画面上に表示する。分析者はこれを確認し、例えばその中の最小のものよりもさらに小さい値を共通基準値として操作部４より入力する。このとき、入力された値が複数の個別基準値の中の最小値よりも大きいと、規格化演算の際にオーバーフローが生じるおそれがあるから、そうした値が入力されたときには警告を発したり、或いはそうした入力自体ができないように上限を設定したりしてもよい。共通基準値決定部２２はこの入力された値を共通基準値に設定する。これにより、自動的に決まった値ではなく分析者が入力した値を基準とした強度値の規格化が可能となる。

また、前述のように、上記実施例のイメージング質量分析装置では、long_Maxの要素が織り込まれていない未スケーリング個別基準値Ｆ_jがデータファイル内に格納されているが、long_Maxは装置（ソフトウエア）に固有で定まっているから、規格化処理方法の説明で述べたように、(2)式に基づいてlong_Maxの要素を織り込んだ個別基準値Ｐs_jを求め、これをデータファイル内に格納してもよい。この場合には、この個別基準値Ｐs_jから共通基準値Ｐminを求め、共通基準値Ｐminに基づき(3)式に従って求めた規格化係数Ｇを用いて各測定点のマススペクトルデータの強度値を規格化すればよく、規格化の際にはスケーリングを行う必要はない。

また、上記実施例や上述した各種の変形例はいずれも本発明の一例にすぎず、本発明の趣旨の範囲で適宜に変更、修正、追加を行っても本願特許請求の範囲に包含されることは当然である。

１…イメージング質量分析部
２…データ処理部
２０…データ収集部
２１…個別基準値算出部
２２…共通基準値決定部
２３…規格化演算処理部
２４…ピーク行列作成部
２５…イメージング画像作成部
２６…統計解析演算部
２７…データファイル作成部
２８…メインメモリ
２９…表示処理部
３…外部記憶装置
４…操作部
５…表示部
１００…サンプル
１０１…測定対象領域
１０２…測定点

Claims (7)

1. 試料上に設定された所定の測定対象領域内の複数の測定点に対しそれぞれ質量分析を実行することで収集された、質量電荷比とイオン強度値との関係を示すマススペクトルデータが前記測定点の空間位置情報に関連付けられてなるスペクトルデータ集合を扱う分析データ処理方法であって、含まれるマススペクトルデータの質量分解能及び／又は空間分解能が互いに異なる複数のスペクトルデータ集合について、
   a)一つのスペクトルデータ集合毎に、各測定点のマススペクトルデータ中の全て又は一部の質量電荷比値に対する強度値を基準値に基づいて規格化する際に、その規格化後の強度値が所定の許容値を超えない基準値を求める個別基準値取得ステップと、
   b)全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得ステップにより得られた複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出ステップと、
   c)各スペクトルデータ集合に含まれるマススペクトルデータ中の全て又は一部の質量電荷比値に対する強度値を、前記共通基準値選出ステップにより選出された共通の基準値に基づいて規格化する規格化実行ステップと、
   を有することを特徴とする分析データ処理方法。
2. 試料上に設定された所定の測定対象領域内の複数の測定点に対しそれぞれ質量分析を実行することで収集された、質量電荷比とイオン強度値との関係を示すマススペクトルデータが前記測定点の空間位置情報に関連付けられてなるスペクトルデータ集合を扱う分析データ処理方法であって、含まれるマススペクトルデータの質量分解能及び／又は空間分解能が互いに異なる複数のスペクトルデータ集合について、
   a)一つのスペクトルデータ集合毎に、一つの測定点におけるマススペクトルデータ中の全て又は一部の質量電荷比値に対する強度値の積算値と最大強度値との比が全ての測定点の中で最大であるものを規格化のための基準値として求める個別基準値取得ステップと、
   b)全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得ステップにより得られた複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出ステップと、
   c)各スペクトルデータ集合に含まれるマススペクトルデータ中の全て又は一部の質量電荷比値に対する強度値を、前記共通基準値選出ステップにより選出された共通の基準値に基づいて、規格化後の強度値が所定の許容値を超えないように規格化する規格化実行ステップと、
   を有することを特徴とする分析データ処理方法。
3. 請求項１又は２に記載の分析データ処理方法であって、
   前記所定の許容値は、前記規格化実行ステップによる規格化演算を実行する際に強度値が格納される変数が採り得る最大値であることを特徴とする分析データ処理方法。
4. 請求項１〜３のいずれか１項に記載の分析データ処理方法であって、
   前記個別基準値取得ステップによる一つのスペクトルデータ集合毎の基準値の取得は、所定の測定対象領域内の複数の測定点に対しそれぞれ質量分析を実行することでそのスペクトルデータ集合に含まれるマススペクトルデータが収集されるときに行われることを特徴とする分析データ処理方法。
5. 請求項１〜４のいずれか１項に記載の分析データ処理方法であって、
   前記共通基準値選出ステップでは、全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得ステップにより得られた複数の基準値をユーザに提示し、その提示された情報に基づくユーザの指示に応じた値を共通の基準値として設定することを特徴とする分析データ処理方法。
6. 試料上に設定された所定の測定対象領域内の複数の測定点に対しそれぞれ質量分析を実行することで収集された、質量電荷比とイオン強度値との関係を示すマススペクトルデータが前記測定点の空間位置情報に関連付けられてなるスペクトルデータ集合を扱う分析データ処理装置において、含まれるマススペクトルデータの質量分解能及び／又は空間分解能が互いに異なる複数のスペクトルデータ集合について、
   a)一つのスペクトルデータ集合毎に、各測定点のマススペクトルデータ中の全て又は一部の質量電荷比値に対する強度値を基準値に基づいて規格化する際に、その規格化後の強度値が所定の許容値を超えない基準値を求める個別基準値取得部と、
   b)全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得部により得られた複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出部と、
   c)各スペクトルデータ集合に含まれるマススペクトルデータ中の全て又は一部の質量電荷比値に対する強度値を、前記共通基準値選出部により選出された共通の基準値に基づいて規格化する規格化実行部と、
   を備えることを特徴とする分析データ処理装置。
7. 試料上に設定された所定の測定対象領域内の複数の測定点に対しそれぞれ質量分析を実行することで収集された、質量電荷比とイオン強度値との関係を示すマススペクトルデータが前記測定点の空間位置情報に関連付けられてなるスペクトルデータ集合を扱う分析データ処理装置であって、含まれるマススペクトルデータの質量分解能及び／又は空間分解能が互いに異なる複数のスペクトルデータ集合について、
   a)一つのスペクトルデータ集合毎に、一つの測定点におけるマススペクトルデータ中の全て又は一部の質量電荷比値に対する強度値の積算値と最大強度値との比が全ての測定点の中で最大であるものを規格化のための基準値として求める個別基準値取得部と、
   b)全てのスペクトルデータ集合に対し前記個別基準値取得部により得られた複数の基準値の中から最小のものを共通の基準値として選出する、又はその最小のものよりもさらに小さい値を共通の基準値として設定する共通基準値選出部と、
   c)各スペクトルデータ集合に含まれるマススペクトルデータ中の全て又は一部の質量電荷比値に対する強度値を、前記共通基準値選出部により選出された共通の基準値に基づいて、規格化後の強度値が所定の許容値を超えないように規格化する規格化実行部と、
   を備えることを特徴とする分析データ処理装置。

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