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FR3010904A1 - Bacteries du genre stenotrophomonas et/ou inducteur de croissance desdites bacteries pour la prevention et/ou le traitement de la dermatite atopique - Google Patents

Bacteries du genre stenotrophomonas et/ou inducteur de croissance desdites bacteries pour la prevention et/ou le traitement de la dermatite atopique Download PDF

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FR3010904A1 FR1359246A FR1359246A FR3010904A1 FR 3010904 A1 FR3010904 A1 FR 3010904A1 FR 1359246 A FR1359246 A FR 1359246A FR 1359246 A FR1359246 A FR 1359246A FR 3010904 A1 FR3010904 A1 FR 3010904A1
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Abstract

La présente invention a pour objet une composition dermatologique comprenant à titre de principe actif des bactéries d'au moins une souche de Stenotrophomonas et/ou au moins un inducteur de croissance de Stenotrophomonas, et leur utilisation dans la prévention et/ou le traitement de la dermatite atopique. La présente invention concerne également un procédé in vitro de pronostic et/ou de diagnostic de la dermatite atopique et un procédé de sélection d'un inducteur de croissance de Stenotrophomonas.

Description

Bactéries du genre Stenotrophomonas et/ou inducteur de croissance desdites bactéries pour la prévention et/ou le traitement de la dermatite atopique Domaine de l'invention La présente invention concerne des bactéries du genre Stenotrophomonas et/ou un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas pour la prévention et/ou le traitement de la dermatite atopique.
Etat de la technique A ce jour, plus de 500 espèces bactériennes ont été détectées sur des peaux saines rassemblant plus de 2 millions de gènes. Environs 106 bactéries habitent chaque cm2 de peau. Le microbiome de la peau de sujets sains a été décrite comme présentant une spécificité suivant 3 types de zones: humide, sec et gras.
L'écosystème bactérien de la peau agit sur la réponse immune et contribue aux signes cliniques de certains déséquilibres cutanés, tels que la dermatite atopique. La dermatite atopique, également appelée eczéma atopique, est une maladie inflammatoire et chronique de la peau. La dermatite atopique concerne préférentiellement le nourrisson et les enfants, mais touche également l'adolescent et l'adulte. Le nombre de patients souffrant de dermatite atopique est en augmentation constante. La dermatite atopique se caractérise par une sécheresse cutanée, un prurit et/ou un eczéma, ces trois symptômes apparaissant généralement successivement. En effet, le premier signe de la dermatite atopique est une peau très sèche, suivi de l'apparition d'érythèmes et oedèmes, puis de vésicules et lésions croûteuses et suintantes. Par ailleurs, la dermatite atopique est une maladie qui évolue par poussées. La prévention de la dermatite atopique consiste à hydrater la peau chez les personnes à risque ou ayant déjà présenté un ou plusieurs épisodes de dermatite atopique. Le traitement de la dermatite atopique consiste à hydrater la peau, diminuer l'inflammation et soulager les démangeaisons. A cet égard sont prescrites l'application de crèmes hydratantes et l'administration orale ou topique d'antihistaminiques et/ou anti- inflammatoires, tels que la cortisone. Lors des poussées, il est important de surveiller l'apparition surinfections bactériennes au niveau des zones lésées grattées par le patient. La dermatite atopique est également une cause des troubles du sommeil, du fait des fortes démangeaisons associées.
Les traitements de la dermatite atopique existant ne sont pas toujours efficaces, et souvent les poussées reprennent à l'arrêt du traitement.
Aussi existe-t-il toujours un besoin de solutions alternatives pour la prévention et/ou le traitement de la dermatite atopique. Description détaillée La présente invention repose sur la mise en évidence de l'implication des bactéries du genre Stenotrophomonas dans la dermatite atopique. Les inventeurs ont en effet montré une diminution significative du nombre de bactéries du genre Stenotrophomonas au niveau des zones lésionnelles de patients souffrant de dermatite atopique par rapport aux zones non pathologiques des mêmes patients. De plus, les inventeurs ont mis en évidence que le traitement des zones lésionnelles de patients souffrant de dermatite atopique avec un produit à base d'eau thermale de La Roche Posay permet d'augmenter significativement le nombre de bactéries du genre Stenotrophomonas au niveau des zones lésionnelles.
Les inventeurs ont également montré que le traitement de zones lésionnelles avec le produit à base d'eau thermale de La Roche Posay permet de promouvoir la proportion de bactéries du genre Stenotrophomonas dans le microbiome de la zone lésée traitée. De manière intéressante, l'eau thermale de La Roche Posay contient naturellement des bactéries de Stenotrophomonas maltophilia.
En utilisant des bactéries du genre Stenotrophomonas et/ou au moins un inducteur de la croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas, la présente invention permet ainsi de rétablir l'équilibre du microbiome en bactéries du genre Stenotrophomonas au niveau des zones lésionnelles traitées. La présente invention a ainsi pour objet une composition dermatologique comprenant à titre de principe actif des bactéries d'au moins une souche du genre Stenotrophomonas et/ou au moins un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas. La présente invention a également pour objet des bactéries d'au moins une souche du genre Stenotrophomonas et/ou un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas, ou une composition dermatologique les comprenant, pour utilisation dans la prévention et/ou le traitement de la dermatite atopique. Un autre objet de l'invention concerne un procédé in vitro de pronostic et/ou de diagnostic de la dermatite atopique comprenant les étapes consistant à: a) mesurer le niveau de bactéries du genre Stenotrophomonas dans un échantillon provenant d'une zone suspectée d'être une zone lésée ou d'une zone suspectée de devenir une zone lésée d'un individu, et b) déduire à partir de la mesure obtenue à l'étape a) si l'individu risque d'être atteint ou est atteint d'une dermatite atopique. Encore un autre objet de l'invention concerne un procédé de sélection d'un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas, comprenant les étapes consistant à: - mettre un composé à tester en contact avec des bactéries du genre Stenotrophomonas, mesurer la croissance des bactéries en présence dudit composé à tester, et sélectionner en tant qu'inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas, un composé capable d'améliorer la croissance des bactéries du genre Stenotrophomonas par rapport à leur croissance en l'absence dudit composé. Définitions - Prévention et/ou traitement de la dermatite atopique La présente invention a principalement pour objet la prévention et/ou le traitement de la dermatite atopique chez l'homme. Par l'expression « chez l'homme », on entend désigner les hommes et les femmes de tout âge, en particulier les nourrissons, enfants, adolescents, adultes et personnes âgées.
L'homme est désigné par la suite par les termes patient(s) ou individu(s). La dermatite atopique est décrite comme associée à un déficit dans le métabolisme des lipides du stratum comeum, et notamment des céramides. Cette pathologie se présente sous la forme d'une xérose plus ou moins chronique concernant une grande étendue du corps, associée à des poussées inflammatoires et prurigineuses par plaques. Le terme « xérose » signifie un dessèchement de la peau, appelé également sécheresse cutanée. L' « atopie » est une prédisposition héréditaire du système immunitaire à privilégier des réactions d'hypersensibilité médiées par les immunoglobulines E (IgE) vis-à-vis d'antigènes communs dans l'alimentation, l'environnement extérieur ou domestique. Les patients atteints de dermatite atopique ont une peau dite atopique. Le terme « peau » englobe ici à la fois la peau et le cuir chevelu, mais ne comprend pas les muqueuses. Les termes « zone », « zone de peau » et « zone cutanée » sont utilisés ici indifféremment.
Par l'expression « zone lésée » ou « zone lésionnelle », on désigne ici une zone de la peau affectée par la dermatite atopique. Les zones lésées sont notamment caractérisées par une sécheresse de la peau, des rougeurs, des vésicules, des croûtes ou leurs combinaisons.
Les inventeurs ont montré que les zones lésées sont également caractérisées par un microbiome de faible diversité, comprenant majoritairement des bactéries du genre Staphylococcus et une proportion de bactéries du genre Stenotrophomonas plus faible que dans le microbiome des zones non lésées. L'inflammation, le prurit et la sécheresse intense sont trois symptômes caractéristiques de la dermatite atopique. On utilise ici indifféremment les termes « prurit » et « démangeaisons ». Par « microbiome », on désigne ici l'ensemble des génomes des bactéries présentes à la surface d'une zone cutanée de l'homme. Par opposition à une « zone lésée », les expressions « zone non lésée », « zone non pathologique » ou « zone saine » désignent une zone de la peau non affectée par la dermatite atopique, et de préférence non affectée par une autre pathologie ou une blessure cutanée. Par « zone suspectée d'être une zone lésée », on désigne par exemple une zone de la peau présentant au moins une caractéristique sélectionnée dans le groupe consistant en une inflammation, un prurit, une lésion croûteuse et une lésion suintante, de préférence au moins deux de ces caractéristiques. Par « zone suspectée de devenir une zone lésée », on désigne par exemple une zone présentant une xérose et/ou une zone de peau ayant été une zone lésée. Par l'expression « procédé de diagnostic de la dermatite atopique », on désigne ici un procédé permettant de déterminer si un individu est atteint de dermatite atopique. Par l'expression « procédé de pronostic de la dermatite atopique », on désigne ici un procédé permettant de déterminer si un individu risque d'être atteint de dermatite atopique. Par l'expression « prévention de la dermatite atopique », on désigne le traitement prophylactique ou préventif de la dermatite atopique, qui consiste à prévenir l'apparition de la dermatite atopique, en particulier la xérose. Par l'expression « traitement de la dermatite atopique », on désigne le traitement thérapeutique de la dermatite atopique qui consiste à réduire, inhiber, éliminer les symptômes de la dermatite atopique, tels que xérose, inflammation, eczéma et prurit, l'étendue des lésions, ou la progression de la dermatite atopique, par exemple en retardant, espaçant ou supprimant les poussées inflammatoires et prurigineuses.
Bactéries du genre Stenotrophomonas Les bactéries du genre Stenotrophomonas, appelé également sténotropomone, sont des protéobactéries à Gram négatif aérobie.
La souche du genre Stenotrophomonas est par exemple sélectionnée dans le groupe consistant en Stenotrophomonas acidaminiphila, Stenotrophomonas africana, Stenotrophomonas chelatiphaga, Stenotrophomonas daejeonensis, Stenotrophomonas dokdonensis, Stenotrophomonas ginsengisoli, Stenotrophomonas humi, Stenotrophomonas koreensis, Stenotrophomonas maltophilia, Stenotrophomonas 10 nitritireducens, Stenotrophomonas pavanii, Stenotrophomonas rhizophila, et Stenotrophomonas terrae. La souche du genre Stenotrophomonas selon l'invention est de préférence une souche existant naturellement à la surface de la peau de l'homme. Une souche du genre Stenotrophomonas préférée selon l'invention est une 15 souche de Stenotrophomonas maltophilia. Les bactéries du genre Stenotrophomonas peuvent être sous forme vivante, sous forme inactivée, sous forme atténuée, sous forme d'une fraction desdits bactéries, par exemple un lipopolysaccharide (LPS) desdites bactéries, ou sous une combinaison desdites formes. 20 Les bactéries du genre Stenotrophomonas utilisées dans le cadre de la présente invention sont de préférence sous forme inactivée. Les termes « sous forme inactivée », « sous forme non revivifiable » et « sous forme morte » sont ici synonymes. Des bactéries « sous forme atténuée » sont des bactéries qui ont perdu 25 partiellement ou totalement leurs propriétés éventuellement pathogènes. Les bactéries utilisées dans le cadre de la présente invention peuvent être des bactéries provenant d'une ou plusieurs souches du genre Stenotrophomonas. Lorsque les bactéries proviennent d'une ou plusieurs souches du genre Stenotrophomonas, il s'agit de souches de la même espèce et/ou de souches d'espèces 30 différentes. Par « bactéries d'une souche du genre Stenotrophomonas » ou « bactéries provenant d'une souche du genre Stenotrophomonas », on désigne ici des bactéries obtenues par culture d'une souche du genre Stenotrophomonas. Une souche du genre Stenotrophomonas préférée selon l'invention est apportée 35 sous la forme de l'eau thermale de La Roche Posay et/ou un extrait d'eau thermale de La Roche Posay.
L'eau thermale de la Roche Posay est extraite de la source du même nom. Il s'agit d'une eau bicarbonatée calcique, silicatée et séléniée. L'eau thermale de La Roche Posay a une concentration totale en carbonates et bicarbonates supérieure à 360 mg/I et une minéralisation supérieure ou égale à 400 mg/I. De préférence, l'eau thermale de la Roche Posay comprend au moins 9 mg/I d'oxyde de silicium. Typiquement, l'eau thermale de La Roche Posay comprend entre 370 mg/I et 410 mg/I, de préférence entre 380 mg/I et 400 mg/I d'ions bicarbonates, entre 120 mg/I et 160 mg/I, de préférence entre 130 mg/I et 150 mg/I d'ions calcium, et au moins 4 mg/I de sulfates.
Par exemple, l'eau thermale de La Roche Posay comprend 387 mg/I d'ions bicarbonates, 140 mg/I d'ions calcium et au moins 4 mg/I de sulfates. Inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas Un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas est un composé qui permet d'améliorer la croissance des bactéries du genre Stenotrophomonas, notamment de Stenotrophomonas maltophilia, par rapport à la croissance obtenue en l'absence dudit inducteur de croissance. Par « améliorer la croissance des bactéries », on désigne notamment le fait que l'inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas permet aux bactéries du genre Stenotrophomonas d'augmenter leur proportion au sein d'un microbiome donné. L'inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas peut par exemple permettre une multiplication plus rapide des bactéries du genre Stenotrophomonas par rapport à la multiplication des autres bactéries présentes dans le m icrobio me.
Dans un mode de réalisation préféré, l'inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas est sélectionné dans le groupe consistant en une ou plusieurs kératines, un ou plusieurs dérivés de kératine, une ou plusieurs peptones de levure, un ou plusieurs extraits de levure, un ou plusieurs sucres, un ou plusieurs oligoéléments et leurs combinaisons.
Par « dérivé de kératine », on désigne ici des kératines partiellement ou totalement hydrolysées. L'inducteur de croissance est de préférence utilisé dans une composition dont la concentration saline, notamment en NaCI, est inférieure à 6 g/I, de préférence inférieure à 3 g/I.
Un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas préféré selon l'invention est apporté sous la forme de l'eau thermale de La Roche Posay et/ou d'un extrait d'eau thermale de La Roche Posay.
Composition La présente invention a particulièrement pour objet une composition dermatologique comprenant à titre de principe actif des bactéries d'au moins une souche du genre Stenotrophomonas et/ou au moins un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas.
Ladite composition est une composition dermatologique ou une composition cosmétique. Une composition préférée selon l'invention est une composition dermatologique. La souche du genre Stenotrophomonas, en particulier de Stenotrophomonas maltophilia, et l'inducteur de la croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas, en particulier de Stenotrophomonas maltophilia, sont notamment tels que définis ci-dessus. La composition selon l'invention peut comprendre en outre d'autres microorganismes, par exemple choisis parmi les microorganismes utiles dans la prévention et/ou le traitement de la dermatite atopique. Ces autres microorganismes peuvent être présents dans la composition sous forme vivante, à l'état végétatif ou sporulé, ou bien sous forme inactive. Dans un autre mode de réalisation, la composition selon l'invention ne comprend pas de microorganisme autre que des bactéries du genre Stenotrophomonas ou ne comprend pas de microorganisme autre que Stenotrophomonas maltophilia. La composition selon l'invention peut comprendre un ou plusieurs inducteurs de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas, par exemple au moins deux ou au moins trois inducteurs de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas. Une composition selon l'invention peut comprendre de manière avantageuse à la fois des bactéries d'au moins une souche du genre Stenotrophomonas et au moins un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas, ledit inducteur de croissance améliorant de préférence la croissance des bactéries de la ou des souches du genre Stenotrophomonas présentes dans ladite composition. Lorsque la composition selon l'invention comprend des bactéries d'une souche du genre Stenotrophomonas, ladite composition peut comprendre de 100 à 1000000 équivalents cellulaires bactériens de bactéries de ladite souche du genre Stenotrophomonas pour 100 g de ladite composition, de préférence de 10000 à 100000 équivalents cellulaires bactériens pour 100 g de ladite composition.
Lorsque la composition selon l'invention comprend un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas, ladite composition peut comprendre de 0,01% à 5% dudit inducteur de croissance, de préférence de 0,1% à 1% dudit inducteur de croissance, les pourcentages étant exprimés en g pour 100 g de ladite composition.
La composition selon l'invention peut en outre avantageusement comprendre au moins un sucre, par exemple un hexose tel que le glucose. Dans un mode de réalisation préféré, la composition selon l'invention a une concentration saline, en particulier en NaCI, inférieure à 6 g/I, de préférence inférieur à 4 g/I, plus préférentiellement inférieure à 3 g/I.
Dans un mode de réalisation préféré selon l'invention, la composition est caractérisée en ce que les bactéries d'au moins une souche du genre Stenotrophomonas, de préférence au moins une souche de Stenotrophomonas maltophilia, et/ou ledit inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas sont apportés sous la forme d'eau thermale de La Roche Posay et/ou d'un extrait d'eau thermale de La Roche Posay. Dans un mode de réalisation préféré, la composition selon l'invention ne comprend pas de microorganismes autres que ceux apportés par l'eau thermale de La Roche Posay et/ou d'un extrait d'eau thermale de La Roche Posay. La présente invention a notamment pour objet une composition telle que définie ci- dessus, caractérisée en ce qu'elle comprend de 1% à 80% d'eau thermale de La Roche Posay, de préférence de 20 (3/0 à 60%, plus préférentiellement de 30% à 50 (3/0, les pourcentages étant exprimés en g pour 100 g de composition. Dans un autre mode de réalisation, la composition ne contient pas d'eau thermale de La Roche Posay et/ou d'extrait d'eau thermale de La Roche Posay.
Dans un autre mode de réalisation, la présente invention a ainsi pour objet une composition comprenant à titre de principe actif des bactéries d'au moins une souche du genre Stenotrophomonas et/ou au moins un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas, ladite composition ne comprenant pas d'eau thermale de La Roche Posay et/ou ne comprenant pas un extrait d'eau thermale de La Roche Posay.
Dans ce cas, les bactéries d'au moins une souche du genre Stenotrophomonas et/ou le ou les inducteurs de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas sont apportés sous une autre forme. La composition selon l'invention est de préférence appropriée pour une application topique.
Les expressions « topique » et « sur la peau » sont ici synonymes.
La composition peut ainsi se présenter sous toute forme appropriée pour un usage topique, telle qu'une crème, un baume, un gel, une huile, une eau, une pommade, une pâte ou un spray.
Méthode de prévention et/ou de traitement de la dermatite atopique La présente invention a également pour objet des bactéries d'au moins une souche du genre Stenotrophomonas et/ou au moins un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas, pour utilisation dans la prévention et/ou le traitement de la dermatite atopique. Dans un mode de réalisation préféré, les bactéries d'au moins une souche du genre Stenotrophomonas et/ou le ou les inducteurs de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas sont formulés dans une composition dermatologique. La souche du genre Stenotrophomonas, en particulier de Stenotrophomonas maltophilia, l'inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas, en particulier de Stenotrophomonas maltophilia, et la composition dermatologique sont notamment tels que définis ci-dessus. La composition dermatologique est typiquement appliquée une à trois fois par jour, par exemple deux fois par jour, sur les zones lésées et de préférence également autour des zones lésées, et/ou sur des zones suspectées de devenir des zones lésées Le traitement concerne des patients atteints de dermatite atopique. La prévention concerne des individus à risque d'être atteint d'une dermatite atopique, tels que des individus ayant connu au moins un épisode de dermatite atopique au cours de leur vie ou présentant une sècheresse cutanée importante.
La présente invention a notamment pour objet des bactéries d'au moins une souche du genre Stenotrophomonas, un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas, ou une composition dermatologique comprenant des bactéries d'au moins une souche du genre Stenotrophomonas et/ou au moins un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas, pour utilisation dans la prévention et/ou le traitement de la dermatite atopique d'individus diagnostiqués comme atteints de dermatite atopique ou à risque d'être atteints de dermatite atopique, en particulier après mise en oeuvre du procédé de pronostic et/ou diagnostic selon l'invention détaillé ci-après. Le traitement est effectué au moins jusqu'à disparition des symptômes. Le traitement est de préférence poursuivi plusieurs jours ou plusieurs semaines après la disparition des symptômes, en diminuant éventuellement progressivement la fréquence d'administration de la composition dermatologique.
La présente invention a également pour objet une méthode de prévention et/ou de traitement de la dermatite atopique comprenant l'administration d'une composition dermatologique selon l'invention sur la peau, au niveau des zones lésées et de préférence également autour des zones lésées, et/ou sur des zones suspectées de devenir des zones lésées. La présente invention a également pour objet des bactéries d'au moins une souche du genre Stenotrophomonas et/ou au moins un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas pour leur utilisation dans la prévention et/ou le traitement de la dermatite atopique telle que définie ci-dessus, caractérisée en ce lesdites bactéries et/ou ledit inducteur de croissance permet d'équilibrer la proportion de bactéries du genre Stenotrophomonas au sein du microbiome présent à la surface de la peau, de préférence au niveau d'une zone lésée de la peau ou suspectée de devenir une zone lésée, chez un un individu atteint de dermatite atopique ou risquant d'être atteint d'une dermatite atopique.
La présente invention a également pour objet un procédé visant à équilibrer la proportion de bactéries du genre Stenotrophomonas au sein du microbiome présent à la surface de la peau, comprenant l'administration topique de bactéries d'au moins une souche du genre Stenotrophomonas et/ou d'au moins un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas et/ou d'une composition dermatologique telle que définie ci-dessus, chez un individu atteint de dermatite atopique ou risquant d'être atteint d'une dermatite atopique, de préférence au niveau d'une zone lésée de la peau et /ou d'une zone suspectée de devenir une zone lésée. Méthode de traitement cosmétique La présente invention a également pour objet une méthode de traitement cosmétique comprenant une étape d'application sur une peau sèche, notamment chez un sujet ne présentant pas d'atopie, d'une composition cosmétique comprenant au moins une souche du genre Stenotrophomonas et/ou au moins un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas.
La composition cosmétique est notamment telle que définie ci-dessus. La présente invention a également pour objet l'utilisation d'une composition cosmétique comprenant au moins une souche du genre Stenotrophomonas et/ou au moins un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas pour apaiser la peau sèche, notamment chez un individu ne présentant pas d'atopie.
Un individu ne présentant pas d'atopie a une peau dite non atopique.
Procédé in vitro de pronostic et/ou de diagnostic Lorsque la population de bactéries du genre Stenotrophomonas diminue ou commence à diminuer avant l'apparition des symptômes de la dermatite atopique, il est ainsi possible de prévenir les épisodes de poussées inflammatoires et prurigineuses alors que les symptômes cliniques ne sont pas installés. La présente invention a ainsi également pour objet un procédé in vitro de pronostic et/ou de diagnostic de la dermatite atopique comprenant les étapes consistant à: a) mesurer le niveau de bactéries du genre Stenotrophomonas dans un échantillon provenant d'une zone suspectée d'être une zone lésée ou d'une zone suspectée de devenir une zone lésée d'un individu, b) déduire à partir de la mesure obtenue à l'étape a) si l'individu risque d'être atteint ou est atteint d'une dermatite atopique. Par « niveau de bactéries », on entend par exemple la quantité ou concentration de bactéries. Le niveau de bactéries peut être mesuré par toute méthode appropriée bien connue de l'homme du métier, telle que mesure de l'ADN bactérien, l'ARN bactérien (en particulier ARN16S), du signal obtenu après marquage des bactéries, par exemple avec un anticorps, ou par ELISA (Enzyme Linked Immun° Sorbant Assay) (notamment en utilisant un anticorps sur lequel est greffé un système enzymatique permettant un développement d'une couleur dans le visible). Le procédé in vitro de de pronostic et/ou de diagnostic de la dermatite atopique peut également comprendre, entre l'étape a) et l'étape b), une étape consistant à comparer le niveau de bactéries mesuré à l'étape a) au niveau de bactérie du genre Stenotrophomonas dans un échantillon provenant d'une zone non lésée du même patient et/ou provenant d'une zone non pathologique d'un individu ne souffrant pas de dermatite atopique, et/ou à une valeur de référence. La valeur de référence peut être obtenue à partir d'une moyenne de niveaux de bactéries du genre Stenotrophomonas mesurés dans des échantillons de plusieurs individus provenant d'une zone non lésée de patients souffrant de dermatite atopique et/ou provenant d'une zone non pathologique d'un individu ne souffrant pas de dermatite atopique Un échantillon provenant d'une zone de peau donnée est par exemple obtenu en appliquant sur ladite zone de peau un disque collant, par exemple un disque de type D- Squame, ou par grattage de la surface de ladite zone de peau.
La zone de l'échantillon a une surface de 0,2 cm2 à 3 cm2, de préférence de 0,5 cm2 à 2 cm2. Dans un mode de réalisation préféré, la zone non lésée est une zone saine qui est la plus proche possible de la zone lésée.
Une zone non lésée est ainsi de préférence située à proximité de la zone lésée, par exemple à au moins 0,2 cm, au moins 0,4 cm, au moins 0,6 cm, au moins 0,8 cm ou au moins 1 cm de distance des bords de la zone lésée, et de préférence à au plus 3 cm ou au plus 2 cm de distance des bords de la zone lésée.
Procédé de sélection d'un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas La présente invention a également pour objet un procédé de sélection d'un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas, comprenant les étapes consistant à : mettre un composé à tester en contact avec des bactéries du genre Stenotrophomonas, mesurer la croissance des bactéries en présence dudit composé à tester, et sélectionner en tant qu'inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas, un composé capable d'améliorer la croissance des bactéries par rapport à leur croissance en l'absence dudit composé. Le composé à tester peut par exemple être un extrait d'eau de La Roche Posay. Ledit procédé de sélection est un procédé in vitro ou ex vivo. Dans un mode de réalisation avantageux, l'étape de mise en contact du composé à tester avec des bactéries du genre Stenotrophomonas est effectuée au sein d'un microbiome. Ce microbiome peut être un microbiome d'un individu ou être un milieu comprenant les différentes bactéries dans les proportions correspondant à un microbiome de référence. Le microbiome dudit individu et/ou le microbiome de référence peut être un microbiome d'une zone lésée d'un patient atteint de dermatite atopique ou d'une zone non lésée d'un patient atteint de dermatite atopique ou d'un individu ne souffrant pas de dermatite atopique. Le microbiome de référence peut également être un milieu comprenant différentes bactéries dans différentes proportions, qui ne correspond pas nécessairement à un microbiome naturel.
Le microbiome dudit individu et/ou le microbiome de référence est de préférence un microbiome d'une zone lésée d'un patient atteint de dermatite atopique, plus préférentiellement une zone lésée non traitée.
La présente invention a ainsi pour objet un procédé de sélection d'un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas, comprenant les étapes consistant à: mettre un composé à tester en contact avec des bactéries du genre Stenotrophomonas au sein d'un microbiome, mesurer la croissance des bactéries du genre Stenotrophomonas en présence dudit composé à tester, et sélectionner en tant qu'inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas, un composé capable d'améliorer la croissance des bactéries du genre Stenotrophomonas par rapport à leur croissance en l'absence dudit composé, en particulier un composé capable d'augmenter la proportion de bactéries du genre Stenotrophomonas au sein du microbiome. Dans un autre mode de réalisation avantageux, l'étape de mise en contact du composé à tester avec des bactéries du genre Stenotrophomonas est effectuée dans un milieu comprenant les bactéries du genre Stenotrophomonas comme seul microorganisme. Dans ce cas, le procédé de sélection comprend de préférence une étape ultérieure de mise en contact du composé à tester améliorant la croissance des bactéries du genre Stenotrophomonas présentes comme seul microorganisme, avec les bactéries du genre Stenotrophomonas au sein d'un microbiome, le microbiome étant tel que défini ci-dessus.
La présente invention a ainsi pour objet un procédé de sélection d'un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas, comprenant les étapes consistant à: mettre un composé à tester en contact dans un milieu contenant des bactéries du genre Stenotrophomonas comme seul microorganisme, mesurer la croissance des bactéries du genre Stenotrophomonas en présence dudit composé à tester, sélectionner un composé capable d'améliorer la croissance des bactéries du genre Stenotrophomonas par rapport à leur croissance en l'absence dudit composé dans ledit milieu, de préférence, mettre le composé sélectionné à l'étape précédente en contact avec des bactéries du genre Stenotrophomonas au sein d'un microbiome, de préférence, mesurer la croissance des bactéries du genre Stenotrophomonas en présence dudit composé au sein dudit microbiome, et sélectionner en tant qu'inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas, un composé capable d'améliorer la croissance des bactéries du genre Stenotrophomonas par rapport à leur croissance en l'absence dudit composé, en particulier un composé capable d'augmenter la proportion de bactéries du genre Stenotrophomonas au sein du microbiome. Par « milieu », on entend un milieu apte à la croissance des bactéries.
Il peut s'agir d'un milieu solide ou solide. Le procédé de sélection est réalisé dans des conditions permettant la croissance des bactéries en l'absence dudit composé à tester. D'autres caractéristiques et avantages de l'invention ressortiront mieux des exemples qui suivent, donnés à titre illustratif et non limitatif. Figures Figure 1 : Abondance relative moyenne par genre de bactérie au niveau de zones lésées et non lésées d'un même individu atteint de dermatite atopique, avant traitement et après traitement. Pour chaque genre, la 1 ère colonne correspond aux résultats sur la zone non lésée avant traitement, la 2ème colonne sur la zone non lésée après traitement, la 3ème colonne sur la zone lésée avant traitement et la 4ème colonne sur la zone lésée après traitement. Figure 2: Cartographie du genre Staphylococcus par espèce au niveau de zones lésées et non lésées d'un même individu atteint de dermatite atopique, avant traitement et après traitement. En ordonnées figure l'abondance relative moyenne (1 représente 100%). A: Staphylococcus epidermidis, B: Staphylococcus aureus, C: Staphylococcus spp., D: Staphylococcus haemolyticus, E : autres Staphylococcaceae, 1 : zone non lésée avant traitement, 2 : zone non lésée après traitement, 3 : zone lésée avant traitement, 4 : zone lésée après traitement. Figure 3 : Photographie de la diversité bactérienne par genre sur une peau non atopique (moyenne obtenue sur des bras de 93 femmes non atopiques). Figure 4: Photographie de la diversité bactérienne par genre à 84 jours après le début du traitement sur des zones lésées de patients atteints de dermatite atopique et répondant favorablement au traitement.
Figure 5: Photographie de la diversité bactérienne par genre à 84 jours après le début du traitement sur des zones non lésées de patients atteints de dermatite atopique et répondant favorablement au traitement.
Exemple : Matériel et méthodes Patients L'étude a été réalisée chez 50 patients atteints de dermatite atopique et présentant des zones lésées et des zones non lésées. Le SCORAD (sévérité globale de l'eczéma atopique) moyen à l'inclusion était de 33 ± 5,6. L'âge moyen était de 12 ± 9 ans. Mode opératoire Les 50 patients ont appliqué le produit de la Roche Posay «Baume Lipikar AP» à base d'eau thermale de la Roche Posay pendant 84 jours, à raison de deux applications par jour.
Plusieurs prélèvements bactériens sont réalisés sur des zones lésées et des zones proximales non lésées de chaque sujet, de la période allant avant le début du traitement jusqu'à l'issue du traitement. Des photos des zones prélevées sont réalisées. La sécheresse, l'érythème et la desquamation des zones prélevées sont évaluées.
La taille de la zone des prélèvements est de taille réduite, en particulier de 0,5 à 2 cm2. La zone prélevée est la plus représentative de la zone lésée. Le prélèvement s'effectue avec des coton tiges stériles à usage unique et sous flux d'air stérile. Le flux d'air stérile est produit par une hotte à flux laminaire portative. Elle filtre l'air ambiant et permet un prélèvement dit « axénique » c'est-à-dire sans microorganismes de l'environnement. Le préleveur ne coupe jamais le flux laminaire d'air durant le prélèvement. Le prélèvement s'effectue dans un endroit calme et le prélevé comme le préleveur sont silencieux durant l'opération. Le coton tige stérile est plongé dans une solution d'eau milliQ contenant 0,15 M de NaCI et 0,1% de Tween 20. Cette solution est filtrée à 0,22 lm (Minisart ref 16534) extemporanément sous hotte à flux laminaire pour garantir sa stérilité. Le prélèvement a été standardisé en fonction de la zone prélevée (force, durée et surface). Le coton tige est brisé dans un tube de type Eppendorf stérilisé à 121°C/30' garanti exempt de RNAse et de DNAse. Les échantillons sont immédiatement placés à -20°C pour quelques heures, puis transférés à -80°C (de préférence directement placés à -80°C) où ils sont stables au moins 6 mois. Après amplification de l'ADN bactérien codant pour l'ARN 16S, à la fois le genre et les espèces bactériennes sont déterminés, par leur analyse en utilisant la base de données bactérienne Qiime. La comparaison du microbiome est effectuée sur une zone lésée et non lésée d'un même sujet. La diversité du microbiome est analysée par plusieurs méthodes dont l'Indice de Shannon qui est le plus utilisé par l'homme de l'art. L'indice de Shannon est obtenu par la formule suivante : H' : indice de biodiversité de Shannon : une espèce du milieu d'étude p : Proportion d'une espèce i par rapport au nombre total d'espèces (S) dans le milieu d'étude (ou richesse spécifique du milieu), qui se calcule de la façon suivante : ' f où n, est le nombre d'individus pour l'espèce jet N est l'effectif total (les individus de toutes les espèces).
Résultats Analyse clinique (n=50 sujets) A l'inclusion des sujets, la sévérité globale de l'eczéma atopique (SCORAD) n'est pas corrélée à l'ancienneté, ni au sexe des individus.
L'ancienneté de la maladie est fortement corrélée à l'âge du patient ce qui confirme le caractère « inné » de la pathologie (incluant une composante génétique démontrée avec les polymorphismes de la fillagrine) avec quelques sujets cependant récemment et sévèrement atteints (eczéma acquis ou cumulant facteurs environnementaux déclencheurs).
La sévérité de l'érythème et la sécheresse des lésions prélevées à l'inclusion sont des facteurs bien corrélés (érythème p=3.10-9, dryness p=1.10-4) avec le score global du patient Dans cette étude, le traitement diminue le score global de l'atopie de façon plus importante chez les hommes que chez les femmes. 36 patients ont répondu favorablement au traitement et 14 patients n'ont pas répondu au traitement, parmi lesquels un patient avec SCORAD aggravé pendant la période.
Analyse microflore cutanée Avant traitement, le microbiome des zones lésionnelles est significativement différent des zones adjacentes non lésionnelles (p= 0.001) (cf. figure 1).
Le microbiome des zones lésionnelles présente une diversité bactérienne moins importante que celle des zones adjacentes, richesse mesurée par deux indices de référence (Shannon, p=0.002 et Bray- Curtis). La diversité a tendance à disparaitre au profit d'une signature commune sur les zones lésionnelles et cela, de façon indépendante de la zone prélevée.
Après un traitement, le microbiome des zones lésionnelles évolue vers une communauté bactérienne qui se rapproche de celle des zones adjacentes non lésionnelles (p=0,16). Cette communauté microbienne reste différente de celle observée avant le traitement quelles que soient les zones (p=0.002). Autrement dit le microbiome des zones non lésionnelles à l'inclusion est également modifié suite au traitement.
Le traitement de la zone lésionnelle met en évidence un enrichissement significatif du genre Stenotrophomonas par rapport aux zones lésionnelles non traitées (cf. figures 1 et 3 à 5). La valeur moyenne sur 105 femmes américaines d'origine lndoeuropéenne prélevées sur 7 zones du corps (scalp, front, joues, nez, aisselle, bras et paume de la main) montre que le pourcentage de Stenotrophomonas sur la peau est voisin de 0,16% sur des sujets non atopiques. Les staphylocoques représentent le genre le plus représenté de la microflore dans la zone lésée et également de la zone adjacente non lésée (de 15 a 35% de la microflore totale mesurée) (cf. figures 1 et 2).

Claims (4)

  1. REVENDICATIONS1. Composition dermatologique comprenant à titre de principe actif des bactéries d'au moins une souche du genre Stenotrophomonas.
  2. 2. Composition selon la revendication 1, caractérisée en ce qu'elle comprend de 100 à 1000000 équivalents cellulaires bactériens de bactéries de ladite souche du genre Stenotrophomonas pour 100 g de ladite composition.
  3. 3. Composition selon la revendication 1 ou 2, caractérisée en ce que ladite souche de Stenotrophomonas est sélectionnée dans le groupe consistant en Stenotrophomonas acidaminiphila, Stenotrophomonas africana, Stenotrophomonas chelatiphaga, Stenotrophomonas ciaejeonensis, Stenotrophomonas dokdonensis, Stenotrophomonas ginsengisoli, Stenotrophomonas hum!, Stenotrophomonas koreensis, Stenotrophomonas maitophilia, Stenotrophomonas nitritireducens, Stenotrophomonas pavanii, Stenotrophomonas rhizophila, et Stenotrophomona.s terrae.
  4. 4. Composition selon l'une des revendications 1 à 3, caractérisée en ce qu'elle comprend au moins un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas sélectionné dans le groupe consistant en une ou plusieurs kératines, un ou plusieurs dérivés de kératine, une ou plusieurs peptones de levure, un ou plusieurs extraits de levure, un ou plusieurs sucres, un ou plusieurs oligoéléments, et leurs combinaisons. 8. Composition selon la revendication 4, caractérisée en ce qu'elle comprend de 0,01% à 5% dudit inducteur de croissance, de préférence de 0,1% à 1%, les pourcentages étant exprimés en g pour 100 g de composition. 6' Bactéries d'au moins une souche de Stenotrophomonas, pour leur utilisation dans la prévention et/ou le traitement de la dermatite atopique. 7. Bactéries d'au moins une souche du genre Stenotrophomonas pour l'utilisation selon la revendication 6, caractérisée en ce que lesdites bactéries sont formulées dans une composition dermatologique.8. Bactéries d'au moins une souche du genre Stenotrophomonas pour l'utilisation selon la revendication 7, caractérisée en ce que lesdites bactéries sont apportées sous la forme d'eau thermale de La Roche Posay ou d'un extrait d'eau thermale de La Roche Posay. 9. Bactéries d'au moins une souche du genre Stenotrophomonas, pour l'utilisation selon la revendication 8, caractérisée en ce que la composition dermatologique comprend de 1% à 80% d'eau thermale de La Roche Posay, de préférence de 20% à 60%, plus préférentiellement de 30% à 50%, les pourcentages étant exprimés en g pour 100 g de composition, 10. Bactéries d'au moins une souche du genre Stenotrophomonas pour l'utilisation selon l'une des revendications 7 à 9, caractérisée en ce que la composition dermatologique est appropriée pour une application topique. 11 Bactéries d'au moins une souche du genre Stenotrophomonas pour l'utilisation selon l'une des revendications 7 à 10, caractérisée en ce que la composition dermatologique comprend au moins un inducteur de croissance de bactéries du genre Stenotrophomonas sélectionné dans le groupe consistant en une ou plusieurs kératines, un ou plusieurs dérivés de kératine, une ou plusieurs peptones de levure, un ou plusieurs extraits de levure, un ou plusieurs sucres, un ou plusieurs oligoéléments et leurs combinaisons. 12. Procédé in vitro de pronostic et/ou de diagnostic de la dermatite atopique comprenant les étapes consistant à : a) mesurer le niveau de bactéries du 'genre Stenotrophomonas dans un échantillon provenant d'une zone suspectée d'être une zone lésée ou d'une zone sùspectée de devenir une zone lésée d'un individu, b) comparer le niveau de bactéries mesuré à l'étape a) au niveau de bactéries du genre Stenotrophomonas dans un échantillon provenant d'une zone non lésée du même patient et/ou provenant d'une zone non pathologique d'un individu ne souffrant pas de dermatite atopique et/ou à une valeur de référence, c) déduire que l'individu risque d'être atteint ou est atteint d'une dermatite atopique lorsque le niveau de bactéries mesuré à l'étape a) est inférieur au niveau de bactéries du genre Stenotrophomonas dans un échantillon provenant d'une zone non lésée du même patient et/ou provenant d'une zonenon pathologique d'un individu ne souffrant pas de dermatite atopique et/ou à une valeur de référence.
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