중간엽 줄기세포로부터 분리된 신규한 세포외 소포체
본 발명의 일 측면은, 인간 유래 세포로부터 분리된 세포외 소포체로서, 상기 세포외 소포체는 i) NovelmiRNA-67, hsa-miR-199a-3p, NovelmiRNA-298, hsa-miR-145-5p, NovelmiRNA-281, NovelmiRNA-109, hsa-miR-432-5p, NovelmiRNA-230, NovelmiRNA-88, hsa-miR-200b-3p, NovelmiRNA-169, hsa-miR-200a-3p, hsa-miR-487b-3p, hsa-miR-214-3p, NovelmiRNA-208, NovelmiRNA-164, NovelmiRNA-225, NovelmiRNA-174, hsa-miR-708-5p, hsa-miR-124-3p, NovelmiRNA-150, hsa-miR-135a-5p, NovelmiRNA-64, NovelmiRNA-92, NovelmiRNA-168, NovelmiRNA-22, NovelmiRNA-35, NovelmiRNA-161, hsa-miR-3940-3p, hsa-miR-219a-3p, hsa-miR-212-3p, NovelmiRNA-76, hsa-miR-323a-3p, hsa-miR-654-3p, hsa-miR-204-5p, hsa-miR-136-3p, NovelmiRNA-39, NovelmiRNA-175, hsa-miR-134-5p, hsa-miR-454-3p, NovelmiRNA-286, hsa-miR-542-3p, hsa-miR-433-3p, hsa-miR-574-5p, hsa-miR-6086, hsa-miR-4701-3p, hsa-miR-3149, hsa-miR-4743-5p, hsa-miR-8075, hsa-miR-6880-5p, hsa-miR-3148, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-6846-5p, hsa-mir-320e, hsa-miR-32-3p, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-4505, hsa-miR-595, hsa-miR-4487, hsa-miR-4721, hsa-miR-7151-3p, hsa-miR-4484, hsa-miR-642b-3p, ENSG00000239154, hsa-miR-4706, hsa-miR-6126, hsa-miR-378h, hsa-miR-6849-5p, hsa-miR-7844-5p, hsa-miR-4535, hsa-mir-9-1, hsa-miR-4459, hsa-miR-4443, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR-3064-5p, hsa-miR-3178, hsa-miR-3135b, hsa-miR-4717-3p, hsa-miR-206, hsa-miR-4529-3p 및 hsa-miR-3613-5p로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 miRNA를 포함하고,
ii) MED13L, lnc-TOMM20L-1, lnc-CDK5R1-1, ETV3, SLC35G1, SMARCA4, ACAT2, ADAM12, ARFGEF1, CELF3, DNAJB5, lnc-WRNIP1-2, ACTL8, lnc-TM2D3-2, GCN1L1, LOC101929337, FAM217A, XLOC_l2_013467, SNHG4, NUDT13, MCTS1, ATG4D, NPEPL1, YEATS2, SPEN, GGT6, lnc-RP11-770J1.4.1-1, MIAT, lnc-HMCN1-2, RETN, lnc-EXT1-2, LIN54, C17orf74, SLC12A2, TTC28, ADRA2A, NLGN2, lnc-FBXO25-4, LOC100506603, LOC399886, RCC2, KIAA0040, HOXB9, JMJD8, LINC01146, lnc-GIT1-1, VRTN, NHP2, KIF26A, HAUS5, lnc-SOD2-2, APOL3, lnc-POLR2L-1, lnc-SUPT3H-1, lnc-XRN2-3, RTP2, TERT, TNFRSF12A, LOC645427, lnc-CTR9-5, LOC100507420, OPA3, XLOC_l2_014245, lnc-NR5A1-1, DMTN, SMPD4, TXLNB, SPRR1A, DISP1, LOC100130285, lnc-SLC17A9-1, lnc-SELV.1-1, XLOC_l2_000018, lnc-ROM1-2, lnc-RABEPK-1, lnc-RRP8-1, lnc-RP11-234B24.6.1-1, lnc-TMEM189-UBE2V1-2, LAMTOR2, BTK, lnc-BSND-1, C2orf71, lnc-C17orf63-2, lnc-CHGA-1, ABCD1, NCAN, C9orf106, AGAP2, EMC6, CD86, LOC100129175, lnc-PHYHD1-1, GIGYF2, RNF151, BAGE, ADRA2C, lnc-SLC43A1-1, ENTPD8, NYAP1, lnc-GLIPR1L1-1, CCNT2-AS1, NAV1, TBX21, GNAZ, DNM3OS, PRKAG2-AS1, lnc-MFSD9-4, lnc-RPGRIP1-2, ABCC6, LRFN3, lnc-COL1A1-2, lnc-PPAPDC3-2, CTU1, lnc-PABPC4-1, LOC100507165, LOC102724861, SPTSSB, lnc-C20orf96-4, DCDC5, lnc-CRYL1-1, LOC100506114, SHARPIN, ASMTL-AS1, HMOX1, SHARPIN, LOC101928207, TRAIP, lnc-ANTXRL-2, LINC01135, BZRAP1, LOC101926983, WDR6, C19orf81, NAMA, LIM2, FAM155A-IT1, lnc-RPP30-2, ZNF264, MALAT1, HTT-AS, ZDHHC22, SEPHS2, ABTB1, lnc-RP11-791J7.2.1-1, CCDC28B, LOC284263, lnc-PPIC-2, CDC42BPB, C9orf173-AS1, C9orf139, FGD5, SP6, RCOR2, lnc-AC016251.1-2, lnc-PRKAA2-1, RANBP3, lnc-SH2B3-1, XLOC_l2_011901, CACNA1H, LINC01314, lnc-VAPB-1, ARHGAP23, ATG9A, GM2A, XLOC_l2_013547, lnc-SLC25A26-1, TMEM240, CLSTN3, ATG16L2, MMP11, TSSK3, lnc-SOX6-1, EDEM3, LOC101927210, C14orf169, EBLN2, lnc-XRN1-1, lnc-FTSJD2-1, MDFI, LOC102546226, SLC5A10, SENP7, lnc-C17orf97-4, ARNTL, lnc-RTL1-1, ZNF713, XLOC_l2_005871, QSOX1, SP2-AS1, ARSA, PHF7, GS1-24F4.2, LRIT1, PLLP, SLC4A11, C11orf95, FAM110B, IER5, LINC01508, lnc-GTPBP8-1, LOC400958, WFDC21P, lnc-CPXM2-2, P2RX6, SLC22A7, lnc-PPP2R2C-1, lnc-GATA5-2, MARVELD1, lnc-TRIM41-3, PRSS8, SEMA6C, SLC48A1, RPL28, BGN, BZW1, lnc-C6orf221-2, SLC20A2, HYALP1, SNAR-G1, SEC22A, TIMM8B, ATAD1, FNDC7, B3GNT8, STARD7-AS1, TMEM100, LARP6, HELZ2, TMX2, lnc-EPHB6-1, PSMC2, lnc-LINC00273-1, TNFRSF25, BCL3, LOC101929450, LOC102724416, FLII, WAC, PPP6R1, LOC100507377, LRRFIP2, CCNT2-AS1, lnc-SCAMP5-1, BRD1, lnc-ELAVL4-3, CHRDL1, lnc-FUT8-1, lnc-DNAJC7-1, LINC01264, LMO2, LINC01197, LOC101927533, REP15, C1orf226, lnc-STEAP1B-1, SNORD3B-1, lnc-TMEM135-2, lnc-FAM160A1-1, GOLGA2P5, TMEM132C, GPX3, lnc-DCAF4L2-2, XLOC_l2_014217, PPT1, RPA4, KCTD5, lnc-UQCRFS1-9, MTUS2-AS1, CHKA, TBC1D31, SNORD38A, lnc-RP11-322L20.1.1-7, RAD51, MEIOB, lnc-ADAMTS14-1, NOS2 및 PCDHA13로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 mRNA를 포함하고, 및
iii) IL-6, IL-8, MCP-3, MCP-1, IP-10, IL-1β 및 RANTES로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 사이토카인을 포함하는 것인, 세포외 소포체를 제공한다.
상기 인간 유래 세포는 인간의 조직에서 유래한 세포, 세포주 또는 줄기세포일 수 있으나, 이에 한정되지는 않는다.
상기 인간의 조직에서 유래한 세포는 인간의 심장, 위, 대장, 소장, 폐, 간, 신장 또는 자궁에서 유래한 세포일 수 있다. 또한, 상기 인간의 조직에서 유래한 세포는 인간 유래 불멸화 세포주(immortalized cell line)일 수 있다.
상기 줄기세포는 중간엽 줄기세포(mesenchymal stem cell), 조혈 줄기세포(hematopoietic stem cell), 신경 줄기세포(neural stem cell), 배아 줄기세포(embryonic stem cell) 또는 유도 만능 줄기세포(induced pluripotent stem cell)일 수 있다. 구체적으로, 상기 줄기세포는 중간엽 줄기세포일 수 있다.
본 명세서에서 사용된 용어, "중간엽 줄기세포(mesenchymal stem cell, MSC)"는 수정란이 분열하여 생긴 중배엽에서 분화된 연골, 골조직, 지방조직, 골수의 기질(stroma) 등에 존재하는 줄기세포를 의미하고, 포유류, 예를 들면 인간을 포함한 동물의 중간엽 줄기세포를 포함할 수 있다. 중간엽 줄기세포는 줄기세포능(stemness)과 자기재생능(self-renewal)을 유지하고 연골세포, 조골세포, 근육세포, 지방세포를 포함한 다양한 세포로 분화할 수 있는 능력을 가지며, 와튼 젤리(Wharton's Jelly), 골수(bone marrow), 지방조직(adipose tissue), 제대혈(umbilical cord blood), 활막(synovial membrane), 골조직(trabecular bone), 근육, 슬개건하 지방(infrapatellar fat pad), 말초혈액(peripheral blood), 간(Liver), 치아(teeth), 모낭(hair follicle) 등에서 추출할 수 있다. 중간엽 줄기세포는 T 림프구, B 림프구의 활성, 증식을 억제하며, 자연 살해 세포(natural killer cell, NK cell)의 활성을 억제하고, 수지상세포(dendritic cell)와 대식세포(macrophage)의 기능을 조절하는 면역 조절 능력을 가지고 있으므로 동종이식(allotransplantation)과 이종이식(xenotransplantation)이 가능한 세포이다.
상기 중간엽 줄기세포는 탯줄, 제대혈, 와튼 젤리(Wharton's jelly), 골수, 지방, 근육, 신경, 피부, 양막 또는 태반에서 유래되거나 유도 만능 줄기세포로부터 분화된 것일 수 있으나, 이에 한정되지는 않는다. 구체적으로, 상기 중간엽 줄기세포는 와튼 젤리에서 유래된 것일 수 있다.
본 명세서에서 사용된 용어, "유래된 세포(derived cell)", 예를 들어, "유래된 중간엽 줄기세포" 등은 세포가 기원하는 조직, 예를 들어, 와튼 젤리로부터 실질적으로 분리된 세포나 유도줄기세포로 분화된 세포를 의미한다.
본 명세서에서 사용된 용어, "유도 만능 줄기세포(induced pluripotent stem cell, iPSC)"는 분화가 완료된 체세포에 특정 인자를 도입하여 역분화시켜 줄기세포와 같은 다능성을 가지도록 유도한 세포를 의미한다.
본 명세서에서 사용된 용어, "분화(differentiation)"는 세포가 분열 증식하여 성장하는 동안에 서로 구조나 기능이 특수화하는 현상, 즉 생물의 세포, 조직 등이 각각에게 주어진 일을 수행하기 위하여 형태나 기능이 변해가는 것을 의미한다.
본 명세서에서 사용된 용어, "세포외 소포체(extracellular vesicle)"은 살아있는 세포에서 지질 이중막으로 포장되어 자연적으로 분비되는 나노 크기의 입자를 의미하고, 세포와 세포 사이의 정보 전달 역할을 하며 세포외 소포체와 유사한 조성을 갖는 소포체(엑소좀, 미세소포체, 다중소포체, 세포외 소포체-유사 소포체)를 모두 포함하는 개념일 수 있다.
본 명세서에서 사용된 용어, "분리된 세포외 소포체(isolated extracellular vesicle)"는 세포외 소포체가 기원하는 세포, 예를 들어, 중간엽 줄기세포로부터 실질적으로 분리된 세포외 소포체를 의미한다.
일 실시예에서, 상기 세포외 소포체는 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포 배양액으로부터 분리될 수 있다.
일 실시예에서, 상기 세포외 소포체는 유도 만능 줄기세포로부터 분화된 중간엽 줄기세포의 배양액으로부터 분리될 수 있다. 상기 중간엽 줄기세포는 화학적으로 분화가 유도된 것일 수 있다.
일 실시예에서, 상기 세포외 소포체는 HEK293T 세포주 배양액으로부터 분리될 수 있다.
일 실시예에서, 지모산(zymosan), Polyinosinic-polycytidylic acid(Poly I:C) 및 monophosphoryl lipid A(MPLA)으로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상을 첨가한 배지에서 배양한 중간엽 줄기세포로부터 분리한 세포외 소포체의 miRNA를 분석한 결과, NovelmiRNA-67, hsa-miR-199a-3p, NovelmiRNA-298, hsa-miR-145-5p, NovelmiRNA-281, NovelmiRNA-109, hsa-miR-432-5p, NovelmiRNA-230, NovelmiRNA-88, hsa-miR-200b-3p, NovelmiRNA-169, hsa-miR-200a-3p, hsa-miR-487b-3p, hsa-miR-214-3p, NovelmiRNA-208, NovelmiRNA-164, NovelmiRNA-225, NovelmiRNA-174, hsa-miR-708-5p, hsa-miR-124-3p, NovelmiRNA-150, hsa-miR-135a-5p, NovelmiRNA-64, NovelmiRNA-92, NovelmiRNA-168, NovelmiRNA-22, NovelmiRNA-35, NovelmiRNA-161, hsa-miR-3940-3p, hsa-miR-219a-3p, hsa-miR-212-3p, NovelmiRNA-76, hsa-miR-323a-3p, hsa-miR-654-3p, hsa-miR-204-5p, hsa-miR-136-3p, NovelmiRNA-39, NovelmiRNA-175, hsa-miR-134-5p, hsa-miR-454-3p, NovelmiRNA-286, hsa-miR-542-3p,hsa-miR-433-3p, hsa-miR-574-5p, hsa-miR-6086, hsa-miR-4701-3p, hsa-miR-3149, hsa-miR-4743-5p, hsa-miR-8075, hsa-miR-6880-5p, hsa-miR-3148, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-6846-5p, hsa-mir-320e, hsa-miR-32-3p, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-4505, hsa-miR-595, hsa-miR-4487, hsa-miR-4721, hsa-miR-7151-3p, hsa-miR-4484, hsa-miR-642b-3p, ENSG00000239154, hsa-miR-4706, hsa-miR-6126, hsa-miR-378h, hsa-miR-6849-5p, hsa-miR-7844-5p, hsa-miR-4535, hsa-mir-9-1, hsa-miR-4459, hsa-miR-4443, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR-3064-5p, hsa-miR-3178, hsa-miR-3135b, hsa-miR-4717-3p, hsa-miR-206, hsa-miR-4529-3p 및 hsa-miR-3613-5p로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 miRNA를 포함할 수 있다. 예를 들어, 상기 세포외 소포체는 상기 43종의 miRNA 중에서 2 이상, 3 이상, 4 이상, 5 이상, 6 이상, 7 이상, 8 이상, 9 이상, 10 이상, 11 이상, 12 이상, 13 이상, 14 이상, 15 이상, 16 이상, 17 이상, 18 이상 또는 모든 miRNA를 포함할 수 있다.
일 구현예에서, 지모산(zymosan), Polyinosinic-polycytidylic acid(Poly I:C) 및 monophosphoryl lipid A(MPLA)으로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상을 첨가한 배지에서 배양한 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리한 세포외 소포체의 miRNA를 분석한 결과, NovelmiRNA-67, hsa-miR-199a-3p, NovelmiRNA-298, hsa-miR-145-5p, NovelmiRNA-281, NovelmiRNA-109, hsa-miR-432-5p, NovelmiRNA-230, NovelmiRNA-88, hsa-miR-200b-3p, NovelmiRNA-169, hsa-miR-200a-3p, hsa-miR-487b-3p, hsa-miR-214-3p, NovelmiRNA-208, NovelmiRNA-164, NovelmiRNA-225, NovelmiRNA-174, hsa-miR-708-5p, hsa-miR-124-3p, NovelmiRNA-150, hsa-miR-135a-5p, NovelmiRNA-64, NovelmiRNA-92, NovelmiRNA-168, NovelmiRNA-22, NovelmiRNA-35, NovelmiRNA-161, hsa-miR-3940-3p, hsa-miR-219a-3p, hsa-miR-212-3p, NovelmiRNA-76, hsa-miR-323a-3p, hsa-miR-654-3p, hsa-miR-204-5p, hsa-miR-136-3p, NovelmiRNA-39, NovelmiRNA-175, hsa-miR-134-5p, hsa-miR-454-3p, NovelmiRNA-286, hsa-miR-542-3p 및 hsa-miR-433-3p로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 miRNA를 포함할 수 있다. 또한, 화학 물질 처리하지 않은 비교군 엑소좀보다 상기 miRNA를 현저하게 발현할 수 있다.
hsa-miR-199a-3p 및 hsa-miR-200b-3p는 세포 증식을 억제하고 세포자연사(apoptosis)를 유도할 수 있고, hsa-miR-145-5p, hsa-miR-432-5p 및 hsa-miR-200a-3p는 세포 이동 및 침윤을 억제할 수 있으며, hsa-miR-214-3p 및 hsa-miR-708-5p는 세포 증식 및 세포 주기 진행을 억제할 수 있고, hsa-miR-487b-3p는 골육종의 화학 내성 및 전이를 억제할 수 있으며, hsa-miR-124-3p는 종양 억제제로 기능할 수 있고, hsa-miR-135a-5p는 종양 침윤을 억제할 수 있다.
일 구현예에서, 지모산(zymosan), Polyinosinic-polycytidylic acid(Poly I:C) 및 monophosphoryl lipid A(MPLA)으로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상을 첨가한 배지에서 배양한 유도 만능 줄기세포로부터 분화된 중간엽 줄기세포로부터 분리한 세포외 소포체의 miRNA를 분석한 결과, hsa-miR-574-5p, hsa-miR-6086, hsa-miR-4701-3p, hsa-miR-3149, hsa-miR-4743-5p, hsa-miR-8075, hsa-miR-6880-5p, hsa-miR-3148, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-6846-5p, hsa-mir-320e, hsa-miR-32-3p, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-4505, hsa-miR-595, hsa-miR-4487, hsa-miR-4721, hsa-miR-7151-3p, hsa-miR-4484, hsa-miR-642b-3p, ENSG00000239154, hsa-miR-4706, hsa-miR-6126, hsa-miR-378h, hsa-miR-6849-5p, hsa-miR-7844-5p, hsa-miR-4535, hsa-mir-9-1, hsa-miR-4459, hsa-miR-4443, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR-3064-5p, hsa-miR-3178, hsa-miR-3135b, hsa-miR-4717-3p, hsa-miR-206, hsa-miR-4529-3p 및 hsa-miR-3613-5p 로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 miRNA를 포함할 수 있다. 또한, 화학 물질 처리하지 않은 비교군 엑소좀보다 상기 miRNA를 현저하게 발현할 수 있다.
또 다른 구현예에서, 지모산(zymosan), Polyinosinic-polycytidylic acid(Poly I:C) 및 monophosphoryl lipid A(MPLA)으로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상을 첨가한 배지에서 배양한 중간엽 줄기세포로부터 분리한 세포외 소포체의 mRNA를 분석한 결과, MED13L, lnc-TOMM20L-1, lnc-CDK5R1-1, ETV3, SLC35G1, SMARCA4, ACAT2, ADAM12, ARFGEF1, CELF3, DNAJB5, lnc-WRNIP1-2, ACTL8, lnc-TM2D3-2, GCN1L1, LOC101929337, FAM217A, XLOC_l2_013467, SNHG4, NUDT13, MCTS1, ATG4D, NPEPL1, YEATS2, SPEN, GGT6, lnc-RP11-770J1.4.1-1, MIAT, lnc-HMCN1-2, RETN, lnc-EXT1-2, LIN54, C17orf74, SLC12A2, TTC28, ADRA2A, NLGN2, lnc-FBXO25-4, LOC100506603, LOC399886, RCC2, KIAA0040, HOXB9, JMJD8, LINC01146, lnc-GIT1-1, VRTN, NHP2, KIF26A, HAUS5, lnc-SOD2-2, APOL3, lnc-POLR2L-1, lnc-SUPT3H-1, lnc-XRN2-3, RTP2, TERT, TNFRSF12A, LOC645427, lnc-CTR9-5, LOC100507420, OPA3, XLOC_l2_014245, lnc-NR5A1-1, DMTN, SMPD4, TXLNB, SPRR1A, DISP1, LOC100130285, lnc-SLC17A9-1, lnc-SELV.1-1, XLOC_l2_000018, lnc-ROM1-2, lnc-RABEPK-1, lnc-RRP8-1, lnc-RP11-234B24.6.1-1, lnc-TMEM189-UBE2V1-2, LAMTOR2, BTK, lnc-BSND-1, C2orf71, lnc-C17orf63-2, lnc-CHGA-1, ABCD1, NCAN, C9orf106, AGAP2, EMC6, CD86, LOC100129175, lnc-PHYHD1-1, GIGYF2, RNF151, BAGE, ADRA2C, lnc-SLC43A1-1, ENTPD8, NYAP1, lnc-GLIPR1L1-1, CCNT2-AS1, NAV1, TBX21, GNAZ, DNM3OS, PRKAG2-AS1, lnc-MFSD9-4, lnc-RPGRIP1-2, ABCC6, LRFN3, lnc-COL1A1-2, lnc-PPAPDC3-2, CTU1, lnc-PABPC4-1, LOC100507165, LOC102724861, SPTSSB, lnc-C20orf96-4, DCDC5, lnc-CRYL1-1, LOC100506114, SHARPIN, ASMTL-AS1, HMOX1, SHARPIN, LOC101928207, TRAIP, lnc-ANTXRL-2, LINC01135, BZRAP1, LOC101926983, WDR6, C19orf81, NAMA, LIM2, FAM155A-IT1, lnc-RPP30-2, ZNF264, MALAT1, HTT-AS, ZDHHC22, SEPHS2, ABTB1, lnc-RP11-791J7.2.1-1, CCDC28B, LOC284263, lnc-PPIC-2, CDC42BPB, C9orf173-AS1, C9orf139, FGD5, SP6, RCOR2, lnc-AC016251.1-2, lnc-PRKAA2-1, RANBP3, lnc-SH2B3-1, XLOC_l2_011901, CACNA1H, LINC01314, lnc-VAPB-1, ARHGAP23, ATG9A, GM2A, XLOC_l2_013547, lnc-SLC25A26-1, TMEM240, CLSTN3, ATG16L2, MMP11, TSSK3, lnc-SOX6-1, EDEM3, LOC101927210, C14orf169, EBLN2, lnc-XRN1-1, lnc-FTSJD2-1, MDFI, LOC102546226, SLC5A10, SENP7, lnc-C17orf97-4, ARNTL, lnc-RTL1-1, ZNF713, XLOC_l2_005871, QSOX1, SP2-AS1, ARSA, PHF7, GS1-24F4.2, LRIT1, PLLP, SLC4A11, C11orf95, FAM110B, IER5, LINC01508, lnc-GTPBP8-1, LOC400958, WFDC21P, lnc-CPXM2-2, P2RX6, SLC22A7, lnc-PPP2R2C-1, lnc-GATA5-2, MARVELD1, lnc-TRIM41-3, PRSS8, SEMA6C, SLC48A1, RPL28, BGN, BZW1, lnc-C6orf221-2, SLC20A2, HYALP1, SNAR-G1, SEC22A, TIMM8B, ATAD1, FNDC7, B3GNT8, STARD7-AS1, TMEM100, LARP6, HELZ2, TMX2, lnc-EPHB6-1, PSMC2, lnc-LINC00273-1, TNFRSF25, BCL3, LOC101929450, LOC102724416, FLII, WAC, PPP6R1, LOC100507377, LRRFIP2, CCNT2-AS1, lnc-SCAMP5-1, BRD1, lnc-ELAVL4-3, CHRDL1, lnc-FUT8-1, lnc-DNAJC7-1, LINC01264, LMO2, LINC01197, LOC101927533, REP15, C1orf226, lnc-STEAP1B-1, SNORD3B-1, lnc-TMEM135-2, lnc-FAM160A1-1, GOLGA2P5, TMEM132C, GPX3, lnc-DCAF4L2-2, XLOC_l2_014217, PPT1, RPA4, KCTD5, lnc-UQCRFS1-9, MTUS2-AS1, CHKA, TBC1D31, SNORD38A, lnc-RP11-322L20.1.1-7, RAD51, MEIOB, lnc-ADAMTS14-1, NOS2 및 PCDHA13로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 mRNA를 포함할 수 있다. 예를 들어, 상기 세포외 소포체는 상기 275종의 mRNA 중에서 2 이상, 3 이상, 4 이상, 5 이상, 6 이상, 7 이상, 8 이상, 9 이상, 10 이상, 11 이상, 12 이상, 13 이상, 14 이상, 15 이상, 16 이상, 17 이상, 18 이상, 19 이상, 20 이상, 21 이상, 22 이상, 23 이상, 24 이상, 25 이상, 26 이상, 27 이상, 28 이상, 29 이상, 30 이상 또는 모든 mRNA를 포함할 수 있다.
또 다른 구현예에서, 지모산(zymosan), Polyinosinic-polycytidylic acid(Poly I:C) 및 monophosphoryl lipid A(MPLA)으로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상을 첨가한 배지에서 배양한 중간엽 줄기세포로부터 분리한 세포외 소포체의 사이토카인을 분석한 결과, IL-6, IL-8, MCP-3, MCP-1, IP-10 및 RANTES로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 사이토카인을 포함할 수 있다. 예를 들어, 상기 세포외 소포체는 상기 6종의 사이토카인 중에서 2 이상, 3 이상, 4 이상, 5 이상 또는 모든 사이토카인을 포함할 수 있다.
상기 세포외 소포체는 지모산(zymosan), Poly I:C 및 monophosphoryl lipid A(MPLA)로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상을 포함할 수 있다.
본 명세서에서 사용된 용어, "지모산(zymosan)"은 효모 세포벽에서 얻어지는 단백질과 탄수화물 복합체로서, β-1,3-글리코시드 결합으로 연결된 포도당 단위가 반복되는 글루칸을 의미한다. 지모산(zymosan)은 하기 화학식 1로 표시되는 화합물일 수 있다.
[화학식 1]
본 명세서에서 사용된 용어, "Polyinosinic-polycytidylic acid(Poly I:C)"는 면역 자극제를 의미한다. Poly I:C는 대식세포 및 수지상 세포의 엔도솜 막에서 발현되는 toll-like receptor 3(TLR3)와 상호작용하는 것으로 알려져 있으며, 하기 화학식 2로 표시되는 화합물일 수 있다.
[화학식 2]
본 명세서에서 사용된 용어, "monophosphoryl lipid A(MPLA)"는 변형된 형태의 지질 A로서, toll-like receptor 4의 작용제를 의미한다. monophosphoryl lipid A(MPLA)는 비병원성 살모넬라균의 세포벽에서 유래하며, 면역 자극 활성을 가지는 것으로 알려져 있으며 하기 화학식 3으로 표시되는 화합물일 수 있다.
[화학식 3]
상기 세포외 소포체는 i) CD9, CD63, CD81 및 TSG101로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 마커에 대하여 양성을 나타내고, ii) GM130 및 칼넥신으로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 마커에 대하여 음성을 나타낼 수 있다.
본 명세서에서 사용된 용어, "양성"은 특정 마커와 관련하여, 그 마커가 기준이 되는 대조군과 비교하였을 때 더 많은 양, 또는 더 높은 농도로 존재하는 것을 의미할 수 있다. 즉, 본 발명에 의한 세포외 소포체는 어느 마커가 세포외 소포체 표면 또는 내부에 존재하기 때문에 그 마커를 이용하여 그 세포외 소포체를 하나 이상의 비세포외 소포체 또는 다른 세포외 소포체와 구별할 수 있으면 그 마커에 대하여 양성이 된다. 예를 들어, 본 발명의 세포외 소포체를 세포외 소포체 특이적 표면 항원인 CD81에 특이적인 항체로 검출 가능할 수 있고, 이 항체로부터의 신호 강도가 대조군(예를 들어, 배경값)보다 검출 가능하게 더 크면 그 세포외 소포체는 "CD81+(CD81 양성)"이다.
본 명세서에서 사용된 용어, "음성"은 특정 항체를 사용하여도 배경값에 비교하여 그 마커를 검출할 수 없음을 의미할 수 있다. 예를 들어, 본 발명의 세포외 소포체를 GM130에 특이적인 항체로 검출 가능하게 표지할 수 없다면 그 세포외 소포체는 "GM130(GM130 음성)"이다.
상기 면역학적 특성은 본 발명이 속하는 기술분야에 공지된 통상적인 방법에 의해 결정할 수 있다. 예를 들면 유세포분석법, 면역세포화학염색, 웨스턴 블랏(Western blot) 또는 RT-PCR 등 다양한 방법이 이용될 수 있다.
본 발명의 다른 측면은, 지모산(zymosan), Poly I:C 및 monophosphoryl lipid A(MPLA)으로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상이 처리된 중간엽 줄기세포로부터 분리된 세포외 소포체를 제공한다.
상기 세포외 소포체는 i) NovelmiRNA-67, hsa-miR-199a-3p, NovelmiRNA-298, hsa-miR-145-5p, NovelmiRNA-281, NovelmiRNA-109, hsa-miR-432-5p, NovelmiRNA-230, NovelmiRNA-88, hsa-miR-200b-3p, NovelmiRNA-169, hsa-miR-200a-3p, hsa-miR-487b-3p, hsa-miR-214-3p, NovelmiRNA-208, NovelmiRNA-164, NovelmiRNA-225, NovelmiRNA-174, hsa-miR-708-5p, hsa-miR-124-3p, NovelmiRNA-150, hsa-miR-135a-5p, NovelmiRNA-64, NovelmiRNA-92, NovelmiRNA-168, NovelmiRNA-22, NovelmiRNA-35, NovelmiRNA-161, hsa-miR-3940-3p, hsa-miR-219a-3p, hsa-miR-212-3p, NovelmiRNA-76, hsa-miR-323a-3p, hsa-miR-654-3p, hsa-miR-204-5p, hsa-miR-136-3p, NovelmiRNA-39, NovelmiRNA-175, hsa-miR-134-5p, hsa-miR-454-3p, NovelmiRNA-286, hsa-miR-542-3p, hsa-miR-433-3p, hsa-miR-574-5p, hsa-miR-6086, hsa-miR-4701-3p, hsa-miR-3149, hsa-miR-4743-5p, hsa-miR-8075, hsa-miR-6880-5p, hsa-miR-3148, hsa-miR-6780b-5p, hsa-miR-6846-5p, hsa-mir-320e, hsa-miR-32-3p, hsa-miR-642a-3p, hsa-miR-4505, hsa-miR-595, hsa-miR-4487, hsa-miR-4721, hsa-miR-7151-3p, hsa-miR-4484, hsa-miR-642b-3p, ENSG00000239154, hsa-miR-4706, hsa-miR-6126, hsa-miR-378h, hsa-miR-6849-5p, hsa-miR-7844-5p, hsa-miR-4535, hsa-mir-9-1, hsa-miR-4459, hsa-miR-4443, hsa-miR-6732-5p, hsa-miR-3064-5p, hsa-miR-3178, hsa-miR-3135b, hsa-miR-4717-3p, hsa-miR-206, hsa-miR-4529-3p 및 hsa-miR-3613-5p로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 miRNA를 포함하고,
ii) MED13L, lnc-TOMM20L-1, lnc-CDK5R1-1, ETV3, SLC35G1, SMARCA4, ACAT2, ADAM12, ARFGEF1, CELF3, DNAJB5, lnc-WRNIP1-2, ACTL8, lnc-TM2D3-2, GCN1L1, LOC101929337, FAM217A, XLOC_l2_013467, SNHG4, NUDT13, MCTS1, ATG4D, NPEPL1, YEATS2, SPEN, GGT6, lnc-RP11-770J1.4.1-1, MIAT, lnc-HMCN1-2, RETN, lnc-EXT1-2, LIN54, C17orf74, SLC12A2, TTC28, ADRA2A, NLGN2, lnc-FBXO25-4, LOC100506603, LOC399886, RCC2, KIAA0040, HOXB9, JMJD8, LINC01146, lnc-GIT1-1, VRTN, NHP2, KIF26A, HAUS5, lnc-SOD2-2, APOL3, lnc-POLR2L-1, lnc-SUPT3H-1, lnc-XRN2-3, RTP2, TERT, TNFRSF12A, LOC645427, lnc-CTR9-5, LOC100507420, OPA3, XLOC_l2_014245, lnc-NR5A1-1, DMTN, SMPD4, TXLNB, SPRR1A, DISP1, LOC100130285, lnc-SLC17A9-1, lnc-SELV.1-1, XLOC_l2_000018, lnc-ROM1-2, lnc-RABEPK-1, lnc-RRP8-1, lnc-RP11-234B24.6.1-1, lnc-TMEM189-UBE2V1-2, LAMTOR2, BTK, lnc-BSND-1, C2orf71, lnc-C17orf63-2, lnc-CHGA-1, ABCD1, NCAN, C9orf106, AGAP2, EMC6, CD86, LOC100129175, lnc-PHYHD1-1, GIGYF2, RNF151, BAGE, ADRA2C, lnc-SLC43A1-1, ENTPD8, NYAP1, lnc-GLIPR1L1-1, CCNT2-AS1, NAV1, TBX21, GNAZ, DNM3OS, PRKAG2-AS1, lnc-MFSD9-4, lnc-RPGRIP1-2, ABCC6, LRFN3, lnc-COL1A1-2, lnc-PPAPDC3-2, CTU1, lnc-PABPC4-1, LOC100507165, LOC102724861, SPTSSB, lnc-C20orf96-4, DCDC5, lnc-CRYL1-1, LOC100506114, SHARPIN, ASMTL-AS1, HMOX1, SHARPIN, LOC101928207, TRAIP, lnc-ANTXRL-2, LINC01135, BZRAP1, LOC101926983, WDR6, C19orf81, NAMA, LIM2, FAM155A-IT1, lnc-RPP30-2, ZNF264, MALAT1, HTT-AS, ZDHHC22, SEPHS2, ABTB1, lnc-RP11-791J7.2.1-1, CCDC28B, LOC284263, lnc-PPIC-2, CDC42BPB, C9orf173-AS1, C9orf139, FGD5, SP6, RCOR2, lnc-AC016251.1-2, lnc-PRKAA2-1, RANBP3, lnc-SH2B3-1, XLOC_l2_011901, CACNA1H, LINC01314, lnc-VAPB-1, ARHGAP23, ATG9A, GM2A, XLOC_l2_013547, lnc-SLC25A26-1, TMEM240, CLSTN3, ATG16L2, MMP11, TSSK3, lnc-SOX6-1, EDEM3, LOC101927210, C14orf169, EBLN2, lnc-XRN1-1, lnc-FTSJD2-1, MDFI, LOC102546226, SLC5A10, SENP7, lnc-C17orf97-4, ARNTL, lnc-RTL1-1, ZNF713, XLOC_l2_005871, QSOX1, SP2-AS1, ARSA, PHF7, GS1-24F4.2, LRIT1, PLLP, SLC4A11, C11orf95, FAM110B, IER5, LINC01508, lnc-GTPBP8-1, LOC400958, WFDC21P, lnc-CPXM2-2, P2RX6, SLC22A7, lnc-PPP2R2C-1, lnc-GATA5-2, MARVELD1, lnc-TRIM41-3, PRSS8, SEMA6C, SLC48A1, RPL28, BGN, BZW1, lnc-C6orf221-2, SLC20A2, HYALP1, SNAR-G1, SEC22A, TIMM8B, ATAD1, FNDC7, B3GNT8, STARD7-AS1, TMEM100, LARP6, HELZ2, TMX2, lnc-EPHB6-1, PSMC2, lnc-LINC00273-1, TNFRSF25, BCL3, LOC101929450, LOC102724416, FLII, WAC, PPP6R1, LOC100507377, LRRFIP2, CCNT2-AS1, lnc-SCAMP5-1, BRD1, lnc-ELAVL4-3, CHRDL1, lnc-FUT8-1, lnc-DNAJC7-1, LINC01264, LMO2, LINC01197, LOC101927533, REP15, C1orf226, lnc-STEAP1B-1, SNORD3B-1, lnc-TMEM135-2, lnc-FAM160A1-1, GOLGA2P5, TMEM132C, GPX3, lnc-DCAF4L2-2, XLOC_l2_014217, PPT1, RPA4, KCTD5, lnc-UQCRFS1-9, MTUS2-AS1, CHKA, TBC1D31, SNORD38A, lnc-RP11-322L20.1.1-7, RAD51, MEIOB, lnc-ADAMTS14-1, NOS2 및 PCDHA13로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 mRNA를 포함하고, 및
iii) IL-6, IL-8, MCP-3, MCP-1, IP-10, IL-1β 및 RANTES로 구성된 군에서 선택되는 하나 이상의 사이토카인을 포함하는 것일 수 있다.
일 구체예에서, 상기 세포외 소포체는 Poly I:C 및 monophosphoryl lipid A(MPLA); 또는 지모산(zymosan), Poly I:C 및 monophosphoryl lipid A(MPLA) 처리된 것일 수 있다.
일 구체예에서, 상기 세포외 소포체는 Poly I:C 및 monophosphoryl lipid A(MPLA); 또는 지모산(zymosan), Poly I:C 및 monophosphoryl lipid A(MPLA) 처리된 것일 수 있다.
상기 세포외 소포체에 대해서는 상기 기재한 바와 같다.
중간엽 줄기세포로부터 분리된 신규한 세포외 소포체의 약학적 용도
본 발명의 다른 측면은 상기 세포외 소포체를 유효성분으로 포함하는 암 치료 또는 예방용 약학적 조성물을 제공한다.
본 발명의 지모산(zymosan), Poly I:C 및 monophosphoryl lipid A(MPLA)으로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상이 처리된 중간엽 줄기세포로부터 분리된 세포외 소포체를 유효성분으로 포함하는 암 예방 또는 치료용 약학적 조성물은 암 치료 및/또는 예방 효능(efficacy)을 증가시킬 수 있다.
상기 세포외 소포체에 대해서는 상기 기재한 바와 같다.
일 실시예에서, 지모산(zymosan), Poly I:C 및 monophosphoryl lipid A(MPLA)가 처리된 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 세포외 소포체의 암 세포에 대한 면역 자극 활성 효과와 종양 성장 억제 효과를 확인할 수 있다.
또한, 다른 실시예에서 유도 만능 줄기세포에서 분화된 중간엽 줄기세포에 지모산(zymosan), Poly I:C 및 monophosphoryl lipid A(MPLA)를 처리하여 배양한 후 분리된 세포외 소포체의 종양 성장 억제 효과를 확인할 수 있다.
상기 암은 위암, 간암, 폐암, 대장암, 유방암, 전립선암, 난소암, 췌장암, 자궁경부암, 갑상선암, 후두암, 급성 골수성 백혈병, 뇌종양, 신경모세포종, 망막 모세포종, 두경부암, 침샘암 및 림프종으로 구성된 군에서 선택되는 어느 하나일 수 있으나, 이에 한정되지는 않는다.
상기 약학적 조성물의 바람직한 투여량은 환자의 상태 및 체중, 질병의 정도, 약물 형태, 투여 경로 및 기간에 따라 다르지만, 당업자에 의해 적절하게 선택될 수 있다. 본 발명의 암 예방 또는 치료용 약학적 조성물에서 그 유효성분은 항암 활성을 나타낼 수 있는 한, 용도, 제형, 배합 목적 등에 따라 임의의 양(유효량)으로 포함될 수 있는데, 통상적인 세포외 소포체의 유효량은 조성물 전체 중량을 기준으로 할 때 0.001 중량% 내지 20.0 중량% 범위 내에서 결정될 것이다. 여기서 "유효량"이란 항암 효과를 유도할 수 있는 유효성분의 양을 말한다. 이러한 유효량은 당업자의 통상의 능력 범위 내에서 실험적으로 결정될 수 있다.
본 명세서에서 사용된 용어, "치료"는 치료학적 처리 및 예방적 처리를 모두 포함하는 의미로 사용될 수 있다. 이때, 예방은 개체의 병리학적 상태 또는 질환을 완화시키거나 감소시키는 의미로 사용될 수 있다. 일 구체예에서, 용어 "치료"는 인간을 포함한 포유류에서 질환을 치료하기 위한 적용이나 어떠한 형태의 투약을 모두 포함한다. 또한, 상기 용어는 질환 또는 질환의 진행을 억제하거나 늦추는 것을 포함하며; 손상되거나, 결손된 기능을 회복시키거나, 수리하여, 질환을 부분적이거나 완전하게 완화시키거나; 또는 비효율적인 프로세스를 자극하거나; 심각한 질환을 완화하는 의미를 포함한다.
본 명세서에서 사용된 용어, "효능(efficacy)" 은 1년, 5년, 또는 10년과 같이 일정 기간에 걸쳐 생존 또는 질병이 없는 상태에서 생존(disease-free survival)과 같은 하나 이상의 파라미터에 의해 결정될 수 있다. 뿐만 아니라, 상기 파라미터는 개체에서 적어도 하나의 종양의 크기가 억제되는 것을 포함할 수 있다.
생체 이용률과 같은 약동학적 파라미터(Pharmacokinetic parameters) 및 클리어런스율(clearance rate)과 같은 기본적인 파라미터(underlying parameters)도 효능에 영향을 줄 수 있다. 따라서, "향상된 효능"(예를 들어, 효능의 개선)은 향상된 약동학적 파라미터 및 향상된 효능에 기인할 수 있으며, 시험 동물 또는 인간 대상체에서 클리어런스율 및 종양 성장을 비교하거나, 생존, 재발율 또는 질병이 없는 상태에서 생존과 같은 파라미터를 비교하여 측정될 수 있다.
여기서 "치료학적으로 유효한 양" 또는 "약학적으로 유효한 양"이란 대상 질환을 예방 또는 치료하는데 유효한 화합물 또는 조성물의 양으로서, 의학적 치료에 적용 가능한 합리적인 수혜/위험 비율로 질환을 치료하기에 충분하며 부작용을 일으키지 않을 정도의 양을 의미한다. 상기 유효량의 수준은 환자의 건강상태, 질환의 종류, 중증도, 약물의 활성, 약물에 대한 민감도, 투여 방법, 투여 시간, 투여 경로 및 배출 비율, 치료 기간, 배합 또는 동시 사용되는 약물을 포함한 요소 및 기타 의학 분야에 잘 알려진 요소에 따라 결정될 수 있다. 일 구체예에서 치료학적으로 유효한 양은 암을 치료하는데 효과적인 약물의 양을 의미한다.
상기 약학적 조성물은 개별 치료제로 투여하거나 다른 치료제와 병용하여 투여될 수 있고, 종래의 치료제와 순차적으로 또는 동시에 투여될 수 있으며, 단일 또는 다중 투여될 수 있다. 상기한 요소들을 모두 고려하여 부작용 없이 최소한의 양으로 최대 효과를 얻을 수 있는 양을 투여하는 것이 중요하며, 이는 당업자에 의해 용이하게 결정될 수 있다.
이때, 상기 약학적 조성물은 약학적으로 허용 가능한 담체를 더 포함할 수 있다. 상기 약학적으로 허용 가능한 담체는 환자에게 전달하기에 적절한 비-독성 물질이면 어떠한 담체라도 가능하다. 증류수, 알코올, 지방, 왁스 및 비활성 고체가 담체로 포함될 수 있다. 약물학적으로 허용되는 애쥬번트(완충제, 분산제) 또한 약학적 조성물에 포함될 수 있다.
구체적으로, 상기 약학적 조성물은 유효성분 이외에 약제학적으로 허용되는 담체를 포함하여 당업계에 공지된 통상의 방법으로 투여 경로에 따라 비경구용 제형으로 제조될 수 있다. 여기서 "약제학적으로 허용되는" 의미는 유효성분의 활성을 억제하지 않으면서 적용(처방) 대상이 적응 가능한 이상의 독성을 지니지 않는다는 의미이다.
상기 약학적 조성물이 비경구용 제형으로 제조될 경우, 적합한 담체와 함께 당업계에 공지된 방법에 따라 주사제, 경피 투여제, 비강 흡입제 및 좌제의 형태로 제제화될 수 있다. 주사제로 제제화할 경우 적합한 담체로서는 멸균수, 에탄올, 글리세롤이나 프로필렌 글리콜 등의 폴리올 또는 이들의 혼합물을 사용할 수 있으며, 바람직하게는 링거 용액, 트리에탄올 아민이 함유된 PBS(phosphate buffered saline)나 주사용 멸균수, 5% 덱스트로스 같은 등장 용액 등을 사용할 수 있다. 약제학적 조성물의 제제화와 관련하여서는 당업계에 공지되어 있으며, 구체적으로 문헌[Remington's Pharmaceutical Sciences(19th ed., 1995)] 등을 참조할 수 있다. 상기 문헌은 본 명세서의 일부로서 간주된다.
상기 약학적 조성물의 바람직한 투여량은 환자의 상태, 체중, 성별, 연령, 환자의 중증도, 투여 경로에 따라 1일 0.01 ug/kg 내지 10 g/kg 범위, 또는 0.01 mg/kg 내지 1 g/kg 범위일 수 있다. 투여는 1일 1회 또는 수회로 나누어 이루어질 수 있다. 이러한 투여량은 투여 경로, 질병의 중증도, 성별, 체중, 연령 등에 따라서 증감될 수 있으므로, 어떠한 측면으로든 본 발명의 범위를 제한하는 것으로 해석되어서는 아니 된다.
상기 약학적 조성물이 적용(처방)될 수 있는 대상은 포유동물 및 사람이며, 특히 사람인 경우가 바람직하다. 본 발명의 약학적 조성물은 유효성분 이외에, 항암 활성의 상승·보강을 위하여 이미 안전성이 검증되고 항암 활성을 갖는 것으로 공지된 임의의 화합물이나 천연 추출물을 추가로 포함할 수 있다.
본 발명의 다른 측면은, 상기 세포외 소포체와 면역 항암제를 유효성분으로 포함하는 암 치료 또는 예방을 위한 병용 투여용 약학적 조성물을 제공한다.
상기 세포외 소포체는 체내의 면역 활성을 증가시키기 때문에, 종래에 활용되고 있는 항암제인 면역관문 억제제와 병행하여 이용할 수 있다.
상기 면역 항암제는 면역관문 억제제(immune checkpoint inhibitor), CAR-T(Chimeric antigen receptor-T cells), T 수용체 발현 T 세포(T cell receptor modified T cells; TCR-T), TIL(Tumor infiltrating lymphocytes), BiTE(Bispecific T-cell engager), 암 백신(tumor vaccine) 및 항암 바이러스(oncolytic virus)로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나일 수 있으나, 이에 한정되지는 않는다.
상기 면역 관문 억제제는 항-PD-1 항체, 항-PD-L1 항체, 항-PD-L2 항체, 항-CTLA-4 항체, 항-B7-H4 항체, 항-HVEM 항체, 항-TIM3 항체, 항-GAL9 항체, 항-LAG3 항체, 항-VISTA 항체, 항-KIR 항체, 항-BTLA 항체 및 항-TIGIT 항체로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나일 수 있으나, 이에 한정되지는 않는다. 구체적으로, 항-PD-1 항체일 수 있다. 일 구체예로, 상기 면역 관문 억제제는 Ipilimumab, Pembrolizumab, Nivolumab, Cemiplimab, Atezolizumab, Avelumab, Duralumab 또는 이들의 조합 등일 수 있으나, 이에 한정되지는 않는다.
본 명세서에서 사용된 용어, "면역 관문 억제제(immune checkpoint inhibitor)"는 면역 세포의 분화, 증식, 활성을 억제하는 면역 관문 단백질(immune checkpoint protein)의 활성을 저해하는 물질로, 암세포가 면역시스템을 회피하는 기능을 발휘하는 것을 막아 암 세포를 제거하는 것으로 알려져 있다.
일 구현예에서, 상기 세포외 소포체의 단독 투여와 상기 세포외 소포체와 항 PD-1 항체의 병용 투여를 비교한 결과, 병용 투여한 경우에 종양 성장 억제 효과가 유의하게 증가한 것을 확인할 수 있다.
신규한 세포외 소포체의 제조 방법
본 발명의 다른 측면은, a) Poly I:C 및 monophosphoryl lipid A(MPLA)이 첨가된 무혈청 세포 배양 배지에서 인간 유래 세포를 배양하는 단계; b) 상기 배양하는 과정에서 배양액을 수득하는 단계; 및 c) 상기 과정에서 수득한 배양액을 여과하여 200 nm보다 큰 입자를 제거한 후 세포외 소포체를 분리하는 단계를 포함하는 세포외 소포체의 제조방법을 제공한다.
일 구체예에서, 상기 무혈청 세포 배양 배지는 지모산(zymosan)이 추가적으로 첨가된 것일 수 있다. 구체적으로, 상기 무혈청 세포 배양 배지는 Poly I:C 및 monophosphoryl lipid A(MPLA); 또는 지모산(zymosan), Poly I:C 및 monophosphoryl lipid A(MPLA)가 첨가된 것일 수 있다.
중복되는 내용은 본 명세서의 복잡성을 고려하여 생략하며, 본 명세서에서 달리 정의되지 않은 용어들은 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상적으로 사용되는 의미를 갖는 것이다.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 예시하기 위한 것으로, 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되는 것으로 해석되지 않는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 자명할 것이다.
준비예 1. 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포의 배양
인간 와튼 젤리(Wharton's jelly) 유래 중간엽 줄기세포(Wharton's jelly-derived mesenchymal stem cells, WJ-MSC)는 10% 소태아혈청(Corning, USA)과 1% 페니실린-스트렙토마이신을 첨가한 minimal essential media alpha modification(α-MEM)(Welgene, South Korea) 배지에서 37℃, 5% CO2 조건으로 배양하였다. 상기 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포는 삼성서울병원에서 IRB 승인을 받고 획득한 세포를 연구 동의하에 사용하였다.
제조예 1. 화학 물질 칵테일 처리된 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 엑소좀의 분리
준비예 1의 WJ-MSC를 7회 내지 13회 계대배양하고 WJ-MSC의 밀집도(confluency)가 80% 내지 90%에 도달했을 때, 배양 배지를 제거한 후 PBS(Welgene, South Korea)로 세척하였다. 이어서, 화학 물질 칵테일을 첨가한 혈청이 없는 α-MEM 배지에서 37℃, 5% CO2 조건으로 24시간 동안 배양하는 과정에서 배양액을 수득하였다. 화학 물질 칵테일은 1 μg/㎖의 zymosan A(Saccharomyces cerevisiae에서 분리됨)(Sigma-Aldrich, USA), 30 ng/㎖의 Polyinosinic-polycytidylic acid(Poly I:C)(Sigma-Aldrich, USA) 및 1 μg/ml의 monophosphoryl lipid A(MPLA)(InvivoGen, USA)로 구성하였다.
상기 수득한 WJ-MSC 배양액을 4℃, 3,000 xg 조건으로 20분 동안 원심분리하여 세포와 큰 세포 파편을 제거하였다. 원심분리를 통하여 수득한 상층액을 0.2 μm Minisart™ NML 시린지 필터(Sartorious, Germany)에 통과시켜 200 nm보다 큰 크기의 입자를 제거하였다. 이어서, Labspinner(Live Cell Instrument, South Korea) 장비를 사용하여 엑소좀을 분리하였다. 엑소좀은 PBS 내에 존재하는 상태로 수득하여 바로 실험에 사용하거나 80℃ 조건에서 냉동 보관하였다.
비교예 1. 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 엑소좀의 분리
준비예 1의 WJ-MSC를 7회 내지 13회 계대배양하고 WJ-MSC의 밀집도(confluency)가 80% 내지 90%에 도달했을 때, 배양 배지를 제거한 후 PBS(Welgene, South Korea)로 세척하였다. 이어서, 혈청이 없는 α-MEM 배지에서 37℃, 5% CO2 조건으로 24시간 동안 배양하는 과정에서 배양액을 수득하였다.
제조예 1에 기재된 방법과 동일하게 상기 수득한 배양액으로부터 엑소좀을 분리하였다.
비교예 2. Poly I:C 처리된 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 엑소좀의 분리
준비예 1의 WJ-MSC를 7회 내지 13회 계대배양하고 WJ-MSC의 밀집도(confluency)가 80% 내지 90%에 도달했을 때, 배양 배지를 제거한 후 PBS(Welgene, South Korea)로 세척하였다. 이어서, 30 ng/㎖의 Poly I:C(Sigma-Aldrich, USA)을 첨가한 혈청이 없는 α-MEM 배지에서 37℃, 5% CO2 조건으로 24시간 동안 배양하는 과정에서 배양액을 수득하였다.
제조예 1에 기재된 방법과 동일하게 상기 수득한 배양액으로부터 엑소좀을 분리하였다.
비교예 3. 화학 물질 칵테일 처리된 HeLa 세포로부터 엑소좀의 분리
WJ-MSC 대신에 HeLa 세포를 사용하여 제조예 1에 기재된 방법과 동일하게 엑소좀을 분리하였다. 상기의 HeLa 세포는 ATCC로부터 구매하여 사용하였다.
제조예 2.
화학 물질 칵테일 처리된 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 엑소좀의 대량 분리
준비예 1의 WJ-MSC를 7회 내지 13회 계대배양하고 WJ-MSC의 밀집도(confluency)가 80% 내지 90%에 도달했을 때, 배양 배지를 제거한 후 PBS(Welgene, South Korea)로 세척하였다. 이어서, 화학 물질 칵테일을 첨가한 혈청이 없는 α-MEM 배지에서 37℃, 5% CO2 조건으로 24시간 동안 배양하는 과정에서 배양액을 수득하였다. 화학 물질 칵테일은 1 μg/㎖의 zymosan A(Saccharomyces cerevisiae에서 분리됨)(Sigma-Aldrich, USA), 30 ng/㎖의 Polyinosinic-polycytidylic acid(Poly I:C)(Sigma-Aldrich, USA) 및 1 μg/ml의 monophosphoryl lipid A(MPLA)(InvivoGen, USA)로 구성하였다.
상기 수득한 WJ-MSC 배양액을 접선유동여과(TFF, Tangential Flow Filtration) 방법을 사용하여 세포와 큰 세포 파편을 제거하였다(0.65 ㎛). 필터를 통과하여 얻어진 용액을 MWCO 300,000 또는 500,000 Da(Dalton) 필터를 사용하여 동일 방식(TFF)으로 농축하면서 MWCO 이하의 불순물을 제거하였다. 이후, 동일 방식(TFF)에 의해 PBS 등으로의 버퍼 교환(Dialysis)을 수행하여 엑소좀을 분리하였다.
비교예 4. 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 엑소좀의 대량 분리
준비예 1의 WJ-MSC를 7회 내지 13회 계대배양하고 WJ-MSC의 밀집도(confluency)가 80% 내지 90%에 도달했을 때, 배양 배지를 제거한 후 PBS(Welgene, South Korea)로 세척하였다. 이어서, 혈청이 없는 α-MEM 배지에서 37℃, 5% CO2 조건으로 24시간 동안 배양하는 과정에서 배양액을 수득하였다.
제조예 2에 기재된 방법과 동일하게 상기 수득한 배양액으로부터 엑소좀을 분리하였다.
비교예 5. 화학 물질 칵테일 처리된 iPSC 유래 중간엽 줄기세포로부터 엑소좀의 대량 분리
ATCC에서 구매한 유도 만능 줄기세포를 비트로넥틴으로 코팅된 12-웰 플레이트에 준비하고, 10% 소태아혈청(FBS)과 1% 페니실린-스트렙토마이신(PS)이 보충된 α-MEM 배지에 Sb4, SB431542, Y27632, PD0325901, SB202190, SP600125, Go6983 및 CHIR99021을 포함하는 화학 물질 칵테일을 첨가하여 5일 동안 배양하였다. 이를 통하여 중배엽(mesoderm)으로 분화한 세포를 얻은 후, 0.25% Trypsin-EDTA를 처리하여 배지로부터 분리된 세포들을 300 RCF에서 5분 동안 원심 분리하였다. 이어서, 10% FBS와 1% PS이 보충된 α-MEM 배지에 Y27632, PD0325901, SB202190, SP600125, Go6983 및 CHIR99021를 포함하는 화학 물질 칵테일을 첨가하고 수집된 세포를 부유시킨 후, 웰 당 1x106 cells를 6-웰 플레이트에 넣어주고 5일 동안 배양하여 중간엽 줄기세포(mesenchymal stem cell)로의 분화를 유도하였다. 분화가 완료된 iPSC 유래 중간엽 줄기세포(ciMSC)를 10% FBS와 1% PS이 보충된 저농도 DMEM 배지에서 배양하는 과정에서 배양액을 수득하였다.
제조예 2에 기재된 방법과 동일하게 상기 수득한 배양액으로부터 엑소좀을 분리하였다.
실험예 1. 화학 물질 칵테일 처리된 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀의 특성 분석
실험예 1.1. 엑소좀의 사이즈 측정
비교예 1에서 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀(CTRL Exo)과 제조예 1에서 화학 물질 칵테일 처리된 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀(CHEM Exo)의 사이즈와 사이즈 별 분포를 nanoparticle tracking analysis(NTA; NS300, Malvern Panalytical, UK)를 통해 측정하고, 그 결과를 도 1에 나타냈다.
도 1에 나타난 바와 같이, CTRL Exo과 CHEM Exo의 사이즈가 50 내지 200nm 사이에 분포되어 있는 것을 확인하였다.
실험예 1.2. 엑소좀의 마커 발현 확인
비교예 1에서 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀(CTRL Exo)와 제조예 1에서 화학 물질 칵테일 처리된 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀(CHEM Exo)가 엑소좀 특이적 마커를 발현하는지 여부를 확인하기 위하여 웨스턴 블랏(Western blot)을 수행하였다. 구체적으로, 1차 항체로서 엑소좀 양성 마커인 CD63 단일클론 항체(mAbs; Abcam, UK), CD81 mAbs(Bioss Antibodies, USA), CD9 mAbs(Cell Signaling Technology, USA)와 TSG101 mAbs(Abcam, UK), 엑소좀 음성 마커인 GM130 다중클론 항체(pAbs; Bioss Antibodies, USA), calnexin mAbs(Bioss Antibodies, USA)를 사용하였다. 1차 항체의 탐지를 위해 horseradish peroxidase(HRP)가 부착된 goat anti-mouse 또는 goat anti-rabbit IgG H&L(Abcam, UK)를 2차 항체로서 사용하였다. 웨스턴 블랏을 수행한 결과를 도 2에 나타냈다.
도 2에 나타난 바와 같이, CTRL Exo와 CHEM Exo 모두 엑소좀의 막단백질인 Tetraspanin 족(family)에 속하는 CD9, CD63, CD81 단백질 및 다소포체(Multivesicular body) 단백질인 TSG101을 발현하는 것을 확인하였다. 또한, 소포체(endoplasmic reticulum)에 존재하는 막 내재성 단백질인 calnexin 및 골지 마커인 GM130은 발현하지 않는 것을 확인하였다. 이를 통하여, 제조예 1에서 분리한 엑소좀이 엑소좀 이외의 세포 소기관들을 포함하지 않는 순수한 엑소좀임을 확인하였다.
실험예 2. 엑소좀에 존재하는 사이토카인 분석
엑소좀에 존재하는 사이토카인을 분석하기 위하여 사이토카인 ELISA를 수행하였다. 사이토카인 분석은 Creative Biolabs의 Exosomal cytokine profiling service를 통해 이루어졌으며, 이는 여러 사이토카인의 발현을 한 번에 확인할 수 있는 Bio-Plex Pro human cytokine screening 48-plex panel(Bio-Rad, #1200283)을 이용한 분석이다. 2021년 8월부터 9월까지 데이터 분석을 수행하였다.
구체적으로, S1에서 S8은 표준 곡선을 만들기 위한 샘플이며, S1부터 순서대로 농도가 감소하도록 설정하고, PBS는 네거티브 컨트롤(negative control)로 사용하였다. CTRL Exo는 비교예 1에서 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀이고, CHEM Exo는 제조예 1에서 화학 물질 칵테일 처리된 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀이며, POLYI:C Exo는 비교예 2에서 Poly I:C 처리된 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀이고, HeLa CHEM Exo는 비교예 3에서 화학 물질 칵테일 처리된 HeLa 세포로부터 분리된 엑소좀이다.
제조예 1에서 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀에 존재하는 사이토카인 분석 결과가 중간엽 줄기세포 특이적인 결과인지 확인하기 위하여, 비교예 3에서 가장 흔하게 사용되는 세포주인 HeLa 세포에 제조예 1에 기재된 화학 물질 칵테일을 처리한 후 엑소좀을 분리하여 사이토카인의 발현을 확인하고, 그 결과를 도 3에 나타냈다.
도 3에 나타난 바와 같이, 화학 물질 칵테일을 처리한 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀(CHEM Exo)에서는 화학 물질 칵테일을 처리하지 않은 경우(CTRL Exo)와 Poly I:C만 처리한 경우(POLYI:C Exo)와 비교하여 IL-6, IL-8, MCP-3, MCP-1, IP-10, RANTES의 발현이 강하게 증가하는 것을 확인하였다. 또한, 같은 구성의 화학 물질 칵테일을 처리했을 때에 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포에서 분리된 엑소좀(CHEM Exo)에서는 IL-6, IL-8, MCP-3, MCP-1, IP-10, RANTES의 발현이 강하게 증가하는 것에 비해 HeLa 세포에서 분리된 엑소좀(HeLa CHEM Exo)에서는 해당 사이토카인들의 발현이 증가하지 않음을 확인하였다.
실험예 3. 화학 물질 칵테일 처리된 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀에 존재하는 miRNA 분석
엑소좀에 존재하는 miRNA를 분석하기 위해서 Creative Biolabs의 Extracellular vesicle characterization service를 이용하였다. 구체적으로, 엑소좀 시료에 포함되어 있는 miRNA를 추출하여 라이브러리를 제작한 후에 sequencing을 수행하였다. 이를 통하여 얻어진 서열 정보를 기존의 miRbase 데이터베이스와 비교함으로써 각각의 엑소좀 시료에서 상대적으로 더 많이 발현하는 miRNA를 분석하고 그 결과를 도 4에 나타냈다. 2021년 8월부터 9월까지 데이터 분석을 수행하였다.
비교예 1은 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀이고(CTRL Exo), 제조예 1은 화학 물질 칵테일 처리된 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀이며(CHEM Exo), 비교예 2는 Poly I:C 처리된 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀이고(POLY IC Exo), 비교예 3은 화학 물질 칵테일 처리된 HeLa 세포로부터 분리된 엑소좀(HeLa CHEM Exo)이다. 각각의 엑소좀에 존재하는 miRNA 종류 및 이의 발현 강도를 측정한 결과를 하기 표 1에 기재하였다.
표 1에 나타난 바와 같이, 비교예 1 내지 3에서 분리된 엑소좀과 비교하여 제조예 1에서 분리된 엑소좀(CHEM Exo)에서 NovelmiRNA-67, hsa-miR-199a-3p, NovelmiRNA-298, hsa-miR-145-5p, NovelmiRNA-281, NovelmiRNA-109, hsa-miR-432-5p, NovelmiRNA-230, NovelmiRNA-88, hsa-miR-200b-3p, NovelmiRNA-169, hsa-miR-200a-3p, hsa-miR-487b-3p, hsa-miR-214-3p, NovelmiRNA-208, NovelmiRNA-164, NovelmiRNA-225, NovelmiRNA-174, hsa-miR-708-5p, hsa-miR-124-3p, NovelmiRNA-150, hsa-miR-135a-5p, NovelmiRNA-64, NovelmiRNA-92, NovelmiRNA-168, NovelmiRNA-22, NovelmiRNA-35, NovelmiRNA-161, hsa-miR-3940-3p, hsa-miR-219a-3p, hsa-miR-212-3p, NovelmiRNA-76, hsa-miR-323a-3p, hsa-miR-654-3p, hsa-miR-204-5p, hsa-miR-136-3p, NovelmiRNA-39, NovelmiRNA-175, hsa-miR-134-5p, hsa-miR-454-3p, NovelmiRNA-286, hsa-miR-542-3p 및 hsa-miR-433-3p의 발현 강도가 특이적으로 증가한 것을 확인하였다.
구체적으로, 세포 증식을 억제하고 세포자연사(apoptosis)를 유도하는 것으로 알려진 hsa-miR-199a-3p 및 hsa-miR-200b-3p, 세포 이동 및 침윤을 억제하는 것으로 알려진 hsa-miR-145-5p, hsa-miR-432-5p 및 hsa-miR-200a-3p, 세포 증식 및 세포 주기 진행을 억제하는 것으로 알려진 hsa-miR-214-3p 및 hsa-miR-708-5p, 골육종의 화학 내성 및 전이를 억제하는 것으로 알려진 hsa-miR-487b-3p, 종양 억제제로 기능하는 것으로 알려진 hsa-miR-124-3p와 종양 침윤을 억제하는 것으로 알려진 hsa-miR-135a-5p의 발현 강도가 특이적으로 증가한 것을 확인하였다.
한편, 비교예 2에서 Poly I:C 처리된 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀(POLY IC Exo)와 비교하여, 제조예 1에서 지모산(zymosan), Poly I:C 및 monophosphoryl lipid A(MPLA)가 처리된 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀(CHEM Exo)에서 hsa-miR-376a-2-3p, hsa-miR-376a-3p, hsa-miR-664a-5p, hsa-miR-150-3p, hsa-miR-3909, hsa-miR-618, NovelmiRNA-52, NovelmiRNA-172, NovelmiRNA-218, NovelmiRNA-220, NovelmiRNA-222, NovelmiRNA-266 및 NovelmiRNA-283의 발현 강도가 상대적으로 감소한 것을 확인하였다.
실험예 4. 화학 물질 칵테일 처리된 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀에 존재하는 mRNA 분석
제조예 1에서 화학 물질 칵테일 처리된 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀과 비교예 1에서 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀의 mRNA 발현 양상을 비교하기 위하여 마이크로 어레이(microarray) 실험을 수행하였다. 구체적으로, Creative Biolabs의 Extracellular vesicle characterization service를 이용하여, 각각의 엑소좀 시료에 포함되어 있는 mRNA를 추출하고 microarray를 통하여 상대적으로 더 많이 발현하는 mRNA를 분석하였다. 2021년 8월부터 9월까지 데이터 분석을 수행하였다. Microarray를 수행한 결과, MED13L을 비롯해 총 275종류의 mRNA 발현 수준이 화학 물질 칵테일 처리된 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포에서 유의미하게 증가한 것을 확인하였다. 하기 표 2에 275종류의 mRNA를 기재하였다.
| MED13L |
lnc-EXT1-2 |
LOC100507420 |
lnc-PHYHD1-1 |
SHARPIN |
| lnc-TOMM20L-1 |
LIN54 |
OPA3 |
GIGYF2 |
ASMTL-AS1 |
| lnc-CDK5R1-1 |
C17orf74 |
XLOC_l2_014245 |
RNF151 |
HMOX1 |
| ETV3 |
SLC12A2 |
lnc-NR5A1-1 |
BAGE |
SHARPIN |
| SLC35G1 |
TTC28 |
DMTN |
ADRA2C |
LOC101928207 |
| SMARCA4 |
ADRA2A |
SMPD4 |
lnc-SLC43A1-1 |
TRAIP |
| ACAT2 |
NLGN2 |
TXLNB |
ENTPD8 |
lnc-ANTXRL-2 |
| ADAM12 |
lnc-FBXO25-4 |
SPRR1A |
NYAP1 |
LINC01135 |
| ARFGEF1 |
LOC100506603 |
DISP1 |
lnc-GLIPR1L1-1 |
BZRAP1 |
| CELF3 |
LOC399886 |
LOC100130285 |
CCNT2-AS1 |
LOC101926983 |
| DNAJB5 |
RCC2 |
lnc-SLC17A9-1 |
NAV1 |
WDR6 |
| lnc-WRNIP1-2 |
KIAA0040 |
lnc-SELV.1-1 |
TBX21 |
C19orf81 |
| ACTL8 |
HOXB9 |
lnc-ROM1-2 |
GNAZ |
NAMA |
| lnc-TM2D3-2 |
JMJD8 |
lnc-RABEPK-1 |
DNM3OS |
LIM2 |
| GCN1L1 |
LINC01146 |
lnc-RRP8-1 |
PRKAG2-AS1 |
FAM155A-IT1 |
| LOC101929337 |
lnc-GIT1-1 |
lnc-RP11-234B24.6.1-1 |
lnc-MFSD9-4 |
lnc-RPP30-2 |
| FAM217A |
VRTN |
lnc-TMEM189-UBE2V1-2 |
lnc-RPGRIP1-2 |
ZNF264 |
| XLOC_l2_013467 |
NHP2 |
LAMTOR2 |
ABCC6 |
MALAT1 |
| SNHG4 |
KIF26A |
BTK |
LRFN3 |
HTT-AS |
| NUDT13 |
HAUS5 |
lnc-BSND-1 |
lnc-COL1A1-2 |
ZDHHC22 |
| MCTS1 |
lnc-SOD2-2 |
C2orf71 |
lnc-PPAPDC3-2 |
SEPHS2 |
| ATG4D |
APOL3 |
lnc-C17orf63-2 |
CTU1 |
ABTB1 |
| NPEPL1 |
lnc-POLR2L-1 |
lnc-CHGA-1 |
lnc-PABPC4-1 |
lnc-RP11-791J7.2.1-1 |
| YEATS2 |
lnc-SUPT3H-1 |
ABCD1 |
LOC100507165 |
CCDC28B |
| SPEN |
lnc-XRN2-3 |
NCAN |
LOC102724861 |
LOC284263 |
| GGT6 |
RTP2 |
C9orf106 |
SPTSSB |
lnc-PPIC-2 |
| lnc-RP11-770J1.4.1-1 |
TERT |
AGAP2 |
lnc-C20orf96-4 |
CDC42BPB |
| MIAT |
TNFRSF12A |
EMC6 |
DCDC5 |
C9orf173-AS1 |
| lnc-HMCN1-2 |
LOC645427 |
CD86 |
lnc-CRYL1-1 |
C9orf139 |
| RETN |
lnc-CTR9-5 |
LOC100129175 |
LOC100506114 |
FGD5 |
| SP6 |
SENP7 |
SLC48A1 |
CCNT2-AS1 |
lnc-RP11-322L20.1.1-7 |
| RCOR2 |
lnc-C17orf97-4 |
RPL28 |
lnc-SCAMP5-1 |
RAD51 |
| lnc-AC016251.1-2 |
ARNTL |
BGN |
BRD1 |
MEIOB |
| lnc-PRKAA2-1 |
lnc-RTL1-1 |
BZW1 |
lnc-ELAVL4-3 |
lnc-ADAMTS14-1 |
| RANBP3 |
ZNF713 |
lnc-C6orf221-2 |
CHRDL1 |
PCDHA13 |
| lnc-SH2B3-1 |
XLOC_l2_005871 |
SLC20A2 |
lnc-FUT8-1 |
|
| XLOC_l2_011901 |
QSOX1 |
HYALP1 |
lnc-DNAJC7-1 |
|
| CACNA1H |
SP2-AS1 |
SNAR-G1 |
LINC01264 |
|
| LINC01314 |
ARSA |
SEC22A |
LMO2 |
|
| lnc-VAPB-1 |
PHF7 |
TIMM8B |
LINC01197 |
|
| ARHGAP23 |
GS1-24F4.2 |
ATAD1 |
LOC101927533 |
|
| ATG9A |
LRIT1 |
FNDC7 |
REP15 |
|
| GM2A |
PLLP |
B3GNT8 |
C1orf226 |
|
| XLOC_l2_013547 |
SLC4A11 |
STARD7-AS1 |
lnc-STEAP1B-1 |
|
| lnc-SLC25A26-1 |
C11orf95 |
TMEM100 |
SNORD3B-1 |
|
| TMEM240 |
FAM110B |
LARP6 |
lnc-TMEM135-2 |
|
| CLSTN3 |
IER5 |
HELZ2 |
lnc-FAM160A1-1 |
|
| ATG16L2 |
LINC01508 |
TMX2 |
GOLGA2P5 |
|
| MMP11 |
lnc-GTPBP8-1 |
lnc-EPHB6-1 |
TMEM132C |
|
| TSSK3 |
LOC400958 |
PSMC2 |
GPX3 |
|
| lnc-SOX6-1 |
WFDC21P |
lnc-LINC00273-1 |
lnc-DCAF4L2-2 |
|
| EDEM3 |
lnc-CPXM2-2 |
TNFRSF25 |
XLOC_l2_014217 |
|
| LOC101927210 |
P2RX6 |
BCL3 |
PPT1 |
|
| C14orf169 |
SLC22A7 |
LOC101929450 |
RPA4 |
|
| EBLN2 |
lnc-PPP2R2C-1 |
LOC102724416 |
KCTD5 |
|
| lnc-XRN1-1 |
lnc-GATA5-2 |
FLII |
lnc-UQCRFS1-9 |
|
| lnc-FTSJD2-1 |
MARVELD1 |
WAC |
MTUS2-AS1 |
|
| MDFI |
lnc-TRIM41-3 |
PPP6R1 |
CHKA |
|
| LOC102546226 |
PRSS8 |
LOC100507377 |
TBC1D31 |
|
| SLC5A10 |
SEMA6C |
LRRFIP2 |
SNORD38A |
|
실험예 5. 화학 물질 칵테일 처리된 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀의 in vitro 효과 확인
실험예 5.1. 마우스 대식 세포주의 배양 및 엑소좀의 처리
마우스 대식 세포 세포주인 RAW 264.7(ATCC, TIB-71)를 열 처리된 10% 태아 소 혈청(Corning, USA)과 1% 페니실린-스트렙토마이신을 첨가한 Dulbecco's modified Eagle medium with high glucose(DMEM; Welgene, South Korea) 배지에서 37℃, 5% CO2 조건으로 배양하였다.
48-웰 플레이트(Corning, USA)에 RAW 264.7을 웰 당 1x105 cells로 씨딩(seeding)하였다. 세포는 아무것도 처리되지 않거나(CTRL), 비교예 1에서 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 1x108개의 엑소좀(CTRL Exo), 제조예 1에서 화학 물질 칵테일 처리된 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 1x108 입자의 엑소좀(CHEM Exo), 또는 10 ng/㎖의 지질다당체(lipopolysaccharide, Sigma-Aldrich, USA)(LPS)를 각각 첨가한 무혈청의 DMEM 배지에서 24시간 동안 배양하였다.
실험예 5.2. 일산화질소 생성량의 분석
CTRL, CTRL Exo, CHEM Exo 또는 LPS 처리에 따른 RAW 264.7의 일산화질소(nitric oxide, NO) 생성량을 분석하기 위하여, CTRL, CTRL Exo, CHEM Exo 및 LPS를 각각 처리한 세포에서 얻어진 배양 배지를 각각 새로운 96-웰 플레이트(VWR, USA)로 옮긴 후, Nitric Oxide plus detection kit(iNtRON Biotech, South Korea)를 사용하여 NO 농도를 측정하고 그 결과를 도 5에 나타냈다.
도 5에 나타난 바와 같이, LPS를 처리하여 염증 반응을 유도한 경우보다 CHEM Exo을 처리한 경우에 일산화질소의 생성량이 유의하게 증가하는 것을 확인하였다. 이를 통하여, 제조예 1에서 화학 물질 칵테일 처리된 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀이 일산화질소 분비를 통하여 대식 세포의 활성화를 유도하여 염증 반응을 증진시키는 것을 확인하였다.
실험예 5.3. 염증 관련 mRNA 발현 수준의 측정
CTRL, CTRL Exo, CHEM Exo 또는 LPS 처리에 따른 RAW 264.7의 사이토카인 및 케모카인의 발현 수준을 분석하기 위하여, 실시간 중합효소 연쇄반응(quantitative reverse transcription PCR, RT-qPCR)을 수행하였다. 구체적으로, CTRL, CTRL Exo, CHEM Exo 및 LPS를 각각 처리한 세포를 용해시킨 후 TaKaRa MiniBEST universal RNA extraction kit(Takara Bio Inc, Japan)를 이용하여 RNA를 추출 및 정제하였다. 이어서, PrimeScript쪠 1st strand cDNA synthesis kit(Takara Bio Inc, Japan)를 사용하여 RNA의 상보적인 DNA(complementary DNAs, cDNA)를 합성하였다. 합성된 cDNA로 RT-qPCR을 수행하여 마우스의 interleukin-6(IL-6), IL-1β, 종양 괴사 인자-알파(tumor necrosis factor-α, TNF-α), 산화 질소 합성효소 2(nitric oxide synthase 2, NOS2) 및 사이클로옥시게나아제(cyclooxygenase 2, COX2)의 발현 수준을 측정하고, 그 결과를 도 6에 나타냈다. 유전자 발현 수준의 표준화를 위하여 GAPDH를 레퍼런스 유전자로 사용하였으며, RT-qPCR에 사용한 프라이머의 서열정보는 하기 표 3에 기재한 바와 같다.
|
유전자
|
프라이머
|
서열번호
|
Annealing
Temperature(℃)
|
Size(bp)
|
| GAPDH |
Forward |
CAT CAC TGC CAC CCA GAA GAC TG |
1 |
63.3 |
153 |
| Reverse |
ATG CCA GTG AGC TTC CCG AG |
2 |
65.2 |
| IL-6 |
Forward |
AGT TGC CTT CTT GGG ACT GAT |
3 |
59.3 |
159 |
| Reverse |
TCC ACG ATT TCC CAG AGA ACA |
4 |
59 |
| IL-12 |
Forward |
AGG TCA CAC TGG ACC AAA GG |
5 |
60.5 |
173 |
| Reverse |
TGG TTT GAT GAT GTC CCT GA |
6 |
56.4 |
| IL-1β |
Forward |
TTC CTG TTG TCT ACA CCA ATG C |
7 |
60.3 |
162 |
| Reverse |
CGG GCT TTA AGT GAG TAG GAG A |
8 |
62.1 |
| TNF-α |
Forward |
ACG GCA TGG ATC TCA AAG AC |
9 |
60.1 |
116 |
| Reverse |
GTG GGT GAG GAG CAC GTA GT |
10 |
60.2 |
| NOS2 |
Forward |
GAA CTG TAG CAC AGC ACA GGA AAT |
11 |
61.6 |
158 |
| Reverse |
CGT ACC GGA TGA GCT GTG AAT |
12 |
60.2 |
| COX2 |
Forward |
CAG TTT ATG TTG TCT GTC CAG AGT TTC |
13 |
60.5 |
127 |
| Reverse |
CCA GCA CTT CAC CCA TCA GTT |
14 |
60.6 |
도 6에 나타난 바와 같이, CTRL 또는 CTRL Exo를 처리한 경우보다 CHEM 엑소좀을 처리한 경우에 염증성 사이토카인인 IL-6, IL-12, TNF-α 및 IL-1β와 염증 관련 효소인 NOS2 및 COX2의 발현 강도가 유의하게 증가함을 확인하였다. 또한, 일반적으로 염증 반응을 유도하는 것으로 알려진 LPS를 처리한 경우와 비교하여 IL-6, IL-12, IL-1β, NOS2 및 COX2의 발현을 유의미하게 증가시키는 것을 확인함으로써, CHEM Exo에 의한 면역 반응의 강도가 유의미함을 확인하였다. 증가한 사이토카인은 모두 전염증성 사이토카인(proinflammatory cytokine)으로 수지상세포, 대식세포, T세포, B세포를 활성화시키는 사이토카인이다. 따라서, 이러한 실험 결과는 제조예 1의 CHEM Exo가 면역 세포 활성화를 유도할 수 있음을 시사한다. 또한, LPS보다 전염증성 사이토카인의 분비가 증가한 결과는 제조예 1의 CHEM Exo의 면역 활성 효과가 매우 뛰어남을 시사한다.
실험예 6. 화학 물질 칵테일 처리된 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 대량 분리된 엑소좀의 in vivo 효과 확인
실험예 6.1. 마우스 대장암 세포주의 준비
마우스 대장암 세포주인 CT26(ATCC, CRL-2638)을 열 처리된 10% 태아 소 혈청(Gibco, 10082-147)과 1% 페니실린-스트렙토마이신을 을 첨가한 RPMI1640 배지에 부유시켜 세포 배양용 플라스크에 넣고 37℃, 5% CO2 조건의 incubator에서 배양하였다. 배양이 완료된 세포는 PBS로 세척한 후, 10배 희석한 2.5% Trypsin-EDTA(Gibco, 15090)를 첨가하여 세포를 분리하였다. 이어서, 1,000 rpm으로 5분 동안 원심분리를 수행하고, 상층액을 제거하여 수득한 세포 부유액을 새로운 배지로 이동하였다. 현미경을 이용하여 세포 생존률(viability)을 확인한 후, 5.0x106 cells/㎖의 농도로 DPBS에 희석하여 세포주를 준비하였다.
실험예 6.2. 마우스 대장암 모델의 준비
BALB/c 마우스를 7일 동안 사육 환경에서 적응시킨 후, CT26 세포주를 이식하기 전날에 마우스의 등쪽 피부를 전기용 면도기를 사용하여 제모를 실시하였다. 세포주 이식 시, 투여 부위를 70% 알코올로 소독하고, 엄지와 검지로 오른쪽 마우스 등쪽의 피부를 잡아당겨 피부와 근육 사이에 공간을 만든 후 동물의 전방으로부터 엄지와 검지 사이의 피하 공간에 인슐린 주사기(insulin syringe)를 이용하여 5.0x105 cells/0.1 ㎖/head의 투여량으로 피하 투여하였다. 세포주 접종 후 이식 부위의 종양 크기가 약 300 mm3에 도달하였을 때, 종양의 크기에 따라 각 군의 종양 크기가 균일하게 분포하도록 7개의 군으로 6마리씩 분리하였다.
실험예 6.3. 마우스 대장암 모델에 엑소좀 투여
상기 분리된 7개의 군에 PBS, 비교예 4에서 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 대량 분리된 엑소좀(Ctrl Exo), 항-PD-1 항체(BioXCell, #BP0273), 제조예 2에서 화학 물질 칵테일 처리된 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 대량 분리된 엑소좀(IEP-01), 비교예 5에서 화학 물질 칵테일 처리된 iPSC 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀(IEP-01-i), IEP-01와 항-PD-1 항체 병용 및 IEP-01-i와 항-PD-1 항체 병용을 각각 투여하였다. 투여 물질은 각각 일주일에 3회씩, 2주에 걸쳐 총 6회 투여하였다. CTRL Exo, IEP-01 및 IEP-01-i는 5x108 입자/head 투여량으로 정맥 투여하였고, 항-PD-1 항체는 5 mg/kg 투여량으로 복강 투여하였다.
실험예 6.4. 마우스 대장암 모델의 체중 및 종양 부피 측정
상기 물질 투여 개시일을 기준으로 일주일에 3회씩 체중 및 종양 부피를 측정하였다. 종양의 부피는 캘리퍼스를 이용하여 종양의 장축 및 단축을 측정하고 다음의 계산식을 이용하여 종양의 부피를 산출하고, 그 결과를 도 7 및 도 8에 나타냈다. 또한 각 마우스의 체중을 측정하여 도 9에 나타냈다.
[수학식 1]
종양 부피(㎣) = ab2/2 (a: 장축 길이, b: 단축 길이)
도 7 및 도 8에 나타난 바와 같이, 단독 투여의 경우에는 제조예 2에서 화학 물질 칵테일 처리된 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 대량 분리된 엑소좀(IEP-01)을 투여한 군의 종양 성장 억제 효과가 가장 우수하였으며, 화학 물질 칵테일 처리된 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀(IEP-01 또는 IEP-01-i)의 단독 투여보다는 항-PD-1 항체와 병용 투여하는 경우에 종양 성장 억제 효과가 증가하는 것을 확인하였다. 한편, 도 9에 나타난 바와 같이, 각 투여 물질에 따른 마우스의 체중 변화는 거의 없는 것을 확인하였다.
실험예 6.5. 마우스 대장암 모델의 종양 무게 측정
상기 물질 투여 개시일로부터 15일 후에 모든 생존 마우스를 마취한 후 후대정맥에서 주사기를 이용하여 채혈을 실시하고 복대동맥 및 후대정맥을 절단하여 방혈 및 치사 시킨 후 종양을 적출하였다. 적출한 종양은 PBS로 가볍게 세척하고 물기를 제거한 뒤 사진을 촬영하여 그 결과를 도 11에 나타내고, 무게를 측정하여 그 결과를 도 10에 나타냈다.
도 10 및 도 11에 나타난 바와 같이, 제조예 2에서 화학 물질 칵테일 처리된 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 대량 분리된 엑소좀(IEP-01)을 투여한 군의 종양 무게가 가장 적었으며, 비교예 5에서 화학 물질 칵테일 처리된 iPSC 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀(IEP-01-i)의 단독 투여보다는 항-PD-1 항체와 병용 투여하는 경우에 종양 감소 효과가 증가하는 것을 확인하였다.
실험예 6.6. Poly I:C 단독 처리와 화학 물질 칵테일 처리된 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 분리된 엑소좀의 기능 비교
제조예 2에서 화학 물질 칵테일 처리된 인간 와튼 젤리 유래 중간엽 줄기세포로부터 대량 분리된 엑소좀(IEP-01)에 의한 전염증성 사이토카인 분비 효과가 엑소좀의 자체의 효과인지 또는 제조예 2에서 사용한 화학 물질 칵테일 성분에 의한 효과인지 확인하기 위하여 다음과 같은 in vitro 실험을 수행하였다.
구체적으로, RAW 264.7 세포주에 제조예 2에서 대량 분리한 엑소좀(IEP-01) 또는 Poly I:C를 단독으로 처리한 후, 실험예 5.3.에 기재된 방법과 동일한 방법으로 RT-PCR을 수행하여 전염증성 사이토카인인 IL-6의 발현량을 측정하고, 그 결과를 도 12에 나타냈다.
도 12에 나타난 바와 같이, 처리한 IEP-01의 개수를 기준으로 Poly I:C 농도를 계산했을 때 IEP-01를 처리한 경우에 Poly I:C를 단독으로 처리한 경우와 비교하여 저농도에서 IL-6의 발현을 증가시킨 것을 확인하였다. 구체적으로, IL-6 mRNA의 발현량이 4,000일 때, Poly I:C는 35 ㎍이 필요하였으나, IEP-01의 경우에는 13.8 ㎍의 Poly I:C가 사용된 것을 확인하였다. 이는, IEP-01이 Poly I:C 단독으로 사용되는 경우보다 2.5배 낮은 농도의 Poly I:C 농도로도 동일한 효과를 나타낼 수 있음을 보여주는 결과이다. 즉, IEP-01의 전염증성 사이토카인 분비는 Poly I:C 단독에 의한 효과가 아닌 IEP-01에 존재하는 사이토카인, miRNA, mRNA와 함께 작용하는 결과임을 확인하였다.
실험예 7. 수득한 세포 종류별 엑소좀의 비교 실험
실험예 7.1. 화학 물질 칵테일 처리된 세포로부터 엑소좀의 분리
상기 WJ-MSC 유래 엑소좀, 상기 iPSC에서 분화한 ciMSC 유래 엑소좀 및 HEK293T 세포주에서 수득한 엑소좀을 처리된 화학 물질 별로 비교하였다.
세포 배양액을 수득하기 하루 전, 키우던 세포의 배양액을 제거하고 PBS로 세척한 후, FBS가 포함되어 있지 않은 배양 배지에 아무것도 추가하지 않은 것을 naive 엑소좀 군으로 하였다. 또한, poly I:C 30μg/ml, MPLA 1μg/ml 및 Zymosan 1μg/ml을 처리한 3-chem 군에서 수득한 엑소좀을 IEP-01로 명명하였다 또한, poly I:C 30μg/ml 및 MPLA 1μg/ml을 처리한 2-chem 군에서 수득한 엑소좀을 IEP-01'로 명명하였다. ciMSC에서 수득된 엑소좀은 "i"를 추가적으로 표기하고, HEK293T에서 수득된 엑소좀은 "h"를 추가적으로 표기하였다. 각 실험군별로 24시간 동안 배양한 다음 세포 배양액을 수거하였다.
세포 배양액으로부터 엑소좀 샘플은 Tangential flow filtration 방식을 통해서 분리하였다. 엑소좀을 표지하기 위해서 엑소좀 샘플을 PKH67 지질친화성 형광 염료와 5분간 상온에서 배양한 후, 충분한 양의 10% BSA를 포함한 PBS로 두 번 세척하였다. 표지된 엑소좀은 Amicon 100 kDa MWCO 필터 컬럼을 이용해 농축하였고, NTA로 정량하였다.
실험예 7.2. 각 엑소좀에 존재하는 mRNA 분석
각각의 세포군에 화합물을 처리하여 수득한 엑소좀 1000 ptc/cell 또는 1 ng/ml의 LPS를 마우스 유래 대식세포 세포주인 Raw264.7 세포에 24시간 처리하였다. 이후, Raw264.7 세포에서 mRNA를 분리한 후 역전사를 통해서 cDNA를 합성하였다. 합성된 cDNA를 이용하여 IL-6, iNOS2, 및 IL-1β 발현을 확인하기 위하여 TaqMan 프로브를 이용하여 qRT-PCR을 수행하였다. Raw264.7을 활성화시키기 위한 양성대조군으로 LPS를 이용하였다. 각각의 유전자 발현은 GAPDH를 기준으로 상대적인 값으로 정량하였다.
그 결과, 도 13a 내지 13c에 나타낸 것과 같이, WJ-MSC 유래 엑소좀 중, Naive 엑소좀을 처리한 군에서는 Raw264.7 세포에서 IL-6, IL-1β, 또는 iNOS2의 발현이 유도되지 않았으나, 2-chem 및 3-chem을 처리한 군에서 수득한 엑소좀에서는 IL-6, IL-1β, 또는 iNOS2의 발현이 LPS에 의해 유도된 것 이상으로 강하게 유도되는 것을 확인하였다.
또한, 도 13d 및 13e에 나타낸 것과 같이, WJ-MSC에서 수득한 엑소좀과 마찬가지로, ciMSC 유래 엑소좀 중 Naive Exosome을 처리한 군에서는 IL-6, 또는 iNOS의 발현이 유도되지 않았으나, 2-chem 및 3-chem을 처리한 군에서 수득한 엑소좀에서는 IL-6, 또는 iNOS2의 발현이 LPS에 의해 유도된 것 이상으로 강하게 유도되는 것을 확인하였다.
더불어, 도 13f 및 도 13g에 나타낸 것과 같이, WJ-MSC 및 ciMSC에서 수득한 엑소좀과 마찬가지로, HEK293T 세포주 유래 엑소좀 중 Naive 엑소좀을 처리한 군에서는 IL-6 및 IL-1β 발현이 유도되지 않았으나, 2-chem 및 3-chem을 처리한 군에서 수득한 엑소좀에서는 IL-6, 또는 IL-1β의 발현이 상당히 증가하는 것을 관찰하였다.
이러한 결과는, 다양한 세포주에 polyI:C와 MPLA를 처리한다면 Raw264.7 대식세포를 활성화시킬 수 있는 엑소좀이 분비될 수 있음을 의미한다.
실험예 8. ciMSC 유래 엑소좀의 세포별 흡수 정도 확인
PBMC 및 면역세포 종류별로 ciMSC 유래 엑소좀을 흡수하는 정도를 비교하였다.
엑소좀 흡수 실험을 위해, 인간 말초 혈액 단핵세포(CTL)와 상기에서 제조한 표지된 ciMSC 유래 엑소좀 또는 표지되지 않은 ciMSC 유래 엑소좀과 3000 입자/세포 농도로 37℃ CO2 인큐베이터에서 4시간 동안 배양하고 PBS로 두 번 세척하였다. 세포들은 이뮤노타이핑을 위해서 형광 표지된 항체들과 4℃에서 3분 배양하고, 이후 2% FBS를 포함한 PBS로 세척하였으며, Cytoflex 유세포분석기를 통해 분석하였다. 모든 데이터는 Kaluza 소프트웨어를 통해 분석하였다.
이때, 이뮤노타이핑은 APC anti-human CD3(Biolegend, 300312), APC anti-human CD19(Biolegend, 302212), Brilliant Violet 421TM anti-human CD19(Biolegend, 302233), Brilliant Violet 421TM anti-human CD56(NCAM) (Biolegend, 362551), Brilliant Violet 421TM anti-human CD11b(Biolegend, 301323), Brilliant Violet 421TM anti-human CD11c(Biolegend, 301627), PerCP/Cyanine5.5 anti-human CD14(Biolegend, 367110), PE anti-human HLA-DR, DP, DQ(MHC class II)(Biolegend, 361716) 항체들을 이용하였다.
그 결과, 도 14a 내지 14c에 나타낸 것과 같이, PBMC 중에서도 특히, 수지상세포, 단구세포, 대식세포에서 PKH 형광 표지가 달린 ciMSC 유래 엑소좀이 유의미하게 많이 흡수됨을 확인하였다.
실험예 9. ciMSC 유래 엑소좀에 의한 대식세포 활성화 및 분화 확인
실험예 9.1. 엑소좀에 의한 대식세포 활성화 확인
ciMSC 유래 엑소좀이 대식세포를 활성화시키는지를 확인하기 위해서 마우스 유래 대식세포 세포주인 Raw264.7 세포에 LPS 10 ng/ml 또는 IEP-01i'(2-chem 처리된 ciMSC 유래 엑소좀)을 1000 ptc/ml 24시간 처리하였다. 처리 후 세포를 PBS로 세척하고 PE anti-mouse CD80(Biolegend, 104708) 항체와 30분 동안 4℃에서 배양하였다. 다음으로, 2% FBS를 포함한 PBS로 세척하여 이들을 Cytoflex 유세포분석기를 통해 분석하였다. 모든 데이터는 Kaluza 소프트웨어를 통해 분석하였다.
그 결과, 도 15a 및 15b에 나타낸 것과 같이, 양성대조군인 LPS만큼 IEP-01i'이 대식세포의 활성화를 잘 유도함을 확인하였다.
실험예 9.2. 엑소좀에 의한 대식세포 분화 확인
ciMSC 유래 엑소좀에 의한 대식세포 분화를 확인하기 위해서 마우스 유래 대식세포 세포주인 Raw264.7 세포를 20 ng/ml IL-4로 24시간 전처리하여 M2 대식세포로 분화를 유도하였다. 이후, 이 세포들에 LPS 10 ng/ml 또는 IEP-01i' (2-chem 처리된 ciMSC 유래 엑소좀)을 1000 ptc/ml 24시간 처리하였다. 처리 후 세포를 PBS로 세척하고 PE anti-mouse CD80(Biolegend, 104708) 항체와 30분 동안 4℃에서 배양한 다음, 2% FBS를 포함한 PBS로 세척하여 이들을 Cytoflex 유세포분석기를 통해 분석하였다. 모든 데이터는 Kaluza 소프트웨어를 통해 분석하였다.
그 결과, 도 15c 및 15d에 나타낸 것과 같이, IL-4를 처리하면 M2 대식세포로의 분화가 되기에 M1 대식세포 마커가 감소하지만, 여기에 IEP-01i'을 처리하면 LPS를 처리한 것처럼 M1 대식세포 마커인 CD80 발현이 강하게 유도됨을 확인하였다.
이러한 결과는, IEP-01i'에 의해 M2 대식세포로의 분화가 저해되고, M1 대식세포로의 분화는 유도됨을 의미한다.
실험예 10. ciMSC 유래 엑소좀에 의한 수지상세포 활성화 확인
ciMSC 유래 엑소좀에 의한 수지상세포 활성화를 확인하기 위해서, 상기 실험예 8과 같이 형광 표지된 ciMSC 유래 엑소좀을 처리군별로 각각 준비하였다.
인간 말초 혈액 유래 미성숙 수지상세포(Stem cell technologies, #70041)를 표지된 naive 또는 IEP-01i' 엑소좀 또는 표지되지 않은 naive 또는 IEP-01i' 엑소좀을 3000 입자/세포 농도로 처리하여 37℃ CO2 인큐베이터에서 24시간 동안 배양한 후, PBS로 두 번 세척하였다. 양성대조군으로서 수지상세포를 활성화하기 위해 미성숙 수지상세포에 1 μg/ml의 LPS를 24시간 동안 처리하였다. 수지상세포 활성화를 확인하기 위하여 세포들을 형광 표지된 항체들과 4℃에서 30분 배양하였다. 이후 2% FBS를 포함한 PBS로 세척하였으며, 이들을 Cytoflex 유세포분석기를 통해 분석하였다. 모든 데이터는 Kaluza 소프트웨어를 통해 분석하였다.
이때, APC anti-human CD11c(Biolegend, 301614), PE anti-human CD80(Biolegend, 305208), PE anti-human CD86(Biolegend, 374206), PE anti-human HLA-A,B,C(MHC class I)(Biolegend, 311406), PE anti-human HLA-DR, DP, DQ(MHC class II) (361716) 항체들이 분석에 이용하였다.
그 결과, 도 16a 내지 도 16d에 나타낸 것과 같이, PKH 표지된 엑소좀을 처리한 그룹에서 PKH 양성인 수지상세포가 확인되었다.
도 16e 및 16f에 나타낸 것과 같이, IEP-01i' 엑소좀을 처리한 수지상세포 그룹에서 아무것도 처리하지 않은 수지상세포보다 수지상세포 활성 마커인 CD80을 많이 발현함을 확인하였다. 특히, PKH로 표지된 수지상세포, 즉 해당 엑소좀을 흡수한 수지상세포에서 특이적으로 CD80의 발현이 현저히 증가함을 확인하였다.
또한, 도 16g 및 16h에 나타낸 것과 같이, IEP-01i' 엑소좀을 처리한 수지상세포 그룹에서 아무것도 처리하지 않은 수지상세포보다 수지상세포 활성 마커인 CD86을 많이 발현함을 확인하였다. 특히, PKH로 표지된 수지상세포, 즉 해당 엑소좀을 흡수한 수지상세포에서 특이적으로 CD86의 발현이 현저히 증가함을 확인하였다. 또한, naive 엑소좀을 처리한 수지상 세포에 비하여 IEP-01i'을 처리한 수지상세포가 CD86을 많이 발현함을 확인하였다.
도 16i 및 16j에 나타낸 것과 같이, IEP-01i' 엑소좀을 처리한 수지상세포 군에서 아무것도 처리하지 않은 수지상세포보다 항원제시분자인 MHC class I을 많이 발현함을 확인하였다. 특히, PKH로 표지된 수지상세포, 즉 해당 엑소좀을 흡수한 수지상세포에서 특이적으로 MHC class I의 발현이 현저히 증가함을 확인하였다.
도 16k 및 16l에 나타낸 것과 같이, IEP-01i' 엑소좀을 처리한 수지상세포 그룹에서 아무것도 처리하지 않은 수지상세포보다 항원제시분자인 MHC class II을 많이 발현함을 확인하였다. 특히 PKH로 표지된 수지상세포, 즉 해당 엑소좀을 흡수한 수지상세포에서 특이적으로 MHC class II 발현이 현저히 증가함을 확인하였다. 또한, naive 엑소좀을 처리한 수지상 세포에 비하여 IEP-01i'을 처리한 수지상세포에서 훨씬 많은 MHC class II를 발현함을 확인하였다.
실험예 11. ciMSC 유래 엑소좀의 사이토카인 분석
ciMSC 유래 엑소좀에 함유되어 있는 사이토카인을 분석하기 위해, 상기 실험예 7.1.의 ciMSC 유래 엑소좀 시료를 1x1010 ptc/ml 농도로 준비하였다. 그 후, 1% Triton X-100을 넣고 상온에서 10분 동안 처리하여 엑소좀을 용해시켰다. 다음으로, Legendplex human essential immune response panel(Biolegend, 740930)을 이용하여 엑소좀 내부에 있는 사이토카인을 확인하고, 사이토카인의 양을 정량하였다. 분석은 제조사의 매뉴얼에 따라 이루어졌으며, 모든 시료의 분석은 3회 반복 수행하였다.
그 결과, 도 17a 내지 17e에 나타낸 것과 같이, Naive 엑소좀에 비해 IEP-01i'는 IP-10, IL-6, MCP-1 및 IL-8을 현저히 많이 포함함을 확인하였다. 반면에 TGF-β1의 양은 Naive 엑소좀에 비해 훨씬 적은 양을 포함하였다.
이러한 결과는 IEP-01i'이 수지상세포나 대식세포의 화학유인(chemoattraction)을 활성화시킬 수 있는 사이토카인 분자들을 함유하고 있음을 의미한다. 또한, 암세포의 성장을 촉진시키는 TGF-β1은 적게 함유하고 있음을 의미한다.
따라서, ciMSC 유래 엑소좀의 사이토카인을 통해서 선천성 면역세포의 침윤 및 활성화를 통해서 암세포의 성장을 억제할 수 있음을 예측할 수 있다.
실험예 12. ciMSC 유래 엑소좀을 이용한 대장암 동물 실험
실험예 12.1. ciMSC 유래 엑소좀 단독 투여
ciMSC 유래 엑소좀 단독 투여시 항암 효과를 확인하기 위해 대장암 마우스에 엑소좀을 단독으로 용량별로 투여하였다. 대장암 세포는 상기 실시예 6.1.과 같이 제작하고, 대장암 마우스는 상기 실시예 6.2.와 같이 준비하였다.
순화기간 중 건강한 동물을 선발하여 세포주 접종을 실시하였다. 그 후, 세포주를 이식한 부위의 종양 크기가 약 100 mm3에 도달하였을 때, 종양의 크기에 따라 각 군의 종양 크기가 최대한 균일하게 분포하도록 분배하였다. 투여는 도 18a에 나타낸 바와 같이 진행하였다. 구체적으로, 시험물질은 저용량(5x108 ptc/200μl), 중간 용량(1.5x109 ptc/200μl), 고용량(5x109 ptc/200μl)을 매일 또는 2일에 한 번, 총 6번 정맥투여하였다. 군분리일 또는 시험물질 투여개시일(Day 0) 이후부터 주 3회 종양 발생여부를 확인하였고, 종양의 크기를 측정하였다. 종양 크기는 상기 실시예 6.4.와 같이 측정하였다.
그 결과, 도 18b에 나타낸 것과 같이, 처리 간격에 상관없이 IEP-01i'의 용량 의존적으로 CT26에 대한 항암효과가 나타남을 확인할 수 있었다. 또한, IEP-01i' 역시 단일 투여로서 CT26 종양 모델에서 의미 있는 항암 효과를 나타냄을 확인하였다.
또한, 도 18c 내지 도 18i에 나타낸 것과 같이, 처리 간격에 상관없이 IEP-01i'의 용량 의존적으로 CT26에 대한 항암효과가 나타남을 확인할 수 있었으며, 특히 고용량 처리 그룹에서 일부 개체는 완전 관해를 보임을 확인하였다.
실험예 12.2. ciMSC 유래 엑소좀 병용 투여
엑소좀 단독 또는 면역관문억제제와의 병용 투여시 항암 효과를 확인하기 위해 대장암 마우스에 항-PD-1 항체, IEP-01 및 IEP-01i를 단독 또는 병용 처리하였다. 실험은 상기 실험예 12.1과 동일하게 수행하였다.
투여는 도 19a에 나타낸 바와 같이 진행하였다. 항-PD-1 항체는 5 mg/kg으로 복강투여, IEP-01(WJ-MSC 유래 엑소좀) 또는 IEP-01i(ciMSC 유래 엑소좀)는 5x108 ptc/200 μl으로 정맥투여 방식으로 각 시험동물에 일주일에 세 번씩, 총 6번 처리하였다. 군분리일 또는 시험물질 투여개시일(Day 0) 이후부터 주 3 회 종양 발생 여부를 확인하였고, 종양의 크기를 측정하였다.
그 결과, 도 19b에 나타낸 것과 같이, IEP-01 또는 IEP-01i를 단독 처리한 그룹에서 항암 효과가 일부 나타났다. 뿐만 아니라, IEP-01 또는 IEP-01i과 항-PD-1 항체와의 병용처리 그룹에서 항암 효과가 현저함을 확인하였다. 일부 마우스 개체에서 각 치료에 의해 완전 관해가 관찰되었으며, 특히 IEP-01 또는 IEP-01i와 항-PD-1 항체와의 병용처리 그룹에서 가장 많은 완전 관해(complete response; CR)가 관찰되었다. 완전 관해가 관찰되었던 마우스 모델에서는 CT26 암세포를 다시 주입하였을 때, 암세포가 자라나지 못하는 것을 관찰하였으며, 이는 각 처리에 의해 치료된 개체에서 면역학적 메모리가 형성되었음을 의미한다.
또한, 도 19c 내지 19i에 나타낸 것과 같이, CT26 대장암 동물 모델 개체별 종양 성장을 모니터링한 결과, 개체별로 편차가 있으나, 확실한 종양 성장 억제를 보임을 확인하였다.
실험예 13. ciMSC 유래 엑소좀을 이용한 흑색종 동물 실험
ciMSC 유래 엑소좀 단독 또는 병용 투여시 항암 효과를 확인하기 위해 흑색종 마우스에 항-PD-1 항체 및 IEP-01i을 단독 또는 병용 처리하였다.
흑색종 마우스는 동결 마우스 종양 세포주(B16F10 cell line)를 사용하였다는 것을 제외하고는 상기 실시예 6.1.과 동일하게 제작하였다. 또한, 상기 실시예 6.2.와 동일하게 실험을 준비하였다.
순화기간 중 건강한 동물을 선발하여 세포주 접종을 실시한 뒤, 세포주를 이식한 부위의 종양 크기가 약 100 mm3에 도달하였을 때, 종양의 크기에 따라 각 군의 종양 크기가 최대한 균일하게 분포하도록 분배하였다. 투여는 도 20a에 나타낸 바와 같이 진행하였다. 항-PD-1 항체는 5 mg/kg로 복강투여, IEP-01i는 5x108 ptc/200 μl으로 정맥투여 방식으로 각 시험동물에 일주일에 세 번씩, 2주간, 총 6번 처리하였다. 군분리일 또는 시험물질 투여개시일(Day 0) 이후에는 주 3 회 종양 발생 여부를 확인하였고, 종양의 크기를 측정하였다.
그 결과, 도 20b에 나타낸 것과 같이, IEP-01i 및 항-PD-1 항체를 각각 처리하였을 경우, B16F10의 종양 크기가 감소하였으며, 병용 처리하였을 경우에는 단일 처리한 그룹보다 종양 억제가 현저하였음을 확인하였다.
또한, 도 20c 내지 도 20i에 나타낸 것과 같이, IEP-01i 및 항-PD-1 항체 단독 처리 또는 병용 처리한 그룹에서 종양의 성장 속도가 더디어지는 개체들이 다수 관찰되었다. 또한, PBS를 처리한 그룹의 경우 다수의 마우스가 사망에 이른 반면(3/7), IEP-01 및 항-PD-1 항체 단독 또는 병용처리 그룹에서는 사망에 이르는 개체의 수가 더 적었음을 확인하였다(IEP-01i 단독; 2/7, 항-PD-1 항체 단독; 1/7, IEP-01i 와 항-PD-1 항체 병용; 1/7).
실험예 14. ciMSC 유래 엑소좀을 이용한 췌장암 동물 실험
ciMSC 유래 엑소좀 단독 또는 병용 투여시 항암 효과를 확인하기 위해 췌장암 마우스에 항-PD-1 항체 및 IEP-01i을 단독 또는 병용 처리하였다.
췌장암 마우스는 하기와 같이 제작된 동결 마우스 종양 세포주(Pan-02 cell line)를 사용하였다는 것을 제외하고는 동일하게 준비되었다.
세포주 준비는 동결 마우스 종양 세포주(Pan-02 cell line) 1 vial을 열 불활성화된 10% FBS(fetal bovine serum, Gibco, 10082-147)가 들어있는 RPMI1640 배지를 세포배양용 플라스크에 넣고 37℃ 5% CO2 인큐베이터에서 배양하였다. PBS를 이용하여 세척하고, 2.5% Trypsin-EDTA(Gibco, 15090)를 10 배 희석하였다. 그 후, 이를 첨가하여 세포를 분리한 후, 원심분리(1,000 rpm, 5 분)하여 상층액을 버린 뒤, 새로운 배지로 세포 부유액을 수득하였다. 현미경을 이용하여 생존력을 확인한 다음, 5.0 x 106 cells/mL의 농도로 배지와 매트리겔을 1 : 1로 섞은 용액에 희석하여 세포주를 준비하였다.
순화기간 중 건강한 동물을 선발하여 세포주 접종을 실시한 뒤, 세포주를 이식한 부위의 종양 크기가 약 100 mm3에 도달하였을 때, 종양의 크기에 따라 각 군의 종양 크기가 최대한 균일하게 분포하도록 분배하였다. 투여는 도 20a에 나타낸 바와 같이 진행하였다. 항-PD-1 항체는 15 mg/kg으로 복강투여, IEP-01i'는 1 x 1010 ptc/200 μl으로 정맥투여 방식으로 각 시험동물에 일주일에 세 번씩, 2주간, 총 6번 처리하였다. 군분리일 또는 시험물질 투여개시일(Day 0) 이후부터 주 3회 종양 발생 확인 및 종양의 크기를 측정하였다.
그 결과, 도 21b 내지 도 21f에 나타낸 것과 같이, 항-PD-1 항체를 처리한 그룹은 Vehicle(PBS)을 처리한 음성대조군 그룹과 종양 성장 속도에서 거의 차이가 나지 않았으나, IEP-01i' 단독 처리한 그룹은 췌장암 종양 성장 속도를 현저히 늦추는 것을 확인하였다. 또한, IEP-01i'과 항-PD-1 항체를 병용 처리한 그룹에서 췌장암 종양이 가장 많이 저해됨을 확인하였다.
이러한 결과는, IEP-01i'이 항-PD-1 항체와 같은 면역관문억제제에 잘 반응하지 않은 췌장암과 같은 고형암종에서도 종양 성장을 효과적으로 억제할 수 있음을 의미한다.
실험예 15. IEP-01 내 poly IC 포함 평가
엑소좀(IEP-01) 정제 후 정제 공정 전/후의 샘플에 대해 poly IC 피크가 검출되는지 HPLC를 이용하여 분석하였다.
그 결과, 도 22a 내지 22c에 나타낸 것과 같이, 단순히 배지에 섞여 있는 poly IC의 경우 정제공정을 거치면서 모두 제거됨을 확인하였으나, IEP-01의 경우에는 정제공정을 거치더라도 여전히 poly IC 가 검출되었다.
이러한 결과는, IEP-01 내부에 poly IC 가 포함되어 있음을 의미하는 것으로, Naive 엑소좀과의 비교결과에서도 IEP-01 에서만 poly IC 가 존재함을 의미한다.
실험예 16. 화학 물질 칵테일 처리된 ciMSC 유래 엑소좀에 존재하는 miRNA 분석
마크로젠의 Affymetrix miRNA 4.0 service를 이용하여 엑소좀에 존재하는 miRNA를 분석하였다.
구체적으로, 엑소좀 시료에 포함되어 있는 miRNA를 추출하여 라이브러리를 제작한 후에 시퀀싱을 수행하였다. 이를 통하여 얻어진 서열 정보를 기존의 miRbase 데이터베이스와 비교함으로써 각각의 엑소좀 시료에서 상대적으로 더 많이 발현하는 miRNA를 분석하고 그 결과를 도 23에 나타내었다. Ctrl_Exo은 아무것도 처리하지 않은 ciMSC에서 수득한 엑소좀이고, 3 chem Exo는 3 chem을 처리한 ciMSC에서 수득한 엑소좀, 2 chem Exo는 2 chem을 처리한 ciMSC에서 수득한 엑소좀이다.
각각의 엑소좀에 존재하는 miRNA 종류 및 이의 발현 강도를 측정한 결과를 하기 표 4에 기재하였다.
| Transcript ID(Array Design) |
Ctrl Exo |
3 chem Exo |
2 chem Exo |
| hsa-miR-574-5p |
2.431340 |
10.242110 |
11.253710 |
| hsa-miR-6086 |
4.905830 |
10.407030 |
1.620650 |
| hsa-miR-4701-3p |
3.464640 |
8.666940 |
9.709270 |
| hsa-miR-3149 |
0.854740 |
6.039780 |
8.705470 |
| hsa-miR-4743-5p |
6.657570 |
11.590950 |
11.714050 |
| hsa-miR-8075 |
5.973260 |
10.838260 |
11.220240 |
| hsa-miR-6880-5p |
5.401840 |
10.000900 |
5.018530 |
| hsa-miR-3148 |
1.299280 |
5.893540 |
7.617760 |
| hsa-miR-6780b-5p |
6.760150 |
11.072200 |
9.817130 |
| hsa-miR-6846-5p |
6.528900 |
10.589760 |
10.657420 |
| hsa-mir-320e |
6.245890 |
10.228630 |
10.101240 |
| hsa-miR-32-3p |
1.483410 |
5.424420 |
7.875170 |
| hsa-miR-642a-3p |
7.378470 |
10.459880 |
10.819200 |
| hsa-miR-4505 |
10.281990 |
13.026020 |
12.986160 |
| hsa-miR-595 |
2.434340 |
5.102860 |
8.189200 |
| hsa-miR-4487 |
4.401570 |
6.858980 |
5.015790 |
| hsa-miR-4721 |
6.131810 |
8.575690 |
7.869180 |
| hsa-miR-7151-3p |
3.061450 |
5.424420 |
5.955770 |
| hsa-miR-4484 |
10.642280 |
12.915840 |
11.641950 |
| hsa-miR-642b-3p |
6.809470 |
9.076000 |
10.405250 |
| ENSG00000239154 |
3.881070 |
6.112830 |
5.860120 |
| hsa-miR-4706 |
7.523010 |
9.646450 |
7.645370 |
| hsa-miR-6126 |
10.413740 |
12.388690 |
12.388690 |
| hsa-miR-378h |
3.627520 |
5.496800 |
4.926410 |
| hsa-miR-6849-5p |
3.703310 |
5.424420 |
7.195840 |
| hsa-miR-7844-5p |
1.371450 |
3.089640 |
6.132980 |
| hsa-miR-4535 |
4.702010 |
6.373170 |
6.373170 |
| hsa-mir-9-1 |
2.941450 |
4.552650 |
5.270960 |
| hsa-miR-4459 |
8.104580 |
9.663110 |
8.935170 |
| hsa-miR-4443 |
5.790840 |
7.230830 |
12.209800 |
| hsa-miR-6732-5p |
9.461700 |
10.722030 |
11.155110 |
| hsa-miR-3064-5p |
2.513040 |
3.733250 |
4.466610 |
| hsa-miR-3178 |
10.666070 |
11.761590 |
12.505970 |
| hsa-miR-3135b |
10.625810 |
11.636710 |
11.807040 |
| hsa-miR-4717-3p |
3.551030 |
4.180980 |
7.376090 |
| hsa-miR-206 |
1.761700 |
2.084930 |
4.191640 |
| hsa-miR-4529-3p |
2.432770 |
2.432770 |
6.025090 |
| hsa-miR-3613-5p |
2.030240 |
1.363560 |
4.762030 |