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WO2023053994A1 - 幹細胞の製造方法 - Google Patents

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WO2023053994A1
WO2023053994A1 PCT/JP2022/034609 JP2022034609W WO2023053994A1 WO 2023053994 A1 WO2023053994 A1 WO 2023053994A1 JP 2022034609 W JP2022034609 W JP 2022034609W WO 2023053994 A1 WO2023053994 A1 WO 2023053994A1
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WO
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cells
stem cells
blood
producing
blood cells
Prior art date
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Ceased
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PCT/JP2022/034609
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English (en)
French (fr)
Inventor
剛士 田邊
健太 須藤
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I Peace Inc
Original Assignee
I Peace Inc
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Publication date
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Priority to JP2023551310A priority patent/JP7758307B2/ja
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    • C12N5/0696Artificially induced pluripotent stem cells, e.g. iPS
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    • C12N5/06Animal cells or tissues; Human cells or tissues
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    • C12N5/0634Cells from the blood or the immune system
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    • C12N2500/30Organic components
    • C12N2500/42Organic phosphate, e.g. beta glycerophosphate
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    • C12N2501/125Stem cell factor [SCF], c-kit ligand [KL]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
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    • C12N2501/00Active agents used in cell culture processes, e.g. differentation
    • C12N2501/20Cytokines; Chemokines
    • C12N2501/23Interleukins [IL]
    • C12N2501/2302Interleukin-2 (IL-2)
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    • C12N2510/00Genetically modified cells

Definitions

  • the present invention relates to cell technology, and to a method for producing stem cells.
  • T cells derived from hematopoietic stem cells play an important role in immunity.
  • T cells express a wide variety of T cell receptors (TCRs) on their surface.
  • TCR diversity is brought about by V(D)J gene rearrangements. The VJ gene rearrangement is shown in FIG.
  • DN1 double negative 1 cells, which are progenitor cells of T cells, proliferate in response to interleukin-7 (IL-7) and c-kit ligand (KL), which are strongly expressed in the cortical subcapsular region of the thymus.
  • IL-7 interleukin-7
  • KL c-kit ligand
  • a TCR comprises a variable (V) region and a constant (C) region.
  • V regions are highly diverse and form binding sites with antigens.
  • the V region gene exists in the germline DNA divided into the V gene, D (diversity) gene, and J (joining) gene, and in the process of differentiation into T cells, these become V-(D)-J. It is rearranged in one string on the chromosome and becomes a phenotypic gene.
  • J genes include JP1 gene, JP gene, J1 gene, JP2 gene, and J2 gene.
  • TCR ⁇ type T cells TCR consists of ⁇ and ⁇ chains.
  • TCR ⁇ type T cells TCR consists of ⁇ chain and ⁇ chain. The branching decision to become TCR ⁇ -type T cells or TCR ⁇ -type T cells is controlled by the silencer regions present in the TCR ⁇ locus and the TCR ⁇ locus.
  • TCR ⁇ type T cells are fewer than TCR ⁇ type T cells, but they occupy the majority in the epithelial intercellular lymphocyte population in the intestinal mucosa.
  • TCR ⁇ -type T cells sense various stresses that damage cells and induce immune responses.
  • TCR ⁇ type T cells are said to sense changes in properties associated with canceration of cells in addition to external stresses such as bacterial and viral infections.
  • TCR ⁇ type T cells proliferate and activate after recognizing intermediate products in mevalonate metabolism in the cholesterol synthesis pathway of antigen-presenting cells (APC) and isopentenyl pyrophosphate (IPP) as antigens. Therefore, cancer immunotherapy is performed in which a patient's TCR ⁇ T cells are activated outside the body and returned to the body.
  • APC antigen-presenting cells
  • IPP isopentenyl pyrophosphate
  • Patent Document 1 it has been proposed to induce iPS cells with reconstituted ⁇ -TCR genes by reprogramming blood cells stimulated with zoledronic acid (see Patent Document 1, for example).
  • Patent Document 1 it has been reported that iPS cells induced by this method do not reconstitute the ⁇ -TCR gene having the J1/J2 gene (see, for example, Non-Patent Document 1).
  • One of the objects of the present invention is to provide a method for efficiently inducing stem cells having a reconstituted ⁇ -TCR gene.
  • a method for producing stem cells according to an aspect of the present invention comprises applying phosphorylation to blood cells; deriving stem cells from blood cells.
  • the phosphate may be an intermediate or final product of the non-mevalonate pathway.
  • the phosphate may be (E)-4-hydroxy-3-methyl-2-butenyl diphosphate.
  • the above method for producing stem cells may further include applying interleukin to blood cells.
  • the interleukin may be at least one selected from the group consisting of IL-2, IL-15, and IL-23.
  • the blood cells may be mononuclear cells.
  • the stem cells may be iPS cells.
  • an inducer RNA may be introduced into blood cells in inducing stem cells from blood cells.
  • a Sendai virus vector may be used in inducing stem cells from blood cells.
  • a stealth RNA vector may be used in inducing stem cells from blood cells.
  • the stem cells may comprise a ⁇ -TCR rearrangement gene.
  • a method for producing blood cells according to an aspect of the present invention includes preparing stem cells produced by the method for producing stem cells described above, and inducing blood cells from the stem cells.
  • the blood cells may be ⁇ T cells.
  • cell clusters of stem cells may be seeded on feeder cells.
  • the feeder cells may be interstitial cells (stromal cells).
  • Stromal cells may be derived from bone marrow.
  • the stromal cells may be OP9 cells.
  • FIG. 4 is a schematic diagram showing VJ gene rearrangement. 4 is a graph showing the number of colonies of induced stem cells according to Example 1 and Comparative Example 1.
  • FIG. 1 is a photograph of induced stem cells according to Example 1.
  • FIG. 1 is a photograph of induced stem cells according to Example 1.
  • FIG. 1 is a photograph showing the result of PCR analysis of genomes of induced stem cells according to Example 1 and Comparative Example 1.
  • FIG. 1 is a photograph of immunostained cells according to Example 1.
  • FIG. 1 is a photograph of immunostained cells according to Example 1.
  • FIG. 1 is a photograph of immunostained cells according to Example 1.
  • FIG. 1 is a photograph of immunostained cells according to Example 1.
  • FIG. 1 is a dot plot by a flow cytometer showing the results of Example 1.
  • FIG. 4 is a photograph of cells according to Example 2.
  • FIG. 4 is a photograph of cells according to Example 2.
  • FIG. 4 is a photograph of cells according to Example 2.
  • a method for producing stem cells includes applying phosphorylation to blood cells and inducing stem cells from the blood cells.
  • Stem cells are, for example, induced pluripotent stem cells (iPS cells).
  • Blood cells may be human-derived or non-human animal-derived. Blood cells are separated from the blood. Blood includes, but is not limited to, peripheral blood and umbilical cord blood. Blood may be collected from an adult or from a minor. Anticoagulants such as ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA), heparin, and biological standard blood storage solution A (ACD-A) solution may be used during blood collection.
  • EDTA ethylenediaminetetraacetic acid
  • ACD-A biological standard blood storage solution A
  • Blood cells are, for example, nucleated cells such as monocytes, neutrophils, eosinophils, basophils, and lymphocytes, and do not include red blood cells, granulocytes, and platelets.
  • Blood cells may be, for example, endothelial progenitor cells, blood stem/progenitor cells, T cells, or B cells.
  • T cells may be, for example, ⁇ T cells or ⁇ T cells. Blood cells need not be ⁇ T cells.
  • the phosphate may be an intermediate or final product of the non-mevalonate pathway.
  • the non-mevalonate pathway is a synthetic pathway for isopentenyl pyrophosphate (IPP) that does not go through mevalonate.
  • IPP isopentenyl pyrophosphate
  • Examples of non-mevalonate pathway intermediates include 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate (DOXP), 2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate (MEP), 4-diphosphocytidyl-2 -C-methylerythritol (CDP-ME), 4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol-2-phosphate (CDP-MEP), 2-C-methyl-D-erythritol-2,4-cyclo pyrophosphate (MEcPP), and (E)-4-hydroxy-3-methyl-2-butenyl diphosphate (HMB-PP).
  • DOXP 1-de
  • the phosphorylation may be added to the medium for culturing the blood cells.
  • concentration of phosphorylation in the medium is, for example, 1 ⁇ mol/L or more and 50 ⁇ mol/L or less, 3 ⁇ mol/L or more and 20 ⁇ mol/L or less, or 5 ⁇ mol/L or more and 12 ⁇ mol/L or less.
  • the blood cells may be cultured for 1 day or more, 2 days or more, or 3 days or more in the medium supplemented with phosphorylation.
  • Blood cells may be cultured in medium supplemented with phosphate for 14 days or less, 10 days or more, or 7 days or more.
  • Interleukin may also be applied to blood cells.
  • Examples of interleukins include IL-2, IL-15, and IL-23.
  • interleukin When applying interleukin to blood cells, interleukin may be added to the medium for culturing blood cells.
  • concentration of interleukin in the medium is, for example, 5 ng/mL or more and 100 ng/mL or less, 10 ng/mL or more and 90 ng/mL or less, or 15 ng/mL or more and 80 ng/mL or less.
  • Blood cells may be cultured for 1 or more days, 2 or more days, or 3 or more days in a medium supplemented with interleukin.
  • the blood cells may be cultured in medium supplemented with interleukin for 14 days or less, 10 days or more, or 7 days or more.
  • Phosphate and interleukin may be applied simultaneously to blood cells.
  • Phosphate may be applied after applying interleukin to blood cells.
  • Examples of media for culturing blood cells include, but are not limited to, RPMI1640 medium, minimum essential medium ( ⁇ -MEM), Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM), and F12 medium.
  • an inducer is introduced into the blood cells to which at least phosphorylation has been applied to induce stem cells from the blood cells.
  • induction refers to reprogramming, reprogramming, transformation, cell fate reprogramming, and the like.
  • the inducer introduced into blood cells may be RNA.
  • RNA may be mRNA.
  • Inducers include, for example, OCT3/4, SOX2, KLF4, and c-MYC.
  • OCT3/4 modified M 3 O may be used.
  • the inducer is LIN28A, FOXH1, LIN28B, GLIS1, p53-dominant negative, p53-P275S, L-MYC, NANOG, DPPA2, DPPA4, DPPA5, ZIC3, BCL-2, E-RAS, TPT1, SALL2, NAC1 , DAX1, TERT, ZNF206, FOXD3, REX1, UTF1, KLF2, KLF5, ESRRB, miR-291-3p, miR-294, miR-295, NR5A1, NR5A2, TBX3, MBD3sh, TH2A, TH2B, and P53DD may be at least one selected from RNAs for these inducers are available from TriLink.
  • Inducer RNAs are pseudouridine ( ⁇ ), 5-methyluridine (5meU), N1-methylpseudouridine (me1 ⁇ ), 5-methoxyuridine (5moU), 5-hydroxymethyluridine (5hmU), 5-formyluridine.
  • 5fU 5-carboxymethyl ester uridine (5camU), thienoguanosine (thG), N4-methylcytidine (me4C), 5-methylcytidine (m5C), 5-methoxytidine (5moC), 5-hydroxymethylcytidine (5hmC ), 5-hydroxycytidine (5hoC), 5-formcytidine (5fC), 5-carboxycytidine (5caC), N6-methyl-2-aminoadenosine (m6DAP), diaminopurine (DAP), 5-methyluridine (m5U ), 2′-O-methyluridine (Um or m2′-OU), 2-thiouridine (s2U), and N6-methyladenosine (m6A) may be modified with at least one selected from the group consisting of .
  • the inducer RNA may be polyadenylated.
  • RNA may be prepared by polyadenylation of in vitro transcribed (IVT) RNA.
  • IVT in vitro transcribed
  • RNA may be polyadenylated during IVT by using a DNA template encoding poly(A) ends.
  • RNA may be capped. To maximize the efficiency of expression in cells, it is preferred that most RNA molecules contain a cap.
  • the RNA may have a 5'cap[m7G(5')ppp(5')G] structure.
  • the sequence is a sequence that stabilizes RNA and promotes transcription. 5'triphosphate may be removed from RNA having 5'triphosphate by dephosphorylation treatment.
  • RNA may have [3'O-Me-m7G(5')ppp(5')G] as Anti-Reverse Cap Analog (ARCA).
  • ARCA is a sequence that is inserted before the start of transcription, doubling the efficiency of the RNA being transcribed.
  • the RNA may have a PolyA tail.
  • the RNA of the inducer may be a replicative RNA having self-proliferation ability.
  • Replicative RNA is RNA having the ability to self-replicate, and unlike normal RNA, it also has the ability to express proteins necessary for RNA replication.
  • the replicative RNA is derived from the Venezuelan equine encephalitis (VEE) virus, an alphavirus.
  • VEE Venezuelan equine encephalitis
  • Replicative RNA sequences include alphavirus replicon RNA, Eastern Equine Encephalitis virus (EEE), Venezuelan Equine Encephalitis virus (VEE), Everglades virus, Mucambo virus, Pixuna virus, and Western It may comprise a sequence obtained from an alphavirus selected from the group consisting of equine encephalitis virus (WEE).
  • EEE Eastern Equine Encephalitis virus
  • VEE Venezuelan Equine Encephalitis virus
  • Everglades virus a sequence obtained from an alphavirus selected from the group consisting of equine encephalitis virus (WEE).
  • replicative RNA includes Sindbis virus, Semliki Forest virus, Middelburg virus, Chikungunya virus, O'nyong-nyong virus, and Ross River virus.
  • Barmah Forest virus, Getah virus, Sagiyama virus, Bebaru virus, Mayaro virus, Una virus, Aura virus, Whataroa virus , Babanki virus, Kyzylagach virus, Highlands J virus, Fort Morgan virus, Ndumu virus, and Buggy Creek virus. may contain a sequence obtained from
  • Replicative RNA for example, from 5' to 3', (VEE RNA replicase) - (promoter) - (RF1) - (self-cleaving peptide) - (RF2) - (self-cleaving peptide) - ( RF3) - (IRES or core promoter) - (RF4) - (IRES or any promoter) - (VEE 3'UTR and poly A tail) - (optionally selectable marker) - Contains the promoter.
  • RF1-4 described above are factors that induce dedifferentiation of somatic cells into pluripotent cells.
  • RF2-3, RF3-4, and RF4 above are optional.
  • RF1-4 are OCT3/4, KLF4, SOX-2, c-MYC, LIN28A, LIN28B, GLIS1, FOXH1, p53-dominant negative, p53-P275S, L-MYC, NANOG, DPPA2, DPPA4, DPPA5, ZIC3, BCL-2, E-RAS, TPT1, SALL2, NAC1, DAX1, TERT, ZNF206, FOXD3, REX1, UTF1, KLF2, KLF5, ESRRB, miR-291-3p, miR-294, miR-295, NR5A1, It may be selected from the group consisting of NR5A2, TBX3, MBD3sh, TH2A, and TH2B.
  • the method of introducing the inducer into blood cells is arbitrary.
  • vectors may be used to introduce inducers into blood cells.
  • the inducer may be introduced into blood cells by lipofection.
  • Sendai virus can be used as a vector.
  • Sendai virus is a virus whose genome is RNA and belongs to the family Paramyxoviridae of the order Mononegavirales.
  • the Sendai virus has an RNA genome and an envelope consisting of a lipid bilayer membrane encapsulating the RNA.
  • CytoTune (registered trademark, Invitrogen) can be used as a Sendai virus loaded with inducer RNA.
  • the Sendai virus vector may be a Sendai virus vector with improved persistence of infection.
  • a Sendai virus vector with improved persistence of infection is also called a stealth RNA vector.
  • SRV iPSC-1 Vector, SRV iPSC-2 Vector, SRV iPSC-3 Vector, and SRV iPSC-4 Vector (registered trademark, Tokiwa Bio Co., Ltd.) can be used as stealth RNA vectors. Details of the stealth RNA vector are described in Japanese Patent No. 4478788, Japanese Patent No. 4936482, Japanese Patent No. 5633075, and Japanese Patent No. 5963309.
  • the index of Sendai virus titer includes the multiplicity of infection (MOI).
  • the MOI of Sendai virus is, for example, 0.1 to 100.0, or 1.0 to 50.0.
  • An inducer may be introduced into blood cells that have been adherently cultured, or an inducer may be introduced into blood cells that have been suspension-cultured in a gel medium.
  • Blood cells into which an inducer is introduced may be cultured feeder-free using a basement membrane matrix such as Matrigel (Corning), CELLstart (registered trademark, ThermoFisher), or Laminin511 (iMatrix-511, nippi).
  • a basement membrane matrix such as Matrigel (Corning), CELLstart (registered trademark, ThermoFisher), or Laminin511 (iMatrix-511, nippi).
  • a stem cell medium such as a human ES/iPS medium such as Stemfit (Ajinomoto) can be used.
  • the stem cell medium is not limited to this, and various stem cell medium can be used.
  • Primate ES Cell Medium, mTeSR1, and TeSR2 (STEM CELL Technologies) may be used.
  • a stem cell culture medium is placed, for example, in a dish, well, tube, or the like.
  • the gel medium does not contain growth factors such as basic fibroblast growth factor (bFGF).
  • the gel medium contains growth factors such as bFGF at low concentrations of 400 ⁇ g/L or less, 40 ⁇ g/L or less, or 10 ⁇ g/L or less.
  • the gel medium does not contain TGF- ⁇ , or contains TGF- ⁇ at a low concentration of 600 ng/L or less, 300 ng/L or less, or 100 ng/L or less.
  • the gel medium does not have to be stirred. Also, the gel medium may not contain feeder cells.
  • the gel medium may contain at least one substance selected from the group consisting of cadherin, laminin, fibronectin, and vitronectin.
  • the cells After introducing the inducer into the blood cells, the cells may be initialized in a liquid medium other than the gel medium, or the cells may be initialized in the gel medium.
  • the cells introduced with the inducer are collected, and at least one passaging is performed by seeding at least a portion of the collected and mixed cells in a culture medium.
  • clones of inducer-introduced cells may be mixed.
  • different clones of inducer-introduced cells may be mixed.
  • the cells into which the inducer has been introduced may be recovered, and at least a portion of the recovered and mixed cells may be seeded in a culture medium for subculturing, which may be performed multiple times.
  • the inducer-introduced cells may be harvested, and at least a portion of the harvested mixed cells may be seeded in culture medium and passaged until stem cells are established. In addition, all of the collected mixed cells may be seeded in the medium.
  • recovering the inducer-introduced cells and seeding at least a portion of the recovered and mixed cells in a medium for passage means, for example, that the inducer-introduced cells are subjected to gene expression state It means to pass without distinction.
  • cells introduced with an inducer may be seeded in the same culture vessel without being differentiated by gene expression state.
  • recovering the inducer-introduced cells and seeding at least a portion of the recovered and mixed cells in a medium for passaging means, for example, that the inducer-introduced cells are subjected to the degree of reprogramming. It means to pass without distinction.
  • at passaging cells introduced with an inducer may be seeded in the same culture vessel without being differentiated by the degree of reprogramming.
  • recovering the inducer-introduced cells and seeding at least a portion of the recovered and mixed cells in a medium for passage means, for example, distinguishing the inducer-introduced cells by morphology It means to pass without For example, at passaging, the inducer-introduced cells may be seeded in the same culture vessel without being differentiated by morphology.
  • recovering the inducer-introduced cells and seeding at least a portion of the recovered and mixed cells in a culture medium for passage means, for example, size-discriminating the inducer-introduced cells. It means to pass without For example, at passaging, the inducer-introduced cells may be seeded in the same culture vessel without size discrimination.
  • recovering the inducer-introduced cells and seeding at least a portion of the recovered and mixed cells in a medium for passage means passaging without cloning the inducer-introduced cells. It means to For example, when passage without cloning, it is not necessary to pick up colonies formed by cells into which the inducer has been introduced. For example, when passaging without cloning, multiple colonies formed by cells into which an inducer has been introduced may not be separated from each other. For example, during passaging, cells forming different colonies may be mixed and seeded in the same culture vessel. Also, for example, when passage without cloning, it is not necessary to clone a single colony formed by cells into which an inducer has been introduced. For example, at passaging colonies may be mixed and seeded in the same culture vessel.
  • the adherently cultured cells may be collected, and at least a portion of the collected and mixed cells may be seeded in a medium for passage.
  • cells may be detached from a culture vessel and at least a portion of the detached and mixed cells may be seeded into the same culture vessel.
  • the cells may be detached from the incubator with a detachment solution, and the detached and mixed whole cells may be passaged.
  • non-colony forming cells may be passaged.
  • the cells When passaging the inducer-introduced cells, the cells may be seeded in a medium or incubator at a low concentration.
  • the low concentration is, for example, 1 cell/cm 2 or more, 0.25 ⁇ 10 4 cells/cm 2 or less, 1.25 ⁇ 10 3 cells/cm 2 or less, 0.25 ⁇ 10 3 cells/cm 2 or less. cm 2 or less, 0.25 ⁇ 10 2 cells/cm 2 or less, or 0.25 ⁇ 10 1 cells/cm 2 or less.
  • low concentration means that 10 or less, 9 or less, 8 or less, 7 or less, 6 or less, 5 or less, 4 or less, 3 or less, or 2 or less cells can contact each other. It is a concentration at which 11 or more cells do not come into contact with each other.
  • the state in which the entire bottom surface of the cell container is covered with cells is 100% confluent, and low concentration means 5% or less confluent, 4% or less confluent, 3% or less confluent, 2% or less confluent, 1% or less confluent, 0 0.5% confluent, 0.1% confluent, 0.05% confluent, or 0.01% confluent.
  • the low concentration is, for example, a concentration at which single cells do not contact each other in seeded cells.
  • wells of a well plate may be seeded with single cells.
  • a well plate may be a 12-well plate or a 96-well plate.
  • the proportion of cells in which Sendai virus remains is, for example, 4% or less, 3% or less, 2% or less, 1% or less, 0.5% or less, or 0%.
  • Cells into which an inducer has been introduced may be cultured and passaged in a closed incubator.
  • a closed incubator does not exchange, for example, gases, viruses, microorganisms and impurities with the outside.
  • the cells into which the inducer has been introduced may be expanded by two-dimensional culture, or expanded by three-dimensional culture.
  • the whole adherent cultured cells may be cryopreserved as stem cells.
  • whole cells detached from the incubator with a detachment solution may be cryopreserved as stem cells.
  • the whole cells in suspension culture may be cryopreserved as stem cells.
  • Induced stem cells can express undifferentiated cell markers such as Nanog, OCT4, and SOX2. Induced stem cells can express TERT. Induced stem cells may exhibit temoutherase activity.
  • stem cells have been induced from blood cells can be confirmed, for example, from the morphology of the cells.
  • induced stem cells can form flat-shouldered colonies similar to ES cells and express alkaline phosphatase.
  • whether or not stem cells were induced from blood cells can be determined by a cytoflow meter from cell surface markers TRA-1-60, TRA-1-81, SSEA-1, and SSEA5, which indicate undifferentiation. This may be done by analyzing whether at least one selected surface marker is positive.
  • TRA-1-60 is an iPS/ES cell specific antigen and is not detected in somatic cells. Since iPS cells can be generated only from the TRA-1-60 positive fraction, the TRA-1-60 positive cells are considered to be iPS cells.
  • Induced stem cells for example, have a ⁇ -TCR rearrangement gene.
  • a ⁇ -TCR rearranged gene is a TCR-encoding gene in which the TCR ⁇ region and the TCR ⁇ region have been rearranged.
  • the TCR ⁇ region includes V ⁇ -J ⁇ .
  • the TCR delta region includes V delta - D delta - J delta.
  • Induced stem cells are equipped with the ⁇ -TCR rearrangement genes, eg with the J1/J2 genes.
  • a method for producing blood cells includes preparing stem cells produced by the method for producing stem cells described above, and inducing blood cells from the stem cells.
  • the method of inducing blood cells from stem cells is not particularly limited.
  • the prepared cells are cultured for 4 days in a medium containing a GSK3 inhibitor such as CHIR99021, a bone morphogenetic protein such as BMP-4, and a growth factor such as VEGF. .
  • the cells are cultured for 2 days in a medium containing an ALK5 inhibitor such as SB431542, growth factors such as VEGF and bFGF, and stem cell factor (SCF).
  • the cells are cultured for 2 days in a medium containing growth factors such as VEGF, interleukins such as SCF, IL-3 and IL-6, cytokines such as Flt3L, and erythropoietin (EPO).
  • the cells are cultured in a medium containing SCF, interleukin such as IL-6, and EPO. This induces blood cells.
  • stem cells may be seeded on stromal cells and blood cells may be induced from the stem cells.
  • Stromal cells may be derived from bone marrow.
  • the stromal cells may be OP9 cells.
  • OP9 cells do not produce macrophage-stimulating factor (M-CSF) and function to support the differentiation of stem cells into blood cells.
  • M-CSF macrophage-stimulating factor
  • a stem cell colony is divided into a plurality of cell clumps, and the stem cell clumps are seeded on OP9 cells as feeder cells.
  • Blood cells are thereby induced from the stem cells. Blood cells that are induced are, for example, positive for CD34 and CD43.
  • the induced blood cells may be ⁇ type T cells.
  • Example 1 10 nmol/L (E)-4-hydroxy-3-methyl-2-butenyl diphosphate (HMBPP, Sigma-Aldrich®), 10% fetal bovine serum (Life Technologies), 1.0 ⁇ 10 ⁇ RPMI (Roswell Park Memorial Institute) 1640 medium (Gibco) containing 5 mol/L 2-mercaptoethanol (Nacalai Tesque), 100 U/mL penicillin, and 100 ⁇ g/mL streptomycin (Life Technologies) as HMBPP-containing medium prepared.
  • HMBPP E-4-hydroxy-3-methyl-2-butenyl diphosphate
  • Human peripheral blood mononuclear cells were added to the medium, and the medium containing about 1 ⁇ 10 6 mononuclear cells was placed in a 24-well plate (Day 1). Medium was supplemented with 1 ⁇ L of 20 ⁇ g/mL IL-2 daily. Medium with cells was harvested from the plates on day 3, the medium was centrifuged and the supernatant removed. After that, 2 mL of fresh HMBPP-containing medium was added to the cells and 1 mL was added to 2 wells of a 24-well plate.
  • Fresh HMBPP-containing medium was added to the medium containing the cells collected from the 96-well plate on day 7 and placed in a 6-well plate. On the 8th, 10th, and 12th days, a stem cell medium (Stem Fit, Ajinomoto) was added, and then the medium was replaced with the stem cell medium.
  • a stem cell medium Ste Fit, Ajinomoto
  • FIG. 2 A photograph of the established iPS cells is shown in FIG.
  • genomic DNA was extracted from the iPS cells and analyzed by PCR and electrophoresis to determine whether or not they contained the reconstructed V ⁇ 9 gene.
  • Genomic DNA of ⁇ T cells was analyzed as a positive control, and the genome of iPS cells without the reconstructed V ⁇ 9 gene was similarly analyzed as a negative control.
  • FIG. 4 the iPS cells established in Example 1 were confirmed to have rearranged V ⁇ 9 genes with J1/J2 genes.
  • the established iPS cells were immunostained with antibodies against LIN28 and OCT3/4, which are pluripotent stem cell markers, the cells were positive for LIN28 and OCT3/4, as shown in FIG. Furthermore, when the established iPS cells were analyzed with a flow cytometer, they were TRA-1-60 positive as shown in FIG.
  • Comparative example 1 iPS cells were induced in the same manner as in Example 1, except that 5 ⁇ L of zoledronic acid (Zol, Sigma-Aldrich) was used instead of HMBPP in the HMBPP-containing medium. As shown in FIG. 2, in Tests 1 and 3 of Comparative Example 1, iPS cell colonies were not formed. In Test 2 of the comparative example, colonies of iPS cells were formed, but significantly less than in Test 2 of Example 1. As shown in FIG. 4, it was confirmed that the iPS cells established in Comparative Example 1 did not have the rearranged V ⁇ 9 gene with the J1/J2 gene.
  • zoledronic acid Zol, Sigma-Aldrich
  • Example 2 The iPS cell colonies prepared in Example 1 were detached from the culture vessel with 0.25% trypsin and 1 mg/mL collagenase IV, and divided into multiple cell clusters by pipetting. A culture vessel in which OP9 cells and OP9/DLL1 cells were cultured as feeder cells was prepared. OP9 and OP9/DLL1 cells were cultured in ⁇ -MEM medium supplemented with 20% fetal bovine serum (FBS). A plurality of cell clusters each consisting of iPS cells were seeded on the feeder cells.
  • FBS fetal bovine serum
  • FIG. 7 shows photographs of the iPS cells 5 days, 9 days, and 14 days after seeding the iPS cells on the feeder cells.
  • the iPS cells were observed to differentiate into blood progenitor cells.
  • FIG. 8 shows the results of analyzing the cells on the 14th day by flow cytometry. The cells were confirmed to be positive for blood cell markers CD34 and CD43.

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Abstract

本開示によれば、血液細胞にリン酸化物を適用することと、血液細胞から幹細胞を誘導することと、を含む、幹細胞の製造方法が提供される。リン酸化物が、非メバロン酸経路の中間生成物又は最終生成物であってもよい。リン酸化物が、(E)-4-ヒドロキシ-3-メチル-2-ブテニル二リン酸であってもよい。

Description

幹細胞の製造方法
 本発明は、細胞技術に関し、幹細胞の製造方法に関する。
 造血幹細胞に由来するT細胞は、免疫で重要な役割を果たしている。T細胞は、表面に多様性に富むT細胞受容体(TCR)を発現する。TCRの多様性は、V(D)J遺伝子再構成によりもたらされる。VJ遺伝子再構成を図1に示す。
 T細胞の前駆細胞であるDN1(double negative 1)細胞は、胸腺内の皮質被膜下領域に強く発現されるインターロイキン-7(IL-7)とc-kitリガンド(KL)に反応して増殖するとともに、CD25(interleukin-2 receptorα鎖)を発現し、DN2細胞になる。DN2細胞は、しだいにCD44発現を減少させて、DN3細胞になる。
 TCRは、可変(V)領域と定常(C)領域とを備える。V領域のアミノ酸配列は多様性に富み、抗原との結合部位を形成する。V領域遺伝子は、germline DNAにおいてはV遺伝子、D(diversity)遺伝子、及びJ(joining)遺伝子に分断されて存在し,T細胞へ分化する過程で、これらが、V-(D)-Jと染色体上でひとつながりに再構成され、発現型の遺伝子となる。なお、J遺伝子には、JP1遺伝子、JP遺伝子、J1遺伝子、JP2遺伝子、J2遺伝子がある。
 TCRβ及びTCRγ遺伝子座のV(D)J遺伝子再構成が起こったDN3細胞は、TCRαβ型T細胞か、TCRγδ型T細胞になる。TCRαβ型T細胞においては、TCRがα鎖とβ鎖からなる。TCRγδ型T細胞においては、TCRがγ鎖とδ鎖からなる。TCRαβ型T細胞となるか、TCRγδ型T細胞となるかの分岐決定は、TCRγ遺伝子座とTCRα遺伝子座に存在するサイレンサー領域における制御による。
 TCRγδ型T細胞は、TCRαβ型T細胞より少数であるが、腸粘膜における上皮細胞間リンパ球集団の中では、多数を占める。TCRγδ型T細胞は、細胞に傷害を与える様々なストレスを感知し、免疫反応を誘導する。TCRγδ型T細胞は、細菌感染やウイルス感染などの体外からのストレスの他に、細胞のガン化に伴う性質の変化を感知するといわれている。
 TCRγδ型T細胞は、抗原提示細胞(APC)のコレステロール合成経路のメバロン酸代謝における中間生成物や、イソペンテニルピロリン酸(IPP)を抗原として認識した後、増殖や活性化する。そのため、患者のTCRγδ型T細胞を体外で活性化させ、体内に戻す癌免疫療法が実施されている。しかし、TCRγδ型T細胞は、末梢血中に1から5%しか存在しないため、採血しても十分なTCRγδ型T細胞が得られないという問題がある。
 そのため、ゾレドロン酸で刺激した血液細胞を初期化して、再構成されたγδ―TCR遺伝子を有するiPS細胞を誘導することが提案されている(例えば、特許文献1参照。)。しかし、当該方法で誘導されたiPS細胞は、J1/J2遺伝子を有するγδ―TCR遺伝子が再構成されないことが報告されている(例えば、非特許文献1参照。)。
国際公開第2018/143243号
 本発明は、再構成されたγδ―TCR遺伝子を有する幹細胞を効率的に誘導する方法を提供することを目的の一つとする。
 本発明の態様に係る幹細胞の製造方法は、血液細胞にリン酸化物を適用することと、
 血液細胞から幹細胞を誘導することと、を含む。
 上記の幹細胞の製造方法において、リン酸化物が、非メバロン酸経路の中間生成物又は最終生成物であってもよい。
 上記の幹細胞の製造方法において、リン酸化物が、(E)-4-ヒドロキシ-3-メチル-2-ブテニル二リン酸であってもよい。
 上記の幹細胞の製造方法が、血液細胞にインターロイキンを適用することをさらに含んでいてもよい。
 上記の幹細胞の製造方法において、インターロイキンがIL-2、IL-15、及びIL-23からなる群から選択される少なくとも一つであってもよい。
 上記の幹細胞の製造方法において、血液細胞が、単核球であってもよい。
 上記の幹細胞の製造方法において、幹細胞が、iPS細胞であってもよい。
 上記の幹細胞の製造方法において、血液細胞から幹細胞を誘導することにおいて、誘導因子RNAを血液細胞に導入してもよい。
 上記の幹細胞の製造方法において、血液細胞から幹細胞を誘導することにおいて、センダイウイルスベクターを用いてもよい。
 上記の幹細胞の製造方法において、血液細胞から幹細胞を誘導することにおいて、ステルス型RNAベクターを用いてもよい。
 上記の幹細胞の製造方法において、幹細胞が、γδ-TCR再構成遺伝子を備えていてもよい。
 本発明の態様に係る血液細胞の製造方法は、上記の幹細胞の製造方法で製造された幹細胞を用意することと、幹細胞から血液細胞を誘導することと、を含む。
 上記の血液細胞の製造方法において、血液細胞が、γδ型T細胞であってもよい。
 上記の血液細胞の製造方法において、幹細胞から血液細胞を誘導することにおいて、幹細胞の細胞塊をフィーダー細胞上に播種してもよい。
 上記の血液細胞の製造方法において、フィーダー細胞が間質細胞(ストロマ細胞)であってもよい。間質細胞が骨髄由来であってもよい。間質細胞がOP9細胞であってもよい。
 本発明によれば、再構成されたγδ―TCR遺伝子を有する幹細胞を効率的に誘導する方法を提供可能である。
VJ遺伝子再構成を示す模式図である。 実施例1及び比較例1に係る誘導された幹細胞のコロニー数を示すグラフである。 実施例1に係る誘導された幹細胞の写真である。 実施例1に係る誘導された幹細胞の写真である。 実施例1及び比較例1に係る誘導された幹細胞のゲノムをPCRで解析した結果を示す写真である。 実施例1に係る免疫染色された細胞の写真である。 実施例1に係る免疫染色された細胞の写真である。 実施例1に係る免疫染色された細胞の写真である。 実施例1に係る免疫染色された細胞の写真である。 実施例1の結果を示すフローサイトメーターによるドットプロットである。 実施例2に係る細胞の写真である。 実施例2に係る細胞の写真である。 実施例2に係る細胞の写真である。 実施例2の結果を示すフローサイトメーターによるドットプロットである。
 以下、本発明の実施形態について詳細に説明する。なお以下の示す実施形態は、この発明の技術的思想を具体化するための例示をするものであって、この発明の技術的思想は構成部材の組み合わせ等を下記のものに特定するものではない。この発明の技術的思想は、特許請求の範囲において種々の変更を加えることができる。
 実施形態に係る幹細胞の製造方法は、血液細胞にリン酸化物を適用することと、血液細胞から幹細胞を誘導することと、を含む。幹細胞は、例えば、人工多能性幹細胞(iPS細胞)である。
 血液細胞はヒト由来であってもよいし、非ヒト動物由来であってもよい。血液細胞は、血液から分離される。血液は、例えば末梢血及び臍帯血であるが、これらに限定されない。血液は、成年から採取されてもよいし、未成年から採取されてもよい。採血の際には、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)、ヘパリン、及び生物学的製剤基準血液保存液A液(ACD-A)液等の抗凝固剤を用いてもよい。
 血液細胞は、例えば、単核球(Monocyte)、好中球、好酸球、好塩基球、及びリンパ球等の有核細胞であり、赤血球、顆粒球、及び血小板を含まない。血液細胞は、例えば血管内皮前駆細胞、血液幹・前駆細胞、T細胞、又はB細胞であってもよい。T細胞は、例えばαβT細胞であってもよいし、γδT細胞であってもよい。血液細胞は、γδT細胞でなくてもよい。
 リン酸化物が、非メバロン酸経路の中間生成物又は最終生成物であってもよい。非メバロン酸経路は、メバロン酸を経由しない、イソペンテニルピロリン酸(IPP)の合成経路である。非メバロン酸経路の中間生成物の例としては、1-デオキシ-D-キシルロース5-リン酸(DOXP)、2-C-メチル-D-エリスリトール4-リン酸(MEP)、4-ジホスホシチジル-2-C-メチルエリトリトール(CDP-ME)、4-ジホスホシチジル-2-C-メチル-D-エリトリトール-2-リン酸(CDP-MEP)、2-C-メチル-D-エリトリトール-2,4-シクロピロリン酸(MEcPP)、及び(E)-4-ヒドロキシ-3-メチル-2-ブテニル二リン酸(HMB-PP)が挙げられる。
 血液細胞にリン酸化物を適用する際には、血液細胞を培養する培地にリン酸化物を添加してもよい。培地中におけるリン酸化物の濃度は、例えば、1μmol/L以上50μmol/L以下、3μmol/L以上20μmol/L以下、あるいは5μmol/L以上12μmol/L以下である。リン酸化物を添加した培地で血液細胞を1日以上、2日以上、あるいは3日以上培養してもよい。リン酸化物を添加した培地で血液細胞を14日以下、10日以上、あるいは7日以上培養してもよい。
 血液細胞にインターロイキンをさらに適用してもよい。インターロイキンの例としては、IL-2、IL-15、及びIL-23が挙げられる。
 血液細胞にインターロイキンを適用する際には、血液細胞を培養する培地にインターロイキンを添加してもよい。培地中におけるインターロイキンの濃度は、例えば、5ng/mL以上100ng/mL以下、10ng/mL以上90ng/mL以下、あるいは15ng/mL以上80ng/mL以下である。インターロイキンを添加した培地で血液細胞を1日以上、2日以上、あるいは3日以上培養してもよい。インターロイキンを添加した培地で血液細胞を14日以下、10日以上、あるいは7日以上培養してもよい。
 血液細胞にリン酸化物を適用した後にインターロイキンを適用してもよい。血液細胞にリン酸化物とインターロイキンを同時に適用してもよい。血液細胞にインターロイキンを適用した後にリン酸化物を適用してもよい。
 血液細胞を培養する培地の例としては、RPMI1640培地、最小必須培地(α-MEM)、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、及びF12培地が挙げられるが、これらに限定されない。
 次に、少なくともリン酸化物を適用された血液細胞に誘導因子を導入して、血液細胞から幹細胞を誘導する。幹細胞を誘導することにおいて、誘導とは、リプログラミング、初期化、形質転換、及び細胞の運命変更(Cell fate reprogramming)等を指す。
 血液細胞に導入される誘導因子は、RNAであってもよい。RNAは、mRNAであってもよい。誘導因子は、例えば、OCT3/4、SOX2、KLF4、及びc-MYCを含む。誘導因子として、OCT3/4を改良したMOを使用してもよい。また、誘導因子は、LIN28A、FOXH1、LIN28B、GLIS1、p53-dominant negative、p53-P275S、L-MYC、NANOG、DPPA2、DPPA4、DPPA5、ZIC3、BCL-2、E-RAS、TPT1、SALL2、NAC1、DAX1、TERT、ZNF206、FOXD3、REX1、UTF1、KLF2、KLF5、ESRRB、miR-291-3p、miR-294、miR-295、NR5A1、NR5A2、TBX3、MBD3sh、TH2A、TH2B、及びP53DDからなる群から選択される少なくとも一つであってもよい。これらの誘導因子のRNAは、TriLinkから入手可能である。なお、ここでは遺伝子記号はヒトで記載しているが、大文字・小文字表記によって、種を制限することを意図するものではない。例えば、全て大文字表記していても、マウス又はラットの遺伝子を含むことを排除するものではない。ただし、実施例においては、実際に使用した生物種に則って、遺伝子記号を表記している。
 誘導因子のRNAは、プソイドウリジン(Ψ)、5-メチルウリジン(5meU)、N1-メチルシュードウリジン(me1Ψ)、5-メトキシウリジン(5moU)、5-ヒドロキシメチルウリジン(5hmU)、5-フォーミルウリジン(5fU)、5-カルボキシメチルエステルウリジン(5camU)、チエノグアノシン(thG)、N4-メチルシチジン(me4C)、5-メチルシチジン(m5C)、5-メチオキシチジン(5moC)、5-ヒドロキシメチルシチジン(5hmC)、5-ヒドロキシシチジン(5hoC)、5-フォルムシチジン(5fC)、5-カルボキシシチジン(5caC)、N6-メチル-2-アミノアデノシン(m6DAP)、ジアミノプリン(DAP)、5-メチルウリジン(m5U)、2’-O-メチルウリジン(Umまたはm2’-OU)、2-チオウリジン(s2U)、及びN6-メチルアデノシン(m6A)からなる群から選択される少なくとも1つで修飾されていてもよい。
 誘導因子のRNAは、ポリアデニル化されていてもよい。
 誘導因子のRNAは、インビトロで転写される(IVT)RNAのポリアデニル化によって調製されてもよい。RNAは、ポリ(A)末端をコードするDNAテンプレートを用いることによって、IVTの間にポリアデニル化されてもよい。RNAがキャッピングされてもよい。細胞における発現の効率性を最大化するために、大部分のRNA分子がキャップを含有することが好ましい。RNAは5’cap[m7G(5’)ppp(5’)G]構造を有していてもよい。当該配列はRNAを安定化させ、転写を促進させる配列である。5’triphosphateをもつRNAからは、脱リン酸化処理により5’triphosphateを取り除いてもよい。RNAはAnti-Reverse Cap Analog(ARCA)として[3’O-Me-m7G(5’)ppp(5’)G]を有していてもよい。ARCAは転写開始点より前に挿入される配列であり、転写されるRNAの効率は二倍となる。RNAはPolyAテールを有していてもよい。
 また、誘導因子のRNAは、自己増殖能を持つリプリケイティブRNAであってもよい。リプリケイティブRNAとは、自己増殖能を持つRNAであり、通常のRNAと異なり、RNAの複製に必要なタンパク質を発現させる能力を併せ持っている。リプリケイティブRNAはアルファウイルスの一種であるベネズエラ馬脳炎(VEE)ウイルス由来である。リプリケイティブRNAを細胞にトランスフェクションすると、誘導因子を作り続けるRNAを細胞に発現させることができるため、RNAを細胞に複数回導入することを省くことが可能となる。
 リプリケイティブRNAの配列は、アルファウイルスレプリコンRNA、東部ウマ脳炎ウイルス(EEE)、ベネズエラウマ脳炎ウイルス(VEE)、エバーグレーズ(Everglades)ウイルス、ムカンボ(Mucambo)ウイルス、ピクスナ(Pixuna)ウイルス、及び西部ウマ脳炎ウイルス(WEE)からなる群から選択されるアルファウイルスから得られる配列を含んでいてよい。
 また、リプリケイティブRNAは、シンドビス(Sindbis)ウイルス、セムリキ森林(Semliki Forest)ウイルス、ミデルブルグ(Middelburg)ウイルス、チクングニア(Chikungunya)ウイルス、オニョンニョン(O’nyong-nyong)ウイルス、ロスリバー(Ross River)ウイルス、バーマフォレスト(Barmah Forest)ウイルス、ゲタ(Getah)ウイルス、サギヤマ(Sagiyama)ウイルス、ベバル(Bebaru)ウイルス、マヤロ(Mayaro)ウイルス、ウナ(Una)ウイルス、アウラ(Aura)ウイルス、ワタロア(Whataroa)ウイルス、ババンキ(Babanki)ウイルス、Kyzylagachウイルス、ハイランドJ(Highlands J)ウイルス、フォートモーガン(Fort Morgan)ウイルス、ヌドゥム(Ndumu)ウイルス、及びバギークリーク(Buggy Creek)ウイルスからなる群から選択されるアルファウイルスから得られる配列を含んでいてよい。
 リプリケイティブRNAは、例えば、5’から3’に向かって、(VEE RNAレプリカーゼ)-(プロモーター)-(RF1)-(自己切断型ペプチド)-(RF2)-(自己切断型ペプチド)-(RF3)-(IRESもしくはコアプロモーター)-(RF4)-(IRESもしくは任意のプロモーター)-(任意に選択可能なマーカー)-(VEE 3’UTR及びポリAテール)-(任意に選択可能なマーカー)-プロモーターを含んでいる。上記のRF1-4は、多能性細胞への体細胞の脱分化を誘導する因子である。上記のRF2-3、RF3-4、RF4は任意である。上記のRF1-4は、OCT3/4、KLF4、SOX-2、c-MYC、LIN28A、LIN28B、GLIS1、FOXH1、p53-dominant negative、p53-P275S、L-MYC、NANOG、DPPA2、DPPA4、DPPA5、ZIC3、BCL-2、E-RAS、TPT1、SALL2、NAC1、DAX1、TERT、ZNF206、FOXD3、REX1、UTF1、KLF2、KLF5、ESRRB、miR-291-3p、miR-294、miR-295、NR5A1、NR5A2、TBX3、MBD3sh、TH2A、及びTH2Bからなる群から選択されてもよい。
 血液細胞に誘導因子を導入する方法は任意である。例えば、ベクターを用いて誘導因子を血液細胞に導入してもよい。リポフェクションにより誘導因子を血液細胞に導入してもよい。
 ベクターとして、センダイウイルス(Sev)を用いることができる。センダイウイルスは、モノネガウイルス目パラミクソウイルス科に属する、RNAをゲノムとするウイルスである。センダイウイルスは、RNAのゲノムと、RNAを内包する脂質二重膜からなるエンベロープと、を備える。
 誘導因子のRNAを搭載したセンダイウイルスとしては、CytoTune(登録商標、Invitrogen)が使用可能である。センダイウイルスベクターは、感染持続性を改善したセンダイウイルスベクターであってもよい。感染持続性を改善したセンダイウイルスベクターは、ステルス型RNAベクターとも呼ばれる。ステルス型RNAベクターとしては、SRV iPSC-1 Vector、SRV iPSC-2 Vector、SRV iPSC-3 Vector、SRV iPSC-4 Vector(登録商標、ときわバイオ株式会社)が使用可能である。ステルス型RNAベクターの詳細は、特許第4478788号公報、特許第4936482号公報、特許第5633075号公報、及び特許第5963309号公報に記載されている。
 センダイウイルスの力価(タイター)の指標としては、感染多重度(MOI)が挙げられる。センダイウイルスのMOIは、例えば、0.1から100.0、あるいは1.0から50.0である。
 接着培養されている血液細胞に、誘導因子を導入してもよいし、ゲル培地で浮遊培養されている血液細胞に、誘導因子を導入してもよい。
 誘導因子を導入される血液細胞は、Matrigel(Corning)、CELLstart(登録商標、ThermoFisher)、あるいはLaminin511(iMatrix-511、nippi)等の基底膜マトリックスを用いて、フィーダーフリーで培養してもよい。
 誘導因子を導入される血液細胞が培養される培地としては、例えば、Stemfit (Ajinomoto)等のヒトES/iPS培地等の幹細胞培地を使用可能である。
 ただし、幹細胞培地は、これに限定されず、種々の幹細胞培地が使用可能である。例えばPrimate ES Cell Medium、mTeSR1、及びTeSR2(STEMCELL Technologies)等を利用してもよい。幹細胞培地は、例えば、ディッシュ、ウェル、又はチューブ等に入れられる。
 ゲル培地は、例えば、basic fibroblast growth factor(bFGF)等の成長因子を含まない。あるいは、ゲル培地は、bFGF等の成長因子を、400μg/L以下、40μg/L以下、あるいは10μg/L以下の低濃度で含む。
 また、ゲル培地は、TGF-βを含まないか、TGF-βを600ng/L以下、300ng/L以下、あるいは100ng/L以下の低濃度で含む。
 ゲル培地は、撹拌されなくともよい。また、ゲル培地は、フィーダー細胞を含まなくともよい。
 ゲル培地は、カドヘリン、ラミニン、フィブロネクチン、及びビトロネクチンからなる群から選択される少なくとも1種の物質を含んでいてもよい。
 血液細胞へ誘導因子の導入を行った後、ゲル培地ではない液体培地中で細胞を初期化させてもよいし、ゲル培地中で細胞を初期化させてもよい。
 血液細胞に誘導因子を導入し、細胞を培養した後、誘導因子を導入された細胞を回収し、回収して混じり合った細胞の少なくとも一部を培地に播種する継代を少なくとも1回実行してもよい。継代することにおいて、誘導因子を導入された細胞のクローンどうしを混合してもよい。継代することにおいて、誘導因子を導入された細胞の異なるクローンどうしを混合してもよい。その後、誘導因子を導入された細胞を回収し、回収して混じり合った細胞の少なくとも一部を培地に播種して継代することを、複数回実施してもよい。幹細胞が樹立するまで、誘導因子を導入された細胞を回収し、回収した混じり合った細胞の少なくとも一部を培地に播種して継代してもよい。なお、回収した混じり合った細胞の全てを培地に播種してもよい。
 ここで、誘導因子を導入された細胞を回収し、回収して混じり合った細胞の少なくとも一部を培地に播種して継代するとは、例えば、誘導因子を導入された細胞を、遺伝子発現状態で区別することなく継代することをいう。例えば、継代時に、誘導因子を導入された細胞を、遺伝子発現状態で区別することなく、同じ培養器に播種してもよい。あるいは、誘導因子を導入された細胞を回収し、回収して混じり合った細胞の少なくとも一部を培地に播種して継代するとは、例えば、誘導因子を導入された細胞を、リプログラミングの程度で区別することなく継代することをいう。例えば、継代時に、誘導因子を導入された細胞を、リプログラミングの程度で区別することなく、同じ培養器に播種してもよい。
 あるいは、誘導因子を導入された細胞を回収し、回収して混じり合った細胞の少なくとも一部を培地に播種して継代するとは、例えば、誘導因子を導入された細胞を、形態で区別することなく継代することをいう。例えば、継代時に、誘導因子を導入された細胞を、形態で区別することなく、同じ培養器に播種してもよい。あるいは、誘導因子を導入された細胞を回収し、回収して混じり合った細胞の少なくとも一部を培地に播種して継代するとは、例えば、誘導因子を導入された細胞を、大きさ区別することなく継代することをいう。例えば、継代時に、誘導因子を導入された細胞を、大きさ区別することなく、同じ培養器に播種してもよい。
 またあるいは、誘導因子を導入された細胞を回収し、回収して混じり合った細胞の少なくとも一部を培地に播種して継代するとは、誘導因子を導入された細胞をクローニングすることなく継代することをいう。例えば、クローニングすることなく継代する場合、誘導因子を導入された細胞が形成するコロニーをピックアップしなくともよい。例えば、クローニングすることなく継代する場合、誘導因子を導入された細胞が形成する複数のコロニーを互いに分離しなくともよい。例えば、継代時に、複数の異なるコロニーを形成した細胞同士を混合して、同じ培養器に播種してもよい。また、例えば、クローニングすることなく継代する場合、誘導因子を導入された細胞が形成する単一のコロニーをクローニングしなくともよい。例えば、継代時に、コロニーどうしを混合して、同じ培養器に播種してもよい。
 例えば、誘導因子を導入された細胞が接着培養されている場合、接着培養されている細胞を回収し、回収して混じり合った細胞の少なくとも一部を培地に播種して継代してもよい。例えば、継代時に、培養器から細胞を剥離し、剥離して混じり合った細胞の少なくとも一部を同じ培養器に播種してもよい。例えば、剥離液で培養器から細胞を剥がし、剥がして混じり合った細胞全体を継代してもよい。例えば、コロニーを形成していない細胞を継代してもよい。誘導因子を導入された細胞が浮遊培養されている場合、浮遊培養されている細胞全体を継代してもよい。
 誘導因子を導入された細胞を継代する際、細胞は低濃度で培地あるいは培養器に播種されてもよい。ここで、低濃度とは、例えば、1cell/cm以上であり、0.25×10cells/cm以下、1.25×103cells/cm以下、0.25×10cells/cm以下、0.25×10cells/cm以下、あるいは0.25×10cells/cm以下である。あるいは、低濃度とは、10個以下、9個以下、8個以下、7個以下、6個以下、5個以下、4個以下、3個以下、あるいは2個以下の細胞同士が接触可能であり、11個以上の細胞同士が接触しない濃度である。なお、10個以下の細胞同士が接触した細胞塊が複数あってもよい。あるいは、細胞容器底面全体が細胞で覆われた状態を100%コンフルエントとして、低濃度とは、5%以下コンフルエント、4%以下コンフルエント、3%以下コンフルエント、2%以下コンフルエント、1%以下コンフルエント、0.5%以下コンフルエント、0.1%以下コンフルエント、0.05%以下コンフルエント、あるいは0.01%以下コンフルエントである。またあるいは、低濃度とは、例えば、播種された細胞においてシングルセル同士が接触しない濃度である。例えば、ウェルプレートのウェルに、シングルセルを播種してもよい。ウェルプレートは、12ウェルプレートや96ウェルプレートであってもよい。本発明者らの知見によれば、誘導因子を導入された細胞を継代する際、低濃度で細胞を培地に播種することにより、細胞から誘導される幹細胞におけるセンダイウイルスの残存を抑制することが可能である。誘導される幹細胞において、センダイウイルスが残存する細胞の割合は、例えば4%以下、3%以下、2%以下、1%以下、0.5%以下あるいは0%である。
 誘導因子を導入された細胞は、閉鎖された培養器内で培養され、継代されてもよい。閉鎖された培養器は、例えば、外部と気体、ウイルス、微生物及び不純物等の交換をしない。また、誘導因子を導入された細胞を二次元培養で拡大培養してもよいし、三次元培養で拡大培養してもよい。
 誘導因子を導入された細胞が幹細胞に誘導され、幹細胞が樹立された後、接着培養されている細胞全体を、幹細胞として凍結保存してもよい。例えば、剥離液で培養器から剥がれた細胞全体を幹細胞として凍結保存してもよい。また、誘導因子を導入された細胞が幹細胞に誘導された後、浮遊培養されている細胞全体を、幹細胞として凍結保存してもよい。
 誘導された幹細胞は、未分化細胞マー力一であるNanog、OCT4、及びSOX2等を発現し得る。誘導された幹細胞は、TERTを発現し得る。誘導された幹細胞は、テ口メラーゼ活性を示し得る。
 また、血液細胞から幹細胞が誘導されたか否かは、例えば、細胞の形態から確認することができる。例えば、誘導された幹細胞は、ES細胞に類似する肩平なコロニーを形成し、アルカリホスファターゼを発現し得る。あるいは、血液細胞から幹細胞が誘導されたか否かは、サイトフローメータで、未分化であることを示す細胞表面マーカーであるTRA-1-60、TRA-1-81、SSEA-1、及びSSEA5から選択される少なくとも一つの表面マーカーが陽性であるか否かを分析することにより行ってもよい。TRA-1-60は、iPS/ES細胞に特異的な抗原であり、体細胞では検出されない。iPS細胞はTRA-1-60陽性画分からのみできることから、TRA-1-60陽性細胞はiPS細胞と考えられる。
 誘導された幹細胞は、例えば、γδ-TCR再構成遺伝子を備えている。γδ-TCR再構成遺伝子とは、TCRγ領域及びTCRδ領域の再構成が生じた、TCRをコードする遺伝子である。TCRγ領域はVγ-Jγを含む。TCRδ領域は、Vδ―Dδ―Jδを含む。誘導された幹細胞は、例えば、J1/J2遺伝子を有するγδ―TCR再構成遺伝子を備えている。
 実施形態に係る血液細胞の製造方法は、上記の幹細胞の製造方法で製造された幹細胞を用意することと、幹細胞から血液細胞を誘導することと、を含む。
 幹細胞から血液細胞を誘導する方法は、特に限定されない、例えば、CHIR99021等のGSK3阻害剤、BMP-4等の骨形成タンパク質、VEGF等の成長因子を含む培地で、用意した細胞を4日間培養する。さらに、SB431542等のALK5阻害剤、VEGF及びbFGF等の成長因子、幹細胞因子(SCF)を含む培地で、細胞を2日間培養する。さらに、VEGF等の成長因子、SCF、IL-3及びIL-6等のインターロイキン、Flt3L等のサイトカイン、エリスロポエチン(EPO)を含む培地で細胞を2日間培養する。さらに、SCF、IL-6等のインターロイキン、EPOを含む培地で細胞を培養する。これにより、血液細胞が誘導される。
 あるいは、間質細胞(ストロマ細胞)上に幹細胞を播種して、幹細胞から血液細胞を誘導してもよい。間質細胞が骨髄由来であってもよい。間質細胞がOP9細胞であってもよい。OP9細胞は、マクロファージ刺激因子(M-CSF)を産生せず、幹細胞から血液細胞への分化を支持する機能を有する。例えば、幹細胞のコロニーを複数の細胞塊に分割し、幹細胞の細胞塊をフィーダー細胞としてのOP9細胞上に播種する。これにより、幹細胞から血液細胞が誘導される。誘導される血液細胞は、例えば、CD34とCD43が陽性である。
 誘導される血液細胞は、γδ型T細胞であってもよい。
 (実施例1)
 10nmol/Lの(E)-4-ヒドロキシ-3-メチル-2-ブテニル二リン酸(HMBPP、Sigma-Aldrich、登録商標)、10%のウシ胎児血清(Life Technologies)、1.0×10-5mol/Lの2-メルカプトエタノール(ナカライテスク)、100U/mLのペニシリン、及び100μg/mLのストレプトマイシン(Life Technologies)を含むRPMI(ロズウェルパーク記念研究所)1640培地(Gibco)をHMBPP含有培地として用意した。
 培地にヒト末梢血単核球を入れ、約1×106個の単核球を含む培地を24ウェルプレートに入れた(1日目)。培地には、毎日20μg/mLのIL-2を1μL添加した。3日目に細胞を含む培地をプレートから回収し、培地を遠心分離し、上清を除いた。その後、細胞に新しいHMBPP含有培地を2mL添加し、24ウェルプレートの2ウェルに1mLずつ入れた。
 6日目に細胞を含む培地をプレートから回収し、培地を遠心分離し、上清を除いた。その後、細胞にHMBPP含有培地を添加し、2×10個の単核球を含む培地を96ウェルプレートに入れた。CytoTune-iPS 2.0(Thermo Fisher)を用いて、細胞にKLF4、OCT3/4、SOX2、c-MYCを導入した。感染多重度(MOI)は、20から30になるよう調整した。
 7日目に96ウェルプレートから回収した細胞を含む培地に、新鮮なHMBPP含有培地を加え、6ウェルプレートに入れた。8日目、10日目、12日目に、幹細胞培地(Stem Fit、味の素)を添加し、その後は、幹細胞培地を用いて培地交換を行った。
 図2に示すように、14日目、iPS細胞の複数のコロニーが形成されたことを確認した。樹立したiPS細胞の写真を図3に示す。また、iPS細胞からゲノムDNAを抽出し、再構成されたVγ9遺伝子を有するかを、PCRと電気泳動により解析した。陽性コントロールとしてγδT細胞のゲノムDNA、陰性コントロールとして再構成されたVγ9遺伝子を有しないiPS細胞のゲノムを同様に解析した。その結果、図4に示すように、実施例1で樹立されたiPS細胞は、J1/J2遺伝子を有する再構成されたVγ9遺伝子を有することが確認された。
 また、樹立したiPS細胞を、多能性幹細胞のマーカーであるLIN28及びOCT3/4に対する抗体で免疫染色したところ、図5に示すように、細胞は、LIN28及びOCT3/4陽性を示した。さらに、樹立したiPS細胞を、フローサイトメーターで分析したところ、図6に示すように、TRA-1-60陽性であった。
 (比較例1)
 HMBPP含有培地のHMBPPを5μLのゾレドロン酸(Zol、Sigma-Aldrich)に変えた以外は、実施例1と同様の方法で、iPS細胞を誘導した。図2に示すように、比較例1の試験1、3では、iPS細胞のコロニーが形成されなかった。比較例の試験2では、iPS細胞のコロニーが形成されたが、実施例1の試験2と比較して顕著に少なかった。図4に示すように、比較例1で樹立されたiPS細胞は、J1/J2遺伝子を有する再構成されたVγ9遺伝子を有していないことが確認された。
 (実施例2)
 実施例1で用意したiPS細胞のコロニーを0.25%のトリプシンと1mg/mLのコラゲナーゼIVで培養器から剥離し、ピペッティングにより複数の細胞塊に分割した。フィーダー細胞としてOP9細胞とOP9/DLL1細胞が培養されている培養器を用意した。OP9細胞とOP9/DLL1細胞は、20%ウシ胎仔血清(FBS)が添加されたα-MEM培地で培養されていた。フィーダー細胞上に、それぞれiPS細胞からなる複数の細胞塊を播種した。
 iPS細胞をフィーダー細胞上に播種してから5日目、9日目、及び14日目の細胞の写真を図7に示す。iPS細胞が、血液前駆細胞に分化していく経過が観察された。また、14日目の細胞をフローサイトメトリーで分析した結果を図8に示す。細胞は、血液細胞のマーカーであるCD34とCD43が陽性であることが確認された。
 
 

Claims (14)

  1.  血液細胞にリン酸化物を適用することと、
     前記血液細胞から幹細胞を誘導することと、
     を含む、幹細胞の製造方法。
  2.  前記リン酸化物が、非メバロン酸経路の中間生成物又は最終生成物である、請求項1に記載の幹細胞の製造方法。
  3.  前記リン酸化物が、(E)-4-ヒドロキシ-3-メチル-2-ブテニル二リン酸である、請求項1に記載の幹細胞の製造方法。
  4.  前記血液細胞にインターロイキンを適用することをさらに含む、請求項1から3のいずれか1項に記載の幹細胞の製造方法。
  5.  前記インターロイキンがIL-2、IL-15、及びIL-23からなる群から選択される少なくとも一つである、請求項4に記載の幹細胞の製造方法。
  6.  前記血液細胞が、単核球である、請求項1から5のいずれか1項に記載の幹細胞の製造方法。
  7.  前記幹細胞が、iPS細胞である、請求項1から6のいずれか1項に記載の幹細胞の製造方法。
  8.  前記血液細胞から前記幹細胞を誘導することにおいて、誘導因子RNAを前記血液細胞に導入する、請求項1から7のいずれか1項に記載の幹細胞の製造方法。
  9.  前記血液細胞から前記幹細胞を誘導することにおいて、センダイウイルスベクターを用いる、請求項1から8のいずれか1項に記載の幹細胞の製造方法。
  10.  前記幹細胞が、γδ-TCR再構成遺伝子を備える、請求項1から9のいずれか1項に記載の幹細胞の製造方法。
  11.  請求項1から10のいずれか1項の記載の幹細胞の製造方法で製造された幹細胞を用意することと、
     前記幹細胞から血液細胞を誘導することと、
     を含む、血液細胞の製造方法。
  12.  前記血液細胞が、γδ型T細胞である、請求項11に記載の血液細胞の製造方法。
  13.  前記幹細胞から前記血液細胞を誘導することにおいて、前記幹細胞の細胞塊をフィーダー細胞上に播種する、請求項11又は12に記載の方法。
  14.  前記フィーダー細胞が間質細胞である、請求項13に記載の方法。
     
     
     
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ZHENG W. CHEN: "Immune biology of Ag-specific γδ T cells in infections", CELLULAR AND MOLECULAR LIFE SCIENCES, BIRKHäUSER-VERLAG, BA, vol. 68, no. 14, 11 June 2011 (2011-06-11), Ba , pages 2409 - 2417, XP019919474, ISSN: 1420-9071, DOI: 10.1007/s00018-011-0703-9 *

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