WO2018034298A1 - カルシウムインジケーターを有する遺伝子改変トリパノソーマ・クルージおよび抗トリパノソーマ薬のスクリーニングのためのその応用 - Google Patents
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Definitions
- the present invention is an application that enjoys the benefit of the priority of the US provisional application (US 62 / 375,622, filing date: 8/16/2017), the entirety of which is incorporated herein by reference.
- the present invention provides genetically modified trypanosoma cruzi having a calcium indicator and its application for screening for antitrypanosoma drugs.
- Trypanosoma cruzi is a parasitic protist that causes Chagas disease in Latin America.
- Two benznidazole and nifurtimox have been developed to date for the treatment of Chagas disease, but these often have serious side effects.
- these Chagas disease therapeutic agents are effective only in the acute phase, and their effects are limited.
- T. cruzi In Trypanosoma cruzi, it has been found that the mRNA expression of T. cruzi's IP 3 R homolog (TcIP 3 R) varies greatly in its life cycle (Non-patent Document 1). Moreover, it has been shown that T. cruzi cannot grow when the expression level of TcIP 3 R is reduced to half or less (Non-patent Document 1).
- the present invention provides genetically modified trypanosoma cruzi having a calcium indicator and its application for screening for antitrypanosoma drugs.
- the inventors of the present invention produced trypanosoma cruzi that expresses an intracellular calcium indicator and infected the cells.
- the trypanosoma cruzi changed its intracellular calcium ion concentration in a life cycle-dependent manner, and the cells It was found that the intracellular life cycle can be estimated from the calcium ion concentration in the cell.
- the inventors have also found that amastigotes exhibit a particularly high intracellular calcium ion concentration, and that amastigotes are effectively killed by reducing the intracellular calcium ion concentration.
- the present invention is based on these findings.
- the marker protein and M13 peptide may be fused in this order with or without a linker ⁇ .
- the fluorescent protein has a donor fluorescent protein portion and an acceptor fluorescent protein portion that cause fluorescence resonance energy transfer (FRET), and the calcium concentration can be detected by the ratio of the fluorescence intensity derived from the donor and the acceptor (for example, chameleon protein)
- FRET fluorescence resonance energy transfer
- a mammalian cell for example, a human cell containing the trypanosoma cruzi according to any one of (1) to (4) above at the stage of amastigote (amastigote or non-flagellate body).
- a second intracellular calcium indicator comprising a mammalian calmodulin, a myosin light chain kinase-derived peptide (M13 peptide) and a second fusion protein of a marker protein different from the marker protein in the Trypanosoma cruzi (5)
- the cell according to (5) further comprising (but not limited to, for example, a calcium concentration in Trypanosoma cruzi and a calcium concentration in mammalian cells (eg, human cells)).
- the cell according to (6) above, wherein the second intracellular calcium indicator is GECO, preferably G-GECO, B-GECO, R-GECO, GEX-GECO or GEM-GECO.
- the marker protein in the second intracellular calcium indicator has a donor fluorescent protein portion and an acceptor fluorescent protein portion that cause fluorescence resonance energy transfer (FRET), and the calcium concentration is a ratio of the fluorescence intensity derived from the donor and the acceptor.
- FRET fluorescence resonance energy transfer
- the cell according to (6) which can be detected by (for example, a chameleon protein).
- Screening method for antitrypanosome drug comprising the following steps: (A) a step of measuring the calcium ion concentration in the Trypanosoma cruzi according to any one of (1) to (4) above by detecting the intensity indicated by the marker; (B) contacting the test substance with the trypanosoma cruzi, (C) a step of selecting a substance whose calcium ion concentration in the Trypanosoma cruzi is reduced to a predetermined ratio or less by contact compared with the calcium ion concentration measured in (a) ⁇ where the specified ratio is 2 It is a numerical value of 1/3, 1/4, 1/4, or 1/5 or less ⁇ .
- a screening method for an antitrypanosoma drug that acts on amastigote of Trypanosoma cruzi including the following steps: (A-0) providing a mammalian cell (for example, a human cell) infected with the trypanosoma cruzi according to any one of (1) to (4) above, (A-1) measuring the calcium ion concentration of amastigote of Trypanosoma cruzi by detecting the intensity indicated by the marker, (B-1) contacting the test substance with the mammalian cell; (C-1) Compared with the calcium ion concentration measured in (a-1), a substance that reduces the calcium ion concentration in the amastigote of Trypanosoma cruzi in the mammalian cell by contact is selected by contact.
- A-0 providing a mammalian cell (for example, a human cell) infected with the trypanosoma cruzi according to any one of (1) to (4) above, (A-1) measuring the calcium ion concentration of amastigote of Try
- Step ⁇ the specified value is a concentration of 300 nM or less, 290 nM or less, 280 nM or less, 270 nM or less, 260 nM or less, 250 nM or less, 240 nM or less, 230 nM or less, 220 nM or less, 210 nM or less, 200 nM or less, or 150 nM or less, preferably Is in the range of 100 nM to 250 nM ⁇ .
- a mammalian cell has a second intracellular calcium indicator comprising a fusion protein of a marker protein different from a marker protein in a trypanosome cruzi, a calmodulin derived from a mammal, a myosin light chain kinase-derived peptide (M13 peptide)
- the marker protein in the intracellular calcium indicator in Trypanosoma cruzi has a donor fluorescent protein portion and an acceptor fluorescent protein portion that cause fluorescence resonance energy transfer (FRET), and the calcium concentration is the fluorescence intensity derived from the donor and the acceptor.
- FRET fluorescence resonance energy transfer
- the second intracellular calcium indicator is GECO, preferably G-GECO, B-GECO, R-GECO, GEX-GECO or GEM-GECO.
- the fluorescent protein in the second intracellular calcium indicator has a donor fluorescent protein part and an acceptor fluorescent protein part that cause fluorescence resonance energy transfer (FRET), and the calcium concentration is a ratio of the fluorescence intensity derived from the donor and the acceptor. (For example, it is a chameleon protein), and the method according to (11) above.
- the calcium indicator included in Trypanosoma cruzi exhibits any fluorescent color of red, orange, yellow, green, and blue in the presence of calcium, and the calcium indicator included in cells derived from mammals is calcium. The method according to any one of (9) to (15) above, which exhibits a fluorescent color different from the fluorescent color in the presence of.
- step c-1 a substance having an action of selectively reducing the fluorescence intensity of the calcium indicator included in the protozoan strain (for example, at a larger ratio) than the fluorescence intensity of the calcium indicator in mammalian cells is selected.
- An orange fluorescent protein for example, OFP, Kusterrorism, for example
- a red fluorescent protein for example, RFP, mcherry, mRuby2, DsRed, Azalea B5, red fluorescent mutagenesis cp (circular permutation) GFP, etc.
- red fluorescent protein for example, RFP, mcherry, mRuby2, DsRed, Azalea B5, red fluorescent mutagenesis cp (circular permutation) GFP, etc.
- green fluorescent proteins GFP, EGFP, mAG, mKG, KikG
- 22G 22G
- mWasabi cp (circular permutation) GFP, etc.
- blue fluorescent protein eg CFP, ECFP, BFP, EBFP, Kusterrorism Cyan, mBlueb ry, blue fluorescent mutation-introduced cp (cir
- the fluorescent protein has a donor fluorescent protein portion and an acceptor fluorescent protein portion that cause fluorescence resonance energy transfer (FRET), and the calcium ion concentration can be detected by a ratio of the fluorescence intensity derived from the donor and the acceptor (2A ) Trypanosoma cruzi.
- FRET fluorescence resonance energy transfer
- 5A A mammalian cell containing the trypanosoma cruzi according to any one of (1A) to (4A) above at the stage of amastigote (astigote or non-flagellate body).
- (6A) a second intracellular calcium indicator comprising a mammalian calmodulin, a myosin light chain kinase-derived peptide (M13 peptide) and a second fusion protein of a marker protein different from the marker protein in the Trypanosoma cruzi
- the cell according to (5A) further comprising: (7A) The cell according to (6A) above, wherein the second intracellular calcium indicator is GECO, preferably G-GECO, B-GECO, R-GECO, GEX-GECO or GEM-GECO.
- the marker protein in the second intracellular calcium indicator has a donor fluorescent protein portion and an acceptor fluorescent protein portion that cause fluorescence resonance energy transfer (FRET), and the calcium ion concentration is determined based on the fluorescence intensity derived from the donor and the acceptor.
- FRET fluorescence resonance energy transfer
- the cell according to (6A) which can be detected by a ratio.
- (9A) Screening method for antitrypanosome drug comprising the following steps: (A) a step of measuring the calcium ion concentration in the Trypanosoma cruzi according to any one of (1A) to (4A) above by detecting the intensity indicated by the marker; (B) contacting the test substance with the trypanosoma cruzi, (C) A step of selecting a substance having a calcium ion concentration in the Trypanosoma cruzi reduced to a specified ratio or less by contact as compared with the calcium ion concentration measured in (a).
- a screening method for an antitrypanosome drug that acts on amastigote of Trypanosoma cruzi comprising the following steps: (A-0) providing a mammalian cell (for example, human cell) infected with the trypanosoma cruzi according to any one of (1A) to (4A) above, (A-1) measuring the calcium ion concentration of amastigote of Trypanosoma cruzi by detecting the intensity indicated by the marker, (B-1) contacting the test substance with the mammalian cell; (C-1) Compared with the calcium ion concentration measured in (a-1), a substance that reduces the calcium ion concentration in the amastigote of Trypanosoma cruzi in the mammalian cell by contact is selected by contact.
- a mammalian cell for example, human cell
- a mammalian cell has a second intracellular calcium indicator comprising a fusion protein of a mammalian protein calmodulin, a myosin light chain kinase-derived peptide (M13 peptide) and a marker protein different from the marker protein in Trypanosoma cruzi
- M13 peptide myosin light chain kinase-derived peptide
- a marker protein different from the marker protein in Trypanosoma cruzi The method described in (10A) above, (12A) Any of (9A) to (11A) above, wherein the intracellular calcium indicator in Trypanosoma cruzi is GECO, preferably G-GECO, B-GECO, R-GECO, GEX-GECO or GEM-GECO The method described in 1.
- the marker protein in the intracellular calcium indicator in Trypanosoma cruzi has a donor fluorescent protein portion and an acceptor fluorescent protein portion that cause fluorescence resonance energy transfer (FRET), and the calcium ion concentration is determined from the donor-derived and acceptor-derived fluorescence.
- FRET fluorescence resonance energy transfer
- the fluorescent protein in the second intracellular calcium indicator has a donor fluorescent protein part and an acceptor fluorescent protein part that cause fluorescence resonance energy transfer (FRET), and the calcium ion concentration is determined from the donor-derived and acceptor-derived fluorescent intensities.
- FRET fluorescence resonance energy transfer
- the calcium indicator included in Trypanosoma cruzi exhibits any fluorescent color of red, orange, yellow, green, and blue in the presence of calcium, and the calcium indicator included in cells derived from mammals is calcium.
- the method according to any one of (9A) to (15A) above which exhibits a fluorescent color different from the fluorescent color in the presence of.
- step c-1 a substance having an action of selectively reducing the fluorescence intensity of the calcium indicator included in the protozoan strain as compared with the fluorescence intensity of the calcium indicator in mammalian cells is selected.
- the marker protein is derived from a red fluorescent protein, derived from an orange fluorescent protein, derived from a yellow fluorescent protein, derived from a green fluorescent protein, or derived from a blue fluorescent protein.
- FIG. 1A shows the calcium ion concentration in the body of Trypanosoma cruzi epimastigotes.
- FIG. 1A also shows the calcium ion concentration in the body of epimastigotes treated with 100 ⁇ M BAPTA-AM for 3 minutes.
- 20 epimastigotes were observed in each group, and the intracellular calcium ion concentration was estimated from the fluorescence intensity of expressed R-GECO1 and illustrated.
- the symbol “***” in the figure means that p ⁇ 0.001 in Student's t-test between the two groups.
- FIG. 1B shows the fluorescence intensity of R-GECO1 at each stage of a clone of Trypanosoma cruzi that expresses R-GECO1.
- FIG. 1B shows the fluorescence signal of R-GECO1 in epimastigote, tripomastigote and amastigote in normal medium, and the lower panel of FIG. 1B shows calcium ions and ionomycin in the medium. The fluorescence signal when is added is shown. The bar in the figure indicates 5 ⁇ m.
- FIG. 1C shows intracellular calcium ion concentration [Ca 2+ ] i in epimastigote (E), tripomastigote (T), and amastigote (A). The fluorescence intensity of 20 individuals in each group was measured. Statistical analysis was performed using one-way analysis of variance (one-way ANOVA) and Tukey's test, and the p-values were illustrated.
- FIG. 1C shows intracellular calcium ion concentration [Ca 2+ ] i in epimastigote (E), tripomastigote (T), and amastigote (A). The fluorescence intensity of 20 individuals in each group was measured.
- FIG. 2A is a fluorescence image of cells obtained by infecting 3T3-Swiss albino cells with R-GECO1-expressing tripomastigote and 84 hours after infection.
- the motion of the amastigote was recorded using a real-time confocal microscope (Nikon AIR) equipped with a 40 ⁇ dry type objective lens. Serial images were acquired at 15 minute intervals.
- FIG. 2A shows that one cell amastigote (indicated by the arrowhead) divides once, becomes two cells, divides twice, becomes four cells, and divides three times to become eight cells. Yes.
- FIG. 1 shows that one cell amastigote (indicated by the arrowhead) divides once, becomes two cells, divides twice, becomes four cells, and divides three times to become eight cells. Yes.
- FIG. 2B shows a bright-field image of cells severely infected with R-GECO1-expressing tripomastigotes (arrows) and tripomastigotes (arrowheads) in the left panel.
- This fluorescence image is the right panel of FIG. 2B.
- This representative microscope image was acquired using an inverted microscope (IX72; Olympus, Tokyo, Japan). A video of this field revealed that tripomastigotes move violently in this host cell.
- the bar in FIG. 2B represents 10 ⁇ m.
- FIG. 3A shows the relationship between the expression level of TcIP 3 R mRNA and the intracellular calcium ion concentration at each stage of Trypanosoma cruzi.
- FIG. 3A shows a tripomastigote
- A indicates an amastigote
- E indicates an epimastigote
- FIG. 3B shows intracellular calcium ion concentrations of R-GECO1 expressing wild type epimastigote and SKO strain epimastigote. In FIG. 3B, the fluorescence intensity of each 20 individuals was measured.
- FIG. 3C shows the intracellular calcium ion concentration of wild-type epimastigotes expressing R-GECO1 treated with 10 mM calcium chloride or 10 mM BAPTA for 2 hours. In FIG. 3C, the fluorescence intensity of each 20 individuals was measured.
- Trypanosoma cruzi is a kind of protozoa belonging to the genus Trypanosoma and is known as the cause of Chargas' disease, a zoonotic disease. Trypanosoma cruzi has a different environment in its life cycle, mainly in the form and metabolism of amastigote (non-flagellar), tripomastigote (conflagellate) and epimastigote (upper flagella) Can adapt to.
- the life cycle of Trypanosoma cruzi is broadly divided into an insect phase and a mammalian phase, and the mammalian phase is outlined as follows: When Tripomastigotes infect animals, they enter cells in the body; In cells, tripomastigotes become amastigotes; Amastigotes grow by division in cells; The amastigote in the proliferated cell becomes a tripomastigote again and breaks the cell and infects other cells, or enters the bloodstream and diffuses into the body.
- animal is used to include mammals, particularly humans.
- calcium indicator means a protein capable of detecting the calcium ion concentration in an aqueous solution.
- the calcium indicator can be used for estimating the calcium ion concentration from the fluorescence intensity by changing the fluorescence intensity depending on the concentration of calcium ions.
- intracellular calcium indicator means a calcium indicator suitable for estimation of intracellular calcium ion concentration.
- various indicators that emit a signal for example, light such as blue, green, and red fluorescence and luminescence
- the intracellular calcium indicator various indicators that emit a signal (for example, light such as blue, green, and red fluorescence and luminescence) depending on the intracellular calcium ion concentration are known, particularly those encoded by proteins. It is well known.
- Those skilled in the art can appropriately design the calcium indicator by connecting a calcium-binding peptide and a fluorescent protein via a linker.
- fluorescence resonance energy transfer means that when the spectrum of the fluorescence wavelength of the first fluorescence protein and the spectrum of the excitation light wavelength of the second fluorescence protein overlap, the two fluorescence proteins When approaching, when the first fluorescent protein is excited, the energy absorbed by the first fluorescent protein is used as the energy for exciting the second fluorescent protein, and the second fluorescent protein emits fluorescence. It is a phenomenon.
- the first fluorescent protein is called a donor protein (donor)
- the second fluorescent protein is called an acceptor protein (acceptor). It is considered that the FRET efficiency is remarkably improved when the distance between the donor protein and the acceptor protein is about 10 nm or less.
- FRET is well known to those skilled in the art as a technique for analyzing changes in protein-protein interactions. Specifically, in FRET, an interaction between proteins A and B can be detected by linking a donor protein to protein A and linking an acceptor protein to protein B. FRET is also used as a technique for analyzing changes in the relative positional relationship between domains in a molecule. For example, when a donor protein is linked to domain A and an acceptor protein is linked to domain B, and the conformation of the protein changes, the distance between the donor protein and the acceptor protein varies, causing a change in FRET efficiency. It is known that it can be.
- bioluminescence resonance energy transfer refers to the use of a bioluminescent protein instead of the first fluorescent protein as a donor in FRET, and when the donor protein and the acceptor protein are in close proximity, This is a phenomenon in which when a protein tries to bioluminescence, its energy is used as energy for excitation of the acceptor protein, and the acceptor protein emits fluorescence instead of the donor.
- An example of a bioluminescent protein is luciferase.
- fluorescent protein means a protein that emits fluorescence when excited by light having a specific wavelength. Usually, the fluorescence has a longer wavelength than the excitation light.
- a dichroic mirror is used to distinguish excitation light from fluorescence. The dichroic mirror reflects light of a specific wavelength, but has a property of transmitting light of other wavelengths.
- expression or “expressing” means that a protein is produced from a gene encoding the protein.
- vector refers to a nucleic acid molecule used for genetic recombination.
- the vector since gene transfer into E. coli is considered, the vector has a replication origin capable of self-replication in E. coli, a resistance gene for selecting transformed E. coli, and a foreign gene. Has an insertion site (for example, a multicloning site).
- protein expression vector means a vector used to express a protein in a cell. The protein expression vector usually has a promoter for expressing the protein in the cell and a poly A addition sequence. As protein expression vectors, plasmids are often used.
- genetic modification means that genetic information is artificially changed using genetic engineering.
- genetically modified animal is used to mean an animal having its genome modified and an animal having a target vector in its body without modifying its genome.
- fusion protein means a protein in which all or part of a protein is linked to all or part of another protein.
- the protein from which the fusion protein is derived may be two or more types, and is used to include, for example, a fusion protein in which all or part of the three types of proteins are linked as one polypeptide.
- the “calcium ion concentration” means the concentration of Ca 2+ that is calcium ions (that is, [Ca 2+ ]).
- the intracellular calcium ion concentration may be expressed as [Ca 2+ ] i.
- the inventors of the present invention produced trypanosoma cruzi that expresses an intracellular calcium indicator and infected the cells.
- the trypanosoma cruzi changed its intracellular calcium ion concentration in a life cycle-dependent manner, and the cells It was found that the intracellular life cycle can be estimated from the calcium ion concentration in the cell.
- the inventors have also found that amastigotes exhibit a particularly high intracellular calcium ion concentration, and that amastigotes are effectively killed by reducing the intracellular calcium ion concentration.
- a trypanosoma cruzi having an intracellular calcium indicator in the body. Trypanosoma cruzi greatly changes the intracellular calcium ion concentration depending on the life cycle, so it is possible to easily determine which life cycle the trypanosoma cruzi is by having an intracellular calcium indicator in the body.
- the indicator which contains the fluctuation range of the calcium ion in the body of Trypanosoma cruzi in the body among the calcium indicators developed widely can be used.
- the indicator includes 100 nM to 600 nM in the dynamic range, fluctuations in calcium ions in the body of Trypanosoma cruzi can be detected well.
- an indicator that includes a dynamic range in the range of 50 nM to 600 nM is suitable for determining whether a trypanosoma cruzi is an amastigote, an epimastigote, or a tripomastigote.
- an indicator that emits a specific signal in response to only the calcium ion concentration in the body of amastigote may be used, and such an indicator is suitable for detection of amastigote.
- An indicator that emits a specific signal in response to a calcium ion concentration of 510 nM or more, 520 nM or more, 530 nM or more, 540 nM or more, 550 nM or more is suitable for detection of amastigote.
- the intracellular calcium indicator may include a calmodulin derived from a mammal, a myosin light chain kinase-derived peptide (M13 peptide) and a fusion protein with a marker protein (hereinafter sometimes referred to as “the fusion protein of the present invention”).
- mammalian calmodulin binds to M13 peptide in a calcium ion concentration-dependent manner, and through this, the structure of the marker protein can be converted, and the function of the marker protein can be turned on / off.
- the marker protein a fluorescent protein or a photoprotein that can be easily imaged can be used. Examples of such fusion proteins include GCaMP and GECO.
- GCaMP that can be used in the present invention is not particularly limited, and examples thereof include GCaMP1.6, GCaMP2, GCaMP3 (for example, SEQ ID NO: 1), and GCaMP6f, 6m, and 6s.
- marker proteins for example, calmodulin
- marker protein and M13 peptide may be fused in this order with or without a linker.
- M13 peptide, EGFP (149-238), linker (GGTGGS), EGFP (1-144), linker (TR), and calmodulin (2-148) were linked from the N-terminal side.
- Calmodulin and M13 peptide are dissociated in a low calcium ion concentration environment where calmodulin shows no structural change, and EGFP can fluoresce, but when calmodulin binds to calcium, it interacts with M13 peptide. As a result, the structure of EGFP is distorted so that fluorescence cannot be emitted.
- a fusion protein in which M13 peptide, EGFP, and calmodulin are linked in this order, or calmodulin, EGFP, and M13 peptide are linked in this order can emit specific fluorescence depending on intracellular calcium ion concentration.
- calmodulin, EGFP, and M13 peptide are linked in this order
- various intracellular calcium indicators could be produced.
- GFP also has a luminophore in the center of one ⁇ -helix, surrounded by 11 anti-parallel ⁇ -sheets, stabilizing the ⁇ -helix and generating stable fluorescence. I am letting.
- GFP emission and quenching can be controlled by converting the structure of the ⁇ -sheet portion surrounding the ⁇ -helix in the same manner using M13 peptide and calmodulin.
- a person skilled in the art will be able to produce a fusion protein that emits specific fluorescence in a calcium ion concentration-dependent manner by combining calmodulin, a fluorescent protein, and an M13 peptide.
- the marker protein is, for example, Derived from red fluorescent protein (eg, RFP, mcherry, mRuby2, DsRed, Azalea B5, red fluorescent mutagenesis cp (circular permutation) GFP, etc.); Derived from a yellow fluorescent protein (YFP, EYFP, Ypet, TurboYFP, Venus, mVenus, Topaz, etc.) derived from an orange fluorescent protein (eg, OFP, Kusecuring Orange, mKO, mKO2, mOrange, etc.); Derived from green fluorescent protein (GFP, EGFP, mAG, mKG, KikG, 22G, mWasabi, cp (circular permutation) GFP, etc .; or It can be derived from a blue fluorescent protein (for example, CFP, ECFP, BFP, EBFP, Kusterrorism Cyan, mBlueberry, blue fluorescent mutagenesis cp (circular permutation)
- GECO that can be used in the present invention is not particularly limited.
- G-GECO for example, a protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2
- B-GECO for example, the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 3 Protein
- GEX-GECO eg, a protein having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 4
- GEM-GECO eg, a protein having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 5
- R-GECO eg, And a protein having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 6
- the present invention also has a donor fluorescent protein portion and an acceptor fluorescent protein portion that cause fluorescence resonance energy transfer (FRET) as the fusion protein, and the calcium ion concentration can be detected by the ratio of the fluorescence intensity derived from the donor and the acceptor.
- FRET fluorescence resonance energy transfer
- Proteins can be used.
- the fusion protein further has a donor fluorescent protein portion and an acceptor fluorescent protein portion that cause bioluminescence resonance energy transfer (BRET), and the calcium ion concentration can be detected by a ratio of the fluorescence intensity derived from the donor and the acceptor. Proteins can be used.
- BRET bioluminescence resonance energy transfer
- Proteins can be used.
- Such a protein is not particularly limited, and chameleon can be used.
- Chameleon has blue fluorescent protein (CFP) and yellow fluorescent protein (YFP) as donor fluorescent protein part and acceptor fluorescent protein part that cause fluorescence resonance energy transfer (FRET), respectively, which are linked by calmodulin and M13 peptide. Fusion protein.
- CFP blue fluorescent protein
- YFP yellow fluorescent protein
- FRET fluorescence resonance energy transfer
- those skilled in the art can produce a protein having a donor fluorescent protein portion and an acceptor fluorescent protein portion that generate FRET, and capable of detecting the calcium ion concentration by the ratio of the fluorescence intensity derived from the donor and the acceptor.
- This can be used in the present invention.
- a protein having a donor photoprotein portion and an acceptor fluorescent protein portion that causes bioluminescence resonance energy transfer (BRET) and capable of detecting the calcium ion concentration by the ratio of the fluorescence intensity from the donor and the acceptor is also known to those skilled in the art. If it can be produced, it can be used in the present invention.
- FRET or BRET can be efficiently induced by selecting the donor protein and the acceptor fluorescent protein so that the emission wavelength of the donor protein overlaps with the excitation wavelength of the acceptor fluorescent protein.
- a gene expression vector can be obtained as a vector for expressing a fusion protein by operably linking the fusion protein to a promoter that enables gene expression.
- the fusion protein may be introduced by introducing a gene encoding the fusion protein into the Trypanosoma cruzi genome.
- the genetically modified trypanosoma cruzi having the intracellular calcium indicator containing the fusion protein of the present invention in the body may be referred to as “the genetically modified trypanosoma cruzi of the present invention”.
- a mammalian cell (hereinafter referred to as “mammalian cell of the present invention”) containing trypanosoma cruzi (in the stage of amastigote) having the fusion protein of the present invention in the body.
- mammalian cell of the present invention containing trypanosoma cruzi (in the stage of amastigote) having the fusion protein of the present invention in the body.
- Such mammalian cells are considered useful for screening and development of antitrypanosoma drugs.
- the mammalian cell can be, for example, a human cell.
- the mammalian cell of the present invention may have the fusion protein of the second invention different from the fusion protein of the first invention of Trypanosoma cruzi.
- the fusion protein of the second invention fluoresces at a wavelength different from that of the first fusion protein, so that the calcium ion concentration of trypanosoma cruzi and the calcium ion concentration of mammalian cells are visually observed. And may be distinguished from each other. By doing so, it is possible to estimate the calcium ion concentration in Trypanosoma cruzi and to easily estimate the calcium ion concentration in mammalian cells.
- a method for screening an antitrypanosoma drug comprising the following steps: (A) a step of measuring the calcium ion concentration in the genetically modified trypanosoma cruzi of the present invention by detecting the intensity indicated by the marker protein, (B) a step of bringing the test substance into contact with the Trypanosoma cruzi, and (c) the calcium ion concentration in the Trypanosoma cruzi is reduced to a specified ratio or less by contact as compared with the calcium ion concentration measured in (a). A step of sorting the deposited material is provided.
- the calcium ion concentration can be measured by detecting the intensity (for example, fluorescence intensity in the case of a fluorescent protein) indicated by the marker protein contained in the fusion protein of the present invention.
- the relationship between the strength indicated by the marker protein and the calcium ion concentration may be determined by preparing a calibration curve in advance, and the calcium ion concentration may be estimated from the strength indicated by the marker protein based on the obtained calibration curve. .
- the test substance is a candidate for an antitrypanosoma drug (for example, an antitrypanosoma cruzi drug).
- the test substance may be permeable or non-permeable to the cell membrane of Trypanosoma cruzi.
- the specified ratio may be a numerical value equal to or less than one half, one third, one fourth, or one fifth.
- a method for screening an antitrypanosoma drug that acts on amastigote of Trypanosoma cruzi comprising the steps of: (A-0) providing a mammalian cell (eg, human cell) of the present invention, (A-1) a step of detecting the intensity of the marker protein to measure the calcium ion concentration of amastigote of Trypanosoma cruzi, (B-1) contacting the test substance with the mammalian cell; (C-1) Compared with the calcium ion concentration measured in (a-1), a substance that reduces the calcium ion concentration in the amastigote of Trypanosoma cruzi in the mammalian cell by contact is selected by contact.
- a process is provided.
- the mammalian cell of the present invention can be prepared as described above.
- the mammalian cell may have the fusion protein of the second invention in the cell as described above.
- the calcium ion concentration can be measured by detecting the intensity indicated by the marker protein contained in the fusion protein of the present invention (for example, fluorescence intensity in the case of a fluorescent protein).
- the relationship between the strength indicated by the marker protein and the calcium ion concentration may be determined by preparing a calibration curve in advance, and the calcium ion concentration may be estimated from the strength indicated by the marker protein based on the obtained calibration curve. .
- the test substance is a candidate for an antitrypanosoma drug (for example, an antitrypanosoma cruzi drug).
- the test substance may be permeable or non-permeable to the cell membrane of Trypanosoma cruzi.
- a substance obtained by reducing the calcium ion concentration in the trypanosoma cruzi to a predetermined value or less by contact is an antitrypanosoma drug ( For example, it is screened as an anti-trypanosoma cruzi drug).
- the specified value is a concentration of 300 nM or less, 290 nM or less, 280 nM or less, 270 nM or less, 260 nM or less, 250 nM or less, 240 nM or less, 230 nM or less, 220 nM or less, 210 nM or less, 200 nM or less, or 150 nM or less, preferably , In the range of 100 nM to 250 nM.
- the calcium ion concentration in Trypanosoma cruzi is set higher than the calcium ion concentration in the mammalian cell.
- the substance to be selectively reduced can be selected in the above (c-1).
- Example 1 Relationship between Trypanosoma Life Cycle and Intracellular Calcium Ion Concentration
- T. Cruzi in which the calcium indicator R-GECO1 was forcibly expressed was prepared, and T. Cruzi life cycle and intracellular The relationship with calcium ion concentration was investigated.
- R-GECO1 gene expression vector The R-GECO1 gene was obtained by PCR amplification using the pCMV-R-GECO1 plasmid vector (Addgene, plasmid 45494) as a template.
- a primer Forward primer: 5'- CACC ATGGTCGACCTTCACGTCGTA-3 'SEQ ID NO: 7
- Reverse primer 5'-CTACTTCGCTGTCATCATTTGTAC-3 'SEQ ID NO: 8
- the CACC sequence indicated by the underline of the forward primer is a sequence necessary for cloning into a vector described later.
- PCR amplification by-products were cloned into pENTR / D-TOPO (Life Technologies, Rockville, MD) vector.
- the obtained plasmid was converted into a pTREX vector containing a neomycin resistance gene and modified with the Gateway Vector Conversion System (pTREX (neo R ) -GW; Life Technologies) to obtain pTREX (neo R ) -GW / R-GECO1 .
- This vector has been cloned into a T. cruzi pTREX vector that drives protein expression with a ribosome promoter (see Vazquez, MP & Levin, MJ, Gene, 239, 217-225, 1999), allowing constitutive expression of the protein. .
- Stable transformants (TcIP 3 R SKO) were selected by culturing the cells for 30 days in LIT medium containing 0.25 mg / mL G418 and 3 ⁇ g / mL puromycin.
- the amastigotes and tripomastigotes that stably express R-GECO1 were obtained by converting the epimastigotes that stably express R-GECO1 as described above.
- BAPTA is a Ca 2+ chelating agent that is impermeable to the cell membrane and reduces the extracellular Ca 2+ concentration.
- O, O′-bis (2-aminophenyl) ethylene glycol-N, N, N ′, N '-Tetraacetate, tetraacetoxymethyl ester (BAPTA-AM) is a Ca 2+ chelator that is permeable to the cell membrane and reduces the intracellular Ca 2+ concentration [Ca 2+ ] i , these are Dojindo Molecular Technologies , Inc. (Kumamoto, Japan).
- 2-aminoethoxydiphenylborate (2-APB) an IP 3 R inhibitor
- T. cruzi takes the form of epimastigotes, tripomastigotes, and amastigotes. It was confirmed how [Ca 2+ ] i fluctuated in each form. The result was as shown in FIG. 1B.
- [Ca 2+ ] i was calculated from the fluorescence signal intensity of R-GECO1 for epimastigote (E), tripomastigote (T), and amastigote (A). Then, as shown in FIG. 1C, [Ca 2+ ] i is high in amastigote (579 ⁇ 204 nM) and epimastigote (327 ⁇ 44 nM), and in tripomastigote (85 ⁇ 39 nM). It was low.
- Example 2 In change this embodiment of [Ca 2+] i trypanosome which parasitize the host cell, was examined [Ca 2+] i changes in T. cruzi infected host cells. 3T3-Swiss cells were infected with R-GECO1-expressing tripomastigote, and the growth of one T. cruzi (amastigote) was observed under a fluorescence microscope. The result was as shown in FIG. 2A.
- the fluorescence signal of R-GECO1 could be observed in the tripomastigote (arrowhead on the right panel) in the host cell.
- [Ca 2+ ] i was calculated from this, it was significantly lower than [Ca 2+ ] i of amastigote (arrow on the right panel). From these results, it was found that amastigote can maintain [Ca 2+ ] i even in a low calcium ion concentration environment such as the cytoplasm of the host cell.
- [Ca 2+ ] i in tripomastigote was significantly lower than [Ca 2+ ] i in amastigote.
- Example 3 Relationship between TcIP 3 R and [Ca 2+ ] i
- IP of T. cruzi mRNA expression 3 R homolog (TCIP 3 R) is found to vary significantly. Therefore, in this example, the relationship between TcIP 3 R mRNA expression and [Ca 2+ ] i was examined.
- TcIP 3 R single knockout (SKO) strains which were prepared by Hashimoto, M. et al., Mol. Microbiol., 87, 1133-1150, 2013, were prepared.
- SKO Southern blot analysis revealed that the expression of a single TcIP 3 R was specifically disrupted and that the expression of TcIP 3 R in SKO was reduced by about 35%. ing.
- SKO also exhibits several phenotypes such as suppression of epimastigote growth.
- PTREX pur R
- R-GECO1-expressing SKO was selected with puromycin and G418.
- a wild-type Tulahuen strain was transfected with pTREX (pur R ) and selected with puromycin, and an R-GECO1-expressing wild strain was also prepared.
- the fluorescence signal intensity of R-GECO1 was measured in multiple individuals picked up randomly. The result was as shown in FIG. 3B.
- the fluorescence intensity of the SKO strain was significantly lower than that of the wild strain.
- the expression of TcIP 3 R in SKO was about 65% of that of the wild strain, and the fluorescence signal intensity in the SKO strain was about 50% of that of the wild strain.
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Abstract
本発明は、カルシウムインジケーターを有する遺伝子改変トリパノソーマ・クルージおよび抗トリパノソーマ薬のスクリーニングのためのその応用を提供する。具体的には、本発明によれば、哺乳動物由来カルモジュリン、ミオシン軽鎖キナーゼ由来ペプチド(M13ペプチド)およびマーカータンパク質との融合タンパク質を含む細胞内カルシウムインジケーターを体内に有する遺伝子改変トリパノソーマ・クルージおよびこれを用いた抗トリパノソーマ薬のスクリーニング方法が提供される。
Description
本発明は、米国仮出願(US 62/375,622、出願日:2016/8/16)の優先権の利益を享受する出願であり、その全体は引用することによって本願に取り込まれる。
本発明は、カルシウムインジケーターを有する遺伝子改変トリパノソーマ・クルージおよび抗トリパノソーマ薬のスクリーニングのためのその応用を提供する。
トリパノソーマ・クルージは、ラテンアメリカにおいて見られるシャーガス病の原因となる寄生性原生生物である。これまでにシャーガス病治療薬としてベンズニダゾール(benznidazole)およびニフルティモックス(nifurtimox)の2つが開発されているが、これらはしばしば重篤な副作用をもたらす。また、これらのシャーガス病治療薬は、急性期に対してしか有効性を示さず、その効果は限定的である。
トリパノソーマ・クルージは、その生活環においてT. cruziのIP3Rホモログ(TcIP3R)のmRNA発現が大きく変動することが見出されている(非特許文献1)。また、TcIP3Rの発現量を半分以下に低下させるとT. cruziが成長できないことが示されている(非特許文献1)。
Hashimoto, M. et al., Mol. Microbiol., 87, 1133-1150, 2013
本発明は、カルシウムインジケーターを有する遺伝子改変トリパノソーマ・クルージおよび抗トリパノソーマ薬のスクリーニングのためのその応用を提供する。
本発明者らは、細胞内カルシウムインジケーターを発現するトリパノソーマ・クルージを作製し、細胞に感染させたところ、トリパノソーマ・クルージは、生活環依存的にその細胞内カルシウムイオン濃度を変化させること、および細胞内カルシウムイオン濃度から細胞内の生活環を推定することができることを見出した。
本発明者らはまた、アマスティゴートが特に高い細胞内カルシウムイオン濃度を示すこと、および細胞内カルシウムイオン濃度を低下させることによってアマスティゴートが効果的に死滅することも見出した。
本発明はこれら知見に基づくものである。
本発明者らはまた、アマスティゴートが特に高い細胞内カルシウムイオン濃度を示すこと、および細胞内カルシウムイオン濃度を低下させることによってアマスティゴートが効果的に死滅することも見出した。
本発明はこれら知見に基づくものである。
本発明によれば、例えば以下の発明が提供される。
(1)哺乳動物由来カルモジュリン、ミオシン軽鎖キナーゼ由来ペプチド(M13ペプチド)およびマーカータンパク質との融合タンパク質を含む細胞内カルシウムインジケーターを体内に有する遺伝子改変トリパノソーマ・クルージ(Trypanosoma cruzi){例えば、前記カルモジュリン、マーカータンパク質およびM13ペプチドは、リンカーを介してまたは介さずにこの順番で融合していてもよい}。
(2)マーカータンパク質が蛍光タンパク質又は発光タンパク質である、上記(1)記載のトリパノソーマ・クルージ。
(3)細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、上記(2)に記載のトリパノソーマ・クルージ。
(4)蛍光タンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウム濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる(例えば、カメレオンタンパク質である)、上記(2)に記載のトリパノソーマ・クルージ。
(5)amastigote(アマスティゴートまたは無鞭毛体)のステージにある上記(1)から(4)のいずれかに記載のトリパノソーマ・クルージを細胞内に含む哺乳動物細胞(例えば、ヒト細胞)。
(6)哺乳動物由来カルモジュリン、ミオシン軽鎖キナーゼ由来ペプチド(M13ペプチド)および前記トリパノソーマ・クルージ内のマーカータンパク質と異なるマーカータンパク質との第二の融合タンパク質を含む第二の細胞内カルシウムインジケーターを細胞内にさらに有する(特に限定されないが例えば、これにより、トリパノソーマ・クルージ内のカルシウム濃度と哺乳動物細胞(例えば、ヒト細胞)内のカルシウム濃度とをそれぞれ測定できる)、上記(5)記載の細胞。
(7)第二の細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、上記(6)に記載の細胞。
(8)第二の細胞内カルシウムインジケーターにおけるマーカータンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウム濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる(例えば、カメレオンタンパク質である)、上記(6)に記載の細胞。
(9)下記の工程を含む、抗トリパノソーマ薬のスクリーニング方法:
(a) 上記(1)~(4)のいずれかに記載のトリパノソーマ・クルージ内のカルシウムイオン濃度を前記マーカーの示す強度を検出して測定する工程、
(b) 被験物質を前記トリパノソーマ・クルージに接触させる工程、
(c) (a)で測定したカルシウムイオン濃度と比較して、接触によって前記トリパノソーマ・クルージ内のカルシウムイオン濃度を規定比率以下に減少させた物質を選別する工程{ここで、規定比率は、2分の1、3分の1、4分の1または5分の1以下の数値である}。
(10)下記の工程を含む、トリパノソーマ・クルージのamastigoteに作用する抗トリパノソーマ薬のスクリーニング方法:
(a-0)上記(1)~(4)のいずれかに記載のトリパノソーマ・クルージを感染させた哺乳動物細胞(例えば、ヒト細胞)を提供する工程、
(a-1) 前記トリパノソーマ・クルージのamastigoteのカルシウムイオン濃度を前記マーカーの示す強度を検出して測定する工程、
(b-1) 被験物質を前記哺乳動物細胞に接触させる工程、
(c-1) (a-1)で測定したカルシウムイオン濃度と比較して、接触によって前記哺乳動物細胞内のトリパノソーマ・クルージのamastigote内のカルシウムイオン濃度を規定値以下に減少させる物質を選別する工程{ここで規定値は、300nM以下、290nM以下、280nM以下、270nM以下、260nM以下、250nM以下、240nM以下、230nM以下、220nM以下、210nM以下、200nM以下、または150nM以下の濃度であり、好ましくは、100nM~250nMの範囲である}。
(11)哺乳動物細胞が、哺乳動物由来カルモジュリン、ミオシン軽鎖キナーゼ由来ペプチド(M13ペプチド)およびトリパノソーマ・クルージ内のマーカータンパク質と異なるマーカータンパク質との融合タンパク質を含む第二の細胞内カルシウムインジケーターを細胞内に有する、上記(10)記載の方法。
(12)トリパノソーマ・クルージ内の細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、上記(9)から(11)のいずれかに記載の方法。
(13)トリパノソーマ・クルージ内の細胞内カルシウムインジケーターにおけるマーカータンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウム濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる(例えば、カメレオンタンパク質である)、上記(9)から(11)のいずれかに記載の方法。
(14)第二の細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、上記(11)に記載の方法。
(15)第二の細胞内カルシウムインジケーターにおける蛍光タンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウム濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる(例えば、カメレオンタンパク質である)、上記(11)記載の方法。
(16)トリパノソーマ・クルージに包含されたカルシウムインジケーターがカルシウムの存在下において赤色、橙色、黄色、緑色、および青色のいずれかの蛍光色を呈し、哺乳動物由来の細胞に包含されたカルシウムインジケーターがカルシウムの存在下において前記蛍光色とは異なる蛍光色を呈する、上記(9)から(15)のいずれかに記載の方法。
(17)工程c-1において、原虫株に包含されたカルシウムインジケーターの蛍光強度を哺乳動物細胞におけるカルシウムインジケーターの蛍光強度に対するよりも選択的に(例えば、大きな比率で)減じる作用を有する物質を選別する、上記(11)から(15)のいずれかに記載の方法。
(18)マーカータンパク質が、赤色蛍光タンパク質(例えば、RFP、mcherry、mRuby2、DsRed、Azalea B5、赤色蛍光変異導入cp(円順列変異)GFPなど)に由来する、橙色蛍光タンパク質(例えば、OFP、Kusabira Orange、mKO、mKO2、mOrangeなど)に由来する、黄色蛍光タンパク質(YFP、EYFP、Ypet、TurboYFP、Venus、mVenus、Topazなど)に由来する、または緑色蛍光タンパク質(GFP、EGFP、mAG、mKG、KikG、22G、mWasabi、cp(円順列変異)GFPなどに由来する、または、青色蛍光タンパク質(例えば、CFP、ECFP、BFP、EBFP、Kusabira Cyan、mBlueberry、青色蛍光変異導入cp(円順列変異)GFPなど)に由来する、上記(1)に記載の原虫株、上記(4)に記載の原虫株、上記(6)~(8)のいずれかに記載の細胞、または上記(9)~(14)のいずれかに記載の方法。
(1)哺乳動物由来カルモジュリン、ミオシン軽鎖キナーゼ由来ペプチド(M13ペプチド)およびマーカータンパク質との融合タンパク質を含む細胞内カルシウムインジケーターを体内に有する遺伝子改変トリパノソーマ・クルージ(Trypanosoma cruzi){例えば、前記カルモジュリン、マーカータンパク質およびM13ペプチドは、リンカーを介してまたは介さずにこの順番で融合していてもよい}。
(2)マーカータンパク質が蛍光タンパク質又は発光タンパク質である、上記(1)記載のトリパノソーマ・クルージ。
(3)細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、上記(2)に記載のトリパノソーマ・クルージ。
(4)蛍光タンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウム濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる(例えば、カメレオンタンパク質である)、上記(2)に記載のトリパノソーマ・クルージ。
(5)amastigote(アマスティゴートまたは無鞭毛体)のステージにある上記(1)から(4)のいずれかに記載のトリパノソーマ・クルージを細胞内に含む哺乳動物細胞(例えば、ヒト細胞)。
(6)哺乳動物由来カルモジュリン、ミオシン軽鎖キナーゼ由来ペプチド(M13ペプチド)および前記トリパノソーマ・クルージ内のマーカータンパク質と異なるマーカータンパク質との第二の融合タンパク質を含む第二の細胞内カルシウムインジケーターを細胞内にさらに有する(特に限定されないが例えば、これにより、トリパノソーマ・クルージ内のカルシウム濃度と哺乳動物細胞(例えば、ヒト細胞)内のカルシウム濃度とをそれぞれ測定できる)、上記(5)記載の細胞。
(7)第二の細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、上記(6)に記載の細胞。
(8)第二の細胞内カルシウムインジケーターにおけるマーカータンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウム濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる(例えば、カメレオンタンパク質である)、上記(6)に記載の細胞。
(9)下記の工程を含む、抗トリパノソーマ薬のスクリーニング方法:
(a) 上記(1)~(4)のいずれかに記載のトリパノソーマ・クルージ内のカルシウムイオン濃度を前記マーカーの示す強度を検出して測定する工程、
(b) 被験物質を前記トリパノソーマ・クルージに接触させる工程、
(c) (a)で測定したカルシウムイオン濃度と比較して、接触によって前記トリパノソーマ・クルージ内のカルシウムイオン濃度を規定比率以下に減少させた物質を選別する工程{ここで、規定比率は、2分の1、3分の1、4分の1または5分の1以下の数値である}。
(10)下記の工程を含む、トリパノソーマ・クルージのamastigoteに作用する抗トリパノソーマ薬のスクリーニング方法:
(a-0)上記(1)~(4)のいずれかに記載のトリパノソーマ・クルージを感染させた哺乳動物細胞(例えば、ヒト細胞)を提供する工程、
(a-1) 前記トリパノソーマ・クルージのamastigoteのカルシウムイオン濃度を前記マーカーの示す強度を検出して測定する工程、
(b-1) 被験物質を前記哺乳動物細胞に接触させる工程、
(c-1) (a-1)で測定したカルシウムイオン濃度と比較して、接触によって前記哺乳動物細胞内のトリパノソーマ・クルージのamastigote内のカルシウムイオン濃度を規定値以下に減少させる物質を選別する工程{ここで規定値は、300nM以下、290nM以下、280nM以下、270nM以下、260nM以下、250nM以下、240nM以下、230nM以下、220nM以下、210nM以下、200nM以下、または150nM以下の濃度であり、好ましくは、100nM~250nMの範囲である}。
(11)哺乳動物細胞が、哺乳動物由来カルモジュリン、ミオシン軽鎖キナーゼ由来ペプチド(M13ペプチド)およびトリパノソーマ・クルージ内のマーカータンパク質と異なるマーカータンパク質との融合タンパク質を含む第二の細胞内カルシウムインジケーターを細胞内に有する、上記(10)記載の方法。
(12)トリパノソーマ・クルージ内の細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、上記(9)から(11)のいずれかに記載の方法。
(13)トリパノソーマ・クルージ内の細胞内カルシウムインジケーターにおけるマーカータンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウム濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる(例えば、カメレオンタンパク質である)、上記(9)から(11)のいずれかに記載の方法。
(14)第二の細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、上記(11)に記載の方法。
(15)第二の細胞内カルシウムインジケーターにおける蛍光タンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウム濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる(例えば、カメレオンタンパク質である)、上記(11)記載の方法。
(16)トリパノソーマ・クルージに包含されたカルシウムインジケーターがカルシウムの存在下において赤色、橙色、黄色、緑色、および青色のいずれかの蛍光色を呈し、哺乳動物由来の細胞に包含されたカルシウムインジケーターがカルシウムの存在下において前記蛍光色とは異なる蛍光色を呈する、上記(9)から(15)のいずれかに記載の方法。
(17)工程c-1において、原虫株に包含されたカルシウムインジケーターの蛍光強度を哺乳動物細胞におけるカルシウムインジケーターの蛍光強度に対するよりも選択的に(例えば、大きな比率で)減じる作用を有する物質を選別する、上記(11)から(15)のいずれかに記載の方法。
(18)マーカータンパク質が、赤色蛍光タンパク質(例えば、RFP、mcherry、mRuby2、DsRed、Azalea B5、赤色蛍光変異導入cp(円順列変異)GFPなど)に由来する、橙色蛍光タンパク質(例えば、OFP、Kusabira Orange、mKO、mKO2、mOrangeなど)に由来する、黄色蛍光タンパク質(YFP、EYFP、Ypet、TurboYFP、Venus、mVenus、Topazなど)に由来する、または緑色蛍光タンパク質(GFP、EGFP、mAG、mKG、KikG、22G、mWasabi、cp(円順列変異)GFPなどに由来する、または、青色蛍光タンパク質(例えば、CFP、ECFP、BFP、EBFP、Kusabira Cyan、mBlueberry、青色蛍光変異導入cp(円順列変異)GFPなど)に由来する、上記(1)に記載の原虫株、上記(4)に記載の原虫株、上記(6)~(8)のいずれかに記載の細胞、または上記(9)~(14)のいずれかに記載の方法。
本発明では、例えば、以下の発明が提供される。
(1A)哺乳動物由来カルモジュリン、ミオシン軽鎖キナーゼ由来ペプチド(M13ペプチド)およびマーカータンパク質との融合タンパク質を含む細胞内カルシウムインジケーターを体内に有する遺伝子改変トリパノソーマ・クルージ。
(2A)マーカータンパク質が蛍光タンパク質又は発光タンパク質である、上記(1A)記載のトリパノソーマ・クルージ。
(3A)細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、上記(2A)に記載のトリパノソーマ・クルージ。
(4A)蛍光タンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウムイオン濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる、上記(2A)に記載のトリパノソーマ・クルージ。
(5A)amastigote(アマスティゴートまたは無鞭毛体)のステージにある上記(1A)から(4A)のいずれかに記載のトリパノソーマ・クルージを細胞内に含む哺乳動物細胞。
(6A)哺乳動物由来カルモジュリン、ミオシン軽鎖キナーゼ由来ペプチド(M13ペプチド)および前記トリパノソーマ・クルージ内のマーカータンパク質と異なるマーカータンパク質との第二の融合タンパク質を含む第二の細胞内カルシウムインジケーターを細胞内にさらに有する、上記(5A)記載の細胞。
(7A)第二の細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、上記(6A)に記載の細胞。
(8)第二の細胞内カルシウムインジケーターにおけるマーカータンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウムイオン濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる、上記(6A)に記載の細胞。
(9A)下記の工程を含む、抗トリパノソーマ薬のスクリーニング方法:
(a)上記(1A)~(4A)のいずれかに記載のトリパノソーマ・クルージ内のカルシウムイオン濃度を前記マーカーの示す強度を検出して測定する工程、
(b) 被験物質を前記トリパノソーマ・クルージに接触させる工程、
(c) (a)で測定したカルシウムイオン濃度と比較して、接触によって前記トリパノソーマ・クルージ内のカルシウムイオン濃度を規定比率以下に減少させた物質を選別する工程。
(10A)下記の工程を含む、トリパノソーマ・クルージのamastigoteに作用する抗トリパノソーマ薬のスクリーニング方法:
(a-0)上記(1A)~(4A)のいずれかに記載のトリパノソーマ・クルージを感染させた哺乳動物細胞(例えば、ヒト細胞)を提供する工程、
(a-1) 前記トリパノソーマ・クルージのamastigoteのカルシウムイオン濃度を前記マーカーの示す強度を検出して測定する工程、
(b-1) 被験物質を前記哺乳動物細胞に接触させる工程、
(c-1) (a-1)で測定したカルシウムイオン濃度と比較して、接触によって前記哺乳動物細胞内のトリパノソーマ・クルージのamastigote内のカルシウムイオン濃度を規定値以下に減少させる物質を選別する工程。
(11A)哺乳動物細胞が、哺乳動物由来カルモジュリン、ミオシン軽鎖キナーゼ由来ペプチド(M13ペプチド)およびトリパノソーマ・クルージ内のマーカータンパク質と異なるマーカータンパク質との融合タンパク質を含む第二の細胞内カルシウムインジケーターを細胞内に有する、上記(10A)記載の方法。
(12A)トリパノソーマ・クルージ内の細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、上記(9A)から(11A)のいずれかに記載の方法。
(13A)トリパノソーマ・クルージ内の細胞内カルシウムインジケーターにおけるマーカータンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウムイオン濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる、上記(9A)から(11A)のいずれかに記載の方法。
(14A)第二の細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、上記(11A)に記載の方法。
(15A)第二の細胞内カルシウムインジケーターにおける蛍光タンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウムイオン濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる、上記(11A)記載の方法。
(16A)トリパノソーマ・クルージに包含されたカルシウムインジケーターがカルシウムの存在下において赤色、橙色、黄色、緑色、および青色のいずれかの蛍光色を呈し、哺乳動物由来の細胞に包含されたカルシウムインジケーターがカルシウムの存在下において前記蛍光色とは異なる蛍光色を呈する、上記(9A)から(15A)のいずれかに記載の方法。
(17A)工程c-1において、原虫株に包含されたカルシウムインジケーターの蛍光強度を哺乳動物細胞におけるカルシウムインジケーターの蛍光強度に対するよりも選択的に減じる作用を有する物質を選別する、上記(11A)から(15A)のいずれかに記載の方法。
(18A)マーカータンパク質が、赤色蛍光タンパク質に由来する、橙色蛍光タンパク質に由来する、黄色蛍光タンパク質に由来する、または緑色蛍光タンパク質に由来する、または、青色蛍光タンパク質に由来する、上記(1A)に記載の原虫株、上記(4A)に記載の原虫株、上記(6A)~(8A)のいずれかに記載の細胞、または上記(9A)~(14A)のいずれかに記載の方法。
(1A)哺乳動物由来カルモジュリン、ミオシン軽鎖キナーゼ由来ペプチド(M13ペプチド)およびマーカータンパク質との融合タンパク質を含む細胞内カルシウムインジケーターを体内に有する遺伝子改変トリパノソーマ・クルージ。
(2A)マーカータンパク質が蛍光タンパク質又は発光タンパク質である、上記(1A)記載のトリパノソーマ・クルージ。
(3A)細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、上記(2A)に記載のトリパノソーマ・クルージ。
(4A)蛍光タンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウムイオン濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる、上記(2A)に記載のトリパノソーマ・クルージ。
(5A)amastigote(アマスティゴートまたは無鞭毛体)のステージにある上記(1A)から(4A)のいずれかに記載のトリパノソーマ・クルージを細胞内に含む哺乳動物細胞。
(6A)哺乳動物由来カルモジュリン、ミオシン軽鎖キナーゼ由来ペプチド(M13ペプチド)および前記トリパノソーマ・クルージ内のマーカータンパク質と異なるマーカータンパク質との第二の融合タンパク質を含む第二の細胞内カルシウムインジケーターを細胞内にさらに有する、上記(5A)記載の細胞。
(7A)第二の細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、上記(6A)に記載の細胞。
(8)第二の細胞内カルシウムインジケーターにおけるマーカータンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウムイオン濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる、上記(6A)に記載の細胞。
(9A)下記の工程を含む、抗トリパノソーマ薬のスクリーニング方法:
(a)上記(1A)~(4A)のいずれかに記載のトリパノソーマ・クルージ内のカルシウムイオン濃度を前記マーカーの示す強度を検出して測定する工程、
(b) 被験物質を前記トリパノソーマ・クルージに接触させる工程、
(c) (a)で測定したカルシウムイオン濃度と比較して、接触によって前記トリパノソーマ・クルージ内のカルシウムイオン濃度を規定比率以下に減少させた物質を選別する工程。
(10A)下記の工程を含む、トリパノソーマ・クルージのamastigoteに作用する抗トリパノソーマ薬のスクリーニング方法:
(a-0)上記(1A)~(4A)のいずれかに記載のトリパノソーマ・クルージを感染させた哺乳動物細胞(例えば、ヒト細胞)を提供する工程、
(a-1) 前記トリパノソーマ・クルージのamastigoteのカルシウムイオン濃度を前記マーカーの示す強度を検出して測定する工程、
(b-1) 被験物質を前記哺乳動物細胞に接触させる工程、
(c-1) (a-1)で測定したカルシウムイオン濃度と比較して、接触によって前記哺乳動物細胞内のトリパノソーマ・クルージのamastigote内のカルシウムイオン濃度を規定値以下に減少させる物質を選別する工程。
(11A)哺乳動物細胞が、哺乳動物由来カルモジュリン、ミオシン軽鎖キナーゼ由来ペプチド(M13ペプチド)およびトリパノソーマ・クルージ内のマーカータンパク質と異なるマーカータンパク質との融合タンパク質を含む第二の細胞内カルシウムインジケーターを細胞内に有する、上記(10A)記載の方法。
(12A)トリパノソーマ・クルージ内の細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、上記(9A)から(11A)のいずれかに記載の方法。
(13A)トリパノソーマ・クルージ内の細胞内カルシウムインジケーターにおけるマーカータンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウムイオン濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる、上記(9A)から(11A)のいずれかに記載の方法。
(14A)第二の細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、上記(11A)に記載の方法。
(15A)第二の細胞内カルシウムインジケーターにおける蛍光タンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウムイオン濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる、上記(11A)記載の方法。
(16A)トリパノソーマ・クルージに包含されたカルシウムインジケーターがカルシウムの存在下において赤色、橙色、黄色、緑色、および青色のいずれかの蛍光色を呈し、哺乳動物由来の細胞に包含されたカルシウムインジケーターがカルシウムの存在下において前記蛍光色とは異なる蛍光色を呈する、上記(9A)から(15A)のいずれかに記載の方法。
(17A)工程c-1において、原虫株に包含されたカルシウムインジケーターの蛍光強度を哺乳動物細胞におけるカルシウムインジケーターの蛍光強度に対するよりも選択的に減じる作用を有する物質を選別する、上記(11A)から(15A)のいずれかに記載の方法。
(18A)マーカータンパク質が、赤色蛍光タンパク質に由来する、橙色蛍光タンパク質に由来する、黄色蛍光タンパク質に由来する、または緑色蛍光タンパク質に由来する、または、青色蛍光タンパク質に由来する、上記(1A)に記載の原虫株、上記(4A)に記載の原虫株、上記(6A)~(8A)のいずれかに記載の細胞、または上記(9A)~(14A)のいずれかに記載の方法。
「トリパノソーマ・クルージ」(Trypanosoma cruzi)とは、トリパノソーマ属に属する原虫の一種であり、人獣共通感染症であるシャーガス病(Chargas’ disease)の原因として知られている。トリパノソーマ・クルージは、その生活環において、主に、アマスティゴート(無鞭毛型)、トリポマスティゴート(錐鞭毛型)、およびエピマスティゴート(上鞭毛型)の形態および代謝型を取り、異なる環境に適応することができる。
トリパノソーマ・クルージの生活環は、昆虫相(insect phase)と哺乳動物相(mammalian phase)とに大別され、哺乳動物相は以下の通りに概略される:
トリポマスティゴートが動物に感染すると、体内で細胞内に侵入する;
細胞内では、トリポマスティゴートは、アマスティゴートになる;
アマスティゴートは、細胞内で分裂により増殖する;
増殖した細胞内のアマスティゴートは、再びトリポマスティゴートになり、細胞を壊して他の細胞に感染したり、血流に入って体内に拡散する。
トリパノソーマ・クルージの生活環は、昆虫相(insect phase)と哺乳動物相(mammalian phase)とに大別され、哺乳動物相は以下の通りに概略される:
トリポマスティゴートが動物に感染すると、体内で細胞内に侵入する;
細胞内では、トリポマスティゴートは、アマスティゴートになる;
アマスティゴートは、細胞内で分裂により増殖する;
増殖した細胞内のアマスティゴートは、再びトリポマスティゴートになり、細胞を壊して他の細胞に感染したり、血流に入って体内に拡散する。
本明細書では、「動物」は、哺乳動物、特にヒトを含む意味で用いられる。
本明細書では、「カルシウムインジケーター」とは、水溶液中のカルシウムイオン濃度を検出できるタンパク質を意味する。カルシウムインジケーターは、カルシウムイオンの濃度依存的にその蛍光強度を変化させ、蛍光強度からカルシウムイオン濃度を推定することに用い得る。本明細書では、「細胞内カルシウムインジケーター」とは、細胞内のカルシウムイオン濃度の推定に適したカルシウムインジケーターを意味する。細胞内カルシウムインジケーターとしては、細胞内カルシウムイオン濃度依存的にシグナル(例えば、青、緑及び赤の蛍光や発光などの光)を発する各種インジケーターが知られており、特にタンパク質でコードされるものが周知である。カルシウムインジケーターは、当業者であればカルシウム結合ペプチドと蛍光タンパク質とをリンカーを介して連結させることにより適宜設計することができる。
本明細書では、「蛍光共鳴エネルギー移動」(FRET)とは、第一の蛍光タンパク質の蛍光の波長と第二の蛍光タンパク質の励起光の波長のスペクトルが重なり合う場合に、前記2つの蛍光タンパク質が近接すると、第一の蛍光タンパク質を励起したときに、第一の蛍光タンパク質が吸収したエネルギーが、第二の蛍光タンパク質の励起のためのエネルギーとして用いられ、第二の蛍光タンパク質の蛍光が発するという現象である。このとき第一の蛍光タンパク質をドナータンパク質(供与体)といい、第二の蛍光タンパク質をアクセプタータンパク質(受容体)という。ドナータンパク質とアクセプタータンパク質との距離が10nm以下程度になったときにFRET効率が顕著に向上すると考えられている。
FRETは、タンパク質間相互作用の変化の解析手法として当業者に周知である。具体的には、FRETでは、タンパク質Aにドナータンパク質を連結し、タンパク質Bにアクセプタータンパク質を連結して、タンパク質AとBとの相互作用を検出することができる。FRETは、分子内のドメイン間の相対的位置関係の変化の解析手法としても用いられている。例えば、ドメインAにドナータンパク質を連結し、ドメインBにアクセプタータンパク質を連結して、タンパク質のコンフォメーションが変化すると、ドナータンパク質とアクセプタータンパク質との距離が変動し、FRET効率に変化を生じさせることができることが知られている。
FRETは、タンパク質間相互作用の変化の解析手法として当業者に周知である。具体的には、FRETでは、タンパク質Aにドナータンパク質を連結し、タンパク質Bにアクセプタータンパク質を連結して、タンパク質AとBとの相互作用を検出することができる。FRETは、分子内のドメイン間の相対的位置関係の変化の解析手法としても用いられている。例えば、ドメインAにドナータンパク質を連結し、ドメインBにアクセプタータンパク質を連結して、タンパク質のコンフォメーションが変化すると、ドナータンパク質とアクセプタータンパク質との距離が変動し、FRET効率に変化を生じさせることができることが知られている。
本明細書では、「生物発光共鳴エネルギー移動」(BRET)とは、FRETにおいて供与体として第1の蛍光タンパク質の代わりに生物発光タンパク質を用いて、ドナータンパク質とアクセプタータンパク質とが近接すると、ドナータンパク質が生物発光しようとするときにそのエネルギーがアクセプタータンパク質の励起のためのエネルギーとして用いられ、ドナーの代わりにアクセプタータンパク質の蛍光が発するという現象である。生物発光タンパク質としては、ルシフェラーゼが挙げられる。
本明細書では、「蛍光タンパク質」とは、特定の波長を有する光で励起することにより、蛍光を発するタンパク質を意味する。通常は、蛍光は励起光よりも長い波長を有する。励起光と蛍光を区別するためにダイクロイックミラーが用いられる。ダイクロイックミラーは、特定波長の光を反射するが、それ以外の波長の光を透過する性質を有する。
本明細書では、「発現」または「発現する」とは、タンパク質をコードする遺伝子からタンパク質が産生されることを意味する。
本明細書では、「ベクター」とは、遺伝子組換えに用いられる核酸分子を言う。本明細書では、大腸菌に遺伝子導入することが念頭に置かれるため、ベクターは、大腸菌で自己複製可能な複製起点を有し、形質転換した大腸菌を選択するための耐性遺伝子を有し、外来遺伝子を導入するための挿入部位(例えば、マルチクローニングサイト)を有する。
本明細書では、「タンパク質発現ベクター」とは、細胞内でタンパク質を発現させることに用いるベクターを意味する。タンパク質発現ベクターは、通常、細胞においてタンパク質を発現させるためのプロモーターおよびポリA付加配列を有する。タンパク質発現ベクターとしては、プラスミドがよく用いられている。
本明細書では、「タンパク質発現ベクター」とは、細胞内でタンパク質を発現させることに用いるベクターを意味する。タンパク質発現ベクターは、通常、細胞においてタンパク質を発現させるためのプロモーターおよびポリA付加配列を有する。タンパク質発現ベクターとしては、プラスミドがよく用いられている。
本明細書では、「遺伝子改変」とは、遺伝子工学を用いて人為的に遺伝情報を変化させたことを意味する。遺伝子改変動物には、そのゲノムを改変した動物およびそのゲノムを改変せずに目的ベクターを体内に有する動物を含む意味で用いられる。
本明細書では、「融合タンパク質」とは、タンパク質の全部または一部と他のタンパク質の全部または一部とが連結したタンパク質を意味する。融合タンパク質が由来するタンパク質は、2種類以上であり得、例えば、3種類のタンパク質の全部または一部が1つのポリペプチドとして連結した融合タンパク質を含む意味で用いられる。
本明細書では、「カルシウムイオン濃度」とは、カルシウムイオンであるCa2+の濃度(すなわち、[Ca2+])を意味する。本明細書では、細胞内カルシウムイオン濃度を[Ca2+]iと表記することがある。
本発明者らは、細胞内カルシウムインジケーターを発現するトリパノソーマ・クルージを作製し、細胞に感染させたところ、トリパノソーマ・クルージは、生活環依存的にその細胞内カルシウムイオン濃度を変化させること、および細胞内カルシウムイオン濃度から細胞内の生活環を推定することができることを見出した。
本発明者らはまた、アマスティゴートが特に高い細胞内カルシウムイオン濃度を示すこと、および細胞内カルシウムイオン濃度を低下させることによってアマスティゴートが効果的に死滅することも見出した。
本発明者らはまた、アマスティゴートが特に高い細胞内カルシウムイオン濃度を示すこと、および細胞内カルシウムイオン濃度を低下させることによってアマスティゴートが効果的に死滅することも見出した。
本発明によれば、細胞内カルシウムインジケーターを体内に有する、トリパノソーマ・クルージが提供される。トリパノソーマ・クルージは、生活環によって細胞内カルシウムイオン濃度を大きく変動させるから、細胞内カルシウムインジケーターを体内に持たせることによってトリパノソーマ・クルージがどの生活環であるかを、容易に判別することができる。
細胞内カルシウムインジケーターとしては、特に限定されないが例えば、多く開発されているカルシウムインジケーターの内、トリパノソーマ・クルージの体内のカルシウムイオンの変動域をダイナミックレンジに含むインジケーターを用いることができる。
例えば、100nM~600nMをダイナミックレンジに含むインジケーターであれば、トリパノソーマ・クルージの体内のカルシウムイオンの変動を良好に検出することができる。例えば、50nM~600nMの範囲にダイナミックレンジを含むインジケーターは、トリパノソーマ・クルージが、アマスティゴートか、エピマスティゴートか、トリポマスティゴートのいずれかであるかを判別することに適している。
また例えば、アマスティゴートの体内カルシウムイオン濃度にのみ応答して特定のシグナルを発するインジケーターを用いてもよく、このようなインジケーターは、アマスティゴートの検出に適している。例えば、350nM以上、360nM以上、370nM以上、380nM以上、390nM以上、400nM以上、410nM以上、420nM以上、430nM以上、440nM以上、450nM以上、460nM以上、470nM以上、480nM以上、490nM以上、500nM以上、510nM以上、520nM以上、530nM以上、540nM以上、550nM以上のカルシウムイオン濃度に応答して特定のシグナルを発するインジケーターがアマスティゴートの検出に適している。
例えば、100nM~600nMをダイナミックレンジに含むインジケーターであれば、トリパノソーマ・クルージの体内のカルシウムイオンの変動を良好に検出することができる。例えば、50nM~600nMの範囲にダイナミックレンジを含むインジケーターは、トリパノソーマ・クルージが、アマスティゴートか、エピマスティゴートか、トリポマスティゴートのいずれかであるかを判別することに適している。
また例えば、アマスティゴートの体内カルシウムイオン濃度にのみ応答して特定のシグナルを発するインジケーターを用いてもよく、このようなインジケーターは、アマスティゴートの検出に適している。例えば、350nM以上、360nM以上、370nM以上、380nM以上、390nM以上、400nM以上、410nM以上、420nM以上、430nM以上、440nM以上、450nM以上、460nM以上、470nM以上、480nM以上、490nM以上、500nM以上、510nM以上、520nM以上、530nM以上、540nM以上、550nM以上のカルシウムイオン濃度に応答して特定のシグナルを発するインジケーターがアマスティゴートの検出に適している。
細胞内カルシウムインジケーターは、哺乳動物由来カルモジュリン、ミオシン軽鎖キナーゼ由来ペプチド(M13ペプチド)およびマーカータンパク質との融合タンパク質(以下、「本発明の融合タンパク質」ということがある)を含み得る。上記融合タンパク質において、哺乳動物由来カルモジュリンは、カルシウムイオン濃度依存的にM13ペプチドに結合し、これを介してマーカータンパク質の構造を変換し、マーカータンパク質の機能をオン・オフすることができる。マーカータンパク質としては、イメージングが容易な蛍光タンパク質または発光タンパク質を用いることができる。このような融合タンパク質としては、例えば、GCaMP、およびGECOが挙げられる。
本発明で用いられ得るGCaMPとしては、特に限定されないが例えば、GCaMP1.6、GCaMP2、GCaMP3(例えば、配列番号1)、並びに、GCaMP6f、6mおよび6sが挙げられる。
マーカータンパク質では、例えば、カルモジュリン、マーカータンパク質およびM13ペプチドは、リンカーを介してまたは介さずにこの順番で融合していてもよい。例えば、GCaMPでは、N末端側から、M13ペプチド、EGFP(149~238)、リンカー(GGTGGS)、EGFP(1~144)、リンカー(TR)、及びカルモジュリン(2~148)が連結された。カルモジュリンが構造変化を示さない低カルシウムイオン濃度環境下では、カルモジュリンとM13ペプチドとは解離しており、EGFPが蛍光を発し得るが、カルモジュリンがカルシウムと結合すると、M13ペプチドと相互作用をするようになり、EGFPの構造が歪められて蛍光を発し得ない状態となる。このように、M13ペプチドとEGFPとカルモジュリンとがこの順番で、あるいは、カルモジュリンとEGFPとM13ペプチドとがこの順番で連結した融合タンパク質は、細胞内カルシウムイオン濃度依存的に特定の蛍光を発し得る。このような原理で、EGFP部分を他の蛍光タンパク質に置き換えれば、様々な細胞内カルシウムインジケーターを作製することができるであろう。また、GFPは、中央に存在する1本のαヘリックス部分に発光団が存在し、これを11本のアンチパラレルβシートが取り囲む構造をし、αヘリックスを安定化させ、安定的な蛍光を発生させている。従って、αヘリックスを取り巻くβシート部分の構造を、同様にM13ペプチドとカルモジュリンを用いて変換させることにより、GFPの発光と消光を制御できる。
このように当業者であれば、カルモジュリンと蛍光タンパク質とM13ペプチドとを組み合わせてカルシウムイオン濃度依存的に特定の蛍光を発する融合タンパク質を作製することができるであろう。
このように当業者であれば、カルモジュリンと蛍光タンパク質とM13ペプチドとを組み合わせてカルシウムイオン濃度依存的に特定の蛍光を発する融合タンパク質を作製することができるであろう。
ある態様では、マーカータンパク質は、例えば、
赤色蛍光タンパク質(例えば、RFP、mcherry、mRuby2、DsRed、Azalea B5、赤色蛍光変異導入cp(円順列変異)GFPなど)に由来する;
橙色蛍光タンパク質(例えば、OFP、Kusabira Orange、mKO、mKO2、mOrangeなど)に由来する、黄色蛍光タンパク質(YFP、EYFP、Ypet、TurboYFP、Venus、mVenus、Topazなど)に由来する;
緑色蛍光タンパク質(GFP、EGFP、mAG、mKG、KikG、22G、mWasabi、cp(円順列変異)GFPなどに由来する;または、
青色蛍光タンパク質(例えば、CFP、ECFP、BFP、EBFP、Kusabira Cyan、mBlueberry、青色蛍光変異導入cp(円順列変異)GFPなど)に由来するものとすることができる。
赤色蛍光タンパク質(例えば、RFP、mcherry、mRuby2、DsRed、Azalea B5、赤色蛍光変異導入cp(円順列変異)GFPなど)に由来する;
橙色蛍光タンパク質(例えば、OFP、Kusabira Orange、mKO、mKO2、mOrangeなど)に由来する、黄色蛍光タンパク質(YFP、EYFP、Ypet、TurboYFP、Venus、mVenus、Topazなど)に由来する;
緑色蛍光タンパク質(GFP、EGFP、mAG、mKG、KikG、22G、mWasabi、cp(円順列変異)GFPなどに由来する;または、
青色蛍光タンパク質(例えば、CFP、ECFP、BFP、EBFP、Kusabira Cyan、mBlueberry、青色蛍光変異導入cp(円順列変異)GFPなど)に由来するものとすることができる。
本発明で用いられ得るGECOとしては、特に限定されないが例えば、G-GECO(例えば、配列番号2に示されるアミノ酸配列を有するタンパク質)、B-GECO(例えば、配列番号3に示されるアミノ酸配列を有するタンパク質)、GEX-GECO(例えば、配列番号4に示されるアミノ酸配列を有するタンパク質)、GEM-GECO(例えば、配列番号5に示されるアミノ酸配列を有するタンパク質)、および、R-GECO(例えば、配列番号6に示されるアミノ酸配列を有するタンパク質)が挙げられる。
本発明ではまた、上記融合タンパク質として、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウムイオン濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる、タンパク質を用いることができる。本発明ではさらに、融合タンパク質として、生物発光共鳴エネルギー移動(BRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウムイオン濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる、タンパク質を用いることができる。
このようなタンパク質としては、特に限定されないがカメレオンを用いることができる。カメレオンは、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分として、青色蛍光タンパク質(CFP)および黄色蛍光タンパク質(YFP)をそれぞれ有し、これがカルモジュリンとM13ペプチドとで連結された融合タンパク質である。カルモジュリンがカルシウムに反応すると、M13ペプチドと結合し、これによってCFPとYFPの距離が縮まり、FRETを生じるようになる。すなわち、低カルシウムイオン濃度環境下では、この融合タンパク質は、CFPによる蛍光を発するが、高カルシウムイオン濃度環境下(つまり、カルモジュリンがカルシウムに結合する環境下)では、この融合タンパク質は、YFPの蛍光を発する。
このように、FRETを生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウムイオン濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる、タンパク質を当業者であれば作製することができ、これを本発明において用いることができる。同様にして、生物発光共鳴エネルギー移動(BRET)を生じるドナー発光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウムイオン濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる、タンパク質も当業者であれば作製することができ、これを本発明において用いることができる。
FRETおよびBRETにおいては、ドナータンパク質の発光波長が、アクセプター蛍光タンパク質の励起波長と重なるようにドナータンパク質とアクセプター蛍光タンパク質を選択することで、効率良くFRETまたはBRETを誘発することができる。
このようなタンパク質としては、特に限定されないがカメレオンを用いることができる。カメレオンは、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分として、青色蛍光タンパク質(CFP)および黄色蛍光タンパク質(YFP)をそれぞれ有し、これがカルモジュリンとM13ペプチドとで連結された融合タンパク質である。カルモジュリンがカルシウムに反応すると、M13ペプチドと結合し、これによってCFPとYFPの距離が縮まり、FRETを生じるようになる。すなわち、低カルシウムイオン濃度環境下では、この融合タンパク質は、CFPによる蛍光を発するが、高カルシウムイオン濃度環境下(つまり、カルモジュリンがカルシウムに結合する環境下)では、この融合タンパク質は、YFPの蛍光を発する。
このように、FRETを生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウムイオン濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる、タンパク質を当業者であれば作製することができ、これを本発明において用いることができる。同様にして、生物発光共鳴エネルギー移動(BRET)を生じるドナー発光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウムイオン濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる、タンパク質も当業者であれば作製することができ、これを本発明において用いることができる。
FRETおよびBRETにおいては、ドナータンパク質の発光波長が、アクセプター蛍光タンパク質の励起波長と重なるようにドナータンパク質とアクセプター蛍光タンパク質を選択することで、効率良くFRETまたはBRETを誘発することができる。
トリパノソーマ・クルージへの融合タンパク質の導入は、遺伝子発現ベクターを用いて常法により行うことができる。遺伝子発現ベクターは、遺伝子発現を可能とするプロモーターに作動可能に融合タンパク質を連結することによって、融合タンパク質を発現するベクターとして得ることができる。融合タンパク質の導入は、トリパノソーマ・クルージのゲノム中に融合タンパク質をコードする遺伝子を導入することによって行ってもよいであろう。以下、本発明の融合タンパク質を含む細胞内カルシウムインジケーターを体内に有する遺伝子改変トリパノソーマ・クルージを、「本発明の遺伝子改変トリパノソーマ・クルージ」と呼ぶことがある。
トリパノソーマ・クルージは、トリポマスティゴートの形態で細胞内に侵入し、細胞内ではアマスティゴートに変化する。従って、本発明では、本発明の融合タンパク質を体内に有するトリパノソーマ・クルージ(アマスティゴートのステージにある)を細胞内に含む、哺乳動物細胞(以下、「本発明の哺乳動物細胞」ということがある)が提供される。このような哺乳動物細胞は、抗トリパノソーマ薬のスクリーニングや開発に有用であると考えられる。哺乳動物細胞は、例えばヒト細胞であり得る。
本発明の哺乳動物細胞は、トリパノソーマ・クルージが有する第1の本発明の融合タンパク質とは異なる第2の本発明の融合タンパク質を有していてもよい。本発明のある態様では、第2の本発明の融合タンパク質は、第1の融合タンパク質とは異なる波長の蛍光を発し、これにより視覚的にトリパノソーマ・クルージのカルシウムイオン濃度と哺乳細胞のカルシウムイオン濃度とを区別できるようにしてもよい。このようにすることで、トリパノソーマ・クルージ内のカルシウムイオン濃度を推定できると共に、哺乳動物細胞内のカルシウムイオン濃度を推定することが容易になる。
本発明によれば、細胞内のトリパノソーマ・クルージは、そのカルシウムイオン濃度を低下させると死滅することが明らかとなった。従って、本発明によれば、下記の工程を含む、抗トリパノソーマ薬のスクリーニング方法:
(a) 本発明の遺伝子改変トリパノソーマ・クルージ内のカルシウムイオン濃度を前記マーカータンパク質の示す強度を検出して測定する工程、
(b) 被験物質を前記トリパノソーマ・クルージに接触させる工程、および
(c) (a)で測定したカルシウムイオン濃度と比較して、接触によって前記トリパノソーマ・クルージ内のカルシウムイオン濃度を規定比率以下に減少させた物質を選別する工程
が提供される。
(a) 本発明の遺伝子改変トリパノソーマ・クルージ内のカルシウムイオン濃度を前記マーカータンパク質の示す強度を検出して測定する工程、
(b) 被験物質を前記トリパノソーマ・クルージに接触させる工程、および
(c) (a)で測定したカルシウムイオン濃度と比較して、接触によって前記トリパノソーマ・クルージ内のカルシウムイオン濃度を規定比率以下に減少させた物質を選別する工程
が提供される。
上記(a)において、カルシウムイオン濃度は、本発明の融合タンパク質に含まれるマーカータンパク質が示す強度(例えば、蛍光タンパク質の場合は蛍光強度)を検出することにより、測定することができる。マーカータンパク質が示す強度と、カルシウムイオン濃度との関係は、事前に検量線を作製して決定し、得られている検量線に基づいてマーカータンパク質が示す強度からカルシウムイオン濃度を推定してもよい。
上記(b)において、被験物質は、抗トリパノソーマ薬(例えば、抗トリパノソーマ・クルージ薬)の候補である。被験物質は、トリパノソーマ・クルージの細胞膜に対して透過性であっても、非透過性であってもよい。
上記(c)において、(a)で測定したカルシウムイオン濃度と比較して、接触によって前記トリパノソーマ・クルージ内のカルシウムイオン濃度を規定比率以下に減少させた物質が、抗トリパノソーマ・クルージ薬としてスクリーニングされる。ここで、規定比率は、例えば、2分の1、3分の1、4分の1または5分の1以下の数値であり得る。
本発明によればまた、記の工程を含む、トリパノソーマ・クルージのamastigoteに作用する抗トリパノソーマ薬のスクリーニング方法:
(a-0) 本発明の哺乳動物細胞(例えば、ヒト細胞)を提供する工程、
(a-1) 前記トリパノソーマ・クルージのamastigoteのカルシウムイオン濃度を前記マーカータンパク質の示す強度を検出して測定する工程、
(b-1) 被験物質を前記哺乳動物細胞に接触させる工程、
(c-1) (a-1)で測定したカルシウムイオン濃度と比較して、接触によって前記哺乳動物細胞内のトリパノソーマ・クルージのamastigote内のカルシウムイオン濃度を規定値以下に減少させる物質を選別する工程
が提供される。
(a-0) 本発明の哺乳動物細胞(例えば、ヒト細胞)を提供する工程、
(a-1) 前記トリパノソーマ・クルージのamastigoteのカルシウムイオン濃度を前記マーカータンパク質の示す強度を検出して測定する工程、
(b-1) 被験物質を前記哺乳動物細胞に接触させる工程、
(c-1) (a-1)で測定したカルシウムイオン濃度と比較して、接触によって前記哺乳動物細胞内のトリパノソーマ・クルージのamastigote内のカルシウムイオン濃度を規定値以下に減少させる物質を選別する工程
が提供される。
上記(a-0)において、本発明の哺乳動物細胞は、上記の通り、作製することができる。本発明のある態様では、上記哺乳動物細胞は、上述の通り、第2の本発明の融合タンパク質を細胞内に有していてもよい。
上記(a-1)において、カルシウムイオン濃度は、本発明の融合タンパク質に含まれるマーカータンパク質が示す強度(例えば、蛍光タンパク質の場合は蛍光強度)を検出することにより、測定することができる。マーカータンパク質が示す強度と、カルシウムイオン濃度との関係は、事前に検量線を作製して決定し、得られている検量線に基づいてマーカータンパク質が示す強度からカルシウムイオン濃度を推定してもよい。
上記(b-1)において、被験物質は、抗トリパノソーマ薬(例えば、抗トリパノソーマ・クルージ薬)の候補である。被験物質は、トリパノソーマ・クルージの細胞膜に対して透過性であっても、非透過性であってもよい。
上記(c-1)において、(a-1)で測定したカルシウムイオン濃度と比較して、接触によって前記トリパノソーマ・クルージ内のカルシウムイオン濃度を規定値以下に減少させた物質が、抗トリパノソーマ薬(例えば、抗トリパノソーマ・クルージ薬)としてスクリーニングされる。ここで、規定値は、300nM以下、290nM以下、280nM以下、270nM以下、260nM以下、250nM以下、240nM以下、230nM以下、220nM以下、210nM以下、200nM以下、または150nM以下の濃度であり、好ましくは、100nM~250nMの範囲である。
上記(a-0)において、上記哺乳動物細胞は、第2の本発明の融合タンパク質を細胞内に有する場合には、哺乳動物細胞のカルシウムイオン濃度よりも、トリパノソーマ・クルージ内のカルシウムイオン濃度を選択的に低下させる物質を、上記(c-1)において選択することができる。このようにすることで、哺乳動物細胞に対する副作用が低減された抗トリパノソーマ薬(例えば、抗トリパノソーマ・クルージ薬)をスクリーニングできる期待が高まる。
以下、実施例により本発明を説明するが、下記実施例は本発明を限定するために用いられることが意図されているものではなく、本発明を理解するために例示されたものである。そして、本発明は、特許請求の範囲に記載された事項に基づいて規定されるものである。
実施例1:トリパノソーマの生活環と細胞内カルシウムイオン濃度との関係
本実施例では、カルシウムインジケーターであるR-GECO1を強制発現させたT. Cruziを作製し、T. Cruziの生活環と細胞内カルシウムイオン濃度との関係を調べた。
本実施例では、カルシウムインジケーターであるR-GECO1を強制発現させたT. Cruziを作製し、T. Cruziの生活環と細胞内カルシウムイオン濃度との関係を調べた。
(1)R-GECO1遺伝子の発現ベクターの作製
R-GECO1遺伝子は、pCMV-R-GECO1プラスミドベクター(Addgene, plasmid 45494)を鋳型としてPCRにより増幅して得た。この際には、プライマーとして、
フォワードプライマー:5’-CACCATGGTCGACCTTCACGTCGTA-3’ 配列番号7
リバースプライマー :5’-CTACTTCGCTGTCATCATTTGTAC-3’ 配列番号8
をそれぞれ用いた。ここで、フォワードプライマーの下線で示されるCACC配列は、後述するベクターにクローニングするために必要となる配列である。
R-GECO1遺伝子は、pCMV-R-GECO1プラスミドベクター(Addgene, plasmid 45494)を鋳型としてPCRにより増幅して得た。この際には、プライマーとして、
フォワードプライマー:5’-CACCATGGTCGACCTTCACGTCGTA-3’ 配列番号7
リバースプライマー :5’-CTACTTCGCTGTCATCATTTGTAC-3’ 配列番号8
をそれぞれ用いた。ここで、フォワードプライマーの下線で示されるCACC配列は、後述するベクターにクローニングするために必要となる配列である。
PCR増副産物をpENTR/D-TOPO (Life Technologies, Rockville, MD)ベクターにクローニングした。得られたプラスミドをネオマイシン耐性遺伝子を含むpTREXベクターに変換し、Gateway Vector Conversion System (pTREX(neoR)-GW; Life Technologies)で改変してpTREX (neoR)-GW/R-GECO1を得た。このベクターは、リボソームプロモーターでタンパク質発現を駆動するT. cruzi pTREXベクターにクローニングされ(Vazquez, M. P. & Levin, M. J., Gene, 239, 217-225, 1999参照)、タンパク質の恒常的発現を可能とする。
次に、ピューロマイシン耐性遺伝子を、pBApo-CMV Pur DNAプラスミドベクター(Clontech Laboratories, Inc., Mountain View, CA)を鋳型として、以下プライマー:
フォワードプライマー:5’-ATGACCGAGTACAAGCCCAC-3’ 配列番号9
リバースプライマー :5’-TCAGGCACCGGGCTTGC-3’ 配列番号10
を用いたPCRにより増幅した。pTREX (neoR)-GW/R-GECO1のネオマイシン耐性遺伝子を得られたピューロマイシン耐性遺伝子と置き換えるため、pTREX (neoR)-GW/R-GECO1を鋳型とし、以下プライマー:
フォワードプライマー:5’-GGGGATCGATCCGGAACAA-3’ 配列番号11
リバースプライマー :5’-ATTGGCTGCAGGGTCGCT-3’ 配列番号12
を用いたPCRを行った。得られた増副産物とピューロマイシン耐性遺伝子の増副産物とをライゲーションして、pTREX (purR)-GW/R-GECO1を得た。
フォワードプライマー:5’-ATGACCGAGTACAAGCCCAC-3’ 配列番号9
リバースプライマー :5’-TCAGGCACCGGGCTTGC-3’ 配列番号10
を用いたPCRにより増幅した。pTREX (neoR)-GW/R-GECO1のネオマイシン耐性遺伝子を得られたピューロマイシン耐性遺伝子と置き換えるため、pTREX (neoR)-GW/R-GECO1を鋳型とし、以下プライマー:
フォワードプライマー:5’-GGGGATCGATCCGGAACAA-3’ 配列番号11
リバースプライマー :5’-ATTGGCTGCAGGGTCGCT-3’ 配列番号12
を用いたPCRを行った。得られた増副産物とピューロマイシン耐性遺伝子の増副産物とをライゲーションして、pTREX (purR)-GW/R-GECO1を得た。
(2)トリパノソーマ・クルージの培養
T. CruziのTulahuen株のエピマスティゴートは、Iizumi, K. et al., Biochim. Biophys. Acta. 1758, 738-46, 2006に記載の通りに培養した。マンマリアンステージは、HeLa細胞または3T3-Swissアルビノ細胞(Health Science Research Resources Bank, Tokyo, Japan)で維持し、トリポマスティゴートは、感染した3T3-Swissアルビノ細胞のサブカルチャーを遠心分離して回収した(Nakajima-Shimada, J., Antimicrob Agents Chemother. 40, 2455-2458, 1996)。メタサイクロジェネシス(metacyclogenesis)は、Hashimoto, M. et al., Trypanosoma cruzi, Mol Microbiol. 87, 1133-1350, 2013に記載された通りに行った。
T. CruziのTcIP3Rのシングルノックアウト(SKO)株は、Hashimoto, M. et al., Trypanosoma cruzi, Mol Microbiol. 87, 1133-1350, 2013に記載されたものである。
T. CruziのTulahuen株のエピマスティゴートは、Iizumi, K. et al., Biochim. Biophys. Acta. 1758, 738-46, 2006に記載の通りに培養した。マンマリアンステージは、HeLa細胞または3T3-Swissアルビノ細胞(Health Science Research Resources Bank, Tokyo, Japan)で維持し、トリポマスティゴートは、感染した3T3-Swissアルビノ細胞のサブカルチャーを遠心分離して回収した(Nakajima-Shimada, J., Antimicrob Agents Chemother. 40, 2455-2458, 1996)。メタサイクロジェネシス(metacyclogenesis)は、Hashimoto, M. et al., Trypanosoma cruzi, Mol Microbiol. 87, 1133-1350, 2013に記載された通りに行った。
T. CruziのTcIP3Rのシングルノックアウト(SKO)株は、Hashimoto, M. et al., Trypanosoma cruzi, Mol Microbiol. 87, 1133-1350, 2013に記載されたものである。
(3)R-GECO1のT. Cruziでの発現
1×107個体のエピマスティゴートをAmaxa Basic(商標) Parasite Nucleofector Kit 2 solution (Lonza, Germany)で懸濁した。個体(野生型またはTcIP3RのSKO)をpTREX (neoR)/R-GECO1またはpTREX (purR)/R-GECO1とそれぞれ混合し、エレクトロポレーションした。安定形質転換体(野生型)は、0.5 mg/mLのG418を含むLIT培地で30日間細胞を培養して選択した。安定形質転換体(TcIP3RのSKO)は、0.25 mg/mLのG418と3 μg/mLのピューロマイシンを含むLIT培地で30日間細胞を培養して選択した。R-GECO1を安定発現するアマスティゴートおよびトリポマスティゴートは、R-GECO1を安定発現するエピマスティゴートから上述の通り転換して得た。
1×107個体のエピマスティゴートをAmaxa Basic(商標) Parasite Nucleofector Kit 2 solution (Lonza, Germany)で懸濁した。個体(野生型またはTcIP3RのSKO)をpTREX (neoR)/R-GECO1またはpTREX (purR)/R-GECO1とそれぞれ混合し、エレクトロポレーションした。安定形質転換体(野生型)は、0.5 mg/mLのG418を含むLIT培地で30日間細胞を培養して選択した。安定形質転換体(TcIP3RのSKO)は、0.25 mg/mLのG418と3 μg/mLのピューロマイシンを含むLIT培地で30日間細胞を培養して選択した。R-GECO1を安定発現するアマスティゴートおよびトリポマスティゴートは、R-GECO1を安定発現するエピマスティゴートから上述の通り転換して得た。
(4)蛍光顕微鏡下での細胞内カルシウムイオン濃度[Ca2+]iの検出
T. cruziのカルシウムイオン濃度のイメージングでは、蛍光顕微鏡(Axio Imager M2; Carl Zeiss Co. Ltd., Oberkochen, Germany)またはレーザー共焦点顕微鏡(Nikon A1R, Nikon Co. Ltd., Tokyo, Japan)を用いた。通常の培養培地中で蛍光イメージを取得した後に、各個体においてR-GECO1の最大蛍光シグナル(Fmax)を決定するために個体をカルシウム溶液(10 mM Ca2+および0.26 mMイオノマイシン)で処理した。これにより、細胞質Ca2+濃度が上昇し、R-GECO1をCa2+で飽和させることができる。蛍光強度をCa2+濃度に変換するために、以下式を用いた:
[Ca2+]i n = Kd n × (F - FMIN)/(FMAX - F)
{ここで、KdはR-GECO1の解離定数(482nM)であり、nはR-GECO1のヒル係数(2.0)であり、Fは各個体の蛍光強度であり、FMAXは各個体におけるR-GECO1の最大蛍光強度であり、FMINはZhaoらにより得られた変換比を用いて計算されたR-GECO1の最小強度(=FMAX/16)である。}。
BAPTAは、細胞膜非透過性であり、細胞外Ca2+濃度を低下させるCa2+キレート剤であり、O,O’-ビス(2-アミノフェニル)エチレングリコール-N,N,N’,N’-四酢酸塩、テトラアセトキシメチルエステル(BAPTA-AM)は、細胞膜透過性であり、細胞内Ca2+濃度[Ca2+]iを低下させるCa2+キレート剤であり、これらは、Dojindo Molecular Technologies, Inc. (Kumamoto, Japan)から購入した。また、IP3R阻害剤である2-アミノエトキシジフェニルボラート(2-APB)は、Sigma-Aldrich (St. Louis, MO)から購入した。
統計解析は、一元配置分散分析(one-way ANOVA)またはスチューデントのt検定(Student’s t-test)を用いたSigma Plot ver. 12 software (Systat Software, Inc., San Jose, CA)により行った。
T. cruziのカルシウムイオン濃度のイメージングでは、蛍光顕微鏡(Axio Imager M2; Carl Zeiss Co. Ltd., Oberkochen, Germany)またはレーザー共焦点顕微鏡(Nikon A1R, Nikon Co. Ltd., Tokyo, Japan)を用いた。通常の培養培地中で蛍光イメージを取得した後に、各個体においてR-GECO1の最大蛍光シグナル(Fmax)を決定するために個体をカルシウム溶液(10 mM Ca2+および0.26 mMイオノマイシン)で処理した。これにより、細胞質Ca2+濃度が上昇し、R-GECO1をCa2+で飽和させることができる。蛍光強度をCa2+濃度に変換するために、以下式を用いた:
[Ca2+]i n = Kd n × (F - FMIN)/(FMAX - F)
{ここで、KdはR-GECO1の解離定数(482nM)であり、nはR-GECO1のヒル係数(2.0)であり、Fは各個体の蛍光強度であり、FMAXは各個体におけるR-GECO1の最大蛍光強度であり、FMINはZhaoらにより得られた変換比を用いて計算されたR-GECO1の最小強度(=FMAX/16)である。}。
BAPTAは、細胞膜非透過性であり、細胞外Ca2+濃度を低下させるCa2+キレート剤であり、O,O’-ビス(2-アミノフェニル)エチレングリコール-N,N,N’,N’-四酢酸塩、テトラアセトキシメチルエステル(BAPTA-AM)は、細胞膜透過性であり、細胞内Ca2+濃度[Ca2+]iを低下させるCa2+キレート剤であり、これらは、Dojindo Molecular Technologies, Inc. (Kumamoto, Japan)から購入した。また、IP3R阻害剤である2-アミノエトキシジフェニルボラート(2-APB)は、Sigma-Aldrich (St. Louis, MO)から購入した。
統計解析は、一元配置分散分析(one-way ANOVA)またはスチューデントのt検定(Student’s t-test)を用いたSigma Plot ver. 12 software (Systat Software, Inc., San Jose, CA)により行った。
実験と結果
まず、T. Cruziの生活環において細胞内カルシウムイオン濃度[Ca2+]i変化を検出できるかどうかを確認した。上述のように調製したR-GECO1を発現するT. Cruziを100μMのBAPTA-AMの存在下及び非存在下で観察した。T. Cruziの培地をPBSに置き換え、最終濃度100μMのBAPTA-AMを添加し、3分後にR-GECO1の蛍光強度から[Ca2+]iを算出した。結果は、図1Aに示される通りであった。
まず、T. Cruziの生活環において細胞内カルシウムイオン濃度[Ca2+]i変化を検出できるかどうかを確認した。上述のように調製したR-GECO1を発現するT. Cruziを100μMのBAPTA-AMの存在下及び非存在下で観察した。T. Cruziの培地をPBSに置き換え、最終濃度100μMのBAPTA-AMを添加し、3分後にR-GECO1の蛍光強度から[Ca2+]iを算出した。結果は、図1Aに示される通りであった。
図1Aに示されるように、R-GECO1の蛍光強度変化から、BAPTA-AMの添加による[Ca2+]iの濃度変化を確認することができた。このことは、BAPTA-AMがT. Cruziの細胞内カルシウムイオン濃度を低下させることができる。処理後のT. Cruziは死滅していることも確認された。
次に、個体毎のばらつきを排除するためT. cruziをクローニングして、以降の実験を行った。
次に、個体毎のばらつきを排除するためT. cruziをクローニングして、以降の実験を行った。
T. cruziはエピマスティゴート、トリポマスティゴート、およびアマスティゴートの形態を取る。それぞれの形態において[Ca2+]iがどのように変動するかを確認した。結果は図1Bに示される通りであった。
図1Bに示されるように、いずれの形態においても、T. cruziの細胞質においてR-GECO1の蛍光シグナルを観察することができたが、蛍光強度が形態によって大きく異なっていた。そこで、エピマスティゴート(E)、トリポマスティゴート(T)、およびアマスティゴート(A)について、R-GECO1の蛍光シグナル強度から[Ca2+]iを算出した。
すると図1Cに示されるとように、[Ca2+]iは、アマスティゴート(579 ± 204 nM)とエピマスティゴート(327 ± 44 nM)において高く、トリポマスティゴート(85 ± 39 nM)では低かった。この結果は、[Ca2+]iがT. cruziの生活環の進行によって顕著に変動することを意味する。
その後、10mMカルシウムと260μMイオノマイシンを添加したところ、T. cruziの細胞質におけるR-GECO1の蛍光シグナルは同等になった(図1B)。
なお、カルシウム振動はいずれの形態においても観察されなかった。
すると図1Cに示されるとように、[Ca2+]iは、アマスティゴート(579 ± 204 nM)とエピマスティゴート(327 ± 44 nM)において高く、トリポマスティゴート(85 ± 39 nM)では低かった。この結果は、[Ca2+]iがT. cruziの生活環の進行によって顕著に変動することを意味する。
その後、10mMカルシウムと260μMイオノマイシンを添加したところ、T. cruziの細胞質におけるR-GECO1の蛍光シグナルは同等になった(図1B)。
なお、カルシウム振動はいずれの形態においても観察されなかった。
実施例2:宿主細胞に寄生したトリパノソーマの[Ca 2+ ]iの変化
本実施例では、宿主細胞に感染したT. cruziの[Ca2+]i変化を調べた。
3T3-Swiss細胞にR-GECO1発現トリポマスティゴートを感染させ、ある一つのT. cruzi(アマスティゴート)の成長を蛍光顕微鏡下で観察した。結果は図2Aに示される通りであった。
本実施例では、宿主細胞に感染したT. cruziの[Ca2+]i変化を調べた。
3T3-Swiss細胞にR-GECO1発現トリポマスティゴートを感染させ、ある一つのT. cruzi(アマスティゴート)の成長を蛍光顕微鏡下で観察した。結果は図2Aに示される通りであった。
図2Aに示されるように、T. cruziが3回分裂して8つになるところを観察することができた。また、図2Aに示されるように、[Ca2+]iは分裂を通して変化しなかった。
アマスティゴートは細胞内で数回分裂するとトリポマスティゴートに転換し、細胞を溶解させる。宿主細胞に寄生したトリポマスティゴートにおける[Ca2+]iが減少するのかを確認した。結果は、図2Bに示される通りであった。
図2Bに示されるように、宿主細胞においてもトリポマスティゴート(右パネルの矢尻)中でR-GECO1の蛍光シグナルを観察することができた。ここから[Ca2+]iを算出したところ、アマスティゴート(右パネルの矢印)の[Ca2+]iと比較して顕著に低かった。
これらの結果から、アマスティゴートは、宿主細胞の細胞質などの低カルシウムイオン濃度環境においても[Ca2+]iを維持することができることが分かった。また、トリポマスティゴートにおける[Ca2+]iは、アマスティゴートの[Ca2+]iよりも顕著に低かった。
これらの結果から、アマスティゴートは、宿主細胞の細胞質などの低カルシウムイオン濃度環境においても[Ca2+]iを維持することができることが分かった。また、トリポマスティゴートにおける[Ca2+]iは、アマスティゴートの[Ca2+]iよりも顕著に低かった。
実施例3:TcIP 3 Rと[Ca 2+ ]iとの関係
Hashimoto, M. et al., Mol. Microbiol., 87, 1133-1150, 2013においてT. cruziの生活環においてT. cruziのIP3Rホモログ(TcIP3R)のmRNA発現が大きく変動することが見出されている。そこで、本実施例では、TcIP3RのmRNA発現と[Ca2+]iとの関係を調べた。
Hashimoto, M. et al., Mol. Microbiol., 87, 1133-1150, 2013においてT. cruziの生活環においてT. cruziのIP3Rホモログ(TcIP3R)のmRNA発現が大きく変動することが見出されている。そこで、本実施例では、TcIP3RのmRNA発現と[Ca2+]iとの関係を調べた。
図3Aに示されるように、各形態(T、EまたはA)におけるとTcIP3RのmRNA発現量と[Ca2+]iとには正の線型的な相関(R2=0.66)があることが明らかとなった。この結果は、TcIP3RがT. cruziの[Ca2+]iの制御に関与していることを示唆する結果であった。
そこで、Hashimoto, M. et al., Mol. Microbiol., 87, 1133-1150, 2013により作製された、ゲノム上に3つ存在するTcIP3Rの単一ノックアウト(SKO)株を用意した。このSKO株においては、サザンブロット解析により単一のTcIP3Rの発現が特異的に破壊されていることと、SKOにおいてはTcIP3Rの発現が約35%低下していることが明らかとなっている。また、SKOは、エピマスティゴートの成長の抑制などのいくつかの表現型を示す。
ネオマイシン耐性遺伝子を有するSKOにpTREX(purR)をトランスフェクションし、ピューロマイシンとG418とでR-GECO1発現SKOを選択した。また、野生型Tulahuen株にpTREX(purR)をトランスフェクションし、ピューロマイシンで選択した、R-GECO1発現野生株も用意した。R-GECO1の蛍光シグナル強度をランダムにピックアップした複数の個体において測定した。その結果は、図3Bに示される通りであった。
ネオマイシン耐性遺伝子を有するSKOにpTREX(purR)をトランスフェクションし、ピューロマイシンとG418とでR-GECO1発現SKOを選択した。また、野生型Tulahuen株にpTREX(purR)をトランスフェクションし、ピューロマイシンで選択した、R-GECO1発現野生株も用意した。R-GECO1の蛍光シグナル強度をランダムにピックアップした複数の個体において測定した。その結果は、図3Bに示される通りであった。
図3Bに示されるように、SKO株の蛍光強度は、野生株の蛍光強度よりも有意に低かった。また、SKOにおけるTcIP3Rの発現は、野生株の約65%であり、SKO株における蛍光シグナル強度は、野生株の約50%であった。
次に、[Ca2+]iの維持にカルシウムイオンの流入や排出が影響するのかを確認した。具体的には、細胞外培地に過剰量の塩化カルシウムまたは細胞膜非透過性カルシウムキレート剤であるBAPTAを添加した。2時間後、上記処理を行ったT. cruziの[Ca2+]iを非処理のT. cruziの[Ca2+]iと比較した。結果は、図3Cに示される通りであった。
図3Cに示されるように、[Ca2+]iは、過剰量の塩化カルシウムまたはBAPTAの添加によって影響を受けなかった。BAPTAの添加によって培地中のカルシウムイオンがキレートされると、[Ca2+]iはPMCAの機能によって低下し得ると考えていたが、[Ca2+]iはBAPTA処理によっても低下しなかった。この結果は、T. cruziが構成的なカルシウムイオンの流入や排出をしていないことを示唆する。
Claims (18)
- 哺乳動物由来カルモジュリン、ミオシン軽鎖キナーゼ由来ペプチド(M13ペプチド)およびマーカータンパク質との融合タンパク質を含む細胞内カルシウムインジケーターを体内に有する遺伝子改変トリパノソーマ・クルージ。
- マーカータンパク質が蛍光タンパク質又は発光タンパク質である、請求項1記載のトリパノソーマ・クルージ。
- 細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、請求項2に記載のトリパノソーマ・クルージ。
- 蛍光タンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウムイオン濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる、請求項2に記載のトリパノソーマ・クルージ。
- amastigote(アマスティゴートまたは無鞭毛体)のステージにある請求項1から4のいずれか1項に記載のトリパノソーマ・クルージを細胞内に含む哺乳動物細胞。
- 哺乳動物由来カルモジュリン、ミオシン軽鎖キナーゼ由来ペプチド(M13ペプチド)および前記トリパノソーマ・クルージ内のマーカータンパク質と異なるマーカータンパク質との第二の融合タンパク質を含む第二の細胞内カルシウムインジケーターを細胞内にさらに有する、請求項5記載の細胞。
- 第二の細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、請求項6に記載の細胞。
- 第二の細胞内カルシウムインジケーターにおけるマーカータンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウムイオン濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる、請求項6に記載の細胞。
- 下記の工程を含む、抗トリパノソーマ薬のスクリーニング方法:
(a) 請求項1~4のいずれか一項に記載のトリパノソーマ・クルージ内のカルシウムイオン濃度を前記マーカーの示す強度を検出して測定する工程、
(b) 被験物質を前記トリパノソーマ・クルージに接触させる工程、
(c) (a)で測定したカルシウムイオン濃度と比較して、接触によって前記トリパノソーマ・クルージ内のカルシウムイオン濃度を規定比率以下に減少させた物質を選別する工程。 - 下記の工程を含む、トリパノソーマ・クルージのamastigoteに作用する抗トリパノソーマ薬のスクリーニング方法:
(a-0) 請求項1~4のいずれか一項に記載のトリパノソーマ・クルージを感染させた哺乳動物細胞(例えば、ヒト細胞)を提供する工程、
(a-1) 前記トリパノソーマ・クルージのamastigoteのカルシウムイオン濃度を前記マーカーの示す強度を検出して測定する工程、
(b-1) 被験物質を前記哺乳動物細胞に接触させる工程、
(c-1) (a-1)で測定したカルシウムイオン濃度と比較して、接触によって前記哺乳動物細胞内のトリパノソーマ・クルージのamastigote内のカルシウムイオン濃度を規定値以下に減少させる物質を選別する工程。 - 哺乳動物細胞が、哺乳動物由来カルモジュリン、ミオシン軽鎖キナーゼ由来ペプチド(M13ペプチド)およびトリパノソーマ・クルージ内のマーカータンパク質と異なるマーカータンパク質との融合タンパク質を含む第二の細胞内カルシウムインジケーターを細胞内に有する、請求項10記載の方法。
- トリパノソーマ・クルージ内の細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、請求項9から11のいずれか1項に記載の方法。
- トリパノソーマ・クルージ内の細胞内カルシウムインジケーターにおけるマーカータンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウムイオン濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる、請求項9から11のいずれか1項に記載の方法。
- 第二の細胞内カルシウムインジケーターがGECO、好ましくはG-GECO、B-GECO、R-GECO、GEX-GECOまたはGEM-GECOである、請求項11に記載の方法。
- 第二の細胞内カルシウムインジケーターにおける蛍光タンパク質が、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を生じるドナー蛍光タンパク質部分とアクセプター蛍光タンパク質部分を有し、カルシウムイオン濃度をドナー由来およびアクセプター由来の蛍光強度の比により検出できる、請求項11記載の方法。
- トリパノソーマ・クルージに包含されたカルシウムインジケーターがカルシウムの存在下において赤色、橙色、黄色、緑色、および青色のいずれかの蛍光色を呈し、哺乳動物由来の細胞に包含されたカルシウムインジケーターがカルシウムの存在下において前記蛍光色とは異なる蛍光色を呈する、請求項9から15のいずれか1項に記載の方法。
- 工程c-1において、原虫株に包含されたカルシウムインジケーターの蛍光強度を哺乳動物細胞におけるカルシウムインジケーターの蛍光強度に対するよりも選択的に減じる作用を有する物質を選別する、請求項11から15のいずれか一項に記載の方法。
- マーカータンパク質が、赤色蛍光タンパク質に由来する、橙色蛍光タンパク質に由来する、黄色蛍光タンパク質に由来する、または緑色蛍光タンパク質に由来する、または、青色蛍光タンパク質に由来する、請求項1に記載の原虫株、請求項4に記載の原虫株、請求項6~8のいずれか一項に記載の細胞、または請求項9~14のいずれか一項に記載の方法。
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