[go: up one dir, main page]

WO2015006811A3 - Méthodes de diagnostic - Google Patents

Méthodes de diagnostic Download PDF

Info

Publication number
WO2015006811A3
WO2015006811A3 PCT/AU2014/000730 AU2014000730W WO2015006811A3 WO 2015006811 A3 WO2015006811 A3 WO 2015006811A3 AU 2014000730 W AU2014000730 W AU 2014000730W WO 2015006811 A3 WO2015006811 A3 WO 2015006811A3
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
genetic
test
sample
concordance
degree
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Ceased
Application number
PCT/AU2014/000730
Other languages
English (en)
Other versions
WO2015006811A2 (fr
Inventor
Marnie BLEWITT
Leonard Charles Harrison
Jovana MAKSIMOVIC
Gaetano NASELLI
Alicia OSHLACK
Yuxia Zhang
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research
Murdoch Childrens Research Institute
Original Assignee
Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research
Murdoch Childrens Research Institute
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from AU2013902753A external-priority patent/AU2013902753A0/en
Application filed by Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research, Murdoch Childrens Research Institute filed Critical Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research
Publication of WO2015006811A2 publication Critical patent/WO2015006811A2/fr
Anticipated expiration legal-status Critical
Publication of WO2015006811A3 publication Critical patent/WO2015006811A3/fr
Ceased legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6881Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for tissue or cell typing, e.g. human leukocyte antigen [HLA] probes

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Abstract

L'invention concerne une méthode destinée à identifier le niveau d'activité d'un lymphocyte T dans un échantillon biologique de test comprenant des cellules immunitaires, la méthode consistant à cribler un échantillon de test pour les profils de méthylation d'un locus génétique présélectionné/loci sélectionnés dans la liste constituée de : i) au moins un locus génétique ou au moins deux loci génétiques définis dans un ou plusieurs des Tableaux 1 à 5; ii) au moins un locus génétique ou au moins deux loci génétiques définis dans un ou plusieurs des Tableaux 6 à 10; et iii) au moins deux loci génétiques définis dans un ou plusieurs des Tableaux 1 à 5, et un ou plusieurs des Tableaux 6 à 10; et déterminer le degré de concordance entre les profils de méthylation d'essai et un profil de méthylation de référence, dans lequel le degré de concordance identifie le niveau de l'activité des lymphocytes T dans l'échantillon.
PCT/AU2014/000730 2013-07-19 2014-07-18 Méthodes de diagnostic Ceased WO2015006811A2 (fr)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
AU2013902753A AU2013902753A0 (en) 2013-07-19 Diagnostic Methods
AU2013902753 2013-07-19

Publications (2)

Publication Number Publication Date
WO2015006811A2 WO2015006811A2 (fr) 2015-01-22
WO2015006811A3 true WO2015006811A3 (fr) 2016-06-23

Family

ID=52346782

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/AU2014/000730 Ceased WO2015006811A2 (fr) 2013-07-19 2014-07-18 Méthodes de diagnostic

Country Status (1)

Country Link
WO (1) WO2015006811A2 (fr)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2016094961A1 (fr) * 2014-12-19 2016-06-23 Murdoch Childrens Research Institute Essai de méthylation
CA3041055A1 (fr) * 2016-11-04 2018-05-11 Qiagen Sciences, Llc Reactifs de clivage contenant du thiol et lavage oxydatif

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1826278A1 (fr) * 2006-02-28 2007-08-29 Epiontis GmbH Modification épigénétique des loci pour camta1 et/ou foxp3 à des fins de marquage dans le traitement du cancer
WO2009126688A2 (fr) * 2008-04-09 2009-10-15 Genentech, Inc. Compositions et procédés nouveaux pour le traitement de maladies de nature immunitaire

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1826278A1 (fr) * 2006-02-28 2007-08-29 Epiontis GmbH Modification épigénétique des loci pour camta1 et/ou foxp3 à des fins de marquage dans le traitement du cancer
EP1826279A1 (fr) * 2006-02-28 2007-08-29 Charite-Universitätsmedizin Berlin Détection et contrôle de la qualité de lymphocytes T de régulation via l'analyse de méthylation de l'ADN du gène FoxP3
WO2009126688A2 (fr) * 2008-04-09 2009-10-15 Genentech, Inc. Compositions et procédés nouveaux pour le traitement de maladies de nature immunitaire

Non-Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
BARON, U. ET AL.: "DNA demethylation in the human FOXP3 locus discriminates regulatory T cells from activated FOXP3+ conventional T cells", EUROPEAN JOURNAL OF IMMUNOLOGY, vol. 37, 2007, pages 2378 - 2389, XP002503237, DOI: doi:10.1002/EJI.200737594 *
OKHURA, N. ET AL.: "T Cell Receptor Stimulation-Induced Epigenetic Changes and Foxp3 Expression Are Independent and Complementary Events Required for Treg Cell Development", IMMUNITY, vol. 37, 2012, pages 785 - 799 *
ROUAS, R. ET AL.: "Human natural Treg microRNA signature: Role of microRNA-31 and microRNA-21 in FOXP3 expression", EUROPEAN JOURNAL OF IMMUNOLOGY, vol. 39, 2009, pages 1608 - 1618 *
SCHMIDL, C. ET AL.: "Lineage-specific DNA methylation in T cells correlates with histone methylation and enhancer activity", GENOME RESEARCH, vol. 19, 2009, pages 1165 - 1174 *
ZHANG, Y. ET AL.: "Genome-wide DNA methylation analysis identifies hypomethylated genes regulated by FOXP3 in human regulatory T cells", BLOOD, vol. 122, no. 16, 13 October 2013 (2013-10-13), pages 2823 - 2836 *

Also Published As

Publication number Publication date
WO2015006811A2 (fr) 2015-01-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
WO2015200893A3 (fr) Procédés d'analyse d'acides nucléiques provenant de cellules individuelles ou de populations de cellules
SG11202001916TA (en) Systems, methods and hydrogels for cell culture and analysis
WO2014151764A3 (fr) Procédés et compositions pour classification d'échantillons
WO2015159293A3 (fr) Procédé et kit permettant de déterminer l'origine tissulaire ou cellulaire de l'adn
WO2013086429A3 (fr) Procédés et compositions pour la classification d'échantillons
EP4306955A3 (fr) Profilage fonctionnel et moléculaire intégré de cellules
WO2010048417A3 (fr) Bioréacteur à perfusion, systèmes de culture cellulaire et procédés de production de cellules et de produits dérivés de cellule
BRPI1013896A2 (pt) Célula de levedura, e, métodos para produzir um composto isoprenóide e para detectar em uma amostra biológica a presença ou ausência de uma célula microbiana geneticamente.
SG10201903822XA (en) Method for the enrichment of circulating tumor dna
WO2015195949A3 (fr) Méthodes, compositions et dispositifs pour l'analyse rapide de marqueurs biologiques
WO2013159035A3 (fr) Surveillance hautement sensible utilisant une détection d'adn acellulaire
WO2012047678A3 (fr) Appareil, procédé et système pour l'imagerie automatisée et l'évaluation d'embryons, d'ovocytes et de cellules souches
WO2009075799A3 (fr) Procédé de diagnostic des cancers du poumon à l'aide de profils d'expression génétique dans des cellules mononucléaires de sang périphérique
WO2017009372A3 (fr) Système et méthodologie pour l'analyse de données génomiques obtenues auprès d'un sujet
EP2579019A4 (fr) Trieur de cellules, système de tri de cellules, et procédé de tri de cellules
EP3090058A4 (fr) Systemes, compositions et procedes pour la detection et l'analyse de profils des micro-arn a partir d'un echantillon biologique
WO2015130696A8 (fr) Réduction du biais dans des mesures de couverture génomique
WO2012033537A8 (fr) Références pour l'identification des cellules normales
WO2009114185A3 (fr) Procédés et compositions pour profil translationnel et phénotypage moléculaire
EP3829451A4 (fr) Méthodes et systèmes de collecte de cellules et d'échantillons biologiques pour criblage
WO2017147593A3 (fr) Long arn intergénique non codant en tant que biomarqueur de pan-cancer
WO2011156249A3 (fr) Mesure de viabilité et de concentration de levures
HK1215875A1 (zh) 用於监视放射治疗癌症反应的方法和试剂盒
WO2009076229A3 (fr) Procédés permettant de déterminer si un sujet réagira à un inhibiteur bcr-abl
WO2015006811A3 (fr) Méthodes de diagnostic

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 14826515

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A2

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

122 Ep: pct application non-entry in european phase

Ref document number: 14826515

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A2