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WO2010115593A3 - Nouvelles cibles pour le diagnostic et le traitement de la dysplasie - Google Patents

Nouvelles cibles pour le diagnostic et le traitement de la dysplasie Download PDF

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WO2010115593A3
WO2010115593A3 PCT/EP2010/002130 EP2010002130W WO2010115593A3 WO 2010115593 A3 WO2010115593 A3 WO 2010115593A3 EP 2010002130 W EP2010002130 W EP 2010002130W WO 2010115593 A3 WO2010115593 A3 WO 2010115593A3
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Abstract

L'identification de patients courant le risque de développer le cancer à des stades précoces de la maladie aurait un important impact sur la survie globale. Les perturbations moléculaires associées aux stades précoces du cancer du poumon sont, toutefois, inconnues, de même que les réseaux de régulation génique qui induisent la transformation des cellules dysplasiques en cellules malignes. Pour ce faire, la présente invention décrit un procédé simple et efficace pour identifier des cibles diagnostiques pouvant être utilisées dans le diagnostic, ou la surveillance des traitements de la dysplasie, et l'utilisation desdites cibles et substances apparentées pour le diagnostic, la surveillance des traitements et le traitement de la dysplasie, en particulier, la dysplasie de stade bas ou de stade élevé liée à l'adénocarcinome du poumon. En particulier, cette invention concerne un procédé permettant d'identifier des cibles pouvant être utilisées dans le diagnostic ou la surveillance des traitements de la dysplasie, en particulier, la dysplasie de stade bas ou de stade élevé liée à l'adénocarcinome du poumon, comprenant les étapes suivantes : microdissection au laser de cellules provenant du tissu d'un animal transgénique surexprimant un oncogène placé sous la commande d'une séquence de régulation provenant d'un gène spécifique du tissu, pour recueillir des cellules dysplasiques et des cellules morphologiquement non altérées, l'isolation de l'ARN (1) provenant desdites cellules dysplasiques et l'isolation de l'ARN (2) provenant desdites cellules morphologiquement inaltérées, la détermination, pour chacun des ARN (1) et (2) isolés, d'un profil d'expression génique, de préférence, génomique, et l'identification de la cible sous la forme d'un gène significativement surexprimé dans le profil d'expression génique de l'ARN isolé (1) par rapport au profil d'expression génique de l'ARN isolé (2). Plus particulièrement, l'invention concerne l'utilisation d'un gène identifié par ledit procédé, ledit gène étant, de préférence, choisi dans le groupe des Areg, Ereg, Adcyap1, Adora1, Afp, Apoa1, Arg2, Brunol4, Cldn2, Cldn4, Cldn8, CIu, Fst, Gpx2, Gsta4, Hnf4a, Inhbb, Lad1, Pcbd1, Pthlh, Rasgrf1, Rgs16, Stk39, Tnfsf9, de préférence, APOA1 ou dans le groupe des gènes Btbd11, C8orf13, Cyp1 b1, Fetub, Fut2, Klc3, Pcsk6, Pkhd1, Pla2gl1 b, Psrd, Ptprn2, Rnf 128, Ros1, Sdcbp2, Sult2b1, de préférence, PKHD1, ou d'un produit de gène codé par l'un de ceux-ci ou des séquences ARN ou ADN, qui s'hybrident audit gène et qui codent pour un polypeptide ayant la fonction dudit produit de gène, ou d'un anticorps dirigé contre ledit produit de gène ou d'un anticorps dirigé contre ledit polypeptide, pour le diagnostic ou la surveillance des traitements de la dysplasie, en particulier, la dysplasie de stade bas ou de stade élevé liée à l'adénocarcinome du poumon et/ou pour identifier par criblage des médicaments contre la dysplasie, en particulier, la dysplasie de stade bas ou de stade élevé liée à l'adénocarcinome du poumon.
PCT/EP2010/002130 2009-04-03 2010-03-29 Nouvelles cibles pour le diagnostic et le traitement de la dysplasie Ceased WO2010115593A2 (fr)

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Families Citing this family (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2336171A1 (fr) * 2009-12-11 2011-06-22 Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. Nouvelles cibles pour le traitement des maladies proliférantes
JP5858391B2 (ja) 2013-04-22 2016-02-10 株式会社栃木臨床病理研究所 抗腫瘍剤
CN107267518B (zh) * 2017-08-01 2019-11-26 浙江大学 特异性抑制CLDN8基因表达的siRNA及其重组载体和应用
WO2019035075A1 (fr) * 2017-08-17 2019-02-21 NantOmics, LLC. Changements dynamiques dans l'arn libre circulant de tumeurs neurales
CN113122626B (zh) * 2019-12-30 2023-08-11 广州医科大学附属第三医院（广州重症孕产妇救治中心、广州柔济医院） Klc3基因作为标志物在卵巢癌中诊断及治疗的应用
CN119742082B (zh) * 2025-03-04 2025-05-23 天津市胸科医院 基于大数据的主动脉夹层术后对照模型构建方法及系统

Non-Patent Citations (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
CUNNINGHAM STEVEN C ET AL: "Claudin-4, mitogen-activated protein kinase kinase 4, and stratifin are markers of gastric adenocarcinoma precursor lesions", CANCER EPIDEMIOLOGY, BIOMARKERS AND PREVENTION, PHILADELPHIA, PA, US LNKD- DOI:10.1158/1055-9965.EPI-05-0539, vol. 15, no. 2, 1 February 2006 (2006-02-01), pages 281 - 287, XP009135183, ISSN: 1055-9965 *
ILONA LINNOILA R ET AL: "MORPHOMETRIC ANALYSIS OF CC10-hASH1 TRANSGENIC MOUSE LUNG: A Model for Bronchiolization of Alveoli and Neuroendocrine Carcinoma", EXPERIMENTAL LUNG RESEARCH,, vol. 26, no. 8, 1 December 2000 (2000-12-01), pages 595 - 625, XP009135031, ISSN: 0190-2148 *
KWON B S ET AL: "Isolation and sequence analysis of serine protease cDNAs from mouse cytolytic T lymphocytes", THE JOURNAL OF EXPERIMENTAL MEDICINE, ROCKEFELLER UNIVERSITY PRESS, US, vol. 168, no. 5, 1 November 1988 (1988-11-01), pages 1839 - 1854, XP009135421, ISSN: 0022-1007 *
LECHNER S ET AL: "Gene expression pattern of laser microdissected colonic crypts of adenomas with low grade dysplasia", GUT, BRITISH MEDICAL ASSOCIATION, LONDON, UK LNKD- DOI:10.1136/GUT.52.8.1148, vol. 52, no. 8, 1 August 2003 (2003-08-01), pages 1148 - 1153, XP009135028, ISSN: 0017-5749 *
NAMBIAR PRASHANT R ET AL: "Genetic signatures of high- and low-risk aberrant crypt foci in a mouse model of sporadic colon cancer", CANCER RESEARCH, AMERICAN ASSOCIATION FOR CANCER REREARCH, US LNKD- DOI:10.1158/0008-5472.CAN-04-0933, vol. 64, no. 18, 15 September 2004 (2004-09-15), pages 6394 - 6401, XP002510625, ISSN: 0008-5472 *
SABATES-BELLVER JACOB ET AL: "Transcriptome profile of human colorectal adenomas", MOLECULAR CANCER RESEARCH, AMERICAN ASSOCIATION FOR CANCER RESEARCH (A AC R), US, vol. 5, no. 12, 1 December 2007 (2007-12-01), pages 1263 - 1275, XP009135103, ISSN: 1541-7786 *
SYDER ANDREW J ET AL: "A transgenic mouse model of metastatic carcinoma involving transdifferentiation of a gastric epithelial lineage progenitor to a neuroendocrine phenotype", PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES (PNAS), NATIONAL ACADEMY OF SCIENCE, US LNKD- DOI:10.1073/PNAS.0307983101, vol. 101, no. 13, 30 March 2004 (2004-03-30), pages 4471 - 4476, XP009135029, ISSN: 0027-8424 *
WAGENAAR GERRY T M ET AL: "Gene expression profile and histopathology of experimental bronchopulmonary dysplasia induced by prolonged oxidative stress", FREE RADICAL BIOLOGY AND MEDICINE, ELSEVIER SCIENCE, US, vol. 36, no. 6, 15 March 2004 (2004-03-15), pages 782 - 801, XP009135196, ISSN: 0891-5849 *
WALCH AXEL ET AL: "Microdissection of tissue sections: Application to the molecular genetic characterisation of premalignant lesions", PATHOBIOLOGY, KARGER, BASEL, CH LNKD- DOI:10.1159/000028110, vol. 68, no. 1, 1 January 2000 (2000-01-01), pages 9 - 17, XP002188837, ISSN: 1015-2008 *

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