[go: up one dir, main page]

WO2006073195A1 - 糖尿病の予知・診断方法および糖尿病予知・診断用キット - Google Patents

糖尿病の予知・診断方法および糖尿病予知・診断用キット Download PDF

Info

Publication number
WO2006073195A1
WO2006073195A1 PCT/JP2006/300115 JP2006300115W WO2006073195A1 WO 2006073195 A1 WO2006073195 A1 WO 2006073195A1 JP 2006300115 W JP2006300115 W JP 2006300115W WO 2006073195 A1 WO2006073195 A1 WO 2006073195A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
apolipoprotein
substance
protein
diabetes
transthyretin
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Ceased
Application number
PCT/JP2006/300115
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
Toshikazu Yoshikawa
Yuji Naito
Hisashi Arikuni
Satomi Akagiri
Kenichi Mihara
Toshichika Ooki
Tsugihisa Yamaguchi
Syouichi Mafune
Yutaka Takahashi
Yumiko Nakashima
Motohide Aoki
Mari Kobayashi
Eri Kigawa
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Biomarker Science Co Ltd
Original Assignee
Biomarker Science Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Biomarker Science Co Ltd filed Critical Biomarker Science Co Ltd
Priority to JP2006550912A priority Critical patent/JPWO2006073195A1/ja
Publication of WO2006073195A1 publication Critical patent/WO2006073195A1/ja
Anticipated expiration legal-status Critical
Ceased legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/92Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving lipids, e.g. cholesterol, lipoproteins, or their receptors
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/5005Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
    • G01N33/5091Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing the pathological state of an organism
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/76Assays involving albumins other than in routine use for blocking surfaces or for anchoring haptens during immunisation
    • G01N2333/765Serum albumin, e.g. HSA
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/775Apolipopeptides
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/04Endocrine or metabolic disorders
    • G01N2800/042Disorders of carbohydrate metabolism, e.g. diabetes, glucose metabolism

Definitions

  • the present invention relates to a method for prior diagnosis and diagnosis of a disease, a method for evaluating a substance, and a method for screening a substance, and more specifically, using the concentration of a marker substance in a body fluid of a subject as an index.
  • Diagnosis of disease to determine the presence or absence of diabetes or risk of future development (preliminary diagnosis), animals that develop diabetes, or animals with high risk of future development, ingest animals with test substances, and body fluids of the animals
  • the method of evaluating a substance that evaluates the effect of improving diabetes or reducing the risk of future onset of the test substance by using the concentration of the marker substance in the test substance, and the effect of improving diabetes or the future using the evaluation method The present invention relates to a screening method for a substance that screens for a substance having an effect of reducing the risk of developing the disease.
  • the present invention relates to a method for diagnosing glucoseuria by measuring the concentration of a marker substance in blood and comparing the value with a healthy value, and a kit for use in diagnosing diabetes.
  • Diabetes is a complex disease caused by hyperglycemia due to insufficient action of insulin. Diabetes is classified into type 1 and type 2. In type 1 diabetes, as a result of inflammation of the islets of Langernos in the spleen, the ability to secrete insulin is reduced or withered, leading to hyperglycemia. On the other hand, type 2 diabetes causes insulin deficiency due to other causes, leading to hyperglycemia. Is. This type 2 diabetes accounts for the majority of Japanese diabetes and is particularly problematic. The pathogenesis of type 2 diabetes is still unclear. It is believed that the disease is triggered mainly by environmental factors, and overeating and obesity are major causes.
  • the amount of insulin secretion in the spleen increases dramatically due to obesity, resulting in fatigue of the spleen and conversely the decrease in insulin secretion, resulting in insufficient insulin action and hyperglycemia.
  • insulin receptors decrease due to increased fat, resulting in insufficient insulin action and hyperglycemia.
  • the excess glucose produced by the insufficiency of insulin is stored as fat and obesity progresses, and diabetes is closely related to obesity in its pathogenesis.
  • type 2 diabetes often has no subjective symptoms at the beginning of the onset. In other words, it is expected that there will be a considerable number of reserves for type 2 diabetes.
  • Patent Document 1 Japanese Unexamined Patent Application Publication No. 2004-163379
  • An object of the present invention is to provide a diagnostic method for determining the presence or absence of diabetes or the risk of future onset, and a method of evaluating the effect of improving diabetes or reducing the risk of future onset of a test substance, And a means for solving the problem of providing a method for screening a substance having an effect of improving diabetes or reducing the risk of developing future disease using the evaluation method
  • the present inventors have developed a new diabetes that is useful for prior diagnosis and early detection for the prevention of diabetes.
  • proteins that are gene products specific to diabetic patients As a result, we found several proteins with statistically significant differences between diabetics and healthy individuals.
  • these proteins were identified, they were identified as transthyretin, apolipoprotein CII, apolipoprotein CIII, and serum albumin and their derivatives (eg, oxides, cystinates, glycosyl derivatives, etc.) .
  • the present inventors show that transthyretin and apolipoprotein cm in blood are higher than those in healthy subjects in diabetic subjects and pre-diabetes groups, and lower values in healthy subjects than in healthy subjects.
  • the present invention has been completed. That is, the gist of the present invention is as follows.
  • the present inventors also prepared various body fluid samples from the stage before the onset of diabetes, which resolves the above problems, to the boundary between onset and non-onset, and the stage of onset.
  • the body fluid sample was comprehensively analyzed by proteomic analysis using a mass spectrometer.
  • proteomic analysis using a mass spectrometer.
  • proteins that are related to the risk of future onset (that is, enabling pre-diagnosis).
  • a system for determining the presence / absence of diabetes or the risk of future onset ie, prior diagnosis
  • a system for evaluating the diabetic improvement effect or the future risk reduction effect of the test substance was constructed using the concentration of the protein in the body fluid of the animal as an index. Furthermore, using this evaluation method, a system was established to screen for substances that have the effect of improving diabetes or reducing the risk of future onset.
  • the present invention has been completed. That is, the gist of the present invention is as follows.
  • the marker substance is selected from the group consisting of transthyretin, transthyretin derivative, apolipoprotein cn, apolipoprotein cn derivative, apolipoprotein cm, apolipoprotein cm derivative and serum albumin and their corresponding protein strength.
  • the above means are mass spectrometer, nuclear magnetic resonance analyzer, X-ray analyzer, SPR, chromatography, immunological means, biochemical means, electrophoresis instrument, chemical analyzer, two-dimensional fluorescence
  • the quantification means includes a determination means for comparing the standard curve with the measurement result to determine whether the marker substance is within a normal value range.
  • the determination means is a computer.
  • the marker substance includes at least one substance selected from the group consisting of transthyretin and transthyretin derivatives, and the transthyretin derivative comprises S-cystinyl transthyretin, S-cystinyl trans Thyretin, Glutathonylated transthyretin, S—S bond-forming transthyretin, Oxidized transthyretin, Formylated transthyretin, Acetylated transthyretin, Phosphorylated transthyretin, Carbohydrate thyretin with sugar chain 2.
  • the system according to item 1 wherein the system is selected from the group consisting of myristylated transthyretin and complex derivatives thereof.
  • At least one phenomenon selected from the group consisting of a decrease in the transthyretin and an increase in the transthyretin derivative is an indicator of developing diabetes or a high risk for the future.
  • At least one phenomenon selected from the group consisting of a decrease in the transthyretin and an increase in the transthyretin derivative is an indicator of the degree of onset of diabetes or a high risk of developing in the future.
  • the transthyretin has the force encoded by the nucleic acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 3, or the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 4, or a modified sequence thereof.
  • the system according to item 21, comprising:
  • the transthyretin derivative is positioned at position 10 in the amino acid sequence encoded by the nucleic acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 3, or in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 4, respectively.
  • 28. The system according to item 21, wherein the cysteine of the cysteine or a corresponding cysteine is a derivatized derivative.
  • the factor or the means further recognizes transthyretin and S-cysteine transthyretin, and the system further comprises means for identifying U between transthyretin and S-cystineyltransthyretin.
  • the system according to item 1.
  • the factor or the means recognizes transthyretin and S-cysteyl transthyretin
  • the system recognizes the molecular weight of transthyretin and the molecular weight of S-cystineyl transthyretin, and trans Item 4.
  • At least one phenomenon selected from the group comprising the decrease in the apolipoprotein CII and the variability of the apolipoprotein CII derivative is an indicator of developing diabetes or high risk of developing in the future.
  • a decrease in the apolipoprotein CII and the variability of the apolipoprotein CII derivative are at least one phenomenon selected from the group consisting of indicators of a degree of developing diabetes or a high risk of developing in the future.
  • the apolipoprotein CII has a force encoded by the nucleic acid sequence shown in SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 7, or the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 6 or SEQ ID NO: 8, or a modified sequence thereof.
  • the factor or the means has an ability to selectively identify apolipoprotein CII, and the system includes a means for quantifying the apolipoprotein CII.
  • the marker substance includes apolipoprotein cm or an apolipoprotein CIII derivative, and the apolipoprotein cm is apolipoprotein cni,
  • apolipoprotein cm derivative is selected from the group consisting of apolipoprotein cni and apolipoprotein cm force.
  • (39) at least selected from the group consisting of an increase in apolipoprotein cm, an increase in apolipoprotein cni, and an increase in apolipoprotein cm
  • At least one phenomenon selected from the group consisting of the increase in apolipoprotein cm, the increase in apolipoprotein cni, and the increase in apolipoprotein cm is diabetic.
  • the apolipoprotein cm has a force encoded by the nucleic acid sequence shown in SEQ ID NO: 9 or SEQ ID NO: 11, or the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 10 or SEQ ID NO: 12, or they 39.
  • the system according to item 38, wherein the force is also a morphological force lacking the 20 amino acids at the N-terminal, or a modified sequence thereof.
  • the apolipoprotein cm derivative is represented by the force encoded by the nucleic acid sequence shown in SEQ ID NO: 9 or SEQ ID NO: 11 or the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 10 or SEQ ID NO: 12, Each of the 94th and 95th positions or the corresponding threonine derivative with a sugar chain
  • the factor or the means described above is apolipoprotein cm, apolipoprotein CI
  • the system according to 38. (45) The above-mentioned factor or the above means comprises: apolipoprotein cm and apolipoprotein CI
  • the above-mentioned factor or the above means is apolipoprotein cm, apolipoprotein CI
  • the factor or the means recognizes apolipoprotein cm and an apolipoprotein CII I derivative, and the system comprises apolipoprotein cm and apolipoprotein cn
  • the factor or the means recognizes apolipoprotein cm and an apolipoprotein cn I derivative, and the system comprises apolipoprotein cm, apolipoprotein
  • the factor or the means recognizes apolipoprotein cm and an apolipoprotein cn I derivative, and the system comprises apolipoprotein cm and apolipoprotein.
  • Item 38 further comprising means for distinguishing between II and apolipoprotein cm.
  • the serum albumin has the force encoded by the nucleic acid sequence shown in SEQ ID NO: 13 or SEQ ID NO: 15, or the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 14 or SEQ ID NO: 16, or a modified sequence thereof. 52. The system according to 52.
  • Item 60 The method according to Item 60, wherein the concentration of a marker substance in blood is measured, the value is compared with a healthy value, and the group substance of transthyretin, apolipoprotein CIII, and serum albumin is selected as the marker substance.
  • the apolipoprotein CIII is apolipoprotein CIII, apolipoprotein CIII,
  • Apolipoprotein CIII group power is also selected.
  • Diabetes mellitus diagnosis method according to item 66.
  • step (2) a step of detecting diabetes by comparing the concentration of transthyretin in serum or plasma obtained in step (1) with a healthy value;
  • step (3) if diabetes is not detected in step (2), the step of detecting diabetes by comparing the concentration value of apolipoprotein cm in serum or plasma with a healthy value;
  • step (3) the step of detecting diabetes by comparing the concentration of apolipoprotein CIII in serum or plasma with a healthy value
  • (6) a step of detecting diabetes by comparing the serum albumin obtained in step (5) or the serum albumin concentration value with a healthy value;
  • step (6) If diabetes is detected in step (6), the step of detecting diabetes by comparing the apolipoprotein CIII concentration in serum or plasma with a healthy value;
  • step (7) When diabetes is not detected in step (7), the step of detecting diabetes by further comparing the concentration value of apolipoprotein CIII in serum or plasma with a healthy value;
  • the diagnostic method according to item 67 comprising:
  • the concentration of apolipoprotein CIII in serum or plasma is further compared with a healthy value to detect diabetes.
  • Item 72 The method according to Item 68.
  • the concentration of apolipoprotein CIII in serum or plasma is compared with a healthy value to detect diabetes.
  • Item 72 The method according to Item 69.
  • Item 60 The method according to Item 60, wherein the concentration of the marker substance in the blood is measured, the value is compared with a healthy value, and the marker substance is the following (a;) to (e):
  • Item 60 The method according to Item 60, wherein the concentration of the marker substance in the blood is measured and the value is determined.
  • Item 66 to 73 wherein serum or plasma is contacted with a carrier on which a substance having affinity for the marker substance is immobilized, the marker substance is captured, and the concentration of the marker substance is measured.
  • the method of crab is contacted with a carrier on which a substance having affinity for the marker substance is immobilized, the marker substance is captured, and the concentration of the marker substance is measured.
  • Item 2 The system according to Item 1, wherein the antibody is immobilized on a carrier. (79)
  • Item 60 The method according to Item 60, wherein the following marker substances (a) to (n) in the body fluid of the subject:
  • (m) weak cation exchange at pH 4.0 A protein that binds to the body and produces an ion peak with a mass to charge ratio of approximately 12800 when subjected to mass spectrometry;
  • the body fluid or body fluid component is brought into contact with a carrier on which a substance having affinity for the marker substance is immobilized, the marker substance in the body fluid is captured on the carrier, and based on the amount of the captured marker substance.
  • a carrier on which a substance having affinity for the marker substance is immobilized
  • the marker substance in the body fluid is captured on the carrier, and based on the amount of the captured marker substance.
  • Item 84 The method according to Item 84, wherein the marker substance is the following marker substance (a) to (n):
  • (m) weak cation exchange at pH 4.0 A protein that binds to the body and produces an ion peak with a mass to charge ratio of approximately 12800 when subjected to mass spectrometry;
  • a method wherein the protein is at least one protein selected from the group consisting of: (87)
  • the above-mentioned standard value is the value obtained when an animal that has developed diabetes or an animal that has a high risk of developing in the future is ingested with a known substance that does not have an effect of improving diabetes or reducing the risk of developing future disease. 89.
  • test substance is a food material.
  • the body fluid or body fluid component is brought into contact with a carrier on which a substance having affinity for the marker substance is fixed, the marker substance in the body fluid is captured on the carrier, and the amount of the marker substance captured.
  • a carrier on which a substance having affinity for the marker substance is fixed
  • the marker substance in the body fluid is captured on the carrier, and the amount of the marker substance captured.
  • Substance screening characterized in that the test substance is evaluated by the substance evaluation method described in any of items 84 to 92, and a substance having an effect of improving glucoseuria or reducing the risk of developing future disease is screened. Method.
  • Transthyretin, apolipoprotein cm, and serum albumin are known substances and have some known clinical significance. It has become clear for the first time that the present invention can be a marker substance for diabetes. .
  • diabetes diagnosis and pre-diagnosis can be performed more reliably and accurately.
  • diabetes can be diagnosed and pre-diagnosed by a multi-marker system by combining a plurality of marker substances.
  • diabetes can be diagnosed and pre-diagnosed more easily and with high accuracy.
  • composition diagnosis and pre-diagnosis of the disease of the present invention, in addition to the presence or absence of diabetes, the risk of future onset of diabetes is determined (ie, prior diagnosis). can do.
  • the effect of reducing the risk of developing future diabetes can be evaluated.
  • a substance having an effect of improving diabetes in addition to a substance having an effect of improving diabetes, a substance having an effect of reducing the future risk of developing diabetes can be screened.
  • FIG. 1 is a flowchart showing the procedure of an example in which the method for diagnosing diabetes of the present invention is applied to a multimarker system.
  • FIG. 2 is a flowchart showing another example procedure in which the method for diagnosing diabetes of the present invention is applied to a multi-marker system.
  • FIG. 3 Measurement results for the peak with mZz of 13867 are shown.
  • Fig. 3 (a) is a graph plotting peak intensities for diabetics and healthy subjects
  • Fig. 3 (b) is a graph of Fig. 3 (a). Is a graph showing the maximum value, minimum value, median value, and cut-off value
  • Fig. 3 (c) is a graph showing the ROC curve.
  • FIG. 4 The measurement results for the peak with mZz of 8690 are shown.
  • Fig. 4 (b) is a graph plotting the peak intensities for the normal subjects.
  • Figure 4 (c) is a graph showing the ROC curve.
  • FIG. 5 is a photograph showing the result of subjecting the serum of a diabetic patient to two-dimensional electrophoresis.
  • FIG. 6 The measurement results for the peak with mZz of 66216 are shown.
  • Fig. 6 (a) is a graph plotting peak intensities for diabetics and healthy subjects
  • Fig. 6 (b) is the graph of Fig. 6 (a). Is a graph showing the maximum value, minimum value, median value, and cut-off value
  • FIG. 6 (c) is a graph showing the ROC curve.
  • FIG. 7 Box diagram of the ion peak with mass Z charge ratio of 7043 (average value).
  • FIG. 8 is a box diagram for an ion peak with a mass Z charge ratio of 8325 (average value).
  • FIG. 9 is a box diagram of an ion peak with a mass Z charge ratio of 8532 (average value).
  • FIG. 10 is a box diagram of an ion peak with a mass Z charge ratio of 9062 (average value).
  • FIG. 11 is a box diagram of an ion peak with a mass Z charge ratio of 9255 (average value).
  • FIG. 12 is a box diagram of an ion peak with a mass Z charge ratio of 9445 (average value).
  • FIG. 13 is a box diagram of an ion peak with a mass Z charge ratio of 13720 (average value).
  • FIG. 14 is a box diagram of an ion peak having a mass Z charge ratio of 76404 (average value).
  • FIG. 15 is a box diagram of an ion peak with a mass Z charge ratio of 79085 (average value).
  • FIG. 16 is a box diagram of an ion peak with a mass Z charge ratio of 3497 (average value).
  • FIG. 17 is a box diagram of an ion peak with a mass Z charge ratio of 3559 (average value).
  • FIG. 18 is a box diagram of an ion peak with a mass Z charge ratio of 4184 (average value).
  • FIG. 19 is a box diagram of an ion peak with a mass Z charge ratio of 12786 (average value).
  • FIG. 20 This is a box diagram of the ion peak with mass Z charge ratio of 65700 (average value).
  • FIG. 25 shows the tetrameric structure of TTR and the amino acid sequence of the monomer.
  • transthyretin usually has a tetrameric structure, and it is postulated that when it collapses, it becomes diabetic.
  • FIG. 26 shows the three-dimensional structure (top) and secondary structure sequence (bottom) of the human TTR a-domain.
  • FIG. 27 shows a gel photograph of a band identified as rat apolipoprotein CIII and analysis of the band by SELDI-TOF.
  • FIG. 28 shows a gel photograph of a band identified as rat apolipoprotein CIII and analysis of the band by SELDI-TOF.
  • FIG. 29 shows spots on two-dimensional electrophoresis that are considered to be spots of human polypoprotein CIII (0-2).
  • FIG. 30 shows the result of mass spectrometry of each spot in FIG.
  • FIG. 31 shows the SELDI-MS results for each spot.
  • FIG. 32 shows the results of a CM10 study.
  • FIG. 34 shows the results of examination of optimum conditions. From these results, it is clear that the obtained spot is a spot of human polypoprotein CIII (0-2).
  • FIG. 38 shows measured data for MZZ: 13, 863 in diabetic patients.
  • FIG. 39 shows a diabetic rat serum 8.3K (Apo CII) box diagram.
  • FIG. 40 shows the above time-series data.
  • FIG. 41 shows the results of SELDI-MS of the band on the gel.
  • FIG. 42 shows confirmation of the obtained band by Western blot.
  • FIG. 43 shows the enhancement by anti-ApoC2 antibody in chromatographic fractionation.
  • FIG. 44 shows that apolipoprotein CII in humans is also a pre-diagnostic marker. Here, the mass spectrometry result of a healthy person's apolipoprotein CII is shown.
  • FIG. 45 shows that apolipoprotein CII in humans is also a pre-diagnostic marker.
  • the mass spectrometry result of apolipoprotein CII of a diabetic patient is shown.
  • FIG. 46 shows that apolipoprotein CII in humans using another fraction is also a pre-diagnostic marker. Here, the results of the mass analysis of apolipoprotein CII in healthy individuals are shown.
  • FIG. 47 shows that apolipoprotein CII in humans using a different fraction is also a pre-diagnostic marker. Here, the results of mass spectrometry of apolipoprotein CII in diabetic patients are shown.
  • SEQ ID NOs: 1-2 transthyretin human (nucleic acid and amino acid sequences, respectively)
  • SEQ ID NO: 3-4 transthyretin rat (nucleic acid and amino acid sequences, respectively)
  • SEQ ID NOs: 5-6 apolipoprotein cn human (respectively, nucleic acid sequences) And amino acid sequences)
  • SEQ ID NOs: 7-8 Apolipoprotein cn rat (nucleic acid sequence and amino acid sequence, respectively)
  • SEQ ID NOs: 9-10 apolipoprotein cm human (nucleic acid sequence and amino acid sequence, respectively)
  • SEQ ID NO: 11 12 apolipoprotein cm rat (nucleic acid sequence and amino acid sequence, respectively)
  • SEQ ID NO: 13-14 Serum albumin Human (Nucleic acid sequence and amino acid sequence, respectively)
  • SEQ ID NO: 15-16 Serum albumin Rat (Nucleic acid sequence and amino acid sequence, respectively)
  • SEQ ID NO: 17-18 Serum albumin mouse (Nucleic acid sequence and amino acid sequence, respectively) )
  • SEQ ID NO: 19 Serum albumin (Nucleic acid sequence and amino acid sequence, respectively)
  • SEQ ID NO: 21-22 Serum albumin Usagi (Nucleic acid sequence and amino acid sequence, respectively)
  • SEQ ID NOs: 23-24 Serum albumin monkeys (nucleic acid sequence and amino acid sequence, respectively) BEST MODE FOR CARRYING OUT THE INVENTION
  • Examples of technologies related to protein chips include technologies available from Cyphergen.
  • marker substance refers to a substance that serves as an indicator for tracking whether there is a certain condition (eg, a disease such as diabetes)! .
  • marker substances include genes, gene products, metabolites, and enzymes.
  • gene product refers to a protein or mRNA encoded by a gene.
  • gene products not directly related to sugar metabolism ie, proteins not related to sugar metabolism such as insulin
  • proteins not related to sugar metabolism such as insulin
  • transthyretin is also known as prealbumin, and is known as a protein that forms a tetramer composed of homogenous subunits. It is known to form a protein complex with retinol-binding protein (RBP), which binds to thyroxine (T). In rats, the main T transport tongue
  • Transthyretin was isolated and purified by Raz, A. et al., And its primary structure was identified by Kanda et al. (Raz, A. & Goodman DS, (1969), J. Biol. Chem. 224, 3230-3237; Kanda, Y. et al., (1974), J. Biol. Chem., 247, 6796-6805).
  • Kanda et al. Ros, A. & Goodman DS, (1969), J. Biol. Chem. 224, 3230-3237
  • Kanda, Y. et al. (1974), J. Biol. Chem., 247, 6796-6805.
  • the abnormality is associated with Alzheimer's dementia and familial amyloidosis poly-Europe.
  • a representative nucleotide sequence of transthyretin is:
  • amino acid sequence of transthyretin is:
  • polypeptide having activity (a) a polypeptide comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 4 or a fragment thereof; (b) having one mutation selected from the group consisting of substitution, addition and deletion in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 4, and one or more amino acids, and biological A polypeptide having activity;
  • polypeptide having an amino acid sequence with at least 70% identity to any one of the polypeptides of (a) to (d) and having biological activity
  • transthyretin Representative sequences of transthyretin are shown in SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 3 (nucleic acid sequence) and SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 4 (amino acid sequence).
  • transthyretin is known as, for example, a protein that forms a tetramer, and is a retinol-binding protein (RBP) that is a vitamin A transport protein in blood.
  • RBP retinol-binding protein
  • T thyroxine
  • Transthyretin is a complex protein consisting of four subunits having a molecular weight of about 14,000 and is synthesized in the liver.
  • the clinical significance of transthyretin in the blood is said to reflect the nutritional state and the ability of the liver to synthesize proteins, and is known to show high levels in the recovery phase of nephrotic syndrome and acute hepatitis.
  • transthyretin refers to both a tetrameric complex protein and a subunit alone without any particular distinction.
  • Transthyretin and its derivatives are not limited to humans, rats, and other animals (for example, mammals) and homologs thereof (hereinafter referred to as "corresponding" genes or proteins). Are known. Therefore, in the present specification, transthyretin and a derivative thereof usually refer to transthyretin and a derivative thereof present in general organisms as well as humans and rats unless otherwise specified.
  • transthyretin derivative refers to any inducement of transthyretin. Refers to conductors, especially metabolites in vivo such as post-translational modifications. Representative transthyretin derivative modifications are shown below with mass variation values:
  • transthyretin derivatives include cystine (systemyl), dartathionization, s-S bond formation, oxidation (eg, oxidation of methionine side chain), formylation , Acetylation, phosphorylation, glycosylation, myristylation, and the like, but are not limited thereto.
  • the amount of transthyretin is reduced in a diabetic patient or at a high risk to the subject, and instead a specific derivative of transthyretin (eg, cysteine transthysine).
  • transthyretin eg, cysteine transthysine
  • Retin, Dartathionized transthyretin, S—S bond-formed transthyretin, oxidized transthyretin (eg, transthyretin with methionine side chain acidified), formylated transthyretin, acetylated transthyretin, phosphorylated Transthyretin, sugar-linked lance thyretin, and myristylated transthyretin were found to increase. Therefore, it is possible to diagnose or pre-diagnose a subject with a high risk of diabetes or its risk using the decrease of these transthyretins or the increase of transthyretin derivatives as an index.
  • apolipoprotein or “apolipid protein” means lipid and A protein that binds to form a lipid protein and is roughly classified into A, B, C, D, and E. It is the protein component of the lipoprotein complex, which is a typical component of human plasma milk fat particles (chylomicron), HDL, LDL, and VLDL. Apolipoprotein C — II (sometimes abbreviated as APOC2) is a polypoprotein present in VLDL, HDL and chylomicrons. It is an active factor of lipoprotein lipase. This protein deficiency results in hyperchylomicronemia and hypertriglyceridemia.
  • Apolipoprotein C-III (sometimes abbreviated as APOC3) is an apolipoprotein present in VLDL, HDL, and chylomicron, and is known to suppress many lipases.
  • APOC3 apolipoprotein C-III
  • a representative nucleotide sequence of apolipoprotein CII is:
  • a polynucleotide encoding a variant polypeptide having biological activity
  • amino acid sequence of apolipoprotein CII is:
  • amino acids In the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 6 or SEQ ID NO: 8, one or more amino acids have one mutation selected from the group consisting of substitution, addition, and deletion, and have biological activity A polypeptide;
  • polypeptide having an amino acid sequence with at least 70% identity to any one of the polypeptides of (a) to (d) and having biological activity
  • apolipoprotein CII is shown in SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 7 (nucleic acid sequence) and SEQ ID NO: 6 or SEQ ID NO: 8 (amino acid sequence).
  • Examples of the biological activity of apolipoprotein CII include the ability to constitute VLDL, HDL, and chylomicron.
  • Apolipoprotein CII is a homologue of humans, rats, and other animals (eg, mammals) (hereinafter referred to as “corresponding” gene or protein, etc.). )It has been known. Therefore, in the present specification, unless otherwise specified, apolipoprotein CII usually refers to apolipoprotein CII that exists in human beings, rats and general organisms.
  • Apolipoprotein is produced as a pro-form. When making a more detailed judgment, it is preferable to distinguish between the body and the mature body.
  • a representative nucleotide sequence of apolipoprotein cm is:
  • one or more amino acids are a variant polypeptide having one mutation selected from the group consisting of substitution, addition and deletion ability, or a fragment thereof A polynucleotide encoding a variant polypeptide having biological activity;
  • one or more amino acids in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 10 or SEQ ID NO: 12, one or more amino acids have one mutation selected from the group consisting of substitution, addition and deletion, and have biological activity Having a polypeptide;
  • polypeptide that is a species homologue of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 10 or SEQ ID NO: 12, or (e) a polypeptide having an amino acid sequence with at least 70% identity to any one of the polypeptides of (a) to (d) and having biological activity,
  • apolipoprotein cm Representative sequences of apolipoprotein cm are shown in SEQ ID NO: 9 or SEQ ID NO: 11 (nucleic acid sequence) and SEQ ID NO: 10 or SEQ ID NO: 12 (amino acid sequence).
  • Examples of the biological activity of apolipoprotein CIII include the ability to form VLDL, HDL, and chylomicron.
  • Apolipoprotein cm is the homologue of humans, rats, other animals (eg, mammals) (hereinafter referred to as “corresponding” gene or protein, etc.). )It has been known. Therefore, in the present specification, apolipoprotein cm usually refers to apolipoprotein CIII present in humans, rats, and organisms unless otherwise specified.
  • apolipoprotein cm is at least CIII, CIII, CIII.
  • apolipoprotein CIII is a general term for three types of proteins, and is classified into apolipoprotein cni, apolipoprotein cm, and apolipoprotein cm.
  • the concentration of at least one of these three types of apolipoprotein cm is measured. According to the method for diagnosing diabetes of the present invention, since the concentration of apolipoprotein cm is subdivided and measured, the accuracy is high!
  • Apolipoprotein cm is one of 10 or more apolipoproteins present in the blood and is synthesized in the liver.
  • the clinical significance of apolipoprotein cm in the blood is known to be high in obstructive jaundice antilipidemia.
  • apolipoprotein cm depends on the presence or absence of sugar chains and the difference in structure.
  • Apolipoprotein cni has no sugar chain
  • apolipoprotein cni is apolipoprotein C
  • apolipoprotein cm is apolipoprotein
  • a sugar chain is added to I in a more complex manner.
  • serum albumin means that albumin contained in serum is the most abundant in serum protein (about 4 g per 100 ml), and 60% of the total protein is contained. Occupy. In humans, it has a molecular weight of 64000-68000 and an isoelectric point of pH 4.7-4.9. It has several roles, such as maintaining blood osmotic pressure, binding and transporting various substances (ions, pigments, some water-soluble vitamins, drugs, etc.), and providing a source of amino acids to tissues. It is. Serum albumin is an albumin and the most abundant protein in serum.
  • Serum albumin is a protein that does not have a sugar chain and has a molecular weight of about 69000 (calculated value of amino acid primary structure is 66439) and is synthesized in the liver.
  • the clinical significance of serum albumin in blood is known to be low, reflecting the deterioration of nutritional status and the degree of liver damage.
  • a representative nucleotide sequence of serum albumin is:
  • one or more amino acids are a variant polypeptide or a fragment thereof having one mutation selected from the group consisting of substitution, addition and deletion ability
  • one or more amino acids in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 14 or SEQ ID NO: 16, one or more amino acids have one mutation selected from the group consisting of substitution, addition and deletion, and have biological activity Having a polypeptide;
  • polypeptides of (a) to (d) and having biological activity (d) a polypeptide that is a species homologue of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 14 or SEQ ID NO: 16; or (e) a polypeptide having an amino acid sequence with at least 70% identity to any one of the polypeptides of (a) to (d) and having biological activity,
  • serum albumin Representative sequences of serum albumin are shown in SEQ ID NO: 13 or SEQ ID NO: 15 (nucleic acid sequence) and SEQ ID NO: 14 or SEQ ID NO: 16 (amino acid sequence).
  • the biological activity of serum albumin includes, for example, maintaining blood osmotic pressure, binding and transporting various substances (ions, dyes, some water-soluble vitamins, drugs, etc.), The ability to supply amino acids can be mentioned.
  • Serum albumin is known to be homologous in humans, rats, and other animals (eg, mammals) (referred to herein as “corresponding” genes or proteins). Being! / Therefore, in the present specification, serum albumin usually refers to serum albumin present not only in humans, rats but also in general organisms, unless otherwise specified. Other animal sequences for serum albumin include mouse (SEQ ID NO: 17-18), Inu (SEQ ID NO: 19-20), Usagi (SEQ ID NO: 21-22), monkey (SEQ ID NO: 23-24). it can.
  • diagnosis or pre-diagnosis can be realized by using a factor or means specific to the marker substance.
  • agent refers to any substance or other element (eg, energy such as light, radioactivity, heat, electricity, etc.) as long as the intended purpose can be achieved. There may be.
  • substances include, for example, proteins, polypeptides, oligopeptides, peptides, polynucleotides, oligonucleotides, nucleotides, nucleic acids (eg, DNA such as cDNA, genomic DNA, RNA such as mRNA), Polysaccharides, oligosaccharides, lipids, small organic molecules (e.g.
  • a specific factor for a polynucleotide is typically a polynucleotide having a certain sequence homology to the polynucleotide sequence (for example, 70% or more sequence identity) and complementarity.
  • a transcription factor that binds to the promoter region examples include, but are not limited to, polypeptides such as children.
  • Factors specific for a polypeptide typically include an antibody specifically directed against the polypeptide or a derivative or analog thereof (eg, a single chain antibody), a polypeptide thereof. Examples include, but are not limited to, a specific ligand or receptor when the peptide is a receptor or a ligand, and a substrate when the polypeptide is an enzyme.
  • a factor that specifically interacts” with a biological agent such as a polynucleotide or a polypeptide means an affinity for a biological agent such as that polynucleotide or its polypeptide.
  • Gender is typically the same, or preferably significantly (eg, statistically) greater than its affinity for other unrelated (especially less than 30% identity) polynucleotides or polypeptides. Includes those that are scientifically significant).
  • affinity can be measured, for example, by hybridization assay, binding assay, or the like.
  • a first substance or factor "specifically interacts" with a second substance or factor means that the first substance or factor is to interact with a higher affinity than a substance or factor other than a second substance or factor (especially another substance or factor present in a sample containing a second substance or factor).
  • Specific interactions for substances or factors include both nucleic acids and proteins, such as hybridization in nucleic acids, antigen-antibody reactions in proteins, ligand-receptor reactions, enzyme-substrate reactions, etc. Examples include, but are not limited to, protein-lipid interaction, nucleic acid-lipid interaction, and the like, such as a reaction between a transcription factor and a binding site of the transcription factor.
  • the first substance or factor when both a substance or factor is a nucleic acid, the first substance or factor is “specifically interacting” with the second substance or factor if the first substance or factor is the second substance. Alternatively, it includes at least a part of the complementarity to the factor.
  • the fact that the first substance or factor “specifically interacts” with the second substance or factor includes, for example, an antigen-antibody reaction interaction, Examples include interaction by septa-one ligand reaction, enzyme-substrate interaction, etc. It is not limited to them.
  • the first substance or factor “specifically interacts” with the second substance or factor means that the transcription factor and the transcription factor Interactions with the binding region of the nucleic acid molecule of interest are included.
  • antibody refers to polyclonal antibodies, monoclonal antibodies, multispecific antibodies, chimeric antibodies, and anti-idiotype antibodies, and fragments thereof, such as F (ab ') and Fab fragments, As well as other recombinantly produced conjugates.
  • antibodies may be covalently linked or recombinantly fused to an enzyme, such as alkaline phosphatase, horse radish peroxidase, alpha galactosidase, etc.
  • an enzyme such as alkaline phosphatase, horse radish peroxidase, alpha galactosidase, etc.
  • antigen refers to any substrate that can be specifically bound by an antibody molecule.
  • immunogen refers to an antigen capable of initiating lymphocyte activity that produces an antigen-specific immune response.
  • the antibody used in the present invention may be a polyclonal antibody or a monoclonal antibody.
  • compound means any identifiable chemical entity or molecule, including small molecules, peptides, proteins, sugars, nucleotides, or nucleic acids. Without being limited thereto, and such compounds can be natural or synthetic.
  • small organic molecule means an organic molecule having a relatively small molecular weight. Usually, a small organic molecule has a molecular weight of about 1000 or less, but may have a higher molecular weight. Small organic molecules can be synthesized by using methods known in the art or by combining them. Such small organic molecules may be produced by living organisms. Examples of small organic molecules include hormones, ligands, signal transmitters, Examples include, but are not limited to, small molecules, molecules synthesized by combinatorial chemistry, and small molecules that can be used as pharmaceuticals (for example, small molecule ligands).
  • ligand refers to a substance that specifically binds to a protein.
  • ligands For example, lectins, antigens, antibodies, hormones, neurotransmitters, etc. that specifically bind to various receptor protein molecules present on the cell membrane can be mentioned as ligands.
  • protein protein
  • polypeptide oligopeptide
  • peptide refers to a polymer of amino acids of any length.
  • the polymer may be linear or branched or cyclic.
  • the amino acid may be a modified amino acid, whether natural or non-natural.
  • the term can also refer to a complex assembled into a complex of multiple polypeptide chains.
  • the term also encompasses natural or artificially modified amino acid polymers. Such modifications include, for example, disulfide bond formation, glycosylation, lipidation, acetylation, phosphate or any other manipulation or modification (eg, conjugation with a labeling component) and the like. .
  • polypeptides containing one or more analogs of amino acids eg, including non-natural amino acids, etc.
  • peptidomimetic compounds eg, peptoids
  • Other modifications are included.
  • the “polypeptide” of the present invention may refer to a marker substance.
  • amino acid may be natural or non-natural.
  • “Derivative amino acid” or “amino acid analog” refers to an amino acid that is different from a naturally occurring amino acid but has the same function as the original amino acid. Such derivative amino acids and amino acid analogs are well known in the art.
  • natural amino acid means the L isomer of a natural amino acid. Natural amino acids are glycine, alanine, norin, leucine, isoleucine, serine, methionine, threonine, phenylalanine, tyrosine, tryptophan, cysteine, proline, histidine, aspartic acid, asparagine, glutamic acid, glutamine, ⁇ -carboxyglutamic acid Arginine, orthine, and lysine. Unless otherwise indicated, in this specification, all amino acids are in the L form.
  • unnatural amino acid is not normally found in proteins normally. Means an amino acid.
  • non-natural amino acids include the above-mentioned D-form amino acids, norleucine, normal nitrophenylalanine, homophenylalanine, parafluorophenylalanine, 3 amino-2 benzylpropionic acid, homoarginine D-form or L-form and D-phenol- Lualanin is mentioned.
  • amino acid analog refers to a molecule that is not an amino acid but is similar to the physical properties and Z or function of an amino acid.
  • amino acid analogs include ethionine, canavanine, 2-methylglutamine and the like.
  • Amino acid mimetics refers to chemical compounds that have a structure that is different from the general chemical structure of an amino acid, but that functions in a manner similar to a naturally occurring amino acid.
  • Amino acids may be referred to herein by either their commonly known three letter symbol power or by the one letter symbol recommended by the IUPAC — IUB Biochemica 1 Nomenclature Commission. Nucleotides can also be referred to by the generally accepted single letter code.
  • polynucleotide refers to a polymer of nucleotides of any length.
  • the term also includes “oligonucleotide derivatives” or “polynucleotide derivatives”.
  • Oligonucleotide derivatives refer to oligonucleotides or polynucleotides that include derivatives of nucleotides or that have unusual linkages between nucleotides, and are used interchangeably.
  • oligonucleotides include, for example, 2, 1 O-methyl-ribonucleotide, oligonucleotide derivatives in which a phosphodiester bond in an oligonucleotide is converted to a phosphoroate bond, and oligonucleotides.
  • nucleic acid sequence may also contain conservatively modified variants (eg, degenerate codon substitutes) and complements, as well as explicitly indicated sequences. It is contemplated to encompass the sequence.
  • a degenerate codon substitute creates a sequence in which the third position of one or more selected (or all) codons is replaced with a mixed base and a Z or deoxyinosine residue.
  • nucleotide may be natural or non-natural.
  • Nucleotide derivative or “nucleotide analog” refers to a substance that is different from a naturally occurring nucleotide but has the same function as the original nucleotide.
  • nucleotide derivatives and nucleotide analogs are well known in the art. Examples of such nucleotide derivatives and nucleotide analogs include phosphoroates, phosphoramidates, methylphosphonates, chiral methylphosphonates, 2,1 O-methylribonucleotides, peptide-type nucleic acids (PNA) Not.
  • PNA peptide-type nucleic acids
  • complex molecule refers to a molecule formed by linking a plurality of molecules such as polypeptides, polynucleotides, lipids, sugars, and small molecules.
  • complex molecules include, but are not limited to, glycolipids and glycopeptides.
  • a polypeptide having the amino acid of SEQ ID NO: 2, or a variant or fragment thereof, as long as it has biological activity involved in diagnosis encodes each variant or fragment.
  • Nucleic acid molecules can also be used.
  • a complex molecule containing such a nuclear acid molecule can also be used.
  • nucleic acid is also used interchangeably with gene, cDNA, mRNA, oligonucleotide, and polynucleotide.
  • Particular nucleic acid sequences also include “splice variants”.
  • a particular protein encoded by a nucleic acid has its nucleus Any protein encoded by an acid splice variant is implicitly included.
  • splice variants are the product of alternative splicing of genes. After transcription, the initial nucleic acid transcript can be spliced such that different (alternate) nucleic acid splice products encode different polypeptides.
  • the mechanism of splice variant production varies, but includes exon alternative splicing.
  • Other polypeptides derived from the same nucleic acid by read-through transcription are also included in this definition. Any product of a splicing reaction (including recombinant forms of the splice product) is included in this definition.
  • gene refers to a factor that defines a genetic trait. Usually arranged on a chromosome in a certain order. A gene that defines the primary structure of a protein is called a structural gene, and a gene that affects its expression is called a regulatory gene. As used herein, “gene” may refer to “polynucleotide”, “oligonucleotide” and “nucleic acid” and Z or “protein” “polypeptide”, “oligopeptide” and “peptide”.
  • homology of a gene refers to the degree of identity of two or more gene sequences with respect to each other. Therefore, the higher the homology between two genes, the higher the sequence identity or similarity.
  • the ability of two genes to have homology can be determined by direct sequence comparison or, in the case of nucleic acids, hybridization methods under stringent conditions.
  • the DNA sequence power between the gene sequences is typically at least 50% identical, preferably at least 70% identical, more preferably at least 80%, 90%, If they are 95%, 96%, 97%, 98% or 99% identical, the genes have homology.
  • BLAST is a tool for sequence analysis, using default parameters.
  • An identity search can be performed, for example, using NCBI's BLAST 2.2.9 (issued May 12, 2004).
  • the identity value usually refers to the value when aligned using the above-mentioned BLAST under the default conditions. However, if a higher value is obtained by changing the parameter, the highest value is the identity value. When identity is evaluated in multiple areas, the highest value is used as the identity value.
  • a "corresponding" amino acid or nucleic acid refers to a polypeptide molecule or Refers to an amino acid or nucleotide that has, or is predicted to have, the same effect as a given amino acid or nucleotide in a polypeptide or polynucleotide used as a reference for comparison in a polynucleotide molecule.
  • an antisense molecule can be a similar part in an ortholog corresponding to a particular part of the antisense molecule.
  • the corresponding amino acid is, for example, cystine
  • corresponding amino acid can be the amino acid responsible for the dimer.
  • Such “corresponding” amino acids or nucleic acids may be regions or domains spanning a range. Thus, in such cases, it is referred to herein as a “corresponding” region or domain.
  • a "corresponding" gene eg, a polypeptide molecule or a polynucleotide molecule
  • a gene that is predicted to have for example, a polypeptide molecule or a polynucleotide molecule
  • the gene corresponding to a gene can be an ortholog of that gene.
  • mouse and rat apolipoprotein cn, apolipoprotein cm, transthyretin and serum albumin can find the corresponding apolipoprotein cn, apolipoprotein cm, transthyretin and serum albumin in humans, respectively. .
  • corresponding genes can be identified using techniques well known in the field.
  • the corresponding gene in a certain animal eg, mouse
  • the sequence of the gene that is the basis for the corresponding gene (eg, apolipoprotein cn, apolipoprotein cm, transthyretin, serum albumin).
  • the sequence database of the animal eg, human, rat
  • a “fragment” refers to a polypeptide or polynucleotide having a sequence length of 1 to n ⁇ 1 with respect to a full-length polypeptide or polynucleotide (length n). Say Chido.
  • the length of the fragment can be changed as appropriate according to its purpose. For example, the lower limit of the length is 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 in the case of a polypeptide. , 15, 20, 25, 30, 40, 50 and more amino acids, and lengths expressed in integers not specifically listed here (e.g., 11 etc.) are also suitable as lower limits. It can be.
  • examples include 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 75, 100 and more nucleotides.
  • !!, NA! /, Integer lengths (eg 11) may also be appropriate as lower bounds.
  • it is understood that such a fragment falls within the scope of the present invention as long as the full-length fragment functions as a marker as long as the fragment itself also functions as a marker.
  • contacting refers to bringing a compound in physical proximity to the polypeptide or polynucleotide of the present invention, either directly or indirectly. Means that.
  • the polypeptide or polynucleotide can be present in many buffers, salts, solutions, and the like. Contact includes placing the compound in, for example, a beaker, microtiter plate, cell culture flask or microarray (eg, gene chip) containing a polypeptide encoding a nucleic acid molecule or fragment thereof.
  • polynucleotide that is neutralized under stringent conditions refers to well-known conditions commonly used in the art.
  • a colony 'hybridization method plaque' hybridization method, Southern blot hybridization method or the like using a polynucleotide selected from among the polynucleotides of the present invention as a probe.
  • Such a polynucleotide can be obtained. Specifically, using a filter on which colony or plaque-derived DNA is immobilized, 0.7 to 1.
  • a sequence containing only the A sequence or only the T sequence is preferably excluded from the sequence that hybridizes under stringent conditions. Therefore, a polypeptide (for example, transthyretin) used in the present invention includes a nucleic acid that is hybridized under stringent conditions with respect to a nucleic acid molecule encoding a polypeptide particularly described in the present invention. Also included are polypeptides encoded by the molecule.
  • a polynucleotide that can be hybridized refers to a polynucleotide that can hybridize to another polynucleotide under the above hybridization conditions.
  • a polynucleotide capable of hybridizing is a polynucleotide having at least 60% homology with a DNA base sequence encoding a polypeptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, 4, 6, etc.
  • a polynucleotide having a homology of 80% or more is preferable, and a polynucleotide having a homology of 95% or more is more preferable.
  • Factors affecting the stability of DNA duplex include base composition, length, and degree of base pair mismatch. Hybridization conditions can be adjusted by those skilled in the art to apply these variables and allow different sequence related DNAs to form hybrids.
  • the melting temperature of a perfectly matched DNA duplex can be estimated by the following equation:
  • N is the length of the double chain formed
  • [Na +] is the molar concentration of sodium ions in the noble, hybridization solution or wash solution
  • % G + C is The percentage of (guanine + cytosine) bases in the.
  • the melting temperature decreases by about 1 ° C for each 1% mismatch.
  • a "purified" biological agent eg, nucleic acid or protein
  • a purified biological agent is one from which at least some of the factors that naturally accompany the biological agent have been removed. Say. Therefore, usually in the purified biological factor of that biological factor Purity is higher (ie, concentrated) than the biological agent is normally present.
  • purified is preferably at least 75 wt%, more preferably at least 85 wt%, even more preferably at least 95 wt%, and most preferably at least 98 wt%. % Of the same type of biological agent is present.
  • expression of a gene, polynucleotide, polypeptide, etc. means that the gene or the like is subjected to a certain action in vivo to take another form. Preferably, it refers to force transcription and translation of genes, polynucleotides, and the like to form a polypeptide, but transcription and production of mRNA may also be an embodiment of expression. More preferably, such polypeptide forms may be post-translationally processed (derivatives herein).
  • detection or “quantification” of polypeptide expression can be accomplished using suitable methods, including, for example, mRNA measurement and immunoassay methods.
  • molecular biological measurement methods include Northern plot method, dot plot method, and PCR method.
  • immunological measurement method include an ELISA method using a microtiter plate, an RIA method, a fluorescent antibody method, a Western plot method, and an immunohistochemical staining method.
  • quantification methods include ELISA and RIA.
  • expression level refers to the amount by which a polypeptide or mRNA is expressed in a target cell or the like. Such expression level is evaluated by any appropriate method including immunological measurement methods such as ELI SA method, RIA method, fluorescent antibody method, Western plot method, and immunohistochemical staining method using the antibody of the present invention. Expressed in the protein level of the polypeptide of the present invention, or used in the present invention evaluated by any appropriate method including molecular biological measurement methods such as Northern blotting, dot blotting, and PCR. Expression level of the polypeptide at the mRNA level.
  • “Change in expression level” means expression at the protein level or mRNA level of the polypeptide used in the present invention evaluated by any appropriate method including the above immunological measurement method or molecular biological measurement method. Means that the amount increases or decreases.
  • the term "binding” refers to a physical or chemical interaction between two proteins or compounds or related proteins or compounds, or a combination thereof. Means. Bonds include ionic bonds, non-ionic bonds, hydrogen bonds, van der Waals bonds, hydrophobic interactions, and the like. A physical interaction (binding) can be direct or indirect, where indirect is due to or due to the effect of another protein or compound. Direct binding refers to an interaction that does not occur through or due to the effects of another protein or compound and is not accompanied by other substantial chemical intermediates.
  • modulate refers to an increase, decrease or maintenance in the amount, quality or effect of a particular activity, transcript or protein. means.
  • “decrease” or “suppression” or synonyms for activity, expression product (eg, protein, transcript (such as RNA)) or the like is a quantity, quality or quantity of a particular activity, transcript or protein or Refers to a decrease in effect or an activity that decreases.
  • the term "probe” refers to a substance used as a search means used in biological experiments such as screening in vitro and Z or in vivo. Examples thereof include, but are not limited to, a nucleic acid molecule containing a specific base sequence or a peptide containing a specific amino acid sequence. In this specification, a probe is used as a marker detection means.
  • Nucleic acid sequences used as probes include nucleic acid sequences that are at least 70% homologous, more preferably at least 80% homologous, more preferably at least 90% homologous, at least 95% homologous to the sequences described above. Is included.
  • search refers to other nucleobase sequences having a specific function and Z or property using a certain nucleobase sequence electronically or biologically or by other methods.
  • Electronic searches include BLAST (Altschul et al., J. Mol. Biol. 215: 403—410 (1990)), FASTA (Pearson & Lipman, Proc. Natl. Acad. Sci., USA 85: 2444- 2448 (1988)), Smith and Waterman method (Smith and Waterman, J. Mol. Biol. 147: 195—197 (1981)), and Needleman and Wunsch method (Needleman and Wunsch, J. Mol. Biol.
  • Bio searches include stringent hybridization, macroarrays with genomic DNA attached to nylon membranes or microarrays (microarray assembly) attached to glass plates, PCR and in situ hybridizers. Examples include, but are not limited to. In the present specification, it is intended that the gene used in the present invention should include the corresponding gene identified by such an electronic search or biological search.
  • the “primer” refers to a substance necessary for the initiation of a reaction of a polymer compound to be synthesized in a polymer synthase reaction.
  • a nucleic acid molecule for example, DNA or RNA
  • the primer can be used as a marker detection means.
  • nucleic acid molecules that are usually used as primers include those having a nucleic acid sequence of at least 8 consecutive nucleotides that is complementary to the nucleic acid sequence of the target gene. It is. Such a nucleic acid sequence is preferably at least 12 contiguous nucleotides of at least 9 contiguous nucleotides, more preferably of at least 10 contiguous nucleotides, more preferably of at least 11 contiguous nucleotides.
  • Nucleic acid sequences used as probes are at least 70% homologous, more preferably at least 80% homologous, more preferably at least 90% homologous, at least 95% homologous to the sequences described above. Nucleic acid sequences are included.
  • a sequence suitable as a primer may vary depending on the nature of the sequence intended for synthesis (amplification), but those skilled in the art can appropriately design a primer according to the intended sequence. Such primer design is well known in the art and may be performed manually or using a computer program (eg, LASERGENE, PrimerSelect, DNAStar).
  • biological activity refers to an activity that a certain factor (for example, a polypeptide or a protein) can have in a living body, and an activity that exhibits various functions. Is included. For example, if an agent is a ligand, its biological activity includes the activity of that ligand binding to the corresponding receptor.
  • transthyretin When detecting transthyretin, transthyretin derivatives, apolipoprotein cn, apolipoprotein cn derivative, apolipoprotein cm, apolipoprotein cin derivative and serum albumin and serum albumin and their corresponding proteins contained in body fluids, etc.
  • transthyretin antibody transthyretin derivative antibody, transthyretin derivative antibody, apolipoprotein cn antibody, Apolipoprotein cn derivative antibody, apolipoprotein cm antibody, apolipoprotein cm derivative antibody and serum albumin antibody and their corresponding protein antibodies.
  • transthyretin antibody transthyretin derivative antibody, apolipoprotein cn antibody, Apolipoprotein cn derivative antibody, apolipoprotein cm antibody, apolipoprotein cm derivative antibody and serum albumin antibody and their corresponding protein antibodies.
  • Such an antibody can be prepared using a conventionally known method.
  • the antibody may be a monoclonal antibody or a polyclonal antibody.
  • transthyretin for example, transthyretin, transthyretin derivatives, apolipoprotein cn, apolipoprotein cn derivative, apolipotan cni, apolipoprotein cm derivative and serum albumin and their corresponding proteins
  • antibodies can be made.
  • Transthyretin monoclonal antibody is prepared by preparing hyperpridoma by cell fusion of antibody-producing cells obtained from animal immunized with an antigen and myeloma cells, and the activity of transthyretin is specifically determined from the resulting hyperidoma. It can be prepared by selecting clones that produce antibodies to inhibit.
  • transthyretin protein used as an antigen for animal immunization examples include all or part of the amino acid sequence of the transthyretin protein prepared by recombinant DNA method or chemical synthesis.
  • transthyretin monoclonal antibody for specifically detecting the transthyretin protein present on the cell surface any 10 or more peptides in the amino acid sequence of the transthyretin protein shown in SEQ ID NO: 2 can be used. Is preferably used as an antigen.
  • transthyretin e.g., transthyretin, transthyretin derivatives, apolipoprotein cn, apolipoprotein cn derivatives, apolipoprotein cm, apolipoprotein cm derivatives and serum albumin and their corresponding Antigens
  • transthyretin e.g., transthyretin, transthyretin derivatives, apolipoprotein cn, apolipoprotein cn derivatives, apolipoprotein cm, apolipoprotein cm derivatives and serum albumin and their corresponding Antigens
  • transthyretin e.g., transthyretin, transthyretin derivatives, apolipoprotein cn, apolipoprotein cn derivatives, apolipoprotein cm, apolipoprotein cm derivatives and serum albumin and their corresponding Antigens
  • proteins such as proteins.
  • transthyretin for antigen is bound to a carrier protein (for example, thyroglobulin).
  • a carrier protein for example, thyroglobulin
  • an adjuvant is added.
  • Freund's complete And incomplete adjuvant of Freund and Freund, etc., and any of these may be mixed.
  • the antigen obtained as described above is administered to mammals such as mammals such as mice, rats, horses, monkeys, rabbits, goats, and hidges.
  • Immunization can be performed by any existing method, but is mainly performed by intravenous injection, subcutaneous injection, intraperitoneal injection, or the like. Immunization intervals are not particularly limited, and immunization is performed at intervals of several days to several weeks, preferably at intervals of 4 to 21 days.
  • Antibody-producing cells are collected 2-3 days after the last immunization.
  • Examples of antibody-producing cells include spleen cells, lymph node cells, and peripheral blood cells.
  • spleen cells are used.
  • 100 g of antigen is used per mouse at a time.
  • the antibody titer in the blood of the immunized animal or the culture supernatant of the antibody-producing cell was selected.
  • the antibody titer is measured.
  • the antibody detection method include known techniques such as EIA (Enzym Immunoassay), RIA (Radio Immunase), ELISA (Enzyme Linked Immunosorbent Assay), and the like.
  • myeloma (myeloma) cells to be fused with antibody-producing cells cell lines derived from various animals such as mice, rats, humans and generally available to those skilled in the art are used.
  • a cell line having drug resistance and having the property that it cannot survive in a selective medium (for example, HAT medium) in an unfused state but can survive only in a fused state is used.
  • An 8-azaguanine resistant strain is generally used, and this cell line lacks hypoxanthine guanine phosphoribosyltransferase and cannot grow in hypoxanthine / aminopterin / thymidine (HAT) medium! / It is.
  • HAT hypoxanthine guanine phosphoribosyltransferase and cannot grow in hypoxanthine / aminopterin / thymidine (HAT) medium! / It is.
  • Myeloma cells are known in various cell lines such as P3 (P3x63Ag8.653) (J. Immunol. (1979) 123: 1548-1550), P3x63Ag8U.1 (Current Topics in Microbiology and Immunology (1978). 81: 1—7), NS—l (Kohler, G. and Milstein, C., Eur. J. Immunol. (1976) 6: 511—519), MPC—11 (M argulies, DH et al., Cell (1976) 8: 405-415), SP2 / 0 (Shulman, M. et al., Nature (1978) 276: 269-270), FO (de St.
  • Antibody-producing cells can be obtained from spleen cells, lymph node cells, and the like. That is, the spleen, lymph nodes, etc. are removed or collected from the various animals, and these tissues are crushed. The resulting disrupted product is suspended in a medium or buffer such as PBS, DMEM, RPMI1640, etc., filtered through a stainless steel mesh, etc., and centrifuged to prepare the desired antibody-producing cells.
  • a medium or buffer such as PBS, DMEM, RPMI1640, etc.
  • the myeloma cells and antibody-producing cells are fused.
  • Cell fusion is carried out by mixing myeloma cells and antibody-producing cells at a mixing ratio of 1: 1 to 1:10 in an animal cell culture medium such as MEM, DMEM, RPME-1640 medium, It is performed by contacting at 30-37 ° C for 1-15 minutes.
  • a fusion promoter such as polyethylene glycol, polyvinyl alcohol or Sendai virus having an average molecular weight of 1,000 to 6,000 or a fusion virus can be used.
  • antibody-producing cells and myeloma cells can be fused using a commercially available cell fusion device using electric stimulation (for example, electoral position).
  • the target hyperidoma is selected from the cells after cell fusion treatment.
  • Examples of the method include a method utilizing selective growth of cells in a selective medium. In other words, after diluting the cell suspension with an appropriate medium, it is spread on a microtiter plate, and a selective medium (such as HAT medium) is added to each well. As a result, growing cells can be obtained as hybridomas.
  • the screening of wild and ibridoma is performed by limiting dilution method, fluorescence excitation cell sorter method, etc., and finally monoclonal antibody-producing hyperidoma is obtained.
  • Examples of a method for collecting monoclonal antibodies with the acquired nodobridoma power include ordinary cell culture methods and ascites formation methods.
  • Hypridoma is cultured in an animal cell culture medium such as RPMI-1640 medium containing 10-20% urine fetal serum, MEM medium, or serum-free medium under normal culture conditions (for example, 37 ° C, Incubate for 2-14 days at 5% CO concentration)
  • Antibodies are obtained from the culture supernatant.
  • hypridoma is administered in the abdominal cavity of animals of the same kind as mammals derived from myeloma cells, and the amount of hyperidoma is increased in large quantities. Let it grow. Ascites or serum is collected after 1 to 4 weeks.
  • the antibody collection method requires purification of the antibody, a known method such as an ammonium sulfate salting-out method, ion exchange chromatography, or affinity chromatography is appropriately selected. Or by combining them.
  • a known method such as an ammonium sulfate salting-out method, ion exchange chromatography, or affinity chromatography is appropriately selected. Or by combining them.
  • an antigen binds to an antibody, or binds to a specific receptor such as B lymphocyte or T lymphocyte to cause antibody production and an immune reaction such as Z or cytotoxicity (eg, protein, Lipids, sugars, etc., but are not limited to these).
  • an antibody or lymphocyte receptor is called “antigenicity”.
  • Properties that induce immune responses such as antibody production are called “immunogenicity”.
  • Substances used as antigens include, for example, at least one target substance (eg, protein).
  • the contained substance is preferably full length, but may be a partial sequence as long as it contains at least one epitope capable of inducing immunity.
  • epitope or “antigenic determinant” refers to a site in an antigen molecule to which an antibody or lymphocyte receptor binds. Methods for determining epitopes are well known in the art, and such epitopes can be determined by those skilled in the art using such conventional techniques once the primary sequence of the nucleic acid or amino acid is provided. .
  • Epitopes can be used without necessarily knowing their exact location and structure. Thus, epitopes require a set of amino acid residues involved in recognition by specific immunoglobulins, or in the case of T cells, recognition by T cell receptor proteins and Z or major histocompatibility complex (MHC) receptors. A set of amino acid residues is included. The term is also used interchangeably with “antigenic determinant” or “antigenic determinant site”. In the immune system field, in vivo or in vitro, epitopes are molecular features (e.g., primary peptide structure, secondary peptide structure or tertiary peptide structure and charge) and are recognized by immunoglobulins, T cell receptors or HLA molecules. Forming a site.
  • MHC major histocompatibility complex
  • Epitopes containing peptides may contain more than two amino acids in a spatial conformation unique to the epitopes.
  • epitopes consist of at least 5 such amino acids, typically consisting of at least 6, 7, 8, 9, or 10 such amino acids.
  • the length of the epitope is longer However, it is generally preferred because it resembles the antigenicity of the original peptide, but this is not always the case when considering conformation.
  • Methods for determining the spatial conformation of amino acids are known in the art and include, for example, X-ray crystallography and two-dimensional nuclear magnetic resonance spectroscopy.
  • identification of epitopes in a given protein is readily accomplished using techniques well known in the art. For example, Geysen et al. (1984) Proc.
  • a sequence of at least 3 amino acids in length is required for use as a peptide containing peptide, preferably this sequence is at least 4 amino acids, more preferably at least 5 amino acids, at least 6 amino acids.
  • a sequence of at least 7 amino acids, at least 8 amino acids, at least 9 amino acids, at least 10 amino acids, at least 15 amino acids, at least 20 amino acids, at least 25 amino acids may be required.
  • Epitopes can be linear or conformational.
  • Certain amino acids can be converted to other amino acids without any apparent loss or loss of interaction binding capacity, for example, in the protein structure such as a carbohydrate binding region, cysteinylation region, cationic region, or substrate molecule binding site. Can be replaced. It is the ability and nature of the protein to define the biological function of a protein. Thus, specific amino acid substitutions can be made in the amino acid sequence or at the level of its DNA coding sequence, resulting in a protein that still retains its original properties after substitution. Accordingly, various modifications are disclosed herein without apparent loss of biological utility. Or the corresponding DNA encoding this peptide.
  • hydrophobicity index of amino acids can be considered.
  • the importance of the hydrophobic amino acid index in conferring interactive biological functions in proteins is generally recognized in the art (Kyte. J and Doolittle, RFJ Mol. Biol. 157 (1): 105-132, 1982).
  • the hydrophobic nature of amino acids contributes to the secondary structure of the protein produced, and then defines the interaction of the protein with other molecules (eg, enzymes, substrates, receptors, DNA, antibodies, antigens, etc.).
  • Each amino acid is assigned a hydrophobicity index based on their hydrophobicity and charge properties.
  • the hydrophobicity index is preferably within ⁇ 2, more preferably within ⁇ 1, and even more preferably within ⁇ 0.5. It is understood in the art that such substitution of amino acids based on hydrophobicity is efficient.
  • hydrophilicity index is also useful for modifying the amino acid sequence of the present invention.
  • the following hydrophilicity indices have been assigned to amino acid residues: arginine (+3.0); lysine (+3.0); aspartic acid (+ 3.0 ⁇ 1); glutamate (+ 3.0 ⁇ 1); serine (+0.3); asparagine (+0.2); glutamine (+0.2); glycine (0) Threonine (one 0.4); proline (one 0.5 ⁇ 1); alanine (one 0.5); histidine (-0.5); cystine (one 1.0); methionine (one 1.3) Valine (one 1.5); leucine (one 1.8); isoleucine (one 1.8); tyrosine (one 2.3); ferulalanine (one 2.5); Tohuan (1 3.4).
  • an amino acid can be replaced with another that has a similar hydrophilicity index and still can provide a biological equivalent.
  • the hydrophilicity index is preferably within ⁇ 2, more preferably within ⁇ 1, and even more preferably within ⁇ 0.5.
  • conservative substitution means that the amino acid substitution is similar to the hydrophilicity index or Z and hydrophobicity index with the amino acid substituted with the original amino acid as described above. This refers to substitution. Examples of conservative substitutions are well known to those skilled in the art and include, for example, substitutions within the following groups: arginine and lysine; glutamic acid and aspartic acid; serine and threonine; glutamine and asparagine; and palin, leucine, and isoleucine However, it is not limited to these.
  • variant refers to a substance in which a part of the original substance such as a polypeptide or polynucleotide has been changed. Such variants include substitutional variants, addition variants, deletion variants, truncated variants, allelic variants, and the like. Alleles are genetic variants that belong to the same locus and are distinguished from each other. Therefore, an “allelic variant” refers to a variant that has an allelic relationship with a gene.
  • a “species homologue or homolog” is a homology (preferably at least 60% homology, more preferably at least 80%, at a certain amino acid level or nucleotide level within a species.
  • ortholog also called orthologous gene, refers to a gene derived from speciation from a common ancestor with two genes. For example, taking the hemoglobin gene family with multiple gene structures as an example, human and mouse ⁇ -hemoglobin genes are orthologs. Human ⁇ -hemoglobin genes and / 3 hemoglobin genes are paralogs (genes generated by gene duplication). It is.
  • nucleic acid sequences As used herein, “conservative (modified) variants” applies to both amino acid and nucleic acid sequences.
  • Conservatively modified with respect to a particular nucleic acid sequence refers to a nucleic acid that encodes the same or essentially the same amino acid sequence, where the nucleic acid is an amino acid. When no acid sequence is encoded, it refers to an essentially identical sequence. Because of the degeneracy of the genetic code, a large number of functionally identical nucleic acids encode any given protein. For example, the codons GCA, GCC, GCG, and GCU all encode the amino acid alanine.
  • nucleic acid variations are “silent modifications (mutations),” which are one species of conservatively modified mutations.
  • Every nucleic acid sequence herein which encodes a polypeptide also describes every possible silent variation of that nucleic acid.
  • each codon in nuclear acid except AUG, which is usually the only codon for methionine, and TGG, which is usually the only codon for tryptophan
  • 1S produces functionally identical molecules It is thus understood that this can be modified.
  • each silent variation of a nucleic acid that encodes a polypeptide is implicit in each described sequence.
  • modifications can be made to avoid substitution of cystine, an amino acid that significantly affects the conformation of the polypeptide.
  • amino acid additions, deletions, or modifications can also be made in order to produce functionally equivalent polypeptides.
  • Amino acid substitution refers to substitution of the original peptide with one or more, for example, 1 to: LO, preferably 1 to 5, more preferably 1 to 3 amino acids.
  • the addition of amino acids means that one or more, for example, 1 to 10, preferably 1 to 5, more preferably 1 to 3 amino acids are added to the original peptide chain.
  • Deletion of amino acids refers to deletion of one or more, for example, 1 to 10, preferably 1 to 5, more preferably 1 to 3 amino acids from the original peptide.
  • Amino acid modifications include, but are not limited to, amidation, carboxylation, sulfation, halogenation, alkylation, glycosylation, phosphorylation, hydroxylation, acylation (eg, acetylation), and the like.
  • the substituted or added amino acid may be a natural amino acid or a non-natural amino acid, or an amino acid analog. Natural amino acids are preferred.
  • substitution, addition or deletion of a polypeptide or polynucleotide refers to an amino acid or its substitute, or nucleotide, respectively, with respect to the original polypeptide or polynucleotide. Or replace or add to its substitute power Or to be removed.
  • substitution, addition, or deletion techniques are well known in the art, and examples of such techniques include site-directed mutagenesis techniques. Any number of substitutions, additions or deletions is acceptable as long as it is one or more. Such a number retains the desired function (for example, marker, etc.) in the variant having the substitution, addition or deletion. You can do as much as you can. For example, such a number can be 1 or several, and is preferably within 20%, within 10%, or less than 100, less than 50, less than 25, etc. of the total length. possible.
  • diagnosis refers to identifying various parameters related to a disease, disorder, or condition in a subject and determining the current state or future of such a disease, disorder, or condition.
  • the state of the body can be investigated, and such information can be used to treat a disease, disorder, condition, treatment to be administered or prevention in a subject.
  • Various parameters such as formulation or method can be selected.
  • diagnosis in a narrow sense refers to diagnosis of the current state, but includes “pre-diagnosis” in a broad sense.
  • preliminary diagnosis refers to detecting the stage before the onset of diabetes when referring to diabetes, for the purpose of determining the risk of future onset and preventing diabetes. Including determining whether there is a risk of suffering from diabetes.
  • the state of the body can be examined in advance, and such information can be used to treat a disease, disorder, condition, treatment to be administered or prevention in a subject.
  • Various parameters such as formulation or method can be selected.
  • the diagnostic method of the present invention is industrially useful because, as a general rule, it is possible to use the physical strength, and it can be performed away from the hands of medical personnel such as doctors. .
  • it may be specifically referred to as “preliminary diagnosis or support for diagnosis”.
  • treatment refers to such a condition for a disease or disorder. In such a case, it means preventing, preferably maintaining the status quo, more preferably reducing, and even more preferably eliminating such a disease or disorder.
  • the concentration of at least one of these three proteins in blood is measured as a marker substance for diabetes. Diabetes is diagnosed by comparing the measured value with a healthy value.
  • diagnosis of diabetes refers to determining whether or not there is a risk of developing diabetes for the purpose of preventing diabetes, not just determining whether or not the patient has diabetes. Includes monitoring of condition and recurrence.
  • the concentration of only a part of the three types of marker substances may be measured! / Or the concentration of all three types may be measured.
  • a multi-marker system can be used to diagnose diabetes with multidirectional power, and the diagnosis is highly accurate.
  • these three kinds of proteins are also present in the blood of healthy subjects, by monitoring the fluctuations in the concentration, it is possible to detect signs that the healthy subjects will develop diabetes.
  • the method for diagnosing a disease of the present invention comprises comparing at least one concentration of the marker substance (eg, (a) to (n)) in a body fluid of a subject with a healthy value, and It is used to determine the presence or future risk of onset.
  • the marker substance eg, (a) to (n)
  • the disease diagnosis method of the present invention since another marker substance is used as an index instead of using blood glucose as a direct index, it is possible to capture the state before the blood glucose level rises. As a result, in addition to the presence or absence of diabetes, the risk of developing future diabetes can be determined.
  • pre-diagnosis of diabetes and “determining future risk of developing diabetes” are used interchangeably, and there is a possibility (risk) of having diabetes in the future when diabetes does not occur. Determining whether or not there is a possibility or the degree of possibility (risk).
  • the values of “about 7040”, “about 8330”, “about 8530”, etc. of the mass Z charge ratio (hereinafter sometimes abbreviated as “MZZ”) in each marker substance are the mass. This is a value that takes into account the error range of the measured values in the analysis, and generally has a range of ⁇ 0.2%. That is, approximately 7040 represents approximately 7040 ⁇ 0.2%, approximately 8330 approximately 8330 ⁇ 0.2%, and approximately 8530 approximately 8530 ⁇ 0.2%.
  • the other mass Z charge ratios have a width of approximately ⁇ 0.2% in a similar manner.
  • all of these marker substances are proteins mainly present in blood.
  • the marker substances in body fluids (a), (b), (c), (d), (e), ( The concentrations of f), (g), (h) and (i) are higher, and the concentrations of marker substances (k), (1), (m) and (n) are lower.
  • a carrier on which a substance having affinity for a marker substance is immobilized is used. Then, a bodily fluid or bodily fluid component is brought into contact with the carrier, and the marker substance contained in the bodily fluid or bodily fluid component is captured on the carrier via a substance having affinity for the marker substance, and the amount of the trapped marker substance Based on the above, the concentration of the marker substance in the body fluid is calculated. According to the disease diagnosis method of the present invention, since the marker substance captured on the carrier is the measurement target, the influence of the contaminant substance contained in the measurement sample can be reduced, and the sensitivity and precision can be increased. The concentration of marker substances can be measured. Examples of the body fluid component include serum or plasma when the body fluid is blood.
  • a carrier having a planar portion is used, and the substance having affinity for the marker substance is immobilized on a part of the planar portion.
  • the substance having affinity for the marker substance can be fixed in spots on a plurality of locations on the carrier.
  • the concentration of the marker substance can be measured even with a very small amount of measurement sample.
  • An example of the carrier having a flat surface portion is a substrate such as a chip.
  • an ion exchanger, metal chelate or antibody is used as the substance having affinity for the marker substance, and the ion exchanger, metal chelate or The marker substance in the measurement sample is captured on the carrier via the antibody.
  • the material force ion exchanger or metal chelate various types are easily available, and a carrier for capturing the marker substance can be easily prepared.
  • the substance is an antibody, the marker substance can be captured more specifically. Methods for measuring the amount of marker substance captured include mass spectrometry and immunoassay. (In the case of antibodies).
  • system refers to any system for diagnosis, generally one or more component forces, where there are multiple components that interact with each other. In other words, it is a system that satisfies the three conditions of harmonizing behavior and function as a whole.
  • the system can be in any form, such as a device, composition, diagnostic agent. Therefore, the system includes, for example, a large-scale system including a measuring device, a system including a chromatographic system, a kit using an immune reaction, a composition including an antibody (that is, a marker substance including a monoclonal antibody). And diagnostic agents that are in-vitro drugs).
  • screening refers to selecting a target such as an organism or substance having a specific target property from a large number of populations using a specific operation Z evaluation method.
  • an agent eg, antibody
  • polypeptide or nucleic acid molecule of the invention can be used.
  • the screening may be performed using a library generated using an in silico (computer system) system that may use a system using a real substance such as in vitro or in vivo.
  • in silico computer system
  • compounds obtained by screening having the desired activity are also included within the scope of the present invention.
  • the present invention contemplates providing a drug by computer modeling based on the disclosure of the present invention.
  • the present invention relates to a candidate combination that modulates the ability to bind to, or the activity of, a protein of the present invention or a polypeptide of the present invention, or a biologically active portion thereof.
  • Test compounds of the present invention can be obtained using any of a number of approaches in a combinatorial library method known in the art, including: biological libraries; spatial Accessible parallel solid phase or solution phase live Rally; one synthetic library method that requires deconvolution; one “one bead one-rich” library method; and one synthetic library method using affinity chromatography selection.
  • the biological library approach is limited to peptide libraries, but the other four approaches are applicable to small libraries of peptides, non-peptide oligomers or compounds (Lam (1997) Anticancer Drug Des. 12 : 145).
  • the present invention provides a straightforward structural activity by a computer as a tool for screening an agent that is as effective as the active ingredient of the present invention (eg, polypeptide or nucleic acid).
  • an agent that is as effective as the active ingredient of the present invention (eg, polypeptide or nucleic acid).
  • QSAR quantitative structure activity relationship
  • the computer technology includes creation of a substrate cage type, a pharmacophore, and a homology model of the active site of the present invention produced by several computers.
  • methods for modeling the normal characteristic groups of an interacting substance for a substance from in vitro data are described in the CATALYST TM pharmacophore method (Ekins et al.
  • Fitting of a compound to the active site can be performed using any of a variety of computer modeling techniques known in the art. Visual inspection and manual manipulation of compounds to active sites are described in QUANTA (Molecular Simulations, Burlington, MA, 1992), SYBYL (Molecular Modeling Software, Tripos Associates, Inc., St. Louis, MO, 1992), AMBER (Weiner et a 1., J. Am. Chem. Soc., 106: 765-784, 1984), CHARMM (Brooks et a 1., J. Comp. Chem., 4: 187-217, 1983), etc. You can use a program like this. In addition, energy can be minimized by using a standard force field such as CHARMM, AMBER, etc.
  • composition containing the substance obtained by the screening method of the present invention can be provided in any preparation form as long as it is in a form suitable for transfer to an organism.
  • formulation forms include solutions, injections, and sustained release agents.
  • administration routes include oral administration, parenteral administration, and direct administration to the affected area.
  • kit refers to a unit provided with a part to be provided (eg, antibody, label, etc.) usually divided into two or more compartments. This kit form is preferred when it is intended to provide a composition that should preferably be mixed and used immediately prior to use.
  • a kit preferably comprises a provided part (eg, instructions or instructions describing how the reagent should be processed).
  • the kit When used as a reagent kit, the kit usually includes instructions describing how to use the antibody.
  • the "instruction” describes an explanation for a person who administers a method of administering the medicine of the present invention, such as a doctor or a patient.
  • This instruction manual describes a word for instructing how to use the diagnostic agent of the present invention or administering a medicine or the like.
  • the instructions may include a word indicating that administration is performed to skeletal muscle (for example, by injection) as an administration site.
  • This instruction is prepared in accordance with the format prescribed by the national supervisory authority (for example, the Ministry of Health, Labor and Welfare in Japan, the Food and Drug Administration (FDA) in the United States, etc.) in the country where the present invention is implemented, and approved by the regulatory authority. It is clearly stated that it has been received. Instructions are so-called package inserts, usually provided in paper form, but not limited to it, for example, in the form of electronic media (e.g. home page provided by the Internet, e-mail). But it can be provided.
  • subject refers to an organism to which the treatment of the present invention is applied, and is also referred to as "patient”.
  • patient refers to an organism to which the treatment of the present invention is applied, and is also referred to as “patient”.
  • patient or subject may preferably be a human.
  • in vivo refers to the inside of a living body.
  • in vivo refers to the location where a target substance is to be placed.
  • in vitro refers to a state in which a part of a living body is removed or released “outside the living body” (for example, in a test tube) for various research purposes. It is a term that contrasts with in vivo.
  • ex vivo refers to a case where target cells for gene transfer are extracted from a subject, a therapeutic gene or factor is introduced in vitro, and then returned to the same subject again. A series of operations is called ex vivo.
  • polypeptides, nucleic acids, pharmaceuticals used in the present invention, and compositions prepared by such polypeptides or nucleic acids may be in any formulation form as long as they are in a form suitable for transfer to an organism.
  • examples of such a preparation form include liquids, injections and sustained-release agents.
  • Administration methods include oral administration and parenteral administration (e.g., intravenous administration, intramuscular administration, subcutaneous administration, intradermal administration, mucosal administration, rectal administration, intravaginal administration, topical administration to affected areas, skin administration, etc.) And direct administration to the affected area.
  • Formulations for such administration can be provided in any pharmaceutical form. Examples of such a preparation form include liquids, injections, and sustained release agents.
  • compositions and medicaments of the present invention may be in the form of orally acceptable aqueous solutions that do not contain pyrogens when administered systemically.
  • the preparation of such pharmaceutically acceptable protein solutions is within the skill of the artisan, provided that considerable attention is paid to pH, isotonicity, stability, and the like.
  • the solvent used for pharmaceutical formulation in the present invention may have either aqueous or non-aqueous properties.
  • the vehicle can be used to modify or maintain the pH, osmolality, viscosity, clarity, color, sterility, stability, isotonicity, disintegration rate, or odor of the formulation. It may contain material.
  • the compositions of the present invention may include other formulation materials to modify or maintain the release rate of the active ingredient or to facilitate absorption or permeation of the active ingredient.
  • the prescription procedure of the preparation of the present invention is known in the art, and is described in, for example, the Japanese Pharmacopeia, the US Pharmacopeia, the pharmacopoeia of other countries, and the like. Thus, one skilled in the art can determine the amount to be administered without undue experimentation as described herein.
  • the present invention includes a marker substance in a sample derived from a subject, a factor that specifically interacts with the single substance, or a means for selectively recognizing the marker substance.
  • a marker substance in a sample derived from a subject, a factor that specifically interacts with the single substance, or a means for selectively recognizing the marker substance.
  • the present invention provides a system or composition for pre-diagnosing whether a subject is diabetic, comprising a marker substance in a sample from the subject.
  • the present invention provides a system for pre-diagnosing whether a subject is diabetic or comprising a factor that specifically interacts with a marker substance in a sample derived from the subject.
  • a composition is provided.
  • the present invention provides a system for pre-diagnosing whether a subject is diabetic, comprising means for selectively recognizing a marker substance in a sample derived from a subject. provide.
  • the present invention provides a system or composition for diagnosing whether a subject is diabetic, comprising a marker substance in a sample derived from the subject.
  • the present invention provides a system for diagnosing whether a subject is diabetic or comprising a factor that specifically interacts with a marker substance in a sample derived from a subject.
  • a composition is provided.
  • the present invention provides a system for diagnosing whether a subject is diabetic, comprising means for selectively recognizing a marker substance in a sample derived from a subject. To do.
  • the marker substance or system can identify the marker substance, the marker substance in a sample from any subject, a factor that specifically interacts with the marker substance, or the It can be appreciated that means for selectively recognizing the marker substance can be used. Therefore, the factors or procedures specifically described herein It is understood that any equivalent factor or means known in the art can be used, not just the stage.
  • the marker substance used is characterized in that it is present in the body fluid, preferably blood of the subject. This is because if the body fluid is desired to be bound by theory, the post-treatment after removal is simple, and a large amount of diagnosis or diagnosis support is possible. While not wishing to be bound by theory, blood is preferred because it significantly reflects the behavior of the marker substance of the present invention.
  • the marker substance used in the present invention is characterized in that it is a gene product.
  • the gene product is one that has not been previously known to be directly related to sugar metabolism. This is because it has not been known so far that even markers that are known to be directly related to glucose metabolism can be diagnosed or pre-diagnosed as marker substances for diabetes. This is because diagnosis can be performed.
  • the marker substance identified in the present invention has been shown to be a marker in model animals, and can vary depending on a number of etiologies, such as markers that have been found empirically in humans. In many cases, it is unclear whether diabetes is caused only by the disease, but the marker substance of the present invention does not have such an ambiguity. This is because the marker substance of the present invention has been found as a result of comprehensive analysis using a protein chip, and has the power to confirm in a model animal.
  • the marker substance used in the present invention is transthyretin, transthyretin derivative, apolipoprotein CII, apolipoprotein CII derivative, apolipoprotein cm, apolipoprotein cm derivative and serum albumin and These include one or more substances that are selected from the group of corresponding protein forces.
  • 2 or more, 3 or more or more marker substances in particular, a plurality of marker substances selected from different groups when each paired with a derivative is regarded as one group
  • the factor used in the present invention is a nucleic acid molecule, a polypeptide. , Lipids, sugar chains, small organic molecules and complex molecules thereof.
  • the factor is a protein or complex molecule (eg, glycoprotein, lipid protein, etc.).
  • the factor is an antibody (eg, a polyclonal antibody or a monoclonal antibody).
  • Such factors are preferably labeled or labelable. This is because it is easy to diagnose.
  • label refers to an entity (such as a substance, energy, electromagnetic wave, etc.) for identifying other molecules or substances of interest.
  • labeling methods include RI (radioisotope) method, fluorescence method, piotin method, chemiluminescence method and the like.
  • RI radioisotope
  • fluorescence method fluorescence method
  • piotin method piotin method
  • chemiluminescence method chemiluminescence method and the like.
  • the labeling is performed with fluorescent substances having different fluorescence emission maximum wavelengths. The difference in the maximum fluorescence emission wavelength is preferably lOnm or more. Any fluorescent substance can be used as long as it can bind to the base moiety of nucleic acid.
  • Cyanine dyes eg, CyDye TM series Cy3, Cy5, etc.
  • rhodamine 6G reagent N-acetoxy N2-acetylene
  • minofluorene AAF
  • AAIF iodine derivative of AAF
  • fluorescent substances having a difference in fluorescence emission maximum wavelength of lOnm or more include a combination of Cy5 and rhodamine 6G reagent, a combination of Cy3 and fluorescein, a combination of rhodamine 6G reagent and fluorescein, etc.
  • such a label can be used to modify the target object so that it can be detected by the detection means used. Such modifications are known in the art, and those skilled in the art can appropriately carry out such methods depending on the label and the target object.
  • the means used are mass spectrometer, nuclear magnetic resonance analyzer, X-ray analyzer, SPR, chromatography (eg, HPLC, thin layer chromatography, gas chromatography). ), Immunological means (eg, Western plotting, ELISA, RIA), biochemical means (eg, pi electrophoresis, Southern blotting, two-dimensional electrophoresis), electrophoresis equipment, chemical analysis equipment, fluorescent fluorescence Dimensional differential electrophoresis (2DE—DIGE), isotope labeling (ICAT), tandem purification (TAP), physical means, laser microdissection and combinations thereof Is selected from the group.
  • Immunological means eg, Western plotting, ELISA, RIA
  • biochemical means eg, pi electrophoresis, Southern blotting, two-dimensional electrophoresis
  • electrophoresis equipment chemical analysis equipment
  • ICAT isotope labeling
  • TAP tandem
  • the system of the present invention further comprises a standard of marker substance.
  • a standard of marker substance confirms whether the marker substance detection means (such as a factor that specifically interacts with the marker substance or a means for selectively recognizing the marker substance) is functioning normally. Preferred to use for.
  • the present invention may further comprise means for purifying the sample of interest.
  • purification means include chromatography. Because refinement can increase the accuracy of the diagnosis, it can be used in a preferred embodiment. This is not essential.
  • the subject includes a mammal, and in one embodiment, the subject includes a rodent.
  • rodents for example, rats, mice, etc.
  • model animals particularly diabetic model animals, have been prepared.
  • the subject includes a human.
  • the factor or means used in the present invention has the ability to quantify a single substance of the present invention.
  • Such quantification is preferably a means or factor that allows a standard curve to be drawn properly when a standard curve is drawn.
  • Preferable examples include antibodies, mass spectrometry, and chromatographic analysis. Therefore, in one embodiment, the system of the present invention further includes a quantification means for quantifying the marker substance.
  • the quantification unit includes a determination unit that compares a standard curve with a measurement result to determine whether the marker substance is within a normal value range.
  • a determination means can be realized using a computer.
  • the system of the present invention is a composition comprising a marker substance or the agent that specifically interacts with the marker substance.
  • the marker substance of interest in the system of the present invention includes at least one substance selected from the group consisting of transthyretin and transthyretin derivative power
  • the transthyretin derivative contains S-cystine- Letransthyretin, Dal Tathionized transthyretin, S—S bond-forming transthyretin, oxidation (eg, oxidation of methionine side chain) transthyretin, formylated transthyretin, acetylated transthyretin, phosphorylated transthyretin, sugar Examples include chain transthyretin and myristino transthyretin.
  • S-cystinyl transthyretin is preferable.
  • the present invention examines the amount ratio between transthyretin and a transthyretin derivative (particularly, a metabolite appearing in the acid-reduction pathway), thereby reducing the severity or risk of diabetes. It should be obvious that the points you have found can be determined!
  • At least one phenomenon selected from the group consisting of a decrease in transthyretin and an increase in transthyretin inducer caloric is the ability to develop diabetes or the risk of future development. Is an indicator of high.
  • At least one phenomenon selected from the group consisting of a decrease in transthyretin and an increase in the amount of transthyretin derivatives is an indicator of the degree of developing diabetes or the risk of developing future It can be. It is understood that such indicators can be determined by those skilled in the art based on the description herein.
  • the transthyretin which is a subject of the present invention is the force encoded by the nucleic acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 3, or SEQ ID NO:
  • the transthyretin derivative of interest in the present invention is an amino acid sequence encoded by the nucleic acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 3, or SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 4.
  • the cysteine at position 30 (position 10 in the mature form) or a corresponding cysteine is cysteine-modified, or may have a modified sequence thereof.
  • the factor or means used in the present invention has the ability to distinguish between transthyretin monomers and tetramers.
  • the factor or means used in the present invention has the ability to differentiate between transthyretin and S-cysteine transthyretin (eg, antibody o Factors or means with such capabilities are, for example, antibodies, generating an antibody library and, from that library, transthyretin or S-cysteine transthyretin.
  • transthyretin and S-cysteine transthyretin eg, antibodies generating an antibody library and, from that library, transthyretin or S-cysteine transthyretin.
  • Such techniques can be achieved using techniques well known in the art. it can. In addition to antibodies, this can also be achieved using techniques well known in the art.
  • the factor or means in the present invention recognizes transthyretin and S-cysteinyl transthyretin, and the system of the present invention uses transthyretin and S-cysteinyl transthyretin.
  • a means for identifying is further provided. For example, by providing a combination of identification means such as antibody + electrophoresis and molecular weight, etc., transthyretins are identified, but electrophoresis or mass spectrometry is used to distinguish derivatives from others. It is understood that identification can be achieved by using. Such techniques can be achieved using techniques well known in the art.
  • the factor or means in the present invention recognizes transthyretin and S-cysteinyl transthyretin, and the system of the present invention uses the molecular weight of transthyretin and the molecular weight of S-cysteinyl transthyretin. And a means for measuring the relative ratio of transthyretin to S-cysteine transthyretin. By providing such a system, the present invention can determine the degree of deterioration of diabetes and the onset probability.
  • the marker substance used in the system of the present invention includes apolipoprotein CII or apolipoprotein CII derivative, and examples of the apolipoprotein CII derivative include proapolipoprotein CII.
  • At least one phenomenon selected from the group consisting of apolipoprotein CII reduction and apolipoprotein CII derivative variability has a risk of developing diabetes or a high risk of developing in the future, Can be an indicator of this.
  • apolipoprotein CII reduction and apolipoprotein CII induction The degree of onset of diabetes is at least one phenomenon selected from the group
  • the risk of future onset may be an indicator of height.
  • the target apolipoprotein CII is a force encoded by the nucleic acid sequence shown in SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 7, or SEQ ID NO: 6 or SEQ ID NO: It has the amino acid sequence shown in 8 or a modified sequence thereof.
  • the target blower polypoprotein CII may be one in which the lead sequence is bound to the above sequence.
  • the factor or means used in the present invention has the ability to selectively identify apolipoprotein CII (eg, an antibody).
  • a factor or means having such a capability is to prepare a library of antibodies, and to specifically select apolipoprotein CII from the library (preferably, selective). Ii) can be made by selecting those that react, and such techniques can be achieved using techniques well known in the field. Similarly, other than antibodies can also be achieved in this field using well-known techniques.
  • the factor or means in the present invention has the ability to selectively identify apolipoprotein CI I, and the system comprises means for quantifying the apolipoprotein CII.
  • the present invention can determine the degree of deterioration of diabetes and the onset probability.
  • the marker substance used in the system of the present invention includes apolipoprotein cm or apolipoprotein cm derivative, and the apolipoprotein cin is apolipoprotein cni, and the apolipoprotein
  • the 0 cni derivative is selected from the group consisting of apolipoprotein cm and apolipoprotein force.
  • Akira is apolipoprotein cni apolipoprotein polypoprotein
  • One phenomenon is an indicator of the ability to develop diabetes or an increased risk of developing it in the future.
  • One phenomenon can be an indicator of the degree of onset of diabetes or the risk of future onset. It will be understood that such indicators can be determined by those skilled in the art based on the description herein.
  • the target apolipoprotein cm is a force encoded by the nucleic acid sequence represented by SEQ ID NO: 9 or SEQ ID NO: 11, or SEQ ID NO: 10 or sequence. It has the amino acid sequence shown in No. 12 (pro form), a form lacking 20 amino acids at the N-terminal thereof (mature form), or a modified sequence thereof. Preferably, it has a sequence lacking the first 20 C-terminal amino acids.
  • the apolipoprotein cm derivative of interest is a force encoded by the nucleic acid sequence represented by SEQ ID NO: 9 or SEQ ID NO: 11, or SEQ ID NO: 10 or 12, respectively.
  • a force that is a derivative having a sugar chain at 94-position or 95-position or the corresponding threonine, or these forces also have a form lacking the 20 amino acids at the N-terminus.
  • it has a sequence lacking the first 20 C-terminal amino acids.
  • the factor or means used in the present invention has the ability to distinguish between apolipoprotein cm and apolipoprotein CIII derivatives.
  • the factor or means used in the present invention is at least two of apolipoprotein CIII, apolipoprotein CIII and apolipoprotein CIII.
  • the factor or means having such ability is, for example, an antibody library if it is an antibody, and further, apolipoprotein CIII, apolipoprotein cni and apolipoprotein are selected from the library.
  • the factor or means of the present invention has the ability to distinguish all of apolipoprotein CI II, apolipoprotein CIII and apolipoprotein CIII.
  • a factor or means having such a capability is to prepare an antibody library, and further, from the library, apolipoprotein CIII, apolipoprotein CIII, and apolipoprotein CIII.
  • the factor or said means comprises an antibody having the ability to distinguish between apolipoprotein cm and apolipoprotein cm derivatives, preferably apolipoprotein CIII, apolipoprotein CIII and Less of apolipoprotein CIII
  • 0 1 2 Including an antibody capable of distinguishing at least two, apolipoprotein CIII and apolipo
  • the factor or means in the present invention is apolipoprotein CI
  • the system further comprises means for discriminating between apolipoproteins ci wrinkles and apolipoprotein cm derivatives. For example, by providing a combination of identification means such as antibody + electrophoresis and molecular weight etc., apolipoprotein cms can be identified, but electrophoresis or mass spectrometry etc. to distinguish between derivatives and others It is understood that identification can be achieved by using. Such a technique can be achieved using techniques well known in the art.
  • the factor or means of the present invention is apolipoprotein CI
  • the system of the present invention is capable of at least two of apolipoprotein CIII, apolipoprotein CIII and apolipoprotein CIII.
  • apolipoprotein cms use electrophoresis or mass spectrometry to discriminate between force derivatives to identify and others by providing a combination of identification means by molecular weight etc. such as antibody + electrophoresis It is understood that identification can be achieved. Such a technique can be achieved by using a well-known technique in this field.
  • the factor or means in the present invention is apolipoprotein CI
  • the present invention can determine the degree of diabetes and the onset probability.
  • the marker substance used in the system of the present invention includes serum albumin or a serum albumin derivative
  • the serum albumin derivative includes acidified serum albumin, fractionated serum albumin, and the like.
  • At least one phenomenon selected from the group that also has a decrease in serum albumin and a variability in serum albumin derivatives is developing diabetes or having a high risk of developing in the future. It is an indicator.
  • Albumin is a power that is measured as an index of various diseases. It has never been known that albumin is an index of diabetes. In particular, it is worth noting that it has been found for the first time to increase the accuracy of diagnosis when combined with transthyretin, apolipoprotein cn, apolipoprotein IV, and the like.
  • At least one phenomenon selected from the group consisting of serum albumin reduction and serum albumin derivative variability is an indicator of the degree of developing diabetes or the risk of high future development. It is understood that such an indicator can be determined by those skilled in the art based on the description of this specification.
  • the subject serum albumin is a force encoded by the nucleic acid sequence shown in SEQ ID NO: 13 or SEQ ID NO: 15, or SEQ ID NO: 14 or SEQ ID NO: It has the amino acid sequence shown in 16 or a modified sequence thereof. Alternatively, it may have a known serum albumin sequence in addition to the forces described herein.
  • the factor or means used in the present invention has the ability to selectively distinguish serum albumin (eg, an antibody).
  • serum albumin eg, an antibody
  • an antibody library is prepared, and a library that reacts specifically (preferably, selectively) with serum albumin is selected from the library.
  • a technique can be achieved using known techniques in the art.
  • antibodies other than antibodies this can be achieved using known techniques in the art.
  • the factor or means in the present invention has the ability to selectively distinguish serum albumin, and the system comprises means for quantifying the serum albumin.
  • the system comprises means for quantifying the serum albumin.
  • identification means based on molecular weight such as antibody + electrophoresis
  • serum albumins have the ability to identify Use electrophoresis or mass spectrometry to distinguish between serum albumin itself and others It is understood that identification can be achieved. Such a technique can be achieved using techniques well known in the art.
  • system of the present invention can be preferably used as a diagnostic agent
  • the invention provides a method for prediagnosis or diagnosis of whether a subject is diabetic or to support the prediagnosis or diagnosis comprising: A) in a sample from the subject Providing a method comprising: measuring a marker substance; and B) determining from the measurement results whether the subject is diabetic or likely.
  • any means may be used for obtaining the sample.
  • the process of determining whether or not there is diabetes may be carried out by judging whether it is abnormal compared to the normal value compared to each marker substance. it can.
  • the marker substance and the like to be used are listed in the sections (System), (Transthyretin), (Apolipoprotein CIII), (Apolipoprotein CII) and (Serum albumin) !, It is understood that any one or more of the features described in the above may be included as long as they do not conflict. [0224] (Use)
  • the present invention relates to a marker substance in a sample derived from a subject, a factor that specifically interacts with the single substance, or a means for selectively recognizing the marker substance. It provides use in the manufacture of a medicament for pre-diagnosis or diagnosis of diabetes.
  • the sample may be acquired by any means. Usually, when a person other than the doctor is engaged in the measurement, it may have been obtained by the doctor in some form. From the measurement results, the process of determining whether or not diabetes is possible can be carried out by determining whether it is abnormal compared to each marker substance compared to normal values. .
  • the marker substance and the like to be used are listed in the sections (System), (Transthyretin), (Apolipoprotein CIII), (Apolipoprotein CII) and (Serum albumin) !, It is understood that any one or more of the features described in the above may be included as long as they do not conflict.
  • the present invention provides a subject that is a marker substance in a sample derived from a subject, a factor that specifically interacts with the marker substance, or a means that selectively recognizes the marker substance.
  • a subject that is a marker substance in a sample derived from a subject, a factor that specifically interacts with the marker substance, or a means that selectively recognizes the marker substance.
  • any means may be used for obtaining the sample.
  • a person other than the doctor engages in the measurement it may have been acquired by the doctor in some form.
  • the step of determining whether or not there is a possibility of diabetes from the measurement result can be carried out by determining whether or not it is abnormal as compared with each marker substance compared with the normal value.
  • the marker substance and the like to be used are listed in the sections (System), (Transthyretin), (Apolipoprotein CIII), (Apolipoprotein CII) and (Serum albumin) !, It is understood that any one or more of the features described in the above may be included as long as they do not conflict.
  • the method for measuring the concentration of a marker substance can be used for protein quantification as long as the marker substance concentration can be specifically measured.
  • a generally used method can be used as it is. For example, various immunoassays, mass spectrometry (MS), chromatography, electrophoresis and the like can be used.
  • Imnoassay the concentration of a marker substance can be accurately measured even in a sample with a lot of contaminants.
  • immunoassays include classical methods such as sedimentation, agglutination, and hemolysis that directly or indirectly measure antigen-antibody conjugates, as well as an enzyme that has increased detection sensitivity in combination with a labeling method. Examples include Immunoassay (EIA), Radioimmunoassay (RIA), and Fluorescent Imnoassay (FIA).
  • EIA Immunoassay
  • RIA Radioimmunoassay
  • FIA Fluorescent Imnoassay
  • the antibody specific for the marker substance used in these immunoassays may be monoclonal or polyclonal.
  • Ion ion methods for measuring the concentration of marker substances by mass spectrometry include matrix-assisted laser desorption / lonizat ion (MALDI), electrospray ionization, Any force of ESI) is applicable.
  • MALDI matrix-assisted laser desorption / lonizat ion
  • Any force of ESI is applicable.
  • MALDI is preferred because it produces less multivalent ions.
  • MALDI-TOF-MS combined with a time-of-flight mass spectrometer (TOF) can measure the concentration of marker substances more accurately.
  • MSZMS using two mass spectrometers, the concentration of one marker substance can be measured more accurately.
  • the test material is subjected to SDS polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) to separate the target marker substance, and an appropriate dye or fluorescent substance is used. It is only necessary to stain the gel and measure the intensity and fluorescence intensity of the band corresponding to the target marker substance. If the marker substance cannot be separated by SDS-PAGE alone, two-dimensional electrophoresis combined with isoelectric focusing (IEF) can be used. Furthermore, the amount of marker substance on the membrane can be measured by performing Western plotting rather than detecting directly from the gel.
  • SDS-PAGE SDS polyacrylamide gel electrophoresis
  • the method for diagnosing diabetes of the present invention comprises (a) a protein having a molecular weight of about 13800, which is captured by a cation exchanger at a pH of 7.0 or lower, and (b) a metal at a pH of 7.0 or lower.
  • a protein with a molecular weight of about 8700 trapped by an ion-immobilization carrier (c) a protein with a molecular weight of about 9400 trapped by a cation exchanger at a pH of 7.0 or lower, or pH 7.0 (D) a protein having a molecular weight of about 9700, or (d) a protein having a molecular weight of about 9700, which is captured by a cation exchanger at a pH of 7.0 or less, or p A protein with a molecular weight of about 9700 that is captured on a metal ion-immobilized support at H7.0.
  • (E) A protein with a molecular weight of about 66000 that is captured by a cation exchanger at a pH of 7.0 or lower. Or a protein having a molecular weight of about 66000, trapped on a metal ion-immobilized carrier at pH 7.0, And a marker substance, the method also including comparing the amount of blood and healthy value.
  • the physical properties of the above (a), (b), (c), (d), and (e) are as follows: transthyretin subunit, apolipoprotein CIII0, apolipoprotein CIII1, apolipoprotein C1112 Match.
  • the method for diagnosing diabetes provides: (a) Digestion with trypsin yields polypeptides having molecular weights of about 1270, about 1370, about 1390, about 1520, about 2450, about 2640, and about 3140. Digestion with a molecular weight of about 13800 and Z or (b) trypsin yields a positive molecular weight of about 900, about 1200, about 1390, about 1710, about 1940, and about 2080. It also includes a method in which a protein having a molecular weight of about 8700-9700 is used as a marker substance and the amount in the blood is compared with a healthy value.
  • peptide mass fingerprinting is performed using the ProFound database, (a) is identified as transthyretin.
  • peptide mass fingerprinting is performed using the MS-Fit database
  • (b) is identified as apolipoprotein CIII.
  • One of the preferred embodiments of the method for diagnosing diabetes of the present invention is to capture a marker substance on a carrier and measure the concentration of the captured marker substance. That is, a substance having affinity for the marker substance is immobilized on the carrier, and the marker substance is captured on the carrier via the substance having the affinity. According to this embodiment, it is possible to reduce the influence of contaminants contained in the sample, and to measure the concentration of the marker substance with higher sensitivity and accuracy. Examples of “affinity” include antigen and antibody,
  • the present embodiment when immunoassay is used as a method for measuring a marker substance, it is preferable to use a carrier on which an antibody is immobilized. In this way, an immunoassay system using the antibody immobilized on the carrier as the primary antibody can be easily constructed. For example, prepare two types of antibodies that are specific to the marker substance and have different epitopes, one is immobilized on the carrier as the primary antibody, and the other is enzyme-labeled as the secondary antibody to construct a sandwich EIA system be able to. In addition, it is possible to construct an ImnoAtsuy system using the binding prevention method or the competition method. Furthermore, when a substrate is used as a carrier, immunoassay using an antibody chip is possible. According to the antibody chip, the concentration of a plurality of marker substances can be measured simultaneously, and rapid measurement is possible.
  • the marker substance when mass spectrometry is used in the marker substance measurement method in the present embodiment, the marker substance can be captured on a carrier by ion binding or hydrophobic interaction in addition to the antibody. Ion binding and hydrophobic interaction can also capture substances other than marker substances with specificities similar to those of bioaffinity such as antigens and antibodies, but according to mass spectrometry, the mass spectrometer spectrum reflects the molecular weight. Since it is quantified, there is no problem.
  • the concentration of the marker substance can be measured more accurately.
  • An exchange substrate and a metal ion substrate are preferably used.
  • the ion exchanger When the marker substance is captured on the carrier by ionic bonding, the ion exchanger is immobilized on the carrier.
  • an anion exchanger or a cation exchanger can be used as the ion exchanger, and moreover, Sarako, strong anion exchanger, weak anion exchanger, strong cation exchanger, weak cation exchanger.
  • Any ion exchanger can be used.
  • weak anion exchangers such as dimethylaminoethyl (DE) and jetylaminoethyl (DEAE) What has an anion exchange group is mentioned.
  • strong anion exchangers include quaternary ammonia (trimethylaminomethyl) (QA), quaternary aminoethyl (jetyl, mono-2-hydroxybutylaminoethyl) (QAE), and quaternary ammonia. And those having a strong anion exchange group such as -um (trimethylammonium) (QMA).
  • weak cation exchangers include those having weak cation exchange groups such as carboxymethyl (CM). Further, examples of the strong cation exchanger include those having a strong cation exchange group such as sulfopropyl (SP).
  • a substance having a hydrophobic group is immobilized on the carrier.
  • the hydrophobic group include a C4 to C20 alkyl group and a phenyl group.
  • metal ions such as Cu2 +, Zn2 +, Ni2 +, Ca2 +, Co2 +, Mg2 + are immobilized.
  • the carrier used in the present embodiment known ones such as beads, microtiter plates, and resin can be used.
  • beads and microtiter plates have also been used in conventional immunoassays, making it easy to build a measurement system.
  • a carrier having a planar portion such as a substrate can also be used.
  • An example is a carrier in which a chip is used as a substrate and an antibody specific for a marker substance is immobilized in spots on a plurality of spots on the surface.
  • serum or plasma prepared from the blood force it is preferable to use blood collected from a subject as a specimen and serum or plasma prepared from the blood force as a test material.
  • Serum or plasma can be prepared by a known method such as centrifugation.
  • FIG. 1 is a flow chart showing the procedure of the method for diagnosing diabetes of the present invention using a multimarker system. According to the method of the flowchart in FIG. 1, firstly, a primary determination is made using the concentration of transthyretin in blood as an index. If the concentration of transthyretin is higher than the normal value, it is determined as diabetes.
  • the concentration of transthyretin is below the normal value If this is the case, a secondary determination is made using the concentration of apolipoprotein CIII2 in the blood as an index. If the concentration of apolipoprotein CIII2 is higher than the normal value, it is determined as diabetes. On the other hand, if the concentration of apolipoprotein CIII2 is below the normal value, a third determination is made using the concentration of apolipoprotein cmi in the blood as an index. If the concentration of the apolipoprotein cmi is below the normal value, it is determined as normal (not diabetic).
  • a quaternary determination is made using the concentration of apolipoprotein cmo in the blood as an index. And when the density
  • FIG. 2 is a flowchart showing the procedure of the method for diagnosing diabetes of the present invention using another multimarker system.
  • a primary determination is made using the concentration of serum albumin in blood as an index. If the serum albumin concentration is equal to or higher than the normal value, it is determined as normal (not diabetic). On the other hand, if the serum albumin concentration is lower than the normal value, a secondary determination is made using the concentration of apolipoprotein CIII2 in the blood as an index. If the concentration of apolipoprotein CIII2 is higher than the normal value, it is determined as diabetes.
  • a third determination is made using the concentration of apolipoprotein cmi in the blood as an index. If the apolipoprotein cmi concentration is below the normal level, it is determined as normal (not diabetic). On the other hand, if the concentration of apolipoprotein cmi is higher than the normal value, a quaternary determination is made using the concentration of apolipoprotein cmo in the blood as an index. If the concentration of apolipoprotein cmo is higher than the normal value, it is determined as diabetes. On the other hand, if the concentration of apolipoprotein cmo is below normal, it is determined as normal (not diabetic).
  • transthyretin, apolipoprotein CIII, and serum albumin used as diabetes markers in the present invention are combined with conventionally known clinical markers such as HbAlc and CPR to achieve multi-function. It is possible to build a marker system.
  • diabetes can be diagnosed with high accuracy. Furthermore, it is also suitable for detection of a stage before the onset of diabetes, that is, diagnosis of a diabetic reserve army, which is difficult with a conventional method for diagnosing diabetes. In addition, according to the multi-marker system, it is possible to detect the diabetes reserve army only by detecting diabetes and monitor the improvement state of diabetes with high accuracy.
  • the diabetes diagnosis kit of the present invention comprises an antibody specific for a marker substance such as transthyretin.
  • the antibody contained in the kit may be a single reagent, or may be immobilized in advance on a carrier.
  • the shape may be a solution or a lyophilized product.
  • a plurality of antibodies may be included.
  • a labeled antibody used in Immunase may be included as a secondary antibody.
  • the kit for diagnosing diabetes of the present invention may contain other reagents. For example, if it is a kit for performing EIA, a carrier such as beads, a blocking solution, a buffer solution such as PBS, a chromogenic substrate, etc. May be included.
  • the disease diagnosis method of the present invention compares the concentration of at least one of the following marker substances (a) to (n) in the body fluid of a subject with a healthy value, and determines the presence or absence of diabetes or the risk of future onset. Judgment.
  • (m) weak cation exchange at pH 4.0 A protein that binds to the body and produces an ion peak with a mass to charge ratio of approximately 12800 when subjected to mass spectrometry,
  • All of these marker substances are mainly proteins present in blood. If the subject develops diabetes or has a high risk of developing diabetes in the future, the marker substances in body fluids (a), (b), (c), (d), (e) , (F), (g), (h), and (i) concentrations are higher, and marker substances, (k), (1), (m), and (n) concentrations are lower.
  • the Hereinafter, the group consisting of marker substances (a), (b), (c), (d), (e), (f), (g), (h), and (i) is referred to as “Group 1”, and the marker substance
  • the loop consisting of (j), (k), (1), (m) and (n) may be referred to as “Group 2”.
  • the healthy value used in the disease diagnosis method of the present invention is, for example, in the body fluid of the marker substances (a) to (n) in a healthy person who has been diagnosed as having developed diabetes! Concentration data can be collected and set based on that concentration value. When determining the future risk of developing diabetes, a healthy value can be set based on the concentration value in the healthy person. It is also possible to set multiple healthy values in stages and quantitatively determine the presence or absence of diabetes or the risk of future onset.
  • blood is preferably used.
  • serum or plasma body fluid component
  • Serum or plasma can be prepared from blood by a known method such as centrifugation.
  • the present invention provides a method for evaluating a substance, in which an animal that develops diabetes or an animal that has a high risk of developing the disease ingests a test substance and a marker in the body fluid of the animal Compares the concentration of at least one substance (for example, 14 types (a) to (n)) with a reference value, and evaluates the effect of the test substance on improving diabetes or reducing the risk of future onset. is there.
  • a marker substance is used as an index instead of using blood glucose as a direct index, a state before an increase in blood glucose level in an animal can be captured.
  • “Animals” include humans in addition to animals such as rats.
  • the body fluid or body fluid component is contacted with a carrier in which a substance having affinity for the marker substance is immobilized.
  • the marker substance in the body fluid is captured on the carrier, and the concentration of the marker substance in the body fluid is calculated based on the amount of the captured marker substance (claim 10), the carrier is a planar portion
  • the substance having affinity for the marker substance is configured to be fixed to a part of the planar portion, and the substance having affinity for the marker substance is an ion exchanger, metal chelate or With antibodies A configuration is recommended.
  • an animal that develops diabetes or an animal that has a high future risk of developing is ingested with a test substance, and the marker substances (a) to (! 1) in the animal are ingested. At least one concentration is compared with a reference value to evaluate the effect of the test substance on improving diabetes or reducing the risk of future onset.
  • the concentration of the marker substance belonging to Group 1 in the body fluid is lower, and the concentration of the marker substance belonging to Group 2 is lower. Indicates a higher value.
  • the reference value does not have an effect of improving diabetes or reducing the risk of developing future in animals that develop diabetes!
  • the concentration of the marker substance in the body fluid of the animal when a known substance is ingested is used. That is, if an animal that has developed diabetes or an animal that has a high risk of developing in the future is ingested with a known substance that does not have an effect of improving diabetes or a risk of reducing the risk of developing future disease, the marker substance in the body fluid
  • the concentration of is an “abnormal value”.
  • the value (measured value) in the animal ingested with the test substance is compared with the reference value (abnormal value), and if the measured value is significantly different from the reference value and is on the normal side (normal side)
  • the test substance can be evaluated as having an effect of improving diabetes or reducing the risk of future onset.
  • the marker substance belonging to Group 1 is used as an index
  • the measured value is significantly lower than the reference value
  • the marker substance belonging to Group 2 when the marker substance belonging to Group 2 is used as an index
  • the measured value is When the test substance is significantly higher than the reference value, it can be evaluated that the test substance has an effect of improving diabetes or a risk of reducing future risk.
  • a value (normal value; negative reference) in an animal or animal that has a low risk of developing diabetes can be added to the reference value.
  • Known substances that have no effect of improving diabetes or reducing the risk of future onset in animals Three groups are established: a group to be ingested (a group that exhibits abnormal values), and (3) a group in which the test substance is ingested by an animal that has developed diabetes or a high risk of developing diabetes. Is raised. Then, the marker substance in the body fluid of each animal is measured and the measured values are compared. At this time, there is a significant difference between (1) and (2), there is a significant difference between (3) and (2), and (3) is closer to the normal side (close to (1) than (2) If the test substance is maintained on the normal side, it can be evaluated that the test substance has an effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the disease in the future. In other words, if the test substance has an effect of improving diabetes or reducing the risk of future onset, the blood glucose level is maintained at the normal level in (3) and the concentration of the marker substance is close to the normal level (1) Takes a value.
  • (4) a group in which an animal that has developed diabetes or an animal that has a high future risk of taking a known substance that has an effect of improving diabetes or reducing the risk of developing future Values in animals (positive controls) can also be added.
  • the group of (4) above is set up and raised.
  • the test substance can be evaluated as having an effect of improving diabetes or reducing the risk of future onset.
  • it can be said that such a test substance exhibits the same behavior as the known substance adopted in (4) and has the same action.
  • the above-mentioned "animal that develops diabetes! /, Or an animal that has a high risk of developing diabetes” can be realized, for example, by using an animal that necessarily genetically develops diabetes. More specifically, for example, OLETF (Otsuka Long-Evans Tokushima Fatty) rats supplied by Tokushima Research Institute, Otsuka Pharmaceutical Co., Ltd. can be used. OLETF rats are model rats that spontaneously develop type 2 diabetes with obesity. In males, almost all cases are diagnosed with diabetes by OGTT at 25 weeks of age.
  • an animal that does not develop diabetes or an animal that has a low risk of developing diabetes can be realized, for example, by using a model animal that does not genetically develop diabetes at all. More specifically, for example, LETO (Long-Evans Tokushima Otsuka) rats supplied from Tokushima Laboratory, Otsuka Pharmaceutical Co., Ltd. can be used. LETO rats are control rats that never develop diabetes and are genetically OLET It is closely related to F-Rad.
  • the animal used in the method for evaluating a substance of the present invention is not particularly limited, and examples thereof include mice, rats, rabbits, pigs, and the like. In particular, since rats and mice can be easily bred, they are preferably used in the evaluation method of the present invention. There are no particular limitations on the method of raising the animal. For example, the animal can be fed freely for about 3 to 20 days. Furthermore, humans can also be used as animals. When humans are used, substances will be evaluated based on the results of clinical trials.
  • Blood is preferably used as an animal body fluid used in the method for evaluating a substance of this aspect.
  • serum or plasma body fluid component
  • Serum or plasma can be prepared by a known method such as centrifugation.
  • test substance in the method for evaluating a substance of the present invention examples include food materials and drug substances.
  • food materials when food materials are to be evaluated, it can be used to develop functional foods.
  • an evaluation kit can be constructed by collecting necessary reagents.
  • the evaluation kit include those containing a carrier on which a substance having affinity for a marker substance is immobilized.
  • a carrier on which a weak cation exchanger such as CM, a metal chelate such as copper ion, or a substrate on which an antibody against a marker substance is immobilized SELDI-TO F-MS or antibody Immunization with a chip can be performed easily.
  • the kit may contain other reagents such as standard substances and various pretreatment buffers.
  • the substance screening method of the present invention evaluates a test substance by the substance evaluation method of the present invention, and screens for a substance having an effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the future.
  • the same embodiment as the above-described method for evaluating substances of the present invention can be employed.
  • the present invention also evaluates a test substance by the method for evaluating a substance described in the present invention.
  • a screening method for a substance characterized by screening a substance having an effect of ameliorating a disease or an effect of reducing the risk of developing the future.
  • the present invention relates to a method for screening a substance, and compares at least one concentration of a marker substance (for example, 14 species (a) to (n)) in an animal body fluid with a reference value to improve diabetes.
  • a marker substance for example, 14 species (a) to (n)
  • This is to screen for substances that have an effect or reduce the risk of future onset.
  • blood glucose is not directly used as an index, but another marker substance is used as an index, so that it is possible to capture a state before an increase in blood glucose level in an animal.
  • substances having an effect of reducing the risk of developing future diabetes can be screened.
  • the test substance is a food material
  • the present invention also provides a substance obtained by such a screening method.
  • Each fraction was subjected to SELDI-TOF-MS using a protein chip to exhaustively search for proteins specific to the serum of diabetic patients.
  • protein chips metal ions (Cu2 +), weak cation exchangers (CM), strong anion exchangers (Q), and reversed-phase (C16 alkyl chains). I examined it.
  • Two types of energy-absorbing substances (EAM) were studied: a-cyanose 4-hydroxycacin acid (CHC A) and sinapinic acid (SPA).
  • CHC A a-cyanose 4-hydroxycacin acid
  • SPA sinapinic acid
  • a number of peaks were detected depending on combinations of protein chip type, fraction type, chip washing conditions (pH), EAM type, and the like. From these peaks, we searched for peaks with significantly different intensities between diabetics and healthy individuals.
  • Mass / charge it (m / z) force S 13867, 14049, 13885 using a protein chip with a weak cation exchanger fixed, and fraction 4 with a wash pH of 7.0 Five peaks at 14087 and 13761 were detected. In addition, using a protein chip with a weak cation exchanger immobilized, and a wash pH of 4.0 for fraction 5, a peak of mZz force 3885 was detected. From these six peaks, it was suggested that a candidate protein (hereinafter referred to as “candidate protein (1)”) exists in the vicinity of a molecular weight range of 13800 to 14100.
  • FIGS. 3 (a) to 3 (c) show an example of a peak having an mZz of 13 867.
  • Fig. 3 (a) is a graph plotting peak intensities for diabetics and healthy individuals, and the horizontal line is the cutoff value.
  • Fig. 3 (b) is a graph showing the results of Fig. 3 (a) in terms of maximum, minimum, median and cut-off values.
  • Fig. 3 (c) shows the ROC curve. The closer the ROC area is to 1, the higher the accuracy of the measurement system (the closer the curve is to the upper left)! Create a similar graph (not shown) for the other five peaks. It was. Table 2 below summarizes the P value, ROC area, chip used, chip cleaning conditions, fractions, and EAM used for each peak.
  • Candidate protein (1) was purified from the serum of diabetic patients by the following procedure. First, 75 L of a denaturing buffer (9 M urea, 2% CHAPS, 50 mM Tris-HCl (pH 9.0)) was added to 50 L of serum of a diabetic patient and treated at 4 ° C for 20 minutes. In addition, wash Z-binding buffer (50 mM phosphate buffer (pH 7.0) containing lOOmM NaCl) 1.5 mL of the diluted Z-buffer, and then equilibrated with wash Z-binding buffer, Q Ceramic HyperD FS pin Column (Biosepla Company). The mixture was stirred at 4 ° C for 30 minutes, and then washed twice with 500 L of washing / binding knife.
  • a denaturing buffer 9 M urea, 2% CHAPS, 50 mM Tris-HCl (pH 9.0)
  • wash Z-binding buffer 50 mM phosphate buffer (pH 7.0) containing lOOmM Na
  • fractionation was performed by sequentially eluting with 100 L of 5 kinds of 50 mM phosphate buffer (pH 7.0) containing 125 mM, 150 mM, 175 mM, 200 mM, or 250 mM NaCl.
  • 50 mM phosphate buffer pH 7.0
  • a peak with a molecular weight of about 13800-14100 similar to that of the candidate protein (1) was found in the fraction eluted with a buffer containing 175 mM, 200 mM, and 250 mM NaCl. was detected. All albumin was eluted in the washing step before elution, and the candidate protein (1) and albumin were completely separated under these conditions.
  • Fractions with NaCl concentrations of 175 mM, 200 mM, and 250 mM were mixed (90 / z LX 3). Concentrate the mixed fractions with VivaSpin 5000 Cut Off (Sartorius), and add 10 volumes of 50 mM phosphate buffer (pH 7.0) to concentrate to a final volume of 50 L. I changed the koffer. Next, the concentrated sample was subjected to SDS-PAGE with a gel concentration of 16%, and the gel was stained with Coomassie Brilliant Blue (CBB). As a result, a target band was detected at a molecular weight of about 13800.
  • CBB Coomassie Brilliant Blue
  • the molecular weight of the conventionally known transthyretin subunit is 13890 and the isoelectric point is 5.3, whereas the molecular weight of the isolated protein is about 13800, and the expected isoelectric point is 5.3.
  • the physico-chemical properties of the two are almost the same.
  • transthyretin is known to be a tetramer consisting of four identical subunits, according to the results of this example, transthyretin is not in the form of a tetramer. Detected by subunit alone.
  • Example 2
  • Example 2 In the same manner as in Example 1, another candidate peak was searched. As a result, two peaks with m / z of 9279 and 9705 were detected when a protein chip fixed with a weak cation exchanger was used and the washing pH of fraction 6 was 4.0. In addition, when a protein chip on which a weak cation exchanger was immobilized and a washing pH of 4.0 was set to 4.0, two peaks with mZz of 9 285 and 9415 were detected. In addition, three peaks of mZz forces 9289, 9638, and 9712 were detected using a protein chip with a weak cation exchanger immobilized and a washing pH of 7.0 for fraction 6.
  • Figs. 4 (a) to 4 (c) show examples of mZz peaks at 8690 !.
  • Fig. 4 (a) is a graph plotting peak intensities for diabetics and healthy individuals, and Fig. 4 (b) shows the results of Fig. 4 (a) with the maximum, minimum, median, and The graph shows the cutoff value, and Fig. 4 (c) shows the ROC curve. Similar graphs (not shown) were prepared for the other 10 peaks. Table 3 below summarizes the P value, ROC area, chip used, chip cleaning conditions, fractions, and EAM used for each peak.
  • Candidate protein (2) was purified from the serum of diabetic patients by the following procedure. First, 75 ⁇ L of denaturing buffer was added to 50 ⁇ L of serum of diabetic patients and treated at 4 ° C. for 20 minutes. Furthermore, after washing and diluting 1.5 mL of washing / binding buffer (50 mM phosphate buffer (pH 6.0)), it was applied to a Q Ceramic HyperD F Spin Column equilibrated with washing Z binding buffer. The mixture was stirred at 4 ° C for 30 minutes, and then washed twice with 500 L of washing Z-binding buffer. Next, contain 50 mM, 150 mM, or 250 mM NaCl.
  • washing / binding buffer 50 mM phosphate buffer (pH 6.0)
  • the target band purified by SDS-PAGE was digested in gel with a 0.02 ⁇ & / ⁇ L trypsin solution (dissolved in 25 mM ammonium bicarbonate (pH 8.0)).
  • trypsin solution dissolved in 25 mM ammonium bicarbonate (pH 8.0)
  • MALDI-MSZMS analysis was performed on the extinguished sample, at least five Pitaka S were detected, and their molecular weights were “898”, “1197”, “1717”, “1939”, “2076” ”Was calculated. Based on these data, the MS-Fit database was searched for known proteins and peptide mass fingerprinting was performed.
  • apolipoprotein cmo Three apolipoproteins cni were identified: apolipoprotein cmo, apolipoprotein CIII1, and apolipoprotein CIII2.
  • the molecular weights of apolipoprotein CIII0, apolipoprotein Cini, and apolipoprotein CIII2 that are conventionally known are 87 65, 9421, and 9713, respectively, while the isoelectric points are 4.95, 4.80, and 4.65, respectively.
  • the molecular weights of the three proteins isolated this time were 8690, 9415, and 9712, respectively, and the expected isoelectric points were all in the range of 4.5 to 5.0.
  • Serum from a diabetic patient was subjected to two-dimensional electrophoresis with IEF in the first dimension (horizontal direction) and SDS-PAGE in the second dimension (vertical direction).
  • the molecular weight was 6.5 to 14.4 kDa and the isoelectric point ( pi)
  • Three bands A, B, and C were detected around 5 (Fig. 5). These bands were not detected in the serum of healthy individuals.
  • SELDI-TOF-MS the molecular weights of A, B, and C coincided with the molecular weights of apolipoprotein CIII2, apolipoprotein cmi, and apolipoprotein cnio, respectively. This result coincided with the search result of the candidate protein (2) using the above protein chip.
  • Candidate peak search (3) Further candidate peaks were searched in the same manner as in Example 1. As a result, two peaks of mZz force 66418 and 66449 were detected when a protein chip fixed with a weak cation exchanger was used and the washing pH of fraction 3 was 7.0. In addition, when a protein chip with a weak cation exchanger fixed thereto was used and the washing pH was set to 4.0 for fraction 5, a peak with m Zz of 66449 was detected. In addition, using a protein chip with a weak cation exchanger fixed, and a washing pH of 7.0 for fraction 6, a peak of mZz force S66572 was detected.
  • candidate protein (3) was a candidate for a molecular weight in the range of 66000-67000.
  • This molecular weight value was very close to the known human serum albumin molecular weight (66439) value, and a peak almost identical to the molecular weight of human serum albumin with m Zz of 66449 was detected. 3) was identified as serum albumin.
  • Fig. 6 (a) to (c) shows an example of a peak with mZz of 66216.
  • Fig. 6 (a) is a graph plotting peak intensities for diabetic patients and healthy individuals, and Fig. 6 (b) shows the results of Fig. 6 (a) with the maximum, minimum, median, and cut values. This graph shows the off value, and Fig. 6 (c) shows the ROC curve. Since this peak shows a lower value in diabetic patients, the ROC curve in Fig.
  • a diabetes detection kit (1) having the following constitution was constructed.
  • This kit includes a substrate on which an antibody is immobilized.
  • the kit captures a marker substance on the substrate and measures transthyretin, apolipoprotein cm, and serum albumin in a sandwich EIA system. Detection is performed with fluorescently labeled streptavidin.
  • Apolipoprotein CHI standard product (lyophilized product)
  • Anti-human serum albumin monoclonal antibody immobilized glass substrate
  • a diabetes detection kit (2) having the following constitution was constructed. This kit is for measuring transthyretin, apolipoprotein cm, and serum albumin by sandwich EIA using a microtiter plate.
  • Apolipoprotein cm standard product (lyophilized product)
  • Anti-human serum albumin monoclonal antibody plate (96 holes)
  • OLETF rats were prepared as model rats with spontaneous onset of type 2 diabetes, and LETO rats were prepared as rats that did not develop type 2 diabetes of the same strain (genetically related) as the model rats.
  • OLE TF rats and LETO rats were also provided by Tokushima Laboratories, Otsuka Pharmaceutical Co., Ltd.
  • a group of LETO rats (Group 1) and a group of OLETF rats (Group 2) were established and each rat was raised.
  • CRF-1 Oriental Bioscience
  • Each group also started testing at 5 weeks of age and was raised until 50 or 62 weeks. 5 (at start of breeding), 9, 13, 17, 21, 25, 29, 33, 37, 41, 45, and 49 at the age of each week [Do this OGTT!
  • Denaturation buffer (9% urea, 2% CHAPS, 50 mM Tris-HCl (pH9.0)) 30 / z L was added to each serum sample 20; .
  • each pretreated serum sample was applied to a strong anion exchange resin column (Q Ceramic Hyper D, Pyosepura).
  • a pH 9.0 buffer 50 mM Tris—HC1 (pH 9.0), 0.1% (WZV) 1—o—N-octyl- ⁇ -D-darcobilanoside (hereinafter referred to as “OGPJ”)).
  • pH 7.0 buffer 50 mM HEPES—NaOH (pH 7.0), 0.1% (wZv) OGP) ⁇ pH 5.0 buffer (lOOmM sodium oxalate (pH 5.0), 0.1% (wZv ) OGP), pH 4.0 buffer (lOOmM sodium acetate (pH 4.0), 0.1% (w / v) OGP) ⁇ pH 3.0 buffer (50 mM sodium citrate (pH 3.0), 0 l% (w / v) OGP), and organic solvent (33.3% isopropyl alcohol, 16.7% acetonitrile, 0.1% trifluoroacetic acid mixture) elute sequentially at 200 / z L each, fraction 1 (elute at ⁇ 9.0) , Pass-through), fraction 2 (eluted at pH 7.0), fraction 3 (eluted at pH 5.0), fraction 4 (eluted at pH 4.0), fraction 5 (eluted at pH 3.0), fraction Six crude fractions of 6 (organic solvent) were obtained
  • Each of the obtained fractions was diluted 10-fold with a pH 4.0 protein chip binding buffer (lOOmM sodium acetate) and then added to a cation exchange chip CM10 (Cyphergen).
  • CM10 cation exchange chip
  • 10 L of each of the obtained fractions was diluted 10-fold with pH 7.0 protein chip binding buffer (lOOmM phosphoric acid, 0.5 M NaCl), and then added with copper modified chip IMAC30 (Cyphergen) did.
  • Each protein chip was washed 3 times with each binding buffer and then once with deionized water and dried.
  • FIG. 7 shows a box plot when the peak intensity of this peak at 21 weeks of age is plotted for each group.
  • the top and bottom edges of the basket are the maximum and minimum values, respectively
  • the top and bottom sides of the box are the third quartile (75th percentile) and the first quartile (25th percentile), respectively
  • the lines in the box are The median value (the same applies to the following figures). That is, this peak showed a low value in the first group and a high value in the second group.
  • the marker substance (a) is also present in human blood, it is possible to determine the onset of diabetes or the risk of future development using the concentration of the marker substance (a) in the blood as an index. It was shown that it can be done.
  • the test substance evaluates the effect of improving diabetes or reducing the risk of future onset, and It was shown that screening of new substances can be performed. For example, the same animal experiment using a desired test substance is performed to prepare a serum sample, and when SELDI-TOF-MS is performed in the same procedure, a peak with a mass-Z charge ratio of about 7040 is obtained. When the concentration of the protein that produces the above is maintained at a normal value, the test substance can be evaluated as having an effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the future.
  • the test substance evaluates the effect of improving diabetes or reducing the risk of future onset, And it has been shown that such substances can be screened. For example, when a serum sample is prepared by performing the same animal experiment using a desired test substance and SELDI-TOF-MS is performed in the same procedure, a peak with a mass-Z charge ratio of about 8330 is obtained. When the concentration of the resulting protein is maintained at a normal value, the test substance can be evaluated as having an effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the future.
  • the marker substance (c) when the marker substance (c) is also present in human blood, the presence or absence or future risk of developing diabetes is determined using the marker substance (c) concentration in the blood as an index. It was shown that Furthermore, using the concentration of the marker substance (c) in the blood of the animal ingested as the test substance as an index, the test substance evaluates the effect of improving diabetes or reducing the risk of future onset, And it has been shown that such substances can be screened. For example, when a similar animal experiment is performed using a desired test substance to prepare a serum sample and SELDI-TOF-MS is performed in the same procedure, a peak with a mass-Z charge ratio of about 8530 is obtained. When the concentration of the resulting protein is maintained at a normal value, it can be evaluated that the test substance has an effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the future.
  • the concentration of the marker substance (d) in the blood is used as an index to detect diabetes. It has been shown that the presence of onset or the risk of future onset can be determined. Furthermore, using the concentration of the marker substance (d) in the blood of the animal ingested as the test substance as an index, the test substance evaluates the effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the future, and such It has been shown that screening of substances can be performed. For example, when a similar animal experiment is performed using a desired test substance to prepare a serum sample, and SELDI-TOF-MS is performed in the same procedure, a peak with a mass-Z charge ratio of about 9060 is obtained. When the concentration of the resulting protein is maintained at a normal value, the test substance can be evaluated as having an effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the future.
  • the marker substance (e) when the marker substance (e) is also present in human blood, the presence or absence or future risk of developing diabetes is determined using the marker substance (e) concentration in the blood as an index. It was shown that In addition, using the concentration of the marker substance (e) in the blood of the animal that ingested the test substance as an index, evaluate the effect of the test substance on improving diabetes or reducing the risk of future onset. It has been shown that screening of such substances can be performed. For example, when a similar animal experiment is performed using a desired test substance to prepare a serum sample and SELDI-TOF-MS is performed in the same procedure, a peak with a mass-to-charge ratio of about 9260 is generated. When the protein concentration is maintained at a normal value, the test substance can be evaluated as having an effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the future.
  • Corrected form (Rule 91) A box plot when the peak strength is plotted for each group is shown. That is, this peak showed a low value in the first group and a high value in the second group. From 2 and above, a protein that produces a peak with a mass / charge ratio of about 9450 when subjected to SELDI-TOF-MS (marker substance (f)) is specific to rats with diabetes or high risk of development in the future. It was found that the substance can be a marker for the disease. As a result, when a single marker substance (f) is also present in human blood, it is possible to determine the presence or future risk of developing diabetes using the marker substance (f) concentration in the blood as an index. It was shown that we can do it.
  • the test substance evaluates the effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the future, and such It has been shown that screening of substances can be performed. For example, when a similar animal experiment is performed using the desired test substance to prepare a serum sample and SELDI-TOF-MS is performed in the same procedure, a peak with a mass-Z charge ratio of about 9450 is obtained. When the concentration of the resulting protein is maintained at a normal value, the test substance can be evaluated as having an effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the future.
  • the marker substance (g) when the marker substance (g) is also present in human blood, the presence or absence of diabetes or the risk of developing it in the future is determined using the marker substance (g) concentration in the blood as an index. It was shown that In addition, using the concentration of the marker substance (g) in the blood of the animal ingested as an index, the test substance evaluates the effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the future, and It has been shown that such substances can be screened.
  • test substance For example, a similar animal experiment is performed using a desired test substance to prepare a serum sample, When the SELDI-TOF-MS is performed in order and the concentration of the protein that produces a peak with a mass-Z charge ratio of approximately 13700 is maintained at a normal value, the test substance is effective in improving diabetes or developing in the future. It can be evaluated that it has a risk reduction effect.
  • the test substance evaluates the effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the future, and such It has been shown that screening of substances can be performed. For example, when a similar animal experiment is performed using a desired test substance to prepare a serum sample, and a SELDI-TOF-MS is performed in the same procedure, a peak with a mass-Z charge ratio of about 76400 is obtained. When the concentration of the resulting protein is maintained at a normal value, the test substance can be evaluated as having an effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the future.
  • the test substance evaluates the effect of improving diabetes or reducing the risk of future onset, and such It has been shown that screening of substances can be performed. For example, when a similar animal experiment is performed using the desired test substance to prepare a serum sample, and SELDI-TOF-MS is performed in the same procedure, a peak with a mass-Z charge ratio of about 79100 is obtained. When the concentration of the resulting protein is maintained at a normal value, the test substance can be evaluated as having an effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the future.
  • the concentration of marker substance (j) in the blood as an index when the marker substance G) is also present in human blood. It has been shown . Furthermore, using the concentration of the marker substance (i) in the blood of the animal ingested as an index, the test substance evaluates the effect of improving diabetes or reducing the risk of future onset, and such It has been shown that screening of substances can be performed. For example, when a similar animal experiment is performed using the desired test substance to prepare a serum sample and SELDI-TOF-MS is performed in the same procedure, a peak with a mass-to-Z charge ratio of about 3500 is obtained. When the concentration of the resulting protein is maintained at a normal value, the test substance can be evaluated as having an effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the future.
  • the marker substance (k) when the marker substance (k) is also present in human blood, it is possible to determine the presence or future risk of developing diabetes using the marker substance (k) concentration in the blood as an index. It has been shown. Furthermore, using the concentration of the marker substance (k) in the blood of the animal ingested as the test substance as an index, the test substance evaluates the effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the future, and such It has been shown that screening of substances can be performed. For example, when a similar animal experiment is performed using a desired test substance to prepare a serum sample and SELDI-TOF-MS is performed in the same procedure, a peak with a mass-Z charge ratio of about 3560 is obtained. When the concentration of the resulting protein is maintained at a normal value, it can be evaluated that the test substance has an effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the future.
  • a protein that produces a peak with a mass-to-Z charge ratio of about 4180 when subjected to SELDI-TOF-MS is specific to rats with diabetes or high risk of developing in the future. It was found that this substance can be a marker for the disease.
  • marker substance (1) when marker substance (1) is also present in human blood, it is possible to determine the onset of diabetes or the risk of future development using the concentration of marker substance (1) in the blood as an index. It has been shown. Furthermore, using the concentration of the marker substance (1) in the blood of the animal ingested as the test substance as an index, the test substance evaluates the effect of improving diabetes or reducing the risk of future onset, and such It has been shown that screening of substances can be performed. For example, the desired When a test sample is used to prepare a serum sample by performing the same animal experiment and SELDI-TOF-MS is performed in the same procedure, the concentration of the protein that produces a peak with a mass-to-charge ratio of about 4180 is obtained. When maintained at a normal value, the test substance can be evaluated as having an effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the future.
  • a protein that produces a peak with a mass-to-Z charge ratio of about 12800 when subjected to SELDI-TOF-MS is specific to rats with diabetes or high risk of developing in the future. It was found that this substance can be a marker for the disease.
  • the presence of diabetes or the risk of future development can be determined using the marker substance (m) concentration in the blood as an index. It was shown that it can be done. Furthermore, using the concentration of the marker substance (m) in the blood of the animal ingested as an index, the test substance evaluates the effect of improving diabetes or reducing the risk of future onset, and It was shown that screening of new substances can be performed. For example, if a serum sample is prepared by performing similar animal experiments using the desired test substance and SELDI-TOF-MS is performed in the same procedure, a peak with a mass / charge ratio of approximately 12800 is obtained. When the concentration of the resulting protein is maintained at a normal value, the test substance can be evaluated as having an effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the future.
  • FIG. 20 shows a box plot when the peak intensity of this peak at 21 weeks of age is plotted for each group. That is, this peak showed a high value in the first group and a low value in the second group.
  • Corrected form (Rule 91) It was found that it can be a marker for the disease. As a result, when a single marker substance (n) is also present in human blood, it is possible to determine the onset of diabetes or the risk of future development using the marker substance (n) concentration in the blood as an index. It was shown that it can be done. Furthermore, using the concentration of the marker substance (n) in the blood of the animal ingested as an index, the test substance evaluates the effect of improving diabetes or reducing the risk of future onset, and It was shown that screening of new substances can be performed.
  • Example 7 when a similar animal experiment is performed using the desired test substance to prepare a serum sample, and a SELDI TOF MS is performed in the same procedure, a peak with a mass Z charge specific force of about 65700 is generated.
  • the test substance can be evaluated as having an effect of improving diabetes or reducing the risk of developing the future.
  • Amersham HiTrapQ is a strong anion exchange column after diluting 5 times of 500 L of serum of diabetic patients and healthy individuals with 50 mM Tris-HCl (pH 7.0) and centrifuging at 20 kG, 4 ° C, lOmin. Fractionation was performed using 1 mL of HP. First, 5 CV washing was performed with 50 mM Tris-HCl (pH 7.0), and then 5 CV washing was performed with 50 mM Tris-HCl (pH 7.0) and 160 mM NaCl. Elution was performed at 2 CV using 50 mM Na-Acetate (pH 4.0).
  • the eluted sample was subjected to acetone precipitation with 5 volumes of acetone, and the resulting precipitate was mixed with 62.5 mM Tris-HCl (pH 6.8), 1% SDS, 20% glycerol, 0.005% BPB mixed solution 200 Dissolved in L to prepare a sample for SDS-PAGE.
  • TBS Tris-buffer saline
  • Anti-human Transthyretin antibody (rabbit IgG 200 g / mL) diluted 1000 times with TTBS (final concentration 0.2 ⁇ g / mL)
  • AP color development buffer Dilute 25x stock 25 times with ultra pure water to make AP color development buffer. 200 ⁇ L of AP color development reagent A, 200 against 20 mL of AP color development buffer Add ⁇ L of AP color development reagent B to make AP color solution.
  • the plate was immersed in TTBS and washed by shaking for 5 minutes x 3 times at room temperature.
  • FIG. 25 shows the tetrameric structure of TTR and the amino acid sequence of the monomer.
  • transthyretin usually has a tetrameric structure, and it is postulated that when it collapses, it becomes diabetic.
  • Figure 26 shows the three-dimensional structure and secondary structure of the human TTR a -domain. Derivatives can be analyzed by mass spectrometry using the typical post-translational modifications and mass changes in proteins and peptides shown in Table 1.
  • Rat Serum 750 / z L was diluted 5-fold with 50 mM Tris—HC1 (pH 6.0) and filtered using a Millipore Millex—HV (0.45 m) filter unit to obtain a sample.
  • Amersham HiTrapQ is a strong anion exchange column. Fractionation was performed using 1 mL of HP. First, wash with 5 mM V in 50 mM Tris—HCl (pH 6.0), then wash with 12 CV in 50 mM Tris—HCl (pH 6.0), 200 mM NaCl, and then with 50 mM Tris—HCl (pH 6.0). 5CV washing was performed. Elution was performed at 2 CV using 50 mM Na-Acetate (pH 3.0).
  • the eluted sample was subjected to acetone precipitation with 10 times the amount of acetone, and the resulting precipitate was mixed with 62.5 mM Tris-HCl (pH 6.8), 1% SDS, 20% glycerol, 0.005% BPB mixed solution. U-dissolved sample was used for SDS-PAGE.
  • Trypsin (20 i ug) is dissolved in 50 mM acetic acid (0.1 mL) to make a trypsin stock solution. Add tryptic solution (25 L) to ultrapure water (200 L), lOOmM bicarbonate (500 L), MeCNOO / z L) to make a trypsin solution.
  • Figure 27 shows a gel photograph of the identified band and analysis of the band by SELDI-TOF.
  • Fig. 28 shows a gel photograph of the identified band and analysis of the band by SELDI-TOF.
  • pH3.0 50 mM Na—Citrate Buffer pH 3.5-5.5: 50 mM Na— Acetate Buffer
  • FIG. 29 shows spots on two-dimensional electrophoresis that are considered to be spots of human polypoprotein CIII (0-2).
  • Fig. 30 shows the results of mass spectrometry of each spot.
  • Figure 31 shows the SELDI-MS results for each spot.
  • FIGS. 32 to 34 show the results of the examination of the optimum adsorption conditions.
  • Figure 32 shows the results of the CM10 study
  • Figure 33 shows the results of the Q10 study.
  • Figure 34 shows the results of the optimal condition study. From these results, it is clear that the obtained spot is a spot of human apolipoprotein cm (o-2).
  • This example shows that S-cysteylated transthyretin identified as described above shows a correlation even in the severity evaluation based on the hemoglobin (HbAlc) level. It was. HbAlc is currently used as the most reliable diabetes marker.
  • IMAC30 chelate metal (Cu) immobilization chip
  • Vertical axis S-cysteinyl measured with SELDI-TOF-MS Ion intensity of ated TTR; horizontal axis: C: control (healthy person), P: diabetic patient.
  • IMAC30 chelate metal (Cu) immobilization chip
  • Figure 36 shows the results.
  • Vertical axis ionic strength of S-cysteinylated TTR measured by SELDI—TOF—MS; horizontal axis: C: control (healthy person), P: diabetic patient.
  • Vertical axis ionic strength of S—cysteinylated TTR measured by SELDI—TOF—MS; horizontal axis: C: control (healthy), P: diabetic patients [0352]
  • FIG. 38 shows the actual measurement data of MZZ: 13, 863 in diabetic patients.
  • 8.3K predicted as a prophylactic (pre-) marker in the above example was identified as Apo CII.
  • the obtained sample was fractionated using Amersham HiTrapQ HP lmL which is a strong anion exchange column. First, wash with 5 mM CV with 50 mM Tris-HCl (pH 6.0), then wash with 50 mM Tris-HCl (pH 6.0), 200 mM NaCl (trowel 12 CV, then 50 mM Tris-HCl (pH 6. At 0), 5CV cleaning was performed.
  • the measurement was carried out twice washed ⁇ at 1% TFA line! / ,, matrix ⁇ or to ride 25 0/0 SPA 0. twice.
  • Trypsin (20 i ug) is dissolved in 50 mM acetic acid (0.1 mL) to make a trypsin stock solution. Add tryptic solution (25 L) to ultrapure water (200 L), lOOmM bicarbonate (500 L), MeCNOO / z L) to make a trypsin solution.
  • TBS Tris-buffer saline
  • AP coloring solution Dilute 25x stock 25 times with ultra pure water to make AP color development buffer. Add 200 L of AP color development reagent A and 200 ⁇ L of AP color development reagent B to 20 mL of AP color development buffer to make an AP color solution.

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Physiology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Endocrinology (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

 本発明は、糖尿病の検出や予防に有用で、マルチマーカーシステムにも応用できる糖尿病の診断または事前診断の方法および糖尿病診断または事前診断のキットを提供する。糖尿病のマーカー物質として、血液中のトランスサイレチン、アポリポタンパク質CII、アポリポタンパク質CIII、血清アルブミンおよびそれらの関連物質の群から選択される1または2以上のタンパク質を選択し、これらの濃度を健常値と比較して糖尿病の診断または事前診断を行う。マーカー物質の濃度を測定する方法としては、マーカー物質に特異的な抗体を用いることが好ましい。また、担体にマーカー物質を捕捉して測定することもできる。マーカー物質に特異的な抗体を含む糖尿病診断または事前診断のキットによれば、より簡便に糖尿病の診断または事前診断を行うことができる。

Description

明 細 書
糖尿病の予知 ·診断方法および糖尿病予知 ·診断用キット
技術分野
[0001] 本発明は、疾病の事前診断および診断のための方法、物質の評価方法、および物 質のスクリーニング方法に関し、さらに詳細には、被検者の体液中におけるマーカー 物質の濃度を指標として、糖尿病の有無または将来の発症リスクを判定 (事前診断) する疾病の診断方法、糖尿病を発症して 、る動物または将来の発症リスクが高 、動 物に被験物質を摂取させ、該動物の体液中におけるマーカー物質の濃度を指標し て、被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を評価 する物質の評価方法、および、該評価方法を用いて糖尿病の改善効果または将来 の発症リスクの低減効果を有する物質をスクリーニングする物質のスクリーニング方 法、に関する。
[0002] 本発明は、血液中のマーカー物質の濃度を測定し、その値を健常値と比較する糖 尿病の診断方法、および糖尿病の診断に用いるためのキットに関する。
背景技術
[0003] 近年、食生活の欧米化が進み、それに起因すると考えられる肥満,糖尿病,動脈 硬化等の生活習慣病が増カロしている。これらの発症増加は遺伝的なものではなぐ 主に環境因子によるものである。例えば、高脂肪食や高カロリー食の摂取による脂質 代謝異常が、血中脂質上昇、インスリン抵抗性の発症、脂肪細胞肥大化、インスリン 分泌不全等の原因となっている。その結果、糖尿病、肥満、動脈硬化等が高確率で 発症し、病態の進展へとつながっている。これらの生活習慣病の中でも糖尿病は、知 覚麻痺、失明、動脈硬化等との合併症を引き起こすことも多ぐ日常生活に多大な障 害をもたらす病気として特に問題視されて 、る。
[0004] 糖尿病はインスリンの作用不足による高血糖が引き起こす複合疾患である。糖尿病 は 1型と 2型に分類される。 1型糖尿病は、脾臓のランゲルノヽンス島が炎症を起こした 結果、インスリン分泌能が低下または枯渴してしまい、高血糖に至るものである。一方 、 2型糖尿病はそれ以外の原因によってインスリンの作用不足が起こり、高血糖に至 るものである。この 2型糖尿病は日本人の糖尿病の大部分を占めるものであり、特に 問題視されている。 2型糖尿病の発病メカニズムはまだ不明の点がある力 主に環境 因子が引き金になって発病するとされ、過食や肥満が大きな原因の一つである。例 えば、肥満のために脾臓のインスリン分泌量が激増した結果、脾臓が疲労して逆にィ ンスリン分泌量が減少し、結局インスリンの作用不足となり高血糖となる。あるいは、 脂肪の増加によってインスリン受容体が減少し、その結果、インスリンの作用不足とな り高血糖となる。一方、逆に、インスリンの作用不足力 生まれる余剰のグルコースが 脂肪となって蓄えられて肥満が進むこともあり、糖尿病はその発症メカニズムにおい て肥満と密接に関係している。また、 2型糖尿病は発症初期に自覚症状がないことが 多ぐ発見時には力なり進行していて治療が困難となることもある。すなわち、 2型糖 尿病の予備軍は相当に多いと予想される。
[0005] 現在、糖尿病の診断に用いられて!/、る臨床検査項目としては、尿糖、空腹時血糖、 ヘモグロビン Ale (HbAlc)、血中インスリン値、血中 '尿中 C—ペプチド値(CPR)な どがある。その他、グルコースを経口摂取した後の血中グルコース濃度をモニターし 、そのクリアランス能力をみる経口グルコース負荷試験(OGTT)も行われている。ま た、新たな臨床マーカーの例としては、血中レチノイン酸が提案されている(特許文 献 1)。
[0006] しかし、インスリンの増減は、必ずしも糖尿病の明確な指標にならない。そこで、この ほかに、遺伝子産物として有用な糖尿病のマーカー、特に、事前診断が可能なマー カーの報告はこれまでになされて ヽな 、。
[0007] また、ヒトは他因子の病態が絡み合っているが、因子が純粋なモデル動物で同様の 診断指標となるかどうかは不明である。
特許文献 1 :特開 2004— 163379号公報
発明の開示
発明が解決しょうとする課題
[0008] 2型糖尿病のように発症初期に自覚症状が少な!/、疾患の場合は、予防をすること が特に大事である。そのためには、糖尿病の発症前の段階を検出する、いわゆる事 前診断の技術が必要である。そうすれば、糖尿病が発症する前に食事制限や運動 等の処置を行うことができ、糖尿病を予防することが可能になる。し力しながら、従来 の臨床検査では糖尿病を発症前の段階で検出することは難しぐ予防という観点で はほとんど無力であるのが現状である。一方、マルチマーカーシステムと称し、複数 のマーカー物質を指標にして臨床検査の診断精度を上げる方法がすでに提案され ている。したがって、糖尿病の診断にもマルチマーカーシステムを適用して診断精度 を上げることが考えられる。しかし、マルチマーカーシステムによって糖尿病の診断を 行うには、複数の有用なマーカー物質が必要となる力 現在のところそのような複数 のマーカー物質は存在せず、マルチマーカーシステムによって糖尿病を検出した例 は報告されていない。このように、糖尿病の予防や早期発見に有用で、マルチマー カーシステムにも適用可能な糖尿病の診断方法が求められて 、る。
[0009] 2型糖尿病のように発症初期に自覚症状が少な!/、疾患の場合は、予防をすること が特に大事である。そのためには、糖尿病の発症の有無に加えて、糖尿病の将来の 発症リスクを判定する診断技術が求められる。そうすれば、糖尿病が発症する前に、 生活習慣の是正、食事制限、運動等の処置を行うことができ、当該疾病の発症を予 防することが可能になる。さらに、当該疾病の発症リスクを低減させるような効果を有 する食品素材等があれば、そのような食品素材を含む食品を日常的に摂取すること で、糖尿病を容易に予防することができる。
[0010] しかし、糖尿病の将来の発症リスクを判定する診断技術は確立しておらず、物質が 有する当該疾病の改善効果や発症リスクを低減させる効果を評価する方法、および 、当該疾患の改善効果や発症リスクを低減させる効果を有する物質をスクリーニング する方法も開発されて!ヽな ヽ。
[0011] 本発明の目的は、糖尿病の有無または将来の発症リスクを判定する診断方法を提 供し、さらに、被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減 効果を評価する方法、および、該評価方法を用いて糖尿病の改善効果または将来 の発症リスクの低減効果を有する物質をスクリーニングする方法を提供することにある 課題を解決するための手段
[0012] 本発明者らは、糖尿病の予防のための事前診断や早期発見に有用な糖尿病の新 たなマーカー物質を検索すベぐ糖尿病患者と健常者の血液中のタンパク質を質量 分析計スペクトルにより網羅的に比較し、糖尿病患者に特異的な、遺伝子産物であ るタンパク質を検索した。その結果、糖尿病患者と健常者の間で統計的に有意差の ある複数のタンパク質を見出した。さらに、それらのタンパク質を同定したところ、トラ ンスサイレチン(transthyretin)、アポリポタンパク質 CII、アポリポタンパク質 CIII、 および血清アルブミンならびにそれらの誘導体 (たとえば、酸化物、システィニル化物 、グリコシルイ匕物等)と同定された。すなわち、本発明者らは、糖尿病の被験体および 糖尿病予備群においては血液中のトランスサイレチンおよびアポリポタンパク質 cm は健常者より高ぐアポリポタンパク質 cnおよび血清アルブミンについては健常者よ り低い値を示すことを見出し、本発明を完成した。すなわち、本発明の要旨は以下の 通りである。
本発明者らはまた、上記課題を解決すベぐ糖尿病を発症する前の段階から、発症 と未発症の境界、そして発症している段階、に至る種々の動物の体液サンプルを調 製した。そして、当該体液サンプルを質量分析計によるプロテオーム解析により網羅 的に解析した。その結果、糖尿病の有無に加え、将来の発症リスクと関連する(すな わち、事前診断を可能にする)タンパク質を複数見出した。そして、被検者の体液中 における当該タンパク質の濃度を指標として、糖尿病の有無または将来の発症リスク の判定 (すなわち、事前診断)する系を構築した。さらに、動物の体液中における当 該タンパク質の濃度を指標として、被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来 の発症リスクの低減効果を評価する系を構築した。さらに、当該評価方法を用いて、 糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を有する物質のスクリーニン グする系を構築した。本発明を完成した。すなわち、本発明の要旨は以下の通りであ る。
(1) 被験体由来のサンプル中のマーカー物質、上記マーカー物質に特異的に相 互作用する因子、または上記マーカー物質を選択的に認識する手段を含む、被験 体が糖尿病であるかどうか事前診断または診断するためのシステム。
(2) 上記マーカー物質が、上記被験体の体液中に存在する、項目 1に記載のシス テム。 (3) 上記マーカー物質が、上記被験体の血液中に存在する、項目 1に記載のシス テム。
(4) 上記マーカー物質が、遺伝子産物である、項目 1に記載のシステム。
(5) 上記マーカー物質が、トランスサイレチン、トランスサイレチン誘導体、アポリポ タンパク質 cn、アポリポタンパク質 cn誘導体、アポリポタンパク質 cm、ァポリポタン パク質 cm誘導体および血清アルブミンならびにこれらに対応するタンパク質力 な る群より選択される、 1またはそれより多い物質を含む、項目 1に記載のシステム。
(6)上記因子は、核酸分子、ポリペプチド、脂質、糖鎖、有機低分子およびそれらの 複合分子からなる群より選択される、項目 1に記載のシステム。
(7)上記因子は、タンパク質または上記複合分子である、項目 1に記載のシステム。
(8)上記因子は、抗体である、項目 1に記載のシステム。
(9)上記因子は、標識されるか、または標識可能である、項目 1に記載のシステム。
(10)上記手段は、質量分析装置、核磁気共鳴測定装置、 X線解析装置、 SPR、クロ マトグラフィー、免疫学的手段、生化学的手段、電気泳動機器、化学的分析機器、 蛍光二次元ディファレンシャル電気泳動法、同位体標識法、タンデムァフィ-ティ精 製法、物理学的手段、レーザーマイクロダイセクションおよびこれらの組み合わせか らなる群より選択される、項目 1に記載のシステム。
(11)さらに、上記マーカー物質の標準を含む、項目 1に記載のシステム。
(12)さらに、上記サンプルを精製する手段を備える、項目 1に記載のシステム。
(13)上記被験体は、哺乳動物を含む、項目 1に記載のシステム。
(14)上記被験体は、齧歯類を含む、項目 1に記載のシステム。
(15)上記被験体は、ヒトを含む、項目 1に記載のシステム。
(16)上記因子または上記手段は、上記マーカー物質の定量をする能力を有する、 項目 1に記載のシステム。
(17)上記マーカー物質の定量を行うための定量手段をさらに備える、項目 1に記載 のシステム。
(18)上記定量手段は、標準曲線と測定結果とを比較して上記マーカー物質が正常 値の範囲内かどうかを判定する判定手段を含む、項目 17に記載のシステム。 (19)上記判定手段は、コンピュータである、項目 18に記載のシステム。
(20)上記システムは、上記マーカー物質または上記マーカー物質に特異的に相互 作用する上記因子を含む組成物である、項目 1に記載のシステム。
(21) 上記マーカー物質が、トランスサイレチンおよびトランスサイレチン誘導体から なる群より選択される少なくとも 1つの物質を含み、上記トランスサイレチン誘導体は、 S—システィニルトランスサイレチン、 S—システィニルトランスサイレチン、グルタチォ ン化トランスサイレチン、 S— S結合形成トランスサイレチン、酸化トランスサイレチン、 ホルミル化トランスサイレチン、ァセチル化トランスサイレチン、リン酸化トランスサイレ チン、糖鎖付カ卟ランスサイレチン、ミリスチル化トランスサイレチンおよびこれらの複 合誘導体からなる群より選択される、項目 1に記載のシステム。
(22) 上記トランスサイレチンの減少および上記トランスサイレチン誘導体の増加か らなる群より選択される少なくとも 1つの現象が、糖尿病を発症しているか、または将 来の発症リスクが高いことの指標である、項目 21に記載のシステム。
(23) 上記トランスサイレチンの減少および上記トランスサイレチン誘導体の増加か らなる群より選択される少なくとも 1つの現象が、糖尿病を発症の程度、または将来の 発症リスクが高さの指標である、項目 21に記載のシステム。
(24) 上記トランスサイレチンは、配列番号 1もしくは配列番号 3に示される核酸配列 によってコードされる力、または配列番号 2もしくは配列番号 4に示されるアミノ酸配列 を有する、あるいは、これらの改変配列を有する、項目 21に記載のシステム。
(25) 上記トランスサイレチン誘導体は、配列番号 1もしくは配列番号 3に示される核 酸配列によってコードされるアミノ酸配列、または配列番号 2もしくは配列番号 4に示 されるアミノ酸配列における、それぞれ、 10位のシスティンまたはそれに対応するシ スティンのシスティンがシスティ-ル化されている誘導体である、項目 21に記載のシ ステム。
(26) 上記因子または上記手段は、トランスサイレチンの単量体と四量体との区別を する能力を有する、項目 1に記載のシステム。
(27) 上記因子または上記手段は、トランスサイレチンと S—システィ-ルトランスサ ィレチンとの区別をする能力を有する、項目 1に記載のシステム。 (28) 上記因子または上記手段は、トランスサイレチンと S—システィ-ルトランスサ ィレチンとの区別をする能力を有する抗体を含む、項目 1に記載のシステム。
(29) 上記因子または上記手段は、トランスサイレチンと S—システィ-ルトランスサ ィレチンとを認識し、かつ、上記システムはトランスサイレチンと S—システィニルトラン スサイレチンとを識另 Uする手段をさらに備える、項目 1に記載のシステム。
(30) 上記因子または上記手段は、トランスサイレチンと S—システィ-ルトランスサ ィレチンとを認識し、上記システムはトランスサイレチンの分子量と S—システィニルト ランスサイレチンの分子量とを識別する手段、およびトランスサイレチンと S—システィ -ルトランスサイレチンとの相対比を測定する手段をさらに備える、項目 1に記載のシ ステム。
(31) 上記マーカー物質が、アポリポタンパク質 CIIまたはアポリポタンパク質 CII誘 導体を含み、上記アポリポタンパク質 CII誘導体は、プロ体である、項目 1に記載のシ ステム。
(32) 上記アポリポタンパク質 CIIの減少および上記アポリポタンパク質 CII誘導体 の変動力もなる群より選択される少なくとも 1つの現象が、糖尿病を発症しているか、 または将来の発症リスクが高いことの指標である、項目 31に記載のシステム。
(33) 上記アポリポタンパク質 CIIの減少および上記アポリポタンパク質 CII誘導体 の変動力 なる群より選択される少なくとも 1つの現象が、糖尿病を発症の程度、また は将来の発症リスクが高さの指標である、項目 31に記載のシステム。
(34) 上記アポリポタンパク質 CIIは、配列番号 5もしくは配列番号 7に示される核酸 配列によってコードされる力、または配列番号 6もしくは配列番号 8に示されるアミノ酸 配列、あるいは、これらの改変配列を有する、項目 31に記載のシステム。
(35) 上記因子または上記手段は、アポリポタンパク質 CIIを選択的に識別する能 力を有する、項目 31に記載のシステム。
(36) 上記因子または上記手段は、アポリポタンパク質 CIIを選択的に識別する能 力を有する抗体を含む、項目 31に記載のシステム。
(37) 上記因子または上記手段は、アポリポタンパク質 CIIを選択的に識別する能 力を有し、かつ、上記システムは上記アポリポタンパク質 CIIを定量する手段を備える 、項目 31に記載のシステム。
(38) 上記マーカー物質が、アポリポタンパク質 cmまたはアポリポタンパク質 CIII 誘導体を含み、上記アポリポタンパク質 cmはアポリポタンパク質 cniであり、上記
0
アポリポタンパク質 cm誘導体は、アポリポタンパク質 cniおよびアポリポタンパク質 cm力 なる群より選択される、項目 1に記載のシステム。
2
(39) 上記アポリポタンパク質 cmの増カロ、アポリポタンパク質 cniの増加およびァ ポリポタンパク質 cmの増カロからなる群より選択される少なくとも
2 1つの現象が、糖尿 病を発症しているか、または将来の発症リスクが高いことの指標である、項目 38に記 載のシステム。
(40) 上記アポリポタンパク質 cmの増カロ、アポリポタンパク質 cniの増加およびァ ポリポタンパク質 cmの増カロからなる群より選択される少なくとも 1つの現象が、糖尿
2
病を発症の程度、または将来の発症リスクが高さの指標である、項目 38に記載のシ ステム。
(41) 上記アポリポタンパク質 cmは、配列番号 9もしくは配列番号 11に示される核 酸配列によってコードされる力、または配列番号 10もしくは配列番号 12に示されるァ ミノ酸配列を有するか、あるいは、それら力も N末端の 20アミノ酸が欠如した形態力、 あるいは、これらの改変配列を有する、項目 38に記載のシステム。
(42) 上記アポリポタンパク質 cm誘導体は、配列番号 9もしくは配列番号 11に示さ れる核酸配列によってコードされる力 または配列番号 10もしくは配列番号 12に示さ れるアミノ酸配列において、それぞれ、配列番号 10もしくは 12のそれぞれ 94位もしく は 95位またはそれに対応するスレオニンに糖鎖を有する誘導体である力 ある 、は
、それら力も N末端の 20アミノ酸が欠如した形態を有する、項目 38に記載のシステム
(43) 上記因子または上記手段は、アポリポタンパク質 cmとアポリポタンパク質 CII I誘導体とを区別する能力を有する、項目 38に記載のシステム。
(44) 上記因子または上記手段は、アポリポタンパク質 cm、アポリポタンパク質 CI
0
IIおよびアポリポタンパク質 CIIIのうち少なくとも 2つを区別する能力を有する、項目
1 2
38に記載のシステム。 (45) 上記因子または上記手段は、アポリポタンパク質 cmとアポリポタンパク質 CI
0
IIとアポリポタンパク質 cmとをすベて区別する能力を有する、項目 38に記載のシ
1 2
ステム。
(46) 上記因子または上記手段は、アポリポタンパク質 cmとアポリポタンパク質 CII I誘導体とを区別する能力を有する抗体を含む、項目 38に記載のシステム。
(47) 上記因子または上記手段は、アポリポタンパク質 cm、アポリポタンパク質 CI
0
IIおよびアポリポタンパク質 CHIのうち少なくとも 2つを区別する能力を有する抗体
1 2
を含む、項目 38に記載のシステム。
(48) 上記因子または上記手段は、アポリポタンパク質 cmとアポリポタンパク質 CI
0
IIとアポリポタンパク質 cmとをすベて区別する能力を有する抗体の組み合わせを
1 2
含む、項目 38に記載のシステム。
(49) 上記因子または上記手段は、アポリポタンパク質 cmとアポリポタンパク質 CII I誘導体とを認識し、上記システムは、アポリポタンパク質 cmとアポリポタンパク質 cn
I誘導体とを識別する手段をさらに備える、項目 38に記載のシステム。
(50) 上記因子または上記手段は、アポリポタンパク質 cmとアポリポタンパク質 cn I誘導体とを認識し、上記システムは、アポリポタンパク質 cm、アポリポタンパク質
0 ci
IIおよびアポリポタンパク質 CHIのうち少なくとも 2つを識別する手段をさらに備える
1 2
、項目 38に記載のシステム。
(51) 上記因子または上記手段は、アポリポタンパク質 cmとアポリポタンパク質 cn I誘導体とを認識し、上記システムは、アポリポタンパク質 cmとアポリポタンパク質
0 ci
IIとアポリポタンパク質 cmとをすベて識別する手段をさらに備える、項目 38に記載
1 2
のシステム。
(52) 上記マーカー物質が、血清アルブミンまたは血清アルブミン誘導体を含む、 項目 1に記載のシステム。
(53) 上記血清アルブミンの減少および上記血清アルブミン誘導体の変動力 なる 群より選択される少なくとも 1つの現象が、糖尿病を発症しているか、または将来の発 症リスクが高いことの指標である、項目 52に記載のシステム。
(54) 上記血清アルブミンの減少および上記血清アルブミン誘導体の変動力 なる 群より選択される少なくとも 1つの現象が、糖尿病を発症の程度、または将来の発症リ スクが高さの指標である、項目 52に記載のシステム。
(55) 上記血清アルブミンは、配列番号 13もしくは配列番号 15に示される核酸配列 によってコードされる力、または配列番号 14もしくは配列番号 16に示されるアミノ酸 配列、あるいは、これらの改変配列を有する、項目 52に記載のシステム。
(56) 上記因子または上記手段は、血清アルブミンを選択的に識別する能力を有 する、項目 52に記載のシステム。
(57) 上記因子または上記手段は、血清アルブミンを選択的に識別する能力を有 する抗体を含む、項目 52に記載のシステム。
(58) 上記因子または上記手段は、血清アルブミンを選択的に識別する能力を有し 、かつ、上記システムは上記血清アルブミンを定量する手段を備える、項目 31に記 載のシステム。
(59)診断薬である、項目 1に記載のシステム。
(60)被験体が糖尿病であるかどうか事前診断もしくは診断するため、または上記事 前診断もしくは診断を支援するための方法であって、
A)上記被験体由来のサンプル中のマーカー物質を測定する工程;および
B)上記測定結果から、上記被験体が糖尿病またはその可能性があるかどうかを決 定する工程、
を包含する、方法。
(61)項目 2〜59のいずれか 1項に記載の特徴を有する、項目 60に記載の方法。
(62) 被験体由来のサンプル中のマーカー物質、上記マーカー物質に特異的に相 互作用する因子、または上記マーカー物質を選択的に認識する手段の、被験体が 糖尿病であるかどうか事前診断または診断するための医薬の製造における、使用。
(63) 項目 2〜59のいずれか 1項に記載の特徴を有する、項目 62に記載の使用。
(64) 被験体由来のサンプル中のマーカー物質、上記マーカー物質に特異的に相 互作用する因子、または上記マーカー物質を選択的に認識する手段の、被験体が 糖尿病であるかどうか事前診断または診断するための使用。
(65) 項目 2〜59のいずれか 1項に記載の特徴を有する、項目 64に記載の使用。 (66)
項目 60に記載の方法であって、血液中のマーカー物質の濃度を測定し、その値を 健常値と比較し、上記マーカー物質がトランスサイレチン、アポリポタンパク質 CIII、 血清アルブミンの群力も選択される 1または 2以上のタンパク質であることを特徴とす る、方法。
(67)
上記アポリポタンパク質 CIIIは、アポリポタンパク質 CIII、アポリポタンパク質 CIII、
0 1 アポリポタンパク質 CIIIの群力も選択される 1または 2以上のタンパク質であることを
2
特徴とする項目 66に記載の糖尿病の診断方法。
(68)
下記工程 (1)〜(4):
(1)被検者の血液から血清または血漿を調製する工程;
( 2)工程( 1 )で得られた血清または血漿中のトランスサイレチンの濃度値を健常値と 比較して、糖尿病を検出する工程;
(3)工程(2)で糖尿病が検出されな力つた場合は、さらに、血清または血漿中のアポ リポタンパク質 cmの濃度値を健常値と比較して、糖尿病を検出する工程;および
2
(4)工程(3)で糖尿病が検出されな力つた場合は、さらに、血清または血漿中のアポ リポタンパク質 CIIIの濃度値を健常値と比較して、糖尿病を検出する工程、
1
を含む、項目 67に記載の方法。
(69)
下記工程 (5)〜 (8) :
(5)被検者の血液から血清または血漿を調製する工程、
(6)工程 (5)で得られた血清または血漿中の血清アルブミンの濃度値を健常値と比 較して、糖尿病を検出する工程、
(7)工程 (6)で糖尿病が検出された場合は、さらに、血清または血漿中のアポリポタ ンパク質 CIIIの濃度値を健常値と比較して、糖尿病を検出する工程、
2
(8)工程(7)で糖尿病が検出されな力つた場合は、さらに、血清または血漿中のアポ リポタンパク質 CIIIの濃度値を健常値と比較して、糖尿病を検出する工程; を含む、項目 67に記載の診断方法。
(70)
上記工程 (4)で糖尿病が検出された場合は、さらに、血清または血漿中のアポリポ タンパク質 CIIIの濃度値を健常値と比較して、糖尿病を検出することを特徴とする項
0
目 68に記載の方法。
(71)
上記工程(8)で糖尿病が検出された場合は、さらに、血清または血漿中のアポリポ タンパク質 CIIIの濃度値を健常値と比較して、糖尿病を検出することを特徴とする項
0
目 69に記載の方法。
(72)
項目 60に記載の方法であって、血液中のマーカー物質の濃度を測定し、その値を 健常値と比較し、上記マーカー物質が下記 (a;)〜(e):
(a) 7. 0以下の pHで陽イオン交換体に捕捉される、分子量が約 13800であるタンパ ク質;
(b) 7. 0以下の pHで金属イオン固定ィ匕担体に捕捉される、分子量が約 8700である タンパク質;
(c) 7. 0以下の pHで陽イオン交換体に捕捉される、分子量が約 9400であるタンパク 質または、 pH7. 0で金属イオン固定ィ匕担体に捕捉される、分子量が約 9400である タンパク質;
(d) 7. 0以下の pHで陽イオン交換体に捕捉される、分子量が約 9700であるタンパク 質、または、 pH7. 0で金属イオン固定化担体に捕捉される、分子量が約 9700であ るタンパク質;および
(e) 7. 0以下の pHで陽イオン交換体に捕捉される、分子量が約 66000であるタンパ ク質、または、 pH7. 0で金属イオン固定化担体に捕捉される、分子量が約 66000で あるタンパク質、
の群力 選択される 1または 2以上のタンパク質であることを特徴とする、方法。
(73)
項目 60に記載の方法であって、血液中のマーカー物質の濃度を測定し、その値を
.訂正された招紙 (親則 91) 健常値と比較し、上記マーカー物質が下記:
(a)トリプシンで消ィ匕すると、分子量力 S約 1270、約 1370、約 1390、約 1520、約 245 0、約 2640、および約 3140のポリペプチドを生じる、分子量約 13800のタンパク質; および Zまたは
(b)卜リプシンで消ィ匕すると、分子量力 S約 900、約 1200、約 1390、約 1710、約 194 0、および約 2080のポジペプチドを生じる、分子量約 8700〜9700のタンパク質、 のタンパク質であることを特徴とする、方法。
(74)
上記マーカー物質に対する親和性を有する物質を固定化した担体に血清または 血漿を接触させて、マーカー物質を捕捉し、上記マーカー物質の濃度を測定するこ とを特徴とする項目 66乃至 73の 、ずれかに記載の方法。
(75)
上記マーカー物質に対する親和性を有する物質は、上記マーカー物質に特異的 な抗体であることを特徴とする項目 74に記載の方法。
(76)
上記マーカー物質に対する親和性を有する物質は、イオン交換基を有するもので あることを特徴とする項目 74に記載の糖尿病の診断方法。
(77)
上記担体は平面部分を有し、上記マーカー物質に対する親和性を有する物質は 上記平面部分の一部に固定ィ匕されていることを特徴とする項目 74〜76のいずれか に記載の方法。
(78)
上記抗体は、担体に固定ィ匕されていることを特徴とする項目 1に記載のシステム。 (79)
項目 60に記載の方法であって、上記被験体の体液中における下記マーカー物質 ( a)〜、n):
(a) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 7040のイオンピークを生じるタンパク質、 (b) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量/電荷比 が約 8330のイオンピークを生じるタンパク質、
(c) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 8530のイオンピークを生じるタンパク質。
(d) pH7. 0かつ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 9060のイオンピークを生じるタンパク質、
(e) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 9260のイオンピークを生じるタンパク質、
(f) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量/電荷比 が約 9450のイオンピークを生じるタンパク質、
(g) pH7. 0力つ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 13700のイオンピークを生じるタンパク質、
(h) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 76400のイオンピークを生じるタンパク質、
(i) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比が 約 79100のイオンピークを生じるタンパク質、
(j) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比が 約 3500のイオンピークを生じるタンパク質、
(k) pH7. 0力つ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 3560のイオンピークを生じるタンパク質、 (1) ρΗ7. 0かつ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 4180のイオンピークを生じるタンパク質、 (m) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 12800のイオンピークを生じるタンパク質;
(n) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 65700のイオンピークを生じるタンパク質;および
(a)〜 (n)のタンパク質に対応するタンパク質または改変体
からなる群より選択される少なくとも 1つタンパク質の濃度を健常値と比較し、糖尿病 の発症の有無または将来の糖尿病の発症リスクを判定することを特徴とする、方法。
(80)
上記体液は、血液であることを特徴とする項目 79に記載の方法。
(81)
上記体液または体液成分を、上記マーカー物質に対する親和性を有する物質を固 定化した担体に接触させて、体液中の上記マーカー物質を担体上に捕捉し、捕捉 された上記マーカー物質の量に基づいて体液中の上記マーカー物質の濃度を算出 することを特徴とする項目 79または 80に記載の疾病の診断方法。
(82)
上記担体は平面部分を有し、上記マーカー物質に対する親和性を有する物質は、 上記平面部分の一部に固定ィ匕されていることを特徴とする項目 81に記載の方法。 (83)
上記マーカー物質に対する親和性を有する物質は、イオン交換体、金属キレート 体または抗体であることを特徴とする項目 81または 82に記載の方法。
(84)被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を評 価することを特徴とする物質の評価方法であって、
a)糖尿病を発症して!/、る動物または将来の発症リスクが高 、動物に被験物質を摂 取させる工程;および
b)上記動物の体液中における上記マーカー物質の少なくとも 1つの濃度を基準値 と比較し、被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果 を評価する工程、
を包含する、方法。
(85) 項目 2〜59のいずれか 1項に記載の特徴を有する、項目 84に記載の方法。 (86)
項目 84に記載の方法であって、上記マーカー物質が、下記マーカー物質 (a)〜(n ):
(a) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 7040のイオンピークを生じるタンパク質、 (b) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量/電荷比 が約 8330のイオンピークを生じるタンパク質、
(c) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 8530のイオンピークを生じるタンパク質。
(d) pH7. 0かつ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 9060のイオンピークを生じるタンパク質、
(e) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 9260のイオンピークを生じるタンパク質、
(f) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量/電荷比 が約 9450のイオンピークを生じるタンパク質、
(g) pH7. 0力つ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 13700のイオンピークを生じるタンパク質、
(h) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 76400のイオンピークを生じるタンパク質、
(i) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比が 約 79100のイオンピークを生じるタンパク質、
(j) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比が 約 3500のイオンピークを生じるタンパク質、
(k) pH7. 0力つ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 3560のイオンピークを生じるタンパク質、 (1) ρΗ7. 0かつ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 4180のイオンピークを生じるタンパク質、 (m) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 12800のイオンピークを生じるタンパク質;
(n) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 65700のイオンピークを生じるタンパク質;および
(a)〜 (n)のタンパク質に対応するタンパク質または改変体
からなる群より選択される少なくとも 1つタンパク質である、方法。 (87)
上記基準値は、糖尿病を発症している動物または将来の発症リスクが高い動物に、 糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を有さない既知物質を摂取さ せた際の、上記動物の体液中における上記マーカー物質の濃度であることを特徴と する項目 86に記載の方法。
(88)
上記体液は、血液であることを特徴とする項目 86または 87に記載の方法。
(89)
上記被検物質は、食品素材であることを特徴とする項目 86〜88のいずれか〖こ記 載の方法。
(90)
上記体液または体液成分を、上記マーカー物質に対する親和性を有する物質を固 定ィ匕した担体に接触させて、体液中の上記マーカー物質を担体上に捕捉し、捕捉さ れた上記マーカー物質の量に基づいて体液中の上記マーカー物質の濃度を算出 することを特徴とする項目 86〜89の 、ずれかに記載の方法。
(91)
上記担体は平面部分を有し、上記マーカー物質に対する親和性を有する物質は、 上記平面部分の一部に固定ィ匕されていることを特徴とする項目 90に記載の方法。 (92)
上記マーカー物質に対する親和性を有する物質は、イオン交換体、金属キレート 体または抗体であることを特徴とする項目 90または 91に記載の方法。
(93)
項目 84〜92のいずれかに記載の物質の評価方法によって被検物質を評価し、糖 尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を有する物質をスクリーニング することを特徴とする物質のスクリーニング方法。
(94)項目 93に記載の方法によって得られた物質。
従って、本発明のこれらおよび他の利点は、添付の図面を参照して、以下の詳細な 説明を読みかつ理解すれば、当業者には明白〖こなることが理解される。 発明の効果
[0015] トランスサイレチン、アポリポタンパク質 cm、および血清アルブミンは既知物質でか つある種の臨床的意義は知られている力 糖尿病のマーカー物質となり得ることは本 発明により初めて明ら力となった。
[0016] 本発明の糖尿病の診断および事前診断のための方法およびそのためのシステムも しくは組成物 (診断薬)によれば、糖尿病の診断および事前診断をより確実かつ精度 よく行うことができる。また、複数のマーカー物質を組み合わせることによってマルチ マーカーシステムによる糖尿病の診断および事前診断を行うことができる。
[0017] 本発明の糖尿病診断用キットによれば、より簡便かつ高精度で糖尿病の診断およ び事前診断をすることができる。
[0018] 本発明の疾病の診断および事前診断のための方法、組成物 (診断薬)およびシス テムによれば、糖尿病の有無に加え、糖尿病の将来の発症リスクを判定 (すなわち事 前診断)することができる。
[0019] 本発明の物質の評価方法によれば、被検物質が有する糖尿病の改善効果に加え 、糖尿病の将来の発症リスクの低減効果を評価することができる。
[0020] 本発明の物質のスクリーニング方法によれば、糖尿病の改善効果を有する物質に 加え、糖尿病の将来の発症リスクの低減効果を有する物質をスクリーニングすること ができる。
図面の簡単な説明
[0021] [図 1]本発明の糖尿病の診断方法をマルチマーカーシステムに応用した例の手順を 表すフローチャートである。
[図 2]本発明の糖尿病の診断方法をマルチマーカーシステムに応用した別の例の手 順を表すフローチャートである。
[図 3]mZzが 13867のピークについての測定結果を表し、図 3 (a)は糖尿病患者と 健常者に分けてピーク強度をプロットしたグラフであり、図 3 (b)は図 3 (a)の結果を、 最大値、最小値、中央値、およびカットオフ値で示したグラフであり、図 3 (c)は ROC 曲線を示すグラフである。
[図 4]mZzが 8690のピークについての測定結果を表し、図 4 (a)は糖尿病患者と健 常者に分けてピーク強度をプロットしたグラフであり、図 4(b)は図 4 (a)の結果を、最 大値、最小値、中央値、およびカットオフ値で示したグラフであり、図 4 (c)は ROC曲 線を示すグラフである
[図 5]糖尿病患者の血清を 2次元電気泳動に供した結果を表す写真である。
[図 6]mZzが 66216のピークについての測定結果を表し、図 6 (a)は糖尿病患者と 健常者に分けてピーク強度をプロットしたグラフであり、図 6 (b)は図 6 (a)の結果を、 最大値、最小値、中央値、およびカットオフ値で示したグラフであり、図 6 (c)は ROC 曲線を示すグラフである。
[図 7]質量 Z電荷比が 7043 (平均値)のイオンピークにっ ヽての箱髭図である。
[図 8]質量 Z電荷比が 8325 (平均値)のイオンピークにっ ヽての箱髭図である。
[図 9]質量 Z電荷比が 8532 (平均値)のイオンピークについての箱髭図である。
[図 10]質量 Z電荷比が 9062 (平均値)のイオンピークについての箱髭図である。
[図 11]質量 Z電荷比が 9255 (平均値)のイオンピークについての箱髭図である。
[図 12]質量 Z電荷比が 9445 (平均値)のイオンピークについての箱髭図である。
[図 13]質量 Z電荷比が 13720 (平均値)のイオンピークについての箱髭図である。
[図 14]質量 Z電荷比が 76404 (平均値)のイオンピークについての箱髭図である。
[図 15]質量 Z電荷比が 79085 (平均値)のイオンピークについての箱髭図である。
[図 16]質量 Z電荷比が 3497 (平均値)のイオンピークについての箱髭図である。
[図 17]質量 Z電荷比が 3559 (平均値)のイオンピークについての箱髭図である。
[図 18]質量 Z電荷比が 4184 (平均値)のイオンピークについての箱髭図である。
[図 19]質量 Z電荷比が 12786 (平均値)のイオンピークについての箱髭図である。
[図 20]質量 Z電荷比が 65700 (平均値)のイオンピークにつ!、ての箱髭図である。
[図 21]図 21には、健常人由来 S- cysteinylated TTRを示す。測定値: M/Z= 13874.74 80。
[図 22]図 22には、還元処理後の健常人由来 S-cysteinylated TTRを示す。測定値: M /Z= 13759.7393。
[図 23]図 23には、糖尿病患者由来 S- cysteinylated TTRを示す。測定値: M/Z= 1387 1.3320。 [図 24]図 24には、還元処理後の糖尿病患者由来 S-cysteinylated TTRを示す。測定 値: M/Z= 13755.64940
[図 25]図 25には、 TTRの 4量体構造とモノマーのアミノ酸配列を示す。このように、トラ ンスサイレチンは、通常 4量体構造をとつており、これが崩れていくと糖尿病になると 仮定される。
[図 26]図 26には、ヒト TTR a -ドメインの 3次元構造 (上)と 2次構造配列(下)が示され る。
[図 27]図 27は、ラットアポリポタンパク質 CIIIと同定したバンドのゲル写真と、そのバ ンドの SELDI—TOFによる分析を示す。
[図 28]図 28は、ラットアポリポタンパク質 CIIIと同定したバンドのゲル写真と、そのバ ンドの SELDI—TOFによる分析を示す。
[図 29]図 29には、ヒトァポリポタンパク質 CIII (0〜2)のスポットであると考えられる二 次元電気泳動上のスポットを示す。
[図 30]図 30には、図 29の各スポットの質量分析の結果を示す。
[図 31]図 31には、各スポットの SELDI— MSの結果を示す。
[図 32]図 32には、 CM10の検討結果を示す。
[図 33]図 33には、 Q10の検討結果を示す。
[図 34]図 34は、至適条件検討結果を示す。これらの結果から、得られたスポットが、ヒ トァポリポタンパク質 CIII (0〜2)のスポットであることが明らかになる。
[図 35]図 35には、糖尿病患者における S—システィ-ル化トランスサイレチン (測定 値: MZZ= 13, 863,理論値: MZZ= 13880. 53)のイオン強度と HbAlc値の 関係を示す。
[図 36]図 36には、糖尿病患者における S—システィ-ル化トランスサイレチン (測定 値: MZZ= 13, 874,理論値: MZZ= 13880. 53)のイオン強度と HbAlc値の 関係が示される。
[図 37]図 37には、糖尿病患者における S—システィ-ル化トランスサイレチン (測定 値: MZZ= 13, 884,理論値: MZZ= 13880. 53)のイオン強度と HbAlc値の 関係が示される。 [図 38]図 38は、糖尿病患者における MZZ: 13, 863の実測データを示す。
[図 39]図 39には、糖尿病ラット血清 8.3K ( Apo CII)箱髭図を示す。
[図 40]図 40には、上記の時系列データを示す。
[図 41]図 41は、ゲル上のバンドの SELDI— MSの結果を示す。
[図 42]図 42には、得られたバンドのウェスタンブロットによる確認を示す。
[図 43]図 43には、クロマトグラフィーによる分画において抗 ApoC2抗体により増強さ れる様子を示す。
[図 44]図 44は、ヒトにおけるアポリポタンパク質 CIIもまた事前診断マーカーであるこ とを示す。ここでは、健常人のアポリポタンパク質 CIIの質量分析結果を示す。
[図 45]図 45は、ヒトにおけるアポリポタンパク質 CIIもまた事前診断マーカーであるこ とを示す。ここでは、糖尿病患者のアポリポタンパク質 CIIの質量分析結果を示す。
[図 46]図 46は、別の画分を用いた場合でのヒトにおけるアポリポタンパク質 CIIもまた 事前診断マーカーであることを示す。ここでは、健常人のアポリポタンパク質 CIIの質 量分析結果を示す。
[図 47]図 47は、別の画分を用いた場合でのヒトにおけるアポリポタンパク質 CIIもまた 事前診断マーカーであることを示す。ここでは、糖尿病患者のアポリポタンパク質 CII の質量分析結果を示す。
配列表の簡単な説明
配列番号 1 - 2 トランスサイレチン ヒト(それぞれ、核酸配列およびアミノ酸配列) 配列番号 3 - 4 トランスサイレチン ラット (それぞれ、核酸配列およびアミノ酸配列) 配列番号 5 - 6 アポリポタンパク質 cn ヒト (それぞれ、核酸配列およびアミノ酸配 列)、
配列番号 7 - 8 アポリポタンパク質 cn ラット (それぞれ、核酸配列およびアミノ酸配 列)
配列番号 9 - 10 アポリポタンパク質 cm ヒト (それぞれ、核酸配列およびアミノ酸 配列)
配列番号 11 12 アポリポタンパク質 cm ラット (それぞれ、核酸配列およびァミノ 酸配列) 配列番号 13— 14 血清アルブミン ヒト(それぞれ、核酸配列およびアミノ酸配列) 配列番号 15— 16 血清アルブミン ラット(それぞれ、核酸配列およびアミノ酸配列) 配列番号 17— 18 血清アルブミン マウス(それぞれ、核酸配列およびアミノ酸配列 )
配列番号 19 20 血清アルブミン ィヌ(それぞれ、核酸配列およびアミノ酸配列) 配列番号 21— 22 血清アルブミン ゥサギ(それぞれ、核酸配列およびアミノ酸配列 )
配列番号 23— 24 血清アルブミン サル (それぞれ、核酸配列およびアミノ酸配列) 発明を実施するための最良の形態
[0023] 以下、本発明を説明する。本明細書の全体にわたり、単数形の冠詞 (例えば、英語 の場合は「a」、「an」、「the」など、他の言語における対応する冠詞、形容詞など)は、 特に言及しない限り、その複数形の概念をも含むことが理解されるべきである。また、 本明細書において使用される用語は、特に言及しない限り、当該分野で通常用いら れる意味で用いられることが理解されるべきである。
[0024] (一般技術)
本明細書において用いられる分子生物学的手法、生化学的手法、微生物学的手 法は、当該分野において周知であり慣用されるものであり、例えば、 Maniatis, T. e t al. (,1989) . Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harborおよびその 3rd Ed. (2001); Ausubel, F. M. (1987) . Current Pro tocols in Molecular Biology, Greene Pub. AssociatESand Wiley— Inte rscience ; Ausubel, F. M. (1989) . Short Protocols in Molecular Biolog y : A Compendium of Methods from Current Protocols in Molecul ar Biology, Greene Pub. Associates ana
Figure imgf000024_0001
; Sambroo k, J. et al. (1989) . Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor ; Innis, M. A. (1990) . PCR Protocols: A Guide to Me thods and Applications, Academic Press ; Ausubel, F. M. (1992) . Shor t Protocols in Molecular Biology: A Compendium of Methods fro m Current Protocols in Molecular Biology, Greene Pub. Associates ; Ausubel, F. M. (1995) . Short Protocols in Molecular Biology: A Co mpendium of Methods from Current Protocols in Molecular Biolog y, Greene Pub. Associates ;Innis, M. A. et al. (1995) . PCR Strategies , Academic Press ; Ausubel, F. M. (1999) . Short Protocols in Molecul ar Biology: A Compendium of Methods from Current Protocols in Molecular Biology, Wiley, and annual updates ; Sninsky, J. J. et al. (1 999) . PCR Applications: Protocols for Functional Genomics, Acade mic Press、別冊実験医学「遺伝子導入 &発現解析実験法」羊土社、 1997などに 記載されており、これらは本明細書において関連する部分 (全部であり得る)が参考と して援用される。
[0025] プロテインチップに関連する技術としては、例えば、サイファージェン社から入手可 能な技術などを挙げることができる。
[0026] (用語の説明)
以下に本明細書において使用される用語を説明する。
[0027] (マーカー物質として同定された代表的な遺伝子産物)
本明細書において「マーカー物質」とは、ある状態 (例えば、糖尿病などの疾患)に 罹患して!/、る力またはその危険性があるかどうかを追跡する示標となる物質を!、う。こ のようなマーカー物質としては、遺伝子、遺伝子産物、代謝物質、酵素などを挙げる ことができる。
[0028] 本明細書において、「遺伝子産物」とは、遺伝子によってコードされるタンパク質ま たは mRNAをいう。本明細書では、糖代謝に直接関連しない遺伝子産物(すなわち 、インスリンなどの糖代謝に関連しないタンパク質など)が糖尿病の指標として使用可 能であることが見出された。
[0029] 本明細書において「トランスサイレチン (TTR)」とは、別名プレアルブミンともいい、 同質のサブユニットからなる四量体を形成するタンパク質として知られており、血中ビ タミン A輸送タンパク質であるレチノール結合タンパク質 (RBP)とタンパク質複合体を 形成し、チロキシン (T )と結合することが知られている。ラットでは、主な T輸送タン
4 4 パク質として知られている。 [0030] トランスサイレチンは、 Raz, A.らにより単離精製され、神田らにより一次構造が同 定された(Raz, A. & Goodman D. S. , (1969) , J. Biol. Chem. 224, 3230 - 3237 ;Kanda, Y. et al. , (1974) , J. Biol. Chem. , 247, 6796— 6805)。 これまで、その異常がアルツハイマー性痴呆および家族性アミロイド一シスポリ-ユー ロバチ一と関連して 、ることが知られて 、る。
[0031] トランスサイレチンの代表的なヌクレオチド配列は、
(a)配列番号 1または配列番号 3に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を 有するポリヌクレオチド;
(b)配列番号 2または配列番号 4に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたは そのフラグメントをコードするポリヌクレオチド;
(c)配列番号 2または配列番号 4に記載のアミノ酸配列にぉ 、て、 1以上のアミノ酸 力 置換、付加および欠失力 なる群より選択される 1つの変異を有する改変体ポリ ペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチド をコードする、ポリヌクレオチド;
(d)配列番号 1または配列番号 3に記載の塩基配列のスプライス変異体もしくは対 立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド;
(e)配列番号 2または配列番号 4に記載のアミノ酸配列力 なるポリペプチドの種相 同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド;
(f) (a)〜(e)のいずれ力 1つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリ ダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;また は
(g) (a)〜(e)のいずれ力 1つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一 性が少なくとも 70%である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリぺプ チドをコードするポリヌクレオチド
であり得る。
[0032] トランスサイレチンのアミノ酸配列としては、
(a)配列番号 2または配列番号 4に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントから なる、ポリペプチド; (b)配列番号 2または配列番号 4に記載のアミノ酸配列にぉ 、て、 1以上のアミノ酸 が置換、付加および欠失からなる群より選択される 1つの変異を有し、かつ、生物学 的活性を有する、ポリペプチド;
(c)配列番号 1または配列番号 3に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立 遺伝子変異体によってコードされる、ポリペプチド;
(d)配列番号 2または配列番号 4に記載のアミノ酸配列の種相同体である、ポリべ プチド;または
(e) (a)〜(d)のいずれか 1つのポリペプチドに対する同一性が少なくとも 70%であ るアミノ酸配列を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、
であり得る。
[0033] トランスサイレチンの代表的な配列は、配列番号 1または配列番号 3 (核酸配列)お よび配列番号 2または配列番号 4 (アミノ酸配列)にお 、て示される。
[0034] ここで、トランスサイレチンの生物学的活性としては、例えば、四量体を形成するタ ンパク質として知られており、血中ビタミン A輸送タンパク質であるレチノール結合タン パク質 (RBP)とタンパク質複合体を形成し、チロキシン (T )と結合する能力を挙げる
4
ことができる。
[0035] トランスサイレチンは分子量約 14000のサブユニット 4個からなる複合タンパク質で あり、肝臓で合成される。血液中のトランスサイレチンの臨床的意義としては、栄養状 態および肝臓のタンパク質合成能を反映して ヽるとされ、ネフローゼ症候群や急性 肝炎の回復期等で高値を示すことが知られている。なお、本明細書では、トランスサ ィレチンというときは、 4量体の複合タンパク質とサブユニット単体とを特に区別せず、 両方を指すものとする。
[0036] トランスサイレチンおよびその誘導体は、ヒト、ラットのほか、他の動物(例えば、哺乳 動物)でもそのホモログ (本明細書にぉ 、て、「対応する」遺伝子またはタンパク質な どという)が知られている。従って、本明細書においてトランスサイレチンおよびその誘 導体は、通常、特に言及しない場合は、ヒト、ラットのほか、生物一般において存在す るトランスサイレチンおよびその誘導体を指す。
[0037] 本明細書において「トランスサイレチン誘導体」とは、トランスサイレチンの任意の誘 導体を指し、特に、翻訳後修飾などの生体内での代謝産物をいう。代表的なトランス サイレチン誘導体の改変を、以下に質量変動値とともに示す:
[0038] [表 1]
タンパク質やペプチドにおける
代表的な翻訳後修飾とその質量変化
修飾基 質量変動 ffi 修飾基 質量変動値
Modifications Monoisotopic Mass Modifications onoi sotopic Mass メチォニンのホモセリン^: -29.99 へキソサミン(GalN,GlcN) 161.06 グルタミンからのピ口グルタミン化 -17.02 へキソ一ス {Man. Gal. Glc) 162.05 ジスルフイド 結合の形成 - 2.01 リポン酸(リジンとァミト'結合 > 188.03
Glyの C-末端アミド形成 - 0.9S N-ァセ于ルへキソサミン iGalNAc, GlcNAc) 203.07
Asnや Ginのデアミデーシヨン - 0.98 フアルネシル化 204.18 メチル化 14.01 ミリストイル化 210.19 ヒドロキシル化 15.99 ビォチン化(1級ァミンとァミト 1§合) 226.07 メチォニンの酸化 15,33 ピリドキサ一ルリん酸 231,02 ペプチド結合 1個の解離 18.01 (1級ァミンとシフ埴基を形成)
フォルミル化 27.99 ス亍ァロイル化 266.2G ァセチ JK 42.01 ゲラニルゲラニル化 272.25
Aspや GlLtの力ルポキシル化 43.98 シアル酸 (NeuAc, NANA, SA) 291.09 りん酸化 79.96 グルタチオン化 305.06 硗酸化 79.95 N-グリコリルニューラミン酸 (NeuGc) 307.09 システィン化 119.00 5'-アデノシル化 329.05 ペン! ス(Ara, Rib, Xyl) 132.04 4',フォスフォパント亍イン 339.07 デォキシへキソース(Fuc, Rha) e.os ADP-リポシル化《from DNA) 541.06
[0039] 本明細書では、代表的な、トランスサイレチン誘導体としては、システィンィ匕 (システ ィ-ル)、ダルタチオン化、 s— S結合形成、酸化 (例えば、メチォニン側鎖の酸化)、 ホルミル化、ァセチル化、リン酸化、糖鎖付加、ミリスチルイ匕などを挙げることができる がそれらに限定されない。
[0040] 本発明では、糖尿病の患者またはその危険が高 、被験体にぉ 、て、トランスサイレ チンの量が減少し、代わって、トランスサイレチンの特定の誘導体 (例えば、システィ -ルトランスサイレチン、ダルタチオン化トランスサイレチン、 S— S結合形成したトラン スサイレチン、酸化トランスサイレチン (例えば、メチォニン側鎖が酸ィ匕したトランスサ ィレチン)、ホルミル化トランスサイレチン、ァセチル化トランスサイレチン、リン酸化トラ ンスサイレチン、糖鎖付カ卟ランスサイレチン、ミリスチル化トランスサイレチン)が増加 していることが明らかになった。従って、これらのトランスサイレチンの減少またはトラ ンスサイレチン誘導体の増加を指標として、糖尿病またはその危険が高 ヽ被験体を 診断または事前診断することが可能である。
[0041] 本明細書にぉ 、て「ァポリポタンパク質」または「アポ脂質タンパク質」とは、脂質と 結合して脂質タンパク質を形成するタンパク質をいい、 A、 B、 C、 Dおよび Eに大別さ れる。ヒトの血漿乳び脂粒 (カイロミクロン), HDL, LDL,および VLDLなどの典型 的な成分であるリポタンパク質複合体のタンパク質成分である。アポリポタンパク質 C — II (APOC2と略することがある)は、 VLDL, HDLやカイロミクロン中に存在するァ ポリポタンパク質である。リポタンパク質リパーゼの活性ィ匕因子である。このタンパク質 の欠損により高カイロミクロン血症や高トリグリセリド血症が生じる。アポリポタンパク質 C— III (APOC3と略することがある)は、 VLDL, HDLやカイロミクロン中に存在する アポリポタンパク質であり、多数のリパーゼを抑制することが知られている。アポリポタ ンパク質 Cなどについての概説は、 Bondarenko, P. V. et al. J. Lipid Res. 1999;40:5 43-555を参照のこと。
アポリポタンパク質 CIIの代表的なヌクレオチド配列は、
(a)配列番号 5または配列番号 7に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を 有するポリヌクレオチド;
(b)配列番号 6または配列番号 8に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたは そのフラグメントをコードするポリヌクレオチド;
(c)配列番号 6または配列番号 8に記載のアミノ酸配列において、 1以上のアミノ酸 力 置換、付加および欠失力 なる群より選択される 1つの変異を有する改変体ポリ ペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリペプチド をコードする、ポリヌクレオチド;
(d)配列番号 5または配列番号 7に記載の塩基配列のスプライス変異体もしくは対 立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド;
(e)配列番号 6または配列番号 8に記載のアミノ酸配列力 なるポリペプチドの種相 同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド;
(f) (a)〜(e)のいずれ力 1つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリ ダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;また は
(g) (a)〜(e)のいずれ力 1つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一 性が少なくとも 70%である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリぺプ チドをコードするポリヌクレオチド
であり得る。
[0043] アポリポタンパク質 CIIのアミノ酸配列としては、
(a)配列番号 6または配列番号 8に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントから なる、ポリペプチド;
(b)配列番号 6または配列番号 8に記載のアミノ酸配列において、 1以上のアミノ酸 が置換、付加および欠失からなる群より選択される 1つの変異を有し、かつ、生物学 的活性を有する、ポリペプチド;
(c)配列番号 5または配列番号 7に記載の塩基配列のスプライス変異体または対立 遺伝子変異体によってコードされる、ポリペプチド;
(d)配列番号 6または配列番号 8に記載のアミノ酸配列の種相同体である、ポリべ プチド;または
(e) (a)〜(d)のいずれか 1つのポリペプチドに対する同一性が少なくとも 70%であ るアミノ酸配列を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、
であり得る。
[0044] アポリポタンパク質 CIIの代表的な配列は、配列番号 5または配列番号 7 (核酸配列 )および配列番号 6または配列番号 8 (アミノ酸配列)にお 、て示される。
[0045] アポリポタンパク質 CIIの生物学的活性としては、例えば、 VLDL, HDLやカイロミ クロンを構成する能力などを挙げることができる。
[0046] アポリポタンパク質 CIIは、ヒト、ラットのほ力、他の動物(例えば、哺乳動物)でもそ のホモログ (本明細書にぉ 、て、「対応する」遺伝子またはタンパク質などと!/、う)が知 られている。従って、本明細書においてアポリポタンパク質 CIIは、通常、特に言及し ない場合は、ヒト、ラットのほか、生物一般において存在するアポリポタンパク質 CIIを 指す。
[0047] アポリポタンパク質は、プロ体として生成される。より詳細な判定をする場合には、プ 口体と成熟体とを区別してみることが好まし 、。
[0048] アポリポタンパク質 cmの代表的なヌクレオチド配列は、
(a)配列番号 9または配列番号 11に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列を 有するポリヌクレオチド;
(b)配列番号 10または配列番号 12に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまた はそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド;
(c)配列番号 10または配列番号 12に記載のアミノ酸配列において、 1以上のァミノ 酸が、置換、付加および欠失力 なる群より選択される 1つの変異を有する改変体ポ リペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリべプチ ドをコードする、ポリヌクレオチド;
(d)配列番号 9または配列番号 11に記載の塩基配列のスプライス変異体もしくは対 立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド;
(e)配列番号 10または配列番号 12に記載のアミノ酸配列力もなるポリペプチドの 種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド;
(f) (a)〜(e)のいずれ力 1つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリ ダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;また は
(g) (a)〜(e)のいずれ力 1つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一 性が少なくとも 70%である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリぺプ チドをコードするポリヌクレオチド
であり得る。
アポリポタンパク質 cmのアミノ酸配列としては、
(a)配列番号 10または配列番号 12に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントか らなる、ポリペプチド;
(b)配列番号 10または配列番号 12に記載のアミノ酸配列において、 1以上のァミノ 酸が置換、付加および欠失からなる群より選択される 1つの変異を有し、かつ、生物 学的活性を有する、ポリペプチド;
(c)配列番号 9または配列番号 11に記載の塩基配列のスプライス変異体または対 立遺伝子変異体によってコードされる、ポリペプチド;
(d)配列番号 10または配列番号 12に記載のアミノ酸配列の種相同体である、ポリ ペプチド;または (e) (a)〜(d)のいずれか 1つのポリペプチドに対する同一性が少なくとも 70%であ るアミノ酸配列を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、
であり得る。
[0050] アポリポタンパク質 cmの代表的な配列は、配列番号 9または配列番号 11 (核酸配 列)および配列番号 10または配列番号 12 (アミノ酸配列)にお 、て示される。
[0051] アポリポタンパク質 CIIIの生物学的活性としては、例えば、 VLDL, HDLやカイロミ クロンを構成する能力などを挙げることができる。
[0052] アポリポタンパク質 cmは、ヒト、ラットのほ力、他の動物(例えば、哺乳動物)でもそ のホモログ (本明細書にぉ 、て、「対応する」遺伝子またはタンパク質などと!/、う)が知 られている。従って、本明細書においてアポリポタンパク質 cmは、通常、特に言及し ない場合は、ヒト、ラットのほ力、生物一般において存在するアポリポタンパク質 CIII を指す。
[0053] アポリポタンパク質 cmは、糖鎖の結合度合いにより、 CIII、 CIII、 CIIIの少なくと
0 1 2 も 3種類が存在することが知られて 、る。
[0054] このように、アポリポタンパク質 CIIIは 3種のタンパク質の総称であり、アポリポタンパ ク質 cni、アポリポタンパク質 cm、アポリポタンパク質 cmに分類される。そして、
0 1 2
本発明の糖尿病の診断方法においては、これら 3種のアポリポタンパク質 cmの少な くとも 1種の濃度を測定する。本発明の糖尿病の診断方法によれば、アポリポタンパ ク質 cmの濃度を細分ィ匕して測定するので、精度が高!、。
[0055] アポリポタンパク質 cmは血液中に存在する 10種類以上のアポリポタンパク質の 1 種であり、肝臓で合成される。血液中のアポリポタンパク質 cmの臨床的意義として は、閉塞性黄疽ゃ抗脂血症で高値を示すことが知られている。また、アポリポタンパ ク質 cmは糖鎖の有無および構造の違いにより、アポリポタンパク質 cni、アポリポタ
0 ンパク質 cni、アポリポタンパク質
1 cmの
2 3種にさらに分類される。ァポリポタンパク 質 cniは糖鎖を持たないものであり、アポリポタンパク質 cniはアポリポタンパク質 C
0 1
inに糖鎖が付加されたものであり、アポリポタンパク質 cmはアポリポタンパク質
0 2 en
Iにさらに複合的に糖鎖が付加されたものである。
1
[0056] Bondarenko, Ρ· V. et al. J. Lipid Res. 1999;40:543- 555によれば、アポリポタンパ ク質 cni、アポリポタンパク質 cni、アポリポタンパク質 うな構造をし
0 1 cniは以下のよ
2
ている
[0057] [化 1]
Proapo C-II, MM - 8914.9
TQQPQQDE P SPTFLTQV E SLS5YWESAK TAAQ LYEKT YLPAVDEKLR DLYSKSTAAM STYTGIFTDQ VLSVLKGEE
Apo C- Πί, M ^ S765.7 Da for apo C-I1I。 74 SEAEDASLLS FMOGYMKHAT KTAKDALSSV QESQVAQQA GWVTDGFSSL KPYWSTVKDK FSEFWDLDPE VRPTSAVAA
蝤销
Apo C-JIi, Apo C-1I1, Apo C-III, Te KPL
Figure imgf000033_0001
[0058] これらを識別するには、識別可能な抗体などの特異的因子を用いる力 またはこれ ら特定の糖鎖を選択的に切断する酵素を用いて処理し、分子量が減少するかどうか を判定することなどによって確認することができる。
[0059] 本明細書にぉ 、て「血清アルブミン」とは、血清中に含まれるアルブミンを 、 、、漿 蛋白質中にもっとも多量に含まれ (100mlあたり約 4g)で,全蛋白質の 60%を占めるで ある。ヒトでは、分子量 64000-68000,等電点 pH4.7-4.9である。その役割はいくつか あり、血液の浸透圧の維持,様々な物質 (イオン,色素,一部の水溶性ビタミン,薬剤 など)を結合し運搬すること,組織へのアミノ酸の供給源となることなどである。血清ァ ルブミンはアルブミンの 1種であり、血清中で最も多量に存在するタンパク質である。 血清アルブミンは、分子量約 69000 (アミノ酸 1次構造力もの計算値は 66439)の糖 鎖を持たないタンパク質であり、肝臓で合成される。血液中の血清アルブミンの臨床 的意義としては、栄養状態の悪化や肝障害の程度を反映して低値を示すことが知ら れている。
[0060] 血清アルブミンの代表的なヌクレオチド配列は、
(a)配列番号 13または配列番号 15に記載の塩基配列またはそのフラグメント配列 を有するポリヌクレオチド;
(b)配列番号 14または配列番号 16に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドまた はそのフラグメントをコードするポリヌクレオチド;
(c)配列番号 14または配列番号 16に記載のアミノ酸配列において、 1以上のァミノ 酸が、置換、付加および欠失力 なる群より選択される 1つの変異を有する改変体ポ リペプチドまたはそのフラグメントであって、生物学的活性を有する改変体ポリべプチ ドをコードする、ポリヌクレオチド;
(d)配列番号 13または配列番号 15に記載の塩基配列のスプライス変異体もしくは 対立遺伝子変異体またはそのフラグメントである、ポリヌクレオチド;
(e)配列番号 14または配列番号 16に記載のアミノ酸配列力もなるポリペプチドの 種相同体またはそのフラグメントをコードする、ポリヌクレオチド;
(f) (a)〜(e)のいずれ力 1つのポリヌクレオチドにストリンジェント条件下でハイブリ ダイズし、かつ生物学的活性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;また は
(g) (a)〜(e)のいずれ力 1つのポリヌクレオチドまたはその相補配列に対する同一 性が少なくとも 70%である塩基配列からなり、かつ、生物学的活性を有するポリぺプ チドをコードするポリヌクレオチド
であり得る。
血清アルブミンのアミノ酸配列としては、
(a)配列番号 14または配列番号 16に記載のアミノ酸配列またはそのフラグメントか らなる、ポリペプチド;
(b)配列番号 14または配列番号 16に記載のアミノ酸配列において、 1以上のァミノ 酸が置換、付加および欠失からなる群より選択される 1つの変異を有し、かつ、生物 学的活性を有する、ポリペプチド;
(c)配列番号 13または配列番号 15に記載の塩基配列のスプライス変異体または 対立遺伝子変異体によってコードされる、ポリペプチド;
(d)配列番号 14または配列番号 16に記載のアミノ酸配列の種相同体である、ポリ ペプチド;または (e) (a)〜(d)のいずれか 1つのポリペプチドに対する同一性が少なくとも 70%であ るアミノ酸配列を有し、かつ、生物学的活性を有する、ポリペプチド、
であり得る。
[0062] 血清アルブミンの代表的な配列は、配列番号 13または配列番号 15 (核酸配列)お よび配列番号 14または配列番号 16 (アミノ酸配列)において示される。
[0063] 血清アルブミンの生物学的活性としては、例えば、血液の浸透圧の維持,様々な物 質 (イオン,色素,一部の水溶性ビタミン,薬剤など)を結合し運搬すること,組織への アミノ酸の供給源となる能力などを挙げることができる。
[0064] 血清アルブミンは、ヒト、ラットのほ力 他の動物(例えば、哺乳動物)でもそのホモ口 グ (本明細書にぉ 、て、「対応する」遺伝子またはタンパク質などと 、う)が知られて!/、 る。従って、本明細書において血清アルブミンは、通常、特に言及しない場合は、ヒト 、ラットのほか、生物一般において存在する血清アルブミンを指す。血清アルブミンの 他の動物の配列は、マウス(配列番号 17— 18)、ィヌ(配列番号 19— 20)、ゥサギ( 配列番号 21— 22)、サル(配列番号 23— 24)を挙げることができる。
[0065] (診断'事前診断 (予防)因子)
本発明において、診断、または事前診断は、マーカー物質に特異的な因子または 手段を用いて実現することができる。
[0066] 本明細書において「因子」(agent)としては、意図する目的を達成することができる 限りどのような物質または他の要素 (例えば、光、放射能、熱、電気などのエネルギー )でもあってもよい。そのような物質としては、例えば、タンパク質、ポリペプチド、オリ ゴペプチド、ペプチド、ポリヌクレオチド、オリゴヌクレオチド、ヌクレオチド、核酸 (例え ば、 cDNA、ゲノム DNAのような DNA、 mRNAのような RNAを含む)、ポリサッカリド 、オリゴサッカリド、脂質、有機低分子 (例えば、ホルモン、リガンド、情報伝達物質、 有機低分子、コンビナトリアルケミストリで合成された分子、医薬品として利用され得る 低分子 (例えば、低分子リガンドなど)など)、これらの複合分子が挙げられるがそれら に限定されない。ポリヌクレオチドに対して特異的な因子としては、代表的には、その ポリヌクレオチドの配列に対して一定の配列相同性を (例えば、 70%以上の配列同 一性)もって相補性を有するポリヌクレオチド、プロモーター領域に結合する転写因 子のようなポリペプチドなどが挙げられるがそれらに限定されない。ポリペプチドに対 して特異的な因子としては、代表的には、そのポリペプチドに対して特異的に指向さ れた抗体またはその誘導体あるいはその類似物 (例えば、単鎖抗体)、そのポリぺプ チドがレセプターまたはリガンドである場合の特異的なリガンドまたはレセプター、そ のポリペプチドが酵素である場合、その基質などが挙げられるがそれらに限定されな い。
[0067] したがって、本明細書においてポリヌクレオチドまたはポリペプチドなどの生物学的 因子に対して「特異的に相互作用する因子」とは、そのポリヌクレオチドまたはそのポ リペプチドなどの生物学的因子に対する親和性が、他の無関連の(特に、同一性が 3 0%未満の)ポリヌクレオチドまたはポリペプチドに対する親和性よりも、代表的には同 等またはより高いか、好ましくは有意に (例えば、統計学的に有意に)高いものを包含 する。そのような親和性は、例えば、ハイブリダィゼーシヨンアツセィ、結合アツセィな どによって測定することができる。
[0068] 本明細書において第一の物質または因子が第二の物質または因子に「特異的に 相互作用する」とは、第一の物質または因子が、第二の物質または因子に対して、第 二の物質または因子以外の物質または因子 (特に、第二の物質または因子を含むサ ンプル中に存在する他の物質または因子)に対するよりも高い親和性で相互作用す ることをいう。物質または因子について特異的な相互作用としては、例えば、核酸に おけるハイブリダィゼーシヨン、タンパク質における抗原抗体反応、リガンド―レセプタ 一反応、酵素一基質反応など、核酸およびタンパク質の両方が関係する場合、転写 因子とその転写因子の結合部位との反応など、タンパク質—脂質相互作用、核酸— 脂質相互作用などが挙げられるがそれらに限定されない。従って、物質または因子 がともに核酸である場合、第一の物質または因子が第二の物質または因子に「特異 的に相互作用する」ことには、第一の物質または因子が、第二の物質または因子に 対して少なくとも一部に相補性を有することが包含される。また例えば、物質または因 子がともにタンパク質である場合、第一の物質または因子が第二の物質または因子 に「特異的に相互作用する」こととしては、例えば、抗原抗体反応による相互作用、レ セプタ一一リガンド反応による相互作用、酵素一基質相互作用などが挙げられるが それらに限定されない。 2種類の物質または因子がタンパク質および核酸を含む場 合、第一の物質または因子が第二の物質または因子に「特異的に相互作用する」こ とには、転写因子と、その転写因子が対象とする核酸分子の結合領域との間の相互 作用が包含される。
[0069] 本明細書にお!、て「抗体」は、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、多重特異 性抗体、キメラ抗体、および抗イディォタイプ抗体、ならびにそれらの断片、例えば F (ab' ) および Fab断片、ならびにその他の組換えにより生産された結合体を含む。さ
2
らにこのような抗体を、酵素、例えばアルカリホスファターゼ、西洋ヮサビペルォキシ ダーゼ、 αガラクトシダーゼなど、に共有結合させまたは組換えにより融合させてよい
[0070] 本明細書にぉ 、て「手段」とは、ある目的を達成する任意の道具となり得るものを 、 い、特に、本明細書では、「選択的に認識する手段」とは、ある対象を他のものとは異 なって認識することができる手段を 、う。
[0071] 本明細書において「抗原」(antigen)とは、抗体分子によって特異的に結合され得 る任意の基質をいう。本明細書において「免疫原」(immunogen)とは、抗原特異的 免疫応答を生じるリンパ球活性ィ匕を開始し得る抗原をいう。
[0072] 本明細書において使用される抗体は、擬陽性が減じられるかぎり、どのような特異 性の抗体を用いても良いことが理解される。従って、本発明において用いられる抗体 は、ポリクローナル抗体であってもよぐモノクローナル抗体であってもよい。
[0073] 本明細書中で使用される「化合物」は、任意の識別可能な化学物質または分子を 意味し、これらには、低分子、ペプチド、タンパク質、糖、ヌクレオチド、または核酸が 挙げられるが、これらに限定されず、そしてこのような化合物は、天然物または合成物 であり得る。
[0074] 本明細書にぉ 、て「有機低分子」とは、有機分子であって、比較的分子量が小さな ものをいう。通常有機低分子は、分子量が約 1000以下のものをいうが、それ以上の ものであってもよい。有機低分子は、通常当該分野において公知の方法を用いるか それらを組み合わせて合成することができる。そのような有機低分子は、生物に生産 させてもよい。有機低分子としては、例えば、ホルモン、リガンド、情報伝達物質、有 機低分子、コンビナトリアルケミストリで合成された分子、医薬品として利用され得る低 分子 (例えば、低分子リガンドなど)などが挙げられるがそれらに限定されな 、。
[0075] 本明細書において「リガンド」とは、あるタンパク質に特異的に結合する物質をいう。
例えば,細胞膜上に存在する種々のレセプタータンパク質分子と特異的に結合する レクチン、抗原、抗体、ホルモン、神経伝達物質などがリガンドとして挙げられる。
[0076] 本明細書において「タンパク質」、「ポリペプチド」、「オリゴペプチド」および「ぺプチ ド」は、本明細書において同じ意味で使用され、任意の長さのアミノ酸のポリマーをい う。このポリマーは、直鎖であっても分岐していてもよぐ環状であってもよい。アミノ酸 は、天然のものであっても非天然のものであってもよぐ改変されたアミノ酸であっても よい。この用語はまた、複数のポリペプチド鎖の複合体へとアセンブルされた複合体 をさし得る。この用語はまた、天然または人工的に改変されたアミノ酸ポリマーも包含 する。そのような改変としては、例えば、ジスルフイド結合形成、グリコシル化、脂質ィ匕 、ァセチル化、リン酸ィ匕または任意の他の操作もしくは改変(例えば、標識成分との 結合体化)などが挙げられる。この定義にはまた、例えば、アミノ酸の 1または 2以上 のアナログを含むポリペプチド (例えば、非天然のアミノ酸などを含む)、ペプチド様 化合物(例えば、ぺプトイド)および当該分野にお!、て公知の他の改変が包含される 。特に言及する場合、本発明の「ポリペプチド」は、マーカー物質を指すことがある。
[0077] 本明細書にぉ 、て「アミノ酸」は、天然のものでも非天然のものでもよ 、。「誘導体 アミノ酸」または「アミノ酸アナログ」とは、天然に存在するアミノ酸とは異なるがもとの アミノ酸と同様の機能を有するものをいう。そのような誘導体アミノ酸およびアミノ酸ァ ナログは、当該分野において周知である。
[0078] 本明細書において「天然のアミノ酸」とは、天然のアミノ酸の L 異性体を意味する 。天然のアミノ酸は、グリシン、ァラニン、ノ リン、ロイシン、イソロイシン、セリン、メチォ ニン、トレオニン、フエ二ルァラニン、チロシン、トリプトファン、システィン、プロリン、ヒ スチジン、ァスパラギン酸、ァスパラギン、グルタミン酸、グルタミン、 γ カルボキシ グルタミン酸、アルギニン、オル-チン、およびリジンである。特に示されない限り、本 明細書で 、う全てのアミノ酸は L体である。
[0079] 本明細書において「非天然アミノ酸」とは、タンパク質中で通常は天然に見出されな いアミノ酸を意味する。非天然アミノ酸の例として、上述の D型アミノ酸、ノルロイシン、 ノ ラーニトロフエ二ルァラニン、ホモフエ二ルァラニン、パラーフルオロフェニルァラニ ン、 3 アミノー 2 ベンジルプロピオン酸、ホモアルギニンの D体または L体および D フエ-ルァラニンが挙げられる。
[0080] 本明細書において「アミノ酸アナログ」とは、アミノ酸ではないが、アミノ酸の物性お よび Zまたは機能に類似する分子をいう。アミノ酸アナログとしては、例えば、ェチォ ニン、カナバニン、 2—メチルグルタミンなどが挙げられる。アミノ酸模倣物とは、ァミノ 酸の一般的な化学構造とは異なる構造を有するが、天然に存在するアミノ酸と同様 な様式で機能する化合物を 、う。
[0081] アミノ酸は、その一般に公知の 3文字記号力、または IUPAC— IUB Biochemica 1 Nomenclature Commissionにより推奨される 1文字記号のいずれかにより、本 明細書中で言及され得る。ヌクレオチドも同様に、一般に受け入れられた 1文字コー ドにより言及され得る。
[0082] 本明細書において「ポリヌクレオチド」、「オリゴヌクレオチド」および「核酸」は、本明 細書において同じ意味で使用され、任意の長さのヌクレオチドのポリマーをいう。この 用語はまた、「オリゴヌクレオチド誘導体」または「ポリヌクレオチド誘導体」を含む。「ォ リゴヌクレオチド誘導体」または「ポリヌクレオチド誘導体」とは、ヌクレオチドの誘導体 を含むか、またはヌクレオチド間の結合が通常とは異なるオリゴヌクレオチドまたはポ リヌクレオチドをいい、互換的に使用される。そのようなオリゴヌクレオチドとして具体 的には、例えば、 2,一O—メチルーリボヌクレオチド、オリゴヌクレオチド中のリン酸ジ エステル結合がホスホロチォエート結合に変換されたオリゴヌクレオチド誘導体、オリ ゴヌクレオチド中のリン酸ジエステル結合が N3,—P5,ホスホロアミデート結合に変換 されたオリゴヌクレオチド誘導体、オリゴヌクレオチド中のリボースとリン酸ジエステル 結合とがペプチド核酸結合に変換されたオリゴヌクレオチド誘導体、オリゴヌクレオチ ド中のゥラシルが C— 5プロピ-ルゥラシルで置換されたオリゴヌクレオチド誘導体、ォ リゴヌクレオチド中のゥラシルが C— 5チアゾールゥラシルで置換されたオリゴヌクレオ チド誘導体、オリゴヌクレオチド中のシトシンが C— 5プロピ-ルシトシンで置換された オリゴヌクレオチド誘導体、オリゴヌクレオチド中のシトシンがフエノキサジン修飾シト シン(phenoxazine— modified cytosine)で置換されたオリゴヌクレオチド誘導体 、 DNA中のリボースが 2, 一O—プロピルリボースで置換されたオリゴヌクレオチド誘 導体およびオリゴヌクレオチド中のリボースが 2,ーメトキシエトキシリボースで置換され たオリゴヌクレオチド誘導体などが例示される。他にそうではな 、と示されなければ、 特定の核酸配列はまた、明示的に示された配列と同様に、その保存的に改変された 改変体 (例えば、縮重コドン置換体)および相補配列を包含することが企図される。具 体的には、縮重コドン置換体は、 1またはそれ以上の選択された (または、すべての) コドンの 3番目の位置が混合塩基および Zまたはデォキシイノシン残基で置換された 配列を作成することにより達成され得る(Batzerら、 Nucleic Acid Res. 19 : 5081 (1991) ; Ohtsukaら、 J. Biol. Chem. 260 : 2605— 2608 (1985) ;Rossoliniら、 Mol. Cell. Probes 8 : 91— 98 (1994) )。
[0083] 本明細書にぉ 、て「ヌクレオチド」は、天然のものでも非天然のものでもよ 、。「ヌク レオチド誘導体」または「ヌクレオチドアナログ」とは、天然に存在するヌクレオチドとは 異なるがもとのヌクレオチドと同様の機能を有するものをいう。そのようなヌクレオチド 誘導体およびヌクレオチドアナログは、当該分野において周知である。そのようなヌク レオチド誘導体およびヌクレオチドアナログの例としては、ホスホロチォエート、ホスホ ルアミデート、メチルホスホネート、キラルメチルホスホネート、 2, 一 O—メチルリボヌク レオチド、ペプチド型核酸 (PNA)が含まれる力 これらに限定されない。
[0084] 本明細書にぉ 、て「複合分子」とは、ポリペプチド、ポリヌクレオチド、脂質、糖、低 分子などの分子が複数種連結してできた分子を 、う。そのような複合分子としては、 例えば、糖脂質、糖ペプチドなどが挙げられるがそれらに限定されない。本明細書で は、配列番号 2のアミノ酸を有するポリペプチドまたはその改変体もしくはフラグメント であって、診断に関与する生物学的な活性性を有する限り、それぞれの改変体もしく はフラグメントなどをコードする核酸分子も使用することができる。また、そのような核 酸分子を含む複合分子も使用することができる。
[0085] 本明細書にぉ 、て「核酸」はまた、遺伝子、 cDNA、 mRNA、オリゴヌクレオチド、 およびポリヌクレオチドと互換可能に使用される。特定の核酸配列はまた、「スプライ ス改変体」を包含する。同様に、核酸によりコードされた特定のタンパク質は、その核 酸のスプライス改変体によりコードされる任意のタンパク質を暗黙に包含する。その名 が示唆するように「スプライス改変体」は、遺伝子のオルタナティブスプライシングの産 物である。転写後、最初の核酸転写物は、異なる(別の)核酸スプライス産物が異なる ポリペプチドをコードするようにスプライスされ得る。スプライス改変体の産生機構は 変化するが、ェキソンのオルタナティブスプライシングを含む。読み過し転写により同 じ核酸に由来する別のポリペプチドもまた、この定義に包含される。スプライシング反 応の任意の産物 (組換え形態のスプライス産物を含む)がこの定義に含まれる。
[0086] 本明細書において「遺伝子」とは、遺伝形質を規定する因子をいう。通常染色体上 に一定の順序に配列して ヽる。タンパク質の一次構造を規定する遺伝子を構造遺伝 子といい、その発現を左右する遺伝子を調節遺伝子という。本明細書では、「遺伝子 」は、「ポリヌクレオチド」、「オリゴヌクレオチド」および「核酸」ならびに Zあるいは「タン パク質」「ポリペプチド」、「オリゴペプチド」および「ペプチド」をさすことがある。
[0087] 本明細書において遺伝子の「相同性」とは、 2以上の遺伝子配列の、互いに対する 同一性の程度をいう。従って、ある 2つの遺伝子の相同性が高いほど、それらの配列 の同一性または類似性は高い。 2種類の遺伝子が相同性を有する力否かは、配列の 直接の比較、または核酸の場合ストリンジェントな条件下でのハイブリダィゼーシヨン 法によって調べられ得る。 2つの遺伝子配列を直接比較する場合、その遺伝子配列 間で DNA配列力 代表的には少なくとも 50%同一である場合、好ましくは少なくとも 70%同一である場合、より好ましくは少なくとも 80%、 90%、 95%、 96%、 97%、 98 %または 99%同一である場合、それらの遺伝子は相同性を有する。
[0088] 本明細書ではアミノ酸および塩基配列の類似性、相同性および同一性の比較は、 配列分析用ツールである BLASTを用いてデフォルトパラメータを用いて算出される 。同一性の検索は例えば、 NCBIの BLAST 2. 2. 9 (2004. 5. 12 発行)を用 いて行うことができる。本明細書における同一性の値は通常は上記 BLASTを用い、 デフォルトの条件でァラインした際の値をいう。ただし、パラメータの変更により、より 高い値が出る場合は、最も高い値を同一性の値とする。複数の領域で同一性が評価 される場合はそのうちの最も高い値を同一性の値とする。
[0089] 本明細書において「対応する」アミノ酸または核酸とは、あるポリペプチド分子また はポリヌクレオチド分子において、比較の基準となるポリペプチドまたはポリヌクレオ チドにおける所定のアミノ酸またはヌクレオチドと同様の作用を有する力、または有す ることが予測されるアミノ酸またはヌクレオチドをいい、特に酵素分子にあっては、活 性部位中の同様の位置に存在し触媒活性に同様の寄与をするアミノ酸を!ヽぅ。例え ば、アンチセンス分子であれば、そのアンチセンス分子の特定の部分に対応するォ ルソログにおける同様の部分であり得る。対応するアミノ酸は、例えば、システィンィ匕
、、ダルタチオン化、 S— S結合形成、酸化 (例えば、メチォニン側鎖の酸化)、ホルミ ル化、ァセチル化、リン酸化、糖鎖付加、ミリスチルイ匕などがされる特定のアミノ酸で あり得る。あるいは、対応するアミノ酸は、二量体ィ匕を担うアミノ酸であり得る。このよう な「対応する」アミノ酸または核酸は、一定範囲にわたる領域またはドメインであっても よい。従って、そのような場合、本明細書において「対応する」領域またはドメインと称 される。
[0090] 本明細書にぉ 、て「対応する」遺伝子 (例えば、ポリペプチド分子またはポリヌクレ ォチド分子)とは、ある種において、比較の基準となる種における所定の遺伝子と同 様の作用を有するか、または有することが予測される遺伝子 (例えば、ポリペプチド分 子またはポリヌクレオチド分子)をいい、そのような作用を有する遺伝子が複数存在す る場合、進化学的に同じ起源を有するものをいう。従って、ある遺伝子に対応する遺 伝子は、その遺伝子のオルソログであり得る。従って、マウス、ラットのアポリポタンパ ク質 cn,アポリポタンパク質 cm,トランスサイレチン、血清アルブミンは、それぞれ、 ヒトにおいて、対応するアポリポタンパク質 cn,アポリポタンパク質 cm,トランスサイ レチン、血清アルブミンを見出すことができる。そのような対応する遺伝子は、当該分 野において周知の技術を用いて同定することができる。したがって、例えば、ある動 物(例えば、マウス)における対応する遺伝子は、対応する遺伝子の基準となる遺伝 子(例えば、アポリポタンパク質 cn,アポリポタンパク質 cm,トランスサイレチン、血 清アルブミン)は、の配列をクエリ配列として用いてその動物(例えばヒト、ラット)の配 列データベースを検索することによって見出すことができる。
[0091] 本明細書にぉ 、て「フラグメント」とは、全長のポリペプチドまたはポリヌクレオチド( 長さが n)に対して、 l〜n— 1までの配列長さを有するポリペプチドまたはポリヌクレオ チドをいう。フラグメントの長さは、その目的に応じて、適宜変更することができ、例え ば、その長さの下限としては、ポリペプチドの場合、 3、 4、 5、 6、 7、 8、 9、 10、 15、 2 0、 25、 30、 40、 50およびそれ以上のアミノ酸が挙げられ、ここの具体的に列挙して いない整数で表される長さ (例えば、 11など)もまた、下限として適切であり得る。また 、ポリヌクレオチドの場合、 5、 6、 7、 8、 9、 10、 15、 20、 25、 30、 40、 50、 75、 100 およびそれ以上のヌクレオチドが挙げられ、ここの具体的に列挙して!/、な!/、整数で表 される長さ(例えば、 11など)もまた、下限として適切であり得る。本明細書において、 このようなフラグメントは、例えば、全長のものがマーカーとして機能する場合、そのフ ラグメント自体もまたマーカーとしての機能を有する限り、本発明の範囲内に入ること が理解される。
[0092] 本明細書中で使用される「接触 (させる)」とは、化合物を、直接的または間接的の いずれかで、本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチドに対して物理的に近接さ せることを意味する。ポリペプチドまたはポリヌクレオチドは、多くの緩衝液、塩、溶液 などに存在し得る。接触とは、核酸分子またはそのフラグメントをコードするポリぺプ チドを含む、例えば、ビーカー、マイクロタイタープレート、細胞培養フラスコまたはマ イクロアレイ (例えば、遺伝子チップ)などに化合物を置くことが挙げられる。
[0093] 本明細書にぉ 、て「ストリンジェントな条件でノヽイブリダィズするポリヌクレオチド」と は、当該分野で慣用される周知の条件をいう。本発明のポリヌクレオチド中から選択 されたポリヌクレオチドをプローブとして、コロニ一'ハイブリダィゼーシヨン法、プラー ク 'ハイブリダィゼーシヨン法あるいはサザンブロットハイブリダィゼーシヨン法などを用 いることにより、そのようなポリヌクレオチドを得ることができる。具体的には、コロニー あるいはプラーク由来の DNAを固定化したフィルターを用いて、 0. 7〜1. OMの Na C1存在下、 65°Cでハイブリダィゼーシヨンを行った後、 0. 1〜2倍濃度の SSC (salin e- sodium citrate)溶液(1倍濃度の SSC溶液の組成は、 150mM 塩化ナトリウ ム、 15mM クェン酸ナトリウムである)を用い、 65°C条件下でフィルターを洗浄する ことにより同定できるポリヌクレオチドを意味する。ハイブリダィゼーシヨンは、 Molecu lar Cloning 2ηα ed. , Current Protocols m Molecular Biology, ¾uppl ement 1〜38、 DNA Cloning 1: Core Techniques, A PRacltical Appr oach, Second Edition, Oxford University Press (1995)などの実験書に記 載されている方法に準じて行うことができる。ここで、ストリンジェントな条件下でハイブ リダィズする配列からは、好ましくは、 A配列のみまたは T配列のみを含む配列が除 外される。従って、本発明において使用されるポリペプチド (例えば、トランスサイレチ ンなど)には、本発明で特に記載されたポリペプチドをコードする核酸分子に対して、 ストリンジェントな条件下でノヽイブリダィズする核酸分子によってコードされるポリぺプ チドも包含される。
[0094] 本明細書にぉ 、て「ノヽイブリダィズ可能なポリヌクレオチド」とは、上記ハイブリダィ ズ条件下で別のポリヌクレオチドにハイブリダィズすることができるポリヌクレオチドを いう。ハイブリダィズ可能なポリヌクレオチドとして具体的には、配列番号 2、 4、 6など で表されるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする DNAの塩基配列と少なくと も 60%以上の相同性を有するポリヌクレオチド、好ましくは 80%以上の相同性を有 するポリヌクレオチド、さらに好ましくは 95%以上の相同性を有するポリヌクレオチドを 挙げることができる。
[0095] DNA二重鎖の安定性に影響を与える因子としては、塩基の組成、長さおよび塩基 対不一致の程度が挙げられる。ハイブリダィゼーシヨン条件は、当業者によって調整 され得、これらの変数を適用させ、そして異なる配列関連性の DNAがハイブリッドを 形成するのを可能にする。完全に一致した DNA二重鎖の融解温度は、以下の式に よって概算され得る。
Tm (°C) =81. 5 + 16. 6 (log[Na+]) +0. 41 (%G + C) -600/N-O. 72 (%ホ ルムアミド)
ここで、 Nは、形成される二重鎖の長さであり、 [Na+]は、ノ、イブリダィゼーシヨン溶 液または洗浄溶液中のナトリウムイオンのモル濃度であり、%G + Cは、ノ、イブリツド 中の(グァニン +シトシン)塩基のパーセンテージである。不完全に一致したノヽイブリ ッドに関して、融解温度は、各 1%不一致 (ミスマッチ)に対して約 1°Cずつ減少する。
[0096] 本明細書において「精製された」生物学的因子 (例えば、核酸またはタンパク質な ど)とは、その生物学的因子に天然に随伴する因子の少なくとも一部が除去されたも のをいう。したがって、通常、精製された生物学的因子におけるその生物学的因子の 純度は、その生物学的因子が通常存在する状態よりも高い (すなわち濃縮されてい る)。
[0097] 本明細書中で使用される用語「精製された」は、好ましくは少なくとも 75重量%、より 好ましくは少なくとも 85重量%、よりさらに好ましくは少なくとも 95重量%、そして最も 好ましくは少なくとも 98重量%の、同型の生物学的因子が存在することを意味する。
[0098] 本明細書にぉ 、て遺伝子、ポリヌクレオチド、ポリペプチドなどの「発現」とは、その 遺伝子など力 Sインビボで一定の作用を受けて、別の形態になることをいう。好ましくは 、遺伝子、ポリヌクレオチドなど力 転写および翻訳されて、ポリペプチドの形態にな ることをいうが、転写されて mRNAが作製されることもまた発現の一態様であり得る。 より好ましくは、そのようなポリペプチドの形態は、翻訳後プロセシングを受けたもの( 本明細書に 、う誘導体)であり得る。
[0099] 本明細書にぉ 、てポリペプチド発現の「検出」または「定量」は、例えば、 mRNAの 測定および免疫学的測定方法を含む適切な方法を用いて達成され得る。分子生物 学的測定方法としては、例えば、ノーザンプロット法、ドットプロット法または PCR法な どが例示される。免疫学的測定方法としては、例えば、方法としては、マイクロタイタ 一プレートを用いる ELISA法、 RIA法、蛍光抗体法、ウェスタンプロット法、免疫組織 染色法などが例示される。また、定量方法としては、 ELISA法または RIA法などが例 示される。
[0100] 本明細書において「発現量」とは、目的の細胞などにおいて、ポリペプチドまたは m RNAが発現される量をいう。そのような発現量としては、本発明の抗体を用いて ELI SA法、 RIA法、蛍光抗体法、ウェスタンプロット法、免疫組織染色法などの免疫学的 測定方法を含む任意の適切な方法により評価される本発明ポリペプチドのタンパク 質レベルでの発現量、またはノーザンブロット法、ドットブロット法、 PCR法などの分子 生物学的測定方法を含む任意の適切な方法により評価される本発明において使用 されるポリペプチドの mRNAレベルでの発現量が挙げられる。「発現量の変化」とは 、上記免疫学的測定方法または分子生物学的測定方法を含む任意の適切な方法 により評価される本発明において使用されるポリペプチドのタンパク質レベルまたは mRNAレベルでの発現量が増加あるいは減少することを意味する。 [0101] 本明細書中で使用される用語「結合」は、 2つのタンパク質もしくは化合物または関 連するタンパク質もしくは化合物の間、あるいはそれらの組み合わせの間での、物理 的相互作用または化学的相互作用を意味する。結合には、イオン結合、非イオン結 合、水素結合、ファンデルワールス結合、疎水性相互作用などが含まれる。物理的 相互作用(結合)は、直接的または間接的であり得、間接的なものは、別のタンパク 質または化合物の効果を介する力または起因する。直接的な結合とは、別のタンパク 質または化合物の効果を介してもまたはそれらに起因しても起こらず、他の実質的な 化学中間体を伴わない、相互作用をいう。
[0102] 本明細書中で使用される用語「調節する(modulate)」または「改変する(modify) 」は、特定の活性、転写物またはタンパク質の量、質または効果における増加または 減少あるいは維持を意味する。
[0103] 本明細書において、活性、発現産物(例えば、タンパク質、転写物 (RNAなど))の「 減少」または「抑制」あるいはその類義語は、特定の活性、転写物またはタンパク質の 量、質または効果における減少、または減少させる活性をいう。
[0104] 本明細書において、活性、発現産物(例えば、タンパク質、転写物 (RNAなど))の「 増カロ」または「活性化」あるいはその類義語は、特定の活性、転写物またはタンパク 質の量、質または効果における増加または増加させる活性を 、う。
[0105] 本明細書にぉ 、て「プローブ」とは、インビトロおよび Zまたはインビボなどのスクリ 一ユングなどの生物学的実験にお!、て用いられる、検索の手段となる物質を!、 、、 例えば、特定の塩基配列を含む核酸分子または特定のアミノ酸配列を含むペプチド などが挙げられるがそれに限定されない。本明細書においてプローブは、マーカー 検出手段としてもちいられる。
[0106] 通常プローブとして用いられる核酸分子としては、 目的とする遺伝子の核酸配列と 相同なまたは相補的な、少なくとも 8の連続するヌクレオチド長の核酸配列を有するも のが挙げられる。そのような核酸配列は、好ましくは、少なくとも 9の連続するヌクレオ チド長の、より好ましくは少なくとも 10の連続するヌクレオチド長の、さらに好ましくは 少なくとも 11の連続するヌクレオチド長の、少なくとも 12の連続するヌクレオチド長の 、少なくとも 13の連続するヌクレオチド長の、少なくとも 14の連続するヌクレオチド長 の、少なくとも 15の連続するヌクレオチド長の、少なくとも 20の連続するヌクレオチド 長の、少なくとも 25の連続するヌクレオチド長の、少なくとも 30の連続するヌクレオチ ド長の、少なくとも 40の連続するヌクレオチド長の、少なくとも 50の連続するヌクレオ チド長の、少なくとも核酸配列であり得る。プローブとして使用される核酸配列には、 上述の配列に対して、少なくとも 70%相同な、より好ましくは、少なくとも 80%相同な 、さらに好ましくは、少なくとも 90%相同な、少なくとも 95%相同な核酸配列が含まれ る。
[0107] 本明細書において「検索」とは、電子的にまたは生物学的あるいは他の方法により 、ある核酸塩基配列を利用して、特定の機能および Zまたは性質を有する他の核酸 塩基配列を見出すことをいう。電子的な検索としては、 BLAST (Altschul et al. , J. Mol. Biol. 215 :403— 410 (1990) )、 FASTA (Pearson & Lipman, Proc . Natl. Acad. Sci. , USA 85 : 2444- 2448 (1988) ) , Smith and Waterma n法(Smith and Waterman, J. Mol. Biol. 147 : 195— 197 (1981) )、および Needleman and Wunsch法 (Needleman and Wunsch, J. Mol. Biol. 48 : 443— 453 (1970) )などが挙げられるがそれらに限定されない。生物学的な検索と しては、ストリンジェントハイブリダィゼーシヨン、ゲノム DNAをナイロンメンブレン等に 貼り付けたマクロアレイまたはガラス板に貼り付けたマイクロアレイ (マイクロアレイアツ セィ)、 PCRおよび in situハイブリダィゼーシヨンなどが挙げられるがそれらに限定 されない。本明細書において、本発明において使用される遺伝子には、このような電 子的検索、生物学的検索によって同定された対応遺伝子も含まれるべきであること が意図される。
[0108] 本明細書における「プライマー」とは、高分子合成酵素反応において、合成される 高分子化合物の反応の開始に必要な物質をいう。核酸分子の合成反応では、合成 されるべき高分子化合物の一部の配列に相補的な核酸分子 (例えば、 DNAまたは RNAなど)が用いられ得る。本明細書においてプライマーはマーカー検出手段とし て使用され得る。
[0109] 通常プライマーとして用いられる核酸分子としては、目的とする遺伝子の核酸配列 と相補的な、少なくとも 8の連続するヌクレオチド長の核酸配列を有するものが挙げら れる。そのような核酸配列は、好ましくは、少なくとも 9の連続するヌクレオチド長の、よ り好ましくは少なくとも 10の連続するヌクレオチド長の、さらに好ましくは少なくとも 11 の連続するヌクレオチド長の、少なくとも 12の連続するヌクレオチド長の、少なくとも 1 3の連続するヌクレオチド長の、少なくとも 14の連続するヌクレオチド長の、少なくとも 15の連続するヌクレオチド長の、少なくとも 16の連続するヌクレオチド長の、少なくと も 17の連続するヌクレオチド長の、少なくとも 18の連続するヌクレオチド長の、少なく とも 19の連続するヌクレオチド長の、少なくとも 20の連続するヌクレオチド長の、少な くとも 25の連続するヌクレオチド長の、少なくとも 30の連続するヌクレオチド長の、少 なくとも 40の連続するヌクレオチド長の、少なくとも 50の連続するヌクレオチド長の、 核酸配列であり得る。プローブとして使用される核酸配列には、上述の配列に対して 、少なくとも 70%相同な、より好ましくは、少なくとも 80%相同な、さらに好ましくは、少 なくとも 90%相同な、少なくとも 95%相同な核酸配列が含まれる。プライマーとして 適切な配列は、合成 (増幅)が意図される配列の性質によって変動し得るが、当業者 は、意図される配列に応じて適宜プライマーを設計することができる。そのようなブラ イマ一の設計は当該分野において周知であり、手動でおこなってもよくコンピュータ プログラム(例えば、 LASERGENE, PrimerSelect, DNAStar)を用いて行っても よい。
[0110] 本明細書において「生物学的活性」とは、ある因子 (例えば、ポリペプチドまたはタ ンパク質)力 生体内において有し得る活性のことをいい、種々の機能を発揮する活 性が包含される。例えば、ある因子がリガンドである場合、その生物学的活性は、そ のリガンドが対応するレセプターに結合する活性を包含する。
[0111] (トランスサイレチン、トランスサイレチン誘導体、アポリポタンパク質 cn、アポリポタ ンパク質 cn誘導体、アポリポタンパク質 cm、アポリポタンパク質 cm誘導体および 血清アルブミンならびにこれらに対応するタンパク質の検出)
体液などに含まれるトランスサイレチン、トランスサイレチン誘導体、ァポリポタンパク 質 cn、アポリポタンパク質 cn誘導体、アポリポタンパク質 cm、アポリポタンパク質 c in誘導体および血清アルブミンならびにこれらに対応するタンパク質を検出する際 には、これらトランスサイレチン、トランスサイレチン誘導体、アポリポタンパク質 cn、 アポリポタンパク質 cn誘導体、アポリポタンパク質 cm、アポリポタンパク質 cm誘導 体および血清アルブミンならびにこれらに対応するタンパク質を特異的に認識する抗 体 (以下、トランスサイレチン抗体、トランスサイレチン誘導体抗体、ァポリポタンパク 質 cn抗体、アポリポタンパク質 cn誘導体抗体、アポリポタンパク質 cm抗体、ァポリ ポタンパク質 cm誘導体抗体および血清アルブミン抗体ならびにこれらに対応するタ ンパク質の抗体などと呼ぶ)を作製する。このような抗体は、従来公知の手法を用い て作製することができる。なお、抗体は、モノクローナル抗体であっても、ポリクローナ ル抗体であっても良い。他のマーカー物質 (例えば、トランスサイレチン、トランスサイ レチン誘導体、アポリポタンパク質 cn、アポリポタンパク質 cn誘導体、ァポリポタン ノ ク質 cni、アポリポタンパク質 cm誘導体および血清アルブミンならびにこれらに対 応するタンパク質など)についても、同様に抗体を作製することができる。
[0112] 一例として、トランスサイレチンモノクローナル抗体の調製方法を以下に記載する。
トランスサイレチンモノクローナル抗体は、抗原で免疫した動物カゝら得られる抗体産 生細胞と、ミエローマ細胞との細胞融合によりハイプリドーマを調製し、得られるハイ プリドーマからトランスサイレチンの活性を特異的に阻害する抗体を産生するクローン を選択することにより調製することができる。
[0113] 動物の免疫に抗原として用いるトランスサイレチンタンパク質としては、組換え DNA 法または化学合成により調製したトランスサイレチンタンパク質のアミノ酸配列の全部 若しくは一部のペプチドが挙げられる。また、細胞表面に存在するトランスサイレチン タンパク質を特異的に検出するためのトランスサイレチンモノクローナル抗体としては 、配列番号 2に示したトランスサイレチンタンパク質のアミノ酸配列における任意の 10 以上カゝらなるペプチドを抗原として使用することが好ましい。他のトランスサイレチン の分子経路における任意の因子 (例えば、トランスサイレチン、トランスサイレチン誘 導体、アポリポタンパク質 cn、アポリポタンパク質 cn誘導体、アポリポタンパク質 cm 、アポリポタンパク質 cm誘導体および血清アルブミンならびにこれらに対応するタン ノ ク質など)についても同様に抗原を設計することができる。
[0114] 得られた抗原用トランスサイレチンをキャリアータンパク質 (例えばサイログロブリン) に結合させた後、アジュバントを添加する。アジュバントとしては、フロイント完全アジ ュバント、フロイントの不完全アジュバント等が挙げられ、これらの何れのものを混合し てもよい。
[0115] 上記のようにして得られた抗原を哺乳動物、例えばマウス、ラット、ゥマ、サル、ゥサ ギ、ャギ、ヒッジなどの哺乳動物に投与する。免疫は、既存の方法であれば何れの方 法をも用いることができるが、主として静脈内注射、皮下注射、腹腔内注射などにより 行う。また、免疫の間隔は特に限定されず、数日から数週間間隔で、好ましくは 4〜2 1日間隔で免疫する。
[0116] 最終の免疫日から 2〜3日後に抗体産生細胞を採集する。抗体産生細胞としては、 脾臓細胞、リンパ節細胞、末梢血細胞が挙げられるが、一般に脾臓細胞が用いられ る。抗原の免疫量は 1回にマウス 1匹当たり、例えば 100 g用いられる。
[0117] 免疫した動物の免疫応答レベルを確認し、また、細胞融合処理後の細胞から目的 とするハイプリドーマを選択するため、免疫した動物の血中抗体価、または抗体産生 細胞の培養上清中の抗体価を測定する。抗体検出の方法としては、公知技術、例え ば EIA (ェンザィムィムノアツセィ)、 RIA (ラジオィムノアツセィ)、 ELISA (酵素連結 ィムノソルベントアツセィ)等が挙げられる。
[0118] 抗体産生細胞と融合させるミエローマ (骨髄腫)細胞として、マウス、ラット、ヒトなど 種々の動物に由来し、当業者が一般に入手可能な株化細胞を使用する。使用する 細胞株としては、薬剤抵抗性を有し、未融合の状態では選択培地 (例えば HAT培地 )で生存できず、融合した状態でのみ生存できる性質を有するものが用いられる。一 般的に 8—ァザグァニン耐性株が用いられ、この細胞株は、ヒポキサンチン グァ- ン ホスホリボシルトランスフェラーゼを欠損し、ヒポキサンチン ·アミノプテリン ·チミジ ン(HAT)培地に生育できな!/、ものである。
[0119] ミエローマ細胞は、既に公知の種々の細胞株、例えば、 P3 (P3x63Ag8. 653) (J . Immunol. (1979) 123 : 1548— 1550)、 P3x63Ag8U. 1 (Current Topics i n Microbiology and Immunology (1978) 81 : 1— 7)、 NS— l (Kohler, G. and Milstein, C. , Eur. J. Immunol. (1976) 6 : 511— 519)、 MPC— 11 (M argulies, D. H. et al. , Cell (1976) 8 :405-415) , SP2/0 (Shulman, M . et al. , Nature (1978) 276 : 269— 270)、 FO (de St. Groth, S. F. et al . , J. Immunol. Methods (1980) 35 : 1— 21)、 S194 (Trowbridge, I. S. , J . Exp. Med. (1978) 148 : 313— 323)、 R210 (Galfre, G. et al. , Nature ( 1979) 277 : 131— 133)等が好適に使用される。
[0120] 抗体産生細胞は、脾臓細胞、リンパ節細胞など力 得られる。すなわち、前記各種 動物から脾臓、リンパ節等を摘出または採取し、これら組織を破砕する。得られる破 砕物を PBS 、 DMEM、 RPMI1640等の培地または緩衝液に懸濁し、ステンレスメ ッシュ等で濾過後、遠心分離を行うことにより目的とする抗体産生細胞を調製する。
[0121] 次に、上記ミエローマ細胞と抗体産生細胞とを細胞融合させる。細胞融合は、 ME M 、 DMEM、 RPME— 1640培地などの動物細胞培養用培地中で、ミエローマ細 胞と抗体産生細胞とを、混合比 1: 1〜1: 10で融合促進剤の存在下、 30〜37°Cで 1 〜15分間接触させることによって行われる。細胞融合を促進させるためには、平均 分子量 1, 000〜6, 000のポリエチレングリコール、ポリビニルアルコールまたはセン ダイウィルスなどの融合促進剤や融合ウィルスを使用することができる。また、電気刺 激 (例えばエレクト口ポレーシヨン)を利用した市販の細胞融合装置を用いて抗体産 生細胞とミエローマ細胞とを融合させることもできる。
[0122] 細胞融合処理後の細胞から目的とするハイプリドーマを選別する。その方法として 、選択培地における細胞の選択的増殖を利用する方法等が挙げられる。すなわ ち 、細胞懸濁液を適切な培地で希釈後、マイクロタイタープレート上にまき、各ゥエルに 選択培地 (HAT培地など)を加え、以後適当に選択培地を交換して培養を行う。そ の結果、生育してくる細胞をハイブリドーマとして得ることができる。
[0123] ノ、イブリドーマのスクリーニングは、限界希釈法、蛍光励起セルソーター法等により 行い、最終的にモノクローナル抗体産生ハイプリドーマを取得する。取得したノ、イブリ ドーマ力もモノクローナル抗体を採取する方法としては、通常の細胞培養法や腹水 形成法等が挙げられる。細胞培養法においては、ハイプリドーマを 10〜20%ゥシ胎 児血清含有 RPMI— 1640培地、 MEM培地、または無血清培地等の動物細胞培養 培地中で、通常の培養条件 (例えば 37°C, 5%CO濃度)で 2〜14日間培養し、そ
2
の培養上清から抗体を取得する。腹水形成法においては、ミエローマ細胞由来の哺 乳動物と同種の動物の腹腔内にハイプリドーマを投与し、ハイプリドーマを大量に増 殖させる。そして、 1〜4週間後に腹水または血清を採取する。
[0124] 上記抗体の採取方法にお!、て、抗体の精製が必要とされる場合は、硫安塩析法、 イオン交換クロマトグラフィー、ァフィ-ティークロマトグラフィーなどの公知の方法を 適宜に選択して、またはこれらを組み合わせることにより精製する。
[0125] 従って、抗原は、抗体と結合したり、 Bリンパ球、 Tリンパ球などの特異的レセプター に結合して、抗体産生および Zまたは細胞障害などの免疫反応をひきおこす物質( 例えば、タンパク質、脂質、糖などが挙げられるがそれらに限定されない)である。ここ で、抗体またはリンパ球レセプターとの結合性を、「抗原性」(antigecity)という。抗 体産生などの免疫応答を誘導する特性を「免疫原性」(immunogenicity)という。抗 原として使用される物質は、例えば、その目的とする物質 (例えば、タンパク質)を少 なくとも 1つ含む。含まれる物質は、全長が好ましいが、免疫を惹起し得るェピトープ を少なくとも一つ含んでいれば、部分配列でもよい。本明細書において「ェピトープ」 または「抗原決定基」とは、抗体またはリンパ球レセプターが結合する抗原分子中の 部位をいう。ェピトープを決定する方法は、当該分野において周知であり、そのような ェピトープは、核酸またはアミノ酸の一次配列が提供されると、当業者はそのような周 知慣用技術を用いて決定することができる。
[0126] ェピトープは、必ずしもその正確な位置および構造が判明して 、な 、としても使用 することができる。従って、ェピトープには特定の免疫グロブリンによる認識に関与す るアミノ酸残基のセット、または、 T細胞の場合は、 T細胞レセプタータンパク質および Zもしくは主要組織適合性複合体 (MHC)レセプターによる認識について必要であ るアミノ酸残基のセットが包含される。この用語はまた、「抗原決定基」または「抗原決 定部位」と交換可能に使用される。免疫系分野において、インビボまたはインビトロで 、ェピトープは、分子の特徴 (例えば、一次ペプチド構造、二次ペプチド構造または 三次ペプチド構造および電荷)であり、免疫グロブリン、 T細胞レセプターまたは HL A分子によって認識される部位を形成する。ペプチドを含むェピトープは、ェピトープ に独特な空間的コンフオメーシヨン中に 3つ以上のアミノ酸を含み得る。一般に、ェピ トープは、少なくとも 5つのこのようなアミノ酸からなり、代表的には少なくとも 6つ、 7つ 、 8つ、 9つ、または 10のこのようなアミノ酸からなる。ェピトープの長さは、より長いほ ど、もとのペプチドの抗原性に類似することから一般的に好ましいが、コンフオメーシ ヨンを考慮すると、必ずしもそうでないことがある。アミノ酸の空間的コンフオメーシヨン を決定する方法は、当該分野で公知であり、例えば、 X線結晶学、および 2次元核磁 気共鳴分光法を含む。さらに、所定のタンパク質におけるェピトープの同定は、当該 分野で周知の技術を使用して容易に達成される。例えば、 Geysenら(1984) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81 : 3998 (所定の抗原における免疫原性ェピトープの位 置を決定するために迅速にペプチドを合成する一般的な方法);米国特許第 4, 708 , 871号 (抗原のェピトープを同定し、そして化学的に合成するための手順);および Geysenら(1986) Molecular Immunology 23 : 709 (所定の抗体に対して高い 親和性を有するペプチドを同定するための技術)を参照されたい。同じェピトープを 認識する抗体は、単純な免疫アツセィにおいて同定され得る。このように、ペプチドを 含むェピトープを決定する方法は、当該分野において周知であり、そのようなェピト ープは、核酸またはアミノ酸の一次配列が提供されると、当業者はそのような周知慣 用技術を用いて決定することができる。
[0127] 従って、ペプチドを含むェピトープとして使用するためには、少なくとも 3アミノ酸の 長さの配列が必要であり、好ましくは、この配列は、少なくとも 4アミノ酸、より好ましく は少なくとも 5アミノ酸、少なくとも 6アミノ酸、少なくとも 7アミノ酸、少なくとも 8アミノ酸、 少なくとも 9アミノ酸、少なくとも 10アミノ酸、少なくとも 15アミノ酸、少なくとも 20ァミノ 酸、少なくとも 25アミノ酸の長さの配列が必要であり得る。ェピトープは線状であって もコンフオメーシヨン形態であってもよ 、。
[0128] (改変体)
あるアミノ酸は、相互作用結合能力の明らかな低下または消失なしに、例えば、糖 鎖結合領域、システィニル化領域、カチオン性領域または基質分子の結合部位のよ うなタンパク質構造にぉ 、て他のアミノ酸に置換され得る。あるタンパク質の生物学 的機能を規定するのは、タンパク質の相互作用能力および性質である。従って、特 定のアミノ酸の置換がアミノ酸配列において、またはその DNAコード配列のレベルに おいて行われ得、置換後もなお、もとの性質を維持するタンパク質が生じ得る。従つ て、生物学的有用性の明らかな損失なしに、種々の改変が、本明細書において開示 されたペプチドまたはこのペプチドをコードする対応する DNAにおいて行われ得る。
[0129] 上記のような改変を設計する際に、アミノ酸の疎水性指数が考慮され得る。タンパク 質における相互作用的な生物学的機能を与える際の疎水性アミノ酸指数の重要性 は、一般に当該分野で認められている(Kyte. Jおよび Doolittle, R. F. J. Mol. Bi ol. 157 (1) : 105- 132, 1982)。アミノ酸の疎水的性質は、生成したタンパク質の 二次構造に寄与し、次いでそのタンパク質と他の分子 (例えば、酵素、基質、レセプ ター、 DNA、抗体、抗原など)との相互作用を規定する。各アミノ酸は、それらの疎水 性および電荷の性質に基づく疎水性指数を割り当てられる。それらは:イソロイシン( +4. 5);バリン(+4. 2);ロイシン( + 3. 8);フエ-ルァラニン( + 2. 8);システィン Zシスチン( + 2. 5);メチォニン( + 1. 9);ァラニン( + 1. 8);グリシン(一0. 4);スレ ォニン(一 0. 7) ;セリン(一0. 8);トリプトファン(一0. 9) ;チロシン(一1. 3) ;プロリン (— 1. 6) ;ヒスチジン(一3. 2);グノレタミン酸(一 3. 5);グノレタミン(一3. 5) ;ァスパラ ギン酸(一3. 5);ァスパラギン(一3. 5) ;リジン(一3. 9);およびアルギニン(一4. 5) )である。
[0130] あるアミノ酸を、同様の疎水性指数を有する他のアミノ酸により置換して、そして依 然として同様の生物学的機能を有するタンパク質 (例えば、酵素活性において等価 なタンパク質)を生じさせ得ることが当該分野で周知である。このようなアミノ酸置換に おいて、疎水性指数が ± 2以内であることが好ましぐ ± 1以内であることがより好まし ぐおよび ±0. 5以内であることがさらにより好ましい。疎水性に基づくこのようなァミノ 酸の置換は効率的であることが当該分野において理解される。
[0131] 親水性指数もまた、本発明のアミノ酸配列を改変するのに有用である。米国特許第 4, 554, 101号に記載されるように、以下の親水性指数がアミノ酸残基に割り当てら れている:アルギニン( + 3. 0);リジン( + 3. 0);ァスパラギン酸( + 3. 0± 1);グルタ ミン酸( + 3. 0± 1);セリン( + 0. 3);ァスパラギン( + 0. 2);グルタミン( + 0. 2);グリ シン(0);スレオニン(一0. 4);プロリン(一0. 5± 1);ァラニン(一0. 5);ヒスチジン( —0. 5);システィン(一1. 0);メチォニン(一1. 3);バリン(一 1. 5);ロイシン(一1. 8 ) ;イソロイシン(一 1. 8) ;チロシン(一2. 3);フエ-ルァラニン(一2. 5) ;およびトリプ トフアン(一 3. 4)。アミノ酸が同様の親水性指数を有しかつ依然として生物学的等価 体を与え得る別のものに置換され得ることが理解される。このようなアミノ酸置換にお いて、親水性指数が ± 2以内であることが好ましぐ ± 1以内であることがより好ましく 、および ±0. 5以内であることがさらにより好ましい。
[0132] 本発明にお 、て、「保存的置換」とは、アミノ酸置換にぉ 、て、元のアミノ酸と置換さ れるアミノ酸との親水性指数または Zおよび疎水性指数が上記のように類似して 、る 置換をいう。保存的置換の例は、当業者に周知であり、例えば、次の各グループ内 での置換:アルギニンおよびリジン;グルタミン酸およびァスパラギン酸;セリンおよび スレオニン;グルタミンおよびァスパラギン;ならびにパリン、ロイシン、およびイソロイ シン、などが挙げられるがこれらに限定されない。
[0133] 本明細書において「改変体」とは、もとのポリペプチドまたはポリヌクレオチドなどの 物質に対して、一部が変更されているものをいう。そのような改変体としては、置換改 変体、付加改変体、欠失改変体、短縮 (truncated)改変体、対立遺伝子変異体な どが挙げられる。対立遺伝子 (allele)とは、同一遺伝子座に属し、互いに区別される 遺伝的改変体のことをいう。従って、「対立遺伝子変異体」とは、ある遺伝子に対して 、対立遺伝子の関係にある改変体をいう。「種相同体またはホモログ (homolog)」と は、ある種の中で、ある遺伝子とアミノ酸レベルまたはヌクレオチドレベルで、相同性( 好ましくは、 60%以上の相同性、より好ましくは、 80%以上、 85%以上、 90%以上、 95%以上の相同性)を有するものをいう。そのような種相同体を取得する方法は、本 明細書の記載から明らかである。「オルソログ(ortholog)」とは、オルソロガス遺伝子 (orthologous gene)ともいい、二つの遺伝子がある共通祖先からの種分化に由来 する遺伝子をいう。例えば、多重遺伝子構造をもつヘモグロビン遺伝子ファミリーを 例にとると、ヒトとマウスの αヘモグロビン遺伝子はオルソログである力 ヒトの αへモ グロビン遺伝子と /3ヘモグロビン遺伝子はパラログ (遺伝子重複で生じた遺伝子)で ある。
[0134] 本明細書にぉ 、て「保存的(に改変された)改変体」は、アミノ酸配列および核酸配 列の両方に適用される。特定の核酸配列に関して、保存的に改変された改変体とは 、同一のまたは本質的に同一のアミノ酸配列をコードする核酸をいい、核酸がァミノ 酸配列をコードしない場合には、本質的に同一な配列をいう。遺伝コードの縮重のた め、多数の機能的に同一な核酸が任意の所定のタンパク質をコードする。例えば、コ ドン GCA、 GCC、 GCG、および GCUはすべて、アミノ酸ァラニンをコードする。した がって、ァラニンがコドンにより特定される全ての位置で、そのコドンは、コードされた ポリペプチドを変更することなぐ記載された対応するコドンの任意のものに変更され 得る。このような核酸の変動は、保存的に改変された変異の 1つの種である「サイレン ト改変(変異)」である。ポリペプチドをコードする本明細書中のすべての核酸配列は また、その核酸の可能なすべてのサイレント変異を記載する。当該分野において、核 酸中の各コドン(通常メチォニンのための唯一のコドンである AUG、および通常トリプ トフアンのための唯一のコドンである TGGを除く) 1S 機能的に同一な分子を産生す るため〖こ改変され得ることが理解される。したがって、ポリペプチドをコードする核酸 の各サイレント変異は、記載された各配列において暗黙に含まれる。好ましくは、そ のような改変は、ポリペプチドの高次構造に多大な影響を与えるアミノ酸であるシステ インの置換を回避するようになされ得る。
[0135] 本明細書中において、機能的に等価なポリペプチドを作製するために、アミノ酸の 置換のほかに、アミノ酸の付加、欠失、または修飾もまた行うことができる。アミノ酸の 置換とは、もとのペプチドを 1つ以上、例えば、 1〜: LO個、好ましくは 1〜5個、より好ま しくは 1〜3個のアミノ酸で置換することをいう。アミノ酸の付加とは、もとのペプチド鎖 に 1つ以上、例えば、 1〜10個、好ましくは 1〜5個、より好ましくは 1〜3個のアミノ酸 を付加することをいう。アミノ酸の欠失とは、もとのペプチドから 1つ以上、例えば、 1〜 10個、好ましくは 1〜5個、より好ましくは 1〜3個のアミノ酸を欠失させることをいう。ァ ミノ酸修飾は、アミド化、カルボキシル化、硫酸化、ハロゲン化、アルキル化、グリコシ ル化、リン酸化、水酸化、ァシル化 (例えば、ァセチル化)などを含むが、これらに限 定されない。置換、または付加されるアミノ酸は、天然のアミノ酸であってもよぐ非天 然のアミノ酸、またはアミノ酸アナログでもよい。天然のアミノ酸が好ましい。
[0136] 本明細書にぉ 、て、ポリペプチドまたはポリヌクレオチドの「置換、付加または欠失」 とは、もとのポリペプチドまたはポリヌクレオチドに対して、それぞれアミノ酸もしくはそ の代替物、またはヌクレオチドもしくはその代替物力 置き換わること、付け加わること または取り除かれることをいう。このような置換、付加または欠失の技術は、当該分野 において周知であり、そのような技術の例としては、部位特異的変異誘発技術などが 挙げられる。置換、付加または欠失は、 1つ以上であれば任意の数でよぐそのような 数は、その置換、付加または欠失を有する改変体において目的とする機能 (例えば、 マーカーなど)が保持される限り、多くすることができる。例えば、そのような数は、 1ま たは数個であり得、そして好ましくは、全体の長さの 20%以内、 10%以内、または 10 0個以下、 50個以下、 25個以下などであり得る。
[0137] 本明細書にぉ 、て「誘導体」は、上記のような「改変体」に対しても存在し得る。
[0138] (診断方法)
本明細書において「診断」とは、被検体における疾患、障害、状態などに関連する 種々のパラメータを同定し、そのような疾患、障害、状態の現状または未来を判定す ることをいう。本発明の方法、装置、システムを用いることによって、体内の状態を調 ベることができ、そのような情報を用いて、被検体における疾患、障害、状態、投与す べき処置または予防のための処方物または方法などの種々のパラメータを選定する ことができる。本明細書において、狭義には、「診断」は、現状を診断することをいうが 、広義には「事前診断」を含む。
[0139] 本明細書において特に、「事前診断」とは、糖尿病について言及する場合、糖尿病 の発症前の段階を検出することをいい、将来の発症リスクを判定すること、糖尿病の 予防を目的として糖尿病に罹患するおそれの有無を判定することを含む。本発明の 方法、装置、システムを用いることによって、体内の状態を事前に調べることができ、 そのような情報を用いて、被検体における疾患、障害、状態、投与すべき処置または 予防のための処方物または方法などの種々のパラメータを選定することができる。
[0140] 本発明の診断方法は、原則として、身体力 出たものを利用することができることか ら、医師などの医療従事者の手を離れて実施することができることから、産業上有用 である。本明細書において、医師などの医療従事者の手を離れて実施することがで きることを明確にするために、特に「事前診断もしくは診断を支援」すると称することが ある。
[0141] 本明細書において「治療」とは、ある疾患または障害について、そのような状態にな つた場合に、そのような疾患または障害の悪ィ匕を防止、好ましくは、現状維持、より好 ましくは、軽減、さらに好ましくは消退させることをいう。
[0142] 本発明の糖尿病の診断方法においては、糖尿病のマーカー物質として、血液中の これら 3種のタンパク質のうちの少なくとも 1種の濃度を測定する。そして、その測定値 を健常値と比較することにより、糖尿病の診断を行う。ここで、「糖尿病の診断」とは、 糖尿病に罹患している力否かを判定することのみではなぐ糖尿病の予防を目的とし て糖尿病に罹患するおそれの有無を判定することや、糖尿病の改善状態や再発の モニタリングを行うことも含む。本発明の糖尿病の診断方法においては、 3種のマー カー物質の一部だけの濃度を測定してもよ!/、し、 3種全部の濃度を測定してもよ 、。 特に、全部のマーカー物質の濃度を測定する場合は、マルチマーカーシステムを組 んで多方面力も糖尿病の診断を行うことができ、診断の精度が高い。また、これら 3種 のタンパク質は 、ずれも健常者の血液中にも存在して 、るので、その濃度の変動を モニタリングすることにより、健常者が糖尿病を発病する兆候を検出することもできる。
[0143] 本発明の疾病の診断方法は、被検者の体液中における上記マーカー物質 (例え ば、(a)〜(n) )の少なくとも 1つの濃度を健常値と比較し、糖尿病の発症の有無また は将来の発症リスクを判定するものである。本発明の疾病の診断方法では、血糖を 直接指標とするのではなぐ別のマーカー物質を指標とするので、血糖値が上昇す る前の状態をも捉えることができる。その結果、糖尿病の有無に加え、糖尿病の将来 の発症リスクを判定することができる。なお、「糖尿病の事前診断」および「糖尿病の 将来の発症リスクを判定する」とは、交換可能に使用され、糖尿病を発症していない 時点において、将来、糖尿病に罹患する可能性 (危険性)の有無またはその可能性( 危険性)の程度を判定することを 、う。
[0144] ここで、各マーカー物質における質量 Z電荷比(以下、「MZZ」と略記することもあ る。)の「約 7040」、「約 8330」、「約 8530」等の値は、質量分析における測定値の誤 差範囲を考慮した値であり、概ね ±0. 2%の幅を有する。すなわち、約 7040は概ね 7040±0. 2%、約 8330は概ね 8330±0. 2%、約 8530は概ね 8530±0. 2%を 表す。他の質量 Z電荷比についても全く同様に、概ね ±0. 2%の幅を有する。また 、これらのマーカー物質はいずれも主に血液中に存在するタンパク質である。なお、 被検者が糖尿病を発症して 、る場合または糖尿病の将来の発症リスクが高 、場合、 体液中のマーカー物質 (a)、(b)、 (c)、 (d)、 (e)、 (f)、 (g)、 (h)および (i)の濃度は より高値を示し、マーカー物質 、(k)、 (1)、 (m)および (n)の濃度はより低値を示 す。
[0145] 本発明の疾病の診断方法の好ましい実施形態においては、マーカー物質に対す る親和性を有する物質を固定化した担体を使用する。そして、該担体に体液または 体液成分を接触させて、体液または体液成分に含まれるマーカー物質を、マーカー 物質に対する親和性を有する物質を介して担体上に捕捉し、捕捉されたマーカー物 質の量に基づいて体液中のマーカー物質の濃度を算出する。本発明の疾病の診断 方法によれば、担体上に捕捉されたマーカー物質を測定対象とするので、測定試料 中に含まれる夾雑物質の影響を低減させることができ、より高感度かつ高精度でマー カー物質の濃度を測定することができる。なお、体液成分の例としては、体液が血液 である場合の血清または血漿が挙げられる。
[0146] 本発明の疾病の診断方法の好ま ヽ実施形態では、平面部分を有する担体を用 い、マーカー物質に対する親和性を有する物質は該平面部分の一部に固定化され ている。力かる構成により、マーカー物質に対する親和性を有する物質を、担体上の 複数箇所にスポット的に固定ィ匕することができる。その結果、 1個の担体で複数の測 定試料を同時処理することや、 1個の担体で複数のマーカー物質の濃度を同時測定 することが可能となり、作業効率がよい。さらに、各スポットの面積を小さくすることによ り、微量の測定試料力もでもマーカー物質の濃度を測定することができる。なお、平 面部分を有する担体の例としては、チップ等の基板が挙げられる。
[0147] 本発明の疾病の診断方法の好ましい実施形態においては、マーカー物質に対す る親和性を有する物質としてイオン交換体、金属キレート体または抗体を用い、ィォ ン交換体、金属キレート体または抗体を介して測定試料中のマーカー物質を担体上 に捕捉する。当該物質力イオン交換体または金属キレート体の場合は各種のものが 入手容易であり、マーカー物質を捕捉するための担体を容易に調製することができる 。また、当該物質が抗体の場合は、より特異的にマーカー物質を捕捉することができ る。捕捉されたマーカー物質の量を測定する方法としては、質量分析、ィムノアッセィ (抗体の場合)が挙げられる。
[0148] (システム)
本明細書において、「システム」とは、診断するための任意の系をいい、一般に、 1 または複数の構成要素力 なり、複数の構成要素がある場合それらの要素は互いに 作用 '関連し合っており、全体として調和のとれた挙動'機能を示すという 3条件を満 足する系をいう。システムは、装置、組成物、診断薬など任意の形態であり得る。従つ て、システムは、例えば、測定装置を備える大掛力りなシステムから、クロマトグラフィ 一を備えるシステム、免疫反応を利用したキット、抗体を含む組成物(すなわち、マー カー物質のモノクロナール抗体を含む、体外医薬品である診断薬)などを包含するこ とが理解される。
[0149] (スクリーニング)
本発明では、本発明の開示をもとに、コンピュータモデリングによる薬物が提供され ることち企図される。
[0150] 本明細書において「スクリーニング」とは、 目的とするある特定の性質をもつ生物ま たは物質などの標的を、特定の操作 Z評価方法で多数を含む集団の中から選抜す ることをいう。スクリーニングのために、本発明の因子 (例えば、抗体)、ポリペプチドま たは核酸分子を使用することができる。スクリーニングは、インビトロ、インビボなど実 在物質を用いた系を使用してもよぐインシリコ(コンピュータを用いた系)の系を用い て生成されたライブラリーを用いてもよい。本発明では、所望の活性を有するスクリー ユングによって得られた化合物もまた、本発明の範囲内に包含されることが理解され る。また本発明では、本発明の開示をもとに、コンピュータモデリングによる薬物が提 供されることち企図される。
[0151] 1実施形態において、本発明は、本発明のタンパク質または本発明のポリペプチド 、あるいはその生物学的に活性な部分に結合する力、またはこれらの活性を調節す る、候補ィ匕合物もしくは試験化合物をスクリーニングするためのアツセィを提供する。 本発明の試験化合物は、当該分野において公知のコンビナトリアルライブラリ一法に おける多数のアプローチの任意のものを使用して得られ得、これには、以下が挙げら れる:生物学的ライブラリー;空間的にアクセス可能な平行固相もしくは溶液相ライブ ラリー;逆重畳を要する合成ライブラリ一法;「1ビーズ 1ィヒ合物」ライブラリ一法;およ びァフィユティークロマトグラフィー選択を使用する合成ライブラリ一法。生物学的ライ ブラリーアプローチはペプチドライブラリーに限定されるが、他の 4つのアプローチは 、ペプチド、非ペプチドオリゴマーもしくは化合物の低分子ライブラリーに適用可能で ある(Lam (1997) Anticancer Drug Des.12:145)。
[0152] 分子ライブラリーの合成のための方法の例は、当該分野において、例えば以下に 見出され得る: DeWittら(1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:6909;Erbら (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91:11422; Zuckermann¾ ( 1994) J. M ed. Chem 37: 2678 ;Cho¾ (1993) Science 261:1303; Carrell¾ ( 1994) An gew Chem. Int. Ed. Engl.33:2059;Carrell (1994)Angew Chem. Int. Ed. Engl.33 :2061;および Gallopら(1994) Med. Chem 37:1233。
[0153] 化合物のライブラリ一は、溶液中で(例えば、 Houghten(1992)BioTechniques
13:412〜421)、あるいはビーズ上(Lam(1991)Nature 354:82〜84)、チッ プ上(Fodor( 1993) Nature 364: 555〜556)、細菌(Ladner 米国特許第 5, 2 23, 409号)、胞子(Ladner、上記)、プラスミド(Cullら(1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:1865〜1869)またはファージ上(3。01 ぉょび3111辻11(1990)3(^ nce 249 :386〜390; Devlin (1990) Science 249:404〜406;Cwirlaら(199 0) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.87:6378〜6382;Felici(1991)J Mol B iol 222 : 301〜310 ; Ladner上記)にお!/、て示され得る。
[0154] 本発明は、他の実施形態において、本発明の活性成分 (例えば、ポリペプチドまた は核酸)と同等に有効な因子をスクリーニングするための道具として、コンピュータに よる疋直的構造活'性ネ目関 (quantitative structure activity relationship = Q SAR)モデルィ匕技術を使用して得られる化合物もまた、本発明に包含される。ここで 、コンピュータ技術は、いくつかのコンピュータによって作成した基質铸型、ファーマ コフォア、ならびに本発明の活性部位の相同モデルの作製などを包含する。一般に 、インビトロで得られたデータから、ある物質に対する相互作用物質の通常の特性基 をモデル化することに対する方法は、 CATALYST™ ファーマコフォア法 (Ekins et al. ^ Pharmacogenetics, 9:477〜489, l999;Ekms et al.、J. Pharmac ol. & Exp. Ther. , 288 : 21〜29, 1999 ;Ekins et al.、 Pharmacol. & Exp. Ther. , 290 :429〜438, 1999 ;Ekins et al.、 Pharmacol. & Exp. Ther. , 291 :424〜433, 1999)および比較分子電界分析(comparative molec ular field analysis; CoMFA) (Jones et ai. 、 Drug Metabolism & Disp osition, 24 : 1〜6, 1996)などを使用して示されている。本発明において、コンビュ ータモデリングは、分子モデル化ソフトウェア(例えば、 CATALYST™バージョン 4 ( Molecular Simulations, Inc. , San Diego, CA)など)を使用して行われ得る。
[0155] 活性部位に対する化合物のフィッティングは、当該分野で公知の種々のコンビユー タモデリング技術のいずれかを使用してで行うことができる。視覚による検査および活 性部位に対する化合物のマニュアルによる操作は、 QUANTA (Molecular Simul ations, Burlington, MA, 1992)、 SYBYL (Molecular Modeling Software , Tripos Associates, Inc. , St. Louis, MO, 1992)、 AMBER (Weiner et a 1. , J. Am. Chem. Soc. , 106 : 765— 784, 1984)、 CHARMM (Brooks et a 1. 、J. Comp. Chem. , 4 : 187〜217, 1983)などのようなプログラムを使用して行 うことができる。これにカロえ、 CHARMM, AMBERなどのような標準的な力の場を使 用してエネルギーの最小化を行うこともできる。他のさらに特殊ィ匕されたコンピュータ モデリングは、 GRID (Goodford et al. 、J. Med. Chem. , 28 : 849〜857, 198 5) , MCSS (Miranker and Karplus, Function and Genetics, 11 : 29〜34 , 1991)、 AUTODOCK(Goodsell and Olsen, Proteins : S tructure, Func tion and Genetics, 8 : 195〜202, 1990)、 DOCK (Kuntz et al. , J. Mol. Biol. , 161 : 269-288, (1982) )などを含む。さらなる構造の化合物は、空白の活 性部位、既知の低分子化合物における活性部位などに、 LUDKBohm, J. Comp. Aid. Molec. Design, 6 : 61〜78, 1992)、 LEGEND (Nishibata and Itai, T etrahedron, 47 : 8985, 1991)、 Leap Frog (Tripos Associates, St. Louis, MO)などのようなコンピュータープログラムを使用して新規に構築することもできる。 このようなモデリングは、当該分野において周知慣用されており、当業者は、本明細 書の開示に従って、適宜本発明の範囲に入る化合物を設計することができる。
[0156] (投与 '注入'医薬) 本発明のスクリーニング方法によって得られた物質を含む組成物は、生物への移 入に適した形態であれば、任意の製剤形態で提供され得る。そのような製剤形態とし ては、例えば、液剤、注射剤、徐放剤が挙げられる。投与経路としては経口投与、非 経口投与、患部への直接投与などが挙げられる。
[0157] 本明細書において「キット」とは、通常 2つ以上の区画に分けて、提供されるべき部 分 (例えば、抗体、標識など)が提供されるユニットをいう。混合されて提供されるべき でなぐ使用直前に混合して使用することが好ましいような組成物の提供を目的とす るときに、このキットの形態は好ましい。そのようなキットは、好ましくは、提供される部 分 (例えば、試薬をどのように処理すべき力を記載する指示書または説明書を備えて いることが有利である。本明細書においてキットが試薬キットとして使用される場合、 キットには、通常、抗体の使い方などを記載した指示書などが含まれる。
[0158] 本明細書において「指示書」は、本発明の医薬などを投与する方法を医師、患者な ど投与を行う人に対する説明を記載したものである。この指示書は、本発明の診断薬 の使い方、または医薬などを投与することを指示する文言が記載されている。また、 指示書には、投与部位として、骨格筋に投与 (例えば、注射などによる)することを指 示する文言が記載されていてもよい。この指示書は、本発明が実施される国の監督 官庁 (例えば、 日本であれば厚生労働省、米国であれば食品医薬品局 (FDA)など) が規定した様式に従って作成され、その監督官庁により承認を受けた旨が明記され る。指示書は、いわゆる添付文書 (package insert)であり、通常は紙媒体で提供さ れるが、それに限定されず、例えば、電子媒体 (例えば、インターネットで提供される ホームページ、電子メール)のような形態でも提供され得る。
[0159] 本明細書において「被験体」とは、本発明の処置が適用される生物をいい、「患者」 ともいわれる。患者または被験体は好ましくは、ヒトであり得る。
[0160] 本明細書において「生体内」または「インビボ」(in vivo)とは、生体の内部をいう。
特定の文脈において、「生体内」は、目的とする物質が配置されるべき位置をいう。
[0161] 本明細書にぉ 、て「インビトロ」とは、種々の研究目的のために生体の一部分が「生 体外に」(例えば、試験管内に)摘出または遊離されている状態をいう。インビボと対 照をなす用語である。 [0162] 本明細書にぉ 、て「ェキソビボ」とは、遺伝子導入を行うための標的細胞を被験体 より抽出し、インビトロで治療遺伝子または因子を導入した後に、再び同一被験体に 戻す場合、一連の動作をェキソビボという。
[0163] 本発明において使用されるポリペプチド、核酸、医薬ならびにそのようなポリべプチ ドまたは核酸によって調製された組成物は、生物への移入に適した形態であれば、 任意の製剤形態で提供され得る。そのような製剤形態としては、例えば、液剤、注射 剤、徐放剤が挙げられる。投与方法は、経口投与、非経口投与 (例えば、静脈内投 与、筋肉内投与、皮下投与、皮内投与、粘膜投与、直腸内投与、膣内投与、患部へ の局所投与、皮膚投与など)、患部への直接投与などが挙げられる。そのような投与 のための処方物は、任意の製剤形態で提供され得る。そのような製剤形態としては、 例えば、液剤、注射剤、徐放剤が挙げられる。本発明の組成物および医薬は、全身 投与されるとき、発熱物質を含ない、経口的に受容可能な水溶液の形態であり得る。 そのような薬学的に受容可能なタンパク質溶液の調製は、 pH、等張性、安定性など に相当な注意を払うことを条件として、当業者の技術範囲内である。
[0164] 本発明において医薬の処方のために使用される溶媒は、水性または非水性のいず れかの性質を有し得る。さらに、そのビヒクルは、処方物の、 pH、容量ォスモル濃度、 粘性、明澄性、色、滅菌性、安定性、等張性、崩壊速度、または臭いを改変または維 持するための他の処方物材料を含み得る。同様に、本発明の組成物は、有効成分 の放出速度を改変または維持するため、または有効成分の吸収もしくは透過を促進 するための他の処方物材料を含み得る。
[0165] 本発明の製剤の処方手順は、当該分野において公知であり、例えば、日本薬局方 、米国薬局方、他の国の薬局方などに記載されている。従って、当業者は、本明細 書の記載があれば、過度な実験を行うことなぐ投与すべき量を決定することができる
[0166] (好ましい実施形態)
以下に本発明の好ましい実施形態を説明する。以下に提供される実施形態は、本 発明のよりよい理解のために提供されるものであり、本発明の範囲は以下の記載に 限定されるべきでないことが理解される。従って、当業者は、本明細書中の記載を参 酌して、本発明の範囲内で適宜改変を行うことができることは明らかである。
[0167] (診断システム)
1つの局面において、本発明は、被験体由来のサンプル中のマーカー物質、該マ 一力一物質に特異的に相互作用する因子、または該マーカー物質を選択的に認識 する手段を含む、被験体が糖尿病であるかどうか事前診断または診断するためのシ ステムを提供する。
[0168] ある具体的な局面では、本発明は、被験体由来のサンプル中のマーカー物質を含 む、被験体が糖尿病であるかどうか事前診断するためのシステムまたは組成物を提 供する。
[0169] ある具体的な局面では、本発明は、被験体由来のサンプル中のマーカー物質に特 異的に相互作用する因子を含む、被験体が糖尿病であるかどうか事前診断するため のシステムまたは組成物を提供する。
[0170] ある具体的な局面では、本発明は、被験体由来のサンプル中のマーカー物質を選 択的に認識する手段を含む、被験体が糖尿病であるかどうか事前診断するためのシ ステムを提供する。
[0171] ある具体的な局面では、本発明は、被験体由来のサンプル中のマーカー物質を含 む、被験体が糖尿病であるかどうか診断するためのシステムまたは組成物を提供す る。
[0172] ある具体的な局面では、本発明は、被験体由来のサンプル中のマーカー物質に特 異的に相互作用する因子を含む、被験体が糖尿病であるかどうか診断するためのシ ステムまたは組成物を提供する。
[0173] ある具体的な局面では、本発明は、被験体由来のサンプル中のマーカー物質を選 択的に認識する手段を含む、被験体が糖尿病であるかどうか診断するためのシステ ムを提供する。
[0174] これらの糸且成物またはシステムは、上記マーカー物質を同定することができる限り、 任意の被験体由来のサンプル中のマーカー物質、該マーカー物質に特異的に相互 作用する因子、または該マーカー物質を選択的に認識する手段を用いることができ ることが理解され得る。従って、本明細書において具体的に記載された因子または手 段のみならず、当該分野において公知の任意の等価の因子または手段を用いること 力できることが理解される。
[0175] 1つの実施形態において、使用されるマーカー物質は、前記被験体の体液、好まし くは血液中に存在するものであることが特徴である。理論に束縛されることを望まな ヽ 力 体液であれば、取り出した後処理が簡便であり、大量の診断または診断支援が 可能であるからである。理論に束縛されることを望まないが、血液が好ましいのは、本 発明のマーカー物質の挙動が顕著に反映されるからである。
[0176] 1つの実施形態では、本発明において使用されるマーカー物質は、遺伝子産物で あることが特徴である。特に、この遺伝子産物は、糖代謝に直接関連することがこれ まで知られていな力つたものであることが好ましい。なぜなら、糖代謝に直接関連する ことが知られて ヽな 、マーカーでも、糖尿病のマーカー物質として診断または事前診 断が可能になることは、これまで知られておらず、簡便、早期に糖尿病の診断を行う ことが可能になるからである。また、本発明において同定されたマーカー物質は、モ デル動物においてもマーカーとなることが示されており、ヒトにおいて経験的に見出さ れてきたマーカーのように、多数の病因によって変動し得、従って、糖尿病であれば その疾患のみに起因するかどうかが不明であったものが多いところ、本発明のマーカ 一物質では、そのような不明確性は無い。なぜなら、本発明のマーカー物質は、プロ ティンチップによる網羅解析の結果見出されたものであり、かつ、モデル動物におけ る確認も行って 、る力 である。
[0177] 具体的な実施形態では、本発明において用いられるマーカー物質は、トランスサイ レチン、トランスサイレチン誘導体、アポリポタンパク質 CII、アポリポタンパク質 CII誘 導体、アポリポタンパク質 cm、アポリポタンパク質 cm誘導体および血清アルブミン ならびにこれらに対応するタンパク質力もなる群より選択される、 1またはそれより多い 物質を含む。好ましくは、 2以上、 3以上、あるいはそれより多い数のマーカー物質( 特に、各々、誘導体と対を成しているものを 1群とみなしたとき、異なる群から選択さ れる複数のマーカー物質)を含むことが有利である。マルチマーカーシステムとして、 より精確な診断を行うことが可能であり、確定診断をも可能にするからである。
[0178] 1つの実施形態では、本発明において使用される因子は、核酸分子、ポリペプチド 、脂質、糖鎖、有機低分子およびそれらの複合分子からなる群より選択され、好ましく は、因子は、タンパク質または複合分子 (例えば、糖タンパク質、脂質タンパク質など )である。好ましくは、因子は、抗体 (例えば、ポリクローナル抗体またはモノクローナ ル抗体)である。このような因子は、標識されるか、または標識可能であることが好まし い。なぜなら、診断することが容易となるからである。
[0179] 本明細書において「標識」とは、目的となる分子または物質を他力も識別するため の存在 (たとえば、物質、エネルギー、電磁波など)をいう。そのような標識方法として は、 RI (ラジオアイソトープ)法、蛍光法、ピオチン法、化学発光法等を挙げることがで きる。上記の核酸断片および相補性を示すオリゴヌクレオチドを何れも蛍光法によつ て標識する場合には、蛍光発光極大波長が互いに異なる蛍光物質によって標識を 行う。蛍光発光極大波長の差は、 lOnm以上であることが好ましい。蛍光物質として は、核酸の塩基部分と結合できるものであれば何れも用いることができる力 シァニン 色素(例えば、 CyDye™シリーズの Cy3、 Cy5等)、ローダミン 6G試薬、 N ァセトキ シ N2—ァセチルァミノフルオレン(AAF)、 AAIF (AAFのヨウ素誘導体)等を使用 することが好ましい。蛍光発光極大波長の差が lOnm以上である蛍光物質としては、 例えば、 Cy5とローダミン 6G試薬との組み合わせ、 Cy3とフルォレセインとの組み合 わせ、ローダミン 6G試薬とフルォレセインとの組み合わせ等を挙げることができる。本 発明では、このような標識を利用して、使用される検出手段に検出され得るように目 的とする対象を改変することができる。そのような改変は、当該分野において公知で あり、当業者は標識におよび目的とする対象に応じて適宜そのような方法を実施する ことができる。
[0180] 本発明の好ましい実施形態において、使用される手段は、質量分析装置、核磁気 共鳴測定装置、 X線解析装置、 SPR、クロマトグラフィー(例えば、 HPLC、薄層クロ マトグラフィー、ガスクロマトグラフィー)、免疫学的手段 (例えば、ウェスタンプロッティ ング、 ELISA、 RIA)、生化学的手段(例えば、 pi電気泳動、サザンブロッテイング、 二次元電気泳動)、電気泳動機器、化学的分析機器、蛍光二次元ディファレンシャ ル電気泳動法(2DE— DIGE)、同位体標識法 (ICAT)、タンデムァフィ-ティ精製 法 (TAP法)、物理学的手段、レーザーマイクロダイセクションおよびこれらの組み合 わせ力 なる群より選択される。
[0181] 本発明の好ましい実施形態では、本発明のシステムは、さらに、マーカー物質の標 準を含む。このような標準は、マーカー物質の検出手段 (該マーカー物質に特異的 に相互作用する因子、または該マーカー物質を選択的に認識する手段など)が正常 に機能して 、るかどうかを確認するために用いることが好ま 、。
[0182] 好ましい実施形態では、本発明では、対象となるサンプルを精製する手段をさら〖こ 備え得る。このような精製手段としては、例えば、クロマトグラフィーなどを挙げることが できる。精製することによって、診断の精度を上げることができることから、好ましい実 施形態にぉ 、て使用され得る力 これは必須ではな 、。
[0183] 本発明にお 、て、被験体は、哺乳動物を含み、 1つの実施形態では、被験体は、 齧歯類を含む。このような齧歯類 (例えば、ラット、マウスなど)は、モデル動物、特に 、糖尿病のモデル動物が作製されていることから好ましい。好ましい実施形態では、 被験体は、ヒトを含む。
[0184] 1つの実施形態では、本発明において使用される因子または手段は、本発明のマ 一力一物質の定量をする能力を有する。このような定量は、標準曲線を描いたときに 、検量線がきちんと描ける手段または因子であるものがよい。好ましくは、例えば、抗 体、質量分析、クロマトグラフィー分析などを挙げることができる。従って、ある実施形 態では、本発明のシステムは、マーカー物質の定量を行うための定量手段をさらに 備える。
[0185] 1つの実施形態では、定量手段は、標準曲線と測定結果とを比較して前記マーカ 一物質が正常値の範囲内かどうかを判定する判定手段を含む。このような判定手段 は、コンピュータを用いて実現することができる。
[0186] 1つの実施形態では、本発明のシステムは、マーカー物質またはマーカー物質に 特異的に相互作用する前記因子を含む組成物である。
[0187] (トランスサイレチン関連)
1つの局面では、本発明のシステムにおいて対象となるマーカー物質は、トランスサ ィレチンおよびトランスサイレチン誘導体力 なる群より選択される少なくとも 1つの物 質を含み、該トランスサイレチン誘導体は、 S—システィ-ルトランスサイレチン、ダル タチオン化トランスサイレチン、 S— S結合形成トランスサイレチン、酸化 (例えば、メチ ォニン側鎖の酸化)トランスサイレチン、ホルミル化トランスサイレチン、ァセチル化トラ ンスサイレチン、リン酸ィ匕トランスサイレチン、糖鎖付カ卩トランスサイレチン、ミリスチノレ ィ匕トランスサイレチンなどを挙げることができる。特に、 S—システィニルトランスサイレ チンであることが好ましい。また、本発明は、トランスサイレチンと、トランスサイレチン 誘導体 (特に、酸ィ匕還元経路において登場する代謝産物)との量比を検討することに よって、糖尿病の悪ィ匕度または危険度を決定することができることを見出した点に顕 著性があると!/、うべきである。
[0188] 従って、 1つの実施形態では、トランスサイレチンの減少およびトランスサイレチン誘 導体の増カロからなる群より選択される少なくとも 1つの現象は、糖尿病を発症している 力 または将来の発症リスクが高 、ことの指標である。
[0189] 好ましくは、トランスサイレチンの減少およびトランスサイレチン誘導体の増カロからな る群より選択される少なくとも 1つの現象は、糖尿病を発症の程度、または将来の発 症リスクが高さの指標であり得る。このような指標は、本明細書の記載に基づいて当 業者が決定することができることが理解される。
[0190] 具体的な実施形態では、本発明において対象となるトランスサイレチンは、配列番 号 1もしくは配列番号 3に示される核酸配列によってコードされる力、または配列番号
2もしくは配列番号 4に示されるアミノ酸配列を有する、あるいは、これらの改変配列を 有する。
[0191] 別の実施形態では、本発明において対象となるトランスサイレチン誘導体は、配列 番号 1もしくは配列番号 3に示される核酸配列によってコードされるアミノ酸配列、ま たは配列番号 2もしくは配列番号 4に示されるアミノ酸配列における、それぞれ、 30 位 (成熟形態では 10位)のシスティンまたはそれに対応するシスティンがシスティ- ル化されている誘導体であるか、あるいは、これらの改変配列を有し得る。
[0192] 1つの実施形態では、本発明において使用される因子または手段は、トランスサイ レチンの単量体と四量体との区別をする能力を有する。
[0193] 別の実施形態では、本発明において使用される因子または手段は、トランスサイレ チンと S—システィ-ルトランスサイレチンとの区別をする能力を有する(例えば、抗体 ) oこのような能力を有する因子または手段は、例えば、抗体であれば、抗体のライブ ラリーを作製し、さらに、そのライブラリーの中から、トランスサイレチンまたは S シス ティ-ルトランスサイレチンの 、ずれか一方に特異的に (好ましくは、選択的に)反応 するものを選択することによって作製することができ、このような技術は、当該分野に おいて周知技術を用いて達成することができる。抗体以外でも同様に、当該分野に お!、て周知技術を用いて達成することができる。
[0194] 好ましい実施形態では、本発明における因子または手段は、トランスサイレチンと S システィニルトランスサイレチンとを認識し、かつ、本発明のシステムはトランスサイ レチンと S システィニルトランスサイレチンとを識別する手段をさらに備える。例えば 、抗体 +電気泳動などの分子量等での識別手段の組み合わせを提供することによつ て、トランスサイレチン類は同定するが、誘導体とそれ以外とを識別するために電気 泳動または質量分析などを利用することで識別を達成することができることが理解さ れる。このような技術は、当該分野において周知技術を用いて達成することができる
[0195] 好ましい実施形態では、本発明における因子または手段は、トランスサイレチンと S システィニルトランスサイレチンとを認識し、本発明のシステムはトランスサイレチン の分子量と S システィニルトランスサイレチンの分子量とを識別する手段、およびト ランスサイレチンと S システィ-ルトランスサイレチンとの相対比を測定する手段をさ らに備える。このようなシステムを提供することによって、本発明は、糖尿病の悪化度 、発症確率の判定することができる。
[0196] (アポリポタンパク質 CII)
好ましい局面では、本発明のシステムにおいて用いられるマーカー物質は、ァポリ ポタンパク質 CIIまたはアポリポタンパク質 CII誘導体を含み、該ァポリポタンパク質 C II誘導体は、プロアポリポタンパク質 CIIなどを挙げることができる。
[0197] 1つの実施形態では、アポリポタンパク質 CIIの減少およびアポリポタンパク質 CII誘 導体の変動力 なる群より選択される少なくとも 1つの現象が、糖尿病を発症している 力 または将来の発症リスクが高 、ことの指標であり得る。
[0198] 1つの実施形態では、アポリポタンパク質 CIIの減少およびアポリポタンパク質 CII誘 導体の変動力 なる群より選択される少なくとも 1つの現象が、糖尿病を発症の程度
、または将来の発症リスクが高さの指標であり得る。
[0199] 具体的な実施形態では、本発明にお 、て対象となるアポリポタンパク質 CIIは、配 列番号 5もしくは配列番号 7に示される核酸配列によってコードされる力、または配列 番号 6もしくは配列番号 8に示されるアミノ酸配列、あるいは、これらの改変配列を有 する。
[0200] 別の実施形態では、本発明にお 、て対象となるブロアポリポタンパク質 CIIは、上記 配列においてリード配列が結合したものであり得る。
[0201] 1つの実施形態では、本発明において使用される因子または手段は、ァポリポタン パク質 CIIを選択的に識別する能力を有する (例えば、抗体)。このような能力を有す る因子または手段は、例えば、抗体であれば、抗体のライブラリーを作製し、さらに、 そのライブラリーの中から、アポリポタンパク質 CIIを特異的に (好ましくは、選択的に) 反応するものを選択することによって作製することができ、このような技術は、当該分 野において周知技術を用いて達成することができる。抗体以外でも同様に、当該分 野にお 、て周知技術を用いて達成することができる。
[0202] 好ま 、実施形態では、本発明における因子または手段は、アポリポタンパク質 CI Iを選択的に識別する能力を有し、かつ、システムは該ァポリポタンパク質 CIIを定量 する手段を備える。このようなシステムを提供することによって、本発明は、糖尿病の 悪化度、発症確率の判定することができる。
[0203] (アポリポタンパク質 cm)
好ましい局面では、本発明のシステムにおいて用いられるマーカー物質は、ァポリ ポタンパク質 cmまたはアポリポタンパク質 cm誘導体を含み、該ァポリポタンパク質 cinはアポリポタンパク質 cniであり、該ァポリポタンパク質
0 cni誘導体は、アポリポ タンパク質 cmおよびアポリポタンパク質 力もなる群より選択される。また、本発
1 cm 2
明は、アポリポタンパク質 cni アポリポタンパク質 ポリポタンパク質
0、 cniおよびア
1 cn
Iの量比を検討することによって、糖尿病の悪ィ匕度または危険度を精確に決定するこ
2
とができることを見出した点に顕著性があるというべきである。
[0204] 従って、 1つの実施形態では、アポリポタンパク質 cmの増カロ、アポリポタンパク質 c inの増加およびアポリポタンパク質 cmの増カロからなる群より選択される少なくとも
1 2
1つの現象が、糖尿病を発症している力、または将来の発症リスクが高いことの指標 である。
[0205] 好ましくは、アポリポタンパク質 cmの増カロ、アポリポタンパク質 cniの増加および アポリポタンパク質 cmの増加からなる群より選択される少なくとも
2 1つの現象が、糖 尿病を発症の程度、または将来の発症リスクが高さの指標であり得る。このような指標 は、本明細書の記載に基づいて当業者が決定することができることが理解される。
[0206] 具体的な実施形態では、本発明にお 、て対象となるアポリポタンパク質 cmは、配 列番号 9もしくは配列番号 11に示される核酸配列によってコードされる力、または配 列番号 10もしくは配列番号 12に示されるアミノ酸配列を有する(プロ体)か、それらか ら N末端の 20アミノ酸が欠如した形態 (成熟体)か、あるいは、これらの改変配列を有 する。好ましくは、先頭の C末端の 20アミノ酸が欠如した配列を有する。
[0207] 別の実施形態では、本発明にお 、て対象となるアポリポタンパク質 cm誘導体は、 配列番号 9もしくは配列番号 11に示される核酸配列によってコードされる力、または 配列番号 10もしくは 12のそれぞれ 94位もしくは 95位またはそれに対応するスレオ- ンに糖鎖を有する誘導体である力 あるいは、それら力も N末端の 20アミノ酸が欠如 した形態を有する。好ましくは、先頭の C末端の 20アミノ酸が欠如した配列を有する。
[0208] 1つの実施形態では、本発明において使用される因子または手段は、ァポリポタン パク質 cmとアポリポタンパク質 CIII誘導体とを区別する能力を有する。
[0209] 別の実施形態では、本発明において使用される因子または手段は、アポリポタンパ ク質 CIII、アポリポタンパク質 CIIIおよびアポリポタンパク質 CIIIのうち少なくとも 2
0 1 2 つを区別する能力を有する。このような能力を有する因子または手段は、例えば、抗 体であれば、抗体のライブラリーを作製し、さらに、そのライブラリーの中から、ァポリ ポタンパク質 CIII、アポリポタンパク質 cniおよびアポリポタンパク質
0 1 cniのうち少
2 なくとも 2つを特異的に (好ましくは、選択的に)反応するものを選択することによって 作製することができ、このような技術は、当該分野において周知技術を用いて達成す ることができる。抗体以外でも同様に、当該分野において周知技術を用いて達成す ることがでさる。 [0210] 好ましい実施形態では、本発明における因子または手段は、アポリポタンパク質 CI IIとアポリポタンパク質 CIIIとアポリポタンパク質 CIIIとをすベて区別する能力を有
0 1 2
する(例えば、抗体)。このような能力を有する因子または手段は、例えば、抗体であ れば、抗体のライブラリーを作製し、さらに、そのライブラリーの中から、アポリポタンパ ク質 CIIIとアポリポタンパク質 CIIIとアポリポタンパク質 CIIIとをすベて区別するよう
0 1 2
に特異的に (好ましくは、選択的に)反応するものを選択することによって作製するこ とができ、このような技術は、当該分野において周知技術を用いて達成することがで きる。抗体以外でも同様に、当該分野において周知技術を用いて達成することがで きる。
[0211] 従って、 1つの実施形態では、因子または前記手段は、アポリポタンパク質 cmとァ ポリポタンパク質 cm誘導体とを区別する能力を有する抗体を含み、好ましくは、アポ リポタンパク質 CIII、アポリポタンパク質 CIIIおよびアポリポタンパク質 CIIIのうち少
0 1 2 なくとも 2つを区別する能力を有する抗体を含み、アポリポタンパク質 CIIIとアポリポ
0 タンパク質 cmとアポリポタンパク質 cmとをすベて区別する能力を有する抗体の
1 2
組み合わせを含む。
[0212] 好ましい実施形態では、本発明における因子または手段は、アポリポタンパク質 CI
Πとアポリポタンパク質 cm誘導体とを認識し、前記システムは、アポリポタンパク質 ci Πとアポリポタンパク質 cm誘導体とを識別する手段をさらに備える。例えば、抗体 + 電気泳動などの分子量等での識別手段の組み合わせを提供することによって、アポ リポタンパク質 cm類は、同定するが、誘導体とそれ以外とを識別するために電気泳 動または質量分析などを利用することで識別を達成することができることが理解され る。このような技術は、当該分野において周知技術を用いて達成することができる。
[0213] 好ましい実施形態では、本発明における因子または手段は、アポリポタンパク質 CI
Πとアポリポタンパク質 cm誘導体とを認識し、本発明のシステムは、ァポリポタンパク 質 CIII、アポリポタンパク質 CIIIおよびアポリポタンパク質 CIIIのうち少なくとも 2つ
0 1 2
を識別する手段をさらに備える。例えば、抗体 +電気泳動などの分子量等での識別 手段の組み合わせを提供することによって、アポリポタンパク質 cm類は、同定する 力 誘導体とそれ以外とを識別するために電気泳動または質量分析などを利用する ことで識別を達成することができることが理解される。このような技術は、当該分野に お!、て周知技術を用いて達成することができる。
[0214] 好ましい実施形態では、本発明における因子または手段は、アポリポタンパク質 CI
Πとアポリポタンパク質 cm誘導体とを認識し、前記システムは、アポリポタンパク質 ci
II 0とアポリポタンパク質 CIII 1とアポリポタンパク質 cni2とをすベて識別する手段をさら に備える。このようなシステムを提供することによって、本発明は、糖尿病の悪化度、 発症確率の判定することができる。
[0215] (血清アルブミン)
別の局面において、本発明のシステムにおいて用いられるマーカー物質は、血清 アルブミンまたは血清アルブミン誘導体を含み、該血清アルブミン誘導体は、酸ィ匕さ れた血清アルブミン、フラクション化された血清アルブミンなどが挙げられる。
[0216] 従って、 1つの実施形態では、血清アルブミンの減少および血清アルブミン誘導体 の変動力もなる群より選択される少なくとも 1つの現象が、糖尿病を発症しているか、 または将来の発症リスクが高いことの指標である。アルブミンは、種々の疾患の指標と して測定されている力 糖尿病の指標であることはこれまで知られていな力つた。特 に、トランスサイレチン、アポリポタンパク質 cn、アポリポタンパク質 ΠΙなどと組み合わ せたときに、診断の精度を上昇させることは初めて見出されたことは特筆に価する。
[0217] 好ましくは、血清アルブミンの減少および血清アルブミン誘導体の変動力 なる群 より選択される少なくとも 1つの現象が、糖尿病を発症の程度、または将来の発症リス クが高さの指標である。このような指標は、本明細書の記載に基づいて当業者が決 定することができることが理解される。
[0218] 具体的な実施形態では、本発明にお 、て対象となる血清アルブミンは、配列番号 1 3もしくは配列番号 15に示される核酸配列によってコードされる力、または配列番号 1 4もしくは配列番号 16に示されるアミノ酸配列、あるいは、これらの改変配列を有する 。あるいは、本明細書において記載される力他に公知の血清アルブミン配列を有して いても良い。
[0219] 1つの実施形態では、本発明において使用される因子または手段は、血清アルブミ ンを選択的に識別する能力を有する(例えば、抗体)。このような能力を有する因子ま たは手段は、例えば、抗体であれば、抗体のライブラリーを作製し、さらに、そのライ ブラリーの中から、血清アルブミンに特異的に (好ましくは、選択的に)反応するもの を選択することによって作製することができ、このような技術は、当該分野において周 知技術を用いて達成することができる。抗体以外でも同様に、当該分野において周 知技術を用いて達成することができる。
[0220] 好ましい実施形態では、本発明における因子または手段は、血清アルブミンを選択 的に識別する能力を有し、かつ、前記システムは該血清アルブミンを定量する手段を 備える。例えば、抗体 +電気泳動などの分子量等での識別手段の組み合わせを提 供することによって、血清アルブミン類は同定する力 血清アルブミン自体とそれ以外 とを識別するために電気泳動または質量分析などを利用することで識別を達成する ことができることが理解される。このような技術は、当該分野において周知技術を用い て達成することができる。
[0221] 1つの局面において、本発明のシステムは、好ましくは、診断薬として使用され得る
[0222] (診断方法)
1つの局面において、本発明は、被験体が糖尿病であるかどうか事前診断もしくは 診断するため、または該事前診断もしくは診断を支援するための方法であって、 A) 該被験体由来のサンプル中のマーカー物質を測定する工程;および B)該測定結果 から、該被験体が糖尿病またはその可能性があるかどうかを決定する工程、を包含 する、方法を提供する。ここで、サンプルの取得は、どのような手段であっても良い。 通常、医師以外の担当者が測定に従事する場合は、何らかの形で医師が取得したも のであり得る。測定結果から、糖尿病またはその可能性があるかどうかを決定するェ 程は、正常値と比べて、各々のマーカー物質に比較して異常であるかどうかを判定 すること〖こよって実施することができる。
[0223] 本発明の方法において、使用されるマーカー物質などは、上記 (システム)、(トラン スサイレチン)、(アポリポタンパク質 CIII)、(アポリポタンパク質 CII)および (血清アル ブミン)の項にお!、て記載される任意の 1または複数の特徴を矛盾することがない限 り有して 、ても良!、ことが理解される。 [0224] (使用)
1つの局面において、本発明は、被験体由来のサンプル中のマーカー物質、該マ 一力一物質に特異的に相互作用する因子、または該マーカー物質を選択的に認識 する手段の、被験体が糖尿病であるかどうか事前診断または診断するための医薬の 製造における、使用を提供する。ここで、サンプルの取得は、どのような手段であって も良い。通常、医師以外の担当者が測定に従事する場合は、何らかの形で医師が取 得したものであり得る。測定結果から、糖尿病またはその可能性があるかどうかを決 定する工程は、正常値と比べて、各々のマーカー物質に比較して異常であるかどう かを判定することによって実施することができる。
[0225] 本発明の方法において、使用されるマーカー物質などは、上記 (システム)、(トラン スサイレチン)、(アポリポタンパク質 CIII)、(アポリポタンパク質 CII)および (血清アル ブミン)の項にお!、て記載される任意の 1または複数の特徴を矛盾することがない限 り有して 、ても良!、ことが理解される。
[0226] 別の局面では、本発明は、被験体由来のサンプル中のマーカー物質、該マーカー 物質に特異的に相互作用する因子、または該マーカー物質を選択的に認識する手 段の、被験体が糖尿病であるかどうか事前診断または診断するための使用を提供す る。ここで、サンプルの取得は、どのような手段であっても良い。通常、医師以外の担 当者が測定に従事する場合は、何らかの形で医師が取得したものであり得る。測定 結果から、糖尿病またはその可能性があるかどうかを決定する工程は、正常値と比べ て、各々のマーカー物質に比較して異常であるかどうかを判定することによって実施 することができる。
[0227] 本発明の方法において、使用されるマーカー物質などは、上記 (システム)、(トラン スサイレチン)、(アポリポタンパク質 CIII)、(アポリポタンパク質 CII)および (血清アル ブミン)の項にお!、て記載される任意の 1または複数の特徴を矛盾することがない限 り有して 、ても良!、ことが理解される。
[0228] (さらなる説明)
本発明の糖尿病の診断方法において、マーカー物質の濃度を測定する方法は、 そのマーカー物質の濃度を特異的に測定できる方法であれば、タンパク質の定量に 一般に用いられている方法をそのまま用いることができる。例えば、各種のィムノアツ セィ、質量分析 (MS)、クロマトグラフィー、電気泳動等を用いることができる。
[0229] ィムノアッセィによれば、夾雑物質の多い試料のままでも正確にマーカー物質の濃 度を測定することが出来る。ィムノアツセィの例としては、抗原抗体結合物を直接的ま たは間接的に測定する沈降反応、凝集反応、溶血反応などの古典的な方法や、標 識法と組み合わせて検出感度を高めたェンザィムィムノアッセィ (EIA)、ラジオィムノ アツセィ (RIA)、蛍光ィムノアッセィ (FIA)等の方法が挙げられる。なお、これらのィ ムノアツセィに用いるマーカー物質に特異的な抗体は、モノクローナルでもよいし、ポ リクローナルでもよい。
[0230] 質量分析によってマーカー物質の濃度を測定する場合のイオンィ匕の方法としては 、マトリクス支援レーサーイオンィ匕 (matrix— assisted laser desorption/ lonizat ion、 MALDI)、エレクトロスプレーイオンィ匕(electrospray ionization, ESI)のい ずれも適用可能である力 多価イオンの生成が少ない MALDIが好ましい。特に、飛 行時間質量分析計(time— of— flight mass spectromer、 TOF)と組み合わせ た MALDI— TOF— MSによれば、より正確にマーカー物質の濃度を測定すること ができる。さらに、 2台の質量分析計を用いた MSZMSによれば、より正確にマーカ 一物質の濃度を測定することができる。
[0231] 電気泳動によりマーカー物質の濃度を測定する場合は、例えば、検査材料を SDS ポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS— PAGE)に供して目的のマーカー物質を 分離し、適宜の色素や蛍光物質でゲルを染色し、目的のマーカー物質に相当する バンドの濃さや蛍光強度を測定すればよい。 SDS— PAGEだけではマーカー物質 の分離が不十分な場合は、等電点電気泳動 (IEF)と組み合わせた 2次元電気泳動 を用いることもできる。さらに、ゲルから直接検出するのではなぐウェスタンプロッティ ングを行って膜上のマーカー物質の量を測定することもできる。
[0232] クロマトグラフィーによってマーカー物質の濃度を測定する場合は、例えば、液体高 速クロマトグラフィー (HPLC)による方法を用いることができる。すなわち、試料を HP LCに供して目的のマーカー物質を分離し、そのクロマトグラムのピーク面積を測定す ることにより試料中のマーカー物質の濃度を測定することができる。 [0233] 本発明の糖尿病の診断方法は、 (a) 7. 0以下の pHで陽イオン交換体に捕捉され る、分子量が約 13800であるタンパク質、(b) 7. 0以下の pHで金属イオン固定化担 体に捕捉される、分子量が約 8700であるタンパク質、(c) 7. 0以下の pHで陽イオン 交換体に捕捉される、分子量が約 9400であるタンパク質、または、 pH7. 0で金属ィ オン固定化担体に捕捉される、分子量が約 9400であるタンパク質、(d) 7. 0以下の pHで陽イオン交換体に捕捉される、分子量が約 9700であるタンパク質、または、 p H7. 0で金属イオン固定化担体に捕捉される、分子量が約 9700であるタンパク質、 (e) 7. 0以下の pHで陽イオン交換体に捕捉される、分子量が約 66000であるタンパ ク質、または、 pH7. 0で金属イオン固定ィ匕担体に捕捉される、分子量が約 66000で あるタンパク質、をマーカー物質とし、その血液中の量を健常値と比較する方法も含 む。なお、上記 (a)、 (b)、(c)、(d)、(e)の物性は、それぞれ、トランスサイレチンサ ブユニット、アポリポタンパク質 CIII0、アポリポタンパク質 CIII1、アポリポタンパク質 C 1112、血清アルブミンと一致する。
[0234] 本発明の糖尿病の診断方法は、 (a)トリプシンで消化すると、分子量が約 1270、約 1370、約 1390、約 1520、約 2450、約 2640、および約 3140のポリペプチドを生じ る、分子量約 13800のタンパク質、および Zまたは、(b)トリプシンで消化すると、分 子量カ約 900、約 1200、約 1390、約 1710、約 1940、およぴ約 2080のポジぺプチ ドを生じる、分子量約 8700〜 9700のタンパク質をマーカー物質とし、その血液中の 量を健常値と比較する方法も含む。なお、 ProFoundデータベースを用いてぺプチ ドマスフインガープリンティングを行うと、(a)はトランスサイレチンと同定される。また、 MS— Fitデータベースを用いてペプチドマスフィンガープリンティングを行うと、 (b) はァポリポタンパク質 CIIIと同定される。
[0235] 本発明の糖尿病の診断方法における好ましい実施形態の一つは、マーカー物質 を担体上に捕捉し、その捕捉されたマーカー物質の濃度を測定することである。すな わち、マーカー物質に対する親和性を有する物質を担体に固定ィ匕し、その親和性を 有する物質を介してマーカー物質を担体上に捕捉する。本実施形態によれば、試料 中に含まれる夾雑物質の影響を低減させることができ、より高感度かつ高精度でマー カー物質の濃度を測定することができる。なお「親和性」の例としては、抗原と抗体、
訂正された用紙 (規則 91) 酵素と基質、ホルモンとレセプターのようなノ ィオアフィ-ティの他、イオン結合、疎水 性相互作用等の化学的な作用が挙げられる。
[0236] 本実施形態においてマーカー物質の測定方法にィムノアツセィを用いる場合は、 抗体を固定ィ匕した担体を用いることが好ましい。このようにすれば、担体に固定ィ匕さ れた抗体を 1次抗体としたィムノアツセィの系を簡単に構築することができる。例えば 、マーカー物質に特異的でェピトープの異なる 2種類の抗体を用意し、一方を 1次抗 体として担体に固定ィ匕し、他方を 2次抗体として酵素標識し、サンドイッチ EIAの系を 構築することができる。その他、結合阻止法や競合法によるィムノアツセィの系も構築 可能である。さらに、担体として基板を用いる場合は、抗体チップによるィムノアッセィ が可能である。抗体チップによれば、複数のマーカー物質の濃度を同時に測定でき 、迅速な測定が可能である。
[0237] 一方、本実施形態においてマーカー物質の測定方法に質量分析を用いる場合は 、抗体の他、イオン結合や疎水性相互作用によってマーカー物質を担体に捕捉する こともできる。イオン結合や疎水性相互作用は抗原と抗体等のバイオアフィ-ティほ どの特異性がなぐマーカー物質以外の物質も捕捉されるが、質量分析によれば分 子量を反映した質量分析計スペクトルによって定量するので、問題はない。特に、担 体として基板を使用したプロテインチップを用い、表面ェンハンス型レーザー脱離ィ オンィ匕 (surf ace— enhanced laser desorption/ionization 一飛? T時間貧量 分析 (time— of— flight mass spectrometrv)
Figure imgf000079_0001
「&) ELDI— Tu — M 」と 称する)を行えば、マーカー物質の濃度をより正確に測定することができる。使用でき る基板の種類としては、陽イオン交換基板、陰イオン交換基板、順相基板、逆相基板 、金属イオン基板、抗体基板等を用いることができるが、陽イオン交換基板、特に弱 陽イオン交換基板と、金属イオン基板が好ましく用いられる。
[0238] イオン結合によってマーカー物質を担体に捕捉する場合は、イオン交換体を担体 に固定ィ匕する。この場合、イオン交換体には陰イオン交換体、陽イオン交換体のい ずれも用いることができ、さら〖こ、強陰イオン交換体、弱陰イオン交換体、強陽イオン 交換体、弱陽イオン交換体のいずれも用いることができる。例えば、弱陰イオン交換 体の例としては、ジメチルアミノエチル(DE)、ジェチルアミノエチル(DEAE)等の弱 陰イオン交換基を有するものが挙げられる。また、強陰イオン交換体の例としては、 4 級アンモ-ゥム(トリメチルアミノメチル)(QA)、 4級アミノエチル(ジェチル,モノ · 2— ヒドロキシブチルアミノエチル)(QAE)、 4級アンモ-ゥム(トリメチルアンモ-ゥム)(Q MA)等の強陰イオン交換基を有するものが挙げられる。また、弱陽イオン交換体の 例としては、カルボキシメチル (CM)等の弱陽イオン交換基を有するものが挙げられ る。さらに、強陽イオン交換体の例としては、スルホプロピル (SP)等の強陽イオン交 換基を有するものが挙げられる。一方、疎水性相互作用によってマーカー物質を担 体に捕捉する場合は、担体に疎水基をもつ物質を固定化する。疎水基の例としては 、 C4〜C20のアルキル基、フエ-ル基等が挙げられる。さらに、 Cu2+、 Zn2+、 Ni2+ 、 Ca2+、 Co2+、 Mg2+等の金属イオンを固定ィ匕した担体にマーカー物質を捕捉する ことちでさる。
[0239] 本実施形態において用いる担体の例としては、ビーズ、マイクロタイタープレート、 榭脂等の公知のものを使用することができる。特に、ビーズとマイクロタイタープレート は、ィムノアッセィにおいて従来力も用いられており、測定系の構築が容易である。一 方、基板のような、平面部分を有する担体を用いることもできる。この場合は、平面部 分の一部にマーカー物質に対する親和性を有する物質を固定ィヒすることが好ましい 。例としては、基盤としてチップを用い、その表面の複数箇所にスポット的にマーカー 物質に特異的な抗体を固定ィ匕した担体が挙げられる。
[0240] 本発明の糖尿病の診断方法にぉ 、ては、被験者力 採取した血液を検体とし、そ の血液力 調製した血清または血漿を検査材料とすることが好ま 、。血清または血 漿は遠心分離等の公知の方法で血液力 調製することができる。
[0241] 本発明の糖尿病の診断方法における好ましい実施形態の一つとして、マルチマー カーシステムによる糖尿病の診断が挙げられる。本発明の糖尿病の診断方法をマル チマ一力一システムに応用する例を、図 1および図 2を参照しながら説明する。図 1は 、マルチマーカーシステムによる本発明の糖尿病の診断方法の手順を示すフローチ ヤートである。図 1のフローチャートの方法によれば、まず、血液中のトランスサイレチ ンの濃度を指標として 1次判定をする。そして、トランスサイレチンの濃度が健常値よ りも高い場合は、糖尿病と判定する。一方、トランスサイレチンの濃度が健常値以下 である場合は、血液中のアポリポタンパク質 CIII2の濃度を指標として 2次判定をする 。そして、アポリポタンパク質 CIII2の濃度が健常値よりも高い場合は、糖尿病と判定 する。一方、アポリポタンパク質 CIII2の濃度が健常値以下である場合は、血液中の アポリポタンパク質 cmiの濃度を指標として 3次判定をする。そして、アポリポタンパ ク質 cmiの濃度が健常値以下である場合は、正常 (糖尿病ではない)と判定する。 一方、アポリポタンパク質 cmiの濃度が健常値よりも高い場合は、血液中のアポリポ タンパク質 cmoの濃度を指標として 4次判定をする。そして、アポリポタンパク質 cm 0の濃度が健常値よりも高い場合は、糖尿病と判定する。一方、アポリポタンパク質 CI noの濃度が健常値以下である場合は、正常 (糖尿病ではない)と判定する。
[0242] 図 2は、別のマルチマーカーシステムによる本発明の糖尿病の診断方法の手順を 示すフローチャートである。図 2のフローチャートの方法によれば、まず、血液中の血 清アルブミンの濃度を指標として 1次判定をする。そして、血清アルブミンの濃度が健 常値以上である場合は、正常 (糖尿病ではない)と判定する。一方、血清アルブミン の濃度が健常値よりも低い場合は、血液中のアポリポタンパク質 CIII2の濃度を指標 として 2次判定をする。そして、アポリポタンパク質 CIII2の濃度が健常値よりも高い場 合は、糖尿病と判定する。一方、アポリポタンパク質 CIII2の濃度が健常値以下であ る場合は、血液中のアポリポタンパク質 cmiの濃度を指標として 3次判定をする。そ して、アポリポタンパク質 cmiの濃度が健常値以下である場合は、正常 (糖尿病では ない)と判定する。一方、アポリポタンパク質 cmiの濃度が健常値よりも高い場合は、 血液中のアポリポタンパク質 cmoの濃度を指標として 4次判定をする。そして、ァポリ ポタンパク質 cmoの濃度が健常値よりも高い場合は、糖尿病と判定する。一方、アポ リポタンパク質 cmoの濃度が健常値以下である場合は、正常 (糖尿病ではない)と判 定する。
[0243] なお、本発明で糖尿病マーカーとして使用するトランスサイレチン、ァポリポタンパク 質 CIII、および血清アルブミンと、従来から知られている HbAlcや CPR等の臨床マ 一力一を組み合わせることによつてもマルチマーカーシステムを構築することは可能 である。
[0244] 上記のようなマルチマーカーシステムによる糖尿病の診断方法によれば、多方面か ら判定できるので、力なりの高精度で糖尿病の診断をすることができる。さらに、従来 の糖尿病の診断方法では困難であった、糖尿病の発病前の段階の検出、すなわち 糖尿病予備軍の診断にも好適である。また、マルチマーカーシステムによれば、糖尿 病の検出のみでなぐ糖尿病予備軍の検出、糖尿病の改善状態のモニターも高精度 に行うことができる。
[0245] 本発明の糖尿病診断用キットは、トランスサイレチン等のマーカー物質に特異的な 抗体を含むものである。キットに含まれる抗体は単独の試薬としてもよいし、担体にあ らかじめ固定化された状態でもよい。単独の試薬の場合は、その形状は溶液でもよ いし凍結乾燥物でもよい。また、複数の抗体を含めてもよぐ例えば、ィムノアツセィで 使用する標識抗体を 2次抗体として含めてもよい。また、本発明の糖尿病診断用キッ トには他の試薬類を含めてもよぐ例えば EIAを行うためのキットであれば、ビーズ等 の担体、ブロッキング液、 PBS等の緩衝液、発色基質等を含むものでもよい。
[0246] 本発明の疾病の診断方法は、被検者の体液中における下記マーカー物質 (a)〜( n)の少なくとも 1つの濃度を健常値と比較し、糖尿病の有無または将来の発症リスク を判定するものである。
(a) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 7040のイオンピークを生じるタンパク質、
(b) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量/電荷比 が約 8330のイオンピークを生じるタンパク質、
(c) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 8530のイオンピークを生じるタンパク質。
(d) pH7. 0かつ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 9060のイオンピークを生じるタンパク質、
(e) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 9260のイオンピークを生じるタンパク質、
(f) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量/電荷比 が約 9450のイオンピークを生じるタンパク質、
(g) pH7. 0力つ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 13700のイオンピークを生じるタンパク質、
(h) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 76400のイオンピークを生じるタンパク質、
(i) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量/電荷比が 約 79100のイオンピークを生じるタンパク質、
(j) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量/電荷比が 約 3500のイオンピークを生じるタンパク質、
(k) pH7. 0力つ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 3560のイオンピークを生じるタンパク質、 (1) ρΗ7. 0かつ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 4180のイオンピークを生じるタンパク質、 (m) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 12800のイオンピークを生じるタンパク質、
(n) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 65700のイオンピークを生じるタンパク質。
[0247] これらのマーカー物質はいずれも主に血液中に存在するタンパク質である。なお、 被検者が糖尿病を発症して 、る場合または糖尿病の将来の発症リスクが高 、場合、 体液中のマーカー物質 (a)、(b)、 (c)、 (d)、 (e)、 (f)、 (g)、 (h)および (i)の濃度は より高値を示し、マーカー物質 、(k)、 (1)、 (m)および (n)の濃度はより低値を示 す。以下、マーカー物質 (a)、(b)、 (c)、 (d)、 (e)、 (f)、 (g)、 (h)および (i)からなる グループを「グループ 1」、マーカー物質 (j)、 (k)、 (1)、 (m)および (n)からなるダル ープを「グループ 2」と称することがある。
[0248] 本発明の疾病の診断方法で使用する健常値は、例えば、糖尿病を発症して!/ヽな 、 と確定診断された健常人における上記マーカー物質 (a)〜 (n)の体液中の濃度デー タを収集し、その濃度値を元に設定することができる。糖尿病の将来の発症リスクを 判定する場合も、当該健常人における濃度値を元に健常値を設定することができる。 なお、健常値を段階的に複数設定し、糖尿病の有無または将来の発症リスクを定量 的に判定することもできる。 [0249] 本発明の疾病の診断方法において使用する体液としては、血液が好ましく用いら れる。特に、被検者から採取した血液から調製した血清または血漿 (体液成分)を測 定試料とすることが好ま 、。血清または血漿は遠心分離等の公知の方法で血液か ら調製することがでさる。
[0250] (評価方法)
1つの局面において、本発明は物質の評価方法を提供し、この方法は、糖尿病を 発症している動物または将来の発症リスクが高い動物に被験物質を摂取させ、該動 物の体液中におけるマーカー物質 (例えば、(a)〜(n)の 14種)の少なくとも 1つの濃 度を基準値と比較し、被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスク の低減効果を評価するものである。本発明の物質の評価方法では、血糖を直接指標 とするのではなぐ別のマーカー物質を指標とするので、動物における血糖値が上昇 する前の状態をも捉えることができる。その結果、被検物質が有する糖尿病の改善効 果に加え、糖尿病の将来の発症リスクの低減効果を評価することができる。なお、「動 物」には、ラット等の飼育可能な動物の他、ヒトも含むものとする。
[0251] 力かる構成により、より正確に、被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の 発症リスクの低減効果を評価することができる。
[0252] 力かる構成により、測定試料となる体液を簡単に採取でき、より簡便かつ迅速に、 被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を評価す ることがでさる。
[0253] 力かる構成により、機能性食品の開発を目的として、糖尿病の改善効果または将来 の発症リスクの低減効果を評価することができる。
[0254] 上記した本発明の疾病の診断方法と同様に、本発明の物質の評価方法において も、前記体液または体液成分を、前記マーカー物質に対する親和性を有する物質を 固定ィ匕した担体に接触させて、体液中の前記マーカー物質を担体上に捕捉し、捕捉 された前記マーカー物質の量に基づいて体液中の前記マーカー物質の濃度を算出 する構成 (請求項 10)、前記担体は平面部分を有し、前記マーカー物質に対する親 和性を有する物質は、該平面部分の一部に固定ィ匕されている構成、前記マーカー 物質に対する親和性を有する物質は、イオン交換体、金属キレート体または抗体で ある構成が推奨される。
[0255] 本発明の物質の評価方法では、糖尿病を発症している動物または将来の発症リス クが高い動物に被験物質を摂取させ、該動物における上記マーカー物質 (a)〜(! 1) の少なくとも 1つの濃度を基準値と比較し、被検物質が有する糖尿病の改善効果また は将来の発症リスクの低減効果を評価するものである。なお、被検物質が糖尿病の 改善効果または将来の発症リスクの低減効果を有する場合、体液中におけるグルー プ 1に属するマーカー物質の濃度はより低値を示し、グループ 2に属するマーカー物 質の濃度はより高値を示す。
[0256] 好ま 、実施形態では、上記基準値として、糖尿病を発症して!/、る動物または将来 の発症リスクが高い動物に、糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果 を有さない既知物質を摂取させた際の、該動物の体液中における前記マーカー物 質の濃度を用いる。すなわち、糖尿病を発症している動物または将来の発症リスクが 高い動物に、糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を有さない既知 物質を摂取させた場合、その体液中の上記マーカー物質の濃度は「異常値」となる。 そして、被検物質を摂取させた上記動物における値 (測定値)と当該基準値 (異常値 )とを比較し、測定値が基準値と有意に差がありかつ正常側である場合 (正常側に維 持された場合)に、当該被検物質が糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低 減効果を有すると評価することができる。具体的には、グループ 1に属するマーカー 物質を指標とする場合は、測定値が当該基準値に比べて有意に低いときに、グルー プ 2に属するマーカー物質を指標とする場合は、測定値が基準値に比べて有意に高 いときに、当該被検物質が糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を 有すると評価することができる。
[0257] さらに、基準値は複数あってもよい。例えば、上記の異常値に加え、糖尿病を発症 して 、な 、動物または糖尿病の発症リスクが低 、動物における値 (正常値。陰性対 照。)を基準値に加えることができる。具体的には、(1)糖尿病を発症していない動物 または糖尿病の発症リスクが低い動物に、普通食または被検物質を摂取させる群 (正 常値を示す群)、 (2)糖尿病を発症して!/ヽる動物または糖尿病の発症リスクが高!、動 物に、糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を有さない既知物質を 摂取させる群 (異常値を示す群)、および、(3)糖尿病を発症している動物または糖 尿病の発症リスクが高い動物に被検物質を摂取させる群、の 3群を設定し、動物を飼 育する。そして、各動物の体液中の上記マーカー物質を測定し、各測定値を比較す る。このとき、(1)と (2)とで有意差があり、(3)と (2)とで有意差があり、かつ(3)が(2) に比べて正常側((1)に近い側)である場合 (正常側に維持された場合)に、当該被 検物質が糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を有すると評価する ことができる。すなわち、被検物質に糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低 減効果があれば、(3)において血糖値が正常値に維持され、マーカー物質の濃度が 正常値である(1)に近い値をとる。
[0258] さらに、基準値として、(4)糖尿病を発症している動物または将来の発症リスクが高 い動物に、糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を有する既知物質 を摂取させる群、の動物における値(陽性対照)を加えることもできる。具体的には、 上記(1)〜(3)に加えて、上記 (4)の群を設定し、動物^!司育する。このとき、(1)と( 2)とで有意差があり、(3)と (2)とで有意差があり、かつ(3)が(2)に比べて正常側(( 1)および (4)に近い側)である場合に、当該被検物質が糖尿病の改善効果または将 来の発症リスクの低減効果を有すると評価することができる。すなわち、このような被 検物質は、(4)で採用した上記既知物質と同様の挙動を示し、同様の作用を有する 物質といえる。
[0259] 上記した「糖尿病を発症して!/、る動物、または糖尿病の発症リスクが高 、動物」は、 例えば、遺伝的に必ず糖尿病を発症する動物を用いることで、実現できる。より具体 的には、例えば、大塚製薬 (株)徳島研究所カゝら供給されている OLETF (Otsuka Lo ng-Evans Tokushima Fatty)ラットを用いることができる。 OLETFラットは肥満を伴う 2 型糖尿病を自然発症するモデルラットであり、雄では 25週齢における OGTTでほぼ 全例が糖尿病と診断される。同様に、「糖尿病を発症していない動物、または糖尿病 の発症リスクが低い動物」は、例えば、遺伝的に全く糖尿病を発症しないモデル動物 を用いることで、実現できる。より具体的には、例えば、大塚製薬 (株)徳島研究所か ら供給されている LETO (Long- Evans Tokushima Otsuka)ラットを用いることができる 。 LETOラットは、糖尿病を全く発症しないコントロールラットであり、遺伝的に OLET Fラッドと近縁である。
[0260] 本発明の物質の評価方法に使用する動物としては、特に限定はなぐ例えばマウス 、ラット、ゥサギ、ブタ等を使用することができる。特に、ラットとマウスはその飼育が容 易であるので、本発明の評価方法に好ましくに用いられる。動物の飼育方法としては 特に限定はなぐ例えば、飼料を自由摂取させて、 3〜20日程度飼育すればよい。さ らに、動物としてヒトを用いることもできる。ヒトを用いる場合は、臨床試験の結果によ つて物質を評価することになる。
[0261] 本様相の物質の評価方法において使用する動物の体液としては、血液が好ましく 用いられる。特に、血液から調製した血清または血漿 (体液成分)を測定試料とする ことが好ま 、。血清または血漿は遠心分離等の公知の方法で血液力 調製するこ とがでさる。
[0262] 本発明の物質の評価方法における被検物質としては、食品素材、医薬原体などが 挙げられる。特に、食品素材を評価対象とする場合は、機能性食品の開発に役立て ることがでさる。
[0263] 本発明の物質の評価方法を簡便に行なうために、必要な試薬類をまとめて評価用 キットを構築することができる。当該評価用キットとしては、例えば、マーカー物質に 対する親和性を有する物質を固定化した担体を含むものが挙げられる。特に、担体 として、 CM等の弱陽イオン交換体、銅イオン等の金属キレート体、あるいはマーカー 物質に対する抗体を固定化した基板を含めた評価用キットによれば、 SELDI-TO F— MSや抗体チップによるィムノアツセィを簡便に行なうことができる。本キット中に は他の試薬類、例えば、標準物質、前処理用の各種緩衝液等を含めてもよい。
[0264] 本発明の物質のスクリーニング方法は、本発明の物質の評価方法によって被検物 質を評価し、糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を有する物質を スクリーニングするものである。本発明の物質のスクリーニング方法においても、上記 した本発明の物質の評価方法の実施形態と全く同様の実施形態をとることができる。 さらに、上記した評価用キットと同様の構成力もなるスクリーニング用キットを構築する ことちでさる。
[0265] 本発明はまた、本発明に記載の物質の評価方法によって被検物質を評価し、糖尿 病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を有する物質をスクリーニングする ことを特徴とする物質のスクリーニング方法である。
[0266] 本発明は物質のスクリーニング方法にかかり、動物の体液中におけるマーカー物 質 (例えば、(a)〜(n)の 14種)の少なくとも 1つの濃度を基準値と比較し、糖尿病の 改善効果または将来の発症リスクの低減効果を有する物質をスクリーニングするもの である。本発明の物質のスクリーニング方法では、血糖を直接指標とするのではなく 、別のマーカー物質を指標とするので、動物における血糖値が上昇する前の状態を も捉えることができる。その結果、糖尿病の改善効果を有する物質に加え、糖尿病の 将来の発症リスクの低減効果を有する物質をスクリーニングすることができる。特に、 被検物質が食品素材の場合は、糖尿病の改善効果を有する機能性食品または将来 の発症リスクの低減効果を有する機能性食品の開発に有用な食品素材をスクリー二 ングすることができる。
[0267] 本発明は、このようなスクリーニング方法によって得られた物質も提供する。
[0268] 本明細書において引用された、科学文献、特許、特許出願などの参考文献は、そ の全体が、各々具体的に記載されたのと同じ程度に本明細書において参考として援 用される。
[0269] 以上、本発明を、理解の容易のために好まし!/ヽ実施形態を示して説明してきた。以 下に、実施例に基づいて本発明を説明するが、上述の説明および以下の実施例は 、例示の目的のみに提供され、本発明を限定する目的で提供したのではない。従つ て、本発明の範囲は、本明細書に具体的に記載された実施形態にも実施例にも限 定されず、特許請求の範囲によってのみ限定される。
[0270] [実施例]
以下に、実施例をもって本発明をさらに具体的に説明する力 本発明はこれらの実 施例に限定されるものではない。
実施例 1
[0271] 1.プロテインチップを用いた糖尿病マーカー候補タンパク質の検索
糖尿病患者 10名分、健常者 10名分、計 20名分の血清サンプルを収集した。各血 清サンプルについて、変性バッファー(9M 尿素、 2% CHAPS、 50mM Tris— HCl (pH9. 0) )をカ卩えて前処理を行い、一部の夾雑タンパク質を除去した。次に、 前処理した各血清サンプルを強陰イオン交換樹脂に吸着させた後、 pHの異なる溶 出液で順に溶出させ、画分 1 (素通り)、画分 2 (pH7. 0で溶出)、画分 3 (pH5. 0で 溶出)、画分 4 (pH4. 0で溶出)、画分 5 (pH3. 0で溶出)、画分 6 (有機溶媒で溶出) の 6つの画分を得た。それぞれの画分に対して、プロテインチップを用いて SELDI— TOF— MSを行い、糖尿病患者の血清に特異的なタンパク質を網羅的に検索した。 プロテインチップは、金属イオン (Cu2+)、弱陽イオン交換体 (CM)、強陰イオン交換 体 (Q)、逆相(C 16アルキル鎖)の 4種 ( 、ずれもサイファージヱン社製)につ 、て検 討した。エネルギー吸収物質 (EAM)は、 aーシァノー 4ーヒドロキシケィ皮酸(CHC A)とシナピン酸 (SPA)の 2種を検討した。その結果、プロテインチップの種類、画分 の種類、チップの洗浄条件(pH)、 EAMの種類等の組み合わせによって多数のピー クが検出された。これらのピークから、糖尿病患者と健常者との間で有意に強度が異 なるピークを検索した。
[0272] 2.候補ピークの検索(1)
弱陽イオン交換体を固定ィ匕したプロテインチップを用い、画分 4につ 、て洗浄 pHを 7. 0とした場合に、質量/電荷 it (m/z)力 S 13867, 14049, 13885, 14087,お よび 13761の 5個のピークが検出された。また、弱陽イオン交換体を固定化したプロ ティンチップを用い、画分 5について洗浄 pHを 4. 0とした場合に、 mZz力 3885の ピークが検出された。これら 6個のピークから、分子量 13800〜14100の範囲付近 に候補となるタンパク質 (以下、「候補タンパク質(1)」と称する。)が存在することが示 唆された。
[0273] 各ピークについて、糖尿病患者と健常者に分けてピーク強度をプロットし、 ROC曲 線を作成し、さらに、カットオフ値を設定した。一例として、図 3 (a)〜(c)に mZzが 13 867のピークについての例を示す。図 3 (a)は糖尿病患者と健常者に分けてピーク強 度をプロットしたグラフであり、水平線はカットオフ値である。図 3 (b)は図 3 (a)の結果 を、最大値、最小値、中央値、およびカットオフ値で示したグラフである。図 3 (c)は R OC曲線であり、 ROC面積が 1に近 、ほど(曲線が左上に寄るほど)その測定系の精 度が高!、ことを示す。他の 5個のピークにっ ヽても同様のグラフ(図示せず)を作成し た。各ピークについて、 P値、 ROC面積、使用チップ、チップの洗浄条件、画分、お よび使用 EAMをまとめた表を以下の表 2に示す。
[表 2]
Figure imgf000090_0001
[0275] 3.候補タンパク質 (1)の精製
糖尿病患者の血清から、以下の手順により候補タンパク質(1)を精製した。まず、 糖尿病患者の血清 50 Lに変性バッファー(9M 尿素、 2% CHAPS、50mM T ris— HCl (pH9. 0) ) 75 Lをカ卩え、 4°Cで 20分間処理した。さらに、洗浄 Z結合バ ッファー(lOOmM NaClを含む、 50mM リン酸ノ ッファー(pH7. 0) ) 1. 5mLをカロ えて希釈した後、洗浄 Z結合バッファーで平衡化した Q Ceramic HyperD F S pin Column (バイオセプラ社)にアプライした。そのまま 4°Cで 30分間攪拌した後、 500 Lの洗净/結合ノ ッファーで 2回洗净した。次【こ、 125mM、 150mM、 175m M、 200mM、または 250mMの NaClを含む 5種類の 50mM リン酸バッファー(pH 7. 0) 100 Lで順に溶出して分画した。各画分について SELDI—TOF— MSにて 分析したところ、 175mM、 200mM、および 250mMの NaClを含むバッファーで溶 出した画分に、候補タンパク質(1)と同様の分子量約 13800〜14100のピークが検 出された。なお、アルブミンは溶出前の洗浄工程で全て溶出されており、この条件で 候補タンパク質(1)とアルブミンは完全に分離された。
[0276] 4.候補タンパク質(1)の同定
NaCl濃度が 175mM、 200mM、および 250mMの画分を混合した(90 /z L X 3) 。混合した画分を VivaSpin 5000 Cut Off (ザルトリウス社)にて遠心濃縮し、さら に 10倍量の 50mM リン酸バッファー(pH7. 0)をカ卩えて最終液量 50 Lまで濃縮 し、ノ ッファー交換した。次に、濃縮したサンプルをゲル濃度 16%の SDS— PAGE に供し、クマシ一ブリリアントブルー(CBB)にてゲルを染色した。その結果、分子量 約 13800の位置に目的のバンドが検出された。次に、 目的のバンドに 0. 02 μ Ε μ Lのトリプシン溶液(25mM 炭酸水素アンモ-ゥム (pH8. 0)に溶解)を作用させて ゲル内で消化した。消化したサンプルにつ 、て MALDI— MSZMS分析をしたとこ ろ、少なくとも 7個のピークが検出され、それらの分子量は、「1266. 960」、「1366. 300」、「1394. 270」、「1522. 140」、「2451. 790」、「2646. 030」、および「314 1. 310」と算出された。これらのデータを元に ProFoundデータベースによって既知 タンパク質を検索し、ペプチドマスフィンガープリンティングを行ったところ、 目的のタ ンパク質は 99%以上の確率でトランスサイレチンのサブユニットと同定された。従来 知られているトランスサイレチンのサブユニットの分子量は 13890、等電点は 5. 3で あるのに対し、今回単離したタンパク質の分子量は約 13800、予想される等電点は 5 . 3であり、両者の物理ィ匕学的性質はほぼ一致した。
[0277] なお、トランスサイレチンは同一のサブユニット 4個からなる 4量体であることが知ら れているが、本実施例の結果によれば、トランスサイレチンは 4量体の形ではなくサブ ユニット単体で検出された。 実施例 2
[0278] 1.候補ピークの検索(2)
実施例 1と同様にして別の候補ピークを検索した。その結果、弱陽イオン交換体を 固定ィ匕したプロテインチップを用い、画分 6について洗浄 pHを 4. 0とした場合に、 m /zが 9279, 9705の 2個のピークが検出された。また、弱陽イオン交換体を固定ィ匕 したプロテインチップを用い、画分 5について洗浄 pHを 4. 0とした場合に、 mZzが 9 285, 9415の 2個のピークが検出された。また、弱陽イオン交換体を固定化したプロ ティンチップを用い、画分 6について洗浄 pHを 7. 0とした場合に、 mZz力 9289, 9 638, 9712の 3個のピークが検出された。また、金属イオン(Cu2+)を固定化したプ 口ティンチップを用い、画分 6について洗浄 pHを 7. 0とした場合に、 mZz力 690, 9289, 9638、 9712の 4偶のピーク力 S検出された。これら 11偶のピーク力ら、分子量 8600〜9800の範囲付近に候補となるタンパク質 (以下、「候補タンパク質(2)」と称 する。)が存在することが示唆された。
[0279] 実施例 1と同様にして、各ピークについて、糖尿病患者と健常者に分けてピーク強 度をプロットし、 ROC曲線を作成し、さらに、カットオフ値を設定した。一例として、図 4 (a)〜(c)に mZzが 8690のピークにつ!、ての例を示す。図 4 (a)は糖尿病患者と健 常者に分けてピーク強度をプロットしたグラフであり、図 4 (b)は図 4 (a)の結果を、最 大値、最小値、中央値、およびカットオフ値で示したグラフであり、図 4 (c)は ROC曲 線である。他の 10個のピークについても同様のグラフ(図示せず)を作成した。各ピ ークについて、 P値、 ROC面積、使用チップ、チップの洗浄条件、画分、および使用 EAMをまとめた表を以下の表 3に示す。
[0280] [表 3]
Figure imgf000092_0001
[0281] 2.候補タンパク質 (2)の精製
糖尿病患者の血清から、以下の手順により候補タンパク質 (2)を精製した。まず、 糖尿病患者の血清 50 μ Lに変性バッファー 75 μ Lを加え、 4°Cで 20分間処理した。 さらに、洗浄/結合バッファー(50mM リン酸バッファー(pH6. 0) ) 1. 5mLをカロえ て希釈した後、洗浄 Z結合バッファーで平衡化した Q Ceramic HyperD F Spi n Columnにアプライした。そのまま 4°Cで 30分間攪拌した後、 500 Lの洗浄 Z結 合バッファーで 2回洗浄した。次に、 50mM、 150mM、または 250mMの NaClを含 む 3種類の 50mM リン酸バッファー(pH6. 0) 100 μ Lで順に溶出して分画した。各 画分について SELDI—TOF— MSにて分析したところ、候補タンパク質(2)と同様 の分子量約 8690、 9415、 9712のピークが検出された。なお、アルブミンは溶出前 の洗浄工程で全て溶出されており、この条件で候補タンパク質(2)とアルブミンは完 全に分離された。
[0282] 3.候補タンパク質(2)の同定
SDS— PAGEにて精製した目的のバンドに 0. 02 μ &/ μ Lのトリプシン溶液(25 mM 炭酸水素アンモ-ゥム (pH8. 0)に溶解)を作用させてゲル内で消化した。消 化したサンプルにつ 、て MALDI— MSZMS分析をしたところ、少なくとも 5個のピ 一タカ S検出され、それらの分子量は、「898」、 「1197」、 「1717」、 「1939」、 「2076」 と算出された。これらのデータを元に MS— Fitデータベースによって既知タンパク質 を検索し、ペプチドマスフィンガープリンティングを行ったところ、 目的のタンパク質は
3種のアポリポタンパク質 cni、すなわち、アポリポタンパク質 cmo、ァポリポタンパク 質 CIII1、アポリポタンパク質 CIII2と同定された。従来知られているアポリポタンパク 質 CIII0、アポリポタンパク質 Cini、アポリポタンパク質 CIII2の分子量はそれぞれ 87 65、 9421、 9713、等電点はそれぞれ 4. 95、 4. 80、 4. 65であるのに対し、今回単 離した 3種のタンパク質の分子量はそれぞれ 8690、 9415、 9712、予想される等電 点はいずれも 4. 5〜5. 0であり、両者の物理ィ匕学的性質はほぼ一致した。
[0283] 4. 2次元電気泳動による糖尿病患者血清の分析
糖尿病患者の血清を、 1次元目(水平方向)が IEF、 2次元目(垂直方向)が SDS— PAGEの 2次元電気泳動に供したところ、分子量 6. 5〜14. 4kDa、等電点(pi) 5付 近に 3個のバンド A、 B、 Cが検出された(図 5)。これらのバンドは健常者の血清から は検出されなかった。これらのバンド A、 B、 Cについて、 SELDI—TOF— MSによつ て分析したところ、 A、 B、 Cの分子量は、それぞれアポリポタンパク質 CIII2、アポリポ タンパク質 cmi、アポリポタンパク質 cnioの分子量と一致した。この結果は、上記の プロテインチップを用いた候補タンパク質(2)の検索結果と一致した。
実施例 3
[0284] 候補ピークの検索(3) 実施例 1と同様にしてさらに別の候補ピークを検索した。その結果、弱陽イオン交換 体を固定ィ匕したプロテインチップを用い、画分 3について洗浄 pHを 7. 0とした場合に 、 mZz力 66418, 66449の 2個のピークが検出された。また、弱陽イオン交換体を 固定ィ匕したプロテインチップを用い、画分 5について洗浄 pHを 4. 0とした場合に、 m Zzが 66449のピークが検出された。また、弱陽イオン交換体を固定ィ匕したプロティ ンチップを用い、画分 6について洗浄 pHを 7. 0とした場合に、 mZz力 S66572のピー クが検出された。また、金属イオン (Cu2+)を固定ィ匕したプロテインチップを用い、画 分 4について洗浄 pHを 7. 0とした場合に、 m/zが 66216のピークが検出された。ま た、金属イオン (Cu2+)を固定ィ匕したプロテインチップを用い、画分 6について洗浄 p Hを 7. 0とした場合に、 mZz力 66572, 66582の 2個のピークが検出された。また、 金属イオン(Cu2+)を固定ィ匕したプロテインチップを用い、画分 5について洗浄 pHを 7. 0とした場合に、 m/zが 66596のピークが検出された。なお、これらのピークは候 補タンパク質(1)や候補タンパク質 (2)とは異なり、糖尿病患者にお!ヽて低値を示し た。これら 8個のピークから、分子量 66000〜67000の範囲付近〖こ候補となるタンパ ク質 (以下、「候補タンパク質 (3)」と称する。)が存在することが示唆された。この分子 量の値は、公知のヒト血清アルブミンの分子量(66439)の値に極めて近ぐかつ m Zzが 66449というヒト血清アルブミンの分子量とほとんど同じ値のピークも検出され たことから、候補タンパク質(3)は血清アルブミンであると同定した。
実施例 1および 2と同様にして、各ピークについて、糖尿病患者と健常者に分けて ピーク強度をプロットし、 ROC曲線を作成し、さらに、カットオフ値を設定した。一例と して、図 6 (a)〜(c)に mZzが 66216のピークについての例を示す。図 6 (a)は糖尿 病患者と健常者に分けてピーク強度をプロットしたグラフであり、図 6 (b)は図 6 (a)の 結果を、最大値、最小値、中央値、およびカットオフ値で示したグラフであり、図 6 (c) は ROC曲線である。なお、本ピークは糖尿病患者の方が低値を示すので、図 6 (c) の ROC曲線は右下に傾き、かつ右下に寄るほど精度が高いことを示す。他の 7個の ピークについても同様のグラフ(図示せず)を作成した。各ピークについて、 P値、 RO C面積、使用チップ、チップの洗浄条件、画分、および使用 EAMをまとめた表を以 下の表 4に示す。 [0286] [表 4]
Figure imgf000095_0001
実施例 4
[0287] 以下の構成の糖尿病検出用キット(1)を構築した。本キットは抗体を固定ィ匕した基 板を含むものであり、基板上にマーカー物質を捕捉し、サンドイッチ EIAの系でトラン スサイレチン、アポリポタンパク質 cm、および血清アルブミンを測定するためのもの である。検出は蛍光標識ストレプトアビジンで行う。
[0288] [表 5] 適 ^適産茵 s ^ 抗トランスサイレチンモノクローナル抗体固定化ガラス基板 ¾量量量量量量量量量文 ピオチン標識抗トランスサイレチンモノクローナル抗体 (溶液)
トランスサイレチン標準品(凍結乾燥品) 抗ァポリポタンパク質 CIIIモノクロ一ナル抗体固定化ガラス基板
ピオチン標識抗ァポリポタンパク質 cmモノクローナル抗体 (溶液)
アポリポタンパク質 CHI標準品(凍結乾燥品) 抗ヒト血清アルブミンモノクロ一ナル抗体固定化ガラス基板
ピオチン標識抗ヒト血清アルブミン質 CII【モノクロ一ナル抗体 (溶液)
ヒト血清アルブミン榡準品(凍結乾燥品) ブロッキング液
洗浄用緩衝液(X I 0)
蛍光標識ストレプトアビジン 実施例 5 [0289] 以下の構成の糖尿病検出用キット (2)を構築した。本キットは、マイクロタイタープレ ートを用いたサンドイッチ EIAによって、トランスサイレチン、アポリポタンパク質 cm、 および血清アルブミンを測定するためのものである。
[0290] [表 6] 抗トランスサイレチンモノクローナル抗体プレート(96穴)
ペルォキシダ一ゼ標識抗トランスサイレチンモノクロ一ナル抗体 (凍結乾燥品) トランスサイレチン標準品(凍結乾燥品) 抗ァポリポタンパク質 CI11モノクローナル抗体プレート(96穴)
ペルォキシダーゼ標識抗ァポリポタンパク質 cmモノクローナル抗体
(凍結乾燥品)
アポリポタンパク質 cm標準品(凍結乾燥品) 抗ヒト血清アルブミンモノクローナル抗体プレート(96穴)
ペルォキシダ一ゼ標識抗ヒト血清アルブミンモノクローナル抗体 (凍結乾燥品) ヒト血清アルブミン標準品(凍結乾燥品) ブロッキング液
洗浄用緩衝液(X 1 0)
基質液(3, 3' , 5, 5'ー亍トラメチルベンジジン、 TMBZ)
反応停止液(1 N 硫酸)
実施例 6 適適適 ^ ^ ^ 111菌鹿
%量量量量量量量量量久量"9.
[0291] 1.ラットを用いた動物実験
2型糖尿病自然発症モデルラットとして OLETFラットを、該モデルラットと同じ系統 ( 遺伝的に近縁)の 2型糖尿病を発症しないラットとして LETOラットを準備した。 OLE TFラットと LETOラットは ヽずれも大塚製薬 (株)徳島研究所より提供された。 LETO ラットの群 (第 1群)と OLETFラットの群 (第 2群)とを設定し、各ラットを飼育した。飼料 には CRF— 1 (オリエンタルバイオサイエンス社)を用い、各群とも自由摂取とした。各 群とも 5週齢力も試験を開始し、 50週または 62週まで飼育した。 5 (飼育開始時), 9, 13, 17, 21, 25, 29, 33, 37, 41, 45,および 49の各週齢時【こ OGTTを行な!/ヽ、 血液をサンプリングした。これらの各血液サンプル力 血清を調製した。飼育終了後 、特に異常が見られな力つたラットから、第 1群力も 4匹、第 2群力も 7匹を選択した。 それらのラットにおける OGTTの評価を、常法に従い、正常(〇)、境界(△)、糖尿病 (參)の 3段階で評価した。 OGTTの結果を第 1表に示す。表中、 1—1から 1—4はそ れぞれ第 1群のラット(計 4匹)、 2— 1から 2— 7は第 2群の各ラット (計 7匹)の結果で あり、 5〜49の整数はラットの週齢である。すなわち、第 1群のラットでは糖尿病を発 病しな力つた力 第 2群のラットでは、 21週齢あたりから徐々に糖尿病を発症していた 。次に、第 1表で特に示した 21サンプルを、以下の解析に供した。
[0292] [表 7] 第 1表
Figure imgf000097_0002
Figure imgf000097_0001
[0293] 各血清サンプル 20 ;z Lに、変性バッファー(9Μ 尿素、 2% CHAPS、 50mM T ris-HCl (pH9. 0) ) 30 /z Lを加えて前処理を行い、タンパク質を変性させた。次に 、前処理した各血清サンプルを強陰イオン交換榭脂カラム (Q Ceramic Hyper D、パイォセプラ社)にアプライした。次に、 pH9. 0の緩衝液(50mM Tris— HC1( pH9. 0)、 0. 1% (WZV) 1— o— N—ォクチルー β—D—ダルコビラノシド(以下、「 OGPJと称する。))、 pH7. 0の緩衝液(50mM HEPES— NaOH (pH7. 0)、 0. 1 % (wZv) OGP)ゝ pH5. 0の緩衝液(lOOmM 齚酸ナトリウム(pH5. 0)、0. 1% ( wZv) OGP)、pH4. 0の緩衝液(lOOmM 酢酸ナトリウム(pH4. 0)、0. l% (w/ v) OGP)ゝ pH3. 0の緩衝液(50mM クェン酸ナトリウム(pH3. 0)、0. l% (w/v) OGP)、および有機溶媒(33. 3%イソプロピルアルコール、 16. 7%ァセトニトリル、 0. 1%トリフルォロ酢酸力もなる混合液)各 200 /z Lで順に溶出させ、画分 1 (ρΗ9. 0 で溶出、素通り)、画分 2 (pH7. 0で溶出)、画分 3 (pH5. 0で溶出)、画分 4 (pH4. 0で溶出)、画分 5 (pH3. 0で溶出)、画分 6 (有機溶媒)の 6つの粗分画画分を得た。
[0294] 得られた各画分 を pH4. 0のプロテインチップ結合バッファー(lOOmM 酢 酸ナトリウム)で 10倍希釈した後、陽イオン交換チップ CM10 (サイファージェン社)に 添加した。同様に、得られた各画分 10 Lを pH7. 0のプロテインチップ結合バッファ 一(lOOmM リン酸、 0. 5M NaCl)で 10倍希釈した後、銅修飾チップ IMAC30 ( サイファージェン社)〖こ添加した。各プロテインチップを各結合バッファーで 3回洗浄 した後に脱イオン水で 1回洗浄し、乾燥させた。次に、エネルギー吸収分子であるシ ナピン酸(SPA)または α シァノ 4—ヒドロキシケィ皮酸(CHCA)を添加し、プロ ティンチップリーダー Model PBS lie (サイファージェン社)を用いて、 SELDI— T OF— MSを行なった。なお、測定分子量範囲(MZZ)は、 3000〜200000の範囲 で行なった。また、測定は 2連で行い、 MZZの平均値を算出した。データ解析は、 P rotem Chip So土 tware、 CipnergenExpress Data Magnager、お び Bioma rker Patterns Software ( 、ずれもサイファージェン社)を用いて行なった。具体 的には、ベースライン補正、分子量校正、スペクトルの正規ィ匕処理を行なった後、シ ングルマーカー解析および数本のマーカーを組み合わせたマルチフロー解析を行 なった。その結果、粗分画画分の種類、プロテインチップの種類、チップの洗浄条件 等の組み合わせによって多数のピークが検出された。これらのピークの中から、第 1 群と第 2群のサンプル間で有意差があったピークを 14個選抜した。
[0295] 2.マーカー物質(a)の特定
画分 5において、陽イオン交換チップ CM10を用いた場合に、質量/電荷比が 70 43 (平均値)のイオンピークが検出された。図 7に、 21週齢時における本ピークのピ ーク強度を各群に分けてプロットした場合の箱髭図を示す。図中、髭の上端と下端は それぞれ最大値と最小値、箱の上辺と下辺はそれぞれ第 3四分位(75パーセンタイ ル)と第 1四分位(25パーセンタイル)、箱の中の線は中央値である(以下の図も同じ )。すなわち、本ピークは、第 1群で低値を示し、第 2群で高値を示した。以上より、 SE LDI—TOF— MSに供すると質量 Z電荷比が約 7040のピークを生じるタンパク質( マーカー物質 (a) )が、糖尿病を発症して!/、るラットまたは将来の発症リスクが高!、ラ ットに特異的な物質で、当該疾病のマーカーとなり得ることがわ力つた。これにより、ヒ トの血液中にもマーカー物質 (a)が存在する場合に、血中におけるマーカー物質 (a) の濃度を指標として、糖尿病の発症の有無または将来の発症リスクを判定することが できることが示された。さらに、被検物質を摂取させた動物の血中におけるマーカー 物質 (a)の濃度を指標として、被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発 症リスクの低減効果の評価、および、そのような物質のスクリーニングが行なえること が示された。例えば、所望の被検物質を使用して同様の動物実験を行なって血清サ ンプルを調製し、同様の手順で SELDI— TOF— MSを行なった場合に、質量 Z電 荷比が約 7040のピークを生じるタンパク質の濃度が正常値に維持されたとき、該被 検物質は、糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を有すると評価す ることがでさる。
3.マーカー物質 (b)の特定
画分 6において、陽イオン交換チップ CM10を用いた場合に、質量/電荷比が 83 25 (平均値)のイオンピークが検出された。図 8に、 21週齢時における本ピークのピ ーク強度を各群に分けてプロットした場合の箱髭図を示す。すなわち、本ピークは、 第 1群で低値を示し、第 2群で高値を示した。以上より、 SELDI— TOF— MSに供す ると質量 Z電荷比が約 8330のピークを生じるタンパク質 (マーカー物質 (b) )力 糖 尿病を発症しているラットまたは将来の発症リスクが高いラットに特異的な物質で、当 該疾病のマーカーとなり得ることがわかった。これにより、ヒトの血液中にもマーカー 物質 (b)が存在する場合に、血中におけるマーカー物質 (b)の濃度を指標として、糖 尿病の発症の有無または将来の発症リスクを判定することができることが示された。さ らに、被検物質を摂取させた動物の血中におけるマーカー物質 (b)の濃度を指標と して、被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果の評 価、および、そのような物質のスクリーニングが行なえることが示された。例えば、所望 の被検物質を使用して同様の動物実験を行なって血清サンプルを調製し、同様の手 順で SELDI— TOF— MSを行なった場合に、質量 Z電荷比が約 8330のピークを 生じるタンパク質の濃度が正常値に維持されたとき、該被検物質は、糖尿病の改善 効果または将来の発症リスクの低減効果を有すると評価することができる。
[0297] 4.マーカー物質(c)の特定
画分 6において、陽イオン交換チップ CM10を用いた場合に、質量/電荷比が 85 32 (平均値)のイオンピークが検出された。図 9に、 21週齢時における本ピークのピ ーク強度を各群に分けてプロットした場合の箱髭図を示す。すなわち、本ピークは、 第 1群で低値を示し、第 2群で高値を示した。以上より、 SELDI— TOF— MSに供す ると質量 Z電荷比が約 8530のピークを生じるタンパク質 (マーカー物質 (c) )力 糖 尿病を発症しているラットまたは将来の発症リスクが高いラットに特異的な物質で、当 該疾病のマーカーとなり得ることがわかった。これにより、ヒトの血液中にもマーカー 物質 (c)が存在する場合に、血中におけるマーカー物質 (c)の濃度を指標として、糖 尿病の発症の有無または将来の発症リスクを判定することができることが示された。さ らに、被検物質を摂取させた動物の血中におけるマーカー物質 (c)の濃度を指標と して、被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果の評 価、および、そのような物質のスクリーニングが行なえることが示された。例えば、所望 の被検物質を使用して同様の動物実験を行なって血清サンプルを調製し、同様の手 順で SELDI— TOF— MSを行なった場合に、質量 Z電荷比が約 8530のピークを 生じるタンパク質の濃度が正常値に維持されたとき、該被検物質は、糖尿病の改善 効果または将来の発症リスクの低減効果を有すると評価することができる。
[0298] 5.マーカー物質(d)の特定
画分 1において、銅修飾チップ IMAC30を用いた場合に、質量/電荷比が 9062 ( 平均値)のイオンピークが検出された。図 10に、 21週齢時における本ピークのピーク 強度を各群に分けてプロットした場合の箱髭図を示す。すなわち、本ピークは、第 1 群で低値を示し、第 2群で高値を示した。以上より、 SELDI— TOF— MSに供すると 質量 Z電荷比が約 9060ピークを生じるタンパク質 (マーカー物質 (d) )が、糖尿病を 発症しているラットまたは将来の発症リスクが高いラットに特異的な物質で、当該疾病 のマーカーとなり得ることがわかった。これにより、ヒトの血液中にもマーカー物質(d) が存在する場合に、血中におけるマーカー物質 (d)の濃度を指標として、糖尿病の 発症の有無または将来の発症リスクを判定することができることが示された。さらに、 被検物質を摂取させた動物の血中におけるマーカー物質 (d)の濃度を指標として、 被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果の評価、 および、そのような物質のスクリーニングが行なえることが示された。例えば、所望の 被検物質を使用して同様の動物実験を行なって血清サンプルを調製し、同様の手 順で SELDI— TOF— MSを行なった場合に、質量 Z電荷比が約 9060のピークを 生じるタンパク質の濃度が正常値に維持されたとき、該被検物質は、糖尿病の改善 効果または将来の発症リスクの低減効果を有すると評価することができる。
[0299] 6.マーカー物質(e)の特定
画分 6において、陽イオン交換チップ CM10を用いた場合に、質量 Z電荷比が 92 55 (平均値)のイオンピークが検出された。図 11に、 21週齢時における本ピークのピ ーク強度を各群に分けてプロットした場合の箱髭図を示す。すなわち、本ピークは、 第 1群で低値を示し、第 2群で高値を示した。以上より、 SELDI— TOF— MSに供す ると質量 Z電荷比が約 9260のピークを生じるタンパク質 (マーカー物質 (e) )力 糖 尿病を発症しているラットまたは将来の発症リスクが高レ、ラットに特異的な物質で、当 該疾病のマーカーとなり得ることがわかった。これにより、ヒトの血液中にもマーカー 物質 (e)が存在する場合に、血中におけるマーカー物質 (e)の濃度を指標として、糖 尿病の発症の有無または将来の発症リスクを判定することができることが示された。さ らに、被検物質を摂取させた動物の血中におけるマーカー物質 (e)の濃度を指標と して、被検物質が有す 糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果の評 価、および、そのような物質のスクリーニングが行なえることが示された。例えば、所望 の被検物質を使用して同様の動物実験を行なって血清サンプルを調製し、同様の手 順で SELDI— TOF— MSを行なった場合に、質量 電荷比が約 9260のピークを 生じるタンパク質の濃度が正常値に維持されたとき、該被検物質は、糖尿病の改善 効果または将来の発症リスクの低減効果を有すると評価することができる。
[0300] 7.マーカー物質 (f)の特定
画分 6において、陽イオン交換チップ CM10を用いた場合に、質量/電荷比が 94 45 (平均値)のイオンピークが検出された。図 12に、 21週齢時における本ピークのピ
訂正された用紙 (規則91) ーク強度を各群に分けてプロットした場合の箱髭図を示す。すなわち、本ピークは、 第 1群で低値を示し、第 2群で高値を示した。 2以上より、 SELDI— TOF— MSに供 すると質量/電荷比が約 9450のピークを生じるタンパク質 (マーカー物質 (f) )が、 糖尿病を発症しているラットまたは将来の発症リスクが高いラットに特異的な物質で、 当該疾病のマーカーとなり得ることがわかった。これにより、ヒトの血液中にもマーカ 一物質 (f)が存在する場合に、血中におけるマーカー物質 (f)の濃度を指標として、 糖尿病の発症の有無または将来の発症リスクを判定することができることが示された 。さらに、被検物質を摂取させた動物の血中におけるマーカー物質 (f)の濃度を指標 として、被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果の 評価、および、そのような物質のスクリーニングが行なえることが示された。例えば、所 望の被検物質を使用して同様の動物実験を行なって血清サンプルを調製し、同様の 手順で SELDI—TOF— MSを行なった場合に、質量 Z電荷比が約 9450のピーク を生じるタンパク質の濃度が正常値に維持されたとき、該被検物質は、糖尿病の改 善効果または将来の発症リスクの低減効果を有すると評価することができる。
8.マーカー物質 (g)の特定
画分 4において、銅修飾チップ IMAC30を用いた場合に、質量/電荷比が 13720 (平均値)のイオンピークが検出された。図 13に、 21週齢時における本ピークのピー ク強度を各群に分けてプロットした場合の箱髭図を示す。すなわち、本ピークは、第 1 群で低値を示し、第 2群で高値を示した。 2以上より、 SELDI—TOF— MSに供する と質量 Z電荷比が約 13700ピークを生じるタンパク質 (マーカー物質 (g) )が、糖尿 病を発症しているラットまたは将来の発症リスクが高いラットに特異的な物質で、当該 疾病のマーカーとなり得ることがわかった。これにより、ヒトの血液中にもマーカー物 質 (g)が存在する場合に、血中におけるマーカー物質 (g)の濃度を指標として、糖尿 病の発症の有無または将来の発症リスクを判定することができることが示された。さら に、被検物質を摂取させた動物の血中におけるマーカー物質 (g)の濃度を指標とし て、被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果の評 価、および、そのような物質のスクリーニングが行なえることが示された。例えば、所望 の被検物質を使用して同様の動物実験を行なって血清サンプルを調製し、同様の手 順で SELDI—TOF— MSを行なった場合に、質量 Z電荷比が約 13700のピークを 生じるタンパク質の濃度が正常値に維持されたとき、該被検物質は、糖尿病の改善 効果または将来の発症リスクの低減効果を有すると評価することができる。
[0302] 9.マーカー物質(h)の特定
画分 3において、陽イオン交換チップ CM10を用いた場合に、質量/電荷比が 76 404 (平均値)のイオンピークが検出された。図 14に、 21週齢時における本ピークの ピーク強度を各群に分けてプロットした場合の箱髭図を示す。すなわち、本ピークは 、第 1群で低値を示し、第 2群で高値を示した。 2以上より、 SELDI—TOF— MSに 供すると質量 Z電荷比が約 76400のピークを生じるタンパク質 (マーカー物質 (h) ) 力 糖尿病を発症しているラットまたは将来の発症リスクが高いラットに特異的な物質 で、当該疾病のマーカーとなり得ることがわ力つた。これにより、ヒトの血液中にもマー カー物質 (h)が存在する場合に、血中におけるマーカー物質 (h)の濃度を指標とし て、糖尿病の発症の有無または将来の発症リスクを判定することができることが示さ れた。さらに、被検物質を摂取させた動物の血中におけるマーカー物質 (h)の濃度 を指標として、被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減 効果の評価、および、そのような物質のスクリーニングが行なえることが示された。例 えば、所望の被検物質を使用して同様の動物実験を行なって血清サンプルを調製し 、同様の手順で SELDI— TOF— MSを行なった場合に、質量 Z電荷比が約 76400 のピークを生じるタンパク質の濃度が正常値に維持されたとき、該被検物質は、糖尿 病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を有すると評価することができる。
[0303] 10.マーカー物質(i)の特定
画分 4において、陽イオン交換チップ CM10を用いた場合に、質量/電荷比が 79 085 (平均値)のイオンピークが検出された。図 15に、 21週齢時における本ピークの ピーク強度を各群に分けてプロットした場合の箱髭図を示す。すなわち、本ピークは 、第 1群で低値を示し、第 2群で高値を示した。以上より、 SELDI—TOF— MSに供 すると質量 Z電荷比が約 79100のピークを生じるタンパク質 (マーカー物質 (i) )が、 糖尿病を発症しているラットまたは将来の発症リスクが高いラットに特異的な物質で、 当該疾病のマーカーとなり得ることがわかった。これにより、ヒトの血液中にもマーカ 一物質 (i)が存在する場合に、血中におけるマーカー物質 (i)の濃度を指標として、 糖尿病の発症の有無または将来の発症リスクを判定することができることが示された 。さらに、被検物質を摂取させた動物の血中におけるマーカー物質 (i)の濃度を指標 として、被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果の 評価、および、そのような物質のスクリーニングが行なえることが示された。例えば、所 望の被検物質を使用して同様の動物実験を行なって血清サンプルを調製し、同様の 手順で SELDI—TOF— MSを行なった場合に、質量 Z電荷比が約 79100のピーク を生じるタンパク質の濃度が正常値に維持されたとき、該被検物質は、糖尿病の改 善効果または将来の発症リスクの低減効果を有すると評価することができる。
[0304] 11.マーカー物質 (j)の特定
画分 6において、陽イオン交換チップ CM10を用いた場合に、質量/電荷比が 34 97 (平均値)のイオンピークが検出された。図 16に、 21週齢時における本ピークのピ ーク強度を各群に分けてプロットした場合の箱髭図を示す。すなわち、本ピークは、 第 1群で高値を示し、第 2群で低値を示した。 2以上より、 SELDI—TOF— MSに供 すると質量/電荷比が約 3500のピークを生じるタンパク質 (マーカー物質 (j) )が、 糖尿病を発症しているラットまたは将来の発症リスクが高いラットに特異的な物質で、 当該疾病のマーカーとなり得ることがわかった。これにより、ヒトの血液中にもマーカ 一物質 G)が存在する場合に、血中におけるマーカー物質 (j)の濃度を指標として、 糖尿病の発症の有無または将来の発症リスクを判定することができることが示された 。さらに、被検物質を摂取させた動物の血中におけるマーカー物質 (i)の濃度を指標 として、被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果の 評価、および、そのような物質のスクリーニングが行なえることが示された。例えば、所 望の被検物質を使用して同様の動物実験を行なって血清サンプルを調製し、同様の 手順で SELDI—TOF— MSを行なった場合に、質量 Z電荷比が約 3500のピーク を生じるタンパク質の濃度が正常値に維持されたとき、該被検物質は、糖尿病の改 善効果または将来の発症リスクの低減効果を有すると評価することができる。
[0305] 12.マーカー物質(k)の特定
画分 1において、銅修飾チップ IMAC30を用いた場合に、質量/電荷比が 3559 ( 平均値)のイオンピークが検出された。図 17に、 21週齢時における本ピークのピーク 強度を各群に分けてプロットした場合の箱髭図を示す。すなわち、本ピークは、第 1 群で高値を示し、第 2群で低値を示した。以上より、 SELDI— TOF— MSに供すると 質量 Z電荷比が約 3560のピークを生じるタンパク質 (マーカー物質 (k) )が、糖尿病 を発症しているラットまたは将来の発症リスクが高いラットに特異的な物質で、当該疾 病のマーカーとなり得ることがわかった。これにより、ヒトの血液中にもマーカー物質( k)が存在する場合に、血中におけるマーカー物質 (k)の濃度を指標として、糖尿病 の発症の有無または将来の発症リスクを判定することができることが示された。さらに 、被検物質を摂取させた動物の血中におけるマーカー物質 (k)の濃度を指標として 、被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果の評価、 および、そのような物質のスクリーニングが行なえることが示された。例えば、所望の 被検物質を使用して同様の動物実験を行なって血清サンプルを調製し、同様の手 順で SELDI— TOF— MSを行なった場合に、質量 Z電荷比が約 3560のピークを 生じるタンパク質の濃度が正常値に維持されたとき、該被検物質は、糖尿病の改善 効果または将来の発症リスクの低減効果を有すると評価することができる。
13.マーカー物質(1)の特定
画分 4において、銅修飾チップ IMAC30を用いた場合に、質量 Z電荷比が 4184 ( 平均値)のイオンピークが検出された。図 18に、 21週齢時における本ピークのピーク 強度を各群に分けてプロットした場合の箱髭図を示す。すなわち、本ピークは、第 1 群で高値を示し、第 2群で低値を示した。以上より、 SELDI— TOF— MSに供すると 質量 Z電荷比が約 4180のピークを生じるタンパク質 (マーカー物質 (1) )が、糖尿病 を発症しているラットまたは将来の発症リスクが高いラットに特異的な物質で、当該疾 病のマーカーとなり得ることがわかった。これにより、ヒトの血液中にもマーカー物質 (1 )が存在する場合に、血中におけるマーカー物質 (1)の濃度を指標として、糖尿病の 発症の有無または将来の発症リスクを判定することができることが示された。さらに、 被検物質を摂取させた動物の血中におけるマーカー物質 (1)の濃度を指標として、 被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果の評価、 および、そのような物質のスクリーニングが行なえることが示された。例えば、所望の 被検物質を使用して同様の動物実験を行なって血清サンプルを調製し、同様の手 順で SELDI— TOF— MSを行なった場合に、質量 電荷比が約 4180のピークを 生じるタンパク質の濃度が正常値に維持されたとき、該被検物質は、糖尿病の改善 効果または将来の発症リスクの低減効果を有すると評価することができる。
[0307] 14·マーカー物質 (m)の特定
画分 5において、陽イオン交換チップ CM10を用いた場合に、質量/電荷比が 12 786 (平均値)のイオンピークが検出された。図 19に、 21週齢時における本ピークの ピーク強度を各群に分けてプロットした場合の箱髭図を示す。すなわち、本ピークは 、第 1群で高値を示し、第 2群で低値を示した。以上より、 SELDI— TOF— MSに供 すると質量 Z電荷比が約 12800のピークを生じるタンパク質 (マーカー物質 (m) )が 、糖尿病を発症しているラットまたは将来の発症リスクが高いラットに特異的な物質で 、当該疾病のマーカーとなり得ることがわかった。これにより、ヒトの血液中にもマーカ 一物質 (m)が存在する場合に、血中におけるマーカー物質 (m)の濃度を指標として 、糖尿病の発症の有無または将来の発症リスクを判定することができることが示され た。さらに、被検物質を摂取させた動物の血中におけるマーカー物質 (m)の濃度を 指標として、被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効 果の評価、および、そのような物質のスクリーニングが行なえることが示された。例え ば、所望の被検物質を使用して同様の動物実験を行なって血清サンプルを調製し、 同様の手順で SELDI— TOF— MSを行なった場合に、質量/電荷比が約 12800 のピークを生じるタンパク質の濃度が正常値に維持されたとき、該被検物質は、糖尿 病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を有すると評価することができる。
[0308] 15.マーカー物質 (n)の特定
画分 4において、陽イオン交換チップ CM10を用いた場合に、質量 Z電荷比が 65 700 (平均値)のイオンピークが検出された。図 20に、 21週齢時における本ピークの ピーク強度を各群に分けてプロットした場合の箱髭図を示す。すなわち、本ピークは 、第 1群で高値を示し、第 2群で低値を示した。以上より、 SELDI— TOF— MSに供 すると質量/電荷比が約 65700のピークを生じるタンパク質 (マーカー物質 (n) )力 糖尿病を発症してレヽるラットまたは将来の発症リスクが高レヽラットに特異的な物質で、
訂正された用紙 (規則 91) 当該疾病のマーカーとなり得ることがわかった。これにより、ヒトの血液中にもマーカ 一物質 (n)が存在する場合に、血中におけるマーカー物質 (n)の濃度を指標として、 糖尿病の発症の有無または将来の発症リスクを判定することができることが示された 。さらに、被検物質を摂取させた動物の血中におけるマーカー物質 (n)の濃度を指 標として、被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果 の評価、および、そのような物質のスクリーニングが行なえることが示された。例えば、 所望の被検物質を使用して同様の動物実験を行なって血清サンプルを調製し、同 様の手順で SELDI TOF MSを行なつた場合に、質量 Z電荷比力約 65700の ピークを生じるタンパク質の濃度が正常値に維持されたとき、該被検物質は、糖尿病 の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を有すると評価することができる。 実施例 7
[0309] 上記実施例において、分子量から、 S システィ-ルトランスサイレチンであると予 測されたマーカー物質について以下に同定するスキームを記載する。
[0310] 糖尿病患者および、対照である健常人の血清由来 S-cysteinylatedTTRの精製同定 スキームを記す。
[0311] (A.イオン交椽による精製法)
糖尿病患者および、健常人の血清 500 Lを 50mM Tris—HCl (pH7. 0)にて 5倍希釈を行い、 20kG, 4°C, lOmin遠心分離処理後、強陰イオン交換カラムであ る Amersham HiTrapQ HP lmLを用いて分画を行った。はじめに 50mM Tri s-HCl (pH7. 0)にて 5CV洗浄を行い、次いで、 50mM Tris—HCl (pH7. 0 ) , 160mM NaClにて 5CV洗浄を行った。溶出は 50mM Na -Acetate (pH4. 0)を用いて 2CV行った。溶出サンプルは 5倍量のアセトンにてアセトン沈殿を行い、 得られた沈殿物を 62. 5mM Tris—HCl (pH6. 8) , 1% SDS, 20%グリセロー ル, 0. 005% BPB混合溶液 200 Lに溶解し SDS— PAGE用のサンプルとした。
[0312] (B. SDS— PAGEによる精製法)
A.の要領で作成した上記サンプルを 20 L使用し、 DRC Perfect NT Gelポ リペプチド分析用を用い、定電圧 (100V, 2. 5hr)にて分画を行った。泳動バッフ ァ一は lOOmM Tris, lOOmM Tricine, 0. 1% SDSを用いた。泳動終了後、 1 0% AcOH in 40% MeOHにて固定化を行い、超純水にて洗浄後、 CBBにて 染色を行った。
[0313] (C.ウェスタンブロッテイングによる同定法)
B.の要領で SDS— PAGEを行った後、 CBBで染色を行わず、下記の要領で PV DF膜にブロッテイングを行い、 BIO— RAD Amplified Alkaline Phosphatase
Goat Anti- Rabbit Immun— Blot Assay Kitにより検出を行った。
[0314] (1)試薬の調製
'陽極バッファー
60mM Tris, 40mM CAPS, 0.1% SDS, pH9.6
'陰極バッファー
60mM Tris, 40mM CAPS, 15% MeOH, pH9.6
•Tris - buffer saline(TBS)
20mM Tris-HCl, 500mM NaCl, pH7.5
•Wash Solution (TTBS)
20mM Tris-HCl, 500mM NaCl, 0.05% Tween— 20, pH 7.5
• Blocking Buffer
5% non-fat dry milk in TBS
•1次抗体溶液
抗 human Transthyretin抗体 (rabbit IgG 200 g/mL)を TTBSで 1000倍希釈(終濃度 0.2 μ g/mL)
•2次抗体溶液
Biotinylated Goat Anti Rabbit IgG(H+L)を TTBSで 3000倍希釈
'ストレプトアビジン—ピオチン化アルカリホスファターゼ複合体
Streptavidin 10 Lを 30mLの TTBSに溶解し、更に biotinylated alkaline phosphatase 10 /z Lをカ卩え、 2時間、室温でインキュベートする。
•AP発色溶液
25x stockを超純水にて 25倍希釈し、 AP color development bufferを作成する。 AP c olor development buffer 20mLに对し 200 μ Lの AP color development reagent A, 200 μ Lの AP color development reagent Bを添カ卩し AP発色溶液とする。
(2)陽極板に陽極バッファーを湿潤させたろ紙を重ね、その上にメタノールを 5分間 湿潤させた PVDF膜(7 X 6cm)を重ね、更にゲルを乗せ、陰極バッファーを湿潤さ せたろ紙を重ね、陰極板を乗せ、定電流 105mAで 30分通電した。
(3)通電後、 PVDF膜は超純水に浸し、 5分振とうした。
(4) PVDF膜は風乾後、 Blocking Bufferにてブロッキングを行った。ブロッキング は室温、にて 1時間振とうの条件で行った。
(5)ブロッキング後、 TTBSに浸し室温にて 5分 X 3回、振とうを行い Blocking Buff erの洗浄を行った。
(6) 1次抗体溶液に浸し、室温で 2時間、振とうを行った。
(7) 1次抗体反応後、 TTBSに浸し室温にて 5分 X 3回、振とうし洗浄を行った。
(8) 2次抗体溶液に浸し、室温で 2時間、振とうを行った。
(9) (8)の作業中、ストレプトアビジン一ピオチン化アルカリホスファターゼ複合体を 作製した。
( 10) 2次抗体反応後、 TTBSに浸し室温にて 5分 X 3回、振とうし洗浄を行った。
( 11)ストレプトアビジン一ピオチンィ匕アルカリホスファターゼ複合体溶液に浸し、室温 で 2時間、振とうを行った。
( 12)ストレプトアビジン ピオチン化アルカリホスファターゼ複合体反応後、 TTBS に浸し室温にて 5分 X 3回、振とうし洗浄を行った。
( 13) AP発色溶液に浸し、ヒト TTRであることを確認した。
[0315] (D.ゲルからの柚出および MALDI— TOF— MS分析)
ゲルからの抽出は、メタノールと lOOmM 重炭酸アンモ-ゥムの等量混合溶液を 用いて脱色を行 、、超純水: lOOmM 重炭酸アンモ-ゥム: MeCN= 2: 5: 3の比で 混合した混合溶液 (15 L)を用いて行った。
[0316] 得られた抽出液 2 μ Lを金属プレートに乗せ、マトリックスには飽和 CHCA 0. 4 μ Lを用いて Applied Bio systems 4700 Proteomics Analyzerにて測定を行つ た。
[0317] (結果) 結果を図 21〜図 24に示す。
[0318] (ウェスタンブロッテイングによる TTRモノマーの確認)
上記方法にて、 13. 8K付近のタンパク質力TTR抗体を用いて、 TTRモノマーであ ることを確認した。各誘導体は、モノマー分画に含まれたことも見出した。
[0319] 上記モノマー分画の MSスペクトルは以下の通りである。
[0320] 理論値: S- cysteinylated TTR M/Z=13880.53
還元後 TTR M/Z=13761.41
図 21には、健常人由来 S- cysteinylated TTRを示す。測定値: M/Z= 13874.7480。
[0321] 図 22には、還元処理後の健常人由来 S-cysteinylated TTRを示す。測定値: M/Z= 13759.7393。
[0322] 図 23には、糖尿病患者由来 S- cysteinylated TTRを示す。測定値: M/Z= 13871.33 20。
[0323] 図 24には、還元処理後の糖尿病患者由来 S-cysteinylated TTRを示す。測定値: M /Z= 13755.64940
[0324] 図 25には、 TTRの 4量体構造とモノマーのアミノ酸配列を示す。このように、トランス サイレチンは、通常 4量体構造をとつており、これが崩れていくと糖尿病になると仮定 される。
[0325] 図 26には、ヒト TTR a -ドメインの 3次元構造と 2次構造配列が示される。表 1に示さ れるタンパク質やペプチドにおける代表的な翻訳後修飾とその質量変化を用いて、 質量分析により、誘導体を分析することができる。
実施例 8
[0326] 上記実施例において、分子量から、アポリポタンパク質 cmであると予測されたマー カー物質にっ 、て以下に同定するスキームを記載する。
[0327] 以下に Rat Apolipoprotein CIIIの精製同定スキームを記載する。
[0328] (A.イオン交換による精製法)
Rat Serum 750 /z Lを 50mM Tris— HC1 (pH6. 0)にて 5倍希釈を行い、 M illipore Millex— HV (0. 45 m)フィルターユニットを用いてろ過したものをサン プルとした。得られたサンプルを強陰イオン交換カラムである Amersham HiTrapQ HP lmLを用いて分画を行った。はじめに 50mM Tris— HCl (pH6. 0)にて 5C V洗浄を行い、次いで 50mM Tris— HCl (pH6. 0) , 200mM NaClにて 12CV 洗浄を行い、その後 50mM Tris— HCl (pH6. 0)にて 5CV洗浄を行った。溶出は 50mM Na -Acetate (pH3. 0)を用いて 2CV行った。溶出サンプルは 10倍量 のアセトンにてアセトン沈殿を行い、得られた沈殿物を 62. 5mM Tris-HCl (pH 6. 8) , 1% SDS, 20%グリセロール, 0. 005% BPB混合溶液 100 Uこ溶解し SDS - PAGE用のサンプルとした。
[0329] (B. SDS— PAGEによる精製法)
A.の要領で作成した上記サンプルを 20 L使用し、 DRC Perfect NT Gelポ リペプチド分析用を用い、定電圧(100V, 2. 5hr)にて分画を行った。泳動ノッファ 一は lOOmM Tris, lOOmM Tricine, 0. 1% SDSを用いた。泳動終了後、 10 % AcOH in 40% MeOHにて固定化を行い、超純水にて洗浄後、 CBBにて染 色を行った。
[0330] (C.ゲルからの抽出および SELDI— TOF— MS分析)
ゲルからの抽出は、メタノールと lOOmM重炭酸アンモ-ゥムの等量混合溶液を用
V、て脱色を行!、、超純水: lOOmM 重炭酸アンモ-ゥム: MeCN = 2: 5: 3の比で混 合した混合溶液(15 L)を用いて行った。
[0331] 得られた抽出液 を CIPHERGEN H50 ProteinChipArrayに乗せ、 0.
1% TFA にて 2回洗净を行!/、、マトリックスに ίま 250/0 SPA 0. 5 Lを 2回 乗せて測定を行った。
[0332] (D.ゲル 消化による同定法)
SELDI— TOF— MSを用いて分子量を測定したサンプルについてゲル内消化を 行い、同定を行った。 (下記プロトコールを参照)
(1)反応溶液の調整
還元溶液の調整 <用事調整 >
•DTT (1. 5mg)を lOOmM 重炭酸アンモ-ゥム(lmL)に溶解する。
アルキル化溶液の調整 <用事調整 >
- Iodoacetamide ( 10mg)を lOOmM 重炭酸アンモ-ゥム(lmL)に溶解する。 トリプシン溶液の調整 <用事調整 >
·Trypsin (20 iu g)を50mM 酢酸(0. lmL)に溶解し、トリプシン保存液とする。トリ プシン保存液(25 L)に超純水(200 L) , lOOmM 重炭酸アンモ-ゥム(500 L) , MeCN OO /z L)を加え、トリプシン溶液とする。
(2)バンドを切り出し、 500 Lのチューブに入れる。
(3)メタノールと lOOmM 重炭酸アンモ-ゥムの等量混合溶液を 100 Lカ卩ぇ脱色 する。
(4)還元溶液を 100 L加え、 30分インキュベートする。
(5)アルキル化溶液を 100 L加え、 30分インキュベートする。
(6)トリプシン溶液を 15 Lカロえ、 37°Cでー晚インキュベートする。
(7) 1Z10倍量の 1% TFAをカ卩え、反応を停止する。
[0333] 消化サンプル 1 μ Lを金属プレートに乗せ、マトリックスには飽和 CHCA 0. 4 U L を用いて Applied Bio systems 4700 Proteomics Analyzerにて柳 J疋を行つ た。
[0334] (得られたデータにつ ヽて)
Mascot (http://www.matrixscience.com/search— form— select. ntml) (Dy ~~グへ1 ~~ス サーチを行い、ラットアポリポタンパク質 cmであると同定した。その結果を図 27およ び図 28に示す。
[0335] 図 27は、同定したバンドのゲル写真と、そのバンドの SELDI— TOFによる分析を 示す。
[0336] 図 28は、同定したバンドのゲル写真と、そのバンドの SELDI— TOFによる分析を 示す。
[0337] 同様のマーカーがヒトにおいて存在することを以下のようにして確認した。
[0338] 精製レジンの選択およびレジンへの至適吸着条件の検討を行った。
[0339] 使用 Protein Chips Q10及び CM 10
検討 pH pH 3.0, 3.5, 4.0, 4.5, 5.0, 5.5, 7.0
使用 Buffer
pH3.0 : 50mM Na— Citrate Buffer pH3.5〜5.5 : 50mM Na— Acetate Buffer
pH7.0 : 50mM HEPES Buffer
図 29には、ヒトァポリポタンパク質 CIII (0〜2)のスポットであると考えられる二次元 電気泳動上のスポットを示す。
[0340] 図 30には、各スポットの質量分析の結果を示す。
[0341] 図 31には、各スポットの SELDI— MSの結果を示す。
[0342] 図 32から図 34には、上記至適吸着条件検討の結果を示す。図 32には、 CM10の 検討結果を示し、図 33には、 Q10の検討結果を示す。図 34は、至適条件検討結果 を示す。これらの結果から、得られたスポットが、ヒトァポリポタンパク質 cm(o〜2)の スポットであることが明らかになる。
実施例 9
[0343] (S—システィ-ル化トランスサイレチンは糖ィ匕ヘモグロビン(Saccharic Hemoglo bin; HbAlc)値による重症度評価にお 、ても相関する)
上記のようにして同定した S—システィ-ル化トランスサイレチンが糖ィ匕へモグロビ ン (HbAlc)値による重症度評価にぉ 、ても相関性を示すことを本実施例にぉ 、て 示した。 HbAlcは、現在最も信頼性のある糖尿病マーカーとして用いられている。
[0344] まず、上記実施例に記載されるプロトコールを用いて、糖尿病患者における S—シ スティ-ル化トランスサイレチン(測定値: MZZ= 13, 863,理論値: MZZ= 138 80. 53)のイオン強度と HbAlc値の関係を確認した。
[0345] 測定条件および統計値
IMAC30:キレート金属(Cu)固定化チップ、
Fr4 :図 血清の発現解析プロトコール参照。
CHCA: MS測定マトリックス
測定値 : M/Z : 13, 863,
P- Value : 0. 0004, ROC area: 0. 86。
[0346] 結果を図 35に示す。図 35には、糖尿病患者における S—システィニル化トランスサ ィレチン(測定値: MZZ= 13, 863,理論値: MZZ= 13880. 53)のイオン強度 と HbAlc値の関係を示す。縦軸: SELDI—TOF—MSで測定したS— cysteinyl ated TTRのイオン強度;横軸: C :コントロール (健常者)、 P :糖尿病患者。
[0347] 次に、糖尿病患者における S—システィニル化トランスサイレチン (測定値: MZZ
= 13, 874,理論値: MZZ= 13880. 53)のイオン強度と HbAlc値の関係を測 し 7こ。
[0348] 測定条件および統計値
IMAC30:キレート金属(Cu)固定化チップ、
Fr4 :図 血清の発現解析プロトコール参照。
MS測定マトリックス: SPA— H
測定値 : M/Z : 13, 874,
P- Value : 0. 007, ROC area: 0. 82。
[0349] 図 36に、その結果を示す。図 36には、糖尿病患者における S—システィ-ル化トラ ンスサイレチン(測定値: M/Z= 13, 874,理論値: MZZ= 13880. 53)のィォ ン強度と HbAlc値の関係が示されており、縦軸: SELDI— TOF— MSで測定した S -cysteinylated TTRのイオン強度;横軸: C :コントロール (健常者)、 P :糖尿 病患者が記載されている。
[0350] 次に、糖尿病患者における S—システィニル化トランスサイレチン (測定値: MZZ
= 13, 884,理論値: MZZ= 13880. 53)のイオン強度と HbAlc値の関係を調 ベた。
[0351] 測定条件および統計値
CM10 (pH7):弱陽イオン交換チップ (洗浄条件)
Fr4:図 血清の発現解析プロトコール参照。
SPA— H :: MS測定マトリックス
測定値 : M/Z : 13884,
P- Value : 0. 0005, ROC area : 0. 90
その結果を図 37に示す。図 37には、糖尿病患者における S—システィ-ル化トラン スサイレチン(測定値: M/Z= 13, 884,理論値: MZZ= 13880. 53)のイオン 強度と HbAlc値の関係が示される。縦軸: SELDI— TOF— MSで測定した S— cy steinylated TTRのイオン強度;横軸: C :コントロール (健常者)、 P :糖尿病患者 [0352] 次に、糖尿病患者における MZZ : 13, 863の実測データを示す(図 38)。
[0353] このように、 S—システィ-ル化トランスサイレチンの挙動は、糖尿病の指標であるこ とが判明し、し力もその重症度に相関していることも明らかになった。
実施例 10
[0354] (アポリポタンパク質は良好な事前診断マーカーである。 )
本実施例において、上記実施例において、予防 (事前)マーカーと予測した 8.3Kは 、 Apo CIIと同定した。
[0355] (ラットァポリポタンパク質 C2の精製同定スキーム)
(A.イオン 橼による精製法)
ラッ卜血清 750 Lを 50mM Tris-HCl (pH6. 0)【こて 5倍希釈を行!ヽ、 Millip ore Millex— HV(0. 45 m)フィルターユニットを用いてろ過したものをサンプルと した。得られたサンプルを強陰イオン交換カラムである Amersham HiTrapQ HP lmLを用いて分画を行った。はじめに 50mM Tris-HCl (pH6. 0)にて 5CV 洗净を行 ヽ、次 ヽで 50mM Tris-HCl (pH6. 0) , 200mM NaCl【こて 12CV 洗浄を行い、その後 50mM Tris-HCl (pH6. 0)にて 5CV洗浄を行った。溶出 は 50mM Na- Acetate (pH3. 0)を用いて 2CV行った。溶出サンプルは 10倍 量のアセトンにてアセトン沈殿を行い、得られた沈殿物を 62. 5mM Tris-HCl (p H6. 8) , 1% SDS, 20%グリセロール, 0. 005% BPB混合溶液 100 Uこ溶解 し SDS - PAGE用のサンプルとした。
[0356] (B. SDS— PAGEによる精製法)
A.の要領で作成した上記サンプルを 20 L使用し、 DRC Perfect NT Gelポ リペプチド分析用を用い、定電圧 (100V, 2. 5hr)にて分画を行った。泳動バッフ ァ一は lOOmM Tris, lOOmM Tricine, 0. 1% SDSを用いた。泳動終了後、 1 0% AcOH in 40% MeOHにて固定化を行い、超純水にて洗浄後、 CBBにて 染色を行った
丄 C.ゲルからの ϋ^^ίび SELDI— TOF— MS^ffil
ゲルからの抽出は、メタノールと lOOmM 重炭酸アンモ-ゥムの等量混合溶液を 用いて脱色を行 、、超純水: lOOmM 重炭酸アンモ-ゥム: MeCN= 2: 5: 3の比で 混合した混合溶液(15 L)を用いて行った。
[0357] 得られた抽出液 を CIPHERGEN H50 ProteinChipArrayに乗せ、 0.
1% TFA にて 2回洗净を行!/、、マトリックス ίま 250/0 SPA 0. を 2回乗 せて測定を行った。
[0358] (D.ゲル 消化による同定法)
SELDI— TOF— MSを用いて分子量を測定したサンプルについてゲル内消化を 行い、同定を行った。 (下記プロトコールを参照)
(1)反応溶液の調整
還元溶液の調整 <用事調整 >
•DTT (1. 5mg)を lOOmM 重炭酸アンモ-ゥム(lmL)に溶解する。
アルキル化溶液の調整 <用事調整 >
- Iodoacetamide ( 10mg)を lOOmM 重炭酸アンモ-ゥム(lmL)に溶解する。 トリプシン溶液の調整 <用事調整 >
·Trypsin (20 iu g)を50mM 酢酸(0. lmL)に溶解し、トリプシン保存液とする。トリ プシン保存液(25 L)に超純水(200 L) , lOOmM 重炭酸アンモ-ゥム(500 L) , MeCN OO /z L)を加え、トリプシン溶液とする。
(2)バンドを切り出し、 500 Lのチューブに入れる。
(3)メタノールと lOOmM 重炭酸アンモ-ゥムの等量混合溶液を 100 Lカ卩ぇ脱色 する。
(4)還元溶液を 100 L加え、 30分インキュベートする。
(5)アルキル化溶液を 100 L加え、 30分インキュベートする。
(6)トリプシン溶液を 15 Lカロえ、 37°Cでー晚インキュベートする。
(7) 1Z10倍量の 1% TFAをカ卩え、反応を停止する。
[0359] 消化サンプル 1 μ Lを金属プレートに乗せ、マトリックスには飽和 CHCA 0. 4 U L を用いて Applied Bio systems 4700 Proteomics Analyzerにて柳 J疋を行つ た。
[0360] 得られたデータについて Mascot (http://www.matrixscience.com/ search— form— select.html)のデ1 ~~タべ1 ~~ス サーチを行い、 Rat Similer to Apolipoprotein C2であると同定した。
(E.ウェスタンブロッテイングによる同定法)
B.の要領で SDS— PAGEを行った後、 CBBで染色を行わず、下記の要領で PV DF膜にブロッテイングを行い、 BIO— RAD Amplified Alkaline Phosphatase
Goat Anti- Rabbit Immun—Blot Assay Kit, 170— 6412, Lot 30000 2087により検出を行った。
(1)試薬の調製
'陽極バッファー
60mM Tris, 40mM CAPS, 0. 1% SDS, pH9. 6
'陰極バッファー
60mM Tris, 40mM CAPS, 15% MeOH, pH9. 6
•Tris - buffer saline (TBS)
20mM Tris-HCl, 500mM NaCl, pH7. 5
•Wash Solution (TTBS)
20mM Tris-HCl, 500mM NaCl, 0. 05% Tween— 20, pH 7. 5
• Blocking Buffer
5% non-fat dry milk in TBS
•1次抗体溶液
Santa Cruz Biotechnology, anti Apo C2 (Q— 20) Goat polyclonal I gG, sc- 19014, Lot C1904を TTBSで 1000倍希釈(終濃度 0. 2 μ g/mL) •2次抗体溶液
Zymed Laboratories, Rabbit Anti— Goat IgG (H + L) Biotin—し onjugat e, 81 - 1640, Lot 50494328を TTBSで 3000倍希釈
'ストレプトアビジン—ピオチン化アルカリホスファターゼ複合体
Streptavidin 10 Lを 30mLの TTBSに溶解し、更に biotinylated alkaline p hosphatase 10 μ Lを加え、 2時間、室温でインキュベートする。
•AP発色溶液 25x stockを超純水にて 25倍希釈し、 AP color development bufferを作成 する。 AP color development buffer 20mLに対し 200 Lの AP color dev elopment reagent A, 200 μ Lの AP color development reagent Bを添 加し AP発色溶液とする。
(2)陽極板に陽極バッファーを湿潤させたろ紙を重ね、その上にメタノールを 5分間 湿潤させた PVDF膜(7 X 6cm)を重ね、更にゲルを乗せ、陰極バッファーを湿潤さ せたろ紙を重ね、陰極板を乗せ、定電流 105mAで 30分通電した。
(3)通電後、 PVDF膜は超純水に浸し、 5分振とうした。
(4) PVDF膜は風乾後、 Blocking Bufferにてブロッキングを行った。ブロッキング は室温、にて 1時間振とうの条件で行った。
(5)ブロッキング後、 TTBSに浸し室温にて 5分 X 3回、振とうを行い Blocking Buff erの洗浄を行った。
(6) 1次抗体溶液に浸し、室温で 2時間、振とうを行った。
(7) 1次抗体反応後、 TTBSに浸し室温にて 5分 X 3回、振とうし洗浄を行った。
(8) 2次抗体溶液に浸し、室温で 2時間、振とうを行った。
(9) (8)の作業中、ストレプトアビジン一ピオチン化アルカリホスファターゼ複合体を 作成した。
(10) 2次抗体反応後、 TTBSに浸し室温にて 5分 X 3回、振とうし洗浄を行った。
(11)ストレプトアビジン一ピオチンィ匕アルカリホスファターゼ複合体溶液に浸し、室温 で 2時間、振とうを行った。
( 12)ストレプトアビジン ピオチン化アルカリホスファターゼ複合体と反応後、 TTBS に浸し室温にて 5分 X 3回、振とうし洗浄を行った。
( 13) AP発色溶液に浸し確認した。
(F.抗体チップ(CIPHERGEN PS10/PS20 Protein Chip Arrav)を用いた同定法)
Cの要領により抽出したサンプルについて、抗体チップを用いて同定を行った。(下 記プロトコールを参照)
(1)試薬の調整
Blocking Buffer: 1M Tris—HCl pH 8. 0 + 140mM NaCl Wash Buffer 1 : 0. 1% TritonX— 100 / PBS
Wash Buffer 2 : 1% TritonX— 100 / PBS + 150mM NaCl
(2) 50% MeCN 200 Lを各スポットにアプライし、 1分室温で静置する(PS 10 のみ)。
(3) MeCNを除去し PBS 200 μ Lを各スポットにアプライし、 1分室温で静置する(Ρ S10のみ)。
(4) PBSを除去し 125 μ g/mL 100 μ Lの Protein A溶液を各スポットにアプライ し、 4°Cにてー晚静置する。
(5) Protein A溶液く SIGMA Aldrich, Protein A from Staphylococcus aureus, P7837- 5MG, Lot 074K10321 >を除去し、 Blocking Buffer 200 μ Lをアプライし、 30分室温で静置する。
(6) Blocking Bufferを除去し Wash Buffer 1 200 μ Lをアプライし、 5分室温 で静置する(2回)。
(7) Wash Buffer 1を除去し、抗体溶液 < Santa Cruz Biotechnology, anti Apo C2 (Q- 20) Goat polyclonal IgG, sc— 19014, Lot C1904>を PB Sにて終濃度 30 gZmLになるように希釈し、抗体溶液 100 Lをアプライし、 2時 間室温で振とうを行う。
(8)抗体溶液を除去し、 Wash Buffer 1 200 Lをアプライし、 5分室温で振とう を行う(2回)。
(9) Wash Buffer 1を除去し、 PBS 200 Lをアプライし、 5分室温で振とうを行う
(10) PBSを除去し、 10mM HEPES (pH 7. 5) 200 Lをアプライし、 30秒室 温で振とうを行う。
(11) HEPESを除去し、抗原溶液 20 /z Lをアプライし、 2時間室温で振とうを行う。
(12)抗原溶液を除去し、 Wash Buffer 2 200 Lをアプライし、 3分室温で振とう を行う(2回)。
(13) Wash Buffer 2を除去し、 PBS 200 Lをアプライし、 3分室温で振とうを行
5o (14) PBSを除去し、 10mM HEPES (pH 7. 4) 200 Lをアプライし、 30秒室 温で振とうを行う。
(15) HEPESを除去し、風乾後、 EAM (50% SPA 0. 5 L X 2回)をアプライ し、測定を行う。
[0363] また、その結果を図 39および図 40に示す。
[0364] 図 39には、糖尿病ラット血清 8.3K (Apo CII)箱髭図を示す。
[0365] 図 40には、上記の時系列データを示す。アポ CIIが良好な事前診断マーカーであ ることが明らかになった。
[0366] 図 41〜43には、得られた血清力 ラットのアポリポタンパク質 CIIであることを示す 結果が示されている。図 41は、ゲル上のバンドの SELDI— MSの結果を示す。図 42 には、得られたバンドのウェスタンブロットによる確認を示す。図 43には、クロマトダラ フィ一による分画において抗 ApoC2抗体により増強される様子を示す。
[0367] 図 44力 図 47は、ヒトにおけるアポリポタンパク質 CIIもまた事前診断マーカーであ ることを実証する。
実施例 11
[0368] (スクリーニング)
まず、本発明において見出されたマーカー物質に変動 (好ましくは、正常化)させる 可能性のある物質を、スクリーニングする。
[0369] 本実施例では、糖尿病を発症している動物または将来の発症リスクが高い動物に 被験物質を摂取させ、該動物の体液中における該マーカー物質の少なくとも 1つの 濃度を基準値と比較し、被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リス クの低減効果を評価する。
実施例 12
[0370] (ヒトでのスクリーニング)
実施例 11で動物モデルで糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果 が見られた物質について、実際にヒト被験体においても効果があるかを評価する。こ れは、通常の治験と同様の手続に則って行う。
[0371] このようなスクリーニングにより、動物において実際に糖尿病 以上のように、本発明の好ましい実施形態を用いて本発明を例示してきた力 本発 明は、特許請求の範囲によってのみその範囲が解釈されるべきであることが理解され る。本明細書において引用した特許、特許出願および文献は、その内容自体が具体 的に本明細書に記載されているのと同様にその内容が本明細書に対する参考として 援用されるべきであることが理解される。
産業上の利用可能性
本発明は、医薬品産業等において利用性を有する。特に、診断薬の製造において 産業上の利用可能性を有する。

Claims

請求の範囲
[I] 被験体由来のサンプル中のマーカー物質、該マーカー物質に特異的に相互作用 する因子、または該マーカー物質を選択的に認識する手段を含む、被験体が糖尿 病であるかどうか事前診断または診断するためのシステム。
[2] 前記マーカー物質が、前記被験体の体液中に存在する、請求項 1に記載のシステ ム。
[3] 前記マーカー物質が、前記被験体の血液中に存在する、請求項 1に記載のシステ ム。
[4] 前記マーカー物質が、遺伝子産物である、請求項 1に記載のシステム。
[5] 前記マーカー物質が、トランスサイレチン、トランスサイレチン誘導体、ァポリポタン ノ ク質 cn、アポリポタンパク質 cn誘導体、アポリポタンパク質 cm、ァポリポタンパク 質 CIII誘導体および血清アルブミンならびにこれらに対応するタンパク質からなる群 より選択される、 1またはそれより多い物質を含む、請求項 1に記載のシステム。
[6] 前記因子は、核酸分子、ポリペプチド、脂質、糖鎖、有機低分子およびそれらの複合 分子からなる群より選択される、請求項 1に記載のシステム。
[7] 前記因子は、タンパク質または前記複合分子である、請求項 1に記載のシステム。
[8] 前記因子は、抗体である、請求項 1に記載のシステム。
[9] 前記因子は、標識されるか、または標識可能である、請求項 1に記載のシステム。
[10] 前記手段は、質量分析装置、核磁気共鳴測定装置、 X線解析装置、 SPR、クロマト グラフィー、免疫学的手段、生化学的手段、電気泳動機器、化学的分析機器、蛍光 二次元ディファレンシャル電気泳動法、同位体標識法、タンデムァフィ-ティ精製法 、物理学的手段、レーザーマイクロダイセクションおよびこれらの組み合わせ力もなる 群より選択される、請求項 1に記載のシステム。
[II] さらに、前記マーカー物質の標準を含む、請求項 1に記載のシステム。
[12] さらに、前記サンプルを精製する手段を備える、請求項 1に記載のシステム。
[13] 前記被験体は、哺乳動物を含む、請求項 1に記載のシステム。
[14] 前記被験体は、齧歯類を含む、請求項 1に記載のシステム。
[15] 前記被験体は、ヒトを含む、請求項 1に記載のシステム。
[16] 前記因子または前記手段は、前記マーカー物質の定量をする能力を有する、請求 項 1に記載のシステム。
[17] 前記マーカー物質の定量を行うための定量手段をさらに備える、請求項 1に記載の システム。
[18] 前記定量手段は、標準曲線と測定結果とを比較して前記マーカー物質が正常値の 範囲内かどうかを判定する判定手段を含む、請求項 17に記載のシステム。
[19] 前記判定手段は、コンピュータである、請求項 18に記載のシステム。
[20] 前記システムは、前記マーカー物質または該マーカー物質に特異的に相互作用す る前記因子を含む組成物である、請求項 1に記載のシステム。
[21] 前記マーカー物質が、トランスサイレチンおよびトランスサイレチン誘導体力 なる 群より選択される少なくとも 1つの物質を含み、該トランスサイレチン誘導体は、 S—シ スティニルトランスサイレチン、 S—システィ-ルトランスサイレチン、グルタチオン化ト ランスサイレチン、 S— S結合形成トランスサイレチン、酸化トランスサイレチン、ホルミ ル化トランスサイレチン、ァセチル化トランスサイレチン、リン酸化トランスサイレチン、 糖鎖付カ卟ランスサイレチン、ミリスチル化トランスサイレチンおよびこれらの複合誘導 体力 なる群より選択される、請求項 1に記載のシステム。
[22] 前記トランスサイレチンの減少および前記トランスサイレチン誘導体の増力!]からなる 群より選択される少なくとも 1つの現象が、糖尿病を発症しているか、または将来の発 症リスクが高 ヽことの指標である、請求項 21に記載のシステム。
[23] 前記トランスサイレチンの減少および前記トランスサイレチン誘導体の増力!]からなる 群より選択される少なくとも 1つの現象が、糖尿病を発症の程度、または将来の発症リ スクが高さの指標である、請求項 21に記載のシステム。
[24] 前記トランスサイレチンは、配列番号 1もしくは配列番号 3に示される核酸配列によ つてコードされるカゝ、または配列番号 2もしくは配列番号 4に示されるアミノ酸配列を 有する、あるいは、これらの改変配列を有する、請求項 21に記載のシステム。
[25] 前記トランスサイレチン誘導体は、配列番号 1もしくは配列番号 3に示される核酸配 列によってコードされるアミノ酸配列、または配列番号 2もしくは配列番号 4に示される アミノ酸配列における、それぞれ、 10位のシスティンまたはそれに対応するシスティ ンのシスティンがシスティ二ルイ匕されて 、る誘導体である、請求項 21に記載のシステ ム。
[26] 前記因子または前記手段は、トランスサイレチンの単量体と四量体との区別をする 能力を有する、請求項 1に記載のシステム。
[27] 前記因子または前記手段は、トランスサイレチンと S—システィニルトランスサイレチ ンとの区別をする能力を有する、請求項 1に記載のシステム。
[28] 前記因子または前記手段は、トランスサイレチンと S—システィニルトランスサイレチ ンとの区別をする能力を有する抗体を含む、請求項 1に記載のシステム。
[29] 前記因子または前記手段は、トランスサイレチンと S—システィニルトランスサイレチ ンとを認識し、かつ、前記システムはトランスサイレチンと S—システィニルトランスサイ レチンとを識另 IJする手段をさらに備える、請求項 1に記載のシステム。
[30] 前記因子または前記手段は、トランスサイレチンと S—システィニルトランスサイレチ ンとを認識し、前記システムはトランスサイレチンの分子量と S—システィ-ルトランス サイレチンの分子量とを識別する手段、およびトランスサイレチンと S—システィニルト ランスサイレチンとの相対比を測定する手段をさらに備える、請求項 1に記載のシステ ム。
[31] 前記マーカー物質が、アポリポタンパク質 Cnまたはアポリポタンパク質 CII誘導体 を含み、該ァポリポタンパク質 CII誘導体は、プロ体である、請求項 1に記載のシステ ム。
[32] 前記アポリポタンパク質 CIIの減少および前記アポリポタンパク質 CII誘導体の変動 力もなる群より選択される少なくとも 1つの現象が、糖尿病を発症している力 または 将来の発症リスクが高いことの指標である、請求項 31に記載のシステム。
[33] 前記アポリポタンパク質 CIIの減少および前記アポリポタンパク質 CII誘導体の変動 力もなる群より選択される少なくとも 1つの現象が、糖尿病を発症の程度、または将来 の発症リスクが高さの指標である、請求項 31に記載のシステム。
[34] 前記アポリポタンパク質 CIIは、配列番号 5もしくは配列番号 7に示される核酸配列 によってコードされる力、または配列番号 6もしくは配列番号 8に示されるアミノ酸配列 、あるいは、これらの改変配列を有する、請求項 31に記載のシステム。
[35] 前記因子または前記手段は、アポリポタンパク質 CIIを選択的に識別する能力を有 する、請求項 31に記載のシステム。
[36] 前記因子または前記手段は、アポリポタンパク質 CIIを選択的に識別する能力を有 する抗体を含む、請求項 31に記載のシステム。
[37] 前記因子または前記手段は、アポリポタンパク質 CIIを選択的に識別する能力を有 し、かつ、前記システムは該ァポリポタンパク質 CIIを定量する手段を備える、請求項
31に記載のシステム。
[38] 前記マーカー物質が、アポリポタンパク質 CIIIまたはアポリポタンパク質 cm誘導体 を含み、該ァポリポタンパク質 cmはアポリポタンパク質 cniであり、該ァポリポタン
0
パク質 cm誘導体は、アポリポタンパク質 cmおよびアポリポタンパク質
1 cm力 な
2 る群より選択される、請求項 1に記載のシステム。
[39] 前記アポリポタンパク質 cmの増カロ、アポリポタンパク質 cniの増加およびアポリポ タンパク質 cniの増加からなる群より選択される少なくとも
2 1つの現象力 糖尿病を発 症している力、または将来の発症リスクが高いことの指標である、請求項 38に記載の システム。
[40] 前記アポリポタンパク質 cmの増カロ、アポリポタンパク質 cniの増加およびアポリポ タンパク質 CIIIの増加からなる群より選択される少なくとも 1つの現象力 糖尿病を発
2
症の程度、または将来の発症リスクが高さの指標である、請求項 38に記載のシステ ム。
[41] 前記アポリポタンパク質 cmは、配列番号 9もしくは配列番号 11に示される核酸配 列によってコードされる力、または配列番号 10もしくは配列番号 12に示されるァミノ 酸配列を有するか、あるいは、それら力も N末端の 20アミノ酸が欠如した形態力、あ るいは、これらの改変配列を有する、請求項 38に記載のシステム。
[42] 前記アポリポタンパク質 cm誘導体は、配列番号 9もしくは配列番号 11に示される 核酸配列によってコードされる力、または配列番号 10もしくは配列番号 12に示される アミノ酸配列において、それぞれ、配列番号 10もしくは 12のそれぞれ 94位もしくは 9 5位またはそれに対応するスレオニンに糖鎖を有する誘導体であるか、あるいは、そ れらカも N末端の 20アミノ酸が欠如した形態を有する、請求項 38に記載のシステム。
[43] 前記因子または前記手段は、アポリポタンパク質 cmとアポリポタンパク質 cm誘導 体とを区別する能力を有する、請求項 38に記載のシステム。
[44] 前記因子または前記手段は、アポリポタンパク質 cm、アポリポタンパク質 cmお
0 1 よびアポリポタンパク質 CIIIのうち少なくとも 2つを区別する能力を有する、請求項 3
2
8に記載のシステム。
[45] 前記因子または前記手段は、アポリポタンパク質 cmとアポリポタンパク質 cmと
0 1 アポリポタンパク質 cmとをすベて区別する能力を有する、請求項 38に記載のシス
2
テム。
[46] 前記因子または前記手段は、アポリポタンパク質 cmとアポリポタンパク質 cm誘導 体とを区別する能力を有する抗体を含む、請求項 38に記載のシステム。
[47] 前記因子または前記手段は、アポリポタンパク質 cm、アポリポタンパク質 cmお
0 1 よびアポリポタンパク質 CIIIのうち少なくとも 2つを区別する能力を有する抗体を含む
2
、請求項 38に記載のシステム。
[48] 前記因子または前記手段は、アポリポタンパク質 cmとアポリポタンパク質
0 cmと
1 アポリポタンパク質 cmとをすベて区別する能力を有する抗体の組み合わせを含む
2
、請求項 38に記載のシステム。
[49] 前記因子または前記手段は、アポリポタンパク質 cmとアポリポタンパク質 cm誘導 体とを認識し、前記システムは、アポリポタンパク質 cmとアポリポタンパク質 cm誘導 体とを識別する手段をさらに備える、請求項 38に記載のシステム。
[50] 前記因子または前記手段は、アポリポタンパク質 cmとアポリポタンパク質 cm誘導 体とを認識し、前記システムは、アポリポタンパク質 cm、アポリポタンパク質
0 cmお
1 よびアポリポタンパク質 CIIIのうち少なくとも 2つを識別する手段をさらに備える、請
2
求項 38に記載のシステム。
[51] 前記因子または前記手段は、アポリポタンパク質 cmとアポリポタンパク質 cm誘導 体とを認識し、前記システムは、アポリポタンパク質 cmとアポリポタンパク質
0 cmと
1 アポリポタンパク質 cmとをすベて識別する手段をさらに備える、請求項
2 38に記載 のシステム。
[52] 前記マーカー物質が、血清アルブミンまたは血清アルブミン誘導体を含む、請求項 1に記載のシステム。
[53] 前記血清アルブミンの減少および前記血清アルブミン誘導体の変動からなる群より 選択される少なくとも 1つの現象が、糖尿病を発症している力、または将来の発症リス クが高いことの指標である、請求項 52に記載のシステム。
[54] 前記血清アルブミンの減少および前記血清アルブミン誘導体の変動からなる群より 選択される少なくとも 1つの現象が、糖尿病を発症の程度、または将来の発症リスクが 高さの指標である、請求項 52に記載のシステム。
[55] 前記血清アルブミンは、配列番号 13もしくは配列番号 15に示される核酸配列によ つてコードされる力、または配列番号 14もしくは配列番号 16に示されるアミノ酸配列
、あるいは、これらの改変配列を有する、請求項 52に記載のシステム。
[56] 前記因子または前記手段は、血清アルブミンを選択的に識別する能力を有する、 請求項 52に記載のシステム。
[57] 前記因子または前記手段は、血清アルブミンを選択的に識別する能力を有する抗 体を含む、請求項 52に記載のシステム。
[58] 前記因子または前記手段は、血清アルブミンを選択的に識別する能力を有し、か つ、前記システムは該血清アルブミンを定量する手段を備える、請求項 31に記載の システム。
[59] 診断薬である、請求項 1に記載のシステム。
[60] 被験体が糖尿病であるかどうか事前診断もしくは診断するため、または該事前診断も しくは診断を支援するための方法であって、
A)該被験体由来のサンプル中のマーカー物質を測定する工程;および
B)該測定結果から、該被験体が糖尿病またはその可能性があるかどうかを決定す る工程、
を包含する、方法。
[61] 請求項 2〜59のいずれか 1項に記載の特徴を有する、請求項 60に記載の方法。
[62] 被験体由来のサンプル中のマーカー物質、該マーカー物質に特異的に相互作用 する因子、または該マーカー物質を選択的に認識する手段の、被験体が糖尿病であ るかどうか事前診断または診断するための医薬の製造における、使用。
[63] 請求項 2〜59のいずれか 1項に記載の特徴を有する、請求項 62に記載の使用。
[64] 被験体由来のサンプル中のマーカー物質、該マーカー物質に特異的に相互作用 する因子、または該マーカー物質を選択的に認識する手段の、被験体が糖尿病であ るかどうか事前診断または診断するための使用。
[65] 請求項 2〜59のいずれか 1項に記載の特徴を有する、請求項 64に記載の使用。
[66] 請求項 60に記載の方法であって、血液中のマーカー物質の濃度を測定し、その値 を健常値と比較し、前記マーカー物質がトランスサイレチン、アポリポタンパク質 CIII
、血清アルブミンの群力も選択される 1または 2以上のタンパク質であることを特徴と する、方法。
[67] 前記アポリポタンパク質 cmは、アポリポタンパク質 CIII、アポリポタンパク質 CIII、
0 1 アポリポタンパク質 CIIIの群力も選択される 1または 2以上のタンパク質であることを
2
特徴とする請求項 66に記載の糖尿病の診断方法。
[68] 下記工程(1)〜(4):
(1)被検者の血液から血清または血漿を調製する工程;
( 2)工程( 1 )で得られた血清または血漿中のトランスサイレチンの濃度値を健常値と 比較して、糖尿病を検出する工程;
(3)工程(2)で糖尿病が検出されな力つた場合は、さらに、血清または血漿中のアポ リポタンパク質 cmの濃度値を健常値と比較して、糖尿病を検出する工程;および
2
(4)工程(3)で糖尿病が検出されな力つた場合は、さらに、血清または血漿中のアポ リポタンパク質 cmの濃度値を健常値と比較して、糖尿病を検出する工程、
1
を含む、請求項 67に記載の方法。
[69] 下記工程 (5)〜 (8) :
(5)被検者の血液から血清または血漿を調製する工程、
(6)工程 (5)で得られた血清または血漿中の血清アルブミンの濃度値を健常値と比 較して、糖尿病を検出する工程、
(7)工程 (6)で糖尿病が検出された場合は、さらに、血清または血漿中のアポリポタ ンパク質 CIIIの濃度値を健常値と比較して、糖尿病を検出する工程、
2
(8)工程(7)で糖尿病が検出されな力つた場合は、さらに、血清または血漿中のアポ リポタンパク質 CII^の濃度値を健常値と比較して、糖尿病を検出する工程; を含む、請求項 67に記載の診断方法。
[70] 前記工程 (4)で糖尿病が検出された場合は、さらに、血清または血漿中のアポリポ タンパク質 CIIIの濃度値を健常値と比較して、糖尿病を検出することを特徴とする請
0
求項 68に記載の方法。
[71] 前記工程 (8)で糖尿病が検出された場合は、さらに、血清または血漿中のアポリポ タンパク質 CIIIの濃度値を健常値と比較して、糖尿病を検出することを特徴とする請
0
求項 69に記載の方法。
[72] 請求項 60に記載の方法であって、血液中のマーカー物質の濃度を測定し、その値 を健常値と比較し、前記マーカー物質が下記 (a)〜 (e):
(a) 7. 0以下の pHで陽イオン交換体に捕捉される、分子量が約 13800であるタンパ ク質;
(b) 7. 0以下の pHで金属イオン固定ィ匕担体に捕捉される、分子量が約 8700である タンパク質;
(c) 7. 0以下の pHで陽イオン交換体に捕捉される、分子量が約 9400であるタンパク 質または、 pH7. 0で金属イオン固定ィ匕担体に捕捉される、分子量が約 9400である タンパク質;
(d) 7. 0以下の pHで陽イオン交換体に捕捉される、分子量が約 9700であるタンパク 質、または、 H7. 0で金属イオン固定化担体に捕捉される、分子量が約 9700であ るタンパク質;および
(e) 7. 0以下の pHで陽イオン交換体に捕捉される、分子量が約 66000であるタンパ ク質、または、 pH7. 0で金属イオン固定化担体に捕捉される、分子量が約 66000で るタンノク質、
の群力 選択される 1または 2以上のタンパク質であることを特徴とする、方法。
[73] 請求項 60に記載の方法であって、血液中のマーカー物質の濃度を測定し、その値 を健常値と比較し、前記マーカー物質が下記:
(a)トリプシンで消化すると、分子量が約 1270、約 1370、約 1390、約 1520、約 245 0、約 2640、および約 3140のポリペプチドを生じる、分子量約 13800のタンパク質;
訂正された用紙 (規則 91) および Zまたは
(b)卜リプシンで消ィ匕すると、分子量力 S約 900、約 1200、約 1390、約 1710、約 194 0、および約 2080のポジペプチドを生じる、分子量約 8700〜9700のタンパク質、 のタンパク質であることを特徴とする、方法。
[74] 前記マーカー物質に対する親和性を有する物質を固定ィヒした担体に血清または 血漿を接触させて、マーカー物質を捕捉し、前記マーカー物質の濃度を測定するこ とを特徴とする請求項 66乃至 73のいずれかに記載の方法。
[75] 前記マーカー物質に対する親和性を有する物質は、前記マーカー物質に特異的 な抗体であることを特徴とする請求項 74に記載の方法。
[76] 前記マーカー物質に対する親和性を有する物質は、イオン交換基を有するもので あることを特徴とする請求項 74に記載の糖尿病の診断方法。
[77] 前記担体は平面部分を有し、前記マーカー物質に対する親和性を有する物質は 該平面部分の一部に固定ィ匕されていることを特徴とする請求項 74〜76のいずれか に記載の方法。
[78] 前記抗体は、担体に固定化されて 、ることを特徴とする請求項 1に記載のシステム
[79] 請求項 60に記載の方法であって、前記被験体の体液中における下記マーカー物 質 (aト (n) :
(a) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 7040のイオンピークを生じるタンパク質、
(b) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量/電荷比 が約 8330のイオンピークを生じるタンパク質、
(c) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 8530のイオンピークを生じるタンパク質。
(d) pH7. 0かつ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 9060のイオンピークを生じるタンパク質、
(e) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 9260のイオンピークを生じるタンパク質、 (f) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量/電荷比 が約 9450のイオンピークを生じるタンパク質、
(g) pH7. 0力つ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 13700のイオンピークを生じるタンパク質、
(h) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 76400のイオンピークを生じるタンパク質、
(i) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量/電荷比が 約 79100のイオンピークを生じるタンパク質、
(j) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量/電荷比が 約 3500のイオンピークを生じるタンパク質、
(k) pH7. 0力つ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 3560のイオンピークを生じるタンパク質、 (1) ρΗ7. 0かつ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 4180のイオンピークを生じるタンパク質、 (m) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 12800のイオンピークを生じるタンパク質;
(n) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 65700のイオンピークを生じるタンパク質;および
(a)〜 (n)のタンパク質に対応するタンパク質または改変体
力 なる群より選択される少なくとも 1つタンパク質の濃度を健常値と比較し、糖尿病 の発症の有無または将来の糖尿病の発症リスクを判定することを特徴とする、方法。
[80] 前記体液は、血液であることを特徴とする請求項 79に記載の方法。
[81] 前記体液または体液成分を、前記マーカー物質に対する親和性を有する物質を固 定ィ匕した担体に接触させて、体液中の前記マーカー物質を担体上に捕捉し、捕捉 された前記マーカー物質の量に基づいて体液中の前記マーカー物質の濃度を算出 することを特徴とする請求項 79または 80に記載の疾病の診断方法。
[82] 前記担体は平面部分を有し、前記マーカー物質に対する親和性を有する物質は、 該平面部分の一部に固定ィ匕されていることを特徴とする請求項 81に記載の方法。
[83] 前記マーカー物質に対する親和性を有する物質は、イオン交換体、金属キレート 体または抗体であることを特徴とする請求項 81または 82に記載の方法。
[84] 被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を評価す ることを特徴とする物質の評価方法であって、
a)糖尿病を発症して!/、る動物または将来の発症リスクが高 、動物に被験物質を摂 取させる工程;および
b)該動物の体液中における該マーカー物質の少なくとも 1つの濃度を基準値と比 較し、被検物質が有する糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を評 価する工程、
を包含する、方法。
[85] 請求項 2〜59のいずれか 1項に記載の特徴を有する、請求項 84に記載の方法。
[86] 請求項 84に記載の方法であって、前記マーカー物質が、下記マーカー物質 (a)〜
(n) :
(a) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 7040のイオンピークを生じるタンパク質、
(b) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量/電荷比 が約 8330のイオンピークを生じるタンパク質、
(c) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 8530のイオンピークを生じるタンパク質。
(d) pH7. 0かつ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 9060のイオンピークを生じるタンパク質、
(e) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 9260のイオンピークを生じるタンパク質、
(f) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量/電荷比 が約 9450のイオンピークを生じるタンパク質、
(g) pH7. 0力つ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 13700のイオンピークを生じるタンパク質、
(h) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 76400のイオンピークを生じるタンパク質、
(i) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量/電荷比が 約 79100のイオンピークを生じるタンパク質、
(j) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量/電荷比が 約 3500のイオンピークを生じるタンパク質、
(k) pH7. 0力つ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 3560のイオンピークを生じるタンパク質、 (1) ρΗ7. 0かつ 0. 5Mの NaCl濃度で銅イオン結合金属キレート体に結合し、かつ 質量分析に供すると質量 Z電荷比が約 4180のイオンピークを生じるタンパク質、 (m) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 12800のイオンピークを生じるタンパク質;
(n) pH4. 0で弱陽イオン交換体に結合し、かつ質量分析に供すると質量 Z電荷比 が約 65700のイオンピークを生じるタンパク質;および
(a)〜 (n)のタンパク質に対応するタンパク質または改変体
力もなる群より選択される少なくとも 1つタンパク質である、方法。
[87] 前記基準値は、糖尿病を発症している動物または将来の発症リスクが高い動物に、 糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を有さない既知物質を摂取さ せた際の、該動物の体液中における前記マーカー物質の濃度であることを特徴とす る請求項 86に記載の方法。
[88] 前記体液は、血液であることを特徴とする請求項 86または 87に記載の方法。
[89] 前記被検物質は、食品素材であることを特徴とする請求項 86〜88のいずれかに 記載の方法。
[90] 前記体液または体液成分を、前記マーカー物質に対する親和性を有する物質を固 定ィ匕した担体に接触させて、体液中の前記マーカー物質を担体上に捕捉し、捕捉さ れた前記マーカー物質の量に基づいて体液中の前記マーカー物質の濃度を算出 することを特徴とする請求項 86〜89のいずれかに記載の方法。
[91] 前記担体は平面部分を有し、前記マーカー物質に対する親和性を有する物質は、 該平面部分の一部に固定ィ匕されていることを特徴とする請求項 90に記載の方法。
[92] 前記マーカー物質に対する親和性を有する物質は、イオン交換体、金属キレート 体または抗体であることを特徴とする請求項 90または 91に記載の方法。
[93] 請求項 84〜92の 、ずれかに記載の物質の評価方法によって被検物質を評価し、 糖尿病の改善効果または将来の発症リスクの低減効果を有する物質をスクリーニン グすることを特徴とする物質のスクリーニング方法。
[94] 請求項 93に記載の方法によって得られた物質。
PCT/JP2006/300115 2005-01-07 2006-01-06 糖尿病の予知・診断方法および糖尿病予知・診断用キット Ceased WO2006073195A1 (ja)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2006550912A JPWO2006073195A1 (ja) 2005-01-07 2006-01-06 糖尿病の予知・診断方法および糖尿病予知・診断用キット

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2005-002826 2005-01-07
JP2005002826 2005-01-07
JP2005327243 2005-11-11
JP2005-327243 2005-11-11

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO2006073195A1 true WO2006073195A1 (ja) 2006-07-13

Family

ID=36647672

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/JP2006/300115 Ceased WO2006073195A1 (ja) 2005-01-07 2006-01-06 糖尿病の予知・診断方法および糖尿病予知・診断用キット

Country Status (2)

Country Link
JP (1) JPWO2006073195A1 (ja)
WO (1) WO2006073195A1 (ja)

Cited By (17)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2007055341A1 (ja) * 2005-11-11 2007-05-18 Biomarker Science Co., Ltd. 示差的な糖尿病の予知・診断方法および糖尿病予知・診断用キット
JP2008127364A (ja) * 2006-11-24 2008-06-05 Taiyo Kagaku Co Ltd マーカータンパク質発現制御剤
JP2009264932A (ja) * 2008-04-25 2009-11-12 Biomarker Science:Kk 運動機能の向上・維持・回復効果の評価方法及び評価用キット、並びに、物質のスクリーニング方法
JP2010019687A (ja) * 2008-07-10 2010-01-28 Biomarker Science:Kk 動脈硬化改善・予防効果の評価方法及び評価用キット、並びに、物質のスクリーニング方法
JP2010537157A (ja) * 2007-07-17 2010-12-02 メタボロン インコーポレイテッド 糖尿病前症、心血管疾患及びその他のメタボリックシンドローム関連障害のバイオマーカー並びにその使用方法
CN102481319A (zh) * 2009-07-07 2012-05-30 英特琳斯克拜奥普洛博思有限公司 糖尿病前期和2型糖尿病中的载脂蛋白ciii
JP2013076703A (ja) * 2006-03-24 2013-04-25 Metanomics Gmbh 糖尿病の予測手段および予測方法
US20130225496A1 (en) * 2010-11-01 2013-08-29 Novozymes Biopharma Dk A/S Albumin Variants
US9944691B2 (en) 2012-03-16 2018-04-17 Albumedix A/S Albumin variants
US10233228B2 (en) 2010-04-09 2019-03-19 Albumedix Ltd Albumin derivatives and variants
US10501524B2 (en) 2012-11-08 2019-12-10 Albumedix Ltd Albumin variants
US10633428B2 (en) 2015-08-20 2020-04-28 Albumedix Ltd Albumin variants and conjugates
US10696732B2 (en) 2009-10-30 2020-06-30 Albumedix, Ltd Albumin variants
US10711050B2 (en) 2011-11-18 2020-07-14 Albumedix Ltd Variant serum albumin with improved half-life and other properties
CN112924689A (zh) * 2019-12-06 2021-06-08 中国科学院大连化学物理研究所 基于多肽组合标志物定量测定的糖尿病诊断试剂盒及其方法
CN112924687A (zh) * 2019-12-06 2021-06-08 中国科学院大连化学物理研究所 基于多肽组合标志物的糖尿病诊断试剂盒及其方法
US11555061B2 (en) 2009-02-11 2023-01-17 Albumedix, Ltd Albumin variants and conjugates

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2000298131A (ja) * 1999-04-14 2000-10-24 Ryuzo Kawamori 前糖尿病状態の検出方法
WO2003032810A2 (en) * 2001-10-15 2003-04-24 Genentech, Inc. Treatment and diagnosis of insulin resistant states
JP2003270241A (ja) * 2002-03-12 2003-09-25 Omron Corp 健康管理装置
WO2003102163A2 (en) * 2002-06-04 2003-12-11 Metabolex, Inc. Methods of diagnosing and treating diabetes and insulin resistance
JP2004283086A (ja) * 2003-03-24 2004-10-14 Osaka Industrial Promotion Organization 2型糖尿病および動脈硬化のマーカー、およびこれを検出するためのプローブならびにプライマー

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2000298131A (ja) * 1999-04-14 2000-10-24 Ryuzo Kawamori 前糖尿病状態の検出方法
WO2003032810A2 (en) * 2001-10-15 2003-04-24 Genentech, Inc. Treatment and diagnosis of insulin resistant states
JP2003270241A (ja) * 2002-03-12 2003-09-25 Omron Corp 健康管理装置
WO2003102163A2 (en) * 2002-06-04 2003-12-11 Metabolex, Inc. Methods of diagnosing and treating diabetes and insulin resistance
JP2004283086A (ja) * 2003-03-24 2004-10-14 Osaka Industrial Promotion Organization 2型糖尿病および動脈硬化のマーカー、およびこれを検出するためのプローブならびにプライマー

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
YOSHIKAWA T.: "Shirizu 'Nutrigenomics no Shokuhin Kino eno Oyo' -7-Nutrigenomics kara Proteomics eno Tenkai", ILSI, no. 80, 2004, pages 14 - 19 *

Cited By (22)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2007055341A1 (ja) * 2005-11-11 2007-05-18 Biomarker Science Co., Ltd. 示差的な糖尿病の予知・診断方法および糖尿病予知・診断用キット
JP2013076703A (ja) * 2006-03-24 2013-04-25 Metanomics Gmbh 糖尿病の予測手段および予測方法
JP2008127364A (ja) * 2006-11-24 2008-06-05 Taiyo Kagaku Co Ltd マーカータンパク質発現制御剤
JP2010537157A (ja) * 2007-07-17 2010-12-02 メタボロン インコーポレイテッド 糖尿病前症、心血管疾患及びその他のメタボリックシンドローム関連障害のバイオマーカー並びにその使用方法
JP2009264932A (ja) * 2008-04-25 2009-11-12 Biomarker Science:Kk 運動機能の向上・維持・回復効果の評価方法及び評価用キット、並びに、物質のスクリーニング方法
JP2010019687A (ja) * 2008-07-10 2010-01-28 Biomarker Science:Kk 動脈硬化改善・予防効果の評価方法及び評価用キット、並びに、物質のスクリーニング方法
US11555061B2 (en) 2009-02-11 2023-01-17 Albumedix, Ltd Albumin variants and conjugates
CN102481319A (zh) * 2009-07-07 2012-05-30 英特琳斯克拜奥普洛博思有限公司 糖尿病前期和2型糖尿病中的载脂蛋白ciii
EP2451466A4 (en) * 2009-07-07 2012-12-12 Intrinsic Bioprobes Inc APOLIPOPROTEIN CIII FOR PRE-DIABETES AND DIABETES OF TYPE 2
JP2012533066A (ja) * 2009-07-07 2012-12-20 イントリンジック バイオプローブズ,インコーポレイテッド 糖尿病前症及び2型糖尿病におけるアポリポタンパク質ciii
US10696732B2 (en) 2009-10-30 2020-06-30 Albumedix, Ltd Albumin variants
US10233228B2 (en) 2010-04-09 2019-03-19 Albumedix Ltd Albumin derivatives and variants
US20130225496A1 (en) * 2010-11-01 2013-08-29 Novozymes Biopharma Dk A/S Albumin Variants
US10711050B2 (en) 2011-11-18 2020-07-14 Albumedix Ltd Variant serum albumin with improved half-life and other properties
US10329340B2 (en) 2012-03-16 2019-06-25 Albumedix Ltd Albumin variants
US9944691B2 (en) 2012-03-16 2018-04-17 Albumedix A/S Albumin variants
US10501524B2 (en) 2012-11-08 2019-12-10 Albumedix Ltd Albumin variants
US10934341B2 (en) 2012-11-08 2021-03-02 Albumedix, Ltd. Albumin variants
US10633428B2 (en) 2015-08-20 2020-04-28 Albumedix Ltd Albumin variants and conjugates
US12116400B2 (en) 2015-08-20 2024-10-15 Sartorius Albumedix Limited Albumin variants and conjugates
CN112924689A (zh) * 2019-12-06 2021-06-08 中国科学院大连化学物理研究所 基于多肽组合标志物定量测定的糖尿病诊断试剂盒及其方法
CN112924687A (zh) * 2019-12-06 2021-06-08 中国科学院大连化学物理研究所 基于多肽组合标志物的糖尿病诊断试剂盒及其方法

Also Published As

Publication number Publication date
JPWO2006073195A1 (ja) 2008-06-12

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US20070292869A1 (en) Compositions and Methods for Analyzing Renal Cancer
WO2006073195A1 (ja) 糖尿病の予知・診断方法および糖尿病予知・診断用キット
US20050048574A1 (en) Biomarkers for diagnosing rheumatoid arthritis
EP2121747A2 (en) New protein isoforms and uses thereof
JP2003284574A (ja) 核酸分子、ポリペプチド、ならびにアルツハイマー病の診断および処置を含むそれらの使用
EP2333552B1 (en) Novel biomarkers for nonalcoholic fatty liver disease and methods for detecting nonalcoholic fatty liver disease using biomarker
JP2009515183A (ja) 新たなタンパク質アイソフォーム及びその使用
JP2005510575A (ja) アルツハイマー病を予測するig重鎖、igカッパ、igラムダバイオポリマーマーカー
WO2015025975A1 (ja) 糖尿病腎症の発症または発症リスクの検出方法及びキット
US20070264643A1 (en) Compositions and Methods Relating to CNS Lymphoma
JP5688829B2 (ja) 示差的な糖尿病の予知・診断方法および糖尿病予知・診断用キット
WO2006107078A1 (ja) インターフェロン療法の有効性判定方法および判定用キット
US7026129B2 (en) IG lambda biopolymer markers predictive of Alzheimers disease
JP6004369B2 (ja) 糖尿病合併症マーカーとなり得る新規rageリガンド
JP2005510728A (ja) インスリン耐性を予測するタンパク質バイオポリマーマーカー
JP2005510731A (ja) Ii型糖尿病のスクリーニングのためのフィブリノゲンバイオポリマーマーカーおよびその使用
WO2006108051A2 (en) Compositions and methods relating to alzheimer&#39;s disease
JP2005523422A (ja) インスリン耐性を予測するタンパク質バイオポリマーマーカー
JP2005510718A (ja) Ii型糖尿病を予測する補体c3前駆体バイオポリマーマーカー
JP2007278811A (ja) インターフェロン療法の有効性判定方法および判定用キットの改良
JP2005523420A (ja) アルツハイマー病を示す補体c3前駆体バイオポリマーマーカー
JP2005523419A (ja) インスリン耐性を示すフィブロネクチンおよびフィブリノゲンバイオポリマーマーカー
JP2005525535A (ja) インスリン耐性を示すマクログロブリンバイオポリマーマーカー
JP2005510727A (ja) アルツハイマー病を予測するhpおよびアポリポタンパク質バイオポリマーマーカー
US20030113808A1 (en) Apolipoprotein biopolymer markers predictive of alzheimers disease

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application
WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 2006550912

Country of ref document: JP

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

122 Ep: pct application non-entry in european phase

Ref document number: 06711485

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1

WWW Wipo information: withdrawn in national office

Ref document number: 6711485

Country of ref document: EP