[go: up one dir, main page]

WO2004020663A3 - Genetische marker für die diagnose der prädisposition zur vererbung oder ausprägung des phänotyps „afterlosigkeit” bei haus-, zucht- und nutztieren - Google Patents

Genetische marker für die diagnose der prädisposition zur vererbung oder ausprägung des phänotyps „afterlosigkeit” bei haus-, zucht- und nutztieren Download PDF

Info

Publication number
WO2004020663A3
WO2004020663A3 PCT/EP2003/008786 EP0308786W WO2004020663A3 WO 2004020663 A3 WO2004020663 A3 WO 2004020663A3 EP 0308786 W EP0308786 W EP 0308786W WO 2004020663 A3 WO2004020663 A3 WO 2004020663A3
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
animals
mammals
nucleic acid
expression
heredity
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Ceased
Application number
PCT/EP2003/008786
Other languages
English (en)
French (fr)
Other versions
WO2004020663A2 (de
Inventor
Hans-Rudolf Fries
Georg Thaller
Sabine Wiedemann
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
FOERDERVEREIN BIOTECHNOLOGIEFORSCHUNG DER DEUTSCHENSCHWEINEPRODUKTION EV
FOERDERVER BIOTECHNOLOGIEFORSC
Original Assignee
FOERDERVEREIN BIOTECHNOLOGIEFORSCHUNG DER DEUTSCHENSCHWEINEPRODUKTION EV
FOERDERVER BIOTECHNOLOGIEFORSC
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by FOERDERVEREIN BIOTECHNOLOGIEFORSCHUNG DER DEUTSCHENSCHWEINEPRODUKTION EV, FOERDERVER BIOTECHNOLOGIEFORSC filed Critical FOERDERVEREIN BIOTECHNOLOGIEFORSCHUNG DER DEUTSCHENSCHWEINEPRODUKTION EV
Priority to EP03790882A priority Critical patent/EP1529119A2/de
Priority to AU2003260386A priority patent/AU2003260386A1/en
Publication of WO2004020663A2 publication Critical patent/WO2004020663A2/de
Publication of WO2004020663A3 publication Critical patent/WO2004020663A3/de
Anticipated expiration legal-status Critical
Ceased legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156Polymorphic or mutational markers

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Verwendung einer ersten Nukleinsäure zur Bestimmung der Prädisposition zur Ausprägung oder Vererbung des Phänotypus „Afterlosigkeit” in einem Säuger, wobei die erste Nukleinsäure eine Länge von mindestens 8 Nukleotiden aufweist und identisch oder im wesentlichen identisch ist mit einer zweiten Nukleinsäure, die vorkommt, auf Chromosoms 1 des Schweins oder in einer homologen Position im Genom anderer Säuger, und zwar im Bereich eines Mikrosatelliten ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus SW2185, SW 1621, SW 1902, S0155, und S0320; oder auf Chromosoms 3 des Schweins oder in einer homologen Position im Genom anderer Säuger, und zwar im Bereich des Mikrosatelliten S0002; oder auf Chromosoms 9 des Schweins oder in einer homologen Position im Genom anderer Säuger, und zwar im Bereich eines Mikrosatelliten ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus SW2401 und S0081; oder auf Chromosom 12 des Schweins oder in einer homologen Position im Genom anderer Säuger, und zwar im Bereich eines Mikrosatelliten ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus SW957 und S0229. Die Erfindung betrifft ferner Verfahren zur Bestimmung der Prädisposition zur Ausprägung oder Vererbung des Merkmals „Afterlosigkeit” in Säugern, vorzugsweise in Haus­, Zucht- oder Nutztieren, wobei man die Säuger, deren befruchtete oder unbefruchtete Eizellen, oder deren Sperma auf die Anwesenheit, Beschaffenheit oder Ausprägung der oben genannten zweiten Nukleinsäure testet. Schließlich betrifft die Erfindung ein Kit, mindestens enthaltend ein Primerpaar zur Amplifikation einer der oben genannten zweiten Nukleinsäure, wobei jeweils ein Primer an den + Strang und ein weiterer Primer an den - Strang der Nukleinsäure bindet, oder eine Hybridisierungssonde mit einer Länge von mindestens 8 Nukleotiden die an eine der oben genannten zweiten Nukleinsäuren bindet, oder einen spezifischen Antikörper oder ein Antikörperfragment, das an die zweite vorstehend offenbarte Nukleinsäure bindet.
PCT/EP2003/008786 2002-08-09 2003-08-07 Genetische marker für die diagnose der prädisposition zur vererbung oder ausprägung des phänotyps „afterlosigkeit” bei haus-, zucht- und nutztieren Ceased WO2004020663A2 (de)

Priority Applications (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP03790882A EP1529119A2 (de) 2002-08-09 2003-08-07 Genetische marker fur die diagnose der pradisposition zur vererbung oder ausprägung des phanotyps "afterlosigkeit" bei haus-, zucht- und nutztieren
AU2003260386A AU2003260386A1 (en) 2002-08-09 2003-08-07 Genetic markers for diagnosing predisposition to heredity or expression of the imperforate anus phenotype in domestic animals, breeding animals and working animals

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP02017954.5 2002-08-09
EP02017954 2002-08-09

Publications (2)

Publication Number Publication Date
WO2004020663A2 WO2004020663A2 (de) 2004-03-11
WO2004020663A3 true WO2004020663A3 (de) 2004-08-19

Family

ID=31970261

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/EP2003/008786 Ceased WO2004020663A2 (de) 2002-08-09 2003-08-07 Genetische marker für die diagnose der prädisposition zur vererbung oder ausprägung des phänotyps „afterlosigkeit” bei haus-, zucht- und nutztieren

Country Status (3)

Country Link
EP (1) EP1529119A2 (de)
AU (1) AU2003260386A1 (de)
WO (1) WO2004020663A2 (de)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102719532A (zh) * 2012-05-16 2012-10-10 新疆维吾尔自治区畜牧科学院中国-澳大利亚绵羊育种研究中心 一种通过微卫星标记检测陶赛特羊早期生长发育的方法

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1996039538A1 (en) * 1995-06-06 1996-12-12 Dekalb Swine Breeders Evaluating scrotal hernia in swine
WO2001077374A2 (de) * 2000-04-08 2001-10-18 Biopsytek Analytik Gmbh Verfahren zur identifizierung und isolierung von genomfragmenten mit kopplungsungleichgewicht

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1996039538A1 (en) * 1995-06-06 1996-12-12 Dekalb Swine Breeders Evaluating scrotal hernia in swine
WO2001077374A2 (de) * 2000-04-08 2001-10-18 Biopsytek Analytik Gmbh Verfahren zur identifizierung und isolierung von genomfragmenten mit kopplungsungleichgewicht

Non-Patent Citations (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
ALEXANDER L J ET AL: "CLONING AND CHARACTERIZATION OF 414 POLYMORPHIC PORCINE MICROSATELLITES", ANIMAL GENETICS, BLACKWELL SCIENTIFIC PUBLICATIONS, LONDON, GB, vol. 27, no. 3, 1996, pages 137 - 148, XP001032578, ISSN: 0268-9146 *
ALEXANDER L J ET AL: "Physical assignments of 68 porcine cosmid and lambda clones containing polymorphic microsatellites", MAMMALIAN GENOME, vol. 7, no. 5, 1996, pages 368 - 372, XP002270235, ISSN: 0938-8990 *
BEUZEN N D ET AL: "Molecular markers and their use in animal breeding.", VETERINARY JOURNAL (LONDON, ENGLAND: 1997) ENGLAND JUL 2000, vol. 160, no. 1, July 2000 (2000-07-01), pages 42 - 52, XP008027296, ISSN: 1090-0233 *
DEAR D V ANDERSON ET AL: "Isolation of dinucleotide repeats from a pig chromosome 1-specific DNA library", MAMMALIAN GENOME, vol. 5, no. 10, 1994, pages 649 - 651, XP008027561, ISSN: 0938-8990 *
ELLEGREN HANS ET AL: "A physically anchored linkage map of pig chromosome 1 uncovers sex- and position-specific recombination rates", GENOMICS, vol. 24, no. 2, 1994, pages 342 - 350, XP002270236, ISSN: 0888-7543 *
FIRST N L: "NEW ANIMAL BREEDING TECHNIQUES AND THEIR APPLICATIONS", JOURNAL OF REPRODUCTION AND FERTILITY. SUPPLEMENT, JOURNALS OF REPRODUCTIVE AND FERTILITY LTD.,, GB, vol. 41, no. SUPPL, 1990, pages 3 - 14, XP000941129, ISSN: 0449-3087 *
HORI T ET AL: "Mapping loci causing susceptibility to anal atresia in pigs, using a resource pedigree.", JOURNAL OF PEDIATRIC SURGERY. UNITED STATES SEP 2001, vol. 36, no. 9, September 2001 (2001-09-01), pages 1370 - 1374, XP008026807, ISSN: 0022-3468 *
KANG SEONGMAN ET AL: "GLI3 frameshift mutations cause autosomal dominant Pallister-Hall syndrome", NATURE GENETICS, vol. 15, no. 3, 1997, pages 266 - 268, XP008027536, ISSN: 1061-4036 *
KOHLHASE JUERGEN ET AL: "Mutations in the SALL1 putative transcription factor gene cause Townes-Brocks syndrome", NATURE GENETICS, vol. 18, no. 1, January 1998 (1998-01-01), pages 81 - 83, XP008027535, ISSN: 1061-4036 *
MO RONG ET AL: "Anorectal malformations caused by defects in sonic hedgehog signaling", AMERICAN JOURNAL OF PATHOLOGY, vol. 159, no. 2, August 2001 (2001-08-01), pages 765 - 774, XP002269520, ISSN: 0002-9440 *
ROBIC A ET AL: "Isolation of 28 new porcine microsatellites revealing polymorphism", MAMMALIAN GENOME, vol. 5, no. 9, 1994, pages 580 - 583, XP008027626, ISSN: 0938-8990 *
ROHRER G A ET AL: "A comprehensive map of the porcine genome", PCR METHODS AND APPLICATIONS, COLD SPRING HARBOR, NY, US, vol. 6, no. 5, May 1996 (1996-05-01), pages 371 - 391, XP002193166, ISSN: 1054-9803 *
ROHRER G A ET AL: "A MICROSATELLITE LINKAGE MAP OF THE PORCINE GENOME", GENETICS, GENETICS SOCIETY OF AMERICA, AUSTIN, TX, US, vol. 136, no. 1, 1994, pages 231 - 245, XP000601919, ISSN: 0016-6731 *
STIGLER J ET AL: "SEGREGATION ANALYSIS OF HEREDITARY DEFECTS IN PIGS", ZUECHTUNGSKUNDE, vol. 63, no. 4, 1991, pages 294 - 305, XP008026805, ISSN: 0044-5401 *
THALLER G ET AL: "Investigation of the inheritance of birth defects in swine by complex segregation analysis", JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, vol. 113, no. 2, 1996, pages 77 - 92, XP008026806, ISSN: 0931-2668 *

Also Published As

Publication number Publication date
EP1529119A2 (de) 2005-05-11
WO2004020663A2 (de) 2004-03-11
AU2003260386A1 (en) 2004-03-19

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Meurs et al. A substitution mutation in the myosin binding protein C gene in ragdoll hypertrophic cardiomyopathy
CA2421754A1 (en) Novel prkag3 alleles and use of the same as genetic markers for reproductive and meat quality traits
Witt et al. Alleles of the KIR2DL4 receptor and their lack of association with pre‐eclampsia
JP2005508642A5 (ja) 試験サンプル中のMycoplasma pneumoniaeの存在を決定するための組成物、方法およびキット
US10378057B2 (en) Method to predict the pattern of locomotion in horses
Sato et al. Transforming growth factor‐β1 gene polymorphism modifies the histological and clinical manifestations in Japanese patients with IgA nephropathy
Marra et al. PCR amplification of the mating‐type idiomorphs in Cryphonectria parasitica
WO2005056758A3 (en) Methods and compositions for genetically detecting improved milk production traits in cattle
WO1998045477A3 (en) Methods for assessing cardiovascular status and compositions for use thereof
Sakamoto et al. Delineation of genomic deletion in cardiomyopathic hamster
Skinner et al. Cloning and mapping of the porcine cytochrome‐p450 2E1 gene and its association with skatole levels in the domestic pig
Clapcott et al. Two ENU-induced mutations in Rasgrf1 and early mouse growth retardation
WO2004020663A3 (de) Genetische marker für die diagnose der prädisposition zur vererbung oder ausprägung des phänotyps „afterlosigkeit” bei haus-, zucht- und nutztieren
US8932810B2 (en) Identification of mutation and method for detecting lavender foal syndrome in the horse
KR101892582B1 (ko) Eaa 유전자 인트론 7의 다형성을 이용한 돼지 혈액형 감별 방법
US20090176224A1 (en) Udder Health Characteristics
AU2011201207A1 (en) Genemarker for evaluating genetic potential for marbling in bovine individual and method for evaluating genetic potential for marbling using the same
US20150247195A1 (en) Detecting a brachyspina mutation
Alves et al. Development of Y‐chromosome‐Specific SCAR Markers Conserved in Taurine, Zebu and Bubaline Cattle
WO2003066891A3 (de) Genetische marker für die diagnose der ausprägung von stülpzitzen bei haus-, zucht- und nutztieren
Waldick et al. Identification and characterization of 14 polymorphic microsatellite loci for a member of the Herpestidae (Mungos mungo)
WO2001021835A3 (en) Method to determine the susceptibility of scrapie in sheep
US7718785B2 (en) Mutations in the SLC40A1 gene associated to impaired iron homeostasis
US20060211774A1 (en) Method of diagnosins a genetic susceptibility for bone damage
JP4982771B2 (ja) 炎症性疾患の判定方法

Legal Events

Date Code Title Description
AK Designated states

Kind code of ref document: A2

Designated state(s): AE AG AL AM AT AU AZ BA BB BG BR BY BZ CA CH CN CO CR CU CZ DE DK DM DZ EC EE ES FI GB GD GE GH GM HR HU ID IL IN IS JP KE KG KP KR KZ LC LK LR LS LT LU LV MA MD MG MK MN MW MX MZ NI NO NZ OM PG PH PL PT RO RU SC SD SE SG SK SL SY TJ TM TN TR TT TZ UA UG US UZ VC VN YU ZA ZM ZW

AL Designated countries for regional patents

Kind code of ref document: A2

Designated state(s): GH GM KE LS MW MZ SD SL SZ TZ UG ZM ZW AM AZ BY KG KZ MD RU TJ TM AT BE BG CH CY CZ DE DK EE ES FI FR GB GR HU IE IT LU MC NL PT RO SE SI SK TR BF BJ CF CG CI CM GA GN GQ GW ML MR NE SN TD TG

121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application
WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 2003790882

Country of ref document: EP

WWP Wipo information: published in national office

Ref document number: 2003790882

Country of ref document: EP

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: JP

WWW Wipo information: withdrawn in national office

Country of ref document: JP