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TWI622595B - 充當抗癌劑的經取代核苷衍生物 - Google Patents

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TWI622595B
TWI622595B TW105104968A TW105104968A TWI622595B TW I622595 B TWI622595 B TW I622595B TW 105104968 A TW105104968 A TW 105104968A TW 105104968 A TW105104968 A TW 105104968A TW I622595 B TWI622595 B TW I622595B
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Abstract

通式(I)化合物: 製備這些化合物之方法,含有這些化合物之組成物、及這些化合物之用途。

Description

充當抗癌劑的經取代核苷衍生物
本發明係關於可用於治療哺乳動物之異常細胞生長諸如癌症的新穎核苷衍生物。本發明亦關於使用此些化合物於以治療哺乳動物尤其人類之異常細胞生長的方法,及關於作為抗癌劑之醫藥組成物。
精胺酸殘基藉甲基化反應進行之轉譯後修飾對許多關鍵細胞過程包括染色質重塑、基因轉錄、蛋白轉譯、信號轉導、RNA剪接及細胞增殖是重要的。精胺酸之甲基化反應係藉蛋白精胺酸甲基轉移酶(PRMT)酵素催化。總計有九種PRMT成員,有八種經報告對標靶基質具有酵素活性。
蛋白精胺酸甲基轉移酶(PRMT)酵素家族使用S-腺苷甲硫胺酸(SAM)將甲基轉移至標靶蛋白上的精胺酸殘基上。第I型PRMT催化單甲基精胺酸及不對稱二甲基精胺酸的形成,而第II型PRMT催化單甲基精胺酸及對稱二甲基精胺酸。PRMT5為第II型酵素,兩次地將來自SAM 的甲基轉移至精胺酸的兩個ω-胍基(ω-guanidino)氮原子上,導致蛋白基質的ω-NG,N’G二-對稱甲基化反應。
PRMT5蛋白經發現於核及細胞質中,且具有多重蛋白基質諸如組織蛋白、轉錄因子及剪接體蛋白。PRMT5具有結合配體,Mep50(甲基轉移酶複合體蛋白50)且於多重蛋白複合體中作用。PRMT5與染色質重塑複合體(SWI/SNF,NuRD)有關且經由組織蛋白之甲基化反應而表觀遺傳地控制涉及發育、細胞增殖、及分化的基因包括腫瘤抑制基因(Karkhanis,V.et al.,Versatility of PRMT5 Induced methylation in Growth Control and Development,Trends Biochem Sci 36(12)633-641(2011))。PRMT5亦經由與募集PRMT5之蛋白複合體聯合以將一些轉錄因子甲基化而控制基因表現,這些轉錄因子有p53(Jansson,M.et al.,Arginine methylation Regulates the p53 Response,Nat.Cell Biol.10,1431-1439(2008));E2F1(Zheng,S.et al.,Arginine methylation-Dependent Reader-Writer Interplay Governs Growth Control by E2F-1,Mol Cell 52(1),37-51(2013));HOXA9(Bandyopadhyay,S.et al.,HOXA9 methylation by PRMT5 is Essential for Endothelial Cell Expression of Leukocyte Adhesion Molecules,Mol.Cell.Biol.32(7):1202-1213(2012));及NFκB(Wei,H.et al.,PRMT5 dimethylates R30 of the p65 Subunit to Activate NFκB,PNAS 110(33),13516-13521(2013))。細胞質內,PRMT5具有多種多樣之涉及其他細胞功能包括RNA剪接 (Sm proteins)、高爾基裝配(golgi assembly)(gm130)、核糖體之生物發生(RPS10)、piRNA媒介性基因靜默(Piwi proteins)及EGFR信號傳遞(Karkhanis,2011)的基質。
與PRMT5有關之其他論文包括:Aggarwal,P.et al.、(2010)Nuclear Cyclin D1/CDK4 Kinase Regulates CUL4B Expression and Triggers Neoplastic Growth via Activation of the PRMT5 methyltransferase,Cancer Cell 18329-340;Bao,X.et al.,Overexpression of PRMT5 Promotes Tumor Cell Growth and is Associated with Poor Disease Prognosis in Epithelial Ovarian Cancer,J Histochem Cytochem 61:206-217(2013);Cho E.et al.,Arginine methylation Controls Growth Regulation by E2F1,EMBO J.31(7)1785-1797(2012);Gu,Z.et al.,Protein Arginine methyltransferase 5 Functions in Opposite Ways in the Cytoplasm and Nucleus of Prostate Cancer Cells,PLoS One 7(8)e44033(2012);Gu,Z.et al.,Protein Arginine methyltransferase 5 is Essential for Growth of Lung Cancer Cells,Biochem J.446:235-241(2012);Kim,J.et al.,Identification of Gastric Cancer Related Genes Using a cDNA Microarray Containing Novel Expressed Sequence Tags Expressed in Gastric Cancer Cells,Clin Cancer Res.11(2)473-482(2005);Nicholas,C.et al.,PRMT5 is Upregulated in Malignant and Metastatic Melanoma and Regulates Expression of MITF and p27(Kip1),PLoS One 8(9)e74710(2012);Powers,M.et al.,Protein Arginine methyltransferase 5 Accelerates Tumor Growth by Arginine methylation of the Tumor Suppressor Programmed Cell Death 4,Cancer Res.71(16)5579-5587(2011);Wang,L.et al.,Protein Arginine methyltransferase 5 Suppresses the Transcription of the RB Family of Tumor Suppressors in Leukemia and Lymphoma Cells,Mol.Cell Biol.28(20),6262-6277(2008)。
PRMT5於許多癌症中過度表現且已於患者樣品及細胞系包括B細胞淋巴瘤及白血病(Wang,2008)及下列實體腫瘤中觀察到:胃(Kim 2005)、食道(Aggarwal,2010)、乳房(Powers,2011)、肺(Gu,2012)、攝護腺(Gu,2012)、黑色素瘤(Nicholas 2012)、結腸(Cho,2012)及卵巢(Bao,2013)。許多這些癌症中,PRMT5之過度表現與不良預後有關聯。除了癌症以外,PRMT5基質之脫離常軌的精胺酸甲基化反應亦與其他適應症諸如代謝失調、炎性及自體免疫疾病及血色素病變有關。
在調節各種生物過程的角色上,PRMT5為具有吸引力之標靶以供以小分子抑制劑進行調節。迄今極少有效之PRMT5抑制劑被發展出,且無PRMT5抑制劑已進入臨床。
下述本發明化合物之實施態樣可各自地與本案所述之 本發明化合物的任何其他實施態樣結合,且該任何其他實施態樣不會與其所結合之實施態樣不一致。此外,以下描述本發明之實施態樣各自地將本發明化合物之醫藥上可接受之鹽設想在其範圍內。因此詞組“或其醫藥上可接受之鹽”毫無疑問地在本案所述所有化合物之說明中。
本發明包括實施態樣,其中提供式(I)化合物: 或其醫藥上可接受之鹽,其中:R1選自由以下所組成之群組:(C1-C8)烷基、(C1-C8)鹵烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基、3-12員雜環基、OR4、SR4及N(R4)2,其中R4各自獨立地為A-R14,其中A為不存在、(C1-C3)烷基、-C(O)-或-SO2-,且R14為氫、(C1-C8)烷基、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基或3-12員雜環基,或者兩個R4連結以形成含有1-3個選自N、O及S之雜原子的4-6員雜環; R2為氫、鹵素、(C1-C8)烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基或N(R5)2,其中R5各自獨立地為氫或(C1-C8)烷基,或者兩個R5連結以形成含有1-3個選自N、O及S之雜原子的4-6員雜環;R3為氫、羥基或NH2,或者如果m為0,則R3不存在;Q不存在或為選自O、S、NH及(C1-C8)伸烷基之二價部分;U選自由以下所組成之群組:OR6、SR6、N(R6)2、(C1-C8)烷基-N(R6)2、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基、3-12員雜環基、(C1-C8)烷基、(C1-C8)雜烷基及(C1-C8)鹵烷基,其中如果m+n=0,則U不為CH2-羥基,且其中如果m+n=1且R3為氫,則U不為羥基,其中U隨意地經一或多個各自獨立地選自(C1-C8)烷基、(C1-C8)烷基-N(R6)2、O(C2-C8)烷基-N(R6)2、(C1-C8)鹵烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基、鹵素、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基、3-12員雜環基、OR6、N(R6)2及SO2R6之取代基取代,且其中R6各自獨立地為氫、(C1-C8)烷基、(C1-C8)烷基-N(R7)2,其中R7各自為氫或(C1-C8)烷基、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基或3-12員雜環基,或者兩個R6連結以形成含有1-3個選自N、O及S之雜原子的4-6員雜環;V為N或C,其中如果V形成雙鍵,則V為碳;W為N或C,其中如果W形成雙鍵,則W為碳; X為N或C,其中如果X形成雙鍵,則X為碳;Y為CR10、N、NR10、O或S,其中如果Y為CR10,則R10各自獨立地選自氫、(C1-C8)烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基、鹵素、SH、S-(C1-C8)烷基及N(R11)2,其中當Y為CR10或N時,則Y與相鄰之環員形成雙鍵,且其中R11各自獨立地為氫、(C1-C8)烷基、(C5-C12)芳基或5-12員雜芳基或者兩個R11連結以形成含有1-3個選自N、O及S之雜原子的4-6員雜環或者Y為C(R10)2且該兩個R10與彼等所連接之碳形成羰基或硫羰基;Z為CR12、N、NR12、O或S,其中R12各自獨立地選自氫、(C1-C8)烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基、氟基、氯基、溴基、SH、S-(C1-C8)烷基及N(R13)2,其中如果Z為CR12或N,則Z與相鄰之環員形成雙鍵,其中R13各自獨立地為氫、(C1-C8)烷基、(C5-C12)芳基或5-12員雜芳基,或者兩個R13連結以形成含有1-3個選自N、O及S之雜原子的4-6員雜環,且其中如果X為N、V為C、W為C且Y為CR10,則Z不為NR12,或者Z為C(R12)2且該兩個R12與彼等所連接之碳形成羰基或硫羰基;-----各自為隨意鍵,其中可存在不多於兩個之非相鄰-----;m為0-1;且n為0-1。
本發明亦提供式(I)化合物: 或其醫藥上可接受之鹽,其中:R1選自由以下所組成之群組:(C1-C8)烷基、(C1-C8)鹵烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基、3-12員雜環基、OR4、SR4及N(R4)2,其中R4各自獨立地為A-R14,其中A為不存在、(C1-C3)烷基、-C(O)-或-SO2-,且R14為氫、(C1-C8)烷基、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基或3-12員雜環基,或者兩個R4連結以形成含有1-3個選自N、O及S之雜原子的4-6員雜環;R2為氫、鹵素、(C1-C8)烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基或N(R5)2,其中R5各自獨立地為氫或(C1-C8)烷基,或者兩個R5連結以形成含有1-3個選自N、O及S之雜原子的4-6員雜環;R3為氫、羥基或NH2,或者如果m為0,則R3不存 在;Q不存在或為選自O、S、NH及(C1-C8)伸烷基之二價部分;U選自由以下所組成之群組:OR6、SR6、N(R6)2、(C1-C8)烷基-N(R6)2、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基、3-12員雜環基、(C1-C8)烷基、(C1-C8)雜烷基及(C1-C8)鹵烷基,其中如果m+n=0,則U不為CH2-羥基,且其中如果m+n=1且R3為氫,則U不為羥基,其中U隨意地經一或多個各自獨立地選自(C1-C8)烷基、(C1-C8)烷基-N(R6)2、O(C2-C8)烷基-N(R6)2、(C1-C8)鹵烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基、鹵素、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基、3-12員雜環基、OR6、N(R6)2及SO2R6之取代基取代,且其中R6各自獨立地為氫、(C1-C8)烷基、(C1-C8)烷基-N(R7)2,其中R7各自為氫或(C1-C8)烷基、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基或3-12員雜環基,或者兩個R6連結以形成含有1-3個選自N、O及S之雜原子的4-6員雜環,其中如果-Q-R1為NH2或H,則不為-CH2-SH、-CH2-S-(C1-C8烷基)、-CH2-NH2、-CH2(H)(C1-C8烷基或-CH2-(C1-C8烷基)2;V為N或C,其中如果V形成雙鍵,則V為碳;W為N或C,其中如果W形成雙鍵,則W為碳; X為N或C,其中如果X形成雙鍵,則X為碳;Y為CR10、N、NR10、O或S,其中如果Y為CR10,則R10各自獨立地選自氫、(C1-C8)烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基、鹵素、SH、S-(C1-C8)烷基及N(R11)2,其中當Y為CR10或N時,則Y與相鄰之環員形成雙鍵,且其中R11各自獨立地為氫、(C1-C8)烷基、(C5-C12)芳基或5-12員雜芳基或者兩個R11連結以形成含有1-3個選自N、O及S之雜原子的4-6員雜環或者Y為C(R10)2且該兩個R10與彼等所連接之碳形成羰基或硫羰基;Z為CR12、N、NR12、O或S,其中R12各自獨立地選自氫、(C1-C8)烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基、氟基、氯基、溴基、SH、S-(C1-C8)烷基及N(R13)2,其中如果Z為CR12或N,則Z與相鄰之環員形成雙鍵,其中R13各自獨立地為氫、(C1-C8)烷基、(C5-C12)芳基或5-12員雜芳基,或者兩個R13連結以形成含有1-3個選自N、O及S之雜原子的4-6員雜環,且其中如果X為N、V為C、W為C且Y為CR10,則Z不為NR12,或者Z為C(R12)2且該兩個R12與彼等所連接之碳形成羰基或硫羰基;-----各自為隨意鍵,其中可存在不多於兩個之非相鄰-----;m為0-1;且n為0-1。
本發明進一步提供式(I)化合物: 或其醫藥上可接受之鹽,其中:R1選自由以下所組成之群組:(C1-C8)烷基、(C1-C8)鹵烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基、3-12員雜環基、OR4、SR4及N(R4)2,其中R4各自獨立地為A-R14,其中A為不存在、(C1-C3)烷基、-C(O)-或-SO2-,且R14為氫、(C1-C8)烷基、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基或3-12員雜環基,或者兩個R4連結以形成含有1-3個選自N、O及S之雜原子的4-6員雜環;R2為氫、鹵素、(C1-C8)烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基或N(R5)2,其中R5各自獨立地為氫或(C1-C8)烷基,或者兩個R5連結以形成含有1-3個選自N、O及S之雜原子的4-6員雜環;R3為氫、羥基或NH2,或者如果m為0,則R3不存 在;Q不存在或為選自O、S、NH及(C1-C8)伸烷基之二價部分;U選自由以下所組成之群組:OR6、(C1-C8)烷基-N(R6)2、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基、3-12員雜環基、(C1-C8)烷基、(C1-C8)雜烷基及(C1-C8)鹵烷基,其中如果m+n=0,則U不為CH2-羥基,且其中如果m+n=1且R3為氫,則U不為羥基,其中U隨意地經一或多個各自獨立地選自(C1-C8)烷基、(C1-C8)烷基-N(R6)2、O(C2-C8)烷基-N(R6)2、(C1-C8)鹵烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基、鹵素、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基、3-12員雜環基、OR6、N(R6)2及SO2R6之取代基取代,且其中R6各自獨立地為氫、(C1-C8)烷基、(C1-C8)烷基-N(R7)2,其中R7各自為氫或(C1-C8)烷基、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基或3-12員雜環基,或者兩個R6連結以形成含有1-3個選自N、O及S之雜原子的4-6員雜環;V為N或C,其中如果V形成雙鍵,則V為碳;W為N或C,其中如果W形成雙鍵,則W為碳;X為N或C,其中如果X形成雙鍵,則X為碳;Y為CR10、N、NR10、O或S,其中如果Y為CR10,則R10各自獨立地選自氫、(C1-C8)烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基、鹵素、SH、S-(C1-C8)烷基及N(R11)2,其中當Y為CR10或N時,則Y與相鄰之環員形成雙鍵,且其中R11 各自獨立地為氫、(C1-C8)烷基、(C5-C12)芳基或5-12員雜芳基或者兩個R11連結以形成含有1-3個選自N、O及S之雜原子的4-6員雜環或者Y為C(R10)2且該兩個R10與彼等所連接之碳形成羰基或硫羰基;Z為CR12、N、NR12、O或S,其中R12各自獨立地選自氫、(C1-C8)烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基、氟基、氯基、溴基、SH、S-(C1-C8)烷基及N(R13)2,其中如果Z為CR12或N,則Z與相鄰之環員形成雙鍵,其中R13各自獨立地為氫、(C1-C8)烷基、(C5-C12)芳基或5-12員雜芳基,或者兩個R13連結以形成含有1-3個選自N、O及S之雜原子的4-6員雜環,且其中如果X為N、V為C、W為C且Y為CR10,則Z不為NR12,或者Z為C(R12)2且該兩個R12與彼等所連接之碳形成羰基或硫羰基;-----各自為隨意鍵,其中可存在不多於兩個之非相鄰-----;m為0-1;且n為0-1。
此外,本發明亦提供式(I)化合物: 或其醫藥上可接受之鹽,其中:R1選自由以下所組成之群組:(C1-C8)烷基、(C1-C8)鹵烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基、3-12員雜環基、OR4、SR4及N(R4)2,其中R4各自獨立地為A-R14,其中A為不存在、(C1-C3)烷基、-C(O)-或-SO2-,且R14為氫、(C1-C8)烷基、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基或3-12員雜環基,或者兩個R4連結以形成含有1-3個選自N、O及S之雜原子的4-6員雜環;R2為氫、(C1-C8)烷基或N(R5)2,其中R5各自獨立地為氫或(C1-C8)烷基,或者兩個R5連結以形成含有1-3個選自N、O及S之雜原子的4-6員雜環;R3為氫、羥基或NH2,或者如果m為0,則R3不存在;Q不存在或為選自O、S、NH及(C1-C8)伸烷基之二價部分; U為(C5-C12)芳基或5-12員雜芳基,其中U隨意地經一或多個各自獨立地選自(C1-C8)烷基、(C1-C8)烷基-N(R6)2、O(C2-C8)烷基-N(R6)2、(C1-C8)鹵烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基、鹵素、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基、3-12員雜環基、OR6、N(R6)2及SO2R6之取代基取代,其中R6各自獨立地為氫、(C1-C8)烷基、(C1-C8)烷基-N(R7)2,其中R7各自為氫或(C1-C8)烷基、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基或3-12員雜環基,或者兩個R6連結以形成含有1-3個選自N、O及S之雜原子的4-6員雜環;V為N或C,其中如果V形成雙鍵,則V為碳;W為N或C,其中如果W形成雙鍵,則W為碳;X為N或C,其中如果X形成雙鍵,則X為碳;Y為CH、C(O)、C(S)、N或NR10,其中R10為氫、(C1-C8)烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基、鹵素、SH、S-(C1-C8)烷基,且其中如果Y為CH或N,則Y與相鄰之環員形成雙鍵;Z為CR12、N、NR12或O,其中R12各自為氫、(C1-C8)烷基或鹵素,且其中如果Z為CR12或N,則Z與相鄰之環員形成雙鍵;-----各自為隨意鍵,其中可存在不多於兩個之非相鄰-----;m為0-1;且n為0-1。
本發明亦提供式(II)化合物: 或其醫藥上可接受之鹽,其中:R1選自由以下所組成之群組:(C1-C8)烷基、N(R4)2或(C3-C10)環烷基,其中R4各自獨立地為氫、(C1-C8)烷基、(C5-C12)芳基或5-12員雜芳基;R2為氫、甲基或NH2;R3為羥基或NH2;U為(C5-C12)芳基或5-12員雜芳基,其中U隨意地經一或多個各自獨立地選自(C1-C8)烷基、(C1-C8)烷基-N(R6)2、O(C2-C8)烷基-N(R6)2、(C1-C8)鹵烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基、鹵素、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基、3-12員雜環基、OR6、N(R6)2及SO2R6之取代基取代,其中R6各自獨立地為氫、(C1-C8)烷基、(C1-C8)烷基-N(R7)2,其中R7各自為氫或(C1-C8)烷基、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基或3-12員 雜環基,或者兩個R6連結以形成含有1-3個選自N、O及S之雜原子的4-6員雜環;Z為CR12,其中R12各自為氫、(C1-C8)烷基或鹵素;m為0-1;且n為0-1。
某些實施態樣中,式(II)為:
某些實施態樣中,式(II)為:
某些實施態樣中,式(II)為:
本發明之某些實施態樣中,提供式I之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中R1為NH2,Z為CF,R2為氫,R3為羥基,m為1且n為0。
本發明之某些實施態樣中,提供式I之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中R1為NH2,Z為CH,R2為氫,R3為羥基,m為1且n為0。
本發明之某些實施態樣中,提供式I之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中R1為CH3,Z為CH,R2為氫,R3為羥基,m為1且n為0。
本發明之某些實施態樣中,提供式I之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中R1為CH3,Z為CF,R2為氫,R3為羥基,m為1且n為0。
本發明之某些實施態樣中,提供式I之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中R1為CH3,Z為CH,R2為NH2,R3為羥基,m為1且n為0。
本發明之某些實施態樣中,提供式I之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中R1為CH3,Z為CH,R2為CH3,R3為羥基,m為1且n為0。
本發明之某些實施態樣中,提供式II之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中R1為NH2,Z為CF,R2為氫,R3為羥基,m為1且n為0。
本發明之某些實施態樣中,提供式II之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中R1為NH2,Z為CH,R2為氫,R3為羥基,m為1且n為0。
本發明之某些實施態樣中,提供式II之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中R1為CH3,Z為CH,R2為氫,R3為羥基,m為1且n為0。
本發明之某些實施態樣中,提供式II之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中R1為CH3,Z為CF,R2為氫,R3為羥基,m為1且n為0。
本發明之某些實施態樣中,提供式II之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中R1為CH3,Z為CH,R2為NH2,R3為羥基,m為1且n為0。
本發明之某些實施態樣中,提供式II之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中R1為CH3,Z為CH,R2為CH3,R3為羥基,m為1且n為0。
本發明之某些實施態樣中,提供式III之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中R1為NH2,Z為CF,R2為氫,R3為羥基,m為1且n為0。
本發明之某些實施態樣中,提供式III之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中R1為NH2,Z為CH,R2為氫,R3為羥基,m為1且n為0。
本發明之某些實施態樣中,提供式III之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中R1為CH3,Z為CH,R2為氫,R3為羥基,m為1且n為0。
本發明之某些實施態樣中,提供式III之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中R1為CH3,Z為CF,R2為氫,R3為羥基,m為1且n為0。
本發明之某些實施態樣中,提供式III之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中R1為CH3,Z為CH,R2為NH2,R3為羥基,m為1且n為0。
本發明之某些實施態樣中,提供式III之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中R1為CH3,Z為CH,R2為CH3,R3為羥基,m為1且n為0。
本發明之某些實施態樣中,提供式I之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中U為隨意經取代之(C5-C12)芳基或5-12員雜芳基。
本發明之某些實施態樣中,提供式II之化合物或醫藥上可接受之鹽,其中U為隨意經取代之(C5-C12)芳基或5-12員雜芳基。
本發明進一步提供實施態樣,其中如同於式I或式II中所見之:
選自:
本發明之額外實施態樣包括下列多種化合物之一種: 或其醫藥上可接受之鹽或鹽類。
本發明之額外實施態樣包括下列多種化合物之一種: 或其醫藥上可接受之鹽或鹽類。
本發明之額外實施例包括醫藥組成物,其包含本案所述之化合物或其醫藥上可接受之鹽,及醫藥上可接受之載體。
本發明之額外實施例包括治療哺乳動物之異常細胞生長的方法,該方法包含將治療有效量之本案所述之化合物或其醫藥上可接受之鹽,及醫藥上可接受之載體投予該哺乳動物。
本發明之額外實施例包括如本案所述之此些治療方法,其中該異常細胞生長為癌症。尤其此些方法其中之癌症為肺癌、骨癌、胰臟癌、皮膚癌、頭頸部癌症、皮膚或眼內黑色素瘤、子宮癌、卵巢癌、直腸癌、肛門區的癌症、胃癌、結腸癌、乳癌、子宮癌、輸卵管癌、子宮內膜癌、子宮頸癌、陰道癌、外陰癌、霍奇金氏病(Hodgkin's Disease)、食道癌、小腸癌、內分泌系統癌症、甲狀腺癌、副甲狀腺癌、腎上腺癌、軟組織肉瘤、尿道癌、陰莖癌、攝護腺癌、慢性或急性白血病、淋巴細胞性淋巴瘤、膀胱癌、腎或輸尿管癌、腎細胞癌、腎盂癌、中樞神經系統(CNS)的腫瘤、原發性中樞神經系統淋巴瘤、脊椎軸心腫瘤、腦幹膠質瘤、或垂體腺瘤。
本發明之實施態樣亦提供本案所述之化合物或其醫藥上可接受之鹽於製造藥劑之用途,該藥劑可用於治療哺乳動物之異常細胞生長,尤其地其中該異常細胞生長為癌症,且更尤其地其中該癌症為肺癌、骨癌、胰臟癌、皮膚 癌、頭頸部癌症、皮膚或眼內黑色素瘤、子宮癌、卵巢癌、直腸癌、肛門區的癌症、胃癌、結腸癌、乳癌、子宮癌、輸卵管癌、子宮內膜癌、子宮頸癌、陰道癌、外陰癌、霍奇金氏病(Hodgkin's Disease)、食道癌、小腸癌、內分泌系統癌症、甲狀腺癌、副甲狀腺癌、腎上腺癌、軟組織肉瘤、尿道癌、陰莖癌、攝護腺癌、慢性或急性白血病、淋巴細胞性淋巴瘤、膀胱癌、腎或輸尿管癌、腎細胞癌、腎盂癌、中樞神經系統(CNS)的腫瘤、原發性中樞神經系統淋巴瘤、脊椎軸心腫瘤、腦幹膠質瘤、或垂體腺瘤。
另一實施態樣中,本發明提供醫藥組成物,其包含本發明化合物或其醫藥上可接受之鹽,及醫藥上可接受之載體。
另一實施態樣中,本發明提供治療哺乳動物包括人類之異常細胞生長的方法,該方法包含將治療有效量之本發明化合物或其醫藥上可接受之鹽投予該哺乳動物。另一實施態樣中,該異常細胞生長為癌症。另一實施態樣中,該癌症為肺癌、骨癌、胰臟癌、皮膚癌、頭頸部癌症、皮膚或眼內黑色素瘤、子宮癌、卵巢癌、直腸癌、肛門區的癌症、胃癌、結腸癌、乳癌、子宮癌、輸卵管癌、子宮內膜癌、子宮頸癌、陰道癌、外陰癌、霍奇金氏病(Hodgkin's Disease)、食道癌、小腸癌、內分泌系統癌症、甲狀腺癌、副甲狀腺癌、腎上腺癌、軟組織肉瘤、尿道癌、陰莖癌、攝護腺癌、慢性或急性白血病、淋巴細胞性淋巴瘤、 膀胱癌、腎或輸尿管癌、腎細胞癌、腎盂癌、中樞神經系統(CNS)的腫瘤、原發性中樞神經系統淋巴瘤、脊椎軸心腫瘤、腦幹膠質瘤、或垂體腺瘤。
定義
除非另有說明,否則本專利說明書及申請專利範圍中之下列術語具有以下討論之意義。此文節中所定義之變數諸如R、X、n等等僅供於此文節範圍內作為參考,而非意指具有與超出本定義文節範圍外所可使用者相同之意義。此外,本案所定義之許多基團可隨意地經取代。此典型取代基定義文節中的列表為例示而非意在限制本說明書及申請專利範圍內之他處所定義之取代基。
“烯基”意指如本案所定義之烷基,由至少兩個碳原子及至少一個碳-碳雙鍵所組成。代表性實例包括(但不限定於)乙烯基、1-丙烯基、2-丙烯基、1-、2-、或3-丁烯基等等。“伸烯基”意指烯基的二價形式。
“烷氧基”意指-O-烷基,其中烷基較佳地為C1-C8、C1-C7、C1-C6、C1-C5、C1-C4、C1-C3、C1-C2或C1烷基。
“烷基”意指飽和脂族烴基包括具有1至20個碳原子(“(C1-C20)烷基”)、較佳地1至12個碳原子(“(C1-C12)烷基”)、更佳地1至8個碳原子(“(C1-C8)烷基”)、或1至6個碳原子(“(C1-C6)烷基”)、或1至4個碳原子(“(C1-C4)烷基”)之直鏈及支鏈基。烷基之實例包括甲基、乙基、丙基、2-丙基、正丁基、異丁基、三級丁基、戊基、新戊基 等等。烷基可經取代或未經取代。典型之取代基包括環烷基、芳基、雜芳基、雜脂環基、羥基、烷氧基、芳氧基、巰基、烷硫基、芳硫基、氰基、鹵素、羰基、硫羰基、O-胺基甲醯基、N-胺基甲醯基、O-硫代胺基甲醯基、N-硫代胺基甲醯基、C-醯胺基、N-醯胺基、C-羧基、O-羧基、硝基、矽基、胺基及-NRxRy,其中Rx及Ry例如為氫、烷基、環烷基、芳基、羰基、乙醯基、磺醯基、三氟甲磺醯基,及組合為五或六員雜脂環。“鹵烷基”例如(C1-C8)鹵烷基意指具有一或多個鹵素取代基之烷基。“伸烷基”意指烷基的二價形式。
“炔基”意指如本案所定義之烷基,由至少兩個碳原子及至少一個碳-碳三鍵所組成。代表性實例包括(但不限定於)乙炔基、1-丙炔基、2-丙炔基、1-、2-、或3-丁炔基等等。“伸炔基”意指炔基的二價形式。
“胺基”意指-NRxRy基,其中Rx及Ry均為氫。
“(C6-C12)芳基”意指具有完全共軛π電子系統之具有6至12個碳原子的全碳單環或稠環多環基。芳基之實例(未限制)為苯基、萘基及蒽基。芳基可經取代或未經取代。典型之取代基包括鹵基、三鹵甲基、烷基、羥基、烷氧基、芳氧基、巰基、烷硫基、芳硫基、氰基、硝基、羰基、硫羰基、C-羧基、O-羧基、O-胺基甲醯基、N-胺基甲醯基、O-硫代胺基甲醯基、N-硫代胺基甲醯基、C-醯胺基、N-醯胺基、亞磺醯基、磺醯基、胺基及-NRxRy,且Rx及Ry為如上所定義者。
“氰基”意指-C≡N基。氰基可以CN表示。
“(C3-C10)環烷基”意指3至10員全碳單環、3至10員全碳雙環、全碳5員/6員或6員/6員稠合雙環、多環型稠環(“稠”環意指系統中之每個環與系統中之其他環彼此共享相鄰之碳原子配對)基,其中一或多個環可含有一或多個雙鍵但沒有一個環具有完全共軛π電子系統、及橋連全碳環系統。環烷基之實例(未限制)為環丙烷、環丁烷、環戊烷、環戊烯、環己烷、環己二烯、金剛烷、環庚烷、環庚三烯等等。環烷基可經取代或未經取代。典型之取代基包括烷基、芳基、雜芳基、雜脂環基、羥基、烷氧基、芳氧基、巰基、烷硫基、芳硫基、氰基、鹵基、羰基、硫羰基、C-羧基、O-羧基、O-胺基甲醯基、N-胺基甲醯基、C-醯胺基、N-醯胺基、硝基、胺基及-NRxRy,且Rx及Ry為如上所定義者。環烷基之例證實例為衍生(但未限制)自下列者:
“鹵素”或字首“鹵基”意指氟基、氯基、溴基及碘基。鹵素較佳地意指氟基或氯基。
“雜烷基”意指具1至20個碳原子、較佳地1至12個碳原子、更佳地1至8個碳原子、或1至6個碳原子、或1至4個碳原子之直鏈或支鏈烷基,其中之一、二或三個碳原子經選自NRx、O、及S(O)n(其中n為0、1或2)之雜原子所替代。例示之雜烷基包括烷基醚、二級或三級烷基胺、醯胺、烷基硫等等。基團可為端基或橋連基。如本案所用,所提及之正鏈當用於橋連基之情況時,乃意指連結橋連基之兩個末端位置的原子直鏈。就如“烷基”一樣,“雜烷基”上之典型取代基包括環烷基、芳基、雜芳基、雜脂環基、羥基、烷氧基、芳氧基、巰基、烷硫基、芳硫基、氰基、鹵素、羰基、硫羰基、O-胺基甲醯基、N-胺基甲醯基、O-硫代胺基甲醯基、N-硫代胺基甲醯基、C-醯胺基、N-醯胺基、C-羧基、O-羧基、硝基、矽基、胺基及-NRxRy,其中Rx及Ry例如為氫、烷基、環烷基、芳基、羰基、乙醯基、磺醯基、三氟甲磺醯基,及組合為五或六員雜脂環。“雜烯基”意指具有一或多個碳-碳雙鍵的雜烷基。“伸雜烷基”意指雜烷基的二價形式。“伸雜烯基”意指雜烯基的二價形式。
“雜芳基”意指具有5至12個碳環原子之單環或稠環基,其含有一、二、三或四個選自NRx、O、及S(O)n(其中n為0、1或2)之環雜原子,此外,亦具有完全共軛π電子系統。較佳之雜芳基包括根據上述定義之(C2-C7)雜芳基。未經取代之雜芳基的實例(未限制)為吡咯、呋喃、噻吩、咪唑、唑、噻唑、吡唑、吡啶、嘧啶、喹啉、異喹 啉、嘌呤、四唑、三嗪、及咔唑。雜芳基可經取代或未經取代。典型之取代基包括烷基、環烷基、鹵基、三鹵甲基、羥基、烷氧基、芳氧基、巰基、烷硫基、芳硫基、氰基、硝基、羰基、硫羰基、磺醯胺基、C-羧基、O-羧基、亞磺醯基、磺醯基、O-胺基甲醯基、N-胺基甲醯基、O-硫代胺基甲醯基、N-硫代胺基甲醯基、C-醯胺基、N-醯胺基、胺基及-NRxRy,且Rx及Ry為如上所定義者。醫藥上可接受之雜芳基為足夠安定以待連接至本發明化合物、調配成醫藥組成物且繼而投予有此需求之患者者。典型單環雜芳基之實例包括(但未限定於):
適當稠環雜芳基之實例包括(但未限定於):
“雜環基”意指具有3至12個環原子之單環或稠環系統,其含有一、二、三或四個選自N、O、及S(O)n(其中n為0、1或2)之環雜原子及1-9個碳原子。這些環亦可具有一或多個雙鍵。然而,這些環並不具有完全共軛π電子系統。較佳之雜環包括根據上述定義之(C2-C6)雜環。適當飽和雜脂環基的實例包括(但未限定於):
適當之部分不飽和雜脂環基的實例包括(但未限定於):
雜環基係隨意地經一或二個獨立地選自鹵基、低級烷基、經羧基取代之低級烷基、酯羥基、或單或二烷胺基的取代基取代。而且,雜環可含有橋連,包括雜環上之非相鄰碳之間的橋連,且該橋含有1至2個碳及0至1個選自NRx、O、及S(O)n(其中n為0、1或2)之雜原子。
“羥基(hydroxy)”或“羥基(hydroxyl)”意指-OH基。
“體外(In vitro)”意指在人工環境諸如(未限制)在試管內或培養基內進行之程序。
“體內(In vivo)”意指在活的有機體中諸如(未限制)於小鼠、大鼠或兔中進行之程序。
“隨意的”或“隨意地”意指隨後所述之事件或狀況可發生但也可不必發生,且該說明包括其中該事件或狀況發生的情況或其中該事件或狀況並未發生的情況。例如,“隨意地經烷基取代之雜環基”意指該烷基可存在但亦可不必存在,且該說明包括其中該雜環基經烷基取代之事態及其中該雜環基未經烷基取代之事態。
“有機體”意指由至少一個細胞所組成之任何活的實 體。活有機體可簡單地如同(例如)單一真核細胞或複雜地如同哺乳動物包括人類。
“醫藥上可接受之賦形劑”意指加至醫藥組成物中以進一步促進化合物之投予的惰性物質。賦形劑之實例包括(未限制)碳酸鈣、磷酸鈣、各種糖類及澱粉型式、纖維素衍生物、明膠、植物油及聚乙二醇。
本案所用之術語“醫藥上可接受之鹽”意指保留母化合物之生物效能及性質的彼些鹽類。此些鹽類包括:(i)酸加成鹽,其可藉將母化合物之游離鹼與無機酸諸如鹽酸、氫溴酸、硝酸、磷酸、硫酸、及過氯酸等等,或與有機酸諸如乙酸、草酸、(D)或(L)蘋果酸、馬來酸、甲磺酸、乙磺酸、對甲苯磺酸、水楊酸、酒石酸、檸檬酸、琥珀酸或丙二酸等等反應而得;或(ii)當母化合物中存在之酸性質子被金屬離子例如鹼金屬離子、鹼土金屬離子、或被鋁離子替代時所形成之鹽;或與有機鹼諸如乙醇胺、二乙醇胺、三乙醇胺、胺基丁三醇、N-甲基還原葡糖胺等等配位時所形成之鹽。
“醫藥組成物”意指一或多種本案所述化合物或其生理上/醫藥上可接受之鹽、溶劑合物、水合物或前藥,與其他化學組份諸如生理上/醫藥上可接受之載體及賦形劑的混合物。醫藥組成物的目的係欲促進化合物之投予至有機體。
本案所用之“生理上/醫藥上可接受之載體”意指不會對有機體導致顯著刺激且不會消除所投予化合物之生物活 性及性質的載體或稀釋劑。
“治療有效量”意指所投予之化合物的量,該量能緩解待治療之失調的一或多種症狀到達某種程度。有關於癌症之治療方面,治療有效量意指具有下列至少一種效應之量:(1)降低腫瘤大小;(2)抑制腫瘤轉移(亦即,減緩至某種程度,較佳地為停止);(3)抑制腫瘤生長到某種程度(亦即,減緩至某種程度,較佳地為停止),及(4)緩解與癌症有關之一或多種症狀到某種程度(或者,較佳地為消除)。
“治療(Treat)”、“治療(treating)”及“治療(treatment)”意指減輕或消除甲基轉移酶媒介性細胞失調及/或其伴隨而來之症狀的方法。尤其有關於癌症方面,這些術語僅意指受癌症所影響之個體的預期壽命將會增加或者該疾病之一或多種症狀將會減少。
合成本發明化合物之一般反應圖可見於本案之實例文節中。
除非另有指定,否則本案所提及之所有本發明化合物均包括其鹽類、溶劑合物、水合物及複合物,及其鹽之溶劑合物、水合物及複合物,包括其多形物、立體異構物、 及同位素標記型式。
醫藥上可接受之鹽包括酸加成鹽及鹼鹽(包括二鹽)。
適當之酸加成鹽係由可形成無毒性鹽之酸形成。實例包括乙酸鹽、天冬胺酸鹽、苯甲酸鹽、苯磺酸鹽、碳酸氫鹽/碳酸鹽、硫酸氫鹽/硫酸鹽、硼酸鹽、樟腦磺酸鹽、檸檬酸鹽、乙二磺酸鹽、乙磺酸鹽、甲酸鹽、富馬酸鹽、葡庚糖酸鹽、葡萄糖酸鹽、葡萄糖醛酸鹽、六氟磷酸鹽、海苯酸鹽、鹽酸鹽/氯化物、氫溴酸鹽/溴化物、氫碘酸鹽/碘化物、羥乙磺酸鹽、乳酸鹽、蘋果酸鹽、馬來酸鹽、丙二酸鹽、甲磺酸鹽、甲基硫酸鹽、萘甲酸鹽、2-萘磺酸鹽、菸鹼酸鹽、硝酸鹽、乳清酸鹽、草酸鹽、棕櫚酸鹽、巴莫酸鹽、磷酸鹽/磷酸氫鹽/磷酸二氫鹽、蔗糖酸鹽、硬脂酸鹽、琥珀酸鹽、酒石酸鹽、甲苯磺酸鹽、及三氟乙酸鹽。
適當之鹼鹽係由可形成無毒性鹽之鹼形成。實例包括鋁、精胺酸、苄星、鈣、膽鹼、二乙胺、二醇胺、甘胺酸、離胺酸、鎂、甲葡胺、乙醇胺、鉀、鈉、胺基丁三醇及鋅鹽。欲回顧適當之鹽,請參見“Handbook of Pharmaceutical Salts:Properties,Selection,and Use”by Stahl and Wermuth(Wiley-VCH,Weinheim,Germany,2002),其揭示內容乃整體併入本案中以供參考。
本發明化合物之醫藥上可接受之鹽可藉將化合物溶液視情況與期望之酸或鹼一起混合而輕易製得。鹽可由溶液中沈澱出且藉過濾法收集或者可藉將溶劑蒸發而回收。鹽中之離子化程度可由完全離子化至幾乎未離子化間變化。
本發明化合物可以非溶劑合化及溶劑合化形式存在。術語“溶劑合物”在本案中用以說明包括本發明化合物及一或多種醫藥上可接受之溶劑分子例如乙醇的分子複合物。術語‘水合物’係用在當溶劑為水時。根據本發明之醫藥上可接受的溶劑合物包括其中結晶溶劑可經同位素取代例如D2O、d6-丙酮、d6-DMSO之水合物及溶劑合物。
亦包括在本發明範圍內者為複合物諸如晶籠化合物、藥物-宿主包合複合物,其中與上述溶劑合物成對比,藥物及宿主係以化學計量或非學計量之量存在。亦包括者為含有二或多種有機及/或無機組份之藥物的複合物,其可以化學計量或非化學計量之量存在。所得之複合物可予離子化、部分離子化、或非離子化。欲回顧此些複合物,參見J Pharm Sci,64(8),1269-1288 by Haleblian(August 1975),其揭示內容乃整體併入本案中以供參考。
亦在本發明範圍內者為本發明化合物之多形物、前藥、及異構物(包括光學、幾何及互變異構物)。
本發明化合物之衍生物本身可具有少許或不具有藥理學活性,但當投予患者時,可例如藉由水解性裂解作用轉化成本發明化合物。此衍生物稱之為“前藥”。有關於前藥使用的進一步資訊可見於‘Pro-drugs as Novel Delivery Systems,Vol.14,ACS Symposium Series(T Higuchi and W Stella) and‘Bioreversible Carriers in Drug Design’,Pergamon Press,1987(ed.E B Roche,American Pharmaceutical Association)中,其揭示內容乃整體併入本 案中以供參考。
根據本發明之前藥可(例如)藉將本發明化合物中存在的適當官能基以熟知技藝者已知的某些部分例如述於"Design of Prodrugs" by H Bundgaard(Elsevier,1985)中之“前部分”替代而製得,其揭示內容乃整體併入本案中以供參考。
根據本發明之前藥的一些實例包括:(i)其中該化合物含有接酸官能基-(COOH)、其酯,例如,將氫以(C1-C8)烷基替代;(ii)其中該化合物含有醇官能基(-OH)、其醚,例如,將氫以(C1-C6)烷醯氧基甲基替代;及(iii)其中該化合物含有一級或二級胺基官能基(-NH2或-NHR,其中R≠H),其醯胺,例如,將一或二個氫以(C1-C10)烷醯基替代。
根據前述實例及其他前藥型式實例之替代基團的進一步實例可見於上述參考資料中。
最後,某些本發明化合物本身可作為其他本發明化合物的前藥。
含有一或多個不對稱碳原子之本發明化合物可以二或多種立體異構物形式存在。當根據本發明之化合物具有至少一個手性中心時,彼等可因此以鏡像異構物形式存在。當化合物具有二或多個手性中心時,彼等可另外地以非鏡像異構物形式存在。同樣地,其中本發明化合物含有環丙基或其他環狀基且其中手性存在、及烯基或伸烯基時,則 幾何順/反(或Z/E)異構物是可能的。當化合物含有(例如)酮基或肟基或芳族部分時,則可發生互變異構現象。單一化合物可顯現大於一種型式之異構現象。
在本發明範圍內者包括本發明之所有立體異構物、幾何異構物及互變異構形式,包括顯現大於一種型式之異構現象的化合物,及其一或多種之混合物。亦包括者為酸加成或鹼鹽,其中相對離子為光學活性,例如D-乳酸鹽或L-離胺酸,或消旋物,例如DL-酒石酸鹽或DL-精胺酸。
順/反異構物可藉熟諳此藝者詳知之慣用技術例如層析法及分段結晶法分離。
用於製備/分離出個別鏡像異構物之慣用技術包括由適當光學純先質中進行手性合成或將消旋物(或鹽或衍生物之消旋物)使用(例如)手性高壓液相層析(HPLC)或超臨界流體層析法(SFC)進行解析。
另外,消旋物(或消旋物先質)可與適當之光學活性化合物例如醇或者當化合物含有酸性或鹼性部分,則與酸或鹼諸如酒石酸或1-苯基乙胺反應。所得之非鏡像異構物混合物可藉層析法及/或分段結晶法分離且藉熟諳此藝者詳知之方法將一或二種非鏡像異構物轉化成相應之純鏡像異構物。
立體異構集成物可藉熟諳此藝者已知之慣用技術分離;例如參見“Stereochemistry of Organic Compounds”by E L Eliel(Wiley,New York,1994),其揭示內容乃整體併入本案中以供參考。
本發明亦包括本發明之同位素標記化合物,其中一或多個原子被具有相同原子數但原子質量或質量數不同於自然界通常發現之原子質量或質量數的原子所替代。適於包括在本發明化合物中的同位素實例包括氫之同位素,諸如2H及3H;碳之同位素,諸如11C、13C及14C;氯之同位素,諸如36Cl;氟之同位素,諸如18F;碘之同位素,諸如123I及125I;氮之同位素,諸如13N及15N;氧之同位素,諸如15O、17O及18O;磷之同位素,諸如32P;及硫之同位素,諸如35S。本發明之某些同位素標記化合物,例如併入放射活性同位素者,可用於藥物及/或基質組織分佈研究中。放射活性同位素氚(亦即3H)及碳-14(亦即14C)特別可用於供此目的,因其易於併入且偵測方法方便之故。以較重之同位素諸如氘(亦即2H)取代則可能因為較大之代謝安定性,例如提高於體內之半生期或降低劑量需求而得到某些醫療優勢,因此在一些狀況下可能較佳。以正子發射同位素諸如11C、18F、15O及13N取代則可用於正子斷層造影(PET)研究中以檢查基質受體之佔有率。
本發明之同位素標記化合物通常可藉熟諳技藝者已知之慣用技術或藉類似於本案所述之方法,使用適當之同位素標記試劑取代另於他處使用之未標記試劑製得。
根據本發明之醫藥上可接受之溶劑合物包括其中結晶溶劑可經同位素取代例如D2O、d6-丙酮、d6-DMSO者。
欲達醫藥用途的本發明化合物可以晶態或非晶態產物形式、或其混合物形式投予。彼等可藉諸如沈澱、結晶、 凍乾、噴霧乾燥、或蒸發乾燥等方法(例如)以固體塞(plug)、粉末、或薄膜形式獲得。微波或射頻乾燥法可用以達此目的。
本化合物可單獨地或與一或多種其他本發明化合物組合地投予。通常,彼等係以與一或多種醫藥上可接受之賦形劑聯合地形成配方形式投予。本案所用之術語’賦形劑’係指除了本發明化合物以外的任何成分。賦形劑之選擇在很大程度上將依諸如特定投予模式、賦形劑對溶解度及安定性之效應,及劑型之特性等因素而定。
適於供遞送本發明化合物之醫藥組成物及其製備方法將會是熟諳此藝者顯而易見的。此組成物及其製備方法可見於(例如)‘Remington’s Pharmaceutical Sciences’,19th Edition(Mack Publishing Company,1995)中,其揭示內容乃整體併入本案中以供參考。
經口投予:本發明化合物可經口投予。經口投予可包括吞嚥,故化合物進入胃腸道,或者可使用頰部或舌下投予,化合物可藉此而由口部直接進入血流中。
適於經口投予之配方包括固體配方諸如片劑;含有微粒、液體、或粉末之膠囊;錠劑(包括填充液體之錠劑);咀嚼錠;多重-及奈米-微粒;凝膠;固體溶液;微脂粒;薄膜(包括黏膜黏著性);卵狀小體;噴霧及液體配方。
液體配方包括懸浮液,溶液,糖漿及酏劑。此些配方可作為軟或硬膠囊中之填料且典型地包括載體,例如,水、乙醇、聚乙二醇、丙二醇、甲基纖維素、或適當的 油,及一或多種乳化劑及/或懸浮劑。液體配方亦可藉將(例如)來自小藥囊中之固體予以再構成而製得。
本發明化合物亦可用於速溶性、速崩性劑型中諸如述於Expert Opinion in Therapeutic Patents,11(6),981-986 by Liang and Chen(2001)中者,其揭示內容乃整體併入本案中以供參考。
有關片劑劑型方面,依劑量而定,藥物可配製成佔劑型之1重量%至80重量%,更常佔劑型之5重量%至60重量%。除了藥物之外,片劑通常含有崩解劑。崩解劑之實例包括乙醇酸澱粉鈉、羧甲基纖維素鈉、羧甲基纖維素鈣、交聯羧甲基纖維素鈉、交聯聚乙烯吡咯啶酮、聚乙烯吡咯啶酮、甲基纖維素、微晶纖維素、低級烷基-取代之羥丙基纖維素、澱粉、預明膠化澱粉及藻酸鈉。通常,崩解劑佔劑型之1重量%至25重量%,較佳為5重量%至20重量%。
黏結劑通常用以賦予片劑配方黏著性質。適當黏結劑實例包括微晶纖維素、明膠、糖類、聚乙二醇、天然及合成膠、聚乙烯吡咯啶酮、預明膠化澱粉、羥丙基纖維素及羥丙基甲基纖維素。片劑亦可含有稀釋劑,諸如乳糖(單水合物、噴霧乾燥化單水合物、無水等等)、甘露糖醇、木糖醇、右旋糖、蔗糖、山梨糖醇、微晶纖維素、澱粉及磷酸氫鈣二水合物。
片劑亦可隨意地包括表面活化劑,諸如月桂基硫酸鈉及聚山梨酯-80,及助流劑諸如二氧化矽及滑石。當存在 時,表面活化劑典型地佔片劑之0.2重量%至5重量%,且助流劑典型地佔片劑之0.2重量%至1重量%。
片劑一般亦含有潤滑劑諸如硬脂酸鎂、硬脂酸鈣、硬脂酸鋅、硬脂富馬酸鈉、及硬脂酸鎂與月桂基硫酸鈉之混合物。潤滑劑一般以劑型之0.25重量%至10重量%,較佳地0.5重量%至3重量%的量存在。
其他慣用成分包括抗氧化劑、著色劑、調味劑、防腐劑及遮味劑。
例示片劑含有至多約80重量%藥物,約10重量%至約90重量%黏結劑,約0重量%至約85重量%稀釋劑,約2重量%至約10重量%崩解劑,及約0.25重量%至約10重量%潤滑劑。
片劑摻合物可直接壓縮或藉輥壓縮以形成片劑。片劑摻合物或一部分摻合物可於壓片之前另予濕粒化、乾粒化、熔體造粒化,熔體凍凝化、或擠壓。最終配方可包括一或多層且可予包衣或未包衣;或裝入膠囊中。
片劑之配方詳細地於“Pharmaceutical Dosage Forms:Tablets,Vol.1”,by H.Lieberman and L.Lachman,Marcel Dekker,N.Y.,N.Y.,1980(ISBN 0-8247-6918-X)中討論,其揭示內容乃整體併入本案中以供參考。用於經口投予之固體配方可調配成立即釋放及/或調控釋放型。調控釋放配方包括延遲-、持續-、脈衝-、控制-、靶向及程序化釋放。
供本發明目的用之適當調控釋放配方乃述於美國專利 號6,106,864中。其他適當釋放技術之細節諸如高能量分散術以及滲透及包衣微粒等可見於Verma et al,Pharmaceutical Technology On-line,25(2),1-14(2001)中。咀嚼膠在達到控制性釋放之用途則述於WO 00/35298中。這些參考資料之揭示內容乃整體併入本案中以供參考。
非經腸部投予
本發明化合物亦可直接投至血流中,至肌肉中,或至內部器官中。供非經腸部投予之適當方法包括靜脈內、動脈內、腹膜內、鞘內、腦室內、尿道內、胸骨內、顱內、肌內及皮下。供非經腸部投予之適當裝置包括針(包括微針)注射器、無針頭注射器及輸注技術。
非經腸部配方典型地為水性溶液,其可含有賦形劑諸如鹽類、醣類及緩衝劑(例如至3-9之pH),但在一些應用方面,彼等更適於調配成無菌非水性溶液形式或乾燥形式以待與適當載劑諸如無菌、無熱原之水一起使用。
非經腸部配方於無菌條件下(例如)藉凍乾法之製備可使用熟諳此藝者詳知之標準醫藥技術輕易完成。
非經腸部溶液製備中所用之本發明化合物的溶解度可藉使用適當調配技術,諸如置入溶解度增強劑而增加。用於非經腸部投予之配方可調配成立即釋放及/或調控釋放型。調控釋放配方包括延遲-、持續-、脈衝-、控制-、靶向及程序化釋放。因此本發明化合物可調配成固體、半固體、或搖變性液體以供以植入補給站之形式投予以提供活 性化合物之調控釋放。此配方之實例包括藥物塗佈支架及PGLA微球體。
局部投予
本發明化合物亦可局部地亦即皮部或經皮地投至皮膚或黏膜。供此目的之典型配方包括凝膠、水凝膠、洗劑、溶液、乳膏、軟膏、撒布劑、敷料、泡沫、薄膜、皮膚貼布、糯米紙、植入物、藥棉、纖維、繃帶及微乳膠。微脂體亦可使用。典型載體包括酒精、水、礦油、液體石蠟、白凡士林、甘油、聚乙二醇及丙二醇。滲透增強劑可併入。例如參見J Pharm Sci,88(10),955-958 by Finnin and Morgan(October 1999)。局部投予之其他方法包括藉電穿孔法、離子電滲法、聲泳法、超音波導入法及微針或無針頭(例如PowderjectTM、BiojectTM等)注射法遞送。這些參考資料之揭示內容乃整體併入本案中以供參考。
用於局部投予之配方可調配成立即釋放及/或調控釋放型。調控釋放配方包括延遲-、持續-、脈衝-、控制-、靶向及程序化釋放。
吸入/鼻內投予
本發明化合物亦可由鼻內或藉吸入法投予,典型地以乾燥粉末形式(單獨地,以混合物形式,例如於與乳糖之乾燥摻合物中,或以混合型組份微粒形式,例如與磷脂諸如磷脂醯膽鹼混合)由乾燥粉末吸入器中投予或以氣溶膠 噴霧形式由加壓容器、泵、噴霧器、霧化器(較佳地使用電動力學以產生細水霧之霧化器)、或氣霧器中,伴隨或不伴隨使用適當推進劑諸如1,1,1,2-四氟乙烷或1,1,1,2,3,3,3-七氟丙烷投予。供鼻內用途方面,粉末可包含生物黏附劑,例如甲殼素或環糊精。
加壓容器、泵、噴霧器、霧化器或氣霧器含有本發明化合物之溶液或懸浮液,其包含(例如)乙醇、水性乙醇、或適當之用於將活性成分分散、溶解或延長釋放的其他製劑、作為溶劑之推進劑、以及隨意之表面活性劑諸如山梨糖醇酐三油酸酯、油酸或寡乳酸。
在用於乾燥粉末或懸浮液配方之前,先將藥產物微粒化成適於藉吸入法遞送之尺寸(典型地小於5微米)。其可藉任合適當粉碎方法諸如螺旋噴射磨法、流體床噴射磨法、超臨界流體法以形成奈米微粒、高壓均質法、或噴霧乾燥法達成。
用於吸入器或吹入器中之膠囊(例如由明膠或羥丙基甲基纖維素製得)、鋁塑包及藥筒可予調配以含有本發明化合物、適當粉末藥基諸如乳糖或澱粉及效能改良劑諸如l-亮胺酸、甘露糖醇、或硬脂酸鎂之粉末混合物。乳糖可為無水或為單水合物形式,較佳地為後者。其他適當賦形劑包括葡聚糖、葡萄糖、麥芽糖、山梨糖醇、木糖醇、果糖、蔗糖及海藻糖。
用於使用電動力學以產生細水霧之霧化器中的適當溶液配方可含有每次驅動1μg至20mg之本發明化合物且驅 動量可在1μL至100μL間變化。典型配方包括本發明化合物、丙二醇、無菌水、乙醇及氯化鈉。可用以取代丙二醇之其他溶劑包括甘油及聚乙二醇。
適當調味劑諸如薄荷醇及左旋薄荷醇,或甜味劑諸如糖精或糖精鈉,可加至欲供吸入/鼻內投予之彼些本發明配方中。
用於吸入/鼻內投予之配方可使用例如聚(DL-乳酸-乙醇酸(PGLA)調配成立即釋放及/或調控釋放型。調控釋放配方包括延遲-、持續-、脈衝-、控制-、靶向及程序化釋放。
如為乾燥粉末吸入器及氣溶膠,則劑量單位係藉由可遞送計量之量的閥來決定。根據本發明之單位典型地安排成投予含有期望量之本發明化合物的計量劑量或“吸入(puff)”。整體每日劑量可以單一劑量投予或者更常以分劑量整日投予。
直腸部/陰道部投予:本發明化合物可由直腸部或陰道部,例如以坐藥、子宮托、或灌腸劑形式投予。可可脂為傳統之栓劑基質,但視情況可使用各種替代品。用於直腸部/陰道部投予之配方可調配成立即釋放及/或調控釋放型。調控釋放配方包括延遲-、持續-、脈衝-、控制-、靶向及程序化釋放。
眼部投予:本發明化合物亦可直接投予眼部或耳部,典型地以於等張、酸鹼值經調整、無菌鹽水中之微粒化懸浮液或溶液的滴劑形式投予。適於眼部及耳部投予之其他 配方包括軟膏、可生物降解性(例如可吸收性凝膠藥棉、膠原)及非可生物降解性(例如矽酮)植入物、糯米紙、透鏡、及微粒或囊泡系統諸如泡囊體或微脂體。聚合物諸如交聯聚丙烯酸、聚乙烯醇、玻尿酸、纖維素聚合物例如羥丙基甲基纖維素、羥乙基纖維素或甲基纖維素、或雜多醣聚合物例如結冷膠可與防腐劑諸如苯甲烷氯化銨一起併入。此些配方亦可藉離子電滲法遞送。
用於眼部/耳部投予之配方可調配成立即釋放及/或調控釋放型。調控釋放配方包括延遲-、持續-、脈衝-、控制-、靶向及程序化釋放。
其他技術
本發明化合物可與可溶性大分子實體諸如環糊精及其適當衍生物或含聚乙二醇之聚合物組合地用於上述任何投予模式中以改善其溶解度、溶解速率、遮味、生物利用率及/或安定性。
藥物-環糊精複合物(例如)經發現通常可用於大多數劑型及投予路徑。包涵體及非包涵體複合物均可使用。除了直接與藥物複合之外,環糊精亦可用作為輔助添加劑,亦即作為載體、稀釋劑、或溶解劑。最常用於此目的者為α-、β-及γ-環糊精,其實例可見於國際專利申請案案號WO 91/11172、WO 94/02518及WO 98/55148中,其揭示內容乃整體併入本案中以供參考。
劑量:活性化合物之投予量將依待治療個體、失調或 病症之嚴重性、投予速率、化合物之配置及處方醫師的判斷而定。然而,有效劑量典型地在每天每公斤體重約0.001至約100毫克之範圍內,較佳地約0.01至約35毫克/公斤/天,以單一或分劑量方式。對70公斤人類而言,此等於約0.07至約7000毫克/天,較佳地約0.7毫克至約2500毫克/天。一些情況下,低於上述範圍之下限的劑量值可能就非常足夠,而其他情況下可能仍要使用不會導致任何有害副作用的更大劑量,且此更大劑量典型地要先分成一些較小劑量以供整日投予。
套組配件:因為可能合乎需要的是投予活性化合物之組合,例如,以供治療特定疾病或病症之目的,故在本發明範圍內者為二或多種醫藥組成物(其中至少一種含有根據本發明之化合物)可方便地組合於適於組合物之共同投予的套組形式中。故本發明之套組包括二或多種個別醫藥組成物(其中至少一者含有本發明化合物),及分別容納該些組成物之器具諸如容器、分隔瓶或分隔箔包。此套組之實例為眾所熟悉之用於包裝片劑、膠囊等等之罩板包裝。
本發明之套組尤其適於不同劑型之投予,例如經口及非經腸部,以供於不同給藥間隔個別的組成物投予,或供個別組成物互相的滴定。欲協助順從性,套組典型地包括投予指引且可備有記憶輔助工具。
實例 核糖化合物之一般合成反應圖
反應圖1所例示,適當經保護之核糖諸如1a可購買或合成(J.Am.Chem.Soc.1988,110,7128-7135)。典型地,將(3aR,6R,6aR)-6-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-醇(1a)於C1位置活化成脫離基諸如:使用N,N-二乙基-α,α-二氟-(-甲基苄基)胺、二乙胺基三氟化硫(DAST)或氫氟酸吡啶活化成氟基;使用CCl4及HMPT、二甲基三氯甲胺、或甲磺醯氯活化成氯基;使用三甲基矽基溴、溴化氫或四溴化碳活化成溴基;或使用乙酸酐及吡啶活化成乙酸鹽。典型地這些反應係於範圍在-78℃至-20℃的低溫、於溶劑諸如甲苯中進行。將C1經活化之糖以核苷或含氮雜環置 換係以鹼諸如氫化鈉、氫氧化鉀或TDA-1完成以得化合物諸如1b。這些反應典型地於室溫、於與活化反應相同的溶劑中進行。另外,C1經活化之糖的置換可以核苷或含氮雜環及三氟甲磺酸三甲基矽酯或路易斯酸諸如二乙基二氯化鋁完成,以得化合物諸如1b。這些反應典型地於溶劑諸如甲苯、乙腈、THF或類似溶劑中、於範圍在-78℃至60℃的溫度進行。1b一級醇之脫保護反應典型地以氟化物源諸如TBAF完成,以得化合物諸如1c。典型地,這些反應係於THF溶劑中、於範圍在0℃至室溫之溫度進行。一級醇1c氧化成化合物羧酸1d之反應典型地以TEMPO及NaClO2或PhI(OAc)2完成。典型地,這些反應係於乙腈與水混合液中、於範圍在-20℃至60℃之溫度進行。將類似於羧酸1d之化合物經由以N,O-二甲基羥胺HCl及標準醯胺偶合試劑諸如HOBT及EDCI、T3P或HATU以鹼諸如DIPEA或TEA處理而轉化成化合物諸如Weinreb醯胺1e(溫勒伯醯胺1e)。典型地,這些反應係於溶劑諸如DMF或THF中完成及於範圍在0℃至60℃之溫度進行。Weinreb醯胺(溫勒伯醯胺)諸如1e係使用烷基及芳基金屬試劑諸如烷基及芳基格任雅Grignards(M=Mg)、烷基及芳基鋰試劑、銅酸烷酯及芳酯、鋅酸烷酯及芳酯以及其他有機金屬試劑而轉化成烷基及芳基酮諸如1f。典型地這些反應係於醚性溶劑諸如THF、MeTHF、二烷或類似溶劑中、於範圍在-78℃至60℃之溫度進行。烷基及芳基酮諸如1f可使用還原劑諸如NaBH4、LiBH4、LiAlH4、 DIBAL及其他而轉化成二級醇諸如1g。典型地這些反應可於各種溶劑諸如DCM、THF、MeOH、EtOH或其他溶劑中、於各種溫度進行。烷基及芳基酮諸如1f可較佳地使用手性還原條件諸如RuCl(對異丙基甲苯)[(R,R)-Ts-DPEN]及甲酸鈉(J.Org.Chem,2014,79,3238-3243)轉化成非鏡像異構物富集之二級醇諸如1g。典型地,這些反應係於EtOAc溶劑中完成及於室溫進行。最後,化合物諸如1g可藉以酸諸如TFA或稀HCl處理予以脫保護以得三醇化合物諸如1h。典型地這些反應係於水之存在下、於0℃或室溫完成。每一步驟之化合物可藉標準技術諸如管柱層析法、結晶法、逆相HPLC或SFC予以純化。如有需要,1g1h之非鏡像異構物的分離可以技藝中已知之標準方法諸如手性SFC或HPLC進行,以得單一非鏡像異構物。
反應圖2所例示,化合物諸如1c可於一級醇以試劑諸如氰基伸甲基三丁基磷烷予以活化。含氮芳族雜環諸如吡咯、吡唑、咪唑或類似雜環可用於反應中以產生化合物諸如2a。典型地,這些反應係於甲苯、THF、乙腈或類 似溶劑中、於範圍在室溫至100℃的溫度完成。化合物諸如2a可藉以酸諸如TFA或稀HCl處理予以脫保護以呈現二醇化合物諸如2b。典型地這些反應係於水之存在下、於0℃或室溫完成。每一步驟之化合物可藉標準技術諸如管柱層析法、結晶法、逆相HPLC或手性SFC予以純化。
反應圖3所例示,烷基及芳基酮諸如化合物1f可使用氟化試劑諸如二乙胺基三氟化硫、DAST、BAST、NFSI或類似試劑轉化成相應之胚二氟化合物諸如3a。這些反應典型地於鹵化試劑諸如DCM或DCE中進行。化合物諸如3a可藉以酸諸如TFA或稀HCl處理予以脫保護以呈現二醇化合物諸如3b。典型地這些反應係於水之存在下、於0℃或室溫完成。每一步驟之化合物可藉標準技術諸如管柱層析法、結晶法、逆相HPLC或手性SFC予以純化。
來蘇糖化合物之一般合成反應圖
反應圖4所例示,內酯化合物諸如4a可使用還原試劑諸如LiAlH4、NaBH4、LiBH4、DIBAL或類似試劑轉化成鄰位羥基內醚化合物諸如4b。典型地這些反應可於各種溶劑諸如DCM、THF、MeOH、EtOH或其他溶劑中、於各種溫度下進行(J.Am.Chem.Soc.1983,105,3661-3672)。鄰位羥基內醚化合物諸如4b可藉與烷基鏻鹽諸如異丙基三苯基碘化鏻及鹼諸如丁基鋰、氫化鈉、六甲基二矽基胺鋰或類似之鹼反應而轉化成烯化合物諸如4c。典型地這些反應係於溶劑諸如甲苯、THF或類似之溶劑中、於範圍在-78℃至室溫之溫度進行(J.Org.Chem.1993,58,3277-3284)。將一級醇化合物諸如4c使用超價碘化物試劑諸如戴斯-馬丁試劑(Dess-Martin Periodinane)、DMSO連同草醯氯或亞硫醯氯之活化、或經由其化氧化試劑而氧化成醛諸如化合物4d。這些反應 典型地於各種溶劑諸如DCM、THF、乙腈或DCE中、於範圍在0℃至80℃之溫度進行。將醛諸如4d使用芳基金屬試劑諸如芳基格任雅(aryl Grignards)(M=Mg)、芳基鋰試劑、銅酸芳酯、鋅酸芳酯以及其他有機金屬試劑轉化成芳基醇諸如4e4f。典型地這些反應係於醚性溶劑諸如THF、MeTHF、二烷或類似溶劑中、於範圍在-78℃至60℃之溫度進行。芳基醇諸如4f可藉以臭氧及還原試劑諸如二甲基硫或三苯膦處理而轉化成鄰位羥基內醚諸如4g。典型地,這些反應係於溶劑諸如DCM、THF、MeOH或類似溶劑中、於範圍在-78℃至0℃之溫度進行。典型地,鄰位羥基內醚諸如化合物4g係於C1位置活化成脫離基諸如:使用N,N-二乙基-α,α-二氟-(-甲基苄基)胺、二乙胺基三氟化硫(DAST)或氫氟酸吡啶活化成氟基;使用CCl4及HMPT、二甲基三氯甲胺、或甲磺醯氯活化成氯基;使用三甲基矽基溴、溴化氫或四溴化碳活化成溴基;或使用乙酸酐及吡啶活化成乙酸鹽。典型地這些反應係於範圍在-78℃至-20℃的低溫、於溶劑諸如甲苯中進行。將C1經活化之鄰位羥基內醚以核苷或含氮雜環置換係以鹼諸如氫化鈉、氫氧化鉀或TDA-1完成以得化合物諸如4h。這些反應典型地於室溫、於與活化反應相同的溶劑中進行。另外,C1經活化之鄰位羥基內醚的置換可以核苷或含氮雜環及三氟甲磺酸三甲基矽酯或路易斯酸諸如二乙基二氯化鋁完成,以得化合物諸如4h。這些反應典型地於溶劑諸如甲苯、乙腈、THF或類似溶劑中、於範圍在- 78℃至60℃的溫度進行。化合物諸如4h可藉以酸諸如TFA或稀HCl處理予以脫保護以呈現二醇化合物諸如4i。典型地這些反應係於水之存在下、於0℃或室溫完成。每一步驟之化合物可藉標準技術諸如管柱層析法、結晶法、逆相HPLC或SFC予以純化。如有需要,4e4f之非鏡像異構物的分離可以技藝中已知之標準方法諸如手性SFC或HPLC進行,以得單一非鏡像異構物。
反應圖5所例示,鄰位羥基內醚諸如化合物5c可用購買的或者藉將D-葡糖酸內酯(5a)或(3R,4S,5S)-5-((R)-1,2-二羥基乙基)-3,4-二羥基二氫呋喃-2(3H)-酮予以保護,且將其藉以丙酮或2,2-二甲氧基丙烷及酸諸如對甲苯 磺酸或稀HCl處理予以保護以形成化合物諸如5b而合成。典型地,這些反應係於溶劑諸如甲苯或丙酮中、於室溫進行(Synthesis 2008,22,3682-3686)。經保護之內酯化合物諸如5b可使用還原劑諸如LiAlH4、NaBH4、LiBH4、DIBAL或類似試劑轉化成鄰位羥基內醚化合物諸如5c。典型地這些反應可於各種溶劑諸如DCM、THF、MeOH、EtOH或其他溶劑中、於各種溫度進行(J.Org.Chem.1984,49,3994-4003)。鄰位羥基內醚諸如5c之活化可C1位置達成而活化成脫離基諸如;使用N,N-二乙基-α,α-二氟-(-甲基苄基)胺、二乙胺基三氟化硫(DAST)或氫氟酸吡啶活化成氟基;使用CCl4及HMPT、二甲基三氯甲胺、或甲磺醯氯活化成氯基;使用三甲基矽基溴、溴化氫或四溴化碳活化成溴基;或使用乙酸酐及吡啶活化成乙酸鹽。典型地這些反應係於範圍在-78℃至-20℃的低溫、於溶劑諸如甲苯中進行。將C1經活化之糖以核苷或含氮雜環置換係以鹼諸如氫化鈉、氫氧化鉀或TDA-1完成以得化合物諸如5d。這些反應典型地於室溫、於與活化反應相同的溶劑中進行。另外,C1經活化之糖的置換可以核苷或含氮雜環及三氟甲磺酸三甲基矽酯或路易斯酸諸如二乙基二氯化鋁完成,以得化合物諸如5d。這些反應典型地於溶劑諸如甲苯、乙腈、THF或類似溶劑中、於範圍在-78℃至60℃的溫度進行。化合物諸如5d可藉以弱乙酸處理予以選擇性地脫保護以得二醇諸如5e。典型地這些反應係於水性乙酸中、於室溫進行。二醇化合物諸如5e可 藉以溫和氧化劑諸如過碘酸鈉或類似試劑處理而轉化成醛化合物諸如5f。典型地,這些反應係於溶劑諸如THF、乙腈或水中、於室溫進行。將醛化合物諸如5f使用烷基及芳基金屬試劑諸如烷基及芳基格任雅(aryl Grignards)(M=Mg)、芳基鋰試劑、銅酸烷酯及芳酯、鋅酸烷酯及芳酯以及其他有機金屬試劑轉化成烷基及芳基醇諸如5g5h。典型地這些反應係於醚性溶劑諸如THF、MeTHF、二烷或類似溶劑中、於範圍在-78℃至60℃之溫度進行。化合物諸如5g5h可藉以酸諸如TFA或稀HCl處理予以脫保護以呈現三醇化合物諸如5i5j。典型地這些反應係於水之存在下、於0℃或室溫完成。每一步驟之化合物可藉標準技術諸如管柱層析法、結晶法、逆相HPLC或SFC予以純化。如有需要,5g5h5i5j之非鏡像異構物的分離可以技藝中已知之標準方法諸如手性SFC或HPLC進行,以得單一非鏡像異構物。
反應圖6所例示,醛化合物諸如5f可以試劑諸如 TOSMIC處理,然後環化反應可以試劑諸如碳酸鉀或氨促進以形成5員環雜環化合物諸如6a。典型地,這些反應係於溶劑諸如MeOH、EtOH、THF或類似溶劑中、於範圍在25℃至80℃之溫度進行。另一替代方法中,醛化合物諸如5f可以乙炔性金屬化合物諸如乙炔基溴化鎂或類似試劑處理以形成炔丙基醇。這些反應典型地於醚性溶劑諸如THF、MeTHF、二烷或類似溶劑中、於範圍在-78℃至0℃之溫度完成。然後將炔丙基醇使用氧化劑諸如戴斯馬丁試劑(Dess Martin Periodinane)或類似試劑氧化成炔丙基酮,繼而以肼予以環化以得5員環雜環化合物諸如6a。典型地,氧化反應係於溶劑諸如DCM、DCE或類似溶劑、於室溫進行。然後將粗製材料萃取且與期望之肼於範圍在25℃至80℃之溫度再溶於溶劑諸如MeOH、EtOH或類似溶劑中。化合物諸如6a可藉以酸諸如TFA或稀HCl處理予以脫保護以呈現二醇化合物諸如6b。典型地這些反應係於水之存在下、於0℃或室溫完成。每一步驟之化合物可藉標準技術諸如管柱層析法、結晶法、逆相HPLC或SFC予以純化。如有需要,6b之分離可以技藝中已知之標準方法諸如手性SFC或HPLC進行,以得單一鏡像異構物。
C-醣苷化合物之一般合成反應圖
反應圖7所例示,化合物諸如7a(其可藉各種方法合成(J.Med.Chem.1974,17,1286-1289;US2012/77814 A1,2012))可藉以TEMPO及NaClO2或PhI(OAc)2或類似氧化試劑處理而氧化成羧酸諸如7b。典型地,這些反應應係於乙腈及水混合液中、於範圍在-20℃至60℃之溫度進行。將類似於羧酸7b之化合物經由以N,O-二甲基羥胺HCl及標準醯胺偶合試劑諸如HOBT及EDCI、T3P或HATU以鹼諸如DIPEA或TEA處理而轉化成化合物諸如Weinreb醯胺7c(溫勒伯醯胺7c)。典型地,這些反應係於溶劑諸如DMF或THF中完成及於範圍在0℃至60℃之溫度進行。Weinreb醯胺(溫勒伯醯胺)諸如7c係使用烷基及芳基金屬試劑諸如烷基及芳基格任雅Grignards(M=Mg)、烷基及芳基鋰試劑、銅酸烷酯及芳酯、鋅酸烷酯及芳酯以 及其他有機金屬試劑而轉化成烷基及芳基酮諸如7d。典型地這些反應係於醚性溶劑諸如THF、MeTHF、二烷或類似溶劑中、於範圍在-78℃至60℃之溫度進行。烷基及芳基酮諸如7d可使用還原劑諸如NaBH4、LiBH4、LiAlH4、DIBAL及其他而轉化成二級醇諸如7e。典型地這些反應可於各種溶劑諸如DCM、THF、MeOH、EtOH或其他溶劑中、於各種溫度進行。烷基及芳基酮諸如7d可較佳地使用手性還原條件諸如RuCl(對異丙基甲苯)[(R,R)-Ts-DPEN]及甲酸鈉(J.Org.Chem,2014,79,3238-3243)轉化成非鏡像異構物富集之二級醇諸如7e。典型地,這些反應係於EtOAc溶劑中完成及於室溫進行。最後,化合物諸如7e可藉以酸諸如TFA或稀HCl處理予以脫保護以得三醇化合物諸如7f。典型地這些反應係於水之存在下、於0℃或室溫完成。每一步驟之化合物可藉標準技術諸如管柱層析法、結晶法、逆相HPLC或SFC予以純化。如有需要,7e7f之非鏡像異構物的分離可以技藝中已知之標準方法諸如手性SFC或HPLC進行,以得單一非鏡像異構物。
實例
在上述製備本發明化合物的方法的一些步驟方面,可能需要保護不想要反應的潛在反應官能基,再隨後將該保護基裂解。此情況下,可使用任何可相容之保護基。特別之保護及脫保護方法可使用諸如由T.W.Greene(Protective Groups in Organic Synthesis,A.Wiley-Interscience Publication,1981)或P.J.Kocienski(Protecting groups,Georg Thieme Verlag,1994)所述者。
所有上述反應及前面方法中所用的新穎起始材料之製備為慣用的,且適當試劑及用於其效能或製備之反應條件以及用於分離出期望產物的步驟為熟諳此藝者參照文獻步驟及有關於此之實例及製備例而詳知。
下列縮寫可用於本案中:Ac(乙醯基);AcCl(乙醯氯);AcOH或HOAc(乙酸);Ac2O(乙酸酐);aq.(水性);Boc或boc(三級丁氧羰基);ca.(約或約略);CDCl3(氘化之氯仿);CH2Cl2及/或DCM(二氯甲烷);DAST(二乙胺基三氟化硫);DCE(二氯乙烷);DEA(二乙胺);DIBAL或DIBAL-H(二異丁基氫化鋁);DIC(二異丙基碳化二亞胺);DIPEA或亨尼格氏鹼(Hunig’s base)(N,N-二異丙基乙胺);DMA(二甲基乙醯胺);DMF(二甲基甲醯胺);DME(乙二醇);DMP(戴斯馬丁試劑(Dess-Martin Periodinane));DMAP(4-二甲胺基吡啶);DMSO(二甲亞碸);DMSO-d6(氘化之二甲亞碸);EDC或EDCI(1-乙基-3-(3-二甲胺基丙基)-羰化二亞胺);Et(乙基);Et3N或TEA(三乙胺);EtOH(乙醇);EtOAc(乙酸乙酯);Et2O(乙醚);g或gm(克(gram)或克(grams));HATU(2-(7-氮雜-1H-苯並三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲鎓六氟磷酸鹽);HBTU(o-(苯並三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲鎓六氟磷酸鹽);HMPT(參(二甲胺基)膦);HPLC(高效能 液相層析法);HOBT(1-羥基苯並三唑);h或hr(視情況為小時(hour)或小時(hours));iBu(異丁基);IPA(異丙醇);iPr(異丙基);iPrOAc(乙酸異丙酯);KHMDS(雙(三甲基矽基)胺鉀);KOAc(乙酸鉀);LCMS(液相層析-質譜術);LiHMDS(雙(三甲基矽基)胺鋰);Me(甲基);MeOH(甲醇);MeOD(氘化之甲醇);MeCN(乙腈);m或min(視情況為分鐘(minute)或分鐘(minutes));mg(毫克(milligram)或毫克(milligrams));Ms(甲磺醯基);MsCl(甲磺醯氯);N(正);NBS(N-溴琥珀醯亞胺);NFSI(N-氟二苯磺醯胺);NMR(核磁共振);nBu(正丁基);nBuLi(正丁基鋰);nPr(正丙基);Pd/C(鈀/碳);Pd2(dba)3((二亞苄基丙酮)二鈀(0));Pd(dppf)Cl2([1,1'-(二苯膦基)二茂鐵]二氯鈀(II));Ph(苯基);PTSA或pTSA(對甲苯磺酸);Rt(滯留時間);rt(室溫);RuCl(對異丙基甲苯)[(R,R)-Ts-DPEN]([N-[(1R,2R)-2-(胺基-κN)-1,2-二苯基乙基]-4-甲基苯磺醯胺根合-κN]氯[(1,2,3,4,5,6-η)-1-甲基-4-(1-甲基乙基)苯]-钌);s或sec(視情況為秒(second)或秒(seconds));Selectfluor(N-氯甲基-N'-氟三伸乙基銨雙(四氟硼酸鹽));SEM(2-三甲基矽基乙氧基甲氧基);SFC(超臨界流體層析法);Si-Thiol(矽石1-丙硫醇);T3P(丙基膦酸酐);TBAF(四丁基氟化銨);TBDMSCl(三級丁基-二甲基矽基氯);TBME或MTBE(三級丁基甲基醚);t-BuOH(2-甲基-2-丙醇、三級丁醇或三級丁基醇);TDA-1(參[2-(2-甲氧基乙氧基)乙基]胺或參(3,6-二氧雜庚基)胺);TEA、NEt3或Et3N(三乙胺); TFA(三氟乙酸);THF(四氫呋喃);THP(四氫哌喃);TLC(薄層層析法);TMS(三甲基矽基);TMSCl(三甲基矽基氯);TMSCF3(三甲基(三氟甲基)矽烷);Tos或tosyl(4-甲苯磺醯基);TOSMIC(對甲苯磺醯基甲基異腈);UV(紫外線)。
實例1(反應圖A)(2R,3R,4S,5R)-2-(6-胺基-9H-嘌呤-9-基)-5-((R)-1-羥乙基)四氫呋喃-3,4-二醇(A-8) 實例2(反應圖A)(2R,3R,4S,5R)-2-(6-胺基-9H-嘌呤-9-基)-5-((S)-1-羥乙基)四氫呋喃-3,4-二醇(A-9)
步驟1:(3aS,4S,6R,6aR)-6-(6-胺基-9H-嘌呤-9-基)-N-甲氧基-N,2,2-三甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-甲醯胺(A-2)之合成
於0℃將N-甲基嗎啉(944mg,9.3mmol)其後EDC(776mg,4.0mmol)、HOBT(547mg,4.0mmol)加至A-1(JACS,2007,13812-13813)(1000mg,3.1mmol)及N,O-二甲基羥胺HCl(334mg,3.4mmol)之DMF(20mL)混合液中。將混合物於室溫攪拌過夜。將混合物濃縮以得粗製油狀物,將其藉急驟管柱以DCM:MeOH=1%-4%洗提予以純化,即得白色固狀之A-2(1.1g,97.0%)。
步驟2:粗製(3aS,4S,6R,6aR)-6-(6-(N-苯甲醯基苯甲醯胺基)-9H-嘌呤-9-基)-N-甲氧基-N,2,2-三甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-甲醯胺(A-3)之合成
於0℃將苯甲醯氯(1.02g,7.2mmol)逐滴加至A-2(1.2g,3.3mmol)之DCM(50mL)混合液中。加入後,將混合物於室溫攪拌3小時。TLC(DCM/MeOH=10:1)顯示有30%之B-2餘留。將混合物冷卻回0℃,將苯甲醯氯(500mg,3.6mmol)加入。將混合物於室溫攪拌過夜。將混合物以水性NaHCO3清洗,濃縮以得粗製油狀物。將油狀物藉急驟管柱以石油醚/EtOAc=1%-40%洗提予以純化,即得白色固狀之粗製A-3(1.5g,79.5%)。
步驟3:N-(9-((3aR,4R,6S,6aS)-6-乙醯基-2,2-二甲基四氫 呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-9H-嘌呤-6-基)苯甲醯胺(A-4)之合成
於-78℃將MeMgBr(1.2mL,3M之THF液)加至已攪拌之A-3(400mg,0.70mmol)之THF(15mL)溶液中。加入後,將混合物於-30℃攪拌30分鐘,TLC(DCM/MeOH=20:1)顯示反應完成。藉H2O(5mL)令混合物之反應中止,以EtOAc(15mL×2)萃取。將有機層濃縮以得粗製油狀物。將油狀物藉DCM:EtOAc=1%-60%純化,即得白色固狀之A-4(180mg,60.9%)。LCMS:424.0(M+H)+
步驟4:N-(9-((3aR,4R,6R,6aR)-6-((S)-1-羥乙基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-9H-嘌呤-6-基)苯甲醯胺(A-5)之合成
於0℃將NaBH4(32.2mg,0.85mmol)加至A-4(180mg,0.42mmol)之EtOH溶液中。將混合物於0℃攪拌1小時。TLC(DCM/MeOH=20:1)顯示反應完成。將混合物濃縮以得粗製油狀物,將其藉急驟管柱以DCM/MeOH=0%-4%洗提予以純化,即得白色固狀之A-5(140mg,77.4%)。
步驟5:(S)-1-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-胺基-9H-嘌呤-9-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)乙-1-醇(A-6)之合成
將A-5(140mg,0.33mmol)之二烷/NH3.H2O(1mL/ 1mL)混合液於90℃、於熱壓器中攪拌4小時。TLC(DCM/MeOH=10:1)顯示反應完成。將混合物濃縮以得產物,將其藉急驟管柱以DCM/MeOH=0-5%洗提予以純化,即得白色固狀之A-6(94mg,89%)。LCMS:343.8(M+Na)+
步驟6:(2R,3R,4S,5R)-2-(6-胺基-9H-嘌呤-9-基)-5-(1-羥乙基)四氫呋喃-3,4-二醇(A-7)之合成
將A-6(90mg,0.28mmol)之TFA/H2O(1mL/1mL)溶液於室溫攪拌2小時。TLC(DCM/MeOH=10:1)顯示反應完成。將混合物濃縮以得粗製油狀物,將其溶於H2O中,以EtOAc(1mL×2)清洗。將水層直接凍乾,即得白色固狀之A-7(45mg,57%)。LCMS:282.12(M+H)+
1H NMR(400MHz,MeOD)δ ppm 8.64-8.53(m,1H),8.38-8.36(m,1H),6.10-6.02(m,1H),4.66-4.63(m,1H),4.33-4.31(m,1H),4.01-4.00(m,2H),1.30-1.26(m,3H)。
步驟7:使用SFC Chiralpak AD-3 4.6 x 100mm 3u管柱,40% MeOH於120巴,4mL/min進行之非鏡像異構物的分離 A-8:(2R,3R,4S,5R)-2-(6-胺基-9H-嘌呤-9-基)-5-((R)-1-羥乙基)四氫呋喃-3,4-二醇
1H NMR(400MHz,MeOD)δ ppm 8.26(s,1H),8.17(s,1H),5.90(d,J=7.34Hz,1H),4.77(dd,J=5.38,7.34Hz,1H),4.33(d,J=5.26Hz,1H),4.03-4.11(m,1H),4.02(d, J=1.47Hz,1H),1.25(d,J=6.72Hz,3H)
LCMS:282.12(M+H)+
A-9:(2R,3R,4S,5R)-2-(6-胺基-9H-嘌呤-9-基)-5-((S)-1-羥乙基)四氫呋喃-3,4-二醇
1H NMR(400MHz,MeOD)δ ppm 8.31(s,1H),8.18(s,1H),5.96(d,J=6.60Hz,1H),4.70-4.77(m,1H),4.28(dd,J=2.32,5.14Hz,1H),4.01(t,J=2.26Hz,1H),3.94(dd,J=2.32,6.60Hz,1H),1.26(d,J=6.60Hz,3H)
LCMS:282.12(M+H)+。
反應圖B中之實例3-8係遵循類似於實例1 & 2之步驟3-7(反應圖A)的程序以適當之烷基格任雅試劑(Grignard reagent)合成。
實例9(反應圖C)(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(C-12)
步驟1:(3aR,6R,6aR)-6-(羥甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-醇(C-2)之合成
將白色之(2R,3R,4R)-2,3,4,5-四羥基戊醛C-1(150g, 999mmol)及濃H2SO4(9.8g,5.33mL,99.9mmol)之丙酮(1500mL)懸浮液於室溫攪拌(25℃)3小時。懸浮液幾乎轉為清澈溶液。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示一個主要斑點。將120g NaHCO3加入,再攪拌1小時,然後過濾。將濾液濃縮至乾即得無色油狀之粗製C-2(210g,>100%),將其用於下一步驟而不必純化。
步驟2:(3aR,6R,6aR)-6-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-醇(C-3)之合成
於0-10℃於30分鐘期間將TBDMSCl(157g,1.04mol)之CH2Cl2(300mL)溶液加至粗製C-2(210g,~990mmol)及咪唑(94.7g,1.39mol)之CH2Cl2(1500mL)溶液中。小心:反應為放熱性。加入後,形成大量沈澱物。TLC(石油醚/EtOAc=1:1,8:1)顯示大多數起始材料被消耗且形成良好之新斑點。將懸浮液於室溫攪拌過夜(20小時)。將混合物倒至水(1500mL)中,再分離。再水性層以CH2Cl2(1000mL)萃取。將結合之有機相以鹽水(500mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥再於真空中濃縮。將殘留物藉矽膠層析法以石油醚/EtOAc=50:1至20:1洗提予以純化,即得微黃色油狀之C-3(98g,32%)。
步驟3:三級丁基(((3aR,4R,6aR)-6-氯-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲氧基)二甲基矽烷(C-4)之 合成
於-30℃將P(NMe2)3(61.3g,376mmol)逐滴加至化合物C-3(88g,289mmol)及CCl4(66.7g,434mmol)之無水甲苯(500mL)溶液中。內溫升至-20℃且反應溶液之顏色由無色改變成紅色。加入後,將混合物於0℃攪拌另2小時。TLC(石油醚/EtOAc=8:1)顯示餘留約50%的起始材料且且形成良好的斑點。以已冷卻之鹽水(300mL)令反應中止,再予分離。將黃色有機層(~500mL)以鹽水(200mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥以得C-4,其係直接用於下一步驟中。
步驟4:7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(C-5)之合成
將參[2-(2-甲氧基乙氧基)乙基]胺(TDA-1)(46.7g,144mmol)加至4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(44.4g,289mmol)及粉狀KOH(19.5g,347mmol)之無水甲苯(400mL)懸浮液中(懸浮液轉為幾乎清澈)且內溫升至35℃。無需冷卻地(內溫35℃)將粗製A-4(93.3g,288.9mmol)之甲苯(500mL)溶液逐滴加入。將所得溶液於室溫(25℃)攪拌20小時。TLC(石油醚/EtOAc=8:1)顯示形成UV吸收新斑點。藉水性NH4Cl(300mL)令紅色清澈溶液之反應中止。過量之4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶沈澱。將混合物過濾。將有機層分離出,以鹽水(200mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥 及濃縮至乾,即得粗製C-5(156g)。將殘留物藉矽膠層析法以石油醚/EtOAc=40:1至20:1洗提予以純化,即得無色油狀之A-5(49g,38.5%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.66(s,1H),7.57(d,1H),6.63(d,1H),6.41(br,1H),5.07-5.05(m,1H),4.96-4.94(m,1H),4.36-4.35(m,1H),3.90-3.79(m,2H),1.65(s,3H),1.39(s,3H),0.90(s,9H),0.06(s,6H)
步驟5:7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(C-6)之合成
將Pd(PPh3)4(5.15g,4.45mmol)加至C-5(49g,111.36mmol)之無水THF(500mL)溶液中。將懸浮液以Ar脫氣四次。將1M二甲基鋅之甲苯溶液(557mL,557mmol)加至混合物中。將混合物再度以Ar脫氣四次。將黃色溶液於70℃加熱4小時,然後於室溫靜置過夜。TLC(石油醚/EtOAc=8:1,3:1)顯示大多數起始材料被消耗且產物乾淨。將混合物小心地倒至已冷卻之水性NH4Cl(1000mL)中。將混合物以EtOAc(800mL×3)萃取。將萃取物以鹽水(500mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得粗製物(60g)。將粗製物藉矽膠層析法以石油醚/EtOAc=10:1至4:1洗提予以純化,即得黃色油狀之C-6(37g,79.2%)。LCMS[M+1]420;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.77(s,1H),7.43(d,1H),6.57(d,1H), 6.40(d,1H),5.14-5.11(m,1H),4,99-4.96(m,1H),4.32-4.31(m,1H),3.88-3.77(m,2H),2.72(s,3H),1.64(s,3H),1.38(s,3H),0.89(s,9H),0.05(d,6H)
步驟6:((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲醇(C-7)之合成
於室溫將1M TBAF之THF溶液(8.82mL,8.82mmol)加至C-6(37g,88.2mmol)之THF(370mL)溶液中。將混合物於室溫(25℃)攪拌一個週末。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數起始材料被消耗。將混合物於真空中濃縮以得粗製物(40g)。將殘留物藉矽膠層析法以石油醚/EtOAc=3:1至1:3洗提予以純化,即得黃色膠狀之C-7(24.1g,89.2%)。LCMS[M+1]306;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.72(s,1H),7.22(d,1H),6.56(d,1H),6.11(br,1H),5.84(d,1H),5.29-5.26(m,1H),5.14(d,1H),4.50(s,1H),4.00-3.79(m,2H),2.74(s,3H),1.64(s,3H),1.37(s,3H)。
步驟7:(3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-羧酸(C-8)之合成
無需冷卻地於室溫(25℃)將H2O(66mL)、TEMPO(9.64g,61.7mmol)及PhI(OAc)2(56.8g,150mmol)分次 加至C-7(24.1g,78.931mmol)之MeCN(66mL)溶液中。反應為放熱性。於室溫(25℃)攪拌5分鐘後,反應混合物的溫度升至65℃。無需冷卻地將混合物攪拌另10分鐘。TLC(石油醚/EtOAc=1:2,CH2Cl2/MeOH/HOAc=100:10:1)顯示大多數起始材料被消耗且形成新斑點。將混合物於室溫(25℃)靜置過夜。將液體倒出。將殘留物以TBME(400mL)研磨。將固狀物過濾,再於真空中乾燥以得白色固狀之化合物C-8(12g,47.6%)。將液狀物於真空中濃縮以移除MeCN。將殘留物以水(100mL)稀釋,再以TBME(50mL×3)清洗。將水性層以EtOAc/THF(1:1,100mL×4)萃取。將萃取物於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮,即得黃色固狀之化合物C-8(藉TLC測得為~80%純度,3.6g,14.3%)。LCMS[M+1]320;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 12.79(br,1H),8.61(s,1H),7.67(d,1H),6.74(d,1H),6.41(s,1H),5.53(d,1H),5.42(d,1H),4.66(s,1H),2.65(s,3H),1.54(s,3H),1.36(s,3H)
步驟8:(3aS,4S,6R,6aR)-N-甲氧基-N,2,2-三甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-甲醯胺(C-9)之合成
於10℃將DIPEA(13.8g,107mmol)、HOBt(5.31g,39.3mmol)及EDC(7.53g,39.3mmol)加至C-8(11.4g,35.702mmol)及N,O-二甲基羥胺HCl(5.22g,53.6mmol)之CH2Cl2(300mL)懸浮液中。DIPEA加入後,將固 狀物溶解。將所得無色溶液於室溫(25℃)攪拌24小時。LCMS顯示反應完成且乾淨。將混合物倒至水(300mL)中再予分離。將水性層以CH2Cl2(100mL×3)萃取。將萃取物以鹽水(300mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得無色膠狀粗製物(13g)。將粗製物藉矽膠層析法以石油醚/EtOAc=1:1至1:3洗提予以純化,即得黃色膠狀之C-9(11g,85%)。LCMS[M+1]363;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.74(s,1H),7.55(br,1H),6.67(s,1H),6.59(d,1H),5.29(br,1H),5.22-5.17(m,2 H),3.68(s,3H),3.16(s,3H),2.71(s,3H),1.66(s,3H),1.40(s,3H)
步驟9:(3,4-二氟苯基)((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲酮(C-10)之合成
於5℃將3,4-二氟苯基溴化鎂(0.5M之2-Me-THF液,375mL,188mmol)加至C-9(20.0g,55.2mmol)之無水THF(800mL)溶液中。將所得黃色溶液於5℃攪拌0.5小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數起始材料被消耗且形成新斑點。將混合物倒至水性NH4Cl(500mL)中,再以EtOAc(1000mL)萃取。將萃取物以鹽水(500mL×2)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得黃色膠狀之粗製化合物C-10(27g,>100%),其於靜置後固化且直接用於下一步驟中。LCMS[M+1]416;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.49(s,1H),7.54-7.35(m,4H),6.60(d, 1H),6.47(s,1H),5.66-5.64(m,1 H),5.54(d,1 H),5.48(d,1H),2.54(s,3H),1.60(s,3H),1.35(s,3H)
步驟10:(R)-(3,4-二氟苯基)((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲醇(C-11)及(3,4-二氟苯基)((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲醇(C-12)之合成
於20℃將2.5M水性甲酸鈉(6040mL,1.51mol)加至微黃色之粗製C-10(172g,~377.5mmol)之EtOAc(1800mL)溶液中。將混合物以N2起泡1小時。將Ru(對異丙基甲苯)[(R,R)TsDPEN](2.5g,3.93mmol)加入,再以N2起泡5分鐘。將所得黃色混合物於20℃攪拌一個週末。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數的起始材料被消耗且形成良好斑點。將混合物分離,再將有機層於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得粗製物(180g)。將粗製物藉矽膠層析法以石油醚/EtOAc=10:1至2:1洗提予以純化。將洗提液於真空中濃縮至約200mL,然後過濾。將固狀物於真空中乾燥,即得淡黃色固狀之C-11(95g,60%)及淡黃色固狀之C-13(27g,17%)。
C-11:LCMS[M+H]418;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.79(s,1H),7.45(s,1H),7.43-7.36(m,1H),7.27-7.13(m,3H),6.59(d,J=3.8Hz,1H),5.82(d,J=5.0Hz,1H), 5.27(t,J=5.5Hz,1H),5.09(s,1H),4.92(dd,J=1.3,6.0Hz,1H),4.55(s,1H),2.81-2.72(m,3H),1.60-1.52(m,3H),1.33-1.24(m,3H)
C-13:LCMS[M+H]418
步驟11:(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(C-12)之合成
於0℃將TFA(100mL)加至C-11(14g,33.5mmol)之H2O(100mL)懸浮液中。將所得紅色溶液於室溫(25℃)攪拌1小時。LCMS顯示5%的起始材料被消耗且偵測出93%產物。將混合物於室溫(25℃)攪拌另20分鐘。於0℃將混合物加至20%水性K2CO3(800mL)中。將混合物以EtOAc(250mL×2)萃取。將萃取物以鹽水(200mL×2)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮,即得白色固狀之C-12(12.2g,96.4%)。LCMS[M+H]378;1H NMR(400MHz,MeOD)δ ppm 8.65(s,1H),7.64(d,J=3.8Hz,1H),7.46-7.31(m,1H),7.28-7.13(m,2H),6.77(d,J=3.7Hz,1H),6.15(d,J=7.1Hz,1H),4.98(d,J=2.7Hz,1H),4.80-4.75(m,1H),4.30-4.22(m,2H),2.76(s,3H)
(S)-(3,4-二氟苯基)((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲醇(SS-1)之分離
C-12(1g,2.4mmol)藉SFC手性層析法分離,即得C-11(386mg,39%)及SS-1(494mg,49%)。
SS-1:LCMS[M+1] 418;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.84(s,1H),7.21-7.11(m,3H),7.07-7.00(m,2H),6.56(d,J=3.7Hz,1H),5.79(d,J=3.8Hz,1H),5.30-5.20(m,2H),4.99(d,J=10.6Hz,1H),4.64(s,1H),1.65(s,3H),1.40(s,3H)
實例10-24
反應圖D中之實例10-24係遵循類似於實例9之步驟9-11(反應圖C)的程序以適當之格任雅試劑(Grignard reagent)合成。
實例10-11使用市售之格任雅試劑(Grignard reagent)。
實例12方面,如反應圖E所示地將格任雅試劑 (Grignard reagent)由芳基溴製備,再與C-9直接用於下一反應中。
((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(4-氟-3-甲氧基苯基)甲酮(E-3)之合成 步驟1:(4-氟-3-甲氧基苯基)溴化鎂(E-2)之合成
將精鍊鎂屑(593mg,24.4mmol)懸浮於無THF(10mL)中。將5-溴-2-氟苯甲醚(1g,4.877mmol)及1,2-二溴乙烷(500mg,2.66mmol)溶於無水THF(10mL)中。無需冷卻地於室溫(25℃)將上述溶液加至鎂懸浮液中。加入後,以加熱槍將反應加熱至輕微迴流。令反應開始且保持於迴流另0.5小時。以丙酮令整除份之反應中止,且TLC(石油醚)顯示大多數起始材料被消耗。化合物E-2混合物(~0.244M之THF液)係直接用於下一步驟中。
步驟2:((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4- 基)(4-氟-3-甲氧基苯基)甲酮(E-3)之合成
於室溫(25℃)將格任雅試劑(Grignard reagent)化合物E-2(~0.244M之THF液,20mL,4.88mmol)加至化合物C-9(200mg,0.552mmol)之無水THF(5mL)溶液中。將所得黃色溶液於室溫(25℃)攪拌0.5小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數起始材料被消耗且形成新斑點。將混合物倒至水性NH4Cl(40mL)中,再以EtOAc(20mL×2)萃取。將萃取物以鹽水(20mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得黃色油狀物(600mg)。將粗製物藉矽膠層析法以石油醚/EtOAc=3:1至1:1洗提予以純化,即得無色膠狀之化合物E-3(113mg,47.9%)。
實例13方面,如反應圖F所示地將格任雅試劑(Grignard reagent)由芳基溴製備,再與C-9直接用於下一反應中。
5-((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-羰基)-2-氟苯甲腈(F-2)之合成
於-60℃將1.3M i-PrMgCl.LiCl(1.69mL,2.2mmol) 加至5-溴-2-氟苯甲腈(400mg,2.00mmol)之無水THF(4mL)溶液中。將所得紅色溶液於-60℃攪拌5分鐘,然後於0℃攪拌15分鐘。於0℃將C-9(150mg,0.414mmol)之無水THF(1.5mL)溶液加入。將混合物於0℃攪拌1小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數的C-9被消耗且形成良好的斑點。以水性NH4Cl(10mL)令混合物之反應中止,再以EtOAc(10mL×2)萃取。將萃取物於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得黃色固狀粗製物(500mg)。將粗製物藉矽膠層析法以石油醚/EtOAc=5:1至1:1洗提予以純化,即得微黃色固狀之化合物F-2(150mg,85.8%)。LCMS[M+1]423
實例21方面,如同反應圖G所示地製備芳基碘,用以製造相應之格任雅試劑(Grignard reagent),再與C-9反應。
(3-(二氟甲基)苯并呋喃-5-基)((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4- d][1,3]二氧呃-4-基)甲酮(G-7)之合成 步驟1:5-溴苯并呋喃-3-羧酸乙酯(G-2)之合成
於低於38℃將HBF4.Et2O(806mg,4.97mmol)、其後N2CH2COOEt(9.08g,79.6mmol)之CH2Cl2(10mL)溶液小心地逐滴加至5-溴柳醛(10g,49.747mmol)之CH2Cl2(20mL)溶液中。小心:氣體釋出。加入後,將混合物於室溫(25℃)攪拌10分鐘。TLC(石油醚/EtOAc=8/1,3/1)顯示大多數起始材料被消耗且形成良好的斑點。將混合物於真空中濃縮至乾以得黃色濃稠油狀物。將濃硫酸(5mL)徐緩地加至所得油狀物中。將混合物於室溫(25℃)攪拌10分鐘。顏色變成棕色。將混合物以DCM(100mL)稀釋。將NaHCO3(20g)分次加入。將混合物於室溫(25℃)攪拌20小時。TLC(石油醚/EtOAc=3/1,8/1)顯示大多數中間體被消耗且形成良好的斑點。將混合物通過矽膠過濾,再於真空中濃縮以得黃色油狀G-2(14g,>99%),其於靜置後固化。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.24(s,1H),8.19(s,1H),7.47(d,1H),7.40(d,1H),4.43-4.38(m,2H),1.44-1.40(m,3H)
步驟2:(5-溴苯并呋喃-3-基)甲醇(G-3)之合成
於5-10℃將1M DIBAL-H之甲苯液(116mL,116mmol)加至黃色之G-2(13g,48.311mmol)之無水CH2Cl2(220mL)溶液中。將所得黃色溶液於室溫(25℃)攪拌30分鐘。TLC(石油醚/EtOAc=8/1,3/1)顯示大多數起始材料被 消耗且形成良好的斑點。於室溫10℃小心地以水性NH4Cl(10mL)令混合物之反應中止。將硫酸鈉及矽藻土(celite)加至混合物中。攪拌30分鐘後,將混合物通過矽藻土(celite)過濾。將濾液於真空中濃縮,即得黃色固狀之G-3(6g,54.7%)。
步驟3:5-溴苯并呋喃-3-甲醛(G-4)之合成
於室溫(25℃)將MnO2(22.2g,255mmol)加至黃色之G-3(5.8g,25.54mmol)之CHCl3/MeOH(120mL/12mL)溶液中。將黑色懸浮液於迴流攪拌3小時。TLC(石油醚/EtOAc=3/1)顯示餘留約20%之起始材料。將混合物迴流另3小時,然後於室溫靜置過夜。TLC(石油醚/EtOAc=3/1)顯示大多數起始材料被消耗且形成良好的斑點。將混合物通過矽藻土(celite)過濾。將濾液於真空中濃縮,得黃色固狀之G-4(5.1g,88.7%)且直接用於下一步驟中。
步驟4:5-溴-3-(二氟甲基)苯并呋喃(G-5)之合成
於0℃將DAST(14.6g,90.7mmol)加至黃色之G-4(5.1g,22.66mmol)之無水CH2Cl2(110mL)溶液中。將混合物於室溫(25℃)攪拌整個週末。TLC(石油醚/EtOAc=3/1,8/1)顯示有起始材料餘留且形成良好的斑點。將混合物倒至水性NaHCO3(200mL)中,再通過矽藻土(celite)過濾。將有機層於真空中濃縮以得粗製物(6g)。將粗製物藉矽膠層析法以EtOAc之石油醚液(由0至10%)洗提予以純 化,即得無色油狀之G-5(4g,71.4%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 7.87(d,1H),7.83(s,1H),7.50(d,1H),7.47(d,1H),7.01-6.73(m,1H)
步驟5:3-(二氟甲基)-5-碘苯并呋喃(G-6)之合成
將G-5(1000mg,4.048mmol)、NaI(1.82g,12.1mmol)、CuI(77.1mg,0.405mmol)及反-N,N-二甲基環己烷(115mg,0.810mmol)之無水二烷(12mL)混合液以Ar吹洗。將所得黃色懸浮液於110℃、於密封管中攪拌24小時。將混合物倒至水/NH3.H2O(50mL/10mL)中,再以EtOAc(20mL×3)萃取。將萃取物以鹽水/NH3.H2O(20mL/5mL)清洗兩次,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得粗製物(1.4g)。將粗製物藉矽膠層析法以EtOAc之石油醚液(由0至50%)洗提予以純化,得無色油狀之G-6(1200mg,101%),其於靜置後固化。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.06(s,1H),7.92(t,1H),7.66(dd,1H),7.31(s,1H),6.86(t,1H)
步驟6:(3-(二氟甲基)苯并呋喃-5-基)((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲酮(G-7)之合成
於-60℃將1.3M i-PrMgCl.LiCl(0.722mL,0.939mmol)加至G-6(230mg,0.782mmol)之無水THF(2mL)溶液中。將混合物於-30℃攪拌1小時。混合物變成微黃 色。將化合物C-9(90mg,0.25mmol)之THF(1mL)溶液加至反應混合物中。將混合物於-30℃攪拌30分鐘,然後於0℃攪拌30分鐘。TLC(石油醚/EtOAc=1/1)顯示大多數的化合物C-9被消耗且形成良好的斑點。以飽和水性水性NH4Cl(5mL)令混合物之反應中止。將混合物以EtOAc(5mL×3)萃取。將萃取物於真空中濃縮以得粗製物(300mg)。將粗製物藉矽膠層析法以EtOAc之石油醚液(由0至100%)洗提予以純化,即得無色膠狀之化合物G-7(100mg,86%),其於靜置後固化。
實例14-20方面,以類似於反應圖G步驟5 & 6之方式將適當芳基溴經由芳基碘轉化成芳基格任雅(aryl Grignard),再與化合物C-9反應以形成相應之芳基酮。以類似於反應圖C步驟10 & 11之方式將所得芳基酮進行還原及脫保護。
實例2223方面,如同反應圖H所示地製備芳基碘,用以製造相應之格任雅試劑(Grignard reagent),再與C-9反應。
步驟1:5-溴-1-(二氟甲基)-1H-苯并[d]咪唑(H-2)及6-溴-1-(二氟甲基)-1H-苯并[d]咪唑(H-3)之合成
於90℃以CHClF2起泡至紅色之5-溴-1H-苯并[d]咪唑(5000mg,25.38mmol)及K2CO3(14g,102mmol)之無水DMF(80mL)懸浮液中20分鐘。TLC(石油醚/EtOAc=8:1)顯示餘留大量的起始材料且形成良好的斑點。於90℃以CHClF2起泡至混合物另1小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數的起始材料被消耗且形成良好的斑點。將混合物倒至水(150mL)中,再以TBME(50mL×3)萃取。將萃取物於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得粗製物(5.8g)。將粗製物藉矽膠層析法(Biotage,120g管柱)以EtOAc之石油醚液(由0至50%)洗提予以純化,得黃色膠狀之化合物H-2及H-3的混合物(5g,79.8%),其於靜置後固化。
步驟2:1-(二氟甲基)-5-碘-1H-苯并[d]咪唑(H-4)及1-(二氟甲基)-6-碘-1H-苯并[d]咪唑(H-5)之合成
將化合物H-2和H-3(1000mg,4.048mmol)、NaI(1.82g,12.1mmol)、CuI(77.1mg,0.405mmol)及反-N,N’-二甲基環己烷(115mg,0.81mmol)之無水二烷(10mL)混合液以Ar吹洗。將所得黃色懸浮液於110℃、於密封管中攪拌20小時。LCMS顯示反應完成且乾淨。將混合物倒至水/NH3.H2O(50mL/10mL)中,再以EtOAc(20 mL×3)萃取。將萃取物以鹽水/NH3.H2O(20mL/5mL)清洗2次,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得粗製物(1.4g)。將粗製物藉矽膠層析法以EtOAc之石油醚液(由0至50%)洗提予以純化,即得不可分離混合物形式之化合物H-4和H-5(1000mg,84%),其於靜置後固化。
步驟3:(1-(二氟甲基)-1H-苯并[d]咪唑-6-基)((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲酮(H-6)及(1-(二氟甲基)-1H-苯并[d]咪唑-5-基)((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲酮(H-7)之合成
於-60℃將1.3M i-PrMgCl.LiCl(0.722mL,0.939mmol)加至紅色之化合物H-4及H-5(230mg,0.782mmol)之無水THF(2mL)溶液中。將紅色混合物於-30℃攪拌1小時。將含有C-9(100mg,0.276mmol)之THF(1mL)溶液加入。將混合物於-30℃攪拌30分鐘,然後於0℃攪拌30分鐘。以水性NH4Cl(5mL)令混合物之反應中止。將混合物以EtOAc(5mL×3)萃取。將萃取物於真空中濃縮以得粗製物(300mg)。將粗製物藉矽膠層析法以乙酸乙酯之石油醚液(由0至100%)洗提予以純化,得無色膠狀之化合物H-6及H-7(100mg,77.2%)。將此混合物藉SFC予以純化,得化合物G-6(13mg)及化合物G-7(53mg)。LCMS[M+1]470
化合物H-6: 1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.54(s,1H),8.23(s,1H),8.05(s,1H),7.84(d,1H),7.76(d,1H),7.47-7.18(m,1H),7.18(d,1H),6.42-6.39(m,2H),5.79(d,1H),5.52-5.49(m,2H),2.56(s,3H),1.71(s,3H),1.46(s,3H)。
化合物H-7: 1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.53(s,1H),8.38(s,1H),8.17(s,1H),7.84(d,1H),7.54(d,1H),7.31-7.16(m,1H),7.20(d,1H),6.44(s,2H),5.77-5.76(m,1H),5.52(s,1H),5.47(d,1H),2.59(s,3H),1.71(s,3H),1.45(s,3H)。
實例24方面,如同反應圖I所示地使用芳基碘,再與C-9反應。
1-((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-2-(苯磺醯基)乙-1-酮(I-2)之合成
於-60℃將1.3M i-PrMgCl.LiCl(1.48mL,1.9mmol)加至1-碘-2-(甲磺醯基)苯(400mg,1.42mmol)之無水 THF(4mL)溶液中。將混合物於-30℃攪拌1小時。混合物變為黃色。將化合物C-9(200mg,0.552mmol)之THF(2mL)溶液加入。將混合物於-30℃攪拌30分鐘,然後於0℃攪拌30分鐘。LCMS顯示反應完成且顯示反應完成且主峰為期望化合物。以水性NH4Cl(5mL)令混合物之反應中止。將混合物以EtOAc(5mL×3)萃取。將萃取物於真空中濃縮以得粗製物(370mg)。將粗製材料藉矽膠層析法以EtOAc之石油醚液(0-100%)洗提予以純化,得黃色固狀之化合物I-2(100mg,39.6%)。LCMS[M+1]458
以類似於反應圖C步驟10 & 11之方式,將化合物I-2進行還原及脫保護,即得(2S,3S,4R,5R)-2-((R)-1-羥基-2-(苯磺醯基)乙基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(實例24)。
實例25(反應圖J)(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-羥基(1-甲基-1H-吲哚-6-基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(J-5)
步驟1:6-溴-1-甲基-1H-吲哚(J-2)之合成
於0℃將6-溴吲哚(11.8g,60.191mmol)分次加至60% NaH(3.61g,90.3mmol)之無水DMF(150mL)懸浮液中。小心:氣體釋出。內溫升至7℃。將混合物再冷卻至0℃。將所得紅色懸浮液於0℃攪拌3小時。於0-5℃將CH3I(3.26g,23mmol)逐滴加入。將反應懸浮液於室溫(25℃)攪拌2小時。TLC(石油醚/EtOAc=8/1)顯示大多數起始材料被消耗且形成良好的斑點。將混合物倒至冰水(200mL)中,再以石油醚(100mL×3)萃取。將萃取物以鹽水(100mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮至乾以得粗製物(15g)。將粗製物藉矽膠層析法以EtOAc之石油醚液(由0至10%)洗提予以純化,得微黃色油狀之J-2(10g,79.1%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 7.49-7.47(m,2H),7.22(d,1H),7.03(d,1H),6.46(d,1H),3.76(s,3H)。
步驟2:((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(1-甲基-1H-吲哚-6-基)甲酮之合成
於-60~-55℃於5分鐘期間將2.5M n-BuLi(1.5mL,3.8mmol)加至無色之J-2(700mg,3.33mmol)之無水THF(10mL)溶液中。於加入終了之時,形成大量固狀物且顏色變為黃色。將所得黃色懸浮液於-65℃攪拌1小時。於-65℃於5分鐘期間將化合物C-9(220mg,0.607mmol)之無水THF(2mL)溶液加入。所得懸浮液變為黃色溶液,再於-65℃攪拌1小時。TLC(石油醚/EtOAc=1/1)顯示大多數的起始材料被消耗且形成良好的斑點。將反應倒至水性NH4Cl(10mL)中,再以EtOAc(10mL×3)萃取。將萃取物以鹽水(10mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得粗製物(1g)。將粗製物藉矽膠層析法(10g管柱)以EtOAc之石油醚液(由0至100%)洗提予以純化,得黃色膠狀之J-3(200mg,76.2%)。LCMS[M+H]433
以類似於反應圖C步驟10 & 11之方式,將化合物J-3進行還原及脫保護,即得(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-羥基(1-甲基-1H-吲唑-6-基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(實例25)。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.67(s,1H),7.99(s,1H),7.82(d,1H),7.69-7.65(m,2H),7.20(d,1H),6.79(d,1H),6.23(d,1 H),6.18(d,1H),5.27(d,1H),5.07(d, 1H),4.98-4.96(m,1H),4.68-4.67(m 1H),4.19-4.15(m,2H),4.01(s,3H),2.67(s,3H)
實例26(反應圖K)-(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-羥基(苯基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(K-4) 實例27(反應圖K)-(2R,3S,4R,5R)-2-((S)-羥基(苯基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(K-5)
步驟1:((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(苯基)甲酮(K-1)之合成
於-5-0℃將PhMgBr(3M之Et2O液,6.81mL,20.4mmol)加至C-9(740mg,2.04mmol)之無水THF(30mL)溶 液中。將所得黃色懸浮液於-5℃攪拌0.5小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數起始材料被消耗且形成新斑點。將混合物倒至水性NH4Cl(60mL)中,再以EtOAc(50mL×2)萃取。將萃取物以鹽水(50mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得黃色油狀之粗製產物(1.5g)。將粗製產物藉矽膠層析法(40g管柱)以EtOAc之石油醚液(由0至100%)洗提予以純化,得黃色膠狀之K-1(750mg,96.8%)。
步驟2:(S)-((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(苯基)甲醇(K-2)之合成
於室溫將NaBH4(40mg)加至K-1(90mg,0.25mmol)之EtOH(5mL)溶液中。將混合物於室溫攪拌30分鐘。TLC(石油醚/EtOAc=1:2)顯示反應完成且乾淨。將混合物於真空中濃縮至乾,得K-2(100mg,>100%),其係直接用於下一步驟中。
步驟3 & 4:(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-羥基(苯基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(K-4)及(2R,3S,4R,5R)-2-((S)-羥基(苯基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(K-5)之合成
於室溫將TFA(2mL)加至K-2(100mg,0.262mmol)之H2O(2mL)懸浮液中。將所得微黃色溶液於室溫攪拌 4.5小時。LCMS顯示大多數起始材料被消耗且偵測出95%產物。於0℃將混合物加至10%水性K2CO3(40mL)中。將混合物以EtOAc(20mL×4)萃取。將萃取物於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮,得K-3(100mg)。將粗製K-3藉SFC予以純化,得K-4(10mg,12%)及K-5(58mg,66%)。
實例26(K-4):LCMS[M+23]364;1H NMR(400MHz,MeOD)δ ppm 8.64(s,1H),7.61(d,J=3.7Hz,1H),7.47(d,J=7.6Hz,2H),7.36(t,J=7.5Hz,2H),7.29-7.22(m,J=7.3Hz,1H),6.75(d,J=3.7Hz,1H),6.14(d,J=7.5Hz,1H),5.00(d,J=2.8Hz,1H),4.78-4.73(m,1H),4.32-4.24(m,2H),2.74(s,3H)
實例27(K-5):LCMS[M+23]364;1H NMR(400MHz,MeOD)δ ppm 8.68(s,1H),7.78(d,1H),7.43(d,2H),7.30-7.26(m,2H),7.24-7.22(m,1H),6.80(d,1H),6.20(d,1H),4.93(s,1 H),4.65-4.62(m,1H),4.40-4.39(m,1H),4.30(br,1H),2.76(s,3H)
實例28-43
反應圖L中之實例28-55係遵循類似於實例26 & 27之步驟1-4(反應圖K)的程序以適當之格任雅試劑(Grignard reagent)合成。
實例28-49使用市售之格任雅試劑(Grignard reagent)。
實例50-53方面,格任雅試劑(Grignard reagent)係以類似於反應圖E(實例12)步驟1之方式由適當芳基或烷基溴中製備。此材料係以類似於反應圖K步驟1之方式直接與化合物C-9使用以產生酮。接續之以NaBH4還原、 以TFA脫保護及最終藉SFC之手性分離係以類似於反應圖K步驟2-4之方式進行,即得最終化合物實例50、51、52 & 53
實例54 & 55
格任雅試劑(Grignard reagent)之製備述於反應圖M中。
步驟1:呋喃-2-基溴化鎂之合成
於0℃將2.5M n-BuLi(2.21mL,5.52mmol)加至呋喃(0.4mL,5.52mmol)之無水THF(5mL)溶液中。將混合物於0℃攪拌30分鐘。將MgBr2(1.3g,7.06mmol)一次地加入。溫度升至15℃。將混合物於0℃攪拌20分鐘且形成大量固狀物。混合物係直接用於下一步驟中。
格任雅試劑(Grignard reagent)係以類似於反應圖K步驟1之方式直接與化合物C-9使用以產生芳基酮。接續之以NaBH4還原、以TFA脫保護及最終藉SFC之手性分離係以類似於反應圖K步驟2-4之方式進行,即得最終化合物實例54 & 55
實例56(反應圖N)(2R,3R,4S,5S)-2-(4-甲基-7H-吡咯并 [2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((S)-2,2,2-三氟-1-羥乙基)四氫呋喃-3,4-二醇(N-4) 實例57(反應圖N)(2R,3R,4S,5S)-2-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-2,2,2-三氟-1-羥乙基)四氫呋喃-3,4-二醇(N-5)
步驟1:1-((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-2,2,2-三氟乙-1,1-二醇(N-1)之合成
將CsF(21.8mg,0.143mmol)加至已以N2吹洗之乾燥反應容器中。將C-9(260mg,0.717mmol)之甲苯(1.43mL)溶液加至容器中。將混合物於冰浴中冷卻至0℃。將TMSCF3(408mg,2.87mmol)於5分鐘期間逐滴加至反應混合物中。將反應混合物加溫至25℃,再於此溫攪拌20小時。TLC(CH2Cl2/MeOH=20:1,UV活性)顯示反應完成且形成新斑點。將MeOH(2mL)加至反應混合物中,混合 物變為清澈。再將混合物於室溫攪拌2小時。將混合物加至水性KHSO4溶液(100mg/10mL)中。將混合物以EtOAc(15mL×2)萃取。將有機層分離出,乾燥再蒸發,得黃色油狀之粗製N-1(150mg,53.7%)。(Ref.Leadbeater,N.et al,Chem.Commun.,2012,48,9610-9612.)
步驟2:1-((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-2,2,2-三氟乙-1-醇(N-2)之合成
將N-1(150mg,0.385mmol)溶於乙醇(5mL)中。將NaBH4(79.2mg,1.93mmol)分兩份地加至於冰浴上之上述混合物中,其中發生氣體之釋出。將清澈黃色溶液於25℃攪拌2小時。TLC(CH2Cl2/MeOH=20:1,UV活性)顯示反應完成,TLC(石油醚/EtOAc=2:1,UV活性)顯示形成兩個主要斑點。將混合物過濾以移除溶劑。將殘留物以EtOAc(10mL×2)及水(10mL)萃取。將有機層分離出,乾燥再蒸發,得粗製產物N-2(120mg,83.4%)。
步驟3:(2R,3R,4S,5S)-2-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-(2,2,2-三氟-1-羥乙基)四氫呋喃-3,4-二醇(N-3)之合成
於0℃將TFA(5mL)加至N-2(120mg,0.321mmol)之H2O(10mL)懸浮液中。將所得淡黃色溶液於25℃攪拌1小時。LCMS顯示大多數起始材料被消耗且形成主峰。於 0℃將混合物加至10%水性K2CO3(5mL)中(反應之pH變為7-9)。將混合物以EtOAc(20mL×3)萃取。將萃取物以鹽水(20mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得粗製產物(120mg),將其藉Biotage以DCM/MeOH(由0%至10%)洗提予以純化,即得N-3(60mg,56%)。
步驟4:使用SFC進行之非鏡像異構物之分離
將N-3藉SFC分離。將兩個期望部分分別蒸發及凍乾,即得白色固狀之N-4(6.9mg,12.8%)及白色固狀之N-5(8.9mg,16.6%)。SFC條件:管柱,AD(250*30mm 5um);流動相:20% EtOH+NH3H2O 60mL/min 220nm水。
(2R,3R,4S,5S)-2-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((S)-2,2,2-三氟-1-羥乙基)四氫呋喃-3,4-二醇(N-4):LCMS[M+1]334;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.66(s,1H),7.76-7.75(d,1H),6.91(br,1H),6.80-6.79(d,1H),6.24-6.22(d,1H),5.43-5.37(m,2H),4.59-4.57(m,1H),4.26-4.24(m,2H),4.03-4.03(d,1H),2.66(s,3H)
(2R,3R,4S,5S)-2-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-2,2,2-三氟-1-羥乙基)四氫呋喃-3,4-二醇(N-5):LCMS[M+1]334;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.65(s,1H),7.80-7.79(d,1H),7.02-7.00(d,1H),6.77-6.76(d,1H),6.21-6.20(d,1H),5.50-5.36(m,2H),4.41-4.17(m,4H),2.66(s,3H)
實例58(反應圖O)(2R,3S,4R,5R)-2-((1H-吡唑-1-基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(O-2)
步驟1:7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-((1H-吡唑-1-基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(O-1)之合成
將吡唑(49.1mg,0.721mmol)加至已烘箱乾燥之微波小玻璃瓶(已於氬氣流下冷卻且備有磁性攪拌棒)中。將小玻璃瓶以鐵氟龍蓋密封,再將C-7(200mg,0.655mmol)以溶於甲苯(7mL,0.09M)之溶液形式加入,其後將氰基伸甲基三丁基正膦(174mg,0.721mmol)加入。將小玻璃瓶置於加熱組中,再於90℃攪拌16小時。將小玻璃瓶中加熱組中移出,再令其冷卻至室溫。將溶液轉移至圓底燒瓶,再於真空下濃縮。將暗棕色殘留物經由急驟管柱層析法(10gSiO2,Biotage,100%庚烷至100% EtOAc)予以純化,即得暗棕色膠狀之化合物O-1(116mg,50%)。TLC(100% EtOAc):Rf=0.35;LCMS[M+H]356;1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.84(s,1H),7.58(d,J=1.59Hz,1H), 7.21-7.26(m,1H),7.02(d,J=3.67Hz,1H),6.67(br.s.,1H),6.31(br.s.,1H),6.25(br.s,1H),5.21(dd,J=3.67,6.36Hz,1H),5.06(br.s.,1H),4.59(dd,J=4.50,8.70Hz,1H),4.48(d,J=4.65Hz,2H),2.89(br.s.,3H),1.63(s,3H),1.38(s,3H)。
步驟2:(2R,3S,4R,5R)-2-((1H-吡唑-1-基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(O-2)之合成
將水(1mL)及三氟乙酸(5mL)加至備有磁性攪拌棒且含有O-1(116mg,0.326mmol)之圓底燒瓶中。將反應於室溫攪拌30分鐘。將反應於真空下濃縮。將棕色殘留物置於甲醇(5mL)中,再於真空下再濃縮。此過程重覆另3次。將殘留物經由超臨界流體層析法(ZymorSpher 4-吡啶150x21.2mm管柱,使用15-23% MeOH @ 3%/min,100巴,58mL/min.)予以純化,即得白色固狀之化合物O-2(62.2mg,60%)。LCMS[M+H]316;1H NMR(400MHz,CD3OD)δ ppm 8.63(s,1H),7.54(d,J=2.20Hz,1H),7.52(d,J=1.71Hz,1H),7.27(d,J=3.79Hz,1H),6.72(d,J=3.79Hz,1H),6.26(t,J=2.08Hz,1H),6.23(d,J=4.65Hz,1H),4.82(br.s,2H),4.47-4.59(m,2H),4.27-4.38(m,3H),2.71(s,3H)。
實例59(反應圖P)(3S,4R,5R)-2-(二氟(4-氟苯基)甲基)-5- (4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(P-3)
步驟1:((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(4-氟苯基)甲酮(P-1)之合成
於0℃將(4-氟苯基)溴化鎂(24.3mL,24.3mmol)加至化合物C-9(800mg,2.21mmol)之無水THF(30mL)溶液中。將所得黃色懸浮液於0℃攪拌0.5小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:2)顯示反應完成且形成良好的斑點。將混合物逐滴加至水性NH4Cl(100mL)中。將混合物以EtOAc(50mL×2)萃取。將萃取物以鹽水(50mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得粗製產物(1.2g)。將粗製產物藉矽膠層析法(40g管柱)以EtOAc之石油醚液(由0-100%)洗提予以純化,即得微黃色油狀之化合物P-1(820mg,93.5%),其於靜置後固化。LCMS[M+1]398
步驟2:7-((3aR,4R,6aS)-6-(二氟(4-氟苯基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(P-2)之合成
將P-1(143mg,0.360mmol)及DCM加至備有磁性攪拌棒之鐵氟龍小玻璃瓶中,其後將二乙胺基三氟化硫(150μL,1.14mmol)逐滴加入。將反應於室溫攪拌48小時。以水令反應中止,與DCM轉移至分液漏斗中,再以另外之水稀釋。分相,再將水性相以3份DCM萃取。將結合之有機萃取物於真空下濃縮,再將殘留物經由急驟管柱層析法(12g SiO2,Isco,100%庚烷至100% EtOAc,9mL流份)予以純化,即得暗棕色膠狀之化合物P-2(24.9mg,16%)。LCMS[M+H]420;1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.75(br.s.,1H),7.41(dd,J=5.26,8.44Hz,2H),7.25(d,J=3.67Hz,1H),6.96-7.06(m,2H),6.65(d,J=3.67Hz,1H),6.53(d,J=2.81Hz,1H),5.21(ddd,J=3.30,6.36,18.10Hz,2H),4.57(ddd,J=3.18,5.62,17.61Hz,1H),2.76(s,3H),1.66(s,3H),1.40(s,3H)。
步驟3:(3S,4R,5R)-2-(二氟(4-氟苯基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(P-3)之合成
將水(2mL)及三氟乙酸(2mL)加至備有磁性攪拌棒且含有P-2(47.2mg,0.113mmol)之熌爍小玻璃瓶中。將反應於室溫攪拌1小時。將反應於真空下濃縮。將殘留物置 於甲醇(5mL)中,再於真空下再濃縮。此過程重覆另3次。將殘留物經由超臨界流體層析法(Nacalai Cosmosil 3-羥基苯基鍵結之20×150mm管柱,使用10-18% MeOH @ 3%/min,100巴,58mL/min.)予以純化,即得白色固狀之化合物P-3(21.2mg,50%)。LCMS[M+H]380;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 2.65(s,3 H)4.36(br.s.,1 H)4.39-4.53(m,2 H)5.59(d,J=6.48Hz,1 H)5.64(d,J=5.01Hz,1 H)6.28(d,J=6.72Hz,1 H)6.80(d,J=3.55Hz,1 H)7.27(t,J=8.62Hz,2 H)7.49(d,J=3.55Hz,1 H)7.57(dd,J=7.95,5.62Hz,2 H)8.64(s,1 H)。19F NMR(376MHz,DMSO-d6)δ ppm -110.54(br.s.,1 F)-106.97(d,J=258.64Hz,1 F)-100.57(d,J=254.06Hz,1 F)。
實例60(反應圖R)(2R,3R,4S,5R)-2-(4-胺基-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(R-8)
4-氯-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(Q-2)之合成
將4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶Q-1(10g,65.1mmol)及Selectfluor(27.7g,78.1mmol)之CH3CN(500mL)及AcOH(100mL)溶液於70℃攪拌16小時。(反應進行四次,10g Q-1於每一容器中)。反應溶液由無色轉為黑色。TLC(CH2Cl2/CH3OH=20:1)顯示餘留20%的起始材料,然後將反應溶液濃縮以得粗製物。將固狀物溶於EtOAc(1L)中,以H2O(300mL×2)清洗。將有機層濃縮以得棕色固狀之Q-2(7g)。將結合之四批藉prep-HPLC(0.225%甲酸/乙腈)予以純化,得白色固狀之Q-2(11.6g,26%)。LCMS[M+1]172;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 12.47(s,1H),8.62(s,1H),7.72(d,1H)
製備Q-2之另一程序
步驟1:於室溫將NBS(1.1g,6.23mmol)加至4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶Q-1(870mg,5.67mmol)之DMF(14.2mL,0.4M)溶液中。將反應攪拌過夜16小時。LCMS顯示起始材料被消耗且形成產物。以飽和水性NaHCO3令反應混合物之反應中止,然後以EtOAc萃取。將EtOAc以鹽水清洗,以硫酸鈉乾燥,過濾再濃縮以得暗棕色固狀物。將固狀物懸浮於CH2Cl2中,然後負載至12g ISCO固體負載匣上,且純化0-50% EtOAc/庚烷以得204mg淡棕褐色固狀物。此不可溶之淡棕色固狀物亦為產物,再予乾燥以得839mg淡棕色固狀物。結合材料後得5-溴-4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(Q-3)(1.043g,79%)。 LCMS[M+1]232/234;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 12.96(br.s.,1H),8.62(s,1H),7.94(s,1H)
步驟2:將BuLi(2.62mL,4.20mmol,1.6M)逐滴加至已於乾冰丙酮浴中冷卻之5-溴-4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(Q-3)(465mg,2mmol)之THF(10mL,0.2M)溶液中。將混合物於-78℃攪拌20分鐘。反應混合物變為黏滯懸浮液。將Accufluor(NFSI)(757mg,2.4mmol)之THF(2mL,0.2M)溶液逐滴加入。完全加入後,反應混合物變為均勻。令反應混合物徐緩加溫至室溫過夜16小時。LCMS顯示為~1:1產物與起始材料之混合物。以飽和水性NH4Cl令反應混合物之反應中止,然後以水及EtOAc稀釋。將EtOAc以鹽水清洗,以硫酸鈉乾燥,過濾再濃縮成油狀物。將此材料藉於ISCO管柱上以0-100% EtOAc/庚烷洗提進行管柱層析予以純化,即得75%純度之Q-2。LCMS[M+1]172/174;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.62(s,1H),7.71(d,J=2.2Hz,1H)
步驟1:7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-氯-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(R-1)之合成
將C-4(~31g,96mmol,甲苯(120mL)液)逐滴加至已攪拌之Q-2(7.6g,44.3mmol)、粉狀KOH(5.59g,99.7mmol)及參[2-(2-甲氧基乙氧基)乙基]胺(TDA-1)(7.16g,22.1mmol)之甲苯(125mL)懸浮液中。加入後,將反應混合物於室溫攪拌16小時。TLC(石油醚/EtOAc=10:1,Rf~0.25)偵測出新斑點。以飽和NH4Cl溶液(100mL)令混合物之反應中止,再以CH2Cl2(200mL×2)萃取。將結合之有機層以鹽水(100mL×2)清洗,於硫酸鈉上乾燥再濃縮以得殘留物,將其藉SiO2管柱層析法(石油醚/EtOAc=100:1至20:1)予以純化,即得~80%純度無色油狀之R-1(10 g,49.3%)(20%水解之A-3)。
步驟2:((3aR,4R,6R,6aR)-6-(4-氯-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲醇(R-2)之合成
於0℃將TBAF(20mL,20mmol,1M之THF液)加至己攪拌之R-1(20g,43.668mmol,~80%純度)之THF(100mL)溶液中。加入後,將反應混合物於同一溫度攪拌1小時。TLC(石油醚/EtOAc=5:1,Rf~0.1)顯示反應完成。以H2O(20mL)令混合物之反應中止,再以EtOAc(50mL×2)萃取。將結合之有機層以鹽水(30mL×2)清洗,於硫酸鈉上乾燥再濃縮以得殘留物,將其藉SiO2管柱層析法(石油醚/EtOAc=10:1至5:1)予以純化,即得白色固狀之R-2(9g,60%)。LCMS[M+1]344;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.63(s,1H),7.17(d,J=2.9Hz,1H),5.86(d,J=4.5Hz,1H),5.16(t,J=5.2Hz,1H),5.08-5.06(m,1H),4.56(d,J=9.2Hz,1H),4.45(d,J=1.6Hz,1H),3.94(d,J=12Hz,1H),3.81(t,J=10.4Hz,1H),1.63(s,3H),1.37(s,3H)
步驟3:(3aS,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-羧酸(R-3)之合成
於室溫(25℃)無需冷卻地將H2O(15mL)、TEMPO(1.78g,11.4mmol)及PhI(OAc)2(10.5g,27.6mmol)分次 加至R-2(5g,14.5mmol)之MeCN(15mL)溶液中。反應為放熱性。將混合物於室溫(25℃)攪拌20小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數起始材料被消耗。將混合物以水(200mL)稀釋,再將液體倒掉。將殘留物以水(20mL×3)清洗。將殘留物以TBME(20mL)研磨10分鐘,然後將石油醚(200mL)加入。藉過濾法收集固狀物,再於真空中乾燥,即得微黃色固狀之R-3(2.6g,50%)。LCMS[M+1]358;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.67(s,1H),7.94(d,1H),6.40(s,1H),5.51-5.48(m,2H),4.71(d,1 H),1.52(s,3H),1.36(s,3H)
步驟4:(3aS,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-N-甲氧基-N,2,2-三甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-甲醯胺(R-4)之合成
於室溫(15℃)將DIPEA(2.82g,21.8mmol)及50%T3P(6.94,6.36mL,10.9mmol)加至R-3(2.6g,7.268mmol)及N,O-二甲氧基羥胺HCl(1.06g,10.9mmol)之THF(50mL)懸浮液中。將所得無色溶液於室溫(15℃)攪拌20小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數起始材料被消耗且形成良好的斑點。將混合物以EtOAc(100mL)稀釋,再以水性NH4Cl(100mL)、水性NaHCO3(50mL)、鹽水(50mL×2)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮,得黃色膠狀之R-4(2.6g,89.3%)。LCMS[M+1]401;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.62(s,1H),7.59(br,1H), 6.70(s,1H),5.30-5.12(m,3H),3.72(s,3H),3.21(s,3H),1.67(s,3H),1.39(s,3H)
步驟5:((3aS,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(3,4-二氟苯基)甲酮(R-5)之合成
將3,4-二氟苯基溴化鎂(2.14mL,1.07mmol,0.50M)加至已冷卻(冰浴)之R-4(214mg,0.534mmol)之THF(3.0mL,0.178M)溶液中。將反應於冰浴中攪拌30分鐘。LCMS顯示反應完成。將飽和NH4Cl加入,將反應加溫至室溫,然後以EtOAc(2 x)萃取。將結合之萃取物以鹽水清洗,然後乾燥(硫酸鎂),過濾再濃縮。將粗製殘留物藉使用ISCO及12g Si管柱進行管柱層析法以0-50% EtOAc/庚烷洗提予以純化,得R-5(206mg,85%)。LCMS[M+1]454;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.49(s,1H),7.69(ddd,J=2.08,7.83,10.39Hz,1H),7.60-7.66(m,1H),7.15-7.24(m,1H),7.12(d,J=2.57Hz,1H),6.38(s,1H),5.61(dd,J=2.26,6.05Hz,1H),5.38-5.43(m,2H),1.70(s,3H),1.45(s,3H)
步驟6:(R)-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(4-氯-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(3,4-二氟苯基)甲醇(R-6)之合成
於室溫(15℃)將RuCl(對異丙基甲苯)[(R,R)-Ts- DPEN](65mg,0.102mmol)及甲酸鈉(18.4g,271mmol)加至粗製R-5(3.7g,~6.8mmol)之EtOAc/H2O(30mL/120mL)懸浮液中。將所得黃色混合物於室溫(15℃)攪拌整個週末。LCMS顯示餘留約24%的起始材料且偵測到47%的期望化合物。將另外之RuCl(對異丙基甲苯)[(R,R)-Ts-DPEN](130mg,0.204mmol)加入。將混合物於室溫(15℃)攪拌4小時。LCMS顯示大多數起始材料被消耗且主峰為期望化合物且未觀察到異構物。TLC(石油醚/EtOAc=3:1)顯示形成兩個主要斑點。將混合物以EtOAc(30mL×2)萃取。將萃取物以鹽水(50mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得粗製R-6(5g)。將粗製材料藉矽膠層析法以EtOAc之石油醚液(由0至50%)洗提予以純化,即得白色固狀之R-6(1.9g,62%)及白色固狀之不期望非鏡像異構物(640mg,21%)。LCMS[M+1]456
步驟7:(R)-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(4-胺基-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(3,4-二氟苯基)甲醇(R-7)之合成
將R-6(950mg,2.08mmol)之二烷/NH3.H2O(5mL/5mL)溶液於微波爐下、於120℃加熱20分鐘。LCMS顯示大多數起始材料被消耗且產物為乾淨的。將混合物於真空中濃縮,得微黃色固狀之粗製R-7(1200mg,>100%),直接用於下一步驟中。
步驟8:(2R,3R,4S,5R)-2-(4-胺基-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(R-8)之合成
於0℃將TFA(20mL)加至粗製R-7(2.4g,~4.1mmol)之H2O(20mL)懸浮液中。將混合物於室溫(15℃)攪拌1小時。LCMS顯示大多數的起始材料被消耗且期望產物為乾淨的。將混合物倒至20%水性K2CO3(100mL),再以EtOAc(50mL×2)萃取。將萃取物以鹽水(50mL×2)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮,然後於真空中乾燥過夜,即得白色固狀之R-8(1500mg,93%)。LCMS[M+H]397;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.06(s,1H),7.47-7.30(m,3H),7.26-7.20(m,1H),7.02(br.s.,2H),6.25(d,J=4.3Hz,1H),6.02(d,J=7.5Hz,1H),5.23(d,J=6.8Hz,1H),5.04(d,J=4.2Hz,1H),4.80-4.72(m,1H),4.49-4.41(m,J=5.1Hz,1H),4.07-4.01(m,1H),3.96(d,J=4.9Hz,1H)
實例61(2R,3R,4S,5R)-2-(4-胺基-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(4-氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇
標題化合物(實例61)係以類似於實例60(反應圖R) 之方法,其中以4-氟苯基氯化鎂取代3,4-二氟苯基溴化鎂製得。LCMS[M+H]378.8;1H NMR(700MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.05(s,1H),7.41(dd,J=5.7,8.3Hz,2H),7.29(d,J=1.2Hz,1H),7.12(t,J=8.9Hz,2H),7.00(br.s.,2H),5.99(d,J=7.7Hz,1H),4.75(br.s.,1H),4.45(br.s.,1H),4.04(d,J=3.9Hz,1H),3.99-3.91(m,1H)。
實例62(反應圖S)(2R,3R,4S,5R)-2-(2-胺基-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-1-羥丙基)四氫呋喃-3,4-二醇(S-10)
步驟1:4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-胺(S-1)之合成
將Pd(PPh3)4(679mg,0.59mmol)加至4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-胺(2200mg,11.74mmol)之THF(45mL)溶液中,其後將AlMe3(1750mg,23.5mmol,11.7mL,2M之己烷液)逐滴加入。將反應於密封管中加熱至75℃ 16小時。LCMS分析顯示餘留約40%的起始材料。將另外之Pd(PPh3)4(679mg)加入,再於75℃連續加熱18小時。將粗製反應於冰浴中冷卻,然後小心地以羅謝氏鹽(Rochelle salt,酒石酸鉀鈉,飽和,10mL)令反應中止。將水(75mL)加入,再將混合物以EtOAc(3×50mL)萃取。將結合之萃取物以鹽水(75mL)清洗,然後乾燥(硫酸鎂),過濾再濃縮。將粗製殘留物置於MeOH中,再倒至2×10g SCX管柱上。將非鹼性雜質以MeOH(各100mL)洗提,其後以7N NH3/MeOH(各50mL)釋出期望產物。將鹼性潤洗液濃縮再於高真空上乾燥,得1740mg(100%)固狀之化合物S-1。LCMS[M+H]149.1;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 10.99(br.s.,1H),6.92(dd,J=2.38,3.24Hz,1H),6.30(dd,J=1.71,3.42Hz,1H),5.90(s,2H),2.41(s,3H)。
步驟2:2-[雙(三級丁氧羰基)胺基]-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-羧酸三級丁酯(S-2)之合成
將二碳酸二-三級丁酯(6.81g,31.2mmol)及4-二甲胺基吡啶(218mg,1.78mmol)加至4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-胺(S-1)(1320mg,8.91mmol)之ACN/DCM(25mL:25mL)溶液中。將反應於室溫攪拌18 小時,然後濃縮,其後藉使用ISCO及40g Si管柱進行管柱層析法以0-60% EtOAc/庚烷洗提予以純化,得1791mg(44.8%)白色固狀之S-2。LCMS[M+H]448.9;1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ ppm 7.83(d,J=4.16Hz,1H),6.85(d,J=4.03Hz,1H),2.74(s,3H),1.68(s,9H),1.41(s,18H)。
步驟3:(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-基)-亞胺基二碳酸二-三級丁酯(S-3)之合成
於室溫將三乙胺(4360mg,43.0mmol,6.00mL)加至2-[雙(三級丁氧羰基)胺基]-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-羧酸三級丁酯(S-2)(1791mg,3.993mmol)之MeOH(7.0mL)溶液中。將反應加熱至60℃18小時,然後濃縮,再藉使用ISCO及40g Si管柱進行管柱層析法以0-90% EtOAc/庚烷洗提予以純化,得1761mg(78%)白色固狀之S-3。LCMS[M+H]348.9;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 12.10(br.s.,1H),7.52(d,J=3.42Hz,1H),6.67(d,J=3.55Hz,1H),2.64(s,3H),1.39(s,18H)。
步驟4:(7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-基)-亞胺基二碳酸二-三級丁酯(S-4)之合成
將四氯化碳(883mg,5.74mmol,0.555mL)加至 (3aR,6R,6aR)-6-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-醇(C-3)(1170mg,3.83mmol)之甲苯(15mL)溶液中。將反應於乾冰/MeCN浴(~-50℃)中冷卻,然後將參(二甲胺基)膦(955mg,4.98mmol,1.06mL)逐滴加入。內溫於添加期間升至-35℃且清澈溶液變為淺黃色。將反應由冷浴中取出,且保持溫度於-15℃至0℃間1小時。以冰冷鹽水(3mL)令反應中止,再分層。將有機相乾燥(硫酸鎂)再過濾,然後加至預攪拌之化合物S-3(1000mg,2.870mmol)之甲苯(10mL)液、KOH(322mg,5.74mmol)及參(3,6-二氧雜庚基)-胺(521mg,1.53mmol,0.516mL)之混合物中。將反應混合物於室溫攪拌40小時,然後以NH4Cl(飽和,25mL)令反應中止,再以DCM(2×30mL)萃取。將結合之有機萃取物乾燥(硫酸鎂),過濾再濃縮。將粗製殘留物藉使用ISCO及24g Si管柱進行管柱層析法以0-100% EtOAc/庚烷洗提予以純化,得751mg(41.2%)淺黃色固狀之S-4。LCMS[M+H]634.8;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 7.75(d,J=3.67Hz,1H),6.81(d,J=3.67Hz,1H),6.24(d,J=2.81Hz,1H),5.21(dd,J=2.75,6.30Hz,1H),4.91(dd,J=3.18,6.24Hz,1H),4.09-4.26(m,1H),3.61-3.81(m,2H),2.65(s,3H),1.53(s,3H),1.40(s,18H),1.31(s,3H),0.83(s,9H),-0.02(d,J=1.47Hz,6H)。
步驟5:(7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(羥甲基)-2,2-二甲基四氫 呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-基)-亞胺基二碳酸二-三級丁酯(S-5)之合成
將四正丁基氟化銨(464mg,1.77mmol,1.8mL,1.0M之THF液)加至S-4(751mg,1.18mmol)之THF(6mL)溶液中。將反應於室溫攪拌1.5小時,然後濃縮,再藉使用ISCO及24g Si管柱進行管柱層析法以0-90% EtOAc/庚烷洗提予以純化,得596mg(96.8%)膠態固狀之化合物S-5。LCMS[M+H]520.8;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 7.83(d,J=3.8Hz,1H),6.82(d,J=3.7Hz,1H),6.24(d,J=3.4Hz,1H),5.17(dd,J=3.4,6.4Hz,1H),5.05(t,J=5.4Hz,1H),4.92(dd,J=2.9,6.3Hz,1H),4.21-4.11(m,1H),3.54(t,J=5.1Hz,2H),2.66(s,3H),1.53(s,3H),1.39(s,18H),1.31(s,3H)。
步驟6:(3aS,4S,6R,6aR)-6-(2-[雙(三級丁氧羰基)胺基]-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-羧酸(S-6)之合成
將(7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(羥甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-基)-亞胺基二碳酸二-三級丁酯(S-5)(363mg,0.863mmol)、TEMPO(11.0mg,0.0697mmol)、ACN(3.5mL)及0.67M磷酸鹽緩衝液(3000mg,16.2mmol,3mL)之混合物加熱至35℃。將水性亞氯酸鈉(158mg,1.39mmol,1.39M)及稀釋漂白劑(0.6mL,將1mL市售漂白劑以19 mL水稀釋所製成之溶液)同步加入。將反應於35℃攪拌18小時,然後冷卻至室溫。以1M NaOH調整pH至8-9,再以MTBE(10mL)萃取。將有機相留出,再將水性相以1N HCl調整至pH 4,然後以MTBE(2×10mL)萃取。將結合之有機萃取物以鹽水(10mL)清洗,然後乾燥(硫酸鎂),過濾再濃縮,得237mg(64%)白色固狀之化合物S-6。LCMS[M+H]535.2;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 7.69(d,J=3.8Hz,1H),6.81(d,J=3.8Hz,1H),6.37(d,J=2.0Hz,1H),5.34(dd,J=2.6,6.1Hz,1H),5.27(dd,J=1.7,6.1Hz,1H),4.65(d,J=2.4Hz,1H),2.65(s,3H),1.54(s,3H),1.41(s,18H),1.34(s,3H)。
步驟7:(7-((3aR,4R,6S,6aS)-6-(甲氧基(甲基)胺基甲醯基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-基)-亞胺基二碳酸二-三級丁酯(S-7)之合成
將N,O-二甲基羥胺鹽酸鹽(64.9mg,0.665mmol)其後二異丙基乙胺(172mg,1.33mmol,0.232mL)及50%丙基膦酸酐之DMF液(339mg,0.532mmol,0.311mL)加至化合物S-6(237.0mg,0.443mmol)之THF(2mL)溶液中。將反應於室溫攪拌18小時,然後以水(5mL)稀釋,再以EtOAc(2×10mL)萃取。將結合之有機萃取物乾燥(硫酸鎂),過濾再濃縮,然後藉使用ISCO及12g Si管柱進行管柱層析法以20-100% EtOAc/庚烷洗提予以純化,得 112.0mg(43.7%)棕褐色膠態固狀之化合物S-7。LCMS[M+H]578.2;1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 7.57(br.s.,1H),6.63(s,1H),6.59(d,J=3.79Hz,1H),5.29(br.s.,1H),5.16(d,J=3.67Hz,2H),3.67(s,3H),3.18(s,3H),2.71(s,3H),1.64(s,3H),1.45(s,18H),1.39(s,3H)。
步驟8:(7-((3aR,4R,6S,6aS)-2,2-二甲基-6-丙醯基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-基)-亞胺基二碳酸二-三級丁酯(S-8)之合成
將(7-((3aR,4R,6S,6aS)-6-(甲氧基(甲基)胺基甲醯基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-基)-亞胺基二碳酸二-三級丁酯(S-7)(113.0mg,0.196mmol)之THF(1.0mL)溶液於冰浴中冷卻,然後將乙基溴化鎂(52.1mg,0.391mmol,0.196mL,2.00M)加入。將反應於冰浴中攪拌10分鐘,然後以飽和(5mL)令反應中止。將反應加溫至室溫,再以EtOAc(2×10mL)萃取。將結合之有機萃取物乾燥(硫酸鎂),過濾再濃縮,得52mg(49%)棕褐色固狀之化合物S-8。LCMS[M+H-Boc]447.3。
步驟9:(7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-((R)-1-羥丙基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-基)-亞胺基二碳酸二-三級丁酯(S-9)之合成
將(7-((3aR,4R,6S,6aS)-2,2-二甲基-6-丙醯基四氫呋喃 并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-基)-亞胺基二碳酸二-三級丁酯(S-8)(52mg,0.095mmol)及(R,R)-N-(對甲苯磺醯基)-1,2-二苯基乙烷二胺(氯)(對異丙基甲苯)钌(II)(5.0mg,0.0075mmol)於圓底燒瓶中結合,再以氮吹洗。將水性甲酸鈉(262mg,3.81mmol,1.52mL,2.5M之水液)其後EtOAc(0.5mL)加入。將雙相混合物於室溫下、於氮下攪拌20小時。將反應以EtOAc(5mL)及水(5mL)稀釋。分層,再將有機相以鹽水(5mL)清洗,然後乾燥(硫酸鎂),過濾再濃縮,得52mg(100%)S-9。LCMS[M+H-Boc]448.9。
步驟10:(2R,3R,4S,5R)-2-(2-胺基-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-1-羥丙基)四氫呋喃-3,4-二醇(S-10)之合成
將三氟乙酸(740mg,6.5mmol,0.5mL)加至(7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-((R)-1-羥丙基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-基)-亞胺基二碳酸二-三級丁酯(S-9)(52mg,0.095mmol)之二氯甲烷(0.2mL)溶液中。將反應於室溫攪拌6小時。將粗製反應濃縮,然後藉SFC使用Chiralpak AS-3 4.6×100mm 3u管柱以10% MeOH於120巴及4mL/min洗提予以純化,即得白色固狀之S-10(12.29mg,42%,99% de)。LCMS[M+H]308.9;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 7.20(d,J=3.79Hz,1H),6.42(d,J=3.67Hz,1H), 6.06(s,2H),5.94(d,J=7.46Hz,1H),5.11(d,J=6.36Hz,1H),5.02(d,J=5.01Hz,1H),4.97(d,J=2.81Hz,1H),4.30-4.40(m,1H),4.12(br.s.,1H),3.68(d,J=3.67Hz,1H),3.47(dd,J=4.34,8.25Hz,1H),2.42(s,3H),1.42-1.56(m,1H),1.39(s,1H),1.32(td,J=7.35,14.27Hz,1H),0.90(t,J=7.34Hz,2H)。
實例63(2R,3R,4S,5R)-2-(2-胺基-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-1-羥丁基)四氫呋喃-3,4-二醇
標題化合物(實例63)係以類似於實例62(反應圖S)之方法,其中以丙基氯化鎂取代乙基溴化鎂製得。Chiralpak AD-3 4.6×100mm 3u管柱/30% MeOH/DEA @ 120巴,4mL/min。18.51mg(44%)99% de;LCMS[M+H]322.9;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 7.20(d,J=3.67Hz,1H),6.42(d,J=3.67Hz,1H),6.07(s,2H),5.94(d,J=7.46Hz,1H),5.12(d,J=6.72Hz,1H),5.02(d,J=5.26Hz,1H),4.97(d,J=3.79Hz,1H),4.30-4.40(m,1H),4.11(br.s.,1H),3.66(d,J=3.42Hz,1H),3.55(d,J=3.67Hz,1H),2.42(s,3H),1.20-1。54(m,4H),0.86(t,J=6.54Hz,3H)。
實例64(反應圖T)(2R,3R,4S,5R)-2-(2-胺基-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(4-氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(T-4)
LCMS[M+H]374.9;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 7.41(d,J=3.79Hz,1H),7.37(dd,J=5.75,8.56Hz,2H),7.11(t,J=8.86Hz,2H),6.58(d,J=3.79Hz,1H),6.52(br.s.,1H),5.96(d,J=6.72Hz,1H),5.93(d,J=5.99Hz,1H),5.24(d,J=4.77Hz,1H),5.09(br.s.,1H),4.80(br.s.,1H),4.23-4.33(m,J=5.26Hz,1H),4.13(br.s.,1H),4.00(t,J=2.57Hz,1H)。
實例65(反應圖T)(2R,3R,4S,5R)-2-(2-胺基-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((S)-(4-氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(T-5)
LCMS[M+H]374.8;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 7.42(dd,J=5.75,8.44Hz,2H),7.25(d,J=3.67Hz,1H),7.13(t,J=8.86Hz,2H),6.46(d,J=3.67Hz,1H),6.16(br.s., 2H),5.98(d,J=7.95Hz,1H),5.95(d,J=4.28Hz,1H),5.17(d,J=6.72Hz,1H),4.97(d,J=3.55Hz,1H),4.75(t,J=4.59Hz,1H),4.43-4.54(m,1H),4.09(br.s.,1H),3.93(d,J=5.14Hz,1H),2.44(s,3H)。
實例6465化合物係以類似於實例62(反應圖S)之方法,其中以4-氟苯基溴化鎂取代乙基溴化鎂且其中使用NaBH4取代(R,R)-N-(對甲苯磺醯基)-1,2-二苯基乙烷二胺(氯)(對異丙基甲苯)钌(II)及甲酸鈉製得。
將NaBH4(76.9mg,2.03mmol)加至(7-((3aR,4R,6S,6aS)-6-(4-氟苯甲醯基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-基)-亞胺基二碳酸二-三級丁酯(T-1)(249mg,0.406mmol)之EtOH(10mL)溶液中。LCMS顯示反應於5分鐘內完成。將反應濃縮以得250mg非鏡像異構物之粗製混合物(T-2),其係直接用於下一步驟。脫保護及手性分離係以類似於反應圖S步驟10之程序進行,即得化合物T-4及T-5。
實例66(反應圖U)(2R,3R,4S,5S)-2-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-苯基四氫呋喃-3,4-二醇(U-7)
步驟1:(3aR,6aR)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-醇(U-1)之合成
將(3aR,6aR)-2,2-二甲基二氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4(3aH)-酮(10g,63mmol)及250mL CH2Cl2加至備有溫度計及N2之二頸式燒瓶內,冷卻至-78℃,邊保持溫度約-70℃邊將1.0M DIBAL之CH2Cl2液(126mL,1.26mmol)逐滴加入,將反應於-78℃攪拌1.5小時。藉於-78℃徐緩加入14mL MeOH令反應中止,令其加溫至室溫,將另外之MeOH加入,通過矽藻土(celite)過濾,以10% MeOH/CH2Cl2潤洗,濃縮以得8g黃色油狀物U-1。將矽藻土(celite)塊置於艾氏燒瓶(Erlenmeyer)中,將10% MeOH/CH2Cl2加入,攪拌過夜,過濾再濃縮,將結合之 粗製物藉ISCO 80g Si管柱以0-10% MeOH/CH2Cl2洗提予以純化,得淡黃色油狀之8.01g U-1。
步驟2:((4R,5S)-2,2-二甲基-5-(2-甲基丙-1-烯-1-基)-1,3-二氧雜環戊烷-4-基)甲醇(U-2)之合成
將異丙基三苯基碘化鏻(64.9g,150mmol)及300mL THF加至備有溫度計及N2之二頸式燒瓶內,冷卻至-25℃,邊保持溫度約-25℃邊將1.6M nBuLi之己烷液(93.8mL,150mmol)逐滴加至懸浮液中。加入後,將乾冰浴移除,再令反應加溫至室溫。更換乾冰浴,再冷卻至-25℃,邊保持溫度約-25℃邊將(3aR,6aR)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-醇(U-1)(8.01g,50mmol)之60mL THF液經由注射器加入。加入後,將乾冰浴移除,再將反應加溫至室溫且攪拌2小時。徐緩加入30mL H2O令反應中止,將固狀物過濾,將濾液以乙酸乙酯萃取,濃縮,藉ISCO 220g Si管柱以20-30% EtOAc/庚烷洗提予以純化,得8.02g淡黃色油狀之U-2。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 5.26(dt,J=8.93,1.34Hz,1 H)4.95(dd,J=8.86,6.66Hz,1 H)4.21(td,J=6.60,5.01Hz,1 H)3.53-3.62(m,2 H)1.77-1.80(m,3 H)1.73(d,J=1.10Hz,3 H)1.51(s,3 H)1.41(s,3 H)
步驟3:(4S,5S)-2,2-二甲基-5-(2-甲基丙-1-烯-1-基)-1,3-二氧雜環戊烷-4-甲醛(U-3)之合成
於-78℃將1.16mL DMSO加至草醯氯(1.02g,8.05mmol)之CH2Cl2(20mL)溶液中,將混合物攪拌5分鐘,將((4R,5S)-2,2-二甲基-5-(2-甲基丙-1-烯-1-基)-1,3-二氧雜環戊烷-4-基)甲醇(U-2)(1g,5.37mmol)之CH2Cl2(10mL)溶液於5分鐘期間加入,將混合物攪拌30分鐘,將三乙胺(2.72g,26.8mmol)於5分鐘期間逐滴加入。將混合物攪拌另10分鐘,將乾冰浴移除,再將反應加溫至室溫。藉由H2O(30mL)令反應混合物之反應中止,分層,將水性層以CH2Cl2萃取3次。將有機層以lN HCl清洗3次,以飽和NaHCO3清洗一次,及以鹽水(20mL)清洗。將有機相乾燥,將乾燥試劑過濾,再將有機相蒸發,得淡黃色油狀之粗製U-3(1g)。
步驟4:(R)-((4R,5S)-2,2-二甲基-5-(2-甲基丙-1-烯-1-基)-1,3-二氧雜環戊烷-4-基)(苯基)甲醇(U-4b)之合成
於N2於-78℃將1.8M苯基鋰之二正丁基醚液(4.52mL,8.14mmol)加至(4S,5S)-2,2-二甲基-5-(2-甲基丙-1-烯-1-基)-1,3-二氧雜環戊烷-4-甲醛(U-3)(1g,5.43mmol)之THF(20mL)溶液中。加入後,將乾冰浴移除,再將反應加溫至室溫且攪拌過夜。將H2O(30mL)及EtOAc加至反應混合物中,分層,將水性層以EtOAc萃取3次。將有機層蒸發,將粗製物藉ISCO 40g Si管柱先以0-40%乙醚/庚烷然後換成2.5-10%(1:1庚烷:CH2Cl2)/EtOAc洗提予以純化,即洗提出150mg淡黃色油狀之第一種非鏡像 異構物(U-4a),然後洗提出860mg淡黃色油狀之第二種非鏡像異構物(U-4b)。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 7.27-7.44(m,5 H)5.37(dt,J=9.29,1.28Hz,1 H)4.78(dd,J=9.23,6.42Hz,1 H)4.65(d,J=6.60Hz,1 H)4.39(t,J=6.48Hz,1 H)1.68(d,J=1.10Hz,3 H)1.59(s,3 H)1.43(s,3 H)1.32(d,J=1.10Hz,3 H)
步驟5:(3aR,4R,6S,6aR)-2,2-二甲基-6-苯基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-醇(U-5)之合成
於-78℃將O3起泡至(R)-((4R,5S)-2,2-二甲基-5-(2-甲基丙-1-烯-1-基)-1,3-二氧雜環戊烷-4-基)(苯基)甲醇(U-4b)(750mg,2.86mmol)之1:1 CH2Cl2/MeOH(30mL)溶液中5分鐘。溶液轉為淡藍色。將氣體O3換成N2,起泡1分鐘,將0.5mL DMS加入,將乾冰浴移除,再將反應加溫至室溫0.5小時。將混合物濃縮,藉ISCO 24g Si管柱以3% CH2Cl2/EtOAc洗提予以純化,得636mg白色固狀之U-5。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 7.31-7.44(m,5 H)5.56(s,1 H)5.28(d,J=3.67Hz,1 H)4.87(dd,J=5.75,3.67Hz,1 H)4.74(d,J=5.75Hz,1 H)1.45(s,3 H)1.29(s,3 H)
步驟6:7-((3aR,4R,6S,6aR)-2,2-二甲基-6-苯基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(U-6)之合成
將154μL CCl4加至(3aR,4R,6S,6aR)-2,2-二甲基-6-苯基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-醇(U-5)(250mg,1.06mmol)之甲苯(15mL)溶液中。將反應於乾冰/丙酮浴(~-50℃)中冷卻,然後將參-(二甲胺基)膦(264mg,1.38mmol)之2mL甲苯液於10分鐘期間逐滴加入。內溫於添加期間升至~35℃且清澈溶液變為淡黃色。將反應由冷浴中取出,且保持溫度在-15℃與0℃之間1小時。以冰冷鹽水(3mL)令反應中止,再分層。將有機相於硫酸鎂上乾燥再過濾,然後加至預攪拌之4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(V-1)(141mg,1.06mmol)之甲苯(15mL)液、固態KOH(89mg,1.59mmol)、參-(3,6-二氧雜庚基)-胺(144mg,0.423mmol)之混合物中。將反應混合物於室溫攪拌40小時,然後以飽和NH4Cl溶液(25mL)令反應中止,再以DCM(2×30mL)萃取。將結合之有機萃取物乾燥(硫酸鎂),過濾再濃縮。將粗製殘留物藉ISCO 40g Si管柱以0-50% EtOAc/Hep洗提予以純化,得124mg白色固狀之U-6。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.88(s,1 H)7.29-7.45(m,6 H)6.70(d,J=2.93Hz,1 H)6.23(s,1 H)5.79(d,J=5.62Hz,1 H)5.44(d,J=3.55Hz,1 H)5.28-5.34(m,1 H)2.82-2.93(m,3 H)1.57(s,3 H)1.38(s,3 H)
步驟7:(2R,3R,4S,5S)-2-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-苯基四氫呋喃-3,4-二醇(U-7)之合成
將7-((3aR,4R,6S,6aR)-2,2-二甲基-6-苯基四氫呋喃并 [3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(U-6)(124mg,0.353mmol)溶於10mL TFA中,將2mL H2O加入,於室溫攪拌5小時。將反應濃縮,再藉SFC使用Chiralpak AS-3 4.6×100mm 3u管柱以10% MeOH於120巴及4mL/min洗提予以純化,即得85.24mg白色固狀之U-7。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.70(s,1 H)7.90(d,J=3.67Hz,1 H)7.29-7.42(m,4 H)7.22-7.29(m,1 H)6.80(d,J=3.79Hz,1 H)6.40(d,J=7.58Hz,1 H)5.60(d,J=2.32Hz,1 H)5.45(d,J=6.97Hz,1 H)5.07(dt,J=7.21,3.61Hz,1 H)5.04(d,J=4.65Hz,1 H)4.24-4.30(m,1 H)2.68(s,3 H)
中間體V-1之合成
4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(V-1)之合成
將4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(1.54g,10mmol)及Pd(PPh3)4(116mg,0.100mmol)之THF(10.0mL,1M)懸浮液以N2真空吹洗。然後將二甲基鋅溶液(3.82g,40.0mmol,20.0mL,2M之甲苯溶液)加入,再將混合物以N2真空吹洗,然後加熱至60℃ 16小時。LCMS-APCI(+)顯 示為~1:1起始材料與產物之混合物。將反應加熱至80℃另24小時,其中LCMS顯示為~2:1產物與起始材料之混合物。將反應混合物於冰水浴中冷卻,然後以飽和水性NaHCO3令反應中止,再以EtOAc萃取。將EtOAc以鹽水清洗,以硫酸鎂乾燥,過濾再濃縮成油狀物。將粗製材料藉於24g管柱上以0-100% EtOAc-庚烷洗提進行ISCO-Rf予以純化,即得化合物V-1(561mg,42%)。LCMS[M+1]134;1HNMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.94(s,1H),7.42(d,J=3.4Hz,1H),6.68(d,J=3.4Hz,1H),2.87(s,3H)
實例67(反應圖W)(2R,3R,4S,5S)-2-(4-胺基-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-苯基四氫呋喃-3,4-二醇(W-2)
步驟1:4-氯-7-((3aR,4R,6S,6aR)-2,2-二甲基-6-苯基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(W-1)之合成
W-1係以類似於7-((3aR,4R,6S,6aR)-2,2-二甲基-6-苯基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(U-6,反應圖U)之方法,其中4-甲基-7H-吡咯 并[2,3-d]嘧啶(V-1)被4-氯-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(Q-2)取代而製得。
步驟2:(2R,3R,4S,5S)-2-(4-胺基-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-苯基四氫呋喃-3,4-二醇(W-2)之合成
將4-氯-7-((3aR,4R,6S,6aR)-2,2-二甲基-6-苯基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(W-1)(131mg,0.336mmol)溶於2mL二烷中,將2mL NH4OH加入,密封,再於95℃加熱過夜。將混合物濃縮,再溶於10mL TFA中,將2mL H2O加入,於室溫攪拌1小時。將反應濃縮,然後藉SFC使用Chiralpak AS-3 4.6×100mm 3u管柱以10% MeOH於120巴及4mL/min洗提予以純化,即得68.82mg白色固狀之化合物W-2。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.12(s,1 H)7.52(d,J=1.47Hz,1 H)7.29-7.39(m,4 H)7.22-7.29(m,1 H)6.97(br.s.,2 H)6.32(d,J=7.34Hz,1 H)5.49(d,J=2.45Hz,1 H)5.40(d,J=7.21Hz,1 H)4.96(d,J=4.65Hz,1 H)4.90(td,J=7.34,4.16Hz,1 H)4.17-4.24(m,1 H)
實例68(反應圖X)(2R,3R,4S,5S)-2-(2-胺基-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-苯基四氫呋喃-3,4-二醇(X-2)
步驟1:(7-((3aR,4R,6S,6aR)-2,2-二甲基-6-苯基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-基)(三級丁氧基甲基)胺基甲酸三級丁酯(X-1)之合成
X-1係以類似於7-((3aR,4R,6S,6aR)-2,2-二甲基-6-苯基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(U-6,反應圖U)之方法,其中4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(V-1)被(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-基)(三級丁氧基甲基)胺基甲酸三級丁酯(S-3)而製得。
步驟2:(2R,3R,4S,5S)-2-(2-胺基-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-苯基四氫呋喃-3,4-二醇(X-2)之合成
X-2係以類似於實例66(步驟6,反應圖U)之方式製得。
1H NMR(700MHz,DMSO-d6)δ ppm 7.38(d,J=3.74Hz,1 H)7.29-7.36(m,3 H)7.21-7.27(m,1 H)6.50(d,J=3.74Hz,1 H)6.28(br.s.,2 H)6.20(d,J=7.48Hz,1 H)5.49-5.53(m,1 H)5.40(d,J=6.82Hz,1 H)4.95(d,J=3.96Hz,1 H)4.89-4.93(m,1 H)4.17-4.23(m,1 H)2.45(s,3 H)
實例69(反應圖Y)(2R,3R,4S,5R)-2-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-( 唑-5-基)四氫呋喃-3,4-二醇(Y-6)
步驟1:4-氯-7-((3aR,4R,6S,6aR)-6-((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧雜環戊烷-4-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(Y-1)之合成
將CCl4(1.28mL,13.2mmol)加至(3aR,6S,6aR)-6-((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧雜環戊烷-4-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-醇(2.65g,10.2mmol)之THF(20.4mL,0.5M)溶液中。將所得混合物於乾冰/丙酮浴中冷卻,然後將HMPT(2.78mL,15.3mmol)加入。將 乾冰浴轉換成冰-水浴,再令溶液加溫至~0C。45分鐘後,將反應混合物倒至含有冷鹽水之分液漏斗中,然後以MTBE(30ml)萃取。然後將MTBE層以硫酸鈉乾燥,過濾繼而置於200ml RB燒瓶中。
將4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(908mg,6.82mmol)及KOH(857mg,15.3mmol)之混合物懸浮於THF(30.0mL,0.20M)中。將TDA-1(1.30mL,4.07mmol)加至懸浮液中,~10分鐘後混合物變為均勻。然後將先前製得之MTBE溶液經由套管加至此反應混合物中。將所得混合物於室溫攪拌16小時。以飽和水性NH4Cl令反應混合物之反應中止,然後以水及EtOAc稀釋。將EtOAc層以鹽水清洗,以硫酸鈉乾燥,過濾然後濃縮成油狀物。將粗製油狀物藉SiO2管柱層析法(庚烷/EtOAc=100/0至1/1)予以純化,得無色油狀之Y-1(1.14g,39%產率)。LCMS-ESI(+):396[M+1]+
1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.62(s,1 H)7.29(d,J=3.67Hz,1 H)6.62(d,J=3.67Hz,1 H)6.05(s,1 H)5.57(d,J=5.87Hz,1H)5.23(dd,J=5.75,3.55Hz,1 H)4.38-4.53(m,2 H)4.22-4.33(m,1 H)3.69-3.85(m,1 H)1.57(s,3 H)1.32-1.45(m,9 H)
步驟2:7-((3aR,4R,6S,6aR)-6-((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧雜環戊烷-4-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(Y-2)之合成
將4-氯-7-((3aR,4R,6S,6aR)-6-((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧雜環戊烷-4-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(Y-1)(611.0mg,1.54mmol)及Pd(PPh3)4(71.3mg,0.0617mmol)之THF(7.72ml)溶液以N2真空沖洗。接著將Me2Zn 2M之甲苯溶液(4.63mL,9.26mmol)加入,再將混合物以N2真空沖洗,再加熱至70℃ 4小時。將反應混合物於冰浴中冷卻,再藉逐滴加入飽和水性NaHCO3(1ml)令反應中止。發生一些起泡現象,接著於完全加入後消退。將粗製混合物以EtOAc及水稀釋。水性層含有白色固狀物,其從未進入溶液狀態。將EtOAc層以鹽水清洗,以硫酸鈉乾燥,過濾然後濃縮成油狀物。將粗製油狀物藉SiO2管柱層析法(庚烷/EtOAc=9/1至3/7)予以純化,得淡琥珀色油狀之Y-2(565mg,98%產率)。LCMS-APCI(+):376[M+1]+
1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.78(s,1H),7.30(d,J=3.7Hz,1H),6.64(d,J=3.4Hz,1H),6.07(s,1H),5.58(d,J=5.9Hz,1H),5.23(dd,J=3.4,5.9Hz,1H),4.47-4.40(m,2H),4.32-4.20(m,1H),3.85-3.71(m,1H),2.85(s,3H),1.58(s,3H),1.47-1.33(m,11H)
步驟3:(R)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)乙-1,2-二醇(Y-3)之合成
將7-((3aR,4R,6S,6aR)-6-((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧雜 環戊烷-4-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(Y-2)(565mg,1.50mmol)之70%v/v水性乙酸(3.01mL,c=0.5M)溶液於50℃攪拌4天。將反應混合物冷卻至室溫,然後於真空中濃縮成琥珀色油狀物。將油狀物再溶於EtOAc中,然後以飽和水性NaHCO3清洗,以硫酸鎂乾燥,過濾再濃縮以得凝膠樣固狀物。將固狀物懸浮於MTBE中,然後音波處理再過濾。接著將固狀物風乾,且進一步於房室真空下乾燥,得白色固狀之Y-3(392mg,78%產率)。LCMS-ESI(+):336[M+1]+
1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.79(s,1 H)7.33(d,J=3.67Hz,1 H)6.67(d,J=3.42Hz,1 H)6.11(s,1 H)5.63(d,J=5.62Hz,1H)5.25-5.34(m,1 H)4.40-4.48(m,1 H)4.17(q,J=5.30Hz,1 H)3.67-3.86(m,2 H)3.22(s,1 H)2.85(s,3 H)1.42(s,3 H)1.32-1.40(m,1H)1.20(s,4 H)。
步驟4:(3aS,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-甲醛(Y-4)之合成
於室溫將NaIO4加至(R)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)乙-1,2-二醇(Y-3)(392mg,1.1mmol))之2:1 THF(5mL)與水(2mL)混合液之溶液中。2小時 後,將反應混合物以EtOAc及水稀釋,然後將EtOAc層以鹽水清洗,以硫酸鎂乾燥,過濾然後濃縮成油狀物,得淡琥珀色油狀之粗製Y-4(300mg,91%產率)。LCMS-ESI(+)=304[M+1]+
1H NMR(400MHz,CD3OD)δ ppm 8.64(s,1H),7.51(t,J=3.2Hz,1H),6.78-6.62(m,1H),6.18(s,1H),5.55(dd,J=3.4,5.6Hz,1H),5.34-5.16(m,1H),4.78-4.67(m,1H),4.32-4.12(m,1H),3.35(s,4H),2.70(d,J=2.4Hz,4H),1.56(d,J=2.4Hz,4H),1.40(s,3H)。
步驟5:(2R,3R,4S,5R)-2-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-( 唑-5-基)四氫呋喃-3,4-二醇(Y-5)之合成
將(3aS,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-甲醛(Y-4)(100mg,0.330mmol)、TOSMIC(64.4mg,0.330mmol)及K2CO3(137mg,0.989mmol)之MeOH(1.10mL)混合液加熱至80℃ 2小時,然後濃縮成油狀物。將粗製油狀物藉Prep-HPLC予以純化,得淡琥珀色油狀之5-((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)唑(Y-5)(41mg,36%產率)。LCMS-ESI(+):343[M+1]+
步驟6:(2R,3R,4S,5R)-2-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-( 唑-5-基)四氫呋喃-3,4-二醇(Y-6)之合成
將5-((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)唑(Y-5)(41mg,0.12mmol)以TFA(250ul)及水(30ul)處理,然後於室溫攪拌24小時,再濃縮成油狀物。將粗製油狀物藉SFC予以純化,即得固狀之Y-6(19.6mg,20%產率)。LCMS-ESI(+):303[M+1]+
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.67(s,1 H)8.33(s,1 H)7.87(d,J=3.67Hz,1 H)7.19(s,1 H)6.79(d,J=3.67Hz,1 H)6.31(d,J=7.58Hz,1 H)5.66(d,J=2.69Hz,1 H)5.46-5.58(m,2 H)4.94-5.06(m,1 H)4.33(q,J=3.91Hz,1 H)2.66(s,3 H)。
實例70(反應圖Z)(2S,3S,4R,5R)-2-((R)-1-羥乙基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(Z-2)
(2S,3S,4R,5R)-2-((R)-1-羥乙基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(Z-2)之合成
將3.0M甲基溴化鎂(400ul,1.20mmol)加至已於乾冰丙酮浴中冷卻之(3aS,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃 -4-甲醛(Y-4)(60.7mg,0.2mmol)之THF(0.67mL,0.3M)溶液中。2小時後,將另外之3.0M甲基溴化鎂(400ul,1.20mmol)加入,再令反應混合物加溫至室溫。另19小時後,以飽和水性NH4Cl令反應混合物之反應中止,然後以水稀釋,再以EtOAc萃取。將EtOAc以鹽水清洗,以硫酸鎂乾燥,過濾然後濃縮成油狀物。將油狀物藉SiO2管柱層析法(庚烷/EtOAc=60/40至0/100然後EtOAc/MeOH=100/0至70/30)予以純化,得無色油狀之Z-1(23mg,36%產率)。
將油狀物Z-1(23mg,0.072mmol)溶於TFA(250ul)與水(30ul)之混合液中,然後於室溫攪拌2小時。將反應混合物以甲苯(1ml)稀釋,然後於真空中濃縮以得紅色油狀物。將油狀物藉SFC層析法予以純化,即得Z-2(5.46mg,10%產率);LCMS-APCI(+):280[M+1]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ ppm 8.63(s,1 H)7.63(d,J=3.67Hz,1 H)6.76(d,J=3.67Hz,1 H)6.25(d,J=7.34Hz,1 H)4.95(dd,J=7.34,4.40Hz,1 H)4.42(t,J=3.30Hz,1 H)4.21(dd,J=7.70,2.57Hz,1 H)4.01-4.15(m,1 H)2.72(s,3 H)1.23(d,J=6.36Hz,3 H)。
實例71(反應圖AA)(2S,3S,4R,5R)-2-(羥甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(AA-2)
步驟1:((3aR,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲醇(AA-1)之合成
於室溫將NaBH4(31.1mg,0.798mmol)加至(3aS,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-甲醛(Y-4)(220mg,0.725mmol)之MeOH(2.42ml)溶液中。將混合物於室溫攪拌3小時,然後以水令反應中止,再濃縮以移除MeOH。將殘留物再溶於EtOAc中,然後將EtOAc以水、鹽水清洗,以硫酸鎂乾燥,過濾然後濃縮成油狀物。將粗製油狀物藉SiO2層析法(50-100% EtOAc-庚烷7分鐘然後0-3% MeOH-EtOAc 7分鐘),得無色油狀之AA-1(192mg,87%產率)。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.81(s,1H),7.35(d,J=3.4Hz,1H),6.70(d,J=3.4Hz,1H),6.11(s,1H),5.62(d,J=5.9Hz,1H),5.31(dd,J=3.9,5.9Hz,1H),4.56-4.44(m,1H),4.05-3.88(m,2H),2.89(s,3H),1.60(s,3H),1.43(s,3H)
步驟2:(2S,3S,4R,5R)-2-(羥甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并 [2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(AA-2)之合成
將醇AA-1(24mg,0.079mmol)、TFA(2.73mmol,209uL)及H2O(1.36mmol,24.6uL)之混合物於室溫攪拌。1小時後,將反應混合物濃縮成油狀物。將粗製油狀物藉SFC層析法予以純化,即得白色固狀之AA-2(9.33mg,30%產率)。LCMS-APCI(+):266[M+1]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ ppm 7.39(s,1 H)6.27-6.29(m,1 H)5.47(d,J=3.42Hz,1 H)4.95(d,J=6.60Hz,1 H)3.54(t,J=5.38Hz,1 H)3.25-3.28(m,1 H)3.14(t,J=3.79Hz,1 H)2.50-2.65(m,2 H)1.47(s,3 H)
實例72(反應圖BB)(2R,3R,4S,5S)-2-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-(1H-吡唑-5-基)四氫呋喃-3,4-二醇(BB-4)
步驟1:1-((3aR,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)丙-2-炔-1-醇(BB-1)之合成
將乙炔基溴化鎂(5.58mL,2.79mmol,0.5M)加至已於乾冰丙酮浴中冷卻之(3aS,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-甲醛(Y-4)(141mg,0.465mmol)之THF(0.667mL,0.3M)溶液中。令反應混合物徐緩地加溫至室溫。45小時後,將反應混合物於乾冰丙酮浴中再度冷卻,然後將另外之乙炔基溴化鎂(5.58mL,2.79mmol,0.5M)加入。將乾冰丙酮浴以冰-水浴替代。另6小時後,以飽和水性NH4Cl令反應混合物之反應中止,以水稀釋,再以EtOAc萃取。將結合之EtOAc以鹽水清洗,以硫酸鎂乾燥,過濾然後濃縮成油狀物。將粗製油狀物藉SiO2層析法(庚烷/EtOAc 60/40至0/100)9分鐘然後MeOH/EtOAc 0-3% MeOH 5分鐘予以純化,得無色油狀之BB-1(70mg,46% 產率)。LCMS-ESI(+):330[MH]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.61-8.85(m,1 H)7.20-7.26(m,1 H)6.48-6.69(m,1 H)6.04(s,1 H)5.45-5.75(m,2 H)4.67-4.84(m,1 H)4.57(dd,J=7.09,3.67Hz,1 H)2.65-2.82(m,3 H)1.53-1.70(m,3 H)1.33-1.49(m,3 H)
步驟2:1-((3aS,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)丙-2-炔-1-酮(BB-2)之合成
將1-((3aR,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)丙 -2-炔-1-醇(BB-1)(70mg,0.21mmol)及戴斯-馬丁試劑(Dess-Martin Periodinane,108mg,0.255mmol)之DCM(0.708mL,c=0.3M)混合液於室溫攪拌。40分鐘後,LCMS顯示起始材料被消耗。將粗製反應混合物藉SiO2層析法(庚烷/EtOAc 60/40至0/100)予以純化,得紅色固狀之BB-2(37mg,53%產率)。LCMS-ESI(+):328[M+1]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.77(s,1H),7.24(d,J=3.7Hz,1H),6.59(d,J=3.7Hz,1H),6.15(s,1H),5.81-5.73(m,1H),5.62(d,J=5.6Hz,1H),5.31(s,1H),5.19(d,J=4.4Hz,1H),3.42(s,1H),2.75(s,3H),2.10(s,1H),1.56(s,3H),1.41(s,3H)
步驟3:(2R,3R,4S,5S)-2-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-(1H-吡唑-5-基)四氫呋喃-3,4-二醇(BB-2)之合成
於室溫將單水合肼(6.58ul,0.136mmol)加至1-((3aS,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)丙-2-炔-1-酮(BB-2)(37mg,0.11mmol)之EtOH(0.377ml)溶液中。7分鐘後,LCMS顯示起始酮被消耗。將反應混合物濃縮成油狀物,然後藉SiO2層析法(庚烷/EtOAc 6/4至0/10 8分鐘,然後MeOH/EtOAc 0/100至3/97)予以純化,得紅棕色油狀之7-((3aR,4R,6S,6aR)-2,2-二甲基-6-(1H-吡唑-5-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(BB-3)(23mg)。LCMS-ESI(+):342[M+1]+
將7-((3aR,4R,6S,6aR)-2,2-二甲基-6-(1H-吡唑-5-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(BB-3)(23mg)以TFA(200ul)及水(20ul)之混合液處理,然後於室溫攪拌。4小時後,將反應混合物濃縮成油狀物。將粗製油狀物藉SFC層析法予以純化,即得固狀之BB-4(7.51mg,22%產率)。LCMS-APCI(+):302[M+1]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ ppm 8.66(br.s.,1 H)7.70(br.s.,1 H)7.59(br.s.,1 H)6.77(br.s.,1 H)6.28-6.58(m,2 H)5.76(br.s.,1 H)5.18(br.s.,1 H)4.42(br.s.,1 H)2.73(br.s.,3 H)。
實例73(反應圖CC)(2S,3S,4R,5R)-2-((S)-羥基(苯基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(CC-3) 實例74(反應圖CC)(2S,3S,4R,5R)-2-((R)-羥基(苯基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(CC-4)
步驟1:(S)-((3aR,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(苯基)甲醇(CC-1)及(R)-((3aR,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(苯基)甲醇(CC-2)之合成
將3M苯基溴化鎂(0.73mL,2.19mmol)加至已於冰-水浴中冷卻之0.6M LaCl3 2LiCl(4.01mL,2.41mmol)之THF溶液中。將混合物於0℃攪拌1小時,然後將(3aS,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-甲醛(Y-4)(332mg,1.09mmol)之THF(2.19ml)溶液加入。17小時後,以飽和水性NH4Cl令反應混合物之反應中止,然後以水及EtOAc稀釋。水性相由於過量之鹽,故保留乳膠狀態。將EtOAc層分離出,再將水性層再一次以EtOAc萃取。將集結之EtOAc層以鹽水清洗,以硫酸鎂乾燥,過濾然後濃 縮成油狀物。將粗製油狀物藉SiO2層析法(0-100% EtOAc之庚烷液)予以純化,得白色泡沫狀之1:1非鏡像異構物混合物(130mg,31%產率)。
將非鏡像異構物藉SFC(Whelk-O1(S,S)4.6×100mm 5u管柱,20% MeOH @ 120巴,4mL/min)分離,得白色固狀之CC-1(56mg,13%產率)。LCMS-ESI(+):382[M+1]+,>99% de,1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 7.46-7.39(m,2H),7.37-7.28(m,3H),7.12(d,J=3.4Hz,1H),6.52(d,J=3.7Hz,1H),6.05(s,1H),5.65(d,J=5.9Hz,1H),5.38(dd,J=3.8,5.7Hz,1H),5.02(t,J=6.4Hz,1H),4.59(dd,J=3.7,7.1Hz,1H),3.30(d,J=5.9Hz,1H),2.71(s,3H),1.69(s,3H),1.46(s,3H)及白色固狀之CC-2(41mg,10%產率)。LCMS-ESI(+):382[M+1]+,~98% de,1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 7.40(d,J=6.8Hz,2H),7.31-7.20(m,3H),7.12(br.s.,1H),6.48(d,J=3.4Hz,1H),6.01(s,1H),5.54(d,J=5.6Hz,1H),5.07(d,J=6.8Hz,1H),4.88(dd,J=3.4,5.6Hz,1H),4.43(dd,J=3.3,7.0Hz,1H),2.75(d,J=1.2Hz,1H),1.59(s,3H),1.29(s,3H)
步驟2:(2S,3S,4R,5R)-2-((S)-羥基(苯基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(CC-3)之合成
將材料CC-1以TFA以類似於實例71(步驟2,反應圖AA)之方式處理。將所得粗製材料藉SiO2層析法(60- 100% EtOAc-庚烷8分鐘,然後0-5% MeOH-EtOAc 8分鐘)予以純化,得白色固狀之CC-3(17mg,34%產率)。LCMS-ESI(+):342[M+1]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.62(s,1H),7.73(d,J=3.7Hz,1H),7.32(d,J=7.3Hz,2H),7.23(t,J=7.5Hz,2H),7.19-7.11(m,1H),6.68(d,J=3.7Hz,1H),6.18(d,J=7.8Hz,1H),5.43-5.27(m,3H),4.85(d,J=3.4Hz,1H),4.76(dd,J=4.4,8.8Hz,1H),4.44(dd,J=2.1,8.9Hz,1H),4.30(br.s.,1H),2.60(s,3H)
步驟3:(2S,3S,4R,5R)-2-((R)-羥基(苯基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(CC-4)之合成
將材料CC-2以TFA以類似於實例71(步驟2,反應圖AA)之方式處理。將所得粗製材料藉SiO2層析法(60-100% EtOAc-庚烷8分鐘,然後0-5% MeOH-EtOAc 8分鐘)予以純化,得白色固狀之CC-4(8mg,20%產率)。LCMS-ESI(+):342[M+1]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.67(s,1H),7.83(d,J=3.4Hz,1H),7.47(d,J=7.3Hz,2H),7.38-7.29(m,2H),7.29-7.20(m,1H),6.77(d,J=3.7Hz,1H),6.30(d,J=7.3Hz,1H),5.52(br.s.,1H),5.29-5.16(m,2H),4.86(dd,J=3.5,7.9Hz,1H),4.79(br.s.,1H),4.40(dd,J=2.2,8.1Hz,1H),3.65(br.s.,1H),2.66(s,3H)
實例75(反應圖DD)(2S,3S,4R,5R)-2-((S)-(4-氟苯基)(羥基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(DD-3) 實例76(反應圖DD)(2S,3S,4R,5R)-2-((R)-(4-氟苯基)(羥基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(DD-4)
步驟1:(S)-((3aR,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(4-氟苯基)甲醇(DD-1)及(R)-((3aR,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(4-氟苯基)甲醇(DD-2)之合成
化合物係以類似於CC-1及CC-2(反應圖CC)之方法使用4-F-苯基溴化鎂取代苯基溴化鎂製得。將非鏡像異構物藉SFC(Chiralpak IC-3 4.6×100mm 3u管柱20% MeOH @ 120巴,4mL/min)分離,得白色固狀之DD-1(63mg,18%產率)。LCMS-ESI(+):400[M+1]+,>99% de,1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.71(s,1H),7.38(dd,J=5.5,8.4Hz,2H),7.11(d,J=3.4Hz,1H),7.01(t,J=8.7Hz,2H),6.52(d,J=3.4Hz,1H),6.04(s,1H),5.64(d,J=5.9Hz,1H),5.40(dd,J=3.9,5.6Hz,1H),5.05-4.82(m,1H),4.53(dd,J=3.8,7.5Hz,1H),3.25(d,J=5.6Hz,1H),2.71(s,3H),1.69(s,3H),1.46(s,3H)及白色固狀之DD-2(55mg,15%產率)。LCMS-ESI(+):400[M+1]+,>99% de,1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.69(br.s.,1H),7.47(dd,J=5.5,8.4Hz,2H),7.19(d,J=3.4Hz,1H),7.03(t,J=8.7Hz,2H),6.57(d,J=3.4Hz,1H),6.08(s,1H),5.64(d,J=5.6Hz,1H),5.13(d,J=7.1Hz,1H),4.97(dd,J=3.7,5.6Hz,1H),4.47(dd,J=3.4,7.1Hz,1H),2.87(s,1H),2.73(s,3H),1.67(s,4H),1.38(s,3H)
步驟2:(2S,3S,4R,5R)-2-((S)-(4-氟苯基)(羥基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(DD-3)之合成
將材料DD-1以TFA以類似於實例71(步驟2,反應圖AA)之方式處理。將所得粗製材料藉SiO2層析法(60-100% EtOAc-庚烷9分鐘,然後0-5% MeOH-EtOAc 5分鐘)予以純化,得白色固狀之DD-3(37mg,66%產率)。LCMS-ESI(+):360[M+1]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4) δ ppm 8.61(br.s.,1H),7.53(br.s.,1H),7.43(br.s.,2H),6.99(t,J=7.9Hz,2H),6.68(br.s.,1H),6.27(d,J=6.8Hz,1H),4.96(br.s.,2H),4.57(d,J=8.3Hz,1H),4.47(br.s.,1H),2.68(br.s.,3H)。
步驟3:(2S,3S,4R,5R)-2-((R)-(4-氟苯基)(羥基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(DD-4)之合成
將材料DD-2以TFA以類似於實例71(步驟2,反應圖AA)之方式處理。將所得粗製材料藉SiO2層析法(60-100% EtOAc-庚烷9分鐘,然後0-3% MeOH-EtOAc 4分鐘)予以純化,得白色固狀之DD-4(26mg,50%產率)。LCMS-ESI(+):360[M+1]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.67(s,1H),7.83(d,J=3.7Hz,1H),7.49(dd,J=6.0,8.2Hz,2H),7.15(t,J=8.8Hz,2H),6.77(d,J=3.7Hz,1H),6.30(d,J=7.3Hz,1H),5.46(br.s.,1H),5.29(d,J=4.2Hz,1H),5.19(d,J=2.7Hz,1H),4.92-4.69(m,2H),4.37(dd,J=2.1,8.2Hz,1H),3.63(br.s.,1H),2.66(s,3H),1.99(s,1H)
實例77(反應圖FF)(2S,3S,4R,5R)-2-(1-甲基-1H-吡唑-3-基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(EE-2)
步驟1:7-((3aR,4R,6S,6aR)-2,2-二甲基-6-(1-甲基-1H-吡唑-3-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(EE-1)之合成
將1-((3aR,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)丙-2-炔-1-醇(BB-1)(99mg,0.30mmol)及戴斯-馬丁試劑(Dess-Martin periodinane,153mg,0.361mmol)之DCM(3.0ml)溶液於室溫攪拌3小時,然後以10%水性硫代硫酸鈉令反應中止。將水性層以DCM萃取,然後將結合之DCM層以鹽水清洗,以硫酸鎂乾燥,過濾然後濃縮成油狀物。將粗製油狀物藉SiO2層析法(40-100% EtOAc之庚烷液)予以純化,得BB-2。
將BB-2及苯基肼(33ul,0.331mmol)之EtOH(3ml)混合液於室溫攪拌1小時,然後濃縮成油狀物。將粗製油狀物藉SiO2層析法(0-50% EtOAc之庚烷液)予以純化,得黃色泡沫狀之EE-1(55mg,44%產率)。LCMS-ESI(+): 418[M+1]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.80(s,1H),7.90(d,J=2.4Hz,1H),7.63(d,J=7.8Hz,2H),7.42(t,J=7.9Hz,2H),7.28(br.s.,1H),7.26-7.23(m,1H),6.71(d,J=2.4Hz,1H),6.59(d,J=3.4Hz,1H),6.16(s,1H),5.87(d,J=5.6Hz,1H),5.66(d,J=3.7Hz,1H),5.42(dd,J=3.8,5.5Hz,1H),2.75(s,3H),1.68(s,3H),1.45(s,3H)
步驟2:(2S,3S,4R,5R)-2-(1-甲基-1H-吡唑-3-基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(EE-2)之合成
將材料EE-1以TFA以類似於實例71(步驟2,反應圖AA)之方式處理。將所得粗製材料藉SiO2層析法(60-100% EtOAc-庚烷8分鐘,然後0-3% MeOH-EtOAc 6分鐘)予以純化,得白色固狀之EE-2(34mg,73%產率)。LCMS-ESI(+):378[M+1]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.69(s,1H),8.42(d,J=2.4Hz,1H),7.91(d,J=3.7Hz,1H),7.80(d,J=7.8Hz,2H),7.48(t,J=7.9Hz,2H),7.34-7.23(m,1H),6.79(d,J=3.7Hz,1H),6.62(d,J=2.4Hz,1H),6.37(d,J=7.3Hz,1H),5.68(d,J=2.4Hz,1H),5.51(d,J=6.6Hz,1H),5.30(d,J=4.4Hz,1H),5.06(d,J=4.2Hz,1H),4.27(d,J=2.7Hz,1H),2.67(s,3H)
實例78(反應圖GG)(2S,3S,4R,5R)-2-(3-(乙氧基甲基)-1H-吡唑-5-基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四 氫呋喃-3,4-二醇(FF-6)
步驟1:4-((三級丁基二甲基矽基)氧基)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)丁-2-炔-1-醇(FF-1)之合成
化合物FF-1係以類似於BB-1(反應圖BB)之方式使用(3-((三級丁基二甲基矽基)氧基)丙-1-炔-1-基)溴化鎂取代乙炔基溴化鎂製得。得琥珀色玻璃狀物(289mg,62%產率)。LCMS-ESI(+):474[M+1]+1H NMR(400MHz,氯仿 -d)δ ppm 8.74(s,1H),7.20(d,J=3.7Hz,1H),6.57(d,J=3.7Hz,1H),6.11-5.96(m,1H),5.76-5.62(m,1H),5.51(dd,J=3.8,5.7Hz,1H),4.87-4.68(m,1H),4.61-4.47(m,1H),4.43-4.30(m,2H),2.74(s,3H),1.68-1.58(m,3H),1.50-1.37(m,3H),0.97-0.76(m,9H),0.19-0.00(m,6H)
步驟2:4-((三級丁基二甲基矽基)氧基)-1-((3aS,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)丁-2-炔-1-酮(FF-2)之合成
化合物FF-2係以類似於BB-2(反應圖BB)之方式使用戴斯-馬丁試劑(Dess-Martin Periodinane)製備,得琥珀色玻璃狀之材料(195mg,68%產率)。LCMS-ESI(+):472[M+1]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.74(s,1H),7.21(d,J=3.7Hz,1H),6.57(d,J=3.7Hz,1H),6.11(s,1H),5.79-5.71(m,1H),5.63(d,J=5.6Hz,1H),5.19(d,J=4.2Hz,1H),4.54(s,2H),2.74(s,3H),1.55(s,3H),1.40(s,3H),0.95(s,9H),0.18(s,6H)
步驟3:7-((3aR,4R,6S,6aR)-6-(3-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(FF-3)之合成
將單水合肼(22ul,0.455mmol)加至4-((三級丁基二 甲基矽基)氧基)-1-((3aS,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)丁-2-炔-1-酮(FF-2)(195mg,0.413mmol)之EtOH(1.38ml)溶液中。將反應混合物攪拌4小時,然後濃縮成油狀物。將粗製油狀物藉SiO2層析法(0-50% EtOAc之庚烷液)予以純化,得淡琥珀色油狀之FF-3(124mg,62%產率)。LCMS-ESI(+):486[M+1]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.77(s,1H),7.23(d,J=3.7Hz,1H),6.58(d,J=3.7Hz,1H),6.31(s,1H),6.08(s,1H),5.83(d,J=5.6Hz,1H),5.56(d,J=3.2Hz,1H),5.37(dd,J=3.5,5.5Hz,1H),4.88-4.67(m,2H),2.74(s,3H),1.64(s,3H),1.43(s,3H),0.91(s,9H),0.09(d,J=2.2Hz,6H)
步驟4:7-((3aR,4R,6S,6aR)-6-(3-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)-1-(四氫-2H-哌喃-2-基)-1H-吡唑-5-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(FF-4)之合成
將7-((3aR,4R,6S,6aR)-6-(3-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)-1H-吡唑-5-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(FF-3)(124mg,0.255mmol)、二氫哌喃(116ul,1.28mmol)、Na2SO4(300mg,2.11mmol)及PTSA(4mg,0.0255mmol)之DCM(0.85ml)混合液於室溫攪拌31小時,然後以飽和水性NaHCO3令反應中止。將DCM層以 鹽水清洗,以硫酸鎂乾燥,過濾然後濃縮成油狀物。將粗製油狀物藉SiO2層析法(0-70% EtOAc/庚烷)予以純化,得白色泡沫狀之FF-4(105mg,72%產率)。LCMS-ESI(+):570[M+1]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.76(d,J=6.6Hz,1H),7.23(d,J=3.7Hz,1H),6.61-6.51(m,1H),6.42(d,J=3.9Hz,1H),6.11(s,1H),5.90-5.75(m,1H),5.57-5.36(m,2H),5.33-5.22(m,1H),4.86-4.62(m,2H),4.16-3.92(m,1H),2.82-2.60(m,3H),1.42(d,J=6.4Hz,3H),0.91(d,J=6.4Hz,9H),0.15-0.00(m,6H)。
步驟5:7-((3aR,4R,6S,6aR)-6-(3-(乙氧基甲基)-1-(四氫-2H-哌喃-2-基)-1H-吡唑-5-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(FF-5)之合成
於室溫將1M TBAF之THF液(276ul,0.276mmol)加至7-((3aR,4R,6S,6aR)-6-(3-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)-1-(四氫-2H-哌喃-2-基)-1H-吡唑-5-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(FF-4)(105mg,0.184mmol)之THF(614ul)溶液中。10分鐘後,將反應混合物濃縮成油狀物,然後再溶於EtOAc中。將EtOAc以水、鹽水清洗,以硫酸鈉乾燥,過濾然後濃縮成油狀物。將粗製油狀物溶於DMF(614ul)中,然後於冰-水浴中冷卻。將乙基碘(57mg,0.369mmol)其後NaH(9mg,0.221mmol)加入。4小時後,以飽 和水性NH4Cl令反應混合物之反應中止。將混合物以EtOAc萃取,然後以鹽水清洗,以硫酸鈉乾燥,過濾再濃縮成油狀物。將粗製油狀物藉SiO2層析法(20-80% EtOAc-庚烷)予以純化,得無色油狀之FF-5(50mg,56%產率)。LCMS-ESI(+):484[M+1]+1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.76(d,J=5.9Hz,1H),7.22(d,J=3.7Hz,1H),6.57-6.52(m,1H),6.48(d,J=10.0Hz,1H),6.09(s,1H),5.91-5.77(m,1H),5.56-5.45(m,1H),5.42(ddd,J=2.4,4.9,10.0Hz,1H),5.29(dd,J=3.7,5.4Hz,1H),4.72-4.42(m,2H),4.11-3.94(m,1H),3.71-3.56(m,1H),3.48(qd,J=7.0,10.6Hz,2H),2.73(s,3H),2.45-2.21(m,1H),1.94-1.78(m,1H),1.64(d,J=2.4Hz,5H),1.41(d,J=5.4Hz,3H),1.19(q,J=7.1Hz,3H)。
步驟6:(2S,3S,4R,5R)-2-(3-(乙氧基甲基)-1H-吡唑-5-基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(FF-6)之合成
將化合物FF-5以TFA以類似於實例71(步驟2,反應圖AA)之方式處理。將所得粗製材料藉SFC層析法予以純化,即得白色固狀之FF-6(5mg,12%產率)。LCMS-ESI(+):360[M+1]+1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.67(s,1H),7.87(d,J=3.2Hz,1H),6.77(d,J=3.4Hz,1H),6.31(d,J=7.3Hz,1H),6.27(s,1H),5.56(br.s.,1H),5.01(br.s.,1H),4.39(s,2H),4.20(br.s.,1H),3.44(q,J=6.8 Hz,3H),2.66(s,3H),1.11(t,J=7.0Hz,3H)。
實例79(反應圖HH)(2S,3S,4R,5R)-2-(1,2-二羥基乙基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(GG-1)
(2S,3S,4R,5R)-2-(1,2-二羥基乙基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(GG-1)之合成
將7-((3aR,4R,6S,6aR)-6-((R)-2,2-二甲基-1,3-二氧雜環戊烷-4-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(Y-2)(59mg,0.16mmol)、TFA(250ul)及水(50ul)之混合物於室溫攪拌23小時,然後以甲苯(1ml)稀釋,再濃縮成油狀物。將粗製油狀物藉SFC(ZymorSpher Diol Monol 150×21.2mm管柱,使用10-25% MeOH @ 6%/min,100巴,58mL/min))予以純化,得固狀之(2S,3S,4R,5R)-2-(1,2-二羥基乙基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(GG-1)(18mg,39%產率)。LCMS-APCI(+):296[M+1]+1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ ppm 8.69(s,1 H)7.71(d, J=3.91Hz,1 H)6.82(d,J=3.67Hz,1 H)6.33(d,J=6.85Hz,1 H)4.90(dd,J=6.85,4.40Hz,1 H)4.52(dd,J=6.36,3.42Hz,1 H)4.40(t,J=3.79Hz,1 H)4.03(d,J=5.38Hz,1 H)3.61-3.77(m,2 H)2.76(s,3 H)
實例80(反應圖HH)(2S,3R,4S,5R)-2-(4-胺基呋喃并[3,2-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(4-氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(HH-10)
2-((3aS,6R,6aR)-6-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)乙腈(HH-1)之合成
步驟1:將(二乙膦基)乙腈(1.91mL,11.8mmol)及THF(105mL)加至已烘箱乾燥之備有磁性攪拌棒且於氬氣流下冷卻之圓底燒瓶中。將溶液冷卻至0℃,再將LHMDS(11.8mL,11.8mmol,1M之己烷溶液)逐滴加入。將溶液於0℃攪拌1小時,其後將C-3(反應圖C)以溶於THF(10mL)中之溶液形式逐滴加入。藉TLC使用KMnO4染料顯像以監測反應。1.5小時後,反應被視為完成。藉加至水/冰混合物(~250mL)中令反應逆中止,再將溶液與EtOAc轉移至分液漏斗中。分相,再將產物以3份(~50mL)EtOAc萃取。將結合之有機相乾燥(硫酸鎂),過濾,再於真空下濃縮。將粗製殘留物經由急驟管柱層析法(50g SiO2,Biotage,100%庚烷至15% EtOAc/庚烷,27mL流份)予以純化,得無色油狀之化合物HH-1(3.14g,97%),其為~2.5:1比之環化:非環化產物。混合物係用於下一步驟中而不必進一步純化。積分於環化產物之1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm4.68-4.75(m,1H),4.39-4.49(m,1H),4.11-4.24(m,2H),3.74(dd,J=2.32,7.83Hz,1H),3.67(s,1H),2.70(dd,J=4.03,6.11Hz,1H),2.66(d,J=6.72Hz,1H),1.55(br.s.,3H),1.36(s,3H),0.86-0.92(m,9H),0.10(s,3H),0.08(s,3H)。積分於非環化產物之1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 7.03(dd,J=3.85,16.20Hz, 1H),5.75(dd,J=2.02,16.20Hz,1H),4.86(d,J=5.99Hz,1H),4.81-4.84(m,1H),3.78-3.83(m,1H),3.78(d,J=3.06Hz,1H),3.75(d,J=1.47Hz,1H),3.43-3.51(m,1H),1.51(s,3H),1.48(s,3H),0.92(s,9H),0.10(s,3H),0.10(s,3H)。
3-胺基-4-((3aS,6R,6aR)-6-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并-[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)呋喃-2-甲腈(HH-5)之合成
步驟2:將DMF(20mL)及三級丁氧基-雙(二甲胺基)-甲烷(6mL,29.1mmol)加至備有磁性攪拌棒且含有HH-1(1.28g,3.91mmol)之圓底燒瓶中。將燒瓶置於砂浴中,再於50℃加熱70小時。將燒瓶由砂浴中移出,再令其冷卻至室溫。將反應與MTBE轉移至分液漏斗中,再將溶液以3份水、1份鹽水清洗,乾燥(硫酸鎂),過濾,再於真空下濃縮以得橙色黏滯油狀之粗製產物HH-2(1.5g)。此粗製材料係用於下一步驟中而不必進一步純化。
步驟3:將水(30mL)及乙酸(0.9mL)加至備有磁性攪拌棒且含有粗製HH-2(1.50g)之圓底燒瓶中。將反應於室溫攪拌4小時,再將額外整除份之乙酸(0.9mL)加入。將反應攪拌另24小時,將將另一整除份之乙酸(1.8mL)加入。攪拌另22小時後,將反應與EtOAc轉移至分液漏斗中。將溶液以一份水、2份半飽和水性NaHCO3、1份鹽水清洗,乾燥(硫酸鎂),過濾,再於真空下濃縮,得黃色油狀之粗製產物HH-3(1.21g)。此粗製材料係用於下一步 驟中而不必進一步純化。
步驟4:將DMF(40mL)、碳酸銫(1.33g,4.08mmol)、及溴乙腈(0.28mL,4.08mmol)加至備有磁性攪拌棒且含有粗製HH-3(1.21g)之圓底燒瓶中。將反應於室溫攪拌,再藉TLC使用KMnO4染料顯像以監測反應。2小時後,反應被視為完成。以水令反應中止,再與EtOAc轉移至分液漏斗中。分相,再將有機相以2份水及1份鹽水清洗。將水性相以EtOAc反萃取,再將結合之有機相乾燥(硫酸鎂),過濾,再於真空下濃縮。將粗製殘留物藉急驟管柱層析法(50g SiO2,Biotage,100%庚烷至40% EtOAc/庚烷,21mL流份)予以純化,得淺黃色油狀之期望產物HH-4(0.71g)。此期望產物係以異構物混合物形式獲得且係用於下一步驟中而不必進一步純化。
步驟5:將THF(45mL)加至備有磁性攪拌棒且含有粗製HH-4(0.71g,1.80mmol)之圓底燒瓶中。將溶液冷卻至-78℃,其後將LDA(4.5mL,9.00mmol,2M之THF/正庚烷/乙基苯溶液)逐滴加入。將溶液於-78℃攪拌3小時。於-78℃以半飽和水性NH4Cl(100mL)令反應中止,再與EtOAc轉移至分液漏斗中。分相,再將水性相以3份EtOAc萃取。將結合之有機相乾燥(硫酸鎂),過濾,再於真空下濃縮。將粗製殘留物經由急驟管柱層析法(10g SiO2,Biotage,100%庚烷至30% EtOAc/庚烷,9mL流份)予以純化,得橙色黏滯油狀之化合物HH-5(322mg,4步驟得21%)。產物以偏好β異構物之~3:1異構物混合物 形式分離出來。LCMS[M+H]395;1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 0.09(s,3 H)0.12(s,3 H)0.91(s,9 H)1.37(s,3 H)1.51(s,3 H,次要非鏡像異構物)1.59(s,3 H)3.83(dd,J=11.37,2.45Hz,2 H)3.91(dd,J=11.37,2.45Hz,1 H)4.15(q,J=2.57,Hz,1 H)4.20-4.23(m,1 H,次要非鏡像異構物)4.62(t,J=6.24Hz,1 H)4.75(d,J=5.75Hz,1 H)4.81(dd,J=6.72,3.42Hz,2 H)4.83(d,J=4.03Hz,1 H,次要非鏡像異構物)4.92(d,J=5.99Hz,1 H,次要非鏡像異構物)5.14(d,J=4.03Hz,1 H,次要非鏡像異構物)7.22(s,1 H)7.25(s,1 H,次要非鏡像異構物)。
((3aR,4R,6S,6aS)-6-(4-胺基呋喃并[3,2-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲醇(HH-6)之合成
步驟6:將甲脒乙酸鹽(2.55g,24.5mmol)及乙醇(10mL)加至備有磁性攪拌棒且含有HH-5(322mg,0.816mmol)之微波小玻璃瓶中。將小玻璃瓶以鐵氟龍蓋密封,置於加熱組中,再於90℃加熱3天。將燒瓶由加熱組中移出,再令其冷卻至室溫。以水令反應中止,再與EtOAc轉移至分液漏斗中。分相,再將水性相以三份EtOAc萃取。將結合之有機相以1份鹽水清洗。將結合之有機相乾燥(硫酸鎂),過濾,再於真空下濃縮,得棕色油狀之含有一些二矽基化副產物的期望產物(250mg)。
步驟7:將粗製混合物溶於THF(4.0mL)中,其後將 四丁基氟化銨(1.22mL,1.22mmol,1M之THF溶液)逐滴加作。將反應於室溫攪拌21小時。將溶液於真空下濃縮,再將殘留物經由急驟管柱層析法(25g SiO2,Biotage,100%庚烷至100% EtOAc至10% MeOH/EtOAc,15mL流份)予以純化,得橙色膠狀之主要變旋異構物(HH-6)(97mg,2步驟得39%)。次要變旋異構物(40.9mg,2步驟得16%)亦以橙色膠狀物形式分離出來。LCMS[M+H] 308;1H NMR(β變旋異構物)(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.43(s,1H),7.81(s,1H),5.89(br.s.,2H),5.05(dd,J=0.92,5.81Hz,1H),5.00(d,J=6.24Hz,1H),4.89(t,J=5.99Hz,1H),4.45-4.49(m,1H),3.97(dd,J=1.59,12.59Hz,1H),3.77(dd,J=1.53,12.53Hz,1H),2.10(s,1H),1.64(s,3H),1.37(s,3H)。1H NMR(α變旋異構物)(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.40(br.s.,1H),8.01(s,1H),5.86(br.s.,2H),5.39(d,J=3.06Hz,1H),5.01(dd,J=3.79,5.50Hz,1H),4.87(d,J=5.87Hz,1H),4.27(t,J=4.40Hz,1H),3.72-3.87(m,2H),2.09(s,1H),1.49(s,3H),1.35(s,3H)。
(3aS,4S,6S,6aS)-6-(4-胺基呋喃并[3,2-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-羧酸(HH-7)之合成
步驟8:將乙腈(2.8mL)及水(0.7mL)加至備有攪拌棒且含有HH-6(97.0mg,0.316mmol)之錐形底燒瓶中。將溶液冷卻至0℃,再將二乙醯氧基氧碘苯(224mg,0.694 mmol)其後TEMPO(9.86mg,0.063mmol)加入。將溶液於0℃攪拌30分鐘,然後將冰浴移除。令溶液逐漸地加溫至室溫。將反應於室溫攪拌20小時。將溶液於真空下濃縮,再將粗製殘留物經由急驟管柱層析法(10g SiO2,Biotage,100%庚烷至10% MeOH/EtOAc,9mL流份)予以純化,得淺黃色固狀之化合物HH-7(75.9mg,75%)。LCMS[M+H]322;1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ ppm 8.41(s,1H),8.23(s,1H),5.27(d,J=4.52Hz,1H),5.03(dd,J=2.45,5.87Hz,1H),4.59(d,J=2.32Hz,1H),1.61(s,3H),1.37(s,3H)。
(3aS,4S,6S,6aS)-6-(4-胺基呋喃并[3,2-d]嘧啶-7-基)-N-甲氧基-N,2,2-三甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-甲醯胺(HH-8)之合成
步驟9:將二甲基羥胺鹽酸鹽(26.5mg,0.272mmol)、EtOAc(0.33mL)及吡啶(0.11mL)加至備有磁性攪拌棒且含有HH-7(75.9mg,0.236mmol)之4打蘭小玻璃瓶中。將溶液冷卻至0℃,其後將1-丙烷膦酸酐(0.3mL,0.500mmol,50wt%之EtOAc溶液)加入。將反應於0℃攪拌4小時。以0.42mL 20%水性檸檬酸令反應中止,再將小玻璃瓶內容物以3份EtOAc萃取。將結合之有機萃取物以1份半之飽和水性NaHCO3、1份半之飽和鹽水清洗,乾燥(硫酸鎂),過濾,再於真空下濃縮。將水性相結合,再以3份3:1 CHCl3/i-PrOH反萃取。將第二回合之 有機萃取物乾燥(硫酸鎂),過濾,與第一回合之萃取物結合,再於真空下濃縮。將粗製殘留物經由急驟管柱層析法(10g SiO2,Biotage,100%庚烷至100% EtOAc至10% MeOH/EtOAc,9mL流份)予以純化,得到被小量雜質污染之期望產物。將殘留物再接受急驟管柱層析法(10g SiO2,Biotage,100%庚烷至10% MeOH/EtOAc,9mL流份),得無色玻璃狀之化合物HH-8(29.2mg,34%)。LCMS[M+H]365;1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.48(s,1H),7.96(s,1H),5.71(br.s.,2H),5.46(s,1H),4.98-5.20(m,3H),3.77(br.s.,3H),3.22(s,3H),1.65(s,3H),1.40(s,3H)。
(2S,3R,4S,5R)-2-(4-胺基呋喃并[3,2-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(4-氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(HH-10)之合成
步驟10:將THF(0.4mL)加至已烘箱乾燥之備有磁性攪拌棒且含有HH-8(29.2mg,0.080mmo1)之反應小玻璃瓶中。將溶液冷卻至0℃,其後將4-氟苯基溴化鎂(0.16mL,0.160mmol,1M之THF溶液)逐滴加入。將溶液於0℃攪拌2小時,再將另一整除份之4-氟苯基溴化鎂(0.16mL,0.160mmol,1M之THF溶液)加入。將溶液於於0℃攪拌另1小時。於0℃以飽和水性NH4Cl令反應中止,再以水進一步稀釋。將EtOAc加至溶液中,再藉吸管分相。將水性相以2份EtOAc萃取。將有機萃取物結合,再於硫酸鎂床上過濾,再將鹽以數小份之EtOAc清洗。 將濾液於真空下濃縮,得到淺黃色固狀之被小量雜質污染的HH-9(32mg)。粗製材料係用於下一步驟中而不必進一步純化。LCMS[M+H]400;1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ ppm 8.12(br.s,1H),7.92(s,1H),7.88(dd,J=5.44,8.86Hz,2H),7.36(dd,J=5.56,8.50Hz,2H),5.52(dd,J=2.02,6.05Hz,1H),5.41(s,1H),5.30(br.s,1H),5.23(d,J=5.99Hz,1H),3.55(s,2H),1.64(s,3H),1.43(s,3H)。
步驟11:將甲酸鈉(218mg,3.20mmol)及RuCl(對異丙基甲苯)[(R,R)-Ts-DPEN](5.1mg,0.008mmol)加至備有磁性攪拌棒且含有粗製HH-9(32mg,0.080mmol)之錐形底燒瓶中。將燒瓶以氬吹洗,其後將已脫氣之EtOAc(0.33mL)及水(1.34mL)加入。將反應於室溫攪拌30分鐘,再將另一份EtOAc(1.0mL)加入以改善溶解度。令反應持續於室溫攪拌13小時。將反應於真空下濃縮,粗製產物之水性溶液係用於下一步驟中而不必進一步純化。LCMS分析顯示d.r.為~2:1。
步驟12:將三氟乙酸(2.0mL)加至含有粗製產物水性溶液之錐形底燒瓶中。將反應於室溫攪拌1小時,其後於真空下濃縮。將殘留物置於甲醇(5mL)中,且於真空下再濃縮。此過程重覆另3次。將殘留物經由製備HPLC(Lux Cellulose-1 4.6×100mm 3u管柱,25% MeOH @ 120巴,4mL/min)予以純化以分離非鏡像異構物,得白色固狀之含有小量雜質的標題化合物JJ-10(主要非鏡像異構物,17.02mg)。將此材料經由離子交換層析法(Varian SCX 20cc 5g,100% MeOH至100% 7N NH3/MeOH)予以再純化,即得白色固狀之化合物HH-10(7.5mg,3步驟得26%,99% de)。LCMS[M+H]362;[α]D 22=-27.3(c=0.1,MeOH);1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ ppm 8.28(s,1H),8.02(s,1H),7.50(dd,J=5.56,8.38Hz,2H),7.10(t,J=8.86Hz,2H),5.01(d,J=1.96Hz,1H),4.92(d,J=8.80Hz,1H),4.51(dd,J=5.14,8.68Hz,1H),4.25(dd,J=0.98,2.32Hz,1H),4.15(d,J=5.14Hz,1H)。
實例81((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(2-(甲磺醯基)苯基)甲酮
實例81係遵循類似於實例9(反應圖C)步驟9-11之程序以適當格任雅試劑(Grignard reagent)及示於反應圖II中之額外氧化步驟合成。LCMS[M+1]442;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.67-8.64(m,1H),7.96-7.90(m,2H),7.83-7.80(m,1H),7.80-7.74(m,1H),7.61-7.53(m,1H),6.82-6.77(m,1H),6.25-6.22(m,1H),6.22-6.18(m,1H),5.62-5.58(m,1H),5.35-5.31(m,1H),5.16-5.12(m,1H),4.57-4.50(m,1H),4.35-4.28(m,1H),4.24-4.20(m,1H),3.22(s,3H),2.66(s,3H)。
步驟1:((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(2-(甲硫基)苯基)甲酮(II-2)之合成
於-60℃將iPrMgCl.LiCl(1.54mL,2mmol,1.3M)加至2-碘硫苯甲醚(500mg,2mmol)之無水THF(8mL)溶液中。將混合物於-60℃攪拌20分鐘。混合物變為淡黃色。將C-9(200mg,0.552mmol)之THF(2mL)液加入。將混合物於-60℃攪拌30分鐘。令混合物徐緩加溫至室溫(15℃),然後於室溫(15℃)30分鐘。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數的起始材料消耗且形成良好的斑點。以水性NH4Cl(5mL)令混合物之反應中止。將混合物以EtOAc(5mL×2)萃取。將萃取物於真空中濃縮以得粗製物(400mg)。將粗製材料藉矽膠層析法以EtOAc之石油醚液(由0-100%)洗提予以純化,得黃色膠狀之II-2(130mg,55.4%)。LCMS[M+23]448
步驟2:((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4- 基)(2-(甲磺醯基)苯基)甲酮(II-3)之合成
於室溫(15℃)將m-CPBA(248mg,1.22mmol)加至II-2(130mg,0.306mmol)之DCM(10mL)溶液中。將混合物於室溫(15℃)攪拌20小時。LCMS顯示主峰為474(M+16+1)N-氧化物形成。將混合物於真空中濃縮至乾。將殘留物溶於DMF(10mL)中,其後將四羥基二硼(164mg,1.83mmol)加入。將混合物於室溫(15℃)攪拌20分鐘。LCMS顯示期望望化合物形成。將混合物倒至水(20mL)中,再以EtOAc(10mL×2)萃取。將萃取物以鹽水(10mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得粗製物(500mg)。將粗製物藉矽膠層析以EtOAc之石油醚液(由0-100%)洗提予以純化,得白色固狀之II-3(130mg,93%)。LCMS[M+1]458;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.76(s,1H),8.06-8.00(m,1H),7.57(td,J=2.1,4.8Hz,2H),7.39-7.35(m,1H),7.34(d,J=3.8Hz,1H),6.67(d,J=3.0Hz,1H),6.53(d,J=3.8Hz,1H),5.47(dd,J=2.8,6.3Hz,1H),5.25(d,J=3.0Hz,1H),5.16(dd,J=3.0,6.3Hz,1H),3.27(s,3H),2.68(br.s.,3H),1.67(s,3H),1.39(s,3H)
實例82(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-羥基(1H-吲哚-7-基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(JJ-5)
步驟1:7-溴-1-((2-(三甲基矽基)乙氧基)甲基)-1H-吲哚(JJ-1)之合成
於0℃將60% NaH(581mg,14.5mmol)加至7-溴吲哚(1.9g,9.692mmol)之無水DMF(20mL)溶液中。將混合物於0℃攪拌30分鐘。於0℃將SEM-Cl(1.78g,10.7mmol)加入。將混合物於室溫(15℃)攪拌20小時。TLC(石油醚/EtOAc=8:1)顯示大多數的起始材料被消耗且形成良好的斑點。將混合物倒至水(40mL)中,再以EtOAc(30mL×3)萃取。將萃取物以鹽水(30mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得粗製物(3g)。將粗製物藉矽膠層析法以EtOAc之石油醚液(由0-10%)洗提予以純化,得無色油狀之JJ-1(2.3g,72.7%)。HNMR顯示餘留約10%之起始材料。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 7.56(d,J=8.0Hz,1H),7.40(d,J=7.5Hz,1H),7.19(d,J=3.3Hz,1H),7.01-6.95(m,1H),6.53(d,J=3.3Hz,1H),5.88-5.83(m,2H),3.55-3.46(m,2H),0.94-0.87(m,2H),-0.04- 0.10(m,9H)
步驟2:((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(1-((2-(三甲基矽基)乙氧基)甲基)-1H-吲哚-7-基)甲酮(JJ-2)之合成
於-85~-90℃將2.5M n-BuLi(0.891mL,2.23mmol)於10分鐘期間加至無色之JJ-1(661mg,2.03mmol)之無水THF(6mL)溶液中。將所得微黃色溶液於-85~-90℃攪拌1小時,其中形成一些固狀物。於-85℃將C-9(200mg,0.552mmol)之無水THF(2mL)溶液加至此白色懸浮液中。將混合物於-85℃攪拌2小時,然後以水性NH4Cl令反應中止。LCMS顯示大多數的C-9被消耗且觀察到期望的化合物。將混合物以EtOAc(5mL×2)萃取。將萃取物於真空中濃縮以得粗製物(400mg)。將粗製物藉矽膠層析法以EtOAc之石油醚液(由0-100%)洗提予以純化,得黃色固狀之JJ-2(80mg,26.4%)。LCMS[M+23]571
步驟3:(R)-((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(1-((2-(三甲基矽基)乙氧基)甲基)-1H-吲哚-7-基)甲醇(JJ-3)之合成
以類似反應圖C步驟10之方式令化合物JJ-2接受還原反應,得JJ-3。LCMS[M+23]573
步驟4:(R)-((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(1H-吲哚-7-基)甲醇(JJ-4)
將TBAF(2g)加至JJ-3(60mg,0.109mmol)之THF(2mL)溶液中,再將混合物於60℃攪拌一個週末。LCMS顯示大多數的起始材料被消耗且主峰為期望化合物。將混合物以EtOAc(30mL)稀釋,再以水(20mL×3)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮,得黃色固狀之粗製JJ-4(24mg,52.4%),直接用於下一步驟中。LCMS[M+1]421
步驟5:(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-羥基(1H-吲哚-7-基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(JJ-5)之合成
以類似之方式(步驟10,反應圖C)令化合物JJ-4接受脫保護條件,即得JJ-5。LCMS[M+1]381;1H NMR(400MHz,MeOD)δ ppm 8.71(br.s.,1H),7.53(d,J=7.3Hz,1H),7.42(d,J=3.8Hz,1H),7.25-7.16(m,2H),7.11-7.01(m,1H),6.74(d,J=3.8Hz,1H),6.46(d,J=3.0Hz,1H),6.19(d,J=7.3Hz,1H),5.38(d,J=2.8Hz,1H),4.73(dd,J=5.3,7.3Hz,1H),4.54-4.45(m,1H),4.38(dd,J=1.6,5.1Hz,1H),2.78(s,3H)
實例83(2R,3R,4S,5R)-2-(4-胺基-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d] 嘧啶-7-基)-5-((R)-(5-氟吡啶-2-基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇
標題化合物(實例83)係以類似於實例60(反應圖R)之方法,其中以3-氟-2-吡啶基氯化鎂取代3,4-二氟苯基溴化鎂製得。LCMS[M+23]402;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.54(d,J=3.0Hz,1H),8.08(s,1H),7.74(dt,J=2.9,8.8Hz,1H),7.61(dd,J=4.8,8.8Hz,1H),7.29(d,J=1.8Hz,1H),7.05(br.s.,2H),6.46(d,J=4.3Hz,1H),6.02(d,J=8.0Hz,1H),5.24(d,J=6.8Hz,1H),4.97(d,J=4.3Hz,1H),4.82(t,J=3.9Hz,1H),4.48-4.41(m,1H),4.27(d,J=2.5Hz,1H),4.01(t,J=3.9Hz,1H)
步驟1:(5-氟吡啶-2-基)溴化鎂(KK-2)之合成
於0℃將iPrMgCl.LiCl(1.3M之THF液,4.37mL,5.68mmol)加至淡黃色之2-溴-氟吡啶(1g,5.68mmol)之 無水THF(10mL)溶液中。將混合物於室溫(20℃)攪拌2小時。反應由淡變暗。以丙酮令整除份之反應中止,TLC(石油醚/EtOAc=3:1)顯示大多數的起始材料被消耗且形成具有高極性之良好斑點。混合物係直接用於下一步驟中。
步驟2:((3aS,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(5-氟吡啶-2-基)甲酮(KK-3)
於0℃將2(~0.386M之THF液,新鮮製備,1.29mL,0.499mmol)加至C-9(100mg,0.250mmol)之無水THF(2mL)溶液中。將混合物於室溫(20℃)攪拌2小時。LCMS顯示大多數的起始材料被消耗且主峰為期望化合物。以水性NH4Cl(5mL)令混合物之反應中止,再以EtOAc(3mL×3)萃取。將萃取物於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮,得粗製物(128mg),直接用於下一步驟中。LCMS[M+1]437
實例84(2R,3R,4S,5R)-2-(6-胺基-9H-嘌呤-9-基)-5-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(LL-6)
步驟1:(3aS,4S,6R,6aR)-6-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-N-甲氧基-N,2,2-三甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-甲醯胺(LL-2)
於室溫(12℃)將DIPEA(1.14g,8.80mmol)及50% T3P(2.80g,2.57mL,4.40mmol)加至LL-1(Biorganic and Medicinal Chemistry,2006,14,1618-1629)(1.00g,2.93mmol)及N,O-二甲基羥胺HCl(429mg,4.40mmol)之THF(20mL)懸浮液中。將所得無色溶液於室溫(12℃)攪拌20小時。TLC(DCM:MeOH=10:1,UV)顯示大多數的起始材料被消耗且形成良好的斑點。將混合物以EtOAc(100mL)稀釋,再以水性NH4Cl(50mL)、水性NaHCO3(50mL)、鹽水(50mL×2)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得黃色油狀之殘留物(1.35g)。將殘留物藉矽膠層析法以(MeOH:DCM,0-10%)洗提予以純化,得黃色油狀之LL-2(1.10g,97.7%)。LCMS[M+23]406;1H NMR (400MHz,CDCl3)δ ppm 8.75(s,1H),8.59(s,1H),7.26(s,1H),6.46(m,1H),5.43(d,J=5.8Hz,1H),5.30-5.27(m,1H),5.23(d,J=5.3Hz,1H),3.74(s,3H),3.17(s,3H),1.67(s,3H),1.43(s,3H)
步驟2:((3aS,4S,6R,6aR)-6-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(3,4-二氟苯基)甲酮(LL-3)
於5℃將3,4-二氟苯基溴化鎂(0.5M之THF液,4.95mL,2.48mmol)加至微黃色之LL-2(500mg,1.30mmol)之無水THF(19.5mL)溶液中。加入後,將混合物於5℃攪拌10分鐘。TLC(石油醚/EtOAc=1:1,UV)顯示大多數的起始材料被消耗且形成良好之UV斑點。於冰浴中以水性NH4Cl(40mL)令混合物之反應中止,再以EtOAc(50mL×2)萃取。將萃取物以鹽水(50mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮,得黃色膠狀之粗製LL-3(800mg,141%,純度:70%),直接用於下一步驟中。LCMS[M+1]437
步驟3:(R)-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-氯-9H-嘌呤-9-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(3,4-二氟苯基)甲醇(LL-4)
於室溫(14℃)將Ru(對異丙基甲苯)[(R,R)TsDPEN](20mg,0.031mmol,10mg/mL EtOAc)及甲酸鈉(1.30g, 19.1mmol,~2.5mol/L H2O)加至粗製LL-3(800mg,~1.3mmol)之EtOAc/H2O(2mL/8mL)懸浮液(以氬或氮吹洗30分鐘)中。將所得黃色混合物於室溫(14℃)攪拌20小時。LCMS顯示起始材料被消耗且偵測到期望化合物。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示形成兩個主要斑點。將混合物以EtOAc(30mL×2)萃取。將萃取物以鹽水(50mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得棕色油狀之粗製物(630mg)。將粗製物藉矽膠層析法以EtOAc之石油醚液(由0-78%)洗提予以純化,得棕色固狀之LL-4(280mg,50%)。LCMS[M+1]439;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.90(s,1H),8.85(s,1H),7.39-7.24(m,2H),7.07(br.s.,1H),6.29(d,J=2.3Hz,1H),6.08(d,J=4.8Hz,1H),5.47(dd,J=2.5,6.0Hz,1H),5.10(dd,J=2.4,6.1Hz,1H),4.75(t,J=5.0Hz,1H),4.34(dd,J=2.5,5.0Hz,1H),1.51(s,3H),1.30(s,3H)。
步驟4:(R)-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-胺基-9H-嘌呤-9-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(3,4-二氟苯基)甲醇(LL-5)之合成
LL-4(70mg,0.16mmol)之二烷/NH3.H2O(2mL/2mL)溶液於微波爐下、於120℃加熱20分鐘。TLC(DCM:MeOH=10:1)及LCMS顯示材料被消耗且出現新斑點。將混合物於真空中濃縮以得黃色固狀之粗製物(90mg)。將粗製物藉prep TLC(DCM:MeOH=15:1)予以純 化,得白色固狀之LL-5(38mg,57%)。LCMS[M+1]420;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.35(s,1H),8.19(s,1H),7.42(s,2H),7.37-7.28(m,1H),7.26-7.16(m,1H),7.02(br.s.,1H),6.39(d,J=4.3Hz,1H),6.13(d,J=3.3Hz,1H),5.39(dd,J=3.1,6.1Hz,1H),5.08(dd,J=2.0,6.3Hz,1H),4.75(t,J=5.0Hz,1H),4.25(dd,J=2.0,5.8Hz,1H),1.51(s,3H),1.30(s,3H)
步驟5:(2R,3R,4S,5R)-2-(6-胺基-9H-嘌呤-9-基)-5-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(LL-6)之合成
於(0℃)將TFA(5mL)加至LL-5(110mg,0.25mmol)之H2O(5mL)懸浮液中。將混合物於室溫(12℃)攪拌2小時。LCMS顯示起始材料被消耗且期望產物為乾淨的。將混合物倒至20%水性K2CO3(50mL)中,再以EtOAc(30mL×3)萃取。將萃取物以鹽水(50mL×2)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮,即得白色固狀之LL-6(40mg,42%)。LCMS[M+1]380;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.33(s,1H),8.16(s,1H),7.52-7.39(m,3H),7.39-7.31(m,1H),7.26(br.s.,1H),6.75(d,J=3.3Hz,1H),5.87(d,J=7.5Hz,1H),5.42(d,J=6.8Hz,1H),5.14(d,J=3.8Hz,1H),4.88(br.s.,1H),4.82-4.68(m,1H),4.07(d,J=4.3Hz,2H)
實例85(2R,3R,4S,5R)-2-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(MM-7)
步驟1:((3aR,4R,6R,6aR)-6-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲醇(MM-1)之合成
於室溫(15℃)將1M TBAF之THF溶液(6.65mL,6.65mmol)加至粗製C-5(32.5g,66mmol)之THF(325mL)溶液中。將黃色溶液於室溫(15℃)攪拌一個週末。TLC(石油醚/EtOAc=8:1)顯示餘留許多的起始材料。將1M TBAF(6.65mL,6.65mmol)加入。將混合物於室溫(15℃)攪拌24小時。TLC顯示大多數的起始材料被消耗且期望 斑點為乾淨的。將混合物於真空中濃縮成100mL。將殘留物以EtOAc(500mL)稀釋,再以水(200mL×2)、鹽水(200mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得微黃色油狀之粗製MM-1(22.5g,100%),直接用於下一步驟中。HNMR顯示產物純度為約80%。LCMS[M+1]326;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.64(s,1H),7.33(d,J=3.5Hz,1H),6.64(d,J=3.8Hz,1H),5.87(d,J=5.0Hz,1H),5.35(d,J=10.8Hz,1H),5.24(t,J=5.4Hz,1H),5.12(dd,J=1.5,6.0Hz,1H),4.50(d,J=1.8Hz,1H),4.01-3.93(m,1H),3.85-3.77(m,1H),1.65(s,3H),1.39-1.34(m,3H)
步驟2:(3aS,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-羧酸(MM-2)之合成
於35℃將NaClO2(12.3g,123mmol)之水(54mL)溶液加至MM-1(20g,49mmol)與TEMPO(3.07g,19.6mmol)之CH3CN(200mL)及磷酸鹽緩衝液(146mL,0.67M,pH=6.7)的兩相混合液中。將混合物於35℃攪拌另16小時。混合物變成暗色。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數的起始材料被消耗。將混合物於真空中濃縮以移除CH3CN,其中形成沈澱物。以1N HCl將混合物調整至pH=2。藉過濾法收集固狀物。將固狀物溶於EtOAc(50mL)中,以鹽水(30mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空 中濃縮至乾,得白色固狀之MM-2(12g,72%)。LCMS[M+1]340;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 12.82(br.s.,1H),8.61(s,1H),7.89(d,J=3.8Hz,1H),6.72(d,J=3.5Hz,1H),6.45(s,1H),5.64-5.26(m,2H),4.70(d,J=1.5Hz,1H),1.53(s,3H),1.36(s,3H)
步驟3:(3aS,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-N-甲氧基-N,2,2-三甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-甲醯胺(MM-3)之合成
於室溫(15℃)將DIPEA(30mL,172mmol)及50%T3P(33.7g,30.9mL,53mmol)加至MM-2(12g,35.32mmol)及N,O-二甲基羥胺HCl(5.17g,53.0mmol)之THF(200mL)懸浮液中。加入DIPEA後,混合物變為紅色。將所得紅色溶液於室溫(15℃)攪拌20小時,其中形成一些固狀物。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數的起始材料被消耗且形成良好的斑點。將混合物於真空中濃縮以移除大多數的THF。將殘留物倒至水(200mL)中,再以EtOAc(200mL×2)萃取。將萃取物以水性NaHCO3(100mL)、鹽水(200mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮,得黃色膠狀之MM-3(12g,88.7%)。LCMS[M+1]383
步驟4:((3aS,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(3,4- 二氟苯基)甲酮(MM-4)之合成
於5℃將3,4-二氟苯基溴化鎂(0.5M之THF液,6.66mL,3.33mmol)加至淡黃色之MM-3(1.00g,2.61mmol)之無水THF(10mL)溶液中。加入後,將混合物於5℃攪拌1小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數的起始材料被消耗且形成一良好之UV斑點及一微弱之UV斑點。於冰浴中以水性NH4Cl(20mL)令混合物之反應中止,再以EtOAc(10mL×2)萃取。將萃取物以鹽水(10mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮,得黃色膠狀之粗製MM-4(1.34g,>100%),直接用於下一步驟中。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.46(s,1H),7.69-7.60(m,1H),7.60-7.54(m,1H),7.29(d,J=3.8Hz,1H),7.14(ddd,J=7.7,8.6,9.6Hz,1H),6.57(d,J=3.5Hz,1H),6.39(d,J=0.8Hz,1H),5.71(dd,J=2.1,6.1Hz,1H),5.47(d,J=5.5Hz,1H),5.37(d,J=2.3Hz,1H),1.69(s,3H),1.45(s,3H)
步驟5:(R)-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(3,4-二氟苯基)甲醇(MM-5)之合成
於室溫(20℃)將2.5M水性甲酸鈉(41.8mL,104mmol)加至淡黃色之粗製MM-4(1.34g,~2.61mmol)之EtOAc(8mL)溶液中。將混合物以N2起泡1小時。將Ru(對異丙基甲苯)[(R,R)TsDPEN](30mg,0.047mmol)加入。以N2起泡5分鐘後,將所得黃色混合物於室溫(20 ℃)攪拌20小時。LCMS顯示大多數的起始材料被消耗且主峰為期望化合物。將混合物以EtOAc(10mL×3)萃取。將萃取物以鹽水(10mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得粗製物(1.4g)。HNMR顯示兩種異構物之比值為約4:1。將粗製物藉矽膠層析法以EtOAc/石油醚(由0-60%)洗提予以純化,得白色固狀之MM-5(750mg,65.6%)。LCMS[M+1]438;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.71(s,1H),7.39(dd,J=7.7,11.7Hz,1H),7.34(s,1H),7.23-7.18(m,2H),6.71(d,J=1.3Hz,1H),6.68(d,J=4.0Hz,1H),5.85(d,J=5.3Hz,1H),5.24(t,J=5.7Hz,1H),5.09(s,1H),4.93(dd,J=1.3,6.2Hz,1H),4.56(s,1H),1.59(s,3H),1.29(s,3H)
步驟6:(R)-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(3,4-二氟苯基)甲醇(MM-6)之合成
MM-5(500mg,1.14mmol)之二烷/NH3.H2O(5mL/5mL)溶液以微波爐於120℃加熱20分鐘。TLC(石油醚/EtOAc=3:1)顯示餘留起始材料。將混合物以微波爐於120℃加熱另40分鐘。TLC顯示大多數的起始材料被消耗且形成良好的斑點。將反應混合物以(5mL×3)萃取。將萃取物以鹽水(5mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮至乾,得白色固狀之MM-6(500mg,>100%)。LCMS顯示產物之純度為約94%。LCMS[M+1]419
步驟7:(2R,3R,4S,5R)-2-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(MM-7)之合成
將TFA/H2O(7mL/7mL,已冷卻至0℃)加至化合物MM-6(500mg,~1.2mmol)中。將所得懸浮液於室溫攪拌1小時。LCMS顯示大多數的起始材料被消耗且主峰為期望化合物。將混合物倒至20% K2CO3(30mL)中,再以EtOAc(20mL×3)萃取。將萃取物以鹽水(20mL×2)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得粗製物(450mg)。將粗製物由EtOAc(20mL)及戊烷(20mL)中予以再結晶,即得白色固狀之產物MM-7(380mg,84%)。LCMS[M+23]401;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.06(s,1H),7.49-7.36(m,2H),7.34(d,J=3.8Hz,1H),7.28(d,J=3.3Hz,1H),7.13(br.s.,2H),6.74(d,J=3.8Hz,1H),6.60(d,J=3.5Hz,1H),5.92(d,J=8.0Hz,1H),5.23(d,J=7.0Hz,1H),5.04(d,J=4.0Hz,1H),4.82(t,J=3.9Hz,1H),4.66-4.58(m,1H),4.06-3.99(m,2H)
實例86-88
反應圖NN中之實例86-88係以類似於實例85(反應圖MM)步驟4-7之程序以適當格任雅試劑(Grignard reagent)合成。
實例89(S)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)乙-1-醇(OO-2)
步驟1:1-((3aR,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)乙-1-醇(Y-7)之合成
將CeCl3置於25mL燒瓶中,於真空下加熱至150℃1小時。然後將燒瓶冷卻至室溫,再冷卻至0℃。將THF(8mL)及MeMgBr(1.8mL,3M)加入,再將混合物於0℃攪拌30分鐘。將Y-4(400mg,1.0mmol)之THF溶液逐滴加入。LCMS顯示餘留約30%的起始材料。藉NH4Cl令混合物之反應中止。將混合物以H2O及EtOAc稀釋。將有機層濃縮,得油狀之粗製OO-1(420mg,97%)。LCMS[M+1]320
步驟2-3:(2S,3S,4R,5R)-2-((S)-1-羥乙基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(OO-2)之合成
OO-1(50mg,0.16mmol)之TFA/H2O(2mL/2mL)溶液於20℃攪拌24小時。TLC DCM:MeOH=10:1顯示反應完成。將溶液濃縮以得44mg,100%油狀物。LCMS[M+1]280。將期望化合物OO-2藉手性SFC分離出。LCMS[M+1]280;1H NMR(400MHz,MeOD)δ ppm 8.67(s,1H),7.72(d,J=3.8Hz,1H),6.86(d,J=3.8Hz,1H),6.32(d,J=7.3Hz,1H),4.90(dd,J=4.4,7.4Hz,1H),4.39-4.33(m,1H),4.29(dd,J=3.0,7.5Hz,1H),4.18-4.03(m,1H),2.76(s,3H),1.25(d,J=6.5Hz,3H)。
實例90 2-((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)丙-2-醇(PP-3)
步驟1:1-((3aS,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)乙-1-酮(PP-1)
將DMP(669mg,1.2mmol)加至OO-1(420mg,1.32mmol)之DCM(5mL)溶液中。將溶液於25℃攪拌1小時,其中有許多固狀物形成。反應顏色變為紅色。TLC DCM/EtOAc=1:1顯示反應完成。藉1.0g Na2S2O3之4mL NaHCO3液令混合物之反應中止。將混合物於25℃攪拌2分鐘。將有機層濃縮以得粗製固狀物,將其藉急驟管柱以EtOAc/DCM 0~50%洗提予以純化,得白色固狀之PP-1(270mg,64.7%)。LCMS[M+1]318
步驟2:2-((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)丙-2-醇(PP-2)
將MeMgBr(0.42mL,1.26mmol,3M之Et2O液)加 至PP-1(100mg,0.315mmol)之THF(2mL)溶液中,再以乾冰/丙酮浴冷卻。加入後,將混合物於0℃攪拌10分鐘。有許多固狀物形成,然後變為清澈。TLC DCM:EtOAc=1:1顯示反應完成。藉0.3mL NH4Cl令混合物之反應中止。將混合物以EtOAc萃取。將EtOAc層濃縮,得無色油狀之PP-2(100mg,95%)。LCMS[M+1]334
步驟3:(2R,3S,4R,5R)-2-(2-羥基丙-2-基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(PP-3)
將TFA(1mL)加至PP-2(100mg,0.3mmol)之H2O(1mL)溶液中。將溶液於25℃攪拌24小時。TLC(DCM:MeOH=10:1)顯示反應完成。將溶液濃縮以得粗製油狀物,將其藉prep-HPLC予以純化,即得PP-3。LCMS[M+1]294;1H NMR(400MHz,D2O)δ ppm 8.49(s,1H),7.55(d,J=3.8Hz,1H),6.72(d,J=3.8Hz,1H),6.24(d,J=8.0Hz,1H),4.84(dd,J=4.1,8.2Hz,1H),4.58-4.49(m,1H),4.27(d,J=3.0Hz,1H),2.57(s,3H),1.30(s,3H),1.15(s,3H)
實例91(3,4-二氟苯基)((2S,3S,4R,5R)-3,4-二羥基-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-2-基)甲酮(QQ-1)
於備有磁性攪拌棒之反應小玻璃瓶內裝入C-10(48.6mg,117mmol)及水(0.5mL),其後將三氟乙酸(0.5mL)逐滴加入。將溶液於室溫攪拌2小時。將反應與EtOAc轉移至分液漏斗中。將有機相以2份飽和水性NaHCO3清洗,乾燥(硫酸鎂),過濾,再於真空下濃縮。將粗製殘留物經由超臨界流體層析法(ZymorSPHER pyr/diol 150×4.6mm管柱,5-50% MeOH,4.5mL/min)予以純化,即得白色固狀之標題化合物QQ-1(15.3mg,35%)。LCMS[M+H]376;1H NMR(700MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.65(s,1H),8.00-8.06(m,1H),7.91(d,J=6.49Hz,1H),7.85(d,J=3.76Hz,1H),7.59-7.65(m,1H),6.81(d,J=3.59Hz,1H),6.41(d,J=6.83Hz,1H),5.48(d,J=2.39Hz,1H),4.37-4.42(m,1H),4.34-4.37(m,1H),2.65(s,3H)。
實例92(2S,3S,4R,5R)-2-((R)-(3,4-二氟苯基)氟甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(RR-2) 實例93(2S,3S,4R,5R)-2-((S)-(3,4-二氟苯基)氟甲基)-5- (4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(RR-3)
步驟1:7-((3aR,4R,6S,6aS)-6-((3,4-二氟苯基)氟甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(RR-1)之合成
將DAST(965mg,5.99mmol)加至SS-1(反應圖SS)(500mg,1.20mmol)之5mL CH2Cl2溶液中,於室溫攪拌30分鐘。以水令反應中止,轉移至分液漏斗中,再以10mL水稀釋。分相,再將水性相以3份5mL CH2Cl2萃取。將有機相結合,再以10mL鹽水清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮。將殘留物藉矽膠層析法以50% EtOAc/庚烷洗提予以純化,得黃色油狀物RR-1(190mg,37.8%)。
步驟3:(2S,3S,4R,5R)-2-((R)-(3,4-二氟苯基)氟甲基)-5- (4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(RR-2)及(2S,3S,4R,5R)-2-((S)-(3,4-二氟苯基)氟甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(RR-3)之合成
將RR-1(190mg,0.453mmol)溶於2mL TFA中,將2mL H2O加入,於室溫攪拌30分鐘。將反應濃縮,然後藉SFC使用Chiralpak IC-3 4.6×100mm 3u管柱以20% MeOH/DEA於120巴及4mL/min洗提予以純化,即得19.96mg(RR-2)及59.05mg(RR-3)白色固狀物。
RR-2-LCMS[M+1]380;1H NMR(700MHz,DMSO-d6)δ ppm 2.67(s,3 H)4.13-4.20(m,1 H)4.20-4.29(m,1 H)4.47(q,J=5.50Hz,1 H)5.38(d,J=5.06Hz,1 H)5.54(d,J=6.38Hz,1 H)5.80-5.90(m,1H)6.26(d,J=6.16Hz,1 H)6.84(d,J=3.74Hz,1 H)7.24-7.32(m,1 H)7.40-7.54(m,2 H)7.71(d,J=3.74Hz,1 H)8.67(s,1 H)
RR-3-LCMS[M+1]380;1H NMR(700MHz,DMSO-d6)δ ppm 2.65(s,3 H)4.21-4.30(m,2 H)4.54-4.60(m,1 H)5.48(d,J=4.40Hz,1 H)5.51(d,J=6.60Hz,1 H)5.74-5.84(m,1 H)6.21(d,J=6.82Hz,1 H)6.77(d,J=3.74Hz,1 H)7.21-7.29(m,1 H)7.36-7.43(m,1 H)7.43-7.49(m,1 H)7.62(d,J=3.74Hz,1 H)8.64(s,1 H)
實例94(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-胺基(3,4-二氟苯基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇 (SS-4)
步驟1:2-((R)-(3,4-二氟苯基)((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲基)異吲哚啉-1,3-二酮(SS-2)之合成
將SS-1(反應圖SS)(100mg,0.240mmol)、酞醯亞胺(53mg,0.359mmol)、三苯膦(94.3mg,0.359mmol)、THF(1.20mL,0.2M)加入圓底燒瓶內。將混合物於冰浴中冷卻至0℃。將DIAD(0.074mL,0.359mmol)逐滴加入,再於室溫攪拌16小時。將反應以EtOAc及水(各30 mL)稀釋。將水性層以EtOAc(3×20mL)萃取。將結合之有機相以水及鹽水清洗,於硫酸鈉上乾燥,過濾再濃縮以得油狀物。將粗製材料藉ISCO 12g管柱金0-100% EtOAc/庚烷洗提予以純化,得SS-2(84mg,64%)。LCMS[M+1]547;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.91(s,1H),7.87(dd,J=3.0,5.4Hz,2H),7.76-7.65(m,2H),7.14(d,J=3.7Hz,2H),7.03-6.82(m,2H),6.54(d,J=3.7Hz,1H),6.16(d,J=1.6Hz,1H),5.80-5.67(m,1H),5.54-5.38(m,2H),5.16(dd,J=3.9,6.3Hz,1H),2.74(s,3H),1.61(s,3H),1.29(s,3H)
步驟2:(R)-(3,4-二氟苯基)((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲胺(SS-3)之合成
SS-2(84mg,0.15mmol)之EtOH(2mL)及水合肼(1.50mL,30.7mmol)液加入圓底燒瓶內。將反應於室溫攪拌16小時。LCMS顯示期望產物。將反應濃縮,再藉prep HPLC予以純化,得白色固狀物SS-3(50mg,78%)。LCMS[M+1]417;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.74(s,1H),7.38-7.29(m,1H),7.25-7.14(m,3H),6.63(d,J=3.8Hz,1H),5.96(d,J=3.8Hz,1H),5.42-5.35(m,1H),5.31(dd,J=3.8,6.7Hz,1H),4.55(d,J=3.8Hz,1H),4.47(t,J=3.7Hz,1H),2.76(s,3H),1.57(s,3H),1.34(s,3H)
步驟3:(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-胺基(3,4-二氟苯基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(SS-4)之合成
SS-3、TFA(1mL)及水(1mL)加入小玻璃瓶內,再於室溫攪拌16小時。LCMS顯示完全脫保護。濃縮,再將游離鹼使用1g SCX管柱先以MeOH其後以10% 7N NH3/MeOH沖洗,得產物。凍乾成白色固狀物,即得SS-4(6mg,80%)。LCMS 377[M+1];1H NMR(400MHz,MeOD)δ ppm 8.56(s,1H),7.32(d,J=3.7Hz,1H),7.28-7.17(m,1H),7.16-7.05(m,2H),6.70(d,J=3.7Hz,1H),6.08(d,J=5.0Hz,1H),4.60(t,J=5.3Hz,1H),4.29(t,J=4.9Hz,1H),4.18(d,J=2.4Hz,2H),2.71(s,3H)
實例95(2R,3S,4R,5R)-2-((S)-胺基(3,4-二氟苯基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(SS-7) 步驟1:2-((S)-(3,4-二氟苯基)((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲基)異吲哚啉-1,3-二酮(SS-5)之合成
C-11(反應圖SS)(100mg,0.240mmol)、酞醯亞胺(53mg,0.359mmol)、三苯膦(94mg,0.359mmol)之THF(1.20mL,0.2M)液加至圓底燒瓶中。將混合物於冰浴中冷卻至0℃。將DIAD(0.074mL,0.359mmol)逐滴加 入,再於室溫攪拌16小時。將反應以EtOAc及水(各30mL)稀釋。將水性層以EtOAc(3×20mL)萃取。將結合之有機相以水及鹽水清洗,於硫酸鈉上乾燥,過濾再濃縮成油狀物,然後藉ISCO 12g管柱金0-100% EtOAc/庚烷洗提予以純化,得SS-5(32mg,24%)。LCMS[M+1]547;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.85(s,1H),7.69-7.60(m,4H),7.56-7.48(m,1H),7.39-7.32(m,1H),7.23-7.12(m,1H),7.11(d,J=3.7Hz,1H),6.53(d,J=3.7Hz,1H),6.15(d,J=1.3Hz,1H),5.63-5.56(m,2H),5.52-5.44(m,1H),5.10-4.99(m,1H),2.77(s,3H),1.64(s,3H),1.34(s,3H)
步驟2:(S)-(3,4-二氟苯基)((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲胺(SS-6)之合成
SS-5(32mg,0.059mmol)、EtOH(1.17mL,0.05M),及水合肼(0.570mL,11.7mmol)加至圓底燒瓶內。將反應於室溫攪拌16小時。LCMS顯示期望產物形成。將反應濃縮成油狀物,得SS-6(24mg,98%)。LCMS[M+1]417
步驟3:(2R,3S,4R,5R)-2-((S)-胺基(3,4-二氟苯基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(SS-7)之合成
將TFA(1mL)及水(1mL)加至含有SS-6(24mg,0.059 mmol)之圓底燒瓶內。將反應於室溫攪拌16小時。LCMS顯示完全脫保護。然後將反應濃縮,再藉SCX管柱先以MeOH其後以10% 7N NH3/MeOH洗提予以純化以得產物。藉SFC純化,即得白色固狀物(SS-7)(3mg,10%)。LCMS[M+1]377;1H NMR(400MHz,MeOD)δ ppm 8.56(s,1H),7.47(d,J=3.5Hz,1H),7.29-7.18(m,1H),7.10(d,J=4.3Hz,2H),6.67(d,J=3.5Hz,1H),6.05(d,J=6.2Hz,1H),4.61(t,J=5.7Hz,1H),4.13(d,J=4.8Hz,2H),4.03-3.95(m,1H)
實例96(2R,3R,4S,5R)-2-(4-(二氟甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(4-氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(TT-7)
步驟1:7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(((三級丁基二甲基矽基)氧 基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-(二氟甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(TT-1)之合成
遵循類似於實例9(反應圖C)之步驟4的程序使用4-(二氟甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(VV-5),即得TT-1。LCMS[M+1]456;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.95(s,1 H)7.67(d,J=3.79Hz,1 H)6.63-6.96(m,2 H)6.49(d,J=3.06Hz,1 H)5.08(dd,J=6.24,3.06Hz,1 H)4.97(dd,J=6.24,2.93Hz,1 H)4.37(q,J=3.26Hz,1 H)3.90(dd,J=11.25,3.42Hz,1 H)3.82(dd,J=11.25,3.55Hz,1 H)1.67(s,3 H)1.40(s,3 H)0.89-0.92(m,9 H)0.08(d,J=1.71Hz,6 H)
步驟2:((3aR,4R,6R,6aR)-6-(4-(二氟甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲醇(TT-2)之合成
遵循類似於實例9(反應圖C)之步驟6的程序使用TT-1,即得TT-2。LCMS[M+1]342;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.92(s,1 H)7.44(d,J=3.67Hz,1 H)6.64-6.96(m,2 H)5.96(d,J=4.77Hz,1 H)5.28(t,J=5.38Hz,1 H)5.14(dd,J=6.11,1.83Hz,1 H)4.51(d,J=1.83Hz,1 H)3.99(dd,J=12.47,1.83Hz,1 H)3.84(dd,J=12.47,2.20Hz,1 H)1.66(s,3 H)1.39(s,3 H)
步驟3:(3aS,4S,6R,6aR)-6-(4-(二氟甲基)-7H-吡咯并[2,3- d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-羧酸(TT-3)之合成
遵循類似於實例9(反應圖C)之步驟7的程序使用TT-2,即得TT-3。LCMS[M+1]356。
步驟4:(3aS,4S,6R,6aR)-6-(4-(二氟甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-N-甲氧基-N,2,2-三甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-甲醯胺(TT-4)之合成
遵循類似於實例9(反應圖C)之步驟8的程序使用TT-3,即得TT-4。LCMS[M+1]399;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.93(s,1H)7.81(br.s.,1 H)6.64-6.97(m,3 H)5.19-5.31(m,3 H)3.71(s,3 H)3.20(s,3 H)1.69(s,3 H)1.42(s,3 H)
步驟5:((3aS,4S,6R,6aR)-6-(4-(二氟甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(4-氟苯基)甲酮(TT-5)之合成
遵循類似於實例9(反應圖C)之步驟9的程序使用(4-氟苯基)溴化鎂及TT-4,即得TT-5。LCMS[M+1]434;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.76(s,1 H)7.78-7.86(m,2 H)7.39(d,J=3.67Hz,1 H)7.01(t,J=8.68Hz,2 H)6.57-6.88(m,2 H)6.48(s,1 H)5.71(dd,J=6.11,2.08Hz,1 H)5.48(d,J=5.62Hz,1 H)5.43(d,J=2.20Hz,1 H)1.71(s,3 H)1.46(s,3 H)
步驟6:(R)-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(4-(二氟甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(4-氟苯基)甲醇(TT-6)之合成
遵循類似於實例9(反應圖C)之步驟10的程序使用TT-5,即得TT-6。LCMS[M+1]436。
步驟7:(2R,3R,4S,5R)-2-(4-(二氟甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(4-氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(TT-7)之合成
遵循類似於實例9(反應圖C)之步驟11的程序使用TT-6,即得TT-7。LCMS[M+1]396;1H NMR(700MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.86(s,1 H)8.00(br.s.,1 H)7.36(t,J=6.60Hz,2 H)7.00-7.27(m,3 H)6.80(br.s.,1 H)6.20(d,J=7.70Hz,1 H)5.88(br.s.,1 H)5.28(d,J=6.60Hz,1 H)5.09(br.s.,1 H)4.70-4.77(m,1 H)4.48-4.55(m,1 H)4.09(br.s.,1 H)3.96(d,J=5.06Hz,1 H)
實例97(2R,3R,4S,5R)-2-(4-(二氟甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(UU-3)
步驟1:((3aS,4S,6R,6aR)-6-(4-(二氟甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(3,4-二氟苯基)甲酮(UU-1)之合成
遵循類似於實例9(反應圖C)之步驟9的程序使用TT-4及(3,4-二氟苯基)溴化鎂,即得UU-1。LCMS[M+1]452;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.76(s,1 H)7.54-7.66(m,2 H)7.36(d,J=3.67Hz,1 H)7.05-7.14(m,1 H)6.53-6.88(m,2 H)6.46(s,1 H)5.74(dd,J=6.05,2.14Hz,1 H)5.50(d,J=6.11Hz,1 H)5.36(d,J=2.20Hz,1 H)1.71(s,3 H)1.47(s,3 H)
步驟2:(R)-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(4-(二氟甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(3,4-二氟苯基)甲醇(UU-2)之合成
遵循類似於實例9(反應圖C)之步驟10的程序使用UU-1,即得UU-2。LCMS[M+1]454。
步驟3:(2R,3R,4S,5R)-2-(4-(二氟甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(UU-3)之合成
遵循類似於實例9(反應圖C)之步驟11的程序使用UU-2,即得UU-3。LCMS[M+1]414;1H NMR(700MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.94(s,1 H)8.09(d,J=3.30Hz,1 H)7.39-7.45(m,1 H)7.33-7.39(m,1 H)7.13-7.33(m,2 H)6.88(br.s.,1 H)6.28(d,J=7.70Hz,1 H)6.08(d,J=4.62Hz,1 H)5.37(d,J=6.82Hz,1 H)5.19(d,J=4.18Hz,1 H)4.82(t,J=4.51Hz,1 H)4.54-4.64(m,1 H)4.16(br.s.,1 H)4.03(d,J=5.06Hz,1 H)
步驟1:4-碘-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(VV-1)
將氫碘酸(10mL)於冰浴中冷卻,然後將4-氯-7H-吡咯并[2,3D]嘧啶(565mg,3.68mmol)分五份加入。將黃色漿液徐緩加溫至室溫,再攪拌18小時。將混合物過濾,再將固狀物以水潤洗,然後於高真空上乾燥,得1230 mg(90%)氫碘酸鹽形式之4-碘-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(VV-1)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 12.69(br.s.,1H),8.53(s,1H),7.73(dd,J=2.4,3.4Hz,1H),6.42(dd,J=1.8,3.5Hz,1H);LCMS[M+1]246。
步驟2:4-碘-7-((2-(三甲基矽基)乙氧基)甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(VV-2)
將氫化鈉分散液(351mg,8.77mmol,60%)懸浮於DMA(10mL)中,然後於冰浴中冷卻。將4-碘-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(VV-1)(1.79g,7.31mmol)以溶於DMA(10mL)之溶液形式逐滴加入,再於冰浴中連續攪拌20分鐘。將SEMCL(1350mg,7.31mmol,1.44mL)以於DMA(5mL)之溶液形式逐滴加入,再將反應徐緩加溫至室溫,再攪拌共2.5小時。小心地以水令反應中止,然後以EtOAc(2×20)萃取。將結合之萃取液以鹽水(25mL)清洗,然後乾燥(硫酸鎂),過濾再濃縮。將粗製殘留物藉管柱層析法使用ISCO及40g Si管柱以0-40% EtOAc/Hep洗提予以純化,得2.2g(80%)4-碘-7-((2-(三甲基矽基)乙氧基)甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(VV-2)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.52(s,1H),7.83(d,J=3.7Hz,1H),6.43(d,J=3.7Hz,1H),5.61(s,2H),3.51(t,J=7.9Hz,2H),0.82(t,J=7.9Hz,2H),-0.11(s,9H);LCMS[M+1]376。
步驟3:2,2-二氟-2-(7-((2-(三甲基矽基)乙氧基)甲基)-7H- 吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)乙酸乙酯(VV-3)
將4-碘-7-((2-(三甲基矽基)乙氧基)甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(VV-2)(2000mg,5.329mmol)、碘化亞銅(I)(1220mg,6.40mmol)及氟化鉀(433mg,7.46mmol)加至小玻璃瓶中。將小玻璃瓶加蓋,再以氮吹洗,然後將DMSO(10.7mL,c=0.5M)及二氟(三甲基矽基)乙酸乙酯(2160mg,10.7mmol,1.74mL)加入。將反應加熱至70℃ 18小時,然後以水(10mL)及EtOAc(30mL)稀釋。將混合物通過矽藻土(celite)床過濾,然後分層,再將有機相乾燥(硫酸鎂),過濾再濃縮。將粗製殘留物藉管柱層析法使用ISCO及24g Si管柱以0-70% EtOAc/Hep洗提予以純化,得975mg(49%)2,2-二氟-2-(7-((2-(三甲基矽基)乙氧基)甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)乙酸乙酯(VV-3)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.96(s,1H),8.01(d,J=3.7Hz,1H),6.93-6.72(m,1H),5.70(s,2H),4.36(q,J=7.1Hz,2H),3.54(t,J=7.9Hz,2H),1.22(t,J=7.1Hz,3H),0.82(t,J=8.0Hz,2H),-0.11(s,9H);LCMS[M+1]372。
步驟4:4-(二氟甲基)-7-((2-(三甲基矽基)乙氧基)甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(VV-4)
於室溫將碳酸鈉(100mg,1mmol,0.5mL,2.0M)加至2,2-二氟-2-(7-((2-(三甲基矽基)乙氧基)甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)乙酸乙酯(VV-3)(96.0mg,0.26mmol) 之MeOH(1mL)溶液中。加入鹼後,形成沈澱物。將反應於室溫攪拌1小時,然後濃縮。將殘留物置於水(15mL)中,然後以以1N HCl調整pH至4,再以EtOAc(2×15)萃取。將結合之萃取物乾燥(硫酸鎂)過濾再濃縮。將所得固狀物溶於DMF(2.0mL,c=0.086M)中,再將氟化鉀(93.8mg,1.61mmol)加入。將反應加熱至140℃ 40分鐘。將混合物以水稀釋,再以EtOAc(2×20mL)萃取。將結合之有機相以鹽水清洗然後乾燥(硫酸鎂),過濾再濃縮,得56mg(72%)4-(二氟甲基)-7-((2-(三甲基矽基)乙氧基)甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(VV-4)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.95(s,1H),7.93(d,J=3.7Hz,1H),7.45-7.04(m,1H),6.91-6.73(m,1H),5.69(s,2H),3.64-3.43(m,2H),0.82(t,J=7.9Hz,2H),-0.10(s,9H);LCMS[M+1]300。
步驟5:4-(二氟甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(VV-5)
將三氟乙酸(740mg,6.5mmol,0.50mL)加至4-(二氟甲基)-7-((2-(三甲基矽基)乙氧基)甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(VV-4)(56mg,0.19mmol)之DCM(1mL)溶液中。將反應於室溫攪拌4小時,然後濃縮,再於高真空上乾燥。將黃色固狀物溶於MeOH(1mL)中,然後將氫氧化銨(328mg,2.62mmol,0.364mL)及乙二胺(5.63mg,0.0935mmol)加入。將反應於室溫攪拌2小時,然後濃縮。將殘留物以水稀釋,再以1N HCl將pH調整至7, 然後以DCM(3×15mL)萃取。將結合之有機萃取物以鹽水清洗,然後乾燥(硫酸鎂),過濾再濃縮,即得23.0mg(73%)4-(二氟甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(VV-5)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 12.51(br.s.,1H),8.86(s,1H),7.76(br.s.,1H),7.18(t,J=54.2Hz,1H),6.72(d,J=1.7Hz,1H);LCMS[M+1]170。
實例98(2R,3R,4S,5R)-2-(5-氟-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(4-氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(WW-7)
步驟1:7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)- 5-氟-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(WW-1)之合成
使用5-氟-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(Bioorg.Med.Chem.Lett.22(2012)7742-7747)進行類似於反應圖C步驟4之程序,即得WW-11H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.76(s,1H),7.26(br.s.,1H),6.46(br.s.,1H),5.02-4.89(m,2H),4.33(d,J=2.8Hz,1H),3.91-3.76(m,2H),2.80(s,3H),1.65(s,3H),1.39(s,3H),0.92(s,9H),0.13-0.04(m,6H)
步驟2:((3aR,4R,6R,6aR)-6-(5-氟-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲醇(WW-2)
遵循類似於反應圖C步驟6之脫保護程序使用WW-1合成,即得WW-2。LCMS[M+1]324
步驟3:(3aS,4S,6R,6aR)-6-(5-氟-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-羧酸(WW-3)
遵循類似於反應圖C步驟7之氧化程序使用WW-2合成,即得WW-3
步驟4:(3aS,4S,6R,6aR)-6-(5-氟-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-N-甲氧基-N,2,2-三甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-甲醯胺(WW-4)
遵循類似於反應圖C步驟8之醯胺形成程序使用WW-3合成,即得WW-4
步驟5:((3aS,4S,6R,6aR)-6-(5-氟-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(4-氟苯基)甲酮(WW-5)
遵循類似於反應圖C步驟9之格任雅添加(Grignard addition)程序使用WW-4及(4-氟苯基)溴化鎂合成,即得WW-5
步驟6:(R)-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(5-氟-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(4-氟苯基)甲醇(WW-6)
遵循類似於反應圖C步驟10之還原程序使用WW-5合成,即得WW-6。LCMS[M+1]418
步驟7:(2R,3R,4S,5R)-2-(5-氟-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(4-氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(WW-7)
遵循類似於反應圖C步驟11之脫保護程序使用WW-6合成,即得WW-7。LCMS[M+1]378;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.71(s,1H),7.81(s,1H),7.43(dd,J=5.9,8.4Hz,2H),7.14(t,J=8.8Hz,2H),6.24(d,J=7.8Hz,1H),5.96(d,J=4.3Hz,1H),5.34(d,J=6.8Hz,1H), 5.16(d,J=4.0Hz,1H),4.78(t,J=5.0Hz,1H),4.54-4.44(m,1H),4.13(t,J=4.4Hz,1H),3.99(d,J=5.3Hz,1H),2.73(s,3H)
實例99(2R,3R,4S,5R)-2-(2,4-二甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(4-氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(XX-8)
步驟1:2,4-二甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(XX-1)之合成
將4-氯-2-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(Journal of Medicinal Chemistry,2014,57,1097-1110)(1.5g,8.95mmol)之無水THF(15mL)溶液加至Pd(PPh3)4(517mg,0.448mmol)中。將懸浮液以N2脫氣4次。將2M三甲基鋁溶液(8.95mL,17.9mmol)於冰水下加至上述混合物中,加入後,將黃色溶液於80℃加熱16小時。TLC(DCM/MeOH=20:1)顯示起始材料完全被消耗且形成主要斑點。以已冷卻之水性羅謝氏鹽(aq Rochelle salt,15mL)於冰水中極小心地令混合物中止,有許多氣體產生,然後以水及EtOAc稀釋,將溶液通過矽藻土(celite)過濾。將水相以EtOAc(6mL×3)再萃取。將萃取物以鹽水(50mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得粗製產物,將其藉急驟biotage以DCM/MeOH=1-5%洗提予以純化,得黃色固狀之XX-1(0.9g,68.3%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 11.74(br.s.,1H),7.35(br.s.,1H),6.54(br.s.,1H),2.59(s,3H),2.57(s,3H)
步驟2:7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(((三級丁基二甲基矽基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-2,4-二甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(XX-2)之合成
使用2,4-二甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(XX-1)進行類似於反應圖C步驟4之程序,即得XX-2
步驟3:((3aR,4R,6R,6aR)-6-(2,4-二甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4- 基)甲醇(XX-3)之合成
遵循類似於反應圖C步驟6之脫保護程序使用XX-2合成,即得XX-3。LCMS[M+1]320。
步驟4:(3aS,4S,6R,6aR)-6-(2,4-二甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-羧酸(XX-4)之合成
遵循類似於反應圖C步驟7之氧化程序使用XX-3合成,即得XX-4。LCMS[M+1]334。
步驟5:(3aS,4S,6R,6aR)-6-(2,4-二甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-N-甲氧基-N,2,2-三甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-甲醯胺(XX-5)之合成
遵循類似於反應圖C步驟8之醯胺形成程序使用XX-4合成,即得XX-5
步驟6:((3aS,4S,6R,6aR)-6-(2,4-二甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(4-氟苯基)甲酮(XX-6)之合成
遵循類似於反應圖C步驟9之格任雅添加(Grignard addition)程序使用XX-5及(4-氟苯基)溴化鎂合成,即得XX-6
步驟7:(R)-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(2,4-二甲基-7H-吡咯并 [2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(4-氟苯基)甲醇(XX-7)之合成
遵循類似於反應圖C步驟10之還原程序使用XX-6合成,即得XX-7。LCMS[M+1]414。
步驟8:(2R,3R,4S,5R)-2-(2,4-二甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(4-氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(XX-8)之合成
遵循類似於反應圖C步驟11之程序使用XX-7合成,即得XX-8。LCMS[M+1]374;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 7.687.67(m,1H),7.46-7.42(m,2H),7.17-7.12(m,2H),6.71-6.70(m,1H),6.20-6.19(m,1H),6.11-6.09(m,1H),5.27-5.26(m,1H),5.11-5.10(m,1H),4.83-4.80(m,1H),4.66-4.61(m,1H),4.11-4.10(m,1H),4.01-4.00(m,1H),2.62(s,3H),2.61(s,3H)
實例100(2R,3S,4R,5R)-2-(4-氟苄基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(YY-7)
步驟1:(4S,5S)-2,2-二甲基-4-(2-甲基丙-1-烯-1-基)-5-((R)-環氧乙烷-2-基)-1,3-二氧雜環戊烷(YY-2)之合成
將三苯基異丙基碘化鏻(13.2g,30.6mmol)及THF(23mL)加至已烘箱乾燥之備有磁性攪拌棒且於乾燥器中冷卻之圓底燒瓶中。將溶液冷卻至0℃,其後將正丁基鋰(12mL,30mmol,2.5M之己烷液)逐滴加入。將反應於0℃攪拌15分鐘,於此時點得到暗紅色的亞烷基化合物溶液。將粗製YY-1(Tetrahedron Letters,1992,33,3567)(4.58g)以溶於THF(15mL)之溶液形式加至此亞烷基化合物溶液中。將冰浴移除,再令反應逐漸加溫至室溫。5小時後,TLC分析顯示無起始材料餘留。藉徐緩加入水(~100mL)觸發三苯基氧化膦之沈澱以令反應中止。將固狀物通過矽藻土(celite)墊過濾,再以數份MTBE潤洗。將濾液轉移至分液漏斗中,再分相。將水性相以3份MTBE萃取。將結合之有機萃取物乾燥(硫酸鎂),過濾,再於真空下濃縮。將粗製殘留物經由急驟管柱層析法(40g SiO2,Isco,100%庚烷至40% MTBE/庚烷,20mL流份)予以純化,得淺黃色油狀之標題化合物YY-2(0.56g,3步驟由d-核糖得21%)。TLC(30% EtOAc/Hept):Rf=0.34(product visualized with KMnO4 stain);1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 5.36-5.48(m,1H),5.01(dd,J=6.24,8.80Hz,1H),3.68-3.74(m,1H),3.00(ddd,J=2.69,4.07,7.06Hz,1H),2.83(dd,J=3.97,5.07Hz,1H),2.67(dd, J=2.57,5.01Hz,1H),1.83(d,J=0.86Hz,3H),1.77(d,J=1.22Hz,3H),1.52(s,3H),1.40(s,3H)。
步驟2:(R)-1-((4R,5S)-2,2-二甲基-5-(2-甲基丙-1-烯-1-基)-1,3-二氧雜環戊烷-4-基)-2-(4-氟苯基)乙-1-醇(YY-3)之合成
將溴化銅-二甲基硫錯合物(697mg,3.39mmol)加至已烘箱乾燥之備有磁性攪拌棒且於氬氣流下冷卻之反應小玻璃瓶中。將小玻璃瓶以氬氣流吹洗~5分鐘,再將THF(8mL)加入。將溶液冷卻至0℃,再將4-氟苯基溴化鎂(7.0mL,7.0mmol,1.0M之THF液)加入。將溶液於0℃攪拌30分鐘,其後將YY-2(0.56g,2.8mmol)以於THF(6mL)之溶液形式加入。將反應於0℃攪拌另30分鐘,於此時點TLC分析顯示無餘留之起始材料。藉逐滴加入飽和水性NH4Cl令反應中止,再與水轉移至分液漏斗中。將水性溶液以4份EtOAc萃取。將結合之有機萃取物乾燥(硫酸鎂),過濾,再於真空下濃縮。將粗製殘留物經由急驟管柱層析法(24g SiO2,Isco,100%庚烷至40% MTBE/庚烷,9mL流份)予以純化,得無色油狀之標題化合物YY-3(0.57g,69%)。TLC(20% EtOAc/庚烷):Rf=0.34;1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 7.24(dd,J=5.62,8.31Hz,2H),6.95-7.06(m,3H),5.40(d,J=9.29Hz,1H),4.96(dd,J=6.30,9.23Hz,1H),3.94(dd,J=6.30,8.62Hz,1H),3.83(dt,J=2.81,8.56Hz,1H),3.07(dd,J=2.57, 14.06Hz,1H),2.68(dd,J=8.56,13.94Hz,1H),1.78(s,3H),1.74(s,3H),1.52(s,3H),1.40(s,3H)。
步驟3:(3aR,4R,6R,6aR)-6-(4-氟苄基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-醇(YY-4)之合成
將DCM(10mL)及MeOH(10mL)加至磁性攪拌棒且含有YY-3(0.57g,1.9mmol)之圓底燒瓶中。將溶液冷卻至-78℃,再以臭氧氣流噴布。連續噴布1小時後,TLC分析顯示無餘留之起始材料。將反應以氮噴布~15分鐘,其後將二甲基硫(1.4mL,19mmol)加入。將冰浴移除,再令溶液逐漸加溫至室溫過夜。將溶液於真空下濃縮,再將粗製殘留物經由急驟管柱層析法(12g SiO2,Isco,100%庚烷至40% EtOAc/庚烷,9mL流份)予以純化,得白色固狀之標題化合物YY-4(0.42g,81%)。1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 7.16-7.24(m,2H),6.96-7.05(m,2H),5.48(d,J=2.57Hz,1H),4.71(d,J=5.87Hz,1H),4.67(d,J=5.75Hz,1H),4.45(t,J=7.89Hz,1H),3.01(dd,J=8.44,14.43Hz,1H),2.91(dd,J=7.58,13.82Hz,1H),2.65(d,J=2.81Hz,1H),1.47(s,3H),1.32(s,3H)。
步驟4:(3aR,4R,6R,6aR)-4-氯-6-(4-氟苄基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃(YY-5)之合成
將YY-4(226mg,0.841mmol)、甲苯(1.9mL)及四氯化碳(0.11mL,1.09mmol)加至已烘箱乾燥之備有磁性攪 拌棒且於氬氣流下冷卻之反應小玻璃瓶中。將溶液冷卻至-50℃,再將六甲基三胺基膦(0.23mL,1.26mmol)逐滴加入。添加完成後,將小玻璃瓶轉移至冰浴,再將反應於0℃攪拌1小時。以冰冷之鹽水(0.5mL)令反應中止,再將有機相經由吸管分離出。將有機相乾燥(硫酸鎂),此粗製之氯化物YY-5溶液係立即地用於下一步驟中而不必進一步純化。
步驟5:7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(4-氟苄基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(YY-6)之合成
將吡咯并嘧啶V-1(75.0mg,0.56mmol)、氫氧化鉀(70.7mg,1.26mmol)、甲苯(2.3mL)、乙腈(0.38mL)及TDA-1(0.11mL,0.34mmol)加至已烘箱乾燥之備有磁性攪拌棒且於氬氣流下冷卻之反應小玻璃瓶中。將溶液於室溫攪拌30分鐘,於此時點將粗製氯化物YY-5溶液加至小玻璃瓶中。將反應於室溫攪拌24小時。以飽和水性NH4Cl令反應中止,再與EtOAc轉移至分液漏斗中。將產物以3份EtOAc萃取,再將結合之有機相乾燥(硫酸鎂),過濾,再於真空下濃縮。將粗製殘留物經由急驟管柱層析法(12g SiO2,Isco,100%庚烷至100% EtOAc,9mL流份)予以純化,得黃色膠狀之標題化合物YY-6(120mg,2步驟得55%)。LCMS[M+H]384;1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.87(s,1H),7.04-7.18(m,2H),6.88-7.03(m, 2H),6.72(br.s,1H),6.25(d,J=2.57Hz,1H),5.15-5.29(m,1H),4.86(dd,J=6.30,4.46Hz,1H),4.34-4.47(m,1H),2.83-3.12(m,5H),1.62(s,3H),1.37(s,3H)。
步驟6:(2R,3S,4R,5R)-2-(4-氟苄基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(YY-7)之合成
將水(2.0mL)及三氟乙酸(1.0mL)加至備有磁性攪拌棒且含有YY-6(120mg,0.313mmol)之反應小玻璃瓶中。將反應於室溫攪拌30分鐘。將反應與EtOAc轉移至分液漏斗中。將有機相以3份飽和水性NaHCO3清洗,乾燥(硫酸鎂),過濾,再於真空下濃縮。將粗製殘留物經由超臨界流體層析法(ZymorSpher HADP管柱,4.6×150mm管柱使用10%至50% MeOH,3.0mL/min.)予以純化,即得白色固狀之標題化合物YY-7(35.2mg,33%)。LCMS[M+H]344;1H NMR(400MHz,甲醇-d4)ppm 8.61(s,1H),7.36(d,J=3.79Hz,1H),7.23(dd,J=5.50,8.44Hz,2H),6.95(t,J=8.80Hz,2H),6.73(d,J=3.67Hz,1H),6.21(d,J=4.65Hz,1H),5.49(s,1H),4.47(t,J=4.89Hz,1H),4.12-4.26(m,2H),3.09(dd,J=4.65,14.18Hz,1H),2.99(dd,J=6.36,13.94Hz,1H),2.72(s,3H);19F PCD NMR(376MHz,甲醇-d4)δ ppm -119.11(s,1F)。
實例101(2R,3R,4S,5R)-2-(4-胺基-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-(4-氟苄基)四氫呋喃-3,4-二醇(ZZ-3)
步驟1:4-氯-5-氟-7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(4-氟苄基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(ZZ-1)之合成
將吡咯并嘧啶Q-2(64mg,0.37mmol)、氫氧化鉀(46.9mg,0.835mmol)、甲苯(1.59mL)、乙腈(0.26mL)及TDA-1(71μL,0.223mmol)加至已烘箱乾燥之備有磁性攪拌棒且於氬氣流下冷卻之反應小玻璃瓶中。令溶液於室溫攪拌30分鐘,於此時點將粗製氯化物YY-5溶液加入。將反應於室溫攪拌15小時。以半飽和水性NH4Cl令反應中止,再與EtOAc轉移至分液漏斗中。將產物以3份EtOAc萃取,再將結合之有機相乾燥(硫酸鎂),過濾,再於真空下濃縮。將粗製殘留物經由急驟管柱層析法(12g SiO2,Isco,100%庚烷至100% EtOAc,9mL流份)予以純化,得無色膠狀之標題化合物ZZ-1(60.5mg,2步驟得38%)。LCMS[M+H]422;1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ ppm 8.66(s,1H),7.12(dd,J=5.44,8.50Hz,2H),6.97-7.01(m,2H),6.95(d,J=2.81Hz,1H),6.21(d,J=2.57Hz,1H),5.13(dd,J=2.81,6.60Hz,1H),4.80(dd,J=4.34,6.54Hz,1H),4.35-4.42(m,1H),2.98(dq,J=6.30,14.28Hz,2H),1.61(s,3H),1.36(s,3H)。
步驟2:5-氟-7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(4-氟苄基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-胺(ZZ-2)之合成
於備有磁性攪拌棒且含有ZZ-1(60.5mg,0.143mmol)之微波小玻璃瓶內裝入二烷(0.36mL)及氫氧化銨(0.36mL)。將小玻璃瓶以鐵氟龍蓋密封,再置於加熱組中。將反應加熱至120℃ 22小時。將反應凍乾,粗製產物ZZ-2(65.7mg)係用於下一步驟中而不必進一步純化。LCMS[M+H]403
步驟3:(2R,3R,4S,5R)-2-(4-胺基-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-(4-氟苄基)四氫呋喃-3,4-二醇(ZZ-3)之合成
將水(0.7mL)加至備有磁性攪拌棒且含有粗製ZZ-2(65.7mg)之反應小玻璃瓶中,其後將三氟乙酸(0.7mL)逐滴加入。將反應於室溫攪拌3小時。將反應與EtOAc轉移至分液漏斗中,再分相。將有機相以3份飽和水性NaHCO3清洗,再將結合之水性清洗物以1份EtOAc反萃取。將結合之有機萃取物乾燥(硫酸鎂),過濾,再於真空 下濃縮。將粗製殘留物經由超臨界流體層析法(ZymorSpher HADP 150×21.2mm管柱,20-30% MeOH,60mL/min)予以純化,即得白色固狀之標題化合物ZZ-3(19.6mg)。LCMS[M+H]363;1H NMR(700MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.05(s,1H),7.23(dd,J=5.72,8.46Hz,2H),7.20(d,J=1.37Hz,1H),7.07(t,J=8.88Hz,2H),6.97(br.s.,2H),6.06(d,J=5.12Hz,1H),4.31(t,J=5.47Hz,1H),3.97-4.02(m,1H),3.93(t,J=4.53Hz,1H),2.97(dd,J=5.04,14.09Hz,1H),2.87(dd,J=8.20,14.18Hz,1H)。
實例102(2R,3R,4S,5R)-2-(4-胺基噻吩并[3,4-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(4-氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(AAA-7)
步驟1:((3aR,4R,6R,6aR)-6-(4-胺基噻吩并[3,4-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲醇 (AAA-2)之合成
將二甲氧基丙烷(0.737mL,6.00mmol)及PTSA(163mg,0.858mmol)加至AAA-1(Journal of American Chemistry Society,2011,133,14912)(243mg,0.858mmol)之丙酮(8.58mL,1M)懸浮液中,再於室溫攪拌16小時。將反應濃縮,再於12g-ISCO管柱上以100% EtOAc及10% MeOH/EtOAc洗提予以純化,得清澈膠狀之AAA-2(80mg,29%,β變旋異構物)。LCMS[M+1]324;1H NMR(400MHz,MeOD)δ ppm 8.33(s,1 H),8.07(s,1 H),5.49(d,J=5.26Hz,1 H),4.89-4.95(m,1 H),4.86(dd,J=6.30,3.00Hz,1 H),4.23(d,J=3.18Hz,1 H),3.69-3.82(m,2 H),1.61(s,3 H),1.35(s,3 H)
步驟2:(3aS,4S,6R,6aR)-6-(4-胺基噻吩并[3,4-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-羧酸(AAA-3)之合成
AAA-2(86mg,0.27mmol)、乙腈(2.8mL)、及水(0.7mL)加至圓底燒瓶內。將溶液冷卻至0℃(冰浴),再將二乙醯氧基碘苯(BAIB,188mg,0.585mmol)其後TEMPO(8.31mg,0.05mmol)加入,再於0℃攪拌(清澈黃色溶液)。2.5小時後,LCMS顯示完全轉化成酸。將反應濃縮且粗製地(AAA-3)用於下一反應(Weinreb醯胺之形成);LCMS[M+1]338。
步驟3:(3aS,4S,6R,6aR)-6-(4-胺基噻吩并[3,4-d]嘧啶-7-基)-N-甲氧基-N,2,2-三甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-甲醯胺(AAA-4)之合成
AAA-3(80mg,0.24mmol)、N,O-二甲基羥胺HCl(115mg,1.18mmol)、THF(2mL)、及吡啶(0.095mL,1.18mmol)加至圓底燒瓶內。將反應冷卻至0℃,再將T3P(50%之EtOAc液,0.3mL,0.5mmol)逐滴加入。於第4滴時(黏滯),出現膠狀物。將另5eq之吡啶加入(0.095mL,1.18mmol)。將冰浴移除,再於室溫攪拌過夜。LCMS顯示產物質量在極極性區。濃縮,且以粗製之AAA-4(96mg)形式用於下一反應中。LCMS[M+1]381。
步驟4:((3aS,4S,6R,6aR)-6-(4-胺基噻吩并[3,4-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(4-氟苯基)甲酮(AAA-5)之合成
於0℃將4-氟苯基溴化鎂(0.75mL,0.756mmol,1M之THF液)逐滴加至已以冰浴冷卻至0℃之含有AAA-4(96mg,0.25mmol)及THF(2mL)之乾燥小玻璃瓶中。將反應於室溫攪拌16小時。將反應以EtOAc稀釋,再以飽和NH4Cl令反應中止。將水性層以EtOAc(3×10mL)萃取。將結合之有機相於硫酸鈉上乾燥,過濾再濃縮成油狀物。將粗製材料於ISCO 12g管柱上以0-100% EtOAc/庚烷然後10% MeOH/EtOAc洗提予以純化,即得油狀之AAA-5(6mg,6%)。LCMS[M+1]416
步驟5-6:(R)-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(4-胺基噻吩并[3,4-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(4-氟苯基)甲醇(AAA-6)及(2R,3R,4S,5R)-2-(4-胺基噻吩并[3,4-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(4-氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(AAA-7)之合成
將甲酸鈉(40mg,0.578mmol)及Ru(對異丙基甲苯)[(R,R)TsDPEN](0.1mg,0.001mmol)加至備有磁性攪拌棒且含有AAA-5(6mg,0.01mmol)之錐底微波小玻璃瓶中。以氬吹洗。將水(0.240mL,以氬吹洗30分鐘)及EtOAc(0.06mL,以氬吹洗30分鐘)加入,再於室溫攪拌24小時。LCMS顯示產物AAA-6。將反應濃縮至乾,得棕色油狀物。將2mL TFA及1Ml水加入,再於室溫攪拌1小時。LCMS顯示產物AAA-7。濃縮,再將游離鹼以SCX管柱(以MeOH然後10% NH3/MeOH洗提)進行。繼而將粗製產物藉SFC予以純化,得AAA-7。LCMS[M+1]378。
實例103(2R,3R,4S,5S)-2-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-1-(3,4-二氟苯基)-1-羥乙基)四氫呋喃-3,4-二醇(BBB-4)
步驟1:(R)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-1-(3,4-二氟苯基)乙-1-醇(BBB-1)及(S)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-1-(3,4-二氟苯基)乙-1-醇(BBB-2)之合成
於室溫將甲基溴化鎂(0.765mL,2.29mmol,3.0M)加至((3aS,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(3,4-二氟苯基)甲酮(MM-4)(200mg,0.456mmol)之無水THF(4.5mL,c=0.10M)溶液中,將所得溶液於室溫攪拌0.5小時。將水性NH4Cl(40mL)徐緩地加至此混合物中,將混合物以EtOAc(25mL×3)萃取。將萃取物結合,再以鹽水(25mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮,藉管柱層析法以30% EtOAc/庚烷洗提予以純化,得170mg(82%產率)白色固狀之(R)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-6-(4-氯- 7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-1-(3,4-二氟苯基)乙-1-醇(BBB-1)。LCMS[M+1]452;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 1.22(s,3 H)1.51(s,3 H)1.58(s,4 H)4.67(d,J=6.11Hz,1 H)5.12-5.17(m,1 H)5.86(d,J=5.26Hz,1 H)6.68(d,J=3.67Hz,1 H)7.18-7.22(m,1 H)7.22-7.26(m,1 H)7.32-7.36(m,1 H)7.44-7.52(m,1 H)8.72(s,1 H)。以40% EtOAc/庚烷洗提,得26mg(13%產率)油狀之(S)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-1-(3,4-二氟苯基)乙-1-醇(BBB-2)。
LCMS[M+1]452;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 1.41(s,3 H)1.59(s,3 H)1.67(s,3 H)4.64(d,J=2.57Hz,1 H)5.14(dd,J=6.66,4.46Hz,1 H)5.30(dd,J=6.72,2.57Hz,1 H)5.78(d,J=4.40Hz,1 H)6.58(d,J=3.67Hz,1 H)6.99-7.08(m,1 H)7.09-7.15(m,1 H)7.20-7.26(m,2 H)8.71(s,1 H)。
步驟2:(R)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-6-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-1-(3,4-二氟苯基)乙-1-醇(BBB-3)之合成
將(R)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-1-(3,4-二氟苯基)乙-1-醇(170mg,0.376mmol)溶於5 mL二烷中,將5mL氫氧化銨加入,將反應容器密封,再於100℃加熱過夜。將反應混合物濃縮,將H2O加至殘留物中,以EtOAc萃取,藉管柱層析法以70-80% EtOAc/庚烷洗提予以純化,得159mg(100%產率)無色油狀之標題化合物(BBB-3),其於真空下固化。
LCMS[M+1]433;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 1.21(s,3 H)1.51(s,3 H)1.57(s,3 H)4.49-4.56(m,1 H)4.63-4.70(m,1 H)5.16(t,J=5.62Hz,1 H)5.81(d,J=5.26Hz,1 H)5.90(br.s.,2 H)6.51(d,J=3.55Hz,1 H)7.09(d,J=3.55Hz,1 H)7.19(dd,J=9.90,8.19Hz,1 H)7.23-7.27(m,1 H)7.48(ddd,J=11.98,7.76,2.14Hz,1 H)8.33(s,1 H)
步驟3:(2R,3R,4S,5S)-2-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-1-(3,4-二氟苯基)-1-羥乙基)四氫呋喃-3,4-二醇(BBB-4)之合成
遵循類似於實例9(反應圖C)步驟11之程序。LCMS[M+1]393;1H NMR(700MHz,DMSO-d6)d ppm 1.41(s,2 H)3.68(d,J=4.84Hz,1 H)4.13(s,1 H)4.58(br.s.,1 H)4.86(br.s.,1 H)5.17(br.s.,1 H)5.86(d,J=7.92Hz,1 H)6.67(d,J=3.52Hz,1 H)7.34-7.42(m,3 H)7.47(br.s.,2 H)7.54-7.60(m,1 H)8.13(br.s.,1 H)
實例104(2R,3R,4S,5S)-2-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((S)-1-(3,4-二氟苯基)-1-羥乙基)四氫呋喃-3,4-二醇(CCC-2)
步驟1:(S)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-6-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-1-(3,4-二氟苯基)乙-1-醇(CCC-2)之合成
將(S)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-1-(3,4-二氟苯基)乙-1-醇(BBB-2)(26mg,0.058mmol)溶於1mL二烷中,將1mL氫氧化銨加入,將反應容器密封,再於100℃加熱過夜。將反應混合物濃縮,將H2O加至殘留物中,以EtOAc萃取。將有機層結合,以鹽水清洗,於硫酸鈉上乾燥,濃縮,得25mg(100%產率)油狀之CCC-1
LCMS[M+1]433;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 1.40(s,3 H)1.58(s,3 H)1.65(s,3 H)4.62(d,J=2.32Hz,1 H)5.14(dd,J=6.60,4.52Hz,1 H)5.28(dd,J=6.60,2.32Hz,1 H)5.61(br.s.,2 H)5.69(d,J=4.40Hz,1 H)6.31(d,J=3.55Hz,1 H)6.91(d,J=3.55Hz,1 H)6.97-7.07(m,1 H)7.10-7.16(m,1 H)7.26(ddd,J=11.92,7.64,2.20Hz,1 H)8.33(s,1 H)
步驟2:(2R,3R,4S,5S)-2-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((S)-1-(3,4-二氟苯基)-1-羥乙基)四氫呋喃-3,4-二醇(CCC-2)之合成
遵循類似於實例9(反應圖C)步驟11之程序。LCMS[M+1]393;1H NMR(700MHz,DMSO-d6)d ppm 1.48(s,3 H)4.17(s,1 H)4.21-4.28(m,2 H)5.93(d,J=6.16Hz,1 H)6.89(d,J=3.52Hz,1 H)7.20-7.33(m,2 H)7.39-7.47(m,1 H)7.56(d,J=3.30Hz,1 H)8.33(br.s.,1 H)
實例105(2R,3R,4S,5S)-2-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-1-(4-氯-3-氟苯基)-1-羥乙基)四氫呋喃-3,4-二醇(DDD-5)
步驟1:(R)-1-(4-氯-3-氟苯基)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)乙-1-醇(DDD-2)及(S)-1-(4-氯-3-氟苯基)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)乙-1-醇(DDD-3)之合成
於室溫將甲基溴化鎂(0.848mL,2.54mmol,3.0M)加至(4-氯-3-氟苯基)((3aS,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲酮(DDD-1,反應圖DDD,以類似於MM-4之方式使用4-氯-3-氟苯基溴化鎂製得)(230mg,0.509mmol)之無水THF(5.0mL,c=0.10M)溶液中,將所得溶液於室溫攪拌0.5小時。將水性NH4Cl(40mL)徐緩地加至混合物中,將混合物以EtOAc(25mL×3)萃取。將萃取物結合,再以鹽水(25mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮,藉管柱層析法以25% EtOAc/庚烷洗提予以純化,得175mg(73.5%產率)白色固狀之(R)-1-(4-氯-3-氟苯基)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)乙-1-醇(DDD-2)。
LCMS[M+1]468;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 1.22(s,3 H)1.51(s,3 H)1.58(s,3 H)4.56(d,J=1.22Hz,1 H)4.66(dd,J=6.11,1.10Hz,1 H)5.15(t,J=5.75Hz,1 H)5.86(d,J=5.26Hz,1 H)6.68(d,J=3.67Hz,1 H)7.25- 7.29(m,1 H)7.34(d,J=3.67Hz,1 H)7.40-7.48(m,2 H)8.72(s,1 H)。
以30% EtOAc/庚烷洗提,得26mg(11%產率)油狀之(S)-1-(4-氯-3-氟苯基)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)乙-1-醇(DDD-3)。
LCMS[M+1]468;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 1.41(s,3 H)1.59(s,3 H)1.67(s,3 H)4.65(d,J=2.57Hz,1 H)5.14(dd,J=6.66,4.46Hz,1 H)5.30(dd,J=6.72,2.57Hz,1 H)5.77(d,J=4.40Hz,1 H)6.58(d,J=3.67Hz,1 H)7.11-7.16(m,1 H)7.19-7.24(m,2 H)7.25-7.29(m,1 H)8.71(s,1 H)
步驟2:(R)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-6-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-1-(4-氯-3-氟苯基)乙-1-醇(DDD-4)之合成
將(R)-1-(4-氯-3-氟苯基)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)乙-1-醇(175mg,0.374mmol)溶於5mL二烷中,將5mL氫氧化銨加入,將反應容器密封,再於100℃加熱過夜。將反應混合物濃縮,將H2O加至殘留物中,以EtOAc萃取。將有機層結合,以鹽水清洗,於硫酸鈉上乾燥,濃縮,得168mg(100%產率)油狀之DDD-4
LCMS[M+1]449;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 1.21(s,3 H)1.52(s,3 H)1.57(s,3 H)4.52(d,J=1.22Hz,1 H)4.62-4.68(m,1 H)5.09(t,J=5.62Hz,1 H)5.88(d,J=5.14Hz,1 H)6.82(d,J=3.55Hz,1 H)7.17(br.s.,2 H)7.20-7.26(m,2 H)7.39-7.46(m,2 H)8.28(s,1 H)
步驟3:(2R,3R,4S,5S)-2-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-1-(4-氯-3-氟苯基)-1-羥乙基)四氫呋喃-3,4-二醇(DDD-5)之合成
遵循類似於實例9(反應圖C)步驟11之程序。LCMS[M+1]409;1H NMR(700MHz,DMSO-d6)d ppm 1.41(s,3 H)3.67(d,J=5.06Hz,1 H)4.13(s,1 H)4.58(br.s.,1 H)4.88(br.s.,1 H)5.18(br.s.,1 H)5.86(d,J=8.14Hz,1 H)6.66(d,J=3.52Hz,1 H)7.38(d,J=3.30Hz,1 H)7.40-7.42(m,1 H)7.44(br.s.,1 H)7.53-7.58(m,2 H)8.13(br.s.,1 H)
實例106(2R,3R,4S,5S)-2-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((S)-1-(4-氯-3-氟苯基)-1-羥乙基)四氫呋喃-3,4-二醇(EEE-2)
步驟1:(S)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-6-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-1-(4-氯-3-氟苯基)乙-1-醇(EEE-1)之合成
將(S)-1-(4-氯-3-氟苯基)-1-((3aR,4S,6R,6aR)-6-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)乙-1-醇(26mg,0.056mmol)溶於1mL二烷中,將1mL氫氧化銨加入,將反應容器密封,再於100℃加熱過夜。將反應混合物濃縮,將H2O加至殘留物中,以EtOAc萃取。將有機層結合,以鹽水清洗,於硫酸鈉上乾燥,濃縮,得25mg(100%產率)油狀之EEE-1
LCMS[M+1]449;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 1.40(s,3 H)1.57(s,3 H)1.65(s,3 H)4.62(d,J=2.32Hz,1 H)5.14(dd,J=6.48,4.52Hz,1 H)5.28(dd,J=6.60,2.32Hz,1 H)5.69(d,J=4.40Hz,1 H)5.77(br.s.,2 H)6.34(d,J=3.42Hz,1 H)6.92(d,J=3.67Hz,1 H)7.14(dd,J=8.38,1.77Hz,1 H)7.21-7.24(m,1 H)7.26(s,1 H)8.31(br.s.,1 H)
步驟2:(2R,3R,4S,5S)-2-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((S)-1-(4-氯-3-氟苯基)-1-羥乙基)四氫呋喃-3,4-二醇(EEE-2)之合成
遵循類似於實例9(反應圖C)步驟11之程序。LCMS[M+1]409;1H NMR(700MHz,DMSO-d6)d ppm 1.48(s,3 H)4.20(d,J=1.54Hz,1 H)4.26(dd,J=5.39,1.43Hz,1 H)4.28-4.35(m,1 H)5.34(br.s.,2 H)5.89(d,J=7.04Hz,1 H)6.83(d,J=3.52Hz,1 H)7.29(dd,=8.58,1.76Hz,1 H)7.37-7.48(m,2 H)7.51(d,J=3.30Hz,1 H)8.29(s,1 H)
實例107(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)-5-(4-(氟甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(FFF-6)
步驟1-7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-羧酸甲酯(FFF-1)之合成
MM-5(反應圖FFF)(500mg,1.14mmol)、Pd(dppf)Cl2(167mg,0.228mmol)及Et3N(462mg,4.57mmol)之MeOH(50mL)混合液以CO脫氣四次。將混合物於100℃、於CO(2MPa)下、於熱壓器中攪拌20小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示反應完成且產物為乾淨的。將混合物於真空中濃縮,再將殘留物藉矽膠層析法以EtOAc之石油醚液(由0至100%)洗提予以純化,得白色固狀之FFF-1(500mg,94.9%)。LCMS[M+1]462;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 9.07(s,1H),7.48(d,J=3.8Hz,1H),7.39(dd,J=7.8,11.5Hz,1H),7.24-7.18(m,2H),7.16(d,J=3.5Hz,1H),6.63(d,J=1.3Hz,1H),5.90(d,J=5.0Hz,1H),5.27(t,J=5.6Hz,1H),5.10(s,1H),4.94(dd,J=1.4,6.1Hz,1H),4.57(s,1H),4.12(s,3H),1.59(s,3H),1.29(s,3H)
步驟2-7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-((1R)-(3,4-二氟苯基)((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-羧酸(FFF-2)之合成
於室溫(25℃)將3,4-二氫-2H-哌喃(109mg,1.3 mmol)加至FFF-1(300mg,0.60mmol)及PPTS(32.7mg,0.13mmol)之THF(3mL)溶液中。將混合物於室溫(25℃)攪拌1小時。將混合物於室溫、於N2下攪拌12小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示起始材料:產物的比值為約5:1。將CuSO4(1eq)及3,4-二氫-2H-哌喃(1.09g,13mmol)加入。將混合物於室溫攪拌24小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數的起始材料被消耗。將混合物藉矽膠層析法以EtOAc之石油醚液(由0-100)洗提予以純化,得固狀之FFF-2(120mg,34.7%)。LCMS[M+1]532
步驟3-7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-((1R)-(3,4-二氟苯基)((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-羧酸甲酯(FFF-3)之合成
於0℃將氯甲酸異丁酯(56.5mg,0.414mmol)加至FFF-2(110mg,0.207mmol)及Et3N(83.8mg,0.828mmol)之無水THF(2mL)溶液中。將混合物於室溫(25℃)攪拌1小時。將MeOH(2mL)加至混合物中。將混合物於室溫(25℃)攪拌1小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示形成新斑點。將混合物倒至鹽水(10mL)中,再以EtOAc(10mL×2)萃取。將萃取物於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮,得膠狀之FFF-3(100mg,88%),其係直接用於下一步驟中。LCMS[M+23]568
步驟4-(7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-((1R)-(3,4-二氟苯基)((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)甲醇(FFF-4)之合成
於室溫(25℃)將NaBH4(150mg,3.96mmol)加至FFF-3(150mg,3.96mmol)之MeOH(15mL)溶液中。將混合物於室溫攪拌1小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數的起始材料被消耗且形成新斑點。將混合物於真空中濃縮至乾。將殘留物藉prep-TLC(石油醚/EtOAc=1:1)予以純化,得白色固狀之FFF-4(90mg,63.2%)。LCMS[M+1]518
步驟5-7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-((1R)-(3,4-二氟苯基)((四氫-2H-哌喃-2-基)氧基)甲基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-4-(氟甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(FFF-5)之合成
於-70℃將雙(2-甲氧基乙基)胺基三氟化硫(150mg,0.678mmol)加至FFF-4(50mg,0.0966mmol)之無水DCM(5mL)溶液中。將所得黃色溶液加溫至室溫,再於室溫(25℃)攪拌2小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數的起始材料被消耗且主峰具有期望之質量。將混合物藉矽膠層析法以EtOAc之石油醚液(由0至50%)洗提予以純化,得白色固狀之FFF-5(25mg,50%)。LMCS[M+1]520
步驟6-(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)-5-(4-(氟甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(FFF-6)之合成
於室溫(25℃)將TFA/H2O(1mL/1mL)加至化合物FFF-5(25mg,0.0481mmol)中。將混合物於室溫攪拌2小時。LCMS顯示大多數的起始材料被消耗且主峰為期望化合物。將混合物倒至20%水性K2CO3(10mL)中,再以EtOAc(10mL×2)萃取。將萃取物以鹽水(10mL×2)清洗,於硫酸鎂上乾燥,再於真空中濃縮以得粗製物(18mg)。將粗製物藉prep-TLC(DCM/MeOH=10:11)予以純化,即得白色固狀之FFF-6(13mg,68.3%)。LCMS[M+1]396;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.80(s,1H),7.94(d,J=3.8Hz,1H),7.46-7.32(m,2H),7.28-7.21(m,1H),6.85-6.80(m,1H),6.23(d,J=7.8Hz,1H),6.11(d,J=4.5Hz,1H),5.86(s,1H),5.74(s,1H),5.33(d,J=6.8Hz,1H),5.17(d,J=4.3Hz,1H),4.81(t,J=4.9Hz,1H),4.65-4.54(m,1H),4.14(t,J=4.5Hz,1H),4.01(d,J=5.5Hz,1H)
實例108(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)-5-(4-(羥甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(GGG-2)
步驟1-(R)-(3,4-二氟苯基)((3aR,4R,6R,6aR)-6-(4-(羥甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲醇(GGG-1)之合成
於室溫(25℃)將NaBH4(492mg,13mmol)加至FFF-1(反應圖GGG)(200mg)之MeOH(30mL)溶液中。將混合物於室溫攪拌30分鐘。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數的起始材料被消耗。將混合物於真空中濃縮以移除大多數的MeOH。將殘留物以水稀釋(30mL),再以EtOAc(20mL×3)萃取。將萃取物以鹽水(20mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得粗製材料,將其藉prep TLC(石油醚/EtOAc=2:3)予以純化,得淡黃色固狀之GGG-1(80mg,42.6%)。LCMS[M+1]434;1HNMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.88(s,1H),7.48-7.35(m,1H),7.31(br.s.,1H),7.24-7.14(m,2H),7.12(br.s.,1H),6.61(br.s.,1H),5.85(d,J=4.8Hz,1H),5.27(br.s.,1H),5.16-5.02(m,3H),4.94(d,J=6.0Hz,1H),4.56(br.s.,1H),3.90(br.s.,1H),1.58(br.s.,3H),1.29(s,3H)
步驟2-(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)-5-(4-(羥甲基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(GGG-2)之合成
於0℃將GGG-1(60mg,0.138mmol)加至TFA/H2O(2mL/2mL)溶液中。將混合物於室溫(30℃)攪拌1小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數的起始材料被消耗。將混合物倒至20% K2CO3(20mL)中,再以EtOAc(20mL×2)萃取。將萃取物以鹽水(20mL×2)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮,即得白色固狀之GGG-2(45mg,83%)。LCMS[M+1]394;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.70(s,1H),7.81(d,J=3.8Hz,1H),7.48-7.31(m,2H),7.25(br.s.,1H),6.91(d,J=3.8Hz,1H),6.20(d,J=7.8Hz,1H),6.15(d,J=4.5Hz,1H),5.61(t,J=6.0Hz,1H),5.29(d,J=6.8Hz,1H),5.14(d,J=4.0Hz,1H),4.88-4.75(m,3H),4.64-4.52(m,1H),4.13(t,J=4.5Hz,1H),4.00(d,J=5.5Hz,1H)
實例109(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-(3,4-二氟苯基)(甲胺基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(HHH-3)
步驟1:N-((R)-(3,4-二氟苯基)((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲基)-N-甲基-2-硝基苯磺醯胺(HHH-1)之合成
SS-1(反應圖HHH)(100.0mg,0.240mmol)、N-甲基-2-硝基苯磺醯胺(62.2mg,0.287mmol)、三苯膦(94.3mg,0.359mmol)、及THF(17.3mg,0.240mmol,1.20mL,0.2M)加至圓底燒瓶內。將混合物於冰浴中冷卻至0℃。將DIAD(77.3mg,0.359mmol,0.0740mL)逐滴加入,再於室溫攪拌16小時。LCMS顯示完全轉化成產物。將反應以EtOAc及水(各30mL)稀釋。將水性層以EtOAc(3×20mL)萃取。藉prep HPLC予以純化,得固狀之HHH-1(57mg,39%)。LCMS[M+1]616;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.84(s,1H),7.97-7.90(m,1H),7.73-7.66(m,1H),7.66-7.59(m,2H),7.15(d,J=3.8Hz,1H), 6.97-6.86(m,3H),6.58(d,J=3.7Hz,1H),6.21(d,J=2.4Hz,1H),5.40(d,J=8.7Hz,1H),5.29(dd,J=2.5,6.7Hz,1H),5.18(dd,J=4.2,6.5Hz,1H),4.64(dd,J=4.2,8.7Hz,1H),2.95(s,3H),2.74(s,3H),1.62(s,3H),1.30(s,3H)
步驟2:(R)-1-(3,4-二氟苯基)-1-((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)-N-甲基甲胺(HHH-2)之合成
HHH-1(57.0mg,0.093mmol)之MeOH懸浮液以巰基乙酸(0.020mL,0.277mmol)及氫氧化鋰水合物(23.3mg,0.556mmol)處理。將反應於55℃攪拌24小時。將反應直接通過SCX管柱中首先以MeOH其後以10% 7N NH3/MeOH沖洗,得清澈油狀之產物(HHH-2)。LCMS[M+1]431
步驟3:(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-(3,4-二氟苯基)(甲胺基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(HHH-3)
將粗製清澈油狀之HHH-2溶於TFA及水(各1mL)中,再於室溫攪拌16小時。將反應直接通過SCX管柱中,首先以MeOH其後以10% 7N NH3/MeOH沖洗,得清澈油狀之產物。藉SFC純化,即得白色固狀之HHH-3(17.4mg,48%)LCMS[M+1]391;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 8.62(s,1H),7.55(br.s.,1H),7.38- 7.26(m,2H),7.18(br.s.,1H),6.73(d,J=3.7Hz,1H),6.05(d,J=6.4Hz,1H),5.33(d,J=6.1Hz,1H),5.20-5.09(m,1H),4.48(q,J=6.2Hz,1H),4.19-4.12(m,1H),4.05-3.96(m,1H),3.87-3.73(m,1H),2.65(s,3H),2.17(s,3H)
實例110-112係遵循類似於實例9(反應圖C)步驟9-11的程序,使用適當之芳基鹵製備格任雅試劑(Grignard reagent)而合成。用於實例112之芳基鹵的製備程序如下。
8-碘-3,4-二氫異喹啉-2(1H)-羧酸三級丁酯(用於實例112中)之合成
步驟1:8-溴-3,4-二氫異喹啉-2(1H)-羧酸三級丁酯之合成
將Boc2O(1030mg,4.72mmol)及NEt3(960mg,9.43mmol)加至8-溴-1,2,3,4-四氫異喹啉HCl(1g,4.72mmol)之DCM(20mL)溶液中。將混合物於20℃攪拌1.5小時。將混合物於真空中濃縮以得粗製產物(2000mg)。將粗製物藉矽膠層析法以EtOAc之石油醚液(由0至30%)洗提予以純化,得期望產物(1.36mg,94%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 7.42(d,J=7.5Hz,1H),7.14-6.97(m,2H),4.61-4.48(m,2H),3.64(t,J=5.4Hz,2H),2.90-2.75(m,2H),1.50(s,9H)
步驟2:8-碘-3,4-二氫異喹啉-2(1H)-羧酸三級丁酯之合成
將8-溴-3,4-二氫異喹啉-2(1H)-羧酸三級丁酯(500mg,1.60mmol)、NaI(720mg,4.80mmol)、CuI(45.8mg,0.240mmol)及反-N,N-二甲基環己烷二胺(68mg,0.48mmol)之二烷(10mL)混合液以N2吹洗10分鐘。將所得黃色懸浮液於110℃於密封管中攪拌20小時。LCMS顯示50%轉化率,因此將另外之NaI(720mg,4.80mmol)、CuI(45.8mg,0.24mmol)及反-N,N-二甲基環己烷二胺(68mg,0.40mmol)加入,其後以N2吹洗10分鐘。將所得黃色懸浮液於110℃於密封管中攪拌20小時。將混合物倒至水(20mL)中,再以EtOAc(10mL×3)萃取。將萃取物於真空中濃縮以得粗製材料,將其藉矽膠層析法以EtOAc之石油醚液(由0至20%)洗提予以純化,即得淡黃色油狀之產物(450mg,78%)。LCMS[M-tBu]304;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 7.70(d,J=8.0Hz,1H),7.12(d,J=7.0Hz,1H),6.94-6.82(m,1H),4.44(m,2H),3.62(t,J=5.5Hz,2H),2.81(br.s.,2H),1.50(s,9H)
實例113 6-((R)-((2R,3S,4R,5R)-3,4-二羥基-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-2-基)(羥基)甲基)吡啶-2(1H)-酮(III-4)
步驟1:(6-(苄氧基)吡啶-2-基)((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲酮(III-1)之合成
於-65℃將2.5M n-BuLi(0.662mL,1.66mmol)加至2-(苄氧基)-6-溴吡啶(437mg,1.66mmol)之無水THF(10mL)溶液中。將黃色漿液於-65℃攪拌1小時。將C-9(150mg,0.414mmol)之THF(1mL)溶液加入。將混合物於室溫攪拌1小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數起始材料被消耗且形成良好之新斑點。將混合物倒至水(20 mL)中,再以EtOAc(10mL×3)萃取。將萃取物以鹽水(10mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮以得粗製材料且直接用於下一步驟中。LCMS[M+1]487。
步驟2:(R)-(6-(苄氧基)吡啶-2-基)((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲醇(III-2)之合成
將淡黃色之粗製III-1(411mg,0.41mmol)之EtOAc(2.5mL)及2.5M水性甲酸鈉(11.6mL,29mmol)混合液以N2吹洗5分鐘。於室溫(20℃)將Ru(對異丙基甲苯)[(R,R)TsDPEN](30mg,0.047mmol)加至混合物中。將所得黃色混合物於N2下、於室溫(20℃)攪拌20小時。將混合物以EtOAc(10mL×3)萃取。將萃取物以鹽水(10mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥再於真空中濃縮。將殘留物藉矽膠層析法以EtOAc之石油醚液(由0至100%)洗提予以純化,得棕色膠狀物(80mg,兩步驟得40%)。LCMS[M+1]489;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.82(s,1H),7.65(t,J=7.8Hz,1H),7.47(d,J=7.0Hz,2H),7.38(t,J=7.3Hz,2H),7.34-7.29(m,2H),7.19(d,J=7.3Hz,1H),7.05(d,J=2.3Hz,1H),6.74(d,J=8.3Hz,1H),6.60(d,J=3.8Hz,1H),5.93(d,J=5.0Hz,1H),5.39(d,J=2.8Hz,2H),5.34-5.32(m,1H),5.09-5.03(m,2H),4.94(s,1H),2.77(s,3H),1.61(s,3H),1.29(s,3H)
步驟3:6-((R)-((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(羥基)甲基)吡啶-2(1H)-酮(III-3)之合成
III-2(80mg,0.16mmol)及Pd/C(35mg,0.0164mmol)之MeOH(4mL)混合液以H2脫氣四次。將混合物於室溫(15℃)於H2氣球下攪拌16小時。LCMS顯示大多數起始材料被消耗且主峰為期望化合物。將混合物過濾,再於真空中濃縮。將殘留物藉prep-TLC予以純化,得棕色膠狀之產物(60mg,92%)。LCMS[M+1]399;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 10.53(br.s,1H),8.74(s,1H),8.36(br.s.,1H),7.43(t,J=9.3Hz,1H),7.24(d,J=3.8Hz,1H),6.60(d,J=3.8Hz,1H),6.51(d,J=9.0Hz,1H),6.20(d,J=7.0Hz,1H),5.85(d,J=5.0Hz,1H),5.21(t,J=5.5Hz,1H),5.03(s,1H),4.85(d,J=6.3Hz,1H),4.65(s,1H),2.78(s,3H),1.61(s,3H),1.31(s,3H)
步驟4:6-((R)-((2R,3S,4R,5R)-3,4-二羥基-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-2-基)(羥基)甲基)吡啶-2(1H)-酮(III-4)之合成
將TFA/H2O(1mL/1mL,已事先冷卻至0℃)加至III-3(60mg,0.151mmol)中。將混合物於室溫(25℃)攪拌2小時。LCMS顯示大多數起始材料被消耗且觀察到峰(0.15min)。將混合物倒至20% K2CO3(10mL)中。將水性相以NaCl飽和,再以EtOcA/THF(5mL/5mL×6)萃取。將萃取 物於硫酸鈉上乾燥過夜。將混合物過濾,再於真空中濃縮以得粗製材料,將其藉prep-HPLC予以純化,即得產物(25mg,43%)。LCMS[M+1]359;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 11.43(br.s,1H),8.70(s,1H),7.83(d,J=3.8Hz,1H),7.47-7.36(m,1H),6.84(d,J=3.5Hz,1H),6.32(br.s,2H),6.19(d,J=7.8Hz,2H),5.31(br.s,2H),4.60(s,1H),4.53-4.45(m,1H),4.16-4.05(m,2H),2.68(s,3H)
實例114(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-(4-氟-3-(羥甲基)苯基)(羥基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(JJJ-5)
步驟1:(3-溴-4-氟苯基)((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲酮(JJJ-1)之合成
於-60℃將1.3M i-PrMgCl.LiCl(3.4mL,4.4mmol)加 至無色之(3-溴-4-氟苯基)溴化鎂(1g,3.3mmol)之無水THF(10mL)溶液中。將混合物於-20°-40℃攪拌1小時,其中反應轉為黃色。將C-9(400mg,1.1mmol)之THF(6mL)液加入,混合物變為紅色,再於0℃攪拌1小時。TLC(DCM/MeOH=20:1,UV)顯示反應完成。以水性NH4Cl(50mL)令混合物之反應中止,再以EtOAc(40mL×3)萃取。將結合之有機層於真空中濃縮,得黃色油狀之粗製產物(445mg,85%),其係直接用於下一步驟。LCMS[M+1]476
步驟2:(R)-(3-溴-4-氟苯基)((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲醇(JJJ-2)之合成
將粗製JJJ-1(445mg,0.93mmol)及甲酸鈉(2540mg,37.4mmol)之EtOAc/H2O(3.2mL/12mL)溶液以N2吹洗30分鐘,然後將Ru(對異丙基甲苯)[(R,R)TsDPEN](30mg,0.047mmol)加入。將所得黃色混合物於室溫(25℃)攪拌24小時。TLC(DCM/MeOH=20:1,UV)顯示起始材料完全被消耗且形成新斑點(期望化合物)。將反應以EtOAc(40mL×3)萃取。將萃取物於真空中濃縮以得粗製產物,將其藉矽膠層析法(石油醚/EtOAc=10-60%)予以純化,得棕色固狀之JJJ-2(300mg,67%)。LCMS[M+1]478;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.80(s,1H),7.77(td,J=0.9,7.7Hz,1H),7.50(s,1H),7.45-7.38(m, 1H),7.25(d,J=3.5Hz,1H),7.17(t,J=8.4Hz,1H),6.60(d,J=3.8Hz,1H),5.83(d,J=5.0Hz,1H),5.32-5.24(m,1H),5.11(s,1H),4.93(dd,J=1.3,6.3Hz,1H),4.59-4.56(m,1H),2.78(s,3H),1.59(s,3H),1.29(br.s.,3H)
步驟3:5-((R)-((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(羥基)甲基)-2-氟苯甲酸甲酯(JJJ-3)之合成
JJJ-2(150mg,0.31mmol)之MeOH(10mL)及DMF(5mL)溶液裝至密封管內。將Pd(OAc)2(49mg,0.22mmol)、DPPP(91mg,0.22mmol)其後Et3N(95mg,0.94mmol)加入。將反應脫氣,再以CO吹洗三次。將反應混合物於120℃於3MPa之CO下加熱16小時。TLC(DCM/MeOH=20:1,UV)顯示餘留約50%的起始材料且主要新斑點為期望產物。令反應停止,再將溶劑移除。將殘留物藉急驟管柱予以純化,得JJJ-3(26mg,27%)及起始材料(50mg)。LCMS[M+1]458;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.81(s,1H),8.12-8.08(m,1H),7.71(d,J=4.5Hz,1H),7.53-7.50(m,1H),7.26-7.18(m,2H),6.60(d,J=3.8Hz,1H),5.83(d,J=5.3Hz,1H),5.29(t,J=5.6Hz,1H),5.16(s,1H),4.95-4.90(m,1H),4.60(s,1H),3.96(s,3H),2.78(s,3H),1.58(s,3H),1.28(s,3H)
步驟4:(R)-((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(4-甲基-7H- 吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)(4-氟-3-(羥甲基)苯基)甲醇(JJJ-4)之合成
於0℃於N2下將LAH(7mg,0.17mmol)一次地加至JJJ-3(26mg,0.06mmol)之無水THF(1mL)溶液中。將所得黃色懸浮液於10℃攪拌2小時。TLC(DCM/MeOH=20:1,UV)顯示反應差不多完成,然後以EtOAc令反應中止,攪拌30分鐘。將混合物通過矽藻土(celite)過濾,再濃縮。將殘留物藉prep-TLC予以純化,得白色固狀之產物JJJ-4(15mg,61%)。LCMS[M+1]430
步驟5:(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-(4-氟-3-(羥甲基)苯基)(羥基)甲基)-5-(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(JJJ-5)之合成
將TFA(0.1mL)加至JJJ-4(15mg,0.04mmol)之水(0.2mL)溶液中,然後將反應於5℃攪拌3小時。LCMS顯示反應完成,再將溶劑於真空中移除。將殘留物溶於MeOH(1mL)中,再將K2CO3(6mg)加入且於室溫(8℃)攪拌30分鐘。將溶劑移除,再將殘留物以EtOAc稀釋,再以水(5mL×2)清洗。將有機層於硫酸鈉上乾燥,於真空中濃縮,再藉prep-TLC予以純化,即得白色固狀之JJJ-5(3mg,20%)。LCMS[M+1]390;1H NMR(400MHz,MeOD)δ ppm 8.65(s,1H),7.64(d,J=3.5Hz,1H),7.59(d,J=5.8Hz,1H),7.44-7.38(m,J=4.5Hz,1H),7.09-7.03(m,1H),6.77(d,J=3.8Hz,1H),6.15(d,J=7.5Hz,1H),5.00(d,J=2.8 Hz,1H),4.79(dd,J=5.0,7.3Hz,1H),4.67(s,2H),4.30-4.27(m,2H),2.75(s,3H)
實例115(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-(4-氯-3-氟苯基)(羥基)甲基)-5-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(KKK-4)
步驟1:(3aS,4S,6R,6aR)-N-甲氧基-N,2,2-三甲基-6-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-甲醯胺(KKK-1)之合成
MM-3(1g,2.6mmol)及Pd/C(200mg)之MeOH(30mL)混合液以H2脫氣四次。將混合物於室溫(25℃)於H2氣球下攪拌2小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數的起始材料被消耗且形成良好的斑點。將混合物過濾,再於真空中濃縮。將殘留物藉矽膠層析法以EtOAc之石油醚液(由0至100%)然後10% MeOH之DCM液洗提予以純化,得黃色膠狀之產物KKK-1(530mg,58%)。LCMS [M+1]349;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.99(br.s.,1H),8.91(br.s.,1H),7.65(br.s.,1H),6.72(d,J=2.0Hz,1H),6.61(d,J=3.8Hz,1H),5.35-5.26(m,1H),5.25-5.16(m,2H),3.69(s,3H),3.18(s,3H),1.68(s,3H),1.41(s,3H)
步驟2:(4-氯-3-氟苯基)((3aS,4S,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲酮(KKK-2)之合成
於0℃將(4-氯-3-氟苯基)溴化鎂(2.0mL,1.0mmol)加至KKK-1(265mg,0.76mmol)之無水THF(5mL)溶液中。將混合物於0℃攪拌1小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數起始材料被消耗且形成良好的斑點。以水性NH4Cl(5mL)令混合物之反應中止,再以EtOAc(5mL×3)稀釋。將有機層以鹽水(10mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮,得黃色油狀之粗製材料KKK-2(380mg,>99%),其係直接用於下一步驟中。LCMS[M+1]418;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.86(s,1H),8.68(s,1H),7.57-7.47(m,2H),7.38-7.30(m,1H),7.24(d,J=3.8Hz,1H),6.52(d,J=3.8Hz,1H),6.39(s,1H),5.80-5.72(m,1H),5.51(d,J=6.0Hz,1H),5.35(d,J=1.8Hz,1H),1.70(s,3H),1.46(s,3H)
步驟3:(R)-(4-氯-3-氟苯基)((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基 -6-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲醇(KKK-3)之合成
將淡黃色之KKK-2(75mg,0.16mmol)之EtOAc(0.5mL)及2.5M水性甲酸鈉(4mL,10mmol)混合液以N2吹洗1小時。於室溫(25℃)將Ru(對異丙基甲苯)[(R,R)TsDPEN](10mg,0.02mmol)加至混合物中。將所得黃色混合物於N2下於室溫(25℃)攪拌20小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數起始材料被消耗。將混合物以EtOAc(1mL×2)萃取。將萃取物藉prep-TLC(石油醚/EtOAc=1:1)予以純化,得白色固狀之產物KKK-3(25mg,38%)。LCMS[M+1]420;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 9.07(s,1H),8.92(s,1H),7.47-7.36(m,2H),7.31(d,J=3.8Hz,1H),7.25-7.20(m,2H),6.62(d,J=3.8Hz,1H),5.85(d,J=5.3Hz,1H),5.29(t,J=5.6Hz,1H),5.12(s,1H),4.92(d,J=6.0Hz,1H),4.58(s,1H),1.59(s,3H),1.29(s,3H)
步驟4:(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-(4-氯-3-氟苯基)(羥基)甲基)-5-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(KKK-4)之合成
將KKK-3(25mg,0.06mmol)冷卻至0℃,再將TFA/H2O(各1mL)加入。將混合物於室溫(25℃)攪拌2小時。LCMS顯示大多數起始材料被消耗。將混合物倒至20% K2CO3(10mL)中,再以EtOAc(10mL×2)萃取。將萃 取物以鹽水(10mL×2)清洗,於硫酸鎂上乾燥,再於真空中濃縮。將產物凍乾,即得白色固狀物(20mg,88%).LCMS[M+1]380;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 9.05(s,1H),8.81(s,1H),7.89(d,J=3.8Hz,1H),7.52(t,J=7.9Hz,1H),7.40(d,J=12.0Hz,1H),7.27(d,J=8.5Hz,1H),6.75(d,J=3.5Hz,1H),6.21(d,J=7.5Hz,1H),6.17(d,J=4.8Hz,1H),5.33(d,J=7.0Hz,1H),5.17(d,J=4.3Hz,1H),4.83(t,J=4.9Hz,1H),4.64-4.56(m,1H),4.16-4.10(m,1H),4.02(d,J=5.0Hz,1H)
實例116(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-胺基(4-氯-3-氟苯基)甲基)-5-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(LLL-4)
步驟1:(S)-(4-氯-3-氟苯基)((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二 氧呃-4-基)甲醇(LLL-1)之合成
將化合物JJJ-2(295mg,0.61mmol)之EtOAc(2mL)及2.5M水性甲酸鈉(16mL,40mmol)液以N2吹洗1小時。於室溫(25℃)將Ru(對異丙基甲苯)[(S,S)TsDPEN](40mg,0.06mmol)加至混合物中。將所得黃色混合物於N2下於室溫攪拌20小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數起始材料被消耗且形成良好的斑點。將混合物以EtOAc(5mL×2)萃取。將萃取物以鹽水(5mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再於真空中濃縮,得粗製材料。(HNMR顯示兩種異構物的比值為2.3:1)。將粗製材料藉矽膠層析法以EtOAc之石油醚液(由0至60%)洗提予以純化,得白色固狀之產物LLL-1(110mg,43%)。LCMS[M+1]420;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 9.06(s,1H),8.97(s,1H),7.30(d,J=7.5Hz,1H),7.22(d,J=3.5Hz,1H),7.14(d,J=10.0Hz,1H),7.07(d,J=10.8Hz,2H),6.58(d,J=3.5Hz,1H),5.80(d,J=4.0Hz,1H),5.31-5.22(m,2H),5.02(d,J=11.0Hz,1H),4.68(s,1H),1.66(s,3H),1.41(s,3H)。
步驟2:2-((R)-(4-氯-3-氟苯基)((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲基)異吲哚啉-1,3-二酮(LLL-2)之合成
於0℃將DIAD(80mg,0.393mmol)加至LLL-1(110mg,0.26mmol)、酞醯亞胺(58mg,0.39mmol)及 PPh3(103mg,0.39mmol)之無水THF(2mL)溶液中。將混合物於室溫(25℃)於N2下攪拌20小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數起始材料被消耗。將混合物藉prep-TLC(石油醚/EtOAc=1:1)予以純化,得淡黃色固狀之產物LLL-2(95mg,66%)。LCMS[M+1]549;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 9.05(s,1H),9.01(s,1H),7.92-7.83(m,2H),7.76(dd,J=3.0,5.5Hz,2H),7.22-7.14(m,3H),6.98(d,J=8.5Hz,1H),6.57(d,J=3.8Hz,1H),6.19(s,1H),5.76(d,J=10.8Hz,1H),5.57-5.39(m,2H),5.18(dd,J=3.9,6.1Hz,1H),1.62(s,3H),1.31(s,3H)
步驟3:(R)-(4-氯-3-氟苯基)((3aR,4R,6R,6aR)-2,2-二甲基-6-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲胺(LLL-3)之合成
將85% N2H4.H2O(0.5mL)加至淡黃色之LLL-2(90mg,0.16mmol)之EtOH(2mL)懸浮液中。將所得黃色溶液於室溫(25℃)攪拌16小時。TLC(石油醚/EtOAc=1:1)顯示大多數起始材料被消耗。將混合物藉pre-TLC(石油醚/EtOAc=1:1)予以純化,得白色固狀之產物LLL-3(50mg,72.8%)。LCMS[M+1]419;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 9.01(s,1H),8.90(s,1H),7.33(t,J=7.9Hz,1H),7.25(d,J=3.8Hz,1H),7.15(dd,J=1.9,10.2Hz,1H),7.03(d,J=8.0Hz,1H),6.61(d,J=3.8Hz,1H),6.10(d,J=3.8Hz,1H),5.42(dd,J=3.6,6.7Hz,1H),5.15(dd,J=3.5,6.8 Hz,1H),4.35-4.13(m,2H),1.58(s,3H),1.34(s,3H)
步驟4:(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-胺基(4-氯-3-氟苯基)甲基)-5-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(LLL-4)之合成
將TFA/H2O(各1mL,已事先冷卻至0℃)加至LLL-3(50mg,0.12mmol)中。將混合物於室溫(25℃)攪拌2小時。LCMS顯示大多數起始材料被消耗且主峰為期望化合物。將混合物倒至20% K2CO3(10mL)中,以鹽水(10mL)稀釋,再以EtOAc(10mL×3)萃取。將萃取物以鹽水(10mL×2)清洗,於硫酸鎂上乾燥,過濾,再於真空中濃縮。將產物LLL-4凍乾,即得白色固狀物(30mg,66%)。LCMS[M+1]379;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 9.03(s,1H),8.79(s,1H),7.84(d,J=3.8Hz,1H),7.51-7.39(m,2H),7.24(d,J=8.0Hz,1H),6.71(d,J=3.8Hz,1H),6.12(d,J=7.3Hz,1H),5.34(d,J=6.5Hz,1H),5.15(br.s.,1H),4.66-4.54(m,1H),4.24(br.s.,1H),4.09(d,J=6.8Hz,1H),3.95(dd,J=2.1,6.9Hz,1H)。
實例117(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)-5-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇
實例117係以類似於實例115(反應圖KKK)之程序製備,惟於步驟2中使用3,4-二氟苯基溴化鎂步驟2。
LCMS[M+1]364;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 9.04(s,1H),8.80(s,1H),7.88(d,J=3.8Hz,1H),7.45-7.28(m,2H),7.24(br.s.,1H),6.74(d,J=3.8Hz,1H),6.20(d,J=7.5Hz,1H),6.12(d,J=4.3Hz,1H),5.32(d,J=7.0Hz,1H),5.15(d,J=4.0Hz,1H),4.80(t,J=4.9Hz,1H),4.59(d,J=5.0Hz,1H),4.13(t,J=4.9Hz,1H),4.00(d,J=4.5Hz,1H)
實例118(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-胺基(3,4-二氟苯基)甲基)-5-(7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇
實例118係以類似於實例116(反應圖LLL)之程序製備,惟使用實例117(反應圖KKK)步驟2之3,4-二氟苯基溴化鎂。
LCMS[M+1]363;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 9.02(s,1H),8.78(s,1H),7.81(d,J=3.8Hz,1H),7.47-7.38(m,1H),7.28(dd,J=8.3,10.8Hz,1H),7.21(br.s.,1H),6.70(d,J=3.5Hz,1H),6.11(d,J=7.3Hz,1H),5.33(d,J=6.5Hz,1H),5.13(br.s.,1H),4.56(d,J=5.5Hz,1H),4.22(d,J=3.3Hz,1H),4.08(d,J=6.5Hz,1H),3.94(dd,J=2.1,6.7Hz,1H)
實例119(2R,3R,4S,5R)-2-(4-胺基-5-碘-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(MMM-6)
步驟1:(S)-(3,4-二氟苯基)((3aR,4R,6R,6aR)-6-甲氧基-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲醇(MMM-2)之合成
(3aR,4S,6R,6aR)-6-甲氧基-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-甲醛MMM-1係使用Tetrahedron, 2013,10581-10592 and Organic Letters,Vol.4,No.17,2002,3001之二步驟文獻程序製備。於20℃於N2下將Et2Zn(70.9mL,1M之甲苯液,70.9mmol)徐緩地加至白色之(3,4-二氟苯基)酸(3.2g,20.26mmol)之無水甲苯(79mL)懸浮液中。將混合物於60℃加熱1小時,大多數的白色固狀物溶解。然後於60℃將MMM-1(4.1g,20.3mmol)之甲苯(5mL)溶液徐緩地加入。將混合物於60℃攪拌另1.5小時。TLC(石油醚:EtOAc=1:1,PMA染料)顯示起始材料被消耗且偵測到新斑點。於10℃徐緩地藉水(40mL)令混合物之反應中止,且黃色固狀物形成。將混合物以EtOAc(50mL)稀釋。將濾液分離出,再將水性相以EtOAc(50mL)萃取。將結合之有機層以鹽水(100mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,過濾再濃縮以得黃色油狀之粗製產物,將其藉ISCO(矽膠,石油醚:EtOAc=4:1)予以純化,得4g黃色油狀之MMM-2(63%產率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 7.26-7.01(m,3H),4.98(s,1H),4.89(d,J=6.0Hz,1H),4.70-4.65(m,2H),4.63(d,J=4.0Hz,1H),4.03(d,J=9.0Hz,1H),3.39(s,3H),1.48(s,3H),1.33(s,3H)
步驟2:苯甲酸(R)-(3,4-二氟苯基)((3aR,4R,6R,6aR)-6-甲氧基-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲酯(MMM-3)之合成
於0℃於N2下將DIAD(3840mg,19mmol)加至 MMM-2(4g,12.65mmol)、PhCOOH(2.32g,19mmol)、PPh3(4.98g,19mmol)之甲苯(90mL)混合液中。將黃色溶液於20℃攪拌3小時。TLC(石油醚:EtOAc=4:1)顯示起始材料被消耗且偵測到較低極性的斑點。將混合物以EtOAc(50mL)稀釋,再以飽和Na2CO3(50mL×2)、鹽水(50mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再過濾。將濾液濃縮以得無色油狀之粗製產物,將其藉ISCO(矽膠,EtOAc/石油醚=12%)予以純化,得4.3g無色膠狀之MMM-3(81%產率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.06(dd,J=1.3,8.3Hz,2H),7.61-7.59(m,1H),7.47(d,J=8.0Hz,2H),7.37-7.28(m,1H),7.25-7.08(m,2H),5.93(d,J=9.3Hz,1H),4.94(s,1H),4.89-4.83(m,1H),4.74-4.68(m,1H),4.67-4.61(m,1H),3.21(s,3H),1.50(s,3H),1.33(s,3H);HRMS m/z C22H22F2O6[M+23]443。
步驟3:苯甲酸(IR)-(3,4-二氟苯基)((2S,3S,4R)-3,4,5-tri羥基四氫呋喃-2-基)甲酯(MMM-4)之合成
將MMM-3(1060mg,2.521mmol)之10mL三氟乙酸及5mL蒸餾水溶液於室溫攪拌過夜。將反應混合物藉飽和NaHCO3中和,以EtOAc萃取3次,將有機層結合,以鹽水清洗,於硫酸鈉上乾燥,濃縮,藉管柱層析法以100% EtOAc洗提予以純化,得0.9g(97%產率)白色固狀之MMM-41H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 2.61(d,J=6.36Hz,1 H)2.90(d,J=7.34Hz,1 H)3.46(d,J=6.85Hz, 1 H)3.98-4.07(m,1 H)4.15-4.23(m,1 H)4.49-4.55(m,1 H)5.35(dd,J=6.72,4.28Hz,1 H)6.07(d,J=5.01Hz,1 H)7.14-7.24(m,2 H)7.28-7.36(m,1 H)7.49(t,J=7.70Hz,2 H)7.62(t,J=7.46Hz,1 H)8.05-8.10(m,2 H)
步驟4:苯甲酸(R)-((2S,3S,4R,5R)-5-(4-氯-5-碘-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3,4-二羥基四氫呋喃-2-基)(3,4-二氟苯基)甲酯(MMM-5)之合成
於室溫將吡啶(21.6mg,0.27mmol,0.02mL)加至4-氯-5-碘-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(76.2mg,0.27mmol)之10ml THF溶液中,於室溫將偶氮二甲酸二異丙酯(116.0mg,0.57mmol)其後三正丁基膦(114mg,0.546mmol)加入,將MMM-4(100mg,0.27mmol)一次地加入。將反應於室溫攪拌30分鐘。將反應混合物濃縮,將EtOAc及H2O加入,以EtOAc萃取3次,將有機層結合,以鹽水清洗,於硫酸鈉上乾燥,濃縮,藉逆相製備HPLC予以純化,得60mg(35%產率)白色固狀之MMM-5。LCMS[M+1]627.9;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 4.56(dd,J=5.32,2.75Hz,1 H)4.62-4.73(m,2 H)6.06(d,J=5.26Hz,1 H)6.38(d,J=4.28Hz,1 H)7.15-7.24(m,2 H)7.24-7.32(m,3 H)7.38(t,J=7.76Hz,2 H)7.55(t,J=7.46Hz,1 H)7.90-7.97(m,2 H)8.48(s,1 H)
步驟5:(2R,3R,4S,5R)-2-(4-胺基-5-碘-7H-吡咯并[2,3-d] 嘧啶-7-基)-5-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(MMM-6)之合成
將MMM-5(23mg,0.037mmol)溶於1mL二烷中,將1mL氫氧化銨溶液加入。將反應容器密封,再於100℃加熱過夜。冷卻至室溫後,將反應混合物濃縮,再溶於MeOH中,藉逆相製備HPLC予以純化,即得15.8mg(86%產率)白色固狀之MMM-6。LCMS[M+1]505.0;1H NMR(400MHz,MeOD)δ ppm 4.17(dd,J=5.26,1.83Hz,1 H)4.20-4.27(m,1 H)4.69(dd,J=7.09,5.38Hz,1 H)4.96(d,J=2.81Hz,1 H)5.96(d,J=7.09Hz,1 H)7.20-7.27(m,2 H)7.34-7.41(m,1 H)7.42(s,1 H)8.10(s,1 H)
實例120(2R,3R,4S,5R)-2-(2-胺基-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(NNN-6)
步驟1:(S)-(4-氯-3-氟苯基)((3aR,4R,6R,6aR)-6-甲氧基-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲醇(NNN-1)之合成
於20℃於N2下將Et2Zn(71.3mL,1M之甲苯液,71.3mmol)徐緩地加至白色之(4-氯-3-氟苯基)酸(3550mg,20.36mmol)之無水甲苯(92mL)懸浮液中。將混合物於60℃加熱1小時。白色固狀物溶解且混合物轉為清澈。然後於60℃將MMM-1(4.11g,20.33mmol)之甲苯(10mL)溶液徐緩地加入。將混合物於60℃攪拌另1.5小時。混合物轉為黃色。TLC(石油醚:EtOAc=2:1,PMA 染料,Rf~0.6)顯示起始材料被消耗且偵測到新斑點。於10℃徐緩地藉水(40mL)令混合物之反應中止且黃色固狀物形成。將混合物以EtOAc(80mL)稀釋,再過濾。將濾液分離出,再以鹽水(30mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,過濾再濃縮以得黃色油狀之粗製產物。將粗製產物藉ISCO(矽膠,石油醚:EtOAc=4:1)予以純化,得3.75g無色膠狀之NNN-1(55%產率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 7.40(t,J=7.9Hz,1H),7.20(dd,J=1.8,10.0Hz,1H),7.13-7.05(m,1H),4.97(s,1H),4.91(d,J=6.3Hz,1H),4.75-4.62(m,3H),4.09(d,J=9.3Hz,1H),3.38(s,3H),1.49(s,3H),1.34(s,3H)
步驟2:苯甲酸(R)-(4-氯-3-氟苯基)((3aR,4R,6R,6aR)-6-甲氧基-2,2-二甲基四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧呃-4-基)甲酯(NNN-2)之合成
於0℃於N2下將DIAD(2.65g,13.1mmol)加至NNN-1(2.91g,8.745mmol)、hCOOH(1.6g,13.1mmol)、PPh3(3440mg,13.1mmol)之甲苯(60mL)混合液中。將黃色溶液於20℃攪拌3小時。TLC(石油醚:EtOAc=10:1)顯示起始材料被消耗且偵測到較怟極性的斑點。將混合物以EtOAc(60mL)稀釋,再以飽和Na2CO3(30mL×2)、鹽水(60mL)清洗,於硫酸鈉上乾燥,再過濾。將濾液濃縮以得黃色油狀之粗製產物。將粗製產物藉ISCO(矽膠,EtOAc:石油醚=0~10%)予以純化,得3.1g 無色膠狀之NNN-2(81%產率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 8.06(dd,J=1.3,8.5Hz,2H),7.63-7.56(m,1H),7.47(d,J=7.8Hz,2H),7.43-7.37(m,1H),7.31-7.27(m,1H),7.24-7.19(m,1H),5.96-5.90(m,1H),4.94(s,1H),4.88-4.85(m,1H),4.70(d,J=6.0Hz,1H),4.67-4.61(m,1H),3.22(s,3H),1.50(s,3H),1.33(s,3H)C22H22FClO6[M+23]+ HRMS m/z 459.0567
步驟3:(5-碘-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-基)胺基甲酸雙-三級丁酯(NNN-7)之合成
將N-碘琥珀醯亞胺(271mg,1.21mmol)加至(4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2-基)胺基甲酸雙-三級丁酯(350mg,1.00mmol)之5mL DMF溶液中,於室溫攪拌過夜。將EtOAc及H2O加至反應混合物以H2O清洗3次,濃縮,再藉管柱層析法以50% EtOAc/庚烷洗提予以純化,得288mg(60%產率)淡黃色固狀之NNN-7。LCMS[M+1]475.0;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 1.39(s,17 H)2.86(s,3 H)7.79(d,J=2.32Hz,1 H)12.54(br.s.,1 H)
步驟4:苯甲酸(1R)-(4-氯-3-氟苯基)((2S,3S,4R)-3,4,5-tri羥基四氫呋喃-2-基)甲酯(NNN-3)之合成
遵循類似於實例119步驟3之程序。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 2.61(br.s.,1 H)3.98-4.11(m,1 H)4.19(br.s.,1 H)4.48-4.56(m,1 H)5.28-5.39(m,1 H) 6.03-6.15(m,1 H)7.17-7.25(m,1 H)7.27-7.33(m,1 H)7.37-7.45(m,1 H)7.45-7.53(m,2 H)7.55-7.68(m,1 H)8.01-8.16(m,2 H)
步驟5:苯甲酸(R)-((2S,3S,4R,5R)-5-(2-((雙-三級丁氧基羰基)胺基)-5-碘-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3,4-二羥基四氫呋喃-2-基)(4-氯-3-氟苯基)甲酯(NNN-4)之合成
遵循類似於實例119步驟4之程序。LCMS[M+1]839.0。
步驟6:苯甲酸(R)-((2S,3S,4R,5R)-5-(2-胺基-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3,4-二羥基四氫呋喃-2-基)(4-氯-3-氟苯基)甲酯(NNN-5)之合成
將NNN-4(150mg,0.179mmol)溶於2.0mL THF中,於室溫將異丙基氯化鎂(64.9mg,0.447mmol,0.344mL,1.3M)加入,於室溫攪拌1小時。藉H2O令反應中止,將飽和NH4Cl及EtOAc加入,以EtOAc萃取3次,將有機層結合,以鹽水清洗,於硫酸鈉上乾燥,再濃縮。
將上述粗製材料之1mL DCM及1mL三氟乙酸溶液於室溫攪拌過夜。將反應混合物濃縮,將EtOAc加入,以水清洗,將有機層結合再濃縮,藉逆相製備HPLC予以純化,得44mg(兩步驟得48%)黃色油狀之NNN-5。LCMS[M+1]513.0。
步驟6:(2R,3R,4S,5R)-2-(2-胺基-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(4-氯-3-氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(NNN-6)之合成
遵循類似於實例119步驟5之程序。LCMS[M+1]408.9;1H NMR(700MHz,DMSO-d6)δ ppm 2.42(s,3 H)3.92(d,J=4.84Hz,1 H)4.07(br.s.,1 H)4.43-4.52(m,1 H)4.77(br.s.,1 H)5.00(d,J=3.74Hz,1 H)5.17(d,J=6.82Hz,1 H)5.97(d,J=7.48Hz,1 H)6.09(br.s.,2 H)6.12(d,J=4.40Hz,1 H)6.44(br.s.,1 H)7.20-7.29(m,1 H)7.38(d,J=10.34Hz,1 H)7.50(t,J=7.81Hz,1 H)
實例121(2R,3R,4S,5R)-2-(2-氯-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(OOO-2) 實例122(2R,3R,4S,5R)-2-(2-胺基-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(3,4-二氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(OOO-3)
步驟1:2-氯-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(OOO-4)之合成
將selectfluor(8.3g,23.4mmol)加至2-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(2.4g,15.63mmol)之MeCN(80mL)懸浮液中。將乙酸(8mL)加入,再將反應於70℃加熱17小時。將揮發物移除,再將殘留物溶於水中,以NaHCO3中和,再以EtOAc萃取3次。將有機相結合,濃縮,再將殘留物藉管柱層析法以40% EtOAc/庚烷洗提予以純化,得460mg(17%產率)白色固狀之OOO-4。LCMS[M+1]172.0;1H NMR(400MHz,MeOD)δ ppm 7.30(d,J=2.57Hz,1 H)8.89(s,1 H)
步驟2:苯甲酸(R)-(4-氯-3-氟苯基)((2S,3S,4R,5R)-5-(2-氯-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3,4-二羥基四氫呋喃-2-基)甲酯(OOO-1)之合成
遵循類似於實例119步驟4之程序。LCMS[M+1] 536.0;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ ppm 4.25-4.34(m,1 H)4.37(dd,J=6.24,3.55Hz,1 H)4.52(q,J=6.15Hz,1 H)5.53(d,J=5.50Hz,1 H)5.58(d,J=6.24Hz,1 H)6.13(d,J=6.11Hz,1 H)6.19(d,J=6.36Hz,1 H)7.36(d,J=8.56Hz,1 H)7.49-7.56(m,2 H)7.59(t,J=7.70Hz,2 H)7.67(d,J=1.71Hz,1 H)7.70-7.76(m,1 H)8.07(s,1 H)8.09(s,1 H)9.06(s,1 H)
步驟3:(2R,3S,4R,5R)-2-((R)-(4-氯-3-氟苯基)(羥基)甲基)-5-(2-氯-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)四氫呋喃-3,4-二醇(OOO-2)及(2R,3R,4S,5R)-2-(2-胺基-5-氟-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(4-氯-3-氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇(OOO-3)之合成
遵循類似於實例119步驟5之程序。
OOO-2 LCMS[M+1]432.0。1H NMR(700MHz,DMSO-d6)δ ppm 3.93(br.s.,1 H)4.05(br.s.,1 H)4.39(br.s.,1 H)4.72(br.s.,1 H)5.10-5.20(m,1 H)5.33(d,J=6.38Hz,1 H)5.94-6.03(m,1 H)6.04-6.13(m,1 H)7.19(d,J=7.70Hz,1 H)7.32(d,J=10.12Hz,1 H)7.44(t,J=7.15Hz,1 H)7.87(br.s.,1 H)9.02(br.s.,1 H)
OOO-3 LCMS[M+1]413.0;1H NMR(400MHz,MeOD)δ ppm 4.14-4.23(m,2 H)4.60(dd,J=6.97,5.26Hz,1 H)4.93(d,J=3.42Hz,1 H)5.96-6.03(m,1 H)7.02(d,J=2.08Hz,1 H)7.24(dd,J=8.19,1.83Hz,1 H) 7.35(dd,J=10.51,1.59Hz,1 H)7.43(t,J=7.89Hz,1 H)8.51(br.s.,1 H)
實例123(2R,3R,4S,5R)-2-(2-胺基-5-氟-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(4-氯-3-氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇乙酸鹽(PPP-2)
步驟1:2,4-二氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-羧酸三級丁酯(PPP-3)之合成
將4-二甲胺基吡啶(650mg,5.32mmol)、Boc酐(8710mg,39.9mmol)及二異丙基乙胺(4120mg,31.9mmol)接續地加至己攪拌之2,4-二氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(5000mg,26.59mmol)之二氯甲烷(50ml)懸浮液中,再將混合物於室溫攪拌2小時。將溶劑於減壓下移除以得 粗製產物,將其藉管柱層析法以二氯甲烷洗提予以純化,得5.4g(70.5%產率)黃色固狀之PPP-3。LCMS[M+1-2Cl-Boc]120.1;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 1.70(s,9 H)6.66(d,J=4.03Hz,1 H)7.71(d,J=4.16Hz,1 H)
步驟2:2-氯-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-羧酸三級丁酯(PPP-4)之合成
將四氫呋喃(50ml)加至PPP-3(4600mg,15.96mmol)、三甲基環硼氧烷(5010mg,39.9mmol)、磷酸鉀(6780mg,31.9mmol)及PdCl2(PPh3)2(1120mg,1.60mmol)中,再將混合物脫氣,密封,再於100℃加熱至迴流1.5小時。將反應冷卻室室溫,將溶劑蒸發,將二氯甲烷及H2O加至殘留物中,分層,將水性層以二氯甲烷處理3次,將有機層結合,再濃縮以得粗製產物,將其藉管柱層析法以10% EtOAc/DCM洗提予以純化,得2.5g(58.5%產率)灰白色固狀之PPP-4。LCMS[M+1-Cl-Boc]134.1;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 1.69(s,9 H)2.72(s,3 H)6.58(d,J=4.03Hz,1 H)7.62(d,J=4.03Hz,1 H)
步驟3:2-氯-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(PPP-5)之合成
將甲醇鈉25wt%之甲醇液(2350mg,10.9mmol,2.49mL)逐滴加至已冷卻(冰浴)之PPP-4(1940mg,7.246mmol)之四氫呋喃(60mL,c=0.12M)溶液中。將反應於冰 浴中攪拌10分鐘,其後將水加入。將混合物以EtOAc(3×25mL)萃取。將結合之有機相以鹽水清洗,然後於硫酸鎂上乾燥,過濾再濃縮。將固狀物以DCM研磨,過濾,再以DCM潤洗,得1.13g(93%產率)黃色固狀之PPP-5。LCMS[M+1-Cl]134.1;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ ppm 2.77(s,3 H)6.61(dd,J=3.67,1.96Hz,1 H)7.32(dd,J=3.55,2.32Hz,1 H)10.36(br.s.,1 H)
步驟4:2-氯-5-氟-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(PPP-6)之合成
遵循類似於實例121實例122之步驟1的程序。LCMS[M+1]186.0;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)d ppm 2.70(s,3 H)7.53(t,J=2.32Hz,1 H)12.14(br.s.,1 H)
步驟5:苯甲酸(R)-(4-氯-3-氟苯基)((2S,3S,4R,5R)-5-(2-氯-5-氟-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-3,4-二羥基四氫呋喃-2-基)甲酯(PPP-1)之合成
遵循類似於實例119步驟4之程序。LCMS[M+1]550.0;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)d ppm 2.68(s,3 H)4.23-4.31(m,1 H)4.35(dd,J=6.17,3.48Hz,1 H)4.50(q,J=5.79Hz,1 H)5.51(d,J=5.38Hz,1 H)5.56(d,J=6.11Hz,1 H)6.09(d,J=6.11Hz,1 H)6.17(d,J=6.11Hz,1 H)7.34(dd,J=8.25,1.65Hz,1 H)7.47-7.54(m,2 H)7.54-7.61(m,3 H)7.68-7.76(m,1 H)8.03-8.10(m,2 H)
步驟6:(2R,3R,4S,5R)-2-(2-胺基-5-氟-4-甲基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-((R)-(4-氯-3-氟苯基)(羥基)甲基)四氫呋喃-3,4-二醇乙酸鹽(PPP-2)之合成
遵循類似於實例119步驟5之程序。LCMS[M+1]427.0;1H NMR(400MHz,MeOD)δ ppm 1.99(s,3 H)2.56(s,3 H)4.15-4.21(m,2 H)4.62(dd,J=6.97,5.01Hz,1 H)4.93(d,J=3.18Hz,1 H)5.94(d,J=6.97Hz,1 H)6.94(d,J=2.08Hz,1 H)7.23(dd,J=8.25,1.77Hz,1 H)7.34(dd,J=10.51,1.59Hz,1 H)7.41(t,J=7.89Hz,1 H)
生物學實例 生化分析法
將化合物溶解於DMSO中,再以50倍地大於期望分析濃度的濃度使用3倍稀釋地系列稀釋至100% DMSO中。稀釋後,將1ul加至空的96孔式微滴定盤中。將PRMT5/MEP50蛋白複合體與H4(1-21)肽(SGRGKGGKGLGKGGAKRHRKV)於PRMT5分析緩衝液(50mM Tris pH 8.5,50mM NaCl,5mM MgCl2,1mM EDTA,1mM TCEP)中結合,再將44ul加至含有化合物之微滴定盤中。S-腺苷基-L-甲硫胺酸(SAM)係藉將標記3H之SAM與未標記之SAM於PRMT5分析緩衝液中結合以使最終SAM濃度為10uM且比活性為0.2uCi/ul而製得。藉將5ul SAM儲液加至微滴定盤中令反應開始。最 終反應條件為10nM PRMT5/MEP50複合體、200nM肽及1uM SAM。於室溫培育25分鐘後,加入100uL 20% TCA令反應停止。使用96孔式過濾盤(MSIPN4B,Millipore)以捕獲3H-肽產物,再以PBS緩衝液清洗5次。將閃爍液(100ul)加至已乾燥之過濾盤中,再於液體閃爍計數器中計數。IC50值係藉使用煇瑞專屬軟體(Pfizer proprietary software)將數據擬合至標準4-參數劑量反應方程式中而測得。
諸實例之生化分析結果總結於表1中,以IC50(單位為μM)顯示。
A549增殖分析法
將A549肺腺癌細胞(American Type Culture Collection)保持於補充有10% v/v熱去活化胎牛血清(Sigma)之DMEM生長培養基(Life Technologies)中,再於37℃、5% CO2培養。將指數生長之A549細胞以2500個細胞/毫升的密度、100μl培養基的量塗佈於96孔式黑組織培養處理盤(Corning)中,再令其於37℃、5% CO2黏著過夜。隔天,化合物盤係藉製成九點3.3倍於DMSO中之稀釋濃度連同10mM之最高濃度製得。將化合物於培養基中進一步稀釋,再將11μl加至細胞中(最終之最高分析濃度為10μM且DMSO為0.2%)。將細胞與化合物於37 ℃、5%CO2培育7天,且於第4天替換培養基及化合物。細胞存活力係於第7天藉將100μl Cell Titer Glo(Promega)試劑加至盤中以測量細胞中存在的ATP量進行分析。冷光係使用Envision 2104 Multilabel Reader(Perkin Elmer)讀數。50%抑制濃度(IC50)係於劑量反應中使用常態化至DMSO對照組的4參數擬合模型測得。
諸實例之A549增殖分析法結果總結於表2中,以IC50值(單位為μM)顯示。
分子生物學
將編碼全長PRMT5開放閱讀框(ORF)的基因於Ala2 直接融入編碼Flag標籤之MDYKDDDDKGRAT序列中(SEQ ID:1),且將全長未標籤化之MEP50(SEQ ID:2)予以密碼子最適化以供哺乳動物之表現及藉GenScript,Piscataway,NJ合成。使用標準之以限制酶為基底之選殖步驟將所合成之基因選殖至昆蟲細胞表現載體pFASTBac Dual(Life Technologies)中。在最後的建構中,PRMT5 ORF在多角體蛋白啟動子(polH)的控制之下,而MEP50 ORF在p10啟動子的控制之下。此外,使用標準之以限制酶為基底之選殖步驟將MEP50(SEQ ID:2)次選殖至pFASTBac1載體中。
蛋白表現
使用標準Bac-to-Bac病毒產生擬案(Life Technologies)以產生病毒,再擴增至高滴價的第二代(P2)儲液。蛋白過度表現係於被P2病毒儲液以MOI=1感染之指數生長之Sf21細胞(2×106)中進行,該病毒儲液為1:1比值之PRMT5-Mep50雙重建構病毒及Mep50建構病毒。共同表現擬案係用以補充額外之Mep50以供FlagPRMT5-Mep50雜二聚物之形成。將細胞於感染後72小時藉離心法採收,再將冷凍之丸粒貯存於-80 0C。
蛋白純化
使用Flag親合層析法將FlagPRMT5-Mep50複合體由細胞溶解產物中純化。將細胞於補充有不含EDTA之蛋白 酶混合抑制劑(EDTA-free protease inhibitor cocktail)(Roche)的50mM Tris 7.5、200mM NaCl、10%甘油、0.25mM TCEP中溶解。每1克冷凍丸粒中加入1.5ml溶解緩衝液。澄清的溶解產物係藉將細胞溶解產物於4 C以10,000g之速離心1小時而得。將5ml分離用之抗-FLAG M2瓊脂糖(Anti-FLAG M2 Agarose(Sigma))3小時加至澄清之溶解產物中以分離出FlagPRMT5-Mep50。於4 C批次結合3小時後,將結合至FlagPRMT5-Mep50的Flag樹脂以20管柱體積(CV)的50mM Tris 7.5、200mM NaCl、10%甘油、0.25mM TCEP清洗,其後將FlagPRMT5-Mep50複合體使用補充有200ug/ml FLAG肽(DYKDDDDK)之50mM Tris 7.5、200mM NaCl、10%甘油、0.25mM TCEP洗提出。將FlagPRMT5-Mep50使用以2 CV of 25mM Tris pH7.5、150mM NaCl、5%甘油、0.5mM TCEP緩衝液預均衡化的S300 26/600管柱(GE Healthcare)進一步純化。將含有FlagPRMT5-Mep50複合體之峰流份濃縮成1.6mg/ml,使用液態氮分成小整除份地急驟冷凍,再貯存於-80 0C。
序列
SEQ ID:1
SEQ ID:2
<110> 輝瑞股份有限公司(Pfizer Inc.)
<120> 充當抗癌劑的經取代核苷衍生物
<130> PC72171A
<140> TW 105104968
<141> 2016-02-19
<150> US 62/119,932
<151> 2015-02-24
<150> US 62/213,801
<151> 2015-09-03
<150> US 62/279,209
<151> 2016-01-15
<160> 2
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 649
<212> PRT
<213> 智人
<400> 1
<210> 2
<211> 342
<212> PRT
<213> 智人
<400> 2

Claims (20)

  1. 一種式(II)化合物,或其醫藥上可接受之鹽,
    Figure TWI622595B_C0001
    其中:R1選自由以下所組成之群組:(C1-C8)烷基、或N(R4)2,其中R4各自獨立地為氫、或(C1-C8)烷基;R2為氫、甲基或NH2;R3為羥基或NH2;U為(C5-C12)芳基或5-12員雜芳基,其中U隨意地經一或多個各自獨立地選自(C1-C8)烷基、(C1-C8)烷基-N(R6)2、O(C2-C8)烷基-N(R6)2、(C1-C8)鹵烷基、羥基、(C1-C8)烷氧基、鹵素、(C5-C12)芳基、5-12員雜芳基、(C3-C10)環烷基、3-12員雜環基、OR6、N(R6)2及SO2R6之取代基取代,其中R6各自獨立地為氫、(C1-C8)烷基、(C1-C8)烷基-N(R7)2,其中R7各自為氫或(C1-C8)烷基;Z為CR12,其中R12各自為氫、(C1-C8)烷基或鹵素;m為0-1;且n為0-1。
  2. 如申請專利範圍第1項之化合物,或其醫藥上可接受之鹽,其中式(II)為:
    Figure TWI622595B_C0002
  3. 如申請專利範圍第1項之化合物,或其醫藥上可接受之鹽,其中式(II)為:
    Figure TWI622595B_C0003
  4. 如申請專利範圍第1項之化合物,或其醫藥上可接受之鹽,其中式(II)為:
    Figure TWI622595B_C0004
  5. 如申請專利範圍第1項之化合物,或其醫藥上可接受之鹽,其中R1為NH2,Z為CF,R2為氫,R3為羥基,m為1且n為0。
  6. 如申請專利範圍第1項之化合物,或其醫藥上可接受之鹽,其中R1為NH2,Z為CH,R2為氫,R3為羥基,m為1且n為0。
  7. 如申請專利範圍第1項之化合物,或其醫藥上可接受之鹽,其中R1為CH3,Z為CH,R2為氫,R3為羥基,m為1且n為0。
  8. 如申請專利範圍第1項之化合物,或其醫藥上可接受之鹽,其中R1為CH3,Z為CF,R2為氫,R3為羥基,m為1且n為0。
  9. 如申請專利範圍第1項之化合物,或其醫藥上可接受之鹽,其中R1為CH3,Z為CH,R2為NH2,R3為羥基,m為1且n為0。
  10. 如申請專利範圍第1項之化合物,或其醫藥上可接受之鹽,其中R1為CH3,Z為CH,R2為CH3,R3為羥基,m為1且n為0。
  11. 如申請專利範圍第1項之化合物,或其醫藥上可接受之鹽,其中U為隨意經取代之(C5-C12)芳基或5-12員雜芳基。
  12. 一種化合物,或其醫藥上可接受之鹽,該化合物係選自:
    Figure TWI622595B_C0005
    Figure TWI622595B_C0006
    Figure TWI622595B_C0007
    Figure TWI622595B_C0008
    Figure TWI622595B_C0009
    Figure TWI622595B_C0010
    Figure TWI622595B_C0011
    Figure TWI622595B_C0012
    Figure TWI622595B_C0013
    Figure TWI622595B_C0014
    Figure TWI622595B_C0015
    Figure TWI622595B_C0016
    Figure TWI622595B_C0017
    Figure TWI622595B_C0018
    Figure TWI622595B_C0019
    Figure TWI622595B_C0020
    Figure TWI622595B_C0021
    Figure TWI622595B_C0022
    Figure TWI622595B_C0023
  13. 一種化合物,或其醫藥上可接受之鹽,該化合物係選自:
    Figure TWI622595B_C0024
    Figure TWI622595B_C0025
    Figure TWI622595B_C0026
    Figure TWI622595B_C0027
    Figure TWI622595B_C0028
    Figure TWI622595B_C0029
    Figure TWI622595B_C0030
    Figure TWI622595B_C0031
    Figure TWI622595B_C0032
    Figure TWI622595B_C0033
    Figure TWI622595B_C0034
    Figure TWI622595B_C0035
    Figure TWI622595B_C0036
    Figure TWI622595B_C0037
    Figure TWI622595B_C0038
    Figure TWI622595B_C0039
    Figure TWI622595B_C0040
    Figure TWI622595B_C0041
    Figure TWI622595B_C0042
    Figure TWI622595B_C0043
    Figure TWI622595B_C0044
    Figure TWI622595B_C0045
    Figure TWI622595B_C0046
  14. 一種醫藥組成物,其包含根據申請專利範圍第1至13項中任一項之化合物,或其醫藥上可接受之鹽,及醫藥上可接受之載體。
  15. 一種用於治療哺乳動物之異常細胞生長的醫藥組成物,其包含治療有效量之根據申請專利範圍第1至13項中任一項之化合物,或其醫藥上可接受之鹽。
  16. 如申請專利範圍第15項之醫藥組成物,其中該異常細胞生長為癌症。
  17. 如申請專利範圍第16項之醫藥組成物,其中該癌症為肺癌、骨癌、胰臟癌、皮膚癌、頭頸部癌症、皮膚或眼內黑色素瘤、子宮癌、卵巢癌、直腸癌、肛門區的癌症、胃癌、結腸癌、乳癌、子宮癌、輸卵管癌、子宮內膜癌、子宮頸癌、陰道癌、外陰癌、霍奇金氏病(Hodgkin's Disease)、食道癌、小腸癌、內分泌系統癌症、甲狀腺癌、副甲狀腺癌、腎上腺癌、軟組織肉瘤、尿道癌、陰莖癌、攝護腺癌、慢性或急性白血病、淋巴細胞性淋巴瘤、膀胱癌、腎或輸尿管癌、腎細胞癌、腎盂癌、中樞神經系統(CNS)的腫瘤、原發性中樞神經系統淋巴瘤、脊椎軸心腫瘤、腦幹膠質瘤、或垂體腺瘤。
  18. 一種根據申請專利範圍第1至13項中任一項之化合物,或其醫藥上可接受之鹽於製造藥劑之用途,該藥劑可用於治療哺乳動物之異常細胞生長。
  19. 如申請專利範圍第18項之用途,其中該異常細胞生長為癌症。
  20. 如申請專利範圍第19項之用途,其中該癌症為肺癌、骨癌、胰臟癌、皮膚癌、頭頸部癌症、皮膚或眼內黑色素瘤、子宮癌、卵巢癌、直腸癌、肛門區的癌症、胃癌、結腸癌、乳癌、子宮癌、輸卵管癌、子宮內膜癌、子宮頸癌、陰道癌、外陰癌、霍奇金氏病(Hodgkin's Disease)、食道癌、小腸癌、內分泌系統癌症、甲狀腺癌、副甲狀腺癌、腎上腺癌、軟組織肉瘤、尿道癌、陰莖癌、攝護腺癌、慢性或急性白血病、淋巴細胞性淋巴瘤、膀胱癌、腎或輸尿管癌、腎細胞癌、腎盂癌、中樞神經系統(CNS)的腫瘤、原發性中樞神經系統淋巴瘤、脊椎軸心腫瘤、腦幹膠質瘤、或垂體腺瘤。
TW105104968A 2015-02-24 2016-02-19 充當抗癌劑的經取代核苷衍生物 TWI622595B (zh)

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