TW202348630A - 新穎抗cd3抗體及其用途 - Google Patents
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Abstract
本發明提供抗CD3抗體或其抗原結合片段、編碼其之分離的多核苷酸、包括其之醫藥組合物及其用途。
Description
本發明總體上係關於新穎抗CD3抗體、其抗原結合片段以及其用途。
CD3 (分化簇3) T細胞共受體係一種蛋白質複合物且由四條不同的鏈組成,亦即CD3γ鏈、CD3δ鏈及兩條CD3ε鏈。此等鏈與稱為T細胞受體(TCR)之分子及ζ鏈締合,以在T淋巴細胞中產生活化信號。TCR、ζ鏈及CD3分子一起形成TCR-CD3複合物,其中TCR作為亞基識別且結合至抗原,且CD3作為亞基將抗原刺激轉移及傳遞至信號傳導通路,且最終調節T細胞活性。CD3蛋白實際上存在於所有T細胞中。
特異性針對人類CD3之小鼠單株抗體,如OKT3 (Kung等人, (1979)
Science, 206: 347-9),係用於治療之第一代CD3抗體。儘管OKT3具有強免疫抑制效力,但其臨床應用受到與其免疫原性及促有絲分裂潛能相關之嚴重副作用的阻礙(Chatenoud (2003)
Nature Reviews Immunology3:123-132)。OKT3誘導之抗球蛋白反應,會促進其自身的快速清除及中和(Chatenoud等人, (1982)
Eur. J. Immunol., 137:830-8)。此外,OKT3在體外誘導T細胞增殖及細胞介素產生,且導致體內細胞介素之大規模釋放(Hirsch等人, (1989)
J. Immunol, 142: 737-43)。細胞介素釋放(亦被稱為「細胞介素風暴」)進而導致「流感樣」症候群,其特徵為發熱、寒戰、頭痛、噁心、嘔吐、腹瀉、呼吸窘迫、膿毒性腦膜炎及低血壓(Chatenoud (2003)
Nature Reviews Immunology, 3:123-132)。此類嚴重副作用限制了OKT3在移植中之更廣泛應用以及將其應用擴展至其他臨床領域如自體免疫。
CD3抗體之更近期應用係以雙特異性抗體之形式,一方面結合CD3,且另一方面結合腫瘤細胞抗原。此類抗體與其兩個靶標之同時結合將迫使靶細胞及T細胞之間暫時相互作用,導致任何細胞毒性T細胞之活化及隨後靶細胞之裂解。
仍需要新穎抗CD3抗體。
在整個本發明中,本文使用之冠詞「一(a/an)」及「上述」係指冠詞之文法賓語中之一者或多於一者(亦即,至少一者)。舉例而言,「一種抗體」意謂一種抗體或多於一種抗體。
在一個態樣中,本發明提供一種特異性結合至CD3之抗體或其抗原結合片段,上述抗體或其抗原結合片段包括:
一個或兩個或三個重鏈互補決定區(HCDR1、HCDR2及/或HCDR3),上述重鏈互補決定區包含在選自由以下組成之群的重鏈可變(VH)區序列中之任一者中:SEQ ID NO: 7、15、23、31、39、47、55、63、71、79、87、95、108、116、124、132、140、148、156、163、164、165、166、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195及196;及/或
一個或兩個或三個輕鏈互補決定區(LCDR1、LCDR2及/或LCDR3),上述輕鏈互補決定區包含在選自由以下組成之群的輕鏈可變(VL)區序列中之任一者中:SEQ ID NO: 8、16、24、32、40、48、56、64、72、80、88、96、109、117、125、133、141、149、157、168、169、170、197、198、199及200。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段包括至少一個重鏈或輕鏈互補決定區(CDR),其包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 1、2、3、4、5、6、9、10、11、12、13、14、17、18、19、20、21、22、25、26、27、28、29、30、33、34、35、36、37、38、41、42、43、44、45、46、49、50、51、52、53、54、57、58、59、60、61、62、65、66、67、68、69、70、73、74、75、76、77、78、81、82、83、84、85、86、89、90、91、92、93、94、102、103、104、105、106、107、110、111、112、113、114、115、118、119、120、121、122、123、126、127、128、129、130、131、134、135、136、137、138、139、142、143、144、145、146、147、150、151、152、153、154、155、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、201、162及167。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段包括VH區,上述VH區包括HCDR1、HCDR2及HCDR3中之一者或兩者或三者,上述HCDR1、HCDR2及HCDR3包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 1、2、3、9、10、11、17、18、19、25、26、27、33、34、35、41、42、43、49、50、51、57、58、59、65、66、67、73、74、75、81、82、83、89、90、91、102、103、104、110、111、112、118、119、120、126、127、128、134、135、136、142、143、144、150、151、152、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、201及162。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段包括VL區,上述VL區包括LCDR1、LCDR2及LCDR3中之一者或兩者或三者,上述LCDR1、LCDR2及LCDR3包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 4、5、6、12、13、14、20、21、22、28、29、30、36、37、38、44、45、46、52、53、54、60、61、62、68、69、70、76、77、78、84、85、86、92、93、94、105、106、107、113、114、115、121、122、123、129、130、131、137、138、139、145、146、147、153、154、155、182、183、184、185及167。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段包括:
(a) HCDR1,上述HCDR1包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:選自SEQ ID NO: 1、9、17、25、33、41、49、57、65、73、81、89、102、110、118、126、134、142及150;
(b) HCDR2,上述HCDR2包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:選自SEQ ID NO: 2、10、18、26、34、42、50、58、66、74、82、90、103、111、119、127、135、143、151、171、172、173及201;以及
(c) HCDR3,上述HCDR3包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:選自SEQ ID NO: 3、11、19、27、35、43、51、59、67、75、83、91、104、112、120、128、136、144、152、174、175、176、177、178、179、180、181及162。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段包括:
(a) LCDR1,上述LCDR1包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:選自SEQ ID NO: 4、12、20、28、36、44、52、60、68、76、84、92、105、113、121、129、137、145及153;
(b) LCDR2,上述LCDR2包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:選自SEQ ID NO: 5、13、21、29、37、45、53、61、69、77、85、93、106、114、122、130、138、146及154;及
(c) LCDR3,上述LCDR3包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:選自SEQ ID NO: 6、14、22、30、38、46、54、62、70、78、86、94、107、115、123、131、139、147、155、182、183、184、185及167。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段包括:
(a)包括如SEQ ID NO: 1所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 2所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 3所示之胺基酸序列之HCDR3;
(b)包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列之HCDR3;
(c)包括如SEQ ID NO: 17所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 18所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 19所示之胺基酸序列之HCDR3;
(d)包括如SEQ ID NO: 25所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 26所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 27所示之胺基酸序列之HCDR3;
(e)包括如SEQ ID NO: 33所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 34所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 35所示之胺基酸序列之HCDR3;
(f)包括如SEQ ID NO: 41所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 42所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 43所示之胺基酸序列之HCDR3;
(g)包括如SEQ ID NO: 49所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 50所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 51所示之胺基酸序列之HCDR3;
(h)包括如SEQ ID NO: 57所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 58所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 59所示之胺基酸序列之HCDR3;
(i)包括如SEQ ID NO: 65所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 66所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 67所示之胺基酸序列之HCDR3;
(j)包括如SEQ ID NO: 73所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 74所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 75所示之胺基酸序列之HCDR3;
(k)包括如SEQ ID NO: 81所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 82所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 83所示之胺基酸序列之HCDR3;
(l)包括如SEQ ID NO: 89所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 90所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 91所示之胺基酸序列之HCDR3;
(m)包括如SEQ ID NO: 102所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 103所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 104所示之胺基酸序列之HCDR3;
(n)包括如SEQ ID NO: 110所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 111所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 112所示之胺基酸序列之HCDR3;
(o)包括如SEQ ID NO: 118所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 119所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 120所示之胺基酸序列之HCDR3;
(p)包括如SEQ ID NO: 126所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 127所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 128所示之胺基酸序列之HCDR3;
(q)包括如SEQ ID NO: 134所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 135所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 136所示之胺基酸序列之HCDR3;
(r)包括如SEQ ID NO: 142所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 143所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 144所示之胺基酸序列之HCDR3;
(s)包括如SEQ ID NO: 150所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 151所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 152所示之胺基酸序列之HCDR3;
(t)包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 201所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 162所示之胺基酸序列之HCDR3;或者
(u)包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1;包括如SEQ ID NO: 10、171、172或173所示之胺基酸序列之HCDR2;包括如SEQ ID NO: 11、174、175、176、177、178、179、180或181所示之胺基酸序列之HCDR3。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段包括:
(a)包括如SEQ ID NO: 4所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 5所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 6所示之胺基酸序列之LCDR3;
(b)包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3;
(c)包括如SEQ ID NO: 20所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 21所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 22所示之胺基酸序列之LCDR3;
(d)包括如SEQ ID NO: 28所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 29所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 30所示之胺基酸序列之LCDR3;
(e)包括如SEQ ID NO: 36所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 37所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 38所示之胺基酸序列之LCDR3;
(f)包括如SEQ ID NO: 44所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 45所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 46所示之胺基酸序列之LCDR3;
(g)包括如SEQ ID NO: 52所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 53所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 54所示之胺基酸序列之LCDR3;
(h)包括如SEQ ID NO: 60所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 61所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 62所示之胺基酸序列之LCDR3;
(i)包括如SEQ ID NO: 68所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 69所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 70所示之胺基酸序列之LCDR3;
(j)包括如SEQ ID NO: 76所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 77所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 78所示之胺基酸序列之LCDR3;
(k)包括如SEQ ID NO: 84所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 85所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 86所示之胺基酸序列之LCDR3;
(l)包括如SEQ ID NO: 92所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 93所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 94所示之胺基酸序列之LCDR3;
(m)包括如SEQ ID NO: 105所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 106所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 107所示之胺基酸序列之LCDR3;
(n)包括如SEQ ID NO: 113所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 114所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 115所示之胺基酸序列之LCDR3;
(o)包括如SEQ ID NO: 121所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 122所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 123所示之胺基酸序列之LCDR3;
(p)包括如SEQ ID NO: 129所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 130所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 131所示之胺基酸序列之LCDR3;
(q)包括如SEQ ID NO: 137所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 138所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 139所示之胺基酸序列之LCDR3;
(r)包括如SEQ ID NO: 145所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 146所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 147所示之胺基酸序列之LCDR3;
(s)包括如SEQ ID NO: 153所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 154所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 155所示之胺基酸序列之LCDR3;
(t)包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 167所示之胺基酸序列之LCDR3;或者
(u)包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14、182、183、184或185所示之胺基酸序列之LCDR3。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段包括:
(a)包括如SEQ ID NO: 1所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 2所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 3所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 4所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 5所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 6所示之胺基酸序列之LCDR3;
(b)包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3;
(c)包括如SEQ ID NO: 17所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 18所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 19所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 20所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 21所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 22所示之胺基酸序列之LCDR3;
(d)包括如SEQ ID NO: 25所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 26所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 27所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 28所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 29所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 30所示之胺基酸序列之LCDR3;
(e)包括如SEQ ID NO: 33所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 34所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 35所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 36所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 37所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 38所示之胺基酸序列之LCDR3;
(f)包括如SEQ ID NO: 41所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 42所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 43所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 44所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 45所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 46所示之胺基酸序列之LCDR3;
(g)包括如SEQ ID NO: 49所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 50所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 51所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 52所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 53所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 54所示之胺基酸序列之LCDR3;
(h)包括如SEQ ID NO: 57所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 58所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 59所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 60所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 61所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 62所示之胺基酸序列之LCDR3;
(i)包括如SEQ ID NO: 65所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 66所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 67所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 68所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 69所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 70所示之胺基酸序列之LCDR3;
(j)包括如SEQ ID NO: 73所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 74所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 75所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 76所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 77所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 78所示之胺基酸序列之LCDR3;
(k)包括如SEQ ID NO: 81所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 82所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 83所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 84所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 85所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 86所示之胺基酸序列之LCDR3;
(l)包括如SEQ ID NO: 89所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 90所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 91所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 92所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 93所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 94所示之胺基酸序列之LCDR3;
(m)包括如SEQ ID NO: 102所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 103所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 104所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 105所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 106所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 107所示之胺基酸序列之LCDR3;
(n)包括如SEQ ID NO: 110所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 111所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 112所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 113所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 114所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 115所示之胺基酸序列之LCDR3;
(o)包括如SEQ ID NO: 118所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 119所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 120所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 121所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 122所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 123所示之胺基酸序列之LCDR3;
(p)包括如SEQ ID NO: 126所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 127所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 128所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 129所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 130所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 131所示之胺基酸序列之LCDR3;
(q)包括如SEQ ID NO: 134所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 135所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 136所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 137所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 138所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 139所示之胺基酸序列之LCDR3;
(r)包括如SEQ ID NO: 142所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 143所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 144所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 145所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 146所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 147所示之胺基酸序列之LCDR3;
(s)包括如SEQ ID NO: 150所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 151所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 152所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 153所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 154所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 155所示之胺基酸序列之LCDR3;
(t)包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 171所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3;
(u)包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 172所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3;
(v)包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 173所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3;
(w)包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 174所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3;
(x)包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 175所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3;
(y)包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 176所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3;
(z)包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 177所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3;
(aa)包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 178所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3;
(bb)包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 179所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3;
(cc)包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 180所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3;
(dd)包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 181所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3;
(ee)包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 182所示之胺基酸序列之LCDR3;
(ff)包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 183所示之胺基酸序列之LCDR3;
(gg)包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 184所示之胺基酸序列之LCDR3;或
(hh)包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 185所示之胺基酸序列之LCDR3。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段包括VH區,上述VH區具有如SEQ ID NO: 7、15、23、31、39、47、55、63、71、79、87、95、108、116、124、132、140、148、156、163、164、165、166、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195或196所示之胺基酸序列,或與SEQ ID NO: 7、15、23、31、39、47、55、63、71、79、87、95、108、116、124、132、140、148、156、163、164、165、166、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195或196具有至少80%序列一致性之同源序列。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段包括VL區,上述VL區具有如SEQ ID NO: 8、16、24、32、40、48、56、64、72、80、88、96、109、117、125、133、141、149、157、168、169、170、197、198、199或200所示之胺基酸序列,或與SEQ ID NO: 8、16、24、32、40、48、56、64、72、80、88、96、109、117、125、133、141、149、157、168、169、170、197、198、199或200具有至少80%序列一致性之同源序列。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段包括選自由以下組成之群的VH/VL胺基酸序列對:SEQ ID NO: 7/8、15/16、23/24、31/32、39/40、47/48、55/56、63/64、71/72、79/80、87/88、95/96、108/109、116/117、124/125、132/133、140/141、148/149、156/157、163/168、163/169、163/170、164/168、164/169、164/170、165/168、165/169、165/170、166/168、166/169、166/170、186/169、187/169、188/169、189/169、190/169、191/169、192/169、193/169、194/169、195/169、196/169、165/197、165/198、165/199及165/200。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段進一步包括一或多個胺基酸殘基取代或修飾,但仍保留對CD3之特異性結合親和力。在一些實施例中,取代或修飾中之至少一者位於VH區或VL區之一或多個CDR序列中。在一些實施例中,取代或修飾中之至少一者位於VH區或VL區之一或多個非CDR序列中。在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段進一步包括一或多個非天然胺基酸(NNAA)取代。在一些實施例中,NNAA能夠被結合。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段具有一或多種與CD3之結合特性,上述結合特性選自由以下組成之群:
(a)能夠特異性結合至人類CD3,藉由FACS測定所量測;
(b)具有T細胞活化能力,藉由Jurkat NFAT-螢光素酶活化測定所量測;及
(c)具有PBMC活化能力,藉由ELISA測定所量測。
在另一態樣中,本發明提供一種抗體或其抗原結合片段,其與如上所述之抗體或其抗原結合片段競爭結合CD3。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段為嵌合抗體、人源化抗體或人類抗體或其抗原結合片段。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段為經標記之抗體、二價抗體、抗獨特型抗體或融合蛋白。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段為雙功能抗體(diabody)、Fab、Fab'、F(ab')
2、Fd、Fv片段、二硫鍵穩定之Fv片段(dsFv)、(dsFv)
2、雙特異性dsFv(dsFv-dsFv')、二硫鍵穩定之雙功能抗體(ds diabody)、單鏈抗體分子(scFv)、scFv二聚體(二價雙功能抗體)、駱駝化單域抗體、奈米抗體、域抗體或二價域抗體。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段進一步包括Fc區。在一些實施例中,Fc區為人類免疫球蛋白(Ig)之Fc區。在一些實施例中,Fc區為人類IgG之Fc區。在一些實施例中,Fc區源自人類IgG1、IgG2、IgG3或IgG4。在一些實施例中,Fc區源自人類IgG1。在一些實施例中,Fc區包括選自SEQ ID NO: 97-99組成之群的胺基酸序列。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段之輕鏈為λ輕鏈或κ輕鏈。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段為雙特異性抗體或多特異性抗體或其抗原結合片段。在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段能夠特異性結合至除CD3之外的一或多種額外抗原,或CD3上之第二表位。在一些實施例中,除CD3之外的一或多種額外抗原選自由以下組成之群:CD16a、CD33、CD38、CD45、CD123、CD146、CD228、CLL-1、FLT3、FLT3L、TAF1、TgPRF、HVCN1、IL-6R、IL-11R、IL17A、IL-23R、IL-33、ILDR2、LAP、TSLP、TREM-1、ANGPT2、APOE、IFNAR、CypA、DOG-1、NKp30、CSF-1R、CCR2、LRRC15、間皮素、Dickkopf2、DLL3、HER-2、C10orf54、TrkA、MEKK1、KRAS、ERK、XPO1、mTORC1/2、PAK4、NAMPT、ATR、EGFR、FGFR、VEGF、LILRB (例如,LILRB1、LILRB2、LILRB3、LILRB4、LILRB5)、c-MET、Her2、Her3、CTLA4、GITA、CD112R、CD2、CD7、CD16、CD19、CD20、CD24、CD27、CD30、CD34、CD37、CD39、CD70、CD73、CD83、CD28、CD80(B7-1)、CD86 (B7-2)、CD40、CD40L (CD154)、CD47、SIRPα、CD122、CD137、CD137L、OX40 (CD134)、OX40L (CD252)、BCMA (例如,BCMA02)、PSMA、CLDN18 (例如,CLDN18.2)、NKG2C、4-1BB、LIGHT、PVRIG、SLAMF7、HVEM、BAFFR、ICAM-1、2B4、LFA-1、GITR、ICOS (CD278)、ICOSLG (CD275)、LAG3 (CD223)、A2AR、B7-H3 (CD276)、B7-H4 (VTCN1)、B7-H5、BTLA (CD272)、CD160、CTLA-4 (CD152)、GPRC5D、IDO (例如,IDO1、IDO2)、TDO、KIR、LAIR-1、NOX2、PD-1、PD-L1、PD-L2、TIM-3、VISTA、SIGLEC-7 (CD328)、SIGLEC-9 (CD329)、SIGLEC-15、TIGIT、PVR (CD155)、TLR3、CLEC9A、DEC-205、STING及TGFβ。
在一些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段連接至一或多個結合物部分。在一些實施例中,結合物部分包括清除調節劑、化療劑、毒素、放射性同位素、鑭系元素、可偵測標記物(例如,發光標記物、螢光標記物)、酶-受質標記物、DNA烷化劑、拓樸異構酶抑制劑、微管蛋白結合劑、純化部分或其他抗癌藥物。在一些實施例中,結合物部分直接或經由連接子共價連接。
在另一態樣中,本發明提供一種醫藥組合物,其包括本發明之抗體或其抗原結合片段,以及一或多種醫藥學上可接受之載劑。
在另一態樣中,本發明提供一種嵌合抗原受體,其包括本發明之抗體或其抗原結合片段、跨膜區及胞內信號區。在一些實施例中,跨膜區包括CD3、CD4、CD8或CD28之跨膜區。在一些實施例中,胞內信號區選自由以下組成之群:CD3、FcγRI、CD27、CD28、CD137、CD134、MyD88、CD40、CD278、TLR或其組合之胞內信號區序列。在一些實施例中,嵌合抗原受體之抗原結合片段為scFv。
在另一態樣中,本發明提供一種經分離多核苷酸,其編碼本發明之抗體或其抗原結合片段,及/或本發明之嵌合抗原受體。
在另一態樣中,本發明提供一種載體,其包括本發明之經分離多核苷酸。
在另一態樣中,本發明提供一種宿主表現系統,其包括本發明之載體,或具有整合至其基因體中之本發明之多核苷酸。在一些實施例中,本發明之宿主表現系統為微生物、酵母或哺乳動物細胞。在一些實施例中,微生物選自大腸桿菌及枯草芽孢桿菌組成之群。在一些實施例中,酵母為酵母屬(
Saccharomyces)。在一些實施例中,哺乳動物細胞選自下組:COS、CHO-S、CHO-K1、HEK-293及3T3細胞。
在另一態樣中,本發明提供一種病毒,其包括本發明之載體。
在另一態樣中,本發明提供一種套組,其包括本發明之抗體或其抗原結合片段及/或本發明之醫藥組合物及/或本發明之嵌合抗原受體,以及第二治療劑。
在另一態樣中,本發明提供一種表現本發明之抗體或其抗原結合片段或嵌合抗原受體之方法,其包括在表現本發明之抗體或其抗原結合片段或本發明之嵌合抗原受體之條件下培養本發明之宿主表現系統。
在另一態樣中,本發明提供一種在受試者中治療、預防或減輕疾病、病症或病狀之方法,其包括向上述受試者投與治療有效量之本發明之抗體或其抗原結合片段及/或醫藥組合物及/或嵌合抗原受體。
在另一態樣中,本發明提供本發明之抗體或其抗原結合片段及/或醫藥組合物及/或嵌合抗原受體在製備用於在受試者中治療CD3相關疾病、病症或病狀之藥物中之用途。
在另一態樣中,本發明提供本發明之抗體或其抗原結合片段及/或嵌合抗原受體及/或醫藥組合物在製備用於診斷CD3相關疾病、病症或病狀之診斷試劑中之用途。
在一些實施例中,上述疾病、病症或病狀為免疫性疾病、炎性疾病、癌症或神經系統疾病。在一些實施例中,癌症為實體瘤或血液腫瘤。在一些實施例中,上述疾病、病症或病狀選自由以下組成之群:肺癌(例如,非小細胞肺癌(NSCLC)、小細胞肺癌(SCLC)、肺腺癌或肺鱗狀細胞癌)、腹膜癌、類癌、骨癌、胰臟癌、原始神經外胚層腫瘤、皮膚癌、膽囊癌、頭頸部癌症、鱗狀細胞癌、子宮癌、卵巢癌、直腸癌、前列腺癌、膀胱癌(例如,尿路上皮癌)、肛門區癌症(例如,肛門鱗狀細胞癌)、胃部癌症或胃癌(例如,胃腸癌)、食道癌、結腸癌、乳癌、子宮癌、肝癌(例如,肝母細胞瘤、肝細胞癌/肝癌(hepatoma)或肝癌(hepatic carcinoma))、膽管癌、肉瘤、結腸直腸癌、輸卵管癌、唾液腺癌、子宮頸癌、子宮內膜癌或子宮癌、骨肉瘤、陰道癌、外陰癌、食道癌、小腸癌、內分泌系統癌、甲狀腺癌、甲狀旁腺癌、腎上腺癌、鼻咽癌、軟組織肉瘤、真性紅細胞增多症(polycythemia vera)、尿道癌、陰莖癌、腎或輸尿管癌(例如,腎橫紋肌樣瘤)、皮膚T細胞淋巴瘤、髓母細胞瘤、腎母細胞瘤、骨髓增生異常症候群(myelodysplastic syndrome)、慢性及非慢性骨髓增生性病症、脈絡叢乳頭狀瘤(choroid plexus papilloma)、腎細胞癌、腎盂癌、中樞神經系統(CNS)腫瘤、軟組織肉瘤(例如,橫紋肌肉瘤、纖維肉瘤、卡波西氏肉瘤)、脊柱軸腫瘤(spinal axis tumor)、神經膠質瘤(例如,室管膜瘤、星形細胞瘤、間變性星形細胞瘤、少突膠質細胞瘤、眼癌(例如,視網膜母細胞瘤)、腦幹神經膠質瘤或混合神經膠質瘤如少突星形細胞瘤(oligoastrocytoma))、腦腫瘤(例如,膠質母細胞瘤/多形性膠質母細胞瘤(GBM)、非膠質母細胞瘤腦腫瘤或腦膜瘤)、黑色素瘤(例如,皮膚或眼內黑色素瘤)、血小板增多症、間皮瘤、蕈樣肉芽腫、塞紮里症候群、特發性骨髓纖維化、孤立性漿細胞瘤、前庭神經鞘瘤(vestibular schwannoma)、尤文氏肉瘤、軟骨肉瘤、MYH相關息肉病、垂體腺瘤、兒科癌症如兒科肉瘤(例如,神經母細胞瘤、橫紋肌肉瘤及骨肉瘤)、血液癌症、霍奇金氏淋巴瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、白血病(例如,淋巴細胞/淋巴母細胞白血病)、慢性或急性白血病、肥大細胞白血病、淋巴細胞淋巴瘤、原發性CNS淋巴瘤、慢性淋巴球白血病(CLL)、急性淋巴球白血病(ALL)、慢性骨髓白血病(CML)、急性骨髓白血病(AML)、慢性骨髓單核細胞性白血病(CMML)、慢性淋巴母細胞白血病、急性淋巴母細胞白血病、毛細胞白血病(HCL)、伯基特氏淋巴瘤(BL)、多發性骨髓瘤(例如,復發性或難治性多發性骨髓瘤)、T細胞淋巴瘤或B細胞淋巴瘤、套細胞淋巴瘤(MCL) (例如,復發性或難治性套細胞淋巴瘤)、惡性黑色素瘤、瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、由濾泡性淋巴瘤引起之DLBCL、高級別B細胞淋巴瘤、原發性縱隔大B細胞淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤(FL)及原發性縱隔B細胞淋巴瘤。
在一些實施例中,受試者為人類。
在一些實施例中,投與係藉由腸胃外途徑,包括皮下、腹膜內、靜脈內、肌內或皮內注射;或非腸胃外途徑,包括經皮、口服、鼻內、眼內、舌下、直腸或外用。
在一些實施例中,在受試者中治療、預防或減輕疾病、病症或病狀之方法進一步包含向有需要之受試者投與額外治療劑。在一些實施例中,額外治療劑選自由以下組成之群:活性劑、成像劑、細胞毒性劑、血管生成抑制劑、激酶抑制劑、共刺激分子促效劑、共抑制分子阻斷劑、黏附分子阻斷劑、抗細胞介素抗體或其功能片段、可偵測標記物或報導子、抗微生物劑、基因編輯劑、β促效劑、病毒RNA抑制劑、聚合酶抑制劑、干擾素及微小RNA。在一些實施例中,額外治療劑在本發明之抗體或其抗原結合片段及/或醫藥組合物及/或嵌合抗原受體之前、之後或與其同時被投與於有需要之受試者。
在另一態樣中,本發明提供一種在活體內或活體外活化表現CD3之T細胞之方法,其包括使表現CD3之T細胞與本發明之抗體或其抗原結合片段及/或醫藥組合物及/或嵌合抗原受體接觸。
在另一態樣中,本發明提供一種調節表現CD3之細胞中CD3活性之方法,其包括將表現CD3之細胞暴露於本發明之抗體或其抗原結合片段及/或醫藥組合物及/或嵌合抗原受體。
在另一態樣中,本發明提供一種促進表現CD3之T細胞在活體內或活體外加工第二抗原之方法,其包括使表現CD3之T細胞與本發明之雙特異性抗體或其抗原結合片段接觸,其中雙特異性抗體或其抗原結合片段能夠特異性結合至表現CD3之T細胞及第二抗原兩者,從而使兩者鄰近。
在另一態樣中,本發明提供一種偵測樣本中CD3之存在或量之方法,其包括使樣本與本發明之抗體或其抗原結合片段及/或醫藥組合物及/或嵌合抗原受體接觸,且確定樣本中CD3之存在或量。
在另一態樣中,本發明提供一種在受試者中診斷CD3相關疾病或病狀之方法,其包括:a)使獲自受試者之樣本與本發明之抗體或其抗原結合片段及/或嵌合抗原受體及/或醫藥組合物接觸;b)確定樣本中CD3之存在或量;以及c)將受試者中CD3之存在或量與CD3相關疾病或病狀之存在或狀態相關聯。
在另一態樣中,本發明提供一種套組,其包括本發明之抗體或其抗原結合片段及/或嵌合抗原受體及/或醫藥組合物,用於偵測CD3,視情況重組CD3、在細胞表面上表現之CD3或表現CD3之細胞。
本發明之以下描述僅旨在說明本發明之各個實施例。如此,所討論之具體修改不應被解釋為對本發明之範疇之限制。對於熟習此項技術者將顯而易見的是,在不脫離本發明之範疇之情況下,可做出各種等同物、改變及修改,且應理解,此類等同實施例將被包括在本文中。在本文中引用之所有文獻,包括公開案、專利及專利申請案均以全文引用之方式併入本文中。
定義
本文中使用之術語「抗體」包括與特定抗原結合之任何免疫球蛋白、單株抗體、多株抗體、多價抗體、二價抗體、單價抗體、多特異性抗體或雙特異性抗體。天然的完整抗體包括兩條重(H)鏈及兩條輕(L)鏈。哺乳動物重鏈分為α、δ、ε、γ及μ,各重鏈包括可變區(VH)以及第一恆定區、第二恆定區、第三恆定區以及視情況選用之第四恆定區(分別為CH1、CH2、CH3、CH4);哺乳動物輕鏈分為λ或κ,而各輕鏈包括可變區(VL)以及恆定區。抗體呈「Y」型,其中Y型結構之莖部包括藉由二硫鍵結合在一起的兩條重鏈之第二恆定區及第三恆定區。Y之各臂包括與單條輕鏈之可變區及恆定區結合之單條重鏈之可變區及第一恆定區。輕鏈及重鏈之可變區負責抗原結合。各鏈之可變區通常含有三個高變區,稱為互補決定區(CDR) (輕鏈CDR包括LCDR1、LCDR2、LCDR3,重鏈CDR包括HCDR1、HCDR2、HCDR3)。三個CDR由被稱為框架區(FR) (輕鏈FR包括LFR1、LFR2、LFR3及LFR4,重鏈FR包括HFR1、HFR2、HFR3及HFR4)之側翼段間隔開,上述框架區比CDR更加高度保守且形成支架以支撐高度可變環。重鏈及輕鏈之恆定區與抗原結合無關,但表現出多種效應功能。抗體基於其重鏈恆定區之胺基酸序列可分成幾類。抗體之五個主要類別或同型為IgA、IgD、IgE、IgG及IgM,其特徵分別在於存在α、δ、ε、γ及μ重鏈。若干主要抗體類別被分為子類,如IgG1 (γ1重鏈)、IgG2 (γ2重鏈)、IgG3 (γ3重鏈)、IgG4 (γ4重鏈)、IgA1 (α1重鏈)或IgA2 (α2重鏈)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體涵蓋其任何抗原結合片段。如本文所用,術語「抗原結合片段」係指由包括一或多個(例如,1個、2個、3個、4個、5個或6個) CDR之抗體之一部分形成之抗體片段,或與抗原結合但不包括完整天然抗體結構之任何其他抗體片段。抗原結合片段之實例包括但不限於雙功能抗體(diabody)、Fab、Fab'、F(ab')
2、Fd、Fv片段、二硫鍵穩定之Fv片段(dsFv)、(dsFv)
2、雙特異性dsFv (dsFv-dsFv')、二硫鍵穩定之雙功能抗體(ds diabody)、單鏈抗體分子(scFv)、scFv二聚體(二價雙功能抗體)、雙特異性抗體、多特異性抗體、駱駝單域抗體、奈米抗體、域抗體或二價域抗體。抗原結合片段能夠與親本抗體結合相同的抗原或表位。
抗體之「Fab」係指由單條輕鏈(包括可變區及恆定區)及單條重鏈之可變區及第一恆定區經二硫鍵結合起來組成之抗體之一部分。
「Fab'」係指包括鉸鏈區之一部分之Fab片段。
「F(ab')
2」係指Fab'之二聚體。
抗體(例如,IgG、IgA或IgD同型)之「Fc」係指由第一重鏈之第二恆定域及第三恆定域藉由二硫鍵與第二重鏈之第二恆定域及第三恆定域結合組成之抗體之一部分。IgM及IgE同型抗體之Fc進一步包括第四恆定域。抗體之Fc部分負責多種不同的效應功能,如抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC)及補體依賴性細胞毒性(CDC),但在抗原結合中不起作用。
抗體之「Fv」係指含有完整抗原結合位點之最小抗體片段。Fv片段由單條輕鏈之可變區與單條重鏈之可變區結合組成。
「單鏈Fv抗體」或「scFv」係指由輕鏈可變區及重鏈可變區組成之工程化抗體,上述輕鏈可變區及重鏈可變區直接相互連接或藉由連接子(例如,肽序列)相互連接(Huston JS等人
Proc Natl Acad Sci USA, 85:5879(1988))。
「單鏈Fv-Fc抗體」或「scFv-Fc」係指由連接至抗體之Fc區之scFv組成之工程化抗體。
「駱駝化單域抗體」、「重鏈抗體」或「HCAb」係指含有兩個VH域而不含有輕鏈之抗體(Riechmann L.及Muyldermans S.,
J Immunol Methods12月10日; 231(1-2):25-38 (1999);Muyldermans S.,
J Biotechnol. 6月; 74(4):277-302 (2001);WO94/04678;WO94/25591;美國專利第6,005,079號)。重鏈抗體最初源自駱駝科(
Camelidae) (駱駝、單峰駝及美洲駝)。雖然缺失輕鏈,但駱駝化抗體有確證的抗原結合全部功能(Hamers-Casterman C.等人,
Nature6月3日; 363(6428):446-8 (1993); Nguyen VK.等人,
Immunogenetics4月; 54(1):39-47 (2002);Nguyen VK.等人,
Immunology5月; 109(1):93-101 (2003))。重鏈抗體之可變區(VHH域)表示由適應性免疫反應產生之最小已知抗原結合單位(Koch-Nolte F.等人,
FASEB J.11月; 21(13):3490-8 電子版2007年6月15日(2007))。
「奈米抗體」係指由來自重鏈抗體之VHH域以及兩個恆定域CH2及CH3組成之抗體片段。
「雙功能抗體」、「diabody」或「dAb」包括具有兩個抗原結合位點之小抗體片段,其中上述片段包括在同一條多肽鏈上連接之VH域及VL域(VH-VL或VL-VH) (參見例如Holliger P.等人,
Proc Natl Acad Sci USA. 7月15日;90(14):6444-8 (1993);EP404097;WO93/11161)。藉由使用太短以至於不允許在同一條鏈上之兩個域之間配對之連接子,域被迫與另一條鏈之互補域配對,從而產生兩個抗原結合位點。上述抗原結合位點可靶向相同或不同抗原(或表位)。在某些實施例中,「雙特異性ds雙功能抗體」係靶向兩種不同抗原(或表位)之雙功能抗體。
「域抗體」係指僅含有重鏈可變區或輕鏈可變區之抗體片段。在某些情況下,兩個或更多個VH域由肽連接子共價接合以產生二價或多價域抗體。二價域抗體之兩個VH域可靶向相同或不同抗原(或表位)。
如本文所用,術語「價」係指給定分子中存在指定數量之抗原結合位點。術語「單價」係指僅具有一個抗原結合位點之抗體或抗原結合片段;且術語「多價」係指具有多個抗原結合位點之抗體或抗原結合片段。如此,術語「二價」、「四價」及「六價」分別表示抗原結合分子中存在兩個抗原結合位點、四個抗原結合位點及六個抗原結合位點。在一些實施例中,上述抗體或其抗原結合片段係二價的。
如本文所用,「雙特異性」抗體係指具有源自兩個不同單株抗體之片段且能夠與兩個不同表位結合之人工抗體。上述兩個表位可存在於同一抗原上,或者其可存在於兩個不同抗原上。
如本文所用,「多特異性」抗體係指與至少兩個不同抗原或相同抗原之至少兩個不同表位特異性結合之抗體。多特異性抗體可與例如兩個、三個、四個、五個或更多不同抗原結合,或者可與相同抗原之兩個、三個、四個、五個或更多個不同表位結合。
在某些實施例中,「scFv二聚體」為二價雙功能抗體(diabody)或雙特異性scFv (BsFv),其包括二聚化的兩個VH-VL (由肽連接子連接)部分,使得一個部分之VH與另一個部分之VL協作形成兩個結合位點,上述兩個結合位點可靶向相同抗原(或表位)或不同抗原(或表位)。在其他實施例中,「scFv二聚體」為雙特異性雙功能抗體,上述雙特異性雙功能抗體包括相互締合之VH1-VL2 (由肽連接子連接)及VL1-VH2 (亦由肽連接子連接),使得VH1及VL1協作,VH2及VL2協作,且各協作配對具有不同的抗原特異性。
「dsFv」係指二硫鍵穩定之Fv片段,其單條輕鏈之可變區與單條重鏈之可變區之間的連接為二硫鍵。在一些實施例中,「(dsFv)
2」或「(dsFv-dsFv')」包括三條肽鏈:兩個VH部分藉由肽連接子(例如,長的可撓性連接子)連接,且藉由二硫鍵分別與兩個VL部分結合。在一些實施例中,dsFv-dsFv'具有雙特異性,其中各對藉由二硫鍵配對之重鏈及輕鏈具有不同的抗原特異性。
如本文所用,術語「嵌合」係指具有源自一種物種之重鏈及/或輕鏈之一部分且上述重鏈及/或輕鏈之其餘部分源自另一不同物種之抗體或抗原結合片段。在說明性實例中,嵌合抗體可包括源自人類之恆定區及源自非人類動物(例如小鼠)之可變區。在一些實施例中,上述非人類動物為哺乳動物,例如小鼠、大鼠、兔、山羊、綿羊、豚鼠或倉鼠。
如本文所用,術語「人源化」係指包括源自非人類動物之CDR、源自人類之FR區以及源自人類之恆定區(當適用時)之抗體或抗原結合片段。本發明所提供之人源化抗體之CDR可含有相較於其親本抗體之CDR的突變。
如本文所用,術語「親和力」係指免疫球蛋白分子(亦即,抗體)或其抗原結合片段與抗原之間非共價相互作用之強度。
與靶標(例如,表位)「特異性結合」(specifically binds/specific binding)之抗體或其抗原結合片段係此項技術中所熟知之術語,且用於確定此類特異性結合之方法亦為此項技術中所熟知的。若分子與特定細胞或物質比其與替代性細胞或物質更頻繁地、更快速地、持續時間更長地及/或親和力更大地反應或締合,則上述分子被稱為展現出「特異性結合」。若抗體比其與其他物質親和力更大地、親合性更高地、更容易地及/或持續時間更長地結合,則上述抗體與靶標「特異性結合」。例如,與CD3表位特異性結合之抗體為結合此CD31表位比結合其他CD3表位或非CD3表位親和力更大地、親合性更高地、更容易地及/或持續時間更長的抗體。藉由閱讀此定義亦應理解,例如,與第一靶標特異性結合之抗體(或部分或表位)可與第二靶標特異性結合或可不與第二靶標特異性結合。如此,「特異性結合」(specific binding/specifically bind)不一定需要(儘管其可包括)排他性的結合。通常,但並非必然地,提及結合係指特異性結合。
如本文所用,「競爭結合CD3」之能力係指第一抗體或抗原結合片段將CD3及第二抗CD3抗體之間的結合相互作用抑制至任何可偵測程度之能力。在某些實施例中,競爭結合CD3之抗體或抗原結合片段抑制CD3及第二抗CD3抗體之間的結合相互作用至少85%,或至少90%。在某些實施例中,上述抑制可大於95%或大於99%。
如本文所用,術語「表位」係指抗體所結合之抗原上特定的一組原子或胺基酸。若兩種抗體展現出針對抗原之競爭性結合,則其可能結合抗原內相同或緊密相關之表位。表位可為線性的或構形的(亦即,包括間隔開的胺基酸殘基)。例如,若抗體或抗原結合片段阻擋參考抗體與抗原之結合至少85%、或至少90%或至少95%,則上述抗體或抗原結合部分可被視為與參考抗體結合相同或緊密相關之表位。
如本文所用,術語「胺基酸」係指含有胺基(-NH
2)及羧基(-COOH)官能基以及各胺基酸特有之側鏈之有機化合物。胺基酸名稱在本發明中亦以標準的單字母或三字母代碼表示,總結如下:
| 名稱 | 三字母代碼 | 單字母代碼 |
| 丙胺酸 | Ala | A |
| 精胺酸 | Arg | R |
| 天冬醯胺 | Asn | N |
| 天冬胺酸 | Asp | D |
| 半胱胺酸 | Cys | C |
| 麩胺酸 | Glu | E |
| 麩醯胺酸 | Gln | Q |
| 甘胺酸 | Gly | G |
| 組胺酸 | His | H |
| 異白胺酸 | Ile | I |
| 白胺酸 | Leu | L |
| 離胺酸 | Lys | K |
| 甲硫胺酸 | Met | M |
| 苯丙胺酸 | Phe | F |
| 脯胺酸 | Pro | P |
| 絲胺酸 | Ser | S |
| 蘇胺酸 | Thr | T |
| 色胺酸 | Trp | W |
| 酪胺酸 | Tyr | Y |
| 纈胺酸 | Val | V |
關於胺基酸序列之「保守取代」係指將胺基酸殘基用不同的具有相似理化特性之側鏈之胺基酸殘基替代。例如,可在具有疏水側鏈之胺基酸殘基(例如Met、Ala、Val、Leu及Ile)之間、具有中性親水側鏈之胺基酸殘基(例如Cys、Ser、Thr、Asn及Gln)之間、具有酸性側鏈之胺基酸殘基(例如Asp、Glu)之間、具有鹼性側鏈之胺基酸殘基(例如His、Lys及Arg)之間或具有芳族側鏈之胺基酸殘基(例如Trp、Tyr及Phe)之間進行保守取代。如此項技術中已知,保守取代通常不會引起蛋白質構形結構之顯著變化,且因此可保留蛋白質之生物活性。
如本文所用,術語「同源」係指在最佳比對時與另一個序列具有至少60%(例如,至少65%、70%、75%、80%、85%、88%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、或者99%)之序列一致性之核酸序列(或其互補鏈)或胺基酸序列。
關於胺基酸序列(或核酸序列)之「序列一致性百分比(%)」被定義為在比對序列,且必要時引入空位以實現最大數量之相同胺基酸(或核酸)後,在候選序列中與參考序列中之胺基酸(或核酸)殘基相同的胺基酸(或核酸)殘基之百分比。換言之,胺基酸序列(或核酸序列)之序列一致性百分比(%)可藉由將相對於其比較之參考序列相同的胺基酸殘基(或鹼基)之數目除以候選序列或參考序列(以較短者為準)中胺基酸殘基(或鹼基)之總數來計算。胺基酸殘基之保守取代可視為或可不視為相同殘基。可例如使用公開可用的工具,如BLASTN、BLASTp (可在美國國家生物技術資訊中心(U.S. National Center for Biotechnology Information,NCBI)之網站上獲得,亦參見Altschul S.F.等人,
J. Mol. Biol., 215:403-410 (1990);Stephen F.等人,
Nucleic Acids Res., 25:3389-3402 (1997))、ClustalW2 (可在歐洲生物資訊學研究所(European Bioinformatics Institute)之網站上獲得,亦參見Higgins D.G.等人,
Methods In Enzymology, 266:383-402 (1996);Larkin M.A.等人,
Bioinformatics(Oxford, England), 23(21): 2947-8 (2007)以及ALIGN或Megalign (DNASTAR)軟體來實現比對以確定胺基酸(或核酸)序列一致性百分比。熟習此項技術者可使用由上述工具提供之預設參數或可根據比對的需要適當定製參數,例如藉由選擇合適的算法。
如本文所用,「效應功能」係指由抗體之Fc區與其效應子(例如,C1複合物及Fc受體)結合引起之生物活性。例示性效應功能包括:由抗體及C1複合物上之C1q相互作用所介導之補體依賴性細胞毒性(CDC);由抗體之Fc區與效應細胞上之Fc受體結合所介導之抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC);以及吞噬作用。可使用各種測定,如Fc受體結合測定、C1q結合測定及細胞裂解測定來評估效應功能。
如本文所用,「抗體依賴性細胞介導之細胞毒性」或「ADCC」係指細胞介導之反應,其中表現Fc受體(FcR)之效應細胞識別靶細胞上之結合抗體或抗原結合片段且隨後引起靶細胞之裂解。「ADCC活性」或「ADCC效應」係指結合在靶細胞上之抗體或抗原結合片段以引發如上所述之ADCC反應的能力。
如本文所用,「補體依賴性細胞毒性」或「CDC」係指一種機制,藉由上述機制,抗體可藉由活化有機體之補體系統來介導特異性靶細胞裂解。在CDC中,C1q結合抗體且這種結合觸發補體級聯,作為經典通路補體活化之結果,其導致在靶細胞表面處形成膜攻擊複合物(MAC) (C5b至C9)。「CDC活性」或「CDC效應」係指結合在靶細胞上之抗體或抗原結合片段以引發如上所述之CDC反應的能力。
如本文所用,「靶細胞」係指包括Fc區之抗體特異性結合之細胞。「效應細胞」為表現一或多種Fc受體且執行效應功能之白血球。介導ADCC的人類白血球的實例包括周邊血液單核細胞(PBMC)、自然殺傷(NK)細胞、單核球、細胞毒性T細胞及嗜中性球;其中PBMC及NK細胞較佳。效應細胞可自其天然來源中分離,例如自此項技術中已知之血液或PBMC中分離。
「分離的」物質已經人工由自然狀態改變。若自然界中出現某種「分離的」組合物或物質,則其已被改變或脫離其原始環境,或二者均有發生。例如,某一活體動物體內天然存在之多核苷酸或多肽並非「分離的」,但若上述多核苷酸或多肽與其在天然狀態下共存之物質充分分離且以基本上純的狀態存在,則可視為「分離的」。「分離的核酸序列」係指分離的核酸分子之序列。在某些實施例中,「分離的抗體或其抗原結合片段」係指純度為至少60%、70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%之抗體或其抗原結合片段,如藉由電泳方法(如SDS-PAGE、等電聚焦、毛細管電泳)或層析方法(如離子交換層析法或反相HPLC)所確定。
如本文所用,術語「載體」係指可將編碼蛋白質之多核苷酸可操作地插入其中以便引起上述蛋白質之表現之媒劑。載體可用於轉化、轉導或轉染宿主細胞,使其攜帶之遺傳元件在宿主細胞內得以表現。載體之實例包括質體、噬菌粒、黏粒、人工染色體如酵母人工染色體(YAC)、細菌人工染色體(BAC)或P1來源之人工染色體(PAC)、如λ噬菌體或M13噬菌體等噬菌體以及動物病毒。用作載體之動物病毒之類別包括逆轉錄病毒(包括慢病毒)、腺病毒、腺相關病毒、疱疹病毒(例如,單純疱疹病毒)、痘病毒、桿狀病毒、乳頭瘤病毒及乳多空病毒(例如,SV40)。載體可含有多種用於控制表現之元件,包括啟動子序列、轉錄起始序列、增強子序列、可選擇元件及報導基因。另外,載體亦可含有複製起點。載體亦可包括協助其進入細胞之材料,包括但不限於病毒顆粒、脂質體或蛋白質包衣。載體可為表現載體或選殖載體。本發明提供載體(例如,表現載體),上述載體含有本文所提供之編碼抗體或其抗原結合片段之核酸序列、至少一個可操作地連接至上述核酸序列之啟動子(例如,SV40、CMV、EF-1α)以及至少一個選擇標記。載體之實例包括但不限於逆轉錄病毒(包括慢病毒)、腺病毒、腺相關病毒、疱疹病毒(例如,單純疱疹病毒)、痘病毒、桿狀病毒、乳頭瘤病毒、乳多空病毒(例如,SV40)、λ噬菌體及M13噬菌體、質體pcDNA3.3、pMD18-T、pOptivec、pCMV、pEGFP、pIRES、pQD-Hyg-Gseu、pALTER、pBAD、pcDNA、pCal、pL、pET、pGEMEX、pGEX、pCI、pEGFT、pSV2、pFUSE、pVITRO、pVIVO、pMAL、pMONO、pSELECT、pUNO、pDUO、Psg5L、pBABE、pWPXL、pBI、p15TV-L、pPro18、pTD、pRS10、pLexA、pACT2.2、pCMV-SCRIPT.RTM.、pCDM8、pCDNA1.1/amp、pcDNA3.1、pRc/RSV、PCR 2.1、pEF-1、pFB、pSG5、pXT1、pCDEF3、pSVSPORT、pEF-Bos等。
如本文所用,片語「宿主細胞」係指其中可引入或已引入外源多核苷酸及/或載體之細胞。
術語「受試者」包括人及非人類動物。非人類動物包括所有脊椎動物,例如哺乳動物及非哺乳動物,如非人靈長類動物、小鼠、大鼠、貓、兔、綿羊、狗、牛、雞、兩棲動物及爬行動物。除在指出時之外,術語「患者」、「受試者」或「個體」在本文中可互換使用。
術語「抗腫瘤活性」意謂腫瘤細胞增殖、活力或轉移活性之降低。例如,與未使用療法之對照相比,可藉由在治療期間出現之異常細胞之生長率的減少或腫瘤大小穩定性或減少或由於治療引起之更長存活率來表示抗腫瘤活性。可使用公認的體外或體內腫瘤模型來評估此類活性,上述模型包括但不限於異種移植模型、同種異體移植模型、小鼠乳腺腫瘤病毒(MMTV)模型及此項技術中已知之其他已知模型來研究抗腫瘤活性。
如本文所用,疾病、病症或病狀之「治療(treating/treatment)」包括預防或緩解疾病、病症或病狀、減緩疾病、病症或病狀之發作或發展速率、降低罹患疾病、病症或病狀之風險、預防或延緩與疾病、病症或病狀相關之症狀的發展、減少或結束與疾病、病症或病狀相關之症狀、使疾病、病症或病狀完全或部分消退、治癒疾病、病症或病狀或其一些組合。
術語「診斷(diagnosis/diagnose/diagnosing)」係指對病理狀態、疾病或病狀之鑑定,如對CD3相關疾病之鑑定,或者係指對可能受益於特定治療方案的患有CD3相關疾病之受試者之鑑定。在一些實施例中,診斷含有CD3之異常量或活性之鑑定。在一些實施例中,診斷係指對受試者中癌症之鑑定。
如本文所用,術語「生物樣品」或「樣品」係指自所關注受試者獲得或源自所關注受試者之生物組合物,上述生物組合物含有例如基於物理、生化、化學及/或生理特性待表徵及/或鑑定之細胞及/或其他分子實體。生物樣品包括但不限於藉由熟習此項技術者已知之任何方法獲得之受試者之細胞、組織、器官及/或生物體液。在一些實施例中,上述生物樣品為體液樣品。在一些實施例中,上述體液樣品為全血、血漿、血清、黏液(包括鼻腔引流物及痰)、腹膜液、胸膜液、胸液、唾液、尿液、滑液、腦脊液(CSF)、胸腔穿刺液、腹腔積液、腹水或心包液。在一些實施例中,上述生物樣品為獲自上述受試者之胃、心臟、肝臟、脾、肺、腎、皮膚或血管之組織或細胞。
如本文所用,「CD3」係指分化簇3蛋白,且包括CD3的藉由細胞自然表現或藉由用CD3基因轉染之細胞表現之任何變異體、構形、同型及物種同系物。例如,本文所描述之CD3可指源自任何脊椎動物來源之分化簇3蛋白,上述脊椎動物來源包括如靈長類動物(例如,人、猴)及嚙齒動物(例如,小鼠及大鼠)等哺乳動物。在哺乳動物中,CD3分子為六條鏈之多蛋白複合物,包含:CD3γ鏈、CD3δ鏈、兩條CD3ε鏈及CD3ζ鏈之同型二聚體,其中CD3ζ鏈為CD3分子之胞內尾,且CD3γ、CD3δ及CD3ε鏈均含有在T細胞之表面上表現之胞外域(ECD)。人類CD3之例示性序列包含人類CD3ε蛋白(NCBI Ref Seq No. NP_000724)、人類CD3δ蛋白(NCBI Ref Seq No. NP_000723)及人類CD3γ蛋白(NCBI Ref Seq No. NP_000064)。非人類CD3之例示性序列包含食蟹獼猴(猴)CD3ε蛋白(NCBI Ref Seq No. NP_001270544)、食蟹獼猴(
Macaca fascicularis) (猴) CD3δ蛋白(NCBI Ref Seq No. NP_001274617)、食蟹獼猴(猴) CD3γ蛋白(NCBI Ref Seq No. NP_001270839);小家鼠(
Mus musculus) (小鼠)CD3ε蛋白(NCBI Ref Seq No. NP_031674)、小家鼠(小鼠)CD3δ蛋白(NCBI Ref Seq No. NP_038515)、小家鼠(小鼠)CD3γ蛋白(NCBI Ref Seq No. AAA37400);褐家鼠(
Rattus norvegicus) (大鼠)CD3ε蛋白(NCBI Ref Seq No. NP_001101610)、褐家鼠(大鼠)CD3δ蛋白(NCBI Ref Seq No. NP_037301)、褐家鼠(大鼠)CD3γ蛋白(NCBI Ref Seq No. NP_001071114)。在某些實施例中,本文所使用之CD3亦可為重組CD3,例如,包括重組CD3ε蛋白、重組CD3δ蛋白及重組CD3γ蛋白,上述重組CD3可視情況以重組CD3複合物之形式表現。重組CD3複合物可在細胞表面上表現,或者亦可與細胞表面不結合之可溶形式表現。在某些實施例中,CD3為人類CD3。術語「CD3」、「CD-3」、「CD 3」、「分化簇3」在本發明中可互換使用。
術語「抗CD3抗體」係指特異性結合至CD3(例如,人類CD3)之抗體。術語「抗人類CD3抗體」係指特異性結合至人類CD3之抗體。在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體特異性結合至CD3γ蛋白。在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體特異性結合至CD3δ蛋白。在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體特異性結合至CD3ε蛋白。
如本文所用,術語「CD3γ」旨在涵蓋任何形式之CD3γ,例如,1)天然未加工之CD3γ分子,「全長」CD3γ鏈或天然存在之CD3γ變異體,包含例如剪接變異體或對偶基因變異體;2)在細胞中由加工產生之任何形式之CD3γ;或3)藉由重組方法產生之CD3γ亞基之全長、片段(例如,截短形式、胞外/跨膜域)或修飾形式(例如,突變形式、醣基化/聚乙二醇化、His標籤/免疫螢光融合形式)。
如本文所用,術語「CD3δ」旨在涵蓋任何形式之CD3δ,例如,1)天然未加工之CD3δ分子,「全長」CD3δ鏈或天然存在之CD3δ變異體,包含例如剪接變異體或對偶基因變異體;2)在細胞中由加工產生之任何形式之CD3δ;或3)藉由重組方法產生之CD3δ亞基之全長、片段(例如,截短形式、胞外/跨膜域)或修飾形式(例如,突變形式、醣基化/聚乙二醇化、His標籤/免疫螢光融合形式)。
如本文所用,術語「CD3ε」旨在涵蓋任何形式之CD3ε,例如,1)天然未加工之CD3ε分子,「全長」CD3ε鏈或天然存在之CD3ε變異體,包含例如剪接變異體或對偶基因變異體;2)在細胞中由加工產生之任何形式之CD3ε;或3)藉由重組方法產生之CD3ε亞基之全長、片段(例如,截短形式、胞外/跨膜域)或修飾形式(例如,突變形式、醣基化/聚乙二醇化、His標籤/免疫螢光融合形式)。
在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體特異性結合至CD3ε,但不結合至CD3γ (或CD3δ)或較差地結合至CD3γ (或CD3δ),例如,對CD3ε之結合親和力比對CD3γ (或CD3δ)之結合親和力低至少10倍,或比對CD3γ (或CD3δ)之結合親和力低至少50倍,或低至少100倍,或低至少200倍。在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體對CD3γ (或CD3δ)不具有可偵測結合親和力。在一些實施例中,結合親和力藉由FACS測定來確定。在一些實施例中,結合親和力藉由由FACS測定偵測之平均螢光強度(MFI)來確定。
如本文所用,「與CD3相關(CD3 related/CD3-related)」之疾病、病症或病狀係指由CD3之表現或活性之增加或降低所引起、加劇或以其他方式連接之任何疾病、病症或病狀。在一些實施例中,與CD3相關之疾病、病症或病狀係與過量細胞增殖相關之病症,例如癌症。在某些實施例中,上述疾病、病症或病狀之特徵在於表現或過度表現CD3或與CD3相關之基因。
術語「醫藥學上可接受之」表示指定載劑、媒劑、稀釋劑、賦形劑及/或鹽通常與構成製劑之其他成分在化學上及/或物理上相容,且與接受者在生理上相容。
如本文所用,術語「表現CD3之細胞」係指在細胞之表面上表現CD3之細胞。
抗 CD3 抗體
本發明提供抗CD3抗體及其抗原結合片段。本文所提供之抗CD3抗體及抗原結合片段能夠結合(例如,特異性結合)至CD3(例如,人類CD3)。
本文所提供之抗體或其抗原結合片段之結合親和力可由K
D值表示,其代表當抗原與抗原結合分子之間的結合達到平衡時解離速率與締合速率之比率(k
off/k
on)。可使用此項技術中已知之合適方法(包括例如流式細胞術測定)適當地測定抗原結合親和力(例如,K
D)。在一些實施例中,可藉由流式細胞術測定抗體或其抗原結合片段與不同濃度之抗原之結合,所確定之平均螢光強度(MFI)可首先對抗體濃度進行繪圖,然後使用Prism版本5 (GraphPad Software, San Diego, CA),可藉由將特異性結合螢光強度(Y)及抗體濃度(X)之依賴性擬合至一個位點飽和方程(site saturation equation)中來計算K
D值:Y=B
max*X/(K
D+ X),其中B
max係指被測抗體與抗原之最大特異性結合。
本文所提供之抗體或其抗原結合片段與CD3之結合亦可用「半最大有效濃度」(EC
50)值表示,其係指抗體的觀察到其最大結合之50%之濃度。EC
50值可藉由此項技術中已知之結合測定來量測,例如直接或間接結合測定,如酶聯免疫吸附測定(ELISA)、FACS測定及其他結合測定。在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段能夠與人類CD3特異性結合(例如,藉由FACS測定所量測)。在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段能夠與人及食蟹獼猴CD3兩者部分特異性結合(例如,藉由FACS測定所量測)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段具有T細胞活化能力。在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段具有比OKT3更高的T細胞活化能力。OKT3係美國FDA於1986年批准的第一種對人類CD3抗原具有特異性之單株抗體藥物。OKT3在先前技術中被描述為有效的T細胞分裂原(Van Wauve,
J. Immunol., 124(1980), 2708-18)以及有效的T細胞殺傷劑(Wong等人,
Transplantation50(1990), 683-9)。在某些實施例中,與BMK-B219或BMK-TCB相比,本文所提供之抗體或其抗原結合片段具有更高的或至少相當的T細胞活化能力。BMK-B219係由Johnson & Johnson開發之抗CD3抗體,且其資訊可在例如WO2019224717A2中找到。BMK-TCB係由Roche開發之抗CD3抗體,且其資訊可在例如WO2019154890A1中找到。
抗CD3抗體之T細胞活化能力可藉由此項技術中熟知之方法量測,例如,可藉由Jurkat NFAT-螢光素酶活化測定來量測。在某些實施例中,T細胞活化能力藉由本發明之實例2.3及實例3.2中描述之方法來量測。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段具有PBMC活化能力。在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段具有比OKT3、BMK-B219及/或BMK-TCB更高的PBMC活化能力。抗CD3抗體之PBMC活化能力可藉由此項技術中熟知之方法來確定,例如,可藉由ELISA測定來確定,例如,量測IL-2及/或IFNγ釋放水平,量測CD3
+T細胞上之CD25表現。在某些實施例中,PBMC活化能力藉由如本發明之實例3.6中所述之方法來量測。
例示性抗 CD3 抗體
在某些實施例中,本發明提供特異性結合至CD3之抗體或其抗原結合片段,其包括:
包含在選自由以下組成之群的重鏈可變(VH)區序列中之任一者內之一個或兩個或三個重鏈互補決定區(HCDR1、HCDR2及/或HCDR3):SEQ ID NO: 7、15、23、31、39、47、55、63、71、79、87、95、108、116、124、132、140、148、156、163、164、165、166、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195及196;及/或
包含在選自由以下組成之群的輕鏈可變(VL)區序列中之任一者內之一個或兩個或三個輕鏈互補決定區(LCDR1、LCDR2及/或LCDR3):SEQ ID NO: 8、16、24、32、40、48、56、64、72、80、88、96、109、117、125、133、141、149、157、168、169、170、197、198、199及200。
熟習此項技術者可藉由此項技術中已知之方法定義或確定VH區或VL區之CDR邊界,只要上述VH區或VL區之胺基酸序列係已知的。例如,抗體或其抗原結合片段之CDR邊界可藉由Kabat、IMGT、Chothia或Al-Lazikani規則來定義或確定(Al-Lazikani, B.、Chothia, C.、Lesk, A. M.,
J. Mol. Biol., 273(4), 927 (1997);Chothia, C.等人,
J. Mol. Biol.12月5日;186(3):651-63 (1985);Chothia, C.及Lesk, A.M.,
J. Mol. Biol., 196,901 (1987);Chothia, C.等人,
Nature. 12月21-28日;342(6252):877-83 (1989);Kabat E.A.等人, Sequences of Proteins of immunological Interest, 第5版 公共衛生署(Public Health Service), 國立衛生研究院(National Institutes of Health), Bethesda, Md. (1991); Marie-Paule Lefranc等人,
Developmental and Comparative Immunology, 27: 55-77 (2003);Marie-Paule Lefranc等人,
Immunome Research, 1(3), (2005);Marie-Paule Lefranc, Molecular Biology of B cells (第二版), 第26章, 481-514, (2015))。在一些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段之CDR邊界係根據Kabat規則確定的。在一些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段之CDR邊界係根據IMGT規則確定的。在一些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段之CDR邊界係根據Chothia規則確定的。在一些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段之CDR邊界係根據Al-Lazikani規則確定的。
在某些實施例中,本發明提供與CD3特異性結合之抗體或其抗原結合片段,上述抗體或其抗原結合片段包括抗CD3抗體25-G12-G6-C12、40-C12-C10-E9、8-B12-F9-B11、31-F8-F5-C5、16-F2-C11-D9、20-E11-E11-C2、7-D9-G10-H2、7-D8-G12-E4、2-F12-A6-G2、3-C6-C11-F12、4-F12-F1-A4、3-F3-G12-E2、124E3D6、126A11A4、127E2D3、133B4C7、140D2B10、147C6F3或147E11E2中之一或多個(例如,1個、2個、3個、4個、5個或6個) CDR序列。
如本文所用,抗體「25-G12-G6-C12」係指小鼠單株抗體,其包括具有SEQ ID NO: 7之序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 8之序列之輕鏈可變區。
如本文所用,抗體「40-C12-C10-E9」係指小鼠單株抗體,其包括具有SEQ ID NO: 15之序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 16之序列之輕鏈可變區。
如本文所用,抗體「8-B12-F9-B11」係指小鼠單株抗體,其包括具有SEQ ID NO: 23之序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 24之序列之輕鏈可變區。
如本文所用,抗體「31-F8-F5-C5」係指小鼠單株抗體,其包括具有SEQ ID NO: 31之序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 32之序列之輕鏈可變區。
如本文所用,抗體「16-F2-C11-D9」係指小鼠單株抗體,其包括具有SEQ ID NO: 39之序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 40之序列之輕鏈可變區。
如本文所用,抗體「20-E11-E11-C2」係指小鼠單株抗體,其包括具有SEQ ID NO: 47之序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 48之序列之輕鏈可變區。
如本文所用,抗體「7-D9-G10-H2」係指小鼠單株抗體,其包括具有SEQ ID NO: 55之序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 56之序列之輕鏈可變區。
如本文所用,抗體「7-D8-G12-E4」係指小鼠單株抗體,其包括具有SEQ ID NO: 63之序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 64之序列之輕鏈可變區。
如本文所用,抗體「2-F12-A6-G2」係指小鼠單株抗體,其包括具有SEQ ID NO: 71之序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 72之序列之輕鏈可變區。
如本文所用,抗體「3-C6-C11-F12」係指小鼠單株抗體,其包括具有SEQ ID NO: 79之序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 80之序列之輕鏈可變區。
如本文所用,抗體「4-F12-F1-A4」係指小鼠單株抗體,其包括具有SEQ ID NO: 87之序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 88之序列之輕鏈可變區。
如本文所用,抗體「3-F3-G12-E2」係指小鼠單株抗體,其包括具有SEQ ID NO: 95之序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 96之序列之輕鏈可變區。
如本文所用,抗體「124E3D6」係指小鼠單株抗體,其包括具有SEQ ID NO: 108之序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 109之序列之輕鏈可變區。
如本文所用,抗體「126A11A4」係指小鼠單株抗體,其包括具有SEQ ID NO: 116之序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 117之序列之輕鏈可變區。
如本文所用,抗體「127E2D3」係指小鼠單株抗體,其包括具有SEQ ID NO: 124之序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 125之序列之輕鏈可變區。
如本文所用,抗體「133B4C7」係指小鼠單株抗體,其包括具有SEQ ID NO: 132之序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 133之序列之輕鏈可變區。
如本文所用,抗體「140D2B10」係指小鼠單株抗體,其包括具有SEQ ID NO: 140之序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 141之序列之輕鏈可變區。
如本文所用,抗體「147C6F3」係指小鼠單株抗體,其包括具有SEQ ID NO: 148之序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 149之序列之輕鏈可變區。
如本文所用,抗體「147E11E2」係指小鼠單株抗體,其包括具有SEQ ID NO: 156之序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 157之序列之輕鏈可變區。
下表3中示出如上所述之各例示性抗體之重鏈可變區及輕鏈可變區的具體胺基酸序列。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括包含在如SEQ ID NO: 7所示之VH區序列內之三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2及HCDR3)以及包含在如SEQ ID NO: 8所示之VL區序列內之三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括包含在如SEQ ID NO: 15所示之VH區序列內之三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2及HCDR3)以及包含在如SEQ ID NO: 16所示之VL區序列內之三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括包含在如SEQ ID NO: 23所示之VH區序列內之三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2及HCDR3)以及包含在如SEQ ID NO: 24所示之VL區序列內之三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括包含在如SEQ ID NO: 31所示之VH區序列內之三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2及HCDR3)以及包含在如SEQ ID NO: 32所示之VL區序列內之三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括包含在如SEQ ID NO: 39所示之VH區序列內之三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2及HCDR3)以及包含在如SEQ ID NO: 40所示之VL區序列內之三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括包含在如SEQ ID NO: 47所示之VH區序列內之三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2及HCDR3)以及包含在如SEQ ID NO: 48所示之VL區序列內之三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括包含在如SEQ ID NO: 55所示之VH區序列內之三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2及HCDR3)以及包含在如SEQ ID NO: 56所示之VL區序列內之三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括包含在如SEQ ID NO: 63所示之VH區序列內之三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2及HCDR3)以及包含在如SEQ ID NO: 64所示之VL區序列內之三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括包含在如SEQ ID NO: 71所示之VL區序列內之三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2及HCDR3)以及包含在如SEQ ID NO: 72所示之VH區序列內之三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括包含在如SEQ ID NO: 79所示之VH區序列內之三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2及HCDR3)以及包含在如SEQ ID NO: 80所示之VL區序列內之三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括包含在如SEQ ID NO: 87所示之VH區序列內之三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2及HCDR3)以及包含在如SEQ ID NO: 88所示之VL區序列內之三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括包含在如SEQ ID NO: 95所示之VH區序列內之三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2及HCDR3)以及包含在如SEQ ID NO: 96所示之VL區序列內之三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括包含在如SEQ ID NO: 108所示之VH區序列內之三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2及HCDR3)以及包含在如SEQ ID NO: 109所示之VL區序列內之三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括包含在如SEQ ID NO: 116所示之VH區序列內之三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2及HCDR3)以及包含在如SEQ ID NO: 117所示之VL區序列內之三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括包含在如SEQ ID NO: 124所示之VH區序列內之三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2及HCDR3)以及包含在如SEQ ID NO: 125所示之VL區序列內之三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括包含在如SEQ ID NO: 132所示之VH區序列內之三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2及HCDR3)以及包含在如SEQ ID NO: 133所示之VL區序列內之三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括包含在如SEQ ID NO: 140所示之VH區序列內之三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2及HCDR3)以及包含在如SEQ ID NO: 141所示之VL區序列內之三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括包含在如SEQ ID NO: 148所示之VH區序列內之三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2及HCDR3)以及包含在如SEQ ID NO: 149所示之VL區序列內之三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括包含在如SEQ ID NO: 156所示之VH區序列內之三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2及HCDR3)以及包含在如SEQ ID NO: 157所示之VL區序列內之三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2及LCDR3)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括至少一個(例如,1個、2個或3個)重鏈CDR或輕鏈CDR,上述CDR包含選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 1、2、3、4、5、6、9、10、11、12、13、14、17、18、19、20、21、22、25、26、27、28、29、30、33、34、35、36、37、38、41、42、43、44、45、46、49、50、51、52、53、54、57、58、59、60、61、62、65、66、67、68、69、70、73、74、75、76、77、78、81、82、83、84、85、86、89、90、91、92、93、94、102、103、104、105、106、107、110、111、112、113、114、115、118、119、120、121、122、123、126、127、128、129、130、131、134、135、136、137、138、139、142、143、144、145、146、147、150、151、152、153、154、155、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、201、162及167。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括VH區,上述VH區包括HCDR1、HCDR2及HCDR3中之一者或兩者或三者,上述HCDR1、HCDR2及HCDR3包含選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 1、2、3、9、10、11、17、18、19、25、26、27、33、34、35、41、42、43、49、50、51、57、58、59、65、66、67、73、74、75、81、82、83、89、90、91、102、103、104、110、111、112、118、119、120、126、127、128、134、135、136、142、143、144、150、151、152、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、201及162。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括VL區,上述VL區包括LCDR1、LCDR2及LCDR3中之一者或兩者或三者,上述LCDR1、LCDR2及LCDR3包含選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 4、5、6、12、13、14、20、21、22、28、29、30、36、37、38、44、45、46、52、53、54、60、61、62、68、69、70、76、77、78、84、85、86、92、93、94、105、106、107、113、114、115、121、122、123、129、130、131、137、138、139、145、146、147、153、154、155、182、183、184、185及167。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 1、9、17、25、33、41、49、57、65、73、81、89、102、110、118、126、134、142及150;上述HCDR2包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 2、10、18、26、34、42、50、58、66、74、82、90、103、111、119、127、135、143、151、171、172、173及201;上述HCDR3包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 3、11、19、27、35、43、51、59、67、75、83、91、104、112、120、128、136、144、152、174、175、176、177、178、179、180、181及162。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 4、12、20、28、36、44、52、60、68、76、84、92、105、113、121、129、137、145及153;上述LCDR2包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 5、13、21、29、37、45、53、61、69、77、85、93、106、114、122、130、138、146及154;上述LCDR3包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 6、14、22、30、38、46、54、62、70、78、86、94、107、115、123、131、139、147、155、182、183、184、185及167。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括:
(a) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 1所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 2所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 3所示之胺基酸序列;
(b) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列;
(c) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 17所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 18所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 19所示之胺基酸序列;
(d) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 25所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 26所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 27所示之胺基酸序列;
(e) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 33所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 34所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 35所示之胺基酸序列;
(f) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 41所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 42所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 43所示之胺基酸序列;
(g) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 49所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 50所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 51所示之胺基酸序列;
(h) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 57所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 58所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 59所示之胺基酸序列;
(i) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 65所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 66所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 67所示之胺基酸序列;
(j) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 73所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 74所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 75所示之胺基酸序列;
(k) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 81所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 82所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 83所示之胺基酸序列;
(l) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 89所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 90所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 91所示之胺基酸序列;
(m) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 102所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 103所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 104所示之胺基酸序列;
(n) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 110所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 111所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 112所示之胺基酸序列;
(o) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 118所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 119所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 120所示之胺基酸序列;
(p) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 126所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 127所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 128所示之胺基酸序列;
(q) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 134所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 135所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 136所示之胺基酸序列;
(r) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 142所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 143所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 144所示之胺基酸序列;
(s) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 150所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 151所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 152所示之胺基酸序列;
(t) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 201所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 162所示之胺基酸序列;或
(u) HCDR1、HCDR2及HCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 10、171、172或173所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 11、174、175、176、177、178、179、180或181所示之胺基酸序列。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括:
(a) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 4所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 5所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 6所示之胺基酸序列;
(b) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列;
(c) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 20所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 21所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 22所示之胺基酸序列;
(d) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 28所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 29所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 30所示之胺基酸序列;
(e) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 36所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 37所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 38所示之胺基酸序列;
(f) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 44所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 45所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 46所示之胺基酸序列;
(g) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 52所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 53所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 54所示之胺基酸序列;
(h) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 60所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 61所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 62所示之胺基酸序列;
(i) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 68所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 69所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 70所示之胺基酸序列;
(j) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 76所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 77所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 78所示之胺基酸序列;
(k) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 84所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 85所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 86所示之胺基酸序列;
(l) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 92所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 93所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 94所示之胺基酸序列;
(m) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 105所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 106所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 107所示之胺基酸序列;
(n) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 113所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 114所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 115所示之胺基酸序列;
(o) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 121所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 122所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 123所示之胺基酸序列;
(p) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 129所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 130所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 131所示之胺基酸序列;
(q) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 137所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 138所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 139所示之胺基酸序列;
(r) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 145所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 146所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 147所示之胺基酸序列;
(s) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 153所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 154所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 155所示之胺基酸序列;
(t) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 167所示之胺基酸序列;或
(u) LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 14、182、183、184或185所示之胺基酸序列。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括:
(a) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 1所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 2所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 3所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 4所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 5所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 6所示之胺基酸序列;
(b) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列;
(c) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 17所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 18所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 19所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 20所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 21所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 22所示之胺基酸序列;
(d) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 25所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 26所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 27所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 28所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 29所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 30所示之胺基酸序列;
(e) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 33所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 34所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 35所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 36所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 37所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 38所示之胺基酸序列;
(f) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 41所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 42所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 43所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 44所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 45所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 46所示之胺基酸序列;
(g) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 49所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 50所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 51所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 52所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 53所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 54所示之胺基酸序列;
(h) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 57所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 58所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 59所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 60所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 61所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 62所示之胺基酸序列;
(i) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 65所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 66所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 67所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 68所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 69所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 70所示之胺基酸序列;
(j) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 73所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 74所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 75所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 76所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 77所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 78所示之胺基酸序列;
(k) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 81所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 82所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 83所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 84所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 85所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 86所示之胺基酸序列;
(l) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 89所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 90所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 91所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 92所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 93所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 94所示之胺基酸序列;
(m) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 102所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 103所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 104所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 105所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 106所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 107所示之胺基酸序列;
(n) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 110所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 111所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 112所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 113所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 114所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 115所示之胺基酸序列;
(o) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 118所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 119所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 120所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 121所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 122所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 123所示之胺基酸序列;
(p) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 126所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 127所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 128所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 129所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 130所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 131所示之胺基酸序列;
(q) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 134所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 135所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 136所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 137所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 138所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 139所示之胺基酸序列;
(r) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 142所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 143所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 144所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 145所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 146所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 147所示之胺基酸序列;
(s) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 150所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 151所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 152所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 153所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 154所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 155所示之胺基酸序列;
(t) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 171所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列;
(u) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 172所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列;
(v) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 173所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列;
(w) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 174所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列;
(x) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 175所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列;
(y) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 176所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列;
(z) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 177所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列;
(aa) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 178所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列;
(bb) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 179所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列;
(cc) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 180所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列;
(dd) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 181所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列;
(ee) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 182所示之胺基酸序列;
(ff) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 183所示之胺基酸序列;
(gg) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 184所示之胺基酸序列;或
(hh) HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,上述HCDR1包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列,上述HCDR2包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列,上述HCDR3包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列,上述LCDR1包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列,上述LCDR2包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列,上述LCDR3包括如SEQ ID NO: 185所示之胺基酸序列。
下表1中示出上述19種單株抗體中之各單株抗體之重鏈(表示為「H」)可變區、輕鏈(表示為「L」)可變區、HCDR及LCDR之SEQ ID NO。除非另有說明,否則如本文描述之CDR邊界均由Kabat規則定義或確定。下表2中示出19種例示性單株抗體之各CDR之胺基酸序列。下表3中示出19種例示性單株抗體之各VH及VL之胺基酸序列。
表 1. 19 種例示性單株抗體之 VH 、 VL 、 HCDR 及 LCDR 之 SEQ ID NO
表 2. 19 種例示性單株抗體之各 CDR 之胺基酸序列
表 3. 19 種例示性單株抗體之各 VH 及 VL 之胺基酸序列
| 抗體 | 鏈 | 可變區 (SEQ ID NO) | CDR1 (SEQ ID NO) | CDR2 (SEQ ID NO) | CDR3 (SEQ ID NO) |
| 25-G12-G6-C12 | H | 7 | 1 | 2 | 3 |
| L | 8 | 4 | 5 | 6 | |
| 40-C12-C10-E9 | H | 15 | 9 | 10 | 11 |
| L | 16 | 12 | 13 | 14 | |
| 8-B12-F9-B11 | H | 23 | 17 | 18 | 19 |
| L | 24 | 20 | 21 | 22 | |
| 31-F8-F5-C5 | H | 31 | 25 | 26 | 27 |
| L | 32 | 28 | 29 | 30 | |
| 16-F2-C11-D9 | H | 39 | 33 | 34 | 35 |
| L | 40 | 36 | 37 | 38 | |
| 20-E11-E11-C2 | H | 47 | 41 | 42 | 43 |
| L | 48 | 44 | 45 | 46 | |
| 7-D9-G10-H2 | H | 55 | 49 | 50 | 51 |
| L | 56 | 52 | 53 | 54 | |
| 7-D8-G12-E4 | H | 63 | 57 | 58 | 59 |
| L | 64 | 60 | 61 | 62 | |
| 2-F12-A6-G2 | H | 71 | 65 | 66 | 67 |
| L | 72 | 68 | 69 | 70 | |
| 3-C6-C11-F12 | H | 79 | 73 | 74 | 75 |
| L | 80 | 76 | 77 | 78 | |
| 4-F12-F1-A4 | H | 87 | 81 | 82 | 83 |
| L | 88 | 84 | 85 | 86 | |
| 3-F3-G12-E2 | H | 95 | 89 | 90 | 91 |
| L | 96 | 92 | 93 | 94 | |
| 124E3D6 | H | 108 | 102 | 103 | 104 |
| L | 109 | 105 | 106 | 107 | |
| 126A11A4 | H | 116 | 110 | 111 | 112 |
| L | 117 | 113 | 114 | 115 | |
| 127E2D3 | H | 124 | 118 | 119 | 120 |
| L | 125 | 121 | 122 | 123 | |
| 133B4C7 | H | 132 | 126 | 127 | 128 |
| L | 133 | 129 | 130 | 131 | |
| 140D2B10 | H | 140 | 134 | 135 | 136 |
| L | 141 | 137 | 138 | 139 | |
| 147C6F3 | H | 148 | 142 | 143 | 144 |
| L | 149 | 145 | 146 | 147 | |
| 147E11E2 | H | 156 | 150 | 151 | 152 |
| L | 157 | 153 | 154 | 155 |
| 描述 | SEQ ID NO | 胺基酸序列 |
| HCDR1 | 1 | SYVIY |
| 9 | SYVIH | |
| 17 | DYGMH | |
| 25 | RYPIH | |
| 33 | DFNIH | |
| 41 | DYYMN | |
| 49 | GYFMN | |
| 57 | SYPMS | |
| 65 | SYGVS | |
| 73 | TYGMH | |
| 81 | SYTMS | |
| 89 | DYYMN | |
| 102 | SYWMH | |
| 110 | SYWMH | |
| 118 | SYWMH | |
| 126 | SYWMH | |
| 134 | SYWMH | |
| 142 | SYWMH | |
| 150 | SYWMH | |
| HCDR2 | 2 | YINPYKDVTKYSEKFND |
| 10 | YINPYNDVIKYNEKFKG | |
| 18 | YISSASGKIYYADTVKG | |
| 26 | YINPRNDYTKYTQRFKD | |
| 34 | YINPNDGGSTYNQKFKG | |
| 42 | DINPIHGGISSNQKFSD | |
| 50 | RFNPYNGDTFYNQNFKG | |
| 58 | TISSGGGNTYYPDSVKG | |
| 66 | VIWGDGNTNYNSDLKT | |
| 74 | YISNGGSTIYYADSVKG | |
| 82 | TISSGGGNTFYADSVKG | |
| 90 | EINPNNGGTTYRQTFKG | |
| 103 | NINPSNGDTNYNEKFKS | |
| 111 | NINPSNGDTNYNEKFKS | |
| 119 | NIYPGSSSINYNEKFKS | |
| 127 | NINPSNGDTNFNEKFKS | |
| 135 | NINPSNGESNYNEKFKS | |
| 143 | NLNPSNGEINYNEKFKH | |
| 151 | NINPSNGATNYNEKFKS | |
| HCDR3 | 3 | AIYHDYDGFGY |
| 11 | DSYYSYDGFAY | |
| 19 | VLRWSVNYVMDY | |
| 27 | SINDYDGFAY | |
| 35 | PFLDS | |
| 43 | RIYYGYDWYFDV | |
| 51 | GDY | |
| 59 | GLYWYFDV | |
| 67 | VSYWYFDV | |
| 75 | PTWGGFAY | |
| 83 | SLYYYDGTYVRKDYYAMDY | |
| 91 | SGY | |
| 104 | DRSSQYYFDY | |
| 112 | DRSSQYYFDY | |
| 120 | DRSSQYYFDY | |
| 128 | DRSSQYYFDY | |
| 136 | DRSSQYYFDY | |
| 144 | DRSSQYYFDY | |
| 152 | DRSSQYYFDY | |
| LCDR1 | 4 | SASSSVTYIN |
| 12 | SASSSVSYMH | |
| 20 | ESSQSVLYSSNQKNYLA | |
| 28 | SASSSVSYMN | |
| 36 | KASQDINSYLR | |
| 44 | SASSSVTSRYFF | |
| 52 | KSSQSLLDSDGKTYLN | |
| 60 | RSSQSIAHSNGDTYLE | |
| 68 | RASENIYSYLA | |
| 76 | RSSQSIAHSNGDTYLE | |
| 84 | RASENIFSNLA | |
| 92 | RSSQSIVHSNGNTYLE | |
| 105 | KSSQSLLNSRTRKNYLA | |
| 113 | KSSQSLLNSRTRKNYLA | |
| 121 | KSSQSLLNSRTRKNYLA | |
| 129 | KSSQSLLNSRTRKNYLA | |
| 137 | KSSQSLLNSRTRKNYLA | |
| 145 | KSSQSLLNSRTRKNYLA | |
| 153 | KSSQSLLNSRSRKNYLA | |
| LCDR2 | 5 | DTSKLAS |
| 13 | DTSKLAS | |
| 21 | WASTRES | |
| 29 | DTSKLAS | |
| 37 | GASSLVD | |
| 45 | STSNLAS | |
| 53 | LVSKLDS | |
| 61 | KVSNRIS | |
| 69 | NAKTLPE | |
| 77 | KVSNRIS | |
| 85 | AATNLAE | |
| 93 | KVSNRFS | |
| 106 | WASTRES | |
| 114 | WASTRES | |
| 122 | WASTRES | |
| 130 | WASTRES | |
| 138 | WASTRES | |
| 146 | WASTRES | |
| 154 | WASTRES | |
| LCDR3 | 6 | QQWSRNPLT |
| 14 | QQWSSNPPT | |
| 22 | HQYLSSWT | |
| 30 | QQWSSNPLT | |
| 38 | LQYDEVPLT | |
| 46 | QQYSTSPST | |
| 54 | WQGTHFPFT | |
| 62 | FQGSHVPYT | |
| 70 | QHHYGTPPT | |
| 78 | FQGSHVPYT | |
| 86 | QQFWGTPWT | |
| 94 | FQGSHVPRT | |
| 107 | KQSYNLRT | |
| 115 | KQSFILRT | |
| 123 | TQSYNLRT | |
| 131 | KQSYTLRT | |
| 139 | KQSYTLRT | |
| 147 | KQSYILRT | |
| 155 | TQSYTLRT |
| 抗體 | VH(SEQ ID NO) | VL(SEQ ID NO) |
| 25-G12-G6-C12 | EVQLQQSGPELVKPGASVKMSCKASGYKFTSYVIYWVKQKPGQGLEWIGYINPYKDVTKYSEKFNDKATLTSDKSSSTAYMEISSLTSEDSAVYYCARAIYHDYDGFGYWGQGTLVIVSA (SEQ ID NO: 7) | QIVLTQSPAIMSASPGEKVTMTCSASSSVTYINWYQQMSGTSPKRWIYDTSKLASGVPARFSGSGSGTSYSLTISSLEAEDAATYYCQQWSRNPLTFGAGTKLELK (SEQ ID NO: 8) |
| 40-C12-C10-E9 | EVQLQLSGPELVKPGASVKMSCKASGYTFSSYVIHWVKQKPGQGLEWIGYINPYNDVIKYNEKFKGKATLTSDKSSSTAYMELSSLTSEDSAVYYCARDSYYSYDGFAYWGQGTLVTVSA (SEQ ID NO: 15) | QIVLTQSPAIMSASPGEKVTMTCSASSSVSYMHWYQQKSGTSPKRWIYDTSKLASGVPARFSGSGSGTSYSLTISSMEAEDAATYYCQQWSSNPPTFGGGTKVEIK (SEQ ID NO: 16) |
| 8-B12-F9-B11 | EVQLVESGGGIVKPGGSRKLSCAASGFTFSDYGMHWVRQAPEKGLEWIAYISSASGKIYYADTVKGRFTISRDNAKNILFLQMTSLRSEDTAMYYCARVLRWSVNYVMDYWGQGTSVTVSS (SEQ ID NO: 23) | DIVMTQSPSSLAVSAGEKVTMNCESSQSVLYSSNQKNYLAWYQQKPGQSPKLLIYWASTRESGVPDRFTGTGSGTDFTLTISSVQAEDLAVYYCHQYLSSWTFGGGTKLEIK (SEQ ID NO: 24) |
| 31-F8-F5-C5 | EVQLQQSGAELARPGASVRMSCKASGYTFTRYPIHWVKQRPGQGLEWIGYINPRNDYTKYTQRFKDKATLTADKSSSTAYMQLSSLTSEDSAVYYCAKSINDYDGFAYWGQGTLVTVSA (SEQ ID NO: 31) | DIVLSQSPTILSASPGEKVTMTCSASSSVSYMNWYQQRSGTSPKRWIYDTSKLASGVPARFSGSGSGTSYSLTISSMEAEDAATYYCQQWSSNPLTFGAGTKLELK (SEQ ID NO: 32) |
| 16-F2-C11-D9 | EVQLQQSGPELVKPGASVKMSCKASGYTFTDFNIHWVKQSLGKSLEWIGYINPNDGGSTYNQKFKGKATLTINKSSSSAYMELRSLTSEDSAVYYCAIPFLDSWGQGTSVTVSS (SEQ ID NO: 39) | TLMMTQSPSSMYASLGERVTITCKASQDINSYLRWYQQKPGKSPKTLIYGASSLVDGVPSRFSGRGSGQDYSLTISSLEYEDMGIYYCLQYDEVPLTFGAGTKLELK (SEQ ID NO: 40) |
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考慮到19種例示性單株抗體中之各單株抗體均可與CD3結合,且抗原結合特異性主要係由CDR1區、CDR2區及CDR3區提供,19種例示性單株抗體中之各單株抗體之HCDR1序列、HCDR2序列及HCDR3序列以及LCDR1序列、LCDR2序列及LCDR3序列可被「混合及匹配」(亦即,來自不同抗體之CDR可被混合及匹配,但各抗體必須包含HCDR1、HCDR2及HCDR3以及LCDR1、LCDR2及LCDR3)以產生本發明之抗CD3抗體或其抗原結合片段。可使用上述及實施例中之結合測定來測試此類「混合及匹配」抗體與CD3之結合。較佳地,當VH CDR序列被混合及匹配時,來自特定VH序列之HCDR1序列、HCDR2序列及/或HCDR3序列被結構上類似的CDR序列替換。同樣,當VL CDR序列被混合及匹配時,來自特定VL序列之LCDR1序列、LCDR2序列及/或LCDR3序列較佳被結構上類似的CDR序列替換。例如,抗體25-G12-G6-C12及40-C12-C10-E9之HCDR1共用一些結構相似性,且因此易於混合及匹配。對熟習此項技術者顯而易見的是,可藉由用來自19種例示性單株抗體之本文揭示之CDR序列之結構上類似的序列取代一或多個VH及/或VL CDR序列來產生新穎VH及VL序列。
已知CDR負責抗原結合。然而,已發現並非所有6個CDR均為不可缺少或不可改變的。換言之,可替換或改變或修飾19種例示性單株抗體中之各單株抗體之一或多個CDR,但基本上保留對CD3之特異性結合親和力。
在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體及抗原結合片段包括抗CD3抗體25-G12-G6-C12、40-C12-C10-E9、8-B12-F9-B11、31-F8-F5-C5、16-F2-C11-D9、20-E11-E11-C2、7-D9-G10-H2、7-D8-G12-E4、2-F12-A6-G2、3-C6-C11-F12、4-F12-F1-A4、3-F3-G12-E2、124E3D6、126A11A4、127E2D3、133B4C7、140D2B10、147C6F3及147E11E2中之一者之重鏈CDR3序列。在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體及抗原結合片段包括選自由以下組成之群的重鏈CDR3序列:SEQ ID NO: 3、11、19、27、35、43、51、59、67、75、83、91、104、112、120、128、136、144及152。重鏈CDR3區位於抗原結合位點之中心,且因此被認為與抗原接觸最緊密,且為抗體提供對抗原之親和力的最多自由量。亦認為,藉由多種多樣化機制,重鏈CDR3係迄今為止抗原結合位點在長度、胺基酸組成及構形方面最多樣化的CDR (Tonegawa S.
Nature302:575-81)。重鏈CDR3之多樣性足以產生大多數抗體特異性(Xu JL、Davis MM.
Immunity.13:37-45)以及理想的抗原結合親和力(Schier R等人,
J Mol Biol.263:551-67)。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括VH區,上述VH區具有如SEQ ID NO: 7、15、23、31、39、47、55、63、71、79、87、95、108、116、124、132、140、148、156、163、164、165、166、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195或196所示之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 7、15、23、31、39、47、55、63、71、79、87、95、108、116、124、132、140、148、156、163、164、165、166、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195或196具有至少80%(例如,至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%)序列一致性之同源序列。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括VL區,上述VL區具有如SEQ ID NO: 8、16、24、32、40、48、56、64、72、80、88、96、109、117、125、133、141、149、157、168、169、170、197、198、199或200所示之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 8、16、24、32、40、48、56、64、72、80、88、96、109、117、125、133、141、149、157、168、169、170、197、198、199或200具有至少80% (例如,至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%)序列一致性之同源序列。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段包括VH/VL胺基酸序列對,上述胺基酸序列對選自由以下組成之群:SEQ ID NO: 7/8、15/16、23/24、31/32、39/40、47/48、55/56、63/64、71/72、79/80、87/88、95/96、108/109、116/117、124/125、132/133、140/141、148/149、156/157、163/168、163/169、163/170、164/168、164/169、164/170、165/168、165/169、165/170、166/168、166/169、166/170、186/169、187/169、188/169、189/169、190/169、191/169、192/169、193/169、194/169、195/169、196/169、165/197、165/198、165/199及165/200。
在某些實施例中,本文所提供之抗體及其抗原結合片段包括合適的框架區(FR)序列,只要上述抗體及其抗原結合片段可特異性結合至CD3即可。上表2中提供之CDR序列係獲自小鼠抗體,但上述CDR序列可使用如重組技術等此項技術中已知的合適方法移植至如小鼠、人、大鼠、兔等任何合適物種之任何合適FR序列中。
在某些實施例中,本文所提供之抗體及其抗原結合片段係人源化的。期望的人源化抗體或其抗原結合片段在人類中具有降低的免疫原性。人源化抗體在其可變區係嵌合的,因為非人類CDR序列被移植至人或基本上為人類之FR序列。抗體或抗原結合片段之人源化基本上可藉由用非人類(如鼠) CDR基因取代人類免疫球蛋白基因中之對應人類CDR基因來進行(參見例如Jones等人(1986)
Nature321:522-525;Riechmann等人(1988)
Nature332:323-327;Verhoeyen等人(1988)
Science239:1534-1536)。
可使用此項技術中已知之方法選擇合適的人類重鏈及輕鏈可變域以實現此目的。在說明性實例中,可使用「最佳擬合」方法,其中針對已知人類可變域序列之資料庫篩選或BLAST非人(例如,嚙齒動物)抗體可變域序列,鑑定出最接近非人類查詢序列之人類序列,且用作用於移植非人類CDR序列之人類框架(參見例如Sims等人, (1993)
J. Immunol.151:2296;Chothia等人(1987)
J. Mot. Biol.196:901)。替代地,來源於所有人類抗體之共有序列之框架可用於移植非人類CDR (參見例如Carter等人(1992)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89:4285;Presta等人(1993)
J. Immunol., 151:2623)。
在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段係人源化的。在某些實施例中,除了非人類CDR序列之外,本文所提供之人源化抗體或其抗原結合片段由基本上全人序列構成。在一些實施例中,可變區FR及恆定區(若存在)完全或基本上來自人類免疫球蛋白序列。人類FR序列及人恆定區序列可源自不同的人類免疫球蛋白基因,例如,FR序列源自一種人類抗體且恆定區源自另一種人類抗體。在一些實施例中,人源化抗體或其抗原結合片段包括人類重鏈HFR1、HFR2、HFR3及HFR4及/或輕鏈LFR1、LFR2、LFR3及LFR4。
在一些實施例中,源自人類之FR區可包括與其所源自之人類免疫球蛋白相同的胺基酸序列。在一些實施例中,人類FR之一或多個胺基酸殘基被來自親本非人類抗體之對應殘基取代。在某些可能期望的實施例中,以使人源化抗體或其片段非常接近非人類親本抗體之結構,從而使其結合特性(例如,增加結合親和力)最佳化。在某些實施例中,本文所提供之人源化抗體或其抗原結合片段在多個人類FR序列中之各人類FR序列中包括不超過10、9、8、7、6、5、4、3、2或1個胺基酸殘基取代,或者在重鏈可變域或輕鏈可變域之所有FR序列中包括不超過10、9、8、7、6、5、4、3、2或1個胺基酸殘基取代。在一些實施例中,胺基酸殘基之此類變化可僅存在於重鏈FR區、僅存在於輕鏈FR區、或存在於兩條鏈中。在某些實施例中,使人類FR序列之一或多個胺基酸隨機突變以增加結合親和力。在某些實施例中,使人類FR序列之一或多個胺基酸回復突變為親本非人類抗體之對應胺基酸以增加結合親和力。
在一些實施例中,選自在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類輕鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 168之位置45、46、48及70 (分別對應於根據Kabat編號之位置46、47、49及71,或分別對應於根據IMGT編號之位置52、53、55及87)組成之群的位置處之一個、兩個、三個或四個胺基酸被回突變為親本小鼠抗體之相應胺基酸。
例如,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類輕鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 168之位置45 (對應於根據Kabat編號之位置46,或對應於根據IMGT編號之位置52)處之一個胺基酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在一個實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類輕鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 168之位置45 (對應於根據Kabat編號之位置46,或對應於根據IMGT編號之位置52)處之白胺酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在另一實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類輕鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 168之位置45 (對應於根據Kabat編號之位置46,或對應於根據IMGT編號之位置52)處之白胺酸被突變為精胺酸(亦即L45R)。
對於另一實例,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類輕鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 168之位置46 (對應於根據Kabat編號之位置47,或對應於根據IMGT編號之位置53)處之一個胺基酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在一個實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類輕鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 168之位置46 (對應於根據Kabat編號之位置47,或對應於根據IMGT編號之位置53)處之白胺酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在另一實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類輕鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 168之位置46 (對應於根據Kabat編號之位置47,或對應於根據IMGT編號之位置53)處之白胺酸被突變為色胺酸(亦即L46W)。
對於又一實例,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類輕鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 168之位置48 (對應於根據Kabat編號之位置49,或根據IMGT編號之位置55)處之一個胺基酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在一個實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類輕鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 168之位置48 (對應於根據Kabat編號之位置49,或根據IMGT編號之位置55)處之離胺酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在另一實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類輕鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 168的位置48 (對應於根據Kabat編號之位置49,或根據IMGT編號之位置55)處之離胺酸被突變為酪胺酸(亦即,K48Y)。
對於又一實例,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類輕鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 168之位置70 (對應於根據Kabat編號之位置71,或根據IMGT編號之位置87)處之一個胺基酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在一個實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類輕鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 168之位置70 (對應於根據Kabat編號之位置71,或根據IMGT編號之位置87)處之苯丙胺酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在另一實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類輕鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 168之位置70 (對應於根據Kabat編號之位置71,或根據IMGT編號之位置87)處之苯丙胺酸被突變為酪胺酸(亦即F70Y)。
對於又一實例,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類輕鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 168之位置45 (對應於根據Kabat編號之位置46,或根據IMGT編號之位置52)處之一個胺基酸及在相對於SEQ ID NO: 168之位置48 (對應於根據Kabat編號之位置49,或根據IMGT編號之位置55)處之一個胺基酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在一個實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類輕鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 168之位置45 (對應於根據Kabat編號之位置46,或根據IMGT編號之位置52)處之白胺酸及在相對於SEQ ID NO: 168之位置48 (對應於根據Kabat編號之位置49,或根據IMGT編號之位置55)處之離胺酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在另一實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類輕鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 168之位置45 (對應於根據Kabat編號之位置46,或根據IMGT編號之位置52)處之白胺酸及相對於SEQ ID NO: 168之位置48 (對應於根據Kabat編號之位置49,或根據IMGT編號之位置55)處之離胺酸分別被回突變為精胺酸及酪胺酸(亦即L45R+K48Y)。
對於又一實例,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類輕鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 168之位置45、46、48及70 (分別對應於根據Kabat編號之位置46、47、49及71,或分別對應於根據IMGT編號之位置52、53、55及87)處之各胺基酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在一個實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類輕鏈FR序列的分別相對於SEQ ID NO: 168之位置45、46、48及70 (分別對應於根據Kabat編號之位置46、47、49及71,或分別對應於根據IMGT編號之位置52、53、55及87)處之白胺酸、白胺酸、離胺酸及苯丙胺酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在另一實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類輕鏈FR序列的分別相對於SEQ ID NO: 168之位置45、46、48及70 (分別對應於根據Kabat編號之位置46、47、49及71,或分別對應於根據IMGT編號之位置52、53、55及87)處之白胺酸、白胺酸、離胺酸及苯丙胺酸分別被突變為精胺酸、色胺酸、酪胺酸及酪胺酸(亦即L45R+L46W+K48Y+F70Y)。
在一些實施例中,選自在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 163之位置27、48、68、70及72 (分別對應於根據Kabat編號之位置27、48、67、69及71,或分別對應於根據IMGT編號之位置28、53、76、78及80)組成之群的位置處之一個、兩個、三個、四個或五個胺基酸被回突變為親本小鼠抗體之相應胺基酸。
例如,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 163之位置27 (對應於根據Kabat編號之位置27,或對應於根據IMGT編號之位置28)處之一個胺基酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在一個實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 163之位置27 (對應於根據Kabat編號之位置27,或對應於根據IMGT編號之位置28)處之甘胺酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在另一實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 163之位置27 (對應於根據Kabat編號之位置27,或對應於根據IMGT編號之位置28)處之甘胺酸被回突變為酪胺酸(亦即G27Y)。
對於另一實例,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 163之位置48 (對應於根據Kabat編號之位置48,或對應於根據IMGT編號之位置53)處之一個胺基酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在一個實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 163之位置48 (對應於根據Kabat編號之位置48,或對應於根據IMGT編號之位置53)處之甲硫胺酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在另一實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 163之位置48 (對應於根據Kabat編號之位置48,或對應於根據IMGT編號之位置53)處之甲硫胺酸被回突變為異白胺酸(亦即M48I)。
對於另一實例,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 163之位置68 (對應於根據Kabat編號之位置67,或對應於根據IMGT編號之位置76)處之一個胺基酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在一個實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 163之位置68 (對應於根據Kabat編號之位置67,或對應於根據IMGT編號之位置76)處之纈胺酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在另一實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 163之位置68 (對應於根據Kabat編號之位置67,或對應於根據IMGT編號之位置76)處之纈胺酸被回突變為丙胺酸(亦即V68A)。
對於另一實例,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 163之位置70 (對應於根據Kabat編號之位置69,或對應於根據IMGT編號之位置78)處之一個胺基酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在一個實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 163之位置70 (對應於根據Kabat編號之位置69,或對應於根據IMGT編號之位置78)處之異白胺酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在另一實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 163之位置70 (對應於根據Kabat編號之位置69,或對應於根據IMGT編號之位置78)處之異白胺酸被回突變為白胺酸(亦即I70L)。
對於另一實例,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 163之位置72 (對應於根據Kabat編號之位置71,或對應於根據IMGT編號之位置80)處之一個胺基酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在一個實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 163之位置72 (對應於根據Kabat編號之位置71,或對應於根據IMGT編號之位置80)處之丙胺酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在另一實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 163之位置72 (對應於根據Kabat編號之位置71,或對應於根據IMGT編號之位置80)處之丙胺酸被回突變為絲胺酸(亦即,A72S)。
對於又一實例,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 163之位置27、70及72 (分別對應於根據Kabat編號之位置27、69及71,或分別對應於根據IMGT編號之位置28、78及80)處之各胺基酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在一個實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的分別相對於SEQ ID NO: 163之位置27、70及72 (分別對應於根據Kabat編號之位置27、69及71,或分別對應於根據IMGT編號之位置28、78及80)處之甘胺酸、異白胺酸及丙胺酸分別被突變為酪胺酸、白胺酸及絲胺酸(亦即G27Y+I70L+A72S)。
對於又一實例,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的相對於SEQ ID NO: 163之位置27、48、68、70及72 (分別對應於根據Kabat編號之位置27、48、67、69及71,或分別對應於根據IMGT編號之位置28、53、76、78及80)處之各胺基酸被回突變為親代小鼠抗體之相應胺基酸。在一個實施例中,在本文所提供之人源化抗CD3抗體或其抗原結合片段之人類重鏈FR序列的分別相對於SEQ ID NO: 163之位置27、48、68、70及72 (分別對應於根據Kabat編號之位置27、48、67、69及71,或分別對應於根據IMGT編號之位置28、53、76、78及80)處之甘胺酸、甲硫胺酸、纈胺酸、異白胺酸及丙胺酸分別被突變為酪胺酸、異白胺酸、丙胺酸、白胺酸及絲胺酸(亦即G27Y+M48I+V68A+I70L+A72S)。
在一些實施例中,本發明提供一種殖株40-C12-C10-E9之人源化抗體或其抗原結合片段(在本發明中亦被稱為「人源化40-C12-C10-E9」)。在一些實施例中,本發明提供12種人源化40-C12-C10-E9,其分別被命名為hu40E9-L1H1、hu40E9-L1H2、hu40E9-L1H3、hu40E9-L1H4、hu40E9-L2H1、hu40E9-L2H2、hu40E9-L2H3、hu40E9-L2H4、hu40E9-L3H1、hu40E9-L3H2、hu40E9-L3H3及hu40E9-L3H4。各人源化40-C12-C10-E9之重鏈及輕鏈可變區之SEQ ID NO在下表20中示出(藉由Kabat之慣例鑑定之CDR序列被加底線)。12種人源化40-C12-C10-E9殖株中之各者均包括HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,其分別包括如SEQ ID NO: 9、10、11、12、13及14所示之胺基酸序列。
在一些實施例中,本文所提供之人源化抗體或其抗原結合片段包括VH區,該VH區具有如SEQ ID NO: 163、164、165或166所示之胺基酸序列,或與SEQ ID NO: 163、164、165或166具有至少80%(例如,至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%)序列一致性之同源序列。在一些實施例中,本文所提供之人源化抗體或其抗原結合片段包括VL區,該VL區具有如SEQ ID NO: 168、169或170所示之胺基酸序列,或與SEQ ID NO: 168、169或170具有至少80%(例如,至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%)序列一致性之同源序列。
本發明亦提供殖株40-C12-C10-E9之例示性人源化抗體,包括:
1)「hu40E9-L1H1」,其包括hu40E9-H1之重鏈可變區(SEQ ID NO: 163)及hu40E9-L1之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 168);
2)「hu40E9-L1H2」,其包括hu40E9-H2之重鏈可變區(SEQ ID NO: 164)及hu40E9-L1之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 168);
3)「hu40E9-L1H3」,其包括hu40E9-H3之重鏈可變區(SEQ ID NO: 165)及hu40E9-L1之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 168);
4)「hu40E9-L1H4」,其包括hu40E9-H4之重鏈可變區(SEQ ID NO: 166)及hu40E9-L1之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 168);
5)「hu40E9-L2H1」,其包括hu40E9-H1之重鏈可變區(SEQ ID NO: 163)及hu40E9-L2之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 169);
6)「hu40E9-L2H2」,其包括hu40E9-H2之重鏈可變區(SEQ ID NO: 164)及hu40E9-L2之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 169);
7)「hu40E9-L2H3」,其包括hu40E9-H3之重鏈可變區(SEQ ID NO: 165)及hu40E9-L2之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 169);
8)「hu40E9-L2H4」,其包括hu40E9-H4之重鏈可變區(SEQ ID NO: 166)及hu40E9-L2之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 169);
9)「hu40E9-L3H1」,其包括hu40E9-H1之重鏈可變區(SEQ ID NO: 163)及hu40E9-L3之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 170);
10)「hu40E9-L3H2」,其包括hu40E9-H2之重鏈可變區(SEQ ID NO: 164)及hu40E9-L3之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 170);
11)「hu40E9-L3H3」,其包括hu40E9-H3之重鏈可變區(SEQ ID NO: 165)及hu40E9-L3之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 170);或者
12)「hu40E9-L3H4」,其包括hu40E9-H4之重鏈可變區(SEQ ID NO: 166)及hu40E9-L3之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 170)。
表 20. 人源化 40-C12-C10-E9 之各 VH 及 VL 之胺基酸序列
| 描述 | SEQ ID NO | 胺基酸序列 |
| hu40E9-H1 | 163 | EVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFS SYVIHWVRQAPGQGLEWMG YINPYNDVIKYNEKFKGRVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR DSYYSYDGFAYWGQGTLVTVSS |
| hu40E9-H2 | 164 | EVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFS SYVIHWVRQAPGQGLEWMG YINPYNDVIKYNEKFKGRVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR DSYYSYDGFAYWGQGTLVTVSS |
| hu40E9-H3 | 165 | EVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFS SYVIHWVRQAPGQGLEWMG YINPYNDVIKYNEKFKGRVTLTSDKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR DSYYSYDGFAYWGQGTLVTVSS |
| hu40E9-H4 | 166 | EVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFS SYVIHWVRQAPGQGLEWIG YINPYNDVIKYNEKFKGRATLTSDKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR DSYYSYDGFAYWGQGTLVTVSS |
| hu40E9-L1 | 168 | EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITC SASSSVSYMHWYQQKPDQSPKLLIK DTSKLASGVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYYC QQWSSNPPTFGGGTKVEIK |
| hu40E9-L2 | 169 | EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITC SASSSVSYMHWYQQKPDQSPKRLIY DTSKLASGVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYYC QQWSSNPPTFGGGTKVEIK |
| hu40E9-L3 | 170 | EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITC SASSSVSYMHWYQQKPDQSPKRWIY DTSKLASGVPSRFSGSGSGTDYTLTINSLEAEDAATYYC QQWSSNPPTFGGGTKVEIK |
本發明亦提供特異性結合至CD3之人源化及親和力改良之抗體或其抗原結合片段。在一些實施例中,親和力成熟係基於hu40E9-H3及hu40E9-L2之序列進行,其具有與殖株40-C12-C10-E9相同的CDR。在一些實施例中,候選抗體之一或多個CDR內之一或多個胺基酸被突變以提高親和力,例如,突變發生在候選抗體之HCDR2 (例如,相對於SEQ ID NO: 165之位置54-56)、HCDR3 (例如,相對於SEQ ID NO: 165之位置99-106)或LCDR3 (例如,相對於SEQ ID NO: 169之位置91-93)內。因此,本發明提供抗CD3抗體或其抗原結合片段,其具有與殖株40-C12-C10-E9相同的CDR,除了HCDR2、HCDR3或LCDR3之胺基酸序列不同外。
在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括有包括如SEQ ID NO: 201所示之胺基酸序列之HCDR2。在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括有包括如SEQ ID NO: 10、171、172或173所示之胺基酸序列之HCDR2。
在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括有包括如SEQ ID NO: 162所示之胺基酸序列之HCDR3。在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括有包括如SEQ ID NO: 11、174、175、176、177、178、179、180或181所示之胺基酸序列之HCDR3。
在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括有包括如SEQ ID NO: 167所示之胺基酸序列之LCDR3。在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括有包括如SEQ ID NO: 14、182、183、184或185所示之胺基酸序列之LCDR3。
在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括:包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 201所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 162所示之胺基酸序列之HCDR3。在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括:包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 167所示之胺基酸序列之LCDR3。在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及LCDR3,其分別包括如SEQ ID NO: 9、201、162、12、13及167所示之胺基酸序列。
在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括:包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1;包括如SEQ ID NO: 10、171、172或173所示之胺基酸序列之HCDR2;包括如SEQ ID NO: 11、174、175、176、177、178、179、180或181所示之胺基酸序列之HCDR3。在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括:包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1;包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2;以及包括如SEQ ID NO: 14、182、183、184或185所示之胺基酸序列之LCDR3。在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括:包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1;包括如SEQ ID NO: 10、171、172或173所示之胺基酸序列之HCDR2;包括如SEQ ID NO: 11、174、175、176、177、178、179、180或181所示之胺基酸序列之HCDR3;包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1;包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2;以及包括如SEQ ID NO: 14、182、183、184或185所示之胺基酸序列之LCDR3。
SEQ ID NO: 171-185、201、162及167之胺基酸序列在下表22中示出。
在一些實施例中,本發明提供特異性結合至CD3之抗體或其抗原結合片段,其包括一個或兩個或三個HCDR,該HCDR被包含在選自由以下組成之群的VH區序列中之任一者中:SEQ ID NO: 186、187、188、189、190、191、192、193、194、195及196;及/或一個或兩個或三個LCDR,該LCDR被包含在選自由以下組成之群的VL區序列中之任一者中:SEQ ID NO: 197、198、199及200。在一些實施例中,本發明亦提供抗CD3抗體或其抗原結合片段,其包括HCDR1、HCDR2及HCDR3,其被包含在選自SEQ ID NO: 186、187、188、189、190、191、192、193、194、195及196組成之群的VH區序列中之任一者中;以及LCDR1、LCDR2及LCDR3,其被包含在選自SEQ ID NO: 197、198、199及200組成之群的VL區序列中之任一者中。
SEQ ID NO: 186-200之胺基酸序列在下表21中示出。
表 21. 例示性 VH 及 VL 區之胺基酸序列
表 22. 例示性 CDR 之胺基酸序列
| 描述 | SEQ ID NO | 胺基酸序列 |
| hu40E9-H3-N55S.H | 186 | EVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFSSYVIHWVRQAPGQGLEWMGYINPY SDVIKYNEKFKGRVTLTSDKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARDSYYSYDGFAYWGQGTLVTVSS |
| hu40E9-H3-D99E.H | 187 | EVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFSSYVIHWVRQAPGQGLEWMGYINPYNDVIKYNEKFKGRVTLTSDKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR ESYYSYDGFAYWGQGTLVTVSS |
| hu40E9-H3-Y101F.H | 188 | EVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFSSYVIHWVRQAPGQGLEWMGYINPYNDVIKYNEKFKGRVTLTSDKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARDS FYSYDGFAYWGQGTLVTVSS |
| hu40E9-H3-D105E.H | 189 | EVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFSSYVIHWVRQAPGQGLEWMGYINPYNDVIKYNEKFKGRVTLTSDKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARDSYYSY EGFAYWGQGTLVTVSS |
| hu40E9-H3-G106A.H | 190 | EVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFSSYVIHWVRQAPGQGLEWMGYINPYNDVIKYNEKFKGRVTLTSDKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARDSYYSYD AFAYWGQGTLVTVSS |
| hu40E9-H3-Y54G.H | 191 | EVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFSSYVIHWVRQAPGQGLEWMGYINP GNDVIKYNEKFKGRVTLTSDKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARDSYYSYDGFAYWGQGTLVTVSS |
| hu40E9-H3-D56G.H | 192 | EVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFSSYVIHWVRQAPGQGLEWMGYINPYN GVIKYNEKFKGRVTLTSDKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARDSYYSYDGFAYWGQGTLVTVSS |
| hu40E9-H3-D99R.H | 193 | EVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFSSYVIHWVRQAPGQGLEWMGYINPYNDVIKYNEKFKGRVTLTSDKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR RSYYSYDGFAYWGQGTLVTVSS |
| hu40E9-H3-S100R.H | 194 | EVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFSSYVIHWVRQAPGQGLEWMGYINPYNDVIKYNEKFKGRVTLTSDKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARD RYYSYDGFAYWGQGTLVTVSS |
| hu40E9-H3-Y102S.H | 195 | EVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFSSYVIHWVRQAPGQGLEWMGYINPYNDVIKYNEKFKGRVTLTSDKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARDSY SSYDGFAYWGQGTLVTVSS |
| hu40E9-H3-D105R.H | 196 | EVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFSSYVIHWVRQAPGQGLEWMGYINPYNDVIKYNEKFKGRVTLTSDKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARDSYYSY RGFAYWGQGTLVTVSS |
| hu40E9-L2-N93S.L | 197 | EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITCSASSSVSYMHWYQQKPDQSPKRLIYDTSKLASGVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYYCQQWSS SPPTFGGGTKVEIK |
| hu40E9-L2-S91R.L | 198 | EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITCSASSSVSYMHWYQQKPDQSPKRLIYDTSKLASGVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYYCQQW RSNPPTFGGGTKVEIK |
| hu40E9-L2-N93R.L | 199 | EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITCSASSSVSYMHWYQQKPDQSPKRLIYDTSKLASGVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYYCQQWSS RPPTFGGGTKVEIK |
| hu40E9-L2-N93W.L | 200 | EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITCSASSSVSYMHWYQQKPDQSPKRLIYDTSKLASGVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYYCQQWSS WPPTFGGGTKVEIK |
| 描述 | SEQ ID NO | 胺基酸序列 |
| N55S.H(HCDR2) | 171 | YINPY SDVIKYNEKFKG |
| Y54G.H(HCDR2) | 172 | YINP GNDVIKYNEKFKG |
| D56G.H(HCDR2) | 173 | YINPYN GVIKYNEKFKG |
| 201 | YINPX 1X 2X 3VIKYNEKFKG (其中X 1= Y或G;X 2= N或S;且X 3= D或G) | |
| D99E.H(HCDR3) | 174 | ESYYSYDGFAY |
| Y101F.H(HCDR3) | 175 | DS FYSYDGFAY |
| D105E.H(HCDR3) | 176 | DSYYSY EGFAY |
| G106A.H(HCDR3) | 177 | DSYYSYD AFAY |
| D99R.H(HCDR3) | 178 | RSYYSYDGFAY |
| S100R.H(HCDR3) | 179 | D RYYSYDGFAY |
| Y102S.H(HCDR3) | 180 | DSY SSYDGFAY |
| D105R.H(HCDR3) | 181 | DSYYSY RGFAY |
| 162 | X 4X 5X 6X 7SYX 8X 9FAY (其中X 4= D或E或R;X 5= S或R;X 6= Y或F;X 7= Y或S;X 8= D或E或R;X 9= G或A) | |
| N93S.L(LCDR3) | 182 | QQWSS SPPT |
| S91R.L(LCDR3) | 183 | QQW RSNPPT |
| N93R.L(LCDR3) | 184 | QQWSS RPPT |
| N93W.L(LCDR3) | 185 | QQWSS WPPT |
| 167 | QQWX 10SX 11PPT (其中X 10= S或R;X 11= N或S或R或W) |
本發明進一步提供殖株40-C12-C10-E9之例示性人源化及親和力改良之抗體,包括:
1)「hu40E9-L2H3-N55S.H」,其包括hu40E9-H3-N55S.H之重鏈可變區(SEQ ID NO: 186)及hu40E9-L2之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 169);
2)「hu40E9-L2H3-D99E.H」,其包括hu40E9-H3-D99E.H之重鏈可變區(SEQ ID NO: 187)及hu40E9-L2之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 169);
3)「hu40E9-L2H3-Y101F.H」,其包括hu40E9-H3-Y101F.H之重鏈可變區(SEQ ID NO: 188)及hu40E9-L2之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 169);
4)「hu40E9-L2H3-D105E.H」,其包括hu40E9-H3-D105E.H之重鏈可變區(SEQ ID NO: 189)及hu40E9-L2之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 169);
5)「hu40E9-L2H3-G106A.H」,其包括hu40E9-H3-G106A.H之重鏈可變區(SEQ ID NO: 190)及hu40E9-L2之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 169);
6)「hu40E9-L2H3-Y54G.H」,其包括hu40E9-H3-Y54G.H之重鏈可變區(SEQ ID NO: 191)及hu40E9-L2之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 169);
7)「hu40E9-L2H3-D56G.H」,其包括hu40E9-H3-D56G.H之重鏈可變區(SEQ ID NO: 192)及hu40E9-L2之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 169);
8)「hu40E9-L2H3-D99R.H」,其包括hu40E9-H3-D99R.H之重鏈可變區(SEQ ID NO: 193)及hu40E9-L2之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 169);
9)「hu40E9-L2H3-S100R.H」,其包括hu40E9-H3-S100R.H之重鏈可變區(SEQ ID NO: 194)及hu40E9-L2之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 169);
10)「hu40E9-L2H3-Y102S.H」,其包括hu40E9-H3-Y102S.H之重鏈可變區(SEQ ID NO: 195)及hu40E9-L2之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 169);
11)「hu40E9-L2H3-D105R.H」,其包括hu40E9-H3-D105R.H之重鏈可變區(SEQ ID NO: 196)及hu40E9-L2之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 169);
12)「hu40E9-L2H3-N93S.L」,其包括hu40E9-H3之重鏈可變區(SEQ ID NO: 165)及hu40E9-L2-N93S.L之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 197);
13)「hu40E9-L2H3-S91R.L」,其包括hu40E9-H3之重鏈可變區(SEQ ID NO: 165)及hu40E9-L2-S91R.L之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 198);
14)「hu40E9-L2H3-N93R.L」,其包括hu40E9-H3之重鏈可變區(SEQ ID NO: 165)及hu40E9-L2-N93R.L之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 199);或者
15)「hu40E9-L2H3-N93W.L」,其包括hu40E9-H3之重鏈可變區(SEQ ID NO: 165)及hu40E9-L2-N93W.L之輕鏈可變區(SEQ ID NO: 200)。
在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體及抗原結合片段包括重鏈可變域之全部或一部分及/或輕鏈可變域之全部或一部分。在一個實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段係由本文所提供之重鏈可變域之全部或一部分組成之單域抗體。可在此項技術中獲得有關此類單域抗體之更多資訊(參見例如美國專利6,248,516號)。
在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段進一步包括Fc區。在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段進一步包括人類免疫球蛋白(Ig)之Fc區。在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段進一步包括恆定區,上述恆定區視情況進一步包括重鏈及/或輕鏈恆定區。在某些實施例中,重鏈恆定區包括CH1、鉸鏈及/或CH2-CH3區(或視情況選用之CH2-CH3-CH4區)。在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括人類IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、IgA2或IgM之重鏈恆定區。在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括λ (lambda)輕鏈或κ (kappa)輕鏈。本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段之恆定區可與野生型恆定區序列相同或在一或多個突變中不同。
在某些實施例中,重鏈恆定區包括Fc區。已知Fc區介導效應功能,如抗體之抗體依賴性細胞毒性(ADCC)及補體依賴性細胞毒性(CDC)。不同Ig同型之Fc區具有不同的誘導效應功能之能力。例如,IgG1及IgG3之Fc區已被公認為比IgG2及IgG4之Fc區更有效地誘導ADCC及CDC兩者。在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體及其抗原結合片段包括IgG1或IgG3同型之Fc區,上述Fc區可誘導ADCC或CDC;或替代地,IgG4或IgG2同型之恆定區,上述恆定區具有降低或缺失之效應功能。在一些實施例中,上述Fc區源自人類IgG1。在一些實施例中,上述Fc區源自具有增強之效應功能之人類IgG1。在一些實施例中,上述Fc區包括如SEQ ID NO: 97所示之胺基酸序列。
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(SEQ ID NO: 97)
在一些實施例中,上述Fc區包括如SEQ ID NO: 84所示之胺基酸序列。
AKTTPPSVYPLAPGSAAQTNSMVTLGCLVKGYFPEPVTVTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVPSSTWPSETVTCNVAHPASSTKVDKKIVPRDCGCKPCICTVPEVSSVFIFPPKPKDVLTITLTPKVTCVVVDISKDDPEVQFSWFVDDVEVHTAQTQPREEQFNSTFRSVSELPIMHQDWLNGKEFKCRVNSAAFPAPIEKTISKTKGRPKAPQVYTIPPPKEQMAKDKVSLTCMITDFFPEDITVEWQWNGQPAENYKNTQPIMDTDGSYFVYSKLNVQKSNWEAGNTFTCSVLHEGLHNHHTEKSLSHSPGK(SEQ ID NO: 84)
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段對人類CD3具有特異性結合親和力,這足以提供診斷及/或治療用途。
本文所提供之抗體或其抗原結合片段可為單株抗體、多株抗體、人源化抗體、人類抗體、嵌合抗體、重組抗體、雙特異性抗體、多特異性抗體、標記抗體、二價抗體、抗獨特型抗體或融合蛋白。重組抗體係使用重組方法在體外而非在動物體內製備之抗體。
在某些實施例中,本發明提供抗CD3抗體或其抗原結合片段,上述抗CD3抗體或其抗原結合片段與本文所提供之抗體或其抗原結合片段競爭結合CD3。在某些實施例中,本發明提供抗CD3抗體或其抗原結合片段,上述抗CD3抗體或其抗原結合片段與抗體25-G12-G6-C12、40-C12-C10-E9、8-B12-F9-B11、31-F8-F5-C5、16-F2-C11-D9、20-E11-E11-C2、7-D9-G10-H2、7-D8-G12-E4、2-F12-A6-G2、3-C6-C11-F12、4-F12-F1-A4、3-F3-G12-E2、124E3D6、126A11A4、127E2D3、133B4C7、140D2B10、147C6F3、147E11E2、hu40E9-L1H1、hu40E9-L1H2、hu40E9-L1H3、hu40E9-L1H4、hu40E9-L2H1、hu40E9-L2H2、hu40E9-L2H3、hu40E9-L2H4、hu40E9-L3H1、hu40E9-L3H2、hu40E9-L3H3、hu40E9-L3H4、hu40E9-L2H3-N55S.H、hu40E9-L2H3-D99E.H、hu40E9-L2H3-Y101F.H、hu40E9-L2H3-D105E.H、hu40E9-L2H3-G106A.H、hu40E9-L2H3-Y54G.H、hu40E9-L2H3-D56G.H、hu40E9-L2H3-D99R.H、hu40E9-L2H3-S100R.H、hu40E9-L2H3-Y102S.H、hu40E9-L2H3-D105R.H、hu40E9-L2H3-N93S.L、hu40E9-L2H3-S91R.L、hu40E9-L2H3-N93R.L及hu40E9-L2H3-N93W.L中之任一者競爭結合人類CD3。在一些實施例中,本發明提供抗CD3抗體或其抗原結合片段,上述抗CD3抗體或其抗原結合片段與本文所提供之抗體或抗原結合片段競爭相同表位。
如本文所用,「阻斷結合」或「競爭結合」之能力係指抗體或抗原結合片段抑制兩個分子(例如,人類CD3與抗CD3抗體)之間結合之相互作用至任何可偵測程度的能力。在某些實施例中,阻斷兩個分子之間結合之抗體或其抗原結合片段且將兩個分子之間結合之相互作用抑制至少85%或至少90%。在某些實施例中,上述抑制可大於85%或大於90%。
熟習此項技術者將認識到,藉由確定人類單株抗體是否阻止本發明之抗體與CD3結合,可在不進行不當實驗之情況下確定人類單株抗體是否與本發明之抗體(例如,小鼠單株抗體25-G12-G6-C12、40-C12-C10-E9、8-B12-F9-B11、31-F8-F5-C5、16-F2-C11-D9、20-E11-E11-C2、7-D9-G10-H2、7-D8-G12-E4、2-F12-A6-G2、3-C6-C11-F12、4-F12-F1-A4、3-F3-G12-E2、124E3D6、126A11A4、127E2D3、133B4C7、140D2B10、147C6F3、147E11E2、hu40E9-L1H1、hu40E9-L1H2、hu40E9-L1H3、hu40E9-L1H4、hu40E9-L2H1、hu40E9-L2H2、hu40E9-L2H3、hu40E9-L2H4、hu40E9-L3H1、hu40E9-L3H2、hu40E9-L3H3、hu40E9-L3H4、hu40E9-L2H3-N55S.H、hu40E9-L2H3-D99E.H、hu40E9-L2H3-Y101F.H、hu40E9-L2H3-D105E.H、hu40E9-L2H3-G106A.H、hu40E9-L2H3-Y54G.H、hu40E9-L2H3-D56G.H、hu40E9-L2H3-D99R.H、hu40E9-L2H3-S100R.H、hu40E9-L2H3-Y102S.H、hu40E9-L2H3-D105R.H、hu40E9-L2H3-N93S.L、hu40E9-L2H3-S91R.L、hu40E9-L2H3-N93R.L及hu40E9-L2H3-N93W.L)相同的表位。若測試抗體與本發明之抗體競爭,如由本發明之抗體與CD3抗原多肽之結合減少所示,則兩種抗體結合至相同或緊密相關之表位。或者若測試抗體與CD3抗原多肽之結合被本發明之抗體抑制,則兩種抗體結合至相同或緊密相關之表位。
在某些實施例中,本發明提供抗CD3抗體或其抗原結合片段,其與OKT3、BMK-B219及/或BMK-TCB相比,對CD3(例如,人類CD3或食蟹獼猴CD3)具有更高或相當的結合親和力。
在某些實施例中,與本文所提供之抗體或其抗原結合片段競爭結合CD3之抗CD3抗體或抗原結合片段不為OKT3、BMK-B219或BMK-TCB。
如本文所用,「OKT3」係指包括具有SEQ ID NO: 100之胺基酸序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 101之胺基酸序列之輕鏈可變區之抗體或其抗原結合片段。CDR序列分別在SEQ ID NO: 100及SEQ ID NO: 101中加底線。
QVQLQQSGAELARPGASVKMSCKASGYTFT
RYTMHWVKQRPGQGLEWIG
YINPSRGYTNYNQKFKDKATLTTDKSSSTAYMQLSSLTSEDSAVYYCAR
YYDDHYCLDYWGQGTTLTVSS(SEQ ID NO: 100)
QIVLTQSPAIMSASPGEKVTMTC
SASSSVSYMNWYQQKSGTSPKRWIY
DTSKLASGVPAHFRGSGSGTSYSLTISGMEAEDAATYYC
QQWSSNPFTFGSGTKLEINRAD(SEQ ID NO: 101)
如本文所用,「BMK-B219」係指包括具有SEQ ID NO: 158之胺基酸序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 159之胺基酸序列之輕鏈可變區之抗體或其抗原結合片段。CDR序列分別在SEQ ID NO: 158及SEQ ID NO: 159中加底線。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFN
TYAMNWVRQAPGKGLEWVA
RIRSKYNNYATYYAASVKGRFTISRDDSKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCAR
HGNFGNSYVSWFAYWGQGTLVTVSS(SEQ ID NO: 158)
QTVVTQEPSLTVSPGGTVTLTC
RSSTGAVTTSNYANWVQQKPGQAPRGLIG
GTNKRAPGTPARFSGSLLGGKAALTLSGVQPEDEAEYYC
ALWYSNLWVFGGGTKLTVL(SEQ ID NO: 159)
如本文所用,「BMK-TCB」係指包括具有SEQ ID NO: 160之胺基酸序列之重鏈可變區及具有SEQ ID NO: 161之胺基酸序列之輕鏈可變區之抗體或其抗原結合片段。CDR序列分別在SEQ ID NO: 160及SEQ ID NO: 161中加底線。
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFS
TYAMNWVRQAPGKGLEWVS
RIRSKYNNYATYYADSVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCVR
HGNFGNSYVSWFAYWGQGTLVTVSS(SEQ ID NO: 160)
QAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTC
GSSTGAVTTSNYANWVQEKPGQAFRGLIG
GTNKRAPGTPARFSGSLLGGKAALTLSGAQPEDEAEYYC
ALWYSNLWVFGGGTKLTVL(SEQ ID NO: 161)
抗體變異體
本文所提供之抗體及其抗原結合片段亦涵蓋本文所提供之抗體序列之各種變異體。
在某些實施例中,上述抗體變異體包括一或多個胺基酸殘基取代或修飾,但仍保留對CD3之特異性結合親和力。在某些實施例中,上述取代或修飾中之至少一者位於上述VH區或上述VL區之一或多個CDR序列中。在某些實施例中,上述取代或修飾中之至少一者位於上述VH區或上述VL區之一或多個非CDR序列中。在某些實施例中,本發明之抗體或其抗原結合片段進一步包括一或多個非天然胺基酸(NNAA)取代。在某些實施例中,上述NNAA能夠被結合。
例如,上述抗體變異體包括在上表2中提供之CDR序列中之一或多個、上表3中提供之重鏈可變區或輕鏈可變區之非CDR序列中之一或多個及/或恆定區(例如,Fc區)中之一或多個胺基酸殘基取代或修飾。此類變異體保留其親本抗體對CD3之結合特異性,但具有一或多種由修飾或取代賦予之期望特性。例如,抗體變異體可具有改善的抗原結合親和力、改善的醣基化模式、降低的醣基化風險、減少的脫胺基作用、增強的效應子功能、改善的FcRn受體結合、增加的藥物動力學半衰期、pH敏感性及/或與結合之相容性(例如,一或多個引入之半胱胺酸殘基)等。
可使用此項技術中已知之方法,例如「丙胺酸掃描誘變」,篩選親本抗體序列以鑑定合適或較佳待修飾或取代之殘基(參見例如Cunningham及Wells (1989)
Science, 244:1081-1085)。簡言之,可鑑定靶標殘基(例如帶電殘基,如Arg、Asp、His、Lys及Glu)且被中性或帶負電胺基酸(例如丙胺酸或聚丙胺酸)替換,且產生經修飾抗體,且針對所關注特性對其進行篩選。若在特定胺基酸位置處之取代表現出所關注功能性改變,則上述位置可被鑑定為用於修飾或取代之潛在殘基。可藉由用另一種殘基(例如,半胱胺酸殘基、帶正電殘基等)取代來進一步評估上述潛在殘基。
親和力變異體
抗體之親和力變異體可含有上表2中提供之一或多個CDR序列、一或多個FR序列或上表3中提供之重鏈可變區或輕鏈可變區序列中之修飾或取代。熟習此項技術者可基於上表2中之CDR序列及上表3中之可變區序列容易地鑑定FR序列,因為此項技術中公知在可變區中,CDR區側接兩個FR區。親和力變異體保留親本抗體對CD3之特異性結合親和力,或者甚至比親本抗體具有更高的CD3特異性結合親和力。在某些實施例中,CDR序列、FR序列或可變區序列中之至少一個(或全部)取代包括保守取代。
熟習此項技術者將理解,在上表2中提供之CDR序列以及上表3中提供之可變區序列中,一或多個胺基酸殘基可被取代,但所得抗體或抗原結合片段仍保留對CD3之結合親和力或結合能力,或者甚至具有改良之結合親和力或結合能力。可使用此項技術中已知之各種方法來實現此目的。例如,可生成抗體變異體(如Fab或scFv變異體)之文庫,且用噬菌體展示技術表現,隨後針對與人類CD3結合之親和力對其進行篩選。再例如,電腦軟體可用於虛擬模擬抗體與人類CD3之結合,且鑑定抗體上之形成結合界面之胺基酸殘基。在取代中可避開此類殘基以防止結合親和力降低,或者可作為取代之靶標以獲得更強的結合。
在某些實施例中,本文所提供之人源化抗體或其抗原結合片段包括CDR序列中之一或多個CDR序列及/或FR序列中之一或多個FR序列中之一或多個胺基酸殘基取代。在某些實施例中,親和力變異體包括CDR序列及/或FR序列中總共不超過20個、15個、10個、9個、8個、7個、6個、5個、4個、3個、2個或1個取代。
在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括1個、2個或3個CDR序列,上述序列與上表2中所列出之上述序列具有至少80% (例如,至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%)序列一致性,但仍以相對於其親本抗體而言相似或甚至更高的水平保留對CD3之特異性結合親和力。
在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括一或多個可變區序列,上述一或多個可變區序列與上表3中所列出之上述序列具有至少80%(例如,至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%)序列一致性,但仍以相對於其親本抗體而言相似或甚至更高的水平保留對CD3之特異性結合親和力。在一些實施例中,在上表3中列出之可變區序列中總共取代、插入或缺失1至10個胺基酸。在一些實施例中,上述取代、插入或缺失發生在CDR之外的區中(例如,在FR中)。
醣基化變異體
本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段亦涵蓋醣基化變異體,可獲得上述醣基化變異體以增加或減少上述抗體或其抗原結合片段之醣基化程度。
本文所提供之抗體或其抗原結合片段可包括引入或移除醣基化位點之一或多個修飾。醣基化位點係具有側鏈之胺基酸殘基,碳水化合物部分(例如,寡糖結構)可連接至上述側鏈。抗體之醣基化通常係N連接的或O連接的。N連接係指碳水化合物部分連接至天冬醯胺殘基(例如,如天冬醯胺-X-絲胺酸及天冬醯胺-X-蘇胺酸等三肽序列中之天冬醯胺殘基)之側鏈,其中X係除了脯胺酸之外的任何胺基酸。O連接之醣基化係指將N-乙醯半乳糖胺、半乳糖或木糖之一與羥基胺基酸連接,最常見的係與絲胺酸或蘇胺酸連接。可方便地移除天然醣基化位點,例如藉由改變胺基酸序列,使得存在於上述序列中之上述三肽序列(對於N連接的醣基化位點)或者絲胺酸或蘇胺酸殘基(對於O連接的醣基化位點)中之一者經取代。可藉由引入此類三肽序列或者絲胺酸或蘇胺酸殘基以相似的方式產生新的醣基化位點。
半胱胺酸工程化變異體
本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段亦涵蓋半胱胺酸工程化變異體,上述變異體包括一或多個引入之游離半胱胺酸胺基酸殘基。
游離半胱胺酸殘基係不為二硫鍵之一部分之半胱胺酸殘基。半胱胺酸工程化變異體可用於藉由例如順丁烯二醯亞胺或鹵乙醯基在經工程化半胱胺酸之位點處與例如細胞毒性化合物及/或成像化合物、標記或放射性同位素等結合。用於工程化抗體或其抗原結合片段以引入游離半胱胺酸殘基之方法係此項技術中已知的,參見例如WO2006/034488。
Fc 變異體
本文所提供之抗CD3抗體及抗原結合片段亦涵蓋Fc變異體,上述Fc變異體包括在其Fc區及/或鉸鏈區處之一或多個胺基酸殘基修飾或取代。
在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括改善與新生兒Fc受體(FcRn)之pH依賴性結合之一或多個胺基酸取代。此類變異體可具有延長的藥物動力學半衰期,因為它在酸性pH下與FcRn結合,使其得以免於在溶酶體中降解,且隨後被轉移且釋放至細胞外。工程化抗體或其抗原結合片段以提高與FcRn之結合親和力之方法係此項技術中眾所周知的,參見例如Vaughn, D.等人,
Structure, 6(1): 63-73, 1998;Kontermann, R.等人,
Antibody Engineering, 第1卷, 第27章: Engineering of the Fc region for improved PK, 由施普林格(Springer)出版, 2010年;Yeung, Y.等人,
Cancer Research, 70: 3269-3277 (2010);以及Hinton, P.等人,
J. Immunology, 176:346-356 (2006)。
在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括一或多個改變ADCC之胺基酸取代。在Fc區之CH2域處之某些胺基酸殘基可被取代以提供增強的ADCC活性。替代地或另外,可改變抗體上之碳水化合物結構以增強ADCC活性。藉由抗體工程化改變ADCC活性之方法在此項技術中已有描述,參見例如Shields RL.等人,
J Biol Chem.2001 276(9): 6591-604;Idusogie EE.等人,
J Immunol.2000.164 (8):4178-84;Steurer W.等人,
J Immunol.1995, 155(3): 1165-74;Idusogie EE.等人,
J Immunol.2001, 166(4):2571-5;Lazar GA.等人,
PNAS, 2006, 103(11): 4005-4010;Ryan MC.等人,
Mol. Cancer Ther., 2007, 6: 3009-3018;Richards JO等人,
Mol Cancer Ther.2008, 7(8): 2517-27;Shields R. L.等人,
J. Biol. Chem, 2002, 277: 26733-26740;Shinkawa T.等人,
J. Biol. Chem, 2003, 278: 3466-3473。
在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括改變CDC之一或多個胺基酸取代,例如藉由改善或減少C1q結合及/或CDC(參見例如WO99/51642;Duncan及Winter
Science322:738-40 (1988);美國專利第5,648,260號;美國專利第5,624,821號);以及關於Fc區變異體之其他實例之WO94/29351。可將選自Fc區之第329、331及322位胺基酸殘基之一或多個胺基酸替換為不同的胺基酸殘基,以改變C1q結合及/或增強CDC(參見Idusogie等人之美國專利第6,194,551號)。亦可引入一或多個胺基酸取代,以改變抗體固定補體之能力(參見Bodmer等人之PCT公開案WO 94/29351)。
在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括人類免疫球蛋白(例如,IgG1)中位於第234及/或235位(根據EP編號)之一或多個胺基酸取代。在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括人類免疫球蛋白(例如,IgG1)中位於第234及235位(根據EP編號)之兩個胺基酸取代。在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括L234A及L235A(根據EU編號)胺基酸取代。
在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段在人類免疫球蛋白(例如IgG4)中在位置228(根據EU編號)處包括一或多個胺基酸取代。在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括S228P(根據EU編號)胺基酸取代。
在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括Fc區之界面中之一或多個胺基酸取代以便於推動及/或促進異二聚體化。此等修飾包括將突起引入至第一Fc多肽中且將空腔引入至第二Fc多肽中,其中突起可定位於空腔中,以便促進第一Fc多肽與第二Fc多肽之相互作用以形成異二聚體或複合物。產生具有此等修飾之抗體之方法係此項技術中已知的,例如,如美國專利第5,731,168號中所述。
在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括第一Fc多肽之第366位(根據EP編號)之胺基酸取代,且包括第二Fc多肽之第366、368及407位(根據EP編號)中之一個、兩個或三個位置處之一個、兩個或三個胺基酸取代。在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括第一Fc多肽之T366W (根據EP編號)取代,且包括第二Fc多肽之T366S+L368A+Y407V (根據EP編號)取代。
在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段亦包括第一Fc多肽之一或多個胺基酸取代,且包括第二Fc多肽之一或多個胺基酸取代,從而在兩個Fc多肽之間引入非天然二硫鍵。例如,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括第一Fc多肽之第354位(根據EU編號)之胺基酸取代,且包括第二Fc多肽之第349位(根據EU編號)之胺基酸取代。在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括第一Fc多肽之S354C (根據EP編號)取代,且包括第二Fc多肽之Y349C (根據EP編號)取代。
在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段包括第一Fc多肽及第二Fc多肽,上述第一Fc多肽包括如SEQ ID NO: 98所示之胺基酸序列,上述第二Fc多肽包括如SEQ ID NO: 99所示之胺基酸序列。
KTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCREEMTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(SEQ ID NO: 98)
KTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSREEMTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(SEQ ID NO: 99)
抗原結合片段
本文亦提供抗CD3抗原結合片段。各種類型之抗原結合片段係此項技術中已知的且可基於本文所提供之抗CD3抗體開發,上述抗體包括例如其CDR在上表2中示出且可變序列在表3中示出之例示性抗體及其不同變異體(如親和力變異體、醣基化變異體、Fc變異體、半胱胺酸工程化變異體等)。
在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗原結合片段為雙功能抗體(diabody)、Fab、Fab'、F(ab')
2、Fd、Fv片段、二硫鍵穩定之Fv片段(dsFv)、(dsFv)
2、雙特異性dsFv(dsFv-dsFv')、二硫鍵穩定之雙功能抗體(ds diabody)、單鏈抗體分子(scFv)、scFv二聚體(二價雙功能抗體)、多特異性抗體、駱駝化單域抗體、奈米抗體、域抗體或二價域抗體。
可使用多種技術產生此類抗原結合片段。例示性方法包括完整抗體之酶消化(參見例如Morimoto等人,
Journal of Biochemical and Biophysical Methods24:107-117 (1992);以及Brennan等人,
Science, 229:81 (1985))、藉由如大腸桿菌等宿主細胞進行之重組表現(例如,對於Fab、Fv及ScFv抗體片段)、如上文討論的自噬菌體展示文庫篩選(例如,對於ScFv)以及兩個Fab'-SH片段之化學偶聯以形成F(ab')
2片段(Carter等人,
Bio/Technology10:163-167 (1992))。用於產生抗體片段之其他技術對熟習此項技術者而言係顯而易見的。
在某些實施例中,抗原結合片段為scFv。以下各者中描述scFv之產生:例如WO 93/16185;美國專利第5,571,894號;以及第5,587,458號。ScFv可在胺基端或羧基端與效應蛋白融合以提供融合蛋白(參見例如Antibody Engineering, Borrebaeck編)。
在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段係二價的、四價的、六價的或多價的。任何超過二價的分子均被視為多價的,涵蓋例如三價、四價、六價等。
若兩個結合位點均與同一抗原或同一表位特異性結合,則二價分子可為單特異性的。在某些實施例中,此提供比單價對應物更強的與抗原或表位之結合。類似地,多價分子亦可為單特異性的。在某些實施例中,在二價或多價抗原結合部分中,結合位點之第一價及結合位點之第二價在結構上相同(亦即,具有相同序列)或在結構上不同(亦即,具有不同序列,但具有相同特異性)。
若兩個結合位點對不同抗原或表位具有特異性,則二價亦可為雙特異性的。此亦適用於多價分子。例如,當兩個結合位點對第一抗原(或表位)為單特異性的且第三結合位點對第二抗原(或表位)為特異性的時,三價分子可為雙特異性的。
雙特異性或多特異性抗體
在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段為雙特異性的或多特異性的。在某些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段進一步與具有與上述抗CD3抗體不同的結合特異性之第二功能部分或其抗原結合片段連接。在一些實施例中,本文所提供之雙特異性抗體或多特異性抗體及其抗原結合片段對CD3具有第一特異性,且具有第二特異性。在一些實施例中,第二特異性係針對CD3但針對不同表位。在一些實施例中,第二特異性針對不同於CD3之第二抗原,且其在表現CD3之T細胞附近的存在對於第二抗原被免疫系統識別係期望的。例如,使表現CD3之T細胞非常接近腫瘤抗原或病原體抗原,從而促進免疫系統對此類抗原之識別或消除。
在某些實施例中,第二特異性係針對腫瘤相關抗原或其表位。術語「腫瘤相關抗原」係指一種抗原,其出現在或可呈遞在腫瘤細胞表面上,亦可位於腫瘤細胞上或腫瘤細胞內。在一些實施例中,腫瘤相關抗原只能由腫瘤細胞呈遞,而不能由正常細胞(亦即,非腫瘤細胞)呈遞。在一些其他實施例中,腫瘤相關抗原可排他性地表現於腫瘤細胞上或可表示相較於非腫瘤細胞之腫瘤特異性突變。在一些其他實施例中,腫瘤相關抗原可在腫瘤細胞及非腫瘤細胞兩者中找到,但當相較於非腫瘤細胞時在腫瘤細胞上過度表現,或由於相較於非腫瘤組織之腫瘤組織的較不緊湊結構而可用於腫瘤細胞中之抗體結合。在一些實施例中,腫瘤相關抗原位於腫瘤之脈管系統上。
在某些實施例中,本文所提供之雙特異性抗體或多特異性抗體或其抗原結合片段能夠與除CD3以外的一或多種(例如,1種、2種、3種、4種、5種或更多種)額外抗原特異性結合,或與CD3上之第二表位特異性結合。在某些實施例中,除CD3以外的一或多種額外抗原選自由以下組成之群:CD16a、CD33、CD38、CD45、CD123、CD146、CD228、CLL-1、FLT3、FLT3L、TAF1、TgPRF、HVCN1、IL-6R、IL-11R、IL17A、IL-23R、IL-33、ILDR2、LAP、TSLP、TREM-1、ANGPT2、APOE、IFNAR、CypA、DOG-1、NKp30、CSF-1R、CCR2、LRRC15、間皮素、Dickkopf2、DLL3、HER-2、C10orf54、TrkA、MEKK1、KRAS、ERK、XPO1、mTORC1/2、PAK4、NAMPT、ATR、EGFR、FGFR、VEGF、LILRB (例如,LILRB1、LILRB2、LILRB3、LILRB4、LILRB5)、c-MET、Her2、Her3、CTLA4、GITA、CD112R、CD2、CD7、CD16、CD19、CD20、CD24、CD27、CD30、CD34、CD37、CD39、CD70、CD73、CD83、CD28、CD80 (B7-1)、CD86 (B7-2)、CD40、CD40L (CD154)、CD47、SIRPα、CD122、CD137、CD137L、OX40 (CD134)、OX40L (CD252)、BCMA (例如,BCMA02)、PSMA、CLDN18 (例如,CLDN18.2)、NKG2C、4-1BB、LIGHT、PVRIG、SLAMF7、HVEM、BAFFR、ICAM-1、2B4、LFA-1、GITR、ICOS (CD278)、ICOSLG (CD275)、LAG3 (CD223)、A2AR、B7-H3 (CD276)、B7-H4 (VTCN1)、B7-H5、BTLA(CD272)、CD160、CTLA-4 (CD152)、GPRC5D、IDO (例如,IDO1、IDO2)、TDO、KIR、LAIR-1、NOX2、PD-1、PD-L1、PD-L2、TIM-3、VISTA、SIGLEC-7 (CD328)、SIGLEC-9 (CD329)、SIGLEC-15、TIGIT、PVR(CD155)、TLR3、CLEC9A、DEC-205、STING及TGFβ。
在某些實施例中,本文所提供之雙特異性抗體或其抗原結合片段能夠特異性地與CD3及CD19結合。在某些實施例中,本文所提供之雙特異性抗體或其抗原結合片段能夠特異性結合至CD3及CLDN18(例如,CLDN18.2)。在某些實施例中,本文所提供之雙特異性抗體或其抗原結合片段能夠特異性結合至CD3及PD-L1。在某些實施例中,本文所提供之雙特異性抗體或其抗原結合片段能夠特異性結合至CD3及BCMA。在某些實施例中,本文所提供之雙特異性抗體或其抗原結合片段能夠特異性結合至CD3及GPRC5D。
結合物
在一些實施例中,本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段進一步包括一或多個結合物部分。結合物部分可與抗體或其抗原結合片段連接。結合部分係可與抗體或其抗原結合片段連接之部分。可設想,多種結合物部分可與本文所提供之抗體或其抗原結合片段結合(參見例如「結合物疫苗(Conjugate Vaccines)」, Contributions to Microbiology and Immunology, J. M. Cruse及R. E. Lewis, Jr. (編), Carger Press, New York, (1989))。此等結合物部分可藉由共價結合(例如,二硫鍵)、親和力結合、嵌入、配位結合、絡合、締合、共混或添加等方法與抗體或其抗原結合片段連接。在一些實施例中,抗體或其抗原結合片段可藉由連接子或交聯劑與一或多種結合物連接。連接子或交聯劑包括反應性化學基團,上述反應性化學基團可與本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段反應。反應性化學基團可為N-琥珀醯亞胺基酯及N-磺基琥珀醯亞胺基酯。另外,上述連接子包括反應性化學基團,上述反應性化學基團可為可與藥物反應以形成二硫鍵之二硫代吡啶基。連接子分子包括例如N-琥珀醯亞胺基4-(順丁烯二醯亞胺基甲基)環己烷甲酸酯(SMCC)、N-琥珀醯亞胺基3-(2-吡啶基二硫代)丙酸酯(SPDP) (參見例如Carlsson等人,
Biochem. J., 173: 723-737 (1978))、N-琥珀醯亞胺基4-(2-吡啶基二硫代)丁酸酯(SPDB) (參見例如美國專利第4,563,304號)、N-琥珀醯亞胺基4-(2-吡啶基二硫代)2-磺基丁酸酯(磺基-SPDB) (參見美國公開第20090274713號)、N-琥珀醯亞胺基4-(2-吡啶基二硫代)戊酸酯(SPP) (參見例如CAS註冊號341498-08-6)、2-亞胺基硫烷或乙醯琥珀酸酐。例如,抗體或細胞結合劑可用交聯試劑修飾,且因此所得含有游離或受保護硫醇基團之抗體或細胞結合劑然後與含有二硫化物或硫醇之美登醇(maytansinoid)反應以產生結合物。結合物可藉由層析純化,包括但不限於HPLC、尺寸排阻、吸附、離子交換及親和力捕獲、透析或正切流過濾。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段可被工程化以含有表位結合部分之外的可用於與一或多個結合物部分結合之特異性位點。例如,此類位點可包括一或多個反應性胺基酸殘基,例如半胱胺酸或組胺酸殘基,以促進與結合物部分之共價連接。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段可間接地或藉由另一結合物部分與結合物部分連接。例如,本文所提供之抗體或其抗原結合片段可與生物素結合,然後與和親和素結合之第二結合物間接結合。在一些實施例中,結合物部分包括清除修飾劑(例如,延長半衰期之聚合物,如PEG)、化學治療劑、毒素、放射性同位素、鑭系元素、可偵測標記(例如,發光標記、螢光標記、酶受質標記)、DNA烷化劑、拓樸異構酶抑制劑、微管蛋白結合劑、純化部分或其他抗癌藥物(例如,toll樣受體7 (TLR-7)、TLR-8及/或TLR-9之促效劑、siRNA、抗體或其抗原結合片段、肽(如短肽)等)。
「毒素」可為對細胞有害或可損傷或殺死細胞之任何藥劑。毒素之實例包括但不限於紫杉醇、紫杉烷類、CC-1065及CC-1065類似物、杜卡黴素(duocarmycin)及杜卡黴素類似物、如卡奇黴素(calicheamicin)等烯二炔類、多拉司他汀(dolastatin)及多拉司他汀類似物(包括澳瑞他汀(auristatin))、托美黴素衍生物(tomaymycin derivative)、來普黴素衍生物(leptomycin derivative)、順鉑(cisplatin)、卡鉑(carboplatin)、柔紅黴素、小紅莓、長春新鹼(vincristine)、長春鹼(vinblastine)、馬法蘭(melphalan)、絲裂黴素C、苯丁酸氮芥及嗎啉代小紅莓、細胞鬆弛素B、短桿菌肽D、溴化乙錠、吐根鹼、絲裂黴素、依託泊苷(etoposide)、替尼泊苷(tenoposide)、MMAE、MMAF、DM1、DM4、長春花鹼(vinblastine)、秋水仙鹼(colchicine)、小紅莓、柔紅黴素、二羧基炭疽菌素二酮(dihydroxy anthracin dione)、米托蒽醌(mitoxantrone)、光神黴素(mithramycin)、放線菌素D(actinomycin D)、1-去氫睾酮、糖皮質激素、普魯卡因(procaine)、丁卡因(tetracaine)、利多卡因(lidocaine)、普萘洛爾(propranolol)、嘌呤黴素(puromycin)及其類似物、抗代謝物(例如,甲胺喋呤、6-巰基嘌呤、6-硫鳥嘌呤、阿糖胞苷、5-氟尿嘧啶、達卡巴嗪(dacarbazine)、烷化劑(例如,氮芥、塞替派苯丁酸氮芥(thioepa chlorambucil)、美法侖(melphalan)、卡莫司汀(carmustine) (BSNU)及洛莫司汀(lomustine) (CCNU)、環磷醯胺、白消安(busulfan)、二溴甘露醇、鏈脲黴素(streptozotocin)、絲裂黴素C及二氯二胺鉑(II) (DDP順鉑)、蒽環黴素(anthracycline) (例如,柔紅黴素(先前之道諾黴素(daunomycin)及小紅莓)、抗生素(例如,更生黴素(dactinomycin) (先前之放線菌素)、博萊黴素(bleomycin)、光神黴素及氨茴黴素(anthramycin) (AMC))、抗有絲分裂劑(例如,長春新鹼及長春鹼)、拓樸異構酶抑制劑及微管蛋白結合劑。
可偵測標記之實例可包括螢光標記(例如,螢光素、若丹明、丹醯、藻赤素或德克薩斯紅)、酶受質標記(例如,辣根過氧化物酶、鹼性磷酸酶、螢光素酶、葡糖澱粉酶、溶菌酶、糖類氧化酶或β-D-半乳糖苷酶)、放射性同位素(例如,
123I、
124I、
125I、
131I、
35S、
3H、
111In、
112In、
14C、
64Cu、
67Cu、
86Y、
88Y、
90Y、
177Lu、
211At、
186Re、
188Re、
153Sm、
212Bi及
32P、其他鑭系元素)、發光標記、發色團部分、地高辛、生物素/親和素、DNA分子或金以供偵測。
在某些實施例中,結合物部分可為幫助增加抗體之半衰期之清除修飾劑。說明性實例包括水溶性聚合物,如PEG、羧甲基纖維素、葡聚糖、聚乙烯醇、聚乙烯吡咯啶酮、乙二醇/丙二醇之共聚物等。聚合物可具有任何分子量,且可為支化的或未支化的。與抗體連接之聚合物之數量可能會有所不同,且若連接多於一種聚合物,則其可為相同或不同的分子。
在某些實施例中,結合物部分可為純化部分,如磁珠。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段用作結合物之基底。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段與單個肽結合。信號肽(有時稱為信號序列、前導序列或前導肽)可用於促進本文所提供之抗體或其抗原結合片段之分泌及分離。信號肽通常表徵為疏水胺基酸之核心,上述疏水胺基酸通常在一或多個切割事件中在分泌期間自成熟蛋白質上切割下來。此類信號肽含有加工位點,當成熟蛋白質穿過分泌途徑時,上述加工位點允許自成熟蛋白質上切割信號序列。因此,本發明涉及所描述的具有信號序列之多肽以及信號序列已被蛋白水解切割之多肽(亦即,切割產物)。在一個實施例中,編碼信號序列之核酸序列可在表現載體中與所關注蛋白質,如通常不分泌或以其他方式難以分離之蛋白質可操作地連接。信號序列引導蛋白質之分泌,如自表現載體轉化至其中之真核宿主,且信號序列隨後或同時被切割。然後可藉由此項技術中公認之方法容易地自細胞外培養基中純化蛋白質。替代地,信號序列可使用促進純化之序列與所關注蛋白質連接,如使用GST域。
嵌合抗原受體
在某些實施例中,本發明提供一種嵌合抗原受體,上述嵌合抗原受體包括本文所提供之抗體或其抗原結合片段、跨膜區以及細胞內信號區。
如本文所用,術語「嵌合抗原受體」或「CAR」係指將抗原特異性移植至細胞(例如,T細胞,如原初T細胞、中樞記憶T細胞、效應記憶T細胞、調節T細胞,天然殺手細胞或其任何組合)之工程化受體。CAR亦被稱為人造細胞受體、嵌合細胞受體或嵌合免疫受體。在一些實施例中,CAR包括抗原特異性靶向區(例如,如本文所提供之抗CD3抗體之抗原結合片段)、細胞外區、跨膜區、一或多個共刺激區以及細胞內信號區。
在一些實施例中,上述抗原特異性靶向區為scFv。在一些實施例中,上述跨膜區包括CD3、CD4、CD8或CD28之跨膜區。在一些實施例中,共刺激區包括CD28、ICOS、CD27、4-1BB、OX40及CD40L之共刺激域。在一些實施例中,上述細胞內信號區選自由以下組成之群:CD3、FcγRI、CD27、CD28、CD137、CD134、MyD88、CD40、CD278、TLR或其組合之細胞內信號區序列。
CAR可被移植至各種細胞,例如,同種異體細胞、自體細胞或異種細胞。
本文中使用之術語「同種異體細胞」係指源自相同物種之不同個體之任何細胞。
本文中使用之術語「自體細胞」係指源自同一個體之任何細胞,此等細胞隨後被重新引入該個體。
本文中使用之術語「異種細胞」係指源自不同物種之不同個體之任何細胞。
在某些實施例中,CAR被移植至免疫效應細胞,例如,T細胞、自然殺手細胞、巨噬細胞、腫瘤浸潤淋巴細胞等。
多核苷酸及重組方法
本發明提供經分離多核苷酸,上述經分離多核苷酸編碼本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段及/或編碼本文所提供之嵌合抗原受體。如本文所用,術語「核酸」或「多核苷酸」係指呈單鏈或雙鏈形式之脫氧核糖核酸(DNA)或核糖核酸(RNA)及其聚合物。除非另外指出,否則特定多核苷酸序列亦隱含地涵蓋其保守修飾之變異體(例如,簡併密碼子取代)、對偶基因、直系同源物、SNP及互補序列以及明確指出之序列。具體而言,簡併密碼子取代可藉由生成序列來實現,在上述序列中,一或多個所選(或全部)密碼子之第三位被混合鹼基及/或脫氧肌苷殘基取代(參見Batzer等人,
Nucleic Acid Res. 19:5081 (1991);Ohtsuka等人,
J. Biol. Chem., 260:2605-2608 (1985);以及Rossolini等人,
Mol. Cell. Probes, 8:91-98 (1994))
。
編碼抗體或其抗原結合片段之DNA或本文所提供之嵌合抗原受體使用習知程序(例如藉由使用能夠與編碼抗體之重鏈及輕鏈之基因特異性結合之寡核苷酸探針)容易地分離及定序。編碼DNA亦可藉由合成方法獲得。
可使用此項技術中已知之重組技術將編碼本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段及/或本文所提供之嵌合抗原受體之經分離多核苷酸插入至載體中以供進一步選殖(DNA之擴增)或表現。許多載體可用。載體組成通常包括但不限於以下中之一或多者:信號序列、複製起點、一或多種標記基因、增強子元件、啟動子(例如,SV40、CMV、EF-1α)及轉錄終止序列。
本發明提供包括本文所提供之經分離多核苷酸之載體。在某些實施例中,本文所提供之多核苷酸編碼抗體或其抗原結合片段及/或嵌合抗原受體、與核酸序列可操作地連接之至少一種啟動子(例如,SV40、CMV、EF-1α)以及至少一種選擇標記。載體之實例包括但不限於逆轉錄病毒(包括慢病毒)、腺病毒、腺相關病毒、疱疹病毒(例如,單純疱疹病毒)、痘病毒、桿狀病毒、乳頭瘤病毒、乳多空病毒(例如,SV40)、λ噬菌體及M13噬菌體、質體pcDNA3.3、pMD18-T、pOptivec、pCMV、pEGFP、pIRES、pQD-Hyg-GSeu、pALTER、pBAD、pcDNA、pCal、pL、pET、pGEMEX、pGEX、pCI、pEGFT、pSV2、pFUSE、pVITRO、pVIVO、pMAL、pMONO、pSELECT、pUNO、pDUO、Psg5L、pBABE、pWPXL、pBI、p15TV-L、pPro18、pTD、pRS10、pLexA、pACT2.2、pCMV-SCRIPT.RTM.、pCDM8、pCDNA1.1/amp、pcDNA3.1、pRc/RSV、PCR 2.1、pEF-1、pFB、pSG5、pXT1、pCDEF3、pSVSPORT、pEF-Bos等。
包括編碼本文所提供之抗體或其抗原結合片段及/或嵌合抗原受體之多核苷酸序列之載體可被引入至宿主表現系統(例如,宿主細胞)進行選殖或基因表現。在某些實施例中,本文所提供之宿主表現系統為微生物、酵母或哺乳動物細胞。在某些實施例中,上述微生物選自大腸桿菌及枯草芽孢桿菌組成之群。在某些實施例中,上述酵母為酵母菌屬。在某些實施例中,上述哺乳動物細胞選自下組:COS、CHO-S、CHO-K1、HEK-293及3T3細胞。
用於選殖或表現本文載體中之DNA之合適宿主細胞為上述原核細胞、酵母細胞或高等真核細胞。用於此目的之合適的原核生物包括真細菌,如革蘭氏陰性或革蘭氏陽性生物體,例如腸桿菌科(
Enterobacteriaceae),如埃希氏桿菌屬(
Escherichia) (例如,大腸桿菌)、腸桿菌屬(
Enterobacter)、歐文氏菌屬(
Erwinia)、克雷伯氏菌屬(
Klebsiella)、變形桿菌屬(
Proteus)、沙門氏菌屬(
Salmonella) (例如,鼠傷寒沙門氏菌(
Salmonella typhimurium))、沙雷氏菌屬(
Serratia) (例如,黏質沙雷氏菌(
Serratia marcescans))及志賀氏菌屬(
Shigella)以及芽孢桿菌屬(
Bacilli),如枯草芽孢桿菌及地衣芽孢桿菌(
B. licheniformis)、假單胞菌屬(
Pseudomonas),如銅綠假單胞菌(
P. aeruginosa)以及鏈黴菌屬(
Streptomyces)。
除了原核生物之外,真核微生物(如絲狀真菌或酵母)亦為編碼抗CD3抗體之載體之合適選殖或表現宿主。釀酒酵母(
Saccharomyces cerevisiae)或普通麵包酵母為低等真核宿主微生物中最常用的。然而,許多其他屬、種及菌株均比較常用且在本文中適用,如粟酒裂殖酵母(
Schizosaccharomyces pombe);克魯維酵母屬宿主(
Kluyveromyceshost),例如乳酸克魯維酵母(
K. lactis)、脆壁克魯維酵母(
K. fragilis) (ATCC 12,424)、保加利亞克魯維酵母(
K. bulgaricus) (ATCC 16,045)、魏氏克魯維酵母(
K. wickeramii) (ATCC 24,178)、克魯雄酵母(
K. waltii) (ATCC 56,500)、果蠅克魯維酵母(
K. drosophilarum) (ATCC 36,906)、耐熱克魯維酵母(
K. thermotolerans)及馬克斯克魯維酵母(
K. marxianus);耶氏酵母屬(
yarrowia) (EP 402,226);巴斯德畢赤酵母(
Pichia pastoris) (EP 183,070);假絲酵母(
Candida);里氏木黴(
Trichoderma reesia) (EP 244,234);粗糙脈孢菌(
Neurospora crassa);許旺酵母(
Schwanniomyces),如西方許旺酵母(
Schwanniomyces occidentalis);以及絲狀真菌(
filamentous fungi),例如脈孢菌(
Neurospora)、青黴菌(
Penicillium)、彎頸黴(
Tolypocladium)及曲黴菌宿主(
Aspergillushost) (如鉤巢麴黴(
A. nidulans)及黑麴黴(
A. niger))。
用於表現本文所提供之醣基化抗體或其抗原結合片段之合適宿主細胞源自多細胞生物體。無脊椎細胞之實例包括植物及昆蟲細胞。已鑑定多種桿狀病毒株及變異體以及對應的許可性昆蟲宿主細胞,上述許可性昆蟲宿主細胞來自於如以下等宿主:草地夜蛾(
Spodoptera frugiperda) (毛蟲)、埃及斑蚊(
Aedes aegypti) (蚊子)、白紋伊蚊(
Aedes albopictus) (蚊子)、黑腹果蠅(
Drosophila melanogaster) (果蠅)及家蠶(
Bombyx mori)。多種用於轉染之病毒株為公眾可得,例如苜蓿銀紋夜蛾(
Autographa californica)NPV之L-1變異體以及家蠶NPV之Bm-5株變異體,且此類病毒均可根據本發明用作本文之病毒,特別係用於轉染草地夜蛾細胞。棉花、玉米、馬鈴薯、大豆、矮牽牛、番茄及菸草之植物細胞培養物亦可用作宿主。
然而,最感興趣的係脊椎動物細胞,且脊椎動物細胞在培養物(組織培養物)中之繁殖已成為習知程序。有用的哺乳動物宿主細胞株之實例係由SV40(COS-7,ATCC CRL 1651)轉化之猴腎CV1系;人胚胎腎系(被次選殖以在懸浮培養物中生長之293或293細胞,Graham等人,
J. Gen. Virol.36/59 (1977));幼倉鼠腎細胞(BHK,ATCC CCL 10);中國倉鼠卵巢細胞/-DHFR (CHO, Urlaub等人,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA77:4216 (1980));小鼠賽爾托利細胞(TM4,Mather,
Biol. Reprod.23:243-251 (1980));猴腎細胞(CV1 ATCC CCL 70);非洲綠猴腎細胞(VERO-76,ATCC CRL-1587);人子宮頸癌細胞(HELA,ATCC CCL 2);犬腎細胞(MDCK,ATCC CCL 34);布法羅大鼠(buffalo rat)肝細胞(BRL 3A,ATCC CRL 1442);人肺細胞(W138,ATCC CCL 75);人肝細胞(Hep G2,HB 8065);小鼠乳腺腫瘤(MMT 060562,ATCC CCL51);TRI細胞(Mather等人,
Annals N.Y. Acad. Sci.383:44-68 (1982));MRC 5細胞;FS4細胞;小鼠前胃癌細胞(MFC)、SNU620細胞及人肝癌系(Hep G2)。在一些實施例中,宿主細胞為哺乳動物培養之細胞株,如CHO、BHK、NS0、293、MFC、SNU620及其衍生物。
用上述用於抗CD3抗體產生之表現或選殖載體轉化宿主細胞,且將上述宿主細胞在習知營養培養基中培養,上述習知營養培養基被改性成適於誘導啟動子、選擇轉化子或擴增編碼期望序列之基因。在另一實施例中,抗體可藉由此項技術中已知之同源重組產生。在某些實施例中,宿主細胞能夠產生本文所提供之抗體或其抗原結合片段。
本發明亦提供一種表現本文所提供之抗體或其抗原結合片段及/或嵌合抗原受體的方法,上述方法包括在表現抗體或其抗原結合片段及/或嵌合抗原受體的條件下培養本文所提供之宿主表現系統。用於產生本文所提供之抗體或其抗原結合片段及/或嵌合抗原受體之宿主表現系統可在多種培養基中培養。可商購獲得之培養基如Ham's F10 (Sigma)、最低必需培養基(Minimal Essential Medium,MEM) (Sigma)、RPMI-1640 (Sigma)及杜氏改良伊氏培養基(Dulbecco's Modified Eagle's Medium,DMEM) (Sigma)適用於培養宿主細胞。另外,在以下各者中描述之任何培養基均可用作宿主細胞之培養基:Ham等人,
Meth. Enz.58:44 (1979);Barnes等人,
Anal. Biochem.102:255 (1980);美國專利第4,767,704號;第4,657,866號;第4,927,762號第4,560,655號或第5,122,469號;WO 90/03430;WO 87/00195;或美國再版專利30,985。任何此等培養基均可根據需要補充激素及/或其他生長因子(如胰島素、轉鐵蛋白或表皮生長因子)、鹽(如氯化鈉、鈣、鎂及磷酸鹽)、緩衝液(如HEPES)、核苷酸(如腺苷及胸苷)、抗生素(如GENTAMYCIN
TM藥物)、微量元素(定義為最終濃度通常在微莫耳範圍內之無機化合物)及葡萄糖或等效能量源。亦可以熟習此項技術者已知的適當濃度包括任何其他必要補充物。如溫度、pH等培養條件係先前與被選定用於表現之宿主細胞一起使用之彼等條件,且對於熟習此項技術者而言將係顯而易見的。
當使用重組技術時,抗體可在細胞內、周質間隙中產生,或者直接分泌至培養基中。若在細胞內產生抗體,則作為第一步驟,可例如藉由離心或超濾來移除宿主細胞或溶解片段之微粒狀碎片。Carter等人,
Bio/Technology10:163-167 (1992)描述一種用於分離分泌至大腸桿菌之周質間隙之抗體之程序。簡言之,將細胞糊在乙酸鈉(pH 3.5)、EDTA及苯甲基磺醯氟(PMSF)存在下解凍約30分鐘。細胞碎片可藉由離心移除。當抗體被分泌至培養基中時,通常首先使用可商購獲得的蛋白質濃縮過濾器(例如Amicon或Millipore Pellicon超濾單元)對來自此類表現系統之上清液進行濃縮。如PMSF等蛋白酶抑制劑可包括在上述步驟中之任何步驟中以抑制蛋白水解,且可包括抗生素以防止外來污染物的生長。
由宿主表現系統製備之抗CD3抗體或其抗原結合片段及/或嵌合抗原受體可使用例如羥基磷灰石層析法、凝膠電泳、透析、DEAE-纖維素離子交換層析法、硫酸銨沈澱、鹽析及親和層析法來純化,其中親和層析法係較佳純化技術。
在某些實施例中,固定在固相上之蛋白A用於本文所提供之抗體及其抗原結合片段及/或嵌合抗原受體之免疫親和純化。蛋白A是否合適作為親和配位體取決於抗體中存在之任何免疫球蛋白Fc域之種類及同型。蛋白A可用於純化基於人γ1、γ2或γ4重鏈之抗體(Lindmark等人,
J. Immunol. Meth.62:1-13 (1983))。蛋白G被推薦用於所有小鼠同型及人類γ3 (Guss等人,
EMBO J.5:1567 1575 (1986))。親和配位體附著之基質最常為瓊脂糖,但其他基質亦為可用的。與可用瓊脂糖達成之流速及處理時間相比,機械穩定的基質如可控孔度玻璃或聚(苯乙烯二乙烯)苯可實現更快的流速及更短的處理時間。在抗體包括CH3域之情況下,Bakerbond ABXTM樹脂(J. T. Baker, Phillipsburg, N.J.)可用於純化。根據待回收之抗體,用於蛋白質純化之其他技術亦為可用的,如在離子交換柱上進行分級、乙醇沈澱、反相HPLC、在二氧化矽上進行層析法、在肝素SEPHAROSETM上進行層析法、在陰離子或陽離子交換樹脂(如聚天冬胺酸柱)上進行層析法、層析聚焦、SDS-PAGE、以及硫酸銨沈澱。
在任何初步純化步驟之後,可使用pH介於約2.5-4.5之間的溶離緩衝液使包含所關注抗體及污染物之混合物經受低pH疏水相互作用層析法,較佳在低鹽濃度(例如,約0-0.25 M鹽)下進行。
醫藥組合物
本發明進一步提供醫藥組合物,其包括本文所提供之抗CD3抗體或其抗原結合片段及/或嵌合抗原受體,以及一或多種醫藥學上可接受之載劑。
用於本文揭示之醫藥組合物之醫藥學上可接受之載劑可包括例如醫藥學上可接受之液體、凝膠或固體載劑、水性媒劑、非水性媒劑、抗微生物劑、等滲劑、緩衝劑、抗氧化劑、麻醉劑、懸浮劑/分配劑、多價螯合劑或螯合劑、稀釋劑、佐劑、賦形劑或無毒輔助物質、此項技術中已知之其他組分或其各種組合。
合適的組分可包括例如抗氧化劑、填料、黏結劑、崩解劑、緩衝劑、防腐劑、潤滑劑、調味劑、增稠劑、著色劑、乳化劑或穩定劑,如糖及環糊精。合適的抗氧化劑可包括例如甲硫胺酸、抗壞血酸、EDTA、硫代硫酸鈉、鉑、過氧化氫酶、檸檬酸、半胱胺酸、硫代甘油、巰基乙酸、硫代山梨糖醇、丁基化羥基茴香醚(butylated hydroxanisol)、丁基化羥基甲苯及/或沒食子酸丙酯。如本文所揭示,在包括本文所提供之抗體或其抗原結合片段及結合物之組合物中包括一或多種如甲硫胺酸等抗氧化劑降低抗體或其抗原結合片段之氧化。此氧化降低可防止或減少結合親和力的喪失,從而提高抗體穩定性且最大化保質期。因此,在某些實施例中,提供包括如本文揭示之一或多種抗體或其抗原結合片段及一或多種如甲硫胺酸等抗氧化劑之醫藥組合物。進一步提供用於藉由將抗體或抗原結合片段與一或多種如甲硫胺酸等抗氧化劑混合來防止本文所提供之抗體或抗原結合片段之氧化、延長保質期及/或提高功效之方法。
為了進一步說明,醫藥學上可接受之載劑可包括例如:水性媒劑,如氯化鈉注射液、林格氏注射液(Ringer's injection)、等滲右旋糖注射液、無菌水注射液或右旋糖及乳酸林格氏注射液;非水性媒劑,如植物來源之固定油、棉籽油、玉米油、芝麻油或花生油;細菌抑制或真菌抑制濃度下之抗微生物劑;等滲劑,如氯化鈉或右旋糖;緩衝劑,如磷酸鹽或檸檬酸鹽緩衝劑;抗氧化劑,如硫酸氫鈉;局部麻醉劑,如鹽酸普魯卡因;懸浮及分散劑,如羧甲基纖維素鈉、羥丙基甲基纖維素或聚乙烯吡咯啶酮;乳化劑,如聚山梨醇酯80 (TWEEN-80);多價螯合劑或螯合劑,如EDTA (乙二胺四乙酸)或EGTA (乙二醇四乙酸);乙醇;聚乙二醇;丙二醇;氫氧化鈉;鹽酸;檸檬酸或乳酸。可將用作載劑之抗微生物劑添加至多劑量容器中之醫藥組合物中,上述抗微生物劑包括苯酚或甲酚、汞劑、苯甲醇、氯丁醇、對羥基苯甲酸甲酯及丙酯、硫柳汞、苯紮氯銨及苄索氯銨。合適的賦形劑可包括例如水、鹽水、右旋糖、甘油或乙醇。合適的無毒輔助物質可包括例如潤濕劑或乳化劑、pH緩衝劑、穩定劑、溶解度增強劑或如乙酸鈉、脫水山梨糖醇單月桂酸酯、三乙醇胺油酸酯或環糊精等藥劑。
醫藥組合物可為液體溶液、懸浮液、乳液、丸劑、膠囊、錠劑、緩釋調配物或粉末。口服調配物可包括標準載劑,如醫藥級甘露醇、乳糖、澱粉、硬脂酸鎂、聚乙烯吡咯啶酮、糖精鈉、纖維素、碳酸鎂等。
在某些實施例中,將醫藥組合物調配成可注射醫藥組合物。可注射組合物可以任何習知形式製備,上述習知形式例如液體溶液、懸浮液、乳液或適用於產生液體溶液、懸浮液或乳液之固體形式。注射製劑可包括準備注射之無菌及/或無熱原溶液、準備在使用前與溶劑組合之無菌乾燥可溶性產品(如凍乾粉末,包括皮下注射錠劑)、準備注射之無菌懸浮液、準備在使用前與媒劑組合之無菌乾燥的不溶性產品以及無菌及/或無熱原乳液。溶液可為水性的或非水性的。
在某些實施例中,單位劑量腸胃外製劑被包裝在安瓿、小瓶或帶有針頭之注射器中。正如此項技術中所已知及實踐,所有用於腸胃外投與之製劑均應為無菌且無熱原的。
在某些實施例中,藉由將如本文揭示之抗體或其抗原結合片段溶解在合適的溶劑中來製備無菌凍乾粉末。上述溶劑可含有賦形劑,上述賦形劑可改善粉末或由粉末製備之重構溶液之穩定性或其他藥理學組分。可使用之賦形劑包括但不限於水、右旋糖、山梨糖醇、果糖、玉米糖漿、木糖醇、甘油、葡萄糖、蔗糖或其他合適的藥劑。溶劑可含有緩衝劑,如檸檬酸鹽、磷酸鈉或磷酸鉀、或熟習此項技術者已知之其他此類緩衝劑,在一個實施例中,上述緩衝劑為約中性pH。隨後對溶液進行無菌過濾,然後在熟習此項技術者已知之標準條件下凍乾,從而提供期望的調配物。在一個實施例中,將所得溶液分配至小瓶中以凍乾。各小瓶可含有單劑量或多劑量之抗CD3抗體或其抗原結合片段或其組合物。用略微高於各劑量所需或多次劑量所需之量(例如約10%)過填充小瓶係可接受的,以便促進取樣精確及給藥精確。可在適當條件下(如在約4℃至室溫下)儲存凍乾粉末。
用注射用水將凍乾粉末重構,從而提供用於腸胃外投與之調配物。在一個實施例中,為了重構,將無菌及/或無熱原水或其他合適的液體載劑添加至凍乾粉末中。精確量取決於給予之所選療法且可根據經驗確定。
套組
在某些實施例中,本發明提供一種套組,上述套組包括本文所提供之抗體或其抗原結合片段及/或本文所提供之醫藥組合物及/或本文所提供之嵌合抗原受體。在某些實施例中,本發明提供一種套組,上述套組包括本文所提供之抗體或其抗原結合片段及/或本文所提供之醫藥組合物及/或本文所提供之嵌合抗原受體以及第二治療劑。在某些實施例中,第二治療劑選自由以下組成之群:偵測劑、化學治療劑、抗癌藥物、放射療法、免疫治療劑、抗血管生成劑、靶向療法、細胞療法、基因療法、激素療法、抗病毒劑、抗生素、鎮痛劑、抗氧化劑、金屬螯合劑及細胞介素。
如將對熟習此項技術者顯而易見的是,若需要,此類藥物套組可進一步包括各種習知套組組件中之一或多者,例如具有一或多種醫藥學上可接受之載劑之容器、額外容器等。套組中亦可包括指示待投與之組分之量的說明書(作為插入物或作為標籤)、投與指南及/或用於混合組分之指南。
使用方法
本發明亦提供在受試者中治療、預防或減輕疾病、病症或病狀之方法,其包括向該受試者投與治療有效量之本文所提供之抗體或其抗原結合片段及/或本文所提供之醫藥組合物及/或本文所提供之嵌合抗原受體。在某些實施例中,疾病、病症或病狀為CD3相關疾病、病症或病狀。在某些實施例中,受試者為人類。
在一些實施例中,CD3相關之疾病、病症或病狀之特徵在於表現或過度表現CD3。
在某些實施例中,疾病、病症或病症為免疫性疾病、炎性疾病、癌症或神經系統疾病。在某些實施例中,上述癌症為CD3表現性癌症。如本文所用,「CD3表現性癌症」係指特徵在於表現癌細胞(亦即腫瘤浸潤免疫細胞)中之CD3蛋白或表現癌細胞(亦即腫瘤浸潤免疫細胞)中之CD3之癌症,其表現水平顯著高於正常細胞之預期水平。可使用各種方法來確定受試者之測試生物樣品中CD3之存在及/或量。例如,測試生物樣品可暴露於抗CD3抗體或其抗原結合片段,其結合且偵測所表現之CD3蛋白。替代地,亦可使用如qPCR、逆轉錄酶PCR、微陣列、SAGE、FISH等方法在核酸表現水平上偵測CD3。在一些實施例中,測試樣品源自癌細胞或組織、或腫瘤浸潤免疫細胞。參考樣品可為自健康或非患病個體獲得之對照樣品,或為自獲得測試樣品之同一個體獲得之健康或非患病樣品。例如,參考樣品可為與測試樣品(例如,腫瘤)相鄰或在測試樣品附近之非患病樣品。在某些實施例中,上述癌症為實體瘤或血液腫瘤。
在某些實施例中,疾病、病症或病狀選自由以下組成之群:肺癌(例如,非小細胞肺癌(NSCLC)、小細胞肺癌(SCLC) (肺腺癌或肺鱗狀細胞癌)、腹膜癌、類癌、骨癌、胰臟癌、原始性神經外胚層瘤、皮膚癌、膽囊癌、頭頸癌、鱗狀細胞癌、子宮癌、卵巢癌、直腸癌、前列腺癌、膀胱癌(例如,尿路上皮癌)、肛區癌(例如,肛門鱗狀細胞癌)、胃癌(gastric or stomach cancer) (例如,胃腸癌)、食道癌、結腸癌、乳癌、子宮癌、肝癌(例如,肝母細胞癌、肝細胞性肝癌/肝細胞瘤或肝癌)、膽管癌、肉瘤、結腸直腸癌、輸卵管癌、唾液腺癌、子宮頸癌、子宮內膜癌或子宮癌、骨肉瘤、陰道癌、陰戶癌、食管癌、小腸癌、內分泌系統癌、甲狀腺癌、甲狀旁腺癌、腎上腺癌、鼻咽癌、軟組織肉瘤、真性紅細胞增多、尿道癌、陰莖癌、腎臟或尿道癌(例如,腎臟橫紋肌樣瘤)、皮膚T細胞淋巴癌、成神經管細胞瘤、腎胚細胞瘤、骨髓增生異常症候群、慢性及非慢性骨髓增殖性病症、脈絡叢乳頭狀瘤、腎細胞癌、腎盂癌、中樞神經系統(CNS)贅生物、軟組織肉瘤(例如,橫紋肌肉瘤、纖維肉瘤、卡波濟氏肉瘤)、脊髓軸腫瘤、膠質瘤(例如,室管膜瘤、星形細胞瘤、間變型星形細胞瘤、少突神經膠質瘤)、眼癌(例如,視網膜母細胞瘤)、腦幹膠質瘤或如少突星形細胞瘤等混合膠質瘤、腦瘤(例如,成膠質細胞瘤/多形性成膠質細胞瘤(GBM)、非成膠質細胞瘤腦瘤或腦膜瘤)、黑色素瘤(例如,皮膚或眼內黑色素瘤)、血小板增多、間皮瘤、蕈樣肉芽腫、塞紮里症候群、原發性骨髓纖維化、孤立性漿細胞瘤、前庭神經鞘瘤、尤因氏肉瘤、軟骨肉瘤、MYH相關息肉病、垂體腺瘤、小兒癌症,如小兒肉瘤(例如,神經母細胞瘤、橫紋肌肉瘤及骨肉瘤),血液學癌症、霍奇金氏淋巴瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、白血病(例如,淋巴細胞/成淋巴球白血病)、慢性或急性白血病、肥大細胞白血病、淋巴細胞淋巴瘤、原發性CNS淋巴瘤、慢性淋巴球白血病(CLL)、急性淋巴球白血病(ALL)、慢性髓系白血病(CML)、急性髓系白血病(AML)、慢性骨髓單核細胞性白血病(CMML)、慢性淋巴球白血病、急性淋巴球白血病、毛細胞白血病(HCL)、伯基特氏淋巴瘤(BL)、多發性骨髓瘤(例如,復發性或難治性多發性骨髓瘤)、T細胞或B細胞淋巴瘤、套細胞淋巴瘤(MCL) (例如,復發性或難治性套細胞淋巴瘤)、惡性黑色素瘤、瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、由濾泡性淋巴瘤引起之DLBCL、高級B細胞淋巴瘤、原發性縱隔大B細胞淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤(FL)及原發性縱隔B細胞淋巴瘤。
在一些實施例中,受試者已被鑑定為具有表現CD3之癌細胞或腫瘤浸潤免疫細胞,視情況在顯著高於通常在非癌細胞上發現之水平下。
在另一態樣中,提供治療、預防或減輕受試者之將受益於CD3活性之調節之疾病、病症或病狀的方法,其包括向該受試者投與治療有效量之本文所提供之抗體或其抗原結合片段及/或本文所提供之醫藥組合物及/或本文所提供之嵌合抗原受體。在某些實施例中,該疾病、病症或病狀係上文定義之CD3相關疾病、病症或病狀。
本文所提供之抗體或抗原結合片段之治療有效量將取決於此項技術中已知之各種因素,例如,體重、年齡、既往病史、當前藥物治療、受試者之健康狀況及交叉反應之潛力、過敏、敏感性及不良副作用以及投與途徑及疾病發展之程度。熟習此項技術者(例如,醫師或獸醫)可根據此等及其他情況或要求的指示按比例減少或增加劑量。
在某些實施例中,本文所提供之抗體或抗原結合片段及/或嵌合受體可以約0.01 mg/kg至約100 mg/kg之治療有效劑量投與。在某些實施例中,投與劑量可在治療過程中改變。例如,在某些實施例中,初始投與劑量可高於後續投與劑量。在某些實施例中,投與劑量可在治療過程中根據受試者之反應而變化。
可調整劑量方案以提供最佳的期望反應(例如,治療反應)。例如,可投與單一劑量,或者可隨時間推移投與多個分開的劑量。
本文所提供之抗體或其抗原結合片段及/或嵌合抗原受體可藉由此項技術中已知之任何途徑投與,例如,藉由包括皮下注射、腹膜內注射、靜脈內注射、肌肉內注射或皮內注射之腸胃外途徑投與;或藉由非胃腸外途徑,包括透皮、口服、鼻內、眼內、舌下、直腸或外用。
在一些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段及/或嵌合抗原受體可單獨投與或與治療有效量之第二治療劑組合投與。例如,本文揭示之抗體或其抗原結合片段及/或嵌合抗原受體可與第二治療劑組合投與,上述第二治療劑係例如偵測劑、化療劑、抗癌藥物、放療劑、免疫療法藥劑、靶向療法藥劑、細胞療法藥劑、基因療法藥劑、激素療法藥劑、抗病毒劑、抗生素、鎮痛藥、抗氧化劑、金屬螯合劑、細胞介素、活性劑、成像劑、細胞毒性劑、血管生成抑制劑、激酶抑制劑、共刺激分子促效劑、共抑制分子阻滯劑、黏附分子阻斷劑、抗細胞介素抗體或其功能片段、可偵測標記或報導基因、抗菌劑、基因編輯劑、β促效劑、病毒RNA抑制劑、聚合酶抑制劑、干擾素或微小RNA。
如本文所用,術語「免疫療法」係指刺激免疫系統對抗如癌症等疾病或以一般方式增強免疫系統之療法類型。免疫療法之實例包括但不限於檢查點調節劑、過繼性細胞轉移、細胞介素、溶瘤病毒及治療性疫苗。
「靶向療法」係作用於與癌症相關之特定分子之療法類型,上述特定分子如存在於癌細胞中但不存在於正常細胞中或在癌細胞中更豐富的特定蛋白質,或有助於癌症生長及存活之癌症微環境中之靶分子。靶向療法將治療劑靶向腫瘤,從而使正常組織免受治療劑的影響。
在此等實施例中之某些實施例中,本文所提供之抗體或其抗原結合片段及/或本文所提供之醫藥組合物及/或本文所提供之嵌合抗原受體與一或多種額外藥劑組合投與,可與一或多種額外治療劑同時投與,且在此等實施例中之某些實施例中,抗體或其抗原結合片段及/或本文所提供之醫藥組合物及/或本文所提供之嵌合抗原受體以及額外藥劑可作為相同醫藥組合物之一部分投與。然而,抗體或其抗原結合片段及/或本文所提供之醫藥組合物及/或本文所提供之嵌合抗原受體與另一種藥劑「組合」投與不必與上述藥劑同時投與或以與上述藥劑相同的組合物投與。在另一種藥劑之前或之後投與之抗體或其抗原結合片段、醫藥組合物或嵌合抗原受體被視為與上述藥劑「組合」投與,如本文所使用之片語,即使抗體或抗原結合片段、醫藥組合物或嵌合抗原受體及第二治療劑藉由不同途徑投與亦如此。在可能的情況下,與本文揭示之抗體或其抗原結合片段、醫藥組合物或嵌合抗原受體組合投與之額外藥劑根據額外治療劑之產品資訊表中列出之時間表或根據醫生桌上參考手冊2003 (Physicians' Desk Reference, 第57版; Medical Economics Company; ISBN: 1563634457第57版(2002年11月))或此項技術中眾所周知的方案投與。
本發明進一步提供在體內或體外活化表現CD3之T細胞之方法,其包括使表現CD3之T細胞與本文所提供之抗體或其抗原結合片段及/或本文所提供之醫藥組合物及/或本文所提供之嵌合抗原受體接觸。
本發明進一步提供調節表現CD3之細胞中CD3活性之方法,其包括將表現CD3之細胞暴露於本文所提供之抗體或其抗原結合片段及/或本文所提供之醫藥組合物及/或本文所提供之嵌合抗原受體。
本發明進一步提供促進表現CD3之T細胞在活體內或活體外加工第二抗原之方法,其包括使表現CD3之T細胞與本文所提供之雙特異性抗體或其抗原結合片段接觸,其中雙特異性抗體或其抗原結合片段能夠特異性結合至表現CD3之T細胞及第二抗原,從而使兩者鄰近。
在另一態樣中,本發明提供一種偵測樣本中CD3之存在或量之方法,其包括使樣本與本文所提供之抗體或其抗原結合片段及/或本文所提供之醫藥組合物及/或本文所提供之嵌合抗原受體接觸,且確定樣本中CD3之存在或量。
在另一態樣中,本發明提供一種在受試者中診斷CD3相關疾病、病症或病狀之方法,其包括:a)自受試者獲得樣本,b)使自受試者獲得之樣本與本文所提供之抗體或其抗原結合片段及/或本文所提供之醫藥組合物及/或本文所提供之嵌合抗原受體接觸;c)確定樣本中CD3之存在或量;以及d)將受試者中CD3之存在或量與CD3相關疾病、病症或病狀之存在或狀態相關聯。
在另一態樣中,本發明提供本文所提供之套組,上述套組包括本文所提供之抗體或其抗原結合片段及/或本文所提供之醫藥組合物及/或本文所提供之嵌合抗原受體,視情況與可偵測部分結合,上述套組可用於偵測CD3,視情況重組CD3,在細胞表面上表現之CD3,或表現CD3之細胞。套組可進一步包括使用說明。
在另一態樣中,本發明亦提供一種本文所提供之抗體或其抗原結合片段及/或本文所提供之醫藥組合物及/或本文所提供之嵌合抗原受體在製備用於在受試者中治療、預防或減輕CD3相關疾病、病症或病狀的藥物中的用途,在製備用於診斷CD3相關疾病、病症或病狀的診斷試劑中的用途。
提供以下實例以更好地說明所主張之發明且不應將上述實施例解釋為限制本發明之範疇。下文描述之所有具體組合物、材料及方法全部或部分地落入本發明之範疇內。此等具體組合物、材料及方法不旨在限制本發明,而僅用於說明落入本發明範圍內之具體實施例。熟習此項技術者可在不運用發明能力及不脫離本發明範圍之情況下開發出等效組合物、材料及方法。將理解,可在本文描述之程序中做出許多變化,同時仍保持在本發明之界限內。本發明之發明人之意圖為此類變化均包括於本發明之範疇內。
實例 實例 1. 抗體產生 1.1 . 免疫
為了產生抗CD3之抗體,在各組中,SJL、Balb/c及CD1小鼠被用細胞(亦即,人類CD3過度表現細胞(Jurkat-hCD3mix或293T-hCD3mix)、人類CD3
+T細胞、活化人類CD3
+T細胞、食蟹獼猴CD3
+T細胞)、CD3蛋白(亦即,人類CD3 δε複合物及人類CD3 γε複合物、食蟹獼猴CD3 δε複合物及食蟹獼猴CD3 γε複合物蛋白)或基因(PTT 5-人類CD3 δε質體,PTT 5-食蟹獼猴CD3 δε質體)進行免疫。被免疫Balb/c及CD1小鼠如表4所示。被免疫SJL小鼠如表5所示。初次免疫隨後進行若干次增強免疫,直至動物產生適合於融合瘤開發之令人滿意的抗血清效價。CPG被用作佐劑。下表6、7、8、9、10及11中示出各組動物之免疫方案。
表 4. Balb/c 及 CD1 小鼠之分組
表 5. SJL 小鼠之分組
表 6. 組 1 之免疫方案
表 7. 組 2 之免疫方案
表 8. 組 3 之免疫方案
表 9. 組 4 之免疫方案
表 10. 組 5 之免疫方案
表 11. 組 6 之免疫方案
1.2 融合瘤產生及篩選 1.2.1. 細胞融合及篩選
| 組 | 免疫原 | 途徑 | 動物/ 品種 | 組大小 | 劑量 |
| 1 | Jurkat-hCD3mix | 腹腔注射 | Balb/c &CD1 | 5/5 | 5×10 6/小鼠 |
| 2 | 人類CD3 +T細胞 | 腹腔注射 | Balb/c &CD1 | 5/5 | 5×10 6/小鼠 |
| 3 | 活化人類CD3 +T細胞 | 腹腔注射 | Balb/c &CD1 | 5/5 | 5×10 6/小鼠 |
| 4 | 人類CD3 δε複合物 人類CD3 γε複合物 | 皮下注射 | Balb/c &CD1 | 5/5 | 25 μg 25 μg |
| 組 | 免疫原 | 途徑 | 動物/ 品種 | 組大小 | 劑量 |
| 5 | pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體 | 基因槍 | SLJ | 3/3 | 4 μg |
| pTT5-人類CD3 δε質體 | 基因槍 | 4 μg | |||
| pTT5-人類CD3 δε質體+pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體 & 人類CD3 δε複合物+人類CD3 γε複合物+食蟹獼猴CD3 δε複合物+食蟹獼猴CD3 γε複合物 | 基因槍 皮下注射 | 2 μg+2 μg 12.5 μg+12.5 μg+12.5 μg+12.5 μg | |||
| pTT5-人類CD3 δε質體+pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體 | 基因槍 | 2 μg+2 μg | |||
| pTT5-人類CD3 δε質體+pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體 & 人類CD3 δε複合物+人類CD3 γε複合物+食蟹獼猴CD3 δε複合物+食蟹獼猴CD3 γε複合物 & Jurkat細胞+食蟹獼猴CD3 +T細胞 | 基因槍 皮下注射 腹腔注射 | 2 μg+2 μg 12.5 μg+12.5 μg+12.5 μg+12.5 μg 5 × 10 6各小鼠 +5 × 10 6各小鼠 | |||
| 6 | pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體 | 基因槍 | SLJ | 2/2 | 4 μg |
| pTT5-人類CD3 δε質體 | 基因槍 | 4 μg | |||
| pTT5-人類CD3 δε質體+pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體 & 人類CD3 δε複合物+人類CD3 γε複合物+食蟹獼猴CD3 δε複合物+食蟹獼猴CD3 γε複合物 | 基因槍 皮下注射 | 2 μg+2 μg 12.5 μg+12.5 μg+12.5 μg+12.5 μg | |||
| pTT5-人類CD3 δε質體+pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體 | 基因槍 | 2 μg+2 μg | |||
| pTT5-人類CD3 δε質體+pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體 & 293T-hCD3mix細胞+食蟹獼猴CD3 +T細胞 | 基因槍 腹腔注射 | 2 μg+2 μg 5×10 6各小鼠 +5×10 6各小鼠 |
| 第0天 | 預採血(15-30 μL血清/小鼠) 原代:5 × 10 6個細胞/小鼠,腹腔注射 |
| 第21天 | 增強1:5 × 10 6個細胞/小鼠,腹腔注射 |
| 第35天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB1) |
| 第42天 | 增強2:5 × 10 6個細胞/小鼠,腹腔注射 |
| 第56天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB2) |
| 第77天 | 增強3:5 × 10 6個細胞/小鼠,腹腔注射 |
| 第91天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB3) |
| 資料分析及階段結論 | |
| 第118天 | 融合前(最終)增強,對於每隻小鼠:25 μg CD3 δε複合物,皮下注射,25 μg CD3 γε複合物,皮下注射,5 × 10 6個Jurkat-hCD3mix,腹腔注射,5 × 10 6個活化CD3 +T細胞,腹腔注射 |
| 未被選擇用於細胞融合之動物被保持在籠子中,且可能被給予額外增強免疫。 |
| 第0天 | 預採血(15-30 μL血清/小鼠) 原代:5 × 10 6個細胞/小鼠,腹腔注射 |
| 第21天 | 增強1:5 × 10 6個細胞/小鼠,腹腔注射 |
| 第35天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB1) |
| 第42天 | 增強2:5 × 10 6個細胞/小鼠,腹腔注射 |
| 第56天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB2) |
| 第77天 | 增強3:5 × 10 6個細胞/小鼠,腹腔注射 |
| 第91天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB3) |
| 資料分析及階段結論 | |
| 第118天 | 融合前(最終)增強,對於每隻小鼠:25 μg CD3 δε複合物,皮下注射,25 μg CD3 γε複合物,皮下注射,5 × 10 6個Jurkat-hCD3mix,腹腔注射,5 × 10 6個活化CD3 +T細胞,腹腔注射 |
| 未被選擇用於細胞融合之動物被保持在籠子中,且可能被給予額外增強免疫。 |
| 第0天 | 預採血(15-30 μL血清/小鼠) 原代:5 × 10 6個細胞/小鼠,腹腔注射 |
| 第21天 | 增強1:5 × 10 6個細胞/小鼠,腹腔注射 |
| 第35天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB1) |
| 第42天 | 增強2:5 × 10 6個細胞/小鼠,腹腔注射 |
| 第56天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB2) |
| 第77天 | 增強3:5 × 10 6個細胞/小鼠,腹腔注射 |
| 第91天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB3) |
| 資料分析及階段結論 | |
| 第118天 | 融合前(最終)增強,對於每隻小鼠:25 μg CD3 δε複合物,皮下注射,25 μg CD3 γε複合物,皮下注射,5 × 10 6個Jurkat-hCD3mix,腹腔注射,5 × 10 6個活化CD3 +T細胞,腹腔注射 |
| 未被選擇用於細胞融合之動物被保持在籠子中,且可能被給予額外增強免疫。 |
| 第0天 | 預採血(15-30 μL血清/小鼠) 原代:25 μg CD3 δε複合物,皮下注射,25 μg CD3 γε複合物,皮下注射 |
| 第21天 | 增強1:25 μg CD3 δε複合物,皮下注射,25 μg CD3 γε複合物,各小鼠皮下注射 |
| 第35天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB1) |
| 第42天 | 增強2:25 μg CD3 δε複合物,皮下注射,25 μg CD3 γε複合物,各小鼠皮下注射 |
| 第56天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB2) |
| 第77天 | 增強3:25 μg CD3 δε複合物,皮下注射,25 μg CD3 γε複合物,各小鼠皮下注射 |
| 第91天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB3) |
| 資料分析及階段結論 | |
| 第118天 | 融合前(最終)增強,對於每隻小鼠:25 μg CD3 δε複合物,皮下注射,25 μg CD3 γε複合物,皮下注射,5 × 10 6個Jurkat-hCD3mix,腹腔注射,5 × 10 6個活化CD3 +T細胞,腹腔注射 |
| 未被選擇用於細胞融合之動物被保持在籠子中,且可能被給予額外增強免疫。 |
| 第0天 | 預採血(15-30 μL血清/小鼠) 原代:pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體4 μg,基因槍。 |
| 第14天 | 增強1:pTT5-人類CD3 δε質體,4 μg,基因槍。 |
| 第21天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB1) |
| 第28天 | 增強2:pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體4 μg,基因槍。 |
| 第35天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB2) |
| 第42天 | 增強3:pTT5-人類CD3 δε質體2 μg+pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體2 μg,基因槍;人類CD3 δε複合物12.5 μg+人類CD3 γε複合物12.5 μg+食蟹獼猴CD3 δε複合物12.5 μg+食蟹獼猴CD3 γε複合物12.5 μg,皮下注射。 |
| 第49天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB3) |
| 第56天 | 增強4:pTT5-人類CD3 δε質體2 μg+pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體2 μg,基因槍。 |
| 第78天 | 增強5:pTT5-人類CD3 δε質體2 μg+pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體2 μg,基因槍;人類CD3 δε複合物12.5 μg+人類CD3 γε複合物12.5 μg+食蟹獼猴CD3 δε複合物12.5 μg+食蟹獼猴CD3 γε複合物12.5 μg,皮下注射。 |
| 第85天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB5) |
| 資料分析及階段結論 | |
| 第92天 | 融合前(最終)增強:pTT5-人類CD3 δε質體2 μg+pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體2 μg,基因槍;人類CD3 δε複合物12.5 μg+人類CD3 γε複合物12.5 μg+食蟹獼猴CD3 δε複合物12.5 μg+食蟹獼猴CD3 γε複合物12.5 μg,皮下注射;5 × 10 6個Jurkat細胞 +5 × 10 6個食蟹獼猴CD3 +T細胞,腹腔注射。 |
| ● 未被選擇用於細胞融合之動物被保持在籠子中,且可能被給予額外增強免疫。 |
| 第0天 | 預採血(15-30 μL血清/小鼠) 原代:pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體4 μg,基因槍。 |
| 第14天 | 增強1:pTT5-人類CD3 δε質體,4 μg,基因槍。 |
| 第21天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB1) |
| 第28天 | 增強2:pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體4 μg,基因槍。 |
| 第35天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB2) |
| 第42天 | 增強3:pTT5-人類CD3 δε質體2 μg+pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體2 μg,基因槍;人類CD3 δε複合物12.5 μg+人類CD3 γε複合物12.5 μg+食蟹獼猴CD3 δε複合物12.5 μg+食蟹獼猴CD3 γε複合物12.5 μg,皮下注射。 |
| 第49天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB3) |
| 第56天 | 增強4:pTT5-人類CD3 δε質體2 μg+pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體2 μg,基因槍。 |
| 第78天 | 增強5:pTT5-人類CD3 δε質體2 μg+pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體2 μg,基因槍;5 × 10 6個293T-hCD3mix細胞+5 × 10 6個食蟹獼猴CD3 +T細胞,腹腔注射。 |
| 第85天 | 測試採血(15-30 μL血清/小鼠) (TB5) |
| 資料分析及階段結論 | |
| 第92天 | 融合前(最終)增強:pTT5-人類CD3 δε質體2 μg+pTT5-食蟹獼猴CD3 δε質體2 μg,基因槍;人類CD3 δε複合物12.5 μg+人類CD3 γε複合物12.5 μg+食蟹獼猴CD3 δε複合物12.5 μg+食蟹獼猴CD3 γε複合物12.5 μg,皮下注射;5 × 10 6個Jurkat細胞 +5 × 10 6個食蟹獼猴CD3 +T細胞,腹腔注射。 |
| ● 未被選擇用於細胞融合之動物被保持在籠子中,且可能被給予額外增強免疫。 |
藉由測試採血之FACS及/或ELISA以確定對免疫反應最佳之小鼠進行脾細胞融合。FACS測定在穩定地過度表現人類CD3之293F、HEK 293T或Jurkat細胞株上進行。使用最佳化電融合方案,將來自脾臟及淋巴結之淋巴細胞與小鼠骨髓瘤細胞株(SP2/0)融合。進行多次融合,以確保項目成功。
將融合細胞接種(每孔2×10
4至10
5個細胞)至一堆96孔盤中。監測盤中細胞之生長情況且每週進料一次。具有細胞生長之孔在10-14天內被用FACS及/或其他可行的測定如ELISA (具有生物素標記的人類CD3 δε複合物)的初級篩選測定來篩選。對各靶向抗原進行多次融合且進行篩選。將顯示與HEK293T-hCD3mix、Jurkat-hCD3mix或穩定地過度表現人類CD3之CHO-K1(CHO-K1-hCD3mix)細胞之陽性結合及來自初步篩選之陽性ELISA信號(如與人類CD3 δε複合物及人類CD3 γε複合物之ELISA信號)之陽性親代殖株擴增至24孔盤中用於二次篩選。選擇所關注融合瘤(如顯示與Jurkat及293F-cynoCD3mix細胞之基於陽性細胞之結合之融合瘤)以進行次選殖。
1.2.2. 融合瘤次選殖、篩選及冷凍保存
然後藉由多輪有限稀釋或單細胞分選對具有所期望反應性及來自上述篩選條件之同型之親本融合瘤進行次選殖,直至獲得單株為止。
藉由蛋白質、基於細胞之ELISA或基於細胞之結合測定(如對CHO-K1-hCD3mix細胞之基於細胞之結合測定、對人類CD3 δε複合物及人類CD3 γε複合物蛋白質之ELISA測定)來篩選次選殖盤,且將具有良好結合能力之次殖株擴增至24孔,用於藉由對HEK293T及HEK293T-hCD3mix細胞或Jurkat及293F-cynoCD3mix細胞之基於細胞之結合測定進行確認測試。
對所需次選殖細胞株進行定序,且使其進一步擴增至培養瓶中以進行冷凍保存。最初以0.5-13.0 × 10
6個細胞/小瓶冷凍保存各細胞株4-6個小瓶。若需要,為選定的最有價值細胞株建立主細胞庫及工作細胞庫。
作為結果,發現19種具有獨特序列之抗體。在19種抗體中,12種抗體顯示出與穩定地過度表現人類CD3蛋白之HEK293T細胞(293T-hCD3mix)之陽性結合,但不與親代HEK293T細胞結合(如下表12所示),表明此等抗體係人類CD3識別抗體;其他7種抗體顯示出與Jurkat及293F-cynoCD3mix細胞之陽性結合,但不與Jurkat-KO或親代293F細胞結合(如下表13所示),表明此等抗體係人類及食蟹獼猴CD3識別抗體。
表 12. 與 HEK293T 及 293T-hCD3mix 結合之抗體之 FACS MFI
表 13. 與 Jurkat 、 Jurkat-KO 、 293F-cynoCD3mix 及 293F 細胞結合之抗體之 MFI
實例 2. 抗體表徵 2.1 抗體
| 抗體 | FACS MFI(HEK293T) | FACS MFI (HEK293T-hCD3mix) |
| 25-G12-G6-C12 | 200 | 38920 |
| 16-F2-C11-D9 | 2070 | 80290 |
| 20-E11-E11-C2 | 2140 | 55240 |
| 7-D9-G10-H2 | 4330 | 50980 |
| 31-F8-F5-C5 | 500 | 77328 |
| 7-D8-G12-E4 | 1616 | 65240 |
| 40-C12-C10-E9 | 290 | 13120 |
| 2-F12-A6-G2 | 880 | 53840 |
| 3-C6-C11-F12 | 1760 | 21750 |
| 8-B12-F9-B11 | 160 | 67080 |
| 4-F12-F1-A4 | 500 | 16760 |
| 3-F3-G12-E2 | 14080 | 92740 |
| 抗體 | FACS_MFI (Jurkat) | FACS_MFI (Jurkat-KO) | FACS_MFI (293F-cynoCD3mix) | FACS_MFI (293F) |
| 124E3D6 | 126 | 97 | 400 | 98 |
| 126A11A4 | 1621 | 101 | 2215 | 101 |
| 127E2D3 | 930 | 109 | 1925 | 102 |
| 133B4C7 | 681 | 105 | 1785 | 100 |
| 140D2B10 | 872 | 100 | 2038 | 98 |
| 147C6F3 | 1857 | 101 | 2231 | 98 |
| 147E11E2 | 2453 | 104 | 2526 | 102 |
對融合瘤抗體殖株25-G12-G6-C12、40-C12-C10-E9、8-B12-F9-B11、31-F8-F5-C5、16-F2-C11-D9、20-E11-E11-C2、7-D9-G10-H2、7-D8-G12-E4、2-F12-A6-G2、3-C6-C11-F12、4-F12-F1-A4、3-F3-G12-E2、124E3D6、126A11A4、127E2D3、133B4C7、140D2B10、147C6F3及147E11E2進行表徵。
2.2 融合瘤定序
按照RNAiso Plus (TAKARA目錄號9109)之技術手冊自融合瘤細胞中分離出總RNA。然後按照PrimeScript II第1鏈cDNA合成套組(TAKARA目錄號6210A)之技術手冊,使用同型特異性反義引子或通用引子將總RNA逆轉錄為cDNA。根據TaKaRa Taq
TM(目錄號R001A)擴增VH及VL之抗體片段。將經擴增之抗體片段單獨選殖至標準選殖載體中。進行菌落PCR以篩選具有正確大小之插入物之殖株。對各片段之不少於五個具有正確大小之插入物之菌落進行定序。對不同殖株之序列進行比對,且提供此等殖株之共有序列。
上表3中提供融合瘤抗體之可變區序列。
2.3 抗體 25-G12-G6-C12 、 40-C12-C10-E9 、 8-B12-F9-B11 、 31-F8-F5-C5 、 16-F2-C11-D9 、 20-E11-E11-C2 、 7-D9-G10-H2 、 7-D8-G12-E4 、 2-F12-A6-G2 、 3-C6-C11-F12 、 4-F12-F1-A4 及 3-F3-G12-E2 之表徵
此等抗體之T細胞活化能力藉由Jurkat NFAT-螢光素酶活化測定來確定。OKT3被用作陽性對照。用於活化分析之方案描述如下:
●
小鼠抗體在37℃下塗覆在96孔盤中持續1小時,50 μg/mL及100 μl/孔;
●
在各孔中接種Jurkat-NFAT-螢光素酶細胞,持續24小時,2×10
4個細胞/孔;
●
向各孔中加入20 μL Bright-Glo,用微孔盤讀取器讀取螢光素酶值。
結果在下表14中示出。如表14所示,此等小鼠抗體之活化能力高於陽性對照OKT3。
表 14. 用小鼠抗體活化 Jurkat-NFAT- 螢光素酶
實例 3. 嵌合抗體之產生及表徵 3.1. 嵌合抗體之產生
| 盤1 | |||
| 編號 | 名稱 | RLU | |
| 1 | OKT3 | 5626 | 5711 |
| 2 | 同型對照 | 564 | 582 |
| 3 | 16-F2-C11-D9 | 941 | 789 |
| 4 | 20-E11-E11-C2 | 748 | 710 |
| 5 | 7-D9-G10-H2 | 772 | 712 |
| 6 | 40-C12-C10-E9 | 1101 | 1057 |
| 7 | 2-F12-A6-G2 | 786 | 688 |
| 8 | 4-F12-F1-A4 | 1504 | 1557 |
| 盤2 | |||
| 編號 | 名稱 | RLU | |
| 1 | OKT3 | 2594 | 2520 |
| 2 | 同型對照 | 386 | 380 |
| 3 | 25-G12-G6-C12 | 1503 | 1211 |
| 4 | 31-F8-F5-C5 | 606 | 722 |
| 5 | 7-D8-G12-E4 | 395 | 378 |
| 6 | 3-C6-C11-F12 | 509 | 513 |
| 盤3 | |||
| 編號 | 名稱 | RLU | |
| 1 | OKT3 | 1131 | 1045 |
| 2 | 同型對照 | 237 | 231 |
| 3 | 8-B12-F9-B11 | 1039 | 1144 |
選擇16種融合瘤抗體((25-G12-G6-C12、4-F12-F1-A4、7-D8-G12-E4、20-E11-E11-C2、7-D9-G10-H2、40-C12-C10-E9、31-F8-F5-C5、8-B12-F9-B11、3-F3-G12-E2、133B4C7、124E3D6、147E11E2、126A11A4、147C6F3、127E2D3及140D2B10)之序列以生成及產生人類IgG1嵌合抗體。合成編碼16種融合瘤抗體之可變區之DNA,且次選殖至預先包含人類IgG恆定基因之表現載體中。將載體轉染至哺乳動物細胞中用於重組蛋白表現,且使用蛋白A親和層析柱純化表現之抗體。所得嵌合抗體在本文中被稱為ch25-G12-G6-C12、ch4-F12-F1-A4、ch7-D8-G12-E4、ch20-E11-E11-C2、ch7-D9-G10-H2、ch40-C12-C10-E9、ch31-F8-F5-C5、ch8-B12-F9-B11、ch3-F3-G12-E2、ch133B4C7、ch124E3D6、ch147E11E2、ch126A11A4、ch147C6F3、ch127E2D3、ch140D2B10,其中字首「ch」表示「嵌合的」,且後面表示融合瘤抗體殖株。例如,ch25-G12-G6-C12表明其係來自融合瘤抗體25-G12-G6-C12之嵌合抗體。
3.2. ch124E3D6 、 ch126A11A4 、 ch127E2D3 、 ch133B4C7 、 ch140D2B10 、 ch147C6F3 及 ch147E11E2 之 T 細胞活化能力測定
嵌合抗體ch124E3D6、ch126A11A4、ch127E2D3、ch133B4C7、ch140D2B10、ch147C6F3及ch147E11E2之T細胞活化能力藉由Jurkat NFAT-螢光素酶活化測定來確定。BMK-B219 (由JNJ開發之抗CD3抗體)及BMK-TCB (由Roche開發之抗CD3抗體)被用作陽性對照,且hIgG1同型被用作陰性對照。用於活化分析之實驗步驟描述如下:
●
將連續稀釋之測試抗體在37℃下塗覆在96孔盤上持續2小時,100 μl/孔;
●
在各孔中接種Jurkat-NFAT-螢光素酶細胞,且培育24小時,2×10
4個細胞/孔;
●
移除上清液,且用25μL/孔之裂解試劑(Promega,RLB-E3971)裂解細胞;
●
樣本在-80℃下冷凍保存30分鐘,然後在生化培養箱中在37℃下加熱15分鐘;
●
然後將96孔盤以500 xg離心10分鐘,且將各孔之20 μL上清液轉移至新的白色不透明96孔盤中;
●
將100 μL/孔之螢光素酶測定受質(Promega,E4530)加入至96孔盤中;
●
微孔盤讀取器用於確定反映螢光素酶活性之水平之相對發光單位(RLU)。
結果在下圖1及表15中示出。如圖1及表15所示,選定抗體之活化能力高於兩種基準抗體或與兩種基準抗體類似。
表 15. 用嵌合抗體活化 Jurkat-NFAT- 螢光素酶
3.3. 對 Jurkat 細胞之基於細胞之結合親和力
| 排序 | 抗體 | EC 50(nM) | 最大信號 |
| 1 | ch133B4C7 | 27.97 | 290 |
| 2 | ch124E3D6 | 32.38 | 482.3 |
| 3 | ch147E11E2 | 32.99 | 420.8 |
| 4 | ch126A11A4 | 33.56 | 681.7 |
| 5 | ch147C6F3 | 57.36 | 427.8 |
| 6 | BMK-TCB | 59.35 | 752.6 |
| 7 | ch127E2D3 | 61.68 | 336.6 |
| 8 | BMK-B219 | 68.37 | 811.3 |
藉由FACS分析來確定產生之嵌合抗體及基準抗體(OKT3,BMK-B219或BMK-TCB)對人類患者來源之淋巴細胞癌細胞株Jurkat之結合親和力,且hIgG1同型被用作陰性對照。用於FACS分析之方案描述如下:
(a)收穫Jurkat細胞且用FACS緩衝液重懸;
(b)對細胞進行計數,且將濃度調整至4×10^6個細胞/ml。將50 μl/孔之細胞懸浮液加入至96孔盤中;
(c)將50 μl/孔2x連續稀釋之測試抗體添加至盤中。盤在4℃下培育1小時;
(d)將盤以300 g離心3分鐘,且棄去上清液;
(e)在200 μl FASC緩衝液中洗滌細胞兩次,且重複步驟(d);
(f)將100 μl/孔之抗人類IgG-PE之山羊pAb或抗小鼠IgG-PE之山羊pAb之二級抗體加入至盤中。將盤在4℃培育30分鐘;
(g)將盤以300 g離心3分鐘,且棄去上清液;
(h)在200 μl FASC緩衝液中洗滌細胞兩次,且重複步驟(g);
(i)用150 μl FASC緩衝液重懸細胞,且在FACS上測試。
如下圖2及表16所示,嵌合抗體ch31-F8-F5-C5、ch25-G12-G6-C12、ch40-C12-C10-E9及ch8-B12-F9-B11以及基準抗體OKT3對Jurkat細胞具有陽性結合親和力。如下圖3及表17所示,嵌合抗體ch147E11E2、ch126A11A4及ch147C6F3對Jurkat細胞之結合親和力高於兩種基準抗體BMK-B219及BMK-TCB或與兩種基準抗體BMK-B219及BMK-TCB類似。
表 16. 選定嵌合抗體對 Jurkat 細胞之結合親和力
表 17. 選定嵌合抗體對 Jurkat 細胞之結合親和力
3.4. 對 293T-cynoCD3mix 細胞之基於細胞之結合親和力
| 排序 | 抗體 | EC 50(nM) | 最大FACS 信號 |
| 1 | OKT3 | 0.22 | 3124 |
| 2 | ch31-F8-F5-C5 | 0.74 | 2540 |
| 3 | ch25-G12-G6-C12 | 0.84 | 2790 |
| 4 | ch40-C12-C10-E9 | 1.01 | 2545 |
| 5 | ch8-B12-F9-B11 | 17.99 | 2721 |
| 排序 | 抗體 | EC 50(nM) | 最大信號 |
| 1 | ch147E11E2 | 0.4192 | 2777 |
| 2 | ch126A11A4 | 0.5668 | 1764 |
| 3 | BMK-B219 | 1.47 | 3001 |
| 4 | ch147C6F3 | 1.774 | 2282 |
| 5 | BMK-TCB | 1.912 | 3145 |
藉由FACS分析來確定選定嵌合抗體及基準抗體對穩定地過度表現食蟹獼猴CD3(293T-cynoCD3mix)細胞之HEK 293T之結合親和力。BMK-B219及BMK-TCB被用作陽性對照,且hIgG1同型被用作陰性對照。用於FACS分析之方案描述如下:
(a)收穫293T-cynoCD3mix細胞且用FACS緩衝液重懸;
(b)對細胞進行計數,且將濃度調整至4×10^6個細胞/ml。將50 μl/孔之細胞懸浮液加入至96孔盤中;
(c)將50 μl/孔2x連續稀釋之測試抗體添加至盤中,且在4℃下培育1小時;
(d)將盤以300 g離心3分鐘,且棄去上清液;
(e)在200 μl FASC緩衝液中洗滌細胞兩次,且重複步驟(d);
(f)將100 μl/孔之抗人類IgG-PE之二級抗體山羊pAb(Abcam,ab98596)加入至盤中,且在4℃下培育30分鐘;
(g)將盤以300 g離心3分鐘,且棄去上清液;
(h)在200 μl FASC緩衝液中洗滌細胞兩次,且重複步驟(g);
(i)用150 μl FASC緩衝液重懸細胞,且在FACS上測試。
如下圖4及表18所示,選定嵌合抗體對293T-cynoCD3mix細胞之結合親和力高於兩種基準抗體對293T-cynoCD3mix細胞之結合親和力。
表 18. 對 293T-cynoCD3mix 細胞之結合親和力
3.5. Jurkat-NFAT- 螢光素酶活化測定
| 排序 | 抗體 | EC 50(nM) | 最大信號 |
| 1 | ch147E11E2 | 2.19 | 53876 |
| 2 | ch127E2D3 | 2.33 | 46947 |
| 3 | ch124E3D6 | 2.64 | 45795 |
| 4 | ch140D2B10 | 2.81 | 52929 |
| 5 | ch133B4C7 | 2.81 | 45246 |
| 6 | ch126A11A4 | 2.91 | 57049 |
| 7 | ch147C6F3 | 4.15 | 55201 |
| 8 | BMK-B219 | 4.34 | 60013 |
| 9 | BMK-TCB | 4.72 | 60397 |
如下使用人類患者來源之淋巴球癌細胞株Jurkat對若干選定嵌合抗體及基準抗體(OKT3)進行Jurkat-NFAT-螢光素酶活化測定。
(a)用50 μl/孔之連續稀釋之測試抗體在37℃下塗覆盤持續2小時;
(b)收穫Jurkat-NFAT-Luc細胞且用1640培養基(10%胎牛血清,1%P/S)重懸;
(c)對細胞進行計數,且將濃度調整至2×10^5個細胞/ ml。將100 μl/孔之細胞懸浮液接種至96孔細胞培養盤中。加入100 μl培養基作為陰性對照;
(d)將細胞盤放回37℃、5%CO
2之培養箱中持續24小時;
(e)以500 g離心10分鐘,且棄去上清液;
(f)在PBS中洗滌細胞一次,且重複步驟(e);
(g)加入30 μl/孔之1x裂解緩衝液,將盤置於-80℃冰箱中持續30分鐘,然後移動至37℃培養箱中持續15分鐘;
(h)以500 g離心10分鐘,且將20 μl上清液轉移至另一96孔盤(Coning 3903)。加入100 μl/孔螢光素酶測定受質且輕輕混合均勻;
(i)在微孔盤讀取器上讀取盤用於發光信號(RLU)。
如下圖5及表19所示,選定嵌合抗體之活化能力高於基準抗體OKT3或與基準抗體OKT3類似。
表 19. 嵌合抗體對 Jurkat-NFAT-Luc 細胞之活化能力
3.6. PBMC 活化測定 3.6.1 實驗 1
| 排序 | 抗體 | EC 50(nM) | 最大FACS 信號 |
| 1 | ch25-G12-G6-C12 | 1.674 | 249.8 |
| 2 | ch31-F8-F5-C5 | 3.83 | 253.2 |
| 3 | OKT3 | 10.12 | 363.7 |
| 4 | ch8-B12-F9-B11 | 11.27 | 457.2 |
| 5 | ch40-C12-C10-E9 | 24.17 | 810.2 |
基於原代人類周邊血液單核細胞(PBMC)之測定用於確定若干選定嵌合抗體對T細胞之活化能力。如下進行選定嵌合抗體及基準抗體(OKT3)與PBMC之PBMC活化測定。
(a)用50 μl/孔之連續稀釋之測試抗體在37℃下塗覆盤持續2小時;
(b)丟棄抗體溶液,且用200 μl之PBS洗滌盤之孔一次;
(c)分離PBMC且用1640培養基(10%FBS,1%P/S)重懸;
(d)對細胞進行計數,且將濃度調整至1×10^6個細胞/ml。將200 μl/孔之細胞懸浮液接種至96孔細胞培養盤中。加入200 μl培養基作為陰性對照;
(e)將細胞盤放回37℃、5%CO
2之培養箱中持續120小時;
(f)以400 g離心5分鐘,且收集上清液,以藉由ELISA測定偵測IL-2及IFNγ細胞介素釋放。
如下進行ELISA測定。
(a)向各孔中加入100 μl稀釋之捕獲抗體。在4℃下培育隔夜;
(b)抽吸且清洗3次;
(c)封閉盤:向各孔中加入200 μl測定稀釋劑。在室溫下培育1小時;
(d)抽吸且清洗3次;
(e)向各孔中加入100 μl標準品或樣本。在室溫下培育2小時;
(f)抽吸且清洗5次;
(g)向各孔中加入100 μl工作偵測劑(偵測抗體+SAv-HRP)。在室溫下培育1小時;
(h)抽吸且清洗7次(浸泡30秒至1分鐘);
(i)向各孔中加入100 μl受質溶液。在黑暗中在室溫下培育30分鐘;
(j)向各孔中加入50 μl終止溶液;
(k)在30分鐘內在450 nm處讀取吸光度。
在圖6及圖7中分別示出IL-2及IFNγ釋放之結果。如圖6所示,選定嵌合抗體ch25-G12-G6-C12、ch40-C12-C10-E9、ch31-F8-F5-C5及ch8-B12-F9-B11以及基準抗體OKT3顯著地誘導IL-2之釋放。如圖7所示,選定嵌合抗體ch25-G12-G6-C12、ch40-C12-C10-E9、ch31-F8-F5-C5、ch8-B12-F9-B11以及基準抗體OKT3顯著地增加IFNγ之釋放,且選定嵌合抗體之PBMC活化能力高於基準抗體OKT3或至少與基準抗體OKT3類似。
3.6.2. 實驗 2
基於原代人類周邊血液單核細胞(PBMC)之測定用於確定若干其他選定嵌合抗體對T細胞之活化能力。眾所周知,當T細胞被活化時,表面蛋白CD25之表現被上調。BMK-B219及BMK-TCB被用作陽性對照,且hIgG1同型被用作陰性對照。用於活化分析之方案描述如下:
(a)100 μl/孔之10 μg/ml測試抗體在37℃下塗覆在96孔盤中持續2小時;
(b)在各孔中接種2×10
5個細胞/孔之新鮮人類PBMC,且培育3天;
(a)收集細胞且轉移至新的96孔盤中。將盤以400 g離心3分鐘,且棄去上清液;
(c)將細胞重懸在100 μl FASC緩衝液中,該緩衝液含有抗人類CD25 Alexa Fluor 488-結合抗體(R&D,FAB9926G)及抗人類CD3 Brilliant Violet 421-結合抗體(Biolegend,317344);
(d)將盤在4℃下培育30分鐘;
(e)將盤以400 g離心3分鐘,且棄去上清液;
(f)在200 μl FASC緩衝液中洗滌細胞兩次,且重複步驟(d);
(g)用150 μl FASC緩衝液重懸細胞,且在FACS上測試。
如圖8所示,陽性對照BMK-B219及BMK-TCB誘導人類T細胞上CD25之上調,如由CD3
+T細胞中CD25
+細胞之亞群比率所指示。在嵌合抗體中,若干(亦即ch124E3D6、ch126A11A4、ch140D2B10、ch147C6F3及ch147E11E2)誘導CD25表現之程度弱於陽性對照。嵌合抗體ch127E2D3及ch133B4C7未顯著誘導CD25上調。
實例 4. 人源化抗體之產生、親和力成熟及抗體表徵 4.1 人源化抗體之產生
選擇嵌合抗體ch40-C12-C10-E9作為用於人源化之殖株。將抗體序列與人類生殖系序列進行比對,以鑑定最適合模型。基於與原始小鼠抗體序列之同源性,選擇最匹配的人類生殖系序列作為人源化之模板。通常,藉由比較IMGT(https://www.imgt.org)人類抗體重鏈及輕鏈可變株基因資料庫來進行抗體之人源化,選擇與鼠源抗體具有高同源性之重鏈及輕鏈可變株基因作為模板,且將鼠源抗體之CDR移植至相應的人類模板中。形成順序為FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4之可變區序列。根據需要,骨架序列中之關鍵胺基酸被還原且被突變為對應於鼠抗體之胺基酸,以確保原始親和力。
藉由混合及匹配人源化輕鏈可變區之3個變異體(亦即,hu40E9-L1、hu40E9-L2及hu40E9-L3)及人源化重鏈可變區之4個變異體(亦即,hu40E9-H1、hu40E9-H2、hu40E9-H3及hu40E9-H4),獲得針對ch40-C12-C10-E9之總共12種人源化抗體。同樣,12種人源化抗體被命名為hu40E9-L1H1、hu40E9-L2H1等,如下表25所示。對此等產生之人源化抗體評估免疫原性風險及熱點,且未鑑定出免疫原性風險或熱點。
表 25. 針對 ch40-C12-C10-E9 之例示性人源化抗體之重鏈及輕鏈可變區
4.2 親和力成熟
| VL 區 VH 區 | hu40E9-L1 (SEQ ID NO: 168) | hu40E9-L2 (SEQ ID NO: 169) | hu40E9-L3 (SEQ ID NO: 170) |
| hu40E9-H1 (SEQ ID NO: 163) | hu40E9-L1H1 (SEQ ID NOs: 168/163) | hu40E9-L2H1 (SEQ ID NOs: 169/163) | hu40E9-L3H1 (SEQ ID NOs: 170/163) |
| hu40E9-H2 (SEQ ID NO: 164) | hu40E9-L1H2 (SEQ ID NOs: 168/164) | hu40E9-L2H2 (SEQ ID NOs: 169/164) | hu40E9-L3H2 (SEQ ID NOs: 170/164) |
| hu40E9-H3 (SEQ ID NO: 165) | hu40E9-L1H3 (SEQ ID NOs: 168/165) | hu40E9-L2H3 (SEQ ID NOs: 169/165) | hu40E9-L3H3 (SEQ ID NOs: 170/165) |
| hu40E9-H4 (SEQ ID NO: 166) | hu40E9-L1H4 (SEQ ID NOs: 168/166) | hu40E9-L2H4 (SEQ ID NOs: 169/166) | hu40E9-L3H4 (SEQ ID NOs: 170/166) |
然後選擇實例4.1中獲得之hu40E9-L2變異體(亦即,SEQ ID NO: 169)及hu40E9-H3變異體(亦即,SEQ ID NO: 165)以進行親和力成熟。特定言之,選擇SEQ ID NO: 165之CDR2中之位置54、55及56 (相對於SEQ ID NO: 165)、SEQ ID NO: 165之CDR3中之位置99-106 (相對於SEQ ID NO: 165)以及SEQ ID NO: 169之CDR3中之位置91、92及93 (相對於SEQ ID NO: 169)以用於親和力工程改造。在考慮若干因素後,總共獲得15個突變,亦即如SEQ ID NO: 165中所述之重鏈可變區中之N55S、D99E、Y101F、D105E、G106A、Y54G、D56G、D99R、S100R、Y102S或D105R;或如SEQ ID NO: 169所示之輕鏈可變區中之N93S、S91R、N93R或N93W。
因此,對於ch40-C12-C10-E9,藉由混合且匹配人源化ch40-C12-C10-E9重鏈可變區之11個變異體(亦即,hu40E9-H3-N55S.H、hu40E9-H3-D99E.H、hu40E9-H3-Y101F.H、hu40E9-H3-D105E.H、hu40E9-H3-G106A.H、hu40E9-H3-Y54G.H、hu40E9-H3-D56G.H、hu40E9-H3-D99R.H、hu40E9-H3-S100R.H、hu40E9-H3-Y102S.H及hu40E9-H3-D105R.H)及人源化ch40-C12-C10-E9輕鏈可變區之4個變異體(亦即hu40E9-L2-N93S.L、hu40E9-L2-S91R.L、hu40E9-L2-N93R.L及hu40E9-L2-N93W.L)獲得總共15個人源化及親和力成熟的抗體殖株。該15個人源化抗體殖株被命名為hu40E9-L2H3-N55S.H、hu40E9-L2H3-N93S.L等等,如下表26及表27所示,其中字首「hu」表示「人源化的」,且例如字尾「L2H3-N55S.H」表示具有hu40E9-L2變異體及hu40E9-H3-N55S.H變異體可變區之ch40-C12-C10-E9之人源化抗體殖株之序列號。對於另一實施例,人源化抗體hu40E9-L2H3-N93S.L表示具有hu40E9-L2-N93S.L變異體及hu40E9-H3變異體可變區之ch40-C12-C10-E9之人源化抗體殖株之序列號。
表 26. 針對 ch40-C12-C10-E9 之例示性人源化抗體之重鏈及輕鏈可變區
表 27. 針對 ch40-C12-C10-E9 之例示性人源化抗體之重鏈及輕鏈可變區
4.3 對 Jurkat 細胞之基於細胞之結合親和力
| VL 區 VH 區 | hu40E9-L2 (SEQ ID NO: 169) |
| hu40E9-H3-N55S.H (SEQ ID NO: 186) | hu40E9-L2H3-N55S.H (SEQ ID NOs: 169/186) |
| hu40E9-H3-D99E.H (SEQ ID NO: 187) | hu40E9-L2H3-D99E.H (SEQ ID NOs: 169/187) |
| hu40E9-H3-Y101F.H (SEQ ID NO: 188) | hu40E9-L2H3-Y101F.H (SEQ ID NOs: 169/188) |
| hu40E9-H3-D105E.H (SEQ ID NO: 189) | hu40E9-L2H3-D105E.H (SEQ ID NOs: 169/189) |
| hu40E9-H3-G106A.H (SEQ ID NO: 190) | hu40E9-L2H3-G106A.H (SEQ ID NOs: 169/190) |
| hu40E9-H3-Y54G.H (SEQ ID NO: 191) | hu40E9-L2H3-Y54G.H (SEQ ID NOs: 169/191) |
| hu40E9-H3-D56G.H (SEQ ID NO: 192) | hu40E9-L2H3-D56G.H (SEQ ID NOs: 169/192) |
| hu40E9-H3-D99R.H (SEQ ID NO: 193) | hu40E9-L2H3-D99R.H (SEQ ID NOs: 169/193) |
| hu40E9-H3-S100R.H (SEQ ID NO: 194) | hu40E9-L2H3-S100R.H (SEQ ID NOs: 169/194) |
| hu40E9-H3-Y102S.H (SEQ ID NO: 195) | hu40E9-L2H3-Y102S.H (SEQ ID NOs: 169/195) |
| hu40E9-H3-D105R.H (SEQ ID NO: 196) | hu40E9-L2H3-D105R.H (SEQ ID NOs: 169/196) |
| VH 區 VL 區 | hu40E9-H3(SEQ ID NO: 165) |
| hu40E9-L2-N93S.L (SEQ ID NO: 197) | hu40E9-L2H3-N93S.L (SEQ ID NO: 197/165) |
| hu40E9-L2-S91R.L (SEQ ID NO: 198) | hu40E9-L2H3-S91R.L (SEQ ID NO: 198/165) |
| hu40E9-L2-N93R.L (SEQ ID NO: 199) | hu40E9-L2H3-N93R.L (SEQ ID NO: 199/165) |
| hu40E9-L2-N93W.L (SEQ ID NO: 200) | hu40E9-L2H3-N93W.L (SEQ ID NO: 200/165) |
藉由FACS分析來確定產生之人源化40-C12-C10-E9抗體及基於40E9-L2H3之親和力成熟抗體對人類患者來源之淋巴細胞癌細胞株Jurkat之結合親和力。基準抗體BMK-TCB被用作陽性對照,且hIgG1同型被用作陰性對照。用於FACS分析之方案在實施例3.3中描述,除了步驟(c)中使用之測試抗體不同外。
如下圖9A、圖9B及表23所示,產生之人源化及/或親和力成熟的40-C12-C10-E9抗體對Jurkat細胞之結合親和力高於基準抗體BMK-TCB或與基準抗體BMK-TCB類似。
表 23. 選定人源化抗體對 Jurkat 細胞之結合親和力
4.4 Jurkat-NFAT- 螢光素酶活化測定
| 排序 | 抗體 | EC 50(nM) | 最大FACS 信號 |
| 1 | hu40E9-L2H3-D99E.H | 0.31 | 957 |
| 2 | hu40E9-L2H3-S91R.L | 0.32 | 1358 |
| 3 | hu40E9-L2H3-D56G.H | 0.32 | 1452 |
| 4 | ch40-C12-C10-E9 | 0.45 | 1621 |
| 5 | hu40E9-L2H3-Y102S.H | 0.47 | 1165 |
| 6 | hu40E9-L3H4 | 0.49 | 1365 |
| 7 | hu40E9-L2H3-N93W.L | 0.51 | 1210 |
| 8 | hu40E9-L2H3-Y54G.H | 0.51 | 1186 |
| 9 | hu40E9-L2H3-N55S.H | 0.51 | 1165 |
| 10 | hu40E9-L3H2 | 0.52 | 1412 |
| 11 | hu40E9-L2H3-D105R.H | 0.56 | 1479 |
| 12 | hu40E9-L2H3-N93S.L | 0.60 | 1355 |
| 13 | hu40E9-L2H3-N93R.L | 0.63 | 1417 |
| 14 | hu40E9-L2H3-Y101F.H | 0.64 | 1187 |
| 15 | hu40E9-L2H3 | 0.65 | 1578 |
| 16 | hu40E9-L2H1 | 0.73 | 892 |
| 17 | hu40E9-L3H1 | 0.75 | 1250 |
| 18 | hu40E9-L2H2 | 0.81 | 1573 |
| 19 | hu40E9-L2H4 | 0.86 | 1571 |
| 20 | hu40E9-L2H3-D105E.H | 1.16 | 1409 |
| 21 | BMK-TCB | 1.60 | 1739 |
| 22 | hu40E9-L2H3-G106A.H | 2.39 | 771 |
此等抗體之T細胞活化能力藉由Jurkat NFAT-螢光素酶活化測定來確定。基準抗體BMK-TCB被用作陽性對照,且hIgG1同型被用作陰性對照。用於活化分析之方案描述如下。
a)將連續稀釋之測試抗體在37℃下塗覆在96孔盤上持續2小時,100 μl/孔。
b)在各孔中接種Jurkat-NFAT-螢光素酶細胞,且培育24小時,2×10
4個細胞/孔。
c)移除上清液,且用25 μL/孔之裂解試劑(Promega,RLB-E3971)裂解細胞。
d)樣本在-80℃下冷凍保存30分鐘,然後在生化培養箱中在37℃下加熱15分鐘。
e)然後將96孔盤以500 xg離心10分鐘,且將各孔之20 μL上清液轉移至新的白色不透明96孔盤中。
f)將100 μL/孔之螢光素酶測定受質(Promega,E4530)加入至96孔盤中。
g)微孔盤讀取器用於確定反映螢光素酶活性之水平之相對發光單位(RLU)。
根據同一盤上之活化之EC
50及最大信號之值以ch40-C12-C10-E9為標準進行歸一化,且基準抗體BMK-TCB之值被顯示為平均值。如下圖10A-F及表24所示,選定人源化抗體之活化能力高於基準抗體BMK-TCB或與基準抗體BMK-TCB類似。
表 24. 人源化抗體對 Jurkat-NFAT- 螢光素酶細胞之活化能力
4.5 人類 PBMC 活化測定
| 排序 | 抗體 | EC 50_ 倍數變化 | 最大FACS 信號_ 倍數變化 |
| 1 | hu40E9-L3H2 | 0.57 | 0.73 |
| 2 | hu40E9-L3H4 | 0.61 | 0.64 |
| 3 | hu40E9-L2H3-D56G.H | 0.65 | 0.82 |
| 4 | hu40E9-L2H3-N93W.L | 0.72 | 0.88 |
| 5 | hu40E9-L2H3-N93S.L | 0.74 | 0.87 |
| 6 | hu40E9-L2H3-S91R.L | 0.79 | 0.95 |
| 7 | hu40E9-L2H4 | 0.80 | 0.89 |
| 8 | hu40E9-L2H3-N93R.L | 0.81 | 1.07 |
| 9 | hu40E9-L2H3-Y102S.H | 0.87 | 0.96 |
| 10 | ch40-C12-C10-E9 | 1.00 | 1.00 |
| 11 | hu40E9-L2H3-Y54G.H | 1.06 | 0.94 |
| 12 | hu40E9-L2H3-D99E.H | 1.19 | 0.91 |
| 13 | hu40E9-L2H3-Y101F.H | 1.23 | 0.94 |
| 14 | hu40E9-L3H1 | 1.33 | 0.97 |
| 15 | hu40E9-L2H3-N55S.H | 1.35 | 1.03 |
| 16 | hu40E9-L2H3-D105R.H | 1.95 | 0.81 |
| 17 | hu40E9-L2H2 | 2.14 | 1.28 |
| 18 | hu40E9-L2H3 | 2.43 | 1.18 |
| 19 | hu40E9-L2H3-D105E.H | 3.77 | 0.74 |
| 20 | hu40E9-L2H3-G106A.H | 4.95 | 0.99 |
| 21 | hu40E9-L2H1 | 5.73 | 1.37 |
| 22 | BMK-TCB | 8.17 | 0.48 |
基於原代人類周邊血液單核細胞(PBMC)之測定用於確定人源化抗體對T細胞之活化能力。眾所周知,當T細胞被活化時,表面蛋白CD25之表現被上調。基準抗體BMK-TCB被用作陽性對照,且hIgG1同型被用作陰性對照。用於活化分析之實驗步驟在實施例3.6.2中描述,除了步驟(a)中使用之測試抗體不同外。
如下圖11所示,如由CD3
+T細胞中CD25
+細胞之亞群比率所指示,陽性對照BMK-TCB會誘導人類T細胞上CD25之上調。人源化抗體之活化效果高於基準抗體BMK-TCB或與基準抗體BMK-TCB類似。
圖1示出若干選定抗體對Jurkat-NFAT-Luc細胞之活化能力。
圖2示出若干選定嵌合抗體及基準抗體OKT3對Jurkat細胞之結合親和力之FACS分析結果。
圖3示出若干選定嵌合抗體及基準抗體BMK-B219及BMK-TCB對Jurkat細胞之結合親和力之FACS分析結果。
圖4示出若干選定嵌合抗體對293T-cynoCD3mix細胞之結合親和力。
圖5示出若干選定嵌合抗體及基準抗體OKT3對Jurkat-NFAT-Luc細胞之活化能力。
圖6示出在PBMC活化測定中由若干選定嵌合抗體及基準抗體OKT3誘導之IL-2釋放。
圖7示出在PBMC活化測定中由若干選定嵌合抗體及基準抗體OKT3誘導之IFNγ釋放。
圖8示出在PBMC活化測定中由若干選定嵌合抗體及基準抗體BMK-B219及BMK-TCB誘導之CD3+人類T細胞之CD25表現。
圖9A及圖9B示出若干產生之人源化或親和力成熟40-C12-C10-E9抗體對Jurkat細胞之結合親和力。
圖10A-F示出若干人源化或親和力成熟抗體及基準抗體BMK-TCB對Jurkat-NFAT-Luc細胞之活化能力。
圖11示出若干人源化或親和力成熟抗體及基準抗體BMK-TCB在PBMC活化測定中之活化效果。
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Claims (64)
- 一種特異性結合至CD3之抗體或其抗原結合片段,其包括: 一個或兩個或三個重鏈互補決定區(HCDR1、HCDR2及/或HCDR3),上述重鏈互補決定區包含在選自由以下組成之群的重鏈可變(VH)區序列中之任一者中:SEQ ID NO: 7、15、23、31、39、47、55、63、71、79、87、95、108、116、124、132、140、148、156、163、164、165、166、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195及196;及/或 一個或兩個或三個輕鏈互補決定區(LCDR1、LCDR2及/或LCDR3),上述輕鏈互補決定區包含在選自由以下組成之群的輕鏈可變(VL)區序列中之任一者中:SEQ ID NO: 8、16、24、32、40、48、56、64、72、80、88、96、109、117、125、133、141、149、157、168、169、170、197、198、199及200。
- 如請求項1之抗體或其抗原結合片段,其中上述抗體或抗原結合片段包括至少一個重鏈或輕鏈互補決定區(CDR),其包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 1、2、3、4、5、6、9、10、11、12、13、14、17、18、19、20、21、22、25、26、27、28、29、30、33、34、35、36、37、38、41、42、43、44、45、46、49、50、51、52、53、54、57、58、59、60、61、62、65、66、67、68、69、70、73、74、75、76、77、78、81、82、83、84、85、86、89、90、91、92、93、94、102、103、104、105、106、107、110、111、112、113、114、115、118、119、120、121、122、123、126、127、128、129、130、131、134、135、136、137、138、139、142、143、144、145、146、147、150、151、152、153、154、155、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、201、162及167。
- 如請求項1或2之抗體或其抗原結合片段,其包括VH區,上述VH區包括HCDR1、HCDR2及HCDR3中之一者或兩者或三者,上述HCDR1、HCDR2及HCDR3包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 1、2、3、9、10、11、17、18、19、25、26、27、33、34、35、41、42、43、49、50、51、57、58、59、65、66、67、73、74、75、81、82、83、89、90、91、102、103、104、110、111、112、118、119、120、126、127、128、134、135、136、142、143、144、150、151、152、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、201及162。
- 如前述請求項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其包括VL區,上述VL區包括LCDR1、LCDR2及LCDR3中之一者或兩者或三者,上述LCDR1、LCDR2及LCDR3包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 4、5、6、12、13、14、20、21、22、28、29、30、36、37、38、44、45、46、52、53、54、60、61、62、68、69、70、76、77、78、84、85、86、92、93、94、105、106、107、113、114、115、121、122、123、129、130、131、137、138、139、145、146、147、153、154、155、182、183、184、185及167。
- 如前述請求項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其包括: i. HCDR1,上述HCDR1包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 1、9、17、25、33、41、49、57、65、73、81、89、102、110、118、126、134、142及150; ii. HCDR2,上述HCDR2包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 2、10、18、26、34、42、50、58、66、74、82、90、103、111、119、127、135、143、151、171、172、173及201;及 iii. HCDR3,上述HCDR3包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 3、11、19、27、35、43、51、59、67、75、83、91、104、112、120、128、136、144、152、174、175、176、177、178、179、180、181及162。
- 如前述請求項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其包括: i. LCDR1,上述LCDR1包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 4、12、20、28、36、44、52、60、68、76、84、92、105、113、121、129、137、145及153; ii. LCDR2,上述LCDR2包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 5、13、21、29、37、45、53、61、69、77、85、93、106、114、122、130、138、146及154;及 iii. LCDR3,上述LCDR3包括選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 6、14、22、30、38、46、54、62、70、78、86、94、107、115、123、131、139、147、155、182、183、184、185及167。
- 如前述請求項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其包括: i. 包括如SEQ ID NO: 1所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 2所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 3所示之胺基酸序列之HCDR3; ii. 包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列之HCDR3; iii. 包括如SEQ ID NO: 17所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 18所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 19所示之胺基酸序列之HCDR3; iv. 包括如SEQ ID NO: 25所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 26所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 27所示之胺基酸序列之HCDR3; v. 包括如SEQ ID NO: 33所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 34所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 35所示之胺基酸序列之HCDR3; vi. 包括如SEQ ID NO: 41所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 42所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 43所示之胺基酸序列之HCDR3; vii. 包括如SEQ ID NO: 49所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 50所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 51所示之胺基酸序列之HCDR3; viii. 包括如SEQ ID NO: 57所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 58所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 59所示之胺基酸序列之HCDR3; ix. 包括如SEQ ID NO: 65所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 66所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 67所示之胺基酸序列之HCDR3; x. 包括如SEQ ID NO: 73所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 74所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 75所示之胺基酸序列之HCDR3; xi. 包括如SEQ ID NO: 81所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 82所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 83所示之胺基酸序列之HCDR3; xii. 包括如SEQ ID NO: 89所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 90所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 91所示之胺基酸序列之HCDR3; xiii. 包括如SEQ ID NO: 102所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 103所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 104所示之胺基酸序列之HCDR3; xiv. 包括如SEQ ID NO: 110所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 111所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 112所示之胺基酸序列之HCDR3; xv. 包括如SEQ ID NO: 118所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 119所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 120所示之胺基酸序列之HCDR3; xvi. 包括如SEQ ID NO: 126所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 127所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 128所示之胺基酸序列之HCDR3; xvii. 包括如SEQ ID NO: 134所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 135所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 136所示之胺基酸序列之HCDR3; xviii. 包括如SEQ ID NO: 142所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 143所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 144所示之胺基酸序列之HCDR3; xix. 包括如SEQ ID NO: 150所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 151所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 152所示之胺基酸序列之HCDR3; xx. 包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 201所示之胺基酸序列之HCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 162所示之胺基酸序列之HCDR3;或者 xxi. 包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10、171、172或173所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 11、174、175、176、177、178、179、180或181所示之胺基酸序列之HCDR3。
- 如前述請求項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其包括: i. 包括如SEQ ID NO: 4所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 5所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 6所示之胺基酸序列之LCDR3; ii. 包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3; iii. 包括如SEQ ID NO: 20所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 21所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 22所示之胺基酸序列之LCDR3; iv. 包括如SEQ ID NO: 28所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 29所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 30所示之胺基酸序列之LCDR3; v. 包括如SEQ ID NO: 36所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 37所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 38所示之胺基酸序列之LCDR3; vi. 包括如SEQ ID NO: 44所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 45所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 46所示之胺基酸序列之LCDR3; vii. 包括如SEQ ID NO: 52所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 53所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 54所示之胺基酸序列之LCDR3; viii. 包括如SEQ ID NO: 60所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 61所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 62所示之胺基酸序列之LCDR3; ix. 包括如SEQ ID NO: 68所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 69所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 70所示之胺基酸序列之LCDR3; x. 包括如SEQ ID NO: 76所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 77所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 78所示之胺基酸序列之LCDR3; xi. 包括如SEQ ID NO: 84所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 85所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 86所示之胺基酸序列之LCDR3; xii. 包括如SEQ ID NO: 92所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 93所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 94所示之胺基酸序列之LCDR3; xiii. 包括如SEQ ID NO: 105所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 106所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 107所示之胺基酸序列之LCDR3; xiv. 包括如SEQ ID NO: 113所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 114所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 115所示之胺基酸序列之LCDR3; xv. 包括如SEQ ID NO: 121所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 122所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 123所示之胺基酸序列之LCDR3; xvi. 包括如SEQ ID NO: 129所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 130所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 131所示之胺基酸序列之LCDR3; xvii. 包括如SEQ ID NO: 137所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 138所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 139所示之胺基酸序列之LCDR3; xviii. 包括如SEQ ID NO: 145所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 146所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 147所示之胺基酸序列之LCDR3; xix. 包括如SEQ ID NO: 153所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 154所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 155所示之胺基酸序列之LCDR3; xx. 包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 167所示之胺基酸序列之LCDR3;或者 xxi. 包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14、182、183、184或185所示之胺基酸序列之LCDR3。
- 如前述請求項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其包括: i. 包括如SEQ ID NO: 1所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 2所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 3所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 4所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 5所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 6所示之胺基酸序列之LCDR3; ii. 包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3; iii. 包括如SEQ ID NO: 17所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 18所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 19所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 20所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 21所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 22所示之胺基酸序列之LCDR3; iv. 包括如SEQ ID NO: 25所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 26所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 27所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 28所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 29所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 30所示之胺基酸序列之LCDR3; v. 包括如SEQ ID NO: 33所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 34所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 35所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 36所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 37所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 38所示之胺基酸序列之LCDR3; vi. 包括如SEQ ID NO: 41所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 42所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 43所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 44所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 45所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 46所示之胺基酸序列之LCDR3; vii. 包括如SEQ ID NO: 49所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 50所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 51所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 52所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 53所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 54所示之胺基酸序列之LCDR3; viii. 包括如SEQ ID NO: 57所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 58所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 59所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 60所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 61所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 62所示之胺基酸序列之LCDR3; ix. 包括如SEQ ID NO: 65所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 66所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 67所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 68所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 69所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 70所示之胺基酸序列之LCDR3; x. 包括如SEQ ID NO: 73所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 74所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 75所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 76所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 77所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 78所示之胺基酸序列之LCDR3; xi. 包括如SEQ ID NO: 81所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 82所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 83所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 84所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 85所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 86所示之胺基酸序列之LCDR3; xii. 包括如SEQ ID NO: 89所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 90所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 91所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 92所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 93所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 94所示之胺基酸序列之LCDR3; xiii. 包括如SEQ ID NO: 102所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 103所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 104所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 105所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 106所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO:107所示之胺基酸序列之LCDR3; xiv. 包括如SEQ ID NO: 110所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 111所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 112所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 113所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 114所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO:115所示之胺基酸序列之LCDR3; xv. 包括如SEQ ID NO: 118所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 119所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 120所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 121所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 122所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO:123所示之胺基酸序列之LCDR3; xvi. 包括如SEQ ID NO: 126所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 127所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 128所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 129所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 130所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO:131所示之胺基酸序列之LCDR3; xvii. 包括如SEQ ID NO: 134所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 135所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 136所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 137所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 138所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO:139所示之胺基酸序列之LCDR3; xviii. 包括如SEQ ID NO: 142所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 143所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 144所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 145所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 146所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 147所示之胺基酸序列之LCDR3; xix. 包括如SEQ ID NO: 150所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 151所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 152所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 153所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 154所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO:155所示之胺基酸序列之LCDR3; xx. 包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 171所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3; xxi. 包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 172所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3; xxii. 包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 173所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3; xxiii. 包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 174所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3; xxiv. 包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 175所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3; xxv. 包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 176所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3; xxvi. 包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 177所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3; xxvii. 包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 178所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3; xxviii. 包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 179所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3; xxix. 包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 180所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3; xxx. 包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 181所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 14所示之胺基酸序列之LCDR3; xxxi. 包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 182所示之胺基酸序列之LCDR3; xxxii. 包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 183所示之胺基酸序列之LCDR3; xxxiii. 包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 184所示之胺基酸序列之LCDR3;或者 xxxiv. 包括如SEQ ID NO: 9所示之胺基酸序列之HCDR1,包括如SEQ ID NO: 10所示之胺基酸序列之HCDR2,包括如SEQ ID NO: 11所示之胺基酸序列之HCDR3,包括如SEQ ID NO: 12所示之胺基酸序列之LCDR1,包括如SEQ ID NO: 13所示之胺基酸序列之LCDR2,以及包括如SEQ ID NO: 185所示之胺基酸序列之LCDR3。
- 如前述請求項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其包括VH區,上述VH區具有如SEQ ID NO: 7、15、23、31、39、47、55、63、71、79、87、95、108、116、124、132、140、148、156、163、164、165、166、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195或196所示之胺基酸序列,或與SEQ ID NO: 7、15、23、31、39、47、55、63、71、79、87、95、108、116、124、132、140、148、156、163、164、165、166、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195或196具有至少80%序列一致性之同源序列。
- 如前述請求項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其包括VL區,上述VL區具有如SEQ ID NO: 8、16、24、32、40、48、56、64、72、80、88、96、109、117、125、133、141、149、157、168、169、170、197、198、199或200所示之胺基酸序列,或與SEQ ID NO: 8、16、24、32、40、48、56、64、72、80、88、96、109、117、125、133、141、149、157、168、169、170、197、198、199或200具有至少80%序列一致性之同源序列。
- 如前述請求項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其包括選自由以下組成之群的VH/VL胺基酸序列對:SEQ ID NO: 7/8、15/16、23/24、31/32、39/40、47/48、55/56、63/64、71/72、79/80、87/88、95/96、108/109、116/117、124/125、132/133、140/141、148/149、156/157、163/168、163/169、163/170、164/168、164/169、164/170、165/168、165/169、165/170、166/168、166/169、166/170、186/169、187/169、188/169、189/169、190/169、191/169、192/169、193/169、194/169、195/169、196/169、165/197、165/198、165/199及165/200。
- 如前述請求項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其進一步包括一或多個胺基酸殘基取代或修飾,但仍保留對CD3之特異性結合親和力。
- 如請求項13之抗體或其抗原結合片段,其中上述取代或修飾中之至少一者位於上述VH區或VL區之一或多個CDR序列中。
- 如請求項13之抗體或其抗原結合片段,其中上述取代或修飾中之至少一者位於上述VH區或VL區之一或多個非CDR序列中。
- 如前述請求項之抗體或抗原結合片段,其進一步包括一或多個非天然胺基酸(NNAA)取代。
- 如請求項16之抗體或抗原結合片段,其中上述NNAA能夠被結合。
- 如前述請求項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其對CD3具有一或多種特性,上述特性選自由以下組成之群: i. 能夠特異性結合至人類CD3 (例如,藉由FACS測定所量測); ii. 能夠結合至人類CD3及食蟹獼猴CD3兩者(例如,藉由FACS測定所量測); iii. 具有T細胞活化能力(例如,藉由Jurkat NFAT-螢光素酶活化測定所量測);及 iv. 具有PBMC活化能力(例如,藉由ELISA測定所量測)。
- 一種抗體或其抗原結合片段,其與如前述請求項中任一項之抗體或其抗原結合片段競爭結合CD3。
- 如前述請求項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其為嵌合抗體、人源化抗體或人類抗體或其抗原結合片段。
- 如前述請求項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其為經標記之抗體、二價抗體、抗獨特型抗體或融合蛋白。
- 如前述請求項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其為雙功能抗體(diabody)、Fab、Fab'、F(ab') 2、Fd、Fv片段、二硫鍵穩定之Fv片段(dsFv)、(dsFv) 2、雙特異性dsFv(dsFv-dsFv')、二硫鍵穩定之雙功能抗體(ds diabody)、單鏈抗體分子(scFv)、scFv二聚體(二價雙功能抗體)、駱駝化單域抗體、奈米抗體、域抗體或二價域抗體。
- 如前述請求項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其進一步包括Fc區,視情況人類免疫球蛋白(Ig)之Fc區,或視情況人類IgG之Fc區。
- 如請求項23之抗體或其抗原結合片段,其中上述Fc區源自人類IgG1、IgG2、IgG3或IgG4。
- 如請求項24之抗體或其抗原結合片段,其中上述Fc區包括選自SEQ ID NO: 97-99組成之群的胺基酸序列。
- 如前述請求項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其中上述輕鏈為λ輕鏈或κ輕鏈。
- 如前述請求項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其為雙特異性抗體或多特異性抗體或其抗原結合片段。
- 如請求項27之抗體或其抗原結合片段,其能夠特異性結合至除CD3之外的一或多種額外抗原,或CD3上之第二表位。
- 如請求項28之抗體或其抗原結合片段,其中上述除CD3之外的一或多種額外抗原選自由以下組成之群:CD16a、CD33、CD38、CD45、CD123、CD146、CD228、CLL-1、FLT3、FLT3L、TAF1、TgPRF、HVCN1、IL-6R、IL-11R、IL17A、IL-23R、IL-33、ILDR2、LAP、TSLP、TREM-1、ANGPT2、APOE、IFNAR、CypA、DOG-1、NKp30、CSF-1R、CCR2、LRRC15、間皮素、Dickkopf2、DLL3、HER-2、C10orf54、TrkA、MEKK1、KRAS、ERK、XPO1、mTORC1/2、PAK4、NAMPT、ATR、EGFR、FGFR、VEGF、LILRB (例如,LILRB1、LILRB2、LILRB3、LILRB4、LILRB5)、c-MET、Her2、Her3、CTLA4、GITA、CD112R、CD2、CD7、CD16、CD19、CD20、CD24、CD27、CD30、CD34、CD37、CD39、CD70、CD73、CD83、CD28、CD80 (B7-1)、CD86 (B7-2)、CD40、CD40L (CD154)、CD47、SIRPα、CD122、CD137、CD137L、OX40 (CD134)、OX40L (CD252)、BCMA (例如,BCMA02)、PSMA、CLDN18 (例如,CLDN18.2)、NKG2C、4-1BB、LIGHT、PVRIG、SLAMF7、HVEM、BAFFR、ICAM-1、2B4、LFA-1、GITR、ICOS(CD278)、ICOSLG (CD275)、LAG3 (CD223)、A2AR、B7-H3 (CD276)、B7-H4 (VTCN1)、B7-H5、BTLA (CD272)、CD160、CTLA-4 (CD152)、GPRC5D、IDO (例如,IDO1、IDO2)、ILT3、TDO、KIR、LAIR-1、NOX2、PD-1、PD-L1、PD-L2、TIM-3、VISTA、SIGLEC-7 (CD328)、SIGLEC-9 (CD329)、SIGLEC-15、TIGIT、PVR (CD155)、TLR3、CLEC9A、DEC-205、STING及TGFβ。
- 如前述請求項中任一項之抗體或其抗原結合片段,其與一或多個結合物部分連接。
- 如請求項30之抗體或其抗原結合片段,其中上述結合物部分包括清除修飾劑、化療劑、毒素、放射性同位素、鑭系元素、可偵測標記物、DNA烷化劑、拓樸異構酶抑制劑、微管蛋白結合劑、純化部分或其他抗癌藥物。
- 如請求項30或31之抗體或其抗原結合片段,其中上述結合物部分直接地或經由連接子共價連接。
- 一種嵌合抗原受體,其包括如請求項1至29中任一項之抗體或抗原結合片段、跨膜區及胞內信號區。
- 如請求項33之嵌合抗原受體,其中上述跨膜區包括CD3、CD4、CD8或CD28之跨膜區。
- 如請求項33之嵌合抗原受體,其中上述胞內信號區選自由以下組成之群:CD3、FcγRI、CD27、CD28、CD137、CD134、MyD88、CD40、CD278、TLR或其組合之胞內信號區序列。
- 如請求項33至35中任一項之嵌合抗原受體,其中上述抗原結合片段為scFv。
- 如請求項33至36中任一項之嵌合抗原受體,其中上述嵌合抗原受體被移植至同種異體細胞、自體細胞或異種細胞。
- 如請求項33至37中任一項之嵌合抗原受體,其中上述嵌合抗原受體被移植至免疫效應細胞。
- 如請求項33至38中任一項之嵌合抗原受體,其中上述嵌合抗原受體被移植至T細胞、自然殺手細胞、巨噬細胞或腫瘤浸潤性淋巴細胞。
- 一種醫藥組合物,其包括如請求項1至32中任一項之抗體或其抗原結合片段,或如請求項33至39中任一項之嵌合抗原受體,以及一或多種醫藥學上可接受之載劑。
- 一種經分離多核苷酸,其編碼如請求項1至29中任一項之抗體或其抗原結合片段,及/或如請求項33至39中任一項之嵌合抗原受體。
- 一種載體,其包括如請求項41之經分離多核苷酸。
- 一種宿主表現系統,其包括如請求項42之載體,或具有整合至其基因體中之如請求項41之多核苷酸。
- 如請求項43之宿主表現系統,其為微生物、酵母或哺乳動物細胞,視情況,其中上述微生物選自大腸桿菌及枯草芽孢桿菌組成之群,視情況其中上述酵母為酵母屬( Saccharomyces),且視情況其中上述哺乳動物細胞選自由以下組成之群:COS、CHO-S、CHO-K1、HEK-293及3T3細胞。
- 一種病毒,其包括如請求項42之載體。
- 一種套組,其包括如請求項1至29中任一項之抗體或其抗原結合片段及/或如請求項33至39中任一項之嵌合抗原受體及/或如請求項40之醫藥組合物,以及第二治療劑。
- 一種表現如請求項1至29中任一項之抗體或其抗原結合片段或如請求項33至39中任一項之嵌合抗原受體之方法,其包括在表現如請求項1至29中任一項之抗體或抗原結合片段或如請求項33至39中任一項之嵌合抗原受體之條件下培養如請求項43之宿主表現系統。
- 一種在受試者中治療、預防或減輕疾病、病症或病狀之方法,其包括向上述受試者投與治療有效量之如請求項1至32中任一項之抗體或其抗原結合片段及/或如請求項33至39中任一項之嵌合抗原受體及/或如請求項40之醫藥組合物。
- 如請求項48之方法,其中上述疾病、病症或病狀為免疫性疾病、炎性疾病、癌症或神經系統疾病。
- 如請求項49之方法,其中上述癌症為實體瘤或血液腫瘤。
- 如請求項48至50中任一項之方法,其中上述疾病、病症或病狀選自由以下組成之群:肺癌(例如,非小細胞肺癌(NSCLC)、小細胞肺癌(SCLC)、肺腺癌或肺鱗狀細胞癌)、腹膜癌、類癌、骨癌、胰臟癌、原始神經外胚層腫瘤、皮膚癌、膽囊癌、頭頸部癌症、鱗狀細胞癌、子宮癌、卵巢癌、直腸癌、前列腺癌、膀胱癌(例如,尿路上皮癌)、肛門區癌症(例如,肛門鱗狀細胞癌)、胃部癌症或胃癌(例如,胃腸癌)、食道癌、結腸癌、乳癌、子宮癌、肝癌(例如,肝母細胞瘤、肝細胞癌/肝癌或肝癌)、膽管癌、肉瘤、結腸直腸癌、輸卵管癌、唾液腺癌、子宮頸癌、子宮內膜癌或子宮癌、骨肉瘤、陰道癌、外陰癌、食道癌、小腸癌、內分泌系統癌、甲狀腺癌、甲狀旁腺癌、腎上腺癌、鼻咽癌、軟組織肉瘤、真性紅細胞增多症、尿道癌、陰莖癌、腎或輸尿管癌(例如,腎橫紋肌樣瘤)、皮膚T細胞淋巴瘤、髓母細胞瘤、腎母細胞瘤、骨髓增生異常症候群、慢性及非慢性骨髓增生性病症、脈絡叢乳頭狀瘤、腎細胞癌、腎盂癌、中樞神經系統(CNS)腫瘤、軟組織肉瘤(例如,橫紋肌肉瘤、纖維肉瘤、卡波西氏肉瘤(Kaposi's sarcoma))、脊柱軸腫瘤、神經膠質瘤(例如,室管膜瘤、星形細胞瘤、間變性星形細胞瘤、少突膠質細胞瘤、眼癌(例如,視網膜母細胞瘤)、腦幹神經膠質瘤或混合神經膠質瘤如少突星形細胞瘤)、腦腫瘤(例如,膠質母細胞瘤/多形性膠質母細胞瘤(GBM)、非膠質母細胞瘤腦腫瘤或腦膜瘤)、黑色素瘤(例如,皮膚或眼內黑色素瘤)、血小板增多症、間皮瘤、蕈樣肉芽腫、塞紮里症候群(Sezary syndrome)、特發性骨髓纖維化、孤立性漿細胞瘤、前庭神經鞘瘤、尤文氏肉瘤(Ewing's sarcoma)、軟骨肉瘤、MYH相關息肉病、垂體腺瘤、兒科癌症如兒科肉瘤(例如,神經母細胞瘤、橫紋肌肉瘤及骨肉瘤)、血液癌症、霍奇金氏淋巴瘤(Hodgkin's lymphoma)、非霍奇金氏淋巴瘤、白血病(例如,淋巴細胞/淋巴母細胞白血病)、慢性或急性白血病、肥大細胞白血病、淋巴細胞淋巴瘤、原發性CNS淋巴瘤、慢性淋巴球白血病(CLL)、急性淋巴球白血病(ALL)、慢性骨髓白血病(CML)、急性骨髓白血病(AML)、慢性骨髓單核細胞性白血病(CMML)、慢性淋巴母細胞白血病、急性淋巴母細胞白血病、毛細胞白血病(HCL)、伯基特氏淋巴瘤(Burkitt's lymphoma,BL)、多發性骨髓瘤(例如,復發性或難治性多發性骨髓瘤)、T細胞淋巴瘤或B細胞淋巴瘤、套細胞淋巴瘤(MCL) (例如,復發性或難治性套細胞淋巴瘤)、惡性黑色素瘤、瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、由濾泡性淋巴瘤引起之DLBCL、高級別B細胞淋巴瘤、原發性縱隔大B細胞淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤(FL)及原發性縱隔B細胞淋巴瘤。
- 如請求項48至51中任一項之方法,其中上述受試者為人類。
- 如請求項48至52中任一項之方法,其中上述投與係藉由腸胃外途徑,包括皮下、腹膜內、靜脈內、肌內或皮內注射;或非腸胃外途徑,包括經皮、口服、鼻內、眼內、舌下、直腸或外用。
- 如請求項48至53中任一項之方法,其中上述方法進一步包括向有需要之上述受試者投與額外治療劑。
- 如請求項54之方法,其中上述額外治療劑選自由以下組成之群:活性劑、成像劑、細胞毒性劑、血管生成抑制劑、激酶抑制劑、共刺激分子促效劑、共抑制分子阻斷劑、黏附分子阻斷劑、抗細胞介素抗體或其功能片段、可偵測標記物或報導子、抗微生物劑、基因編輯劑、β促效劑、病毒RNA抑制劑、聚合酶抑制劑、干擾素及微小RNA。
- 如請求項54之方法,其中上述額外治療劑在如請求項1至32中任一項之抗體或其抗原結合片段及/或如請求項33至39中任一項之嵌合抗原受體及/或如請求項40之醫藥組合物之前、之後或與其同時被投與於有需要之上述受試者。
- 一種在活體內或活體外活化表現CD3之T細胞之方法,其包括使表現CD3之T細胞與如請求項1至32中任一項之抗體或其抗原結合片段及/或如請求項33至39中任一項之嵌合抗原受體及/或如請求項40之醫藥組合物接觸。
- 一種調節表現CD3之細胞中CD3活性之方法,其包括將上述表現CD3之細胞暴露於如請求項1至32中任一項之抗體或其抗原結合片段及/或如請求項33至39中任一項之嵌合抗原受體及/或如請求項40之醫藥組合物。
- 一種促進表現CD3之T細胞在活體內或活體外加工第二抗原之方法,其包括使上述表現CD3之T細胞與如請求項27至32中任一項之雙特異性抗體或多特異性抗體或其抗原結合片段接觸,其中上述雙特異性抗體或多特異性抗體或其抗原結合片段能夠結合至上述表現CD3之T細胞及第二抗原兩者,從而使兩者鄰近。
- 一種偵測樣本中CD3之存在或量之方法,其包括使上述樣本與如請求項1至32中任一項之抗體或其抗原結合片段及/或如請求項33至39中任一項之嵌合抗原受體及/或如請求項40之醫藥組合物接觸,且確定上述樣本中CD3之存在或量。
- 一種在受試者中診斷CD3相關疾病或病狀之方法,其包括:a)使獲自上述受試者之樣本與如請求項1至32中任一項之抗體或其抗原結合片段及/或如請求項33至39中任一項之嵌合抗原受體及/或如請求項40之醫藥組合物接觸;b)確定上述樣本中CD3之存在或量;以及c)將上述受試者中CD3之存在或量與上述CD3相關疾病或病狀之存在或狀態相關聯。
- 如請求項1至32中任一項之抗體或其抗原結合片段及/或如請求項33至39中任一項之嵌合抗原受體及/或如請求項40之醫藥組合物在製備用於在受試者中治療CD3相關疾病、病症或病狀之藥物中之用途。
- 如請求項1至32中任一項之抗體或其抗原結合片段及/或如請求項33至39中任一項之嵌合抗原受體及/或如請求項40之醫藥組合物在製備用於診斷CD3相關疾病、病症或病狀之診斷試劑中之用途。
- 一種套組,其包括如請求項1至32中任一項之抗體或其抗原結合片段及/或如請求項33至39中任一項之嵌合抗原受體及/或如請求項40之醫藥組合物,用於偵測CD3,視情況重組CD3、在細胞表面上表現之CD3,或表現CD3之細胞。
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