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TW200825066A - Phthalazinone derivative - Google Patents

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TW200825066A
TW200825066A TW096138353A TW96138353A TW200825066A TW 200825066 A TW200825066 A TW 200825066A TW 096138353 A TW096138353 A TW 096138353A TW 96138353 A TW96138353 A TW 96138353A TW 200825066 A TW200825066 A TW 200825066A
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Keith Allan Menear
Anthony Peter Ottridge
Derek John Londesbrough
Michael Raymond Hallett
Keith Raymond Mulholland
John David Pittam
David Dermot Patrick Laffan
Ian Woodward Ashworth
Martin Francis Jones
Janette Helen Cherryman
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Kudos Pharm Ltd
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Publication date
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First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=38952365&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=TW200825066(A) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Kudos Pharm Ltd filed Critical Kudos Pharm Ltd
Publication of TW200825066A publication Critical patent/TW200825066A/zh
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Description

200825066 九、發明說明: 【發明所屬之技術領域】 本發明係關於特定酞嗪酮衍生物之晶體形式及合成其之 改良方法、該合成中之中間體及醫藥組合物及該晶體形式 之用途。 【先前技術】 哺乳動物酵素PARP(—種113-kDa之多區域蛋白質)涉及 藉助其識別並快速結合DNA單鏈或雙鏈斷裂之能力來遞送 DNA損傷之信號(D’Amours等人,Biochem. J·,342,249-268 (1999))。 許多觀察已得出以下結論:PARP參與各種與DNA相關 之作用(包括基因擴增、細胞分裂、分化、凋亡、DNA鹼 基切除修復)且亦影響端粒長度及染色體穩定性(cTAdda di Fagagna等人,Λ^ίι/re Gm·,23(1),76-80 (1999))。 對PARP調節DNA修復及其他過程之機制的研究確定了 其在形成細胞核内聚(ADP-核糖)鏈中之重要性(Althaus, F.R·及 Richter,C.,ADP-Ribosylation of Proteins: Enzymology and Biological Significance,Springer-Verlag,Berlin (1987))。 與DNA結合並經活化之parp利用NAD於多種核把蛋白(包 括拓撲異構酶、組蛋白及PARP自身)上合成聚(ADP-核 糖)(Rhun專人,及以 Comm㈣.,245,1-10 (1998))。 聚(ADP-核糖基)化作用亦與惡性轉化相關。舉例而言, 在SV40轉化之成纖維細胞的分離細胞核中Parp活性較 125153.doc 200825066 高,而且白血病細胞及結腸癌細胞二者均顯示較同種正常 白細胞及結腸黏膜中為高之酵素活性(Miwa等人, A·,181,313-321 (1977) ; Burzio 等人, /Vm. 5W·心/7· Mec/·,149,933-938 (1975);及 Hirai 等人,Cawcer 43, 3441-3446 (1983))。 許多低分子量PARP抑制劑已用於闡釋聚(ADP-核糖基) 化作用在DNA修復中之功能性作用。在經烷基化試劑處理 之細胞中,PARP之抑制會導致Dna鏈斷裂及細胞殺傷顯 著增加(Durkacz 等人,❻% 283,593-596 (1980);
Berger,N.A.,iiaearc/z,101,4-14 (1985))。 隨後,該等抑制劑顯示可藉由抑制潛在致死損傷之修復 來增強輻射反應之作用(Ben_Hur等人,沿/2乃以⑽/ 〇/ C_ar,49 (Suppl. VI),34-42 (1984) ; Schlicker等人,/价. 乂 山anzW·,75, 91-100 (1999))。據報道,parp抑制劑 在射線增敏性乏氧腫瘤細胞中有效(美國專利第5,〇32,617 號;美國專利第5,215,7:38號及美國專利第5,〇41,653號)。 此外,PARP基因剔除(PARP -/-)動物響應烷基化試劑及 γ-轄照展示基因組不穩定性(Wang等人,/)〜.,9, 509-520 (1995) ; Menissier de Murcia等人,/Voc. W"·
Acad. Sci. USA, 945 7303-7307 (1997)) 〇 PARP之作用亦展示於一些血管疾病、敗血性休克、缺 血性損傷及神經毒性中(Cantoni等人,价 —α,1014, 1-7 (1989) ; Szabo等人,乂 c/z>?如廳,,1〇〇, 723-735 (1997))。導致DNA鏈斷裂(其隨後藉由pARp識別) 125153.doc 200825066 之氧自由基DNA損傷係該等如在PARP抑制劑研究中所示 之疾病狀態的主要影響因素(Cosi等人,及以., 39,38-46 (1994) ; Said等人,/Voc. Sc/· 儿, 93,4688-4692 (1996))。近來,已證明PARP在出血性休克 之發病機理中起作用(Liaudet等人,iVw/· dead 5W. 97(3), 10203-10208 (2000)) 〇 亦已證明哺乳動物細胞之有效逆轉錄病毒感染可藉由抑 制PARP活性來阻斷。已顯示,重組逆轉錄載體感染之此 抑制可發生於各種不同細胞類型中(Gaken等人,J. Fz>〇/ag>;, 70(6),3992-4000 (1996))。因此,人們已經開發出PARP抑制 劑以用於抗病毒治療及癌症治療(WO 91/18591)。 另外,已推測PARP抑制可延遲人類成纖維細胞中老化 特徵之開始(Rattan and Clark, Biochem. Biophys, Res. Comm., 201(2),665-672 (1994))。此可能與PARP在控制端 粒功能中所起之作用相關(d’Adda di Fagagna等人, G亂,23(1),76-80 (1999)) 〇 WO 2004/080976揭示許多酞嗪酮衍生物、其抑制PARP 之活性、及其在治療癌症中之重要用途(無論其作為放射 治療或化學治療之輔助藥劑還是作為單獨藥劑)。 WO 2005/053 662闡述PARP抑制劑(尤其酞嗪酮衍生物)作 為鹼基切除修復(BER)抑制劑之用途。其闡述該等抑制劑 在製造藥物中之用途,該等藥物用於治療同源重組(HR)依 賴性DNA DSB修復活性缺陷之癌症、尤其用於治療具有 BRCA1及/或BRCA2缺陷表型之癌症。 125153.doc 200825066 WO 2004/080976中所揭示之4_[3-(4_環丙烷羰基_六氫吡 嗪-1-幾基)_4_氟·节基]-2H-酞嗪小酮(化合物A) ··
〇 尤其令人感興趣。
在WO 2004/080976中,化合物A係作為許多文庫化合物 中之-自4-[4-氟-3-(六氫 比唤小艘基)_节基]n秦小晒 (化合物B)藉由以下合成:
NH 將環丙烷羰醯氯 c,\z 添加於(B)溶於二氣甲、J^ 虱f烷之溶液中,隨後添加Hanig鹼 (N,N-二異丙基乙基胺)。 該反應在室溫下邊攪拌邊眚 干遠實加達16小時,且所得化合物 藉由製備型HPLC純化。 六氫吡嗪衍生物(B)係藉由 ^ 田以下製備:使用6M HC1及乙 醇脫保護4-[2-氟-5-(4-氧代> •,4_二氧_酞嗪-1-基甲基)_苯甲 125153.doc -10- 200825066 醯基]-六氫吡嗪_1-甲酸第三丁基酯(化合物C):
去保護達1小時,隨後用氨鹼化至pH為9,並將其萃取入二 氣甲烷中。
經Boc-保護之六氫吡嗪衍生物(C)係自2_銳_5-(心氧代· 3,4_二氫-酉大嗪-1-基甲基)_苯曱酸(化合物d)藉由以下製 備:
添加六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯:
六氣碟酸2-(m-苯并三嗤_丨-基四甲基脲尿鑌 (HBTU)及存於二甲基乙醯胺中之N,N-二異丙基乙基胺, 隨後攪拌18小時。 化合物A之特定形式可具有有利性質,例如,就其溶解 性及/或其穩定性及/或其生物利用度及/或其雜質分佈圖及/ 或其過濾特性及/或其乾燥特性及/或其缺乏吸水性、及/或 其可更容易地處理及/或微粒化及/或形成錠劑而言。亦期 125153.doc 11 200825066 望有種適於大規模合成化合物A之改良合成方法。 【發明内容】 因此’本發明之第一態樣提供實質上呈晶體形式、且尤 其呈形式A之4-[3-(4-環丙烷羰基-六氫吡嗪羰基)_4_氟_ 苄基]-2Η-酞嗪-丨_酮(化合物A)。 上文所用之Π實質上呈晶體形式,,意指至少50重量%、較 佳至少70重量%、8〇重量%或9〇重量%之化合物a呈晶體形 式。在一些實施例中,至少95重量%、99重量。/。或甚至 99.5重量%或更高重量百分數呈晶體形式。 呈晶體形式A之化合物A具有在以下位置處包含特定峰 之X射線繞射圖案(χ=1.5418Α): 峰 2Θ0 (土 0.1。) 12.0 __2 17.8 21.1 22.3 29.2 呈晶體形式Α之化合物Α亦可具有下列額外峰之X射線繞 射圖案(λ=1·5418Α): 峰 2Θ。(士 0.1。) ____6 10.5 — 14.0 21.7 24.3 26.1 125153.doc -12- 200825066 呈晶體形式A之化合物a之特徵亦在於三個或更多選自 上述1 0個峰列表中之峰的任何組合。 呈形式A之化合物A的代表性粉末XRD圖案展示於圖3 中。 不欲受限於理論,化合物A能容易地形成其中溶劑分子 可佔據晶袼中之位置的結構。該等溶劑合物(本質上不必 按化學計量)可由-種純溶劑合物(例如,化合物A的甲醇 合物、及化合物A的四氫呋喃合物)構成或可能由一種以上 溶劑組份(例如’甲醇及二乙基⑷構成。該等溶劑分子通 常位於由化合物A分子所產生之洞穴内。纟某些情況下, 該等洞穴之體積具有足夠撓性以納人—㈣溶劑,此使得 材料之整體結構幾乎無變化,且因此在XRpD反射中僅有 微小位移。 石物(包括彼等共享相同整體結構者)係 /L· TL λι « 、 ,溶液熟化及結晶實驗產生:二氣甲烷、乙酸乙醋、甲 醇、乙醇、異丙醇、2_ 丁酮、第三丁基甲基醚、甲苯、四 氫呋喃、水、環己烷、環丙基甲基酮、U _ 敦乙酸乙醋、氣苯六氣-異-丙醇、曱基九氣丁基二; 丙醇、確基甲烧、丙腈、三氯乙稀、α•三氟甲 ^坑、二氧雜環己烧、乙腈,該等可作為純溶劑或盘 展:=。且最:二之:劑合物結構的 且通吊包含下列位置處之最強峰·· 125153.doc -13 - 200825066
峰 2Θ°(±0.1°) (λ=1.5418Α)
應瞭解,圖中所示之峰的相對強度可根據測試下樣品之 定向及所使用儀器之類型及設定而變化,因此本文所包括 之XRD痕跡之強度係闡釋性的且並非意欲用於絕對比較。
V 化5物Α之形式Α實質上不含溶劑。本文所用術語"實質 上不3办劑意指僅具有可忽略量之任何溶劑的形式,例 如,具有總共0.5重量。/◦或更少之任何溶劑的形式。任何溶 劑(包括水)之總量可係0.25重量%、〇1重量%、〇 〇5重量% 或0.025重量%或更低。 化合物A之形式A亦可使用DSC表徵。當以1(rc/分鐘之 速率自25°C加熱至325°C時,化合物A之形式八在以^丨它幻 C下開始熔化。呈形式A之化合物A的代表性DSC痕跡於圖 5中顯示。 本發明之第二態樣提供一種獲得呈晶體形式A之4-[3-(4-環丙烧幾基-六氫u比嗪-1-獄基)-4-氟-苄基]_2H-酜嗓-1-酮 (化合物A)之方法,其包括使化合物A在一種溶劑中結晶及 125153.doc 200825066 隨後用替代劑自晶體形式中替代該溶劑。該替代劑可係水 或<^·2醇與水之混合物。 在第一實施例中,該方法包括以下步驟: ⑴自-溶齊j中結晶析出心[3-(4-環丙烧幾基六氫。比嗓-1-羰基)-4-氟-苄基卜2H-酞嗪化合物A); ⑻右初始溶劑不為乙醇,則用乙醇處理該晶體化合物
(in)用水處理該晶體化合物Α以移除所捕獲之乙醇; (iv)乾燥所得產物。 用於最初結晶之溶劑可係(例如)二氯甲烷或乙腈。 獲得形式A之方法通常可涉及溶劑替換。已發現化合物 A以在晶格内形成能捕獲溶劑之通道的方式結晶, 該等溶劑難以移除。 化合物A結晶中所用溶劑為二氣甲烷,則尤其可使用 f 一實施例之方法。用乙醇作為溶劑來交換作為溶劑之二
亂甲坑的步驟可藉由在乙醇存在下於常壓下蒸館化合物A 的溶液來實施。當頭部溫度達到乙醇沸點(例如,至少 時π成此交換。具體而言,該交換可藉由蒸餾出大部分 職、然後添加大量乙醇來實施。然後繼續蒸館,同時用 等體積乙醇替換餾出物批料。 可藉由將溶液冷卻至低於饥、較佳低於阶、 至約來實施化合物a自乙酿、、交南丨々从曰 劑之結晶。然、後可藉由過 濾將化合物A之晶體自溶液移出。 可用水處理該晶體化合物切移除所捕獲乙醇,此係藉 125153.doc 15- 200825066 由將該晶體材料懸浮於水中並於回流下加熱足夠長之時間 (例如至少3小時,且較佳至少約4小時)來實施。可藉由過 遽將該晶體化合物A自存於水中之懸浮液中移出。 上述步驟所得產物之乾燥可容易地達成。舉例而言,藉 由在一烘箱中於至少6(rc、較佳約7〇。〇之溫度下加熱該產 物來達成。 在另一该實施例中,該方法包含下列步驟: (I) 獲得包含溶劑呈晶體形式之化合物A ; (II) 若在合成呈晶體形式之化合物A中所用初始溶劑不 為水與Cm醇(即甲醇、乙醇)之混合物,則用水與〔μ醇之 混合物處理呈晶體形式之化合物A ; (ii)乾燥所得產物。 可用水與C!·2醇之混合物進一步處理所得產物,並將其 乾燥以進一步分離呈晶體形式A之化合物a。 水與Cw醇之混合物較佳以體積計在2:1至丨:2之範圍 内,且更佳以體積計在之範圍内。尤其較佳之 混合物係丨份水·^份^·2醇。另一尤其較佳之混合物係2份 水:1份(:1-2醇。該Cl_2醇較佳為乙醇。 如上所述,可藉由使化合物A自溶劑中結晶來獲得呈晶 體形式之化合物A。 步驟(Π)之溶劑處理可藉由將化合物A懸浮於水與Ci2醇 之混合物中並邊攪拌邊加熱回流來實施。此後,可將其冷 卻至55。。與65。。之間並(例如)藉助矽藻土墊過濾。用水與 c丨-2醇之混合物洗務渡塾,然後於常壓(通常i atm)、或高 125153.doc -16 - 200825066 於常壓下蒸餾。停止蒸餾獲得懸浮液,將該懸浮液置於室 溫下,隨後過濾。用水洗滌所得濾餅。 上述步驟所得產物之乾燥可容易地達成。舉例而言,藉 由在烘箱中於至少50。(:、較佳約60°C之溫度下加熱該產物 來達成。 可以類似於上述之方式進行進一步處理。 在第三實施例中,該方法包括:
(1)將化合物A懸浮於作為溶劑之水與Cl_2醇之混合物 中; (H)將該懸浮液加熱回流,· (m)冷卻該溶液並用呈形式A之化合物a種晶種; (iv)乾燥所得產物。 可用水與Cw醇之混合物進一步處理所得產物,並將其 乾燥以進一步分離呈晶體形式A之化合物A。 水與C〗·2醇之混合物較佳以體積計在2:丨至丨:5之範圍 内’且更佳以體積計在1:2至1:4之範圍内。尤其較佳之混 «為1份水:3份C!_2醇。該匚丨.2醇較佳為乙醇。 步驟(出)可包括將溶液冷卻至65M75t之間(例如7〇 :C)並(例如)藉助石夕藻土墊過濾。用水…醇之混合物洗 滌濾墊’然後將其蒸餾(例如’在常壓、或更高壓力下)。 :所得渡液冷卻至贼與贼之間(例如4rc)後,可添加 在2與3小時之_如25小時)將所得懸浮液冷卻至 如,C)並於該溫度下維持足夠長時間以產生結 曰時間可係12小時至24小時之間,且可約16小時。此 125153.doc 200825066 階段結束後,可進-步添加水。該量可約等於所存在溶劑 (水及Cu醇)之總體積且應(例如)在4至6(例如5)小時内緩 慢添加。添加水後,將懸浮液維持在周溫下(例如)達2小 時。 • 然後可過濾該懸浮液,用Cw醇及水之混合物(比率介於 , 1:3與1:2之間,例如1:2·3)洗滌所得濾餅。 上述步驟所得產物之乾燥可容易地達成。舉例而言,藉 ( 由在烘箱中於真空下在40。〇與6〇。(:間之溫度下加熱二產^ 來達成。 本發明之第二態樣提供一種自化合物B合成化合物A之 方法,其包括如下步驟: (Ο以控制方式將溶於適當有機溶劑(例如dCM(二氣甲 烷))中之二乙基胺及環丙烷羰醯氯之預混合溶液添 加至溶於相同有機溶劑之化合物B中,同時將溶液 溫度控制在低於20。(:。 ( 在一些實施例中,該方法進一步包括下列步驟: (Π)攪動(例如攪拌)來自⑴之所得溶液直至反應完成, 同時將溶液溫度維持在低於2(rc。 步驟⑴中之添加可以逐滴方式實施。 該方法較WO 2004/080976中所述之方法控制更嚴格,此 使得醯基氯之加成更具位置選擇性。先前技術控制較少之 方法可導致醯基氣加成至酞嗪酮態氮及/或氧、以及期望 之六氫吡啶態氮上。 較佳地,上述方法在氮蒙氣下實施。 125153.doc 200825066 更佳地,階段(ii)中溶液之溫度保持在10 °c與1 5 °C之 間。 上述反應之產物較佳藉由至少一步水洗滌步驟處理。更 佳地,該處理包括最初及最終之水洗滌步驟、及用稀酸 (例如5%檸檬酸溶液)、隨後用稀鹼(例如5%碳酸鈉溶液)之 中間洗滌步驟。 本發明之第四態樣提供一種自化合物D合成化合物A之 方法,其包括使化合物D與1-(環丙基羰基)六氫吡嗪、或 其無機酸鹽在醯胺偶合劑及驗(例如,胺(例如三級胺,諸 如二異丙基乙基胺))之存在下反應。 該無機酸鹽可係(例如)鹽酸鹽。 1-(環丙基羰基)六氫吡嗪 '或其無機酸鹽至化合物D之 添加可在任何適宜溶劑(例如,乙腈)中實施。該醯胺偶合 劑較佳為六氟磷酸2_(1H_苯并三唑]•基卜^^四甲基脲 鑌(HBTU)。其較佳在一段時間内(例如3〇分鐘)將丨_(環丙 基碳基)六氫吡嗪、或其無機酸鹽之溶液添加至二異丙基 乙基胺及化合物D中。T將所得溶液之溫度維持在饥或 更低(或20°C或更低’例如18。〇。在其添加完後,可將所 得溶液靜置-段時間。較佳之溫度狀態係將溶液在室溫下 維持2小時。 可藉由將溶液冷卻至低於1〇。(〕(或低於,例如3。〔〕)達 :段時間(例如i小時)、隨後過遽來將所得化合物A自溶液 中移出。可用(例如)冷乙腈洗滌所得化合物A。 W〇 2〇〇4/〇80976中揭示了下述至化合物D之路線: 125153.doc -19- 200825066
c
於〇c下將亞磷酸二甲酯逐滴添加至甲醇鈉於甲醇中之 溶液中。然後將2·羧基苯曱醛(H)逐份添加至作為溶於甲 醉中之漿液的反應混合物中’同時溫度保持低於代。在丄 小時内將所得淺黃色溶液升溫至抓。將甲糾酸逐滴添 加至該反應中並於真空下蒸發所得白色懸浮液。用水使白 色殘餘物驟冷並將其萃取至氣仿中。將合併的有機萃取物 用水洗務、經MgS〇4乾燥、並於真空下蒸發,獲得白色固 體狀(3-氧代-二氫-異苯并咬喃小基)膦冑二甲基醋 (G)(產率:95%)。然後其可不經進一步純化 段。 、丨I白 ,在25分鐘内向存於四氫呋喃中之(3_氧代-丨,3•二氫-異苯 并呋喃-1-基)膦酸二甲基酯(G)及存於四氫呋喃中之氟T 甲醯基f腈(F)之混合物中逐滴添加三乙基胺,同時膝: 。:保持低於抑…小時内將反應混合物緩慢升溫至二 並於真空下濃縮。將白色殘餘物在水中成漿液達%分 、’里^過據、用水、己烧及鱗洗務、並乾燥,獲得2·氣二 (3_乳代-3H-異苯并咬喃小亞基甲基)节赌⑻,其為^及^異 125153.doc -20 - 200825066 構體之5 0 ·· 5 0混合物(產率:9 6 % )。 向2_氟_5-(3-氧代-3H-異苯并呋喃小亞基甲基)节腈⑻存 於水中之懸淨液中添加氫氧化鈉水溶液並於氮氣下將反應 混合物於90°C下加熱達30分鐘。將反應混合物部分冷卻至 7(TC,添加水合肼並於贼下授拌18小時。將反應冷卻至 室溫並用2M HC1酸化至pH4。將混合物攪拌1〇分鐘並過
濾、。將所得固體用水、己烧、醚、乙酸乙醋洗務並乾燥, 獲得淺粉色粉末狀化合物D(產率:77%)。 亦期望有一種合成化合物D之改良方法。 因此,本發明之第五態樣提供一種合成化合物D之方 法,其包括如下步驟: ⑷自2-缓基笨甲路⑻合成(3m,3_二氯_2_苯并咬 喃-1-基)膦酸二乙酯(G,); (b)自(3氧代-1,3·一氳-2-苯并吱喃小基)膦酸二乙酯合 成2备5-[(Ε/ΖΗ3_氧代_2·苯并吱喃](叫亞基)甲基代 腈(Ε) 〇 較佳地,化合物G,在合成中未分離。該方法避免使用在 醇溶液中不穩定之亞磷酸二甲酿之鈉鹽(Peich〇wicz等人, /. Chem. Soc, 4348-4350 (1961^ ^ y+ n 1 b1))。較佳地,步驟(a)係在亞 填酸二乙酯之鈉鹽於其中穩定 τ k疋之2-甲基四氫呋喃中實施。 該鹽可藉由將亞破酸二乙酯添, 曰♦加至第二戊醇鈉存於2-甲基 四氫呋喃中之冷溶液中原位报士 ^ ^ 开少成。與亞磷酸二乙酯之鈉鹽 反應後可與甲烷磺酸反應。 步驟(b)可在2-曱基四氫呋喃中 穴南中冋時添加三乙基胺來實 125153.doc 200825066 施。 合成化合物D之方法可進一步包括如下步驟: (C)自化合物E藉由與水合肼反應合成2-氟-5-[(私氧代 3,4_二氫酞嗪基)甲基]苄腈(ED):
及 (d)自化合物ED藉由與氫氧化鈉反應合成化合物〇。 可藉由使用1.1與丨·3當量之間存於四氫呋喃之水合肼、 隨後用乙酸中和過量水合肼來達成步驟(c)。 本發明之第六態樣提供化合物: / \
及其在化合物D合成中之用途。 本發明之進一步態樣提供一種丨_(環丙基羰基)六氫。比嗪 之無機酸鹽、及藉由六氫吡嗪與乙酸反應、隨後添加環丙 烷羰醯氯來合成其之方法。 & 本發明之第七態樣提供一種醫藥組合物,其包括第一能 樣之化合物及一醫藥上可接受之載劑或稀釋劑。 125153.doc >22- 200825066 本發明之第八態樣提供第一態樣化合物用於治療人體或 動物體之方法。 本發明之第九態樣提供本發明第—㈣巾所定義之化合 物在製備用於抑制PARP活性之藥物中的用途。 本發明之進一步態樣提供本發明第一態樣中所定義之化 =物在製備藥物中的該藥物用於治療下列疾病··血 管疾病;敗血性休克;缺血性損傷;神經毒性;出血性休 克;病毒感染;或藉由抑制PARP活性改善之疾病。 本發明之另一其他態樣提供本發明第一態樣中所定義之 化合物在製備藥物中之用途,該藥物在癌症治療中用作辅 助某抝或用於加強利用電離輻射或化學治療劑之腫瘤細胞 治療。 本發明之其他態樣提供治療藉由抑制pARp來改善之疾 病的方法,其包括投與需要治療之受試者治療有效量之第 一悲樣所定義、較佳呈醫藥組合物形式的化合物;及治療 癌症之方法,其包括投與需要治療之受試者治療有效量之 第一態樣所定義、較佳呈醫藥組合物形式的化合物,同時 或隨後用電離輻射或化學治療劑治療。 在本發明之其他態樣中,該等化合物可用於製備治療同 源重組(HR)依賴性DNA DSB修復活性缺陷之癌症的藥物、 或用於治療同源重組(HR)依賴性DNA DSB修復活性缺陷之 癌症患者,其包括投與該患者治療有效量之該化合物。 该HR依賴性DNA DSB修復通路經由同源機制修復dna 中之雙鏈斷裂(DSB)以重新形成連續DNA螺旋(κ κ· 125153.doc -23 - 200825066
Khanna 及 S.P. Jackson,Nat. Genet. 27(3): 247-254 (2001))。HR依賴性DNA DSB修復通路之組份包括(但不限 於),ATM (NM—000051)、RAD51 (NM—002875)、RAD51L1 (NM—002877)、RAD51C (NM一002876)、RAD51L3 (NM—002878)、 DMC1 (NM—007068) 、 XRCC2 (NM_005431) 、 XRCC3 (NM—005432)、RAD52 (NM—002879)、RAD54L (NM—003579)、 RAD54B (NM 一 012415) 、BRCA1 (NM 一007295) 、BRCA2 (NM—000059)、RAD50 (NM—005732)、MRE11A (NM—005590)及 NBS1 (NM—002485)。其他參與該HR依賴性DNA DSB修復通 路之蛋白質包括諸如EMSY等調節因子(Hughes-Davies等 人,Ce//,115,第523-535頁)。HR組份亦闡述於Wood等人 之 291,1284-1289 (2001)中。 HR依賴性DNA DSB修復缺陷之癌症可包含或由一或多 個藉助該途徑修復DNA DSB之能力相對於正常細胞降低或 消失之癌細胞構成,即,HR依賴性DNA DSB修復通路之 活性在該一或多個癌細胞中降低或消失。 在患有HR依賴性DNA DSB修復缺陷之癌症個體的該一 或多個癌細胞中一或多個HR依賴性DNA DSB修復通路的 組份之活性可能消失。業内已充分識別HR依賴性DNA DSB修復通路之組份(參見例如Wood等人,291, 1284-1289 (200 1))且其包括上文所列之組份。 在一些較佳實施例中,該等癌細胞可具有BRCA1及/或 BRCA2缺陷表型,gp,在癌細胞中BRCA1及/或BRCA2活 性降低或消失。具有此表型之癌細胞可能存在BRCA1及/ 125153.doc -24· 200825066 或BRCA2缺陷,即,在癌細胞中BRCA1及/或BRCA2之表 現及/或活性可能降低或消失,例如藉助編碼核酸之突變 或多態現象、或藉助編碼調節因子之基因(例如編碼 BRCA2調節因子之EMSY基因)的擴增、突變或多態現象 (Hughes-Davies等人,CW/,115, 523-535)。 BRCA1及BRCA2為習知之腫瘤抑制基因,其野生型等位 基因通常在雜合體攜帶者之腫瘤中丟失(Jasin M., 21(58),8981_93 (2002) ; Tutt等人,Mo/ Md·,8(12),571-6,(2002))。業内已充分識別 BRCA1 及 /或 BRCA2突變與乳癌相關(Radice,P.J·,五x/7 C7k 穴以., 21(3 Suppl),9-12 (2002))。亦習知,編碼 BRCA2結合因子 之EMSY基因的擴增與乳癌及卵巢癌相關。 BRCA1及/或BRCA2突變體攜帶者亦具有升高之印巢 癌、前列腺癌及胰腺癌風險。 在一些較佳實施例中,在BRCA1及/或BRCA2或其調節 基因中該個體為一或多種變異(例如突變及多態現象)之雜 合體。BRCA1及BRCA2變異檢測已為業内所熟知且描述 於,例如歐洲專利第699 754號、歐洲專利第705 903號、 Neuhausen,S.L·及 Ostrander,E.A·,7^,,1,75-83 (1992) ; Chappnis,Ρ·0·及 Foulkes,W.D·,Career 107,29_59 (2002) ; Janatova M.等人,50(4), 246-50 (2003) ; Jancarkova, N.5 Ceska GynekoL, 68(1), 11-6 (2003)中。BRCA2結合因子EMSY擴增之確定描述於 Hughes-Davies 等人之 Ce//,115,523-535 中。 125153.doc -25- 200825066 與癌症相關之突變及多態現象可在核酸階段藉由檢測變 異核酸序列之存在或在蛋白階段藉由檢測變異(即,突變 或等位基因變異)多肽之存在來檢測。 【實施方式】 本發明提供呈形式A之化合物A作為活性化合物、尤其 抑制PARP活性之活性物質。
本文所用術語”活性物質,,係指能抑制pARp活性之化合 物。一種可方便地用以評價該化合物所提供之pARp抑制 之分析闌述於以下實例中。 本發明進一步提供一種在細胞中抑制pARp活性之方 法,該方法包括使該細胞接觸有效量之活性化合物,該活 性化合物較佳呈醫藥上可接受之組合物形式。此方法可在 活體外或活體内實施。 舉例而言,細胞樣品可於活體外生長並使該活性化合物 與該等細胞接觸,並觀察該化合物對該等細胞之作用。作 =作曰用之實例,可檢測到在一定時間内受影響之膽a修 復之量。若發現該活性化合物對該等細胞產生影響,則該 化口物可在治療攜帶相同細胞類型之細胞的患者之方法中 用作功效的預後或診斷標記物。 2文在治療-病狀之上下文中所用術語,,治療,,通常係指 無論人類還是動物(例如,在 在被w應用中)其中達成某些期 望〉口療效果(例如,永卩去丨 抑制该病狀之發展,且包括使發展速 又-使發展速度停止、改善該病狀及治癒該病狀)之 125153.doc • 26 - 200825066 治療及療法。亦包括作氣 栝作為預防措轭之治療(即,預防)。 本文所用術語,,輔助”係指該活性化合物連㈣知^ 法一起使用。該等方法包括用於治療不同癌症類型之藥物 的細胞毒性方式及/或電離輕射。具體而言,已知該等活 性化合物可加強多種癌症化學治療作用,料化學治療包 括毒劑之拓撲異構酶類型⑽如,㈣㈣㈣心㈣、伊 立替康(mnotecan)、魯比替康(rubitecan))、大多數習用烷 基化刮(例如,DTIC、替莫嗤胺(tem〇z〇lamide))及用於治 療癌症之基於鉑之藥物(例如卡鉑、順鉑)。 該活性化合物亦可用作抑制pARp之細胞培養添加劑以 (例如)使、、、田胞對習知化學治療劑或活體外之電離輻射處理 敏感。 口亥活f生化口物亦可作為活體外分析之一部分以(例如)確 疋一候選俏主是否可能受益於用所述化合物之治療。 投與 ^ 該活性化合物或包含該活性化合物之醫藥組合物可藉由 任一方便投與途徑投與受試者,無論以全身方式/外周方 式還是在期望作用點投與皆可,該作用點包括(但不限於) 口(例如藉由攝取);局部(包括例如經皮、鼻内、經眼、經 口腔及經舌下);肺部(例如藉由使用例如氣溶膠(例如)通 過嘴或鼻吸入或吹入療法);直腸;陰道;非經腸,例如 藉由注射’包括皮下、皮内、肌内、靜脈内、動脈内、心 臟内、鞘内、脊柱内、莢膜内、囊下、眼窩内、腹膜腔 内、氣管内、表皮下、關節内、蛛網膜下及胸骨内注射; 125153.doc -27- 200825066 藉由(例如)經皮下或肌内植入儲積物。 二=係真核生物、動物:脊椎動物、喷乳動物、 _類動物(例如’天竺鼠、倉鼠、大 物(例如,小鼠)、大科叙舲α丨l w 鼠科動 ……/ 狗)、描科動物(例如, ':)、馬科動物(例如,馬)、靈長類、猿類(例如,猴子或 % )、猴科動物(例如織狼 " 猩、黑獲獲、獲獲、長臂猿)或人類。 大獲 調配物 人;=單獨投與該活性化合物,但其較佳作為-醫藥組 &物(例如,義物)存在,該醫藥組合物包含上文所定義 之活性化合物及—或多種醫藥上可接受之載劑、輔助劑、 賦形劑、稀釋劑、填充劑、緩衝劑、穩定劑、防腐劑、潤 滑劑或其他熟習該項技術者習 或預防劑。 支…知的材料及視情況其他治療 因此二本發明進—步提供上文所定義之醫藥組合物及製 備-醫樂組合物之方法’該方法包括將上文所定義之活性 化口物與一或多種醫藥上可接受之載劑、賦形劑、緩衝 劑、辅助劑、敎劑或其他本文所述之材料混合在一起, 以使活性化合物仍呈晶體形式A。 、,本:所用術語”醫藥上可接受的,,係指彼等在合理的藥學 判斷範圍内適於與_叉試者(例如,人類)之組織接觸使用 …、k门# |± % ;敫十生、過敏性反應或其他問題或併發症 並與合理的效益/風險比率相應之化合物、材料、組合物 及/或^型。各載劑、賦形劑等就與該調配物之其他成份 125153.doc -28- 200825066 相容之意義上而言亦必須係”可接受的”。 適宜載劑、稀釋劑、賦形劑等可在標準醫藥教科書中找 到參見例如 Handbook of Pharmaceutical Additives,,,第 一版(eds. Μ· Ash 及 I· Ash),2001 (Synapse Information
Resources公司,Endicott,New York,USA)、,,Remington,s Pharmaceutical Sciences”,第 20 版,pub. Lippincott, Williams & Wilkins,2000 ;及’’Handbook of Pharmaceutical
Excipients",第二版,1994。 该等调配物可採用方便的單位劑型且可藉由製藥技術中 習知之任何方法製備。該等方法包括使該活性化合物與包 含一或多種辅助成份之載劑結合之步驟。一般而言,該等 調配物可藉由使該活性化合物與液體載劑或微細固體載劑 或兩者均勻且充分結合且然後(若必要)使該產物成形來製 備。 調配物可呈懸浮液、錠劑、顆粒、粉末、膠囊、藥丸、 丸劑或膏糊形式。 適於口服投與(例如,藉由攝取)之調配物可作為下列形 式存在:離散單元,例如膠囊、藥丸或錠劑,各皆包含預 定量的活性化合物;粉末或顆粒;存於水性液體或非水性 液體中之懸浮液;或膏糊。 可視情況使用一或多種輔助成份藉由習知方法(例如, 壓縮或模製)製備錠劑。可藉由在一適宜機器中壓縮該呈 自由流動形式(例如粉末或顆粒)之活性化合物來製備壓縮 鍵劑’該活性化合物視情況與一或多種下列成份混合:黏 125153.doc -29- 200825066 合劑(例如,聚乙烯吡咯啶_、明 $ 醇、磺蓍膠、羥丙基甲基纖’ σ <白膠、山梨 如,乳糖、微晶纖維素、鱗酸氣填充劑或稀㈣ 鈉、經交聯聚乙烯吡咯啶酮、έ“:例如,翹乙酸澱粉 表面活性劑或分散劑〜聯竣甲基纖維素納); 防腐_丨1 劑(例如,月桂基硫酸鈉);及 對-經基苯甲酸甲酿、對,基苯甲酸丙醋、 、門、…、★肖由在一適宜機器中模製經惰性液體稀釋劑 狀化合物之混合物來製傷模製錠劑。該等錠劑 可視十月況經塗敷或刻痕且可經調配以便使用(例如)各種比 例之㈣基甲基纖維素提供其中之活性化合物的緩慢或控 制釋放以提供期望的釋放性質。錠劑可視情況具有—腸溶 衣以在部分内臟而非胃中提供釋放。 膠囊可包括呈懸浮液之活性化合物。 適於局部投與(例如,經皮、鼻内、經眼、頰内及舌下) 之調配物可調配成膏糊。 適用於局部投與眼睛之調配物亦包括滴眼劑,其中該活 性化合物懸浮於適宜載劑中,尤指用於該活性化合物之水 性溶劑。 適用於經鼻投與之調配物(其中該載劑為一固體)包括具 有(例如)約20至約500微米粒徑之粗粉末,其以其中藉由 (即)藉助鼻腔自一保持靠近鼻子處之粉末容器快速吸入來 攝取之方式投與。 適於藉由吸入投與之調配物包括彼等呈加壓包裝之氣溶 125153.doc -30- 200825066 膠喷霧者,其同時使用諸如二氯二氟甲烧、三氯氟甲烧、 氣乙烧、二氧化碳或其他適宜氣體等適宜推進 劑量 應瞭解,該活性化合物及包含該活性化合物之 適宜劑量可因患者而異。最_量之確定衫涉及治療效 盈私度與本發明治療之任何風險或有害副作用之平衡。, 經選擇之劑量程度應端視各種因素而定,該等因素包: (但不限於)特定化合物之活性、投與途徑、投與時間、該 化合物之排泄速率、治療持續時間、該組合中所用其他藥: 物、化合物及/或材料、及患者的年齡、性別、重量、狀 況、全身健康狀況及先前醫療史。化合物之量及投與途徑 最終應由s師判冑’但通常該劑量在作用點應達到達成期 望效果而不會造成實質性傷害或有害副作用之局部濃度: 活體内投與可在整個治療過程中以單劑量連續或間歇 (例如,依適宜間隔時間投與分割之劑量)實施。確定最有 效投與方法及劑量之方法已為熟習此項技術者所習知且應 隨用於治療之調配物、治療之目的、所治療之靶細胞及所 治療之受試者而變化。可根據主治醫師所選擇之劑量程度 及模式實施單次或多次投與。 般而吕’該活性化合物之適宜劑量介於約i 0毫克至約 6〇0毫克/平方米身體面積受試者體重/天之間。 實例 實例1 :化合物A之合成 125153.doc -31 - 200825066
起始材料(D)藉由w〇 2004/080976所揭示之方法合成。 方法
製備型HPLC 用一 Waters質量指導之純化系統純化樣品,該系統使用 Waters 600 LC 幫浦、Waters Xterra C18 管柱(5微米,19 毫 米x50^米)及Micromass ZQ質譜儀,以陽離子電喷射離子 化模式操作。流動相Α(0·1%存於水中之甲酸)及Β(0·1%存 於乙腈中之甲酸)以梯度使用;在7分鐘内自5% Β至 100%,保持3分鐘,流速為20毫升/分鐘。
分析型HPLC-MS 分析型HPLC係使用Spectra System Ρ4000幫浦及Jones Genesis C18管柱(4微米,50毫米Χ4·6毫米)來實施。流動相 Α(〇·1 %存於水中之曱酸)及Β (乙腈)使用5% Β保持1分鐘、 5分鐘後升至98% Β之梯度,以2毫升/分鐘之流速保持3分 鐘。藉由TSP UV 6000LP檢測器於254奈米UV及量程210-600奈米PDA檢測。質譜儀係以陽離子電噴射模式操作之 125153.doc -32- 200825066
Finnigan LCQ。
NMR iH NMR光譜係在300 MHz下使用Bruke:r Dpx 300光譜儀 進行記錄。化學位移係根據相對於四甲基矽烷内標之§標 度以百萬分率(ppm)報告。除非另有說明否則所有樣品皆 溶於 DMSO-d6。 (a) 4-[2-氟-5-(4-氧代_3,4_二氫-酞嗪_:ι_基甲基)_苯甲醯 基]-六氫吼嗓-1 -甲酸第三-丁基酯(C) 於室溫下在氮氣下向起始材料D(85〇克)存於二甲基乙醯 胺(DMA)(3 561毫升)中之攪拌溶液中一次性添加HBTU(六 氟磷酸2_(1H-苯并三唑_1_基Η」),%四甲基脲鑌)(14〇2 克)。然後添加Hiinig’s鹼(iPr2Net,1〇96毫升),同時將溫 度保持在15 C至25 C之間,隨後添加卜b〇c-六氫α比嗓(63 7 克)存於DMA(1428毫升)中之溶液,同時將溫度保持在15 °C至25°(:之間。 於室溫下將溶液攪拌2小時並取樣用於確定是否完成 (HPLC)。完成後,將溶液添加至劇烈擾拌的水(ι7〇85毫 升)中,同時將溫度保持在15°C至25°C之間並濾、出固體、 用水(2x7131毫升)、己烷(2x7131毫升)及甲基第三-丁基醚 (ΜΤΒΕ)(2χ3561毫升)洗滌。然後將固體乾燥過夜,隨後取 樣用於水含量及化學純度分析。 然後重複該反應,參見下表: 125153.doc -33- 200825066 批次 產量(克) 純度(HPLC面積%) 水含量(K.F·) 續正產量 1 1571.3 86.80 24.3 1032.5 克(78%) 2 2781.6 85.00 40.3 1411.5 克(106%) a.大於100%產率係由於非代表性取樣 (b) 4-[4-氟- 3-(六氫吼嗪-1-羰基)-节基]-2H-酜嗪-1-酮(B) 在室溫於氮氣下向工業甲基化乙醇(IMS)(2200毫升)及濃 HC1(4400宅升)之擾摔溶液中分次添加化合物c(2780.2 克),藉由添加速率來控制起泡。然後在1 5 °C至25 °C下將 溶液攪拌30分鐘並取樣用於確定是否完成(Hplc)。 完成後蒸發該溶液以移除任何IMS並用CH2C12(2x3500毫 升)萃取含水物質,然後使用濃氨水將pH值調至>8。然後 用水(10000毫升)稀釋所得漿液並用CH2C12(4x3500毫升)萃 取、用水(2x2000毫升)洗滌、經MgSO4(250克)乾燥並蒸 發。然後將粗產物在CH2C12(3500毫升)中變成漿液並添加 至MTBE(5000毫升)中。過濾所得懸浮液並於5〇〇c乾燥過 夜,獲得611.0克(58.5%產率)純度為94.12%之材料。 (c) 4-[3-(4-環丙烷羰基-六氫σ比嗪-丨-羰基)_4_氟-苄基]_2H_ 酞嗓-1-酮(A) 在氮氣下向化合物B( 1290克)存於CH2Ch( 15480毫升)中 之擾拌懸浮液中逐滴添加三乙基胺(47〇毫升)及環丙烷羰醯 氯(306毫升)存於CH2C12(129〇毫升)中之預混合溶液,同時 將溫度保持低於2〇°C。然後在i〇_15°c下將該溶液攪拌15 分鐘並取樣用於確定是否完成。發現反應混合物僅含 125153.doc -34- 200825066 1.18%起始材料b並因此認為反應已完成且隨後實施分批處 理。 用水(7595毫升)、5%檸檬酸溶液(7595毫升)、5%碳酸鈉 溶液(7595毫升)及水(7595毫升)洗滌該反應混合物。然後 經硫酸鎂(5 00克)乾燥該有機層。 然後分離包含CHAl2之產物層,藉助Ceiite過濾並裝填 於25公升容器中。然後於常壓下蒸餾出CH2C12(8445毫升) f 並添加乙醇(10000毫升)。然後繼續蒸餾,同時所有4000毫 升被移除之错出物用乙醇(4000毫升)代替,直至頭部溫度 達73.7°c為止。然後反應體積減少(至773〇毫升),此時頭 部溫度達78.9°C並使該溶液冷卻至8°C過夜。然後過濾出 固體’用乙醇(1290毫升)洗滌並於7〇。〇乾燥過夜。 產率=1377.3 克(90%)。HPLC 純度(99.34%[面積%])。藉 由 GC 包含 4.93% 乙醇及 0.45% CH2C12。 (d)化合物A之水處理 {: 將如藉由實例1之方法所製造化合物A( 13 77.0克)存於水 中的懸浮液加熱回流達4小時,冷卻至室溫並過濾。用水 (2754毫升)洗滌固體並於7〇°C乾燥過夜。 產率=1274·8 克(92.6%)。HPLC 純度(99.49%[面積%])。 藉由GC包含0.01%乙醇及0.01% CH2C12 。 水處理後化合物A之1H NMR光譜(DMSO-d6)顯示於圖1 中。 水處理後化合物A之粉末XRD圖案顯示於圖2中,該圖顯 示該化合物呈形式A。 125153.doc -35- 200825066 實例2 :化合物A使用1-(環丙基羰基)六氩ϋ比嗪之代替合成
〇 方法(亦用於實例3及4)
NMR H-NMR光譜係在400 MHz下使用Bruker DPX 400光譜儀 進行記錄。化學位移係根據相對於四甲基矽烷内標之§標 度以百萬分率(ppm)報告。除非另有說明,否則所有樣品 皆溶解於DMSO_d6中。 質譜 質譜係於Agilent XCT離子陷阱質譜儀上使用用於結構 確定之串列質譜法(MS/MS)記錄。該儀器以陽離子電噴射 模式操作。 (a) 4-[3-(4-環丙烷羰基-六氫啦嗪_丨_羰基卜4_氟_苄基]_2h_ 酜嗪-1 -酮(化合物A) 在氮氣下授拌的同時將2 -氟-5-[(4-氧代-3,4-二氫駄嗅-基)甲基]苯甲酸(D)(15.23克,51.07毫莫耳)懸浮於乙腈(96 笔升)中。添加二異丙基乙基胺(19·6毫升,U23毫莫耳), 隨後添加丨-環丙基羰基六氫吡嗪(1)(9.45克,61.28毫莫耳) 及乙腈(1毫升)。將反應混合物冷卻至18c。然後在3〇分鐘 内添加六說磷酸〇-苯并三唑-^基-四曱基脲鏽(2518克, 66.39毫莫耳)並於室溫下將該反應混合物攪拌2小時。將該 125153.doc -36 - 200825066 反應混合物冷卻至3 °c並維持在此溫度達1小時,然後過 渡。用冷(3 C )乙腈(20毫升)洗務渡餅,然後於真空下高達 40 C之溫度下將其乾燥’獲得淺黃色固體狀標題化合物 (20.21 克)。 質譜:MH+ 435 c 1H NMR (400 MHz,DMSO-d6) δ : 0.70 (m,4H)、1.88 (br s,1H)、3.20 (br s,2H)、3.56 (m,6H)、4.31 (s, 2H)、 7.17 (t,1H)、7.34 (dd,1H)、7.41 (m,1H)、7.77 (dt, 1H)、7·83 (dt,1H)、7.92 (d,1H)、8.25 (dd,1H)、12.53 (s,1H) 〇 實例3 :化合物A使用1-(環丙基羰基)六氩吡嗪HC1鹽之代 替合成
ί (a) 1-(環丙基羰基)六氫吼嗪HCI鹽(I1) 在15分鐘内於氮氣下邊攪拌邊用六氫。比嗪(50.00克, 〇·581莫耳)逐份處理乙酸(700毫升)。將該反應混合物加熱 至40°C並維持在此溫度直至獲得一完全溶液。在1 5分鐘内 添加環丙烷羰醯氯(59.2毫升,0.638莫耳)。將該反應混合 物在室溫下攪拌過夜。過濾該反應混合物並於降低之壓力 下蒸餾濾液直至收集到約430毫升餾出物。將曱苯(550毫 125153.doc -37- 200825066 升)裝填至該反應混合物 卿甲並繼績降壓蒸餾直至進一步收 集到400毫升餾出物。進一 ^ 步裝填甲苯(550毫升)並繼續降 壓蒸餾直至收集到350毫升 一 笔开餾出物。用甲苯(2〇〇毫升)稀釋 所得聚液並將其㈣過夜。進-步添加甲苯(毫升)以使 漿液流動。過滤該漿液、用甲苯⑽毫升)洗滌並在真空下 於40 C乾燥’獲得灰白色固體狀標題化合物(86· 78克)。 質譜:MH+ 155 1H NMR (400 MHz,D2〇) δ : 〇·92 (m,4H)、1·98 (m, 1Η)、3.29 (m,2Η)、3·38 (m,2Η)、3.84 (m,2Η)、4.08 (m, 2H)。 ’
(b) 化合物A 在氮氣下攪拌的同時將2-氟-5-[(4-氧代-3,4-二氫酞嗪 基)甲基]苯甲酸(D)(0.95克,3.19毫莫耳)懸浮於乙腈(4毫 升)中。添加六氟磷酸2-(1Η-苯并三唑-1-基四甲 基脲鑌(HBTU)(1.45克,3.83毫莫耳),然後添加ι_環丙基 羰基六氫吡嗪HC1鹽(Ι’)(0·73克,3.83毫莫耳)。在3分鐘内 添加二異丙基乙基胺(1.39毫升,7.98毫莫耳)並在室溫下 將該反應混合物攪拌過夜。將該反應混合物冷卻至5 °C並 維持在此溫度達1小時,然後過濾。用冷(3 °C)乙腈(2毫升) 洗滌濾餅,然後在真空下於高達4〇°C之溫度下將其乾燥以 獲得淺黃色固體狀標題化合物(0·93克)。 (c) 化合物A自含水曱醇之再結晶 將源自步驟(b)之化合物Α(9.40克’ 21.64毫莫耳)懸浮於 水(100毫升)及甲醇(120毫升)之混合物中。邊攪拌邊將該 125153.doc 200825066 懸浮液加熱至回流。然後將所產生之混濁溶液冷卻至6crc 並藉助harborlite墊過濾。用水(5毫升)與甲醇(5毫升)之混 合物洗滌濾墊。於常壓下蒸餾該濾液直至收集到u 5毫升 德出物。然後停止蒸德並使所產生之懸浮液冷卻至室溫。 將δ亥所得懸浮液授拌約1 §小時,然後過濾。用水(2〇毫升) 洗務濾餅,然後在真空下於高達6(TC之溫度下將其乾燥以 獲付白色固體狀呈形式A的標題化合物(8.67克)。 質譜·· MH+ 435 1H NMR (400 MHz,DMSO-d6) δ : 0.70 (m,4H)、1.88 (br s,1H)、3.20 (br s,2H)、3.56 (m,6H)、4.31 (s,2H)、 7·17 (t,1H)、7.34 (dd,1H)、7.41 (m,1H)、7·77 (dt, 1H)、7.83 (dt,1H)、7.92 (d,1H)、8.25 (dd,1H)、12.53 (s, 1H) 〇 (d)化合物A自含水乙醇之再結晶 將源自步驟(b)之化合物Α(9·40克,21.64毫莫耳)懸浮於 水(100毫升)與乙醇(50毫升)之混合物中。邊攪拌邊將懸浮 液加熱至回流。然後將所產生之混濁溶液冷卻至6(rc並藉 助harborlite墊過濾。用水(5毫升)與乙醇(5毫升)之混合物 洗滌濾墊。在常壓下蒸餾濾液直至收集到53毫升館出物。 然後停止蒸鶴並使所產生之懸浮液冷卻至室溫。將所得轉 浮液授拌約1 8小時,然後過濾。用水(2〇毫升)洗條濾餅, 然後在真空中於6 0 °C下將其乾燥以獲得白色固體狀呈开4气 A之標題化合物(8·74克)。 質譜:MH+ 435 125153.doc -39- 200825066 1H NMR (400 MHZ, DMS〇-d6) δ : 0.70 (m, 4H) . 1.88 (br s,1H)、3.20 (br s,2H)、3.56 (m,6H)、4 31 (s,2H)、 7.17 (t, 1H) > 7.34 (dd, 1H) . 7.41 (m, 1H) ^ 7.77 (dt, 1H)、7.83 (dt,1H)、7.92 (d,1H)、8.25 (dd,1H)、12.53 (s, 1H) 〇 實例4 ··化合物D之代替合成
(a) 2-氟-5-[(E/Z)-(3-氧代-2-苯并呋喃-1(3Η)_亞基)甲基]节 腈(Ε) 在氮氣氣氛下將第三戊醇鈉(99〇〇克,〇·854莫耳)及2_曱 基四氫呋喃(960毫升)冷卻至2〇c。逐滴添加亞磷酸二乙酯 (110*升,0.855莫耳)並維持溫度<5。〇。添加2_甲基四氫 呋喃(40耄升)進行線上洗滌。於2〇c下將反應攪拌i小時 分鐘。添加2-羧基苯甲醛(H)(8〇克,〇·533莫耳)存於2_甲基 四氫呋喃(200毫升)中之溶液並在整個添加過程維持溫度 <7 C。添加2-甲基四氣呋喃(4〇毫升)進行線上洗滌。將該 反應混合物升溫至20 °C並於20 °C下維持20分鐘。在1小時 10分鐘内添加甲烷磺酸(66毫升,101莫耳),然後添加2_ 甲基四氫呋喃(40毫升)。在2(rc下將該反應混合物攪拌過 夜。添加甲烧磺酸(7毫升,〇 ·丨〇丨莫耳),隨後添加2_甲基 四氫呋喃(7毫升)並於2〇°C下將反應混合物再攪拌4小時。 125153.doc -40- 200825066 於室溫下添加水(400毫升)並於室溫下將所得兩相混合物攪 拌20刀鐘。移除下部水層並將碳酸氫鉀克,0.534莫 耳)存於水(400毫升)中之溶液添加至有機層中。於室溫下 將該雙相混合物攪拌20分鐘且隨後移除下部水溶液。保留 有機部分((3-氧代丨^氫·2_苯并呋喃+基)膊酸二乙醋溶 液)。將2-氟-5-甲醯基苄腈(64克,〇·429莫耳)添加至有機 邛刀中並於20 C下攪拌該混合物。逐滴添加三乙基胺(66 笑升,0.473莫耳),隨後添加2-甲基四氫呋喃毫升)。然 後於20°C下將該反應混合物攪拌過夜,然後冷卻至5它, 過濾,用工業甲基化乙醇(48〇毫升)洗滌並隨後在真空中於 高達40°C之溫度下乾燥,獲得標題化合物(91·2克)。 質譜:ΜΗ+ 266 1Η NMR (400 MHz,DMSO-d6) δ : 6.89(s,1Η,主要異 構體)、6.94(s,1H,次要異構體)、7.4〇(dd,m,次要異 構體)、7.58(t,1H,兩種異構體)、7.7〇(t,m,兩種異構 體)、7.89(t,1H,兩種異構體)、7·95((1,m,兩種異構 體)、8.05(d’ 1H,兩種異構體)、8.i5(m,2H,兩種異構 體)。 (1〇2-氟-5-[(4-氧代-3,4-一風駄嘻-1_基)甲基]节猜(^£^) 在氮氣氣氛下,於室溫下將2-氟-5-[(Ε/Ζ)-(3·氧代-2·苯 并呋喃_1(3Η)_亞基)甲基]苄腈(Ε)(2〇克,75.40毫莫耳)及四 氫呋喃(200毫升)攪拌30分鐘。添加單水合肼(4·4〇毫升, 90.53毫莫耳),隨後添加四氫呋喃(4毫升)用以線洗。於室 温下將該反應混合物攪拌1小時45分鐘。添加乙酸〇1〇毫 125153.doc •41 · 200825066 升I9·20耄莫耳)並將反應混合物升溫至6〇°C。將反應混 合物保持在6〇它過夜。將反應混合物冷卻至50°C並逐滴添 加水(2〇〇耄升)。在整個添加過程中將溫度維持在45°C。將 反應混合物冷卻至2〇r,過濾,用水(3〇毫升)及四氫呋喃 (30宅升)之混合物洗務,並隨後在真空中於高達。〇下將 其乾燥以獲得標題化合物(18 · 7克)。 質譜:MH+ 280 1H NMR (400 MHz,DMSO-d6) δ : 4·38 (s,2H)、7.46 (t,1Η)、7.72 (m,1Η)、7·85 (dt,1Η)、7·92 (m,2Η)、7 99 (d,1H)、8.27 (dd,1H)、12.57 (s,1H)。 (〇)2-氟-5-[(4-氧代-3,4-二氫欧嗓-1-基)甲基]苯甲酸(〇) 於20 C下擾拌2-氟- 5-[(4-氧代-3,4-二氫酞嗪_ι·基)甲基] 苄腈(ED)(9.60克,34.37毫莫耳)及水(40毫升)。添加2 乂氫 氧化納(36¾升,72.00¾莫耳)’將反應混合物升溫至9〇 並維持此溫度過夜。將反應混合物冷卻至室溫並過漁。用 水(10毫升)洗滌濾墊並於60°C下在40分鐘内將經合併之滤 液添加至2M HC1(56毫升,112.00毫莫耳)中。將所得懸浮 液冷卻至50°C並過濾,用水(57毫升)洗滌並在真空中於高 達60 °C下將其乾燥以獲得白色固體狀標題化合物(9.72 克)。 質譜:MH+ 299 1H NMR (400 MHz,DMSO-d6) δ : 4.36 (s,2H)、7 24 (dd,1Η)、7·59 (m,1Η)、7·84 (dt,2Η)、7.90 (dt,1Η)、 7.98 (d,1H)、8·27 (dd,1H)、12.59 (s,1H)、13.22 (br s 125153.doc -42- 200825066 1H) 〇 實例5 :化合物A自含水乙醇之再結晶 將4-(3-{[4-(環丙基羰基)六氫吼嗪_丨_基]羰基}_4•氟苄基) 酞嗪-1(2H)-酮(化合物Α)(20·00克,44.66毫莫耳)懸浮於水 (50毫升)與乙酵(150毫升)之混合物中。邊攪拌邊將該懸浮 液加熱至回流。然後將所產生之溶液冷卻至7〇。〇並過濾。 用水(8毫升)與乙醇(22毫升)之混合物洗滌濾墊。 邊攪拌邊將濾液冷卻至45°C。添加呈形式a之4-(3-{[4_ (環丙基羰基)六氫啦嗪-1·基]羰基卜4_氟苄基)酞嗪“(2H)_ 酮(化合物Α)(0·08克)以為混合物種晶種。在2·5小時内將所 得懸浮液冷卻至20°C並於此溫度下再攪拌16小時以產生結 晶。在5小時内添加水(2〇〇毫升)並將溫度維持在⑼^。在 添加結束後將懸浮液維持在2〇它達2小時。 過濾該懸浮液並用乙醇(24毫升)與水(56毫升)之混合物 洗務;慮餅。取出經分離之固體並在真空中於4 〇 _ $ 〇。〇下將 其乾燥,獲仔灰白色固體狀標題化合物(形式Α)(ι 8· 1克)。 獲得圖3-5之方法 粉末XRD-圖3(呈形式A之化合物a) 粉末X-射線繞射係使用Bruker D5000繞射儀(χ_射線之 波長為1.5418 A Cii源,電壓40 kV,燈絲發射40 mA)記 錄。使用0.02。步寬及4秒鐘時間計數自2_4〇。2Θ掃描樣 品° 粉末XRD-圖4(溶合形式之化合物a) 溶劑合物種類之粉末X-射線繞射係使用一裝配有彎曲位 125153.doc •43 - 200825066 置敏感檢測器(範圍120° 2Θ)之Inel XRG-3000繞射儀(X-射 線之波長為1.5418 A Cu源、電壓40 kV、燈絲級發射30 mA)記錄。使用0.03。步寬自2.5-40。2Θ掃描樣品,通常總 收集時間為300秒鐘。 差示掃描量熱法(DSC)-囷5 使用一具有TSO801RO自動化系統之Mettler DSC820E記 錄DSC。通常將少於5克之材料包含於40微升配有刺破蓋 子的鋁盤中,以l〇°C/分鐘之恆定加熱速率在25°C至325°C 溫度範圍内加熱。以1 〇 〇毫升/分鐘之流速使用氮氣吹掃 氣。 實例6 抑制作用 使用下列分析來測定IC5G值以便評價該活性化合物之抑 制作用。 在96孔FlashPlates(商標名)(NEN,UK)中用Z-緩衝液(25 mM Hepes (Sigma) ; 12.5 mM MgCl2 (Sigma) ; 50 mM KC1 (Sigma) ; 1 mM DTT (Sigma) ; 10%甘油(Sigma) ; 0.001% NP-40 (Sigma) ; pH 7.4)培養自Hela細胞核提取物分離之哺 乳動物PARP並添加不同濃度之該等抑制劑。所有化合物 皆稀釋於DMSO中並提供介於10與0.01 μΜ間之最終分析濃 度,同時DMSO之最終濃度為1%/孔。每孔之總分析體積 為40微升。 於30 °C下培養10分鐘後,藉由添加10微升包含NAD (5 μΜ)、3H-NAD及30 mer雙鏈DNA寡聚物之反應混合物來 125153.doc -44- 200825066 開始反應。指定之陽性及陰性反應孔與化合物孔(未知)一 起處理以便計算%酵素活性。然後將該等板振盪2分鐘並 於30°C下培育45分鐘。 培育後,藉由添加50微升30%乙酸至各孔中來淬滅反 應。然後將該等板於室溫下振蘯1小時。 將該等板轉移至TopCount NXT(商標名)(Packard,UK)用 於閃爍計數。所記錄之值為各孔計數30秒鐘後之計數/分 鐘(cpm) 〇
然後使用以下等式計算該化合物之%酵素活性: %抑制=100 ( (未知之cpm-平均陰性cpm) _ 10Ox-- V (平均陽性cpm-平均陰性cpm) 計算IC5G值(50%酵素活性受到抑制之濃度),該值係在一 系列不同濃度内(通常自10 μΜ低至0.001 μΜ)測定。該等 IC5〇用作比較值以確定化合物效力的增加。 化合物A具有約5 nM之IC50。 增強係數 活性化合物之增強係數(PF5G)係計算成對照細胞生長之 IC5G除以添加PARP抑制劑之細胞生長之IC5〇的比率。對照 及經化合物處理細胞的生長抑制曲線皆在烷基化試劑甲烷 磺酸甲酯(MMS)存在下測得。測試化合物以0.2微莫耳之固 定濃度使用。MMS之濃度介於0至10微克/毫升之間。 使用石黃醢羅丹明B(sulforhodamine B) (SRB)分析評價細 胞生長(Skehan,P.等人,(1990) New colorimetric cytotoxicity assay for anticancer-drug screening. J. Natl. Cancer Inst. 125153.doc -45 - 200825066 82,U〇7-1112·)。將2,000個HeLa細胞以100微升之體積接 種於平底96孔微量滴定板之各孔中並於37。〇培育6小時。 用單獨的培養基或包含終濃度為〇·5、i或5 PARP抑制 劑之培養基替換細胞培養基。使細胞再生長丨小時,然後 將一系列濃度(通常為〇、1、2、3、5、7及1〇微克/毫升)之 MMS添加至未處理細胞或經parP抑制劑處理之細胞。使 用經由PARP抑制劑單獨處理之細胞來評價由parP抑制劑 引起之生長抑制。 將細胞再放置16小時,然後替換培養基並於37^下使細 胞再生長72小時。然後移除培養基並隨後用1 〇〇微升冰冷 的10% (w/v)三氯乙酸固定細胞。將該等板於4。〇培育2〇分 鐘並隨後用水洗滌4次。然後用100微升溶於〇·4% (w/v)存 於1 %乙酸中之SRB對各孔之細胞實施染色達2〇分鐘,然後 用1%乙酸洗滌4次。然後將板在室溫下乾燥2小時。藉由 添加100微升10 mM Tris鹼至各孔中來溶解經染色細胞之 染料。輕輕搖動板並將其於室溫下放置30分鐘,然後在 Microquant微量滴定板讀取器上於564 nM下量測光密度。 化合物A在200 nM具有至少20之PF5〇。 【圖式簡單說明】 圖1顯示化合物A水處理後之NMR(實例1); 圖2顯示呈形式A之化合物A水處理後的粉末xrd圖案(實 例1); 圖3顯示呈形式A之化合物A的代表性粉末xrd圖案; 圖4顯示呈溶合形式之化合物A的代表性粉末XRD圖案; 125153.doc -46- 200825066 圖5顯示呈形式A之化合物A的代表性DSC痕跡,其係藉 由以10°C/分鐘自25°C加熱至325°C獲得。 125153.doc 47-

Claims (1)

  1. 200825066 十、申請專利範圍: 1. 一種4-[3-(4-環丙烷羰基-六氫π比嗪-1-羰基)-4-氟-苄基]-2H-酞嗪-1-酮,其呈晶體形式A。 2. 如請求項1之化合物,其在粉末XRD中具有下列特徵 峰: 峰 2Θ0 (士 0.1。) (λ=1.5418λ) 1 12.0 2 17.8 3 21.1 4 22.3 5 29.2 3.如請求項1之化合物,其在粉末XRD中具有下列特徵 峰: 峰 2Θ0 (±0.1°) (λ=1·5418Α) 1 12.0 2 17.8 3 21.1 4 22.3 5 29.2 6 10.5 7 14.0 8 21.7 9 24.3 10 26.1 4.如請求項1至3中任一項之化合物,其在DSC中以10°C /分 125153.doc 200825066 鐘自25°C加熱至325°C時在210.1°C 士 1°C開始熔化。 一種獲仔呈晶體形式A之4-[3_ (4-環丙烧羧基-六氫吼嗓-1-羰基)-4-氟-苄基]_2H•酞嗪化合物A)之方法,其 包括如下步驟: (i) 自溶劑中結晶析出4-[3-(4-環丙烷羰基-六氫吼嗪-1-羰基)-4-氟-苄基]-2H-酞嗪-1-酮; (ii) 若初始溶劑不為乙醇,則用乙醇處理該晶體化合物 A ; (iii) 用水處理該晶體化合物A以移除所捕獲乙醇; (iv) 乾燥所得產物。 一種獲得呈晶體形式A之4-[3-(4-環丙烷羰基-六氫吡嗪-Ι-lk基)-4-氟-苄基]-2H-酜嗓-Ι-g同(化合物A)之方法,其 包括如下步驟: (i) 自溶劑中結晶析出4_[3_(4_環丙烷羰基-六氫σ比嗪-羰基)-4-氟-苄基]-2Η-酞嗪-1-酮; (ii) 若呈晶體形式之化合物A合成法所用初始溶劑不為水 與C! _2醇之混合物’則將該化合物與水與c丨2醇之混 合物一起加熱; (iii) 於常壓下蒸餾該混合物;及 (iv) 乾燥所得產物。 種獲件呈晶體形式A之4-[3-(4 -環丙烧幾基-六氫外b.-基)-4-氟-苄基]-2H-酞嗪-1-酮(化合物A)之方法,其 包括如下步驟·· (0將化合物A懸浮於作為溶劑之水與c!_2醇的混合物 125153.doc 200825066 中; (ii) 加熱該懸浮液至回流; (iii) 冷卻該溶液並用接種呈形式A之化合物A晶種; Ο)乾燥所得產物。 8· 一種自4-[4-氟-3-(六氫吨嗪-1-羰基 > 苄基]_2H-酞嗪―卜酮 合成4-[3-(4-環丙烷羰基-六氫吡嗪·丨_羰基)_4_氟·苄基]_ 2H-酞嗪-1-酮之方法,其包括如下步驟: f (0以控制方式將含二乙基胺及環丙烷羰醯氣之有機溶 劑之預混合溶液添加至存於相同有機溶劑中之4_[4_ 氟-3-(六氫吼嗪-丨_羰基)·节基]·2Η_酞嗪·丨-酮中,同 時將溶液溫度控制在低於2〇t。 9種自獻氧代·3,4-二氫-酞嗪-1-基甲基)-苯甲酸 口成4 [3-(4-¼丙烷碳基_六氫^比嗓小幾基)_4_氟·节基]· 2仏駄嗪小_之方法,其包括使2备5♦氧代_3,心二 氫-酉太嗪-1_基甲基)-苯曱酴盥,/與工#、 u 、 -、1 - (%丙基幾基)六氫υ比唤或 其無機酸鹽在醯胺偶合劑存在下反應。 10. —種合成2-氟-5·(4-氧代1 Λ 卜 礼代3,4·二虱-酞嗪-1-基甲基)-苯甲 酸之方法’其包括如下步驟: (a)自2-羧基苯甲醛合成门 风虱代_1,3-二氫·2-苯并呋喃-1- 基)膦酸二乙酯; (b)自(3 -氧代_ι,3_二氫_2_笼丑 本开呋喃·1-基)膦酸二乙酯合 成 2_氟-5_[(£/2)-(3-蓋处。* 氧代本并呋喃-1(3Η)-亞基)甲 基]节腈。 11·如請求項1〇之方法,其 ^ 步包括如下步驟: 125153.doc 200825066 (c)由化合物E與水合肼反應,合成2-氟·5-[(4-氧代-3,4-二氫醜嗪-1-基)甲基]苄腈(ED):
    及 (d)由化合物ED與氫氧化鈉反應,合成化合物D。 12. —種2-氟-5-[(4-氧代-3,4-二氫醜嗓小基)曱基]节腈 (ED):
    13. —種醫藥組合物’其包括如請求項丨至4中任一項之化合 物及一醫藥上可接受之載劑或稀釋劑。 U.如請求項⑴中任一項之化合物,其用於治療人體或動 物體之方法中。 15.如請求項⑴中任一項之化合物,其用於在人體或動物 體治療中抑制PARP之方法中。 16·-種如請求項⑴中任一項之化合物在製備藥物中之的 用途’該藥物用於抑制PARP活性。 種:請求項丨至4中任一項之化合物在製備藥物中的用 …樂物用於治療下列疾病:血管疾病;敗血性休 125153.doc 200825066 克;缺血性損傷;神經毒性;出血性休克;病毒感染; 或可藉由抑制PARP活性來改善之疾病。 1 8. —種如睛求項丨至4中任一項之化合物在製備藥物中之用 途,該藥物用於在癌症治療中用作辅助藥劑或用於加強 利用電離輻射或化學治療劑之腫瘤細胞治療。 19·種如凊求項1至4中任一項之化合物在製造用於治療個 體中癌症的藥物中之用途,其中該癌症存在HR依賴性 DNADSB修復通路缺陷。 2 0 ·如明求項19之用途,其中該癌症包含一或多個相對於正 常細胞已降低或消失由HR修復DNA DSB的能力之癌細 胞。 21. 如請求項20之用途,其中該等癌細胞具有BRCAl或 B R C A 2缺陷表型。 22. 如凊求項21之用途,其中該等癌細胞存在BRCA1或 BRCA2缺陷。 23 ·如凊求項1 9至22中任一項之用途,其中該個體係編碼HR 依賴性DNA DSB修復通路之組份的基因突變之雜合體。 24·如請求項23之用途,其中該個體係BrCA1& /或brCA2 突變之雜合體。 25·如請求項19至24中任一項之用途,其中該癌症係乳癌、 印巢癌、騰腺癌或前列腺癌。 26·如請求項19至25中任一項之用途,其中該治療進一步包 括投與電離輪射或化學治療劑。 125153.doc
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