RU98123553A - Зонд для анализа нуклеиновых кислот - Google Patents
Зонд для анализа нуклеиновых кислотInfo
- Publication number
- RU98123553A RU98123553A RU98123553/13A RU98123553A RU98123553A RU 98123553 A RU98123553 A RU 98123553A RU 98123553/13 A RU98123553/13 A RU 98123553/13A RU 98123553 A RU98123553 A RU 98123553A RU 98123553 A RU98123553 A RU 98123553A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- groups
- probe according
- paragraphs
- probe
- sre
- Prior art date
Links
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title claims 10
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title claims 8
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title claims 8
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims 38
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 claims 18
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 12
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 claims 11
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 claims 11
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 claims 11
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 claims 9
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 8
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 claims 8
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 claims 7
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 7
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 claims 7
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims 7
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 claims 6
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 claims 6
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 claims 6
- 125000006853 reporter group Chemical group 0.000 claims 6
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 claims 6
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 claims 5
- CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N Pyrimidine Chemical compound C1=CN=CN=C1 CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- 125000005842 heteroatom Chemical group 0.000 claims 4
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 claims 4
- 238000004020 luminiscence type Methods 0.000 claims 4
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 3
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 claims 3
- 150000002431 hydrogen Chemical class 0.000 claims 3
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims 3
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 3
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims 3
- 238000006862 quantum yield reaction Methods 0.000 claims 3
- 230000011664 signaling Effects 0.000 claims 3
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical class CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 3
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims 2
- 108091093037 Peptide nucleic acid Proteins 0.000 claims 2
- 150000001721 carbon Chemical group 0.000 claims 2
- -1 cyanine compound Chemical class 0.000 claims 2
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 125000001183 hydrocarbyl group Chemical group 0.000 claims 2
- 230000008863 intramolecular interaction Effects 0.000 claims 2
- 239000002159 nanocrystal Substances 0.000 claims 2
- 125000006413 ring segment Chemical group 0.000 claims 2
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 claims 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 claims 1
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 claims 1
- 125000002915 carbonyl group Chemical group [*:2]C([*:1])=O 0.000 claims 1
- 150000001793 charged compounds Chemical class 0.000 claims 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 claims 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims 1
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 claims 1
- 230000000593 degrading effect Effects 0.000 claims 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims 1
- 238000000799 fluorescence microscopy Methods 0.000 claims 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 claims 1
- 230000004807 localization Effects 0.000 claims 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims 1
- 230000000051 modifying effect Effects 0.000 claims 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 claims 1
- QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N nitrogen group Chemical group [N] QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims 1
- 150000002926 oxygen Chemical class 0.000 claims 1
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 claims 1
- 150000004713 phosphodiesters Chemical group 0.000 claims 1
- YBBRCQOCSYXUOC-UHFFFAOYSA-N sulfuryl dichloride Chemical compound ClS(Cl)(=O)=O YBBRCQOCSYXUOC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 claims 1
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 claims 1
- 0 CC(C)(C1)C=CC(C2)=C1C(*I)=C2*=C Chemical compound CC(C)(C1)C=CC(C2)=C1C(*I)=C2*=C 0.000 description 1
Claims (1)
1. Зонд для выбранных последовательностей нуклеиновых кислот (ВП), включающий в себя элемент, узнающий последовательность (SRE), связанный ковалентно с репортерной группой (группами) (РГ), сигнальные свойства которой значительно изменяются при ее присоединении к нуклеиновой кислоте (НК), включая выбранную последовательность (ВП), при этом зонд по крайней мере, в части, близко находящейся от РГ, имеет такую структуру, что подавляется всякое внутримолекулярное взаимодействие между SRE и РГ, которое оказывает влияние на сигнал РГ, или зонд имеет такую последовательность оснований, которая, по крайней мере, на конце, ближайшем к РГ, минимально влияет на сигнальные свойства РГ.
2. Зонд для выбранных последовательностей нуклеиновых кислот (ВП), включающий в себя элемент, узнающий последовательность (SRE), связанный ковалентно с репортерной группой или группами (РГ), сигнальные свойства которой значительно изменяются при ее присоединении к нуклеиновой кислоте (НК), включая выбранную последовательность (ВП), при этом, по крайней мере, в части, ближайшей к РГ, зонд имеет такую структуру, что подавляется всякое внутримолекулярное взаимодействие между SRE и РГ, которое оказывает влияние на сигнал РГ, или зонд имеет такую последовательность оснований различных пиримидинов, по крайней мере, на конце, ближайшем к РГ, которая минимально влияет на сигнальные свойства РГ.
3. Зонд по п. 1, отличающийся тем, что при связывании с ВП он образует структуру, которая увеличивает влияние на сигнал, вызванное присоединением РГ к НК.
4. Зонд по п. 1, отличающийся тем, что SRE, по крайней мере, в части, ближайшей к РГ, имеет структуру, отличную от структуры природных нуклеиновых кислот.
5. Зонд по п. 1, отличающийся тем, что SRE выбрана из синтетических аналогов дезоксирибонуклеиновых кислот (АНК), последовательностей, распознающих белок или пептид, аналогов дезоксирибонуклеиновй кислоты, присоединенных к белку или пептиду, и олигонуклеотидов, присоединенных к белку или пептиду.
6. Зонд по п. 1, отличающийся тем, что SRE является нуклеиновой кислотой (НК), основание или основания которой, на том конце, где присоединена РГ, являются такими, к которым РГ имеет наименьшее аффинное сродство и/или такими, взаимодействие РГ с которыми минимально влияет на сигнальные свойства РГ.
7. Зонд по п. 5, отличающийся тем, что SRE является АНК, который отличается от природных нуклеиновых кислот НК, так как имеет измененный или замещенный фосфородиэфирный остов, или измененные или замещенные сахарные части, или имеет отличную от природных НК стереохимию.
8. Зонд по п. 7, отличающийся тем, что АНК имеет полный нейтральный или положительный заряд, причем на одно основание приходится не более одного заряда, предпочтительно, не более одного заряда на три основания.
9. Зонд по п. 7 или 8, отличающийся тем, что АНК является пептидной нуклеиновой кислотой (ПНК).
10. Зонд по любому из пп. 1-9, отличающийся тем, что наблюдаемым сигнальным свойством является люминесценция.
11. Зонд по любому из пп. 1-10, отличающийся тем, что сигнал РГ увеличивает свою интенсивность при связывании РГ с ВП.
12. Зонд по любому из пп. 1-11, отличающийся тем, что репортерная группа является веществом, которое имеет
а) сродство к ssHK и/или dsHK между 0,1 и 108M-1 (-1<logК<8),
б) квантовый выход люминисценции в водном растворе меньше, чем 0,05, предпочтительно меньше, чем 0,01, более предпочтительно меньше, чем 0,001,
в) при наличии связи с НК квантовый выход люминисценции больше, чем 0,01, предпочтительно больше, чем 0,1, более предпочтительно больше, чем 0,25,
г) увеличение квантового выхода люминисценции при связывании с НК, по крайней мере, пятикратное, предпочтительно, по крайней мере, пятидесятикратное, более предпочтительно, по крайней мере, пятисоткратное,
д) максимальное молярное поглощение составляет, по крайней мере, 1000 M1см-1, предпочтительно, по крайней мере, 10000 M1см-1, еще более предпочтительно, по крайней мере, 50000 M1см-1.
а) сродство к ssHK и/или dsHK между 0,1 и 108M-1 (-1<logК<8),
б) квантовый выход люминисценции в водном растворе меньше, чем 0,05, предпочтительно меньше, чем 0,01, более предпочтительно меньше, чем 0,001,
в) при наличии связи с НК квантовый выход люминисценции больше, чем 0,01, предпочтительно больше, чем 0,1, более предпочтительно больше, чем 0,25,
г) увеличение квантового выхода люминисценции при связывании с НК, по крайней мере, пятикратное, предпочтительно, по крайней мере, пятидесятикратное, более предпочтительно, по крайней мере, пятисоткратное,
д) максимальное молярное поглощение составляет, по крайней мере, 1000 M1см-1, предпочтительно, по крайней мере, 10000 M1см-1, еще более предпочтительно, по крайней мере, 50000 M1см-1.
13. Зонд по п. 11, отличающийся тем, что репортерная группа представляет собой вещество, которое содержит ароматические области, по крайней мере две из них соединены ковалентной связью, находящейся в сопряжении с ароматической системой.
14. Зонд по любому из пп. 1-12, отличающийся тем, что репортерная группа является ассиметричным цианиновым соединением.
15. Зонд по п. 14, отличающийся тем, что ассиметричное цианиновое соединение в свободной форме имеет одну из следующих химических структур
где R1 является водородом или алкильной группой, несопряженной с азотом, имеющей до 6 углеродных атомов, которая может быть замещена полярными остатками, такими как гидроксируппы, алкоксигруппы, карбоксигруппы и аминогруппы,
где Х - О, S, Se, NR5, где R5 - водород или алкильная группа имеющая до 6 атомов углерода, или CR6R7, где R6 и R7, каждый независимо, являются водородами или алкильными группами имеющими до 6 атомов углерода, где R2, R3 и R4, из которых два или все три могут быть одинаковыми, представляют собой водород, небольшие алкильные группы, арилы, или в паре, R2 и R4 или R3 и R4 и в комбинации с двумя кольцевыми атомами, к которым они присоединены, образуют 5- или 6-членное ароматическое кольцо, которое может содержать 0-2 гетероатомов типа О, S и N-R8, где R5 указан выше,
где n = 0, 1 или 2,
где Y является НС=СН, и В и А оба равны 0 или 1, при условии, что если А=1, то В=0 и наоборот, где R9 и R10, независимо представляют собой водороды или алкильные группы, несопряженные с азотом, имеющие до 6 атомов углерода, причем алкильные группы могут быть заменены полярными остатками, такими как гидроксигруппы, алкоксигруппы, карбоксигруппы и аминогруппы
16. Зонд по п. 8, отличающийся тем, что РГ является положительно заряженным соединением.
где R1 является водородом или алкильной группой, несопряженной с азотом, имеющей до 6 углеродных атомов, которая может быть замещена полярными остатками, такими как гидроксируппы, алкоксигруппы, карбоксигруппы и аминогруппы,
где Х - О, S, Se, NR5, где R5 - водород или алкильная группа имеющая до 6 атомов углерода, или CR6R7, где R6 и R7, каждый независимо, являются водородами или алкильными группами имеющими до 6 атомов углерода, где R2, R3 и R4, из которых два или все три могут быть одинаковыми, представляют собой водород, небольшие алкильные группы, арилы, или в паре, R2 и R4 или R3 и R4 и в комбинации с двумя кольцевыми атомами, к которым они присоединены, образуют 5- или 6-членное ароматическое кольцо, которое может содержать 0-2 гетероатомов типа О, S и N-R8, где R5 указан выше,
где n = 0, 1 или 2,
где Y является НС=СН, и В и А оба равны 0 или 1, при условии, что если А=1, то В=0 и наоборот, где R9 и R10, независимо представляют собой водороды или алкильные группы, несопряженные с азотом, имеющие до 6 атомов углерода, причем алкильные группы могут быть заменены полярными остатками, такими как гидроксигруппы, алкоксигруппы, карбоксигруппы и аминогруппы
16. Зонд по п. 8, отличающийся тем, что РГ является положительно заряженным соединением.
17. Зонд по любому из пп. 1-16 формулы, отличающийся тем, что SRE и РГ связаны углеводородной цепочкой, содержащей одну или несколько:
а) жесткие группы, такие как двойные и тройные связи,
б) гетероатомы
в) полярные группы,
г) заряженные группы,
д) объемные группы.
а) жесткие группы, такие как двойные и тройные связи,
б) гетероатомы
в) полярные группы,
г) заряженные группы,
д) объемные группы.
18. Зонд по любому из пп. 1-17 формулы, отличающийся тем, что связь между SRE и РГ имеет по крайней мере один положительный заряд.
19. Зонд по любому из пп. 14-18 формулы, отличающийся тем, что SRE является АНК или НК, и более чем 50% его оснований являются пиримидиновыми.
20. Зонд по любому из пп. 14-19 формулы, отличающийся тем, что, по крайней мере, в каждом втором положении находится пиримидиновое основание.
21. Зонд по любому из пп. 14-20 формулы, отличающийся тем, что основания, находящиеся на конце, к которому прикреплена РГ, являются двумя тиминами, или цитозином и тимином.
22. Зонд по любому из пп. 14-21, отличающийся тем, что все основания являются пиримидиновыми.
23. Способ присоединения соединения с одной из следующих химических структур к аминогруппе в SRE при помощи обычного пептидного синтеза:
где R1 является водородом или алкильной группой, несопряженной с азотом, имеющей до 6 углеродных атомов, при этом алкильные группы которые могут быть замещены полярными остатками, такими как гидроксируппы, алкоксигруппы, карбоксигруппы и аминогруппы,
где Х является О, S, Se, N-F5, где R5 - водород или алкильная группа имеющая до 6 атомов углерода, или CR6R5, где R6 и R7, независимо, являются водородами или алкильными группами имеющими до 6 атомов углерода,
где R2, R3 и R4, из которых два или все три могут быть одинаковыми, представляют собой водород, небольшие алкильные группы, арилы, или в паре, R2 и R4 или R3 и R4 и в комбинации с двумя кольцевыми атомами, к которым они присоединены, образуют 5- или 6-членное ароматическое кольцо, которое может содержать 0-2 гетероатомов типа О, S и N-R8, где R5 описано выше,
где n = 0, 1 или 2,
где Y - НС=СН, и В и А являются оба 0 или 1, при условии, что если А=1, то В=0 и наоборот,
где R9 и R10, независимо представляют собой водороды или алкильные группы, несопряженные с азотом, содержащие до 6 атомов углерода, причем алкильные группы могут быть замещены полярными остатками, такими как гидроксируппы, алкоксигруппы, карбоксигруппы и аминогруппы, и R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7, R8, R9 и R10 являются углеродными цепочками, и могут быть замещены полярными остатками, и содержать жесткие, заряженные или объемные группы, и один из них содержит изотиоцианин, имидил, сульфонилхлорид или карбонильную группу, которая отделена от ароматической системы, по крайней мере, одним sp3-гибридизованным атомом углерода.
где R1 является водородом или алкильной группой, несопряженной с азотом, имеющей до 6 углеродных атомов, при этом алкильные группы которые могут быть замещены полярными остатками, такими как гидроксируппы, алкоксигруппы, карбоксигруппы и аминогруппы,
где Х является О, S, Se, N-F5, где R5 - водород или алкильная группа имеющая до 6 атомов углерода, или CR6R5, где R6 и R7, независимо, являются водородами или алкильными группами имеющими до 6 атомов углерода,
где R2, R3 и R4, из которых два или все три могут быть одинаковыми, представляют собой водород, небольшие алкильные группы, арилы, или в паре, R2 и R4 или R3 и R4 и в комбинации с двумя кольцевыми атомами, к которым они присоединены, образуют 5- или 6-членное ароматическое кольцо, которое может содержать 0-2 гетероатомов типа О, S и N-R8, где R5 описано выше,
где n = 0, 1 или 2,
где Y - НС=СН, и В и А являются оба 0 или 1, при условии, что если А=1, то В=0 и наоборот,
где R9 и R10, независимо представляют собой водороды или алкильные группы, несопряженные с азотом, содержащие до 6 атомов углерода, причем алкильные группы могут быть замещены полярными остатками, такими как гидроксируппы, алкоксигруппы, карбоксигруппы и аминогруппы, и R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7, R8, R9 и R10 являются углеродными цепочками, и могут быть замещены полярными остатками, и содержать жесткие, заряженные или объемные группы, и один из них содержит изотиоцианин, имидил, сульфонилхлорид или карбонильную группу, которая отделена от ароматической системы, по крайней мере, одним sp3-гибридизованным атомом углерода.
24. Способ определения выбранной последовательности ВП в dsHK, без предварительного разделения ее цепей, с использованием зонда по любому из пп. 1-22.
25. Способ определения последовательности в dsHK путем гибридизации зонда по любому из пп. 1-22 к одной из ее цепей в условиях, при которых dsHK является нестабильной.
26. Способ обнаружения или количественного определения специфичной НК в образце, содержащем активные ферменты с использованием зонда по любому из пп. 7-9.
27. Способ количественного определения специфичной НК в режиме реального времени, в образце, который может содержать модифицирующие, деградирующие или синтезирующие HK ферменты, с использованием зонда по любому из пп. 7-9.
28. Способ определения ВП в ssHK путем гибридизации зонда по любому из пп. 1-22 формулы и олигомера к расположенным близко частям ВП, таким образом, что РГ взаимодействует с регионом дуплекса, образованного олигомером.
29. Способ обнаружения или количественного определения HK, с использованием зонда по любому из пп. 1-22, отличающийся тем, что зонд иммобилизован.
30. Зонд по любому из пп. 1-22, отличающийся тем, что содержит более одной РГ, которые могут быть идентичными, причем оказывается влияние на индивидуальные или комбинированные сигнальные свойства.
31. Зонд по любому из пп. 1-9, или п. 30, отличающийся тем, что, по крайней мере, одна из РГ присоединена к одному или нескольким:
а) нуклеотидным основаниям
б) атомам остова
в) атомам сахаров
и/или атомам, образующим линкер между SRE и ВП.
а) нуклеотидным основаниям
б) атомам остова
в) атомам сахаров
и/или атомам, образующим линкер между SRE и ВП.
32. Вещества с химической структурой:
где R1 является водородом или алкильной группой, несопряженной с азотом, имеющей до 6 углеродных атомов, которая может быть замещена полярными остатками, такими как гидроксируппы, алкоксигруппы, карбоксигруппы и аминогруппы,
где Х является О, S, Se, NR5, где R5 представляет собой водород или алкильную группу, содержащую до 6 атомов углерода, или CR6R7, где R6 и R7, независимо, являются водородами или алкильными группами, содержащими до 6 атомов углерода,
где R2, R3 и R4 из которых два или все три могут быть одинаковыми, представляют собой водород, небольшие алкильные группы, арилы, или в паре, R2 и R4 или R3 и R4 и в комбинации с двумя кольцевыми атомами, к которым они присоединены, образуют 5- или 6-членное ароматическое кольцо, которое может содержать 0-2 гетероатомов типа О, S и N-R8, где R5 описано выше,
где n = 0, 1 или 2,
где Y является НС=СН, и В и А оба равны 0 или 1, при условии что если А= 1, то В=0 и наоборот,
где R9 и R10, независимо представляют собой водороды или алкильные группы, несопряженные с азотом, содержащие до 6 атомов углерода, причем алкильные группы могут быть замещены полярными остатками, как описано ниже, и R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7, R8, R9 и R10 являются углеродными цепочками, и могут содержать полярные остатки, такие как, гидроксильные, алкокси, карбоксильные группы и аминогруппы, и одна из R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7, R8, R9 и R10 содержит карбоксильную группу, которая отделена от ароматической системы по крайней мере одним sp3-гибридизованным атомом углерода.
где R1 является водородом или алкильной группой, несопряженной с азотом, имеющей до 6 углеродных атомов, которая может быть замещена полярными остатками, такими как гидроксируппы, алкоксигруппы, карбоксигруппы и аминогруппы,
где Х является О, S, Se, NR5, где R5 представляет собой водород или алкильную группу, содержащую до 6 атомов углерода, или CR6R7, где R6 и R7, независимо, являются водородами или алкильными группами, содержащими до 6 атомов углерода,
где R2, R3 и R4 из которых два или все три могут быть одинаковыми, представляют собой водород, небольшие алкильные группы, арилы, или в паре, R2 и R4 или R3 и R4 и в комбинации с двумя кольцевыми атомами, к которым они присоединены, образуют 5- или 6-членное ароматическое кольцо, которое может содержать 0-2 гетероатомов типа О, S и N-R8, где R5 описано выше,
где n = 0, 1 или 2,
где Y является НС=СН, и В и А оба равны 0 или 1, при условии что если А= 1, то В=0 и наоборот,
где R9 и R10, независимо представляют собой водороды или алкильные группы, несопряженные с азотом, содержащие до 6 атомов углерода, причем алкильные группы могут быть замещены полярными остатками, как описано ниже, и R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7, R8, R9 и R10 являются углеродными цепочками, и могут содержать полярные остатки, такие как, гидроксильные, алкокси, карбоксильные группы и аминогруппы, и одна из R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7, R8, R9 и R10 содержит карбоксильную группу, которая отделена от ароматической системы по крайней мере одним sp3-гибридизованным атомом углерода.
33. Вещества по п. 32, в частности, ТО и ВО и их кислородные аналоги, отличающиеся тем, что карбоксильная группа расположена на углеводородной боковой цепи, в частности к R1, R2 и R9, которая присоединена к азоту, входящему в состав цикла.
34. Использование зонда по пп. 1-22, 30 и 31 для локализации сегмента хромосомы или ее части для прямого наблюдения гибрида при помощи флюоресцентной микроскопии.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| SE9602183-7 | 1996-05-31 | ||
| SE9602183A SE506700C2 (sv) | 1996-05-31 | 1996-05-31 | Sond och förfaranden för analys av nukleinsyra |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU98123553A true RU98123553A (ru) | 2000-09-27 |
| RU2223966C2 RU2223966C2 (ru) | 2004-02-20 |
Family
ID=20402854
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU98123553/04A RU2223966C2 (ru) | 1996-05-31 | 1997-05-30 | Зонд для анализа нуклеиновых кислот |
Country Status (12)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US6329144B1 (ru) |
| EP (2) | EP0918852A1 (ru) |
| JP (2) | JP2000511057A (ru) |
| CN (1) | CN100398648C (ru) |
| AU (1) | AU3112997A (ru) |
| BR (1) | BR9709495A (ru) |
| CA (1) | CA2256545C (ru) |
| NZ (1) | NZ333473A (ru) |
| PL (1) | PL188875B1 (ru) |
| RU (1) | RU2223966C2 (ru) |
| SE (1) | SE506700C2 (ru) |
| WO (1) | WO1997045539A1 (ru) |
Families Citing this family (148)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5658751A (en) * | 1993-04-13 | 1997-08-19 | Molecular Probes, Inc. | Substituted unsymmetrical cyanine dyes with selected permeability |
| US7070921B2 (en) | 2000-04-28 | 2006-07-04 | Molecular Devices Corporation | Molecular modification assays |
| US7632651B2 (en) | 1997-09-15 | 2009-12-15 | Mds Analytical Technologies (Us) Inc. | Molecular modification assays |
| US6485901B1 (en) | 1997-10-27 | 2002-11-26 | Boston Probes, Inc. | Methods, kits and compositions pertaining to linear beacons |
| US6080868A (en) * | 1998-01-23 | 2000-06-27 | The Perkin-Elmer Corporation | Nitro-substituted non-fluorescent asymmetric cyanine dye compounds |
| GB9812768D0 (en) * | 1998-06-13 | 1998-08-12 | Zeneca Ltd | Methods |
| US6441152B1 (en) | 1998-12-08 | 2002-08-27 | Boston Probes, Inc. | Methods, kits and compositions for the identification of nucleic acids electrostatically bound to matrices |
| US6858390B2 (en) | 1998-12-31 | 2005-02-22 | Ingeneus Corporation | Aptamers containing sequences of nucleic acid or nucleic acid analogues bound homologously, or in novel complexes |
| US6656692B2 (en) | 1999-12-21 | 2003-12-02 | Ingeneus Corporation | Parallel or antiparallel, homologous or complementary binding of nucleic acids or analogues thereof to form duplex, triplex or quadruplex complexes |
| US6403313B1 (en) * | 1999-12-21 | 2002-06-11 | Ingeneus Corporation | Fluorescent intensity assay for duplex and triplex nucleic acid hybridization solution utilizing fluorescent intercalators |
| US6900300B1 (en) | 2000-09-19 | 2005-05-31 | Ingeneus Corporation | Quadruplex DNA and duplex probe systems |
| US6420115B1 (en) | 1999-12-21 | 2002-07-16 | Ingeneus Corporation | Cation mediated triplex hybridization assay |
| US6432642B1 (en) | 1999-01-15 | 2002-08-13 | Pe Corporation (Ny) | Binary probe and clamp composition and methods for a target hybridization detection |
| SE9902565D0 (sv) * | 1999-07-05 | 1999-07-05 | Jonas Karlsson | Probe for analysis of nucleic acids |
| US6472153B1 (en) * | 1999-10-26 | 2002-10-29 | Epoch Biosciences, Inc. | Hybridization-triggered fluorescent detection of nucleic acids |
| US6911536B1 (en) | 1999-12-21 | 2005-06-28 | Ingeneus Corporation | Triplex and quadruplex catalytic hybridization |
| US7309569B2 (en) | 1999-12-21 | 2007-12-18 | Ingeneus, Inc. | Parallel or antiparallel, homologous or complementary binding of nucleic acids or analogues thereof to form duplex, triplex or quadruplex complexes |
| US6924108B2 (en) | 1999-12-21 | 2005-08-02 | Ingeneus Corporation | Nucleic acid binding enhancement by conjugation with nucleotides, nucleosides, bases and/or their analogues |
| US7052844B2 (en) | 1999-12-21 | 2006-05-30 | Ingeneus, Inc. | Purification of DS-DNA using heteropolymeric capture probes and a triplex, quadruplex or homologous duplex binding mechanism |
| US6927027B2 (en) | 1999-12-21 | 2005-08-09 | Ingeneus Corporation | Nucleic acid multiplex formation |
| US6982147B2 (en) | 2000-01-24 | 2006-01-03 | Ingeneus Corporation | Apparatus for assaying biopolymer binding by means of multiple measurements under varied conditions |
| US6613524B1 (en) | 2000-01-24 | 2003-09-02 | Ingeneus Corporation | Amperometric affinity assay and electrically stimulated complexes of nucleic acids |
| US7220541B2 (en) | 2000-01-24 | 2007-05-22 | Ingeneus, Inc. | Homogeneous assay of biopolymer binding by means of multiple measurements under varied conditions |
| US7998673B2 (en) | 2000-03-29 | 2011-08-16 | Lgc Limited | Hybridisation beacon and method of rapid sequence detection and discrimination |
| EP1715063B1 (en) * | 2000-03-29 | 2011-01-26 | LGC Limited | Hybridisation beacon and method of rapid sequence detection and discrimination |
| US7019129B1 (en) | 2000-05-09 | 2006-03-28 | Biosearch Technologies, Inc. | Dark quenchers for donor-acceptor energy transfer |
| US6887664B2 (en) | 2000-06-06 | 2005-05-03 | Applera Corporation | Asynchronous primed PCR |
| SE519172C2 (sv) * | 2000-06-07 | 2003-01-21 | Lightup Technologies Ab | Fastfas syntes av cyaninfärgämnen |
| WO2002027036A2 (en) | 2000-09-26 | 2002-04-04 | Boston Probes, Inc. | Probes, probe sets, methods and kits pertaining to the detection, identification and/or enumeration of bacteria |
| ATE346950T1 (de) | 2001-03-09 | 2006-12-15 | Boston Probes Inc | Kombinationsoligomere betreffende verfahren, kits und zusammensetzungen |
| EP1412724B1 (en) | 2001-07-25 | 2016-03-23 | Life Technologies Corporation | Time-delay integration in electrophoretic detection systems |
| US20030087309A1 (en) * | 2001-08-27 | 2003-05-08 | Shiping Chen | Desktop drug screening system |
| WO2003042697A1 (en) * | 2001-11-14 | 2003-05-22 | Genospectra, Inc. | Biochemical analysis system with combinatorial chemistry applications |
| AU2002362013B2 (en) | 2001-11-21 | 2008-04-24 | Applied Biosystems, Llc. | Digital assay |
| CA2490961A1 (en) * | 2002-07-01 | 2004-01-08 | Guava Technologies, Inc. | Fluorescent dyes, energy transfer couples and methods |
| WO2004022578A2 (en) | 2002-09-08 | 2004-03-18 | Applera Corporation | Methods, compositions and libraries pertaining pna dimer and pna oligomer synthesis |
| US7927840B2 (en) | 2006-09-11 | 2011-04-19 | Gen Probe Incorporated | Method for detecting West Nile Virus nucleic acids in the 3′ non-coding region |
| EP3241915B1 (en) * | 2002-10-16 | 2021-06-23 | Gen-Probe Incorporated | Compositions and methods for detecting west nile virus |
| US20040229253A1 (en) * | 2003-02-18 | 2004-11-18 | Hyldig-Nielsen Jens J. | Compositions and methods for multiplex analysis of polynucleotides |
| WO2004079349A1 (en) | 2003-03-07 | 2004-09-16 | Luxcel Biosciences Limited | An oxygen sensitive probe |
| US8372648B2 (en) | 2003-04-16 | 2013-02-12 | APDN (B.V.I.), Inc. | Optical reporter compositions |
| US8415164B2 (en) | 2003-04-16 | 2013-04-09 | Apdn (B.V.I.) Inc. | System and method for secure document printing and detection |
| US8124333B2 (en) | 2003-04-16 | 2012-02-28 | APDN, Inc. | Methods for covalent linking of optical reporters |
| US8415165B2 (en) | 2003-04-16 | 2013-04-09 | APDN (B.V.I.), Inc. | System and method for authenticating sports identification goods |
| US8420400B2 (en) | 2003-04-16 | 2013-04-16 | APDN (B.V.I.), Inc. | System and method for authenticating tablets |
| US8426216B2 (en) | 2003-04-16 | 2013-04-23 | APDN (B.V.I.), Inc. | Methods for authenticating articles with optical reporters |
| DK1538154T3 (da) | 2003-11-20 | 2009-03-02 | Exiqon As | Quencher-sammensætninger, der indeholder anthraquinon-enheder |
| US7776529B2 (en) | 2003-12-05 | 2010-08-17 | Life Technologies Corporation | Methine-substituted cyanine dye compounds |
| EP2607431B1 (en) * | 2003-12-05 | 2016-08-24 | Life Technologies Corporation | Cyanine dye compounds |
| WO2006001835A2 (en) | 2003-12-30 | 2006-01-05 | The Regents Of The University Of California | Aromatic triamide-lanthanide complexes |
| US7705150B2 (en) | 2004-02-04 | 2010-04-27 | Biosearch Technologies, Inc. | Cyanine dyes |
| WO2005080596A1 (en) * | 2004-02-19 | 2005-09-01 | University College Cork - National University Of Ireland, Cork | Detection of biologically active compounds |
| US7888010B2 (en) | 2004-05-28 | 2011-02-15 | Asuragen, Inc. | Methods and compositions involving microRNA |
| US7910753B2 (en) * | 2004-09-10 | 2011-03-22 | Anaspec Incorporated | Cyanine dyes and their applications as luminescence quenching compounds |
| EP2808389A1 (en) | 2004-11-12 | 2014-12-03 | Asuragen, Inc. | Methods and compositions involving MIRNA and MIRNA inhibitor molecules |
| DE102004063339A1 (de) * | 2004-12-23 | 2006-07-06 | Bayer Technology Services Gmbh | Sonde zum Nachweis von Nukleinsäuren |
| EP1836319B1 (en) | 2005-01-06 | 2012-09-19 | Life Technologies Corporation | Polypeptides having nucleic acid binding activity and methods for nucleic acid amplification |
| WO2006095941A1 (en) | 2005-03-05 | 2006-09-14 | Seegene, Inc. | Processes using dual specificity oligonucleotide and dual specificity oligonucleotide |
| WO2006095981A1 (en) | 2005-03-05 | 2006-09-14 | Seegene, Inc. | Processes using dual specificity oligonucleotide and dual specificity oligonucleotide |
| WO2006124816A1 (en) | 2005-05-11 | 2006-11-23 | Molecular Probes, Inc. | Fluorescent chemical compounds having high selectivity for double stranded dna, and methods for their use |
| EP2236616B1 (en) | 2005-06-02 | 2013-12-18 | AdvanDx, Inc. | Peptide nucleic acid probes for analysis of microorganisms |
| US20070059713A1 (en) | 2005-09-09 | 2007-03-15 | Lee Jun E | SSB-DNA polymerase fusion proteins |
| US9677123B2 (en) | 2006-03-15 | 2017-06-13 | Siemens Healthcare Diagnostics Inc. | Degenerate nucleobase analogs |
| RU2394915C2 (ru) * | 2006-03-24 | 2010-07-20 | Александр Борисович Четверин | Бесконтактные способы обнаружения молекулярных колоний, наборы реагентов и устройство для их осуществления |
| US10741034B2 (en) | 2006-05-19 | 2020-08-11 | Apdn (B.V.I.) Inc. | Security system and method of marking an inventory item and/or person in the vicinity |
| US9790538B2 (en) | 2013-03-07 | 2017-10-17 | Apdn (B.V.I.) Inc. | Alkaline activation for immobilization of DNA taggants |
| US20140106357A1 (en) | 2012-10-16 | 2014-04-17 | Applied Dna Sciences, Inc. | Security system and method of marking an inventory item and/or person in the vicinity |
| EP2636755A1 (en) | 2006-05-26 | 2013-09-11 | AltheaDx Incorporated | Biochemical analysis of partitioned cells |
| CA2659251C (en) | 2006-07-10 | 2016-06-14 | The Regents Of The University Of California | Luminescent 1-hydroxy-2-pyridinone chelates of lanthanides |
| DK2423201T3 (en) | 2006-08-15 | 2018-01-15 | Univ California | Luminescent macrocyclic lanthanide complexes |
| WO2008092120A1 (en) | 2007-01-25 | 2008-07-31 | Lumiphore, Inc. | Multi-color time resolved fluorophores based on macrocyclic lanthanide complexes |
| US20080274458A1 (en) * | 2007-05-01 | 2008-11-06 | Latham Gary J | Nucleic acid quantitation methods |
| EP2198050A1 (en) | 2007-09-14 | 2010-06-23 | Asuragen, INC. | Micrornas differentially expressed in cervical cancer and uses thereof |
| EP2201009B1 (en) * | 2007-10-02 | 2016-10-26 | Thermo Fisher Scientific Inc. | Monomethine dyes |
| US20090131279A1 (en) * | 2007-11-15 | 2009-05-21 | Sigma Aldrich Company | Nucleic acid fluorescent stains |
| US20100041045A1 (en) * | 2007-11-15 | 2010-02-18 | Sigma-Aldrich Co. | Nucleic acid fluorescent stains |
| WO2009070805A2 (en) * | 2007-12-01 | 2009-06-04 | Asuragen, Inc. | Mir-124 regulated genes and pathways as targets for therapeutic intervention |
| PT2757091T (pt) | 2008-04-01 | 2017-07-24 | Biosearch Tech Inc | Sondas de fluoróforo e supressor de fluorescência de ácido nucleico estabilizadas |
| EP2990487A1 (en) | 2008-05-08 | 2016-03-02 | Asuragen, INC. | Compositions and methods related to mirna modulation of neovascularization or angiogenesis |
| US8669079B2 (en) | 2008-11-12 | 2014-03-11 | Cara Therapeutics, Inc. | Methods for genetic analysis of textiles made of Gossypium barbadense and Gossypium hirsutum cotton |
| US8940485B2 (en) | 2008-11-12 | 2015-01-27 | Apdn (B.V.I.) Inc. | Methods for genotyping mature cotton fibers and textiles |
| US7943320B2 (en) * | 2008-12-30 | 2011-05-17 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | Unsymmetrical cyanine dyes for high resolution nucleic acid melting analysis |
| EP2256215A1 (en) | 2009-04-30 | 2010-12-01 | Steffen Mergemeier | Assay system using a nuclease activity of a nucleic acid polymerase |
| EP3150619B1 (en) | 2009-05-21 | 2019-09-18 | Siemens Healthcare Diagnostics Inc. | Universal tags with non-natural nucleobases |
| EP2432895A2 (en) | 2009-05-22 | 2012-03-28 | Asuragen, INC. | Mirna biomarkers of prostate disease |
| US9273059B2 (en) | 2009-08-24 | 2016-03-01 | Lumiphore, Inc. | Macrocyclic HOPO chelators |
| CN102725632A (zh) | 2009-08-28 | 2012-10-10 | 奥斯瑞根公司 | 肺病的miRNA生物标志物 |
| WO2011027966A2 (en) | 2009-09-03 | 2011-03-10 | Seegene, Inc. | Td probe and its uses |
| WO2012058633A1 (en) | 2010-10-29 | 2012-05-03 | Latham Gary J | mPCR METHODS FOR ANALYZING REPEAT SEQUENCES |
| CN103459598B (zh) | 2011-02-03 | 2016-08-10 | 米尔纳医疗股份有限公司 | Mir-124的合成模拟物 |
| US9771617B2 (en) | 2011-06-27 | 2017-09-26 | Eisai R&D Management Co., Ltd. | Microrna biomarkers indicative of alzheimer's disease |
| KR102012690B1 (ko) * | 2011-07-12 | 2019-08-21 | 주식회사 파나진 | 평행 결합 구조의 이중 혼성화 ｐｎａ 프로브 시스템 |
| US9644241B2 (en) | 2011-09-13 | 2017-05-09 | Interpace Diagnostics, Llc | Methods and compositions involving miR-135B for distinguishing pancreatic cancer from benign pancreatic disease |
| CN102408741B (zh) * | 2011-09-15 | 2014-04-23 | 中山大学 | 一种染料及其制备方法与在检测特殊dna二级结构中的应用 |
| CA2854939A1 (en) * | 2011-11-14 | 2013-05-23 | Carnegie Mellon University | Gamma-pna miniprobes for fluorescent labeling |
| WO2013112458A1 (en) | 2012-01-24 | 2013-08-01 | Beth Israel Deaconess Medical Center, Inc. | Novel chrebp isoforms and methods using the same |
| WO2013173844A1 (en) | 2012-05-18 | 2013-11-21 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Heteroarylcyanine dyes |
| US9297032B2 (en) | 2012-10-10 | 2016-03-29 | Apdn (B.V.I.) Inc. | Use of perturbants to facilitate incorporation and recovery of taggants from polymerized coatings |
| US9266370B2 (en) | 2012-10-10 | 2016-02-23 | Apdn (B.V.I) Inc. | DNA marking of previously undistinguished items for traceability |
| EP2929050A1 (en) | 2012-12-10 | 2015-10-14 | AdvanDx, Inc. | Use of probes for mass spectrometric identification of microorganisms or cells and associated conditions of interest |
| US9963740B2 (en) | 2013-03-07 | 2018-05-08 | APDN (B.V.I.), Inc. | Method and device for marking articles |
| US11453652B2 (en) | 2013-03-15 | 2022-09-27 | Lumiphore, Inc. | Di-macrocycles |
| EP2999796B1 (en) | 2013-05-20 | 2017-10-25 | BioVentures, LLC | Gep5 model for multiple myeloma |
| CA2926436A1 (en) | 2013-10-07 | 2015-04-16 | Judith Murrah | Multimode image and spectral reader |
| JP6706208B2 (ja) | 2014-01-05 | 2020-06-03 | バイオマーナ ホールディングス リミテッド | Ｍｉｒｎａ比率を使用する肺がん決定 |
| US10619210B2 (en) | 2014-02-07 | 2020-04-14 | The Johns Hopkins University | Predicting response to epigenetic drug therapy |
| US10745825B2 (en) | 2014-03-18 | 2020-08-18 | Apdn (B.V.I.) Inc. | Encrypted optical markers for security applications |
| JP2017512692A (ja) | 2014-03-18 | 2017-05-25 | エーピーディーエヌ（ビー・ヴイ・アイ）・インコーポレイテッド | セキュリティ用途のための暗号化された光学マーカー |
| US10301310B2 (en) | 2014-05-09 | 2019-05-28 | Biosearch Technologies, Inc. | Cosmic quenchers |
| US10174363B2 (en) | 2015-05-20 | 2019-01-08 | Quantum-Si Incorporated | Methods for nucleic acid sequencing |
| CN107109474B (zh) | 2014-08-19 | 2021-03-19 | 豪夫迈·罗氏有限公司 | 用于核酸检测的方法和组合物 |
| WO2016094330A2 (en) | 2014-12-08 | 2016-06-16 | 20/20 Genesystems, Inc | Methods and machine learning systems for predicting the liklihood or risk of having cancer |
| WO2016092045A1 (en) | 2014-12-11 | 2016-06-16 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Methods and kits for predicting medically refractory acute severe colitis |
| US10760182B2 (en) | 2014-12-16 | 2020-09-01 | Apdn (B.V.I.) Inc. | Method and device for marking fibrous materials |
| EP3283499B1 (en) | 2015-04-15 | 2022-07-06 | Biosearch Technologies, Inc. | Dual quencher probes |
| US11091799B2 (en) | 2015-04-24 | 2021-08-17 | Atila Biosystems Incorporated | Amplification with primers of limited nucleotide composition |
| WO2016177774A1 (en) | 2015-05-04 | 2016-11-10 | Academisch Medisch Centrum | Method of quantifying mirnas using normalization |
| CN108027325A (zh) * | 2015-05-20 | 2018-05-11 | 宽腾矽公司 | 采用时间分辨发光确定核酸序列的方法 |
| US11214829B2 (en) | 2015-07-23 | 2022-01-04 | Asuragen, Inc. | Methods, compositions, kits, and uses for analysis of nucleic acids comprising repeating A/T-rich segments |
| CN109070130B (zh) | 2016-04-11 | 2022-03-22 | 亚普蒂恩（B V I）公司 | 用于标记纤维素产品的方法 |
| WO2018023094A1 (en) | 2016-07-29 | 2018-02-01 | Juno Therapeutics, Inc. | Methods for assessing the presence or absence of replication competent virus |
| WO2018045162A1 (en) | 2016-09-01 | 2018-03-08 | Biogen Ma Inc. | Biomarkers predictive of primary progressive multiple sclerosis and uses thereof |
| US10995371B2 (en) | 2016-10-13 | 2021-05-04 | Apdn (B.V.I.) Inc. | Composition and method of DNA marking elastomeric material |
| WO2018156352A1 (en) | 2017-02-21 | 2018-08-30 | Apdn (B.V.I) Inc. | Nucleic acid coated submicron particles for authentication |
| CA3067602A1 (en) | 2017-06-29 | 2019-01-03 | Juno Therapeutics, Inc. | Mouse model for assessing toxicities associated with immunotherapies |
| US20230242654A1 (en) | 2017-07-29 | 2023-08-03 | Juno Therapeutics, Inc. | Reagents for expanding cells expressing recombinant receptors |
| US20210071258A1 (en) | 2017-09-01 | 2021-03-11 | Juno Therapeutics, Inc. | Gene expression and assessment of risk of developing toxicity following cell therapy |
| EP3704229B1 (en) | 2017-11-01 | 2023-12-20 | Juno Therapeutics, Inc. | Process for producing a t cell composition |
| JP2021511802A (ja) | 2018-01-31 | 2021-05-13 | ジュノー セラピューティクス インコーポレイテッド | 複製可能ウイルスの存在または非存在を評価するための方法および試薬 |
| EP3877054B1 (en) | 2018-11-06 | 2023-11-01 | Juno Therapeutics, Inc. | Process for producing genetically engineered t cells |
| EP3719144A1 (en) | 2019-04-05 | 2020-10-07 | Fundación para la Investigación Biomédica del Hospital Universitario de la Paz (FIBHULP) | Mir-151a-3p as an universal endogenous control for exosome cargo normalization |
| WO2020214867A1 (en) | 2019-04-17 | 2020-10-22 | Alpine Immune Sciences, Inc. | Methods and uses of variant icos ligand (icosl) fusion proteins |
| KR20220034782A (ko) | 2019-06-12 | 2022-03-18 | 주노 쎄러퓨티크스 인코퍼레이티드 | 세포 매개 세포 독성 요법 및 친생존 ｂｃｌ2 패밀리 단백질 억제제의 병용 요법 |
| EP3999664A1 (en) | 2019-07-19 | 2022-05-25 | Fundación para la Investigación Biomédica del Hospital Universitario de la Paz (FIBHULP) | Method for determining the response to treatment of a patient affected by non-small cell lung carcinoma (nsclc) |
| US20220298222A1 (en) | 2019-08-22 | 2022-09-22 | Juno Therapeutics, Inc. | Combination therapy of a t cell therapy and an enhancer of zeste homolog 2 (ezh2) inhibitor and related methods |
| WO2021140173A1 (en) | 2020-01-10 | 2021-07-15 | Biouniversa S.R.L. | Methods and uses for treating fibrotic solid tumors with bags inhibitors |
| EP4090734B1 (en) | 2020-01-13 | 2024-11-06 | Aspen Neuroscience, Inc. | Method of differentiating neural cells and related compositions and methods of use |
| KR20230022868A (ko) | 2020-05-13 | 2023-02-16 | 주노 쎄러퓨티크스 인코퍼레이티드 | 재조합 수용체를 발현하는 공여자-배치 세포의 제조 방법 |
| US20240216508A1 (en) | 2020-06-26 | 2024-07-04 | Juno Therapeutics Gmbh | Engineered t cells conditionally expressing a recombinant receptor, related polynucleotides and methods |
| WO2022099658A1 (zh) * | 2020-11-13 | 2022-05-19 | 大连理工大学 | 菁类化合物、含菁类化合物的染料以及菁类化合物的应用 |
| WO2022099659A1 (zh) * | 2020-11-13 | 2022-05-19 | 大连理工大学 | 白细胞分类试剂、红细胞分析试剂、试剂盒以及分析方法 |
| US20240329032A1 (en) | 2021-07-21 | 2024-10-03 | Aspen Neuroscience, Inc. | Methods of differentiating neural cells and predicting engraftment thereof and related compositions |
| KR102783485B1 (ko) | 2021-10-15 | 2025-03-20 | 아주대학교산학협력단 | miR-625-3p의 건선 중증도 진단용 바이오마커로서의 용도 |
| KR20250007548A (ko) | 2022-04-15 | 2025-01-14 | 아스펜 뉴로사이언스 인코포레이티드 | 세포의 분화 상태를 분류하는 방법 및 관련 분화된 세포 조성물 |
| WO2023230581A1 (en) | 2022-05-25 | 2023-11-30 | Celgene Corporation | Methods of manufacturing t cell therapies |
| CN119707923B (zh) * | 2023-09-28 | 2025-10-17 | 中国科学院大连化学物理研究所 | 一种衍生化试剂及其在鉴定氨基代谢物方法中的应用 |
| WO2025141105A1 (en) | 2023-12-27 | 2025-07-03 | bioMérieux | Specific probes for the detection of nucleic acids, methods and uses |
| WO2025245399A1 (en) | 2024-05-23 | 2025-11-27 | Indapta Therapeutics, Inc. | Method of treating cancer with natural killer cells |
Family Cites Families (22)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JPS5570834A (en) * | 1978-11-21 | 1980-05-28 | Oriental Shashin Kogyo Kk | Silver halide photographic emulsion for helium-neon laser light exposure |
| SU1114028A1 (ru) * | 1983-03-11 | 1995-02-09 | Всесоюзный Государственный Научно-Исследовательский И Проектный Институт Химико-Фотографической Промышленности | Производные бензимидатиазолинокарбоцианинов в качестве спектральных сенсибилизаторов галогенсеребряных фотографических эмульсий к зоне спектра от 460 до 550 нм с максимумом сенсибилизации 510 - 520 нм. |
| US4883867A (en) | 1985-11-01 | 1989-11-28 | Becton, Dickinson And Company | Detection of reticulocytes, RNA or DNA |
| US5569587A (en) * | 1986-04-18 | 1996-10-29 | Carnegie Mellon University | Method for labeling and detecting materials employing luminescent arysulfonate cyanine dyes |
| US5627027A (en) * | 1986-04-18 | 1997-05-06 | Carnegie Mellon University | Cyanine dyes as labeling reagents for detection of biological and other materials by luminescence methods |
| US5268486A (en) * | 1986-04-18 | 1993-12-07 | Carnegie-Mellon Unversity | Method for labeling and detecting materials employing arylsulfonate cyanine dyes |
| US4937198A (en) * | 1989-07-28 | 1990-06-26 | Becton, Dickinson And Company | Novel fluorescent dye |
| DE69132765T2 (de) * | 1990-12-24 | 2002-02-21 | Enzo Diagnostics, Inc. | Verfahren zum Nachweis eines Zielpolynukleotids in einer Probe unter Verwendung eines Reagenz, das den Hintergrund verringert, und eine dieses Reagenz enthaltende Zusammensetzung und Kit. |
| DK51092D0 (da) * | 1991-05-24 | 1992-04-15 | Ole Buchardt | Oligonucleotid-analoge betegnet pna, monomere synthoner og fremgangsmaade til fremstilling deraf samt anvendelser deraf |
| US5321130A (en) | 1992-02-10 | 1994-06-14 | Molecular Probes, Inc. | Unsymmetrical cyanine dyes with a cationic side chain |
| JPH05287209A (ja) * | 1992-04-09 | 1993-11-02 | Hitachi Chem Co Ltd | 蛍光標識用色素、蛍光標識用色素で標識された生物由来物質、及びそれらを含有する試薬 |
| US5410030A (en) * | 1993-04-05 | 1995-04-25 | Molecular Probes, Inc. | Dimers of unsymmetrical cyanine dyes containing pyridinium moieties |
| US5534416A (en) | 1993-04-13 | 1996-07-09 | Molecular Probes, Inc. | Fluorescent viability assay using cyclic-substituted unsymmetrical cyanine dyes |
| US5658751A (en) * | 1993-04-13 | 1997-08-19 | Molecular Probes, Inc. | Substituted unsymmetrical cyanine dyes with selected permeability |
| US5436134A (en) | 1993-04-13 | 1995-07-25 | Molecular Probes, Inc. | Cyclic-substituted unsymmetrical cyanine dyes |
| US5563070A (en) * | 1993-05-28 | 1996-10-08 | Omron Corporation | Method of counting reticulocytes |
| DE69435240D1 (de) * | 1993-06-30 | 2009-10-29 | Abbott Lab | Interkalatoren mit DNA-Affinität und Anwendungsverfahren |
| EP0684316B1 (en) * | 1994-04-29 | 2004-10-20 | Johnson & Johnson Clinical Diagnostics, Inc. | Homogeneous method for assay of double-stranded nucleic acids using fluorescent dyes and kit useful therein |
| US5453505A (en) * | 1994-06-30 | 1995-09-26 | Biometric Imaging, Inc. | N-heteroaromatic ion and iminium ion substituted cyanine dyes for use as fluorescence labels |
| US5597696A (en) * | 1994-07-18 | 1997-01-28 | Becton Dickinson And Company | Covalent cyanine dye oligonucleotide conjugates |
| ATE222589T1 (de) * | 1994-10-06 | 2002-09-15 | Isis Pharmaceuticals Inc | Peptid-nukleinsäure-konjugate |
| JP3189000B2 (ja) * | 1994-12-01 | 2001-07-16 | 東ソー株式会社 | 特定核酸配列の検出方法 |
-
1996
- 1996-05-31 SE SE9602183A patent/SE506700C2/sv unknown
-
1997
- 1997-05-30 BR BR9709495A patent/BR9709495A/pt not_active Application Discontinuation
- 1997-05-30 CA CA002256545A patent/CA2256545C/en not_active Expired - Fee Related
- 1997-05-30 NZ NZ333473A patent/NZ333473A/en unknown
- 1997-05-30 RU RU98123553/04A patent/RU2223966C2/ru not_active IP Right Cessation
- 1997-05-30 CN CNB971968721A patent/CN100398648C/zh not_active Expired - Fee Related
- 1997-05-30 PL PL97366875A patent/PL188875B1/pl not_active IP Right Cessation
- 1997-05-30 JP JP09542246A patent/JP2000511057A/ja active Pending
- 1997-05-30 EP EP97926344A patent/EP0918852A1/en not_active Withdrawn
- 1997-05-30 AU AU31129/97A patent/AU3112997A/en not_active Abandoned
- 1997-05-30 EP EP03011589A patent/EP1357185A1/en not_active Withdrawn
- 1997-05-30 WO PCT/SE1997/000953 patent/WO1997045539A1/en not_active Ceased
- 1997-05-30 US US09/194,679 patent/US6329144B1/en not_active Expired - Fee Related
-
2004
- 2004-07-12 JP JP2004204075A patent/JP2005047901A/ja not_active Withdrawn
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU98123553A (ru) | Зонд для анализа нуклеиновых кислот | |
| US6117973A (en) | PNA monomers with electron donor or acceptor | |
| JP4035589B2 (ja) | 修飾バックボーンを有するアンチセンスプローブと核酸の液中ハイブリッド形成 | |
| US6110676A (en) | Methods for suppressing the binding of detectable probes to non-target sequences in hybridization assays | |
| EP1025120B1 (en) | Methods, kits and compositions pertaining to pna molecular beacons | |
| US7816501B2 (en) | Compositions comprising a linked acceptor moiety | |
| DE69220946T2 (de) | Verwendung von nukleinsäureanaloga in diagnostischen und analytischen verfahren | |
| US6329144B1 (en) | Probe for analysis of target nucleic acids | |
| US6743905B2 (en) | Mobility-modified nucleobase polymers and methods of using same | |
| Davies et al. | Synthesis of fluorescently labelled oligonucleotides and nucleic acids | |
| US20030064402A1 (en) | Multipartite high-affinity nucleic acid probes | |
| US20060014191A1 (en) | Analog probe complexes | |
| KR960705834A (ko) | Pna-dna-pna 잡종 거대분자들 | |
| HU221237B1 (en) | Solution phase nucleic acid sandwich assays having reduced background noise | |
| JP3495752B2 (ja) | 生標的個体の検出方法およびプローブ | |
| JP4908714B2 (ja) | ポリアミド核酸誘導体および薬剤、ならびにその調製方法 | |
| Wojciechowski et al. | Nucleobase modifications in peptide nucleic acids | |
| JP2001515923A (ja) | 核酸混成のためのプローブ調整方法 | |
| EP0968309B1 (en) | Method for determining a nucleic acid | |
| JP2002507434A (ja) | 検出複合体に関する方法、キットおよび組成物 | |
| US6962778B1 (en) | Methods, kits and compositions for suppressing the binding of detectable probes to non-target sequences in hybridization assays | |
| JP2001269197A (ja) | 固定化オリゴヌクレオチドプローブ | |
| JP3379774B2 (ja) | 塩基配列決定方法 | |
| EP0815259B1 (en) | Modulation of the binding properties of nucleic acid binding partners | |
| AU768137B2 (en) | Probe for analysis of nucleic acids |