[go: up one dir, main page]

RU2838210C2 - Variant of corynebacterium glutamicum, having improved ability to produce l-lysine, and method of producing l-lysine using same - Google Patents

Variant of corynebacterium glutamicum, having improved ability to produce l-lysine, and method of producing l-lysine using same Download PDF

Info

Publication number
RU2838210C2
RU2838210C2 RU2023129139A RU2023129139A RU2838210C2 RU 2838210 C2 RU2838210 C2 RU 2838210C2 RU 2023129139 A RU2023129139 A RU 2023129139A RU 2023129139 A RU2023129139 A RU 2023129139A RU 2838210 C2 RU2838210 C2 RU 2838210C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
lysine
variant
corynebacterium glutamicum
strain
promoter
Prior art date
Application number
RU2023129139A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU2023129139A (en
Inventor
Ён Чжу ЛИ
Сун Хи ЛИ
Хан Джин ЛИ
Сок Хён ПАК
Чжун Хён ПАК
Original Assignee
СиДжей ЧеилДжеданг Корпорейшн
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by СиДжей ЧеилДжеданг Корпорейшн filed Critical СиДжей ЧеилДжеданг Корпорейшн
Publication of RU2023129139A publication Critical patent/RU2023129139A/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2838210C2 publication Critical patent/RU2838210C2/en

Links

Abstract

FIELD: biotechnology.
SUBSTANCE: disclosed is a promoter containing a nucleotide sequence presented by SEQ ID NO: 4. Also disclosed is a microorganism Corynebacterium glutamicum, which produces L-lysine and contains a nucleotide sequence presented by SEQ ID NO: 4, and a method of producing L-lysine using said microorganism.
EFFECT: invention provides improved output of L-lysine production as compared to the parent strain.
3 cl, 3 dwg, 3 tbl, 4 ex

Description

ОБЛАСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯFIELD OF INVENTION

Настоящее раскрытие относится к варианту Corynebacterium glutamicum с улучшенной способностью к продуцированию L-лизина и к способу продуцирования L-лизина с его применением.The present disclosure relates to a variant of Corynebacterium glutamicum with improved ability to produce L-lysine and to a method for producing L-lysine using the same.

ПРЕДШЕСТВУЮЩИЙ УРОВЕНЬ ТЕХНИКИPRIOR ART

L-лизин представляет собой незаменимую аминокислоту, которая не синтезируется в человеческом или животном организме и должна поставляться извне, и он обычно продуцируется посредством ферментации с использованием микроорганизмов, таких как бактерии или дрожжи. При продукции L-лизина можно использовать полученные в природе штаммы дикого типа или варианты, модифицированные для наличия у них повышенной способности к продуцированию L-лизина. Недавно для того, чтобы улучшить эффективность продукции L-лизина разработали разные рекомбинантные штаммы или варианты с превосходной способностью к продуцированию L-лизина и способы продуцирования L-лизина с их использованием посредством применения технологии генной инженерии к таким микроорганизмам, как Escherichia coli и Corynebacterium, и т.д., которые широко используются при продукции L-аминокислот и других полезных веществ.L-lysine is an essential amino acid that is not synthesized in the human or animal body and must be supplied from outside, and it is usually produced by fermentation using microorganisms such as bacteria or yeast. In the production of L-lysine, naturally occurring wild-type strains or variants modified to have an enhanced ability to produce L-lysine can be used. Recently, in order to improve the efficiency of L-lysine production, various recombinant strains or variants with excellent ability to produce L-lysine and methods for producing L-lysine using them have been developed by applying genetic engineering technology to microorganisms such as Escherichia coli and Corynebacterium, etc., which are widely used in the production of L-amino acids and other beneficial substances.

Согласно корейским патентам №10-0838038 и 10-2139806 нуклеотидные последовательности генов, кодирующих белки, включающие ферменты, связанные с продукцией L-лизина, или их аминокислотные последовательности, модифицируют для увеличения экспрессии генов или для удаления не являющихся необходимыми генов и, посредством этого, улучшают способность к продуцированию L-лизина. Кроме того, в публикации корейского патента №10-2020-0026881 раскрыт способ замены существующего промотора гена промотором с сильной активностью для того, чтобы увеличить экспрессию гена, кодирующего фермент, участвующий в продукции L-лизина.According to Korean Patent Nos. 10-0838038 and 10-2139806, nucleotide sequences of genes encoding proteins including enzymes related to L-lysine production or amino acid sequences thereof are modified to increase gene expression or to remove unnecessary genes, and thereby improve the ability to produce L-lysine. In addition, Korean Patent Publication No. 10-2020-0026881 discloses a method for replacing an existing gene promoter with a promoter having strong activity in order to increase the expression of a gene encoding an enzyme involved in L-lysine production.

Как было описано, разрабатывают целый ряд способов для увеличения способности к продуцированию L-лизина. Тем не менее, поскольку существуют десятки типов белков, таких как ферменты, транскрипционные факторы, транспортные белки и т.д., которые прямо или опосредованно участвуют в продукции L-лизина, необходимо проводить много исследований по тому, увеличивается ли или нет способность к продуцированию L-лизина согласно изменениям активностей данных белков.As described, a variety of methods are being developed to increase the ability to produce L-lysine. However, since there are dozens of types of proteins such as enzymes, transcription factors, transport proteins, etc. that are directly or indirectly involved in the production of L-lysine, much research needs to be done on whether or not the ability to produce L-lysine is increased according to changes in the activities of these proteins.

Документы предшествующего уровня техникиPrior Art Documents

Патентные документыPatent documents

Корейский патент №10-0838038Korean Patent No. 10-0838038

Корейский патент №10-2139806Korean Patent No. 10-2139806

Публикация корейского патента №10-2020-0026881Korean Patent Publication No.10-2020-0026881

ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯDESCRIPTION OF THE INVENTION

Техническая проблемаTechnical problem

Целью настоящего раскрытия является предложение варианта Corynebacterium glutamicum с улучшенной способностью к продуцированию L-лизина.The purpose of the present disclosure is to provide a variant of Corynebacterium glutamicum with improved L-lysine producing ability.

Кроме того, другой целью настоящего раскрытия является предложение способа продуцирования L-лизина с использованием данного варианта.Furthermore, another object of the present disclosure is to provide a method for producing L-lysine using this variant.

Техническое решениеTechnical solution

Авторы настоящего изобретения исследовали разработку нового варианта с улучшенной способностью к продуцированию L-лизина с использованием штамма Corynebacterium glutamicum и, в результате, они обнаружили то, что продукция L-лизина увеличивается посредством замены нуклеотидной последовательности в конкретном положении в промоторе гена aspB, кодирующего аспартатаминотрансферазу, который участвует в поставке аспартата - предшественника лизина - в биосинтетическом пути L-лизина, посредством этого осуществляя настоящее раскрытие.The present inventors investigated the development of a new variant with improved L-lysine producing ability using a Corynebacterium glutamicum strain and, as a result, they found that L-lysine production was increased by replacing the nucleotide sequence at a specific position in the promoter of the aspB gene encoding aspartate aminotransferase, which is involved in the supply of aspartate, a precursor of lysine, in the biosynthetic pathway of L-lysine, thereby completing the present disclosure.

Согласно одному аспекту настоящего раскрытия предложен вариант Corynebacterium glutamicum с улучшенной способностью к продуцированию L-лизина посредством усиления активности аспартатаминотрансферазы.According to one aspect of the present disclosure, there is provided a variant of Corynebacterium glutamicum with improved ability to produce L-lysine by enhancing aspartate aminotransferase activity.

Термин «аспартатаминотрансфераза» (аспартаттрансаминаза) в том виде, как он здесь используется, относится к ферменту, который катализирует реакцию превращения оксалоацетата до аспартата в пути биосинтеза L-лизина.The term aspartate aminotransferase (aspartate transaminase) as used here refers to the enzyme that catalyzes the reaction of converting oxaloacetate to aspartate in the L-lysine biosynthetic pathway.

Согласно конкретному воплощению настоящего раскрытия аспартатаминотрансфераза может происходить из штамма рода Corynebacterium. В частности, штамм рода Corynebacterium может представлять собой Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium crudilactis, Corynebacterium deserti, Corynebacterium callunae, Corynebacterium suranareeae, Corynebacterium lubricantis, Corynebacterium doosanense, Corynebacterium efficiens, Corynebacterium uterequi, Corynebacterium stationis, Corynebacterium pacaense, Corynebacterium singulare, Corynebacterium humireducens, Corynebacterium marinum, Corynebacterium halotolerans, Corynebacterium spheniscorum, Corynebacterium freiburgense, Corynebacterium striatum, Corynebacterium canis, Corynebacterium ammoniagenes, Corynebacterium renale, Corynebacterium pollutisoli, Corynebacterium imitans, Corynebacterium caspium, Corynebacterium testudinoris, Corynebacaterium pseudopelargi или Corynebacterium flavescens, но не ограничивается ими.According to a specific embodiment of the present disclosure, the aspartate aminotransferase may be derived from a strain of the genus Corynebacterium. In particular, the strain of the genus Corynebacterium may be Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium crudilactis, Corynebacterium deserti, Corynebacterium callunae, Corynebacterium suranareeae, Corynebacterium lubricantis, Corynebacterium doosanense, Corynebacterium efficiens, Corynebacterium uterequi, Corynebacterium stationis, Corynebacterium pacaense, Corynebacterium singulare, Corynebacterium humireducens, Corynebacterium marinum, Corynebacterium halotolerans, Corynebacterium spheniscorum, Corynebacterium freiburgense, Corynebacterium striatum, Corynebacterium canis, Corynebacterium ammoniagenes, Corynebacterium renale, Corynebacterium pollutisoli, Corynebacterium imitans, Corynebacterium caspium, Corynebacterium testudinoris, Corynebacaterium pseudopelargi, or Corynebacterium flavescens, but is not limited to them.

Термин «усиление активности» в том виде, как он здесь используется, означает то, что уровни экспрессии генов, кодирующих белки, такие как целевые ферменты, транскрипционные факторы, транспортные белки и т.д., увеличиваются посредством введения вновь или усиления данных генов по сравнению с генами штамма дикого типа или штамма перед модификацией. Такое усиление активности также включает случай, где активность самого белка увеличивается посредством замены, вставки или делеции нуклеотида кодирующего гена или их комбинации по сравнению с активностью белка, которым исходно обладал микроорганизм, и случай, где общая ферментативная активность в клетках выше, чем активность штамма дикого типа или штамма перед модификацией из-за повышенной экспрессии или повышенной трансляции кодирующих их генов и их комбинации.The term "enhancement of activity" as used herein means that the expression levels of genes encoding proteins such as target enzymes, transcription factors, transport proteins, etc., are increased by reintroduction or enhancement of these genes as compared to the genes of the wild-type strain or the strain before modification. Such enhancement of activity also includes the case where the activity of the protein itself is increased by substitution, insertion or deletion of a nucleotide of the encoding gene or a combination thereof as compared to the activity of the protein originally possessed by the microorganism, and the case where the total enzymatic activity in the cells is higher than the activity of the wild-type strain or the strain before modification due to increased expression or increased translation of the genes encoding them and a combination thereof.

Согласно конкретному воплощению настоящего раскрытия усиление активности аспартатаминотрансферазы может быть индуцировано сайт-специфичной мутацией в промоторе гена, кодирующего аспартатаминотрансферазу.According to a specific embodiment of the present disclosure, an increase in aspartate aminotransferase activity can be induced by a site-specific mutation in the promoter of the gene encoding aspartate aminotransferase.

Согласно конкретному воплощению настоящего раскрытия промотор гена, кодирующего аспартатаминотрансферазу, может быть представлен нуклеотидной последовательностью SEQ ID NO: 1.According to a specific embodiment of the present disclosure, the promoter of the gene encoding aspartate aminotransferase can be represented by the nucleotide sequence SEQ ID NO: 1.

Термин «промотор» в том виде, как он здесь используется, относится к специфической области ДНК, которая регулирует транскрипцию гена посредством включения сайта связывания РНК-полимеразы, которая инициирует транскрипцию мРНК интересующего гена и обычно находится выше сайта начала транскрипции. Промотор у прокариот определяется как область около сайта начала транскрипции, где связывается РНК-полимераза, и он обычно состоит из двух коротких нуклеотидных последовательностей в областях пар оснований -10 и -35 выше сайта начала транскрипции. В настоящем раскрытии мутация промотора заключается в том, что промотор улучшается для того, чтобы иметь более высокую активность по сравнению с промотором дикого типа и может увеличивать экспрессию генов, расположенных ниже, посредством индуцирования мутаций в промоторной области, расположенной выше сайта начала транскрипции.The term "promoter" as used herein refers to a specific region of DNA that regulates the transcription of a gene by including a binding site for RNA polymerase, which initiates the transcription of the mRNA of the gene of interest, and is typically located upstream of the transcription start site. A promoter in prokaryotes is defined as a region near the transcription start site where RNA polymerase binds, and it typically consists of two short nucleotide sequences in the -10 and -35 base pair regions upstream of the transcription start site. In the present disclosure, a promoter mutation is that the promoter is improved to have higher activity compared to a wild-type promoter and can increase the expression of downstream genes by inducing mutations in the promoter region upstream of the transcription start site.

Согласно конкретному воплощению настоящего раскрытия усиление активности аспартатаминотрансферазы может быть обусловлено заменой одного или более чем одного основания в областях от -100 до -10 выше от сайта начала транскрипции в последовательности промотора гена, кодирующего аспартатаминотрансферазу.According to a specific embodiment of the present disclosure, the enhancement of aspartate aminotransferase activity may be due to the substitution of one or more bases in the regions from -100 to -10 upstream of the transcription start site in the promoter sequence of the gene encoding aspartate aminotransferase.

Более конкретно, мутация промотора по настоящему раскрытию может представлять собой последовательную или непоследовательную замену одного или более чем одного основания в областях от -100 до -10, предпочтительно последовательную или непоследовательную замену одного, двух, трех, четырех или пяти оснований в областях от -95 до -15, областях от -95 до -55, областях от -55 до -40 или областях от -30 до -15.More specifically, the promoter mutation of the present disclosure may be a sequential or non-sequential substitution of one or more bases in the regions from -100 to -10, preferably a sequential or non-sequential substitution of one, two, three, four or five bases in the regions from -95 to -15, the regions from -95 to -55, the regions from -55 to -40 or the regions from -30 to -15.

Согласно одному типичному воплощению настоящего раскрытия С, который представляет собой нуклеотидную последовательность в области -22 промоторной последовательности гена aspB, кодирующего аспартатаминотрансферазу штамма Corynebacterium glutamicum, заменяется на G с получением варианта Corynebacterium glutamicum, имеющего новую промоторную последовательность гена aspB. Такой вариант Corynebacterium glutamicum может включать измененный промотор гена aspB, который представлен нуклеотидной последовательностью SEQ ID NO: 2.According to one typical embodiment of the present disclosure, C, which is a nucleotide sequence in the -22 region of the promoter sequence of the aspB gene encoding aspartate aminotransferase of the Corynebacterium glutamicum strain, is replaced by G to obtain a Corynebacterium glutamicum variant having a new promoter sequence of the aspB gene. Such a Corynebacterium glutamicum variant may include an altered promoter of the aspB gene, which is represented by the nucleotide sequence SEQ ID NO: 2.

Кроме того, согласно одному типичному воплощению настоящего раскрытия Т, который представляет собой нуклеотидную последовательность в области -45 промоторной последовательности гена aspB, кодирующего аспартатаминотрансферазу штамма Corynebacterium glutamicum, заменяется на А с получением варианта Corynebacterium glutamicum, имеющего новую промоторную последовательность гена aspB. Такой вариант Corynebacterium glutamicum может включать измененный промотор гена aspB, который представлен нуклеотидной последовательностью SEQ ID NO: 3.Furthermore, according to one typical embodiment of the present disclosure, T, which is a nucleotide sequence in the -45 region of the promoter sequence of the aspB gene encoding aspartate aminotransferase of the Corynebacterium glutamicum strain, is replaced by A to obtain a Corynebacterium glutamicum variant having a new promoter sequence of the aspB gene. Such a Corynebacterium glutamicum variant may include an altered promoter of the aspB gene, which is represented by the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3.

Согласно одному типичному воплощению настоящего раскрытия Т, который представляет собой нуклеотидную последовательность в области -88 промоторной последовательности гена aspB, кодирующего аспартатаминотрансферазу штамма Corynebacterium glutamicum, заменяется на А с получением варианта Corynebacterium glutamicum, имеющего новую промоторную последовательность гена aspB. Такой вариант Corynebacterium glutamicum может включать измененной промотор гена aspB, который представлен нуклеотидной последовательностью SEQ ID NO: 4.According to one typical embodiment of the present disclosure, T, which is a nucleotide sequence in the -88 region of the promoter sequence of the aspB gene encoding aspartate aminotransferase of the Corynebacterium glutamicum strain, is replaced by A to obtain a Corynebacterium glutamicum variant having a new promoter sequence of the aspB gene. Such a Corynebacterium glutamicum variant may include an altered promoter of the aspB gene, which is represented by the nucleotide sequence SEQ ID NO: 4.

Термин «улучшенная способность к продукции» в том виде, как он здесь используется, означает повышенную продуктивность в отношении L-лизина по сравнению с продуктивностью родительского штамма. Родительский штамм относится к штамму дикого типа или варианту штамма, который подвергся мутации, и он включает субъекта, который непосредственно мутирован или преобразован рекомбинантным вектором и т.д. В настоящем раскрытии родительский штамм может представлять собой штамм Corynebacterium glutamicum дикого типа или штамм, мутировавший из дикого типа.The term "improved production ability" as used herein means an increased productivity of L-lysine compared to the productivity of the parent strain. The parent strain refers to a wild-type strain or a variant of the strain that has undergone mutation, and includes a subject that is directly mutated or transformed by a recombinant vector, etc. In the present disclosure, the parent strain may be a wild-type Corynebacterium glutamicum strain or a strain mutated from the wild type.

Согласно конкретному воплощению настоящего раскрытия родительский штамм представляет собой вариант, в котором индуцируются мутации в последовательностях генов (например, генов lysC, zwf и hom), участвующих в продукции лизина, и он может представлять собой штамм Corynebacterium glutamicum (далее именуемый «штамм DS1 Corynebacterium glutamicum»), депонированный в Корейский центр культивирования микроорганизмов 2 апреля 2021 г. с номером доступа KCCM12969P.According to a specific embodiment of the present disclosure, the parent strain is a variant in which mutations are induced in gene sequences (e.g., lysC, zwf, and hom genes) involved in lysine production, and it may be a Corynebacterium glutamicum strain (hereinafter referred to as the “DS1 Corynebacterium glutamicum strain”) deposited with the Korea Microorganism Culture Center on April 2, 2021 under accession number KCCM12969P.

Вариант Corynebacterium glutamicum по настоящему раскрытию, имеющий улучшенную способность к продуцированию L-лизина, может включать мутировавшую промоторную последовательность гена, кодирующего аспартатаминотрансферазу.The Corynebacterium glutamicum variant of the present disclosure having improved ability to produce L-lysine may comprise a mutated promoter sequence of a gene encoding aspartate aminotransferase.

Согласно конкретному воплощению настоящего раскрытия данный вариант может включать любую из нуклеотидных последовательностей, представленных SEQ ID NO: 2-4, в качестве промоторной последовательности гена аспартатаминотрансферазы.According to a specific embodiment of the present disclosure, the variant may comprise any of the nucleotide sequences represented by SEQ ID NO: 2-4 as a promoter sequence of the aspartate aminotransferase gene.

Согласно одному типичному воплощению настоящего раскрытия данный вариант может включать мутацию промотора гена aspB, кодирующего аспартатаминотрансферазу, демонстрируя, посредством этого, повышенную способность к продуцированию L-лизина по сравнению с родительским штаммом, и, в частности, может демонстрировать 3%-ное или большее, в частности, от 3%-ного до 40%-ного и, более конкретно, от 5%-ного до 30%-ного увеличения продукции L-лизина по сравнению с родительским штаммом, продуцируя посредством этого от 65 г до 90 г L-лизина, предпочтительно от 70 г до 80 г L-лизина на 1 л культуры данного штамма.According to one typical embodiment of the present disclosure, this variant may comprise a mutation in the promoter of the aspB gene encoding aspartate aminotransferase, thereby exhibiting an increased ability to produce L-lysine compared to the parent strain, and in particular may exhibit a 3% or greater, in particular from 3% to 40% and more in particular from 5% to 30% increase in L-lysine production compared to the parent strain, thereby producing from 65 g to 90 g of L-lysine, preferably from 70 g to 80 g of L-lysine per 1 liter of culture of this strain.

Получение варианта Corynebacterium glutamicum по конкретному воплощению настоящего раскрытия может быть достигнуто посредством рекомбинантного вектора, включающего вариант, в котором заменена часть последовательности промотора гена, кодирующего аспартатаминотрансферазу у родительского штамма.The production of a variant of Corynebacterium glutamicum according to a specific embodiment of the present disclosure can be achieved by means of a recombinant vector comprising a variant in which a portion of the promoter sequence of the gene encoding aspartate aminotransferase in the parent strain has been replaced.

Термин «часть» в том виде, как он здесь используется, означает не всю нуклеотидную последовательность или последовательность полинуклеотида, и может содержать от 1 до 300, предпочтительно от 1 до 100 и более предпочтительно от 1 до 50 нуклеотидов, но не ограничиваясь ими.The term "portion" as used herein does not mean the entire nucleotide sequence or polynucleotide sequence, and may comprise, but is not limited to, 1 to 300, preferably 1 to 100, and more preferably 1 to 50 nucleotides.

Термин «вариант» в том виде, как он здесь используется, относится к варианту промотора, в котором заменено одно или более чем одно основание в областях от -100 до -10 в промоторной последовательности гена аспартатаминотрансферазы, участвующего в биосинтезе L-лизина.The term "variant" as used herein refers to a promoter variant in which one or more bases in the -100 to -10 regions of the promoter sequence of the aspartate aminotransferase gene involved in L-lysine biosynthesis are substituted.

Согласно конкретному воплощению настоящего раскрытия варианты, в каждом из которых нуклеотидная последовательность в областях -22, -45 или -88 в последовательности промотора гена аспартатаминотрансферазы заменена на G, А или А, могут иметь нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3 или SEQ ID NO: 4 соответственно.According to a specific embodiment of the present disclosure, variants in each of which the nucleotide sequence in the -22, -45 or -88 regions in the aspartate aminotransferase gene promoter sequence is replaced with G, A or A may have the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3 or SEQ ID NO: 4, respectively.

Термин «вектор» в том виде, как он здесь используется, представляет собой экспрессионный вектор, способный экспрессировать целевой белок в подходящей клетке-хозяине, и он относится к генетической конструкции, включающей существенные регуляторные элементы, которые связаны функциональным образом таким образом, что экспрессируется вставка гена. Здесь термин «связанный функциональным образом» означает то, что ген, требующий экспрессии, и его регуляторная последовательность функционально связаны друг с другом с индукцией экспрессии гена, и «регуляторные элементы» включают промотор для осуществления транскрипции, любую последовательность оператора для осуществления контроля транскрипции, последовательность, кодирующую подходящий сайт связывания рибосомы с мРНК, и последовательность, контролирующую терминацию транскрипции и трансляции. Такой вектор может включать плазмидный вектор, космидный вектор, бактериофаговый вектор, вирусный вектор и т.д., но не ограничивается ими.The term "vector" as used herein is an expression vector capable of expressing a target protein in a suitable host cell, and it refers to a genetic construct comprising essential regulatory elements that are operatively linked such that the inserted gene is expressed. Here, the term "operationally linked" means that the gene requiring expression and its regulatory sequence are operatively linked to each other to induce expression of the gene, and "regulatory elements" include a promoter for transcription, any operator sequence for transcription control, a sequence encoding a suitable ribosome binding site for mRNA, and a sequence controlling transcription and translation termination. Such a vector may include a plasmid vector, a cosmid vector, a bacteriophage vector, a viral vector, etc., but is not limited to them.

«Рекомбинантный вектор» в том виде, как здесь используется данный термин, трансформируют в подходящую клетку-хозяина, и затем он реплицируется независимо от генома данной клетки-хозяина или может быть интегрирован в сам геном. В данном отношении «подходящая клетка-хозяин», где данный вектор является реплицируемым, может включать репликатор, который представляет собой конкретную нуклеотидную последовательность, в которой инициируется репликация.A "recombinant vector," as the term is used herein, is transformed into a suitable host cell and then replicates independently of the host cell's genome or may be integrated into the genome itself. In this regard, a "suitable host cell" where the vector is replicable may include a replicator, which is a specific nucleotide sequence at which replication is initiated.

Для трансформации выбирают подходящую технологию введения вектора, в зависимости от клетки-хозяина для экспрессии целевого гена в данной клетке-хозяине. Например, введение вектора может осуществляться электропорацией, тепловым шоком, осаждением с фосфатом кальция (CaPO4), осаждением с хлоридом кальция (CaCl2), микроинъекцией, способом с полиэтиленгликолем (PEG), способом с DEAE-декстраном, способом с катионными липосомами, способом с ацетатом лития-DMSO (диметилсульфоксид) или их комбинациями. При условии, что трансформированный ген может экспрессироваться в клетке-хозяине, он может быть включен без ограничения, независимо от того, вставлен ли или не вставлен данный ген в хромосому клетки-хозяина или локализуется вне хромосомы.For transformation, a suitable vector introduction technology is selected depending on the host cell for expressing the target gene in the host cell. For example, the vector introduction can be carried out by electroporation, heat shock, calcium phosphate ( CaPO4 ) precipitation, calcium chloride ( CaCl2 ) precipitation, microinjection, polyethylene glycol (PEG) method, DEAE-dextran method, cationic liposome method, lithium acetate-DMSO (dimethyl sulfoxide) method or combinations thereof. As long as the transformed gene can be expressed in the host cell, it can be included without limitation, regardless of whether the gene is inserted into the chromosome of the host cell or is localized outside the chromosome.

Клетки-хозяева включают клетки, трансфицированные, трансформированные или инфицированные рекомбинантным вектором или полинуклеотидом по настоящему раскрытию in vivo или in vitro. Клетки-хозяева, включающие рекомбинантный вектор по настоящему раскрытию, представляют собой рекомбинантные клетки-хозяева, рекомбинантные клетки или рекомбинантные микроорганизмы.Host cells include cells transfected, transformed, or infected with a recombinant vector or polynucleotide of the present disclosure in vivo or in vitro. Host cells comprising a recombinant vector of the present disclosure are recombinant host cells, recombinant cells, or recombinant microorganisms.

Кроме того, рекомбинантный вектор по настоящему раскрытию может включать селективный маркер, который предназначен для отбора трансформанта (клетки-хозяина), трансформированного данным вектором. В среде, обработанной селективным маркером, только клетки, экспрессирующие данный селективный маркер, могут выживать, и, таким образом, могут быть отобраны трансформированные клетки. Селективный маркер может быть представлен канамицином, стрептомицином, хлорамфениколом и т.д., но не ограничивается ими.In addition, the recombinant vector of the present disclosure may include a selectable marker, which is intended to select a transformant (host cell) transformed with the vector. In a medium treated with the selectable marker, only cells expressing the selectable marker can survive, and thus transformed cells can be selected. The selectable marker may be represented by kanamycin, streptomycin, chloramphenicol, etc., but is not limited to them.

Гены, вставленные в рекомбинантный вектор для трансформации по настоящему раскрытию, могут быть введены в клетки-хозяева, такие как микроорганизмы рода Corynebacterium, из-за кроссинговера посредством гомологичной рекомбинации.Genes inserted into the recombinant transformation vector of the present disclosure can be introduced into host cells such as microorganisms of the genus Corynebacterium due to crossing over via homologous recombination.

Согласно конкретному воплощению настоящего раскрытия клетка-хозяин может представлять собой штамм рода Corynebacterium, например, штамм Corynebacterium glutamicum.According to a specific embodiment of the present disclosure, the host cell may be a strain of the genus Corynebacterium, such as a strain of Corynebacterium glutamicum.

Кроме того, согласно другому аспекту настоящего раскрытия предложен способ продуцирования L-лизина, включающий стадии а) культивирования варианта Corynebacterium glutamicum в среде; и б) выделения L-лизина из данного варианта или среды, в которой культивируется данный вариант.Furthermore, according to another aspect of the present disclosure, there is provided a method for producing L-lysine, comprising the steps of a) culturing a variant of Corynebacterium glutamicum in a medium; and b) isolating L-lysine from the variant or the medium in which the variant is cultivated.

Культивирование может осуществляться согласно подходящей среде и культуральным условиям, известным в данной области, и любой специалист в данной области может легко корректировать и применять данную среду и культуральные условия. В частности, данная среда может представлять собой жидкую среду, но не ограничивается ей. Способ культивирования может включать, например, периодическое культивирование, непрерывное культивирование, культивирование с подпиткой или их комбинации, но не ограничивается ими.The culturing can be carried out according to a suitable medium and culture conditions known in the art, and any person skilled in the art can easily adjust and apply the medium and culture conditions. In particular, the medium may be a liquid medium, but is not limited to it. The culturing method may include, for example, batch culturing, continuous culturing, fed-batch culturing, or combinations thereof, but is not limited to them.

Согласно конкретному воплощению настоящего раскрытия данная среда должна удовлетворять требованиям конкретного штамма правильным образом, и она может быть подходящим образом модифицирована специалистом в данной области. Относительно культуральной среды для штамма рода Corynebacterium может быть сделана ссылка на известный документ (Manual of Methods for General Bacteriology. American Society for Bacteriology. Washington D.C., USA, 1981), но не ограничиваясь им.According to a specific embodiment of the present disclosure, the medium must meet the requirements of a specific strain in a proper manner, and it can be suitably modified by a person skilled in the art. As for the culture medium for a strain of the genus Corynebacterium, reference may be made to a known document (Manual of Methods for General Bacteriology. American Society for Bacteriology. Washington D.C., USA, 1981), but is not limited thereto.

Согласно конкретному воплощению настоящего раскрытия данная среда может включать разные источники углерода, источники азота и компоненты-микроэлементы. Источники углерода, которые можно использовать, включают сахариды и углеводы, такие как такие как глюкоза, сахароза, лактоза, фруктоза, мальтоза, крахмал, целлюлоза и т.д., жиры и масла, такие как соевое масло, подсолнечное масло, касторовое масло, кокосовое масло и т.д., жирные кислоты, такие как пальмитиновая кислота, стеариновая кислота и линолевая кислота, спирты, такие как глицерин и этанол, и органические кислоты, такие как уксусная кислота. Данные вещества можно использовать индивидуально или в смеси, но не ограничиваясь ими. Источники азота, которые можно использовать, включают пептон, дрожжевой экстракт, мясной экстракт, солодовый экстракт, жидкий кукурузный экстракт, соевый жмых, мочевину или неорганические соединения, например, сульфат аммония, хлорид аммония, фосфат аммония, карбонат аммония и нитрат аммония. Данные источники азота также можно использовать индивидуально или в смеси, но не ограничиваясь ими. Источники фосфора, которые можно использовать, могут включать калия дигидрофосфат или дикалия гидрофосфат, или соответствующие натрийсодержащие соли, но не ограничиваются ими. Кроме того, культуральная среда может включать соли металлов, такие как сульфат магния или сульфат железа, которые требуются для роста, но не ограничиваются ими. Кроме того, культуральная среда может включать незаменимые ростовые вещества, такие как аминокислоты и витамины. Кроме того, в данной культуральной среде можно использовать подходящие предшественники. Среду или индивидуальные компоненты можно добавлять в культуральную среду во время культивирования подходящим способом периодически или непрерывно, но не ограничиваясь ими.According to a specific embodiment of the present disclosure, the medium may include various carbon sources, nitrogen sources and micronutrient components. Carbon sources that can be used include saccharides and carbohydrates such as glucose, sucrose, lactose, fructose, maltose, starch, cellulose, etc., fats and oils such as soybean oil, sunflower oil, castor oil, coconut oil, etc., fatty acids such as palmitic acid, stearic acid and linoleic acid, alcohols such as glycerol and ethanol, and organic acids such as acetic acid. These substances can be used individually or in a mixture, but are not limited to them. Nitrogen sources that can be used include peptone, yeast extract, meat extract, malt extract, liquid corn steep liquor, soybean meal, urea or inorganic compounds such as ammonium sulfate, ammonium chloride, ammonium phosphate, ammonium carbonate and ammonium nitrate. These nitrogen sources can also be used individually or in a mixture, but are not limited to them. Phosphorus sources that can be used can include potassium dihydrogen phosphate or dipotassium hydrogen phosphate, or the corresponding sodium salts, but are not limited to them. In addition, the culture medium can include metal salts such as magnesium sulfate or iron sulfate, which are required for growth, but are not limited to them. In addition, the culture medium can include essential growth substances such as amino acids and vitamins. In addition, suitable precursors can be used in this culture medium. The medium or individual components can be added to the culture medium during the culturing in a suitable manner periodically or continuously, but are not limited to them.

Согласно конкретному воплощению настоящего раскрытия рН культуральной среды можно корректировать добавлением в культуральную среду микроорганизма подходящим способом во время культивирования таких соединений, как гидроксид аммония, гидроксид калия, аммиак, фосфорная кислота и серная кислота. Кроме того, во время культивирования пенообразование можно подавлять с использованием пеногасителя, такого как сложный полигликоле вый эфир жирной кислоты. Кроме того, для поддержания культуральной среды в аэробном состоянии в данную культуральную среду можно инъецировать кислород или кислородсодержащий газ (например, воздух). Температура данной культуральной среды обычно может составлять от 20°С до 45°С, например, от 25°С до 40°С. Культивирование можно продолжать, пока не продуцируется желательное количество полезного вещества. Например, время культивирования может составлять от 10 часов до 160 часов.According to a specific embodiment of the present disclosure, the pH of the culture medium can be adjusted by adding compounds such as ammonium hydroxide, potassium hydroxide, ammonia, phosphoric acid and sulfuric acid to the culture medium of the microorganism in a suitable manner during the culturing. In addition, during the culturing, foaming can be suppressed using an antifoaming agent such as a fatty acid polyglycol ester. In addition, oxygen or an oxygen-containing gas (for example, air) can be injected into the culture medium to maintain the culture medium in an aerobic state. The temperature of the culture medium can typically be from 20°C to 45°C, such as from 25°C to 40°C. The culturing can be continued until a desired amount of the useful substance is produced. For example, the culturing time can be from 10 hours to 160 hours.

Согласно конкретному воплощению настоящего раскрытия на стадии выделения L-лизина из культивируемого варианта и среды, в которой культивируется данный вариант, продуцированный L-лизин может быть отобран или выделен из культуральной среды с использованием подходящего способа, известного в данной области, в зависимости от способа культивирования. Например, можно использовать центрифугирование, фильтрование, экстракцию, распыление, сушку, упаривание, осаждение, кристаллизацию, электрофорез, фракционное растворение (например, осаждение сульфатом аммония), хроматографию (например, ионообменная, аффинная, гидрофобная и гель-фильтрация) и т.д., но способ не ограничивается ими.According to a specific embodiment of the present disclosure, in the step of isolating L-lysine from a cultured variant and a medium in which the variant is cultured, the produced L-lysine can be collected or isolated from the culture medium using a suitable method known in the art depending on the culturing method. For example, centrifugation, filtration, extraction, spraying, drying, evaporation, precipitation, crystallization, electrophoresis, fractional dissolution (e.g., ammonium sulfate precipitation), chromatography (e.g., ion exchange, affinity, hydrophobic and gel filtration), etc. can be used, but the method is not limited to them.

Согласно конкретному воплощению настоящего раскрытия на стадии выделения лизина культуральную среду центрифугируют на низкой скорости для удаления биомассы, и полученный супернатант можно разделять посредством ионообменной хроматографии.According to a specific embodiment of the present disclosure, in the lysine isolation step, the culture medium is centrifuged at low speed to remove biomass, and the resulting supernatant can be separated by ion exchange chromatography.

Согласно конкретному воплощению настоящего раскрытия стадия выделения L-лизина может включать способ очистки L-лизина. Полезные эффектыAccording to a specific embodiment of the present disclosure, the step of isolating L-lysine may include a method for purifying L-lysine. Beneficial effects

Вариант Corynebacterium glutamicum по настоящему раскрытию может улучшать продукционный выход L-лизина посредством увеличения или усиления экспрессии гена, кодирующего аспартатаминотрансферазу, по сравнению с родительским штаммом.The Corynebacterium glutamicum variant of the present disclosure can improve the production yield of L-lysine by increasing or enhancing the expression of a gene encoding aspartate aminotransferase, compared to the parent strain.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ГРАФИЧЕСКИХ МАТЕРИАЛОВBRIEF DESCRIPTION OF GRAPHIC MATERIALS

На ФИГ. 1 показана конструкция рекомбинантного вектора pCGI(DS7-2) для замены последовательности в положении 22 промоторной области с С на G согласно одному типичному воплощению настоящего раскрытия;FIG. 1 shows the construction of the recombinant vector pCGI(DS7-2) for replacing the sequence at position 22 of the promoter region from C to G according to one exemplary embodiment of the present disclosure;

На ФИГ. 2 показана конструкция рекомбинантного вектора pCGI(DS7-l) для замены последовательности в положении 45 промоторной области с Т на А согласно одному типичному воплощению настоящего раскрытия; иFIG. 2 shows the construction of the recombinant vector pCGI(DS7-1) for replacing the sequence at position 45 of the promoter region from T to A according to one exemplary embodiment of the present disclosure; and

На ФИГ. 3 показана конструкция рекомбинантного вектора pCGI(DS7) для замены последовательности в положении 88 промоторной области с Т на А согласно одному типичному воплощению настоящего раскрытия.FIG. 3 shows the construction of a recombinant vector pCGI(DS7) for replacing the sequence at position 88 of the promoter region from T to A according to one exemplary embodiment of the present disclosure.

Далее настоящее раскрытие будет описано более подробно. Однако данное описание просто приводится для того, чтобы помочь пониманию настоящего раскрытия, и объем настоящего раскрытия не ограничивается данным типичным описанием.The present disclosure will now be described in more detail. However, this description is merely provided to aid in understanding the present disclosure, and the scope of the present disclosure is not limited to this typical description.

Пример 1. Получение варианта Corynebacterium glutamicumExample 1. Obtaining a variant of Corynebacterium glutamicum

Для получения варианта Corynebacterium glutamicum с повышенной аспартатаминотрансферазной активностью для индукции случайной мутации использовали штамм DS1 Corynebacterium glutamicum.To obtain a variant of Corynebacterium glutamicum with increased aspartate aminotransferase activity, the DS1 strain of Corynebacterium glutamicum was used to induce random mutation.

1-1. Мутагенез1-1. Mutagenesis

Штамм DS1 Corynebacterium glutamicum инокулировали в колбу, содержащую 50 мл жидкой среды СМ (5 г глюкозы, 2,5 г NaCl, 5,0 г дрожжевого экстракта, 1,0 г мочевины, 10,0 г полипептона и 5,0 г говяжьего экстракта, рН 6,8), и добавляли N-метил-N'-нитро-N-нитрозогуанидин (NTG), который представляет собой мутаген, в конечной концентрации 300 мкг/мл, с последующим культивированием при 30°С со встряхиванием при 200 об/мин в течение 20 часов. Затем, для индуцирования дополнительной мутации осуществляли воздействие УФ (ультрафиолетовое излучение) в течение 20 минут. После завершения культивирования культуру центрифугировали при 12000 об/мин в течение 10 минут для удаления супернатанта, и получаемое в результате один раз промывали физиологическим раствором и три раза или более промывали фосфатным буфером. Это суспендировали в 5 мл фосфатного буфера, распределяли на твердой среде СМ (в жидкую среду СМ дополнительно добавляли 15 г/л агара и 8% лизина) и культивировали при 30°С в течение 30 часов для выделения 100 колоний.The DS1 strain of Corynebacterium glutamicum was inoculated into a flask containing 50 ml of CM liquid medium (5 g glucose, 2.5 g NaCl, 5.0 g yeast extract, 1.0 g urea, 10.0 g polypeptone, and 5.0 g beef extract, pH 6.8), and N-methyl-N'-nitro-N-nitrosoguanidine (NTG), which is a mutagen, was added at a final concentration of 300 μg/ml, followed by culturing at 30°C with shaking at 200 rpm for 20 hours. Then, UV (ultraviolet irradiation) was applied for 20 minutes to induce additional mutation. After completion of the culture, the culture was centrifuged at 12,000 rpm for 10 minutes to remove the supernatant, and the resulting solution was washed once with saline and washed three times or more with phosphate buffer. It was suspended in 5 ml of phosphate buffer, spread on solid CM medium (15 g/L agar and 8% lysine were additionally added to the liquid CM medium), and cultured at 30°C for 30 hours to isolate 100 colonies.

1-2. Отбор вариантов с улучшенной способностью к продуцированию L-лизина1-2. Selection of variants with improved ability to produce L-lysine

Каждые 5% 100 выделенных колоний инокулировали в колбу, содержащую 10 мл жидкой среды для продукции, показанной ниже в Таблице 1, и культивировали со встряхиванием при 200 об/мин при 30°С в течение 30 часов. Поглощение каждой культуры измеряли при ОП 610 нм, и сравнивали продукцию L-лизина для отбора 10 колоний, продуцирующих 75,0 г/л или более L-лизина, по сравнению со штаммом DS1 Corynebacterium glutamicum, в котором мутация не была индуцирована, и его нуклеотидные последовательности анализировали для идентификации сайтов мутации в промоторе гена aspB. В результате проверки нуклеотидных последовательностей вариантов DS1 Corynebacterium glutamicum, в которых были индуцированы данные мутации, идентифицировали три типа мутаций: С>G в положении -22, Т>А в положении -45 и Т>А в положении -88.Every 5% of 100 isolated colonies were inoculated into a flask containing 10 ml of the liquid production medium shown in Table 1 below and cultured with shaking at 200 rpm at 30°C for 30 hours. The absorbance of each culture was measured at OD 610 nm, and the production of L-lysine was compared to select 10 colonies producing 75.0 g/L or more L-lysine, compared with Corynebacterium glutamicum strain DS1 in which the mutation was not induced, and its nucleotide sequences were analyzed to identify the mutation sites in the promoter of the aspB gene. As a result of inspection of the nucleotide sequences of the DS1 variants of Corynebacterium glutamicum in which these mutations were induced, three types of mutations were identified: C>G at position -22, T>A at position -45, and T>A at position -88.

Затем проводили эксперимент для проверки увеличения продуктивности в отношении L-лизина из-за трех типов мутаций промотора в гене aspB.An experiment was then conducted to test the increase in L-lysine productivity due to three types of promoter mutations in the aspB gene.

Пример 2. Получение варианта Corynebacterium glutamicumExample 2. Obtaining a variant of Corynebacterium glutamicum

Для получения варианта Corynebacterium glutamicum с усиленной аспартатаминотрансферазной активностью использовали штамм DS1 Corynebacterium glutamicum и DH5a E. coli (HIT Competent cells™, кат. № RH618).To obtain a variant of Corynebacterium glutamicum with enhanced aspartate aminotransferase activity, the DS1 strain of Corynebacterium glutamicum and DH5a E. coli (HIT Competent cells™, cat. no. RH618) were used.

Штамм DS1 Corynebacterium glutamicum культивировали при температуре 30°C в среде СМ или твердой среде (добавление 15 г/л агара, по необходимости) (рН 6,8), имеющей следующий состав: 5 г глюкозы, 2,5 г NaCl, 5,0 г дрожжевого экстракта, 1,0 г мочевины, 10,0 г полипептона и 5,0 г говяжьего экстракта в 1 л дистиллированной воды.The DS1 strain of Corynebacterium glutamicum was cultured at 30°C in CM medium or solid medium (addition of 15 g/L agar, if necessary) (pH 6.8) having the following composition: 5 g glucose, 2.5 g NaCl, 5.0 g yeast extract, 1.0 g urea, 10.0 g polypeptone and 5.0 g beef extract in 1 L of distilled water.

DH5a Е. coli культивировали при температуре 37°С в среде LB, имеющей следующий состав: 10,0 г триптона, 10,0 г NaCl и 5,0 г дрожжевого экстракта в 1 л дистиллированной воды.DH5a E. coli was cultured at 37°C in LB medium containing 10.0 g tryptone, 10.0 g NaCl, and 5.0 g yeast extract in 1 L distilled water.

Использовали антибиотики - канамицин и стрептомицин продукты Sigma а анализ секвенирования ДНК проводили в Macrogen Co., Ltd.The antibiotics used were kanamycin and streptomycin products from Sigma, and DNA sequencing analysis was performed at Macrogen Co., Ltd.

2-1. Получение рекомбинантного вектора2-1. Obtaining a recombinant vector

Для увеличения продуктивности в отношении лизина посредством усиления поставки в штамм аспартата, предшественника лизина, намеревались усилить активность аспартатаминотрансферазы. Способ, используемый в данном Примере, индуцировал специфичную мутацию в промоторе гена aspB для того, чтобы увеличить экспрессию гена aspB, кодирующего аспартатаминотрансферазу. Нуклеотидную последовательность в положении -22 промотора гена aspB заменяли на G, и фрагмент из 1256 п.н. вокруг гена aspB в геноме каждого варианта, полученного в Примере 1, амплифицировали посредством ПЦР (полимеразная цепная реакция), и клонировали в рекомбинантный вектор pCGI (см. [Kim et al., Journal of Microbiological Methods 84 (2011) 128-130]). Данную плазмиду называли pCGI(DS7-2) (см. ФИГ. 1). Для конструирования данной плазмиды использовали праймеры, показанные в Таблице 2 ниже, для амплификации каждого фрагмента гена.In order to increase the productivity of lysine by enhancing the supply of aspartate, a precursor of lysine, into the strain, it was intended to enhance the activity of aspartate aminotransferase. The method used in this Example induced a specific mutation in the promoter of the aspB gene in order to increase the expression of the aspB gene encoding aspartate aminotransferase. The nucleotide sequence at position -22 of the aspB gene promoter was replaced with G, and a 1256 bp fragment around the aspB gene in the genome of each variant obtained in Example 1 was amplified by PCR (polymerase chain reaction) and cloned into the recombinant vector pCGI (see [Kim et al., Journal of Microbiological Methods 84 (2011) 128-130]). This plasmid was named pCGI(DS7-2) (see FIG. 1). To construct this plasmid, the primers shown in Table 2 below were used to amplify each gene fragment.

ПЦР проводили с использованием приведенных выше праймеров при следующих условиях. От 25 до 30 циклов проводили с использованием термоциклера (ТР600, TAKARA BIO Inc., Япония) в присутствии 1 единицы смеси ДНК-полимеразы pfu-X (Solgent) с использованием 1 пМ олигонуклеотида и 10 нг хромосомной ДНК варианта DS1 Corynebacterium glutamicum (мутация происходила в положении -22 промотора), отобранного в Примере 1, в качестве матрицы в реакционном растворе, в который добавляли 100 мкл каждого дезоксинуклеотидтрифосфата (дАТФ, дЦТФ, дГТФ, дТТФ). ПЦР проводили при следующих условиях: (1) стадия денатурации: при 94°С в течение 30 секунд, (2) стадия отжига: при 58°С в течение 30 секунд, и (3) стадия элонгации: при 72°С в течение 1 минуты 2 минут (время полимеризации 2 минуты на 1 т.п.н.).PCR was performed using the above primers under the following conditions. 25 to 30 cycles were performed using a thermal cycler (TP600, TAKARA BIO Inc., Japan) in the presence of 1 unit of pfu-X DNA polymerase mixture (Solgent) using 1 pM of the oligonucleotide and 10 ng of the chromosomal DNA of the DS1 variant of Corynebacterium glutamicum (mutation occurred at position -22 of the promoter) selected in Example 1 as a template in a reaction solution to which 100 μl of each deoxynucleotide triphosphate (dATP, dCTP, dGTP, dTTP) was added. PCR was performed under the following conditions: (1) denaturation step: at 94°C for 30 seconds, (2) annealing step: at 58°C for 30 seconds, and (3) elongation step: at 72°C for 1 min 2 min (polymerization time 2 minutes per 1 kbp).

Каждый фрагмент гена, полученный таким образом, клонировали в вектор pCGI с использованием самосборочного клонирования. Данный вектор трансформировали в Е. coli DH5a, производили посев на чашки с LB-агаром, содержащим 50 мкг/мл канамицина, и культивировали при 37°С в течение 24 часов. Образующиеся наконец колонии выделяли, и подтверждали, правильно ли присутствовала данная вставка в векторе, который выделяли и использовали при рекомбинации штамма Corynebacterium glutamicum.Each gene fragment obtained in this way was cloned into the pCGI vector using self-assembly cloning. This vector was transformed into E. coli DH5a, plated on LB agar plates containing 50 μg/ml kanamycin, and grown at 37°C for 24 hours. The resulting colonies were isolated, and it was confirmed whether the insert was correctly present in the vector, which was isolated and used to recombine a Corynebacterium glutamicum strain.

2-2. Получение варианта2-2. Getting a variant

Штамм DS7-2, который представляет собой вариант штамма, получали с использованием вектора pCGI(DS7-2). Данный вектор получали в конечной концентрации 1 мкг/мл или больше, и первичную рекомбинацию индуцировали в штамме DS1 Corynebacterium glutamicum с использованием электропорации (см. документ [Tauch et al., FEMS Microbiology letters 123 (1994) 343-347]). В это время подвергнутый электропорации штамм затем распределяли на твердой среде СМ, содержащей 20 мкг/мкл канамицина, с выделением колоний, и затем подтверждали посредством ПЦР и анализа секвенирования оснований, правильно ли данный вектор был вставлен в индуцированное положение в геноме. Для индукции вторичной рекомбинации выделенный штамм инокулировали в жидкую среду СМ, культивировали в течение ночи или дольше и затем распределяли на среде с агаром, содержащей 40 мг/л стрептомицина для выделения колоний. После проверки устойчивости к канамицину в конечных выделенных колониях посредством анализа секвенирования оснований подтвердили, были ли введены мутации в промотор гена aspB в штаммах без устойчивости к антибиотику (см. документ [Schafer et al., Gene 145 (1994) 69-73]). Наконец, получали вариант Corynebacterium glutamicum (DS7-2), в который вводили мутировавший промотор гена aspB.Strain DS7-2, which is a variant strain, was prepared using the pCGI(DS7-2) vector. This vector was prepared at a final concentration of 1 μg/ml or more, and primary recombination was induced in Corynebacterium glutamicum strain DS1 using electroporation (see [Tauch et al., FEMS Microbiology letters 123 (1994) 343-347]). At this time, the electroporated strain was then spread on solid CM medium containing 20 μg/μl kanamycin to isolate colonies, and then it was confirmed by PCR and base sequencing analysis whether the vector was correctly inserted into the induced position in the genome. To induce secondary recombination, the isolated strain was inoculated into liquid CM medium, cultured overnight or longer, and then spread onto agar medium containing 40 mg/L streptomycin to isolate colonies. After checking for kanamycin resistance in the final isolated colonies, base sequencing analysis was used to confirm whether mutations had been introduced into the aspB promoter in strains without antibiotic resistance (see [Schafer et al., Gene 145 (1994) 69-73]). Finally, a variant of Corynebacterium glutamicum (DS7-2) was obtained in which the mutated aspB promoter was introduced.

Пример 3. Получение варианта Corynebacterium glutamicumExample 3. Obtaining a variant of Corynebacterium glutamicum

Вариант Corynebacterium glutamicum получали таким же способом, как и в Примере 2, за исключением того, что производили замену нуклеотидной последовательности в положении -45 промотора гена aspB от Т до А, и вариант Corynebacterium glutamicum DS1 (мутация происходила в положении -45 промотора), отобранный в Примере 1, использовали в качестве ДНК-матрицы.A variant of Corynebacterium glutamicum was obtained in the same manner as in Example 2, except that the nucleotide sequence at position -45 of the aspB gene promoter was replaced from T to A, and the variant of Corynebacterium glutamicum DS1 (mutation occurred at position -45 of the promoter) selected in Example 1 was used as a DNA template.

Здесь для конструирования плазмиды использовали праймеры, показанные в Таблице 2 ниже, для амплификации каждого фрагмента гена, и штамм DS7-1, который представляет собой вариант штамма, получали с использованием полученного вектора плазмиды pCGI(DS7-1) (см. ФИГ. 2). Наконец, получали вариант Corynebacterium glutamicum (DS7-1), в который вводили мутировавший ген aspB.Here, the primers shown in Table 2 below were used to construct a plasmid to amplify each gene fragment, and the DS7-1 strain, which is a variant strain, was obtained using the obtained plasmid vector pCGI(DS7-1) (see FIG. 2). Finally, a variant Corynebacterium glutamicum (DS7-1) into which the mutated aspB gene was introduced was obtained.

Пример 4. Получение варианта Corynebacterium glutamicumExample 4. Obtaining a variant of Corynebacterium glutamicum

Вариант Corynebacterium glutamicum получали таким же способом, как и в Примере 2, за исключением того, что производили замену нуклеотидной последовательности в положении -88 промотора гена aspB с Т на А, и вариант Corynebacterium glutamicum DS1 (мутация происходила в положении -88 промотора), отобранный в Примере 1, использовали в качестве ДНК-матрицы.A variant of Corynebacterium glutamicum was obtained in the same manner as in Example 2, except that the nucleotide sequence at position -88 of the aspB gene promoter was replaced from T to A, and the variant of Corynebacterium glutamicum DS1 (the mutation occurred at position -88 of the promoter) selected in Example 1 was used as a DNA template.

Здесь для конструирования плазмиды использовали праймеры, показанные в Таблице 2 ниже, для амплификации каждого фрагмента гена, и штамм DS7, который представляет собой вариант штамма, получали с использованием полученного вектора плазмиды pCGI(DS7) (см. ФИГ. 3). Наконец, получали вариант Corynebacterium glutamicum (DS7), в который вводили мутировавший ген aspB.Here, the primers shown in Table 2 below were used to construct a plasmid to amplify each gene fragment, and the DS7 strain, which is a variant strain, was obtained using the obtained plasmid vector pCGI(DS7) (see FIG. 3). Finally, a variant Corynebacterium glutamicum (DS7) into which the mutated aspB gene was introduced was obtained.

Экспериментальный пример 1. Сравнение продуктивности в отношении L-лизина между вариантамиExperimental Example 1: Comparison of L-Lysine Productivity Between Variants

Продуктивность в отношении L-лизина сравнивали между родительским штаммом DS1 Corynebacterium glutamicum, штаммами DS7-2, DS7-1 и DS7, которые представляют собой варианты, продуцирующие лизин, полученные в Примерах 2-4.The productivity of L-lysine was compared between the parent strain DS1 of Corynebacterium glutamicum, strains DS7-2, DS7-1 and DS7, which are lysine-producing variants obtained in Examples 2-4.

Каждый штамм инокулировали в 100 мл колбу, содержащую 10 мл лизиновой среды, имеющей композицию, как показано в Таблице 1, и культивировали со встряхиванием при 180 об/мин при 30°С в течение 28 часов. После завершения культивирования анализ L-лизина проводили посредством измерения продукции L-лизина с использованием ВЭЖХ (высокоэффективная жидкостная хроматография) (Shimazu, Япония). Результаты показаны в Таблице 3.Each strain was inoculated into a 100 ml flask containing 10 ml of lysine medium having the composition as shown in Table 1, and cultured with shaking at 180 rpm at 30°C for 28 hours. After completion of the culture, L-lysine analysis was performed by measuring L-lysine production using HPLC (high performance liquid chromatography) (Shimazu, Japan). The results are shown in Table 3.

Как показано в Таблице 3, подтвердили то, что варианты Corynebacterium glutamicum - штаммы DS7-2, DS7-1 и DS7 - демонстрировали примерно 3,7%-ное, 7,7%-ное и 16,9%-ное увеличение продуктивности в отношении L-лизина, соответственно, по сравнению с родительским штаммом DS1 Corynebacterium glutamicum из-за замены специфических положений (области -22, -45 или -88) в последовательности промотора гена aspB оптимальной нуклеотидной последовательностью для усиления биосинтетического пути лизина. В частности, подтвердили то, что штамм DS7 демонстрировал наивысшую продуктивность по сравнению с другими вариантами. Данные результаты показывают то, что усиленная экспрессия гена aspB может стимулировать поставку предшественника лизина, стимулируя, посредством этого, способность данного штамма к продуцированию L-лизина.As shown in Table 3, it was confirmed that the Corynebacterium glutamicum variants, strains DS7-2, DS7-1 and DS7, exhibited approximately 3.7%, 7.7% and 16.9% increases in L-lysine productivity, respectively, compared with the parental Corynebacterium glutamicum strain DS1 due to the replacement of specific positions (regions -22, -45 or -88) in the promoter sequence of the aspB gene with the optimal nucleotide sequence for enhancing the lysine biosynthetic pathway. In particular, it was confirmed that the DS7 strain exhibited the highest productivity compared with the other variants. These results indicate that the enhanced expression of the aspB gene can stimulate the supply of lysine precursor, thereby promoting the L-lysine producing ability of this strain.

Выше настоящее раскрытие было описано со ссылкой на его предпочтительные типичные воплощения. Специалистам в области, к которой относится настоящее раскрытие, будет понятно то, что настоящее раскрытие можно осуществлять в модифицированных формах без отступления от важных характеристик настоящего раскрытия. Соответственно, раскрытые здесь типичные воплощения следует рассматривать в иллюстративном аспекте, а не в ограничивающем аспекте. Объем настоящего раскрытия показан не в приведенном выше объяснении, а в приложенной формуле изобретения, и все различия в пределах эквивалентного ей объема следует интерпретировать как включенные в настоящее раскрытие.The present disclosure has been described above with reference to preferred exemplary embodiments thereof. It will be understood by those skilled in the art to which the present disclosure pertains that the present disclosure can be embodied in modified forms without departing from the essential characteristics of the present disclosure. Accordingly, the exemplary embodiments disclosed herein are to be considered in an illustrative aspect and not in a limiting aspect. The scope of the present disclosure is shown not in the explanation above but in the appended claims, and all differences within the equivalent scope thereof are to be interpreted as being included in the present disclosure.

--->--->

ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙSEQUENCE LIST

<110> CJ CheilJedang Corporation<110> CJ CheilJedang Corporation

<120> ВАРИАНТ CORYNEBACTERIUM GLUTAMICUM, ИМЕЮЩИЙ УЛУЧШЕННУЮ СПОСОБНОСТЬ <120> A VARIANT OF CORYNEBACTERIUM GLUTAMICUM WITH IMPROVED ABILITY

К ПРОДУКЦИИ L-ЛИЗИНА, И СПОСОБ ПРОДУЦИРОВАНИЯ L-ЛИЗИНА С ЕГО ПРИМЕНЕНИЕМTO THE PRODUCTION OF L-LYSINE, AND A METHOD FOR PRODUCING L-LYSINE WITH ITS USE

<130> OPA23236<130>OPA23236

<150> KR 10-2021-0055536<150> KR 10-2021-0055536

<151> 2021-04-29<151> 2021-04-29

<150> KR 10-2021-0066151<150> KR 10-2021-0066151

<151> 2021-05-24<151> 2021-05-24

<160> 6<160> 6

<170> KoPatentIn 3.0<170> KoPatentIn 3.0

<210> 1<210> 1

<211> 134<211> 134

<212> DNA<212> DNA

<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence

<220><220>

<223> последовательность промотора гена aspB<223> aspB gene promoter sequence

<400> 1<400> 1

agggtcagcg agctctgacg ggtgcgcggg atcccctaaa acgtctagag tagtggcttg 60agggtcagcg agctctgacg ggtgcgcggg atcccctaaa acgtctagag tagtggcttg 60

aggtcactgc tctttttttg tgcccttttt tggtccgtct attttgccac cacatgcgga 120aggtcactgc tctttttttg tgcccttttt tggtccgtct attttgccac cacatgcgga 120

ggtacgcagt tatg 134ggtacgcagt tatg 134

<210> 2<210> 2

<211> 134<211> 134

<212> DNA<212> DNA

<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence

<220><220>

<223> мутантная последовательность промотора гена aspB<223> mutant sequence of the aspB gene promoter

<400> 2<400> 2

agggtcagcg agctctgacg ggtgcgcggg atcccctaaa acgtctagag tagtggcttg 60agggtcagcg agctctgacg ggtgcgcggg atcccctaaa acgtctagag tagtggcttg 60

aggtcactgc tctttttttg tgcccttttt tggtccgtct attttgccag cacatgcgga 120aggtcactgc tctttttttg tgcccttttt tggtccgtct attttgccag cacatgcgga 120

ggtacgcagt tatg 134ggtacgcagt tatg 134

<210> 3<210> 3

<211> 134<211> 134

<212> DNA<212> DNA

<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence

<220><220>

<223> мутантная последовательность промотора гена aspB<223> mutant sequence of the aspB gene promoter

<400> 3<400> 3

agggtcagcg agctctgacg ggtgcgcggg atcccctaaa acgtctagag tagtggcttg 60agggtcagcg agctctgacg ggtgcgcggg atcccctaaa acgtctagag tagtggcttg 60

aggtcactgc tctttttttg tgccctattt tggtccgtct attttgccac cacatgcgga 120aggtcactgc tctttttttg tgccctattt tggtccgtct attttgccac cacatgcgga 120

ggtacgcagt tatg 134ggtacgcagt tatg 134

<210> 4<210> 4

<211> 134<211> 134

<212> DNA<212> DNA

<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence

<220><220>

<223> мутантная последовательность промотора гена aspB<223> mutant sequence of the aspB gene promoter

<400> 4<400> 4

agggtcagcg agctctgacg ggtgcgcggg atcccctaaa acgactagag tagtggcttg 60agggtcagcg agctctgacg ggtgcgcggg atcccctaaa acgactagag tagtggcttg 60

aggtcactgc tctttttttg tgcccttttt tggtccgtct attttgccac cacatgcgga 120aggtcactgc tctttttttg tgcccttttt tggtccgtct attttgccac cacatgcgga 120

ggtacgcagt tatg 134ggtacgcagt tatg 134

<210> 5<210> 5

<211> 18<211> 18

<212> DNA<212> DNA

<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence

<220><220>

<223> DS7-F<223>DS7-F

<400> 5<400> 5

cgagaattac cggcgatg 18cgagaattac cggcgatg 18

<210> 6<210> 6

<211> 18<211> 18

<212> DNA<212> DNA

<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence

<220><220>

<223> DS7-R<223>DS7-R

<400> 6<400> 6

tcaccgtgaa accagtcg 18tcaccgtgaa accagtcg 18

<---<---

Claims (5)

1. Промотор, содержащий нуклеотидную последовательность, представленную SEQ ID NO: 4.1. A promoter comprising the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 4. 2. Микроорганизм Corynebacterium glutamicum, продуцирующий L-лизин, содержащий нуклеотидную последовательность, представленную SEQ ID NO: 4.2. Microorganism Corynebacterium glutamicum producing L-lysine containing the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 4. 3. Способ продуцирования L-лизина, включающий следующие стадии:3. A method for producing L-lysine, comprising the following steps: а) культивирование микроорганизма по п. 2 в среде; иa) cultivating the microorganism according to item 2 in a medium; and б) выделение L-лизина из данного микроорганизма или среды, в которой культивируется данный микроорганизм.b) isolation of L-lysine from a given microorganism or the medium in which a given microorganism is cultivated.
RU2023129139A 2021-04-29 2021-05-25 Variant of corynebacterium glutamicum, having improved ability to produce l-lysine, and method of producing l-lysine using same RU2838210C2 (en)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR10-2021-0055536 2021-04-29
KR10-2021-0066151 2021-05-24

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2023129139A RU2023129139A (en) 2024-01-19
RU2838210C2 true RU2838210C2 (en) 2025-04-14

Family

ID=

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2011108808A2 (en) * 2010-03-05 2011-09-09 Cj Cheiljedang Corporation Enhanced promoter and method for producing l-lysine using the same
RU2667425C2 (en) * 2013-10-28 2018-09-19 СиДжей ЧеилДжеданг Корп. Microorganism of corynebacterium species having enhanced l-lysine producibility and method for producing l-lysine using same
WO2018226964A2 (en) * 2017-06-07 2018-12-13 Zymergen Inc. Promoters from corynebacterium glutamicum and uses thereof in regulating ancillary gene expression

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2011108808A2 (en) * 2010-03-05 2011-09-09 Cj Cheiljedang Corporation Enhanced promoter and method for producing l-lysine using the same
RU2667425C2 (en) * 2013-10-28 2018-09-19 СиДжей ЧеилДжеданг Корп. Microorganism of corynebacterium species having enhanced l-lysine producibility and method for producing l-lysine using same
WO2018226964A2 (en) * 2017-06-07 2018-12-13 Zymergen Inc. Promoters from corynebacterium glutamicum and uses thereof in regulating ancillary gene expression

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
JIANZHONG XU ET AL. Genetically modifying aspartate aminotransferase and aspartate ammonia-lyase affects metabolite accumulation in l-lysine producing strain derived from Corynebacterium glutamicum ATCC13032. Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic, Volume 113, March 2015, Pages 82-89. https://doi.org/10.1016/j.molcatb.2014.12.015. *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP2025168674A (en) Corynebacterium glutamicum mutant strain with improved L-lysine production ability and method for producing L-lysine using the same
KR20240017394A (en) Mutant of Corynebacterium glutamicum with enhanced L-citrulline productivity and method for preparing L-citrulline using the same
JP7766704B2 (en) Corynebacterium glutamicum mutant with improved L-lysine production ability and method for producing L-lysine using the same
RU2838210C2 (en) Variant of corynebacterium glutamicum, having improved ability to produce l-lysine, and method of producing l-lysine using same
RU2829715C2 (en) Variant of corynebacterium glutamicum with improved ability to produce l-lysine and method of producing l-lysine using same
RU2837131C2 (en) Variant of corynebacterium glutamicum, having improved ability to produce l-lysine, and method of producing l-lysine by using same
RU2834919C1 (en) Variant of corynebacterium glutamicum having improved ability to produce l-lysine, and method of producing l-lysine using same
JP2023540518A (en) Corynebacterium glutamicum mutant strain with improved L-lysine production ability and method for producing L-lysine using the same
JP7683040B2 (en) Corynebacterium glutamicum mutant with improved L-lysine production ability and method for producing L-lysine using the same
JP7620123B2 (en) Corynebacterium glutamicum mutant with improved L-lysine production ability and method for producing L-lysine using the same
JP7683041B2 (en) Corynebacterium glutamicum mutant with improved L-lysine production ability and method for producing L-lysine using the same
KR102845795B1 (en) A microorganism of Corynebacterium genus having enhanced L-arginine or L-citrulline productivity and a method for producing L-arginine or L-citrulline using the same
KR102703209B1 (en) Mutant of Corynebacterium glutamicum with enhanced L-lysine productivity and method for preparing L-lysine using the same
KR20220148694A (en) Mutant of Corynebacterium glutamicum with enhanced L-lysine productivity and method for preparing L-lysine using the same
KR20220126610A (en) Mutant of Corynebacterium glutamicum with enhanced L-lysine productivity and method for preparing L-lysine using the same
KR20220149219A (en) Mutant of Corynebacterium glutamicum with enhanced L-lysine productivity and method for preparing L-lysine using the same