RU2847121C2 - Композиции на основе олигонуклеотидов и способы, связанные с ними - Google Patents

Abstract

Изобретение относится к области биотехнологии, в частности к олигонуклеотиду, способному нацеливаться на аллель А SNP rs362273, а также к композиции, его содержащей. Изобретение эффективно для лечения болезни Хантингтона, для предупреждения болезни Хантингтона, для задержки возникновения болезни Хантингтона, а также для уменьшения тяжести по меньшей мере одного симптома болезни Хантингтона. 13 н. и 19 з.п. ф-лы, 1 ил., 64 табл., 2 пр.

Description

ПЕРЕКРЕСТНАЯ ССЫЛКА НА РОДСТВЕННЫЕ ЗАЯВКИ

[0001] Настоящая заявка испрашивает приоритет согласно предварительным заявкам на патент США №№62/800409, поданной 1 февраля 2019 г., и 62/911335, поданной 6 октября 2019 г., при этом полное содержание каждой из них включено в данный документ посредством ссылки.

УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ

[0002] Олигонуклеотиды, нацеливающиеся на конкретный ген, применимы в различных вариантах применения, например, в вариантах применения в терапии, диагностике и/или исследованиях, включая без ограничений лечение различных нарушений, связанных с геном-мишенью.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ

[0003] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены олигонуклеотиды и композиции на их основе, которые обладают значительно улучшенными свойствами и/или видами активности. Помимо прочего в настоящем изобретении представлены технологии конструирования, изготовления и использования таких олигонуклеотидов и композиций. В частности, в некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены применимые паттерны межнуклеотидных связей [например, типы, модификации и/или конфигурация (Rp или Sp) фосфора в составе хиральной связи и т.д.] и/или паттерны модификаций сахара (например, типы, паттерны и т.д.), которые в комбинации с одним или несколькими другими структурными элементами, описанными в данном документе, например, последовательностью оснований (или ее частью), модификациями нуклеиновых оснований (и их паттернами), модификациями межнуклеотидных связей (и их паттернами), дополнительными химическими фрагментами и т.д. могут обеспечивать олигонуклеотиды и композиции с высокими уровнями видов активности и/или требуемых свойств, включая без ограничений аллель-специфический нокдаун мутантного аллеля гена НТТ (хантингтина), где мутантный аллель находится на той же хромосоме (в одной гаметической фазе) с областью экспансии CAG-повторов, ассоциированной с болезнью Хантингтона.

[0004] В некоторых вариантах осуществления нуклеиновая кислота НТТ-мишени является мутантной, при этом включает как положение распознавания, так и мутацию, такую как область экспансии CAG-повторов (например, более чем приблизительно 36 CAG), которая ассоциирована с болезнью Хантингтона. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновая кислота эталонного НТТ или нуклеиновая кислота НТТ, не являющегося мишенью, представляет собой нуклеиновую кислоту дикого типа, а также содержит другой вариант положения распознавания и не содержит область экспансии CAG-повторов (например, область CAG-повторов составляет менее приблизительно 35 CAG и не ассоциирована с болезнью Хантингтона). В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид (олигонуклеотид, который нацеливается на НТТ, нуклеиновую кислоту НТТ-мишени) способен осуществлять распознавание нуклеиновой кислоты НТТ-мишени и нуклеиновой кислоты эталонного НТТ и способен опосредовать аллель-специфический нокдаун нуклеиновой кислоты НТТ-мишени. В некоторых вариантах осуществления положение распознавания представляет собой сайт однонуклеотидного полиморфизма (SNP), точечную мутацию и т.д. В некоторых вариантах осуществления последовательность нуклеиновой кислоты НТТ-мишени и последовательность нуклеиновой кислоты эталонного НТТ содержат отличающееся основание в сайте SNP. В некоторых вариантах осуществления сайт в нуклеиновой кислоте НТТ-мишени полностью комплементарен сайту в олигонуклеотиде по настоящему изобретению, в то время как соответствующий сайт в нуклеиновой кислоте эталонного НТТ не является комплементарным. Например, в некоторых вариантах осуществления последовательность нуклеиновой кислоты НТТ-мишени содержит rs362273 и имеет основание А в положении данного SNP, а ее аллель содержит экспансию CAG-повторов (например, 36 или больше), и она ассоциирована с болезнью Хантингтона; при этом последовательность нуклеиновой кислоты эталонного НТТ содержит rs362273 и имеет основание G в положении данного SNP, а ее аллель содержит меньшее число CAG-повторов (например, 35 или меньше), и она в меньшей степени ассоциирована или не ассоциирована с болезнью Хантингтона. В некоторых вариантах осуществления последовательности представленных олигонуклеотидов, например GUUGATCTGTAGCAGCAGCT, комплементарны последовательности нуклеиновой кислоты НТТ-мишени в конкретном сайте, например в сайте SNP (например, в случае основание комплементарно основанию Δ в положении SNP rs362273).

[0005] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид имеет последовательность оснований, которая не отличается от нуклеиновой кислоты мутантного НТТ-мишени и нуклеиновой кислоты НТТ дикого типа. В некоторых вариантах осуществления такой олигонуклеотид способен обеспечивать нокдаун уровня, экспрессии и/или активности как мутантного НТТ, так и НТТ дикого типа; и олигонуклеотид можно сконструировать в качестве панспепифического олигонуклеотида или олигонуклеотида, не являющегося аллель-специфическим.

[0006] В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды и композиции применимы для предупреждения и/или лечения различных состояний, нарушений или заболеваний, в частности состояний, нарушений или заболеваний, связанных с НТТ, включая болезнь Хантингтона. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды и композиции селективно снижают уровни транскриптов НТТ и/или кодируемых ими продуктов, которые ассоциированы с болезнью Хантингтона. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды и композиции селективно снижают уровни транскриптов НТТ, содержащих экспансию CAG-повторов (например, 36 или больше), и/или кодируемых ими продуктов.

[0007] Помимо прочего, настоящее изобретение охватывает признание того, что контроль структурных элементов НТТ-олигонуклеотидов может оказывать значительное влияние на свойства и/или виды активности олигонуклеотидов, включая нокдаун (например, снижение активности, экспрессии и/или уровня) гена НТТ-мишени (или его продукта). В некоторых вариантах осуществления болезнь Хантингтона ассоциирована с присутствием мутантного аллеля НТТ, который содержит экспансию CAG (например, увеличение длины области, содержащей множественные CAG-повторы). В некоторых вариантах осуществления нокдаун является аллель-специфическим (при этом осуществляется преимущественный нокдаун мутантного аллеля НТТ по сравнению с диким типом). В некоторых вариантах осуществления нокдаун является панспецифическим (при этом осуществляется значительный нокдаун как мутантного аллеля, так и аллеля дикого типа НТТ). В некоторых вариантах осуществления нокдаун гена НТТ-мишени опосредуется РНКазой Н и/или стерическим затруднением, воздействующим на трансляцию. В некоторых вариантах осуществления нокдаун гена НТТ-мишени опосредуется механизмом, вовлекающим РНК-интерференцию. В некоторых вариантах осуществления контролируемые структурные элементы НТТ-олигонуклеотидов включают без ограничений: последовательность оснований, химические модификации (например, модификации сахара, основания и/или межнуклеотидной связи) или их паттерны, изменения стереохимии (например, стереохимии хиральной межнуклеотидной связи остова) или их паттерны, структуру первого или второго крыла или кора и/или конъюгирование с дополнительным химическим фрагментом (например, углеводным фрагментом, нацеливающим фрагментом и т.д.). В частности, в некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения продемонстрировано, что контроль стереохимии хиральных центров остова (стереохимии атома фосфора в составе связи), необязательно при контроле других аспектов структуры олигонуклеотида и/или включении углеводных фрагментов, может значительно улучшить свойства и/или виды активности НТТ-олигонуклеотидов.

[0008] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к любому НТТ-олигонуклеотиду, который действует посредством любого механизма и который содержит любую последовательность, структуру или форму (или их часть), описанные в данном документе, где олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну не встречающуюся в природе модификацию основания, сахара или межнуклеотидной связи.

[0009] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида, содержащая совокупность олигонуклеотидов, где олигонуклеотиды содержат по меньшей мере одну межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью [межнуклеотидную связь, атом фосфора которой находится в конфигурации Rp или Sp или обогащен ею (например, 80-100%, 85%-100%, 90%-100%, 95%-100%, или 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или больше из всех олигонуклеотидов одного и того же состава в композиции характеризуются одинаковой стереохимией атома фосфора в составе связи), а не является случайной смесью Rp и Sp, такая межнуклеотидная связь также является "стереомерно задаваемой межнуклеотидной связью"], например фосфотиоатную связь, атом фосфора которой представляет собой Rp или Sp. В некоторых вариантах осуществления количество межнуклеотидных связей с контролируемой хиральностью составляет 1-100, 1-50, 1-40, 1-35, 1-30, 1-25, 1-20, 5-100, 5-50, 5-40, 5-35, 5-30, 5-25, 5-20, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, или 25. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 1 межнуклеотидная связь представляет собой межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью и представляет собой Sp, и/или по меньшей мере 1 межнуклеотидная связь представляет собой межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью и представляет собой Rp. В некоторых вариантах осуществления паттерн хиральных центров остова олигонуклеотида или его части (например, кора) представляет собой или содержит Rp(Sp)₂. В некоторых вариантах осуществления паттерн хиральных центров остова олигонуклеотида или его части (например, кора) представляет собой или содержит (Np)t[(Rp)n(Sp)m]y, где каждый из t, n, m и y независимо является таким, как описано в данном документе.

[0010] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения продемонстрировано, что олигонуклеотиды, содержащие межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью Rp в положении -1, +1 или +3 относительно положения распознавания (положения, по основанию или комплементарному основанию которого можно распознавать нуклеиновую кислоту мутантного НТТ-мишень и нуклеиновую кислоту эталонного НТТ дикого типа), могут обеспечивать высокие уровни видов активности и/или селективности и в некоторых варианта осуществления могут быть особенно применимы для снижения уровней транскриптов, ассоциированных с заболеванием, и/или продуктов, кодируемых ими. Если не указано иное, для определения положения межнуклеотидной связи Rp "-" отсчитывают от нуклеозида в положении распознавания по направлению к 5'-концу олигонуклеотида, при этом межнуклеотидная связь в положении -1 является межнуклеотидной связью, соединенной с 5'-углеродом нуклеозида в положении распознавания, а "+" отсчитывают от нуклеозида в положении распознавания по направлению к 3'-концу олигонуклеотида, при этом межнуклеотидная связь в положении +1 является межнуклеотидной связью, соединенной с 3'-углеродом нуклеозида в положении распознавания. В некоторых вариантах осуществления Rp в положении -1 обеспечивает повышенную активность и селективность. В некоторых вариантах осуществления Rp в положении +1 обеспечивает повышенную активность и селективность. В некоторых вариантах осуществления Rp в положении +3 обеспечивает повышенную активность. Например, как показано в данном документе, НТТ-олигонуклеотиды WV-12281 (одна фосфотиоатная связь в конфигурации Rp в положении -1 относительно положения SNP), WV-12282 (+1) и WV-12284 (+3) могут обеспечивать высокую селективность при использовании для аллель-специфического нокдауна мутантного аллеля.

[0011] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к композиции на основе НТТ-олигонуклеотида, где НТТ-олигонуклеотиды содержат по меньшей мере одну хиральную межнуклеотидную связь, которая не характеризуется контролируемой хиральностью.

[0012] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды содержат одну или несколько (например, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10) межнуклеотидных связей, не являющихся отрицательно заряженными. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды содержат одну или несколько нейтральных межнуклеотидных связей. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит межнуклеотидную связь, которая не является отрицательно заряженной, или нейтральную межнуклеозидную связь. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен олигонуклеотид, где последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из последовательности оснований, которая идентична или комплементарна последовательности оснований гена НТТ или его транскрипта, где олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь, не являющуюся отрицательно заряженной, и где олигонуклеотид способен обеспечивать снижение уровня, экспрессии и/или активности гена НТТ-мишени или его генного продукта.

[0013] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает признание того, что различные необязательные дополнительные химические фрагменты, такие как углеводные фрагменты, нацеливающие фрагменты и т.д., при включении в олигонуклеотиды могут улучшать одно или несколько свойств и/или видов активности.

[0014] В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент выбран из: GalNAc, глюкозного, GluNAc (N-ацетиламиноглюкозаминового) и анизамидного фрагментов и их производных, или любого дополнительного химического фрагмента, описанного в данном документе и/или известного в данной области техники. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид может содержать два или более дополнительных химических фрагмента, где дополнительные химические фрагменты являются идентичными или неидентичными, или принадлежат к одной категории (например, углеводный фрагмент, сахарный фрагмент, нацеливающий фрагмент и т.д.) или не к одной категории. В некоторых вариантах осуществления определенные дополнительные химические фрагменты облегчают доставку олигонуклеотидов у требуемым клеткам, тканям и/или органам; и/или облегчают интернализацию олигонуклеотидов; и/или повышают стабильность олигонуклеотидов.

[0015] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, содержащая совокупность олигонуклеотидов, которые характеризуются:

1) общей последовательностью оснований;

2) общим паттерном связей остова и

3) общим паттерном хиральных центров остова, при этом композиция представляет собой по сути чистый препарат из одного олигонуклеотид, в том смысле, что неслучайный или контролируемый уровень олигонуклеотидов в композиции характеризуется общей последовательностью оснований, общим паттерном связей остова и общим паттерном хиральных центров остова.

[0016] В некоторых вариантах осуществления композиция на основе олигонуклеотида представляет собой композицию на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, содержащую совокупность олигонуклеотидов определенного типа олигонуклеотидов, причем данная композиция характеризуется контролируемой хиральностью в том смысле, что она является обогащенной относительно по сути рацемического препарата из олигонуклеотидов, характеризующихся такой же последовательностью оснований и паттерном хиральных межнуклеотидных связей в случае олигонуклеотидов конкретного олигонуклеотидного типа.

[0017] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, содержащая совокупность олигонуклеотидов, способных управлять нокдауном НТТ, где олигонуклеотиды из совокупности относятся к конкретному типу олигонуклеотидов, причем композиция характеризуется контролируемой хиральностью в том смысле, что она является обогащенной относительно по сути рацемического препарата из олигонуклеотидов, характеризующихся такой же последовательностью оснований в случае олигонуклеотидов конкретного типа олигонуклеотидов.

[0018] В некоторых вариантах осуществления представленный олигонуклеотид содержит один или несколько блоков. В некоторых вариантах осуществления блок содержит один или несколько последовательных нуклеозидов, и/или нуклеотидов, и/или сахаров, или оснований, и/или межнуклеотидных связей, которые характеризуются общим химическим составом (например, по меньшей мере одной общей модификацией сахара, основания или межнуклеотидной связи, или их комбинацией или паттерном, или паттерном стереохимии), которые не присутствуют в соседнем блоке, или наоборот. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит три или более блоков, где блоки на каждом конце не являются идентичными, и за счет этого олигонуклеотид является асимметричным. В некоторых вариантах осуществления блок представляет собой крыло или кор. В некоторых вариантах осуществления кор также называют гэпом.

[0019] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид содержит по меньшей мере одно крыло и по меньшей мере один кор, где крыло отличается по структуре от кора тем, что крыло олигонуклеотида предусматривает структуру [например, стереохимию или химическую модификацию сахара, основания или межнуклеотидной связи (или их паттерн) и т.д.], которая не присутствует в коре, или наоборот. В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида предусматривает структуру крыло-кор-крыло. В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида предусматривает структуру крыло-кор, кор-крыло или крыло-кор-крыло, где одно крыло отличается по структуре [например, стереохимии, дополнительному химическому фрагменту или химической модификации сахара, основания или межнуклеотидной связи (или их паттерну)] от другого крыла и кора (например, асимметричный олигонуклеотид).

[0020] В некоторых вариантах осуществления крыло содержит модификацию сахара или ее паттерн, которые отсутствуют в коре. В некоторых вариантах осуществления крыло содержит модификацию сахара, которая отсутствует в коре. В некоторых вариантах осуществления один или несколько (например, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10) сахаров крыла являются независимо модифицированными. В некоторых вариантах осуществления каждый сахар крыла является независимо модифицированным. В некоторых вариантах осуществления все сахара в крыле являются одинаковыми. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один сахар в крыле отличается от другого сахара в крыле. В некоторых вариантах осуществления одна или несколько модификаций сахара и/или паттернов модификаций сахара в первом крыле олигонуклеотида (например, 5'-крыле) отличаются от одной или нескольких модификаций сахара и/или паттернов модификаций сахара во втором крыле олигонуклеотида (например, 3'-крыле). В некоторых вариантах осуществления модификация представляет собой модификацию 2'-OR, где R является таким, как описано в данном документе. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный С_1-4алкил. В некоторых вариантах осуществления модификация представляет собой 2'-ОМе. В некоторых вариантах осуществления модификация представляет собой 2'-МОЕ. В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар представляет собой высокоаффинный сахар, например бициклический сахар (например, LNA-сахар), 2'-МОЕ-сахар и т.д. В некоторых вариантах осуществления сахар 3'-крыла представляет собой высокоаффинный сахар. В некоторых вариантах осуществления 3'-крыло содержит один или несколько высокоаффинных сахаров. В некоторых вариантах осуществления каждый сахар 3'-крыла независимо представляет собой высокоаффинный сахар. В некоторых вариантах осуществления высокоаффинный сахар представляет собой 2'-МОЕ-сахар. В некоторых вариантах осуществления высокоаффинный сахар соединен с межнуклеотидной связью, не являющейся отрицательно заряженной.

[0021] В некоторых вариантах осуществления крыло содержит одну или несколько межнуклеотидных связей, не являющихся отрицательно заряженными. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, представляет собой нейтральную межнуклеотидную связь. В некоторых вариантах осуществления каждая межнуклеотидной связь, не являющаяся отрицательно заряженной, независимо представляет собой нейтральную межнуклеотидную связь. В некоторых вариантах осуществления, как продемонстрировано в данном документе, олигонуклеотиды, которые содержат крылья, содержащие одну или несколько межнуклеотидных связей, не являющихся отрицательно заряженными, могут обеспечивать высокие уровни видов активности и/или селективности. В некоторых вариантах осуществления в случае описания межнуклеотидных связей и их паттернов (включая стереохимические паттерны) межнуклеотидные связи, связывающие нуклеозид крыла и нуклеозид кора, считаются частью кора. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, является связью с контролируемой хиральностью и представляет собой Rp или Sp.

[0022] В некоторых вариантах осуществления сахар кора представляет собой природный сахар ДНК, который не содержит замещения в положении 2' (два Н при 2'-углероде). В некоторых вариантах осуществления каждый сахар кора представляет собой природный сахар ДНК, который не содержит замещения в положении 2' (два -Н при 2'-углерода).

[0023] В некоторых вариантах осуществления положение распознавания (например, местоположение SNP или другая мутация, по которой распознают последовательность-мишень дикого типа от ассоциированной с заболеванием или мутантной последовательности) представляет собой положение 4, 5 или 6 от 5'-конца коровой области. В некоторых вариантах осуществления 4^ое, 5^ое или 6^ое нуклеиновое основание коровой области (от 5'-конца кора) является характерным для последовательности и позволяет распознавать последовательность от другой последовательности (например, SNP). В некоторых вариантах осуществления положение распознавания представляет собой положение 4 от 5'-конца коровой области. В некоторых вариантах осуществления положение распознавания представляет собой положение 5 от 5'-конца коровой области. В некоторых вариантах осуществления положение распознавания представляет собой положение 6 от 5'-конца коровой области. В некоторых вариантах осуществления положение распознавания представляет собой положение 9, 10 или 11 от 5'-конца олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления положение распознавания представляет собой положение 9 от 3'-конца олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления положение распознавания представляет собой положение 10 от 5'-конца олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления положение распознавания представляет собой положение 11 от 5'-конца олигонуклеотида.

[0024] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид или композиция на основе олигонуклеотида применимы для предупреждения или лечения состояния, нарушения или заболевания. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид или композиция на основе НТТ-олигонуклеотида применимы для способа лечения состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ, таких как болезнь Хантингтона, у субъекта, нуждающегося в этом.

[0025] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид или композиция на основе олигонуклеотида применимы для изготовления лекарственного препарата для лечения состояния, нарушения или заболевания, такого как болезнь Хантингтона, у субъекта, нуждающегося в этом. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид или композиция на основе НТТ-олигонуклеотида применимы для изготовления лекарственного препарата для лечения состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ, таких как болезнь Хантингтона, у субъекта, нуждающегося в этом.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ГРАФИЧЕСКИХ МАТЕРИАЛОВ

[0026] Фигуры 1A-1D. На фигурах 1A-1D показаны различные форматы, которые можно применять, полностью или частично, для олигонуклеотидов, например НТТ-олигонуклеотидов.

ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ ОПРЕДЕЛЕННЫХ ВАРИАНТОВ ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ

[0027] Для более легкого понимания технологий по настоящему изобретению можно обратиться к нижеследующему подробному описанию определенных вариантов осуществления.

Определения

[0028] Если не указано иное, при использовании в данном документе должны применяться следующие определения. Для целей настоящего изобретения химические элементы идентифицированы в соответствии с Периодической системой химических элементов версии CAS, Handbook of Chemistry and Physics, 75th Ed. Кроме того, основные принципы органической химии описаны в "Organic Chemistry", Thomas Sorrell, University Science Books, Sausalito: 1999, и "March's Advanced Organic Chemistry", 5th Ed., Ed.: Smith, M.B. and March, J., John Wiley & Sons, New York: 2001.

[0029] При использовании в данном документе касательно настоящего изобретения, если иное не явствует из контекста, (i) формы единственного числа можно понимать как означающие "по меньшей мере, один"; (ii) термин "или" можно понимать как означающий "и/или"; (iii) термины "содержащий", "содержит", "включающий" (с использованием фразы "без ограничений" или без нее) и "включает" (с использованием фразы "без ограничений" или без нее) можно понимать как охватывающие перечисленные компоненты или стадии, представленные сами по себе или вместе с одним или несколькими дополнительными компонентами или стадиями; (iv) термин "другой" можно понимать как означающий по меньшей мере один дополнительный/второй или более; (v) термины "приблизительно" и "примерно" можно понимать как допускающие стандартное изменение, как будет понятно средним специалистам в данной области техники; и (vi) если указываются диапазоны, то конечные точки включены.

[0030] Если не указано иное, описание олигонуклеотидов и их элементов (например, последовательности оснований, модификаций сахара, межнуклеотидных связей, стереохимии фосфора в составе связи и т.д.) осуществляется в направлении 5'-3'. Если не указано иное, описанные в данном документе олигонуклеотиды могут быть представлены и/или использованы в солевой форме, в частности в форме фармацевтически приемлемой соли. Как будет понятно специалистам в данной области техники после прочтения настоящего изобретения, в некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды могут быть представлены в виде солей, например натриевых солей. Как будет понятно специалистам в данной области техники, в некоторых вариантах осуществления может считаться, что отдельные олигонуклеотиды в пределах композиции имеют одинаковый состав и/или структуру даже в том случае, если в пределах такой композиции (например, жидкой композиции) такие конкретные олигонуклеотиды могут находиться в форме(-ах) различных солей (и могут быть растворены, а олигонуклеотидная цепь может существовать в виде анионной формы при нахождении, например, в жидкой композиции) в конкретный момент времени. Например, специалистам в данной области техники будет понятно, что при заданном рН отдельные межнуклеотидные связи вдоль олигонуклеотидной цепи могут находиться в кислотной (Н) форме или в одной из множества возможных солевых форм (например, натриевой соли или соли другого катиона, в зависимости от того, какие ионы могут присутствовать в препарате или композиции)), и будет понятно, что при условии, что их кислотные формы (например, при замене всех катионов, если таковые имеются, на Н) имеют одинаковый состав и/или структуру, может справедливо считаться, что такие отдельные олигонуклеотиды имеют одинаковый состав и/или структуру.

[0031] Алифатический. Используемый в данном документе "алифатический" означает прямую (т.е. неразветвленную) или разветвленную, замещенную или незамещенную углеводородную цепь, которая является полностью насыщенной или которая содержит одно или несколько звеньев с ненасыщенной связью, или замещенное или незамещенное моноциклическое, бициклическое или полициклическое углеводородное кольцо, которое является полностью насыщенным или которое содержит одно или несколько звеньев с ненасыщенной связью (но не ароматическое), или их комбинации. В некоторых вариантах осуществления алифатические группы содержат 1-50 алифатических атомов углерода. В некоторых вариантах осуществления алифатические группы содержат 1-20 алифатических атомов углерода. В других вариантах осуществления алифатические группы содержат 1-10 алифатических атомов углерода. В других вариантах осуществления алифатические группы содержат 1-9 алифатических атомов углерода. В других вариантах осуществления алифатические группы содержат 1-8 алифатических атомов углерода. В других вариантах осуществления алифатические группы содержат 1-7 алифатических атомов углерода. В других вариантах осуществления алифатические группы содержат 1-6 алифатических атомов углерода. В еще других вариантах осуществления алифатические группы содержат 1-5 алифатических атомов углерода, а в еще одних вариантах осуществления алифатические группы содержат 1, 2, 3 или 4 алифатических атома углерода. Подходящие алифатические группы включают без ограничения линейные или разветвленные, замещенные или незамещенные алкильные, алкенильные, алкинильные группы и их гибридные формы, такие как (циклоалкил)алкил, (циклоалкенил)алкил или (циклоалкил)алкенил.

[0032] Алкенил. Используемый в данном документе термин "алкенил" относится к алифатической группе, как определено в данном документе, имеющей одну или несколько двойных связей.

[0033] Алкил. Используемый в данном документе термин "алкил" имеет свое обычное значение в данной области техники и может включать насыщенные алифатические группы, включая алкильные группы с прямой цепью, алкильные группы с разветвленной цепью, циклоалкильные (алициклические) группы, алкилзамещенные циклоалкильные группы и циклоалкилзамещенные алкильные группы. В некоторых вариантах осуществления алкил содержит 1-100 атомов углерода. В определенных вариантах осуществления алкил с прямой цепью или разветвленной цепью содержит приблизительно 1-20 атомов углерода в своем остове (например, С₁-C₂₀ в случае прямой цепи, С₂-С₂₀ в случае разветвленной цепи) и альтернативно приблизительно 1-10. В некоторых вариантах осуществления циклоалкильные кольца содержат от приблизительно 3 до 10 атомов углерода в своей кольцевой структуре, при этом такие кольца являются моноциклическими, бициклическими или полициклическими, и альтернативно приблизительно 5, 6 или 7 атомов углерода в кольцевой структуре. В некоторых вариантах осуществления алкильная группа может представлять собой группу низшего алкила, где группа низшего алкила содержит 1-4 атома углерода (например, С₁-С₄ в случае низших алкилов с прямой цепью).

[0034] Алкинил. Используемый в данном документе термин "алкинил" относится к алифатической группе, как определено в данном документе, имеющей одну или несколько тройных связей.

[0035] Аналог. Термин "аналог" включает любой химический фрагмент, который отличается по структуре от эталонного химического фрагмента или класса фрагментов, но который способен к осуществлению по меньшей мере одной функции такого эталонного химического фрагмента или класса фрагментов. В качестве неограничивающих примеров аналог нуклеотида отличается по структуре от нуклеотида, но осуществляет по меньшей мере одну функцию нуклеотида; аналог нуклеинового основания отличается по структуре от нуклеинового основания, но осуществляет по меньшей мере одну функцию нуклеинового основания и т.д.

[0036] Животное. Используемый в данном документе термин "животное" относится к любому представителю царства Животные. В некоторых вариантах осуществления "животное" относится к человеку на любой стадии развития. В некоторых вариантах осуществления "животное" относится к отличным от человека животным на любой стадии развития. В определенных вариантах осуществления отличное от человека животное представляет собой млекопитающее (например, грызуна, мышь, крысу, кролика, обезьяну, собаку, кошку, овцу, крупный рогатый скот, примата и/или свинью). В некоторых вариантах осуществления животные включают без ограничений млекопитающих, птиц, рептилий, земноводных, рыб и/или червей. В некоторых вариантах осуществления животное может представлять собой трансгенное животное, генетически сконструированное животное и/или клон.

[0037] Антисмысловая. Используемый в данном документе термин "антисмысловой" относится к характеристике олигонуклеотида или другой нуклеиновой кислоты, имеющими последовательность оснований, комплементарную или по сути комплементарную нуклеиновой кислоте НТТ-мишени, с которой она способна гибридизоваться. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновая кислота НТТ-мишени представляет собой мРНК гена-мишени. В некоторых вариантах осуществления гибридизация необходима для одного вида активности или приводит к нему, например, к снижению уровня, экспрессии или активности нуклеиновой кислоты НТТ-мишени или ее генного продукта. Используемый в данном документе термин "антисмысловой олигонуклеотид" относится к олигонуклеотиду, комплементарному нуклеиновой кислоте НТТ-мишени. В некоторых вариантах осуществления антисмысловой олигонуклеотид способен управлять снижением уровня, экспрессии или активности нуклеиновой кислоты НТТ-мишени или ее продукта. В некоторых вариантах осуществления антисмысловой олигонуклеотид способен управлять снижением уровня, экспрессии или активности нуклеиновой кислоты НТТ-мишени или ее продукта посредством механизма, в который вовлечены РНКаза Н, стерическое затруднение и/или РНК-интерференция.

[0038] Арил. Используемый в данном документе термин "арил", который используется сам по себе или как часть более крупного фрагмента, такого как "аралкил", "аралкокси" или "арилоксиалкил", относится к моноциклическим, бициклическим или полициклическим кольцевым системам, имеющим суммарно от пяти до тридцати членов кольца, где по меньшей мере одно кольцо в системе является ароматическим. В некоторых вариантах осуществления арильная группа представляет собой моноциклическую, бициклическую или полициклическую кольцевую систему, имеющую суммарно от пяти до четырнадцати членов кольца, где по меньшей мере одно кольцо в системе является ароматическим, и где каждое кольцо в системе содержит от 3 до 7 членов кольца. В некоторых вариантах осуществления арильная группа представляет собой биарильную группу. Термин "арил" может использоваться взаимозаменяемо с термином "арильное кольцо". В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения "арил" относится к ароматической кольцевой системе, которая включает без ограничений фенил, бифенил, нафтил, бинафтил, антранил и т.п., которые могут нести один или несколько заместителей. Также в объем термина "арил", как он используется в данном документе, входит группа, в которой ароматическое кольцо конденсировано с одним или несколькими неароматическими кольцами, такая как инданил, фталимидил, нафтимидил, фенантридинил или тетрагидронафтил и т.п.

[0039] Контроль хиральности. Используемый в данном документе "контроль хиральности" относится к контролю стереохимического определения хирального атома фосфора в составе связи в хиральной межнуклеотидной связи в пределах олигонуклеотида. Используемая в данном документе хиральная межнуклеотидная связь представляет собой межнуклеотидную связь, в которой атом фосфора является хиральным. В некоторых вариантах осуществления контроль обеспечивается за счет хирального элемента, который отсутствует в сахарном фрагменте и фрагменте, являющемся основанием, олигонуклеотида, например, в некоторых вариантах осуществления контроль обеспечивается за счет применения одного или нескольких хиральных вспомогательных средств в ходе получения олигонуклеотида, как описано в настоящем изобретении, при этом хиральные вспомогательные средства зачастую являются частью хиральных фосфорамидитов, используемых в ходе получения олигонуклеотидов. Средний специалист в данной области техники понимает, что, в отличие от контроля хиральности, при традиционном олигонуклеотидном синтезе, который не предусматривает применения хиральных вспомогательных средств, невозможно осуществлять контроль стереохимии по хиральной межнуклеотидной связи, если такой традиционный олигонуклеотидный синтез используют для образования хиральной межнуклеотидной связи. В некоторых вариантах осуществления стереохимическое определение каждого хиральной атома фосфора в составе связи в каждой хиральной межнуклеотидной связи в пределах олигонуклеотида является контролируемым.

[0040] Композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиралъностью. Используемые в данном документе термины "композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью", "композиция на основе нуклеиновой кислоты с контролируемой хиральностью" и т.п. относятся к композиции, которая содержит совокупность олигонуклеотидов (или нуклеиновых кислот), которые характеризуются 1) общей последовательностью оснований, 2) общим паттерном связей остова и 3) общим паттерном модификаций по атому фосфора в остове, где совокупность олигонуклеотидов (или нуклеиновых кислот) характеризуются одинаковой стереохимией атома фосфора в составе связи в одной или нескольких хиральных межнуклеотидных связях (межнуклеотидных связях с контролируемой хиральностью или стереомерно задаваемых межнуклеотидных связях, в которых хиральный атом фосфора в составе связи представляет собой Rp или Sp в композиции ("стереомерно задаваемой"), а не случайную смесь Rp и Sp как у межнуклеотидных связей без контролируемой хиральности). Уровень совокупности олигонуклеотидов (или нуклеиновых кислот) в композиции на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью предварительно определен/контролируется (например, за счет получения олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью со стереоселективным образованием одной или нескольких хиральных межнуклеотидных связей). В некоторых вариантах осуществления приблизительно 1%-100% (например, приблизительно 5%-100%, 10%-100%, 20%-100%, 30%-100%, 40%-100%, 50%-100%, 60%-100%, 70%-100%, 80-100%, 90-100%, 95-100%, 50%-90%, или приблизительно 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100%, или по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, или 99%) от всех олигонуклеотидов в композиции на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью представляют собой олигонуклеотиды из совокупности. В некоторых вариантах осуществления приблизительно 1%-100% (например, приблизительно 5%-100%, 10%-100%, 20%-100%, 30%-100%, 40%-100%, 50%-100%, 60%-100%, 70%-100%, 80-100%, 90-100%, 95-100%, 50%-90%, или приблизительно 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100%, или по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, или 99%) от всех олигонуклеотидов в композиции на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, которые характеризуются общей последовательностью оснований, общим паттерном связей остова и общим паттерном модификаций по атому фосфора в остове, представляют собой олигонуклеотиды из совокупности. В некоторых вариантах осуществления уровень составляет приблизительно 1%-100% (например, приблизительно 5%-100%, 10%-100%, 20%-100%, 30%-100%, 40%-100%, 50%-100%, 60%-100%, 70%-100%, 80-100%, 90-100%, 95-100%, 50%-90%, или приблизительно 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100%, или по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, или 99%) от всех олигонуклеотидов в композиции, или от всех олигонуклеотидов в композиции, которые характеризуются общей последовательностью оснований (например, из совокупности олигонуклеотидов или типов олигонуклеотидов), или от всех олигонуклеотидов в композиции, которые характеризуются общей последовательностью оснований, общим паттерном связей остова и общим паттерном модификаций по атому фосфора в остове, или от всех олигонуклеотидов в композиции, которые характеризуются общей последовательностью оснований, общим паттерном модификаций оснований, общим паттерном модификаций сахара, общим паттерном типов межнуклеотидных связей и/или общим паттерном модификаций межнуклеотидных связей. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды в совокупности характеризуются одинаковой стереохимией по приблизительно 1-50 (например, приблизительно 1-10, 1-20, 5-10, 5-20, 10-15, 10-20, 10-25, 10-30, или приблизительно 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, или 20, или по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, или 20) хиральным межнуклеотидным связям. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды в совокупности характеризуются одинаковой стереохимией по приблизительно 1%-100% (например, приблизительно 5%-100%, 10%-100%, 20%-100%, 30%-100%, 40%-100%, 50%-100%, 60%-100%, 70%-100%, 80-100%, 90-100%, 95-100%, 50%-90%, приблизительно 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 100%, или по меньшей мере 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 99%) хиральных межнуклеотидных связей. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды (или нуклеиновые кислоты) из совокупности имеют одинаковый состав. В некоторых вариантах осуществления уровень олигонуклеотидов (или нуклеиновых кислот) совокупности составляет приблизительно 1%-100%, (например, приблизительно 5%-100%, 10%-100%, 20%-100%, 30%-100%, 40%-100%, 50%-100%, 60%-100%, 70%-100%, 80-100%, 90-100%, 95-100%, 50%-90%, или приблизительно 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100%, или по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, или 99%) от всех олигонуклеотидов (или нуклеиновых кислот) в композиции, которые характеризуются таким же составом, что и олигонуклеотиды (или нуклеиновые кислоты) совокупности. В некоторых вариантах осуществления каждая хиральная межнуклеотидная связь представляет собой межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью, а композиция представляет собой композицию на основе олигонуклеотида с полностью контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды (или нуклеиновые кислоты) совокупности являются идентичными по структуре. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь с контролируемой хиральностью характеризуется диастереомерной чистотой, составляющей по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 99,5%, как правило, по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 99,5%. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь с контролируемой хиральностью характеризуется диастереомерной чистотой, составляющей по меньшей мере 95%. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь с контролируемой хиральностью характеризуется диастереомерной чистотой, составляющей по меньшей мере 96%. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь с контролируемой хиральностью характеризуется диастереомерной чистотой, составляющей по меньшей мере 97%. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь с контролируемой хиральностью характеризуется диастереомерной чистотой, составляющей по меньшей мере 98%. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь с контролируемой хиральностью характеризуется диастереомерной чистотой, составляющей по меньшей мере 99%. В некоторых вариантах осуществления процентный показатель уровня составляет или составляет по меньшей мере (DS)^nc, где DS представляет собой диастереомерную чистоту, как описано в настоящем изобретении (например, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 99,5% или больше), а nc представляет собой число межнуклеотидных связей с контролируемой хиральностью, как описано в настоящем изобретении (например, 1-50, 1-40, 1-30, 1-25, 1-20, 5-50, 5-40, 5-30, 5-25, 5-20, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 или больше). В некоторых вариантах осуществления процентный показатель уровня составляет или составляет по меньшей мере (DS)^nc, где DS составляет 95%-100%. Например, если DS составляет 99%, а nc составляет 10, процентный показатель составляет или составляет по меньшей мере 90% ((99%)¹⁰≈0,90=90%). В некоторых вариантах осуществления уровень совокупности олигонуклеотидов в композиции представлен как произведение диастереомерной чистоты каждой межнуклеотидной связи с контролируемой хиральностью в олигонуклеотидах. В некоторых вариантах осуществления диастереомерная чистота межнуклеотидной связи, соединяющей два нуклеозида в олигонуклеотиде (или нуклеиновой кислоте), представлена диастереомерной чистотой межнуклеотидной связи димера, соединяющего те же два нуклеозида, где димер получают в сравнимых условиях, в некоторых случаях в условиях идентичного синтетического цикла (например, для связи между Nx и Ny в олигонуклеотиде …NxNy… димером является NxNy). В некоторых вариантах осуществления не все хиральные межнуклеотидные связи представляют собой межнуклеотидные связи с контролируемой хиральностью, а композиция представляет собой композицию на основе олигонуклеотида с частично контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь без контролируемой хиральности характеризуется диастереомерной чистотой, составляющей менее приблизительно 80%, 75%, 70%, 65%, 60%, 55% или приблизительно 50%, что, как правило, наблюдают в композициях на основе стереомерно неупорядоченных олигонуклеотидов (например, как понятно специалистам в данной области техники, при традиционном олигонуклеотидном синтезе, например, фосфорамидитном способе). В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды (или нуклеиновые кислоты) совокупности относятся к одному типу. В некоторых вариантах осуществления композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью содержит неслучайные или контролируемые уровни отдельных олигонуклеотидных типов или типов нуклеиновых кислот. Например, в некоторых вариантах осуществления композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью содержит один и не более одного типа олигонуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью содержит более одного типа олигонуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью содержит несколько типов олигонуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью представляет собой композицию на основе олигонуклеотидов, относящихся к одному типу олигонуклеотидов, при этом композиция содержит неслучайный или контролируемый уровень совокупности олигонуклеотидов, относящихся к данному типу олигонуклеотидов.

[0041] Сопоставимый. Термин "сопоставимый" используется в данном документе для описания двух (или более) наборов условий или обстоятельств, которые достаточно схожи друг с другом, чтобы позволить сравнение полученных результатов или наблюдаемых явлений. В некоторых вариантах осуществления сопоставимые наборы условий или обстоятельств характеризуются совокупностью по сути идентичных признаков и одним или небольшим числом изменяемых признаков. Средние специалисты в данной области техники поймут, что наборы условий сопоставимы друг с другом, если они характеризуются достаточным числом и типом по сути идентичных признаков, чтобы сделать обоснованное заключение о том, что отличия в полученных результатах или явлениях, наблюдаемых при разных наборах условий или обстоятельств, вызваны изменением или свидетельствуют об изменении тех признаков, которые изменяются.

[0042] Циклоалифатическая группа. Термины "циклоалифатическая группа", "карбоцикл", "карбоциклил", "карбоциклический радикал" и "карбоциклическое кольцо" используются взаимозаменяемо и при использовании в данном документе относятся к насыщенным или частично ненасыщенным, но не ароматическим, циклическим алифатическим моноциклическим, бициклическим или полициклическим кольцевым системам, как описано в данном документе, имеющим, если не указано иное, от 3 до 30 членов кольца. Циклоалифатические группы включают без ограничения циклопропил, циклобутил, циклопентил, циклопентенил, циклогексил, циклогексенил, циклогептил, циклогептенил, циклооктил, циклооктенил, норборнил, адамантил и циклооктадиенил. В некоторых вариантах осуществления циклоалифатическая группа содержит 34) атомов углерода. В некоторых вариантах осуществления циклоалифатическая группа является насыщенной и представляет собой циклоалкил. Термин "циклоалифатический" может также включать алифатические кольца, которые конденсированы с одним или несколькими ароматическими или неароматическими кольцами, такие как декагидронафтил или тетрагидронафтил. В некоторых вариантах осуществления циклоалифатическая группа является бициклической. В некоторых вариантах осуществления циклоалифатическая группа является трициклической. В некоторых вариантах осуществления циклоалифатическая группа является полициклической. В некоторых вариантах осуществления "циклоалифатический" относится к моноциклическому С₃-С₆углеводороду или бициклическому или полициклическому С₈-С₁₀углеводороду, который является полностью насыщенным или который содержит одно или несколько звеньев с ненасыщенной связью, но не является ароматическим, который имеет единственную точку присоединения к остальной части молекулы, или полициклическому С₉-С₁₆углеводороду, который является полностью насыщенным или который содержит одно или несколько звеньев с ненасыщенной связью, но не является ароматическим, который имеет единственную точку присоединения к остальной части молекулы.

[0043] Гэпмер. Используемый в данном документе термин "гэпмер" относится к олигонуклеотиду, характеризующемуся тем, что он содержит кор, фланкированный 5'- и 3'-крылом. В некоторых вариантах осуществления в гэпмере по меньшей мере одна межнуклеотидная фосфорная связь олигонуклеотида представляет собой природную фосфатную связь. В некоторых вариантах осуществления более чем одна межнуклеотидная фосфорная связь олигонуклеотидной нити представляет собой природную фосфатную связь. В некоторых вариантах осуществления гэпмер представляет собой гэпмер с модификацией сахара, где каждый сахар крыла независимо содержит модификацию сахара, и ни один сахар кора не содержит модификацию сахара, обнаруживаемую в сахаре крыла. В некоторых вариантах осуществления каждый сахар кора не содержит модификацию и является 2'-незамещенным (как в природной ДНК). В некоторых вариантах осуществления каждый сахар крыла представляет собой независимо 2'-модифицированный сахар. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один сахар крыла представляет собой бициклический сахар. В некоторых вариантах осуществления сахарные звенья в каждом крыле имеют одинаковую модификацию сахара (например, 2'-ОМе-сахар (2'-ОМе крыло), 2'-МОЕ-сахар (2'-МОЕ крыло) и т.д.). В некоторых вариантах осуществления каждый сахар крыла имеет одинаковую модификацию. Длина кора и крыла могут быть различными. В некоторых вариантах осуществления длина крыла составляет 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 нуклеозидов или больше (во многих вариантах осуществления 3, 4, 5 или 6 или больше), а длина кора составляет 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 нуклеозидов или больше (во многих вариантах осуществления 8, 9, 10, 11, 12 или больше). В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид содержит структуру крыло-кор-крыло, содержащую 2-9-6, 3-9-3, 3-9-4, 3-9-5, 4-7-4, 4-9-4, 4-9-5, 4-10-5, 4-11-4, 4-11-5, 5-7-5, 5-8-6, 5-9-3, 5-9-5, 5-10-4, 5-10-5, 6-7-6, 6-8-5, или 6-9-2 или состоит из нее. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид представляет собой гэпмер.

[0044] Гетероалифатическая группа. Используемый в данном документе термин "гетероалифатическая группа" имеет его обычное значение в данной области техники и относится к алифатическим группам, как описано в данном документе, в которых один или несколько атомов углерода независимо заменены одним или несколькими гетероатомами (например, атомом кислорода, азота, серы, кремния, фосфора и т.п.). В некоторых вариантах осуществления одно или несколько звеньев, выбранных из С, СН, СН₂ и СН₃, независимо заменены одним или несколькими гетероатомами (включая их окисленные и/или замещенные формы). В некоторых вариантах осуществления гетероалифатическая группа представляет собой гетероалкил. В некоторых вариантах осуществления гетероалифатическая группа представляет собой гетероалкенил.

[0045] Гетероалкил. Используемый в данном документе термин "гетероалкил" имеет его обычное значение в данной области техники и относится к алкильным группам, как описано в данном документе, в которых один или несколько атомов углерода независимо заменены одним или несколькими гетероатомами (например, атомом кислорода, азота, серы, кремния, фосфора и т.п.). Примеры гетероалкильных групп включают без ограничений алкокси, поли(этиленгликоль)-, алкилзамещенную аминогруппу, тетрагидрофуранил, пиперидинил, морфолинил и т.д.

[0046] Гетероарил. Используемые в данном документе термины "гетероарил" и "гетероар-", которые используются сами по себе или как часть более крупного фрагмента, например, "гетероаралкил" или "гетероаралкокси", относятся к моноциклическим, бициклическим или полициклическим кольцевым системам, имеющим суммарно от пяти до тридцати членов кольца, где по меньшей мере одно кольцо в системе является ароматическим, и по меньшей мере один атом ароматического кольца представляет собой гетероатом. В некоторых вариантах осуществления гетероарильная группа представляет собой группу, имеющую от 5 до 10 атомов кольца (т.е. моноциклическую, бициклическую или полициклическую), в некоторых вариантах осуществления 5, 6, 9 или 10 атомов кольца. В некоторых вариантах осуществления гетероарильная группа имеет 6, 10 или 14 π-электронов, обобществленных в циклической структуре; и кроме атомов углерода имеет от одного до пяти гетероатомов. Гетероарильные группы включают без ограничения тиенил, фуранил, пирролил, имидазолил, пиразолил, триазолил, тетразолил, оксазолил, изоксазолил, оксадиазолил, тиазолил, изотиазолил, тиадиазолил, пиридил, пиридазинил, пиримидинил, пиразинил, индолизинил, пуринил, нафтиридинил и птеридинил. В некоторых вариантах осуществления гетероарил представляет собой гетеробиарильную группу, такую как бипиридил и т.п. Используемые в данном документе термины "гетероарил" и "гетероар-" также включают группы, в которых гетероароматическое кольцо конденсировано с одним или несколькими арильными, циклоалифатическими или гетероциклильными кольцами, где радикал или точка присоединения расположены на гетероароматическом кольце. Неограничивающие примеры включают индолил, изоиндолил, бензотиенил, бензофуранил, дибензофуранил, индазолил, бензимидазолил, бензтиазолил, хинолил, изохинолил, циннолинил, фталазинил, хиназолинил, хиноксалинил, 4H-хинолизинил, карбазолил, акридинил, феназинил, фенотиазинил, феноксазинил, тетрагидрохинолинил, тетрагидроизохинолинил и пиридо[2,3-b]-1,4-оксазин-3-(4Н)-он. Гетероарильная группа может быть моноциклической, бициклической или полициклической. Термин "гетероарил" может использоваться взаимозаменяемо с терминами "гетероарильное кольцо", "гетероарильная группа" или "гетероароматический", при этом любой из этих терминов включает кольца, которые являются необязательно замещенными. Термин "гетероаралкил" относится к алкильной группе, замещенной гетероарильной группой, где алкильная и гетероарильная части независимо являются необязательно замещенными.

[0047] Гетероатом. Используемый в данном документе термин "гетероатом" означает атом, который не является атомом углерода или водорода. В некоторых вариантах осуществления гетероатом представляет собой атом бора, кислорода, серы, азота, фосфора или кремния (включая любую окисленную форму атома азота, серы, фосфора или кремния; четвертичную форму любого основного азота или замещаемый азот гетероциклического кольца (например, N как в 3,4-дигидро-2H-пирролиле), NH (как в пирролидиниле) или NR⁺ (как в N-замещенном пирролидиниле) и т.д.); в некоторых вариантах осуществления гетероатом представляет собой атом кислорода, серы или азота.

[0048] Гетероцикл. Используемые в данном документе термины "гетероцикл", "гетероциклил", "гетероциклический радикал" и "гетероциклическое кольцо" используются взаимозаменяемо и относятся к фрагменту, представляющему собой моноциклическое, бициклическое или полициклическое кольцо (например, 3-30-членное), которое является насыщенным или частично ненасыщенным и имеет один или несколько гетероатомов, являющихся атомами кольца. В некоторых вариантах осуществления гетероциклильная группа представляет собой стабильный 5-7-членный моноциклический или 7-10-членный бициклический гетероциклический фрагмент, который является либо насыщенным, либо частично ненасыщенным и кроме атомов углерода содержит один или несколько, предпочтительно от одного до четырех, гетероатомов, как определено выше. При использовании в отношении атома кольца гетероцикла термин "атом азота" включает замещенный атом азота. Например, в насыщенном или частично ненасыщенном кольце, содержащем 0-3 гетероатома, выбранные из атомов кислорода, серы и азота, атом азота может представлять собой N (как в 3,4-дигидро-2H-пирролиле), NH (как в пирролидиниле) или +NR (как в N-замещенном пирролидиниле). Гетероциклическое кольцо может быть присоединено к своей боковой группе по любому гетероатому или атому углерода, что приводит к стабильной структуре, и при этом любой из атомов кольца может быть необязательно замещенным. Примеры таких насыщенных или частично ненасыщенных гетероциклических радикалов включают без ограничения тетрагидрофуранил, тетрагидротиенил, пирролидинил, пиперидинил, пирролинил, тетрагидрохинолинил, тетрагидроизохинолинил, декагидрохинолинил, оксазолидинил, пиперазинил, диоксанил, диоксоланил, диазепинил, оксазепинил, тиазепинил, морфолинил и хинуклидинил. Термины "гетероцикл", "гетероциклил", "гетероциклильное кольцо", "гетероциклическая группа", "гетероциклический фрагмент" и "гетероциклический радикал" используются в данном документе взаимозаменяемо и также включают группы, в которых гетероциклильное кольцо конденсировано с одним или несколькими арильными, гетероарильными или циклоалифатическими кольцами, такие как индолинил, 3H-индолил, хроманил, фенантридинил или тетрагидрохинолинил. Гетероциклильная группа может быть моноциклической, бициклической или полициклической. Термин "гетероциклилалкил" относится к алкильной группе, замещенной гетероциклилом, где алкильная и гетероциклильная части независимо являются необязательно замещенными.

[0049] Гомология. Термины "гомология", или "идентичность", или "сходство" относятся к сходству последовательностей между двумя молекулами нуклеиновой кислоты. Каждую из гомологии и идентичности можно определять путем сравнения положения в каждой последовательности, которые можно выравнивать для целей сравнения. Если эквивалентное положение в сравниваемых последовательностях занято одним и тем же основанием, то молекулы являются идентичными по этому положению; если эквивалентный сайт занят таким же или сходным остатком нуклеиновой кислоты (например, сходным по стерической и/или электронной природе), то молекулы можно называть гомологичными (сходными) по этому положению. Выражение гомологии/сходства или идентичности в виде процентного показателя относится к функции числа идентичных или сходных нуклеиновых кислот в положениях, общих для сравниваемых последовательностей. В некоторых вариантах осуществления последовательность, которая является "неродственной" или "негомологичной", характеризуется менее чем 40% идентичностью, менее чем 35% идентичностью, менее чем 30% идентичностью или менее чем 25% идентичностью с последовательностью, описанной в данном документе. При сравнении двух последовательностей отсутствие остатков (аминокислот или нуклеиновых кислот) или присутствие дополнительных остатков также снижает идентичность и гомологию/сходство. В некоторых вариантах осуществления считается, что полимерные молекулы (например, олигонуклеотиды, нуклеиновые кислоты, белки и т.д.) являются "гомологичными" друг другу, если их последовательности идентичны на по меньшей мере 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 99%. В некоторых вариантах осуществления считается, что полимерные молекулы являются "гомологичными" друг другу, если их последовательности сходны на по меньшей мере 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 99%.

[0050] В некоторых вариантах осуществления термин "гомология" описывает математически обоснованное сравнение сходства последовательностей, которое используют для идентификации генов со сходными функциями или мотивами. Последовательности нуклеиновых кислот, описанные в данном документе, можно использовать в качестве "запрашиваемой последовательности" для выполнения поиска в общедоступных базах данных, например, для идентификации других членов семейства, родственных последовательностей или гомологов. В некоторых вариантах осуществления такие поиски можно выполнять с использованием программ NBLAST и XBLAST (версия 2.0) no Altschul, et al. (1990) J. Mol. Biol. 215:403-10. В некоторых вариантах осуществления нуклеотидные поиски BLAST можно выполнять с помощью программы NBLAST, балл = 100, длина слова = 12, для получения нуклеотидных последовательностей, гомологичных молекулам нуклеиновых кислот по настоящему изобретению. В некоторых вариантах осуществления для получения выравниваний с гэпами для целей сравнения можно использовать программу Gapped BLAST, описанную в Altschul et al., (1997) Nucleic Acids Res. 25(17):3389-3402. При использовании программ BLAST и Gapped BLAST можно использовать параметры по умолчанию соответствующих программ (например, XBLAST и BLAST) (см. www.ncbi.nlm.nih.gov).

[0051] Идентичность. Используемый в данном документе термин "идентичность" относится к общему родству между полимерными молекулами, например, между молекулами нуклеиновых кислот (например, олигонуклеотидами, ДНК, РНК и т.д.) и/или между полипептидными молекулами. В некоторых вариантах осуществления считается, что полимерные молекулы являются "по сути идентичными" друг другу, если их последовательности идентичны на по меньшей мере 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 99%. Расчет процента идентичности двух последовательностей нуклеиновой кислоты или полипептидных последовательностей, например, можно выполнять путем выравнивания двух последовательностей для целей оптимального сравнения (например, для оптимального выравнивания в одну или обе из первой и второй последовательностей можно вводить гэпы, а неидентичные последовательности можно не принимать во внимание для целей сравнения). В определенных вариантах осуществления длина последовательности, подвергаемой выравниванию для целей сравнения, составляет по меньшей мере 30%, по меньшей мере 40%, по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 95% или по существу 100% от длины эталонной последовательности. Затем сравнивают нуклеотиды в соответствующих положениях. Если положение в первой последовательности занято тем же остатком (например, нуклеотидом или аминокислотой), что и соответствующее положение во второй последовательности, то молекулы являются идентичными по данному положению. Процент идентичности между двумя последовательностями является функцией числа идентичных положений, общих для последовательностей, с учетом числа гэпов и длины каждого гэпа, которые необходимо вводить для оптимального выравнивания двух последовательностей. Сравнение последовательностей и определение процента идентичности между двумя последовательностями можно выполнять с использованием математического алгоритма. Например, процент идентичности между двумя нуклеотидными последовательностями можно определить с помощью алгоритма Мейерса и Миллера (CABIOS, 1989, 4: 11-17), который включен в программу ALIGN (версия 2.0). В некоторых иллюстративных вариантах осуществления при сравнениях последовательностей нуклеиновых кислот, выполняемых с помощью программы ALIGN, используют таблицу весов замен остатков РАМ120, штраф за длину гэпа, составляющий 12, и штраф за введение гэп, составляющий 4. Альтернативно процент идентичности между двумя нуклеотидными последовательностями можно определить с помощью программы GAP в пакете программного обеспечения GCG с использованием матрицы NWSgapdna.CMP.

[0052] Межнуклеотидная связь. Используемая в данном документе фраза "межнуклеотидная связь" в целом относится к связи, соединяющей нуклеозидные звенья олигонуклеотида или нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь представляет собой фосфодиэфирную связь, которая в широко распространена во встречающихся в природе молекулах ДНК и РНК (природная фосфатная связь (-ОР(=0)(ОН)O-), которая, как понятно специалистам в данной области техники, может существовать в виде солевой формы). В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь представляет собой модифицированную межнуклеотидную связь (а не природную фосфатную связь). В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь представляет собой "модифицированную межнуклеотидную связь", где по меньшей мере один атом кислорода или группа -ОН фосфодиэфирной связи заменены другим органическим или неорганическим фрагментом. В некоторых вариантах осуществления такой органический или неорганический фрагмент выбирают из =S, =Se, =NR', -SR', -SeR', N(R)₂, B(R')₃, S, -Se- и -N(R')-, где каждый R' независимо является таким, как определено и описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь представляет собой фосфотриэфирную связь, фосфотиоатную связь (или фосфотиоатную диэфирную связь, -OP(=O)(SH)O-, которая, как понятно специалистам в данной области техники, может существовать в виде солевой формы) или фосфотиоатную триэфирную связь. В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой фосфотиоатную связь. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь представляет собой одну из связей, образующих, например, PNA (пептидную нуклеиновую кислоту) или РМО (морфолино-фосфодиамидатный олигомер). В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой межнуклеотидную связь, не являющуюся отрицательно заряженной. В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой нейтральную межнуклеотидную связь (например, n001 в определенных представленных олигонуклеотидах). Специалисту в данной области техники понятно, что при заданном рН межнуклеотидная связь может существовать в виде аниона или катиона из-за присутствия кислых или основных фрагментов в связи. В некоторых вариантах осуществления модифицированные межнуклеотидные связи представляют собой модифицированные межнуклеотидные связи, обозначенные как s, s1, s2, s3, s4, s5, s6, s7, s8, s9, s10, s11, s12, s13, s14, s15, s16, s17 и s18, описанные в WO 2017/210647.

[0053] In vitro. Используемый в данном документе термин "in vitro" относится к событиям, которые происходят в искусственной среде, например, в пробирке или реакционном сосуде, в культуре клеток и т.д., а не внутри организма (например, животного, растения и/или микроорганизма).

[0054] In vivo. Используемый в данном документе термин "in vivo" относится к событиям, которые происходят внутри организма (например, животного, растения и/или микроорганизма).

[0055] Атом фосфора в составе связи. Как определено в данном документе, фразу "атом фосфора в составе связи" используют для обозначения того, что конкретный атом фосфора, о котором идет речь, представляет собой атом фосфора, присутствующий в межнуклеотидной связи, при этом атом фосфора соответствует атому фосфора в составе фосфодиэфирной межнуклеотидной связи, которая присутствует во встречающейся в природе ДНК и РНК. В некоторых вариантах осуществления атом фосфора в составе связи находится в составе модифицированной межнуклеотидной связи, где каждый атом кислорода фосфодиэфирной связи необязательно и независимо заменен органическим или неорганическим фрагментом. В некоторых вариантах осуществления атом фосфора в составе связи представляет собой Р в формуле I, как определено в данном документе. В некоторых вариантах осуществления атом фосфора в составе связи является хиральным. В некоторых вариантах осуществления атом фосфора в составе связи является ахиральным (например, как в природных фосфатных связях).

[0056] Линкер. Термины "линкер", "линкерный фрагмент" и т.п. относятся к любому химическому фрагменту, который соединяет один химический фрагмент с другим. Как понятно специалистам в данной области техники, линкер может быть двухвалентным или трехвалентным, или иметь большую валентность, в зависимости от числа химических фрагментов, которые соединяет линкер. В некоторых вариантах осуществления линкер представляет собой фрагмент, который соединяет один олигонуклеотид с другим олигонуклеотидом в мультимере. В некоторых вариантах осуществления линкер представляет собой фрагмент, необязательно расположенный между концевым нуклеозидом и твердой подложкой или между концевым нуклеозидом и другим нуклеозидом, нуклеотидом или нуклеиновой кислотой. В некоторых вариантах осуществления в олигонуклеотиде линкер соединяет химический фрагмент (например, нацеливающий фрагмент, липидный фрагмент, углеводный фрагмент и т.д.) с олигонуклеотидной цепью (например, через ее 5'-конец, 3'-конец, азотистое основание, сахар, межнуклеотидную связь и т.д.)

[0057] Низший алкил. Термин "низший алкил" относится к группе прямого или разветвленного C_1-4алкила. Примерами групп низших алкилов являются метил, этил, пропил, изопропил, бутил, изобутил и трет-бутил.

[0058] Низший галогеналкил. Термин "низший галогеналкил" относится к группе прямого или разветвленного С_1-4алкила, который замещен одним или несколькими атомами галогена.

[0059] Модифицированное нуклеиновое основание. Термины "модифицированное нуклеиновое основание", "модифицированное основание" и т п. относятся к химическому фрагменту, который отличается химической природой от нуклеинового основания, но который способен к осуществлению по меньшей мере одной функции нуклеинового основания. В некоторых вариантах осуществления модифицированное нуклеиновое основание представляет собой нуклеиновое основание, которое содержит модификацию. В некоторых вариантах осуществления модифицированное нуклеиновое основание способно к осуществлению по меньшей мере одной функции нуклеинового основания, например, образованию фрагмента в полимере, способного к образованию пар оснований с нуклеиновой кислотой, содержащей по меньшей мере комплементарную последовательность оснований. В некоторых вариантах осуществления модифицированное нуклеиновое основание представляет собой замещенный А, Т, С, G или U или замещенный таутомер А, Т, С, G или U. В некоторых вариантах осуществления модифицированное нуклеиновое основание в контексте олигонуклеотидов относится к нуклеиновому основанию, отличному от А, Т, С, G или U.

[0060] Модифицированный нуклеозид. Термин "модифицированный нуклеозид" относится к фрагменту, полученному из природного нуклеозида или химически подобного ему, но который содержит химическую модификацию, которая позволяет распознавать его от природного нуклеозида. Неограничивающие примеры модифицированных нуклеозидов включают нуклеозиды, которые содержат модификацию основания и/или сахара. Неограничивающие примеры модифицированных нуклеозидов включают нуклеозиды, которые содержат 2'-модификацию сахара. Неограничивающие примеры модифицированных нуклеозидов также включают нуклеозиды с удаленным азотистым основанием (в которых отсутствует нуклеиновое основание). В некоторых вариантах осуществления модифицированный нуклеозид способен к осуществлению по меньшей мере одной функции нуклеозида, например, образованию фрагмента в полимере, способного к образованию пар оснований с нуклеиновой кислотой, содержащей по меньшей мере комплементарную последовательность оснований.

[0061] Модифицированный нуклеотид. Термин "модифицированный нуклеотид" включает любой химический фрагмент, который отличается по структуре от природного нуклеотида, но который способен к осуществлению по меньшей мере одной функции природного нуклеотида. В некоторых вариантах осуществления модифицированный нуклеотид содержит модификацию сахара, основания и/или межнуклеотидной связи. В некоторых вариантах осуществления модифицированный нуклеотид содержит модифицированный сахар, модифицированное нуклеиновое основание и/или модифицированную межнуклеотидную связь. В некоторых вариантах осуществления модифицированный нуклеотид способен к осуществлению по меньшей мере одной функции нуклеотида, например, образованию субъединицы в полимере, способной к образованию пар оснований с нуклеиновой кислотой, содержащей по меньшей мере комплементарную последовательность оснований.

[0062] Модифицированный сахар. Термин "модифицированный сахар" относится к фрагменту, который может заменять сахар. Модифицированный сахар имитирует пространственное расположение, электронные свойства или какое-то другое физико-химическое свойство сахара. В некоторых вариантах осуществления, как описано в настоящем изобретении, модифицированный сахар представляет собой замещенную рибозу или дезоксирибозу. В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар содержит 2'-модификацию. Примеры применимой 2'-модификации широко используются в данной области техники и описаны в данном документе. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-OR, где R представляет собой необязательно замещенную С_1-10алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-ОМе. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-МОЕ. В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар представляет собой бициклический сахар (например, сахар, используемый в LNA, BNA и т.д.). В некоторых вариантах осуществления в контексте олигонуклеотидов модифицированный сахар представляет собой сахар, который не является рибозой или дезоксирибозой, которые обычно встречаются в природной РНК или ДНК.

[0063] Нуклеиновая кислота. Используемый в данном документе термин "нуклеиновая кислота" включает любые нуклеотиды и их полимеры. Используемый в данном документе термин "полинуклеотид" относится к полимерной форме любой длины, состоящей из нуклеотидов, либо из рибонуклеотидов (РНК), либо из дезоксирибонуклеотидов (ДНК), либо их комбинации. Данные термины относятся к первичной структуре молекул и, таким образом, включают двух- и однонитевую ДНК, а также двух- и однонитевую РНК. В качестве эквивалентов данные термины включают аналоги РНК или ДНК, содержащие модифицированные нуклеотиды и/или модифицированные полинуклеотиды, такие как без ограничения метилированные, защищенные и/или кэппированные нуклеотиды или полинуклеотиды. Термины охватывают поли- или олигорибонуклеотиды (РНК) и поли- или олигодезоксирибонуклеотиды (ДНК); РНК или ДНК, полученную из N-гликозидов или С-гликозидов нуклеиновых оснований и/или модифицированных нуклеиновых оснований; нуклеиновые кислоты, полученные из сахаров и/или модифицированных сахаров; и нуклеиновые кислоты, полученные из фосфатных мостиков и/или модифицированных межнуклеотидных связей. Термин охватывает нуклеиновые кислоты, содержащие любые комбинации нуклеиновых оснований, модифицированных нуклеиновых оснований, сахаров, модифицированных сахаров, фосфатных мостиков или модифицированных межнуклеотидных связей. Примеры включают без ограничений нуклеиновые кислоты, содержащие рибозные фрагменты, нуклеиновые кислоты, содержащие дезоксирибозные фрагменты, нуклеиновые кислоты, содержащие как рибозные, так и дезоксирибозные фрагменты, нуклеиновые кислоты, содержащие рибозные фрагменты и модифицированные рибозные фрагменты. Если не указано иное, то префикс поли- относится к нуклеиновой кислоте, содержащей от 2 до приблизительно 10000 нуклеотидных мономерных звеньев, и где префикс олиго- относится к нуклеиновой кислоте, содержащей от 2 до приблизительно 200 нуклеотидных мономерных звеньев.

[0064] Нуклеиновое основание. Термин "нуклеиновое основание" относится к частям нуклеиновых кислот, которые вовлечены в образование водородной связи, которая связывает одну нить нуклеиновой кислоты с другой комплементарной нитью специфическим для последовательности образом. Наиболее распространенными встречающимися в природе нуклеиновыми основаниям являются аденин (А), гуанин (G), урацил (U), цитозин (С) и тимин (Т). В некоторых вариантах осуществления встречающиеся в природе нуклеиновые основания представляют собой модифицированные аденин, гуанин, урацил, цитозин или тимин. В некоторых вариантах осуществления встречающиеся в природе нуклеиновые основания представляют собой метилированные аденин, гуанин, урацил, цитозин или тимин. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание содержит гетероарильное кольцо, где атом кольца представляет собой атом азота, и в составе нуклеозида атом азота связан с сахарным фрагментом. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание содержит гетероциклическое кольцо, где атом кольца представляет собой атом азота, и в составе нуклеозида атом азота связан с сахарным фрагментом. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой "модифицированное нуклеиновое основание", нуклеиновое основание, отличное от аденина (А), гуанина (G), урацила (U), цитозина (С) и тимина (Т). В некоторых вариантах осуществления модифицированное нуклеиновое основание представляет собой замещенный А, Т, С, G или U. В некоторых вариантах осуществления модифицированное нуклеиновое основание представляет собой замещенный таутомер А, Т, С, G или U. В некоторых вариантах осуществления модифицированные нуклеиновые основания представляют собой метилированные аденин, гуанин, урацил, цитозин или тимин. В некоторых вариантах осуществления модифицированное нуклеиновое основание имитирует пространственное расположение, электронные свойства или какое-либо другое физико-химическое свойство нуклеинового основания и сохраняет свойство образования водородной связи, которая связывает одну нить нуклеиновой кислоты с другой специфическим для последовательности образом. В некоторых вариантах осуществления модифицированное нуклеиновое основание может образовывать пару со всеми пятью встречающимися в природе основаниями (урацилом, тимином, аденином, цитозином или гуанином), не оказывая существенного воздействия на характер плавления, распознавание внутриклеточными ферментами или активность олигонуклеотидного дуплекса. Используемый в данном документе термин "нуклеиновое основание" также охватывает структурные аналоги, используемые вместо природных или встречающихся в природе нуклеотидов, такие как модифицированные нуклеиновые основания и аналоги нуклеиновых оснований. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой необязательно замещенный А, Т, С, G или U или необязательно замещенный таутомер А, Т, С, G или U. В некоторых вариантах осуществления "нуклеиновое основание" относится к звену, содержащему нуклеиновое основание, в олигонуклеотиде или нуклеиновой кислоте (например, А, Т, С, G или U в олигонуклеотиде или нуклеиновой кислоте).

[0065] Нуклеозид. Термин "нуклеозид" относится к фрагменту, в котором нуклеиновое основание или модифицированное нуклеиновое основание ковалентно связано с сахаром или модифицированным сахаром. В некоторых вариантах осуществления нуклеозид представляет собой природный нуклеозид, например аденозин, дезоксиаденозин, гуанозин, дезоксигуанозин, тимидин, уридин, цитидин или дезоксицитидин. В некоторых вариантах осуществления нуклеозид представляет собой модифицированный нуклеозид, например, замещенный природный нуклеозид, выбранный из аденозина, дезоксиаденозина, гуанозина, дезоксигуанозина, тимидина, уридина, цитидина и дезоксицитидина. В некоторых вариантах осуществления нуклеозид представляет собой модифицированный нуклеозид, например, замещенный таутомер природного нуклеозида, выбранный из аденозина, дезоксиаденозина, гуанозина, дезоксигуанозина, тимидина, уридина, цитидина и дезоксицитидина. В некоторых вариантах осуществления "нуклеозид" относится к нуклеозидному звену в олигонуклеотиде или нуклеиновой кислоте.

[0066] Аналог нуклеозида. Термин "аналог нуклеозида" относится к химическому фрагменту, который отличается химической природой от природного нуклеозида, но который способен к осуществлению по меньшей мере одной функции нуклеозида. В некоторых вариантах осуществления аналог нуклеозида содержит аналог сахара и/или аналог нуклеинового основания. В некоторых вариантах осуществления модифицированный нуклеозид способен к осуществлению по меньшей мере одной функции нуклеозида, например, образованию фрагмента в полимере, способного к образованию пар оснований с нуклеиновой кислотой, содержащей комплементарную последовательность оснований.

[0067] Нуклеотид. Используемый в данном документе термин "нуклеотид" относится к мономерному звену полинуклеотида, которое состоит из нуклеинового основания, сахара и одной или нескольких межнуклеотидных связей (например, фосфатных связей в природных ДНК и РНК). Встречающиеся в природе основания [гуанин, (G), аденин, (А), цитозин, (С), тимин, (Т) и урацил (U)] являются производными пурина или пиримидина, хотя следует понимать, что также включены встречающиеся в природе и не встречающиеся в природе аналоги оснований. Встречающийся в природе сахар представляет собой пентозу (пятиуглеродный сахар) дезоксирибозу (которая образует ДНК) или рибозу (которая образует РНК), хотя следует понимать, что также включены встречающиеся в природе и не встречающиеся в природе аналоги сахара. Нуклеотиды связаны посредством межнуклеотидных связей с образованием нуклеиновых кислот или полинуклеотидов. Многие межнуклеотидные связи известны в данной области техники (такие как без ограничений фосфатные, фосфотиоатные, боранофосфатные и т.п.). Искусственные нуклеиновые кислоты включают PNA (пептидные нуклеиновые кислоты), фосфотриэфиры, фосфотионаты, Н-фосфонаты, фосфорамидаты, боранофосфаты, метилфосфонаты, фосфоноацетаты, тиофосфоноацетаты и другие варианты фосфатного остова нативных нуклеиновых кислот, такие как описаны в данном документе. В некоторых вариантах осуществления природный нуклеотид содержит встречающиеся в природе основание, сахар и межнуклеотидную связь. Используемый в данном документе термин "нуклеотид" также охватывает структурные аналоги, используемые вместо природных или встречающихся в природе нуклеотидов, такие как модифицированные нуклеотиды и аналоги нуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления "нуклеотид" относится к нуклеотидному звену в олигонуклеотиде или нуклеиновой кислоте.

[0068] Олигонуклеотид. Термин "олигонуклеотид" относится к полимеру или олигомеру из нуклеотидов и может содержать любую комбинацию природных и неприродных нуклеиновых оснований, сахаров и межнуклеотидных связей.

[0069] Олигонуклеотиды могут быть однонитевыми или двухнитевыми. Однонитевой олигонуклеотид может содержать двухнитевые области (образованные двумя частями однонитевого олигонуклеотида), а двухнитевой олигонуклеотид, который содержит две олигонуклеотидные цепи, может содержать однонитевые области, например, в областях, где две олигонуклеотидные цепи не являются комплементарными друг другу. Примеры олигонуклеотидов включают без ограничений структурные гены, гены, содержащие области контроля и терминации, самореплицирующиеся системы, такие как вирусная или плазмидная ДНК, однонитевые и двухнитевые средства для RNAi и другие реагенты для РНК-интерференции (средства для RNAi или средства iRNA), shRNA, антисмысловые олигонуклеотиды, рибозимы, микроРНК, миметики микроРНК, супер-miR, аптамеры, анти-miR, антагонисты miR, адаптеры U1, триплекс-образующие олигонуклеотиды, олигонуклеотиды, образующие G-квадруплекс, активаторы РНК, иммуностимулирующие олигонуклеотиды и олигонуклеотиды-ловушки.

[0070] Длина олигонуклеотидов по настоящему изобретению может быть различной. В конкретных вариантах осуществления длина олигонуклеотидов может находиться в диапазоне от приблизительно 2 до приблизительно 200 нуклеозидов. В различных связанных вариантах осуществления длина однонитевых, двухнитевых и трехнитевых олигонуклеотидов может находиться в диапазоне от приблизительно 4 до приблизительно 10 нуклеозидов, от приблизительно 10 до приблизительно 50 нуклеозидов, от приблизительно 20 до приблизительно 50 нуклеозидов, от приблизительно 15 до приблизительно 30 нуклеозидов, от приблизительно 20 до приблизительно 30 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет от приблизительно 9 до приблизительно 39 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, или 25 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 4 нуклеозида. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 5 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 6 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 7 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 8 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 9 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 10 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 11 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 12 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 15 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 15 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 16 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 17 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 18 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 19 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 20 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 25 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления длина олигонуклеотида составляет по меньшей мере 30 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид представляет собой дуплекс из комплементарных нитей длиной по меньшей мере 18 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид представляет собой дуплекс из комплементарных нитей длиной по меньшей мере 21 нуклеозид. В некоторых вариантах осуществления каждый нуклеозид, учитываемый в длине олигонуклеотида, независимо содержит А, Т, С, G или U, или необязательно замещенный А, Т, С, G или U, или необязательно замещенный таутомер А, Т, С, G или U.

[0071] Тип олигонуклеотидов. Используемую в данном документе фразу "тип олигонуклеотидов" используют для определения олигонуклеотида, который имеет конкретную последовательность оснований, паттерн связей остова (т.е. паттерн типов межнуклеотидных связей, например, фосфатных, фосфотиоатных, фосфотиоатных триэфирных и т.д.), паттерн хиральных центров остова [т.е. паттерн стереохимии атома фосфора в составе связи (Rp/Sp)] и паттерн модификаций по атому фосфора в остове (например, паттерн групп " XLR¹" в формуле I, как описано в данном документе). В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды общего указанного "типа" являются идентичными друг другу по структуре.

[0072] Специалист в данной области техники поймет, что способы синтеза по настоящему изобретению обеспечивают степень контроля в ходе синтеза олигонуклеотидной нити, так что каждое нуклеотидное звено олигонуклеотидной нити может быть разработано и/или выбрано заранее для обеспечения конкретной стереохимии по атому фосфора в составе связи и/или конкретной модификации по атому фосфора в составе связи, и/или конкретного основания, и/или конкретного сахара. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотидную нить разрабатывают и/или выбирают заранее для обеспечения конкретной комбинации стереоцентров у атома фосфора в составе связи. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотидную нить разрабатывают и/или определяют для того, обеспечения конкретной комбинации модификаций по атому фосфора в составе связи. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотидную нить разрабатывают и/или выбирают для обеспечения конкретной комбинации оснований. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотидную нить разрабатывают и/или выбирают для обеспечения конкретной комбинации из одной или нескольких приведенных выше структурных характеристик. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены композиции, содержащие совокупность олигонуклеотидных молекул (например, композиции на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью) или состоящие из нее. В некоторых вариантах осуществления все такие молекулы относятся к одному типу (т.е. являются идентичными друг другу по структуре). Однако в некоторых вариантах осуществления представленные композиции содержат совокупность из олигонуклеотидов разных типов, как правило, с предварительно определенными относительными количествами.

[0073] Необязательно замещенный. Описываемые в данном документе соединения, например, олигонуклеотиды по настоящему изобретению, могут содержать необязательно замещенные и/или замещенные фрагменты. В целом термин "замещенный", независимо от того стоит ли перед ним термин "необязательно" или нет, означает, что один или несколько атомов водорода в указанном фрагменте заменены подходящим заместителем. Если не указано иное, то "необязательно замещенная" группа может содержать подходящий заместитель в каждом замещаемом положении группы, и когда более одного положения в любой заданной структуре могут быть замещены более чем одним заместителем, выбранным из указанной группы, заместители могут быть одинаковыми или разными в каждом положении. В некоторых вариантах осуществления необязательно замещенная группа является незамещенной. Комбинации заместителей, предусмотренные в настоящем изобретении, предпочтительно представляют собой комбинации, которые приводят к образованию стабильных или химически осуществимых соединений. Используемый в данном документе термин "стабильные" относится к соединениям, которые не изменяются в значительной степени под воздействием условий, обеспечивающих их получение, выявление и, в определенных вариантах осуществления, их извлечение, очистку и применение для одной или нескольких целей, раскрытых в данном документе. Некоторые заместители описаны ниже.

[0074] Подходящие одновалентные заместители при замещаемом атоме, например подходящем атоме углерода, независимо представляют собой галоген; -(CH₂)_0-4R^o; -(CH₂)_0-4OR^o; -O(CH₂)_0-4R^o, -O-(CH₂)_0-4C(O)OR^o; -(CH₂)_0-4CH(OR^o)₂; -(CH₂)_0-4Ph, который может быть замещен R^o; -(СН₂)_0-4O(СН₂)_0-1Ph, который может быть замещен R^o; -CH=CHPh, который может быть замещен R^o; -(СН₂)_0-4O(СН₂)_0-1-пиридил, который может быть замещен R^o; -NO₂; -CN; -N₃; -(CH₂)_0-4N(R^o)₂; -(CH₂)_0-4N(R^o)C(O)R^o; -N(R^o)C(S)R^o; -(CH₂)_0-4N(R^o)C(O)NR^o ₂; -N(R^o)C(S)NR^o ₂; -(CH₂)_0-4N(R^o)C(O)OR^o; -N(R^o)N(R^o)C(O)R^o; -N(R^o)N(R^o)C(O)NR^o ₂; -N(R^o)N(R^o)C(O)OR^o; -(CH₂)_0-4C(O)R^o; -C(S)R^o; -(CH₂)_0-4C(O)OR^o; -(CH₂)_0-4C(O)SR^o; -(CH₂)_0-4C(O)OSiR^o ₃; -(CH₂)_0-4OC(O)R^o; -OC(O)(CH₂)_0-4SR^o, -SC(S)SR^o; -(CH₂)_0-4SC(O)R^o; -(CH₂)_0-4C(O)NR^o ₂; -C(S)NR^o ₂; -C(S)SR^o; -(CH₂)_0-4OC(O)NR^o ₂; -C(O)N(OR^o)Ro²; -C(O)C(O)R^o; -C(O)CH₂C(O)R^o; -C(NOR^o)R^o; -(CH₂)_0-4SSR^o; -(CH₂)_0-4S(O)₂R^o; -(CH₂)_0-4S(O)₂OR^o; -(CH₂)_0-4OS(O)₂R^o; -S(O)₂NR^o ₂; -(СН₂)_0-4S(O)R^o; -N(R^o)S(O)₂NR^o ₂; -N(R^o)S(O)₂R^o; -N(OR^o)R^o; -C(NH)NR^o ₂; -Si(R^o)₃; -OSi(R^o)₃; -B(R^o)₂; -OB(R^o)₂; -OB(OR^o)₂; -P(R^o)₂; -P(OR^o)₂; -P(R^o)(OR^o); -OP(R^o)₂; -OP(OR^o)₂; -OP(R^o)(OR^o); -P(O)(R^o)₂; -P(O)(OR^o)₂; -OP(O)(R^o)₂; -OP(O)(OR^o)₂; -OP(O)(OR^o)(SR^o); -SP(O)(R^o)₂; -SP(O)(OR^o)₂; -N(R^o)P(O)(R^o)₂; -N(R^o)P(O)(OR^o)₂; -P(R^o)₂[B(R^o)₃]; -P(OR^o)₂[B(R^o)₃]; -OP(R^o)₂[B(R^o)₃]; -OP(OR^o)₂[B(R^o)₃]; -(линейный или разветвленный C_1-4алкилен)O-N(R^o)₂ или (линейный или разветвленный C_1-4алкилен)C(O)O-N(R^o)₂, где каждый R^o может быть замещенным, как определено в данном документе, и независимо представляет собой водород, C_1-20алифатическую группу, C_1-20гетероалифатическую группу, содержащую 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода, серы, кремния и фосфора, -СН₂-(С_6-14арил), -О(СН₂)_0-1(С_6-14арил), -СН₂-(5-14-членное гетероарильное кольцо), 5-20-членное моноциклическое, бициклическое или полициклическое, насыщенное, частично ненасыщенное или арильное кольцо, содержащее 0-5 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода, серы, кремния и фосфора, или, безотносительно вышеприведенного определения, два независимых варианта R^o, взятые вместе с их промежуточным(-ыми) атомом(-ами), образуют 5-20-членное моноциклическое, бициклическое или полициклическое, насыщенное, частично ненасыщенное или арильное кольцо, содержащее 0-5 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода, серы, кремния и фосфора, которые могут быть замещены, как определено ниже.

[0075] Подходящие одновалентные заместители при R^o (или кольце, образованном двумя независимыми вариантами R^o, взятыми вместе с их промежуточными атомами) независимо представляют собой галоген, -(CH₂)_0-2R^λ, -(галоген-R^λ), -(СН₂)_0-2ОН, -(CH₂)_0-2OR^λ, -(СН₂)_0-2CH(OR^λ)₂; -O(галоген-R^λ), -CN, -N₃, -(CH₂)_0-2C(O)R^λ, -(СН₂)_0-2С(О)ОН, -(CH₂)_0-2C(O)OR^λ, -(CH₂)_0-2SR^λ, -(CH₂)_0-2SH, -(CH₂)_0-2NH₂, -(CH₂)_0-2NHR^λ, -(CH₂)_0-2NR^λ ₂, -NO₂, SiR^λ ₃, -OSiR^λ ₃, -C(O)SR^λ, -(линейный или разветвленный C_1-4алкилен)C(O)OR^λ или -SSR^λ, где каждый R^λ является незамещенным или, если ему предшествует "галоген", замещенным только одним или несколькими галогенами, и независимо выбранным из С_1-4алифатической группы, -CH₂Ph, -O(CH₂)_0-1Ph и 5-6-членного насыщенного, частично ненасыщенного или арильного кольца, содержащего 0-4 гетероатома, независимо выбранных из азота, кислорода и серы. Подходящие двухвалентные заместители при насыщенном атоме углерода в R^o включают =O и =S.

[0076] Подходящие двухвалентные заместители, например, при подходящем атоме углерода, независимо представляют собой следующее: =O, =S, =NNR^* ₂, =NNHC(O)R^*, =NNHC(O)OR^*, =NNHS(O)₂R^*, =NR^*, =NOR^*, -O(C(R^* ₂))_2-3O- или -S(C(R^* ₂))_2-3S-, где каждый независимый вариант R^* выбран из водорода, С_1-6алифатической группы, которая может быть замещена, как определено ниже, и незамещенного 5-6-членного насыщенного, частично ненасыщенного или арильного кольца, содержащего 0-4 гетероатома, независимо выбранных из азота, кислорода и серы. Подходящие двухвалентные заместители, которые связаны с соседними замещаемыми атомами углерода "необязательно замещенной" группы, включают: -O(CR^* ₂)_2-3O-, где каждый независимый вариант R^* выбран из водорода, C_1-6алифатической группы, которая может быть замещена, как определено ниже, и незамещенного 5-6-членного насыщенного, частично ненасыщенного и арильного кольца, содержащего 0-4 гетероатома, независимо выбранных из азота, кислорода и серы.

[0077] Подходящие заместители при алифатической группе R^* независимо представляют собой галоген, -R^λ, -(галоген-R^λ), -ОН, -OR^λ, -O(галоген-R^λ), -CN, С(O)ОН, -C(O)OR^λ, -NH₂, -NHR^λ, -NR^λ ₂ или -NO₂, где каждый R^λ является незамещенным или, если ему предшествует "галоген", замещенным только одним или несколькими галогенами, и независимо представляет собой С_1-4алифатическую группу, CH₂Pb, -O(СН₂)_0-1Pb или 5-6-членное насыщенное, частично ненасыщенное или арильное кольцо, содержащее 0-4 гетероатома, независимо выбранных из азота, кислорода или серы.

[0078] В некоторых вариантах осуществления подходящие заместители при замещаемом атоме азота независимо представляют собой где каждый независимо представляет собой водород, C_1-6алифатическую группу, которая может быть замещена, как определено ниже, незамещенный -OPh или незамещенное 5-6-членное насыщенное, частично ненасыщенное или арильное кольцо, содержащее 0-4 гетероатома, независимо выбранных из азота, кислорода и серы, или, безотносительно вышеприведенного определения, два независимых варианта , взятые вместе с их промежуточным(-ыми) атомом(-ами), образуют незамещенное 3 12-членное насыщенное, частично ненасыщенное или арильное моно- или бициклическое кольцо, содержащее 0-4 гетероатома, независимо выбранных из азота, кислорода и серы.

[0079] Подходящие заместители при алифатической группе независимо представляют собой галоген, -R^λ, -(галоген-R^λ), -ОН, -OR^λ, -O(галоген-R^λ), -CN, -С(O)ОН, -C(O)OR^λ, -NH₂, -NHR^λ, -NR^λ ₂ или -NO₂, где каждый R^λ является незамещенным или, если ему предшествует "галоген", замещенным только одним или несколькими галогенами, и независимо представляет собой С_1-4алифатическую группу, -CH₂Ph, -O(CH₂)_0-1Ph или 5-6-членное насыщенное, частично ненасыщенное или арильное кольцо, содержащее 0-4 гетероатома, независимо выбранных из азота, кислорода и серы.

[0080] Пероральный. Используемые в данном документе фразы "пероральное введение" и "вводимый перорально" имеют свое установленное в данной области техники значение, относящееся к введению соединения или композиции через рот.

[0081] Р-модификация. Используемый в данном документе термин "Р-модификация" относится к любой модификации по атому фосфора в составе связи, отличной от стереохимической модификации. В некоторых вариантах осуществления Р-модификация предусматривает добавление, замещение или удаление бокового фрагмента, ковалентно присоединенного к атому фосфора в составе связи. В некоторых вариантах осуществления "Р-модификация" представляет собой -X-L-R¹, где каждый из X, L и R¹ независимо является таким, как определено и описано в настоящем изобретении.

[0082] Парентеральный. Используемые в данном документе фразы "парентеральное введение" и "вводимый парентерально" имеют свое установленное в данной области техники значение, относящееся к путям введения, отличным от энтерального и местного введения, обычно путем инъекции, и включают без ограничения внутривенную, внутримышечную, внутриартериальную, интратекальную, внутрикапсульную, интраорбитальную, внутрисердечную, интрадермальную, внутрибрюшинную, транстрахеальную, подкожную, субкутикулярную, внутрисуставную, субкапсулярную, субарахноидальную, интраспинальную и внутригрудинную инъекцию и инфузию.

[0083] Частично ненасыщенный. Используемый в данном документе термин "частично ненасыщенный" относится к кольцевому фрагменту, который содержит по меньшей мере одну двойную или тройную связь. Подразумевается, что термин "частично ненасыщенный" охватывает кольца, содержащие несколько участков с ненасыщенной связью, но не подразумевается, что он включает арильные или гетероарильные фрагменты, как определено в данном документе.

[0084] Фармацевтическая композиция. Используемый в данном документе термин "фармацевтическая композиция" относится к активному средству, составленному вместе с одним или несколькими фармацевтически приемлемыми носителями. В некоторых вариантах осуществления активное средство присутствует в соответствующем стандартной дозе количестве, подходящем для введения в рамках схемы терапии, которая демонстрирует статистически значимую вероятность достижения предварительно определенного терапевтического эффекта при введении соответствующей группе. В некоторых вариантах осуществления фармацевтические композиции могут быть специально составлены для введения в твердой или жидкой форме, включая формы, адаптированные для следующего: перорального введения, например, жидкие лекарственные формы (водные или неводные растворы или суспензии), таблетки, например, предназначенные для трансбуккального, сублингвального и системного всасывания, болюсы, порошки, гранулы, пасты для нанесения на язык; парентерального введения, например, путем подкожной, внутримышечной, внутривенной или эпидуральной инъекции в виде, например, стерильного раствора или суспензии или состава с замедленным высвобождением; местного применения, например, в виде крема, мази или пластыря или спрея с контролируемым высвобождением, наносимых на кожу, легкие или полость рта; интравагинального или интраректального введения, например, в виде пессария, крема или пены; сублингвального; глазного; трансдермального или назального, легочного введения и нанесения на поверхности других слизистых оболочек.

[0085] Фармацевтически приемлемый. Используемая в данном документе фраза "фармацевтически приемлемый" относится к тем соединениям, материалам, композициям и/или лекарственным формам, которые в рамках обоснованного врачебного решения подходят для применения в контакте с тканями людей и животных без избыточных токсичности, раздражения, аллергической реакции или другой проблемы или осложнения, соизмеримых с разумным соотношением польза/риск.

[0086] Фармацевтически приемлемый носитель. Используемый в данном документе термин "фармацевтически приемлемый носитель" означает фармацевтически приемлемые материал, композицию или среду-носитель, такие как жидкий или твердый наполнитель, разбавитель, вспомогательное вещество или материал, инкапсулирующий растворитель, которые вовлечены в перенос или транспортировку заявляемого соединения из одного органа или части тела в другой орган или часть тела. Каждый носитель должен быть "приемлемым" в плане совместимости с другими ингредиентами состава и не причинять вреда пациенту. Некоторые примеры материалов, которые могут служить в качестве фармацевтически приемлемых носителей, включают: сахара, такие как лактоза, глюкоза и сахароза; крахмалы, такие как кукурузный крахмал и картофельный крахмал; целлюлозу и ее производные, такие как натрий-карбоксиметилцеллюлоза, этилцеллюлоза и ацетилцеллюлоза; порошкообразный трагакант; солод; желатин; тальк; вспомогательные вещества, такие как масло какао и воски для суппозиториев; масла, такие как арахисовое масло, хлопковое масло, сафлоровое масло, кунжутное масло, оливковое масло, кукурузное масло и соевое масло; гликоли, такие как пропиленгликоль; полиолы, такие как глицерин, сорбит, маннит и полиэтиленгликоль; сложные эфиры, такие как этилолеат и этиллаурат; агар; буферные средства, такие как гидроксид магния и гидроксид алюминия; альгиновую кислоту; апирогенную воду; изотонический солевой раствор; раствор Рингера; этиловый спирт; буферные растворы для поддержания рН; сложные полиэфиры, поликарбонаты и/или полиангидриды и другие нетоксичные совместимые вещества, используемые в фармацевтических составах.

[0087] Фармацевтически приемлемая соль. Используемый в данном документе термин "фармацевтически приемлемая соль" относится к солям таких соединений, которые являются подходящими для применения в фармацевтическом контексте, т.е. солям, которые в рамках обоснованного врачебного решения подходят для применения в контакте с тканями людей и низших животных без избыточных токсичности, раздражения, аллергической реакции и т.п. и соизмеримых с разумным соотношением польза/риск. Фармацевтически приемлемые соли хорошо известны из уровня техники. Например, S.М. Berge, et al. подробно описывают фармацевтически приемлемые соли в J. Pharmaceutical Sciences, 66: 1-19 (1977). В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая соль включает без ограничений нетоксичные соли присоединения кислот, которые являются солями по аминогруппе, образованными с неорганическими кислотами, такими как хлористоводородная кислота, бромистоводородная кислота, фосфорная кислота, серная кислота и перхлорная кислота, или с органическими кислотами, такими как уксусная кислота, малеиновая кислота, винная кислота, лимонная кислота, янтарная кислота или малоновая кислота, или с помощью других способов, используемых в данной области техники, таких как ионообмен. В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемые соли включают без ограничений адипатные, альгинатные, аскорбатные, аспартатные, бензолсульфонатные, бензоатные, бисульфатные, боратные, бутиратные, камфоратные, камфорсульфонатные, цитратные, циклопентанпропионатные, диглюконатные, доденилсульфатные, этансульфонатные, формиатные, фумаратные, глюкогептонатные, глицерофосфатные, глюконатные, гемисульфатные, гептаноатные, гексаноатные, гидройодидные, 2-гидроксиэтансульфонатные, лактобионатные, лактатные, лауратные, лаурилсульфатные, малатные, малеатные, малонатные, метансульфонатные, 2-нафталинсульфонатные, никотинатные, нитратные, олеатные, оксалатные, пальмитатные, памоатные, пектинатные, персульфатные, 3-фенилпропионатные, фосфатные, пикратные, пивалатные, пропионатные, стеаратные, сукцинатные, сульфатные, тартратные, тиоцианатные, n-толуолсульфонатные, ундеканоатные, валератные соли и т.п. В некоторых вариантах осуществления представленное соединение содержит одну или несколько кислотных групп, например в случае олигонуклеотида, и фармацевтически приемлемая соль является солью щелочного, щелочноземельного металла или аммония (например, аммониевой солью N(R)₃, где каждый R независимо является таким, как определено и описано в настоящем изобретении). Типичные соли щелочных или щелочноземельных металлов включают натриевую, литиевую, калиевую, кальциевую, магниевую соли и т.п.В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая соль представляет собой натриевую соль. В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая соль представляет собой калиевую соль. В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая соль представляет собой кальциевую соль. В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемые соли включают в соответствующих случаях соли катионов нетоксичного аммония, четвертичного аммония и амина, образованные с использованием противоионов, таких как галогенид, гидроксид, карбоксилат, сульфат, фосфат, нитрат, алкил, содержащий 1-6 атомов углерода, сульфонат и арилсульфонат. В некоторых вариантах осуществления представленное соединение содержит более одной кислотной группы, например, олигонуклеотид может содержать две или более кислотные группы (например, в природных фосфатных связях и/или модифицированных межнуклеотидных связях). В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая соль или в целом соль такого соединения содержит два или более катиона, которые могут быть одинаковыми или разными. В некоторых вариантах осуществления в фармацевтически приемлемой соли (или в целом соли) все ионизируемые атомы водорода (например, в водном растворе со значением pKa, составляющим не более приблизительно 11, 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3 или 2; в некоторых вариантах осуществления не более приблизительно 7; в некоторых вариантах осуществления не более приблизительно 6; в некоторых вариантах осуществления не более приблизительно 5; в некоторых вариантах осуществления не более приблизительно 4; в некоторых вариантах осуществления не более приблизительно 3) в кислотных группах заменены на катионы. В некоторых вариантах осуществления каждая фосфотиоатная и фосфатная группа независимо существует в своей солевой форме (например, в случае натриевой соли, -O-P(O)(SNa)-O- и -О-P(O)(ONa)-О- соответственно). В некоторых вариантах осуществления каждая фосфотиоатная и фосфатная межнуклеотидная связь независимо существует в своей солевой форме (например, в случае натриевой соли, -O-P(O)(SNa)-O- и -O-P(O)(ONa)-O-соответственно). В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая соль представляет собой натриевую соль олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая соль представляет собой натриевую соль олигонуклеотида, где каждая кислотная фосфатная и модифицированная фосфатная группа (например, фосфотиоатная, фосфатная и т.д.), если таковая присутствует, существует в форме соли (во всех случаях в форме натриевой соли).

[0088] Защитная группа. Используемый в данном документе термин "защитная группа" хорошо известен в данной области техники и включает защитные группы, описанные подробно в Protecting Groups in Organic Synthesis, Т.W. Greene and P.G.M. Wuts, 3^rd edition, John Wiley & Sons, 1999, полное содержание которого включено в данный документ посредством ссылки. Также включены те защитные группы, которые специально адаптированы к химическим характеристикам нуклеозидов и нуклеотидов, описанные в Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry, под ред. Serge L. Beaucage et al. 06/2012, полное содержание раздела 2 в котором включено в данный документ посредством ссылки. Подходящие аминозащитные группы включают без ограничений описанные в данном документе и/или в WO 2018/022473, WO 2018/098264, WO 2018/223056, WO 2018/223073, WO 2018/223081, WO 2018/237194, WO 2019/032607, WO 2019/055951 и/или WO 2019/075357, при этом описание защитных групп из каждого из них независимо включено в данный документ в посредством ссылки.

[0089] Субъект. Используемый в данном документе термин "субъект" или "тестируемый субъект" относится к любому организму, которому представленное соединение (например, представленный олигонуклеотид) или композицию вводят в соответствии с настоящим изобретением, например, в экспериментальных, диагностических, профилактических и/или терапевтических целях. Типичные субъекты включают животных (например, млекопитающих, таких как мыши, крысы, кролики, отличные от человека приматы и люди; насекомых, червей и т.д.) и растения. В некоторых вариантах осуществления субъектом является человек. В некоторых вариантах осуществления субъект может страдать от заболевания, нарушения и/или состояния и/или быть восприимчивым к нему.

[0090] По сути. Используемый в данном документе термин "по сути" относится к количественному состоянию проявления полной или практически полной степени или меры характеристики или свойства, представляющих интерес. Последовательность оснований, которая по сути комплементарна второй последовательности, не является идентичной второй последовательности, но является в значительной мере или почти идентичной второй последовательности. Кроме того, средний специалист в области биологии будет понимать, что биологические и химические явления редко, если это вообще когда-либо происходит, доходят до завершения и/или протекают до завершения, или достигают или избегают абсолютного результата. Термин "по сути", таким образом, используется в данном документе для обозначения потенциального отсутствия завершенности, присущего многим биологическим и/или химическим явлениям.

[0091] Сахар. Термин "сахар" относится к моносахариду или полисахариду в замкнутой и/или открытой форме. В некоторых вариантах осуществления сахара представляют собой моносахариды. В некоторых вариантах осуществления сахара представляют собой полисахариды. Сахара включают без ограничений рибозный, дезоксирибозный, пентофуранозный, пентопиранозный и гексопиранозный фрагменты. Используемый в данном документе термин "сахар" также охватывает структурные аналоги, используемые вместо традиционных молекул Сахаров, такие как гликоль, полимер которого образует остов аналога нуклеиновой кислоты, гликолевую нуклеиновую кислоту ("GNA") и т.д. Используемый в данном документе термин "сахар" также охватывает структурные аналоги, используемые вместо природных или встречающихся в природе нуклеотидов, такие как модифицированные сахара и нуклеотидные сахара. В некоторых вариантах осуществления сахар представляет собой сахар РНК или ДНК (рибозу или дезоксирибозу). В некоторых вариантах осуществления сахар представляет собой модифицированный рибозный или дезоксирибозный сахар, например, 2'-модифицированный, 5'-модифицированный и т.д. Как описано в данном документе, в некоторых вариантах осуществления при использовании в олигонуклеотидах и/или нуклеиновых кислотах модифицированные сахара могут обеспечивать одно или несколько требуемых свойств, видов активности и т.д. В некоторых вариантах осуществления сахар представляет собой необязательно замещенную рибозу или дезоксирибозу. В некоторых вариантах осуществления "сахар" относится к сахарному звену в олигонуклеотиде или нуклеиновой кислоте.

[0092] Восприимчивый к. Индивидуум, который является "восприимчивым" к заболеванию, нарушению и/или состоянию, представляет собой индивидуума, для которого характерен более высокий риск развития заболевания, нарушения и/или состояния, чем у представителя основной части населения. В некоторых вариантах осуществления индивидуум, который является восприимчивым к заболеванию, нарушению и/или состоянию, предрасположен к наличию данного заболевания, нарушения и/или состояния. В некоторых вариантах осуществления у индивидуума, который является восприимчивым к заболеванию, нарушению и/или состоянию, заболевание, нарушение и/или состояние может не быть диагностировано. В некоторых вариантах осуществления у индивидуума, который является восприимчивым к заболеванию, нарушению и/или состоянию, могут проявляться симптомы заболевания, нарушения и/или состояния. В некоторых вариантах осуществления у индивидуума, который является восприимчивым к заболеванию, нарушению и/или состоянию, могут не проявляться симптомы заболевания, нарушения и/или состояния. В некоторых вариантах осуществления у индивидуума, который является восприимчивым к заболеванию, нарушению и/или состоянию, будет развиваться заболевание, нарушение и/или состояние. В некоторых вариантах осуществления у индивидуума, который является восприимчивым к заболеванию, нарушению и/или состоянию, не будет развиваться заболевание, нарушение и/или состояние.

[0093] Терапевтическое средство. Используемый в данном документе термин "терапевтическое средство" в целом относится к любому средству, которое вызывает требуемый эффект (например, требуемый биологический, клинический или фармакологический эффект) при введении субъекту. В некоторых вариантах осуществления средство считается терапевтическим средством, если оно демонстрирует статистически значимый эффект в пределах соответствующей группы. В некоторых вариантах осуществления соответствующая группа представляет собой группу субъектов, страдающих от заболевания, нарушения или состояния и/или восприимчивых к нему. В некоторых вариантах осуществления соответствующая группа представляет собой группу модельных организмов. В некоторых вариантах осуществления соответствующую группу можно определять по одному или нескольким критериям, таким как возрастная группа, пол, генетический фон, предшествующие клинические состояния, проводимая ранее терапия. В некоторых вариантах осуществления терапевтическое средство представляет собой вещество, которое облегчает, уменьшает интенсивность, ослабляет, подавляет, предупреждает, задерживает возникновение, снижает тяжесть и/или снижает частоту возникновения одного или нескольких симптомов или признаков заболевания, нарушения и/или состояние у субъекта при введении субъекту в эффективном количестве. В некоторых вариантах осуществления "терапевтическое средство" представляет собой средство, которое уже было одобрено или которому требуется получение одобрения государственного органа, прежде чем оно поступит на рынок для применения у человека. В некоторых вариантах осуществления "терапевтическое средство" представляет собой средство, для которого требуется рецепт врача при применении у человека. В некоторых вариантах осуществления терапевтическое средство представляет собой представленное соединение, например представленный олигонуклеотид.

[0094] Терапевтически эффективное количество. Используемый в данном документе термин "терапевтически эффективное количество" означает количество вещества (например, терапевтического средства, композиции и/или состава), которое вызывает требуемый биологический ответ при введении в качестве части схемы терапии. В некоторых вариантах осуществления терапевтически эффективное количество вещества представляет собой количество, которое при введении субъекту, страдающему от заболевания, нарушения и/или состояния или восприимчивому к ним, является достаточным для лечения, диагностирования, предупреждения и/или задержки возникновения заболевания, нарушения и/или состояния. Средним специалистам в данной области техники будет понятно, что эффективное количество вещества может варьироваться в зависимости от таких факторов, как требуемая биологическая конечная точка, вещество, подлежащее доставке, клетка- или ткань-мишень и т.д. Например, эффективное количество соединения в составе для лечения заболевания, нарушения и/или состояния представляет собой количество, которое облегчает, уменьшает интенсивность, смягчает, подавляет, предупреждает, задерживает возникновение, уменьшает тяжесть и/или уменьшает частоту возникновения одного или нескольких симптомов или признаков заболевания, нарушения и/или состояния. В некоторых вариантах осуществления терапевтически эффективное количество вводят в однократной дозе; в некоторых вариантах осуществления для доставки терапевтически эффективного количества требуется несколько стандартных доз.

[0095] Лечить. Используемые в данном документе термины "лечить", "лечение" или "проведение лечения" относятся к любому способу, применяемому для частичного или полного облегчения, уменьшения интенсивности, смягчения, подавления, предупреждения, задержки возникновения, уменьшения тяжести и/или уменьшения частоты возникновения одного или нескольких симптомов или признаков заболевания, нарушения и/или состояния. Лечение может применяться в отношении субъекта, у которого не проявляются признаки заболевания, нарушения и/или состояния. В некоторых вариантах осуществления лечение может применяться в отношении субъекта, у которого проявляются лишь ранние признаки заболевания, нарушения и/или состояния, например с целью уменьшения риска развития патологии, ассоциированной с заболеванием, нарушением и/или состоянием.

[0096] Ненасыщенный. Используемый в данном документе термин "ненасыщенный" означает, что фрагмент содержит одно или несколько звеньев с ненасыщенной связью.

[0097] Дикий тип. Используемый в данном документе термин "дикий тип" имеет свое установленное в данной области техники значение, относящееся к объекту, имеющему структуру и/или активность, которые обнаруживаются в природе в "нормальном" (в отличие от мутантного, болезненного, измененного и т.д.) состоянии или окружении. Средние специалисты в данной области техники будут понимать, что гены и полипептиды дикого типа зачастую существуют в нескольких различных формах (например, аллелях).

[0098] Для целей настоящего изобретения химические элементы идентифицированы в соответствии с Периодической системой химических элементов версии CAS, Handbook of Chemistry and Physics, 67th Ed., 1986-87, внутренняя сторона обложки.

[0099] Как будет понятно специалистам в данной области техники, способы и композиции, описанные в данном документе, относящиеся к представленным соединениям (например, олигонуклеотидам), также применимы к фармацевтически приемлемым солям таких соединений.

Описание определенных вариантов осуществления

[00100] Олигонуклеотиды являются полезными инструментами при множестве вариантов применения. Например, НТТ-олигонуклеотиды применимы в вариантах применения в терапии, диагностике и исследованиях, включая лечение различных состояний, нарушений и заболеваний, связанных с НТТ, включая болезнь Хантингтона. Применение встречающихся в природе нуклеиновых кислот (например, немодифицированной ДНК или РНК) является ограниченным, например, вследствие их чувствительности к эндо- и экзонуклеазам. В связи с этим, для преодоления данных недостатков и/или для дальнейшего улучшения различных свойств и активности были разработаны различные синтетические аналоги. К ним относятся синтетические олигонуклеотиды, которые содержат химические модификации, например, модификации оснований, модификации Сахаров, модификации остова и т.д., которые, среди прочего, делают эти молекулы менее чувствительными к разрушению и улучшают другие свойства и/или виды активности. Со структурной точки зрения модификации межнуклеотидных связей могут вносить хиральность, и на определенные свойства олигонуклеотидов могут воздействовать конфигурации атомов фосфора в составе связи. Например, на аффинность связывания, специфическое в отношении последовательности связывание с комплементарной РНК, устойчивость к нуклеазам, расщепление нуклеиновых кислот НТТ-мишени, доставку, фармакокинетику и т.д. может воздействовать, среди прочего, хиральность атомов фосфора в составе связей остова. Среди всего прочего, в настоящем изобретении представлены технологии для контроля и/или использования различных структурных элементов, например, модификаций Сахаров и их паттернов, модификаций нуклеиновых оснований и их паттернов, модифицированных межнуклеотидных связей и их паттернов, стереохимии атомов фосфора в составе связи и их паттернов, дополнительных химических фрагментов (фрагменты, которые обычно не входят в олигонуклеотидную цепь) и их паттернов и т.д., а также различных комбинаций одного или нескольких, или всех таких структурных элементов в олигонуклеотидах.

[00101] В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды представляют собой олигонуклеотиды, нацеливающиеся на НТТ, и они могут снижать уровни мутантных транскриптов НТТ и/или одного или нескольких продуктов, кодируемых ими. Такие олигонуклеотиды особенно применимы для предупреждения и/или лечения состояний, нарушений и/или заболеваний, связанных с НТТ, включая болезнь Хантингтона.

[00102] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит последовательность, которая полностью или по сути идентична или полностью или по сути комплементарна 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, как правило, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 или более смежным основаниям из геномной последовательности НТТ или ее транскрипта (например, пре-мРНК, мРНК и т.д.). Специалистам в данной области техники будет понятно, что "НТТ-олигонуклеотид" может иметь нуклеотидной последовательностью, которая идентична (или по сути идентична) или комплементарна (или по сути комплементарна) последовательности оснований НТТ (например, геномной последовательности, последовательности транскрипта, последовательности мРНК и т.д.) или ее части.

[00103] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен НТТ-олигонуклеотид, раскрытый в данном документе, например в таблице, или НТТ-олигонуклеотид, который имеет последовательность оснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных оснований из олигонуклеотида, раскрытого в данном документе.

[00104] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен НТТ олигонуклеотид, имеющий последовательность оснований, раскрытую в данном документе, например в таблице, или ее часть, содержащую по меньшей мере 10 смежных оснований, где НТТ-олигонуклеотид является стереомерно неупорядоченным или не характеризуется контролируемой хиральностью.

[00105] В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидные связи олигонуклеотида содержат или состоят из 1-5, 1-10, 1-15, 1-20, 1-25, 1-30, 1-40, 1-50, или 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более межнуклеотидных связей с контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления композиция на основе олигонуклеотида по настоящему изобретению содержит олигонуклеотиды одинакового состава, где одна или несколько межнуклеотидных связей характеризуются контролируемой хиральностью, а одна или несколько межнуклеотидных связей являются стереомерно неупорядоченными (не характеризуются контролируемой хиральностью). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе НТТ-олигонуклеотида, в которой НТТ-олигонуклеотиды содержат по меньшей мере одну межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе НТТ-олигонуклеотида, в которой НТТ-олигонуклеотиды являются стереомерно неупорядоченными или не характеризуются контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления в НТТ-олигонуклеотиде по меньшей мере одна межнуклеотидная связь является стереомерно неупорядоченной, и по меньшей мере одна межнуклеотидная связь характеризуется контролируемой хиральностью.

[00106] В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидные связи олигонуклеотида содержат или состоят из одной или нескольких отрицательно заряженных межнуклеотидных связей (например, фосфотиоатных межнуклеотидных связей, природных фосфатных связей и т.д.). В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидные связи олигонуклеотида содержат или состоят из одной или нескольких отрицательно заряженных хиральных межнуклеотидных связей (например, фосфотиоатных межнуклеотидных связей). В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидные связи олигонуклеотида содержат или состоят из одной или нескольких межнуклеотидных связей, не являющихся отрицательно заряженными. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидные связи олигонуклеотида содержат или состоят из одной или нескольких нейтральных хиральных межнуклеотидных связей. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к НТТ-олигонуклеотиду, который содержит по меньшей мере одну нейтральную межнуклеотидную связь или межнуклеотидную связь, не являющуюся отрицательно заряженной, как описано в настоящем изобретении.

НТТ

[00107] В некоторых вариантах осуществления НТТ относится к гену или его генному продукту (включая без ограничений нуклеиновую кислоту, включая без ограничений ДНК или РНК, или кодируемый ею белок дикого типа или мутантный белок) из любого вида, и они также могут быть известны как: НТТ, HD, IT15, хантингтин, Хантингтин или LOMARS; внешние ID: OMIM: 613004, MGI: 96067, HomoloGene: 1593, GeneCards: НТТ; вид: человек: Entrez: 3064; Ensembl: ENSG00000197386; UniProt: P42858; RefSeq (мРНК): NM_002111; RefSeq (белок): NP_002102; местоположение (UCSC): Xp.4: 3,04 3,24 млн. о.; вид: мышь: Entrez: 15194; Ensembl: ENSMUSG00000029104; UniProt: P42859; RefSeq (мРНК): NM010414; RefSeq (белок): NP_034544; местоположение (UCSC): Xp.5: 34,76-34,91 млн. о. Дополнительные последовательности НТТ, включая их варианты, от человека, мыши, крысы, обезьяны и т.д. легко доступны специалистам в данной области техники. В некоторых вариантах осуществления НТТ представляет собой НТТ человека или мыши, который содержит последовательность дикого типа или мутантную последовательность.

[00108] В некоторых вариантах осуществления белок НТТ является немодифицированным или модифицированным. В некоторых вариантах осуществления белок НТТ имеет одну или несколько из следующих модификаций: 9 N6-ацетиллизин; 176 N6-ацетиллизин; 234 N6-ацетиллизин; 343 N6-ацетиллизин; 411 фосфосерин; 417 фосфосерин; 419 фосфосерин; 432 фосфосерин; 442 N6-ацетиллизин; 640 фосфосерин; 643 фосфосерин; 1179 фосфосерин; 1199 фосфосерин; 1870 фосфосерин или 1874 фосфосерин.

[00109] Не вдаваясь в какую-либо конкретную теорию, в настоящем изобретении отмечают, что мутация (например, экспансия CAG-повторов) в НТТ по некоторым данным является ключевым фактором возникновения заболеваний и нарушений, таких как болезнь Хантингтона.

[00110] В некоторых вариантах осуществления мутантный НТТ обозначен как mHTT, muHTT, m НТТ, mu НТТ, MU НТТ и т.п., где m или mu обозначают "мутантный". В некоторых вариантах осуществления НТТ дикого типа обозначен как НТТ дикого типа, wtHTT, wt НТТ, WT НТТ, WTHTT и т.п., где wt обозначает "дикого типа". В некоторых вариантах осуществления мутантный НТТ содержит область экспансии CAG-повторов (например, 36-121, 36-250, 37-121, 40-121 повторов или больше). В некоторых вариантах осуществления мутантный НТТ содержит мутантный аллель одного или нескольких SNP (аллель на той же нити ДНК или хромосоме, что и экспансия CAG-повторов). В некоторых вариантах осуществления мутантный НТТ содержит как область экспансии CAG-повторов, так и мутантный аллель конкретного SNP на одной и той же хромосомной цепи.

[00111] В некоторых вариантах осуществления НТТ человека обозначен как hHTT. В некоторых вариантах осуществления мутантный НТТ обозначен как mHTT. В некоторых вариантах осуществления при использовании мыши НТТ мыши может называться mHTT, что будет понятно специалистам в данной области техники.

[00112] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид комплементарен части последовательности нуклеиновой кислоты НТТ, например последовательности гена НТТ, последовательности мРНК НТТ и т.д. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований такой части является характерной для НТТ в том смысле, что никакие другие геномные последовательности или последовательности транскрипта не имеют такую же последовательность, как данная часть. В некоторых вариантах осуществления часть гена, которая комплементарна олигонуклеотиду, называют последовательностью-мишенью олигонуклеотида.

[00113] В некоторых вариантах осуществления последовательность гена НТТ (или ее часть, например, комплементарная олигонуклеотиду НТТ) представляет собой последовательность гена НТТ (или ее часть), известную из уровня техники или описанную в литературе. Определенные нуклеотидные и аминокислотные последовательности НТТ человека можно найти в общедоступных источниках, например, в одной или нескольких общедоступных базах данных, например, GenBank, UniProt, OMEVI и т.д. Специалистам в данной области будет понятно, что в тех случаях, например, когда описанная последовательность нуклеиновой кислоты может представлять собой или включать геномную последовательность, транскрипты, продукты сплайсинга и/или кодируемые белки и т.д., ее можно легко определить по такой геномной последовательности.

[00114] В некоторых вариантах осуществления ген НТТ (или его часть с последовательностью, комплементарной олигонуклеотиду НТТ) включает однонуклеотидный полиморфизм или SNP. Сообщалось о многочисленных SNP НТТ, и их можно найти, например, в базе данных dbSNP от NCBI (см., например, www.ncbi.nlm.nih.gov/snp). Неограничивающие примеры SNP в пределах гена НТТ можно найти по номеру доступа в dbSNP от NCBI, и они включают, например, описанные в данном документе. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на аллель SNP, который находится на той же хромосоме (например, в одной гаметической фазе) с экспансией CAG-повторов и не присутствует в аллеле дикого типа (который не содержит экспансию CAG-повторов).

[00115] Болезнь Хантингтона (HD) представляет собой нейродегенеративное нарушение, которое по некоторым сообщениям вызывает мутация гена НТТ (хантингтина). По некоторым сообщениям изменение данного широко экспрессируемого единственного гена приводит к прогрессирующему нейродегенеративному нарушению с большим числом характерных симптомов. В некоторых вариантах осуществления мутация, связанная с HD, представляет собой экспансию области CAG-повторов в гене НТТ, при этом по некоторым сообщениям большая экспансия приводит к большей тяжести заболевания и возникновению заболевания в более раннем возрасте. По некоторым сообщениям мутация приводит к различным двигательным, эмоциональным и когнитивным симптомам и приводит к образованию агрегатов хантингтина в головном мозге.

[00116] По некоторым сообщениям экспансия CAG приводит к экспансии полиглутаминового тракта в белке хантингтине, белке размером 350 кДа (Huntington Disease Collaborative Research Group, 1993. Cell. 72:971-83). По некоторым сообщениям было обнаружено, что размер нормального аллеля и аллеля HD с экспансией составляет, например, 6-37 CAG-повторов и 35-121 CAG-повторов или больше соответственно. По некоторым сообщениям более длинные последовательности повторов ассоциированы с возникновением заболевания в более раннем возрасте. По некоторым сообщениям отсутствие фенотипа HD у индивидуумов с делецией одной копии хантингтина или повышенная тяжесть заболевания у индивидуумов, гомозиготных по экспансии, позволяет предположить, что мутация не приводит к потере функции (Trottier et al., 1995, Nature Med., 10:104-110). По некоторым сообщениям нарушение регуляции транскрипции и потеря функции белков-коактиваторов транскрипции были вовлечены в патогенез HD. В некоторых сообщениях было показано, что мутантный хантингтин специфически нарушает зависимую от активатора транскрипцию на ранних стадиях патогенеза HD (Dunah et al., 2002. Science 296:2238-2243).

[00117] В одном сообщении при определении профиля генной экспрессии в крови человека выявили 322 мРНК, которые демонстрировали значительно измененную экспрессию в образцах крови индивидуумов с HD по сравнению с нормальными индивидуумами или индивидуумами до появления симптомов. Аналогичным образом, экспрессия маркерных генов была значительно изменена в посмертных образцах головного мозга, полученных из хвостатого ядра индивидуумов с HD, что позволяет предположить, что активация генов в образцах крови отражает механизмы заболевания, обнаруженные в головном мозге. Мониторинг генной экспрессии может обеспечить чувствительный и количественный способ для отслеживания прогрессирования заболевания, особенно на ранних стадиях заболевания, как на животных моделях, так и у пациентов-людей (Borovecki et al., 2005, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102:11023-11028).

[00118] Сообщалось, что болезнь Хантингтона является аутосомно-доминантным нарушением, которое возникает обычно в среднем возрасте, хотя были документально подтверждены случаи возникновения от детского возраста до возраста более 70 лет. По некоторым сообщениям возникновение заболевания в более раннем возрасте ассоциировано с наследственностью по отцу, при этом 70% ювенильных случаев заболевания наследуются через отца.

[00119] В некоторых вариантах осуществления симптомы болезни Хантингтона включают эмоциональный, двигательный и когнитивный компонент. Один симптом, хорея, является характерным признаком двигательного нарушения и определяется как избыточные непроизвольные движения, которые являются нерегулярными по времени, распределенными случайным образом и резкими. Он может варьироваться от едва заметного до тяжелого. Другие часто наблюдаемые симптомы или аномалии включают дистонию, ригидность, брадикинезию, глазодвигательную дисфункцию, тремор и т.д. Нарушения произвольных движений в качестве симптомов включают нарушение координации тонкой моторики, дизартрию и дисфагию. Эмоциональные нарушения или симптомы обычно включают депрессию и раздражительность, а когнитивный компонент включает подкорковую деменцию (Mangiarini et al. 1996. Cell 87:493-506). Сообщается, что изменения в головном мозге индивидуумов с HD широко распространены и включают дегенерацию нейронов и глиоз, в частности, в коре и полосатом теле (Vonsattel and DiFiglia. 1998. J. Neuropathol. Exp.Neurol. 57:369-384).

[00120] Определенная информация, связанная с НТТ и состояниями, нарушениями или заболеваниями, связанными с НТТ, сообщалась, например, в Kremer et al. 1994. N. E. J. Med. 330: 1401; Kordasiewicz et al. 2012 Neuron 74: 1031-1044; Carroll et al. 2011 Mol. Ther. 19: 2178-2185; Warby et al. 2009 Am. J. Hum. Genet. 84: 351-366; Pfister et al. 2009 Current Biol. 19: 774-778; Kay et al. 2015 Mol. Ther. 23: 1759-1771; Kay et al. 2014 Clin. Genet. 86: 29-36; Lee et al. 2015. Am. J. Hum. Genet. 97: 435-444; Skotte et al. 2014. PLOS ONE 9: e107434; Southwell et al. 2014. Mol. Ther. 22: 2093-2106; публикациях заявок на австралийский патент AU 2017276286 и AU 2007210038; публикациях заявок на европейский патент ЕР 3277814 и ЕР 3210633; публикации международной заявки на патент WO2018145009 и публикации заявки на патент США US 20180273945.

[00121] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид, способный обеспечивать снижение уровня, активности и/или экспрессии гена НТТ, применим в способе предупреждения или лечения состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ, например болезни Хантингтона, и/или задержки возникновения и/или снижения тяжести одного или нескольких симптомов болезни Хантингтона.

[00122] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены способы предупреждения или лечения состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ, путем введения субъекту, страдающему от такого состояния, нарушения или заболевания или восприимчивому к нему, терапевтически эффективного количества представленного НТТ-олигонуклеотида или композиции на его основе. В некоторых вариантах осуществления композиция представляет собой композицию на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью.

НТТ-олигонуклеотиды

[00123] Среди всего прочего в настоящем изобретении представлены олигонуклеотиды различной конструкции, которые могут содержать различные нуклеиновые основания и их паттерны, сахара и их паттерны, межнуклеотидные связи и их паттерны и/или дополнительные химические фрагменты и их паттерны, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды представляют собой НТТ-олигонуклеотиды. В некоторых вариантах осуществления представленные НТТ-олигонуклеотиды могут управлять снижением экспрессии, уровня и/или активности гена НТТ и/или одного или нескольких его продуктов (например, транскриптов, мРНК, белков и т.д.). В некоторых вариантах осуществления представленные НТТ-олигонуклеотиды могут управлять снижением экспрессии, уровня и/или активности гена НТТ и/или одного или нескольких его продуктов в любой клетке субъекта или пациента. В некоторых вариантах осуществления клетка представляет собой любую клетку, которая в норме экспрессирует НТТ или продуцирует белок НТТ. В некоторых вариантах осуществления представленные НТТ-олигонуклеотиды могут управлять снижением экспрессии, уровня и/или активности гена НТТ-мишени или продукта гена и имеют последовательность оснований, которая состоит из, содержит или содержит часть (например, участок из 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или более смежных оснований) последовательности оснований НТТ-олигонуклеотида, раскрытого в данном документе, и при этом олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну не встречающуюся в природе модификацию основания, сахара и/или межнуклеотидной связи.

[00124] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит один или несколько углеводных фрагментов. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит один или несколько липидных фрагментов. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит один или несколько нацеливающих фрагментов. В данном документе описаны неограничивающие примеры таких дополнительных химических фрагментов, которые могут быть конъюгированы с олигонуклеотидной цепью.

[00125] В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды могут управлять снижением экспрессии, уровня и/или активности гена-мишени, например, гена НТТ-мишени или его продукта. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды могут управлять снижением экспрессии, уровня и/или активности гена НТТ-мишени или его продукта за счет нокдауна, опосредованного РНКазой Н. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды могут управлять снижением экспрессии, уровня и/или активности гена НТТ-мишени или его продукта за счет стерического блокирования трансляции после связывания с мРНК гена НТТ-мишени и/или за счет изменения или препятствования сплайсингу мРНК. Однако, так или иначе, настоящее изобретение не ограничивается каким-либо конкретным механизмом. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены олигонуклеотиды, композиции, способы и т.д., способные действовать посредством интерференции на основе двухнитевой РНК, интерференции на основе однонитевой РНК, нокдауна, опосредованного РНКазой Н, стерического затруднения трансляции или комбинации двух и более таких механизмов.

[00126] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотиды представляют собой антисмысловые олигонуклеотиды (ASO) в том смысле, что они являются олигонуклеотидами, которые имеют последовательность оснований, которая является антисмысловой (например, комплементарной) последовательности НТТ-мишени. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотиды представляют собой двухнитевые siRNA. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотиды представляют собой однонитевые siRNA. Представленные олигонуклеотиды и композиции на их основе можно использовать для многих целей. Например, представленные НТТ-олигонуклеотиды можно вводить совместно или использовать как часть схемы лечения вместе с одним или несколькими средствами лечения болезни Хантингтона или ее симптома, в том числе без ограничений аптамерами, IncRNA, ингибиторами IncRNA, антителами, пептидами, низкомолекулярными соединениями, другими олигонуклеотидами к НТТ или другим мишеням и/или другими средствами, способными осуществлять подавление экспрессии транскрипта НТТ, снижение уровня и/или активности генного продукта НТТ и/или подавление экспрессии гена или снижение количества генного продукта, которые увеличивают экспрессию, активность и/или уровень транскрипта НТТ или генного продукта НТТ, или гена или генного продукта, которые ассоциированы с нарушением, связанным с НТТ.

[00127] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит структурный элемент или его часть, описанные в данном документе, например, в таблице. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит последовательность оснований (или ее часть), химическую модификацию или паттерн химических модификаций (или его часть) и/или формат или его часть, описанные в данном документе. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит последовательность оснований (или ее часть), паттерн химических модификаций (или его часть) и/или формат олигонуклеотида, раскрытого в данном документе, например, в таблице 1 или на фигурах, или раскрытого в данном документе иным образом. В некоторых вариантах осуществления такие олигонуклеотиды, например НТТ олигонуклеотиды, осуществляют снижение экспрессии, уровня и/или активности гена, например гена НТТ, или его генного продукта.

[00128] Среди всего прочего представленные олигонуклеотиды могут гибридизоваться с нуклеиновыми кислотами НТТ-мишенями (например, пре-мРНК, зрелой мРНК и т.д.). Например, в некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид может гибридизоваться с нуклеиновой кислотой НТТ, полученной из нити ДНК (любой нити гена НТТ). В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид может гибридизоваться с транскриптом НТТ. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид может гибридизоваться с нуклеиновой кислотой НТТ на любой стадии процессинга РНК, включая без ограничений пре-мРНК или зрелую мРНК. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид может гибридизоваться с любым элементом нуклеиновой кислоты НТТ или ее комплементарной последовательности, включая без ограничений: промоторную область, энхансерную область, область остановки транскрипции, сигнал начала трансляции, сигнал остановки трансляции, кодирующую область, некодирующую область, экзон, интрон, соединение интрон/экзон или экзон/интрон, 5'-UTR или 3'-UTR.

[00129] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид гибридизуется с двумя или более вариантами транскриптов, полученными из смысловой нити. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид гибридизуется с двумя или более вариантами НТТ, полученными из смысловой нити. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид гибридизуется со всеми вариантами НТТ, полученными из смысловой нити. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид гибридизуется с двумя или более вариантами НТТ, полученными из антисмысловой нити. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид гибридизуется со всеми вариантами НТТ, полученными из антисмысловой нити.

[00130] В некоторых вариантах осуществления НТТ-мишень НТТ-олигонуклеотида представляет собой РНК НТТ, которая не является мРНК.

[00131] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотиды содержат повышенные уровни одного или нескольких изотопов. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды являются меченными, например, одним или несколькими изотопами одного или нескольких элементов, например, водорода, углерода, азота и т.д. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды в представленных композициях, например олигонуклеотиды из совокупности в композиции, содержат модификации оснований, модификации сахара и/или модификации межнуклеотидных связей, где олигонуклеотиды содержат повышенный уровень дейтерия. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды являются меченными дейтерием (с заменой ¹H на -²Н) по одному или нескольким положениям. В некоторых вариантах осуществления один или несколько ¹H в олигонуклеотидной цепи или любом фрагменте, конъюгированном с олигонуклеотидной цепью (например, нацеливающем фрагменте и т.д.), замещен на ²Н. Такие олигонуклеотиды можно применять в композициях и способах, описанных в данном документе.

[00132] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида, содержащая совокупность олигонуклеотидов, которые:

1) обладают общей последовательностью оснований, комплементарной последовательности-мишени (например, последовательности НТТ-мишени) в транскрипте; и

2) содержат один или несколько модифицированных сахарных фрагментов и/или одну или несколько модифицированных межнуклеотидных связей.

[00133] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды, например НТТ-олигонуклеотиды, имеющие общую последовательность оснований, могут иметь одинаковой паттерн модификаций нуклеозидов, например, модификаций сахара, модификаций оснований и т.д. В некоторых вариантах осуществления паттерн модификаций нуклеозидов может быть представлен комбинацией местоположений и модификаций. В некоторых вариантах осуществления паттерн связей остова содержит местоположения и типы (например, фосфатная, фосфотиоатная, замещенная фосфотиоатная и т.д.) каждой межнуклеотидной связи.

[00134] В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I. В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I-а. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь имеет структуру формулы I, I-a, I-b, I-е, I-n-1, I-n-2, I-n-3, I-n-4, II, II-а-1, II-а-2, II-b-1, II-b-2, II-с-1, II-с-2, II-d-1, или II-d-2, или ее солевой формы.

[00135] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит одну или несколько межнуклеотидных связей, каждая из которых независимо имеет структуру формулы I, I-a, I-b, I-е, I-n-1, I-n-2, I-n-3, I-n-4, II, II-a-1, II-a-2, II-b-1, II-b-2, II-c-1, II-c-2, II-d-1, или II-d-2.

[00136] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды из совокупности, например, в представленных композициях, относятся к одинаковому типу олигонуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды, относящиеся к определенному типу олигонуклеотидов, имеют общий паттерн модификаций сахара. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды, относящиеся к определенному типу олигонуклеотидов, имеют общий паттерн модификаций оснований. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды, относящиеся к определенному типу олигонуклеотидов, имеют общий паттерн модификаций нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды, относящиеся к определенному типу олигонуклеотидов, имеют одинаковый состав. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды, относящиеся к определенному типу олигонуклеотидов, являются идентичными. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды из совокупности являются идентичными. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды из совокупности характеризуются одинаковым составом.

[00137] В некоторых вариантах осуществления, которые проиллюстрированы в данном документе, олигонуклеотиды, например НТТ-олигонуклеотиды, характеризуются контролируемой хиральностью, при этом содержат одну или несколько межнуклеотидных связей с контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды являются стереохимически чистыми. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды являются по сути отделенными от других стереоизомеров.

[00138] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды, например НТТ-олигонуклеотиды, содержат одно или несколько модифицированных нуклеиновых оснований, один или несколько модифицированных Сахаров и/или одну или несколько модифицированных межнуклеотидных связей.

[00139] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды, например НТТ-олигонуклеотиды, содержат один или несколько модифицированных Сахаров. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды по настоящему изобретению содержат одно или несколько модифицированных нуклеиновых оснований. В соответствии с настоящим изобретением в сахар и/или нуклеиновое основание могут быть введены различные модификации. Например, в некоторых вариантах осуществления модификация представляет собой модификацию, описанную в US 9006198. В некоторых вариантах осуществления модификация представляет собой модификацию, описанную в US 9394333, US 9744183, US 9605019, US 9982257, US 20170037399, US 20180216108, US 20180216107, US 9598458, WO 2017/062862, WO 2018/067973, WO 2017/160741, WO 2017/192679, WO 2017/210647 или WO 2018/098264, при этом модификации сахара, основания и межнуклеотидной связи, упомянутые в каждом из них, независимо включены в данный документ посредством ссылки.

[00140] При использовании в настоящем изобретении в некоторых вариантах осуществления один или несколько означает один. В некоторых вариантах осуществления один или несколько означает два. В некоторых вариантах осуществления один или несколько означает три. В некоторых вариантах осуществления один или несколько означает четыре. В некоторых вариантах осуществления один или несколько означает пять. В некоторых вариантах осуществления один или несколько означает шесть. В некоторых вариантах осуществления один или несколько означает семь. В некоторых вариантах осуществления один или несколько означает восемь. В некоторых вариантах осуществления один или несколько означает девять. В некоторых вариантах осуществления один или несколько означает десять. В некоторых вариантах осуществления один или несколько означает по меньшей мере один. В некоторых вариантах осуществления один или несколько означает по меньшей мере два. В некоторых вариантах осуществления один или несколько означает по меньшей мере три. В некоторых вариантах осуществления один или несколько означает по меньшей мере четыре. В некоторых вариантах осуществления один или несколько означает по меньшей мере пять. В некоторых вариантах осуществления один или несколько означает по меньшей мере шесть. В некоторых вариантах осуществления один или несколько означает по меньшей мере семь. В некоторых вариантах осуществления один или несколько означает по меньшей мере восемь. В некоторых вариантах осуществления один или несколько означает по меньшей мере девять. В некоторых вариантах осуществления один или несколько означает по меньшей мере десять.

[00141] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид представляет собой или содержит НТТ-олигонуклеотид, описанный в таблице или на фигуре.

[00142] Как продемонстрировано в настоящем изобретении, в некоторых вариантах осуществления представленный олигонуклеотид (например, НТТ-олигонуклеотид) характеризуется тем, что при контакте с транскриптом в системе для осуществления нокдауна, нокдаун его мишени (например, транскрипта НТТ в случае НТТ-олигонуклеотида, мутантного транскрипта НТТ, содержащего экспансию CAG-повторов и т.д.) повышается по сравнению с наблюдаемым при эталонных условиях (например, выбранных из группы, состоящей из отсутствия композиции, присутствия эталонной композиции и их комбинаций). В некоторых вариантах осуществления нокдаун увеличивается на 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 100%, или 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18,19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 200, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900, 1000-кратно или больше.

[00143] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды представлены в солевых формах. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды представлены в виде солей, содержащих отрицательно заряженные межнуклеотидные связи (например, фосфотиоатные межнуклеотидные связи, природные фосфатные связи и т.д.), существующие в виде их солевых форм. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды представлены в виде фармацевтически приемлемых солей. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды представлены в виде солей металлов. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды представлены в виде натриевых солей. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды представлены в виде солей металлов, например натриевых солей, где каждая отрицательно заряженная межнуклеотидная связь независимо находится в солевой форме (например, для натриевых солей, -O-P(O)(SNa)-O- в случае фосфотиоатной межнуклеотидной связи, -O-P(O)(ONa)-O- в случае природной фосфатной связи и т.д.).

[00144] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид или композиция на основе НТТ-олигонуклеотида характеризуются контролируемой хиральностью (например, являются стереомерно чистыми).

[00145] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид или НТТ-олигонуклеотид являются стереомерно неупорядоченными.

[00146] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP НТТ rs362272, rs362273, rs362273, rs362307, rs362331 или rs363099.

[00147] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362272 и имеет последовательность оснований, которая содержит ACATAGAGGACGCCGTGCAG, AGAGGACGCCGTGCAGGGCT, ATAGAGGACGCCGTGCAGGG, CACATAGAGGACGCCGTGCA, CATAGAGGACGCCGTGCAGG, GCACATAGAGGACGCCGTGC, или TAGAGGACGCCGTGCAGGGC, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00148] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362273 и имеет последовательность оснований, которая содержит AGCTGCTGCTACAGATCAAC, AGCTGCTGCTGCAGATCAAC, GGTTGATCTGTAGCAGCAGCT, GTTGATCTGTAGCAGCAGCT, GTTGATCTGTAGCAGCAGCT, или TTGATCTGTAGCAGCAGCT, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00149] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362273 и имеет последовательность оснований, которая содержит GTTGATCTGTAGCAGCAGCT, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00150] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362307 и имеет последовательность оснований, которая содержит CACAAGGGCACAGACTTCCA, GGCACAAGGGCACAGAC, GGCACAAGGGCACAGACT, GGCACAAGGGCACAGACTT, или GGCACAAGGGCACAGACTTC, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00151] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362331 и имеет последовательность оснований, которая содержит AGTGCACACAGTAGATGAGG, GTGCACACAGTAGATGAGGG, или TGCACACAGTAGATGAGGGA, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00152] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs363099 и имеет последовательность оснований, которая содержит AAGGCTGAGCGGAGAAACCC, AGGCTGAGCGGAGAAACCCT, CAAGGCTGAGCGGAGAAACC, CTGAGCGGAGAAACCCTCCA, GCTGAGCGGAGAAACCCTCC, GGCTGAGCGGAGAAACCCTC, или TGAGCGGAGAAACCCTCCAA, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00153] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362272 и имеет последовательность оснований, которая представляет собой ACATAGAGGACGCCGTGCAG, AGAGGACGCCGTGCAGGGCT, ATAGAGGACGCCGTGCAGGG, CACATAGAGGACGCCGTGCA, CATAGAGGACGCCGTGCAGG, GCACATAGAGGACGCCGTGC, или TAGAGGACGCCGTGCAGGGC, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00154] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362273 и имеет последовательность оснований, которая представляет собой AGCTGCTGCTACAGATCAAC, AGCTGCTGCTGCAGATCAAC, GGTTGATCTGTAGCAGCAGCT, GTTGATCTGTAGCAGCAGCT, GTTGATCTGTAGCAGCAGCT, или TTGATCTGTAGCAGCAGCT, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00155] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362273 и имеет последовательность оснований, которая представляет собой GTTGATCTGTAGCAGCAGCT, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00156] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362307 и имеет последовательность оснований, которая представляет собой CACAAGGGCACAGACTTCCA, GGCACAAGGGCACAGAC, GGCACAAGGGCACAGACT, GGCACAAGGGCACAGACTT, или GGCACAAGGGCACAGACTTC, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00157] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362331 и имеет последовательность оснований, которая представляет собой AGTGCACACAGTAGATGAGG, GTGCACACAGTAGATGAGGG, или TGCACACAGTAGATGAGGGA, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00158] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs363099 и имеет последовательность оснований, которая представляет собой AAGGCTGAGCGGAGAAACCC, AGGCTGAGCGGAGAAACCCT, CAAGGCTGAGCGGAGAAACC, CTGAGCGGAGAAACCCTCCA, GCTGAGCGGAGAAACCCTCC, GGCTGAGCGGAGAAACCCTC, или TGAGCGGAGAAACCCTCCAA, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00159] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362272 и имеет последовательность оснований, которая содержит по меньшей мере 15 смежных оснований, включая положение SNP, из ACATAGAGGACGCCGTGCAG, AGAGGACGCCGTGCAGGGCT, ATAGAGGACGCCGTGCAGGG, CACATAGAGGACGCCGTGCA, CATAGAGGACGCCGTGCAGG, GCACATAGAGGACGCCGTGC, или TAGAGGACGCCGTGCAGGGC, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00160] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362273 и имеет последовательность оснований, которая содержит по меньшей мере 15 смежных оснований, включая положение SNP, из AGCTGCTGCTACAGATCAAC, AGCTGCTGCTGCAGATCAAC, GGTTGATCTGTAGCAGCAGCT, GTTGATCTGTAGCAGCAGCT, GTTGATCTGTAGCAGCAGCT, или TTGATCTGTAGCAGCAGCT, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00161] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362273 и имеет последовательность оснований, которая содержит по меньшей мере 15 смежных оснований, включая положение SNP, из GTTGATCTGTAGCAGCAGCT, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00162] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362307 и имеет последовательность оснований, которая содержит по меньшей мере 15 смежных оснований, включая положение SNP, из CACAAGGGCACAGACTTCCA, GGCACAAGGGCACAGAC, GGCACAAGGGCACAGACT, GGCACAAGGGCACAGACTT, или GGCACAAGGGCACAGACTTC, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00163] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362331 и имеет последовательность оснований, которая содержит по меньшей мере 15 смежных оснований, включая положение SNP, из AGTGCACACAGTAGATGAGG, GTGCACACAGTAGATGAGGG, или TGCACACAGTAGATGAGGGA, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00164] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs363099 и имеет последовательность оснований, которая содержит по меньшей мере 15 смежных оснований, включая положение SNP, из AAGGCTGAGCGGAGAAACCC, AGGCTGAGCGGAGAAACCCT, CAAGGCTGAGCGGAGAAACC, CTGAGCGGAGAAACCCTCCA, GCTGAGCGGAGAAACCCTCC, GGCTGAGCGGAGAAACCCTC, или TGAGCGGAGAAACCCTCCAA, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00165] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362272 и имеет последовательность оснований, которая содержит по меньшей мере 10 смежных оснований, включая положение SNP, из ACATAGAGGACGCCGTGCAG, AGAGGACGCCGTGCAGGGCT, ATAGAGGACGCCGTGCAGGG, CACATAGAGGACGCCGTGCA, CATAGAGGACGCCGTGCAGG, GCACATAGAGGACGCCGTGC, или TAGAGGACGCCGTGCAGGGC, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00166] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362273 и имеет последовательность оснований, которая содержит по меньшей мере 10 смежных оснований, включая положение SNP, из AGCTGCTGCTACAGATCAAC, AGCTGCTGCTGCAGATCAAC, GGTTGATCTGTAGCAGCAGCT, GTTGATCTGTAGCAGCAGCT, GTTGATCTGTAGCAGCAGCT, или TTGATCTGTAGCAGCAGCT, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00167] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362273 и имеет последовательность оснований, которая содержит по меньшей мере 10 смежных оснований, включая положение SNP, из GTTGATCTGTAGCAGCAGCT, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00168] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362307 и имеет последовательность оснований, которая содержит по меньшей мере 10 смежных оснований, включая положение SNP, из CACAAGGGCACAGACTTCCA, GGCACAAGGGCACAGAC, GGCACAAGGGCACAGACT, GGCACAAGGGCACAGACTT, или GGCACAAGGGCACAGACTTC, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00169] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362331 и имеет последовательность оснований, которая содержит по меньшей мере 10 смежных оснований, включая положение SNP, из AGTGCACACAGTAGATGAGG, GTGCACACAGTAGATGAGGG, или TGCACACAGTAGATGAGGGA, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00170] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs363099 и имеет последовательность оснований, которая содержит по меньшей мере 10 смежных оснований, включая положение SNP, из AAGGCTGAGCGGAGAAACCC, AGGCTGAGCGGAGAAACCCT, CAAGGCTGAGCGGAGAAACC, CTGAGCGGAGAAACCCTCCA, GCTGAGCGGAGAAACCCTCC, GGCTGAGCGGAGAAACCCTC, или TGAGCGGAGAAACCCTCCAA, где каждый T может быть независимо замещен на U или наоборот.

[00171] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид не нацеливается на SNP, при этом каждый U может быть независимо замещен на T и наоборот.

[00172] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид не нацеливается на SNP и является панспецифическим, при этом каждый U может быть независимо замещен на T и наоборот.

[00173] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид не нацеливается на SNP и является панспецифическим, а также имеет последовательность оснований, которая содержит, которая представляет собой, которая содержит по меньшей мере 15 смежных оснований или которая содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из ACCGCCATCCCCGCCGTAGC, CCGCCATCCCCGCCGTAGCC, CGCCATCCCCGCCGTAGCCT, CTCAGTAACATTGACACCAC, GCCATCCCCGCCGTAGCCTG, GGCTCTGGGTTGCTGGGTCA, GGTGTCCCTCATGGGCTCTG, или GTTACCGCCATCCCCGCCGT, где каждый U может быть независимо замещен на T и наоборот.

[00174] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид имеет последовательность оснований, содержащую последовательность ACCGCCATCCCCGCCGTAGC, CCGCCATCCCCGCCGTAGCC, CGCCATCCCCGCCGTAGCCT, CTCAGTAACATTGACACCAC, GCCATCCCCGCCGTAGCCTG, GGCTCTGGGTTGCTGGGTCA, GGTGTCCCTCATGGGCTCTG, или GTTACCGCCATCCCCGCCGT, где каждый U может быть независимо замещен на T и наоборот.

[00175] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид имеет последовательность оснований, которая представляет собой последовательность ACCGCCATCCCCGCCGTAGC, CCGCCATCCCCGCCGTAGCC, CGCCATCCCCGCCGTAGCCT, CTCAGTAACATTGACACCAC, GCCATCCCCGCCGTAGCCTG, GGCTCTGGGTTGCTGGGTCA, GGTGTCCCTCATGGGCTCTG, или GTTACCGCCATCCCCGCCGT, где каждый U может быть независимо замещен на T и наоборот.

[00176] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид имеет последовательность оснований, содержащую по меньшей мере 15 смежных оснований из последовательности ACCGCCATCCCCGCCGTAGC, CCGCCATCCCCGCCGTAGCC, CGCCATCCCCGCCGTAGCCT, CTCAGTAACATTGACACCAC, GCCATCCCCGCCGTAGCCTG, GGCTCTGGGTTGCTGGGTCA, GGTGTCCCTCATGGGCTCTG, или GTTACCGCCATCCCCGCCGT, где каждый U может быть независимо замещен на T и наоборот.

[00177] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид имеет последовательность оснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных оснований из последовательности ACCGCCATCCCCGCCGTAGC, CCGCCATCCCCGCCGTAGCC, CGCCATCCCCGCCGTAGCCT, CTCAGTAACATTGACACCAC, GCCATCCCCGCCGTAGCCTG, GGCTCTGGGTTGCTGGGTCA, GGTGTCCCTCATGGGCTCTG, или GTTACCGCCATCCCCGCCGT, где каждый U может быть независимо замещен на T и наоборот.

[00178] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид представляет собой любой НТТ-олигонуклеотид, раскрытый в данном документе, или его соль.

[00179] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид представляет собой любой из WV-10786, WV-10787, WV-10790, WV-10791, WV-10806, WV-10810, WV-10811, WV-12282, WV-12283, WV-12284, WV-14914, WV-15078, WV-15080, WV-17782, WV-19824, WV-19825, WV-19840, WV-19841, WV-21178, WV-21179, WV-21180, WV-21181, WV-21267, WV-21271, WV-21274, WV-21403, WV-21404, WV-21405, WV-21406, WV-21409, WV-21410, WV-21412, WV-21447, WV-21448, WV-23689, WV-23690, WV-23691, WV-23692, WV-28152, WV-28153, WV-28154, WV-28155, WV-28156, WV-28157, WV-28158, WV-28159, WV-28160, WV-28161, WV-28162, WV-28163, WV-28164, WV-28165, WV-28166, WV-28167, WV-28168, или WV-9679, или его соль, где каждый U может быть независимо замещен на T и наоборот.

[00180] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид представляет собой любой стереомерно чистый (характеризующийся контролируемой хиральностью) НТТ-олигонуклеотид, который содержит последовательность оснований из любого из WV-10786, WV-10787, WV-10790, WV-10791, WV-10806, WV-10810, WV-10811, WV-12282, WV-12283, WV-12284, WV-14914, WV-15078, WV-15080, WV-17782, WV-19824, WV-19825, WV-19840, WV-19841, WV-21178, WV-21179, WV-21180, WV-21181, WV-21267, WV-21271, WV-21274, WV-21403, WV-21404, WV-21405, WV-21406, WV-21409, WV-21410, WV-21412, WV-21447, WV-21448, WV-23689, WV-23690, WV-23691, WV-23692, WV-28152, WV-28153, WV-28154, WV-28155, WV-28156, WV-28157, WV-28158, WV-28159, WV-28160, WV-28161, WV-28162, WV-28163, WV-28164, WV-28165, WV-28166, WV-28167, WV-28168, или WV-9679, или его соли, где каждый U может быть независимо замещен на T и наоборот.

[00181] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид представляет собой любой стереомерно чистый (характеризующийся контролируемой хиральностью) НТТ-олигонуклеотид, который имеет любую последовательность оснований из любого из WV-10786, WV-10787, WV-10790, WV-10791, WV-10806, WV-10810, WV-10811, WV-12282, WV-12283, WV-12284, WV-14914, WV-15078, WV-15080, WV-17782, WV-19824, WV-19825, WV-19840, WV-19841, WV-21178, WV-21179, WV-21180, WV-21181, WV-21267, WV-21271, WV-21274, WV-21403, WV-21404, WV-21405, WV-21406, WV-21409, WV-21410, WV-21412, WV-21447, WV-21448, WV-23689, WV-23690, WV-23691, WV-23692, WV-28152, WV-28153, WV-28154, WV-28155, WV-28156, WV-28157, WV-28158, WV-28159, WV-28160, WV-28161, WV-28162, WV-28163, WV-28164, WV-28165, WV-28166, WV-28167, WV-28168, или WV-9679, или его соли, где каждый U может быть независимо замещен на T и наоборот.

[00182] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид представляет собой любой стереомерно чистый (характеризующийся контролируемой хиральностью) НТТ-олигонуклеотид, который имеет последовательность оснований, содержащую по меньшей мере 15 смежных оснований из последовательности оснований из любого из WV-10786, WV-10787, WV-10790, WV-10791, WV-10806, WV-10810, WV-10811, WV-12282, WV-12283, WV-12284, WV-14914, WV-15078, WV-15080, WV-17782, WV-19824, WV-19825, WV-19840, WV-19841, WV-21178, WV-21179, WV-21180, WV-21181, WV-21267, WV-21271, WV-21274, WV-21403, WV-21404, WV-21405, WV-21406, WV-21409, WV-21410, WV-21412, WV-21447, WV-21448, WV-23689, WV-23690, WV-23691, WV-23692, WV-28152, WV-28153, WV-28154, WV-28155, WV-28156, WV-28157, WV-28158, WV-28159, WV-28160, WV-28161, WV-28162, WV-28163, WV-28164, WV-28165, WV-28166, WV-28167, WV-28168, или WV-9679, или его соли, где каждый U может быть независимо замещен на T и наоборот.

[00183] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид представляет собой любой стереомерно чистый (характеризующийся контролируемой хиральностью) НТТ-олигонуклеотид или НТТ-олигонуклеотид, который имеет последовательность оснований, содержащую по меньшей мере 10 смежных оснований из последовательности оснований из любого из WV-10786, WV-10787, WV-10790, WV-10791, WV-10806, WV-10810, WV-10811, WV-12282, WV-12283, WV-12284, WV-14914, WV-15078, WV-15080, WV-17782, WV-19824, WV-19825, WV-19840, WV-19841, WV-21178, WV-21179, WV-21180, WV-21181, WV-21267, WV-21271, WV-21274, WV-21403, WV-21404, WV-21405, WV-21406, WV-21409, WV-21410, WV-21412, WV-21447, WV-21448, WV-23689, WV-23690, WV-23691, WV-23692, WV-28152, WV-28153, WV-28154, WV-28155, WV-28156, WV-28157, WV-28158, WV-28159, WV-28160, WV-28161, WV-28162, WV-28163, WV-28164, WV-28165, WV-28166, WV-28167, WV-28168, или WV-9679, или его соли, где каждый U может быть независимо замещен на T и наоборот.

[00184] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к композиции, содержащей НТТ-олигонуклеотид и фармацевтический носитель.

[00185] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к способу применения НТТ-олигонуклеотида для лечения и/или предупреждения болезни Хантингтона.

[00186] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к способу применения НТТ-олигонуклеотида, способу лечения, предупреждения, задержки возникновения и/или уменьшения тяжести по меньшей мере одного симптома болезни Хантингтона.

[00187] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к способу изготовления лекарственного препарата, содержащего НТТ-олигонуклеотид.

[00188] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид представляет собой любой отдельный НТТ-олигонуклеотид или род НТТ-олигонуклеотидов, описанных в данном документе.

Последовательности оснований

[00189] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит последовательность оснований, описанную в данном документе, или ее часть (например, участок из 5-50, 5-40, 5-30, 5-20, или 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 или по меньшей мере 10, по меньшей мере 15 смежных нуклеиновых оснований) с 0-5 (например, 0, 1, 2, 3, 4 или 5) ошибочными основаниями. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит последовательность оснований, описанную в данном документе, или ее часть, где часть представляет собой участок из по меньшей мере 10 смежных нуклеиновых оснований или участок из по меньшей мере 15 смежных нуклеиновых оснований с 1-5 ошибочными основаниями. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды содержат последовательность оснований, описанную в данном документе, или ее часть, где часть представляет собой участок из по меньшей мере 10 смежных нуклеиновых оснований или участок из по меньшей мере 10 смежных нуклеиновых оснований с 1-5 ошибочными основаниями. В некоторых вариантах осуществления последовательности оснований олигонуклеотидов содержат или состоят из 10-50 (например, приблизительно или по меньшей мере 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 30, 35, 40, 45; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 15; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 16; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 17; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 18; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 19; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 20; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 21; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 22; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 23; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 24; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 25) смежных оснований из последовательности оснований, которая идентична или комплементарна последовательности оснований гена НТТ или его транскрипта (например, мРНК).

[00190] Последовательности оснований представленных олигонуклеотидов, как понятно специалистам в данной области техники, как правило, характеризуются достаточной длиной и комплементарностью в отношении своих мишеней, например РНК-транскриптов (например, пре-мРНК, зрелой мРНК и т.д.) для опосредования мишень-специфического нокдауна. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований НТТ-олигонуклеотида характеризуется достаточной длиной и идентичностью с мишенью-транскриптом НТТ для опосредования мишень-специфического нокдауна. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид является комплементарным части транскрипта НТТ (последовательности мишени-транскрипта НТТ). В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований НТТ-олигонуклеотида характеризуется 90% идентичностью или больше с последовательностью оснований олигонуклеотида, раскрытого в таблице. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований НТТ-олигонуклеотида характеризуется 95% идентичностью или больше с последовательностью оснований олигонуклеотида, раскрытого в таблице. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований НТТ-олигонуклеотида содержит непрерывный участок из 15 или более оснований из олигонуклеотида, раскрытого в таблице, за исключением того, что одно или несколько оснований в пределах участка являются удаленными (например, в нуклеотиде отсутствует нуклеиновое основание). В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований НТТ-олигонуклеотида содержит непрерывный участок из 19 или более оснований из НТТ-олигонуклеотида, раскрытого в данном документе, за исключением того, что одно или несколько оснований в пределах участка являются удаленными (например, в нуклеотиде отсутствует нуклеиновое основание). В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований НТТ-олигонуклеотида содержит непрерывный участок из 19 или более оснований из олигонуклеотида, раскрытого в данном документе, за исключением отличия по 1 или 2 основаниям на 5'-конце и/или 3'-конце последовательностей оснований.

[00191] В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида представляет собой, включает или содержит 10-20, например, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных оснований из TCTCCATTCTATCTTATGTT, где каждый T может быть независимо заменен на U.

[00192] В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида представляет собой, включает или содержит 10-20, например, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных оснований из GTTGATCTGTAGTAGCAGCT или GTTGATCTGTAGCAGCAGCT, где каждый T может быть независимо заменен на U.

[00193] В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида представляет собой, включает или содержит 10-20, например, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных оснований из GTGCACACAGTAGATGAGGG, где каждый T может быть независимо заменен на U.

[00194] В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида представляет собой, включает или содержит 10-20, например, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных оснований из GTGCAACACAGTAGATGAGGG, где каждый T может быть независимо заменен на U.

[00195] В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида представляет собой, включает или содержит 10-20, например, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных оснований из GGCACAAGGGCACAGACTTC, где каждый T может быть независимо заменен на U.

[00196] В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида представляет собой, включает или содержит 10-20, например, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных оснований из GGCACAAAGGGCACAGACTTC, где каждый T может быть независимо заменен на U.

[00197] В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида представляет собой, включает или содержит 10-20, например, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных оснований из CAAGGGCACAGACTTC, где каждый T может быть независимо заменен на U.

[00198] В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида представляет собой, включает или содержит 10-20, например, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 смежных оснований из AAGGGCACAGACTTC, где каждый T может быть независимо заменен на U.

[00199] В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований НТТ-олигонуклеотида является комплементарной последовательности транскрипта НТТ или его части.

[00200] В некоторых вариантах осуществления ген НТТ-мишень представляет собой аллель гена НТТ. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид является аллель-специфическим и сконструирован для нацеливания на специфический аллель НТТ (например, аллель, ассоциированный с состоянием, нарушением или заболеванием, ассоциированным с НТТ). В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида полностью комплементарна последовательности транскрипта НТТ (или его части) с аллеля, ассоциированного с состоянием, нарушением или заболеванием, и не полностью комплементарна последовательности транскрипта НТТ (или его части), в меньшей степени ассоциированного или не ассоциированного с состоянием, нарушением или заболеванием. В некоторых вариантах осуществления ассоциированный с нарушением аллель НТТ содержит SNP, мутацию или другую вариацию последовательности, и НТТ-олигонуклеотид сконструирован как последовательность, комплементарная данной последовательности. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида комплементарна одному аллелю SNP и не комплементарна другим. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида комплементарна одному аллелю SNP, при этом аллель находится на той же нити ДНК, что и экспансия CAG-повторов. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида полностью комплементарна последовательности транскрипта НТТ (или его части) с аллеля, содержащего экспансию CAG-повторов, и не полностью комплементарна последовательности транскрипта НТТ (или его части) с аллеля, содержащего нормальное числом CAG-повторов. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид является панспецифическим и сконструирован для нацеливания на все аллели НТТ (например, все или большинство из известных аллелей НТТ содержат одинаковую последовательность или последовательность, комплементарную ей, в пределах участка из оснований, распознаваемых НТТ-олигонуклеотидом). В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид осуществляет снижение экспрессии, уровня и/или видов активности как НТТ дикого типа, так и мутантного НТТ, и/или их транскриптов, и/или продуктов.

[00201] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит последовательность оснований или ее часть, описанную в таблицах, модификацию сахара, нуклеиновых оснований и/или межнуклеотидных связей, описанную в данном документе, и/или дополнительный химический фрагмент (в дополнение к олигонуклеотидной цепи, например, нацеливающий фрагмент, липидный фрагмент, углеводный фрагмент и т.д.), описанный в данном документе.

[00202] В некоторых вариантах осуществления термины "комплементарный", "полностью комплементарный" и "по сути комплементарный" могут использоваться в отношении соответствия оснований между олигонуклеотидом (например, НТТ-олигонуклеотидом) и последовательностью-мишенью (например, последовательностью НТТ-мишенью), как будет понятно специалистам в данной области техники в контексте их использования. В качестве неограничивающего примера, если последовательность-мишень, например, имеет последовательность оснований 5'-GCAUAGCGAGCGAGGGAAAAC-3', олигонуклеотид с последовательностью оснований 5'GUUUUCCCUCGCUCGCUAUGC-3' является комплементарным (полностью комплементарным) такой последовательности-мишени. Следует отметить, что замена T на U или наоборот обычно не изменяет показатель комплементарности. Используемый в данном документе олигонуклеотид, который является "по сути комплементарным" последовательности-мишени, является в значительной степени или в основном комплементарным, но не на 100% комплементарным. В некоторых вариантах осуществления последовательность (например, НТТ-олигонуклеотид), которая является по сути комплементарной, имеет 1, 2, 3, 4 или 5 ошибочных оснований при выравнивании с ее последовательностью-мишенью. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид имеет последовательность оснований, которая является по сути комплементарной последовательности НТТ-мишени. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид имеет последовательность оснований, которая является по сути комплементарной последовательности, комплементарной НТТ-олигонуклеотиду, раскрытому в данном документе. Как понятно специалистам в данной области техники, в некоторых вариантах осуществления последовательности олигонуклеотидов не должны быть на 100% комплементарны своим мишеням для выполнения олигонуклеотидами своих функций (например, нокдауна нуклеиновых кислот НТТ-мишеней). В некоторых вариантах осуществления гомология, идентичность последовательностей или комплементарность составляет 60%-100%, например, приблизительно или по меньшей мере 60%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, или 99%, или 100%. В некоторых вариантах осуществления представленный олигонуклеотид характеризуется 75%-100% (например, приблизительно или по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, или 99%, или 100%) комплементарностью последовательности с областью-мишенью (например, последовательностью-мишенью) в пределах его нуклеиновой кислоты НТТ-мишени. В некоторых вариантах осуществления процентный показатель составляет приблизительно 80% или больше. В некоторых вариантах осуществления процентный показатель составляет приблизительно 85% или больше. В некоторых вариантах осуществления процентный показатель составляет приблизительно 90% или больше. В некоторых вариантах осуществления процентный показатель составляет приблизительно 95% или больше. Например, представленный олигонуклеотид, длина которого составляет 20 нуклеиновых оснований, будет характеризоваться 90-процентной комплементарностью, если 18 из его 20 нуклеиновых оснований являются комплементарными. Как правило, при определении комплементарности А и T (или U) являются комплементарными нуклеиновыми основаниями, и С и G являются комплементарными нуклеиновыми основаниями.

[00203] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен НТТ-олигонуклеотид, содержащий последовательность, которая встречается в олигонуклеотиде, описанном в таблице. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен НТТ-олигонуклеотид, содержащий последовательность, которая встречается в олигонуклеотиде, описанном в таблице, где один или несколько U независимо и необязательно заменены на T или наоборот. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид может содержать по меньшей мере один T и/или по меньшей мере один U. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен НТТ-олигонуклеотид, содержащий последовательность, которая встречается в олигонуклеотиде, описанном в таблице, где указанная последовательность характеризуется более чем 50% идентичностью с последовательностью олигонуклеотида, описанного в таблице. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен НТТ-олигонуклеотид, содержащий последовательность олигонуклеотида, описанного в таблице. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен НТТ-олигонуклеотид, последовательность оснований которого представляет собой последовательность олигонуклеотида, раскрытого в таблице. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен НТТ-олигонуклеотид, содержащий последовательность, которая встречается в олигонуклеотиде, указанном в таблице, где олигонуклеотиды имеют паттерн связей остова, паттерн хиральных центров остова и/или паттерн модификаций атома фосфора в остове из того же олигонуклеотида или другого олигонуклеотида, указанного в таблице в данном документе.

[00204] Среди всего прочего в таблице 1 и в других местах настоящего изобретения представлены различные олигонуклеотиды, каждый из которых имеет определенную последовательность оснований. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в настоящем изобретении представлен олигонуклеотид, последовательность оснований которого представляет собой, включает или содержит часть последовательности оснований олигонуклеотида, раскрытого в данном документе, например, в таблице, например, в таблице 1 в данном документе. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен олигонуклеотид, имеющий последовательность оснований, которая представляет собой, включает или содержит часть последовательности оснований олигонуклеотида, раскрытого в данном документе, например, в таблице, где олигонуклеотид дополнительно содержит химическую модификацию, стереохимию, формат, дополнительный химический фрагмент, описанный в данном документе (например, нацеливающий фрагмент, липидный фрагмент, углеводный фрагмент и т.д.), и/или другой структурный признак.

[00205] В некоторых вариантах осуществления "часть" (например, последовательности оснований или паттерна модификаций) составляет по меньшей мере 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, или 20 мономерных звеньев в длину (например, в случае последовательности оснований по меньшей мере 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, или 20 оснований в длину). В некоторых вариантах осуществления "часть" последовательности оснований составляет по меньшей мере 5 оснований в длину. В некоторых вариантах осуществления "часть" последовательности оснований составляет по меньшей мере 10 оснований в длину. В некоторых вариантах осуществления "часть" последовательности оснований составляет по меньшей мере 15 оснований в длину. В некоторых вариантах осуществления "часть" последовательности оснований составляет по меньшей мере 20 оснований в длину. В некоторых вариантах осуществления часть последовательности оснований составляет 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или более смежных (последовательных) оснований. В некоторых вариантах осуществления часть последовательности оснований составляет 15 или более смежных (последовательных) оснований.

[00206] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен олигонуклеотид (например, НТТ-олигонуклеотид), последовательность оснований которого представляет собой последовательность оснований олигонуклеотида, указанного в таблице, или ее часть. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен НТТ-олигонуклеотид с последовательностью олигонуклеотида, указанного в таблице, где олигонуклеотид способен управлять снижением экспрессии, уровня и/или активности гена НТТ или его генного продукта. Как понятно специалистам в данной области техники, в представленной последовательности оснований каждый U может быть необязательно и независимо заменен на T или наоборот, и последовательность может содержать смесь U и Т. В некоторых вариантах осуществления С может быть необязательно и независимо заменен на 5mC.

[00207] В некоторых вариантах осуществления часть представляет собой участок из по меньшей мере 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, или 25 суммарных нуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления часть представляет собой участок из по меньшей мере 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, или 25 суммарных нуклеотидов с 0-3 ошибочными основаниями. В некоторых вариантах осуществления часть представляет собой участок из по меньшей мере 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, или 25 суммарных нуклеотидов с 0-3 ошибочными основаниями, где участок с 0 ошибочных оснований является комплементарным, а участок с 1 или несколькими ошибочными основаниями представляет собой неограничивающий пример по сути комплементарного участка. В некоторых вариантах осуществления основание предусматривает часть, характерную для нуклеиновой кислоты (например, гена) в том смысле, что часть является идентичной или комплементарной части нуклеиновой кислоты или ее транскрипта и не является идентичной или комплементарной части любой другой нуклеиновой кислоты (например, гена) или ее транскрипта в том же геноме. В некоторых вариантах осуществления часть является характерной для НТТ человека. В некоторых вариантах осуществления часть является характерной для mHTT человека.

[00208] В некоторых вариантах осуществления длина НТТ-олигонуклеотида составляет не более приблизительно 49, 45, 40, 30, 35, 25 или 23 суммарные нуклеотида, как описано в данном документе. В некоторых вариантах осуществления, где изложенная в данном документе последовательность начинается с U или T на 5'-конце, U может быть удален и/или заменен другим основанием. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид имеет последовательность оснований, которая представляет собой, или включает, или содержит часть последовательности оснований олигонуклеотида, указанного в таблице, который имеет формат или часть формата, раскрытого в данном документе.

[00209] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды, например НТТ-олигонуклеотиды, являются стереомерно неупорядоченными. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды, например НТТ-олигонуклеотиды, характеризуются контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, является хирально чистым (или "стереомерно чистым", "стереохимически чистым"), где олигонуклеотид существует в виде единственной стереоизомерной формы (во многих случаях единственной диастереоизомерной (или "диастереомерной") формы, поскольку в олигонуклеотиде может быть несколько хиральных центров, например, атом фосфора в составе связи, атом углерода в составе сахара и т.д.). Как понятно специалистам в данной области техники, хирально чистый олигонуклеотид отделяют от его других стереоизомерных форм (в той степени, что могут оставаться некоторые примеси, поскольку химические и биологические способы, селективность и/или методы очистки и т.д. редко, если вообще когда-либо, доходят до абсолютной завершенности). В хирально чистом олигонуклеотиде каждый хиральный центр независимо определяется с точки зрения его конфигурации (стереомерно задаваемый или характеризующийся контролируемой хиральностью, например, в случае хирального атома фосфора в составе связи в хиральных межнуклеотидных связях, Rp или Sp (такие межнуклеотидные связи представляют собой межнуклеотидные связи с определенной стереохимией или межнуклеотидные связи с контролируемой хиральностью)). В отличие от олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью или хирально чистых олигонуклеотидов, которые содержат атом фосфора в составе стереомерно задаваемой связи, рацемические (или "стереомерно неупорядоченные", "без контролируемой хиральности") олигонуклеотиды, содержащие хиральный атом фосфора в составе связи, например, полученные в результате традиционного фосфорамидитного олигонуклеотидного синтеза без стереохимического контроля в ходе стадий присоединения в комбинации с традиционным сульфированием (с созданием стереомерно неупорядоченных фосфотиоатных межнуклеотидных связей), относятся к случайной смеси различных стереоизомеров (как правило, диастереоизомеров (или "диастереомеров"), поскольку в олигонуклеотиде существует несколько хиральных центров). Например, в случае А*А*А, где * представляет собой фосфотиоатную межнуклеотидную связь (которая содержит хиральный атом фосфора в составе связи), рацемический олигонуклеотидный препарат включает четыре диастереомера [2²=4, учитывая два хиральных атома фосфора в составе связи, каждый из которых может существовать в одной из двух конфигураций (Sp или Rp)]: A *S A *S A, A *S A *R A, A *R A *S А и A *R A *R А, где *S представляет собой фосфотиоатную межнуклеотидную связь Sp, a *R представляет собой фосфотиоатную межнуклеотидную связь Rp. В случае хирально чистого олигонуклеотида, например, A *S A *S А, он существует в единственной стереоизомерной форме, и его отделяют от других стереоизомеров (например, диастереомеров A *S A *R A, A *R А *S А и A *R A *R А). В некоторых вариантах осуществления фосфотиоат Rp представлен как *S или * S. В некоторых вариантах осуществления фосфотиоат Rp представлен как *R или * R.

[00210] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды, например НТТ-олигонуклеотиды, содержат 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более стереомерно неупорядоченных межнуклеотидных связей (смесь атомов фосфора Rp и Sp в составе связи в межнуклеотидной связи, например, полученных в результате традиционного олигонуклеотидного синтеза без контроля хиральности). В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды, например НТТ-олигонуклеотиды, содержат одну или несколько (например, 1-50, 1-40, 1-30, 1-25, 1-20, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 или более) межнуклеотидных связей с контролируемой хиральностью (атомы фосфора Rp или Sp в составе связи в межнуклеотидной связи, например, полученные в результате олигонуклеотидного синтеза с контролем хиральности). В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь представляет собой фосфотиоатную межнуклеотидную связь. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь представляет собой стереомерно неупорядоченную фосфотиоатную межнуклеотидную связь. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь представляет собой фосфотиоатную межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью.

[00211] Среди всего прочего в настоящем изобретении представлены технологии получения олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью (в некоторых вариантах осуществления стереохимически чистых олигонуклеотидов). В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды являются стереохимически чистыми. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды по настоящему изобретению являются чистыми на приблизительно 5%-100%, 10%-100%, 20%-100%, 30%-100%, 40%-100%, 50%-100%, 60%-100%, 70%-100%, 80-100%, 90-100%, 95-100%, 50%-90%, или на приблизительно 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 100%, или на по меньшей мере приблизительно 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 99%,. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидные связи олигонуклеотидов содержат или состоят из одной или нескольких (например, 1-50, 1-40, 1-30, 1-25, 1-20, 5-50, 5-40, 5-30, 5-25, 5-20, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 или больше) хиральных межнуклеотидных связей, каждая из которых независимо характеризуется диастереомерной чистотой, составляющей по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 99,5%, как правило по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 99,5%. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды по настоящему изобретению, например НТТ-олигонуклеотиды, характеризуются диастереомерной чистотой, составляющей (DS)^CIL, где DS представляет собой диастереомерную чистоту, как описано в настоящем изобретении (например, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 99,5%, или больше), а CIL представляет собой число межнуклеотидных связей с контролируемой хиральностью (например, 1-50, 1-40, 1-30, 1-25, 1-20, 5-50, 5-40, 5-30, 5-25, 5-20, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 или больше). В некоторых вариантах осуществления DS составляет 95%-100%. В некоторых вариантах осуществления каждая межнуклеотидная связь независимо характеризуется контролируемой хиральностью, а CIL представляет собой число межнуклеотидных связей с контролируемой хиральностью.

[00212] В данном документе описаны и/или упомянуты различные НТТ-олигонуклеотиды.

[00213] Последовательности оснований и структуры различных НТТ-олигонуклеотидов, включая без ограничений ONT-450, ONT-451, ONT-452, ONT-453, ONT-454, WV-902, WV-903, WV-904, WV-905, WV-906, WV-907, WV-908, WV-909, WV-910, WV-911, WV-912, WV-913, WV-914, WV-915, WV-916, WV-917, WV-918, WV-919, WV-920, WV-921, WV-922, WV-923, WV-924, WV-925, WV-926, WV-927, WV-928, WV-929, WV-930, WV-931, WV-932, WV-933, WV-934, WV-935, WV-936, WV-937, WV-938, WV-939, WV-940, WV-941, WV-944, WV-945, WV-948, WV-949, WV-950, WV-951, WV-952, WV-953, WV-954, WV-955, WV-956, WV-957, WV-958, WV-959, WV-960, WV-961, WV-962, WV-963, WV-964, WV-965, WV-973, WV-974, WV-975, WV-982, WV-983, WV-984, WV-985, WV-986, WV-987, WV-1001, WV-1002, WV-1003, WV-1004, WV-1005, WV-1006, WV-1007, WV-1008, WV-1009, WV-1010, WV-1011, WV-1012, WV-1013, WV-1014, WV-1015, WV-1016, WV-1017, WV-1018, WV-1019, WV-1020, WV-1021, WV-1022, WV-1023, WV-1024, WV-1025, WV-1026, WV-1027, WV-1028, WV-1029, WV-1030, WV-1031, WV-1032, WV-1033, WV-1034, WV-1035, WV-1036, WV-1037, WV-1038, WV-1039, WV-1040, WV-1041, WV-1042, WV-1043, WV-1044, WV-1045, WV-1046, WV-1047, WV-1048, WV-1049, WV-1050, WV-1051, WV-1052, WV-1053, WV-1054, WV-1055, WV-1056, WV-1057, WV-1058, WV-1059, WV-1060, WV-1061, WV-1062, WV-1063, WV-1064, WV-1065, WV-1066, WV-1067, WV-1068, WV-1069, WV-1070, WV-1071, WV-1072, WV-1073, WV-1074, WV-1075, WV-1076, WV-1077, WV-1078, WV-1079, WV-1080, WV-1081, WV-1082, WV-1083, WV-1084, WV-1085, WV-1086, WV-1087, WV-1088, WV-1089, WV-1090, WV-1091, WV-1092, WV-1234, WV-1235, WV-1497, WV-1508, WV-1509, WV-1510, WV-1511, WV-1654, WV-1655, WV-1788, WV-1789, WV-1790, WV-1799, WV-2022, WV-2023, WV-2024, WV-2025, WV-2026, WV-2027, WV-2028, WV-2029, WV-2030, WV-2031, WV-2032, WV-2033, WV-2034, WV-2035, WV-2036, WV-2037, WV-2038, WV-2039, WV-2040, WV-2041, WV-2042, WV-2043, WV-2044, WV-2045, WV-2046, WV-2047, WV-2048, WV-2049, WV-2050, WV-2051, WV-2052, WV-2053, WV-2054, WV-2055, WV-2056, WV-2057, WV-2058, WV-2059, WV-2060, WV-2061, WV-2062, WV-2063, WV-2064, WV-2065, WV-2066, WV-2067, WV-2068, WV-2069, WV-2070, WV-2071, WV-2072, WV-2073, WV-2074, WV-2075, WV-2076, WV-2077, WV-2078, WV-2079, WV-2080, WV-2081, WV-2082, WV-2083, WV-2084, WV-2085, WV-2086, WV-2087, WV-2088, WV-2089, WV-2090, WV-2163, WV-2164, WV-2269, WV-2270, WV-2271, WV-2272, WV-2374, WV-2375, WV-2376, WV-2377, WV-2378, WV-2379, WV-2380, WV-2416, WV-2417, WV-2418, WV-2419, WV-2431, WV-2589, WV-2590, WV-2591, WV-2592, WV-2593, WV-2594, WV-2595, WV-2596, WV-2597, WV-2598, WV-2599, WV-2600, WV-2601, WV-2602, WV-2603, WV-2604, WV-2605, WV-2606, WV-2607, WV-2608, WV-2609, WV-2610, WV-2611, WV-2612, WV-2613, WV-2614, WV-2615, WV-2616, WV-2617, WV-2618, WV-2619, WV-2620, WV-2623, WV-2638, WV-2639, WV-2640, WV-2641, WV-2642, WV-2643, WV-2659, WV-2671, WV-2672, WV-2673, WV-2674, WV-2675, WV-2676, WV-2682, WV-2683, WV-2684, WV-2685, WV-2686, WV-2687, WV-2688, WV-2689, WV-2690, WV-2691, WV-2692, и WV-2732 описаны в WO 2017/015555 и WO 2017/192664, раскрытия которых, относящиеся к этим олигонуклеотидам, включены посредством ссылки. В данном документе описаны дополнительные НТТ-олигонуклеотиды.

[00214] В качестве примеров определенные НТТ-олигонуклеотиды, содержащие определенные иллюстративные последовательности оснований, модификации нуклеиновых оснований и их паттерны, модификации Сахаров и их паттерны, межнуклеотидные связи и их паттерны, стереохимию атомов фосфора в связи и их паттерны, линкеры и/или дополнительные химические фрагменты, представлены в таблице 1 ниже. Среди всего прочего эти олигонуклеотиды можно использовать для нацеливания на транскрипт НТТ, например, для снижения уровня транскрипта НТТ и/или его продукта.

m: 2'-OMe;

m5: метил в положении 5-атома С (нуклеиновое основание представляет собой 5-метилцитозин); m5Ceo: 5-метил-2'-О-метоксиэтил-С; m5mC: 5-метил-2'-ОМе-С;

m51C: метил в положении 5-атома С (нуклеиновое основание представляет собой 5-метилцитозин), и сахар представляет собой LNA-caxap;

ео: 2-МОЕ (2'-ОСН₂СН₂ОСН₃);

f: 2'-F;

г: 2'-ОН;

О, РО: фосфодиэфир (фосфат). Он может представлять собой концевую группу или связь, например, связь между линкером и олигонуклеотидной цепью, межнуклеотидную связь (природную фосфатную связь) и т. д. Фосфодиэфиры, как правило, обозначены буквой "О" в столбце "Стереохимия/связь" и, как правило, не отмечены в столбце "Описание" (если он является, концевой группой, например 5'-концевой группой, она указана в столбце "Описание" и, как правило, не указана в столбце "Стереохимия/связь"); если в столбце "Описание" не указано никакой связи, она, как правило, представляет собой фосфодиэфир, если не указано иное. Следует обратить внимание, что фосфатная связь между линкером (например, Ь001)и олигонуклеотидной цепью может не быть отмечена в столбце "Описание" и может не быть обозначена буквой "О" в столбце "Стереохимия/связь". Например, в столбце "Описание" для WV-10631 (Mod012L001mG * SmUmGmCmA…) фосфодиэфирная связь между L001 и олигонуклеотидной цепью (начинается с mG * SmUmGmCmA…) не отмечена; эта межнуклеотидная связь обозначена в столбце "Стереохимия/связь" с помощью первой буквы "О" в OSOOO…;

*, PS: фосфотиоат. Он может представлять собой концевую группу (если он представляет собой концевую группу, например, 5'-концевую группу, она указана в столбце "Описание" и, как правило, не указана в столбце "Стереохимия/связь") или связь, например, связь между линкером (например, L001) и олигонуклеотидной цепью, межнуклеотидную связь (фосфотиоатную межнуклеотидную связь) и т. д.;

R, Rp: фосфотиоат в конформации.йр. Следует обратить внимание, что *Rb столбце "Описание" указывает на одну фосфотиоатную связь в конформации Rp;

S, Sp: фосфотиоат в конформации Sp. Следует обратить внимание, что * S в столбце "Описание" указывает на одну фосфотиоатную связь в конформации Sp;

X: стереомерно неупорядоченный фосфотиоат;

1: LNA-caxap;

n001:

nX или Xn: стереомерно неупорядоченный n001;

n001R или nR: n001 в конфигурации Rp;

n001S или nS: n001 в конфигурации Sp;

L001: линкер -NH-(CH₂)₆- (также известный как C6-линкер, С6-аминный линкер или С6-аминолинкер), присоединенный к Mod, если таковой имеется, посредством -NH- и 5'-концу или 3'-концу олигонуклеотидной цепи посредством либо фосфатной связи (-О-Р(O)(ОН)-О-, которая может существовать в виде солевой формы и может обозначаться как О или РО), или фосфотиоатной связи (-О-P(O)(SH)-О-, которая может существовать в виде солевой формы, и может обозначаться как *, если фосфотиоат не характеризуется контролируемой хиральностью; или *S, S или Sp, если фосфотиоат характеризуется контролируемой хиральностью и находится в конфигурации Sp, или *R, R или Rp, если фосфотиоат характеризуется контролируемой хиральностью и находится в конфигурации Rp), как указано в сайте соединения СН₂. Если никакой Mod не указан, L001 присоединен к Н посредством -NH-;

L004: линкер, имеющий структуру -NH(CH₂)₄CH(CH₂OH)CH₂-, где -NH- присоединена к Mod (посредством С(О) ) или Н, а сайт соединения СН₂ присоединен к олигонуклеотидной цепи (например, на 3'-конце) посредством связи, например, фосфодиэфирной (-О-Р(O)(ОН)-О-, которая может существовать в виде солевой формы и может обозначаться как О или РО), фосфотиоатной (-О-P(O)(SH)-О-, которая может существовать в виде солевой формы и может обозначаться как *, если фосфотиоат не характеризуется контролируемой хиральностью; или *S, S или Sp, если фосфотиоат характеризуется контролируемой хиральностью и находится в конфигурации Sp, или *R, R или Rp, если фосфотиоат характеризуется контролируемой хиральностью и находится в конфигурации Rp) или фосфодитиоатной (-О-P(S)(SH)-О-, которая может существовать в виде солевой формы и может обозначаться как PS2, или:, или D) связи. Например, звездочка непосредственно перед L004 (например, *L004) указывает на то, что связь представляет собой фосфотиоатную связь, а отсутствие звездочки непосредственно перед L004 указывает на то, что связь представляет собой фосфодиэфирную связь. Например, в олигонуклеотиде, который оканчивается на …mAL004, линкер L004 присоединен (через сайт -СН₂-) посредством фосфодиэфирной связи к 3'-положению 3'-концевого сахара (который является 2'-ОМе-модифицированным и присоединен к нуклеиновому основанию А), и линкер L004 присоединен через -NH- к Н. Аналогичным образом, в одном или нескольких олигонуклеотидах линкер L004 присоединен (через сайт -СН₂-) посредством фосфодиэфирной связи к 3'-положению 3'-концевого сахара, и L004 присоединен через NH, например, KMod012, Mod085,Mod086HT. д.;

Mod012 (при этом -С(О)- присоединяется к -NH- линкера, такого как L001 или L004):

Mod039 (при этом С(О) присоединяется к NH линкера, такого как L001 или L004):

Mod062 (с -NH-, присоединенной к -С(О)- линкера, такого как L008):

L008: линкер, имеющий структуру -С(O)-(СН2)₉-, где -С(О)- присоединен к Mod (посредством -NH-) или ОН (если никакой Mod не указан), и СН₂ сайт соединения присоединен к олигонуклеотидной цепи (например, на 5'-конце) посредством связи, например, фосфодиэфирной (-О-Р(O)(ОН)-О-, которая может существовать в виде солевой формы и может обозначаться как О или РО), фосфотиоатной (-О-P(O)(SH)-О-, которая может существовать в виде солевой формы и может обозначаться как *, если фосфотиоат не характеризуется контролируемой хиральностью; или *S, S или Sp, если фосфотиоат характеризуется контролируемой хиральностью и находится в конфигурации Sp, или *R, R или Rp, если фосфотиоат характеризуется контролируемой хиральностью и находится в конфигурации Rp) или фосфодитиоатной (-О-P(S)(SH)-О-, которая может существовать в виде солевой формы и может обозначаться как PS2, или:, или D) связи. Например, в WV-11571 L008 присоединен к ОН посредством С(О), а к 5'-концу олигонуклеотидной цепи посредством фосфатной связи (обозначенной как "О" в столбце "Стереохимия/связь"); в WV-11569 L008 присоединен к Mod062 посредством -С(О)-, а к 5'-концу олигонуклеотидной цепи посредством фосфатной связи (обозначенной как "О" в столбце "Стереохимия/связь");

Mod001 (при этом -С(О)- присоединяется к -NH- линкера, такого как L001):

Mod085 (при этом С(О) присоединяется к NH линкера, такого как L001 или L004):

Mod086 (при этом С(О) присоединяется к NH линкера, такого как L001 или L004):

Mod094 (в WV-11570, связанный с 3'-концом олигонуклеотидной цепи (3'-атомом углерода 3'-концевого сахара) посредством фосфатной группы (которая не показана ниже, и которая может существовать в виде солевой формы; и которая обозначена как "О" в столбце "Стереохимия/связь" (…ХХХХО))):

BrdU: нуклеозидное звено, где нуклеиновое основание представляет собой BrU (), и где сахар представляет собой 2-дезоксирибозу (которая широко встречается в природной ДНК; 2'-дезокси (d)) ();

tgal mc6T: модифицированный тимидин, содержащий модифицированный тимин и имеющий структуру

d2AP: нуклеозидное звено, где нуклеиновое основание представляет собой 2-аминопурин ( 2АР), и где сахар представляет собой 2-дезоксирибозу (которая широко встречается в природной ДНК; 2'-дезокси (d)) ( ВА=2АР);

dDAP: нуклеозидное звено, где нуклеиновое основание представляет собой 2,6-диаминопурин (, DAP), и где сахар представляет собой 2-дезоксирибозу (которая широко встречается в природной ДНК; 2'-дезокси (d)) ( ВА=DAP);

dmtr: DMTR, 4,4'-диметокситритил, связанный с 5' -О- сахара, если не указано иное. Например, в dmtrmA:

Дополнительные структурные элементы НТТ-олигонуклеотидов описаны, например, в WO 2018/022473, WO 2018/098264, WO 2018/223056, WO 2018/223073, WO 2018/223081, WO 2018/237194, WO 2019/032607, WO 2019/055951 и/или WO 2019/075357, при этом структурные элементы олигонуклеотидов, упомянутые в них, включены в данный документ посредством ссылки.

Варианты длины

[00215] Как понятно специалистам в данной области техники, олигонуклеотиды могут иметь различную длину, чтобы обеспечивать требуемые свойства и/или виды активности для различных путей применения. Многие технологии для оценки, выбора и/или оптимизации длины олигонуклеотидов доступны в данной области техники и могут использоваться в соответствии с настоящим изобретением. Как показано в данном документе, во многих вариантах осуществления длина представленных олигонуклеотидов является подходящей для гибридизации с их мишенями и обеспечения снижения уровней их мишеней и/или кодируемого ими продукта. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид является достаточно длинным, чтобы распознавать нуклеиновую кислоту НТТ-мишень (например, мРНК НТТ). В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид является достаточно длинным, чтобы различать нуклеиновую кислоту НТТ-мишень и другие нуклеиновые кислоты (например, нуклеиновую кислоту, имеющую последовательность оснований, которая не является последовательностью НТТ) для уменьшения нецелевых эффектов. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, является достаточно коротким, чтобы снизить сложность его изготовления или получения и снизить стоимость продукта.

[00216] В некоторых вариантах осуществления длина последовательности оснований олигонуклеотида составляет приблизительно 10-500 нуклеиновых оснований. В некоторых вариантах осуществления длина последовательности оснований составляет приблизительно 10-500 нуклеиновых оснований. В некоторых вариантах осуществления длина последовательности оснований составляет приблизительно 10-50 нуклеиновых оснований. В некоторых вариантах осуществления длина последовательности оснований составляет приблизительно 15-50 нуклеиновых оснований. В некоторых вариантах осуществления длина последовательности оснований составляет от приблизительно 15 до приблизительно 30 нуклеиновых оснований. В некоторых вариантах осуществления длина последовательности оснований составляет от приблизительно 10 до приблизительно 25 нуклеиновых оснований. В некоторых вариантах осуществления длина последовательности оснований составляет от приблизительно 15 до приблизительно 22 нуклеиновых оснований. В некоторых вариантах осуществления длина последовательности оснований составляет приблизительно 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, или 25 нуклеиновых оснований.

[00217] В некоторых вариантах осуществления каждое нуклеиновое основание независимо содержит необязательно замещенное моноциклическое, бициклическое или полициклическое кольцо, где по меньшей мере один атом кольца представляет собой атом азота. В некоторых вариантах осуществления каждое нуклеиновое основание независимо представляет собой необязательно замещенный аденин, цитозин, гуанозин, тимин или урацил или необязательно замещенный таутомер аденина, цитозина, гуанозина, тимина или урацила.

Области, крылья и коры НТТ-олигонуклеотидов

[00218] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит несколько областей, каждая из которых независимо содержит один или несколько последовательных нуклеозидов и необязательно одну или несколько межнуклеотидных связей. В некоторых вариантах осуществления область отличается от соседней(-их) области (-ей) тем, что она содержит один или несколько структурных признаков, которые отличаются от соответствующих структурных признаков соседней(-их) области(-ей). Примеры структурных признаков включают модификации нуклеиновых оснований и их паттерны, модификации сахаров и их паттерны, межнуклеотидные связи и их паттерны (которые могут представлять собой типы межнуклеотидных связей (например, фосфатную, фосфотиоатную, фосфотиоатную триэфирную, нейтральную межнуклеотидную связь и т.д.) и их паттерны, модификации атома фосфора в составе связи (модификации атома фосфора в составе остова) и их паттерны (например, паттерн -XLR¹, если межнуклеотидные связи имеют структуру формулы I), стереохимию хирального центра остова (атома фосфора в составе связи) и ее паттерны [например, комбинацию Rp и/или Sp в межнуклеотидных связях с контролируемой хиральностью (последовательно в направлении 5'-3'), необязательно с межнуклеотидными связями без контролируемой хиральности и/или природными фосфатными связями, если они присутствуют (например, OSOOO RSSRS SSSRS SOOOS в таблице 1)]. В некоторых вариантах осуществления область содержит химическую модификацию (например, модификацию сахара, модификацию основания, межнуклеотидную связь или стереохимию межнуклеотидной связи), не присутствующую в ее соседней(-их) области(-ях). В некоторых вариантах осуществления у области отсутствует химическая модификация, присутствующая в ее соседней(-их) области(-ях).

[00219] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит две или более областей или состоит из них. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид содержит три или более областей или состоит из них. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид содержит две соседние области или состоит из них, где одна область обозначена как крыловая область, а другая как коровая область. Структура такого олигонуклеотида содержит структуру крыло-кор или кор-крыло или состоит из нее. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид содержит три соседние области или состоит из них, где одна область фланкирована двумя соседними областями. В некоторых вариантах осуществления средняя область обозначена как коровая область, а каждая из фланкирующих областей как крыловая область (5'-крыло, если оно присоединено к 5'-концу кора, 3'-крыло, если оно присоединено к 3'-концу кора). Структура такого олигонуклеотида содержит структуру крыло-кор-крыло или состоит из нее.

[00220] В некоторых вариантах осуществления первая область (например, крыло) отличается от второй области (например, кора) тем, что первая область содержит модификацию(-и) сахара или ее/их паттерн, отсутствующий во второй области. В некоторых вариантах осуществления первая область (например, крыло) содержит модификацию сахара, отсутствующую во второй области (например, коре). В некоторых вариантах осуществления модификация сахара представляет собой 2'-модификацию. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-OR, где R представляет собой необязательно замещенную C_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-OR, где R представляет собой необязательно замещенный C_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-МОЕ. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-ОМе. В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар представляет собой бициклический сахар, например, LNA-caxap. В некоторых вариантах осуществления каждый сахар в области является независимо модифицированным. В некоторых вариантах осуществления каждый сахар области (например, крыла) независимо содержит модификацию, которая может быть одинаковой или отличаться от других. В некоторых вариантах осуществления каждый сахар области (например, крыла) содержит одинаковую модификацию, например 2'-модификацию, описанную в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления сахара области (например, кора) не модифицированы. В некоторых вариантах осуществления каждый сахар области (например, кора) представляет собой немодифицированный сахар ДНК (с двумя -Н в 2'-положении). В некоторых вариантах осуществления структура представленного олигонуклеотида содержит структуру крыло-кор, кор-крыло или крыло-кор-крыло или состоит из нее, где каждое крыло независимо содержит одну или несколько модификаций сахара, и каждый сахар в коре представляет собой природный сахар ДНК (с двумя -Н в 2'-положении).

[00221] Дополнительно или альтернативно первая область (например, крыло) может содержать межнуклеотидную(-ые) связь(-и) или ее/их паттерн, которые отличаются от другой области (например, кора или другого крыла). В некоторых вариантах осуществления область (например, крыло) содержит две или более последовательных природных фосфатных связи. В некоторых вариантах осуществления область (например, кор) не содержит последовательных природных фосфатных связей. В некоторых вариантах осуществления структура представленного олигонуклеотида содержит структуру крыло-кор, кор-крыло или крыло-кор-крыло или состоит из нее, где по меньшей мере одно крыло независимо содержит две или более последовательных природных фосфатных связи, а кор не содержит последовательных природных фосфатных связей. В некоторых вариантах осуществления в структуре крыло-кор-крыло каждое крыло независимо содержит две или более последовательных межнуклеотидных связи. Если не отмечено иное, в рамках стереохимии структур крыло-кор-крыло межнуклеотидные связи, присоединяющие кор к крылу, включают в кор (например, см. выше).

[00222] В некоторых вариантах осуществления область представляет собой 5'-крыло, 3'-крыло или кор. В некоторых вариантах осуществления 5'-крыло находится на 5'-конце олигонуклеотида, 3'-крыло находится на 3'-конце олигонуклеотида, а кор находится между 5'-крылом и 3'-крылом, и олигонуклеотид содержит структуру или формат крыло-кор-крыло или состоит из них. В некоторых вариантах осуществления кор содержит участок из смежных сахаров природной ДНК (2'-дезоксирибоза). В некоторых вариантах осуществления кор содержит участок из по меньшей мере 5 смежных сахаров природной ДНК (2'-дезоксирибоза). В некоторых вариантах осуществления кор содержит участок из по меньшей мере 10 смежных сахаров природной ДНК (2'-дезоксирибоза). В некоторых вариантах осуществления кор называют гэпом. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, который содержит структуру крыло-кор-крыло или состоит из нее, описан как гэпмер. В некоторых вариантах осуществления структура представленного олигонуклеотида содержит структуру крыло-кор или состоит из нее. В некоторых вариантах осуществления структура представленного олигонуклеотида содержит структуру кор-крыло или состоит из нее. Неограничивающие примеры олигонуклеотидов, имеющих структуру кор-крыло, включают WV-2023 и WV-2025. В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида содержит олигонуклеотидную цепь, которая содержит крыло-кор-крыло, крыло-кор или крыло-кор или состоит из них, или состоит из нее, где олигонуклеотидная цепь конъюгирована с дополнительным химическим фрагментом необязательно посредством линкера, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены олигонуклеотиды, которые нацеливаются на НТТ и имеют структуру, которая содержит одно или два крыла и кор, и содержит структуру крыло-кор-крыло, кор-крыло или крыло-кор или состоит из нее.

[00223] По некоторым сообщениям рибонуклеаза Н (РНКаза Н, например, РНКаза HI, РНКаза Н2 и т.д.) распознает структуру, содержащую гибрид РНК и ДНК (например, гетеродуплекс), и расщепляет РНК. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, содержащий участок из смежных сахаров природной ДНК (2'-дезоксирибоза, например, в коровой области), может гибридизироваться с РНК, такой как мРНК, с образованием гетеродуплекса; и при этом данную гетеродуплексную структуру способна распознавать РНКаза Н, и РНК расщепляется под действием РНКазы Н. В некоторых вариантах осуществления кор представленного олигонуклеотида содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более смежных сахаров природной ДНК, и кор может специфически гибридизоваться с транскриптом-мишенью [например, транскриптом НТТ (например, пре-мРНК, зрелой мРНК и т.д.)]; и при этом образованную структуру способна распознавать РНКаза Н, и транскрипт расщепляется под действием РНКазы Н. В некоторых вариантах осуществления кор представленного олигонуклеотида содержит 5 или более смежных сахаров ДНК.

[00224] Длина областей, например, крыльев, коров и т.д., может быть различной подходящей. В некоторых вариантах осуществления область (например, крыло, кор и т.д.) содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 или более нуклеиновых оснований. Как описано в настоящем изобретении, в некоторых вариантах осуществления каждое нуклеиновое основание независимо содержит необязательно замещенное моноциклическое, бициклическое или полициклическое кольцо, причем кольцо содержит по меньшей мере один атом азота в кольце; в некоторых вариантах осуществления каждое нуклеиновое основание независимо представляет собой необязательно замещенный А, Т, С, G или U, или замещенный таутомер А, Т, С, G или U. В некоторых вариантах осуществления в случае крыла число составляет 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, или 10. В некоторых вариантах осуществления каждое крыло из структуры крыло-кор-крыло независимо имеет длину, описанную в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления два крыла имеют одинаковую длину. В некоторых вариантах осуществления два крыла имеют разную длину. В некоторых вариантах осуществления в случае кора число составляет 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 или более.

[00225] В некоторых вариантах осуществления крыло содержит одну или несколько модификаций сахара. В некоторых вариантах осуществления два крыла из структуры крыло-кор-крыло содержат различные модификации сахара (и олигонуклеотид характеризуется "асимметричным" форматом или содержит его). В некоторых вариантах осуществления модификации сахара обеспечивают улучшенную стабильность и/или свойства гибридизации по сравнению с отсутствием модификаций сахара.

[00226] В некоторых вариантах осуществления определенные модификации сахара, например 2'-МОЕ, обеспечивают большую стабильность при определенных условиях, чем другие модификации сахара, например 2'-ОМе. В некоторых вариантах осуществления крыло содержит модификации 2'-МОЕ. В некоторых вариантах осуществления каждое нуклеозидное звено крыла, содержащее пиримидиновое основание (например, С, U, Т и т.д.), содержит модификацию 2'-МОЕ. В некоторых вариантах осуществления каждое сахарное звено крыла содержит модификацию 2'-МОЕ. В некоторых вариантах осуществления каждое нуклеозидное звено крыла, содержащее пуриновое основание (например, A, G и т.д.), не содержит модификации 2'-МОЕ (например, каждое такое нуклеозидное звено содержит 2'-ОМе или не содержит 2'-модификации и т.д.). В некоторых вариантах осуществления каждое нуклеозидное звено крыла, содержащее пуриновое основание, содержит модификацию 2'-ОМе. В некоторых вариантах осуществления каждая межнуклеотидная связь в 3'-положении сахарного звена, содержащего модификацию 2'-МОЕ, является природной фосфатной связью.

[00227] В некоторых вариантах осуществления крыло не содержит модификаций 2'-МОЕ. В некоторых вариантах осуществления крыло содержит модификации 2'-ОМе. В некоторых вариантах осуществления каждое нуклеозидное звено крыла независимо содержит модификацию 2'-ОМе.

[00228] В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где одно крыло содержит модификацию сахара 2'-ОМе, а другое крыло содержит бициклический сахар; где одно крыло содержит 2'-ОМе, а другое крыло содержит бициклический сахар, и большинство сахаров в коре являются сахарами природной ДНК (с отсутствием замены в 2'-положении); где большинство сахаров в одном крыле содержат 2'-ОМе, а большинство сахаров в другом крыле независимо являются бициклическими сахарами; где большинство сахаров в одном крыле содержат 2'-ОМе, а большинство сахаров в другом крыле независимо являются бициклическими сахарами, и большинство сахаров в коре являются сахарами природной ДНК; где большинство сахаров в одном крыле содержат 2'-ОМе, а в другом крыле по меньшей мере один сахар является бициклическим сахаром, и по меньшей мере один сахар содержит 2'-ОМе; где большинство сахаров в одном крыле содержат 2'-ОМе, а в другом крыле по крайней мере один сахар является бициклическим сахаром, и по меньшей мере один сахар содержит 2'-ОМе, и большинство сахаров в коре являются сахарами природной ДНК; где большинство сахаров в одном крыле являются бициклическими сахарами, а в другом крыле по меньшей мере один сахар является бициклическим сахаром, и по меньшей мере один сахар содержит 2'-ОМе; где большинство сахаров в одном крыле являются независимо бициклическими сахарами, а в другом крыле по меньшей мере один сахар является бициклическим сахаром, и по меньшей мере один сахар содержит 2'-ОМе, и большинство сахаров в коре являются сахарами природной ДНК; где каждый сахар в одном крыле содержит 2'-ОМе, а каждый сахар в другом крыле независимо является бициклическим сахаром; где каждый сахар в одном крыле содержит 2'-ОМе, а каждый сахар в другом крыле независимо является бициклическим сахаром, и большинство сахаров в коре являются сахарами природной ДНК; где каждый сахар в одном крыле независимо является бициклическим сахаром, каждый сахар в другом крыле содержит 2'-ОМе, и каждый сахар в коре является сахаром природной ДНК; где одно крыло содержит бициклический сахар, а другое крыло содержит 2'-МОЕ; где одно крыло содержит бициклический сахар, а другое крыло содержит 2'-МОЕ, и большинство сахаров в коре являются сахарами природной ДНК; где большинство сахаров в одном крыле независимо являются бициклическими сахарами, а большинство сахаров в другом крыле содержат 2'-МОЕ; где большинство сахаров в одном крыле независимо являются бициклическими сахарами, а большинство сахаров в другом крыле содержат 2'-МОЕ, и большинство сахаров в коре являются сахарами природной ДНК; где большинство сахаров в одном крыле независимо являются бициклическими сахарами, а в другом крыле по меньшей мере один сахар содержит 2'-МОЕ, и по меньшей мере один сахар является бициклическим сахаром; где большинство сахаров в одном крыле независимо являются бициклическими сахарами, а в другом крыле по меньшей мере один сахар содержит 2'-МОЕ, и по меньшей мере один сахар является бициклическим сахаром, и большинство сахаров в коре являются сахарами природной ДНК; где большинство сахаров в одном крыле содержат 2'-МОЕ, а в другом крыле по меньшей мере один сахар содержит 2'-МОЕ, и по меньшей мере один сахар является бициклическим сахаром; где большинство сахаров в одном крыле содержат 2'-МОЕ, а в другом крыле по меньшей мере один сахар содержит 2'-МОЕ, и по меньшей мере один сахар является бициклическим сахаром, и большинство сахаров в коре являются сахарами природной ДНК; где каждый сахар в одном крыле независимо является бициклическим сахаром, а каждый сахар в другом крыле независимо содержит 2'-МОЕ; и/или где каждый сахар в одном крыле независимо является бициклическим сахаром, а каждый сахар в другом крыле олигонуклеотида содержит 2'-МОЕ, и большинство сахаров в коре являются сахарами природной ДНК.

[00229] В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где каждый сахар в одном крыле содержит 2'-МОЕ, каждый сахар в другом крыле независимо является бициклическим сахаром, и каждый сахар в коре является сахаром природной ДНК.

[00230] В некоторых вариантах осуществления бициклический сахар представляет собой LNA-, cEt- или BNA-caxap.

[00231] В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где одно крыло содержит 2'-ОМе, а другое крыло содержит 2'-F. В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где одно крыло содержит 2'-ОМе, а другое крыло содержит 2'-F, и большинство сахаров в коре являются сахарами природной ДНК.

[00232] В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где большинство сахаров в одном крыле содержат 2'-ОМе, а большинство сахаров в другом крыле содержат 2'-F. В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где большинство сахаров в одном крыле содержат 2'-ОМе, а большинство сахаров в другом крыле содержат 2'-F, и большинство сахаров в коре являются сахарами природной ДНК.

[00233] В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где большинство сахаров в одном крыле содержат 2'-ОМе, а в другом крыле по меньшей мере один сахар содержит 2'-F, и по меньшей мере один сахар содержит 2'-ОМе. В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где большинство сахаров в одном крыле содержат 2'-ОМе, а в другом крыле по меньшей мере один сахар содержит 2'-F, и по меньшей мере один сахар содержит 2'-ОМе, и большинство сахаров в коре являются сахарами ДНК.

[00234] В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где большинство сахаров в одном крыле содержат 2'-F, а в другом крыле по меньшей мере два сахара содержат 2'-F, и по меньшей мере два сахара содержат 2'-ОМе. В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где большинство сахаров в одном крыле содержат 2'-F, а в другом крыле по меньшей мере два сахара содержат 2'-F, и по меньшей мере два сахара содержат 2'-ОМе, а большинство сахаров в коре являются сахарами природной ДНК.

[00235] В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где каждый сахар в одном крыле олигонуклеотида содержит 2'-ОМе, а каждый сахар в другом крыле представленного олигонуклеотида содержит 2'-F. В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где каждый сахар в одном крыле олигонуклеотида содержит 2'-ОМе, а каждый сахар в другом крыле олигонуклеотида содержит 2'-F, и большинство сахаров в коре являются сахарами природной ДНК.

[00236] В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где каждый сахар в одном крыле содержит 2'-F, каждый сахар в другом крыле содержит 2'-ОМе, и каждый сахар в коре является сахаром ДНК.

[00237] В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где одно крыло содержит 2'-F, а другое крыло содержит 2'-МОЕ. В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где одно крыло содержит 2'-F, а другое крыло содержит 2'-МОЕ, и большинство сахаров в коре содержат 2'-дезокси.

[00238] В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где большинство сахаров в одном крыле содержат 2'-F, а большинство сахаров в другом крыле содержат 2'-МОЕ. В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где большинство сахаров в одном крыле содержат 2'-F, а большинство сахаров в другом крыле содержат 2'-МОЕ, и большинство сахаров в коре являются сахарами природной ДНК.

[00239] В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где большинство сахаров в одном крыле содержат 2'-F, а в другом крыле по меньшей мере один сахар содержит 2'-МОЕ, и по меньшей мере один сахар содержит 2'-F. В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где большинство сахаров в одном крыле содержат 2'-F, а в другом крыле по меньшей мере один сахар содержит 2'-МОЕ, и по меньшей мере один сахар содержит 2'-F, а большинство сахаров в коре являются сахарами природной ДНК.

[00240] В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где большинство сахаров в одном крыле содержат 2'-МОЕ, а в другом крыле по меньшей мере один сахар содержит 2'-МОЕ, и по меньшей мере один сахар содержит 2'-F. В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где большинство сахаров в одном крыле содержат 2'-МОЕ, а в другом крыле по меньшей мере один сахар содержит 2'-МОЕ, и по меньшей мере один сахар содержит 2'-F, а большинство сахаров в коре являются сахарами природной ДНК.

[00241] В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит структуру крыло-кор-крыло, где каждый сахар в одном крыле олигонуклеотида содержит 2'-МОЕ, каждый сахар в другом крыле содержит 2'-F, а каждый сахар в коре является сахаром природной ДНК.

[00242] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, имеет структуру крыло-кор-крыло. В некоторых вариантах осуществления кор содержит 1 или несколько сахаров природной ДНК. В некоторых вариантах осуществления кор содержит 5 или более последовательных сахаров природной ДНК. В некоторых вариантах осуществления кор содержит 5-10, 5-15, 5-20, 5-25, 5-30 или 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 или более сахаров природной ДНК, которые необязательно являются последовательными. В некоторых вариантах осуществления кор содержит 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 или более последовательных сахаров природной ДНК. В некоторых вариантах осуществления кор содержит 10 или более последовательных сахаров природной ДНК. В некоторых вариантах осуществления кор способен гибридизоваться с мРНК-мишенью с образованием дуплексной структуры, распознаваемой РНКазой Н за счет чего РНКаза Н способна расщеплять мРНК.

[00243] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, имеет структуру крыло-кор-крыло и имеет асимметричный формат.

[00244] В некоторых вариантах осуществления в олигонуклеотиде, имеющем асимметричный формат, одно крыло отличается от другого модификациями сахара или их паттерном, или межнуклеотидными связями остова или их паттерном, или хиральными центрами остова или их паттерном. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, имеет асимметричный формат, в котором одно крыло содержит модификацию сахара, отличную от таковой другого крыла. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, имеет асимметричный формат, в котором одно крыло содержит паттерн модификаций сахара, отличный от такового другого крыла.

[00245] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид (или его крыло, кор, блок или любая их часть) может содержать любую модификацию, любой паттерн модификаций, любую межнуклеотидную связь, любой паттерн межнуклеотидных связей, любой паттерн хиральных центров или любой формат (включая без ограничений асимметричный формат), описанные в любом из: WO 2017015555; WO 2017192664; W00201200366; WO 2011/034072; WO 2014/010718; WO 2015/108046; WO 2015/108047; WO 2015/108048; WO 2011/005761; WO 2011/108682; WO 2012/039448; WO 2018/067973; WO 2005/028494; WO 2005/092909; WO 2010/064146; WO 2012/073857; WO 2013/012758; WO 2014/010250; WO 2014/012081; WO 2015/107425; WO 2017/015555; WO 2017/015575; WO 2017/062862; WO 2017/160741; WO 2017/192664; WO 2017/192679; WO 2017/210647; WO 2018/022473 или WO 2018/098264, при этом каждая модификация, любой паттерн модификаций, любая межнуклеотидная связь, любой паттерн межнуклеотидных связей или любой формат (включая без ограничений асимметричный формат), описанные в них, включены посредством ссылки.

[00246] В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит асимметричный формат или состоит из него. В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержит симметричный формат или состоит из него.

[00247] В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, представляет собой или содержит асимметричный формат, где структура олигонуклеотида представляет собой структуру крыло-кор-крыло, где формат первого крыла отличается от формата второго крыла. В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, представляет собой или содержит асимметричный формат, где структура олигонуклеотида представляет собой структуру крыло-кор-крыло, где первое и второе крыло различаются модификациями сахара (или их комбинациями или паттернами) и/или межнуклеотидными связями (или их комбинациями или паттернами). В некоторых вариантах осуществления структура олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, представляет собой или содержит асимметричный формат, где структура олигонуклеотида представляет собой структуру крыло-кор-крыло, где первое и второе крыло различаются модификациями сахара (или их комбинациями или паттернами).

[00248] В некоторых вариантах осуществления коровая область содержит последовательность, комплементарную одному аллелю положения распознавания, например, местоположение SNP. В некоторых вариантах осуществления коровая область содержит последовательность, комплементарную одному аллелю SNP (например, который находится на той же нити/хромосоме, что и последовательность, ассоциированная с заболеванием или вызывающая заболевание (например, экспансия CAG-повторов в гене НТТ)), но не комплементарную другим аллелям SNP (например, которые находятся на той же нити/хромосоме, что и последовательность, в меньшей степени ассоциированная или не ассоциированная с заболеванием, или в меньшей степени вызывающая или не вызывающая заболевание (например, нормальное или меньшее число CAG-повторов в гене НТТ)). В некоторых вариантах осуществления в случае SNP такая последовательность представляет собой одно нуклеиновое основание. В некоторых вариантах осуществления коровая область содержит нуклеиновое основание, комплементарное аллелю SNP, который находится на той же нити/хромосоме, что и экспансия CAG-повторов в гене НТТ. Среди всего прочего в настоящем изобретении продемонстрировано, что свойства и/или виды активности олигонуклеотидов можно модулировать посредством определения положения такого нуклеинового основания. В некоторых вариантах осуществления положение такого нуклеинового основания представляет собой положение 4, 5, 6, 7 или 8, считая от 5'-конца коровой области (первый нуклеозид коровой области от 5'-конца находится в положении 1). В некоторых вариантах осуществления положение представляет собой положение 4 от 5'-конца коровой области. В некоторых вариантах осуществления положение представляет собой положение 5 от 5'-конца коровой области. В некоторых вариантах осуществления положение представляет собой положение 6 от 5'-конца коровой области. В некоторых вариантах осуществления положение представляет собой положение 7 от 5'-конца коровой области. В некоторых вариантах осуществления положение представляет собой положение 8 от 5'-конца коровой области. В некоторых вариантах осуществления положение такого нуклеинового основания представляет собой положение 7, 8, 9, 10, 11 или 12, считая от 5'-конца олигонуклеотида (первый нуклеозид олигонуклеотида от 5'-конца находится в положении 1). В некоторых вариантах осуществления положение представляет собой положение 7 от 5'-конца олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления положение представляет собой положение 8 от 5'-конца олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления положение представляет собой положение 9 от 5'-конца олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления положение представляет собой положение 10 от 5'-конца олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления положение представляет собой положение 11 от 5'-конца олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид содержит 5'-концевое крыло, содержащее 5 и не более 5 нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления каждый сахар крыла является 2'-модифицированным. В некоторых вариантах осуществления каждый сахар крыла является 2'-ОМе-модифицированным. В некоторых вариантах осуществления каждый сахар кора независимо не содержит модификации 2'-OR, где R является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления каждый сахар кора независимо представляет собой немодифипированный сахар ДНК.

[00249] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, может содержать любое первое крыло, кор и/или второе крыло, как описано в данном документе или известно в данной области техники.

[00250] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, который имеет последовательность оснований, которая представляет собой, включает или содержит участок из последовательности НТТ-олигонуклеотида, раскрытой в данном документе, может содержать первое крыло, кор и/или второе крыло, как описано в данном документе или известно в данной области техники.

Средства для RNAi

[00251] Олигонуклеотиды по настоящему изобретению могут выполнять одну или несколько функций посредством различных биологических механизмов и/или путей. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен олигонуклеотид, который может осуществлять снижение уровней, экспрессию и/или видов активность генов или их продуктов частично, в основном или полностью посредством РНК-интерференции. Как понятно специалистам в данной области техники, такие олигонуклеотиды могут быть либо однонитевыми, либо двухнитевыми. В некоторых вариантах осуществления одно- или двухнитевой олигонуклеотид способен обеспечивать снижение уровня, экспрессии и/или активности гена-мишени (например, НТТ) или его генного продукта посредством механизма, вовлекающего РНК интерференцию.

[00252] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к олигонуклеотиду, например НТТ-олигонуклеотиду, который имеет последовательность оснований, которая включает, представляет собой или содержит участок из 15 смежных оснований или больше (необязательно, с 1-3 ошибочными основаниями) из последовательности оснований олигонуклеотида, указанного в таблице 1, где олигонуклеотид способен опосредовать РНК-интерференцию.

[00253] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к НТТ-олигонуклеотиду, который имеет последовательность оснований, которая включает, представляет собой или содержит участок из 15 смежных оснований или больше (необязательно, с 1-3 ошибочными основаниями) из последовательности оснований олигонуклеотида, указанного в таблице 1, где НТТ-олигонуклеотид способен опосредовать интерференцию на основе однонитевой РНК.

[00254] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к НТТ-олигонуклеотиду, который имеет последовательность оснований, которая включает, представляет собой или содержит участок из 15 смежных оснований или больше (необязательно, с 1-3 ошибочными основаниями) из последовательности оснований олигонуклеотида, указанного в таблице 1, где НТТ-олигонуклеотид способен опосредовать интерференцию на основе однонитевой РНК.

[00255] В некоторых вариантах осуществления средство для RNAi представляет собой средство (например, нуклеиновую кислоту, включая без ограничений одно- или двухнитевую нуклеиновую кислоту), которое способно опосредовать РНК-интерференцию. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен средство для RNAi, которое нацеливается на НТТ.

[00256] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к однонитевому средству для RNAi, последовательность оснований которого представляет собой или содержит последовательность, которая представляет собой участок или комплементарна участку из 15-30 (например, по меньшей мере 15, 16, 17, 18, 19, 20 или 21) смежных оснований из НТТ или его транскриптов. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к однонитевому средству для RNAi, которое имеет последовательность оснований, которая представляет собой, или включает, или содержит участок из по меньшей мере 15 смежных оснований из любого НТТ-олигонуклеотида, указанного в таблице 1. В некоторых вариантах осуществления такой участок из смежных оснований является характерным для НТТ, и он не идентичен или не комплементарен каким-либо другим последовательностям в геноме или транскриптоме.

[00257] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к двухнитевому средству для RNAi, содержащему смысловую и антисмысловую нить, где последовательность оснований антисмысловой нити представляет собой или содержит последовательность, которая представляет собой участок или комплементарна участку из 15-30 (например, по меньшей мере 15, 16, 17, 18, 19, 20 или 21) смежных оснований из НТТ или его транскрипта. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к двухнитевому средству для RNAi, содержащему смысловую и антисмысловую нить, где антисмысловая нить имеет последовательность оснований, которая представляет собой, или включает, или содержит участок из по меньшей мере 15 смежных оснований из любого НТТ олигонуклеотида, указанного в таблице 1. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к двухнитевому средству для RNAi, содержащему смысловую и антисмысловую нить, где антисмысловая нить имеет последовательность оснований, которая представляет собой, или включает, или содержит участок из по меньшей мере 10 смежных оснований из любого НТТ-олигонуклеотида, указанного в таблице 1. В некоторых вариантах осуществления такой участок из смежных оснований является характерным для НТТ, и он не идентичен или не комплементарен каким-либо другим последовательностям в геноме или транскриптоме.

[00258] В некоторых вариантах осуществления средство для RNAi, например средство для RNAi НТТ, может предусматривать формат средства для RNAi, являющийся либо двух-, либо однонитевым, как описано в данном документе или известно в данной области техники. Различные форматы двухнитевых средств для RNAi, которые могут быть использованы в соответствии с настоящим изобретением, описаны в уровне технике, например, в Elbashir et al. 2001 Gen. Dev. 15: 188; Elbashir et al. 2001 Nature 411: 494; Elbashir et al. 2001 EMBO J. 20: 6877-6888; Sun et al. Nat. Biotech. 26: 1379; Chiu et al. 2003 RNA 9: 1034-1048; Kim et al. (2005) Nat Biotech 23:222-226; US 8084600; US 9175289; US 8329888; US 8090542; US 7507811; US 8828956; US 20130035368; US 20050255487; US 20080242851; WO 2015051366 и ЕР 3052464. Различные форматы однонитевых средств для RNAi, которые могут быть использованы в соответствии с настоящим изобретением, описаны в уровне технике, например, в ЕР 1520022, US 8729036, US 9476044, US 9243246, WO 2004/007718 и т.д.

[00259] В некоторых вариантах осуществления нить однонитевого средства для RNAi или антисмысловая нить двухнитевого средства для RNAi содержит по порядку в направлении 5'-3': 5'-концевую область, затравочную область, постзатравочную область и 3'-конец. В некоторых вариантах осуществления затравочная область в нити содержит нуклеотиды в положениях от приблизительно 2 до приблизительно 7 или приблизительно 8, считая от 5'-конца. В некоторых вариантах осуществления 5'-концевая область содержит часть нити в направлении 5' от затравочной области. В некоторых вариантах осуществления 3'-концевая область содержит либо концевой динуклеотид (например, ТТ или UU) на 3'-конце, либо фрагмент (например, 3'-концевой кэп), который функционально заменяет концевой динуклеотид. 3'-концевые кэпы описаны, например, в патенте США №8084600 и WO 2015/051366. В некоторых вариантах осуществления постзатравочная область содержит часть нити между затравочной областью и 3'-концевой областью.

[00260] В некоторых вариантах осуществления 5'-концевая область содержит фосфатную группу или ее аналог. В некоторых вариантах осуществления с 5'-концевой областью конъюгирован, например непосредственно или опосредованно, дополнительный химический фрагмент, описанный в данном документе. В некоторых вариантах осуществления с 5'-концевой областью конъюгирован, например непосредственно или опосредованно, дополнительный химический фрагмент, который представляет собой GalNAc или его производное, способное связываться с ASPGR.

[00261] В некоторых вариантах осуществления затравочная область особенно важна для распознавания и комплементарного спаривания с областью-мишенью. В некоторых вариантах осуществления затравочная область в меньшей степени подходит для содержания ошибочных оснований относительно мишени, чем 5'-концевая область или постзатравочная область.

[00262] В некоторых вариантах осуществления однонитевое средство для RNAi, например, однонитевой реагент для RNAi НТТ, содержит на 5'-конце химический фрагмент, содержащий фосфор. В некоторых вариантах осуществления однонитевое средство для RNAi на своем 5'-конце содержит группу, которая содержит фосфор. В некоторых вариантах осуществления однонитевое средство для RNAi на своем 5'-конце содержит фосфатную группу или ее аналог.

[00263] В некоторых вариантах осуществления с однонитевым средством для RNAi или с одной, или обеими нитями двухнитевого средства для RNAi связан лиганд ASPGR. В некоторых вариантах осуществления лиганд ASGPR представляет собой GalNAc или его производное, которое способно связываться с ASPGR.

[00264] Неограничивающие примеры олигонуклеотидов, которые можно использовать в качестве однонитевых средств для RNAi включают WV-5153, WV-5154, WV-5155, WV-5156, WV-5157, WV-5158, WV-5159, WV-5160, WV-5161, WV-5162, WV-5163, WV-5164, WV-5165, WV-5166, WV-5167, WV-5168, WV-5169, WV-5170, WV-5171, WV-5172, WV-5173, WV-5174, WV-5175, WV-5176, WV-5177, WV-5178, WV-5179, WV-5180, WV-5181, WV-5182, WV-5183, WV-5184, WV-5185, WV-5186, WV-5187, WV-5188, WV-5189, WV-5190, WV-5191, WV-5192, WV-5193, WV-5194, WV-5195, WV-5196, WV-5197, WV-5198, WV-5199, WV-5200, WV-5201, WV-5202, WV-5203, WV-5204, WV-5205, WV-5206, WV-5207, WV-5208, WV-5209, WV-5210, WV-5211, WV-5212, WV-5213, WV-5214, WV-5215, WV-5216, WV-5217, WV-5218, WV-5219, WV-5220, WV-5221, WV-5222, WV-5223, WV-5224, WV-5225, WV-5226, WV-5227, WV-5228, WV-5229, WV-5230, WV-5231, WV-5232, WV-5233, WV-5234, WV-5235, WV-5236, WV-5237, WV-5238, WV-5239, WV-5240, WV-5241, WV-5242, WV-5243, WV-5244, WV-5245, WV-5246, WV-5247, WV-5248, WV-5249, WV-5250, WV-5251, WV-5252, WV-5253, WV-5254, WV-5255, WV-5256, WV-5257, WV-5258, WV-5259, WV-5260, WV-5261, WV-5262, WV-5263, WV-5264, WV-5265, WV-5266, WV-5267, WV-5268, WV-5269, WV-5270, WV-5271, WV-5272, WV-5273, WV-5274, WV-5275, WV-5276, WV-5277, WV-5278, WV-5279, WV-5280, WV-5281, WV-5282, WV-5283, WV-5284, WV-5285, WV-5286, WV-10107, WV-10108, WV-10109, WV-10110, WV-10111, WV-10112, WV-10113, WV-10114, WV-10115, WV-10116, WV-10117, WV-10118, WV-10119, WV-10120, WV-10121, WV-10122, WV-10123, WV-10124, WV-10125, WV-10126, WV-10127, WV-10128, WV-10129, WV-10130, WV-10131, WV-10132, WV-10133, WV-10134, WV-10135, WV-10136, WV-10137, WV-10138, WV-10139, WV-10140, WV-10141, WV-10142, WV-10143, WV-10144, WV-10145, и WV-10146.

[00265] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к двухнитевому средству для RNAi, которое содержит нить однонитевого средства для RNAi, которая гибридизована со второй нитью. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к двухнитевому средству для RNAi НТТ, которое содержит нить однонитевого средства для RNAi НТТ, описанного в данном документе, которая гибридизована со второй нитью.

[00266] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды, такие как двух- или однонитевые средства для RNAi НТТ, содержат межнуклеотидные связи и/или их паттерны, нуклеиновые основания и их паттерны, сахара и их паттерны, паттерны хиральных центров остова и/или дополнительные химические фрагменты, описанные в данном документе. В некоторых вариантах осуществления применимые структурные элементы, такие как нуклеиновые основания, сахара, межнуклеотидные связи, стереохимия атома фосфора в составе связи, 5'-концевые группы (например, фосфат и его аналоги/производные), дополнительные химические фрагменты, линкеры и т.д., и их применимые паттерны и/или комбинации описаны в WO/2018/223056 и включены в данный документ посредством ссылки.

Межнуклеотидные связи

[00267] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотиды содержат модификации оснований, модификации сахара и/или модификации межнуклеотидных связей. В соответствии с настоящим изобретением можно использовать различные межнуклеотидные связи для связывания звеньев, содержащих нуклеиновые основания, например нуклеозидов. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды содержат одновременно одну или несколько модифицированных межнуклеотидных связей и одну или несколько природных фосфатных связей. Как широко известно специалистам в данной области техники, природные фосфатные связи широко встречаются в молекулах природных ДНК и РНК; они имеют структуру -ОР(O)(ОН)O- соединяют сахара в нуклеозидах в ДНК и РНК и могут находиться в различных солевых формах, например, при физиологическом рН (приблизительно 7,4) природные фосфатные связи преимущественно существуют в солевых формах, при этом анион представляет собой ОР(O)(O^-)O-. Модифицированная межнуклеотидная связь или неприродная фосфатная связь представляет собой межнуклеотидную связь, которая не является природной фосфатной связью или ее солевой формой. Модифицированные межнуклеотидные связи, в зависимости от их структур, также могут находиться в своих солевых формах. Например, как понятно специалистам в данной области техники, фосфотиоатные межнуклеотидные связи, которые имеют структуру -OP(O)(SH)O-, могут находиться в различных солевых формах, например, при физиологическом рН (приблизительно 7,4), при этом анион представляет собой -OP(O)(S^-)O-.

[00268] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит межнуклеотидную связь, которая представляет собой модифицированную межнуклеотидную связь, например, фосфотиоатную, фосфодитиоатную, метилфосфонатную, фосфорамидатную, тиофосфатную, 3'-тиофосфатную или 5'-тиофосфатную.

[00269] В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой хиральную межнуклеотидную связь, которая содержит хиральный атом фосфора в составе связи. В некоторых вариантах осуществления хиральная межнуклеотидная связь представляет собой фосфотиоатную связь. В некоторых вариантах осуществления хиральная межнуклеотидная связь представляет собой фосфотиоатную связь в конфигурации Rp или Sp (обозначенной в данном документе как * R или *S соответственно).

[00270] В некоторых вариантах осуществления хиральная межнуклеотидная связь представляет собой межнуклеотидную связь, не являющуюся отрицательно заряженной. В некоторых вариантах осуществления хиральная межнуклеотидная связь представляет собой нейтральную межнуклеотидную связь. В некоторых вариантах осуществления хиральная межнуклеотидная связь характеризуется контролируемой хиральностью с точки зрения ее хирального атома фосфора в составе связи. В некоторых вариантах осуществления хиральная межнуклеотидная связь является стереохимически чистой с точки зрения ее хирального атома фосфора в составе связи. В некоторых вариантах осуществления хиральная межнуклеотидная связь не характеризуется контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления паттерн хиральных центров остова содержит или состоит из положений межнуклеотидных связях с контролируемой хиральностью и конфигураций атома фосфора в составе связи (Rp или Sp) и положений ахиральных межнуклеотидных связей (например, природных фосфатных связей).

[00271] В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь содержит Р-модификацию, где Р-модификация представляет собой модификацию по атому фосфора в составе связи. В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой фрагмент, который не содержит фосфор, но служит для связывания двух сахаров или двух фрагментов, каждый из которых независимо содержит нуклеиновое основание, например, как в пептидной нуклеиновой кислоте (PNA).

[00272] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид содержит модифицированную межнуклеотидную связь, например, связи, имеющие структуру формулы I, I-а, I-b или I-е и описанные в данном документе и/или в WO 2018/022473, WO 2018/098264, WO 2018/223056, WO 2018/223073, WO 2018/223081, WO 2018/237194, WO 2019/032607, WO 2019/055951 и/или WO 2019/075357, при этом межнуклеотидные связи (например, связи формулы I, I-a, I-b, I-е и т.д.) из каждого из них независимо включены в данный документ посредством ссылки.

[00273] В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой межнуклеотидную связь, не являющуюся отрицательно заряженной. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды содержат одну или несколько межнуклеотидных связей, не являющихся отрицательно заряженными. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, представляет собой положительно заряженную межнуклеотидную связь. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, представляет собой нейтральную межнуклеотидную связь. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены олигонуклеотиды, содержащие одну или несколько нейтральных межнуклеотидных связей. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, имеет структуру формулы I-n-1, I-n-2, I-n-3, I-n-4, II, II-а-1, II-a-2, II-b-1, II-b-2, II-c-1, II-c-2, II-d-1, II-d-2, и т.д. или ее солевой формы, как описано в данном документе и/или в US 9394333, US 9744183, US 9605019, US 9982257, US 20170037399, US 20180216108, US 20180216107, US 9598458, WO 2017/062862, WO 2018/067973, WO 2017/160741, WO 2017/192679, WO 2017/210647, WO 2018/098264, WO 2018/022473, WO 2018/223056, WO 2018/223073, WO 2018/223081, WO 2018/237194, WO 2019/032607, WO 2019/032612, WO 2019/055951 и/или WO 2019/075357, при этом межнуклеотидные связи, не являющиеся отрицательно заряженными (например, связи формулы I-n-1, I-n-2, I-n-3, I-n-4, II, II-a-1, II-a-2, II-b-1, II-b-2, II-c-1, II-c-2, II-d-1, II-d-2, и т.д. или их пригодной солевой формы), из каждого из них независимо включены в данный документ посредством ссылки.

[00274] Неограничивающие примеры олигонуклеотидов, содержащих межнуклеотидную связь, не являющуюся отрицательно заряженной, включают WV-19823, WV-19824, WV-19825, WV-19826, WV-19827, WV-19828, WV-19829, WV-19830, WV-19831, WV-19832, WV-19833, WV-19834, WV-19835, WV-19836, WV-19837, WV-19841, WV-19842, WV-19843, WV-19844, WV-19845, WV-19846, WV-19847, WV-19848, WV-19849, WV-19850, WV-19851, WV-19852, WV-19853, WV-19854, WV-16214, WV-16215, WV-16216, WV-19844, WV-19845, WV-19846, WV-19847, WV-19848, WV-19849, WV-19850, WV-19851, WV-19852, WV-19853, WV-19854, и WV-19855.

[00275] В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, может улучшать доставку и/или активность (например, способность снижать уровень, активность и/или экспрессию гена НТТ или его генного продукта) НТТ-олигонуклеотида.

[00276] В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь (например, межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной) содержит необязательно замещенный триазолил. В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь (например, межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной) содержит необязательно замещенный алкинил. В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь содержит триазольный или алкиновый фрагмент. В некоторых вариантах осуществления триазольный фрагмент, например триазолильная группа, является необязательно замещенным. В некоторых вариантах осуществления триазольный фрагмент, например триазолильная группа, является необязательно замещенным. В некоторых вариантах осуществления триазольный фрагмент является незамещенным. В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь содержит необязательно замещенный циклический гуанидиновый фрагмент. В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь содержит необязательно замещенный циклический гуанидиновый фрагмент и имеет структуру где W представляет собой О или S. В некоторых вариантах осуществления W представляет собой О. В некоторых вариантах осуществления W представляет собой S. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, является стереохимически контролируемой.

[00277] В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, или нейтральная межнуклеотидная связь представляет собой межнуклеотидную связь, содержащую триазольный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, или межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, содержит необязательно замещенную триазолильную группу. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, содержащая триазольный фрагмент (например, необязательно замещенную триазолильную группу), имеет структуру В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, содержащая триазольный фрагмент, имеет структуру В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, например межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, нейтральная межнуклеотидная связь, содержит циклический гуанидиновый фрагмент. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, содержащая циклический гуанидиновый фрагмент, имеет структуру В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, или нейтральная межнуклеотидная связь представляет собой или содержит структуру, выбранную из или где W представляет собой О или S.

[00278] В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь содержит группу Tmg (). В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь содержит группу Tmg и имеет структуру ("межнуклеотидная связь Tmg"). В некоторых вариантах осуществления нейтральные межнуклеотидные связи включают межнуклеотидные связи PNA и РМО, а также межнуклеотидную связь Tmg.

[00279] В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, содержит необязательно замещенную 3-20-членную гетероциклильную или гетероарильную группу, содержащую 1-10 гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, содержит необязательно замещенную 3-20-членную гетероциклильную или гетероарильную группу, содержащую 1-10 гетероатомов, где по меньшей мере один гетероатом представляет собой атом азота. В некоторых вариантах осуществления такая гетероциклильная или гетероарильная группа представлена 5-членным кольцом. В некоторых вариантах осуществления такая гетероциклильная или гетероарильная группа представлена 6-членным кольцом.

[00280] В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, содержит необязательно замещенную 5-20-членную гетероарильную группу, содержащую 1-10 гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, содержит необязательно замещенную 5-20-членную гетероарильную группу, содержащую 1-10 гетероатомов, где по меньшей мере один гетероатом представляет собой атом азота. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, содержит необязательно замещенную 5-6-членную гетероарильную группу, содержащую 1-4 гетероатомов, где по меньшей мере один гетероатом представляет собой атом азота. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, содержит необязательно замещенную 5-членную гетероарильную группу, содержащую 1-4 гетероатома, где по меньшей мере один гетероатом представляет собой атом азота. В некоторых вариантах осуществления гетероарильная группа непосредственно связана с атомом фосфора в составе связи. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, содержит необязательно замещенную триазолильную группу. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, содержит незамещенную триазолильную группу, например . В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, содержит замещенную триазолильную группу, например

[00281] В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, содержит необязательно замещенную 5-20-членную гетероциклильную группу, содержащую 1-10 гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, содержит необязательно замещенную 5-20-членную гетероциклильную группу, содержащую 1-10 гетероатома, где по меньшей мере один гетероатом представляет собой атом азота. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, содержит необязательно замещенную 5-6-членную гетероциклильную группу, содержащую 1-4 гетероатома, где по меньшей мере один гетероатом представляет собой атом азота. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, содержит необязательно замещенную 5-членную гетероциклильную группу, содержащую 1-4 гетероатома, где по меньшей мере один гетероатом представляет собой атом азота. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере два гетероатома представляют собой атом азота. В некоторых вариантах осуществления гетероциклильная группа непосредственно связана с атомом фосфора в составе связи. В некоторых вариантах осуществления гетероциклильная группа связана с атомом фосфора в составе связи посредством линкера, например =N-, если гетероциклильная группа является частью гуанидинового фрагмента, который непосредственно связан с атомом фосфора в составе связи посредством своего =N-. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, содержит необязательно замещенную группу В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, содержит замещенную группу В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, содержит группу В некоторых вариантах осуществления каждый R¹ независимо представляет собой необязательно замещенный С_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления каждый R¹ независимо представляет собой метил.

[00282] В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь, например межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, содержит триазольный или алкиновый фрагмент, каждый из которых является необязательно замещенным. В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь содержит триазольный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь содержит незамещенный триазольный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь содержит замещенный триазольный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь содержит алкильный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь содержит необязательно замещенную алкинильную группу. В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь содержит незамещенную алкинильную группу. В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь содержит замещенную алкинильную группу. В некоторых вариантах осуществления алкинильная группа непосредственно связана с атомом фосфора в составе связи.

[00283] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит разные типы межнуклеотидных фосфорных связей. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере одну природную фосфатную связь и по меньшей мере одну модифицированную (неприродную) межнуклеотидную связь. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну природную фосфатную связь и по меньшей мере один фосфотиоат.В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь, не являющуюся отрицательно заряженной.

[00284] В некоторых вариантах осуществления нейтральная межнуклеотидная связь или межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, имеет структуру любой нейтральной межнуклеотидной связи или межнуклеотидной связи, не являющейся отрицательно заряженной, описанной в любом из US 9394333, US 9744183, US 9605019, US 9982257, US 20170037399, US 20180216108, US 20180216107, US 9598458, WO 2017/062862, WO 2018/067973, WO 2017/160741, WO 2017/192679, WO 2017/210647, WO 2018/098264, WO 2018/022473, WO 2018/223056, WO 2018/223073, WO 2018/223081, WO 2018/237194, WO 2019/032607, WO 2019/032612, WO 2019/055951 и/или WO 2019/075357,2607, WO 2019/032612, WO 2019/055951 и/или WO 2019/075357, при этом каждая нейтральная межнуклеотидная связь или межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, из каждого из них включена в данный документ посредством ссылки.

[00285] В некоторых вариантах осуществления нейтральная межнуклеотидная связь имеет структуру формулы II-d-2. В некоторых вариантах осуществления каждый R' независимо представляет собой необязательно замещенную С_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления каждый R' независимо представляет собой необязательно замещенный С_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления каждый R' независимо представляет собой -СН₃. В некоторых вариантах осуществления каждый R^s представляет собой -Н.

[00286] В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь, не являющаяся отрицательно заряженной, имеет структуру . В некоторых вариантах осуществления W представляет собой О. В некоторых вариантах осуществления W представляет собой S. В некоторых вариантах осуществления нейтральная межнуклеотидная связь представляет собой межнуклеотидную связь, не являющуюся отрицательно заряженной, описанную выше.

[00287] В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды содержат 1 или несколько межнуклеотидных связей, не являющихся отрицательно заряженными, и/или одну или несколько межнуклеотидных связей формулы I, I-a, I-b, I-c, I-n-1, I-n-2, I-n-3, I-n-4, II, II-а-1, II-а-2, II-b-1, II-b-2, II-c-1, II-c-2, II-d-1, или II-d-2.

[00288] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит нейтральную межнуклеотидную связь и межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит нейтральную межнуклеотидную связь и межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью, которая не является нейтральной межнуклеотидной связью. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит нейтральную межнуклеотидную связь и фосфотиоатную межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью.

[00289] Не вдаваясь в какую-либо конкретную теорию, в настоящем изобретении отмечают, что нейтральная межнуклеотидная связь может быть более гидрофобной, чем фосфотиоатная межнуклеотидная связь (PS), которая может быть более гидрофобной, чем природная фосфатная связь (РО). Как правило, в отличие от PS или РО, нейтральная межнуклеотидная связь несет меньший заряд. Не вдаваясь в какую-либо конкретную теорию, в настоящем изобретении отмечают, что встраивание одной или нескольких нейтральных межнуклеотидных связей в НТТ-олигонуклеотид может увеличивать способность олигонуклеотидов захватываться клеткой и/или ускользать из эндосом. Не вдаваясь в какую-либо конкретную теорию, в настоящем изобретении отмечают, что встраивание одной или нескольких нейтральных межнуклеотидных связей можно использовать для модулирования температуры плавления дуплексов, образованных между НТТ-олигонуклеотидом и его нуклеиновой кислотой-мишенью.

[00290] Не вдаваясь в какую-либо конкретную теорию, в настоящем изобретении отмечают, что встраивание одной или нескольких межнуклеотидных связей, не являющихся отрицательно заряженными, например нейтральных межнуклеотидных связей, в НТТ-олигонуклеотид может быть способно привести к увеличению способности олигонуклеотида опосредовать такую функцию как нокдаун гена. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, способный опосредовать нокдаун уровня нуклеиновой кислоты или кодируемого ею продукта, содержит одну или несколько межнуклеотидных связей, не являющихся отрицательно заряженными. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, способный опосредовать нокдаун экспрессии гена НТТ, содержит одну или несколько межнуклеотидных связей, не являющихся отрицательно заряженными.

[00291] В некоторых вариантах осуществления типичное соединение, как в природных ДНК и РНК, является таким, что межнуклеотидная связь образует связи с двумя сахарами (которые могут являться либо немодифицированными, либо модифицированными, как описано в данном документе). Во многих вариантах осуществления, как проиллюстрировано в данном документе, межнуклеотидная связь образует связи посредством своих атомов кислорода с одной необязательно модифицированной рибозой или дезоксирибозой по ее 5'-атому углерода и другой необязательно модифицированной рибозой или дезоксирибозой по ее 3'-атому углерода. В некоторых вариантах осуществления каждое нуклеозидное звено, присоединенное межнуклеотидной связью, независимо содержит нуклеиновое основание, которое независимо представляет собой необязательно замещенный А, Т, С, G или U или замещенный таутомер А, Т, С, G или U.

[00292] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит межнуклеотидную связь, где отрицательно заряженный, не образующий мостик кислород канонической фосфодиэфирной связи заменен незаряженным алкильным заместителем, таким как метильная (Met) или этильная (Et) группа, как в Р-алкилфосфонатной нуклеиновой кислоты (phNA), такой как Р-метил- или Р-этил-phNA. См., например, Micklefield et al. 2001 Curr. Med. Chem. 8, 1157-1179; and Arangundy-Franklin et al. 2019 Nat. Chem. 11, 533-542.

[00293] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид представляет собой фосфонометилтреозильную нуклеиновую кислоту (tPhoNA) и/или содержит фосфонометилтреозильную межнуклеотидную связь. Liu et al. 2018 J. Am. Chem. Soc. 140, 6690-6699.

[00294] Как понятно специалистам в данной области техники, многие другие типы межнуклеотидных связей могут быть использованы в соответствии с настоящим изобретением, например, описанные в патентах США №№3,687,808; 4,469,863; 4,476,301; 5,177,195; 5,023,243; 5,034,506; 5,166,315; 5,185,444; 5,188,897; 5,214,134; 5,216,141; 5,235,033; 5,264,423; 5,264,564; 5,276,019; 5,278,302; 5,286,717; 5,321,131; 5,399,676; 5,405,938; 5,405,939; 5,434,257; 5,453,496; 5,455,233; 5,466,677; 5,466,677; 5,470,967; 5,476,925; 5,489,677; 5,519,126; 5,536,821; 5,541,307; 5,541,316; 5,550,111; 5,561,225; 5,563,253; 5,571,799; 5,587,361; 5,596,086; 5,602,240; 5,608,046; 5,610,289; 5,618,704; 5,623,070; 5,625,050; 5,633,360; 5,64,562; 5,663,312; 5,677,437; 5,677,439; 6,160,109; 6,239,265; 6,028,188; 6,124,445; 6,169,170; 6,172,209; 6,277,603; 6,326,199; 6,346,614; 6,444,423; 6,531,590; 6,534,639; 6,608,035; 6,683,167; 6,858,715; 6,867,294; 6,878,805; 7,015,315; 7,041,816; 7,273,933; 7,321,029; или RE39464. В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой связь, описанную в US 9982257, US 20170037399, US 20180216108, WO 2017192664, WO 2017015575, WO 2017062862, WO 2018067973, WO 2017160741, WO 2017192679, WO 2017210647, WO 2018098264, PCT/US18/35687, PCT/US18/38835 или PCT/US18/51398, при этом нуклеиновые основания, сахара, межнуклеотидные связи, хиральные вспомогательные средства/реагенты и технологии для олигонуклеотидного синтеза (реагенты, условия, циклы и т.д.) из каждого из них независимо включены в данный документ посредством ссылки.

[00295] В некоторых вариантах осуществления каждая межнуклеотидная связь в НТТ-олигонуклеотиде независимо выбрана из природной фосфатной связи, фосфотиоатной связи и межнуклеотидной связи, не являющейся отрицательно заряженной (например, n001). В некоторых вариантах осуществления каждая межнуклеотидная связь в НТТ-олигонуклеотиде независимо выбрана из природной фосфатной связи, фосфотиоатной связи и нейтральной межнуклеотидной связи (например, n001).

[00296] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит один или несколько нуклеотидов, которые независимо содержат модификацию по атому фосфора, склонную к "самовысвобождению" при определенных условиях. То есть, при определенных условиях конкретная модификация по атому фосфора конструируется таким образом, чтобы она самостоятельно отщеплялась от олигонуклеотида с обеспечением, например, природной фосфатной связи. Конкретные примеры таких групп с модификацией по атому фосфора можно найти в US 9982257. В некоторых вариантах осуществления самовысвобождающаяся группа содержит морфолиновую группу. В некоторых вариантах осуществления для самовысвобождающейся группы характерна способность доставлять к межнуклеотидному фосфорному линкеру определенное средство, при этом средство облегчает дальнейшую модификацию атома фосфора, такую как, например, десульфирование. В некоторых вариантах осуществления средство представляет собой воду, а дальнейшая модификация представляет собой гидролиз с образованием природной фосфатной связи.

[00297] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит одну или несколько межнуклеотидных связей, которые улучшают одно или несколько фармацевтических свойств и/или видов активности олигонуклеотида. В данной области техники документально подтверждено, что определенные олигонуклеотиды быстро разлагаются под действием нуклеаз и демонстрируют низкий уровень захват клетками через цитоплазматическую клеточную мембрану (Poijarvi-Virta et al., Curr. Med. Chem. (2006), 13(28);3441-65; Wagner et al., Med. Res. Rev. (2000), 20(6):417-51; Peyrottes et al., Mini Rev. Med. Chem. (2004), 4(4):395-408; Gosselin et al., (1996), 43(l):196-208; Bologna et al., (2002), Antisense & Nucleic Acid Drug Development 12:33-41). Vives и соавт.(Nucleic Acids Research (1999), 27(20):4071-76) сообщали, что проолигонуклеотиды с трет-бутил-SATE демонстрировали заметное увеличение проникновения в клетки по сравнению с исходным олигонуклеотид ом при определенных условиях.

[00298] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения продемонстрировано, что по меньшей мере в некоторых случаях межнуклеотидные связи Sp, в частности на 5'- и/или 3'-конце, могут улучшать стабильность олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения продемонстрировано, что среди всего прочего природные фосфатные связи и/или межнуклеотидные связи в конфигурации Rp могут улучшать удаление олигонуклеотидов из системы. Среднему специалисту в данной области техники понятно, что различные анализы, известные в данной области техники, могут быть использованы для оценки таких свойств в соответствии с настоящим изобретением.

[00299] Для достижения требуемых свойств и/или видов активности олигонуклеотида можно использовать различные типы межнуклеотидных связей в сочетании с другими структурными элементами, например сахарами. Например, в настоящем изобретении при конструировании олигонуклеотидов обычно используются модифицированные межнуклеотидные связи и модифицированные сахара, необязательно с природными фосфатными связями и природными сахарами. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен НТТ-олигонуклеотид, содержащий один или несколько модифицированных сахаров.

[00300] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен НТТ-олигонуклеотид, содержащий один или несколько модифицированных сахаров и одну или несколько модифицированных межнуклеотидных связей, одна или несколько из которых могут характеризоваться контролируемой хиральностью.

[00301] В некоторых вариантах осуществления в НТТ-олигонуклеотиде межнуклеотидные связи с контролируемой хиральностью могут образовывать конкретный паттерн, который может воздействовать на один или несколько видов активности и/или свойств олигонуклеотида.

Композиции на основе НТТ-олигонуклеотидов и их стереохимия

[00302] Среди всего прочего в настоящем изобретении представлены различные композиции на основе НТТ-олигонуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиции на основе олигонуклеотидов, описанных в данном документе,. В некоторых вариантах осуществления композиция на основе НТТ-олигонуклеотида, например композиция на основе НТТ-олигонуклеотида, содержит совокупность НТТ-олигонуклеотидов, описанных в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления композиция на основе НТТ-олигонуклеотида, например композиция на основе НТТ-олигонуклеотида, характеризуется контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления композиция на основе НТТ-олигонуклеотида, например композиция на основе НТТ-олигонуклеотида, не характеризуется контролируемой хиральностью (является стереомерно неупорядоченной).

[00303] Атом фосфора в составе связи в природных фосфатных связях является ахиральным. Атом фосфора в составе связи во многих модифицированных межнуклеотидных связях, например, фосфотиоатных межнуклеотидных связях, является хиральным. В некоторых вариантах осуществления в ходе получения композиций на основе олигонуклеотидов (например, при традиционном фосфорамидитном олигонуклеотидном синтезе) конфигурации хирального атома фосфора в составе связи целенаправленно не конструируются или не контролируются, при этом получают не характеризующиеся контролируемой хиральностью (стереомерно неупорядоченные) композиции на основе олигонуклеотидов (по сути рацемические препараты), которые представляют собой сложные случайные смеси различных стереоизомеров (диастереоизомеров) - в случае олигонуклеотидов с числом хиральных межнуклеотидных связей, равным n (атом фосфора в составе связи является хиральным), существует, как правило, 2ⁿ стереоизомеров (например, если n составляет 10, 2¹⁰=1032; если n составляет 20, 2²⁰=1048576). Эти стереоизомеры обладают одинаковым составом, но различаются с точки зрения паттерна стереохимии их атомов фосфора в составе связи.

[00304] В некоторых вариантах осуществления композиции на основе стереомерно неупорядоченных олигонуклеотидов характеризуются свойствами и/или видами активности, достаточными для выполнения конкретных целей и/или вариантов применения. В некоторых вариантах осуществления композиции на основе стереомерно неупорядоченных олигонуклеотидов могут быть более дешевыми, легкими и/или простыми в получении, чем композиции на основе олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью.

[00305] Однако в некоторых вариантах осуществления стереоизомеры в пределах стереомерно неупорядоченных композиций могут характеризоваться разными свойствами, видами активности, и/или токсичности, что приводит к непостоянным терапевтическим эффектам и/или непредусмотренными побочным эффектам стереомерно неупорядоченных композиций, в частности, по сравнению с определенными композициями на основе олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью на основе олигонуклеотидов одинакового состава.

[00306] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение охватывает технологии конструирования и получения композиций на основе НТТ-олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиции на основе олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, например, на основе многих олигонуклеотидов, указанных в таблице 1, которые содержат S и/или R в своем столбце "Стереохимия/связь". В некоторых вариантах осуществления композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью содержит контролируемый/предварительно определенный (не случайный, как в стереомерно неупорядоченных композициях) уровень совокупности олигонуклеотидов, где олигонуклеотиды характеризуются одинаковой стереохимией атома фосфора в составе связи в одной или нескольких хиральных межнуклеотидных связях (межнуклеотидных связях с контролируемой хиральностью). В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды характеризуются одинаковым паттерном хиральных центров остова (стереохимией атома фосфора в составе связи). В некоторых вариантах осуществления паттерн хиральных центров остова является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды являются идентичными по структуре.

[00307] В некоторых вариантах осуществления уровень диастереомерной чистоты совокупности олигонуклеотидов в композиции может быть определен как произведение диастереомерной чистоты каждой межнуклеотидной связи с контролируемой хиральностью в олигонуклеотидах. В некоторых вариантах осуществления диастереомерная чистота межнуклеотидной связи, соединяющей два нуклеозида в НТТ-олигонуклеотиде (или нуклеиновой кислоте) представлена диастереомерной чистотой межнуклеотидной связи димера, соединяющего те же два нуклеозида, где димер получают в сравнимых условиях, в некоторых случаях в условиях идентичного синтетического цикла.

[00308] В некоторых вариантах осуществления все хиральные межнуклеотидные связи характеризуются контролируемой хиральностью, а композиция представляет собой композицию на основе олигонуклеотида с полностью контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления не все хиральные межнуклеотидные связи представляют собой межнуклеотидные связи с контролируемой хиральностью, а композиция представляет собой композицию на основе олигонуклеотида с частично контролируемой хиральностью.

[00309] Олигонуклеотиды могут содержать или состоять из различных паттернов хиральных центров остова (паттернов стереохимии хирального атома фосфора в составе связи). Определенные применимые паттерны хиральных центров остова описаны в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления совокупность олигонуклеотидов характеризуется общим паттерном хиральных центров остова, который представляет собой или содержит паттерн, описанный в настоящем изобретении (например, как в разделе "стереохимия атомов фосфора в составе связи и их паттерны", паттерн хиральных центров остова олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, указанного в таблице 1 и т.д.).

[00310] В некоторых вариантах осуществления композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью представляет собой композицию на основе хирально чистого (или стереомерно чистого, стереохимически чистого) олигонуклеотида, где композиция на основе олигонуклеотида содержит совокупность олигонуклеотидов, где олигонуклеотиды являются идентичными [включая то, что каждый хиральный элемент олигонуклеотидов, включая каждый хиральный атом фосфора в составе связи, независимо является задаваемым (стереомерно задаваемым)], и композиция не содержит других стереоизомеров. Композиция на основе хирально чистого (или стереомерно чистого, стереохимически чистого) олигонуклеотида, содержащая стереоизомер НТТ-олигонуклеотида, не содержит других стереоизомеров (как понятно специалистам в данной области техники, при этом один или несколько непредусмотренных стереоизомеров могут существовать в виде примесей - иллюстративные показатели чистоты описаны в настоящем изобретении).

[00311] Композиции на основе олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью могут демонстрировать ряд преимуществ по сравнению с композициями на основе стереомерно неупорядоченных олигонуклеотидов. Среди всего прочего композиции на основе олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью являются более однородными с точки зрения структур олигонуклеотидов, чем соответствующие композиции на основе стереомерно неупорядоченных олигонуклеотидов. Посредством контроля стереохимии можно получить и оценить композиции, содержащие отдельные стереоизомеров, чтобы обеспечить возможность разработки композиции на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, содержащей стереоизомеры с требуемыми свойствами и/или видами активности. В некоторых вариантах осуществления композиции на основе олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью обеспечивают лучшие профили доставки, стабильности, клиренса, активности, селективности и/или токсичности по сравнению, например, с соответствующими композициями на основе стереомерно неупорядоченных олигонуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления композиции на основе олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью обеспечивают лучшую эффективность, меньшее количество побочных эффектов и/или более удобные и эффективные схемы приема. Среди всего прочего паттерны хиральных центров остова, описанные в данном документе, можно использовать для обеспечения контролируемого расщепления олигонуклеотидов-мишеней (например, транскриптов, таких как пре-мРНК, зрелая мРНК и т.д.; включая контроль сайтов расщепления, скорости и/или степени расщепления в сайтах расщепления, и/или общей скорости и степени расщепления и т.д.) и значительного увеличения селективности в отношении НТТ-мишеней.

[00312] В некоторых вариантах осуществления композиция на основе НТТ-олигонуклеотида предусматривает одну или несколько межнуклеотидных связей, которые являются стереомерно контролируемыми (характеризующимися контролируемой хиральностью; в некоторых вариантах осуществления стереомерно чистыми), и одну или несколько межнуклеотидных связей, которые являются стереомерно неупорядоченными. В некоторых вариантах осуществления композиция на основе НТТ-олигонуклеотида предусматривает одну или несколько межнуклеотидных связей, которые являются стереомерно контролируемыми (характеризующимися контролируемой хиральностью; в некоторых вариантах осуществления стереомерно чистыми), и одну или несколько межнуклеотидных связей, которые являются стереомерно неупорядоченными.

[00313] В некоторых вариантах осуществления композиция на основе НТТ-олигонуклеотида предусматривает одну или несколько межнуклеотидных связей, которые являются стереомерно контролируемыми (например, характеризующимися контролируемой хиральностью или стереомерно чистыми), и одну или несколько межнуклеотидных связей, которые являются стереомерно неупорядоченными. Такие олигонуклеотиды могут нацеливаться на различные мишени и могут иметь различные последовательности оснований, и могут характеризоваться способностью действовать посредством одного или нескольких различных способов (например, механизма с участием РНКазы Н, стерического затруднения, интерференции на основе двух- или однонитевых РНК, модуляции пропуска экзона, CRISPR, аптамера и т.д.).

[00314] В данном документе описаны неограничивающие примеры композиций на основе стереомерно неупорядоченных олигонуклеотидов, например, композиции на основе стереомерно неупорядоченных НТТ-олигонуклеотидов, включая без ограничений: WV-1027, WV-1028, WV-1029, WV-1030, WV-1031, WV-1032, WV-1033, WV-1034, WV-1035, WV-1036, WV-1037, WV-1038, WV-1039, WV-1040, WV-1041, WV-1042, WV-1043, WV-1044, WV-1045, WV-1046, WV-1047, WV-1048, WV-1049, WV-1050, WV-1051, WV-1052, WV-1053, WV-1054, WV-1055, WV-1056, WV-1057, WV-1058, WV-1059, WV-1060, WV-1061, WV-1062, WV-1063, WV-1064, WV-1065, WV-1066, WV-1067, WV-1068, WV-1069, WV-1070, WV-1071, WV-1072, WV-2023, WV-2024, WV-2025, WV-2026, WV-2027, WV-2028, WV-2029, WV-2030, WV-2031, WV-2032, WV-2033, WV-2034, WV-2035, WV-2036, WV-2037, WV-2038, WV-2039, WV-2040, WV-2041, WV-2042, WV-2043, WV-2044, WV-2045, WV-2046, WV-2047, WV-2048, WV-2049, WV-2050, WV-2051, WV-2052, WV-2053, WV-2054, WV-2055, WV-2056, WV-2057, WV-2058, WV-2059, WV-2060, WV-2061, WV-2062, WV-2063, WV-2064, WV-2065, WV-2066, WV-2067, WV-2068, WV-2069, WV-2070, WV-2071, WV-2072, WV-2073, WV-2074, WV-2075, WV-2076, WV-2077, WV-2078, WV-2079, WV-2080, WV-2081, WV-2082, WV-2083, WV-2084, WV-2085, WV-2086, WV-2087, WV-2088, WV-2089, WV-2090, WV-2605, WV-2606, WV-2607, WV-2608, WV-2609, WV-2610, WV-2611, WV-2612, WV-2613, WV-2614, WV-2615, WV-2616, WV-2617, WV-2618, WV-2619, WV-2620, WV-13625, WV-13626, WV-13627, WV-13628, WV-13629, WV-13630, WV-13631, WV-13632, WV-13633, WV-13634, WV-13635, WV-13646, WV-13647, WV-13648, WV-13649, WV-13650, WV-13651, WV-13652, WV-13653, WV-13654, WV-13655, WV-13656, и WV-13667.

[00315] В данном документе описаны неограничивающие примеры композиций на основе стереомерно чистых (или характеризующихся контролируемой хиральностью) олигонуклеотидов, например, композиции на основе стереомерно чистых (или характеризующихся контролируемой хиральностью) НТТ-олигонуклеотидов, включая без ограничений: WV-2269, WV-2270, WV-2271, WV-2272, WV-2374, WV-2375, WV-2380, WV-2416, WV-2417, WV-2418, WV-2419, WV-2431, WV-2589, WV-2590, WV-2591, WV-2592, WV-2593, WV-2594, WV-2595, WV-2596, WV-2597, WV-2598, WV-2599, WV-2600, WV-2601, WV-2602, WV-2603, WV-2604, WV-2659, WV-2671, WV-2672, WV-2673, WV-2674, WV-2675, WV-2676, WV-2682, WV-2683, WV-2684, WV-2685, WV-2686, WV-2687, WV-2688, WV-2689, WV-2690, WV-2691, WV-2692, WV-2732, WV-13952, WV-13953, WV-13954, WV-13955, WV-13956, WV-13957, WV-13958, WV-13959, WV-13960, WV-13961, WV-13962, WV-14059, WV-14060, WV-14061, WV-14062, WV-14063, WV-14064, WV-14065, WV-14066, WV-14067, WV-14068, WV-14069, WV-14070, WV-14071, WV-14072, WV-14073, WV-14074, WV-14075, WV-14076, WV-14077, WV-14078, WV-14079, WV-14080, WV-14081, WV-14082, WV-14083, WV-14084, WV-14085, WV-14086, WV-14092, WV-14093, WV-14094, WV-14095, WV-14096, WV-14097, WV-14098, WV-14099, WV-14100, WV-14101, WV-14133, WV-14134, WV-14135, WV-14136, WV-14137, WV-14138, WV-14139, и WV-14140.

[00316] Неограничивающие примеры композиций на основе олигонуклеотидов, например, композиций на основе НТТ-олигонуклеотидов, содержащих одну или несколько межнуклеотидных связей, которые являются стереомерно контролируемыми (например, характеризующимися контролируемой хиральностью или стереомерно чистыми), и одну или несколько межнуклеотидных связей, которые являются стереомерно неупорядоченными, включают без ограничений: WV-13636, WV-13637, WV-13638, WV-13639, WV-13640, WV-13641, WV-13642, WV-13643, WV-13644, WV-13645, WV-13657, WV-13658, WV-13659, WV-13660, WV-13661, WV-13662, WV-13663, WV-13664, WV-13665, WV-13666.

[00317] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композицию на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, например композиция на основе НТТ-олигонуклеотида с контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления представленные композиции на основе олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью содержат совокупность НТТ-олигонуклеотидов одинакового состава и предусматривают одну или несколько межнуклеотидных связей. В некоторых вариантах осуществления совокупность олигонуклеотидов, например, в композиции на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, представляет собой совокупность НТТ-олигонуклеотидов, выбранных из таблицы 1, где олигонуклеотид содержит по меньшей мере один атом фосфора Rp или Sp в составе связи в межнуклеотидной связи с контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления совокупность олигонуклеотидов, например, в композиции на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, представляет собой совокупность НТТ-олигонуклеотидов, выбранных из таблицы 1, где каждая фосфотиоатная межнуклеотидная связь в олигонуклеотиде независимо характеризуется контролируемой хиральностью (каждая фосфотиоатная межнуклеотидная связь независимо является Rp или Sp). В некоторых вариантах осуществления композиция на основе НТТ-олигонуклеотида, например композиция на основе НТТ-олигонуклеотида, представляет собой по сути чистый препарат из единственного олигонуклеотида, в том смысле, что олигонуклеотиды в композиции, которые не относятся к единственному олигонуклеотиду, представляют собой примеси, образующиеся в ходе процесса получения единственного олигонуклеотида, в некоторых случаях после определенных процедур очистки. В некоторых вариантах осуществления единственный олигонуклеотид представляет собой НТТ-олигонуклеотид из таблицы 1, где каждая хиральная межнуклеотидная связь в олигонуклеотиде характеризуется контролируемой хиральностью (например, обозначена как S или R, а не X в столбце "Стереохимии/связь").

[00318] В некоторых вариантах осуществления композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью может характеризоваться повышенной активностью и/или стабильностью, повышенной доставкой и/или пониженной способностью вызывать побочные эффекты, такие как активация комплемента, TLR9 и т.д., по сравнению с соответствующей композицией на основе стереомерно неупорядоченного олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления композиция на основе стереомерно неупорядоченного (не характеризующегося контролируемой хиральностью) олигонуклеотида отличается от композиции на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью тем, что ее соответствующая совокупность олигонуклеотидов не содержит каких-либо межнуклеотидных связей с контролируемой хиральностью, но в остальном композиция на основе стереомерно неупорядоченного олигонуклеотида является идентичной композиции на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью.

[00319] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к композиции на основе НТТ-олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, которая способна обеспечивать снижение уровня, активности или экспрессии гена НТТ или его генного продукта.

[00320] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе НТТ-олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, которая способна обеспечивать снижение уровня, активности или экспрессии гена НТТ или его генного продукта и содержит совокупность олигонуклеотидов, которые характеризуются общей последовательностью оснований, которая представляет собой, включает или содержит участок (например, по меньшей мере 10 или 15 смежных оснований) из последовательности оснований, раскрытой в данном документе (например, в таблице 1, где каждый Т может быть независимо заменен на U и наоборот). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе НТТ-олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, которая способна обеспечивать снижение уровня, активности или экспрессии гена НТТ или его генного продукта и содержит совокупность олигонуклеотидов, которые характеризуются общей последовательностью оснований, которая представляет собой или содержит последовательность оснований, раскрытую в данном документе (например, в таблице 1, где каждый Т может быть независимо заменен на U и наоборот). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе НТТ-олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, которая способна обеспечивать снижение уровня, активности или экспрессии гена НТТ или его генного продукта и содержит совокупность олигонуклеотидов, которые характеризуются общей последовательностью оснований, которая представляет собой последовательность оснований, раскрытую в данном документе (например, в таблице 1, где каждый Т может быть независимо заменен на U и наоборот).

[00321] В некоторых вариантах осуществления предусмотренная композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью представляет собой композицию на основе НТТ-олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, содержащую совокупность НТТ-олигонуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью представляет собой композицию на основе хирально чистого (или "стереохимически чистого") олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе хирально чистого олигонуклеотида, содержащая НТТ-олигонуклеотид, указанный в таблице 1, где каждая хиральная межнуклеотидная связь в олигонуклеотиде независимо характеризуется контролируемой хиральностью (Rp или Sp, например, может определяться на основе R или S, но не X в столбце "Стереохимия/связь"). Как будет понятно среднему специалисту в данной области техники, химическая селективность редко, если вообще когда-либо, достигает полноты (абсолютных 100%). В некоторых вариантах осуществления композиция на основе хирально чистого олигонуклеотида содержит совокупность олигонуклеотидов, где олигонуклеотиды в совокупности являются идентичными по структуре и все они имеют одинаковую структуру (одинаковую стереоизомерную форму; в контексте олигонуклеотида, как правило, одинаковую диастереомерную форму, поскольку в НТТ-олигонуклеотиде, как правило, существует несколько хиральных центров), и композиция на основе хирально чистого олигонуклеотида не содержит каких-либо других стереоизомеров (в контексте олигонуклеотида, как правило, диастереомеров, поскольку в НТТ-олигонуклеотиде, как правило, существует несколько хиральных центров; в той степени, которую, например, можно достичь при стереоселективном получении). Как понятно специалистам в данной области техники, композиции на основе стереомерно неупорядоченных (или "рацемических", "не характеризующихся контролируемой хиральностью") олигонуклеотидов представляют собой случайные смеси из многих стереоизомеров (например, содержащие 2n диастереоизомеров, где n представляет собой число хиральных атомов фосфора в составе связи в случае олигонуклеотидов, в которых другие хиральные центры (например, хиральные центры, представляющие собой атомы углерода в сахаре) характеризуются контролируемой хиральностью, при этом каждый независимо существует в одной конфигурации, и только хиральные центры в атомах фосфора в составе связи не характеризуются контролируемой хиральностью).

[00322] Определенные данные, демонстрирующие свойства и/или виды активности композиции на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, например, композиций на основе НТТ-олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, в обеспечении снижения уровня, активности и/или экспрессии гена НТТ или его генного продукта, приведены, например, в разделе "Примеры" в данном документе.

[00323] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе НТТ-олигонуклеотида, содержащая олигонуклеотиды, которые содержат по меньшей мере один хиральный атом фосфора в составе связи. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе НТТ-олигонуклеотида, содержащая НТТ-олигонуклеотиды, которые содержат по меньшей мере один хиральный атом фосфора в составе связи. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе НТТ-олигонуклеотида, в которой НТТ-олигонуклеотиды содержат фосфотиоатную межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью, где атом фосфора в составе связи имеет конфигурацию Rp. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе НТТ-олигонуклеотида, в которой НТТ-олигонуклеотиды содержат фосфотиоатную межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью, где атом фосфора в составе связи имеет конфигурацию Sp.

[00324] В некоторых вариантах осуществления представленные композиции на основе олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью (например, композиции на основе НТТ-олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью) являются неожиданно эффективными по сравнению с эталонными композициями на основе олигонуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления требуемые биологические эффекты (например, что измеряют по снижению уровней мРНК, белков и т.д., уровни которых планируется снижать) могут усиливаться в более чем 5, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50 или 100 раз (например, что измеряют по остаточным уровням мРНК, белков и т.д.). В некоторых вариантах осуществления изменение измеряют по снижению уровня нежелательной мРНК по сравнению с эталонными условиями. В некоторых вариантах осуществления изменение измеряют по повышению уровня требуемой мРНК по сравнению с эталонными условиями. В некоторых вариантах осуществления изменение измеряют по снижению уровня нежелательной мРНК по сравнению с эталонными условиями. В некоторых вариантах осуществления эталонные условия представляют собой отсутствие лечения, например, с помощью композиции на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления эталонные условия представляют собой применение соответствующей композиции на основе стереомерно неупорядоченных олигонуклеотидов, обладающих одинаковым составом.

[00325] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, например композиция на основе НТТ-олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, где атом фосфора в составе связи в по меньшей мере одной межнуклеотидной связи с контролируемой хиральностью представляет собой Sp. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, например композиция на основе НТТ-олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, где большинство атомов фосфора в составе связи в межнуклеотидных связях с контролируемой хиральностью представляют собой Sp. В некоторых вариантах осуществления приблизительно 50%-100%, 55%-100%, 60%-100%, 65%-100%, 70%-100%, 75%-100%, 80%-100%, 85%-100%, 90%-100%, 55%-95%, 60%-95%, 65%-95%, или приблизительно 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 99% или больше из всех межнуклеотидных связей с контролируемой хиральностью (или всех хиральных межнуклеотидных связей, или всех межнуклеотидных связей) представляют собой Sp. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, например композиция на основе НТТ-олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, где большинство хиральных межнуклеотидных связей характеризуются контролируемой хиральностью и представляют собой Sp по их атому фосфора в составе связи. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, например композиция на основе НТТ-олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, где каждая хиральная межнуклеотидная связь характеризуется контролируемой хиральностью, и каждый хиральный атом фосфора в составе связи представляет собой Sp. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, например композиция на основе НТТ-олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, где по меньшей мере одна межнуклеотидная связь с контролируемой хиральностью имеет атом фосфора Rp в составе связи. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, например композиция на основе НТТ-олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, где по меньшей мере одна межнуклеотидная связь с контролируемой хиральностью содержит атом фосфора Rp в составе связи, и по меньшей мере одна межнуклеотидная связь с контролируемой хиральностью содержит атом фосфора Sp в составе связи.

[00326] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, где по меньшей мере две межнуклеотидные связи с контролируемой хиральностью характеризуются различной стереохимией атома фосфора в составе связи и/или различными Р-модификациями относительно друг друга, где Р-модификация представляет собой модификацию по атому фосфора в составе связи. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, где по меньшей мере две межнуклеотидные связи с контролируемой хиральностью характеризуются различной стереохимией относительно друг друга, а паттерн хиральных центров остова в олигонуклеотидах характеризуется повторяющимся паттерном из атомов с чередующейся стереохимией.

[00327] В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, содержащая совокупность олигонуклеотидов, где в каждом из олигонуклеотидов по меньшей мере две отдельные межнуклеотидные связи имеют отличающиеся Р-модификации относительно друг друга. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, содержащая совокупность олигонуклеотидов, где в каждом из олигонуклеотидов по меньшей мере две отдельные межнуклеотидные связи имеют отличающиеся Р-модификации относительно друг друга, и каждый из олигонуклеотидов содержит природную фосфатную связь. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, содержащая совокупность олигонуклеотидов, где в каждом из олигонуклеотидов по меньшей мере две отдельные межнуклеотидные связи имеют отличающиеся Р-модификации относительно друг друга, и каждый из олигонуклеотидов содержит фосфотиоатную межнуклеотидную связь. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, содержащая совокупность олигонуклеотидов, где в каждом из олигонуклеотидов по меньшей мере две отдельные межнуклеотидные связи имеют отличающиеся Р-модификации относительно друг друга, и каждый из олигонуклеотидов содержит природную фосфатную связь и фосфотиоатную межнуклеотидную связь. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, содержащая совокупность олигонуклеотидов, где в каждом из олигонуклеотидов по меньшей мере две отдельные межнуклеотидные связи имеют отличающиеся Р-модификации относительно друг друга, и каждый из олигонуклеотидов содержит фосфотиоатную триэфирную межнуклеотидную связь. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, содержащая совокупность олигонуклеотидов, где в каждом из олигонуклеотидов по меньшей мере две отдельные межнуклеотидные связи имеют отличающиеся Р-модификации относительно друг друга, и каждый из олигонуклеотидов содержит природную фосфатную связь и фосфотиоатную триэфирную межнуклеотидную связь. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, содержащая совокупность олигонуклеотидов, где в каждом из олигонуклеотидов по меньшей мере две отдельные межнуклеотидные связи имеют отличающиеся Р-модификации относительно друг друга, и каждый из олигонуклеотидов содержит фосфотиоатную межнуклеотидную связь и фосфотиоатную триэфирную межнуклеотидную связь.

[00328] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, например композиция на основе НТТ-олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, содержащая совокупность олигонуклеотидов, которые характеризуются общей последовательностью оснований, которая представляет собой последовательность оснований НТТ-олигонуклеотида, раскрытого в данном документе, где по меньшей мере одна межнуклеотидная связь характеризуется контролируемой хиральностью.

Стереохимия и паттерны хиральных центров остова

[00329] В отличие от природных фосфатных связей атом фосфора в составе связи в хиральных модифицированных межнуклеотидных связях, например фосфотиоатных межнуклеотидных связях, является хиральным. Среди всего прочего в настоящем изобретении представлены технологии (например, олигонуклеотиды, композиции, способы и т.д.), включающие контроль стереохимии хирального атома фосфора в составе связи в хиральных межнуклеотидных связях. В некоторых вариантах осуществления, продемонстрированных в данном документе, контроль стереохимии может обеспечивать улучшение свойств и/или видов активности, включая обеспечение требуемой стабильности, сниженной токсичности, улучшенного снижения нуклеиновых кислот НТТ и т.д. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены применимые паттерны хиральных центров остова для олигонуклеотидов и/или их областей, при этом паттерн представляет собой комбинацию стереохимии каждого хирального атома фосфора в составе связи (Rp или Sp) из хиральных атомов фосфора в составе связи, а также указание каждого ахирального атома фосфора в составе связи (Ор, если таковые имеются) и т.д. в направлении от 5' к 3'. В некоторых вариантах осуществления паттерны хиральных центров остова могут контролировать паттерны расщепления нуклеиновых кислот НТТ при их контакте с представленными олигонуклеотидами или композициями на их основе в системе расщепления (например, при анализе in vitro, в клетках, тканях, органах, организмах, субъектах и т.д.). В некоторых вариантах осуществления паттерны хиральных центров остова увеличивают эффективность расщепления и/или селективность в отношении нуклеиновых кислот НТТ при их контакте с представленными олигонуклеотидами или композициями на их основе в системе расщепления.

[00330] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид (или его крыло, кор, блок или любая часть) может содержать любой паттерн хиральных центров, описанный в любом из WO 2017015555; WO 2017192664; W00201200366; WO 2011/034072; WO 2014/010718; WO 2015/108046; WO 2015/108047; WO 2015/108048; WO 2011/005761; WO 2011/108682; WO 2012/039448; WO 2018/067973; WO 2005/028494; WO 2005/092909; WO 2010/064146; WO 2012/073857; WO 2013/012758; WO 2014/010250; WO 2014/012081; WO 2015/107425; WO 2017/015555; WO 2017/015575; WO 2017/062862; WO 2017/160741; WO 2017/192664; WO 2017/192679; WO 2017/210647; WO 2018/022473 или WO 2018/098264, при этом паттерны хиральных центров из них включены посредством ссылки.

[00331] В некоторых вариантах осуществления каждый из олигонуклеотидов в композиции на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью содержит по меньшей мере две межнуклеотидные связи, которые характеризуются отличающейся стереохимией и/или отличающимися Р-модификациями относительно друг друга. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере две межнуклеотидные связи характеризуются отличающейся стереохимией относительно друг друга, и каждый из олигонуклеотидов содержит паттерн хиральных центров остова, содержащий чередующуюся стереохимию атома фосфора в составе связи.

[00332] В некоторых вариантах осуществления фосфотиоатная триэфирная связь включает хиральное вспомогательное средство, которое, например, применяется для контроля стереоселективности реакции, например реакции сочетания в цикле синтеза НТТ-олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления фосфотиоатная триэфирная связь не содержит хиральное вспомогательное средство. В некоторых вариантах осуществления фосфотиоатную триэфирную связь намеренно сохраняется до и/или во время введения композиции на основе олигонуклеотида субъекту.

[00333] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды связаны с твердой подложкой. В некоторых вариантах осуществления твердая подложка представляет собой подложку, предназначенную олигонуклеотидного синтеза. В некоторых вариантах осуществления твердая подложка предусматривает стекло. В некоторых вариантах осуществления твердая подложка представляет собой CPG (стекло с контролируемым размером пор). В некоторых вариантах осуществления твердая подложка представляет собой полимер. В некоторых вариантах осуществления твердая подложка представляет собой полистирол. В некоторых вариантах осуществления твердая подложка представляет собой полистирол с высокой степенью сшивки (НСР). В некоторых вариантах осуществления твердая подложка представляет собой гибридную подложку из стекла с контролируемым размером пор (CPG) и полистирола с высокой степенью сшивки (НСР). В некоторых вариантах осуществления твердая подложка представляет собой металлическую пену. В некоторых вариантах осуществления твердая подложка представляет собой смолу. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды отщепляют от твердой подложки.

[00334] В некоторых вариантах осуществления чистоту, в частности стереохимическую чистоту, и в частности диастереомерную чистоту многих олигонуклеотидов и композиций на их основе, где все другие хиральные центры в олигонуклеотидах, за исключением хиральных центров по атомам фосфора в составе связи, были стереомерно заданы (например, хиральные центры по атомам углерода в сахарах, которые были стереомерно заданными, например, в фосфорамидитах для олигонуклеотидного синтеза), можно контролировать с помощью стереоселективности (как понятно специалистам в данной области техники, диастереоселективности во многих случаях олигонуклеотидного синтеза, где олигонуклеотид содержит более одного хирального центра) по хиральному атому фосфора в составе связи на стадиях сочетания при образовании хиральных межнуклеотидных связей. В некоторых вариантах осуществления стадия сочетания характеризуется стереоселективностью (диастереоселективностью при наличии других хиральных центров), составляющей 60% по атому фосфора в составе связи. После такой стадии сочетания можно обозначать, что вновь образованная межнуклеотидная связь характеризуется стереохимической чистотой 60% (в случае олигонуклеотидов, как правило, диастереомерной чистотой из-за наличия других хиральных центров). В некоторых вариантах осуществления каждая стадия сочетания независимо характеризуется стереоселективностью, составляющей по меньшей мере 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 99,5%. В некоторых вариантах осуществления каждая стадия сочетания независимо характеризуется стереоселективностью, составляющей практически 100%.

[00335] В некоторых вариантах осуществления стадия сочетания характеризуется стереоселективностью, составляющей практически 100%, в том смысле, что каждый обнаруживаемый продукт, полученный на стадии сочетания, при анализе с помощью аналитического метода (например, ЯМР, HPLC и т.д.) характеризуется заданной стереоселективностью. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь с контролируемой хиральностью, как правило, образуется при стереоселективности, составляющей по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99,5% или практически 100% (в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 90%; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 95%; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 96%; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 97%; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 98%; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 99%). В некоторых вариантах осуществления каждая межнуклеотидная связь с контролируемой хиральностью независимо характеризуется стереохимической чистотой (как правило, диастереомерной чистотой в случае олигонуклеотидов с несколькими хиральными центрами), составляющей по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99,5% или практически 100% (в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 90%; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 95%; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 96%; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 97%; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 98%; в некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 99%) по ее хиральному атому фосфора в составе связи.

[00336] В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, или 10 реакций сочетания мономера (как понятно специалистам в данной области техники, во многих вариантах осуществления фосфорамидит для олигонуклеотидного синтеза) независимо характеризуются стереоселективностью, составляющей менее приблизительно 60%, 70%, 80%, 85%, или 90% [в случае олигонуклеотидного синтеза, как правило, диастереоселективностью с точки зрения образующегося хирального(-ых) центра(-ов) по атому фосфора в составе связи].

[00337] В некоторых вариантах осуществления стереохимическая чистота, например диастереомерная чистота, составляет приблизительно 60%-100%.

[00338] В некоторых вариантах осуществления соединения по настоящему изобретению (например, олигонуклеотиды, хиральные вспомогательные средства и т.д.) содержат несколько хиральных элементов (например, несколько хиральных центров по атому углерода и/или фосфора (например, атому фосфора в составе связи хиральных межнуклеотидных связей)). В некоторых вариантах осуществления каждый из по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или более хиральных элементов представленного соединения (например НТТ-олигонуклеотида) независимо характеризуется диастереомерной чистотой, как описано в данном документе.

[00339] Как понятно среднему специалисту в данной области техники, в некоторых вариантах осуществления диастереоселективность сочетания или диастереомерную чистоту хирального центра по атому фосфора можно оценить по диастереоселективности образования димера или диастереомерной чистоты димера, полученного в тех же или сопоставимых условиях, где димер имеет те же 5'- и 3'-нуклеозиды и межнуклеотидную связь.

[00340] Различные технологии можно использовать для идентификации или подтверждения стереохимии хиральных элементов (например, конфигурации хирального атома фосфора в составе связи) и/или паттернов хиральных центров остова, и/или для оценки стереоселективности (например, диастереоселективности стадий сочетания при олигонуклеотидном синтезе) и/или стереохимической чистоты (например, диастереомерной чистоты межнуклеотидных связей, соединений (например, олигонуклеотидов) и т.д.). Примеры технологий включают ЯМР [например, 1D (одномерную) и/или 2D (двумерную) ¹H-³¹Р HETCOR (гетероядерную корреляционную спектроскопию)], HPLC, RP-HPLC, масс-спектрометрию, LC-MS и расщепление межнуклеотидных связей с помощью стереоспецифических нуклеаз и т.д., которые можно использовать по отдельности или в комбинации. Примеры применимых нуклеаз включают бензоназу, нуклеазу микрококков и svPDE (фосфодиэстеразу змеиного яда), которые являются специфическими для определенных межнуклеотидных связей с атомом фосфора Rp в составе связи (например, фосфотиоатной связи Rp); и нуклеазу Р1, нуклеазу бобов мунг и нуклеазу S1, которые являются специфическими для межнуклеотидных связей с атомом фосфора Sp в составе связи (например, фосфотиоатной связи Sp). Не вдаваясь в какую-либо конкретную теорию, в настоящем изобретении отмечают, что по меньшей мере в некоторых случаях на расщепление олигонуклеотидов под действием конкретной нуклеазы могут влиять структурные элементы, например, химические модификации (например, 2'-модификации сахаров), последовательности оснований или стереохимия окружения. Например, наблюдалось, что в некоторых случаях бензоназа и нуклеаза микрококков, которые являются специфическими для межнуклеотидных связей с атом фосфора Rp в составе связи, были неспособны расщеплять отдельную фосфотиоатную межнуклеотидную связь Rp, фланкированную фосфотиоатными межнуклеотидными связями Sp.

[00341] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотиды в совокупности характеризуется одинаковым составом. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотиды в совокупности являются идентичными (один и тот же стереоизомер). В некоторых вариантах осуществления композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, например композиция на основе НТТ-олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, представляет собой композицию на основе стереомерно чистого олигонуклеотида, где олигонуклеотиды в совокупности являются идентичными (один и тот же стереоизомер), и композиция не содержит каких-либо других стереоизомеров. Специалистам в данной области техники будет понятно, что один или несколько других стереоизомеров могут существовать в виде примесей, поскольку процессы, селективность, методы очистки и т.д. могут не достигать полноты.

[00342] В некоторых вариантах осуществления предусмотренная композиция характеризуется тем, что при ее контакте с нуклеиновой кислотой НТТ [например, транскриптом НТТ (например, пре-мРНК, зрелой мРНК, другими типами РНК и т.д., которые гибридизуются с олигонуклеотидами композиции)] уровни нуклеиновой кислоты НТТ и/или продукта, кодируемого ею (например, белка), снижаются по сравнению с уровнем, наблюдаемым при эталонных условиях. В некоторых вариантах осуществления эталонные условия выбраны из группы, состоящей из отсутствия композиции, присутствия эталонной композиции и их комбинаций. В некоторых вариантах осуществления эталонными условиями является отсутствие композиции. В некоторых вариантах осуществления эталонными условиями является присутствие эталонной композиции. В некоторых вариантах осуществления эталонная композиция представляет собой композицию, олигонуклеотиды которой не гибридизуются с нуклеиновой кислотой НТТ. В некоторых вариантах осуществления эталонная композиция представляет собой композицию, олигонуклеотиды которой не содержат последовательность, которая в достаточной степени комплементарна нуклеиновой кислоте НТТ. В некоторых вариантах осуществления предусмотренная композиция представляет собой композицию на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, а эталонная композиция представляет собой композицию на основе олигонуклеотида без контроля хиральности, которая в остальном идентична, но не характеризуется контролируемой хиральностью (например, представляет собой рацемический препарат олигонуклеотидов того же состава, что и олигонуклеотиды (например, из совокупности конкретного типа олигонуклеотидов и т.д.) в композиции на основе олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью).

[00343] Как отмечено выше и понятно в данной области техники, в некоторых вариантах осуществления последовательность оснований НТТ-олигонуклеотида может относиться к природе и/или статусу модификаций нуклеозидных остатков (например, компонентов сахара и/или оснований по сравнению со стандартными встречающимися в природе нуклеотидами, такими как аденин, цитозин, гуанозин, тимин и урацил) в олигонуклеотиде и/или к характеру гибридизации (т.е. способности гибридизоваться с конкретными комплементарными остатками) таких остатков.

[00344] Как продемонстрировано в данном документе, структурные элементы олигонуклеотидов (например, паттерны модификаций сахаров, связей остова, хиральных центров остова, модификаций фосфора остова и т.д.) и их комбинации могут обеспечивать неожиданное улучшение свойств и/или видов биоактивности.

[00345] В некоторых вариантах осуществления композиции на основе олигонуклеотидов способны снижать экспрессию, уровень и/или активность гена НТТ или его генного продукта. В некоторых вариантах осуществления композиции на основе олигонуклеотидов способны снижать экспрессию, уровень и/или активность гена НТТ или его генного продукта путем стерического блокирования трансляции после гибридизации с мРНК НТТ (например, пре-мРНК или зрелой мРНК), путем расщепления мРНК. В некоторых вариантах осуществления представленные композиции на основе НТТ-олигонуклеотидов способны снижать экспрессию, уровень и/или активность гена НТТ или его генного продукта. В некоторых вариантах осуществления представленные композиции на основе НТТ-олигонуклеотидов способны снижать экспрессию, уровень и/или активность гена НТТ или его генного продукта путем стерического блокирования трансляции после гибридизации с мРНК НТТ, путем расщепления мРНК НТТ (пре-мРНК или зрелой мРНК) и/или путем изменения или препятствования сплайсингу мРНК.

[00346] В некоторых вариантах осуществления композиция на основе НТТ-олигонуклеотида, например композиция на основе НТТ-олигонуклеотида, представляет собой по сути чистый препарат из единственного стереоизомера олигонуклеотида, например стереоизомера НТТ-олигонуклеотида, при этом олигонуклеотиды в композиции, которые не относятся к стереоизомеру олигонуклеотида, представляют собой примеси, образующиеся в ходе способа получения указанного стереоизомера олигонуклеотида, в некоторых случаях после определенных процедур очистки.

[00347] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены олигонуклеотиды и композиции на основе олигонуклеотидов, которые характеризуются контролируемой хиральностью, и в некоторых вариантах осуществления являются стереомерно чистыми. Например, в некоторых вариантах осуществления представленная композиция характеризуется неслучайными или контролируемыми уровнями одного или нескольких отдельных типов олигонуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды, относящиеся к одному и тому же типу олигонуклеотидов, являются идентичными.

Сахара

[00348] В соответствии с настоящим изобретением можно использовать различные сахара, включая модифицированные сахара. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены модификации сахаров и их паттерны, необязательно в комбинации с другими структурными элементами (например, модификациями межнуклеотидных связей и их паттернами, паттерном хиральных центров их остова и т.д.), которые при встраивании в олигонуклеотиды могут обеспечивать улучшение свойств и/или видов активности.

[00349] Наиболее часто встречающиеся в природе нуклеозиды содержат рибозные сахара (например, в РНК) или дезоксирибозные сахара (например, в ДНК), связанные с нуклеиновыми основаниями аденозином (А), цитозином (С), гуанином (G), тимином (Т) или урацилом (U). В некоторых вариантах осуществления сахар, например, различные сахара во многих олигонуклеотидах, указанных в таблице 1 (если не отмечено иное), представляет собой сахар природной ДНК (в нуклеиновых кислотах или олигонуклеотидах ДНК, имеющий структуру , где нуклеиновое основание прикрепляется к положению 1', а положения 3 'и 5' присоединены к межнуклеотидным связям (как понятно специалистам в данной области техники, если находится на 5'-конце НТТ-олигонуклеотида, положение 5' может быть присоединено к 5'-концевой группой (например, -ОН), а если находится на 3'-конце НТТ-олигонуклеотида, положение 3' может быть присоединено к 3'-концевой группе (например, -ОН). В некоторых вариантах осуществления сахар представляет собой сахар природной РНК (в нуклеиновых кислотах или олигонуклеотидах РНК, имеющий структуру , где нуклеиновое основание прикрепляется к положению 1', а положения 3 'и 5' присоединены к межнуклеотидным связям (как понятно специалистам в данной области техники, если находится на 5'-конце НТТ-олигонуклеотида, положение 5' может быть присоединено к 5'-концевой группе (например, -ОН), а если находится на 3'-конце НТТ-олигонуклеотида, положение 3' может быть присоединено к 3'-концевой группе (например, -ОН). В некоторых вариантах осуществления сахар представляет собой модифицированный сахар в том смысле, что он не является сахаром природной ДНК или сахаром природной РНК. Среди всего прочего модифицированные сахара могут обеспечивать повышение стабильности. В некоторых вариантах осуществления модифицированные сахара можно использовать для изменения и/или оптимизации одной или нескольких характеристик гибридизации. В некоторых вариантах осуществления модифицированные сахара можно использовать для изменения и/или оптимизации распознавания нуклеиновой кислоты НТТ. В некоторых вариантах осуществления модифицированные сахара можно использовать для оптимизации Tm. В некоторых вариантах осуществления модифицированные сахара можно использовать для улучшения видов активности олигонуклеотида.

[00350] Сахара могут быть связаны с межнуклеотидными связями по различным положениям. В качестве неограничивающих примеров, межнуклеотидные связи могут быть связаны с положением 2', 3', 4' или 5' в сахарах. В некоторых вариантах осуществления, как это чаще всего встречается в природных нуклеиновых кислотах, межнуклеотидная связь соединяется с одним сахаром по положению 5' и с другим сахаром по положению 3'.

[00351] В некоторых вариантах осуществления сахар представляет собой необязательно замещенный сахар природной ДНК или РНК. В некоторых вариантах осуществления заместитель, сахар, модифицированный сахар и/или модификация сахара являются такими, как описано в US 9394333, US 9744183, US 9605019, US 9982257, US 20170037399, US 20180216108, US 20180216107, US 9598458, WO 2017/062862, WO 2018/067973, WO 2017/160741, WO 2017/192679, WO 2017/210647, WO 2018/098264, WO 2018/022473, WO 2018/223056, WO 2018/223073, WO 2018/223081, WO 2018/237194, WO 2019/032607, WO 2019/032612, WO 2019/055951 и/или WO 2019/075357, при этом заместители, модификации сахаров и модифицированные сахара из каждого из них независимо включены в данный документ посредством ссылки. Такие различные сахара использованы в таблице 1.

[00352] В некоторых вариантах осуществления сахар представляет собой бициклический сахар. В некоторых вариантах осуществления сахар выбран из LNA-сахаров, BNA-сахаров, cEt-сахаров и т.д.

[00353] В некоторых вариантах осуществления сахар представляет собой 2'-ОМе-, 2'-МОЕ-, 2'-F, LNA- (запертая нуклеиновая кислота), ENA- (нуклеиновая кислота с этиленовым мостиком), BNA(NMe)- (нуклеиновая кислота с метиламиновым мостиком), 2'-F ANA- (2'-F-арабинозный), альфа-ДНК- (альфа-D-рибозный), 2'/5' ODN- (например, 2'/5' связанный олигонуклеотид), mv-(инвертированный сахар, например, инвертированную дезоксирибозу), AmR- (аминорибоза), ThioR- (тиорибоза), HNA- (гексозонуклеиновая кислота), CeNA- (циклогексеннуклеиновая кислота) или MOR- (морфолиновая нуклеиновая кислота) сахар.

[00354] В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды содержат один или несколько модифицированных сахаров. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды содержат один или несколько модифицированных сахаров и один или несколько природных сахаров.

[00355] Примеры бициклических сахаров включают альфа-L-метиленокси (4'-СН₂-O-2') LNA, бета-D-метиленокси (4'-СН₂-O-2') LNA, этиленокси (4'-(СН₂)₂-O-2') LNA, аминоокси (4'-СН₂-O-N(R)-2') LNA и оксиамино (4'-СН₂-N(R)-O-2') LNA. В некоторых вариантах осуществления бициклический сахар, например, LNA- или BNA-caxap, представляет собой сахар, содержащий по меньшей мере один мостик между двумя атомами углерода в сахаре. В некоторых вариантах осуществления бициклический сахар в нуклеозиде может иметь стереохимические конфигурации альфа-L-рибофуранозы или бета-D-рибофуранозы. В некоторых вариантах осуществления сахар представляет собой сахар, описанный в WO 1999014226. В некоторых вариантах осуществления 4'-2' бициклический сахар или от 4' к 2' бициклический сахар представляет собой бициклический сахар, содержащий фуранозное кольцо, которое содержит мостик, соединяющий 2'-атом углерода и 4'-атом углерода сахарного кольца. В некоторых вариантах осуществления бициклический сахар, например LNA- или BNA-caxap, содержит по меньшей мере один мостик между двумя атомами углерода пентофуранозильного сахара. В некоторых вариантах осуществления LNA- или BNA-caxap содержит по меньшей мере один мостик между 4'- и 2'-атомами углерода пентофуранозильного сахара.

[00356] В некоторых вариантах осуществления бициклический сахар может дополнительно задаваться изомерной конфигурацией.

[00357] Определенные модифицированные сахара (например, бициклические сахара, которые содержат мостиковые группы 4'-2', такие как 4'-СН₂-O-2' и 4'-СН₂-S-2'), их получение и/или пути применения описаны в Kumar et al., Bioorg. Med. Chem. Lett., 1998, 8, 2219-2222; WO 1999014226 и т.д. 2'-амино-BNA, которые в некоторых случаях могут обеспечивать конформационное ограничение и высокую аффинность, описаны, например, в Singh et al., J. Qrg. Chem., 1998, 63, 10035-10039. В дополнение, ранее сообщалось о 2'-амино- и 2'-метиламино-BNA-сахарах и термостабильности их дуплексов с комплементарными нитями РНК и ДНК.

[00358] В некоторых вариантах осуществления сахара представляют собой бициклические сахара, содержащие углеводородный мостик, например, мостик 4'-(СН₂)₃-2', мостик 4'-СН=СН-СН₂-2' и т.д. (например, в Freier et al., Nucleic Acids Research, 1997, 25(22), 4429-4443; Albaek et al., J. Org. Chem., 2006, 71, 7731-7740 и т.д.). Сообщалось о примерах получения таких бициклических сахаров и нуклеозидов вместе с их олигомеризацией и биохимическими исследованиями, например, в Srivastava et al., J. Am. Chem. Soc. 2007, 129(26), 8362-8379.

[00359] В некоторых вариантах осуществления бициклический сахар представляет собой сахар из альфа-L-метиленокси (4'-СН₂-O-2') BNA, бета-D-метиленокси (4'-СН₂-O-2') BNA, этиленокси (4'-(СН₂)₂-O-2') BNA, аминоокси (4'-СН₂-O-N(R)-2') BNA, оксиамино (4'-СН₂-N(R)-O-2') BNA, метил(метиленокси) (4'-СН(СН₃)-O-2') BNA (также называемой затрудненной этилом или cEt), метилентио (4'-СН₂-S-2') BNA, метиленамино (4'-СН₂-N(R)-2') BNA, метилкарбоциклической (4'-СН₂-СН(СН₃)-2') BNA, пропиленкарбоциклической (4'-(СН₂)₃-2') BNA или винил-BNA.

[00360] В некоторых вариантах осуществления модификация сахара представляет собой модификацию, описанную в US 9006198. В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар описан в US 9006198. В некоторых вариантах осуществления модификация сахара представляет собой модификацию, описанную в US 9394333, US 9744183, US 9605019, US 9982257, US 20170037399, US 20180216108, US 20180216107, US 9598458, WO 2017/062862, WO 2018/067973, WO 2017/160741, WO 2017/192679, WO 2017/210647, WO 2018/098264, WO 2018/022473, WO 2018/223056, WO 2018/223073, WO 2018/223081, WO 2018/237194, WO 2019/032607, WO 2019/032612, WO 2019/055951 и/или WO 2019/075357, при этом модификации сахаров и модифицированные сахара из каждого из них независимо включены в данный документ посредством ссылки.

[00361] В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар представляет собой сахар, описанный в US 5658873, US 5118800, US 5393878, US 5514785, US 5627053, US 7034133,7084125, US 7399845, US 5319080, US 5591722, US 5597909, US 5466786, US 6268490, US 6525191, US 5519134, US 5576427, US 6794499, US 6998484, US 7053207, US 4981957, US 5359044, US 6770748, US 7427672, US 5446137, US 6670461, US 7569686, US 7741457, US 8022193, US 8030467, US 8278425, US 5610300, US 5646265, US 8278426, US 5567811, US 5700920, US 8278283, US 5639873, US 5670633, US 8314227, US 2008/0039618 или US 2009/0012281.

[00362] В некоторых вариантах осуществления модификация сахара представляет собой 2'-ОМе, 2'-МОЕ, 2'-LNA, 2'-F, 5'-винил или S-cEt. В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар представляет собой сахар из FRNA, FANA или морфолиновой нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит аналог нуклеиновой кислоты, например, GNA, LNA, PNA, TNA, F-HNA (F-THP или 3'-фтортетрагидропиран), MNA (маннит-нуклеиновую кислоту, например, описанную в Leumann 2002 Bioorg. Med. Chem. 10: 841-854), ANA (анит-нуклеиновую кислоту) или морфолиновую нуклеиновую кислоту, или ее часть. В некоторых вариантах осуществления модификация сахара заменяет природный сахар на другой циклический или ациклический фрагмент. Примеры таких фрагментов широко известны в данной области техники, например, используемые в морфолиновых, гликолевых нуклеиновых кислотах и т.д., и могут использоваться в соответствии с настоящим изобретением. Как понятно специалистам в данной области техники, при использовании с модифицированными сахарами в некоторых вариантах осуществления межнуклеотидные связи могут быть модифицированными, например, как в морфолиновых нуклеиновых кислотах, PNA и т.д.

[00363] В некоторых вариантах осуществления сахара представляют собой 6'-модифицированные бициклические сахара, которые характеризуются либо (R)-, либо (S)-хиральностью по положению 6, например, описанные в US 7399845. В некоторых вариантах осуществления сахар представляет собой 5'-модифицированный бициклический сахар, который характеризуется либо (R)-, либо (S)-хиральностью по положению 5, например, такой, как описано в US 20070287831.

[00364] В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар содержит один или несколько заместителей по положению 2' (как правило, один заместитель и часто в аксиальном положении), которые независимо выбраны из -F; -CF₃, -CN, -N₃, -NO, -NO₂, -OR', -SR' или -N(R')₂, где каждый R' независимо является таким, как описано в настоящем изобретении; -O-(С₁-С₁₀алкил), -S-(С₁-С₁₀алкил), -NH-(С₁-С₁₀алкил) или -N(С₁-С₁₀алкил)₂; -O-(С₂-С₁₀алкенил), -S-(С₂-С₁₀алкенил), -NH-(С₂-С₁₀алкенил) или -N(С₂-С₁₀алкенил)₂; -O-(С₂-С₁₀алкинил), -S-(С₂-С₁₀алкинил), -NH-(С₂-С₁₀алкинил) или -N(С₂-С₁₀алкинил)₂; или -О-(С₁-С₁₀алкилен)-O-(С₁-С₁₀алкил), -O-(С₁-С₁₀алкилен)-NH-(С₁-С₁₀алкил) или -O-(С₁-С₁₀алкилен)-NH-(С₁-С₁₀алкил)₂, -NH-(С₁-С₁₀алкилен)-O-(С₁-С₁₀алкил) или -N(С₁-С₁₀алкил)-(С₁-С₁₀алкилен)-O-(С₁-С₁₀алкил), где каждый из алкила, алкилена, алкенила и алкинила является независимо и необязательно замещенным. В некоторых вариантах осуществления заместитель представляет собой -O(СН₂)_nOCH₃, 0(СН₂)_nNH₂, МОЕ, DMAOE или DMAEOE, где n составляет от 1 до приблизительно 10. В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар представляет собой сахар, описанный в WO 2001/088198 и Martin et al., Helv. Ctum. Acta, 1995, 78, 486-504. В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар содержит одну или несколько групп, выбранных из замещенной силильной группы, группы, расщепляющей РНК, репортерной группы, флуоресцентной метки, интеркалятора, группы для улучшения фармакокинетических свойств нуклеиновой кислоты, группы для улучшения фармакодинамических свойств нуклеиновой кислоты или других заместителей, имеющих аналогичные свойства. В некоторых вариантах осуществления модификации выполнены в одном или нескольких из положений 2', 3', 4' или 5', в том числе в положении 3' сахара в 3'-концевом нуклеозиде или в положении 5' в 5'-концевом нуклеозиде.

[00365] В некоторых вариантах осуществления 2'-ОН рибозы заменен на группу, выбранную из -Н, -F; -CF₃, -CN, -N₃, -NO, -NO₂, -OR', -SR' или -N(R')₂, где каждый R независимо является таким, как описано в настоящем изобретении; -O-(С₁-С₁₀алкил), -S-(С₁-С₁₀алкил), -NH-(С₁-С₁₀алкил) или -N(С₁-С₁₀алкил)₂; -O-(С₂-С₁₀алкенил), -S-(С₂-С₁₀алкенил), -NH-(С₂-С₁₀алкенил) или -N(С₂-С₁₀алкенил)₂; -O-(С₂-С₁₀алкинил), -S-(С₂-С₁₀алкинил), -NH-(С₂-С₁₀алкинил) или -N(С₂-С₁₀алкинил)₂; или -О-(С₁-С₁₀алкилен)-O-(С₁-С₁₀алкил), -O-(С₁-С₁₀алкилен)-NH-(С₁-С₁₀алкил) или -O-(С₁-С₁₀алкилен)-NH-(С₁-С₁₀алкил)₂, -NH-(С₁-С₁₀алкилен)-O-(С₁-С₁₀алкил) или -N(С₁-С₁₀алкил)-(С₁-С₁₀алкилен)-O-(С₁-С₁₀алкил), где каждый из алкила, алкилена, алкенила и алкинила является независимо и необязательно замещенным. В некоторых вариантах осуществления 2'-ОН заменен на -Н (дезоксирибоза). В некоторых вариантах осуществления 2'-ОН заменен на -F. В некоторых вариантах осуществления 2'-ОН заменен на -OR'. В некоторых вариантах осуществления 2'-ОН заменен на -ОМе. В некоторых вариантах осуществления 2'-ОН заменен на -OCH₂CH₂OMe.

[00366] В некоторых вариантах осуществления модификация сахара представляет собой 2'-модификацию. Обычно используемые 2'-модификации включают без ограничений 2'-OR¹, где R¹ не является водородом, а является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления модификация представляет собой 2'-OR, где R представляет собой необязательно замещенную C_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления модификация представляет собой 2'-OR, где R представляет собой необязательно замещенный C_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления модификация представляет собой 2'-ОМе. В некоторых вариантах осуществления модификация представляет собой 2'-МОЕ. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой S-cEt. В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар представляет собой LNA-сахар. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой F. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой FANA. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой FRNA. В некоторых вариантах осуществления модификация сахара представляет собой 5'-модификацию, например 5'-Ме. В некоторых вариантах осуществления модификация сахара изменяет размер сахарного кольца. В некоторых вариантах осуществления модификация сахара представляет собой сахарный фрагмент в FHNA.

[00367] В некоторых вариантах осуществления модификации сахара заменяет сахарный фрагмент на другой циклический или ациклический фрагмент. Примеры таких фрагментов широко известны в данной области техники, включая без ограничений фрагменты, используемые в морфолиновых (необязательно с их фосфородиамидатной связью), гликолевых нуклеиновых кислотах и т.д.

[00368] В некоторых вариантах осуществления один или несколько сахаров НТТ-олигонуклеотида являются модифицированными. В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар содержит 2'-модификацию. В некоторых вариантах осуществления каждый модифицированный сахар независимо содержит 2'-модификацию. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-OR. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-ОМе. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-МОЕ. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой LNA-модификацию сахара. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-F. В некоторых вариантах осуществления каждая модификация сахара независимо представляет собой 2'-модификацию. В некоторых вариантах осуществления каждая модификация сахара независимо представляет собой 2'-OR или 2'-F. В некоторых вариантах осуществления каждая модификация сахара независимо представляет собой 2'-OR или 2'-F, где R¹ представляет собой необязательно замещенный С_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления каждая модификация сахара независимо представляет собой 2'-OR или 2'-F, где по меньшей мере одна модификация представляет собой 2'-F. В некоторых вариантах осуществления каждая модификация сахара независимо представляет собой 2'-OR или 2'-F, где R¹ представляет собой необязательно замещенный C_1-6алкил, и где по меньшей мере одна модификация представляет собой 2'-OR. В некоторых вариантах осуществления каждая модификация сахара независимо представляет собой 2'-OR или 2'-F, где по меньшей мере одна модификация представляет собой 2'-F, и по меньшей мере одна модификация представляет собой 2'-OR. В некоторых вариантах осуществления каждая модификация сахара независимо представляет собой 2'-OR или 2'-F, где R1 представляет собой необязательно замещенный C_1-6алкил, и где по меньшей мере одна модификация представляет собой 2'-F, и по меньшей мере одна модификация представляет собой 2'-OR. В некоторых вариантах осуществления каждая модификация сахара независимо представляет собой 2'-OR. В некоторых вариантах осуществления каждая модификация сахара независимо представляет собой 2'-OR, где R1 представляет собой необязательно замещенный C_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления каждая модификация сахара представляет собой 2'-ОМе. В некоторых вариантах осуществления каждая модификация сахара представляет собой 2'-МОЕ. В некоторых вариантах осуществления каждая модификация сахара независимо представляет собой 2'-ОМе или 2'-МОЕ. В некоторых вариантах осуществления каждая модификация сахара независимо представляет собой 2'-ОМе, 2'-МОЕ или LNA-caxap.

[00369] В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар представляет собой необязательно замещенный ENA-caxap. В некоторых вариантах осуществления сахар представляет собой сахар, описанный, например, в Seth et al., J Am Chem Soc. 2010 October 27; 132(42): 14942 14950. В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар представляет собой сахар в XNA (ксенонуклеиновая кислота), например, арабинозу, ангидрогексит, треозу, 2'-фторарабинозу или циклогексен.

[00370] Модифицированные сахара включают циклобутильные или циклопентильные фрагменты вместо пентофуранозильного сахара. Типичные примеры таких модифицированных сахаров включают сахара, описанные в US 4981957, US 5118800, US 5319080 или US 5359044. В некоторых вариантах осуществления атом кислорода в пределах рибозного кольца заменен на атом азота, серы, селена или углерода. В некоторых вариантах осуществления -О- заменен на -N(R')-, -S-, -Se- или -C(R')₂-. В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар представляет собой модифицированную рибозу, где атом кислорода в пределах рибозного кольца заменен на атом азота, и где атом азота необязательно замещен алкильной группой (например, метилом, этилом, изопропилом и т.д.).

[00371] Неограничивающим примером модифицированных сахаров является глицерин, который является частью глицериновых нуклеиновых кислот (GNA), например, описанных в Zhang, R et al., J. Am. Chem. Soc., 2008, 130, 5846-5847; Zhang L, et al., J. Am. Chem. Soc., 2005, 127, 4174-4175 и Tsai CH et al., PNAS, 2007, 14598-14603.

[00372] Гибкая нуклеиновая кислота (FNA) основана на смешанном ацетале-аминале формилглицерина, например, описанном в Joyce GF et al., PNAS, 1987, 84, 4398-4402 и Heuberger BD and Switzer C, J. Am. Chem. Soc., 2008, 130, 412-413.

[00373] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид и/или его модифицированный нуклеозид содержит сахар или модифицированный сахар, описанный в WO 2018/022473, WO 2018/098264, WO 2018/223056, WO 2018/223073, WO 2018/223081, WO 2018/237194, WO 2019/032607, WO 2019/055951 и/или WO 2019/075357, при этом сахара и модифицированные сахара их каждого из них независимо включены в данный документ посредством ссылки.

[00374] В некоторых вариантах осуществления одна или несколько гидроксильных групп в сахаре необязательно и независимо заменены на галоген, R' -N(R')₂, -OR' или -SR, где каждый R независимо описан в настоящем изобретении.

[00375] В некоторых вариантах осуществления модифицированный нуклеозид представляет собой любой модифицированный нуклеозид, описанный в WO 2018/022473, WO 2018/098264, WO 2018/223056, WO 2018/223073, WO 2018/223081, WO 2018/237194, WO 2019/032607, WO 2019/055951 и/или WO 2019/075357, при этом модифицированные нуклеозиды из каждого из них независимо включены в данный документ посредством ссылки.

[00376] В некоторых вариантах осуществления модифицированный нуклеозид содержит модифицированный сахар и имеет структуру

где каждый R¹ и R² независимо представляет собой -Н, -F, -ОМе, -МОЕ или необязательно замещенный C_1-6алкил, R' представляет собой R', как описано в настоящем изобретении, а ВА представляет собой нуклеиновое основание, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления сахар представляет собой сахар из такого нуклеозида. В некоторых вариантах осуществления сахар представляет собой сахар из 2'-тио-LNA, HNA, бета-D-окси-LNA, бета-D-тио-LNA, бета-D-амино-LNA, ксило-LNA, альфа-L-LNA, ENA, бета-D-ENA, метилфосфонат-LNA, (R, S)-cEt, (R)-cEt, (S)-cEt, (R, S)-cMOE, (R)-cMOE, (S)-cMOE, (R, S)-5'-Me-LNA, (R)-5'-Me-LNA, (S)-5'-Me-LNA, (S)-Me cLNA, метилен-cLNA, 3'-метил-альфа-L-LNA, (R)-6'-метил-альфа-L-LNA, (S)-5'-метил-альфа-L-LNA или (R)-5'-Ме-альфа-L-LNA. Примеры модифицированных сахаров дополнительно описаны в WO 2008/101157, WO 2007/134181, WO 2016/167780 или US 20050130923.

[00377] Модифицированные сахара, способы их получения, пути применения и т.д., которые можно использовать в соответствии с настоящим изобретением, включают описанные в любом из A. Eschenmoser, Science (1999), 284:2118; M. Bohringer et al., Helv. Chim. Acta (1992), 75:1416-1477; M. Egli et al., J. Am. Chem. Soc. (2006), 128(33): 10847-56; A. Eschenmoser в Chemical Synthesis: Gnosis to Prognosis, C. Chatgilialoglu and V. Sniekus, Ed., (Kluwer Academic, Netherlands, 1996), p.293; K.-U. Schoning et al., Science (2000), 290:1347-1351; A. Eschenmoser et al., Helv. Chim. Acta (1992), 75:218; J. Hunziker et al., Helv. Chim. Acta (1993), 76:259; G. Otting et al., Helv. Chim. Acta (1993), 76:2701; K. Groebke et al., Helv. Chim. Acta (1998), 81:375; или A. Eschenmoser, Science (1999), 284:2118. Модифицированные сахара и связанные с ними способы также можно найти в Verma, S. et al. Annu. Rev. Biochem. 1998, 67, 99-134 а также в литературных источниках, упоминаемых в данной публикации. 2'-фтор-модифицированные сахара и способы описаны, например, в Kawasaki et. al., J. Med. Chem., 1993, 36, 831-841); 2'-МОЕ-модифицированные сахара и способы описаны, например, в Martin, P. Helv. Chim. Acta 1996, 79, 1930-1938; и LNA-caxapa и способы описаны, например, в Wengel, J. Асе. Chem. Res. 1999, 32, 301-310. В некоторых вариантах осуществления модифицированные сахара и связанные с ними способы представляют собой описанные в WO 2012/030683. Применимые модифицированные сахара и связанные с ними способы также описаны в Gryaznov, S; Chen, J.-K. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 3143; Hendrix et al. 1997 Chem. Eur. J. 3: 110; Hyrup et al. 1996 Bioorg. Med. Chem. 4: 5; Jepsen et al. 2004 Oligo. 14: 130-146; Jones et al. J. Org. Chem. 1993, 58, 2983; Koizumi et al. 2003 Nuc. Acids Res. 12: 3267-3273; Koshkin et al. 1998 Tetrahedron 54: 3607-3630; Kumar et al. 1998 Bioo. Med. Chem. Let. 8: 2219-2222; Lauritsen et al. 2002 Chem. Comm. 5: 530-531; Lauritsen et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 13: 253-256; Mesmaeker et al. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1994, 33, 226; Morita et al. 2001 Nucl. Acids Res. Supp. 1: 241-242; Morita et al. 2002 Bioo. Med. Chem. Lett. 12: 73-76; Morita et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 2211-2226; Nielsen et al. 1997 Chem. Soc. Rev. 73; Nielsen et al. 1997 J. Chem. Soc. Perkins Transl. 1: 3423-3433; Obika et al. 1997 Tetrahedron Lett. 38 (50): 8735-8; Obika et al. 1998 Tetrahedron Lett. 39: 5401-5404; Pallan et al. 2012 Chem. Comm. 48: 8195-8197; Petersen et al. 2003 TRENDS Biotech. 21: 74-81; Rajwanshi et al. 1999 Chem. Conunun. 1395-1396; Schultz et al. 1996 Nucleic Acids Res. 24: 2966; Seth et al. 2009 J. Med. Chem. 52: 10-13; Seth et al. 2010 J. Med. Chem. 53: 8309-8318; Seth et al. 2010 J. Org. Chem. 75: 1569-1581; Seth et al. 2012 Bioo. Med. Chem. Lett. 22: 296-299; Seth et al. 2012 Mol. Ther-Nuc. Acids. 1, e47; Seth, Punit P; Siwkowski, Andrew; Allerson, Charles R; Vasquez, Guillermo; Lee, Sam; Prakash, Thazha P; Kinberger, Garth; Migawa, Michael T; Gaus, Hans; Bhat, Balkrishen; et al., из Nucleic Acids Symposium Series (2008), 52(1), 553-554; Singh et al. 1998 Chem. Comm. 1247-1248; Singh et al. 1998 J. Org. Chem. 63: 10035-39; Singh et al. 1998 J. Qrg. Chem. 63: 6078-6079; Sorensen 2003 Chem. Comm. 2130-2131; Ts'o et al. Aim. N. Y. Acad. Sci. 1988, 507, 220; Van Aerschot et al. 1995 Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 34: 1338; и Vasseur et al. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4006. Определенные бициклические сахара, их получение и пути применения, которые можно использовать в соответствии с настоящим изобретением, описаны в WO 2007090071 и WO 2016/079181.

[00378] В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар представляет собой необязательно замещенную пентозу или гексозу. В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар представляет собой необязательно замещенную пентозу. В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар представляет собой необязательно замещенную гексозу. В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар представляет собой необязательно замещенную рибозу или гексит. В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар представляет собой необязательно замещенную рибозу. В некоторых вариантах осуществления модифицированный сахар представляет собой необязательно замещенный гексит.

[00379] В некоторых вариантах осуществления модификация сахара представляет собой 5'-винил (R или S), 5'-метил (R или S), 2'-SH, 2'-F, 2'-ОСН₃, 2'-ОСН₂СН₃, 2'-OCH₂CH₂F или 2'-O(СН₂)₂OCH₃. В некоторых вариантах осуществления заместитель по положению 2', например, 2'-модификация, представляет собой аллил, амино, азидо, тио, O-аллил, O-С₁-С₁₀алкил, OCF₃, OCH₂F, O(СН₂)₂SCH₃, O(CH₂)₂-O-N(R_m)(R_n), O-СН₂-C(=O)-N(R_m)(R_n) и O-СН₂-C(=O)-N(R₁)-(СН₂)₂-N(R_m)(R_n), где каждый аллил, амино и алкил является необязательно замещенным, и каждый из R₁, R_m и R_n независимо представляет собой R', как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления каждый из R₁, R_m и R_n независимо представляет собой Н или необязательно замещенный С₁-С₁₀алкил.

[00380] Определенные бициклические сахара описаны, например, в Chattopadhyaya et al., J. Qrg. Chem., 2009, 74, 118-134, WO 2008154401, WO 2009006478, Srivastava et al., J. Am. Chem. Soc., 2007, 129(26) 8362-8379; Frieden et al., Nucleic Acids Research, 2003, 21, 6365-6372; Elayadi et al., Curr. Opinion Inverts. Drugs, 2001, 2, 558-561; Braasch et al., Chem. Biol., 2001, 8, 1-7; Oram et al., Curr. Opinion Mol Ther., 2001, 3, 239-243; Wahlestedt et al., Proc. Nati Acad. Sci. U. S. A., 2000, 97, 5633-5638; Singh et al., Chem. Commun., 1998, 4, 455-456; Koshldn et al., Tetrahedron, 1998, 54, 3607-3630; Kumar et al., Bioorg. Med. Chem. Lett., 1998, 8, 2219-2222; Singh et al., J. Org. Chem., 1998, 63, 10035-10039; US 7399845; US 7053207; US 7034133; US 6794499; US 6770748; US 6670461; US 6525191; US 6268490; US 7741457; US 8501805; US 8546556; US 20080039618; US 20070287831; US 20040171570; WO 2007134181; WO 2005021570; WO 2004106356; WO 2009006478; WO 2008154401;WO 2008150729 и т.д.

[00381] В некоторых вариантах осуществления сахар представляет собой тетрагидропиран или ТНР-сахар. В некоторых вариантах осуществления модифицированный нуклеозид представляет собой тетрагидропирановый нуклеозид или ТНР-нуклеозид, который представляет собой нуклеозид с шестичленным тетрагидропирановым сахаром, замещающим пентофуранозильный остаток в типичных природных нуклеозидах. ТНР-сахара и/или нуклеозиды включают применяемые в гексит-нуклеиновой кислоте (HNA), анит-нуклеиновой кислоте (ANA), маннит-нуклеиновой кислоте (MNA) (описанных, например, в Leumann, Bioorg. Med. Chem., 2002, 10, 841-854) или фтор-HNA (F-HNA).

[00382] В некоторых вариантах осуществления сахара содержат кольца, содержащие более 5 атомов и/или более одного гетероатома, например, морфолиновые сахара, которые описаны, например, в Braasch et al., Biochemistiy. 2002, 41, 4503-4510; US 5698685; US 5166315; US 5185444; US 5034506 и т.д.

[00383] Как будет понятно специалистам в данной области техники, модификации сахаров, нуклеиновых оснований, межнуклеотидных связей и т.д. могут и зачастую используются в комбинации в олигонуклеотидах, например, см. различные олигонуклеотиды, указанные в таблице 1. Например, комбинацией модификации сахара и модификации нуклеинового основания являются 2'-F (сахар)-5-метил (нуклеиновое основание)-модифицированные нуклеозиды. Дополнительные примеры см. в WO 2008101157. В некоторых вариантах осуществления комбинация представляет собой замену атома кислорода рибозильного кольца на S и замещение по положению 2' (например, как описано в US 20050130923) или 5'-замещение бициклического сахара (например, см. WO 2007134181, где 4'-СН₂-O-2' бициклический нуклеозид дополнительно замещен по положению 5' с помощью 5'-метильной или 5'-винильной группы).

[00384] В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды содержат один или несколько модифицированных циклогексенильных нуклеозидов, которые представляют собой нуклеозид, содержащий шестичленный циклогексенил вместо пентофуранозильного остатка из встречающихся в природе нуклеозидов. Примеры циклогексенильных нуклеозидов, их получение и пути применения описаны, например, в WO 2010036696; Robeyns et al., J. Am. Chem. Soc., 2008, 130(6), 1979-1984; Horvath et al., Tetrahedron Letters, 2007, 48, 3621-3623; Nauwelaerts et al., J. Am. Chem. Soc., 2007, 129(30), 9340-9348; Gu et al., Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids, 2005, 24(5-7), 993-998; Nauwelaerts et al., Nucleic Acids Research, 2005, 33(8), 2452-2463; Robeyns et al., Acta Crystallographica, Section F: Structural Biology and Crystallization Communications, 2005, F61(6), 585-586; Gu et al., Tetrahedron, 2004, 60(9), 2111-2123; Gu et al., Oligonucleotides, 2003, 13(6), 479-489; Wang et al., J. Qrg. Chem., 2003, 68, 4499-4505; Verbeure et al., Nucleic Acids Research, 2001, 29(24), 4941-4947; Wang et al., J. Qrg. Chem., 2001, 66, 8478-82; Wang et al., Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids, 2001, 20(4-7), 785-788; Wang et al., J. Am. Chem., 2000, 122, 8595-8602; WO 2006047842; WO 2001049687 и т.д.

[00385] Многие моноциклические, бициклические и трициклические кольцевые системы применимы в качестве заменителей сахаров (модифицированных сахаров) и могут использоваться в соответствии с настоящим изобретением. См., например, Leumann, Christian J. Bioorg. & Med. Chem., 2002, 10, 841-854. Такие кольцевые системы можно подвергать различным дополнительным заменам для дальнейшего улучшения их свойств и/или видов активности.

[00386] В некоторых вариантах осуществления 2'-модифицированный сахар представляет собой фуранозильный сахар, модифицированный по положению 2'. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой галоген, -R' (где R' не является -Н), -OR' (где R' не является -Н), -SR', -N(R')₂, необязательно замещенный -СН₂-СН=СН₂, необязательно замещенный алкенил или необязательно замещенный алкинил. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификации выбраны из -O[(СН₂)_nO]_mCH₃, -O(СН₂)_nNH₂, -O(СН₂)_nCH₃, -O(СН₂)_nF, -O(СН₂)_nONH₂, -OCH₂C(=O)N(H)CH₃ и -O(СН₂)_nON[(СН₂)_nCH₃]₂, где каждый пит независимо составляет от 1 до приблизительно 10. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой необязательно замещенный С₁-С₁₂алкил, необязательно замещенный алкенил, необязательно замещенный алкинил, необязательно замещенный алкарил, необязательно замещенный аралкил, необязательно замещенный -О-алкарил, необязательно замещенный -O-аралкил, -SH, SCH₃, -OCN, -Cl, -Br, -CN, -F, CF₃, -OCF₃, -SOCH₃, -SO₂CH₃, -ONO₂, -NO₂, -N₃, -NH₂, необязательно замещенный гетероциклоалкил, необязательно замещенный гетероциклоалкарил, необязательно замещенный аминоалкиламино, необязательно замещенный полиалкиламино, замещенный силил, репортерную группу, интеркалятор, группу для улучшения фармакокинетических свойств, группу для улучшения фармакодинамических свойств и другие заместители. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой 2'-МОЕ-модификацию (например, см. Baker et al., J. Biol. Chem., 1997, 272, 11944-12000). Сообщалось, что в некоторых случаях 2'-МОЕ-модификация характеризовалась улучшенной аффинностью связывания по сравнению с не модифицированными сахарами и некоторыми другими модификациями нуклеозидов, такими как 2'-O-метил, 2'-O-пропил и 2'-O-аминопропил. Также сообщалось, что олигонуклеотиды с 2'-МОЕ-модификацией способны ингибировать экспрессию генов с перспективными признаками для применения in vivo (см., например, Martin, Helv. Chim. Acta, 1995, 78, 486-504; Altmann et al., Chimia, 1996, 50, 168-176; Altmann et al., Biochem. Soc. Trans., 1996, 24, 630-637; и Altmaim et al., Nucleosides Nucleotides, 1997, 16, 917-926 и т.д.).

[00387] В некоторых вариантах осуществления 2'-модифицированный или 2'-замещенный сахар или нуклеозид представляют собой сахар или нуклеозид, содержащие заместитель в положении 2' сахара, отличный от -Н (как правило, не считается заместителем) или -ОН. В некоторых вариантах осуществления 2'-модифицированный сахар представляет собой бициклический сахар, содержащий мостик, соединяющий два атома углерода сахарного кольца, один из которых является 2'-атомом углерода. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация не является мостиковой, например, аллил, амино, азидо, тио, необязательно замещенный -O-аллил, необязательно замещенный -O-С₁-С₁₀алкил, -OCF₃, -O(СН₂)₂OCH₃, 2'-O(СН₂)₂SCH₃, -O(СН₂)₂ON(R_m)(R_n) или -OCH₂C(=O)N(R_m)(R_n), где каждый R_m и R_n независимо представляет собой Н или необязательно замещенный С₁-С₁₀алкил.

[00388] Определенные модифицированные сахара, их получение и пути применения описаны в US 4981957, US 5118800, US 5319080, US 5359044, US 5393878, US 5446137, US 5466786, US 5514785, US 5519134, US 5567811, US 5576427, US 5591722, US 5597909, US 5610300, US 5627053, US 5639873, US 5646265, US 5670633, US 5700920, US 5792847, US 6600032 и WO 2005121371.

[00389] В некоторых вариантах осуществления сахар представляет собой сахар из N-метанокарба, LNA, cMOE BNA, cEt BNA, α-L-LNA или родственных аналогов, HNA, Me-ANA, MOE-ANA, Ara-FHNA, FHNA, R-6'-Me-FHNA, S-6'-Me-FHNA, ENA или c-ANA. В некоторых вариантах осуществления модифицированная межнуклеотидная связь представляет собой С3-амидную связь (например, сахар, который имеет амидную модификацию, присоединенную к атому С3', Mutisya et al. 2014 Nucleic Acids Res. 2014 Jun 1; 42(10): 6542-6551), формацетальную, тиоформацетальную связь, связь MMI [например, метилен(метилимино), Peoc'h et al. 2006 Nucleosides and Nucleotides 16 (7-9)], связь РМО (морфолиновая нуклеиновая кислота с фосфородиамидатной связью) (которая соединяет два сахара) или связь PNA (пептидная нуклеиновая кислота). В некоторых вариантах осуществления примеры межнуклеотидных связей и/или сахаров описаны в Allerson et al. 2005 J. Med. Chem. 48: 901-4; BMCL 2011 21: 1122; BMCL 2011 21: 588; BMCL 2012 22: 296; Chattopadhyaya et al. 2007 J. Am. Chem. Soc. 129: 8362; Chem. Bio. Chem. 2013 14: 58; Curr. Prot. Nucl. Acids Chem. 2011 1.24.1; Egli et al. 2011 J. Am. Chem. Soc. 133: 16642; Hendrix et al. 1997 Chem. Eur. J. 3: 110; Hyrup et al. 1996 Bioorg. Med. Chem. 4: 5; Imanishi 1997 Tet. Lett. 38: 8735; J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 3143; J. Med. Chem. 2009 52: 10; J. Qrg. Chem. 2010 75: 1589; Jepsen et al. 2004 Oligo. 14: 130-146; Jones et al. J. Org. Chem. 1993, 58, 2983; Jung et al. 2014 ACIEE 53: 9893; Kodama et al. 2014 AGDS; Koizumi 2003 BMC 11: 2211; Koizumi et al. 2003 Nuc. Acids Res. 12: 3267-3273; Koshkin et al. 1998 Tetrahedron 54: 3607-3630; Kumar et al. 1998 Bioo. Med. Chem. Let. 8: 2219-2222; Lauritsen et al. 2002 Chem. Comm. 5: 530-531; Lauritsen et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 13: 253-256; Lima et al. 2012 Cell 150: 883-894; Mesmaeker et al. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1994, 33, 226; Migawa et al. 2013 Org. Lett. 15: 4316; Mol. Ther. Nucl. Acids 2012 1: e47; Morita et al. 2001 Nucl. Acids Res. Supp. 1: 241-242; Morita et al. 2002 Bioo. Med. Chem. Lett. 12: 73-76; Morita et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 2211-2226; Murray et al. 2012 Nucl. Acids Res. 40: 6135; Nielsen et al. 1997 Chem. Soc. Rev. 73; Nielsen et al. 1997 J. Chem. Soc. Perkins Transl. 1: 3423-3433; Obika et al. 1997 Tetrahedron Lett. 38 (50): 8735 8; Obika et al. 1998 Tetrahedron Lett. 39: 5401-5404; Obika et al. 2008 J. Am. Chem. Soc. 130: 4886; Obika et al. 2011 Qrg. Lett. 13: 6050; Oestergaard et al. 2014 JOC 79: 8877; Pallan et al. 2012 Biochem. 51: 7; Pallan et al. 2012 Chem. Comm. 48: 8195-8197; Petersen et al. 2003 TRENDS Biotech. 21: 74-81; Prakash et al. 2010 J. Med. Chem. 53: 1636; Prakash et al. 2015 Nucl. Acids Res. 43: 2993-3011; Prakash et al. 2016 Bioorg. Med. Chem. Lett. 26: 2817-2820; Rajwanshi et al. 1999 Chem. Commun. 1395-1396; Schultz et al. 1996 Nucleic Acids Res. 24: 2966; Seth et al. 2008 Nucl. Acid Sym. Ser. 52: 553; Seth et al. 2009 J. Med. Chem. 52: 10-13; Seth et al. 2010 J. Am. Chem. Soc. 132: 14942; Seth et al. 2010 J. Med. Chem. 53: 8309-8318; Seth et al. 2010 J. Org. Chem. 75: 1569-1581; Seth et al. 2011 BMCL 21: 4690; Seth et al. 2012 Bioo. Med. Chem. Lett. 22: 296-299; Seth et al. 2012 Mol. Ther-Nuc. Acids. 1, e47; Seth et al., Nucleic Acids Symposium Series (2008), 52(1), 553-554; Singh et al. 1998 Chem. Comm. 1247-1248; Singh et al. 1998 J. Org. Chem. 63: 10035-39; Singh et al. 1998 J. Org. Chem. 63: 6078-6079; Sorensen 2003 Chem. Comm. 2130-2131; Starrup et al. 2010 Nucl. Acids Res. 38: 7100; Swayze et al. 2007 Nucl. Acids Res. 35: 687; Ts'o et al. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1988, 507, 220; Van Aerschot et al. 1995 Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 34: 1338; Vasseur et al. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4006; WO 2007090071; WO 2016079181; US 6326199; US 6066500 или US 6440739.

[00390] Различные дополнительные сахара, применимые при получении олигонуклеотидов или их аналогов, известны в данной области техники и могут быть использованы в соответствии с настоящим изобретением.

Нуклеиновые основания

[00391] В представленных олигонуклеотидах в соответствии с настоящим изобретением можно использовать различные нуклеиновые основания. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой природное нуклеиновое основание, при этом наиболее часто встречающимися из них являются А, Т, С, G и U. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой модифицированное нуклеиновое основание в том смысле, что оно не является А, Т, С, G или U. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой необязательно замещенный А, Т, С, G или U, или замещенный таутомер А Т, С, G или U. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой необязательно замещенный А, Т, С, G или U, например 5mC, 5-гидроксиметил С и т.д. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой алкил-замещенный А, Т, С, G или U. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой А. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой Т. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой С. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой G. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой U. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой 5mC. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой замещенный А, Т, С, G или U. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой замещенный таутомер А, Т, С, G или U. В некоторых вариантах осуществления замещение защищает определенные функциональные группы в нуклеиновых основаниях для сведения к минимуму нежелательных реакций во время олигонуклеотидного синтеза. Подходящие технологии защиты нуклеиновых оснований при олигонуклеотидном синтезе широко известны в данной области техники и могут использоваться в соответствии с настоящим изобретением. В некоторых вариантах осуществления модифицированные нуклеиновые основания улучшают свойства и/или виды активности олигонуклеотидов. Например, во многих случаях 5mC можно использовать вместо С для модуляции определенных нежелательных биологических эффектов, например иммунных ответов. В некоторых вариантах осуществления при определении идентичности последовательностей замещенное нуклеиновое основание с таким же паттерном водородных связей рассматривается как такое же основание, что и незамещенное нуклеиновое основание, например 5mC может рассматриваться как такое же основание, что и С [например, считается, что НТТ-олигонуклеотид, содержащий 5mC вместо С (например, AT5mCG), имеет такую же последовательность оснований, что и НТТ-олигонуклеотид с С в соответствующем(-их) местоположении(-ях) (например, ATCG)].

[00392] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит один или несколько А, Т, С, G или U. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит один или несколько необязательно замещенных А, Т, С, G или U. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит один или несколько 5-метилцитидинов, 5-гидроксиметилцитидинов, 5-формилцитозинов или 5-карбоксилцитозинов. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит один или несколько 5-метилцитидинов. В некоторых вариантах осуществления каждое нуклеиновое основание в НТТ-олигонуклеотиде выбрано из группы, состоящей из необязательно замещенных А, Т, С, G и U и необязательно замещенных таутомеров А, Т, С, G и U. В некоторых вариантах осуществления каждое нуклеиновое основание в НТТ-олигонуклеотиде представляет собой необязательно защищенный А, Т, С, G и U. В некоторых вариантах осуществления каждое нуклеиновое основание в НТТ-олигонуклеотиде представляет собой необязательно замещенный А, Т, С, G или U. В некоторых вариантах осуществления каждое нуклеиновое основание в НТТ-олигонуклеотиде выбрано из группы, состоящей из А, Т, С, G, U и 5mC.

[00393] В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой необязательно замещенный 2АР или DAP. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой необязательно замещенный 2АР. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой необязательно замещенный DAP. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой 2АР. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой DAP.

[00394] Как понятно специалистам в данной области техники, различные нуклеиновые основания известны в данной области техники и могут использоваться в соответствии с настоящим изобретением, например, описанные в US 9394333, US 9744183, US 9605019, US 9982257, US 20170037399, US 20180216108, US 20180216107, US 9598458, WO 2017/062862, WO 2018/067973, WO 2017/160741, WO 2017/192679, WO 2017/210647, WO 2018/098264, WO 2018/022473, WO 2018/223056, WO 2018/223073, WO 2018/223081, WO 2018/237194, WO 2019/032607, W02019/032612, WO 2019/055951 и/или WO 2019/075357, при этом модификации сахаров, оснований и межнуклеотидных связей из каждого из них независимо включены в данный документ посредством ссылки. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновые основания защищены и применимы для олигонуклеотидного синтеза.

[00395] В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой природное нуклеиновое основание или модифицированное нуклеиновое основание, полученное из природного нуклеинового основания. Примеры включают урацил, тимин, аденин, цитозин и гуанин, у которых их соответствующие аминогруппы необязательно защищены ацильными защитными группами, 2-фторурацил, 2-фторцитозин, 5-бромурацил, 5-йодурацил, 2,6-диаминопурин, азацитозин, пиримидиновые аналоги, такие как псевдоизоцитозин и псевдоурацил, и другие модифицированные нуклеиновые основания, такие как 8-замещенные пурины, ксантин или гипоксантин (последние два являются продуктами природного распада). Определенные примеры модифицированных нуклеиновых оснований раскрыты в Chiu and Rana, RNA, 2003, 9, 1034-1048, Limbach et al. Nucleic Acids Research, 1994, 22, 2183-2196 и Revankar and Rao, Comprehensive Natural Products Chemistry, vol. 7, 313. В некоторых вариантах осуществления модифицированное нуклеиновое основание представляет собой замещенный урацил, тимин, аденин, цитозин или гуанин. В некоторых вариантах осуществления модифицированное нуклеиновое основание представляет собой функциональное замещение, например, с точки зрения образования водородной связи и/или образования пары оснований, урацила, тимина, аденина, цитозина или гуанина. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой необязательно замещенный урацил, тимин, аденин, цитозин, 5-метилцитозин или гуанин. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой урацил, тимин, аденин, цитозин, 5-метилцитозин или гуанин.

[00396] В некоторых вариантах осуществления представленный НТТ-олигонуклеотид содержит один или несколько 5-метилцитозинов. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен НТТ-олигонуклеотид, последовательность оснований которого раскрыта в данном документе, например, в таблице 1, где каждый Т может быть независимо заменен на U и наоборот, и каждый цитозин необязательно и независимо заменен на 5-метилцитозин или наоборот. Как понятно специалистам в данной области техники, в некоторых вариантах осуществления 5mC может рассматривать как С с точки зрения последовательности оснований НТТ-олигонуклеотида - такой олигонуклеотид содержит модификацию нуклеинового основания в положении С (например, см. различные олигонуклеотиды, указанные в таблице 1). Как правило, при описании олигонуклеотидов, если не указано иное, нуклеиновые основания, сахара и межнуклеотидные связи являются немодифицированными. Например, в различных олигонуклеотидах в данном документе Aeo, Geo, Teo, m5Ceo являются модифицированными, как указано (модифицированные A, G, Т или С, каждый из которых модифицирован с помощью 2'-МОЕ; и дополнительно 5-метильная модификация в случае m5Ceo); С, Т, G и А представляют собой немодифицированные дезоксирибонуклеозиды, содержащие нуклеиновые основания С, Т, G и А соответственно (например, которые обычно встречаются в природной ДНК, без модификаций сахара или оснований); m означает 2'-ОМе-модификацию (например, mA представляет собой А, модифицированный с помощью 2'-ОМе; mU представляет собой U, модифицированный с помощью 2'-ОМе; и т.д.); и каждая межнуклеотидная связь, если не указано иное, независимо представляет собой природную фосфатную связь (например, природную фосфатную связь между …Aeom5Ceo…); и каждая фосфотиоатная межнуклеотидная связь Sp представлена как * S (или *S); каждая фосфотиоатная межнуклеотидная связь Rp представлена как * R (или *R), a стереомерно неупорядоченная фосфотиоатная межнуклеотидная связь в композициях представлена как *.

[00397] В некоторых вариантах осуществления модифицированное основание представляет собой необязательно замещенный аденин, цигозин, гуанин, тимин или урацил, или их таутомер. В некоторых вариантах осуществления модифицированное нуклеиновое основание представляет собой модифицированный аденин, цитозин, гуанин, тимин или урацил, модифицированные посредством одной или нескольких модификаций, при которых:

(1) нуклеиновое основание модифицировано посредством одной или нескольких необязательно замещенных групп, которые независимо выбраны из ацила, галогена, амино, азида, алкила, алкенила, алкинила, арила, гетероалкила, гетероалкенила, гетероалкинила, гетероциклила, гетероарила, карбоксила, гидроксила, биотина, авидина, стрептавидина, замещенного силила и их комбинаций;

(2) один или несколько атомов нуклеинового основания независимо заменены на отличающийся атом, выбранный из атома углерода, азота и серы;

(3) одна или несколько двойных связей в нуклеиновом основании являются независимо гидрогенизированными; или

(4) одно или несколько арильных или гетероарильных колец независимо встроены в нуклеиновое основание.

[00398] В некоторых вариантах осуществления модифицированное нуклеиновое основание представляет собой модифицированное нуклеиновое основание, известное из уровня техники, например, описанное в WO 2017/210647. В некоторых вариантах осуществления модифицированные нуклеиновые основания представляют собой нуклеиновые основания увеличенного размера, в которые были добавлены одно или несколько арильных и/или гетероарильных колец, таких как фенильные кольца. Определенные примеры модифицированных нуклеиновых оснований, включая замены нуклеиновых оснований, описаны в каталоге Glen Research (Glen Research, Стерлинг, Вирджиния); Krueger AT et al., Ace. Chem. Res., 2007, 40, 141-150; Kool, ET, Асе. Chem. Res., 2002, 35, 936-943; Benner S.A., et al., Nat. Rev. Genet., 2005, 6, 553-543; Romesberg, F.E., et al., Curr. Opin. Chem. Biol., 2003, 7, 723-733; или Hirao, I., Curr. Opin. Chem. Biol., 2006, 10, 622-627. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание увеличенного размера представляет собой нуклеиновое основание увеличенного размера, описанное, например, в WO 2017/210647. В некоторых вариантах осуществления модифицированные нуклеиновые основания представляют собой фрагменты, такие как корриновые или порфириновые кольца. Определенные замены оснований с использованием порфириновых колец описаны, например, в Morales-Rojas, H and Kool, ET, Qrg. Lett., 2002, 4, 4377-4380. В некоторых вариантах осуществления порфириновое кольцо представляет собой порфириновое кольцо, описанное, например, в WO 2017/219647. В некоторых вариантах осуществления модифицированное нуклеиновое основание представляет собой модифицированное нуклеиновое основание, описанное, например, в WO 2017/219647. В некоторых вариантах осуществления модифицированное нуклеиновое основание является флуоресцентным. Примеры таких флуоресцентных модифицированных нуклеиновых оснований включают фенантрен, пирен, стильбен, изоксантин, изозантоптерин, терфенил, тертиофен, бензотертиофен, кумарин, люмазин, связанный стильбен, бензоурацил, нафтоурацил и т.д., а также описанные, например, в WO 2017/210647. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание или модифицированное нуклеиновое основание выбрано из С5-Пронина Т, С5-Пронина С, С5-тиазола, феноксазина, 2-тиотимина, 5-триазолилфенилтимина, диаминопурина и N2-аминопропилгуанина.

[00399] В некоторых вариантах осуществления модифицированное нуклеиновое основание выбрано из 5-замещенных пиримидинов, 6-азапиримидинов, алкил- или алкинилзамещенных пиримидинов, алкилзамещенных пуринов и N-2-, N-6- и O-6-замещенных пуринов. В определенных вариантах осуществления модифицированные нуклеиновые основания выбраны из 2-аминопропиладенина, 5-гидроксиметилцитозина, ксантина, гипоксантина, 2-аминоаденина, 6-N-метилгуанина, 6-N-метиладенина, 2-пропиладенина, 2-тиоурацила, 2-тиотимина и 2-тиоцитозина, 5-пропинил (-С≡С-СН₃) урацила, 5-пропинилцитозина, 6-азоурацила, 6-азоцитозина, 6-азотимина, 5-рибозилурацила (псевдоурацила), 4-тиоурацила, 8-галоген-, 8-амино-, 8-тиол-, 8-тиоалкил-, 8-гидроксил-, 8-аза- и других 8-замещенных пуринов, 5-галоген-, в частности 5-бром-, 5-трифторметил-, 5-галогенурацила и 5-галогенцитозина, 7-метилгуанина, 7-метиладенина, 2-F-аденина, 2-аминоаденина, 7-деазагуанина, 7-деазааденина, 3-деазагуанина, 3-деазааденина, 6-N-бензоиладенина, 2-N-изобутирилгуанина, 4-N-бензоилцитозина, 4-N-бензоилурацила, 5-метил-4-N-бензоилцитозина, 5-метил-4-N-бензоилурацила, универсальных оснований, гидрофобных оснований, неизбирательных оснований, оснований с увеличенным размером и фторированных оснований. В некоторых вариантах осуществления модифицированные нуклеиновые основания представляют собой трициклические пиримидины, такие как 1,3-диазафеноксазин-2-он, 1,3-диазафенотиазин-2-он или 9-(2-аминоэтокси)-1,3-диазафеноксазин-2-он (G-фиксирующее основание). В некоторых вариантах осуществления модифицированные нуклеиновые основания представляют собой основания, в которых пуриновое или пиримидиновое основание заменено на другие гетероциклы, например, 7-деазааденин, 7-дезазагуанозин, 2-аминопиридин или 2-пиридон. В некоторых вариантах осуществления модифицированные нуклеиновые основания представляют собой основания, раскрытые в US 3687808, The Concise Encyclopedia Of Polymer Science And Engineering, Kroschwitz, J.I., Ed., John Wiley & Sons, 1990, 858-859; Engliseh et al., Angewandte Chemie, International Edition, 1991, 30, 613; Sanghvi, Y.S., Chapter 15, Antisense Research and Applications, Crooke, S.T. and Lebleu, В., Eds., CRC Press, 1993, 273-288; или в разделах 6 и 15, Antisense Drug Technology, Crooke S.T., Ed., CRC Press, 2008, 163-166 и 442-443.

[00400] В некоторых вариантах осуществления модифицированные нуклеиновые основания и связанные с ними способы являются такими, как описано в US 20030158403, US 3687808, US 4845205, US 5130302, US 5134066, US 5175273, US 5367066, US 5432272, US 5434257, US 5457187, US 5459255, US 5484908, US 5502177, US 5525711, US 5552540, US 5587469, US 5594 121, US 5596091, US 5614617, US 5645985, US 5681941, US 5750692, US 5763588, US 5830653 или US 6005096.

[00401] В некоторых вариантах осуществления модифицированное нуклеиновое основание является замещенным. В некоторых вариантах осуществления модифицированное нуклеиновое основание является замещенным таким образом, что оно содержит, например, гетероатомы, алкильные группы или связывающие фрагменты, соединенные с флуоресцентными фрагментами, биотиновым или авидиновым фрагментами или другим белком или пептидами. В некоторых вариантах осуществления модифицированное нуклеиновое основание представляет собой "универсальное основание", которое не является нуклеиновым основанием в наиболее классическом смысле, но которое выполняет функции аналогично нуклеиновому основанию. Одним из примеров универсального основания является 3-нитропиррол.

[00402] В некоторых вариантах осуществления нуклеозиды, которые можно использовать в представленных технологиях, содержат модифицированные нуклеиновые основания и/или модифицированные сахара, например, 4-ацетилцитидин; 5-(карбоксигидроксилметил)уридин; 2'-O-метилцитидин; 5-карбоксиметиламинометил-2-тиоуридин; 5-карбоксиметиламинометилуридин; дигидроуридин; 2'-O-метилпсевдоуридин; бета-D-галактозилквеозин; 2'-O-метилгуанозин; N⁶-изопентениладенозин; 1-метиладенозин; 1-метилпсевдоуридин; 1-метилгуанозин; 1-метилинозин; 2,2-диметилгуанозин; 2-метиладенозин; 2-метилгуанозин; N⁷-метилгуанозин; 3-метилцитидин; 5-метилцитидин; 5-гидроксиметилцитидин; 5-формилцитозин; 5-карбоксилцитозин; N⁶-метиладенозин; 7-метилгуанозин; 5-метиламиноэтилуридин; 5-метоксиаминометил-2-тиоуридин; бета-О-маннозилквеозин; 5-метоксикарбонилметилуридин; 5-метоксиуридин; 2-метилтио-N⁶-изопентениладенозин; N-((9-бета-D-рибофуранозил-2-метилтиопурин-6-ил)карбамоил)треонин; N-((9-бета-D-рибофуранозилпурин-6-ил)-N-метилкарбамоил)треонин; сложный метиловый эфир уридин-5-оксиуксусной кислоты; уридин-5-оксиуксусную кислоту (v); псевдоуридин; квеозин; 2-тиоцитидин; 5-метил-2-тиоуридин; 2-тиоуридин; 4-тиоуридин; 5-метилуридин; 2'-O-метил-5-метилуридин; и 2'-O-метилуридин.

[00403] В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание, например модифицированное нуклеиновое основание, содержит один или несколько фрагментов для связывания биомолекул, таких как, например, антитела, фрагменты антител, биотин, авидин, стрептавидин, лиганды рецепторов или хелатирующие фрагменты. В других вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой 5-бромурацил, 5-йодурацил или 2,6-диаминопурин. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание содержит замещение флуоресцентным фрагментом или фрагментом для связывания биомолекул. В некоторых вариантах осуществления заместитель представляет собой флуоресцентный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления заместитель представляет собой биотин или авидин.

[00404] Определенные примеры нуклеиновых оснований и связанных с ними способов описаны в US 3687808, 4845205, US 513030, US 5134066, US 5175273, US 5367066, US 5432272, US 5457187, US 5457191, US 5459255, US 5484908, US 5502177, US 5525711, US 5552540, US 5587469, US 5594121, US 5596091, US 5614617, US 5681941, US 5750692, US 6015886, US 6147200, US 6166197, US 6222025, US 6235887, US 6380368, US 6528640, US 6639062, US 6617438, US 7045610, US 7427672, US или US 7495088.

[00405] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит нуклеиновое основание, сахар, нуклеозид и/или межнуклеотидную связь, которые описаны в любом из Gryaznov, S; Chen, J.-K. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 3143; Hendrix et al. 1997 Chem. Eur. J. 3: 110; Hyrup et al. 1996 Bioorg. Med. Chem. 4: 5; Jepsen et al. 2004 Oligo. 14: 130-146; Jones et al. J. Qrg. Chem. 1993, 58, 2983; Koizumi et al. 2003 Nuc. Acids Res. 12: 3267-3273; Koshkin et al. 1998 Tetrahedron 54: 3607-3630; Kumar et al. 1998 Bioo. Med. Chem. Let. 8: 2219-2222; Lauritsen et al. 2002 Chem. Comm. 5: 530-531; Lauritsen et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 13: 253-256; Mesmaeker et al. Angew. Chem., bit. Ed. Engl. 1994, 33, 226; Morita et al. 2001 Nucl. Acids Res. Supp. 1: 241-242; Morita et al. 2002 Bioo. Med. Chem. Lett. 12: 73-76; Morita et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 2211-2226; Nielsen et al. 1997 Chem. Soc. Rev. 73; Nielsen et al. 1997 J. Chem. Soc. Peri-tins Transl. 1: 3423-3433; Obika et al. 1997 Tetrahedron Lett. 38 (50): 8735-8; Obika et al. 1998 Tetrahedron Lett. 39: 5401-5404; Pallan et al. 2012 Chem. Comm. 48: 8195-8197; Petersen et al. 2003 TRENDS Biotech. 21: 74-81; Rajwanshi et al. 1999 Chem. Commun. 1395-1396; Schultz et al. 1996 Nucleic Acids Res. 24: 2966; Seth et al. 2009 J. Med. Chem. 52: 10-13; Seth et al. 2010 J. Med. Chem. 53: 8309-8318; Seth et al. 2010 J. Org. Chem. 75: 1569-1581; Seth et al. 2012 Bioo. Med. Chem. Lett. 22: 296-299; Seth et al. 2012 Mol. Ther-Nuc. Acids. 1, e47; Seth, Punit P; Siwkowski, Andrew; Allerson, Charles R; Vasquez, Guillermo; Lee, Sam; Prakash, Thazha P; Kinberger, Garth; Migawa, Michael T; Gaus, Hans; Bhat, Balkrishen; et al., из Nucleic Acids Symposium Series (2008), 52(1), 553-554; Singh et al. 1998 Chem. Comm. 1247-1248; Singh et al. 1998 J. Org. Chem. 63: 10035-39; Singh et al. 1998 J. Org. Chem. 63: 6078-6079; Sorensen 2003 Chem. Comm. 2130-2131; Ts'o et al. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1988, 507, 220; Van Aerschot et al. 1995 Angew. Chem. bit. Ed. Engl. 34: 1338; Vasseur et al. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4006; WO 2007090071 или WO 2016/079181; Feldman et al. 2017 J. Am. Chem. Soc. 139: 11427-11433, Feldman et al. 2017 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 114: E6478-E6479, Hwang et al. 2009 Nucl. Acids Res. 37: 4757-4763, Hwang et al. 2008 J. Am. Chem. Soc. 130: 14872-14882, Lavergne et al. 2012 Chem. Eur. J. 18: 1231-1239, Lavergne et al. 2013 J. Am. Chem. Soc. 135: 5408-5419, Ledbetter et al. 2018 J. Am. Chem. Soc. 140: 758-765, Malyshev et al. 2009 J. Am. Chem. Soc. 131: 14620-14621, Seo et al. 2009 Chem. Bio. Chem. 10: 2394-2400, например, d3FB, аналоги d2Py, d2Py, d3MPy, d4MPy, d5MPy, d34DMPy, d35DMPy, d45DMPy, d5FM, d5PrM, d5SICS, dFEMO, dMM02, dNaM, dNM01, dTPT3, нуклеотиды с 2'-азидо, 2'-хлор, 2'-амино или арабинозными сахарами, изокарбостирил-, нафтил- и азаиндолнуклеотиды, а также их модификации и производные, и функционализированные версии, например, в которых сахар содержит 2'-модификацию и/или другую модификацию, и производные dMM02 с метахлорными, -бромными, -йодными, -метильными или -пропинильными заместителями.

[00406] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит нуклеиновое основание или модифицированное нуклеиновое основание, описанные в WO 2018/022473, WO 2018/098264, WO 2018/223056, WO 2018/223073, WO 2018/223081, WO 2018/237194, WO 2019/032607, WO 2019/055951 и/или WO 2019/075357, US 5552540, US 6222025, US 6528640, US 4845205, US 5681941, US 5750692, US 6015886, US 5614617, US 6147200, US 5457187, US 6639062, US 7427672, US 5459255, US 5484908, US 7045610, US 3687808, US 5502177, US 5525711 6235887, US 5175273, US 6617438, US 5594121, US 6380368, US 5367066, US 5587469, US 6166197, US 5432272, US 7495088, US 5134066 или US 5596091, US 2011/0294124, US 2015/0211006, US 2015/0197540, WO 2015/107425, WO 2017/192679, WO 2018/022473, WO 2018/098264, WO 2018/223056, WO 2018/223073, WO 2018/223081, WO 2018/237194, WO 2019/032607, WO 2019/055951 и/или WO 2019/075357, при этом основания и модифицированные нуклеиновые основания из каждого из них независимо включены в данный документ посредством ссылки.

[00407] В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание содержит по меньшей мере одно необязательно замещенное кольцо, которое содержит гетероатом, являющийся атомом кольца. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание содержит по меньшей мере одно необязательно замещенное кольцо, которое содержит атом азота в кольце. В некоторых вариантах осуществления такое кольцо является ароматическим. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание связано с сахаром посредством гетероатома. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание связано с сахаром посредством атома азота. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание связано с сахаром посредством атома азота в кольце.

[00408] В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой необязательно замещенный остаток пуринового основания. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой защищенный остаток пуринового основания. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой необязательно замещенный остаток аденина. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой защищенный остаток аденина. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой необязательно замещенный остаток гуанина. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой защищенный остаток гуанина. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой необязательно замещенный остаток цитозина. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой защищенный остаток цитозина. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой необязательно замещенный остаток тимина. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой защищенный остаток тимина. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой необязательно замещенный остаток урацила. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой защищенный остаток урацила. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой необязательно замещенный остаток 5-метилцитозина. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой защищенный остаток 5-метилцитозина.

[00409] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит BrdU, который представляет собой нуклеозидное звено, где нуклеиновое основание представляет собой BrU (), а сахар представляет собой 2-дезоксирибозу (которая широко встречается в природной ДНК) ().

[00410] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит d2AP, DAP и/или dDAP:

d2AP: нуклеозидное звено, где нуклеиновое основание представляет собой 2-аминопурин (, 2АР), и где сахар представляет собой 2-дезоксирибозу (которая широко встречается в природной ДНК; 2'-дезокси (d)) (, ВА - 2АР);

dDAP: нуклеозидное звено, где нуклеиновое основание представляет собой 2,6-диаминопурин (, DAP), и где сахар представляет собой 2-дезоксирибозу (которая широко встречается в природной ДНК; 2'-дезокси (d)) (, ВА - DAP).

Дополнительные химические фрагменты

[00411] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит один или несколько дополнительных химических фрагментов. Различные дополнительные химические фрагменты, например, нацеливающие фрагменты, углеводные фрагменты, липидные фрагменты и т.д., известны в данной области техники, и их можно использовать в соответствии с настоящим изобретением для модулирования свойств и/или видов активности представленных олигонуклеотидов, например, стабильности, периода полу выведения, видов активности, доставки, фармако динамических свойств, фармакокинетических свойств и т.д. В некоторых вариантах осуществления определенные дополнительные химические фрагменты содействуют доставке олигонуклеотидов к требуемым клеткам, тканям и/или органам, включая без ограничений клетки центральной нервной системы. В некоторых вариантах осуществления определенные дополнительные химические фрагменты содействуют интернализации олигонуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления определенные дополнительные химические фрагменты повышают стабильность олигонуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены технологии для включения различных дополнительных химических фрагментов в олигонуклеотиды.

[00412] По некоторым сообщениям НТТ экспрессируется во всех клетках, при этом самые высокие концентрации обнаруживаются в головном мозге и семенниках, а умеренные количества встречаются в печени, сердце и легких. В различных вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент, конъюгированный с НТТ-олигонуклеотидом, обеспечивает увеличение доставки и/или проникновения в клетки головного мозга, семенников, печени, сердца или легких. По некоторым сообщениям белок или мРНК НТТ обнаруживали в тканях надпочечников, аппендикса, костного мозга, головного мозга, толстой кишки, двенадцатиперстной кишки, эндометрия, пищевода, жировой ткани, желчного пузыря, сердца, почек, печени, легких, лимфатических узлов, яичников, поджелудочной железы, плаценты, предстательной железы, слюнных желез, кожи, тонкого кишечника, селезенки, желудка, семенников, щитовидной железы и мочевого пузыря. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид, содержащий дополнительный химический фрагмент, демонстрирует увеличение доставки и/или активности в ткани по сравнению с эталонным олигонуклеотидом, например, эталонным олигонуклеотидом, который не содержит дополнительный химический фрагмент, но в остальном является идентичным.

[00413] В некоторых вариантах осуществления неограничивающие примеры дополнительных химических фрагментов включают углеводные фрагменты, нацеливающие фрагменты и т.д., которые при включении в олигонуклеотиды могут улучшать одно или несколько свойств. В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент выбран из глюкозы, GluNAc (N-ацетиламиноглюкозамин) и анизамидных фрагментов. В некоторых вариантах осуществления представленный олигонуклеотид может содержать два или более дополнительных химических фрагмента, где дополнительные химические фрагменты являются идентичными или неидентичными, или относятся к одинаковой категории (например, углеводный фрагмент, сахарный фрагмент, нацеливающий фрагмент и т.д.) или к неодинаковой категории.

[00414] В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой нацеливающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой или содержит углеводный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой или содержит липидный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой или содержит фрагменг-лиганд, например, для клеточных рецепторов, таких как сигма-рецептор, асиалогликопротеиновый рецептор и т.д. В некоторых вариантах осуществления фрагмент-лиганд представляет собой или содержит анизамидный фрагмент, который может представлять собой фрагмент-лиганд для сигма-рецептора. В некоторых вариантах осуществления фрагмент-лиганд представляет собой или содержит фрагмент GalNAc, который может представлять собой фрагмент-лиганд для асиалогликопротеинового рецептора.

[00415] В некоторых вариантах осуществления представленный олигонуклеотид может содержать один или несколько линкеров и дополнительных химических фрагментов (например, нацеливающих фрагментов), и/или может характеризоваться контролируемой хиральностью или не характеризоваться контролируемой хиральностью, и/или имеет последовательность оснований и/или одну или несколько модификаций, и/или форматов, как описано в данном документе.

[00416] В соответствии с настоящим изобретением можно использовать различные линкеры, углеводные фрагменты и нацеливающие фрагменты, включая многие известные в данной области техники. В некоторых вариантах осуществления углеводный фрагмент представляет собой нацеливающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления нацеливающий фрагмент представляет собой углеводный фрагмент.

[00417] В некоторых вариантах осуществления представленный олигонуклеотид содержит дополнительный химический фрагмент, применимый для доставки, например, глюкозу, GluNAc (N-ацетиламиноглюкозамин) и анизамид, или структуру, выбранную из

и . В некоторых вариантах осуществления n составляет 1. В некоторых вариантах осуществления n составляет 2. В некоторых вариантах осуществления n составляет 3. В некоторых вариантах осуществления n составляет 4. В некоторых вариантах осуществления n составляет 5. В некоторых вариантах осуществления n составляет 6. В некоторых вариантах осуществления n составляет 7. В некоторых вариантах осуществления n составляет 8.

[00418] В некоторых вариантах осуществления дополнительные химические фрагменты представляют собой любые из фрагментов, описанных в примерах, включая примеры различных дополнительных химических фрагментов, включенных в различные олигонуклеотиды.

[00419] В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент, конъюгированный с олигонуклеотидом, способен нацеливать олигонуклеотид к клетке центральной нервной системы.

[00420] В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент содержит или представляет собой лиганд клеточного рецептора. В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент содержит или представляет собой связывающий белок, например, который связывается с белком клеточной поверхности. Такие фрагменты, среди всего прочего, могут быть применимы для нацеливания олигонуклеотидов к клеткам, экспрессирующим соответствующие рецепторы или белки. В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представленного олигонуклеотида содержит анизамид или его производное или аналог и способен нацеливать олигонуклеотид к клетке, экспрессирующую конкретный рецептор, такой как рецептор сигма-1.

[00421] В некоторых вариантах осуществления представленный олигонуклеотид составлен для введения в клетку и/или ткань организма, которые экспрессируют его мишень. В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент, конъюгированный с олигонуклеотидом, способен нацеливать олигонуклеотид к клетке.

[00422] В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент выбран из необязательно замещенного фенила,

где n' составляет 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, а все остальные переменные являются такими, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой F. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой ОМе. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой ОН. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой NHAc. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой NHCOCF₃. В некоторых вариантах осуществления R' представляет собой Н. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой Н. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой NHAc, и R^5s представляет собой ОН. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой пара-анизоил, и R^5s представляет собой ОН. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой NHAc, и R^5s представляет собой пара-анизоил. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой ОН, и R^5s представляет собой пара-анизоил. В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент выбран из

В некоторых вариантах осуществления n' составляет 1. В некоторых вариантах осуществления n' составляет 0. В некоторых вариантах осуществления n'' составляет 1. В некоторых вариантах осуществления n'' составляет 2.

[00423] В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой или содержит лиганд асиалогликопротеинового рецептора (ASGPR).

[00424] Не вдаваясь в какую-либо конкретную теорию, в настоящем изобретении отмечают, что, как сообщалось, ASGPR1 также экспрессируется в области гиппокампа и/или слое клеток Пуркинье мозжечка мыши. http://mouse.brain-map.org/experiment/show/2048

[00425] Различные другие лиганды ASGPR известны в данной области техники и могут использоваться в соответствии с настоящим изобретением. В некоторых вариантах осуществления лиганд ASGPR представляет собой углевод. В некоторых вариантах осуществления лиганд ASGPR представляет собой GalNac или его производное или аналог. В некоторых вариантах осуществления лиганд ASGPR представляет собой лиганд, описанный в Sanhueza et al. J. Am. Chem. Soc., 2017, 139 (9), pp 3528-3536. В некоторых вариантах осуществления лиганд ASGPR представляет собой лиганд, описанный в Mamidyala et al. J. Am. Chem. Soc., 2012, 134, pp 1978-1981. В некоторых вариантах осуществления лиганд ASGPR представляет собой лиганд, описанный в US 20160207953. В некоторых вариантах осуществления лиганд ASGPR представляет собой замещенное 6,8-диоксабицикло[3.2.1]октан-2,3-диольное производное, раскрытое, например, в US 20160207953. В некоторых вариантах осуществления лиганд ASGPR представляет собой лиганд, описанный, например, в US 20150329555. В некоторых вариантах осуществления лиганд ASGPR представляет собой замещенное 6,8-диоксабицикло[3.2.1]октан-2,3-диольное производное, раскрытое, например, в US 20150329555. В некоторых вариантах осуществления лиганд ASGPR представляет собой лиганд, описанный в US 8877917, US 20160376585, US 10086081 или US 8106022. Лиганды ASGPR, описанные в указанных документах, включены в данный документ посредством ссылки. Специалистам в данной области будет понятно, что в данной области техники известны различные технологии, в том числе описанные в указанных документах, для оценки связывания химического фрагмента с ASGPR, и их можно использовать в соответствии с настоящим изобретением. В некоторых вариантах осуществления представленный олигонуклеотид конъюгирован с лигандом ASGPR. В некоторых вариантах осуществления представленный олигонуклеотид содержит лиганд ASGPR. В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент, содержащий лиганд ASGPR, представляет собой

где каждая переменная независимо является такой, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой -Н. В некоторых вариантах осуществления R' представляет собой -C(O)R.

[00426] В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой или содержит . в некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой или содержит . В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой или содержит . В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой или содержит . в некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой или содержит необязательно замещенный . В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой или содержит . В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой или содержит . В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой или содержит . В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой или содержит .

[00427] В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент содержит один или несколько фрагментов, которые могут связываться, например, с клетками-мишенями. Например, в некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент содержит один или несколько белковых фрагментов-лигандов, например, в некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент содержит несколько фрагментов, каждый из которых независимо представляет собой лиганд ASGPR. В некоторых вариантах осуществления, как в случае Mod 001 и Mod083, дополнительный химический фрагмент содержит три таких лиганда. Mod001:

[00428] В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой группу Mod, описанную в данном документе, например, в таблице 1.

[00429] В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой или содержит:

Mod012 (в качестве неограничивающего примера, при этом -С(O)- присоединяется к -NH-линкера, такого как L001):

Mod039 (в качестве неограничивающего примера, при этом -С(O)- присоединяется к -NH-линкера, такого как L001 или L004):

Mod062 (в качестве неограничивающего примера, с –NH-, соединяющимся с -С(O)- линкера, такого как L008):

Mod085 (в качестве неограничивающего примера, при этом -С(O)- присоединяется к -NH-линкера, такого как L001 или L004):

Mod086 (в качестве неограничивающего примера, при этом -С(O)- присоединяется к -NH- L001 или L004):

Mod094 (в качестве неограничивающего примера, связанный с 5'- или 3'-концом олигонуклеотидной цепи посредством фосфата или фосфотиоата):

[00430] В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой Mod001 В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой Mod083. В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент, например, группа Mod, непосредственно конъюгирован (например, без линкера) с остальной частью олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент конъюгирован через линкер с остальной частью олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления дополнительные химические фрагменты, например, группы Mod, могут быть присоединены непосредственно и/или через линкер к нуклеиновым основаниям, сахарам и/или межнуклеотидным связям олигонуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления группы Mod присоединены либо непосредственно, либо через линкер к сахарам. В некоторых вариантах осуществления группы Mod присоединены либо непосредственно, либо через линкер к 5'-концевым сахарам. В некоторых вариантах осуществления группы Mod присоединены либо непосредственно, либо через линкер к 5'-концевым сахарам через 5'-атом углерода. В качестве примеров см. различные олигонуклеотиды, указанные в таблице 1. В некоторых вариантах осуществления группы Mod присоединены либо непосредственно, либо через линкер к 3'-концевым сахарам. В некоторых вариантах осуществления группы Mod присоединены либо непосредственно, либо через линкер к 3'-концевым сахарам через 3'-атом углерода. В некоторых вариантах осуществления группы Mod присоединены либо непосредственно, либо через линкер к нуклеиновым основаниям. В некоторых вариантах осуществления группы Mod присоединены либо непосредственно, либо через линкер к межнуклеотидным связям. Например, в некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент может быть присоединен с нуклеиновому основанию:

Определенные дополнительные химические фрагменты (например, липидные фрагменты, нацеливающие фрагменты, углеводные фрагменты) и линкеры для присоединения дополнительных химических фрагментов к олигонуклеотидным цепям описаны в WO 2017/062862, WO 2018/067973, WO 2017/160741, WO 2017/192679, WO 2017/210647 или WO 2018/098264, при этом дополнительные химические фрагменты и линкеры из каждого из них независимо включены в данный документ посредством ссылки и могут быть использованы в соответствии с настоящим изобретением. В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой дигоксигенин или биотин или их производное.

[00431] В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент представляет собой фрагмент, описанный в WO 2012/030683. В некоторых вариантах осуществления представленный олигонуклеотид содержит химическую структуру (например, линкер, липид, солюбилизирующую группу и/или нацеливающий лиганд), описанную в WO 2012/030683.

[00432] В некоторых вариантах осуществления представленный олигонуклеотид содержит дополнительный химический фрагмент и/или модификацию (например, модификацию нуклеинового основания, сахара, межнуклеотидной связи и т.д.), описанные в патентах США №№5,688,941; 6,294,664; 6,320,017; 6,576,752; 5,258,506; 5,591,584; 4,958,013; 5,082,830; 5,118,802; 5,138,045; 6,783,931; 5,254,469; 5,414,077; 5,486,603; 5,112,963; 5,599,928; 6,900,297; 5,214,136; 5,109,124; 5,512,439; 4,667,025; 5,525,465; 5,514,785; 5,565,552; 5,541,313; 5,545,730; 4,835,263; 4,876,335; 5,578,717; 5,580,731; 5,451,463; 5,510,475; 4,904,582; 5,082,830; 4,762,779; 4,789,737; 4,824,941; 4,828,979; 5,595,726; 5,214,136; 5,245,022; 5,317,098; 5,371,241; 5,391,723; 4,948,882; 5,218,105; 5,112,963; 5,567,810; 5,574,142; 5,578,718; 5,608,046; 4,587,044; 4,605,735; 5,585,481; 5,292,873; 5,552,538; 5,512,667; 5,597,696; 5,599,923; 7,037,646; 5,587,371; 5,416,203; 5,262,536; 5,272,250; или 8,106,022.

[00433] В некоторых вариантах осуществления дополнительный химический фрагмент, например Mod, присоединен через линкер. Различные линкеры доступны в данной области техники и могут быть использованы в соответствии с настоящим изобретением, например, линкеры, используемые для конъюгирования различных фрагментов с белками (например, с антителами с образованием конъюгатов антитело-лекарственное средство), нуклеиновыми кислотами и т.д. Определенные применимые линкеры описаны в US 9982257, US 20170037399, US 20180216108, US 20180216107, US 9598458, WO 2017/062862, WO 2018/067973, WO 2017/160741, WO 2017/192679, WO 2017/210647, WO 2018/098264, WO 2018/223056 или WO 2018/237194, при этом линкерные фрагменты из каждого из них независимо включены в данный документ посредством ссылки. В некоторых вариантах осуществления в качестве неограничивающих примеров линкер представляет собой L001, L004, L009 или L010. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид содержит линкер, но не содержит дополнительного химического фрагмента, отличного от линкера. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид содержит линкер, но не содержит дополнительного химического фрагмента, отличного от линкера, где линкер представляет собой L001, L004, L009 или L010.

[00434] L003: линкер . В некоторых вариантах осуществления он присоединен к Mod, если таковой присутствует (если Mod отсутствует, то -Н), посредством своей аминогруппы и 5'-концом или 3'-концом олигонуклеотидной цепи, например, через связь (например, фосфатную связь (О или РО) или фосфотиоатную связь (может либо не характеризоваться контролируемой хиральностью, либо характеризоваться контролируемой хиральностью (Sp или Rp))).

[00435] L009: -СН₂СН₂СН₂. В некоторых вариантах осуществления, если L009 присутствует на 5'-конце олигонуклеотид а без Mod, один конец L009 присоединен к -ОН, а другой конец присоединен к 5'-атому углерода олигонуклеотидной цепи, например, через связь (например, фосфатную связь (О или РО) или фосфотиоатную связь (может либо не характеризоваться контролируемой хиральностью, либо характеризоваться контролируемой хиральностью (Sp или Rp))).

[00436] L010: . В некоторых вариантах осуществления, если L010 присутствует на 5'-конце олигонуклеотида без Mod, 5'-атом углерода L010 присоединен к -ОН, а 3'-атом углерода присоединен к 5'-атому углерода олигонуклеотидной цепи, например, через связь (например, фосфатную связь (О или РО) или фосфотиоатную связь (может либо не характеризоваться контролируемой хиральностью, либо характеризоваться контролируемой хиральностью (Sp или Rp))).

[00437] Неограничивающие примеры олигонуклеотидов, например НТТ-олигонуклеотидов, которые содержат дополнительный химический фрагмент, включают WV-10483, WV-10484, WV-10485, WV-10486, WV-10631, WV-10632, WV-10633, WV-10640, WV-10641, WV-10642, WV-10643, WV-10644, WV-11569, WV-11570, WV-11571, HWV-20213.

Олигонуклеотидные мультимеры

[00438] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен мультимеры олигонуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один из мономеров представляет собой представленный олигонуклеотид. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один из мономеров представляет собой НГТ-олигонуклеотид. В некоторых вариантах осуществления мультимер представляет собой мультимер из одинаковых олигонуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления мультимер представляет собой мультимер из различных по структуре олигонуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления мультимер представляет собой мультимер из олигонуклеотидов, последовательности оснований которых не являются одинаковыми. В некоторых вариантах осуществления каждый олигонуклеотид мультимера выполняет свои функции независимо посредством своих собственных путей, например, РНК-интерференции (RNAi), пути, зависимого от РНКазы Н и т.д. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды существуют в олигомерной или полимерной форме, при которой один или несколько олигонуклеотидных фрагментов соединены вместе с помощью линкеров, посредством нуклеиновых оснований, сахаров и/или межнуклеотидных связей олигонуклеотидных фрагментов.

[00439] В некоторых вариантах осуществления мультимер содержит 2 олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления мультимер содержит 3 олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления мультимер содержит 4 олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления мультимер содержит 5 олигонуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления мультимер содержит 2 НТТ-олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления мультимер содержит 3 НТТ-олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления мультимер содержит 4 НТТ-олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления мультимер содержит 5 НТТ-олигонуклеотида.

[00440] В некоторых вариантах осуществления мультимер имеет мультимерную структуру, описанную в WO 2017/062862, WO 2018/067973, WO 2017/160741, WO 2017/192679, WO 2017/210647 или WO 2018/098264, при этом мультимер из каждого из них независимо включен в данный документ посредством ссылки.

Получение олигонуклеотидов и композиций

[00441] Для получения олигонуклеотидов и композиций можно использовать различные способы, и их можно использовать в соответствии с настоящим изобретением. Например, традиционный фосфорамидитный механизм можно использовать для получения стереомерно неупорядоченных олигонуклеотидов и композиций, а определенные реагенты и технологии с контролируемой хиральностью можно использовать для получения композиций на основе олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью, например, как описано в US 9982257, US 20170037399, US 20180216108, US 20180216107, US 9598458, WO 2017/062862, WO 2018/067973, WO 2017/160741, WO 2017/192679, WO 2017/210647, WO 2018/098264, WO 2018/223056 или WO 2018/237194, при этом реагенты и способы из каждого из них включены в данный документ посредством ссылки.

[00442] В некоторых вариантах осуществления получение с контролируемой хиральностью/стереоселективное получение олигонуклеотидов и композиций на их основе включает использование хирального вспомогательного средства, например, в качестве части мономерных фосфорамидитов. Примеры таких хиральных вспомогательных реагентов и фосфорамидитов описаны в US 9982257, US 20170037399, US 20180216108, US 20180216107, US 9598458, WO 2017/062862, WO 2018/067973, WO 2017/160741, WO 2017/192679, WO 2017/210647, WO 2018/098264, WO 2018/223056 или WO 2018/237194, при этом хиральные вспомогательные реагенты и фосфорамидиты из каждого из них независимо включены в данный документ посредством ссылки. В некоторых вариантах осуществления хиральное вспомогательное средство представляет собой (хиральные вспомогательные средства DPSE). В некоторых вариантах осуществления хиральное вспомогательное средство представляет собой В некоторых вариантах осуществления хиральное вспомогательное средство представляет собой В некоторых вариантах осуществления хиральное вспомогательное средство представляет собой (хиральные вспомогательные вещества PSM).

[00443] В некоторых вариантах осуществления технологии получения с контролируемой хиральностью, включая циклы, реагенты и условия для олигонуклеотидного синтеза, описаны в US 9982257, US 20170037399, US 20180216108, US 20180216107, US 9598458, WO 2017/062862, WO 2018/067973, WO 2017/160741, WO 2017/192679, WO 2017/210647 или WO 2018/098264, при этом способы, циклы, реагенты и условия для олигонуклеотидного синтеза из каждого из них независимо включены в данный документ посредством ссылки. В некоторых вариантах осуществления применимый цикл олигонуклеотидного синтеза с использованием хиральных вспомогательных средств DPSE изображен ниже, где каждый из BA₁, ВА₂ и ВА₃ независимо представляет собой BA, R^LP представляет собой -L-R¹, а все другие переменные независимо являются такими, как описано в настоящем изобретении.

[00444] После синтеза представленные олигонуклеотиды и композиции, как правило, дополнительно очищают. Пригодные технологии очистки широко известны и применяются на практике специалистами в данной области техники, включая без ограничений описанные в US 9982257, US 20170037399, US 20180216108, US 20180216107, US 9598458, WO 2017/062862, WO 2018/067973, WO 2017/160741, WO 2017/192679, WO 2017/210647, WO 2018/098264, WO 2018/223056 или WO 2018/237194, при этом технологии очистки из каждого из них независимо включены в данный документ посредством ссылки.

[00445] В некоторых вариантах осуществления цикл включает или состоит из сочетания, кэппирования, модификации и деблокирования. В некоторых вариантах осуществления цикл включает или состоит из сочетания, кэппирования, модификации, кэппирования и деблокирования. Данные стадии, как правило, выполняют в том порядке, в котором они перечислены, но в некоторых вариантах осуществления, как понятно специалистам в данной области техники, порядок определенных стадий, например, кэппирования и модификации, может быть изменен. При необходимости можно повторить одну или несколько стадий для улучшения превращения, выхода и/или чистоты, что специалисты в данной области техники зачастую выполняют при синтезе. Например, в некоторых вариантах осуществления можно повторять сочетание; в некоторых вариантах осуществления можно повторять модифицирование (например, окисление для введения =O, сульфирование для введения =S и т.д.); в некоторых вариантах осуществления сочетание повторяют после модифицирование, что может превращать связь Р(III) в связь P(V), которая может быть более стабильной при определенных обстоятельствах, и за сочетанием обычно следует модифицирование для превращения вновь образованных связей Р(III) в связи P(V). В некоторых вариантах осуществления при повторении стадий могут использоваться другие условия (например, концентрация, температура, реагент, время и т.д.).

[00446] Технологии составления представленных олигонуклеотидов и/или получения фармацевтических композиций, например, для введения субъектам различными путями, легко доступны в данной области техники и могут использоваться в соответствии с настоящим изобретением, например, технологии, описанные в US 9982257, US 20170037399, US 20180216108, US 20180216107, US 9598458, WO 2017/062862, WO 2018/067973, WO 2017/160741, WO 2017/192679, WO 2017/210647, WO 2018/098264, WO 2018/223056 или WO 2018/237194 и цитируемых в них литературных источниках.

Варианты применения в биологических целях

[00447] Как понятно специалистам в данной области техники, олигонуклеотиды применимы для многих целей. В некоторых вариантах осуществления представленные технологии (например, олигонуклеотиды, композиции, способы и т.д.) применимы для снижения уровней и/или видов активности различных транскриптов (например, РНК) и/или кодируемых ими продуктов (например, белков). В некоторых вариантах осуществления представленные технологии обеспечивают снижение уровней и/или видов активности РНК, например РНК-транскриптов НТТ. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды и композиции обеспечивают улучшение нокдауна транскриптов, например, транскриптов НТТ, по сравнению с эталонными условиями, выбранными из группы, состоящей из отсутствия олигонуклеотида или композиции, присутствия эталонного олигонуклеотида или композиции и их комбинаций. Определенные примеры вариантов применения и/или способов применения и получения различных олигонуклеотидов описаны в US 9394333, US 9744183, US 9605019, US 9982257, US 20170037399, US 20180216108, US 20180216107, US 9598458, WO 2017/062862, WO 2018/067973, WO 2017/160741, WO 2017/192679, WO 2017/210647, WO 2018/098264, WO 2018/223056 или WO 2018/237194.

[00448] Например, в некоторых вариантах осуществления представленный олигонуклеотид представляет собой НТТ-олигонуклеотид, способный опосредовать снижение экспрессии, активности и/или уровня генного продукта НТТ. Улучшение, опосредованное НТТ-олигонуклеотидом, может представлять собой улучшение любых требуемых биологических функций, включая без ограничений лечение и/или предупреждение нарушения, связанного с НТТ, или его симптома.

[00449] В некоторых вариантах осуществления представленное соединение, например олигонуклеотид, и/или композиции на его основе, могут модулировать активность и/или функции гена-мишени. В некоторых вариантах осуществления ген-мишень представляет собой ген, у которого предполагается изменить экспрессию и/или активность одного или нескольких генных продуктов (например, РНК и/или белковых продуктов). Во многих вариантах осуществления предполагается ингибирование гена-мишени. Таким образом, если олигонуклеотид, описанный в данном документе, действует на конкретный ген-мишень, присутствие и/или активность одного или нескольких генных продуктов такого гена изменяется, когда олигонуклеотид присутствует по сравнению с его отсутствием. В некоторых вариантах осуществления ген-мишень представляет собой НТТ.

[00450] В некоторых вариантах осуществления последовательность-мишень представляет собой последовательность гена или его транскрипта, с которой гибридизуется олигонуклеотид. В некоторых вариантах осуществления последовательность-мишень является полностью комплементарной или по сути комплементарной последовательности олигонуклеотида или последовательным остаткам в нем (например, олигонуклеотид включает последовательность, связывающую мишень, которая является точной комплементарной последовательностью для последовательности-мишени). В некоторых вариантах осуществления допускается небольшое число различий/ошибочных оснований между (соответствующей частью) олигонуклеотида и его последовательностью-мишенью. Во многих вариантах осуществления последовательность-мишень присутствует в пределах гена-мишени. Во многих вариантах осуществления последовательность-мишень присутствует в пределах транскрипта (например, мРНК и/или пре-мРНК), полученного из гена-мишени. В некоторых вариантах осуществления последовательность-мишень представляет собой последовательность-мишень НТТ, которая представляет собой последовательность гена НТТ или его транскрипта, с которыми гибридизуется НТТ-олигонуклеотид.

[00451] В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды и композиции применимы для лечения различных состояний, нарушений или заболеваний путем снижения уровней и/или видов активности транскриптов и/или продуктов, кодируемых ими, которые ассоциированы с состояниями, нарушениями или заболеваниями. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены способы предупреждения или лечения состояния, нарушения или заболевания, включающие введение субъекту, подверженному или страдающему от состояния, нарушения или заболевания, представленного олигонуклеотида или композиции на его основе. В некоторых вариантах осуществления представленный олигонуклеотид или олигонуклеотиды в представленной композиции имеют последовательность оснований, которая представляет собой часть транскрипта или комплементарна ей, при этом данный транскрипт ассоциирован с состоянием, нарушением или заболеванием. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований является таковой, что она селективно связывается с транскриптом, например транскриптом НТТ, ассоциированным с состоянием, нарушением или заболеванием, в большей степени, чем с другими транскриптами, которые не ассоциированы с тем же состоянием, нарушением или заболеванием. В некоторых вариантах осуществления состояние, нарушение или заболевание ассоциированы с НТТ.

[00452] В некоторых вариантах осуществления в способе лечения заболевания путем введения композиции, содержащей совокупность олигонуклеотидов, характеризующихся общей последовательностью оснований, при этом данная последовательность оснований является комплементарной последовательности-мишени в транскрипте-мишени, в настоящем изобретении представлено улучшение, которое предусматривает введение в качестве композиции на основе олигонуклеотида композиции на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, как описано в настоящем изобретение, характеризующейся тем, что, когда она контактирует с транскриптом-мишенью в системе нокдауна, нокдаун транскрипта улучшается по сравнению с тем, который наблюдается при эталонных условиях, которые выбраны из группы, включающей отсутствие композиции, присутствие эталонной композиции и их комбинации. В некоторых вариантах осуществления эталонная композиция представляет собой рацемический препарат на основе олигонуклеотидов с одинаковой последовательностью или составом. В некоторых вариантах осуществления транскрипт-мишень представляет собой транскрипт НТТ.

[00453] В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды могут связываться с транскриптом и обеспечивать улучшение нокдауна транскрипта (например, РНК НТТ). В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотиды обеспечивают улучшение нокдауна, например нокдауна НТТ, с эффективностью, превышающей таковую у сопоставимого олигонуклеотида при одном или нескольких подходящих условиях.

[00454] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, или композиция на его основе способны опосредовать снижение экспрессии или уровня гена-мишени, например НТТ, или его генного продукта при концентрации олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, составляющей 1 нМ или меньше в клетке in vitro. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, или композиция на его основе способны опосредовать снижение экспрессии или уровня гена-мишени, например НТТ, или его генного продукта при концентрации олигонуклеотида, например ТТТТ-олигонуклеотида, составляющей 5 нМ или меньше в клетке in vitro. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, или композиция на его основе способны опосредовать снижение экспрессии или уровня гена-мишени, например НТТ, или его генного продукта при концентрации олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, составляющей 10 нМ или меньше в клетке in vitro.

[00455] В некоторых вариантах осуществления активность представленного олигонуклеотида или композиции на основе олигонуклеотида можно оценить с помощью IC50, которая представляет собой ингибирующую концентрацию, требуемую для снижения экспрессии или уровня гена-мишени или его генного продукта на 50% в подходящих условиях, например, в клеточных анализах in vitro. В некоторых вариантах осуществления IC50 представленных олигонуклеотидов составляет не более 0,001, 0,01, 0,1, 0,5, 1, 2, 5, 10, 50, 100, 200, 500 или 1000 нМ. В некоторых вариантах осуществления IC50 олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, составляет не более приблизительно 10 нМ в клетке(-ах) in vitro. В некоторых вариантах осуществления IC50 олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, составляет не более приблизительно 5 нМ в клетке(-ах) in vitro. В некоторых вариантах осуществления IC50 олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, составляет не более приблизительно 2 нМ в клетке(-ах) in vitro. В некоторых вариантах осуществления IC50 олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, составляет не более приблизительно 1 нМ в клетке(-ах) in vitro. В некоторых вариантах осуществления IC50 олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, составляет не более приблизительно 0,5 нМ в клетке(-ах) in vitro. В некоторых вариантах осуществления IC50 олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, составляет не более приблизительно 0,1 нМ в клетке(-ах) in vitro. В некоторых вариантах осуществления IC50 олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, составляет не более приблизительно 0,01 нМ в клетке(-ах) in vitro. В некоторых вариантах осуществления IC50 олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, составляет не более приблизительно 0,001 нМ в клетке(-ах) in vitro.

[00456] В некоторых вариантах осуществления паттерн стереохимии представленного НТТ-олигонуклеотида предусматривает паттерн стереохимии, описанный в данном документе, или любую его часть. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид содержит паттерн стереохимии, описанный в данном документе, и он способен управлять нокдауном, опосредованным РНКазой Н. В некоторых вариантах осуществления представленный НТТ-олигонуклеотид содержит паттерн стереохимии, описанный в данном документе, и он способен управлять нокдауном НТТ, опосредованным РНКазой Н.

[00457] В некоторых вариантах осуществления представленный НТТ-олигонуклеотид содержит модификацию или паттерн модификаций, описанные в данном документе. В некоторых вариантах осуществления представленный НТТ-олигонуклеотид содержит паттерн модификаций, описанный в данном документе, и он способен управлять нокдауном НТТ, опосредованным РНКазой Н. В некоторых вариантах осуществления модификация или паттерн модификаций представляет собой модификацию или паттерн модификаций из модификаций сахаров, например, модификаций по положению 2' Сахаров (например, 2'-F, 2'-ОМе, 2'-МОЕ и т.д.).

Нацеливание на ассоциированный с болезнью Хантингтона аллель путем нацеливания на ассоциированный SNP

[00458] Среди всего прочего олигонуклеотиды по настоящему изобретению могут обеспечивать высокую специфичность. Например, в некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, нацеливающийся на НТТ, способен опосредовать аллель-специфический нокдаун, где мутантный, ассоциированный с HD аллель НТТ (или его генный продукт) подвергается нокдауну в большей степени, чем аллель, который не ассоциирован с HD или ассоциирован в меньшей степени, например, аллель дикого типа. В некоторых вариантах осуществления ассоциированный с HD аллель содержит экспансию CAG-повторов. В некоторых вариантах осуществления аллель-специфический нокдаун достигается за счет НТТ-олигонуклеотида, который не нацеливается на область CAG аллеля НТТ, ассоциированного с заболеванием, а на другой генетический локус в том же генетическом материале. Как продемонстрировано в данном документе, можно сконструировать средство терапии на основе нуклеиновой кислоты, которое нацеливается на транскрипт, например мРНК, с мутацией, но не нацеливается непосредственно на сайт мутации. Вместо этого средство терапии на основе нуклеиновой кислоты может нацеливаться на другой генетический локус, такой как однонуклеотидный полиморфизм (SNP), который находится в том же транскрипте, например мРНК, что и мутация (например, экспансия CAG-повторов в НТТ).

[00459] В некоторых вариантах осуществления для лечения аутосомно-доминантного заболевания, такого как болезнь Хантингтона (HD), при котором одной мутантной копии гена достаточно, чтобы вызвать заболевание, предпочтительным является селективное нацеливание на транскрипты, например мРНК, соответствующие аллелю, вызывающему заболевание. В некоторых вариантах осуществления стратегия для достижения данной цели включает использование олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, способного нацеливаться на SNP, например SNP НТТ, где один вариант SNP ассоциирован с вызывающей заболевание мутацией с высокой частотой.

[00460] В некоторых вариантах осуществления SNP представляет собой вариацию в одном нуклеотиде, которая встречается в специфическом положении в геноме, где каждая вариация присутствует в некоторой поддающейся оценке степени в популяции (например, >1%). В некоторых вариантах осуществления используемые в данном документе термины "однонуклеотидный полиморфизм" и "SNP" относятся к однонуклеотидной вариации в геномах индивидуумов одного и того же вида. Например, в специфическом положении основания в геноме человека у большинства индивидуумов может встречаться основание С, но у поддающегося оценке меньшинства индивидуумов это положение занимает основание А. Считается, что в этом специфическом положении основания присутствует SNP, а две возможные вариации нуклеотидов - С или А - являются аллелями (или вариантами, или изоформами) для данного положения основания. В некоторых вариантах осуществления присутствуют только два разных аллеля. В некоторых вариантах осуществления SNP является триаллельным, при этом в популяции могут сосуществовать три различных вариации основания. Hodgkinson et al. 2009 Genetics 1. doi:10.4172/2157-7145.1000107. В некоторых вариантах осуществления SNP может представлять собой однонуклеотидную делецию или вставку. В целом, SNP могут относительно часто встречаться в геномах и вносить вклад в генетическое разнообразие. В некоторых вариантах осуществления местоположение SNP фланкируется высококонсервативными последовательностями. В некоторых вариантах осуществления индивидуум может быть гомозиготным или гетерозиготным по аллелю в каждом сайте SNP. Гетерозиготный аллель SNP может представлять собой дифференцирующий полиморфизм. Как продемонстрировано в данном документе на SNP можно нацеливаться с помощью олигонуклеотида, необязательно с селективностью.

[00461] Большие коллекции подтвержденных и аннотированных SNP являются общедоступными (например, Консорциум SNP (The SNP Consortium), Национальный центр биотехнологической информации, Лаборатория Колд Спринг Харбор) [Sachidanandam et al. 2001 Nature 409: 928-933; The 1000 Genomes Project Consortium 2010 Nature 467: 1061-73 и Corrigendum; Kay et al. 2015 Mol. Ther. 23: 1759-1771].

[00462] По некоторым сообщениям многие SNP в гене НТТ (например, SNP НТТ) ассоциированы с хромосомами, характерными для заболевания, и связаны сильными ассоциациями сцепления с вредной, ассоциированной с HD экспансией CAG. Многие SNP, в высокой степени ассоциированные с экспансией CAG, не сегрегируют независимо и находятся в неравновесном сцеплении друг с другом. Среди всего прочего в настоящем изобретении признается, что сильная ассоциация между специфическими SNP НТТ и хромосомами с экспансией CAG-повторов, обеспечивает перспективную терапевтическую возможность для лечения болезни Хантингтона, например, посредством антисмысловой терапии. Более того, ассоциация специфических SNP в комбинации с высокими показателями гетерозиготности у пациентов с HD обеспечивает подходящие мишени для аллель-специфического нокдауна продукта мутантного гена.

[00463] В некоторых вариантах осуществления один вариант SNP НТТ может быть более часто ассоциирован (например, находиться на одной хромосоме или в фазе) с вредной экспансией С AG. В некоторых вариантах осуществления вариант SNP также обозначается как изоформа SNP. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на вариант SNP, который находится в одной гаметической фазе (например, на том же аллеле или на той же хромосоме), что и вредная экспансия CAG, и НТТ-олигонуклеотид способен опосредовать аллель-специфическое подавление (или супрессию), при этом уровень, экспрессия и/или активность мутантного аллеля НТТ (предусматривающую экспрессию CAG) предпочтительно снижаются относительно уровня, экспрессии и/или активности аллеля НТТ дикого типа (который не содержит экспансию CAG).

[00464] В некоторых вариантах осуществления перед лечением субъекта с помощью НТТ-олигонуклеотида, который нацеливается на конкретный вариант конкретного SNP и который способен опосредовать аллель-специфический нокдаун мутантного НТТ, выполняют генетический анализ субъекта для определения варианта целевого SNP, находящегося на той же хромосоме, что и вредная экспансия CAG. В некоторых вариантах осуществления обширная категория способов определения того, находится ли конкретная изоформа SNP на той же хромосоме (например, в том же аллеле или в той же гаметической фазе) с экспансией CAG, называется фазированием. В данном и в следующем разделах описаны различные способы фазирования.

[00465] В заданном генном локусе на паре аутосомных хромосом диплоидный организм (например, человек) наследует один аллель гена от матери и другой аллель гена от отца. В гетерозиготном генном локусе два родителя вносят разные аллели (например, один А и один а). Без дополнительной обработки может быть невозможно определить, какой из родителей внес какой аллель. Такие генотипические данные, которые не соотносятся с конкретным родителем, называют данными генотипа без определения гаметической фазы. Как правило, первоначальные данные генотипа, полученные с помощью чипов для генотипирования, часто находятся в форме без определения гаметической фазы.

[00466] Многие процедуры секвенирования могут выявить, что у индивидуума присутствует вариабельность последовательности в конкретных положениях. Например, в одном положении (например, SNP) у индивидуума в одной копии гена может находиться С, а в другой G. В отдельном положении (например, другом SNP) у индивидуума в одной копии может находиться А, а в другой U. Поскольку многие методики секвенирования включают фрагментацию матрицы нуклеиновой кислоты, в зависимости от используемой методики секвенирования может оказаться невозможным определить, например, находятся ли С и А или С и U на одной и той же хромосоме. Информация по фазированию будет предоставлять информацию о расположении разных аллелей на разных хромосомах.

[00467] Как отметили Laver et al., фазирование также является важным для фармакогенетики, HLA-типирования трансплантата и картирования ассоциаций с заболеваниями. Laver et al. 2016 Nature Scientific Reports 6: 21746 DOI: 10.1038/srep21746. Фазирование аллельных вариантов является важным для клинической интерпретации генома, генетического анализа популяции и функционального геномного анализа аллельной активности. Фазирование редких вариантов и вариантов de novo имеет решающее значение для идентификации предполагаемых причинных вариантов при использовании в клинической генетике, например, путем различения сложных гетерозигот от двух вариантов на одном и том же аллеле.

[00468] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на часть транскрипта НТТ, например мРНК, содержащую положение SNP. В данной области техники известны многие SNP НТТ.

[00469] В некоторых вариантах осуществления способа лечения болезни Хантингтона пациент поражен болезнью Хантингтона, характеризующейся экспансией CAG-повторов в одном аллеле гена НТТ, и пациенту вводят терапевтически эффективное количество НТТ-олигонуклеотида, где НТТ нацеливается на SNP НТТ (например, часть мРНК НТТ, содержащую положение SNP), где SNP находится на той же хромосоме (например, в одной гаметической фазе) с экспансией CAG-повторов.

[00470] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид содержит последовательность, которая комплементарна аллелю SNP, ассоциированному с состоянием, нарушением или заболеванием. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на сайт НТТ, который выбран из любого из следующих SNP: rs362267, rs362268, rs362272, rs362273, rs362275, rs362302, rs362303, rs362304, rs362305, rs362306, rs362307, rs362308, rs362331, rs362336, rs363075, rs363088, rs363125, rs1065746, rs1557210, rs2024115, rs2298969, rs2530595, rs3025805, rs3025806, rs4690072, rs4690074, rs6844859, rs7685686, rs17781557 и rs35892913.

[00471] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на сайт НТТ, который выбран из любого из следующих SNP: rs362267, rs362268, rs362272, rs362273, rs362275, rs362302, rs362303, rs362304, rs362305, rs362306, rs362307, rs362308, rs362331, rs362336, rs363075, rs363088, rs363125, rs1065746, rs1557210, rs2024115, rs2298969, rs3025805, rs3025806, rs4690072, rs4690074, rs6844859, rs7685686, rs113407847, rs17781557 и rs35892913.

[00472] В некоторых вариантах осуществления целевой SNP представляет собой rs362268, rs362306, rs362307, rs362331, rs2530595 или rs7685686. В некоторых вариантах осуществления целевой SNP представляет собой rs362307, rs7685686, rs362268 или rs362306. В некоторых вариантах осуществления целевой SNP представляет собой rs362307. В некоторых вариантах осуществления целевой SNP представляет собой rs7685686. В некоторых вариантах осуществления целевой SNP не является rs7685686. В некоторых вариантах осуществления целевой SNP представляет собой rs362268.

[00473] В некоторых вариантах осуществления целевой SNP НТТ представляет собой: rs362268, rs362272, rs362273, rs362306, rs362307, rs362331, rs363099, rs2530595, rs2830088, rs7685686 или rs1 13407847, или любой SNP НТТ, раскрытый в данном документе.

[00474] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на сайт НТТ, который выбран из любого из следующих SNP (где один вариант SNP указан после номера SNP): rs10015979_G, rs1006798_A, rs10488840_G, rs108850_C, rs11731237_T, rs1263309_T, rs16843804_C, rs2024115_A, rs2285086_A, rs2298967_T, rs2298969_A, ra2798235_G, rs2798296_G, rs2857936_C, rs3095074_G, rs3121417_G, rs3121419_C, rs3129322_T, rs34315806_C, rs362271_G, rs362272_G, rs362273_A, rs362275_C, rs362296_C, rs362303_C, rs362306_G, rs362307_T, rs362310_C, rs362331_T, rs363064_C, rs363072_A, rs363080_C, rs363088_A, rs363092_C, rs363096_T, rs363099_C, rs363125_C, rs3775061_A, rs3856973_G, rs4690072_T, rs4690073_G, rs6446723_T, rs6844859_T, rs762855_A, rs7659144_C, rs7685686_A, rs7691627_G, rs7694687_C, rs916171_С, и rs9993542_С. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид содержит последовательность оснований, комплементарную rs10015979_G, rs1006798_A, rs10488840_G, rs108850_C, rs11731237_T, rs1263309_T, rs16843804_C, rs2024115_A, rs2285086_A, rs2298967_T, rs2298969_A, rs2798235_G, rs2798296_G, rs2857936_C, rs3095074_G, rs3121417_G, rs3121419_C, rs3129322_T, rs34315806_C, rs362271_G, rs362272_G, rs362273_A, rs362275_C, rs362296_C, rs362303_C, rs362306_G, rs362307_T rs362310_C, rs362331_T, rs363064_C, rs363072_A, rs363080_C, rs363088_A, rs363092_C, rs363096_T, rs363099_C, rs363125_C, rs3775061_A, rs3856973_G, rs4690072_T, rs4690073_G, rs6446723_T, rs6844859_T, rs762855_A, rs7659144_C, rs7685686_A, rs7691627_G, rs7694687_C, rs916171_C, или rs89993542_С.

[00475] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на сайт НТТ, который выбран из любого из следующих SNP (где один вариант SNP указан после номера SNP): rs16843804_C, rs2276881_G, rs2285086_A rs2298967_T, rs2298969_A, rs2530595_C, rs2530595_T, rs3025838_C, rs3025849_A, rs3121419_C, rs34315806_C, rs362271_G, rs362273_A, rs362303_C, rs362306_G, rs362310_C, rs362322_A, rs362331_T, rs363064_C, rs363075_G, rs363081_G, rs363088_A, rs363099_C, rs3856973_G, rs4690072_T, rs6844859_T, и rs7685686_A.

[00476] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на сайт НТТ, который выбран из любого из следующих SNP (где один вариант SNP указан после номера SNP): rs16843804_C, rs2276881_G, rs2285086_A rs2298967_T, rs2298969_A, rs3025838_C, rs3025849_A, rs3121419_C, rs34315806_C, rs362271_G, rs362273_A, rs362303_C, rs362306_G, rs362310_C, rs362322_A, rs362331_T, rs363064_C, rs363075_G, rs363081_G, rs363088_A, rs363099_C, rs3856973_G, rs4690072_T, rs6844859_T, и rs7685686_A.

[00477] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на сайт НТТ, который выбран из любого из следующих SNP (где один вариант SNP указан после номера SNP): rs10015979_G, rs11731237_Т, rs2024115_A, rs2285086_A, rs2298969_A, ra362272_G, rs362331_T, rs363092_C, rs363096_T, rs3856973_G, rs4690072_T, rs4690073_G, rs6446723_T, rs6844859_T, rs7685686_A, rs7691627_G, и rs916171_C.

[00478] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на сайт НТТ, который выбран из любого из следующих SNP: rs362307, rs362331, rs1936032, rs363075, rs35892913, rs1143646, rs3025837, rs362273, rs2276881, rs362272, rs363099, rs3025843, rs34315806, rs363125, rs363096, rs113407847, и rs2857790. В некоторых вариантах осуществления SNP НТТ содержит аллель, ассоциированный с заболеванием (вариант, который чаще находится в одной гаметической фазе с экспансией С AG), и аллель, не ассоциированный с заболеванием (например, вариант, который чаще находится не в одной гаметической фазе с экспансией CAG).

[00479] В некоторых вариантах осуществления сайт-мишень SNP хантингтина выбран из следующих.

[00480] Сообщалось, что по меньшей мере на один из SNP сложно нацеливаться с помощью олигонуклеотида для снижения экспрессии, уровня и/или активности НТТ или его продукта, особенно с селективностью по мутантному НТТ. Среди всего прочего в настоящем изобретении представлены технологии, например, олигонуклеотиды, композиции, способы и т.д., для нацеливания на такие сложные SNP (и другие) для снижения экспрессии, уровня и/или активности НТТ или его продукта, во многих случаях селективного нацеливания на мутантный НТТ или его продукт.

[00481] В некоторых вариантах осуществления целевой SNP НТТ представляет собой rs362268.

[00482] В некоторых вариантах осуществления транскрипт muHTT, например мРНК, содержащий SNP rs362268, имеет последовательность (5'-3') UGC AGG CUG GCU GUU GGC СС (где SNP отмечен как жирный подчеркнутый текст), и где соответствующая часть аллеля дикого типа имеет последовательность UGC AGG CUG GGU GUU GGC СС, и где НТТ-олигонуклеотид, нацеливающийся на SNP, имеет последовательность оснований, содержащую последовательность GGGCCAACAGCCAGCCTGCA (где основание, способное к образованию пары оснований с SNP, отмечено как жирный подчеркнутый текст) или участок последовательности, который имеет по меньшей мере 8 оснований в длину и содержит основание, способное к образованию пары оснований с SNP.

[00483] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362268 НТТ и имеет последовательность оснований, содержащую SNP (или последовательность, комплементарную последовательности оснований, содержащей SNP) или имеет последовательность оснований, содержащую основание дикого типа, соответствующее SNP (или последовательность, комплементарную ей). В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362268 НТТ и представляет собой: WV-949, WV-960, WV-961, WV-962, WV-963, WV-964, WV-965, WV-1031, WV-1032, WV-1033, WV-1034, WV-1035, WV-1036, WV-1037, WV-1038, WV-1039, WV-1040, WV-1041, WV-1042, WV-1043, WV-1044, WV-1045, WV-1046, WV-1047, WV-1048, WV-1049, WV-1050, WV-1051, WV-1052, WV-1053, WV-1054, WV-1055, WV-1056, WV-1057, WV-1058, WV-1059, или WV-1060. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из любого из данных олигонуклеотидов и содержит SNP. Последовательности, данные и другая информация, связанная с различными НТТ-олигонуклеотидами для данного SNP, представлены в данном документе и в WO 2017015555 и WO 2017/192664.

[00484] Неограничивающие примеры НТТ-олигонуклеотидов, которые нацеливаются на rs362268, включают следующие: WV-1031, WV-1032, WV-1033, WV-1034, WV-1035, WV-1036, WV-1037, WV-1038, WV-1039, WV-1040, WV-1041, WV-1042, WV-1043, WV-1044, WV-1045, WV-1046, WV-1047, WV-1048, WV-1049, WV-1050, WV-1051, WV-1052, WV-1053, WV-1054, WV-1055, WV-1056, WV-1057, WV-1058, WV-1059, WV-1060, WV-960, WV-961, WV-962, WV-963, WV-964, и WV-965. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из любого из данных олигонуклеотидов и содержит SNP.

[00485] Олигонуклеотид, имеющий последовательность фрагмента мРНК, содержащего изоформу дикого типа данного SNP, представляет собой WV-958; олигонуклеотид, имеющий последовательность фрагмента мРНК, содержащего мутантную изоформу данного SNP, представляет собой WV-959.

[00486] В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида представляет собой, включает или содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из GGGCCAACAGCCAGCCTGCA, где каждый U может быть независимо заменен на Т, и/или каждый Т может быть независимо заменен на U. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида представляет собой, включает или содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из GGGCCAACACCCAGCCTGCA, где каждый U может быть независимо заменен на Т, и/или каждый Т может быть независимо заменен на U.

[00487] В некоторых вариантах осуществления целевой SNP НТТ представляет собой rs362272.

[00488] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362272 НТТ и имеет последовательность оснований, содержащую SNP (или последовательность, комплементарную последовательности оснований, содержащей SNP) или имеет последовательность оснований, содержащую основание дикого типа, соответствующее SNP (или последовательность, комплементарную ей). В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362272 НТТ и представляет собой: WV-10989, WV-10990, WV-10991, WV-10992, WV-10993, WV-10994, WV-10995, WV-10996, WV-10997, WV-10998, WV-10999, WV-11000, WV-11001, WV-11002, WV-11003, WV-11004, WV-11005, WV-11006, WV-11007, WV-11008, WV-11009, WV-11010, WV-11011, WV-11012, WV-11013, WV-11014, WV-11015, WV-11016, WV-11017, WV-11018, WV-11019, WV-11020, WV-11021, WV-11022, WV-11023, WV-11024, WV-11025, WV-11026, WV-11027, WV-11028, WV-11029, WV-11030, WV-11031, WV-11032, WV-11033, WV-11034, WV-11035, WV-11036, WV-11037, WV-11038, WV-13411, WV-13412, WV-13413, WV-13414, WV-13415, WV-13416, WV-13417, WV-13418, WV-13419, WV-13420, WV-13421, WV-13422, WV-13423, WV-13424, WV-13425, WV-13426, WV-13427, WV-13428, WV-13429, WV-13430, WV-13431, WV-13432, WV-13433, WV-13434, WV-13435, WV-13436, WV-13437, или WV-13438. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из любого из данных олигонуклеотидов и содержит SNP.

[00489] В некоторых вариантах осуществления целевой SNP НТТ представляет собой rs362273.

[00490] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362273 НТТ и имеет последовательность оснований, содержащую SNP (или последовательность, комплементарную последовательности оснований, содержащей SNP) или имеет последовательность оснований, содержащую основание дикого типа, соответствующее SNP (или последовательность, комплементарную ей). В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362273 НТТ и представляет собой: WV-10939, WV-10940, WV-10941, WV-10942, WV-10943, WV-10944, WV-10945, WV-10946, WV-10947, WV-10948, WV-10949, WV-10950, WV-10951, WV-10952, WV-10953, WV-10954, WV-10955, WV-10956, WV-10957, WV-10958, WV-10959, WV-10960, WV-10961, WV-10962, WV-10963, WV-10964, WV-10965, WV-10966, WV-10967, WV-10968, WV-10969, WV-10970, WV-10971, WV-10972, WV-10973, WV-10974, WV-10975, WV-10976, WV-10977, WV-10978, WV-10979, WV-10980, WV-10981, WV-10982, WV-10983, WV-10984, WV-10985, WV-10986, WV-10987, WV-10988, WV-12258, WV-12259, WV-12260, WV-12261, WV-12262, WV-12263, WV-12264, WV-12265, WV-12266, WV-12267, WV-12268, WV-12269, WV-12270, WV-12271, WV-12272, WV-12273, WV-12274, WV-12275, WV-12276, WV-12277, WV-12278, WV-12279, WV-12280, WV-12281, WV-12282, WV-12283, WV-12284, WV-12285, WV-12286, WV-12287, WV-12425, WV-12426, WV-12427, WV-12428, WV-12429, WV-12430, WV-12431, WV-12432, WV-12433, WV-12434, WV-12435, WV-12436, WV-12437, WV-12438, WV-14059, WV-14060, WV-14061, WV-14062, WV-14063, WV-14064, WV-14065, WV-14066, WV-14067, WV-14068, WV-14069, WV-14070, WV-14071, WV-14072, WV-14073, WV-14074, WV-14075, WV-14076, WV-14077, WV-14078, WV-14079, WV-14080, WV-14081, WV-14082, WV-14083, WV-14084, WV-14085, WV-14086, WV-14092, WV-14093, WV-14094, WV-14095, WV-14096, WV-14097, WV-14098, WV-14099, WV-14100, WV-14101, WV-14712, WV-14713, WV-14759, WV-14914, WV-14915, WV-15077, WV-15078, WV-15079, WV-15080, WV-16214, WV-16215, WV-16216, WV-16217, WV-16218, WV-17776, WV-17777, WV-17778, WV-17779, WV-17780, WV-17781, WV-17782, WV-17783, WV-17784, WV-17785, WV-17786, WV-17787, WV-17788, WV-17789, WV-17790, WV-17791, WV-17792, WV-17793, WV-17794, WV-17795, WV-17796, WV-17797, WV-17798, WV-17799, WV-17800, WV-19819, WV-19820, WV-19821, WV-19822, WV-19823, WV-19824, WV-19825, WV-19826, WV-19827, WV-19828, WV-19829, WV-19830, WV-19831, WV-19832, WV-19833, WV-19834, WV-19835, WV-19836, WV-19837, WV-19838, WV-19839, WV-19840, WV-19841, WV-19842, WV-19843, WV-19844, WV-19845, WV-19846, WV-19847, WV-19848, WV-19849, WV-19850, WV-19851, WV-19852, WV-19853, WV-19854, или WV-19855. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из любого из данных олигонуклеотидов и содержит SNP.

[00491] В некоторых вариантах осуществления целевой SNP НТТ представляет собой rs362306.

[00492] В некоторых вариантах осуществления транскрипт muHTT, например мРНК, содержащий SNP rs362306, содержит последовательность (5'-3') UUG CCA GGU UGC AGC UGC UC (где SNP отмечен как жирный подчеркнутый текст), и где соответствующая часть аллеля дикого типа имеет последовательность UUG CCA GGU UAC AGC UGC UC, и где НТТ-олигонуклеотид, нацеливающийся на SNP, имеет последовательность оснований, содержащую последовательность GAGCAGCTGCAACCTGGCAA (где основание, способное к образованию пары оснований с SNP, отмечено как жирный подчеркнутый текст) или участок последовательности, который имеет по меньшей мере 8 оснований в длину и содержит основание, способное к образованию пары оснований с SNP.

[00493] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид, например, который нацеливается на мутантный (mu) аллель данного SNP, представляет собой WV-951 или любой олигонуклеотид, который содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из последовательности оснований данного НТТ-олигонуклеотида и содержит SNP. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид, например, который нацеливается на аллель wt (дикого типа) данного SNP, представляет собой WV-950 или любой олигонуклеотид, который содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из последовательности оснований данного НТТ-олигонуклеотида и содержит SNP.

[00494] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362306 НТТ и имеет последовательность оснований, содержащую SNP (или последовательность, комплементарную последовательности оснований, содержащей SNP) или имеет последовательность оснований, содержащую основание дикого типа, соответствующее SNP (или последовательность, комплементарную ей).

[00495] Неограничивающие примеры НТТ-олигонуклеотидов, которые нацеливаются на rs362306, включают следующие: WV-1001, WV-1002, WV-1003, WV-1004, WV-1005, WV-1006, WV-1007, WV-1008, WV-1009, WV-1010, WV-1011, WV-1012, WV-1013, WV-1014, WV-1015, WV-1016, WV-1017, WV-1018, WV-1019, WV-1020, WV-1021, WV-1022, WV-1023, WV-1024, WV-1025, WV-1026, WV-1027, WV-1028, WV-1029, WV-1030, WV-952, WV-953, WV-954, WV-955, WV-956, и WV-957. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из любого из данных олигонуклеотидов и содержит SNP.

[00496] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362306 НТТ и имеет последовательность оснований, содержащую SNP (или последовательность, комплементарную последовательности оснований, содержащей SNP) или имеет последовательность оснований, содержащую основание дикого типа, соответствующее SNP (или последовательность, комплементарную ей). В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362306 НТТ и представляет собой: WV-948, WV-950, WV-951, WV-952, WV-953, WV-954, WV-955, WV-956, WV-957, WV-1001, WV-1002, WV-1003, WV-1004, WV-1005, WV-1006, WV-1007, WV-1008, WV-1009, WV-1010, WV-1011, WV-1012, WV-1013, WV-1014, WV-1015, WV-1016, WV-1017, WV-1018, WV-1019, WV-1020, WV-1021, WV-1022, WV-1023, WV-1024, WV-1025, WV-1026, WV-1027, WV-1028, WV-1029, или WV-1030. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из любого из данных олигонуклеотидов и содержит SNP.

[00497] Последовательности, данные и другая информация, связанная с различными НТТ-олигонуклеотидами для данного SNP, представлены в данном документе и в WO 2017015555 и WO 2017192664.

[00498] В некоторых вариантах осуществления целевой SNP НТТ представляет собой rs362307.

[00499] В некоторых вариантах осуществления транскрипт muHTT, например мРНК, содержащий SNP rs362307, содержит последовательность (5'-3') UGG AAG UCU GUG ССС UUG UG (где SNP отмечен как жирный подчеркнутый текст, а основание дикого типа в данном положении представляет собой С), и где соответствующая часть аллеля дикого типа имеет последовательность UGG AAG UCU GCG CCC UUG UG, и где НТТ-олигонуклеотид, нацеливающийся на SNP, имеет последовательность оснований, содержащую последовательность CACAAGGGCACAGACTTCCA (где основание, способное к образованию пары оснований с SNP, отмечено как жирный подчеркнутый текст) или участок последовательности, который имеет по меньшей мере 8 оснований в длину и содержит основание, способное к образованию пары оснований с SNP. U-изоформа SNP rs362307 в нуклеотиде 9633 мРНК хантингтина зачастую ассоциирована (например, находится в одной гаметической фазе) с аллелем заболевания с экспансией CAG.

[00500] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362307 НТТ и имеет последовательность оснований, содержащую SNP (или последовательность, комплементарную последовательности оснований, содержащей SNP) или имеет последовательность оснований, содержащую основание дикого типа, соответствующее SNP (или последовательность, комплементарную ей).

[00501] Неограничивающие примеры НТТ-олигонуклеотидов, которые нацеливаются на rs362307, включают следующие: WV-904, WV-905, WV-906, WV-907, WV-908, WV-909, WV-910, WV-911, WV-912, WV-913, WV-914, WV-915, WV-916, WV-917, WV-918, WV-919, WV-920, WV-921, WV-922, WV-923, WV-924, WV-925, WV-926, WV-927, WV-928, WV-929, WV-930, WV-931, WV-932, WV-933, WV-934, WV-935, WV-936, WV-937, WV-938, WV-939, WV-940, WV-941, WV-1085, WV-1086, WV-1087, WV-1088, WV-1089, WV-1090, WV-1091, WV-1092, WV-982, WV-983, WV-984, WV-985, WV-986, WV-987, WV-1234, WV-1235, WV-1067, WV-1068, WV-1069, WV-1070, WV-1071, WV-1072, WV-1510, WV-1511, WV-1497, и WV-1655. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из любого из данных олигонуклеотидов и содержит SNP.

[00502] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362307 НТТ и представляет собой: WV-905, WV-906, WV-907, WV-908, WV-909, WV-911, WV-912, WV-913, WV-914, WV-915, WV-921, WV-935, WV-937, WV-938, WV-939, WV-940, WV-941, WV-985, WV-986, WV-987, WV-1068, WV-1069, WV-1071, WV-1072, WV-1088, WV-1089, WV-1090, WV-1198, WV-1199, WV-1200, WV-1201, WV-1202, WV-1203, WV-1204, WV-1205, WV-1206, WV-1207, WV-1208, WV-1209, WV-1210, WV-1211, WV-1212, WV-1213, WV-1214, WV-1215, WV-1216, WV-1235, WV-1654, WV-1655, WV-2623, WV-13646, WV-13647, WV-13648, WV-13649, WV-13650, WV-13651, WV-13652, WV-13653, WV-13654, WV-13655, WV-13656, WV-13657, WV-13658, WV-13659, WV-13660, WV-13661, WV-13662, WV-13663, WV-13664, WV-13665, WV-13666, WV-13935, WV-13936, WV-13940, WV-13941, WV-13942, WV-13943, WV-13944, WV-13945, WV-13946, WV-13947, WV-13948, WV-13949, WV-13957, WV-13958, WV-13961, WV-13962, WV-15634, WV-15635, WV-15636, WV-15637, WV-17895, WV-17896, WV-17897, WV-17898, WV-904, WV-905, WV-906, WV-907, WV-908, WV-909, WV-910, WV-911, WV-912, WV-913, WV-914, WV-915, WV-916, WV-917, WV-918, WV-919, WV-920, WV-921, WV-922, WV-923, WV-924, WV-925, WV-926, WV-927, WV-928, WV-929, WV-930, WV-931, WV-932, WV-933, WV-934, WV-935, WV-936, WV-937, WV-938, WV-939, WV-940, WV-941, WV-982, WV-983, WV-984, WV-985, WV-1067, WV-1068, WV-1069, WV-1070, WV-1071, WV-1072, WV-1085, WV-1086, WV-1087, WV-1088, WV-1089, WV-1090, WV-1091, WV-1092, WV-1183, WV-1184, WV-1185, WV-1186, WV-1187, WV-1188, WV-1189, WV-1190, WV-1191, WV-1192, WV-1193, WV-1194, WV-1195, WV-1196, WV-1197, WV-1198, WV-1199, WV-1200, WV-1201, WV-1202, WV-1203, WV-1204, WV-1234, WV-1235, WV-1497, WV-1510, WV-1511, WV-1654, WV-1655, WV-1788, WV-2022, WV-2377, WV-2378, WV-2379, WV-2380, WV-2623, WV-2659, WV-2676, WV-2682, WV-2683, WV-2684, WV-2685, WV-2686, WV-2687, WV-2688, WV-2689, WV-2690, WV-2691, WV-2692, WV-2732, WV-4241, WV-4242, WV-4278, WV-5141, WV-5142, WV-5143, WV-5144, WV-5145, WV-5146, WV-5147, WV-5148, WV-5149, WV-5150, WV-5151, WV-5152, WV-5159, WV-5160, WV-5161, WV-5162, WV-5163, WV-5164, WV-5165, WV-5166, WV-5167, WV-5168, WV-5169, WV-5170, WV-5177, WV-5178, WV-5179, WV-5180, WV-5181, WV-5182, WV-5183, WV-5184, WV-5185, WV-5186, WV-5187, WV-5188, WV-5189, WV-5190, WV-5197, WV-5198, WV-5199, WV-5200, WV-5201, WV-5202, WV-5203, WV-5204, WV-5205, WV-5206, WV-5207, WV-5208, WV-5209, WV-5210, WV-6013, WV-6014, WV-6506, WV-8706, WV-8707, WV-8708, WV-8709, WV-9854, WV-9855, WV-10113, WV-10114, WV-10115, WV-10116, WV-10117, WV-10118, WV-10119, WV-10120, WV-10121, WV-10122, WV-10123, WV-10124, WV-10125, WV-10126, WV-10133, WV-10134, WV-10135, WV-10136, WV-10137, WV-10138, WV-10139, WV-10140, WV-10141, WV-10142, WV-10143, WV-10144, WV-10145, WV-10146, WV-10483, WV-10484, WV-10485, WV-10486, WV-10640, WV-10641, WV-13646, WV-13647, WV-13648, WV-13649, WV-13650, WV-13651, WV-13652, WV-13653, WV-13654, WV-13655, WV-13656, WV-13657, WV-13658, WV-13659, WV-13660, WV-13661, WV-13662, WV-13663, WV-13664, WV-13665, WV-13666, WV-13935, WV-13936, WV-13937, WV-13938, WV-13939, WV-13940, WV-13941, WV-13942, WV-13943, WV-13944, WV-13945, WV-13946, WV-13947, WV-13948, WV-13949, WV-13953, WV-13954, WV-13957, WV-13958, WV-13961, WV-13962, WV-14133, WV-14134, WV-14135, WV-14136, WV-15634, WV-15635, WV-15636, WV-15637, WV-15642, WV-15643, WV-15644, WV-15645, WV-17895, WV-17896, WV-17897, WV-17898, WV-17899, WV-17900, WV-17901, WV-17902, WV-17903, WV-17904, WV-17905, WV-17906, WV-17907, WV-17908, WV-17909, WV-17910, WV-17911, WV-17912, WV-17913, WV-17914, WV-17915, WV-17916, WV-17917, WV-17918, WV-19872, WV-19873, WV-19874, WV-19875, WV-19876, WV-19877, WV-19878, WV-19879, WV-19880, WV-19881, WV-19882, или WV-19883. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из любого из данных олигонуклеотидов и содержит SNP. Последовательности, данные и другая информация, связанная с различными НТТ-олигонуклеотидами для данного SNP, представлены в данном документе и в WO 2017015555 и WO 2017192664.

[00503] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид имеет последовательность, которая содержит основание дикого типа в положении, соответствующем SNP rs362307. Неограничивающие примеры такого олигонуклеотида включают: WV-9660, WV-9661, WV-9662, WV-9663, WV-9664, WV-9665, WV-9666, WV-9667, WV-9668, WV-9669, WV-9692, WV-9693, WV-10767, WV-10768, WV-10769, WV-10770, WV-10771, WV-10772, WV-10773, WV-10774, WV-10775, WV-10776, WV-10862, WV-10863, WV-11534, WV-11535, WV-11536, WV-11537, WV-11538, WV-11539, WV-11540, WV-11541, WV-11542, WV-11543, WV-11968, WV-11969, WV-11970, WV-11971, WV-11972, WV-11973, WV-11974, WV-11975, WV-11976, WV-11977, WV-11978, WV-11979, WV-11980, WV-11981, WV-11982, WV-11983, WV-11984, WV-11985, WV-11986, WV-11987, WV-11988, WV-11989, WV-11990, WV-11991, WV-11992, WV-11993, WV-11994, WV-11995, WV-11996, WV-11997, WV-11998, WV-11999, WV-12000, WV-12001, WV-12002, WV-12003, WV-12004, WV-12005, WV-12006, WV-12007, WV-12013, WV-12014, WV-12015, WV-12016, WV-12017, WV-12018, WV-12019, WV-12020, WV-12021, WV-12022, WV-12033, WV-12034, WV-12035, WV-12036, WV-12037, WV-12038, WV-12039, WV-12040, WV-12041, WV-12042, WV-12288, WV-12289, WV-12290, WV-12291, WV-12292, WV-12293, WV-12294, WV-12295, WV-12296, WV-12297, WV-12298, WV-12299, WV-12300, WV-12301, WV-12302, WV-12544, WV-13625, WV-13626, WV-13627, WV-13628, WV-13629, WV-13630, WV-13631, WV-13632, WV-13633, WV-13634, WV-13635, WV-13636, WV-13637, WV-13638, WV-13639, WV-13640, WV-13641, WV-13642, WV-13643, WV-13644, WV-13645, WV-13667, WV-13920, WV-13921, WV-13922, WV-13923, WV-13924, WV-13925, WV-13926, WV-13927, WV-13928, WV-13929, WV-13930, WV-13932, WV-13933, WV-13934, WV-13950, WV-13951, WV-13952, WV-13955, WV-13956, WV-13959, WV-13960, WV-15630, WV-15631, WV-15632, WV-15633, WV-15638, WV-15639, WV-15640, WV-15641, WV-17886, WV-17887, WV-17888, WV-17889, WV-17890, WV-17891, WV-17892, WV-17893, WV-17894, WV-11970, WV-11971, WV-11972, WV-11973, WV-11974, WV-11975, и WV-11976. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из любого из данных олигонуклеотидов и содержит SNP.

[00504] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержащий изоформу wt SNP, применим для тестирования на клетках и/или животных, у которых оба аллеля данного SNP относятся к дикому типу. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержащий изоформу wt SNP, можно применять в таких клетках и/или животных дикого типа в качестве заменителя олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, содержащего мутантную изоформу SNP. Неограничивающие примеры заменителя wt для мутантного НТТ-олигонуклеотида включают: WV-9660, WV-9661, WV-9662, WV-9663, WV-9664, WV-9665, WV-9666, WV-9667, WV-9668, WV-9669, WV-9692, и WV-9693.

[00505] В некоторых вариантах осуществления целевой SNP НТТ представляет собой rs362331.

[00506] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362331 НТТ и имеет последовательность оснований, содержащую SNP (или последовательность, комплементарную последовательности оснований, содержащей SNP) или имеет последовательность оснований, содержащую основание дикого типа, соответствующее SNP (или последовательность, комплементарную ей). В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP_rs362331 НТТ и представляет собой: WV-2597, WV-2598, WV-2599, WV-2600, WV-2601, WV-2602, WV-2603, WV-2604, WV-2613, WV-2614, WV-2615, WV-2616, WV-2617, WV-2618, WV-2619, WV-2620, WV-2642, WV-2643, WV-3857, WV-4279, WV-5211, WV-5212, WV-5213, WV-5214, WV-5215, WV-5216, WV-5217, WV-5218, WV-5219, WV-5220, WV-5221, WV-5222, WV-5223, WV-5224, WV-5225, WV-5226, WV-5227, WV-5228, WV-5229, WV-5230, WV-5231, WV-5232, WV-5233, WV-5234, WV-5235, WV-5236, WV-5237, WV-5238, WV-5239, WV-5240, WV-5241, WV-5242, WV-5243, WV-5244, WV-5245, WV-5246, WV-5247, WV-5248, WV-5249, WV-5250, WV-5251, WV-5252, WV-5253, WV-5254, WV-5255, WV-5256, WV-5257, WV-5258, WV-5259, WV-5260, WV-5261, WV-5262, WV-5263, WV-5264, WV-5265, WV-5266, WV-5267, WV-5268, WV-5269, WV-5270, WV-5271, WV-5272, WV-5273, WV-5274, WV-5275, WV-5276, WV-5277, WV-5278, WV-5279, WV-5280, WV-5281, WV-5282, WV-5283, WV-5284, WV-5285, WV-5286, WV-8710, WV-8711, WV-8712, WV-8713, WV-9856, WV-9857, WV-10631, WV-10632, WV-10633, WV-10642, WV-10643, WV-10644, WV-10864, WV-10865, WV-10866, WV-10867, WV-11115, WV-11116, WV-11117, WV-11118, WV-11119, WV-11120, WV-11121, WV-11122, WV-11123, WV-11124, WV-11125, WV-11126, WV-11127, WV-11128, WV-11129, WV-11130, WV-11131, WV-11132, WV-11548, WV-11549, WV-11550, WV-11551, WV-11552, WV-11553, WV-11554, WV-11555, WV-11556, WV-11557, WV-11558, WV-11559, WV-11560, WV-11561, WV-11562, WV-11563, WV-11564, WV-11565, WV-11566, WV-11567, WV-12049, WV-12539, WV-12540, WV-12541, WV-12542, WV-12543, WV-15133, WV-15134, WV-15135, WV-15136, WV-15137, WV-15138, WV-15139, WV-15140, WV-15141, или WV-15142. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из любого из данных олигонуклеотидов и содержит SNP. Последовательности, данные и другая информация, связанная с различными НТТ-олигонуклеотидами для данного SNP, представлены в данном документе и в WO 2017015555 и WO 2017192664.

[00507] В некоторых вариантах осуществления целевой SNP НТТ представляет собой rs363099.

[00508] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs363099 НТТ и имеет последовательность оснований, содержащую SNP (или последовательность, комплементарную последовательности оснований, содержащей SNP) или имеет последовательность оснований, содержащую основание дикого типа, соответствующее SNP (или последовательность, комплементарную ей). В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP_rs363099 НТТ и представляет собой: WV-10889, WV-10890, WV-10891, WV-10892, WV-10893, WV-10894, WV-10895, WV-10896, WV-10897, WV-10898, WV-10899, WV-10900, WV-10901, WV-10902, WV-10903, WV-10904, WV-10905, WV-10906, WV-10907, WV-10908, WV-10909, WV-10910, WV-10911, WV-10912, WV-10913, WV-10914, WV-10915, WV-10916, WV-10917, WV-10918, WV-10919, WV-10920, WV-10921, WV-10922, WV-10923, WV-10924, WV-10925, WV-10926, WV-10927, WV-10928, WV-10929, WV-10930, WV-10931, WV-10932, WV-10933, WV-10934, WV-10935, WV-10936, WV-10937, WV-10938, WV-12509, WV-12510, WV-12511, WV-12512, WV-12513, WV-12514, WV-12515, WV-12516, WV-12517, WV-12518, WV-12519, WV-12520, WV-12521, WV-12522, WV-12523, WV-12524, WV-12525, WV-12526, WV-12527, WV-12528, WV-12529, WV-12530, WV-12531, WV-12532, WV-12533, WV-12534, WV-12535, WV-12536, WV-12537, или WV-12538. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из любого из данных олигонуклеотидов и содержит SNP.

[00509] В некоторых вариантах осуществления целевой SNP НТТ представляет собой rs2530595.

[00510] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs2530595 НТТ и имеет последовательность оснований, содержащую SNP (или последовательность, комплементарную последовательности оснований, содержащей SNP) или имеет последовательность оснований, содержащую основание дикого типа, соответствующее SNP (или последовательность, комплементарную ей). В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs2530595 НТТ и представляет собой: WV-2589, WV-2590, WV-2591, WV-2592, WV-2593, WV-2594, WV-2595, WV-2596, WV-2605, WV-2606, WV-2607, WV-2608, WV-2609, WV-2610, WV-2611, WV-2612, WV-2671, WV-2672, WV-2673, или WV-2674. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из любого из данных олигонуклеотидов и содержит SNP. Последовательности, данные и другая информация, связанная с различными НТТ-олигонуклеотидами для данного SNP, представлены в данном документе и в WO 2017015555 и WO 2017192664.

[00511] В некоторых вариантах осуществления целевой SNP НТТ представляет собой rs2830088.

[00512] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs2830088 НТТ и имеет последовательность оснований, содержащую SNP (или последовательность, комплементарную последовательности оснований, содержащей SNP) или имеет последовательность оснований, содержащую основание дикого типа, соответствующее SNP (или последовательность, комплементарную ей). В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs2830088 НТТ и представляет собой: WV-15157, WV-15158, WV-15159, WV-15160, WV-15161, WV-15175, WV-15176, WV-15177, WV-15178, WV-15179, WV-15193, WV-15194, WV-15195, WV-15196, WV-15197, WV-15211, WV-15212, WV-15213, WV-15214, или WV-15215. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из любого из данных олигонуклеотидов и содержит SNP.

[00513] В некоторых вариантах осуществления целевой SNP НТТ представляет собой rs7685686.

[00514] Неограничивающие примеры НТТ-олигонуклеотидов, которые нацеливаются на rs7685686, включают следующие: ONT-450, ONT-451, ONT-452, WV-1077, WV-1078, WV-1079, WV-1080, WV-1081, WV-1082, WV-1083, WV-1084, WV-1508, WV-1509, WV-2023, WV-2024, WV-2025, WV-2026, WV-2027, WV-2028, WV-2029, WV-2030, WV-2031, WV-2032, WV-2033, WV-2034, WV-2035, WV-2036, WV-2037, WV-2038, WV-2039, WV-2040, WV-2041, WV-2042, WV-2043, WV-2044, WV-2045, WV-2046, WV-2047, WV-2048, WV-2049, WV-2050, WV-2051, WV-2052, WV-2053, WV-2054, WV-2055, WV-2056, WV-2057, WV-2058, WV-2059, WV-2060, WV-2061, WV-2062, WV-2063, WV-2064, WV-2065, WV-2066, WV-2067, WV-2068, WV-2069, WV-2070, WV-2071, WV-2072, WV-2073, WV-2074, WV-2075, WV-2076, WV-2077, WV-2078, WV-2079, WV-2080, WV-2081, WV-2082, WV-2083, WV-2084, WV-2085, WV-2086, WV-2087, WV-2088, WV-2089, и WV-2090. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из любого из данных олигонуклеотидов и содержит SNP.

[00515] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs7685686 НТТ и имеет последовательность оснований, содержащую SNP (или последовательность, комплементарную последовательности оснований, содержащей SNP) или имеет последовательность оснований, содержащую основание дикого типа, соответствующее SNP (или последовательность, комплементарную ей). В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP rs7685686 НТТ и выбран из любого из: WV-1077, WV-1078, WV-1079, WV-1080, WV-1081, WV-1082, WV-1083, WV-1084, WV-1508, WV-1509, WV-2023, WV-2024, WV-2025, WV-2026, WV-2027, WV-2028, WV-2029, WV-2030, WV-2031, WV-2032, WV-2033, WV-2034, WV-2035, WV-2036, WV-2037, WV-2038, WV-2039, WV-2040, WV-2041, WV-2042, WV-2043, WV-2044, WV-2045, WV-2046, WV-2047, WV-2048, WV-2049, WV-2050, WV-2051, WV-2052, WV-2053, WV-2054, WV-2055, WV-2056, WV-2057, WV-2058, WV-2059, WV-2060, WV-2061, WV-2062, WV-2063, WV-2064, WV-2065, WV-2066, WV-2067, WV-2068, WV-2069, WV-2070, WV-2071, WV-2072, WV-2073, WV-2074, WV-2075, WV-2076, WV-2077, WV-2078, WV-2079, WV-2080, WV-2081, WV-2082, WV-2083, WV-2084, WV-2085, WV-2086, WV-2087, WV-2088, WV-2089, WV-2090, WV-2163, WV-2164, WV-2269, WV-2270, WV-2271, WV-2272, WV-2374, WV-2375, WV-2416, WV-2417, WV-2418, и WV-2419. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид имеет последовательность оснований, которая содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из любого из данных олигонуклеотидов (или эквивалента дикого типа, который содержит нуклеотид дикого типа в положении SNP) или из его комплементарной последовательности и которая содержит SNP. Последовательности, данные и другая информация, связанная с различными НТТ-олигонуклеотидами для данного SNP, представлены в данном документе и в WO 2017015555 и WO 2017192664.

[00516] В некоторых вариантах осуществления целевой SNP НТТ является интронным.

[00517] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на SNP, который является интронным.

[00518] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид нацеливается на интронный SNP НТТ и имеет последовательность оснований, содержащую SNP (или последовательностью, комплементарную последовательности оснований, содержащей SNP) или имеет последовательность оснований, содержащую основание дикого типа, соответствующее SNP (или последовательность, комплементарную ей).

[00519] Неограничивающие примеры таких олигонуклеотидов включают: WV-10783, WV-10784, WV-10785, WV-10786, WV-10787, WV-10788, WV-10789, WV-10790, WV-10791, WV-10792, WV-10793, WV-10794, WV-10795, WV-10796, WV-10797, WV-10798, WV-10799, WV-10800, WV-10801, WV-10802, WV-10803, WV-10804, WV-10805, WV-10806, WV-10807, WV-10808, WV-10809, WV-10810, WV-10811, WV-10812, WV-10813, WV-10814, WV-10815, WV-10816, hWV-10817.

[00520] В некоторых вариантах осуществления основание, образующее пару оснований с основанием в сайте SNP (основание SNP; основание, образующее пару оснований с основанием SNP, основание, образующее пару с SNP) в транскрипте, например мРНК НТТ, может быть расположено в различных положениях олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления основание, образующее пару с SNP, находится в положении 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 19, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 или 30 (считая от 5'-конца) олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления положение 1 (считая от 5'-конца) также обозначается Р1; положение 2 (считая от 5'-конца) также обозначается Р2 и т.д. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 19, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 или 30 (считая от 5'-конца).

[00521] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р1 (олигонуклеотида, где положение отсчитывается как число оснований от 5' к 3'). В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р2. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении РЗ. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р4. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р5. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р6. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р7. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р8. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р9. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р10. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р11. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р12. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р13. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р14. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р15. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р16. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р17. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р18. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р19. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р20. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р21. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р22. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р23. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р24. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р25. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р26. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р27. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р28. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р29. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, содержит основание, образующее пару с SNP, в положении Р30.

[00522] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит основание, способное к образованию пары оснований с SNP в мРНК НТТ в положении Р3 (НТТ-олигонуклеотида, где положение отсчитывают как число оснований, отсчитывая в направлении от 5' к 3'). Неограничивающие примеры такого олигонуклеотида включают без ограничений: WV-2023 и WV-2057.

[00523] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит основание, способное к образованию пары оснований с SNP в мРНК НТТ в положении Р4. Неограничивающие примеры такого олигонуклеотида включают без ограничений: WV-2024, WV-2025, WV-2058, и WV-2059.

[00524] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит основание, способное к образованию пары оснований с SNP в мРНК НТТ в положении Р5. Неограничивающие примеры такого олигонуклеотида включают без ограничений: WV-2026, WV-2027, WV-2060, и WV-2061.

[00525] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит основание, способное к образованию пары оснований с SNP в мРНК НТТ в положении Р6. Неограничивающие примеры такого олигонуклеотида включают без ограничений: WV-2028, WV-2029, WV-2062, и WV-2063.

[00526] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит основание, способное к образованию пары оснований с SNP в мРНК НТТ в положении Р7. Неограничивающие примеры такого олигонуклеотида включают без ограничений: WV-2030, WV-2031, WV-2064, и WV-2065.

[00527] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит основание, способное к образованию пары оснований с SNP в мРНК НТТ в положении Р8. Неограничивающие примеры такого олигонуклеотида включают без ограничений: WV-2032, WV-2033, WV-2066, и WV-2067.

[00528] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит основание, способное к образованию пары оснований с SNP в мРНК НТТ в положении Р9. Неограшгчивающие примеры такого олигонуклеотида включают без ограничений: WV-2034, WV-2035, WV-2068, и WV-2069.

[00529] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит основание, способное к образованию пары оснований с SNP в мРНК НТТ в положении Р10. Неограничивающие примеры такого олигонуклеотида включают без ограничений: WV-2036, WV-2037, WV-2038, WV-2070, WV-2071, и WV-2072.

[00530] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит основание, способное к образованию пары оснований с SNP в мРНК НТТ в положении Р11. Неограничивающие примеры такого олигонуклеотида включают без ограничений: WV-2039, WV-2040, WV-2041, WV-2042, WV-2073, WV-2074, WV-2075, и WV-2076.

[00531] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит основание, способное к образованию пары оснований с SNP в мРНК НТТ в положении Р12. Неограничивающие примеры такого олигонуклеотида включают без ограничений: WV-2043, WV-2044, WV-2045, WV-2046, WV-2077, WV-2078, WV-2079, и WV-2080.

[00532] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит основание, способное к образованию пары оснований с SNP в мРНК НТТ в положении Р13. Неограничивающие примеры такого олигонуклеотида включают без ограничений: WV-2047, WV-2048, WV-2049, WV-2050, WV-2081, WV-2082, WV-2083, и WV-2084.

[00533] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит основание, способное к образованию пары оснований с SNP в мРНК НТТ в положении Р14. Неограничивающие примеры такого олигонуклеотида включают без ограничений: WV-2051, WV-2052, WV-2053, WV-2085, и WV-2087.

[00534] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит основание, способное к образованию пары оснований с SNP в мРНК НТТ в положении Р15. Неограничивающие примеры такого олигонуклеотида включают без ограничений: WV-2054, WV-2055, WV-2088, и WV-2089.

[00535] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит основание, способное к образованию пары оснований с SNP в мРНК НТТ в положении Р16. Неограничивающие примеры такого олигонуклеотида включают без ограничений: WV-2056, и WV-2090.

[00536] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид содержит BrdU. Неограничивающие примеры такого олигонуклеотида включают: WV-1235, WV-1788, WV-1789, WV-1790, WV-2022 и WV-1234.

[00537] Данные, относящиеся к эффективности различных НТТ-олигонуклеотидов, которые нацеливаются на различные SNP НТТ, показаны в примерах, приведенных в данном документе и в WO 2017015555 и WO 2017192664.

[00538] Последовательности, данные и другая информация, относящаяся к данным различным олигонуклеотидам, включая WV-905, WV-911, WV-917, WV-931, WV-937, WV-944, WV-945, WV-945, WV-1085, WV-1086, WV-1087, WV-1088, WV-1089, WV-1090, WV-1091, WV-1092, WV-1497, WV-2063, WV-2067, WV-2069, WV-2072, WV-2076, WV-2077, WV-2416, WV-2417, WV-2418, WV-2419, WV-2589, WV-2590, WV-2591, WV-2592, WV-2593, WV-2594, WV-2595, WV-2596, WV-2597, WV-2598, WV-2599, WV-2600, WV-2601, WV-2602, WV-2603, WV-2604, WV-2605, WV-2606, WV-2607, WV-2608, WV-2609, WV-2610, WV-2611, WV-2612, WV-2614, WV-2615, WV-2616, WV-2617, WV-2618, WV-2619, WV-2620, WV-2671, WV-2672, WV-2673, и WV-2675, представлена в данном документе и, например, в WO 2017015555 и WO 2017192664.

[00539] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к любому олигонуклеотиду, содержащему последовательность любого олигонуклеотида или содержащему участок из 10 или более последовательных оснований из последовательности любого олигонуклеотида, раскрытого в данном документе или в WO 2017015555 или WO 2017192664, где любое одно или несколько оснований заменено на инозин.

[00540] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к любому олигонуклеотиду, содержащему последовательность любого олигонуклеотида или содержащему участок из 10 или более последовательных оснований из последовательности любого олигонуклеотида, раскрытого в данном документе или в WO 2017015555; WO 2017192664; W00201200366; WO 2011/034072; WO 2014/010718; WO 2015/108046; WO 2015/108047; WO 2015/108048; WO 2011/005761; WO 2011/108682; WO 2012/039448; WO 2018/067973; WO 2005/028494; WO 2005/092909; WO 2010/064146; WO 2012/073857; WO 2013/012758; WO 2014/010250; WO 2014/012081; WO 2015/107425; WO 2017/015555; WO 2017/015575; WO 2017/062862; WO 2017/160741; WO 2017/192664; WO 2017/192679; WO 2017/210647; WO 2018/022473 или WO 2018/098264, где любое одно или несколько оснований заменено на инозин.

[00541] Фазирование

[00542] Различные методики могут использоваться для определения того, находится ли конкретный аллель SNP на одной и той же хромосоме с ассоциированной с заболеванием последовательностью, например экспансией CAG-повторов в случае НТТ. Как правило, если аллель SNP и экспансия CAG-повторов находятся на одной и той же хромосоме, НТТ-олигонуклеотид, который нацеливается на данный аллель SNP, также может "нацеливаться" на ассоциированную с заболеванием экспансию CAG-повторов, за счет чего обеспечивается снижение экспрессии, уровня и/или активности аллеля НТТ с мутацией, ассоциированной с заболеванием. Так, например, НТТ-олигонуклеотид можно применять для нарушения, лечения связанного с НТТ, такого как болезнь Хантингтона. Таким образом, НТТ-олигонуклеотид, нацеливающийся на SNP, может предпочтительно обеспечивать снижение экспрессии, уровня и/или активности мутантного аллеля НТТ по сравнению с аллелем дикого типа.

[00543] Человек, в числе прочих живых существ, является диплоидным организмом, и определение сцепления аллелей генетических локус ов на одной или разных хромосомах требуется в случае методик фазирования. Последовательности, расположенные на соответствующих хромосомах известны как гаплотипы. Процесс определения того, какие аллели находятся на каких хромосомах, известен как фазирование, фазирование гаплотипа или гаплотипирование. Информация по фазированию применима при стратификации пациентов, судебно-медицинской экспертизе и различных других вариантах применения в лечении заболеваний и нарушений, связанных с НТТ, таких как болезнь Хантингтона. Дополнительную общую информацию о фазировании см., например, в: Twehey et al. 2011 Nat. Rev. Genet. 12: 215-223; и Glusman et al. 2014 Genome Med. 6: 73.

[00544] Данные по результатам фазирования могут быть важны для средств аллель-специфической терапии при таких заболеваниях, как болезнь Хантингтона. При некоторых заболеваниях было идентифицировано такое генетическое повреждение, как вредоносный повтор, делеция, вставка, инверсия или другая мутация, такая как экспансия CAG-повторов в мутантных (и ассоциированных с заболеванием) аллелях НТТ. У некоторых пациентов один аллель гена, такого как НТТ, может содержать ассоциированную с заболеванием мутацию в генетическом локусе, в то время как другой аллель является нормальным, аллелем дикого типа или иным образом не ассоциированным с заболеванием. В некоторых вариантах осуществления средство аллель-специфической терапии может нацеливаться на аллель НТТ, содержащий ассоциированную с заболеванием мутацию, а не на соответствующий аллель дикого типа. В некоторых вариантах осуществления средство аллель-специфической терапии может нацеливаться на аллель НТТ, содержащий ассоциированную с заболеванием мутацию в конкретном локусе, такую как экспансия CAG-повторов (или расширенный С AG-тракт), но не путем непосредственного нацеливания на локус, а путем нацеливания на другой локус мутантного аллеля. В качестве неограничивающего примера, средство аллель-специфической терапии может нацеливаться на аллель, содержащий ассоциированную с заболеванием мутацию в локусе, путем нацеливания на другой локус в том же аллеле, такой как SNP (однонуклеотидный полиморфизм) в том же гене.

[00545] В качестве неограничивающего примера, на некоторые ассоциированные с заболеванием генетические повреждения может быть сложно нацеливаться или они иным образом с трудом поддаются нацеливанию. В качестве неограничивающего примера, некоторые гены, такие как мутантный НТТ, содержат повторы (например, тринуклеотидные или тетрануклеотидные повторы); в некоторых случаях, таких как болезнь Хантингтона, небольшое число повторов не является ассоциированным с заболеванием, а аномально большое число повторов или экспансия повторов являются ассоциированными с заболеванием. Поскольку повторы существуют как в аллелях дикого типа, так и в мутантных аллелях, может быть сложно непосредственно нацеливаться на ассоциированные с заболеванием повторы. Однако, если конкретный вариант SNP находится на одном и том же аллеле с ассоциированной с заболеванием экспансией повторов, а не на аллеле дикого типа, данный вариант SNP можно применять для нацеливания средства аллель-специфической терапии, которое нацеливается на мутантный аллель, а не на аллель дикого типа.

[00546] В качестве неограничивающего примера, данные по результатам фазирования для индивидуума указывают, находится ли конкретный SNP в одной гаметической фазе (например, на одной и той же хромосоме) с повреждением, и, таким образом, что на данный SNP можно нацеливаться с помощью терапевтической нуклеиновой кислоты. Тогда терапевтическое средство может нацеливаться на мутантный ген, при этом не нацеливаясь на аллель дикого типа. Получение данных по результатам фазирования для нацеливания только на мутантный аллель может быть особенно применимым, если экспрессия аллеля дикого типа является существенно важной.

[00547] В качестве другого неограничивающего примера информация по фазированию является применимой, если известно, что у индивидуума присутствует как аллель дикого типа, так и мутантный аллель каждого из двух генетических локусов одного и того же гена. Информация по фазированию выявит, имеют ли обе копии гена по одному мутантному аллелю, или одна копия гена имеет две мутации, в то время как другая относится к дикому типу по обоим аллелям.

[00548] В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении представлены, среди прочего различные способы фазирования генетических локусов на матрице нуклеиновой кислоты. В качестве неограничивающих примеров в настоящем изобретении представлены способы фазирования генетического локуса, такого как генетическое повреждение (такое как инверсия, слияние, деления, вставка или другая мутация), и другого генетического локуса (такого как SNP) на хромосоме; при этом два генетических локуса могут находиться в одном и том же гене или в разных генах.

[00549] В неограничивающем примере у рассматриваемого в качестве примера пациента может иметься болезнь Хантингтона, которая связана с мутацией в гене хантингтина (НТТ), содержащем избыточное число повторов (например, экспансию повторов) последовательности CAG. В некоторых вариантах осуществления пациент может рассматриваться как кандидат на лечение аллель-специфическим терапевтическим средством (например, антисмысловым олигонуклеотидом или средством для RNAi), которое распознает конкретный аллельный вариант генетического локуса в гене НТТ (который находится за пределами экспансии повторов), в качестве неограничивающего примера SNP. Если фазирование выявляет, что одна и та же хромосома пациента содержит как экспансию повторов, так и конкретный аллельный вариант генетического локуса (например, SNP), распознаваемый аллель-специфическим терапевтическим средством, тогда пациент соответствует критериям для лечения аллель-специфическим терапевтическим средством.

[00550] В данной области техники известны различные способы фазирования, включая без ограничений, описанные в WO 2018/022473; и Berger et al. 2015 Res. Comp. Mol. Biol. 9029: 28-29; Castel et al. 2015 Genome Biol. 16: 195; Castel et al. 2016 phASER: Long range phasing and haplotypic expression from RNA sequencing, doi: http://dx.doi.org/10.1101/039529; Delaneau et al. 2012 Nat. Methods 9: 179-181; Garg et al. 2016 Read-Based Phasing of Related Individuals; Hickey et al. 2011 Genet. Select. Evol. 43: 12; Kuleshov et al. 2014 Nat. Biotech. 32: 261-266; Laver et al. 2016 Nature Scientific Reports |6: 21746| DOI: 10.1038/srep21746; O'Connell et al. 2014 PLoS ONE 10: e1004234; Regan et al. 2015 PloS ONE 10: e0118270; Roach et al. 2011 Am. J. Hum. Genet. 89: 382-397; и Yang et al. 2013 Bioinformatics 29: 2245-2252. В некоторых вариантах осуществления для фазирования можно использовать секвенирование, в частности секвенирование, которое может давать длинные одиночные считывания.

[00551] Панспецифические НТТ-олигонуклеотиды

[00552] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид обеспечивает снижение экспрессии, уровня и/или активности как мутантных аллелей, так и аллелей НТТ дикого типа или их продуктов без значительной селективности. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид не нацеливается на область, содержащую SNP; например, НТТ-олигонуклеотид является полностью комплементарным последовательности в гене НТТ или мРНК, которая присутствует у всех, по сути у всех или почти у всех людей. Такой НТТ можно рассматривать как панспецифический НТТ-олигонуклеотид, и он не может различать аллели НТТ дикого типа и мутантные аллели, но может быть применим для обеспечения существенного снижения экспрессии, уровня и/или активности мутантного аллеля НТТ (но при этом, по меньшей мере в некоторых случаях одновременно обеспечивая снижение экспрессии, уровня и/или активности аллеля НТТ дикого типа). В некоторых вариантах осуществления панспецифический НТТ-олигонуклеотид способен опосредовать снижение экспрессии, уровня и/или активности мутантного гена НТТ или его генного продукта, что является достаточным для уменьшения интенсивности, предупреждения или задержки возникновения болезни Хантингтона или по меньшей мере одного ее симптома, но при этом одновременно панспецифический НТТ-олигонуклеотид не обеспечивает снижение экспрессии, уровня и/или активности гена дикого типа или генного продукта в достаточной степени, чтобы вызвать вредоносный эффект у субъекта или пациента.

[00553] В данном документе описаны примеры снижения уровней, видов активности и/или экспрессии гена НТТ-мишени или его генного продукта, опосредованные различными НТТ-олигонуклеотидами, некоторые из которых являются панспецифическими.

[00554] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид не нацеливается на SNP. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований не содержит SNP.

[00555] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид имеет последовательность оснований, которая не характеризуется известным SNP; в некоторых вариантах осуществления такой олигонуклеотид может быть способен осуществлять нокдаун как НТТ дикого типа, так и мутантного, а в некоторых вариантах осуществления такой олигонуклеотид является панспецифическим олигонуклеотидом.

[00556] Неограничивающим примером панспецифического олигонуклеотида является НТТ-олигонуклеотид, имеющий последовательностью оснований, которая представляет собой или содержит последовательность CTCAGTAACATTGACACCAC или ее участок (например, 10 смежных оснований), и которая не содержит SNP в своей последовательности оснований. Неограничивающие примеры олигонуклеотида, имеющего последовательность оснований CTCAGTAACATTGACACCAC, включают WV-1789, WV-1790 и WV-9679.

[00557] Другой олигонуклеотид, известный в данной области техники, который имеет такую же последовательность оснований в виде CTCAGTAACATTGACACCAC, представляет собой ISIS HuASO, 5'-CTCAGtaacattgacACCAC-3', при этом нуклеотиды, написанные заглавными буквами, содержат модификации 2'-O-(2-метокси)этил, а нуклеотидами, написанные незаглавными буквами, содержат 2'-дезокси, как описано в Kordasiewicz et al. 2012 Neuron 74(6): 1031-44. Олигонуклеотид, имеющий данную последовательность оснований, также описан в Southwell et al. 2018 Science Translational Medicine Vol. 10, Issue 461, eaar3959.

[00558] Панспецифические НТТ-олигонуклеотиды, имеющие последовательности оснований CTCGACTAAAGCAGGATTTC, CCTGCATCAGCTTTATTTGT, и TCTCTATTGCACATTCCAAG, описаны в Southwell et al. 2014 Mol. Ther. 22: 2093-2106. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к панспецифическому НТТ-олигонуклеотиду, который имеет последовательность оснований, которая представляет собой или содержит CTCGACTAAAGCAGGATTTC, CCTGCATCAGCTTTATTTGT или TCTCTATTGCACATTCCAAG, или их участок (например, 10 смежных оснований), и не содержит SNP. В любой последовательности, описанной в данном документе, каждый Т может быть независимо замещен на U и наоборот.

[00559] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к композиции на основе олигонуклеотида, содержащей совокупность олигонуклеотидов, где олигонуклеотиды представляют собой панспецифические НТТ-олигонуклеотиды, которые содержат по меньшей мере одну межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь с контролируемой хиральностью представляет собой фосфотиоатную межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь с контролируемой хиральностью представляет собой фосфотиоатную межнуклеотидную связь Sp с контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления межнуклеотидная связь с контролируемой хиральностью представляет собой фосфотиоатную межнуклеотидную связь Rp с контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды содержат по меньшей мере одну фосфотиоатную межнуклеотидную связь Sp с контролируемой хиральностью и по меньшей мере одну межнуклеотидную связь Rp с контролируемой хиральностью.

Метаболиты и укороченные версии олигонуклеотидов

[00560] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, соответствует метаболиту, получаемому путем расщепления (например, ферментативного расщепления под действием нуклеазы) более длинного олигонуклеотида, например более длинного НТТ-олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к НТТ-олигонуклеотиду, который соответствует метаболиту, получаемому путем расщепления НТТ-олигонуклеотида, описанного в данном документе. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к НТТ-олигонуклеотиду, который соответствует части или фрагменту НТТ-олигонуклеотида, раскрытого в данном документе.

[00561] Проводили несколько экспериментов, в которых олигонуклеотид инкубировали in vitro в присутствии любого из различных веществ, содержащих нуклеазы. В различных экспериментах такие вещества включают гомогенат головного мозга, спинномозговую жидкость или плазму крови, полученные от крыс Спрег-Доули или яванского макака. Плазму крови гепаринизировали. Олигонуклеотиды инкубировали в течение различных моментов времени (например, 0, 1, 2, 3, 4 или 5 дней в случае гомогената тканей головного мозга с периодом предварительной инкубации 0, 1 или 2 дня; 0, 1, 2, 4, 8, 16, 24 или 48 часов в случае спинномозговой жидкости; или 0, 1, 2, 4, 8, 16 или 24 часов в случае плазмы крови). Предварительная инкубация означает, что гомогенат инкубируют при 37 градусах С в течение 0, 24 или 48 ч для активации ферментов перед добавлением олигонуклеотида. Конечные концентрация и объем олигонуклеотидов составляли 20 мкМ в 200 мкл. Продукты, полученные путем расщепления олигонуклеотидов, анализировали с помощью LC/MS.

[00562] Длина одного олигонуклеотида составляла 20 оснований, и его тестировали на гомогенате головного мозга крыс с получением основных метаболитов, которые были усечены на 5'-конце на 4, 10, 11, 12 или 13 оснований, оставляя метаболиты, представляющие собой 3'-конец олигонуклеотида и имеющие 16, 10, 9, 8 или 7 оснований в длину соответственно. Данный олигонуклеотид также давал метаболит, который представлял собой 5'-фрагмент, которого имел 12 оснований в дину (усеченный на 3'-конце на 8 оснований). Длина второго олигонуклеотида составляла 20 оснований, и его тестировали на гомогенате головного мозга крыс с получением основных метаболитов, которые были усечены на 3'-конце на 4, 8, 9 или 10 оснований, оставляя метаболиты, представляющие собой 5'-конец олигонуклеотида и имевшие 16, 12, 11 или 10 оснований в длину соответственно. Два протестированных олигонуклеотида содержат межнуклеотидные связи, которые представляют собой фосфодиэфирные связи, фосфотиоатные связи в конфигурации Rp и фосфотиоатные связи в конфигурации Sp.В целом, фосфодиэфирные связи были более лабильными, чем фосфотиоатные связи в конфигурации Rp или фосфотиоатные связи в конфигурации Sp.В некоторых случаях метаболит олигонуклеотида представлял продукт расщепления по природной фосфатной связи.

[00563] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к олигонуклеотиду, который соответствует метаболиту олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, раскрытого в данном документе. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к олигонуклеотиду, который на 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 или более оснований короче олигонуклеотида, раскрытого в данном документе. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к олигонуклеотиду, который имеет последовательность оснований, которая на 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 или более оснований короче последовательности олигонуклеотида, раскрытого в данном документе.

[00564] В некоторых вариантах осуществления метаболит обозначается как 3'-N-# или 5'-N-#, где # указывает число удаленных оснований, а 3' или 5' указывает на то, с какого конца молекулы были удалены основания. Например, 3'-N-1 указывает фрагмент или метаболит, где 1 основание было удалено с 3'-конца.

[00565] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к олигонуклеотиду, который соответствует фрагменту или метаболиту олигонуклеотида, раскрытого в данном документе, где фрагмент или метаболит могут описываться как соответствующие 3'-N-1, 3'-N-2, 3'-N-3, 3'-N-4, 3'-N-5, 3'-N-6, 3'-N-7, 3'-N-8, 3'-N-9, 3'-N-10, 3'-N-11, 3'-N-12, 5'-N-1, 5'-N-2, 5'-N-3, 5'-N-4, 5'-N-5, 5'-N-6, 5'-N-7, 5'-N-8, 5'-N-9, 5'-N-10, 5'-N-11 или 5'-N-12 олигонуклеотида, описанного в данном документе.

[00566] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к олигонуклеотиду, который на 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 или более оснований на 5'-конце короче олигонуклеотида, раскрытого в данном документе. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к олигонуклеотиду, который имеет последовательность оснований, которая на 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 или более оснований на 5'-конце короче последовательности олигонуклеотида, раскрытого в данном документе. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к олигонуклеотиду, который на 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 или более оснований на 3'-конце короче олигонуклеотида, раскрытого в данном документе. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к олигонуклеотиду, который имеет последовательность оснований, которая на 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 или более оснований на 3'-конце короче последовательности олигонуклеотида, раскрытого в данном документе.

[00567] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к метаболиту, который соответствует метаболиту олигонуклеотида, где метаболит усечен на 5'-и/или 3'-конце по сравнению с олигонуклеотидом, раскрытым в данном документе. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к метаболиту, который соответствует метаболиту олигонуклеотида, где метаболит усечен как на 5'-, так и на 3'-концах по сравнению с олигонуклеотидом, раскрытым в данном документе. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к олигонуклеотиду, который в целом на 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 или более оснований на 5'- и/или 3'-конце короче олигонуклеотида, раскрытого в данном документе. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к олигонуклеотиду, который имеет последовательность оснований, которая в целом на 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 или более оснований на 5'- и/или 3'-конце короче последовательности олигонуклеотида, раскрытого в данном документе.

[00568] В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к олигонуклеотиду, который может быть представлен продуктом расщепления олигонуклеотида, раскрытого в данном документе, который расщепляется по фосфодиэфирной связи. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к олигонуклеотиду, который может быть представлен продуктом расщепления олигонуклеотида, раскрытого в данном документе, если такой олигонуклеотид расщеплен по фосфотиоатной связи в конфигурации Rp. В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к олигонуклеотиду, который может быть представлен продуктом расщепления олигонуклеотида, раскрытого в данном документе, если такой олигонуклеотид расщеплен по фосфотиоатной связи в конфигурации Rp.

Определение характеристик и оценка

[00569] В некоторых вариантах осуществления свойства и/или виды активности НТТ-олигонуклеотидов и композиций на их основе можно характеризовать и/или оценивать с использованием различных технологий, доступных специалистам в данной области техники, например, биохимических анализов (например, анализов с использованием РНКазы Н), клеточных анализов, животных моделей, клинических испытаний и т.д.

[00570] В некоторых вариантах осуществления способ идентификации и/или определения характеристики композиции на основе олигонуклеотида, например композиции на основе НТТ-олигонуклеотида, включает стадии:

обеспечения по меньшей мере одной композиции, содержащей совокупность олигонуклеотидов и

оценки доставки относительно эталонной композиции.

[00571] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен способ идентификации и/или определения характеристик композиции на основе олигонуклеотида, например композиции на основе НТТ-олигонуклеотида, включающий стадии:

обеспечения по меньшей мере одной композиции, содержащей совокупность олигонуклеотидов и

оценки захвата клетками относительно эталонной композиции.

[00572] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен способ идентификации и/или определения характеристик композиции на основе олигонуклеотида, например композиции на основе НТТ-олигонуклеотида, включающий стадии:

обеспечения по меньшей мере одной композиции, содержащей совокупность олигонуклеотидов и

оценки снижения уровня транскриптов гена-мишени и/или кодируемого им продукта относительно эталонной композиции.

[00573] В некоторых вариантах осуществления свойства и/или виды активности олигонуклеотидов, например НТТ-олигонуклеотидов, и композиций на их основе сравнивают с эталонными олигонуклеотидами и композициями на их основе соответственно.

[00574] В некоторых вариантах осуществления эталонная композиция на основе олигонуклеотида представляет собой композицию на основе стереомерно неупорядоченного олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления эталонная композиция на основе олигонуклеотида представляет собой стереомерно неупорядоченную композицию из олигонуклеотидов, в которых все межнуклеотидные связи являются фосфотиоатными. В некоторых вариантах осуществления эталонная композиция на основе олигонуклеотида представляет собой композицию на основе ДНК-олигонуклеотида со всеми фосфатными связями. В некоторых вариантах осуществления эталонная композиция на основе олигонуклеотида в остальном идентична представленной композиции на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, за исключением того, что она не характеризуется контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления эталонная композиция на основе олигонуклеотида в остальном идентична представленной композиции на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, за исключением того, что она характеризуется отличающимся паттерном стереохимии. В некоторых вариантах осуществления эталонная композиция на основе олигонуклеотида является подобной представленной композиции на основе олигонуклеотида, за исключением того, что она имеет отличающуюся модификацию одного или нескольких Сахаров, оснований и/или межнуклеотидных связей, или паттерн модификаций. В некоторых вариантах осуществления композиция на основе олигонуклеотида является стереомерно неупорядоченной, и эталонная композиция на основе олигонуклеотида также является стереомерно неупорядоченной, но они различаются с точки зрения модификации(-й) сахара и/или оснований или их паттернов.

[00575] В некоторых вариантах осуществления эталонная композиция представляет собой композицию из олигонуклеотидов, характеризующихся одинаковой последовательностью оснований и одинаковыми химическими модификациями. В некоторых вариантах осуществления эталонная композиция представляет собой композицию из олигонуклеотидов, характеризующихся одинаковой последовательностью оснований и одинаковым паттерном химических модификаций. В некоторых вариантах осуществления эталонная композиция представляет собой не характеризующуюся контролируемой хиральностью (или стереомерно неупорядоченную) композицию из олигонуклеотидов, характеризующихся одинаковой последовательностью оснований и химическими модификациями. В некоторых вариантах осуществления эталонная композиция представляет собой не характеризующуюся контролируемой хиральностью (или стереомерно неупорядоченную) композицию из олигонуклеотидов одинакового состава, но в остальном идентичную представленной композиции на основе олигонуклеотидов с контролируемой хиральностью.

[00576] В некоторых вариантах осуществления суффикс "r" добавляют к обозначению композиции на основе стереомерно неупорядоченного олигонуклеотида; например, WV-2614, которая является стереомерно неупорядоченной, также обозначается WV-2614r. В некоторых вариантах осуществления суффикс "р" добавляют к обозначению композиции на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью (или стереомерно чистой); например, WV-2599, которая является стереомерно чистой, также обозначается WV-2599 p. Суффиксы "r" и "р" являются необязательными.

[00577] В некоторых вариантах осуществления эталонная композиция представляет собой композицию из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований, но отличающиеся химические модификации, включая без ограничений химические модификации, описанные в данном документе. В некоторых вариантах осуществления эталонная композиция представляет собой композицию из олигонуклеотидов, имеющих одинаковую последовательность оснований, но отличающиеся паттерны межнуклеотидных связей и/или стереохимии межнуклеотидных связей и/или химических модификаций.

[00578] В данной области техники известны различные способы обнаружения генных продуктов, экспрессия, уровень и/или активность которых может меняться после введения или применения представленного олигонуклеотида. Например, транскрипты и их нокдаун можно обнаружить и количественно определить с помощью qPCR, а уровни белка можно определить с помощью вестерн-блоттинга.

[00579] В некоторых вариантах осуществления оценку эффективности олигонуклеотидов можно выполнять с помощью биохимических анализов или in vitro в клетках. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды можно вводить в клетки с помощью различных способов, доступных специалистам в данной области техники, например, путем гимнотической доставки, трансфекции, липофекции и т.д.

[00580] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид тестируют на клеточной или животной модели HD.

[00581] В некоторых вариантах осуществления клеточная модель HD представляет собой клетку, содержащую ген НТТ дикого типа и/или мутантный ген. В некоторых вариантах осуществления клеточную модель или животную модель, которая содержит ген НТТ дикого типа, можно применять в качестве контроля в эксперименте, предусматривающем нокдаун мутантного гена НТТ в соответствующей клеточной модели или животной модели. В некоторых вариантах осуществления, где НТТ-олигонуклеотид сконструирован для нокдауна как аллелей НТТ дикого типа, так и мутантных аллелей (например, панспецифический НТТ-олигонуклеотид), клеточную модель и/или животную модель, содержащую аллель НТТ дикого типа и/или мутантный аллель, можно использовать для оценки способности НТТ-олигонуклеотида обеспечивать нокдаун НТТ.

[00582] В некоторых вариантах осуществления клеточная модель HD представляет собой нейрон iCell или нейрон, происходящий из iPSC.

[00583] В некоторых вариантах осуществления клеточная модель HD представляет собой клетку РС12, экспрессирующую мутантный ген хантингтина.

[00584] В некоторых вариантах осуществления клеточная модель HD представляет собой фибробласт от пациента с HD.

[00585] В некоторых вариантах осуществления клеточная модель HD представляет собой клетку феохромоцитомы крысы РС6-3, которая, по некоторым сообщениям, была котрансфицирована плазмидами CMV-HTT человека (37Qs) и шпилечной siRNA U6. См., например, US 10072264.

[00586] В некоторых вариантах осуществления клеточная модель HD представляет собой клетку полосатого тела, введенную в культуру от мышей с нокином Hdh Q111, которые несут 111 CAG-повторов, встроенных в локус хантингтина мыши. См., например, Trettel et al. Human Mol. Genet., 2000, 9, 2799-2809.

[00587] В некоторых вариантах осуществления клеточная модель HD представляет собой линию клеток полосатого тела мыши с хантингтином дикого типа, STHdhQ7/7 (Q7/7), и/или мутантным хантингтином, STHdhQ111/111 (Q111/111).

[00588] В некоторых вариантах осуществления клеточная модель HD представляет собой линию клеток полосатого тела мыши с хантингтином дикого типа, STHdhQ7/7 (Q7/7), и мутантным хантингтином, STHdhQ111/111 (Q111/111).

[00589] В некоторых вариантах осуществления клеточная модель содержит конструкцию, охватывающую экзоны 1-3 гена НТТ мыши, содержащего экспансию из 79 CAG-повторов, мышиный эквивалент N171-82Q.

[00590] Многие технологии для оценки видов активности и/или свойств олигонуклеотидов у животных известны и применяются на практике специалистами в данной области техники, и их можно использовать в соответствии с настоящим изобретением. В некоторых вариантах осуществления оценку олигонуклеотида можно выполнять на животном. Для оценки свойств и видов активности представленных олигонуклеотидов и композиций на их основе можно использовать различных животных.

[00591] Идентификация гена НТТ позволила разработать животные модели заболевания, включая трансгенных мышей, несущих мутировавшие формы гена человека или мыши. Модели включают мышей, несущих фрагмент гена человека, как правило, первый один или два экзона, которые содержат экспансию глутамина (или эквивалент дикого типа), в дополнение к ненарушенному эндогенному гену мыши дикого типа; мышей, несущих полноразмерный хантингтин человека с областью экспансии глутаминового повтора снова с эндогенным геном мыши; а также мышей с патогенными CAG-повторами, встроенными область CAG-повторов. Все модели характеризуются по меньшей мере некоторыми общими признаками с заболеванием человека. Данные мыши позволили протестировать целый ряд различных терапевтических средств для предупреждения, уменьшения интенсивности и лечения HD (см., например, Hersch and Ferrante, 2004. NeuroRx. 1: 298-306) с использованием целого ряда конечных точек. Считается, что соединения функционируют за счет целого ряда различных механизмов, включая подавление транскрипции, ингибирование каспазы, ингибирование гистондеацетилазы, антиоксидантный механизм, ингибирование хантингтина/антиоксидантный механизм, биогенергетический/антиоксидантный механизм, антиэксайтотоксический и антиапоптозный механизмы.

[00592] В литературе сообщалось о различных животных моделях HD. В качестве неограничивающих примеров они включают модели, о которых сообщалось в Diaz-Hernandez et al. 2005. J. Neurosci. 25: 9773-81; Wang et al. 2005. Nuerosci. Res. 53: 241-9; Machida et al. 2006. Biochem. Biophys. Res. Commun. 343: 190-7; Harper et al. 2005. PNAS 102: 5820-25; или Rodrigues-Lebron et al. 2005. Mol. Ther. 12: 618-33; Mangiarini L. et al., Cell. 1996 Nov; 87(3): 493-506; и Southwell et al. Science Translational Medicine 03 Oct 2018: Vol. 10, Issue 461, eaar3959; или Meade et al., J. Comp. Neurol. 449: 241-269, 2002.

[00593] Информацию, касающуюся животных моделей и других экспериментальных процедур, связанных с НТТ, см. в источниках, указанных в данном документе или в соответствующей области техники, включая, например Hersch and Ferrante 2004 NeuroRx. 1: 298-306; Diaz-Hernandez et al. 2005. J. Neurosci. 25: 9773-81; Wang et al. 2005. Nuerosci. Res. 53: 241-9; Machida et al. 2006. Biochem. Biophys. Res. Commun. 343: 190-7; Harper et al. 2005. PNAS 102: 5820-25; Rodrigues-Lebron et al. 2005. Mol. Ther. 12: 618-33; Nguyen et al. 2005. PNAS 102: 11840-45.

[00594] В некоторых вариантах осуществления животная модель HD представляет собой мышь, несущую полноразмерный хантингтин человека с областью экспансии глутаминового повтора, снова с эндогенным геном мыши; и мышей с патогенными CAG-повторами, встроенными в область CAG-повторов. В некоторых вариантах осуществления животная модель HD представляет собой мышиную модель R6/2 или R6/1.

[00595] В некоторых вариантах осуществления животная модель HD представляет собой трансгенную мышиную модель R6/2, по некоторым сообщениям в геном которой были интегрирована 1 тысяча нуклеотидов гена хантингтина человека, включая 5'-UTR экзона 1 и первые 262 пары оснований интрона 1. См., например, Mangiarini L. et al., Cell, 1996, 87, 493-506. По некоторым сообщениям данный трансген содержит 144 CAG-повтора. По некоторым сообщениям трансген кодирует приблизительно 3% N-концевой области белка хантингтина, экспрессией которого управляет промотор хантингтина человека. По некоторым сообщениям уровни экспрессии данной усеченной версии белка хантингтина человека составляют приблизительно 75% от уровней эндогенного белка хантингтина мыши. По некоторым сообщениям трансгенные мыши R6/2 проявляют симптомы болезни Хантингтона человека и дисфункции головного мозга.

[00596] В некоторых вариантах осуществления животная модель HD представляет собой трансгенных мышей YAC128, которые, по некоторым сообщениям, имеют искусственную дрожжевую хромосому (YAC), несущую полный ген хантингтина, включая промоторную область и 128 CAG-повторов. См., например, Hodgson J.G. et al., Human Mol. Genet., 1998, 5, 1875. По некоторым сообщениям такая YAC экспрессирует весь ген человека, кроме экзона 1. По

некоторым сообщениям данные трансгенные мыши не экспрессируют эндогенный хантингтин мыши.

[00597] В некоторых вариантах осуществления животная модель HD представляет собой мышей Q111, у которых эндогенный ген хантингтина мыши, по некоторым сообщениям, содержит 111 CAG-повторов, встроенных в экзон 1 гена. См., например, Wheeler V. С.et al., Human Mol. Genet., 8, 115-122).

[00598] В некоторых вариантах осуществления животная модель HD представляет собой трансгенных мышей Q150, где, по некоторым сообщениям, CAG-повтор в экзоне 1 гена хантингтина мыши дикого типа заменен на 150 CAG-повторов. См., например, Li С.Н. et al., Human Mol. Genet., 2001, 10, 137.

[00599] В некоторых вариантах осуществления животная модель HD представляет собой тетрациклин-регулируемую мышиную модель HD. См., например, Yamamoto et al., Cell, 101(1), 57-66 (2000).

[00600] В некоторых вариантах осуществления животная модель HD представляет собой любую из трансгенных мышиных моделей и моделей с нокином, описанных в Bates et al., Curr Opin Neurol 16:465-470, 2003.

[00601] В некоторых вариантах осуществления животная модель HD представляет собой мышиную модель HD, где добавление двух дополнительных экзонов к трансгену и ограничение экспрессии с помощью прионного промотора, по некоторым сообщениям, привело к мышиной модели HD, демонстрирующей важные характеристики HD, но менее агрессивное прогрессирование заболевания. См., например, Schilling et al., Hum Mol Genet 8(3):397-407, 1999; и Schilling et al., Neurobiol Dis 8:405-418, 2001.

[00602] В некоторых вариантах осуществления животная модель HD представляет собой мышиную модель с нокином, где Детлофф (Detloff) и коллеги, по некоторым сообщениям, создали мышиную модель с нокином с расширением эндогенного CAG-повтора мыши до приблизительно 150 CAG. По некоторым сообщениям данная модель, линия CHL2, демонстрирует более агрессивные фенотипы, чем предыдущие мышиные модели с нокином, содержащие меньшее количество повторов. По некоторым сообщениям измеряемые неврологические дефициты включают сжимание конечностей, нарушения походки, ядерные включения и астроглиоз. Lin et al., Hum. Mol. Genet., 10(2), 137-44 (2001).

[00603] В некоторых вариантах осуществления клеточная модель или животная модель(например, мышиная модель) содержит конструкцию, охватывающую экзоны 1-3 гена НТТ мыши, содержащую экспансию из 79 CAG-повторов, мышиный эквивалент N171-82Q.

[00604] В некоторых вариантах осуществления животная модель HD представляет собой мышиную модель Борчелта (N171-82Q, линия 81) или модель Детлоффа с нокином, линия CHL2.

[00605] В некоторых вариантах осуществления животная модель HD представляет собой модель Борчелта, N171-82Q, для которой, по некоторым сообщениям, характерны более высокие уровни РНК, чем у дикого типа, но сниженные количества мутантного белка по сравнению с эндогенным НТТ. По некоторым сообщениям мыши N171-82Q демонстрируют нормальное развитие в течение первых 1-2 месяцев, после чего наблюдают отсутствие прибавки веса, прогрессирующую потерю координации, гипокинез и треморы.

[00606] В некоторых вариантах осуществления животная модель HD представляет собой мышиную модель болезни Хантингтона (HD), экспрессирующую мутантный экзон 1. См., например, WO 2018145009.

[00607] В некоторых вариантах осуществления животная модель HD представляет собой крысу. См., например, Jae K. Ryu et al. Neurobiology of Disease, Volume 16, Issue 1, June 2004, Pages 68-77; O. Isacson, Neuroscience, Volume 22, Issue 2, August 1987, Pages 481-497; и Stephan von Horsten et al., Human Molecular Genetics, Volume 12, Issue 6, 15 March 2003, Pages 617-624.

[00608] В некоторых вариантах осуществления животная модель HD представляет собой обезьяну. См., например, Kenya Sato and Erika Sasaki, Journal of Human Genetics, volume 63, pages 125-131 (2018); и Kittiphong Putkhao, Cloning Transgenes. 2013; 2: 1000116.

[00609] Дополнительные документы, касающиеся применения животных моделей HD, включают Ian Fyfe Nature Reviews Neurology (2018); и Kenya Sato and Erika Sasaki, Journal of Human Genetics, volume 63, pages 125 131 (2018).

[00610] В некоторых вариантах осуществления, где олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, нацеливается на конкретный вариант SNP, может потребоваться тестирование олигонуклеотида на конкретном подопытном животном. Однако также может случиться, что подопытное животное может не иметь в своем геноме комплементарную последовательность данного варианта SNP. В таком случае может потребоваться сконструировать олигонуклеотид, который идентичен подлежащему тестированию НТТ-олигонуклеотиду, за исключением того, что он содержит вариант SNP, который является комплементарным варианту SNP у подопытного животного. Такой олигонуклеотид может называться, например, заменителем подлежащего тестированию НТТ-олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления представленный НТТ-олигонуклеотид идентичен любому НТТ-олигонуклеотиду, описанному в данном документе, или любому олигонуклеотиду, который содержит по меньшей мере 10 смежных оснований из него, за исключением того, что олигонуклеотид содержит вариант SNP, отличающийся от описанного в данном документе.

[00611] В некоторых вариантах осуществления с помощью животной модели, которой вводят олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, можно оценить безопасность и/или эффективность.

[00612] В некоторых вариантах осуществления можно оценить эффект(-ы) введения олигонуклеотида животному, включая любые эффекты в отношении поведения, воспаления и токсичности. В некоторых вариантах осуществления после введения дозы за животными можно наблюдать в отношении признаков токсичности, включая проблемы с уходом за шерстью, недостаточное потребление пищи и любых других признаков заторможенности. В некоторых вариантах осуществления на мышиной модели болезни Хантингтона после введения НТТ-олигонуклеотида можно осуществлять отслеживание животных для определения времени проявления фенотипа сжимания задней лапы.

[00613] В некоторых вариантах осуществления после введения животному НТТ-олигонуклеотида животное можно умертвить и можно выполнять анализ тканей или клеток для определения изменений в мутантном или НТТ дикого типа или других биохимических или других изменений. В некоторых вариантах осуществления после проведения некропсии печень, сердце, легкое, почку и селезенку можно собрать, зафиксировать и обработать для гистопатологической оценки (стандартное исследование предметных стекол с тканями, окрашенными гематоксилином и эозином, с помощью световой микроскопии).

[00614] В некоторых вариантах осуществления после введения животному олигонуклеотида, например НТТ-олигонуклеотида, можно проводить отслеживание или оценку изменений в поведении. В некоторых вариантах осуществления такую оценку можно выполнять с использованием ускоряющегося вращающегося стержня и теста "открытого поля". В некоторых вариантах осуществления анализ с ускоряющимся вращающимся стержнем можно проводить с использованием вращающегося стержня для грызунов от San Diego Instruments™ (Сан-Диего, Калифорния, США). В некоторых вариантах осуществления также можно проводить автоматизированную 30-минутную оценку поведения в камере "открытого поля", например, с использованием системы видеослежения Noldus Etho Vision для записи и оцифровки движений мыши (Noldus Information Technology, Нидерланды). В некоторых вариантах осуществления можно использовать программное обеспечение для разделения движений мыши на эпизоды замедления и сегменты движения вперед и вычисления для них дополнительных параметров, таких как скорость и ускорение. В некоторых вариантах осуществления после введения НТТ-олигонуклеотида подопытное животное можно оценивать по выполнению теста на вращающемся стержне (RR) или параметрам в тесте "открытого поля", таким как пройденное расстояние, максимальная скорость, число остановок, связанных с тревогой (т.е. избегание центра поля). В некоторых вариантах осуществления подопытное животное можно использовать для оценки фармакокинетики и фармакодинамики НТТ-олигонуклеотида.

[00615] Различные эффекты тестирования на животных, описанные в данном документе, также можно отслеживать у субъектов-людей или пациентов после введения НТТ-олигонуклеотида.

[00616] В дополнение, эффективность НТТ-олигонуклеотида у пациента-человека можно измерять путем оценки после введения олигонуклеотида любого из различных параметров, известных в данной области техники, включая без ограничений следующее: общий показатель двигательной активности (TMS); тест на сопоставление символов и цифр (SDMT); тест Струпа на чтение слов (SWRT); показатель общей функциональной способности (TFC) и/или составную единую оценочную шкалу болезни Хантингтона (cUHDRS).

[00617] В некоторых вариантах осуществления после лечения человека олигонуклеотидом или после контакта клетки или ткани in vitro с олигонуклеотидом, клетки и/или ткани собирают для анализа.

[00618] В некоторых вариантах осуществления в различных клетках и/или тканях уровни нуклеиновой кислоты НТТ-мишени можно количественно определять с помощью способов, доступных в данной области техники, многие из которых можно выполнять с помощью коммерчески доступных наборов и материалов. Такие способы включают, например, нозерн-блоттинг, конкурентную полимеразную цепную реакцию (ПНР), количественную ПНР в реальном времени и т.д. Анализ РНК можно проводить на общей клеточной РНК или поли(А) + мРНК. Зонды и праймеры разрабатываются для гибридизации с нуклеиновой кислотой, подлежащей обнаружению. Способы разработки зондов и праймеров для ПНР в реальном времени хорошо известны и широко применяются на практике в данной области техники. Например, для обнаружения и количественной оценки РНК НТТ приводимый в качестве примера способ включает выделение общей РНК (например, включающей мРНК) из клетки или животного, обработанных олигонуклеотидом или композицией, и анализ РНК с помощью обратной транскрипции и/или количественной ПНР в реальном времени, например, как описано в данном документе или в Moon et al. 2012 Cell Metab. 15: 240-246.

[00619] В некоторых вариантах осуществления уровни белка можно оценивать или количественно определять с помощью различных способов, известных в данной области техники, например, твердофазного иммуноферментного анализа (ELISA), вестерн-блоттинг-анализа (иммуноблоттинга), иммуноцитохимии, сортировки флуоресцентно-активированных клеток (FACS), иммуногистохимии, иммунопреципитации, анализов активности бежа (например, анализов активности каспазы) и количественных белковых анализов. Антитела, применимые для обнаружения белков мыши, крысы, обезьяны и человека, являются коммерчески доступными или могут быть получены в случае необходимости. Например, различные антитела к НТТ являются коммерчески доступными, и/или они сообщались, например, среди тех, которые являются коммерчески доступными от Lifespan Biosciences, Сиэтл, Вашингтон, США; Sigma-Aldrich, Сент-Луис, Миссури, США; и т.д.

[00620] В данной области техники являются доступными и/или известными различные технологии для определения уровней олигонуклеотидов или других нуклеиновых кислот. Такие технологии применимы для обнаружения НТТ-олигонуклеотидов при введении, чтобы оценить, например, доставку, захват клетками, стабильность, распределение и т.д.

[00621] В некоторых вариантах осуществления для оценки данных, полученных в различных анализах, и для выбора особенно пригодных олигонуклеотидов, например, пригодных НТТ-олигонуклеотидов, с определенными свойствами и активностью используются критерии отбора. В некоторых вариантах осуществления критерии отбора включают IC₅₀, составляющую менее приблизительно 10 нМ, менее приблизительно 5 нМ или менее приблизительно 1 нМ. В некоторых вариантах осуществления критерии отбора по анализу стабильности включают стабильность, составляющую по меньшей мере 50% [по меньшей мере 50% олигонуклеотида остается и/или может быть обнаружено] в день 1. В некоторых вариантах осуществления критерии отбора по анализу стабильности включают стабильность, составляющую по меньшей мере 50% в день 2. В некоторых вариантах осуществления критерии отбора по анализу стабильности включают стабильность, составляющую по меньшей мере 50% в день 3. В некоторых вариантах осуществления критерии отбора по анализу стабильности включают стабильность, составляющую по меньшей мере 50% в день 4. В некоторых вариантах осуществления критерии отбора по анализу стабильности включают стабильность, составляющую по меньшей мере 50% в день 5. В некоторых вариантах осуществления критерии отбора по анализу стабильности составляют по меньшей мере 80% [по меньшей мере 80% олигонуклеотида остается] в день 5.

[00622] В некоторых вариантах осуществления ген-мишень, например НТТ, представляет собой ген дикого типа. В некоторых вариантах осуществления ген-мишень содержит одну или несколько мутаций. В некоторых вариантах осуществления ген-мишень содержит мутацию, ассоциированную с нарушением. В некоторых вариантах осуществления мутация представляет собой однонуклеотидный полиморфизм (SNP). В некоторых вариантах осуществления последовательности оснований представленных олигонуклеотидов являются комплементарными последовательностям-мишеням в транскриптах, содержащих мутации или SNP, ассоциированные с состоянием, нарушением или заболеванием. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды и композиции обеспечивают селективное снижение уровней транскриптов, содержащих мутацию или SNP, ассоциированные с состоянием, нарушением или заболеванием, и/или кодируемых ими продуктов по сравнению с транскриптами дикого типа и/или транскриптами, в меньшей степени ассоциированными с состоянием, нарушением или заболеванием, и/или кодируемыми ими продуктами. Во многих вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды являются комплементарными транскриптам, содержащим мутации или SNP, ассоциированные с состояниями, нарушениями или заболеваниями, в сайтах мутации или SNP, при этом они имеют ошибочные основания при гибридизации с транскриптами дикого типа или в меньшей степени ассоциированными транскриптами в сайтах, соответствующих мутациям или SNP. В некоторых вариантах осуществления мутация или SNP расположены на расстоянии 0, 1, 2, 3 или 4 межнуклеотидных связей от межнуклеотидной связи Rp или Ор, когда транскрипт, содержащий мутацию или SNP, гибридизируется с представленным олигонуклеотидом.

[00623] В некоторых вариантах осуществления эффективность НТТ-олигонуклеотида оценивают непосредственно или опосредованно путем отслеживания, измерения или обнаружения изменения состояния, нарушения или заболевания или биологического пути, ассоциированного с НТТ.

[00624] В некоторых вариантах осуществления эффективность НТТ-олигонуклеотида оценивают непосредственно или опосредованно путем отслеживания, измерения или обнаружения изменения биохимического явления, ассоциированного с болезнью Хантингтона (HD), такого как любое из: накопления нерастворимого бежа; накопления агрегатов бежа хантингтина; скоплений нейронов в полосатом теле; изменения размера и числа внутриядерных включений в нейронах и других маркеров HD; изменения регуляции экспрессии DARPP-32; атрофии полосатого тела; дегенерации нейронов полосатого тела и коры; изменения уровня глюкозы и/или инсулина в крови или гибели нейронов и глиоза, в частности, в коре и полосатом теле.

[00625] В некоторых вариантах осуществления эффективность НТТ-олигонуклеотида оценивают непосредственно или опосредованно путем отслеживания, измерения или обнаружения изменения ответа, на который воздействует нокдаун НТТ.

[00626] В некоторых вариантах осуществления представленный олигонуклеотид (например, НТТ-олигонуклеотид) можно анализировать с помощью анализа последовательности, чтобы определить какие другие гены [например, гены, которые не являются геном-мишенью (например, НТТ)] имеют последовательность, которая комплементарна последовательности оснований представленного олигонуклеотида (например, НТТ-олигонуклеотида) или которая имеет 0, 1, 2 или более ошибочных оснований относительно последовательности оснований представленного олигонуклеотида (например, НТТ-олигонуклеотида). Нокдаун данных потенциальных нецелевых мишеней под действием олигонуклеотида, при его присутствии, можно определять для оценки потенциальных нецелевых эффектов олигонуклеотида (например, НТТ-олигонуклеотида). В некоторых вариантах осуществления нецелевой эффект также называют не предусмотренным эффектом и/или связан с гибридизацией со сторонней (не являющейся мишенью) последовательностью или геном.

[00627] Олигонуклеотиды, которые прошли оценку и тестирование в отношении эффективности осуществления нокдауна НТТ, имеют различные пути применения, например, для лечения или предупреждения состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ, или их симптомов.

[00628] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид, который прошел оценку и тестирование в отношении его способности обеспечивать конкретный биологический эффект (например, снижение уровня, экспрессии и/или активности гена НТТ-мишени или его генного продукта), можно применять для лечения, уменьшения интенсивности и/или предупреждения состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ.

Состояния, нарушения или заболевания, связанные с НТТ

[00629] В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды и композиции на их основе способны обеспечивать снижение экспрессии и/или уровня гена НТТ-мишени или его генного продукта. В некоторых вариантах осуществления представленный олигонуклеотид или композиция нацеливаются на ген НТТ и применимы для лечения состояний, нарушений или заболеваний, связанных с НТТ. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены олигонуклеотиды и композиции для предупреждения и/или лечения состояний, нарушений или заболеваний, связанных с НТТ. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены способы предупреждения и/или лечения состояний, нарушений или заболеваний, связанных с НТТ, включающие введение субъекту, предрасположенному к ним или страдающему от них, терапевтически эффективного количества представленного НТТ-олигонуклеотида или композиции на его основе. Состояния, нарушения или заболевания, связанные с НТТ, подробно описаны в данной области техники.

[00630] В некоторых вариантах осуществления состояние, нарушение или заболевание, связанные с НТТ, представляют собой состояние, нарушение или заболевание, которые связаны, вызваны и/или ассоциированы с аномальной или чрезмерной активностью, уровнем и/или экспрессией, или аномальным распределением в ткани, или в межклеточном пространстве или внутри клеток гена НТТ или его генного продукта. В некоторых вариантах осуществления состояние, нарушение или заболевание, связанные с НТТ, ассоциированы с НТТ, если присутствие, уровень и/или форма транскрипции области НТТ, транскрипта НТТ и/или кодируемого ими продукта, коррелируют с частотой встречаемости и/или предрасположенностью к состоянию, нарушению или заболеванию (например, среди соответствующей популяции). В некоторых вариантах осуществления состояние, нарушение или заболевание, связанные с НТТ, представляют собой состояние, нарушение или заболевание, при которых снижение уровня, экспрессии и/или активности гена НТТ или его продукта приводит к уменьшению интенсивности, предупреждению и/или снижению тяжести состояния, нарушения или заболевания.

[00631] Примеры состояний, нарушений или заболеваний, связанных с НТТ, включают болезнь Хантингтона (HD), также известную как хорея Хантингтона. В некоторых вариантах осуществления состояние, нарушение или заболевание, связанные с НТТ, представляют собой ювенильную HD, акинетически-ригидный или вестфальский вариант HD.

[00632] Среди всего прочего в настоящем изобретении представлены способы применения

олигонуклеотидов, раскрытых в данном документе, которые способны нацеливаться на НТТ, для лечения и/или изготовления средства лечения для состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ. В некоторых вариантах осуществления последовательность оснований НТТ-олигонуклеотида или однонитевого средства для RNAi может содержать или состоять из последовательности оснований, которая имеет указанное максимальное количество ошибочных оснований (например, 1, 2, 3 и т.д.) относительно указанной последовательности оснований.

Лечение состояний, нарушений или заболеваний, связанных с НТТ

[00633] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен НТТ-олигонуклеотид, который нацеливается на НТТ (например, НТТ-олигонуклеотид, содержащий последовательность НТТ-мишень или последовательность, комплементарную последовательности НТТ-мишени). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен НТТ-олигонуклеотид, который управляет мишень-специфическим нокдауном НТТ. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен НТТ-олигонуклеотид, который управляет мишень-специфическим нокдауном НТТ, опосредованным РНКазой Н и/или РНК-интерференцией. В данном документе представлены различные олигонуклеотиды, способные нацеливаться на НТТ. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены способы предупреждения и/или лечения состояний, нарушений или заболеваний, связанных с НТТ, с использованием представленных НТТ-олигонуклеотидов и композиций на их основе. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены олигонуклеотиды и композиции на их основе для применения в качестве лекарственных препаратов, например, для состояний, нарушений или заболеваний, связанных с НТТ. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены олигонуклеотиды и композиции на их основе для применения в лечении состояний, нарушений или заболеваний, связанных с НТТ. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены олигонуклеотиды и композиции на их основе для изготовления лекарственных средств для лечения состояний, нарушений или заболеваний, связанных с НТТ.

[00634] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен способ предупреждения, лечения или уменьшения интенсивности состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ, у субъекта, предрасположенного к ним или страдающего от них, включающий введение субъекту терапевтически эффективного количества НТТ-олигонуклеотида или фармацевтической композиции на его основе.

[00635] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен способ лечения или уменьшения интенсивности состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ, у субъекта, страдающего от них, включающий введение субъекту терапевтически эффективного количества НТТ-олигонуклеотида или фармацевтической композиции на его основе.

[00636] В некоторых вариантах осуществления состояние, нарушение или заболевание, связанных с НТТ, представляют собой болезнь Хантингтона (HD), также известную как хорея Хантингтона. В некоторых вариантах осуществления состояние, нарушение или заболевание, связанные с НТТ, представляют собой ювенильную HD, акинетически-ригидный или вестфальский вариант HD.

[00637] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен способ снижения экспрессии гена НТТ в клетке, включающий приведение клетки в контакт с НТТ-олигонуклеотидом или композицией на его основе. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен способ снижения уровня транскрипта НТТ в клетке, включаюпшй: приведение клетки в контакт с НТТ-олигонуклеотидом или композицией на его основе. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен способ снижения уровня белка НТТ в клетке, включающий приведение клетки в контакт с НТТ олигонуклеотидом или композицией на его основе. В некоторых вариантах осуществления представленные способы селективно снижают уровни транскриптов НТТ и/или кодируемых ими продуктов, которые связаны с состояниями, нарушениями или заболеваниями.

[00638] По некоторым сообщениям НТТ экспрессируется во всех клетках, при этом самые высокие концентрации обнаруживаются в головном мозге и семенниках, а умеренные количества встречаются в печени, сердце и легких. В различных вариантах осуществления клетка находится в головном мозге, семенниках, печени, сердце или легких.

[00639] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен способ снижения экспрессии гена НТТ у млекопитающего, нуждающегося в этом, включающий введение млекопитающему липидной частицы с нуклеиновой кислотой, содержащей указанный НТТ-олигонуклеотид или композицию на его основе.

[00640] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен способ доставки НТТ-олигонуклеотида in vivo, включающий введение млекопитающему НТТ-олигонуклеотида или композиции на его основе.

[00641] В некоторых вариантах осуществления млекопитающим является человек. В некоторых вариантах осуществления млекопитающее поражено и/или страдает от состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ.

[00642] В некоторых вариантах осуществления специалист в области здравоохранения может идентифицировать субъекта или пациента, подходящих для лечения состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ, таких как болезнь Хантингтона (HD), или поставить им диагноз. Например, при неврологическом состоянии, нарушении или заболевании после физикального осмотра может последовать тщательное неврологическое обследование. В некоторых вариантах осуществления неврологическое обследование может оценивать двигательные и сенсорные навыки, функциональное состояние нервов, слух и речь, зрение, координацию и равновесие, психическое состояние и/или изменения настроения или поведения. Примеры симптомов неврологических состояний, нарушений или заболеваний, таких как болезнь Хантингтона (HD), включают слабость в руках, ногах, ступнях или лодыжках; невнятность речи; затруднение подъема передней части стопы и пальцев ног; слабость или неуклюжесть рук; мышечный паралич; ригидность мышц; непроизвольные подергивания или писчие движения (хорея); непроизвольные длительные контрактуры мышц (дистония); брадикинезию; утрату автоматических движений; нарушение осанки и равновесия; отсутствие гибкости; покалывание в частях тела; ощущения прохождения электрического тока, возникающие при движении головы; подергивания в руке, плечах и языке; затрудненное глотание; затрудненное дыхание; затрудненное жевание; частичную или полную потерю зрения; двоение в глазах; медленные или ненормальные движения глаз; тремор; нетвердую походку; усталость; потерю памяти; головокружение; трудности с мышлением или концентрацией; трудности с чтением или письмом; неверное толкование пространственного расположения; дезориентацию; депрессию; беспокойство; трудности с принятием решений и суждениями; потерю контроля над побуждениями; трудности с планированием и выполнением привычных задач; агрессивность; раздражительность; социальную изоляцию; перепады настроения; слабоумие; изменение привычного характера сна; блуждание и/или изменение аппетита.

[00643] В некоторых вариантах осуществления симптомом болезни Хантингтона является любое из: накопления нерастворимого белка; накопления агрегатов белка хантингтина; скоплений нейронов в полосатом теле; изменения размера и числа внутриядерных включений в нейронах и других маркеров HD; изменения регуляции экспрессии DARPP-32; атрофии полосатого тела; нейродегенерации в полосатом теле и коре; изменения уровней глюкозы и/или инсулина в крови или гибели нейронов и глиоза, в частности, в коре и полосатом теле.

[00644] В некоторых вариантах осуществления симптомом болезни Хантингтона является любое из: аномалий поведения и невропатологических аномалий; изменения выполнения теста на вращающемся стержне у подопытных животных; уменьшения потери веса; изменения продолжительности жизни; отклонения поведения от нормы; эмоциональных, двигательных и когнитивных изменений или нарушений; депрессии; раздражительности; непроизвольных движений (хорея); хореиформных движений; нарушения координации; чрезмерных спонтанных движений, которые являются нерегулярными по времени, беспорядочно распределенными и резкими; брадикинезии; дистонии; судорог; ригидности; дисфункции глазодвигательного нерва; тремора; нарушения тонкой двигательной координации; дизартрии; дисфагии; подкорковой деменции; прогрессирующей деменции или психического расстройства.

[00645] В некоторых вариантах осуществления представленный олигонуклеотид или композиция на его основе обеспечивают предупреждение, лечение, уменьшение интенсивности или замедление прогрессирования состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ, или по меньшей мере одного симптома состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ.

[00646] В некоторых вариантах осуществления способ по настоящему изобретению предназначен для лечения болезни Хантингтона у субъекта, где способ включает введение субъекту терапевтически эффективного количества НТТ-олигонуклеотида или фармацевтической композиции на его основе.

[00647] В некоторых вариантах осуществления представленный способ обеспечивает

уменьшение по меньшей мере одного симптома болезни Хантингтона, где способ включает введение субъекту терапевтически эффективного количества НТТ-олигонуклеотида или фармацевтической композиции на его основе.

[00648] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен способ лечения или снижения степени тяжести болезни Хантингтона на по меньшей мере один пункт или снижения медицинских последствий неалкогольного стеатогепатита у субъекта, включающий введение субъекту терапевтически эффективного количества НТТ-олигонуклеотида или фармацевтической композиции на его основе.

[00649] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен способ лечения и/или уменьшения интенсивности одного или нескольких симптомов, ассоциированных с состоянием, нарушением или заболеванием, связанными с НТТ, у млекопитающего, нуждающегося в этом, при этом способ включает введение млекопитающему терапевтически эффективного количества НТТ-олигонуклеотида или композиции на его основе. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен способ снижения предрасположенности к состоянию, нарушению или заболеванию, связанным с НТТ, у млекопитающего, нуждающегося в этом, при этом способ включает введение млекопитающему терапевтически эффективного количества НТТ-олигонуклеотида или композиции на его основе. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен способ предупреждения или задержки возникновения состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ, у млекопитающего, нуждающегося в этом, при этом способ включает введение млекопитающему терапевтически эффективного количества НТТ-олигонуклеотида или композиции на его основе. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен способ лечения и/или уменьшения интенсивности одного или нескольких симптомов, ассоциированных с состоянием, нарушением или заболеванием, связанными с НТТ, у млекопитающего, нуждающегося в этом, при этом способ включает: введение млекопитающему терапевтически эффективного количества липидной частицы с нуклеиновой кислотой, содержащей НТТ-олигонуклеотид. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен способ снижения предрасположенности к состоянию, нарушению или заболеванию, связанным с НТТ, у млекопитающего, нуждающегося в этом, при этом способ включает введение млекопитающему терапевтически эффективного количества липидной частицы с нуклеиновой кислотой, содержащей НТТ-олигонуклеотид. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен способ предупреждения или задержки возникновения состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ, у млекопитающего, нуждающегося в этом, при этом способ включает введение млекопитающему терапевтически эффективного количества липидной частицы с нуклеиновой кислотой, содержащей НТТ-олигонуклеотид. В некоторых вариантах осуществления млекопитающим является человек. В некоторых вариантах осуществления млекопитающее поражено и/или страдает от состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ.

[00650] В некоторых вариантах осуществления введение НТТ-олигонуклеотида пациенту или субъекту способно опосредовать любое одно или несколько из: замедления прогрессирования болезни Хантингтона, задержки возникновения HD или по меньшей мере одного ее симптома, улучшения одного или нескольких показателей при HD и/или увеличение времени выживания или продолжительности жизни пациента или субъекта.

[00651] В некоторых вариантах осуществления замедление прогрессирования заболевания относится к предупреждению или отсрочке клинически нежелательного изменения одного или нескольких клинических параметров, описанных в данном документе, у индивидуума, страдающего от HD. Бесспорно, в пределах компетенции врача является идентификация замедления прогрессирования заболевания у индивидуума, страдающего от HD, с использованием одного или нескольких описанных в данном документе тестов для оценки заболевания. Дополнительно, разумеется, врач может назначать индивидууму диагностические тесты, отличные от описанных в данном документе, для оценки степени прогрессирования заболевания у индивидуума, страдающего от ITD.

[00652] В некоторых вариантах осуществления отсрочка возникновения HD или ее симптома относится к задержке возникновения одного или нескольких нежелательных изменений одного или нескольких показателей HD, которые являются отрицательными при HD. Врач может использовать семейный анамнез HD или сравнения с другими пациентами с HD, имеющими аналогичный генетический профиль (например, число CAG-повторов), чтобы определить ожидаемый приблизительный возраст перехода от возникновения HD в HD, для определения наличия задержки возникновения HD.

[00653] В некоторых вариантах осуществления показатели HD включают параметры, используемые медицинский специалистом, таким как врач, для диагностики или измерения прогрессирования HD, и включают без ограничений результаты генетического тестирования, слух, движения глаз, силу, координацию, хорею (быстрые, резкие, непроизвольные движения), ощущения, рефлексы, равновесие, движение, психическое состояние, деменцию, расстройство личности, семейный анамнез, потерю веса и дегенерацию хвостатого ядра. Дегенерацию хвостатого ядра оценивают с помощью методик визуализации головного мозга, таких как магнитно-резонансная томография (MRI) или компьютерная томография (СТ).

[00654] В некоторых вариантах осуществления улучшение показателя HD относится к отсутствию нежелательного изменения или присутствию требуемого изменения одного или нескольких показателей HD. В одном варианте осуществления улучшение показателя HD подтверждается отсутствием измеряемого изменения одного или нескольких показателей HD. В другом варианте осуществления улучшение показателя HD подтверждается требуемым изменением одного или нескольких показателей HD.

[00655] В некоторых вариантах осуществления замедление прогрессирования заболевания может дополнительно включать увеличение времени выживания индивидуума, страдающего от HD. В некоторых вариантах осуществления увеличение времени выживания относится к среднему увеличению выживания индивидуума, страдающего от HD, относительно приблизительного времени выживания, основанного на прогрессировании HD и/или семейном анамнезе HD. Врач может использовать один или несколько тестов для оценки заболевания, описанных в данном документе, для прогнозирования приблизительного времени выживания индивидуума, страдающего от HD. Врач может дополнительно использовать семейный анамнез индивидуума, страдающего от HD, или сравнения с другими пациентами с HD с аналогичным генетическим профилем (например, числом CAG-повторов), для прогнозирования ожидаемого времени выживания.

[00656] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен способ подавления экспрессии НТТ в клетке, включающий: (а) приведение клетки в контакт с НТТ-олигонуклеотидом и (b) поддержание клетки, полученной на стадии (а), в течение времени, достаточного для того, чтобы произошла деградация мРНК-транскрипта гена НТТ, за счет чего подавляется экспрессия гена НТТ в клетке. В некоторых вариантах осуществления экспрессия НТТ подавляется на по меньшей мере 30%.

[00657] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен способ лечения состояния, нарушения или заболевания, опосредованного экспрессией НТТ, включающий введение человеку, страдающему от них, терапевтически эффективного количества НТТ-олигонуклеотида или композиции на его основе. В некоторых вариантах осуществления введение вызывает снижение экспрессии, активности и/или уровня транскрипта НТТ. В некоторых вариантах осуществления введение ассоциировано со снижением экспрессии, активности и/или уровня транскрипта НТТ. В некоторых вариантах осуществления введение сопровождается снижением экспрессии, активности и/или уровня транскрипта НТТ.

[00658] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлен НТТ-олигонуклеотид для применения у субъекта для лечения состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ. В некоторых вариантах осуществления состояние, нарушение или заболевание, связанные с НТТ, выбраны из болезни Хантингтона.

[00659] В некоторых вариантах осуществления субъекту вводят олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, или композицию на его основе и дополнительное средство и/или способ, например дополнительное терапевтическое средство и/или способ. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид или композицию на его основе можно вводить отдельно или в комбинации с одним или несколькими дополнительными терапевтическими средствами и/или средством лечения. При введении в комбинации каждый компонент можно вводить одновременно или последовательно в любом порядке в разные моменты времени. В некоторых вариантах осуществления каждый компонент можно вводить отдельно, но достаточно вплотную по времени для обеспечения требуемого терапевтического эффекта. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды и дополнительные терапевтические компоненты вводят одновременно. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды и дополнительные терапевтические компоненты вводят в виде одной композиции. В некоторых вариантах осуществления в один момент времени на подвергаемого введению субъекта воздействуют как представленных олигонуклеотидов, так и дополнительные компоненты одновременно.

[00660] В некоторых вариантах осуществления дополнительное терапевтическое средство или способ способны обеспечивать предупреждение, лечение, уменьшение интенсивности или замедление прогрессирования неврологического состояния, нарушения или заболевания. В некоторых вариантах осуществления дополнительное терапевтическое средство или способ способны обеспечивать предупреждение, лечение, уменьшение интенсивности или замедление прогрессирования состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ. В некоторых вариантах осуществления дополнительное терапевтическое средство или способ могут "опосредованно" обеспечивать снижение экспрессии, активности и/или уровня НТТ, например, с помощью нокдауна гена или генного продукта, который может увеличивать экспрессию, активность и/или уровень НТТ.

[00661] В некоторых вариантах осуществления дополнительное терапевтическое средство физически конъюгировано с олигонуклеотидом, например НТТ-олигонуклеотидом. В некоторых вариантах осуществления дополнительное средство представляет собой НТТ-олигонуклеотид. В некоторых вариантах осуществления представленный олигонуклеотид физически конъюгирован с дополнительным средством, которое представляет собой НТТ-олигонуклеотид. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды в составе дополнительного средства имеют последовательности оснований, сахара, нуклеиновые основания, межнуклеотидные связи, паттерны сахаров, нуклеиновых оснований и/или модификаций межнуклеотидных связей, паттерны хиральных центров остова и т.д., или любые их комбинации, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления дополнительный олигонуклеотид нацеливается на НТТ. В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид физически конъюгирован со вторым олигонуклеотидом, который может обеспечивать снижение (прямое или опосредованно) экспрессии, активности и/или уровня НТТ, или который применим для лечения состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ. В некоторых вариантах осуществления первый НТТ-олигонуклеотид физически конъюгирован со вторым НТТ-олигонуклеотидом, который может быть идентичен первому олигонуклеотиду НТТ или не идентичен, и который может нацеливаться на отличающуюся, или такую же, или перекрывающуюся последовательность, что и первый НТТ-олигонуклеотид.

[00662] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид можно вводить с одним или несколькими дополнительными (или вторыми) терапевтическими средствами для HD, например, селективным ингибитором обратного захвата серотонина, амантадином, противопаркинсоническим лекарственным средством, антипсихотическим лекарственным средством, бензодиазепином, миртазапином, нейролептиком, ремацемидом, вальпроевой кислотой, тетрабеназином (ксеназин), антипсихотическим лекарственным средством, галоперидолом (халдол), хлорпромазином, рисперидоном (риспердал), кветиапином (сероквель), лекарственным препаратом, которое может содействовать подавлению хореи, амантадином, леветирацетамом (кеппра), клоназепамом (клонопин), лекарственным препаратом для лечения психического расстройства, антидепрессантом, циталопрамом (целекса), эсциталопрамом (лексапро), флуоксетином (прозак, сарафем), сертралином (золофт), риспердалом (рисперидон), халдолом (галоперидол), торазином (хлорпромазин), антипсихотическим лекарственным средством, кветиапином (сероквель), рисперидоном (риспердал), оланзапином (зипрекса), нормотимическим лекарственным средством, противосудорожным средством, вальпроатом (депакон), карбамазепином (карбатрол, эпитол, тегретол), клонопином (клоназепам), валиумом (диазепам), карбатролом (карбамазепин), депаконом (вальпроат), ламикталом (ламотриджин), SRX246, средством терапии для сайленсинга генов, средством терапии, направленным на снижение воспаления в головном мозге, VX15/2503, KD3010, VX15, бексаротеном, лаквинимодом, нейропротекторным средством терапии, хунтексилом (продопидин), SBT-20, ламотриджином (ламиктал), психотерапией, логотерапией, физиотерапией и/или эрготерапией.

[00663] В некоторых вариантах осуществления дополнительное терапевтическое средство или способ описаны в любом из патентов США №№6,127,401; 6,169,115; 6,174,909; 6,221,904; 6,258,353; 6,300,373; 6,319,944; 6,372,736; 6,372,768; 6,395,749; 6,455,536; 6,503,899; 6,517,859; 6,525,054; 6,534,651; 6,552,041; 6,565,875; 6,630,461; 6,642,227; 6,660,748; 6,706,711; 6,746,678; 6,819,956; 6,833,478; 6,884,804; 6,921,774; 6,953,796; 7,053,057; 7,111,346; 7,132,414; 7,183,307; 7,304,061; 7,304,071; 7,404,221; 7,728,018; 7,741,365; 7,803,752; 7,807,654; 7,935,718; 8,003,610; 8,222,279; 8,278,272; 8,362,066; 8,410,110; 8,481,086; 8,604,080; 8,669,248; 8,691,824; 8,778,947; 8,802,440; 8,835,171; 8,853,198; 8,853,241; 9,005,677; 9,006,205; 9,011,937; 9,181,544; 9,193,695; 9,193,969; 9,198,944; 9,212,205; 9,216,161; 9,220,778; 9,260,394; 9,278,963; 9,289,143; 9,308,182; 9,315,532; 9,326,956; 9,351,946; 9,358,293; 9,382,314; 9,393,409; 9,415,030; 9,422,234; 9,447,006; 9,475,747; 9,504,665; 9,523,093; 9,555,071; 9,585,878; 9,604,957; 9,617,210; 9,629,815; 9,700,587; 9,796,673; 9,808,448; 9,833,621; 9,861,594; 9,861,596; 9,872,865; 9,879,063; 9,889,143; 9,913,877; 9,919,129; 9,987,286; 10,004,722; 10,087,228; 10,123,969; или 10, 124, 166; или любом из WO/2018/227142; WO/2018/226771; WO/2018/226622; WO/2018/220457; WO/2018/218185; WO/2018/218091; WO/2018/213766; WO/2018/208636; WO/2018/206798; WO/2018/204803; WO/2018/194736; WO/2018/189393; WO/2018/187503; WO/2018/185468; WO/2018/178665; WO/2018/174839; WO/2018/174838; WO/2018/172527; WO/2018/148220; WO/2018/145009; WO/2018/138088; WO/2018/138086; WO/2018/138085; WO/2018/136635; WO/2018/132845; WO/2018/127462; WO/2018/112672; WO/2018/107072; WO/2018/093957; WO/2018/084712; WO/2018/080636; WO/2018/078042; WO/2018/076245; WO/2018/075086; WO/2018/071521; WO/2018/071508; WO/2018/071452; WO/2018/057855; WO/2018/045217; WO/2018/044808 или WO/2018/039207.

[00664] В некоторых вариантах осуществления субъекту вводят НТТ-олигонуклеотид и дополнительное терапевтическое средство, где дополнительное терапевтическое средство представляет собой средство, описанное в данном документе или известное в данной области техники, которое применимо для лечения состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ.

[00665] В некоторых вариантах осуществления второе или дополнительное терапевтическое средство вводят субъекту перед, одновременно или после введения НТТ-олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления второе или дополнительное терапевтическое средство вводят субъекту несколько раз, и НТТ-олигонуклеотид также вводят субъекту несколько раз, и введения осуществляют в любом порядке.

[00666] В некоторых вариантах осуществления улучшение может включать уменьшение экспрессии, активности и/или уровня гена или генного продукта, которые являются слишком высокими при болезненном состоянии; повышение экспрессии, активности и/или уровня гена или генного продукта, которые являются слишком низкими при болезненном состоянии; и/или уменьшение экспрессии, активности и/или уровня мутантного и/или ассоциированного с заболеванием варианта гена или генного продукта.

[00667] В некоторых вариантах осуществления НТТ-олигонуклеотид, применимый для лечения, уменьшения интенсивности и/или предупреждения состояния, нарушения или заболевания, связанных с НТТ, можно вводить (например, субъекту) с помощью любого способа, описанного в данном документе или известного в данной области техники.

[00668] В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды, например НТТ-олигонуклеотиды, вводят в виде фармацевтической композиции, например, для лечения, уменьшения интенсивности и/или предупреждения состояний, нарушений или заболеваний, связанных с НТТ. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды содержат по меньшей мере одну межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления представленные композиции на основе олигонуклеотидов характеризуются контролируемой хиральностью.

[00669] В некоторых вариантах осуществления дополнительное терапевтическое средство включает одно или несколько или все из нижеследующего: кортикостероида (например, дексаметазона); ацетаминофена; блокатора H1 (например, дифенгидрамина) и/или блокатора Н2 (например, ранитидина). В некоторых вариантах осуществления такое дополнительное терапевтическое средство вводят для контроля или облегчения по меньшей мере одного побочного эффекта или нежелательного эффекта, связанного с введением олигонуклеотида.

[00670] По некоторым сообщениям в некоторых случаях пациенты с болезнью Хантингтона могут дополнительно страдать от дополнительного, ассоциированного нарушения или заболевания или осложнения, таких как пневмония, болезни сердца, суицидальное поведение или мысли, неспособность принимать пищу, потеря веса, физические травмы, например, в результате падений, и т.д. В некоторых вариантах осуществления дополнительное терапевтическое средство вводят для лечения дополнительного ассоциированного нарушения, или заболевания, или осложнения HD.

[00671] В некоторых случаях пациенты, которым вводили олигонуклеотид в качестве лекарственного препарата, испытывали определенные побочные эффекты или нежелательные эффекты, включающие: атриовентрикулярную (AV) блокаду сердца, инфекцию нижних дыхательных путей, запор, прорезывание зубов, инфекцию мочевыводящих путей, заложенность верхних дыхательных путей, ушную инфекцию, метеоризм, снижение веса, тромбоцитопению, нарушения свертывания крови, почечную токсичность, токсичность в месте инъекции, сыпь, гломерулонефрит, гепатотоксичность, гипонатриемию, поражения желтого пятна, поражения кожи, гипертермию, головную боль, рвоту, постпункционный синдром, носовое кровотечение, боль в спине, инфекцию, менингит, гидроцефалию, гиперемию, тошноту, боль в области живота, одышку, гипертензию, обморок, артралгию, бронхит, диспепсию, одышку, эритему, инфузионную реакцию, мышечные спазмы, головокружение, назофарингит, инфекцию верхних дыхательных путей, инфекцию дыхательных путей, фарингит, ринит, синусит, вирусную инфекцию верхних дыхательных путей, заложенность верхних дыхательных путей, артралгию или боль (включая боль в спине, шее или мышечно-скелетную боль), гиперемию (включая покраснение лица или ощущение тепла в коже), тошноту, боль в области живота, кашель, дискомфорт в области груди или боль в области груди, головную боль, сыпь, озноб, головокружение, усталость, увеличение частоты сердечных сокращений или учащенное сердцебиение, гипотензию, гипертензию, отек лица, отек, нежелательные реакции со стороны глаз, синдром сухого глаза, помутнение зрения, плавающие помутнения стекловидного тела, экстравазацию, флебит, тромбофлебит, отек в месте инфузии или инъекции, дерматит (подкожное воспаление), целлюлит, эритему, покраснение в месте инъекции, ощущение жжения, боль в месте инъекции, наличие базофильных гранул в клетках Купфера, плохую местную переносимость, увеличение времени коагуляции, активацию комплемента, гематотоксичность, стимуляцию иммунной системы, увеличение веса селезенки, полиорганную лимфогистиоцитарную инфильтрацию, экстрамедуллярный гемопоэз в селезенке, воспалительные эффекты и/или токсическое действие на репродуктивную систему.

[00672] В некоторых вариантах осуществления дополнительное терапевтическое средство может вводиться пациенту с целью контроля или облегчения одного или нескольких побочных эффектов или нежелательных эффектов, ассоциированных с введением олигонуклеотида.

[00673] В некоторых вариантах осуществления пациенту вводят олигонуклеотид и одно или несколько дополнительных терапевтических средств (в любом порядке), где дополнительное терапевтическое средство может вводиться пациенту с целью контроля или облегчения одного или нескольких побочных эффектов или нежелательных эффектов, ассоциированных с введением олигонуклеотида.

[00674] В некоторых вариантах осуществления пациенту вводят олигонуклеотид и одно или несколько дополнительных терапевтических средств (в любом порядке), где дополнительное терапевтическое средство может вводиться пациенту с целью контроля или облегчения одного или нескольких побочных эффектов или нежелательных эффектов, ассоциированных с введением олигонуклеотида, и где олигонуклеотид нацеливается на любую мишень, включая без ограничений: НТТ, DMD, АРОСЗ, PNPLA3, C9orf72 или SMN2, или любой другой ген-мишень.

[00675] В некоторых вариантах осуществления пациенту вводят олигонуклеотид и одно или несколько дополнительных терапевтических средств (в любом порядке), где дополнительное терапевтическое средство может вводиться пациенту с целью контроля или облегчения одного или нескольких побочных эффектов или нежелательных эффектов, ассоциированных с введением олигонуклеотида, и где олигонуклеотид действует посредством любого биохимического механизма, включая без ограничений уменьшение уровня, экспрессии и/или активности гена-мишени или его генного продукта, увеличение или уменьшение пропуска одного или нескольких экзонов в мРНК гена-мишени, механизм, опосредованный РНКазой Н, механизм, опосредованный стерическим затруднением, и/или механизм, опосредованный РНК-интерференцией, где олигонуклеотид является одно- или двухнитевым.

[00676] В некоторых вариантах осуществления пациенту вводят олигонуклеотид и одно или несколько дополнительных терапевтических средств (в любом порядке), где дополнительное терапевтическое средство может вводиться пациенту с целью контроля или облегчения одного или нескольких побочных эффектов или нежелательных эффектов, ассоциированных с введением олигонуклеотида, и где олигонуклеотид действует посредством любого биохимического механизма, включая без ограничений уменьшение уровня, экспрессии и/или активности гена мишени или его генного продукта, увеличение или уменьшение пропуска одного или нескольких экзонов в мРНК гена-мишени, механизм, опосредованный РНКазой Н, механизм, опосредованный стерическим затруднением, и/или механизм, опосредованный РНК-интерференцией, где олигонуклеотид является одно- или двухнитевым, и где олигонуклеотид нацеливается на любую мишень, включая без ограничений:. НТТ, DMD, АРОС3, PNPLA3, C9orf72 или SMN2, или любой другой ген-мишень.

[00677] В некоторых вариантах осуществления пациенту вводят композицию на основе олигонуклеотида и одно или несколько дополнительных терапевтических средств (в любом порядке), где дополнительное терапевтическое средство может вводиться пациенту с целью контроля или облегчения одного или нескольких побочных эффектов или нежелательных эффектов, ассоциированных с введением композиции на основе олигонуклеотида, и где композиция на основе олигонуклеотида характеризуется контролируемой хиральностью или содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью (включая без ограничений фосфотиоатную связь с контролируемой хиральностью).

Введение олигонуклеотидов и композиций на их основе

[00678] В соответствии с настоящим изобретением для введения представленных олигонуклеотидов и композиций на их основе (как правило, фармацевтических композиций для терапевтических целей) можно использовать множество способов, схем доставки и т.д., включая различные технологии, известные в данной области техники.

[00679] В некоторых вариантах осуществления композицию на основе олигонуклеотида, например композицию на основе НТТ-олигонуклеотида, вводят в более низкой дозе и/или с более низкой частотой, чем в случае таковые для сопоставимой в остальном эталонной композиции на основе олигонуклеотида, и получают сопоставимые или улучшенные эффекты. В некоторых вариантах осуществления композицию на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью вводят в более низкой дозе и/или с более низкой частотой, чем таковые для сопоставимой, в остальном идентичной эталонной композицией на основе стереомерно неупорядоченного олигонуклеотида, и с получением сопоставимых или улучшенных эффектов, например, в отношении улучшения нокдауна транскрипта-мишени.

[00680] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения признается, что свойства и активность, например, активность в отношении нокдауна, стабильность, токсичность и т.д. олигонуклеотидов и композиций на их основе можно модулировать и оптимизировать с помощью химических модификаций и/или стереохимии. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены способы оптимизации свойств и/или видов активности олигонуклеотидов посредством химических модификаций и/или стереохимии. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены олигонуклеотиды и композиции на их основе с улучшенными свойствами и/или видами активности. Не вдаваясь в какую-либо теорию, что в связи, например, с их улучшенными профилями активности, стабильности, доставки, распределения, токсичности, фармакокинетики, фармакодинамики и/или эффективности заявители отмечают, что представленные олигонуклеотиды и композиции на их основе в некоторых вариантах осуществления можно вводить в более низкой дозе и/или с меньшей частотой для достижения сопоставимой или большей эффективности, а в некоторых вариантах осуществления можно вводить в более высокой дозе и/или с большей частотой для обеспечения улучшенных эффектов.

[00681] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в способе введения композиции на основе олигонуклеотида, содержащей совокупность олигонуклеотидов, обладающих общей последовательностью оснований, представлено улучшение, предусматривающее введение олигонуклеотида, содержащегося в совокупности олигонуклеотидов, который характеризуется улучшенной доставкой по сравнению с эталонной композицией на основе олигонуклеотидов с той же общей последовательностью оснований.

[00682] В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды, композиции и способы обеспечивают улучшенную доставку. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды, композиции и способы обеспечивают улучшенную доставку в цитоплазму. В некоторых вариантах осуществления улучшенная доставка осуществляется в популяцию клеток. В некоторых вариантах осуществления улучшенная доставка осуществляется в ткань. В некоторых вариантах осуществления улучшенная доставка осуществляется в орган. В некоторых вариантах осуществления улучшенная доставка осуществляется в организм, например, пациента или субъекта. Примеры структурных элементов (например, химические модификации, стереохимия, их комбинации и т.д.), олигонуклеотиды, композиции и способы, которые обеспечивают улучшенную доставку, подробно описаны в настоящем изобретении.

[00683] Для введения олигонуклеотидов и композиций по настоящему изобретению можно использовать различные схемы введения доз. В некоторых вариантах осуществления вводят несколько стандартных доз, разделенных интервалами времени. В некоторых вариантах осуществления заданная композиция характеризуется рекомендованной схемой введения доз, которая может включать одну или несколько доз. В некоторых вариантах осуществления схема введения доз включает совокупность доз, каждая из которых отделена от другой временным интервалом одинаковой продолжительности; в некоторых вариантах осуществления схема введения доз включает совокупность доз и по меньшей мере два разных временных интервала, разделяющих отдельные дозы. В некоторых вариантах осуществления все дозы в пределах схемы введения доз имеют одинаковое количество, соответствующее стандартной дозе. В некоторых вариантах осуществления разные дозы в пределах схемы введения доз имеют разные количества. В некоторых вариантах осуществления схема введения доз предусматривает первую дозу в количестве, соответствующем первой дозе, после чего следуют одна или несколько дополнительных доз в количестве, соответствующем второй дозе, отличном от количества, соответствующего первой дозе. В некоторых вариантах осуществления схема введения доз предусматривает первую дозу в количестве, соответствующем первой дозе, после чего следуют одна или несколько дополнительных доз в количестве, соответствующем второй (или последующей) дозе, которое является таким же, как количество, соответствующее первой дозе (или другой предшествующей дозе), или отличается от него. В некоторых вариантах осуществления композицию на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью вводят в соответствии со схемой введения доз, которая отличается от схемы, используемой для композиции на основе олигонуклеотида, не характеризующегося контролируемой хиральностью (например, стереомерно неупорядоченного), с такой же последовательностью, и/или композиции на основе другого олигонуклеотида с контролируемой хиральностью с такой же последовательностью. В некоторых вариантах осуществления композицию на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью вводят в соответствии со схемой введения доз, которая снижена по сравнению со схемой, используемой для композиции на основе олигонуклеотида с неконтролируемой хиральностью (например, стереомерно неупорядоченного) с такой же последовательностью, в том смысле, что она обеспечивает более низкий уровень общего воздействия за заданную единицу времени, включает одну или несколько более низких стандартных доз и/или включает меньшее число доз в течение заданной единицы времени. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид с неконтролируемой хиральностью вводят в соответствии со схемой введения доз, которая растянута на более длительный период времени, чем схема, используемая для композиции на основе олигонуклеотида с неконтролируемой хиральностью (например, стереомерно неупорядоченного) с такой же последовательностью. Не вдаваясь в теорию, заявители отмечают, что в некоторых вариантах осуществления более короткая схема введения доз и/или более длительные временные интервалы между дозами могут быть обусловлены улучшенной стабильностью, биодоступностью и/или эффективностью композиции на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления представленные композиции с улучшенной доставкой (и другими свойствами) можно вводить в более низких дозировках и/или с более низкой частотой для достижения биологических эффектов, например, клинической эффективности.

Фармацевтические композиции

[00684] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены фармацевтические композиции, содержащие представленное соединение, например, олигонуклеотид или его фармацевтически приемлемую соль, и фармацевтический носитель. В некоторых вариантах осуществления для терапевтических и клинических целей олигонуклеотиды по настоящему изобретению представлены в виде фармацевтических композиций. Как понятно специалистам в данной области техники, олигонуклеотиды по настоящему изобретению могут быть представлены в их кислотной, основной или солевой формах. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды могут находиться в кислотных формах, например, в случае природных фосфатных связей в форме -ОР(O)(ОН)O-; в случае фосфотиоатных межнуклеотидных связей в форме -OP(O)(SH)O- и т.д. В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды могут находиться в солевых формах, например, в случае природных фосфатных связей в форме -OP(O)(ONa)O- в натриевых солях; в случае фосфотиоатных межнуклеотидных связей в форме OP(O)(SNa)O в натриевых солях и т.д. Если не указано иное, олигонуклеотиды по настоящему изобретению могут существовать в кислотной, основной и/или солевой формах.

[00685] При применении в качестве терапевтических средств НТТ-олигонуклеотид или композицию на основе олигонуклеотида, как правило, вводят в виде фармацевтической композиции. В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция применима для введения олигонуклеотида в область тела, пораженную состоянием, нарушением или заболеванием. В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция содержит терапевтически эффективное количество представленного олигонуклеотида или его фармацевтически приемлемой соли и фармацевтически приемлемый неактивный ингредиент. В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемый неактивный ингредиент выбран из фармацевтически приемлемых разбавителей, фармацевтически приемлемых наполнителей и фармацевтически приемлемых носителей. В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемый неактивный ингредиент представляет собой фармацевтически приемлемый носитель.

[00686] В некоторых вариантах осуществления представленный олигонуклеотид составлен для введения в клетку и/или ткань организма, экспрессирующую его мишень, и/или для приведения в контакт с ними. Например, в некоторых вариантах осуществления представленный НТТ-олигонуклеотид составлен для введения в клетку и/или ткань организма, экспрессирующие НТТ. В некоторых вариантах осуществления такие клетка и/или ткань организма представляют собой нейрон или клетку и/или ткань центральной нервной системы. В некоторых вариантах осуществления широкого распределения олигонуклеотидов и композиций можно достичь путем интрапаренхимального введения, интратекального введения или интрацеребровентрикулярного введения.

[00687] В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция составлена для внутривенной инъекции, перорального введения, трансбуккального введения, ингаляции, назального введения, местного введения, офтальмического введения или ушного введения. В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция представлена в виде таблетки, пилюли, капсулы, жидкости, лекарственной формы для ингаляции, раствора назального спрея, суппозитория, суспензии, геля, коллоидного раствора, дисперсии, суспензии, раствора, эмульсии, мази, лосьона, глазных капель или ушных капель.

[00688] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлена фармацевтическая композиция, содержащая олигонуклеотид с контролируемой хиральностью или композицию на его основе в смеси с фармацевтически приемлемым неактивным ингредиентом (например, фармацевтически приемлемым вспомогательным веществом, фармацевтически приемлемым носителем и т.д.). Специалисту в данной области техники будет понятно, что фармацевтические композиции включают фармацевтически приемлемые соли представленного олигонуклеотида или композиций. В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция представляет собой композицию на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью. В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция представляет собой композицию на основе стереомерно чистого олигонуклеотида.

[00689] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены соли олигонуклеотидов и фармацевтические композиции на их основе. В некоторых вариантах осуществления соль представляет собой фармацевтически приемлемую соль. В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция содержит олигонуклеотид, необязательно в его солевой форме, и натриевую соль. В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция содержит олигонуклеотид, необязательно в его солевой форме, и хлорид натрия. В некоторых вариантах осуществления каждый ион водорода олигонуклеотида, который может переходить к основанию (например, в условиях водного раствора, фармацевтической композиции и т.д.), заменен катионом, отличным от Н⁺. Например, в некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая соль олигонуклеотида представляет собой соль, образованную только ионами металлов, где каждый ион водорода (например, в ОН, SH и т.д.) в каждой межнуклеотидной связи (например, природной фосфатной связи, фосфотиоатной межнуклеотидной связи и т.д.) заменен ионом металла. Различные соответствующие соли металлов для фармацевтических композиций широко известны в данной области техники и могут использоваться в соответствии с настоящим изобретением. В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая соль представляет собой натриевую соль. В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая соль представляет собой магниевую соль. В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая соль представляет собой кальциевую соль. В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая соль представляет собой калиевую соль. В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая соль представляет собой аммониевую соль (катион N(R)₄ ⁺). В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая соль содержит один и не более одного типа катионов. В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая соль содержит два или более типов катионов. В некоторых вариантах осуществления катион представляет собой Li⁺, Na⁺, K⁺, Mg²⁺ или Са²⁺. В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая соль представляет собой соль, образованную только ионами натрия. В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая соль представляет собой соль, образованную только ионами натрия, где каждая межнуклеотидная связь, которая представляет собой природную фосфатную связь (кислотная форма -O-Р(O)(ОН)-O-), если таковая присутствует, существует в форме ее натриевой соли (-O-P(O)(ONa)-O-), и каждая межнуклеотидная связь, которая представляет собой фосфотиоатную межнуклеотидную связь (кислотная форма -О-P(O)(SH)О), если таковая присутствует, существует в форме ее натриевой соли (-O-P(O)(SNa)-O-).

[00690] Различные технологии доставки нуклеиновых кислот и/или олигонуклеотидов известны в данной области техники и могут использоваться в соответствии с настоящим изобретением. Например, для доставки нуклеиновых кислот можно использовать различные супрамолекулярные наноносители. Примеры наноносителей включают без ограничения липосомы, катионные полимерные комплексы и различные полимерные соединения. Образование комплексов нуклеиновых кислот с различными поликатионами является другим подходом для внутриклеточной доставки; он включает применение пегилированных поликатионов, комплексов полиэтиленимина (PEI), катионных блок-сополимеров и дендримеров. Некоторые катионные наноносители, включающие PEI и полиамид оаминные дендримеры, способствуют высвобождению содержимого из эндосом. Другие подходы включают применение полимерных наночастиц, микросфер, липосом, дендримеров, биоразлагаемых полимеров, конъюгатов, пролекарств, неорганических коллоидов, таких как сера или железо, антител, имплантатов, биоразлагаемых имплантатов, биоразлагаемых микросфер, имплантатов с осмотическим контролем, липидных наночастиц, эмульсий, масляных растворов, водных растворов, биоразлагаемых полимеров, сополимера молочной кислоты и гликолевой кислоты, полимолочной кислоты, жидкого депо-препарата, полимерных мицелл, квантовых точек и липоплексов. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид конъюгирован с другой молекулой.

[00691] В вариантах терапевтического и/или диагностического применения соединения, например олигонуклеотиды по настоящему изобретению, могут быть составлены для различных способов введения, включающих системное и местное или локализированное введение. Методики и составы в целом можно найти в Remington, The Science and Practice of Pharmacy (20th ed. 2000).

[00692] Фармацевтически приемлемые соли для основных фрагментов в целом хорошо известны средним специалистам в данной области техники и могут включать, например, ацетат, бензолсульфонат, безилат, бензоат, бикарбонат, битартрат, бромид, эдетат кальция, карнозилат, карбонат, цитрат, эдетат, эдизилат, эстолат, эзилат, фумарат, глюцептат, глюконат, глутамат, гликолиларсанилат, гексилрезорцинат, гидрабамин, гидробромид, гидрохлорид, гидроксинафтоат, йодид, изетионат, лактат, лактобионат, малат, малеат, манде лат, мезилат, мукат, напсилат, нитрат, памоат (эмбонат), пантотенат, фосфат/дифосфат, полигалактуронат, салицилат, стеарат, субацетат, сукцинат, сульфат, таннат, тартрат или теоклат. Другие фармацевтически приемлемые соли можно найти, например, в Remington, The Science and Practice of Pharmacy (20th ed. 2000). Предпочтительные фармацевтически приемлемые соли включают, например, ацетат, бензоат, бромид, карбонат, цитрат, глюконат, гидробромид, гидрохлорид, малеат, мезилат, напсилат, памоат (эмбонат), фосфат, салицилат, сукцинат, сульфат или тартрат.

[00693] В некоторых вариантах осуществления представленные олигонуклеотиды составлены в фармацевтические композиции, описанные в WO 2005/060697, WO 2011/076807 или WO 2014/136086.

[00694] В зависимости от специфических состояний, нарушений или заболеваний, подлежащих лечению, представленные средства, например олигонуклеотиды, могут быть составлены в виде жидких или твердых лекарственных форм и вводиться системно или местно. Представленные олигонуклеотиды могут доставляться, например, в форме с контролируемым по времени или замедленным слабым высвобождением, что известно специалистам в данной области техники. Методики для составления и введения можно найти в Remington, The Science and Practice of Pharmacy (20th ed. 2000). Подходящие пути могут включать пероральное, трансбуккальное, с помощью спрея для ингаляций, сублингвальное, ректальное, трансдермальное, вагинальное, чресслизистое, назальное или кишечное введение; парентеральную доставку, включающую внутримышечную, подкожную, интрамедуллярную инъекции, а также интратекальную, прямую интравентрикулярную, внутривенную, внутрисуставную, внутригрудинную, интрасиновиальную, внутрипеченочную, внутриочаговую, внутричерепную, внутрибрюшинную, интраназальную или внутриглазную инъекции или другой способ доставки.

[00695] В случае инъекции представленные средства, например олигонуклеотиды, могут быть составлены и разведены в водных растворах, таких как физиологически совместимые буферные растворы, такие как раствор Хэнкса, раствор Рингера или физиологический буферный солевой раствор. В случае такого чресслизистого введения в составах используются обеспечивающие проникновение вещества соответствующие барьеру, подлежащего прохождению. Такие обеспечивающие проникновение вещества общеизвестны в данной области техники и могут использоваться в соответствии с настоящим изобретением.

[00696] Использование фармацевтически приемлемых носителей для составления соединений, например, представленных олигонуклеотидов, для применения на практике по настоящему изобретению, в дозировках, подходящих для различных способов введения, хорошо известно в данной области техники. При правильном выборе носителя и подходящей технологии изготовления композиции по настоящему изобретению, например, составленные в виде растворов, можно вводить различными путями, например, парентерально, как, например, путем внутривенной инъекции.

[00697] В некоторых вариантах осуществления композиция, содержащая олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, дополнительно содержит любой или все из дигидрата хлорида кальция, гексагидрата хлорида магния, хлорида калия, хлорида натрия, безводного двухосновного фосфата натрия, фосфата натрия, одноосновного дигидрата и/или воды для инъекций. В некоторых вариантах осуществления композиция дополнительно содержит любой или все из: дигидрата хлорида кальция (0,21 мг) USP, гексагидрата хлорида магния (0,16 мг) USP, хлорида калия (0,22 мг) USP, хлорида натрия (8,77 мг) USP, безводного двухосновного фосфата натрия (0,10 мг) USP, одноосновного дигидрата фосфата натрия (0,05 мг) USP и воды для инъекций USP.

[00698] В некоторых вариантах осуществления композиция, содержащая олигонуклеотид, дополнительно содержит любой или все из: холестерина, (6Z,9Z,28Z,31Z)-гептатриаконта-6,9,28,31-тетраен-19-ил-4-(диметиламино)бутаноата (DLin-MC3-DMA), 1,2-дистеароил-sn-глицеро-3-фосфохолина (DSPC), альфа-(3'-{[1,2-ди(миристилокси)пропанокси]карбониламино}пропил)-омега-метоксиполиоксиэтилена (PEG2000-C-DMG), безводного одноосновного фосфата калия NF, хлорида натрия, двухосновного гептагидрата фосфата натрия и воды для инъекций. В некоторых вариантах осуществления рН композиции, содержащей олигонуклеотид, например НТТ-олигонуклеотид, составляет ~7,0. В некоторых вариантах осуществления композиция, содержащая олигонуклеотид, дополнительно содержит любой или все из: 6,2 мг холестерина USP, 13,0 мг (6Z,9Z,28Z,31Z)-гептатриаконта-6,9,28,31-тетраен-19-ил-4-(диметиламино)бутаноата (DLin-MC3-DMA), 3,3 мг 1,2-дистеароил-sn-глицеро-3-фосфохолина (DSPC), 1,6 мг α-(3'-{[1,2-ди(миристилокси)пропанокси]карбониламино}пропил)-ω-метоксиполиоксиэтилена (PEG2000-C-DMG), 0,2 мг безводного одноосновного фосфата калия NF, 8,8 мг хлорида натрия USP, 2,3 мг двухосновного гептагидрата фосфата натрия и воды для инъекций USP в общем объеме, составляющем приблизительно 1 мл.

[00699] Представленные соединения, например олигонуклеотиды, можно легко составить с использованием фармацевтически приемлемых носителей, хорошо известных в данной области техники, в дозах, подходящих для перорального введения. В некоторых вариантах осуществления, такие носители позволяют составлять представленные олигонуклеотиды в виде таблеток, пилюль, капсул, жидкостей, гелей, сиропов, взвесей, суспензий и т.п., например, для перорального приема субъектом (например, пациентом), подлежащим лечению.

[00700] Для назальной или ингаляционной доставки представленные соединения, например олигонуклеотиды, могут быть составлены с помощью способов, известных специалистам в данной области техники, и они могут включать, например, примеры солюбилизирующих, разбавляющих или диспергирующих веществ, таких как солевой раствор, консерванты, такие как бензиловый спирт, активаторы абсорбции и фторуглероды.

[00701] В определенных вариантах осуществления олигонуклеотиды и композиции доставляются в ЦНС. В определенных вариантах осуществления олигонуклеотиды и композиции доставляются в спинномозговую жидкость. В определенных вариантах осуществления олигонуклеотиды и композиции вводят в паренхиму головного мозга. В определенных вариантах осуществления олигонуклеотиды и композиции доставляются животному/субъекту путем интратекального введения или интрацеребровентрикулярного введения. Широкого распределения олигонуклеотидов и композиций можно достичь с помощью способов введения, описанных в данном документе и/или известных в данной области техники.

[00702] В определенных вариантах осуществления парентеральное введение осуществляют путем инъекции, например, с помощью шприца, насоса и т.д. В определенных вариантах осуществления инъекция представляет собой болюсную инъекцию. В определенных вариантах осуществления инъекцию осуществляют непосредственно в ткань или местоположение, такое как полосатое тело, хвостатое тело, кора больших полушарий, гиппокамп и/или мозжечок.

[00703] В определенных вариантах осуществления способы специфической локализации представленных соединений, например олигонуклеотидов, такие как болюсная инъекция, могут снижать среднюю эффективную концентрацию (ЕС50) в 20, 25, 30, 35, 40, 45 или 50 раз. В определенных вариантах осуществления целевая ткань представляет собой ткань головного мозга. В определенных вариантах осуществления целевая ткань представляет собой ткань полосатого тела. В определенных вариантах осуществления снижение ЕС50 является желательным, поскольку при этом снижается доза, необходимая для достижения фармакологического результата у пациента, нуждающегося в этом.

[00704] В определенных вариантах осуществления представленный олигонуклеотид доставляется посредством инъекции или инфузии один раз в месяц, один раз в два месяца, один раз в 90 дней, один раз в 3 месяца, один раз 6 месяцев, два раза в год или один раз в год.

[00705] Фармацевтические композиции, подходящие для применения в настоящем изобретении, включают композиции, где активные ингредиенты, например олигонуклеотиды, содержатся в эффективных количествах, обеспечивающих достижение запланированных целей. Определение эффективных количеств находится в пределах компетенции специалистов в данной области техники, особенно в свете подробного описания, представленного в данном документе.

[00706] В дополнение к активным ингредиентам, фармацевтические композиции могут содержать подходящие фармацевтически приемлемые носители, содержащие вспомогательные вещества и вспомогательные средства, которые облегчают переработку активного соединения в препараты, которые можно использовать в фармацевтике. Препараты, составленные для перорального введения, могут быть представлены в форме таблеток, драже, капсул или растворов.

[00707] В некоторых вариантах осуществления фармацевтические композиции для перорального применения можно получать путем объединения активного соединения с твердыми вспомогательными веществами, необязательно измельчения полученной смеси и обработки смеси из гранул после добавления подходящих вспомогательных средств, если это необходимо, с получением таблеток или ядер драже. Подходящие вспомогательные вещества представляют собой, в частности, наполнители, такие как сахара, включая лактозу, сахарозу, маннит или сорбит; препараты целлюлозы, например маисовый крахмал, пшеничный крахмал, рисовый крахмал, картофельный крахмал, желатин, трагакантовую камедь, метилцеллюлозу, гидроксипропилметилцеллюлозу, натрий-карбоксиметилцеллюлозу (CMC) и/или поливинилпирролидон (PVP: повидон). При необходимости могут быть добавлены разрыхлители, такие как сшитый поливинилпирролидон, агар или альгиновая кислота или ее соль, такая как альгинат натрия.

[00708] В некоторых вариантах осуществления ядра драже обеспечиваются подходящими покрытиями. Для этой цели могут использоваться концентрированные растворы Сахаров, которые необязательно могут содержать аравийскую камедь, тальк, поливинилпирролидон, карбополовый гель, полиэтиленгликоль (PEG) и/или диоксид титана, растворы лаков и подходящие органические растворители или смеси растворителей. Красители или пигменты могут быть добавлены к покрытиям для таблеток или драже для идентификации или для характеристики различных комбинаций доз активного соединения.

[00709] Фармацевтические препараты, которые могут использоваться перорально, включают твердые капсулы, изготовленные из желатина, а также мягкие, герметичные капсулы, изготовленные из желатина, и пластификатор, такой как глицерин или сорбит. Твердые капсулы могут содержать активные ингредиенты, например олигонуклеотиды, в смеси с наполнителями, такими как лактоза, связующими, такими как крахмалы, и/или смазывающими средствами, такими как тальк или стеарат магния, и необязательно стабилизаторами. В мягких капсулах активные соединения, например олигонуклеотиды, могут быть растворены или суспендированы в подходящих жидкостях, таких как жирные масла, жидкий парафин или жидкие полиэтиленгликоли (PEG). Кроме того, могут быть добавлены стабилизаторы.

[00710] В некоторых вариантах осуществления предусмотренная композиция содержит липид. В некоторых вариантах осуществления липид конъюгирован с активным соединением, например олигонуклеотидом. В некоторых вариантах осуществления липид не конъюгирован с активным соединением. В некоторых вариантах осуществления липид содержит линейную, насыщенную или частично ненасыщенную С₁₀-С₄₀алифатическую цепь. В некоторых вариантах осуществления липид содержит линейную, насыщенную или частично ненасыщенную С₁₀-С₄₀алифатическую цепь, необязательно замещенную одной или несколькими С_1-4алифатическими группами. В некоторых вариантах осуществления липид выбран из группы, состоящей из лауриновой кислоты, миристиновой кислоты, пальмитиновой кислоты, стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, линолевой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, докозагексаеновой кислоты (цис-DHA), турбинаровой кислоты и дилинолеилового спирта. В некоторых вариантах осуществления активное соединение представляет собой представленный олигонуклеотид. В некоторых вариантах осуществления композиция содержит липид и активное соединение и дополнительно содержит другой компонент, который представляет собой другой липид, или нацеливающее соединение или фрагмент. В некоторых вариантах осуществления липид представляет собой аминолипид; амфипатический липид; анионный липид; аполипопротеин; катионный липид; низкомолекулярный катионный липид; катионный липид, такой как CLinDMA и DLinDMA; ионизируемый катионный липид; маскирующий компонент; хелперный липид; липопептид; нейтральный липид; нейтральный цвиттер-ионный липид; гидрофобную малую молекулу; гидрофобный витамин; PEG-липид; незаряженный липид, модифицированный с помощью одного или нескольких гидрофильных полимеров; фосфолипид; фосфолипид, такой как 1,2-диолеоил-sn-глицеро-3-фосфоэтаноламин; липид-невидимку; стерол; холестерин; нацеливающий липид или другой липид, описанный в данном документе или известный в данной области техники, подходящий для вариантов фармацевтического применения. В некоторых вариантах осуществления композиция содержит лиггид и часть другого лиггида, способного опосредовать по меньшей мере одну функцию другого лиггида. В некоторых вариантах осуществления нацеливающее соединение или фрагмент способны нацеливать соединение (например, олигонуклеотид) на конкретную клетку или ткани или подгруппу клеток или тканей. В некоторых вариантах осуществления нацеливающий фрагмент сконструирован для использования экспрессии конкретных мишеней, рецепторов, белков или другого субклеточного компонента, которые являются специфическими для клетки или ткани. В некоторых вариантах осуществления нацеливающий фрагмент представляет собой лиганд (например, малую молекулу, антитело, пептид, белок, углевод, аптамер и т.д.), который нацеливает композицию на клетку или ткань и/или связывается с мишенью, рецептором, белком или другим субклеточным компонентом.

[00711] Определенные примеры липидов для доставки активного соединения, например олигонуклеотида, обеспечивают возможность (например, не предотвращают или не препятствуют) выполнения функции активного соединения. В некоторых вариантах осуществления липид представляет собой лауриновую кислоту, миристиновую кислоту, пальмитиновую кислоту, стеариновую кислоту, олеиновую кислоту, линолевую кислоту, альфа-линоленовую кислоту, гамма-линоленовую кислоту, докозагексаеновую кислоту (цис-DHA), турбинаровую кислоту или дилинолеиловый спирт.

[00712] Как описано в настоящем изобретении, конъюгация с липидом, такая как конъюгация с жирными кислотами, может улучшать одно или несколько свойств олигонуклеотидов.

[00713] В некоторых вариантах осуществления композиция, предназначенная для доставки активного соединения, например олигонуклеотида, при необходимости способна нацеливать активное соединение на конкретные клетки или ткани. В некоторых вариантах осуществления композиция, предназначенная для доставки активного соединения, способна к нацеливанию активного соединения на мышечную клетку или ткань. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены композиции и способы, связанные с доставкой активных соединений, где композиции содержат активное соединение и липид. В различных вариантах осуществления, связанных с мышечной клеткой или тканью, липид выбран из лауриновой кислоты, миристиновой кислоты, пальмитиновой кислоты, стеариновой кислоты, олеиновой кислоты, линолевой кислоты, альфа-линоленовой кислоты, гамма-линоленовой кислоты, докозагексаеновой кислоты (цис-DHA), турбинаровой кислоты и дилинолеилового спирта.

[00714] В некоторых вариантах осуществления композиция, содержащая олигонуклеотид, является лиофилизированной. В некоторых вариантах осуществления композиция, содержащая олигонуклеотид, является лиофилизированной, и лиофилизированный олигонуклеотид находится во флаконе. В некоторых вариантах осуществления флакон заполнен азотом. В некоторых вариантах осуществления лиофилизированную композицию на основе олигонуклеотида восстанавливают перед введением. В некоторых вариантах осуществления лиофилизированную композицию на основе олигонуклеотида восстанавливают с помощью раствора хлорида натрия перед введением. В некоторых вариантах осуществления лиофилизированную композицию на основе олигонуклеотида восстанавливают с помощью 0,9% раствора хлорида натрия перед введением. В некоторых вариантах осуществления восстановление осуществляют в клиническом центре, где проводится введение. В некоторых вариантах осуществления, относящихся к лиофилизированной композиции, композиция на основе олигонуклеотида характеризуется контролируемой хиральностью или содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью, и/или олигонуклеотид нацеливается на любую мишень, включая без ограничений,: НТТ, DMD, АРОС3, PNPLA3, C9orf72 или SMN2, или любой другой ген-мишень.

Определенные варианты осуществления переменных

[00715] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения используются переменные в формулах, паттернах и т.д. Определенные иллюстративные варианты осуществления таких переменных описаны ниже. Как понятно специалистам в данной области техники, варианты осуществления для каждой переменной, описанной ниже или где-либо еще в настоящем изобретении, могут независимо и необязательно комбинироваться с вариантами осуществления для других переменных в тех же формулах, паттернах и т.д., которые описаны ниже или где-либо еще в настоящем изобретении.

[00716] В некоторых вариантах осуществления R^5s-L^s- представляет собой -СН₂ОН. В некоторых вариантах осуществления R^5s-L^s- представляет собой -C(R^5s)₂-OH, где R^5s является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R^5s-L^s представляет собой CH(R^5s) ОН, где R^5s является таким, как описано в настоящем изобретении.

[00717] В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из С_3-30циклоалифатической группы, С₆-₃₀арила, С_5-30гетероарила, содержащего 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, С_3-30гетероциклила, содержащего 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, фрагмента, являющегося природным нуклеиновым основанием, и фрагмента, являющегося модифицированным нуклеиновым основанием. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из С_5-30гетероарила, содержащего 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, С_3-30гетероциклила, содержащего 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, фрагмента, являющегося природным нуклеиновым основанием, и фрагмента, являющегося модифицированным нуклеиновым основанием. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из С_5-30гетероарила, содержащего 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, фрагмента, являющегося природным нуклеиновым основанием, и фрагмента, являющегося модифицированным нуклеиновым основанием. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенный С_5-30 гетероарил, содержащий 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота и серы. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенные природные нуклеиновые основания и их таутомеры. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой защищенные природные нуклеиновые основания и их таутомеры. Известны различные защитные группы для нуклеиновых оснований, предназначенные для олигонуклеотидного синтеза, и их можно использовать в соответствии с настоящим изобретением. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенное нуклеиновое основание, выбранное из аденина, цитозина, гуанозина, тимина и урапила и их таутомеров. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно защищенное нуклеиновое основание, выбранное из аденина, цитозина, гуанозина, тимина и урапила и их таутомеров.

[00718] В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенную С_3-30циклоалифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенный С_6-30арил. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенный С_5-30гетероциклил. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенный С_3-30гетероарил. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенный фрагмент, являющийся природным основанием. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенный фрагмент, являющийся модифицированным основанием. ВА представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из С_3-30циклоалифатической группы, С_6-30арила, С_3-30гетерониклила и С_5-30 гетероарила. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из С_3-30циклоалифатической группы, С_6-30арила, С₃-₃₀гетероциклила, С_5-30гетероарила и фрагмента, являющегося природным нуклеиновым основанием.

[00719] В некоторых вариантах осуществления ВА присоединен посредством ароматического кольца. В некоторых вариантах осуществления ВА присоединен посредством гетероатома. В некоторых вариантах осуществления ВА присоединен посредством гетероатома кольца в составе ароматического кольца. В некоторых вариантах осуществления ВА присоединен посредством атома азота кольца в составе ароматического кольца.

[00720] В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой природное нуклеиновое основание. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенное природное нуклеиновое основание. В некоторых вариантах осуществления В А представляет собой замещенное природное нуклеиновое основание. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенный А, Т, С, U или G или его необязательно замещенный таутомер. В некоторых вариантах осуществления В А представляет собой природное нуклеиновое основание А, Т, С, U или G. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из природных нуклеиновых оснований А, Т, С, U и G.

[00721] В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенный остаток пуринового основания. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой защищенный остаток пуринового основания. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенный остаток аденина. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой защищенный остаток аденина. В некоторых вариантах осуществления В А представляет собой необязательно замещенный остаток гуанина. В некоторых вариантах осуществления В А представляет собой защищенный остаток гуанина. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенный остаток цитозина. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой защищенный остаток цитозина. В некоторых вариантах осуществления В А представляет собой необязательно замещенный остаток тимина. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой защищенный остаток тимина. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенный остаток урацила. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой защищенный остаток урацила. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой необязательно замещенный остаток 5-метилцитозина. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой защищенный остаток 5-метилцитозина.

[00722] В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой защищенный остаток основания, применяемый в получении олигонуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления ВА представляет собой нуклеиновое основание, как описано в настоящем изобретении.

[00723] В некоторых вариантах осуществления каждый R^s независимо представляет собой Н, галоген, -CN, -N₃, -NO, -NQ₂, -L^s-R, L^s-Si(R)₃, -L^s-OR', -L^s-SR, -L^s-N(R')_2-, -О-L^s-R', -O-L^s-Si(R)₃, -O-L^s-OR', -O-L^s-SR' или -O-L^s-N(R')₂, как описано в настоящем изобретении.

[00724] В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой R', где R является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой R, где R является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой необязательно замещенную C₁-₃₀гетероалифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R^s содержит один или несколько атомов кремния. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -CH₂Si(Ph)₂СН₃.

[00725] В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -L^s-R'. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -L^s-R' где -L^s- представляет собой двухвалентную, необязательно замещенную C_1-30гетероалифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -CH₂Si(Ph)₂CH₃.

[00726] В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -F. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой Cl. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -Br. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -L^d-. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -CN. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой N₃. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -NO. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -NO₂. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -L^s-Si(R)₃. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -Si(R)₃. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -L^s-R'. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -R'. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собо-L^s-OR'. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой OR'. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -L^s-SR'. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -SR'. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -L^s-N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -O-L^s-R'. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -O-L^s-Si(R)₃. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -O-L^s-OR'. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой О-L^s-SR'. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -O-L^s-N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой 2'-модификацию, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -OR, где R является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -OR, где R представляет собой необязательно замещенную С_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -ОМе. В некоторых вариантах осуществления R^s представляет собой -ОС₂СН₂ОМе.

[00727] В некоторых вариантах осуществления s составляет 0-20. В некоторых вариантах осуществления s составляет 1-20. В некоторых вариантах осуществления s составляет 1-5. В некоторых вариантах осуществления s составляет 1. В некоторых вариантах осуществления s составляет 2. В некоторых вариантах осуществления s составляет 3. В некоторых вариантах осуществления s составляет 4. В некоторых вариантах осуществления s составляет 5. В некоторых вариантах осуществления s составляет 6. В некоторых вариантах осуществления s составляет 7. В некоторых вариантах осуществления s составляет 8. В некоторых вариантах осуществления s составляет 9. В некоторых вариантах осуществления s составляет 10. В некоторых вариантах осуществления s составляет 11. В некоторых вариантах осуществления s составляет 12. В некоторых вариантах осуществления s составляет 13. В некоторых вариантах осуществления s составляет 14. В некоторых вариантах осуществления s составляет 15. В некоторых вариантах осуществления s составляет 16. В некоторых вариантах осуществления s составляет 17. В некоторых вариантах осуществления s составляет 18. В некоторых вариантах осуществления s составляет 19. В некоторых вариантах осуществления s составляет 20.

[00728] В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой L, где L является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления L представляет собой двухвалентную необязательно замещенную метиленовую группу. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой -СН₂-. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой -C(R')₂-. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой CH(R'). В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой -CHR-. В некоторых вариантах осуществления каждый L^s независимо представляет собой ковалентную связь или двухвалентную, необязательно замещенную, линейную или разветвленную группу, выбранную из C_1-30алифатической группы и C_1-30гетероалифатической группы, содержащей 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, где одно или несколько метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из С_1-6алкилена, С_1-6алкенилена, С≡С, двухвалентной C₁-С₆гетероалифатической группы, содержащей 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)O-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -C(O)S-, -C(O)O-, -P(O)(OR')-, -P(O)(SR')-, -P(O)(R')-, -P(O)(NR')-, -P(S)(OR')-, -P(S)(SR')-, -P(S)(R')-, P(S)(NR'), P(R'), -P(OR'), -P(SR')-, P(NR'), P(OR')[B(R')₃], OP(O)(OR')O, -OP(O)(SR')O-, -OP(O)(R')O-, -OP(O)(NR')O-, -OP(OR')O-, -OP(SR')C)-, -OP(NR')C-, -OP(R')O- или -OP(OR')[B(R')₃]O-, и один или несколько атомов углерода необязательно и независимо заменены на Cy^L.

[00729] В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой ковалентную связь или двухвалентную, необязательно замещенную, линейную или разветвленную группу, выбранную из C_1-30алифатической группы и C_1-30гетероалифатической группы, содержащей 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, где одно или несколько метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из С_1-6алкилена, С_1-6алкенилена, С≡С; двухвалентной C₁-С₆гетероалифатической группы, содержащей 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, -C(R')₂- -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)O, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -C(O)S-, -C(O)O- -P(O)(OR')-, -P(O)(SR')- -P(O)(R')-, -P(O)(NR')-, -P(S)(OR')-, -P(S)(SR')-, -P(S)(R')- -P(S)(NR')-, -P(R')-, -P(OR')-, -P(SR')-, -P(NR')- -P(OR')[B(R')₃]-, -OP(O)(OR')O-, -OP(O)(SR')O-, -OP(O)(R')O-, -OP(O)(NR')O-, -OP(OR')O-, -OP(SR')C)-, -OP(NR')C-, -OP(R')O- или -OP(OR')[B(R')₃]O-, и один или несколько атомов углерода необязательно и независимо заменены на Cy^L. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой ковалентную связь или двухвалентную, необязательно замещенную, линейную или разветвленную С_1-30алифатическую группу, где одно или несколько метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из С_1-6алкилена, C_1-6-6алкенилена, С≡С; двухвалентной C₁-С₆гетероалифатической группы, содержащей 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)O-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -C(O)S-, -C(O)O-, -P(O)(OR')-, -P(O)(SR')-, -P(O)(R')-, -P(O)(NR')-, -P(S)(OR')-, -P(S)(SR')-, -P(S)(R')-, -P(S)(NR')-, -P(R')-, -P(OR')-, -P(SR')- -P(NR')-, -P(OR')[B(R')₃]-, -OP(O)(OR')O-, -OP(O)(SR')O-, -OP(O)(R')O-, -OP(O)(NR')O-, -OP(OR')O-, -OP(SR')O-, -OP(NR')O-, -OP(R')O- или -OP(OR')[B(R')₃]O-, и один или несколько атомов углерода необязательно и независимо заменены на Cy^L. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой ковалентную связь или двухвалентную, необязательно замещенную, линейную или разветвленную С_1-30гетероалифатическую группу, содержащую 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, где одно или несколько метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из С_1-6алкилена, C_1-6алкенилена, -C≡C, двухвалентной C₁-С₃гетероалифатической группы, содержащей 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, C(R')₂, -Су-,-О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')- -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)O-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -C(O)S-, -C(O)O-, -P(O)(OR')-, -P(O)(SR')-, -P(O)(R')-, -P(O)(NR')-,-P(S)(OR')-, -P(S)(SR')-, -P(S)(R')-, -P(S)(NR')-, -P(R')-, -P(OR')-, -P(SR')-, -P(NR')-, -P(OR')[B(R')₃]-, -OP(O)(OR')O-, -OP(O)(SR')O-, -OP(O)(R')O-, -OP(O)(NR')O-, -OP(OR')O-, -OP(SR')O-, -OP(NR')O- -OP(R')O- или -OP(OR')[B(R')₃]O-, и один или несколько атомов углерода необязательно и независимо заменены на Cy^L. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой ковалентную связь или двухвалентную, необязательно замещенную, линейную или разветвленную группу, выбранную из C_1-30 алифатической группы и C_1-30гетероалифатической группы, содержащей 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, где одно или несколько метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из С_1-6алкилена, С_1-6алкенилена, С≡С; двухвалентной C₁-С₆гетероалифатической группы, содержащей 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, C(R')₂, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)O-,-S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -C(O)S- или -C(O)O- и один или несколько атомов углерода необязательно и независимо заменены на Cy^L. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой ковалентную связь или двухвалентную, необязательно замещенную, линейную или разветвленную группу, выбранную из С_1-10алифатической группы и С_1-30гетероалифатической группы, содержащей 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, где одно или несколько метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из С_1-6алкилена, С_1-6алкенилена, C(R')₂, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)O, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -C(O)S- и -C(O)O-, и один или несколько атомов углерода необязательно и независимо заменены на Cy^L. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой ковалентную связь или двухвалентную, необязательно замещенную, линейную или разветвленную группу, выбранную из С_1-10 алифатической группы и С_1-10гетероалифатической группы, содержащей 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, где одно или несколько метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из -C(R')₂-, -Су-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R)C(O)O-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -C(O)S- и -C(O)O-.

[00730] В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой ковалентную связь. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой необязательно замещенную двухвалентную С_1-30алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой необязательно замещенную двухвалентную С_1-30гетероалифатическую группу, содержащую 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из бора, кислорода, азота, серы, фосфора и кремния.

[00731] В некоторых вариантах осуществления алифатические фрагменты, например, такие фрагменты из L^s, R и т.д., одновалентные, или двухвалентные, или многовалентные, могут содержать любое число атомов углерода (перед любым необязательным замещением) в пределах своего диапазона, например, C₁, С₂, С₃, С₄, С₅, С₆, C₇, C₈, С₉, С₁₀, С₁₁, С₁₂, С₁₃, С₁₄, C₁₅, C₁₆, С₁₇, C₁₈, С₁₉, С₂₀, С₂₁, С₂₂, С₂₃, С₂₄, С₂₅, С₂₆, С₂₇, С₂₈, С₂₉, С₃₀ и т.д. В некоторых вариантах осуществления гетероалифатические фрагменты, например, такие фрагменты из L^s, R и т.д., одновалентные, или двухвалентные, или многовалентные, могут содержать любое число атомов углерода (перед любым необязательным замещением) в пределах своего диапазона, например, C₁, С₂, С₃, С₄, С₅, С₆, C₇, C₈, С₉, С₁₀, С₁₁, С₁₂, С₁₃, С₁₄, C₁₅, C₁₆, С₁₇, C₁₈, С₁₉, С₂₀, С₂₁, С₂₂, С₂₃, С₂₄, С₂₅, С₂₆, С₂₇, С₂₈, С₂₉, С₃₀ и т.д.

[00732] В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -Су-, где Су является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления одно или несколько метиленовых звеньев необязательно и независимо замещены -О-, -S-, -N(R')-, -С(О)-, -S(O)-, -S(O)₂-, -P(O)(OR')-, -P(O)(SR')-, -P(S)(OR')- или -P(S)(OR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -О-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -S-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -N(R')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -С(О)-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -S(O)-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на S(O)₂. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на P(O)(OR'). В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(O)(SR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(O)(R')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(O)(NR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(S)(OR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(S)(SR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(S)(R')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(S)(NR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(R')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(OR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(SR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(NR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(OR')[B(R')₃]-. В некоторых вариантах осуществления одно или несколько метиленовых звеньев необязательно и независимо замещены -О- -S-, -N(R')-, -С(О)-, -S(O)-, -S(O)₂-, -P(O)(OR')-, -P(O)(SR')-, --P(S)(OR')- или -P(S)(OR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -OP(O)(OR')O-, -OP(O)(SR')O-, -OP(O)(R')O-, -OP(O)(NR')O-, -OP(OR')O-, -OP(SR')O-, -OP(NR')O-, -OP(R')O- или -OP(OR')[B(R')₃O-, каждый из которых независимо может представлять собой межнуклеотидную связь.

[00733] В некоторых вариантах осуществления L^s, например, при присоединении к R^s, представляет собой СН₂. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой C(R)₂, где по меньшей мере один R не представляет собой водород. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой -CHR-. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой водород. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой -CHR-, где R не представляет собой водород. В некоторых вариантах осуществления атом С из -CHR- является хиральным. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой -(R)-CHR-, где атом С из -CHR- является хиральным. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой -(S)-CHR-, где атом С из -CHR- является хиральным. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную C_1-6 алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный С_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_1-5 алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный С_1-5алкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную C_1-5алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный С_1-4алкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную C_1-3алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный C_1-3алкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С₂алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный метил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-5 алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-5алкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой C_1-4алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-4алкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой C_1-3алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой C_1-3алкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С₂ алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой метил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-6галогеналифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-6галогеналкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-5галогеналифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-5галогеналкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-4 галогеналифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой C_1-4 галогеналкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-3галогеналифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-3галогеналкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С₂ галогеналифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой метил, замещенный одним или несколькими галогенами. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой -CF₃-. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой необязательно замещенный -СН=СН-. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой необязательно замещенный (Е)-СН=СН-. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой необязательно замещенный (Z)-СН=СН. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой -С≡С-.

[00734] В некоторых вариантах осуществления L^s содержит по меньшей мере один атом фосфора. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере одно метиленовое звено из L^s заменено на -P(O)(OR')-, -P(O)(SR')-, -P(O)(R')-, -P(O)(NR')-, -P(S)(OR')-, -P(S)(SR')-, -P(S)(R')-, -P(S)(NR')-, -P(R')-, -P(OR')-, -P(SR')-, -P(NR')-, -P(OR')[B(R')₃]-, -OP(O)(OR')O-, -OP(O)(SR')O-, -OP(O)(R')O, -OP(O)(NR')O-, -OP(OR')O-, -OP(SR')C-, OP(NR')O, -OP(R')O- или -OP(OR')[B(R')₃]O-.

[00735] В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой -Су-. В некоторых вариантах осуществления -Су- представляет собой необязательно замещенное моноциклическое или бициклическое 3-20-членное гетероциклильное кольцо, содержащее 1-5 гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления -Су- представляет собой необязательно замещенное моноциклическое или бициклическое 5-20-членное гетероциклильное кольцо, содержащее 1-5 гетероатомов, где по меньшей мере один гетероатом представляет собой кислород. В некоторых вариантах осуществления -Су- представляет собой необязательно замещенное двухвалентное тетрагидрофурановое кольцо. В некоторых вариантах осуществления -Су- представляет собой необязательно замещенный фуранозный фрагмент.

[00736] Как описано в данном документе, каждый L независимо представляет собой ковалентную связь или двухвалентную, необязательно замещенную, линейную или разветвленную группу, выбранную из C_1-30алифатической группы и C_1-30гетероалифатической группы, содержащей 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора, бора и кремния, где одно или несколько метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены на C_1-6алкилен, C_1-6алкенилен, -c≡c-, C(R)₂, -О-, S, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)O-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -C(O)S-, -C(O)O-, -P(O)(OR')-, -P(O)(SR')-, -P(O)(R')-, -P(O)(NR')-, -P(S)(OR')-, -P(S)(SR')-,-P(S)(R')-, -P(S)(NR')-, -P(R')-, -P(OR')-, -P(SR')-, P(NR'), P(OR')[B(R)₃], -OP(O)(OR')O-, -OP(O)(SR')O-, -OP(O)(R')O-, -OP(O)(NR')O-, -OP(OR')O-, -OP(SR')O-, -OP(NR')O-OP(R')O или OP(OR')[B(R')₃]O; и один или несколько атомов углерода необязательно и независимо заменены на Cy^L.

[00737] В некоторых вариантах осуществления L представляет собой ковалентную связь или двухвалентную, необязательно замещенную, линейную или разветвленную группу, выбранную из C_1-30алифатической группы и C_1-30гетероалифатической группы, содержащей 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, где одно или несколько метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из C_1-6алкилена, C_1-6алкенилена, , -C(R')₂-, -О-, -S-, -S-S-, N(R'), -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)O-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -C(O)S-, -C(O)O-, -P(O)(OR')-, -P(O)(SR')-, -P(O)(R')-, P(O)(NR'), -P(S)(OR')-, -P(S)(SR')-, -P(S)(R')-, -P(S)(NR')-, -P(R')-, -P(OR')-, -P(SR')-, -P(NR')-P(OR)[B(R')₃], -OP(O)(OR')O-, -OP(O)(SR')O-, -OP(O)(R')O-, -OP(O)(NR')O-, -OP(OR)O-, -OP(SR')O-, -OP(NR')O-, -OP(R')O- или -OP(OR')[B(R')₃]O-, и один или несколько атомов углерода необязательно и независимо заменены на Cy^L. В некоторых вариантах осуществления L представляет собой ковалентную связь или двухвалентную, необязательно замещенную, линейную или разветвленную C_1-30алифатическую группу, где одно или несколько метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из C_1-6алкилена, С_1-6алкенилена, , -C(R')₂-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)O-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -C(O)S-, -C(O)O-, -P(O)(OR')-, -P(O)(SR')-, -P(O)(R')-, -P(O)(NR')-, -P(S)(OR')-, -P(S)(SR')-, -P(S)(R')-, -P(S)(NR')-, -P(R')-, -P(OR')-, -P(SR')-, -P(NR')-, -P(OR')[B(R')₃]-, -OP(O)(OR')O-, -OP(O)(SR)O-, -OP(O)(R')O-, -OP(O)(NR')O-, -OP(OR')O- ,-OP(SR')O-, -OP(NR')O-, -OP(R')O- или -OP(OR')[B(R)₃]O-, и один или несколько атомов углерода необязательно и независимо заменены на Cy^L. В некоторых вариантах осуществления L представляет собой ковалентную связь или двухвалентную, необязательно замещенную, линейную или разветвленную C_1-30гетероалифатическую группу, содержащую 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, где одно или несколько метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из C_1-6алкилена, C_1-6алкенилена, ; -C(R')₂- -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)- -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)O-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -C(O)S-, -C(O)O-, -P(O)(OR')-, -P(O)(SR')-, -P(O)(R')-, -P(O)(NR')-, -P(S)(OR')-, -P(S)(SR')-, -P(S)(R')-, -P(S)(NR')-, -P(R')-, -P(OR')-, -P(SR')-, -P(NR')-, -P(OR')[B(R')₃]-, -OP(O)(OR')O-, OP(O)(SR')O, -OP(O)(R')O-, -OP(O)(NR')O-, OP(OR')O, -OP(SR')O-, -OP(NR')O-, -OP(R')O- или -OP(OR')[B(R)₃]O-, и один или несколько атомов углерода необязательно и независимо заменены на Cy^L. В некоторых вариантах осуществления L представляет собой ковалентную связь или двухвалентную, необязательно замещенную, линейную или разветвленную группу, выбранную из C_1-30алифатической группы и C_1-30гетероалифатической группы, содержащей 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, где одно или несколько метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из C_1-6алкилена, C_1-6алкенилена, , -C(R')₂-, -О-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R)C(O)N(R')-, -N(R')C(O)O-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -C(O)S- или -C(O)O-, и один или несколько атомов углерода необязательно и независимо заменены на Cy^L. В некоторых вариантах осуществления L представляет собой ковалентную связь или двухвалентную, необязательно замещенную, линейную или разветвленную группу, выбранную из С_1-10алифатической группы и С_1-10гетероалифатической группы, содержащей 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, где одно или несколько метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из C_1-6алкилена, C_1-6алкенилена, -C(R')₂-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)O-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -C(O)S- и -C(O)O-, и один или несколько атомов углерода необязательно и независимо заменены на Cy^L. В некоторых вариантах осуществления L представляет собой ковалентную связь или двухвалентную, необязательно замещенную, линейную или разветвленную группу, выбранную из C_1-10алифатической группы и С_1-10гетероалифатической группы, содержащей 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, где одно или несколько метиленовых звеньев необязательно и независимо заменены необязательно замещенной группой, выбранной из -C(R')₂-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -С(О)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)O-, -S(O)-, -S(O)₂-, -S(O)₂N(R')-, -C(O)S- и -C(O)O-.

[00738] В некоторых вариантах осуществления L представляет собой ковалентную связь. В некоторых вариантах осуществления L представляет собой необязательно замещенную двухвалентную C_1-30алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления L представляет собой необязательно замещенную двухвалентную С_1-30гетероалифатическую группу, содержащую 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из бора, кислорода, азота, серы, фосфора и кремния.

[00739] В некоторых вариантах осуществления алифатические фрагменты, например, такие фрагменты из L, R и т.д., одновалентные, или двухвалентные, или многовалентные, могут содержать любое число атомов углерода (перед любым необязательным замещением) в пределах своего диапазона, например, C₁, С₂, С₃, С₄, С₅, С₆, С₇, С₈, С₉, С₁₀, С₁₁, С₁₂, С₁₃, С₁₄, С₁₅, C₁₆, С₁₇, C₁₈, С₁₉, С₂₀, С₂₁, С₂₂, С₂₃, С₂₄, С₂₅, С₂₆, С₂₇, С₂₈, С₂₉, С₃₀ и т.д. В некоторых вариантах осуществления гетероалифатические фрагменты, например, такие фрагменты из L, R и т.д., одновалентные, или двухвалентные, или многовалентные, могут содержать любое число атомов углерода (перед любым необязательным замещением) в пределах своего диапазона, например, C₁, С₂, С₃, С₄, С₅, С₆, С₇, С₈, С₉, С₁₀, С₁₁, С₁₂, С₁₃, С₁₄, С₁₅, C₁₆, С₁₇, C₁₈, С₁₉, С₂₀, С₂₁, С₂₂, С₂₃, С₂₄, С₂₅, С₂₆, С₂₇, С₂₈, С₂₉, С₃₀ и т.д.

[00740] В некоторых вариантах осуществления одно или несколько метиленовых звеньев необязательно и независимо замещены -О-, -S-, -N(R')-, -С(O)-, -S(O)-, -S(O)₂-, -P(O)(OR')-, -P(O)(SR')-, -P(S)(OR')- или -P(S)(OR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -О-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -S-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -N(R')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -С(О)-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на S(O). В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -S(O)₂-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(O)(OR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(O)(SR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(O)(R')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(O)(NR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(S)(OR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(S)(SR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(S)(R')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(S)(NR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(R')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(OR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(SR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(NR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -P(OR')[B(R')₃]-. В некоторых вариантах осуществления одно или несколько метиленовых звеньев необязательно и независимо замещены -О-, -S-, -N(R')-, -С(О)-, -S(O)-, -S(O)₂-, -P(O)(OR')-, -P(O)(SR')-, -P(S)(OR')- или -P(S)(OR')-. В некоторых вариантах осуществления метиленовое звено заменено на -OP(O)(OR')O-, -OP(O)(SR')O-, -OP(O)(R')O-, -OP(O)(NR')O-, -OP(OR')O-, -OP(SR')O-, -OP(NR')O-, -OP(R')O- или -OP(OR')[B(R')₃]O-, каждый из которых независимо может представлять собой межнуклеотидную связь.

[00741] В некоторых вариантах осуществления L, например, при присоединении к R, представляет собой -СН₂-. В некоторых вариантах осуществления L представляет собой -C(R)₂-, где по меньшей мере один R не представляет собой водород. В некоторых вариантах осуществления L представляет собой -CHR-. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой водород. В некоторых вариантах осуществления L представляет собой -CHR-, где R не представляет собой водород. В некоторых вариантах осуществления атом С из -CHR- является хиральным. В некоторых вариантах осуществления L представляет собой -(R)-CHR-, где атом С из -CHR- является хиральным. В некоторых вариантах осуществления L представляет собой -(S)-CHR-, где атом С из -CHR- является хиральным. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный С_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_1-5алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный С_1-5алкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_1-4алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный С_1-4алкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_1-3алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный С_1-3алкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С₂алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный метил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой C_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-5алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-5алкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-4алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-4алкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой C_1-3алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-3алкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С₂алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой метил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-6галогеналифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой C_1-6галогеналкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-5галогеналифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-5галогеналкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-4галогеналифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-4галогеналкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С_1-3галогеналифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой C_1-3галогеналкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой С₂галогеналифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой метил, замещенный одним или несколькими галогенами. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой -CF₃. В некоторых вариантах осуществления L представляет собой необязательно замещенный -СН=СН-. В некоторых вариантах осуществления L представляет собой необязательно замещенный (Е)-СН=СН-. В некоторых вариантах осуществления L представляет собой необязательно замещенный (Z)-СН=СН-. В некоторых вариантах осуществления L представляет собой -С≡С-.

[00742] В некоторых вариантах осуществления L содержит по меньшей мере один атом фосфора. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере одно метиленовое звено из L заменено на -P(O)(OR')-, -P(O)(SR')-, -P(O)(R')-, -P(O)(NR')-, -P(S)(OR')-, -P(S)(SR')-, -P(S)(R')-, -P(S)(NR')-, -P(R')-, -P(OR')-, -P(SR')-, -P(NR')-, -P(OR')[B(R')₃]-, -OP(O)(OR')O-, -OP(O)(SR')O-, -OP(O)(R')O, -OP(O)(NR')O-, -OP(OR')O-, -OP(SR')O-, OP(NR')O-, -OP(R')O- или -OP(OR')[B(R')₃]O-.

[00743] В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой необязательно замещенную четырехвалентную группу, выбранную из С_3-20циклоалифатического кольца, С₆-₂₀арильного кольца, 5-20-членного гетероарильного кольца, содержащего 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, и 3-20-членного гетероциклильного кольца, содержащего 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора, бора и кремния.

[00744] В некоторых вариантах осуществления Cy^L является моноциклическим. В некоторых вариантах осуществления Cy^L является бициклическим. В некоторых вариантах осуществления Cy^L является полициклическим.

[00745] В некоторых вариантах осуществления Cy^L является насыщенным. В некоторых вариантах осуществления Cy^L является частично ненасыщенным. В некоторых вариантах осуществления Cy^L является ароматическим. В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой или содержит фрагмент, являющийся насыщенным кольцом. В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой или содержит фрагмент, являющийся частично ненасыщенным кольцом. В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой или содержит фрагмент, являющийся ароматическим кольцом.

[00746] В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой необязательно замещенное С_3-20циклоалифатическое кольцо, как описано в настоящем изобретении (например, такое, как описано для R, но являющееся четырехвалентным). В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой необязательно замещенное насыщенное С_3-20циклоалифатическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой необязательно замещенное частично ненасыщенное С_3-20циклоалифатическое кольцо. Циклоалифатическое кольцо может иметь различные размеры, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления кольцо является 3-, 4-, 5-, 6-, 7-, 8-, 9- или 10-членным. В некоторых вариантах осуществления кольцо является 3-членным. В некоторых вариантах осуществления кольцо является 4-членным. В некоторых вариантах осуществления кольцо является 5-членным. В некоторых вариантах осуществления кольцо является 6-членным. В некоторых вариантах осуществления кольцо является 7-членным. В некоторых вариантах осуществления кольцо является 8-членным. В некоторых вариантах осуществления кольцо является 9-членным. В некоторых вариантах осуществления кольцо является 10-членным. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой необязательно замещенный циклопропильный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой необязательно замещенный циклобутильный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой необязательно замещенный циклопентильный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой необязательно замещенный циклогексильный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой необязательно замещенный циклогептильный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой необязательно замещенный циклооктанильный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления циклоалифатическое кольцо представляет собой циклоалкильное кольцо. В некоторых вариантах осуществления циклоалифатическое кольцо является моноциклическим. В некоторых вариантах осуществления циклоалифатическое кольцо является бициклическим. В некоторых вариантах осуществления циклоалифатическое кольцо является полициклическим. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой циклоалифатический фрагмент, как описано в настоящем изобретении для R, с большим числом валентностей.

[00747] В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой необязательно замещенное 6-20-членное арильное кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой необязательно замещенный четырехвалентный фенильный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой четырехвалентный фенильный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой необязательно замещенный нафталиновый фрагмент. Кольцо может иметь различный размер, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления арильное кольцо является 6-членным. В некоторых вариантах осуществления арильное кольцо является 10-членным. В некоторых вариантах осуществления арильное кольцо является 14-членным. В некоторых вариантах осуществления арильное кольцо является моноциклическим. В некоторых вариантах осуществления арильное кольцо является бициклическим. В некоторых вариантах осуществления арильное кольцо является полициклическим. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой арильный фрагмент, как описано в настоящем изобретении для R, с большим числом валентностей.

[00748] В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой необязательно замещенное 5-20-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой необязательно замещенное 5-20-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота и серы. В некоторых вариантах осуществления, как описано в настоящем изобретении, гетероарильные кольца могут иметь различные размеры и содержать различные числа и/или типы гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления гетероарильное кольцо содержит не более одного гетероатома. В некоторых вариантах осуществления гетероарильное кольцо содержит более одного гетероатома. В некоторых вариантах осуществления гетероарильное кольцо содержит не более одного типа гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления гетероарильное кольцо содержит более одного типа гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления гетероарильное кольцо является 5-членным. В некоторых вариантах осуществления гетероарильное кольцо является 6-членным. В некоторых вариантах осуществления гетероарильное кольцо является 8-членным. В некоторых вариантах осуществления гетероарильное кольцо является 9-членным. В некоторых вариантах осуществления гетероарильное кольцо является 10-членным. В некоторых вариантах осуществления гетероарильное кольцо является моноциклическим. В некоторых вариантах осуществления гетероарильное кольцо является бициклическим. В некоторых вариантах осуществления гетероарильное кольцо является полициклическим. В некоторых вариантах осуществления гетероарильное кольцо представляет собой фрагмент, являющийся нуклеиновым основанием, например А, Т, С, G, U и т.д. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой гетероарильный фрагмент, как описано в настоящем изобретении для R, с большим числом валентностей.

[00749] В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой 3-20-членное гетероциклильное кольцо, содержащее 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой 3-20-членное гетероциклильное кольцо, содержащее 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота и серы. В некоторых вариантах осуществления гетероциклильное кольцо является насыщенным. В некоторых вариантах осуществления гетероциклильное кольцо является частично ненасыщенным. Гетероциклильное кольцо может иметь различные размеры, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления кольцо является 3-, 4-, 5-, 6-, 7-, 8-, 9- или 10-членным. В некоторых вариантах осуществления кольцо является 3-членным. В некоторых вариантах осуществления кольцо является 4-членным. В некоторых вариантах осуществления кольцо является 5-членным. В некоторых вариантах осуществления кольцо является 6-членным. В некоторых вариантах осуществления кольцо является 7-членным. В некоторых вариантах осуществления кольцо является 8-членным. В некоторых вариантах осуществления кольцо является 9-членным. В некоторых вариантах осуществления кольцо является 10-членным. Гетероциклильные кольца могут содержать различные числа и/или типы гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления гетероциклильное кольцо содержит не более одного гетероатома. В некоторых вариантах осуществления гетероциклильное кольцо содержит более одного гетероатома. В некоторых вариантах осуществления гетероциклильное кольцо содержит не более одного типа гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления гетероциклильное кольцо содержит более одного типа гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления гетероциклильное кольцо является моноциклическим. В некоторых вариантах осуществления гетероциклильное кольцо является бициклическим. В некоторых вариантах осуществления гетероциклильное кольцо является полициклическим. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой гетероциклильный фрагмент, как описано в настоящем изобретении для R, с большим числом валентностей.

[00750] Средний специалист в данной области техники легко поймет, что многие подходящие кольцевые фрагменты подробно описаны и могут использоваться в соответствии с настоящим изобретением, например, описанные для R (которые могут иметь большее число валентностей в случае с Cy^L).

[00751] В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой сахарный фрагмент в нуклеиновой кислоте. В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой необязательно замещенный фуранозный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой пиранозный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой необязательно замещенный фуранозный фрагмент, встречающийся в ДНК. В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой необязательно замещенный фуранозный фрагмент, встречающийся в РНК. В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой необязательно замещенный 2'-дезоксирибофуранозный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой необязательно замещенный рибофуранозный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления замещения обеспечивают модификации сахара, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления необязательно замещенный 2'-дезоксирибофуранозный фрагмент и/или необязательно замещенный рибофуранозный фрагмент содержат замещение по 2'-положению. В некоторых вариантах осуществления 2'-положение представляет собой 2'-модификацию, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой F. В некоторых вариантах осуществления 2'-модификация представляет собой -OR, где R является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R не представляет собой водород. В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой модифицированный сахарный фрагмент, такой как сахарный фрагмент в LNA, альфа-L-LNA или GNA. В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой модифицированный сахарный фрагмент, такой как сахарный фрагмент в ENA. В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой концевой сахарный фрагмент олигонуклеотида, соединяющий межнуклеотидную связь и нуклеиновое основание. В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой концевой сахарный фрагмент олигонуклеотида, например, если этот конец присоединен к твердой подложке необязательно посредством линкера. В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой сахарный фрагмент, соединяющий две межнуклеотидные связи и нуклеиновое основание. Примеры сахаров и сахарных фрагментов подробно описаны в настоящем изобретении.

[00752] В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой фрагмент, являющийся нуклеиновым основанием. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой природное нуклеиновое основание, такое как А, Т, С, G, U и т.д. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновое основание представляет собой модифицированное нуклеиновое основание. В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой необязательно замещенный фрагмент, являющийся нуклеиновым основанием, выбранный из А, Т, С, G, U и 5mC. Примеры нуклеиновых оснований и фрагментов, являющихся нуклеиновыми основаниями, подробно описаны в настоящем изобретении.

[00753] В некоторых вариантах осуществления два фрагмента Cy^L присоединены друг к другу, где один Cy^L представляет собой сахарный фрагмент, а другой представляет собой фрагмент, являющийся нуклеиновым основанием. В некоторых вариантах осуществления такой сахарный фрагмент и фрагмент, являющийся нуклеиновым основанием, образуют нуклеозидный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления нуклеозидный фрагмент является природным. В некоторых вариантах осуществления нуклеозид фрагмент является модифицированным. В некоторых вариантах осуществления Cy^L представляет собой необязательно замещенный природный нуклеозидный фрагмент, выбранный из аденозина, 5-метилуридина, цитидина, гуанозина, уридина, 5-метилцитидина, 2'-дезоксиаденозина, тимидина, 2'-дезоксицитидина, 2'-дезоксигуанозина, 2'-дезоксиуридина и 5-метил-2'-дезоксицитидина. Примеры нуклеозидов и нуклеозидных фрагментов подробно описаны в настоящем изобретении.

[00754] В некоторых вариантах осуществления, например в L^s, Cy^L представляет собой необязательно замещенный нуклеозидный фрагмент, связанный с межнуклеотидной связью, например, -OP(O)(OR')O-, -OP(O)(SR')O-, -OP(O)(R')O-, -OP(O)(NR')O-, OP(OR')O-, -OP(SR')O-, -OP(NR')O-, -OP(R')O-, -OP(OR')[B(R)₃]O- и т.д., которые могут образовывать необязательно замещенное нуклеотидное звено. Примеры нуклеотидных и нуклеозидных фрагментов подробно описаны в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления -Су- представляет собой необязательно замещенный двухвалентный 3-30-членный карбоциклилен. В некоторых вариантах осуществления -Су- представляет собой необязательно замещенный двухвалентный 6-30-членный арилен. В некоторых вариантах осуществления -Су- представляет собой необязательно замещенный двухвалентный 5-30-членный гетероарилен, содержащий 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота и серы. В некоторых вариантах осуществления -Су- представляет собой необязательно замещенный двухвалентный 3-30-членный гетероциклилен, содержащий 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления -Су- представляет собой необязательно замещенный двухвалентный 5-30-членный гетероарилен, содержащий 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота и серы. В некоторых вариантах осуществления -Су- представляет собой необязательно замещенный двухвалентный 3-30-членный гетероциклилен, содержащий 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния.

[00755] В некоторых вариантах осуществления каждое кольцо A^s независимо представляет собой необязательно замещенное 3-20-членное моноциклическое, бициклическое или полициклическое кольцо, содержащее 0-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления кольцо A^s представляет собой необязательно замещенное кольцо, при этом кольцо является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления кольцо A^s представляет собой необязательно замещенный В некоторых вариантах осуществления кольцо A^s представляет собой В некоторых вариантах осуществления кольцо A^s представляет собой необязательно замещенный В некоторых вариантах осуществления кольцо A^s представляет собой В некоторых вариантах осуществления кольцо A^s представляет собой бициклическое кольцо, например, бициклическое кольцо в бициклических сахарах. В некоторых вариантах осуществления кольцо A^s представляет собой полициклическое кольцо.

[00756] В некоторых вариантах осуществления имеет структуру

или

где каждый L^b независимо представляет собой L, и каждая другая переменная независимо является такой, как описано в настоящем изобретении. Примеры вариантов осуществления включают те, которые описаны для сахаров. В некоторых вариантах осуществления один L^b представляет собой -О-, -S- или -N(R')-. В некоторых вариантах осуществления L^b, присоединенный к атому 2'-углерода, представляет собой -О-, -S- или -N(R')-. В некоторых вариантах осуществления L^b представляет собой -C(R)₂-. В некоторых вариантах осуществления L^b, присоединенный к атому 4'-углерода, представляет собой -C(R)₂-. В некоторых вариантах осуществления -C(R)₂- представляет собой -CHR-. В некоторых вариантах осуществления оба L^b независимо представляют собой -C(R)₂-.

[00757] В некоторых вариантах осуществления каждый из R^1s, R^2s, R^3s, R^4s и R^5s независимо представляет собой R^s, где R^s является таким, как описано в настоящем изобретении.

[00758] В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой R^s, где R^s является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R^1s находится в 1'-положении (ВА находится в 1'-положении). В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -Н. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -F. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -Cl. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой Br. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -I. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -CN. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -N₃. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -NO. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -NO₂. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -L-R'. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -R'. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -L-OR'. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -OR'. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -L-SR'. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -SR'. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой L-L-N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -OR', где R' представляет собой необязательно замещенную С_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -OR', где R' представляет собой необязательно замещенный С_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -ОМе. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -МОЕ. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой водород. В некоторых вариантах осуществления R^s в одном 1'-положении представляет собой водород, и R^s в другом 1'-положении не представляет собой водород, как описано в данном документе. В некоторых вариантах осуществления R^s в обоих 1'-положениях представляют собой водород. В некоторых вариантах осуществления R^s в одном 1'-положении представляет собой водород, а в другом 1'-положении присоединен к межнуклеотидной связи. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -F. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -Cl. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -Br. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -I. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -CN. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -N₃. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -NO. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -NO₂. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -L-R'. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -R'. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -L-OR'. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -OR'. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -L-SR'. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -SR'. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -L-N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -OR', где R' представляет собой необязательно замещенную С_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -OR', где R' представляет собой необязательно замещенный С_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -ОН. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -ОМе. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -МОЕ. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой водород. В некоторых вариантах осуществления один R^1s в 1'-положении представляет собой водород, а другой R^1s в другом 1'-положении не представляет собой водород, как описано в данном документе. В некоторых вариантах осуществления R^1s в обоих 1'-положениях представляют собой водород. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -O-L^s-OR'. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -O-L^s-OR', где L^s представляет собой необязательно замещенный С_1-6алкилен, a R' представляет собой необязательно замещенную С_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -O-(необязательно замещенный C_1-6алкилен)-OR'. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -O-(необязательно замещенный C_1-6алкилен)-OR', где R' представляет собой необязательно замещенный С_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления R^1s представляет собой -ОСН₂СН₂ОМе.

[00759] В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой R^s, где R^s является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления, если в 2'-положении присутствуют два R^2s, то один R^2s представляет собой -Н, а другой является водородом. В некоторых вариантах осуществления R^2s находится в 2'-положении (ВА находится в 1'-положении). В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -Н. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -F. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -Cl. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -Br. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -I. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -CN. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -N₃. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -NO. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -NO₂. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -L-R'. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -R'. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -L-OR'. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -OR'. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -L-SR'. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой SR'. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой L-L-N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -OR', где R' представляет собой необязательно замещенную C_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -OR', где R' представляет собой необязательно замещенный C_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -ОМе. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -МОЕ. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой водород. В некоторых вариантах осуществления R^s в одном 2'-положении представляет собой водород, и R^s в другом 2'-положении не представляет собой водород, как описано в данном документе. В некоторых вариантах осуществления R^s в обоих 2'-положениях представляют собой водород. В некоторых вариантах осуществления R^s в одном 2'-положении представляет собой водород, а в другом 2'-положении присоединен к межнуклеотидной связи. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -F. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -Cl. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой Br. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -I. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -CN. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -N₃. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -NO. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -NO₂. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -L-R'. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой R'. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -L-OR'. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -OR'. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -L-SR'. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -SR'. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -L-N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -OR', где R' представляет собой необязательно замещенную C_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -OR', где R' представляет собой необязательно замещенный C_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -ОН. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -ОМе. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -МОЕ. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой водород. В некоторых вариантах осуществления один R^2s в 2'-положении представляет собой водород, а другой R^2s в другом 2'-положении не представляет собой водород, как описано в данном документе. В некоторых вариантах осуществления R^2s в обоих 2'-положениях представляют собой водород. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -O-L^s-OR'. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -О-L^s-OR', где L^s представляет собой необязательно замещенный C_1-6алкилен, a R' представляет собой необязательно замещенную C_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -О-(необязательно замещенный С_1-6алкилен)-OR'. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -O-(необязательно замещенный С_1-6алкилен)-OR', где R' представляет собой необязательно замещенный C_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления R^2s представляет собой -ОСН₂СН₂ОМе.

[00760] В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой R^s, где R^s является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R^3s находится в 3'-положении (ВА находится в 1'-положении). В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -Н. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -F. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -Cl. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -Br. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -I. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -CN. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -N₃. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -NO. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -NO₂. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -L-R'. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -R'. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -L-OR'. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -OR'. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -L-SR'. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -SR'. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -L-N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -OR', где R' представляет собой необязательно замещенную C_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -OR', где R' представляет собой необязательно замещенный С_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -ОМе. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -МОЕ. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой водород. В некоторых вариантах осуществления R^s в одном 3'-положении представляет собой водород, и R^s в другом 3'-положении не представляет собой водород, как описано в данном документе. В некоторых вариантах осуществления R^s в обоих 3'-положениях представляют собой водород. В некоторых вариантах осуществления R^s в одном 3'-положении представляет собой водород, а в другом 3'-положении присоединен к межнуклеотидной связи. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -F. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -Cl. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой Br. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -I. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -CN. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -N₃. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -NO. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -NO₂. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -L-R'. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой R'. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -L-OR'. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой OR'. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -L-SR'. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -SR'. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой L-L-N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -OR', где R' представляет собой необязательно замещенную С_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -OR', где R' представляет собой необязательно замещенный С_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -ОН. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -ОМе. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой -МОЕ. В некоторых вариантах осуществления R^3s представляет собой водород.

[00761] В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой R^s, где R^s является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R^4s находится в 4'-положении (ВА находится в 1'-положении). В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -Н. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -F. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -Cl. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -Br. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -I. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -CN. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -N₃. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -NO. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -NO₂. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -L-R'. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой R'. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -L-OR'. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -OR'. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -L-SR'. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -SR'. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -L-N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой OR', где R' представляет собой необязательно замещенную С_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -OR', где R' представляет собой необязательно замещенный C_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -ОМе. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -МОЕ. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой водород. В некоторых вариантах осуществления R^s в одном 4'-положении представляет собой водород, и R^s в другом 4'-положении не представляет собой водород, как описано в данном документе. В некоторых вариантах осуществления R^s в обоих 4'-положениях представляют собой водород. В некоторых вариантах осуществления R^s в одном 4'-положении представляет собой водород, а в другом 4'-положении присоединен к межнуклеотидной связи. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -F. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -Cl. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -Br. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -I. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -CN. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -N₃. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -NO. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -NO₂. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -L-R'. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -R'. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -L-OR'. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -OR'. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -L-SR'. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -SR'. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой L-L-N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -OR', где R' представляет собой необязательно замещенную С_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -OR', где R' представляет собой необязательно замещенный С_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -ОН. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -ОМе. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой -МОЕ. В некоторых вариантах осуществления R^4s представляет собой водород.

[00762] В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой R^s, где R^s является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой R', где R' является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -Н. В некоторых вариантах осуществления два или более R^5s присоединены к одному и тому же атому углерода, и по меньшей мере один из них не представляет собой -Н. В некоторых вариантах осуществления R^5s не представляет собой -Н. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -F. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -Cl. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -Br. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -I. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -CN. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -N₃. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -NO. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -NO₂. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -L-R'. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -R'. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -L-OR'. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -OR'. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -L-SR'. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -SR'. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой L-L-N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -N(R')₂. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой OR', где R' представляет собой необязательно замещенную С_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -OR', где R' представляет собой необязательно замещенный С_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -ОН. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -ОМе. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -МОЕ. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой водород.

[00763] В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой необязательно замещенную C_1-6алифатическую группу, как описано в настоящем изобретении, например, варианты осуществления C_1-6алифатической группы, описанные для R или других переменных. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой необязательно замещенный C_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой метил. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой этил.

[00764] В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой защищенную гидроксильную группу, подходящую для олигонуклеотидного синтеза. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой -OR', где R' представляет собой необязательно замещенную C_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой DMTrO-. Примеры защитных групп широко известны для применения в соответствии с настоящим изобретением. В отношении дополнительных примеров см. Greene, Т. W.; Wuts, P. G. М. Protective Groups in Organic Synthesis, 2nd ed.; Wiley: New York, 1991, а также WO 2011/005761, WO 2013/012758, WO 2014/012081, WO 2015/107425, WO 2010/064146, WO 2014/010250, WO 2011/108682, WO 2012/039448 и WO 2012/073857.

[00765] В некоторых вариантах осуществления два или более из R^1s, R^2s, R^3s, R^4s и R^5s представляют собой R, и они могут быть взяты вместе с промежуточным(-ыми) атом(-ами) с образованием кольца, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R^2s и R^4s представляют собой R, взятые вместе с образованием кольца, и сахарный фрагмент может представлять собой бициклический сахарный фрагмент, например сахарный фрагмент из LNA.

[00766] В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой -C(R^5s)₂-, где каждый R^5s независимо является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления один из R^5s представляет собой Н, а другой не представляет собой Н. В некоторых вариантах осуществления ни один из R^5s не представляет собой Н. В некоторых вариантах осуществления L^s представляет собой -CHR^5s-, где каждый R^5s независимо является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления -C(R^5s)₂- представляет собой необязательно замещенный 5'-С сахарного фрагмента. В некоторых вариантах осуществления атом С в -C(R^5s)₂- представлен в R-конфигурации. В некоторых вариантах осуществления атом С в -C(R^5s)₂- представлен в S-конфигурации. Как описано в настоящем изобретении, в некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой необязательно замещенную C_1-6алифатическую группу; в некоторых вариантах осуществления R^5s представляет собой метил.

[00767] В некоторых вариантах осуществления представленные соединения содержат одно или несколько двухвалентных или многовалентных необязательно замещенных колец, например, кольцо A^s, кольцо A^L, Cy^L, -Су-, образованные двумя или более группами R (R и переменными (комбинациями переменных), которые могут представлять собой R), взятыми вместе и т.д. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой циклоалифатическую, арильную, гетероарильную или гетероциклильную группу, как описано для R, но являющуюся двухвалентной или многовалентной. Специалистам в данной области техники понятно, что кольцевые фрагменты, описанные для одной переменной, например кольца А, также могут быть применимы к другим переменным, например Cy^L, если удовлетворяются требования по другим переменным, например, по числу гетероатомов, валентности и т.д. Примеры колец подробно описаны в настоящем изобретении.

[00768] В некоторых вариантах осуществления кольцо, которое является необязательно замещенным, представляет собой 3-20-членное моноциклическое, бициклическое или полициклическое кольцо, содержащее 0-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния.

[00769] В некоторых вариантах осуществления кольцо может иметь любой размер в пределах своего диапазона, например, являться 3-, 4-, 5-, 6-, 7-, 8-, 9-, 10-, 11-, 12-, 13-, 14-, 15-, 16-, 17-, 18-, 19- или 20-членным.

[00770] В некоторых вариантах осуществления кольцо является моноциклическим. В некоторых вариантах осуществления кольцо является насыщенным и моноциклическим. В некоторых вариантах осуществления кольцо является моноциклическим и частично насыщенным. В некоторых вариантах осуществления кольцо является моноциклическим и ароматическим.

[00771] В некоторых вариантах осуществления кольцо является бициклическим. В некоторых вариантах осуществления кольцо является полициклическим. В некоторых вариантах осуществления бициклическое или полициклическое кольцо содержит два или более моноциклических кольцевых фрагмента, каждый из которых может быть насыщенным, частично насыщенным или ароматическим, при этом каждый из них может не содержать гетероатомы или содержать 1-10 гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления бициклическое или полициклическое кольцо содержит насыщенное моноциклическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления бициклическое или полициклическое кольцо содержит насыщенное моноциклическое кольцо, не содержащее гетероатомы. В некоторых вариантах осуществления бициклическое или полициклическое кольцо содержит насыщенное моноциклическое кольцо, содержащее один или несколько гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления бициклическое или полициклическое кольцо содержит частично насыщенное моноциклическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления бициклическое или полициклическое кольцо содержит частично насыщенное моноциклическое кольцо, не содержащее гетероатомы. В некоторых вариантах осуществления бициклическое или полициклическое кольцо содержит частично насыщенное моноциклическое кольцо, содержащее один или несколько гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления бициклическое или полициклическое кольцо содержит ароматическое моноциклическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления бициклическое или полициклическое кольцо содержит ароматическое моноциклическое кольцо, не содержащее гетероатомы. В некоторых вариантах осуществления бициклическое или полициклическое кольцо содержит ароматическое моноциклическое кольцо, содержащее один или несколько гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления бициклическое или полициклическое кольцо содержит насыщенное кольцо и частично насыщенное кольцо, каждое из которых независимо содержит один или несколько гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления бициклическое кольцо содержит насыщенное кольцо и частично насыщенное кольцо, каждое из которых независимо не содержит гетероатомы или содержит один или несколько гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления бициклическое кольцо содержит ароматическое кольцо и частично насыщенное кольцо, каждое из которых независимо не содержит гетероатомы или содержит один или несколько гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления полициклическое кольцо содержит насыщенное кольцо и частично насыщенное кольцо, каждое из которых независимо не содержит гетероатомы или содержит один или несколько гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления полициклическое кольцо содержит ароматическое кольцо и частично насыщенное кольцо, каждое из которых независимо не содержит гетероатомы или содержит один или несколько гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления полициклическое кольцо содержит ароматическое кольцо и насыщенное кольцо, каждое из которых независимо не содержит гетероатомы или содержит один или несколько гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления полициклическое кольцо содержит ароматическое кольцо, насыщенное кольцо и частично насыщенное кольцо, каждое из которых независимо не содержит гетероатомы или содержит один или несколько гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления кольцо содержит по меньшей мере один гетероатом. В некоторых вариантах осуществления кольцо содержит по меньшей мере один атом азота. В некоторых вариантах осуществления кольцо содержит по меньшей мере один атом кислорода. В некоторых вариантах осуществления кольцо содержит по меньшей мере один атом серы.

[00772] Специалистам в данной области техники будет понятно, что в соответствии с настоящим изобретением кольцо, как правило, является необязательно замещенным. В некоторых вариантах осуществления кольцо является незамещенным. В некоторых вариантах осуществления кольцо является замещенным. В некоторых вариантах осуществления кольцо замещено по одному или нескольким своим атомам углерода. В некоторых вариантах осуществления кольцо замещено по одному или нескольким своим гетероатомам. В некоторых вариантах осуществления кольцо замещено по одному или нескольким своим атомам углерода и одному или нескольким своим гетероатомам. В некоторых вариантах осуществления два или более заместителя могут располагаться при одном и том же атоме кольца. В некоторых вариантах осуществления все доступные атомы кольца являются замещенными. В некоторых вариантах осуществления не все доступные атомы кольца являются замещенными. В некоторых вариантах осуществления в представленных структурах, где указано, что кольца присоединены к другим структурам (например, кольцо А в ), "необязательно замещенный" означает, что помимо тех структур, которые уже присоединены, остальные замещаемые положения в кольце, если таковые имеются, являются необязательно замещенными.

[00773] В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное С_3-30циклоалифатическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное С_3-20циклоалифатическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное С_3-10циклоалифатическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 3-30-членное насыщенное или частично ненасыщенное карбоциклическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 3-7-членное насыщенное или частично ненасыщенное карбоциклическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 3-членное насыщенное или частично ненасыщенное карбоциклическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 4-членное насыщенное или частично ненасыщенное карбоциклическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 5-членное насыщенное или частично ненасыщенное карбоциклическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 6-членное насыщенное или частично ненасыщенное карбоциклическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 7-членное насыщенное или частично ненасыщенное карбоциклическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное циклогексильное кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное циклопентильное кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное циклобутильное кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное циклопропильное кольцо.

[00774] В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное С_6-30арильное кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное фенильное кольцо.

[00775] В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 8-10-членное бициклическое насыщенное, частично ненасыщенное или арильное кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 8-10-членное бициклическое насыщенное кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 8-10-членное бициклическое частично ненасыщенное кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 8-10-членное бициклическое арильное кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное нафтильное кольцо.

[00776] В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 5-30-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 5-30-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота и серы. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 5-30-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 5-30-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота и серы.

[00777] В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 5-6-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 5-6-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, серы и кислорода.

[00778] В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 5-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода или серы. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 6-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы.

[00779] В определенных вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 8-10-членное бициклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное, 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы. В определенных вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы.

[00780] В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 3-30-членное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 3-7-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В определенных вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 5-7-членное частично ненасыщенное моноциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В определенных вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 5-6-членное частично ненасыщенное моноциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В определенных вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 5-членное частично ненасыщенное моноциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В определенных вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 6-членное частично ненасыщенное моноциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В определенных вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 7-членное частично ненасыщенное моноциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 3-членное гетероциклическое кольцо, содержащее один гетероатом, выбранный из азота, кислорода или серы. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 4-членное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 5-членное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 6-членное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 7-членное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы.

[00781] В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 7-10-членное бициклическое насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 8-10-членное бициклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы.

[00782] В некоторых вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы. В определенных вариантах осуществления кольцо представляет собой двухвалентное или многовалентное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы.

[00783] В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, которое, как правило, является необязательно замещенным, представляет собой моноциклическое насыщенное 5-7-членное кольцо, не содержащее дополнительных гетероатомов в дополнение к промежуточным гетероатомам, если таковые имеются. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, представляет собой моноциклическое насыщенное 5-членное кольцо, не содержащее дополнительных гетероатомов в дополнение к промежуточным гетероатомам, если таковые имеются. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, представляет собой моноциклическое насыщенное 6-членное кольцо, не содержащее дополнительных гетероатомов в дополнение к промежуточным гетероатомам, если таковые имеются. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, представляет собой моноциклическое насыщенное 7-членное кольцо, не содержащее дополнительных гетероатомов в дополнение к промежуточным гетероатомам, если таковые имеются.

[00784] В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, представляет собой бициклическое, насыщенное, частично ненасыщенное или арильное 5-30-членное кольцо, содержащее в дополнение к промежуточным гетероатомам, если таковые имеются, 0-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, представляет собой бициклическое, насыщенное, частично ненасыщенное или арильное 5-30-членное кольцо, содержащее в дополнение к промежуточным гетероатомам, если таковые имеются, 0-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота и серы. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, представляет собой бициклическое и насыщенное 8-10-членное бициклическое кольцо, не содержащее дополнительных гетероатомов в дополнение к промежуточным гетероатомам, если таковые имеются. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, представляет собой бициклическое и насыщенное 8-членное бициклическое кольцо, не содержащее дополнительных гетероатомов в дополнение к промежуточным гетероатомам, если таковые имеются. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, представляет собой бициклическое и насыщенное 9-членное бициклическое кольцо, не содержащее дополнительных гетероатомов в дополнение к промежуточным гетероатомам, если таковые имеются. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, представляет собой бициклическое и насыщенное 10-членное бициклическое кольцо, не содержащее дополнительных гетероатомов в дополнение к промежуточным гетероатомам, если таковые имеются. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, является бициклическим и содержит 5-членное кольцо, конденсированное с 5-членным кольцом. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, является бициклическим и содержит 5-членное кольцо, конденсированное с 6-членным кольцом. В некоторых вариантах осуществления 5-членное кольцо содержит один или несколько промежуточных атомов азота, фосфора и кислорода в качестве атомов кольца. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, содержит кольцевую систему, характеризующуюся структурой остова или

[00785] В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, представляет собой полициклическое, насыщенное, частично ненасыщенное или арильное 3-30-членное кольцо, содержащее в дополнение к промежуточным гетероатомам, если таковые имеются, 0-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, представляет собой полициклическое, насыщенное, частично ненасыщенное или арильное 3-30-членное кольцо, содержащее в дополнение к промежуточным гетероатомам, если таковые имеются, 0-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота и серы.

[00786] В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, является моноциклическим, бициклическим или полициклическим и содержит 5-10-членное моноциклическое кольцо, атомы кольца в котором содержат один или несколько промежуточных атомов азота, фосфора и/или кислорода. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, является моноциклическим, бициклическим или полициклическим и содержит 5-9-членное моноциклическое кольцо, атомы кольца в котором содержат один или несколько промежуточных атомов азота, фосфора и/или кислорода. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, является моноциклическим, бициклическим или полициклическим и содержит 5-8-членное моноциклическое кольцо, атомы кольца в котором содержат один или несколько промежуточных атомов азота, фосфора и/или кислорода. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, является моноциклическим, бициклическим или полициклическим и содержит 5-7-членное моноциклическое кольцо, атомы кольца в котором содержат один или несколько промежуточных атомов азота, фосфора и/или кислорода. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, является моноциклическим, бициклическим или полициклическим и содержит 5-6-членное моноциклическое кольцо, атомы кольца в котором содержат один или несколько промежуточных атомов азота, фосфора и/или кислорода.

[00787] В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, является моноциклическим, бициклическим или полициклическим и содержит 5-членное моноциклическое кольцо, атомы кольца в котором содержат один или несколько промежуточных атомов азота, фосфора и/или кислорода. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, является моноциклическим, бициклическим или полициклическим и содержит 6-членное моноциклическое кольцо, атомы кольца в котором содержат один или несколько промежуточных атомов азота, фосфора и/или кислорода. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, является моноциклическим, бициклическим или полициклическим и содержит 7-членное моноциклическое кольцо, атомы кольца в котором содержат один или несколько промежуточных атомов азота, фосфора и/или кислорода. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, является моноциклическим, бициклическим или полициклическим и содержит 8-членное моноциклическое кольцо, атомы кольца в котором содержат один или несколько промежуточных атомов азота, фосфора и/или кислорода. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, является моноциклическим, бициклическим или полициклическим и содержит 9-членное моноциклическое кольцо, атомы кольца в котором содержат один или несколько промежуточных атомов азота, фосфора и/или кислорода. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, является моноциклическим, бициклическим или полициклическим и содержит 10-членное моноциклическое кольцо, атомы кольца в котором содержат один или несколько промежуточных атомов азота, фосфора и/или кислорода.

[00788] В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, является моноциклическим, бициклическим или полициклическим и содержит 5-членное кольцо, атомы кольца в котором состоят из атомов углерода и промежуточных атомов азота, фосфора и кислорода. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, является моноциклическим, бициклическим или полициклическим и содержит 6-членное кольцо, атомы кольца в котором состоят из атомов углерода и промежуточных атомов азота, фосфора и кислорода. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, является моноциклическим, бициклическим или полициклическим и содержит 7-членное кольцо, атомы кольца в котором состоят из атомов углерода и промежуточных атомов азота, фосфора и кислорода. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, является моноциклическим, бициклическим или полициклическим и содержит 8-членное кольцо, атомы кольца в котором состоят из атомов углерода и промежуточных атомов азота, фосфора и кислорода. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, является моноциклическим, бициклическим или полициклическим и содержит 9-членное кольцо, атомы кольца в котором состоят из атомов углерода и промежуточных атомов азота, фосфора и кислорода. В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами, является моноциклическим, бициклическим или полициклическим и содержит 10-членное кольцо, атомы кольца в котором состоят из атомов углерода и промежуточных атомов азота, фосфора и кислорода.

[00789] В некоторых вариантах осуществления кольца, описанные в данном документе, являются незамещенными. В некоторых вариантах осуществления кольца, описанные в данном документе, являются замещенными. В некоторых вариантах осуществления заместители выбраны из заместителей, описанных в иллюстративных соединениях, представленных в настоящем изобретении.

[00790] Как описано в данном документе, каждый L^p независимо представляет собой межнуклеотидную связь, как описано в настоящем изобретении, например, природную фосфатную связь, фосфотиоатную диэфирную связь, модифицированную межнуклеотидную связь, хиральную межнуклеотидную связь, межнуклеотидную связь, не являющуюся отрицательно заряженной и т.д. В некоторых вариантах осуществления каждый L^p независимо представляет собой связь, характеризующуюся структурой формулы I. В некоторых вариантах осуществления один или несколько L^p независимо характеризуются структурой формулы I, I-a-1, I-a-2, I-b, I-c, I-d, I-е, I-n-1, I-n-2, I-n-3, I-n-4, II, II-a-1, II-a-2, II-b-1, II-b-2, II-c-1, II-c-2, II-d-1, или II-d-2 или ее солевой формой. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один L^p представляет собой межнуклеотидную связь, не являющуюся отрицательно заряженной. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один L^p представляет собой нейтральную межнуклеотидную связь. В некоторых вариантах осуществления один или несколько L^p независимо характеризуются структурой формулы I-n-1, I-n-2, I-n-3, I-n-4, II, II-a-1, II-a-2, II-b-1, II-b-2, II-c-1, II-c-2, II-d-1, или II-d-2, или ее солевой формой.

[00791] В некоторых вариантах осуществления L^3E представляет собой -L^s- или -L^s-L^s-. В некоторых вариантах осуществления L^3E представляет собой -L^s-. В некоторых вариантах осуществления L^3E представляет собой -L^s-L^s- В некоторых вариантах осуществления L^3E представляет собой ковалентную связь. В некоторых вариантах осуществления L^3E представляет собой линкер, используемый в олигонуклеотидном синтезе. В некоторых вариантах осуществления L^3E представляет собой линкер, используемый в твердофазном олигонуклеотидном синтезе. Известны различные типы линкеров, и они могут быть использованы в соответствии с настоящим изобретением. В некоторых вариантах осуществления линкер представляет собой сукцинатный линкер (-O-С(O)-СН₂-СН₂-С(O)-). В некоторых вариантах осуществления линкер представляет собой оксалильный линкер (-О-С(О)-С(О)-). В некоторых вариантах осуществления L^3E представляет собой сукцинил-пиперидиновый линкер (SP). В некоторых вариантах осуществления L^3E представляет собой сукцинильный линкер. В некоторых вариантах осуществления L^3E представляет собой Q-линкер.

[00792] В некоторых вариантах осуществления R^3E представляет собой -R', -L^s-R', -OR' или твердую подложку. В некоторых вариантах осуществления R^3E представляет собой -R'. В некоторых вариантах осуществления R^3E представляет собой -L^s-R'. В некоторых вариантах осуществления R^3E представляет собой -OR'. В некоторых вариантах осуществления R^3E представляет собой подложку, предназначенную для олигонуклеотидного синтеза. В некоторых вариантах осуществления R^3E представляет собой твердую подложку. В некоторых вариантах осуществления твердая подложка представляет собой подложку из CPG. В некоторых вариантах осуществления твердая подложка представляет собой полистирольную подложку. В некоторых вариантах осуществления R^3E представляет собой -Н. В некоторых вариантах осуществления -L³-R^3E представляет собой -Н. В некоторых вариантах осуществления R^3E представляет собой -ОН. В некоторых вариантах осуществления -L³-R^3E представляет собой -ОН. В некоторых вариантах осуществления R^3E представляет собой необязательно замещенную С_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R^3E представляет собой необязательно замещенный С_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления R^3E представляет собой -OR'. В некоторых вариантах осуществления R^3E представляет собой -ОН. В некоторых вариантах осуществления R^3E представляет собой -OR', где R' не представляет собой водород. В некоторых вариантах осуществления R^3E представляет собой -OR', где R' представляет собой необязательно замещенный C_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления R^3E представляет собой 3'-концевую кэпирующую группу (например, используемую в технологиях RNAi).

[00793] В некоторых вариантах осуществления R^3E представляет собой твердую подложку. В некоторых вариантах осуществления R^3E представляет собой твердую подложку, предназначенную для олигонуклеотидного синтеза. Известны различные типы твердых подложек, и они могут быть использованы в соответствии с настоящим изобретением. В некоторых вариантах осуществления твердая подложка представляет собой НСР. В некоторых вариантах осуществления твердая подложка представляет собой CPG.

[00794] В некоторых вариантах осуществления R' представляет собой -R, -C(O)R, -C(O)OR или -S(O)₂R, где R является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R' представляет собой R, где R является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R' представляет собой -C(O)R, где R является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой C(O)OR, где R является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R' представляет собой -S(O)₂R, где R является таким, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R' представляет собой водород. В некоторых вариантах осуществления R' не представляет собой водород. В некоторых вариантах осуществления R' представляет собой R, где R представляет собой необязательно замещенную C_1-20алифатическую группу, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R' представляет собой R, где R представляет собой необязательно замещенную С_1-20гетероалифатическую группу, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R' представляет собой R, где R представляет собой необязательно замещенный С_6-20арил, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R' представляет собой R, где R представляет собой необязательно замещенную С_6-20арилалифатическую группу, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой R, где R представляет собой необязательно замещенную С_6-20арилгетероалифатическую группу, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R' представляет собой R, где R представляет собой необязательно замещенный 5-20-членный гетероарил, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R' представляет собой R, где R представляет собой необязательно замещенный 3-20-членный гетероциклил, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления два или более R' представляют собой R, и они необязательно и независимо взяты вместе с образованием необязательно замещенного кольца, как описано в настоящем изобретении.

[00795] В некоторых вариантах осуществления каждый R независимо представляет собой -H или необязательно замещенную группу, выбранную из C_1-30алифатической группы, С_1-30гетероалифатической группы, содержащей 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, С_6-30арила, С_6-30арилалифатической группы, С_6-30арилгетероалифатической группы, содержащей 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, 5-30-членного гетероарила, содержащего 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, и 3-30-членного гетероциклила, содержащего 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, или

две группы R необязательно и независимо взяты вместе с образованием ковалентной связи, или

две или более группы R при одном и том же атоме необязательно и независимо взяты вместе с данным атомом с образованием необязательно замещенного 3-30-членного моноциклического, бициклического или полициклического кольца, содержащего в дополнение к данному атому 0-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, или

две или более группы R при двух или более атомах необязательно и независимо взяты вместе со своими промежуточными атомами с образованием необязательно замещенного 3-30-членного моноциклического, бициклического или полициклического кольца, содержащего в дополнение к промежуточным атомам 0-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния.

[00796] В некоторых вариантах осуществления каждый R независимо представляет собой -H или необязательно замещенную группу, выбранную из C_1-30алифатической группы, С_1-30гетероалифатической группы, содержащей 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, С_6-30арила, С_6-30арилалифатической группы, С_6-30арилгетероалифатической группы, содержащей 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, 5-30-членного гетероарила, содержащего 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, и 3-30-членного гетероциклила, содержащего 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, или

две группы R необязательно и независимо взяты вместе с образованием ковалентной связи, или

две или более группы R при одном и том же атоме необязательно и независимо взяты вместе с данным атомом с образованием необязательно замещенного 3-30-членного моноциклического, бициклического или полициклического кольца, содержащего в дополнение к данному атому 0-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния,

две или более группы R при двух или более атомах необязательно и независимо взяты вместе со своими промежуточными атомами с образованием необязательно замещенного 3-30-членного моноциклического, бициклического или полициклического кольца, содержащего в дополнение к промежуточным атомам 0-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния.

[00797] В некоторых вариантах осуществления каждый R независимо представляет собой -Н или необязательно замещенную группу, выбранную из С_1-20алифатической группы, C_1-20гетероалифатической группы, содержащей 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, С_6-20арила, С_6-20арилалифатической группы, С_6-20арилгетероалифатической группы, содержащей 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, 5-20-членного гетероарила, содержащего 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, и 3-20-членного гетероциклила, содержащего 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, или

две группы R необязательно и независимо взяты вместе с образованием ковалентной связи, или

две или более группы R при одном и том же атоме необязательно и независимо взяты вместе с данным атомом с образованием необязательно замещенного 3-20-членного моноциклического, бициклического или полициклического кольца, содержащего в дополнение к данному атому 0-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния,

две или более группы R при двух или более атомах необязательно и независимо взяты вместе со своими промежуточными атомами с образованием необязательно замещенного 3-20-членного моноциклического, бициклического или полициклического кольца, содержащего в дополнение к промежуточным атомам 0-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния.

[00798] В некоторых вариантах осуществления каждый R независимо представляет собой -Н или необязательно замещенную группу, выбранную из C_1-30алифатической группы, C_1-30гетероалифатической группы, содержащей 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, С_6-30арила, C_6-30арилалифатической группы, С_6-30арилгетероалифатической группы, содержащей 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, 5-30-членного гетероарила, содержащего 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, и 3-30-членного гетероциклила, содержащего 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния.

[00799] В некоторых вариантах осуществления каждый R независимо представляет собой -Н или необязательно замещенную группу, выбранную из С_1-20алифатической группы, C_1-20гетероалифатической группы, содержащей 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, С_6-20арила, С_6-20арилалифатической группы, С_6-20арилгетероалифатической группы, содержащей 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, 5-20-членного гетероарила, содержащего 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, и 3-20-членного гетеропиклила, содержащего 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния.

[00800] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой водород. В некоторых вариантах осуществления R не представляет собой водород. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную группу, выбранную из C_1-30алифатической группы, C_1-30гетероалифатической группы, содержащей 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, C_6-30арила, 5-30-членного гетероарильного кольца, содержащего 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, и 3-30-членного гетероциклического кольца, содержащего 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния.

[00801] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой водород или необязательно замещенную группу, выбранную из С_1-20алифатической группы, фенила, 3-7-членного насыщенного или частично ненасыщенного карбоциклического кольца, 8-10-членного бициклического насыщенного, частично ненасыщенного или арильного кольца, 5-6-членного моноциклического гетероарильного кольца, содержащего 1-4 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы, 4-7-членного насыщенного или частично ненасыщенного гетероциклического кольца, содержащего 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы, 7-10-членного бициклического насыщенного или частично ненасыщенного гетероциклического кольца, содержащего 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы, или 8-10-членного бициклического гетероарильного кольца, содержащего 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы.

[00802] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную C_1-30алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_1-20алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_1-15алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную C_1-10алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную C_1-6алифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный С_1-6алкил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный гексил, пентил, бутил, пропил, этил или метил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный гексил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный пентил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный бутил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный пропил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный этил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный метил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой гексил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой пентил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой бутил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой пропил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой этил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой метил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой изопропил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой н-пропил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой трет-бутил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой втор-бутил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой н-бутил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой -(CH₂)₂CN.

[00803] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_3-30циклоалифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_3-20циклоалифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_3-10циклоалифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный циклогексил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой циклогексил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный циклопентил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой циклопентил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный циклобутил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой циклобутил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный циклопропил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой циклопропил.

[00804] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 3-30-членное насыщенное или частично ненасыщенное карбоциклическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 3-7-членное насыщенное или частично ненасыщенное карбоциклическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 3-членное насыщенное или частично ненасыщенное карбоциклическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 4-членное насыщенное или частично ненасыщенное карбоциклическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное насыщенное или частично ненасыщенное карбоциклическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное насыщенное или частично ненасыщенное карбоциклическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 7-членное насыщенное или частично ненасыщенное карбоциклическое кольцо. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный циклогептил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой циклогептил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный циклогексил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой циклогексил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный циклопентил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой циклопентил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный циклобутил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой циклобутил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный циклопропил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой циклопропил.

[00805] В некоторых вариантах осуществления, если R представляет собой или содержит кольцевую структуру, например, циклоалифатическую, циклогетероалифатическую, арильную, гетероарильную и т.д., то кольцевая структура может быть моноциклической, бициклической или полициклической. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой или содержит моноциклическую структуру. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой или содержит бициклическую структуру. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой или содержит полициклическую структуру.

[00806] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_1-30гетероалифатическую группу, содержащую 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_1-20гетероалифатическую группу, содержащую 1-10 гетероатомов. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_1-20гетероалифатическую группу, содержащую 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора или кремния, необязательно включающих одну или несколько окисленных форм азота, серы, фосфора или селена. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_1-30гетероалифатическую группу, содержащую 1-10 групп, независимо выбранных из , -N=, ≡N, -S-, -S(O)-, -S(O)₂-, -O-, =O, , и .

[00807] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный С_6-30арил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный фенил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой фенил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой замещенный фенил.

[00808] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 8-10-членное бициклическое насыщенное, частично ненасыщенное или арильное кольцо. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 8-10-членное бициклическое насыщенное кольцо. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 8-10-членное бициклическое частично ненасыщенное кольцо. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 8-10-членное бициклическое арильное кольцо. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный нафтил.

[00809] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-30-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-30-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-30-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-30-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота и серы.

[00810] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-6-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой замещенное 5-6-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой незамещенное 5-6-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-6-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, серы и кислорода. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой замещенное 5-6-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой незамещенное 5-6-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, серы и кислорода.

[00811] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода или серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы.

[00812] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное моноциклическое гетероарильное кольцо, содержащее один гетероатом, независимо выбранный из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R выбран из необязательно замещенного пирролила, фуранила или тиенила.

[00813] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное гетероарильное кольцо, содержащее два гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное гетероарильное кольцо, содержащее один атом азота и дополнительный гетероатом, выбранный из серы или кислорода. Иллюстративные группы R включают без ограничения необязательно замещенные пиразолил, имидазолил, тиазолил, изотиазолил, оксазолил или изоксазолил.

[00814] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное гетероарильное кольцо, содержащее три гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. Иллюстративные группы R включают без ограничения необязательно замещенные триазолил, оксадиазолил или тиадиазолил.

[00815] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное гетероарильное кольцо, содержащее четыре гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. Иллюстративные группы R включают без ограничения необязательно замещенные тетразолил, оксатриазолил и тиатриазолил.

[00816] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 атома азота. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1-3 атома азота. В других вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное гетероарильное кольцо, содержащее 1-2 атома азота. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное гетероарильное кольцо, содержащее четыре атома азота. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное гетероарильное кольцо, содержащее три атома азота. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное гетероарильное кольцо, содержащее два атома азота. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное гетероарильное кольцо, содержащее один атом азота. Иллюстративные группы R включают без ограничения необязательно замещенные пиридинил, пиримидинил, пиразинил, пиридазинил, триазинил или тетразинил.

[00817] В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 8-10-членное бициклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В других вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1 гетероатом, независимо выбранный из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный индолил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный азабицикло[3.2.1]октанил. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный азаиндолил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный бензимидазолил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный бензотиазолил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный бензоксазолил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный индазолил. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы.

[00818] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее два гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее три гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее четыре гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее пять гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы.

[00819] В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее один гетероатом, независимо выбранный из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный индолил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный бензофуранил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный бензо[b]тиенил. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее два гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный азаиндолил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный бензимидазолил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный бензотиазолил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный бензоксазолил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный индазолил. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее три гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный оксазолопиридинил, тиазолопиридинил или имидазопиридинил. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее четыре гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный пуринил, оксазолопиримидинил, тиазолопиримидинил, оксазолопиразинил, тиазолопиразинил, имидазопиразинил, оксазолопиридазинил, тиазолопиридазинил или имидазопиридазинил. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее пять гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы.

[00820] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный 1,4-дигидропирроло[3,2-b]пирролил, 4Н-фуро[3,2-b]пирролил, 4Н-тиено[3,2-b]пирролил, фуро[3,2-b]фуранил, тиено[3,2-b]фуранил, тиено[3,2-b]тиенил, 1Н-пирроло[1,2-а]имидазолил, пирроло[2,1-b]оксазолил или пирроло[2,1-b]тиазолил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный дигидропирролоимидазолил, 1Н-фуроимидазолил, 1H-тиеноимидазолил, фурооксазолил, фуроизоксазолил, 4Н-пирролооксазолил, 4Н-пирролоизоксазолил, тиенооксазолил, тиеноизоксазолил, 4Н-пирролотиазолил, фуротиазолил, тиенотиазолил, 1Н-имидазоимидазолил, имидазооксазолил или имидазо[5,1-b]тиазолил.

[00821] В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 14 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В других вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1 гетероатом, независимо выбранный из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный хинолинил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный изохинолинил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный хиназолин или хиноксалин.

[00822] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой 3-30-членное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой 3-30-членное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой 3-30-членное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой 3-30-членное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота и серы.

[00823] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 3-7-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой замещенное 3-7-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой незамещенное 3-7-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-7-членное частично ненасыщенное моноциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-6-членное частично ненасыщенное моноциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное частично ненасыщенное моноциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное частично ненасыщенное моноциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 7-членное частично ненасыщенное моноциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 3-членное гетероциклическое кольцо, содержащее один гетероатом, выбранный из азота, кислорода или серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 4-членное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 7-членное гетерощгклическое кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы.

[00824] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 3-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 4-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 7-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы.

[00825] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 4-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 4-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 4-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее не более 1 гетероатома. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 4-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее не более 1 гетероатома, где гетероатом представляет собой азот. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 4-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее не более 1 гетероатома, где гетероатом представляет собой кислород. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 4-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее не более 1 гетероатома, где гетероатом представляет собой серу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 4-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 2 атома кислорода. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 4-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 2 атома азота. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 4-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 4-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 4-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее не более 1 гетероатома. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 4-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее не более 1 гетероатома, где гетероатом представляет собой азот. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 4-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее не более 1 гетероатома, где гетероатом представляет собой кислород. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 4-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее не более 1 гетероатома, где гетероатом представляет собой серу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 4-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 2 атома кислорода. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 4-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 2 атома азота.

[00826] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее не более 1 гетероатома. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее не более 1 гетероатома, где гетероатом представляет собой азот. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее не более 1 гетероатома, где гетероатом представляет собой кислород. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее не более 1 гетероатома, где гетероатом представляет собой серу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 2 атома кислорода. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 2 атома азота.

[00827] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее не более 1 гетероатома. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее не более 1 гетероатома, где гетероатом представляет собой азот. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее не более 1 гетероатома, где гетероатом представляет собой кислород. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее не более 1 гетероатома, где гетероатом представляет собой серу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 2 атома кислорода. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6-членное частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 2 атома азота.

[00828] В определенных вариантах осуществления R представляет собой 3-7-членное насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный оксиранил, оксетанил, тетрагидрофуранил, тетрагидропиранил, оксепанил, азиридинил, азетидинил, пирролидинил, пиперидинил, азепанил, тииранил, тиетанил, тетрагидротиофенил, тетрагидротиопиранил, тиепанил, диоксоланил, оксатиоланил, оксазолидинил, имидазолидинил, тиазолидинил, дитиоланил, диоксанил, морфолинил, оксатианил, пиперазинил, тиоморфолинил, дитианил, диоксепанил, оксазепанил, оксатиепанил, дитиепанил, диазепанил, дигидрофуранонил, тетрагидропиранонил, оксепанонил, пирролидинонил, пиперидинонил, азепанонил, дигидротиофенонил, тетрагидротиопиранонил, тиепанонил, оксазолидинонил, оксазинанонил, оксазепанонил, диоксоланонил, диоксанонил, диоксепанонил, оксатиолинонил, оксатианонил, оксатиепанонил, тиазолидинонил, тиазинанонил, тиазепанонил, имидазолидинонил, тетрагидропиримидинонил, диазепанонил, имидазолидиндионил, оксазолидиндионил, тиазолидиндионил, диоксоландионил, оксатиоландионил, пиперазиндионил, морфолиндионил, тиоморфолиндионил, тетрагидропиранил, тетрагидрофуранил, морфолинил, тиоморфолинил, пиперидинил, пиперазинил, пирролидинил, тетрагидротиофенил или тетрагидротиопиранил.

[00829] В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5-6-членное частично ненасыщенное моноциклическое кольцо, содержащее 1-2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную тетрагидропиридинильную, дигидротиазолильную, дигидрооксазолильную или оксазолинильную группу.

[00830] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 7-10-членное бициклическое насыщенное или частично ненасыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный индолинил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный изоиндолинил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный 1,2,3,4-тетрагидрохинолинил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный 1,2,3,4-тетрагидроизохинолинил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный азабицикло[3.2.1]октанил.

[00831] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 8-10-членное бициклическое гетероарильное кольцо, содержащее 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы.

[00832] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-4 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-3 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее два гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный 1,4-дигидропирроло[3,2-b]пирролил, 4Н-фуро[3,2-b]пирролил, 4Н-тиено[3,2-b]пирролил, фуро[3,2-b]фуранил, тиено[3,2-b]фуранил, тиено[3,2-b]тиенил, 1H-пирроло[1,2-а]имидазолил, пирроло[2,1-b]оксазолил или пирроло[2,1-b]тиазолил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее три гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный дигидропирролоимидазолил, 1H-фуроимидазолил, 1Н-тиеноимидазолил, фурооксазолил, фуроизоксазолил, 4Н-пирролооксазолил, 4Н-пирролоизоксазолил, тиенооксазолил, тиеноизоксазолил, 4Н-пирролотиазолил, фуротиазолил, тиенотиазолил, 1H-имидазоимидазолил, имидазооксазолил или имидазо[5,1-b]тиазолил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее четыре гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее пять гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы.

[00833] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы. В других вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее один гетероатом, независимо выбранный из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный индолил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный бензофуранил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный бензо[b]тиенил. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее два гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный азаиндолил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный бензимидазолил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный бензотиазолил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный бензоксазолил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный индазолил. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее три гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный оксазолопиридинил, тиазолопиридинил или имидазопиридинил. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее четыре гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный пуринил, оксазолопиримидинил, тиазолопиримидинил, оксазолопиразинил, тиазолопиразинил, имидазопиразинил, оксазолопиридазинил, тиазолопиридазинил или имидазопиридазинил. В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 5,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее пять гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы.

[00834] В определенных вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее 1-2 гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В других вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее один гетероатом, выбранный из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный хинолинил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный изохинолинил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее два гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный хиназолинил, фталазинил, хиноксалинил или нафтиридинил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее три гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный пиридопиримидинил, пиридопиридазинил, пиридопиразинил или бензотриазинил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее четыре гетероатома, независимо выбранные из азота, кислорода и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенный пиридотриазинил, птеридинил, пиразинопиразинил, пиразинопиридазинил, пиридазинопиридазинил, пиримидопиридазинил или пиримидопиримидинил. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенное 6,6-конденсированное гетероарильное кольцо, содержащее пять гетероатомов, независимо выбранных из азота, кислорода и серы.

[00835] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_6-30арилалифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_6-20арилалифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_6-10арилалифатическую группу. В некоторых вариантах осуществления арильный фрагмент арилалифатической группы содержит 6, 10 или 14 атомов углерода в составе арила. В некоторых вариантах осуществления арильный фрагмент арилалифатической группы содержит 6 атомов углерода в составе арила. В некоторых вариантах осуществления арильный фрагмент арилалифатической группы содержит 10 атомов углерода в составе арила. В некоторых вариантах осуществления арильный фрагмент арилалифатической группы содержит 14 атомов углерода в составе арила. В некоторых вариантах осуществления арильный фрагмент представляет собой необязательно замещенный фенил.

[00836] В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_6-30арилгетероалифатическую группу, содержащую 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_6-30арилгетероалифатическую группу, содержащую 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_6-20арилгетероалифатическую группу, содержащую 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_6-20арилгетероалифатическую группу, содержащую 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота и серы. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_6-10арилгетероалифатическую группу, содержащую 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления R представляет собой необязательно замещенную С_6-10арилгетероалифатическую группу, содержащую 1-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота и серы.

[00837] В некоторых вариантах осуществления две группы R необязательно и независимо взяты вместе с образованием ковалентной связи. В некоторых вариантах осуществления образуется -С≡O. В некоторых вариантах осуществления образуется -С≡С-. В некоторых вариантах осуществления образуется -C≡C-.

[00838] В некоторых вариантах осуществления две или более группы R при одном и том же атоме необязательно и независимо взяты вместе с данным атомом с образованием необязательно замещенного 3-30-членного моноциклического, бициклического или полициклического кольца, содержащего в дополнение к данному атому 0-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления две или более группы R при одном и том же атоме необязательно и независимо взяты вместе с данным атомом с образованием необязательно замещенного 3-20-членного моноциклического, бициклического или полициклического кольца, содержащего в дополнение к данному атому 0-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления две или более группы R при одном и том же атоме необязательно и независимо взяты вместе с данным атомом с образованием необязательно замещенного 3-10-членного моноциклического, бициклического или полициклического кольца, содержащего в дополнение к данному атому 0-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления две или более группы R при одном и том же атоме необязательно и независимо взяты вместе с данным атомом с образованием необязательно замещенного 3-6-членного моноциклического, бициклического или полициклического кольца, содержащего в дополнение к данному атому 0-3 гетероатома, независимо выбранные из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления две или более группы R при одном и том же атоме необязательно и независимо взяты вместе с данным атомом с образованием необязательно замещенного 3-5-членного моноциклического, бициклического или полициклического кольца, содержащего в дополнение к данному атому 0-3 гетероатома, независимо выбранные из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния.

[00839] В некоторых вариантах осуществления две или более группы R при двух или более атомах необязательно и независимо взяты вместе со своими промежуточными атомами с образованием необязательно замещенного 3-30-членного моноциклического, бициклического или полициклического кольца, содержащего в дополнение к промежуточным атомам 0-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления две или более группы R при двух или более атомах необязательно и независимо взяты вместе со своими промежуточными атомами с образованием необязательно замещенного 3-20-членного моноциклического, бициклического или полициклического кольца, содержащего в дополнение к промежуточным атомам 0-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления две или более группы R при двух или более атомах необязательно и независимо взяты вместе со своими промежуточными атомами с образованием необязательно замещенного 3-10-членного моноциклического, бициклического или полициклического кольца, содержащего в дополнение к промежуточным атомам 0-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления две или более группы R при двух или более атомах необязательно и независимо взяты вместе со своими промежуточными атомами с образованием необязательно замещенного 3-10-членного моноциклического, бициклического или полициклического кольца, содержащего в дополнение к промежуточным атомам 0-5 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления две или более группы R при двух или более атомах необязательно и независимо взяты вместе со своими промежуточными атомами с образованием необязательно замещенного 3-6-членного моноциклического, бициклического или полициклического кольца, содержащего в дополнение к промежуточным атомам 0-3 гетероатома, независимо выбранные из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния. В некоторых вариантах осуществления две или более группы R при двух или более атомах необязательно и независимо взяты вместе со своими промежуточными атомами с образованием необязательно замещенного 3-5-членного моноциклического, бициклического или полициклического кольца, содержащего в дополнение к промежуточным атомам 0-3 гетероатома, независимо выбранные из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния.

[00840] В некоторых вариантах осуществления гетероатомы в группах R или в структурах, образованных двумя или более взятыми вместе группами R, выбраны из кислорода, азота и серы. В некоторых вариантах осуществления образованное кольцо является 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, или 20-членным. В некоторых вариантах осуществления образованное кольцо является насыщенным. В некоторых вариантах осуществления образованное кольцо является частично насыщенным. В некоторых вариантах осуществления образованное кольцо является ароматическим. В некоторых вариантах осуществления образованное кольцо содержит насыщенный, частично насыщенный или ароматический кольцевой фрагмент. В некоторых вариантах осуществления образованное кольцо содержит 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, или 20 атомов ароматического кольца. В некоторых вариантах осуществления образованное кольцо содержит не более 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, или 20 атомов ароматического кольца. В некоторых вариантах осуществления атомы ароматического кольца выбраны из углерода, азота, кислорода и серы.

[00841] В некоторых вариантах осуществления кольцо, образованное двумя или более взятыми вместе группами R (или двумя или более группами, выбранными из R и переменных, которые могут представлять собой R), представляет собой С_3-30циклоалифатическую группу, С_6-30арил, 5-30-членный гетероарил, содержащий 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, или 3-30-членный гетероциклил, содержащий 1-10 гетероатомов, независимо выбранных из кислорода, азота, серы, фосфора и кремния, при этом кольцо является таким, как описано для R, но двухвалентным или многовалентным.

[00842] В некоторых вариантах осуществления P^L представляет собой P(=W). В некоторых вариантах осуществления P^L представляет собой Р. В некоторых вариантах осуществления P^L представляет собой P→B(R')₃. В некоторых вариантах осуществления Р из P^L является хиральным. В некоторых вариантах осуществления Р из P^L имеет конфигурацию Rp. В некоторых вариантах осуществления Р из P^L имеет конфигурацию Sp. В некоторых вариантах осуществления связь формулы I представляет собой фосфатную связь или ее солевую форму. В некоторых вариантах осуществления связь формулы I представляет собой фосфотиоатную связь или ее солевую форму. В некоторых вариантах осуществления P^L представляет собой P*(=W), где Р* представляет собой хиральный атом фосфора в составе связи. В некоторых вариантах осуществления P^L представляет собой Р*(=0), где Р* представляет собой хиральный атом фосфора в составе связи.

[00843] В некоторых вариантах осуществления W представляет собой О. В некоторых вариантах осуществления W представляет собой S. В некоторых вариантах осуществления W представляет собой Se.

[00844] В некоторых вариантах осуществления X представляет собой О. В некоторых вариантах осуществления X представляет собой -S-. В некоторых вариантах осуществления Y представляет собой -О-. В некоторых вариантах осуществления Z представляет собой -О-. В некоторых вариантах осуществления W представляет собой -О-, Y представляет собой -О-, Z представляет собой -О-, и X представляет собой -О- или S. В некоторых вариантах осуществления W представляет собой -S-, Y представляет собой -О- Z представляет собой -О- и X представляет собой -О-.

[00845] В некоторых вариантах осуществления R¹ представляет собой R, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления R¹ представляет собой -Н. В некоторых вариантах осуществления R¹ не представляет собой -Н.

[00846] В некоторых вариантах осуществления -X-L-R¹ содержит или представляет собой необязательно замещенный фрагмент, являющийся хиральным вспомогательным средством/реагентом {например, H-X-L-R¹ представляет собой необязательно замещенное [например, кэппированное (например, кэппированное по атому азота с использованием C(O)R')] хиральное вспомогательное средство/реагент}, например, используемый в олигонуклеотидном синтезе с контролируемой хиральностью, такое как описанные в US 9982257, US 20170037399, US 20180216108, US 20180216107, US 9598458, WO 2017/062862, WO 2018/067973, WO 2017/160741, WO 2017/192679, WO 2017/210647 или WO 2018/098264, при этом хиральные вспомогательные средства/реагенты из каждого из них независимо включены в данный документ посредством ссылки. В некоторых вариантах осуществления H-X-L-R¹ представляет собой или В некоторых вариантах осуществления H-X-L-R¹ представляет собой или В некоторых вариантах осуществления H-X-L-R¹ представляет собой или В некоторых вариантах осуществления H-X-L-R¹ представляет собой или В некоторых вариантах осуществления H-X-L-R¹ представляет собой или В некоторых вариантах осуществления H-X-L-R¹ представляет собой или В некоторых вариантах осуществления R' представляет собой -C(O)R. В некоторых вариантах осуществления R' представляет собой -С(O)СН₃.

[00847] В некоторых вариантах осуществления представленная композиция на основе олигонуклеотида, например композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, композиция на основе НТТ-олигонуклеотида и т.д., содержит совокупность олигонуклеотидов, каждый из которых представляет собой олигонуклеотид формулы O-I или его соль. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотид формулы O-I содержит химические модификации (например, модификации сахара, модификации оснований, модифицированные межнуклеотидные связи и т.д. и их паттерны), стереохимию (например, хиральные атомы фосфора в составе связи и т.д. и их паттерны), последовательности оснований и т.д., как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, содержащая олигонуклеотиды формулы O-I, представляет собой композицию на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, содержащую олигонуклеотид, выбранный из таблицы 1 и т.д., где олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну межнуклеотидную связь с контролируемой хиральностью.

[00848] В некоторых вариантах осуществления z составляет 1-1000. В некоторых вариантах осуществления z+1 представляет собой длину олигонуклеотида, как описано в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления z составляет не менее 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, или 19. В некоторых вариантах осуществления z составляет не менее 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, или 14. В некоторых вариантах осуществления z составляет не более 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, или 200. В некоторых вариантах осуществления z составляет 5-50, 10-50, 14-50, 14-45, 14-40, 14-35, 14-30, 14-25, 14-100, 14-150, 14-200, 14-250, 14-300, 15-50, 15-45, 15-40, 15-35, 15-30, 15-25, 15-100, 15-150, 15-200, 15-250, 15-300, 16-50, 16-45, 16-40, 16-35, 16-30, 16-25, 16-100, 16-150, 16-200, 16-250, 16-300, 17-50, 17-45, 17-40, 17-35, 17-30, 17-25, 17-100, 17-150, 17-200, 17-250, 17-300, 18-50, 18-45, 18-40, 18-35, 18-30, 18-25, 18-100, 18-150, 18-200, 18-250, 18-300, 19-50, 19-45, 19-40, 19-35, 19-30, 19-25, 19-100, 19-150, 19-200, 19-250, или 19-300. В некоторых вариантах осуществления z составляет 10. В некоторых вариантах осуществления z составляет 11. В некоторых вариантах осуществления z составляет 12. В некоторых вариантах осуществления z составляет 13. В некоторых вариантах осуществления z составляет 14. В некоторых вариантах осуществления z составляет 15. В некоторых вариантах осуществления z составляет 16. В некоторых вариантах осуществления z составляет 17. В некоторых вариантах осуществления z составляет 18. В некоторых вариантах осуществления z составляет 19. В некоторых вариантах осуществления z составляет 20. В некоторых вариантах осуществления z составляет 21. В некоторых вариантах осуществления z составляет 22. В некоторых вариантах осуществления z составляет 23. В некоторых вариантах осуществления z составляет 24. В некоторых вариантах осуществления z составляет 25. В некоторых вариантах осуществления z составляет 26. В некоторых вариантах осуществления z составляет 27. В некоторых вариантах осуществления z составляет 28. В некоторых вариантах осуществления z составляет 29. В некоторых вариантах осуществления z составляет 30. В некоторых вариантах осуществления z составляет 31. В некоторых вариантах осуществления z составляет 32. В некоторых вариантах осуществления z составляет 33. В некоторых вариантах осуществления z составляет 34.

[00849] В некоторых вариантах осуществления кольцо A^L является двухвалентным. В некоторых вариантах осуществления кольцо A^L является многовалентным. В некоторых вариантах осуществления кольцо A^L является двухвалентным и представляет собой -Су-. В некоторых вариантах осуществления кольцо A^L представляет собой необязательно замещенное двухвалентное триазольное кольцо. В некоторых вариантах осуществления кольцо A^L является трехвалентным и представляет собой Cy^L. В некоторых вариантах осуществления кольцо A^L является четырехвалентным и представляет собой Cy^L. В некоторых вариантах осуществления кольцо A^L представляет собой необязательно замещенный

[00850] В некоторых вариантах осуществления -X-L-R¹ представляет собой необязательно замещенный алкинил. В некоторых вариантах осуществления -X-L-R¹ представляет собой -С≡С-. В некоторых вариантах осуществления алкинильная группа, например, -С≡С-, может вступать в реакцию с целым рядом реагентов посредством различных реакций с обеспечением дополнительных модификаций. Например, в некоторых вариантах осуществления алкинильная группа может вступать в реакцию с азидами посредством клик-химии. В некоторых вариантах осуществления азид имеет структуру R¹-N₃.

[00851] В некоторых вариантах осуществления g составляет 0-20. В некоторых вариантах осуществления g составляет 1-20. В некоторых вариантах осуществления g составляет 1-5. В некоторых вариантах осуществления g составляет 1. В некоторых вариантах осуществления g составляет 2. В некоторых вариантах осуществления g составляет 3. В некоторых вариантах осуществления g составляет 4. В некоторых вариантах осуществления g составляет 5. В некоторых вариантах осуществления g составляет 6. В некоторых вариантах осуществления g составляет 7. В некоторых вариантах осуществления g составляет 8. В некоторых вариантах осуществления g составляет 9. В некоторых вариантах осуществления g составляет 10. В некоторых вариантах осуществления g составляет 11. В некоторых вариантах осуществления g составляет 12. В некоторых вариантах осуществления g составляет 13. В некоторых вариантах осуществления g составляет 14. В некоторых вариантах осуществления g составляет 15. В некоторых вариантах осуществления g составляет 16. В некоторых вариантах осуществления g составляет 17. В некоторых вариантах осуществления g составляет 18. В некоторых вариантах осуществления g составляет 19. В некоторых вариантах осуществления g составляет 20.

[00852] В некоторых вариантах осуществления представляет собой В некоторых вариантах осуществления представляет собой В некоторых вариантах осуществления представляет собой

[00853] В некоторых вариантах осуществления t составляет 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, или 25. В некоторых вариантах осуществления t составляет 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, или 10. В некоторых вариантах осуществления t составляет 1-10, 1-15, 1-20, 1-25, 1-30, 2-10, 2-15, 2-20, 2-25, 2-30, 5-10, 5-15, 5-20, 5-25, 5-30, 8-10, 8-15, 8-20, 8-25, 8-30, 10-15, 10-20, 10-25, или 10-30. В некоторых вариантах осуществления t составляет 1-3, 1-4, 1-5, 1-10, 2-3, 2-5, 2-6, или 2-10. В некоторых вариантах осуществления t составляет 1. В некоторых вариантах осуществления t составляет 2. В некоторых вариантах осуществления t составляет 3. В некоторых вариантах осуществления t составляет 4. В некоторых вариантах осуществления t составляет 5. В некоторых вариантах осуществления t составляет 6. В некоторых вариантах осуществления t составляет 7. В некоторых вариантах осуществления t составляет 8. В некоторых вариантах осуществления t составляет 9. В некоторых вариантах осуществления t составляет 10. В некоторых вариантах осуществления t составляет 11. В некоторых вариантах осуществления t составляет 12. В некоторых вариантах осуществления t составляет 13. В некоторых вариантах осуществления t составляет 14. В некоторых вариантах осуществления t составляет 15. В некоторых вариантах осуществления t составляет 16. В некоторых вариантах осуществления t составляет 17. В некоторых вариантах осуществления t составляет 18. В некоторых вариантах осуществления t составляет 19. В некоторых вариантах осуществления t составляет 20.

[00854] В некоторых вариантах осуществления m составляет 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, или 25. В некоторых вариантах осуществления m составляет 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, или 10. В некоторых вариантах осуществления m составляет 1-10, 1-15, 1-20, 1-25, 1-30, 2-10, 2-15, 2-20, 2-25, 2-30, 5-10, 5-15, 5-20, 5-25, 5-30, 8-10, 8-15, 8-20, 8-25, 8-30, 10-15, 10-20, 10-25, или 10-30. В некоторых вариантах осуществления m составляет 1-3, 1-4, 1-5, 1-10, 2-3, 2-5, 2-6, или 2-10. В некоторых вариантах осуществления m составляет 1. В некоторых вариантах осуществления m составляет 2. В некоторых вариантах осуществления m составляет 3. В некоторых вариантах осуществления m составляет 4. В некоторых вариантах осуществления m составляет 5. В некоторых вариантах осуществления m составляет 6. В некоторых вариантах осуществления m составляет 7. В некоторых вариантах осуществления m составляет 8. В некоторых вариантах осуществления m составляет 9. В некоторых вариантах осуществления m составляет 10. В некоторых вариантах осуществления m составляет 11. В некоторых вариантах осуществления m составляет 12. В некоторых вариантах осуществления m составляет 13. В некоторых вариантах осуществления m составляет 14. В некоторых вариантах осуществления m составляет 15. В некоторых вариантах осуществления m составляет 16. В некоторых вариантах осуществления m составляет 17. В некоторых вариантах осуществления m составляет 18. В некоторых вариантах осуществления m составляет 19. В некоторых вариантах осуществления m составляет 20.

[00855] В некоторых вариантах осуществления t=m. В некоторых вариантах осуществления t>m. В некоторых вариантах осуществления t<m. В некоторых вариантах осуществления n составляет 1-10, 1-15, 1-20, 1-25, 1-30, 2-10, 2-15, 2-20, 2-25, 2-30, 5-10, 5-15, 5-20, 5-25, 5-30, 8-10, 8-15, 8-20, 8-25, 8-30, 10-15, 10-20, 10-25, или 10-30. В некоторых вариантах осуществления n составляет 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, или 25. В некоторых вариантах осуществления n составляет 1. В некоторых вариантах осуществления n составляет 2. В некоторых вариантах осуществления n составляет 3. В некоторых вариантах осуществления n составляет 4. В некоторых вариантах осуществления n составляет 5. В некоторых вариантах осуществления n составляет 6. В некоторых вариантах осуществления n составляет 7. В некоторых вариантах осуществления n составляет 8. В некоторых вариантах осуществления n составляет 9. В некоторых вариантах осуществления n составляет 10. В некоторых вариантах осуществления n составляет 11. В некоторых вариантах осуществления n составляет 12. В некоторых вариантах осуществления п составляет 13. В некоторых вариантах осуществления n составляет 14. В некоторых вариантах осуществления n составляет 15. В некоторых вариантах осуществления n составляет 16. В некоторых вариантах осуществления n составляет 17. В некоторых вариантах осуществления n составляет 18. В некоторых вариантах осуществления n составляет 19. В некоторых вариантах осуществления n составляет 20.

[00856] В некоторых вариантах осуществления х составляет 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, или 25. В некоторых вариантах осуществления х составляет 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, или 10. В некоторых вариантах осуществления х составляет 1-10, 1-15, 1-20, 1-25, 1-30, 2-10, 2-15, 2-20, 2-25, 2-30, 5-10, 5-15, 5-20, 5-25, 5-30, 8-10, 8-15, 8-20, 8-25, 8-30, 10-15, 10-20, 10-25, или 10-30. В некоторых вариантах осуществления х составляет 1-3, 1-4, 1-5, 1-10, 2-3, 2-5, 2-6 или 2-10. В некоторых вариантах осуществления х составляет 1. В некоторых вариантах осуществления х составляет 2. В некоторых вариантах осуществления х составляет 3. В некоторых вариантах осуществления х составляет 4. В некоторых вариантах осуществления х составляет 5. В некоторых вариантах осуществления х составляет 6. В некоторых вариантах осуществления х составляет 7. В некоторых вариантах осуществления х составляет 8. В некоторых вариантах осуществления х составляет 9. В некоторых вариантах осуществления х составляет 10. В некоторых вариантах осуществления х составляет 11. В некоторых вариантах осуществления х составляет 12. В некоторых вариантах осуществления х составляет 13. В некоторых вариантах осуществления х составляет 14. В некоторых вариантах осуществления х составляет 15. В некоторых вариантах осуществления х составляет 16. В некоторых вариантах осуществления х составляет 17. В некоторых вариантах осуществления х составляет 18. В некоторых вариантах осуществления х составляет 19. В некоторых вариантах осуществления х составляет 20.

[00857] В некоторых вариантах осуществления у составляет 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, или 25. В некоторых вариантах осуществления у составляет 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, или 10. В некоторых вариантах осуществления у составляет 1-10, 1-15, 1-20, 1-25, 1-30, 2-10, 2-15, 2-20, 2-25, 2-30, 5-10, 5-15, 5-20, 5-25, 5-30, 8-10, 8-15, 8-20, 8-25, 8-30, 10-15, 10-20, 10-25, или 10-30. В некоторых вариантах осуществления у составляет 1-3, 1-4, 1-5, 1-10, 2-3, 2-5, 2-6 или 2-10. В некоторых вариантах осуществления у составляет 1. В некоторых вариантах осуществления у составляет 2. В некоторых вариантах осуществления у составляет 3. В некоторых вариантах осуществления у составляет 4. В некоторых вариантах осуществления у составляет 5. В некоторых вариантах осуществления у составляет 6. В некоторых вариантах осуществления у составляет 7. В некоторых вариантах осуществления у составляет 8. В некоторых вариантах осуществления у составляет 9. В некоторых вариантах осуществления у составляет 10. В некоторых вариантах осуществления у составляет 11. В некоторых вариантах осуществления у составляет 12. В некоторых вариантах осуществления у составляет 13. В некоторых вариантах осуществления у составляет 14. В некоторых вариантах осуществления у составляет 15. В некоторых вариантах осуществления у составляет 16. В некоторых вариантах осуществления у составляет 17. В некоторых вариантах осуществления у составляет 18. В некоторых вариантах осуществления у составляет 19. В некоторых вариантах осуществления у составляет 20.

[00858] В некоторых вариантах осуществления номер, указанный после обозначения олигонуклеотида, означает серию. Например, в некоторых вариантах осуществления WV-#####-01 означает серию 01 олигонуклеотида WV-#####.

ИЛЛЮСТРАТИВНЫЕ ПРИМЕРЫ

[00859] В данном документе представлены определенные примеры представленных технологий (соединений (олигонуклеотидов, реагентов и т.д.), композиций, способов (способов получения, применения, оценки и т.д.) и т.д.).

ПРИМЕР 1. Олигонуклеотидный синтез

[00860] Известны различные технологии получения олигонуклеотидов и композиций на основе олигонуклеотидов (как стереомерно неупорядоченных, так и с контролируемой хиральностью) и их можно использовать в соответствии с настоящим изобретением, включая, например, указанные в US 9982257, US 20170037399, US 20180216108, US 20180216107, US 9598458, WO 2017/062862, WO 2018/067973, WO 2017/160741, WO 2017/192679, WO 2017/210647, WO 2018/098264, WO 2018/223056 или WO 2018/237194, при этом способы и реагенты из каждого из которых включены в данный документ посредством ссылки.

[00861] В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды получают с использованием подходящих хиральных вспомогательных средств, например хиральных вспомогательных средств DPSE. Один пример препарата на основе олигонуклеотидов описан ниже. Различные олигонуклеотиды, например, указанные в таблице 1, и композиции на их основе можно получать аналогичным образом в соответствии с настоящим изобретением. Как понятно специалистам в данной области техники, условия (например, реагенты, растворители, время реакции и т.д.) можно изменять с получением требуемого выхода и/или уровней чистоты на различных стадиях и/или общем синтезе различных олигонуклеотидов.

[00862] В одном примере получения олигонуклеотидов синтез выполняли на синтезаторе ОР100 (GE Healthcare) с использованием колоночного реактора из нержавеющей стали диаметром 3,5 см в масштабе 873 мкмоль, с использованием подложки CPG (загрузка 75 мкмоль/г). Специалистам в данной области техники будет понятно, что также могут быть пригодными другой синтезатор, колонка и подложка. Как правило, использовали пятистадийные циклы (детритилирование, сочетание, кэппирование 1, окисление/тиолирование и кэппирование 2).

[00863] Детритилирование, как правило, проводили в кислых условиях, например, с использованием 3% DCA в толуоле с системой мониторинга, например, командой управления для просмотра в УФ-свете, установленной на 436 нм. После детритилирования реагент для детритилирования и свободный продукт в растворе отмывали. Например, в некоторых случаях, использовали по меньшей мере 4 объема колонки (CV) ACN для вымывания реагента для детритилирования.

[00864] Для реакции сочетания фосфорамидиты и активаторы (например, CMIMT и ЕТТ) растворяли в подходящих растворителях, и растворы получали и сушили, например, над молекулярными ситами 3 в течение достаточного периода времени (например, по меньшей мере 4 часов) перед синтезом. Сочетание фосфорамидитов выполняли при подходящей концентрации амидитов и активаторов. В одном из примеров выполнения сочетание DPSE-амидитов проводили с использованием 0,2 М растворов амидитов и 0,6 М CMIMT. Все амидиты растворяли в подходящих растворителях, например ACN, за исключением того, что dC-L- и dC-D-амидиты обычно растворяли в изобутиронитриле (IBN). DPSE МОЕ-амидиты зачастую растворяли в 20% IBN/ACN об./об. CMIMT, как правило, растворяли в ACN. В некоторых случаях, при использовании подходящего количества, например 2,5 эквивалента, сочетание выполняли путем смешивания 33% (по объему) растворов соответствующих амидитов с 67% активатора CMIMT в потоке перед добавлением в колонку. Смеси для сочетания, как правило, рециркулировали в течение определенного периода времени, например, минимум 6 минут, для обеспечения максимальной эффективности сочетания. В некоторых вариантах осуществления для сочетания можно использовать PSM-амидиты, где хиральные вспомогательные средства PSM можно необязательно удалять позже, например, в основных условиях. В некоторых вариантах осуществления соль азидоимидазолиния (например, гексафторфосфат 2-азидо-1,3-диметилимидазолиния) можно использовать для модификации с получением нейтральной межнуклеотидной связи (например, n001).

[00865] Стандартное CED-амидитное сочетание, как правило, выполняли с использованием 0,2 М растворов амидитов и 0,6 М ЕТТ в ACN. МОЕ-Т-амидит, как правило, растворяли в 20% IBN/ACN об./об. В некоторых случаях, при использовании подходящего количества, например 2,5 эквивалента, сочетание выполняли путем смешивания 40% (по объему) раствора соответствующего амидита с 60% активатора ЕТТ в потоке перед добавлением в колонку. Смеси для сочетания, как правило, рециркулировали в течение определенного периода времени, например, минимум 8 минут, для обеспечения максимальной эффективности сочетания.

[00866] После проведения сочетания колонку промывали подходящим количеством подходящего растворителя, например, с помощью 2 CV ACN.

[00867] Для проведения DPSE-сочетаний затем колонку обрабатывали подходящим раствором для кэппирования в подходящем количестве в течение достаточного периода времени, например, смесью раствора для кэппирования 1 (реагент для кэппирования А: 10/10/80 об./об./об. уксусный ангидрид/лутидин/ACN) для 1 CV в течение 4 минут для кэппирования (например, ацетилирования) хирального вспомогательного амина. После данной стадии колонку промывали подходящим растворителем в подходящем объеме, например, ACN в количестве, составляющем по меньшей мере 2 CV. Затем выполняли модификацию, например тиолирование, с помощью подходящего реагента в подходящих условиях, например, в случае тиолирования использовали 0,1 М гидрида ксантана в пиридине/ACN (1:1) при времени контакта 6 мин для 1,2 CV. После тиолирования колонку промывали с использованием достаточного количества подходящего растворителя, например, 2 CV CAN. Кэппирование 2 выполняли с использованием подходящих условий, например, 0,4 CV реагента для кэппирования А и реагента для кэппирования В (16% н-метилимидазола в ACN), смешанных в потоке (1:1) в течение подходящего времени (например, 0,8 мин) с последующей промывкой достаточным количеством подходящего растворителя (например, промывка с помощью 2 CV ACN).

[00868] В случае стандартных циклов CED-сочетания, как правило, отсутствовала стадия кэппирования 1. Окисление проводили в подходящих условиях, например, с использованием 50 мМ йода в пиридине/Н₂О (9:1) в течение 1,5 мин из расчета 3,5 эквивалента. После промывки, например, с помощью 2 CV ACN выполняли кэппирование 2 с использованием подходящих условий, например, 0,4 CV реагента для кэппирования А и реагента для кэппирования В, смешанных в потоке (1:1) в течение 0,8 мин с последующей промывкой достаточным количеством подходящего растворителя (например, промывка в 2 CV ACN).

[00869] Для обеспечения требуемой олигонуклеотидной последовательности выполняли несколько циклов.

[00870] Отщепление и снятие защитной группы. Для удаления цианоэтильных (CNET) групп в стереомерно неупорядоченных межнуклеотидных связях можно использовать различные технологии, например, в одном способе получения их удаляли путем обработки в колонке с помощью 20% DEA в течение 15 минут в количестве 5 CV. Затем подложку сушили, как правило, в постоянном потоке инертного газа, например азота, в течение определенного периода времени (например, 15 мин). После сушки колонку разгружали, и подложку переносили в подходящий контейнер, например, в 800-мл сосуд для реакций под давлением. Затем DPSE-группы удаляли в подходящих условиях, например, путем обработки твердой подложки со связанными олигонуклеотидами с помощью 1М раствора TEA-HF, приготовленного путем смешивания DMSO, воды, TEA и TEA-3HF при соотношении 39:8:1:2,5 об./об., с получением 100 мл раствора на ммоль олигонуклеотида. Затем смесь встряхивали при 25°С в течение определенного периода времени, например 6 часов, в шейкере-инкубаторе. Смесь охлаждали (на ледяной бане), затем добавляли подходящее количество основания, например, 200 мл водного раствора аммиака на ммоль олигонуклеотида. Затем смесь встряхивали при подходящей температуре, например 45°С, в течение подходящего периода времени, например 16 часов. Затем смесь фильтровали (фильтры 0,2-1,2 мкм) и осадок на фильтре промывали водой. Получали раствор фильтрата и анализировали его с помощью UPLC, и достигли чистоты 45% FLP - среди всего прочего с помощью технологий по настоящему изобретению можно получать олигонуклеотиды с контролируемой хиральностью с высоким выходом и/или степенью чистоты неочищенного продукта. Полученные олигонуклеотиды можно характеризовать и количественно определять с использованием целого ряда технологий, например, HPLC, LCMS, HRMS и т.д. Количественное определение можно выполнять с использованием целого ряда технологий, доступных в данной области техники. В одном способе получения количественное определение проводили с использованием спектрофотометра NanoDrop one (Thermo Scientific). В качестве примера для препарата определили выход, составляющий 80000 OD.

[00871] Очистка и обессоливание. Для очистки и/или обессоливания олигонуклеотидов можно использовать множество технологий. При одной процедуре неочищенный олигонуклеотид загружали в колонку Agilent Load & Lock (2,5 см X 30 см), заполненную TSKgel 15Q (TOSOH Biosciences). Очистку выполняли в АКТА 150 Pure (GE Healthcare) с использованием 20 мМ NaOH и 2,5 М NaCl в качестве элюентов. Фракции анализировали и объединяли с получением материала с чистотой,составляющей ≥85% FLP. Очищенный материал затем обессоливали на мембранах из регенерированной целлюлозы 2K, а затем лиофилизировали с получением олигонуклеотида в виде белого порошка. Материал можно использовать для различных целей, включая конъюгацию с дополнительными химическими фрагментами, например, добавление Mod001 и Mod083, описанных ниже.

ПРИМЕР 2. Представленные олигонуклеотиды могут эффективно снижать уровни своих мишеней

[00872] Для оценки свойств и/или активности свойств и/или видов активности представленных олигонуклеотидов и композиций на их основе можно использовать различные технологии. Некоторые такие технологии описаны в данном примере. Специалисты в данной области техники понимают, что можно легко использовать многие другие технологии. Как продемонстрировано в данном документе, представленные олигонуклеотиды и композиции, среди всего прочего, могут быть высокоактивными например, в снижении уровней своих нуклеиновых кислот НТТ-мишеней.

[00873] Разработали и сконструировали различные НТТ-олигонуклеотиды, включая набор последовательностей для НТТ человека/NHP (отличных от человека приматов) (подгруппа которых имеет 0 или 1 ошибочное основание с соответствующей последовательностью НТТ мыши) и набор последовательностей для НТТ мыши/крысы (подгруппа которых имеет 1 ошибочное основание с соответствующей последовательностью человека/NHP). Целый ряд НТТ-олигонуклеотидов протестировали, включая тестирование нокдауна НТТ in vitro в клетках при одной или диапазоне концентраций, и определили IC₅₀.

[00874] Используемые клетки включали клетки человека и мыши. В некоторых случаях использовали нейроны iPSC. В некоторых случаях использовали клетки Neuro2a или другие клетки.

[00875] Иллюстративный протокол для определения активности НТТ-олигонуклеотидов in vitro и значений IC₅₀. Для определения активности НТТ-олигонуклеотидов клетки человека или мыши трансфицировали олигонуклеотидами в различных концентрациях с использованием 96-луночных планшетов, приблизительно 15000 клеток/лунку, с использованием липофектамина 2000 (Invitrogen), следуя рекомендациям производителя. После обработки в течение 24 или 48 ч общую РНК экстрагировали с использованием набора для выделения общей РНК SV96 (Promega). Получение кДНК из образцов РНК выполняли с использованием набора для обратной транскрипции High-Capacity cDNA (Thermo Fisher) в соответствии с инструкциями производителя, а анализ qPCR выполняли в системе CFX с использованием iQ Multiplex Powermix (Bio-Rad). Уровни нокдауна мРНК рассчитывали как % оставшейся мРНК относительно имитационной обработки (ΔΔCt), а значения IC50 определяли путем подбора трехпараметрической кривой зависимости % оставшейся мРНК от концентрации олигонуклеотида.

[00876] В некоторых экспериментах олигонуклеотиды доставляли с использованием липофектамина или доставляли путем гимнозиса (например, посредством свободного захвата). В различных скрининговых анализах олигонуклеотиды тестировали при концентрации 10 мкМ и доставляли путем гимнозиса. В некоторых экспериментах уровень остаточной мРНК НТТ (после доставки олигонуклеотида) тестировали относительно стандарта, который представляет собой уровень экспрессии гена, отличного от НТТ. Для некоторых экспериментов показаны результаты параллельных анализов.

[00877] В некоторых экспериментах тестируемые олигонуклеотиды имеют формат крыло-кор-крыло. В некоторых экспериментах тестируемые олигонуклеотиды имеют симметричный или асимметричный формат (например, где 5'- и 3'-крылья содержат одинаковые или разные модификации сахара и их паттерны соответственно).

[00878] Подробная информация о различных НТТ-олигонуклеотидах представлена в таблице 1 в данном документе.

[00879] НТТ-олигонуклеотиды тестировали in vitro в клетках при концентрации 5 нМ в течение 24 ч (например, уровни мРНК НТТ определяли через 24 часа после обработки клеток олигонуклеотидами). Числа указывают на относительное количество оставшейся мРНК hHTT (НТТ человека) относительно стандарта hSFRS9. В некоторых таблицах 100,0 будет представлять 100% оставшейся мРНК hHTT (0,0% нокдаун); а 0,0 будет представлять 0,0% оставшейся мРНК hHTT (100,0% нокдаун). В некоторых экспериментах различные НТТ-олигонуклеотиды тестировали в отношении селективности (mu НТТ по сравнению с wt НТТ) в двойном люциферазном анализе, который подробно описан в WO2017015555 и WO2017192664. Вкратце, в некоторых из данных экспериментов использовали следующий протокол: котрансфекция вектора mu или wt (psiCHECK2), содержащего 250-нуклеотидный фрагмент, содержащий изоформу SNP mu или wt, с НТТ-олигонуклеотидом в клетки Cos7; время воздействия: 24 или 48 часов; измерение люминесценции люциферазы Renilla/люциферазы светлячка с использованием двойного люциферазного анализа (Promega, Мэдисон, Висконсин, США) и нормализация R/F для НТТ-олигонуклеотидов относительно R/F отрицательного контроля.

Анализ активности нейронов

Нейроны человека, полученные из iPSC, высевали на 384-луночные планшеты, покрытые Matrigel® (Corning, Корнинг Нью-Йорк, США), с использованием платформы для манипуляции с жидкостями Agilent Bravo (Agilent, Санта-Клара, Калифорния, США).

Через 24 часа после посева среду заменяли свежей средой, содержащей ASO при фиксированной концентрации, и клетки оставляли инкубироваться с ASO в течение 7 дней в условиях, способствующих гимнозису (свободный захват).

В день 7 после обработки клетки лизировали и мРНК количественно определяли с использованием одноплексного анализа разветвленной ДНК QuantiGene™ (Thermo Fisher, Уолтем, Массачусетс, США).

мРНК НТТ человека определяли количественно и уровни нормализовали с использованием тубулина человека. Данные выражали как кратное изменение относительно ненацеливающегося контроля.

Анализ селективности с использованием репортерного гена

Фрагменты гена НТТ человека (NM_002111), содержащие представляющие интерес SNP, клонировали в векторную систему psiCHECK™-2 (Promega, Мэдисон, Висконсин, США) в 3'-нетранслируемую область (UTR) гена люциферазы renilla (hRluc).

Векторы, содержащие либо мутантный SNP, либо SNP дикого типа, котрансфицировали в клетки COS-7, полученные из почек обезьяны, с ASO при концентрациях, составляющих 0,03-50 нМ, в 96-луночных планшетах.

Через 48 часов после трансфекции планшеты обрабатывали с помощью системы для люциферазного анализа Dual-Glo® (Promega); селективность ASO определяли на основании относительных уровней люциферазы renilla по сравнению с внутренним контролем, люциферазой светлячка.

В некоторых экспериментах in vitro различные НТТ-олигонуклеотиды тестировали на клетках НЕК293.

В некоторых экспериментах in vitro использовали контрольный олигонуклеотид (иногда обозначаемый как cASO), который не нацеливается на НТТ. В некоторых экспериментах in vitro олигонуклеотидом отрицательного контроля был WV-9491, который не нацеливается на НТТ.

[00880] Некоторые НТТ-олигонуклеотиды также тестировали на мышах (например, мышах C57BL6 дикого типа или других мышах).

[00881] Определение активности НТТ-олигонуклеотидов in vivo: Все процедуры на животных выполняли в соответствии с рекомендациями IACUC в Biomere (Вустер, Массачусетс, США). Самцам мышей C57BL/6 возрастом 6-8 недель вводили дозу 10 мл/кг при требуемой концентрации олигонуклеотида в день 1 путем подкожного введения в межлопаточное пространство. Животных умерщвляли (например, в день 8) путем удушения с помощью CO₂ с последующей перфузией сердца солевым раствором, и образцы печени собирали и подвергали мгновенной заморозкой в сухом льду. Экстракцию общей РНК, получение кДНК и измерения qPCR выполняли, как описано для определения активности олигонуклеотидов in vitro.

Исследования in vivo

Мышей с HD, которые экспрессируют полноразмерный ген mHTT человека с экспансией CAG-повторов, обрабатывали с помощью 2 интрацеребровентрикулярных (ICV) доз ASO по 50 мкг и умерщвляли через 7 дней после введения последней дозы. Уровни НТТ количественно определяли с помощью одноплексного анализа разветвленной ДНК QuantiGene™ (Thermo Fisher) и нормализовали относительно тубулина мыши. Данные выражали как кратное изменение относительно ненацеливающегося контроля.

Использовали различные контрольные олигонуклеотиды (в том числе в не показанных данных), включающие следующие.

Дополнительные олигонуклеотиды отрицательного контроля включают следующие.

Различные НТТ-олигонуклеотиды тестировали в отношении их способности обеспечивать нокдаун активности, уровня и/или экспрессии мРНК или белка НТТ дикого типа и/или мутантных молекул.

[00882]

Sac, умерщвление.

Объем дозы=0,5 мл/животное

^аВторая доза в группе 5 составляла 6 мг

№2 и №4 из группы 1 заменили на №12 и №24

Дополнительные данные не показаны.

В дополнение к данным экспериментам подтвердилось, что все из WV-10787, WV-10790, WV-21178, WV-21179, WV-21180 и WV-21181 снижают уровень экспрессии muHTT, при этом не оказывают эффект или оказывают небольшой или значительно меньший эффект на экспрессию wt НТТ (данные не показаны); таким образом было показано, что все они опосредуют аллель-специфический нокдаун.

Несмотря на то, что в данном документе были описаны и проиллюстрированы различные варианты осуществления, средние специалисты в данной области техники легко смогут представить себе совокупность других средств и/или структур для осуществления действий и/или получения результатов и/или одного или нескольких преимуществ, описанных в настоящем изобретении, и каждый из таких вариантов и/или модификаций считается как включенный. В более общем смысле специалисты в данной области техники легко поймут, что все параметры, величины, материалы и конфигурации, описанные в данном документе, предназначены для примера, и что фактические параметры, величины, материалы и/или конфигурации могут зависеть от конкретного применения или вариантов применения, для которых используются идеи настоящего изобретения. Посредством проведения не более чем обычных экспериментов специалисты в данной области техники поймут или смогут установить многие эквиваленты вариантов осуществления настоящего изобретения. Следовательно, следует понимать, что вышеупомянутые варианты осуществления представлены только в качестве примера и что в рамках прилагаемой формулы изобретения и ее эквивалентов заявленные технологии могут осуществляться на практике иным образом, чем конкретно описано и заявлено. В дополнение, любая комбинация двух или более признаков, систем, изделий, материалов, наборов и/или способов, если такие признаки, системы, изделия, материалы, наборы и/или способы не являются взаимно противоречащими, входит в объем настоящего изобретения.

ВАРИАНТЫ ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ

1. Олигонуклеотид, где:

(a) олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362273, и последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 15 смежных оснований, включая положение SNP, из последовательности оснований GTTGATCTGTAGCAGCAGCT, где каждый T может быть независимо заменен на U;

(b) олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362272, и последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 15 смежных оснований, включая положение SNP, из последовательности оснований ACATAGAGGACGCCGTGCAG, AGAGGACGCCGTGCAGGGCT, ATAGAGGACGCCGTGCAGGG, CACATAGAGGACGCCGTGCA, CATAGAGGACGCCGTGCAGG, GCACATAGAGGACGCCGTGC, или TAGAGGACGCCGTGCAGGGC, где каждый T может быть независимо заменен на U;

(c) олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362273, и последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 15 смежных оснований, включая положение SNP, из последовательности оснований AGCTGCTGCTACAGATCAAC, AGCTGCTGCTGCAGATCAAC, GGTTGATCTGTAGCAGCAGCT, GTTGATCTGTAGCAGCAGCT, или TTGATCTGTAGCAGCAGCT, где каждый T может быть независимо заменен на U;

(d) олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362307, и последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 15 смежных оснований, включая положение SNP, из последовательности оснований GGCACAAGGGCACAGAC, GGCACAAGGGCACAGACT, или GGCACAAGGGCACAGACTT, где каждый T может быть независимо заменен на U;

(e) олигонуклеотид нацеливается на SNP rs362331, и последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 15 смежных оснований, включая положение SNP, из последовательности оснований GTGCACACAGTAGATGAGGG, где каждый T может быть независимо заменен на U; или

(f) олигонуклеотид нацеливается на SNP rs363099, и последовательность оснований олигонуклеотида содержит по меньшей мере 15 смежных оснований, включая положение SNP, из последовательности оснований AAGGCTGAGCGGAGAAACCC, AGGCTGAGCGGAGAAACCCT, CAAGGCTGAGCGGAGAAACC, CTGAGCGGAGAAACCCTCCA, GCTGAGCGGAGAAACCCTCC, GGCTGAGCGGAGAAACCCTC, или TGAGCGGAGAAACCCTCCAA, где каждый T может быть независимо заменен на U; и

где олигонуклеотид содержит одну или несколько хиральных межнуклеотидных связей.

2. Олигонуклеотид по варианту осуществления 1, где последовательность оснований олигонуклеотид а содержит или представляет собой:

(a) GTTGATCTGTAGCAGCAGCT, где каждый T может быть независимо заменен на U;

(b) ACATAGAGGACGCCGTGCAG, AGAGGACGCCGTGCAGGGCT, ATAGAGGACGCCGTGCAGGG, CACATAGAGGACGCCGTGCA, CATAGAGGACGCCGTGCAGG, GCACATAGAGGACGCCGTGC, или TAGAGGACGCCGTGCAGGGC, где каждый T может быть независимо заменен на U;

(c) AGCTGCTGCTACAGATCAAC, AGCTGCTGCTGCAGATCAAC, GGTTGATCTGTAGCAGCAGCT, GTTGATCTGTAGCAGCAGCT, или TTGATCTGTAGCAGCAGCT, где каждый T может быть независимо заменен на U;

(d) GGCACAAGGGCACAGAC, GGCACAAGGGCACAGACT, или GGCACAAGGGCACAGACTT, где каждый T может быть независимо заменен на U;

(e) GTGCACACAGTAGATGAGGG, где каждый T может быть независимо заменен на U; или

(f) AAGGCTGAGCGGAGAAACCC, AGGCTGAGCGGAGAAACCCT, CAAGGCTGAGCGGAGAAACC, CTGAGCGGAGAAACCCTCCA, GCTGAGCGGAGAAACCCTCC, GGCTGAGCGGAGAAACCCTC, или TGAGCGGAGAAACCCTCCAA, где каждый T может быть независимо заменен на U.

3. Олигонуклеотид по варианту осуществления 1 или 2, где каждая межнуклеотидная связь олигонуклеотида независимо представляет собой природную фосфатную связь, фосфотиоатную связь или связь

4. Олигонуклеотид по варианту осуществления 1 или 2, где олигонуклеотид содержит одну или несколько природных фосфатных связей, одну или несколько фосфотиоатных связей Sp и одну или несколько связей Rp n001.

5. Олигонуклеотид по любому из вариантов осуществления 1-4, где олигонуклеотид содержит 5'-крыло и 3'-крыло, каждое из которых независимо содержит один или несколько модифицированных сахаров, и кор между 5'-крылом и 3'-крылом или состоит из них.

6. Олигонуклеотид по варианту осуществления 5, где олигонуклеотид содержит 3'-крыло, содержащее 5 смежных 2'-ОМе-модифицированных сахаров, и 3'-крыло, содержащее 5 смежных 2'-ОМе-модифицированных сахаров.

7. Олигонуклеотид по любому из вариантов осуществления 5-6, где кор содержит один или несколько немодифицированных сахаров природной ДНК.

8. Олигонуклеотид, где олигонуклеотид представляет собой WV-21404, WV-21405, WV-21406, WV-21412, WV-12282, WV-12283, WV-12284, WV-19840, WV-21178, WV-21179, WV-21180, WV-21181, WV-21403, WV-21409, WV-21410, WV-21447, WV-21448, WV-23689, WV-23690, WV-23691, WV-23692, WV-28152, WV-28153, WV-28154, WV-28155, WV-28157, WV-28158, WV-28159, WV-28160, WV-28161, WV-28162, WV-28163, WV-28164, WV-28165, WV-28166, WV-28167, или WV-28168.

9. Олигонуклеотид по любому из предыдущих вариантов осуществления, где олигонуклеотид находится в форме фармацевтически приемлемой соли.

10. Олигонуклеотид по любому из предыдущих вариантов осуществления, где олигонуклеотид находится в форме натриевой соли.

11. Олигонуклеотид по любому из предыдущих вариантов осуществления, где олигонуклеотид является на по меньшей мере приблизительно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 99% диастереомерно чистым.

12. Композиция на основе олигонуклеотида с контролируемой хиральностью, содержащая олигонуклеотид по любому из вариантов осуществления 1-10.

13. Композиция по варианту осуществления 11, где по меньшей мере приблизительно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% олигонуклеотидов в композиции или каждый из олигонуклеотидов в композиции, которые характеризуются такой же последовательностью оснований, что и олигонуклеотид, независимо представляют собой олигонуклеотид по любому из вариантов осуществления 1-10.

14. Фармацевтическая композиция, содержащая терапевтически эффективное количество олигонуклеотида и фармацевтически приемлемый неактивный ингредиент, где олигонуклеотид представляет собой олигонуклеотид по любому из вариантов осуществления 1-11.

15. Композиция по варианту осуществления 14, где по меньшей мере приблизительно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% олигонуклеотидов в композиции или каждый из олигонуклеотидов в композиции, которые характеризуются такой же последовательностью оснований, что и олигонуклеотид, независимо представляют собой олигонуклеотид по любому из вариантов осуществления 1-10.

16. Композиция по любому из вариантов осуществления 12-15, где олигонуклеотид находится в форме фармацевтически приемлемой соли.

17. Композиция по любому из вариантов осуществления 12-15, где олигонуклеотид находится в форме натриевой соли.

18. Композиция, содержащая олигонуклеотид, выбранный из WV-21404, WV-21405, WV-21406, WV-21412, WV-10786, WV-10787, WV-10790, WV-10791, WV-10806, WV-10810, WV-10811, WV-12282, WV-12283, WV-12284, WV-14914, WV-15078, WV-15080, WV-17782, WV-19824, WV-19825, WV-19840, WV-19841, WV-21178, WV-21179, WV-21180, WV-21181, WV-21267, WV-21271, WV-21274, WV-21403, WV-21409, WV-21410, WV-21447, WV-21448, WV-23689, WV-23690, WV-23691, WV-23692, WV-28152, WV-28153, WV-28154, WV-28155, WV-28156, WV-28157, WV-28158, WV-28159, WV-28160, WV-28161, WV-28162, WV-28163, WV-28164, WV-28165, WV-28166, WV-28167, WV-28168, и WV-9679.

19. Композиция по варианту осуществления 18, где олигонуклеотид находится в форме фармацевтически приемлемой соли.

20. Способ лечения, предупреждения, задержки возникновения и/или уменьшения тяжести по меньшей мере одного симптома болезни Хантингтона, где способ включает введение субъекту, страдающему от нее или предрасположенному к ней, эффективного количества олигонуклеотида или композиции по любому из предыдущих вариантов осуществления.

21. Способ по варианту осуществления 20, где у субъекта имеется аллель НТТ, который содержит область экспансии CAG-повторов и является полностью комплементарным последовательности оснований олигонуклеотида.

22. Олигонуклеотид, композиция или способ, описанные в настоящей заявке.

--->

ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ

<110> WAVE LIFE SCIENCES LTD.

<120> КОМПОЗИЦИИ НА ОСНОВЕ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ И СПОСОБЫ, СВЯЗАННЫЕ С НИМИ

<130> 2010581-0706

<150> US 62/800,409

<151> 2019-02-01

<150> US 62/911,335

<151> 2019-10-06

<160> 2358

<170> PatentIn версия 3.5

<210> 1

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1

acatagagga cgccgtgcag 20

<210> 2

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2

agaggacgcc gtgcagggct 20

<210> 3

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 3

atagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 4

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 4

cacatagagg acgccgtgca 20

<210> 5

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 5

catagaggac gccgtgcagg 20

<210> 6

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 6

gcacatagag gacgccgtgc 20

<210> 7

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 7

tagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 8

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 8

agctgctgct acagatcaac 20

<210> 9

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 9

agctgctgct gcagatcaac 20

<210> 10

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 10

ggttgatctg tagcagcagc t 21

<210> 11

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 11

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 12

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 12

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 13

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 13

ttgatctgta gcagcagct 19

<210> 14

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 14

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 15

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 15

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 16

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 16

ggcacaaggg cacagac 17

<210> 17

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 17

ggcacaaggg cacagact 18

<210> 18

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 18

ggcacaaggg cacagactt 19

<210> 19

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 19

ggcacaaggg cacagacttc 20

<210> 20

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 20

agtgcacaca gtagatgagg 20

<210> 21

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 21

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 22

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 22

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 23

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 23

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 24

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 24

aggctgagcg gagaaaccct 20

<210> 25

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 25

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 26

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 26

ctgagcggag aaaccctcca 20

<210> 27

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 27

gctgagcgga gaaaccctcc 20

<210> 28

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 28

ggctgagcgg agaaaccctc 20

<210> 29

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 29

tgagcggaga aaccctccaa 20

<210> 30

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 30

accgccatcc ccgccgtagc 20

<210> 31

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 31

ccgccatccc cgccgtagcc 20

<210> 32

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 32

cgccatcccc gccgtagcct 20

<210> 33

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 33

ctcagtaaca ttgacaccac 20

<210> 34

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 34

gccatccccg ccgtagcctg 20

<210> 35

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 35

ggctctgggt tgctgggtca 20

<210> 36

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 36

ggtgtccctc atgggctctg 20

<210> 37

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 37

gttaccgcca tccccgccgt 20

<210> 38

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 38

tctccattct atcttatgtt 20

<210> 39

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 39

gttgatctgt agtagcagct 20

<210> 40

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 40

gtgcaacaca gtagatgagg g 21

<210> 41

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 41

ggcacaaagg gcacagactt c 21

<210> 42

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 42

caagggcaca gacttc 16

<210> 43

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 43

aagggcacag acttc 15

<210> 44

<211> 21

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 44

gcauagcgag cgagggaaaa c 21

<210> 45

<211> 21

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 45

guuuucccuc gcucgcuaug c 21

<210> 46

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 46

gaagucugug cccuugugcc 20

<210> 47

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 47

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 48

<211> 16

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 48

caagggcaca gacuuc 16

<210> 49

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 49

ggcacaaggg ca 12

<210> 50

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 50

gugcacacag tagatg 16

<210> 51

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 51

gugcacacag ta 12

<210> 52

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 52

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 53

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 53

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 54

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 54

tacagacuuc caaaggcuct u 21

<210> 55

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 55

tcacagacuu ccaaaggcut u 21

<210> 56

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 56

tgcacagacu uccaaaggct u 21

<210> 57

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 57

tggcacagac uuccaaaggt u 21

<210> 58

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 58

tgggcacaga cuuccaaagt u 21

<210> 59

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 59

tagggcacag acuuccaaat u 21

<210> 60

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 60

taagggcaca gacuuccaat u 21

<210> 61

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 61

tcaagggcac agacuuccat u 21

<210> 62

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 62

tacaagggca cagacuucct u 21

<210> 63

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 63

tcacaagggc acagacuuct u 21

<210> 64

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 64

tgcacaaggg cacagacuut u 21

<210> 65

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 65

tggcacaagg gcacagacut u 21

<210> 66

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 66

tgggcacaag ggcacagact u 21

<210> 67

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 67

tagggcacaa gggcacagat u 21

<210> 68

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 68

tcagggcaca agggcacagt u 21

<210> 69

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 69

tgcagggcac aagggcacat u 21

<210> 70

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 70

tggcagggca caagggcact u 21

<210> 71

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 71

taggcagggc acaagggcat u 21

<210> 72

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 72

tacagacuuc caaaggcuct u 21

<210> 73

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 73

tcacagacuu ccaaaggcut u 21

<210> 74

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 74

tgcacagacu uccaaaggct u 21

<210> 75

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 75

tggcacagac uuccaaaggt u 21

<210> 76

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 76

tgggcacaga cuuccaaagt u 21

<210> 77

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 77

tagggcacag acuuccaaat u 21

<210> 78

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 78

taagggcaca gacuuccaat u 21

<210> 79

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 79

tcaagggcac agacuuccat u 21

<210> 80

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 80

tacaagggca cagacuucct u 21

<210> 81

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 81

tcacaagggc acagacuuct u 21

<210> 82

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 82

tgcacaaggg cacagacuut u 21

<210> 83

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 83

tggcacaagg gcacagacut u 21

<210> 84

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 84

tgggcacaag ggcacagact u 21

<210> 85

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 85

tagggcacaa gggcacagat u 21

<210> 86

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 86

tcagggcaca agggcacagt u 21

<210> 87

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 87

tgcagggcac aagggcacat u 21

<210> 88

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 88

tggcagggca caagggcact u 21

<210> 89

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 89

taggcagggc acaagggcat u 21

<210> 90

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 90

tacagacuuc caaaggcucc gtu 23

<210> 91

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 91

tcacagacuu ccaaaggcuc ctu 23

<210> 92

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 92

tgcacagacu uccaaaggcu ctu 23

<210> 93

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 93

tggcacagac uuccaaaggc utu 23

<210> 94

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 94

tgggcacaga cuuccaaagg ctu 23

<210> 95

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 95

tagggcacag acuuccaaag gtu 23

<210> 96

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 96

taagggcaca gacuuccaaa gtu 23

<210> 97

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 97

tcaagggcac agacuuccaa atu 23

<210> 98

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 98

tacaagggca cagacuucca atu 23

<210> 99

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 99

tcacaagggc acagacuucc atu 23

<210> 100

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 100

tgcacaaggg cacagacuuc ctu 23

<210> 101

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 101

tggcacaagg gcacagacuu ctu 23

<210> 102

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 102

tgggcacaag ggcacagacu utu 23

<210> 103

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 103

tagggcacaa gggcacagac utu 23

<210> 104

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 104

tcagggcaca agggcacaga ctu 23

<210> 105

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 105

tgcagggcac aagggcacag atu 23

<210> 106

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 106

tggcagggca caagggcaca gtu 23

<210> 107

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 107

taggcagggc acaagggcac atu 23

<210> 108

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 108

tgaggcaggg cacaagggca ctu 23

<210> 109

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 109

tggaggcagg gcacaagggc atu 23

<210> 110

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 110

tacagacuuc caaaggcucc gtu 23

<210> 111

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 111

tcacagacuu ccaaaggcuc ctu 23

<210> 112

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 112

tgcacagacu uccaaaggcu ctu 23

<210> 113

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 113

tggcacagac uuccaaaggc utu 23

<210> 114

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 114

tgggcacaga cuuccaaagg ctu 23

<210> 115

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 115

tagggcacag acuuccaaag gtu 23

<210> 116

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 116

taagggcaca gacuuccaaa gtu 23

<210> 117

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 117

tcaagggcac agacuuccaa atu 23

<210> 118

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 118

tacaagggca cagacuucca atu 23

<210> 119

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 119

tcacaagggc acagacuucc atu 23

<210> 120

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 120

tgcacaaggg cacagacuuc ctu 23

<210> 121

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 121

tggcacaagg gcacagacuu ctu 23

<210> 122

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 122

tgggcacaag ggcacagacu utu 23

<210> 123

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 123

tagggcacaa gggcacagac utu 23

<210> 124

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 124

tcagggcaca agggcacaga ctu 23

<210> 125

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 125

tgcagggcac aagggcacag atu 23

<210> 126

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 126

tggcagggca caagggcaca gtu 23

<210> 127

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 127

taggcagggc acaagggcac atu 23

<210> 128

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 128

tgaggcaggg cacaagggca ctu 23

<210> 129

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 129

tggaggcagg gcacaagggc atu 23

<210> 130

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 130

tagaugaggg agcaggcgut u 21

<210> 131

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 131

tuagaugagg gagcaggcgt u 21

<210> 132

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 132

tguagaugag ggagcaggct u 21

<210> 133

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 133

taguagauga gggagcaggt u 21

<210> 134

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 134

tcaguagaug agggagcagt u 21

<210> 135

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 135

tacaguagau gagggagcat u 21

<210> 136

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 136

tcacaguaga ugagggagct u 21

<210> 137

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 137

tacacaguag augagggagt u 21

<210> 138

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 138

tcacacagua gaugagggat u 21

<210> 139

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 139

tgcacacagu agaugagggt u 21

<210> 140

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 140

tugcacacag uagaugaggt u 21

<210> 141

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 141

tgugcacaca guagaugagt u 21

<210> 142

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 142

tagugcacac aguagaugat u 21

<210> 143

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 143

taagugcaca caguagaugt u 21

<210> 144

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 144

tgaagugcac acaguagaut u 21

<210> 145

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 145

tugaagugca cacaguagat u 21

<210> 146

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 146

taugaagugc acacaguagt u 21

<210> 147

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 147

tgaugaagug cacacaguat u 21

<210> 148

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 148

tagaugaggg agcaggcgut u 21

<210> 149

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 149

tuagaugagg gagcaggcgt u 21

<210> 150

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 150

tguagaugag ggagcaggct u 21

<210> 151

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 151

taguagauga gggagcaggt u 21

<210> 152

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 152

tcaguagaug agggagcagt u 21

<210> 153

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 153

tacaguagau gagggagcat u 21

<210> 154

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 154

tcacaguaga ugagggagct u 21

<210> 155

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 155

tacacaguag augagggagt u 21

<210> 156

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 156

tcacacagua gaugagggat u 21

<210> 157

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 157

tgcacacagu agaugagggt u 21

<210> 158

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 158

tugcacacag uagaugaggt u 21

<210> 159

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 159

tgugcacaca guagaugagt u 21

<210> 160

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 160

tagugcacac aguagaugat u 21

<210> 161

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 161

taagugcaca caguagaugt u 21

<210> 162

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 162

tgaagugcac acaguagaut u 21

<210> 163

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 163

tugaagugca cacaguagat u 21

<210> 164

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 164

taugaagugc acacaguagt u 21

<210> 165

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 165

tgaugaagug cacacaguat u 21

<210> 166

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 166

tagaugaggg agcaggcgug gtu 23

<210> 167

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 167

tuagaugagg gagcaggcgu gtu 23

<210> 168

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 168

tguagaugag ggagcaggcg utu 23

<210> 169

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 169

taguagauga gggagcaggc gtu 23

<210> 170

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 170

tcaguagaug agggagcagg ctu 23

<210> 171

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 171

tacaguagau gagggagcag gtu 23

<210> 172

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 172

tcacaguaga ugagggagca gtu 23

<210> 173

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 173

tacacaguag augagggagc atu 23

<210> 174

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 174

tcacacagua gaugagggag ctu 23

<210> 175

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 175

tgcacacagu agaugaggga gtu 23

<210> 176

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 176

tugcacacag uagaugaggg atu 23

<210> 177

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 177

tgugcacaca guagaugagg gtu 23

<210> 178

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 178

tagugcacac aguagaugag gtu 23

<210> 179

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 179

taagugcaca caguagauga gtu 23

<210> 180

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 180

tgaagugcac acaguagaug atu 23

<210> 181

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 181

tugaagugca cacaguagau gtu 23

<210> 182

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 182

taugaagugc acacaguaga utu 23

<210> 183

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 183

tgaugaagug cacacaguag atu 23

<210> 184

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 184

tggaugaagu gcacacagua gtu 23

<210> 185

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 185

taggaugaag ugcacacagu atu 23

<210> 186

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 186

tagaugaggg agcaggcgug gtu 23

<210> 187

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 187

tuagaugagg gagcaggcgu gtu 23

<210> 188

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 188

tguagaugag ggagcaggcg utu 23

<210> 189

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 189

taguagauga gggagcaggc gtu 23

<210> 190

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 190

tcaguagaug agggagcagg ctu 23

<210> 191

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 191

tacaguagau gagggagcag gtu 23

<210> 192

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 192

tcacaguaga ugagggagca gtu 23

<210> 193

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 193

tacacaguag augagggagc atu 23

<210> 194

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 194

tcacacagua gaugagggag ctu 23

<210> 195

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 195

tgcacacagu agaugaggga gtu 23

<210> 196

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 196

tugcacacag uagaugaggg atu 23

<210> 197

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 197

tgugcacaca guagaugagg gtu 23

<210> 198

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 198

tagugcacac aguagaugag gtu 23

<210> 199

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 199

taagugcaca caguagauga gtu 23

<210> 200

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 200

tgaagugcac acaguagaug atu 23

<210> 201

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 201

tugaagugca cacaguagau gtu 23

<210> 202

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 202

taugaagugc acacaguaga utu 23

<210> 203

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 203

tgaugaagug cacacaguag atu 23

<210> 204

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 204

tggaugaagu gcacacagua gtu 23

<210> 205

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 205

taggaugaag ugcacacagu atu 23

<210> 206

<211> 19

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 206

gcacaagggc acagacuuc 19

<210> 207

<211> 18

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 207

cacaagggca cagacuuc 18

<210> 208

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 208

ugcacacagt agatgaggg 19

<210> 209

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 209

gcacacagta gatgaggg 18

<210> 210

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 210

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 211

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 211

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 212

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 212

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 213

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 213

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 214

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 214

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 215

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 215

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 216

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 216

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 217

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 217

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 218

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 218

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 219

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 219

agggcgcaga cttccaaagg 20

<210> 220

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 220

aagggcgcag acttccaaag 20

<210> 221

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 221

caagggcgca gacttccaaa 20

<210> 222

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 222

acaagggcgc agactuccaa 20

<210> 223

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 223

cacaagggcg cagacuucca 20

<210> 224

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 224

gcacaagggc gcagacuucc 20

<210> 225

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 225

ggcacaaggg cgcagacuuc 20

<210> 226

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 226

gggcacaagg gcgcagacuu 20

<210> 227

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 227

agggcacaag ggcgcagacu 20

<210> 228

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 228

cagggcacaa gggcgcagac 20

<210> 229

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 229

ctcagtaaca ttgacaccac 20

<210> 230

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 230

ggcacaaggg cgcagacuuc 20

<210> 231

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 231

ggcacaaggg cgcagacuuc 20

<210> 232

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 232

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 233

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 233

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 234

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 234

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 235

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 235

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 236

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 236

tacagacuuc caaaggcucc gtu 23

<210> 237

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 237

tcacagacuu ccaaaggcuc ctu 23

<210> 238

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 238

tgcacagacu uccaaaggcu ctu 23

<210> 239

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 239

tggcacagac uuccaaaggc utu 23

<210> 240

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 240

tgggcacaga cuuccaaagg ctu 23

<210> 241

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 241

tagggcacag acuuccaaag gtu 23

<210> 242

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 242

taagggcaca gacuuccaaa gtu 23

<210> 243

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 243

tcaagggcac agacuuccaa atu 23

<210> 244

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 244

tacaagggca cagacuucca atu 23

<210> 245

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 245

tcacaagggc acagacuucc atu 23

<210> 246

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 246

tgcacaaggg cacagacuuc ctu 23

<210> 247

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 247

tggcacaagg gcacagacuu ctu 23

<210> 248

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 248

tgggcacaag ggcacagacu utu 23

<210> 249

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 249

tagggcacaa gggcacagac utu 23

<210> 250

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 250

tcagggcaca agggcacaga ctu 23

<210> 251

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 251

tgcagggcac aagggcacag atu 23

<210> 252

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 252

tggcagggca caagggcaca gtu 23

<210> 253

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 253

taggcagggc acaagggcac atu 23

<210> 254

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 254

tgaggcaggg cacaagggca ctu 23

<210> 255

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 255

tggaggcagg gcacaagggc atu 23

<210> 256

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 256

tacagacuuc caaaggcucc gtu 23

<210> 257

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 257

tcacagacuu ccaaaggcuc ctu 23

<210> 258

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 258

tgcacagacu uccaaaggcu ctu 23

<210> 259

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 259

tggcacagac uuccaaaggc utu 23

<210> 260

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 260

tgggcacaga cuuccaaagg ctu 23

<210> 261

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 261

tagggcacag acuuccaaag gtu 23

<210> 262

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 262

taagggcaca gacuuccaaa gtu 23

<210> 263

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 263

tcaagggcac agacuuccaa atu 23

<210> 264

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 264

tacaagggca cagacuucca atu 23

<210> 265

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 265

tcacaagggc acagacuucc atu 23

<210> 266

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 266

tgcacaaggg cacagacuuc ctu 23

<210> 267

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 267

tggcacaagg gcacagacuu ctu 23

<210> 268

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 268

tgggcacaag ggcacagacu utu 23

<210> 269

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 269

tagggcacaa gggcacagac utu 23

<210> 270

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 270

tcagggcaca agggcacaga ctu 23

<210> 271

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 271

tgcagggcac aagggcacag atu 23

<210> 272

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 272

tggcagggca caagggcaca gtu 23

<210> 273

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 273

taggcagggc acaagggcac atu 23

<210> 274

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 274

tgaggcaggg cacaagggca ctu 23

<210> 275

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 275

tggaggcagg gcacaagggc atu 23

<210> 276

<211> 36

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 276

aacaagauga agagcaccaa guuuuagagc uaugcu 36

<210> 277

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 277

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 278

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 278

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 279

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 279

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 280

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 280

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 281

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 281

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 282

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 282

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 283

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 283

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 284

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 284

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 285

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 285

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 286

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 286

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 287

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 287

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 288

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 288

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 289

<211> 31

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 289

gccuuuggaa gucugcgccc uugugcccug c 31

<210> 290

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 290

guggugucaa uguuacugag 20

<210> 291

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 291

agggcgcaga cttccaaagg 20

<210> 292

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 292

aagggcgcag acttccaaag 20

<210> 293

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 293

caagggcgca gacttccaaa 20

<210> 294

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 294

acaagggcgc agactuccaa 20

<210> 295

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 295

cacaagggcg cagacuucca 20

<210> 296

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 296

gcacaagggc gcagacuucc 20

<210> 297

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 297

ggcacaaggg cgcagacuuc 20

<210> 298

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 298

gggcacaagg gcgcagacuu 20

<210> 299

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 299

agggcacaag ggcgcagacu 20

<210> 300

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 300

cagggcacaa gggcgcagac 20

<210> 301

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 301

cccgccgtag cctgggaccc 20

<210> 302

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 302

ccccgccgta gcctgggacc 20

<210> 303

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 303

catccccgcc gtagccuggg 20

<210> 304

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 304

ccgccatccc cgccguagcc 20

<210> 305

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 305

accgccatcc ccgccguagc 20

<210> 306

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 306

uaccgccatc cccgccguag 20

<210> 307

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 307

utaccgccat ccccgccgua 20

<210> 308

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 308

gttaccgcca tccccgccgu 20

<210> 309

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 309

ggttaccgcc atccccgccg 20

<210> 310

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 310

agggutaccg ccatccccgc 20

<210> 311

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 311

cagggttacc gccatccccg 20

<210> 312

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 312

gcagggttac cgccaucccc 20

<210> 313

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 313

ugcagggtta ccgccauccc 20

<210> 314

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 314

agccgggggt tcgtgucgcc 20

<210> 315

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 315

gagccggggg ttcgtgucgc 20

<210> 316

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 316

ggagccgggg gttcgugucg 20

<210> 317

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 317

cggagccggg ggttcguguc 20

<210> 318

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 318

ccctcatggg ctctggguug 20

<210> 319

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 319

ucccucatgg gctctggguu 20

<210> 320

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 320

caggaggggg cgggtguccc 20

<210> 321

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 321

ccaggagggg gcgggugucc 20

<210> 322

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 322

cccaagtgag ggagcggggc 20

<210> 323

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 323

aggccccaac aaggcucugc 20

<210> 324

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 324

ggctctgggt tgctggguca 20

<210> 325

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 325

gtccctcatg ggctcugggu 20

<210> 326

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 326

gtgtccctca tgggcucugg 20

<210> 327

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 327

ccatccccgc cgtagccugg 20

<210> 328

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 328

gccauccccg ccgtagccug 20

<210> 329

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 329

cgccatcccc gccgtagccu 20

<210> 330

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 330

gggtuaccgc catccccgcc 20

<210> 331

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 331

gggcuctggg ttgctggguc 20

<210> 332

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 332

aggagggggc gggtgucccu 20

<210> 333

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 333

ggtguccctc atgggcucug 20

<210> 334

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 334

ugtccctcat gggctcuggg 20

<210> 335

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 335

ugggctctgg gttgcugggu 20

<210> 336

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 336

acagugttgg ccatgcccag 20

<210> 337

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 337

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 338

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 338

uaccgcgacc ctctggacag 20

<210> 339

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 339

gtaccgcgac cctctggaca 20

<210> 340

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 340

ggtaccgcga ccctcuggac 20

<210> 341

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 341

aggtaccgcg accctcugga 20

<210> 342

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 342

cagggaggta ccgcgacccu 20

<210> 343

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 343

ucagggaggt accgcgaccc 20

<210> 344

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 344

ctcagggagg taccgcgacc 20

<210> 345

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 345

cctcagggag gtaccgcgac 20

<210> 346

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 346

ggaaagcctg gcctcaggga 20

<210> 347

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 347

atgcccagca cgcaggccag 20

<210> 348

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 348

gccaugccca gcacgcaggc 20

<210> 349

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 349

cagcacgcag gccaggggcg 20

<210> 350

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 350

catgcccagc acgcaggcca 20

<210> 351

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 351

ccatgcccag cacgcaggcc 20

<210> 352

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 352

gcgaccctct ggacagggaa 20

<210> 353

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 353

ugcccagcac gcaggccagg 20

<210> 354

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 354

aaagcctggc ctcagggagg 20

<210> 355

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 355

gcccagcacg caggccaggg 20

<210> 356

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 356

cccagcacgc aggccagggg 20

<210> 357

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 357

ggccatgccc agcacgcagg 20

<210> 358

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 358

cgcaggccag gggcgcgggg 20

<210> 359

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 359

agcacgcagg ccaggggcgc 20

<210> 360

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 360

ccagcacgca ggccaggggc 20

<210> 361

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 361

gcaggccagg ggcgcggggc 20

<210> 362

<211> 16

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 362

cacaagggcg cagacu 16

<210> 363

<211> 12

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 363

agggcgcaga cu 12

<210> 364

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 364

gugcacacag tggatgaggg 20

<210> 365

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 365

gcacacagtg gatgag 16

<210> 366

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 366

acagtggatg ag 12

<210> 367

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 367

acagtggatg ag 12

<210> 368

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 368

gagcgtagaa accctccaaa 20

<210> 369

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 369

ugagcgtaga aacccuccaa 20

<210> 370

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 370

cugagcgtag aaacccucca 20

<210> 371

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 371

gcugagcgta gaaacccucc 20

<210> 372

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 372

ggcugagcgt agaaacccuc 20

<210> 373

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 373

aggcugagcg tagaaacccu 20

<210> 374

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 374

aaggctgagc gtagaaaccc 20

<210> 375

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 375

caaggctgag cgtagaaacc 20

<210> 376

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 376

ccaaggctga gcgtagaaac 20

<210> 377

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 377

uccaaggctg agcgtagaaa 20

<210> 378

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 378

gagcgtagaa accctccaaa 20

<210> 379

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 379

ugagcgtaga aacccuccaa 20

<210> 380

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 380

cugagcgtag aaacccucca 20

<210> 381

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 381

gcugagcgta gaaacccucc 20

<210> 382

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 382

ggcugagcgt agaaacccuc 20

<210> 383

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 383

aggcugagcg tagaaacccu 20

<210> 384

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 384

aaggctgagc gtagaaaccc 20

<210> 385

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 385

caaggctgag cgtagaaacc 20

<210> 386

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 386

ccaaggctga gcgtagaaac 20

<210> 387

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 387

uccaaggctg agcgtagaaa 20

<210> 388

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 388

gagcgtagaa accctccaaa 20

<210> 389

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 389

tgagcgtaga aaccctccaa 20

<210> 390

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 390

ctgagcgtag aaaccctcca 20

<210> 391

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 391

gctgagcgta gaaaccctcc 20

<210> 392

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 392

ggctgagcgt agaaaccctc 20

<210> 393

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 393

aggctgagcg tagaaaccct 20

<210> 394

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 394

aaggctgagc gtagaaaccc 20

<210> 395

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 395

caaggctgag cgtagaaacc 20

<210> 396

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 396

ccaaggctga gcgtagaaac 20

<210> 397

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 397

tccaaggctg agcgtagaaa 20

<210> 398

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 398

gagcgtagaa accctccaaa 20

<210> 399

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 399

tgagcgtaga aaccctccaa 20

<210> 400

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 400

ctgagcgtag aaaccctcca 20

<210> 401

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 401

gctgagcgta gaaaccctcc 20

<210> 402

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 402

ggctgagcgt agaaaccctc 20

<210> 403

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 403

aggctgagcg tagaaaccct 20

<210> 404

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 404

aaggctgagc gtagaaaccc 20

<210> 405

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 405

caaggctgag cgtagaaacc 20

<210> 406

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 406

ccaaggctga gcgtagaaac 20

<210> 407

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 407

tccaaggctg agcgtagaaa 20

<210> 408

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 408

gagcgtagaa accctccaaa 20

<210> 409

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 409

ugagcgtaga aacccuccaa 20

<210> 410

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 410

ctgagcgtag aaacccucca 20

<210> 411

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 411

gctgagcgta gaaacccucc 20

<210> 412

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 412

ggctgagcgt agaaacccuc 20

<210> 413

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 413

aggcugagcg tagaaacccu 20

<210> 414

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 414

aaggctgagc gtagaaaccc 20

<210> 415

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 415

caaggctgag cgtagaaacc 20

<210> 416

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 416

ccaaggctga gcgtagaaac 20

<210> 417

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 417

uccaaggctg agcgtagaaa 20

<210> 418

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 418

aucugaagca gcagcuucuc 20

<210> 419

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 419

gaucugaagc agcagcuucu 20

<210> 420

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 420

ugauctgaag cagcagcuuc 20

<210> 421

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 421

uugauctgaa gcagcagcuu 20

<210> 422

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 422

guugatctga agcagcagcu 20

<210> 423

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 423

gguugatctg aagcagcagc 20

<210> 424

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 424

ggguugatct gaagcagcag 20

<210> 425

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 425

ggggutgatc tgaagcagca 20

<210> 426

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 426

cggggttgat ctgaagcagc 20

<210> 427

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 427

ucggggttga tctgaagcag 20

<210> 428

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 428

aucugaagca gcagcuucuc 20

<210> 429

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 429

gaucugaagc agcagcuucu 20

<210> 430

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 430

ugauctgaag cagcagcuuc 20

<210> 431

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 431

uugauctgaa gcagcagcuu 20

<210> 432

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 432

guugatctga agcagcagcu 20

<210> 433

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 433

gguugatctg aagcagcagc 20

<210> 434

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 434

ggguugatct gaagcagcag 20

<210> 435

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 435

ggggutgatc tgaagcagca 20

<210> 436

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 436

cggggttgat ctgaagcagc 20

<210> 437

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 437

ucggggttga tctgaagcag 20

<210> 438

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 438

atctgaagca gcagcttctc 20

<210> 439

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 439

gatctgaagc agcagcttct 20

<210> 440

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 440

tgatctgaag cagcagcttc 20

<210> 441

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 441

ttgatctgaa gcagcagctt 20

<210> 442

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 442

gttgatctga agcagcagct 20

<210> 443

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 443

ggttgatctg aagcagcagc 20

<210> 444

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 444

gggttgatct gaagcagcag 20

<210> 445

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 445

ggggttgatc tgaagcagca 20

<210> 446

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 446

cggggttgat ctgaagcagc 20

<210> 447

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 447

tcggggttga tctgaagcag 20

<210> 448

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 448

atctgaagca gcagcttctc 20

<210> 449

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 449

gatctgaagc agcagcttct 20

<210> 450

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 450

tgatctgaag cagcagcttc 20

<210> 451

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 451

ttgatctgaa gcagcagctt 20

<210> 452

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 452

gttgatctga agcagcagct 20

<210> 453

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 453

ggttgatctg aagcagcagc 20

<210> 454

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 454

gggttgatct gaagcagcag 20

<210> 455

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 455

ggggttgatc tgaagcagca 20

<210> 456

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 456

cggggttgat ctgaagcagc 20

<210> 457

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 457

tcggggttga tctgaagcag 20

<210> 458

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 458

atctgaagca gcagcuucuc 20

<210> 459

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 459

gatcugaagc agcagcuucu 20

<210> 460

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 460

ugatctgaag cagcagcuuc 20

<210> 461

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 461

utgauctgaa gcagcagcuu 20

<210> 462

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 462

gttgatctga agcagcagcu 20

<210> 463

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 463

ggttgatctg aagcagcagc 20

<210> 464

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 464

gggtugatct gaagcagcag 20

<210> 465

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 465

ggggutgatc tgaagcagca 20

<210> 466

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 466

cggggttgat ctgaagcagc 20

<210> 467

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 467

ucggggttga tctgaagcag 20

<210> 468

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 468

gaggaggccg tgcagggcuc 20

<210> 469

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 469

agaggaggcc gtgcagggcu 20

<210> 470

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 470

uagaggaggc cgtgcagggc 20

<210> 471

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 471

auagaggagg ccgtgcaggg 20

<210> 472

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 472

cauagaggag gccgtgcagg 20

<210> 473

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 473

acauagagga ggccgugcag 20

<210> 474

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 474

cacauagagg aggccgugca 20

<210> 475

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 475

gcacatagag gaggccgugc 20

<210> 476

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 476

agcacataga ggaggccgug 20

<210> 477

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 477

cagcacatag aggaggccgu 20

<210> 478

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 478

gaggaggccg tgcagggcuc 20

<210> 479

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 479

agaggaggcc gtgcagggcu 20

<210> 480

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 480

uagaggaggc cgtgcagggc 20

<210> 481

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 481

auagaggagg ccgtgcaggg 20

<210> 482

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 482

cauagaggag gccgtgcagg 20

<210> 483

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 483

acauagagga ggccgugcag 20

<210> 484

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 484

cacauagagg aggccgugca 20

<210> 485

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 485

gcacatagag gaggccgugc 20

<210> 486

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 486

agcacataga ggaggccgug 20

<210> 487

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 487

cagcacatag aggaggccgu 20

<210> 488

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 488

gaggaggccg tgcagggctc 20

<210> 489

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 489

agaggaggcc gtgcagggct 20

<210> 490

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 490

tagaggaggc cgtgcagggc 20

<210> 491

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 491

atagaggagg ccgtgcaggg 20

<210> 492

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 492

catagaggag gccgtgcagg 20

<210> 493

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 493

acatagagga ggccgtgcag 20

<210> 494

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 494

cacatagagg aggccgtgca 20

<210> 495

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 495

gcacatagag gaggccgtgc 20

<210> 496

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 496

agcacataga ggaggccgtg 20

<210> 497

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 497

cagcacatag aggaggccgt 20

<210> 498

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 498

gaggaggccg tgcagggctc 20

<210> 499

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 499

agaggaggcc gtgcagggct 20

<210> 500

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 500

tagaggaggc cgtgcagggc 20

<210> 501

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 501

atagaggagg ccgtgcaggg 20

<210> 502

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 502

catagaggag gccgtgcagg 20

<210> 503

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 503

acatagagga ggccgtgcag 20

<210> 504

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 504

cacatagagg aggccgtgca 20

<210> 505

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 505

gcacatagag gaggccgtgc 20

<210> 506

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 506

agcacataga ggaggccgtg 20

<210> 507

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 507

cagcacatag aggaggccgt 20

<210> 508

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 508

gaggaggccg tgcagggcuc 20

<210> 509

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 509

agaggaggcc gtgcagggcu 20

<210> 510

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 510

uagaggaggc cgtgcagggc 20

<210> 511

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 511

atagaggagg ccgtgcaggg 20

<210> 512

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 512

catagaggag gccgtgcagg 20

<210> 513

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 513

acatagagga ggccgugcag 20

<210> 514

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 514

cacauagagg aggccgugca 20

<210> 515

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 515

gcacatagag gaggccgugc 20

<210> 516

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 516

agcacataga ggaggccgug 20

<210> 517

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 517

cagcacatag aggaggccgu 20

<210> 518

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 518

acaguagatg agggaggagg 20

<210> 519

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 519

cacagtagat gagggaggag 20

<210> 520

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 520

acacagtaga tgagggagga 20

<210> 521

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 521

cacacagtag atgagggagg 20

<210> 522

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 522

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 523

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 523

ugcacacagt agatgaggga 20

<210> 524

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 524

agtgcacaca gtagaugagg 20

<210> 525

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 525

aagtgcacac agtagaugag 20

<210> 526

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 526

gaagugcaca cagtagauga 20

<210> 527

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 527

acaguagatg agggaggagg 20

<210> 528

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 528

cacagtagat gagggaggag 20

<210> 529

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 529

acacagtaga tgagggagga 20

<210> 530

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 530

cacacagtag atgagggagg 20

<210> 531

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 531

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 532

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 532

ugcacacagt agatgaggga 20

<210> 533

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 533

agtgcacaca gtagaugagg 20

<210> 534

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 534

aagtgcacac agtagaugag 20

<210> 535

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 535

gaagugcaca cagtagauga 20

<210> 536

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 536

tuaggaggca gaagcagacg utu 23

<210> 537

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 537

agggcgcaga cttccaaagg 20

<210> 538

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 538

aagggcgcag acttccaaag 20

<210> 539

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 539

caagggcgca gacttccaaa 20

<210> 540

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 540

acaagggcgc agacttccaa 20

<210> 541

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 541

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 542

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 542

gcacaagggc gcagacttcc 20

<210> 543

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 543

ggcacaaggg cgcagacttc 20

<210> 544

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 544

gggcacaagg gcgcagactt 20

<210> 545

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 545

agggcacaag ggcgcagact 20

<210> 546

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 546

cagggcacaa gggcgcagac 20

<210> 547

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 547

acaguggatg agggaggagg 20

<210> 548

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 548

cacagtggat gagggaggag 20

<210> 549

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 549

acacagtgga tgagggagga 20

<210> 550

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 550

cacacagtgg atgagggagg 20

<210> 551

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 551

gcacacagtg gatgagggag 20

<210> 552

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 552

ugcacacagt ggatgaggga 20

<210> 553

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 553

gtgcacacag tggatgaggg 20

<210> 554

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 554

agtgcacaca gtggaugagg 20

<210> 555

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 555

aagtgcacac agtggaugag 20

<210> 556

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 556

gaagugcaca cagtggauga 20

<210> 557

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 557

acaguggatg agggaggagg 20

<210> 558

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 558

cacagtggat gagggaggag 20

<210> 559

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 559

acacagtgga tgagggagga 20

<210> 560

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 560

cacacagtgg atgagggagg 20

<210> 561

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 561

gcacacagtg gatgagggag 20

<210> 562

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 562

ugcacacagt ggatgaggga 20

<210> 563

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 563

gtgcacacag tggatgaggg 20

<210> 564

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 564

agtgcacaca gtggaugagg 20

<210> 565

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 565

aagtgcacac agtggaugag 20

<210> 566

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 566

gaagugcaca cagtggauga 20

<210> 567

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 567

uucuctattg cacauucc 18

<210> 568

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 568

uucuctattg cacauucc 18

<210> 569

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 569

uucuctattg cacauucc 18

<210> 570

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 570

uucuctattg cacauucc 18

<210> 571

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 571

agggcgcaga cttccaaagg 20

<210> 572

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 572

aagggcgcag acttccaaag 20

<210> 573

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 573

caagggcgca gacttccaaa 20

<210> 574

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 574

acaagggcgc agacttccaa 20

<210> 575

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 575

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 576

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 576

gcacaagggc gcagacttcc 20

<210> 577

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 577

ggcacaaggg cgcagacttc 20

<210> 578

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 578

gggcacaagg gcgcagactt 20

<210> 579

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 579

agggcacaag ggcgcagact 20

<210> 580

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 580

cagggcacaa gggcgcagac 20

<210> 581

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 581

agggcgcaga cttccaaagg 20

<210> 582

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 582

aagggcgcag acttccaaag 20

<210> 583

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 583

caagggcgca gacttccaaa 20

<210> 584

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 584

acaagggcgc agacttccaa 20

<210> 585

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 585

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 586

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 586

gcacaagggc gcagacttcc 20

<210> 587

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 587

ggcacaaggg cgcagacttc 20

<210> 588

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 588

gggcacaagg gcgcagactt 20

<210> 589

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 589

agggcacaag ggcgcagact 20

<210> 590

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 590

cagggcacaa gggcgcagac 20

<210> 591

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 591

agggcgcaga cttccaaagg 20

<210> 592

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 592

aagggcgcag acttccaaag 20

<210> 593

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 593

caagggcgca gacttccaaa 20

<210> 594

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 594

acaagggcgc agactuccaa 20

<210> 595

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 595

cacaagggcg cagacuucca 20

<210> 596

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 596

gcacaagggc gcagacuucc 20

<210> 597

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 597

ggcacaaggg cgcagacuuc 20

<210> 598

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 598

gggcacaagg gcgcagacut 20

<210> 599

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 599

agggcacaag ggcgcagact 20

<210> 600

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 600

cagggcacaa gggcgcagac 20

<210> 601

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 601

agggcgcaga cttccaaagg 20

<210> 602

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 602

aagggcgcag acttccaaag 20

<210> 603

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 603

caagggcgca gacttccaaa 20

<210> 604

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 604

acaagggcgc agacttccaa 20

<210> 605

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 605

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 606

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 606

gcacaagggc gcagacttcc 20

<210> 607

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 607

ggcacaaggg cgcagacttc 20

<210> 608

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 608

gggcacaagg gcgcagactt 20

<210> 609

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 609

agggcacaag ggcgcagact 20

<210> 610

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 610

cagggcacaa gggcgcagac 20

<210> 611

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 611

tgcagacuuc caaaggcucc gtu 23

<210> 612

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 612

tcgcagacuu ccaaaggcuc ctu 23

<210> 613

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 613

tgcgcagacu uccaaaggcu ctu 23

<210> 614

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 614

tggcgcagac uuccaaaggc utu 23

<210> 615

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 615

tgggcgcaga cuuccaaagg ctu 23

<210> 616

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 616

tagggcgcag acuuccaaag gtu 23

<210> 617

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 617

taagggcgca gacuuccaaa gtu 23

<210> 618

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 618

tcaagggcgc agacuuccaa atu 23

<210> 619

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 619

tacaagggcg cagacuucca atu 23

<210> 620

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 620

tcacaagggc gcagacuucc atu 23

<210> 621

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 621

tgcacaaggg cgcagacuuc ctu 23

<210> 622

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 622

tggcacaagg gcgcagacuu ctu 23

<210> 623

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 623

tgggcacaag ggcgcagacu utu 23

<210> 624

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 624

tagggcacaa gggcgcagac utu 23

<210> 625

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 625

tcagggcaca agggcgcaga ctu 23

<210> 626

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 626

tgcagggcac aagggcgcag atu 23

<210> 627

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 627

tggcagggca caagggcgca gtu 23

<210> 628

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 628

taggcagggc acaagggcgc atu 23

<210> 629

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 629

tgaggcaggg cacaagggcg ctu 23

<210> 630

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 630

tggaggcagg gcacaagggc gtu 23

<210> 631

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 631

tgcagacuuc caaaggcucc gtu 23

<210> 632

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 632

tcgcagacuu ccaaaggcuc ctu 23

<210> 633

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 633

tgcgcagacu uccaaaggcu ctu 23

<210> 634

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 634

tggcgcagac uuccaaaggc utu 23

<210> 635

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 635

tgggcgcaga cuuccaaagg ctu 23

<210> 636

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 636

tagggcgcag acuuccaaag gtu 23

<210> 637

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 637

taagggcgca gacuuccaaa gtu 23

<210> 638

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 638

tcaagggcgc agacuuccaa atu 23

<210> 639

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 639

tacaagggcg cagacuucca atu 23

<210> 640

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 640

tcacaagggc gcagacuucc atu 23

<210> 641

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 641

tgcacaaggg cgcagacuuc ctu 23

<210> 642

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 642

tggcacaagg gcgcagacuu ctu 23

<210> 643

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 643

tgggcacaag ggcgcagacu utu 23

<210> 644

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 644

tagggcacaa gggcgcagac utu 23

<210> 645

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 645

tcagggcaca agggcgcaga ctu 23

<210> 646

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 646

tgcagggcac aagggcgcag atu 23

<210> 647

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 647

tggcagggca caagggcgca gtu 23

<210> 648

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 648

taggcagggc acaagggcgc atu 23

<210> 649

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 649

tgaggcaggg cacaagggcg ctu 23

<210> 650

<211> 23

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 650

tggaggcagg gcacaagggc gtu 23

<210> 651

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 651

cccucaucua cugugugcac 20

<210> 652

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 652

cctcaggccc ccaggttacc 20

<210> 653

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 653

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 654

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 654

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 655

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 655

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 656

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 656

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 657

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 657

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 658

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 658

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 659

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 659

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 660

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 660

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 661

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 661

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 662

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 662

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 663

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 663

gttgatctgt agcaggcagc 20

<210> 664

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 664

gttgatctgt agcaggcagc 20

<210> 665

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 665

gttgatctgt agcaggcagc 20

<210> 666

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 666

gttgatctgt agcaggcagc 20

<210> 667

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 667

gttgatctgt agcaggcagc 20

<210> 668

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 668

gttgatctgt agcaggcagc 20

<210> 669

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 669

gttgatctgt agcaggcagc 20

<210> 670

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 670

gttgatctgt agcaggcagc 20

<210> 671

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 671

gttgatctgt agcaggcagc 20

<210> 672

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 672

gttgatctgt agcaggcagc 20

<210> 673

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 673

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 674

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 674

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 675

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 675

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 676

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 676

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 677

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 677

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 678

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 678

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 679

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 679

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 680

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 680

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 681

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 681

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 682

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 682

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 683

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 683

ggcacaaggg cgcagacttc 20

<210> 684

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 684

ggcacaaggg cgcagacuuc 20

<210> 685

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 685

ggcacaaggg cgcagacuuc 20

<210> 686

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 686

ggcacaaggg cgcagacttc 20

<210> 687

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 687

ggcacaaggg cgcagacttc 20

<210> 688

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 688

ggcacaaggg cgcagacttc 20

<210> 689

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 689

ggcacaaggg cgcagacuuc 20

<210> 690

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 690

ggcacaaggg cgcagacttc 20

<210> 691

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 691

ggcacaaggg cgcagacttc 20

<210> 692

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 692

ggcacaaggg cgcagacttc 20

<210> 693

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 693

ggcacaaggg cgcagacuuc 20

<210> 694

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 694

ggcacaaggg cgcagacuuc 20

<210> 695

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 695

ggcacaaggg cgcagacuuc 20

<210> 696

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 696

ggcacaaggg cgcagacuuc 20

<210> 697

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 697

ggcacaaggg cgcagacuuc 20

<210> 698

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 698

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 699

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 699

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 700

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 700

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 701

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 701

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 702

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 702

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 703

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 703

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 704

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 704

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 705

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 705

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 706

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 706

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 707

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 707

guugatctgt agcagcagcu 20

<210> 708

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 708

guugatctgt agcagcagcu 20

<210> 709

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 709

guugatctgt agcagcagcu 20

<210> 710

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 710

guugatctgt agcagcagcu 20

<210> 711

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 711

guugatctgt agcagcagcu 20

<210> 712

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 712

gagcggagaa accctccaaa 20

<210> 713

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 713

tgagcggaga aaccctccaa 20

<210> 714

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 714

ctgagcggag aaaccctcca 20

<210> 715

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 715

gctgagcgga gaaaccctcc 20

<210> 716

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 716

ggctgagcgg agaaaccctc 20

<210> 717

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 717

aggctgagcg gagaaaccct 20

<210> 718

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 718

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 719

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 719

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 720

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 720

ccaaggctga gcggagaaac 20

<210> 721

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 721

tccaaggctg agcggagaaa 20

<210> 722

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 722

gagcggagaa accctccaaa 20

<210> 723

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 723

tgagcggaga aacccuccaa 20

<210> 724

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 724

ctgagcggag aaacccucca 20

<210> 725

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 725

gctgagcgga gaaacccucc 20

<210> 726

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 726

ggctgagcgg agaaacccuc 20

<210> 727

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 727

aggctgagcg gagaaacccu 20

<210> 728

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 728

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 729

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 729

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 730

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 730

ccaaggctga gcggagaaac 20

<210> 731

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 731

tccaaggctg agcggagaaa 20

<210> 732

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 732

gagcggagaa accctccaaa 20

<210> 733

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 733

ugagcggaga aaccctccaa 20

<210> 734

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 734

cugagcggag aaaccctcca 20

<210> 735

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 735

gcugagcgga gaaaccctcc 20

<210> 736

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 736

ggcugagcgg agaaaccctc 20

<210> 737

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 737

aggctgagcg gagaaaccct 20

<210> 738

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 738

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 739

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 739

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 740

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 740

ccaaggctga gcggagaaac 20

<210> 741

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 741

uccaaggctg agcggagaaa 20

<210> 742

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 742

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 743

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 743

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 744

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 744

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 745

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 745

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 746

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 746

gtgcacacag tggatgaggg 20

<210> 747

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 747

ggcacaaggg cgcagacuuc 20

<210> 748

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 748

aactcaggcc ccctaccctg 20

<210> 749

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 749

gaggaggccg tgcagggctc 20

<210> 750

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 750

agaggaggcc gtgcagggct 20

<210> 751

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 751

tagaggaggc cgtgcagggc 20

<210> 752

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 752

atagaggagg ccgtgcaggg 20

<210> 753

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 753

catagaggag gccgtgcagg 20

<210> 754

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 754

acatagagga ggccgtgcag 20

<210> 755

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 755

cacatagagg aggccgtgca 20

<210> 756

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 756

gaggaggccg tgcagggctc 20

<210> 757

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 757

agaggaggcc gtgcagggct 20

<210> 758

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 758

tagaggaggc cgtgcagggc 20

<210> 759

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 759

atagaggagg ccgtgcaggg 20

<210> 760

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 760

catagaggag gccgtgcagg 20

<210> 761

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 761

acatagagga ggccgtgcag 20

<210> 762

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 762

cacatagagg aggccgtgca 20

<210> 763

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 763

gaggaggccg tgcagggcuc 20

<210> 764

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 764

agaggaggcc gtgcagggcu 20

<210> 765

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 765

tagaggaggc cgtgcagggc 20

<210> 766

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 766

atagaggagg ccgtgcaggg 20

<210> 767

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 767

catagaggag gccgtgcagg 20

<210> 768

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 768

acatagagga ggccgugcag 20

<210> 769

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 769

cacatagagg aggccgugca 20

<210> 770

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 770

gaggaggccg tgcagggctc 20

<210> 771

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 771

agaggaggcc gtgcagggct 20

<210> 772

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 772

uagaggaggc cgtgcagggc 20

<210> 773

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 773

auagaggagg ccgtgcaggg 20

<210> 774

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 774

cauagaggag gccgtgcagg 20

<210> 775

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 775

acauagagga ggccgtgcag 20

<210> 776

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 776

cacauagagg aggccgtgca 20

<210> 777

<211> 24

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 777

ggcacaaggg cgcagacttc caaa 24

<210> 778

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 778

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 779

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 779

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 780

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 780

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 781

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 781

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 782

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 782

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 783

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 783

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 784

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 784

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 785

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 785

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 786

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 786

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 787

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 787

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 788

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 788

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 789

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 789

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 790

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 790

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 791

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 791

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 792

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 792

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 793

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 793

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 794

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 794

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 795

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 795

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 796

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 796

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 797

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 797

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 798

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 798

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 799

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 799

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 800

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 800

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 801

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 801

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 802

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 802

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 803

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 803

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 804

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 804

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 805

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 805

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 806

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 806

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 807

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 807

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 808

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 808

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 809

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 809

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 810

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 810

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 811

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 811

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 812

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 812

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 813

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 813

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 814

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 814

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 815

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 815

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 816

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 816

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 817

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 817

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 818

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 818

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 819

<211> 24

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 819

ggcacaaggg cgcagacttc caaa 24

<210> 820

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 820

gttaccgcca tccccgccgu 20

<210> 821

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 821

gttaccgcca tccccgccgu 20

<210> 822

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 822

gttaccgcca tccccgccgu 20

<210> 823

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 823

gttaccgcca tccccgccgu 20

<210> 824

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 824

gttaccgcca tccccgccgu 20

<210> 825

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 825

gttaccgcca tccccgccgu 20

<210> 826

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 826

gttaccgcca tccccgccgu 20

<210> 827

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 827

gttaccgcca tccccgccgu 20

<210> 828

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 828

gttaccgcca tccccgccgu 20

<210> 829

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 829

gttaccgcca tccccgccgu 20

<210> 830

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 830

gttaccgcca tccccgccgt 20

<210> 831

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 831

gttaccgcca tccccgccgt 20

<210> 832

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 832

gttaccgcca tccccgccgt 20

<210> 833

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 833

gttaccgcca tccccgccgt 20

<210> 834

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 834

gttaccgcca tccccgccgt 20

<210> 835

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 835

gttaccgcca tccccgccgt 20

<210> 836

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 836

gttaccgcca tccccgccgt 20

<210> 837

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 837

gttaccgcca tccccgccgt 20

<210> 838

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 838

gttaccgcca tccccgccgt 20

<210> 839

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 839

gttaccgcca tccccgccgt 20

<210> 840

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 840

accgccatcc ccgccguagc 20

<210> 841

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 841

accgccatcc ccgccguagc 20

<210> 842

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 842

accgccatcc ccgccguagc 20

<210> 843

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 843

accgccatcc ccgccguagc 20

<210> 844

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 844

accgccatcc ccgccguagc 20

<210> 845

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 845

accgccatcc ccgccguagc 20

<210> 846

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 846

accgccatcc ccgccguagc 20

<210> 847

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 847

accgccatcc ccgccguagc 20

<210> 848

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 848

accgccatcc ccgccguagc 20

<210> 849

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 849

accgccatcc ccgccguagc 20

<210> 850

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 850

accgccatcc ccgccgtagc 20

<210> 851

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 851

accgccatcc ccgccgtagc 20

<210> 852

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 852

accgccatcc ccgccgtagc 20

<210> 853

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 853

accgccatcc ccgccgtagc 20

<210> 854

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 854

accgccatcc ccgccgtagc 20

<210> 855

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 855

accgccatcc ccgccgtagc 20

<210> 856

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 856

accgccatcc ccgccgtagc 20

<210> 857

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 857

accgccatcc ccgccgtagc 20

<210> 858

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 858

accgccatcc ccgccgtagc 20

<210> 859

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 859

accgccatcc ccgccgtagc 20

<210> 860

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 860

caagggcgca gacttccaaa 20

<210> 861

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 861

acaagggcgc agacttccaa 20

<210> 862

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 862

cacaagggcg cagactucca 20

<210> 863

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 863

gcacaagggc gcagacuucc 20

<210> 864

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 864

ggcacaaggg cgcagacuuc 20

<210> 865

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 865

caagggcgca gacttccaaa 20

<210> 866

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 866

acaagggcgc agacttccaa 20

<210> 867

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 867

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 868

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 868

gcacaagggc gcagacttcc 20

<210> 869

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 869

ggcacaaggg cgcagacttc 20

<210> 870

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 870

caagggcgca gacttccaaa 20

<210> 871

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 871

acatagagga ggccgtgcag 20

<210> 872

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 872

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 873

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 873

gcacaagggc gcagacttcc 20

<210> 874

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 874

ggcacaaggg cgcagacttc 20

<210> 875

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 875

caagggcaca gacttccaaa 20

<210> 876

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 876

acaagggcac agacttccaa 20

<210> 877

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 877

cacaagggca cagactucca 20

<210> 878

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 878

gcacaagggc acagacuucc 20

<210> 879

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 879

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 880

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 880

caagggcaca gacttccaaa 20

<210> 881

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 881

acaagggcac agacttccaa 20

<210> 882

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 882

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 883

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 883

gcacaagggc acagacttcc 20

<210> 884

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 884

ggcacaaggg cacagacttc 20

<210> 885

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 885

caagggcaca gacttccaaa 20

<210> 886

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 886

acaagggcac agacttccaa 20

<210> 887

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 887

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 888

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 888

gcacaagggc acagacttcc 20

<210> 889

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 889

ggcacaaggg cacagacttc 20

<210> 890

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 890

acaagggcgc agacttccaa 20

<210> 891

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 891

cacaagggcg cagactucca 20

<210> 892

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 892

cacaagggcg cagactucca 20

<210> 893

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 893

cacaagggca cagactucca 20

<210> 894

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 894

cacaagggca cagactucca 20

<210> 895

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 895

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 896

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 896

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 897

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 897

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 898

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 898

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 899

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 899

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 900

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 900

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 901

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 901

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 902

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 902

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 903

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 903

atctgtagca gcagcttctc 20

<210> 904

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 904

gatctgtagc agcagcttct 20

<210> 905

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 905

tgatctgtag cagcagcttc 20

<210> 906

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 906

ttgatctgta gcagcagctt 20

<210> 907

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 907

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 908

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 908

ggttgatctg tagcagcagc 20

<210> 909

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 909

gggttgatct gtagcagcag 20

<210> 910

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 910

atctgtagca gcagcttctc 20

<210> 911

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 911

gatctgtagc agcagcttct 20

<210> 912

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 912

tgatctgtag cagcagcttc 20

<210> 913

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 913

ttgatctgta gcagcagctt 20

<210> 914

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 914

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 915

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 915

ggttgatctg tagcagcagc 20

<210> 916

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 916

gggttgatct gtagcagcag 20

<210> 917

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 917

atctgtagca gcagcuucuc 20

<210> 918

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 918

gatctgtagc agcagcuucu 20

<210> 919

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 919

tgatctgtag cagcagcuuc 20

<210> 920

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 920

ttgatctgta gcagcagcuu 20

<210> 921

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 921

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 922

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 922

ggttgatctg tagcagcagc 20

<210> 923

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 923

gggttgatct gtagcagcag 20

<210> 924

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 924

atctgtagca gcagctucuc 20

<210> 925

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 925

gatctgtagc agcagcuucu 20

<210> 926

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 926

tgatctgtag cagcagcuuc 20

<210> 927

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 927

ttgatctgta gcagcagcuu 20

<210> 928

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 928

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 929

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 929

ggttgatctg tagcagcagc 20

<210> 930

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 930

gggttgatct gtagcagcag 20

<210> 931

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 931

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 932

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 932

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 933

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 933

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 934

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 934

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 935

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 935

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 936

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 936

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 937

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 937

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 938

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 938

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 939

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 939

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 940

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 940

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 941

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 941

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 942

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 942

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 943

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 943

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 944

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 944

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 945

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 945

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 946

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 946

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 947

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 947

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 948

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 948

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 949

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 949

tcctcccttc cctatgtacg 20

<210> 950

<211> 29

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 950

gagaagcugc ugcuacagau caaccccga 29

<210> 951

<211> 29

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 951

gagaagcugc ugcugcagau caaccccga 29

<210> 952

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 952

atctgtagca gcagcttctc 20

<210> 953

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 953

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 954

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 954

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 955

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 955

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 956

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 956

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 957

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 957

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 958

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 958

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 959

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 959

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 960

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 960

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 961

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 961

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 962

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 962

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 963

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 963

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 964

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 964

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 965

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 965

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 966

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 966

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 967

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 967

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 968

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 968

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 969

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 969

catatcccct cctctgccag 20

<210> 970

<211> 31

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 970

gccuuuggaa gucugugccc uugugcccug c 31

<210> 971

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 971

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 972

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 972

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 973

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 973

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 974

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 974

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 975

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 975

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 976

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 976

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 977

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 977

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 978

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 978

cacaagggca cagacttcca 20

<210> 979

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 979

cacaagggcg cagacuucca 20

<210> 980

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 980

cacaagggcg cagacuucca 20

<210> 981

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 981

cacaagggcg cagacuucca 20

<210> 982

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 982

cacaagggcg cagacuucca 20

<210> 983

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 983

cacaagggca cagacuucca 20

<210> 984

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 984

cacaagggca cagacuucca 20

<210> 985

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 985

cacaagggca cagacuucca 20

<210> 986

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 986

cacaagggca cagacuucca 20

<210> 987

<211> 5

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 987

cgcca 5

<210> 988

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 988

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 989

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 989

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 990

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 990

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 991

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 991

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 992

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 992

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 993

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 993

ccuucttcat tcttgcccaa 20

<210> 994

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 994

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 995

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 995

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 996

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 996

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 997

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 997

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 998

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 998

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 999

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 999

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1000

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1000

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1001

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1001

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1002

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1002

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1003

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1003

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1004

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1004

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1005

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1005

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1006

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1006

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1007

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1007

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1008

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1008

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1009

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1009

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1010

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1010

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1011

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1011

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1012

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1012

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1013

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1013

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1014

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1014

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1015

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1015

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1016

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1016

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1017

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1017

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1018

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1018

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1019

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1019

caagggcgca gacttccaaa 20

<210> 1020

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1020

cacaagggcg cagacuucca 20

<210> 1021

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1021

ggcacaaggg cgcagacuuc 20

<210> 1022

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1022

caagggcgca gacttccaaa 20

<210> 1023

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1023

cacaagggcg cagacuucca 20

<210> 1024

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1024

ggcacaaggg cgcagacuuc 20

<210> 1025

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1025

caagggcgca gacttccaaa 20

<210> 1026

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1026

cacaagggcg cagacuucca 20

<210> 1027

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1027

ggcacaaggg cgcagacuuc 20

<210> 1028

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1028

caagggcaca gacttccaaa 20

<210> 1029

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1029

caagggcaca gacttccaaa 20

<210> 1030

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1030

caagggcaca gacttccaaa 20

<210> 1031

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1031

caagggcaca gacttccaaa 20

<210> 1032

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1032

acaagggcac agactuccaa 20

<210> 1033

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1033

acaagggcac agactuccaa 20

<210> 1034

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1034

acaagggcac agactuccaa 20

<210> 1035

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1035

acaagggcac agactuccaa 20

<210> 1036

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1036

acaagggcac agactuccaa 20

<210> 1037

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1037

cacaagggca cagacuucca 20

<210> 1038

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1038

cacaagggca cagacuucca 20

<210> 1039

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1039

cacaagggca cagacuucca 20

<210> 1040

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1040

cacaagggca cagacuucca 20

<210> 1041

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1041

cacaagggca cagacuucca 20

<210> 1042

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1042

cacaagggca cagacuucca 20

<210> 1043

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1043

gcacaagggc acagacuucc 20

<210> 1044

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1044

gcacaagggc acagacuucc 20

<210> 1045

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1045

gcacaagggc acagacuucc 20

<210> 1046

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1046

gcacaagggc acagacuucc 20

<210> 1047

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1047

gcacaagggc acagacuucc 20

<210> 1048

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1048

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1049

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1049

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1050

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1050

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1051

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1051

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1052

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1052

guccucaatg ccccagggtt 20

<210> 1053

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1053

cagtttgggc attttgtccg 20

<210> 1054

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1054

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1055

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1055

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1056

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1056

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1057

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1057

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1058

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1058

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1059

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1059

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1060

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1060

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1061

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1061

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1062

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1062

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1063

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1063

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1064

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1064

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1065

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1065

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1066

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1066

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1067

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1067

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1068

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1068

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1069

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1069

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1070

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1070

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1071

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1071

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1072

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1072

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1073

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1073

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1074

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1074

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1075

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1075

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1076

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1076

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1077

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1077

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1078

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1078

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1079

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1079

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1080

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1080

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1081

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1081

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1082

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1082

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1083

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1083

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1084

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1084

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1085

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1085

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1086

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1086

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1087

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1087

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1088

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1088

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1089

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1089

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1090

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1090

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1091

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1091

uugatctgta gcagcagctt 20

<210> 1092

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1092

uugauctgta gcagcagctt 20

<210> 1093

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1093

uugatctgta gcagcagctt 20

<210> 1094

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1094

uugatctgta gcagcagctt 20

<210> 1095

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1095

uugatctgta gcagcagctt 20

<210> 1096

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1096

uugauctgta gcagcagctt 20

<210> 1097

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1097

uugauctgta gcagcagctt 20

<210> 1098

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1098

uugatctgta gcagcagctt 20

<210> 1099

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1099

uugatctgta gcagcagctt 20

<210> 1100

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1100

uugauctgta gcagcagctt 20

<210> 1101

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1101

uugatctgta gcagcagctt 20

<210> 1102

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1102

uugatctgta gcagcagctt 20

<210> 1103

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1103

uugatctgta gcagcagctt 20

<210> 1104

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1104

uugauctgta gcagcagctt 20

<210> 1105

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1105

uugauctgta gcagcagctt 20

<210> 1106

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1106

uugatctgta gcagcagctt 20

<210> 1107

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1107

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1108

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1108

gcacaagggc acagacuucc 20

<210> 1109

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1109

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1110

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1110

gcacaagggc acagacuucc 20

<210> 1111

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1111

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1112

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1112

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1113

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1113

gcacaagggc acagacuucc 20

<210> 1114

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1114

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1115

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1115

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1116

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1116

gcacaagggc acagacuucc 20

<210> 1117

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1117

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1118

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1118

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1119

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1119

gacctctgtg aaagccaaca 20

<210> 1120

<211> 17

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1120

acaagggcac agacuuc 17

<210> 1121

<211> 19

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1121

ggcacaaggg cacagacuu 19

<210> 1122

<211> 18

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1122

ggcacaaggg cacagacu 18

<210> 1123

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1123

ggcacaaggg cacagac 17

<210> 1124

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1124

cacacagtag atgaggg 17

<210> 1125

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1125

gugcacacag tagatgagg 19

<210> 1126

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1126

gugcacacag tagatgag 18

<210> 1127

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1127

gugcacacag tagatga 17

<210> 1128

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1128

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1129

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1129

accgccatcc ccgccguagc 20

<210> 1130

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1130

gttaccgcca tccccgccgu 20

<210> 1131

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1131

gttaccgcca tccccgccgu 20

<210> 1132

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1132

accgccatcc ccgccguagc 20

<210> 1133

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1133

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1134

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1134

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1135

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1135

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1136

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1136

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1137

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1137

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1138

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1138

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1139

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1139

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1140

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1140

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1141

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1141

cagcacgcag gccaggggcg 20

<210> 1142

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1142

cagcacgcag gccaggggcg 20

<210> 1143

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1143

cagcacgcag gccaggggcg 20

<210> 1144

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1144

cagcacgcag gccaggggcg 20

<210> 1145

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1145

cagcacgcag gccaggggcg 20

<210> 1146

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1146

cagcacgcag gccaggggcg 20

<210> 1147

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1147

cagcacgcag gccaggggcg 20

<210> 1148

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1148

cagcacgcag gccaggggcg 20

<210> 1149

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1149

ugcccagcac gcaggccagg 20

<210> 1150

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1150

ugcccagcac gcaggccagg 20

<210> 1151

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1151

ugcccagcac gcaggccagg 20

<210> 1152

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1152

ugcccagcac gcaggccagg 20

<210> 1153

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1153

ugcccagcac gcaggccagg 20

<210> 1154

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1154

ugcccagcac gcaggccagg 20

<210> 1155

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1155

ugcccagcac gcaggccagg 20

<210> 1156

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1156

ugcccagcac gcaggccagg 20

<210> 1157

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1157

guugauctgt agcagcagct 20

<210> 1158

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1158

guugauctgt agcagcagct 20

<210> 1159

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1159

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1160

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1160

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1161

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1161

guugauctgt agcagcagct 20

<210> 1162

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1162

guugauctgt agcagcagct 20

<210> 1163

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1163

guugauctgt agcagcagct 20

<210> 1164

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1164

guugauctgt agcagcagct 20

<210> 1165

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1165

guugauctgt agcagcagct 20

<210> 1166

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1166

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1167

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1167

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1168

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1168

guugauctgt agcagcagct 20

<210> 1169

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1169

guugauctgt agcagcagct 20

<210> 1170

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1170

guugauctgt agcagcagct 20

<210> 1171

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1171

guugauctgt agcagcagct 20

<210> 1172

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1172

guugauctgt agcagcagct 20

<210> 1173

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1173

guugauctgt agcagcagct 20

<210> 1174

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1174

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1175

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1175

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1176

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1176

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1177

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1177

guugauctgt agcagcagct 20

<210> 1178

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1178

guugauctgt agcagcagct 20

<210> 1179

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1179

guugauctgt agcagcagct 20

<210> 1180

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1180

guugauctgt agcagcagct 20

<210> 1181

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1181

guugauctgt agcagcagct 20

<210> 1182

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1182

guugauctgt agcagcagct 20

<210> 1183

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1183

guugatttgt agcagcagct 20

<210> 1184

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1184

guugatctgt agtagcagct 20

<210> 1185

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1185

guugauttgt agcagcagct 20

<210> 1186

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1186

guugauctgt agtagcagct 20

<210> 1187

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1187

guugauutgt agcagcagct 20

<210> 1188

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1188

guugauctgt agtagcagct 20

<210> 1189

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1189

guugatttgt agcagcagct 20

<210> 1190

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1190

guugatctgt agtagcagct 20

<210> 1191

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1191

guugatttgt agcagcagct 20

<210> 1192

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1192

guugatctgt agtagcagct 20

<210> 1193

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1193

guugauutgt agcagcagct 20

<210> 1194

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1194

guugauctgt agtagcagct 20

<210> 1195

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1195

guugauttgt agcagcagct 20

<210> 1196

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1196

guugauctgt agtagcagct 20

<210> 1197

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1197

guugauutgt agcagcagct 20

<210> 1198

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1198

guugauctgt agtagcagct 20

<210> 1199

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1199

guugatttgt agcagcagct 20

<210> 1200

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1200

guugatctgt agtagcagct 20

<210> 1201

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1201

guugauttgt agcagcagct 20

<210> 1202

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1202

guugauctgt agtagcagct 20

<210> 1203

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1203

guugauutgt agcagcagct 20

<210> 1204

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1204

guugauctgt agtagcagct 20

<210> 1205

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1205

guugatttgt agcagcagct 20

<210> 1206

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1206

guugatctgt agtagcagct 20

<210> 1207

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1207

guugatttgt agcagcagct 20

<210> 1208

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1208

guugatctgt agtagcagct 20

<210> 1209

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1209

guugauutgt agcagcagct 20

<210> 1210

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1210

guugauctgt agtagcagct 20

<210> 1211

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1211

guugauttgt agcagcagct 20

<210> 1212

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1212

guugauctgt agtagcagct 20

<210> 1213

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1213

guugauutgt agcagcagct 20

<210> 1214

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1214

guugauctgt agtagcagct 20

<210> 1215

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1215

guugatttgt agcagcagct 20

<210> 1216

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1216

guugatctgt agtagcagct 20

<210> 1217

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1217

guugauttgt agcagcagct 20

<210> 1218

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1218

guugauctgt agtagcagct 20

<210> 1219

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1219

guugauutgt agcagcagct 20

<210> 1220

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1220

guugauctgt agtagcagct 20

<210> 1221

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1221

guugauutgt agcagcagct 20

<210> 1222

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1222

guugauctgt agtagcagct 20

<210> 1223

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1223

guugatttgt agcagcagct 20

<210> 1224

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1224

guugatctgt agtagcagct 20

<210> 1225

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1225

guugatttgt agcagcagct 20

<210> 1226

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1226

guugatctgt agtagcagct 20

<210> 1227

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1227

guugatttgt agcagcagct 20

<210> 1228

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1228

guugatctgt agtagcagct 20

<210> 1229

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1229

guugauutgt agcagcagct 20

<210> 1230

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1230

guugauctgt agtagcagct 20

<210> 1231

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1231

guugauutgt agcagcagct 20

<210> 1232

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1232

guugauctgt agtagcagct 20

<210> 1233

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1233

guugauttgt agcagcagct 20

<210> 1234

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1234

guugauctgt agtagcagct 20

<210> 1235

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1235

guugauttgt agcagcagct 20

<210> 1236

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1236

guugauctgt agtagcagct 20

<210> 1237

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1237

guugauutgt agcagcagct 20

<210> 1238

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1238

guugauctgt agtagcagct 20

<210> 1239

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1239

guugauutgt agcagcagct 20

<210> 1240

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1240

guugauctgt agtagcagct 20

<210> 1241

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1241

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1242

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1242

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1243

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1243

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1244

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1244

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1245

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1245

guugatctgt agtagcagct 20

<210> 1246

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1246

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1247

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1247

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1248

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1248

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1249

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1249

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1250

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1250

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1251

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1251

guugatctgt agtagcagct 20

<210> 1252

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1252

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1253

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1253

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1254

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1254

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1255

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1255

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1256

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1256

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1257

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1257

guugatctgt agtagcagct 20

<210> 1258

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1258

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1259

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1259

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1260

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1260

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1261

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1261

guugatctgt agtagcagct 20

<210> 1262

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1262

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1263

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1263

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1264

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1264

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1265

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1265

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1266

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1266

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1267

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1267

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1268

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1268

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1269

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1269

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1270

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1270

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1271

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1271

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1272

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1272

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1273

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1273

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1274

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1274

ttgatctgta gcagcagcuu 20

<210> 1275

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1275

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1276

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1276

ggttgatctg tagcagcagc 20

<210> 1277

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1277

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1278

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1278

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1279

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1279

cacaagggcg cagacttcca 20

<210> 1280

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1280

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1281

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1281

guugatctgt agtagcagct 20

<210> 1282

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1282

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1283

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1283

guugatctgt agtagcagct 20

<210> 1284

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1284

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1285

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1285

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1286

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1286

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1287

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1287

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1288

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1288

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1289

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1289

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1290

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1290

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1291

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1291

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1292

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1292

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1293

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1293

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1294

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1294

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1295

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1295

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1296

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1296

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1297

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1297

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1298

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1298

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1299

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1299

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1300

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1300

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1301

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1301

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1302

<211> 21

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1302

ggcacaaagg gcacagacuu c 21

<210> 1303

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1303

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1304

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1304

gugcaacaca gtagatgagg g 21

<210> 1305

<211> 15

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1305

aagggcacag acuuc 15

<210> 1306

<211> 14

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1306

agggcacaga cuuc 14

<210> 1307

<211> 13

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1307

gggcacagac uuc 13

<210> 1308

<211> 12

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1308

ggcacagacu uc 12

<210> 1309

<211> 11

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1309

gcacagacuu c 11

<210> 1310

<211> 10

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1310

cacagacuuc 10

<210> 1311

<211> 9

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1311

acagacuuc 9

<210> 1312

<211> 8

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1312

cagacuuc 8

<210> 1313

<211> 7

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1313

agacuuc 7

<210> 1314

<211> 6

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1314

gacuuc 6

<210> 1315

<211> 16

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1315

caagggcaca gacuuc 16

<210> 1316

<211> 15

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1316

aagggcacag acuuc 15

<210> 1317

<211> 14

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1317

agggcacaga cuuc 14

<210> 1318

<211> 13

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1318

gggcacagac uuc 13

<210> 1319

<211> 12

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1319

ggcacagacu uc 12

<210> 1320

<211> 11

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1320

gcacagacuu c 11

<210> 1321

<211> 10

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1321

cacagacuuc 10

<210> 1322

<211> 9

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1322

acagacuuc 9

<210> 1323

<211> 8

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1323

cagacuuc 8

<210> 1324

<211> 7

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1324

agacuuc 7

<210> 1325

<211> 6

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1325

gacuuc 6

<210> 1326

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1326

tctccattct atcttauguu 20

<210> 1327

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1327

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1328

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1328

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1329

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1329

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1330

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1330

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1331

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1331

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1332

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1332

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1333

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1333

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1334

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1334

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1335

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1335

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1336

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1336

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1337

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1337

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1338

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1338

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1339

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1339

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1340

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1340

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1341

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1341

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1342

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1342

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1343

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1343

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1344

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1344

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1345

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1345

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1346

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1346

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1347

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1347

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1348

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1348

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1349

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1349

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1350

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1350

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1351

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1351

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1352

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1352

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1353

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1353

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1354

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1354

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1355

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1355

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1356

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1356

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1357

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1357

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1358

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1358

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1359

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1359

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1360

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1360

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1361

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1361

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1362

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1362

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1363

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1363

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1364

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1364

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1365

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1365

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1366

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1366

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1367

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1367

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1368

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1368

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1369

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1369

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1370

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1370

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1371

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1371

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1372

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1372

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1373

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1373

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1374

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1374

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1375

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1375

ugcacacagt agatgaggga 20

<210> 1376

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1376

ugcacacagt agatgaggga 20

<210> 1377

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1377

ugcacacagt agatgaggga 20

<210> 1378

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1378

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1379

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1379

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1380

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1380

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1381

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1381

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1382

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1382

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1383

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1383

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1384

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1384

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1385

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1385

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1386

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1386

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1387

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1387

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1388

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1388

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1389

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1389

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1390

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1390

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1391

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1391

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1392

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1392

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1393

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1393

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1394

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1394

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1395

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1395

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1396

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1396

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1397

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1397

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1398

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1398

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1399

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1399

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1400

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1400

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1401

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1401

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1402

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1402

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1403

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1403

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1404

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1404

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1405

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1405

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1406

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1406

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1407

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1407

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1408

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1408

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1409

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1409

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1410

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1410

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1411

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1411

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1412

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1412

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1413

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1413

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1414

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1414

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1415

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1415

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1416

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1416

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1417

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1417

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1418

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1418

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1419

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1419

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1420

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1420

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1421

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1421

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1422

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1422

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1423

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1423

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1424

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1424

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1425

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1425

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1426

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1426

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1427

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1427

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1428

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1428

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1429

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1429

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1430

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1430

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1431

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1431

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1432

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1432

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1433

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1433

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1434

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1434

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1435

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1435

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1436

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1436

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1437

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1437

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1438

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1438

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1439

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1439

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1440

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1440

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1441

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1441

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1442

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1442

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1443

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1443

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1444

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1444

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1445

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1445

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1446

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1446

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1447

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1447

ugcacacagt agatgaggga 20

<210> 1448

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1448

ugcacacagt agatgaggga 20

<210> 1449

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1449

ugcacacagt agatgaggga 20

<210> 1450

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1450

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1451

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1451

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1452

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1452

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1453

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1453

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1454

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1454

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1455

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1455

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1456

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1456

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1457

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1457

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1458

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1458

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1459

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1459

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1460

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1460

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1461

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1461

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1462

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1462

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1463

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1463

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1464

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1464

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1465

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1465

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1466

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1466

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1467

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1467

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1468

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1468

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1469

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1469

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1470

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1470

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1471

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1471

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1472

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1472

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1473

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1473

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1474

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1474

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1475

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1475

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1476

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1476

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1477

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1477

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1478

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1478

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1479

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1479

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1480

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1480

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1481

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1481

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1482

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1482

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1483

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1483

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1484

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1484

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1485

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1485

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 1486

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1486

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1487

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1487

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1488

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1488

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 1489

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1489

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1490

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1490

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1491

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1491

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1492

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1492

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1493

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1493

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1494

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1494

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 1495

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1495

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1496

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1496

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1497

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1497

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 1498

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1498

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1499

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1499

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1500

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1500

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 1501

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1501

ugcacacagt agatgaggga 20

<210> 1502

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1502

ugcacacagt agatgaggga 20

<210> 1503

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1503

ugcacacagt agatgaggga 20

<210> 1504

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1504

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1505

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1505

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1506

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1506

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1507

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1507

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1508

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1508

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1509

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1509

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1510

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1510

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1511

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1511

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1512

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1512

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1513

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1513

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1514

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1514

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1515

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1515

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1516

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1516

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 1517

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1517

ctcagtaaca ttgacaccac 20

<210> 1518

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1518

ctcgactaaa gcaggatttc 20

<210> 1519

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1519

gcagggttac cgccatcccc 20

<210> 1520

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1520

cgagacagtc gcttccactt 20

<210> 1521

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1521

acacagtaga tgaggg 16

<210> 1522

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1522

cacagtagat gaggg 15

<210> 1523

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1523

acagtagatg aggg 14

<210> 1524

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1524

cagtagatga ggg 13

<210> 1525

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1525

agtagatgag gg 12

<210> 1526

<211> 11

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1526

gtagatgagg g 11

<210> 1527

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1527

tagatgaggg 10

<210> 1528

<211> 9

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1528

agatgaggg 9

<210> 1529

<211> 8

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1529

gatgaggg 8

<210> 1530

<211> 7

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1530

atgaggg 7

<210> 1531

<211> 6

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1531

tgaggg 6

<210> 1532

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1532

acacagtaga tgaggg 16

<210> 1533

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1533

cacagtagat gaggg 15

<210> 1534

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1534

acagtagatg aggg 14

<210> 1535

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1535

cagtagatga ggg 13

<210> 1536

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1536

agtagatgag gg 12

<210> 1537

<211> 11

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1537

gtagatgagg g 11

<210> 1538

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1538

tagatgaggg 10

<210> 1539

<211> 9

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1539

agatgaggg 9

<210> 1540

<211> 8

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1540

gatgaggg 8

<210> 1541

<211> 7

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1541

atgaggg 7

<210> 1542

<211> 6

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1542

tgaggg 6

<210> 1543

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1543

ctcgactaaa gcaggatttc 20

<210> 1544

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1544

ctcgactaaa gcaggatttc 20

<210> 1545

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1545

ctcagtaaca ttgacaccac 20

<210> 1546

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1546

ctcagtaaca ttgacaccac 20

<210> 1547

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1547

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1548

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1548

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1549

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1549

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1550

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1550

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1551

<211> 19

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1551

ggcaaagggc acagacuuc 19

<210> 1552

<211> 19

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1552

ggcacaaggg cacagacuc 19

<210> 1553

<211> 19

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1553

ggacaagggc acagacuuc 19

<210> 1554

<211> 19

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1554

ggcacaaggg cacagauuc 19

<210> 1555

<211> 21

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1555

ggcacaaggg ccacagacuu c 21

<210> 1556

<211> 21

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1556

ggcacaaggg caccagacuu c 21

<210> 1557

<211> 21

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1557

ggcacaaggg caacagacuu c 21

<210> 1558

<211> 21

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1558

ggcacaaggg cacaagacuu c 21

<210> 1559

<211> 21

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1559

ggcaccaagg gcacagacuu c 21

<210> 1560

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1560

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1561

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1561

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1562

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1562

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1563

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1563

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1564

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1564

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1565

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1565

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1566

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1566

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1567

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1567

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1568

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1568

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1569

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1569

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1570

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1570

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1571

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1571

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 1572

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1572

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1573

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1573

acacagtaga tgaggg 16

<210> 1574

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1574

cacagtagat gaggg 15

<210> 1575

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1575

acagtagatg aggg 14

<210> 1576

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1576

cagtagatga ggg 13

<210> 1577

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1577

agtagatgag gg 12

<210> 1578

<211> 11

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1578

gtagatgagg g 11

<210> 1579

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1579

tagatgaggg 10

<210> 1580

<211> 9

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1580

agatgaggg 9

<210> 1581

<211> 8

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1581

gatgaggg 8

<210> 1582

<211> 7

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1582

atgaggg 7

<210> 1583

<211> 6

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1583

tgaggg 6

<210> 1584

<211> 2

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1584

gg 2

<210> 1585

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1585

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1586

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1586

acacagtaga tgaggg 16

<210> 1587

<211> 15

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1587

cacagtagat gaggg 15

<210> 1588

<211> 14

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1588

acagtagatg aggg 14

<210> 1589

<211> 13

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1589

cagtagatga ggg 13

<210> 1590

<211> 12

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1590

agtagatgag gg 12

<210> 1591

<211> 11

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1591

gtagatgagg g 11

<210> 1592

<211> 10

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1592

tagatgaggg 10

<210> 1593

<211> 9

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1593

agatgaggg 9

<210> 1594

<211> 8

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1594

gatgaggg 8

<210> 1595

<211> 7

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1595

atgaggg 7

<210> 1596

<211> 6

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1596

tgaggg 6

<210> 1597

<211> 2

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1597

gg 2

<210> 1598

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1598

gugcacaaca gtagatgagg g 21

<210> 1599

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1599

gugcacacaa gtagatgagg g 21

<210> 1600

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1600

gugcacacag taagatgagg g 21

<210> 1601

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1601

gugcacacag tagaatgagg g 21

<210> 1602

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1602

gugcaccaca gtagatgagg g 21

<210> 1603

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1603

gugcacacca gtagatgagg g 21

<210> 1604

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1604

gugcaacaca gtagatgagg g 21

<210> 1605

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1605

gugccacagt agatgaggg 19

<210> 1606

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1606

gugcaccagt agatgaggg 19

<210> 1607

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1607

gugcacacgt agatgaggg 19

<210> 1608

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1608

gugcacacag tgatgaggg 19

<210> 1609

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1609

gugcacacag tagtgaggg 19

<210> 1610

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1610

gugcaacagt agatgaggg 19

<210> 1611

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1611

gugcacaagt agatgaggg 19

<210> 1612

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1612

acacagtaga tgaggg 16

<210> 1613

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1613

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1614

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1614

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1615

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1615

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1616

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1616

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1617

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1617

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1618

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1618

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1619

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1619

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1620

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1620

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1621

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1621

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1622

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1622

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1623

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1623

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1624

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1624

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 1625

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1625

gatctgaagc agcagcttct 20

<210> 1626

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1626

gatctgaagc agcagcttct 20

<210> 1627

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1627

gatctgaagc agcagcttct 20

<210> 1628

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1628

tgatctgaag cagcagcttc 20

<210> 1629

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1629

tgatctgaag cagcagcttc 20

<210> 1630

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1630

tgatctgaag cagcagcttc 20

<210> 1631

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1631

ttgatctgaa gcagcagctt 20

<210> 1632

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1632

ttgatctgaa gcagcagctt 20

<210> 1633

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1633

ttgatctgaa gcagcagctt 20

<210> 1634

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1634

gttgatctga agcagcagct 20

<210> 1635

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1635

gttgatctga agcagcagct 20

<210> 1636

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1636

gttgatctga agcagcagct 20

<210> 1637

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1637

ggttgatctg aagcagcagc 20

<210> 1638

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1638

ggttgatctg aagcagcagc 20

<210> 1639

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1639

ggttgatctg aagcagcagc 20

<210> 1640

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1640

gggttgatct gaagcagcag 20

<210> 1641

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1641

gggttgatct gaagcagcag 20

<210> 1642

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1642

gggttgatct gaagcagcag 20

<210> 1643

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1643

ggggttgatc tgaagcagca 20

<210> 1644

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1644

ggggttgatc tgaagcagca 20

<210> 1645

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1645

ggggttgatc tgaagcagca 20

<210> 1646

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1646

cggggttgat ctgaagcagc 20

<210> 1647

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1647

cggggttgat ctgaagcagc 20

<210> 1648

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1648

cggggttgat ctgaagcagc 20

<210> 1649

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1649

gatctgaagc agcagcuucu 20

<210> 1650

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1650

gatctgaagc agcagcuucu 20

<210> 1651

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1651

gatctgaagc agcagcuucu 20

<210> 1652

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1652

tgatctgaag cagcagcuuc 20

<210> 1653

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1653

tgatctgaag cagcagcuuc 20

<210> 1654

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1654

tgatctgaag cagcagcuuc 20

<210> 1655

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1655

ttgatctgaa gcagcagcuu 20

<210> 1656

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1656

ttgatctgaa gcagcagcuu 20

<210> 1657

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1657

ttgatctgaa gcagcagcuu 20

<210> 1658

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1658

gttgatctga agcagcagcu 20

<210> 1659

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1659

gttgatctga agcagcagcu 20

<210> 1660

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1660

gttgatctga agcagcagcu 20

<210> 1661

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1661

ggttgatctg aagcagcagc 20

<210> 1662

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1662

ggttgatctg aagcagcagc 20

<210> 1663

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1663

ggttgatctg aagcagcagc 20

<210> 1664

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1664

gggttgatct gaagcagcag 20

<210> 1665

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1665

gggttgatct gaagcagcag 20

<210> 1666

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1666

gggttgatct gaagcagcag 20

<210> 1667

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1667

ggggttgatc tgaagcagca 20

<210> 1668

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1668

ggggttgatc tgaagcagca 20

<210> 1669

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1669

ggggttgatc tgaagcagca 20

<210> 1670

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1670

cggggttgat ctgaagcagc 20

<210> 1671

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1671

cggggttgat ctgaagcagc 20

<210> 1672

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1672

cggggttgat ctgaagcagc 20

<210> 1673

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1673

gaucugaagc agcagcttct 20

<210> 1674

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1674

gaucugaagc agcagcttct 20

<210> 1675

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1675

gaucugaagc agcagcttct 20

<210> 1676

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1676

ugauctgaag cagcagcttc 20

<210> 1677

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1677

ugauctgaag cagcagcttc 20

<210> 1678

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1678

ugauctgaag cagcagcttc 20

<210> 1679

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1679

uugauctgaa gcagcagctt 20

<210> 1680

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1680

uugauctgaa gcagcagctt 20

<210> 1681

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1681

uugauctgaa gcagcagctt 20

<210> 1682

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1682

guugatctga agcagcagct 20

<210> 1683

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1683

guugatctga agcagcagct 20

<210> 1684

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1684

guugatctga agcagcagct 20

<210> 1685

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1685

gguugatctg aagcagcagc 20

<210> 1686

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1686

gguugatctg aagcagcagc 20

<210> 1687

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1687

gguugatctg aagcagcagc 20

<210> 1688

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1688

ggguugatct gaagcagcag 20

<210> 1689

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1689

ggguugatct gaagcagcag 20

<210> 1690

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1690

ggguugatct gaagcagcag 20

<210> 1691

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1691

ggggutgatc tgaagcagca 20

<210> 1692

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1692

ggggutgatc tgaagcagca 20

<210> 1693

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1693

ggggutgatc tgaagcagca 20

<210> 1694

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1694

cggggttgat ctgaagcagc 20

<210> 1695

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1695

cggggttgat ctgaagcagc 20

<210> 1696

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1696

cggggttgat ctgaagcagc 20

<210> 1697

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1697

gatctgtagc agcagcttct 20

<210> 1698

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1698

gatctgtagc agcagcttct 20

<210> 1699

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1699

gatctgtagc agcagcttct 20

<210> 1700

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1700

tgatctgtag cagcagcttc 20

<210> 1701

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1701

tgatctgtag cagcagcttc 20

<210> 1702

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1702

tgatctgtag cagcagcttc 20

<210> 1703

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1703

ttgatctgta gcagcagctt 20

<210> 1704

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1704

ttgatctgta gcagcagctt 20

<210> 1705

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1705

ttgatctgta gcagcagctt 20

<210> 1706

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1706

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 1707

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1707

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 1708

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1708

ggttgatctg tagcagcagc 20

<210> 1709

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1709

ggttgatctg tagcagcagc 20

<210> 1710

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1710

ggttgatctg tagcagcagc 20

<210> 1711

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1711

gggttgatct gtagcagcag 20

<210> 1712

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1712

gggttgatct gtagcagcag 20

<210> 1713

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1713

gggttgatct gtagcagcag 20

<210> 1714

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1714

ggggttgatc tgtagcagca 20

<210> 1715

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1715

ggggttgatc tgtagcagca 20

<210> 1716

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1716

ggggttgatc tgtagcagca 20

<210> 1717

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1717

cggggttgat ctgtagcagc 20

<210> 1718

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1718

cggggttgat ctgtagcagc 20

<210> 1719

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1719

cggggttgat ctgtagcagc 20

<210> 1720

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1720

gatctgtagc agcagcuucu 20

<210> 1721

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1721

gatctgtagc agcagcuucu 20

<210> 1722

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1722

gatctgtagc agcagcuucu 20

<210> 1723

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1723

tgatctgtag cagcagcuuc 20

<210> 1724

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1724

tgatctgtag cagcagcuuc 20

<210> 1725

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1725

tgatctgtag cagcagcuuc 20

<210> 1726

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1726

ttgatctgta gcagcagcuu 20

<210> 1727

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1727

ttgatctgta gcagcagcuu 20

<210> 1728

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1728

ttgatctgta gcagcagcuu 20

<210> 1729

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1729

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1730

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1730

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1731

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1731

gttgatctgt agcagcagcu 20

<210> 1732

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1732

ggttgatctg tagcagcagc 20

<210> 1733

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1733

ggttgatctg tagcagcagc 20

<210> 1734

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1734

ggttgatctg tagcagcagc 20

<210> 1735

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1735

gggttgatct gtagcagcag 20

<210> 1736

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1736

gggttgatct gtagcagcag 20

<210> 1737

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1737

gggttgatct gtagcagcag 20

<210> 1738

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1738

ggggttgatc tgtagcagca 20

<210> 1739

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1739

ggggttgatc tgtagcagca 20

<210> 1740

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1740

ggggttgatc tgtagcagca 20

<210> 1741

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1741

cggggttgat ctgtagcagc 20

<210> 1742

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1742

cggggttgat ctgtagcagc 20

<210> 1743

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1743

cggggttgat ctgtagcagc 20

<210> 1744

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1744

gaucugtagc agcagcttct 20

<210> 1745

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1745

gaucugtagc agcagcttct 20

<210> 1746

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1746

gaucugtagc agcagcttct 20

<210> 1747

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1747

ugauctgtag cagcagcttc 20

<210> 1748

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1748

ugauctgtag cagcagcttc 20

<210> 1749

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1749

ugauctgtag cagcagcttc 20

<210> 1750

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1750

uugauctgta gcagcagctt 20

<210> 1751

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1751

uugauctgta gcagcagctt 20

<210> 1752

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1752

uugauctgta gcagcagctt 20

<210> 1753

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1753

gguugatctg tagcagcagc 20

<210> 1754

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1754

gguugatctg tagcagcagc 20

<210> 1755

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1755

gguugatctg tagcagcagc 20

<210> 1756

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1756

ggguugatct gtagcagcag 20

<210> 1757

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1757

ggguugatct gtagcagcag 20

<210> 1758

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1758

ggguugatct gtagcagcag 20

<210> 1759

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1759

ggggutgatc tgtagcagca 20

<210> 1760

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1760

ggggutgatc tgtagcagca 20

<210> 1761

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1761

ggggutgatc tgtagcagca 20

<210> 1762

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1762

cggggttgat ctgtagcagc 20

<210> 1763

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1763

cggggttgat ctgtagcagc 20

<210> 1764

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1764

cggggttgat ctgtagcagc 20

<210> 1765

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1765

cggggttgat ctgtagcagc 20

<210> 1766

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1766

cggggttgat ctgtagcagc 20

<210> 1767

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1767

cggggttgat ctgtagcagc 20

<210> 1768

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1768

cggggttgat ctgtagcagc 20

<210> 1769

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1769

cggggttgat ctgtagcagc 20

<210> 1770

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1770

cggggttgat ctgtagcagc 20

<210> 1771

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1771

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1772

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1772

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1773

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1773

accgccatcc ccgccguagc 20

<210> 1774

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1774

accgccatcc ccgccguagc 20

<210> 1775

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1775

accgccatcc ccgccguagc 20

<210> 1776

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1776

accgccatcc ccgccguagc 20

<210> 1777

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1777

accgccatcc ccgccguagc 20

<210> 1778

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1778

gttaccgcca tccccgccgu 20

<210> 1779

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1779

gttaccgcca tccccgccgu 20

<210> 1780

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1780

gttaccgcca tccccgccgu 20

<210> 1781

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1781

gttaccgcca tccccgccgu 20

<210> 1782

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1782

gttaccgcca tccccgccgu 20

<210> 1783

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1783

ggctctgggt tgctggguca 20

<210> 1784

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1784

ggctctgggt tgctggguca 20

<210> 1785

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1785

ggctctgggt tgctggguca 20

<210> 1786

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1786

ggctctgggt tgctggguca 20

<210> 1787

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1787

ggtguccctc atgggcucug 20

<210> 1788

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1788

ggtguccctc atgggcucug 20

<210> 1789

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1789

ggtguccctc atgggcucug 20

<210> 1790

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1790

ggtguccctc atgggcucug 20

<210> 1791

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1791

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1792

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1792

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1793

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1793

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1794

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1794

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1795

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1795

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1796

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1796

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1797

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1797

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1798

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1798

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1799

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1799

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1800

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1800

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1801

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1801

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1802

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1802

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1803

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1803

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1804

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1804

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1805

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1805

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1806

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1806

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1807

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1807

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1808

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1808

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1809

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1809

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1810

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1810

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1811

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1811

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1812

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1812

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1813

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1813

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1814

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1814

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1815

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1815

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1816

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1816

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1817

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1817

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1818

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1818

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1819

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1819

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1820

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1820

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1821

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1821

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1822

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1822

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1823

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1823

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1824

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1824

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1825

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1825

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1826

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1826

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1827

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1827

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1828

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1828

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1829

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1829

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1830

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1830

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1831

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1831

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1832

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1832

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1833

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1833

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1834

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1834

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1835

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1835

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1836

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1836

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1837

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1837

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1838

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1838

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1839

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1839

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1840

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1840

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1841

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1841

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1842

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1842

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1843

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1843

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1844

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1844

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1845

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1845

accgcgaccc tctggacagg 20

<210> 1846

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1846

accgugaccc tctggacagg 20

<210> 1847

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1847

accgugaccc tctggacagg 20

<210> 1848

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1848

accgugaccc tctggacagg 20

<210> 1849

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1849

accgugaccc tctggacagg 20

<210> 1850

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1850

accgugaccc tctggacagg 20

<210> 1851

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1851

accgugaccc tctggacagg 20

<210> 1852

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1852

accgugaccc tctggacagg 20

<210> 1853

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1853

accgugaccc tctggacagg 20

<210> 1854

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1854

accgugaccc tctggacagg 20

<210> 1855

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1855

accgugaccc tctggacagg 20

<210> 1856

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1856

accgugaccc tctggacagg 20

<210> 1857

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1857

accgugaccc tctggacagg 20

<210> 1858

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1858

accgugaccc tctggacagg 20

<210> 1859

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1859

accgugaccc tctggacagg 20

<210> 1860

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1860

accgugaccc tctggacagg 20

<210> 1861

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1861

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1862

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1862

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1863

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1863

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1864

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1864

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 1865

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1865

agaggacgcc gtgcagggct 20

<210> 1866

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1866

agaggacgcc gtgcagggct 20

<210> 1867

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1867

agaggacgcc gtgcagggct 20

<210> 1868

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1868

tagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1869

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1869

tagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1870

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1870

tagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1871

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1871

atagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1872

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1872

atagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1873

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1873

atagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1874

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1874

catagaggac gccgtgcagg 20

<210> 1875

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1875

catagaggac gccgtgcagg 20

<210> 1876

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1876

catagaggac gccgtgcagg 20

<210> 1877

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1877

acatagagga cgccgtgcag 20

<210> 1878

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1878

acatagagga cgccgtgcag 20

<210> 1879

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1879

acatagagga cgccgtgcag 20

<210> 1880

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1880

cacatagagg acgccgtgca 20

<210> 1881

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1881

cacatagagg acgccgtgca 20

<210> 1882

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1882

cacatagagg acgccgtgca 20

<210> 1883

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1883

gcacatagag gacgccgtgc 20

<210> 1884

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1884

gcacatagag gacgccgtgc 20

<210> 1885

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1885

gcacatagag gacgccgtgc 20

<210> 1886

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1886

agaggacgcc gtgcagggcu 20

<210> 1887

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1887

agaggacgcc gtgcagggcu 20

<210> 1888

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1888

agaggacgcc gtgcagggcu 20

<210> 1889

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1889

tagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1890

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1890

tagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1891

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1891

tagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1892

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1892

atagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1893

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1893

atagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1894

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1894

atagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1895

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1895

catagaggac gccgtgcagg 20

<210> 1896

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1896

catagaggac gccgtgcagg 20

<210> 1897

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1897

catagaggac gccgtgcagg 20

<210> 1898

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1898

acatagagga cgccgugcag 20

<210> 1899

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1899

acatagagga cgccgugcag 20

<210> 1900

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1900

acatagagga cgccgugcag 20

<210> 1901

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1901

cacatagagg acgccgugca 20

<210> 1902

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1902

cacatagagg acgccgugca 20

<210> 1903

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1903

cacatagagg acgccgugca 20

<210> 1904

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1904

gcacatagag gacgccgugc 20

<210> 1905

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1905

gcacatagag gacgccgugc 20

<210> 1906

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1906

gcacatagag gacgccgugc 20

<210> 1907

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1907

agaggacgcc gtgcagggct 20

<210> 1908

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1908

agaggacgcc gtgcagggct 20

<210> 1909

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1909

agaggacgcc gtgcagggct 20

<210> 1910

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1910

uagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1911

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1911

uagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1912

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1912

uagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1913

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1913

auagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1914

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1914

auagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1915

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1915

auagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1916

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1916

cauagaggac gccgtgcagg 20

<210> 1917

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1917

cauagaggac gccgtgcagg 20

<210> 1918

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1918

cauagaggac gccgtgcagg 20

<210> 1919

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1919

acauagagga cgccgtgcag 20

<210> 1920

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1920

acauagagga cgccgtgcag 20

<210> 1921

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1921

acauagagga cgccgtgcag 20

<210> 1922

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1922

cacauagagg acgccgtgca 20

<210> 1923

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1923

cacauagagg acgccgtgca 20

<210> 1924

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1924

cacauagagg acgccgtgca 20

<210> 1925

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1925

gcacatagag gacgccgtgc 20

<210> 1926

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1926

gcacatagag gacgccgtgc 20

<210> 1927

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1927

gcacatagag gacgccgtgc 20

<210> 1928

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1928

agaggacgcc gtgcagggct 20

<210> 1929

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1929

agaggacgcc gtgcagggct 20

<210> 1930

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1930

agaggacgcc gtgcagggct 20

<210> 1931

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1931

tagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1932

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1932

tagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1933

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1933

tagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1934

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1934

atagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1935

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1935

atagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1936

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1936

atagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1937

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1937

catagaggac gccgtgcagg 20

<210> 1938

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1938

catagaggac gccgtgcagg 20

<210> 1939

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1939

catagaggac gccgtgcagg 20

<210> 1940

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1940

acatagagga cgccgtgcag 20

<210> 1941

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1941

acatagagga cgccgtgcag 20

<210> 1942

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1942

acatagagga cgccgtgcag 20

<210> 1943

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1943

cacatagagg acgccgtgca 20

<210> 1944

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1944

cacatagagg acgccgtgca 20

<210> 1945

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1945

cacatagagg acgccgtgca 20

<210> 1946

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1946

gcacatagag gacgccgtgc 20

<210> 1947

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1947

gcacatagag gacgccgtgc 20

<210> 1948

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1948

gcacatagag gacgccgtgc 20

<210> 1949

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1949

agaggacgcc gtgcagggct 20

<210> 1950

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1950

agaggacgcc gtgcagggct 20

<210> 1951

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1951

agaggacgcc gtgcagggct 20

<210> 1952

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1952

tagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1953

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1953

tagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1954

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1954

tagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1955

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1955

atagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1956

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1956

atagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1957

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1957

atagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1958

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1958

catagaggac gccgtgcagg 20

<210> 1959

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1959

catagaggac gccgtgcagg 20

<210> 1960

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1960

catagaggac gccgtgcagg 20

<210> 1961

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1961

acatagagga cgccgtgcag 20

<210> 1962

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1962

acatagagga cgccgtgcag 20

<210> 1963

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1963

acatagagga cgccgtgcag 20

<210> 1964

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1964

cacatagagg acgccgtgca 20

<210> 1965

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1965

cacatagagg acgccgtgca 20

<210> 1966

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1966

cacatagagg acgccgtgca 20

<210> 1967

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1967

gcacatagag gacgccgtgc 20

<210> 1968

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1968

gcacatagag gacgccgtgc 20

<210> 1969

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1969

gcacatagag gacgccgtgc 20

<210> 1970

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1970

agaggacgcc gtgcagggcu 20

<210> 1971

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1971

agaggacgcc gtgcagggcu 20

<210> 1972

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1972

agaggacgcc gtgcagggcu 20

<210> 1973

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1973

tagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1974

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1974

tagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1975

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1975

tagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1976

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1976

atagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1977

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1977

atagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1978

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1978

atagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1979

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1979

catagaggac gccgtgcagg 20

<210> 1980

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1980

catagaggac gccgtgcagg 20

<210> 1981

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1981

catagaggac gccgtgcagg 20

<210> 1982

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1982

acatagagga cgccgugcag 20

<210> 1983

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1983

acatagagga cgccgugcag 20

<210> 1984

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1984

acatagagga cgccgugcag 20

<210> 1985

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1985

cacatagagg acgccgugca 20

<210> 1986

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1986

cacatagagg acgccgugca 20

<210> 1987

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1987

cacatagagg acgccgugca 20

<210> 1988

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1988

gcacatagag gacgccgugc 20

<210> 1989

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1989

gcacatagag gacgccgugc 20

<210> 1990

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1990

gcacatagag gacgccgugc 20

<210> 1991

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1991

agaggacgcc gtgcagggct 20

<210> 1992

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1992

agaggacgcc gtgcagggct 20

<210> 1993

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1993

agaggacgcc gtgcagggct 20

<210> 1994

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1994

uagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1995

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1995

uagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1996

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1996

uagaggacgc cgtgcagggc 20

<210> 1997

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1997

auagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1998

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1998

auagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 1999

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 1999

auagaggacg ccgtgcaggg 20

<210> 2000

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2000

cauagaggac gccgtgcagg 20

<210> 2001

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2001

cauagaggac gccgtgcagg 20

<210> 2002

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2002

cauagaggac gccgtgcagg 20

<210> 2003

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2003

acauagagga cgccgtgcag 20

<210> 2004

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2004

acauagagga cgccgtgcag 20

<210> 2005

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2005

acauagagga cgccgtgcag 20

<210> 2006

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2006

cacauagagg acgccgtgca 20

<210> 2007

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2007

cacauagagg acgccgtgca 20

<210> 2008

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2008

cacauagagg acgccgtgca 20

<210> 2009

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2009

gcacatagag gacgccgtgc 20

<210> 2010

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2010

gcacatagag gacgccgtgc 20

<210> 2011

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2011

gcacatagag gacgccgtgc 20

<210> 2012

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2012

tgagcggaga aaccctccaa 20

<210> 2013

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2013

tgagcggaga aaccctccaa 20

<210> 2014

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2014

tgagcggaga aaccctccaa 20

<210> 2015

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2015

ctgagcggag aaaccctcca 20

<210> 2016

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2016

ctgagcggag aaaccctcca 20

<210> 2017

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2017

ctgagcggag aaaccctcca 20

<210> 2018

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2018

gctgagcgga gaaaccctcc 20

<210> 2019

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2019

gctgagcgga gaaaccctcc 20

<210> 2020

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2020

gctgagcgga gaaaccctcc 20

<210> 2021

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2021

ggctgagcgg agaaaccctc 20

<210> 2022

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2022

ggctgagcgg agaaaccctc 20

<210> 2023

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2023

ggctgagcgg agaaaccctc 20

<210> 2024

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2024

aggctgagcg gagaaaccct 20

<210> 2025

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2025

aggctgagcg gagaaaccct 20

<210> 2026

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2026

aggctgagcg gagaaaccct 20

<210> 2027

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2027

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2028

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2028

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2029

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2029

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2030

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2030

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2031

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2031

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2032

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2032

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2033

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2033

tgagcggaga aacccuccaa 20

<210> 2034

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2034

tgagcggaga aacccuccaa 20

<210> 2035

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2035

tgagcggaga aacccuccaa 20

<210> 2036

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2036

ctgagcggag aaacccucca 20

<210> 2037

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2037

ctgagcggag aaacccucca 20

<210> 2038

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2038

ctgagcggag aaacccucca 20

<210> 2039

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2039

gctgagcgga gaaacccucc 20

<210> 2040

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2040

gctgagcgga gaaacccucc 20

<210> 2041

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2041

gctgagcgga gaaacccucc 20

<210> 2042

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2042

ggctgagcgg agaaacccuc 20

<210> 2043

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2043

ggctgagcgg agaaacccuc 20

<210> 2044

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2044

ggctgagcgg agaaacccuc 20

<210> 2045

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2045

aggctgagcg gagaaacccu 20

<210> 2046

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2046

aggctgagcg gagaaacccu 20

<210> 2047

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2047

aggctgagcg gagaaacccu 20

<210> 2048

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2048

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2049

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2049

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2050

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2050

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2051

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2051

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2052

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2052

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2053

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2053

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2054

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2054

ugagcggaga aaccctccaa 20

<210> 2055

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2055

ugagcggaga aaccctccaa 20

<210> 2056

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2056

ugagcggaga aaccctccaa 20

<210> 2057

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2057

cugagcggag aaaccctcca 20

<210> 2058

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2058

cugagcggag aaaccctcca 20

<210> 2059

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2059

cugagcggag aaaccctcca 20

<210> 2060

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2060

gcugagcgga gaaaccctcc 20

<210> 2061

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2061

gcugagcgga gaaaccctcc 20

<210> 2062

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2062

gcugagcgga gaaaccctcc 20

<210> 2063

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2063

ggcugagcgg agaaaccctc 20

<210> 2064

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2064

ggcugagcgg agaaaccctc 20

<210> 2065

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2065

ggcugagcgg agaaaccctc 20

<210> 2066

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2066

aggcugagcg gagaaaccct 20

<210> 2067

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2067

aggcugagcg gagaaaccct 20

<210> 2068

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2068

aggcugagcg gagaaaccct 20

<210> 2069

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2069

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2070

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2070

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2071

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2071

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2072

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2072

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2073

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2073

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2074

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2074

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2075

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2075

tgagcggaga aaccctccaa 20

<210> 2076

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2076

tgagcggaga aaccctccaa 20

<210> 2077

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2077

tgagcggaga aaccctccaa 20

<210> 2078

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2078

ctgagcggag aaaccctcca 20

<210> 2079

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2079

ctgagcggag aaaccctcca 20

<210> 2080

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2080

ctgagcggag aaaccctcca 20

<210> 2081

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2081

gctgagcgga gaaaccctcc 20

<210> 2082

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2082

gctgagcgga gaaaccctcc 20

<210> 2083

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2083

gctgagcgga gaaaccctcc 20

<210> 2084

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2084

ggctgagcgg agaaaccctc 20

<210> 2085

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2085

ggctgagcgg agaaaccctc 20

<210> 2086

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2086

ggctgagcgg agaaaccctc 20

<210> 2087

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2087

aggctgagcg gagaaaccct 20

<210> 2088

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2088

aggctgagcg gagaaaccct 20

<210> 2089

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2089

aggctgagcg gagaaaccct 20

<210> 2090

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2090

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2091

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2091

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2092

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2092

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2093

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2093

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2094

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2094

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2095

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2095

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2096

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2096

tgagcggaga aaccctccaa 20

<210> 2097

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2097

tgagcggaga aaccctccaa 20

<210> 2098

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2098

tgagcggaga aaccctccaa 20

<210> 2099

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2099

ctgagcggag aaaccctcca 20

<210> 2100

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2100

ctgagcggag aaaccctcca 20

<210> 2101

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2101

ctgagcggag aaaccctcca 20

<210> 2102

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2102

gctgagcgga gaaaccctcc 20

<210> 2103

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2103

gctgagcgga gaaaccctcc 20

<210> 2104

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2104

gctgagcgga gaaaccctcc 20

<210> 2105

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2105

ggctgagcgg agaaaccctc 20

<210> 2106

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2106

ggctgagcgg agaaaccctc 20

<210> 2107

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2107

ggctgagcgg agaaaccctc 20

<210> 2108

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2108

aggctgagcg gagaaaccct 20

<210> 2109

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2109

aggctgagcg gagaaaccct 20

<210> 2110

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2110

aggctgagcg gagaaaccct 20

<210> 2111

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2111

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2112

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2112

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2113

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2113

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2114

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2114

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2115

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2115

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2116

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2116

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2117

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2117

tgagcggaga aacccuccaa 20

<210> 2118

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2118

tgagcggaga aacccuccaa 20

<210> 2119

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2119

tgagcggaga aacccuccaa 20

<210> 2120

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2120

ctgagcggag aaacccucca 20

<210> 2121

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2121

ctgagcggag aaacccucca 20

<210> 2122

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2122

ctgagcggag aaacccucca 20

<210> 2123

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2123

gctgagcgga gaaacccucc 20

<210> 2124

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2124

gctgagcgga gaaacccucc 20

<210> 2125

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2125

gctgagcgga gaaacccucc 20

<210> 2126

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2126

ggctgagcgg agaaacccuc 20

<210> 2127

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2127

ggctgagcgg agaaacccuc 20

<210> 2128

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2128

ggctgagcgg agaaacccuc 20

<210> 2129

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2129

aggctgagcg gagaaacccu 20

<210> 2130

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2130

aggctgagcg gagaaacccu 20

<210> 2131

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2131

aggctgagcg gagaaacccu 20

<210> 2132

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2132

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2133

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2133

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2134

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2134

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2135

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2135

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2136

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2136

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2137

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2137

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2138

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2138

ugagcggaga aaccctccaa 20

<210> 2139

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2139

ugagcggaga aaccctccaa 20

<210> 2140

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2140

ugagcggaga aaccctccaa 20

<210> 2141

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2141

cugagcggag aaaccctcca 20

<210> 2142

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2142

cugagcggag aaaccctcca 20

<210> 2143

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2143

cugagcggag aaaccctcca 20

<210> 2144

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2144

gcugagcgga gaaaccctcc 20

<210> 2145

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2145

gcugagcgga gaaaccctcc 20

<210> 2146

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2146

gcugagcgga gaaaccctcc 20

<210> 2147

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2147

ggcugagcgg agaaaccctc 20

<210> 2148

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2148

ggcugagcgg agaaaccctc 20

<210> 2149

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2149

ggcugagcgg agaaaccctc 20

<210> 2150

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2150

aggcugagcg gagaaaccct 20

<210> 2151

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2151

aggcugagcg gagaaaccct 20

<210> 2152

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2152

aggcugagcg gagaaaccct 20

<210> 2153

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2153

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2154

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2154

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2155

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2155

aaggctgagc ggagaaaccc 20

<210> 2156

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2156

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2157

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2157

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2158

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2158

caaggctgag cggagaaacc 20

<210> 2159

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2159

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2160

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2160

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2161

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2161

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2162

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2162

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2163

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2163

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 2164

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2164

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 2165

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2165

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 2166

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2166

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 2167

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2167

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 2168

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2168

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 2169

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2169

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 2170

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2170

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 2171

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2171

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 2172

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2172

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 2173

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2173

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 2174

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2174

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 2175

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2175

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2176

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2176

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2177

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2177

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2178

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2178

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 2179

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2179

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 2180

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2180

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 2181

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2181

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 2182

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2182

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 2183

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2183

agtgcacaca gtagatgagg 20

<210> 2184

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2184

agtgcacaca gtagatgagg 20

<210> 2185

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2185

agtgcacaca gtagatgagg 20

<210> 2186

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2186

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 2187

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2187

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 2188

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2188

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 2189

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2189

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 2190

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2190

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 2191

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2191

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 2192

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2192

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 2193

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2193

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 2194

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2194

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 2195

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2195

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2196

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2196

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2197

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2197

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2198

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2198

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 2199

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2199

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 2200

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2200

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 2201

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2201

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 2202

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2202

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 2203

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2203

agtgcacaca gtagaugagg 20

<210> 2204

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2204

agtgcacaca gtagaugagg 20

<210> 2205

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2205

agtgcacaca gtagaugagg 20

<210> 2206

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2206

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2207

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2207

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2208

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2208

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2209

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2209

ugcacacagt agatgaggga 20

<210> 2210

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2210

ugcacacagt agatgaggga 20

<210> 2211

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2211

ugcacacagt agatgaggga 20

<210> 2212

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2212

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 2213

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2213

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 2214

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2214

agugcacaca gtagatgagg 20

<210> 2215

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2215

agugcacaca gtagatgagg 20

<210> 2216

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2216

agugcacaca gtagatgagg 20

<210> 2217

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2217

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 2218

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2218

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 2219

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2219

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 2220

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2220

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 2221

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2221

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 2222

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2222

agcugcugcu acagaucaac 20

<210> 2223

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2223

agcugcugcu gcagaucaac 20

<210> 2224

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2224

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2225

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2225

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2226

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2226

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2227

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2227

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2228

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2228

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2229

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2229

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2230

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2230

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2231

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2231

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2232

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2232

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2233

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2233

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2234

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2234

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2235

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2235

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2236

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2236

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2237

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2237

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2238

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2238

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2239

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2239

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2240

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2240

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2241

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2241

uugatctgta gcagcagct 19

<210> 2242

<211> 21

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2242

gguugatctg tagcagcagc t 21

<210> 2243

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2243

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2244

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2244

guugatctgt agcagcagct 20

<210> 2245

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2245

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 2246

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2246

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 2247

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2247

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 2248

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2248

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 2249

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2249

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 2250

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2250

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 2251

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2251

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 2252

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2252

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 2253

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2253

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 2254

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2254

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2255

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2255

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2256

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2256

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2257

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2257

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 2258

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2258

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 2259

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2259

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 2260

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2260

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 2261

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2261

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 2262

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2262

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 2263

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2263

agtgcacaca gtagatgagg 20

<210> 2264

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2264

agtgcacaca gtagatgagg 20

<210> 2265

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2265

agtgcacaca gtagatgagg 20

<210> 2266

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2266

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 2267

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2267

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 2268

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2268

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 2269

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2269

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 2270

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2270

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 2271

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2271

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 2272

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2272

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 2273

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2273

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 2274

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2274

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 2275

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2275

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2276

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2276

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2277

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2277

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2278

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2278

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 2279

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2279

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 2280

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2280

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 2281

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2281

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 2282

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2282

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 2283

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2283

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 2284

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2284

agtgcacaca gtagatgagg 20

<210> 2285

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2285

agtgcacaca gtagatgagg 20

<210> 2286

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2286

agtgcacaca gtagatgagg 20

<210> 2287

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2287

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 2288

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2288

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 2289

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2289

cacagtagat gagggagcag 20

<210> 2290

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2290

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 2291

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2291

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 2292

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2292

acacagtaga tgagggagca 20

<210> 2293

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2293

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 2294

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2294

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 2295

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2295

cacacagtag atgagggagc 20

<210> 2296

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2296

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2297

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2297

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2298

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2298

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2299

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2299

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 2300

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2300

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 2301

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2301

tgcacacagt agatgaggga 20

<210> 2302

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2302

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 2303

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2303

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 2304

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2304

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 2305

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2305

agtgcacaca gtagaugagg 20

<210> 2306

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2306

agtgcacaca gtagaugagg 20

<210> 2307

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2307

agtgcacaca gtagaugagg 20

<210> 2308

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2308

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2309

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2309

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2310

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2310

gcacacagta gatgagggag 20

<210> 2311

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2311

ugcacacagt agatgaggga 20

<210> 2312

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2312

ugcacacagt agatgaggga 20

<210> 2313

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2313

ugcacacagt agatgaggga 20

<210> 2314

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2314

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 2315

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2315

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 2316

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2316

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 2317

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2317

agugcacaca gtagatgagg 20

<210> 2318

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2318

agugcacaca gtagatgagg 20

<210> 2319

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2319

agugcacaca gtagatgagg 20

<210> 2320

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2320

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 2321

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2321

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 2322

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2322

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 2323

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2323

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 2324

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2324

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 2325

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2325

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 2326

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2326

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 2327

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2327

gugcacacag tagatgaggg 20

<210> 2328

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2328

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 2329

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2329

gtgcacacag tagatgaggg 20

<210> 2330

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2330

catgtcaccc agcagaccag 20

<210> 2331

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2331

actcacccac tcgccaccgc 20

<210> 2332

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2332

ggcacaaggg cacagacuuc 20

<210> 2333

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2333

ugcaggcugg cuguuggccc 20

<210> 2334

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2334

ugcaggcugg guguuggccc 20

<210> 2335

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2335

gggccaacag ccagcctgca 20

<210> 2336

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2336

gggccaacac ccagcctgca 20

<210> 2337

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2337

uugccagguu gcagcugcuc 20

<210> 2338

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2338

uugccagguu acagcugcuc 20

<210> 2339

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2339

gagcagctgc aacctggcaa 20

<210> 2340

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2340

uggaagucug ugcccuugug 20

<210> 2341

<211> 20

<212> РНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2341

uggaagucug cgcccuugug 20

<210> 2342

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2342

ctcagtaaca ttgacaccac 20

<210> 2343

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2343

ctcgactaaa gcaggatttc 20

<210> 2344

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2344

cctgcatcag ctttatttgt 20

<210> 2345

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2345

tctctattgc acattccaag 20

<210> 2346

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2346

ggcacaaggg cacagac 17

<210> 2347

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2347

ggcacaaggg cacagact 18

<210> 2348

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2348

ggcacaaggg cacagactt 19

<210> 2349

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2349

gttgatctgt agcagcagct 20

<210> 2350

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2350

ggcacaaggg cacagac 17

<210> 2351

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2351

ggcacaaggg cacagact 18

<210> 2352

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2352

ggcacaaggg cacagactt 19

<210> 2353

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2353

ggcacaaggg cacagac 17

<210> 2354

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2354

ggcacaaggg cacagact 18

<210> 2355

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2355

ggcacaaggg cacagactt 19

<210> 2356

<211> 17

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2356

ggcacaaggg cacagac 17

<210> 2357

<211> 18

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2357

ggcacaaggg cacagact 18

<210> 2358

<211> 19

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> синтетический

<400> 2358

ggcacaaggg cacagactt 19

<---

Claims (60)

1. Олигонуклеотид, способный нацеливаться на аллель А SNP (сайт однонуклеотидного полиморфизма) rs362273, где олигонуклеотид представляет собой

(1) mG * S mUn001R mU mGn001R mA * ST * SC * ST * SG * ST * RA * SG * SC * SA * SG * R m5Ceon001RAeoGeon001R m5Ceo * STeo или его соль; (2) mG * S mUn001R mU * S mGn001R mA * ST * SC * ST * SG * ST * RA * SG * SC * SA * SG * R m5Ceon001RAeoGeon001R m5Ceo * STeo или его соль; (3) mG * S mUn001R mU mGn001R mA * ST * SC * ST * SG * ST * RA * SG * SC * SA * SG * R m5CeoAeoGeon001R m5Ceo * STeo или его соль; или (4) mG * S mUn001R mU * S mG mA * ST * SC * ST * SG * ST * RA * SG * SC * SA * SG * R m5Ceon001RAeoGeon001R m5Ceo * STeo или его соль;

где

m означает 2’-OMe;

eo означает 2’-MOE (2’−OCH₂CH₂OCH₃);

m5 означает метил в положении 5-атома C (нуклеиновое основание представляет собой 5-метилцитозин);

m5Ceo означает 5-метил-2'-O-метоксиэтил-C;

m5mC означает 5-метил-2'-OMe-C;

n001 означает ;

* R означает одну фосфотиоатную связь в конформации Rp;

* S означает одну фосфотиоатную связь в конформации Sp; и

n001R означает n001 в конформации Rp.

2. Олигонуклеотид по п. 1, где олигонуклеотид представляет собой mG * S mUn001R mU mGn001R mA * ST * SC * ST * SG * ST * RA * SG * SC * SA * SG * R m5Ceon001RAeoGeon001R m5Ceo * STeo или его соль,

где

m означает 2’-OMe;

eo означает 2’-MOE (2’−OCH₂CH₂OCH₃);

m5 означает метил в положении 5-атома C (нуклеиновое основание представляет собой 5-метилцитозин);

m5Ceo означает 5-метил-2'-O-метоксиэтил-C;

n001 означает ;

* R означает одну фосфотиоатную связь в конформации Rp;

* S означает одну фосфотиоатную связь в конформации Sp; и

n001R означает n001 в конформации Rp.

3. Олигонуклеотид по п. 1, где олигонуклеотид представляет собой mG * S mUn001R mU * S mG mA * ST * SC * ST * SG * ST * RA * SG * SC * SA * SG * R m5Ceon001RAeoGeon001R m5Ceo * STeo или его соль.

4. Олигонуклеотид по п. 1, где олигонуклеотид представляет собой mG * S mUn001R mU * S mGn001R mA * ST * SC * ST * SG * ST * RA * SG * SC * SA * SG * R m5Ceon001RAeoGeon001R m5Ceo * STeo или его соль.

5. Олигонуклеотид по п. 1, где олигонуклеотид представляет собой mG * S mUn001R mU mGn001R mA * ST * SC * ST * SG * ST * RA * SG * SC * SA * SG * R m5CeoAeoGeon001R m5Ceo * STeo или его соль.

6. Олигонуклеотид по любому из пп. 1-4, где олигонуклеотид находится в форме фармацевтически приемлемой соли.

7. Олигонуклеотид по любому из предыдущих пунктов, где олигонуклеотид находится в форме натриевой соли.

8. Олигонуклеотид по любому из предыдущих пунктов, где олигонуклеотид является на по меньшей мере приблизительно 50% диастереомерно чистым.

9. Олигонуклеотид по любому из предыдущих пунктов, где каждая хиральная межнуклеотидная связь независимо имеет диастереомерную чистоту по меньшей мере 95%.

10. Олигонуклеотидная композиция с контролируемой хиральностью для нацеливания на аллель А SNP rs362273, содержащая совокупность олигонуклеотидов, где:

каждый из олигонуклеотидов указанной совокупности независимо представляет собой олигонуклеотид по п. 2; и

по меньшей мере приблизительно 10% олигонуклеотидов в композиции, которые характеризуются такой же последовательностью оснований, что и олигонуклеотиды из указанной совокупности, представляют собой олигонуклеотиды указанной совокупности.

11. Олигонуклеотидная композиция с контролируемой хиральностью для нацеливания на аллель А SNP rs362273, содержащая неслучайный уровень совокупности олигонуклеотидов, где:

каждый из олигонуклеотидов указанной совокупности независимо представляет собой олигонуклеотид по п. 3; и

по меньшей мере приблизительно 10% олигонуклеотидов в композиции, которые характеризуются такой же последовательностью оснований, что и олигонуклеотиды из указанной совокупности, представляют собой олигонуклеотиды указанной совокупности.

12. Олигонуклеотидная композиция с контролируемой хиральностью для нацеливания на аллель А SNP rs362273, содержащая неслучайный уровень совокупности олигонуклеотидов, где:

каждый из олигонуклеотидов указанной совокупности независимо представляет собой олигонуклеотид по п. 4; и

по меньшей мере приблизительно 10% олигонуклеотидов в композиции, которые характеризуются такой же последовательностью оснований, что и олигонуклеотиды из указанной совокупности, представляют собой олигонуклеотиды указанной совокупности.

13. Олигонуклеотидная композиция с контролируемой хиральностью для нацеливания на аллель А SNP rs362273, содержащая неслучайный уровень совокупности олигонуклеотидов, где:

каждый из олигонуклеотидов указанной совокупности независимо представляет собой олигонуклеотид по п. 5; и

по меньшей мере приблизительно 10% олигонуклеотидов в композиции, которые характеризуются такой же последовательностью оснований, что и олигонуклеотиды из указанной совокупности, представляют собой олигонуклеотиды указанной совокупности.

14. Композиция по любому из пп. 10-13, где по меньшей мере приблизительно 50% олигонуклеотидов в композиции, которые характеризуются такой же последовательностью оснований, что и олигонуклеотиды из указанной совокупности, представляют собой олигонуклеотиды указанной совокупности.

15. Композиция по любому из пп. 10-14, где каждый из олигонуклеотидов указанной совокупности находится в форме фармацевтически приемлемой соли.

16. Композиция по п. 15, где каждый из олигонуклеотидов указанной совокупности находится в форме натриевой соли.

17. Фармацевтическая композиция для нацеливания на аллель А SNP rs362273, содержащая терапевтически эффективное количество олигонуклеотида по п. 2 и фармацевтически приемлемый носитель.

18. Композиция по п. 17, где по меньшей мере приблизительно 10% олигонуклеотидов в композиции, которые характеризуются такой же последовательностью оснований, что и олигонуклеотид по п. 2, каждый независимо представляет собой олигонуклеотид по п. 2.

19. Фармацевтическая композиция для нацеливания на аллель А SNP rs362273, содержащая терапевтически эффективное количество олигонуклеотида по п. 3 и фармацевтически приемлемый носитель.

20. Композиция по п. 19, где по меньшей мере приблизительно 10% олигонуклеотидов в композиции, которые характеризуются такой же последовательностью оснований, что и олигонуклеотид по п. 3, каждый независимо представляет собой олигонуклеотид по п. 3.

21. Фармацевтическая композиция для нацеливания на аллель А SNP rs362273, содержащая терапевтически эффективное количество олигонуклеотида по п. 4 и фармацевтически приемлемый носитель.

22. Композиция по п. 21, где по меньшей мере приблизительно 10% олигонуклеотидов в композиции, которые характеризуются такой же последовательностью оснований, что и олигонуклеотид по п. 4, каждый независимо представляет собой олигонуклеотид по п. 4.

23. Фармацевтическая композиция для нацеливания на аллель А SNP rs362273, содержащая терапевтически эффективное количество олигонуклеотида по п. 5 и фармацевтически приемлемый носитель.

24. Композиция по п. 23, где по меньшей мере приблизительно 10% олигонуклеотидов в композиции, которые характеризуются такой же последовательностью оснований, что и олигонуклеотид по п. 5, каждый независимо представляет собой олигонуклеотид по п. 5.

25. Композиция по любому из пп. 17-24, где фармацевтически приемлемый носитель представляет собой буферный раствор для поддержания рН.

26. Композиция по любому из пп. 17-25, где олигонуклеотид находится в форме фармацевтически приемлемой соли.

27. Композиция по п. 26, где олигонуклеотид находится в форме натриевой соли.

28. Способ лечения болезни Хантингтона, включающий введение субъекту, страдающему от нее, эффективного количества олигонуклеотида по любому из пп. 1-9 или композиции по любому из пп. 10-27.

29. Способ предупреждения болезни Хантингтона, включающий введение субъекту, предрасположенному к ней, эффективного количества олигонуклеотида по любому из пп. 1-9 или композиции по любому из пп. 10-27.

30. Способ задержки возникновения болезни Хантингтона, включающий введение субъекту, предрасположенному к ней, эффективного количества олигонуклеотида по любому из пп. 1-9 или композиции по любому из пп. 10-27.

31. Способ уменьшения тяжести по меньшей мере одного симптома болезни Хантингтона, включающий введение субъекту, страдающему от нее, эффективного количества олигонуклеотида по любому из пп. 1-9 или композиции по любому из пп. 10-27.

32. Способ по любому из пп. 28-31, где у субъекта имеется аллель HTT, который содержит область экспансии CAG-повторов и является полностью комплементарным последовательности оснований олигонуклеотида.