RU2795244C1 - Способ прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин с ожирением - Google Patents
Способ прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин с ожирением Download PDFInfo
- Publication number
- RU2795244C1 RU2795244C1 RU2022126006A RU2022126006A RU2795244C1 RU 2795244 C1 RU2795244 C1 RU 2795244C1 RU 2022126006 A RU2022126006 A RU 2022126006A RU 2022126006 A RU2022126006 A RU 2022126006A RU 2795244 C1 RU2795244 C1 RU 2795244C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- breast cancer
- mmp
- gene
- marker
- equal
- Prior art date
Links
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 title claims abstract description 74
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 title claims abstract description 74
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 34
- 238000011161 development Methods 0.000 title description 12
- 108010015302 Matrix metalloproteinase-9 Proteins 0.000 claims abstract description 24
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims abstract description 14
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims abstract description 14
- 102000054766 genetic haplotypes Human genes 0.000 claims abstract description 13
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims abstract description 9
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 claims abstract description 7
- 208000008589 Obesity Diseases 0.000 claims description 14
- 235000020824 obesity Nutrition 0.000 claims description 14
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 5
- 238000005070 sampling Methods 0.000 claims description 2
- 238000007400 DNA extraction Methods 0.000 claims 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 6
- 238000010241 blood sampling Methods 0.000 abstract description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 abstract description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 44
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 16
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 15
- 102000002274 Matrix Metalloproteinases Human genes 0.000 description 13
- 108010000684 Matrix Metalloproteinases Proteins 0.000 description 13
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 12
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 11
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 8
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 6
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 5
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 5
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 5
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 description 5
- 238000011160 research Methods 0.000 description 5
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 5
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 4
- 102100028116 Amine oxidase [flavin-containing] B Human genes 0.000 description 4
- 108010062431 Monoamine oxidase Proteins 0.000 description 4
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 4
- DDRJAANPRJIHGJ-UHFFFAOYSA-N creatinine Chemical compound CN1CC(=O)NC1=N DDRJAANPRJIHGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 3
- 229930003316 Vitamin D Natural products 0.000 description 3
- QYSXJUFSXHHAJI-XFEUOLMDSA-N Vitamin D3 Natural products C1(/[C@@H]2CC[C@@H]([C@]2(CCC1)C)[C@H](C)CCCC(C)C)=C/C=C1\C[C@@H](O)CCC1=C QYSXJUFSXHHAJI-XFEUOLMDSA-N 0.000 description 3
- 101150076397 blm gene Proteins 0.000 description 3
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 3
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 3
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 3
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 3
- 238000011897 real-time detection Methods 0.000 description 3
- 235000019166 vitamin D Nutrition 0.000 description 3
- 239000011710 vitamin D Substances 0.000 description 3
- 150000003710 vitamin D derivatives Chemical class 0.000 description 3
- 229940046008 vitamin d Drugs 0.000 description 3
- DNXHEGUUPJUMQT-UHFFFAOYSA-N (+)-estrone Natural products OC1=CC=C2C3CCC(C)(C(CC4)=O)C4C3CCC2=C1 DNXHEGUUPJUMQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PROQIPRRNZUXQM-UHFFFAOYSA-N (16alpha,17betaOH)-Estra-1,3,5(10)-triene-3,16,17-triol Natural products OC1=CC=C2C3CCC(C)(C(C(O)C4)O)C4C3CCC2=C1 PROQIPRRNZUXQM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VOXZDWNPVJITMN-ZBRFXRBCSA-N 17β-estradiol Chemical compound OC1=CC=C2[C@H]3CC[C@](C)([C@H](CC4)O)[C@@H]4[C@@H]3CCC2=C1 VOXZDWNPVJITMN-ZBRFXRBCSA-N 0.000 description 2
- BPYKTIZUTYGOLE-IFADSCNNSA-N Bilirubin Chemical compound N1C(=O)C(C)=C(C=C)\C1=C\C1=C(C)C(CCC(O)=O)=C(CC2=C(C(C)=C(\C=C/3C(=C(C=C)C(=O)N\3)C)N2)CCC(O)=O)N1 BPYKTIZUTYGOLE-IFADSCNNSA-N 0.000 description 2
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000029816 Collagenase Human genes 0.000 description 2
- 108060005980 Collagenase Proteins 0.000 description 2
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DNXHEGUUPJUMQT-CBZIJGRNSA-N Estrone Chemical compound OC1=CC=C2[C@H]3CC[C@](C)(C(CC4)=O)[C@@H]4[C@@H]3CCC2=C1 DNXHEGUUPJUMQT-CBZIJGRNSA-N 0.000 description 2
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 206010071602 Genetic polymorphism Diseases 0.000 description 2
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L Magnesium chloride Chemical compound [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 102100030412 Matrix metalloproteinase-9 Human genes 0.000 description 2
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 description 2
- 206010033307 Overweight Diseases 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 210000000577 adipose tissue Anatomy 0.000 description 2
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 2
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 description 2
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 2
- 229940109239 creatinine Drugs 0.000 description 2
- 239000008367 deionised water Substances 0.000 description 2
- 229910021641 deionized water Inorganic materials 0.000 description 2
- 206010012601 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 2
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 2
- 229960005309 estradiol Drugs 0.000 description 2
- 229930182833 estradiol Natural products 0.000 description 2
- PROQIPRRNZUXQM-ZXXIGWHRSA-N estriol Chemical compound OC1=CC=C2[C@H]3CC[C@](C)([C@H]([C@H](O)C4)O)[C@@H]4[C@@H]3CCC2=C1 PROQIPRRNZUXQM-ZXXIGWHRSA-N 0.000 description 2
- 229960001348 estriol Drugs 0.000 description 2
- 229960003399 estrone Drugs 0.000 description 2
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 2
- 230000005484 gravity Effects 0.000 description 2
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 2
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 2
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 2
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 2
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 2
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 2
- 230000000771 oncological effect Effects 0.000 description 2
- 230000027758 ovulation cycle Effects 0.000 description 2
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 2
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 description 2
- 230000003449 preventive effect Effects 0.000 description 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 2
- 238000004062 sedimentation Methods 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100026802 72 kDa type IV collagenase Human genes 0.000 description 1
- 101710151806 72 kDa type IV collagenase Proteins 0.000 description 1
- 201000000736 Amenorrhea Diseases 0.000 description 1
- 206010001928 Amenorrhoea Diseases 0.000 description 1
- 102100029361 Aromatase Human genes 0.000 description 1
- 108010078554 Aromatase Proteins 0.000 description 1
- -1 Ca2+ ions Chemical class 0.000 description 1
- 208000005623 Carcinogenesis Diseases 0.000 description 1
- 102000008186 Collagen Human genes 0.000 description 1
- 108010035532 Collagen Proteins 0.000 description 1
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 1
- 108010067770 Endopeptidase K Proteins 0.000 description 1
- 102000005593 Endopeptidases Human genes 0.000 description 1
- 108010059378 Endopeptidases Proteins 0.000 description 1
- 102100029951 Estrogen receptor beta Human genes 0.000 description 1
- 102000013382 Gelatinases Human genes 0.000 description 1
- 108010026132 Gelatinases Proteins 0.000 description 1
- 206010064571 Gene mutation Diseases 0.000 description 1
- 108091027305 Heteroduplex Proteins 0.000 description 1
- 101001010910 Homo sapiens Estrogen receptor beta Proteins 0.000 description 1
- 206010020772 Hypertension Diseases 0.000 description 1
- 102100030417 Matrilysin Human genes 0.000 description 1
- 108090000855 Matrilysin Proteins 0.000 description 1
- 102100026262 Metalloproteinase inhibitor 2 Human genes 0.000 description 1
- 101150081841 NBN gene Proteins 0.000 description 1
- 206010033264 Ovarian hyperfunction Diseases 0.000 description 1
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101100130647 Rattus norvegicus Mmp7 gene Proteins 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 1
- 208000024799 Thyroid disease Diseases 0.000 description 1
- 108010031372 Tissue Inhibitor of Metalloproteinase-2 Proteins 0.000 description 1
- 238000008050 Total Bilirubin Reagent Methods 0.000 description 1
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 description 1
- 239000013504 Triton X-100 Substances 0.000 description 1
- 206010064390 Tumour invasion Diseases 0.000 description 1
- 230000001594 aberrant effect Effects 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 231100000540 amenorrhea Toxicity 0.000 description 1
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 1
- 239000013060 biological fluid Substances 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 230000036952 cancer formation Effects 0.000 description 1
- 230000009400 cancer invasion Effects 0.000 description 1
- 231100000504 carcinogenesis Toxicity 0.000 description 1
- 210000000748 cardiovascular system Anatomy 0.000 description 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 1
- 208000011654 childhood malignant neoplasm Diseases 0.000 description 1
- YTRQFSDWAXHJCC-UHFFFAOYSA-N chloroform;phenol Chemical compound ClC(Cl)Cl.OC1=CC=CC=C1 YTRQFSDWAXHJCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920001436 collagen Polymers 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 1
- 238000013399 early diagnosis Methods 0.000 description 1
- 210000000750 endocrine system Anatomy 0.000 description 1
- 201000006828 endometrial hyperplasia Diseases 0.000 description 1
- 229940066758 endopeptidases Drugs 0.000 description 1
- 229940011871 estrogen Drugs 0.000 description 1
- 239000000262 estrogen Substances 0.000 description 1
- 201000006564 estrogen excess Diseases 0.000 description 1
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 1
- 208000019622 heart disease Diseases 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 230000003054 hormonal effect Effects 0.000 description 1
- 230000002267 hypothalamic effect Effects 0.000 description 1
- 208000027866 inflammatory disease Diseases 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 208000014674 injury Diseases 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 238000007477 logistic regression Methods 0.000 description 1
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 239000012139 lysis buffer Substances 0.000 description 1
- 229910001629 magnesium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 208000007106 menorrhagia Diseases 0.000 description 1
- 230000005906 menstruation Effects 0.000 description 1
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 description 1
- 210000002346 musculoskeletal system Anatomy 0.000 description 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 1
- 230000002611 ovarian Effects 0.000 description 1
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 1
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 1
- 230000009984 peri-natal effect Effects 0.000 description 1
- 238000001558 permutation test Methods 0.000 description 1
- 238000002205 phenol-chloroform extraction Methods 0.000 description 1
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 description 1
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 210000002345 respiratory system Anatomy 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 102200094055 rs17576 Human genes 0.000 description 1
- 102200094057 rs2250889 Human genes 0.000 description 1
- 238000005185 salting out Methods 0.000 description 1
- 239000013049 sediment Substances 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 108091007196 stromelysin Proteins 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 230000008733 trauma Effects 0.000 description 1
- 210000002229 urogenital system Anatomy 0.000 description 1
Images
Abstract
Изобретение относится к медицине, а именно к клинической онкологии, медицинской генетике, молекулярной диагностике, и может быть использовано для прогнозирования риска развития рака молочной железы (РМЖ) у женщин с ожирением русской национальности, уроженок Центрально-Черноземного региона России. Осуществляют забор периферической венозной крови. Из периферической венозной крови выделяют ДНК. Проводят анализ полиморфных локусов гена ММР-9. При выявлении гаплотипа AGC полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9 прогнозируют высокий риск развития РМЖ у женщин с ожирением. Способ обеспечивает получение новых критериев оценки риска развития РМЖ у пациенток русской национальности, уроженок Центрально–Черноземного региона РФ, на основе данных о полиморфных локусах rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9. 3 ил., 4 пр.
Description
Изобретение относится к области медицины, в частности, к клинической онкологии, медицинской генетике, молекулярной диагностике и может быть использовано для прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин с ожирением.
На сегодняшний день рак молочной железы (РМЖ) можно охарактеризовать как достаточно распространенную среди женского населения онкологическую патологию. В структуре онкологической заболеваемости в России РМЖ занимает первое место, составляя 20,8% от всех злокачественных опухолей. РМЖ является самой частой причиной смерти женщин с онкологическими заболеваниями, занимая 17,0% в структуре летальности. Средний возраст заболевших составляет 62 года, но вместе с тем отмечается тенденция к «омоложению» данной категории заболеваний, что и является одной из ключевых детерминант развития и совершенствования лечебно-диагностического процесса в сфере онкологии с непосредственной актуализацией данного заболевания: совершенствование и «переосмысление» уже существующих методов, разработка принципиально новых методик (хирургических и консервативных) [Пасечникова Е.А., Бодня В.Н., Кадомцев Д.В., Шаров Д-М.А., Нибо К.Б., Георгиева А.Ю., Торосян О.Т., Тихонова Е.Н., Максимовских В.М., Азаркин Е.В., Занина Е.С. Роль интраоперационной лучевой терапии в комплексном лечении рака молочной железы: современное состояние проблемы // Современные проблемы науки и образования. – 2020. – № 1.].
Согласно данным Cancer Research UK. Risk factors for breast cancer (2020) [Cancer Research UK. Risk factors for breast cancer. URL: https://www.cancerresearchuk.org/about-cancer/breast-cancer/risks-causes/risk-factors (дата обращения: 02.07.2022).], выделяют более 20 факторов возникновения и развития РМЖ, большинство из которых включены в современные модели расчёта рисков изучаемого заболевания (Gail, Tyrer-Cusick, Rosner Colditz BCRAT, BCPRO, and BOADICEA) [Olsson HL and Olsson ML (2020) The Menstrual Cycle and Risk of Breast Cancer: A Review. Front. Oncol. 10:21. doi: 10.3389/fonc.2020.00021].
Эндогенный гормональный фон представляется доминирующим механизмом во взаимосвязи ожирения и риска РМЖ. В постменопаузе происходит снижение продукции гормонов в яичниках, активируется синтез эстрогенов в жировой ткани и печени при участии ароматазы. Таким образом, избыточное количество жировой ткани становится причиной гиперэстрогении и, соответственно, повышенного риска РМЖ. У молодых женщин в пременопаузе избыточная масса тела не является фактором риска РМЖ. В развитых странах лица, страдающие различными формами ожирения, составляют 20–30 % от общего числа популяции, а 40–50 % имеют избыточную массу тела. Согласно эпидемиологическим прогнозам, предполагается, что к 2025 г. ожирением будут страдать около 40 % мужчин и 50 % женщин. При ожирении у женщин происходит изменения функции гипоталамо-гипофизарной системы, нарушается гипоталамический контроль за продукцией фолликулостимулирующего и лютеинизирующего гормонов яичника. Эти нарушения приводят к аменорее, меноррагиям или удлинению менструального цикла – факторам риска РМЖ. Ожирение практически всегда сочетается с диабетом и артериальной гипертензией. Исследования показывают, что сочетание диабета и сердечных заболеваний увеличивает риск развития РМЖ в 2,2 раза [Федоров В.Э., Чебуркаева М.Ю. Распространенность и факторы риска рака молочной железы // Фундаментальные исследования. – 2015. – № 1-2. – С. 414-419].
Проведённые зарубежные исследования показали значимую роль MMPs в канцерогенезе при РМЖ [Association of matrix metalloproteinases 3 and 9 single nucleotide polymorphisms with breast cancer risk: A case control study / F.A. Ibrahim, S.E. Elfeky, M. Haroun [et al.] // Mol Clin Oncol.-2020.-N.13.-P.54-62.; Kaczorowska, A. Selected Matrix Metalloproteinases (MMP-2, MMP-7) and Their Inhibitor (TIMP-2) in Adult and Pediatric Cancer / A. Kaczorowska, N. Miękus, J. Stefanowicz [et al.] // Diagnostics (Basel).-2020.-V.10.-N.8.-P.547. doi: 10.3390/diagnostics10080547].
Семейство ММРs (матриксинов) представляет собой пул эндопептидаз, содержащих ионы Zn2+- и Ca2+ в своих активных сайтах. Наиболее значимые представители из них это коллагеназы, не обладающие специфичностью (например, ММР 1,8,13), желатиназы, или специфические коллагеназы коллагена 4-го типа (ММР 2 и 9), стромелизины (например, ММР 3 и 10), матрилизины (ММР 7, ММР 26) и особый тип ММР – мембранный (MMP 14, 15,16, 24) [Conlon GA, Murray GI. Recent advances in understanding the roles of matrix metalloproteinases in tumour invasion and metastasis. J Pathol. 2019 Apr;247(5):629-640. doi: 10.1002/path.5225. Epub 2019 Feb 15. PMID: 30582157.].
В отдельных исследованиях показаны ассоциации с развитием РМЖ полиморфизма генов матриксных металлопротеиназ. Однако, следует отметить, что подавляющее большинство этих исследований выполнено зарубежными учеными, тогда как в Российской Федерации подобные исследования единичны. Также, следует отметить, что полученные в разных популяциях результаты нередко отличаются между собой, что может быть обусловлено как этиопатогенетическими особенностями возникновения и течения РМЖ у индивидуумов из различных этнотерриториальных групп народонаселения, так и разным дизайном исследований.
Одной из важных задач современной онкологии является изучение причин и механизмов развития рака молочной железы, среди которых значимую роль играют генетические факторы.
В Российской Федерации исследования вовлеченности гена ММР-9 в формирование предрасположенности к РМЖ у женщин с ожирением единичны и фрагментарны, а данные о роли генетических вариантов rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9 в развитии РМЖ у женщин с ожирением отсутствуют.
Для оценки сложившейся патентной ситуации был выполнен поиск по охранным документам за период с 1990 по 2022 гг. Анализ документов производился по направлению: способ прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин с ожирением в зависимости от полиморфных маркеров гена ММР-9. Источники информации: сайт Федерального института промышленной собственности http://fips.ru.
В изученной научно-медицинской и доступной патентной литературе авторами не было обнаружено способа прогнозирования риска развития РМЖ у женщин с ожирением на основе данных о полиморфных локусах rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9.
Известен способ прогнозирования прогрессирования рака молочной железы по патенту РФ № 2741232 (опубликован 22.01.2022), включающий определение в периферической крови промежуточного метаболита витамина D 25(OH)D. При значении его содержания в сыворотке крови ≤ 18,9 нг/мл прогнозируют прогрессирование заболевания. Способ обеспечивает повышение точности прогнозирования прогрессирования рака молочной железы за счет определения промежуточного метаболита витамина D 25(OH)D в венозной крови, проявляющееся в снижении показателя промежуточного метаболита витамина D 25(OH)D, предшествующем прогрессированию заболевания. Недостатком этого способа является трудоемкость выполнения и кроме того не учитывается роль генетических полиморфизмов.
Известен способ прогнозирования прогрессирования рака молочной железы по патенту РФ № 2336822 (опубликован 27.08.2008), включающий исследование крови пациента. Дополнительно при обследовании определяют показатели: возраст, социальный статус, сопутствующие заболевания, количество моноцитов крови, скорость оседания эритроцитов (СОЭ), общий билирубин крови, креатинин крови, удельный вес мочи, реакцию мочи. Затем определяют прогностический коэффициент (ПК) для каждого показателя. В системе возраст при маркере до 20 лет устанавливают ПК равным (0), при маркере 20-29 лет - равным (-10), при маркере 30-39 лет - равным (-7), при маркере 40-49 лет - равным (+4), при маркере 50-59 лет - равным (+3), при маркере 60-69 лет - равным (+2), при маркере 70-79 лет - равным (+4), при маркере 80 и более лет - равным (-3). В системе социальный статус при маркере рабочие устанавливают ПК равным (+4), при маркере служащие - равным (-1), при маркере учащиеся - равным (0), при маркере безработные - равным (-12), при маркере пенсионеры и инвалиды труда (ИТР) - равным (+1). В системе сопутствующие заболевания при маркере заболевания желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) устанавливают ПК равным (-10), при маркере заболевания сердечно-сосудистой системы - равным (+2), при маркере заболевания эндокринной системы - равным (+1,5), при маркере заболевания дыхательной системы - равным (0), при маркере заболевания опорно-двигательного аппарата - равным (0), при маркере заболевания мочеполовой системы - равным (-13), при маркере сочетание сопутствующий заболеваний - равным (-1), при маркере отсутствие сопутствующих заболеваний - равным (+2). В системе моноциты крови при маркере нет устанавливают ПК равным (0), при маркере 1-3% - равным (-2,5), при маркере 4-6% - равным (+2), при маркере 7-10% - равным (+2,5), при маркере более 10% - равным (0). В системе скорость оседания эритроцитов при маркере - 1-10 мм/ч устанавливают ПК равным (-1), при маркере 11-20 мм/ч - равным (-3), при маркере 21-30 мм/ч - равным (+7), при маркере 31-40 мм/ч - равным (0), при маркере более 40 мм/ч - равным (0). В системе общий билирубин при маркере менее 8,8 мкмоль/л устанавливают ПК равным (0), при маркере 8,8-17 мкмоль/л - равным (-1), при маркере более 17 мкмоль/л - равным (+5,5). В системе креатинин при маркере менее 0,07 ммоль/л устанавливают ПК равным (+11), при маркере 0,07-0,17 - равным (-3), при маркере более 0,17 мкмоль/л - равным (0). В системе удельный вес мочи при маркере менее 1008 устанавливают ПК равным (0), при маркере 1008-1026 - равным (+2), при маркере более 1026 - равным (+6). В системе реакция мочи при маркере кислая, устанавливают ПК равным (+3), при маркере нейтральная - равным (-3), при маркере щелочная - равным (-12). При сумме ПК от (-54,5) до (-21,5) прогнозируют низкую вероятность рака молочной железы, при сумме от (+11) до (+44,5) прогнозируют высокую вероятность рака молочной железы. Однако прогнозирование таким способом рака молочной железы сопряжено с профилактическими осмотрами, при этом диспансеризация лиц из групп повышенного риска должна проводиться длительное время вплоть до возраста 55 лет.
Известен способ доклинической диагностики рецидива рака молочной железы по патенту РФ 2263319 (опубликован 27.10.2005), включающий биохимическое исследование биологической жидкости пациента, отличающийся тем, что у менопаузальных женщин после комплексного лечения рака молочной железы в динамике определяют концентрацию эстриола, эстрона и эстрадиола в моче, вычисляют соотношение эстриола к эстрону и эстрадиолу и при значении его 1,68±0,23 констатируют отсутствие рецидива, а при его снижении до значений 0,74±0,12 у пациенток, проживающих без рецидива менее 1 года, до 0,65±0,13 у пациенток, проживших без рецидива от 2 до 6 лет, и до 0,50±0,10 у пациенток, проживших без рецидива от 6 до 10 лет, констатируют развитие рецидива. Недостатком данного способа является высокая стоимость анализа, что особенно важно при его многократном повторении в ходе наблюдения за больными после комплексного лечения.
Патент РФ № 2522501 (опубликован 20.07.2014), в котором описан способ прогнозирования наследственной предрасположенности к раку молочной железы. Сущность способа заключается в том, что проводят амплификацию коротких фрагментов гена BLM протяженностью до 200 п.о., с последующим высокоразрешающим плавлением, включающим оптимизированный для гена BLM этап формирования гетеродуплексов: быстрый нагрев до 95°С и медленное снижение температуры до 50°С; выбирают один фрагмент с аберрантным профилем плавления для секвенирования, секвенируют выбранный фрагмент и при выявлении мутации гена BLM прогнозируют наследственную предрасположенность к раку молочной железы. Недостатком этого способа является его трудоемкость, он не учитывает роль генетических полиморфизмов.
Известен способ прогнозирования генерализации рака молочной железы по патенту РФ № 2204836, (опубликован 20.05.2003). В данном способе проводят диагностическое наблюдение больных раком молочной железы. Определяют тромбоцитарную активность МАО-Б в плазме крови, что обеспечивает доклиническое выявление генерализации рака молочной железы. При снижении тромбоцитарной активности МАО-Б в 4-6 раз по отношению к норме прогнозируют генерализацию процесса. Недостатком предлагаемого способа является использование в качестве маркера только одного показателя - тромбоцитарной активности МАО-Б в плазме крови, применение способа в отношении уже больных раком молочной железы, преимущественная информативность предлагаемого показателя тромбоцитарной активности МАО-Б в период генерализации процесса при наличии отдаленных метастазов, что делает невозможным применение способа в ранней диагностике рака молочной железы.
Патент РФ № 2631940 (опубликован 28.09.2017), в котором описан способ прогнозирования рака молочной железы. Сущность способа заключается в том, что определяют факторы риска: ношение тугого бюстгальтера (Б), возраст (В), перенесенные воспалительные заболевания молочной железы (ЗМЖ), перенесенные заболевания щитовидной железы (ЗЩЖ), индекс массы тела (ИМТ), частое употребление жирной, жареной и копченой пищи (Калл), некормление ребенка грудью (НКГ), кормление ребенка грудью год и более (КГ≥1 год), позднее наступление менструации (ПНМ), длительное проживание в военных городках (ПВО), перенесенные травмы молочной железы (ТМЖ). Отсутствие каждого из указанных факторов оценивают как «0 баллов», а наличие - «1 балл». Показатели ПНМ, В, ИМТ оценивают количественно. Рассчитывают прогностический коэффициент ПК по заявленной формуле. Если значение ПК меньше 0,2197, то прогнозируют низкий риск, а если ПК от 0,2197 и более - высокий риск рака молочной железы. Недостатком способа является сложность расчетов и не учитываются генетические факторы.
Прогнозирование риска рака молочной железы на основе естественных исследований // Зиннатуллина Г.Ф., Бермишева М.А., Кононова В.А., Фарахтдинова А.Р., Хуснутдинова Э.К. // Креативная хирургия и онкология. 2009. №2. URL: https://cyberleninka.ru/article/n/prognozirovanie-vozniknoveniya-riska-raka-molochnoy-zhelezy-na-osnove-geneticheskih-issledovaniy (дата обращения: 24.07.2022), характеризуется проведением анализа распространенности двух вариантов гена NBN (c.657del5 и p.R215W) у больных раком молочной железы в Республике Башкортостан и Ханты-Мансийском автономном округе. Недостатком данного исследования является применение только для коренных жителей Республики Башкортостан и Ханты-Мансийского автономного округа.
Задачей настоящего исследования является расширение арсенала методов диагностики риска развития РМЖ у женщин, а именно создание способа прогнозирования риска развития РМЖ у женщин с ожирением на основе данных о полиморфных локусах rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9.
Технический результат использования изобретения – получение критериев оценки риска развития РМЖ у пациенток русской национальности, уроженок Центрально – Черноземного региона РФ, на основе данных о полиморфных локусах rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9, включающий:
- забор периферической венозной крови;
- выделение ДНК из периферической венозной крови;
- анализ полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9;
- прогнозирование высокого риска развития РМЖ у женщин с ожирением при выявлении гаплотипа AGC полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9.
Новизна и изобретательский уровень заключаются в том, что из уровня техники не известна возможность прогноза развития РМЖ у женщин с ожирением на основе данных о гаплотипе AGC полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9.
Способ осуществляют следующим образом:
Производят забор периферической венозной крови. Выделение геномной ДНК из периферической крови осуществляют методом фенольно-хлороформной экстракции (Miller, S. A. A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells / S. A. Miller, D. D. Dykes, H. F. Polesky // Nucleic. Acids. Res. – 1988. – Vol. 16, № 3. – P. 1215) в два этапа. На первом этапе к 4 мл крови с ЭДТА добавляют 25 мл лизирующего буфера, содержащего 320мМ сахарозы, 1% тритон Х-100, 5мМ MgCl2, 10мМ трис-HCl (pH=7,6). Полученную смесь перемешивают и центрифугируют при 4ºС, 4000 об./мин. в течение 20 минут. После центрифугирования надосадочную жидкость сливают, к осадку добавляют 4 мл раствора, содержащего 25 мМ ЭДТА (рН=8,0) и 75 мМ NaCl, ресуспензируют. Затем прибавляют 0,4 мл 10% SDS, 35 мкл протеиназы К (10мг/мл) и инкубируют образец при 37ºС в течение 16 часов.
На втором этапе из полученного лизата последовательно проводят экстракцию ДНК равными объемами фенола, фенол-хлороформа (1:1) и хлороформа с центрифугированием при 4000 об./мин. в течение 10 минут. После каждого центрифугирования производят отбор водной фазы. ДНК осаждают из раствора двумя объемами охлажденного 96% этанола. После лиофилизации полученную ДНК растворяют в бидистиллированной, деионизованной воде и хранят при -200С.
Анализ полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9 осуществлялся методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) на термоциклере CFX-96 Real-Time System (Bio-Rad) c использованием стандартных олигонуклеотидных праймеров и зондов (синтезированы в ООО «Тест - Ген» (Ульяновск)).
Амплификация геномной ДНК производилась в реакционной смеси, суммарным объемом 10 мкл, включающей смесь для ПЦР ММР-9 – 4 мкл, Taq-полимеразу - 2 мкл, исследуемый образец (~30 нг ДНК/мкл) - 1 мкл, деионизированная вода – 3мкл.
Генотипирование исследуемых образцов осуществляли с использованием программного обеспечения «CFX-Manager™» методом дискриминации аллелей по величинам относительных единиц флуоресценции (ОЕФ) (фиг. 1, фиг. 2, фиг. 3).
Изобретение характеризуется фигурами:
Фиг. 1. Дискриминации аллелей методом детекции TaqMan зондов по данным величин ОЕФ (относительные единицы флуоресценции) каждого зонда на амплификаторе CFX96 c детектирующей системой в режиме реального времени полиморфного локуса rs17576 ММР-9 (
- AA, 
- GG, 
- AG, ■ - отриц. контр.).
Фиг. 2. Дискриминации аллелей методом детекции TaqMan зондов по данным величин ОЕФ (относительные единицы флуоресценции) каждого зонда на амплификаторе CFX96 c детектирующей системой в режиме реального времени полиморфного локуса rs3787268 ММР-9 (- AA, - GG, - GA, ■ - отриц. контр.).
Фиг. 3. Дискриминации аллелей методом детекции TaqMan зондов по данным величин ОЕФ (относительные единицы флуоресценции) каждого зонда на амплификаторе CFX96 c детектирующей системой в режиме реального времени полиморфного локуса rs2250889 ММР-9 (
- CC, 
- GG, 
-CG, ■ - отриц. контр.).
Определение частот гаплотипов и анализ ассоциаций гаплотипов с развитием РМЖ у женщин с ожирением проводилось с помощью логистического регрессионного анализа в программе PLINK (версия 1.07) [Ponomarenko, I.V., Polonikov, A.V., Churnosov, M.I. Association of ESR2 RS4986938 polymorphism with the development of endometrial hyperplasia (2019) Akusherstvo i Ginekologiya (Russian Federation), 2019 (4), pp. 66-72.]. При необходимости в исследование включали ковариаты (возраст, индекс массы тела). После проведения пермутационного теста (выполнялось 1000 пермутаций) за статистически значимый уровень принимали ррerm<0,05.
Возможность использования предложенного способа для оценки прогнозирования риска развития РМЖ подтверждает анализ результатов наблюдений 309 пациенток, из них 119 больные с раком молочной железы и ожирением и 190 женщин контрольной группы. Средний возраст больных составил 54,74±12,73 лет (варьировал от 25 до 84 лет). Возрастные характеристики больных и контроля были сопоставимы. В выборки для исследования включались критерии: 1) пациентки русской национальности, являющиеся уроженками Центрального Черноземья РФ, не имеющие родства между собой и проживающие в Белгородской области (Чурносов М.И., Сорокина И.Н., Балановская Е.В. Генофонд населения Белгородской области. Динамика индекса эндогамии в районных популяциях // Генетика. 2008. Т. 44. № 8. С. 1117-1125), добровольно согласившиеся на проведение исследования; 2) в группу больных включались пациентки только после установления диагноза заболевания РМЖ, подтвержденного с помощью клинических и лабораторно-инструментальных (в т.ч. морфологических) методов обследования.
Обследование больных РМЖ проводилось на базе поликлинического и химиотерапевтического отделений Белгородского областного онкологического диспансера; формирование контрольной группы (без клинико-анамнестических признаков РМЖ) проводилось на базе перинатального центра БОКБ Святителя Иоасафа (в ходе проф. осмотров).
Все больные РМЖ и женщины контрольной группы подписали информированное согласие на участие в исследовании (проведение исследования было согласовано с этическим комитетом медицинского института НИУ «БелГУ»).
Типирование молекулярно-генетических маркеров осуществлялось на кафедре медико-биологических дисциплин медицинского института НИУ «БелГУ».
При расчете частот гаплотипов и анализе их ассоциаций у пациенток установлена связь с формированием РМЖ у женщин с ожирением гаплотипа AGC полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9. Гаплотип AGC полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9 является фактором риска развития РМЖ у женщин с ожирением (ОR=1,54).
В качестве примеров конкретного применения разработанного способа приведено генетическое исследование по полиморфным локусам rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9 у русских женщин, уроженок Центрально-Черноземного региона РФ и не являющихся родственницами между собой.
У пациентки Ч. была взята венозная кровь, при генотипировании ДНК-маркеров был выявлен гаплотип GGG полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9, что позволило отнести пациентку в группу женщин с низким риском развития РМЖ с ожирением. При дальнейшем наблюдение диагноз рака молочной железы у пациентки Ч. не подтвердился.
У пациентки О. была взята венозная кровь, при генотипировании ДНК-маркеров был выявлен гаплотип AGC полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9, что позволило отнести пациента в группу пациенток с повышенным риском развития РМЖ с ожирением. Дальнейшее наблюдение подтвердило диагноз рака молочной железы у пациентки О.
У пациентки И. была взята венозная кровь, при генотипировании ДНК-маркеров был выявлен гаплотип ААG полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9, что позволило отнести пациентку в группу больных с пониженным риском развития РМЖ с ожирением. Дальнейшее наблюдение не подтвердило диагноз рака молочной железы у пациентки.
У пациентки Э. была взята венозная кровь, при генотипировании ДНК-маркеров был выявлен гаплотип AGC полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9, что позволило отнести пациентку в группу индувидуумов с повышенным риском развития РМЖ с ожирением. При дальнейшем наблюдение диагноз рака молочной железы у пациентки Э. подтвердился.
Применение данного способа позволит на доклиническом этапе формировать среди пациенток группы риска и своевременно реализовывать в этих группах необходимые лечебно-профилактические мероприятия по предупреждению развития РМЖ у женщин с ожирением.
Claims (1)
- Способ прогнозирования риска развития рака молочной железы (РМЖ) у женщин с ожирением русской национальности, уроженок Центрально-Черноземного региона России, включающий забор периферической венозной крови, выделение ДНК из периферической венозной крови, анализ полиморфных локусов гена ММР-9, характеризующийся тем, что при выявлении гаплотипа AGC полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889 гена ММР-9 прогнозируют высокий риск развития РМЖ у женщин с ожирением.
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2795244C1 true RU2795244C1 (ru) | 2023-05-02 |
Family
ID=
Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN101346629A (zh) * | 2005-11-16 | 2009-01-14 | 儿童医学中心公司 | 评估乳癌风险的方法 |
| WO2013151413A1 (en) * | 2012-04-02 | 2013-10-10 | Infovalley Life Science Sdn. Bhd. | Methods and compositions for determining increased risk for breast cancer |
| RU2617936C2 (ru) * | 2014-12-01 | 2017-04-28 | Общество с ограниченной ответственностью "Таргетные медицинские технологии" | Способ экспресс-анализа генетического полиморфизма для выявления генетической предрасположенности к раку молочной железы |
Patent Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN101346629A (zh) * | 2005-11-16 | 2009-01-14 | 儿童医学中心公司 | 评估乳癌风险的方法 |
| WO2013151413A1 (en) * | 2012-04-02 | 2013-10-10 | Infovalley Life Science Sdn. Bhd. | Methods and compositions for determining increased risk for breast cancer |
| RU2617936C2 (ru) * | 2014-12-01 | 2017-04-28 | Общество с ограниченной ответственностью "Таргетные медицинские технологии" | Способ экспресс-анализа генетического полиморфизма для выявления генетической предрасположенности к раку молочной железы |
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| ПАВЛОВА Н.В. и др. Роль высокопенетрантных мутаций в генах BRCA1 и CHEK2 в характере ассоциаций полиморфизма генов матриксных металлопротеиназ с раком молочной железы. Научные результаты биомедицинских исследований. 2022; 8 (2): 180-197. Принята к печати 2 марта 2022 г. YAN C. Estimation of associations between MMP9 gene polymorphisms and breast cancer: Evidence from a meta-analysis. Int J Biol Markers. 2022 Mar; 37 (1): 13-20. Epub 2022 Feb 14. XU T. et al. Association between matrix metalloproteinase 9 polymorphisms and breast cancer risk: An updated meta-analysis and trial sequential analysis. Gene. 2020 Oct 30; 759: 144972. Epub 2020 Jul 30. * |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CA2900022C (en) | Non-invasive diagnostic method for diagnosing bladder cancer | |
| EP3303618B1 (en) | Methods of prostate cancer prognosis | |
| CN101985651B (zh) | 胃肠肿瘤诊断和预示的新分子标记 | |
| EP3543361A1 (en) | Methods and compositions for correlating genetic markers with colorectal cancer risk | |
| US20080207723A1 (en) | Methods for Detecting and Monitoring COX-2 RNA in Plasma and Serum | |
| US20110070582A1 (en) | Gene Expression Profiling for Predicting the Response to Immunotherapy and/or the Survivability of Melanoma Subjects | |
| WO2011112845A2 (en) | Methods and compositions related to a multi-methylation assay to predict patient outcome | |
| US20240076743A1 (en) | Method for Predicting and Treating Clinically Significant Prostate Cancer | |
| Fraga et al. | The HIF1A functional genetic polymorphism at locus+ 1772 associates with progression to metastatic prostate cancer and refractoriness to hormonal castration | |
| Kim et al. | Genetic variants at 1q32. 1, 10q11. 2 and 19q13. 41 are associated with prostate-specific antigen for prostate cancer screening in two Korean population-based cohort studies | |
| RU2795244C1 (ru) | Способ прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин с ожирением | |
| RU2795726C1 (ru) | Способ прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин без ожирения | |
| CN110029165B (zh) | 一种用于检测子宫内膜癌易感相关遗传标记的试剂盒 | |
| RU2795720C1 (ru) | Способ прогнозирования риска развития люминального подтипа рака молочной железы | |
| RU2795100C1 (ru) | Способ прогнозирования повышенного риска развития рака молочной железы 1-2 стадий у женщин на основе полиморфизма гена матриксной металлопротеиназы 9 | |
| RU2811257C1 (ru) | Способ прогнозирования риска развития тройного негативного подтипа рака молочной железы | |
| RU2795897C1 (ru) | Способ прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин с использованием молекулярно-генетических данных | |
| RU2798666C1 (ru) | Способ прогнозирования низкого риска развития рака молочной железы у женщин с высокопенетратными мутациями в генах BRCA1 и CHEK2 | |
| Chung et al. | Effect of tissue inhibitor of metalloproteinases-3 genetics polymorphism on clinicopathological characteristics of uterine cervical cancer patients in Taiwan | |
| RU2823459C1 (ru) | Способ прогнозирования риска развития 3 степени злокачественности опухолевых клеток при раке молочной железы | |
| RU2557977C1 (ru) | Способ прогнозирования риска формирования гиперпластических процессов эндометрия | |
| RU2830467C1 (ru) | Способ прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин с ожирением на основе данных о полиморфизме генов JMJD1C, PPP1R21 и PRMT6 | |
| RU2828523C1 (ru) | Способ прогнозирования риска развития люминального подтипа рака молочной железы у женщин | |
| RU2828525C1 (ru) | Способ прогнозирования риска развития рака молочной железы у женщин без ожирения по результатам генетического тестирования | |
| RU2830346C1 (ru) | Способ прогнозирования риска развития тройного негативного рака молочной железы у женщин с использованием молекулярно-генетических данных |