RU2782496C1 - Method for predicting the risk of developing h. pylori-positive duodenal ulcer using data on mmp-9 gene polymorphism - Google Patents
Method for predicting the risk of developing h. pylori-positive duodenal ulcer using data on mmp-9 gene polymorphism Download PDFInfo
- Publication number
- RU2782496C1 RU2782496C1 RU2022104029A RU2022104029A RU2782496C1 RU 2782496 C1 RU2782496 C1 RU 2782496C1 RU 2022104029 A RU2022104029 A RU 2022104029A RU 2022104029 A RU2022104029 A RU 2022104029A RU 2782496 C1 RU2782496 C1 RU 2782496C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- pylori
- mmp
- developing
- duodenal ulcer
- risk
- Prior art date
Links
- 208000000718 duodenal ulcer Diseases 0.000 title claims abstract description 42
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 25
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title description 6
- 108010015302 Matrix metalloproteinase-9 Proteins 0.000 claims abstract description 23
- 102000054766 genetic haplotypes Human genes 0.000 claims abstract description 13
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims abstract description 10
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims abstract description 10
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 claims abstract description 3
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims description 5
- 238000010241 blood sampling Methods 0.000 claims description 2
- 238000007400 DNA extraction Methods 0.000 claims 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 abstract 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- 208000008469 Peptic Ulcer Diseases 0.000 description 13
- 238000011161 development Methods 0.000 description 12
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 12
- 208000011906 peptic ulcer disease Diseases 0.000 description 12
- 210000001198 duodenum Anatomy 0.000 description 11
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 10
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 10
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 9
- 208000007107 Stomach Ulcer Diseases 0.000 description 8
- 210000004400 mucous membrane Anatomy 0.000 description 8
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 7
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 7
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 description 7
- 210000004051 gastric juice Anatomy 0.000 description 7
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 6
- 238000009792 diffusion process Methods 0.000 description 6
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 6
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 6
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 6
- 201000005917 gastric ulcer Diseases 0.000 description 6
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 6
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 5
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 description 5
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 5
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 102100030412 Matrix metalloproteinase-9 Human genes 0.000 description 4
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 description 4
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 4
- 238000011897 real-time detection Methods 0.000 description 4
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 206010071602 Genetic polymorphism Diseases 0.000 description 3
- 102000002274 Matrix Metalloproteinases Human genes 0.000 description 3
- 108010000684 Matrix Metalloproteinases Proteins 0.000 description 3
- 208000025865 Ulcer Diseases 0.000 description 3
- 101800000970 Vacuolating cytotoxin Proteins 0.000 description 3
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 3
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 3
- 210000004379 membrane Anatomy 0.000 description 3
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 3
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000590002 Helicobacter pylori Species 0.000 description 2
- 101000990902 Homo sapiens Matrix metalloproteinase-9 Proteins 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 2
- 239000008367 deionised water Substances 0.000 description 2
- 229910021641 deionized water Inorganic materials 0.000 description 2
- 210000001156 gastric mucosa Anatomy 0.000 description 2
- 229940037467 helicobacter pylori Drugs 0.000 description 2
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 2
- -1 hydrogen ions Chemical class 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 2
- 210000003097 mucus Anatomy 0.000 description 2
- 229940021182 non-steroidal anti-inflammatory drug Drugs 0.000 description 2
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 2
- 230000003449 preventive effect Effects 0.000 description 2
- 231100000397 ulcer Toxicity 0.000 description 2
- 230000001018 virulence Effects 0.000 description 2
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-M Bicarbonate Chemical class OC([O-])=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 101710112752 Cytotoxin Proteins 0.000 description 1
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 1
- 206010012735 Diarrhoea Diseases 0.000 description 1
- 108010067770 Endopeptidase K Proteins 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 102000010834 Extracellular Matrix Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010037362 Extracellular Matrix Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102100021022 Gastrin Human genes 0.000 description 1
- 108010052343 Gastrins Proteins 0.000 description 1
- 208000007882 Gastritis Diseases 0.000 description 1
- 241000589989 Helicobacter Species 0.000 description 1
- 206010019375 Helicobacter infections Diseases 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 101001041393 Homo sapiens Serine protease HTRA1 Proteins 0.000 description 1
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- 206010054949 Metaplasia Diseases 0.000 description 1
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 102000057297 Pepsin A Human genes 0.000 description 1
- 108090000284 Pepsin A Proteins 0.000 description 1
- 108010047320 Pepsinogen A Proteins 0.000 description 1
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 1
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 description 1
- 239000013504 Triton X-100 Substances 0.000 description 1
- 102000036861 Zinc-dependent endopeptidases Human genes 0.000 description 1
- 108091006982 Zinc-dependent endopeptidases Proteins 0.000 description 1
- 210000003815 abdominal wall Anatomy 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000016571 aggressive behavior Effects 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 1
- 238000012098 association analyses Methods 0.000 description 1
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 description 1
- 210000002469 basement membrane Anatomy 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 description 1
- 230000036770 blood supply Effects 0.000 description 1
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- AOXOCDRNSPFDPE-UKEONUMOSA-N chembl413654 Chemical compound C([C@H](C(=O)NCC(=O)N[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@H](CCSC)C(=O)N[C@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](CC=1C=CC=CC=1)C(N)=O)NC(=O)[C@@H](C)NC(=O)[C@@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 AOXOCDRNSPFDPE-UKEONUMOSA-N 0.000 description 1
- YTRQFSDWAXHJCC-UHFFFAOYSA-N chloroform;phenol Chemical compound ClC(Cl)Cl.OC1=CC=CC=C1 YTRQFSDWAXHJCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001684 chronic effect Effects 0.000 description 1
- 231100000599 cytotoxic agent Toxicity 0.000 description 1
- 239000002619 cytotoxin Substances 0.000 description 1
- 230000006866 deterioration Effects 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- 230000037213 diet Effects 0.000 description 1
- 235000005911 diet Nutrition 0.000 description 1
- 230000002183 duodenal effect Effects 0.000 description 1
- 238000002848 electrochemical method Methods 0.000 description 1
- 230000002996 emotional effect Effects 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 1
- 230000004090 etiopathogenesis Effects 0.000 description 1
- 210000002744 extracellular matrix Anatomy 0.000 description 1
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 1
- 230000027119 gastric acid secretion Effects 0.000 description 1
- 238000012252 genetic analysis Methods 0.000 description 1
- 230000036732 histological change Effects 0.000 description 1
- 230000013632 homeostatic process Effects 0.000 description 1
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 1
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 1
- 229940088592 immunologic factor Drugs 0.000 description 1
- 239000000367 immunologic factor Substances 0.000 description 1
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 230000003902 lesion Effects 0.000 description 1
- 238000007477 logistic regression Methods 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 239000012139 lysis buffer Substances 0.000 description 1
- 239000003771 matrix metalloproteinase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 229940121386 matrix metalloproteinase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 230000007721 medicinal effect Effects 0.000 description 1
- 230000015689 metaplastic ossification Effects 0.000 description 1
- 230000004899 motility Effects 0.000 description 1
- 210000004877 mucosa Anatomy 0.000 description 1
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 1
- 239000000041 non-steroidal anti-inflammatory agent Substances 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 1
- 210000001711 oxyntic cell Anatomy 0.000 description 1
- 229940094443 oxytocics prostaglandins Drugs 0.000 description 1
- 238000002559 palpation Methods 0.000 description 1
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 1
- 231100000255 pathogenic effect Toxicity 0.000 description 1
- 230000035515 penetration Effects 0.000 description 1
- 229940111202 pepsin Drugs 0.000 description 1
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 1
- 238000001558 permutation test Methods 0.000 description 1
- 238000002205 phenol-chloroform extraction Methods 0.000 description 1
- 230000003234 polygenic effect Effects 0.000 description 1
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 238000011321 prophylaxis Methods 0.000 description 1
- 150000003180 prostaglandins Chemical class 0.000 description 1
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 1
- 230000012846 protein folding Effects 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 230000008929 regeneration Effects 0.000 description 1
- 238000011069 regeneration method Methods 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 102200094055 rs17576 Human genes 0.000 description 1
- 102200094051 rs17577 Human genes 0.000 description 1
- 102200094057 rs2250889 Human genes 0.000 description 1
- 238000005185 salting out Methods 0.000 description 1
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 1
- 239000013049 sediment Substances 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 230000000391 smoking effect Effects 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 230000000472 traumatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 1
Images
Abstract
Description
Изобретение относится к области медицинской диагностики и предназначено для прогнозирования риска развития H. pylori-позитивной язвенной болезни двенадцатиперстной кишки.The invention relates to the field of medical diagnostics and is intended to predict the risk of developing H. pylori-positive duodenal ulcer.
Язвенная болезнь желудка и двенадцатиперстной кишки (ЯБЖ и ДПК) относится к группе многофакторных заболеваний, в формирование которого вовлечены ряд факторов риска и полигенная основа. Этиология и патогенез язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки активно изучаются как российскими, так и зарубежными исследователями (Malfertheiner, P. Helicobacter pylori Infection: New Facts in Clinical Management / P. Malfertheiner, M. Venerito, C. Schulz // Cur. Treat. Options Gastroenterol. - 2018. - Vol. 16, № 4. - P. 605-615), однако, несмотря на это, к настоящему времени, не создана единая теория патогенеза ЯБЖ и ДПК (Осипова А.С. Язвенная болезнь желудка и двенадцатиперстной кишки и ее осложнения / А.С. Осипова, Ю.К. Саитова, С.Н. Стяжкина // Вопросы науки и образования. - 2017. - № 9. - С. 66-69).Peptic ulcer of the stomach and duodenum (PUD and duodenum) belongs to the group of multifactorial diseases, the formation of which involves a number of risk factors and a polygenic basis. The etiology and pathogenesis of gastric and duodenal ulcers are actively studied by both Russian and foreign researchers (Malfertheiner, P. Helicobacter pylori Infection: New Facts in Clinical Management / P. Malfertheiner, M. Venerito, C. Schulz // Cur. Treat. Options Gastroenterol. - 2018. - Vol. 16, No. 4. - P. 605-615), however, despite this, to date, a unified theory of the pathogenesis of GU and duodenum has not been created (Osipova A.S. Gastric ulcer and of the duodenum and its complications / A. S. Osipova, Y. K. Saitova, S. N. Styazhkina // Questions of science and education - 2017. - No. 9. - P. 66-69).
Эпидемиологические исследования свидетельствуют о значимой связи между инфекцией H. pylori и язвенной болезнью. Однако, при этом, следует отметить, что около половины населения мира имеет хроническую инфекцию H. pylori слизистой оболочки желудка и двенадцатиперстной кишки, но только у 5-15% развиваются язвы. Среди факторов, определяющих будет ли инфекция вызывать заболевание, важное значение имеют следующие: характер гистологических изменений, вызванных гастритом, выраженность нарушений в гомеостазе гормонов желудка и секреции соляной кислоты, наличие метаплазии желудка в двенадцатиперстной кишки, взаимодействие H. рylori со слизистым барьером, иммунные факторы, ульцерогенность штамма H. рylori, генетические факторы, прием НПВП и др. (Chaperone activity of serine protease HtrA of Helicobacter pylori as a crucial survival factor under stress conditions / U. Zarzecka, A. Harrer, A. Zawilak-Pawlik [et al.]. - DOI: 10.1186/s12964-019-0481-9 // Cell Commun. Signal. - 2019. - Vol. 17, № 1. - Art. 161. - URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6892219/pdf/12964_2019_Article_481.pdf (date of the application 12.05.2021)).Epidemiological studies show a significant association between H. pylori infection and peptic ulcer disease. However, it should be noted that about half of the world's population has chronic H. pylori infection of the gastric and duodenal mucosa, but only 5-15% develop ulcers. Among the factors that determine whether an infection will cause a disease, the following are important: the nature of the histological changes caused by gastritis, the severity of disturbances in the homeostasis of gastric hormones and hydrochloric acid secretion, the presence of gastric metaplasia in the duodenum, the interaction of H. pylori with the mucous barrier, immune factors , H. pylori strain ulcerogenicity, genetic factors, NSAIDs, etc. (Chaperone activity of serine protease HtrA of Helicobacter pylori as a crucial survival factor under stress conditions / U. Zarzecka, A. Harrer, A. Zawilak-Pawlik [et al .] - DOI: 10.1186/s12964-019-0481-9 // Cell Commun. Signal - 2019. - Vol. 17, No. 1. - Art. 161. - URL: https://www.ncbi.nlm .nih.gov/pmc/articles/PMC6892219/pdf/12964_2019_Article_481.pdf (date of the application 05/12/2021)).
Развитие язвенной болезни включает в себя взаимосвязь между поражением, защитой и восстановлением слизистой оболочки, поскольку она постоянно незащищена от воздействия травмирующих факторов среды (Diagnosis and Treatment of Peptic Ulcer Disease / R. T. Kavitt, A. M. Lipowska, A. Anyane-Yeboa, I. M. Gralnek // Am. J. Med. - 2019. - Vol. 132, № 4. - P. 447-456). Регулярное употребление нестероидных противовоспалительных препаратов, чрезмерное употребление алкоголя, нездоровое питание, курение и эмоциональный стресс являются важными этиологическими факторами развития ЯБЖ и ДПК (Se-Hwan Yeo et al., 2016). Согласно современным представлениям развитие язвенного поражения в слизистой оболочке желудка или 12-перстной кишки обусловлено нарушением в равновесии между факторами агрессии (высокая продукция соляной кислоты за счет повышения числа обкладочных клеток и увеличения образования гастрина, нарушенная нервная и гуморальная регуляция кислотообразования в желудке, повышенная выработка пепсина и пепсиногена, нарушенная моторика желудка и 12-перстной кишки, приводящая к поражению слизистой оболочки) и защитными факторами (уменьшение образования желудочной слизи и изменения в ее качественном составе, снижение содержания бикарбонатов в секрете желудка и поджелудочной железы, нарушение процесса регенерации и ухудшение кровоснабжения в слизистой желудка и 12-перстной кишки, снижение уровня простагландинов в слизистой оболочке гастродуоденальной зоны). Следует отметить, что наиболее значимую роль в патогенезе язвенной болезни желудка играет инфекция H. pylori.The development of peptic ulcer disease includes the relationship between damage, protection and restoration of the mucous membrane, since it is constantly unprotected from the effects of traumatic environmental factors (Diagnosis and Treatment of Peptic Ulcer Disease / R. T. Kavitt, A. M. Lipowska, A. Anyane-Yeboa, I. M. Gralnek // Am. J. Med. - 2019. - Vol. 132, No. 4. - P. 447-456). Regular use of non-steroidal anti-inflammatory drugs, excessive alcohol consumption, unhealthy diet, smoking and emotional stress are important etiological factors in the development of PU and duodenal ulcer (Se-Hwan Yeo et al., 2016). According to modern concepts, the development of an ulcerative lesion in the mucous membrane of the stomach or duodenum is due to a violation in the balance between aggression factors (high production of hydrochloric acid due to an increase in the number of parietal cells and an increase in the formation of gastrin, disturbed nervous and humoral regulation of acid formation in the stomach, increased production of pepsin and pepsinogen, impaired motility of the stomach and duodenum, leading to damage to the mucous membrane) and protective factors (decrease in the formation of gastric mucus and changes in its qualitative composition, a decrease in the content of bicarbonates in the secretion of the stomach and pancreas, disruption of the regeneration process and deterioration of blood supply to mucous membrane of the stomach and duodenum 12, a decrease in the level of prostaglandins in the mucous membrane of the gastroduodenal zone). It should be noted that H. pylori infection plays the most significant role in the pathogenesis of gastric ulcer.
Согласно данным литературы, важное значение в этиопатогенезе ЯБЖ и ДПК имеют матриксные металлопротеиназы (ММР). Данное семейство внеклеточных цинк-зависимых эндопептидаз играет ключевую роль в расщеплении компонентов экстрацеллюлярного матрикса, базальных мембран и ряда клеточных поверхностных белков (Expression pattern and association analysis of porcine matrix metallopeptidase 9 (MMP9) with diarrhea and performance traits in piglets / M. Kou, D. Guo, L. Liu [et al.] // Res. Vet. Sci. - 2020. - Vol. 129. - P. 53-58).According to the literature, matrix metalloproteinases (MMPs) play an important role in the etiopathogenesis of PU and duodenum. This family of extracellular zinc-dependent endopeptidases plays a key role in the breakdown of extracellular matrix components, basement membranes, and a number of cell surface proteins (Expression pattern and association analysis of porcine matrix metallopeptidase 9 (MMP9) with diarrhea and performance traits in piglets / M. Kou, D Guo, L. Liu [et al.] // Res. Vet. Sci. - 2020. - Vol. 129. - P. 53-58).
Эти медико-биологические эффекты матриксных металлопротеиназ, как свидетельствуют литературные материалы, имеют важное значение в патогенезе ЯБЖ и ДПК (Fields, G.B. The Rebirth of Matrix Metalloproteinase Inhibitors: Moving Beyond the Dogma / G.B. Fields. - DOI: 10.3390/cells8090984 // Cells. - 2019. - Vol. 8, № 9. - 984. - URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6769477/pdf/cells-08-00984.pdf (date of the application 02.05.2021)).These medical and biological effects of matrix metalloproteinases, as evidenced by the literature, are important in the pathogenesis of PU and duodenum (Fields, G.B. The Rebirth of Matrix Metalloproteinase Inhibitors: Moving Beyond the Dogma / G.B. Fields. - DOI: 10.3390/cells8090984 // Cells. - 2019. - Vol. 8, No. 9. - 984. - URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6769477/pdf/cells-08-00984.pdf (date of the application 05/02/2021)).
В настоящее время H. рylori признана одним из основных факторов развития ЯБЖ и ДПК и служит наиболее значимым патогенным агентом, колонизирующим слизистую оболочку антрального отдела желудка человека (Gastric Damage and Cancer-Associated Biomarkers in Helicobacter pylori- Infected Children / S. George, Y. Lucero, J.P. Torres [et al.]. - DOI: 10.3389/fmicb.2020.00090 // Front. Microbiol. - 2020. - Vol. 11. - Art. 90. - URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7029740/pdf/fmicb-11-00090.pdf (date of the application 02.05.2021)), который выявляется в 70-90% всех случаев язв желудка и 90% язв двенадцатиперстной кишки у человека. Патогенное действие H. рylori определяется наличием у нее вирулентных генов, обуславливающих развитие болезни. К генам вирулентности H. рylori относятся вакуолизирующий цитотоксин (VacA) и цитотоксин- ассоциированный ген A (CagA) (Farshad, S. Association of H. pylori virulence genes CagA, VacA and UreAB with ulcer and nonulcer diseases in Iranian population / S. Farshad, A. Alborzi, A. Abbasian // Pak. J. Biol. Sci. - 2007. - Vol. 10, № 8. - P. 1185-1189).Currently, H. pylori is recognized as one of the main factors in the development of gastric ulcer and duodenal ulcer and serves as the most significant pathogenic agent that colonizes the mucous membrane of the antrum of the human stomach (Gastric Damage and Cancer-Associated Biomarkers in Helicobacter pylori-Infected Children / S. George, Y. Lucero, J.P. Torres [et al.] - DOI: 10.3389/fmicb.2020.00090 // Front. Microbiol. - 2020. - Vol. 11. - Art. 90. - URL: https://www.ncbi.nlm. nih.gov/pmc/articles/PMC7029740/pdf/fmicb-11-00090.pdf (date of the application 05/02/2021)), which is detected in 70-90% of all cases of gastric ulcers and 90% of duodenal ulcers in humans. The pathogenic effect of H. pylori is determined by the presence of virulent genes in it, which determine the development of the disease. H. pylori virulence genes include vacuolating cytotoxin (VacA) and cytotoxin-associated gene A (CagA) (Farshad, S. Association of H. pylori virulence genes CagA, VacA and UreAB with ulcer and nonulcer diseases in Iranian population / S. Farshad , A. Alborzi, A. Abbasian // Pak. J. Biol. Sci. - 2007. - Vol. 10, No. 8. - P. 1185-1189).
Одной из важных задач современной гастроэнторологии является изучение причин и механизмов развития H. pylori-позитивной язвенной болезни двенадцатиперстной кишки, среди которых значимую роль играют генетические факторы.One of the important tasks of modern gastroenterology is the study of the causes and mechanisms of development of H. pylori-positive duodenal ulcer, among which genetic factors play a significant role.
В Российской Федерации исследования вовлеченности гена ММР-9 в формирование предрасположенности к H. pylori-позитивной ЯБ ДПК единичны, а данные о роли генетических вариантов rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 гена ММР-9 в развитии H. pylori-позитивной ЯБ ДПК отсутствуют.In the Russian Federation, studies of the involvement of the MMP-9 gene in the formation of predisposition to H. pylori-positive duodenal ulcer are rare, and there are no data on the role of genetic variants rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 of the MMP-9 gene in the development of H. pylori-positive duodenal ulcer.
Для оценки сложившейся патентной ситуации был выполнен поиск по охранным документам за период с 1990 по 2021 гг. Анализ документов производился по направлению: способ прогнозирования риска развития язвенной болезни двенадцатиперстной кишки на основе молекулярно-генетических данных в зависимости от полиморфных маркеров гена ММР-9. Источники информации: сайты Федерального института промышленной собственности http://fips.ru.To assess the current patent situation, a search was performed on titles of protection for the period from 1990 to 2021. The analysis of documents was carried out in the direction: a method for predicting the risk of developing duodenal ulcer based on molecular genetic data, depending on polymorphic markers of the MMP-9 gene. Sources of information: sites of the Federal Institute of Industrial Property http://fips.ru.
В изученной научно-медицинской и доступной патентной литературе авторами не было обнаружено способа прогнозирования риска развития H. pylori-позитивной ЯБ ДПК на основе данных о полиморфных локусах rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 гена ММР-9.In the studied scientific medical and available patent literature, the authors did not find a way to predict the risk of developing H. pylori-positive duodenal ulcer based on data on the polymorphic loci rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 of the MMP-9 gene.
Известен способ прогнозирования риска развития язвенной болезни (патент RU №2231794, опубл. 27.06.2004), включающий исследования желудочных проб, основанный на измерении скорости диффузии ионов водорода через слой слизи, покрывающей слизистой оболочки желудка, путем введения в желудок тестового 0,1 H раствора соляной кислоты и исследования динамики проникновения ионов водорода в слизистой оболочки путем эвакуации содержимого желудка, тем самым определяют риск развития язвенной болезни Недостатком этого способа является трудоемкость выполнения, которая заключается в многократной эвакуации содержимого желудка и введении в желудок большого количества соляной кислоты, сложность подсчетов, и кроме того не учитывается роль генетических полиморфизмов.A known method for predicting the risk of developing peptic ulcer (patent RU No. 2231794, publ. 27.06.2004), including studies of gastric samples, based on measuring the rate of diffusion of hydrogen ions through the layer of mucus covering the gastric mucosa, by introducing test 0.1 H into the stomach hydrochloric acid solution and studying the dynamics of the penetration of hydrogen ions into the mucous membrane by evacuating the contents of the stomach, thereby determining the risk of developing peptic ulcer. and besides, the role of genetic polymorphisms is not taken into account.
Известен способ и устройство для прогнозирования риска развития язвенной болезни (патент RU №2318217, опубл. 27.02.2008), сущность способа заключается в том, что электрохимическим методом измеряют диффузионный (жидкостной) или мембранный потенциал между желудочным соком и тестовой жидкостью, и при величине потенциала более порогового уровня, установленного для тестовой жидкости, прогнозируют риск развития язвенной болезни, в качестве тестовой жидкости можно использовать воду. В этом случае пороговый уровень составляет 10 мв, одновременно с измерением диффузионного или мембранного потенциала может быть измерен рн желудочного сока, при этом риск развития язвенной болезни прогнозируют при величине диффузионного или мембранного потенциала более порогового уровня, установленного для тестовой жидкости, и рн менее 1,5. Устройство для осуществления способа при исследовании желудочного сока in vitro состоит из двух емкостей, разделенных диафрагмой: с желудочным соком и с тестовой жидкостью. В них опущены электроды сравнения, напряжение между которыми равно диффузионному потенциалу, устройство для исследования желудочного сока in vivo содержит камеру с тестовой жидкостью, через диафрагму, контактирующую с желудочным соком, и два электрода сравнения, один из которых контактирует с желудочным соком, а другой - с тестовой жидкостью. Напряжение между электродами равно диффузионному потенциалу, использование способа позволяет своевременно начать профилактическое лечение язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки. Недостатком этого способа является его трудоемкость, он не учитывает роль генетических полиморфизмов.A known method and device for predicting the risk of developing peptic ulcer (patent RU No. 2318217, publ. 27.02.2008), the essence of the method lies in the fact that the diffusion (liquid) or membrane potential between gastric juice and test fluid is measured by the electrochemical method, and at a value potential of more than the threshold level set for the test fluid, predict the risk of developing peptic ulcer, water can be used as a test fluid. In this case, the threshold level is 10 mV, simultaneously with the measurement of diffusion or membrane potential, the pH of gastric juice can be measured, while the risk of developing peptic ulcer is predicted if the diffusion or membrane potential is greater than the threshold level set for the test fluid, and pH is less than 1, 5. The device for implementing the method in the study of gastric juice in vitro consists of two containers separated by a diaphragm: with gastric juice and test fluid. They omit the reference electrodes, the voltage between which is equal to the diffusion potential, the device for the study of gastric juice in vivo contains a chamber with a test liquid, through the diaphragm, in contact with gastric juice, and two reference electrodes, one of which is in contact with gastric juice, and the other - with test fluid. The voltage between the electrodes is equal to the diffusion potential, the use of the method allows timely start of prophylactic treatment of gastric ulcer and duodenal ulcer. The disadvantage of this method is its complexity, it does not take into account the role of genetic polymorphisms.
Известен способ прогнозирования развития язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки (патент RU №2281037, опубл. 10.08.2006). Сущность способа заключается в том, что осуществляют определение календарного возраста пациента, биологического возраста, соотношение биологического и календарного возрастов, рост, массу тела, показатели качества жизни. Затем рассчитывают вероятность развития язвенной болезни по формуле:A known method for predicting the development of gastric ulcer and duodenal ulcer (patent RU No. 2281037, publ. 10.08.2006). The essence of the method consists in determining the patient's calendar age, biological age, the ratio of biological and calendar ages, height, body weight, and quality of life indicators. Then the probability of developing a peptic ulcer is calculated using the formula:
где е - экспонента, число оснований натурального логарифма, равное - 2,71, D1 - сумма показателей, умноженных на коэффициент В дискриминантных функций для больных, D2 - сумма показателей, умноженных на коэффициент А дискриминантных функций для здоровых, при этом значения коэффициентов А и В выбирают из таблицы «Коэффициенты дискриминантных функций» и при P1>Р2 прогнозируют риск развития язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки. Недостатком этого способа является то, что он не учитывает роль генетических полиморфизмов.where e is the exponent, the number of bases of the natural logarithm, equal to - 2.71, D1 is the sum of the indicators multiplied by the coefficient B of the discriminant functions for patients, D2 is the sum of the indicators multiplied by the coefficient A of the discriminant functions for healthy people, while the values of the coefficients A and B is selected from the table "Coefficients of discriminant functions" and at P1>P2, the risk of developing gastric ulcer and duodenal ulcer is predicted. The disadvantage of this method is that it does not take into account the role of genetic polymorphisms.
Известен способ оценки риска развития язвенной болезни двенадцатиперстной кишки у хакасов на основе генетического анализа (патент RU №2563828, опубликован 20.09.2015) Способ характеризуется тем, что устанавливают факторы риска - определяют полиморфизм интерлейкина IL-8 методом рестрикционного анализа при выделении ДНК из лимфоцитов венозной крови, а также определяют генотип Helicobacter pylori методом ПЦР при выделении ДНК из биоптатов слизистой оболочки желудка у пациентов, относящихся к коренным жителям Республики Хакасия. Факторам риска присваивают числовые значения и затем определяют прогностические коэффициенты P1, Р2. При Р1>Р2 прогнозируют низкий риск , а при Р1<Р2 прогнозируют высокий риск развития язвенной болезни . Недостатком данного метод является трудоемкость подсчета и применим только для коренных жителей Республики Хакасия.A known method for assessing the risk of developing duodenal ulcer in Khakassians based on genetic analysis (patent RU No. 2563828, published on September 20, 2015) blood, and also determine the genotype of Helicobacter pylori by PCR when extracting DNA from biopsy specimens of the gastric mucosa in patients belonging to the indigenous inhabitants of the Republic of Khakassia. Risk factors are assigned numerical values and then predictive coefficients P1, P2 are determined. At P1>P2, a low risk is predicted, and at P1<P2, a high risk of developing peptic ulcer is predicted. The disadvantage of this method is the complexity of the calculation and is applicable only to the indigenous inhabitants of the Republic of Khakassia.
Задачей настоящего исследования является расширение арсенала методов диагностики, а именно создание способа прогнозирования риска развития H. pylori-позитивной ЯБ ДПК на основе данных о полиморфных локусах rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 гена ММР-9.The aim of this study is to expand the arsenal of diagnostic methods, namely, to create a method for predicting the risk of developing H. pylori-positive duodenal ulcer based on data on the rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 polymorphic loci of the MMP-9 gene.
Технический результат использования изобретения - получение критериев оценки риска развития H. pylori-позитивной язвенной болезни двенадцатиперстной кишки у индивидуумов русской национальности, уроженцев Центрально - Черноземного региона РФ, на основе данных о полиморфных локусах rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 гена ММР-9, включающий:The technical result of using the invention is to obtain criteria for assessing the risk of developing H. pylori-positive duodenal ulcer in individuals of Russian nationality, natives of the Central Chernozem region of the Russian Federation, based on data on polymorphic loci rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 of the MMP-9 gene, including :
- забор венозной крови;- venous blood sampling;
- выделение ДНК из периферической венозной крови;- isolation of DNA from peripheral venous blood;
- анализ полиморфизмов rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 гена ММР-9;- analysis of polymorphisms rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 of the MMP-9 gene;
- прогнозирование высокого риска развития H. pylori-позитивной язвенной болезни двенадцатиперстной кишки у индивидуумов при выявлении гаплотипа GACG полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 гена ММР-9.- predicting a high risk of developing H. pylori-positive duodenal ulcer in individuals when detecting the GACG haplotype of polymorphic loci rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 of the MMP-9 gene.
Новизна и изобретательский уровень заключаются в том, что из уровня техники не известна возможность прогноза развития H. pylori-позитивной ЯБ ДПК у пациентов на основе данных о гаплотипе GACG полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 гена ММР-9.The novelty and inventive step lies in the fact that the prior art does not know the possibility of predicting the development of H. pylori-positive duodenal ulcer in patients based on data on the GACG haplotype of polymorphic loci rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 of the MMP-9 gene.
Способ осуществляют следующим образом:The method is carried out as follows:
Выделение геномной ДНК из периферической крови осуществляют методом фенольно-хлороформной экстракции (Miller, S.A. A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells / S. A. Miller, D.D. Dykes, H.F. Polesky // Nucleic. Acids. Res. - 1988. - Vol. 16, № 3. - P. 1215) в два этапа. На первом этапе к 4 мл крови с ЭДТА добавляют 25 мл лизирующего буфера, содержащего 320 мМ сахарозы, 1% тритон Х-100, 5мМ MgCl2, 10 мМ трис-HCl (pH=7,6). Полученную смесь перемешивают и центрифугируют при 4ºС, 4000 об/мин в течение 20 минут. После центрифугирования надосадочную жидкость сливают, к осадку добавляют 4 мл раствора, содержащего 25 мМ ЭДТА (рН=8,0) и 75 мМ NaCl, ресуспензируют. Затем прибавляют 0,4 мл 10% SDS, 35 мкл протеиназы К (10мг/мл) и инкубируют образец при 37°С в течение 16 часов.Isolation of genomic DNA from peripheral blood is carried out by phenol-chloroform extraction (Miller, SA A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells / SA Miller, DD Dykes, HF Polesky // Nucleic. Acids. Res. - 1988. - Vol 16, No. 3. - P. 1215) in two stages. At the first stage, 25 ml of lysis buffer containing 320 mM sucrose, 1% Triton X-100, 5 mM MgCl 2 , 10 mM Tris-HCl (pH=7.6) is added to 4 ml of blood with EDTA. The resulting mixture is stirred and centrifuged at 4°C, 4000 rpm for 20 minutes. After centrifugation, the supernatant is drained, 4 ml of a solution containing 25 mM EDTA (pH=8.0) and 75 mM NaCl is added to the sediment, and resuspended. Then add 0.4 ml of 10% SDS, 35 µl of proteinase K (10 mg/ml) and incubate the sample at 37°C for 16 hours.
На втором этапе из полученного лизата последовательно проводят экстракцию ДНК равными объемами фенола, фенол-хлороформа (1:1) и хлороформа с центрифугированием при 4000 об/мин в течение 10 минут. После каждого центрифугирования производят отбор водной фазы. ДНК осаждают из раствора двумя объемами охлажденного 96% этанола. После лиофилизации полученную ДНК растворяют в бидистиллированной, деионизованной воде и хранят при -20°С.At the second stage, DNA is sequentially extracted from the obtained lysate with equal volumes of phenol, phenol-chloroform (1:1) and chloroform with centrifugation at 4000 rpm for 10 minutes. After each centrifugation produce the selection of the aqueous phase. DNA is precipitated from solution with two volumes of chilled 96% ethanol. After lyophilization, the resulting DNA is dissolved in bidistilled, deionized water and stored at -20°C.
Анализ полиморфных маркеров rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 гена ММР-9 осуществлялся методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) на термоциклере CFX-96 Real-Time System (Bio-Rad) c использованием стандартных олигонуклеотидных праймеров и зондов (синтезированы в ООО «Тест - Ген» (Ульяновск)).Polymorphic markers rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 of the MMP-9 gene were analyzed by polymerase chain reaction (PCR) on a CFX-96 Real-Time System (Bio-Rad) thermal cycler using standard oligonucleotide primers and probes (synthesized at Test- Gen" (Ulyanovsk)).
Амплификация геномной ДНК производилась в реакционной смеси, суммарным объемом 10 мкл, включающей смесь для ПЦР ММР-9 - 4 мкл, Taq-полимеразу - 2 мкл, исследуемый образец (~30 нг ДНК/мкл) - 1 мкл, деионизированная вода – 3 мкл.Amplification of genomic DNA was carried out in a reaction mixture with a total volume of 10 µl, including a mixture for PCR MMP-9 - 4 µl, Taq polymerase - 2 µl, test sample (~30 ng DNA/µl) - 1 µl, deionized water - 3 µl .
Генотипирование исследуемых образцов осуществлялось с использованием программного обеспечения «CFX-Manager™» методом дискриминации аллелей по величинам относительных единиц флуоресценции (ОЕФ) (фиг. 1, фиг. 2, фиг. 3, фиг. 4).Genotyping of the studied samples was carried out using the software "CFX-Manager™" by the method of discrimination of alleles by the values of relative fluorescence units (RFU) (Fig. 1, Fig. 2, Fig. 3, Fig. 4).
Изобретение характеризуется фигурами:The invention is characterized by figures:
Фиг. 1 - Дискриминации аллелей методом детекции TaqMan зондов по данным величин ОЕФ (относительные единицы флуоресценции) каждого зонда на амплификаторе CFX96 c детектирующей системой в режиме реального времени полиморфизма rs17576 ММР-9 (
Фиг. 2 - Дискриминации аллелей методом детекции TaqMan зондов по данным величин ОЕФ (относительные единицы флуоресценции) каждого зонда на амплификаторе CFX96 c детектирующей системой в режиме реального времени полиморфизма rs3787268 ММР-9 (
Фиг. 3 - Дискриминации аллелей методом детекции TaqMan зондов по данным величин ОЕФ (относительные единицы флуоресценции) каждого зонда на амплификаторе CFX96 c детектирующей системой в режиме реального времени полиморфизма rs2250889 ММР-9 (
Фиг. 4 - Дискриминации аллелей методом детекции TaqMan зондов по данным величин ОЕФ (относительные единицы флуоресценции) каждого зонда на амплификаторе CFX96 c детектирующей системой в режиме реального времени полиморфизма rs17577 ММР-9 (
Определение частот гаплотипов и анализ ассоциаций гаплотипов с развитием H. pylori-позитивной ЯБ ДПК проводились с помощью логистического регрессионного анализа в программе PLINK v. 2.050 (http://zzz.bwh.harvard.edu/plink/). При необходимости в исследование включали ковариаты (возраст, пол, индекс массы тела). После проведения пермутационного теста (выполнялось 1000 пермутаций) за статистически значимый уровень принимали ррerm<0,05.Determination of haplotype frequencies and analysis of haplotype associations with the development of H. pylori-positive duodenal ulcer were carried out using logistic regression analysis in the PLINK v program. 2.050 (http://zzz.bwh.harvard.edu/plink/). When necessary, covariates (age, sex, body mass index) were included in the study. After the permutation test (1000 permutations were performed), p perm <0.05 was taken as a statistically significant level.
Возможность использования предложенного способа для оценки прогнозирования риска развития H. pylori-позитивной язвенной болезни двенадцатиперстной кишки у индивидуумов подтверждает анализ результатов наблюдений 451 пациентов, из них 104 больных с H. pylori-позитивной язвенной болезнью двенадцатиперстной кишки и 347 индивидуумов контрольной группы. Среди больных средний возраст-48,86±13,13, в контрольной группе средний возраст-48,47±13,69 лет. В выборки для исследования включались (критерии включения): 1) индивидуумы русской национальности, родившиеся в Центральном Черноземье России и проживающие в Белгородской области (Чурносов М.И., Сорокина И.Н., Балановская Е.В. Генофонд населения Белгородской области. Динамика индекса эндогамии в районных популяциях // Генетика. 2008. Т. 44. № 8. С. 1117-1125), не имеющие родства между собой, добровольно согласившиеся на проведение исследования; 2) в группу больных включались пациенты с язвенной болезнью двенадцатиперстной кишки, после установления диагноза заболевания, подтвержденного с помощью клинических, клинико-инструментальных и клинико-лабораторных методов исследования. Диагноз язвенной болезни двенадцатиперстной кишки устанавливался на основании: анамнестических данных (характерные жалобы, собирался анамнез заболевания), физикального обследования (обнаружение болезненности и резистентности мышц брюшной стенки при пальпации), инструментального обследования (обнаружение язвенного дефекта при эндоскопическом исследовании желудка и двенадцатиперстной кишки). (Клинические рекомендации, 2019).The possibility of using the proposed method to predict the risk of developing H. pylori-positive duodenal ulcer in individuals is confirmed by the analysis of the results of observations of 451 patients, including 104 patients with H. pylori-positive duodenal ulcer and 347 individuals in the control group. Among patients, the average age is 48.86±13.13, in the control group the average age is 48.47±13.69 years. The samples for the study included (inclusion criteria): 1) individuals of Russian nationality, born in the Central Black Earth region of Russia and living in the Belgorod region (Churnosov M.I., Sorokina I.N., Balanovskaya E.V. Gene pool of the population of the Belgorod region. Dynamics endogamy index in regional populations // Genetika, 2008, vol. 44, no. 2) the group of patients included patients with duodenal ulcer, after establishing the diagnosis of the disease, confirmed using clinical, clinical-instrumental and clinical-laboratory research methods. The diagnosis of duodenal ulcer was established on the basis of: anamnestic data (characteristic complaints, an anamnesis of the disease was collected), physical examination (detection of soreness and resistance of the muscles of the abdominal wall during palpation), instrumental examination (detection of a peptic ulcer during endoscopic examination of the stomach and duodenum). (Clinical guidelines, 2019).
Для выявления инфекции H. pylori использовались два метода:Two methods have been used to detect H. pylori infection:
- иммуноферментный (выявление антител к H. pylori в сыворотке крови)- enzyme immunoassay (detection of antibodies to H. pylori in blood serum)
- гистологический (определялось наличие H. pylori в биоптате слизистой оболочки гастродуоденальной зоны).- histological (the presence of H. pylori was determined in the biopsy of the mucous membrane of the gastroduodenal zone).
Обследование больных H. pylori-позитивной ЯБ ДПК проводилось на базе гастроэнтерологического отделения Белгородской областной клинической больницы Святителя Иоасафа; 3) в контрольную группу входили пациенты, не имеющие клинических и эндоскопических признаков H. pylori-позитивной ЯБ ДПК. Контрольная группа формировалась при профилактических осмотрах (обследовании) населения, проводимого в Белгородской областной клинической больнице Святителя Иоасафа.Examination of patients with H. pylori-positive duodenal ulcer was carried out on the basis of the gastroenterological department of the Belgorod Regional Clinical Hospital of St. Joasaph; 3) the control group included patients without clinical and endoscopic signs of H. pylori-positive duodenal ulcer. The control group was formed during preventive examinations (examination) of the population, conducted in the Belgorod Regional Clinical Hospital of St. Joasaph.
Все исследования проводились под контролем этического комитета ОГБУЗ БОКБ Святителя Иоасафа (протокол № 15 от 21.12.2016) с информированного согласия пациентов на использование материалов лечебно-диагностических мероприятий, связанных с заболеванием, для научно-исследовательских целей и протоколировались по стандартам этического комитета Российской Федерации.All studies were carried out under the supervision of the ethics committee of the St.
Типирование молекулярно-генетических маркеров осуществлялось на кафедре медико-биологических дисциплин медицинского института НИУ «БелГУ».Typing of molecular genetic markers was carried out at the Department of Medical and Biological Disciplines of the Medical Institute of the National Research University "BelSU".
При расчете частот гаплотипов и анализе их ассоциаций у индивидуумов установлена связь с формированием H. pylori-позитивной ЯБ ДПК гаплотипа GACG полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 гена ММР-9. Гаплотип GACG полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 гена ММР-9 является фактором риска развития H. pylori-позитивной ЯБ ДПК у индивидуумов (ОR=2,00, рperm=0,010).When calculating the frequencies of haplotypes and analyzing their associations in individuals, a relationship was established with the formation of H. pylori-positive duodenal ulcer of the GACG haplotype of polymorphic loci rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 of the MMP-9 gene. The GACG haplotype of polymorphic loci rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 of the MMP-9 gene is a risk factor for the development of H. pylori-positive duodenal ulcer in individuals (OR=2.00, pperm =0.010).
В качестве примеров конкретного применения разработанного способа приведено обследование русских пациентов, уроженцев Центрально-Черноземного региона РФ и не являющихся родственниками между собой: проведено генетическое исследование по локусам rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 гена ММР-9.As examples of the specific application of the developed method, an examination of Russian patients, natives of the Central Black Earth region of the Russian Federation and not relatives to each other, is given: a genetic study was carried out at the rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 loci of the MMP-9 gene.
У пациента Б. была взята венозная кровь, при генотипировании ДНК-маркеров был выявлен гаплотип GACG полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 гена ММР-9, что позволило отнести пациента в группу больных с высоким риском развития H. pylori-позитивной ЯБ ДПК. Дальнейшее наблюдение подтвердило диагноз H. pylori-позитивной язвенной болезни двенадцатиперстной кишки у пациента.Venous blood was taken from patient B. The GACG haplotype of polymorphic loci rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 of the MMP-9 gene was detected during genotyping of DNA markers, which made it possible to include the patient in the group of patients with a high risk of developing H. pylori-positive duodenal ulcer . Further follow-up confirmed the diagnosis of H. pylori-positive duodenal ulcer in the patient.
У пациента О. была взята венозная кровь, при генотипировании ДНК-маркеров был выявлен гаплотип АACА полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 гена ММР-9, что позволило отнести пациента в группу индувидуумов с низким риском развития H. pylori-позитивной ЯБ ДПК. Дальнейшее наблюдение не подтвердило диагноз H. pylori-позитивной язвенной болезни двенадцатиперстной кишки у пациента О.Venous blood was taken from patient O., during the genotyping of DNA markers, the AACA haplotype of polymorphic loci rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 of the MMP-9 gene was detected, which made it possible to refer the patient to the group of individuals with a low risk of developing H. pylori-positive duodenal ulcer . Further follow-up did not confirm the diagnosis of H. pylori-positive duodenal ulcer in patient O.
У пациента Л. была взята венозная кровь, при генотипировании ДНК-маркеров был выявлен гаплотип АACG полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 гена ММР-9, что позволило отнести пациента в группу больных с низким риском развития H. pylori-позитивной ЯБ ДПК. Дальнейшее наблюдение не подтвердило диагноз H. pylori-позитивной язвенной болезни двенадцатиперстной кишки у пациента.Venous blood was taken from patient L., during the genotyping of DNA markers, the AACG haplotype of polymorphic loci rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 of the MMP-9 gene was detected, which made it possible to include the patient in a group of patients with a low risk of developing H. pylori-positive duodenal ulcer . Follow-up did not confirm the diagnosis of H. pylori-positive duodenal ulcer in the patient.
У пациентки П. была взята венозная кровь, при генотипировании ДНК-маркеров был выявлен гаплотип GGCG полиморфных локусов rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 гена ММР-9, что позволило отнести пациентку в группу индувидуумов с низким риском развития H. pylori-позитивной ЯБ ДПК. При дальнейшем наблюдение диагноз H. pylori-позитивной язвенной болезни двенадцатиперстной кишки у пациентки П. не подтвердился.Venous blood was taken from the patient P., during the genotyping of DNA markers, the GGCG haplotype of polymorphic loci rs17576-rs3787268-rs2250889-rs17577 of the MMP-9 gene was detected, which made it possible to include the patient in the group of individuals with a low risk of developing H. pylori-positive duodenal ulcer . With further observation, the diagnosis of H. pylori-positive duodenal ulcer in patient P. was not confirmed.
Применение данного способа позволит на доклиническом этапе формировать среди пациентов группы риска и своевременно реализовывать в этих группах необходимые лечебно-профилактические мероприятия по предупреждению развития H. pylori-позитивной ЯБ ДПК.The use of this method will allow at the preclinical stage to form risk groups among patients and timely implement the necessary therapeutic and preventive measures in these groups to prevent the development of H. pylori-positive duodenal ulcer.
Claims (1)
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2782496C1 true RU2782496C1 (en) | 2022-10-28 |
Family
ID=
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2819776C1 (en) * | 2023-10-26 | 2024-05-24 | Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Белгородский государственный национальный исследовательский университет" (НИУ "БелГУ") | Method for prediction of risk of helicobacter pylori-positive gastric ulcer and duodenal ulcer on basis of molecular-genetic testing |
Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2143684C1 (en) * | 1998-03-16 | 1999-12-27 | Новокузнецкий государственный институт усовершенствования врачей | Method of prognosis of probability of duodenum ulcer disease initiation |
| RU2542459C1 (en) * | 2013-09-30 | 2015-02-20 | федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Хакасский государственный университет им. Н.Ф. Катанова" (ФГБОУ ВПО "ХГУ им. Н.Ф. Катанова") | Early diagnostic technique for duodenal ulcer in khakass caucasians by molecular genetic testing |
| RU2652275C2 (en) * | 2016-07-27 | 2018-04-25 | Ольга Анатольевна Курамшина | Method for predicting early development of duodenal ulcer |
Patent Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2143684C1 (en) * | 1998-03-16 | 1999-12-27 | Новокузнецкий государственный институт усовершенствования врачей | Method of prognosis of probability of duodenum ulcer disease initiation |
| RU2542459C1 (en) * | 2013-09-30 | 2015-02-20 | федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Хакасский государственный университет им. Н.Ф. Катанова" (ФГБОУ ВПО "ХГУ им. Н.Ф. Катанова") | Early diagnostic technique for duodenal ulcer in khakass caucasians by molecular genetic testing |
| RU2652275C2 (en) * | 2016-07-27 | 2018-04-25 | Ольга Анатольевна Курамшина | Method for predicting early development of duodenal ulcer |
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| МИНЯЙЛО О.Н. Распределение аллелей и гаплоблочная структура полиморфизма генов матриксных металлопротеиназ у больных Н.pylori-негативной язвенной болезнью желудка и двенадцатиперстной кишки. Научные результаты биомедицинских исследований. 2020; 6(4): 488-502. МИНЯЙЛО О.Н. и др. Гендерные особенности ассоциаций полиморфизма генов матриксных металлопротеиназ с развитием язвенной болезни у населения Центрального Черноземья России. Генетика. 2021; 57(10): 1185-1193. Принята к публикации 11.02.2021. * |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2819776C1 (en) * | 2023-10-26 | 2024-05-24 | Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Белгородский государственный национальный исследовательский университет" (НИУ "БелГУ") | Method for prediction of risk of helicobacter pylori-positive gastric ulcer and duodenal ulcer on basis of molecular-genetic testing |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Lepage et al. | Twin study indicates loss of interaction between microbiota and mucosa of patients with ulcerative colitis | |
| EP2951315B1 (en) | Non-invasive diagnostic method for diagnosing bladder cancer | |
| EP3283643B1 (en) | Means for diagnosing, predicting or monitoring pneumocystis pneumonia | |
| KR101815692B1 (en) | The human oral microbiota in diagnosis of metabolic syndrome | |
| RU2782496C1 (en) | Method for predicting the risk of developing h. pylori-positive duodenal ulcer using data on mmp-9 gene polymorphism | |
| RU2782304C1 (en) | Method for predicting the risk of developing duodenal ulcer based on molecular genetic testing | |
| KR20220162647A (en) | Composition for predicting or diagnosing colon cancer comprising strain detection agent of Lactobacillus murinus and Bacteroides vulgatus | |
| RU2780525C1 (en) | Method for predicting the risk of developing h. pylori-positive gastric ulcer | |
| CN115803450A (en) | Method for detecting severity of atopic dermatitis | |
| RU2786314C1 (en) | A method for predicting the risk of developing peptic ulcer disease in women based on genetic data | |
| RU2780505C1 (en) | Method for predicting the risk of gastric ulcer development based on genetic analysis | |
| CN112430659A (en) | Composition, kit and method for assisting in diagnosing high risk group of colorectal cancer | |
| EP2691537A1 (en) | Method for predicting abdominal obesity | |
| EP3359682B1 (en) | Method for diagnosing hepatic fibrosis based on bacterial profile and diversity | |
| RU2816514C1 (en) | Method for prediction of risk of gastric and duodenal ulcer development based on molecular genetic testing | |
| RU2819776C1 (en) | Method for prediction of risk of helicobacter pylori-positive gastric ulcer and duodenal ulcer on basis of molecular-genetic testing | |
| RU2821471C1 (en) | Method for prediction of risk of helicobacter pylori-negative gastric and duodenal ulcer | |
| RU2816519C1 (en) | Method for prediction of risk of developing duodenal ulcer based on molecular genetic testing | |
| RU2819282C1 (en) | Method for prediction of risk of developing gastric and duodenal ulcer in males based on molecular genetic testing | |
| EP3895716A1 (en) | Fmt performance prediction test to guide and optimize therapeutic management of gvhd patients | |
| RU2542459C1 (en) | Early diagnostic technique for duodenal ulcer in khakass caucasians by molecular genetic testing | |
| RU2811577C1 (en) | Method for predicting risk of developing gastric and duodenal ulcers in women based on molecular genetic testing | |
| RU2809798C1 (en) | Method of predicting risk of developing breast cancer in women using molecular genetic data | |
| Mohammed et al. | Pro-inflammatory cytokines of gastric tissues and its role in patients with H. pylori | |
| RU2811257C1 (en) | Method of predicting risk of developing triple-negative breast cancer |