[go: up one dir, main page]

RU2611358C1 - Method of predicting high risk of reproductive loss in first trimester of pregnancy - Google Patents

Method of predicting high risk of reproductive loss in first trimester of pregnancy Download PDF

Info

Publication number
RU2611358C1
RU2611358C1 RU2016103505A RU2016103505A RU2611358C1 RU 2611358 C1 RU2611358 C1 RU 2611358C1 RU 2016103505 A RU2016103505 A RU 2016103505A RU 2016103505 A RU2016103505 A RU 2016103505A RU 2611358 C1 RU2611358 C1 RU 2611358C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
mtrr
mthfr
pregnancy
trimester
reproductive
Prior art date
Application number
RU2016103505A
Other languages
Russian (ru)
Inventor
Татьяна Павловна Шкурат
Елена Владимировна Машкина
Константин Алексеевич Коваленко
Галина Ивановна Волосовцова
Original Assignee
федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Южный федеральный университет"
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Южный федеральный университет" filed Critical федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Южный федеральный университет"
Priority to RU2016103505A priority Critical patent/RU2611358C1/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2611358C1 publication Critical patent/RU2611358C1/en

Links

Images

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6804Nucleic acid analysis using immunogens
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813Hybridisation assays
    • C12Q1/6827Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6858Allele-specific amplification
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2531/00Reactions of nucleic acids characterised by
    • C12Q2531/10Reactions of nucleic acids characterised by the purpose being amplify/increase the copy number of target nucleic acid
    • C12Q2531/113PCR
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2565/00Nucleic acid analysis characterised by mode or means of detection
    • C12Q2565/10Detection mode being characterised by the assay principle
    • C12Q2565/125Electrophoretic separation
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/118Prognosis of disease development
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156Polymorphic or mutational markers
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/36Gynecology or obstetrics
    • G01N2800/368Pregnancy complicated by disease or abnormalities of pregnancy, e.g. preeclampsia, preterm labour

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

FIELD: medicine.
SUBSTANCE: invention relates to field of medicine, in particular to obstetrics and gynecology, and is intended for prediction of high risk of reproductive loss in first trimester of pregnancy. From peripheral venous blood of women DNA is extracted with the following amplification of polymorphous variants of A66G of gene MTRR, -31C-T (rs1143627) IL-1β, -174G-C (rs1800795) IL-6 and C677T (rs1801133) MTHFR. In case of detection of one of four genotypes: -31CT IL-1β / -174GG IL-6 / 677CT MTHFR / 66GG MTRR; -31CT IL-1β / -174CC IL-6 / 677CC MTHFR / 66AG MTRR; -31CC IL-1β / -174CC IL-6 / 677CC MTHFR/ 66AG MTRR; -31CC IL-1β / -174GC IL-6 / 677CT MTHFR/ 66AG MTRR, high risk of reproductive loss is predicted in first trimester of pregnancy.
EFFECT: invention makes it possible to form among women groups of risk of reproductive loss in first trimester of pregnancy and timely realise necessary thethapeutic-preventive measures in these groups.
1 dwg, 1 tbl, 7 ex

Description

Область техники, к которой относится изобретениеFIELD OF THE INVENTION

Настоящее изобретение относится к области молекулярной биологии и генетики и может быть использовано в акушерстве и гинекологии в качестве генетических маркеров при диагностике репродуктивных патологий первого триместра беременности как на этапе планирования беременности, так и на доклинической стадии.The present invention relates to the field of molecular biology and genetics and can be used in obstetrics and gynecology as genetic markers in the diagnosis of reproductive pathologies of the first trimester of pregnancy both at the stage of pregnancy planning and at the preclinical stage.

Уровень техникиState of the art

Репродуктивные потери у человека составляют около 50% по отношению к общему числу зачатий. Частота невынашивания беременности остается высокой, несмотря на достигнутые успехи в профилактике и лечении нарушений репродукции человека. В настоящее время различные виды самопроизвольного прерывания беременности рассматривают в качестве мультифакторных заболеваний, развитие которых может быть запущено комбинацией нескольких факторов. Индивидуальный вклад каждого фактора может быть незначительным, и только их сумма ведет к развитию заболевания. Подавляющая часть работ, направленных на исследование генетических причин невынашивания беременности, связана с изучением аллельных вариантов генов одной функциональной генной сети, например генов фолатного цикла, генов системы детоксикации ксенобиотиков, генов, кодирующих факторы свертывающей системы крови. В то же время известно, что ранние этапы эмбрионального развития базируются на механизмах, лежащих в основе функционирования нескольких функциональных групп белков и генов, их кодирующих.Reproductive loss in humans is about 50% in relation to the total number of conceptions. The rate of miscarriage remains high, despite the successes achieved in the prevention and treatment of human reproductive disorders. Currently, various types of spontaneous abortion are considered as multifactorial diseases, the development of which can be triggered by a combination of several factors. The individual contribution of each factor may be insignificant, and only their sum leads to the development of the disease. The vast majority of work aimed at studying the genetic causes of miscarriage is associated with the study of allelic variants of genes of one functional gene network, for example, folate cycle genes, xenobiotic detoxification genes, genes encoding coagulation factors of the blood system. At the same time, it is known that the early stages of embryonic development are based on the mechanisms underlying the functioning of several functional groups of proteins and genes encoding them.

Из существующего уровня техники для оценки риска репродуктивных потерь по причине отслойки хориона и плаценты в первом триместре беременности известен способ, который заключается в амплификации аллельных вариантов - 675 5G/4G гена ингибитора активатора плазминогена 1 типа при помощи метода ПНР (RU 2494400, опубл. 27.09.2013) /1/. Вероятность развития отслойки хориона и плаценты у женщин с высоким риском самопроизвольных репродуктивных потерь при генотипе 4G/4G прогнозируют как 50%, при генотипе 4G/5G - как 35,3%. Однако в данном способе учитывается влияния только одного гена, тогда как патогенез ранних эмбриональных потерь сложен и многокомпонентен. Кроме того способ характеризуется ограничением контингента для возможности применения, так как изобретением определена возможность прогнозирования развития отслойки хориона и плаценты только у женщин с высоким риском самопроизвольных репродуктивных потерь.From the existing level of technology for assessing the risk of reproductive losses due to chorionic and placental abruption in the first trimester of pregnancy, a method is known which consists in the amplification of allelic variants - 675 5G / 4G gene of type 1 plasminogen activator inhibitor using the PNR method (RU 2494400, publ. 27.09.09 .2013) / 1 /. The probability of developing chorionic and placental abruption in women with a high risk of spontaneous reproductive loss with the 4G / 4G genotype is predicted as 50%, with the 4G / 5G genotype as 35.3%. However, this method takes into account the influence of only one gene, while the pathogenesis of early embryonic losses is complex and multicomponent. In addition, the method is characterized by a limited contingent for possible use, since the invention determines the possibility of predicting the development of chorionic and placental detachment only in women with a high risk of spontaneous reproductive loss.

Известен способ оценки предрасположенности к развитию привычного невынашивания беременности (RU 2330071 С1, опубл. 27.07.2008) /2/. Способ предусматривает анализ сочетания полиморфизмов С677Т гена MTHFR и R353Q гена фактора VII свертывания крови и составление заключения о риске развития привычного невынашивания беременности. Генотип RRTT квалифицируется как крайне неблагоприятный. Ограничением данного способа является учет влияния только двух генов, повышающих риск, прежде всего, тромботических осложнений, и не учитывающий роль иммунологических факторов в развитии беременности.A known method of assessing a predisposition to the development of habitual miscarriage (RU 2330071 C1, publ. 27.07.2008) / 2 /. The method involves the analysis of a combination of C677T polymorphisms of the MTHFR gene and R353Q gene of coagulation factor VII gene and drawing a conclusion about the risk of developing habitual miscarriage. The RRTT genotype qualifies as extremely unfavorable. The limitation of this method is to take into account the influence of only two genes that increase the risk, primarily thrombotic complications, and do not take into account the role of immunological factors in the development of pregnancy.

На основе комбинации генов цитокинов известен способ прогнозирования риска развития преэклампсии тяжелого течения (RU 2568892 С1, опубл. 20.11.2015) /3/, который предусматривает выделение ДНК из периферической крови женщин и анализ полиморфизмов -308G/A TNFα, +36A/G TNFR1, -801G/A SDF1, C/G МСР-1. Повышенный риск развития преэклампсии тяжелого течения прогнозируют при наличии сочетания генетических вариантов -308А TNFα, +36GG TNFR1 и -801A SDF1. Ограничением данного способа является прогнозирование осложнений беременности лишь со второго триместра.Based on a combination of cytokine genes, a method is known for predicting the risk of severe preeclampsia (RU 2568892 C1, publ. 11/20/2015) / 3 /, which involves the extraction of DNA from the peripheral blood of women and the analysis of polymorphisms -308G / A TNFα, + 36A / G TNFR1 , -801G / A SDF1, C / G MCP-1. An increased risk of severe preeclampsia is predicted with a combination of the genetic variants -308A TNFα, + 36GG TNFR1 and -801A SDF1. The limitation of this method is the prediction of pregnancy complications only from the second trimester.

Известен способ определения наследственной предрасположенности к развитию привычного невынашивания беременности (RU 2532367 С2, опубл. 10.11.2014) /4/, осуществляемый путем выделения геномной ДНК из образцов крови обследуемого лица с последующим генотипированием полиморфных вариантов 34V/L гена FXIII, М235Т гена AGT, 4a/b гена eNOS, PLA1/A2 гена GpIIIa и 353R/Q гена FVII. В данном способе после установления генотипов по всем 5 генам определяют влияние выявленных аллелей на формирование предрасположенности к привычному невынашиванию беременности путем подсчета суммарного балла. Значение суммарного балла менее 0,16 является основанием для отнесения обследуемого лица к группе с низким риском, значение от 0,16 до 0,4 баллов - к группе со средним риском, а значение более 0,4 баллов - к группе с высоким риском формирования привычного невынашивания беременности. Данный способ учитывает влияние только полиморфизмов генов системы гемостаза, что не позволяет дать объективную оценку риска невынашивания беременности.There is a method of determining a hereditary predisposition to the development of habitual miscarriage (RU 2532367 C2, publ. 10.11.2014) / 4 /, carried out by isolating genomic DNA from blood samples of the subject, followed by genotyping of polymorphic variants 34V / L of the FXIII, M235T gene of the AGT gene, 4a / b of the eNOS gene, PLA1 / A2 of the GpIIIa gene and 353R / Q of the FVII gene. In this method, after the establishment of genotypes for all 5 genes, the effect of the identified alleles on the formation of a predisposition to habitual miscarriage is determined by calculating the total score. A total score of less than 0.16 is the basis for classifying the subject as a low-risk group, a value of 0.16 to 0.4 points is a group with an average risk, and a value of more than 0.4 points is a group with a high risk of formation habitual miscarriage. This method takes into account the effect of only polymorphisms of hemostasis system genes, which does not allow an objective assessment of the risk of miscarriage.

Наиболее близким по выполнению к заявляемому изобретению является способ прогнозирования отслойки хориона в первом триместре беременности (RU 2566729 С1, опубл. 27.10.2015) /5/, принимаемый за прототип, в котором осуществляют выделение ДНК из крови пациента с последующей амплификацией полиморфных вариантов Arg353Gln (G10976А) гена коагуляционного фактора VII и Ile22Met (A66G) гена метионинсинтазы редуктазы MTRR при помощи метода ПЦР. При выявлении сочетания гетерозиготы GA полиморфного варианта Arg353Gln (G10976А) гена коагуляционного фактора VII с гомозиготой GG полиморфного варианта Ile22Met (A66G) гена метионинсинтазы редуктазы MTRR прогнозируют риск развития отслойки хориона в первом триместре беременности.The closest to implementation of the claimed invention is a method for predicting chorionic detachment in the first trimester of pregnancy (RU 2566729 C1, publ. 10.27.2015) / 5 /, taken as a prototype in which DNA is extracted from the patient’s blood with subsequent amplification of polymorphic Arg353Gln variants ( G10976A) of the coagulation factor VII gene and Ile22Met (A66G) of the MTRR reductase methionine synthase gene using the PCR method. If a combination of the GA heterozygosity of the polymorphic variant Arg353Gln (G10976A) of the coagulation factor VII gene with the homozygote GG of the polymorphic variant Ile22Met (A66G) of the MTRR reductase methionine synthase gene is predicted, the risk of chorion detachment in the first trimester of pregnancy is revealed.

Ограничение способа-прототипа состоит в том, что отслойка хориона является лишь одним из возможных осложнений гестационного периода первого триместра, более того, отслойка хориона в первом триместре беременности возможна при отсутствии сочетания полиморфизмов гена коагуляционного фактора VII и гена метионинсинтазы редуктазы MTRR. В способе-прототипе учитывается роль только факторов, влияющих на процессы коагуляции, тогда как ранние этапы онтогенеза определяются взаимодействием факторов нескольких функциональных групп, что не позволяет дать объективную оценку риска репродуктивных потерь первого триместра.The limitation of the prototype method is that chorion detachment is only one of the possible complications of the gestational period of the first trimester, moreover, chorion detachment in the first trimester of pregnancy is possible in the absence of a combination of polymorphisms of the coagulation factor VII gene and the MTRR reductase methionine synthase gene. In the prototype method, the role of only factors affecting the coagulation processes is taken into account, while the early stages of ontogenesis are determined by the interaction of factors of several functional groups, which does not allow an objective assessment of the risk of reproductive losses of the first trimester.

Раскрытие изобретенияDisclosure of invention

Техническим результатом настоящего изобретения является повышение достоверности прогнозирования высокого риска репродуктивных потерь в первом триместре беременности путем использования нового сочетания генетических вариантов 677СТ MTHFR, 66AG MTRR, -31СТ IL-1β и -174GC IL-6, т.е. генотипа по 4-м аллельным вариантам генов двух функциональных групп - провоспалительных цитокинов и фолатного цикла.The technical result of the present invention is to increase the reliability of predicting a high risk of reproductive loss in the first trimester of pregnancy by using a new combination of genetic variants 677CT MTHFR, 66AG MTRR, -31CT IL-1β and -174GC IL-6, i.e. genotype for 4 allelic variants of genes of two functional groups - pro-inflammatory cytokines and folate cycle.

Указанный технический результат достигается тем, что способ прогнозирования высокого риска репродуктивных потерь в первом триместре беременности включает выделение ДНК из периферической венозной крови женщин с последующей амплификацией полиморфного варианта A66G гена метионинсинтазы редуктазы MTRR.The specified technical result is achieved in that a method for predicting a high risk of reproductive loss in the first trimester of pregnancy involves the extraction of DNA from the peripheral venous blood of women, followed by amplification of the polymorphic variant A66G of the methionine synthase reductase gene MTRR.

Согласно изобретению проводят амплификацию аллельных вариантов генов провоспалительных цитокинов -31С-Т (rs1143627) IL-1β, -174G-C (rs1800795) IL-6 и ферментов фолатного цикла С677Т (rs1801133) MTHFR и при выявлении одного из четырех генотипов:According to the invention, allelic variants of the pro-inflammatory cytokine -31C-T (rs1143627) IL-1β, -174G-C (rs1800795) IL-6 gene and folate cycle enzymes C677T (rs1801133) MTHFR are amplified and one of the four genotypes is identified:

-31СТ IL-1β / -174GG IL-6 / 677СТ MTHFR / 66GG MTRR;-31CT IL-1β / -174GG IL-6 / 677CT MTHFR / 66GG MTRR;

-31CT IL-1β / -174CC IL-6 / 677CC MTHFR / 66AG MTRR;-31CT IL-1β / -174CC IL-6 / 677CC MTHFR / 66AG MTRR;

-31CC IL-1β / -174CC IL-6 / 677CC MTHFR/ 66AG MTRR;-31CC IL-1β / -174CC IL-6 / 677CC MTHFR / 66AG MTRR;

-3ICC IL-1β / -174GC IL-6 / 677CT MTHFR / 66AG MTRR-3ICC IL-1β / -174GC IL-6 / 677CT MTHFR / 66AG MTRR

прогнозируют высокий риск репродуктивных потерь в первом триместре беременности.predict a high risk of reproductive loss in the first trimester of pregnancy.

Из уровня техники не известна возможность прогноза возникновения репродуктивных потерь в первом триместре беременности по наличию сочетаний генетических вариантов полиморфизмов -31С-Т IL-1β (rs1143627), -174G-C IL-6 (rs1800795), C677T MTHFR (rs1801133), A66G MTRR (rs1801394). Использование генетических маркеров двух функциональных групп повышает достоверность диагностики репродуктивных патологий первого триместра беременности как на этапе планирования беременности или на доклинической стадии репродуктивной патологии.The prior art does not know the possibility of predicting the occurrence of reproductive losses in the first trimester of pregnancy by the presence of combinations of genetic variants of polymorphisms -31C-T IL-1β (rs1143627), -174G-C IL-6 (rs1800795), C677T MTHFR (rs1801133), A66G MTRR (rs1801394). The use of genetic markers of two functional groups increases the reliability of the diagnosis of reproductive pathologies of the first trimester of pregnancy both at the stage of pregnancy planning or at the preclinical stage of reproductive pathology.

На чертеже представлена электрофореграмма результатов амплификации аллелных вариантов -31С-Т (rs1143627) гена IL-1β.The drawing shows an electrophoregram of the amplification results of the allelic variants -31C-T (rs1143627) of the IL-1β gene.

В Таблице представлена распространенность сочетаний генетических вариантов генов цитокинов и ферментов фолатного цикла среди женщин контрольной группы и женщин с репродуктивными потерями в первом триместре беременности.The table shows the prevalence of combinations of genetic variants of cytokine genes and folate cycle enzymes among women in the control group and women with reproductive losses in the first trimester of pregnancy.

Осуществление изобретенияThe implementation of the invention

ДНК выделяют из образцов периферической венозной крови женщин термокоагуляционным методом с использованием коммерческого набора реагентов «ДНК-Экспресс-кровь» (Литех, Россия) согласно инструкции производителя.DNA is isolated from samples of peripheral venous blood of women by the thermocoagulation method using the commercial DNA-Express-blood reagent kit (Litech, Russia) according to the manufacturer's instructions.

В пробирку типа Эппендорф вносят 1000 мкл цельной крови женщин, центрифугируют пробу со скоростью 3000 об/мин в течение 5 мин. Аккуратно удаляют плазму. Закрывают пробирку и замораживают ее при -20°С до полного замораживания форменных элементов не менее 1 часа. Размораживают содержимое пробирки при комнатной температуре. Вносят в пробирку реактив «ДНК-экспресс-кровь» объемом, равным объему оставшихся в пробирке форменных элементов. Содержимое пробирки тщательно перемешивают на вортексе. Устанавливают пробирку в предварительно прогретый до 99°С термостат и выдерживают в течение 15 мин. По окончании охлаждают до 70°С. Центрифугируют пробирку со скоростью 12000 об/мин при комнатной температуре в течение 60 сек. Полученный супернатант используют в качестве исследуемого образца ДНК.1000 μl of women's whole blood is added to an Eppendorf tube, the sample is centrifuged at a speed of 3000 rpm for 5 minutes. Gently remove the plasma. Close the tube and freeze it at -20 ° C until the shaped elements are completely frozen for at least 1 hour. Thaw the contents of the tube at room temperature. Add the DNA-express-blood reagent into the test tube with a volume equal to the volume of the formed elements remaining in the test tube. The contents of the tubes are thoroughly mixed on a vortex. Install the tube in a thermostat preheated to 99 ° C and incubate for 15 minutes. At the end, cool to 70 ° C. Centrifuge the tube at 12,000 rpm at room temperature for 60 seconds. The resulting supernatant is used as a test sample of DNA.

Выделенную ДНК затем подвергают полимеразной цепной реакции с использованием наборов реагентов SNP-экспресс (Литех, Россия) согласно инструкции производителя:The isolated DNA is then subjected to polymerase chain reaction using SNP-express reagent kits (Litech, Russia) according to the manufacturer's instructions:

1. Приготавливают пронумерованные пробирки для проведения амплификации вместимостью 0.6 мл в соответствии с количеством анализируемых проб плюс отрицательный контроль. Для каждой пробы готовят две пробирки: «норма» и «полиморфизм».1. Prepare numbered tubes for amplification with a capacity of 0.6 ml in accordance with the number of analyzed samples plus a negative control. For each sample, two test tubes are prepared: “norm” and “polymorphism”.

2. Из компонентов комплекта SNP-экспресс готовят рабочие смеси реагентов для амплификации из расчета на 1 пробу: 17.5 мкл разбавителя, 2.5 мкл реакционной смеси, 0.2 мкл Taq-полимеразы. Готовят две рабочие смеси: с реакционной смесью «норма» и реакционной смесью «полиморфизм».2. From the components of the SNP-express kit, working mixtures of reagents are prepared for amplification per 1 sample: 17.5 μl of diluent, 2.5 μl of the reaction mixture, 0.2 μl of Taq polymerase. Two working mixtures are prepared: with the norm reaction mixture and the polymorphism reaction mixture.

3. Добавляют по 20 мкл соответствующей рабочей амплификационной смеси во все пробирки, подготовленные для амплификации.3. Add 20 μl of the appropriate working amplification mixture to all tubes prepared for amplification.

4. Добавляют во все пробирки по одной капле (25 мкл) минерального масла.4. Add one drop (25 μl) of mineral oil to all tubes.

5. В пробирку с рабочей амплификационной смесью «норма» и в пробирку с рабочей смесью «полиморфизм» вносят по 5 мкл образца ДНК.5. In a test tube with a working amplification mixture “norm” and in a test tube with a working mixture “polymorphism”, 5 μl of a DNA sample is added.

6. Закрытые пробирки быстро осаждают на вортексе.6. Sealed tubes are rapidly vortexed.

7. Переносят пробирки в прогретый до 94°С программируемый термостат и проводят амплификацию в следующем режиме: 94°С - пауза; 93°С - 1 минута; 93°С - 10 с, 64°С - 10 с, 72°С - 20 с, всего 35 циклов и 72°С - 1 минута в конце процесса.7. Transfer the tubes to a programmable thermostat heated to 94 ° C and amplify in the following mode: 94 ° C - pause; 93 ° C - 1 minute; 93 ° C - 10 s, 64 ° C - 10 s, 72 ° C - 20 s, a total of 35 cycles and 72 ° C - 1 minute at the end of the process.

Детекцию (разделение) продуктов амплификации аллельных вариантов провоспалительных цитокинов -31С-Т IL-1β (rs1143627), -174G-C IL-6 (rs1800795) и ферментов фолатного цикла С677Т MTHFR (rs1801133), A66G MTRR (rs1801394) проводят методом горизонтального электрофореза в 3% агарозном геле и фиксируют электрофореграмму на трансиллюминаторе GelDoc (BioRad (см. чертеж). Как следует из электрофореграммы, в лунки №1, 3, 5, 7, 9 первой справа дорожки добавлена амплификационная смесь с праймерами на «нормальную» аллель исследуемого гена. В лунки №2, 4, 6, 8, 10 - амплификационная смесь с праймерами на полиморфный вариант гена. В лунки №1-2, 3-4, 5-6, 7-8, 9-10 добавлены образцы ДНК исследуемых женщин. В парные лунки (например: 1-2, или 3-4) вносили ДНК одного и того же человека. В лунках №1, 3, 5, 7, 9 реакция прошла - у данных лиц выявлена «нормальная» аллель исследуемого гена. В лунках №2, 4, 6, 10 продукты амплификации не обнаружены, что указывает на отсутствие полиморфного варианта гена. В лунке 8 выявлен ПЦР-продукт, соответствующий полиморфному варианту гена.The detection (separation) of amplification products of allelic variants of the pro-inflammatory cytokines -31C-T IL-1β (rs1143627), -174G-C IL-6 (rs1800795) and folate cycle enzymes C677T MTHFR (rs1801133), A66G MTRR (rs1801394phore) is carried out in a 3% agarose gel and fix the electrophoregram on a GelDoc transilluminator (BioRad (see drawing). As follows from the electrophoregram, in amplification wells No. 1, 3, 5, 7, 9 of the first lane, the amplification mixture with primers was added to the “normal” allele of the test gene to wells No. 2, 4, 6, 8, 10 - amplification mixture with primers on limorphic version of the gene. DNA samples of the studied women were added to wells No. 1-2, 3-4, 5-6, 7-8, 9-10. DNA of one was added to paired wells (for example: 1-2, or 3-4) the same person. In the wells No. 1, 3, 5, 7, 9, the reaction went through - in these individuals a “normal” allele of the studied gene was detected. In wells No. 2, 4, 6, 10 no amplification products were detected, which indicates the absence polymorphic variant of the gene In well 8, a PCR product corresponding to the polymorphic variant of the gene was detected.

Затем выявляют ассоциации сочетаний генетических вариантов с ранними репродуктивными потерями биоинформатическим методом - Multifactor Dimensionality Reduction (программа MDR, v. 1.1.0 www.epistasis.org/mdr.html) для моделирования геномных взаимодействий высокого порядка при изучении характера межгенных взаимодействий для популяционно-генетических исследований мультифакторных полигенных заболеваний, использующих относительно небольшие объемы выборок больных и здоровых. О риске развития репродуктивных потерь судили по отношению шансов (odds ratio - OR). OR указан с 95%-ым доверительным интервалом (CI) (см. таблицу). Статистически значимыми считались различия при уровне значимости p<0,05.Then associations of combinations of genetic variants with early reproductive losses by the bioinformatics method are revealed - Multifactor Dimensionality Reduction (MDR program, v. 1.1.0 www.epistasis.org/mdr.html) for modeling high-order genomic interactions when studying the nature of intergenic interactions for population-genetic studies of multifactorial polygenic diseases using relatively small sample sizes of patients and healthy. The risk of developing reproductive losses was judged by the odds ratio (OR). OR is indicated with a 95% confidence interval (CI) (see table). Differences were considered statistically significant at a significance level of p <0.05.

Выявленные варианты генотипов:Identified variants of genotypes:

-31СТ IL-1β / -174GG IL-6 / 677СТ MTHFR / 66GG MTRR;-31CT IL-1β / -174GG IL-6 / 677CT MTHFR / 66GG MTRR;

-31СТ IL-1β / -174СС IL-6 / 677СС MTHFR / 66AG MTRR;-31CT IL-1β / -174CC IL-6 / 677CC MTHFR / 66AG MTRR;

-31CC IL-1β / -174CC IL-6 / 677CC MTHFR / 66AG MTRR;-31CC IL-1β / -174CC IL-6 / 677CC MTHFR / 66AG MTRR;

-31CC IL-1β / -174GC IL-6 / 677CT MTHFR / 66AG MTRR-31CC IL-1β / -174GC IL-6 / 677CT MTHFR / 66AG MTRR

свидетельствуют о высоком риске репродуктивных потерь.indicate a high risk of reproductive loss.

Возможность использования заявляемого способа для прогнозирования высокого риска ранних эмбриональных потерь подтверждается результатами наблюдений 141 пациентки с невынашиванием беременности первого триместра и 120 женщин контрольной группы. Средний возраст женщин составил 29 лет. В контрольную группу вошли только те женщины, у которых в анамнезе отсутствовали случаи невынашивания беременности.The possibility of using the proposed method for predicting a high risk of early embryonic losses is confirmed by the results of observations of 141 patients with miscarriage of the first trimester and 120 women of the control group. The average age of women was 29 years. The control group included only those women who had no previous history of miscarriage.

Сбор анамнестических данных и формирование исследуемых групп женщин был проведен сотрудниками кафедры акушерства и гинекологии Ростовского государственного медицинского университета, а также врачами акушерами гинекологами городской больницы №8 г. Ростова-на-Дону и роддома №5.The collection of anamnestic data and the formation of the studied groups of women was carried out by employees of the Department of Obstetrics and Gynecology of Rostov State Medical University, as well as obstetrician-gynecologists of the city hospital No. 8 of Rostov-on-Don and the maternity hospital No. 5.

Лабораторные исследования проведены на базе лаборатории генетики человека и животных Южного федерального университета. Проведение исследования было одобрено Комитетом по биоэтике Южного федерального университета.Laboratory studies were conducted at the Laboratory of Human and Animal Genetics of the Southern Federal University. The study was approved by the Bioethics Committee of the Southern Federal University.

Аллельные варианты генов 31С-Т IL-1β (rs1143627), -174G-C IL-6 (rs1800795) C677T MTHFR (rs1801133), A66G MTRR (rs1801394) были отобраны по результатам научных публикаций с учетом их патогенетического вклада в формирование ранних репродуктивных потерь, а также результатов собственных исследований по генотипированию женщин с репродуктивными потерями в первом триместре.Allelic variants of the 31C-T genes IL-1β (rs1143627), -174G-C IL-6 (rs1800795) C677T MTHFR (rs1801133), A66G MTRR (rs1801394) were selected based on the results of scientific publications taking into account their pathogenetic contribution to the formation of early reproductive losses , as well as the results of our own research on the genotyping of women with reproductive losses in the first trimester.

Существенный вклад в патогенез ранних эмбриональных потерь вносят иммунные и аутоиммунные факторы (Керчелаева С.Б., 2003) /6/. Иммунологические нарушения могут быть обусловлены особенностями генотипа, в том числе и по генам цитокинов, которые являются эндогенными медиаторами межклеточных взаимодействий. Ранние этапы эмбриогенеза зависят от соотношения функциональной активности про- и противовоспалительных цитокинов, опосредующих иммунный ответ материнского организма на развивающийся плод, контролирующих процессы формирования плаценты и ангиогенеза (Амчиславский Т. и др., 2003) /7/. Активность иммунологических реакций, реакций воспаления может определяться особенностями функционирования фолатного цикла.A significant contribution to the pathogenesis of early embryonic losses is made by immune and autoimmune factors (Kerchelaeva SB, 2003) / 6 /. Immunological disorders can be due to the characteristics of the genotype, including the cytokine genes, which are endogenous mediators of intercellular interactions. The early stages of embryogenesis depend on the ratio of the functional activity of pro- and anti-inflammatory cytokines, mediating the maternal organism’s immune response to the developing fetus, controlling the processes of placenta formation and angiogenesis (T. Amchislavsky et al., 2003) / 7 /. The activity of immunological reactions, inflammation reactions can be determined by the features of the functioning of the folate cycle.

Цитокины представляют группу полипептидов, основной функцией которых является обеспечение взаимодействий между клетками. Цитокины участвуют в регуляции разнообразных физиологических процессов; входят в систему контроля выживаемости клеток, активируют или подавляют их рост, дифференцировку. Цитокин-зависимыми процессами являются этапы созревания яйцеклетки, процессы оплодотворения, адгезии, имплантации, а также формирования плаценты. Все эти процессы предусматривают активное межклеточное взаимодействие с участием нескольких семейств цитокинов. Важнейшими из них являются цитокины семейства IL-6, TGF-β, IL-1, а также хемокины (Dimitriadis Е. et al., 2005) /8/.Cytokines represent a group of polypeptides whose main function is to provide interactions between cells. Cytokines are involved in the regulation of various physiological processes; enter the control system for cell survival, activate or inhibit their growth, differentiation. Cytokine-dependent processes are the stages of egg maturation, fertilization, adhesion, implantation, and the formation of the placenta. All these processes involve active intercellular interaction involving several families of cytokines. The most important of them are the cytokines of the family of IL-6, TGF-β, IL-1, as well as chemokines (Dimitriadis E. et al., 2005) / 8 /.

Нарушение интенсивности воспалительных реакций, в том числе и из-за особенностей генотипа по генам цитокинов, может быть фактором риска для протекания беременности (Daher S., 2012) /9/. Например, чрезмерный синтез IL-1β может привести к значительной интенсификации воспалительных реакций. Провоспалительные цитокины могут выступать важным звеном между воспалением и гиперкоагуляцией (Yoshida Н., 2009) /10/. Воспаление приводит к нарушению равновесия между про- и антикоагуляционными реакциями. Активация и связывание тромбоцитов с клетками эндотелия и лейкоцитами в зоне воспаления способствует прокоагулянтному состоянию, так как активирует факторы свертывания крови и усиливает образование тромбина (Levi М. et al., 2005) /11/.Violation of the intensity of inflammatory reactions, including due to the characteristics of the genotype for cytokine genes, may be a risk factor for pregnancy (Daher S., 2012) / 9 /. For example, excessive synthesis of IL-1β can lead to significant intensification of inflammatory reactions. Pro-inflammatory cytokines can act as an important link between inflammation and hypercoagulation (Yoshida N., 2009) / 10 /. Inflammation leads to an imbalance between pro- and anticoagulation reactions. Activation and binding of platelets to endothelial cells and leukocytes in the area of inflammation contributes to a procoagulant state, as it activates blood coagulation factors and enhances the formation of thrombin (Levi M. et al., 2005) / 11 /.

К генетическим факторам, ассоциированным с повышенным риском развития тромбозов, относятся и гены фолатного цикла (метилентетрагидрофолат-редуктазы (MTHFR), метионин-синтазы редуктазы (MTRR), метионин-синтазы (MTR)). В клетках человека фолаты необходимы для синтеза нуклеотидов, метаболизма аминокислот, метилирования нуклеиновых кислот и белков. Дефицит фолатов, вне зависимости от факторов его вызывающих, приводит к гипергомоцистеинемии, которая может стать причиной развития целого ряда патологических состояний за счет повышения уровня экспрессии генов провоспалительных цитокинов, индукции окислительного стресса, активации апоптоза и нарушения процессов метилирования (Jacques P. et al., 2001) /12/. Показано, что высокая концентрация гомоцистеина может индуцировать экспрессию IL-6 моноцитами (Su S. et al., 2005) /13/. Повышенный уровень гомоцистеина при беременности может приводить к нарушению кровообращения в плаценте, дефектам имплантации, снижению глубины инвазии трофобласта, нарушению нормального развития фетоплацентарного кровообращения.Genetic factors associated with an increased risk of thrombosis include folate cycle genes (methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR), methionine synthase reductase (MTRR), methionine synthase (MTR)). In human cells, folates are necessary for the synthesis of nucleotides, amino acid metabolism, methylation of nucleic acids and proteins. Folate deficiency, regardless of the factors causing it, leads to hyperhomocysteinemia, which can cause the development of a number of pathological conditions due to increased expression of proinflammatory cytokines, induction of oxidative stress, activation of apoptosis, and disruption of methylation processes (Jacques P. et al., 2001) / 12 /. It was shown that a high concentration of homocysteine can induce the expression of IL-6 by monocytes (Su S. et al., 2005) / 13 /. An increased level of homocysteine during pregnancy can lead to circulatory disturbances in the placenta, implantation defects, a decrease in trophoblast invasion depth, and a disturbance in the normal development of fetoplacental circulation.

Причины нарушения метаболизма фолатов могут быть обусловлены наличием полиморфных вариантов генов. Показана связь однонуклеотидных замен в генах ферментов фолатного цикла с развитием патологии беременности (Wu X. et al., 2012) /14/. По данным литературы известно, что гипергомоцистеинемия создает условия для интенсификации свободно-радикальных реакций, а также реакций воспалительного ответа (Lazzerini Р. еt al., 2007) /15/.Causes of folate metabolism disorders may be due to the presence of polymorphic gene variants. The relationship of single nucleotide substitutions in the folate cycle enzyme genes with the development of pregnancy pathology has been shown (Wu X. et al., 2012) / 14 /. According to the literature, it is known that hyperhomocysteinemia creates conditions for the intensification of free-radical reactions, as well as reactions of the inflammatory response (Lazzerini P. et al., 2007) / 15 /.

Генетические исследования репродуктивной патологии имеют несколько составляющих. В том числе и идентификацию ДНК/РНК-маркеров, имеющих прогностическую ценность для оценки риска невынашивания беременности. Проведение генотипирования по одному полиморфизму не позволяет получить результат с высокой прогностической значимостью. Прогностическая значимость исследования повышается при включении аллельных вариантов нескольких функциональных групп генов, контролирующих ключевые процессы раннего эмбрионального развития. Полиморфизмы таких генов образуют различные комбинации, усиливающие или ослабляющие эффект какого-либо отдельного генетического полиморфизма. Включение полиморфизмов генов IL-1β, IL-6, MTHFR, MTRR в программу генетического тестирования женщин позволит повысить достоверность прогнозирования высокого риска репродуктивных потерь в первом триместре беременности.Genetic studies of reproductive pathology have several components. Including the identification of DNA / RNA markers that have prognostic value for assessing the risk of miscarriage. Genotyping on one polymorphism does not allow to obtain a result with high prognostic significance. The prognostic significance of the study increases with the inclusion of allelic variants of several functional groups of genes that control key processes of early embryonic development. Polymorphisms of such genes form various combinations that enhance or weaken the effect of any particular genetic polymorphism. The inclusion of polymorphisms of the IL-1β, IL-6, MTHFR, MTRR genes in the program of genetic testing of women will increase the reliability of predicting a high risk of reproductive loss in the first trimester of pregnancy.

Как следует из таблицы две комбинации генетических вариантовAs follows from the table, two combinations of genetic variants

-31СТ IL-1β / -174GG IL-6 / 677СТ MTHFR / 66GG MTRR и-31CT IL-1β / -174GG IL-6 / 677CT MTHFR / 66GG MTRR and

-31СТ IL-1β / -174СС IL-6 / CC677 MTHFR / 66AG MTRR встречаются с одинаковой частотой (по 6,4%) среди женщин с репродуктивными потерями в первом триместре беременности, тогда как в контрольной группе два данных генотипа не обнаружены. Эти комбинации аллельных вариантов генов цитокинов и фолатного цикла являются факторами риска репродуктивных потерь первого триместра, так как показатель отношения шансов по двум данным генотипам составил 17,3 (CI: 1,0-300,3, р=0,01).-31CT IL-1β / -174CC IL-6 / CC677 MTHFR / 66AG MTRR occur with the same frequency (6.4%) among women with reproductive losses in the first trimester of pregnancy, while in the control group two of these genotypes were not found. These combinations of allelic variants of cytokine genes and the folate cycle are risk factors for reproductive loss of the first trimester, since the odds ratio for these two genotypes was 17.3 (CI: 1.0-300.3, p = 0.01).

Комбинация генетических вариантов (-31СС IL-1β / -174СС IL-6 / СС677 MTHFR / 66AG MTRR) встречается у 7,8% женщин с репродуктивными потерями в первом триместре беременности, в то время как в контрольной группе данный генотип не выявлен. Эта комбинация аллельных вариантов генов цитокинов и фолатного цикла является фактором риска репродуктивных потерь первого триместра беременности, так как показатель отношения шансов для данного генотипа составил 21,2 (CI: 1,2-364,5, р=0,005).A combination of genetic variants (-31CC IL-1β / -174CC IL-6 / CC677 MTHFR / 66AG MTRR) occurs in 7.8% of women with reproductive losses in the first trimester of pregnancy, while this genotype was not detected in the control group. This combination of allelic variants of cytokine genes and the folate cycle is a risk factor for reproductive losses of the first trimester of pregnancy, since the odds ratio for this genotype was 21.2 (CI: 1.2-364.5, p = 0.005).

Комбинация генетических вариантов (-31СС IL-1β / -174GC IL-6 / СТ677 MTHFR / 66AG MTRR) встречается у 9,9% женщин с репродуктивными потерями в первом триместре беременности, что в 3,9 раза выше аналогичного показателя контрольной группы. Эта комбинация аллельных вариантов генов цитокинов и фолатного цикла является фактором риска репродуктивных потерь первого триместра беременности, так как показатель отношения шансов для данного генотипа составил 4,3 (CI: 1,2-15,3, р=0,03).The combination of genetic variants (-31CC IL-1β / -174GC IL-6 / CT677 MTHFR / 66AG MTRR) occurs in 9.9% of women with reproductive losses in the first trimester of pregnancy, which is 3.9 times higher than the same indicator in the control group. This combination of allelic variants of cytokine genes and the folate cycle is a risk factor for reproductive losses of the first trimester of pregnancy, since the odds ratio for this genotype was 4.3 (CI: 1.2-15.3, p = 0.03).

Из результатов статистической обработки полученных данных следует, что генетические полиморфизмы -31С-Т (rs1143627) IL-1β, -174G-C (rs1800795) IL-6, C677T (rs1801133) MTHFR, A66G (rs1801394) MTRR играют значимую роль в формировании генетической предрасположенности к высокому риску репродуктивных потерь в первом триместре беременности. При этом сочетание полиморфных вариантов:From the results of statistical processing of the obtained data, it follows that the genetic polymorphisms -31C-T (rs1143627) IL-1β, -174G-C (rs1800795) IL-6, C677T (rs1801133) MTHFR, A66G (rs1801394) MTRR play a significant role in the formation of genetic predisposition to a high risk of reproductive loss in the first trimester of pregnancy. In this case, a combination of polymorphic options:

-31СТ IL-1β / -174GG IL-6 / 677СТ MTHFR/ 66GG MTRR;-31CT IL-1β / -174GG IL-6 / 677CT MTHFR / 66GG MTRR;

-31CT IL-1β / -174CC IL-6 / 677CC MTHFR / 66AG MTRR;-31CT IL-1β / -174CC IL-6 / 677CC MTHFR / 66AG MTRR;

-31CC IL-1β / -174CC IL-6 / 677CC MTHFR/ 66AG MTRR;-31CC IL-1β / -174CC IL-6 / 677CC MTHFR / 66AG MTRR;

-31CC IL-1β / -174GC IL-6 / 677CT MTHFR / 66AG MTRR-31CC IL-1β / -174GC IL-6 / 677CT MTHFR / 66AG MTRR

ассоциированы с высоким риском репродуктивных потерь в первом триместре беременности.associated with a high risk of reproductive loss in the first trimester of pregnancy.

Наличие одного из указанных генотипов подтверждает высокую вероятность репродуктивных потерь в первом триместре беременности следующими примерами.The presence of one of these genotypes confirms the high probability of reproductive loss in the first trimester of pregnancy with the following examples.

Пример 1.Example 1

Пациентка А., русская, 1981 года рождения. На момент проведения исследования у женщины диагностирована первая беременность, которая на сроке 6 недель остановилась в развитии. У пациентки была взята венозная кровь; при генотипировании ДНК-маркеров было выявлено сочетание исследуемых полиморфизмов генов цитокинов и ферментов фолатного цикла: -31СТ IL-1β / -174GG IL-6 / 677СТ MTHFR / 66GG MTRR, что подтверждает высокую вероятность репродуктивных потерь в первом триместре.Patient A., Russian, born in 1981. At the time of the study, the woman was diagnosed with the first pregnancy, which stopped developing for a period of 6 weeks. The patient received venous blood; genotyping of DNA markers revealed a combination of the studied polymorphisms of cytokine genes and folate cycle enzymes: -31CT IL-1β / -174GG IL-6 / 677CT MTHFR / 66GG MTRR, which confirms the high probability of reproductive loss in the first trimester.

Пример 2.Example 2

Пациентка С., русская, 1992 года рождения. В анамнезе имеет 1 роды, закончившиеся рождением живого ребенка. На момент проведения исследования у женщины произошел спонтанный аборт на сроке 7 недели беременности. У пациентки была взята венозная кровь; при генотипировании ДНК-маркеров было выявлено сочетание исследуемых полиморфизмов генов цитокинов и ферментов фолатного цикла: -31СТ IL-1β / -174GG IL-6 / 677СТ MTHFR / 66GG MTRR, что подтверждает высокую вероятность ранних репродуктивных потерь.Patient S., Russian, born in 1992. He has a history of 1 birth, ending in the birth of a living child. At the time of the study, the woman had a spontaneous abortion at 7 weeks of gestation. The patient received venous blood; genotyping of DNA markers revealed a combination of the studied polymorphisms of cytokine genes and folate cycle enzymes: -31CT IL-1β / -174GG IL-6 / 677CT MTHFR / 66GG MTRR, which confirms the high probability of early reproductive losses.

Пример 3.Example 3

Пациентка У., русская, 1983 года рождения. В анамнезе имеет 1 роды, закончившиеся рождением живого ребенка. На момент проведения исследования у женщины произошел спонтанный аборт на сроке 7 недели беременности. У пациентки была взята венозная кровь; при генотипировании ДНК-маркеров было выявлено сочетание исследуемых полиморфизмов генов цитокинов и ферментов фолатного цикла: -31СТ IL-1β / -174СС IL-6 / 677СС MTHFR / 66AG MTRR, что подтверждает высокую вероятность репродуктивных потерь в первом триместре.Patient U., Russian, born in 1983. He has a history of 1 birth, ending in the birth of a living child. At the time of the study, the woman had a spontaneous abortion at 7 weeks of gestation. The patient received venous blood; genotyping of DNA markers revealed a combination of the studied polymorphisms of cytokine genes and folate cycle enzymes: -31CT IL-1β / -174CC IL-6 / 677CC MTHFR / 66AG MTRR, which confirms the high probability of reproductive losses in the first trimester.

Пример 4.Example 4

Пациентка Б., русская, 1987 года рождения. На момент проведения исследования у женщины диагностирована первая беременность, которая на сроке 7 недель остановилась в развитии. У пациентки была взята венозная кровь; при генотипировании ДНК-маркеров было выявлено сочетание исследуемых полиморфизмов генов цитокинов и ферментов фолатного цикла: -31СС IL-1β / -174СС IL-6 / 677СС MTHFR / 66AG MTRR. Таким образом, выявлен генотип повышенного риска ранних репродуктивных потерь.Patient B., Russian, born in 1987. At the time of the study, the woman was diagnosed with the first pregnancy, which stopped developing for a period of 7 weeks. The patient received venous blood; genotyping of DNA markers revealed a combination of the studied polymorphisms of cytokine genes and folate cycle enzymes: -31CC IL-1β / -174CC IL-6 / 677CC MTHFR / 66AG MTRR. Thus, a genotype of an increased risk of early reproductive loss was identified.

Пример 5.Example 5

Пациентка И., русская, 1984 года рождения. В анамнезе женщины роды отсутствуют. На момент проведения исследования у женщины диагностирована вторая беременность, которая на сроке 10 недель остановилась в развитии. У пациентки была взята венозная кровь; при генотипировании ДНК-маркеров было выявлено сочетание исследуемых полиморфизмов генов цитокинов и ферментов фолатного цикла: -31СС IL-1β / -174СС IL-6 / 677СС MTHFR / 66AG MTRR. Таким образом, выявлен генотип повышенного риска репродуктивных потерь в первом триместре.Patient I., Russian, born in 1984. In the history of women, childbirth is absent. At the time of the study, the woman was diagnosed with a second pregnancy, which stopped developing for 10 weeks. The patient received venous blood; genotyping of DNA markers revealed a combination of the studied polymorphisms of cytokine genes and folate cycle enzymes: -31CC IL-1β / -174CC IL-6 / 677CC MTHFR / 66AG MTRR. Thus, a genotype of an increased risk of reproductive loss in the first trimester was identified.

Пример 6.Example 6

Пациентка М., русская, 1989 года рождения. В анамнезе имеет 1 роды, закончившиеся рождением живого ребенка. На момент проведения исследования у женщины произошел спонтанный аборт на сроке 6 недель беременности. У пациентки была взята венозная кровь; при генотипировании ДНК-маркеров было выявлено сочетание исследуемых полиморфизмов генов цитокинов и ферментов фолатного цикла: -31 СС IL-1β / -174GC IL-6 / 677СТ MTHFR / 66AG MTRR, что подтверждает высокую вероятность ранних репродуктивных потерь.Patient M., Russian, born in 1989. He has a history of 1 birth, ending in the birth of a living child. At the time of the study, the woman had a spontaneous abortion at 6 weeks of gestation. The patient received venous blood; genotyping of DNA markers revealed a combination of the studied polymorphisms of cytokine genes and folate cycle enzymes: -31 SS IL-1β / -174GC IL-6 / 677ST MTHFR / 66AG MTRR, which confirms the high probability of early reproductive losses.

Пример 7.Example 7

Пациентка О., русская, 1978 года рождения. В анамнезе имеет 1 роды, закончившиеся рождением живого ребенка. На момент проведения исследования у женщины диагностирована 4-я беременность, которая спонтанно прервалась на сроке 9 недель. У пациентки была взята венозная кровь; при генотипировании ДНК-маркеров было выявлено сочетание исследуемых полиморфизмов генов цитокинов и ферментов фолатного цикла: -31СС IL-1β / -174GC IL-6 / 677СТ MTHFR / 66AG MTRR, что подтверждает высокую вероятность репродуктивных потерь в первом триместре.Patient O., Russian, born in 1978. He has a history of 1 birth, ending in the birth of a living child. At the time of the study, the woman was diagnosed with 4th pregnancy, which spontaneously ended at 9 weeks. The patient received venous blood; genotyping of DNA markers revealed a combination of the studied polymorphisms of cytokine genes and folate cycle enzymes: -31CC IL-1β / -174GC IL-6 / 677ST MTHFR / 66AG MTRR, which confirms the high probability of reproductive loss in the first trimester.

Применение заявленного способа позволит формировать среди женщин на этапе прегравидарной подготовки группы риска и своевременно реализовывать в этих группах необходимые лечебно-профилактические мероприятии.The application of the claimed method will allow to form risk groups among women at the stage of pregravid preparation and to timely implement the necessary preventive measures in these groups.

Источники информацииInformation sources

1. RU 2494400, МПК G01N 33/50, опубл. 27.09.2013.1. RU 2494400, IPC G01N 33/50, publ. 09/27/2013.

2. RU2330071 C1 МПК C12Q 1/68, опубл. 27.07.2008.2. RU2330071 C1 IPC C12Q 1/68, publ. 07/27/2008.

3. RU 2568892 С1, МПК G01N 33/52, C12Q 1/68, опубл. 20.11.2015.3. RU 2568892 C1, IPC G01N 33/52, C12Q 1/68, publ. 11/20/2015.

4. RU 2532367С2, МПК G01N 33/68, опубл. 10.11.2014.4. RU 2532367С2, IPC G01N 33/68, publ. 11/10/2014.

5. RU 2566729 C1, МПК G01N 33/68, опубл. 27.10.2015.5. RU 2566729 C1, IPC G01N 33/68, publ. 10/27/2015.

6. Керчелаева С.Б. Значение антител к фосфолипидам и фосфолипидсвязывающим белкам при неразвивающейся беременности // Российский вестник акушера-гинеколога. 2003. - Т. 4. - С. 11-16.6. Kerchelaeva S.B. The value of antibodies to phospholipids and phospholipid-binding proteins during an undeveloped pregnancy // Russian Bulletin of the Obstetrician-Gynecologist. 2003. - T. 4. - S. 11-16.

7. Амчиславский Е.И., Соколов Д.И., Старикова Э.А. Цитокиновый контроль процесса ангиогенеза. Медицинская Иммунология 2003, Т. 5, №5-6, С. 493-506.7. Amchislavsky E.I., Sokolov D.I., Starikova E.A. Cytokine control of the process of angiogenesis. Medical Immunology 2003, T. 5, No. 5-6, S. 493-506.

8. Dimitriadis Е., White С., Jones R. Cytokines, chemokines and growth factors in endometrium related to implantation // Human Reproduction Update. - 2005. - V. 24. - P. 612-628.8. Dimitriadis E., White S., Jones R. Cytokines, chemokines and growth factors in endometrium related to implantation // Human Reproduction Update. - 2005. - V. 24. - P. 612-628.

9. Daher S., Mattar R., Gueuvoghlanian-Silva BY. Genetic polymorphisms and recurrent spontaneous abortions: an overview of current knowledge // Am J Reprod Immunol. - 2012. - V. 67. - P. 341-347.9. Daher S., Mattar R., Gueuvoghlanian-Silva BY. Genetic polymorphisms and recurrent spontaneous abortions: an overview of current knowledge // Am J Reprod Immunol. - 2012. - V. 67. - P. 341-347.

10. Yoshida H., Granger D.N. Inflammatory bowel disease: a paradigm for the link between coagulation and inflammation // Inflamm Bowel Dis. - 2009. - V. 15. - P. 1245-1255.10. Yoshida H., Granger D.N. Inflammatory bowel disease: a paradigm for the link between coagulation and inflammation // Inflamm Bowel Dis. - 2009. - V. 15. - P. 1245-1255.

11. Levi M., Van der Poll T. Two-way interactions between inflammation and coagulation // Trends Cardiovasc Med. - 2005. - V. 15. - P. 254-259.11. Levi M., Van der Poll T. Two-way interactions between inflammation and coagulation // Trends Cardiovasc Med. - 2005. - V. 15. - P. 254-259.

12. Jacques P., Bostom A., Wilson P. Determinants of plasma total homocysteine concentration in the Framingham Offspring cohort // Am J Clin Nutr. - 2001. - V. 73. - P. 613-621.12. Jacques P., Bostom A., Wilson P. Determinants of plasma total homocysteine concentration in the Framingham Offspring cohort // Am J Clin Nutr. - 2001. - V. 73. - P. 613-621.

13. Su S.J., Huang L.W., Pai L.S., Liu H.W. Homocysteine at pathophysiologic concentrations activates human monocyte and induces cytokine expression and inhibits macrophage migration inhibitory factor expression // Nutrition. - 2005. - V. 21. - P. 994-1002.13. Su S.J., Huang L.W., Pai L.S., Liu H.W. Homocysteine at pathophysiologic concentration activates human monocyte and induces cytokine expression and inhibits macrophage migration inhibitory factor expression // Nutrition. - 2005. - V. 21. - P. 994-1002.

14. Wu X., Zhao L., Zhu H. Association between the MTHFR C677T polymorphism and recurrent pregnancy loss: A Meta-analysis // Genet Test Mol Biomarkers. - 2012. - V. 7. - P. 806-811.14. Wu X., Zhao L., Zhu H. Association between the MTHFR C677T polymorphism and recurrent pregnancy loss: A Meta-analysis // Genet Test Mol Biomarkers. - 2012. - V. 7. - P. 806-811.

15. Lazzerini P.E. Hyperhomocysteinemia, inflammation and autoimmunity // Autoimmun Rev. - 2007. - V. 6 (7). - P. 503-509.15. Lazzerini P.E. Hyperhomocysteinemia, inflammation and autoimmunity // Autoimmun Rev. - 2007.- V. 6 (7). - P. 503-509.

Figure 00000001
Figure 00000001

Claims (6)

Способ прогнозирования высокого риска репродуктивных потерь в первом триместре беременности, включающий выделение ДНК из периферической венозной крови женщин с последующей амплификацией полиморфного варианта A66G гена метионинсинтазы редуктазы MTRR, отличающийся тем, что проводят амплификацию аллельных вариантов генов провоспалительных цитокинов -31С-Т (rs1143627) IL-1β, -174G-C (rs1800795) IL-6 и ферментов фолатного цикла С677Т (rs1801133) MTHFR и при выявлении одного из четырех генотипов:A method for predicting a high risk of reproductive loss in the first trimester of pregnancy, including the extraction of DNA from the peripheral venous blood of women, followed by amplification of the polymorphic variant A66G of the MTRR gene for methionine synthase reductase, characterized in that the amplification of allelic variants of the pro-inflammatory cytokine -31C-T genes (rs1143627) IL- 1β, -174G-C (rs1800795) IL-6 and folate cycle enzymes C677T (rs1801133) MTHFR and when one of the four genotypes is detected: -31СТ IL-1β / -174GG IL-6 / 677СТ MTHFR / 66GG MTRR;-31CT IL-1β / -174GG IL-6 / 677CT MTHFR / 66GG MTRR; -31СТ IL-1β / -174СС IL-6 / 677СС MTHFR / 66AG MTRR;-31CT IL-1β / -174CC IL-6 / 677CC MTHFR / 66AG MTRR; -31CC IL-1β / -174CC IL-6 / 677CC MTHFR/ 66AG MTRR;-31CC IL-1β / -174CC IL-6 / 677CC MTHFR / 66AG MTRR; -31CC IL-1β / -174GC IL-6 / 677CT MTHFR/ 66AG MTRR-31CC IL-1β / -174GC IL-6 / 677CT MTHFR / 66AG MTRR прогнозируют высокий риск репродуктивных потерь в первом триместре беременности.predict a high risk of reproductive loss in the first trimester of pregnancy.
RU2016103505A 2016-02-03 2016-02-03 Method of predicting high risk of reproductive loss in first trimester of pregnancy RU2611358C1 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2016103505A RU2611358C1 (en) 2016-02-03 2016-02-03 Method of predicting high risk of reproductive loss in first trimester of pregnancy

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2016103505A RU2611358C1 (en) 2016-02-03 2016-02-03 Method of predicting high risk of reproductive loss in first trimester of pregnancy

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2611358C1 true RU2611358C1 (en) 2017-02-21

Family

ID=58458928

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016103505A RU2611358C1 (en) 2016-02-03 2016-02-03 Method of predicting high risk of reproductive loss in first trimester of pregnancy

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2611358C1 (en)

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2730958C1 (en) * 2019-07-16 2020-08-26 Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России) Diagnostic technique for severe preeclampsia in pregnant women
RU2760499C1 (en) * 2021-03-15 2021-11-25 Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Уральский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБОУ ВО УГМУ Минздрава России) Method for predicting non-developing pregnancy associated with chromosomal abnormalities of the embryo

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2330071C1 (en) * 2006-12-21 2008-07-27 Общество с ограниченной ответственностью "Университетская медицина" Application of dna-diagnostics for presence of polymorphism r353q in gene of factor vii of blood coagulation for estimation of predisposition to development of habitual noncarrying of pregnancy and method of predisposition estimation to this disease by means of analysis of combination of polymorphisms c677t of gene mthfr and of gene r353q of factor vii
RU2566729C1 (en) * 2014-04-28 2015-10-27 Ирина Олеговна Буштырева Method for prediction of chorion separation in first trimester of pregnancy

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2330071C1 (en) * 2006-12-21 2008-07-27 Общество с ограниченной ответственностью "Университетская медицина" Application of dna-diagnostics for presence of polymorphism r353q in gene of factor vii of blood coagulation for estimation of predisposition to development of habitual noncarrying of pregnancy and method of predisposition estimation to this disease by means of analysis of combination of polymorphisms c677t of gene mthfr and of gene r353q of factor vii
RU2566729C1 (en) * 2014-04-28 2015-10-27 Ирина Олеговна Буштырева Method for prediction of chorion separation in first trimester of pregnancy

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
RAHMANI S.A. et al. The association of -511 C/T and -31 C/T polymorphisms in the interleukin 1 beta (Il-1β) gene with unexplained recurrent pregnancy loss in an Iranian Azeri Turkish population. Afinidad. 2014; 80(566): 211-217 [Найдено 26.08.2016] [он-лайн]. Найдено из Интернет: URL: http://wrhrc.tbzmed.ac.ir/uploads/78/CMS/user/file/116/%D9%85%D9%82%D8%A7%D9%84%D8%A7%D8%AA/a92-41-dr%20khaki.pdf. DAHER S. et al. Associations between cytokine gene polymorphisms and recurrent pregnancy loss. J Reprod Immunol. 2003 Feb; 58(1): 69-77. *

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2730958C1 (en) * 2019-07-16 2020-08-26 Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России) Diagnostic technique for severe preeclampsia in pregnant women
RU2760499C1 (en) * 2021-03-15 2021-11-25 Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Уральский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБОУ ВО УГМУ Минздрава России) Method for predicting non-developing pregnancy associated with chromosomal abnormalities of the embryo
RU2760499C9 (en) * 2021-03-15 2021-12-24 Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Уральский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБОУ ВО УГМУ Минздрава России) Method for predicting non-developing pregnancy associated with chromosomal abnormalities of the embryo

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Williams et al. The genetics of pre-eclampsia and other hypertensive disorders of pregnancy
Nishizawa et al. Microarray analysis of differentially expressed fetal genes in placental tissue derived from early and late onset severe pre-eclampsia
AU2021257892B2 (en) Circulating RNA signatures specific to preeclampsia
Wood et al. Genomic markers of ovarian reserve
Quach et al. A combination of single nucleotide polymorphisms in the 3′ untranslated region of HLA-G is associated with preeclampsia
Weeding et al. Genome-wide DNA methylation analysis in primary antiphospholipid syndrome neutrophils
US20250270646A1 (en) Circulating rna signatures specific to preeclampsia
Liu et al. Investigations into the association between polymorphisms in the interleukin-10 gene and risk of early-onset preeclampsia
RU2611358C1 (en) Method of predicting high risk of reproductive loss in first trimester of pregnancy
Galaviz-Hernandez et al. The paternal polymorphism rs5370 in the EDN1 gene decreases the risk of preeclampsia
Lalou et al. Molecular investigation of uniparental disomy (UPD) in spontaneous abortions
Zhang et al. Placental abruption is more frequent in women with the angiotensinogen Thr235 mutation
Hui et al. RNA-Seq of amniotic fluid cell-free RNA: a discovery phase study of the pathophysiology of congenital cytomegalovirus infection
Marakhovskaya et al. Association of growth factors genes with miscarriage
Salimi et al. Association of interleukin‐1 receptor antagonist VNTR polymorphism and risk of pre‐eclampsia in southeast Iranian population
RU2568891C1 (en) Method for prediction of risk of preeclampsia by combination of cytokine genes
Al-Astal et al. Beta-fibrinogen (-455 G/A) and Integrin beta-3 (PLA1/A2) polymorphisms and recurrent pregnancy loss in Gaza strip-Palestine
Турова et al. Immunogenetic predictors of risk of miscarriage
RU2616246C1 (en) Method of predicting risk of development of myomatous nodes of large sizes in patients with myoma
RU2651038C1 (en) Method for detecting disorders in children of immunological reactivity in conditions of excessive exposure to strontium
RU2617249C1 (en) Method for preconception prediction of risk of septal congenital heart defects formation in fetus
RU2741213C1 (en) Method for prediction of complications of pregnancy in young primiparous
Kaleefah et al. New Horizons for the Relationship between Genetic Variations and Two Immune Markers in Spontaneous Abortion among Iraqi Women: A Cross-Sectional Study
Sahar et al. Role of endothelial nitric oxide synthase gene polymorphisms (Glu298asp) in Egyptian patients with recurrent spontaneous abortion
Mohammed et al. Association of The Mthfr C677t, Factor V (Leiden) G1961a and Prothrombin G20210a Gene Mutations with Recurrent Spontaneous Aboration (Rsa) in Duhok Province

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20180204