RU2547583C2 - Способ диагностики рака молочной железы - Google Patents
Способ диагностики рака молочной железы Download PDFInfo
- Publication number
- RU2547583C2 RU2547583C2 RU2013140122/15A RU2013140122A RU2547583C2 RU 2547583 C2 RU2547583 C2 RU 2547583C2 RU 2013140122/15 A RU2013140122/15 A RU 2013140122/15A RU 2013140122 A RU2013140122 A RU 2013140122A RU 2547583 C2 RU2547583 C2 RU 2547583C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- pdlim4
- ril
- breast cancer
- expression
- tumor
- Prior art date
Links
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 title claims abstract description 34
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 title claims abstract description 33
- 238000012631 diagnostic technique Methods 0.000 title abstract 2
- 101000988395 Homo sapiens PDZ and LIM domain protein 4 Proteins 0.000 claims abstract description 68
- 102100029178 PDZ and LIM domain protein 4 Human genes 0.000 claims abstract description 62
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims abstract description 59
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims abstract description 30
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 13
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims abstract description 4
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 claims abstract description 3
- 230000007705 epithelial mesenchymal transition Effects 0.000 claims abstract description 3
- 238000007481 next generation sequencing Methods 0.000 claims description 3
- 239000003814 drug Substances 0.000 abstract description 12
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 abstract description 8
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 4
- 230000003211 malignant effect Effects 0.000 abstract description 3
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 abstract 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 abstract 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 19
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 15
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 15
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 14
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 13
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 12
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 11
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 11
- 102000000905 Cadherin Human genes 0.000 description 9
- 108050007957 Cadherin Proteins 0.000 description 9
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 9
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 description 8
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 8
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 8
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 7
- 238000011161 development Methods 0.000 description 7
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 7
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 7
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 6
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 6
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 6
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 6
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 6
- 230000004044 response Effects 0.000 description 6
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 6
- 102000004887 Transforming Growth Factor beta Human genes 0.000 description 5
- 108090001012 Transforming Growth Factor beta Proteins 0.000 description 5
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 5
- 230000001973 epigenetic effect Effects 0.000 description 5
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 5
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 description 4
- RJKFOVLPORLFTN-LEKSSAKUSA-N Progesterone Chemical compound C1CC2=CC(=O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H](C(=O)C)[C@@]1(C)CC2 RJKFOVLPORLFTN-LEKSSAKUSA-N 0.000 description 4
- 102000057208 Smad2 Human genes 0.000 description 4
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 4
- 101710143123 Mothers against decapentaplegic homolog 2 Proteins 0.000 description 3
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 3
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 3
- 230000036210 malignancy Effects 0.000 description 3
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 3
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 description 3
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 3
- 239000000439 tumor marker Substances 0.000 description 3
- 108060000903 Beta-catenin Proteins 0.000 description 2
- 102000015735 Beta-catenin Human genes 0.000 description 2
- 206010064912 Malignant transformation Diseases 0.000 description 2
- 102000004022 Protein-Tyrosine Kinases Human genes 0.000 description 2
- 108090000412 Protein-Tyrosine Kinases Proteins 0.000 description 2
- 238000000211 autoradiogram Methods 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 2
- 229940011871 estrogen Drugs 0.000 description 2
- 239000000262 estrogen Substances 0.000 description 2
- 238000001794 hormone therapy Methods 0.000 description 2
- 238000003119 immunoblot Methods 0.000 description 2
- 230000036212 malign transformation Effects 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 description 2
- 239000000186 progesterone Substances 0.000 description 2
- 229960003387 progesterone Drugs 0.000 description 2
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 2
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 description 2
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 2
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 2
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 2
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 2
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 2
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 2
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 1
- 102100030346 Antigen peptide transporter 1 Human genes 0.000 description 1
- 102000036365 BRCA1 Human genes 0.000 description 1
- 108700040618 BRCA1 Genes Proteins 0.000 description 1
- 108700010154 BRCA2 Genes Proteins 0.000 description 1
- 208000003174 Brain Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 102100025805 Cadherin-1 Human genes 0.000 description 1
- 102100024154 Cadherin-13 Human genes 0.000 description 1
- 108091007854 Cdh1/Fizzy-related Proteins 0.000 description 1
- 206010008342 Cervix carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 206010008805 Chromosomal abnormalities Diseases 0.000 description 1
- 208000031404 Chromosome Aberrations Diseases 0.000 description 1
- 102100031502 Collagen alpha-2(V) chain Human genes 0.000 description 1
- 102000009512 Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor p15 Human genes 0.000 description 1
- 108010009356 Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor p15 Proteins 0.000 description 1
- 102100034560 Cytosol aminopeptidase Human genes 0.000 description 1
- 102100038595 Estrogen receptor Human genes 0.000 description 1
- 102000017700 GABRP Human genes 0.000 description 1
- 108700031843 GRB7 Adaptor Proteins 0.000 description 1
- 101150052409 GRB7 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000237858 Gastropoda Species 0.000 description 1
- 101710088083 Glomulin Proteins 0.000 description 1
- 102100031181 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Human genes 0.000 description 1
- 102100033107 Growth factor receptor-bound protein 7 Human genes 0.000 description 1
- 101150054472 HER2 gene Proteins 0.000 description 1
- 101000762243 Homo sapiens Cadherin-13 Proteins 0.000 description 1
- 101000941594 Homo sapiens Collagen alpha-2(V) chain Proteins 0.000 description 1
- 101000924389 Homo sapiens Cytosol aminopeptidase Proteins 0.000 description 1
- 101000882584 Homo sapiens Estrogen receptor Proteins 0.000 description 1
- 101000822394 Homo sapiens Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi Proteins 0.000 description 1
- 101000998027 Homo sapiens Keratin, type I cytoskeletal 17 Proteins 0.000 description 1
- 101000998020 Homo sapiens Keratin, type I cytoskeletal 18 Proteins 0.000 description 1
- 101001056473 Homo sapiens Keratin, type II cytoskeletal 5 Proteins 0.000 description 1
- 101000975496 Homo sapiens Keratin, type II cytoskeletal 8 Proteins 0.000 description 1
- 101000962131 Homo sapiens Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001019109 Homo sapiens Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 24 Proteins 0.000 description 1
- 101000669513 Homo sapiens Metalloproteinase inhibitor 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001023043 Homo sapiens Myoblast determination protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000988407 Homo sapiens PDZ and LIM domain protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001012157 Homo sapiens Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Proteins 0.000 description 1
- 101001068027 Homo sapiens Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform Proteins 0.000 description 1
- 101000929936 Homo sapiens Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial Proteins 0.000 description 1
- 101000800116 Homo sapiens Thy-1 membrane glycoprotein Proteins 0.000 description 1
- 101000819111 Homo sapiens Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3 Proteins 0.000 description 1
- 101000634975 Homo sapiens Tripartite motif-containing protein 29 Proteins 0.000 description 1
- 101001087422 Homo sapiens Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13 Proteins 0.000 description 1
- 101000761740 Homo sapiens Ubiquitin/ISG15-conjugating enzyme E2 L6 Proteins 0.000 description 1
- 101000638886 Homo sapiens Urokinase-type plasminogen activator Proteins 0.000 description 1
- 101000666295 Homo sapiens X-box-binding protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 208000026350 Inborn Genetic disease Diseases 0.000 description 1
- 102100033511 Keratin, type I cytoskeletal 17 Human genes 0.000 description 1
- 102100033421 Keratin, type I cytoskeletal 18 Human genes 0.000 description 1
- 102100025756 Keratin, type II cytoskeletal 5 Human genes 0.000 description 1
- 102100023972 Keratin, type II cytoskeletal 8 Human genes 0.000 description 1
- 239000005517 L01XE01 - Imatinib Substances 0.000 description 1
- 102100025169 Max-binding protein MNT Human genes 0.000 description 1
- 102100039204 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100034821 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 24 Human genes 0.000 description 1
- 108010023335 Member 2 Subfamily B ATP Binding Cassette Transporter Proteins 0.000 description 1
- 102100039364 Metalloproteinase inhibitor 1 Human genes 0.000 description 1
- 208000003445 Mouth Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 102100035077 Myoblast determination protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 206010033128 Ovarian cancer Diseases 0.000 description 1
- 206010061535 Ovarian neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 101150104227 PDLIM4 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100029176 PDZ and LIM domain protein 2 Human genes 0.000 description 1
- 206010061902 Pancreatic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 108700019535 Phosphoprotein Phosphatases Proteins 0.000 description 1
- 102000045595 Phosphoprotein Phosphatases Human genes 0.000 description 1
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 1
- 102100023832 Prolyl endopeptidase FAP Human genes 0.000 description 1
- 239000013614 RNA sample Substances 0.000 description 1
- 102100030086 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Human genes 0.000 description 1
- 108010034634 Repressor Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000009661 Repressor Proteins Human genes 0.000 description 1
- 208000007660 Residual Neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 101150047834 SNAI2 gene Proteins 0.000 description 1
- 102000001332 SRC Human genes 0.000 description 1
- 108060006706 SRC Proteins 0.000 description 1
- -1 STAED3 Proteins 0.000 description 1
- 108010044012 STAT1 Transcription Factor Proteins 0.000 description 1
- 102100034464 Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform Human genes 0.000 description 1
- 102100035766 Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial Human genes 0.000 description 1
- 102100029904 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta Human genes 0.000 description 1
- 108700032504 Smad2 Proteins 0.000 description 1
- 108020004459 Small interfering RNA Proteins 0.000 description 1
- 208000005718 Stomach Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 101150045809 TPMT gene Proteins 0.000 description 1
- 102100033523 Thy-1 membrane glycoprotein Human genes 0.000 description 1
- 102100021386 Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3 Human genes 0.000 description 1
- 102000040945 Transcription factor Human genes 0.000 description 1
- 108091023040 Transcription factor Proteins 0.000 description 1
- 102000009618 Transforming Growth Factors Human genes 0.000 description 1
- 108010009583 Transforming Growth Factors Proteins 0.000 description 1
- 108010078184 Trefoil Factor-3 Proteins 0.000 description 1
- 102100039145 Trefoil factor 3 Human genes 0.000 description 1
- 102100029519 Tripartite motif-containing protein 29 Human genes 0.000 description 1
- 108700025716 Tumor Suppressor Genes Proteins 0.000 description 1
- 102000044209 Tumor Suppressor Genes Human genes 0.000 description 1
- 102000001742 Tumor Suppressor Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010040002 Tumor Suppressor Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102100033014 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13 Human genes 0.000 description 1
- 102100024843 Ubiquitin/ISG15-conjugating enzyme E2 L6 Human genes 0.000 description 1
- 102100031358 Urokinase-type plasminogen activator Human genes 0.000 description 1
- 208000006105 Uterine Cervical Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 102100038151 X-box-binding protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 230000035508 accumulation Effects 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 238000011319 anticancer therapy Methods 0.000 description 1
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 description 1
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 201000008274 breast adenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 201000008275 breast carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 208000035269 cancer or benign tumor Diseases 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 201000010881 cervical cancer Diseases 0.000 description 1
- 229940044683 chemotherapy drug Drugs 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 1
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 238000013399 early diagnosis Methods 0.000 description 1
- 230000005014 ectopic expression Effects 0.000 description 1
- 102000052116 epidermal growth factor receptor activity proteins Human genes 0.000 description 1
- 108700015053 epidermal growth factor receptor activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 description 1
- 108700020302 erbB-2 Genes Proteins 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 1
- 230000005714 functional activity Effects 0.000 description 1
- 208000016361 genetic disease Diseases 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 1
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 238000005734 heterodimerization reaction Methods 0.000 description 1
- 230000006607 hypermethylation Effects 0.000 description 1
- KTUFNOKKBVMGRW-UHFFFAOYSA-N imatinib Chemical compound C1CN(C)CCN1CC1=CC=C(C(=O)NC=2C=C(NC=3N=C(C=CN=3)C=3C=NC=CC=3)C(C)=CC=2)C=C1 KTUFNOKKBVMGRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960002411 imatinib Drugs 0.000 description 1
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 1
- 201000002313 intestinal cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 1
- 208000012987 lip and oral cavity carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 208000014018 liver neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 230000005741 malignant process Effects 0.000 description 1
- 210000005075 mammary gland Anatomy 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 238000002483 medication Methods 0.000 description 1
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 description 1
- GLVAUDGFNGKCSF-UHFFFAOYSA-N mercaptopurine Chemical compound S=C1NC=NC2=C1NC=N2 GLVAUDGFNGKCSF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001428 mercaptopurine Drugs 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 239000003475 metalloproteinase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000001394 metastastic effect Effects 0.000 description 1
- 206010061289 metastatic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 230000011987 methylation Effects 0.000 description 1
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000000386 microscopy Methods 0.000 description 1
- 230000005012 migration Effects 0.000 description 1
- 238000013508 migration Methods 0.000 description 1
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 230000006740 morphological transformation Effects 0.000 description 1
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 description 1
- YOHYSYJDKVYCJI-UHFFFAOYSA-N n-[3-[[6-[3-(trifluoromethyl)anilino]pyrimidin-4-yl]amino]phenyl]cyclopropanecarboxamide Chemical compound FC(F)(F)C1=CC=CC(NC=2N=CN=C(NC=3C=C(NC(=O)C4CC4)C=CC=3)C=2)=C1 YOHYSYJDKVYCJI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002547 new drug Substances 0.000 description 1
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 238000011275 oncology therapy Methods 0.000 description 1
- 238000011369 optimal treatment Methods 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 1
- 230000003285 pharmacodynamic effect Effects 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 1
- 230000000861 pro-apoptotic effect Effects 0.000 description 1
- 239000000092 prognostic biomarker Substances 0.000 description 1
- 230000008707 rearrangement Effects 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 238000012502 risk assessment Methods 0.000 description 1
- 208000011581 secondary neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 230000003595 spectral effect Effects 0.000 description 1
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 1
- 201000000498 stomach carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N tgfbeta Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCSC)C(C)C)[C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 108091006107 transcriptional repressors Proteins 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 229960000575 trastuzumab Drugs 0.000 description 1
- 239000000107 tumor biomarker Substances 0.000 description 1
- 230000005740 tumor formation Effects 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
Images
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Изобретение относится к области медицины, в частности к онкологии, и предназначено для определения субтипа рака молочной железы. Определяют уровень экспрессии RIL (PDLIM4) в образце опухолевой ткани пациента с помощью технологии секвенирования следующего поколения NGS или методами Нозерн-гибридизации и ПЦР в реальном времени. При снижении экспрессии RIL (PDLIM4) более чем в два раза в сравнении с его уровнем в нормальных тканях диагностируют субтип злокачественных новообразований молочной железы. Изобретение обеспечивает эффективный способ диагностики субтипа рака молочной железы - опухолей, характеризующихся неполной эпителиально-мезенхимальной транзицией и относительно малоинвазивных. 2 ил., 1 пр.
Description
Изобретение относится к области медицины, в частности к области онкологии, и касается нового онкомаркера.
Рак молочной железы занимает первое место среди всех злокачественных заболеваний у женщин. По современным данным, частота развития рака молочной железы в России за последние 15 лет увеличилась более чем в 2 раза. Известно, что заболеваемость женщин, проживающих в крупных городах и индустриальных районах, выше, чем женщин сельской местности. Рак молочной железы встречается также у мужчин. Многие даже не подозревают о возможности развития у них такого заболевания, что ведет к несвоевременному обращению к врачам, поздней диагностике и началу лечения и, как следствие, к низким терапевтическим результатам.
Терапия заболевания в настоящее время основана на комбинации ранней диагностики и одного или нескольких способов лечения, таких как хирургия, лучевая терапия, химиотерапия и гормональная терапия. Курс лечения в конкретном случае рака молочной железы, как правило, выбирают на основе ряда прогностических параметров, включая анализ специфичных опухолевых маркеров.
Диагностических онкомаркеров известно очень много. Большинство из них успешно применяется в диагностике. Основным применением тестов на определение опухолевых маркеров является мониторинг течения заболевания и эффективности хирургического лечения и/или радио-, химио- и гормонотерапии. Показано, что динамика уровня опухолевого маркера отражает изменение состояния пациента. К тому же иногда удается дифференцировать доброкачественные и злокачественные заболевания по скорости повышения уровня маркера, которая при доброкачественных заболеваниях крайне низка. Ряд тестов может также использоваться в качестве диагностических при скрининговых обследованиях.
Таким образом, определение уровня онкомаркеров представляется целесообразным в следующих случаях:
1. Мониторинг течения заболевания.
2. Мониторинг терапии. Возможность обнаружения рецидива и/или метастазов за 6 мес. и более до начала клинических проявлений, что важно для определения тактики дальнейшего лечения.
3. Идентификация резидуальных опухолей. Отсутствие или незначительное снижение концентрации опухолевого маркера после хирургического вмешательства свидетельствует о неполном удалении опухоли либо о наличии множественных опухолей.
4. Прогнозирование развития некоторых опухолей.
5. Раннее выявление онкозаболеваний у пациентов группы высокого риска. Онкомаркеры могут как продуцироваться самой опухолью, так и вырабатываться организмом в ответ на развитие опухоли. Биомаркеры, используемые для прогнозирования и диагностики опухоли, могут иметь разную природу и происхождение. В современной медицине выделяют следующие категории: генетические, эпигенетические, биомаркеры белковой природы, гликаны (все моно- и полисахариды) и визуальные маркеры.
В настоящее время активно развивается область применения генетических и белковых биомаркеров как наиболее достоверных и простых в измерении.
Наиболее распространенные диагностические тест-системы построены на анализе биомаркеров в физиологических жидкостях, крови и мочи, однако, хорошим материалом для получения красноречивых результатов исследований является также биопсийный материал.
В науке и медицине онкомаркеры в основном используют с тремя основными целями:
1. Диагностической - для диагностики рака на ранних стадиях.
2. Прогностической - для прогноза степени агрессивности опухоли, ее характеристики и оценки рисков и шансов на выздоровление.
3. Предсказательной - для предсказания поведения опухоли в ответ на разные типы лечения. Является необходимой как при выборе вида терапии, так и при подборе конкретных лекарственных препаратов.
Оценка рисков.
Оценка онкомаркеров, ассоциированных с генетическими мутациями и эпигенетическими перестройками, имеет смысл при индивидуальном подходе для определения у пациентов предрасположенности к развитию того или иного вида рака. Известно, что мутации в определенных генах могут способствовать развитию рака и при обнаружении оных у пациентов делается вывод о повышенной предрасположенности к соответствующему типу рака.
Так, например, мутации в генах KRAS, р53, EGFR, erB2 характерны для рака кишечника, желудка, печени и поджелудочной железы; мутации в генах BRCA1 and BRCA2 - для рака молочной железы и яичников; аномальное метилирование в онкосупрессорных генах р16, CDKN2B и pl4ARF для рака мозга, гиперметилирование MYOD1, CDH1 и CDH13 для рака шейки матки, а р16, р14 и RB1 - для рака ротовой полости.
Диагностика.
Использование онкомаркеров оказывается весьма ценным при непосредственном установлении диагноза, в частности определении принадлежности опухоли к первичной или метастазам за счет сравнения хромосомных нарушений, обнаруженных в первичных и повторных опухолях. Если нарушения совпадают, то вторичная опухоль является метастазом первичной, а если различаются - то независимо возникшим новообразованием.
Прогноз и предсказание терапии. Еще одно применение онкомаркеры находят в прогнозировании болезни после того, как рак был диагностирован. Основываясь на присутствии или повышенной экспрессии некоторых биомаркеров, например, можно определить степень агрессивности рака и его потенциальный ответ на терапию. В качестве примера таких прогностических биомаркеров можно привести ингибитор металлопептидазы 1 (TIMP1) - маркер, ассоциированный с более агрессивными типами миеломы; а повышенный уровень эстрогенового (ER) или прогестеронового (PR) рецепторов характерен для пациентов с лучшей выживаемостью при раке молочной железы; гиперэкспрессия гена HER2 при раке молочной железы говорит о хорошем потенциальном ответе на терапию препаратом трастузумабом; а, например, опухоль с мутацией в 11 экзоне протоонкогена c-KIT с высокой вероятностью будет восприимчива к терапии иматинибом.
Фармадинамика и фармакинетика.
Онкомаркеры также используют для подбора наиболее оптимального режима лечения для каждого конкретного пациента. Из-за различия в эффективности метаболических процессов разные люди по-разному могут реагировать на определенные препараты, которые, накапливаясь в организме, могут представлять для некоторых большую опасность. Все эти показатели обязательно учитываются при расчете дозировок лекарственных препаратов при терапии. Так, например, пациенты с мутацией в гене ТРМТ не способны метаболизировать большие количества препарата меркаптопурина, используемого при терапии лейкемии, поэтому лечение этим препаратом назначается им с учетом особенностей организма.
Мониторинг эффективности терапии. Еще одно применение биомаркеры нашли в мониторинге эффективности примененной противораковой терапии во времени. Например, белок SlOO-beta при положительном ответе на терапию значительно сокращается в количестве в ряде меланом и его регулярная количественная оценка позволяет оценить эффективность примененного лечения.
Рецидивы.
Показатели некоторых онкомаркеров позволяют также сделать предсказание о вероятности рецидивов заболевания. Поиск препаратов для терапии рака.
Онкомаркеры оказываются весьма полезными не только в диагностике заболеваний, но и для поиска новых препаратов для химиотерапии, выступая в качестве мишеней при скрининге библиотек химических соединений.
Из уровня техники известен патент RU 2473555, опубл. 2013-01-27, который раскрывает способ оценки клинического прогноза для индивида, страдающего раком молочной железы, основанный на измерении экспрессии генов в образце рака молочной железы в следующих дескрипторных группах: (1) ERBB2, STAED3, GRB7, THRAP4, PPARBP; (2) ESR1, GATA3, ХВР1, TFF3, ACADSB; (3) KRT5, KRT17, TRIM29, GABRP; (4) KRT18, KRT8, PPP2CA, KRT8L2; (5) PLAU, COL5A2, FAP, THY1; (6) STAT1, UBE2L6, TAP1, LAP3 и (7) SEACAM5, SEACAM6, SEACAM7. При этом сверхэкспрессия большинства генов в дескрипторной группе по сравнению с образцом нормальной ткани молочной железы указывает на то, что образец ткани является положительным для данной группы, а отсутствие сверхэкспрессии большинства генов в дескрипторной группе по сравнению с образцом нормальной ткани молочной железы указывает на то, что образец ткани является отрицательным для данной группы.
Известна заявка ЕА 200971079 А1, касающаяся определенных генетических вариантов на Chr5pl2 и Chrl0q26 в качестве вариантов предрасположенности к раку молочной железы. Описываются способы управления течением заболевания, включающие диагностирование повышенной и/или пониженной предрасположенности к раку молочной железы, способы прогнозирования ответа на лечение и способы определения прогноза с применением таких вариантов.
Заявка US 20110251082 касается использования 2-мерного дифференциального геля (2D-ПГЛП) и масс-спектрального метода для идентификации биомаркеров рака молочной железы в трансформированных клетках молочной железы. Определены многочисленные предполагаемые маркеры для различных стадий рака молочной железы. Оценивалась экспрессия различных белков, в том числе PdLIM1. Однако был сделан вывод о потенциальной важности как маркера парвабумина и противоположном эффекте PdLIM1. Не представлено сведений о PdLIM4.
Заявка WO 2009124251 касается способа диагностики метастатического потенциала опухолей, в том числе клеток рака груди. В данном подходе предлагается измерение в клетках пациентов уровней пяти и более маркеров, выбранных из группы генов типизации TGF [Beta]:
Хотя среди используемых генов ген PDLIM4 упомянут, не раскрыто его использование как единственного маркера рака груди вне комбинаций с другими генами.
На данный момент не существует тестов на онкомаркеры, обладающих 100% чувствительностью и специфичностью. Это обстоятельство серьезно ограничивает их использование в первичной диагностике онкологических заболеваний, поэтому для достижения достоверного результата приходится комбинировать показатели нескольких маркеров. Постепенное накопление знаний относительно механизмов малигнизации ткани и нарушений, потенциально лежащих в основе опухолеобразования, приводит к тому, что в рамках существующих, известных, типов опухолей выделяют подгруппы, обладающие различными типичными профилями генетических нарушений и для которых возможно разработать высокоспецифичные терапевтические подходы. Таким образом, разработка новых биомаркеров опухолей способствует более точной и детальной классификации и, как следствие, дает возможность применять более эффективные терапевтические подходы.
Задача изобретения - разработка способа диагностики рака молочной железы и его применение для выявления отдельного подтипа злокачественных новообразований.
Задача решается за счет способа диагностики рака молочной железы с использованием биомаркера, основанного на эпигенетической супрессии гена PDLIM4/RIL, который может быть использован для диагностики и лечения рака молочной железы, оценки агрессивности заболевания и подбора способа терапии опухоли.
Предложен способ диагностики субтипа рака молочной железы, основанный на определении уровня экспрессии PDLIM4/RIL в опухолевой ткани с помощью технологии секвенирования следующего поколения NGS (next-generation sequencing) или методами Нозерн-гибридизации и ПЦР в реальном времени. Снижение экспрессии PDLIM4/RIL в образце пациента более чем в два раза в сравнении с его уровнем в нормальных тканях свидетельствует о злокачественном процессе (раке молочной железы по RIL-негативному типу) и неблагоприятном прогнозе.
Ген PDLIM4/RIL был впервые картирован на участке длинного плеча хромосомы 5 (5q31), часто делетирующей при ряде злокачественных заболеваний человека. Помимо делеций, ген PDLIM4/RIL часто подвергается эпигенетической супрессии, в результате которой его экспрессия подавляется. В таких случаях отмечается меньшая степень морфологической трансформации и пониженная частота активации тирозиновых киназ.
Технический результат, достигаемый при использовании изобретения - быстрая диагностика подтипа рака молочной железы путем измерения уровня транскриптов гена RIL будет способствовать адекватному выбору терапии. Предлагаемый подход позволит поставить правильный диагноз на ранних доклинических и клинических стадиях развития, в случаях малосимптомного, атипичного течения заболевания, уточнить характер новообразований молочной железы, в более короткие сроки определить тактику лечения. В связи со значительным разнообразием течения заболевания у пациентов медицина будущего будет больше ориентироваться на персонифицированные подходы к терапии. В этом смысле изобретение является актуальным, поскольку направлено на выявление распространенного подтипа рака молочной железы, требующего персонифицированного подхода к лечению. Также, определение детального механизма малигнизации опухолей этого подтипа открывает перспективы к созданию высокоизбирательных эффективных химиотерапевтических препаратов, направленных на ключевые компоненты нарушенных сигнальных путей.
Нами впервые была замечена корреляция супрессии гена PDLIM4/RIL с морфологией и биохимическими свойствами опухолевых клеток и установлена роль опухолевого супрессора в злокачественной трансформации клеток молочной железы. Результаты наших исследований указывают на то, что в рамках группы аденокарцином молочной железы, характеризующихся тройным негативным фенотипом, можно выделить крупную подгруппу опухолей, в которых в основе опухолевой трансформации лежит эпигенетическая супрессия PDLIM4/RIL. Подавление PDLIM4/RIL ведет к увеличению функциональной активности фосфатазы PTP-BL, которая, в свою очередь, дефосфорилирует и переводит в функционально-активную форму рецептор-неассоциированную тирозиновую киназу c-Src, ответственную за активизацию пролиферации, подавление про-апоптотических сигналов, увеличение клеточной подвижности. Возможность осуществления изобретения может быть продемонстрирована следующими примерами.
Пример 1. Определение роли PDLIM4/RIL в злокачественной трансформации.
Проведен анализ экспрессии его мРНК в образцах злокачественных новообразований из разных органов по сравнению с окружающей нормальной тканью методом Нозерн-гибридизации с Cancer Profiling Array I (BD Clontech) (241 пара образцов «опухоль/норма» из 8 тканей человека). Было обнаружено, что уровень экспрессии PDLIM4/RIL был подавлен в 2 и более раз в 43% (23 из 53) образцов злокачественных опухолей молочной железы (рис. 1). Для независимого подтверждения этих данных был проанализирован уровень PDLIM4/RIL в панели из 8 линий клеток карцином молочной железы человека. В четырех случаях из 8 экспрессия PDLIM4/RIL оказалась ниже уровня детекции, в остальных 4 клеточных линиях уровень PDLIM4/RIL был сравним с контролем (рис. 2а, б).
Сопоставление статуса PDLIM4/RIL с морфологией клеток позволило показать, что высокий уровень экспрессии PDLIM4/RIL коррелирует с повышенной агрессивностью культур рака молочной железы MDA-MB-231, -435S, -436 и ВТ-474 (рис. 2в). Клетки этих линий характеризуются звездчатой или веретенообразной формой, слабой степенью адгезии и распластанности, высокой скоростью роста и видимым отсутствием межклеточных контактов. Малоагрессивные клеточные линии MCF-7, ВТ-20, T-47D и MDA-MB-468 с недетектируемым уровнем PDLIM4/RIL, наоборот, сохраняют эпителиальную морфологию и межклеточные контакты. Анализ экспрессии эпителиального маркера Е-кадгерина подтвердил эффекты, наблюдаемые на уровне клеточной морфологии. Клетки линий MDA-MB-231, -435S, -436 и ВТ-474 не экспрессируют Е-кадгерин (методами иммуноблоттинга и ОТ-ПЦР) и не имеют межклеточных контактов, т.е. подверглись эпителиально-мезенхимной трансформации, которая является необходимым условием высокой степени агрессивности эпителиальных опухолей. Линии MCF-7, ВТ-20, T-47D и MDA-MB-468, наоборот, сохраняли высокие уровни Е-кадгерина, межклеточные контакты и эпителиальный фенотип (рис. 2).
Тем не менее, ни эктопическая экспрессия PDLIM4/RIL в малоагрессивных культурах клеток рака молочной железы, ни подавление его экспрессии в высокоагрессивных линиях с помощью коротких интерферирующих РНК не привела к реверсии фенотипов или изменению статуса Е-кадгерина. Из этого следует, что обратная корреляция между экспрессией этих двух белков - следствие их корегуляции одним сигнальным каскадом.
Известно, что экспрессия Е-кадгерина регулируется на уровне транскрипции тремя белками-репрессорами Snail, Slug и Twist, которые в свою очередь являются компонентами TGFβ/R-, NFkB-, ERK- или β-катенин- зависимых сигнальных путей. Была выявлена корреляция экспрессии PDLIM4/RIL и транскрипционного репрессора Slug, обратно коррелировавшие с уровнем мРНК Е-кадгерина (рис. 2а), причем эти события не зависели ни от NFkB, ни от ERK, ни от β-катенинового каскадов. При иммуноблот-анализе в тотальных белковых экстрактах малоагрессивных клеточных линий рака молочной железы была детектирована процессированная форма TGFβ1, выполняющего в нормальных условиях функцию сигнала к дифференцировке. Связывание трансформирующего фактора β со своим рецептором приводит к фосфорилированию, гетеродимеризации и транспорту в ядро белка Smad2, транскрипционного фактора, ответственного за активацию генов-мишеней сигнального каскада TGFβ. Выявление фосфорилированной формы Smad2 подтвердило факт активации TGFβ в этих клетках (рис. 2б). При этом тотальные количества Smad2 во всех исследованных клетках были сравнимыми.
Экспрессия PDLIM4/RIL подавляется в злокачественных новообразованиях молочной железы и опухолевых клеточных линиях того же происхождения, что сопровождается активацией сигнального каскада, инициируемого TGFβ1, и сохраненной экспрессией эпителиального маркера Е-кадгерина. Известно, что сверхэкспрессия близкородственного белка Mystique увеличивает зависимость клеток от субстрата. PDLIM4/RIL показывает аналогичный эффект, а его выключение способствует независимости клеток от прикрепления и более эффективному метастазированию. При снятии проблемы зависимости от адгезии с помощью какого-либо другого механизма может происходить отбор клеток с повышенной экспрессией PDLIM4/RIL, что будет способствовать усилению их миграции и пролиферации, повышая агрессивность опухоли.
Таким образом, нами показано, что низкий уровень экспрессии гена PDLIM4/RIL может служить эффективным диагностическим маркером для выявления отдельного подтипа злокачественных новообразований молочной железы - опухолей, характеризующихся неполной эпителиально-мезенхимальной транзицией и относительно малоинвазивных.
Рис.1. Экспрессия мРНК PDLIM4/RIL в человеческих опухолях различного происхождения по сравнению с нормальными тканями. Нозерн-анализ образцов тотальной РНК, представленных на микропанели Cancer Profiling Array I (BD Clontech), с помощью PDLIM4/RIL-специфического зонда. Все значения нормализованы по мРНК GAPDH. а - вид ауторадиограммы микропанели (О - образец тотальной РНК из опухоли; Н - из окружающей морфологически нормальной ткани от того же пациента); б - доля пар «норма : опухоль», в которых экспрессия мРНК PDLIM4/RIL в опухоли подавлена в 2 и более раз (Н/О>2), не изменена (0.5<Н/О<2) или повышена в 2 и более раз (Н/О<0.5). Пунктиром выделена область ауторадиограммы блота (а) и столбчатой диаграммы (б), соответствующие парам «норма : опухоль» из молочной железы.
Рис.2. Экспрессия PDLIM4/PIL и особенности морфологии и сигнальных каскадов линий клеток рака молочной железы человека. а - экспрессия мРНК PDLIM4/RIL, Е-кадгерина и Slug по данным ОТ-ПЦР; б - вестерн-блот анализ экспрессии белков PDLIM4/RIL, Е-кадгерина, трансформирующего фактора роста бета (TGFβ) и активированного Smad2; в - морфология клеток использованных культур опухолей молочной железы и первичного эпителия. Световая микроскопия. Черной рамкой обозначены культуры клеток с высокой экспрессией PDLIM4/RIL, серым пунктиром - линии, где экспрессия PDLIM4/RIL недетектируема.
Claims (1)
- Способ диагностики субтипа рака молочной железы, характеризующийся тем, что определяют уровень экспрессии RIL (PDLIM4) в образце опухолевой ткани пациента с помощью технологии секвенирования следующего поколения NGS или методами Нозерн-гибридизации и ПЦР в реальном времени и при снижении экспрессии RIL (PDLIM4) более чем в два раза в сравнении с его уровнем в нормальных тканях диагностируют субтип злокачественных новообразований молочной железы - опухолей, характеризующихся неполной эпителиально-мезенхимальной транзицией и относительно малоинвазивных.
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2013140122/15A RU2547583C2 (ru) | 2013-08-30 | 2013-08-30 | Способ диагностики рака молочной железы |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2013140122/15A RU2547583C2 (ru) | 2013-08-30 | 2013-08-30 | Способ диагностики рака молочной железы |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2013140122A RU2013140122A (ru) | 2015-03-10 |
| RU2547583C2 true RU2547583C2 (ru) | 2015-04-10 |
Family
ID=53279608
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2013140122/15A RU2547583C2 (ru) | 2013-08-30 | 2013-08-30 | Способ диагностики рака молочной железы |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2547583C2 (ru) |
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2612139C1 (ru) * | 2015-12-29 | 2017-03-02 | Федеральное государственное бюджетное учреждение науки институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук (ИБХ РАН) | Набор синтетических олигонуклеотидов для определения уровней экспрессии гена pdlim4 |
| RU2619739C2 (ru) * | 2012-05-30 | 2017-05-17 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Российский научный центр рентгенорадиологии" Министерства здравоохранения российской федерации (ФГБУ "РНЦРР" Минздрава России) | Способ диагностики и прогноза при гиперпролиферативных заболеваниях молочной железы |
Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2012172511A1 (en) * | 2011-06-16 | 2012-12-20 | Universita' Degli Studi Di Trieste | Method for the prognosis of breast cancer based on the expression of the gene pin1 in combination with mutations in the gene tp53 |
| RU2486518C1 (ru) * | 2012-01-10 | 2013-06-27 | Учреждение Российской академии медицинских наук Научно-исследовательский институт онкологии Сибирского отделения Российской академии медицинских наук (НИИ онкологии СО РАМН) | Способ прогнозирования возникновения местных рецидивов в послеоперационном рубце при уницентрическом инвазивном протоковом раке молочной железы у больных с сохраненной менструальной функцией |
-
2013
- 2013-08-30 RU RU2013140122/15A patent/RU2547583C2/ru active
Patent Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2012172511A1 (en) * | 2011-06-16 | 2012-12-20 | Universita' Degli Studi Di Trieste | Method for the prognosis of breast cancer based on the expression of the gene pin1 in combination with mutations in the gene tp53 |
| RU2486518C1 (ru) * | 2012-01-10 | 2013-06-27 | Учреждение Российской академии медицинских наук Научно-исследовательский институт онкологии Сибирского отделения Российской академии медицинских наук (НИИ онкологии СО РАМН) | Способ прогнозирования возникновения местных рецидивов в послеоперационном рубце при уницентрическом инвазивном протоковом раке молочной железы у больных с сохраненной менструальной функцией |
Non-Patent Citations (2)
| Title |
|---|
| FENG W. et al. Tumor suppressor genes are frequently methylated in lymph node metastases of breast cancers. BMC Cancer. 2010 Jul 20; 10: 378 [найдено 24.09.2014]. Найдено из Интернет: URL: http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1471-2407-10-378.pdf. * |
| ЛИПУНОВ Н.М. и др. Характеристика радиационно-индуцированных изменений субпопуляционного состава культуры клеток линии HeLa. Медицинский академический журнал. 2012; 12(3): 63-65 [найдено 20.01.2015]. Найдено из Интернет: URL: http://www.iemrams.spb.ru/russian/maj/2012art/03_2012_63-65.pdf * |
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2619739C2 (ru) * | 2012-05-30 | 2017-05-17 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Российский научный центр рентгенорадиологии" Министерства здравоохранения российской федерации (ФГБУ "РНЦРР" Минздрава России) | Способ диагностики и прогноза при гиперпролиферативных заболеваниях молочной железы |
| RU2612139C1 (ru) * | 2015-12-29 | 2017-03-02 | Федеральное государственное бюджетное учреждение науки институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук (ИБХ РАН) | Набор синтетических олигонуклеотидов для определения уровней экспрессии гена pdlim4 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| RU2013140122A (ru) | 2015-03-10 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Economopoulou et al. | Liquid biopsy: an emerging prognostic and predictive tool in head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC). Focus on circulating tumor cells (CTCs) | |
| Han et al. | A novel panel of serum miR-21/miR-155/miR-365 as a potential diagnostic biomarker for breast cancer | |
| Tsukamoto et al. | Identification of endometrioid endometrial carcinoma-associated microRNAs in tissue and plasma | |
| KR101437718B1 (ko) | 위암의 예후 예측용 마커 및 이를 이용하는 위암의 예후 예측 방법 | |
| CN106834462B (zh) | 一组胃癌基因的应用 | |
| Wang et al. | Methylation markers for small cell lung cancer in peripheral blood leukocyte DNA | |
| US8911940B2 (en) | Methods of assessing a risk of cancer progression | |
| Roy et al. | MicroRNA and target gene expression based clustering of oral cancer, precancer and normal tissues | |
| AU2019301959B2 (en) | DNA methylation markers for noninvasive detection of cancer and uses thereof | |
| WO2018204725A1 (en) | Theranostic tools for management of pancreatic cancer and its precursors | |
| US10633712B2 (en) | Assays and methods relating to the treatment of melanoma | |
| AU2021309571A1 (en) | Prognostic biomarkers for cancer | |
| Jafri et al. | Detection of kras gene in colorectal cancer patients through liquid biopsy: A cost-effective method | |
| RU2547583C2 (ru) | Способ диагностики рака молочной железы | |
| Condello et al. | Alterations in gene expression associated with invasion of RAS-mutant thyroid tumors and their potential diagnostic and therapeutic utility | |
| US11976330B2 (en) | MiRNA signature expression in cancer | |
| US8110362B2 (en) | Method for determining a tongue cancer | |
| Punyadeera et al. | A Novel Saliva-Based miRNA Profile to Diagnose and Predict Oral Cancer | |
| US20240229159A1 (en) | Gene signature for the identification of lymph node involvement in cancer patients | |
| Zi et al. | LncRNA CASC2 Plays an Indicative Role in Diagnosing Bladder Cancer | |
| JP2025524049A (ja) | 抗腫瘍療法における、単独又はmek阻害薬と組み合わせたbraf阻害薬に対する抵抗性の発生を予測するための方法 | |
| Lin et al. | Early detection of gastric cancer via multiplex blood assay targeting CfDNA methylation signatures | |
| EP3186391B1 (en) | Methods and kit for identification of cancer | |
| US20150329914A1 (en) | Predictive biomarkers for pre-malignant breast lesions | |
| CN114672554A (zh) | 一种检测肿瘤相关基因谱表达量的方法及其用途 |