RU2341795C2 - Гены, связанные с остеоартритом собак, и относящиеся к этому способы и композиции - Google Patents
Гены, связанные с остеоартритом собак, и относящиеся к этому способы и композиции Download PDFInfo
- Publication number
- RU2341795C2 RU2341795C2 RU2006131570/15A RU2006131570A RU2341795C2 RU 2341795 C2 RU2341795 C2 RU 2341795C2 RU 2006131570/15 A RU2006131570/15 A RU 2006131570/15A RU 2006131570 A RU2006131570 A RU 2006131570A RU 2341795 C2 RU2341795 C2 RU 2341795C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- expression
- osteoarthritis
- genes
- seq
- sample
- Prior art date
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P19/00—Drugs for skeletal disorders
- A61P19/02—Drugs for skeletal disorders for joint disorders, e.g. arthritis, arthrosis
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/136—Screening for pharmacological compounds
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Public Health (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Physical Education & Sports Medicine (AREA)
- Pathology (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Rheumatology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Orthopedic Medicine & Surgery (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Acyclic And Carbocyclic Compounds In Medicinal Compositions (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
Abstract
Изобретение относится к области молекулярной биологии и касается генов, включающих полинуклеотиды, дифференциально экспрессирующиеся у субъектов, страдающих остеоартритом или в предостеоартритном состоянии. Описана комбинация, содержащая молекулы полинуклеотидов, выбранных из группы SEQ ID NO 1:396, подвергающиеся дифференциальной экспрессии при остеоартрите. Также описаны способы, которые могут применяться для диагностики и прогнозирования остеоартрита, а также способы, которые могут применяться для скрининга тестируемых веществ на эффективность в возможных способах терапии остеоартрита. Преимущество изобретения заключается в идентификации последовательностей нуклеиновых кислот, подвергающихся дифференциальной экспрессии у субъекта. 10 н. и 5 з.п. ф-лы, 23 табл., 2 ил.
Description
Claims (14)
1. Комбинация, включающая множество молекул полинуклеотидов, причем молекулы полинуклеотидов дифференциально экспрессируются у субъектов, страдающих остеоартритом или в предостеоартритном состоянии, по сравнению с экспрессией у субъектов, не страдающих остеоартритом или не в предостеоартритном состоянии, в которой множество молекул полинуклеотидов включает две или больше молекул, выбранных из SEQ ID NO:1-396.
2. Способ выявления дифференциальной экспрессии нуклеиновых кислот в образце, включающий стадии
a) гибридизации комбинации, включающей множество молекул полинуклеотидов, причем молекулы полинуклеотидов дифференциально экспрессируются у субъектов, страдающих остеоартритом или в предостеоартритном состоянии, по сравнению с экспрессией у субъектов, не страдающих остеоартритом или не в предостеоартритном состоянии, с нуклеиновыми кислотами образца, образуя таким образом один или несколько гибридизационных комплексов, где молекулы полинуклеотидов гибридизуются с последовательностями нуклеиновых кислот, выбранными из SEQ ID NO: 1-396;
b) детектирования гибридизационных комплексов; и
c) сравнения гибридизационных комплексов с таковыми для стандарта, при этом различия между гибридизационными комплексами стандарта и образца указывают на дифференциальную экспрессию нуклеиновых кислот в образце.
3. Способ по п.2, дополнительно включающий стадию обработки образца тестируемым соединением, причем сравнение со стандартом указывает на то, изменяет ли обработка тестируемым соединением дифференциальную экспрессию нуклеиновых кислот или полипептидов в образце.
4. Композиция веществ, включающая набор из двух или больше зондов для детектирования экспрессии генов, дифференциально экспрессируемых у субъектов, страдающих остеоартритом или в предостеоартритном состоянии, по сравнению с субъектами, не страдающими остеоартритом или не в предостеоартритном состоянии, причем зонды включают две или больше из молекул нуклеиновых кислот, которые специфически гибридизуются с двумя или больше генами, где гены включают SEQ ID NO: 1-396.
5. Устройство для детектирования экспрессии множества генов, дифференциально экспрессирующихся при остеоартрите, включающее подложку, на которой фиксировано в известных местах множество зондов, причем зонды включают множество олигонуклеотидов или полинуклеотидов, каждый из которых специфически гибридизуется с другой последовательностью, выбранной из числа SEQ ID NO: 1-396.
6 Способ измерения эффекта тестируемого соединения на экспрессию одного или нескольких генов, дифференциально экспрессирующихся при остеоартрите, включающий стадии
a) измерения стандартной экспрессии путем измерения продуктов транскрипции одного или нескольких генов, включающих любые из SEQ ID NO: 1-396, в стандартном образце в отсутствии тестируемого соединения;
b) измерения опытной экспрессии путем измерения продуктов транскрипции одного или нескольких генов, включающих любые из SEQ ID NO: 1-396 в опытном образце в присутствии тестируемого соединения;
c) сравнения стандартной экспрессии с опытной экспрессией, причем изменение опытной экспрессии по сравнению со стандартной экспрессией указывает на эффект тестируемого соединения на экспрессию генов, дифференциально экспрессирующихся при остеоартрите, по сравнению с состоянием без остеоартрита.
7. Способ по п.6, в котором при измерении используют композицию веществ, включающую множество зондов, причем зонды включают два или больше генов, включающих любые из SEQ ID NO: 1-396.
8. Способ по п.6, в котором стандартный и опытный образцы получают из, по меньшей мере, одного субъекта-млекопитающего.
9. Способ диагностики или составления прогноза для субъекта, проявляющего признаки остеоартрита, (OA) включающий
a) получение образца от субъекта;
b) измерение в образце продукции продуктов транскрипции, образующихся при экспрессии одного или нескольких связанных с OA генов, включающих любые из SEQ ID NO: 1-396;
c) сравнение продуктов транскрипции образца с таковыми для стандарта, причем отличие в экспрессии любого из связанных с OA генов указывает на остеоартрит.
10. Набор для выявления наличия остеоартрита или предрасположенности к остеоартриту у субъекта, включающий один или несколько олигонуклеотидов, содержащих, по меньшей мере, 10 следующих друг за другом нуклеотидов из последовательности, выбранной из последовательностей, гибридизующихся с двумя или более генами, включающими любые из SEQ ID NO: 1-396, причем олигонуклеотиды специфически связываются с нуклеиновыми кислотами, дифференциально экспрессирующимися у субъектов, страдающих остеоартритом или предрасположенных к нему, по сравнению с экспрессией у субъектов, не страдающих остеоартритом или не предрасположенных к нему.
11. Набор для определения экспрессии генов, дифференциально экспрессирующихся при остеоартрите, включающий контейнер, содержащий набор из двух или больше зондов, причем зонды включают один или более из олигонуклеотидов или полинуклеотидов, специфически гибридизующихся с двумя или более генами, включающими любые из SEQ ID NO: 1-396; а также инструкции по проведению анализа экспрессии генов.
12. Способ модулирования экспрессии связанных с остеоартритом генов в клетке путем введения эффективного количества соединения в соответствующих условиях с тем, чтобы повлиять на экспрессию, по меньшей мере, одного связанного с остеоартритом гена, имеющего последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 1-396.
13. Способ по п.12, в котором соединение представляет собой витамин, минерал, нутрицевтик, низкомолекулярное фармацевтическое средство, белок, полипептид, нуклеиновую кислоту, жирную кислоту или полисахарид.
14. Способ по п.13, в котором соединение представляет собой эйкозапентаеновую кислоту, арахидоновую кислоту, глюкозамин, хондроитинсульфат, 1α,25-дигидроксивитамин D3 или 24R,25-дигидроксивитамин D3.
15. Способ идентификации соединений, модулирующих связанные с остеоартритом гены, включающий
a) измерение стандартной экспрессии путем измерения продуктов транскрипции одного или нескольких генов, включающих любые из SEQ ID NO: 1-396, в стандартном образце в отсутствие тестируемого соединения;
b) измерение опытной экспрессии путем измерения продуктов транскрипции одного или нескольких генов, включающих любые из SEQ ID NO: 1-396, в опытном образце в присутствии тестируемого соединения; и
c) сравнение стандартной экспрессии с опытной экспрессией, причем изменение опытной экспрессии по сравнению со стандартной экспрессией указывает на эффект тестируемого соединения на экспрессию генов, дифференциально экспрессирующихся при остеоартрите, по сравнению с состоянием без остеоартрита.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US54134604P | 2004-02-02 | 2004-02-02 | |
| US60/541,346 | 2004-02-02 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2006131570A RU2006131570A (ru) | 2008-03-10 |
| RU2341795C2 true RU2341795C2 (ru) | 2008-12-20 |
Family
ID=34837479
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2006131570/15A RU2341795C2 (ru) | 2004-02-02 | 2005-02-02 | Гены, связанные с остеоартритом собак, и относящиеся к этому способы и композиции |
Country Status (9)
| Country | Link |
|---|---|
| EP (1) | EP1711635A1 (ru) |
| JP (1) | JP4879756B2 (ru) |
| CN (1) | CN1914336B (ru) |
| AU (1) | AU2005210503B2 (ru) |
| BR (1) | BRPI0507349A (ru) |
| CA (1) | CA2555083A1 (ru) |
| RU (1) | RU2341795C2 (ru) |
| WO (1) | WO2005075685A1 (ru) |
| ZA (1) | ZA200607348B (ru) |
Families Citing this family (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20070118295A1 (en) * | 2005-03-02 | 2007-05-24 | Al-Murrani Samer Waleed Khedhe | Methods and Systems for Designing Animal Food Compositions |
| JP2011502162A (ja) * | 2007-10-29 | 2011-01-20 | ザ ユニバーシティー オブ カリフォルニア | 変形性関節症遺伝子治療 |
| EP2123775A1 (en) * | 2008-05-20 | 2009-11-25 | Stiftung Tierärztliche Hochschule Hannover | Analysis for the genetic disposition for hip dysplasia in Canidae |
| US9464330B2 (en) * | 2012-12-21 | 2016-10-11 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Genetic loci associated with soybean cyst nematode resistance and methods of use |
| CN105803085B (zh) * | 2016-04-27 | 2019-07-19 | 范彧 | 一种检测骨关节炎的分子标记物及其用途 |
| TWI857807B (zh) * | 2020-03-20 | 2024-10-01 | 台灣粒線體應用技術股份有限公司 | 含有粒線體之組合物及其用於作為皮膚纖維母細胞活性促進劑之用途 |
| CN113249464B (zh) * | 2021-04-13 | 2022-09-27 | 广东省中医院(广州中医药大学第二附属医院、广州中医药大学第二临床医学院、广东省中医药科学院) | 环状rna作为骨关节炎标志物的应用 |
Family Cites Families (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP1404868A2 (en) * | 2001-02-28 | 2004-04-07 | Chondrogene Inc. | Compositions and methods relating to osteoarthritis |
-
2005
- 2005-02-02 CA CA002555083A patent/CA2555083A1/en not_active Abandoned
- 2005-02-02 JP JP2006551610A patent/JP4879756B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2005-02-02 RU RU2006131570/15A patent/RU2341795C2/ru not_active IP Right Cessation
- 2005-02-02 EP EP05722699A patent/EP1711635A1/en not_active Withdrawn
- 2005-02-02 BR BRPI0507349-9A patent/BRPI0507349A/pt not_active IP Right Cessation
- 2005-02-02 WO PCT/US2005/003375 patent/WO2005075685A1/en not_active Ceased
- 2005-02-02 AU AU2005210503A patent/AU2005210503B2/en not_active Ceased
- 2005-02-02 CN CN2005800039087A patent/CN1914336B/zh not_active Expired - Fee Related
-
2006
- 2006-09-01 ZA ZA200607348A patent/ZA200607348B/en unknown
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| BLUTEAU G., et al. Differential gene expression analysis in a rabbit model of osteoarthritis induced anterior cruciate ligament (ACL) section, Biorheology, 2002, v.349, 1-2, p.247-258 AIGNER THOMAS et al. Functional genomics of osteoarthritis, Pharmacogenetics, sep.2002, v.3, p.635-650. * |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| AU2005210503A1 (en) | 2005-08-18 |
| AU2005210503B2 (en) | 2010-02-25 |
| ZA200607348B (en) | 2008-05-28 |
| EP1711635A1 (en) | 2006-10-18 |
| CA2555083A1 (en) | 2005-08-18 |
| BRPI0507349A (pt) | 2007-04-17 |
| CN1914336A (zh) | 2007-02-14 |
| CN1914336B (zh) | 2012-09-19 |
| JP2007523643A (ja) | 2007-08-23 |
| RU2006131570A (ru) | 2008-03-10 |
| WO2005075685A1 (en) | 2005-08-18 |
| JP4879756B2 (ja) | 2012-02-22 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| EP2061801A1 (en) | Diagnosis of fetal abnormalities by comparative genomic hybridization analysis | |
| JP2011514162A (ja) | 炎症性腸疾患および過敏性腸症候群のバイオマーカー | |
| KR102110039B1 (ko) | 비만 진단을 위한 마이크로RNA-26b 또는 마이크로RNA-4449 바이오마커 및 이의 용도 | |
| RU2018113795A (ru) | Набор зондов для анализа образцов днк и способы их использования | |
| JP2011525106A (ja) | 瀰漫性b大細胞型リンパ腫のマーカーおよびその使用方法 | |
| Kang et al. | Detection of BRAF V600E mutation with thyroid tissue using pyrosequencing: comparison with PNA-clamping and real-time PCR | |
| HRP20150684T1 (hr) | Identifikacija specifiäśnih mjesta nastanka - genetski loci - upalne bolesti crijeva kod djece i postupci njihove uporabe u takvoj dijagnozi te njihovo lijeäśenje | |
| CA2785406A1 (en) | Compositions and methods for diagnosing and treating kidney disorders in a canine | |
| Jiang et al. | Rapid and multiplex microRNA detection on graphically encoded silica suspension array | |
| Sigdel et al. | Targeted transcriptional profiling of kidney transplant biopsies | |
| RU2341795C2 (ru) | Гены, связанные с остеоартритом собак, и относящиеся к этому способы и композиции | |
| KR101604178B1 (ko) | 약물에 의한 간 손상의 예측 및 진단을 위한 바이오마커 | |
| WO2016196451A1 (en) | Methods for monitoring polymorphonuclear myeloid derived suppressor cells | |
| García-Giménez et al. | Epigenetic biomarkers for disease diagnosis | |
| JP7540730B2 (ja) | 関節リウマチを検査する方法 | |
| WO2014124166A2 (en) | Identification of unique gene expression profiles in children with regressive autism spectrum disorder (asd) and ileocolitis | |
| Zhang et al. | Oligonucleotide microarray for HLA‐DRB1 genotyping: preparation and clinical evaluation | |
| US20240301492A1 (en) | Methods of preparing assays, systems, and compositions for determining fetal fraction | |
| WO2023021978A1 (ja) | 自己免疫疾患を検査する方法 | |
| JP2022025456A (ja) | 多発性硬化症を検査する方法 | |
| WO2010142751A1 (en) | In vitro diagnosis/prognosis method and kit for assessment of chronic antibody mediated rejection in kidney transplantation | |
| JP2023020631A (ja) | 全身性エリテマトーデスを検査する方法 | |
| JP2006223303A (ja) | 微量胃癌細胞の検出法 | |
| JP2022076117A (ja) | 前立腺がんを検査する方法 | |
| Assmann et al. | Transcriptomics to devise human health and disease |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20180203 |