[go: up one dir, main page]

RU2018135738A - Композиции и способы синтеза 5-(n-защищенного триптаминкарбоксамида)-2'-дезоксиуридинфосфорамидата для включения в нуклеотидную последовательность - Google Patents

Композиции и способы синтеза 5-(n-защищенного триптаминкарбоксамида)-2'-дезоксиуридинфосфорамидата для включения в нуклеотидную последовательность Download PDF

Info

Publication number
RU2018135738A
RU2018135738A RU2018135738A RU2018135738A RU2018135738A RU 2018135738 A RU2018135738 A RU 2018135738A RU 2018135738 A RU2018135738 A RU 2018135738A RU 2018135738 A RU2018135738 A RU 2018135738A RU 2018135738 A RU2018135738 A RU 2018135738A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
compound
chloride
tert
methoxy
butyl
Prior art date
Application number
RU2018135738A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2018135738A3 (ru
RU2750989C2 (ru
Inventor
Джон РОЛОФФ
Original Assignee
Сомалоджик, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Сомалоджик, Инк. filed Critical Сомалоджик, Инк.
Publication of RU2018135738A publication Critical patent/RU2018135738A/ru
Publication of RU2018135738A3 publication Critical patent/RU2018135738A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2750989C2 publication Critical patent/RU2750989C2/ru

Links

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57484—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving compounds serving as markers for tumor, cancer, neoplasia, e.g. cellular determinants, receptors, heat shock/stress proteins, A-protein, oligosaccharides, metabolites
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61B—DIAGNOSIS; SURGERY; IDENTIFICATION
    • A61B5/00—Measuring for diagnostic purposes; Identification of persons
    • A61B5/45—For evaluating or diagnosing the musculoskeletal system or teeth
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D209/00—Heterocyclic compounds containing five-membered rings, condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom
    • C07D209/02—Heterocyclic compounds containing five-membered rings, condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom condensed with one carbocyclic ring
    • C07D209/04—Indoles; Hydrogenated indoles
    • C07D209/10—Indoles; Hydrogenated indoles with substituted hydrocarbon radicals attached to carbon atoms of the hetero ring
    • C07D209/14—Radicals substituted by nitrogen atoms, not forming part of a nitro radical
    • C07D209/16—Tryptamines
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D209/00—Heterocyclic compounds containing five-membered rings, condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom
    • C07D209/02—Heterocyclic compounds containing five-membered rings, condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom condensed with one carbocyclic ring
    • C07D209/04—Indoles; Hydrogenated indoles
    • C07D209/10—Indoles; Hydrogenated indoles with substituted hydrocarbon radicals attached to carbon atoms of the hetero ring
    • C07D209/18—Radicals substituted by carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals
    • C07D209/24—Radicals substituted by carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals with an alkyl or cycloalkyl radical attached to the ring nitrogen atom
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D209/00—Heterocyclic compounds containing five-membered rings, condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom
    • C07D209/02—Heterocyclic compounds containing five-membered rings, condensed with other rings, with one nitrogen atom as the only ring hetero atom condensed with one carbocyclic ring
    • C07D209/04—Indoles; Hydrogenated indoles
    • C07D209/10—Indoles; Hydrogenated indoles with substituted hydrocarbon radicals attached to carbon atoms of the hetero ring
    • C07D209/18—Radicals substituted by carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals
    • C07D209/26—Radicals substituted by carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals with an acyl radical attached to the ring nitrogen atom
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H1/00—Processes for the preparation of sugar derivatives
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/06—Pyrimidine radicals
    • C07H19/073—Pyrimidine radicals with 2-deoxyribosyl as the saccharide radical
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/06—Pyrimidine radicals
    • C07H19/10—Pyrimidine radicals with the saccharide radical esterified by phosphoric or polyphosphoric acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C07H21/04—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with deoxyribosyl as saccharide radical
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57407—Specifically defined cancers
    • G—PHYSICS
    • G06—COMPUTING OR CALCULATING; COUNTING
    • G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T7/00—Image analysis
    • G06T7/0002—Inspection of images, e.g. flaw detection
    • G06T7/0012—Biomedical image inspection
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/46—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans from vertebrates
    • G01N2333/47—Assays involving proteins of known structure or function as defined in the subgroups
    • G01N2333/4701—Details
    • G01N2333/4727—Calcium binding proteins, e.g. calmodulin
    • G—PHYSICS
    • G06—COMPUTING OR CALCULATING; COUNTING
    • G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T2207/00—Indexing scheme for image analysis or image enhancement
    • G06T2207/30—Subject of image; Context of image processing
    • G06T2207/30004—Biomedical image processing
    • G06T2207/30024—Cell structures in vitro; Tissue sections in vitro
    • G—PHYSICS
    • G06—COMPUTING OR CALCULATING; COUNTING
    • G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T2207/00—Indexing scheme for image analysis or image enhancement
    • G06T2207/30—Subject of image; Context of image processing
    • G06T2207/30004—Biomedical image processing
    • G06T2207/30036—Dental; Teeth

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Computer Vision & Pattern Recognition (AREA)
  • Quality & Reliability (AREA)
  • Radiology & Medical Imaging (AREA)
  • Surgery (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Orthopedic Medicine & Surgery (AREA)
  • Rheumatology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Heart & Thoracic Surgery (AREA)
  • Dentistry (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Oral & Maxillofacial Surgery (AREA)

Claims (200)

1. Соединение, представляющее собой:
Figure 00000001
, или его соль;
где
R1 выбран из трет-бутила, 1,1-диметилпропила; 1,1-диметилбутила; 2-хлорфенила; 2-цианофенила; 1-метилциклопентила; и 1-метилциклогексила;
X1 и Х2 каждый независимо выбран из метокси и водорода;
X3 выбран из метокси, фтора, водорода и трет-бутилдиметилсилилокси.
2. Соединение по п. 1, где R1 представляет собой трет-бутил.
3. Соединение по п. 1 или 2, где Х1 и Х2 представляет собой метокси.
4. Соединение по любому из пп. 1-3, где Х3 представляет собой водород.
5. Соединение по любому из пп.1-3, где Х3 представляет собой метокси.
6. Соединение по любому из пп. 1-3, где Х3 представляет собой фтор.
7. Соединение по п. 1, выбранное из:
Figure 00000002
;
Figure 00000003
;
Figure 00000004
;
Figure 00000005
;
Figure 00000006
;
Figure 00000007
;
Figure 00000008
;
и их солей.
8. Соединение, представляющее собой:
Figure 00000009
, или его соль;
где
R1 выбран из трет-бутила, 1,1-диметилпропила; 1,1-диметилбутила; 2-хлорфенила; 2-цианофенила; 1-метилциклопентила; и 1-метилциклогексила;
X1 и Х2 каждый независимо выбран из метокси и водорода;
X3 выбран из метокси, фтора, водорода и трет-бутилдиметилсилилокси.
9. Соединение по п. 8, где R1 представляет собой трет-бутил.
10. Соединение по п. 8 или 9, где Х1 и Х2 представляет собой метокси.
11. Соединение по любому из пп. 8-10, где Х3 представляет собой водород.
12. Соединение по любому из пп. 8-10, где Х3 представляет собой метокси.
13. Соединение по любому из пп. 8-10, где Х3 представляет собой фтор.
14. Соединение по п. 8, выбранное из:
Figure 00000010
;
Figure 00000011
;
Figure 00000012
;
Figure 00000013
;
Figure 00000014
;
Figure 00000015
;
Figure 00000016
;
и их солей.
15. Соединение, представляющее собой:
Figure 00000017
, или его соль;
где
R1 выбран из трет-бутила, 1,1-диметилпропила; 1,1-диметилбутила; 2-хлорфенила; 2-цианофенила; 1-метилциклопентила; и 1-метилциклогексила.
16. Соединение по п. 15, где R1 представляет собой трет-бутил.
17. Соединение по п. 15, выбранное из:
Figure 00000018
;
Figure 00000019
;
Figure 00000020
;
Figure 00000021
;
Figure 00000022
;
Figure 00000023
;
Figure 00000024
;
и их солей.
18. Соединение, представляющее собой:
Figure 00000025
где
R1 выбран из трет-бутила, 1,1-диметилпропила; 1,1-диметилбутила; 2-хлорфенила; 2-цианофенила; 1-метилциклопентила; и 1-метилциклогексила;
19. Соединение по п. 18, где R1 представляет собой трет-бутил.
20. Соединение по п. 18, выбранное из:
Figure 00000026
;
Figure 00000027
;
Figure 00000028
;
Figure 00000029
;
Figure 00000030
;
Figure 00000031
;
Figure 00000032
.
21. Способ получения соединения, представляющего собой:
Figure 00000033
, или его соль;
где
R1 выбран из трет-бутила, 1,1-диметилпропила; 1,1-диметилбутила; 2-хлорфенила; 2-цианофенила; 1-метилциклопентила; и 1-метилциклогексила;
причем способ включает приведение в контакт N-α-BOC-триптамина с хлорангидридом кислоты, выбранным из пивалоилхлорида, 2,2-диметилбутироилхлорида, 2,2-диметилвалероилхлорида, 1-метилциклопентан-1-карбонилхлорида, 1-метилциклогексан-1-карбонилхлорида, 2-хлорбензоилхлорида и 2-цианобензоилхлорида.
22. Способ по п. 21, где R1 представляет собой трет-бутил, и причем хлорангидрид кислоты представляет собой пивалоилхлорид.
23. Способ по п. 21, отличающийся тем, что соединение выбрано из:
Figure 00000018
;
Figure 00000019
;
Figure 00000020
;
Figure 00000021
;
Figure 00000022
;
Figure 00000023
; и
Figure 00000024
.
24. Способ получения соединения, представляющего собой:
Figure 00000034
,
где
R1 выбран из трет-бутила, 1,1-диметилпропила; 1,1-диметилбутила; 2-хлорфенила; 2-цианофенила; 1-метилциклопентила; и 1-метилциклогексила;
причем способ включает приведение в контакт соединения
Figure 00000017
с трифторуксусной кислотой.
25. Способ по п. 24, где R1 представляет собой трет-бутил.
26. Способ по п. 24, отличающийся тем, что способ приводит к получению соединения, выбранному из:
Figure 00000026
;
Figure 00000027
;
Figure 00000028
;
Figure 00000029
;
Figure 00000030
;
Figure 00000031
;
Figure 00000032
.
27. Способ по п. 21, отлиающийся тем, что способ дополнительно включает приведение в контакт N-α-BOC-триптамина с хлорангидридом кислоты, выбранным из пивалоилхлорида, 2,2-диметилбутироилхлорида, 2,2-диметилвалероилхлорида, 1-метилциклопентан-1-карбонилхлорида, 1-метилциклогексан-1-карбонилхлорида, 2-хлорбензоилхлорида и 2-цианобензоилхлорида, с образованием соединения
Figure 00000017
.
28. Способ получения соединения, представляющего собой:
Figure 00000035
, или его соль;
где
R1 выбран из трет-бутила, 1,1-диметилпропила; 1,1-диметилбутила; 2-хлорфенила; 2-цианофенила; 1-метилциклопентила; и 1-метилциклогексила;
X1 и Х2 каждый независимо выбран из метокси и водорода;
X3 выбран из метокси, фтора, водорода и трет-бутилдиметилсилилокси;
причем способ включает приведение в контакт соединения
Figure 00000034
с 5'-O-DMT-5-(2,2,2-трифторэтилоксикарбонил)-2'-дезоксиуридином (TFEdU).
29. Способ по п. 28, отличающийся тем, что способ приводит к получению соединения, выбранному из:
Figure 00000010
;
Figure 00000011
;
Figure 00000012
;
Figure 00000013
;
Figure 00000014
;
Figure 00000015
;
Figure 00000016
;
и их солей.
30. Способ по п. 28 или 29, отличающийся тем, что способ дополнительно включает приведение в контакт соединения
Figure 00000017
с трифторуксусной кислотой с образованием соединения
Figure 00000034
.
31. Способ по п. 30, отличающийся тем, что способ дополнительно включает приведение в контакт N-α-BOC-триптамина с хлорангидридом кислоты, выбранным из пивалоилхлорида, 2,2-диметилбутироилхлорида, 2,2-диметилвалероилхлорида, 1-метилциклопентан-1-карбонилхлорида, 1-метилциклогексан-1-карбонилхлорида, 2-хлорбензоилхлорида и 2-цианобензоилхлорида, с образованием соединения
Figure 00000017
.
32. Способ получения соединения, представляющего собой:
Figure 00000001
, или его соль;
где
R1 выбран из трет-бутила, 1,1-диметилпропила; 1,1-диметилбутила; 2-хлорфенила; 2-цианофенила; 1-метилциклопентила; и 1-метилциклогексила;
X1 и Х2 каждый независимо выбран из метокси и водорода;
X3 выбран из метокси, фтора, водорода и трет-бутилдиметилсилилокси;
причем способ включает приведение в контакт соединения
Figure 00000009
с 2-цианоэтил-N,N,N',N'-тетраизопропиламидофосфитом.
33. Способ по п. 32, где R1 представляет собой трет-бутил.
34. Способ по п. 32 или 33, где Х1 и Х2 представляют собой метокси.
35. Способ по любому из пп. 32-34, где Х3 представляет собой водород.
36. Способ по любому из пп. 32-34, где Х3 представляет собой метокси.
37. Способ по любому из пп. 32-34, где Х3 представляет собой фтор.
38. Способ по любому из пп. 32-37, отличающийся тем, что способ включает приведение в контакт соединения
Figure 00000025
с 5'-O-DMT-5-(2,2,2-трифторэтилоксикарбонил)-2'-дезоксиуридином (TFEdU) с образованием соединения
Figure 00000009
.
39. Способ по п. 38, отличающийся тем, что способ включает приведение в контакт соединения
Figure 00000017
с трифторуксусной кислотой с образованием соединения
Figure 00000025
.
40. Способ по п. 39, отличающийся тем, что способ включает приведение в контакт N-α-BOC-триптамина с хлорангидридом кислоты, выбранным из пивалоилхлорида, 2,2-диметилбутироилхлорида, 2,2-диметилвалероилхлорида, 1-метилциклопентан-1-карбонилхлорида, 1-метилциклогексан-1-карбонилхлорида, 2-хлорбензоилхлорида и 2-цианобензоилхлорида, с образованием соединения
Figure 00000017
.
41. Способ по любому из пп. 32-40, который приводит к получению соединения, выбранному из:
Figure 00000002
;
Figure 00000003
;
Figure 00000004
;
Figure 00000005
;
Figure 00000006
;
Figure 00000007
;
Figure 00000008
;
и их солей.
42. Способ получения соединения, представляющего собой:
Figure 00000001
, или его соль;
где
R1 выбран из трет-бутила, 1,1-диметилпропила; 1,1-диметилбутила; 2-хлорфенила; 2-цианофенила; 1-метилциклопентила; и 1-метилциклогексила;
X1 и Х2 каждый независимо выбран из метокси и водорода;
X3 выбран из метокси, фтора, водорода и трет-бутилдиметилсилилокси;
включающий стадии:
e) приведение в контакт N-α-BOC-триптамина с хлорангидридом кислоты, выбранным из пивалоилхлорида, 2,2-диметилбутироилхлорида, 2,2-диметилвалероилхлорида, 1-метилциклопентан-1-карбонилхлорида, 1-метилциклогексан-1-карбонилхлорида, 2-хлорбензоилхлорида и 2-цианобензоилхлорида, с образованием соединения
Figure 00000033
;
f) приведение в контакт соединения
Figure 00000033
с трифторуксусной кислотой с образованием соединения
Figure 00000025
;
g) приведение в контакт соединения
Figure 00000025
с 5'-O-DMT-5-(2,2,2-трифторэтилоксикарбонил)-2'-дезоксиуридином (TFEdU) с образованием соединения
Figure 00000035
; и
h) приведение в контакт соединения
Figure 00000035
с 2-цианоэтил-N,N,N',N'-тетраизопропиламидофосфитом.
43. Способ по п. 42, где R1 представляет собой трет-бутил.
44. Способ по п. 42 или 43, где Х1 и Х2 представляют собой метокси.
45. Способ по любому из пп. 42-44, где Х3 представляет собой водород.
46. Способ по любому из пп. 42-44, где Х3 представляет собой метокси.
47. Способ по любому из пп. 42-44, где Х3 представляет собой фтор.
48. Способ по п. 42, отличающийся тем, что способ приводит к получению соединения, выбранному из:
Figure 00000002
;
Figure 00000003
;
Figure 00000004
;
Figure 00000005
;
Figure 00000006
;
Figure 00000007
;
Figure 00000008
;
и их солей.
49. Олигонуклеотид, содержащий по меньшей мере один защищенный нуклеотид TrpU, причем по меньшей мере один защищенный нуклеотид TrpU в олигонуклеотиде имеет структуру:
Figure 00000036
;
где
R1 выбран из трет-бутила, 1,1-диметилпропила; 1,1-диметилбутила; 2-хлорфенила; 2-цианофенила; 1-метилциклопентила; и 1-метилциклогексила;
X3 выбран из метокси, фтора, водорода и трет-бутилдиметилсилилокси;
X4 выбран из OH, -OR, -SR и -Z-P(Z')(Zʺ)O-R, где Z, Z' и Zʺ каждый независимо выбран из O и S, а R представляет собой соседний нуклеотид в олигонуклеотиде; и
X5 выбран из -O-ss, -OR, -SR и -Z-P(Z')(Zʺ)O-R, где ss представляет собой твердую подложку, Z, Z' и Zʺ каждый независимо выбран из O и SS, а R представляет собой соседний нуклеотид в олигонуклеотиде.
50. Способ получения олигонуклеотида, содержащего по меньшей мере один нуклеотид TrpU, включающий включение по меньшей мере одного нуклеотида, имеющего структуру:
Figure 00000036
,
где
R1 выбран из трет-бутила, 1,1-диметилпропила; 1,1-диметилбутила; 2-хлорфенила; 2-цианофенила; 1-метилциклопентила; и 1-метилциклогексила;
X3 выбран из метокси, фтора, водорода и трет-бутилдиметилсилилокси;
X4 выбран из OH, -OR, -SR и -Z-P(Z')(Zʺ)O-R, где Z, Z' и Zʺ каждый независимо выбран из O и SS, а R представляет собой соседний нуклеотид в олигонуклеотиде; и
X5 выбран из -O-ss, -OR, -SR и -Z-P(Z')(Zʺ)O-R, где ss представляет собой твердый носитель, Z, Z' и Zʺ каждый независимо выбран из O и S, а R представляет собой соседний нуклеотид в олигонуклеотиде;
в нуклеотидную последовательность на твердой подложке; и удаление
Figure 00000037
защитной группы из по меньшей мере одного нуклеотида TrpU, включенного в олигонуклеотид.
RU2018135738A 2016-03-14 2017-03-13 Композиции и способы синтеза 5-(n-защищенного триптаминкарбоксамида)-2'-дезоксиуридинфосфорамидита для включения в нуклеиновую кислоту RU2750989C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201662308132P 2016-03-14 2016-03-14
US62/308,132 2016-03-14
PCT/US2017/022007 WO2017160672A1 (en) 2016-03-14 2017-03-13 Compounds and methods for the synthesis of 5-(n-protected-tryptaminocarboxyamide)-2'-deoxyuridine phosphoramidate for incorporation into a nucleic sequence

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2018135738A true RU2018135738A (ru) 2020-04-15
RU2018135738A3 RU2018135738A3 (ru) 2020-07-22
RU2750989C2 RU2750989C2 (ru) 2021-07-07

Family

ID=58410476

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2018135738A RU2750989C2 (ru) 2016-03-14 2017-03-13 Композиции и способы синтеза 5-(n-защищенного триптаминкарбоксамида)-2'-дезоксиуридинфосфорамидита для включения в нуклеиновую кислоту

Country Status (17)

Country Link
US (2) US10634679B2 (ru)
EP (1) EP3430022B1 (ru)
JP (1) JP6853265B2 (ru)
KR (1) KR102269009B1 (ru)
CN (1) CN108779140B (ru)
AR (1) AR107867A1 (ru)
AU (1) AU2017233994B2 (ru)
BR (1) BR112018017316B1 (ru)
CA (1) CA3017853A1 (ru)
DK (1) DK3430022T3 (ru)
ES (1) ES2784946T3 (ru)
IL (1) IL261250A (ru)
MX (1) MX2018011052A (ru)
RU (1) RU2750989C2 (ru)
SG (2) SG10201911357VA (ru)
TW (1) TWI733772B (ru)
WO (1) WO2017160672A1 (ru)

Families Citing this family (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US10049447B2 (en) * 2013-11-06 2018-08-14 H. Lee Moffitt Cancer Center and Research Insititute, Inc. Pathology case review, analysis and prediction
KR20210121181A (ko) 2019-02-28 2021-10-07 후지필름 가부시키가이샤 펩타이드 화합물의 제조 방법, 보호기 형성용 시약, 및 방향족 복소환 화합물
CA3131772A1 (en) 2019-02-28 2020-09-03 Fujifilm Corporation Method for producing peptide compound, protecting group-forming reagent, and condensed polycyclic aromatic hydrocarbon compound
JPWO2021039935A1 (ru) * 2019-08-29 2021-03-04
WO2021095210A1 (ja) * 2019-11-14 2021-05-20 株式会社島津製作所 イメージング分析装置及びイメージングデータ解析方法
EP4630400A1 (en) * 2022-12-06 2025-10-15 MiHKAL GmbH Novel n,n-dimethyltryptamine (dmt) derivatives and uses thereof

Family Cites Families (28)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP4899014B2 (ja) * 1995-06-02 2012-03-21 イーシー・テクノロジー・エルエルシー 求核試薬および一酸化炭素を用いるパラジウム触媒ヌクレオシド修飾方法
US5945527A (en) * 1996-05-30 1999-08-31 Nexstar Pharmaceuticals, Inc. Palladium catalyzed nucleoside modification methods using nucleophiles and carbon monoxide
IL138825A (en) * 2000-10-03 2006-06-11 Neurim Pharma 1991 Pharmaceutical preparations containing tryptamine derivatives and similar compounds, and such new compounds
AU2005289756B2 (en) 2004-09-22 2011-10-13 Tripath Imaging, Inc. Methods and computer program products for analysis and optimization of marker candidates for cancer prognosis
EP1960757A1 (en) 2005-11-25 2008-08-27 British Columbia Cancer Agency Branch Apparatus and methods for automated assessment of tissue pathology
CA2604317C (en) * 2007-08-06 2017-02-28 Historx, Inc. Methods and system for validating sample images for quantitative immunoassays
US9684001B2 (en) * 2008-02-07 2017-06-20 Ranju Ralhan Biomarkers for head-and-neck cancers and precancers
WO2010033508A1 (en) * 2008-09-16 2010-03-25 Historx, Inc. Reproducible quantification of biomarker expression
JP5544833B2 (ja) 2009-11-17 2014-07-09 富士通株式会社 インドール基用保護基
ES2905656T3 (es) * 2010-04-12 2022-04-11 Somalogic Operating Co Inc Pirimidinas modificadas en posición 5 y su uso
AU2013202528B2 (en) 2010-04-12 2015-07-30 Somalogic Operating Co., Inc. 5-position modified pyrimidines and their use
CA2797585C (en) 2010-04-27 2023-03-14 Prelude Corporation Cancer biomarkers and methods of use thereof
US20140235487A1 (en) 2010-11-12 2014-08-21 William Marsh Rice University Oral cancer risk scoring
ES2739623T3 (es) 2011-03-17 2020-02-03 Cernostics Inc Sistemas y composiciones para diagnosticar el esófago de Barrett y métodos para usarlos
TWI541249B (zh) * 2011-04-12 2016-07-11 身體邏輯公司 ５－位置經修飾之嘧啶類及彼等之用途
EP2639238A1 (en) 2012-03-15 2013-09-18 Universität Bern Tricyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
EP2772882A1 (en) * 2013-03-01 2014-09-03 Universite D'angers Automatic measurement of lesions on medical images
CA2904441A1 (en) 2013-03-15 2014-09-18 Metamark Genetics, Inc. Compositions and methods for cancer prognosis
PT2984108T (pt) * 2013-04-09 2017-09-19 Lykera Biomed S A Anticorpos anti-s100a7 para o tratamento e diagnóstico de cancro
WO2014204638A2 (en) 2013-05-31 2014-12-24 Brigham And Women's Hospital, Inc. System and method for analyzing tissue for the presence of cancer using bio-marker profiles
AU2014326975B2 (en) 2013-09-24 2020-05-07 Somalogic Operating Co., Inc. Multiaptamer target detection
ES2764226T3 (es) 2014-03-30 2020-06-02 Cepheid Oligómeros polinucleotídicos de citosina modificados y métodos
EP2933639A1 (en) * 2014-04-16 2015-10-21 Deutsches Krebsforschungszentrum Stiftung des Öffentlichen Rechts S100p and Hyaluronic acid as biomarkers for metastatic breast cancer
US9802975B2 (en) 2014-06-10 2017-10-31 Agilent Technologies, Inc. Protecting groups for “Z nucleotide” and methods thereof
WO2015189264A1 (en) * 2014-06-10 2015-12-17 Ventana Medical Systems, Inc. Predicting breast cancer recurrence directly from image features computed from digitized immunohistopathology tissue slides
US9298968B1 (en) * 2014-09-12 2016-03-29 Flagship Biosciences, Inc. Digital image analysis of inflammatory cells and mediators of inflammation
CA2965431C (en) * 2014-12-03 2023-05-16 Ventana Medical Systems, Inc. Computational pathology systems and methods for early-stage cancer prognosis
CN107847145B (zh) * 2015-07-20 2020-08-14 徐敏 光子结构和化学计量学病理系统

Also Published As

Publication number Publication date
JP6853265B2 (ja) 2021-03-31
MX2018011052A (es) 2019-01-24
WO2017160672A1 (en) 2017-09-21
IL261250A (en) 2018-10-31
BR112018017316A2 (pt) 2019-01-02
DK3430022T3 (da) 2020-05-18
HK1257431A1 (zh) 2019-10-18
EP3430022B1 (en) 2020-03-11
US11585816B2 (en) 2023-02-21
CN108779140A (zh) 2018-11-09
SG11201807079UA (en) 2018-09-27
EP3430022A1 (en) 2019-01-23
US20190072559A1 (en) 2019-03-07
AU2017233994B2 (en) 2021-02-18
BR112018017316B1 (pt) 2022-08-02
CN108779140B (zh) 2022-04-12
RU2018135738A3 (ru) 2020-07-22
CA3017853A1 (en) 2017-09-21
AR107867A1 (es) 2018-06-13
SG10201911357VA (en) 2020-01-30
US10634679B2 (en) 2020-04-28
TW201734030A (zh) 2017-10-01
US20190031702A1 (en) 2019-01-31
KR102269009B1 (ko) 2021-06-28
AU2017233994A1 (en) 2018-08-30
ES2784946T3 (es) 2020-10-02
KR20180116312A (ko) 2018-10-24
TWI733772B (zh) 2021-07-21
JP2019508438A (ja) 2019-03-28
RU2750989C2 (ru) 2021-07-07

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2018135738A (ru) Композиции и способы синтеза 5-(n-защищенного триптаминкарбоксамида)-2'-дезоксиуридинфосфорамидата для включения в нуклеотидную последовательность
Grant et al. Limits of Bayesian skyline plot analysis of mtDNA sequences to infer historical demographies in Pacific herring (and other species)
Bracken-Grissom et al. A comprehensive and integrative reconstruction of evolutionary history for Anomura (Crustacea: Decapoda)
Park et al. Estimation of divergence times in cnidarian evolution based on mitochondrial protein-coding genes and the fossil record
Sullivan et al. Phylogenetic relationships and molecular dating of the major groups of catfishes of the Neotropical superfamily Pimelodoidea (Teleostei, Siluriformes)
Iverson et al. Molecular phylogenetics of the mud and musk turtle family Kinosternidae
Zhang et al. Species delimitation in the morphologically conserved Coecobrya (Collembola: Entomobryidae): A case study integrating morphology and molecular traits to advance current taxonomy
Poux et al. Molecular phylogeny and divergence times of Malagasy tenrecs: influence of data partitioning and taxon sampling on dating analyses
Parker et al. Molecular perspective on evolution and zoogeography of cyprinodontid killifishes (Teleostei; Atherinomorpha)
Litsios et al. Trophic specialization influences the rate of environmental niche evolution in damselfishes (Pomacentridae)
Enk et al. Complete Columbian mammoth mitogenome suggests interbreeding with woolly mammoths
RU2017101172A (ru) Антисмысловые нуклеиновые кислоты
Zieritz et al. Mitogenomic phylogeny and fossil-calibrated mutation rates for all F-and M-type mtDNA genes of the largest freshwater mussel family, the Unionidae (Bivalvia)
Klanten et al. Patterns of lineage diversification in the genus Naso (Acanthuridae)
Hoenemann et al. Phylogenetic analysis and systematic revision of Remipedia (Nectiopoda) from Bayesian analysis of molecular data
Chen et al. Population structure and genetic variability of six bar wrasse (Thallasoma hardwicki) in northern South China Sea revealed by mitochondrial control region sequences
MX2010005697A (es) Plantas que tienen rasgos mejorados relacionados con el rendimiento y un metodo para obtenerlas.
Matschiner et al. The adaptive radiation of notothenioid fishes in the waters of Antarctica
Husemann et al. Multiple independent colonization of the Canary Islands by the winged grasshopper genus Sphingonotus Fieber, 1852
GonÇalves et al. Assessing the role of aridity-induced vicariance and ecological divergence in species diversification in North-West Africa using Agama lizards
Salas-Gismondi et al. Miocene fossils from the southeastern Pacific shed light on the last radiation of marine crocodylians
Pappas et al. Genetic diversity of giant clams (Tridacna spp.) and their associated Symbiodinium in the central Red Sea
Richmond et al. Influence of niche breadth and position on the historical biogeography of seafaring scincid lizards
Arrigoni et al. A new sequence data set of SSU rRNA gene for Scleractinia and its phylogenetic and ecological applications
Sun et al. Evolution of mitochondrial gene arrangements in Arcidae (Bivalvia: Arcida) and their phylogenetic implications