[go: up one dir, main page]

RU2018124295A - Композиции и способы для иммуноонкологии - Google Patents

Композиции и способы для иммуноонкологии Download PDF

Info

Publication number
RU2018124295A
RU2018124295A RU2018124295A RU2018124295A RU2018124295A RU 2018124295 A RU2018124295 A RU 2018124295A RU 2018124295 A RU2018124295 A RU 2018124295A RU 2018124295 A RU2018124295 A RU 2018124295A RU 2018124295 A RU2018124295 A RU 2018124295A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
seq
target
molecule
cell
nrna
Prior art date
Application number
RU2018124295A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2018124295A3 (ru
RU2771624C2 (ru
Inventor
Мин-Вэй Чэнь
Мелисса Дек
Гленн Дранофф
Крейг Микенин
Рейнальд Лескарбо
Селеста Ричардсон
Морег Стюарт
И Ян
Original Assignee
Новартис Аг
Интеллиа Терапьютикс, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Новартис Аг, Интеллиа Терапьютикс, Инк. filed Critical Новартис Аг
Publication of RU2018124295A publication Critical patent/RU2018124295A/ru
Publication of RU2018124295A3 publication Critical patent/RU2018124295A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2771624C2 publication Critical patent/RU2771624C2/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/17Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • A61K38/177Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/17Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • A61K38/177Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • A61K38/1774Immunoglobulin superfamily (e.g. CD2, CD4, CD8, ICAM molecules, B7 molecules, Fc-receptors, MHC-molecules)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/43Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
    • A61K38/46Hydrolases (3)
    • A61K38/465Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1), e.g. lipases, ribonucleases
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K40/00Cellular immunotherapy
    • A61K40/10Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
    • A61K40/11T-cells, e.g. tumour infiltrating lymphocytes [TIL] or regulatory T [Treg] cells; Lymphokine-activated killer [LAK] cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K40/00Cellular immunotherapy
    • A61K40/30Cellular immunotherapy characterised by the recombinant expression of specific molecules in the cells of the immune system
    • A61K40/31Chimeric antigen receptors [CAR]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K40/00Cellular immunotherapy
    • A61K40/30Cellular immunotherapy characterised by the recombinant expression of specific molecules in the cells of the immune system
    • A61K40/32T-cell receptors [TCR]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K40/00Cellular immunotherapy
    • A61K40/40Cellular immunotherapy characterised by antigens that are targeted or presented by cells of the immune system
    • A61K40/41Vertebrate antigens
    • A61K40/42Cancer antigens
    • A61K40/4202Receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • A61K40/421Immunoglobulin superfamily
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K40/00Cellular immunotherapy
    • A61K40/40Cellular immunotherapy characterised by antigens that are targeted or presented by cells of the immune system
    • A61K40/41Vertebrate antigens
    • A61K40/42Cancer antigens
    • A61K40/4202Receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • A61K40/421Immunoglobulin superfamily
    • A61K40/4211CD19 or B4
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K40/00Cellular immunotherapy
    • A61K40/40Cellular immunotherapy characterised by antigens that are targeted or presented by cells of the immune system
    • A61K40/41Vertebrate antigens
    • A61K40/42Cancer antigens
    • A61K40/4202Receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • A61K40/4214Receptors for cytokines
    • A61K40/4215Receptors for tumor necrosis factors [TNF], e.g. lymphotoxin receptor [LTR], CD30
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K45/00Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • A61K45/06Mixtures of active ingredients without chemical characterisation, e.g. antiphlogistics and cardiaca
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/0002Galenical forms characterised by the drug release technique; Application systems commanded by energy
    • A61K9/0009Galenical forms characterised by the drug release technique; Application systems commanded by energy involving or responsive to electricity, magnetism or acoustic waves; Galenical aspects of sonophoresis, iontophoresis, electroporation or electroosmosis
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • A61P35/02Antineoplastic agents specific for leukemia
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70503Immunoglobulin superfamily
    • C07K14/7051T-cell receptor (TcR)-CD3 complex
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/102Mutagenizing nucleic acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1135Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against oncogenes or tumor suppressor genes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1138Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against receptors or cell surface proteins
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • C12N15/902Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
    • C12N15/907Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination in mammalian cells
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N5/00Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
    • C12N5/06Animal cells or tissues; Human cells or tissues
    • C12N5/0602Vertebrate cells
    • C12N5/0634Cells from the blood or the immune system
    • C12N5/0636T lymphocytes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/16Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
    • C12N9/22Ribonucleases [RNase]; Deoxyribonucleases [DNase]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K2121/00Preparations for use in therapy
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K2300/00Mixtures or combinations of active ingredients, wherein at least one active ingredient is fully defined in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K40/00Cellular immunotherapy
    • A61K40/50Cellular immunotherapy characterised by the use of allogeneic cells
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/03Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a transmembrane segment
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/20Type of nucleic acid involving clustered regularly interspaced short palindromic repeats [CRISPR]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/31Chemical structure of the backbone
    • C12N2310/315Phosphorothioates
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/32Chemical structure of the sugar
    • C12N2310/3212'-O-R Modification
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2320/00Applications; Uses
    • C12N2320/30Special therapeutic applications
    • C12N2320/32Special delivery means, e.g. tissue-specific
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2320/00Applications; Uses
    • C12N2320/30Special therapeutic applications
    • C12N2320/35Special therapeutic applications based on a specific dosage / administration regimen
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2510/00Genetically modified cells
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)

Claims (80)

1. Композиция, содержащая молекулу нРНК, включающую tracr и crРНК, где crРНК включает направляющий домен, который комплементарен последовательности-мишени мишени аллогенной T-клетки, выбранной из B2M, CD247, CD3D, CD3E, CD3G, TRAC, TRBC1, TRBC2, HLA-A, HLA-B, HLA-C, DCK, CD52, FKBP1A, CIITA, NLRC5, RFXANK, RFX5, RFXAP или NR3C1, где:
(a) мишенью аллогенной T-клетки является B2M, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 1 - SEQ ID NO: 83 или SEQ ID NO: 5492 - SEQ ID NO: 5527;
(b) мишенью аллогенной T-клетки является TRAC, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 5528 - SEQ ID NO: 5623 или SEQ ID NO: 5816 - SEQ ID NO: 5965;
(c) мишенью аллогенной T-клетки является TRBC1, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 5624 - SEQ ID NO: 5643 или SEQ ID NO: 5966 - SEQ ID NO: 6097;
(d) мишенью аллогенной T-клетки является TRBC2, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 5644 - SEQ ID NO: 5719 или SEQ ID NO: 6098 - SEQ ID NO: 6226;
(e) мишенью аллогенной T-клетки является CD247, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 84 - SEQ ID NO: 392;
(f) мишенью аллогенной T-клетки является CD3D, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 393 - SEQ ID NO: 532 или SEQ ID NO: 10780 - SEQ ID NO: 10794;
(g) мишенью аллогенной T-клетки является CD3E, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 533 - SEQ ID NO: 839 или SEQ ID NO: 10677 - SEQ ID NO: 10764;
(h) мишенью аллогенной T-клетки является CD3G, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 840 - SEQ ID NO: 968 или SEQ ID NO: 10765 - SEQ ID NO: 10779;
(i) мишенью аллогенной T-клетки является HLA-A, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 969 - SEQ ID NO: 1345;
(j) мишенью аллогенной T-клетки является HLA-B, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 1346 - SEQ ID NO: 1698;
(k) мишенью аллогенной T-клетки является HLA-C, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 1699 - SEQ ID NO: 2068;
(l) мишенью аллогенной T-клетки является DCK, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 5278 - SEQ ID NO: 5491;
(m) мишенью аллогенной T-клетки является CD52, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 6227 - SEQ ID NO: 6324;
(n) мишенью аллогенной T-клетки является FKBP1A, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 6325 - SEQ ID NO: 6583 или SEQ ID NO: 6662 - SEQ ID NO: 6749;
(o) мишенью аллогенной T-клетки является NR3C1, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 2069 - SEQ ID NO: 2941;
(p) мишенью аллогенной T-клетки является CIITA, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 6750 - SEQ ID NO: 7716 или SEQ ID NO: 7717 - SEQ ID NO: 7804; или
(q) мишенью аллогенной T-клетки является NLRC5, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 8622 - SEQ ID NO: 10089.
2. Композиция по п.1, где
(a) мишенью аллогенной T-клетки является TRAC, и направляющий домен включает SEQ ID NO: 5569, SEQ ID NO: 5585, SEQ ID NO: 5587, SEQ ID NO: 5592, SEQ ID NO: 5601, SEQ ID NO: 5589, SEQ ID NO: 5600, SEQ ID NO: 5594, SEQ ID NO: 5571, SEQ ID NO: 5593, SEQ ID NO: 5574, SEQ ID NO: 5598, SEQ ID NO: 5586, SEQ ID NO: 5599, SEQ ID NO: 5591, SEQ ID NO: 5610, SEQ ID NO: 5608, SEQ ID NO: 5617, SEQ ID NO: 5619, SEQ ID NO: 5620, SEQ ID NO: 5567, SEQ ID NO: 5568 или SEQ ID NO: 5835;
(b) мишенью аллогенной T-клетки является TRBC2, и направляющий домен включает SEQ ID NO: 5719, SEQ ID NO: 5694, SEQ ID NO: 5706, SEQ ID NO: 5696, SEQ ID NO: 5711, SEQ ID NO: 5708, SEQ ID NO: 5709, SEQ ID NO: 5712, SEQ ID NO: 5703, SEQ ID NO: 5707, SEQ ID NO: 5687, SEQ ID NO: 5705, SEQ ID NO: 5713, SEQ ID NO: 5715 или SEQ ID NO: 5710;
(c) мишенью аллогенной T-клетки является B2M, и направляющий домен включает SEQ ID NO: 5519, SEQ ID NO: 5497, SEQ ID NO: 5499, SEQ ID NO: 5498, SEQ ID NO: 5503, SEQ ID NO: 5496, SEQ ID NO: 5507, SEQ ID NO: 5515, SEQ ID NO: 5493, SEQ ID NO: 5506, SEQ ID NO: 5509, SEQ ID NO: 5517, SEQ ID NO: 5521, SEQ ID NO: 5520, SEQ ID NO: 5500, SEQ ID NO: 5494, SEQ ID NO: 5508, SEQ ID NO: 5514 или SEQ ID NO: 5492;
(d) мишенью аллогенной T-клетки является CIITA, и направляющий домен включает SEQ ID NO: 7771, SEQ ID NO: 7769, SEQ ID NO: 7773, SEQ ID NO: 7726, SEQ ID NO: 7758, SEQ ID NO: 7739, SEQ ID NO: 7779, SEQ ID NO: 7770, SEQ ID NO: 7749, SEQ ID NO: 7754, SEQ ID NO: 7745, SEQ ID NO: 7785, SEQ ID NO: 7731, SEQ ID NO: 7772, SEQ ID NO: 7743 или SEQ ID NO: 7750;
(e) мишенью аллогенной T-клетки является CD3E, и направляющий домен включает SEQ ID NO: 10729, SEQ ID NO: 10719, SEQ ID NO: 10764, SEQ ID NO: 10789, SEQ ID NO: 10701, SEQ ID NO: 10700 или SEQ ID NO: 10722, или
(f) мишенью аллогенной T-клетки является FKBP1A, и направляющий домен включает SEQ ID NO: 6693, SEQ ID NO: 6705, SEQ ID NO: 6694, SEQ ID NO: 6708 или SEQ ID NO: 6699.
3. Композиция, содержащая молекулу нРНК, включающую tracr и crРНК, где crРНК включает направляющий домен, который комплементарен последовательности-мишени ингибирующей молекулы или нижестоящего эффектора сигнализации через ингибирующую молекулу, выбранных из CD274, HAVCR2, LAG3, PDCD1, PD-L2, CTLA4, CEACAM, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD113), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 или CD107), KIR, A2aR, MHC класса I, MHC класса II, GAL9, аденозина и TGF-бета или PTPN11, где
(a) ингибирующей молекулой является CD274 (PD-L1), и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 2942 - SEQ ID NO: 3270;
(b) ингибирующей молекулой является HAVCR2 (TIM3), и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 3271 - SEQ ID NO: 3541;
(c) ингибирующей молекулой является LAG3, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 3542 - SEQ ID NO: 4032;
(d) ингибирующей молекулой является PDCD1 (PD-1), и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 4033 - SEQ ID NO: 4589 или SEQ ID NO: 5720 - SEQ ID NO: 5815; или
(e) нижестоящим эффектором сигнализации через ингибирующую молекулу является PTPN1, и направляющий домен включает любой из SEQ ID NO: 4590 - SEQ ID NO: 5277.
4. Композиция по любому из предыдущих пунктов, где направляющий домен состоит из 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 или 24 последовательных нуклеиновых кислот любой из указанных последовательностей направляющего домена.
5. Композиция по любому из предыдущих пунктов, где направляющий домен и tracr расположены на отдельных молекулах нуклеиновой кислоты, и где молекула нуклеиновой кислоты, включающая направляющий домен, включает SEQ ID NO: 6607, необязательно расположенный непосредственно 3' от направляющего домена, и молекула нуклеиновой кислоты, включающая tracr, включает SEQ ID NO: 6660.
6. Композиция по любому из предыдущих пунктов, где одна или, необязательно, больше чем одна из молекул нуклеиновых кислот, включающих молекулу нРНК, включает:
a) одну или несколько фосфотиоатных модификаций на 3'-конце указанной молекулы или молекул нуклеиновых кислот;
b) одну или несколько фосфотиоатных модификаций на 5'-конце указанной молекулы или молекул нуклеиновых кислот;
c) одну или несколько 2'-O-метил модификаций на 3'-конце указанной молекулы или молекул нуклеиновых кислот;
d) одну или несколько 2'-O-метил модификаций на 5'-конце указанной молекулы или молекул нуклеиновых кислот;
e) одну или несколько 2'-O-метил модификаций на каждом из 4-го от конца, 3-го от конца и 2-го от конца 3' остатков указанной молекулы или молекул нуклеиновых кислот; или
f) их любую комбинацию.
7. Композиция по любому из предыдущих пунктов, дополнительно включающая молекулу Cas9.
8. Композиция по п.7, где молекула Cas9 включает любой из SEQ ID NO: 6611 или SEQ ID NO: 7821 - SEQ ID NO: 7831, или молекулу Cas9, обладающую по меньшей мере 95% гомологией с ними.
9. Композиция по любому из пп.7, 8, где первая молекула нРНК и молекула Cas9 присутствует в рибонуклеопротеиновом комплексе (РНП).
10. Композиция по любому из пп.7-9, дополнительно включающая вторую молекулу нРНК; вторую молекулу нРНК и третью молекулу нРНК; или вторую молекулу нРНК, третью молекулу нРНК и четвертую молекулу нРНК, где каждая молекула нРНК в композиции комплементарна определенной последовательности-мишени.
11. Композиция по п.1, где направляющий домен молекулы нРНК является направляющим доменом по любому из пп.1(a), 1(i), 1(j) или 1(к), и композиция дополнительно включает вторую молекулу нРНК по любому из пп.1-6, где направляющий домен указанной второй молекулы нРНК является направляющим доменом по любому из пп.1(b), 1(c), 1(d), 1(f), 1(g), 1(h) или 1(i).
12. Композиция по п.2, где направляющий домен молекулы нРНК является направляющим доменом по п.2(а); и композиция дополнительно включает вторую молекулу нРНК, где направляющий домен второй молекулы нРНК является направляющим доменом по п.3(с).
13. Композиция по любому из пп.7-12, дополнительно включающая третью молекулу нРНК по любому из пп.1-6, где направляющий домен указанной третьей молекулы нРНК является направляющим доменом по любому их пп.1(n), 1(p) или 1(q).
14. Композиция по п.13, где направляющий домен указанной третьей молекулы нРНК является направляющим доменом по п.1(p).
15. Композиция по любому из пп. 13, 14, дополнительно включающая четвертую молекулу нРНК, где направляющий домен указанной четвертой молекулы нРНК комплементарен последовательности-мишени мишени NK-ингибирующей молекулы.
16. Композиция по п.15, где мишенью NK-ингибирующей молекулы является LILRB1.
17. Композиция по п.16, где направляющий домен указанной четвертой молекулы нРНК включает:
a) любой из SEQ ID NO: 10090 - SEQ ID NO: 10673;
b) 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 или 24 последовательных нуклеотидов, предпочтительно 20 последовательных нуклеотидов, любого из SEQ ID NO: 10090 - SEQ ID NO: 10673;
c) 5' 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 или 24 нуклеотидов, предпочтительно 20 нуклеотидов, любого из SEQ ID NO: 10090 - SEQ ID NO: 10673; или
d) 3' 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 или 24 нуклеотида, предпочтительно 20 нуклеотидов, любого из SEQ ID NO: 10090 - SEQ ID NO: 10673.
18. Нуклеиновая кислота, содержащая последовательность, которая кодирует молекулу нРНК по любому из пп.1-6, или вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, содержащую последовательность, которая кодирует молекулу нРНК по любому из пп.1-6.
19. Композиция по любому из пп.7-17, дополнительно включающая матричную нуклеиновую кислоту.
20. Композиция по п.19, где матричная нуклеиновая кислота включает нуклеиновую кислоту, кодирующую химерный антигенный рецептор (CAR).
21. Композиция по п.20, где CAR является:
(a) CD19 CAR или
(b) BCMA CAR.
22. Способ изменения последовательности-мишени клетки, включающий контакт указанной клетки с:
a) молекулой нРНК по любому из пп.1-6 и молекулой Cas9;
b) молекулой нРНК по любому из пп.1-6 и нуклеиновой кислотой, кодирующей молекулу Cas9;
c) нуклеиновой кислотой, кодирующей молекулу нРНК по любому из пп.1-6, и молекулой Cas9;
d) нуклеиновой кислотой, кодирующей молекулу нРНК по любому из пп.1-6, и нуклеиновой кислотой, кодирующей молекулу Cas9;
e) любым из a)-d), выше, и матричной нуклеиновой кислотой; или
f) любым из a)-d) выше, и нуклеиновой кислотой, включающей последовательность, кодирующую матричную нуклеиновую кислоту.
23. Способ по п.22, включающий: (a) модификацию клеток путем снижения или устранения экспрессии компонента T-клеточного рецептора (TCR), включающую введение в указанные клетки молекулы нРНК по любому из пп.1b-1h, 2(a), 2(b), 3(e); (b) модификацию клеток путем снижения или устранения экспрессии HLA или B2M, включающую введение в указанные клетки молекулы нРНК по любому из пп. 1(a), 1(i), 1 (j) или 1(k), 3(c); и/или (c) модификацию клеток путем снижения или устранения экспрессии мишени для иммуносупрессии, включающую введение в указанные клетки молекулы нРНК по любому из пп.1(l), 1(m), 1(n), 1(o) или 2(f); и (d) размножение указанных клеток.
24. Способ по п.23, где молекула нРНК или нуклеиновая кислота, кодирующая молекулу нРНК, и молекула Cas9 или нуклеиновая кислота, кодирующая молекулу Cas9, включены в состав одной композиции.
25. Клетка, содержащая композицию по любому из пп. 1-17 или 19-21 или нуклеиновую кислоту или вектор по п.18.
26. Клетка по п.25 для применения при лечении заболевания, связанного с экспрессией антигена опухоли.
27. Клетка, включающая:
(a) последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR;
(b) необязательно, последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую HLA-G или слитый белок HLA-G:B2M;
(c) индел в или вблизи от последовательности гена, кодирующего компонент TCR, выбранный из TRAC, TRBC1 TRBC2, CD3E, CD3D или CD3G, в или вблизи от последовательности-мишени нРНК, включающей направляющий домен TRAC, TRBC1, TRBC2, CD3E, CD3D, или CD3G, перечисленный в Таблице 1, Таблице 4, Таблице 5, Таблице 6e, Таблице 6f или Таблице 6g;
(d) индел в или вблизи от последовательности гена, кодирующего B2M, в или вблизи от последовательности-мишени нРНК, включающей направляющий домен к B2M, перечисленный в Таблице 1 или Таблице 3;
(e) необязательно, индел в или вблизи от последовательности гена, кодирующего CIITA, в или вблизи от последовательности-мишени нРНК, включающей направляющий домен к CIITA, перечисленный в Таблице 1 или Таблице 6c; и
(f) необязательно, индел в или вблизи от последовательности гена, кодирующего LILRB1, в или вблизи от последовательности-мишени нРНК, включающей направляющий домен к LILRB1;
где клетка (или популяция клеток, включающих указанную клетку) экспрессирует CAR и, необязательно, NK-ингибирующую молекулу, и демонстрирует сниженную или устраненную экспрессию и/или функцию одного или более из: i) компонента TCR, выбранного из TRAC, TRBC1 TRBC2, CD3D, CD3E или CD3G, ii) B2M, iii) CIITA и/или iv) LILRB1.
RU2018124295A 2015-12-04 2016-12-02 Композиции и способы для иммуноонкологии RU2771624C2 (ru)

Applications Claiming Priority (7)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201562263169P 2015-12-04 2015-12-04
US62/263,169 2015-12-04
US201662316784P 2016-04-01 2016-04-01
US62/316,784 2016-04-01
US201662394290P 2016-09-14 2016-09-14
US62/394,290 2016-09-14
PCT/IB2016/057318 WO2017093969A1 (en) 2015-12-04 2016-12-02 Compositions and methods for immunooncology

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2022103587A Division RU2022103587A (ru) 2015-12-04 2016-12-02 Композиции и способы для иммуноонкологии

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2018124295A true RU2018124295A (ru) 2020-01-13
RU2018124295A3 RU2018124295A3 (ru) 2020-10-23
RU2771624C2 RU2771624C2 (ru) 2022-05-11

Family

ID=

Also Published As

Publication number Publication date
JP2018536436A (ja) 2018-12-13
IL259576B (en) 2022-09-01
AU2020230334A1 (en) 2020-10-01
IL259576A (en) 2018-07-31
EP3384027A1 (en) 2018-10-10
IL295858A (en) 2022-10-01
US20240417722A1 (en) 2024-12-19
NZ782855A (en) 2025-08-29
BR112018011089A2 (pt) 2018-12-04
NZ782859A (en) 2025-08-29
IL317694A (en) 2025-02-01
PH12018501159A1 (en) 2019-01-21
US20180362975A1 (en) 2018-12-20
JP7709408B2 (ja) 2025-07-16
CN108699557A (zh) 2018-10-23
SG10202109655VA (en) 2021-10-28
US12037583B2 (en) 2024-07-16
JP2025131615A (ja) 2025-09-09
IL295858B1 (en) 2025-01-01
CN108699557B (zh) 2025-08-15
NZ782849A (en) 2025-08-29
JP2022137032A (ja) 2022-09-21
UA126373C2 (uk) 2022-09-28
AU2016362129A1 (en) 2018-06-14
IL295858B2 (en) 2025-05-01
CA3006432A1 (en) 2017-06-08
KR20180133840A (ko) 2018-12-17
AU2023201162A1 (en) 2023-04-13
MX2025006476A (es) 2025-07-01
NZ782858A (en) 2025-08-29
WO2017093969A1 (en) 2017-06-08
RU2018124295A3 (ru) 2020-10-23
SG11201804373VA (en) 2018-06-28
MX2018006767A (es) 2019-03-14
EA201891338A1 (ru) 2018-12-28
NZ782857A (en) 2025-08-29
HK1257295A1 (zh) 2019-10-18

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Kedl et al. T cells down-modulate peptide-MHC complexes on APCs in vivo
US20230111593A1 (en) Method of predicting response to chimeric antigen receptor therapy
CN109694854B (zh) 通用型嵌合抗原受体t细胞制备技术
JP2021505131A (ja) 増強されたiPSC由来のエフェクター細胞を用いた免疫療法
JP2017508457A (ja) T細胞バランス遺伝子発現、組成物およびその使用方法
US20200216805A1 (en) Gene editing t cell and use thereof
CA3151690A1 (en) Genetically-edited immune cells and methods of therapy
JP2018536436A5 (ru)
US20190201443A1 (en) Signaling and antigen-presenting bifunctional receptors (sabr)
Lucar et al. A natural impact: NK cells at the intersection of cancer and HIV disease
BR112020007710A2 (pt) métodos para produzir células que expressam receptor de antígeno quimérico
CA3135224A1 (en) Cd3 reconstitution in engineered ipsc and immune effector cells
JP2018522072A5 (ru)
EP3116902A1 (en) Method for generating t-cells compatible for allogenic transplantation
CN109055380B (zh) 一种通用型car-t细胞的制备方法
RU2018111462A (ru) Химерные антигенные рецепторы, нацеленные на антиген созревания b-клеток
CN115916833B (zh) 靶向b7h3的抗原结合多肽及其应用
CA3103337A1 (en) Nef-containing t cells and methods of producing thereof
WO2020223647A1 (en) Modulation of expression of genes related to t cell exhaustion
EP4058474B1 (en) Compositions and methods for treating egfr positive cancers
TW201905201A (zh) 體外剔除T細胞中靶基因的方法以及該方法中使用的crRNA
Schafer et al. KIR3DL01 recognition of Bw4 ligands in the rhesus macaque: maintenance of Bw4 specificity since the divergence of apes and Old World monkeys
US20210102168A1 (en) Methods and compositions for the modulation of cell interactions and signaling in the tumor microenvironment
Kath et al. CAR NK-92 cell–mediated depletion of residual TCR+ cells for ultrapure allogeneic TCR-deleted CAR T-cell products
CA3139131A1 (en) Compositions and methods of acetylcholine receptor chimeric autoantibody receptor cells