RU2017136185A - Составление профиля и отображение противомикробных препаратов для конкретных подтипов - Google Patents
Составление профиля и отображение противомикробных препаратов для конкретных подтипов Download PDFInfo
- Publication number
- RU2017136185A RU2017136185A RU2017136185A RU2017136185A RU2017136185A RU 2017136185 A RU2017136185 A RU 2017136185A RU 2017136185 A RU2017136185 A RU 2017136185A RU 2017136185 A RU2017136185 A RU 2017136185A RU 2017136185 A RU2017136185 A RU 2017136185A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- computer
- isolate
- subtype
- sensitivity
- executable instructions
- Prior art date
Links
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B45/00—ICT specially adapted for bioinformatics-related data visualisation, e.g. displaying of maps or networks
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B61—RAILWAYS
- B61L—GUIDING RAILWAY TRAFFIC; ENSURING THE SAFETY OF RAILWAY TRAFFIC
- B61L5/00—Local operating mechanisms for points or track-mounted scotch-blocks; Visible or audible signals; Local operating mechanisms for visible or audible signals
- B61L5/10—Locking mechanisms for points; Means for indicating the setting of points
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
- C12Q1/18—Testing for antimicrobial activity of a material
Landscapes
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Mechanical Engineering (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Data Mining & Analysis (AREA)
- Evolutionary Biology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medical Treatment And Welfare Office Work (AREA)
Claims (30)
1. Реализуемый компьютером способ создания отображения для конкретных подтипов, включающий:
обеспечение компьютерного процессора, выполненного с возможностью:
(a) приема информации о чувствительности по меньшей мере одного изолята по меньшей мере к одному противомикробному препарату;
(b) приема информации о подтипе по меньшей мере одного изолята и
(c) обеспечения вывода графического отображения чувствительности по меньшей мере одного изолята по меньшей мере к одному противомикробному препарату, упорядоченного по подтипу.
2. Реализуемый компьютером способ по п. 1, в котором прием информации о подтипе по меньшей мере одного изолята включает:
(a) прием данных, описывающих по меньшей мере часть генома по меньшей мере одного изолята;
(b) сравнение принятых геномных данных, полученных в результате операции секвенирования, с базой справочных данных и
(c) идентификацию совпадающего подтипа по меньшей мере для одного изолята исходя из результатов сравнения.
3. Реализуемый компьютером способ по п. 1, в котором прием информации о чувствительности по меньшей мере одного изолята по меньшей мере к одному противомикробному препарату включает прием результатов теста на чувствительность к противомикробным препаратам по меньшей мере для одного изолята с использованием по меньшей мере одного противомикробного препарата.
4. Реализуемый компьютером способ по п. 1, в котором обеспечение вывода графического отображения чувствительности по меньшей мере одного изолята по меньшей мере к одному противомикробному препарату, упорядоченного по подтипу, включает обеспечение вывода графического отображения в виде матрицы, в которой каждому ряду соответствует один подтип, а каждому столбцу соответствует один противомикробный препарат.
5. Реализуемый компьютером способ по п. 1 в котором обеспечение вывода графического отображения чувствительности по меньшей мере одного изолята по меньшей мере к одному противомикробному препарату, упорядоченного по подтипу, включает обеспечение вывода графического отображения в виде матрицы, в которой каждому столбцу соответствует один подтип, а каждому ряду соответствует один противомикробный препарат.
6. Реализуемый компьютером способ по п. 1, в котором обеспечение вывода графического отображения чувствительности по меньшей мере одного изолята по меньшей мере к одному противомикробному препарату, упорядоченного по подтипу, включает обеспечение вывода графического отображения цветных элементов в виде матрицы.
7. Реализуемый компьютером способ по п. 1, в котором обеспечение вывода графического отображения чувствительности по меньшей мере одного изолята по меньшей мере к одному противомикробному препарату, упорядоченного по подтипу, включает обеспечение вывода графического отображения чисел в виде матрицы.
8. Реализуемый компьютером способ по п. 7, в котором
каждое число является показателем распространенности этого изолята в популяции в конкретный период времени, а
коэффициент чувствительности для данного изолята отображают цветом или затемненным кругом.
9. Реализуемый компьютером способ по п. 7, в котором каждое число является средним значением чувствительности для множества изолятов конкретного подтипа к конкретному противомикробному препарату.
10. Реализуемый компьютером способ по п. 7, в котором каждое число является отношением чувствительности к устойчивости для подтипа в отношении противомикробного препарата.
11. Некратковременный машиночитаемый носитель информации, хранящий исполняемые компьютером инструкции для реализации способа создания отображения для конкретных подтипов, содержащий:
(a) исполняемые компьютером инструкции для приема информации о чувствительности по меньшей мере одного изолята по меньшей мере к одному противомикробному препарату;
(b) исполняемые компьютером инструкции для приема информации о подтипе по меньшей мере одного изолята и
(c) исполняемые компьютером инструкции для обеспечения вывода графического отображения чувствительности по меньшей мере одного изолята по меньшей мере к одному противомикробному препарату, упорядоченного по подтипу.
12. Некратковременный машиночитаемый носитель информации по п. 11, в котором исполняемые компьютером инструкции для приема информации о подтипе по меньшей мере одного изолята, содержат:
(a) исполняемые компьютером инструкции для приема данных, описывающих по меньшей мере часть генома по меньшей мере одного изолята;
(b) исполняемые компьютером инструкции для сравнения принятых геномных данных, полученных в результате операции секвенирования, с базой справочных данных; и
(c) исполняемые компьютером инструкции для определения совпадающего подтипа по меньшей мере для одного изолята из результатов сравнения.
13. Некратковременный машиночитаемый носитель информации по п. 11, в котором исполняемые компьютером инструкции для приема информации о чувствительности по меньшей мере одного изолята по меньшей мере к одному противомикробному препарату содержат исполняемые компьютером инструкции для приема результатов теста чувствительности к противомикробным препаратам по меньшей мере для одного изолята с использованием по меньшей мере одного противомикробного препарата.
14. Некратковременный машиночитаемый носитель информации по п. 11, в котором исполняемые компьютером инструкции для обеспечения вывода графического отображения чувствительности по меньшей мере одного изолята по меньшей мере к одному противомикробному препарату, упорядоченного по подтипу, содержат исполняемые компьютером инструкции для обеспечения вывода графического отображения в виде матрицы, в которой каждому ряду соответствует один подтип, а каждому столбцу соответствует один противомикробный препарат.
15. Некратковременный машиночитаемый носитель информации по п. 11, в котором исполняемые компьютером инструкции для обеспечения вывода графического отображения чувствительности по меньшей мере одного изолята по меньшей мере к одному противомикробному препарату, упорядоченного по подтипу, содержат исполняемые компьютером инструкции для обеспечения вывода графического отображения в виде матрицы, в которой каждому столбцу соответствует один подтип, а каждому ряду соответствует один противомикробный препарат.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201562132199P | 2015-03-12 | 2015-03-12 | |
| US62/132,199 | 2015-03-12 | ||
| PCT/IB2016/051352 WO2016142890A1 (en) | 2015-03-12 | 2016-03-10 | Methods of displaying the antimicrobial sensitivity of biological isolates |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2017136185A true RU2017136185A (ru) | 2019-04-12 |
| RU2017136185A3 RU2017136185A3 (ru) | 2019-09-23 |
Family
ID=55661491
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2017136185A RU2017136185A (ru) | 2015-03-12 | 2016-03-10 | Составление профиля и отображение противомикробных препаратов для конкретных подтипов |
Country Status (9)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US11264118B2 (ru) |
| EP (1) | EP3268885A1 (ru) |
| JP (1) | JP6736569B2 (ru) |
| CN (1) | CN107567624A (ru) |
| AU (1) | AU2016230763A1 (ru) |
| CA (1) | CA2979041A1 (ru) |
| MX (1) | MX2017011512A (ru) |
| RU (1) | RU2017136185A (ru) |
| WO (1) | WO2016142890A1 (ru) |
Families Citing this family (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP3332028B1 (en) * | 2015-08-06 | 2021-01-06 | Ares Genetics GmbH | Genetic resistance prediction against antimicrobial drugs in microorganism using structural changes in the genome |
| CN108475297B (zh) | 2015-10-30 | 2022-04-29 | 皇家飞利浦有限公司 | 确定传染原的传播途径的方法、系统和过程 |
| US12009059B2 (en) * | 2016-11-28 | 2024-06-11 | Koninklijke Philips N.V. | Analytic prediction of antibiotic susceptibility |
Family Cites Families (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| AUPS037002A0 (en) * | 2002-02-07 | 2002-02-28 | Melbourne Health | Viral variants and uses therefor |
| EP1620781A4 (en) | 2003-08-21 | 2008-12-03 | Microsoft Corp | SYSTEMS AND METHODS FOR IMPLEMENTING A DIAGRAM OF DIGITAL IMAGES FOR THE ORGANIZATION OF INFORMATION UNITS MAY BE MANAGED BY A MATERIAL / SOFTWARE INTERFACE SYSTEM |
| JP4477894B2 (ja) | 2004-02-16 | 2010-06-09 | 株式会社 ワールドフュージョン | 遺伝子解析システム |
| CN101608242A (zh) * | 2009-04-09 | 2009-12-23 | 泰州亲和力生物技术有限公司 | 一种基于rt-lamp技术的h3亚型流感快速检测分型方法 |
| CN102222178B (zh) * | 2011-03-31 | 2014-12-10 | 清华大学深圳研究生院 | 一种筛选和/或设计针对多靶标的药物的方法 |
| CN103186715A (zh) * | 2011-12-29 | 2013-07-03 | 上海聚类生物科技有限公司 | 预测核酸与蛋白相互作用的新算法 |
| US20150344973A1 (en) | 2012-04-23 | 2015-12-03 | Pathogenica, Inc. | Method and System for Detection of an Organism |
-
2016
- 2016-03-10 AU AU2016230763A patent/AU2016230763A1/en not_active Abandoned
- 2016-03-10 US US15/557,628 patent/US11264118B2/en active Active
- 2016-03-10 CN CN201680015165.3A patent/CN107567624A/zh active Pending
- 2016-03-10 JP JP2017544958A patent/JP6736569B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2016-03-10 MX MX2017011512A patent/MX2017011512A/es unknown
- 2016-03-10 WO PCT/IB2016/051352 patent/WO2016142890A1/en not_active Ceased
- 2016-03-10 RU RU2017136185A patent/RU2017136185A/ru unknown
- 2016-03-10 EP EP16714536.6A patent/EP3268885A1/en not_active Withdrawn
- 2016-03-10 CA CA2979041A patent/CA2979041A1/en not_active Abandoned
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| MX2017011512A (es) | 2018-01-11 |
| US11264118B2 (en) | 2022-03-01 |
| RU2017136185A3 (ru) | 2019-09-23 |
| CA2979041A1 (en) | 2016-09-15 |
| JP6736569B2 (ja) | 2020-08-05 |
| WO2016142890A1 (en) | 2016-09-15 |
| CN107567624A (zh) | 2018-01-09 |
| US20180293349A1 (en) | 2018-10-11 |
| EP3268885A1 (en) | 2018-01-17 |
| JP2018514015A (ja) | 2018-05-31 |
| AU2016230763A1 (en) | 2017-11-02 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Boni | Vaccination and antigenic drift in influenza | |
| Warrilow et al. | Sources of dengue viruses imported into Queensland, Australia, 2002–2010 | |
| RU2016104071A (ru) | Система для скрининга состояния оксигенации субъекта | |
| MX2019008055A (es) | Correccion de fase. | |
| RU2017136185A (ru) | Составление профиля и отображение противомикробных препаратов для конкретных подтипов | |
| PH12018502001A1 (en) | Mixed view display method and device | |
| JP2016529993A5 (ru) | ||
| RU2018110079A (ru) | Способ и устройство для распознавания тканей | |
| Erra et al. | Cross-protection elicited by primary and booster vaccinations against Japanese encephalitis: a two-year follow-up study | |
| RU2010142316A (ru) | Монитор состава тела | |
| GB2547755A (en) | System and method for providing contextual analytics data | |
| JP2016013404A5 (ru) | ||
| RU2015101720A (ru) | Способ объективного измерения эмоциональных установок | |
| WO2015188090A3 (en) | Computer-implemented method, device, and computer-readable medium for visualizing one or more parameters associated with wells at a well site | |
| JP2020049321A5 (ru) | ||
| RU2017133139A (ru) | Устройство, способ и система для графического представления сигналов, зависящего от разрешения | |
| JP2018514015A5 (ru) | ||
| RU2015121337A (ru) | Компьютеризированная иридодиагностика | |
| JP2021112373A5 (ru) | ||
| JP2017162148A5 (ru) | ||
| Shatriah et al. | Clinical profile and aetiology of optic neuritis in Hospital Universiti Sains Malaysia–5 years review | |
| JP2014199568A5 (ru) | ||
| Nelson et al. | The evolutionary dynamics of influenza A and B viruses in the tropical city of Managua, Nicaragua | |
| JP2019010169A5 (ru) | ||
| US20160267245A1 (en) | Method and device for predicting mutated genome sequences, and storage medium of storing mutated genome sequence prediction program |