[go: up one dir, main page]

RU2016133400A - Композиции и способы для добычи трудноизвлекаемых газа и нефти - Google Patents

Композиции и способы для добычи трудноизвлекаемых газа и нефти Download PDF

Info

Publication number
RU2016133400A
RU2016133400A RU2016133400A RU2016133400A RU2016133400A RU 2016133400 A RU2016133400 A RU 2016133400A RU 2016133400 A RU2016133400 A RU 2016133400A RU 2016133400 A RU2016133400 A RU 2016133400A RU 2016133400 A RU2016133400 A RU 2016133400A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
metabolizing
substrate
recombinant
microorganism
polypeptide capable
Prior art date
Application number
RU2016133400A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2016133400A3 (ru
Inventor
Говард Лем Хо ФОНГ
Джон Х. ГРЕЙТ
Луан НГУЙЕН
Джошуа А. СИЛЬВЕРМЕН
Лиза Мэри НЬЮМЕН
Лоррейн Джоан ДЖИВЕР
Дрю Д. РЕДЖИТСКИ
Original Assignee
Калиста, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Калиста, Инк. filed Critical Калиста, Инк.
Publication of RU2016133400A publication Critical patent/RU2016133400A/ru
Publication of RU2016133400A3 publication Critical patent/RU2016133400A3/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A23—FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23K—FODDER
    • A23K10/00—Animal feeding-stuffs
    • A23K10/10—Animal feeding-stuffs obtained by microbiological or biochemical processes
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A23—FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23N—MACHINES OR APPARATUS FOR TREATING HARVESTED FRUIT, VEGETABLES OR FLOWER BULBS IN BULK, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; PEELING VEGETABLES OR FRUIT IN BULK; APPARATUS FOR PREPARING ANIMAL FEEDING- STUFFS
    • A23N17/00—Apparatus specially adapted for preparing animal feeding-stuffs
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01D—SEPARATION
    • B01D53/00—Separation of gases or vapours; Recovering vapours of volatile solvents from gases; Chemical or biological purification of waste gases, e.g. engine exhaust gases, smoke, fumes, flue gases, aerosols
    • B01D53/34—Chemical or biological purification of waste gases
    • B01D53/46—Removing components of defined structure
    • B01D53/48—Sulfur compounds
    • B01D53/52—Hydrogen sulfide
    • B01D53/526—Mixtures of hydrogen sulfide and carbon dioxide
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01D—SEPARATION
    • B01D53/00—Separation of gases or vapours; Recovering vapours of volatile solvents from gases; Chemical or biological purification of waste gases, e.g. engine exhaust gases, smoke, fumes, flue gases, aerosols
    • B01D53/34—Chemical or biological purification of waste gases
    • B01D53/74—General processes for purification of waste gases; Apparatus or devices specially adapted therefor
    • B01D53/84—Biological processes
    • B01D53/85—Biological processes with gas-solid contact
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C09—DYES; PAINTS; POLISHES; NATURAL RESINS; ADHESIVES; COMPOSITIONS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; APPLICATIONS OF MATERIALS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
    • C09K—MATERIALS FOR MISCELLANEOUS APPLICATIONS, NOT PROVIDED FOR ELSEWHERE
    • C09K8/00—Compositions for drilling of boreholes or wells; Compositions for treating boreholes or wells, e.g. for completion or for remedial operations
    • C09K8/52—Compositions for preventing, limiting or eliminating depositions, e.g. for cleaning
    • C09K8/528—Compositions for preventing, limiting or eliminating depositions, e.g. for cleaning inorganic depositions, e.g. sulfates or carbonates
    • C09K8/532—Sulfur
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C10—PETROLEUM, GAS OR COKE INDUSTRIES; TECHNICAL GASES CONTAINING CARBON MONOXIDE; FUELS; LUBRICANTS; PEAT
    • C10G—CRACKING HYDROCARBON OILS; PRODUCTION OF LIQUID HYDROCARBON MIXTURES, e.g. BY DESTRUCTIVE HYDROGENATION, OLIGOMERISATION, POLYMERISATION; RECOVERY OF HYDROCARBON OILS FROM OIL-SHALE, OIL-SAND, OR GASES; REFINING MIXTURES MAINLY CONSISTING OF HYDROCARBONS; REFORMING OF NAPHTHA; MINERAL WAXES
    • C10G3/00—Production of liquid hydrocarbon mixtures from oxygen-containing organic materials, e.g. fatty oils, fatty acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C10—PETROLEUM, GAS OR COKE INDUSTRIES; TECHNICAL GASES CONTAINING CARBON MONOXIDE; FUELS; LUBRICANTS; PEAT
    • C10G—CRACKING HYDROCARBON OILS; PRODUCTION OF LIQUID HYDROCARBON MIXTURES, e.g. BY DESTRUCTIVE HYDROGENATION, OLIGOMERISATION, POLYMERISATION; RECOVERY OF HYDROCARBON OILS FROM OIL-SHALE, OIL-SAND, OR GASES; REFINING MIXTURES MAINLY CONSISTING OF HYDROCARBONS; REFORMING OF NAPHTHA; MINERAL WAXES
    • C10G32/00—Refining of hydrocarbon oils by electric or magnetic means, by irradiation, or by using microorganisms
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C10—PETROLEUM, GAS OR COKE INDUSTRIES; TECHNICAL GASES CONTAINING CARBON MONOXIDE; FUELS; LUBRICANTS; PEAT
    • C10L—FUELS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NATURAL GAS; SYNTHETIC NATURAL GAS OBTAINED BY PROCESSES NOT COVERED BY SUBCLASSES C10G OR C10K; LIQUIFIED PETROLEUM GAS; USE OF ADDITIVES TO FUELS OR FIRES; FIRE-LIGHTERS
    • C10L1/00—Liquid carbonaceous fuels
    • C10L1/04—Liquid carbonaceous fuels essentially based on blends of hydrocarbons
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C10—PETROLEUM, GAS OR COKE INDUSTRIES; TECHNICAL GASES CONTAINING CARBON MONOXIDE; FUELS; LUBRICANTS; PEAT
    • C10L—FUELS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NATURAL GAS; SYNTHETIC NATURAL GAS OBTAINED BY PROCESSES NOT COVERED BY SUBCLASSES C10G OR C10K; LIQUIFIED PETROLEUM GAS; USE OF ADDITIVES TO FUELS OR FIRES; FIRE-LIGHTERS
    • C10L1/00—Liquid carbonaceous fuels
    • C10L1/04—Liquid carbonaceous fuels essentially based on blends of hydrocarbons
    • C10L1/06—Liquid carbonaceous fuels essentially based on blends of hydrocarbons for spark ignition
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C10—PETROLEUM, GAS OR COKE INDUSTRIES; TECHNICAL GASES CONTAINING CARBON MONOXIDE; FUELS; LUBRICANTS; PEAT
    • C10L—FUELS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NATURAL GAS; SYNTHETIC NATURAL GAS OBTAINED BY PROCESSES NOT COVERED BY SUBCLASSES C10G OR C10K; LIQUIFIED PETROLEUM GAS; USE OF ADDITIVES TO FUELS OR FIRES; FIRE-LIGHTERS
    • C10L1/00—Liquid carbonaceous fuels
    • C10L1/04—Liquid carbonaceous fuels essentially based on blends of hydrocarbons
    • C10L1/08—Liquid carbonaceous fuels essentially based on blends of hydrocarbons for compression ignition
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C10—PETROLEUM, GAS OR COKE INDUSTRIES; TECHNICAL GASES CONTAINING CARBON MONOXIDE; FUELS; LUBRICANTS; PEAT
    • C10L—FUELS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NATURAL GAS; SYNTHETIC NATURAL GAS OBTAINED BY PROCESSES NOT COVERED BY SUBCLASSES C10G OR C10K; LIQUIFIED PETROLEUM GAS; USE OF ADDITIVES TO FUELS OR FIRES; FIRE-LIGHTERS
    • C10L3/00—Gaseous fuels; Natural gas; Synthetic natural gas obtained by processes not covered by subclass C10G, C10K; Liquefied petroleum gas
    • C10L3/06—Natural gas; Synthetic natural gas obtained by processes not covered by C10G, C10K3/02 or C10K3/04
    • C10L3/10—Working-up natural gas or synthetic natural gas
    • C10L3/101—Removal of contaminants
    • C10L3/102—Removal of contaminants of acid contaminants
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
    • C12N1/205—Bacterial isolates
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/74—Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0051—Oxidoreductases (1.) acting on a sulfur group of donors (1.8)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0069—Oxidoreductases (1.) acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, i.e. oxygenases (1.13)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
    • C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
    • C12P13/12—Methionine; Cysteine; Cystine
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
    • C12P7/64—Fats; Fatty oils; Ester-type waxes; Higher fatty acids, i.e. having at least seven carbon atoms in an unbroken chain bound to a carboxyl group; Oxidised oils or fats
    • C12P7/6436—Fatty acid esters
    • C12P7/6445—Glycerides
    • C12P7/6463—Glycerides obtained from glyceride producing microorganisms, e.g. single cell oil
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01D—SEPARATION
    • B01D2251/00—Reactants
    • B01D2251/95—Specific microorganisms
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01D—SEPARATION
    • B01D2252/00—Absorbents, i.e. solvents and liquid materials for gas absorption
    • B01D2252/20—Organic absorbents
    • B01D2252/204—Amines
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01D—SEPARATION
    • B01D2256/00—Main component in the product gas stream after treatment
    • B01D2256/24—Hydrocarbons
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01D—SEPARATION
    • B01D2256/00—Main component in the product gas stream after treatment
    • B01D2256/24—Hydrocarbons
    • B01D2256/245—Methane
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01D—SEPARATION
    • B01D2257/00—Components to be removed
    • B01D2257/30—Sulfur compounds
    • B01D2257/304—Hydrogen sulfide
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01D—SEPARATION
    • B01D2257/00—Components to be removed
    • B01D2257/50—Carbon oxides
    • B01D2257/504—Carbon dioxide
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01D—SEPARATION
    • B01D2258/00—Sources of waste gases
    • B01D2258/05—Biogas
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C09—DYES; PAINTS; POLISHES; NATURAL RESINS; ADHESIVES; COMPOSITIONS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; APPLICATIONS OF MATERIALS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
    • C09K—MATERIALS FOR MISCELLANEOUS APPLICATIONS, NOT PROVIDED FOR ELSEWHERE
    • C09K2208/00—Aspects relating to compositions of drilling or well treatment fluids
    • C09K2208/20—Hydrogen sulfide elimination
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C10—PETROLEUM, GAS OR COKE INDUSTRIES; TECHNICAL GASES CONTAINING CARBON MONOXIDE; FUELS; LUBRICANTS; PEAT
    • C10G—CRACKING HYDROCARBON OILS; PRODUCTION OF LIQUID HYDROCARBON MIXTURES, e.g. BY DESTRUCTIVE HYDROGENATION, OLIGOMERISATION, POLYMERISATION; RECOVERY OF HYDROCARBON OILS FROM OIL-SHALE, OIL-SAND, OR GASES; REFINING MIXTURES MAINLY CONSISTING OF HYDROCARBONS; REFORMING OF NAPHTHA; MINERAL WAXES
    • C10G2300/00—Aspects relating to hydrocarbon processing covered by groups C10G1/00 - C10G99/00
    • C10G2300/10—Feedstock materials
    • C10G2300/1025—Natural gas
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C10—PETROLEUM, GAS OR COKE INDUSTRIES; TECHNICAL GASES CONTAINING CARBON MONOXIDE; FUELS; LUBRICANTS; PEAT
    • C10G—CRACKING HYDROCARBON OILS; PRODUCTION OF LIQUID HYDROCARBON MIXTURES, e.g. BY DESTRUCTIVE HYDROGENATION, OLIGOMERISATION, POLYMERISATION; RECOVERY OF HYDROCARBON OILS FROM OIL-SHALE, OIL-SAND, OR GASES; REFINING MIXTURES MAINLY CONSISTING OF HYDROCARBONS; REFORMING OF NAPHTHA; MINERAL WAXES
    • C10G2300/00—Aspects relating to hydrocarbon processing covered by groups C10G1/00 - C10G99/00
    • C10G2300/20—Characteristics of the feedstock or the products
    • C10G2300/201—Impurities
    • C10G2300/202—Heteroatoms content, i.e. S, N, O, P
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C10—PETROLEUM, GAS OR COKE INDUSTRIES; TECHNICAL GASES CONTAINING CARBON MONOXIDE; FUELS; LUBRICANTS; PEAT
    • C10G—CRACKING HYDROCARBON OILS; PRODUCTION OF LIQUID HYDROCARBON MIXTURES, e.g. BY DESTRUCTIVE HYDROGENATION, OLIGOMERISATION, POLYMERISATION; RECOVERY OF HYDROCARBON OILS FROM OIL-SHALE, OIL-SAND, OR GASES; REFINING MIXTURES MAINLY CONSISTING OF HYDROCARBONS; REFORMING OF NAPHTHA; MINERAL WAXES
    • C10G2400/00—Products obtained by processes covered by groups C10G9/00 - C10G69/14
    • C10G2400/02—Gasoline
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C10—PETROLEUM, GAS OR COKE INDUSTRIES; TECHNICAL GASES CONTAINING CARBON MONOXIDE; FUELS; LUBRICANTS; PEAT
    • C10G—CRACKING HYDROCARBON OILS; PRODUCTION OF LIQUID HYDROCARBON MIXTURES, e.g. BY DESTRUCTIVE HYDROGENATION, OLIGOMERISATION, POLYMERISATION; RECOVERY OF HYDROCARBON OILS FROM OIL-SHALE, OIL-SAND, OR GASES; REFINING MIXTURES MAINLY CONSISTING OF HYDROCARBONS; REFORMING OF NAPHTHA; MINERAL WAXES
    • C10G2400/00—Products obtained by processes covered by groups C10G9/00 - C10G69/14
    • C10G2400/04—Diesel oil
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C10—PETROLEUM, GAS OR COKE INDUSTRIES; TECHNICAL GASES CONTAINING CARBON MONOXIDE; FUELS; LUBRICANTS; PEAT
    • C10G—CRACKING HYDROCARBON OILS; PRODUCTION OF LIQUID HYDROCARBON MIXTURES, e.g. BY DESTRUCTIVE HYDROGENATION, OLIGOMERISATION, POLYMERISATION; RECOVERY OF HYDROCARBON OILS FROM OIL-SHALE, OIL-SAND, OR GASES; REFINING MIXTURES MAINLY CONSISTING OF HYDROCARBONS; REFORMING OF NAPHTHA; MINERAL WAXES
    • C10G2400/00—Products obtained by processes covered by groups C10G9/00 - C10G69/14
    • C10G2400/08—Jet fuel
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C10—PETROLEUM, GAS OR COKE INDUSTRIES; TECHNICAL GASES CONTAINING CARBON MONOXIDE; FUELS; LUBRICANTS; PEAT
    • C10L—FUELS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NATURAL GAS; SYNTHETIC NATURAL GAS OBTAINED BY PROCESSES NOT COVERED BY SUBCLASSES C10G OR C10K; LIQUIFIED PETROLEUM GAS; USE OF ADDITIVES TO FUELS OR FIRES; FIRE-LIGHTERS
    • C10L2290/00—Fuel preparation or upgrading, processes or apparatus therefore, comprising specific process steps or apparatus units
    • C10L2290/54—Specific separation steps for separating fractions, components or impurities during preparation or upgrading of a fuel
    • C10L2290/544—Extraction for separating fractions, components or impurities during preparation or upgrading of a fuel
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
    • C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
    • C12R2001/01—Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/20—Air quality improvement or preservation, e.g. vehicle emission control or emission reduction by using catalytic converters
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02C—CAPTURE, STORAGE, SEQUESTRATION OR DISPOSAL OF GREENHOUSE GASES [GHG]
    • Y02C20/00—Capture or disposal of greenhouse gases
    • Y02C20/40—Capture or disposal of greenhouse gases of CO2
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
    • Y02P20/151—Reduction of greenhouse gas [GHG] emissions, e.g. CO2
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
    • Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
    • Y02P20/59—Biological synthesis; Biological purification
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P30/00—Technologies relating to oil refining and petrochemical industry
    • Y02P30/20—Technologies relating to oil refining and petrochemical industry using bio-feedstock

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Oil, Petroleum & Natural Gas (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Polymers & Plastics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Environmental & Geological Engineering (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Physiology (AREA)
  • Animal Husbandry (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Inorganic Chemistry (AREA)
  • General Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Materials Engineering (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Claims (140)

1. Способ обработки газа, включающий культивацию первого рекомбинантного метаболизирующего C1 микроорганизма с сырьевым низкокачественным газом,
в котором сырьевой низкокачественный газ содержит субстрат C1 и субстрат S;
при этом рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм содержит первую экзогенную молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид, способный метаболизировать субстрат S; и
при этом рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм ассимилирует и/или окисляет каждый субстрат.
2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, представляет собой сероводород:НАДФ+-оксидоредуктазу, сероводород:ферредоксин-оксидоредуктазу, сульфид:флавоцитохром-с-оксидоредуктазу, сульфид:хинон-оксидоредуктазу, серадиоксигеназу, сульфитоксидазу или любую их комбинацию.
3. Способ по п. 1, отличающийся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, представляет собой сероводород:НАДФ+-оксидоредуктазу, сульфитоксидазу, или обе.
4. Способ по п. 1, отличающийся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, представляет собой сероводород:ферредоксин-оксидоредуктазу, сульфитоксидазу, или обе.
5. Способ по п. 1, отличающийся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, представляет собой сульфид:флавоцитохром-с-оксидоредуктазу, сульфитоксидазу, или обе.
6. Способ по п. 1, отличающийся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, представляет собой сульфид:хинон-оксидоредуктазу, сульфитоксидазу, или обе.
7. Способ по п. 1, отличающийся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, представляет собой сероводород:НАДФ+-оксидоредуктазу, сероводород:ферредоксин-оксидоредуктазу, сульфид:флавоцитохром-с-оксидоредуктазу, или сульфид:хинон-оксидоредуктазу, причем активность эндогенной сульфитоксидазы повышена.
8. Способ по любому из пп. 1-7, отличающийся тем, что субстрат C1, субстрат S, или оба превращаются в биологический материал.
9. Способ по п. 8, в котором биологический материал представляет собой корм для животных, удобрение или композицию масел.
10. Способ по любому из пп. 1-7, отличающийся тем, что субстрат S окисляется до сульфата.
11. Способ по любому из пп. 1-7, отличающийся тем, что сырьевой низкокачественный газ представляет собой газообразные легкие алканы, природный газ, нетрадиционный природный газ, синтез-газ, нефтяной газ, конденсат попутного газа, или любую их комбинацию.
12. Способ по любому из пп. 1-7, отличающийся тем, что сырьевой низкокачественный газ представляет собой кислый газ или высокосернистый газ.
13. Способ по любому из пп. 1-7, отличающийся тем, что рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм дополнительно содержит вторую экзогенную молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую фермент, продуцирующий жирную кислоту, фермент, ассимилирующий формальдегид или их комбинацию; причем рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм превращает субстрат C1 в композицию масел.
14. Способ по п. 13, отличающийся тем, что композиция масел находится по существу в клеточной мембране метаболизирующего C1 микроорганизма.
15. Способ по п. 13, отличающийся тем, что способ дополнительно включает стадию получения композиции масел путем экстракции.
16. Способ по п. 15, отличающийся тем, что способ дополнительно включает стадию очистки экстрагированной композиции масел до топлива, в котором топливо представляет собой топливо для реактивных двигателей, дизельное топливо, парафиновый керосин, бензин или их комбинацию.
17. Способ по п. 1, отличающийся тем, что способ дополнительно включает второй рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм или его клеточный лизат, в котором второй рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм содержит экзогенную молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид, способный окислять легкие алканы; причем второй рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм или его клеточный лизат окисляет субстрат C1 до композиции спиртов.
18. Способ по п. 1, отличающийся тем, что рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм дополнительно содержит вторую экзогенную молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид, способный окислять легкие алканы; причем рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм или его клеточный лизат окисляет субстрат C1 до композиции спиртов.
19. Способ по п. 17 или 18, отличающийся тем, что полипептид, способный окислять легкие алканы, представляет собой монооксигеназу, выбранную из рММО, sMMO, АМО, рВМО, sBMO, sPMO, РМО:Р450, Р450, или любую их комбинацию.
20. Способ по любому из пп. 1-7, отличающийся тем, что рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм дополнительно содержит вторую экзогенную молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую конвертирующий фермент жирных кислот; причем рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм превращает субстрат C1 в С8-С24 производное жирной кислоты, включая жирный альдегид, жирный спирт, жирную оксикислоту, дикарбоновую кислоту, или любую их комбинацию.
21. Способ по п. 20, отличающийся тем, что конвертирующий фермент жирных кислот является жирный ацил-СоА-редуктазой, способной образовывать жирный спирт.
22. Способ по п. 21, отличающийся тем, что жирный ацил-СоА-редуктаза, способная образовывать жирный спирт, представляет собой FAR, CER4, или Maqu_2220.
23. Способ по п. 20, отличающийся тем, что конвертирующий фермент жирных кислот является жирный ацил-СоА-редуктазой, способной образовывать жирный альдегид.
24. Способ по п. 23, отличающийся тем, что жирный ацил-СоА-редуктаза, способная образовывать жирный альдегид, представляет собой acr1.
25. Способ по п. 20, отличающийся тем, что конвертирующий фермент жирных кислот является редуктазой карбоновой кислоты.
26. Способ по п. 20, отличающийся тем, что рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм дополнительно содержит экзогенную молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую тиоэстеразу.
27. Способ по п. 26, отличающийся тем, что тиоэстераза представляет собой tesA с отсутствующим сигнальным пептидом, UcFatB или ВТЕ.
28. Способ по п. 26 или 27, отличающийся тем, что активность эндогенной тиоэстеразы снижается, является минимальной или прекращается по сравнению с неизмененной активностью эндогенной тиоэстеразы.
29. Способ по п. 20, отличающийся тем, что рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм дополнительно содержит экзогенную молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую ацил-СоА-синтетазу.
30. Способ по п. 29, в котором ацил-СоА-синтетаза представляет собой FadD, yng1 или FAA2.
31. Способ по п. 29 или 30, отличающийся тем, что активность эндогенной ацил-СоА-синтетазы снижается, является минимальной или прекращается по сравнению с неизмененной активностью эндогенной ацил-СоА-синтетазы.
32. Способ по п. 20, дополнительно включающий рекомбинантную молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую монооксигеназу для продуцирования жирной ω-оксикислоты.
33. Способ по п. 32, отличающийся тем, что активность эндогенной алкогольдегидрогеназы снижается, является минимальной или прекращается по сравнению с неизмененной активностью эндогенной алкогольдегидрогеназы.
34. Способ по п. 20, отличающийся тем, что активность эндогенной алкогольдегидрогеназы усилена или повышена по сравнению с неизмененной активностью эндогенной алкогольдегидрогеназы для продуцирования дикарбоновой кислоты.
35. Способ по любому из пп. 1-7, отличающийся тем, что метаболизирующий C1 микроорганизм выбирают из группы, состоящей из Methylomonas, Methylobacter, Methylococcus, Methylosinus, Methylocystis, Methylomicrobium, Methanomonas, Methylophilus, Methylobacillus, Methylobacterium, Hyphomicrobium, Xanthobacter, Bacillus, Paracoccus, Nocardia, Arthrobacter, Rhodopseudomonas и Pseudomonas.
36. Способ по любому из пп. 1-7, отличающийся тем, что метаболизирующий C1 микроорганизм выбирают из группы, состоящей из Candida, Yarrowia, Hansenula, Pichia, Torulopsis и Rhodotorula.
37. Способ по любому из пп. 1-7, отличающийся тем, что метаболизирующий C1 микроорганизм представляет собой бактерию.
38. Способ по п. 37, отличающийся тем, что метаболизирующая C1 бактерия является метанотрофом или метилотрофом.
39. Способ по п. 37, отличающийся тем, что метаболизирующая C1 бактерия является метанотрофом.
40. Способ по п. 39, отличающийся тем, что метанотроф представляет собой Methylomonas, Methylobacter, Methylococcus, Methylosinus, Methylocystis, Methylomicrobium, Methanomonas или их комбинацию.
41. Способ по п. 39, отличающийся тем, что метанотроф представляет собой Methylococcus capsulatus штамм Bath, Methylomonas 16а (АТСС РТА 2402), Methylosinus trichosporium OB3b (NRRL В-11196), Methylosinus sporium (NRRL В-11197), Methylocystis parvus (NRRL B-11198), Methylomonas methanica (NRRL B-11199), Methylomonas albus (NRRL B-11200), Methylobacter capsulatus (NRRL B-11201), Methylobacterium organophilum (ATCC 27886), Methylomonas sp. AJ-3670 (FERM P-2400), Methylocella silvestris, Methylocella palustris (ATCC 700799), Methylocella tundrae, Methylocystis daltona штамм SB2, Methylocystis bryophila, Methylocapsa aurea KYG, Methylacidiphilum infernorum, Methylibium petroleiphilum, Methylomicrobium alcaliphilum или их комбинацию.
42. Способ по п. 39, отличающийся тем, что метанотроф представляет собой Methylosinus trichosporium OB3b, Methylococcus capsulatus Bath, Methylomonas sp. 16a, Methylomicrobium alcaliphilum или их быстрорастущий вариант.
43. Способ по любому из пп. 39-42, отличающийся тем, что культура дополнительно содержит гетерологичную бактерию.
44. Способ по п. 37, отличающийся тем, что метаболизирующая C1 бактерия является метилотрофом.
45. Способ по п. 44, отличающийся тем, что метилотроф представляет собой Methylobacterium extorquens, Methylobacterium radiotolerans, Methylobacterium populi, Methylobacterium chloromethanicum, Methylobacterium nodulans или их комбинацию.
46. Способ по п. 37, отличающийся тем, что метаболизирующая C1 бактерия представляет собой бактерию, метаболизирующую природный газ, нетрадиционный природный газ или синтез-газ.
47. Способ по п. 46, отличающийся тем, что бактерия, метаболизирующая синтез-газ, представляет собой Clostridium, Moorella, Pyrococcus, Eubacterium, Desulfobacterium, Carboxydothermus, Acetogenium, Acetobacterium, Acetoanaerobium, Butyribaceterium, Peptostreptococcus или их комбинацию.
48. Способ по п. 46, отличающийся тем, что бактерия, метаболизирующая синтез-газ, представляет собой Clostridium autoethanogenum, Clostridium ljungdahli, Clostridium ragsdalei, Clostridium carboxydivorans, Butyribacterium methylotrophicum, Clostridium woodii, Clostridium neopropanologen или их комбинацию.
49. Способ по любому из пп. 1-7, отличающийся тем, что метаболизирующий C1 микроорганизм представляет собой облигатный метаболизирующий C1 микроорганизм.
50. Система обработки газа, включающая:
источник газа, содержащий субстрат C1 и субстрат S;
биореактор, содержащий рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм, содержащий первую экзогенную молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид, способный метаболизировать субстрат S; и
соединительное устройство, расположенное между источником газа и биореактором для обеспечения потока газа в биореактор;
причем рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм ассимилирует и/или окисляет каждый субстрат.
51. Система для добычи трудноизвлекаемого газа и/или нефти, включающая:
механизм для извлечения газа из подземной формации, причем газ содержит субстрат C1 и субстрат S, и механизм для извлечения содержит скважину;
механизм для ассимиляции и/или окисления по меньшей мере части каждого субстрата из добытого газа, причем механизм для ассимиляции и/или окисления содержит биореактор, при этом биореактор содержит рекомбинантный метаболизирующий С1 микроорганизм, содержащий первую экзогенную молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид, способный метаболизировать субстрат S; и
механизм для извлечения подвергнутой биологической обработке трудноизвлекаемой нефти из подземной формации, при этом механизм для извлечения содержит скважину.
52. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, представляет собой сероводород:НАДФ+-оксидоредуктазу, сероводород:ферредоксин-оксидоредуктазу, сульфид:флавоцитохром-с-оксидоредуктазу, сульфид:хинон-оксидоредуктазу, серадиоксигеназу, сульфитоксидазу или любую их комбинацию.
53. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, представляет собой сероводород:НАДФ+-оксидоредуктазу, сульфитоксидазу или обе.
54. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, представляет собой сероводород:ферредоксин-оксидоредуктазу, сульфитоксидазу или обе.
55. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, представляет собой сульфид:флавоцитохром-с-оксидоредуктазу, сульфитоксидазу или обе.
56. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, представляет собой сульфид:хинон-оксидоредуктазу, сульфитоксидазу или обе.
57. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, представляет собой сероводород:НАДФ+-оксидоредуктазу, сероводород:ферредоксин-оксидоредуктазу, сульфид:флавоцитохром-с-оксидоредуктазу или сульфид:хинон-оксидоредуктазу, причем активность эндогенной сульфитоксидазы повышена.
58. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что субстрат C1, субстрат S или оба превращаются в биологический материал.
59. Система по п. 58, отличающаяся тем, что биологический материал представляет собой корм для животных, удобрение или композицию масел.
60. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что субстрат S окисляется до сульфата.
61. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что сырьевой низкокачественный газ представляет собой газообразные легкие алканы, природный газ, нетрадиционный природный газ, синтез-газ, нефтяной газ, конденсат попутного газа или любую их комбинацию.
62. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что сырьевой низкокачественный газ представляет собой кислый газ или высокосернистый газ.
63. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм дополнительно содержит вторую экзогенную молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую фермент, продуцирующий жирную кислоту, фермент, ассимилирующий формальдегид или их комбинацию; причем рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм превращает субстрат C1 в композицию масел.
64. Система по п. 63, отличающаяся тем, что композиция масел находится по существу в клеточной мембране метаболизирующего C1 микроорганизма.
65. Система по п. 63, отличающаяся тем, что способ дополнительно включает стадию получения композиции масел путем экстракции.
66. Система по п. 65, отличающаяся тем, что способ дополнительно включает стадию очистки экстрагированной композиции масел до топлива, причем топливо представляет собой топливо для реактивных двигателей, дизельное топливо, парафиновый керосин, бензин или их комбинацию.
67. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что способ дополнительно включает второй рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм или его клеточный лизат, причем второй рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм содержит экзогенную молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид, способный окислять легкие алканы; причем второй рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм или его клеточный лизат окисляет субстрат C1 до композиции спиртов.
68. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм дополнительно содержит вторую экзогенную молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид, способный окислять легкие алканы; причем рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм или его клеточный лизат окисляет субстрат C1 до композиции спиртов.
69. Система по п. 67, отличающаяся тем, что полипептид, способный окислять легкие алканы, представляет собой монооксигеназу, выбранную из pMMO, sMMO, АМО, рВМО, sBMO, sPMO, РМО:Р450, Р450, или любую их комбинацию.
70. Система по п. 68, отличающаяся тем, что полипептид, способный окислять легкие алканы, представляет собой монооксигеназу, выбранную из pMMO, sMMO, АМО, рВМО, sBMO, sPMO, РМО:Р450, Р450, или любую их комбинацию.
71. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм дополнительно содержит вторую экзогенную молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую конвертирующий фермент жирных кислот; причем рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм превращает субстрат C1 в С8-С24 производное жирной кислоты, включая жирный альдегид, жирный спирт, жирную оксикислоту, дикарбоновую кислоту или любую их комбинацию.
72. Система по п. 71, отличающаяся тем, что конвертирующий фермент жирных кислот представляет собой жирную ацил-СоА-редуктазу, способную образовывать жирный спирт.
73. Система по п. 72, отличающаяся тем, что жирная ацил-СоА-редуктаза, способная образовывать жирный спирт, представляет собой FAR, CER4 или Maqu_2220.
74. Система по п. 71, отличающаяся тем, что конвертирующий фермент жирных кислот представляет собой жирную ацил-СоА-редуктазу, способную образовывать жирный альдегид.
75. Система по п. 74, отличающаяся тем, что жирная ацил-СоА-редуктаза, способная образовывать жирный альдегид, представляет собой acr1.
76. Система по п. 71, отличающаяся тем, что конвертирующий фермент жирных кислот представляет собой редуктазу карбоновой кислоты.
77. Система по п. 71, отличающаяся тем, что рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм, дополнительно содержит экзогенную молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую тиоэстеразу.
78. Система по п. 77, отличающаяся тем, что тиоэстераза представляет собой tesA с отсутствующим сигнальным пептидом, UcFatB или ВТЕ.
79. Система по п. 77 или 78, отличающаяся тем, что активность эндогенной тиоэстеразы снижается, является минимальной или прекращается по сравнению с неизмененной активностью эндогенной тиоэстеразы.
80. Система по п. 71, отличающаяся тем, что рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм, дополнительно содержит экзогенную молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую ацил-СоА-синтетазу.
81. Система по п. 80, отличающаяся тем, что ацил-СоА-синтетаза представляет собой FadD, yng1 или FAA2.
82. Система по п. 80 или 81, отличающаяся тем, что активность эндогенной ацил-СоА-синтетазы снижается, является минимальной или прекращается по сравнению с неизмененной активностью эндогенной ацил-СоА-синтетазы.
83. Система по п. 71, дополнительно содержащая рекомбинантную молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую монооксигеназу для продуцирования жирной ω-оксикислоты.
84. Система по п. 83, отличающаяся тем, что активность эндогенной алкогольдегидрогеназы снижается, является минимальной или прекращается по сравнению с неизмененной активностью эндогенной алкогольдегидрогеназы.
85. Система по п. 71, отличающаяся тем, что активность эндогенной алкогольдегидрогеназы усилена или повышена по сравнению с неизмененной активностью эндогенной алкогольдегидрогеназы для продуцирования дикарбоновой кислоты.
86. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что метаболизирующий C1 микроорганизм выбирают из группы, состоящей из Methylomonas, Methylobacter, Methylococcus, Methylosinus, Methylocystis, Methylomicrobium, Methanomonas, Methylophilus, Methylobacillus, Methylobacterium, Hyphomicrobium, Xanthobacter, Bacillus, Paracoccus, Nocardia, Arthrobacter, Rhodopseudomonas и Pseudomonas.
87. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что метаболизирующий C1 микроорганизм выбирают из группы, состоящей из Candida, Yarrowia, Hansenula, Pichia, Torulopsis и Rhodotorula.
88. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что метаболизирующий C1 микроорганизм представляет собой бактерию.
89. Система по п. 88, отличающаяся тем, что метаболизирующая C1 бактерия является метанотрофом или метилотрофом.
90. Система по п. 88, отличающаяся тем, что метаболизирующая C1 бактерия является метанотрофом.
91. Система по п. 90, отличающаяся тем, что метанотроф представляет собой Methylomonas, Methylobacter, Methylococcus, Methylosinus, Methylocystis, Methylomicrobium, Methanomonas или их комбинацию.
92. Система по п. 90, отличающаяся тем, что метанотроф представляет собой Methylococcus capsulatus штамм Bath, Methylomonas 16а (ATCC РТА 2402), Methylosinus trichosporium OB3b (NRRL B-11196), Methylosinus sporium (NRRL B-11197), Methylocystis parvus (NRRL B-11198), Methylomonas methanica (NRRL B-11199), Methylomonas albus (NRRL B-11200), Methylobacter capsulatus (NRRL B-11201), Methylobacterium organophilum (ATCC 27886), Methylomonas sp. AJ-3670 (FERM P-2400), Methylocella silvestris, Methylocella palustris (ATCC 700799), Methylocella tundrae, Methylocystis daltona штамм SB2, Methylocystis bryophila, Methylocapsa aurea KYG, Methylacidiphilum infernorum, Methylibium petroleiphilum, Methylomicrobium alcaliphilum или их комбинацию.
93. Система по п. 90, отличающаяся тем, что метанотроф представляет собой Methylosinus trichosporium OB3b, Methylococcus capsulatus Bath, Methylomonas sp. 16a, Methylomicrobium alcaliphilum или их быстрорастущий вариант.
94. Система по любому из пп. 90-93, отличающаяся тем, что культура дополнительно содержит гетерологичную бактерию.
95. Система по п. 88, отличающаяся тем, что метаболизирующая C1 бактерия является метилотрофом.
96. Система по п. 95, отличающаяся тем, что метилотроф представляет собой Methylobacterium extorquens, Methylobacterium radiotolerans, Methylobacterium populi, Methylobacterium chloromethanicum, Methylobacterium nodulans или их комбинацию.
97. Система по п. 88, отличающаяся тем, что метаболизирующая C1 бактерия представляет собой бактерию, метаболизирующую природный газ, нетрадиционный природный газ или синтез-газ.
98. Система по п. 97, отличающаяся тем, что бактерия, метаболизирующая синтез-газ, представляет собой Clostridium, Moorella, Pyrococcus, Eubacterium, Desulfobacterium, Carboxydothermus, Acetogenium, Acetobacterium, Acetoanaerobium, Butyribaceterium, Peptostreptococcus или их комбинацию.
99. Система по п. 97, отличающаяся тем, что бактерия, метаболизирующая синтез-газ, представляет собой Clostridium autoethanogenum, Clostridium ljungdahli, Clostridium ragsdalei, Clostridium carboxydivorans, Butyribacterium methylotrophicum, Clostridium woodii, Clostridium neopropanologen или их комбинацию.
100. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что метаболизирующий C1 микроорганизм представляет собой облигатный метаболизирующий C1 микроорганизм.
101. Рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм, содержащий первую экзогенную молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид, способный метаболизировать субстрат S, причем рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм способен ассимилировать и/или окислять субстрат S, субстрат C1 или оба.
102. Рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм по п. 101, отличающийся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, представляет собой сероводород:НАДФ+-оксидоредуктазу, сероводород:ферредоксин-оксидоредуктазу, сульфид:флавоцитохром-с-оксидоредуктазу, сульфид:хинон-оксидоредуктазу, серадиоксигеназу, сульфитоксидазу или любую их комбинацию.
103. Рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм по п. 101 или 102, представляющий собой бактерию.
104. Рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм по п. 103, отличающийся тем, что метаболизирующая C1 бактерия является метанотрофом или метилотрофом.
105. Рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм по п. 103, отличающийся тем, что метаболизирующая C1 бактерия является метанотрофом.
106. Рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм по п. 105, отличающийся тем, что метанотроф представляет собой Methylococcus capsulatus штамм Bath, Methylomonas 16а (ATCC РТА 2402), Methylosinus trichosporium OB3b (NRRL B-11196), Methylosinus sporium (NRRL B-11197), Methylocystis parvus (NRRL B-11198), Methylomonas methanica (NRRL B-11199), Methylomonas albus (NRRL B-11200), Methylobacter capsulatus (NRRL B-11201), Methylobacterium organophilum (ATCC 27886), Methylomonas sp. AJ-3670 (FERM P-2400), Methylocella silvestris, Methylocella palustris (ATCC 700799), Methylocella tundrae, Methylocystis daltona штамм SB2, Methylocystis bryophila, Methylocapsa aurea KYG, Methylacidiphilum infernorum, Methylibium petroleiphilum, Methylomicrobium alcaliphilum или их комбинацию.
107. Рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм по п. 105, отличающийся тем, что метанотроф представляет собой Methylosinus trichosporium OB3b, Methylococcus capsulatus Bath, Methylomonas sp. 16a, Methylomicrobium alcaliphilum или их быстрорастущий вариант.
108. Рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм по любому из пп. 105-107, в котором культура дополнительно содержит гетерологичную бактерию.
109. Рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм по п. 103, в котором метаболизирующая C1 бактерия является метилотрофом.
110. Рекомбинантный метаболизирующий С1 микроорганизм по п. 109, в котором метилотроф представляет собой Methylobacterium extorquens, Methylobacterium radiotolerans, Methylobacterium populi, Methylobacterium chloromethanicum, Methylobacterium nodularis или их комбинацию.
111. Рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм по п. 103, в котором метаболизирующая C1 бактерия представляет собой бактерию, метаболизирующую природный газ, нетрадиционный природный газ, или синтез-газ.
112. Рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм по п. 101 или 102, представляющий собой облигатный метаболизирующий C1 микроорганизм.
113. Способ по любому из пп. 1-7, отличающийся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, кодируется нуклеиновой кислотой, содержащей последовательность, представленную любой из SEQ ID NO.: 21-54.
114. Способ по любому из пп. 1-7, отличающийся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, содержит аминокислотную последовательность, представленную любой из SEQ ID NO.: 55-88.
115. Способ по п. 17 или 18, отличающийся тем, что экзогенная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид, способный окислять легкие алканы, содержит последовательность, представленную любой из SEQ ID NO.: 1-20.
116. Способ по п. 17 или 18, отличающийся тем, что полипептид, способный окислять легкие алканы, содержит последовательность, представленную любой из SEQ ID NO.: 89-108.
117. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, кодируется нуклеиновой кислотой, содержащей последовательность, представленную любой из SEQ ID NO.: 21-54.
118. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, содержит аминокислотную последовательность, представленную любой из SEQ ID NO.: 55-88.
119. Система по п. 67, отличающаяся тем, что экзогенная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид, способный окислять легкие алканы, содержит последовательность, представленную любой из SEQ ID NO.: 1-20.
120. Система по п. 68, отличающаяся тем, что экзогенная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид, способный окислять легкие алканы, содержит последовательность, представленную любой из SEQ ID NO.: 1-20.
121. Система по п. 67, отличающаяся тем, что полипептид, способный окислять легкие алканы, содержит последовательность, представленную любой из SEQ ID NO.: 89-108.
122. Система по п. 68, отличающаяся тем, что полипептид, способный окислять легкие алканы, содержит последовательность, представленную любой из SEQ ID NO.: 89-108.
123. Рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм по п. 101 или 102, отличающийся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, кодируется нуклеиновой кислотой, содержащей последовательность, представленную любой из SEQ ID NO.: 21-54.
124. Рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм по п. 101 или п. 102, отличающийся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S содержит аминокислотную последовательность, представленную любой из SEQ ID NO.: 55-88.
125. Способ по п. 1, отличающийся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, представляет собой серооксигеназу.
126. Система по п. 50 или 51, отличающаяся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, представляет собой серооксигеназу.
127. Рекомбинантный метаболизирующий C1 микроорганизм по п. 101, отличающийся тем, что полипептид, способный метаболизировать субстрат S, представляет собой серооксигеназу.
128. Способ по п. 125, отличающийся тем, что серооксигеназа имеет аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 75% идентичную последовательности, приведенной для номера доступа Genbank AAK58572.1 или ABN04222.1 или ее функциональному фрагменту.
129. Система по п. 126, отличающаяся тем, что серооксигеназа имеет аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 75% идентичную последовательности, приведенной для номера доступа Genbank AAK58572.1 или ABN04222.1 или ее функциональному фрагменту.
130. Рекомбинантный метаболизирующий С1 микроорганизм по п. 127, отличающийся тем, что серооксигеназа имеет аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 75% идентичную последовательности, приведенной для номера доступа Genbank AAK58572.1 или ABN04222.1 или ее функциональному фрагменту.
RU2016133400A 2014-01-16 2015-01-16 Композиции и способы для добычи трудноизвлекаемых газа и нефти RU2016133400A (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201461928349P 2014-01-16 2014-01-16
US61/928,349 2014-01-16
PCT/US2015/011806 WO2015109221A1 (en) 2014-01-16 2015-01-16 Compositions and methods for recovery of stranded gas and oil

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2016133400A true RU2016133400A (ru) 2018-02-19
RU2016133400A3 RU2016133400A3 (ru) 2018-08-10

Family

ID=53543493

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016133400A RU2016133400A (ru) 2014-01-16 2015-01-16 Композиции и способы для добычи трудноизвлекаемых газа и нефти

Country Status (4)

Country Link
US (2) US10273446B2 (ru)
CA (1) CA2936848A1 (ru)
RU (1) RU2016133400A (ru)
WO (1) WO2015109221A1 (ru)

Families Citing this family (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US9587159B2 (en) * 2014-12-04 2017-03-07 Baker Hughes Incorporated Enzymes for removing sulfurous compounds in downhole fluids
SG11201708741YA (en) 2015-05-06 2017-11-29 Trelys Inc Compositions and methods for biological production of methionine
RU2761409C2 (ru) 2017-01-10 2021-12-08 Калиста, Инк. Реакторы, системы и способы ферментации с подачей газа с применением зоны вертикального потока
US10907106B2 (en) * 2017-06-21 2021-02-02 Locus Oil Ip Company, Llc Treatment for upgrading heavy crude oil
CA3072344C (en) 2017-08-14 2024-06-04 Calysta, Inc. Gas-fed fermentation reactors, systems and processes utilizing gas/liquid separation vessels
US20190178066A1 (en) 2017-12-12 2019-06-13 Exxonmobil Research And Engineering Company Biological upgrading of hydrocarbon streams with dioxygenases
WO2019118112A1 (en) 2017-12-12 2019-06-20 Exxonmobil Research And Engineering Company Biological upgrading of hydrocarbon streams with oxygenases
US10465105B2 (en) * 2018-04-09 2019-11-05 Baker Hughes, A Ge Company, Llc In-situ hydrogen sulfide mitigation
WO2019229086A1 (en) 2018-05-31 2019-12-05 Centre National De La Recherche Scientifique (Cnrs) Electrochemical bioenzymatic sensor for measuring h2s in biological fluids
US11541105B2 (en) 2018-06-01 2023-01-03 The Research Foundation For The State University Of New York Compositions and methods for disrupting biofilm formation and maintenance
KR102642506B1 (ko) * 2021-04-30 2024-02-28 고려대학교 산학협력단 메탄 또는 부탄 산화 활성을 갖는 신규 단백질
US20240228347A1 (en) * 2021-05-20 2024-07-11 ExxonMobil Technology and Engineering Company Methods for natural gas injection into water
CN117343914B (zh) * 2023-11-24 2024-02-20 四川水王子环境科技有限公司 经修饰的氨单加氧酶、载体、微生物以及用于氨氮降解的方法

Family Cites Families (21)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
USH1430H (en) 1991-07-30 1995-04-04 The United States Of America As Represented By The United States Department Of Energy Clay enhancement of methane, low molecular weight hydrocarbon and halocarbon conversion by methanotrophic bacteria
US6309597B1 (en) * 1997-05-12 2001-10-30 Arkion Life Sciences Method for reducing hydrogen sulfide level in water containing sulfate-reducing bacteria and hydrogen sulfide-metabolizing bacteria
JP3674553B2 (ja) * 2000-09-01 2005-07-20 トヨタ自動車株式会社 燃料中の硫黄含有成分除去装置
US6818424B2 (en) 2000-09-01 2004-11-16 E. I. Du Pont De Nemours And Company Production of cyclic terpenoids
US6689601B2 (en) 2000-09-01 2004-02-10 E. I. Du Pont De Nemours And Company High growth methanotropic bacterial strain
US6576449B2 (en) 2001-03-12 2003-06-10 Bechtel Bwxt Idaho, Llc Microbial production of epoxides
JP2002262861A (ja) 2001-03-13 2002-09-17 Toshiba Corp 難分解性有機物分解微生物の増殖方法及び難分解性有機物の分解方法
US20050176121A1 (en) 2001-09-06 2005-08-11 Ryo Takeshita Method for producing alcohol by using microorganism
RU2294370C2 (ru) 2001-09-06 2007-02-27 Адзиномото Ко., Инк. Способ получения спирта с использованием микроорганизма
US7026464B2 (en) 2002-10-21 2006-04-11 E. I. Du Pont De Nemours And Company Natural promoters for gene expression in C1 metabolizing bacteria
US20060057726A1 (en) * 2003-12-03 2006-03-16 Sharpe Pamela L Method for the positive selection of chromosomal mutations in C1 metabolizing bacteria via homologous recombination
US7670824B2 (en) 2005-07-26 2010-03-02 National Research Council Of Canada Multicopy-integration of heterologous genes and expression in Methylobacterium
US8216821B2 (en) 2005-08-23 2012-07-10 National Research Council Of Canada Regulation of heterologous recombinant protein expression in methylotrophic and methanotrophic bacteria
AU2006288323A1 (en) 2005-09-05 2007-03-15 Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd. Process for producing lactic acid
US7704723B2 (en) 2006-08-31 2010-04-27 The Board Of Regents For Oklahoma State University Isolation and characterization of novel clostridial species
WO2009009391A2 (en) 2007-07-06 2009-01-15 Ls9, Inc. Systems and methods for the production of fatty esters
US9284580B2 (en) * 2010-10-01 2016-03-15 Shang-Tian Yang Metabolic engineering of clostridium tyrobutyricum for butanol production
US8349587B2 (en) 2011-10-31 2013-01-08 Ginkgo Bioworks, Inc. Methods and systems for chemoautotrophic production of organic compounds
US10480016B2 (en) 2012-10-15 2019-11-19 Calysta, Inc. Genetically engineered microorganisms for biological oxidation of hydrocarbons
WO2014066670A1 (en) 2012-10-24 2014-05-01 Calysta Energy, Inc. Engineering of multi-carbon substrate utilization pathways in methanotrophic bacteria
US20150315599A1 (en) 2012-12-07 2015-11-05 Ginkgo Bioworks, Inc Methods and Systems for Methylotrophic Production of Organic Compounds

Also Published As

Publication number Publication date
CA2936848A1 (en) 2015-07-23
US20160333307A1 (en) 2016-11-17
US20190264169A1 (en) 2019-08-29
RU2016133400A3 (ru) 2018-08-10
WO2015109221A1 (en) 2015-07-23
US10273446B2 (en) 2019-04-30

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2016133400A (ru) Композиции и способы для добычи трудноизвлекаемых газа и нефти
US9970032B2 (en) Biorefinery system, methods and compositions thereof
Bisen et al. Biodiesel production with special emphasis on lipase-catalyzed transesterification
CN101802208B (zh) 通过提取式发酵减少原料中杂质的毒性作用
RU2015109898A (ru) Композиции и способы биологического получения производных жирных кислот
Dürre Butanol formation from gaseous substrates
JP2015534831A5 (ru)
JP2015526105A (ja) 組換え微生物およびその使用
RU2016145054A (ru) Способы биологического получения соединений с очень длинной углеродной цепью
EA039754B1 (ru) Способы улучшения процессов биологического превращения и извлечения продукта
KR20160093648A (ko) 케톤을 생산하기 위한 방법 및 미생물
CA2954099A1 (en) Process for producing alkanes using microorganisms combined with kolbe synthesis
JP5252940B2 (ja) コリネ型細菌形質転換体及びそれを用いるブタノールの製造方法
JP2020536520A (ja) Ｗｏｏｄ−ｌｊｕｎｇｄａｈｌ微生物におけるポリヒドロキシブチレートの生成
Kronenburga et al. Effects of detergents on specific activity and enantioselectivity of the epoxide hydrolase from Rhodotorula glutinis
CA2956204A1 (en) Genetically engineered bacterium with altered carbon monoxide dehydrogenase (codh) activity
WO2017117309A1 (en) Microorganism with modified hydrogenase activity
US20220282289A1 (en) Recombinant microorganisms and uses therefor
Honda et al. Molecular mechanism of direct oxidation of polymeric
EA044562B1 (ru) Получение полигидроксибутирата в микроорганизме вуда-льюнгдаля
Makhale Biodiesel Production With Waste Product Cycling
Karayannis et al. Carbon Resources Conversion

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20191113