[go: up one dir, main page]

RU2008130093A - Улучшенный направленный обмен нуклеотидов с пропинил-модифицированными олигонуклеотидами - Google Patents

Улучшенный направленный обмен нуклеотидов с пропинил-модифицированными олигонуклеотидами Download PDF

Info

Publication number
RU2008130093A
RU2008130093A RU2008130093/13A RU2008130093A RU2008130093A RU 2008130093 A RU2008130093 A RU 2008130093A RU 2008130093/13 A RU2008130093/13 A RU 2008130093/13A RU 2008130093 A RU2008130093 A RU 2008130093A RU 2008130093 A RU2008130093 A RU 2008130093A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
dna sequence
oligonucleotide
nucleotide
modified
cell
Prior art date
Application number
RU2008130093/13A
Other languages
English (en)
Inventor
Пол БЮНДОК (NL)
Пол БЮНДОК
БОТ Михил Теодор Ян ДЕ (NL)
БОТ Михил Теодор Ян ДЕ
Рене Корнелис Йозефус ХОГЕРС (NL)
Рене Корнелис Йозефус ХОГЕРС
Original Assignee
Киджин Н.В. (Nl)
Киджин Н.В.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=36691461&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=RU2008130093(A) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Киджин Н.В. (Nl), Киджин Н.В. filed Critical Киджин Н.В. (Nl)
Publication of RU2008130093A publication Critical patent/RU2008130093A/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813Hybridisation assays
    • C12Q1/6816Hybridisation assays characterised by the detection means
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/102Mutagenizing nucleic acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8201Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation
    • C12N15/8213Targeted insertion of genes into the plant genome by homologous recombination
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8271Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • C12N15/8274Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for herbicide resistance
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8271Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • C12N15/8274Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for herbicide resistance
    • C12N15/8278Sulfonylurea
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/88Lyases (4.)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813Hybridisation assays
    • C12Q1/6827Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813Hybridisation assays
    • C12Q1/6832Enhancement of hybridisation reaction

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

1. Олигонуклеотид для направленного изменения дуплексной последовательности ДНК, содержащей первую последовательность ДНК и вторую последовательность ДНК, которая комплементарна первой последовательности ДНК, где олигонуклеотид содержит домен, который способен к гибридизации с первой последовательностью ДНК, и который содержит, по меньшей мере, одну некомплементарность по отношению к первой последовательности, и где олигонуклеотид содержит, по меньшей мере, один участок, который содержит, по меньшей мере, один модифицированный нуклеотид, обладающий более высокой аффинностью связывания по сравнению с природными A, C, T или G и в котором, по меньшей мере, один модифицированный нуклеотид связывается сильнее с нуклеотидом в противоположном положении первой последовательности ДНК по сравнению с природным нуклеотидом комплементарным нуклеотиду в противоположном положении в первой последовательности ДНК, где модифицированный нуклеотид представляет собой C7-пропинпурин или C5-пропинпиримидин. ! 2. Олигонуклеотид по п.1, в котором пурин представляет собой аденозин или гуанозин и/или пиримидин представляет собой цитозин, урацил или тимидин. ! 3. Олигонуклеотид по любому из предыдущих пунктов, в котором, по меньшей мере, 10% пиримидинов и/или пуринов замещены соответствующими пропинилированными производными, предпочтительно, по меньшей мере, 50%, более предпочтительно, по меньшей мере, 75%, а наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 90%. ! 4. Олигонуклеотид по п.1 или 2, в котором модифицированный нуклеотид представляет собой пиримидин. ! 5. Олигонуклеотид по п.1 или 2, в котором модифицированный нуклеотид представляет собой п

Claims (28)

1. Олигонуклеотид для направленного изменения дуплексной последовательности ДНК, содержащей первую последовательность ДНК и вторую последовательность ДНК, которая комплементарна первой последовательности ДНК, где олигонуклеотид содержит домен, который способен к гибридизации с первой последовательностью ДНК, и который содержит, по меньшей мере, одну некомплементарность по отношению к первой последовательности, и где олигонуклеотид содержит, по меньшей мере, один участок, который содержит, по меньшей мере, один модифицированный нуклеотид, обладающий более высокой аффинностью связывания по сравнению с природными A, C, T или G и в котором, по меньшей мере, один модифицированный нуклеотид связывается сильнее с нуклеотидом в противоположном положении первой последовательности ДНК по сравнению с природным нуклеотидом комплементарным нуклеотиду в противоположном положении в первой последовательности ДНК, где модифицированный нуклеотид представляет собой C7-пропинпурин или C5-пропинпиримидин.
2. Олигонуклеотид по п.1, в котором пурин представляет собой аденозин или гуанозин и/или пиримидин представляет собой цитозин, урацил или тимидин.
3. Олигонуклеотид по любому из предыдущих пунктов, в котором, по меньшей мере, 10% пиримидинов и/или пуринов замещены соответствующими пропинилированными производными, предпочтительно, по меньшей мере, 50%, более предпочтительно, по меньшей мере, 75%, а наиболее предпочтительно, по меньшей мере, 90%.
4. Олигонуклеотид по п.1 или 2, в котором модифицированный нуклеотид представляет собой пиримидин.
5. Олигонуклеотид по п.1 или 2, в котором модифицированный нуклеотид представляет собой пурин.
6. Олигонуклеотид по п.1 или 2, где олигонуклеотид содержит, по меньшей мере, 2 участка, предпочтительно - по меньшей мере, 3 участка, которые независимо друг от друга содержат, по меньшей мере, один, предпочтительно, по меньшей мере, 2, более предпочтительно, по меньшей мере, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 модифицированных нуклеотидов.
7. Олигонуклеотид по п.1 или 2, в котором участки расположены вблизи от или на 3'-конце, 5'-конце и/или охватывают или примыкают к положению, в котором расположена некомплементарность.
8. Олигонуклеотид по п.1 или 2, в котором нуклеотид в положении, в котором расположена некомплементарность, не модицифирован.
9. Олигонуклеотид по п.1 или 2, в котором, по меньшей мере, один модифицированный нуклеотид расположен вблизи от некомплементарности, предпочтительно, в пределах 2, 3,4, 6, 7, 8, 9 и 10 нуклеотидов от некомплементарности.
10. Олигонуклеотид по п.1 или 2, имеющий длину от 10 до 500 нуклеотидов.
11. Олигонуклеотид по п.1 или 2, в котором (модифицированный) участок представляет собой домен.
12. Олигонуклеотид по п.1 или 2.
13. Способ направленного изменения дуплексной акцепторной последовательности ДНК, включающий соединение дуплексной акцепторной последовательности ДНК с олигонуклеотидом-донором, где дуплексная акцепторная последовательность ДНК содержит первую последовательность ДНК и вторую последовательность ДНК, которая комплементарна первой последовательности ДНК и, где олигонуклеотид-донор содержит домен, который содержит, по меньшей мере, одну некомплементарность по отношению к дуплексной акцепторной последовательности ДНК, которая должна быть изменена, предпочтительно, по отношению к первой последовательности ДНК, и где олигонуклеотид содержит участок, который содержит, по меньшей мере, один модифицированный нуклеотид, имеющий более высокую аффинность связывания, по сравнению с природными A, C, T или G и где модифицированный нуклеотид связывается сильнее с нуклеотидом в противоположном положении в первой последовательности ДНК по сравнению с природным нуклеотидом, комплементарным нуклеотиду в противоположном положении в первой последовательности ДНК, в присутствии белков, которые способны к обмену нуклеотида-мишени и где модифицированный олигонуклеотид определен в пп.1-12.
14. Способ по п.13, в котором изменение происходит в клетке, предпочтительно выбранной из группы, состоящей из растительной клетки, клетки грибов, клетки грызунов, клетки приматов, клетки человека или клетки дрожжей.
15. Способ по п.13, в котором белки происходят из клеточного экстракта.
16. Способ по п.15, в котором клеточный экстракт выбран из группы, состоящей из экстракта растительных клеток, экстракта клеток грибов, экстракта клеток грызунов, экстракта клеток приматов, экстракта клеток человека или экстракта клеток дрожжей.
17. Способ по п.13, в котором изменение представляет собой делецию, замену или инсерцию, по меньшей мере, одного нуклеотида.
18. Способ по любому из предыдущих пунктов, в котором клетка представляет собой эукариотическую клетку, растительную клетку, клетку млекопитающего, не являющегося человеком или клетку человека.
19. Способ по п.13, в котором ДНК-мишень получена из грибов, бактерий, растений, млекопитающих или человека.
20. Способ по п.13, в котором дуплексная ДНК получена из геномной ДНК, линеаризованной ДНК, искусственных хромосом млекопитающих, бактериальных искусственных хромосом, искусственных хромосом дрожжей, искусственных хромосом растений, ядерной хромосомной ДНК, хромосомной ДНК органеля, эписомной ДНК.
21. Способ по п.13 для изменения клетки, коррекции мутации путем восстановления дикого типа, индуцирования мутации, инактивации фермента путем разрушения кодирующего участка, модификации биоактивности фермента путем изменения кодирующего участка, модификации белка путем разрушения кодирующего участка.
22. Применение олигонуклеотида, определенного в пп.1-12, для изменения клетки, коррекции мутации путем восстановления дикого типа, индуцирования мутации, инактивации фермента путем разрушения кодирующего участка, модификации биоактивности фермента путем изменения кодирующего участка, модификации белка путем разрушения кодирующего участка, репарации некомплементарности, направленного изменения генетического (растительного) материала, включая мутацию гена, направленную репарацию гена и генный нокаут.
23. Применение олигонуклеотида, определенного в пп.1-12, для усиления направленного изменения дуплексной последовательности ДНК, содержащей первую последовательность ДНК и вторую последовательность ДНК, которая комплементарна первой последовательности ДНК, где олигонуклеотид содержит домен, который способен к гибридизации с первой последовательностью ДНК, где домен содержит, по меньшей мере, одну некомплементароность по отношению к первой последовательности ДНК, и где олигонуклеотид содержит участок, который содержит модифицированные нуклеотиды, где модифицированные нуклеотиды имеют более высокую аффинность связывания по сравнению с природными A, C, T или G и где модифицированные нуклеотиды сильнее связываются с нуклеотидом в противоположном положении в первой последовательности ДНК по сравнению с природным нуклеотидом комплементарным нуклеотиду в противоположном положении в первой последовательности ДНК, где модифицированный нуклеотид представляет собой C7-пропинпурин или C5-пропинпиримидин.
24. Применение олигонуклеотида, определенного в пп.1-12, в способе получения растений, резистентных к гербицидам.
25. Набор, содержащий олигонуклеотид, определенный в пп.1-12.
26. Модифицированный генетический материал, полученный способом по пп.13-21.
27. Клетка, содержащая модифицированный генетический материал по п.26.
28. Растение или часть растения, полученные способом по пп.13-21 или содержащие генетический материал по п.26.
RU2008130093/13A 2005-12-22 2006-12-20 Улучшенный направленный обмен нуклеотидов с пропинил-модифицированными олигонуклеотидами RU2008130093A (ru)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
NLPCT/NL2005/000884 2005-12-22
PCT/NL2005/000884 WO2007073149A1 (en) 2005-12-22 2005-12-22 Alternative nucleotides for improved targeted nucleotide exchange
NLPCT/NL2006/000244 2006-05-09
PCT/NL2006/000244 WO2007073154A1 (en) 2005-12-22 2006-05-09 Alternative nucleotides for improved targeted nucleotide exchange

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2008130093A true RU2008130093A (ru) 2010-01-27

Family

ID=36691461

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2008130093/13A RU2008130093A (ru) 2005-12-22 2006-12-20 Улучшенный направленный обмен нуклеотидов с пропинил-модифицированными олигонуклеотидами
RU2008130089/10A RU2463350C2 (ru) 2005-12-22 2006-12-21 Улучшенная направленная замена нуклеотидов модифицированными олигонуклеотидами lna

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2008130089/10A RU2463350C2 (ru) 2005-12-22 2006-12-21 Улучшенная направленная замена нуклеотидов модифицированными олигонуклеотидами lna

Country Status (15)

Country Link
US (3) US20090307805A1 (ru)
EP (4) EP2333115A1 (ru)
JP (3) JP5295780B2 (ru)
KR (2) KR20080092924A (ru)
CN (3) CN101346474B (ru)
AU (2) AU2006328050B2 (ru)
BR (2) BRPI0621134A2 (ru)
CA (2) CA2633741A1 (ru)
ES (2) ES2393277T3 (ru)
IL (2) IL192164A0 (ru)
MX (2) MX2008008258A (ru)
NZ (2) NZ569503A (ru)
RU (2) RU2008130093A (ru)
WO (4) WO2007073149A1 (ru)
ZA (2) ZA200805091B (ru)

Families Citing this family (39)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2007073149A1 (en) * 2005-12-22 2007-06-28 Keygene N.V. Alternative nucleotides for improved targeted nucleotide exchange
EP2167660A1 (en) * 2007-06-22 2010-03-31 Keygene N.V. Targeted nucleotide exchange with improved modified oligonucleotides
CN103146757B (zh) * 2007-12-21 2016-05-04 凯津公司 通过聚乙二醇的介导将致诱变核碱基引入植物原生质体的改进的诱变方法
JP5731201B2 (ja) 2007-12-21 2015-06-10 キージーン ナムローゼ フェンノートシャップ 植物細胞プロトプラストにおける二本鎖アクセプタdna配列の標的化改変の方法
CN102257147A (zh) * 2008-12-22 2011-11-23 凯津公司 在植物原生质体中使用双链rna提高靶基因改变的效率
EP2813572B1 (en) 2009-12-21 2016-04-27 Keygene N.V. Improved techniques for transfecting protoplasts
CN103502449B (zh) 2010-12-02 2016-08-10 关键基因股份有限公司 用寡核苷酸靶向改变dna
CN103459596B (zh) 2010-12-02 2016-12-14 关键基因股份有限公司 靶向改变dna
EP2702157A1 (en) 2011-04-29 2014-03-05 Keygene N.V. Glyphosate resistance enhancement
UY34128A (es) * 2011-06-15 2013-01-31 Grifols Therapeutics Inc Métodos, composiciones y kits para determinar el virus de la inmunodeficiencia humana (vih)?.
EP2554045A1 (en) 2011-08-04 2013-02-06 Rijk Zwaan Zaadteelt en Zaadhandel B.V. Method for systemically influencing processes in the male meiocyte
DK2581448T3 (en) * 2011-10-13 2015-04-27 Ass Inst De Myologie Tricyclo-DNA phosphorothioate
CN102827251B (zh) * 2012-09-12 2014-06-18 中国人民解放军第四军医大学 一种透膜肽介导的反义抗菌剂及其制备方法和应用
US9622430B2 (en) 2012-09-28 2017-04-18 Nunhems B.V. Solanum lycopersicum plants having non-transgenic alterations in the ACS4 gene
AU2013349743B2 (en) 2012-11-21 2019-11-14 Nunhems B.V. Solanum lycopersicum plants having non-transgenic alterations in the acs2 gene
WO2014118150A1 (en) 2013-01-31 2014-08-07 Nunhems B.V. Solanum lycopersicum plants having pink fruits
US9957515B2 (en) 2013-03-15 2018-05-01 Cibus Us Llc Methods and compositions for targeted gene modification
SI3527068T1 (sl) 2013-03-15 2022-10-28 Cibus Us Llc Metode in sestavki za povečanje učinkovitosti ciljne spremembe gena z oligonukleotidom posredovanega popravka gena
US12331303B2 (en) 2013-03-15 2025-06-17 Cibus Us Llc Methods and compositions for increasing efficiency of targeted gene modification using oligonucleotide-mediated gene repair
JP2013247961A (ja) * 2013-08-21 2013-12-12 Keygene Nv 植物細胞プロトプラストにおける二本鎖アクセプタdna配列の標的化改変の方法
CN106455514A (zh) 2014-03-14 2017-02-22 希博斯美国有限公司 采用寡核苷酸介导的基因修复提高靶向基因修饰的效率的方法和组合物
EP4372091A3 (en) * 2014-12-12 2024-07-31 Tod M. Woolf Compositions and methods for editing nucleic acids in cells utilizing oligonucleotides
WO2016105185A1 (en) 2014-12-22 2016-06-30 Keygene N.V. Plant callus populations
US11136618B2 (en) 2015-05-19 2021-10-05 The University Of Chicago Methods and compositions for determining pH
WO2017112941A1 (en) * 2015-12-23 2017-06-29 The Regents Of The University Of California Nano-sensors for nucleic acid detection and discrimination
CA3014036A1 (en) * 2016-02-09 2017-08-17 Cibus Us Llc Methods and compositions for increasing efficiency of targeted gene modification using oligonucleotide-mediated gene repair
EP3257944A1 (en) 2016-06-14 2017-12-20 Nunhems B.V. Tomato plants having alterations in the dmr6 gene
WO2018115389A1 (en) 2016-12-22 2018-06-28 Keygene N.V. Methods of targeted genetic alteration in plant cells
CN111819285B (zh) 2018-01-09 2024-08-09 希博斯美国有限公司 防碎基因和突变
EA202092382A1 (ru) 2018-04-04 2021-02-02 САЙБАС ЮЭс ЛЛС Гены fad2 и мутации
NL2020823B1 (en) 2018-04-25 2019-11-05 Univ Delft Tech NAD+ dependent 7ß-hydroxysteroid dehydrogenase
EP3363751B1 (de) 2018-06-05 2020-04-22 B&R Industrial Automation GmbH Verfahren zur übergabe einer transporteinheit eines langstatorlinearmotors an einer übergabeposition
JP7396770B2 (ja) 2018-07-12 2023-12-12 キージーン ナムローゼ フェンノートシャップ 植物細胞におけるゲノム編集のためのv型crispr/ヌクレアーゼシステム
EP3874048A1 (en) 2018-11-01 2021-09-08 Keygene N.V. Dual guide rna for crispr/cas genome editing in plants cells
CN114262735B (zh) * 2021-12-15 2025-09-16 成都齐碳科技有限公司 用于表征多核苷酸的衔接体及其用途
AU2023227536A1 (en) * 2022-03-01 2024-09-26 AUM LifeTech, Inc. Targeted control of weeds and invasive plants by delivery of fana antisense oligonucleotides
EP4502157A4 (en) * 2022-03-30 2025-06-18 National Institute Of Advanced Industrial Science and Technology Single-stranded polynucleotide and use thereof in genome editing
JP7660960B2 (ja) * 2023-04-26 2025-04-14 Eurus Therapeutics株式会社 標的ヌクレオチド配列の改変のための非天然型ポリヌクレオチド
WO2025110249A1 (ja) * 2023-11-24 2025-05-30 国立大学法人 広島大学 塩基配列編集用組成物およびそれを使用する塩基配列編集方法

Family Cites Families (29)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US645249A (en) * 1899-06-10 1900-03-13 Us Fire And Police Telegraph Company Bell-striker.
US5849482A (en) * 1988-09-28 1998-12-15 Epoch Pharmaceuticals, Inc. Crosslinking oligonucleotides
US5539082A (en) 1993-04-26 1996-07-23 Nielsen; Peter E. Peptide nucleic acids
DK51092D0 (da) 1991-05-24 1992-04-15 Ole Buchardt Oligonucleotid-analoge betegnet pna, monomere synthoner og fremgangsmaade til fremstilling deraf samt anvendelser deraf
MX9207334A (es) 1991-12-18 1993-08-01 Glaxo Inc Acidos nucleicos peptidicos y formulacion farma- ceutica que los contiene
US5731181A (en) 1996-06-17 1998-03-24 Thomas Jefferson University Chimeric mutational vectors having non-natural nucleotides
WO1998022489A1 (en) 1996-11-18 1998-05-28 Takeshi Imanishi Novel nucleotide analogues
JP3756313B2 (ja) 1997-03-07 2006-03-15 武 今西 新規ビシクロヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体
WO1999013108A1 (en) * 1997-09-10 1999-03-18 University Of Maryland, Baltimore Method of amplifying dna and rna mismatch cleavage products
ATE293123T1 (de) 1997-09-12 2005-04-15 Exiqon As Bi- und tri-zyklische - nukleosid, nukleotid und oligonukleotid-analoga
US6010907A (en) 1998-05-12 2000-01-04 Kimeragen, Inc. Eukaryotic use of non-chimeric mutational vectors
ES2268903T3 (es) * 1998-10-26 2007-03-16 Avi Biopharma, Inc. Agente antisentido de p53 y procedimiento.
JP2002540118A (ja) 1999-03-18 2002-11-26 エクシコン エ/エス キシロ−lna類似体
ATE356824T1 (de) 1999-05-04 2007-04-15 Santaris Pharma As L-ribo-lna analoge
WO2001049687A2 (en) * 1999-12-30 2001-07-12 K. U. Leuven Research & Development Cyclohexene nucleic acids
US6936467B2 (en) 2000-03-27 2005-08-30 University Of Delaware Targeted chromosomal genomic alterations with modified single stranded oligonucleotides
NZ521698A (en) * 2000-03-27 2004-08-27 Univ Delaware Targeted chromosomal genomic alterations with modified single stranded oligonucleotides
EP1152058A1 (en) * 2000-05-03 2001-11-07 Institut Curie Methods and compositions for effecting homologous recombination
AU2001263271A1 (en) 2000-05-17 2001-11-26 University Of Delaware Plant gene targeting using oligonucleotides
CN1501976A (zh) * 2000-07-19 2004-06-02 ����˹�ж�-����˹˹����ҩƷ��˾ 用于联合治疗的crf2配体
EP1364008A2 (en) 2000-07-27 2003-11-26 University Of Delaware Methods for enhancing targeted gene alteration using oligonucleotides
US20020119570A1 (en) * 2000-09-25 2002-08-29 Kyonggeun Yoon Targeted gene correction by single-stranded oligodeoxynucleotides
US20050148530A1 (en) * 2002-02-20 2005-07-07 Sirna Therapeutics, Inc. RNA interference mediated inhibition of vascular endothelial growth factor and vascular endothelial growth factor receptor gene expression using short interfering nucleic acid (siNA)
EP1446503A2 (en) 2001-09-27 2004-08-18 University Of Delaware Composition and methods for enhancing oligonucleotide-directed nucleic acid sequence alteration
DK2264172T3 (da) * 2002-04-05 2017-11-27 Roche Innovation Ct Copenhagen As Oligomerforbindelser til modulering af HIF-1á-ekspression
EP1543155A4 (en) * 2002-07-17 2006-08-16 Us Genomics Inc METHODS AND COMPOSITIONS FOR ANALYZING POLYMERS USING CHIMERIC MARKERS
EP1633767B1 (en) * 2003-06-02 2018-11-21 University of Massachusetts Methods and compositions for controlling efficacy of rna silencing
US7368559B2 (en) * 2003-11-14 2008-05-06 Diana Beardsley FcγRIIA-specific nucleic acid interference
WO2007073149A1 (en) * 2005-12-22 2007-06-28 Keygene N.V. Alternative nucleotides for improved targeted nucleotide exchange

Also Published As

Publication number Publication date
EP2333115A1 (en) 2011-06-15
CA2633640A1 (en) 2007-06-28
EP2002001A1 (en) 2008-12-17
AU2006328050A1 (en) 2007-06-28
JP2009520495A (ja) 2009-05-28
JP2009520498A (ja) 2009-05-28
US20090307805A1 (en) 2009-12-10
AU2006328050B2 (en) 2012-12-06
CN101346465B (zh) 2013-06-12
MX2008008261A (es) 2008-09-24
NZ569503A (en) 2011-12-22
EP1974053A1 (en) 2008-10-01
BRPI0621133A2 (pt) 2011-11-29
ES2393277T3 (es) 2012-12-20
EP1963505A1 (en) 2008-09-03
CN101346466A (zh) 2009-01-14
JP5340742B2 (ja) 2013-11-13
JP5405121B2 (ja) 2014-02-05
WO2007073170A1 (en) 2007-06-28
CN101346465A (zh) 2009-01-14
ZA200805141B (en) 2009-09-30
ZA200805091B (en) 2009-06-24
EP2002001B1 (en) 2013-03-13
IL192164A0 (en) 2008-12-29
JP2009520499A (ja) 2009-05-28
CN101346474B (zh) 2013-06-26
WO2007073166A1 (en) 2007-06-28
CN101346466B (zh) 2013-06-12
WO2007073154A1 (en) 2007-06-28
BRPI0621134A2 (pt) 2011-11-29
KR20080092924A (ko) 2008-10-16
NZ569502A (en) 2011-12-22
US20100186124A1 (en) 2010-07-22
MX2008008258A (es) 2008-09-24
US20100055780A1 (en) 2010-03-04
KR20080083179A (ko) 2008-09-16
AU2006328054B2 (en) 2012-12-13
RU2008130089A (ru) 2010-01-27
AU2006328054A1 (en) 2007-06-28
JP5295780B2 (ja) 2013-09-18
EP1963505B1 (en) 2012-08-22
CN101346474A (zh) 2009-01-14
ES2407679T3 (es) 2013-06-13
CA2633741A1 (en) 2007-06-28
RU2463350C2 (ru) 2012-10-10
WO2007073149A1 (en) 2007-06-28
IL192165A0 (en) 2008-12-29

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2008130093A (ru) Улучшенный направленный обмен нуклеотидов с пропинил-модифицированными олигонуклеотидами
RU2010101882A (ru) Направленная нуклеотидная замена при применении улучшенных модифицированных олигонуклеотидов
CAMACHO B chromosomes
Osakabe et al. Genome editing with engineered nucleases in plants
EA200101186A1 (ru) Регуляция экспрессии вирусных генов
Eickbush et al. Finely orchestrated movements: evolution of the ribosomal RNA genes
WO2019103442A3 (ko) CRISPR/Cpf1 시스템을 이용한 유전체 편집용 조성물 및 이의 용도
Louis et al. Chromosome ends: different sequences may provide conserved functions
WO2004037977A3 (en) Use of chimeric nucleases to stimulate gene targeting
NO20031897L (no) Fremgangsmåte for modifisering av eukaryotiske celler
Kanaar et al. Recombination and joining: different means to the same ends
Bloomfield Atypical ploidy cycles, Spo11, and the evolution of meiosis
Jang et al. CRISPR/Cas-mediated genome editing for crop improvement: current applications and future prospects
Liang et al. Off-target challenge for base editor-mediated genome editing
Gao Precision plant breeding using genome editing technologies
RU2010130453A (ru) Улучшенный способ мутагенеза с использованием полиэтиленгликоль-опосредованного введения мутагенных нуклеиновых оснований в растительные протопласты
Yousafzai et al. The molecular features of chromosome pairing at meiosis: the polyploid challenge using wheat as a reference
Mushtaq et al. CRISPR technologies for plant biotechnology innovation
Chovatiya et al. Revolutionizing agriculture: harnessing CRISPR/cas9 for crop enhancement
Ramírez et al. Genome organization of a new double-stranded RNA LA helper virus from wine Torulaspora delbrueckii killer yeast as compared with its Saccharomyces counterparts
Marzec et al. Targeted base editing systems are available for plants
Ma et al. Application of CRISPR/Cas9 in Wheat Genetic Improvement
Otsuka et al. The role of deoxycytidyl transferase activity of yeast Rev1 protein in the bypass of abasic sites
Borisov et al. B chromosomes
Catalán et al. Advances on genomics, biology, ecology and evolution of Brachypodium, a bridging model grass system for cereals and biofuel grasses

Legal Events

Date Code Title Description
FA93 Acknowledgement of application withdrawn (no request for examination)

Effective date: 20100315

FZ9A Application not withdrawn (correction of the notice of withdrawal)

Effective date: 20100323

FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20110601