RU2008120600A - СПОСОБ И УСТРОЙСТВО ДЛЯ АНАЛИЗА IN VITRO mPHK ИЗ ГЕНОВ, УЧАСТВУЮЩИХ В РАЗВИТИИ ГЕМАТОЛОГИЧЕСКИХ НЕОПЛАЗИЙ - Google Patents
СПОСОБ И УСТРОЙСТВО ДЛЯ АНАЛИЗА IN VITRO mPHK ИЗ ГЕНОВ, УЧАСТВУЮЩИХ В РАЗВИТИИ ГЕМАТОЛОГИЧЕСКИХ НЕОПЛАЗИЙ Download PDFInfo
- Publication number
- RU2008120600A RU2008120600A RU2008120600/13A RU2008120600A RU2008120600A RU 2008120600 A RU2008120600 A RU 2008120600A RU 2008120600/13 A RU2008120600/13 A RU 2008120600/13A RU 2008120600 A RU2008120600 A RU 2008120600A RU 2008120600 A RU2008120600 A RU 2008120600A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- vitro
- oligonucleotides
- chronic lymphocytic
- lymphocytic leukemia
- development
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/112—Disease subtyping, staging or classification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/118—Prognosis of disease development
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Oncology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Abstract
1. Композиция, которая содержит, по меньшей мере, один олигонуклеотид из группы, состоящей из: ! SG1, SG2, SG3, SG4, SG5, SG6, SG7, SG8, SG9, SG10, SG11, SG12, SG13, SG14, SG15, SG16, SG17, SG18, SG19, SG20, SG21, SG22, SG23, SG24, SG25, SG26, SG27, SG28, SG29, SG30, SG31, SG32, SG33, SG34, SG35, SG36, SG37, SG38, SG39, SG40, SG41, SG42, SG43, SG44, SG45, SG46, SG47, SG48, SG49, SG50, SG51, SG52, SG53, SG54, SG55, SG56, SG57, SG58, SG59, SG60, SG61, SG62, SG63, SG64, SG65, SG66, SG67, SG68, SG69, SG70, SG71, SG72, SG73, SG74, SG75, SG76, SG77, SG78, SG79, SG80, SG81, SG82, SG83, SG84, SG85, SG86, SG87, SG88, SG89, SG90, SG91, SG92, SG93, SG94, SG95, SG96, SG97, SG98, SG99, SG100, SG101, SG102, SG103, SG104, SG105, SG106, SG107, SG108, SG109, SG110, SG111, SG112, SG113, SG114, SG115, SG116, SG117, SG118, SG119, SG120, SG121, SG122, SG123, SG124, SG125, SG126, SG127, SG128, SG129, SG130, SG131, SG132, SG133, SG134, SG135, SG136, SG137, SG138, SG139, SG140, SG141, SG142, SG143, SG144, SG145, SG146, SG147, SG148, SG149, SG150, SG151, SG152, SG153, SG154, SG155, SG156, SG157, SG158, SG159, SG160, SG161, SG162, SG163, SG164, SG165, SG166, SG167, SG168, SG169, SG170, SG171, SG172, SG173, SG174, SG175, SG176, SG177, SG178, SG179, SG180, SG181, SG182, SG183, SG184, SG185, SG186, SG187, SG188, SG189, SG190, SG191, SG192, SG193, SG194, SG195, SG196, SG197, SG198, SG199, SG200, SG201, SG202, SG203, SG204, SG205, SG206, SG207, SG208, SG209, SG210, SG211, SG212, SG213, SG214, SG215, SG216, SG217, SG218, SG219, SG220, SG221, SG222, SG223, SG224, SG225, SG226, SG227, SG228, SG229, SG230, SG231, SG232, SG233, SG234, SG235, SG236, SG237, SG238, SG239, SG240, SG241, SG242, SG243, SG244, SG245, SG246, SG247, SG248, SG249, SG250, SG251, SG252, SG253, SG254, SG255, SG256, SG257, SG258, SG259, SG260, SG261, SG262, SG263, SG264, SG265, SG266, SG267, SG268, SG269, SG270, SG271, SG272, SG273, SG274, SG275, SG276, SG277, SG278, SG279, SG280, SG281, SG282, SG283, SG284, SG285, SG286, SG287, SG288, SG289, SG290, SG291, SG292, SG293, SG294, SG295, SG296, SG297, SG298, SG299, SG300, SG301, SG302, SG303, SG304, SG305, SG306, SG307, SG308, SG309, SG310, SG311, SG312, SG313, SG314, SG315, SG316, SG317, SG318, SG319, SG320, SG321, SG322, SG323, SG324, SG325, SG326, SG327, SG328, SG329, SG330, SG331, SG332, SG333, SG334, SG335, SG336, SG337, SG338, SG339, SG340, SG341, SG342, SG343, SG344, SG345, SG346, SG347, SG348, SG349, SG350, SG351, SG352, SG353, SG354, SG355, SG356, SG357, SG358, SG359, SG360, SG361, SG362, SG363, SG364, SG365, SG366, SG367, SG368, SG369, SG370, SG371, SG372, SG373, SG374, SG375, SG376, SG377, SG378, SG379, SG380, SG381, SG382, SG383, SG384, SG385, SG386, SG387, SG388, SG389, SG390, SG391, SG392, SG393, SG394, SG395, SG396, SG397, SG398, SG399, SG400, SG401, SG402, SG403, SG404, SG405, SG406, SG407, SG408, SG409, SG410, SG411, SG412, SG413, SG414, SG415, SG416, SG417, SG418, SG419, SG4
Claims (61)
1. Композиция, которая содержит, по меньшей мере, один олигонуклеотид из группы, состоящей из:
SG1, SG2, SG3, SG4, SG5, SG6, SG7, SG8, SG9, SG10, SG11, SG12, SG13, SG14, SG15, SG16, SG17, SG18, SG19, SG20, SG21, SG22, SG23, SG24, SG25, SG26, SG27, SG28, SG29, SG30, SG31, SG32, SG33, SG34, SG35, SG36, SG37, SG38, SG39, SG40, SG41, SG42, SG43, SG44, SG45, SG46, SG47, SG48, SG49, SG50, SG51, SG52, SG53, SG54, SG55, SG56, SG57, SG58, SG59, SG60, SG61, SG62, SG63, SG64, SG65, SG66, SG67, SG68, SG69, SG70, SG71, SG72, SG73, SG74, SG75, SG76, SG77, SG78, SG79, SG80, SG81, SG82, SG83, SG84, SG85, SG86, SG87, SG88, SG89, SG90, SG91, SG92, SG93, SG94, SG95, SG96, SG97, SG98, SG99, SG100, SG101, SG102, SG103, SG104, SG105, SG106, SG107, SG108, SG109, SG110, SG111, SG112, SG113, SG114, SG115, SG116, SG117, SG118, SG119, SG120, SG121, SG122, SG123, SG124, SG125, SG126, SG127, SG128, SG129, SG130, SG131, SG132, SG133, SG134, SG135, SG136, SG137, SG138, SG139, SG140, SG141, SG142, SG143, SG144, SG145, SG146, SG147, SG148, SG149, SG150, SG151, SG152, SG153, SG154, SG155, SG156, SG157, SG158, SG159, SG160, SG161, SG162, SG163, SG164, SG165, SG166, SG167, SG168, SG169, SG170, SG171, SG172, SG173, SG174, SG175, SG176, SG177, SG178, SG179, SG180, SG181, SG182, SG183, SG184, SG185, SG186, SG187, SG188, SG189, SG190, SG191, SG192, SG193, SG194, SG195, SG196, SG197, SG198, SG199, SG200, SG201, SG202, SG203, SG204, SG205, SG206, SG207, SG208, SG209, SG210, SG211, SG212, SG213, SG214, SG215, SG216, SG217, SG218, SG219, SG220, SG221, SG222, SG223, SG224, SG225, SG226, SG227, SG228, SG229, SG230, SG231, SG232, SG233, SG234, SG235, SG236, SG237, SG238, SG239, SG240, SG241, SG242, SG243, SG244, SG245, SG246, SG247, SG248, SG249, SG250, SG251, SG252, SG253, SG254, SG255, SG256, SG257, SG258, SG259, SG260, SG261, SG262, SG263, SG264, SG265, SG266, SG267, SG268, SG269, SG270, SG271, SG272, SG273, SG274, SG275, SG276, SG277, SG278, SG279, SG280, SG281, SG282, SG283, SG284, SG285, SG286, SG287, SG288, SG289, SG290, SG291, SG292, SG293, SG294, SG295, SG296, SG297, SG298, SG299, SG300, SG301, SG302, SG303, SG304, SG305, SG306, SG307, SG308, SG309, SG310, SG311, SG312, SG313, SG314, SG315, SG316, SG317, SG318, SG319, SG320, SG321, SG322, SG323, SG324, SG325, SG326, SG327, SG328, SG329, SG330, SG331, SG332, SG333, SG334, SG335, SG336, SG337, SG338, SG339, SG340, SG341, SG342, SG343, SG344, SG345, SG346, SG347, SG348, SG349, SG350, SG351, SG352, SG353, SG354, SG355, SG356, SG357, SG358, SG359, SG360, SG361, SG362, SG363, SG364, SG365, SG366, SG367, SG368, SG369, SG370, SG371, SG372, SG373, SG374, SG375, SG376, SG377, SG378, SG379, SG380, SG381, SG382, SG383, SG384, SG385, SG386, SG387, SG388, SG389, SG390, SG391, SG392, SG393, SG394, SG395, SG396, SG397, SG398, SG399, SG400, SG401, SG402, SG403, SG404, SG405, SG406, SG407, SG408, SG409, SG410, SG411, SG412, SG413, SG414, SG415, SG416, SG417, SG418, SG419, SG420, SG421, SG422, SG423, SG424, SG425, SG426, SG427, SG428, SG429, SG430, SG431, SG432, SG433, SG434, SG435, SG436, SG437, SG438, SG439, SG440, SG441, SG442, SG443, SG444, SG445, SG446, SG447, SG448, SG449, SG450, SG451, SG452, SG453, SG454, SG455, SG456, SG457, SG458, SG459, SG460, SG461, SG462, SG465, SG468, SG469, SG470, SG471, SG472, SG473, SG474, SG475, SG476, SG477, SG478, SG479, SG480, SG481, SG482, SG483, SG484, SG485, SG486, SG487, SG488, SG489, SG490, SG491, SG492, SG493, SG494, SG495, SG496, SG497, SG498, SG499, SG500, SG501, SG502, SG503, SG504, SG505, SG506, SG507, SG508, SG509, SG510, SG511, SG512, SG513, SG514, SG515, SG516, SG517, SG518, SG519, SG520, SG521, SG522, SG523, SG524, SG525, SG526, SG527, SG428, SG529, SG530, SG531, SG532, SG533, SG534, SG535, SG536, SG537, SG538, SG539, SG540, SG541, SG542, SG543, SG544, SG545, SG546, SG547, SG548, SG549, SG550, SG551, SG552, SG553, SG554, SG555, SG556, SG557, SG558, SG559, SG560, SG561, SG562, SG563,
или их комбинации для использования в качестве зонда при определении уровня экспрессии гена, который обладает последовательностью, комплементарной указанному олигонуклеотиду, путем оценки уровня мРНК, соответствующей этому гену, для применения при диагностике in vitro неоплазий, исходящих из гематопоэтических клеток, и/или прогноза in vitro развития указанного заболевания.
2. Композиция по п.1, которая содержит, по меньшей мере, олигонуклеотиды SG117, SG428, SG459, SG507, SG508.
3. Композиция по п.2, которая дополнительно содержит, по меньшей мере, олигонуклеотиды SG461 и SG493.
4. Композиция по п.2, которая дополнительно содержит, по меньшей мере, олигонуклеотид SG237.
5. Композиция по п.4, которая дополнительно содержит, по меньшей мере, один олигонуклеотид, выбранный из группы, состоящей из:
SG2, SG4, SG8, SG10, SG13, SG15, SG16, SG19, SG20, SG23, SG26, SG28, SG31, SG34, SG36, SG39, SG48, SG58, SG60, SG65, SG76, SG77, SG84, SG89, SG94, SG9, SG97, SG99, SG102, SG106, SG107, SG463, SG115, SG116, SG120, SG129, SG134, SG135, SG138, SG139, SG141, SG145, SG158, SG161, SG163, SG176, SG178, SG185, SG207, SG208, SG210, SG217, SG227, SG231, SG237, SG264, SG272, SG277, SG281, SG283, SG286, SG294, SG298, SG299, SG307, SG308, SG319, SG328, SG330, SG333, SG336, SG342, SG344, SG345, SG347, SG361, SG384, SG389, SG395, SG404, SG407, SG416, SG423, SG430, SG432, SG434, SG444, SG446, SG453, SG458, SG464, SG465, SG466, SG467, SG471, SG473, SG474, SG475, SG481, SG485, SG487, SG491, SG498, SG511, SG517, SG518, SG522, SG526, SG530, SG533, SG538, SG541, SG554, SG558, SG561 или их комбинации.
6. Композиция по любому из пп.2-5 для применения в диагностике in vitro хронического лимфолейкоза.
7. Композиция по п.1, которая содержит, по меньшей мере, олигонуклеотиды SG26, SG216, SG366.
8. Композиция по п.7, которая дополнительно содержит, по меньшей мере, один олигонуклеотид, выбранный из группы SG31, SG177, SG194, SG195, SG197, SG213, SG293, SG301, SG309, SG333, SG343, SG357, SG439, SG452, SG555, SG556.
9. Композиция по п.7 или 8, предназначенная для применения при прогнозе in vitro будущего развития заболевания у пациента, страдающего хроническим лимфолейкозом.
10. Композиция по п.1, которая содержит полный набор олигонуклеотидов из группы, состоящей из:
SG1, SG2, SG3, SG4, SG5, SG6, SG7, SG8, SG9, SG10, SG11, SG12, SG13, SG14, SG15, SG16, SG17, SG18, SG19, SG20, SG21, SG22, SG23, SG24, SG25, SG26, SG27, SG28, SG29, SG30, SG31, SG32, SG33, SG34, SG35, SG36, SG37, SG38, SG39, SG40, SG41, SG42, SG43, SG44, SG45, SG46, SG47, SG48, SG49, SG50, SG51, SG52, SG53, SG54, SG55, SG56, SG57, SG58, SG59, SG60, SG61, SG62, SG63, SG64, SG65, SG66, SG67, SG68, SG69, SG70, SG71, SG72, SG73, SG74, SG75, SG76, SG77, SG78, SG79, SG80, SG81, SG82, SG83, SG84, SG85, SG86, SG87, SG88, SG89, SG90, SG91, SG92, SG93, SG94, SG95, SG96, SG97, SG98, SG99, SG100, SG101, SG102, SG103, SG104, SG105, SG106, SG107, SG108, SG109, SG110, SG111, SG112, SG113, SG114, SG115, SG116, SG117, SG118, SG119, SG120, SG121, SG122, SG123, SG124, SG125, SG126, SG127, SG128, SG129, SG130, SG131, SG132, SG133, SG134, SG135, SG136, SG137, SG138, SG139, SG140, SG141, SG142, SG143, SG144, SG145, SG146, SG147, SG148, SG149, SG150, SG151, SG152, SG153, SG154, SG155, SG156, SG157, SG158, SG159, SG160, SG161, SG162, SG163, SG164, SG165, SG166, SG167, SG168, SG169, SG170, SG171, SG172, SG173, SG174, SG175, SG176, SG177, SG178, SG179, SG180, SG181, SG182, SG183, SG184, SG185, SG186, SG187, SG188, SG189, SG190, SG191, SG192, SG193, SG194, SG195, SG196, SG197, SG198, SG199, SG200, SG201, SG202, SG203, SG204, SG205, SG206, SG207, SG208, SG209, SG210, SG211, SG212, SG213, SG214, SG215, SG216, SG217, SG218, SG219, SG220, SG221, SG222, SG223, SG224, SG225, SG226, SG227, SG228, SG229, SG230, SG231, SG232, SG233, SG234, SG235, SG236, SG237, SG238, SG239, SG240, SG241, SG242, SG243, SG244, SG245, SG246, SG247, SG248, SG249, SG250, SG251, SG252, SG253, SG254, SG255, SG256, SG257, SG258, SG259, SG260, SG261, SG262, SG263, SG264, SG265, SG266, SG267, SG268, SG269, SG270, SG271, SG272, SG273, SG274, SG275, SG276, SG277, SG278, SG279, SG280, SG281, SG282, SG283, SG284, SG285, SG286, SG287, SG288, SG289, SG290, SG291, SG292, SG293, SG294, SG295, SG296, SG297, SG298, SG299, SG300, SG301, SG302, SG303, SG304, SG305, SG306, SG307, SG308, SG309, SG310, SG311, SG312, SG313, SG314, SG315, SG316, SG317, SG318, SG319, SG320, SG321, SG322, SG323, SG324, SG325, SG326, SG327, SG328, SG329, SG330, SG331, SG332, SG333, SG334, SG335, SG336, SG337, SG338, SG339, SG340, SG341, SG342, SG343, SG344, SG345, SG346, SG347, SG348, SG349, SG350, SG351, SG352, SG353, SG354, SG355, SG356, SG357, SG358, SG359, SG360, SG361, SG362, SG363, SG364, SG365, SG366, SG367, SG368, SG369, SG370, SG371, SG372, SG373, SG374, SG375, SG376, SG377, SG378, SG379, SG380, SG381, SG382, SG383, SG384, SG385, SG386, SG387, SG388, SG389, SG390, SG391, SG392, SG393, SG394, SG395, SG396, SG397, SG398, SG399, SG400, SG401, SG402, SG403, SG404, SG405, SG406, SG407, SG408, SG409, SG410, SG411, SG412, SG413, SG414, SG415, SG416, SG417, SG418, SG419, SG420, SG421, SG422, SG423, SG424, SG425, SG426, SG427, SG428, SG429, SG430, SG431, SG432, SG433, SG434, SG435, SG436, SG437, SG438, SG439, SG440, SG441, SG442, SG443, SG444, SG445, SG446, SG447, SG448, SG449, SG450, SG451, SG452, SG453, SG454, SG455, SG456, SG457, SG458, SG459, SG460, SG461, SG462, SG465, SG468, SG469, SG470, SG471, SG472, SG473, SG474, SG475, SG476, SG477, SG478, SG479, SG480, SG481, SG482, SG483, SG484, SG485, SG486, SG487, SG488, SG489, SG490, SG491, SG492, SG493, SG494, SG495, SG496, SG497, SG498, SG499, SG500, SG501, SG502, SG503, SG504, SG505, SG506, SG507, SG508, SG509, SG510, SG511, SG512, SG513, SG514, SG515, SG516, SG517, SG518, SG519, SG520, SG521, SG522, SG523, SG524, SG525, SG526, SG527, SG428, SG529, SG530, SG531, SG532, SG533, SG534, SG535, SG536, SG537, SG538, SG539, SG540, SG541, SG542, SG543, SG544, SG545, SG546, SG547, SG548, SG549, SG550, SG551, SG552, SG553, SG554, SG555, SG556, SG557, SG558, SG559, SG560, SG561, SG562, SG563.
11. Композиция по любому из пп.1-5, 7, 8 и 10, отличающаяся тем, что она дополнительно содержит, по меньшей мере, один олигонуклеотид, выбранный из группы, состоящей из SG463, SG464, SG466, SG467, SSPC1, SSPC2, SSPC3, SSPC4, SSPC5, SSPC6, SSPC7, SCN1, SCN2, SCN3, SCN5, SCN6, SCN7, SCN8, SCN10, SCN11, SCN12, SCN13, SC1, SC2, SC3, SC4, SC5, SC6 и SC7.
12. Композиция по п.1, которая содержит все олигонуклеотиды из группы, состоящей из SG463, SG464, SG466, SG467, SSPC1, SSPC2, SSPC3, SSPC4, SSPC5, SSPC6, SSPC7, SCN1, SCN2, SCN3, SCN5, SCN6, SCN7, SCN8, SCN10, SCN11, SCN12, SCN13, SC1, SC2, SC3, SC4, SC5, SC6 и SC7.
13. Композиция по любому из пп.1-5, 7, 8 и 10, в которой олигонуклеотиды расположены на твердой подложке.
14. Композиция по п.13, в которой олигонуклеотиды расположены упорядоченным образом на твердой подложке, которая представляет собой стекло, аналогичное предметному стеклу, с которым олигонуклеотиды связаны ковалентными связями, образуя микрочип.
15. Композиция в форме микрочипа по п.14, которая содержит полный набор олигонуклеотидов из группы, состоящей из SG1, SG2, SG3, SG4, SG5, SG6, SG7, SG8, SG9, SG10, SG11, SG12, SG13, SG14, SG15, SG16, SG17, SG18, SG19, SG20, SG21, SG22, SG23, SG24, SG25, SG26, SG27, SG28, SG29, SG30, SG31, SG32, SG33, SG34, SG35, SG36, SG37, SG38, SG39, SG40, SG41, SG42, SG43, SG44, SG45, SG46, SG47, SG48, SG49, SG50, SG51, SG52, SG53, SG54, SG55, SG56, SG57, SG58, SG59, SG60, SG61, SG62, SG63, SG64, SG65, SG66, SG67, SG68, SG69, SG70, SG71, SG72, SG73, SG74, SG75, SG76, SG77, SG78, SG79, SG80, SG81, SG82, SG83, SG84, SG85, SG86, SG87, SG88, SG89, SG90, SG91, SG92, SG93, SG94, SG95, SG96, SG97, SG98, SG99, SG100, SG101, SG102, SG103, SG104, SG105, SG106, SG107, SG108, SG109, SG110, SG111, SG112, SG113, SG114, SG115, SG116, SG117, SG118, SG119, SG120, SG121, SG122, SG123, SG124, SG125, SG126, SG127, SG128, SG129, SG130, SG131, SG132, SG133, SG134, SG135, SG136, SG137, SG138, SG139, SG140, SG141, SG142, SG143, SG144, SG145, SG146, SG147, SG148, SG149, SG150, SG151, SG152, SG153, SG154, SG155, SG156, SG157, SG158, SG159, SG160, SG161, SG162, SG163, SG164, SG165, SG166, SG167, SG168, SG169, SG170, SG171, SG172, SG173, SG174, SG175, SG176, SG177, SG178, SG179, SG180, SG181, SG182, SG183, SG184, SG185, SG186, SG187, SG188, SG189, SG190, SG191, SG192, SG193, SG194, SG195, SG196, SG197, SG198, SG199, SG200, SG201, SG202, SG203, SG204, SG205, SG206, SG207, SG208, SG209, SG210, SG211, SG212, SG213, SG214, SG215, SG216, SG217, SG218, SG219, SG220, SG221, SG222, SG223, SG224, SG225, SG226, SG227, SG228, SG229, SG230, SG231, SG232, SG233, SG234, SG235, SG236, SG237, SG238, SG239, SG240, SG241, SG242, SG243, SG244, SG245, SG246, SG247, SG248, SG249, SG250, SG251, SG252, SG253, SG254, SG255, SG256, SG257, SG258, SG259, SG260, SG261, SG262, SG263, SG264, SG265, SG266, SG267, SG268, SG269, SG270, SG271, SG272, SG273, SG274, SG275, SG276, SG277, SG278, SG279, SG280, SG281, SG282, SG283, SG284, SG285, SG286, SG287, SG288, SG289, SG290, SG291, SG292, SG293, SG294, SG295, SG296, SG297, SG298, SG299, SG300, SG301, SG302, SG303, SG304, SG305, SG306, SG307, SG308, SG309, SG310, SG311, SG312, SG313, SG314, SG315, SG316, SG317, SG318, SG319, SG320, SG321, SG322, SG323, SG324, SG325, SG326, SG327, SG328, SG329, SG330, SG331, SG332, SG333, SG334, SG335, SG336, SG337, SG338, SG339, SG340, SG341, SG342, SG343, SG344, SG345, SG346, SG347, SG348, SG349, SG350, SG351, SG352, SG353, SG354, SG355, SG356, SG357, SG358, SG359, SG360, SG361, SG362, SG363, SG364, SG365, SG366, SG367, SG368, SG369, SG370, SG371, SG372, SG373, SG374, SG375, SG376, SG377, SG378, SG379, SG380, SG381, SG382, SG383, SG384, SG385, SG386, SG387, SG388, SG389, SG390, SG391, SG392, SG393, SG394, SG395, SG396, SG397, SG398, SG399, SG400, SG401, SG402, SG403, SG404, SG405, SG406, SG407, SG408, SG409, SG410, SG411, SG412, SG413, SG414, SG415, SG416, SG417, SG418, SG419, SG420, SG421, SG422, SG423, SG424, SG425, SG426, SG427, SG428, SG429, SG430, SG431, SG432, SG433, SG434, SG435, SG436, SG437, SG438, SG439, SG440, SG441, SG442, SG443, SG444, SG445, SG446, SG447, SG448, SG449, SG450, SG451, SG452, SG453, SG454, SG455, SG456, SG457, SG458, SG459, SG460, SG461, SG462, SG465, SG468, SG469, SG470, SG471, SG472, SG473, SG474, SG475, SG476, SG477, SG478, SG479, SG480, SG481, SG482, SG483, SG484, SG485, SG486, SG487, SG488, SG489, SG490, SG491, SG492, SG493, SG494, SG495, SG496, SG497, SG498, SG499, SG500, SG501, SG502, SG503, SG504, SG505, SG506, SG507, SG508, SG509, SG510, SG511, SG512, SG513, SG514, SG515, SG516, SG517, SG518, SG519, SG520, SG521, SG522, SG523, SG524, SG525, SG526, SG527, SG428, SG529, SG530, SG531, SG532, SG533, SG534, SG535, SG536, SG537, SG538, SG539, SG540, SG541, SG542, SG543, SG544, SG545, SG546, SG547, SG548, SG549, SG550, SG551, SG552, SG553, SG554, SG555, SG556, SG557, SG558, SG559, SG560, SG561, SG562, SG563.
16. Композиция в форме микрочипа по п.15, которая дополнительно содержит, по меньшей мере, одну пару олигонуклеотидов, выбранную из пары, состоящей из олигонуклеотидов SG463 и SG464, и из пары, состоящей из олигонуклеотидов SG466 и SG467, по меньшей мере, один олигонуклеотид из группы, состоящей из SSPC1, SSPC2, SSPC3, SSPC4, SSPC5, SSPC6 и SSPC7, по меньшей мере, один олигонуклеотид из группы, состоящей из SCN2, SCN3, SCN6, SCN8, SCN11, SCN12 и SCN13 и, по меньшей мере, один олигонуклеотид из группы, состоящей из SC1, SC2, SC3, SC4, SC5, SC6, SC7, SCN1, SCN5, SCN7 и SCN10.
17. Композиция в форме микрочипа по п.16, которая содержит полный набор олигонуклеотидов из группы, состоящей из
SG463, SG464, SG466, SG467, SSPC1, SSPC2, SSPC3, SSPC4, SSPC5, SSPC6, SSPC7, SCN2, SCN3, SCN6, SCN8, SCN11, SCN12, SCN13, SC1, SC2, SC3, SC4, SC5, SC6, SC7, SCN1, SCN5, SCN7 и SCN10.
18. Композиция в форме микрочипа по п.17, которая дополнительно содержит точки, лишенные олигонуклеотидов, где растворитель, в котором олигонуклеотиды обнаруживаются расположенными на указанном стекле, связан со стеклом.
19. Композиция в форме микрочипа по п.18, которая содержит, по меньшей мере, 12 копий каждого из различных присутствующих в ней олигонуклеотидов, а также, по меньшей мере, 12 точек, лишенных олигонуклеотидов, где растворитель, в котором олигонуклеотиды обнаруживаются расположенными на указанном стекле, связан со стеклом.
20. Композиция в форме микрочипа по любому из пп.18 и 19, где в точках, лишенных олигонуклеотидов, растворитель DMSO связан со стеклом.
21. Композиция в форме микрочипа по любому из пп.15-19 для применения при диагностике in vitro хронического лимфолейкоза и/или для прогноза in vitro развития указанного заболевания.
22. Устройство для диагностики in vitro неоплазии, исходящей из гематопоэтических клеток, и/или для прогноза in vitro его развития, которое включает композицию по любому из пп.1-20.
23. Устройство для диагностики неоплазии, исходящей из гематопоэтических клеток, и/или для прогноза in vitro его развития по п.22, которое включает композицию в форме микрочипа по любому из пп.14-20.
24. Устройство для диагностики in vitro неоплазии, исходящей из гематопоэтических клеток, и/или для прогноза in vitro его развития по п.22, которое включает композицию в форме микрочипа по п.19 или 20.
25. Устройство для диагностики in vitro неоплазии, исходящей из гематопоэтических клеток, и/или для прогноза in vitro его развития по п.23 или 24, где неоплазия, которая диагностируется или развитие которой прогнозируется, представляет собой хронический лимфолейкоз.
26. Способ диагностики in vitro неоплазии, исходящей из гематопоэтических клеток и/или прогноза in vitro ее развития, который включает выявление in vitro в биологическом образце и статистический анализ уровня экспрессии, по меньшей мере, одного значимого гена для классификации образца как связанного или не связанного с указанной неоплазией гена, выбранного из группы, состоящей из GABARAP, NPM3, ABCB1, ABCB4, ABCC3, ABCC5, ABCC6, ABHD1, ABL1, ACTN1, AF1q, AKR1A1, ALDH1A1, ALK, ANK2, ANPEP, ANXA6, ANXA7, APAF1, APEX, ARHGEF2, ARS2, ASNS, ATIC, ATM, ATP5O, BAX, BCL10, BCL2, BCL2A1, BCL2L1, BCL2LAA, BCL3, BCL6, BCL7A, BCL7b, BCR, BECN1, BIK, BIRC3, BIRC5, BLMH, BLR1, BLVRB, BMI1, BMP6, BRMS1, BST2, BTG1, BUB1, C21orf33, C5orf13, CA12, CALD1, CANP2, CASC3, CASP1, CASP3, CASP4, CASP5, CASP6, CASP7, CASP8, CASP9, CAST, CATSD, CBFA2T1, CBFB, CCNA1, CCNB1, CCND1, CCND2, CCND3, CCNE1, CCR6, CCR7, CCT6A, CD14, CD19, CD2, CD22, CD24, CD28, CD33, CD34, CD36, CD38, CD3E, CD4, CD44, CD47, CD48, CD5, CD58, CD59, CD6, CD7, CD79A, CD79B, CD8, CD81, CD83, CD86, CD9, CDA, CDC25A, CDC25B, CDK2, CDK4, CDK5R1, CDKN1A, CDKN1B, CDKN1C, CDKN2A, CDKN2B, CDKN2C, CDKN3, CDW52, CEBPA, CEBPB, CEBPD, CFL1, CKMT1, CKS2, CML66, COL3A1, COL4A6, CR2, CREB1, CREBBP, CRYAB, CSF2, CSF3, CSRP2, CTGF, CTSB, CUZD1, CXADR, CXCL9, CXCR3, CXCR4, CYC1, CYP1A1, CYP2A6, DAD-1, DAPK1, DCK, DDX6, DEK, DHFR, DLAD, DNAJA1, DNMT3B, DNTT, DOK1, DPF2, DPP4, DRG1, DRP2, E2F1, EB-1, EBI2, EDF1, EEF1A1, EEF1B2, EEF1D, EEF1G, EFNB1, EGFR, EGR1, EIF2B2, EIF3S2, EIF4B, EIF4E, EIF5A, ELF1, ELF4, ENPP1, EphA3, EPOR, ERBB2, ERBB4, ERCC1, ERCC2, ERCC3, ERCC5, ERCC6, ETS1, ETS2, ETV6, ETV7, EZH2, FABP5, FADD, FAIM3, FAM38A, FARP1, FAT, FCER2, FCGR3A, FCGR3B, FGFR1, FGFR3, FGR, FHIT, FKBP9, FLI1, FLJ22169, FLT3, FN1, FNTB, FOS, FUS, G1P2, GABPB2, GATA1, GATA2, GATA3, GCET2, GDI2, GGA3, GJA1, GLUD1, GNL3, GOT1, GRB2, GRIA3, GRK4, GSTP1, GSTT1, GUSB, GZMA, H2AFX, H3F3A, HCK, HELLS, HIF1A, HIST1H2BN, HLA-A, HLA-DPA1, HLA-DQA1, HLA-DRA, HLA-DRB3, HLF, HMMR, HNRPH3, HNRPL, HOXA10, HOXA9, HOXD8, HOXD9, HRAS, HSD17B1, HSPB1, IBSP, ICAM1, ICAM3, ID2, IER3, IFRD1, IGFBP2, IGFBP3, IGFIR, IGLV6-57, IL10, IL15, IL1B, IL2, IL2RA, IL3, IL32, IL3RA, IL4R, IL6, IL6R, IL8, ILF2, IRF1, IRF2, IRF4, IRF8, ITGA2, ITGA3, ITGA4, ITGA5, ITGA6, ITGAL, ITGAM, ITGAX, ITGB1, ITGB2, JAK1, JAK2, JUNB, KAI1, KIAA0247, KIAA0864, KIT, KLF1, KLF13, KRAS2, KRT18, LADH, LAG3, LASP1, LCK, LCP1, LEPR, LGALS3, LGALS7, LIF, LIMS1, LMO2, LOC285148, LRP, LSP1, LYL1, LYN, LYZ, MAFB, MAFK, MAGEA1, MAL, MAP3K12, MAP4K1, MAPK10, MAZ, MBP1, MCL1, MCM3, MCM7, MDM2, MEIS1, MEN1, MERTK, MKI67, MLF1, MLF2, MLL, MLLT10, MME, MMP2, MMP7, MMP8, MMP9, MNDA, MPL, MPO, MRPL37, MS4A1, MTCP1, MUC-1, MX1, MYB, MYBL1, MYC, MYOD1, NCALD, NCAM1, NCL, NDP52, NDRG1, NDUFA1, NDUFB, NF1, NFATC1, NFIC, NFKB1, NFKB1A, NINJ1, NPM1, NR3C1, NUMA1, NXF1, ODC1, OGGI, OLIG2, OPRD1, p14ARF, P55CDC, PABPC1, PAX5, PAX6, PAX8, PBX1, PBX3, PCA1, PCD, PCNA, PDCD1, PDGFA, PDGFRB, PDHA1, PGF, PGRMC1, PICALM, PLA2G6, PLAU, PLK1, PLP, PLS3, PLZF, PML, PMM1, POLR2C, POU2F2, PPP1CC, PRAME, PRKCI, PRKCQ, PRKDC, PRL, PRTN3, PSMA5, PSMB4, PSMC5, PSMD7, PTEN, PTGS1, PTHLH, PTK2, PTK2B, PTN, PTPRCCD, PYGB, RAD51, RAF1, RAG1, RARA, RARB, RB1, RBBP4, RBBP6, RBBP8, RBP4, RET, RGS1, RGS1, RIS1, RORA, RPL17, RPL23A, RPL24, RPL36A, RPL37A, RPL41, RPS3, RPS5, RPS9, RUNX1, RXRA, S100A2, S100A8, SDC1, SDHD, SELE, SELL, SEPW1, SERPINA9, SERPINB5, SERPNINA9, SFTPB, SIAT4A, SLC7A5, SNRPB, SOSTDC1, SP1, SPI1, SPN, SPRR1A, SREBF1, SSBP1, STAT1, STAT3, STAT5B, SUMO1, TACSTD2, TAGLN2, TAL1, TBP, TCEB1, TCF1, TCF3, TCF7, TCL1A, TCRbeta, TEGT, TERF1, TERT, TFCP2, TFRC, THBS1, THPO, TIA-2, TIAM1, TK1, TLX1, TMEM4, TNF, TNFRSF10C, TNFRSF1A, TNFRSF25, TNFRSF5, TNFRSF6, TNFRSF8, TNFSF10, TNFSF5, TNFSF6, TOP2A, TOPORS, TP73, TRA@, TRADD, TRAF3, TRAP1, TRIB2, TXNRD1, UBE2C, UHRF1, UVRAG, VCAM1, VEGF, VPREB1, WBSCR20C, WNT16, WT1, XBP1, XPO6, XRCC3, XRCC5, ZAP70, ZFPL1, ZNF42, ZNFN1A1, ZYX, 18S рРНК, 28S рРНК, и уровень экспрессии которого определяется оценкой концентрации его соответствующей мРНК путем использования, по меньшей мере, одного зонда, который имеет последовательность, комплементарную фрагменту цепи указанного гена, зонда, который выбран из группы олигонуклеотидов, состоящей из
SG1, SG2, SG3, SG4, SG5, SG6, SG7, SG8, SG9, SG10, SG11, SG12, SG13, SG14, SG15, SG16, SG17, SG18, SG19, SG20, SG21, SG22, SG23, SG24, SG25, SG26, SG27, SG28, SG29, SG30, SG31, SG32, SG33, SG34, SG35, SG36, SG37, SG38, SG39, SG40, SG41, SG42, SG43, SG44, SG45, SG46, SG47, SG48, SG49, SG50, SG51, SG52, SG53, SG54, SG55, SG56, SG57, SG58, SG59, SG60, SG61, SG62, SG63, SG64, SG65, SG66, SG67, SG68, SG69, SG70, SG71, SG72, SG73, SG74, SG75, SG76, SG77, SG78, SG79, SG80, SG81, SG82, SG83, SG84, SG85, SG86, SG87, SG88, SG89, SG90, SG91, SG92, SG93, SG94, SG95, SG96, SG97, SG98, SG99, SG100, SG101, SG102, SG103, SG104, SG105, SG106, SG107, SG108, SG109, SG110, SG111, SG112, SG113, SG114, SG115, SG116, SG117, SG118, SG119, SG120, SG121, SG122, SG123, SG124, SG125, SG126, SG127, SG128, SG129, SG130, SG131, SG132, SG133, SG134, SG135, SG136, SG137, SG138, SG139, SG140, SG141, SG142, SG143, SG144, SG145, SG146, SG147, SG148, SG149, SG150, SG151, SG152, SG153, SG154, SG155, SG156, SG157, SG158, SG159, SG160, SG161, SG162, SG163, SG164, SG165, SG166, SG167, SG168, SG169, SG170, SG171, SG172, SG173, SG174, SG175, SG176, SG177, SG178, SG179, SG180, SG181, SG182, SG183, SG184, SG185, SG186, SG187, SG188, SG189, SG190, SG191, SG192, SG193, SG194, SG195, SG196, SG197, SG198, SG199, SG200, SG201, SG202, SG203, SG204, SG205, SG206, SG207, SG208, SG209, SG210, SG211, SG212, SG213, SG214, SG215, SG216, SG217, SG218, SG219, SG220, SG221, SG222, SG223, SG224, SG225, SG226, SG227, SG228, SG229, SG230, SG231, SG232, SG233, SG234, SG235, SG236, SG237, SG238, SG239, SG240, SG241, SG242, SG243, SG244, SG245, SG246, SG247, SG248, SG249, SG250, SG251, SG252, SG253, SG254, SG255, SG256, SG257, SG258, SG259, SG260, SG261, SG262, SG263, SG264, SG265, SG266, SG267, SG268, SG269, SG270, SG271, SG272, SG273, SG274, SG275, SG276, SG277, SG278, SG279, SG280, SG281, SG282, SG283, SG284, SG285, SG286, SG287, SG288, SG289, SG290, SG291, SG292, SG293, SG294, SG295, SG296, SG297, SG298, SG299, SG300, SG301, SG302, SG303, SG304, SG305, SG306, SG307, SG308, SG309, SG310, SG311, SG312, SG313, SG314, SG315, SG316, SG317, SG318, SG319, SG320, SG321, SG322, SG323, SG324, SG325, SG326, SG327, SG328, SG329, SG330, SG331, SG332, SG333, SG334, SG335, SG336, SG337, SG338, SG339, SG340, SG341, SG342, SG343, SG344, SG345, SG346, SG347, SG348, SG349, SG350, SG351, SG352, SG353, SG354, SG355, SG356, SG357, SG358, SG359, SG360, SG361, SG362, SG363, SG364, SG365, SG366, SG367, SG368, SG369, SG370, SG371, SG372, SG373, SG374, SG375, SG376, SG377, SG378, SG379, SG380, SG381, SG382, SG383, SG384, SG385, SG386, SG387, SG388, SG389, SG390, SG391, SG392, SG393, SG394, SG395, SG396, SG397, SG398, SG399, SG400, SG401, SG402, SG403, SG404, SG405, SG406, SG407, SG408, SG409, SG410, SG411, SG412, SG413, SG414, SG415, SG416, SG417, SG418, SG419, SG420, SG421, SG422, SG423, SG424, SG425, SG426, SG427, SG428, SG429, SG430, SG431, SG432, SG433, SG434, SG435, SG436, SG437, SG438, SG439, SG440, SG441, SG442, SG443, SG444, SG445, SG446, SG447, SG448, SG449, SG450, SG451, SG452, SG453, SG454, SG455, SG456, SG457, SG458, SG459, SG460, SG461, SG462, SG465, SG468, SG469, SG470, SG471, SG472, SG473, SG474, SG475, SG476, SG477, SG478, SG479, SG480, SG481, SG482, SG483, SG484, SG485, SG486, SG487, SG488, SG489, SG490, SG491, SG492, SG493, SG494, SG495, SG496, SG497, SG498, SG499, SG500, SG501, SG502, SG503, SG504, SG505, SG506, SG507, SG508, SG509, SG510, SG511, SG512, SG513, SG514, SG515, SG516, SG517, SG518, SG519, SG520, SG521, SG522, SG523, SG524, SG525, SG526, SG527, SG428, SG529, SG530, SG531, SG532, SG533, SG534, SG535, SG536, SG537, SG538, SG539, SG540, SG541, SG542, SG543, SG544, SG545, SG546, SG547, SG548, SG549, SG550, SG551, SG552, SG553, SG554, SG555, SG556, SG557, SG558, SG559, SG560, SG561, SG562, SG563 или их комбинации.
27. Способ диагностики in vitro неоплазии, исходящей из гематопоэтических клеток, и/или прогноза in vitro его развития, по п.26, который дополнительно включает предварительную необязательную стадию идентификации генов, значимых для классификации образца как связанного или не связанного со специфическим типом неоплазии, исходящей из гематопоэтических клеток, где предварительная стадия включает подстадии:
а) определения возможных категорий, к которым может быть отнесен образец;
b) получения биологических образцов у индивидуумов, которые ранее были отнесены способом, отличным от заявляемого, к любой из возможных категорий классификации так, чтобы были образцы каждой из возможных категорий;
с) получения общей мРНК каждого из образцов;
d) получения соответствующей общей кРНК, меченной способом, который обеспечивает возможность последующего выявления, по меньшей мере, одной аликвоты каждого из образцов мРНК, где в аликвоту перед получением кРНК добавляется, по меньшей мере, одна последовательность полиаденилированных нуклеотидов с низкой гомологией с человеческими генами, для которых она действует в качестве внутреннего положительного контроля процесса;
е) добавления к одной из аликвот кРНК, которые подлежат использованию на стадии f), по меньшей мере, одного олигонуклеотида с низкой гомологией с человеческими генами, отличного от любой возможной последовательности нуклеотидов, которые были добавлены на стадии d), и не комплементарного им, для которых он действует в качестве положительного контроля гибридизации;
f) гибридизации в жестких условиях, по меньшей мере, одной аликвоты общей кРНК каждого из образцов, по меньшей мере, с одним микрочипом, который содержит, по меньшей мере, 2 копии каждого из олигонуклеотидов из группы, состоящей из
SG1, SG2, SG3, SG4, SG5, SG6, SG7, SG8, SG9, SG10, SG11, SG12, SG13, SG14, SG15, SG16, SG17, SG18, SG19, SG20, SG21, SG22, SG23, SG24, SG25, SG26, SG27, SG28, SG29, SG30, SG31, SG32, SG33, SG34, SG35, SG36, SG37, SG38, SG39, SG40, SG41, SG42, SG43, SG44, SG45, SG46, SG47, SG48, SG49, SG50, SG51, SG52, SG53, SG54, SG55, SG56, SG57, SG58, SG59, SG60, SG61, SG62, SG63, SG64, SG65, SG66, SG67, SG68, SG69, SG70, SG71, SG72, SG73, SG74, SG75, SG76, SG77, SG78, SG79, SG80, SG81, SG82, SG83, SG84, SG85, SG86, SG87, SG88, SG89, SG90, SG91, SG92, SG93, SG94, SG95, SG96, SG97, SG98, SG99, SG100, SG101, SG102, SG103, SG104, SG105, SG106, SG107, SG108, SG109, SG110, SG111, SG112, SG113, SG114, SG115, SG116, SG117, SG118, SG119, SG120, SG121, SG122, SG123, SG124, SG125, SG126, SG127, SG128, SG129, SG130, SG131, SG132, SG133, SG134, SG135, SG136, SG137, SG138, SG139, SG140, SG141, SG142, SG143, SG144, SG145, SG146, SG147, SG148, SG149, SG150, SG151, SG152, SG153, SG154, SG155, SG156, SG157, SG158, SG159, SG160, SG161, SG162, SG163, SG164, SG165, SG166, SG167, SG168, SG169, SG170, SG171, SG172, SG173, SG174, SG175, SG176, SG177, SG178, SG179, SG180, SG181, SG182, SG183, SG184, SG185, SG186, SG187, SG188, SG189, SG190, SG191, SG192, SG193, SG194, SG195, SG196, SG197, SG198, SG199, SG200, SG201, SG202, SG203, SG204, SG205, SG206, SG207, SG208, SG209, SG210, SG211, SG212, SG213, SG214, SG215, SG216, SG217, SG218, SG219, SG220, SG221, SG222, SG223, SG224, SG225, SG226, SG227, SG228, SG229, SG230, SG231, SG232, SG233, SG234, SG235, SG236, SG237, SG238, SG239, SG240, SG241, SG242, SG243, SG244, SG245, SG246, SG247, SG248, SG249, SG250, SG251, SG252, SG253, SG254, SG255, SG256, SG257, SG258, SG259, SG260, SG261, SG262, SG263, SG264, SG265, SG266, SG267, SG268, SG269, SG270, SG271, SG272, SG273, SG274, SG275, SG276, SG277, SG278, SG279, SG280, SG281, SG282, SG283, SG284, SG285, SG286, SG287, SG288, SG289, SG290, SG291, SG292, SG293, SG294, SG295, SG296, SG297, SG298, SG299, SG300, SG301, SG302, SG303, SG304, SG305, SG306, SG307, SG308, SG309, SG310, SG311, SG312, SG313, SG314, SG315, SG316, SG317, SG318, SG319, SG320, SG321, SG322, SG323, SG324, SG325, SG326, SG327, SG328, SG329, SG330, SG331, SG332, SG333, SG334, SG335, SG336, SG337, SG338, SG339, SG340, SG341, SG342, SG343, SG344, SG345, SG346, SG347, SG348, SG349, SG350, SG351, SG352, SG353, SG354, SG355, SG356, SG357, SG358, SG359, SG360, SG361, SG362, SG363, SG364, SG365, SG366, SG367, SG368, SG369, SG370, SG371, SG372, SG373, SG374, SG375, SG376, SG377, SG378, SG379, SG380, SG381, SG382, SG383, SG384, SG385, SG386, SG387, SG388, SG389, SG390, SG391, SG392, SG393, SG394, SG395, SG396, SG397, SG398, SG399, SG400, SG401, SG402, SG403, SG404, SG405, SG406, SG407, SG408, SG409, SG410, SG411, SG412, SG413, SG414, SG415, SG416, SG417, SG418, SG419, SG420, SG421, SG422, SG423, SG424, SG425, SG426, SG427, SG428, SG429, SG430, SG431, SG432, SG433, SG434, SG435, SG436, SG437, SG438, SG439, SG440, SG441, SG442, SG443, SG444, SG445, SG446, SG447, SG448, SG449, SG450, SG451, SG452, SG453, SG454, SG455, SG456, SG457, SG458, SG459, SG460, SG461, SG462, SG465, SG468, SG469, SG470, SG471, SG472, SG473, SG474, SG475, SG476, SG477, SG478, SG479, SG480, SG481, SG482, SG483, SG484, SG485, SG486, SG487, SG488, SG489, SG490, SG491, SG492, SG493, SG494, SG495, SG496, SG497, SG498, SG499, SG500, SG501, SG502, SG503, SG504, SG505, SG506, SG507, SG508, SG509, SG510, SG511, SG512, SG513, SG514, SG515, SG516, SG517, SG518, SG519, SG520, SG521, SG522, SG523, SG524, SG525, SG526, SG527, SG428, SG529, SG530, SG531, SG532, SG533, SG534, SG535, SG536, SG537, SG538, SG539, SG540, SG541, SG542, SG543, SG544, SG545, SG546, SG547, SG548, SG549, SG550, SG551, SG552, SG553, SG554, SG555, SG556, SG557, SG558, SG559, SG560, SG561, SG562, SG563, где микрочип дополнительно содержит:
а. по меньшей мере, 2 точки, которые соответствуют различным аликвотам растворителя, в котором нуклеотиды обнаруживаются во время их расположения на поверхности микрочипа, для которого они служат в качестве контроля,
b. по меньшей мере, 2 копии, по меньшей мере, одного олигонуклеотида для каждой из полиаденилированных последовательностей, добавленных на стадии d), последовательность которого будет соответствовать фрагменту, отличному от зоны полиаденилирования последовательности полиаденилированных нуклеотидов, развитие которого в процессе подлежит контролю;
с. для каждого из олигонуклеотидов, добавленных на стадии е), по меньшей мере, 2 копии олигонуклеотида, комплементарного им;
d. по меньшей мере, 2 копии каждого члена, по меньшей мере, одной пары олигонуклеотидов, где последовательность одного из членов соответствует последовательности зоны 5', а последовательность другого соответствует последовательности зоны 3', мРНК гена, который экспрессируется в конститутивной форме в любой клетке гематопоэтического происхождения;
е. по меньшей мере, 2 копии, по меньшей мере, одного олигонуклеотида с низкой гомологией с человеческими генами, отличного от любого из олигонуклеотидов, определенных в пункте b, и отличного от любого из синтетических олигонуклеотидов, необязательно добавленных на стадии е);
g) выявления и количественного определения сигнала кРНК, гибридизированной с каждой из копий каждого из олигонуклеотидов, присутствующих в микрочипе, а также сигнала, соответствующего точкам растворителя;
h) расчета среднего уровня интенсивности гибридизации каждого из олигонуклеотидов микрочипа расчетом средней величины интенсивности копий каждого из олигонуклеотидов;
i) оценки гибридизации как состоявшейся, если выполняются следующие условия:
а. отношение между средней интенсивностью и средним фоном всех олигонуклеотидов микрочипа составляет больше 10;
b. величина среднего коэффициента вариации всех повторений олигонуклеотидов должна быть менее 0,3;
с. средняя величина отрицательного контроля должна быть в 2,5 раза меньше, чем средняя величина точек, соответствующих растворителю;
d. имеется сигнал и в контролях гибридизации, и во внутренних положительных контролях, используемых в качестве контроля процесса;
j) нормализации данных;
k) устранения олигонуклеотидов с величинами средней интенсивности минус средний фоновый шум приблизительно в 2 раза меньше, чем средняя величина, полученная в точках, соответствующих растворителю, а также олигонуклеотидов с межквартильным диапазоном нормализованной интенсивности по образцам менее 0,3;
l) выполнения статистического анализа для обнаружения статистически значимых олигонуклеотидов с целью дифференциации между различными категориями и возможности классификации образца, который ранее не был отнесен к какой-либо категории, выбора указанных олигонуклеотидов среди олигонуклеотидов, которые не были устранены на предыдущих стадиях, до получения “n” олигонуклеотидов, которые или имеют величину p менее, чем предел, который выбран из открытого интервала от 0 до 0,05, предпочтительно с использованием для этого способа, способного снизить ложноположительные результаты, или того, который лучше всего определяет установленную категорию;
m) проверки того, что группировка образцов в соответствии с различиями величин интенсивности между различными образцами, выявленными для статистически значимых олигонуклеотидов, обеспечивает классифицирование образцов в те же категории, что и образцы, которые были ранее отнесены к ней другим способом.
28. Способ по п.27, в котором микрочип содержит, по меньшей мере, 4 копии каждого из присутствующих в нем олигонуклеотидов и средняя величина интенсивностей копий каждого из олигонуклеотидов, которая рассчитана в пункте h), представляет собой усеченную среднюю.
29. Способ по п.28, в котором нормализация проводится с использованием метода «стабилизации нормализации дисперсии», имеющегося в пакете “vsn” в R.
30. Способ по любому из пп.27-29, в котором статистический анализ для обнаружения статистически значимых олигонуклеотидов для дифференциации между различными категориями проводится с использованием функции mt.maxT пакета множественных тестов в R.
31. Способ по любому из пп.27-29, в котором используется устройство для диагностики по п.24.
32. Способ по любому из пп.27-29, который включает необязательную стадию получения классификационной функции для каждого образца произвольным отнесением величины 0 к одной из возможных категорий «а» и величины 1 к другой возможной категории “b”, где возможна классификация образца и получение с помощью логистической регрессии коэффициента для каждого из олигонуклеотидов, что обеспечивает возможность расчета величины xi для каждого образца функцией типа
где coeff_oligm представляет коэффициент, рассчитанный для определенного олигонуклеотида “m”;
Imni_oligm представляет среднюю величину нормализованной интенсивности, полученную при гибридизации образца i, рассчитанную для олигонуклеотида “m”;
“m” варьируется от 1 до “n”;
n представляет собой общее число олигонуклеотидов, которые считаются значимыми,
где из величины “xi” рассчитывается вероятность “pi” того, что образец “i” относится к той или иной категории, с использованием формулы pi=1/(1+e-xi), и образец классифицируется как относящийся к категории “a” или “b” по ее соответствующей величине pi, которая соответственно ближе к 0 или 1.
33. Способ по любому из пп.27-29, в котором статистический анализ для обнаружения значимых олигонуклеотидов для дифференциации между различными категориями проводится с использованием метода «Ближайших Сжатых Центроидов».
34. Способ по любому из пп.27-29, в котором биологические образцы, анализируемые in vitro, представляют собой образцы периферической крови.
35. Способ по п.34, в котором лейкоз диагностируется in vitro или прогнозируется его развитие.
36. Способ по п.35, в котором диагностируется in vitro, страдает ли индивидуум хроническим лимфолейкозом.
37. Способ по п.35, в котором in vitro прогнозируется развитие хронического лимфолейкоза у субъекта классификацией образца крови, экстрагированного у него, как «связанного со стабильным хроническим лимфолейкозом» или «связанным с прогрессирующим хроническим лимфолейкозом».
38. Способ диагностики in vitro неоплазии, исходящей из гематопоэтических клеток, и/или прогноза in vitro его развития, который включает выявление in vitro и статистический анализ уровня экспрессии, по меньшей мере, одного значимого гена для классификации образца как принадлежащего здоровому индивидууму, или связывания его с типом неоплазии, исходящей из гематопоэтических клеток по п.26, в котором неоплазия, которая диагностируется и/или развитие которой прогнозируется, представляет собой лейкоз.
39. Способ по п.38, в котором ставится диагноз или прогнозируется развитие хронического лимфолейкоза.
40. Способ диагностики in vitro хронического лимфолейкоза и/или прогноза in vitro его развития по п.39, в котором выявление in vitro уровня экспрессии, по меньшей мере, одного значимого гена проводится из образцов периферической крови.
41. Способ диагностики in vitro хронического лимфолейкоза по п.40, в котором субъекты, у которых были взяты соответствующие образцы крови, классифицируются в категорию субъекта, не страдающего CLL, или в категорию субъекта, страдающего CLL.
42. Способ диагностики in vitro хронического лимфолейкоза по п.41, в котором классификация субъектов проводится после выявления in vitro и статистического анализа уровня экспрессии в соответствующих образцах крови, по меньшей мере, генов CD79A, FAIM3, HLA-DRA, HLA-DRB3, HLA-DQA1.
43. Способ диагностики in vitro хронического лимфолейкоза по п.42, в котором классификация субъектов проводится после выявления in vitro и статистического анализа уровня экспрессии в соответствующих образцах крови дополнительно генов IRF8 и COL3A1.
44. Способ диагностики in vitro хронического лимфолейкоза по п.43, в котором выявление in vitro и статистический анализ уровня экспрессии генов CD79A, FAIM3, HLA-DRA, HLA-DRB3, HLA-DQA1, IRF8 и COL3A1 проводится оценкой их соответствующих мРНК гибридизацией их соответствующих кРНК, используя в качестве зондов олигонуклеотиды SG117, SG428, SG459, SG507, SG508, SG461 и SG493.
45. Способ диагностики in vitro хронического лимфолейкоза по п.44, в котором олигонуклеотиды образуют часть композиции в форме микрочипа.
46. Способ диагностики in vitro хронического лимфолейкоза по п.45, в котором оценка гибридизированной кРНК проводится благодаря предшествующему мечению кРНК биотином, окрашиванием гибридизированного микрочипа стрептавидином, конъюгированным с флуорофором, и выявлением сигнала, испускаемого указанным флуорофором.
47. Способ диагностики in vitro хронического лимфолейкоза по п.46, в котором флуорофор представляет собой Су3.
48. Способ диагностики in vitro хронического лимфолейкоза по п.47, в котором классификация субъекта, у которого был взят подвергнутый анализу образец I, в категорию субъекта, не страдающего CLL, или в категорию субъекта, страдающего CLL, проводится расчетом для указанного субъекта величины вероятности pi=1/(1+e-xi), после получения ее соответствующей величины xi по формуле
xi=-719,241486+(2,44756372·Imni_CD79A)+(7,38657611·Imni_FAIM3)+(23,1465464·Imni_HLA-DRA)+(43,6287742·Imni_IRF8)-(19,3978182·Imni_COL3A1)-(2,80282646·Imni_HLA-DRB3)+(49,5345672·Imni_HLA-DQA1),
формуле, где каждая из величин, обозначенных аббревиатурой “Imni” с последующей аббревиатурой гена указывает среднюю величину нормализованной интенсивности, полученную после выявления сигнала гибридизации, соответствующего олигонуклеотиду, который используется в качестве зонда для оценки экспрессии указанного гена,
и классификацией субъекта как субъекта, не страдающего CLL, если величина pi меньше 0,5, и как субъекта, страдающего CLL, если величина pi больше 0,5.
49. Способ прогнозирования in vitro развития заболевания у субъекта, страдающего хроническим лимфолейкозом, по п.40, в котором субъекты, у которых были взяты соответствующие образцы крови, классифицируются в категорию субъектов со стабильным CLL или в категорию субъектов с прогрессирующим CLL.
50. Способ прогнозирования in vitro развития заболевания у субъекта, страдающего хроническим лимфолейкозом, по п.49, в котором классификация субъектов проводится после выявления in vitro и статистического анализа уровня экспрессии в соответствующих образцах крови, по меньшей мере, генов PSMB4, FCER2 и POU2F2.
51. Способ прогнозирования in vitro развития заболевания у субъекта, страдающего хроническим лимфолейкозом, по п.50, в котором классификация субъектов проводится после выявления in vitro и статистического анализа уровня экспрессии в соответствующих образцах крови дополнительно, по меньшей мере, гена, выбранного из группы, состоящей из ODC1, CD79A, CD2, CD3E, CD5, MS4A1, EIF4E, FHIT, NR3C1, LCP1, MAPK10, ABCC5, XRCC3, CML66, PLZF, RBP4.
52. Способ прогнозирования in vitro развития заболевания у субъекта, страдающего хроническим лимфолейкозом, по п.51, в котором классификация субъектов проводится после выявления in vitro и статистического анализа уровня экспрессии в соответствующих образцах крови, по меньшей мере, генов из группы, состоящей из PSMB4, FCER2, POU2F2, ODC1, CD79A, CD2, CD3E, CD5, MS4A1, EIF4E, FHIT, NR3C1, LCP1, MAPK10, ABCC5, XRCC3, CML66, PLZF, RBP4.
53. Способ прогнозирования in vitro развития заболевания у субъекта, страдающего хроническим лимфолейкозом, по п.51 или 52, в котором выявление in vitro и статистический анализ уровня экспрессии исследованных генов проводится оценкой соответствующей мРНК гибридизацией ее соответствующей кРНК, с использованием в качестве зондов соответствующих олигонуклеотидов, выбранных из группы, состоящей из SG26, SG216, SG366, SG31, SG177, SG194, SG195, SG197, SG213, SG293, SG301, SG309, SG33, SG343, SG357, SG439, SG452, SG555, SG556.
54. Способ прогнозирования in vitro развития заболевания у субъекта, страдающего хроническим лимфолейкозом, по п.53, в котором олигонуклеотиды образуют часть композиции в форме микрочипа.
55. Способ прогнозирования in vitro развития заболевания у субъекта, страдающего хроническим лимфолейкозом, по п.54, в котором оценка соответствующей мРНК образца, проанализированной выявлением соответствующей гибридизированной кРНК к соответствующему олигонуклеотиду, проводится благодаря предшествующему мечению кРНК биотином, окрашиванию гибридизированного микрочипа стрептавидином, конъюгированным с флуорофором, и выявлению сигнала, испускаемого указанным флуорофором.
56. Способ прогнозирования in vitro развития заболевания у субъекта, страдающего хроническим лимфолейкозом, по п.55, в котором флуорофор представляет собой Су3.
57. Применение устройства для оценки уровня экспрессии, по меньшей мере, одного гена из группы, состоящей из PSMB4, FCER2, POU2F2, ODC1, CD79A, CD2, CD3E, CD5, MS4A1, EIF4E, FHIT, NR3C1, LCP1, MAPK10, ABCC5, XRCC3, CML66, PLZF, RBP4, CD79A, FAIM3, HLA-DRA, HLA-DRB3, HLA-DQA1, IRF8 и COL3A1, для диагностики in vitro наличия хронического лимфолейкоза у субъекта и/или прогноза in vitro развития хронического лимфолейкоза у субъекта.
58. Применение устройства для оценки уровня экспрессии генов по п.57, в котором уровень экспрессии, по меньшей мере, одного гена из группы, состоящей из CD79A, FAIM3, HLA-DRA, HLA-DRB3, HLA-DQA1, IRF8 и COL3A1, оценивается для диагностики in vitro наличия хронического лимфолейкоза у субъекта.
59. Применение устройства для оценки уровня экспрессии генов по любому из пп.57 и 58, в котором уровень экспрессии, по меньшей мере, генов CD79A, FAIM3, HLA-DRA, HLA-DRB3, HLA-DQA1 оценивается для диагностики in vitro наличия хронического лимфолейкоза у субъекта.
60. Применение устройства для оценки уровня экспрессии генов по п.59, в котором дополнительно оценивается уровень экспрессии, по меньшей мере, генов IRF8 и COL3A1 для диагностики in vitro наличия хронического лимфолейкоза у субъекта.
61. Применение устройства для оценки уровня экспрессии генов по п.57, в котором уровень экспрессии, по меньшей мере, одного гена из группы, состоящей из PSMB4, FCER2, POU2F2, ODC1, CD79A, CD2, CD3E, CD5, MS4A1, EIF4E, FHIT, NR3C1, LCP1, MAPK10, ABCC5, XRCC3, CML66, PLZF, RBP4, оценивается для прогнозирования in vitro развития заболевания у субъекта, страдающего хроническим лимфолейкозом.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| ES200502618 | 2005-10-27 | ||
| ES200502618A ES2324435B1 (es) | 2005-10-27 | 2005-10-27 | Procedimiento y dispositivo de analisis in vitro de mrna de genes implicados en neoplasias hematologicas. |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2008120600A true RU2008120600A (ru) | 2009-12-10 |
| RU2426786C2 RU2426786C2 (ru) | 2011-08-20 |
Family
ID=37967431
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2008120600/10A RU2426786C2 (ru) | 2005-10-27 | 2006-05-08 | СПОСОБ И УСТРОЙСТВО ДЛЯ АНАЛИЗА in vitro мPHK ГЕНОВ, УЧАСТВУЮЩИХ В РАЗВИТИИ ГЕМАТОЛОГИЧЕСКИХ НЕОПЛАЗИЙ |
Country Status (8)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20120157329A1 (ru) |
| EP (1) | EP1947194A4 (ru) |
| AU (1) | AU2006307849B2 (ru) |
| BR (1) | BRPI0617889A2 (ru) |
| CA (1) | CA2626513A1 (ru) |
| ES (1) | ES2324435B1 (ru) |
| RU (1) | RU2426786C2 (ru) |
| WO (1) | WO2007048866A1 (ru) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2614117C1 (ru) * | 2016-03-09 | 2017-03-22 | Федеральное государственное бюджетное научное "Всероссийский научно-исследовательский институт животноводства имени академика Л.К. Эрнста" (ВИЖ им. Л.К. Эрнста) | Способ определения полиморфизма apaf1, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота hh1 |
Families Citing this family (19)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US8768629B2 (en) | 2009-02-11 | 2014-07-01 | Caris Mpi, Inc. | Molecular profiling of tumors |
| BRPI0711011A2 (pt) | 2006-05-18 | 2011-08-23 | Molecular Profiling Inst Inc | método para a determinação da intervenção médica para um estado de doença, método para a identificação de uma terapia de droga com capacidade de interação com um alvo molecular e sistema para a determinação da intervenção médica individualizada para um estado de doença |
| US20090076734A1 (en) | 2007-03-22 | 2009-03-19 | Torres-Roca Javier F | Gene Signature for the Prediction of Radiation Therapy Response |
| WO2009106372A1 (en) * | 2008-02-29 | 2009-09-03 | Istituto Superiore Di Sanatà | Diagnostic method |
| US20110212855A1 (en) * | 2008-08-15 | 2011-09-01 | Decode Genetics Ehf. | Genetic Variants Predictive of Cancer Risk |
| EP3181705A1 (en) | 2008-11-12 | 2017-06-21 | Caris Life Sciences Switzerland Holdings GmbH | Methods and systems of using exosomes for determining phenotypes |
| CN103237901B (zh) | 2010-03-01 | 2016-08-03 | 卡里斯生命科学瑞士控股有限责任公司 | 用于治疗诊断的生物标志物 |
| CA2795776A1 (en) | 2010-04-06 | 2011-10-13 | Caris Life Sciences Luxembourg Holdings, S.A.R.L. | Circulating biomarkers for disease |
| EP2385134A1 (en) * | 2010-05-07 | 2011-11-09 | Ludwig-Maximilians-Universität München | Risk prognosis method for chronic lymphocytic leukemia |
| ES2614978T3 (es) | 2010-12-22 | 2017-06-02 | Universite Francois Rabelais De Tours | Procedimiento de diagnóstico de trastornos hematológicos |
| EP2825161B1 (en) * | 2012-03-12 | 2019-01-02 | Epizyme, Inc. | Inhibitors of human ezh2, and methods of use thereof |
| AU2014236285A1 (en) * | 2013-03-14 | 2015-11-05 | Children's Medical Center Corporation | Compositions and methods for reprogramming hematopoietic stem cell lineages |
| WO2015178804A1 (ru) * | 2014-05-19 | 2015-11-26 | Общество С Ограниченной Ответственностью "Гамма Глобал Рд" | Способ определения вероятности рецидивирования рака молочной железы |
| EP3303635B1 (en) | 2015-06-01 | 2021-09-01 | California Institute of Technology | Compositions and methods for screening t cells with antigens for specific populations |
| WO2017143035A2 (en) * | 2016-02-17 | 2017-08-24 | The Penn State Research Foundation | Method and therapeutic use of pign and other genes or genes products that pign interacts with for prognosis and treatment of hematological neoplasias |
| US12258613B2 (en) | 2017-03-08 | 2025-03-25 | California Institute Of Technology | Pairing antigen specificity of a T cell with T cell receptor sequences |
| KR20210028149A (ko) | 2018-05-17 | 2021-03-11 | 투불 메디테라피 피.씨. | 진단적 혈액 검사 |
| CN110221335B (zh) * | 2019-06-21 | 2022-07-01 | 南华大学 | 一种利用转铁蛋白受体1评价低剂量伽马射线辐射损伤的方法 |
| CN114974401A (zh) * | 2022-05-09 | 2022-08-30 | 桂林电子科技大学 | 一种基于堆叠式集成策略的用于高效识别特定细胞系增强子-启动子相互作用的预测方法 |
Family Cites Families (9)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20040002068A1 (en) * | 2000-03-01 | 2004-01-01 | Corixa Corporation | Compositions and methods for the detection, diagnosis and therapy of hematological malignancies |
| EP1404868A2 (en) * | 2001-02-28 | 2004-04-07 | Chondrogene Inc. | Compositions and methods relating to osteoarthritis |
| US7011947B2 (en) | 2001-07-17 | 2006-03-14 | Whitehead Institute For Biomedical Research | MLL translocations specify a distinct gene expression profile, distinguishing a unique leukemia |
| EP1308522A1 (en) * | 2001-11-05 | 2003-05-07 | Haferlach, Torsten, PD Dr. Dr. | Novel genetic markers for leukemias |
| US20040018513A1 (en) * | 2002-03-22 | 2004-01-29 | Downing James R | Classification and prognosis prediction of acute lymphoblastic leukemia by gene expression profiling |
| WO2005020784A2 (en) * | 2003-05-23 | 2005-03-10 | Mount Sinai School Of Medicine Of New York University | Surrogate cell gene expression signatures for evaluating the physical state of a subject |
| RU2248574C1 (ru) * | 2003-07-22 | 2005-03-20 | Государственное учреждение "Уфимский научно-исследовательский институт медицины труда и экологии человека Министерства здравоохранения Российской Федерации" | Способ прогнозирования развития и течения хронического лимфолейкоза |
| US7711492B2 (en) * | 2003-09-03 | 2010-05-04 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Methods for diagnosing lymphoma types |
| CA2558366A1 (en) * | 2004-02-23 | 2005-09-01 | Erasmus Universiteit Rotterdam | Classification, diagnosis and prognosis of acute myeloid leukemia by gene expression profiling |
-
2005
- 2005-10-27 ES ES200502618A patent/ES2324435B1/es not_active Expired - Fee Related
-
2006
- 2006-05-08 RU RU2008120600/10A patent/RU2426786C2/ru not_active IP Right Cessation
- 2006-05-08 BR BRPI0617889-8A patent/BRPI0617889A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2006-05-08 CA CA002626513A patent/CA2626513A1/en not_active Abandoned
- 2006-05-08 WO PCT/ES2006/070054 patent/WO2007048866A1/es not_active Ceased
- 2006-05-08 AU AU2006307849A patent/AU2006307849B2/en not_active Ceased
- 2006-05-08 EP EP06743492A patent/EP1947194A4/en not_active Withdrawn
- 2006-05-08 US US12/083,824 patent/US20120157329A1/en not_active Abandoned
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2614117C1 (ru) * | 2016-03-09 | 2017-03-22 | Федеральное государственное бюджетное научное "Всероссийский научно-исследовательский институт животноводства имени академика Л.К. Эрнста" (ВИЖ им. Л.К. Эрнста) | Способ определения полиморфизма apaf1, ассоциированного с гаплотипом фертильности голштинского скота hh1 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO2007048866A1 (es) | 2007-05-03 |
| EP1947194A1 (en) | 2008-07-23 |
| CA2626513A1 (en) | 2007-05-03 |
| RU2426786C2 (ru) | 2011-08-20 |
| AU2006307849B2 (en) | 2012-07-05 |
| AU2006307849A1 (en) | 2007-05-03 |
| ES2324435A1 (es) | 2009-08-06 |
| ES2324435B1 (es) | 2010-05-31 |
| US20120157329A1 (en) | 2012-06-21 |
| EP1947194A4 (en) | 2010-01-20 |
| BRPI0617889A2 (pt) | 2011-08-09 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2008120600A (ru) | СПОСОБ И УСТРОЙСТВО ДЛЯ АНАЛИЗА IN VITRO mPHK ИЗ ГЕНОВ, УЧАСТВУЮЩИХ В РАЗВИТИИ ГЕМАТОЛОГИЧЕСКИХ НЕОПЛАЗИЙ | |
| US12139765B2 (en) | Methods for subtyping of lung squamous cell carcinoma | |
| US12139763B2 (en) | Methods for subtyping of lung adenocarcinoma | |
| US20190249260A1 (en) | Method for Using Gene Expression to Determine Prognosis of Prostate Cancer | |
| US7026121B1 (en) | Methods and compositions for diagnosing and monitoring transplant rejection | |
| US7622253B2 (en) | Classification of patients having diffuse large b-cell lymphoma based upon gene expression | |
| US20230366034A1 (en) | Compositions and methods for diagnosing lung cancers using gene expression profiles | |
| US6905827B2 (en) | Methods and compositions for diagnosing or monitoring auto immune and chronic inflammatory diseases | |
| US20060003327A1 (en) | Peripheral blood cell markers useful for diagnosing multiple sclerosis and methods and kits utilizing same | |
| US20100087330A1 (en) | Breast cancer gene array | |
| US20040018513A1 (en) | Classification and prognosis prediction of acute lymphoblastic leukemia by gene expression profiling | |
| CA2537254A1 (en) | Methods for identifying, diagnosing, and predicting survival of lymphomas | |
| CA2897828A1 (en) | Methods for identifying, diagnosing, and predicting survival of lymphomas | |
| JP6164689B2 (ja) | 乳癌術前化学療法に対する感受性の診断補助方法および判定装置 | |
| US20210395825A1 (en) | Urine biomarkers for detecting graft rejection | |
| AU2015227398B2 (en) | Method for using gene expression to determine prognosis of prostate cancer | |
| JP2022061491A (ja) | 慢性副鼻腔炎の患者を分類するためのデータの取得方法、およびその利用 | |
| KR102061950B1 (ko) | 방사선 치료에 대한 직장암의 예후 예측용 조성물 | |
| US20200340036A1 (en) | Dna sequences related to diagnosis and treatment of systemic inflammatory response syndrome | |
| US20250191689A1 (en) | Methods for subtyping and treatment of head and neck squamous cell carcinoma | |
| US20230125549A1 (en) | Methods and compositions for assessing immune response in murine tumor models | |
| Nagle et al. | Novel three gene molecular signature for prostate cancer recurrence. | |
| CN120866519A (zh) | 用于肺癌免疫治疗适用性的检测系统及方法 | |
| CN116042823A (zh) | 用于食管鳞癌预后及疗法疗效评估的分子标记物及其应用 | |
| MX2008004462A (en) | Method and device for the in vitro analysis of mrna of genes involved in haematological neoplasias |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20130509 |