[go: up one dir, main page]

RU2008114304A - INHIBITING VIRAL EXPRESSION OF GENES USING SMALL INTERFERING RNA - Google Patents

INHIBITING VIRAL EXPRESSION OF GENES USING SMALL INTERFERING RNA Download PDF

Info

Publication number
RU2008114304A
RU2008114304A RU2008114304/13A RU2008114304A RU2008114304A RU 2008114304 A RU2008114304 A RU 2008114304A RU 2008114304/13 A RU2008114304/13 A RU 2008114304/13A RU 2008114304 A RU2008114304 A RU 2008114304A RU 2008114304 A RU2008114304 A RU 2008114304A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
seq
sequence
rna
small interfering
nucleotides
Prior art date
Application number
RU2008114304/13A
Other languages
Russian (ru)
Inventor
Роджер Л. КАСПАР (US)
Роджер Л. КАСПАР
Хейни ИЛЬВЕС (US)
Хейни ИЛЬВЕС
Аттила А. СЕЙХАН (US)
Аттила А. СЕЙХАН
Александр В. ВЛАССОВ (US)
Александр В. ВЛАССОВ
Брайан Х. ДЖОНСТОН (US)
Брайан Х. ДЖОНСТОН
Original Assignee
Сомадженикс Инк. (Us)
Сомадженикс Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from PCT/US2005/032768 external-priority patent/WO2006031901A2/en
Application filed by Сомадженикс Инк. (Us), Сомадженикс Инк. filed Critical Сомадженикс Инк. (Us)
Publication of RU2008114304A publication Critical patent/RU2008114304A/en

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1131—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against viruses
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/713—Double-stranded nucleic acids or oligonucleotides
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/11—Antisense
    • C12N2310/111—Antisense spanning the whole gene, or a large part of it
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/14—Type of nucleic acid interfering nucleic acids [NA]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/50—Physical structure
    • C12N2310/53—Physical structure partially self-complementary or closed
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2770/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
    • C12N2770/00011—Details
    • C12N2770/24011—Flaviviridae
    • C12N2770/24211—Hepacivirus, e.g. hepatitis C virus, hepatitis G virus
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2770/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
    • C12N2770/00011—Details
    • C12N2770/36011—Togaviridae
    • C12N2770/36111—Alphavirus, e.g. Sindbis virus, VEE, EEE, WEE, Semliki

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

1. Последовательность РНК, состоящая из ! а) первой последовательности РНК, где первой последовательностью РНК является SEQ ID NO:34, (SEQ ID NO:35), (SEQ ID NO:36), (SEQ ID NO:37), (SEQ ID NO:38), (SEQ ID NO:39), (SEQ ID NO:40), (SEQ ID NO:41), (SEQ ID NO:42), (SEQ ID NO:43), (SEQ ID NO:44), (SEQ ID NO:45), (SEQ ID NO:46), (SEQ ID NO:47), (SEQ ID NO:48), (SEQ ID NO:49), (SEQ ID NO:50), (SEQ ID NO:51), (SEQ ID NO:52), (SEQ ID NO:53), (SEQ ID NO:54), (SEQ ID NO:55), (SEQ ID NO:56) или последовательность, которая отличается от вышеуказанной последовательности одним, двумя или тремя нуклеотидами; ! в) второй последовательности РНК, которая комплементарна первой последовательности; ! с) последовательности петли, расположенной между первой и второй последовательностью нуклеиновой кислоты, где последовательность петли состоит из 4-10 нуклеотидов; и ! d) необязательно, двух нуклеотидных выступов. ! 2. Последовательность РНК по п.1, где первой последовательностью РНК является SEQ ID NO:34, SEQ ID NO:35, SEQ ID NO:36, SEQ ID NO:37, SEQ ID NO:38, SEQ ID NO:39, SEQ ID NO:40, SEQ ID NO:41, SEQ ID NO:42, SEQ ID NO:43, SEQ ID NO:44, SEQ ID NO:45, SEQ ID NO:46, SEQ ID NO:47, SEQ ID NO:48, SEQ ID NO:49, SEQ ID NO:50, SEQ ID NO:51, SEQ ID NO:52, SEQ ID NO:53, SEQ ID NO:54, SEQ ID NO:55, SEQ ID NO:56. ! 3. Последовательность РНК по п.1, где последовательность РНК содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеотид. ! 4. Последовательность РНК по п.1, где последовательность петли являются 4 нуклеотида, 5 нуклеотидов, 6 нуклеотидов, 7 нуклеотидов, 8 нуклеотидов, 9 нуклеотидов, 10 нуклеотидов или по меньшей мере десять нуклеотидов. ! 5. мшРНК, содержащая последовательность нуклеиновой кислоты по п.1 и комплементарную последовательность последовательности по п.1, связанную посредством петли, содержащая по меньшей мере одну ненуклеотидную молекулу. ! 6. мшРНК, содержащая последовательность нуклеиновой кислоты по п.4, где петля находится в 3'-полож1. RNA sequence consisting of! a) the first RNA sequence, where the first RNA sequence is SEQ ID NO: 34, (SEQ ID NO: 35), (SEQ ID NO: 36), (SEQ ID NO: 37), (SEQ ID NO: 38), ( SEQ ID NO: 39), (SEQ ID NO: 40), (SEQ ID NO: 41), (SEQ ID NO: 42), (SEQ ID NO: 43), (SEQ ID NO: 44), (SEQ ID NO: 45), (SEQ ID NO: 46), (SEQ ID NO: 47), (SEQ ID NO: 48), (SEQ ID NO: 49), (SEQ ID NO: 50), (SEQ ID NO: 51), (SEQ ID NO: 52), (SEQ ID NO: 53), (SEQ ID NO: 54), (SEQ ID NO: 55), (SEQ ID NO: 56) or a sequence that differs from the above sequence one, two or three nucleotides; ! c) a second RNA sequence that is complementary to the first sequence; ! c) a loop sequence located between the first and second nucleic acid sequence, where the loop sequence consists of 4-10 nucleotides; and! d) optionally, two nucleotide protrusions. ! 2. The RNA sequence of claim 1, wherein the first RNA sequence is SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 51, SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 56. ! 3. The RNA sequence according to claim 1, where the RNA sequence contains at least one modified nucleotide. ! 4. The RNA sequence of claim 1, wherein the loop sequence is 4 nucleotides, 5 nucleotides, 6 nucleotides, 7 nucleotides, 8 nucleotides, 9 nucleotides, 10 nucleotides or at least ten nucleotides. ! 5. mshRNA containing the nucleic acid sequence according to claim 1 and the complementary sequence of the sequence according to claim 1, linked via a loop containing at least one non-nucleotide molecule. ! 6. mshRNA containing the nucleic acid sequence according to claim 4, where the loop is in the 3'-position

Claims (61)

1. Последовательность РНК, состоящая из1. The sequence of RNA, consisting of а) первой последовательности РНК, где первой последовательностью РНК является SEQ ID NO:34, (SEQ ID NO:35), (SEQ ID NO:36), (SEQ ID NO:37), (SEQ ID NO:38), (SEQ ID NO:39), (SEQ ID NO:40), (SEQ ID NO:41), (SEQ ID NO:42), (SEQ ID NO:43), (SEQ ID NO:44), (SEQ ID NO:45), (SEQ ID NO:46), (SEQ ID NO:47), (SEQ ID NO:48), (SEQ ID NO:49), (SEQ ID NO:50), (SEQ ID NO:51), (SEQ ID NO:52), (SEQ ID NO:53), (SEQ ID NO:54), (SEQ ID NO:55), (SEQ ID NO:56) или последовательность, которая отличается от вышеуказанной последовательности одним, двумя или тремя нуклеотидами;a) the first RNA sequence, where the first RNA sequence is SEQ ID NO: 34, (SEQ ID NO: 35), (SEQ ID NO: 36), (SEQ ID NO: 37), (SEQ ID NO: 38), ( SEQ ID NO: 39), (SEQ ID NO: 40), (SEQ ID NO: 41), (SEQ ID NO: 42), (SEQ ID NO: 43), (SEQ ID NO: 44), (SEQ ID NO: 45), (SEQ ID NO: 46), (SEQ ID NO: 47), (SEQ ID NO: 48), (SEQ ID NO: 49), (SEQ ID NO: 50), (SEQ ID NO: 51), (SEQ ID NO: 52), (SEQ ID NO: 53), (SEQ ID NO: 54), (SEQ ID NO: 55), (SEQ ID NO: 56) or a sequence that differs from the above sequence one, two or three nucleotides; в) второй последовательности РНК, которая комплементарна первой последовательности;c) a second RNA sequence that is complementary to the first sequence; с) последовательности петли, расположенной между первой и второй последовательностью нуклеиновой кислоты, где последовательность петли состоит из 4-10 нуклеотидов; иc) a loop sequence located between the first and second nucleic acid sequence, where the loop sequence consists of 4-10 nucleotides; and d) необязательно, двух нуклеотидных выступов.d) optionally, two nucleotide protrusions. 2. Последовательность РНК по п.1, где первой последовательностью РНК является SEQ ID NO:34, SEQ ID NO:35, SEQ ID NO:36, SEQ ID NO:37, SEQ ID NO:38, SEQ ID NO:39, SEQ ID NO:40, SEQ ID NO:41, SEQ ID NO:42, SEQ ID NO:43, SEQ ID NO:44, SEQ ID NO:45, SEQ ID NO:46, SEQ ID NO:47, SEQ ID NO:48, SEQ ID NO:49, SEQ ID NO:50, SEQ ID NO:51, SEQ ID NO:52, SEQ ID NO:53, SEQ ID NO:54, SEQ ID NO:55, SEQ ID NO:56.2. The RNA sequence of claim 1, wherein the first RNA sequence is SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 51, SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 56. 3. Последовательность РНК по п.1, где последовательность РНК содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеотид.3. The RNA sequence according to claim 1, where the RNA sequence contains at least one modified nucleotide. 4. Последовательность РНК по п.1, где последовательность петли являются 4 нуклеотида, 5 нуклеотидов, 6 нуклеотидов, 7 нуклеотидов, 8 нуклеотидов, 9 нуклеотидов, 10 нуклеотидов или по меньшей мере десять нуклеотидов.4. The RNA sequence of claim 1, wherein the loop sequence is 4 nucleotides, 5 nucleotides, 6 nucleotides, 7 nucleotides, 8 nucleotides, 9 nucleotides, 10 nucleotides, or at least ten nucleotides. 5. мшРНК, содержащая последовательность нуклеиновой кислоты по п.1 и комплементарную последовательность последовательности по п.1, связанную посредством петли, содержащая по меньшей мере одну ненуклеотидную молекулу.5. mshRNA containing the nucleic acid sequence according to claim 1 and the complementary sequence of the sequence according to claim 1, connected by a loop containing at least one non-nucleotide molecule. 6. мшРНК, содержащая последовательность нуклеиновой кислоты по п.4, где петля находится в 3'-положении относительно смысловой нити и 5'-положении относительно комплементарной антисмысловой нити мшРНК.6. mshRNA containing the nucleic acid sequence according to claim 4, where the loop is in the 3'-position relative to the sense strand and 5'-position relative to the complementary antisense strand of mshRNA. 7. мшРНК, содержащая последовательность нуклеиновой кислоты по п.4, где петля находится в 3'-положении относительно антисмысловой нити и 5'-положении относительно комплементарной смысловой нити мшРНК.7. mshRNA containing the nucleic acid sequence according to claim 4, where the loop is in the 3'-position relative to the antisense strand and 5'-position relative to the complementary sense strand of the mshRNA. 8. Последовательность РНК по п.1, где последовательность РНК содержит два нуклеотидных выступа, которые представляют собой 3'-UU.8. The RNA sequence according to claim 1, where the RNA sequence contains two nucleotide protrusions, which are 3'-UU. 9. Последовательность РНК по любому одному из пп.1-8, где первой последовательностью является SEQ ID NO:33, SEQ ID NO:55 или SEQ ID NO:56.9. The RNA sequence according to any one of claims 1 to 8, where the first sequence is SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 55 or SEQ ID NO: 56. 10. Последовательность РНК по п.1, где последовательностью является любая SEQ ID NO:57-59, SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:16, SEQ ID NO:17 или SEQ ID NO:18.10. The RNA sequence of claim 1, wherein the sequence is any SEQ ID NO: 57-59, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 17, or SEQ ID NO: 18. 11. Последовательность ДНК, содержащая последовательность, кодирующую РНК по любому из пп.1-10.11. The DNA sequence containing the sequence encoding the RNA according to any one of claims 1 to 10. 12. Вектор эксперссии, содержащий последовательность ДНК по п.11.12. An examination vector containing the DNA sequence of claim 11. 13. Ретровирусный вектор, содержащий последовательность ДНК по п.11.13. A retroviral vector containing the DNA sequence of claim 11. 14. Ретровирусный вектор по п.13, где при инфицировании клетки вектором продуцируется провирус, который может экспрессировать последовательность РНК по п.1.14. The retroviral vector according to item 13, where upon infection of the cell with the vector, a provirus is produced that can express the RNA sequence according to claim 1. 15. Композиция, содержащая последовательность РНК по любому из пп.1-10 и фармацевтически приемлемый эксципиент.15. A composition comprising an RNA sequence according to any one of claims 1 to 10 and a pharmaceutically acceptable excipient. 16. Композиция, содержащая вектор, содержащий последовательность, кодирующую последовательность РНК по любому из пп.1-10.16. A composition comprising a vector containing a sequence encoding an RNA sequence according to any one of claims 1 to 10. 17. Композиция по п.15, содержащая по меньшей мере две последовательности РНК по п.1.17. The composition according to clause 15, containing at least two RNA sequences according to claim 1. 18. Способ ингибирования экспрессии или активности вируса гепатита C, где способ включает18. A method of inhibiting the expression or activity of hepatitis C virus, where the method includes а) получение клетки, которая может экспрессировать вирус гепатита C; иa) obtaining a cell that can express hepatitis C virus; and в) контактирование клетки с последовательностью РНК по любому из пп.1-10.C) contacting the cell with the RNA sequence according to any one of claims 1 to 10. 19. Способ по п.18, где клетка находится в млекопитающем.19. The method of claim 18, wherein the cell is in a mammal. 20. Способ по п.18, где млекопитающим является человек.20. The method of claim 18, wherein the mammal is a human. 21. Способ по п.18, где млекопитающим является нечеловекообразный примат.21. The method of claim 18, wherein the mammal is a non-human primate. 22. Способ по п.18, где клетка контактирует по меньшей мере с двумя различными последовательностями РНК по п.1.22. The method according to p, where the cell is in contact with at least two different RNA sequences according to claim 1. 23. Способ, включающий23. A method comprising а) идентификацию индивида, инфицированного или у которого имеется подозрение на инфицирование вирусом гепатита C;a) the identification of an individual infected with or suspected of being infected with hepatitis C virus; в) введение индивиду терапевтически эффективного количества композиции по любому из пп.15, 16 или 17.c) administering to the individual a therapeutically effective amount of a composition according to any one of claims 15, 16 or 17. 24. Способ по п.23, дополнительно включающий определение того, действительно ли снижается вирусная нагрузка у индивида после стадии (в).24. The method according to item 23, further comprising determining whether the viral load of the individual is actually reduced after stage (c). 25. Способ по п.23, дополнительно включающий после стадии (в) определение того, действительно ли снижается по меньшей мере уровень одного из вирусных белков или вирусных последовательностей нуклеиновой кислоты у индивида.25. The method of claim 23, further comprising after step (c) determining whether or not at least one of the viral proteins or viral nucleic acid sequences of the individual is reduced. 26. Способ ингибирования экспрессии генов в вирусе, где способ включает введение малой интерферирующей РНК в вируссодержащую клетку, где малая интерферирующая РНК содержит последовательность, которая по меньшей мере частично комплементарна полинуклеотидной последовательности вируса, где взаимодействие по меньшей мере частично комплементарной последовательности малой интерферирующей РНК с указанной полинуклеотидной последовательностью вируса приводит к ингибированию экспрессии генов в вирусе.26. A method of inhibiting gene expression in a virus, wherein the method comprises introducing a small interfering RNA into a virus-containing cell, where the small interfering RNA contains a sequence that is at least partially complementary to the polynucleotide sequence of the virus, where the interaction is at least partially complementary to the sequence of the small interfering RNA with said the polynucleotide sequence of the virus leads to inhibition of gene expression in the virus. 27. Способ по п.26, где малой интерферирующей РНК является мшРНК.27. The method according to p, where the small interfering RNA is mshRNA. 28. Способ по п.26, где малой интерферирующей РНК является миРНК.28. The method of claim 26, wherein the small interfering RNA is siRNA. 29. Способ по любому из пп.26-28, где малая интерферирующая РНК распознает вирусную последовательность из примерно 19-30 нуклеотидов.29. The method according to any one of claims 26 to 28, wherein the small interfering RNA recognizes a viral sequence of about 19-30 nucleotides. 30. Способ по п.26, где вирусом является вирус гепатита C.30. The method according to p, where the virus is hepatitis C. 31. Способ по п.30, где малая интерферирующая РНК взаимодействует с последовательностью сайта внутренней посадки рибосомы (IRES) вируса гепатита C,31. The method of claim 30, wherein the small interfering RNA interacts with the sequence of the hepatitis C virus ribosome internal landing site (IRES), 32. Способ по п.31, где последовательность IRES включает последовательность, показанную в SEQ ID NO:11.32. The method according to p, where the IRES sequence includes the sequence shown in SEQ ID NO: 11. 33. Способ по п.32, где малая интерферирующая РНК узнает вирусную последовательность из от примерно 19 до примерно 30 нуклеотидов в области, показанной в SEQ ID NO:26.33. The method of claim 32, wherein the small interfering RNA recognizes a viral sequence of from about 19 to about 30 nucleotides in the region shown in SEQ ID NO: 26. 34. Способ по любому из пп.30-33, где малой интерферирующей РНК является мшРНК.34. The method according to any one of claims 30-33, wherein the small interfering RNA is mshRNA. 35. Способ по п.34, где мшРНК содержит последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:27, SEQ ID NO:32 и SEQ ID NO:33.35. The method according to clause 34, where the mshRNA contains a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 32 and SEQ ID ID NO: 33. 36. Способ по п.35, где мшРНК имеет последовательность, показанную в SEQ ID NO:12.36. The method according to clause 35, where the mRNA has the sequence shown in SEQ ID NO: 12. 37. Способ по любому из пп.30-33, где малой интерферирующей РНК является миРНК.37. The method according to any one of claims 30-33, wherein the small interfering RNA is siRNA. 38. Способ по п.37, где миРНК включает последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:27, SEQ ID NO:32 и SEQ ID NO:33.38. The method according to clause 37, where the siRNA comprises a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 32 and SEQ ID NO: 33. 39. Способ лечения вирусной инфекции у млекопитающего, где указанный способ включает введение млекопитающему композиции, содержащей терапевтически эффективное количество малой интерферирующей РНК, которая содержит последовательность, которая по меньшей мере частично комплементарна полинуклеотидной последовательности вируса, где взаимодействие указанной по меньшей мере частично комплементарной последовательности малой интерферирующей РНК с указанной полинуклеотидной последовательностью вируса приводит к ингибированию экспрессии генов в вирусе.39. A method of treating a viral infection in a mammal, wherein said method comprises administering to the mammal a composition comprising a therapeutically effective amount of a small interfering RNA, which comprises a sequence that is at least partially complementary to the polynucleotide sequence of the virus, where the interaction of said at least partially complementary small interfering sequence RNA with the indicated polynucleotide sequence of the virus leads to inhibition of express and genes in the virus. 40. Способ по п.39, где малой интерферирующей РНК является мшРНК.40. The method according to § 39, where the small interfering RNA is mshRNA. 41. Способ по п.39, где малой интерферирующей РНК является миРНК.41. The method according to § 39, where the small interfering RNA is siRNA. 42. Способ по любому из пп.39-41, где малая интерферирующая РНК распознает вирусную последовательность из примерно 19-30 нуклеотидов.42. The method according to any one of claims 39-41, wherein the small interfering RNA recognizes a viral sequence of about 19-30 nucleotides. 43. Способ по п.39, где указанным млекопитающим является человек и вирусная инфекция включает вирус гепатита C.43. The method according to § 39, where the specified mammal is a human and a viral infection includes hepatitis C. 44. Способ по п.43, где малая интерферирующая РНК содержит последовательность, которая по меньшей мере частично комплементарна полинуклеотидной последовательности в последовательности IRES вируса гепатита C.44. The method according to item 43, where the small interfering RNA contains a sequence that is at least partially complementary to the polynucleotide sequence in the IRES sequence of hepatitis C. 45. Способ по п.44, где последовательность IRES содержит последовательность, показанную в SEQ ID NO:11.45. The method according to item 44, where the IRES sequence contains the sequence shown in SEQ ID NO: 11. 46. Способ по п.45, где связи малой интерферирующей РНК распознают последовательность из примерно 19-30 нуклеотидов в области, показанной в SEQ ID NO:26.46. The method according to item 45, where the connection of a small interfering RNA recognize a sequence of about 19-30 nucleotides in the region shown in SEQ ID NO: 26. 47. Способ по любому из пп.43-46, где малой интерферирующей РНК является мшРНК.47. The method according to any one of claims 43-46, wherein the small interfering RNA is mshRNA. 48. Способ по п.47, где мшРНК содержит последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:24 и SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:27, SEQ ID NO:32 и SEQ ID NO:33.48. The method according to clause 47, where the mshRNA contains a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 24 and SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 32 and SEQ ID NO: 33. 49. Способ по п.48, где мшРНК имеет последовательность, показанную в SEQ ID NO:12.49. The method of claim 48, wherein the mshRNA has the sequence shown in SEQ ID NO: 12. 50. Способ по любому из пп.43-46, где малой интерферирующей РНК является миРНК.50. The method according to any one of claims 43-46, wherein the small interfering RNA is siRNA. 51. Способ по п.50, где миРНК содержит последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:24 и SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:27, SEQ ID NO:32 и SEQ ID NO:33.51. The method of claim 50, wherein the siRNA comprises a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 24 and SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 32 and SEQ ID NO: 33. 52. Композиция, содержащая миРНК, содержащую последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:24 и SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:27, SEQ ID NO:32 и SEQ ID NO:33.52. A composition comprising siRNA containing a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 24 and SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 32 and SEQ ID NO: 33. 53. Композиция, содержащая миРНК, содержащую последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:25 и SEQ ID NO:27, SEQ ID NO:32 и SEQ ID NO:33.53. A composition comprising siRNA containing a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 25 and SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 32 and SEQ ID NO: 33. 54. Фармацевтическая композиция, содержащая мшРНК по п.52 и фармацевтически приемлемый эксципиент.54. A pharmaceutical composition comprising the mshRNA of claim 52 and a pharmaceutically acceptable excipient. 55. Фармацевтическая композиция, содержащая миРНК по п.53 и фармацевтически приемлемый эксципиент.55. A pharmaceutical composition comprising siRNA according to claim 53 and a pharmaceutically acceptable excipient. 56. Набор, содержащий мшРНК и инструкцию по применению в способе по любому из пп.26, 30-33, 39, 43-46 и 18-25.56. A kit containing mshRNA and instructions for use in the method according to any one of claims 26, 30-33, 39, 43-46 and 18-25. 57. Набор по п.56, где мшРНК содержит последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO:12, SEQ ID NO:17, SEQ ID NO:18, SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:25, SEQ ID NO:27, SEQ ID NO:32 и SEQ ID NO:33.57. The kit of claim 56, wherein the mshRNA comprises a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 32 and SEQ ID NO: 33. 58. Набор, содержащий миРНК и инструкцию по применению в способе по любому из пп.25, 29-32, 38 и 42-45.58. A kit containing siRNA and instructions for use in the method according to any one of paragraphs.25, 29-32, 38 and 42-45. 59. Набор по п.58, где миРНК содержит последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO:19, SEQ ID NO:20, SEQ ID NO:21, SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:23, SEQ ID NO:24, SEQ ID NO:25 и SEQ ID NO:27, SEQ ID NO:32 и SEQ ID NO:33.59. The kit of claim 58, wherein the siRNA contains a sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 25 and SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 32 and SEQ ID NO: 33. 60. Способ по п.43, где вирус гепатита C представляет собой генотип 1a.60. The method according to item 43, where the hepatitis C virus is genotype 1a. 61. Способ по п.39, где млекопитающим является человек. 61. The method of claim 39, wherein the mammal is a human.
RU2008114304/13A 2005-09-12 2006-06-01 INHIBITING VIRAL EXPRESSION OF GENES USING SMALL INTERFERING RNA RU2008114304A (en)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PCT/US2005/032768 WO2006031901A2 (en) 2004-09-10 2005-09-12 SMALL INTERFERING RNAs THAT EFFICIENTLY INHIBIT VIRAL GENE EXPRESSION AND METHODS OF USE THEREOF
USPCT/US2005/032768 2005-09-12

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2008114304A true RU2008114304A (en) 2009-11-20

Family

ID=37708176

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2008114304/13A RU2008114304A (en) 2005-09-12 2006-06-01 INHIBITING VIRAL EXPRESSION OF GENES USING SMALL INTERFERING RNA

Country Status (9)

Country Link
EP (1) EP1979480A2 (en)
JP (1) JP2009521207A (en)
KR (1) KR20090003147A (en)
CN (2) CN102827841A (en)
AU (1) AU2006291568A1 (en)
BR (1) BRPI0615717A2 (en)
CA (1) CA2622242A1 (en)
RU (1) RU2008114304A (en)
WO (1) WO2007032794A2 (en)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2624045C2 (en) * 2010-08-17 2017-06-30 Сирна Терапьютикс,Инк RNA INTERFERENCE MEDIATED INHIBITION OF HEPATITIS B VIRUS (HBV) GENE EXPRESSION USING SHORT INTERFERING NUCLEIC ACID (siNA)

Families Citing this family (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2009042115A2 (en) * 2007-09-24 2009-04-02 Rosetta Inpharmatics Llc Methods of designing short hairpin rnas (shrnas) for gene silencing
JP2012504389A (en) * 2008-09-22 2012-02-23 ダイセルナ ファーマシューティカルズ， インコーポレイテッド Compositions and methods for specific inhibition of gene expression by dsRNA with modifications
EP2352744B1 (en) 2008-10-15 2016-09-21 Somagenics, Inc. Short hairpin rnas for inhibition of gene expression
KR101728655B1 (en) * 2008-12-18 2017-04-19 다이서나 파마수이티컬, 인크. Extended dicer substrate agents and methods for the specific inhibition of gene expression
WO2011008730A2 (en) 2009-07-13 2011-01-20 Somagenics Inc. Chemical modification of small hairpin rnas for inhibition of gene expression
JOP20200092A1 (en) 2014-11-10 2017-06-16 Alnylam Pharmaceuticals Inc HEPATITIS B VIRUS (HBV) iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
KR101668954B1 (en) 2015-05-29 2016-10-24 연세대학교 산학협력단 Therapeutic HCV IRES-silencing siRNA for the treatment of hepatitis C virus infection
BR112019012057A2 (en) 2016-12-15 2019-11-12 Meharry Medical College antiviral agent, pharmaceutical composition for its administration and methods for reducing zika virus (zikv) replication and treating zika virus-mediated disease
US11324820B2 (en) 2017-04-18 2022-05-10 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Methods for the treatment of subjects having a hepatitis b virus (HBV) infection
EA202190528A1 (en) 2018-08-13 2021-04-23 Элнилэм Фармасьютикалз, Инк. COMPOSITIONS OF HEPATITIS B VIRUS (HBV) dsRNA AGENTS AND METHODS OF THEIR APPLICATION
KR102835107B1 (en) * 2021-03-25 2025-07-18 고려대학교 산학협력단 siRNA for preventing or treating COVID-19 having miRNA-like activity and pharmaceutical composition comprising the same

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2003070750A2 (en) * 2002-02-20 2003-08-28 Sirna Therapeutics, Inc Rna interference mediated inhibition of hepatitis c virus
JP2008512500A (en) * 2004-09-10 2008-04-24 ソマジェニックス インコーポレーティッド Small interfering RNA that efficiently inhibits viral gene expression and method of use thereof
CN100344331C (en) * 2004-09-22 2007-10-24 广州拓谱基因技术有限公司 Targeted small interference RNA formulation for preventing and treating Hepatitis C and its preparation method

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2624045C2 (en) * 2010-08-17 2017-06-30 Сирна Терапьютикс,Инк RNA INTERFERENCE MEDIATED INHIBITION OF HEPATITIS B VIRUS (HBV) GENE EXPRESSION USING SHORT INTERFERING NUCLEIC ACID (siNA)
RU2745848C2 (en) * 2010-08-17 2021-04-01 Сирна Терапьютикс, Инк. RNA INTERFERENCE-MEDIATED INHIBITION OF HEPATITIS B VIRUS (HBV) GENE EXPRESSION WITH THE USE OF A SMALL INTERFERING NUCLEIC ACID (siNA)

Also Published As

Publication number Publication date
BRPI0615717A2 (en) 2011-05-24
WO2007032794A2 (en) 2007-03-22
CA2622242A1 (en) 2007-03-22
CN101305095A (en) 2008-11-12
CN102827841A (en) 2012-12-19
CN101305095B (en) 2012-09-26
WO2007032794A3 (en) 2007-08-30
KR20090003147A (en) 2009-01-09
AU2006291568A1 (en) 2007-03-22
EP1979480A2 (en) 2008-10-15
JP2009521207A (en) 2009-06-04

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CA2165821C (en) Antisense oligonucleotides and therapeutic use thereof in human immunodeficiency virus infection
Lulla et al. Targeting the conserved stem loop 2 motif in the SARS-CoV-2 genome
AU2024203581A1 (en) Oligonucleotides for reduction of PD-L1 expression
ES2639568T3 (en) Method to design a drug regimen for HIV-infected patients
JP2008532477A5 (en)
RU2008114304A (en) INHIBITING VIRAL EXPRESSION OF GENES USING SMALL INTERFERING RNA
CN113249380B (en) Antisense oligonucleotide targeting COVID-19 novel coronavirus, NATAC chimeric molecule and application thereof
US20140378526A1 (en) Design of nucleic acid binding molecules with non-watson crick and non-canonical pairing based on artificial mutation consensus sequences to counter escape mutations
US9328347B2 (en) siRNA useful in the treatment of flavivirus infection
Bassett et al. Lessons learned and yet-to-Be learned on the importance of RNA structure in SARS-CoV-2 replication
US20060293267A1 (en) Dual functional oligonucleotides for use as anti-viral agents
EP2071030A2 (en) Oligoribonucleotide or peptide nucleic acid which inhibits action of hepatitis C virus
CN107326067B (en) A miRNA marker for nonalcoholic fatty liver disease
Blazquez et al. U1 interference (U1i) for antiviral approaches
US20050171041A1 (en) Virally-encoded RNAs as substrates, inhibitors and delivery vehicles for RNAi
CN118599838A (en) A siRNA targeting transcription factor ZNF25 and its application
El Awady et al. Antisense oligonucleotide inhibition of hepatitis C virus genotype 4 replication in HepG2 cells
Lulla et al. The stem loop 2 motif is a site of vulnerability for SARS-CoV-2
CN109266684B (en) A method for constructing a sensitive animal model of pathogenic infection
US20220119812A1 (en) Micro rna interactions as therapeutic targets for covid-19 and other viral infections
US20090203890A1 (en) Hepatitis c antivirals
KR100435634B1 (en) RNA Which Binds to HIV-1 Nucleocapsid
RU2021122162A (en) NEW FISH CORONAVIRUS
Baldassarre et al. Non-Coding RNAs and Innovative Therapeutic Strategies to Target the 5’UTR of SARS-CoV-2
Kwok Crosslinked Helical Fork: Towards a Rationally Designed Encodable Scaffold for the Sequence-Specific Targeting of Double-Stranded RNA