[go: up one dir, main page]

RU2005132940A - Способ детекции специфических фрагментов днк или рнк с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени - Google Patents

Способ детекции специфических фрагментов днк или рнк с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени Download PDF

Info

Publication number
RU2005132940A
RU2005132940A RU2005132940/13A RU2005132940A RU2005132940A RU 2005132940 A RU2005132940 A RU 2005132940A RU 2005132940/13 A RU2005132940/13 A RU 2005132940/13A RU 2005132940 A RU2005132940 A RU 2005132940A RU 2005132940 A RU2005132940 A RU 2005132940A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
real time
chain reaction
polymerase chain
specific dna
rna fragments
Prior art date
Application number
RU2005132940/13A
Other languages
English (en)
Inventor
Алексей Викторович Чемерис (RU)
Алексей Викторович Чемерис
Юрий Михайлович Никоноров (RU)
Юрий Михайлович Никоноров
Май Леонидовна Романенкова (RU)
Майя Леонидовна Романенкова
Дмитрий Алексеевич Чемерис (RU)
Дмитрий Алексеевич Чемерис
Равиль Ринатович Гарафутдинов (RU)
Равиль Ринатович Гарафутдинов
Роза Азатовна Магазова (RU)
Роза Азатовна Магазова
Григорий Владимирович Малеев (RU)
Григорий Владимирович Малеев
Венер Абсатарович Вахитов (RU)
Венер Абсатарович Вахитов
Раиф Га нович Василов (RU)
Раиф Гаянович Василов
Original Assignee
Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН (RU)
Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН (RU), Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН filed Critical Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН (RU)
Priority to RU2005132940/13A priority Critical patent/RU2005132940A/ru
Priority to EP06122934A priority patent/EP1780291A1/en
Priority to JP2006289339A priority patent/JP2007125011A/ja
Priority to US11/553,223 priority patent/US8198026B2/en
Publication of RU2005132940A publication Critical patent/RU2005132940A/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/686Polymerase chain reaction [PCR]

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Claims (2)

1. Способ амплификации специфических фрагментов ДНК или РНК с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени, отличающийся тем, что в нем не требуется применения гибридизационных зондов, а используются не образующие вторичных структур олигонуклеотидные праймеры, несущие в своем составе флуоресцентные красители и отжигающиеся на мишени в непосредственной близости друг от друга или даже с небольшим перекрытием, обеспечивая тем самым флуоресцентный резонансный перенос энергии между красителем-донором и красителем-акцептором, входящими соответственно в состав прямого и обратного праймеров и где детекция накопления целевых продуктов амплификации ведется путем регистрации увеличения свечения акцепторного флуорохрома.
2. Способ по п.1, отличающийся тем, что в состав прямого и обратного праймеров входят флуоресцентный краситель и универсальный гаситель, соответственно, а детекция накопления целевых продуктов амплификации ведется путем регистрации снижения свечения флуорохрома за счет возникающего эффекта гашения.
RU2005132940/13A 2005-10-26 2006-03-01 Способ детекции специфических фрагментов днк или рнк с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени RU2005132940A (ru)

Priority Applications (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2005132940/13A RU2005132940A (ru) 2006-03-01 2006-03-01 Способ детекции специфических фрагментов днк или рнк с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени
EP06122934A EP1780291A1 (en) 2006-03-01 2006-10-25 Method of detecting specific fragments of DNA or RNA with the aid of a polymerase chain reaction
JP2006289339A JP2007125011A (ja) 2006-03-01 2006-10-25 ポリメラーゼ連鎖反応の助けによりdna又はrnaの特定のフラグメントを検出する方法
US11/553,223 US8198026B2 (en) 2005-10-26 2006-10-26 Method of detecting specific fragments of DNA or RNA with the aid of a real-time polymerase chain reaction

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2005132940/13A RU2005132940A (ru) 2006-03-01 2006-03-01 Способ детекции специфических фрагментов днк или рнк с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2005132940A true RU2005132940A (ru) 2007-11-27

Family

ID=37529272

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2005132940/13A RU2005132940A (ru) 2005-10-26 2006-03-01 Способ детекции специфических фрагментов днк или рнк с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени

Country Status (4)

Country Link
US (1) US8198026B2 (ru)
EP (1) EP1780291A1 (ru)
JP (1) JP2007125011A (ru)
RU (1) RU2005132940A (ru)

Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7393646B2 (en) 2005-06-20 2008-07-01 Cargill, Inc. Method, apparatus and system for quantifying the content of genetically modified material in a sample
RU2413770C2 (ru) * 2007-06-14 2011-03-10 Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН Способ проведения полимеразной цепной реакции с помощью конвекции
CN101809170B (zh) * 2007-09-28 2014-08-20 3M创新有限公司 用于检测核酸的双寡核苷酸方法
EP2853601B1 (en) * 2008-07-18 2016-09-21 TrovaGene, Inc. Methods for PCR-based detection of "ultra short" nucleic acid sequences
US20100159452A1 (en) * 2008-12-22 2010-06-24 Roche Molecular Systems, Inc. Method For Detecting a Target Nucleic Acid in a Sample
EP4570924A3 (en) * 2013-01-24 2025-09-03 California Institute of Technology Chromophore-based characterization and detection methods
CN107435067B (zh) 2013-08-09 2021-07-09 卢米耐克斯公司 用于在核酸测定中改善熔链分辨和多重性的探针

Family Cites Families (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0566751B1 (en) * 1992-03-23 1996-01-10 F. Hoffmann-La Roche Ag DNA detection method
GB9803382D0 (en) * 1998-02-19 1998-04-15 Secr Defence Detection system
US7160996B1 (en) * 1999-06-09 2007-01-09 Bioresearch Technologies, Inc. Fluorescence energy transfer probes with stabilized conformations
US20020197611A1 (en) * 2001-06-21 2002-12-26 Chagovetz Alexander Michael Method for real-time detection and quantification of nucleic acid sequences using fluorescent primers
ES2269614T3 (es) * 2001-08-31 2007-04-01 The University Of Utah Research Foundation Cuantificacion de genes en tiempo real con estandares internos.
WO2003100019A2 (en) * 2002-05-24 2003-12-04 Invitrogen Corporation Nested pcr employing degradable primers
US20070059690A1 (en) * 2002-05-31 2007-03-15 Amirul Islam "Met/fret based method of target nucleic acid detection whereby the donor/acceptor moieties are on complementary strands"

Also Published As

Publication number Publication date
JP2007125011A (ja) 2007-05-24
US20070117125A1 (en) 2007-05-24
US8198026B2 (en) 2012-06-12
EP1780291A1 (en) 2007-05-02

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Barreda-García et al. Helicase-dependent isothermal amplification: a novel tool in the development of molecular-based analytical systems for rapid pathogen detection
DK0912766T3 (da) Overvågning af hybridisering under PCR
WO2009135093A3 (en) Rnase-h-based assays utilizing modified rna monomers
NZ506333A (en) An assay for detecting and quantifying the presence of particular nucleic acid (DNA or RNA) sequences
WO2007082881A3 (en) Hybridization probe assay and array
US20200291464A1 (en) Enhanced methods of ribonucleic acid hybridization
DE60031489D1 (de) Universalproben und Methoden zum Nachweis von Nukleinsäuren
IL316759A (en) Preparations and methods for identifying biological contaminants
RU2016116333A (ru) Определение нуклеиновых кислот путем амплификации, основанной на встраивании в цепь
Zhu et al. Label‐Free Detection of MicroRNA: Two‐Step Signal Enhancement with a Hairpin‐Probe‐Based Graphene Fluorescence Switch and Isothermal Amplification
RU2015123459A (ru) Одновременная детекция белка-мишени и нуклеиновых кислот-мишеней в одной клетке
RU2005132940A (ru) Способ детекции специфических фрагментов днк или рнк с помощью полимеразной цепной реакции в режиме реального времени
RU2016145448A (ru) Способ амплификации днк на основе внедрения в цепь
JP2018064587A (ja) 核酸増幅のための核酸
RU2012113773A (ru) Пробы пептидных нуклеиновых кислот, набор и способ выявления helicobacter pylori и/или его профиля устойчивости, и применения
RU2016117929A (ru) Мультиплексные зонды
CN106687598B (zh) 检测样品中多种核苷酸的方法
ES2911458T3 (es) Procedimiento para la detección de secuencias de ácido nucleico específicas
Efimov et al. Using chimeric DNA/RNA molecular beacons for target-specific signal amplification
EP1862558A4 (en) GENNACHWEISVERFAHREN
JP2009044967A (ja) 二本鎖核酸の形成に係る情報を得る方法
JP2012502638A5 (ru)
RU2005132941A (ru) Способ детекции специфических фрагментов днк или рнк с помощью гибридизационной цепной реакции в режиме реального времени
RU2006113439A (ru) Набор олигонуклеотидов-праймеров, биочип и способ видовой идентификации ортопокс- и герпесвирусов, патогенных для человека
JP2009533063A5 (ru)

Legal Events

Date Code Title Description
FA93 Acknowledgement of application withdrawn (no request for examination)

Effective date: 20090311