RU2001115828A - Способ изометричного удлинения праймера и набор для выявления и количественного определения специфичной нуклеиновой кислоты - Google Patents
Способ изометричного удлинения праймера и набор для выявления и количественного определения специфичной нуклеиновой кислотыInfo
- Publication number
- RU2001115828A RU2001115828A RU2001115828/13A RU2001115828A RU2001115828A RU 2001115828 A RU2001115828 A RU 2001115828A RU 2001115828/13 A RU2001115828/13 A RU 2001115828/13A RU 2001115828 A RU2001115828 A RU 2001115828A RU 2001115828 A RU2001115828 A RU 2001115828A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- nucleic acid
- primer
- target nucleic
- immobilized
- terminating
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims 41
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title claims 26
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title claims 22
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title claims 22
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims 13
- 239000007787 solid Substances 0.000 claims 13
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims 11
- AHCYMLUZIRLXAA-SHYZEUOFSA-N Deoxyuridine 5'-triphosphate Chemical compound O1[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](O)C[C@@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 AHCYMLUZIRLXAA-SHYZEUOFSA-N 0.000 claims 6
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims 6
- SUYVUBYJARFZHO-RRKCRQDMSA-N dATP Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 SUYVUBYJARFZHO-RRKCRQDMSA-N 0.000 claims 6
- SUYVUBYJARFZHO-UHFFFAOYSA-N dATP Natural products C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C1CC(O)C(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 SUYVUBYJARFZHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 6
- RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-J dCTP(4-) Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@@H]1O[C@H](COP([O-])(=O)OP([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O)[C@@H](O)C1 RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-J 0.000 claims 6
- HAAZLUGHYHWQIW-KVQBGUIXSA-N dGTP Chemical compound C1=NC=2C(=O)NC(N)=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 HAAZLUGHYHWQIW-KVQBGUIXSA-N 0.000 claims 6
- NHVNXKFIZYSCEB-XLPZGREQSA-N dTTP Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](O)C1 NHVNXKFIZYSCEB-XLPZGREQSA-N 0.000 claims 6
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims 6
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims 5
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims 5
- 239000003550 marker Substances 0.000 claims 5
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims 4
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 claims 4
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 claims 4
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims 3
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims 3
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 claims 3
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 claims 3
- 238000006911 enzymatic reaction Methods 0.000 claims 3
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 claims 3
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims 3
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 claims 3
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 claims 3
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 claims 2
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 claims 2
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 claims 2
- 238000007397 LAMP assay Methods 0.000 claims 2
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 claims 2
- 125000003636 chemical group Chemical group 0.000 claims 2
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims 2
- 229920001577 copolymer Polymers 0.000 claims 2
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 claims 2
- 238000007834 ligase chain reaction Methods 0.000 claims 2
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 claims 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims 2
- 238000000053 physical method Methods 0.000 claims 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims 2
- OAKPWEUQDVLTCN-NKWVEPMBSA-N 2',3'-Dideoxyadenosine-5-triphosphate Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@H]1CC[C@@H](CO[P@@](O)(=O)O[P@](O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 OAKPWEUQDVLTCN-NKWVEPMBSA-N 0.000 claims 1
- VGONTNSXDCQUGY-RRKCRQDMSA-N 2'-deoxyinosine Chemical compound C1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(N=CNC2=O)=C2N=C1 VGONTNSXDCQUGY-RRKCRQDMSA-N 0.000 claims 1
- 108091027075 5S-rRNA precursor Proteins 0.000 claims 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims 1
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 claims 1
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 claims 1
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 claims 1
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 claims 1
- QRLVDLBMBULFAL-UHFFFAOYSA-N Digitonin Natural products CC1CCC2(OC1)OC3C(O)C4C5CCC6CC(OC7OC(CO)C(OC8OC(CO)C(O)C(OC9OCC(O)C(O)C9OC%10OC(CO)C(O)C(OC%11OC(CO)C(O)C(O)C%11O)C%10O)C8O)C(O)C7O)C(O)CC6(C)C5CCC4(C)C3C2C QRLVDLBMBULFAL-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 claims 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 claims 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 claims 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 claims 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 claims 1
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 claims 1
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 claims 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims 1
- OTXOHOIOFJSIFX-POYBYMJQSA-N [[(2s,5r)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate Chemical compound O1[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(=O)O)CC[C@@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 OTXOHOIOFJSIFX-POYBYMJQSA-N 0.000 claims 1
- HDRRAMINWIWTNU-NTSWFWBYSA-N [[(2s,5r)-5-(2-amino-6-oxo-3h-purin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate Chemical compound C1=2NC(N)=NC(=O)C=2N=CN1[C@H]1CC[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 HDRRAMINWIWTNU-NTSWFWBYSA-N 0.000 claims 1
- ARLKCWCREKRROD-POYBYMJQSA-N [[(2s,5r)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)CC1 ARLKCWCREKRROD-POYBYMJQSA-N 0.000 claims 1
- 238000000137 annealing Methods 0.000 claims 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 claims 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 claims 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 claims 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims 1
- 238000010367 cloning Methods 0.000 claims 1
- 210000001520 comb Anatomy 0.000 claims 1
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 claims 1
- URGJWIFLBWJRMF-JGVFFNPUSA-N ddTTP Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)CC1 URGJWIFLBWJRMF-JGVFFNPUSA-N 0.000 claims 1
- 125000002637 deoxyribonucleotide group Chemical group 0.000 claims 1
- VGONTNSXDCQUGY-UHFFFAOYSA-N desoxyinosine Natural products C1C(O)C(CO)OC1N1C(NC=NC2=O)=C2N=C1 VGONTNSXDCQUGY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims 1
- UVYVLBIGDKGWPX-KUAJCENISA-N digitonin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H]([C@]2(CC[C@@H]3[C@@]4(C)C[C@@H](O)[C@H](O[C@H]5[C@@H]([C@@H](O)[C@@H](O[C@H]6[C@@H]([C@@H](O[C@H]7[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)CO7)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O6)O[C@H]6[C@@H]([C@@H](O[C@H]7[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O7)O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O6)O)[C@@H](CO)O5)O)C[C@@H]4CC[C@H]3[C@@H]2[C@@H]1O)C)[C@@H]1C)[C@]11CC[C@@H](C)CO1 UVYVLBIGDKGWPX-KUAJCENISA-N 0.000 claims 1
- UVYVLBIGDKGWPX-UHFFFAOYSA-N digitonine Natural products CC1C(C2(CCC3C4(C)CC(O)C(OC5C(C(O)C(OC6C(C(OC7C(C(O)C(O)CO7)O)C(O)C(CO)O6)OC6C(C(OC7C(C(O)C(O)C(CO)O7)O)C(O)C(CO)O6)O)C(CO)O5)O)CC4CCC3C2C2O)C)C2OC11CCC(C)CO1 UVYVLBIGDKGWPX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 238000006073 displacement reaction Methods 0.000 claims 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 claims 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 claims 1
- 229940124276 oligodeoxyribonucleotide Drugs 0.000 claims 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 claims 1
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 claims 1
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 claims 1
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 claims 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 claims 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 claims 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 claims 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 claims 1
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6851—Quantitative amplification
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Immunology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Claims (40)
1. Способ выявления или количественного определения в образце нуклеиновой кислоты-мишени, который включает в себя: (a) приготовление праймера или праймеров, специфично совпадающих с предварительно определенным положением нуклеиновой кислоты-мишени, (b) отжиг праймера или праймеров по пункту (а) с нуклеиновой кислотой-мишенью в условиях высокой жесткости для получения дуплекса праймер-нуклеиновая кислота в предварительно определенном положении нуклеиновой кислоты-мишени, (c) смешивание дуплекса праймер-нуклеиновая кислота по пункту (b) со смесью, содержащей (1) один, или два, или три типа свободных нетерминирующих нуклеотидов и по меньшей мере один тип нетерминирующего нуклеотида, который необязательно мечен регистрируемым маркером, и (2) в присутствии или в отсутствие типа терминирующего нуклеотида, который отличается от одного, или двух, или трех типов нетерминирующих нуклеотидов по пункту (1), (d) выполнение удлинения праймера посредством ферментативной или химической реакции в соответствующем буфере, и (e) выявление или количественное определение количества сигнала метки на нуклеотидах, удлиняющих праймер, или (f) выявление или количественное определение количества удлиненных праймеров с помощью масс-спектрометрии.
2. Способ по п.1, при котором праймер представляет собой праймер нуклеиновой кислоты, олигодезоксирибонуклеотид, олигорибонуклетид или сополимер дезоксирибонуклеиновой кислоты и рибонуклеиновой кислоты.
3. Способ по п.1, при котором интересующей нуклеиновой кислотой является дезоксирибонуклеиновая кислота, рибонуклеиновая кислота или сополимер дезоксирибонуклеиновой кислоты и рибонуклеиновой кислоты.
4. Способ по п.1, при котором нетерминирующим нуклеотидом является дезоксирибонуклеотид или рибонуклеотид.
5. Способ по п.1, при котором терминатором является ди-дезоксирибонуклеотид.
6. Способ по п.1, при котором комбинация нетерминирующих и терминирующих нуклеотидов в смеси представляет собой
(a) dATP, dCTP, dGTP, ddTTP или ddUTP,
(b) dATP, dCTP, dTTP или dUTP, ddGTP,
(c) dATP, dGTP, dTTP или dUTP, ddCTP,
(d) dCTP, dGTP, dTTP или dUTP, ddATP,
(e) dATP, dCTP, dGTP,
(f) dATP, dCTP, dTTP или dUTP,
(g) dATP, dGTP, dTTP или dUTP, или
(h) dCTP, dGTP, dTTP или dUTP.
7. Способ по п.1, при котором по меньшей мере один нетерминирующий нуклеотид метят регистрируемым маркером.
8. Способ по п.1, при котором терминирующий нуклеотид метят с использованием или без использования регистрируемого маркера, который отличается от маркера, которым метят нетерминирующие нуклеотиды.
9. Способ по п.7 или 8, при котором указанный регистрируемый маркер содержит фермент или белковый фрагмент, радиоактивный изотоп, флуоресцентный компонент или химическую группу.
10. Способ по п.1, при котором указанные нетерминирующие и терминирующие нуклеотиды не мечены и стадию выявления или количественного определения выполняют, анализируя количество удлиненных праймеров с использованием масс-спектрометрии.
11. Способ по п.1, при котором указанный фермент является зависимым от матрицы ферментом.
12. Способ по п.11, при котором зависимым от матрицы ферментом является ДНК-полимераза, РНК-полимераза или обратная транскриптаза.
13. Способ по п.12, при котором зависимым от матрицы ферментом является ДНК-полимераза I E.coli, фрагмент Кленова этой полимеразы, ДНК-полимераза Т4, ДНК-полимераза Т7, термофильная ДНК-полимераза, обратная транскриптаза ретровирусов или их комбинация.
14. Способ по п.1, при котором нуклеиновой кислотой-мишенью является нуклеиновая кислота, синтезированная ферментативно in vivo, in vitro или синтезированная не ферментативным путем.
15. Способ по п.1, при котором нуклеиновой кислотой-мишенью является нуклеиновая кислота, синтезированная посредством полимеразной цепной реакции.
16. Способ по п.1, при котором нуклеиновая кислота-мишень содержит неприродные аналоги нуклеотидов.
17. Способ по п.16, при котором неприродные нуклеотидные аналоги включают в себя дезоксиинозин или 7-деаза-2'-дезокси-гуанозин.
18. Способ по п.1, при котором нуклеиновая кислота-мишень включает в себя геномную ДНК организма, ее РНК-транскрипт или кДНК, полученную на ее РНК-транкрипте.
19. Способ по п.18, при котором организмом является растение, микроорганизм, бактерия, вирус.
20. Способ по п.18, при котором организмом является позвоночное или беспозвоночное животное.
21. Способ по п.18, при котором организмом является млекопитающее.
22. Способ по п.21, при котором организмом является организм человека.
23. Способ по п.1, при котором стадия амплификации выполняется на нуклеиновой кислоте-мишени.
24. Способ по п.23, при котором стадия амплификации включает в себя клонирование, транскрипцию, полимеразную цепную реакцию (ПЦР), лигазную цепную реакцию (ЛЦР), амплификацию с вытеснением цепи (SDA) или опосредованную наличием петли изотермическую амплификацию (LAMP).
25. Способ по п.1, при котором праймер содержит один или большее количество фрагментов, позволяющих проводить аффинное разделение праймера и не включившегося реагента и/или интересующей нуклеиновой кислоты.
26. Способ по п.1, при котором праймер содержит один или большее количество фрагментов, позволяющих иммобилизовать праймер на твердом носителе для получения иммобилизованной последовательности праймера.
27. Способ по п.25 или 26, при котором фрагмент включает в себя специальные химические группы, такие как биотин или дигитонин.
28. Способ по п.25 или 26, при котором фрагмент включает в себя последовательность ДНК или РНК, которая позволяет праймеру связываться с твердым носителем посредством спаривания основания с комплементарной последовательностью, присутствующей в твердом носителе.
29. Способ по п.1, при котором праймер непосредственно синтезирован на твердом носителе для получения иммобилизованной праймерной последовательности.
30. Способ по п.29, при котором синтез осуществлен ферментативным, или химическим, или физическим способом.
31. Способ по п.1, при котором праймер иммобилизован на твердом носителе для получения иммобилизованной последовательности нуклеиновой кислоты-мишени.
32. Способ по п.1, при котором праймер обратимо иммобилизован на твердом носителе.
33. Способ по п.32, при котором праймер может быть отщеплен от твердого носителя химическим, ферментативным, или физическим способом.
34. Способ по п.1, при котором нуклеиновой кислотой-мишенью является нуклеиновая кислота, иммобилизованная на твердом носителе для получения иммобилизованной последовательности нуклеиновой кислоты-мишени.
35. Способ по п.1, при котором нуклеиновая кислота-мишень обратимо иммобилизована на твердом носителе.
36. Способ по п.34, при котором нуклеиновая кислота-мишень может быть отщеплена от твердого носителя химическим, ферментативным или физическим способом.
37. Способ по пп.31, 32, 34 или 35, при котором иммобилизация осуществляется посредством фоторазрушаемой связи.
38. Способ по пп.26, 28, 29, 31, 32, 34 или 35, при котором твердый носитель содержит шарики, плоские поверхности, чипы, капилляры, иглы, гребенки или пластинки.
39. Способ по пп.31, 32, 34 или 35, при котором указанная иммобилизация осуществляется посредством гибридизации между комплементарной улавливающей молекулой нуклеиновой кислоты, которая предварительно была иммобилизована на твердом носителе, и частью молекулы нуклеиновой кислоты, которая отличается от последовательности нуклеиновой кислоты-мишени.
40. Способ по пп.31, 32, 34 или 35, при котором указанная иммобилизация осуществляется посредством прямого связывания между твердым носителем и частью молекулы нуклеиновой кислоты, которая отличается от последовательности нуклеиновой кислоты-мишени.
Applications Claiming Priority (4)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US20998700P | 2000-06-08 | 2000-06-08 | |
| US60/209,987 | 2000-06-08 | ||
| US09/862,417 US6824980B2 (en) | 2000-06-08 | 2001-05-23 | Isometric primer extension method and kit for detection and quantification of specific nucleic acid |
| US09/862,417 | 2001-05-23 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2001115828A true RU2001115828A (ru) | 2004-01-27 |
| RU2265058C2 RU2265058C2 (ru) | 2005-11-27 |
Family
ID=26904703
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2001115828/13A RU2265058C2 (ru) | 2000-06-08 | 2001-06-07 | Способ выявления в образце нуклеиновой кислоты-мишени (варианты) |
Country Status (10)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US6824980B2 (ru) |
| EP (1) | EP1162278B1 (ru) |
| JP (1) | JP3789317B2 (ru) |
| KR (1) | KR20010111020A (ru) |
| CN (2) | CN1277934C (ru) |
| CA (1) | CA2349810C (ru) |
| DE (1) | DE60138242D1 (ru) |
| HK (1) | HK1040769B (ru) |
| RU (1) | RU2265058C2 (ru) |
| SG (1) | SG153624A1 (ru) |
Families Citing this family (15)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2001245698A (ja) * | 1999-11-22 | 2001-09-11 | Xiao Bing Wang | 核酸検出法 |
| CA2515938A1 (en) * | 2003-02-12 | 2004-08-26 | Genizon Svenska Ab | Methods and means for nucleic acid sequencing |
| EP1885890A4 (en) * | 2005-05-26 | 2010-01-20 | Univ Boston | QUANTIFICATION OF NUCLEIC ACIDS AND PROTEINS VIA OLIGONUCLEOTIDE MASS LABELS |
| WO2007005649A2 (en) * | 2005-06-30 | 2007-01-11 | Applera Corporation | Proximity probing of target proteins comprising restriction and/or extension field |
| US8012685B2 (en) * | 2006-08-01 | 2011-09-06 | Applied Biosystems, Llc | Detection of analytes and nucleic acids |
| WO2009123494A1 (ru) * | 2008-04-01 | 2009-10-08 | Drygin Yury Fedorovich | Способ одновременного обнаружения множества рнк последовательностей в биологическом образце |
| CN106434873B (zh) * | 2015-08-13 | 2021-08-27 | 生捷科技控股公司 | 使核酸分子同步化的方法 |
| US11414687B2 (en) * | 2017-10-04 | 2022-08-16 | Centrillion Technology Holdings Corporation | Method and system for enzymatic synthesis of oligonucleotides |
| JP2022512058A (ja) * | 2018-12-21 | 2022-02-02 | イルミナ インコーポレイテッド | ヌクレアーゼを利用したｒｎａ枯渇 |
| CN113557298B (zh) * | 2019-03-13 | 2024-08-27 | 东洋纺株式会社 | 核酸的生成和扩增 |
| CA3143685A1 (en) * | 2019-06-18 | 2020-12-24 | Mammoth Biosciences, Inc. | Assays and methods for detection of nucleic acids |
| TW202120693A (zh) * | 2019-08-21 | 2021-06-01 | 美商伊路米納有限公司 | 偵測核苷酸之聚合酶併入的方法 |
| CN116391047A (zh) * | 2020-10-26 | 2023-07-04 | Yyz医药科技有限公司 | 用于核酸检测和疾病诊断的基于质谱的方法和试剂盒 |
| RU2748540C1 (ru) * | 2021-02-08 | 2021-05-26 | Автономная некоммерческая образовательная организация высшего образования "Сколковский институт науки и технологий" | Способ детектирования вируса SARS-CoV-2 методом масс-спектрометрии |
| WO2025134188A1 (ja) * | 2023-12-18 | 2025-06-26 | 株式会社日立ハイテク | 変異遺伝子検出方法 |
Family Cites Families (27)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4948882A (en) * | 1983-02-22 | 1990-08-14 | Syngene, Inc. | Single-stranded labelled oligonucleotides, reactive monomers and methods of synthesis |
| US4965188A (en) | 1986-08-22 | 1990-10-23 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences using a thermostable enzyme |
| GB8805692D0 (en) | 1988-03-10 | 1988-04-07 | Ici Plc | Method of detecting nucleotide sequences |
| US5179198A (en) * | 1988-07-11 | 1993-01-12 | Hidechika Okada | Glycoprotein and gene coding therefor |
| US6013431A (en) | 1990-02-16 | 2000-01-11 | Molecular Tool, Inc. | Method for determining specific nucleotide variations by primer extension in the presence of mixture of labeled nucleotides and terminators |
| US5846710A (en) * | 1990-11-02 | 1998-12-08 | St. Louis University | Method for the detection of genetic diseases and gene sequence variations by single nucleotide primer extension |
| IE66125B1 (en) | 1991-01-31 | 1995-12-13 | Zeneca Ltd | Detection method for variant nucleotides |
| US5888819A (en) | 1991-03-05 | 1999-03-30 | Molecular Tool, Inc. | Method for determining nucleotide identity through primer extension |
| WO1993014217A1 (en) * | 1992-01-10 | 1993-07-22 | Life Technologies, Inc. | Use of predetermined nucleotides having altered base pairing characteristics in the amplification of nucleic acid molecules |
| US5710028A (en) | 1992-07-02 | 1998-01-20 | Eyal; Nurit | Method of quick screening and identification of specific DNA sequences by single nucleotide primer extension and kits therefor |
| US5650277A (en) * | 1992-07-02 | 1997-07-22 | Diagenetics Ltd. | Method of determining the presence and quantifying the number of di- and trinucleotide repeats |
| US6007987A (en) * | 1993-08-23 | 1999-12-28 | The Trustees Of Boston University | Positional sequencing by hybridization |
| JPH09505397A (ja) | 1993-11-17 | 1997-05-27 | アマーシャム・インターナショナル・ピーエルシー | プライマー伸長質量分光分析による核酸配列決定法 |
| EP0663447B1 (en) | 1993-12-28 | 2003-07-09 | Eiken Chemical Co., Ltd. | Method of detecting a specific polynucleotide |
| WO1996030545A1 (en) | 1995-03-24 | 1996-10-03 | Mitokor | Mutation detection by differential primer extension of mutant and wildtype target sequences |
| US5830655A (en) * | 1995-05-22 | 1998-11-03 | Sri International | Oligonucleotide sizing using cleavable primers |
| US5700642A (en) * | 1995-05-22 | 1997-12-23 | Sri International | Oligonucleotide sizing using immobilized cleavable primers |
| US5965363A (en) * | 1996-09-19 | 1999-10-12 | Genetrace Systems Inc. | Methods of preparing nucleic acids for mass spectrometric analysis |
| US5885775A (en) * | 1996-10-04 | 1999-03-23 | Perseptive Biosystems, Inc. | Methods for determining sequences information in polynucleotides using mass spectrometry |
| CA2270132A1 (en) * | 1996-11-06 | 1998-05-14 | Sequenom, Inc. | Dna diagnostics based on mass spectrometry |
| US5888778A (en) | 1997-06-16 | 1999-03-30 | Exact Laboratories, Inc. | High-throughput screening method for identification of genetic mutations or disease-causing microorganisms using segmented primers |
| US5994079A (en) * | 1998-02-06 | 1999-11-30 | Digene Corporation | Direct detection of RNA mediated by reverse transcriptase lacking RNAse H function |
| US6723564B2 (en) | 1998-05-07 | 2004-04-20 | Sequenom, Inc. | IR MALDI mass spectrometry of nucleic acids using liquid matrices |
| US6221592B1 (en) * | 1998-10-20 | 2001-04-24 | Wisconsin Alumi Research Foundation | Computer-based methods and systems for sequencing of individual nucleic acid molecules |
| US6156178A (en) * | 1999-07-13 | 2000-12-05 | Molecular Dynamics, Inc. | Increased throughput analysis of small compounds using multiple temporally spaced injections |
| JP2001245698A (ja) * | 1999-11-22 | 2001-09-11 | Xiao Bing Wang | 核酸検出法 |
| US7582420B2 (en) * | 2001-07-12 | 2009-09-01 | Illumina, Inc. | Multiplex nucleic acid reactions |
-
2001
- 2001-05-23 US US09/862,417 patent/US6824980B2/en not_active Expired - Lifetime
- 2001-06-01 JP JP2001166477A patent/JP3789317B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2001-06-05 SG SG200103744-9A patent/SG153624A1/en unknown
- 2001-06-06 DE DE60138242T patent/DE60138242D1/de not_active Expired - Lifetime
- 2001-06-06 EP EP01304958A patent/EP1162278B1/en not_active Expired - Lifetime
- 2001-06-07 RU RU2001115828/13A patent/RU2265058C2/ru not_active IP Right Cessation
- 2001-06-07 KR KR1020010031733A patent/KR20010111020A/ko not_active Ceased
- 2001-06-07 CA CA2349810A patent/CA2349810C/en not_active Expired - Fee Related
- 2001-06-08 CN CNB2004100399408A patent/CN1277934C/zh not_active Expired - Fee Related
- 2001-06-08 CN CNB011211156A patent/CN1198145C/zh not_active Expired - Fee Related
-
2002
- 2002-03-27 HK HK02102352.6A patent/HK1040769B/zh not_active IP Right Cessation
-
2004
- 2004-01-14 US US10/757,263 patent/US20040137497A1/en not_active Abandoned
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN1333465A (zh) | 2002-01-30 |
| EP1162278B1 (en) | 2009-04-08 |
| JP3789317B2 (ja) | 2006-06-21 |
| US6824980B2 (en) | 2004-11-30 |
| EP1162278A2 (en) | 2001-12-12 |
| DE60138242D1 (de) | 2009-05-20 |
| JP2002027993A (ja) | 2002-01-29 |
| HK1040769B (zh) | 2005-08-12 |
| CA2349810C (en) | 2010-10-26 |
| HK1040769A1 (en) | 2002-06-21 |
| SG153624A1 (en) | 2009-07-29 |
| CA2349810A1 (en) | 2001-12-08 |
| US20040137497A1 (en) | 2004-07-15 |
| US20030148525A1 (en) | 2003-08-07 |
| EP1162278A3 (en) | 2004-04-14 |
| CN1198145C (zh) | 2005-04-20 |
| RU2265058C2 (ru) | 2005-11-27 |
| CN1537955A (zh) | 2004-10-20 |
| KR20010111020A (ko) | 2001-12-15 |
| CN1277934C (zh) | 2006-10-04 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US6300070B1 (en) | Solid phase methods for amplifying multiple nucleic acids | |
| US7378242B2 (en) | DNA sequence detection by limited primer extension | |
| FI111554B (fi) | Reagenssikoostumus ja -kitti nukleiinihapon tietyssä asemassa olevan nukleotidiemäksen tunnistamiseksi | |
| AU624601B2 (en) | Amplification and detection of nucleic acid sequences | |
| KR102843262B1 (ko) | 자가-발광을 기초로 하는 단일-채널 시퀀싱 방법 | |
| RU2001115828A (ru) | Способ изометричного удлинения праймера и набор для выявления и количественного определения специфичной нуклеиновой кислоты | |
| WO1997046703A1 (en) | Optimally fluorescent oligonucleotides | |
| KR20200084866A (ko) | 올리고뉴클레오타이드의 다양한 라이브러리를 사용한 폴리뉴클레오타이드의 신규 합성 방법 | |
| WO2018048911A1 (en) | Tri-nucleotide rolling circle amplification | |
| WO2000042223A1 (en) | Method for controlling the distribution of dna sequencing termination products | |
| CN105063190A (zh) | 微小rna的固相芯片恒温检测方法 | |
| RU2000127095A (ru) | Способ детекции варианта последовательности нуклеиновой кислоты с помощью анализа терминации со сдвигом | |
| US20250115960A1 (en) | Nucleic acid testing method and system | |
| RU2794177C1 (ru) | Способ одноканального секвенирования на основе самолюминесценции | |
| CN119432989A (zh) | 对多核苷酸进行测序的方法 | |
| JP3145169B2 (ja) | 核酸検出法及びキット | |
| CN113564235A (zh) | 脱氧核糖寡核苷酸测序方法和试剂盒 | |
| EP1679381A1 (en) | Isometric primers extension method and kit for detection and quantification of specific nucleic acid | |
| WO1999037820A1 (en) | An exponential nucleic acid amplification method using a single primer of opposing polarity | |
| HK1035004A (en) | Detection of sequence variation of nucleic acid by shifted termination analysis | |
| JPH078300A (ja) | Ｄｎａ解析法 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20120608 |