JP2017037014A - Binder - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は、金属結合能を有する結合剤に関する。 The present invention relates to a binder having a metal binding ability.
電極の表面に抗体又は酵素等の蛋白質を固定化した電極が、バイオセンサやバイオ電池に使用されている。固定化には架橋剤を用いた方法等が知られているが、蛋白質の配向性を制御することが難しいという問題があった(特許文献1)。 An electrode in which a protein such as an antibody or an enzyme is immobilized on the surface of the electrode is used for a biosensor or a biobattery. For immobilization, a method using a crosslinking agent is known, but there is a problem that it is difficult to control protein orientation (Patent Document 1).
配向性を制御する固定化方法も知られているが、電極構成基材が炭素基材に限定される、又は酵素が特定の構造を有する必要があり、汎用性が低いという問題があった(特許文献2又は3)。
An immobilization method for controlling the orientation is also known, but the electrode constituent base material is limited to the carbon base material, or the enzyme needs to have a specific structure, and there is a problem that versatility is low (
一方、幾つかの金属結合性ペプチドが知られていた(非特許文献1及び2)。 On the other hand, some metal binding peptides have been known (Non-patent Documents 1 and 2).
電極への蛋白質の固定化において、配向性を制御できる固定化方法であって、かつ汎用性のある固定化方法が求められていた。本発明は、前記に鑑みてなされたものであり、金属結合能を有する結合剤及び該結合剤を連結した金属結合性蛋白質を提供する。 There has been a demand for a versatile immobilization method that can control the orientation in immobilizing proteins to electrodes. The present invention has been made in view of the above, and provides a binding agent having metal binding ability and a metal binding protein to which the binding agent is linked.
発明者らは、金属結合能を有するペプチドを見出した。更に、蛋白質に該ペプチドを連結することで、金属に蛋白質を結着できることを見出し、本発明を完成した。 The inventors have found a peptide having a metal binding ability. Furthermore, the inventors have found that a protein can be bound to a metal by linking the peptide to a protein, and the present invention has been completed.
すなわち、本発明は、以下の[1]〜[14]の態様に関する。
[1]以下の(i)、(ii)、(iii)及び(iv)の特性を有する金属結合性ペプチドからなる結合剤:
(i)金及び白金族金属結合能を有する;
(ii)塩基性ペプチドである;
(iii)親水性ペプチドである;
(iv)配向性制御能を有する。
[2]ペプチド全体に占めるR及びKの合計比率が少なくとも30%である金属結合性ペプチドからなる、[1]記載の結合剤。
[3]6アミノ酸の金属結合性ペプチドからなる、[1]又は[2]記載の結合剤。
[4]以下の(v)、(vi)及び(vii)の特性を有する、[1]〜[3]の何れかに記載の結合剤:
(v)等電点が8.5〜13.5である;
(vi)親疎水性指標が−0.200〜−4.000である;
(vii)4〜14アミノ酸からなる。
[5]以下の(a)又は(b)のアミノ酸配列を有するペプチドからなり、かつ金属への結合能を有する、結合剤:
(a)以下の(1)〜(17)の何れかに記載のアミノ酸配列;
(1)K、K、R、E、V及びRからなるアミノ酸配列、
(2)V、Y、N、K、R及びKからなるアミノ酸配列、
(3)S、R、A、A、K及びYからなるアミノ酸配列、
(4)Q、K、R、K、V及びVからなるアミノ酸配列、
(5)K、G、R、G、R及びVからなるアミノ酸配列、
(6)K、R、K、A、A及びMからなるアミノ酸配列、
(7)K、T、R、G、V及びKからなるアミノ酸配列、
(8)K、Q、K、K、T及びTからなるアミノ酸配列、
(9)R、T、R、N、R及びSからなるアミノ酸配列、
(10)T、Q、K、G、R及びKからなるアミノ酸配列、
(11)K、G、A、K、K及びVからなるアミノ酸配列、
(12)K、K、T、S、K及びGからなるアミノ酸配列、
(13)K、T、R、M、R及びGからなるアミノ酸配列、
(14)L、K、D、K、K及びKからなるアミノ酸配列、
(15)R、G、Y、K、K及びGからなるアミノ酸配列、
(16)R、K、G、N、K及びAからなるアミノ酸配列、
(17)R、V、G、R、K及びGからなるアミノ酸配列
(b)(a)に記載のアミノ酸配列において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列。
[6]以下の(c)、(d)又は(e)のアミノ酸配列を有するペプチドからなり、かつ金属への結合能を有する、[5]に記載の結合剤:
(c)配列番号1〜17の何れかに記載のアミノ酸配列;
(d)(c)に記載のアミノ酸配列の逆配列;
(e)(c)又は(d)に記載のアミノ酸配列において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列。
[7]K、R、G、V、T、A、Q、S、Y、N、M、L、D又はEから選ばれるアミノ酸からなる、[1]〜[6]の何れかに記載の結合剤。
[8]蛋白質に[1]〜[7]の何れかに記載の結合剤を連結した、金属結合性蛋白質。
[9]蛋白質のN末端及び/又はC末端に結合剤を連結した、[8]記載の金属結合性蛋白質。
[10]蛋白質が抗体又は酵素である、[8]又は[9]記載の金属結合性蛋白質。
[11]蛋白質が酸化還元酵素である、[8]〜[10]の何れかに記載の金属結合性蛋白質。
[12][8]〜[11]の何れかに記載の金属結合性蛋白質を含む、測定試薬組成物。
[13][8]〜[11]の何れかに記載の金属結合性蛋白質を使用する、試料中の測定対象物の測定方法。
[14]測定対象物がグルコースである、[13]記載の測定方法。
That is, the present invention relates to the following aspects [1] to [14].
[1] A binder comprising a metal-binding peptide having the following properties (i), (ii), (iii) and (iv):
(I) has gold and platinum group metal binding ability;
(Ii) is a basic peptide;
(Iii) is a hydrophilic peptide;
(Iv) It has an orientation control ability.
[2] The binder according to [1], comprising a metal-binding peptide in which the total ratio of R and K in the whole peptide is at least 30%.
[3] The binding agent according to [1] or [2], comprising a metal-binding peptide of 6 amino acids.
[4] The binder according to any one of [1] to [3], which has the following properties (v), (vi) and (vii):
(V) the isoelectric point is 8.5 to 13.5;
(Vi) the hydrophilicity / hydrophobicity index is -0.200 to -4,000;
(Vii) It consists of 4 to 14 amino acids.
[5] A binding agent comprising a peptide having the following amino acid sequence (a) or (b) and having a binding ability to metal:
(A) the amino acid sequence according to any one of (1) to (17) below:
(1) an amino acid sequence consisting of K, K, R, E, V and R;
(2) an amino acid sequence consisting of V, Y, N, K, R and K;
(3) an amino acid sequence consisting of S, R, A, A, K and Y,
(4) an amino acid sequence consisting of Q, K, R, K, V and V;
(5) an amino acid sequence consisting of K, G, R, G, R and V;
(6) an amino acid sequence consisting of K, R, K, A, A and M;
(7) an amino acid sequence consisting of K, T, R, G, V and K;
(8) an amino acid sequence consisting of K, Q, K, K, T and T;
(9) an amino acid sequence consisting of R, T, R, N, R and S,
(10) an amino acid sequence consisting of T, Q, K, G, R and K;
(11) an amino acid sequence consisting of K, G, A, K, K and V,
(12) an amino acid sequence consisting of K, K, T, S, K and G;
(13) an amino acid sequence consisting of K, T, R, M, R and G;
(14) an amino acid sequence consisting of L, K, D, K, K and K;
(15) an amino acid sequence consisting of R, G, Y, K, K and G;
(16) an amino acid sequence consisting of R, K, G, N, K and A,
(17) An amino acid sequence consisting of R, V, G, R, K and G, wherein one or several amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence described in (b) (a).
[6] The binding agent according to [5], comprising a peptide having the following amino acid sequence (c), (d) or (e) and having a binding ability to a metal:
(C) the amino acid sequence according to any one of SEQ ID NOs: 1 to 17;
(D) a reverse sequence of the amino acid sequence described in (c);
(E) An amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence described in (c) or (d).
[7] The method according to any one of [1] to [6], comprising an amino acid selected from K, R, G, V, T, A, Q, S, Y, N, M, L, D, or E. Binder.
[8] A metal-binding protein in which the binding agent according to any one of [1] to [7] is linked to a protein.
[9] The metal binding protein according to [8], wherein a binder is linked to the N-terminus and / or C-terminus of the protein.
[10] The metal binding protein according to [8] or [9], wherein the protein is an antibody or an enzyme.
[11] The metal binding protein according to any one of [8] to [10], wherein the protein is an oxidoreductase.
[12] A measurement reagent composition comprising the metal binding protein according to any one of [8] to [11].
[13] A method for measuring an object to be measured in a sample, which uses the metal binding protein according to any one of [8] to [11].
[14] The measurement method according to [13], wherein the measurement target is glucose.
本発明によって、金属結合能を有するペプチドからなる結合剤が利用できるようになった。更に、抗体や酵素等の蛋白質に該結合剤を連結することで、金属結合性蛋白質を得ることができる。該蛋白質は、容易に金属へ結合するため、該蛋白質を簡便に電極へ固定化でき、かつ該蛋白質の配向性を持たせた固定が可能である。 According to the present invention, a binding agent comprising a peptide having a metal binding ability can be used. Furthermore, a metal binding protein can be obtained by linking the binder to a protein such as an antibody or an enzyme. Since the protein easily binds to a metal, the protein can be easily fixed to the electrode and can be fixed with the orientation of the protein.
本発明の結合剤は、以下の特性を有する金属結合性ペプチドからなる。
(i)金及び白金族金属結合性ペプチドである。
(ii)塩基性ペプチドである。
(iii)親水性ペプチドである。
(iv)配向性制御能を有する。
The binder of the present invention comprises a metal-binding peptide having the following characteristics.
(I) Gold and platinum group metal binding peptides.
(Ii) It is a basic peptide.
(Iii) It is a hydrophilic peptide.
(Iv) It has an orientation control ability.
本発明の結合剤は、好ましくは以下の特性を有する金属結合性ペプチドからなる。
(v)等電点が8.5〜13.5であり、好ましくは9.0〜13.0であり、より好ましくは9.5〜12.5である。
尚、該等電点は、ExPASyのProtParam tool(http://web.expasy.org/protparam/)で算出した理論上の等電点(Theoretical pI)である。
(vi)親疎水性指標が−0.200〜−4.000であり、好ましくは−0.500〜−3.500であり、より好ましくは−0.800〜−3.200である。
尚、該親疎水性指標は、ExPASyのProtParam tool(http://web.expasy.org/protparam/)で算出した親疎水性指標(Grand average of hydropathicity(GRAVY))である。
(vii)4〜14アミノ酸からなり、好ましくは5〜13アミノ酸又は6〜12アミノ酸からなり、より好ましくは多くとも10アミノ酸、9アミノ酸、8アミノ酸又は7アミノ酸からなる結合剤である。更に好ましくは6アミノ酸からなる。
The binder of the present invention preferably comprises a metal-binding peptide having the following characteristics.
(V) The isoelectric point is 8.5 to 13.5, preferably 9.0 to 13.0, and more preferably 9.5 to 12.5.
The isoelectric point is a theoretical isoelectric point (Theoretical pI) calculated by the ExPASy ProtParam tool (http://web.expasy.org/protparam/).
(Vi) The hydrophilicity / hydrophobicity index is -0.200 to -4,000, preferably -0.500 to -3.500, and more preferably -0.800 to -3.200.
In addition, the hydrophilicity / hydrophobicity index is a hydrophilicity / hydrophobicity index (GRAVY) calculated by ExPASy's ProtParam tool (http://web.expasy.org/protparam/).
(Vii) A binding agent consisting of 4 to 14 amino acids, preferably 5 to 13 amino acids or 6 to 12 amino acids, more preferably 10 amino acids, 9 amino acids, 8 amino acids or 7 amino acids. More preferably, it consists of 6 amino acids.
本発明の結合剤は、好ましくは(viii)ペプチド全体に占めるアルギニン(R)及びリジン(K)の合計比率が少なくとも20%である金属結合性ペプチドである。より好ましくは、ペプチド全体に占めるRとKの合計比率が、少なくとも25%、30%、35%又は40%である。 The binder of the present invention is preferably (viii) a metal-binding peptide in which the total proportion of arginine (R) and lysine (K) in the total peptide is at least 20%. More preferably, the total ratio of R and K in the whole peptide is at least 25%, 30%, 35% or 40%.
本発明の結合剤は、好ましくは(a)又は(b)のアミノ酸配列を有するペプチドからなり、かつ金属への結合能を有する。
(a)以下の(1)〜(17)の何れかに記載のアミノ酸配列。
(1)K、K、R、E、V及びRからなるアミノ酸配列。
(2)V、Y、N、K、R及びKからなるアミノ酸配列。
(3)S、R、A、A、K及びYからなるアミノ酸配列。
(4)Q、K、R、K、V及びVからなるアミノ酸配列。
(5)K、G、R、G、R及びVからなるアミノ酸配列。
(6)K、R、K、A、A及びMからなるアミノ酸配列。
(7)K、T、R、G、V及びKからなるアミノ酸配列。
(8)K、Q、K、K、T及びTからなるアミノ酸配列。
(9)R、T、R、N、R及びSからなるアミノ酸配列。
(10)T、Q、K、G、R及びKからなるアミノ酸配列。
(11)K、G、A、K、K及びVからなるアミノ酸配列。
(12)K、K、T、S、K及びGからなるアミノ酸配列。
(13)K、T、R、M、R及びGからなるアミノ酸配列。
(14)L、K、D、K、K及びKからなるアミノ酸配列。
(15)R、G、Y、K、K及びGからなるアミノ酸配列。
(16)R、K、G、N、K及びAからなるアミノ酸配列。
(17)R、V、G、R、K及びGからなるアミノ酸配列。
(1)〜(17)に記載のアミノ酸配列は、何れも構成するアミノ酸の順番は限定されない。より好ましくは、前記に記載の順番からなる配列であり又はその逆配列である。更に好ましくは(1)〜(17)の何れかに記載のアミノ酸配列からなるペプチドからなり、かつ金属への結合能を有する。好ましくは前記(i)から(viii)の少なくとも1の特性を有する。尚、(1)〜(17)に記載のアミノ酸は、何れも1文字表記である。
(b)上記(a)に記載のアミノ酸配列において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列を有するペプチドからなり、かつ金属への結合能を有する。数個とは好ましくは3個、より好ましくは2個である。
The binding agent of the present invention preferably comprises a peptide having the amino acid sequence (a) or (b) and has a binding ability to metal.
(A) The amino acid sequence according to any one of (1) to (17) below.
(1) An amino acid sequence consisting of K, K, R, E, V and R.
(2) An amino acid sequence consisting of V, Y, N, K, R and K.
(3) An amino acid sequence consisting of S, R, A, A, K and Y.
(4) An amino acid sequence consisting of Q, K, R, K, V and V.
(5) An amino acid sequence consisting of K, G, R, G, R and V.
(6) An amino acid sequence consisting of K, R, K, A, A and M.
(7) An amino acid sequence consisting of K, T, R, G, V and K.
(8) An amino acid sequence consisting of K, Q, K, K, T, and T.
(9) An amino acid sequence consisting of R, T, R, N, R and S.
(10) An amino acid sequence consisting of T, Q, K, G, R and K.
(11) An amino acid sequence consisting of K, G, A, K, K and V.
(12) An amino acid sequence consisting of K, K, T, S, K and G.
(13) An amino acid sequence consisting of K, T, R, M, R and G.
(14) An amino acid sequence consisting of L, K, D, K, K and K.
(15) An amino acid sequence consisting of R, G, Y, K, K and G.
(16) An amino acid sequence consisting of R, K, G, N, K and A.
(17) An amino acid sequence consisting of R, V, G, R, K and G.
The order of amino acids constituting any of the amino acid sequences described in (1) to (17) is not limited. More preferably, it is a sequence consisting of the order described above, or its reverse sequence. More preferably, it consists of a peptide consisting of the amino acid sequence described in any one of (1) to (17) and has the ability to bind to a metal. Preferably, it has at least one characteristic of (i) to (viii). In addition, all the amino acids described in (1) to (17) are represented by one letter.
(B) It consists of a peptide having an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence described in (a) above, and has a binding ability to metal. The number is preferably 3, and more preferably 2.
本発明の結合剤は、好ましくは下記(c)、(d)又は(e)のアミノ酸配列を有するペプチドからなり、かつ金属への結合能を有する。好ましくは前記(i)から(viii)の少なくとも1の特性を有する。
(c)配列番号1〜17の何れかに記載のアミノ酸配列。
(d)(c)に記載のアミノ酸配列の逆配列。
(e)(c)又は(d)に記載のアミノ酸配列において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列。数個とは好ましくは3個、より好ましくは2個である。
The binding agent of the present invention is preferably composed of a peptide having the following amino acid sequence (c), (d) or (e) and has a binding ability to a metal. Preferably, it has at least one characteristic of (i) to (viii).
(C) The amino acid sequence according to any one of SEQ ID NOs: 1 to 17.
(D) A reverse sequence of the amino acid sequence described in (c).
(E) An amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence described in (c) or (d). The number is preferably 3, and more preferably 2.
本発明の結合剤は、好ましくは下記(f)のアミノ酸配列を有するペプチドからなり、かつ金属への結合能を有する。
(f)(a)、(b)、(c)、(d)又は(e)に記載のアミノ酸配列の内、二配列がタンデム結合したアミノ酸配列。タンデム結合する二配列の組み合わせは、(a)、(b)、(c)、(d)又は(e)に記載のアミノ酸配列であれば特に限定されず、同じ配列の組合せでも良い。
The binding agent of the present invention is preferably composed of a peptide having the following amino acid sequence (f) and has a binding ability to metal.
(F) An amino acid sequence in which two sequences are tandemly linked among the amino acid sequences described in (a), (b), (c), (d) or (e). The combination of two sequences that are tandemly linked is not particularly limited as long as it is an amino acid sequence described in (a), (b), (c), (d), or (e), and may be a combination of the same sequences.
本発明の結合剤は、好ましくはK、R、G、V、T、A、Q、S、Y、N、M、L、D又はEから選ばれるアミノ酸からなる。好ましくはC、H、P、W、I又はFから選ばれる少なくとも1種のアミノ酸を含まない。 The binder of the present invention preferably consists of an amino acid selected from K, R, G, V, T, A, Q, S, Y, N, M, L, D or E. Preferably, it does not contain at least one amino acid selected from C, H, P, W, I or F.
本発明の結合剤は、前記配列を有する金属結合性ペプチドであれば特に限定されず、遺伝子組換えによって得られたペプチドでもよく、合成によって得られたペプチドでもよい。遺伝子組換えは、前記(a)、(b)、(c)、(d)、(e)又は(f)に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列を用いて、周知の方法で行えば良い。 The binding agent of the present invention is not particularly limited as long as it is a metal-binding peptide having the above sequence, and may be a peptide obtained by gene recombination or a peptide obtained by synthesis. The gene recombination may be performed by a well-known method using the base sequence encoding the amino acid sequence described in (a), (b), (c), (d), (e) or (f). .
本発明の結合剤は、金属結合能を有するペプチドであればよく、金属に化学的に結合できるペプチドであれば良い。該結合剤が結合できる金属は、金又は白金族金属が好ましい。例えば、白金族金属は白金、パラジウム、ロジウム、ルテニウム又はイリジウムが例示でき、パラジウムがより好ましい。本発明の結合剤は、該金属を導電物質とする電極に結合でき、測定に使用する酵素や抗体等を電極に固定化できる。 The binding agent of the present invention may be a peptide having a metal binding ability, and may be any peptide that can chemically bind to a metal. The metal to which the binder can bind is preferably gold or a platinum group metal. For example, platinum group metals can be exemplified by platinum, palladium, rhodium, ruthenium or iridium, with palladium being more preferred. The binding agent of the present invention can bind to an electrode using the metal as a conductive substance, and can immobilize an enzyme or antibody used for measurement on the electrode.
前記結合剤を蛋白質に連結することで、金属結合性蛋白質を製造できる。結合剤は、蛋白質のN末端及び/又はC末端に連結するのが好ましい。尚、蛋白質のN末端に結合剤を連結する場合は、分泌シグナル配列を含まないマチュアな蛋白質のN末端に連結すると良い。更に、該蛋白質と該結合剤との間にリンカーペプチドがあっても良い。連結方法は、金属結合性蛋白質全体の全合成でも良く、遺伝子工学的手法でも良い。本発明の結合剤であれば、蛋白質へ連結しても蛋白質の構造に悪影響を与え難く、蛋白質の特性を保持できる。 A metal-binding protein can be produced by linking the binder to a protein. The binding agent is preferably linked to the N-terminus and / or C-terminus of the protein. When linking a binding agent to the N-terminal of the protein, it is preferable to link it to the N-terminal of a mature protein that does not contain a secretory signal sequence. Furthermore, there may be a linker peptide between the protein and the binder. The linking method may be total synthesis of the entire metal binding protein or may be a genetic engineering technique. If it is a binder of this invention, even if it connects with a protein, it will hardly exert a bad influence on the structure of a protein, and can maintain the characteristic of a protein.
例えば、遺伝子工学的手法は、金属結合性蛋白質をコードする塩基配列が挿入されたベクターを準備する。最終的に、発現用ベクターを用いて宿主となる微生物を形質転換し、形質転換体を得る。続いて、該形質転換体を培養し、得られた培養物から金属結合性蛋白質を得ることができる。 For example, in the genetic engineering technique, a vector into which a base sequence encoding a metal binding protein is inserted is prepared. Finally, a host microorganism is transformed using the expression vector to obtain a transformant. Subsequently, the transformant is cultured, and a metal binding protein can be obtained from the obtained culture.
ベクターは、クローニングベクター又は発現ベクターであり、インサートとして前記塩基配列を含む。形質転換体としては、例えば、大腸菌、枯草菌等の原核細胞や、真菌(酵母、アスペルギルス属などの子嚢菌、担子菌等)、昆虫細胞、哺乳動物細胞等の真核細胞等を使用することができる。前記ベクターを、プラスミドのような状態で形質転換細胞内に維持しても良く、染色体中に組みこませて維持しても良い。更に、糖鎖の要、不要、分泌生産等、必要に応じて適宜宿主は選択することができる。尚、蛋白質のN末端側に結合剤を連結した金属結合性蛋白質を宿主に分泌生産させる場合は、結合剤の配列の前に分泌シグナル配列が存在するように塩基配列をデザインする。又は、ベクター側の分泌シグナル配列を使用しても良い。蛋白質のC末端側に結合剤を連結した金属結合性蛋白質を宿主に生産させる場合は、蛋白質遺伝子の終止コドンの前に結合剤をコードする遺伝子配列を挿入する。該蛋白質と該結合剤との間にリンカーペプチドを挿入する場合は、該リンカーペプチドをコードする塩基配列を各遺伝子の間に挿入しても良い。 The vector is a cloning vector or an expression vector, and includes the base sequence as an insert. As the transformant, for example, prokaryotic cells such as Escherichia coli and Bacillus subtilis, eukaryotic cells such as fungi (yeast, Aspergillus genus Ascomycetes, basidiomycetes, etc.), insect cells, mammalian cells and the like are used. Can do. The vector may be maintained in a transformed cell in the state of a plasmid, or may be maintained by being incorporated into a chromosome. Furthermore, the host can be appropriately selected according to the necessity, such as the necessity of sugar chains, unnecessary, secretory production, and the like. When a metal binding protein in which a binder is linked to the N-terminal side of the protein is secreted to the host, the base sequence is designed so that a secretory signal sequence exists before the binding agent sequence. Alternatively, a secretory signal sequence on the vector side may be used. When a metal-binding protein having a binding agent linked to the C-terminal side of the protein is produced in the host, a gene sequence encoding the binding agent is inserted before the stop codon of the protein gene. When a linker peptide is inserted between the protein and the binding agent, a base sequence encoding the linker peptide may be inserted between each gene.
前記結合剤を連結する蛋白質は、糖蛋白質でもよい。該蛋白質は酵素又は抗体が好ましく、前記結合剤をそれらに連結すると、金属結合性酵素又は金属結合性抗体が得られる。該蛋白質は加水分解酵素、転移酵素又は酸化還元酵素が例示でき、前記結合剤をそれらに連結すると、金属結合性加水分解酵素、金属結合性転移酵素又は金属結合性酸化還元酵素が得られる。例えば、加水分解酵素はエステラーゼ、転移酵素はo−アセチルセリンスルフヒドリラーゼが例示できる。酸化還元酵素は、酸化酵素及び脱水素酵素を包含する。例えば、グルコース、乳酸、コレステロール又はアルコールをそれぞれ基質として、酸化反応を触媒する酵素が例示できる。グルコース酸化酵素、グルコース脱水素酵素、乳酸酸化酵素、乳酸脱水素酵素、コレステロール酸化酵素、コレステロール脱水素酵素、アルコール酸化酵素又はアルコール脱水素酵素が好ましい。 The protein linking the binder may be a glycoprotein. The protein is preferably an enzyme or an antibody. When the binding agent is linked to them, a metal-binding enzyme or a metal-binding antibody is obtained. Examples of the protein include hydrolase, transferase, and oxidoreductase. When the binder is linked to them, metal-bonded hydrolase, metal-bound transferase, or metal-bound oxidoreductase is obtained. For example, the hydrolase can be exemplified by esterase, and the transferase can be exemplified by o-acetylserine sulfhydrylase. The oxidoreductase includes an oxidase and a dehydrogenase. Examples thereof include enzymes that catalyze an oxidation reaction using glucose, lactic acid, cholesterol, or alcohol as substrates. Glucose oxidase, glucose dehydrogenase, lactate oxidase, lactate dehydrogenase, cholesterol oxidase, cholesterol dehydrogenase, alcohol oxidase or alcohol dehydrogenase are preferred.
前記蛋白質は、公知の配列を有する蛋白質を使用しても良い。例えば、配列番号18〜22記載のアミノ酸配列を有する蛋白質を使用できる。配列番号18〜22記載のアミノ酸配列のN末端及び/又はC末端に、前記(a)〜(f)の何れかに記載の結合剤の配列を連結して、金属結合性蛋白質を製造しても良い。配列番号18〜22記載のアミノ酸配列の何れかと少なくとも80%、85%、90%、95%又は98%の類似性を有するアミノ酸配列を使用しても良い。配列番号18〜21記載のアミノ酸配列の何れかで、1又はそれ以上のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列を使用しても良い。変異数は、好ましくは多くとも60個、55個、50個、40個、30個、20個、15個、10個、5個、3個又は2個である。それらのアミノ酸配列をコードする塩基配列を使用すると、前記遺伝子工学的手法で本発明の金属結合性蛋白質を製造できる。 As the protein, a protein having a known sequence may be used. For example, a protein having the amino acid sequence described in SEQ ID NOs: 18 to 22 can be used. A metal-binding protein is produced by linking the binding agent sequence described in any of (a) to (f) above to the N-terminal and / or C-terminal of the amino acid sequence described in SEQ ID NOs: 18 to 22. Also good. An amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95% or 98% similarity to any of the amino acid sequences set forth in SEQ ID NOs: 18-22 may be used. Any of the amino acid sequences described in SEQ ID NOs: 18 to 21 may be used in which one or more amino acids are deleted, substituted, or added. The number of mutations is preferably at most 60, 55, 50, 40, 30, 20, 20, 15, 5, 3, or 2. When the base sequence encoding these amino acid sequences is used, the metal binding protein of the present invention can be produced by the genetic engineering technique.
本発明の金属結合性蛋白質を化学結合により電極に固定化することで、金属結合性蛋白質固定化電極を製造できる。本発明の金属結合性蛋白質は、結合剤部分を介して前記金属の導電物質を備える電極に容易に結合し、配向性持たせた固定化が可能である。該金属結合性蛋白質固定化電極の模式図を図1に示す。 A metal-binding protein-immobilized electrode can be produced by immobilizing the metal-binding protein of the present invention on the electrode by chemical bonding. The metal-binding protein of the present invention can be easily bound to an electrode provided with the metal conductive material via a binder portion, and can be immobilized with orientation. A schematic diagram of the metal-binding protein-immobilized electrode is shown in FIG.
本発明の金属結合性蛋白質を固定化した電極及び絶縁性基板を含むバイオセンサを製造できる。例えば、電気化学式バイオセンサは、絶縁性基板上にスクリーン印刷や蒸着等の方法を利用して電極系を形成する工程、及び蛋白質を固定化する工程を含むことにより製造できる。電極は、対極及び作用極を備えることが好ましく、参照極を備えても良い。電流値、イオン、発色強度又は振動数変化等を検知する方式のバイオセンサを構築可能である。更に、メディエータ、緩衝剤又は安定化剤を含んでも良い。 A biosensor including an electrode on which the metal binding protein of the present invention is immobilized and an insulating substrate can be produced. For example, an electrochemical biosensor can be manufactured by including a step of forming an electrode system using a method such as screen printing or vapor deposition on an insulating substrate, and a step of immobilizing a protein. The electrode preferably includes a counter electrode and a working electrode, and may include a reference electrode. It is possible to construct a biosensor that detects a current value, ions, color intensity, or frequency change. In addition, mediators, buffers or stabilizers may be included.
メディエータは、ヘム等の蛋白質性電子メディエータや、フェリシアン化化合物、キノン系化合物、オスミウム系化合物、フェナジン系化合物、フェノチアジン系化合物等を例示できる。緩衝剤は、目的の反応環境に調整できる緩衝剤であれば良い。安定化剤としては、牛血清アルブミン(BSA)若しくは卵白アルブミン、分子識別素子と作用性のない糖類若しくは糖アルコール類、カルボキシル基含有化合物、アルカリ土類金属化合物、アンモニウム塩、硫酸塩又はタンパク質等を例示できる。 Examples of the mediator include proteinaceous electron mediators such as heme, ferricyanide compounds, quinone compounds, osmium compounds, phenazine compounds, and phenothiazine compounds. The buffer may be any buffer that can be adjusted to the target reaction environment. Examples of stabilizers include bovine serum albumin (BSA) or ovalbumin, saccharides or sugar alcohols having no activity with molecular identification elements, carboxyl group-containing compounds, alkaline earth metal compounds, ammonium salts, sulfates or proteins. It can be illustrated.
本発明のバイオセンサを用いることによって、試料液中の測定対象物を測定する、測定方法を提供できる。試料液に該バイオセンサを接触させる工程を備えることで、試料液中の測定対象物を測定できる。固定化する蛋白質は、所望の測定対象物によって、適宜選択すれば良い。例えば、グルコースを測定する場合は、グルコース酸化酵素又はグルコース脱水素酵素を電極に固定化すれば、グルコース測定方法を提供できる。試料液は特に限定されないが、生体試料が例示でき、具体例として血液、涙、尿又は細胞間質液等が例示できる。血糖測定には、フラビンアデニンジヌクレオチドを補酵素とする真核細胞由来のグルコース脱水素酵素が好ましい。 By using the biosensor of the present invention, a measurement method for measuring a measurement object in a sample solution can be provided. By providing the step of bringing the biosensor into contact with the sample solution, the measurement object in the sample solution can be measured. The protein to be immobilized may be appropriately selected depending on the desired measurement object. For example, when measuring glucose, a glucose measuring method can be provided by immobilizing glucose oxidase or glucose dehydrogenase on an electrode. The sample solution is not particularly limited, but a biological sample can be exemplified, and specific examples include blood, tears, urine, cell interstitial fluid, and the like. For blood glucose measurement, eukaryotic cell-derived glucose dehydrogenase using flavin adenine dinucleotide as a coenzyme is preferable.
[実施例1]
(金属結合性ペプチドの取得)
金属結合能を有する金属結合性ペプチドを取得する為に、ファージディスプレイ法により6アミノ酸配列からなるランダムペプチドライブラリーを構築し、バイオパニングを行った。詳細には、下記洗浄条件I、II又はIIIの条件で、サイクル(1)から(3)又は(4)を行った。最終的に、パラジウム(Pd)板に強固に結合するファージ17種を取得し、DNA配列解析を行った。解析したDNA配列から決定した、金属結合性ペプチド17種(P1〜P17)のアミノ酸配列を表1に示す。尚、各アミノ酸配列について、ExPASyのProtParam tool(http://web.expasy.org/protparam/)で理論上の等電点(Theoretical pI)及び親疎水性指標(Grand average of hydropathicity(GRAVY))を算出し、表1に記載した。何れも塩基性ペプチドだった。尚、非特許文献1及び2に記載のAu、Pt又はPd結合性ペプチドについて表2にまとめた。
[Example 1]
(Acquisition of metal-binding peptide)
In order to obtain a metal-binding peptide having metal-binding ability, a random peptide library consisting of 6 amino acid sequences was constructed by the phage display method, and biopanning was performed. Specifically, cycles (1) to (3) or (4) were performed under the following cleaning conditions I, II, or III. Finally, 17 types of phages that bind tightly to the palladium (Pd) plate were obtained and subjected to DNA sequence analysis. Table 1 shows the amino acid sequences of 17 metal-binding peptides (P1 to P17) determined from the analyzed DNA sequences. For each amino acid sequence, the theoretical isoelectric point (Theoretical pI) and the hydrophilicity / hydrophobicity index (GRAVY) of ExPASy's ProtParam tool (http://web.expasy.org/protparam/) Calculated and listed in Table 1. All were basic peptides. The Au, Pt or Pd binding peptides described in
洗浄条件I
サイクル(1):工程1→工程2→工程3(PBS×3回)→工程4→工程5→
サイクル(2):工程2→工程3(PBS×3回)→工程4→工程5→
サイクル(3):工程2→工程3(PBS×3回)→工程4→工程5
洗浄条件II
サイクル(1):工程1→工程2→工程3(PBS×3回)→工程4→工程5→
サイクル(2):工程2→工程3(PBS×3回)→工程4→工程5→
サイクル(3):工程2→工程3(PBS×3回)→工程4→工程5→
サイクル(4):工程2→工程3(FBS×1回、PBS×2回)→工程4→工程5
洗浄条件III
サイクル(1):工程1→工程2→工程3(PBS×3回)→工程4→工程5→
サイクル(2):工程2→工程3(1%SDS×1回、PBS×2回)→工程4→工程5→
サイクル(3):工程2→工程3(PBS×3回)→工程4→工程5→
サイクル(4):工程2→工程3(FBS×1回、PBS×2回)→工程4→工程5
※PBS:リン酸緩衝生理食塩水、FBS:ウシ胎児血清
Cleaning condition I
Cycle (1): Step 1 →
Cycle (2):
Cycle (3):
Cleaning condition II
Cycle (1): Step 1 →
Cycle (2):
Cycle (3):
Cycle (4):
Cleaning condition III
Cycle (1): Step 1 →
Cycle (2):
Cycle (3):
Cycle (4):
* PBS: phosphate buffered saline, FBS: fetal bovine serum
工程1:ランダムペプチドを提示しているT7ファージ懸濁液を用意する。
工程2:Pd板を、T7ファージ懸濁液に、37℃で1時間浸し、Pd板にT7ファージを結合させる。
工程3(洗浄工程):T7ファージを結合させたPd板を、各洗浄条件の緩衝液に、37℃で5分間浸し、洗浄する。該洗浄を各洗浄条件の回数行う。
工程4:洗浄後のPd板を、大腸菌BL21株の培養液に浸し、Pd板上に残っているT7ファージを大腸菌BL21に感染させ、増幅する。
工程5:タイターチェックにて、T7ファージの増幅を確認する。
Step 1: Prepare a T7 phage suspension displaying random peptides.
Step 2: The Pd plate is immersed in a T7 phage suspension at 37 ° C. for 1 hour to bind the T7 phage to the Pd plate.
Step 3 (Washing Step): The Pd plate to which T7 phage is bound is immersed in a buffer solution of each washing condition at 37 ° C. for 5 minutes for washing. The washing is performed for each washing condition.
Step 4: The washed Pd plate is immersed in a culture solution of E. coli BL21 strain, and T7 phage remaining on the Pd plate is infected with E. coli BL21 for amplification.
Step 5: Confirm amplification of T7 phage by titer check.
[実施例2]
(金属結合性エステラーゼ)
(1)金属結合性エステラーゼの作製
配列番号1〜17記載のアミノ酸配列を有する結合性ペプチドP1〜P17を、配列番号18に記載のエステラーゼ(Est)のN末端又はC末端に各々連結した、34種類の金属結合性Estを作製した。各金属結合性Estは、各々、Est−N1、Est−N2、Est−N3、Est−N4、Est−N5、Est−N6、Est−N7、Est−N8、Est−N9、Est−N10、Est−N11、Est−N12、Est−N13、Est−N14、Est−N15、Est−N16、Est−N17、Est−C1、Est−C2、Est−C3、Est−C4、Est−C5、Est−C6、Est−C7、Est−C8、Est−C9、Est−C10、Est−C11、Est−C12、Est−C13、Est−C14、Est−C15、Est−C16又はEst−C17とした。
[Example 2]
(Metal-binding esterase)
(1) Preparation of metal-binding esterase Binding peptides P1 to P17 having the amino acid sequences described in SEQ ID NOs: 1 to 17 were linked to the N-terminus or C-terminus of esterase (Est) described in SEQ ID NO: 18, respectively. Types of metal binding Est were made. Each metal binding Est is, respectively, Est-N1, Est-N2, Est-N3, Est-N4, Est-N5, Est-N6, Est-N7, Est-N8, Est-N9, Est-N10, Est. -N11, Est-N12, Est-N13, Est-N14, Est-N15, Est-N16, Est-N17, Est-C1, Est-C2, Est-C3, Est-C4, Est-C5, Est-C6 Est-C7, Est-C8, Est-C9, Est-C10, Est-C11, Est-C12, Est-C13, Est-C14, Est-C15, Est-C16 or Est-C17.
金属結合性Estは何れも遺伝子工学的手法で製造した。ベクターには、配列番号18に記載のEstを発現する遺伝子が挿入されたHisタグ融合発現ベクターを用いた。 All metal binding Ests were produced by genetic engineering techniques. As the vector, a His tag fusion expression vector into which a gene expressing Est described in SEQ ID NO: 18 was inserted was used.
Est−N1が発現するように、ベクター内のEst遺伝子の開始コドンの前に、配列番号1記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列を挿入し、Est−N1遺伝子全長を含む発現ベクターpEst−N1を作製した。Est−N2〜17についても同様に、Est−N2〜17遺伝子全長を含む発現ベクターpEst−N2〜17を各々作製した。 In order to express Est-N1, a base sequence encoding the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 1 is inserted before the start codon of the Est gene in the vector, and an expression vector pEst-N1 containing the entire length of the Est-N1 gene is inserted. Produced. Similarly, for Est-N2-17, expression vectors pEst-N2-17 containing the entire length of the Est-N2-17 gene were prepared.
Est−C1が発現するように、ベクター内のEst遺伝子の終止コドンの前に、配列番号1記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列を挿入し、Est−C1遺伝子全長を含む発現ベクターpEst−C1を作製した。Est−C2〜17についても同様に、Est−C2〜17遺伝子全長を含む発現ベクターpEst−C2〜17を各々作製した。 An expression vector pEst-C1 containing the entire length of the Est-C1 gene is inserted by inserting a base sequence encoding the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 1 before the stop codon of the Est gene in the vector so that Est-C1 is expressed. Produced. Similarly, for Est-C2-17, expression vectors pEst-C2-17 containing the entire length of the Est-C2-17 gene were prepared.
前記各ベクターで大腸菌を各々形質転換し、Est−N1〜17又はEst−C1〜17産生組換え大腸菌計34種を作製した。各組換え株をアンピシリンを含む液体培地で培養し、各々集菌した。集菌した各組換え大腸菌を超音波破砕し、Est−N1〜17又はEst−C1〜17を含む各無細胞抽出液(CFE)を回収した。各CFEを熱処理した後、Hisタグ融合蛋白質精製カラムで精製し、精製Est−N1〜17又は精製Est−C1〜17計34サンプルを回収した。各精製酵素について、SDS−PAGEで確認したところ、夾雑蛋白質が除去できていた。更に、何れの金属結合性Estも、金属結合性ペプチドを連結していないEstと同程度の活性を有していた。EstのN末端及び/又はC末端に本発明の金属結合性ペプチドを連結しても、連結による不活性化はみられず、酵素活性を保持できることが分かった。各金属結合性Estの模式図を図2に示した。 Escherichia coli was transformed with each of the vectors to produce a total of 34 types of recombinant Escherichia coli producing Est-N1-17 or Est-C1-17. Each recombinant strain was cultured in a liquid medium containing ampicillin and collected. Each recombinant E. coli collected was sonicated and each cell-free extract (CFE) containing Est-N1-17 or Est-C1-17 was recovered. Each CFE was heat-treated and then purified with a His tag fusion protein purification column, and purified Est-N1-17 or purified Est-C1-17 total 34 samples were collected. About each purified enzyme, when confirmed by SDS-PAGE, the contaminating protein was able to be removed. Furthermore, any metal-binding Est had the same activity as Est without linking a metal-binding peptide. It was found that even when the metal-binding peptide of the present invention was linked to the N terminus and / or C terminus of Est, inactivation due to ligation was not observed, and enzyme activity could be retained. A schematic diagram of each metal binding property Est is shown in FIG.
(2)金属結合性エステラーゼの結合能評価
実施例2の(1)で得られた34種類の各金属結合性Estについて、パラジウムへの結合能を評価した。24穴プレートに、片面がパラジウムメッキされた1cm×1cmのプラスチック板(Pd板)を、メッキ面を上にして、両面テープで固定した。該プレートに、10μg/mlEst−N1溶液を、800μL添加し、37℃で1時間静置することで、Pd板上にEst−N1を結合させた。次に、該Pd板を、0.1%Tween20を含むPBSに、37℃で5分間浸す洗浄工程を3回行った。更に、PBSに37℃で5分間浸し、未結合のEst−N1を除去した。
(2) Binding ability evaluation of metal binding esterase The binding ability to palladium was evaluated about each of 34 types of metal binding Est obtained in (1) of Example 2. A 1 cm × 1 cm plastic plate (Pd plate), one side of which was plated with palladium, was fixed to a 24-hole plate with a double-sided tape with the plating side facing up. 800 μL of 10 μg / ml Est-N1 solution was added to the plate and allowed to stand at 37 ° C. for 1 hour to bind Est-N1 on the Pd plate. Next, a washing step of immersing the Pd plate in PBS containing 0.1% Tween 20 at 37 ° C. for 5 minutes was performed three times. Furthermore, it was immersed in PBS at 37 ° C. for 5 minutes to remove unbound Est-N1.
該Pd板上のEst活性を測定するため、該Pd板を、予め37℃保温した4.95mLPBS入り5mL容チューブに移した。該チューブに、100mM p−ニトロフェニル酢酸を50μL添加し、酵素反応を開始した。5分毎に100μLサンプリングして96穴プレートに入れ、プレートリーダーで405nmにおける吸光度を測定した。Est−N2〜17及びEst−C〜17についても前記と同様に測定した。尚、コントロールとして、金属結合性ペプチドを連結していないEstを用いて、前記と同様に測定した。結果を図3に示した。横軸に、金属結合性ペプチドP1〜P17をN末端又はC末端に連結したものを、P1〜P17で表し、前記コントロールをCで表した。縦軸に、Pd板上のエステラーゼ残存活性について、コントロールを1として相対値で表した。 In order to measure the Est activity on the Pd plate, the Pd plate was transferred to a 5 mL tube containing 4.95 mL PBS that had been kept at 37 ° C. in advance. 50 μL of 100 mM p-nitrophenylacetic acid was added to the tube to start the enzyme reaction. 100 μL was sampled every 5 minutes and placed in a 96-well plate, and the absorbance at 405 nm was measured with a plate reader. Est-N2-17 and Est-C-17 were also measured in the same manner as described above. In addition, it measured similarly to the above using Est which has not connected metal binding peptide as control. The results are shown in FIG. On the horizontal axis, metal-binding peptides P1 to P17 linked to the N-terminus or C-terminus are represented by P1 to P17, and the control is represented by C. On the vertical axis, the residual activity of esterase on the Pd plate is expressed as a relative value with the control being 1.
その結果、Est−N1〜17及びEst−C1〜17は、金属結合性ペプチドを連結していないEstと比較して、Pd板上のEst残存活性が約1.5〜4.0倍だった。よって、金属結合性エステラーゼは、何れも、連結した金属結合性ペプチドによって、金属結合能が高まると共に、Pd板上に適正に結合可能になり、Pd板上で高い残存活性を呈することが可能になったと思われる。 As a result, Est-N1-17 and Est-C1-17 had about 1.5 to 4.0 times the residual activity of Est on the Pd plate as compared with Est not linked with the metal-binding peptide. . Therefore, any of the metal-binding esterases can increase the metal-binding ability by the linked metal-binding peptide, can be appropriately bound on the Pd plate, and can exhibit high residual activity on the Pd plate. It seems to have become.
[実施例3]
(金属結合性o−アセチルセリンスルフヒドリラーゼ)
(1)金属結合性o−アセチルセリンスルフヒドリラーゼの作製
配列番号1、2、3、4、9又は13記載のアミノ酸配列を有する金属結合性ペプチドP1、2、3、4、9又は13を、配列番号19に記載のo−アセチルセリンスルフヒドリラーゼ(OASS)のN末端又はC末端に各々連結した、12種類の金属結合性OASSを作製した。各金属結合性OASSは、各々、OASS−N1、OASS−N2、OASS−N3、OASS−N4、OASS−N9、OASS−N13、OASS−C1、OASS−C2、OASS−C3、OASS−C4、OASS−C9又はOASS−C13とした。
[Example 3]
(Metal-binding o-acetylserine sulfhydrylase)
(1) Production of metal-binding o-acetylserine sulfhydrylase Metal-binding peptide P1, 2, 3, 4, 9 or 13 having the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 9 or 13 12 types of metal-binding OASS were prepared by linking each to the N-terminal or C-terminal of o-acetylserine sulfhydrylase (OASS) described in SEQ ID NO: 19. Each metal-bonded OASS is OASS-N1, OASS-N2, OASS-N3, OASS-N4, OASS-N9, OASS-N13, OASS-C1, OASS-C2, OASS-C3, OASS-C4, OASS, respectively. -C9 or OASS-C13.
金属結合性OASSは何れも遺伝子工学的手法で製造した。ベクターには、配列番号19に記載のOASSを発現する遺伝子が挿入されたHisタグ融合発現ベクターを用いた。 All metal-binding OASS was produced by a genetic engineering technique. As the vector, a His tag fusion expression vector into which a gene expressing OASS described in SEQ ID NO: 19 was inserted was used.
OASS−N1が発現するように、ベクター内のOASS遺伝子の開始コドンの前に、配列番号1記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列を挿入し、OASS−N1遺伝子全長を含む発現ベクターpOASS−N1を作製した。OASS−N2、OASS−N3、OASS−N4、OASS−N9又はOASS−N13についても同様に、発現ベクターpOASS−N3、pOASS−N4、pOASS−N9又はpOASS−N13を各々作製した。 An expression vector pOASS-N1 containing the full length of the OASS-N1 gene is inserted by inserting a base sequence encoding the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 1 before the start codon of the OASS gene in the vector so that OASS-N1 is expressed. Produced. Similarly, expression vectors pOASS-N3, pOASS-N4, pOASS-N9 and pOASS-N13 were prepared for OASS-N2, OASS-N3, OASS-N4, OASS-N9 and OASS-N13.
OASS−C1が発現するように、ベクター内のOASS遺伝子の終止コドンの前に、配列番号1記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列を挿入し、OASS−C1遺伝子全長を含む発現ベクターpOASS−C1を作製した。OASS−C2、OASS−C3、OASS−C4、OASS−C9又はOASS−C13についても同様に、発現ベクターpOASS−C2、pOASS−C3、pOASS−C4、pOASS−C9又はpOASS−C13を各々作製した。 An expression vector pOASS-C1 containing the full length of the OASS-C1 gene is inserted by inserting a base sequence encoding the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 1 before the stop codon of the OASS gene in the vector so that OASS-C1 is expressed. Produced. Similarly, for OASS-C2, OASS-C3, OASS-C4, OASS-C9 and OASS-C13, expression vectors pOASS-C2, pOASS-C3, pOASS-C4, pOASS-C9 and pOASS-C13 were prepared.
前記各ベクターで大腸菌を各々形質転換し、OASS−N1、OASS−N2、OASS−N3、OASS−N4、OASS−N9、OASS−N13、OASS−C1、OASS−C2、OASS−C3、OASS−C4、OASS−C9又はOASS−C13産生組換え大腸菌計12種を作製した。各組換え株をアンピシリンを含む液体培地で培養し、各々集菌した。集菌した各組換え大腸菌を超音波破砕し、OASS−N1、OASS−N2、OASS−N3、OASS−N4、OASS−N9、OASS−N13、OASS−C1、OASS−C2、OASS−C3、OASS−C4、OASS−C9又はOASS−C13を含む各無細胞抽出液(CFE)を回収した。その後、Hisタグ融合蛋白質精製カラムで精製し、精製したOASS−N1、OASS−N2、OASS−N3、OASS−N4、OASS−N9、OASS−N13、OASS−C1、OASS−C2、OASS−C3、OASS−C4、OASS−C9又はOASS−C13計12サンプルを回収した。各精製酵素について、SDS−PAGEで確認したところ、夾雑蛋白質が除去できていた。 E. coli was transformed with each of the vectors, and OASS-N1, OASS-N2, OASS-N3, OASS-N4, OASS-N9, OASS-N13, OASS-C1, OASS-C2, OASS-C3, OASS-C4 Twelve kinds of recombinant Escherichia coli producing OASS-C9 or OASS-C13 were prepared. Each recombinant strain was cultured in a liquid medium containing ampicillin and collected. Each recombinant E. coli collected was sonicated and OASS-N1, OASS-N2, OASS-N3, OASS-N4, OASS-N9, OASS-N13, OASS-C1, OASS-C2, OASS-C3, OASS Each cell-free extract (CFE) containing -C4, OASS-C9 or OASS-C13 was collected. Then, purified with a His tag fusion protein purification column, purified OASS-N1, OASS-N2, OASS-N3, OASS-N4, OASS-N9, OASS-N13, OASS-C1, OASS-C2, OASS-C3, A total of 12 samples of OASS-C4, OASS-C9 or OASS-C13 were collected. About each purified enzyme, when confirmed by SDS-PAGE, the contaminating protein was able to be removed.
尚、非特許文献1記載のパラジウム結合性ペプチド:SPHPGPYをOASSのN末端又はC末端に連結した金属結合性OASSも前記と同様に作成し、コントロールとした。 In addition, the metal binding OASS which connected palladium binding peptide: SPHPGPY of nonpatent literature 1 to the N terminal or C terminal of OASS was created similarly to the above, and it was set as control.
(2)金属結合性o-アセチルセリンスルフヒドリラーゼの配向性制御能評価
実施例3の(1)で得られた12種類の各金属結合性OASSについて、NAPiCOSシステム(日本電波工業社製)を用いて配向性制御能を評価した。最初に、QCMセンサ(日本電波工業社製)について、水晶振動子の金電極表面をパラジウム蒸着処理することで、パラジウム成膜処理QCMセンサを作製した。該センサのパラジウム上に、100μg/mL OASS−N1溶液を添加し、室温にて1時間静置することで、パラジウム表面にOASS−N1を結合させた。次に、該センサを、MilliQ水で洗浄して、未結合のOASS−N1を除去し、OASS−N1固定化センサチップを作製した。該センサをNAPiCOSシステムにセットし、1mg/mL BSA溶液でブロッキング処理した。10μg/mLのセリンアセチルトランスフェラーゼ(SAT)溶液を流し、次に100μg/mLのSAT溶液を流して、該センサ上のOASS−N1と相互作用させ、各々の振動数変化を測定した。OASS−N2、OASS−N3、OASS−N4、OASS−N9、OASS−N13、OASS−C1、OASS−C2、OASS−C3、OASS−C4、OASS−C9、OASS−C13又はコントロールについても同様の操作を行い、振動数変化を測定した。結果を図4に示した。図4では、金属結合性ペプチドP1、P2、P3、P4、P9又はP13をN末端又はC末端に連結したものを、P1、P2、P3、P4、P9又はP13で表し、前記コントロールをPCで表した。尚、点線が、N末端側に金属結合性ペプチドを連結した金属結合性OASSの振動数変化を表しており、実線が、C末端側に金属結合性ペプチドを連結した金属結合性OASSの振動数変化を表している。
(2) Evaluation of ability to control orientation of metal binding o-acetylserine sulfhydrylase About each of 12 types of metal binding OASS obtained in (1) of Example 3, NAPiCOS system (manufactured by Nippon Denpa Kogyo Co., Ltd.) Was used to evaluate the orientation control ability. First, for a QCM sensor (manufactured by Nippon Denpa Kogyo Co., Ltd.), a palladium film-forming QCM sensor was produced by performing palladium vapor deposition on the gold electrode surface of the crystal resonator. On the palladium of the sensor, a 100 μg / mL OASS-N1 solution was added and allowed to stand at room temperature for 1 hour to bind OASS-N1 to the palladium surface. Next, the sensor was washed with MilliQ water to remove unbound OASS-N1, and an OASS-N1 immobilized sensor chip was produced. The sensor was set in a NAPiCOS system and blocked with a 1 mg / mL BSA solution. A 10 μg / mL serine acetyltransferase (SAT) solution was flowed, and then a 100 μg / mL SAT solution was flowed to interact with OASS-N1 on the sensor, and each frequency change was measured. Similar operations for OASS-N2, OASS-N3, OASS-N4, OASS-N9, OASS-N13, OASS-C1, OASS-C2, OASS-C3, OASS-C4, OASS-C9, OASS-C13 or control The frequency change was measured. The results are shown in FIG. In FIG. 4, the metal-binding peptide P1, P2, P3, P4, P9 or P13 linked to the N-terminus or C-terminus is represented by P1, P2, P3, P4, P9 or P13, and the control is PC. expressed. The dotted line represents the change in the frequency of the metal-binding OASS having the metal-binding peptide linked to the N-terminal side, and the solid line represents the frequency of the metal-binding OASS having the metal-binding peptide linked to the C-terminal side. It represents a change.
蛋白質のN末端側に金属結合性ペプチドを連結すると、N末端側で金属に結合し、一方、C末端側に金属結合性ペプチドを連結すると、C末端側で金属に結合する。OASSはC末端付近に活性部位があるため、理論上、C末端側で金属に結合すると、SATが作用し難いため測定値が小さく、N末端側で金属に結合すると、活性部位にSATが作用し易いため測定値が大きくなると考えられる。よって、OASS−N1とOASS−C1の前記測定値を比べて、OASS−N1の方が振動数変化が大きければ、金属結合性ペプチドにより配向性制御がなされていると判断できる。 When a metal-binding peptide is linked to the N-terminal side of the protein, it binds to the metal at the N-terminal side, while when a metal-binding peptide is linked to the C-terminal side, it binds to the metal at the C-terminal side. Since OASS has an active site near the C-terminal, theoretically, SAT hardly acts when bound to a metal on the C-terminal side, so the measured value is small. When bound to metal on the N-terminal side, SAT acts on the active site. It is thought that the measured value becomes large because it is easy to do. Therefore, comparing the measured values of OASS-N1 and OASS-C1, if OASS-N1 has a larger frequency change, it can be determined that orientation control is performed by the metal-binding peptide.
図4より、OASS−N1とOASS−C1(P1)、OASS−N2とOASS−C2(P2)、OASS−N3とOASS−C3(P3)、OASS−N4とOASS−C4(P4)、OASS−N9とOASS−C9(P9)又はOASS−N13とOASS−C13(P13)は、全てN末端に金属結合性ペプチドを連結した方が振動数変化が大きかった。一方、コントロール(PC)は、N末端側とC末端側とに各々金属結合性ペプチドを連結したものとで差がみられなかった。すなわち、コントロールでは配向性制御がほとんどなされておらず、本発明の金属結合性ペプチドでは配向性制御がなされていることが明らかとなった。 From FIG. 4, OASS-N1 and OASS-C1 (P1), OASS-N2 and OASS-C2 (P2), OASS-N3 and OASS-C3 (P3), OASS-N4 and OASS-C4 (P4), OASS- N9 and OASS-C9 (P9) or OASS-N13 and OASS-C13 (P13) all had a greater frequency change when the metal-binding peptide was linked to the N-terminus. On the other hand, in the control (PC), there was no difference between the N-terminal side and the C-terminal side in which metal-binding peptides were linked. That is, it was clarified that the orientation was hardly controlled in the control, and the orientation was controlled in the metal-binding peptide of the present invention.
[実施例4]
(金属結合性グルコース脱水素酵素)
(1)金属結合性グルコース脱水素酵素の作製
配列番号1記載のアミノ酸配列又はその逆配列を有する結合性ペプチドを連結した、3種類の金属結合性グルコース脱水素酵素を作製した。1つ目はグルコース脱水素酵素(GLD)のN末端に配列番号1記載のアミノ酸配列を有する結合性ペプチドを連結したGLD−N1である。2つ目はGLDのC末端に配列番号1記載のアミノ酸配列の逆配列を有する結合性ペプチドを連結したGLD−C1’である。3つ目はGLDのN末端に配列番号1記載のアミノ酸配列を有する結合性ペプチドを、及びC末端に配列番号1記載のアミノ酸配列の逆配列を有する結合性ペプチドを連結したGLD−N1C1’である。GLD−N1、GLD−C1’及びGLD−N1C1’は何れも遺伝子工学的手法で製造した。ベクターには、配列番号20に記載のGLDを発現する遺伝子が挿入された発現ベクターを用いた。該ベクターは、WO2006/101239号パンフレットの実施例4に記載されたベクターのシグナル配列遺伝子部分をMLFSLAFLSALSLATASPAGRAをコードする遺伝子に置換したベクターである。
[Example 4]
(Metal-binding glucose dehydrogenase)
(1) Preparation of metal-binding glucose dehydrogenase Three types of metal-binding glucose dehydrogenase were prepared by connecting binding peptides having the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 1 or its reverse sequence. The first is GLD-N1 in which a binding peptide having the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 1 is linked to the N-terminus of glucose dehydrogenase (GLD). The second is GLD-C1 ′ in which a binding peptide having the reverse sequence of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 1 is linked to the C-terminal of GLD. The third is GLD-N1C1 ′ in which a binding peptide having the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 1 is connected to the N-terminal of GLD, and a binding peptide having the reverse sequence of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 1 is connected to the C-terminal. is there. GLD-N1, GLD-C1 ′ and GLD-N1C1 ′ were all produced by genetic engineering techniques. As the vector, an expression vector into which a gene expressing GLD described in SEQ ID NO: 20 was inserted was used. This vector is a vector in which the signal sequence gene portion of the vector described in Example 4 of WO 2006/101239 is replaced with a gene encoding MLFSLAFLSALSLATASPAGRA.
GLD−N1が発現するように、前記ベクター内のシグナル遺伝子配列の後に、配列番号1記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列を挿入し、GLD−N1遺伝子全長を含む発現ベクターpGLD−N1を作製した。 A base sequence encoding the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 was inserted after the signal gene sequence in the vector so that GLD-N1 was expressed, to prepare an expression vector pGLD-N1 containing the full length of the GLD-N1 gene. .
GLD−C1’が発現するように、前記ベクター内のGLD遺伝子の終止コドンの前に、配列番号1記載のアミノ酸配列の逆配列をコードする塩基配列を挿入し、GLD−C1’遺伝子全長を含む発現ベクターpGLD−C1’を作製した。 In order to express GLD-C1 ′, a base sequence encoding the reverse sequence of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 1 is inserted before the stop codon of the GLD gene in the vector, and the entire length of GLD-C1 ′ gene is included. An expression vector pGLD-C1 ′ was prepared.
GLD−N1C1’が発現するように、前記pGLD−N1内のGLD遺伝子の終止コドンの前に、配列番号1記載のアミノ酸配列の逆配列をコードする塩基配列を挿入し、GLD−N1C1’遺伝子全長を含む発現ベクターpGLD−N1C1’を作製した。 In order to express GLD-N1C1 ′, a base sequence encoding the reverse sequence of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 1 is inserted in front of the stop codon of the GLD gene in pGLD-N1, and the full length of the GLD-N1C1 ′ gene An expression vector pGLD-N1C1 ′ containing
WO2006/101239号パンフレットの実施例4に記載の方法で、前記各ベクターでアスペルギルス・オリゼNS4株を各々形質転換し、GLD−N1、GLD−C1’又はGLD−N1C1’産生組換えアスペルギルス・オリゼ3種を作製した。各組換え株を液体培地で培養し、各々培養上清を回収した。各培養上清について、陰イオン交換カラムで精製し、SDS−PAGEで確認したところ、単一バンドのGLD−N1、GLD−C1’又はGLD−N1C1’を確認できた。更に、何れの金属結合性GLDも、金属結合性ペプチドを連結していないGLDと同程度の活性を有していた。GLDのN末端及び/又はC末端に本発明の金属結合性ペプチドを連結しても、連結による不活性化はみられず、酵素活性を保持できることが分かった。各金属結合性GLDの模式図を図5に示した。 Aspergillus oryzae NS4 strain is transformed with each of the vectors by the method described in Example 4 of WO2006 / 101239 pamphlet, and GLD-N1, GLD-C1 ′ or GLD-N1C1′-producing recombinant Aspergillus oryzae 3 A seed was produced. Each recombinant strain was cultured in a liquid medium, and each culture supernatant was collected. Each culture supernatant was purified by an anion exchange column and confirmed by SDS-PAGE. As a result, single band GLD-N1, GLD-C1 'or GLD-N1C1' could be confirmed. Furthermore, any metal-binding GLD had the same activity as GLD not linked with a metal-binding peptide. It was found that even when the metal-binding peptide of the present invention was linked to the N-terminus and / or C-terminus of GLD, inactivation due to the linkage was not observed and the enzyme activity could be retained. A schematic diagram of each metal-binding GLD is shown in FIG.
(2)金属結合性グルコース脱水素酵素の評価
実施例4の(1)で得られたGLD−N1C1’について、パラジウムへの結合能を評価した。12穴プレートに、片面がパラジウムメッキされた1cm×1cmのプラスチック板(Pd板)を、メッキ面を上にして、両面テープで固定した。該プレートに、7μg/mlGLD−N1C1’溶液を1mL添加し、37℃で1時間静置することで、Pd板上にGLD−N1C1’を結合させた。次に、該Pd板を、5mLの0.05%のTween20を含むPBSに、室温で5分間浸す洗浄工程を3回行った。更に、PBSに室温で5分間浸し、未結合のGLD−N1C1’を除去した。
(2) Evaluation of metal binding glucose dehydrogenase GLD-N1C1 ′ obtained in (1) of Example 4 was evaluated for its ability to bind to palladium. A 1 cm × 1 cm plastic plate (Pd plate) with one side plated with palladium was fixed to a 12-hole plate with a double-sided tape with the plated side facing up. 1 mL of a 7 μg / ml GLD-N1C1 ′ solution was added to the plate and left at 37 ° C. for 1 hour to bind GLD-N1C1 ′ on a Pd plate. Next, a washing step of immersing the Pd plate in 5 mL of PBS containing 0.05% Tween 20 at room temperature for 5 minutes was performed three times. Furthermore, it was immersed in PBS for 5 minutes at room temperature to remove unbound GLD-N1C1 ′.
該Pd板上のGLD活性を測定するため、該Pd板を、12穴プレートに移した。該12穴プレートに、予め25℃保温したGLD活性測定試薬を添加することで酵素反応を開始した。経時的にサンプリングして、プレートリーダー(SpectraMax Plus384、モレキュラーデバイス社製)で600nmにおける吸光度を測定した。尚、グルコース脱水素酵素活性測定試薬は、100mMリン酸カリウム緩衝液(pH7.0)1.00mL、1M D−グルコース溶液1.00mL、MilliQ水0.61mL、3mM 2,6−ジクロロフェノールインドフェノール0.14mL及び3mM 1−メトキシ−5−メチルフェナジウムメチルサルフェイト0.20mLの混合液である。尚、コントロールとして、金属結合性ペプチドを連結していないグルコース脱水素酵素を用いて、前記と同様に測定した。何れも2回測定し、平均値を算出した。結果を図6に示した。縦軸に、Pd板上のGLD残存活性について、コントロールの平均値を1として相対値で表した。
In order to measure the GLD activity on the Pd plate, the Pd plate was transferred to a 12-well plate. The enzyme reaction was started by adding a GLD activity measuring reagent kept at 25 ° C. in advance to the 12-well plate. Sampling was performed over time, and the absorbance at 600 nm was measured with a plate reader (SpectraMax Plus 384, manufactured by Molecular Devices). The glucose dehydrogenase activity measuring reagent was 1.00 mL of 100 mM potassium phosphate buffer (pH 7.0), 1.00 mL of 1M D-glucose solution, 0.61 mL of MilliQ water, 3
その結果、平均値で比較すると、GLD−N1C1’は、金属結合性ペプチドを連結していないGLDと比較して、Pd板上のGLD残存活性が約3.8倍だった。よって、金属結合性グルコース脱水素酵素は、連結した金属結合性ペプチドによって、金属結合能が高まると共に、Pd板上に適正に結合可能になり、Pd板上で高い残存活性を呈することが可能になったと思われる。 As a result, when compared with average values, GLD-N1C1 'had a GLD residual activity on the Pd plate of about 3.8 times that of GLD not linked with a metal-binding peptide. Therefore, the metal-binding glucose dehydrogenase can increase the metal-binding ability by the linked metal-binding peptide, and can be appropriately bound on the Pd plate, and can exhibit high residual activity on the Pd plate. It seems to have become.
1・・・蛋白質、2・・・金属結合性ペプチド、3・・・電極、4・・・金属結合性蛋白質 DESCRIPTION OF SYMBOLS 1 ... Protein, 2 ... Metal binding peptide, 3 ... Electrode, 4 ... Metal binding protein
Claims (14)
(i)金及び白金族金属結合能を有する;
(ii)塩基性ペプチドである;
(iii)親水性ペプチドである;
(iv)配向性制御能を有する。 A binder comprising the following properties (i), (ii), (iii) and (iv) and comprising a metal-binding peptide:
(I) has gold and platinum group metal binding ability;
(Ii) is a basic peptide;
(Iii) is a hydrophilic peptide;
(Iv) It has an orientation control ability.
(v)等電点が8.5〜13.5である;
(vi)親疎水性指標が−0.200〜−4.000である;
(vii)4〜14アミノ酸からなる。 The binder according to any one of claims 1 to 3, which has the following properties (v), (vi) and (vii):
(V) the isoelectric point is 8.5 to 13.5;
(Vi) the hydrophilicity / hydrophobicity index is -0.200 to -4,000;
(Vii) It consists of 4 to 14 amino acids.
(a)以下の(1)〜(17)の何れかに記載のアミノ酸配列;
(1)K、K、R、E、V及びRからなるアミノ酸配列、
(2)V、Y、N、K、R及びKからなるアミノ酸配列、
(3)S、R、A、A、K及びYからなるアミノ酸配列、
(4)Q、K、R、K、V及びVからなるアミノ酸配列、
(5)K、G、R、G、R及びVからなるアミノ酸配列、
(6)K、R、K、A、A及びMからなるアミノ酸配列、
(7)K、T、R、G、V及びKからなるアミノ酸配列、
(8)K、Q、K、K、T及びTからなるアミノ酸配列、
(9)R、T、R、N、R及びSからなるアミノ酸配列、
(10)T、Q、K、G、R及びKからなるアミノ酸配列、
(11)K、G、A、K、K及びVからなるアミノ酸配列、
(12)K、K、T、S、K及びGからなるアミノ酸配列、
(13)K、T、R、M、R及びGからなるアミノ酸配列、
(14)L、K、D、K、K及びKからなるアミノ酸配列、
(15)R、G、Y、K、K及びGからなるアミノ酸配列、
(16)R、K、G、N、K及びAからなるアミノ酸配列、
(17)R、V、G、R、K及びGからなるアミノ酸配列
(b)(a)に記載のアミノ酸配列において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列。 A binding agent comprising a peptide having the following amino acid sequence (a) or (b) and having a binding ability to a metal:
(A) the amino acid sequence according to any one of (1) to (17) below:
(1) an amino acid sequence consisting of K, K, R, E, V and R;
(2) an amino acid sequence consisting of V, Y, N, K, R and K;
(3) an amino acid sequence consisting of S, R, A, A, K and Y,
(4) an amino acid sequence consisting of Q, K, R, K, V and V;
(5) an amino acid sequence consisting of K, G, R, G, R and V;
(6) an amino acid sequence consisting of K, R, K, A, A and M;
(7) an amino acid sequence consisting of K, T, R, G, V and K;
(8) an amino acid sequence consisting of K, Q, K, K, T and T;
(9) an amino acid sequence consisting of R, T, R, N, R and S,
(10) an amino acid sequence consisting of T, Q, K, G, R and K;
(11) an amino acid sequence consisting of K, G, A, K, K and V,
(12) an amino acid sequence consisting of K, K, T, S, K and G;
(13) an amino acid sequence consisting of K, T, R, M, R and G;
(14) an amino acid sequence consisting of L, K, D, K, K and K;
(15) an amino acid sequence consisting of R, G, Y, K, K and G;
(16) an amino acid sequence consisting of R, K, G, N, K and A,
(17) An amino acid sequence consisting of R, V, G, R, K and G, wherein one or several amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence described in (b) (a).
(c)配列番号1〜17の何れかに記載のアミノ酸配列;
(d)(c)に記載のアミノ酸配列の逆配列;
(e)(c)又は(d)に記載のアミノ酸配列において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列。 The binding agent according to claim 5, which comprises a peptide having the following amino acid sequence (c), (d) or (e) and has a binding ability to a metal:
(C) the amino acid sequence according to any one of SEQ ID NOs: 1 to 17;
(D) a reverse sequence of the amino acid sequence described in (c);
(E) An amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence described in (c) or (d).
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