JP2017048183A - 抗ヒト受容体型プロテインチロシンホスファターゼσ抗体 - Google Patents
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Abstract
Description
IFNαおよびIFNβは、抗ウイルス活性または抗腫瘍活性を有するI型IFNとして知られている。一方で、IFNαは自己免疫疾患に関連していることが明らかにされた。たとえば、以下の自己免疫疾患患者においてIFNαの異常産生が報告されている。そしてIFNαの中和によって自己免疫症状が緩和される可能性が示唆されている。
全身性エリテマトーデス(Shiozawa et al., Arthr. & Rheum. 35, 412, 1992)、慢性関節リウマチ(Hopkins et al.,Clin. Exp. Immunol. 73, 88, 1988)、さらに、組み換えIFNα2やIFNの投与によって自己免疫疾患症状が発現または悪化した例が報告されている(Wada et al., Am.J. Gastroenterol. 90, 136, 1995;Perez et al., Am. J. Hematol. 49, 365, 1995;Wilson LE et al, Semin Arthritis, Rheum. 32, 163-173, 2002)。
樹状細胞(DC)は、血液中、リンパ組織中などに存在する生体内における主要な抗原提示細胞であり、骨髄系樹状細胞(mDC)と形質細胞様樹状細胞(pDC)に大きく分類される。pDCはその細胞表面にToll様受容体としてTLR7およびTLR9を選択的に発現し、I型インターフェロンαおよびβ、特にインターフェロンαを産生する。
最近の研究により、樹状細胞に作用してその成熟や活性化を制御する種々のリガンド分子が明らかにされ、また、その受容体からの細胞内シグナル伝達機構が明らかになりつつある。しかしながら、樹状細胞の機能の調節および制御機構については不明な点が多い。他の多くの細胞で明らかにされてきたのと同様に、樹状細胞においても、タンパク質のリン酸化が受容体からのシグナル伝達・細胞運動/遊走性の制御等に重要な役割を果たしていると考えられている。タンパク質リン酸化の負の調節因子であるプロテインホスファターゼは、シグナルの強さ、長さを適正に保ち、結果、樹状細胞の活性化や機能を調節する因子として、有力な候補である。
(財団法人北海道科学技術総合振興センター(略称:ノーステック財団)のホームページ中の、田沼延公(北海道大学遺伝子病制御研究所)「樹状細胞成熟過程で誘導されるチロシンホスファターゼの機能解析」http://www.noastec.jp/kinouindex/data2005/pdf/01/01_20.pdf)
国際公開WO2007/41317A1号公報は、少なくともRPTP−σかRPTP−δと特異的に結合し、免疫細胞の免疫応答性を抑制する単離された抗体またはその抗原結合フラグメントに関する。この文献には、RPTPと特異的に結合する抗体を使用することによりポックスウイルスポリペプチドA41LとRPTPとの結合を競合的に阻害し、結果的に免疫細胞の免疫応答性の抑制が達成される旨が記載されている。しかし、この文献はRPTP−σ(PTPRS)と特異的に結合する抗体を実際に取得したことを開示してはおらず、その実施例の記載から判断する限り、A41Lと結合する免疫細胞で発現されたRPTPが、同じサブタイプR2Aに属するRPTP−σ、RPTP−δおよびLARの一部であることを確認し、LARのイムノグロブリン様ドメインとFcとの融合タンパク質(LAR(Igドメイン)−Fc融合タンパク質)を作成したに過ぎない。国際公開WO2007/41317A1号公報には、RPTP−σのみに特異的な抗体やその作成が開示されているとは言いがたい。
RPTP−σ、即ち本願で言うPTPRSの特定の部位にのみ結合する抗体や、同じサブタイプR2Aに属するRPTP−δやLARには結合せずにRPTP−σ(PTPRS)に特異的に結合し得る抗体は得られていない。ヒトPTPRSがpDCにおいて特異的な発現が見られる分子であるが、これまでヒトPTPRSに対する抗体は得られていない。
即ち本発明は、以下の抗ヒトPTPRS抗体、その製造方法、ならびにその用途に関する。
本発明は以下の通りである。
(1)ヒト受容体型プロテインチロシンホスファターゼσ(ヒトPTPRS)の細胞外ドメインに結合するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片。
(2)形質細胞様樹状細胞に結合する前記(1)に記載のモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片。
(3)受託番号FERM BP−11356として寄託されたハイブリドーマ9H5−4、
受託番号FERM BP−11357として寄託されたハイブリドーマ10F7−38、
受託番号FERM BP−11358として寄託されたハイブリドーマ13G5−52、
受託番号FERM BP−11359として寄託されたハイブリドーマ13G5−57、
受託番号FERM BP−11360として寄託されたハイブリドーマ14A8−85、
受託番号FERM BP−11361として寄託されたハイブリドーマ22H8−84、
受託番号FERM BP−11362として寄託されたハイブリドーマ49F2−30、または
受託番号FERM BP−11363として寄託されたハイブリドーマ55E7−79が産生するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片。
(4)前記(1)または(2)に記載のモノクローナル抗体のいずれかを産生するハイブリドーマ。
(5)受託番号FERM BP−11356として寄託されたハイブリドーマ9H5−4、
受託番号FERM BP−11357として寄託されたハイブリドーマ10F7−38、
受託番号FERM BP−11358として寄託されたハイブリドーマ13G5−52、
受託番号FERM BP−11359として寄託されたハイブリドーマ13G5−57、
受託番号FERM BP−11360として寄託されたハイブリドーマ14A8−85、
受託番号FERM BP−11361として寄託されたハイブリドーマ22H8−84、
受託番号FERM BP−11362として寄託されたハイブリドーマ49F2−30、または
受託番号FERM BP−11363として寄託されたハイブリドーマ55E7−79が産生するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片。
(6)前記(5)に記載のハイブリドーマを培養し、培養物からモノクローナル抗体を採取する工程を含む、モノクローナル抗体の製造方法。
(7)次の工程を含む、ヒトPTPRSに結合するモノクローナル抗体を産生する細胞の製造方法;
1)ヒトPTPRSの細胞外ドメインを含む外来性のタンパク質を発現する細胞を免疫動物に投与する工程、および
2)前記免疫動物の抗体産生細胞から、ヒトPTPRSに結合する抗体を産生する抗体産生細胞を選択する工程。
(8)ヒトPTPRSを発現する細胞が、ヒトPTPRSの細胞外ドメインを含むアミノ酸配列をコードする外来性のポリヌクレオチドを発現可能に保持する細胞である前記(7)に記載の方法。
(9)前記細胞が動物細胞である前記(8)に記載の方法。
(10)前記細胞がヒト由来の細胞である前記(9)に記載の方法。
(11)前記ヒト由来の細胞が、HEK−293T細胞である前記(10)に記載の方法。
(12)得られた抗体産生細胞をクローン化する工程を付加的に含む、前記(7)〜(11)のいずれか一項に記載の方法。
(13)前記(9)に記載の方法によって得られた抗体産生細胞を培養し、その培養物からモノクローナル抗体を採取する工程を含む、ヒトPTPRSの細胞外ドメインに結合するモノクローナル抗体の製造方法。
(14)下記の工程によって得ることができる、ヒトPTPRSを認識するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片:
1)ヒトPTPRSの細胞外ドメインを含むタンパク質を外来性に発現する細胞を免疫動物に投与する工程、
2)前記免疫動物の抗体産生細胞から、ヒトPTPRSに結合する抗体を産生する抗体産生細胞を選択する工程、および
3)工程2)で選択された抗体産生細胞を培養しその培養物からヒトPTPRSを認識する抗体を回収する工程。
(15)(a)ヒトPTPRSの細胞外ドメインを含むアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを外来性に発現可能に保持する動物細胞、またはその細胞膜分画を含む、ヒトPTPRSに結合する抗体を製造するための免疫原。
(16)動物細胞がヒト由来の細胞である前記(15)に記載の免疫原。
(17)ヒトPTPRSの細胞外ドメインに結合するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片を被検細胞と接触させ、該細胞に結合したモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片を検出する工程を含む、形質細胞様樹状細胞の検出方法。
(18)ヒトPTPRSの細胞外ドメインに結合するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片を含む、形質細胞様樹状細胞の検出用試薬。
(19)次の成分のいずれかを形質細胞様樹状細胞に接触させる工程を含む、形質細胞様樹状細胞の活性抑制方法:
(a)ヒトPTPRSに結合し、形質細胞様樹状細胞の活性を抑制するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片、
(b)(a)のモノクローナル抗体の相補性決定領域を移植したイムノグロブリン、またはその抗原結合領域を含む断片。
(20)次の成分のいずれかを生体に投与する工程を含む、生体中の形質細胞様樹状細胞の活性抑制方法:
(a)ヒトPTPRSに結合し、形質細胞様樹状細胞の活性を抑制するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片、
(b)(a)のモノクローナル抗体の相補性決定領域を移植したイムノグロブリン、またはその抗原結合領域を含む断片。
(21)形質細胞様樹状細胞の活性が、インターフェロン産生活性およびインターフェロン産生細胞の生存のいずれか、または両方である前記(19)または前記(20)に記載の方法。
(22)次の成分のいずれかを有効成分として含む、形質細胞様樹状細胞の活性抑制剤:
(a)ヒトPTPRSに結合し、形質細胞様樹状細胞の活性を抑制するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片、
(b)(a)のモノクローナル抗体の相補性決定領域を移植したイムノグロブリン、またはその抗原結合領域を含む断片。
(23)形質細胞様樹状細胞の活性が、インターフェロン産生活性およびインターフェロン産生細胞の生存のいずれか、または両方である前記(22)に記載のインターフェロン産生細胞の活性抑制剤。
ヒトPTPRSのアイソフォーム3は配列番号1(図1)の831〜851を膜貫通ドメインとして含む膜貫通タンパク質である。N末端を含む1501アミノ酸残基のうち、29アミノ酸残基(配列番号1における1から29)がシグナル配列で、30〜830が細胞外ドメインを構成する。一方C末端側は細胞内ドメインである。PTPRSにおいては細胞外環境にあるリガンドが活性を制御しうると考えられている。
−ヒト細胞との反応性に基づく確認:
本発明者らの得た知見によれば、ヒトPTPRSは、ヒトpDCに特異的な発現が見られることから、pDCのマーカーとして利用できると考えられる。
本発明者らは、特定の条件でヒトPTPRS遺伝子を発現させたときに、ヒトpDCで発現しているヒトPTPRSの免疫学的特徴が再構成されることを確認した。したがってヒトPTPRSをコードする遺伝子を人為的に導入した細胞に対する抗体の反応性に基づいて、ヒトPTPRSとの反応性を確認することができる。すなわち本発明は、ヒトPTPRSの細胞外ドメインを構成するアミノ酸配列を細胞外ドメインとして含む分子と結合するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片に関する。なお細胞外ドメインは、配列番号1に示したアミノ酸配列のN末端から配列番号1(図1)における30〜830に相当するアミノ酸配列によって構成される。
例えば、ヒトPTPRSをコードするDNAを含む発現ベクターで形質転換した細胞においては、ヒトpDCで発現しているPTPRSの免疫学的特徴が維持される。したがって、ヒトPTPRSを発現する形質転換細胞は、本発明におけるヒトPTPRSの細胞外ドメインに対する抗体の結合性を確認するための細胞として好ましい。本発明において、形質転換細胞によって抗体の反応性を確認するときには、対照として、形質転換されていない細胞を利用するのが望ましい。
a) ヒトpDCと結合する、
b) ヒトpDCと結合する条件下で、単球、マクロファージ、B細胞、CD34陽性細胞ならびにこれらの細胞に由来する樹状細胞からなる群から選択される1または複数種との結合が確認できない。
特に、ヒトpDCと結合する条件下で、単球、マクロファージ、B細胞、CD34陽性細胞およびこれらの細胞に由来する樹状細胞からなる群から選択される1または複数種との結合が確認できない抗体は、本発明のモノクローナル抗体として好ましい。
c) ヒトPTPRSをコードするDNAを発現可能に保持した発現ベクターで形質転換された形質転換細胞と結合する、
d) c)の形質転換細胞と結合する条件下で、c)の形質転換される前の宿主細胞との結合が確認できない。
ハイブリドーマ9H5−4、10F7−38、13G5−52、13G5−57、14A8−85、22H8−84、49F2−30および55E7−79は、2011年4月1日付けで産業技術総合研究所内特許生物寄託センターに対して、それぞれ受託番号FERM BP−11356、FERM BP−11357、FERM BP−11358、FERM BP−11359、FERM BP−11360、FERM BP−11361、FERM BP−11362およびFERM BP−11363として寄託されている。以下に、寄託を特定する内容を記載する。
(a)寄託機関の名称・あて名
名称:産業技術総合研究所 特許生物寄託センター
あて先:日本国茨城県つくば市東1丁目1番1号つくば中央第6(郵便番号305−8566)
(b)寄託日:2011年3月17日
(c)受領番号FERM ABP−11356(ハイブリドーマ 9H5−4)
(c)受領番号FERM ABP−11357(ハイブリドーマ 10F7−38)
(c)受領番号FERM ABP−11358(ハイブリドーマ 13G5−52)
(c)受領番号FERM ABP−11359(ハイブリドーマ 13G5−57)
(c)受領番号FERM ABP−11360(ハイブリドーマ 14A8−85)
(c)受領番号FERM ABP−11361(ハイブリドーマ 22H8−84)
(c)受領番号FERM ABP−11362(ハイブリドーマ 49F2−30)
(c)受領番号FERM ABP−11363(ハイブリドーマ 55E7−79)
(1)ヒトPTPRSの細胞外ドメインを含む外来性の蛋白質を発現する細胞を免疫動物に投与し、そして
(2)前記免疫動物の抗体産生細胞から、ヒトPTPRSに結合する抗体を産生する細胞を選択する。
このようにして得られた抗体産生細胞、または不死化された当該抗体産生細胞を培養し、その培養物から目的とするモノクローナル抗体を回収することができる。抗体産生細胞を不死化するための方法については種々の方法が公知である。
本発明において、外来性のポリヌクレオチドとは、当該ポリヌクレオチドが人為的に宿主細胞に導入されたものであることをいう。細胞としてヒト細胞が用いられる場合には、ヒトの細胞にヒトの遺伝子が導入される。このような組み合わせにおいても、人為的に導入されたポリヌクレオチドは、外来性のポリヌクレオチドとよばれる。したがって、ヒトPTPRSの異所性(ectopic)の発現は、外来性のポリヌクレオチドの発現に含まれる。
[シグナル配列+細胞外ドメイン+膜貫通ドメイン+細胞内領域]
あるいは、下記のように細胞内領域を部分的に欠くアミノ酸配列も、本発明におけるヒトPTPRSの細胞外ドメインを含むアミノ酸配列に含まれる。
[シグナル配列+細胞外ドメイン+膜貫通ドメイン+細胞内領域の一部]
さらに、下記のように細胞内領域を欠いた構造も、本発明におけるヒトPTPRSの細胞外ドメインを含むアミノ酸配列に含まれる。
[シグナル配列+細胞外ドメイン+膜貫通ドメイン]
次に、融合細胞が有する選択マーカーに基づいて、細胞融合に成功した細胞が選択される。たとえばHAT感受性の細胞株を細胞融合に用いた場合には、HAT培地において成育する細胞を選択することによって、細胞融合に成功した細胞が選択される。さらに選択された細胞が産生する抗体が、目的とする反応性を有していることを確認する。
一方、細胞を固定化する担体としては、粒子や、マイクロタイタープレートの内壁を利用することができる。プラスチック製の粒子や容器の表面に、細胞を物理吸着によって固定することができる。たとえばポリスチレン製のビーズや反応容器を、細胞を固定するための担体として利用することができる。
可変領域を含むキメラ抗体、または可変領域を構成するCDRを移植したヒト化抗体として、IgGまたはIgM由来の定常領域を有する抗体は、本発明における好ましい抗体に含まれる。本発明者らは、PTPRSに対するモノクローナル抗体がPTPRS発現細胞に対するCDC作用を有することを確認している。したがって、IgGまたはIgM由来の定常領域を有する抗体は、CDC作用によるPTPRS発現細胞に対する細胞傷害作用を有する。このような抗体は、pDCなどのPTPRS発現細胞の細胞数の抑制に有用である。
ヒトPTPRSを認識するキメラ抗体、またはヒト化抗体は、それをコードするポリヌクレオチドを利用して遺伝子工学的に製造することができる。
(1)ヒトPTPRSの細胞外ドメインを含むタンパク質を免疫動物に投与する工程、
(2)前記免疫動物の抗体産生細胞から、ヒトPTPRSに結合する抗体を産生する抗体産生細胞を選択する皇帝、および
(3)(2)で選択された抗体産生細胞を培養しその培養物からヒトPTPRSを認識する抗体を回収する工程。
(a)ヒトPTPRSに結合し、pDCの活性を抑制するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片、および
(b)(a)のモノクローナル抗体の相補性決定領域を移植したイムノグロブリン、またはその抗原結合領域を含む断片。
(a)ヒトPTPRSに結合し、pDCの活性を抑制するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片、
(b)(a)のモノクローナル抗体の相補性決定領域を移植したイムノグロブリン、またはその抗原結合領域を含む断片、および
(c)(a)または(b)に記載の成分をコードするポリヌクレオチド。
[ヒトpDCの細胞表面抗原のプロファイル]
CD4陽性、CD123陽性、Lineage(CD3、CD14、CD16、CD19、CD20、CD56)陰性、CD11c陰性
したがって、これらの公知のマーカーの発現プロファイルを持ち、IFN産生能をも持つ細胞をpDCと言うこともできる。さらに、これらのマーカーの発現プロファイルの発現パターンとは異なるプロファイルを持つ細胞群であっても、IFN産生能を有する生体中の細胞はpDCに含まれる。
さらに、ヒトpDCに共通して見られる特徴として、以下のような特徴を示すことができる。
[細胞の形態上の特徴]
−プラズマ細胞に似ている
−細胞表面が平滑な丸い細胞
−比較的大きい核をもつ
[細胞の機能的な特徴]
−ウイルス感染時に、短期間に大量のI型IFNを産生する
−ウイルス感染後、樹状細胞に分化する
たとえば、自己免疫性の疾患の病態とIFNαの関連性が指摘されている。IFNαの大部分がpDCによって産生されている。したがってその産生を抑制すれば、IFNαによってもたらされる病態を緩和することができる。なお本発明において、pDCによるIFN産生抑制とはpDCが産生するIFNの少なくとも1種類のIFN産生を抑制することをいう。本発明における好ましいIFNは、I型IFNである。中でもIFNαは重要である。
本発明の好ましい態様において、抗ヒトPTPRSモノクローナル抗体は、ヒトPTPRS発現細胞に結合し、CDC(補体依存性の細胞傷害作用;Complement Dependent Cytotoxicity)作用によって細胞傷害作用を与えることが確認された。CDC作用は、抗体医薬の重要な作用機序の一つである。本発明の抗ヒトPTPRSモノクローナル抗体も、そのCDC作用により、pDCなどのヒトPTPRS発現細胞に対する強力な細胞傷害作用を有する。すなわち、好ましい態様において、IFN産生の抑制機構に加えて、pDCに対する細胞傷害作用によっても、IFN産生抑制効果を期待することができる。
トキシン類:緑膿菌毒素(Pseudomonas Endotoxin; PE)、ジフテリアトキシン、リシン
放射性同位元素:Tc99m、Sr89、I131、Y90
抗癌剤:カリキアマイシン、マイトマイシン、パクリタキセル
タンパク質からなるトキシン類は、2官能性試薬によって抗体またはその断片などに結合することができる。あるいは、抗体をコードする遺伝子にトキシン類をコードする遺伝子を接合し、両者の融合タンパク質を得ることもできる。放射性同位元素を抗体に結合する方法も公知である。たとえば、キレート剤を利用して、抗体を放射性同位元素で標識する方法が公知である。さらに抗癌剤は、糖鎖または2官能性試薬の利用により、抗体に結合することができる。
(a)ヒトPTPRSの細胞外ドメインに結合する抗体、またはその抗原結合領域を含む断片、
(b)(a)の抗体の相補性決定領域を移植したイムノグロブリン、またはその抗原結合領域を含む断片。
本発明において、pDCの活性を抑制するモノクローナル抗体としては、ヒトPTPRSの細胞外ドメインを認識するモノクローナル抗体を利用することができる。本発明においては、1種類または複数種類のモノクローナル抗体を利用することができる。たとえば、ヒトPTPRSの細胞外ドメインを認識する複数種のモノクローナル抗体を配合して、本発明に利用することができる。
−定常領域を欠失した抗原結合領域を含む断片(Monoclonal Antibodies : Principles and Practice, third edition, Academic Press Limited. 1995; Antibody Engineering, A Practical Approach, IRL PRESS, 1996)
−モノクローナル抗体の抗原結合領域と宿主のイムノグロブリンの定常領域とで構成されるキメラ抗体(遺伝子発現実験マニュアル 講談社 1994年 (石田 功、安東 民衛 編))
−宿主のイムノグロブリンにおける相補性決定領域(CDR)をモノクローナル抗体のCDRに置換したCDR置換抗体(遺伝子発現実験マニュアル 講談社 1994年 (石田 功、安東 民衛 編))
ここに引用されたすべての先行技術文献は、参照として組み入れられる。
以下実施例により本発明をさらに詳細に説明するが、本発明はこの実施例により何ら制限されるものではない。
A.PTPRSの発現解析
A−1)SAGEライブラリーを用いた解析
ヒト単球、pDC、および単純ヘルペスウイルス(HSV)処理したpDCにおける遺伝子の発現を、SAGETM(Serial Analysis of Gene Expression)法により比較、解析した。解析方法は次のとおりである。
ヒト末梢血から、単球をCD14陽性細胞として単離し、pDCをBDCA−4陽性細胞として、セルソーターによって分離した。さらにpDCをHSV存在下で12時間培養して、活性化したpDCを調製した。それぞれの細胞からRNAを取得し、I-SAGETMkit(Invitrogen社)を用いて、SAGEライブラリーを作製した。得られた約10万タグの塩基配列データを、SAGE Analysis Software(Invitrogen社)で解析した。その結果、単球/pDC/pDC+HSVのスコア値が0/7/0の遺伝子、すなわちpDC特異的な発現を示す遺伝子として、既知の遺伝子であるPTPRS(GenBank Acc#NM_002856.3)が見出された。PTPRSは、配列番号2に示す塩基配列によってコードされる。そしてそれは、免疫グロブリン様ドメイン(Ig-like domain)およびフィブロネクチンIII型様ドメイン(Fibronectin type III-like domain)を細胞外領域に有する、一回膜貫通膜タンパク質である。また、細胞内領域に2つのプロテインチロシンフォスファターゼ領域(PTP domain)を有する(図1)。
PTPRSの免疫細胞での発現をより詳細に検討した。ヒト末梢血から、セルソーターによって各細胞を分取した。分取した各細胞群からRNAを抽出し、cDNAを合成した。得られたcDNAを鋳型として、定法にしたがって定量的RT−PCRを行い、PTPRS mRNAの発現レベルを解析した。恒常的に発現していることが知られているGAPDH(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)遺伝子の発現レベルで標準化することにより、PTPRS遺伝子の発現を各免疫細胞間で比較した。
用いたプライマーの塩基配列、およびPCRの条件は以下のとおりである。
PTPRS用 Forward primer: 5’CAC GGC CTA TGA CCT CCA 3’(配列番号3)
PTPRS用 Reverse primer: 5’AAG TTC TTG GGC GAG ACT TG 3’(配列番号4)
GAPDH用 Forward primer: 5’CCA CCC ATG GCA AAT TCC 3’(配列番号5)
GAPDH用 Reverse primer: 5’TGG GAT TTC CAT TGA TGA CAA G 3’(配列番号6)
50℃2分を1サイクル、
95℃10分を1サイクル、
[95℃15秒、60℃60秒]を50サイクル。
単球、pDC、HSVで刺激したpDC、B細胞(CD19+細胞)、T細胞(CD3+細胞)、PMA (Phorbol 12-myristate 13-acetate)で刺激した活性化T細胞、NK細胞(CD56+細胞)について測定したところ、PTPRSがpDC特異的に発現していることが示された。また、特徴として、HSVで刺激したpDCで、PTPRSの発現が低下することがわかった(図2)。
さらに、組織における発現をABI PRISM 7000(Applied Biosystem社)を用いた定量PCRにより検討した。cDNAパネルとして、BDTM MTC multiple tissue cDNA panel (Human I; Cat.No.636742, Human immune; Cat.No.636748, Human blood fractions; Cat.No.636750;いずれもBecton Dickinson社)を用いた。使用したプライマーの塩基配列を以下に示す。
PTPRS用 Forward primer: 5' ACT CAC CCA CAC CCT ACA AGA 3’(配列番号7)
PTPRS用 Reverse primer: 5' CTT GGT GGT ACG GCC ATC 3'(配列番号8)
GAPDH用 Forward primer: 5' CCA CCC ATG GCA AAT TCC 3’(配列番号5)
GAPDH用 Reverse primer: 5' TGG GAT TTC CAT TGA TGA CAA G 3'(配列番号6)
SYBR green PCR master mix kit(Applied Biosystem社)を用いて、同じ会社から入手できるABI PRISM 7000によりPCRを行った。解析には同じ会社から入手できるSequence Detection System Softwareを用いた。反応条件は次のとおりである。
ステップ1:50℃, 2分を1サイクル
ステップ2:95℃,10分を1サイクル
ステップ3:95℃,15秒、60℃,1分を40サイクル
恒常的に発現していることが知られているGAPDH(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)遺伝子の発現レベルで標準化することにより、PTPRS遺伝子の発現を各組織間で比較した。その結果、組織においてPTPRS mRNAが広範囲に発現していることが明らかになった(図3)。
PTPRSタンパク質を発現させるため、PTPRS遺伝子の発現ベクターの作製を行った。pCR4-TOPOクローニングベクターに組み込まれたPTPRS cDNA clone(Open Biosystem社 cc# MHS1010-98052887)からPTPRS遺伝子のみを取り出し、pcDNA3.1発現ベクターに組み込んだ(PTPRS/pcDNA3.1)。得られたPTPRS/ pcDNA3.1プラスミドを鋳型に、EcoRI、Not I、およびKozak sequence(GCC GCC ACC)を含むプライマーでPTPRS遺伝子を増幅した(プライマーの情報は下記に示す)。PCR産物はpMX-IP レトロウイルスベクターにEcoRIとNot Iサイトでクローニングされた(PTPRS/pMX-IP)。PCR反応にはKOD Plus DNA polymerase(TOYOBO社)1ユニットを用い、反応条件としては、94℃2分を1サイクル行った後、[94℃15秒、68℃4分30秒]を25サイクルとした。
Forward primer(配列番号9): 5' aaa GAA TTC gcc gcc acc ATG GCG CCC ACC TGG GGC CCT3'
Reverse primer(配列番号10): 5' aaa gcg gcc gcT TAG GTT GCA TAG TGG TCA AAG C 3'
上記の塩基配列において、小文字は制限酵素EcoRIの切断部位またはNot Iの部位を示す。5’末端のaaaは酵素切断のための付加塩基である。
PTPRS遺伝子を含むレトロウイルスを作成するために、FuGENE kit(Roche社)を用いてヒト胚の腎細胞株であるHEK−293T細胞にPTPRS/pMX-IPとウイルスパッケージングベクターPCL-ECOを一過性に遺伝子導入した。2日後に、ウィルスがhPTPRS遺伝子を含む細胞培養上清を回収し、BALB/Cマウスの脾臓由来の樹状細胞であるD2SC/1細胞(Paglia et al.,J.Exp.Med.,178,1893-1901(1993)に基づき作成)に感染させた。pMX-IPレトロウイルスベクターはpuromycin耐性遺伝子を含むことから、感染させたD2SC/1細胞をpuromycinと培養することで、hPTPRSを発現する細胞のみが生存できるようになり、そしてセレクションが可能になる。hPTPRS発現D2SC/1細胞はFACSソーティングによってセレクトされ、培養された。hPTPRSの発現を確認するため、10μg/mLヤギIgG(SantaCruz社)と市販されているhPTPRSポリクローナル抗体 (pAb; R&D社) をセレクトしたhPTPRS/D2SC/1細胞にそれぞれ100μlずつ添加し、混合物を4℃で30分間インキュベートした。PBSで細胞を洗浄した後、100倍希釈したFITCラベル化抗ヤギ IgG抗体(SantaCruz社)を50μLずつ添加し、4℃で30分間インキュベートした。PBSで洗浄した後、FACSCalibur(BD)にてデータを取り込んだ(図4)。
A.抗ヒトPTPRSモノクローナル抗体の作製
A−1)免疫
免疫原とする細胞として、上記hPTPRS/D2SC/I細胞を用いた。BALB/cマウスの麻酔後、足蹠(footpad)に片足50μlずつFreund’s Complete Adjuvant (CFA)エマルジョンを皮下注射した。計100μl/マウスである。次の日、免疫原として準備したhPTPRS/D2SC/1細胞をFreund’s Incomplete Adjuvant (IFA)でエマルジョンを作り、足蹠(footpad)に皮下注射した(50μl/片脚、計100μl/ マウス)。免疫は2日おきに計3回行い、最後の免疫の3日後に所属リンパ節を回収した。
免疫したマウスの両肢から所属リンパ節由来細胞を採取し、10%FBSを含むRPMI1640培地(SIGMA社)で培養したマウスミエローマ細胞P3-X63-Ag8.563を、リンパ節由来細胞とミエローマ細胞の比が5:4になるように混和して、遠心分離により細胞を回収した。細胞融合のために混合細胞にPEG1500(Roche社)を加えた。融合した細胞(ハイブリドーマ)は洗浄し、細胞成長サプリメントを含む10% Fetal Bovine Serum (FBS)+ HAT (Sigma社)- RPMI1640培地 (2 mM L-Glutamine, 100Unit/ml Penicillin,100μg/ml Streptomycin, 10 mM HEPES, 1 mM Sodium Pyruvate, 50μM 2-MEを含む)で培養した。
3x105/ wellのD2SC/1細胞またはhPTPRS/D2SC/1細胞に2.5 μg/mlに調製した抗CD16/32(2.4G2)を50μLずつ添加しFCレセプターをブロックした。PBSで洗浄後、10μg/mlに調製したヤギIgG、市販されている抗hPTPRS pAb (R&D社)、マウス IgG2ak(BioLegend社)と培養していたハイブリドーマの培養上清をそれぞれ60μlずつ添加し、4℃で60分間インキュベートした。PBSで洗浄後、細胞に50倍希釈したFITCラベルされた抗ヤギ IgG抗体と100倍希釈のPEラベルされた抗マウスIgG抗体(BD社)を50μlずつ添加し、遮光下4℃で30分間インキュベートした。PBSで洗浄し、細胞をPBS 200μlで懸濁した。FACS Calibur(BD社)にてデータを取り込んだ。取り込んだデータをFSCとSSCのドットプロットで展開し、生細胞をゲーティングした。このゲート内の細胞のデータが2,000 countになるまでデータを取り込んだ。その結果、抗hPTPRS抗体を産生する13個のハイブリドーマが得られた (2G6、28G10、4B2、2G2、9H5、10F7、22H8、49F2、9D2、14A8、55E7、13G5、16H2) (図5)。
ヒトのpDC様細胞株CAL−1細胞の3x105を上記各ハイブリドーマの培養上清50μlで15分間 4℃で染めた。FACSバッファー(1% FBS+ PBS)で1度洗浄した後、遠心し、上清を除去した。PEラベルされた抗マウスIgG抗体 2μg/ mlを20分間4℃で反応させた。FACS バッファーで1度洗浄した後、遠心し、上清を除去した。細胞ペレットはFACS バッファーで再懸濁し、Caliburにて解析した。その結果、ハイブリドーマ培養上清の2G6、4B2、2G2、9H5、10F7、22H8、49F2、14A8、55E7、13G5、16H2はCAL−1に良く反応した。一方で、28G10と9D2はほとんど反応しなかった(図6)。
[ヒトPBMCの単離]
健常人から末梢血20 mlを集め、HISTOPAQUE-1077 (SIGMA社)を用いた比重遠心で末梢血単核球 (PBMC)を分離した。1x106のPBMCをサンプルごとに染色した。FACS バッファーで細胞を洗浄した後、Fc block reagent (Militenyi社)を5倍希釈で25μlずつ加え、4℃で15分間反応を行った。FACS バッファーで洗浄後、各ハイブリドーマの細胞培養上清50μl、10μg/ mlのヤギIgG、抗hPTPRS pAb、およびマウスIgG2a,κを加え、4℃で20分間反応させた。FACS バッファーで洗浄後、8μg/ mlのFITCラベル化抗ヤギIgG抗体または2μg/ mlのPEラベル化抗マウスIgG抗体を加え、4℃で20分間反応を行った。FACS バッファーで洗浄後、APCラベル化抗BDCA2抗体を10倍希釈の50μlで4℃で20分間反応させた。FACS バッファーで洗浄後、300μlのFACS バッファーに細胞を再懸濁し、FACS caliburにて解析した。その結果、2G6、28G10、4B2、2G2、9H5、10F7、22H8、49F2、14A8、55E7、13G5はpDC細胞群に対して特異的な結合反応を示した。9D2はpDCに結合を示す一方、pDC以外の細胞群 (BDCA2-)にも反応を示した。16H2はPBMC自体に反応を示さなかった(図7)。
PTPRSはPTPRファミリーに属し、そのうちいくつかのファミリー分子のアミノ酸配列はPTPRSのアミノ酸配列に対して高い相同性を有する(図8)。
A−6)PTPRSを認識し、ヒトpDCに特異的に結合する抗体を産生する10種類のハイブリドーマ細胞培養上清(2G6、4B2、2G2、9H5、10F7、22H8、49F2、14A8、55E7、13G5)がPTPRSのみに特異的に結合するかどうかを検討した。特にPTPRSとの相同性の高かったPTPRA (40%)、 PTPRD (76%)、PTPRF (67%) の遺伝子導入細胞を分子のN末端にFLAGタグを付加して作製し、染色した。遺伝子導入細胞でのhPTPREの発現はWestern Blotで確認したが、細胞表面での発現は確認できなかった。したがってhPTPREは細胞表面に発現しなかった。その結果、4B2はhPTPRDに反応し(図9C)、2G6はhPTPRFに交差反応性を示した(図9D)。それ以外の8種類の抗体はPTPRS特異的な結合を示した(図9A-D)。
カニクイザルのPBMCは末梢血(10ml; 新日本科学社)よりHISTOPAQUE-1077 (SIGMA社)を用いた比重遠心で分離した。FACSには、1サンプルあたり5x105の細胞を使用した。FACS バッファーで細胞を洗浄した後、FACS バッファーで希釈した10%のカニクイザルの血清を10μl加え、4℃で20分間反応を行った。FACS バッファーで洗浄後、各ハイブリドーマの細胞培養上清100μl、10μg/ mlのマウスIgG2a,κまたはマウスIgG1,κ(BioLegend社)を加え、4℃で15分間反応させた。FACS バッファーで洗浄後、1μg/ mlのAPCラベルされた抗マウスIgG抗体(BD社)を加え、4℃で20分間反応を行った。FACS バッファーで洗浄後、FITCラベル化抗Lineage1抗体(BD社)、PEラベル化抗CD123抗体(BD社)、およびPerCP7Cy5.5ラベル化抗HLA-DR抗体(BD社)を10倍希釈の25μlで4℃で15分間反応させた。FACS バッファーで洗浄後、300μlのFACS バッファーに細胞を再懸濁し、FACS caliburにて解析した。使用したハイブリドーマ培養上清は、PTPRS特異的で、CAL−1細胞やヒトpDCによく結合する49F2、55E7、14A8、13G5、10F7、22H8、9H5の7種類を選択した。その結果、すべてのハイブリドーマ細胞培養上清はカニクイザルのpDC細胞群(Lineage- CD123+ HLA-DR+)に特異的に結合した(図10)。
上記7種類(49F2、55E7、14A8、13G5、10F7、22H8、9H5)のハイブリドーマをそれぞれ回収し、ソーティングバッファー(1%FBS/PBS)で1×105 cells/mlになるように懸濁した。FACS Aria (BD)を用いて単一細胞ソーティング(single cell sorting)を行った。データを取り込み、取り込んだデータをX軸: FSCとY軸: SSCの2次元ドットプロットで展開した。そのドットプロット上で生細胞をゲートで囲んだ。生細胞ゲート内の細胞からダブレットを除くためのゲートをかけ、その細胞集団を96穴平底プレートに1cell/wellとなるよう分取した。Single cell sortingした細胞は、HAT培地 (RPMI1640+2 mM L-Glutamine, 100 Unit/ml Penicillin,100 μg/ml Streptomycin, 10 mM HEPES, 1 mM Sodium Pyruvate, 50μM 2-ME) + ハイブリドーマ成長サプリメントHFCS (Roche社)で培養した。その後、ハイブリドーマの細胞培養上清を用い、D2SC細胞とhPTPRS/D2SC細胞 (図11AおよびB)、CAL−1細胞(図11C)、およびヒトpDC (図11D)を染色し、シングルハイブリドーマを選択した。
抗体精製
ProteinG Sepharose FastFlow (GEヘルスケア社)を用いた精製により、ハイブリドーマの培養上清から8種類(9H5−4、10F7−38、13G5−52、13G5−57、14A8−85、22H8−14、49F2−30、55E7−79)の精製抗体を得た。Pierce Rapid ELISA mouse mAb Isotyping Kit (Thermo Fisher Scientific社)を用いてアイソタイプを確認した。その結果、13G5−52と13G5−57はマウスIgG2b,κで、55E7−79はマウスIgG2b,κとマウス IgG1,κの両方を有し、その他はマウス IgG1,κであった。もし精製抗体にエンドトキシンが含まれていると、性質決定試験の結果に影響を与えることがある。そこで、エンドトキシン濃度の測定を行った。使用したキットはエンドスペシー ES-50Mセット、トキシカラー DIA-MPセット、およびエンドトキシン標準品 CSE-Lセット(いずれも生化学バイオビジネス社)である。その結果、いずれの精製抗体も基準値である0.3EU/mg Ab以下のエンドトキシン濃度であった(図12)。
精製抗体の結合能をヒトpDC様細胞株であるCAL−1細胞で確認した。(図13)。また、すべての抗体がヒト末梢血のpDC細胞群(BDCA2+)に対して結合能を維持していた(図14)。
抗PTPRS抗体のhPTPRS発現細胞への捕体依存的細胞傷害活性
幼若ウサギcomplementを用いて、ヒトPTPRSを発現するCHO細胞(以下hPTPRS/CHOとする。)およびマウスPTPRS/CUO細胞 (以下mPTPRS/ CHOとする。)に対する抗PTPRS抗体の補体依存性細胞傷害活性 (Complement-dependent cellular cytotoxicity; 以下CDC活性とする)を測定した。活性は細胞から放出された乳酸脱水素酵素 (lactase dehydrogenase: LDH)の測定値より算出した細胞毒性を指標として用いることにより得た。各細胞を2×104 cells/50 μl/wellずつ96穴U底プレートに分注した。CDC培地(RPMI1640+ 0.1%BSA+ 10 mM HEPES+ 2 mM L-Glutamine+ 100Unit/ml Penicillin+ 100μg/ml Streptomycin)で18% Complement (CEDARLANE社)を調製した。コントロール抗体(マウスIgG1,κまたはマウス IgG2b,κ)と抗PTPRS抗体を3.3μg/ mlと30μg/ mlの2点調製した。アッセイはCytoTox 96 Non-Radioactive Cytotoxicity Assay (Promega社)のキットを用いて行った。その結果、hPTPRS/CHOのターゲットに対し、13G5−52と13G5−57は約20%のCDC活性を示した(図16A)。一方で、mPTPRS/CHOのターゲットに対しては、13G5−52と13G5−57は約100%のCDC活性を示した(図16B)。
キメラ化抗体の作製
マウス抗PTPRS抗体を産生するハイブリドーマとしては、下記のものを使用した。
ハイブリドーマ 9H5−4(寄託番号:FERM BP−11356)
ハイブリドーマ 10F7−38(寄託番号:FERM BP−11357)
ハイブリドーマ 13G5−52(寄託番号:FERM BP−11358)
ハイブリドーマ 13G5−57(寄託番号:FERM BP−11359)
ハイブリドーマ 14A8−85(寄託番号:FERM BP−11360)
ハイブリドーマ 22H8−84(寄託番号:FERM BP−11361)
ハイブリドーマ 49F2−30(寄託番号:FERM BP−11362)
1.定常領域のアイソタイプ確認
7種類のハイブリドーマ(9H5−4、10F7−38、13G5−52、13G5−57、14A8−85、22H8−84、49F2−30)より産生された各マウス抗体の定常領域のアイソタイプを確認した。
確認にはmouse monoclonal antibody isotyping kit(カタログ番号: MMT1; Serotec Product社; オックスフォード, 英国)とPierce Rapid ELISA mouse mAb Isotyping Kit
(Thermo Fisher Scientific社)、およびサンプルとして各9H5−4、10F7−38、13G5−52、13G5−57、14A8−85、22H8−84および49F2−30ハイブリドーマ培養上清を用いた。その結果、13G5−52および13G5−57ハイブリドーマの産生する抗体のアイソタイプは重鎖としてマウス IgG2b、軽鎖としてκを含むアイソタイプであった。一方、9H5−4、10F7−38、14H8−85、22H8−84および49F2−30ハイブリドーマの産生する抗体のアイソタイプは重鎖としてマウス IgG1、軽鎖としてκを含むアイソタイプであった。
2-1)total RNAの単離
市販のキット「RNeasy Mini Kit」(Qiagen社、カタログ番号:74106)を用いてキット添付の指示書にしたがい、7種類のハイブリドーマからtotal RNAを単離した。5×106細胞数のハイブリドーマ細胞株から調製して、約30μgのtotal RNAが得られた。
2-1)で単離したtotal RNAのうち5μgを使用し、5’RACE PCR法によって、マウス重鎖可変領域をコードするcDNAを増幅した。増幅にあたっては、市販のキット「5’RACE System for Rapid Amplification of cDNA ENDs, Version 2.0 Kit」(インビトロジェン社、カタログ番号:18374-058)を用いた。詳細は以下の通りである。まず、2-1)で得られたtotal cDNAから逆転写酵素によって、第1鎖cDNAを合成した。このとき、アンチセンスプライマー(GSP1)(配列番号11)は以下に示すものを用いた。
cDNAの増幅に用いたGSP1プライマーは各マウス重鎖のアイソタイブにしたがって用いた。たとえば以下のアンチセンスプライマーが重鎖にマウスIgG1を含む9H5−4、10F7−38、14A8−85、22H8−84、49F2−30ハイブリドーマの重鎖可変領域のクローニングに用いられる。
GSP1プライマー:mu IgG1 VH-GSP1
配列: 5'-CCA GGA GAG TGG GAG AGG CTC TTC TCA GTA TGG TGG-3'(36-mer)(配列番号39)
GSP2プライマー:mu IgG1 VH-GSP2
配列: 5'-GGC TCA GGG AAA TAG CCC TTG ACC AGG CAT CC-3'(32-mer)(配列番号40)
また、たとえば以下のアンチセンスプライマーが重鎖にマウスIgG1を含む9H5−4、10F7−38、14A8−85、22H8−84、49F2−30ハイブリドーマの重鎖可変領域のクローニングに用いられる。
GSP1プライマー:mu IgGHγ1 GSP1
配列: 5'-TCC AGA GTT CCA GGT CAC TGT CAC-3'(24-mer)(配列番号11)
GSP2プライマー:mu IgGHγ1 GSP2
配列: 5'-AGG GGC CAG TGG ATA GAC AGA TGG-3'(32-mer)(配列番号13)
さらに、以下のアンチセンスプライマーが重鎖にマウスIgG2bを含む13G5−52、13G5−57ハイブリドーマの重鎖可変領域のクローニングに用いられる。
GSP1プライマー:mu IgGHγ 2B-GSP1
配列: 5'-TCC AGA GTT CCA AGT CAC AGT CAC-3'(24-mer)(配列番号41)
GSP2プライマー:mu IgGHγ 2B-GSP2
配列: 5'-AGG GGC CAG TGG ATA GAC TGA TGG-3'(32-mer)(配列番号42)
5'RACE用アンカープライマー(配列番号12)5'-GGC CAC GCG TCG ACT AGT ACG GGI IGG GII GGG IIG-3'(36-mer)
5'RACE用AUAPプライマー(配列番号14)5'-GGC CAC GCG TCG ACT AGT AC-3'(20-mer)
2-1)で単離したtotal RNA から、2-2)と同様にして、マウス軽鎖可変領域をコードするcDNAを増幅した。
これら7種類の抗体はマウスIgκ軽鎖を含むことから、以下のアンチセンスプライマーが軽鎖のクローニングに用いられる。
GSP1プライマー:Mu IgVL5RACE-GSP1
配列: 5'-TTC ACT GCC ATC AAT CTT CCA CTT-3'(24-mer)(配列番号15)
GSP2プライマー:Mu IgVL5RACE-GSP2
配列: 5'-GAT GGA TAC AGT TGG TGC AGC-3'(21-mer)(配列番号16)
得られたPCR産物を1.5%低融点アガロース法によって精製した。
2-2)で得られた重鎖可変領域、および2-3) で得られた軽鎖可変領域のcDNA断片をそれぞれ、市販のキット「Zero Blunt TOPO PCR Cloning Kit」(インビトロジェン社、カタログ番号:1325137)を用い、キット添付の指示書にしたがってpCR4Blunt-TOPO ベクターにクローニングし、大腸菌コンピテント細胞に導入して大腸菌形質転換体を得た。この形質転換体からプラスミドを得て、配列解析のために、プラスミドDNA試料をOperon Biotechnology Co. Ltd社(東京)に送付して、プラスミド中のcDNA塩基配列を確認した。配列の解析には「Sequencher DNA sequence assembly and analysis software version 4.2.2 (Gene Codes Corporation)」および「GENETYX-MAC Version.11.1.1」software (GENETYX CORPORATION)」を用いた。
得られた抗PTPRSマウス9H5−4抗体の重鎖可変領域の核酸配列は配列番号43、アミノ酸配列は配列番号44である。マウス9H5−4抗体の重鎖可変領域内のCDR1、CDR2、CDR3のアミノ酸配列はそれぞれ配列番号45、配列番号46、配列番号47である。
得られた抗FTPRSマウス9H5−4抗体の軽鎖可変領域の核酸配列は配列番号48、アミノ酸配列は配列番号49である。マウス9H5−4抗体の軽鎖可変領域内のCDR1、CDR2、CDR3のアミノ酸配列はそれぞれ配列番号50、配列番号51、配列番号52である。
また、得られた抗PTPRSマウス10F7−38抗体および14A8−85抗体の重鎖可変領域および軽鎖可変領域の核酸配列は、CDR1、CDR2、CDR3の配列を含め、9H5−4抗体のものと同じであった。
得られた抗PTPRSマウス13G5−57抗体の重鎖可変領域の核酸配列は配列番号53、アミノ酸配列は配列番号54である。マウス13G5−57抗体の重鎖可変領域内のCDR1、CDR2、CDR3のアミノ酸配列はそれぞれ配列番号55、配列番号56、配列番号57である。
得られた抗FTPRSマウス13G5−57抗体の軽鎖可変領域の核酸配列は配列番号58、アミノ酸配列は配列番号59である。マウス13G5−57抗体の軽鎖可変領域内のCDR1、CDR2、CDR3のアミノ酸配列はそれぞれ配列番号60、配列番号61、配列番号62である。
また、得られた抗PTPRSマウス13G5−52抗体の重鎖可変領域および軽鎖可変領域の核酸配列は、CDR1、CDR2、CDR3の配列を含め、13G5−57抗体のものと同じであった。
得られた抗PTPRSマウス22H8−84抗体の重鎖可変領域の核酸配列は配列番号63、アミノ酸配列は配列番号64である。マウス22H8−84抗体の重鎖可変領域内のCDR1、CDR2、CDR3のアミノ酸配列はそれぞれ配列番号65、配列番号66、配列番号67である。
得られた抗FTPRSマウス22H8−84抗体の軽鎖可変領域の核酸配列は配列番号68、アミノ酸配列は配列番号69である。マウス22H8−84抗体の軽鎖可変領域内のCDR1、CDR2、CDR3のアミノ酸配列はそれぞれ配列番号70、配列番号71、配列番号72である。
得られた抗PTPRSマウス49F2−30抗体の重鎖可変領域の核酸配列は配列番号25、アミノ酸配列は配列番号26である。マウス49F2−30抗体の重鎖可変領域内のCDR1、CDR2、CDR3のアミノ酸配列はそれぞれ配列番号27、配列番号28、配列番号29である。
得られた抗FTPRSマウス49F2−30抗体の軽鎖可変領域の核酸配列は配列番号30、アミノ酸配列は配列番号31である。マウス49F2−30抗体の軽鎖可変領域内のCDR1、CDR2、CDR3のアミノ酸配列はそれぞれ配列番号32、配列番号33、配列番号34である。
得られた抗PTPRSマウス9H5−4抗体の重鎖可変領域の核酸配列(471bp)を以下に示す(配列番号43)。大文字はマウス9H5−4 VH可変領域を示し、小文字はマウスIgG1 重鎖定常領域を示す。
ATGGAGTTGGGACTGAGCTGGGTATTTCTTGTGGCTCTTTTGAATGGTGTCCAGTGTCAGGTGCAGCTTGTAGAGACCGGGGGAGGCTTGGTGAGGCCTGGAAATTCTCTGAAACTCTCCTGTGTTACCTCGGGATTCACTTTCAGTAACTACCGGATGCACTGGCTTCGCCAGCCTCCAGGGAAGAGGCTGGAGTGGATTGCTGTAATTACAGTCAAATCTGATAATTATGGAGCAAATTATGCAGAGTCTGTGAAAGGCAGATTCACTATTTCAAGAGATGATTCAAAAAGCAGTGTCTACCTGCAGATGAACAGATTAAGAGAGGAAGACACTGCCACTTATTATTGTAGTAGATCGGTCTACTATGGTTACGTCCTAGCCTTTGACTACTGGGGCCAAGGCACCACTCTCACAGTCTCCTCAgccaaaacgacacccccatctgtctatccactggcccctaagggc
マウス9H5−4抗体の重鎖可変領域のアミノ酸配列(157 a.a)を以下に示す(配列番号44)。大文字はVH可変領域の配列を示し、小文字はマウスIgG1 重鎖定常領域を示す。下線部分はシグナル配列を示し、二重下線部分はCDR領域(CDR1、CDR2、CDR3)を示す。
9H5−4抗体の重鎖可変領域のCDR1はNYRMH(配列番号45)であり、9H5−4抗体の重鎖可変領域のCDR2はVITVKSDNYGANYAESVKG(配列番号46)であり、9H5−4抗体の重鎖可変領域のCDR3はSVYYGYVLAFDY(配列番号47)である。
得られた抗PTPRSマウス9H5−4抗体の軽鎖可変領域の核酸配列(402bp)を以下に示す(配列番号48)。大文字はマウス9H5−4 VH可変領域を示し、小文字はマウスIg κ 軽鎖定常領域を示す。
ATGATGTCCTCTGCTCAGTTCCTTGGTCTCCTGTTGCTCTGTTTTCAAGGTACCAGATGTGATATCCAGATGACACAGACTACATCCTCCCTGTCTGCCTCTCTGGGAGACAGAGTCACCATCAGTTGCAGGGCAAGTCAGGACATTAGCAATTATTTAAACTGGTATCAGCAGAAACCAGATGGAACTGTTAAACTCCTGATCTACTACACATCAAGATTACACTCAGGAGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGAACAGATTATTCTCTCACCATTAGCAACCTGGAGCAAGAAGATATTGCCACTTACTTTTGCCAACAGGGTAATACGCTTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAAcgggctgatgctgcaccaact
マウス9H5−4抗体の軽鎖可変領域のアミノ酸配列(134 a.a)を以下に示す(配列番号49)。大文字はマウス9H5−4 VH可変領域の配列を示し、小文字はマウスIg κ 軽鎖定常領域を示す。下線部分はシグナル配列を示し、二重下線部分はCDR領域(CDR1、CDR2、CDR3)を示す。
9H5−4抗体の軽鎖可変領域のCDR1はRASQDISNYLN(配列番号50)であり、9H5−4抗体の軽鎖可変領域のCDR2はYTSRLHS(配列番号51)であり、9H5−4抗体の軽鎖可変領域のCDR3はQQGNTLP(配列番号52)である。
抗PTPRSマウス13G5−57抗体の重鎖可変領域の核酸配列(465bp)を以下に示す(配列番号53)。大文字はマウス13G5−57 VH可変領域を示し、小文字はマウスIgG2b 重鎖定常領域を示す。
ATGAACTTGGGGCTCAGCTTGATTTTCCTTGTCCTTGTTTTAAAAGGTGTCCAGTGTGAAGTGAAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTAGTGCAGCCTGGAGGGTCCCTGAAACTCTCCTGTGCAACCTCTGGATTCACTTTCAGTGACTATTACATGTATTGGGTTCGCCAGACTCCAGAGAAGAGGCTGGAGTGGGTCGCATACATTAGTAATGGTGGTGGTAGCACCTATTATCCAGACACTGTAAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAAGAACACCCTGTACCTGCAAATGAGCCGTCTGAAGTCTGAGGACACAGCCATGTATTACTGTGCAAGACATGTTTACTACGGGAGGAACTATGCTATGGACTACTGGGGTCAAGGAACCTCAGTCACCGTCTCCTCAgccaaaacaacacccccatcagtctatccactggcccctaagggc
マウス13G5−57抗体の重鎖可変領域のアミノ酸配列(155 a.a)を以下に示す(配列番号54)。大文字はVH可変領域の配列を示し、小文字はマウスIgG2b 重鎖定常領域を示す。下線部分はシグナル配列を示し、二重下線部分はCDR領域(CDR1、CDR2、CDR3)を示す。
13G5−57抗体の重鎖可変領域のCDR1はDYYMY(配列番号55)であり、13G5−57抗体の重鎖可変領域のCDR2はYISNGGGSTYYPDTVKG(配列番号56)であり、13G5−57抗体の重鎖可変領域のCDR3はHVYYGRNYAMDY(配列番号57)である。
得られた抗PTPRSマウス13G5−57抗体の軽鎖可変領域の核酸配列(465bp)を以下に示す(配列番号58)。大文字はマウス13G5−57 VH可変領域を示し、小文字はマウスIg κ 軽鎖定常領域を示す。
ATGAACTTGGGGCTCAGCTTGATTTTCCTTGTCCTTGTTTTAAAAGGTGTCCAGTGTGAAGTGAAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTAGTGCAGCCTGGAGGGTCCCTGAAACTCTCCTGTGCAACCTCTGGATTCACTTTCAGTGACTATTACATGTATTGGGTTCGCCAGACTCCAGAGAAGAGGCTGGAGTGGGTCGCATACATTAGTAATGGTGGTGGTAGCACCTATTATCCAGACACTGTAAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAAGAACACCCTGTACCTGCAAATGAGCCGTCTGAAGTCTGAGGACACAGCCATGTATTACTGTGCAAGACATGTTTACTACGGGAGGAACTATGCTATGGACTACTGGGGTCAAGGAACCTCAGTCACCGTCTCCTCAgccaaaacaacacccccatcagtctatccactggcccctaagggc
マウス13G5−57抗体の軽鎖可変領域のアミノ酸配列(155 a.a)を以下に示す(配列番号59)。大文字はマウス13G5−57 VH可変領域の配列を示し、小文字はマウスIg κ 軽鎖定常領域を示す。下線部分はシグナル配列を示し、二重下線部分はCDR領域(CDR1、CDR2、CDR3)を示す。
13G5−57抗体の軽鎖可変領域のCDR1はRASQDISNYLN(配列番号60)であり、13G5−57抗体の軽鎖可変領域のCDR2はYTSRLHS(配列番号61)であり、13G5−57抗体の軽鎖可変領域のCDR3はQQGNTLPY(配列番号62)である。
抗PTPRSマウス22H8−84抗体の重鎖可変領域の核酸配列(458bp)を以下に示す(配列番号63)。大文字はマウス22H8−84 VH可変領域を示し、小文字はマウスIgG1 重鎖定常領域を示す。
ATGGAATGTAACTGGATACTTCCTTTTATTCTGTCAGTAACTTCAGGTGTCTACTCACAGGTTCAGCTCCAGCAGTCTGGGGCTGAGCTGGCAAGACCTGGGGCTTCAGTGAAGTTGTCCTGCAAGGCTTCTGGCTACACCTTTACTAGCTACTGGATGCAGTGGGTAAAACAGAGGCCTGGACAGGGTCTGGAATGGATTGGGGCTATTTATCCTGGAGATGGTGATACTAGGTACACTCAGAAGTTCAAGGGCAAGGCCACATTGACTGCAGATAAATCCTCCAGCACAGCCTACATGCAACTCAGCAGCTTGGCATCTGAGGACTCTGCGGTCTATTACTGTGCAAGAAGGATTTACTACGGCTATTACTATGCTATGGACTACTGGGGTCAAGGAACCTCAGTCACCGTCTCCTCagccaaaacgacacccccatctgtctatccactggcccc
マウス22H8−84抗体の重鎖可変領域のアミノ酸配列(152 a.a)を以下に示す(配列番号64)。大文字はVH可変領域の配列を示し、小文字はマウスIgG1 重鎖定常領域を示す。下線部分はシグナル配列を示し、二重下線部分はCDR領域(CDR1、CDR2、CDR3)を示す。
22H8−84抗体の重鎖可変領域のCDR1はSYWMQ(配列番号65)であり、22H8−84抗体の重鎖可変領域のCDR2はAIYPGDGDTRYTQKFKG(配列番号66)であり、22H8−84抗体の重鎖可変領域のCDR3はRIYYGYYYAMDY(配列番号67)である。
得られた抗PTPRSマウス22H8−84抗体の軽鎖可変領域の核酸配列(430bp)を以下に示す(配列番号68)。大文字はマウス22H8−84 VH可変領域を示し、小文字はマウスIg κ 軽鎖定常領域を示す。
ATGGAGACAGACACAATCCTGCTATGGGTGCTGCTGCTCTGGGTTCCAGGCTCCACTGGTGACATTGTGCTGACCCAATCTCCAGCTTCTTTGGCTGTGTCTCTAGGGCAGAGGGCCACCATCTCCTGCAAGGCCAGCCAAAGTGTTGATTATGATGGTGATAGTTATATGAACTGGTACCAACAGAAACCAGGACAGCCACCCAAACTCCTCATCTATGCTGCATCCAATCTAGAATCTGGGATCCCAGCCAGGTTTAGTGGCAGTGGGTCTGGGACAGACTTCACCCTCAACATCCATCCTGTGGAGGAGGAGGATGCTGCAACCTATTACTGTCAGCAAAGTAATGAGGATCCTCTCACGTTCGGTGCTGGGACCAAGCTGGAGCTGAAAcgggctgatgctgcaccaactgtatccatcaagggcg
マウス22H8−84抗体の軽鎖可変領域のアミノ酸配列(143 a.a)を以下に示す(配列番号69)。大文字はマウス22H8−84 VH可変領域の配列を示し、小文字はマウスIg κ 軽鎖定常領域を示す。下線部分はシグナル配列を示し、二重下線部分はCDR領域(CDR1、CDR2、CDR3)を示す。
22H8−84抗体の軽鎖可変領域のCDR1はKASQSVDYDGDSYMN(配列番号70)であり、22H8−84抗体の軽鎖可変領域のCDR2はAASNLES(配列番号71)であり、22H8−84抗体の軽鎖可変領域のCDR3はQQSNEDPL(配列番号72)である。
ATGAACTTCGGGCTCAGGTTGATTTTCCTTGCCCTCATTTTAAAAGGTGTCCAGTGTGAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGACTTAGTGAAGCCTGGAGGGTCCCTGAAACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCATTTTCAGTAGCTATGGCATGTCTTGGGTTCGCCAGACTCCAGACAAGAGGCTGGAGTGGGTCGCAACCATTAGTAGTGGTGGTAGTGACACCTATTATCCAGACAGTGTGAAGGGGCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAACAACACCCTGTACCTGCAAATGAGCAGTCTGAAGTCTGAGGACACAGCCATGTATTACTGTGCAAGACAGGTCTACTATGGTCTTTACTGGTATTTCGATGTCTGGGGCGCAGGGACCACGGTCACCGTCTCCTCAgccaaaacgacacccccatctgtctatccactggcccctaagggcgaat
49F2−30抗体の重鎖可変領域のCDR1はSYGMS(配列番号27)、49F2−30抗体の重鎖可変領域のCDR2はTISSGGSDTYYPDSVKG(配列番号28)、49F2−30抗体の重鎖可変領域のCDR3はQVYYGLYWYFDV(配列番号29)である。
ATGGAGTCACAGATTCAGGTCTTTGTATTCGTGTTTCTCTGGTTGTCTGGTGTTGACGGAGACATTGTGATGACCCAGTCTCACAAATTCATGTCCACATCAGTAGGAGACAGGGTCAGCATCATTTGTAAGGCCAGTCAGGATGTGAATACTGCTGTAGCCTGGTATCAACAGAAACCAGGACAATCTCCTAAATTACTGATTTACTCGGCATCCTACCGGTACACTGGAGTCCCTGATCGCTTCACTGGCAGTGGATCTGGGACGGATTTCACTTTCACCATCAGCAGTGTGCAGGCTGAAGACCTGGCAATTTATTACTGTCAGCAACATTATAGTACTCCGTACACGTTCGGAGGGGGGACCAAGCTGGAAATAAAAcgggctgatgctgcaccaactgtatccatcaa
49F2−30抗体の軽鎖可変領域のCDR1はKASQDVNTAVA(配列番号32)、49F2−30抗体の軽鎖可変領域のCDR2はSASYRYT(配列番号33)、49F2−30抗体の軽鎖可変領域のCDR3はQQHYSTP(配列番号34)である。
3-1)ヒトIgG定常領域をコードするcDNAのクローニング
ヒトPBMCのtotal RNAから、ヒトIgG1重鎖定常領域とヒトIg κ軽鎖定常領域のcDNAをクローニングし、それぞれ、市販のキット「Zero Blunt TOPO PCR Cloning Kit」(インビトロジェン社、カタログ番号:1325137)を用い、キット添付の指示書にしたがってpCR4Blunt-TOPO ベクターにクローニングし、大腸菌コンピテント細胞に導入して大腸菌形質転換体を得た。この形質転換体から上記プラスミドを得て、配列解析のために、プラスミドDNA試料をOperon Biotechnology Co. Ltd社(東京)に送付して、プラスミド中のcDNA塩基配列を確認した。
キメラ化PTPRS抗体の重鎖をコードするcDNAを調製するために、2-2で得られたマウス9H5−4抗体の重鎖可変領域と、ヒトIgG重鎖定常領域が組み込まれたpEE6.4ベクター(Lonza Biologics社, Slough, UK)を融合し、マウス9H5−4抗体の重鎖可変領域をPCR法により増幅し、約450ベース長のPCR産物を得た。このとき、プライマーは以下のものである。得られたPCR産物を1.5%低融点アガロース法によって精製した。
キメラ9H5−4抗体の重鎖発現用プライマー
1) フォワードプライマー:chi10F7VH-IF(Hind3)
配列: 5' ttt AAG CTT gcc gcc acc ATG GAG TTG GGA CTG AGC TGG 3'(39-mer)(配列番号73)
2)リバースプライマー:chi10F7VH-462R(ApaI)
配列: 5' cga tgg gcc ctt ggt gct agc TGA GGA GAC TGT GAG AGT GGT 3'(42-mer)(配列番号74)
「9H5−4重鎖可変領域をコードするPCR産物」はPCR法によって2-2で得られたマウス9H5−4抗体の重鎖可変領域から得た。9H5−4重鎖可変領域をコードするPCR産物をHind IIIとApa I制限酵素で消化し、1.5%アガロースゲル法で精製した。これをddH2Oで溶解し、重鎖可変領域をコードするcDNA断片の溶液とした。
得られたcDNAの9H5−4のVHコード領域を、Hind IIIとApaIをクローニングサイトとして、pEE6.4ベクター(Lonza Biologics社, Slough, UK)へのクローニングのための好適な制限部位(HindIIIおよびApaI)ならびに理想的Kozak配列(GCCGCCACC)を導入したプライマーchi10F7VH-IF(Hind3)およびchi10F7VH-462R(ApaI)を用いて、9H5−4のVH領域を含むpCR4Blunt-TOPOプラスミドクローンからPCRで増幅した。Chi9H5-4VH-pEE6.4ベクターは、ヒトIgG1の重鎖定常領域を含む。VHPCR断片を、HindIIIおよびApaIを用いて、インフレームでpEE6.4ベクターに挿入した。コンストラクトをcDNA塩基配列解析によって調べ、配列解析のために、プラスミドDNA試料をOperon Biotechnology Co. Ltd社(東京)に送付して、プラスミド中のcDNA塩基配列を確認した。
キメラ9H5−4抗体の軽鎖をコードするcDNAを調製するために、2-3で得られたマウス9H5−4抗体軽鎖可変領域と、3-2で得られたヒトIg κ軽鎖定常領域を融合したPCRフラグメントを重複伸長PCR法に基づく手法によって730塩基の長さでPCR産物を増幅した。
9H5−4軽鎖可変領域をコードするPCR産物をHind IIIとEcoRI制限酵素で消化し、1.5%アガロースゲル法で精製した。これをddH2Oで溶解し、軽鎖可変領域をコードするcDNA断片の溶液とした。
得られた9H5−4のVLコードするcDNAを、pEE14.4ベクター(Lonza Biologics)へのクローニングのための好適な制限部位(HindIIIおよびEcoRI)ならびに理想的Kozak配列を導入した、プライマーchi11G9VL-IF(Hind)およびchi11G9VL-726R(RI)を用いて、9H5−4のVL領域を含むpCR4Blunt-TOPOプラスミドクローンからPCRで増幅した。Chi9H5-4VL-pEE14.4ベクターは、カッパ軽鎖定常領域を含む。VL PCR断片を、HindIIIおよびEcoRIを用いて、インフレームで、pEE14.4ベクターに挿入した。コンストラクトをcDNA塩基配列解析によって調べた。
キメラ9H5−4抗体の軽鎖発現用プライマー
1) フォワードプライマー:chi11G9VL-IF(Hind)
配列: 5' acc AAG CTT gcc gcc acc ATG ATG TCC TCT GCT CAG TTC 3'(39-mer)(配列番号75)
2)リバースプライマー:chi11G9VL-408R
配列: 5' agc cac agt tcg TTT GAT TTC CAG CTT GGT GCC 3'(33-mer)(配列番号76)
3) フォワードプライマー:chi11G9VL-385F
配列: 5' CTG GAA ATC AAA cga act gtg gct gca cca tct 3'(33-mer)(配列番号77)
4) リバースプライマー:chi11G9VL-726R
配列: 5' aaa GAA TTC cta gca ctc tcc cct gtt gaa 3'(30-mer)(配列番号78)
3-2)キメラ13G5−57(13G5−52)抗体の発現ベクターの作製
キメラ化PTPRS抗体の重鎖をコードするcDNAを調製するために、2-2で得られたマウス13G5−57抗体の重鎖可変領域と、ヒトIgG重鎖定常領域が組み込まれたpEE6.4ベクター(Lonza Biologics社, Slough, UK)を融合した。9H5−4抗体と同様の方法によりPCR産物を得て、さらに精製した。このとき、プライマーは以下のものである。
キメラ13G5−57抗体の重鎖発現用プライマー
1) フォワードプライマー: chi13G5.57VH-IF(Hind3)
配列: 5' ttt AAG CTT gcc gcc acc ATG AAC TTG GGG CTC AGC TTG 3'(39-mer)(配列番号79)
2)リバースプライマー: chi13G5.57VH-456R(ApaI)
配列: 5' cga tgg gcc ctt ggt gct agc TGA GGA GAC GGT GAC TGA GGT 3'(42-mer)(配列番号80)
キメラ13G5−57抗体の軽鎖をコードするcDNAを調製するために、2-3で得られたマウス13G5−57抗体軽鎖可変領域と、3-2で得られたヒトIg κ軽鎖定常領域を融合したPCRフラグメントを重複伸長PCR法に基づく手法によって730塩基の長さでPCR産物を増幅した。
キメラ13G5−57抗体の軽鎖発現用プライマー
1) フォワードプライマー:chi11G9VL-IF(Hind)
配列: 5' acc AAG CTT gcc gcc acc ATG ATG TCC TCT GCT CAG TTC 3'(39-mer)(配列番号81)
2)リバースプライマー: chi11G9VL-408R
配列: 5' agc cac agt tcg TTT GAT TTC CAG CTT GGT GCC 3'(33-mer)(配列番号82)
3) フォワードプライマー:chi11G9VL-385F
配列: 5' CTG GAA ATC AAA cga act gtg gct gca cca tct 3'(33-mer)(配列番号83)
4) リバースプライマー:chi11G9VL-726R(RI)
配列: 5' aaa GAA TTC cta gca ctc tcc cct gtt gaa 3'(30-mer)(配列番号84)
キメラ9H5−4抗体の発現ベクターの作製と同様の方法で、キメラ13G5−57抗体の重鎖や軽鎖などの発現ベクターを作製した。
3-2)キメラ22H8−84抗体の発現ベクターの作製
キメラ化PTPRS抗体の重鎖をコードするcDNAを調製するために、2-2で得られたマウス22H8−84抗体の重鎖可変領域と、ヒトIgG重鎖定常領域が組み込まれたpEE6.4ベクター(Lonza Biologics社, Slough, UK)を融合した。9H5−4抗体と同様の方法によりPCR産物を得て、さらに精製した。このとき、プライマーは以下のものである。
キメラ22H8−84抗体の重鎖発現用プライマー
1) フォワードプライマー:chi22H8VH-IF(Hind3)
配列: 5' ttt AAG CTT gcc gcc acc ATG GAA TGT AAC TGG ATA CTT 3'(39-mer)(配列番号85)
2)リバースプライマー:chi22H8VH-456R(ApaI)
配列: 5' cga tgg gcc ctt ggt gct agc TGA GGA GAC GGT GAC TGA GGT 3'(42-mer)(配列番号86)
キメラ22H8−84抗体の軽鎖をコードするcDNAを調製するために、2-3で得られたマウス22H8−84抗体軽鎖可変領域と、3-2で得られたヒトIg κ軽鎖定常領域を融合したPCRフラグメントを重複伸長PCR法に基づく手法によって730塩基の長さでPCR産物を増幅した。
キメラ22H8−84抗体の軽鎖発現用プライマー
1) フォワードプライマー:chi22H8VL-IF(Hind)
配列: 5' acc AAG CTT gcc gcc acc ATG GAG ACA GAC ACA ATC CTG 3'(39-mer)(配列番号87)
2)リバースプライマー:chi22H8VL-420R
配列: 5' agc cac agt tcg TTT CAG CTC CAG CTT GGT CCC 3'(33-mer)(配列番号88)
3) フォワードプライマー: chi22H8VL-397F
配列: 5' CTG GAG CTG AAA cga act gtg gct gca cca tct 3'(33-mer)(配列番号89)
4) リバースプライマー: chi49F2VL-726R(RI)
配列: 5' aaa GAA TTC cta gca ctc tcc cct gtt gaa 3'(30-mer)(配列番号90)
キメラ9H5−4抗体の発現ベクターの作製と同様の方法で、キメラ22H8−84抗体の重鎖や軽鎖などの発現ベクターを作製した。
3−2)キメラ化PTPRS抗体の重鎖をコードするcDNAの調製
キメラ化PTPRS抗体の重鎖をコードするcDNAを調製するために、2-2で得られたマウス49F2−30抗体重鎖可変領域と、3-1で得られたヒトIgG重鎖定常領域を融合したPCRフラグメントを重複伸長PCR法に基づく手法によって2つのPCRフラグメントを交互し、ハイブリッド動作の結果として部分的に二重のフィラメント分子の形成を可能にするような方法で1434塩基の長さでPCR産物を増幅した。このとき、プライマーは表1に示すものである(配列番号17〜24)。得られたPCR産物を1.5%低融点アガロース法によって精製した。
キメラ化PTPRS抗体の軽鎖をコードするcDNAを調製するために、2-3で得られたマウス49F2−30抗体軽鎖可変領域と、3-2で得られたヒトIg κ軽鎖定常領域を融合したPCRフラグメントを重複伸長PCR法に基づく手法によって726塩基の長さでPCR産物を増幅した。
得られた49F2−30のVLコードするcDNAを、pEE14.4ベクター(Lonza Biologics社)へのクローニングのための好適な制限部位(HindIIIおよびEcoRI)ならびに理想的Kozak配列を導入した、プライマーchi49F2VL-IF(Hind)およびchi49F2VL-726R(RI)を用いて、49F2−30のVL領域を含むpCR4Blunt-TOPOプラスミドクローンからPCRで増幅した。Chi49F2VL-pEE14.4ベクターは、カッパ軽鎖定常領域を含む。VLPCR断片を、HindIIIおよびEcoRIを用いて、インフレームで、pEE14.4ベクターに挿入した。コンストラクトをcDNA塩基配列解析によって調べた。
キメラ化PTPRS抗体の重鎖発現ベクターおよびキメラ化PTPRS抗体の軽鎖発現ベクターを、標準的なクローニング技術によって、1つの2遺伝子ベクター中で組み合わせたキメラ化PTPRS抗体(ダブルジーン)Lonza 発現ベクターを構築した。
以下の一過性発現vector DNA(80μg)を使用した。
1)chi9H5-4VH/VL DG Lonza vector DNA
2)chi13G5-57VH/VL DG Lonza vector DNA
3)chi22H8-14VH/VL DG Lonza vector DNA
4)chi49F2-30VH/VL DG Lonza vector DNA
293F細胞をトランスフェクション前日に250 mLのエーレンマイヤーフラスコ(corning社 #431144)に8×105cells/mLで80 mLに合わせて37℃、CO2濃度8%の条件で振とう7日間培養した。
7日間培養後に、トランスフェクションを行った293F細胞の培養液を50 mLチューブに回収し、2,070g、4℃の条件で5分間遠心分離を行った。上清をポアサイズ0.45 μmのシリンジフィルター(カタログ番号431220;CORNING社)でろ過を行い、培養上清をひとつにまとめた。
キメラ9H5−4、13G5−57、22H8−14、49F2−30抗体をプロテインAアフィニティクロマトグラフィーによって精製した。4.で得られた粗抗体液を、それぞれプロテインAアフィニティーカラム(rProteinA Sepharose Fast Flow (カタログ番号17-1279-01;Lot.311272;GE Healthcare社)で精製した。カラム条件は以下の通りである。結合バッファー(20 mM Sodium phosphate, 0.15 M NaCl, pH 7.4)、溶出バッファー(0.1M Glycine-HCl, pH 2.7)を用いてアフィニティー精製した。溶出画分は中和バッファー(1M Tris-HCl pH 9.5)を添加してpH7.2付近に調整した。精製後の抗体のバッファーをPBSに置換するために、Slide-A-Lyzer MINI Dialysis Unit 10kMWCO を用いてバッファーの交換を行った。
精製した抗PTPRSキメラ化抗体(ch9H5−4Ab、ch13G5−57Ab、ch22H8−14Ab、ch49F2−30Ab)をSDS−PAGE、Flowcytometry法によって分析した。
重鎖 軽鎖
配列番号91(核酸配列) 配列番号93(核酸配列)
配列番号92(アミノ酸配列) 配列番号94(アミノ酸配列)
抗PTPRSキメラ9H5−4抗体の重鎖の核酸配列 (1419 bp) を以下に示す(配列番号91)。大文字はキメラ9H5−4 VH 可変領域を、小文字はヒトIgG1 重鎖定常領域を示す。
ATGGAGTTGGGACTGAGCTGGGTATTTCTTGTGGCTCTTTTGAATGGTGTCCAGTGTCAGGTGCAGCTTGTAGAGACCGGGGGAGGCTTGGTGAGGCCTGGAAATTCTCTGAAACTCTCCTGTGTTACCTCGGGATTCACTTTCAGTAACTACCGGATGCACTGGCTTCGCCAGCCTCCAGGGAAGAGGCTGGAGTGGATTGCTGTAATTACAGTCAAATCTGATAATTATGGAGCAAATTATGCAGAGTCTGTGAAAGGCAGATTCACTATTTCAAGAGATGATTCAAAAAGCAGTGTCTACCTGCAGATGAACAGATTAAGAGAGGAAGACACTGCCACTTATTATTGTAGTAGATCGGTCTACTATGGTTACGTCCTAGCCTTTGACTACTGGGGCCAAGGCACCACTCTCACAGTCTCCTCAgctagcaccaagggcccatcggtcttccccctggcaccctcctccaagagcacctctgggggcacagcggccctgggctgcctggtcaaggactacttccccgaaccggtgacggtgtcgtggaactcaggcgccctgaccagcggcgtgcacaccttcccggctgtcctacagtcctcaggactctactccctcagcagcgtggtgaccgtgccctccagcagcttgggcacccagacctacatctgcaacgtgaatcacaagcccagcaacaccaaggtggacaagaaagttgagcccaaatcttgtgacaaaactcacacatgcccaccgtgcccagcacctgaactcctggggggaccgtcagtcttcctcttccccccaaaacccaaggacaccctcatgatctcccggacccctgaggtcacatgcgtggtggtggacgtgagccacgaagaccctgaggtcaagttcaactggtacgtggacggcgtggaggtgcataatgccaagacaaagccgcgggaggagcagtacaacagcacgtaccgtgtggtcagcgtcctcaccgtcctgcaccaggactggctgaatggcaaggagtacaagtgcaaggtctccaacaaagccctcccagcccccatcgagaaaaccatctccaaagccaaagggcagccccgagaaccacaggtgtacaccctgcccccatcccgggatgagctgaccaagaaccaggtcagcctgacctgcctggtcaaaggcttctatcccagcgacatcgccgtggagtgggagagcaatgggcagccggagaacaactacaagaccacgcctcccgtgctggactccgacggctccttcttcctctacagcaagctcaccgtggacaagagcaggtggcagcaggggaacgtcttctcatgctccgtgatgcatgaggctctgcacaaccactacacgcagaagagcctctccctgtctccgggtaaatga
抗PTPRSキメラ9H5−4抗体の重鎖のアミノ酸配列 (472 a.a.) を以下に示す(配列番号92)。大文字はキメラ9H5−4 VH 可変領域を、小文字はヒトIgG1 重鎖定常領域を示す
MELGLSWVFLVALLNGVQCQVQLVETGGGLVRPGNSLKLSCVTSGFTFSNYRMHWLRQPPGKRLEWIAVITVKSDNYGANYAESVKGRFTISRDDSKSSVYLQMNRLREEDTATYYCSRSVYYGYVLAFDYWGQGTTLTVSSastkgpsvfplapsskstsggtaalgclvkdyfpepvtvswnsgaltsgvhtfpavlqssglyslssvvtvpssslgtqtyicnvnhkpsntkvdkkvepkscdkthtcppcpapellggpsvflfppkpkdtlmisrtpevtcvvvdvshedpevkfnwyvdgvevhnaktkpreeqynstyrvvsvltvlhqdwlngkeykckvsnkalpapiektiskakgqprepqvytlppsrdeltknqvsltclvkgfypsdiavewesngqpennykttppvldsdgsfflyskltvdksrwqqgnvfscsvmhealhnhytqkslslspgk
抗PTPRSキメラ9H5−4抗体の軽鎖の核酸配列 (705 bp) を以下に示す(配列番号93)。大文字はキメラ9H5−4 VL 可変領域を、小文字はヒトIg κ 軽鎖定常領域を示す。
ATGATGTCCTCTGCTCAGTTCCTTGGTCTCCTGTTGCTCTGTTTTCAAGGTACCAGATGTGATATCCAGATGACACAGACTACATCCTCCCTGTCTGCCTCTCTGGGAGACAGAGTCACCATCAGTTGCAGGGCAAGTCAGGACATTAGCAATTATTTAAACTGGTATCAGCAGAAACCAGATGGAACTGTTAAACTCCTGATCTACTACACATCAAGATTACACTCAGGAGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGAACAGATTATTCTCTCACCATTAGCAACCTGGAGCAAGAAGATATTGCCACTTACTTTTGCCAACAGGGTAATACGCTTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAAcgaactgtggctgcaccatctgtcttcatcttcccgccatctgatgagcagttgaaatctggaactgcctctgttgtgtgcctgctgaataacttctatcccagagaggccaaagtacagtggaaggtggataacgccctccaatcgggtaactcccaggagagtgtcacagagcaggacagcaaggacagcacctacagcctcagcagcaccctgacgctgagcaaagcagactacgagaaacacaaagtctacgcctgcgaagtcacccatcagggcctgagctcgcccgtcacaaagagcttcaacaggggagagtgctag
抗PTPRSキメラ9H5−4抗体の軽鎖のアミノ酸配列 (234 a.a.) を以下に示す(配列番号94)。大文字はキメラ9H5−4 VL 可変領域、小文字はヒトIg κ 軽鎖定常領域を示す。
MMSSAQFLGLLLLCFQGTRCDIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISNYLNWYQQKPDGTVKLLIYYTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPWTFGGGTKLEIKrtvaapsvfifppsdeqlksgtasvvcllnnfypreakvqwkvdnalqsgnsqesvteqdskdstyslsstltlskadyekhkvyacevthqglsspvtksfnrgec
<13G5−57>
作製されたキメラ13G5−57抗体の重鎖、および軽鎖の核酸配列とアミノ酸配列は、それぞれ次の配列番号の通りである。
重鎖 軽鎖
配列番号95(核酸配列) 配列番号97(核酸配列)
配列番号96(アミノ酸配列) 配列番号98(アミノ酸配列)
抗PTPRSキメラ13G5−57抗体の重鎖の核酸配列 (1413 bp) を以下に示す(配列番号95)。大文字はキメラ13G5−57 VH 可変領域を、小文字はヒトIgG1重鎖定常領域を示す。
ATGAACTTGGGGCTCAGCTTGATTTTCCTTGTCCTTGTTTTAAAAGGTGTCCAGTGTGAAGTGAAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTAGTGCAGCCTGGAGGGTCCCTGAAACTCTCCTGTGCAACCTCTGGATTCACTTTCAGTGACTATTACATGTATTGGGTTCGCCAGACTCCAGAGAAGAGGCTGGAGTGGGTCGCATACATTAGTAATGGTGGTGGTAGCACCTATTATCCAGACACTGTAAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAAGAACACCCTGTACCTGCAAATGAGCCGTCTGAAGTCTGAGGACACAGCCATGTATTACTGTGCAAGACATGTTTACTACGGGAGGAACTATGCTATGGACTACTGGGGTCAAGGAACCTCAGTCACCGTCTCCTCAgctagcaccaagggcccatcggtcttccccctggcaccctcctccaagagcacctctgggggcacagcggccctgggctgcctggtcaaggactacttccccgaaccggtgacggtgtcgtggaactcaggcgccctgaccagcggcgtgcacaccttcccggctgtcctacagtcctcaggactctactccctcagcagcgtggtgaccgtgccctccagcagcttgggcacccagacctacatctgcaacgtgaatcacaagcccagcaacaccaaggtggacaagaaagttgagcccaaatcttgtgacaaaactcacacatgcccaccgtgcccagcacctgaactcctggggggaccgtcagtcttcctcttccccccaaaacccaaggacaccctcatgatctcccggacccctgaggtcacatgcgtggtggtggacgtgagccacgaagaccctgaggtcaagttcaactggtacgtggacggcgtggaggtgcataatgccaagacaaagccgcgggaggagcagtacaacagcacgtaccgtgtggtcagcgtcctcaccgtcctgcaccaggactggctgaatggcaaggagtacaagtgcaaggtctccaacaaagccctcccagcccccatcgagaaaaccatctccaaagccaaagggcagccccgagaaccacaggtgtacaccctgcccccatcccgggatgagctgaccaagaaccaggtcagcctgacctgcctggtcaaaggcttctatcccagcgacatcgccgtggagtgggagagcaatgggcagccggagaacaactacaagaccacgcctcccgtgctggactccgacggctccttcttcctctacagcaagctcaccgtggacaagagcaggtggcagcaggggaacgtcttctcatgctccgtgatgcatgaggctctgcacaaccactacacgcagaagagcctctccctgtctccgggtaaatga
抗PTPRSキメラ13G5−57抗体の重鎖のアミノ酸配列 (470 a.a.) を以下に示す(配列番号96)。大文字はキメラ13G5−57 VH 可変領域を、小文字はヒトIgG1 重鎖定常領域を示す
MNLGLSLIFLVLVLKGVQCEVKLVESGGGLVQPGGSLKLSCATSGFTFSDYYMYWVRQTPEKRLEWVAYISNGGGSTYYPDTVKGRFTISRDNAKNTLYLQMSRLKSEDTAMYYCARHVYYGRNYAMDYWGQGTSVTVSSastkgpsvfplapsskstsggtaalgclvkdyfpepvtvswnsgaltsgvhtfpavlqssglyslssvvtvpssslgtqtyicnvnhkpsntkvdkkvepkscdkthtcppcpapellggpsvflfppkpkdtlmisrtpevtcvvvdvshedpevkfnwyvdgvevhnaktkpreeqynstyrvvsvltvlhqdwlngkeykckvsnkalpapiektiskakgqprepqvytlppsrdeltknqvsltclvkgfypsdiavewesngqpennykttppvldsdgsfflyskltvdksrwqqgnvfscsvmhealhnhytqkslslspgk
抗PTPRSキメラ13G5−57抗体の軽鎖の核酸配列 (705 bp) を以下に示す(配列番号97)。大文字はキメラ13G5−57 VL 可変領域を、小文字はヒトIg κ 軽鎖定常領域を示す。
ATGATGTCCTCTGCTCAGTTCCTTGGTCTCCTGTTGCTCTGTTTTCAAGGTACCAGATGTGATATCCAGATGACACAGACTACATCCTCCCTGTCTGCCTCTCTGGGAGACAGAGTCACCATCAGTTGCAGGGCAAGTCAGGACATTAGCAATTATTTAAACTGGTATCAGCAGAAACCAGATGGAACTGTTAAACTCCTGATCTACTACACATCAAGATTACACTCAGGAGTCCCATCAAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGAACAGATTATTCTCTCACCATTAGCAACCTGGAGCAAGAAGATATTGCCACTTACTTTTGCCAACAGGGTAATACGCTTCCGTACACGTTCGGAGGGGGGACCAAGCTGGAAATAAAAcgaactgtggctgcaccatctgtcttcatcttcccgccatctgatgagcagttgaaatctggaactgcctctgttgtgtgcctgctgaataacttctatcccagagaggccaaagtacagtggaaggtggataacgccctccaatcgggtaactcccaggagagtgtcacagagcaggacagcaaggacagcacctacagcctcagcagcaccctgacgctgagcaaagcagactacgagaaacacaaagtctacgcctgcgaagtcacccatcagggcctgagctcgcccgtcacaaagagcttcaacaggggagagtgctag
抗PTPRSキメラ13G5−57抗体の軽鎖のアミノ酸配列 (234 a.a.) を以下に示す(配列番号98)。大文字はキメラ13G5−57 VL 可変領域、小文字はヒトIg κ 軽鎖定常領域を示す。
MMSSAQFLGLLLLCFQGTRCDIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISNYLNWYQQKPDGTVKLLIYYTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPYTFGGGTKLEIKrtvaapsvfifppsdeqlksgtasvvcllnnfypreakvqwkvdnalqsgnsqesvteqdskdstyslsstltlskadyekhkvyacevthqglsspvtksfnrgec
作製されたキメラ22H8−84抗体の重鎖、および軽鎖の核酸配列とアミノ酸配列は、それぞれ次の配列番号の通りである。
重鎖 軽鎖
配列番号99(核酸配列) 配列番号101(核酸配列)
配列番号100(アミノ酸配列) 配列番号102(アミノ酸配列)
抗PTPRSキメラ22H8−84抗体の重鎖の核酸配列 (1413 bp) を以下に示す(配列番号99)。大文字はキメラ22H8−84 VH 可変領域を、小文字はヒトIgG1 重鎖定常領域を示す。
ATGGAATGTAACTGGATACTTCCTTTTATTCTGTCAGTAACTTCAGGTGTCTACTCACAGGTTCAGCTCCAGCAGTCTGGGGCTGAGCTGGCAAGACCTGGGGCTTCAGTGAAGTTGTCCTGCAAGGCTTCTGGCTACACCTTTACTAGCTACTGGATGCAGTGGGTAAAACAGAGGCCTGGACAGGGTCTGGAATGGATTGGGGCTATTTATCCTGGAGATGGTGATACTAGGTACACTCAGAAGTTCAAGGGCAAGGCCACATTGACTGCAGATAAATCCTCCAGCACAGCCTACATGCAACTCAGCAGCTTGGCATCTGAGGACTCTGCGGTCTATTACTGTGCAAGAAGGATTTACTACGGCTATTACTATGCTATGGACTACTGGGGTCAAGGAACCTCAGTCACCGTCTCCTCAgctagcaccaagggcccatcggtcttccccctggcaccctcctccaagagcacctctgggggcacagcggccctgggctgcctggtcaaggactacttccccgaaccggtgacggtgtcgtggaactcaggcgccctgaccagcggcgtgcacaccttcccggctgtcctacagtcctcaggactctactccctcagcagcgtggtgaccgtgccctccagcagcttgggcacccagacctacatctgcaacgtgaatcacaagcccagcaacaccaaggtggacaagaaagttgagcccaaatcttgtgacaaaactcacacatgcccaccgtgcccagcacctgaactcctggggggaccgtcagtcttcctcttccccccaaaacccaaggacaccctcatgatctcccggacccctgaggtcacatgcgtggtggtggacgtgagccacgaagaccctgaggtcaagttcaactggtacgtggacggcgtggaggtgcataatgccaagacaaagccgcgggaggagcagtacaacagcacgtaccgtgtggtcagcgtcctcaccgtcctgcaccaggactggctgaatggcaaggagtacaagtgcaaggtctccaacaaagccctcccagcccccatcgagaaaaccatctccaaagccaaagggcagccccgagaaccacaggtgtacaccctgcccccatcccgggatgagctgaccaagaaccaggtcagcctgacctgcctggtcaaaggcttctatcccagcgacatcgccgtggagtgggagagcaatgggcagccggagaacaactacaagaccacgcctcccgtgctggactccgacggctccttcttcctctacagcaagctcaccgtggacaagagcaggtggcagcaggggaacgtcttctcatgctccgtgatgcatgaggctctgcacaaccactacacgcagaagagcctctccctgtctccgggtaaatga
抗PTPRSキメラ22H8−84抗体の重鎖のアミノ酸配列 (470 a.a.) を以下に示す(配列番号100)。大文字はキメラ22H8−84 VH 可変領域を、小文字はヒトIgG1 重鎖定常領域を示す
MECNWILPFILSVTSGVYSQVQLQQSGAELARPGASVKLSCKASGYTFTSYWMQWVKQRPGQGLEWIGAIYPGDGDTRYTQKFKGKATLTADKSSSTAYMQLSSLASEDSAVYYCARRIYYGYYYAMDYWGQGTSVTVSSastkgpsvfplapsskstsggtaalgclvkdyfpepvtvswnsgaltsgvhtfpavlqssglyslssvvtvpssslgtqtyicnvnhkpsntkvdkkvepkscdkthtcppcpapellggpsvflfppkpkdtlmisrtpevtcvvvdvshedpevkfnwyvdgvevhnaktkpreeqynstyrvvsvltvlhqdwlngkeykckvsnkalpapiektiskakgqprepqvytlppsrdeltknqvsltclvkgfypsdiavewesngqpennykttppvldsdgsfflyskltvdksrwqqgnvfscsvmhealhnhytqkslslspgk
抗PTPRSキメラ22H8−84抗体の軽鎖の核酸配列 (717 bp) を以下に示す(配列番号101)。大文字はキメラ22H8−84 VL 可変領域を、小文字はヒトIg κ 軽鎖定常領域を示す。
ATGGAGACAGACACAATCCTGCTATGGGTGCTGCTGCTCTGGGTTCCAGGCTCCACTGGTGACATTGTGCTGACCCAATCTCCAGCTTCTTTGGCTGTGTCTCTAGGGCAGAGGGCCACCATCTCCTGCAAGGCCAGCCAAAGTGTTGATTATGATGGTGATAGTTATATGAACTGGTACCAACAGAAACCAGGACAGCCACCCAAACTCCTCATCTATGCTGCATCCAATCTAGAATCTGGGATCCCAGCCAGGTTTAGTGGCAGTGGGTCTGGGACAGACTTCACCCTCAACATCCATCCTGTGGAGGAGGAGGATGCTGCAACCTATTACTGTCAGCAAAGTAATGAGGATCCTCTCACGTTCGGTGCTGGGACCAAGCTGGAGCTGAAAcgaactgtggctgcaccatctgtcttcatcttcccgccatctgatgagcagttgaaatctggaactgcctctgttgtgtgcctgctgaataacttctatcccagagaggccaaagtacagtggaaggtggataacgccctccaatcgggtaactcccaggagagtgtcacagagcaggacagcaaggacagcacctacagcctcagcagcaccctgacgctgagcaaagcagactacgagaaacacaaagtctacgcctgcgaagtcacccatcagggcctgagctcgcccgtcacaaagagcttcaacaggggagagtgctag
抗PTPRSキメラ22H8−84抗体の軽鎖のアミノ酸配列 (238 a.a.) を以下に示す(配列番号102)。大文字はキメラ22H8−84 VL 可変領域、小文字はヒトIg κ 軽鎖定常領域を示す。
METDTILLWVLLLWVPGSTGDIVLTQSPASLAVSLGQRATISCKASQSVDYDGDSYMNWYQQKPGQPPKLLIYAASNLESGIPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQQSNEDPLTFGAGTKLELKrtvaapsvfifppsdeqlksgtasvvcllnnfypreakvqwkvdnalqsgnsqesvteqdskdstyslsstltlskadyekhkvyacevthqglsspvtksfnrgec
作製されたキメラ49F2−30抗体の重鎖、および軽鎖の核酸配列とアミノ酸配列は、それぞれ次の配列番号の通りである。
重鎖 軽鎖
配列番号35(核酸配列) 配列番号37(核酸配列)
配列番号36(アミノ酸配列) 配列番号38(アミノ酸配列)
抗PTPRSキメラ49F2−30抗体の重鎖の核酸配列 (1413 bp) を以下に示す(配列番号35)。大文字はキメラ49F2−30 VH 可変領域を、小文字はヒトIgG1 重鎖定常領域を示す。
MNFGLRLIFLALILKGVQCEVQLVESGGDLVKPGGSLKLSCAASGFIFSSYGMSWVRQTPDKRLEWVATISSGGSDTYYPDSVKGRFTISRDNANNTLYLQMSSLKSEDTAMYYCARQVYYGLYWYFDVWGAGTTVTVSSastkgpsvfplapsskstsggtaalgclvkdyfpepvtvswnsgaltsgvhtfpavlqssglyslssvvtvpssslgtqtyicnvnhkpsntkvdkkvepkscdkthtcppcpapellggpsvflfppkpkdtlmisrtpevtcvvvdvshedpevkfnwyvdgvevhnaktkpreeqynstyrvvsvltvlhqdwlngkeykckvsnkalpapiektiskakgqprepqvytlppsrdeltknqvsltclvkgfypsdiavewesngqpennykttppvldsdgsfflyskltvdksrwqqgnvfscsvmhealhnhytqkslslspgk
ATGGAGTCACAGATTCAGGTCTTTGTATTCGTGTTTCTCTGGTTGTCTGGTGTTGACGGAGACATTGTGATGACCCAGTCTCACAAATTCATGTCCACATCAGTAGGAGACAGGGTCAGCATCATTTGTAAGGCCAGTCAGGATGTGAATACTGCTGTAGCCTGGTATCAACAGAAACCAGGACAATCTCCTAAATTACTGATTTACTCGGCATCCTACCGGTACACTGGAGTCCCTGATCGCTTCACTGGCAGTGGATCTGGGACGGATTTCACTTTCACCATCAGCAGTGTGCAGGCTGAAGACCTGGCAATTTATTACTGTCAGCAACATTATAGTACTCCGTACACGTTCGGAGGGGGGACCAAGCTGGAAATAAAAcgaactgtggctgcaccatctgtcttcatcttcccgccatctgatgagcagttgaaatctggaactgcctctgttgtgtgcctgctgaataacttctatcccagagaggccaaagtacagtggaaggtggataacgccctccaatcgggtaactcccaggagagtgtcacagagcaggacagcaaggacagcacctacagcctcagcagcaccctgacgctgagcaaagcagactacgagaaacacaaagtctacgcctgcgaagtcacccatcagggcctgagctcgcccgtcacaaagagcttcaacaggggagagtgctag
MESQIQVFVFVFLWLSGVDGDIVMTQSHKFMSTSVGDRVSIICKASQDVNTAVAWYQQKPGQSPKLLIYSASYRYTGVPDRFTGSGSGTDFTFTISSVQAEDLAIYYCQQHYSTPYTFGGGTKLEIKrtvaapsvfifppsdeqlksgtasvvcllnnfypreakvqwkvdnalqsgnsqesvteqdskdstyslsstltlskadyekhkvyacevthqglsspvtksfnrgec
作製した抗ヒトPTPRSキメラ抗体(ch49F2−30、ch9H5−4、ch13G5−57、ch22H8−84)の抗体依存性細胞傷害活性
(Antibody-dependent cellular cytotoxicity; ADCC活性)を測定した。活性は細胞から放出された乳酸脱水素酵素 (LDH)の測定値より算出した細胞毒性を指標とした。エフェクター細胞となるヒト末梢血単核球はHISTOPAQUE-1077を使った比重遠心で精製した。ターゲットとなる細胞は、CHO (チャイニーズハムスター卵巣細胞株)を使ったhPTPRS遺伝子の強制形質転換細胞を用いた(2x104/ well)。エフェクターとターゲット細胞の割合が、10:1、20:1、40:1、および80:1になるように混合し、作製した抗ヒトPTPRSキメラ抗体(ch49F2−30、ch9H5−4、ch13G5−57、ch22H8−84)またはコントロール抗体のSynagisを10 μg/ mlを加えて、4時間37℃で培養し、抗体の細胞傷害活性効果を評価した。その結果、抗hPTPRSキメラ抗体のch49F2−30、ch9H5−4、ch13G5−57、ch22H8−84はエフェクター細胞数依存的にターゲットのhPTPRS/CHO細胞を傷害した(図17Aおよび図17B)。この結果は、作製した抗PTPRSキメラ抗体が、PTPRSを発現する細胞を選択的に傷害することを示した。
FERM BP−11357
FERM BP−11358
FERM BP−11359
FERM BP−11360
FERM BP−11361
FERM BP−11362
FERM BP−11363
配列番号4:リバースプライマー
配列番号5:フォワードプライマー
配列番号6:リバースプライマー
配列番号7:フォワードプライマー
配列番号8:リバースプライマー
配列番号9:フォワードプライマー
配列番号10:リバースプライマー
配列番号11:アンチセンスプライマー
配列番号12:アンカープライマー
配列番号12:nはデオキシイノシンである。
配列番号13:アンチセンスプライマー
配列番号14:AUAPプライマー
配列番号15:アンチセンスプライマー
配列番号16:アンチセンスプライマー
配列番号17:プライマー
配列番号18:プライマー
配列番号19:プライマー
配列番号20:プライマー
配列番号21:プライマー
配列番号22:プライマー
配列番号23:プライマー
配列番号24:プライマー
配列番号35:抗PTPRSキメラ49F2−30抗体重鎖核酸配列
配列番号36:抗PTPRSキメラ49F2−30抗体重鎖アミノ酸配列
配列番号37:抗PTPRSキメラ49F2−30抗体軽鎖核酸配列
配列番号38:抗PTPRSキメラ49F2−30抗体軽鎖アミノ酸配列
配列番号39:プライマー
配列番号40:プライマー
配列番号41:プライマー
配列番号42:プライマー
配列番号73:フォワードプライマー
配列番号74:リバースプライマー
配列番号75:フォワードプライマー
配列番号76:リバースプライマー
配列番号77:フォワードプライマー
配列番号78:リバースプライマー
配列番号79:フォワードプライマー
配列番号80:リバースプライマー
配列番号81:フォワードプライマー
配列番号82:リバースプライマー
配列番号83:フォワードプライマー
配列番号84:リバースプライマー
配列番号85:フォワードプライマー
配列番号86:リバースプライマー
配列番号87:フォワードプライマー
配列番号88:リバースプライマー
配列番号89:フォワードプライマー
配列番号90:リバースプライマー
配列番号91:抗PTPRSキメラ9H5−4抗体重鎖核酸配列
配列番号92:抗PTPRSキメラ9H5−4抗体重鎖アミノ酸配列
配列番号93:抗PTPRSキメラ9H5−4抗体軽鎖核酸配列
配列番号94:xx:抗PTPRSキメラ9H5−4抗体軽鎖アミノ酸配列
配列番号95:抗PTPRSキメラ13G5−57抗体重鎖核酸配列
配列番号96:抗PTPRSキメラ13G5−57抗体重鎖アミノ酸配列
配列番号97:抗PTPRSキメラ13G5−57抗体軽鎖核酸配列
配列番号98:抗PTPRSキメラ13G5−57抗体軽鎖アミノ酸配列
配列番号99:抗PTPRSキメラ22H8−84抗体重鎖核酸配列
配列番号100:抗PTPRSキメラ22H8−84抗体重鎖アミノ酸配列
配列番号101:抗PTPRSキメラ22H8−84抗体軽鎖核酸配列
配列番号102:抗PTPRSキメラ22H8−84抗体軽鎖アミノ酸配列
Claims (23)
- ヒト受容体型プロテインチロシンホスファターゼσ(ヒトPTPRS)の細胞外ドメインに結合するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片。
- 形質細胞様樹状細胞に結合する請求項1に記載のモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片。
- 受託番号FERM BP−11356として寄託されたハイブリドーマ9H5−4、 受託番号FERM BP−11357として寄託されたハイブリドーマ10F7−38、受託番号FERM BP−11358として寄託されたハイブリドーマ13G5−52、受託番号FERM BP−11359として寄託されたハイブリドーマ13G5−57、受託番号FERM BP−11360として寄託されたハイブリドーマ14A8−85、受託番号FERM BP−11361として寄託されたハイブリドーマ22H8−84、受託番号FERM BP−11362として寄託されたハイブリドーマ49F2−30、または受託番号FERM BP−11363として寄託されたハイブリドーマ55E7−79が産生するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片。
- 請求項1または2に記載のモノクローナル抗体のいずれかを産生するハイブリドーマ。
- 受託番号FERM BP−11356として寄託されたハイブリドーマ9H5−4、受託番号FERM BP−11357として寄託されたハイブリドーマ10F7−38、受託番号FERM BP−11358として寄託されたハイブリドーマ13G5−52、受託番号FERM BP−11359として寄託されたハイブリドーマ13G5−57、受託番号FERM BP−11360として寄託されたハイブリドーマ14A8−85、受託番号FERM BP−11361として寄託されたハイブリドーマ22H8−84、受託番号FERM BP−11362として寄託されたハイブリドーマ49F2−30、または受託番号FERM BP−11363として寄託されたハイブリドーマ55E7−79が産生するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片。
- 請求項5に記載のハイブリドーマを培養し、培養物からモノクローナル抗体を採取する工程を含む、モノクローナル抗体の製造方法。
- 次の工程を含む、ヒトPTPRSに結合するモノクローナル抗体を産生する細胞の製造方法;
(1)ヒトPTPRSの細胞外ドメインを含む外来性のタンパク質を発現する細胞を免疫動物に投与する工程、および
(2)前記免疫動物の抗体産生細胞から、ヒトPTPRSに結合する抗体を産生する抗体産生細胞を選択する工程。 - ヒトPTPRSを発現する細胞が、ヒトPTPRSの細胞外ドメインを含むアミノ酸配列をコードする外来性のポリヌクレオチドを発現可能に保持する細胞である請求項7に記載の方法。
- 前記細胞が動物細胞である請求項8に記載の方法。
- 前記細胞がヒト由来の細胞である請求項9に記載の方法。
- 前記ヒト由来の細胞が、HEK−293T細胞である請求項10に記載の方法。
- 得られた抗体産生細胞をクローン化する工程を付加的に含む、請求項7〜11のいずれか一項に記載の方法。
- 請求項9に記載の方法によって得られた抗体産生細胞を培養し、その培養物からモノクローナル抗体を採取する工程を含む、ヒトPTPRSの細胞外ドメインに結合するモノクローナル抗体の製造方法。
- 下記の工程によって得ることができる、ヒトPTPRSを認識するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片:
(1) ヒトPTPRSの細胞外ドメインを含むタンパク質を外来性に発現する細胞を免疫動物に投与する工程、
(2)前記免疫動物の抗体産生細胞から、ヒトPTPRSに結合する抗体を産生する抗体産生細胞を選択する工程、および
(3)工程(2)で選択された抗体産生細胞を培養しその培養物からヒトPTPRSを認識する抗体を回収する工程。 - (a) ヒトPTPRSの細胞外ドメインを含むアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを外来性に発現可能に保持する動物細胞、またはその細胞膜分画を含む、ヒトPTPRSに結合する抗体を製造するための免疫原。
- 動物細胞がヒト由来の細胞である請求項15に記載の免疫原。
- ヒトPTPRSの細胞外ドメインに結合するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片を被検細胞と接触させ、該細胞に結合したモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片を検出する工程を含む、形質細胞様樹状細胞の検出方法。
- ヒトPTPRSの細胞外ドメインに結合するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片を含む、形質細胞様樹状細胞の検出用試薬。
- 次の成分のいずれかを形質細胞様樹状細胞に接触させる工程を含む、形質細胞様樹状細胞の活性抑制方法:
(a)ヒトPTPRSに結合し、形質細胞様樹状細胞の活性を抑制するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片、
(b)(a)のモノクローナル抗体の相補性決定領域を移植したイムノグロブリン、またはその抗原結合領域を含む断片。 - 次の成分のいずれかを生体に投与する工程を含む、生体中の形質細胞様樹状細胞の活性抑制方法:
(a)ヒトPTPRSに結合し、形質細胞様樹状細胞の活性を抑制するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片、
(b)(a)のモノクローナル抗体の相補性決定領域を移植したイムノグロブリン、またはその抗原結合領域を含む断片。 - 形質細胞様樹状細胞の活性が、インターフェロン産生活性およびインターフェロン産生細胞の生存のいずれか、または両方である請求項19または請求項20に記載の方法。
- 次の成分のいずれかを有効成分として含む、形質細胞様樹状細胞の活性抑制剤:
(a)ヒトPTPRSに結合し、形質細胞様樹状細胞の活性を抑制するモノクローナル抗体、またはその抗原結合領域を含む断片、
(b)(a)のモノクローナル抗体の相補性決定領域を移植したイムノグロブリン、またはその抗原結合領域を含む断片。 - 形質細胞様樹状細胞の活性が、インターフェロン産生活性およびインターフェロン産生細胞の生存のいずれか、または両方である請求項22に記載のインターフェロン産生細胞の活性抑制剤。
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