JP2004533811A5 - - Google Patents

Description

表１に示される核酸配列に対応するｃＤＮＡは、ＰＣＲ増幅を用いて同定された。用いたＰＣＲプライマーは、５’ＣＴＴＧＣＡＡＣＣＡＴＧＡＴＧＣＣＴＡＡＡＣＡＴＴＧＣ（配列番号３６）またはＡＴＧＡＴＧＣＣＴＡＡＡＣＡＴＴＧＣＴＴＴＣＴＡＧＧ（配列番号３７）および３’（ＴＣＡＴＧＧＡＡＴＴＴＣＣＡＣＡＣＡＴＣＴＣＴＣＴＴＣＡＣ）（配列番号７）を含んだ。

Ｑ９ＹＧＣ８ ｇａｌｌｕｓ ｇａｌｌｕｓ（ニワトリ）インターロイキン−１０レセプター２（５／１９９９）（配列番号８）と、表２に示されるアミノ酸配列（配列番号３３）のアミノ酸３０位〜２２７位との間のアラインメントを以下に提供する。示されるアラインメントについては、長さ＝３４１、スコア＝７３．４、ビット（１７７．０）、期待値＝１ｅ^−１２、同一性＝５６／２００（２８％）、およびポジティブ＝９２／２００（４６％）である。

（実施例１：マウスＣＲＦ２−１２配列の単離）
マウスゲノムＤＮＡデータベースおよびＥＳＴ ＤＮＡデータベースをスクリーニングして、そしてｈＣＲＦ２−１２とのホモロジーを含む特定のクローンを同定した。このホモロジーに基づいて、アミノ末端およびカルボキシ末端のＣＲＦ−２−１２配列をコードする配列を含むマウスの配列を明らかにした。ＯＲＦ−ｍｓ１５−６（ＧＧＡＡＣＴＣＴＧＧＴＴＧＣＣＡＧＡＣＡＡＧＣＡＣＡＣ）（配列番号３８）およびプライマーｍｓ５３−５（ＣＡＡＧＧＡＧＡＧＡＴＧＴＧＴＧＣＡＧＡＴＴＣＣＡＴＧＡの逆向き相補体）（配列番号３９）の５’末端および３’末端に対応するプライマーをそれぞれ、合成してそしてＰＣＲ反応におけるプライマーとして使用した。これらのＰＣＲ反応からのＤＮＡ生成物を、ＴＡクローニングによりｐＣＲＩＩ ＴＯＰＯベクター中にクローニングして、そしてそれらプラスミドを配列決定した。このＤＮＡ配列およびタンパク質配列を、それぞれ表７および表８に示す。

（実施例２：ヒトのＣＲＦ２−１２ポリペプチド配列とマウスのＣＲＦ２−１２ポリペプチド配列との間のホモロジー領域の同定）
ヒトＣＲＦ２−１２（配列番号３４）ポリペプチドおよびマウスＣＲＦ２−１２（配列番号３５）ポリペプチドのアミノ酸配列を比較した。このアラインメントを以下に提供する。Ｈｅｎｉｋｏｆｆら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．（ＵＳＡ）８９：１０９１５−１９，１９９２において記載されるように、アラインメントを調製した。示されるアラインメントについて、ギャップ重さ＝８、平均マッチ＝２．９１２、長さ重さ＝２、平均ミスマッチ＝−２．００３、質＝８２９、長さ＝１１０１、割合＝３．５８９、ギャップ＝１である。その２つのタンパク質が、６９．５６５％類似であり、そして６６．９５７％同一であることを見出した。