FR2845389A1 - Procede pour la synthese de peptides comprenant au moins une molecule de glycine - Google Patents
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Abstract
Procédé de préparation d'un peptide ou d'un dérivé de peptide comprenant au moins 2 acides aminés énantiopurs et au moins une molécule de glycine comprenant la réaction d'un composé de formule générale XCH2-C(=O)-HN-A-COOY (II) avec un composé de formule générale HNR1R2 (III)
Description
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Procédé pour la synthèse de peptides comprenant au moins une molécule de glycine
La présente invention concerne un procédé de synthèse de peptides ou de dérivés de peptide comprenant au moins une molécule de glycine, certains peptides ou dérivés de peptide et certains intermédiaires utilisables dans le procédé de synthèse et leur fabrication.
La présente invention concerne un procédé de synthèse de peptides ou de dérivés de peptide comprenant au moins une molécule de glycine, certains peptides ou dérivés de peptide et certains intermédiaires utilisables dans le procédé de synthèse et leur fabrication.
Les peptides ou dérivés de peptide comprenant au moins une molécule de glycine, sont utiles, par exemple comme médicaments, comme intermédiaires pour la fabrication de peptides et comme bras espaceur dans des compositions pharmaceutiques destinées à amener des principes biologiquement actifs spécifiquement à certaines cellules du corps. Un exemple spécifique d'un tel peptide est le Gly-Phe-Leu-Gly. Dans l'état de la technique (J. Chem. Educ, 1999, p. 1558-60), il est illustré que la synthèse de ce tétrapeptide au départ de produits facilement accessibles tels que les aminoacides requiert de multiples opérations de protection, déprotection et couplage. L'invention a pour objet en particulier de fournir un procédé efficace et économique de synthèse de ce peptide.
La demande de brevet EP-A-0950664 décrit la fabrication de N-glycyl-Ltyrosine par réaction de N-chloroacétyl-L-tyrosine en présence d'ions d'ammonium.
Il était souhaitable de mettre à disposition un procédé permettant d'accéder de manière économique à des peptides ou dérivés de peptides, comprenant la glycine, plus complexes que dans l'état de la technique et présentant une pureté notamment optique élévée.
L'invention concerne dès lors un procédé de préparation d'un peptide ou d'un dérivé de peptide comprenant au moins 2 acides aminés énantiopurs et au moins une molécule de glycine, comprenant la fabrication d'un peptide de formule générale -
R1R2NCH2-C(=O)-HN-A-COOH (I) dans laquelle A désigne une chaîne peptidique comprenant au moins 2 acides aminés énantiopurs ;
R1R2NCH2-C(=O)-HN-A-COOH (I) dans laquelle A désigne une chaîne peptidique comprenant au moins 2 acides aminés énantiopurs ;
<Desc/Clms Page number 2>
et R1 et R2 sont choisis indépendamment parmi H ou alkyl, alcényl et aryl éventuellement fonctionnalisés, un peptide et un acide nucléique, ou RI et R2 forment ensemble un substituant cycloalkyl ou cyclohétéroalkyl, par réaction d'un composé de formule générale
XCH2-C(=O)-HN-A-COOY (II) dans laquelle X désigne un groupement susceptible d'être substitué par substitution nucléophile, choisi en particulier parmi Cl et Br et Y est choisi parmi H et des cations A désigne une chaîne peptidique comprenant au moins 2 acides aminés énantiopurs ; avec un composé de formule générale
HNR1R2 (III) dans laquelle R1 et R2 sont indépendamment des substituants, choisis généralement parmi H ou alkyl, alcényl et aryl, éventuellement fonctionnalisés, un peptide et un acide nucléique, ou R1 et R2 forment ensemble un substituant cyclique éventuellement fonctionnalisé.
XCH2-C(=O)-HN-A-COOY (II) dans laquelle X désigne un groupement susceptible d'être substitué par substitution nucléophile, choisi en particulier parmi Cl et Br et Y est choisi parmi H et des cations A désigne une chaîne peptidique comprenant au moins 2 acides aminés énantiopurs ; avec un composé de formule générale
HNR1R2 (III) dans laquelle R1 et R2 sont indépendamment des substituants, choisis généralement parmi H ou alkyl, alcényl et aryl, éventuellement fonctionnalisés, un peptide et un acide nucléique, ou R1 et R2 forment ensemble un substituant cyclique éventuellement fonctionnalisé.
Il a été trouvé de manière surprenante que le procédé selon l'invention permet l'obtention avec un rendement préparatif élevé de peptides complexes présentant plusieurs centres stéréogéniques, tout en évitant la racémisation.
Les peptides et dérivés de peptide obtenus dans le procédé selon l'invention présentent généralement une pureté diastéréomérique, définie comme teneur pondérale en diastéréomère souhaité, supérieure ou égale à 98%. Souvent, la pureté diastéréomérique est supérieure ou égale à 99%. De préférence, la pureté diastéréomérique est supérieure ou égale à 99,5%. De manière particulièrement préférée, la pureté diastéréomérique est supérieure ou égale à 99,9%.
Dans les formules décrivant les produits mis en oeuvre ou obtenus dans le procédé selon l'invention, A désigne une chaîne peptidique comprenant au moins 2 acides aminés énantiopurs.
Par acide aminé, on entend désigner, aux fins de la présente invention tout composé comprenant au moins un groupement NR1R2, de préférence NH2 et au moins un groupement carboxyle.
Les acides aminés énantiopurs utilisés dans la présente invention sont des acides aminés chiraux contenant au moins un carbone asymétrique.
<Desc/Clms Page number 3>
Par aminoacide énantiopur, on entend désigner un acide aminé chiral constitué essentiellement d'un énantiomère. L'excès énantiomérique (ee) est défini : ee (%) = 100(xl-x2)/(xl+x2) avec xi>X2 ; xi et X2 représentent la teneur du mélange en énantiomère 1 ou 2 respectivement.
On met généralement en oeuvre un acide aminé énantiopur dont l'excès énantiomérique est supérieur ou égal à 99 %. On préfère un acide aminé énantiopur dont l'excès énantiomérique est supérieur ou égal à 99,5 %. De manière particulièrement préférée, on met en oeuvre un acide aminé énantiopur dont l'excès énantiomérique est supérieur ou égal à 99,9 %.
On peut mettre en oeuvre tout acide aminé chiral, d'origine naturelle ou synthétique.
Des exemples d'acides aminés énantiopurs sont par exemple, les acide aminés naturels suivants : Alanine, Valine, Norvaline, Leucine, Norleucine, Isoleucine, Sérine, Isosérine, Homosérine, Thréonine, Allothréonine, Méthionine, Ethionine, Acide Glutamique, Acide Aspartique, Asparagine, Cystéine, Cystine, Phénylalanine, Tyrosine, Tryptophane, Lysine, Arginine, Histidine, Ornithine, Glutamine et Citrulline.
Les énantiomères non naturels sont également utilisables.
Des exemples d'acides aminés énantiopurs d'origine synthétique utilisables comme base du réactif selon l'invention comprennent, par exemple, les acides aminés suivants : (1-Naphtyl)alanine, (2-Naphtyl)alanine, Homophénylalanine, (4-Chlorophényl)alanine, (4-Fluorophényl)alanine, (3Pyridyl) alanine, Phénylglycine, Acide Diaminopimélique (Acide 2-6- Diaminoheptane-l,7-dïoique), Acide 2-aminobutyrique, Acide-2-aminotétraline- 2-carboxylique, Erythro (3-Méthylphenylalanine, Threo P-Méthylphenylalanine, (2-Méthoxyphenyl) alanine, Acide 1 -amino-5-hydroxyindane-2-carboxylique, Acide 2-Aminoheptane-1,7-dïoique, (2,6-Diméthyl-4-hydroxyphényl)alanine, Erythro ss-Méthyltrosine, Threo j3-Méthyltyrosine.
De préférence, l'acide aminé énantiopur est sélectionné parmi les acides aminés d'origine naturelle ou synthétique nommés ci-dessus.
Par chaîne peptidique, on entend désigner de préférence une molécule associant au moins deux acides aminés par un lien peptidique. Sont particulièrement préférées les chaînes peptidiques dans lesquelles tous les acides -aminés sont associés par des liens peptidiques. Toutefois chaîne peptidique peut également désigner des dérivés de peptides dans lesquels, par exemple,
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deux ou plusieurs acides aminés sont associés par un autre groupement tel que par exemple un groupement uréide ou thiouréide.
La chaîne peptidique comprend au moins 2 acides aminés. De préférence, le nombre d'acides aminés dans la chaîne peptidique est supérieur ou égal à 3.
Dans une autre variante préférée, le nombre d'acides aminés dans la chaîne peptidique est supérieur ou égal à 4.
Le nombre d'acides aminés que la chaîne peptidique peut comprendre n'est en principe pas limité. Toutefois, la chaîne peptidique comprend souvent au plus 100 acides aminés. De préférence, le nombre d'acides aminés dans la chaîne peptidique est inférieur ou égal à 20. De manière particulièrement préférée, le nombre d'acides aminés dans la chaîne peptidique est inférieur ou égal à 15. Il a été trouvé que le procédé selon l'invention convient particulièrement bien pour la fabrication préparative par voie chimique de peptides et dérivés de peptide présentant un degré élevé de pureté diastéréomérique.
De préférence, A désigne une chaîne peptidique formée d'un nombre d'acides aminés tel que décrit ci-avant.
La chaîne peptidique comprend au moins 2 acides aminés énantiopurs. En fonction de la longueur de la chaîne peptidique, le nombre d'acides aminés énantiopurs dans la chaîne peptidique peut être supérieur ou égal à 3. Ce nombre peut également être supérieur ou égal à 4.
La chaîne peptidique peut être constituée d'acides aminés énantiopurs.
Toutefois la chaîne peptidique comprend fréquemment des acides aminés nonchiraux tels qu'en particulier la glycine. Il a été trouvé que le procédé selon l'invention permet d'obtenir des peptides et des dérivés de peptide présentant un degré élevé de pureté diastéréomérique malgré la présence de nombreux centres stéréogéniques dans la chaîne peptidique, donnant lieu à un risque de racémisation.
Des exemples spécifiques de chaînes peptidiques utilisables à titre de groupement A dans le procédé selon l'invention répondent aux séquences suivantes :
Phe-Leu-Gly, Gly-Phe-Gly-Phe, Gly-Phe-Gly-Leu, Gly-Phe-Gly-Phe-Leu, Gly-Phe-Leu-Gly-Phe-Leu. Phe-Leu-Gly est particulièrement préféré à titre de séquence.
Phe-Leu-Gly, Gly-Phe-Gly-Phe, Gly-Phe-Gly-Leu, Gly-Phe-Gly-Phe-Leu, Gly-Phe-Leu-Gly-Phe-Leu. Phe-Leu-Gly est particulièrement préféré à titre de séquence.
Dans le composé de formule générale (II), X désigne un groupement susceptible d'être substitué par substitution nucléophile. De préférence, X désigne un groupement capable d'être substitué par substitution nucléophile avec
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un composé de formule générale (III), en particulier dans les conditions de réaction détaillées plus loin. Des exemples spécifiques de substituants X sont choisis parmi -O-ester et halogène.
Des esters au sein du groupement X sont souvent choisis parmi des esters fluorés tels que les fluoroacétates, les fluoroalkylsulfonates ou les alkyl- ou arylsulfonates. De préférence, les esters sont choisis parmi le trifluoroacétate et le trifluorométhanesulfonate et le p-tolylsulfonate.
Un halogène convient bient à titre de groupement X. Parmi les halogènes, le chlore et le brome sont préférés. Le chlore est tout particulièrement préféré.
Dans le composé de formule générale (II), Y désigne un groupement choisi parmi H et des cations. Parmi les cations appropriés on peut citer en particulier Li+, Na+, K+, Cs+, Mg2+, Ca2+, Sr2+ et Ba2+. Dans une variante préférée, Y désigne un cation de formule H2NR1R2+, pouvant être obtenu par protonation des composés de formule générale (III) décrits plus bas. Un groupement Y choisi parmi H et NH4+ est particulièrement préféré. Il est entendu qu'un groupement Y donné peut être échangé contre un autre au cours de la mise en oeuvre du procédé selon l'invention.
L'invention concerne aussi le composé de formule générale (II).
Dans le procédé selon l'invention, la réaction est généralement effectuée à une température supérieure ou égale à -30 C. Souvent, la réaction est effectuée à une température supérieure ou égale à 0 C. De préférence, la température est supérieure ou égale à +10 C. Dans le procédé selon l'invention, la réaction est généralement effectuée à une température inférieure ou égale à +60 C. Souvent, la réaction est effectuée à une température inférieure ou égale à +50 C. De préférence, la température est inférieure ou égale à 40 C.
Dans le procédé selon l'invention, la réaction est généralement effectuée dans un milieu liquide. Dans ce cas, la pression est choisie de manière à maintenir le milieu réactionnel à l'état liquide. La pression atmosphérique (environ 101,3 kPa) et des pressions superatmosphériques conviennent bien.
Dans le procédé selon l'invention, l'ammoniaque est tout particulièrement préféré à titre de composé de formule générale (III).
Lorsque, dans le composé de formule générale (III), le substituant RI et/ou R2 est alkyl, il est souvent choisi parmi un groupement alkyl comprenant de 1 à 20 atomes de carbone. Des exemples spécifiques de tels groupements sont méthyl, éthyl, n-propyl, isopropyl, n-butyl, iso-butyl, tert. -butyl, pentyl, cyclopentyl, cyclohexyl et benzyl. Un groupement méthyl ou éthyl est préféré.
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Lorsque, dans le composé de formule générale (III), le substituant R1 et/ou R2 est alcényl, il est souvent choisi parmi un groupement alcényl comprenant de 2 à 20 atomes de carbone. Des exemples spécifiques de tels groupements sont 2allyl, n-but-2-enyl, iso-butenyl, cyclopentenyl, cyclohexenyl. Un groupement allyl est préféré.
Lorsque, dans le composé de formule générale (III), le substituant RI et/ou R2 est aryl, il est souvent choisi parmi un groupement aryl comprenant de 6 à 24 atomes de carbone. Des exemples spécifiques de tels groupements sont phényl, 1-tolyl, 2-tolyl, 3-tolyl, xylyl, 1-naphtyl et 2-naphtyl. Un groupement phényl ou tolyl est préféré.
Lorsque, dans le composé de formule générale (III), le substituant RI et R2 forment ensemble un substituant cyclique, l'hétérocycle incluant le groupement NH est généralement un cycle formé de 3, 4, 5, 6 ou 7 atomes. Des exemples spécifiques de tels hétérocycles sont la pyrrolidine, la pipéridine, la morpholine, la 1,2,3,4-tétrahydroquinoléine, la 1,2,3,4 tétrahydroisoquinoléine, la perhydroquinoléine, la perhydroisoquinoléine et le (lH)-indole. La pyrrolidine, la pipéridine et la morpholine sont préférées.
Lorsque, dans le composé de formule générale (III), le substituant RI et/ou R2 est un peptide, ce peptide comprend au moins 2 acides aminés. Souvent, le peptide comprend au moins 3 acides aminés. Dans un aspect préféré, le peptide comprend au moins 4 acides aminés. Lorsque, dans le composé de formule générale (III), le substituant RI et/ou R2 est un peptide, le nombre d'acides aminés qu'il peut comprendre n'est en principe pas limité. Toutefois, le peptide comprend souvent au plus 100 acides aminés. Dans un aspect préféré, le peptide comprend au plus 20 acides aminés.
Dans une variante, le composé de formule générale (III) est un composé de formule générale (I) tel que décrit plus haut, dans lequel au moins un substituant RI ou R2 est H. De préférence RI et R2 sont H. Lorsque, dans cette variante, A est identique dans le composé de formule générale (II) et le composé de formule générale (III), le produit obtenu est un dérivé de peptide de formule générale R1N(CH2-C(=O)-HN-A-COOH)2 (IV) dans laquelle A est une chaîne peptidique, de préférence telle que définie plus haut et R1 est tel que défini plus haut.
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Lorsque, dans cette variante, A n'est pas identique dans le composé de formule générale (II) et le composé de formule générale (III), le produit obtenu est un dérivé de peptide de formule générale
R IN(CH2-C(=0)-HN -A1-COOH)(CH2-C( =O)-HN-A2-COOH) (V) dans laquelle Al et A2 désignent des chaînes peptidiques différentes, de préférence répondant à la définition du substituant A donnée plus haut et R1 est tel que défini plus haut.
R IN(CH2-C(=0)-HN -A1-COOH)(CH2-C( =O)-HN-A2-COOH) (V) dans laquelle Al et A2 désignent des chaînes peptidiques différentes, de préférence répondant à la définition du substituant A donnée plus haut et R1 est tel que défini plus haut.
L'invention concerne aussi les dérivés de peptide de formule générale (IV) et (V).
Des dérivés de peptides de formule générale (IV) ou (V) préférés sont ceux dans lesquels A désigne une chaîne peptidique formée de 2 à 20 acides aminés, comprenant au moins 2 acides aminés énantiopurs.
Ces dérivés de peptides, sont utilisables comme constituants dans des compositions pharmaceutiques, par exemple comme bras espaceur dans des compositions pharmaceutiques destinées à amener des principes biologiquement actifs spécifiquement à certaines cellules du corps.
L'invention concerne dès lors aussi une composition pharmaceutique comprenant les dérivés de peptide de formule générale (IV) ou (V). De préférence, les compositions pharmaceutiques comprennent les dérivés de peptide de formule générale (IV) ou (V) à titre de bras espaceur. Les dérivés dans lesquels A ou Al et/ou A2 est choisi parmi Phe-Leu et Phe-Leu-Gly sont préférés.
Les compositions pharmaceutiques peuvent être préparées par exemple par une méthode comprenant (a) la dérivatisation du groupement NH central d'un dérivé de peptide de formule générale (IV) et (V) dans lesquel RI est H, par un groupement polymérisable tel qu'un groupement méthacrolyle, éventuellement après protection d'autres groupements fonctionnels du peptide tel que le groupement ou les groupements carboxyle terminaux ; (b) la copolymérisation du dérivé de peptide dérivatisé, avec un comonomère approprié tel que par exemple un méthacylamide fonctionnalisé, en particulier le N-(2-hydroxypropyl)-méthacrylamide ; (c) éventuellement la déprotection du groupement ou des groupements carboxyle terminaux ;
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(d) la condensation du médicament, par exemple la daunomycine, avec le groupement carboxyle, éventuellement protégé.
Dans une première variante du procédé selon l'invention, la réaction est généralement effectuée dans un milieu liquide contenant au moins 25% en poids par rapport au poids total du milieu liquide de composé de formule générale (III).
Plus souvent, le milieu liquide contient au moins 30% en poids de composé de formule générale (III). La limite supérieure de la teneur en composé de formule générale (III) correspond en principe à la limite de solubilité du composé de formule générale (III) dans le milieu choisi.
Dans une deuxième variante, la réaction est effectuée dans un milieu liquide dans lequel on maintient une concentration du composé de formule générale (II) inférieure ou égale à 10% en poids par rapport au poids total du milieu liquide. Une concentration du composé de formule générale (II) inférieure ou égale à 5% en poids est préférée. Une concentration du composé de formule générale (II) inférieure ou égale à 2% en poids est plus particulièrement préférée.
Une concentration du composé de formule générale (Il) inférieure ou égale à 1% en poids est tout particulièrement préférée. Généralement, la réaction est effectuée dans un milieu liquide dans lequel on maintient une concentration du composé de formule générale (II) supérieure ou égale à 0,001% en poids par rapport au poids total du milieu liquide. Souvent, la concentration du composé de formule générale (H) est supérieure ou égale à 0,01% en poids.
Dans la deuxième variante, une manière avantageuse de maintenir la concentration souhaitée en composé de formule générale (Il) comprend d'effectuer une addition progressive du composé de formule générale (II) au milieu liquide.
L'addition progressive du composé de formule générale (II) peut être, par exemple, une addition réalisée en plusieurs portions, identiques ou non. Ce mode d'addition du composé de formule générale (II) correspond à ce qui est appelé, pour des bioréacteurs, une réaction de type fed-batch (Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry, 5. Ed. Vol B4 p.387-388). Généralement, on introduit une portion de composé de formule générale (II) dans le milieu réactionnel initial, puis on ajoute au moins une autre portion ultérieurement, en cours de réaction. Le nombre de portions à mettre en #uvre n'est théoriquement pas limité, s'approchant alors d'un autre mode d'addition du composé de formule générale (II) selon lequel l'addition progressive est réalisée en continu.
Cependant, on emploie généralement un nombre de portions d'au plus 100.
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Souvent, le nombre est d'au plus 50. Le plus souvent, le nombre est d'au plus 20.
Un nombre d'au plus 10 donne de bons résultats. Un nombre d'au plus 5 est avantageux. Un nombre d'au plus 4 est préféré. D'excellents résultats sont obtenus avec un nombre de 2 ou 3.
Les intervalles de temps entre les additions des portions sont généralement d'au moins 1 min. Souvent, les intervalles sont d'au moins 5 min. Plus souvent, les intervalles sont d'au moins 30 min. De préférence, les intervalles sont d'au moins 1 h. Des intervalles d'environ 2, 3, 4, 5 ou 6 h donnent de bons résultats.
Dans un autre mode d'addition du composé de formule générale (II) dans le procédé selon l'invention, l'addition progressive d'au moins une partie du composé de formule générale (II) est réalisée en continu. Ce mode d'addition correspond à ce qui est appelé, pour des bioréacteurs, une réaction de type extended fed-batch (Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry, 5. Ed.
Vol B4 p.387-388). On peut, par exemple, introduire une portion de composé de formule générale (II) dans le milieu réactionnel initial, puis ajouter ultérieurement en cours de réaction une quantité souhaitée de composé de formule générale (II) en continu, en réglant le débit de manière à maintenir la concentration du composé de formule générale (II) en dessous de la concentration souhaitée.
La deuxième variante convient particulièrement bien lorsqu'on veut empêcher la réaction ultérieure du composé de formule générale (I) avec du composé de formule générale (II) présent dans le milieu réactionnel.
La deuxième variante convient en outre également bien pour effectuer une réaction sélective 1:1 d'un composé analogue au composé de formule générale (II), dans lequel, tout autre substitution et les conditions de réaction restant comme décrit pour le composé de formule générale (II), le substituant A comprend 0 ou 1 acide aminé énantiopur.
Les produits obtenus à l'issue du procédé selon l'invention peuvent être dérivatisés par exemple avec des groupements activants ou protecteurs connus.
Ils peuvent également être soumis à des réactions de dérivatisation visant à introduire de tels groupements activants ou protecteurs. Les produits obtenus à l'issue du procédé selon l'invention ou leurs dérivés peuvent être utilisés pour la fabrication ultérieure de peptides ou de dérivés de peptides, par exemple par des couplages peptidiques connus.
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Dans un aspect particulier, le procédé selon l'invention comprend en outre la fabrication du composé de formule générale (II) par couplage peptidique d'un fragment de formule générale
XCH2-C(=O)-HN-B (VI) dans laquelle X désigne un groupement susceptible d'être substitué par substitution nucléophile, tel que défini plus haut, choisi en particulier parmi Cl et Br, et B désigne un acide aminé ou une chaîne peptidique portant éventuellement des groupes protecteurs et/ou activants, avec un fragment C désignant également un acide aminé ou une chaîne peptidique portant éventuellement des groupes protecteurs et/ou activants.
XCH2-C(=O)-HN-B (VI) dans laquelle X désigne un groupement susceptible d'être substitué par substitution nucléophile, tel que défini plus haut, choisi en particulier parmi Cl et Br, et B désigne un acide aminé ou une chaîne peptidique portant éventuellement des groupes protecteurs et/ou activants, avec un fragment C désignant également un acide aminé ou une chaîne peptidique portant éventuellement des groupes protecteurs et/ou activants.
Dans le fragment de formule générale (VI), B peut désigner un acide aminé, en particulier choisi parmi la glycine et les acides aminés cités plus haut.
De préférence, B est un acide aminé énantiopur en particulier tel que mentionné plus haut ou un peptide dont le N-terminus acylé est un acide aminé énantiopur.
Un acide aminé énantiopur choisi parmi Phe, Ile, Val Ala et Leu est particulièrement préféré. Phe est tout particulièrement préféré à titre d'acide aminé énantiopur.
Le fragment C peut être un acide aminé ou une chaîne peptidique comprenant de préférence 2,3, 4 ou 5 acides aminés. Les acides aminés sont choisis en particulier parmi la glycine et les acides aminés cités plus haut.
Les fragments B et C peuvent porter des groupements protecteurs et/ou activants connus en eux-mêmes tels qu'en particulier un groupement benzyloxycarbonyl, un groupement t-butoxycarbonyl ou un groupement silyl.
Les fragments B et C peuvent être couplés par des méthodes connues telles que par exemple une réaction de fragments de formule générale (VI) et C, protégés de manière appropriée en présence de dicyclohexylcarbodiimide, éventuellement en outre en présence d'hydroxysuccinimide ou d'hydroxybenzotriazole.
Il a été trouvé que malgré la présence d'acides aminés énantiopurs acylés ou d'acides aminés énantiopurs au sein d'une chaîne peptidique dont le Nterminus est acylé, il est possible d'effectuer de multiples couplages peptidiques avec un bon rendement en composé de formule générale (II) tout en conservant une pureté optique élévée.
Dans le fragment C, le C-terminus est de préférence un groupement COOZ dont le groupement Z peut être substitué par un groupement Y tel que défini plus haut, dans des conditions qui laissent intact la liaison peptidique et ne
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conduisent pas à une racémisation. Des exemples de groupements Z utilisables sont silyl, en particulier trialkylsilyl. Un groupement triméthylsilyl est particulièrement préféré à titre de substituant Z.
Dans une variante particulièrement préférée, le fragment C est persilylé, c'est-à-dire qu'au moins tous les groupements -NH2 et COOH de l'acide aminé ou du peptide portent un substituant silyl, de préférence trialkylsilyl (-NHSiR3 ; COOSiR3). Des groupements triméthylsilyl sont particulièrement préférés à titre de substituant silyl. La persilylation d'un acide aminé ou d'un peptide peut être effectuée par exemple selon la méthode décrite dans la demande de brevet EP-A- 184243 au nom de la Demanderesse.
Dans une variante tout particulièrement préférée, le fragment C est un aminoacide persilylé. Ce fragment peut être couplé avec un fragment de formule générale (VI) comportant un groupement carboxyle de préférence activé, par exemple par formation d'anhydride ou de chlorure d'acide.
Il est encore plus particulièrement préféré d'effectuer des couplages peptidiques successifs d'un fragment de formule générale (VI) dans lequel B désigne un acide aminé tel que décrit plus haut avec différents fragments C qui sont des acides aminés persilylés, en particulier pertriméthylsilylés. Cette variante convient particulièrement bien pour la synthèse de composés de formule générale (II) dans lesquels A est une chaîne peptidique constituée d'un nombre supérieur ou égal à 2, 3, 4, 5,6, 7 ou 8 acides aminés. Cette variante convient particulièrement bien pour la synthèse de composés de formule générale (II) dans lesquels A est une chaîne peptidique constituée d'un nombre inférieur ou égal à 20,15 ou 10 acides aminés. Il a été trouvé qu'en particulier les composés de formule générale (II) mentionnés ci-avant peuvent être obtenus de manière économique à l'échelle préparative de centaines de grammes voire de kilogrammes avec un rendement élevé par cette variante, sans racémisation substantielle.
Le procédé selon l'invention convient particulièrement bien pour la préparation de tétra-, penta-, hexa-, hepta- et octapeptides N-Gly-terminaux, tels qu'en particulier les séquences mentionnées plus haut et plus particulièrement Gly-Phe-Leu-Gly, par une séquence de réactions selon laquelle (a) on effectue la synthèse d'un composé de formule générale (II) par des couplages peptidiques successifs d'un fragment de formule générale (VI) dans lequel B désigne un acide aminé tel que décrit plus haut, en particulier
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Phe, avec différents fragments C qui sont des acides aminés persilylés, en particulier pertriméthylsilylés (b) on soumet, conformément au procédé selon l'invention tel que décrit plus haut, le composé de formule générale (II) à une réaction avec un composé de formule générale (III).
Les exemples ci-après entendent illustrer l'invention sans toutefois la limiter.
Les différents produits et intermédiaires de synthèse rapportés dans les exemples ont été caractérisés par différentes méthodes analytiques, mises en oeuvre dans les conditions suivantes : Rotation optique (a) : mesurée à 589 nm à 25 C Chromatographie en couche mince (CCM) :
Plaques de silicagel MERCK 60F-254
Eluants pour la CCM
Rfl : EtOAc/nBuOH/HOAc/H20 proportions (volume) 10/1/1/1
Rf2 : EtOAc/nBuOH/HOAc/H20 proportions (volume) 4/1/1/1
Rf3 : EtOAc/nBuOH/HOAc/H2O proportions (volume) 1/1/1/1
Chromatographie HPLC : - Colonne Vydac 5 m 201TP 54 C-18 - Elution : gradient de 98 % A + 2 % B jusqu'à 25 % A + 75 % B en 49 minutes (A = eau 0,1% en acide trifluoroacétique ; B = acétonitrile 0,1% en acide trifluoroacétique) - Débit = 2 ml/min - Détection : UV 220 nm.
Plaques de silicagel MERCK 60F-254
Eluants pour la CCM
Rfl : EtOAc/nBuOH/HOAc/H20 proportions (volume) 10/1/1/1
Rf2 : EtOAc/nBuOH/HOAc/H20 proportions (volume) 4/1/1/1
Rf3 : EtOAc/nBuOH/HOAc/H2O proportions (volume) 1/1/1/1
Chromatographie HPLC : - Colonne Vydac 5 m 201TP 54 C-18 - Elution : gradient de 98 % A + 2 % B jusqu'à 25 % A + 75 % B en 49 minutes (A = eau 0,1% en acide trifluoroacétique ; B = acétonitrile 0,1% en acide trifluoroacétique) - Débit = 2 ml/min - Détection : UV 220 nm.
Résonance magnétique nucléaire (RMN) - Appareil Brüker AMX 500 MHz - Shift donnés en ppm - Allures des résonances : m=multiplet, s=singulet, d=doublet, t=triplet, q=quadruplet, quint=quintuplet, o=octuplet.
Exemple 1 Synthèse de N-Chloroacétyl-Phe-Leu Activation
On a préparé une solution de 1 mole de N-chloroacétyl-(L)-phénylalanine dans 1 litre de dichlorométhane en présence d'une mole de triéthylamine et de 1
On a préparé une solution de 1 mole de N-chloroacétyl-(L)-phénylalanine dans 1 litre de dichlorométhane en présence d'une mole de triéthylamine et de 1
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mole de pyridine. On a refrodi à -35 C et on a ajouté 1,15 mole de chlorure de pivaloyle.
Couplage
A la solution préparée, on a ajouté 1 litre d'une solution de 1,15 mole de N,O-bis(triméthylsilyl)-(L)-Leucine dans le dichlorométhane, refroidie à -15 C.
A la solution préparée, on a ajouté 1 litre d'une solution de 1,15 mole de N,O-bis(triméthylsilyl)-(L)-Leucine dans le dichlorométhane, refroidie à -15 C.
On a laissé réagir pendant 90 min en laissant remonter la température.
Isolation du composé
Le mélange réactionnel a été traité avec une solution de 1 mole de KHS04 dans 2,7 litres d'eau. On a évaporé le dichlorométhane et le N-Chloroacétyl-PheLeu a été récupéré sous forme d'un précipité qu'on a séché et lavé à l'éther.
Le mélange réactionnel a été traité avec une solution de 1 mole de KHS04 dans 2,7 litres d'eau. On a évaporé le dichlorométhane et le N-Chloroacétyl-PheLeu a été récupéré sous forme d'un précipité qu'on a séché et lavé à l'éther.
Rendement 80% Aucune racémisation n'a été observée.
CI CH2 C - Phe - Leu
O m. p. : 158-159 C a : -10. 2 (C=2, CH30H) TLC : Rfl : 0. 86 HPLC : tR : 19.8min RMN (1H) dans CD3 OD, référence interne (ligne centrale du multiplet CD3 à 3. 32ppm) 7. 26-7.21 (5H, m) H aromatique Phe 4. 72 (1H, dd) Ha Phe 4. 46 (1H, dd) Ha Leu 4. 00 (2H, système AB) Cl CH2 - C
O 3. 20 (lH,dd) HplPhe 2. 94 (1H, dd) Hp2 Phe 1. 71 (lH, m) H[gamma] Leu 1. 67 (lH,m) Hss Leu 0. 96 (3H, d) CH3 yl Leu 0. 95 (3H, d) CH3 y2 Leu Exemple 2
Synthèse de N-Chloroacétyl-Phe-Leu-Gly
O m. p. : 158-159 C a : -10. 2 (C=2, CH30H) TLC : Rfl : 0. 86 HPLC : tR : 19.8min RMN (1H) dans CD3 OD, référence interne (ligne centrale du multiplet CD3 à 3. 32ppm) 7. 26-7.21 (5H, m) H aromatique Phe 4. 72 (1H, dd) Ha Phe 4. 46 (1H, dd) Ha Leu 4. 00 (2H, système AB) Cl CH2 - C
O 3. 20 (lH,dd) HplPhe 2. 94 (1H, dd) Hp2 Phe 1. 71 (lH, m) H[gamma] Leu 1. 67 (lH,m) Hss Leu 0. 96 (3H, d) CH3 yl Leu 0. 95 (3H, d) CH3 y2 Leu Exemple 2
Synthèse de N-Chloroacétyl-Phe-Leu-Gly
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On a procédé comme à l'exemple 1 avec les différences suivantes :
On a mis en oeuvre du N-Chloroacétyl-Phe-Leu dans l'étape d'activation et du N,O-bis(triméthylsilyl)-Glycine à l'étape de couplage.
On a mis en oeuvre du N-Chloroacétyl-Phe-Leu dans l'étape d'activation et du N,O-bis(triméthylsilyl)-Glycine à l'étape de couplage.
Rendement 75%
Aucune racémisation n'a été observée.
Aucune racémisation n'a été observée.
Cl CH2 CO -Phe-Leu-Gly m. p. : 207-209 C a: -31 (C=2, CH30H) TLC : Rf(l) : 0. 67 HPLC : tR : 17. 2min RMN (1H) dans CD3 OD, référence interne (ligne centrale du multiplet CD3 à 3. 32ppm) 7. 28-7.22 (5H, m) H aromatiques Phe 4. 96 (1H, dd) Ha Phe 4. 47 (1H, dd) Ha Leu
O # 4. 01 (2H, système AB) CI CH-2 - C 3. 87 (2H, système AB) Ha-Gly 3. 17 (1H, dd) HplPhe 2. 98 (1H, dd) Hp2 Phe 1. 65 (3H, m) Hss + H[gamma] Leu 0. 95 (3H, d) CH3 [gamma]1 Leu 0. 94 (3H, d) CH3 y2 Leu Exemple 3
Synthèse de Gly-Phe-Leu-Gly
On a introduit dans 1 L d'ammoniaque aqueux (25%) 3 portions de 10 g de N-Chloroacétyl-Phe-Leu-Gly à température ambiante. La durée entre les introductions de N-Chloroacétyl-Phe-Leu-Gly était de 6h chaque fois. Après 6h supplémentaires, on a évaporé l'ammoniaque jusqu'à précipitation du produit.
O # 4. 01 (2H, système AB) CI CH-2 - C 3. 87 (2H, système AB) Ha-Gly 3. 17 (1H, dd) HplPhe 2. 98 (1H, dd) Hp2 Phe 1. 65 (3H, m) Hss + H[gamma] Leu 0. 95 (3H, d) CH3 [gamma]1 Leu 0. 94 (3H, d) CH3 y2 Leu Exemple 3
Synthèse de Gly-Phe-Leu-Gly
On a introduit dans 1 L d'ammoniaque aqueux (25%) 3 portions de 10 g de N-Chloroacétyl-Phe-Leu-Gly à température ambiante. La durée entre les introductions de N-Chloroacétyl-Phe-Leu-Gly était de 6h chaque fois. Après 6h supplémentaires, on a évaporé l'ammoniaque jusqu'à précipitation du produit.
Les liqueurs mères ont été neutralisées et stockées à -5 C. Le produit a été filtré et lavé à l' eau.
Rendement en Gly-Phe-Leu-Gly : 80% Gly-Phe-Leu-Gly m. p.: (décomposition) >300 C a : -26 (C=2, 1N HCl)
<Desc/Clms Page number 15>
TLC : Rf(1) = 0.12 Rf(2) = 0.25
Rf (3) = 0.51 HPLC : tR: 11.6 min RMN (1H) dans CD3 OD, référence interne (ligne centrale du multiplet CD3 à 3.32ppm) 7. 27-7.22 (5H, m) H aromatiques Phe 4. 72 (1H, dd) Ha Phe 4. 46 (1H, dd) Ha Leu 3. 91 (2H, système AB) Ha Gly 2 3. 70 (1H, d) Hal Gly 1 3. 62 (1H, d) Ha2 Gly 1 3. 17 (1H, dd) Hss1Phe 2. 93 (1H, dd) Hp2 Phe 1.63 (3H, m) Hss + H[gamma] Leu 0. 95 (3H, d) CH3 yl Leu 0.94 (3H, d) CH3 y2 Leu
Le produit HN(CH2(C=O)-Phe-Leu-Gly)2 a été obtenu par acidification des eaux mères en un rendement de 5%
Aucune racémisation n'a été observée pour les deux produits.
Rf (3) = 0.51 HPLC : tR: 11.6 min RMN (1H) dans CD3 OD, référence interne (ligne centrale du multiplet CD3 à 3.32ppm) 7. 27-7.22 (5H, m) H aromatiques Phe 4. 72 (1H, dd) Ha Phe 4. 46 (1H, dd) Ha Leu 3. 91 (2H, système AB) Ha Gly 2 3. 70 (1H, d) Hal Gly 1 3. 62 (1H, d) Ha2 Gly 1 3. 17 (1H, dd) Hss1Phe 2. 93 (1H, dd) Hp2 Phe 1.63 (3H, m) Hss + H[gamma] Leu 0. 95 (3H, d) CH3 yl Leu 0.94 (3H, d) CH3 y2 Leu
Le produit HN(CH2(C=O)-Phe-Leu-Gly)2 a été obtenu par acidification des eaux mères en un rendement de 5%
Aucune racémisation n'a été observée pour les deux produits.
Exemple 4
Synthèse de
CH2 (C=O) - Phe Leu Gly HN CH2 (C=O) - Phe Leu Gly
On a dissout 1,25 mmol (490mg) de Gly-Phe-Leu-Gly et 1 mmol (41 lmg) de Cl CH2 (C=O) - Phe Leu-Gly dans 5ml de dioxane et 2,25 ml de KOH IN.
Synthèse de
CH2 (C=O) - Phe Leu Gly HN CH2 (C=O) - Phe Leu Gly
On a dissout 1,25 mmol (490mg) de Gly-Phe-Leu-Gly et 1 mmol (41 lmg) de Cl CH2 (C=O) - Phe Leu-Gly dans 5ml de dioxane et 2,25 ml de KOH IN.
On a chauffé à environ 65 C et on a suivi la conversion par HPLC. Dès que la conversion était complète, on a évaporé le dioxane. On a ajouté 10ml d'eau et on a ajusté le pH à 2,5. Le produit a précipité. Il a été lavé à l'eau et à l'acétate d' éthyle.
Rendement : 60% tR (HPLC) : 21.0 min Rf 2 = 0.75 RMN (D2O + 1 goutte d'acide trifluoroacétique) 7. 45-7.36 (m, 10H) H aromatiques Phe
<Desc/Clms Page number 16>
4. 84 (m, 2H) Ha de deux Phe 4. 59 (m, 2H) Ha de deux Leu 4.14-4.00 (m, 8H) Ha de groupements Gly 3. 23 (m, 4H) Hss de deux Phe 1.70 (m, 6H) Hp+Hy de deux Leu 1.00 (d+d, 12H) H# de deux Leu
Exemple 5
Synthèse de
Exemple 5
Synthèse de
Le composé a été obtenu en suivant le mode opératoire de l'exemple 4, au départ de Gly-Phe-Leu-Gly et de CICH2 (C=O) - Phe Leu. tR = 22. 4 min Rf2 : 0.84 RMN CE) dans CD3 OD, référence interne (ligne centrale du multiplet CD3 à 3. 32ppm) 7. 30-7.23 (m, 10H) H aromatiques Phe 4.73 (dd, IH) Ha du 1 er Phe 4. 67 (dd, 1H) Ha du 2ème Phe 3.88 (s, 2H) Ha d'un groupement Gly 3. 55 (système AB, 4H) Ha de deux Gly 3.32 (m, 2H) Hss1de deux Phe 3.23 (m, 2H Hss2 de deux Phe 1. 75-1.68 (m, 6H) Hss+H[gamma] de deux Leu 0. 98-0.95 (m, 12H) H# de deux Leu
Claims (20)
- HNR1R2 (III) dans laquelle R1 et R2 ont la même signification que dans la formule (I).XCH2-C(=O)-HN-A-COOY (II) dans laquelle X désigne un groupement susceptible d'être substitué par substitution nucléophile, choisi en particulier parmi Cl et Br et Y est choisi parmi H et des cations A a la même signification que dans la formule (I); avec un composé de formule généraleR1R2NCH2-C(=O)-HN-A-COOH (I) dans laquelle A désigne une chaîne peptidique comprenant au moins 2 acides aminés énantiopurs ; et R1 et R2 sont choisis indépendamment parmi H ou alkyl, alcényl et aryl, éventuellement fonctionnalisés, un peptide et un acide nucléique, ou RI et R2 forment ensemble un substituant cycloalkyl ou cyclohétéroalkyl, par réaction d'un composé de formule généraleREVENDICATIONS 1. Procédé de préparation d'un peptide ou d'un dérivé de peptide comprenant au moins 2 acides aminés énantiopurs et au moins une molécule de glycine, comprenant la fabrication d'un peptide de formule générale
- 2. Procédé selon la revendication 1, dans lequel la réaction est effectuée dans un milieu liquide contenant au moins 25% en poids par rapport au poids total du milieu liquide de composé de formule générale (III).
- 3. Procédé selon la revendication 2, dans lequel le milieu liquide contient au moins 30% en poids de composé de formule générale (III).
- 4. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 3, dans lequel la réaction est effectuée dans un milieu liquide dans lequel on maintient une<Desc/Clms Page number 18>concentration du composé de formule générale (II) inférieure ou égale à 10% en poids par rapport au poids total du milieu liquide.
- 5. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 4, dans lequel la réaction est effectuée à une température de -30 C à + 60 C.
- 6. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 5 dans lequel le composé de formule générale (III) est l'ammoniaque.
- 7. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 6 dans lequel A désigne une chaîne peptidique formée de 2 à 20 acides aminés.
- 8. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 7, dans lequel le composé de formule générale (III) est un composé répondant à la formule générale (I), au moins R2 dans le composé de formule générale (III) est H, A est identique dans le composé de formule générale (II) et dans le composé de formule générale (III) et le produit obtenu est un dérivé de peptide de formule générale R1N(CH2-C(=O)-HN-A-COOH)2 (IV) dans laquelle A désigne une chaîne peptidique comprenant au moins 2 acides aminés énantiopurs ; et R est choisi parmi H, alkyl, alcényl et aryl, éventuellement fonctionnalisés, un peptide ou un acide nucléique.
- 9. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 8 comprenant la fabrication du composé de formule générale (II) par couplage peptidique d'un fragment de formule généraleXCH2-C(=O)-HN-B (VI) dans laquelle X désigne un groupement susceptible d'être substitué par substitution nucléophile, choisi en particulier parmi Cl et Br et B désigne un acide aminé ou une chaîne peptidique portant éventuellement des groupes protecteurs et/ou activants,avec un fragment C désignant également un<Desc/Clms Page number 19>acide aminé ou une chaîne peptidique portant éventuellement des groupes protecteurs et/ou activants.
- 11. Procédé selon la revendication 9 ou 10 dans lequel le fragment C est un acide aminé persilylé ou une chaîne peptidique persilylée.
- 12. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 11dans lequel le groupement A du composé de formule générale (II) est Phe-Leu-Gly.
- 13. Dérivé de peptide de formule généraleR1N(CH2-C(=O)-HN-A-COOH)2 (IV) dans laquelle A désigne une chaîne peptidique comprenant au moins 2 acides aminés énantiopurs ; et R1 est choisi parmi H, alkyl, alcényl et aryl, éventuellement fonctionnalisés, un peptide ou un acide nucléique.
- 14. Dérivé de peptide de formule généraleR1N(CH2-C(=O)-HN-A1-COOH)(CH2-C(=O)-HN-A2-COOH) (V) dans laquelle Al et A2 désignent des chaînes peptidiques différentes et Al ou A2 comprend au moins 2 acides aminés énantiopurs et R1 est choisi parmi H, alkyl, alcényl et aryl éventuellement fonctionnalisés, un peptide ou un acide nucléique.
- 15. Dérivé de peptide selon la revendication 13 ou 14 dans lequel le groupement A ou Al et/ou A2 est choisi parmi Phe-Leu et Phe-Leu-Gly.
- 16. Composition pharmaceutique comprenant un dérivé de peptide selon l'une quelconque des revendications 13 à 15.
- 17. Composé de formule générale XCH2-C(=0)-HN-A-COOY (il) dans laquelle X désigne un groupement susceptible d'être substitué par substitution nucléophile, choisi en particulier parmi CI et Br et Y est choisi parmi H et des cations, et<Desc/Clms Page number 21>A désigne une chaîne peptidique formée de 2 à 20 acides aminés, comprenant au moins 2 acides aminés énantiopurs.
- 18. Procédé de fabrication du composé de formule générale (II) selon la revendication 17, par couplage peptidique d'un fragment de formule généraleXCH2-C(=O)-HN-B (V) dans laquelle X désigne un groupement susceptible d'être substitué par substitution nucléophile, choisi en particulier parmi CI et Br et B désigne un acide aminé ou une chaîne peptidique portant éventuellement des groupes protecteurs et/ou activants, avec un fragment C désignant également un acide aminé ou une chaîne peptidique portant éventuellement des groupes protecteurs et/ou activants.
- 19. Procédé selon la revendication 18, dans lequel B désigne un acide aminé.
- 20. Procédé selon la revendication 18 ou 19 dans lequel le fragment C est un acide aminé persilylé ou une chaîne peptidique persilylée.
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