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ES2317665T3 - Proteina quimerica que contiene una secuencia de tipo chaperona intramolecular y su aplicacion a la produccion de insulina. - Google Patents

Proteina quimerica que contiene una secuencia de tipo chaperona intramolecular y su aplicacion a la produccion de insulina. Download PDF

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ES2317665T3
ES2317665T3 ES98912192T ES98912192T ES2317665T3 ES 2317665 T3 ES2317665 T3 ES 2317665T3 ES 98912192 T ES98912192 T ES 98912192T ES 98912192 T ES98912192 T ES 98912192T ES 2317665 T3 ES2317665 T3 ES 2317665T3
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protein
insulin
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Zhongru Gan
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Tonghua Gantech Biotechnology Ltd
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Tonghua Gantech Biotechnology Ltd
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Abstract

Una proteína quimérica que comprende, desde el extremo-N al extremo-C: a) un primer fragmento peptidilo constituido por una secuencia de aminoácidos que tiene al menos 60% de identidad con un dominio de la hormona del crecimiento humano que contiene al menos los primeros 20 aminoácidos N-terminales de SEQ ID NO:2 en los que el porcentaje de identidad se determina sobre una secuencia de aminoácidos SEQ ID NO:2 de la misma longitud que el primer fragmento peptidilo; b) un resto Arg, o un resto Lys, o un segundo fragmento peptidilo constituido al menos por 2 aminoácidos en cuyo fragmento peptidilo el resto ácido más C-terminal es un resto Arg o Lys; y c) un tercer fragmento peptidilo constituido por un fragmento peptidilo precursor de insulina humana que comprende la cadena A y la cadena B de insulina humana, y en el que la cadena A y la cadena B están separadas mediante un resto peptidilo removible de una longitud entre 2 y 34 restos; y en la que el primer fragmento peptidilo es capaz de aumentar el rendimiento de la conformación bioactiva del precursor de insulina formado poniendo en contacto la proteína recombinante con un agente caotrópico auxiliar en comparación con el rendimiento de la conformación bioactiva del precursor de insulina formado poniendo en contacto la misma proteína recombinante que carece del primer fragmento peptidilo con el agente caotrópico.

Description

Proteína quimérica que contiene una secuencia de tipo chaperona intramolecular y su aplicación a la producción de insulina.
1. Antecedentes de la invención 1.1. Campo técnico
La presente invención se refiere a una proteína quimérica que contiene una secuencia de tipo chaperona intramolecular (IMC) unida a una proteína diana. En particular, la invención se refiere a una proteína quimérica que contiene una secuencia de tipo IMC unida a un precursor de insulina. La presente invención también se refiere a un procedimiento para obtener una proteína quimérica que contiene precursor de insulina correctamente plegado, que comprende, entre otros, poner en contacto una proteína quimérica incorrectamente plegada que contiene una secuencia de tipo IMC unida a un precursor de insulina con al menos un agente caotrópico auxiliar. La presente invención se refiere adicionalmente a un ensayo para investigar una secuencia de aminoácidos respecto a su capacidad para mejorar el plegado de un precursor de insulina usando una proteína quimérica que contiene una secuencia de tipo IMC unida a un precursor de insulina.
1.2. Técnica antecedente 1.2.1. Chaperonas intramoleculares y plegado de proteína
Las chaperonas moleculares se definen como una clase de proteínas que ayudan a corregir el plegado de otros polipéptidos pero que no son componentes de la estructura ensamblada funcional (Shinde and Inouye, TIBS, 1993, 18:442-446). Las chaperonas intramoleculares (IMC) son parte de los precursores de las proteínas diana que se han de plegar y en su ausencia las moléculas de proteína diana no tienen suficiente información para autoplegado apropiado (Inouye, Enzyme, 1991, 45:314-321). Características únicas de las IMC incluyen: a) la IMC y la proteína diana se unen mediante un enlace peptidilo formando un polipéptido sencillo; b) se requiere absolutamente la IMC para la formación de conformación activa de la proteína diana, pero no se requiere para la función de la proteína diana; c) tras la terminación del plegado de la proteína, la IMC se retira bien por autoprocesado o bien por otra endopeptidasa; d) la IMC no funciona como catalizador, es decir, una molécula de IMC es capaz de volver a plegar solamente una molécula de la proteína diana; y e) la IMC es un polipéptido altamente específico "hecho a medida" que trabaja solamente para las proteínas diana (Inouye, Enzyme, 1991, 45:314-321).
Recientemente, se ha puesto de manifiesto que una IMC o un propéptido pueden ayudar a que la proteína diana se pliegue intermolecularmente, es decir, la IMC o propéptido no se une a la proteína diana por la vía de un enlace peptidilo, sino que más bien se añade a la reacción de plegado como un péptido separado (patente de EE.UU. Nº 5.719.021). Sin embargo, se ha de destacar que el propéptido usado en la patente de EE.UU. Nº 5.719.021 es el propéptido natural de la proteína diana o un propéptido de un polipéptido que tiene la misma función de la proteína diana y el polipéptido también tiene una secuencia de aminoácidos que es similar a la proteína diana. Además, la reacción intermolecular que se describe en la patente de EE.UU. Nº 5.719.021 tiene que llevarse a cabo en un medio acuoso iónico tamponado que favorezca la interacción hidrófoba.
Ejemplos de IMC incluyen los propéptidos de subtilisina, proteasa \alpha-lítica, carboxipeptidasa Y y ubiquitina (Shinde and Inouye, TIBS, 1993, 18:442-446). Ciertas características de una secuencia de subtilisina de IMC incluyen: a) la IMC contiene un porcentaje más alto de restos aminoácido cargados que el de la proteína diana; b) la distribución de estos restos cargados dentro de la IMC es extremadamente irregular, es decir, la mitad N-terminal contiene más restos cargados positivamente que restos cargados negativamente y la mitad C-terminal contiene más restos cargados negativamente que restos cargados positivamente; c) los restos Ser y Thr dentro de la IMC también están distribuidos irregularmente; d) la IMC tiene un contenido de restos aromáticos reactivamente alto; y e) la IMC contiene una secuencia hidrófoba de 9 restos (Inouye, Enzyme, 1991, 45:314-321). Un sesgo similar hacia restos cargados se observa también en proteasa \alpha-lítica y carboxipeptidasa Y (Inouye, Enzyme, 1991, 45:314-321).
1.2.2. Secuencia de aminoácidos de la hormona del crecimiento humano madura
La secuencia de aminoácidos de la hormona del crecimiento humano madura (hGH) se describe en Ikehara y col., Proc. Natl. Acad. Sci. EE.UU., 1984, 81:5956-5960. No hay sugerencia en la técnica de que hGH madura o alguna porción de la misma pueda funcionar como IMC o propéptido. En realidad, la hGH madura o alguna porción de la misma no se puede considerar un propéptido en absoluto porque, por definición, cualquier secuencia pre, pro, o prepro se retira de una secuencia madura.
1.2.3. Estructura de insulina humana
La insulina es un péptido bien definido con secuencia de aminoácidos y características estructurales conocidas (Watson y col., Recombinant DNA-A Short Course; Scientific American Books, W. H. Freeman Co., Nueva York, 1983, págs. 231-235; Norman and Litwack, En Hormones, Academic Press, Nueva York, 1987, págs. 264-317). Esta hormona está constituida por dos cadenas separadas de péptidos que son la cadena A (21 aminoácidos) y la cadena B (30 aminoácidos) unidas mediante puentes disulfuro según se indica en la Figura 1B. Proinsulina es el precursor biológico de insulina y es una cadena sencilla de péptido que se forma cuando las cadenas A y B se conectan mediante el péptido C (Figura 1A).
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1.2.4. Insulina humana producida mediante métodos recombinantes
La insulina humana fue la primera proteína animal hecha en bacterias en una secuencia idéntica a la del péptido pancreático humano (Watson y col., Recombinant DNA-A Short Course; Scientific American Books, W. H. Feeman Co., Nueva York, 1983, págs. 231-235). La primera expresión con éxito de insulina humana en laboratorio se anunció en 1978 y la insulina humana se aprobó como fármaco terapéutico en 1982 (Johnson, Science, 1983, 219:632-637).
1.2.4.1. Método de dos cadenas
Según este método, cada cadena de insulina se produce como proteína de fusión de \beta-galactosidasa (\beta-gal) en fermentaciones separadas usando E. Coli transformada con plásmidos que contienen una secuencia de ADN que codifica la cadena A o B de insulina humana, respectivamente. Los productos son intracelulares y aparecían en cuerpos de inclusión citoplásmicos prominentes (Williams y col., Science, 1982, 215(5):687-689). Las proteínas recombinantes producidas en E. Coli representan habitualmente 10-40% de la proteína total (Burgess, Protein Engineering; Oxender, D. L., Fox, C. F., Eds.; Alan R. Liss, Inc.; Nueva York, 1987; págs. 71-82).
Una vez retiradas de los cuerpos de inclusión, el desdoblamiento químico mediante CNBr en el resto Met entre la \beta-galactosidasa y las cadenas A o B, seguido de purificación, dio los péptidos A y B separados. Se combinan luego los péptidos y se inducen a plegarse en una relación de 2:1 de cadena A-B (formas sulfonadas-S) en presencia de cantidades limitadas de mercaptano a fin de obtener una hormona activa (Chance y col., En Peptides: Synthesis-Structure-Function, Rich D. M. Gross, E., Eds., Pierce Chemical Co., Rockford, II 1981, págs. 721-728; Frank and Chance, En Quo Vadis? Therapeutic Agents Produced by Genetic Engineering, Joyesuk y col., Eds., Sanoff Group, Toulouse-Labege, Francia, 1985, págs. 137-148). Después de 24 h, el rendimiento es aproximadamente 60% referido a la cantidad de cadena B usada (Chance y col. En Insulins, Growth Hormone and Recombinant DNA Technology, Raven Press, Nueva York, 1981, págs. 71-85; Johnson, Fluid Phase Equilib., 1986, 29:109-123). Goeddel y col., Proc. Natl. Acad. Sci. EE.UU., 1979, 76(1):106-110, obtuvieron resultados similares con 20% de la proteína celular total expresada como proteína de fusión tanto de cadena A como B. El plegado posterior de cadenas sulfonadas-S da 50-80% de plegado correcto.
El gran tamaño de la proteína de fusión de \beta-gal limita los rendimientos porque la proteína de fusión de \beta-gal (\sim1000 aminoácidos) y la cadena A o B de insulina (21 ó 30 aminoácidos, respectivamente) llegan a despegarse del ribosoma de las células (terminación prematura de la cadena durante la traducción) y por lo tanto produce péptidos de insulina incompletos (Burnett, Experimental Manipulation of Gene Expression, Inouye, Ed., Academic Press, Nueva York, 1983, págs. 259-277; Hall, Invisible Frontiers-The Race To Synthesize a Human Gene, Atlantic Monthly Press, Nueva York, 1987). Una mejora clave para esta aproximación es el uso del operón del triptófano (Trp) en lugar de operón del Iac (sistema de \beta-gal) para obtener una proteína de fusión más pequeña. El operón del Trp está constituido por una serie de cinco genes bacterianos que sintetizan secuencialmente las enzimas responsables del anabolismo de triptófano. Una de estas enzimas, Trp E, tiene solamente 190 aminoácidos en comparación con los 1000 aminoácidos de \beta-gal. El gen Trp E seguido de genes para las cadenas A o B de insulina tiene la ventaja añadida de potenciar la producción de proteína de fusión de 5-10% a 20-30% de la proteína total (Hall, Invisible Frontiers-The Race To Synthesize a Human Gene, Atlantic Monthly Press, Nueva York, 1987) dado que el promotor de Trp es un promotor fuerte en E. Coli. Esto conduce a una expresión al menos 10 veces mayor de polipéptido cuando se compara con el sistema Iac (es decir \beta-gal) (Burnett, Experimental Manipulation of Gene Expression, Inouye, Ed., Academic Press, Nueva York, 1983, págs. 259-277). El operón del Trp se activa cuando la fermentación de E. Coli se queda sin triptófano (Hall, Invisible Frontiers-The Race To Synthesize a Human Gene, Atlantic Monthly Press, Nueva York, 1987: Etienne-Decent, En Genetic Biochemistry: From Gene to Protein, Ellis Horwood Limited, Chichester, Reino Unido, 1988, págs. 125-127). Esta característica es beneficiosa durante la fermentación dado que la masa celular se puede maximizar al principio. Luego, cuando sea apropiado, se puede activar el sistema de producción de insulina de la célula permitiendo que el medio de fermentación llegue a agotarse de Trp.
Después de que se termina la fermentación, las células se recuperan y se desintegran. Se separa luego el detritus celular de los cuerpos de inclusión, y se disuelven los cuerpos de inclusión en un disolvente, si bien no se conocen específicos (Wheelwright, Protein Purification, Oxford University Press; Nueva York, 1991, pág. 217). Los cuerpos de inclusión en algunas ocasiones se disuelven en HCl de gaunidina 6 M y ditiotreitol 0,1 mM (Burgess, Protein Engineering, Oxender and Fox, Eds., Alan R. Liss, Inc., Nueva York, 1987, págs. 71-82). A continuación, la Trp-LE-Met-cadena A y la Trp-LE-Met-cadena B experimentan un desdoblamiento con CNBr para liberar las cadenas de insulina A y B. Modificaciones adicionales de las cadenas A y B incluyen sulfitolisis oxidativa, purificación y combinación para producir insulina bruta. Esta insulina bruta se somete a intercambio iónico, exclusión por tamaño, y cromatografía líquida de alta resolución en fase inversa (HPLC RP) para producir la insulina humana recombinante purificada (Frank and Chance, Munch Med. Wschr, 1983, 125 (Suppl. 1):514-520).
1.2.4.2. Método de proinsulina (intracelular)
También se puede elaborar insulina humana con microorganismos recombinantes que producen proinsulina íntegra en lugar de las cadenas A o B separadamente (Kroeff y col., J. Chomatogr, 1989, 481:45-61). Inicialmente, ARNm es copiado en ADNc, y un codón de metionina se sintetiza químicamente y se une al extremo 5' del ADNc de proinsulina. El ADNc se inserta a un gen bacteriano en un vector de plásmido que se introduce y a continuación se hace crecer en E. Coli. Se puede liberar proinsulina del fragmento (\beta-gal) de enzima bacteriana (o alternativamente de la Trp-LE/Met Proinsulina (Trp Proinsulina) destruyendo el conector de metionina). La cadena de proinsulina se somete a un proceso de plegado para formar los puentes disulfuro intramoleculares correctos, y el péptido C se puede desdoblar luego con enzimas para producir insulina humana (Frank and Chance, Munch Med. Wschr., 1983, 125(Suppl. 1):514-520). En comparación, el método de las dos cadenas anteriormente descrito es más complejo.
Dorschug y col. construyeron proteínas de fusión que codifican plásmidos recombinantes que contenían una mini-proinsulina (B-Arg-A), expresaron las proteínas de fusión en E. Coli (cuerpo de inclusión) y levadura (segregada), prepararon mini-proinsulina correctamente plegada por la vía de desdoblamiento con BrCN y sulfitolisis oxidativa, y convirtieron la mini-proinsulina correctamente plegada en insulina humana mediante tratamiento con tripsina y carboxipeptidasa B (EP 0.347.781 B1; IL 9.562.511 B y AU 611.303 B2).
Tottrup and Carlsen, Biotechnol. Bioeng, 1990, 35:339-348 usaron el sistema de levadura en una fermentación optimizada alimentada por lotes, y se reseñó que los rendimientos de proteína de fusión de superóxido dismutasa-proinsulina humana (SOD-PI) fueron de 1500 mg/L. El material de partida para la producción de insulina humana recombinante sería SOD-PI; no se han reseñado rendimientos del producto final.
Recientemente, Castellanos-Serra y col., FEBS Letters, 1996, 378:171-176 expresaron en E. Coli una proteína de fusión de proinsulina que llevaba un péptido N-terminal de interleucina-2 modificada (restos aminoácido 1-22) unido al extremo-N de proinsulina mediante un resto lisina. Se aisló la proinsulina quimérica de los cuerpos de inclusión, se re-plegó por la vía de sulfitolisis oxidativa, y luego se convirtió en la insulina de proteínas de fusión correctamente mediante reacción prolongada con tripsina y carboxipeptidasa B. La fusión IL2-proinsulina se puede plegar correctamente sin retirar en primer lugar el fragmento IL2, eliminando así el bromuro de cianógeno y las etapas de purificación asociadas. Sin embargo, la etapa de sulfitolisis oxidativa y las etapas de purificación asociadas no se pueden evitar mediante el uso de proteína de fusión IL2-proinsulina.
1.2.4.3. Método de proinsulina (segregada)
Villa-Komaroff y col., Proc. Natl. Acad, Sci. EE.UU., 1978, 75(8):3727-3731 fueron los primeros en describir un sistema de secreción para proinsulina humana en E. Coli. Thim y col., construyeron proteínas de fusión que codificaban plásmidos recombinantes que contenían una levadura modificada que se acoplaba con una secuencia conductora de factor \alpha1 y un precursor de insulina (Thim y col., Proc. Natl. Acad. Sci. EE.UU., 1986, 83:6766-6770). La secuencia conductora sirve para dirigir la proteína de fusión hacia la red secretora de la célula de levadura y para exponer la proteína de fusión al sistema de enzimas que procesa Lys-Arg. También ocurría un procesado parcial en una o ambas secuencias dibásicas entre cadenas B y A dentro de la proinsulina y otros precursores de insulina que contienen un péptido separador corto (que contiene 6 ó más restos aminoácido) en lugar del péptido C. En contraposición, no se observó procesado en ausencia de péptido separador en la molécula de precursor de insulina, por ejemplo B-Arg-Arg-A (donde A y B son la cadena A y B de proinsulina humana, respectivamente). Este tipo de precursores de insulina de cadena sencilla se podría convertir enzimáticamente en insulina mediante tratamiento con tripsina y carboxipeptidasa B. Diers y col., Drug Biotechnology Regulations (Scientific Basis and Practices), Chiu and Gueriguian, Eds., Marcel Dekker, Inc., Nueva York, 1991, págs. 167-177, describen el péptido no plegado como un conductor o prosegmento, a continuación una secuencia Lys-Arg, la cadena B (aminoácidos 1-29), un puente péptido corto, seguido de la cadena A (aminoácidos 1-21). En este precursor, el aminoácido 29 de la cadena B de insulina se conecta al aminoácido 1 de la cadena A mediante un péptido corto de conexión que contiene un aminoácido básico adyacente a la cadena A. Se produce insulina humana por medio de transpeptidación seguida de hidrólisis del enlace éster formado. Siguen varias etapas de cromatografía para purificación adicional.
1.2.5. Plegado de precursores de insulina
La insulina humana es una proteína que posee dos cadenas de aminoácidos de 51 restos aminoácido en total. Seis restos cisteína están presentes en las dos cadenas de aminoácidos, estando en cada caso dos restos cisteína unidos entre sí por la vía de un enlace disulfuro. Estadísticamente, hay 15 posibilidades de formar puentes disulfuro dentro de una molécula de insulina humana. Sin embargo, solamente una de las 15 posibilidades existe en la insulina humana biológicamente activa con los siguientes puentes disulfuro: 1)A6-A11; 2)A7-B7; y 3)A20-B19.
La formación de los puentes disulfuro que están presentes en la insulina humana se efectúa por la ruta de un producto intermedio, estando los grupos cisteína de la insulina humana provistos de un grupo protector de azufre, por ejemplo, de un grupo sulfonato-S (-S-SO_{3}^{-}) (EP 0.037.255). Además, se ha usado proinsulina de cerdo en la que están presentes los restos cisteína como restos tío (-SH) para obtener proinsulina que posee puentes de cisteína unida correctamente (Biochemistry, 1968, 60:622-629). Obermeier y col. describieron un proceso para obtener proinsulina que posee puentes de cisteína unida correctamente de la correspondiente cadena de aminoácidos de proinsulina en una concentración de 0,05 a 0,3 g por litro en presencia de mercaptano, agentes caotrópicos auxiliares y resinas hidrófobas absorbentes (patente de EE.UU. Nº 5.473.049). La etapa de sulfitolisis oxidativa se elimina en el proceso descrito en la patente de EE.UU. Nº 5.473.049. Sin embargo, la proteína de insulina solamente se puede plegar a una concentración baja, que disminuye grandemente el valor comercial de este proceso. Además, el uso de gran cantidad de mercaptano y resinas hidrófobas absorbentes aumenta la complejidad del proceso y los costes de purificación corriente abajo. A partir de la descripción de la patente de EE.UU. Nº 5.473.049, no está claro si el beneficio de eliminar la etapa de sulfitolisis oxidativa contrapesará los mayores costes de purificación corriente abajo.
La solicitud internacional PCT WO9620724 trata de la generación de insulina humana. La solicitud internacional PCT WO9718233 trata de la producción de proteína o polipéptido biológicamente activo correctamente plegado.
2. Resumen de la invención
La presente invención se refiere a una proteína quimérica que comprende, desde el extremo-N al extremo-C:
a)
un primer fragmento peptidilo constituido por una secuencia de aminoácidos que tiene al menos 60% de identidad con un dominio de la hormona del crecimiento humano que contiene al menos los primeros 20 aminoácidos N-terminales de SEQ ID NO:2 en los que el porcentaje de identidad se determina sobre una secuencia de aminoácidos SEQ ID NO:2 de la misma longitud que el primer fragmento peptidilo;
b)
un resto Arg, o un resto Lys, o un segundo fragmento peptidilo constituido al menos por 2 aminoácidos en cuyo fragmento peptidilo el resto ácido más C-terminal es un resto Arg o Lys; y
c)
un tercer fragmento peptidilo constituido por un fragmento peptidilo precursor de insulina humana que comprende la cadena A y la cadena B de insulina humana, y en el que la cadena A y la cadena B están separadas mediante un resto peptidilo removible de una longitud entre 2 y 34 restos;
y en la que el primer fragmento peptidilo es capaz de aumentar el rendimiento de la conformación bioactiva del precursor de insulina formado poniendo en contacto la proteína recombinante con un agente caotrópico auxiliar en comparación con el rendimiento de la conformación bioactiva del precursor de insulina formado poniendo en contacto la misma proteína recombinante que carece del primer fragmento peptidilo con el agente caotrópico.
La invención también se refiere a un proceso para obtener una proteína quimérica que contiene un primer precursor de insulina correctamente plegado según la reivindicación 15.
La presente invención también se refiere adicionalmente a un ensayo para obtener la proteína quimérica de la reivindicación 1, que comprende: (a) cambiar la secuencia de aminoácidos del primer fragmento peptidilo de una proteína quimérica de la reivindicación 1, obtener dicha proteína quimérica con dichos cambios, poner en contacto dicha proteína quimérica con dichos cambios con al menos un agente caotrópico auxiliar en un medio acuoso bajo condiciones y durante un tiempo suficiente tales que dicha proteína quimérica se pliegue correctamente, y medir el rendimiento de plegado de dicha proteína quimérica con dichos cambios; (b) obtener la misma proteína quimérica que se usa en la etapa (a), pero sin los cambios de secuencia de aminoácidos que se describen en la etapa (a), poner en contacto la proteína quimérica sin los cambios de secuencia de aminoácidos que se describen en la etapa (a) con al menos un agente caotrópico auxiliar en un medio acuoso bajo las mismas condiciones y durante el mismo tiempo que se usa en la etapa (a), y medir el rendimiento de plegado de la proteína quimérica; y (c) comparar el rendimiento de plegado de las proteínas quiméricas medido en las etapas (a) y (b), respectivamente, en las que el rendimiento medido en la etapa (a) que es sustancialmente igual o mayor que el rendimiento medido en la etapa (b) indica que la secuencia de aminoácidos mejora el plegado del precursor de insulina.
El alcance de la presente invención se define por las reivindicaciones. Cualquier materia discutida en este documento que no caiga dentro de las reivindicaciones se describe solamente para fines informativos.
3. Breve descripción de los dibujos
Figuras 1A y 1B. Estructura de proinsulina e insulina madura con puentes disulfuro correctamente formados. 1A representa la estructura de proinsulina. 1B representa la estructura de insulina madura con puentes disulfuro correctamente formados.
Figura 2. Mapa del vector de expresión (pZRhi-1) de hGH-mini-proinsulina (SEC ID NO: 6).
4. Descripción detallada de la invención
Los procesos recombinantes hacen posible producir, en microorganismos, proinsulina humana, o proinsulina con una secuencia de aminoácidos y/o longitud de cadena de aminoácidos que diverge de la de insulina natural. Un problema importante en la producción de proinsulina humana o sus derivados en microorganismos tales como E. Coli es la degradación intracelular (Ladisch and Kohlmann, Biotechnol. Prog., 1992, 2:469-478). Además, la proinsulina humana o sus derivados producidos de modo recombinante en microorganismos no poseen puentes de cisteína unida correctamente (patente de EE.UU. Nº 5.473.049).
Antes de la presente invención, un proceso conocido para obtener insulina humana recombinante estaba basado en los siguientes procedimientos: 1) fermentación de los microorganismos transformados con un vector que expresa una proteína de fusión que contiene proinsulina humana o sus derivados; 2) desintegración celular; 3) aislamiento de la proteína de fusión; 4) desdoblamiento de la proteína de fusión con bromuro de cianógeno; 5) aislamiento del producto de desdoblamiento que tiene la secuencia de proinsulina; 6) sulfitolisis oxidativa; 7) formación de los puentes de cisteína unida correctamente; 8) desalación de la proinsulina; 9) purificación cromatográfica de la proinsulina que posee los puentes de cisteína unida correctamente; 9) concentración de la solución de proinsulina; 10) purificación cromatográfica de la solución concentrada de proinsulina; 11) desdoblamiento enzimático de la proinsulina a fin de obtener insulina humana; y 12) purificación cromatográfica de la insulina humana resultante (EP 0.055.945). Son desventajas de este proceso las numerosas etapas de procedimiento y las pérdidas en las etapas de purificación, que conducen a un rendimiento bajo de insulina. De las etapas de desdoblamiento de la proteína de fusión aislada por vía de bromuro de cianógeno, sulfitolisis y purificación de la proinsulina, se ha de esperar una pérdida de proinsulina hasta el 40% (EP 0.055.945). Por otra parte, el rendimiento de producción de modo recombinante de insulina, o sus derivados, se puede aumentar significativamente si el número de las etapas necesarias en el procedimiento se reduce significativamente.
Un objetivo de la presente invención era desarrollar un proceso recombinante para obtener insulina humana con puentes de cisteína unida correctamente con pocas etapas necesarias de procedimiento, y por lo tanto rendimiento resultante más alto de insulina humana. Otro objetivo de la presente invención era desarrollar una proteína quimérica que contiene un precursor de insulina que se puede usar en el proceso anterior. Todavía otro objetivo de la presente invención era desarrollar un ensayo para investigar una secuencia de aminoácidos, que cuando se unan a un precursor de insulina por la vía de enlace peptidilo, mejorarán el plegado del precursor de insulina.
Los solicitantes han estudiado las secuencias de péptidos que no sólo protegerían las secuencias de insulina de la degradación intracelular por el organismo hospedador, sino que también, en comparación con el sistema de expresión de insulina humana entonces existente, poseen las siguientes ventajas: cuando se une a un precursor de insulina por la vía de un enlace peptidilo, 1) promueve el plegado del precursor de insulina fusionado; 2) facilita la solubilidad de la proteína de fusión y disminuye las interacciones intermoleculares entre las proteínas de fusión, permitiendo así el plegado del precursor de insulina fusionado a una concentración alta comercialmente significativa; 3) elimina las etapas de procedimiento de desdoblamiento con bromuro de cianógeno, sulfitolisis oxidativa y las etapas de purificación relacionadas; y 4) elimina el uso de concentración alta de mercaptano o el uso de resinas hidrófobas absorbentes.
Los solicitantes han descubierto, sorprendentemente, que uniendo una secuencia de tipo IMC a un precursor de insulina por la vía de uno o más residuos de aminoácidos que se pueden desdoblar se logran los objetivos de la presente invención. La secuencia de tipo IMC tiene ciertas características de una secuencia de IMC tales como ayudar al plegado de la proteína diana, contener un porcentaje más alto de restos aminoácido cargados que su proteína diana, tener distribución polarizada de los restos aminoácido cargados y tener una secuencia que parece que está "hecha a medida" para la proteína diana. Sin embargo, la secuencia de tipo IMC que se usa en la presente invención es diferente de una secuencia de IMC en varios aspectos clave. En primer lugar, la secuencia de tipo IMC es heterogénea para la proteína diana, es decir no es un propéptido de la proteína diana. Por ejemplo, si un precursor de insulina es una proteína diana que se ha de plegar, una secuencia de tipo IMC no es el precursor de insulina ni una porción de la misma. Además, el tamaño de la secuencia de tipo IMC es de aproximadamente 20 a aproximadamente 200 restos aminoácidos.
Adicionalmente, contrariamente a las enseñanzas en la técnica anterior (Castellanos-Serra y col., FEBS Letters, 1996, 378:171-176), los solicitantes han descubierto, sorprendentemente, que incluir, dentro de la secuencia de tipo IMC, uno o más restos de aminoácidos que se pueden desdoblar que son idénticos a uno o más restos aminoácido que se pueden desdoblar que separan la secuencia de tipo IMC y un precursor de insulina permite la retirada fragmentada de la secuencia de tipo IMC después del plegado, simplificando, por lo tanto, las etapas de purificación corriente abajo.
Para la claridad de la descripción, y no a manera de limitación, la descripción detallada de la invención se divide en las subsecciones que siguen.
4.1. Ácidos nucleicos que codifican la proteína quimérica descrita en la sección 4.2
La presente invención proporciona un ácido nucleico aislado que comprende una secuencia de nucleótido que codifica la proteína quimérica descrita en la sección 4.2.
En una realización específica, la presente invención proporciona un ácido nucleico aislado que comprende una secuencia de nucleótido que codifica la proteína quimérica que tiene la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6.
En otra realización específica, la presente invención proporciona un ácido nucleico aislado que comprende una secuencia de nucleótido que codifica la proteína quimérica que tiene la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 7.
En una realización preferida, la presente invención proporciona una molécula de ADN aislado que comprende una secuencia de nucleótido que codifica la proteína quimérica descrita en la Sección 4.2.
Adicionalmente se proporciona un ácido nucleico aislado que comprende una secuencia de nucleótido complementaria a la secuencia de nucleótido que codifica la proteína quimérica descrita en la Sección 4.2.
Adicionalmente se proporciona un ácido nucleico aislado hibridable a la secuencia de nucleótido los fragmentos peptidilo primero, segundo y tercero del ADN que codifica la proteína quimérica descrita en la Sección 4.2.
El ácido nucleico que comprende una secuencia de nucleótido que codifica la proteína quimérica descrita en la Sección 4.2., se puede obtener mediante cualquier método conocido en la técnica. El ácido nucleico se puede sintetizar por entero químicamente. Alternativamente, el ácido nucleico que codifica cada fragmento de la proteína quimérica, es decir, el fragmento peptidilo primero, segundo o tercero, se puede obtener mediante clonación molecular o se puede purificar de las células deseadas. El ácido nucleico que codifica cada fragmento de la proteína quimérica se puede unir entonces químicamente o enzimáticamente conjuntamente para formar el ácido nucleico que comprende una secuencia de nucleótido que codifica la proteína quimérica descrita en la Sección 4.2.
Cualquier célula humana puede servir potencialmente como fuente de ácido nucleico para el aislamiento de ácidos nucleicos de hGH. Cualquier célula de mamífero puede servir potencialmente como fuente de ácido nucleico para el aislamiento de ácidos nucleicos de insulina. Las secuencias de ácido nucleico que codifican insulina se pueden aislar de organismo mamífero, humano, porcino, bovino, felino, aviar, canino, así como de fuentes adicionales de roedor o primate, etc.
El ADN se puede obtener mediante procedimientos estándar conocidos en la técnica a partir de ADN clonado (por ejemplo, una "biblioteca" de ADN), mediante síntesis química, mediante clonación de ADNc, o mediante clonación de ADN genómico, o fragmentos del mismo, purificados a partir de las células deseadas. (Véase, por ejemplo, Sambrook y col., 1989, Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2d Ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, Nueva York; Glover, D. M. (ed.), 1985, DNA Cloning: A Practical Approach, MRL Press, Ltd., Oxford, Reino Unido, Vol I, II). Los clones derivados de ADN genómico pueden contener regiones de ADN reguladoras e intrones además de las regiones de codificación, los clones derivados de ADNc contendrán solamente secuencias de exones. Cualquiera que sea la fuente, el gen se debería clonar molecularmente en un vector adecuado para propagación del gen.
En la clonación molecular del gen a partir de ADNc, se genera ADNc a partir de ARN o ARNm totalmente celular mediante métodos que son bien conocidos en la técnica. El gen también se puede obtener a partir de ADN genómico, donde se generan fragmentos de ADN (por ejemplo usando enzimas de restricción o mediante cizalladura mecánica), algunos de los cuales codificarán el gen deseado. Los fragmentos lineales de ADN se pueden separar luego según el tamaño mediante técnicas estándar, que incluyen, pero no se limitan, electroforesis de gel de agarosa y poliacrilamida y cromatografía de columna.
Una vez que se ha obtenido un ácido nucleico que comprende una secuencia de nucleótido que codifica la proteína quimérica descrita en la Sección 4.2., su identidad puede ser confirmada mediante secuenciación de ácido nucleico (mediante cualquier método bien conocido en la técnica) y comparación con las secuencias conocidas. Se puede llevar a cabo análisis de secuencia de ADN mediante cualesquiera técnicas conocidas en el sector, que incluyen, pero no se limitan, el método de Maxam y Gilbert (Maxam and Gilbert, 1980, Meth. Enzymol., 65:499-560), el método de didesoxi de Sanger (Sanger y col., 1977, Proc. Natl. Acad. Sci. EE.UU., 74:5463), el uso de T7 ADN polimerasa (Tabor and Richardson, patente de EE.UU. Nº 4.795.699), uso de un secuenciador automático de ADN (por ejemplo, Applied Biosystems, Foster City, CA) o el método descrito en la publicación PCT WO 97/15690.
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4.2. Proteína quimérica
La presente invención proporciona una proteína quimérica que comprende, desde el extremo-N al extremo-C:
a)
un primer fragmento peptidilo constituido por una secuencia de aminoácidos que tiene al menos 60% de identidad con un dominio de la hormona del crecimiento humano que contiene al menos los primeros 20 aminoácidos N-terminales de SEQ ID NO: 2 en los que el porcentaje de identidad se determina sobre una secuencia de aminoácidos SEQ ID NO: 2 de la misma longitud que el primer fragmento peptidilo;
b)
un resto Arg, o un resto Lys, o un segundo fragmento peptidilo constituido al menos por 2 aminoácidos en cuyo fragmento peptidilo el resto aminoácido más C-terminal es un resto Arg o Lys; y
c)
un tercer fragmento peptidilo constituido por un fragmento peptidilo precursor de insulina humana que comprende la cadena A y la cadena B de insulina humana, y en el que la cadena A y la cadena B están separadas mediante un resto peptidilo removible de una longitud entre 2 y 34 restos;
y en la que el primer fragmento peptidilo es capaz de aumentar el rendimiento de la conformación bioactiva del precursor de insulina formado poniendo en contacto la proteína recombinante con un agente caotrópico auxiliar en comparación con el rendimiento de la conformación bioactiva del precursor de insulina formado poniendo en contacto la misma proteína recombinante que carece del primer fragmento peptidilo con el agente caotrópico.
En otra realización preferida, la presente invención proporciona la proteína quimérica anteriormente descrita, en la que el primer fragmento peptidilo es capaz de unirse a un anticuerpo anti-hGH.
En una realización más preferida, la presente invención proporciona la proteína quimérica anteriormente descrita, en la que el primer fragmento peptidilo está constituido por la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 1.
En otra realización más preferida, la presente invención proporciona la proteína quimérica anteriormente descrita, en la que el primer fragmento peptidilo está constituido por la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2.
En una realización preferida, la presente invención proporciona la proteína quimérica anteriormente descrita, en la que el segundo fragmento peptidilo está constituido por la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 3.
En otra realización más preferida, la presente invención proporciona la proteína quimérica anteriormente descrita, en la que el precursor de insulina humana está constituido por la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 4.
En aún otra realización más preferida, la presente invención proporciona la proteína quimérica anteriormente descrita, en la que el precursor de insulina humana está constituido por la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5.
En la realización más preferida, la presente invención proporciona una proteína quimérica que está constituida por la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6.
En la otra realización más preferida, la presente invención proporciona la proteína quimérica que está constituida por la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 7.
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4.3. Obtención de la proteína quimérica descrita en la sección 4.2
Se pueden obtener proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2., y derivados, análogos y fragmentos de las mismas mediante cualquier método conocido en la técnica, que incluye pero no se limita, métodos de expresión recombinante, purificación a partir de fuentes naturales, y síntesis química.
Por ejemplo, se pueden obtener las proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2., mediante técnicas de expresión de proteína recombinante. Para expresión recombinante, el gen o porción del mismo que codifica las proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2., se inserta en un vector de clonación apropiado para expresión en una célula hospedadora particular. Se puede usar un gran número de sistemas de vector-hospedador conocidos en la técnica. Posibles vectores incluyen, pero no se limitan, plásmidos o virus modificados, pero el sistema de vector tiene que ser compatible con la célula hospedadora usada. Vectores de este tipo incluyen, pero no se limitan, bacteriófagos tales como derivados lambda, o plásmidos tales como pBR322 ó derivados de plásmidos pUC o el vector Bluescript (Stratagene). La inserción en un vector de clonación se puede lograr, por ejemplo, uniendo el fragmento de ADN a un vector de clonación que tiene términos cohesivos complementarios. Sin embargo, si los sitios de restricción complementarios usados para fragmentar el ADN no están presentes en el vector de clonación, los extremos de las moléculas de ADN pueden ser modificados enzimáticamente. Alternativamente, se puede producir cualquier sitio que se desee uniendo secuencias de nucleótido (conectores) a los extremos de ADN, estos conectores unidos pueden comprender oligonucleótidos específicos sintetizados químicamente que codifican secuencias de restricción de reconocimiento de endonucleasa. Se pueden introducir moléculas recombinantes en las células hospedadoras por vía de transformación, transfección, infección, electroporación, etc., de manera que se generan muchas copias de secuencia del gen.
En un método alternativo, se puede identificar y aislar el gen deseado después de inserción en un vector de clonación adecuado en una aproximación de "pistola de inyección". Antes de la inserción en el vector de clonación se puede hacer un enriquecimiento del gen deseado, por ejemplo, mediante fraccionamiento por tamaño.
En realizaciones específicas, la transformación de células hospedadoras con moléculas de ADN recombinante que incorporan el gen aislado que codifica proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2., ADNc, o secuencia de ADN sintetizada, facilita la generación de copias múltiples del gen. Así, el gen se puede obtener en grandes cantidades haciendo crecer transformantes, aislando las moléculas de ADN recombinante de los transformantes y, cuando es necesario, rescatando el gen insertado del ADN recombinante aislado.
La secuencia de nucleótido que codifica las proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2., se puede insertar en un vector de expresión apropiado, es decir, un vector que contiene los elementos necesarios para la transcripción y traducción de la secuencia insertada que codifica la proteína. Se puede utilizar una diversidad de sistemas hospedador-vector para expresar la secuencia que codifica proteína. Estos incluyen, pero no se limitan, sistemas de células de mamíferos infectadas con virus (por ejemplo, virus de la vaccinia, adenovirus, etc.), sistemas de células de insectos infectadas con virus (por ejemplo, baculovirus), microorganismos tales como levadura que contiene vectores de levaduras, o bacterias transformadas con ADN bacteriófago, ADN plásmido, o ADN cósmido. Los elementos de expresión de vectores varían en sus potencias y especificidades. Dependiendo del sistema hospedador-vector utilizado, se puede utilizar uno cualquiera de un conjunto de elementos de transcripción y traducción adecuados.
Cualquiera de los métodos previamente descritos para la inserción de fragmentos de ADN en un vector se puede usar para construir vectores de expresión que contienen un gen quimérico constituido por señales de control de transcripción/traducción apropiadas y las secuencias que codifican proteínas. Estos métodos pueden incluir ADN recombinante y técnicas sintéticas in vitro y recombinantes in vivo (recombinación genética). La expresión de la secuencia de ácido nucleico que codifica proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2., puede ser regulada mediante una segunda secuencia de ácido nucleico de tal manera que las proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2., se expresen en un hospedador transformado con la molécula de ADN recombinante. Por ejemplo, la expresión de las proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2., puede ser controlada mediante cualquier elemento promotor/potenciador conocido en la técnica. Promotores que se pueden usar para controlar la expresión de las proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2., incluyen, pero no se limitan, la región promotora temprana de SV40 (Bernoist and Chambon, 1981, Nature 290:304-310), el promotor contenido en la repetición del terminal largo 3' del virus de sarcoma de Rous (Yamamoto y col., 1980, Cell 22:787-797), el promotor de herpes timidina quinasa (Wagner y col., 1981, Proc. Natl. Acad. Sci. EE.UU., 78:1441-1445), las secuencias reguladoras del gen de la metalotioneína (Brinster y col., 1982, Nature 296:29-42); vectores de expresión procarióticos tales como el promotor de \beta-lactamasa (Villa-Kamaroff y col., 1978, Proc. Natl. Acad. Sci. EE.UU., 75:3727-3731), el promotor fac (DeBoer y col., 1983, Proc. Natl. Acad. Sci. EE.UU., 80:21-25), o promotor Trp E (Hall, Invisible Frontiers-The Race to Synthesize a Human Gene, Atlantic Monthly Press, Nueva York, 1987), véase también "Useful proteins from recombinant bacteria" en Scientific American, 1980, 242:74-94; elementos promotores de levaduras u otros hongos tales como promotor Gal 4, el promotor de ADC (alcohol deshidrogenasa), promotor de PGK (fosfoglicerol quinasa), promotor de fosfatasa alcalina, y las siguientes regiones de control de transcripción animal, que exhiben especificidad de tejido y han sido utilizadas en animales transgénicos: región de control de gen elastasa 1 que es activa en células acinares pancreáticas (Swift y col., 1984, Cell 38:639-646; Ornitz y col., 1986, Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 50:399-409; MacDonald, 1987, Hepatology 7:425-515); región de control del gen de insulina que es activa en células pancreáticas beta (Hanahan, 1985, Nature 315:115-122), región de control de gen de inmunoglobulina que es activa en células linfoides (Grosschedl y col., 1984, Cell 38:647-658; Adames y col., 1985, Nature 318:533-538; Alexander y col., 1987, Mol. Cell. Biol. 7:1436-1444), región de control de virus tumoral mamario de ratón que es activa en células testiculares, mamarias, linfoides y mastocitos (Leder y col., 1986, Cell 45:485-495), región de control de gen de albúmina que es activa en hígado (Pinkert y col., 1987, Genes and Devel. 1:268-276), región de control de gen de alfa-fetoproteína que es activa en hígado (Krumlauf y col., 1985, Mol. Cell. Biol, 5:1639-1648; Hammer y col., 1987, Science 235:53-58; región de control de gen de alfa 1-antitripsina que es activa en el hígado (Kelsey y col., 1987, Genes and Devel. 1:161-171), región de control de gen de beta-globina que es activa en células mieloides (Mogram y col., 1985, Nature 315:338-340; Kollias y col., 1986, Cell 46:89-94), región de control de gen de proteína básica de mielina que es activa en células oligodendrocíticas del cerebro (Readhead y col., 1987, Cell 48:703-712), región de control de gen de cadena 2 de miosina ligera que es activa en músculo esqueletal (Sani, 1985, Nature 314:283-286), y región de control de gen de hormona de liberación gonadotrópica que es activa en el hipotálamo (Mason y col., 1986, Science 324:1372-1378).
Por ejemplo, se puede usar un vector que comprende un promotor unido operativamente a un ácido nucleico que codifica las proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2, uno o más orígenes de replicación, y, opcionalmente, uno o más marcadores seleccionables (por ejemplo, un gen con resistencia a antibióticos).
Se pueden identificar vectores de expresión que contienen inserciones de genes que codifican las proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2., mediante tres aproximaciones generales: (a) hibridación de ácido nucleico, (b) presencia o ausencia de funciones de gen "marcador", y (c) expresión de secuencias insertadas. En la primera aproximación, la presencia de un gen que codifica las proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2., insertado en un vector de expresión se puede detectar mediante hibridación de ácido nucleico usando sondas que comprenden secuencias que son homólogas con un gen insertado que codifica las proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2. En la segunda aproximación, el sistema recombinante vector/hospedador se puede identificar y seleccionar sobre la base de la presencia o ausencia de ciertas funciones de gen "marcador" (por ejemplo, actividad de timidina quinasa, resistencia a antibióticos, fenotipo de transformación, formación de cuerpo de oclusión en baculovirus, etc.) causada por la inserción de un gen que codifica las proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2., en el vector. Por ejemplo, si el gen que codifica las proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2., se inserta dentro de la secuencia de gen marcador del vector, se pueden identificar los recombinantes que contienen la inserción que codifica las proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2., mediante la ausencia de la función de gen marcador. En la tercera aproximación, se pueden identificar vectores de expresión recombinantes ensayando el producto de proteínas quiméricas expresado por el recombinante. Ensayos de este tipo pueden estar basados, por ejemplo, en las propiedades físicas o funcionales de las proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2., en sistemas de ensayo in vitro, por ejemplo, unión con anticuerpo anti-hGH, o anti-insulina.
Una vez que se identifica y se aísla una molécula de ADN recombinante particular, se pueden usar varios métodos conocidos en la técnica para propagarla. Una vez que se establecen un adecuado sistema hospedador y unas condiciones de crecimiento, se pueden propagar y preparar en cantidad vectores de expresión recombinantes. Según se ha explicado anteriormente, los vectores de expresión que se pueden usar incluyen, pero no se limitan, los siguientes vectores y sus derivados: virus humanos o animales tales como virus de la vaccinia o adenovirus, virus de insectos tales como baculovirus, vectores de levaduras, vectores bacteriófagos (por ejemplo, lambda), y vectores de ADN plásmido y cósmido, para nombrar solamente unos pocos.
Además, se puede elegir una cepa de células hospedadoras que module la expresión de las secuencias insertadas, o modifique y procese el producto génico en la manera específica deseada. La expresión de ciertos promotores se puede elevar en presencia de ciertos inductores; así, se puede controlar la expresión de la proteína quimérica descrita en la Sección 4.2., creada mediante ingeniería genética. Asimismo, diferentes células hospedadoras tienen mecanismos característicos y específicos para el procesado y modificación en traducción y post-traducción (por ejemplo glicosilación, fosforilación) de proteínas. Se pueden elegir apropiadas líneas celulares o sistemas hospedadores para asegurar la modificación y el procesado deseados de la proteína foránea expresada. Por ejemplo, se puede usar la expresión en un sistema bacteriano para producir un producto no glicosilado de proteína nuclear. La expresión en levadura producirá un producto glicosilado. La expresión en células de mamífero puede ser usada para asegurar glicosilación "nativa" de una proteína heteróloga. Asimismo, diferentes sistemas de expresión vector/hospedador pueden afectar a las reacciones del proceso en diferentes medidas.
Ambas secuencias de ADNc y genómico pueden ser clonadas y expresadas.
La proteína quimérica descrita en la Sección 4.2., también puede ser aislada y purificada mediante métodos estándar que incluyen cromatografía, (por ejemplo cromatografía de columna de intercambio iónico, de afinidad, y de tamaño), centrifugación, solubilidad diferencial, o mediante otra técnica estándar para la purificación de proteínas. Las propiedades funcionales se pueden evaluar usando cualquier ensayo adecuado.
La secuencia de ácido nucleico que codifica la proteína quimérica descrita en la Sección 4.2., puede ser mutada in vitro o in vivo, para crear y/o destruir secuencias de traducción, iniciación, y/o terminación, o para crear variaciones en regiones de codificación. Se puede usar cualquier técnica de mutagénesis conocida en el sector, que incluye, pero no se limita, mutagénesis in vitro dirigida al sitio (Hutchinson y col., 1978, J. Biol. Chem. 253:6551), uso de conectores TAB (Pharmacia), iniciadores PCR que contienen mutación, etc.
La experimentación implicada en mutagénesis está constituida principalmente por mutagénesis dirigida al sitio seguida de prueba fenotípica del producto génico alterado. Algunos de los protocolos de mutagénesis dirigida al sitio más comúnmente empleados aprovechan vectores que pueden proporcionar ADN de hebra sencilla así como de hebra doble, según se necesite. Generalmente, el protocolo de la mutagénesis con vectores de este tipo es como sigue. Se sintetiza un iniciador mutagénico, es decir, un iniciador complementario a la secuencia que se ha de cambiar, pero que está constituido por una o un pequeño número de bases alteradas, añadidas, o suprimidas. El iniciador es extendido in vitro mediante ADN polimerasa y, después de algunas manipulaciones adicionales, el ahora ADN de doble hebra se transfecta a células bacterianas. A continuación, mediante una diversidad de métodos, se identifica el ADN mutado deseado, y se purifica la proteína deseada de clones que contienen la secuencia mutada. Para secuencias más largas, a menudo se requieren etapas de clonación adicionales porque las inserciones largas (más largas que 2 kilobases) son inestables en esos vectores. Los protocolos son conocidos por los expertos en la técnica y existen kits ampliamente disponibles para mutagénesis dirigida al sitio de compañías de suministro de biotecnología, por ejemplo, de Amersham Life Science, Inc. (Arlington Heights, IL) y Stratagene Cloning Systems (La Jolla, CA).
Además, la proteína quimérica descrita en la Sección 4.2., puede ser sintetizada químicamente. (Véase, por ejemplo, Clark-Lewis y col., 1991, Biochem. 30:3128-3135 y Merrifield. 1963, J. Amer. Chem. Soc. 85:2149-2156). Por ejemplo, las proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2., o fragmentos, derivados y análogos pueden ser sintetizados mediante técnicas de fase sólida, desdoblados de la resina, y purificados mediante cromatografía líquida preparativa de alta resolución (por ejemplo, véase Creighton, 1983, Proteins, Structures and Molecular Principles, W. H. Freeman and Co., N. Y., págs. 50-60). La proteína quimérica descrita en la Sección 4.2., o fragmento, derivados y análogos, también pueden ser sintetizados mediante uso de un sintetizador de péptidos. La composición de los péptidos sintéticos puede ser confirmada mediante análisis o secuenciación de aminoácidos (por ejemplo, el procedimiento de degradación de Edman; véase Creighton, 1983, Proteins, Structures and Molecular Principles, W. H. Freeman and Co., N. Y., págs. 34-49).
Las proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2., pueden ser sintetizadas en su integridad mediante adición secuencial de restos aminoácidos o alternativamente como subcomponentes en fragmentos que pueden ser combinados usando técnicas bien conocidas en el sector, tales como, por ejemplo, condensación de fragmentos (Shin y col., 1992, Biosci. Biotech. Biochem. 56:404-408; Nyfeler y col., 1992, Peptides, Proc. 12th Amer. Pep. Soc., Smith and Rivier (eds.), Leiden, págs. 661-663; y Nokihara y col., 1990, Protein Reseach Foundation, Yanaihara (ed), Osaka, págs. 315-320).
En una realización menos preferida, las proteínas quiméricas descritas en la Sección 4.2., pueden ser obtenidas mediante proteolisis de la proteína seguida de purificación usando métodos estándar tales como los anteriormente descritos (por ejemplo purificación por inmunoafinidad).
4.4. Obtención de precursor de insulina correctamente plegado
La presente invención proporciona un proceso para obtener una proteína quimérica que contiene precursor de insulina correctamente plegado de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 10, que comprende poner en contacto una proteína quimérica que contiene precursor de insulina incorrectamente plegado de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 10 con un agente caotrópico auxiliar.
Según se usa en este documento, la expresión "precursor de insulina humana" se refiere a una molécula que 1) contiene la cadena A y la cadena B de insulina humana, o análogos, derivados o fragmentos de las mismas, 2) contiene 6 restos cisteína, 3) tiene un resto de conexión removible que se une a la cadena A y a la cadena B de insulina, y 4) es capaz de unirse a un anticuerpo anti-insulina humana. Ejemplos de precursores de insulina humana incluyen, pero no se limitan, los que se describen en Ladisch and Kohlman, Biotechnol. Prog., 1992, 8:469-478); Thim y col., Proc. Natl. Acad. Sci. EE.UU. 1986, 83:6766-6770; patente de EE.UU. Nº 5.473.049, patente de EE.UU. Nº 5.457.066, y EP 0.347.781 B1.
La expresión precursor de insulina humana o proteína quimérica que contiene precursor de insulina "correctamente plegado" se refiere a una molécula en la que el precursor de insulina humana tiene la conformación y puentes de disulfuro según se encuentran en una insulina humana natural, biológicamente activa, es decir, se forman los puentes de disulfuro entre a) A-6 y A-11, b) A-7 y B-7, c) A-20 y B-19. La expresión precursor de insulina humana o proteína quimérica que contiene precursor de insulina "incorrectamente plegado" se refiere a una molécula en la que el precursor de insulina humana carece de la conformación, puentes de disulfuro según se encuentran en una insulina humana natural, biológicamente activa, o ambas.
Agentes caotrópicos auxiliares son compuestos que rompen enlaces de hidrógeno en solución acuosa. En una realización específica, la presente invención proporciona un proceso para obtener la proteína quimérica anteriormente descrita que contiene precursor de insulina correctamente plegado, en el que el agente caotrópico auxiliar se selecciona entre el grupo constituido por hidrocloruro de guanidina, carbonato de etileno, tiocianato, dimetilsulfóxido y urea. Preferiblemente, el agente caotrópico auxiliar es urea. Más preferiblemente, la urea está presente a una concentración de aproximadamente 2,0 a aproximadamente 8,0 M. Lo más preferiblemente, la urea está presente a una concentración de aproximadamente 3,0 a aproximadamente 6,0 M.
En otra realización específica, la presente invención proporciona un proceso para obtener la proteína quimérica anteriormente descrita que contiene precursor de insulina correctamente plegado, en el que la proteína quimérica que contiene segundo precursor de insulina incorrectamente plegado se pone en contacto al menos con un agente caotrópico auxiliar en un medio acuoso a un pH de aproximadamente 8,0 a aproximadamente 10,5 y a una concentración de proteína quimérica que contiene segundo precursor de insulina incorrectamente plegado de aproximadamente 0,05 a aproximadamente 15,0 g por litro. Preferiblemente, el pH se mantiene de aproximadamente 9,0 a aproximadamente 10,0. También preferiblemente, la proteína quimérica que contiene segundo precursor de insulina incorrectamente plegado está presente de aproximadamente 0,5 a aproximadamente 5,0 g por litro. Más preferiblemente, la proteína quimérica que contiene segundo precursor de insulina incorrectamente plegado está presente de aproximadamente 2,0 a aproximadamente 3,0 g por litro.
Los mercaptanos son compuestos que son solubles en agua y contienen al menos un grupo -SH.
4.5 Investigación de una secuencia de aminoácidos que mejora el plegado de un precursor de insulina
La presente invención proporciona un ensayo para la investigación de una secuencia de aminoácidos respecto a su capacidad para mejorar el plegado de un precursor de insulina, que comprende: (a) cambiar la secuencia de aminoácidos del primer fragmento peptidilo de una proteína quimérica descrita en la Sección 4.2., obtener dicha proteína quimérica con dichos cambios, poner en contacto dicha proteína quimérica con dichos cambios al menos con un agente caotrópico auxiliar en un medio acuoso bajo condiciones y durante un tiempo suficiente tales que dicha proteína quimérica se pliegue correctamente, y medir el rendimiento de plegado de dicha proteína quimérica con dichos cambios; (b) obtener la misma proteína quimérica que se usa en la etapa (a), pero sin los cambios de secuencia de aminoácidos que se describen en la etapa (a), poner en contacto la proteína quimérica sin los cambios de secuencia de aminoácidos que se describen en la etapa (a) al menos con un agente caotrópico auxiliar en un medio acuoso bajo las mismas condiciones y durante el mismo tiempo que se usa en la etapa (a), y medir el rendimiento de plegado de la proteína quimérica; y (c) comparar el rendimiento de plegado de las proteínas quiméricas medido en las etapas (a) y (b), respectivamente, en las que el rendimiento medido en la etapa (a) que es sustancialmente igual o mayor que el rendimiento medido en la etapa (b) indica que la secuencia de aminoácidos mejora el plegado del precursor de insulina.
La secuencia de aminoácidos del primer fragmento peptidilo de la proteína quimérica descrita en la Sección 4.2., se puede cambiar mediante cualesquiera técnicas de mutagénesis conocidas en el sector, preferiblemente mediante técnicas de mutagénesis descritas en la Sección 4.3.
En una realización preferida del ensayo anterior, la proteína quimérica está constituida por la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6.
En otra realización preferida del ensayo anterior, la proteína quimérica está constituida por la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 7.
En todavía otra realización preferida del ensayo anterior, el agente caotrópico auxiliar es urea.
En aún otra realización preferida del ensayo anterior, el ensayo comprende adicionalmente poner en contacto la proteína quimérica, en etapa (a) y (b) respectivamente, con una cantidad de mercaptano, cantidad tal que produce menos de 5 radicales -SH del mercaptano por resto cisteína de la proteína quimérica. Más preferiblemente, el mercaptano es 2-mercaptoetanol.
En una realización específica, se proporciona el producto del ensayo anterior.
5. Ejemplo
Se sintetizó químicamente un fragmento de ADN que codifica hGH-mini-proinsulina que está constituido por la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6. Se clonó el fragmento de ADN en un vector de expresión bacteriano bajo el control de un promotor Trp. El vector de expresión que contiene hGH-mini-proinsulina se transformó en cepa PR1 de E. Coli y se cultivaron las células recombinantes en medio M9-CA en presencia de oligoelementos. Se recuperaron las proteínas de fusión de hGH-mini-proinsulina de los cuerpos de inclusión y se plegaron en una condición tal que, dentro de las proteínas de fusión de hGH-mini-proinsulina, se formaron puentes de disulfuro de modo que se formarían en una proinsulina humana correctamente plegada, es decir, se formaron puentes de disulfuro A6-A11, A7-B7, A20-B19. Se separaron las proteínas de fusión de hGH-mini-proinsulina plegadas de las proteínas de fusión no plegadas mediante ultrafiltración de 100K. Las proteínas de fusión de hGH-mini-proinsulina correctamente plegadas, aisladas fueron digeridas con tripsina para formar Arg(B31)-insulina humana correctamente plegada. La Arg(B31)-insulina humana se purificó mediante cromatografías de intercambio catiónico hasta una pureza de al menos 90%. La Arg(B31)-insulina humana purificada fue digerida luego con carboxipeptidasa B para formar la insulina humana correctamente plegada, que posteriormente se purificó mediante HPLC de fase inversa. La insulina humana pura así producida fue caracterizada mediante análisis de secuencia N-terminal, determinación de peso molecular y cartografía de péptidos.
5.1. Construcción de vector de expresión de hGH-mini-proinsulina
Se sintetizó químicamente un fragmento de ADN que codifica la hGH-mini-proinsulina constituido por la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6 según el procedimiento descrito en Gan y col., Gene, 1989, 79:159-166. En el fragmento de ADN sintetizado se incluyeron un sitio de 5'Cla I y un sitio de 3'Hind III. En resumen, un fragmento de 5'Cla I a 3'Kpn I, que corta la secuencia de nucleótido que codifica los restos aminoácido 51 y 52 de SEQ ID NO: 6, y un fragmento de 5'Kpn I a 3'Hind III fueron sintetizados químicamente y subclonados en un vector de pUC18, respectivamente. Posteriormente, el fragmento de ADN que codifica la secuencia íntegra de aminoácidos de SEQ ID NO: 6 fue subclonado en un vector de pATH2 modificado de tal manera que la expresión de la hGH-mini-proinsulina estaba bajo el control de un promotor de Trp y una secuencia SD. El vector resultante, pZRhi-1 (Figura 2) se usó para expresar la proteína de fusión hGH-mini-proinsulina.
5.2. Expresión de proteína de fusión de hGH-mini-proinsulina
Los vectores de expresión de proteína de fusión de hGH-mini-proinsulina se transformaron en cepas RR1 o K12 W3110 de E. Coli. Las células de E. Coli transformadas se cultivaron en medio M9-CA en presencia de oligoelementos. El nivel de expresión de proteínas de fusión de hGH-mini-proinsulina se determinó en matraz de agitación así como en fermentador. En ambos casos, se observó una expresión de alto nivel, que alcanzaba a 20-25% de las proteínas totales de E. Coli.
5.3. Re-plegado de la proteína de fusión de hGH-mini-proinsulina
Se expresaron las proteínas de fusión de hGH-mini-proinsulina como una forma insoluble denominada "cuerpos de inclusión". Para liberar los cuerpos de inclusión, las células de E. Coli se desintegraron mediante un homogeneizador de alta presión a 80.000 kPa. El detritus de células y las proteínas solubles de E. Coli se retiraron mediante centrifugación a 10.000 g. Los precipitados de cuerpos de inclusión que contenían las proteínas de fusión de hGH-mini-proinsulina se lavaron 3 veces con agua. Los precipitados de cuerpos de inclusión resultantes, en los que las proteínas de fusión de hGH-mini-proinsulina eran de aproximadamente 90% de pureza, se usaron como material de partida para plegado. El cuerpo de inclusión se disolvió en urea 8 M, pH 10,4, a una concentración de proteína de fusión de hGH-mini-proinsulina de 20-30 mg/ml en presencia de mercaptoetanol 2 a 6 mM. El material insoluble se retiró mediante centrifugación. El material sobrenadante se diluyó 10 veces mediante urea de baja concentración para alcanzar una concentración final de urea de 3 a 6 M, pH 9 a 10, y de mercaptoetanol de 0,2 a 0,6 mM. La rutina de plegado se llevó a cabo a 4ºC y una concentración de urea de 3,2 M, pH 9,3. El proceso de plegado se monitorizó mediante HPLC de fase inversa de C4 con gradiente de acetonitrilo de 30-47% en tampón de fosfato al 0,1%. En condiciones cromatográficas de este tipo, el tiempo de retención de hGH-mini-proinsulina correctamente plegada fue de alrededor de 23 min. El plegado se puede terminar en 24 hr. El rendimiento de re-plegado fue aproximadamente 70%.
La mezcla de plegado se fraccionó mediante ultrafiltración de 100K. Las proteínas de fusión de hGH-mini-proinsulina correctamente plegadas encontradas en las fracciones filtradas se concentraron mediante un sistema de ultrafiltración de 10K. Se retiró urea con agua a pH 3,5. El rendimiento de las etapas de ultrafiltración estuvo por encima de 85%.
5.4. Desdoblamiento en tríptico de hGH-mini-proinsulina re-plegada correctamente
Para el desdoblamiento en tríptico, la concentración de la proteína de fusión de hGH-mini-proinsulina correctamente plegada fue de aproximadamente 10-12 mg/ml, preferiblemente de 10 mg/ml. La relación entre tripsina y la proteína de fusión de hGH-mini-proinsulina osciló de aproximadamente 1:60 a aproximadamente 1:1250, preferiblemente era 1:100. El pH se mantuvo de aproximadamente 10 a aproximadamente 11, preferiblemente en 10,8. Se dejó que transcurriera el desdoblamiento a 4ºC de aproximadamente 1 a aproximadamente 5 hr., preferiblemente se llevó a cabo durante aproximadamente 3,5 hr. La reacción de desdoblamiento se detuvo ajustando el pH a 3,5 con tampón de fosfato. El análisis por HPLC de fase inversa indicó que el rendimiento para esta etapa de desdoblamiento fue más de 95%. A pH por encima de 10, la tripsina actúa sobre los siguientes restos Arg: el resto Arg entre cadenas B y A de mini-proinsulina humana, el resto Arg entre el fragmento de hGH y el fragmento de mini-proinsulina, los restos Arg dentro del fragmento de hGH. La digestión con tripsina produjo varias piezas pequeñas del fragmento de hGH, y una insulina humana con un Arg extra en el extremo-C de la cadena B, que se denomina Arg(B31)-insulina humana. El resto Arg(B22) de insulina humana no se desdobló bajo las condiciones anteriores, debido presumiblemente al impedimento por la estructura en tres dimensiones.
La Arg(B31)-insulina humana se purificó mediante cromatografías de intercambio iónico usando NaCl como eluyente en presencia de tampón de citrato 10 mM. La Arg(B31)-insulina humana purificada fue de más de 90% de pureza.
5.5. Conversión de Arg(b31)-insulina humana a insulina humana
Se retiró la Arg(B31) en el extremo-C de Arg(B31)-insulina humana mediante carboxipeptidasa B. La concentración de Arg(B31)-insulina humana correctamente plegada fue de aproximadamente 10 mg/ml. La relación entre carboxipeptidasa B y la Arg(B31)-insulina humana se mantuvo aproximadamente en 1:1000. Se dejó que transcurriera el desdoblamiento a 37ºC durante aproximadamente 1 hr en tampón de Tris-HCl 50 mM, pH 8,0. La reacción de desdoblamiento se detuvo ajustando el pH a 3,5 con tampón de fosfato. El rendimiento de insulina humana fue más de 99%.
5.6. Purificación de insulina humana
Se cargó insulina humana producida a partir de la digestión con carboxipeptidasa B a una columna HPLC de fase inversa de C8 que había sido estabilizada con tampón de fosfato al 0,1%, pH 3,0. Se eluyó la insulina humana con un gradiente de acetonitrilo de 17% a 35% en tampón de fosfato al 0,1%, pH 3,0. Se reunieron las fracciones de insulina y se añadió ácido acético para alcanzar una concentración de 0,125 a 0,2 M, pH 6,0. La insulina así producida se cristalizó a 4ºC. La pureza de la insulina humana estuvo por encima de 99%.
5.7. Caracterización de la insulina humana purificada
Se determinaron los 15 primeros aminoácidos N-terminales de la insulina humana purificada y de la insulina humana estándar de la OMS mediante degradación estándar de Edman. Las secuencias N-terminales de ambas cadenas A y B de la insulina humana purificada son idénticas a las de la insulina humana estándar de la OMS.
Se determinó el peso molecular de la insulina humana purificada y el de la insulina humana estándar de la OMS mediante análisis de espectrometría de masas de Plataforma VG. Ambas muestras dieron un M/Z de 5807,7.
Tanto la insulina humana purificada como la insulina humana estándar de la OMS fueron digeridas con proteasa V8. Los fragmentos de la digestión fueron analizados mediante HPLC de fase inversa de C18. Ambas muestras dieron idénticos patrones de cartografía de péptidos (Véase Thim y col., Genetics and Molecular Biology of Industrial Microorganisms, Hershberger y col., Ed. American Society for Microbiology, 1989, págs. 322-328).
La presente invención no se limita en alcance por el microorganismo depositado o las realizaciones específicas que se describen en este documento. Antes bien, diversas modificaciones de la invención además de las que se describen en este documento serán evidentes para los expertos en la técnica a partir de la descripción anterior y de las figuras que se acompañan. Se tiene la intención de que las modificaciones de este tipo caigan dentro del alcance de las reivindicaciones que se anexan.
(1) INFORMACIÓN GENERAL
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
SOLICITANTE: Gan, Z. R.
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Proteína quimérica que contiene una secuencia de tipo chaperona intramolecular y su aplicación para la producción de insulina
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
NÚMERO DE SECUENCIAS: 7
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESTINATARIO:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE:
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD:
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
ESTADO:
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS:
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
FORMA LEGIBLE EN ORDENADOR
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
CLASE DE MEDIO: disquette de 3,5 pulgadas
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
ORDENADOR: PC IBM
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
SISTEMA OPERATIVO: DOS
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
PROGRAMA: WordPerfect 5.1
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
DATOS DE LA PRESENTE SOLICITUD
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD: Pendiente de asignación
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN: Presentación simultáneamente con este documento
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
DATOS DE LA SOLICITUD ANTERIOR
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
INFORMACIÓN DEL PROCURADOR/AGENTE
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
NÚMERO DE REGISTRO:
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
REFERENCIA/NÚMERO EXPEDIENTE:
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIÓN
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TELÉFONO:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FAX:
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TÉLEX:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ. ID NO: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 49 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID NO: 1:
1
\vskip1.000000\baselineskip
(3) INFORMACIÓN PARA SEQ. ID NO: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 92 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID NO: 2:
2
\vskip1.000000\baselineskip
(4) INFORMACIÓN PARA SEQ. ID NO: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID NO: 3:
3
\vskip1.000000\baselineskip
(5) INFORMACIÓN PARA SEQ. ID NO: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 86 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID NO: 4:
4
\vskip1.000000\baselineskip
(6) INFORMACIÓN PARA SEQ. ID NO: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 52 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID NO: 5:
5
\vskip1.000000\baselineskip
(7) INFORMACIÓN PARA SEQ. ID NO: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 107 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID NO: 6:
6
\vskip1.000000\baselineskip
(8) INFORMACIÓN PARA SEQ. ID NO: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 150 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID NO: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
7

Claims (17)

1. Una proteína quimérica que comprende, desde el extremo-N al extremo-C:
a)
un primer fragmento peptidilo constituido por una secuencia de aminoácidos que tiene al menos 60% de identidad con un dominio de la hormona del crecimiento humano que contiene al menos los primeros 20 aminoácidos N-terminales de SEQ ID NO:2 en los que el porcentaje de identidad se determina sobre una secuencia de aminoácidos SEQ ID NO:2 de la misma longitud que el primer fragmento peptidilo;
b)
un resto Arg, o un resto Lys, o un segundo fragmento peptidilo constituido al menos por 2 aminoácidos en cuyo fragmento peptidilo el resto ácido más C-terminal es un resto Arg o Lys; y
c)
un tercer fragmento peptidilo constituido por un fragmento peptidilo precursor de insulina humana que comprende la cadena A y la cadena B de insulina humana, y en el que la cadena A y la cadena B están separadas mediante un resto peptidilo removible de una longitud entre 2 y 34 restos;
y en la que el primer fragmento peptidilo es capaz de aumentar el rendimiento de la conformación bioactiva del precursor de insulina formado poniendo en contacto la proteína recombinante con un agente caotrópico auxiliar en comparación con el rendimiento de la conformación bioactiva del precursor de insulina formado poniendo en contacto la misma proteína recombinante que carece del primer fragmento peptidilo con el agente caotrópico.
2. La proteína quimérica de la reivindicación 1, en la que el primer fragmento peptidilo es capaz de unirse a un anticuerpo anti-hGH.
3. La proteína quimérica de la reivindicación 1, en la que el primer fragmento peptidilo está constituido por la secuencia de aminoácidos de SEQ. ID NO: 1.
4. La proteína quimérica de la reivindicación 1, en la que el primer fragmento peptidilo está constituido por la secuencia de aminoácidos de SEQ. ID NO: 2.
5. La proteína quimérica de la reivindicación 1, en la que el segundo fragmento peptidilo está constituido por la secuencia de aminoácidos de SEQ. ID NO: 3.
6. La proteína quimérica de la reivindicación 1, en la que el precursor de insulina está constituido por la secuencia de aminoácidos de SEQ. ID NO: 4.
7. La proteína quimérica de la reivindicación 1, en la que el precursor de insulina humana está constituido por la secuencia de aminoácidos de SEQ. ID NO: 5.
8. La proteína quimérica de la reivindicación 1 que está constituida por la secuencia de aminoácidos de SEQ. ID NO: 6.
9. La proteína quimérica de la reivindicación 1 que está constituida por la secuencia de aminoácidos de SEQ. ID NO: 7.
10. La proteína quimérica de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, en la que el fragmento precursor de insulina está correctamente plegado.
11. Un ácido nucleico aislado que comprende una secuencia de nucleótido que codifica la proteína quimérica de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9.
12. El ácido nucleico de la reivindicación 11, en el que dicho ácido nucleico es ADN.
13. Una célula recombinante que contiene el ácido nucleico de la reivindicación 11.
14. Un procedimiento para producir una proteína quimérica que comprende hacer crecer una célula recombinante que contiene el ácido nucleico de la reivindicación 11 de tal manera que la proteína quimérica codificada se expresa por la célula, y recuperar la proteína quimérica expresada.
15. Un proceso para obtener una proteína quimérica que contiene un primer precursor de insulina correctamente plegado de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 10, que comprende poner en contacto una proteína quimérica que contiene precursor de insulina incorrectamente plegado de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 10 con un agente caotrópico auxiliar.
16. El proceso de la reivindicación 16, en el que el agente caotrópico auxiliar se selecciona entre el grupo constituido por hidrocloruro de guanidina, carbonato de etileno, tiocianato, dimetilsulfóxido y urea.
17. Un ensayo para obtener la proteína quimérica de la reivindicación 1, que comprende: (a) cambiar la secuencia de aminoácidos del primer fragmento peptidilo de una proteína quimérica de la reivindicación 1, obtener dicha proteína quimérica con dichos cambios, poner en contacto dicha proteína quimérica con dichos cambios con al menos un agente caotrópico auxiliar en un medio acuoso bajo condiciones y durante un tiempo suficiente, de tal manera que dicha proteína quimérica se pliegue correctamente, y medir el rendimiento de plegado de dicha proteína quimérica con dichos cambios; (b) obtener la misma proteína quimérica que se usa en la etapa (a), pero sin los cambios de secuencia de aminoácidos que se describen en la etapa (a), poner en contacto la proteína quimérica sin los cambios de secuencia de aminoácidos que se describen en la etapa (a) con al menos un agente caotrópico auxiliar en un medio acuoso bajo las mismas condiciones y durante el mismo tiempo que se usa en la etapa (a), y medir el rendimiento de plegado de la proteína quimérica; y (c) comparar el rendimiento de plegado de las proteínas quiméricas medido en las etapas (a) y (b), respectivamente, en las que el rendimiento medido en la etapa (a) que es sustancialmente igual o mayor que el rendimiento medido en la etapa (b) indica que la secuencia de aminoácidos mejora el plegado del precursor de insulina.
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