ES2315495T3 - Empleo de fotorreceptores biologicos como canales ionicos controlados directamente por la luz. - Google Patents
Empleo de fotorreceptores biologicos como canales ionicos controlados directamente por la luz. Download PDFInfo
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Abstract
Empleo de un fotorreceptor biológico como canal iónico directamente controlado por la luz para modificar la conductividad iónica de una membrana con ayuda de luz, - presentando el fotorreceptor una apoproteína y un polieno fotosensible combinado covalentemente a la apoproteína, que interactúa con la apoproteína y funciona como puerta fotosensible, y - siendo la apoproteína una opsina que forma un canal iónico o un derivado o un fragmento de opsina que forma un canal iónico.
Description
Empleo de fotorreceptores biológicos como
canales iónicos controlados directamente por la luz.
La presente invención se relaciona con el empleo
de fotorreceptores biológicos como canales iónicos controlados
directamente por la luz.
Se sabe desde hace tiempo, que un gran número de
procedimientos centrales en células vegetales y animales se
controla total o parcialmente a través de modificaciones de la
concentración intracelular de determinados iones, por ejemplo, de
la concentración de protones, y modificaciones del potencial de
membrana y del gradiente iónico a través de la membrana. Conforme a
eso, la aclaración de los mecanismos de regulación intracelular de
iones, particularmente de regulación del pH, y de los mecanismos de
los canales iónicos y transportadores iónicos dependientes de la
tensión es objeto de extensas actividades de investigación. Para
estas investigaciones es de gran interés una medición y/o
manipulación rápidas y fáciles de las concentraciones intracelulares
de iones, particularmente de las concentraciones de protones, así
como del gradiente eléctrico y del gradiente iónico, particularmente
del gradiente de protones, a través de membranas celulares.
Una vía, en principio, muy favorable para
posibilitar estas mediciones y/o manipulaciones era la introducción
de un canal iónico controlado por la luz en una membrana de este
tipo, para modificar selectivamente el potencial de membrana y/o el
flujo de determinados iones, por ejemplo, protones, a través de la
membrana.
En el estado actual de la técnica se conoce una
serie de sistemas de transporte iónicos controlados por la luz. Se
diferencia además entre sistemas de transporte de iones pasivos y
activos. En los sistemas pasivos de transporte iónico, las
verdaderas moléculas de transporte, los llamados canales iónicos,
interactúan con complejos de fotorreceptor independientes y se
controlan indirectamente a través de estos fotorreceptores. Son
ejemplos de estos complejos de fotorreceptor que interactúan con un
canal iónico la rodopsina activadora de la proteína G; ver, por
ejemplo, Müller, F., Kaupp, U. B., Transducción de Señales en
Células Visuales, Ciencias de la Naturaleza 85 (1998)
49-61. Como estos sistemas pasivos de transporte
iónico conocidos requieren la cooperación de varias proteínas y
otros componentes, resulta problemático introducirlos en otras
células conservando su función, por ejemplo, mediante
co-expresión de las proteínas apropiadas en sistemas
recombinantes.
Son ejemplos de moléculas de transporte iónico
activas dirigidas por la luz en una membrana celular la rodopsina
de archaea (archaebacterias). Un representante conocido de rodopsina
de archaea es la bacteriorhodopsina, compuesta por un componente
proteico, la bacterioopsina, y un retinal combinado a través de una
base de Schiff. Después de estimularla con luz de la longitud de
onda apropiada, la bacteriorhodopsina transporta protones a través
de la membrana desde el interior de la célula hacia fuera. El
transporte iónico discurre generalmente lentamente (< 100
H^{+}/segundos) y la dirección de transporte de la
bacteriorhodopsina no puede determinarse libremente. En
vivo, la bacteriorhodopsina transporta protones también contra
un gradiente electroquímico existente, compuesto por un gradiente
de pH y un gradiente eléctrico \Delta\psi. Una bomba de protones
dirigida por la luz de este tipo representa un sistema
comparativamente simple. La bacteriorhodopsina y proteínas afines
enlazantes de retinal como la bomba de cloruro halorhodopsina se
exprimieron ya heterologamente y eran capaces del transporte activo
de iones de membrana impelido por la luz, por ejemplo, H^{+} o
Cl^{-}, en el hospedante heterogéneo.
Los sistemas conocidos resultan, sin embargo,
inapropiados para muchos propósitos debido a su complejidad y/o a la
dirección de transporte predefinida.
Un objetivo de la presente invención es
proporcionar medios y vías, que permitan una medición y/o
manipulación rápidas y ligeras de las concentraciones
intracelulares de iones, particularmente de las concentraciones de
protones, así como del gradiente eléctrico a través de una membrana
celular.
Otro objetivo es proporcionar un sistema
apropiado para el screening de alto rendimiento de moléculas
biológicas, particularmente de proteínas de la membrana reguladoras
del pH y proteínas de la membrana dependientes de la tensión.
Los objetivos en los que se basa la invención se
resuelven empleando un fotorreceptor biológico conforme a la
Reivindicación independiente 1. Los modos de ejecución del empleo
conforme a la invención son objeto de las Reivindicaciones
dependientes.
La presente invención resuelve estos objetivos
mediante el empleo de una nueva clase de fotorreceptores con una
función hasta ahora desconocida, que representan sistemas de
transporte iónico pasivos controlados directamente por la luz (un
canal iónico controlado por la luz). Este fotorreceptor comprende
una apoproteína, que proporciona una conductividad iónica, y un
polieno fotosensible combinado covalentemente a la apoproteína, que
interactúa con la apoproteína y funciona como puerta fotosensible.
Sorprendentemente, conforme a la invención se ha logrado compaginar
las ventajas de un sistema relativamente sencillo controlado
directamente por la luz con las ventajas de un canal iónico
pasivo.
La presente invención resuelve los objetivos en
los que se basa mediante el empleo de un fotorreceptor biológico
como canal iónico directamente controlado por la luz para modificar
la conductividad iónica de una membrana con ayuda de la luz,
teniendo el fotorreceptor una apoproteína y un polieno fotosensible
combinado covalentemente a la apoproteína, que interactúa con la
apoproteína y funciona como puerta fotosensible, y siendo la
apoproteína una opsina que forma un canal iónico o un derivado o un
fragmento de opsina que forma un canal iónico.
La apoproteína es una proteína de membrana con
al menos 5 hélices transmembranarias, idónea para el enlace de un
polieno fotosensible. Se prefieren las proteínas transmembranarias
con 6 ó 7 hélices transmembranarias. Sin embargo, las proteínas
transmembranarias con más de 7 hélices, por ejemplo, 8, 9 ó 10
hélices transmembranarias, están asimismo comprendidas por la
invención. La invención abarca, por otra parte, proteínas
transmembranarias que, adicionalmente a la proporción
transmembranaria, contienen secuencias C- y/o
N-terminales, pudiendo introducirse las secuencias
C-terminales en el interior del lumen rodeado por la
membrana, por ejemplo, el citoplasma de una célula o el interior de
un liposoma, o pudiendo disponerse también en la superficie externa
de la membrana. Esto mismo es válido para las secuencias
N-terminales existentes si fuera necesario, que
pueden disponerse asimismo tanto intraluminalmente como también
sobre la superficie externa de la membrana. La longitud de las
secuencias C- y/o N-terminales no está sujeta, en
principio, a ninguna restricción; se prefieren, sin embargo, las
apoproteínas con secuencias C-terminales, no
embebidas en la membrana, con de 1 a 1000 aminoácidos,
preferentemente de 1 a 500, de manera especialmente preferente de 5
a 50 aminoácidos. Independientemente de la longitud de las
secuencias C-terminales, las secuencias
N-terminales dispuestas, no embebidas en la membrana
contienen preferentemente de 1 a 500 aminoácidos, de manera
especialmente preferente de 5 a 50 aminoácidos.
El término hélice transmembranaria es conocido
por el experto. Se trata generalmente de estructuras proteicas
\alpha-helicoidales, que contienen generalmente de
20 a 25 aminoácidos. En función de la naturaleza de la membrana,
que puede ser una membrana natural, por ejemplo, una membrana
celular o plasmática, o también una membrana sintética, de
segmentos transmembranarios pueden ser también más cortos o más
largos. Por ejemplo, puede haber contenidos segmentos
transmembranarios en membranas artificiales de hasta 30 aminoácidos,
aunque, por otro lado, también sólo de menos aminoácidos, por
ejemplo, de 12 a 16.
El canal iónico conforme a la invención puede
servir, en principio, para el transporte pasivo de todos los iones
fisiológicamente importantes. Los sistemas de transporte iónico más
conocidos transportan Na^{+}, K^{+}, Ca^{2+}, H^{+} o
Cl^{-}. En un modo de ejecución preferente, el canal iónico
conforme a la invención es un canal de protones.
En un modo de ejecución especialmente
preferente, el canal de protones comprende como proporción
apoproteica una proteína opsina o un derivado o fragmento de una
proteína opsina naturalmente existente. Como opsinas se designan
aquí las apoproteínas enlazadas covalentemente con un cromóforo de
retinoide y que tienen conductividad iónica, tan pronto absorben
luz. Una molécula, que contiene un cromóforo de retinoide enlazado
covalentemente con una opsina, se designa como rodopsina.
Un derivado de una molécula de opsina presente
naturalmente y que funciona como canal iónico conectado por la luz
está modificado frente al original mediante una sustitución de uno o
varios aminoácidos, mediante una inserción y/o una supresión de uno
o varios aminoácidos en una o varias posiciones. Tanto las moléculas
de opsina presentes naturalmente como también su derivado deberían
presentar una identidad de al menos el 15% con la secuencia de la
bacteriorhodopsina en la zona de las 5 hélices transmembranarias,
correspondientes a las hélices 3 a 7 en la bacteriorhodopsina. Se
prefiere además na identidad del 20% o más entre el derivado de una
channelopsin y la bacteriorhodopsina, relativo sólo al rango de la
hélices 3 a 7 en la bacteriorhodopsina. La identidad en los rangos
de los derivados de la opsina, no correspondientes a las hélices 3 a
7, puede ser, en cambio, mucho menor.
Con el término "identidad" se designa
además el grado de afinidad entre dos o más secuencias proteicas,
determinado por la la coincidencia entre estas secuencias. El
porcentaje de identidad se origina a partir del porcentaje de
aminoácidos idénticos en dos o más secuencias teniendo en cuenta los
huecos y otras particularidades de la secuencia.
La identidad de las moléculas proteicas afines
entre ellas puede determinarse con ayuda de procedimientos
conocidos. Generalmente se emplean programas especiales de ordenador
con algoritmos que tengan en cuenta los requisitos especiales. Los
procedimientos preferentes para la determinación de la identidad
generan primero la mayor coincidencia entre las secuencias
analizadas. Los programas de ordenador para la determinación de la
identidad entre dos secuencias contienen, aunque no se limitan a
ello, el paquete de programas GCG, incluyendo GAP (Devereux et
al., 1984); Genetics Computer Group University of Wisconsin,
Madison, (WI)); BLASTP, BLASTN y CASIA (Altschul et al., NCB
NLM NIH Bethesda MD 20894; Altschul et al., 1990). También el
algoritmo conocido de Smith Waterman puede utilizarse para la
determinación de la identidad.
Los parámetros preferentes para la comparación
de las secuencias contienen lo siguiente:
- Algoritmo: Altschul et al., 1990 (Basic local alignment search tool, J. Mol. Biol. 215, 403-410) (=BLAST)
- Matriz de comparación: BLOSUM 62 (Henikoff and Henikoff, 1992, Amino acid substitution from protein blocks. PNAS 89, 10915-10919)
- Coincidencia (matches) = variable
- No-coincidencia (mismatch) = variable
- Valor de huecos: open 10
- Valor de longitud de los huecos (gap length penalty): 1
\vskip1.000000\baselineskip
El programa GAP resulta también apropiado para
su empleo con los anteriores parámetros. Los anteriores parámetros
son los parámetros estándar sind die Estándarparámetros (default
parameters) para las comparaciones proteicas.
Pueden utilizarse otros algoritmos ejemplares,
valores de abertura de los huecos (gap opening penalties), valores
de extensión de los huecos (gap extension penalties), matrices de
comparación incluidas las citadas en el manual de programa, paquete
Wisconsin, Versión 9, Septiembre 1997. La selección depende de la
comparación a ejecutar y, además, de si la comparación se efectúa
entre pares de secuencias, prefiriéndose GAP o Best Fit, o entre
una secuencia y una extensa base de datos de secuencias,
prefiriéndose CASIA o BLAST.
Para la bomba activa de protones
bacteriorhodopsina se sabe que Asp(D)96 es un
aminoácido esencial para el funcionamiento de la bomba de protones.
Además, los siguientes 16 aminoácidos de la bacteriorhodopsina
intervienen en la red de protones:
- F^{42}, T^{46}, Y^{57}, R^{82}, D^{85}, T^{89}, L^{93}, T^{107}, W^{182}, Y^{185}, W^{189}, E^{194}, E^{204}, D^{212}, K^{216}, F^{219}
\vskip1.000000\baselineskip
En el canal iónico conforme a la invención hay
un aminoácido diferente de "D" en la posición correspondiente
al D^{96} de la secuencia de la bacteriorhodopsina. E^{204} está
sustituido preferentemente por S. En un modo de ejecución, sin
embargo, de los otros 15 aminoácidos al menos 8 se han mantenido
idénticos o se han modificado únicamente mediante sustitución
conservativa. Los aminoácidos, que deberían haberse mantenido lo
más idénticos posible, son preferentemente T^{46}, Y^{57},
R^{82}, T^{89}, T^{107}, W^{182}, E^{194}, D^{212} y
K^{216}. Los aminoácios sustituidos conservativamente son
preferentemente F^{42}, D^{85}, L^{93}, Y^{185}, W^{189}
y F^{219} el experto sabe además, que para una sustitución
conservativa sustitución se selecciona un aminoácido, que sea
funcionalmente similar al aminoácido a sustituir. Se efectúan además
sustituciones normalmente dentro de los siguientes grupos:
Respecto a los aminoácidos indicados
anteriormente, son sustituciones preferentes las siguientes: F42Y,
D85E, Y185F, W189F y F219W.
En otro modo de ejecución preferente se obtienen
una o varias más de las siguientes posiciones, respecto a la
bacteriorhodopsina, en el canal iónico conforme a la invención:
Y^{83}, W^{86}, P^{91}, G^{122}, P^{186} y G^{195}.
En otro modo de ejecución preferente, un canal
pasivo de protones conforme a la invención contiene una apoproteína
con la secuencia consensual L(I)DxxxKxxW(F,Y).
Los aminoácidos indicados entre paréntesis pueden sustituir en cada
caso al aminoácido precedente. Esta secuencia consensual es el
motivo que rodea al aminoácido lisina enlazante del retinal. En la
bacteriorhodopsina, la "K" en la posición 6 de la secuencia
consensual corresponde a la K^{216} en la 7ª hélice de la
bacteriorhodopsina.
En un modo de ejecución preferente, el canal
iónico comprende una apoproteína de eucariotas menores. El grupo de
las eucariotas menores abarca, por ejemplo, algas, protozoos,
ciliatos y levaduras.
Se prefieren especialmente además las algas
verdes mótiles, particularmente Clorophyceae. Las apoproteínas de
las Volvocales resultan además especialmente interesantes. En el
modo de ejecución más preferente, la apoproteína es una proteína
opsina de Chlamydomonas reinhardtii. Otras algas verdes con
modos de ejecución preferentes pueden encontrarse entre las
Ulvophyceae como Acetabularia y Ulva. Otros modos de ejecución
preferentes son las opsinas de Prasinophyceae, por ejemplo,
Pyramimonas y Platymonas (Tetraseimis). Otras formas preferentes
proceden del reino de las Dinophytas con la única clase de las
Dinophyceas y los representantes ejemplares Gymnodinium
splendens, Gyrodinium dorsum, Peridinium balticum y
Gonyaulax.
En otro modo de ejecución preferente, la opsina
que funciona como canal iónico controlado por la luz deriva de un
protozoo, una bacteria o una archaebacteria.
En otro modo de ejecución preferente, la opsina
que funciona como canal iónico controlado por la luz deriva de
hongos como Neurospora crassa, Fusarium sporotrichioides y
Leptosphaeria maculans, o Chytridiomycetes, como por ejemplo,
Allomyces reticulatus, o de ciliatos como Fabrea
salina o Paramecium bursaria o de foraminíferas como
Amphistegina radiata.
Conforme a la invención, de la Chlamydomonas
reinhardtii se extrajeron dos proteínas diferentes con secuencia
funcional conocida y se identificaron por primera vez como sistemas
pasivos de transporte iónico. Se trata además de la channelopsin 1
(= CHOP-1; también denominada
chlamiopsina-3 = COP3) y la channelopsin 2 (=
CHOP-2; también denominada
chlamiopsina-4 =COP4).
La proteína CHOP-1 tiene un peso
molecular de 76 kD y una longitud de 712 aminoácidos. Se identificó
en base a las secuencias parciales de cADN solapantes en una base
de datos EST de C. reinhardtii (Asamizu et al., DNA
Research 7, 305-7 (2000)). Su secuencia de
aminoácidos se representa en la Fig. 1 de la presente solicitud. La
proteína nuclear (aminoácidos 76-309) comprende 7
segmentos transmembranarios hipotéticos con un
15-20% de homología respecto a las rodopsinas de
archaea sensibles, los transportadores iónicos bacteriorhodopsina
(BR) y halorhodopsina (HR), así como respecto a una rodopsina sólo
recién identificada del hongo Neurospora crassa (NOP1).
Estos grados de homología son, en realidad, cuantitativamente
relativamente bajos, aunque, en comparación con la BR, se conservan
especialmente aquellos aminoácidos que definan la posición de enlace
del retinal y la red de transporte de H^{+} en la BR. El motivo
consensual observado LDxxxKxxW sugiere que en la
CHOP-1 K^{296} es el aminoácido enlazante del
retinal. 9 de los 22 aminoácidos, en contacto directo con el
retinal en la bacteriorhodopsina, se han mantenido idénticos en la
CHOP-1 y otros 4 reflejan únicamente modificaciones
conservativas ((Fig.1); Nail et al., en preparación).
Investigaciones detalladas de la función de
transporte iónico controlado por la luz de la proteína
CHOP-1 en oozitos de Xenopus laevis
muestran, que los iones transportados son protones (Fig. 3), aparte
de que el transporte iónico es de naturaleza puramente pasiva (Fig.
4a-c). La fotocorriente inducida y, por tanto, el
transporte iónico depende de la longitud de onda de la luz
estimulante y alcanza un máximo a 500 nm (Fig. 4d).
Los ensayos análogos con dos fragmentos más
cortos de proteína CHOP-1, que comprenden los
aminoácidos 1-346 y/o 1-517,
proporcionan resultados esencialmente iguales que aquellos de la
proteína CHOP-1 en toda su longitud. Esto demuestra
que una mayor parte del rango carboxiterminal de la proteína
CHOP-1 no es necesaria para la función de transporte
iónico.
La proteína CHOP-1 de la C.
reinhardtii representa el primer representante identificado de
una nueva proteína de transporte iónico pasiva dirigida
directamente por la luz. Proteínas de rodopsina estructuralmente y/o
funcionalmente similares aparecen también en otras microalgas, así
como en gametos y zoosporas de macroalgas y, posiblemente también,
en otros organismos.
La segunda proteína identificada como
apoproteína de un canal iónico conectado por la luz es la
channelopsin 2 (CHOP-2), cuya secuencia
comprendiendo 737 aminoácidos se muestra asimismo en la Figura 1.
Tiene una homología de 52.7% respecto a la CHOP-1.
Los aminoácidos importantes para el transporte identificados a
través de la homología entre BR y CHOP-1, así como
cálculos de modelos, se conservan también en la
CHOP-2. También para esta rodopsina se ha
demostrado por primera vez una conductividad de protones pasiva
fotoconectada mediante la expresión en oocitos de Xenopus. El canal
iónico formado con CHOP-2 como apoproteína se
distingue del formado con CHOP-1 en lo que respecta
a su conectividad unitaria, su inactivación en la luz fija y la
forma de la curva de corriente-tensión. La
channelrhodopsin-2 (ChR2), constituida por proteína
channelopsin-2 (CHOP-2) y retinal,
es un canal de cationes controlado por la luz, permeable, por
ejemplo, al Li^{+}, Na^{+}, K^{+}, Ba^{2+}, Sr^{+} y
Ca^{2+}, aunque no al Mg^{2+}. El máximo del la luz estimulante
se encuentra a 440-480 nm.
De manera similar que en la proteína
CHOP-1, aquí podía demostrarse también que una forma
abreviada de CHOP-2, que comprende los aminoácidos
1-315, forma asimismo un canal iónico funcional
fotoconectado (Fig. 5-7).
CHOP-2 y/o
CHOP-2-315 pueden emplearse para la
despolarización de las células (ver Fig. 7) o para la incorporación
de Ca^{2+} (Fig. 6) o para ambas cosas.
Los ensayos análogos con dos fragmentos más
cortos de proteína CHOP-1, que comprenden los
aminoácidos 1-346 y/o 1-517,
proporcionan resultados esencialmente iguales que aquellos de la
proteína CHOP-1 en toda su longitud. Esto demuestra
que una mayor parte del rango carboxiterminal de la proteína
CHOP-1 no es necesaria para la función de transporte
iónico.
La proteína CHOP-1 de la C.
reinhardtii representa el primer representante identificado de
una nueva proteína de transporte iónico pasiva dirigida
directamente por la luz. Proteínas de rodopsina estructuralmente y/o
funcionalmente similares aparecen también en otras microalgas, así
como en gametos y zoosporas de macroalgas y, posiblemente también,
en otros organismos.
La segunda proteína identificada como
apoproteína de un canal iónico conectado por la luz es la
channelopsin 2 (CHOP-2), cuya secuencia
comprendiendo 737 aminoácidos se muestra asimismo en la Figura 1.
Tiene una homología de 52.7 % respecto a la CHOP-1.
Los aminoácidos importantes para el transporte identificados a
través de la homología entre BR y CHOP-1, así como
cálculos de modelos, se conservan también en la
CHOP-2. También para esta rodopsina se ha
demostrado por primera vez una conductividad de protones pasiva
fotoconectada mediante la expresión en oocitos de Xenopus. El canal
iónico formado con CHOP-2 como apoproteína se
distingue del formado con CHOP-1 en lo que respecta
a su conectividad unitaria, su inactivación en la luz fija y la
forma de la curva de corriente-tensión. La
channelrhodopsin-2 (ChR2), constituida por proteína
channelopsin-2 (CHOP-2) y retinal,
es un canal de cationes controlado por la luz, permeable, por
ejemplo, al Li^{+}, Na^{+}, K^{+}, Ba^{2+}, Sr^{+} y
Ca^{2+}, aunque no al Mg^{2+}. El máximo del la luz estimulante
se encuentra a 440-480 nm.
De manera similar que en la proteína
CHOP-1, aquí podía demostrarse también que una forma
abreviada de CHOP-2, que comprende los aminoácidos
1-315, forma asimismo un canal iónico funcional
fotoconectado (Fig. 5-7).
CHOP-2 y/o
CHOP-2-315 pueden emplearse para la
despolarización de las células (ver Fig. 7) o para la incorporación
de Ca^{2+} (Fig. 6) o para ambas cosas.
Conlleva escala de tensiones conforme a la
ecuación de Nerst, es decir, unos 58 mV en el caso de iones
monovalentes, unos 29 mV en el caso de iones divalentes.
Investigando las curvas de
corriente-tensión puede determinarse, por tanto,
para cada canal iónico controlado por la luz, si es un sistema
pasivo o activo.
La presente invención se relaciona, por tanto,
también con derivados y fragmentos de las proteínas CHOP, que
conservan total o parcialmente las propiedades de transporte iónico
de la proteína inicial o las exhiben incluso en mayor medida, así
como opsinas estructuralmente y funcionalmente similares de otros
organismos, de origen natural o modificadas empleando técnicas
recombinantes, cuando tengan las propiedades biofísicas citadas y
puedan emplearse como CHOP-1 y
CHOP-2 para los propósitos citados.
Las extensas series de ensayos para la
elaboración e investigación de estos derivados conllevan el
sorprendente resultado de que la posición de aminoácido 134 en la
proteína CHOP-2 es especialmente importante para la
función como canal iónico conectado por la luz. Así puede
producirse un mutante especialmente activo de la proteína
CHOP-2 completa y/o de la proteína abreviada
CHOP-2-315, por ejemplo,
sustituyendo la histidina de la posición 134 por arginina. Esta
sustitución puede efectuarse por procedimientos estándar, por
ejemplo, mediante mutagénesis de oligonucleótidos dirigida a la
posición. Otros datos sugieren que Glu123 interviene en una
desprotonación fotoinducida, que conlleva una desensibilización del
canal iónico. La mutación de Glu123 a Asp (E123D) eleva así
claramente la razón de la fotocorriente trasiente respecto a la
fotocorriente de equilibrio, mientras que la mutación de Glu123 a
Gln (E123Q) puede casi eclipsar el pico de la fotocorriente
trasiente, aunque conduce también a una fuerte reducción de la
fotocorriente estacionaria.
El sistema pasivo de transporte iónico conforme
a la invención contiene un polieno fotosensible. Puede tratarse,
por ejemplo, de un ácido p-hidroxicinámico, retinal
o un derivado de retinal. Los derivados preferentes de retinal se
seleccionan del siguiente grupo: 3,4-dehidroretinal,
13-etilretinal,
9-dm-retinal,
3-hidroxiretinal, 4-hidroxiretinal,
naftilretinal;
3,7,11-trimetil-dodeca-2,4,6,8,10-pentaenal;
3,7-dimetil-deca-2,4,6,8-tetraenal;
3,7-dimetil-octa-2,4,6-trienal;
así como 6-7-, ó 10-11- retinales
rotacionalmente bloqueados con 4-, 5-, 6- ó 7- puentes de anillos.
Sin embargo, se prefiere especialmente un retinal con
10-12 puentes de cinco anillos (Takahashi et
al. FEBS Lett. 314, 275-279).
Tras la fotoabsorción e isomerización de los
polienos tiene lugar en los canales iónicos controlados por la luz
conformes a la invención una modificación estructural en la proteína
(opsina) y, por tanto, la apertura del canal conuctor de iones, que
une la cara intracelular de la membrana con la extracelular. Este
hecho se distingue, en principio, de la situación en las bombas
iónicas conocidas, en las que el semicanal (EC) extracelular
conductor de protones con el semicanal intracelular (IC) no está
unido de manera conductora. En la bacteriorhodopsina, la base de
Schiff del retinal se une, en el intermediario M anterior del ciclo
de reacción (fotociclo), de manera conductora con la cara
extracelular, estando en cambio unida con la cara intracelular en el
estado M posterior.
Los canales iónicos controlados por la luz que
son conformes a la presente invención pueden incorporarse en una
membrana, por ejemplo, en la membrana plasmática de una célula, y
utilizarse para modificar rápida y definidamente el potencial de
membrana mediante exposición, lo que resulta muy útil para aclarar
los mecanismos de los canales iónicos y transportadores iónicos
dependientes de la tensión. Además, de este modo se origina la
posibilidad de modificar rápida y definidamente los niveles
intracelulares de estos iones con un transporte iónico selectivo
controlado por la luz.
En el caso de la proteína
CHOP-1, esto significa una modificación selectiva
no-invasiva del valor del pH intracelular, lo que
resulta útil para aclarar los mecanismos de regulación intracelular
del pH y/o de la influencia de las modificaciones trasientes del pH
sobre las proteínas propias de la célula.
Midiendo el potencial de inversión de la
conductividad de protones fotoinducida mediada por
CHOP-1 puede medirse rápida y precisamente el valor
intracelular del pH directamente por debajo de la membrana, y/o un
gradiente de pH a través de la membrana conociendo el pH
extracelular. Para ello se determina el potencial de inversión con
la medición "Voltage Clamp" aplicada en la Fig.
2-4 y se calibran, por tanto, las células. A
continuación puede realizarse la modulación del potencial de
membrana y/o del valor intracelular del pH con luz a través del
canal iónico controlado por la luz conforme a la invención,
no-invasivamente. Las mediciones apropiadas se
realizan rápida y definidamente y resultan así apropiadas idealmente
para aparatos de HTS
(High-Throughput-Screening)
modernos, con los que pueden analizarse, por ejemplo, las proteínas
de membrana dependientes de la tensión, reguladas por el pH, como
canales iónicos en aplicaciones de screening con alto rendimiento.
Los saltos de tensión o de pH pueden fotoinducirse en las líneas
celulares, que contengan ChR1 o rodopsina afín.
Una aplicación especialmente interesante es el
acoplamiento optoeléctrico por modulación dirigida por la luz del
potencial de membrana. Esta aplicación se basa en una combinación
del canal iónico pasivo controlado por la luz con un sistema de
transporte iónico activo controlado por la luz, por ejemplo, una
bomba de iones, empleándose para el fotocontrol del canal iónico
pasivo preferentemente un longitud de onda diferente que para el
fotocontrol de los sistemas activos de transporte iónico. En un modo
de ejecución preferente se emplea luz de una longitud de onda de
650 nm para la activación de la bomba de protones bacteriorhodopsina
y para la generación de un potencial de membrana y, a continuación,
luz de una longitud de onda de 440 nm, que actúa inhibiendo la
bacteriorhodopsina, para la activación del sistema de transporte de
protones de CHOP-1 y para la rápida disipación del
potencial.
Los canales iónicos fotoregulados pueden
emplearse también en la transmisión de señales de las redes
neuronales a las redes de microelectrodos. En este contexto se
intentan transmitir los impulsos eléctricos de las neuronas a
microordenadores ("Interconexión de Células Nerviosas y
Semiconductores": Fromherz (2001), pliegos de datos físicos 57,
43-48). Las neuronas se han estimulado hasta ahora o
bien a través de neurotransmisores o directamente con micropipetas.
Las neuronas, que exprimen ChR1, ChR2 o canales iónicos afines
controlados por la luz, podrían controlarse por medio de luz.
Otra aplicación es la terapia de animales ciegos
o, finalmente, de personas. Existen algunas enfermedades, en las
que las células visuales naturales dejan de funcionar, pero todas
las conexiones nerviosas pueden seguir operando. Hoy en día se
intenta, en diferentes centros de investigación, implantar películas
delgadas con fotocélulas cerámicas artificiales sobre la retina (E.
Zrenner (2002) Science 295, 1022-1025.) Estas
fotocélulas deberían servir para despolarizar las células
secundarias aún intactas de la retina y, por tanto, activar un
impulso nervioso (ojos biónicos). La expresión selectiva de las
rodopsinas dirigidas por la luz como ChR1 o ChR2 en estas células
gangliales, células amacrinas o células bipolares representaría una
solución mucho más elegante y posibilitaría una mayor resolución
visual espacial.
La incorporación de los sistemas de transporte
iónico de rodopsina conformes a la invención a la membrana de las
células, que no exprimen la proteína opsina apropiada en la
naturaleza, puede realizarse simplemente, por ejemplo, incorporando
en primer lugar el ADN codificante para esta opsina, empleando
procedimientos conocidos de la tecnología recombinante del ADN, en
un vector de expresión apropiado, por ejemplo, un plásmido, un
cósmico o un virus, para que, a continuación, se transformen las
células objetivo y se extraiga la proteína en este huésped.
Finalmente se tratan las células de manera apropiada, por ejemplo,
con retinal, para hacer posible la conexión de una base de Schiff
entre la proteína y el retinal.
En un modo de ejecución preferente, lo
mencionado se lleva a cabo con éxito en diferentes levaduras como
Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe, Pichia
pastoris, como para rodopsinas ya activas como la
bacteriorhodopsina y/o rinderrhodopsina (Hildebbordet V. et
al. (1989)), Genetic transfer of the pigment bacteriorhodopsin
into the eukaryote Schizosaccharomyces pombe, FEBS Lett.
243(2):137-40; Najmoutin G. et al.,
Heterologous expression of bovine opsins in Pichia pastoris,
Meth. Enzimaol. (2000) 315, 3-11).
La expresión puede realizarse también en
determinados sistemas de células mamarias. Esto tienen lugar o bien
con vectores episomales como expresión trasiente, preferentemente en
células COS (generadas por infección de células de "African green
monkey kidney CV1") (Oprian et al. (1987) Porc Natl. Acad.
Sci USA 84, 8874 ff.) o células HEK ("human embyonic kidney
cells", por ejemplo, células HEK293, Reeves et al. (1996)
Porc. Natl. Acad. Sci USA 84, 11487 ff.) o células BHK ("baby
hamster kidney cells"), o en forma de una expresión estable
(mediante integración en el genoma) en células CHO ("chinese
hamster ovary cells"), células de mieloma o células MDCK
("Madine-Darby canine kidney cells")
(panorámica en: Makrides SC (1999) Prot. Expr. Purif. 17,
183-202) o en células Sf9 de insectos infectadas por
baculovirus (Jansen et al. (1988) Mol Biol. Rep. 13, 65
ff.).
Para garantizar u optimizar la expresión puede
modificarse también el ADN codificante de manera apropiada, por
ejemplo, enlazando con las secuencias regulatorias apropiadas y/o
mediante adaptación de la secuencia de ADN codificante al empleo de
codones preferente del sistema de expresión seleccionado.
Fig. 1
- \quad
- Fig. 1A: secuencia de aminoácidos de la channelopsin 1 (Chop1) SEQ ID NO: AF385748
- \quad
- Fig. 1B: secuencia de aminoácidos de la channelopsin 2 (Chop2) SEQ ID NO: AF461397
- \quad
- Fig. 1C: secuencia de aminoácidos de la bacterioopsina (Bop) de la Halobacterium salinarium (BR). En minúsculas se indica la secuencia líder, que se separa en vivo y no se tiene en cuenta, por motivos históricos, en la enumeración de los aminoácidos. En negrita se indican los aminoácidos esenciales para la transferencia de protones.
- \quad
- Fig. 1D: comparación de la secuencia de aminoácidos de la CHOP-1 (SEQ ID NO: AF461397) y la CHOP-2 (SEQ ID NO: AF461397) de la Chlamydomonas reinhardtii con la de la bacteriorhodopsina de la Halobacteria salinarum. Los aminoácidos, de los que para la BR (Lücke et al. (1999) Science 286, 255-260 y literatura allí citada) se sabe que interactúan directamente con el retinal, se indican con estrellas. Las posiciones de aminoácidos, que sean iguales en al menos dos secuencias, se resaltan en gris oscuro. Los aminoácidos, que contribuyen a la red conductora de H^{+} en la BR y los aminoácidos apropiados a estos en las otras opsinas se indican en letra eb blanco sobre fondo negro. Para esta His 173 de la CHOP-1 se ha demostrado, en el contexto de la invención, que interviene en la conducción de protones. # indica la posición de la lisina enlazante del retinal. Los aminoácidos subrayados indican las 7 hélices transmembranarias de la proteína nuclear.
- \quad
- Fig. 1E: secuencia de aminoácidos del mutante de la proteína nuclear de CHOP-2 CHOP2-315/- H134R), en la que la histidina de la posición 134 se sustituye por arginina.
Fig. 2 fotocorrientes, registradas durante la
exposición de oocitos a la luz verde o roja (500 25 nm y/o 700 25
nm, 1022 fotones, m^{-2} s^{-1}). Potencial de parada (V_{h})
= -100 mV, pulso luminoso indicado por la barra. Disolución del baño
= 96 mM de NaCl, 5 mM de KCI, 2 mM de CaCl_{2}, 1 mM de
MgCl_{2}, 5 mM de MOPS, pH 7,5. A) Un oocito, al que no se le haya
inyectado ningún ARN de CHOP-1, irradiado con luz
verde B) un oocito de CHOP-1, irradiado con luz
verde; C) el mismo oocito de B), irradiado con luz roja.
Fig. 3 dependencia de la corriente interior
fotoinducida de las condiciones iónicas y de la tensión.
- a:
- resultados con uno (de cinco) oocitos característicos de CHOP-1, en la secuencia de la medición (intervalo de aprox. 150 s), representados, V_{h} = -100 mV, luz verde como en la Fig. 2. Las disoluciones se tamponan con 5 mM de MOPS (pH 7,5) o MES (pH 6) o citrato (pH 5 y 4). Concentración en mM:
- 1. 100 NaCl, 2 CaCl_{2}, pH 7,5
- 2: 100 NaCl, 2 CaCl_{2}, pH 6,0 (ref.)
- 3: 100 aspartato de Na, 2 CaCl_{2}, pH 6,0
- 4: 100 NMG-CI, 2 CaCl_{2}, pH 6,0
- 5: como 2
- 6: 100 NaCl, 2 EGTA, 2 MgCl_{2}, pH 6,0
- 7: 200 Sorbita, 5 EGTA, pH 5,0
- 8: 200 Sorbita, 5 EGTA, pH 4,0
- b:
- razones corriente-tensión de las fotocorrientes de la Fig. 3a, concentraciones ver arriba.
Fig. 4 fotocorrientes, apuntadas con variación
del valor externo y externo del pH, y su dependencia de la longitud
de onda
- a:
- fotocorriente a V_{h} = +40 mV. resultados de uno (de cinco) oocitos característicos CHOP-1- en einer disolución de baño de NaCl (100 mM, traza A: luz roja; traza B: luz verde; 1022 fotones, m^{-2} s^{-1}) o butirato sódico (40 mM, +60 mM de NaCl, traza C: luz verde) de pH 7,4
- b:
- razones corriente-tensión de las fotocorrientes en diferentes disoluciones de baño, que contuvieron siempre 100 \muM de ácido butírico no disociado:
- \quad
- \blacksquare 60 mM de NaCl + 40 mM de butirato de Na, pH 7,4; \ding{115}, 84 mM de NaCl + 16 mM de butirato de Na, pH 7,0; \ding{116}, 93,6 mM de NaCl + 6,4 mM de butirato de Na, pH 6,6; \blacklozenge, 97,4 mM de NaCl + 2,6 mM de butirato de Na, pH 6,2;
- c:
- dependencia del pH de los potenciales de inversión de b. Las líneas de puntos muestran la relación teórica para un pH_{i} constante de 6,6 y/o 6,8 y -58 mV/pH. La línea discontinua muestra la relación esperada para un aumento de -48 mV/diferencia de pH y pH_{i} = 6,8 a pH_{o} = 7,4. El aumento de -48 mV/pH corresponde a un pH_{i} lentamente decreciente (unas 0,17 unidades por disminución del pH_{o} de una unidad). \blacksquare, dependencia del pH de los potenciales de inversión de los ensayos con 5,4 mM de ácido acético no disociado (n =3). La línea de puntos muestra la relación teórica para un pH_{i} constante de 5,5 y -58 mV/pH.
- d:
- dependencia de la longitud de onda de la corriente entrante fotoinducida a pH_{o} 5,5 y - 40 mV. Las fotocorrientes se estandarizaron para una misma corriente de fotones.
Fig. 5 fotocorrientes, registradas durante la
exposición (longitud de onda 450 25 nm) de oocitos extraídos de
CHOP2-315 en disolución de Ringer (110 mM de NaCl, 5
mM de KCI, 2 mM de CaCl_{2}, 1mM de MgCl_{2}, 5 mM de MOPS, pH
7,6) a +40 mV y -80 mV.
Fig. 6 tamaño de la corriente entrante de
equilibrio fotoinducida a -100 mV, pH 9, para 115 mM de Li, Na, Cs,
TMA, TEA o NMG y para 80 mM de Mg^{2+}, Ca^{2+}, Sr^{2+} o
Ba^{2+} (para ambas variantes CHOP2 y CHOP2-315,
idénticamente).
\newpage
Fig. 7 Despolarización de una membrana
plasmática de oocito, que exprime CHOP2-315,
mediante un destello de 200 ms.
Los siguientes ejemplos explican la presente
invención, aunque sin limitarla.
Un ADN de CHOP-1 de longitud
completa, que codifica para los aminoácidos 1-712, y
dos ADNs de CHOP-1 más cortos, que codifican para
los aminoácidos 1-346 y/o 1-517 de
CHOP-1, se amplificaron de una matriz de ADNc de
longitud completa por medio de la PCR con empleo de una polimerasa
con función correctora (pfu, promega) y dos oligonucleótidos
iniciales (primers), que contenían puntos restrictivos de BamHI y
HindIII. Los productos se insertaron en el vector pGEMHE (Liman
et al., Neuron 9, 861-71 (1992)) y se
clonaron en E. coli. Tras la verificación de las secuencias
se transcribieron in vitro los ADNs de CHOP-1
(Ambion) y se inyectaron de 20 a 30 ng de ARNc en oocitos de
Xenopus laevis, tal y como se ha descrito ya para la
bacteriorhodopsina (Nagel et al., FEBS Letters, 377,
263-266 (1995). Los oocitos, que exprimieron la
proteína CHOP-1, se incubaron con un
all-trans-retinal (1 \muM) en
disolución de Ringer durante de dos a cinco días.
Para la investigación de la función de
transporte iónico adoptada se sometieron los oocitos exprimidores de
CHOP-1 a diferentes experimentos con empleo de una
técnica de bornes de tensión de dos electrodos, empleada ya para la
bacteriorhodopsina (Nagel et al. FEBS Letters, 377,
263-266 (1995); Nagel et al., Biophysical
Journal 74, 403-412 (1998)). La luz verde, aunque
no la luz roja, indujo corrientes orientadas hacia dentro en los
oocitos, que exprimieron uno de los ARNs de CHOP-1
(Fig. 2). La aparición de fotocorrientes también en los ARNs de
CHOP-1 más cortos demostró que una mayor parte del
rango carboxiterminal de la CHOP-1 no es necesaria
para esta función. A pH 6 y una tensión transmembranaria entre -100
y + 40 mV, las fotocorrientes se orientaron siempre hacia dentro
(Fig. 3b). La sustitución de cloruro por aspartato en la disolución
no tuvo ningún efecto verificable sobre la amplitud de la
fotocorriente (Fig. 3a) o su razón corriente-tensión
(Fig. 3b), un resultado, que descarta al Cl^{-} como ión
transportado. La sustitución del sodio por
N-metil-D-glucamina
(o de NaCl por sorbita, datos no mostrados) conlleva una corriente
orientada de manera similar hacia dentro (Fig. 3a) sin modificación
de la razón corriente-tensión (Fig. 3b), lo que
indica, que la CHOP-1 no transporta al Na^{+}.
Igualmente, la sustitución de Ca^{2+} por Mg^{2+} no produjo
ninguna modificación de las fotocorrientes, un resultado, que
demuestra que el Ca^{2+} no era asimismo el ión transportado (Fig.
3a,b).
En cambio, un aumento de la concentración de
protones en la disolución de baño, [H^{+}]_{o}, a valores
de pH de 5 y/o 4, a potenciales entre -100 y +40 mV, conlleva
claros aumentos de las fotocorrientes orientadas hacia dentro (Fig.
3a,b).
Los resultados obtenidos hasta ahora remiten,
por tanto, a iones H^{+} como soportes de carga de las corrientes
fotoinducidas. Debido a la homología de secuencia citada
inicialmente entre la proteína CHOP-1 y la bomba de
protones bacteriorhodopsina, se insinúa primero la suposición de que
también la proteína CHOP-1 sería componente de un
sistema activo de transporte iónico, o sea, de una bomba de protones
como la bacteriorhodopsina.
Mientras que la bacteriorhodopsina transporta,
sin embargo, para todos los potenciales de membrana analizados de -
60 mV a + 40 mV (ver por ejemplo, Nagel et al., Biophysical
Joumal 74, 403-412 (1998)), protones siempre hacia
fuera, también contra un gradiente de pH, la dirección de transporte
de sistema CHOP-1 depende del gradiente de pH
existente a través de la membrana y del potencial de membrana (Fig.
4a,b,c). Los potenciales de inversión medidos a diferentes
gradientes finales de pH (Fig. 4b,c) ponen de manifiesto que las
corrientes fotoinducidas son de naturaleza puramente pasiva. A
partir de las altas fotocorrientes observadas puede concluirse, que
el transporte de protones no sólo se efectúa mediante una difusión
simplificada de los protones a través de la membrana, sino que la
proteína CHOP es un canal de protones.
La dependencia de la fotocorriente fotoinducida
orientada hacia dentro a pH 5,5 y -40 mV de la longitud de onda de
la luz se representa en la Fig. 4d. El máximo cerca de 500 nm
corresponde a los espectros de acción para corrientes de
fotorreceptor, para reacciones de fototaxia y fotoshoc de células
intactas de C. reinhardtii.
Un ADN de CHOP-2 de longitud
completa, que codifica para los aminoácidos 1-737, y
un ADN abreviado C-terminal de
CHOP-2, que codifica para los aminoácidos
1-315 de CHOP-2, se amplificaron de
una matriz de ADNc de longitud completa por medio de la PCR con
empleo de una polimerasa con función correctora (pfu, promega) y
primers, que contenían puntos restrictivos de BamHI y HindIII. Los
productos se insertaron en el vector pGEMHE (Liman et al.,
Neuron 9, 861-71 (1992)) y se clonaron en E.
coli. Tras la verificación de las secuencias se transcribieron
in vitro los ADNs de CHOP-2 (Ambion) y se
inyectaron de 20 a 30 ng de ARNc en oocitos de Xenopus
laevis, tal y como se ha descrito ya para la bacteriorhodopsina
(Nagel et al., FEBS Letters, 377, 263-266
(1995). Los oocitos, que exprimieron la proteína
CHOP-2, se incubaron con un
all-trans-retinal (1 \muM) en
disolución de Ringer durante de dos a cinco días.
Para la investigación de la función de
transporte iónico se sometieron los oocitos exprimidores de
CHOP-2, incubados para la formación del canal
iónico de ChR2 (channelrhodopsin2) en disolución de Ringer con
retinal, a diferentes experimentos (Fig. 5-7) con
empleo de una técnica de bornes de tensión de dos electrodos, como
la empleada ya para CHOP-1 y/o ChR1.
La Fig. 5 muestra que la fotocorriente
fotoinducida disminuye, al irradiar con luz permanente (longitud de
onda 450 25 nm; corresponde aprox. al máximo del espectro de
acción) a un nivel de equilibrio. Esto significa que el de canal
iónico ChR2 se desensibiliza con la luz permanente de esta longitud
de onda, posiblemente mediante una inactivación de una parte de las
moléculas de ChR2.
La Fig. 6 demuestra que el canal iónico formado
con CHOP-2 representa, en comparación con el canal
iónico formado con CHOP-1, un canal
no-selectivo de cationes, que, además de los
protones, deja pasar también diferentes cationes mono- y
bivalentes.
La conductividad para los cationes monovalentes
analizados disminuye además en la secuencia Li^{+} > Na^{+}
> K^{+} > Cs^{+} » TMA^{+} (tetrametilamonio) =
TEA^{+} (tetraetilamonio), es decir, con radio iónico creciente.
En el caso de los cationes bivalentes, la conductividad disminuye
asimismo con radio iónico creciente. Aquí representa Mg^{2+}, sin
embargo, la excepción. ChR2 no es permeable al Mg^{2+},
probablemente debido a la alta energía de hidratación de este ión
(Diebler et al., Pure Appl. Chem. 20, S. 93, 1969). Las
respectivas fotocorrientes para el canal iónico de longitud completa
formado con CHOP-2 no se distinguen además de las
fotocorrientes apropiadas para el canal iónico, que incluye el
fragmento de CHOP-2 con los aminoácidos
aminoterminales 1-315, lo que permite sacar la
conclusión de que la conductividad catiónica se determina con la
proporción aminoterminal de la proteína ChOP-2, que
contiene los siete dominios transmembranarios supuestos.
<110> Peter, Hegemann y la Sociedad Max
Planck para el Avance de la Ciencia e.V.
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Empleo de fotorreceptores biológicos
como canales iónicos controlados directamente por la luz
\vskip0.400000\baselineskip
<130>
PCT1797-01938/GRI
\vskip0.400000\baselineskip
<140>
\vskip0.400000\baselineskip
<141>
\vskip0.400000\baselineskip
<150> DE 102 16
005.8-41
\vskip0.400000\baselineskip
<151>
2002-04-11
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<170> Patente versión 3.1
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 712
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Chlamydomonas reinhardtii
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia de aminoácidos de
CHOP-1 (AF385748) de la Chlamydomonas
reinhardtii
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 737
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Chlamydomonas reinhardtii
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia de aminoácidos de
CHOP-2 (AF461397) de la Chlamydomonas
reinhardtii
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 259
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Halobacterium salinarum
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia de aminoácidos de
bacteriorhodopsina de la Halobacterium salinarum
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 737
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Halobacterium salinarum
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia de aminoácidos de
CHOP-2 (AF461397) de la Chlamydomonas
reinhardtii
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 315
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Halobacterium salinarum
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia de aminoácidos de
CHOP-2-315 de la Chlamydomonas
reinhardtii
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 315
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Halobacterium salinarum
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> H134R-mutante de la
secuencia de aminoácidos de
CHOP-2-315 de la Chlamydomonas
reinhardtii
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip1.000000\baselineskip
Claims (31)
1. Empleo de un fotorreceptor biológico como
canal iónico directamente controlado por la luz para modificar la
conductividad iónica de una membrana con ayuda de luz,
- -
- presentando el fotorreceptor una apoproteína y un polieno fotosensible combinado covalentemente a la apoproteína, que interactúa con la apoproteína y funciona como puerta fotosensible, y
- -
- siendo la apoproteína una opsina que forma un canal iónico o un derivado o un fragmento de opsina que forma un canal iónico.
2. Empleo acorde a la Reivindicación 1, siendo
la apoproteína una proteína transmembranaria con cinco hélices
transmembranarias o más.
3. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, siendo la apoproteína una channelopsin 1
(CHOP-1) o una channelopsin 2
(CHOP-2) o un derivado o un fragmento de una
channelopsin 1 (CHOP-1) o de una channelopsin 2
(CHOP-2).
4. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, siendo el sistema de transporte iónico un sistema
de transporte de protones.
5. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, siendo el derivado de opsina o fragmento de opsina
el resultado de una sustitución, una inserción y/o supresión de un
aminoácido o de varios aminoácidos en la secuencia natural de
aminoácidos de la proteína opsina.
6. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, siendo el aminoácido correspondiente a la
bacteriorhodopsina-Asp96 un aminoácido diferente de
Asp y manteniéndose en la apoproteína al menos ocho de los otros
sesenta aminoácidos, involucrados en la red de transporte de
protones en la bacteriorhodopsina, idénticos o modificándose
mediante sustitución conservativa.
7. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, habiéndose mantenido al menos los aminoácidos, que
corresponden en la bacteriorhodopsina a los aminoácidos T46, Y57,
R82, T89, T107, W182, D212, K216, idénticamente en la posición
apropiada.
8. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, conteniendo la apoproteína la secuencia consensual
L(I)DxxxKxxW(F,Y).
9. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, derivando la apoproteína de plantas
inferiores.
10. Empleo acorde a la Reivindicación 9, siendo
las plantas inferiores algas.
11. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, siendo la apoproteína una proteína opsina de la
Chlamydomonas reinhardtii.
12. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, comprendiendo la apoproteína al menos los
aminoácidos 61 a 310 de la channelopsin 1 (CHOP-1)
conforme a la secuencia de aminoácidos mostrada en la Fig. 1A.
13. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones 1 a 11, comprendiendo la apoproteína al menos los
aminoácidos 24 a 268 de la channelopsin 2 (CHOP-2)
conforme a la secuencia de aminoácidos mostrada en la Fig. 1B.
14. Empleo acorde a la Reivindicación 13,
sustituyéndose el aminoácido histidina en la posición 134 de la
channelopsin 2 (CHOP-2) por otro aminoácido.
15. Empleo acorde a la Reivindicación 14,
sustituyéndose el aminoácido histidina en la posición 134 de la
channelopsin 2 (CHOP-2) por arginina.
16. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones 1 a 9, derivando la proteína opsina de los
protozoos.
17. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones 1 a 9, derivando la proteína opsina de bacterias o
archaea.
18. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones 1 a 9, derivando la proteína opsina de hongos.
19. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, siendo el polieno fotosensible un retinal o un
derivado de retinal.
20. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, seleccionándose el derivado de retinal del
siguiente grupo: 3,4-dehidroretinal,
13-etilretinal,
9-dm-retinal,
3-hidroxiretinal, 4-hidroxiretinal,
naftilretinal;
3,7,11-trimetil-dodeca-2,4,6,8,10-pentaenal;
3,7-dimetil-deca-2,4,6,8-tetraenal;
3,7-dimetil-octa-2,4,6-trienal;
así como 6-7- u 8-9- o
10-11-retinales bloqueados contra la
rotación.
21. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, para la modificación dirigida por la luz de la
conductividad de protones de la membrana.
22. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, para la modificación dirigida por la luz del
potencial de membrana de una célula.
23. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones 20 a 22, siendo la membrana celular de una
levadura, por ejemplo, Saccharomyces cerevisiae,
Schizosaccharomyces pombe, Pichia pastoris.
24. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones 20 a 22, siendo la membrana celular de una célula
de mamífero o célula de insecto, por ejemplo, COS, BHK, HEK293, CHO,
célula de mieloma, MDCK, célula sf9 infectada por baculovirus.
25. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, para el aumento o disminución controlados por la
luz de la concentración intracelular de iones.
26. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, para el aumento o disminución controlados por la
luz de la concentración intracelular de protones.
27. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, para la medición de la concentración intracelular
de protones directamente en la membrana plasmática o de un gradiente
de concentraciones de protones a través de la membrana plasmática
con ayuda de las curvas de corriente-tensión,
pudiendo determinarse el gradiente de concentraciones de protones
directamente a partir de la diferencia de las curvas de
corriente-tensión con y sin exposición del potencial
de inversión.
28. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, para el screening de alto rendimiento de moléculas
biológicas.
29. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, para el screening de alto rendimiento de proteínas
de la membrana reguladas por el pH.
30. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, para el screening de alto rendimiento de proteínas
de la membrana dependientes de la tensión.
31. Empleo conforme a una de las anteriores
Reivindicaciones, empleándose el canal iónico controlado por la luz
en combinación con un sistema de transporte iónico activo controlado
por la luz.
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