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ES2286886T3 - Expresion de peptidos eucarioticos en plastidos de plantas. - Google Patents

Expresion de peptidos eucarioticos en plastidos de plantas. Download PDF

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ES2286886T3
ES2286886T3 ES99933798T ES99933798T ES2286886T3 ES 2286886 T3 ES2286886 T3 ES 2286886T3 ES 99933798 T ES99933798 T ES 99933798T ES 99933798 T ES99933798 T ES 99933798T ES 2286886 T3 ES2286886 T3 ES 2286886T3
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ES
Spain
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plant
plastid
protein
construct
peptide
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Expired - Lifetime
Application number
ES99933798T
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Kevin E. Mcbride
Narender Nehra
Douglas A. Russell
David M. Stalker
Jeffrey M. Staub
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Monsanto Co
Original Assignee
Calgene LLC
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Abstract

Un constructo que comprende los componentes siguientes en la dirección 5'' a 3'' de la transcipción: a) una secuencia promotora del operón ARN ribosómico 16S (Prrn); b) un sitio de unión al ribosoma unido a dicho componente promotor (a), en el que dicho sitio de unión al ribosoma obtenido a partir de la secuencia conductora del gen 10 del bacteriófago T7; c) una secuencia de ADN que codifica un péptido obtenido a partir de un organismo eucariótico; y d) una región de terminación de transcripción, en el que dicho péptido eucariótico es distinto de un péptido de una planta.

Description

Expresión de péptidos eucarióticos en plástidos de plantas.
Introducción Campo técnico
Esta invención se refiere a la aplicación de técnicas de ingeniería genética a plantas. Específicamente, la invención se refiere a composiciones y procedimientos para potenciar la expresión de proteínas en plástidos de plantas.
Antecedentes
Los plástidos de plantas superiores son una diana atractiva para la ingeniería genética. Los plástidos de plantas (cloroplastos, amiloplastos, elaioplastos, etioplastos, cromoplastos, etc.) son los centros de biosíntesis principales que, además de la fotosíntesis, son responsables de la producción de compuestos industrialmente importantes tales como aminoácidos, carbohidratos complejos, ácidos grasos, y pigmentos. Los plástidos derivan a partir de un precursor común conocido como un protoplástido y, de acuerdo con ello, los plástidos presentes en una especie de planta dada tienen todos el mismo contenido genético. Las células de plantas contienen 500-10.000 copias de un pequeño genoma circular de 120-160 kilobases, cada molécula del cual tiene una repetición invertida grande (de aproximadamente 25 kb). De acuerdo con ello, es posible manipular mediante ingeniería genética células de plantas para que contengan hasta 20.000 copias de un gen particular de interés que potencialmente pueda dar como resultado muy altos niveles de expresión de gen extraño. Además, los plástidos de la mayoría de las plantas son maternalmente heredados. En consecuencia, a diferencia de los genes heterólogos expresados en el núcleo, los genes heterólogos expresados en plástidos no son diseminados por el polen y, por ello, un rasgo introducido dentro de un plástido de una planta no será transmitido a parientes de tipo salvaje.
Existe aún una necesidad de mejorar los elementos reguladores para la expresión de genes en un plástido de planta. Hasta la fecha, las señales de expresión usadas de manera rutinaria para la expresión de transgenes de plástidos derivan a partir de genes de plástidos endógenos. Las señales de expresión de plástidos derivan típicamente a partir de regiones promotoras de genes de plástidos altamente expresados tales las regiones promotoras procedentes del operón ARN ribosómico 16S (Prrn), el gen psbA (PpsbA) o el gen rbcL (PrbcL). Los genes psbA y rbcL están altamente transcriptos, pero su traducción está controlada por factores específicos del tejido y regulados por la luz que limitan su utilidad. En el caso del Prrn, se ha usado típicamente para dirigir la traducción un sitio de unión al ribosoma sintético (RBS) usado como molde después del conductor del gen rbcL de plástido. Sin embargo, este Prrn/RBS no está traducido de manera eficaz debido a la pobre unión al ribosoma.
Los plástidos de plantas superiores presentan una diana atractiva para la ingeniería genética. Tal como se ha mencionado anteriormente, los plástidos de las plantas superiores son maternalmente heredados. Esto ofrece una ventaja para la ingeniería genética de plantas para la tolerancia o la resistencia a condiciones naturales o químicas, tales como tolerancia a herbicidas, ya que sus rasgos no serán transmitidos a parientes de tipo salvaje. Además, el alto nivel de expresión de gen extraño es atractivo para la manipulación mediante ingeniería genética de rasgos tales como la producción de proteínas importantes farmacéuticamente.
La expresión de secuencias de ácido nucleico que codifican enzimas que proporcionan tolerancia herbicidas así como proteínas farmacéuticas a partir del genoma del plástido de plantas ofrece una alternativa atractiva a la expresión a partir del genoma nuclear de plantas.
Sumario de la invención
La presente invención proporciona secuencias de ácidos nucleicos útiles en la potenciación de la expresión de una amplia variedad de genes, tanto eucarióticos como procarióticos, en plástidos de plantas. Además, se proporcionan constructos de expresión de plástidos que son útiles para la ingeniería genética de células de plantas y que proporcionan la expresión potenciada de proteínas EPSP sintasa o la proteína hGH en plástidos de células de plantas. Los plástidos transformados deberían ser plástidos activos metabólicamente, y preferiblemente mantenidos a un alto número de copias en el tejido de la planta de interés, lo más preferiblemente los cloroplastos que se encuentran en los tejidos de las plantas verdes, tales como hojas y cotiledones.
De acuerdo con ello, la invención proporciona:
(1) un constructo que comprende los componentes siguientes en la dirección 5' a 3' de la transcipción:
a)
una secuencia promotora del operón ARN ribosómico 16S (denominado aquí más adelante "Prrn");
b)
un sitio de unión al ribosoma unido a dicho componente promotor (a), en el que dicho sitio de unión al ribosoma está derivado a partir de la secuencia conductora del gen 10 del bacteriófago T7;
c)
una secuencia de ADN que codifica un péptido derivado a partir de un organismo eucariótico; y
d)
una región de terminación de transcripción,
en el que dicho péptido eucariótico es distinto de un péptido de una planta;
(2) un procedimiento de producción de una proteína en una célula de una planta, en el que dicho procedimiento comprende la transformación de los plástidos de dicha célula de planta con un constructo que comprende lo siguiente como componentes unidos de manera operable en la dirección 5' a 3' de transcripción:
a)
una secuencia promotora del operón ARN ribosómico 16S (Prrn);
b)
un sitio de unión al ribosoma unido a dicho componente promotor (a), en el que dicho sitio de unión al ribosoma está derivado a partir de la secuencia conductora del gen 10 del bacteriófago T7;
c)
una secuencia de ADN que codifica un péptido derivado a partir de una célula eucariótica distinta de un péptido de un plástido de una planta; y
d)
una región de terminación de transcripción,
y el crecimiento de células de plantas que comprenden dichos plastidios transformados bajo condiciones en las que dicha secuencia que codifica el ADN está expresada para producir dicho péptido eucariótico en dicho plástido;
(3) un procedimiento para la producción de una proteína N-terminal no metionina en un plástido, en el que dicho procedimiento comprende:
la transformación de un plástido con un constructo que comprende, como componentes unidos de manera operable en la dirección 5' a 3' de transcripción:
a)
una secuencia promotora del operón ARN ribosómico 16S (Prrn);
b)
un sitio de unión al ribosoma unido a dicho componente promotor (a), en el que dicho sitio de unión al ribosoma está derivado a partir de la secuencia conductora 10 del gen bacteriófago T7;
c)
una secuencia de ADN que codifica un péptido ubiquitina escindible,
d)
una secuencia de ADN que codifica una proteína de interés, y
e)
una región de terminación de transcripción; y
el crecimiento de una célula de planta que comprende dicho plástido transformado bajo condiciones adecuadas para la expresión de dicha proteína de interés y dicha secuencia ubiquitina escindible en dicho plástido; y
(4) un procedimiento de producción de una proteína N-terminal no metionina en un plástido, en el que dicho procedimiento comprende:
la transformación de un plástido con un constructo que comprende, como componentes unidos de manera operable en la dirección 5' a 3' de transcripción:
a)
una secuencia promotora del operón ARN ribosómico 16S (Prrn);
b)
un sitio de unión al ribosoma unido a dicho componente promotor (a), en el que dicho sitio de unión al ribosoma está derivado a partir de la secuencia conductora del gen 10 del bacteriófago T7;
c)
una secuencia de ADN que codifica una proteína de interés, en el que dicha proteína de interés es capaz de ser reconocida por una metionina amino peptidasa de célula de planta, y
d)
una región de terminación de transcripción; y
el crecimiento de una célula de planta que comprende dicho plástido transformado bajo condiciones adecuadas para la expresión de dicha proteína de interés que tiene una N-terminación no metionina.
Los constructos de expresión de plástidos para uso en esta invención incluyen una región promotora de plástido capaz de proporcionar la expresión potenciada de una secuencia de ADN, una secuencia de ADN que codifica una proteína EPSP o una hormona del crecimiento humano (hGH), y una región de terminación de la transcripción capaz de terminar la transcripción en un plástido de planta.
La región promotora del plástido de la presente invención está ligada a un sitio de unión al ribosoma que proporciona la traducción potenciada de transcriptos de ARNm en un plástido de planta.
El constructo de expresión de plástido de esta invención está ligado, preferiblemente, a un constructo que tiene una secuencia de ADN que codifica un marcador seleccionable que puede expresarse en un plástido de planta. La expresión del marcador seleccionable permite la identificación de células de plantas que comprenden un plástido que expresa el marcador.
En una realización preferida, los vectores para la transferencia del constructo dentro de una célula de planta incluyen medios para la inserción de los constructos de expresión y selección dentro del genoma del plástido. Preferiblemente, los vectores comprenden regiones de homología con el genoma del plástido diana que flanquean a los constructos.
Los constructos de la presente invención comprenden una secuencia promotora Prrn ligada a un sitio de unión al ribosoma capaz de potenciar la traducción de transcriptos de ARNm en el plástido de planta. El sitio de unión al ribosoma está derivado a partir de la secuencia conductora del gen 10 del bacteriófago T7.
De particular interés en la presente invención es el alto nivel de expresión de secuencias de ácido nucleico en plástidos de plantas. De particular interés es el alto nivel de expresión de secuencias de ácido nucleico que codifican enzimas implicadas en la tolerancia a herbicidas y que codifican proteínas farmacéuticas.
Los constructos de la presente invención comprenden, preferiblemente, una secuencia de ADN que codifica 5-enolpiruvilsiquimato-3-fosfato sintasa (Patente de EE.UU. 5.633.435), nitrilasa, fitoeno desaturasa, aprotinina o una secuencia de ADN que codifica la hormona del crecimiento humano (Patente de EE.UU. 5.424.199).
Los plástidos de células de plantas que contienen los constructos están igualmente contemplados en la invención, tal como son las plantas, semillas de plantas, células de plantas o progenies de las mismas que contienen en plástidos que comprenden el constructo.
La presente invención incluye, igualmente, procedimientos para la expresión potenciada de secuencias de ADN en plástidos de plantas.
La invención incluye, igualmente, un procedimiento para la expresión potenciada de una enzima que codifica la hGH en plástidos de la célula de la planta.
La presente invención incluye, además, procedimientos para la obtención de una proteína expresada a partir de una célula de planta, incluyendo un plástido, que tiene un N-terminal no metionina. Además, se contemplan células de plantas y plástidos que incluyen proteínas N-terminales no metionina.
De acuerdo con ello, la presente invención se refiere a un gen quimérico que contiene una secuencia que codifica una proteína farmacéutica, un vector de expresión de plástido de planta que contiene un promotor Prrn ligado de manera operable a un sitio de unión al ribosoma del gen 10 polimerasa del bacteriófago T7 capaz de expresión potenciada en un plástido de planta ligado de manera operable a un gen que codifica la tolerancia a herbicidas o compuestos farmacéuticos, un vector de transformación de plantas que tiene insertado en él un gen que codifica la tolerancia a herbicidas o producto farmacéutico expresado a partir de un promotor Prrn ligado a un sitio de unión al ribosoma del gen 10 polimerasa del bacteriófago T7, células de plantas transformadas usando dichos vectores y plantas regeneradas a partir de los mismos que muestran un grado substancial de expresión de secuencias de ácido nucleico y proteínas y procedimientos para la producción de dichas plantas y dichas plantas.
Breve descripción de los dibujos
La Figura 1 muestra la secuencia nucleótida del sitio de unión al ribosoma G10L.
La Figura 2 proporciona una secuencia de aminoácidos que codifica la aprotinina.
La Figura 3 proporciona los resultados del análisis mediante RP-HPLC para la caracterización de la proteína de lhGH expresada en el plástido. El pico I (pico más alto) indica el tiempo de retención esperado para la GP2000 de 22 kDa nativa, adecuadamente plegada.
La Figura 4 proporciona un análisis mediante espectrometría de masas (EM) de ionización por electropulverización usando un espectrómetro de masa de duración de la trayectoria por electropulverización Micromass Q-Tof. En particular, se proporcionan unas series de iones que corresponden a las especies presentes en la muestra con números variables de protones unidos. Los ejes del espectro son intensidad frente a la relación masa a carga de las especies presentes.
La Figura 5 proporciona una representación gráfica de la bioactividad de la hGH expresada a partir de un plástido de planta. Las muestras representadas sobre el gráfico son prolactina bovina (bPL), hGH expresada a partir de E. coli (Ala-hGH), y transgénico nulo inoculado con prolactina bovina (SPFF nulo inoculado) como controles positivos, un transgénico nulo (SPFF nulo) como un control negativo, y muestras transgénicas a partir de una columna de Sepharosa (SPFF muestra, SPFF muestra) y una muestra transgénica eluida a partir de la columna de Sepharosa a pH 3,5 (SPFF pH3,5 Eln).
Descripción detallada de la invención
De acuerdo con el sujeto de la invención, se proporcionan constructos de expresión de plástidos que comprenden un promotor Prrn que es funcional en un plástido de planta, un sitio de unión al ribosoma derivado a partir del conductor del gen 10 polimerasa del bacteriófago T7, una secuencia de ADN que codifica un gen de interés, y una región de terminación de transcripción capaz de terminación de la transcripción en un plástido de planta. Estos elementos se proporcionan como componentes unidos de manera operable en la dirección 5' a 3' de transcripción.
Además, los constructos de la presente invención pueden incluir igualmente una secuencia de ácido nucleico que codifica un péptido capaz de identificar dicha secuencia de ADN que codifica una proteína contra el lumen tilacoide dentro del cloroplasto.
De particular interés en la presente invención son procedimientos para la producción de proteínas en un plástico de célula de planta huésped que tiene un N-terminal no metionina. Generalmente, dichos procedimientos implican el uso de proteínas de fusión que tienen una secuencia N-terminal que está reconocida por una proteasa endógena. En particular, una secuencia de ADN que codifica un péptido ubiquitina escindible está fusionada a una secuencia de ADN que codifica una proteína de interés. Después de la expresión de la proteína de fusión en el plástido, una proteasa endógena actúa sobre la fusión para escindir la porción ubiquitina de la proteína.
Igualmente de interés en la presente invención es el uso de constructos de expresión de plástidos para dirigir la transcripción y traducción (expresión) de alto nivel de secuencias de ácidos nucleicos. Dichos constructos de expresión de plástidos encuentran su uso en la dirección de la expresión de alto nivel de secuencias de ADN que codifican enzimas implicadas en la tolerancia a herbicidas o que codifican la producción de proteínas farmacéuticas.
De interés más particular en la presente invención es el uso de los constructos de expresión de plástidos para dirigir la traducción de alto nivel del ARN mensajero transcrito.
La secuencia de ADN y los datos bioquímicos revelan una similitud de las maquinarias de transcripción y traducción de los orgánulos de plástidos y de las señales de iniciación con los encontrados en sistemas procarióticos. De hecho, se ha informado que las secuencias promotoras derivadas de plástidos dirigen la expresión de genes informadores en células procarióticas. Además, los genes de plástidos están frecuentemente organizados dentro de operones policistrónicos tal como existen en procariotes.
A pesar de las aparentes similitudes entre plástidos y procariotes, existen diferencias fundamentales en los procedimientos usados para controlar la expresión de genes en plástidos y procariotes. En oposición a los mecanismos de control de transcripciones típicamente observados en procariotes, la expresión del gen del plástido está predominantemente controlada al nivel de traducción y estabilidad del ARNm mediante proteínas codificadas de trans-actuacion nuclear.
La traducción es un procedimiento multi-etapa que implica, primeramente, la unión del ARN mensajero (ARNm) a ribosomas. Comenzando por el codón iniciador de la traducción, los codones ARNm se leen secuencialmente conforme los ribosomas se desplazan a lo largo de la molécula de ARNm. A continuación, los aminoácidos especificados se agregan secuencialmente a la cadena péptida en desarrollo para proporcionar la proteína o polipéptido codificado en el ARNm.
Tal como se ha mencionado, la primera etapa en el procedimiento de traducción es la unión de la molécula de ARNm al ribosoma. La naturaleza de esta interacción (es decir, unión) ha sido únicamente descubierta parcialmente. El análisis de oligonucleótdos resistentes a ARNasa aislada a partir de complejos de iniciación de traducción bacterianos, indica que un fragmento de ARN de aproximadamente 30 a 40 nucleótidos de longitud comprende el sitio de unión al ribosoma (RBS) inicial. De acuerdo con ello, se entiende aquí más adelante que un RBS comprende una secuencia de ARNm que rodea el codón iniciador de traducción, el cual es responsable de la unión al ribosoma y de la iniciación de traducción.
Recientemente, se han identificado sitios de unión a ribosomas que son capaces de dirigir la traducción en procariotes. Por ejemplo, se ha identificado un sitio de unión al ribosoma a partir del conductor del gen 10 del bacteriófago T7, G10L (Patente de EE.UU. 5.232.840), el cual potencia la expresión de secuencias de ácido nucleico en procariotes.
Los herbicidas tales como N-fosfonometilglicina, hidroxibenzonitrilos halogenas, y norflurazon, han sido el objeto de una gran cantidad de investigaciones.
La N-fosfonometilglicina, comúnmente denominada como glifosato, inhibe la vía del ácido siquímico que conduce a la biosíntesis de compuestos aromáticos que incluyen aminoácidos, hormonas de plantas y vitaminas. Específicamente, el glifosato reprime la conversión del ácido fosfoenolpirúvico (PEP) y el ácido 3-fosfosiquímico a ácido 5-enolpiruvil-3-fosfosiquímico mediante la inhibición de la enzima 5-enolpiruvilsiquimato-3-fosfato sintasa (denominada aquí más adelante como EPSP sintasa o EPSPS).
Se han producido plantas tolerantes al glifosato mediante la transformación de diversos genes de EPSP sintasa dentro del genoma nuclear de una planta. Se ha clonado un gen de EPSP sintasa a partir de Agrobacterium tumefaciens sp cepa CP4 (Patente de EE.UU. 5.633.435) y confiere un alto nivel de tolerancia al glifosato en plantas. Además, se han logrado altos niveles de tolerancia al glifosato en un cierto número de plantas de cultivo mediante la fusión de EPSPS a un péptido de tránsito de cloroplasto (CTP) para expresión dirigida en plástidos. Además, se han aislado variantes de la enzima EPSPS de tipo salvaje que son tolerantes al glifosato como un resultado de alteraciones en la secuencia que codifica los aminoácidos de EPSPS (Kishore y Shah, Ann. Rev. Biochem., vol. 57, págs. 627-663, (1988); Shulze y otros, Arch. Microbiol., vol. 137, págs. 121-123, (1984); Kishore y otros, Fed. Proc., vol 45, pág. 1506, (1986)). Típicamente, estas variantes tienen un K_{i} más alto por el glifosato que la enzima EPSPS de tipo salvaje la cual confiere fenotipo tolerante al glifosato, pero estas variantes se caracterizan igualmente por un K_{m} alto para PEP lo cual hace que la enzima sea cinéticamente menos eficaz (Kishore y Shah, Ann. Rev. Biochem., vol. 57, págs. 627-663, (1988); Sost y otros, FEBS Lett., vol. 173, págs. 238-241, (1984); Shulze y otros, Arch. Microbiol., vol. 137, págs. 121-123, (1984); Kishore y otros, Fed. Proc., vol. 45, pág. 1506, (1986); Sost y Amrhein, Arch. Biochem. Biophys., vol. 282, págs. 433-436, (1990)).
Además de las plantas manipuladas genéticamente para su tolerancia al glifosato, se han manipulado genéticamente plantas para tolerar otras clases de herbicidas tales como hidroxibenzonitrilos halogenados, y norflurazon, usando secuencias de ácido nucleico expresadas en el núcleo.
Los hidroxibenzonitrilos halogenados, tal como Bromoxinil, se ha sugerido que actúan herbecidamente mediante la inhibición del complejo de proteína de unión con quinona del fotosistema II, mediante la inhibición de la transferencia de electrones (Van Rensen, Physiol. Plant, vol. 54, págs. 515-520, (1982), y Sanders y Pallett, Pestic. Biochem. Physiol., vol. 26, págs. 116-122, (1986)). Los herbicidas tal como norflurazon inhiben la producción de carotenoides.
Se han producido plantas que son resistentes al Bromoxynil mediante la expresión de secuencias de ADN que codifican enzimas capaces de destoxificación del Bromoxynil (nitrilasas) en el núcleo de la célula de la planta. Las secuencias de ADN que codifican dichas nitrilasas han sido clonadas a partir de bacterias tal como Klebsiella pneumoniae y usadas para construir vectores para dirigir la expresión de la secuencia de ADN en el núcleo de la célula de la planta (Patente de EE.UU. 4.810.648).
Se han manipulado genéticamente plantas que son resistentes al Norflurazon, mediante la expresión de secuencias de ácido nucleico que codifican enzimas en la vía de la biosíntesis de carotenoides en núcleos de células de plantas. Por ejemplo, la expresión de una fitoeno desaturasa a partir de Erwinia uredovora proporciona tolerancia al Norflurazon.
Aunque las plantas transformadas para expresar secuencias de ácido nucleico que codifican duchas enzimas a partir del genoma nuclear han encontrado utilidad en la manipulación genética de plantas tolerantes a herbicidas, sería con creces beneficioso obtener plantas tolerantes a herbicidas mediante la expresión de plástidos.
En los ejemplos aquí proporcionados, las secuencias de ADN que codifican enzimas implicadas en la tolerancia a herbicidas se han usado en constructos para dirigir la expresión de las secuencias a partir del plástido de la planta. Las secuencias de ADN que codifican la 5-enolpiruvilsiquimato-3-fosfato sintasa (EPSPS), bromoxinil nitrilasa (Bxn), fitoeno desaturasa (crtI (Misawa y otros, Plant Journal, vol. 4, págs. 833-840, (1993), y Plant Jour, vol. 6, págs. 481-489, (1994)), y acetohidroxiácido sintasa (AHAS (Sathasiivan y otros, Nucl. Acids Res., vol. 18, págs. 2188-2193, (1990)) se usan en los constructos de expresión de la presente invención para dirigir la expresión de dichas secuencias nucleótidas de tolerancia al herbicida procedentes del plástido de la planta.
Se han identificado plantas de tabaco transplastómicas que son homoplásmicas para las secuencias de ADN que codifican los genes de tolerancia al herbicida. Las plantas homoplásmicas demuestra un alto nivel de expresión de proteína a partir del plástido. Además, las plantas homoplásmicas demuestran un alto nivel de tolerancia por el herbicida respectivo. Por ejemplo, tal como se describe con más detalle en el ejemplo más adelante, las plantas transformadas para expresar EPSPS a partir del plástido demuestran un alto nivel de tolerancia por el glifosato herbicida. Además, las líneas de tabaco homoplásmicos que expresan nitrilasa o fitoeno desaturasa demuestran altos niveles de tolerancia por los herbicidas Bromoxynil y Norflurazon, respectivamente.
Un técnico experto en la técnica al cual pertenece la presente invención, reconocerá que pueden usarse secuencias adicionales en los constructos de expresión de plástidos de la actual invención para producir plantas tolerantes a herbicidas. Otra secuencia de ácido nucleico que puede encontrar uso en los constructos de expresión de plástidos de plantas tolerantes a herbicidas incluye el gen bar para tolerancia al glufosinato (DeBlock y otros, EMBO J., vol. 6, págs. 2513-2519, (1987)).
Aún más, pueden usarse genes de tolerancia al glifosato adicionales en los constructos de la presente invención. Los genes EPSPS tolerantes al glifosato adicionales se describen en la Patente de EE.UU. No. 5.627.061, en Padgette y otros, Herbicide Resistant Crops, Lewis Publishers, págs. 53-85, (1996), y en Penaloza-Vazquez y otros, Plant Cell Reports, vol. 14, págs. 482-487, (1995).
Debería indicarse que los constructos de tolerancia a herbicidas de la presente invención pueden incluir igualmente secuencias que codifican genes implicados en otros genes de tolerancia al estrés, por ejemplo genes de resistencia/tolerancia a insectos o enfermedades. Tal como se describe con más detalle en los ejemplos que siguen, se han usado constructos de expresión de plástidos para regenerar plantas que son resistentes al herbicida Buctril, y que igualmente expresan la proteína cry1Ac del Bacillus thuringensis.
Además, los constructos de expresión de plástidos encuentran uso igualmente en la dirección de la producción de proteínas biológicas humanas (proteínas farmacéuticas) a partir del plástido de plantas. Tal como se establece con detalle en los ejemplos, se proporcionan constructos para expresión de aprotinina y de hormona del crecimiento humano en el plástido de plantas. Otras secuencias que pueden encontrar uso en los constructos de expresión de la presente invención para la producción de productos biológicos humanos incluyen secuencias que codifican insulina o precursores de insulina. Sin embargo, el técnico experto reconocerá que pueden usarse muchas secuencias de nucleótidos que codifican productos biológicos en los constructos de la presente invención para dirigir su expresión a partir de un plástido de planta, tales como los descritos por Goodman y Gelman en Pharmacological Basis of Therapeutics, Pergamon Press, 8ª Edición, Secciones 14 y 15, (1990). Igualmente, se contempla que cualquier proteína para la cual se ha identificado la secuencia nucleótida pueda ser usada en los constructos de la presente invención.
La presente invención proporciona, igualmente, procedimientos para la producción de una proteína farmacéutica con un N-terminal no metionina en un plástido de planta. En general, los procedimientos comprenden la expresión de una proteína de fusión que incluye un gen de ubiquitina fusionado a una proteína de interés en un plástido. El gen de ubiquitina se obtiene a partir de una fuente natural y se clona dentro de un vector apropiado, tal como se describe en el Documento WO 88/02406, véase anteriormente, o se sintetiza químicamente, usando, por ejemplo, el procedimiento descrito por Ecker y otros, J. Biol. Chem., vol. 262, págs. 3524-3527, (1987) y Ecker y otros, J. Biol. Chem., vol. 262, págs. 14213-14221, (1987), cuyas descripciones se incorporan como referencia. Las proteínas de fusión de ubiquitina son reconocidas por la ubiquitina proteasa, contrariamente a los informes previos (Vierstra, Plant Mol. Biol., vol. 32, págs. 275-302, (1996)), las cuales se escinden inmediatamente más abajo del resto glicina de carboxi-terminación de ubiquitina. Esta propiedad ha permitido la producción de proteínas recombinantes que contienen restos N-terminales distintos de la metionina (Baker, Current Opin. Biotech., vol. 7, págs. 541-546, (1996)).
Igualmente, se proporcionan procedimientos adicionales para la producción de proteínas farmacéuticas con un N-terminal no metionina en un plástido de planta. Tal como se describe más completamente en los Ejemplos más adelante, se prepararon constructos para dirigir la producción de una metionina-hGH (M-hGH) en un plástido de célula de planta. Generalmente, los constructos comprenden una región de iniciación de transcripción y una secuencia de ADN que codifica la hGH. De manera sorprendente, la secuenciación del aminoácido N-terminal de la hGH extraída producida en las plantas transplastómicas revela que la metionina N-terminal se escinde a paritr de la proteína hGH madura, produciendo hGH con una alanina N-terminal (A-hGH). Este resultado indica la interacción de la hGH expresada con una metionina amino peptidasa (MAP) en la célula de la planta. Aunque se espera que cualquier aminoácido puede seguir al N-terminal de metionina, preferiblemente, el segundo aminoácido se selecciona entre el grupo constituido por alanina, cisteína, glicina, prolina, serina, treonina, y valina.
Tal como se describe con más detalle más adelante, se han usado secuencias de ácido nucleico que codifican la hormona del crecimiento humano (hGH) en los constructos de expresión de plástidos de la presente invención. Además, las plantas de tabaco transplastómicas que contienen dichos constructos demuestran un alto nivel de expresión de hGH. Así mismo, la proteína de hGH expresada a partir del plástido de la planta muestra características de procesamiento adecuado así como plegado apropiado de la proteína.
La hormona del crecimiento humano (hGH) participa mucho de la regulación del crecimiento y desarrollo humano normal. Esta hormona de la pituitaria de 22.000 dalton muestra una multitud de efectos biológicos que incluyen el crecimiento lineal (somatogénesis), lactancia, activación de macrófagos, efectos diabetogénicos y de tipo insulina entre otros (Chawla, Ann. Rev. Med., vol. 34, pág. 519, (1983); Edwards y otros, Science, vol. 239, pág. 769, (1988); Thorner y otros, J. Clin. Invest., vol. 81, pág. 745, (1988)). La hGH es un miembro de una familia de hormonas homólogas que incluyen lactógenos placentales, prolactinas, y otras variantes genéticas y de especies de la hormona del crecimiento (Nicoll y otros, Endocrine Reviews, vol. 7, pág. 169, (1986)). La hGH es inusual entre estas dado que muestra especificidad por un amplio número de especies y se une o bien al receptor somatogénico clonado (Leung y otros, Nature, vol. 33, pág. 537, (1987)) o bien al receptor de prolactina (Boutin y otros, Cell, vol. 53, pág. 69, (1988)). El uso principal de hGH es en el tratamiento del enanismo hipopituitario en niños. Las indicaciones adicionales son en el tratamiento del síndrome de Turner, fallo renal crónico, síndrome de agotamiento por VIH y el tratamiento de los enfermos de edad avanzada y críticos (Tritos y otros, Am. J. Med., vol. 105, págs. 44-47, (1998)).
A medida que se produce en la glándula pituitaria, la hGH entra en el sistema secretor, comidiendo con la eliminación de su péptido señal y la formación de dos enlaces disulfuro (Chawla y otros, (1983), véase anteriormente). En la glándula pituitaria, la separación del péptido señal de la hGH (también denominada como somatotropina humana o hST) durante la secreción libera fenilalanina como el aminoácido de N-terminación (Chawla y otros, Annu. Rev. Med., vol. 34, págs. 519-547, (1983)). Como la traducción normal en plástidos se inicia en la metionina, se diseñó una fusión ubiquitina-hGH para proporcionar una fenilalanina N-terminal (F-hGH) en el producto hGH final.
De manera sorprendente, aunque se ha informado anteriormente que la ubiquitina proteasa no está presente en cloroplastos (Vierstra, Plant Mol. Biol., vol. 32, págs. 275-302, (1996)), la fusión ubiquitina-hGH se procesó durante la síntesis, acumulación o purificación a partir de las plantas para producir un producto hGH de fenilalanina N-terminal (F-hGH). El constructo de control que porta el ADNc de longitud completa codifica metionina y alanina como los primeros aminoácidos de hGH.
Tal como se describe en los Ejemplos más adelante, los constructos que comprenden secuencias de ácido nucleico que codifican aprotinina (también conocida como inhibidora de tripsina pancreática bovina, BPTI) se usaron en constructos de expresión de plástidos de la presente invención. La aprotinina es una proteína básica presente en diversos órganos y tejidos bovinos, tales como nódulos linfáticos, páncreas, pulmones, glándula parótida, bazo e hígado. Se sabe que la aprotinina inhibe diversas serina proteasas, incluyendo tripsina, quimotripsina, plasmina y calicreína, y se usa terapéuticamente en el tratamiento de pancreatitis aguda, diversas fases del síndrome de choque, hemorragia hiperfibrinolítica e infarto de miocardio. Además, la administración de aprotinina en dosis altas reduce de manera significativa la pérdida de sangre en relación con la cirugía cardíaca, incluyendo el bypass cardiopulmonar (Bidstrup y otros, Cardiovasc. Surg., vol. 44, págs. 640-645, (1989)).
En el desarrollo de los constructos, los diversos fragmentos que comprenden las regiones reguladoras y el marco de lectura abierto pueden someterse a diferentes condiciones de procesado, tales como ligamiento, digestión de enzima de restricción, PCR, mutagénesis in vitro, adición de ligadores y adaptadores. De acuerdo con ello, pueden llevarse a cabo transiciones, transversiones, inserciones, deleciones, o similares, de nucleótidos, sobre el ADN que se esté usando en las regiones reguladoras o las secuencias del ADN de interés para expresión en los plástidos. Los procedimientos para digestos de restricción, tratamientos de extremos romos de Klenow y ligamientos, son bien conocidos para los expertos en la técnica y se encuentran descritos, por ejemplo, por Maniatis y otros (en Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, (1989)).
Durante la preparación de los constructos, los diversos fragmentos de ADN se clonarán frecuentemente en un vector de clonación apropiado, lo cual permite la amplificación del ADN, la modificación del ADN o la manipulación del ADN mediante secuencias de unión o separación, o ligadores. Preferiblemente, los vectores serán capaces de replicación hasta al menos un número relativamente alto de copias en E. coli. Se encuentran fácilmente disponibles un cierto número de vectores para clonación, los cuales incluyen vectores tales como pBR322, vectores de las series pUC, vectores de las series M13, y vectores pBluescript (Stratagene, La Jolla, CA).
Con el fin de proporcionar unos medios de selección de las células de plantas deseadas, los vectores de transformación de plástidos contienen, típicamente, un constructo que proporciona la expresión de un gen marcador seleccionable. Los genes marcadores son secuencias de ADN expresables en plantas que expresan un polipéptido que resiste una inhibición natural, mediante la atenuación o inactivación de una substancia selectiva, incluyendo, pero sin limitarse a ellas, antibiótico y herbicida.
Como alternativa, un gen marcador puede proporcionar alguna otra respuesta reactiva visible, es decir, puede ocasionar un aspecto o un patrón de crecimiento distintivo con relación a plantas o células de plantas que no expresan el gen marcador seleccionable en la presencia de alguna substancia, bien sea aplicado directamente a la planta o células de plantas o bien presente en la planta o en el medio de crecimiento de la célula de planta.
En ambos casos, las plantas o células de plantas que contienen dichos genes marcadores seleccionables mostrarán un fenotipo distintivo para fines de identificación, es decir, serán distinguibles de las células no transformadas. El fenotipo característico permite la identificación de células, grupos de células, tejidos, órganos, partes de plantas o plantas completas que contienen el constructo.
La detección del fenotipo marcador hace posible la selección de células que tienen un segundo gen al cual se ha ligado el gen marcador. Típicamente, este segundo gen comprende un fenotipo deseable el cual no es fácilmente identificable en células transformadas, pero el cual está presente cuando la célula de planta o un derivado de la misma crece hasta la madurez, incluso bajo condiciones en las que el propio fenotipo marcador seleccionable no es evidente.
El uso de un marcador de este tipo para la identificación de células de plantas que contienen un constructo de plástido ha sido descrito por Svad y otros (1993, véase anteriormente). En los Ejemplos proporcionados más adelante, se expresa un gen aadA bacteriano como el marcador bajo el control regulador de las regiones promotora 5' y de terminación de transcripción 3' del cloroplasto, específicamente las regiones reguladoras del gen psbA (descrito por Staub y otros, en EMBO J., vol. 12 (nº 2), págs. 601-606, (1993)). Igualmente, pueden usarse numerosas regiones promotoras adicionales para impulsar la expresión del gen marcador seleccionable, incluyendo diversos promotores de plástidos y promotores bacterianos los cuales se ha mostrado que funcionan en plástidos de plantas.
La expresión del gen aadA confiere resistencia a la espectinomicina y estretomicina, y, de acuerdo con ello, permite la identificación de células de plantas que expresan este marcador. El producto del gen aadA permite el crecimiento continuo y el verdeamiento de células cuyos cloroplastos comprende el producto del gen marcador seleccionable. Las células que no contienen el producto del gen marcador seleccionable están blanqueadas. De acuerdo con ello, la selección para el gen marcador aadA está basada en la identificación de células de plantas que no son blanqueadas por la presencia de estreptomicina, o más preferiblemente de espectomicina, en el medio de crecimiento de la planta.
Se han desarrollado un cierto número de marcadores para uso con células de plantas, tales como de resistencia al cloranfenicol, al aminoglicósido G418, o a higromicina. Igualmente, pueden usarse como marcadores seleccionables otros genes que codifican un producto implicado en el metabolismo del cloroplasto. Por ejemplo, los genes que proporcionan resistencia a herbicidas para plantas tales como glifosato, bromoxynil o imidazolinona pueden encontrar un uso particular. Se ha informado de dichos genes (Stalker y otros, J. Biol. Chem., vol. 260, págs. 4724-4728, (1985) (EPSP resistente al glifosato); Stalker y otros, J. Biol. Chem., vol. 263, págs. 6310-6314, (1985) (gen nitrilasa resistente al bromoxynil); y Sathasivan y otros, Nucl. Acid. Res., vol. 18, pág. 2188, (1990) (gen de resistencia a imidazolinona AHAS)).
Se ha informado de la transformación estable de genomas de plástidos del tabaco mediante bombardeo de partículas (Svab y otros, (1990), véase anteriormente, y Svad y otros, (1993), véase anteriormente). Los procedimientos allí descritos pueden usarse para obtener plantas homoplásmicas para constructos de expresión de plástidos.
Generalmente, el tejido bombardeado se cultiva durante aproximadamente 2 días sobre un medio que promueve la división celular, después de lo cual el tejido de la planta es transferido a un medio selectivo que contiene una cantidad inhibidora del agente selectivo particular, así como las hormonas particulares y otras substancias necesarias para obtener la regeneración de dichas especies de plantas particulares. A continuación, los vástagos son subcultivados sobre el mismo medio selectivo para asegurar la producción y selección de vástagos homoplásmicos.
Las plantas de tabaco transplastómicas son analizadas para determinar una población pura de genomas de plástidos transformados (líneas homoplásmicas). La homoplasmia se verifica usando el análisis Southern que usa sondas de ácido nucleico de ligamiento a una región del transgen y del genoma del cloroplasto (es decir, la región de inserción). Las plantas transplastómicas que son heteroplásmicas (es decir, que contienen una mezcla de genomas de plástidos que contienen y carecen del transgen) se caracterizan mediante un patrón de hibridación de bandas tipo salvaje y transgénicas. Las plantas homoplásmicas muestran un patrón de hibridación que carece de la banda de tipo salvaje.
Como alternativa, la homoplasmia puede virificarse usando la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Se usan cebadores de PCR que están dirigidos para amplificar a partir de secuencias procedentes de la región de inserción. Por ejemplo, puede usarse un par de cebadores en una reacción PCR. Un cebador amplifica a partir de una región en el transgen, en tanto que el segundo cebador amplifica a partir de una región próxima a la región de inserción en dirección de la región de inserción. Usando cebadores diseñados para amplificar la región de inserción, se lleva a cabo una segunda reacción PCR. Las líneas transplastómicas identificadas como homoplásmicas producen el fragmente del tamaño deseado en la primera reacción, mientras que no producen el fragmento del tamaño predicho en la segunda reacción.
En los casos que se han adaptado procedimientos de transformación y regeneración para una especie de planta dada, bien mediante transformación mediada por Agrobacterium, o bien por bombardeo o algún otro procedimiento, las técnicas establecidas pueden ser modificadas para uso en procedimientos de selección y regeneración con el fin de producir plantas transformadas con plástidos. Por ejemplo, los procedimientos aquí descritos para tabaco son fácilmente adaptables a otras especies solanáceas, tales como tomate, petunia y patata.
Para la transformación de soja, se ha descrito el bombardeo de partículas así como protocolos de transformación y regeneración nuclear mediados por Agrobacterium (Hinchee y otros, Patente de EE.UU. 5.416.011, y Christou y otros, Patente de EE.UU. 5.015.580). El técnica experto reconocerá que pueden usarse los protocolos descritos para la transformación de la soja.
En Brassica, los protocolos de transformación y regeneración mediados por Agrobacterium implican, generalmente, el uso de tejido hipocotilo, un tejido no verde que podría contener un bajo contenido de plástido. De acuerdo con ello, para Brassica, los tejidos diana preferidos incluirían tejidos hipocotilo derivados de microesporas o cotiledonarios (los cuales son verdes y, por ello, contienen numerosos plástidos) de explantes de tejido de hoja. Aunque las proporciones de regeneración a partir de dichos tejidos puedan ser bajas, no son de esperar efectos posicionales, tales como los observados con transformación mediada por Agrobacterium, por lo cual, no sería necesario rastrear numerosas plantas satisfactoriamente transformadas con el fin de obtener un fenotipo deseado.
Para el algodón, se ha descrito la transformación de cotiledones de Gossypium hirsurtum L. mediante co-cultivo con Agrobacterium tumefaciens por Firoozabady y otros, Plant Mol. Bio., vol. 10, págs. 105-116, (1987) y Umbeck y otros, Bio/Technology, vol. 5, págs. 263-266, (1987). De nuevo, al igual que para la Brassica, este tejido puede contener un contenido en plástido insuficiente para la transformación del cloroplasto. De acuerdo con ello, al igual que para la Brassica, puede ser deseable un procedimiento alternativo para transformación y regeneración de tejido diana alternativo que contenga cloroplastos, por ejemplo para identificación de tejido embriogénico verde.
Otras especies de plantas pueden ser transformadas de manera similar usando técnicas relacionadas. Como alternativa, pueden usarse igualmente procedimientos de bombardeo mediante microproyectiles, tal como los descritos por Klein y otros (Bio/Technology, vol. 10, págs. 286-291) para obtener plantas transformadas nucleares que comprenden los constructos de expresión de ARN polimerasa de la subunidad única viral descrita aquí. La transformación de algodón mediante bombardeo por partículas ha sido informada en el documento WO 92/15675, publicado el 17 de Septiembre de 1992. Las plantas adecuadas para la práctica de la presente invención incluyen, pero sin limitarse a ellas, soja, algodón, alfalfa, aceite de colza, lino, tomate, remolacha azucarera, girasol, patata, tabaco, maíz, trigo, arroz y lechuga.
Los vectores para uso en la transformación de plástidos incluyen, preferiblemente, medios para proporcionar una transferencia estable del constructo de expresión del plástido y el constructo marcador seleccionable dentro del genoma del plástido. Este es proporcionado lo más convenientemente por regiones de homología al genoma del plástido diana. Las regiones de homología flanquean el constructo a transferir y proporcionan la transferencia al genoma del plástido mediante recombinación de homólogos, a través de un doble entrecruzamiento dentro del genoma. Se ha informado sobre la secuencia de ADN completa del genoma del plástido del tabaco (Shinozaki y otros, EMBO J., vol. 5, págs. 2043-2049, (1986)). Igualmente, se ha informado sobre las secuencias del ADN completo de los genomas de plástidos procedentes de la agrimonia (Ohyama y otros, Nature, vol. 322, págs. 572-574, (1986) y del arroz (Hiratsuka y otros, Mol. Gen. Genet., vol. 217, págs. 185-194, (1989).
Cuando se encuentran presentes regiones de homología en las regiones repetidas invertidas del genoma del plástido (conocidas como IRA y IRB), son de esperar dos copias del transgen por plástido transformado. Cuando las regiones de homología están presentes fuera de las regiones repetidas invertidas del genoma del plástido, es de esperar una copia del transgen por plástido transformado. Las regiones de homología de dentro del genoma del plástido son de un tamaño de aproximadamente 1 kb. Igualmente, pueden usarse regiones de homología más pequeñas, y tan pequeñas como de 100 bp pueden proporcionar la recombinación de homólogos dentro del genoma del plástido. Sin embargo, la frecuencia de recombinación y, por ello, la frecuencia de obtención de plantas que tienen plástidos transformados disminuye al disminuir el tamaño de las regiones de homología.
Los ejemplos de constructos que tienen regiones de homología dentro del genoma del plástido han sido descritos por Svad y otros (1990, véase anteriormente), Svad y otros (1993, véase anteriormente) y Zoubenko y otros, Nuc. Acids Res., vol. 22, (no. 19), págs. 3819-3824, (1994)).
Tal como se describe con más detalle en los Ejemplos más adelante, se describen constructos que proporcionan la expresión potenciada de secuencias de ADN en plástidos de plantas. Se han usado diversas secuencias de promotor/sitios de unión al ribosoma para dirigir la expresión en plástidos de plantas. En particular, las secuencias promotoras del operón de ARN ribosómico 16S (Prrn) están ligadas a un sitio de unión al ribosoma (RBS) derivado a partir de la secuencia conductora del gen 10 del bacteriófago T7 (G10L). Las secuencias de ADN expresadas bajo el control regulador de la secuencia Prrn/G10L muestran un nivel de expresión de proteína significativamente más alto que los niveles obtenidos bajo el control de otras combinaciones promotor/RBS, mientras que la expresión del ARNm puede ser o no ser más alta en estas plantas.
En los Ejemplos de más adelante, las secuencias de ácido nucleico que codifican la EPSP sintasa de CP4 (Patente de EE.UU. 5.633.435) están situadas dentro de constructos de expresión para expresión de la enzima EPSP sintasa de CP4 a partir del plástido de la planta. Además, una secuencia de ADN que codifica la hGH (Patente de EE.UU. 5.424.199) está igualmente situada dentro del constructo de expresión para la expresión de la hormona del crecimiento humano a partir del plástido de la planta. Los constructos preparados usan un sitio de unión al ribosoma diseñado después del conductor del gen 10 del bacteriógafo T7 (G10L) para incrementar la expresión de las secuencias de ácido nucleico en el plástido de la planta.
Los constructos de expresión de plástidos que codifican la expresión de EPSPS y hGH se introducen a través de un vector de transformación de cloroplasto.
Las líneas de tabaco que contienen la secuencia nativa que codifica a la enzima EPSPS expresada en plástidos bajo el control de la secuencia promotor/sitio de unión al ribosoma Prrn/G10L, demuestran un nivel de expresión de proteína significativamente más alto que los niveles obtenidos a partir de EPSPS expresada bajo el control de la secuencia Prrn/rbcL(RBS). Sin embargo, el ARNm de EPSPS está expresado a un nivel más alto en plantas que expresan EPSPS de CP4 a partir del plástido bajo el control de Prrn/rbcL(RBS). Estos resultados indican que la traducción a partir de transcriptos que contienen el sitio de unión ribosoma del gen 10 del bacteriófago T7 es más eficaz. Además, los niveles de expresión de proteína de EPSPS obtenidos a partir de líneas de tabaco transplastómicas que expresan EPSPS bajo el control de Prrn/G10L(RBS), proporcionan un nivel más alto de tolerancia al glifosato.
Además, las líneas de tabaco transplastómicas transformadas para expresadas hGH bajo el control de la secuencia promotor/sitio de unión al ribosoma Prrn/G10L, demuestran un nivel de expresión de proteína significativamente más alto que los niveles obtenidos a partir de hGH expresada bajo el control de la secuencia promotor PpsbA/RBS.
Pueden obtenerse incrementos en los niveles de expresión de proteína de al menos aproximadamente 200 veces a partir de constructos que usan el Prrn/sitio de unión al ribosoma G10L para la expresión de EPSPS y hGH sobre los niveles de expresión obtenidos a partir de otras combinaciones promotor/RBS para la expresión de plástidos. Además, los niveles de proteína obtenidos a partir de constructos de expresión de plástidos que usan la secuencia promotor/RBS Prrn/G10L pueden acumular niveles 50 a 3500 veces más altos que los constructos de expresión nuclear. De acuerdo con ello, la inclusión del sitio de unión al ribosoma G10L en constructos de expresión de plástidos puede encontrar uso para incrementar los niveles de expresión a partir de plástidos de plantas.
Más aún, los constructos de la presente invención pueden igualmente incluir secuencias para identificar la proteína expresada en una región suborganular particular, por ejemplo, el lumen tilacoide del cloroplasto. Por ejemplo, tal como se describe en los Ejemplos más adelante, una secuencia nucleótida que codifica un péptido procedente del genoma del plástido del citocromo f identifica la proteína aproteína expresada contra la membrana tilacoide. Dicha identificación de proteínas expresadas puede proporcionar una compartimentación de la proteína lo que permite el incremento de estabilidad oxidativa y un plegado apropiado de la proteína.
La invención se describe a continuación de manera general, y será más fácilmente entendida con referencia a los Ejemplos siguientes.
Ejemplos Ejemplo 1 Constructos de expresión
Los constructos y procedimientos para uso en la transformación de plástidos de plantas superiores han sido descritos por Zoubenko y otros (Nucl. Acids Res., vol. 22, (no. 19), págs. 3819-3824, (1994), Svab y otros (Proc. Natl. Acad. Sci., vol. 87, págs. 8526-8530, (1990) y Proc. Natl. Acad. Sci., vol. 90, págs. 913-917, (1993) y Staub y otros (EMBO J., vol. 12, págs. 601-606, (1993)). Los constructos y procedimientos para uso en la transformación de plástidos de plantas superiores para expresar secuencias de ADN bajo el control de una T7 polimerasa identificada por plástido, codificado nuclearmente, se encuentran descritos en la Patente de EE.UU. 5.576.198. Las secuencias del ADN completo del genoma del plástido del tabaco han sido informadas por Shinozaki y otros (EMBO J., vol. 5, págs. 2043-2049, (1986)). Todas las referencias al ADN del plástido en la descripción que sigue son al número de nucleótidos procedentes del tabaco.
La secuencia de nucleótidos completa que codifica el citocromo f del tabaco (petA) ha sido descrita por Bassham y otros, en J. Biol. Chem., vol. 266, págs. 23606-23610, (1991) y por Konishi y otros, en Plant Cell Physiol., vol. 34, págs. 1081-1087, (1993).
IA. Secuencias promotor/ sitio de unión al ribosoma
La región promotora del operón de ARN ribosómico del plástido 16S (Prrn) está ligada a un sitio de unión al ribosoma (RBS) sintético usado como molde sobre el conductor del gen rbcL del plástido para crear el fragmento de Prrn/rbcLRBS. La secuencia de Prrn/rbcLRBS es tal como ha sido descrita por Svab y otros (1993, véase anteriormente) para el fragmento Prrn/rbcL(S).
La región promotora de las secuencias del promotor (PpsbA) y de terminación (TpsbA) del plástido psbA han sido descritas por Staub y otros (EMBO J., vol. 12, págs. 601-606, (1993)).
La secuencia Prrn/G10L se construyó mediante la reasociación de dos secuencias de oligonucleótidos, conductor 1 de T7 y conductor 2 de T7 (Tabla 1), para crear el sitio de unión al ribosoma del plástido G10L (Figura 1). La secuencia G10L se ligó a la terminación 3' de la secuencia promotora Prrn como un fragmento EcoRI/NcoI para crear la secuencia Prrn/G10L.
TABLA 1
1
Preferiblemente, los genes quiméricos se insertaron dentro del vector de expresión para dirigir su transcripción a partir del promotor Prrn. De acuerdo con ello, en el genoma del plástido, los genes quiméricos son transcriptos a partir del promotor Prrn/RBS, o el promotor Prrn/G10L en el plástido de la planta.
IB. Constructos de expresión del plástido EPSPS de CP4
Se construyó un vector de expresión del plástido pMON30117 a partir de un vector precursor pPRV111B (Zoubenko y otros, 1994, véase anteriormente, registro de GenBank U12813). El vector pMON30117 porta un sitio de clonación múltiple para la inserción de un gen pasajero en una caja de expresión Prrn/rbcLRBS/Trps16. La secuencia Prrn/rbccLRBS se clonó dentro del vector pPRV111B como un fragmento EcoRI/NcoI, y la región de terminación procedente del gen rps16 del plástido (Trps16) se clonó 3' con respecto del promotor Prrn como un fragmento HindIII/NcoI. El fragmento Trps16 comprende la región reguladora 3' del gen rps16 desde los nucleótidos 5.087 a 4.939 en el ADN plásmido del tabaco.
La estructura principal del pPRV111B del vector pMON30117 contiene un gen marcador, aadA, para la selección de espectinomicina y estreptomicina, y el rps 7/12 para la integración, mediante recombinación de homólogos, del ADN pasajero dentro de la región intergénica trnV-rps7/12.
El constructo de expresión del plástido pMON30118 se preparó mediante clonación del gen de EPSPS de CP4 nativo fusionado con los cinco (5) aminoácidos N-terminales procedentes del plástido rbcL (descrito por Svab y otros, 1993, véase anteriormente) como un fragmento NcoI/SmaI dentro del sitio de clonación multiple del vector pMON30117.
El constructo de expresión del plástido pMON30123 es, esencialmente, el mismo que pMON30118 con la excepción de la deleción de los cinco (5) aminoácidos N-terminales procedentes del plástido rbcL.
El constructo de expresión del plástido pMON30130 se creó reemplazando la EPSPS de CP4 nativa de pMON
30123, con un gen CP4 sintético. Este constructo carece, igualmente, de la fusión de los 5 aminoácidos N-terminales procedentes del gen rbcL del plástido.
El constructo de expresión del plástido pMON38773 se construyó reemplazando la secuencia Prrn/RBS de pMON
30123 con la secuencia promotora Prrn/G10L descrita anteriormente. La secuencia de ADN de EPSPS de pMON38773 carece, igualmente, de la fusión de los 5 aminoácidos N-terminales procedentes del gen rbcL del plástido.
Se construyó un constructo de expresión de plástido, el pMON38766, usando el promotor procedente del gen 10 del fago T7 (P-T7), que incluye G10L, la región que codifica el gen CP4 (nativo), y la secuencia de terminación procedente del gen rps16 del plástido (Trps16).
Se construyó un constructo de expresión de plástido, el pMON38797, usando el promotor procedente del gen 10 del fago T7 (P-T7), que incluye G10L, la región que codifica el gen CP4 (sintético), y el terminador procedente del gen rps16 del plástido (Trps16).
Se construyó un constructo de expresión de plástido, el pMON38798, usando el promotor del operón de ADN de 16Sr (Prrn), G10L, la región que codifica el gen CP4 (sintético), y el terminador procedente del gen rps16 del plástido (Trps16).
Se construyó un constructo de expresión de plástido, el pMON38793, usando el promotor del operón de ADN de16Sr (Prrn), un sitio de unión al ribosoma (RBS) sintético usado como molde procedente del gen rbcL del plástido, el gen EPSP sintasa de petunia (P-EPSPS, Padgette y otros, Arch. Biochem. Biophys., vol. 258, págs. 564-573, (1987)) tolerante al glifosato, que porta la mutación de glicina a alanina en la posición del aminoácido 101, y el terminador procedente del gen rps16 del plástido (Trps16).
Se construyó un constructo de expresión de plástido, el pMON38796, usando el promotor del operón de ADN de16Sr (Prrn), un sitio de unión al ribosoma (RBS) sintético usado como molde procedente del gen rbcL del plástido, el gen EPSP sintasa de Achromobacter (cepa LBAA) tolerante al glifosato (Patente de EE.UU. 5.627.061), que porta la mutación de glicina a alanina en la posición del aminoácido 100, y el terminador procedente del gen rps16 del plástido (Trps16).
Se construyó un constructo de expresión de plástido, el pMON45204, usando el promotor del operón de ADN de 16Sr (Prrn) con G10L, el gen EPSP sintasa de Pseudomonas (cepa LBAA) tolerante al glifosato, que porta la mutación de glicina a alanina en la posición del aminoácido 100, y el terminador procedente del gen rps16 del plástido (Trps16).
Se construyó un constructo de expresión de plástido, el pMON45201, usando el promotor del operón de ADN de16Sr (Prrn), un sitio de unión al ribosoma (RBS) sintético usado como molde procedente del gen rbcL del plástido, el gen (EPSPS) de Bacillus subtilis aroE tolerante al glifosato de tipo salvaje (Patente de EE.UU. 5.627.061), y el terminador procedente del gen rps16 del plástido (Trps16).
IC. Constructos de expresión del plástido Bucril (bxn)
El gen de resistencia al herbicida bxn (Patente de EE.UU. 4.810.648) se separó del plásmido pBrx47 como un fragmento de restricción NcoI a Asp718 y se clonó dentro del corte Nco/Asp718 de pUC120, dando como resultado el plásmido pBrx87. A continuación, el plásmido pBrx87 se digirió con Nco/Xba y se clonó dentro de los sitios Nco/Xba del plásmido pLAA21 que contiene el promotor del plástido Prrn y la región 3' de rpsL para la expresión del plástido. El plásmido resultante se le designó como pBrx89. El plásmido pBrx89 se digirió con SacI y HindIII y el gen bxn quimérico de 1,5 kb con señales de expresión del plástido se insertó dentro de los sitios Sac/HindIII del vector de homología del plástido del tabaco pOVZ44B (Zoubenko y otros, Nuc. Acids Res., vol. 22, págs. 3819-3824, (1994)) para crear el plásmido pCGN5175.
Para construir el plásmido pCGN6114, el plásmido pBrx90 (un plásmido Bluescript que contiene el gen bxn que codifica la nitrilasa específica de bromoxinilo) se digirió con NcoI/AscI y el gen estructural bxn se substituyó por el gen GUS en el plásmido pCGN5063 digerido con Nco/Asc, dando como resultado el plásmido pCGN6107. Este plásmido contiene el gen bxn bajo el control del conductor gen 10/promotor T7 en el extremo 5' y el terminador de transcripción híbrido psbA/T7 en el extremo 3' del gen quimérico. Este gen quimérico promotor T7/bxn se escindió a partir del pCGN6107 como un segmento de ADN Hindi/NotI y se desplazó dentro del plásmido BCSK+ (Stratagene) de cloroanfenicol en los sitios Hindi/Not para crear el plásmido pCGN6109. A continuación, el gen quimérico se desplazó como un fragmento HindIII/Not procedente del pCGN6109 dentro del vector de homología de cloroplasto pOVZ44B descrito anteriormente, para crear el plásmido pCGN6114. Las plantas de tabaco transformadas con pCGN6114 requieren que el ARN polimerasa de T7 sea suministrado dentro de la estructura principal del plástido de la planta para activar la transcripción del gen bxn quimérico a través del promotor T7. Este sistema ha sido ya detallado por McBride y otros, en PNAS, vol. 91, págs. 7301-7305, (1994) y McBride y otros, en la Patente de EE.UU. 5.576.198.
ID. Constructos de expresión de plástido BXN/AHAS
Se preparó un constructo de expresión de plástido, el pCGN5026, para dirigir la expresión de BXN y AHAS a partir del plástido de la planta. La secuencia nucleótida AHAS (descrita en el documento EP-A 0 525 384 A2) se ligó mediante traducción a la secuencia nucleótida BXN (Patente de EE.UU. 4.810.648). La acetohidroxiácido sintasa que codifica el gen estructural de AHAS se clonó a partir del plásmido pCGN4277 como un fragmento de ADN NcoI a Age dentro de los sitios Nco/Xma del plásmido pUC120 para crear el plásmido pCGN5022. A continuación, este plásmido se digirió con las enzimas BamHI y Pst y un segmento de ADN Bam/Pst de 1,3 kb que contiene el gen bxn que codifica la nitrilasa específica de bromoxinil se escindió a partir del plásmido pBrx26 y se clonó dentro de los sitios Bam/Pst del pCGN5022 para crear el plásmido pCGN5023. El plásmido pCGN5023 contenía un segmento de ADN de 3,3 kb conteniendo el segmento operón AHAS/bxn y este fragmento. Este plásmido se cortó en el sitio único Pst y este sitio Pst se separó y reemplazó con un ligador sintético conteniendo un único sitio de restricción XbaI generándose el plásmido pCGN5024. El plásmido pCGN5024 se digirió con Nco/Xba y el fragmento de ADN Nco/Xba de 3,3 kb se clonó dentro del vector de la caja del promotor del plastidio pLAA21 (Pst) que había sido digerido con Nco y Xba para separar el gen GUS. El plásmido resultante de esta clonación se designó como plásmido pCGN5025 y contenía el operón herbicida bajo el control del promotor Prrn del plástido y el segmento de ADN 3' de rpsL. El operón herbicida quimérico entero bajo el control de los elementos de expresión del plástido se escindió a partir del pCGN5025 como un fragmento de ADN SacI/Pst y se clonó dentro de los sitios Sac/Pst del vector de la caja de homología del plástido pOVZ44B (Zoubenko y otros, Nuc. Acids Res., vol. 22, págs. 3819-3824, (1994)) para facilitar la transferencia dentro del genoma del cloroplasto del tabaco.
IE. Constructo de expresión del plástido cryIAc y bxn de Bt
El plásmido pBrx9 (Stalker y McBride, J. Bacteriol., vol. 169, págs. 955-960, (1987)), un clon original procedente de Klebsiella conteniendo un segmento de ADN del gen bxn, se usó como un molde para generar un fragmento de ADN de PCR BamHI/ClaI de \sim450 bp que abarca el extremo de N-terminación del gen bxn e incluye 44 bp de la porción no traducida 5' del gen nativo. Este fragmento se intercambió con el fragmento Bam/Cla de \sim400 bp en el plásmido pBrx90 dando como resultado el plásmido pBrx90.1. Este plásmido contiene el gen bxn entero y el segmento de ADN 5' no traducido de 44 bp. El gen bxn se escindió a partir del plásmido pBrx90.1 como un segmento de ADN Bam/AscI y se insertó dentro del plásmido pCGN5146 en los sitios BglII/AscI para generar el plásmido pCGN5191. El plasmido pCGN5146 es un derivado de pKK233-2 (Pharmacia) que contiene el gen de longitud completa cryIAc que codifica la protoxina de Bt HD-73. Es decir, el plásmido pCGN5191 contiene los genes cryIAc y bxn en una configuración de operón siendo el gen bxn el gen distal en el operón. Ambos genes están bajo el control de promotor Ptac para expresión de E. coli en 5191. El plásmido pCGN5191 se digirió con Nco/Asc y el fragmento de ADN Nco/Asc que contenía el operón Bt/bxn se clonó dentro de los sitios Nco/Asc del vector de homología de cloroplasto pCGN5155, un derivado de pOVZ44B. El plásmido resultante, pCGN5197, contiene el operón Bt/bxn bajo el control de las regiones promotora y de terminación de transcripción rpsL del plástido Prrn. Este plásmido facilitó la transferencia del operón quimérico Bt/bxn dentro del genoma del plástido del tabaco.
IF. Constructos de expresión del plástido fitoeno desaturasa
El gen crtI se obtuvo como un fragmento de PCR HindIII/SalI a partir del plasmidio original que contenía el operón crt de Erwinia carotova (Misawa y otros, Plant Jour, vol. 6, págs. 481-489, (1994)) y se clonó como un segmento de ADN HindiIII/Sal dentro de BSCK+ (Stratagene) en los sitios HindIII/Sal para generar el plásmido pCGN5172. Este fragmento crtI se clonó a partir de pCGN5172 como un fragmento NcoI/SalI dentro de pCGN5038 (un derivado de pOVZ44B) para crear el constructo de expresión del plástido pCGN5177. Este constructo dirige la expresión de la secuencia crtI a parir del promotor Prrn y la secuencia de terminación rps16. Este plásmido facilitó la transferencia del gen crtI quimérico dentro del genoma del plástido del tabaco.
IG. Constructos de expresión de hGH para transformación de plantas Constructos de expresión nuclear
El constructo pWRG4747 se construyó para dirigir la expresión de hGH en el genoma nuclear de la planta. Este vector contiene la hGH ligada de manera operable al promotor del virus del mosaico de la celidonia menor (Patente de EE.UU. 5.378.619) y el conductor CTP2 para la dirección de la proteína de hGH dentro del plástido. El fragmento FMV/CTP2L::hGH::NpA se clonó conjuntamente con la secuencia de ADN que confiere resistencia a la kanamicina entre los bordes derecho e izquierdo (RB y LB) del ADN de transferencia (tADN) del Agrobacterium tumefaciens para dirigir la integración dentro del genoma nuclear.
El vector de transformación nuclear pWRG4744 contiene esencialmente los mismos elementos que el pWRG4747, excepto que el constructo carece del conductor CTP2 y que la proteína de hGH está dirigida al citoplasma de la célula de la planta.
Constructos de expresión de plástidos
El vector de expresión de plástido pWRG4838 se construyó usando el gen de longitud completa de hGH expresado a partir de la región promotora y de terminación del gen psbA, PpsbA y TpsbA, respectivamente (descrita por Staub y otros, ((1993), véase anteriormente). Esta fusión promotor-gen-terminador quimérica (PpsbA::hGH::TpsbA) se clonó adyacente al gen marcador seleccionable aadA igualmente impulsado por los elementos de expresión del plástido del gen psbA. Las dos secuencias gen quimérico se clonaron dentro de un vector entre dos secuencias que dirigen la integración de las secuencias del gen quimérico dentro del genoma del plástido del tabaco más arriba del ADN del plástido 16Sr. Este se unió a un gen de resistencia a la ampicilina de 1 kb que proporciona la selección de E. coli conteniendo el constructo y origen de replicación de pUC para mantenimiento del plásmido en E. coli.
Este constructo de expresión de plástido pMON38755 se preparó usando la secuencia de ADN de hGH fusionada a modo de traducción en el N-terminación con el gen ubiquitina de levadura (Ozkaynak y otros, Nature, vol. 312, págs. 663-666, (1984)), creándose el gen de fusión Ubi-hGH. El gen de fusión Ubi-hGH se clonó a continuación al gen aadA para la selección de tabaco transplastómico sobre medios que contenían espectinomicina o estreptomicina (a partir del pPRV112B descrito por Zoubenko y otros, (1994), véase anteriormente). Las secuencias se incluyeron para la recombinación de homólogos de secuencias que codifican la expresión de hGH y aadA. Estas secuencias se obtuvieron a partir del vector pPRV112B descrito por Zoubenko y otros ((1994), véase anteriormente). Estas secuencias se unieron a un gen de resistencia a la ampicilina de 1 kb, el cual proporciona la selección de E. coli conteniendo el constructo y el origen de replicación de pUC para mantenimiento del plásmido en E. coli.
El constructo de expresión de plástido pMON38794 contiene, esencialmente, los mismos elementos que pMON
38775, con la excepción de que la secuencia promotora psbA de 0,15 kb está reemplazada con la secuencia promotora Prrn/G10L descrita anteriormente.
1H. Constructos para la expresión de aprotinina en plástidos
Se prepararon una serie de constructos para dirigir la expresión de la proteína farmacéutica aprotinina a partir del plástido. La secuencia de ácido nucleico que codifica la aprotinina (Figura 2) se clonó dentro de un constructo de expresión del plástido para controlar la expresión de aprotinina a partir del promotor del conductor del gen 10 de T7, que se indujo a partir una T7 polimerasa identificada del plástido, expresada nuclearmente. Los constructos usados, en los cuales se clono la secuencia de aprotinina, son tal como se describen en la Patente de EE.UU. 5.576.198. El vector de transformación del plástido pCGN6146 se diseñó mediante el reemplazo de la secuencia de ADN que codifica GUS a partir de pCGN4276 (descrito en la Patente de EE.UU. 5.576.198) con la secuencia que codifica la aprotinina. El constructo de transformación del plástido del tabaco pCGN6147 contiene los mismos elementos que pCGN6146, excepto que el pCGN6147 contienen los seis aminoácidos 5' de la secuencia que codifica GUS ligados en el extremo 5' de la secuencia que codifica la aprotinina. Los seis aminoácidos del extremo 5' de la secuencia del nucleótido GUS se incluyeron con el fin de ayudar a la traducción de la proteína aprotinina. El vector de transformación del plasmidio del tabaco pCGN6156 es, esencialmente, el mismo que pCGN4276, excepto que la región que codifica la aprotinina se clonó en el extremo 3' de la secuencia que codifica GUS. De acuerdo con ello, el pCGN6156 contiene ligado de manera operable el promotor T7, una secuencia de ADN que codifica el GUS fusionado con la secuencia de ADN que codifica la aprotinina y la secuencia de terminación de transcripción 3' de
psbA.
Se construyó un constructo de expresión de plástido, el pCGN6154, a partir del pCGN4276 mediante el reemplazo de la secuencia que codifica GUS con la proteína aprotinina ligada de manera operable a la terminación 3' de la secuencia que codifica el citocromo f (petA) del cloroplasto del tabaco. De acuerdo con ello, el pCGN6154 contiene la secuencia promotora T7 ligada de manera operable a la secuencia nucleótida de petA y aprotinina. La secuencia petA se incluyó para dirigir la proteína aprotinina expresada al tilacoide.
Ejemplo 2 Transformación de plantas 2A. Transformación nuclear
Las plantas de tabaco transformadas para expresar los constructos pWRG4744 y pWRG4747 en el núcleo de una célula de planta pueden obtenerse tal como se describe por Horsch y otros (Science, vol. 227, págs. 1229-1232, (1985)).
2B. Transformación de plástidos
Los plástidos de tabaco se transformaron mediante el suministro con pistola de partículas de microproyectiles tal como se describe por Svab y Maliga (Proc. Natl. Acad. Sci., vol. 90, págs. 913-917, (1993)), y se describe aquí.
Se cortaron hojas redondas, de color verde oscuro, preferiblemente desde la mitad de los vástagos, procedentes de Nicotiana tabacum cv. Havana de 3 semanas de edad que se habían mantenido in vitro en medio MS libre de hormonas (Murashige y Skoog, Physiol Plant., vol. 15, págs. 473-497, (1962)) suplementado con vitaminas B5 en Phytatrays o copas de helado con un fotoperíodo de 16 horas a 24ºC. A continuación, cada hoja cortada se colocó adaxialmente con la cara hacia arriba sobre papel de filtro estéril sobre medio de regeneración de vástagos de tabaco (medio TSO: sales MS, 1 mg/l de N^{6}-benciladenina, 0,1 mg/l de ácido 1-naftalenoacético, 1 mg/l de tiamina, 100 mg/l de inositol, 7 g/l de agar, pH 5,8 y 30 g/l de sacarosa). Preferiblemente, las hojas se colocaron en el centro de la placa con tanto contacto con el medio como fue posible. Preferiblemente, las placas se prepararon inmediatamente antes de su uso, pero pueden prepararse hasta 1 día antes de la transformación mediante bombardeo por partículas envolviéndolas en bolsas de plástico y almacenándolas a 24ºC durante la noche.
Las partículas de tungsteno u oro se esterilizaron para uso como microportadores en experimentos de bombardeo. Las partículas (50 mg) se esterilizaron con 1 ml de etanol al 100%, y se almacenaron a -20ºC o -80ºC. Inmediatamente antes de su uso, las partículas se sedimentaron por centrifugación, se lavaron con 2 a 3 lavados de 1 ml de agua destilada desionizada estéril, se batieron y centrifugaron entre cada lavado. Las partículas lavadas se resuspendieron en 500 \mul de glicerol al 50%.
Las partículas esterilizadas se recubrieron con ADN para transformación. Se agregaron partes alícuotas de 25 microlitros de partículas esterilizadas a un tubo de microcentrífuga de 1,5 ml, y se agregaron 5 \mug del ADN de interés y mezclaron mediante sacudidas. A la mezcla de partículas/ADN se agregaron 35 microlitros de una solución recién preparada de CaCl_{2} 1,8 M y espermidina 30 mM, se mezclaron cuidadosamente, y se incubaron a temperatura ambiente durante 20 minutos. Las partículas recubiertas se sedimentaron mediante una breve centrifugación. Las partículas se lavaron dos veces mediante la adición de 200 \mul de etanol al 70%, se mezclaron suavemente y se centrifugaron brevemente.. Las partículas recubiertas se resuspendieron en 50 \mul de etanol al 100% y se mezclaron suavemente. Para cada bombardeo se usaron 5 a 10 microlitros de partículas recubiertas.
La Transformación mediante bombardeo de partículas se llevó a cabo usando la pistola PDS 1000 Helium (Bio Rad., Richmond CA) usando un protocolo modificado descrito por el fabricante.
Las placas que contenían las muestras de hojas se colocaron sobre el segundo estante a partir de la parte inferior de la cámara de vacío y se bombardearon usando el disco de rotura de 7,79 N/mm^{2}. Después del bombardeo, las placas Petri que contenían las muestras de hoja se envolvieron en bolsas de plástico y se incubaron a 24ºC durante 48 horas.
Después de la incubación, las hojas bombardeadas se cortaron en piezas de aproximadamente 0,5 cm^{2} y se colocaron abaxialmente con la cara hacia arriba sobre medio TSO suplementado con 500 \mug/ml de espectinomicina. Después de 3 a 4 semanas sobre el medio de selección, aparecieron sobre el tejido de la hoja vástagos resistentes a la espectinomicina de color verde, pequeños. Estos vástagos continuaron creciendo sobre el medio que contenía espectinomicina y a los cuales se les denomina como transformantes putativos primarios.
Cuando los transformantes putativos primarios habían desarrollado 2 a 3 hojas, se cortaron de cada hoja 2 pequeñas piezas (de aproximadamente 0,5 cm^{2}) y se usaron o bien para selección o bien para una segunda ronda de regeneración de vástagos. Una pieza se colocó abaxialmente con la cara hacia arriba sobre placas que contenían medio TSO suplementado con 500 \mug/ml de espectinomicina, y la otra pieza se colocó abaxialmente con la cara hacia arriba sobre medio TSO suplementado con 500 \mug/ml de espectinomicina y estreptomicina. Los transformantes positivos se identificaron como los vástagos que forman callo de color verde sobre medio TSO que contenía espectinomicina y estreptomicina.
Después de 3 a 4 semanas, el tejido colocado sobre medio TSO que contenía únicamente espectinomicina, el cual se había identificado como positivo sobre el medio TSO con espectinomicina y estreptomicina, desarrolló vástagos de color verde. Se seleccionaron dos a cuatro vástagos de cada transformante y se transfirieron a medio TSO suplementado con 500 \mug/ml de espectinomicina para la generación de raíces Se llevó a cabo el análisis Southern sobre 2 vástagos para confirmar la homoplasia tal como se describe más adelante. Los vástagos procedentes de episodios homoplásmicos se transfirieron al invernadero para la producción de semillas, en tanto que los transformantes que no fueron homoplásmicos se enviaron a una segunda ronda o regeneración sobre medio TSO con 500 \mug/ml de espectinomicina para alcanzar la homoplasmia.
Ejemplo 3 Análisis de plantas de tabaco transplastómicas transformadas con constructos de tolerancia a herbicidas 3A. Análisis Southern
Las plantas transformadas seleccionadas para la expresión del gen marcador aadA, se analizaron para determinar si se había transformado el contenido completo del plástido de la planta (transformantes homoplásmicos). Típicamente, después de dos rondas de formación de vástagos y selección a espectinomicina, aproximadamente el 50% de las plántulas transgénicas que se había analizado eran homoplásmicas, tal como se determinó mediante análisis de transferencia Southern del ADN del plástido. Las plántulas homoplásmicas se seleccionaron para posterior cultivo.
El ADN genómico se aisló a partir de plantas de tabaco transformadas, se electroforetizó, y se transfirió a filtros tal como se ha descrito por Svab y otros, Proc. Natl. Acad. Sci., vol. 90, págs. 913-917, (1993).
Las plantas de tabaco homoplásmicas transformadas para expresar EPSPS de CP4 en plástidos se identificaron usando una sonda preparada a partir de un fragmento EcoRI/EcoRV de 2,4 kb procedente del vector pOVZ2 (similar al POVZ15 descrito por Zoubenko y otros, (1994), véase anteriormente). El fragmento de sonda de 2,4 kb abarca parte de la secuencia de identificación.
Los resultados de las hibridaciones Southern identificaron 3 líneas homplásmicas procedentes del tabaco transformado con los constructos pMON30123 y pMON30130 y 1 línea procedente del tabaco transformado con pMON38773 para análisis posterior.
La desaparición completa del fragmento BamHI de tabaco nativo de 3,27 kb en las líneas 30123-19-1A, 30123-23-2A, 30123-18-1B, 30130-51-2A, 30130-51-2P, 30130-57-1P, y 38773-6 con una sonda que cubre la región de integración, y la aparición de las bandas del tamaño esperado para los fragmentos de ADN insertados en esos transformantes, de 5,14 kb y 0,9 kb, establece que las plantas transformadas son homplásmicas para los constructos deseados.
Los resultados de las hibridaciones Southern identificaron 3 líneas homoplásmicas procedentes de tabaco transformado con pCGN5177, las líneas 74-1B-P, 74-2 y 74-7.
Las líneas de tabaco 5175 y 6114 transplastómicas se analizaron mediante hibridación Southern para determinar la homoplasmia tal como se ha descrito anteriormente. Los resultados de las hibridaciones Southern identificaron 4 líneas homoplásmicas procedentes de tabaco transformado con pCGN6114.
Los resultados a partir de las hibridaciones de las líneas de tabaco 5175 transplastómicas identificaron una línea, la 76-4A-F, como homoplásmica, y una segunda línea como 95% homoplásmica.
Las plantas de tabaco homoplásmicas transformadas para expresar BXN/AHAS en plastdios, se identificaron usando hibridaciones Southern tal como se ha descrito anteriormente.
Los resultados de las hibridaciones Southern identificaron 14 líneas homoplásmicas procedentes de tabaco transformado con pCGN5026. Los filtros se volvieron a sondar con un fragmento de gen BXN, y se encontraron 21 líneas que contenían BXN, 14 líneas de las cuales fueron homoplásmicas.
3B. Análisis Northern
Con el fin de determinar el nivel de transcripción del ARNm de EPSPS, BXN o AHAS expresado en plantas de tabaco transplastómico, se llevaron a cabo hibridaciones por transferencia Northern con el ARN total aislado procedente de cada una de las líneas identificadas. El ARN total se aisló usando reactivo TRIzol (Gibco-BRL, Life Technologies, Gaithersburg, MD) de acuerdo con el protocolo de los fabricantes. El ARN total, 2 \mug, se separó sobre un gel de agarosa desnaturalizado y se transfirió a una membrana de nilón (Maniatis y otros, (1989), véase anteriormente). Las sondas radiactivas para las hibridaciones se prepararon usando fragmentos marcados con cebador aleatorio (usando el kit de marcado Random Primer de Boehringer Mannheim) de EPSPS de CP4, fitoeno desaturasa, BXN, o AHAS y las hibridaciones se llevaron a cabo en 2x SSPE (Maniatis y otros, (1989), véase anteriormente), a 60ºC. Los filtros se retiraron y volvieron a sondar con una sonda de gen de ARN ribosómico 16S de plástido (procedente de pPRV112A, Zoubenko y otros, (1994), véase anteriormente) para confirmar la carga homogénea de ARN sobre el filtro.
Los resultados de las hibridaciones Northern llevadas a cabo con sondas EPSPS demuestran que las siete (7) líneas examinadas expresan ARNm de EPSPS de CP4. Las hibridaciones llevadas a cabo con sonda de ribosoma 16S confirman que los geles desnaturalizados estaban cargados con cantidades similares de ARN total para cada muestra. Además, las líneas de tabaco transplastómicas que expresan EPSPS a partir de los elementos reguladores Prrn/rbcL(RBS) (pMON30123), expresan ARNm de EPSPS a niveles más altos que plantas de tabaco homoplásmicas para EPSPS controlado mediante las secuencias promotor Prrn/G10L (pMON38773)/RBS.
Los resultados de las hibridaciones Northern llevadas a cabo con sondas BXN, AHAS y crtI demuestran que todas las líeas de tabaco 5026, 5175 y 5177 homoplásmicas expresaron ARNm de crtI, BXN y/o AHAS.
3C. Análisis por transferencia Western de EPSPS de CP4 de tabaco
Para determinar la expresión de la EPSPS, se llevaron a cabo análisis por transferencia Western sobre una única línea procedente de cada constructo, pMON3012, pMON30130, y pMON38773.
La proteína soluble total se extrajo a partir de tejido de hoja congelada mediante trituración de 250 mg de tejido en 250 \mul de tampón PBS (KH_{2}PO_{4} 1 mM, Na_{2}HPO_{4}, NaCl 0,137 M, KCl 2,7 mM, pH 7,0) conteniendo inhibidores de proteasa. El homogenato se centrifugó durante 5 minutos, y el sobrenadante se transfirió a un tubo nuevo. La concentración de la proteína en el sobrenadante se determinó usando un ensayo de concentración de proteína (BioRad, Richmond, CA).
La proteína total extraída se electroforetizó sobre un gel SDS-PAGE al 4-20% (Sigma, St Louis, MO), y se transfirió a una membrana de PVDF en tampón 1x SDS-PAGE (Maniatis y otros, (1989), Cold Spring Harbor Press). Se usaron patrones de proteína de EPSPS de CP4 purificada cuantificada para cuantificar la expresión de la EPSPS de CP4 tal como se expresó en el plástido de la planta.
Las hibridaciones Western se llevaron a cabo tal como han descrito Staub y Maliga en EMBO Journal, vol. 12, (no. 2), págs. 601-606, (1993), excepto que se usaron anticuerpos generados contra EPSPS. Las membranas de PVDF conteniendo la proteína electroforetizada transferida se incubaron en una solución de bloqueo de tampón PBS conteniendo Tween-20 (PBS-T) al 0,05% y leche al 5% durante una noche a 4ºC. A continuación, las membranas se incubaron en una solución de PBS-T conteniendo leche al 1% y un anticuerpo primario generado en cabras contra la EPSPS de CP4 durante 2 horas a temperatura ambiente. Las membranas se lavaron tres veces en una solución de PBS-T conteniendo leche al 0,1%, con una duración cada lavado de 5 minutos a temperatura ambiente. A continuación, las membranas se incubaron en una solución de PBS-T conteniendo leche al 1% y anticuerpo anti-cabra de oveja durante 1 hora a temperatura ambiente, y se lavaron nuevamente en PBS-T conteniendo leche al 0,1%, tres veces durante 10 minutos a temperatura ambiente. Se llevó a cabo un lavado final usando únicamente PBS-T antes del revelado de las membranas usando un kit de detección no radiactivo (ECL, Amersham).
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TABLA 2
2
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Los resultados listados en la Tabla 2 demuestran que pueden obtenerse incrementos significativos en el nivel de proteína de EPSPS a partir de plantas transformadas para expresar EPSPS a partir del promotor Prrn/G10L. Estos resultados demuestran que la expresión de EPSPS impulsada por las secuencias reguladoras Prrn/rbcLRBS pueden producir aproximadamente 0,001% de la proteína soluble total como EPSPS, en tanto que en plantas que expresan EPSPS a partir de las secuencias reguladoras Prrn/G10L expresan 0,2% de la proteína soluble total como EPSPS. Las líneas subsiguientes han demostrado una proteína soluble total de aproximadamente 1% de EPSPS cuando se expresan a partir de las secuencias reguladoras Prrn/G10L. Estos resultados, considerados conjuntamente con los resultados de las hibridaciones Northern anteriores, indican que puede obtenerse una traducción más eficaz a partir del sitio de unión al ribosoma G10L.
Igualmente, se llevó a cabo la hibridación por inmunotransferencia Western sobre 2 líneas de tabaco 5026 homoplásmicas tal como se ha descrito anteriormente, usando anticuerpos generados contra bromoxynil. Los resultados del análisis por inmunotransferencia Western de la proteína soluble total extraída a partir de líneas de tabaco transformadas con pCGN5026, demostraron que ambas líneas homoplásmicas produjeron nitrilasa proteína.
El análisis por inmunotransferencia Western se llevó a cabo tal como se ha descrito anteriormente a partir de proteína total extraída a partir de líneas de tabaco transformadas con pCGN6114 y pCGN5197.
Los resultados de los análisis demostraron que el bromoxynil que se produjo en líneas de tabaco 6114 contenía del 1% al 2% de la proteína de hoja soluble total.
Los resultados del análisis Western de las 20 líneas de tabaco 5197 demostraron que tanto el bromoxynil como Bt produjeron igualmente 1% de la proteína de hoja soluble total.
3D. Análisis de la actividad de la enzima de EPSPS
La actividad de la enzima de EPSPS en plantas de tabaco transplastómicas que contenían el vector de expresión del plástido pMON38773 se determinó usando un ensayo de cromatografía líquida de alta presión (HPLC).
Los procedimientos para el análisis de la enzima de EPSPS están descritos por Padgette y otros en J. Biol. Chem., vol. 263, págs. 1798-1802, (1988) y Arch. Biochem. Biophys., vol. 258, págs. 564-573, (1987) y por Wibbenmeyer y otros, en Biochem. Biophys. Res. Commun., vol. 153, págs. 760-766, (1988). Los resultados se resumen en la Tabla 3 a continuación.
TABLA 3
3
Estos resultados demuestran que la expresión de EPSPS en plástidos produce enzima de EPSPS activa.
3E. Análisis para la tolerancia al glifosato
Se ensayó in vitro una línea de tabaco transplastómico homoplásmica para el constructo pMON38773 para determinar el nivel más alto de tolerancia al glifosato. El tejido de explante se preparó a partir de piezas de hojas de plantas de control de tabaco de tipo salvaje no transgénico, Havana, y la línea de tabaco homoplásmico 38773-6 y se cultivaron para la regeneración de vástagos sobre medio TSO (descrito anteriormente) suplementado con niveles de glifosato de 50 \muM, 75 \muM, 100 \muM, 150 \muM y 200 \muM. Los resultados se resumen en la Tabla 4 a continuación. El número de explantes que producen los vástagos se determinó a las 3 semanas y 6 semanas después de la preparación y cultivo del explante sobre medio que contenía glifosato.
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TABLA 4
4
Los resultados anteriores demuestran que todos los niveles de glifosato examinados, regeneraron vástagos a partir de explantes preparados a partir de una línea de tabaco homoplásmica para pMON38773, en tanto que no regeneraron vástagos a partir de explantes preparados a partir de plantas de control no transformadas. Estos resultados sugieren que las plantas de tabaco que expresan EPSPS en plástidos demuestran tolerancia a niveles de glifosato de al menos 200 \muM.
Se ensayaron in vitro líneas transplastómicas adicionales para determinar la tolerancia al glifosato tal como se ha descrito anteriormente. Los resultados se muestran en la Tabla 5.
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TABLA 5 Resumen de experimentos de transformación de plástidos de tabaco con diversos constructos conteniendo genes de EPSPS
5
Estos resultados demuestran que estas líneas transplastómicas muestran tolerancia al glifosato. Los números entre paréntesis son el número de vástagos resistentes a la selección al glifosato 1 mM. De acuerdo con ello, tal como puede observarse en la Tabla 5, se generaron líneas de tabaco que son tolerantes a la selección a glifosato 1 mM.
Se pulverizaron plantas de tabaco homoplásmicas de la línea 38773-6 con glifosato usando un tractor pulverizador a concentraciones que corresponden a 0 kg/ha, 1,12 kg/ha, 2,24 kg/ha y 4,48 kg/ha, para ensayar la tolerancia de la planta completa. La altura de la planta se midió antes y después de la pulverización con glifosato. Los datos de daños vegetativos se recogieron dos semanas después de la pulverización, en tanto que lo datos de daños reproductivos se recogieron a la madurez de la planta.
Los resultados iniciales indican que las líneas de tabaco homoplásmicas pulverizadas son tolerantes al glifosato a la concentración de 1,12 kg/ha, tal como se demuestra en el daño de tejido vegetativo (Tabla 6). Tal como puede observarse en la Tabla 5, se generaron líneas transplastómicas que demostraron un buen nivel de tolerancia al glifosato a 2,24 kg/ha. En experimentos subsiguientes con líneas transformadas adicionales, las líneas transplastómicas han mostrado tolerancia al glifosato a un nivel de 4,4 kg/ha.
La tolerancia se caracterizó por el crecimiento continuo y verdeamiento de los tejidos pulverizados con glifosato. Sin embargo, conforme se incrementó la concentración del glifosato aplicado, existió un incremento correspondiente en el nivel de daño vegetativo. Por el contrario, las plantas de control no transformadas fueron altamente susceptibles a concentraciones de glifosato tan bajas como de 1,12 kg/ha.
TABLA 6
6
7
Daños vegetativos
0 = planta normal
1 = ligera clorosis de nuevas hojas y atrofiamiento
2 = severa clorosis de nuevas hojas, malformación de nuevas hojas,
y severo atrofiamiento
3 = marchitamiento de la planta
4 = planta muerta
Valoraciones de fertilidad
0 = fértil, sin retraso en la madurez, lotes de semillas
1 = algún aborto, ligero retraso en la formación de semilla, semilla
2 = aborto significativo, retraso significativo en la formación de semilla, alguna semilla
3 = aborto muy severo, tiestos de semillas inmaduras, unas pocas semillas
4 = flores malformadas; si florecen, extremo retraso en la floración y sin producción de semillas
5 = planta muerta
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3F. Análisis de BT/BXN
Se pulverizaron plantas de tabaco homoplásmicas de las líneas 5175 y 5197 con herbicida Buctril a una concentración del 4% para ensayar la tolerancia de la planta completa.
Los resultados del ensayo de pulverización con Buctril demostraron que todas las líneas 5197 que expresan bxn fueron completamente resistentes cuando se pulverizaron con una solución conteniendo herbicida Buctril al 4%.
Dos líneas de las seis líneas 5175 ensayadas fueron completamente resistentes cuando se pulverizaron con una solución conteniendo herbicida Buctril al 4%.
3G. Análisis de resistencia a Norflurazon
Se puso a punto un experimento para determinar la eficacia del rasgo CrtI con respecto a la resistencia al herbicida Norflurazon. Se plantaron tres líneas transformadas 5177, la 74-1B-P, 74-2-A, y 74-7-C, y tres líneas de control. Las plantas se dejaron crecer durante siete semanas y, a continuación, se mojaron con solución de Norflurazon 3 \muM. Las plantas negativas a la presencia del gen que porta el plástido crtI se blanquearon mediante tratamiento con Norflurazon, las plantas positivas se mantuvieron verdes y continuaron creciendo.
Los resultados muestran que tres líneas de tabaco 5177 homoplásmicas fueron resistentes a la solución de Norflurazon 3 \muM, mientras que las plantas de control fueron todas ellas susceptibles a la solución (Tabla 7).
TABLA 7
8
Ejemplo 4 Análisis de plantas de tabaco transgénicas de hGH 4A. Análisis Southern
Las plantas transformadas seleccionadas para la expresión del gen marcador aadA se analizaron para determinar si se había transformado el contenido de plástido completo de la planta (transformantes homoplásmicos). Las plantas homoplásmicas se seleccionaron usando la hibridación Southern para posterior cultivo.
El ADN genómico se aisló a partir de plantas de tabaco transformadas, se electroforetizó, y se transfirió a filtros tal como se ha descrito por Svab y otros, en Proc. Natl. Acad. Sci., vol. 90, págs. 913-917, (1993).
Las plantas de tabaco homoplásmicas transformadas para expresar hGH se identificaron usando una sonda preparada a partir de un fragmento EcoRI/EcoRV de 2,4 kb procedente del vector pOVZ2 (similar al pOVZ15 descrito por Zoubenko y otros, (1994), véase anteriormente). El fragmento de sonda de 2,4 kb abarca parte de la secuencia de identificación.
La desaparición completa del fragmento BamHI de tabaco nativo de 3,27 kb en las líneas con una sonda que cubre la región de integración, y la aparición de la banda del tamaño esperado para los fragmentos de ADN insertados en dichos transformantes, de 5,6 kb, establece que las plantas transformadas son homoplásmicas para los constructos destinados.
4B. Análisis de expresión de proteína
Se usaron líneas de tabaco homoplásmicas que expresan hGH y transformantes de tabaco nucleares para determinar la expresión de la proteína hGH. El análisis por transferencia Western se llevó a cabo sobre líneas de tabaco que contenían los constructos pWRG4838, pMON38755 y pMON38794 para la expresión del plástido y se usó un ensayo ELISA para las líneas de tabaco transgénico que contenían el pWRG4744 y pWRG4747 para la expresión nuclear de hGH.
Las extracciones de proteína total y los procedimientos por transferencia Western se llevaron a cabo tal como se ha descrito anteriormente, con la excepción de que el anticuerpo primario se generó contra hGH.
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TABLA 8 Niveles de expresión de hGH en genoma nuclear y genoma de plástido de tabaco
9
Los resultados del análisis Western (Tabla 8) demuestran que la hGH expresada en plástidos de células de plantas se acumula a niveles significativamente más altos que la hGH expresada en el núcleo y dirigida tanto al citoplasma como al plástido de células de plantas. Las plantas de tabaco transformadas para expresar hGH en el núcleo acumulan niveles de hGH de 0,002% (citoplásmico identificado) hasta 0,025% (plástido identificado) de la proteína de hoja soluble total, en tanto que las plantas de tabaco que expresan hGH en el plástido acumulan niveles de hGH de 0,2% hasta 7,0% de proteína de hoja soluble total como hGH. Además, las plantas de tabaco homoplásmicas que expresan hGH dirigida a partir de las secuencias reguladoras Prrn/G10L acumulan niveles 35 veces más altos de hGH que las plantas de tabaco homoplásmicas que expresan hGH dirigido a partir de la secuencia promotora PpsbA. El nivel más alto de expresión puede ser debido al fuerte promotor Prrn y/o a la traducción potenciada del gen de fusión mediada por la región rbs del conductor del gen 10. Las hojas de diferentes edades mostraban patrones de acumulación de hGH variados, con hojas maduras y viejas conteniendo niveles similares y hojas más jóvenes con mucho menos hGH. Esto está de acuerdo con el índice de cloroplasto más bajo en las hojas jóvenes.
De manera ineresante, tanto la ubiquitina-hGH como la hGH procesada se acumularon en los extractos post-recolectados de las líneas Nt-38755 y Nt-38794. El procesamiento de ubiquitina se observó frecuentemente en >50% de las especies de proteína hST total, dependiendo de las condiciones de extracción. Este resultado confirma la utilidad de la vía de proteína de fusión en proteínas expresadas en cloroplastos. La aparición de una banda extra observada en la muestra Nt-4838 concuerda con un dímero de hGH.
Para la comparación de sistemas de expresión en plantas, se generaron plantas transgénicas nucleares que expresan hGH a partir de dos conjuntos diferentes de señales de expresión. Los constructos wrg4747 y wrg4776 expresan hGH que usan el promotor del virus del mosaico de celidonia menor fuerte o el promotor 35S del virus del mosaico de la coliflor, respectivamente. El constructo wrg4747 usa un péptido de tránsito de cloroplasto contra hGH identificada post-traducción contra cloroplastos (FMV::CTP-hGH), en tanto que el constructo wrg4776 identifica la hGH a través del retículo endoplásmico (ER) contra la vía secretora (35S::ER-hST). Las líneas transgénicas para ambos constructos se obtuvieron a través del bombardeo de partículas. La expresión de hST se cuantificó mediante ensayo ELISA y mostró que era menos de 0,025% de tsp (proteína soluble total). Este nivel de expresión es al menos 300 veces más bajo que el de las líneas pMON38794, lo que prueba la viabilidad del sistema de expresión de cloroplasto para la producción potencial de hST.
4C. Caracterización de proteína hGH expresada en el plástido
Con el fin de determinar si la hGH expresada a partir de plástidos estaba adecuadamente procesada, se llevaron a cabo experimentos para determinar el correcto plegamiento y bioactividad.
Se usaron dos hojas de la parte baja de líneas de tabaco transplastómico conteniendo pMON38794 para extraer y purificar hGH. Los nervios grandes se separaron de las hojas arrancadas, y el tejido de la hoja se cortó en pequeñas secciones (de aproximadamente 0,5 cm^{2}). Las piezas de hoja se congelaron rápidamente en nitrógeno líquido y se molieron hasta un polvo fino en un mortero y pistilo refrigerados. Se agregaron diez gramos de tejido de hoja molido, congelado, a solución base de Tris 100 mM (30 ml) enfriada en hielo y se mezcló vigorosamente mediante batido durante 5 minutos. La solución se filtró a través de una capa sencilla de muselina.
A partir de la solución filtrada, se prepararon tres muestras separadas. La primera muestra se preparó centrifugando 4 ml del filtrado durante 1 minuto a 16.000 rpm. El centrifugado se repartió en partes alícuotas dentro de viales de 1 ml y se congeló en hielo seco. El filtrado remanente se centrifugó durante 10 minutos a 4.800 rpm, y se congelaron diversas partes alícuotas de 0,5 ml tal como anteriormente para la segunda muestra. Al filtrado centrifugado remanente (aproximadamente 25 ml), se agregaron 200 \mul de ácido acético glacial para bajar el pH desde 8,2 hasta 4,56. La solución se centrifugó a 4.800 rpm durante 30 minutos, y el sobrenadante se congeló sobre hielo seco para la tercera muestra.
La proteína soluble total (TSP, Tabla 9) se calculó en estas muestras mediante procedimientos de ensayo de proteína convencionales (Maniatis), y el por ciento de pureza de hGH se calculó en base a los resultados del análisis por transferencia Western usando concentraciones conocidas del material de partida.
TABLA 9
10
El extracto con pH ajustado y centrifugado se purificó mediante HPLC de fase inversa (RP-HPLC) para espectrometría de masa por electropulverización y secuenciación de aminoácido amino-terminal. La RP-HPLC se llevó a cabo usando una bomba y tomamuestras automático Perkin-Elmer serie 200 y una columna de RP-HPLC Vydac C8 (250 por 4,6 mm). Se cargaron 750 microlitros de muestra sobre la columna equilibrada con ácido trifluoroacético (TFA) 20 mM y acetonitrilo al 50%. Después de cargarla, la columna se lavó durante 2 minutos con acetonitrilo al 50% y TFA 20 mM seguido de un gradiente lineal de acetonitrilo al 2% durante 10 minutos, seguido de un gradiente de acetonitrilo al 10% durante 1 minuto. La velocidad de flujo se mantuvo constante a 1,5 ml/min con el eluato de la columna controlado a 278 nm con un detector 785 de Perkin-Elmer. Los datos se recogieron y analizaron con un sistema de datos Turbochrom de PE-Nelson.
Los resultados del análisis mediante RP-HPLC se muestran en la Figura 3. El pico I (pico más alto) tiene el tiempo de retención esperado para GP2000 de 22kDa nativa, plegada adecuadamente. Este pico se recogió y secó en un Savant Speed-Vac para la secuenciación amino-terminal y espectrometría de masas por electropulverización.
En el análisis de espectrometría de masa (MS) de ionización por electropulverización se usó un espectrómetro de masa de duración de la trayectoria por electropulverización Micromass Q-Tof. Las muestras se prepararon mediante resuspensión en metanol al 50% + ácido acético al 2%, y se infundieron dentro de la fuente del espectrómetro de masa a una velocidad de 4 ml/min. Los datos brutos mostrados en la Figura 4 muestran una serie de iones que corresponden a las especies presentes en la muestra con números variables de protones unidos. Los ejes de este espectro son intensidad frente a relación de masa a carga de la especie presente. Se usó un algoritmo de desenrrollamiento para convertir estas series de iones múltiplemente cargados en un espectro de peso molecular.
Los resultados de la espectrometría de masa del pico I de RP-HPLC muestran 4 especies de proteína principales de diferente masa molecular. Las especies de 21,997 kDa representan la masa predicha de hGH con el Phe N-terminal predicho separado mediante sobre-escisión de la ubiquitina proteasa con un resto prolina N-terminal (P-hGH). Las especies de 22,124 kDa representan la masa predicha de la secuencia de aminoácido correcta, adecuadamente procesada, de hGH conteniendo la fenilalanina N-terminal (F-hGH). Las especies de 22,507 kDa y 22.664 kDa se estima que representan una hGH con la Phe N-terminal y hGH que ha sido modificada durante los procedimientos de extracción de la planta, respectivamente. La masa molecular calculada de las proteínas sugiere que la hGH expresada a partir del plástido está adecuadamente plegada (es decir, se han creado los enlaces disulfuro correctos).
La movilidad equivalente a la proteína producida por E. coli replegada indica la formación de los dos enlaces disulfuro y el adecuado plegado de la hGH derivada de cloroplasto. Este resultado fue sorprendente dada la naturaleza procariótica de los cloroplastos. No existen proteínas expresadas en plástidos conocidas que tengan enlaces disulfuro. Sin embargo, las enzimas importadas, codificadas nuclearmente, pueden ser activadas mediante ciclos de oxidación/reducción de enlaces disulfuro, presumiblemente usando el sistema tioredoxina del cloroplasto (Jacquot y otros, New Phytol., vol. 136, págs. 543-570, (1997)) o una disulfuro isomerasa de proteína del cloroplasto recientemente descubierta (Kim y Mayfield, Science, vol. 278, págs. 1954-1957, (1997)). Este resultado sugiere que el orgánulo procariótico tiene la maquinaria necesaria para plegar el complejo de proteínas eucarióticas en el compartimiento del estroma del cloroplasto soluble. Esto es distinto del E. coli, en donde las proteínas recombinantes tienden a acumularse dentro de cuerpos de inclusión y, por ello, requieren la solubilización y el repliegamiento.
La secuenciación amino-terminal se llevó a cabo mediante degradación de Edman convencional, y confirmó las secuencias N-terminales expuestas anteriormente.
4D. Bioactividad de hGG expresada en plástidos de plantas
La bioactividad del extracto ajustado el pH y centrifugado se ensayó usando células procedentes de la línea de células Nb2. Estas células proliferan en la presencia de la hormona del crecimiento y otros compuestos de tipo estrogénico. El ensayo implica la preparación de diversas concentraciones de extracto que contienen la hormona del crecimiento en una placa de 96 pocillos. A continuación, se agregaron a cada pocillo una cantidad constante de células. La placa se incubó durante 48 horas y, a continuación, se agregó un reactivo denominado MTS. Las células metabolizantes retienen el MTS y lo convierten en una substancia de color azul. Cuantas más células existan mayor es el color azul del pocillo. El color azul se midió usando un espectrofotómetro. El número de células debería ser proporcional a la concentración de la hormona del crecimiento en el medio. A una concentración algo elevada es de esperar que las células se saturen con la hormona del crecimiento y que la respuesta a la dosis se igualará. A concentraciones de hGH muy bajas no se observa un crecimiento esencialmente potenciado. Se supone que se ha de producir una gráfica de forma sigmoidea que represente gráficamente el número de células (o absorbancia) frente a la concentración de hGH.
El adecuado emparejamiento disulfuro en la hGH de cloroplasto implica que la proteína debería ser biológicamente activa. Para comprobar esta hipótesis in vitro, se usó una línea de células de linfoma de rata, la Nb2, la cual prolifera en la presencia de somatotropina (hGH) y otros compuestos de tipo estrogénico, La proliferación de esta línea de células es proporcional a la cantidad de somototropina en el medio de cultivo, hasta que se alcanza la saturación. Al medio de cultivo de célula Nb2 se agregó el eluato de la columna de intercambio de iones procedente de plantas Nt-4838 y Nt-38794 transplastómicas o plantas de tipo salvaje tratadas de manera idéntica. Como control, se usó hGH replegado, producido en E. coli. El extracto de planta de tipo salvaje no mostró actividad en este ensayo, lo cual indica que no existe compuesto de planta endógeno capaz de estimular el crecimiento de la línea de células Nb2. Por el contrario, ambos extractos Nt-4838 y Nt-38794 estimularon la proliferación de la línea de células hasta un grado igual que los controles positivos: ya sea el extracto de planta de tipo salvaje que había sido inoculado con hGH de E. coli purificado o bien la hGH pura sola.
Los resultados de la célula Nb2 muestran que la hGH derivada de cloroplasto es biológicamente activa. Los estudios previos de somatotropina recombinante producida en E. coli mostraron farmacocinéticas equivalentes de la proteína tanto con una metionina como una metionina o fenilalanina N-terminal (Moore y otros, Endocrinology, vol. 122, págs. 2920-2926, (1988)). En este estudio, la escisión ubiquitina de la proteína de fusión en las líneas Nt-38794 generó predominantemente P-hST, lo que sugiere que esta especie es también bioactiva. Igualmente, se caracterizó la hST procedente de extractos de Nt-4838. Un análisis de aminoácidos indicó >95% de especies de proteína con alanina en el N-terminal. Este resultado sugiere que una actividad metionina aminopeptidasa generó la alanina-hST, la cual es igualmente bioactiva. Una actividad aminopeptidasa similar existe en E. coli (Meinnel y otros, Biochimie, vol. 75, págs. 1061-1075, (1993)). Este hallazgo en plástidos puede ser explotado en el futuro como un medio alternativo para generar un N-terminal no metionina.
Los resultados del ensayo de bioactividad (Figura 5) demuestran que la hGH expresada a partir de un plástido de planta tiene una forma sigmoidea cuando se representa gráficamente como absorbancia frente a concentración de hGH.
Ejemplo 5 Análisis de aprotinina en plantas de tabaco transplastómicas 5A. Análisis Western de expresión de aprotinina en plástidos
Se usó la expresión de líneas de tabaco homoplásmicas para determinar la expresión de la proteína aprotinina. El análisis por transferencia Western se llevó a cabo sobre líneas de tabaco que contienen los constructos pCGN6146, pCGN6147, pCGN6154 y pCGN6156 para la expresión de plástidos de aprotinina.
Las extracciones de proteína total y los procedimientos por transferencia Western se llevaron a cabo tal como se han descrito anteriormente, con la excepción de que el anticuerpo primario se generó contra aprotinina.
En la Figura 6 se muestran los resultados del análisis Western. Estos resultados indican que la aprotinina se expresó a partir del promotor T7 polimerasa cuando la secuencia que codifica la aprotinina se fusionó o bien con PetA o bien con el gen GUS de longitud completa. Además, estos resultados indican que la secuencia petA identifica de manera eficaz la proteína aprotinina contra el tilacoide de la célula de la planta.
<110> Calgene LLC
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<120> Expresión de péptidos eucarióticos en plástidos de plantas
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<130> 15346WO
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<140> Nueva solicitud
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<141> 1999-07-07
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<150> 09/316847
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<151> 1999-05-21
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<150> 09/113244
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<151> 1998-07-10
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<160> 2
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<170> PatentIn Ver. 2.1
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<210> 1
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<211> 88
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<212> ADN
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<213> a partir del bacteriófago T7 procedente del gen 10
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<400> 1
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\hskip-.1em\dddseqskip
aattgtagaa ataattttgt ttaactttaa gaagagata taccttaaca tctttattaa
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60
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aacaattga aattcttcct ctatatgg
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88
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
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<211> 58
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 2
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100

Claims (70)

1. Un constructo que comprende los componentes siguientes en la dirección 5' a 3' de la transcipción:
a) una secuencia promotora del operón ARN ribosómico 16S (Prrn);
b) un sitio de unión al ribosoma unido a dicho componente promotor (a), en el que dicho sitio de unión al ribosoma obtenido a partir de la secuencia conductora del gen 10 del bacteriófago T7;
c) una secuencia de ADN que codifica un péptido obtenido a partir de un organismo eucariótico; y
d) una región de terminación de transcripción,
en el que dicho péptido eucariótico es distinto de un péptido de una planta.
2. El constructo de acuerdo con la reivindicación 1, en el que dicho constructo comprende además:
(e) un gen que codifica un marcador seleccionable para la selección de células de plantas que comprende un plástido que expresa dicho marcador y (f) regiones de ADN de homología al genoma de dicho plástido, en el que dichas regiones de homología en (f) flanquean los componentes (a), (b), (c), (d) y (e).
3. El constructo de acuerdo con la reivindicación 1, en el que dicho sitio de unión al ribosoma es el sitio de unión al la secuencia conductora del gen 10 del bacteriófago T7.
4. El constructo de acuerdo con la reivindicación 1, en el que dicha secuencia de ADN codifica un péptido nuclear de planta.
5. El constructo de acuerdo con la reivindicación 4, en el que dicho péptido nuclear de planta es un gen del ciclo del carbono.
6. El constructo de acuerdo con la reivindicación 5, en el que dicho gen del ciclo del carbono está seleccionado entre el grupo constituido por fructosa, 1,6-bisfosfatasa aldolasa y seduheptulosa bisfosfatasa.
7. El constructo de acuerdo con la reivindicación 4, en el que dicho péptido nuclear de planta es un péptido antifúngico.
8. El constructo de acuerdo con la reivindicación 1, en el que dicha secuencia de ADN codifica un péptido de mamífero.
9. El constructo de acuerdo con la reivindicación 8, en el que dicho péptido de mamífero es una proteína seleccionada entre el grupo constituido por interferones, anticuerpos monoclonales, agentes hematopoyéticos, hormonas de la pituitaria, hormonas del tiroides, hormonas hipotalámicas, albúminas y hormonas pancreáticas.
10. El constructo de acuerdo con la reivindicación 9, en el que dicho péptido de mamífero es la insulina de hormona pancreática.
11. El constructo de acuerdo con la reivindicación 9, en el que dicho péptido de mamífero es una hormona de la pituitaria seleccionada entre el grupo constituido por hormonas somatomamotrópicas, hormonas gonadotrópicas, hormonas tirotrópicas y hormonas corticotrópicas.
12. El constructo de acuerdo con la reivindicación 11, en el que dicha hormona de la pituitaria es una hormona gonadotrópica seleccionada entre el grupo constituido por gonadotropinas coriónicas, hormonas luteinizantes y hormonas estimulantes del folículo.
13. El constructo de acuerdo con la reivindicación 11, en el que dicha hormona de la pituitaria es una hormona somatomamotrópica seleccionada entre el grupo constituido por prolactina y hormonas del crecimiento.
14. El constructo de acuerdo con la reivindicación 13, en el que dicha hormona somatomamotrópica es la hormona del crecimiento bGH.
15. El constructo de acuerdo con la reivindicación 13, en el que dicha hormona somatomamotrópica es la hormona del crecimiento hGH.
16. El constructo de acuerdo con la reivindicación 13, en el que dicha hormona somatomamotrópica es la hormona del crecimiento pBL.
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17. El constructo de acuerdo con la reivindicación 9, en el que dicho péptido de mamífero es un agente hematopoyético seleccionado entre el grupo de eritropoyetinas, interleucinas, y factores de estimulación de colonias.
18. El constructo de acuerdo con la reivindicación 17, en el que dicho péptido de mamífero es el factor de estimulación de colonias G-CSF.
19. El constructo de acuerdo con la reivindicación 9, en el que dicho anticuerpo monoclonal es un anticuerpo variable de cadena F sencilla.
20. El constructo de acuerdo con la reivindicación 8, en el que dicho péptido de mamífero es una proteína de coagulación no enzimática seleccionada entre el grupo constituido por proteínas cofactores del factor V y el factor VIII.
21. El constructo de acuerdo con la reivindicación 8, en el que dicho péptido de mamífero es un inhibidor de proteinasa.
22. El constructo de acuerdo con la reivindicación 21, en el que dicho inhibidor de proteinasa es aprotinina.
23. El constructo de acuerdo con la reivindicación 2, en el que dicho marcador seleccionable está seleccionado entre el grupo de aadA, resistencia a la espectinomicina, resistencia a la estreptomicina, resistencia a la kanamicina y un gen de tolerancia al glifosato.
24. El constructo de acuerdo con la reivindicación 1, en el que dicha secuencia que codifica el ADN es la secuencia nativa que codifica a dicho gen.
25. El constructo de acuerdo con la reivindicación 1, en el que dicha secuencia que codifica el ADN es la secuencia sintética que codifica dicho gen.
26. Un procedimiento de producción de una proteína en una célula de planta, comprendiendo dicho procedimiento la transformación de los plástidos de dicha célula de planta con un constructo que comprende lo siguiente como componentes unidos de manera operable en la dirección 5' a 3' de transcripción:
a) una secuencia promotora del operón ARN ribosómico 16S (Prrn);
b) un sitio de unión al ribosoma unido a dicho componente promotor (a), habiendose obtenido dicho sitio de unión al ribosoma a partir de la secuencia conductora del gen 10 del bacteriófago T7;
c) una secuencia de ADN que codifica un péptido obtenido a partir de una célula eucariótica distinta de un péptido de un plástido de una planta; y
d) una región de terminación de transcripción,
y el crecimiento de células de plantas que comprenden dichos plástidos transformados bajo condiciones en las que dicha secuencia que codifica el ADN está expresada para producir dicho péptido eucariótico en dicho plástido.
27. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 26, en el que dicho constructo comprende además:
(e) un gen que codifica un marcador seleccionable para la selección de células de plantas que comprende un plástido que expresa dicho marcador y (f) regiones de ADN de homología al genoma de dicho plástido, en el que dichas regiones de homología en (f) flanquean los componentes (a), (b), (c), (d) y (e).
28. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 26, en el que dicho sitio de unión al ribosoma es el sitio de unión de la secuencia conductora del gen 10 del bacteriófago T7.
29. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 26, en el que dicho constructo comprende además:
(g) una secuencia que codifica a una proteína secundaria fusionada a dicha secuencia de ADN que codifica un péptido de una célula eucariótica en (c).
30. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 29, en el que dicha proteína secundaria es la terminación de identificación tilacoide del citocromo f.
31. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 29, en el que dicha proteína secundaria es ubiquitina N-terminal escindible.
32. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 31, por el que dicha fusión ubiquitina N-terminal escindible está escindida a partir de dicho péptido eucariótico mediante la etapa de recolección de dichas células de plantas y exposición de los contenidos de dicho plástido transformado al citosol de dicha célula de planta.
33. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 32, por el que la expresión de dicho péptido eucariótico está potenciada.
34. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 26, en el que dicho péptido eucariótico distinto de un péptido de un plástido de planta expresado en dicho plástido de planta está plegado con el número correcto de enlaces disulfuro.
35. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 34, en el que dicho péptido eucariótico es hGH.
36. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 26, en el que dicho péptido eucariótico distinto de un péptido de un plástido de planta expresado en dicho plástido de planta transformada es bioactivo cuando se aísla a partir de dicho plástido de planta transformada.
37. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 36, en el que dicho péptido eucariótico es hGH.
38. El procedimiento de la reivindicación 26, el cual es adecuado para la producción de una proteína N-terminal no metionina en un plástido de célula de planta, comprendiendo dicho procedimiento:
la transformación de un plástidio de célula de planta con un constructo que comprende, como componentes unidos de manera operable en la dirección 5' a 3' de transcripción:
a) una secuencia promotora del operón ARN ribosómico 16S (Prrn);
b) un sitio de unión al ribosoma unido a dicho componente promotor (a), en el que dicho sitio de unión al ribosoma está obtenido a partir de la secuencia conductora del gen 10 del bacteriófago T7;
c) una secuencia de ADN que codifica un péptido ubiquitina escindible;
d) una secuencia de ADN que codifica una proteína de interés, y
e) una región de terminación de transcripción; y
el crecimiento de una célula de planta que comprende dicho plástido transformado bajo condiciones adecuadas para la expresión de dicha proteína de interés y dicha secuencia ubiquitina escindible en dicho plástido.
39. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 38, en el que dicho constructo comprende además (f) al menos dos regiones de ADN de homología al genoma de dicho plástido.
40. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 38, en el que dicho constructo comprende además (g) un gen que codifica un marcador seleccionable para la selección de una célula de planta que comprende un plástido que expresa dicho marcador.
41. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 38, en el que dicho sitio de unión al ribosoma es el sitio de unión de la secuencia conductora del gen 10 del bacteriófago T7.
42. Un plástido de célula de planta que contiene el constructo de acuerdo con la reivindicación 1.
43. Una planta, semilla de planta, parte de planta, célula de planta o progenie de la misma que contiene un plástido de planta de acuerdo con la reivindicación 42.
44. La célula de planta de la reivindicación 43, que está producida de acuerdo con el procedimiento de la reivindicación 27 y comprende más de aproximadamente 0,01% de la proteína soluble total como dicho péptido eucarió-
tico.
45. La célula de planta de la reivindicación 44, que comprende más de aproximadamente 0,2% de la proteína soluble total como dicho péptido eucariótico.
46. La célula de planta de la reivindicación 44, que comprende más de aproximadamente 1% de la proteína soluble total como dicho péptido eucariótico.
47. La célula de planta de la reivindicación 44, que comprende 7% o más de la proteína soluble total como dicho péptido eucariótico.
48. La célula de planta de la reivindicación 43, que está producida de acuerdo con el procedimiento del reivindicación 27, en la que dicho marcador seleccionable comprende una 5-enolpiruvil-siquimato-3-fosfato sintasa tolerante del glifosato.
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49. La célula de planta de la reivindicación 43, que tiene un plástido transformado de acuerdo con el procedimiento del reivindicación 26.
50. La planta, semilla de planta o parte de planta de la reivindicación 43, que comprende una célula de planta de acuerdo con la reivindicación 49.
51. El plástido de planta de la reivindicación 42 que tiene una proteína de interés producida de acuerdo con la reivindicación 47.
52. El plástido de planta de acuerdo con la reivindicación 51, en el que dicha proteína de interés comprende al menos aproximadamente 1% de la proteína soluble total en dicho plástido.
53. El plástido de planta de acuerdo con la reivindicación 52, en el que dicha proteína de interés comprende al menos aproximadamente 7,0% de la proteína soluble total en dicho plástido.
54. El plástido de planta de la reivindicación 42, que tiene incorporado de manera estable el constructo tal como se ha definido en la reivindicación 38 dentro de su genoma.
55. La célula de planta de la reivindicación 43, que comprende un plástido de planta que tiene incorporado de manera estable el constructo tal como se ha definido en la reivindicación 38 dentro de su genoma.
56. La célula de planta de la reivindicación 43, que comprende un plástido de planta transformado producido de acuerdo con el procedimiento de la reivindicación 38.
57. La planta, semilla de planta o parte de planta de la reivindicación 43 que comprende un plástido de planta de acuerdo con la reivindicación 51 ó 54.
58. La planta, semilla de planta o parte de planta de la reivindicación 43 que comprende una célula de planta de acuerdo con la reivindicación 55 ó 56.
59. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 38, en el que dicha proteína de interés está plegada con el número correcto de enlaces disulfuro.
60. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 38, en el que dicha proteína de interés es hGH.
61. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 38, en el que dicha proteína de interés es bioactiva cuando se aísla a partir de dicha célula de planta.
62. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 61, en el que dicha proteína de interés es hGH.
63. El plástido de planta de la reivindicación 42, que tiene un constructo tal como se ha definido en la reivindicación 38 integrado de manera estable dentro de su genoma; y una proteína N-terminal no metionina.
64. La célula de planta de la reivindicación 43, que comprende un plástido de planta que tiene un constructo tal como se ha definido en la reivindicación 38 integrado de manera estable dentro de su genoma; y una proteína N-terminal no metionina.
65. El procedimiento de la reivindicación 26, el cual es adecuado para la producción de una proteína N-terminal no metionina en un plástido de célula de planta, en el que dicho procedimiento comprende:
la transformación de un plástido de célula de planta con un constructo que comprende, como componentes unidos de manera operable en la dirección 5' a 3' de transcripción:
(a) una secuencia promotora del operón ARN ribosómico 16S (Prrn);
(b) un sitio de unión al ribosoma unido a dicho componente promotor (a), en el que dicho sitio de unión al ribosoma está obtenido a partir de la secuencia conductora del gen 10 del bacteriófago T7 o es el sitio rbcLRBS;
(c) una secuencia de ADN que codifica una proteína de interés, siendo dicha proteína de interés capaz de ser reconocida por una metionina amino peptidasa de célula de planta, y
d) una región de terminación de transcripción; y
el crecimiento de una célula de planta que comprende dicho plástido transformado bajo condiciones adecuadas para la expresión de dicha proteína de interés que tiene un N-terminal no metionina.
66. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 65, que comprende además la etapa de crecimiento de una planta que tiene dicha célula de planta.
67. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 66, que comprende además la etapa de recolección de dicha planta y el someter las células de dicha planta a medios para la purificación de manera substancial de dicha proteína de interés.
68. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 65, en el que dicha metionina amino peptidasa de célula de planta escinde la metionina N-terminal.
69. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 65, en el que el segundo aminoácido de dicha proteína está seleccionado entre el grupo constituido por alanina, cisteína, glicina, prolina, serina, treonina y valina.
70. El procedimiento de acuerdo con la reivindicación 69, en el que dicho segundo aminoácido es alanina.
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