[go: up one dir, main page]

DE69910406D1 - Vorrichtung zum extrahieren und prozessieren eines genmotivs, verfahren zum extrahieren und prozessieren eines genmotivs und aufzeichnungsmedium,das genmotiv-extraktions/prozessierungsprogramm trägt - Google Patents

Vorrichtung zum extrahieren und prozessieren eines genmotivs, verfahren zum extrahieren und prozessieren eines genmotivs und aufzeichnungsmedium,das genmotiv-extraktions/prozessierungsprogramm trägt

Info

Publication number
DE69910406D1
DE69910406D1 DE69910406T DE69910406T DE69910406D1 DE 69910406 D1 DE69910406 D1 DE 69910406D1 DE 69910406 T DE69910406 T DE 69910406T DE 69910406 T DE69910406 T DE 69910406T DE 69910406 D1 DE69910406 D1 DE 69910406D1
Authority
DE
Germany
Prior art keywords
processing
motive
gene
extracting
extract
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Expired - Lifetime
Application number
DE69910406T
Other languages
English (en)
Other versions
DE69910406T2 (de
Inventor
Yuichi Kawanishi
Kimitoshi Naito
Shin Miyazawa
Tatsuya Ito
Takamasa Futatsuki
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Fujitsu Ltd
Original Assignee
Fujitsu Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Fujitsu Ltd filed Critical Fujitsu Ltd
Publication of DE69910406D1 publication Critical patent/DE69910406D1/de
Application granted granted Critical
Publication of DE69910406T2 publication Critical patent/DE69910406T2/de
Anticipated expiration legal-status Critical
Expired - Lifetime legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B30/00ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B30/00ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids
    • G16B30/10Sequence alignment; Homology search
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B50/00ICT programming tools or database systems specially adapted for bioinformatics
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y10TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
    • Y10STECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y10S707/00Data processing: database and file management or data structures
    • Y10S707/99931Database or file accessing
    • Y10S707/99933Query processing, i.e. searching
    • Y10S707/99936Pattern matching access

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Evolutionary Biology (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Databases & Information Systems (AREA)
  • Bioethics (AREA)
  • Information Retrieval, Db Structures And Fs Structures Therefor (AREA)
DE69910406T 1998-08-19 1999-03-31 Vorrichtung zum extrahieren und prozessieren eines genmotivs, verfahren zum extrahieren und prozessieren eines genmotivs und aufzeichnungsmedium,das genmotiv-extraktions/prozessierungsprogramm trägt Expired - Lifetime DE69910406T2 (de)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP23290198A JP4040764B2 (ja) 1998-08-19 1998-08-19 遺伝子のモチーフ抽出処理装置及び遺伝子のモチーフ抽出処理方法並びに遺伝子のモチーフ抽出処理プログラムを記録した記録媒体
JP23290198 1998-08-19
PCT/JP1999/001693 WO2000011145A1 (en) 1998-08-19 1999-03-31 Apparatus for extracting and processing gene motif, method for extracting and processing gene motif and recording medium carrying gene motif extraction/processing program

Publications (2)

Publication Number Publication Date
DE69910406D1 true DE69910406D1 (de) 2003-09-18
DE69910406T2 DE69910406T2 (de) 2004-03-25

Family

ID=16946625

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
DE69910406T Expired - Lifetime DE69910406T2 (de) 1998-08-19 1999-03-31 Vorrichtung zum extrahieren und prozessieren eines genmotivs, verfahren zum extrahieren und prozessieren eines genmotivs und aufzeichnungsmedium,das genmotiv-extraktions/prozessierungsprogramm trägt

Country Status (5)

Country Link
US (1) US6745130B2 (de)
EP (1) EP1106685B1 (de)
JP (1) JP4040764B2 (de)
DE (1) DE69910406T2 (de)
WO (1) WO2000011145A1 (de)

Families Citing this family (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2000342257A (ja) * 1999-06-08 2000-12-12 Japan Science & Technology Corp 遺伝子の制御因子の結合部位構造推定方法及びその装置
KR20030038911A (ko) * 2001-11-07 2003-05-17 (주)엔솔테크 디옥시리보핵산 염기서열정보의 통합 및 자동화 처리방법
US7615616B2 (en) * 2002-09-13 2009-11-10 The Texas A&M University System Bioinformatic method for identifying surface-anchored proteins from gram-positive bacteria and proteins obtained thereby
JP2006113786A (ja) * 2004-10-14 2006-04-27 Mitsubishi Space Software Kk 配列情報抽出装置、配列情報抽出方法および配列情報抽出プログラム
JP4841396B2 (ja) 2006-10-18 2011-12-21 Necソフト株式会社 塩基配列の同定装置、核酸分子の二次構造取得装置、塩基配列の同定方法、核酸分子の二次構造取得方法、プログラム及び記録媒体
US9268903B2 (en) 2010-07-06 2016-02-23 Life Technologies Corporation Systems and methods for sequence data alignment quality assessment
US9529899B2 (en) 2010-10-07 2016-12-27 Hewlett Packard Enterprise Development Lp Visualizing motifs with visual structures
US9483463B2 (en) * 2012-09-10 2016-11-01 Xerox Corporation Method and system for motif extraction in electronic documents
CN103559425B (zh) * 2013-11-19 2017-02-15 黑龙江省森林工程与环境研究所 一种高通量基因测序的有效数据分类寻优目标检测系统及检测方法
CN113724894B (zh) * 2021-09-01 2023-12-29 千乘镜像(北京)科技有限公司 一种超微结构病理数据的分析方法、装置及电子设备

Family Cites Families (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0198403A3 (de) * 1985-04-09 1989-07-19 Fuji Photo Film Co., Ltd. Signalverarbeitungsverfahren um die Reihenfolge der Basen von Nukleinsäure festzustellen
GB2283840B (en) * 1993-11-12 1998-07-22 Fujitsu Ltd Genetic motif extracting method and apparatus
JP3353263B2 (ja) * 1993-11-12 2002-12-03 国立遺伝学研究所長 遺伝子のモチーフ抽出処理装置及び処理方法
US5701256A (en) * 1995-05-31 1997-12-23 Cold Spring Harbor Laboratory Method and apparatus for biological sequence comparison
JP2907169B2 (ja) * 1996-12-27 1999-06-21 日本電気株式会社 タンパク質及び遺伝子の配列の確率的モチーフ発見方法

Also Published As

Publication number Publication date
WO2000011145A1 (en) 2000-03-02
US6745130B2 (en) 2004-06-01
EP1106685A1 (de) 2001-06-13
EP1106685B1 (de) 2003-08-13
JP2000060553A (ja) 2000-02-29
JP4040764B2 (ja) 2008-01-30
US20010004448A1 (en) 2001-06-21
EP1106685A4 (de) 2002-03-06
DE69910406T2 (de) 2004-03-25

Similar Documents

Publication Publication Date Title
DE69924560D1 (de) Vorrichtung und Verfahren zum Hinzufügen von Information auf einem Aufzeichnungsmedium, das Zusatzaufzeichnung ermöglicht
DE69727206D1 (de) Verfahren zum Intergrieren/Extrahieren von Wasserzeichenidentifikationsinformation in/aus Bilddaten und Vorrichtung dafür sowie rechnerlesefähiges Medium
DE60132124D1 (de) Gerät und Verfahren zum Bereitstellen und Verarbeiten von Informationen, und Programmspeichermedium
DE602004027677D1 (de) Informationsaufzeichnungsmedium und Vorrichtung und Verfahren zum Aufzeichnen von Informationen auf das Informationsaufzeichnungsmedium
DE19983761T1 (de) Vorrichtung und Verfahren zum Sammeln und Analysieren von Kommunikationsdaten
DE69428239D1 (de) Verfahren und Vorrichtung zum Extrahieren bestimmter Gebiete
HUP0202198A2 (en) Information processing apparatus and method, program, and recorded medium
DE60125993D1 (de) Optisches Aufzeichnungsmedium, Verfahren zu dessen Herstellung und Verfahren und Vorrichtung zum Aufzeichnen auf oder Lesen von diesem Medium
DE69916160D1 (de) Vorrichtung und Verfahren zur kryptographischen Verarbeitung sowie Aufzeichnungsmedium zum Aufzeichnen eines kryptographischen Verarbeitungsprogramms zur Ausführung einer schnellen kryptographischen Verarbeitung ohne Preisgabe der Sicherheit
DE60303202D1 (de) System und verfahren zum identifizieren und extrahieren von zeichenketten aus erfassten bilddaten
DE19982999T1 (de) Vorrichtung und Verfahren zum Betreiben eines Computerspeichersystems
NO20020544L (no) Fremgangsmåte og apparat for innsamling av data i en hydrokarbonbrönn under produksjon
DE69932294D1 (de) Aufzeichnungsmedium mit darauf aufgezeichneten elektronischen Ticketdefinitionen und Verfahren und Vorrichtungen zum Verarbeiten elektronischerTickets
DE69911842D1 (de) Verfahren und Vorrichtung zum Wiederauffinden von Information und entsprechendes Speichermedium
DE60136244D1 (de) Videospielvorrichtung, Einstellungsverfahren zum Herausbringen eines Hintergrundtons in einem Videospiel und entsprechendes computerlesbares Aufzeichungsmedium
ATE244531T1 (de) Verfahren und gerät zum extrahieren einer geschlossenen kartusche
DE69906403D1 (de) Verfahren und Gerät zum Detektieren eines gesichtsähnlichen Gebiets
DE69828347D1 (de) Verfahren und Vorrichtung zum Extrahieren eines Taktsignals
DE69910406D1 (de) Vorrichtung zum extrahieren und prozessieren eines genmotivs, verfahren zum extrahieren und prozessieren eines genmotivs und aufzeichnungsmedium,das genmotiv-extraktions/prozessierungsprogramm trägt
DE10393540D2 (de) Rotor, Vorrichtung und ein Verfahren zum Einbringen von Fluiden in eine Metallschmelze
DE60036461D1 (de) Verfahren und Vorrichtung zum Ausführen der Kodeerfassung in einem Kodemultiplexvielfachzugriff (CDMA) Kommunikationssystem
DE60117345D1 (de) Verfahren und Vorrichtung zur Vorbereitung eines erweiterten Schlüssels, Aufzeichnungsmedium und Computerprogramm
DE10085161T1 (de) Vorrichtung und Verfahren zum Extrahieren von Nachrichten aus einem Datenstrom
GB2352916B (en) A contour extraction apparatus and method and a program recording medium
ATE312434T1 (de) Verfahren, vorrichtung und träger zum aufnehmen von multiwort-information

Legal Events

Date Code Title Description
8364 No opposition during term of opposition
8328 Change in the person/name/address of the agent

Representative=s name: SEEGER SEEGER LINDNER PARTNERSCHAFT PATENTANWAELTE