DE19838837A1 - Zellspezifische Promoter des Entkopplungsproteins 3 - Google Patents
Zellspezifische Promoter des Entkopplungsproteins 3Info
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Abstract
Die vorliegende Erfindung liegt im Feld der Genpromoter, die die Transkription von Proteinen vermitteln, die eine Rolle im Energiehaushalt von Zellen und bei der Fettleibigkeit spielen. Gegenstand der Erfindung sind DNS-Moleküle, die rekombinante zellspezifische Promoter des Entkopplungsproteins 3 (Engl.: Uncoupling protein 3; UCP 3) oder funktionelle Derivate davon enthalten. Ferner betrifft die Erfindung Zellen, die diese DNS-Moleküle enthalten. Ein weiterer Gegenstand der Erfindung sind Verwendungen dieser DNS-Moleküle und der erfindungsgemäßen Zellen sowie Verfahren zum Auffinden von Substanzen, die die Transkription beeinflussen können. Diese Verfahren können auch im Hochdrucksatzmusterungsformat durchgeführt werden. Ferner werden Verfahren offenbart, die es erlauben, Substanzen oder Faktoren zu finden, die an die erfindungsgemäßen DNS-Moleküle binden.
Description
Die vorliegende Erfindung liegt im Feld der Genpromoter von Proteinen, die eine Rolle im
Energiehaushalt von Zellen und bei der Fettleibigkeit spielen. Gegenstand der Erfindung
sind rekombinante DNS-Moleküle (DNS: Desoxyribonukleinsäure), die zellspezifische
Promoter des Entkopplungsproteins 3 (Engl.: Uncoupling protein 3; UCP 3) oder
funktionelle Derivate davon enthalten. Ferner betrifft die Erfindung Zellen, die diese
rekombinanten DNS-Moleküle enthalten, Verwendungen dieser DNS-Moleküle und der
erfindungsgemäßen Zellen, sowie Verfahren zum Auffinden von Substanzen, die die
Transkription der erfindungsgemäßen Promoter beeinflussen oder die an die
erfindungsgemäßen DNS-Moleküle binden.
Bei der Fettleibigkeit handelt es sich um eine Krankheit, bei der sich das Fettgewebe infolge
einer positiven Energiebilanz vermehrt. Dies kann Folge übermäßiger Nahrungsaufnahme
oder Symptom einer Stoffwechselerkrankung sein (ROCHE Lexikon Medizin, 3. Auflage,
Urban & Schwarzenberg). Fettleibigkeit ist ein häufiges ernährungsbedingtes Problem in
den westlichen Industrieländern und spielt eine wichtige Rolle als Krankheits- und
Todesursache (McGinnis and Foege, 1993; Manson et al., 1995). Da Fettleibigkeit durch
einen ständiges Ungleichgewicht zwischen Nahrungsaufnahme und Energieumsatz
verursacht wird, könnte eine chronische Reduktion des Energieumsatzes ein Risikofaktor
für diesen Zustand sein. Tatsächlich ist ein geringerer Energieumsatz im Ruhezustand ein
Risikofaktor für Fettleibigkeit (Ravussin et al., 1988; Griffiths et al., 1990). Genetische
Faktoren tragen signifikant zu der Höhe des Energiegrundumsatzes bei (Bogardus et al.,
1986; Bouchard et al., 1989). Braunes Fettgewebe (Brown Adipose Tissue; BAT) ist auf
Thermogenese spezialisiert, eine der Hauptfaktoren des Energieumsatzes (Himms-Hagen,
1989). Eine zentrale Bedeutung bei der thermogenen Funktion des BAT haben die
sogenannten Entkopplungsproteine 1, 2 und 3 (Engl.: uncoupling proteins; Abk.: UCPs)
(Klaus et al., 1991; Boss et al., 1997; Fleury et al. 1997; Gimeno et al., 1997; Gong et al.,
1997; Vidal-Puig et al., 1997). Diese Proteine stimulieren die Wärmeerzeugung, indem sie
die Substratoxidation von der ATP-Synthese entkoppeln (Ricquier et al. 1991). Während
die Wichtigkeit des BAT als ein Regulator des Körperfettspeichers für Nagetiere gezeigt
wurde (Lowell et al., 1993; Kopecky et al., 1995), ist dessen Rolle bei der Fettleibigkeit des
Menschen nicht klar, weil Erwachsene sehr wenig BAT besitzen (Krief et al. 1993).
Ungeachtet dieser Einschränkung wurde im intraperitonealen Fettgewebe von fettleibigen
Individuen ein signifikant geringerer UCP1-mRNS-Gehalt (RNS: Ribonukleinsäure; mRNS:
Botenribonukleinsäure) im Vergleich zu schlanken Kontrollpersonen gefunden (Oberkofler
et al., 1997). Ein großer Teil der Schwankungen der Menge der UCP1-mRNS in
fettleibigen Individuen wurde durch gewöhnliche Sequenzveränderungen im UCP1-
Genlokus erklärt (Esterbauer et al., im Druck). Ein Beitrag von UCP1 und BAT zum
Energiegrundumsatz ist daher denkbar.
UCP2 und UCP3, zwei andere kürzlich entdeckte Mitglieder der UCP-Familie, werden im
Menschen und im Nagetier in verschiedenen Geweben exprimiert. UCP2-mRNS kann im
weißen Fettgewebe, BAT, Lunge, Leber, Milz und Makrophagen gefunden werden (Fleury
et al., 1997; Gimeno et al., 1997), während hohe UCP3-mRNS-Mengen im Skelettmuskel
und BAT beobachtet werden (Boss et al., 1997; Gong et al., 1997; Vidal-Puig et al., 1997).
Studien in UCP1 gendefizienten Mäusen (Enerback et al., 1997) und in schlanken Ratten,
die Leptin überexprimieren (Zhou et al., 1997), unterstützen ein Modell, in dem UCP2 als
ein Reservesystem für die Thermogenese fungieren kann, wenn UCP1 defizient ist und/oder
sich die Menge an Leptin aufgrund von Übergewicht vergrößert. UCP3 könnte profunde
Effekte auf die Energiehomöostase haben, weil Muskelgewebe einen großen Teil des
Katecholamins enthält und für die ernährungsinduzierte Thermogenese sowohl in Menschen
(Astrup et al., 1986) als auch in Ratten (Thurlby und Ellis, 1986) verantwortlich ist.
Die menschlichen UCP2 und UCP3-Gene wurden in der Chromosomenregion 11q13
lokalisiert (Fleury et al., 1997; Solanes et al., 1997; Boss et al., 1998). Die Untersuchung
der Stammbäume der Quebec-Familienstudie lieferte sehr starke Indizien, daß diese
chromosomale Region mit dem Energieumsatz im Ruhezustand, dem Körpergewichtsindex
(Body mass index, BMI) und der Fettmasse in Erwachsenen assoziiert ist (Bouchard et al.,
1997). Darüber hinaus ist die syntene Region auf dem Chromosom 7 der Maus für
Fettleibigkeit und insulinunabhängigen Diabetes Mellitus verantwortlich (Hashimoto et al.,
1994; Warden et al., 1995).
Im Vergleich zu schlanken Kontrollpersonen war die Menge an UCP2-mRNS im
intraperitonealen Fettgewebe von krankhaft fettleibigen Personen reduziert. In
Übereinstimmung mit einer Rolle bei der Pathophysiologie der Fettleibigkeit blieb die
Menge der UCP2-mRNS in Patienten nach überstandener Fettleibigkeit niedrig, sowohl vor
als auch nach der Gewichtsreduktion (Oberkofler et al., im Druck). Im Gegensatz dazu
Unterschied sich die Menge der UCP3-mRNS im Muskelgewebe zwischen fettleibigen und
schlanken Individuen nicht (Millet et al., 1997), aber diese Ergebnisse müssen mit Vorsicht
interpretiert werden. Erstens wurden gewebsspezifische Unterschiede in der Regulation der
UCP3-Expression in Nagetieren gefunden (Gong et al., 1997; Larkin et al., 1997; Boss et
al., 1998). Zweitens wurden zwei verschiedene Isoformen (UCP3L und UCP3S) des
menschlichen UCP3-Gens durch Klonierung der zur mRNS komplementären DNS (Engl.:
complementary DNA; cDNA) gefunden. Ein Polyadenylierungssignal in Intron 6 wird in
einem signifikanten Teil der UCP3-Transkripte für die Bildung von UCP3S benützt, wobei
ein zweites Polyadenylierungssignal in Exon 7 für die Bildung von UCPL benützt wird. Der
UCP3S-Form fehlt aufgrund einer C-terminalen Trunkierung die sechste vorhergesagte
Transmembrandomäne und die Purinnukleotidbindungsdomäne, die für die Inhibition der
UCP-Aktivität durch Nukleotide verantwortlich gemacht wird (Jezek et al., 1994). Die
Trunkierung des UCP3 Moleküls könnte auf diese Art und Weise die UCP3-Aktivität
erhöhen, aber eine fehlerhafte Membraninsertion könnte die Stabilität und Funktion von
UCP3 beeinflussen.
Es ist wünschenswert, bessere Behandlungsmethoden für die Fettleibigkeit zu finden. Von
Vorteil sind Substanzen, die den Patienten möglichst schmerz- und nebenwirkungsfrei
verabreicht werden können. Eine Möglichkeit, die Suche nach derartigen Substanzen zu
vereinfachen, besteht darin, körpereigene Faktoren zu identifizieren, die eine wesentliche
Rolle bei diesem Krankheitsgeschehen spielen. Diese könnten ein Zielmolekül (Engl.: target)
für geeignete Substanzen sein, wobei durch die Wechselwirkung die Aktivität oder die
Eigenschaften des körpereigenen Faktors in einer für den Patienten positiven Weise
beeinflußt werden soll. Geeignete Zielmoleküle könnten auch definiert werden, wenn für
bereits bekannte körpereigene Faktoren die Mitwirkung am krankheitsauslösenden
Geschehen nachgewiesen werden kann. Diese Substanzen können nach der Identifikation
eines geeigneten Zielmoleküls mit einer größeren Aussicht auf Erfolg gefunden werden,
indem der Einfluß einer möglichst großen Zahl von Verbindungen auf die Aktivität oder
Eigenschaften des Zielmoleküls gemessen wird. Diese Verbindungen können einer
Naturstoff oder Substanzbibliothek entstammen, wobei hier auch die Kombinatorische
Chemie wertvolle Beiträge liefern kann. Zur Beschleunigung dieser Verfahren werden die
Analysen im Hochdurchsatz-Musterungs-Format (High throughput screening, HTS)
durchgeführt. Naturgemäß werden nur wenige Substanzen aufgefunden, die aber als Basis
für die chemische Derivatisierung und Optimierung und die anschließende
pharmakologische Charakterisierung dienen können.
Für das UCP3-Gen sind im Stand der Technik die aus der cDNS abgeleitete
Aminosäuresequenz, die cDNS-Sequenz (GenBank Zugangsnummer U84763), die
genomische DNS-Sequenz inklusive der Lage der Exons und der Introns (Boss et al., 1998)
und ein Teil des 5'-nichtkodierenden Bereiches vorbekannt (GenBank-Zugangsnummer
AF032871). Ferner war die Lage eines Promoters und eines TATA-Signals bekannt
(Eintrag AF032871 in der Datenbank GenBank). Die genomische DNS-Sequenz des UCP3-
Gens einschließlich der Introns und Exons und der 5'-Region ist übersichtshalber dieser
Anmeldung beigefügt (siehe SEQ ID NO: 17).
Überraschenderweise wurde nun im Rahmen dieser Erfindung gefunden, daß sich im von
dem TATA-Signal stromaufwärts liegenden Bereich ein zusätzlicher Promoter befindet, der
präferentiell in Fettzellen aktiv ist (siehe Beispiel 1). Das UCP3-Gen wird sonst nur noch im
Skelettmuskel stark exprimiert, aber dort unter Verwendung des bekannten Promoter, wie
überraschenderweise im Rahmen dieser Erfindung gefunden wurde (siehe Beispiel 1). Es ist
vorteilhaft, den präferentiell in Fettzellen oder in Muskelzellen aktiven Promoter zu
beeinflussen, da dies zur Behandlung der Fettleibigkeit dienen könnte. Dies ist besonders
vorteilhaft, weil hiermit ein Faktor moduliert werden kann, der ausschließlich in bestimmten
Bereichen des Körpers aktiv ist. Dazu können nun DNS-Konstrukte hergestellt werden, die
es erlauben, die fettzellspezifische oder die muskelzellspezifische Transkription des UCP3-
Gens zu untersuchen und entsprechende Substanzen zu deren Modulation zu finden. Dazu
muß nur der entsprechende Anteil des im anderen Zelltypus aktiven UCP3-Promoters
entfernt werden.
Die Aufgabe der Bereitstellung eines neuen geeigneten Zielmoleküls konnte somit mit der
vorliegenden Erfindung im Rahmen der Beschreibung und der Patentansprüche gelöst
werden. Erfindungsgemäß werden rekombinante DNS-Moleküle mit zellspezifischen
Promotern des UCP3-Gens bereitgestellt. In diesem Zusammenhang werden auch
rekombinante DNS-Moleküle, die funktionelle Derivate der erfindungsgemäßen Promoter
enthalten oder bestimmte Teile der 5'-Sequenz des UCP-3 Promoters umfassen, von der
vorliegenden Erfindung offenbart. Weiterhin werden auch Zellen von der vorliegenden
Erfindung umfaßt, die erfindungsgemäße DNS-Moleküle enthalten. In einer weiteren
Ausführungsform wird die Verwendung dieser DNS-Moleküle oder der erfindungsgemäßen
Zellen zur Transkription eines Gens oder zum Auffinden von Substanzen offenbart, die die
Transkription beeinflussen. Weiterhin werden von der Erfindung Verfahren umfaßt, die es
erlauben, Substanzen aufzufinden, die die Transkriptionsrate des beeinflussen. Besonders
bevorzugt wird das erfindungsgemäße Verfahren im Hochdurchsatz-Musterungs-Format
(High throughput screening, HTS) durchgeführt. Weiterhin werden Verfahren offenbart, die
es erlauben, Substanzen oder Faktoren zu finden, die an die erfindungsgemäßen DNS-
Moleküle binden.
Durch diese Erfindung wird ein rekombinantes DNS-Molekül offenbart, das den
präferentiell in Fettzellen aktiven UCP3-Promoter enthält, aber nicht den bekannten, in
Muskelzellen aktiven UCP3-Promoter. Dieses rekombinante DNS-Molekül enthält die
Sequenzen SEQ ID NO: 1 TATATTAAA und SEQ ID NO: 2 CACCTC, nicht jedoch die
SEQ ID NO: 3 TATAAGA und SEQ ID NO: 4 CAATCC. Es können aber auch die
Sequenzen, die für den in Muskelzellen aktiven Promoter wichtig sind, durch Punktmutation
oder Deletionen oder Kombinationen davon so verändert sein, daß sie ihre Funktion in der
Transkription verlieren. Zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO: 2
können 30 bis 50 Basenpaare, bevorzugt 40 bis 45 Basenpaare, besonders bevorzugt 42
Basenpaare liegen. In einer weiteren Ausführungsform ist das beschriebene DNS-Molekül
weiter dadurch gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 1 zusätzlich ein RXR/PPAR-
Element (Schoonjans et al., 1996) liegt, das bevorzugt die Sequenz SEQ ID NO: 5
TGACCTTTGGACT umfaßt, wobei zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO: 5
bevorzugt 65 bis 75 Basenpaare liegen. Eine Übersicht über wesentliche
Promoterelemente wurde von Locker und Buzard (1990) gegeben. Ein weitere
Ausführungsform der Erfindung ist dadurch gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ
ID NO: 1 zusätzlich eine Alu-Sequenz liegt, wobei zwischen der Sequenz SEQ ID NO: 1
und der Alu-Sequenz 255 bis 265 Basenpaare liegen können. Im Sinne der Erfindung ist
unter Alu-Sequenz ein nur im menschlichen Genom vorkommender Abschnitt von etwa 300
Basenpaaren zu verstehen, der zu den hochrepetitiven DNS-Sequenzen gehört und etwa in
der Mitte ein Schnittstelle für das Restriktionsenzym Alu I trägt. Das beschriebene DNS-
Molekül kann weiter dadurch gekennzeichnet sein, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 1
zusätzlich ein E2A-Element (Locker und Buzard, 1990; Aronheim et al., 1991; Leshkowitz
et al. 1992; Park und Walker, 1992) ist, das der Sequenz SEQ ID NO: 6 CAGATG
entspricht, wobei zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO: 6 440 bis 450
Basenpaare liegen können. Das beschriebene DNS-Molekül kann weiter dadurch
gekennzeichnet sein, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: : 1 zusätzlich eine E-Box
(Aronheim et al., 1991; Leshkowitz et al. 1992; Park und Walker, 1992) ist, die bevorzugt
die Sequenz SEQ ID NO: 7 CACTTG umfaßt, wobei zwischen den Sequenzen SEQ ID
NO: 1 und SEQ ID NO: 7 450 bis 460 Basenpaare liegen können. Das beschriebene DNS-
Molekül kann weiter dadurch gekennzeichnet sein, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 1
zusätzlich eine weitere E-Box (Aronheim et al., 1991; Leshkowitz et al. 1992; Park und
Walker, 1992) ist, die bevorzugt die Sequenz SEQ ID NO: 8 CATTTG umfaßt, wobei
zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO: 8 460 bis 470 Basenpaare liegen
können. Das erfindungsgemäße DNS-Molekül kann weiter dadurch gekennzeichnet sein,
daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 1 zusätzlich eine Oktamersequenz (Locker und
Buzard, 1990) sein kann, die bevorzugt die Sequenz SEQ ID NO: 9 ATGAAAATGT
umfaßt, wobei zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO: 9 515 bis 525
Basenpaare liegen können. Das erfindungsgemäße DNS-Molekül kann weiter dadurch
gekennzeichnet sein, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 1 zusätzlich eine weitere CAAT-
Box (Locker und Buzard, 1990) sein kann, die bevorzugt die Sequenz SEQ ID NO: 10
CCAAT umfaßt, wobei zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO: 10 560
bis 570 Basenpaare liegen können. Die CAAT-Box (Locker und Buzard, 1990) ist Teil
einer bei vielen eukaryontischen Genen, im 5 '-flankierenden Bereich der kodierenden
Region beobachteten, konservierten Basenabfolge. Das erfindungsgemäße DNS-Molekül
kann weiter dadurch gekennzeichnet sein, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 1 zusätzlich
eine weitere CAAT-Box (Locker und Buzard, 1990) sein kann, die bevorzugt die Sequenz
SEQ ID NO: 11 ATTGG umfaßt, wobei zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO:
11 670 bis 680 Basenpaare liegen können. Das erfindungsgemäße DNS-Molekül
kann weiter dadurch gekennzeichnet sein, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 1 zusätzlich
eine CAAT-Box (Locker und Buzard, 1990) angeordnet sein kann, die bevorzugt die
Sequenz SEQ ID NO: 12 ATTGG umfaßt, wobei zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 1
und SEQ ID NO: 12 730 bis 740 Basenpaare liegen können. Das erfindungsgemäße DNS-
Molekül kann weiter dadurch gekennzeichnet sein, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 1
zusätzlich eine Bindungsstelle für einen stromaufwärts bindenden Stimulationsfaktor (Engl.:
USF; Locker und Buzard, 1992) angeordnet ist, die bevorzugt die Sequenz SEQ ID NO: 13
CCACGTGC umfaßt, wobei zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO: 13
845 bis 855 Basenpaare liegen können.
Durch diese Erfindung wird ein weiteres rekombinantes DNS-Molekül offenbart, das nicht
den präferentiell in Fettzellen aktiven UCP3-Promoter enthält, aber den in Muskelzellen
aktiven Promoter. Dieses rekombinante DNS-Molekül enthält die Sequenzen SEQ ID NO:
3 TATAAGA und SEQ ID NO: 4 CAATCC, nicht jedoch die Sequenzen SEQ ID NO: 1
TATATTAAA und SEQ ID NO: 2 CACCTC. Es können aber auch die Sequenzen, die für
den in Fettzellen aktiven Promoter wichtig sind, durch Punktmutation oder Deletionen oder
Kombinationen davon so verändert sein, daß sie ihre Funktion in der Transkription
verlieren. Zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 3 und SEQ ID NO: 4 können 45 bis 70
Basenpaare, bevorzugt 52 bis 58 Basenpaare, ganz besonders bevorzugt 55 Basenpaare
liegen. In einer weiteren Ausführungsform ist das beschriebene DNS-Molekül weiter
dadurch gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 3 zusätzlich ein RXR/PPAR-
Element liegt, das bevorzugt die Sequenz SEQ ID NO: 5 TGACCTTTGGACT
umfaßt. Eine weitere Ausführungsform der Erfindung ist dadurch gekennzeichnet, daß
stromaufwärts von SEQ ID NO: 3 zusätzlich eine Alu-Sequenz ist. Das beschriebene DNS-
Molekül kann weiter dadurch gekennzeichnet sein, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 3
zusätzlich ein E2A-Element ist, das der Sequenz SEQ ID NO: 6 CAGATG entspricht. Das
beschriebene DNS-Molekül kann weiter dadurch gekennzeichnet sein, daß stromaufwärts
von SEQ ID NO: 3 zusätzlich eine E-Box ist, die bevorzugt die Sequenz SEQ ID NO: 7
CACTTG umfaß. Das beschriebene DNS-Molekül kann weiter dadurch gekennzeichnet
sein, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 3 zusätzlich eine weitere E-Box ist, die
bevorzugt die Sequenz SEQ ID NO: 8 CATTTG umfaßt. Das erfindungsgemäße DNS-
Molekül kann weiter dadurch gekennzeichnet sein, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 3
zusätzlich eine Oktamersequenz sein kann, die bevorzugt die Sequenz SEQ ID NO: 9
ATGAAAATGT umfaßt. Das erfindungsgemäße DNS-Molekül kann weiter dadurch
gekennzeichnet sein, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 3 zusätzlich eine weitere CAAT-
Box sein kann, die bevorzugt die Sequenz SEQ ID NO: 10 CCAAT umfaß. Die CAAT-Box
ist Teil einer bei vielen eukaryontischen Genen, im 5'-flankierenden Bereich der
kodierenden Region beobachteten, konservierten Basenabfolge. Das erfindungsgemäße
DNS-Molekül kann weiter dadurch gekennzeichnet sein, daß stromaufwärts von SEQ ID NO:
3 zusätzlich eine weitere CAAT-Box sein kann, die bevorzugt die Sequenz SEQ ID NO:
11 ATTGG umfaßt. Das erfindungsgemäße DNS-Molekül kann weiter dadurch
gekennzeichnet sein, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 3 zusätzlich eine CAAT-Box
angeordnet sein kann, die bevorzugt die Sequenz SEQ ID NO: 12 ATTGG umfaßt. Das
erfindungsgemäße DNS-Molekül kann weiter dadurch gekennzeichnet sein, daß
stromaufwärts von SEQ ID NO: 3 zusätzlich eine Bindungsstelle für einen stromaufwärts
bindenden Stimulationsfaktor angeordnet ist, die bevorzugt die Sequenz SEQ ID NO: 13
CCACGTGC umfaßt.
Weiter werden von der Erfindung auch DNS-Moleküle umfaßt, die die Sequenz SEQ ID
NO 14 oder eine Sequenz, die unter stringenten Bedingungen an SEQ ID NO 14
hybridisiert, enthalten. Unter stringenten Bedingungen versteht der Fachmann Bedingungen,
die für mehr als 85%, bevorzugt mehr als 90% Homologie selektieren (Sambrook et al.,
1989). Die Hybridisierungen werden in 6×SSC/5×Denhardt's Lösung/ 0,1% SDS (SDS:
Natriumdodekylsulfat) bei 65°C durchgeführt. Der Grad der Stringenz wird im
Waschschritt festgelegt. So sind für eine Selektionierung auf DNS-Sequenzen mit ca. 85%
oder mehr Homologie die Bedingungen 0,2×SSC/ 0,01% SDS/65°C und für eine
Selektionierung auf DNS-Sequenzen mit ca. 90% oder mehr Homologie die Bedingungen
0,1×SSC/0,01% SDS/65°C geeignet. Die Zusammensetzung der Reagenzien wird in
Sambrook et al. (1989) beschrieben.
Weiterhin werden von der Erfindung funktionelle Derivate der erfindungsgemäßen, DNS-
Moleküle mit den zellspezifischen UCP3-Promotern umfaßt. Im Sinne der Erfindung
werden unter funktionellen Derivate alle DNS-Sequenzen verstanden, die durch
Punktmutationen oder Deletionen oder Kombinationen von Punktmutationen oder
Deletionen aus der Ursprungssequenz hervorgegangen sind. Diese funktionellen Derivate
haben erfindungsgemäß die gemeinsame Eigenschaft, die Transkription eines am 3'-Ende
des funktionellen Derivats fusionierten Gen zu vermitteln. Es liegt im Können eines
Durchschnittsfachmanns, diese funktionellen Derivate durch zielgerichtete oder zufällige
Mutagenese oder durch die Einführung von Deletionen aus den erfindungsgemäßen
Sequenzen herzustellen. Genaue Verfahren werden von Sambrook et al. (1989) beschrieben.
Es können z. B. Oligonukleotid-gerichtete oder zufällige Mutageneseverfahren verwendet
werden. Für das letztere Verfahren kann auch die Polymerase-Kettenreaktion benützt
werden, die ungenau arbeitet, wenn sie unter suboptimalen Bedingungen durchgeführt wird
(Lin-Goerke et al., 1997). Die Einführung von Deletionen kann z. B. durch die Verwendung
von Oligonukleotiden mit Methoden der zielgerichteten Mutagenese oder bevorzugt durch
Amplifikation gewünschter Bereiche mittels Polymerase-Kettenreaktion erfolgen. Der
Durchschnittsfachmann kann ein funktionelles Derivat ermitteln, indem er die Aktivität eines
am 3'-Ende des funktionellen Derivats fusionierten Reportergens, wie z. B. Luciferase,
bestimmt. Besonders bevorzugt wird die Aktivität eines funktionellen Derivats durch den
Chloramphenicoltransferase-Test bestimmt (engl.: "CAT-Assay"), der nach Sambrook et al.
(1989) durchgeführt wird. Als ein funktionelles Derivat wird der Durchschnittsfachmann
eine durch Punktmutation oder Deletion oder Kombination der beiden Veränderungen
Sequenz erachten, die in einem der beiden vorgenannten Tests ein über dem Hintergrund
liegendes Signal ergibt.
In einer bevorzugten Ausführungsform der Erfindung liegen die erfindungsgemäßen DNS-
Moleküle in Form von Vektoren vor, insbesondere von Expressionsvektoren. In einer
besonders bevorzugten Ausführungsform ist das erfindungsgemäße DNS-Molekül ein
Plasmid. In einer anderen Ausführungsform ist das erfindungsgemäße DNS-Molekül ein
viraler Vektor.
In einer weiteren bevorzugten Ausführungsform werden DNS-Moleküle offenbart, die
zusätzlich zu der DNS-Sequenz der erfindungsgemäßen Promoter noch weitere Gene
enthalten, die funktionell mit den erfindungsgemäßen Promoteren verknüpft sind. Im Sinne
dieser Erfindung soll unter funktionell verstanden werden, daß die Verknüpfung in einer
Weise vorgenommen werden soll, die es ermöglicht, entweder das Gen zu transkribieren
oder das Gen zu transkribieren und dessen Translationsprodukt zu erhalten. Bei den Genen
kann es sich um die cDNS oder die genomischer Sequenz des Entkopplungsproteins 3 oder
um Reportergene handeln. Bei den Translationsprodukten der Reportergene handelt es sich
bevorzugt um Proteine, deren Menge durch Bestimmung der Aktivität, Absorption,
Luminiszenz oder Fluoreszenz leicht bestimmt werden kann, wie z. B. dem grün
fluoreszierenden Protein (Engl.: Green Fluorescent Protein; GFP), der Chloramphenicol-
acetyl-transferase, der β-Galactosidase, der sekretierten Alkalischen Phosphatase oder der
Luziferase. Im Sinne dieser Erfindung sollen unter grün fluoreszierenden Protein auch alle
Varianten verstanden werden, die in anderen Wellenlängenbereichen fluoreszieren, aber sich
von der Aminosäuresequenz des grün fluoreszierenden Proteins ableiten. Besonders
bevorzugt handelt es sich um bei den durch das Reportergen kodierten Proteinen um
Enzyme, die eine Reaktion katalysieren, deren Endprodukt leicht quantitativ zu bestimmen
ist. So wird z. B. von dem Enzym Luziferase eine chemische Reaktion katalysiert, bei der
durch Luminiszenz Licht emittiert wird, das in einem Luminometer bestimmt werden kann.
Ein weiterer Aspekt der Erfindung ist ein DNS-Molekül, das die Sequenz SEQ ID NO 15
oder eine Sequenz, die unter stringenten Bedingungen an SEQ ID NO 15 hybridisiert,
enthält. Unter stringenten Bedingungen versteht der Fachmann Bedingungen, die für mehr
als 85%, bevorzugt mehr als 90% Homologie selektieren (Sambrook et al., 1989). Die
Hybridisierungen werden in 6×SSC/5×Denhardt's Lösung/ 0,1% SDS bei 65°C
durchgeführt. Der Grad der Stringenz wird im Waschschritt festgelegt. So sind für eine
Selektionierung auf DNS-Sequenzen mit ca. 85% oder mehr Homologie die Bedingungen
0,2×SSC/0,01% SDS/65°C und für eine Selektionierung auf DNS-Sequenzen mit ca. 90%
oder mehr Homologie die Bedingungen 0,1×SSC/0,01% SDS/65°C geeignet. Die
Zusammensetzung der beschriebenen Reagenzien ist auch in Sambrook et al. (1989)
beschrieben.
Ein weiterer Aspekt der Erfindung ist eine Wirtszelle, in die ein erfindungsgemäßes DNS-
Molekül eingeführt wurde. Dies kann eine eine eukaryontische Wirtszelle sein, bevorzugt
eine Hefe- oder eine Säugerzelle. Besonders bevorzugt als Wirtszellen sind Adipozyten in
Primärkultur, bevorzugt aus dem Menschen oder aus der Maus, Adipozytenzellinien wie
z. B. NIH-3T3L1 (eine Mausadipozytenzellinie), Muskelzellen in Primärkultur,
Muskelzellinien wie z. B. C2C12 (eine Muskelzellinie aus der Maus) oder Zellinien wie
HEK293 oder HeLa. Dem Durchschnittsfachmann ist es bekannt, wie er durch
Standardmethoden geeignete DNS-Moleküle in bestimmte Zellen einführen kann. Diese
Methoden sind in Sambrook et al. (1989) beschrieben. Für eukaryontische Zellen wird er
bevorzugt die Kalzium-Präzipitationsmethode, die Lipofektion oder die Elektroporation
verwenden. Es liegt auch im Können des Durchschnittsfachmanns Parameter aus der
Literatur zu entnehmen oder ohne unzumutbaren Aufwand zu entwickeln, die eine
erfolgreiche Durchführung der Methoden zum Einbringen von DNS-Moleküle in diese
Zellen ermöglicht.
Ein weiterer Aspekt der Erfindung ist die Verwendung eines erfindungsgemäßen DNS-
Moleküls mit den genannten zellspezifischen Promotern zur Transkription eines Gens. Zur
Herstellung geeigneter DNS-Moleküle wird der Fachmann molekularbiologische Methoden
verwenden, wie von Sambrook et al. (1989) beschrieben, die er unter Kenntnis der Sequenz
der erfindungsgemäßen DNS-Moleküle, der Sequenz des zu transkribierenden Gens und
weiterer Elemente wählen wird. Der Nachweis der Transkripte oder des
Translationsproduktes erfolgt bevorzugt mit Standardmethoden, wie z. B. Nachweis von
RNS durch sequenzspezifische Hybridisierung (Northern Blot), Nachweis des
Translationsproduktes durch Antikörper (z. B. Western Blot) oder durch dessen Aktivität in
geeigneten Nachweissystemen. Das Translationsprodukt kann auch enzymatische Aktivität
haben. Die Methoden hierzu sind von Sambrook et al. (1989) beschrieben.
Eine besonders bevorzugte Ausführungsform der Erfindung ist die Verwendung der
erfindungsgemäßen DNS-Moleküle zum Auffinden von Substanzen, die die Transkription
der erfindungsgemäßen UCP3-Promoter beeinflussen. Dazu werden DNS-Moleküle
bereitgestellt, die die Sequenz der erfindungsgemäßen Promoter, die Sequenz SEQ ID NO
14 oder SEQ ID NO 15 umfassen. Diese können auch funktionelle Derivate davon
enthalten. Bevorzugt werden diese DNS-Moleküle mit anderen DNS-Molekülen verknüpft,
die die Sequenzen für Gene enthalten, die einen leichten Nachweis des Genproduktes
gestatten (Reportergene). Bei diesen Reportergenen kann es sich z. B. um das Luziferasegen
oder das grün fluoreszierende Protein (Engl.: green fluorescent protein, Abk.: GFP)
handeln. Es kann auch die vom erfindungsgemäßen Promoter transkribierte RNS bestimmt
und quantifiziert werden. In einer weiteren Ausführungsform der Erfindung werden hier
auch Zellen verwendet, die mit den erfindungsgemäßen DNS-Molekülen transformiert
wurden.
Ein bevorzugter Aspekt der Erfindung ist ein Verfahren zum Auffinden von Substanzen, die
die Transkription des präferentiell in Fettzellen oder präferentiell in Muskelzellen aktiven
UCP3-Promoter beeinflussen können und in dem die erfindungsgemäßen DNS-Moleküle
benützt werden können. Das erfindungsgemäße Verfahren kann in einem zellfreien oder
einem zellbasierten System durchgeführt werden.
Eine Ausführungsform eines solchen Verfahrens besteht in einem zellfreien in-vitro-
Transkriptionssystem, das als Komponenten mindestens Zellextrakt, Ribonukleotide und ein
erfindungsgemäßes DNS-Molekül enthält. Eine bevorzugte Ausführungsform besteht darin,
die Transkriptionsrate des eingesetzten Promoters in Anwesenheit einer Testsubstanz zu
messen und mit der Transkriptionsrate in Abwesenheit der Testsubstanz zu vergleichen.
Liegt die Menge der pro Zeiteinheit transkribierten RNS in Anwesenheit der Testsubstanz
niedriger als der Vergleichswert (d. h. Abwesenheit der Testsubstanz), so inhibiert die
Testsubstanz die Transkription in diesem Test. Liegt die Menge der pro Zeiteinheit
transkribierten RNS in Anwesenheit der Testsubstanz höher als der Vergleichswert (d. h.
Abwesenheit der Testsubstanz), so steigert die Testsubstanz die Transkription in diesem
Test.
Eine weitere Ausführungsform des Verfahrens zum Auffinden von Substanzen, die die
Transkription des erfindungsgemäßen Promoters beeinflussen können, besteht darin, die
Veränderung der Aktivität eines am 3'-Ende eines erfindungsgemäßen DNS-Moleküls
fusionierten Reportergens zu messen, z. B. dem Luziferasegen oder dem grün
fluoreszierenden Protein. Ein solches Verfahren kann in einem zellfreien System
durchgeführt werden. Eine Ausführungsform des erfindungsgemäßen Verfahrens besteht
darin, die nach in-vitro-Transkription in Gegenwart einer Testsubstanz erhaltene RNS durch
in-vitro-Translation in Proteine zu überführen, deren Menge, Aktivität, Absorption,
Luminiszenz oder Fluoreszenz bestimmt wird. Die erhaltene RNS wird in Proteine
überführt, die eine enzymatische Reaktion katalysieren, deren Produkt einfach bestimmt
werden kann. Ganz besonders bevorzugt ist hier die Verwendung von Luziferase oder des
grün fluoreszierenden Proteins.
Eine besonders bevorzugte Ausführungsform ist ein erfindungsgemäßes zellbasiertes
Verfahren, bei dem Zellen, die ein erfindungsgemäßes DNS-Molekül enthalten, in
Gegenwart einer Testsubstanz wachsen und unter Bedingungen, unter denen von den
erfindungsgemäßen UCP3-Promotern transkribiert wird. Das Prinzip des Verfahrens beruht
darauf, die erfindungsgemäßen UCP3-Promoter zur Expression eines Reportergens zu
benützen, um die Auswirkungen von hinzugefügten Testsubstanzen zu untersuchen. Die
Expression des Reportergens simuliert auf diese Weise die Expression des UCP3-Gens. Die
erfindungsgemäßen Promoter-Reporterkonstrukte können in Tests benützt werden,
nachdem sie in die Zelle eingeführt wurden oder eine Zellinie hergestellt wurde, die diese
Konstrukte stabil in das Genom integriert hat. Bevorzugt wird zu einem gewissen Zeitpunkt
die Menge, Aktivität, Luminiszenz oder Fluoreszenz des Translationsprodukts des an das
3'-Ende der erfindungsgemäßen, zellspezifischen UCP3-Promoter fusionierten
Reportergens bestimmt, wobei die Zellen eventuell vorher lysiert werden. Eine bevorzugte
Ausführungsform eines solchen Verfahrens besteht darin, die Ergebnisse in Anwesenheit
einer Testsubstanz zu messen und mit Ergebnissen in Abwesenheit der Testsubstanz zu
vergleichen. Liegt die Menge, Aktivität, Absorption, Luminiszenz oder Fluoreszenz des pro
Zeiteinheit in Anwesenheit der Testsubstanz produzierten Reporterproteins niedriger als der
Vergleichswert (d. h. Abwesenheit der Testsubstanz), so inhibiert die Testsubstanz die
Transkription in diesem Test. Liegt die Menge, die Aktivität, Absorption oder Fluoreszenz
des pro Zeiteinheit in Anwesenheit der Testsubstanz produzierten Reporterproteins höher
als der Vergleichswert (d. h. Abwesenheit der Testsubstanz), so steigert die Testsubstanz die
Transkription in diesem Test. Die Signalhöhe ist ein Maß für die Aktivität des UCP3-
Promoters.
In der Praxis könnten die erfindungsgemäßen Promoter in Plasmide kloniert werden, die
Reportergene beherbergen, wie z. B. Luziferase, β-Galactosidase, Chloramphenicol-acetyl-
transferase oder sekretierte alkalische Phosphatase. Plasmide, die ein Reportergen enthalten,
sind z. B. die kommerziell erhältlichen pGL2basic oder pGL3basic (Promega, Madison,
Wisconsin, USA) und pSEAP2basic oder pßgal-basic (Clontech, Heidelberg, Deutschland).
Auf gleiche Weise könnten Zellen benützt werden, die die genannten DNS-Konstrukte stabil
in das Genom integriert haben. Zellen, die für die Durchmusterungstest benützt werden
können, sind z. B. primäre Zellkulturen z. B. von Adipozyten oder Muskelgewebe, oder
Zellinien wie HEK293, HeLa, C2C12 oder NIH-3T3. Werden primäre Zellkulturen für
längere Zeit kultiviert, so geht die UCP3-Expression verloren. Auch in einigen Zellinien ist
keine UCP3-Expression nachweisbar. Jedoch sind diese Zellinien geeignet, um Aktivatoren
der UCP3-Transkription zu finden, da diese auch in Zellen aktivatorisch wirken werden, die
UCP3 exprimieren. Besonders Aktivatoren der UCP-3-Transkription im Muskelgewebe
können zur Herstellung von Arzneimitteln zur Behandlung der Fettleibigkeit verwendet
werden. Für diese Zwecke können jedoch auch Aktivatoren der UCP-3-Transkription im
Fettgewebe verwendet werden.
Der Durchschnittsfachmann kann einen solchen Test durchführen (siehe Beispiel 2), indem
er auf Standardmethoden und fertig zusammengestellte Reagenzien zurückgreift, wie sie
z. B. von Promega (Madison, Wisconsin, USA) fertig zusammengestellt (Luciferase Assay
System) angeboten werden. Dazu erhält er auch Vorschriften, wie der Test mit den
kommerziell erhältlichen Reagenzien durchzuführen ist. Der Fachmann stellt dazu mit
Standardmethoden geeignete Konstrukte her und transfiziert diese in geeignete Zellkulturen
(Sambrook et al., 1989). Nach Wachstum in Gegenwart der zu testenden Substanz wird
optional gewaschen und die Zellen anschließend lysiert. Nach Zentrifugation zur Entfernung
der Zelltrümmer wird der Überstand mit dem Luciferin enthaltenden Testreagens versetzt
und das emittierte Licht in einem Luminometer gemessen.
In einer bevorzugten Ausführungsform wird ein erfindungsgemäßes Verfahren im
Hochdurchsatz-Musterungs-Format (High throughput screening, HTS) ausgeführt. Dabei
wird in einer geeigneten Anordnung eine große Anzahl von Testsubstanzen gleichzeitig
geprüft. Ein solches HTS-Verfahren kann vorteilhaft voll- oder teilautomatisiert sein und
die Auswertung durch elektronische Datenverarbeitung erfolgen. Vorteilhaft wird eine
Testsubstanz, die im zellfreien System eine steigernde Wirkung zeigte, zusätzlich in einem
zellbasierten System geprüft. Das im vorherigen Abschnitt beschriebene Verfahren kann von
einem Fachmann ohne erfinderische Tätigkeit an die Erfordernisse im Hochdurchsatz-
Musterungs-Format angepaßt werden.
Eine weitere Ausführungsform der Erfindung besteht darin, die erfindungsgemäßen DNS-
Moleküle zur Identifizierung weiterer Faktoren oder Substanzen zu benützen, die an sie
binden. Bevorzugt werden Faktoren gesucht, die die Transkription eines am 3'-Ende
fusionierten Gens vermitteln, erniedrigen oder erhöhen (Transkriptionsfaktoren). Dazu
können die erfindungsgemäßen DNS-Moleküle auf unlöslichen Trägern gebunden werden
und mit einem Gemisch aus verschiedenen Faktoren oder Substanzen, wie z. B. einem
Kernextrakt oder einer Naturstoffbibliothek, unter geeigneten Bedingungen in Kontakt
gebracht werden. Nach ein oder mehreren Waschschritten, eventueller Wiederholung des
Bindungsprozesses werden die gebundenen Faktoren oder Substanzen durch geeignete
Methoden, wie z. B. Aminosäuresequenzierung, Massenspektroskopie, Gelelektrophorese,
identifiziert.
Unter DNS-Molekülen im Sinne dieser Erfindung sind alle Moleküle zu verstehen, die aus
natürlich vorkommenden Desoxyribonukleotiden bestehen. Dabei sollen aber auch
erfindungsgemäß Moleküle erfaßt werden, die nach chemischer Derivatisierung den
grundsätzlichen chemischen Charakter der DNS behalten haben. Zu den möglichen
Derivatisierungen zählt z. B. die Derivatisierung mit Fluoreszenzfarbstoffen, Veränderungen
im Rückgrat wie der Ersatz von Sauerstoffatomen gegen Schwefelatome zur Stabilisierung
oder das Überführen des DNS-Moleküls in peptidische Nukleinsäuren (Engl.: Peptide
nucleic acids; Abk.: PNA).
Insgesamt wurden 63 nicht verwandte Patienten, 38 krankhaft fettleibige Personen, 10
Personen mit überstandener Fettleibigkeit und 15 nicht fettleibige Personen untersucht.
Gewebeproben wurden vom Musculus rectus abdominis und in der Bauchhöhle vom
Fettgewebe des Bauchnetzes von krankhaft fettleibigen Personen entnommen, bei denen der
Magen zur Gewichtsreduktion chirurgisch bandagiert wurde. Kontrollpersonen und
Personen mit überstandener Fettleibigkeit unterzogen sich bestimmten operativen Eingriffen
wie der Entfernung der Gallenblase, Leistenbruchoperationen und Regulierung oder
Entfernung des Bandes um den Magen. Die Versuchspersonen hatten nach einer Belehrung
in die Studie eingewilligt, die auch von der Ethikkommission des Institutes genehmigt
worden war. Die Personen wurden im nüchternen Zustand durch schnell wirkende
Barbiturate anästhesiert und durch Alfentanil-Hydrochlorid ((INN); JUPAC: N-{1-[2-(4-
Ethyl-5-oxo-2-tetrazolin-1-yl)ethyl]-4-methoxy-methyl-4-piperidyl}-propionanilid) in der
Narkose gehalten. Gewebeproben wurden bei Beginn des chirurgischen Eingriffs
entnommen, in Aliquots aufgeteilt und bei -70°C eingefroren. Das Verhältnis des Gewichts
zur Größe wurde nach Messungen des Gewichts und der Größe bestimmt (Engl. Body mass
index; BMI).
Eine λ-EMBL3-SP6/T7 genomische Bibliothek aus der menschlichen Plazenta (Hersteller:
Clontech, Palo Alto, Kalifornien, USA) wurde durch Plaque-Hybridisierung unter
Verwendung einer Sonde durchmustert, die fast der vollständigen, 1049 Basenpaar langen
UCP3-cDNS entsprach und die Nukleotide +159 bis +1207 (GenBank Zugangsnummer
U84763) umfaßte. Drei überlappende Klone mit einer Größe von etwa 16,5 kBp und mit
dem kompletten menschlichen UCP3 Gen wurden isoliert und in das ZERO-Background™
Klonierungssystem (Invitrogen, Carlsbad, Kalifornien, USA) subkloniert. Die
Sequenzierung der Plasmid-DNS wurde mit fertig zusammengestellten, kommerziell
erhältlichen Reagenzien (PRISM™ Ready Reaction dRhodamine Terminator Kit, Hersteller
Perkin Elmer-Applied Biosystems, Foster City, Kalifornien, USA) unter Verwendung von
dRhodamin-Terminatoren und einem ABI PRISMT™ 310 DNS-Sequenzierautomaten
durchgeführt (Perkin Elmer-Applied Biosystems, Foster City, Kalifornien, USA), wobei
sukzessive, jeweils passende Oligonukleotide zur Durchführung der
Sequenzierungsreaktionen synthetisiert wurden ("Wandern auf der DNS", "Primer
walking").
Gesamt-RNS wurde aus 0,5 g menschlichem Skelettmuskelgewebe nach der Methode von
Chumczynski und Sacchi (1987) isoliert. Die Integrität der RNS-Proben wurde durch
Analyse ihres elektrophoretischen. Laufverhaltens in Formaldehydgelen sichergestellt
(Sambrook et al., 1989). RNS-Konzentrationen wurden durch Absorptionsmessungen bei
260 nm bestimmt. 5' und 3' RACE wurden durchgeführt wie von Frohman et al. (1988)
beschrieben. Für die 5'-RACE wurden 3 µg Gesamt-RNS aus menschlichem Skelettmuskel
mit der Superscript™ II Reversen Transkriptase (GibcoBRL Life Technologies, Paisley,
Großbritannien) und eines UCP3 genspezifischen Oligonukleotid aus dem Intron 1 (5'-
TACACCTGCT TGACGGAG-3') revers transkribiert. Nach Ribonuklease H Verdau
(Hersteller Boehringer Mannheim Corp., Indianapolis, Indiana, USA) und Verlängerung des
polyA-Schwanzes (engl.: polyA-tailing) mit terminaler Transferase (Hersteller Boehringer
Mannheim Corp., Indianapolis, Indiana, USA) wurde die Erststrang-cDNS der Polymerase-
Kettenreaktion (engl.: polymerase chain reaction; Abk.: "PCR") unterworfen mit 5'-
GCTGTGTCCA GTGGAAAGGT AACGAGGTCA GCAA-3' als genspezifischem
Oligonukleotid und 5'-GAGGACTCGA GCTCAAGCT(20)-3' als Adapter-Oligonukleotid.
Die PCR-Produkte wurde erneut amplifiziert unter Verwendung von 5"-GAGGACTCGA
GCTCAAGC-3" als Anker-Oligonukleotid und 5'-TGGGAGGCAC GTCTGAAG-3' als
internes (Engl.: nested) genspezifisches Oligonukleotid. (Für die 3'RACE wurden 3 µg
menschliche Skelettmuskel-RNS revers transkribiert unter Verwendung des oben
angeführten polyA-spezifischem Adapter-Oligonukleotids. Das Anker-Oligonukleotid und
zwei interne (Engl.: nested) Oligonukleotide im kodierenden Strang 5'-CCTCGACTGT
ATGATAAAGA TG- 3' (+921 bis +942) und 5'-CCTCCTGGGC CACCATCTT-3' (+937
bis +955, GenBank Zugangsnummer U84763) wurden für die Amplifizierung benützt).
5' und 3' RACE-PCR-Produkte wurden unter Verwendung von dem Durchschnitts
fachmann bekannten Standardmethoden (Sambrook et al., 1989) in einen gängigen Vektor
subkloniert und sequenziert, nachdem sie über ein Gel gereinigt worden waren.
Eine das 425 bp lange Intron 1 überdeckende Probe (+6816 bis +9074; Sequenz SEQ ID
NO 17) wurde durch reverse Transkriptions-PCR (Abk.: RT-PCR) mit den
Oligonukleotiden 5'-CCTCACCAGC CAGCCTCTTG TC-3' (+ 6816 bis +6837) und 5'-
GCTGTGTCCA GTGGAAAGGTA-3' (+9054 bis +9074), jeweils im kodierenden und im
nicht kodierenden Bereich, hergestellt. Die PCR-Produkte wurden in den pZERO™
Plasmidvektor kloniert und die Sequenz durch Sequenzierung mit farbstoffgekoppelten
Terminatoren (Engl.: Dye-Terminator cycle sequencing) verifiziert.
32P-markierte Gegenstrang-RNS wurde mit einem Kombinationssystem, das den SP6 und
den T7-Promoter verwendet (Riboprobe Combination System SP6/T7; Hersteller: Promega
Corp., Madison, Wisconsin, USA), und α32P-dUTP (3000 Ci/mmol; Hersteller: Amersham
Life Science, Buckingshamshire, Großbritannien) nach den Angaben des Herstellers
erhalten. In vitro transkribierte RNS wurde über ein Gel gereinigt und die inkorporierte
Radioaktivität durch Flüssigkeitsszintillationszählung bestimmt (Hersteller: Wallac 1450
Microbeta PLUS, EG Berthold, Bad Wildbach, Deutschland). Nach der Denaturierung
bei 95°C für 5 Minuten wurden Aliquots der 32P-markierten RNS mit einer Aktivität von
8×104 cpm (Engl.: cpm: counts per minute), mit 5 µg Gesamt-RNS aus menschlichem
Muskel oder 15 µg Gesamt-RNS aus Fettgewebe bei 43°C über Nacht hybridisiert. Nicht
geschützte RNS wurde mit 0,5 Einheiten Ribonuklease A und 20 Einheiten Ribonuklease
T1 (Ambion RPAII Kit; Ambion Inc., Austin, Texas, USA) bei 37°C für 30 Minuten in
einem Gesamtvolumen von 220 µl verdaut. Die Ribonuklease-Inaktivierungs-/Prä
zipititationsmischung, die vom Hersteller mitgeliefert wurde, wurde hinzugefügt, um die
32P-markierten RNS-RNS-Hybride zu präzipitieren. Die Präzipitate wurden mit 70%
Ethanol gewaschen und geschützte Fragmente durch Elektrophorese in 4% Polyacrylamid-
Harnstoffgelen aufgetrennt (Sambrook et al., 1989).
Das 5'-Ende der UCP3-mRNS aus dem Skelettmuskel wurde durch 5'-RACE-Experimente
unter Verwendung eines Gegenstrangoligonukleotids aus dem Intron 1 bestimmt. Zwei
bestimmte PCR-Fragmente wurden erhalten und durch Sequenzierung charakterisiert. Die
Produkte gingen jeweils 184 bp und 331 bp in 5'-Richtung über den Transkriptionsstart
hinaus, was durch zwei transkriptionelle Startstellen erklärt werden kann (Abb. 1A). Der
Gebrauch der am weitesten entfernten Initiationsstelle wurde durch RT-PCR gezeigt (Daten
nicht gezeigt).
Ribonuklease-Schutztests (Engl.: RNAse protection assay) zeigten, daß der Großteil der
Transkripte im Muskelgewebe mehrerer fettleibiger und schlanker Personen an der
stromabwärts gelegenen Stelle bei -184 gestartet wurde. Der Anteil der UCP3-mRNS, der
von der stromaufwärts gelegenen Stelle bei -331 stammt, war weniger als 5%. Jedoch
wurde die stromaufwärts gelegene Stelle vornehmlich, wenn nicht ausschließlich, im
Fettgewebe benützt (Abb. 1B). Ähnliche Ergebnisse wurden im Fettgewebe von 10
fettleibigen und 4 schlanken Individuuen gefunden (Daten nicht gezeigt). Diese Experimente
zeigen, daß bestimmte Promoterbereiche im Fettgewebe und im Skelettmuskel benutzt
werden. Eine Computeranalyse der zu den alternativen Startstellen benachbarten Sequenzen
erbrachte, daß beide Regionen eukaryontische Konsensussequenzen für die
Transkriptionsinititation enthalten. Man findet zwei TATA ähnliche Sequenzen (Locker und
Buzard, 1990), 29 bis 36 BP stromaufwärts, und zwei konservierte Stellen, an die ein
modifizierter 7-Methylguanosinrest an die transkribierte RNS angehängt werden (Engl.: cap
site; Locker und Buzard, 1990), 16 bis 33 BP stromabwärts von der entsprechenden
Startstelle. Von der Transkriptionsstartstelle durch eine Alu-Sequenz getrennt wurden
durch Sequenzvergleich grundlegende Promoterelemente wie CAAT-Boxen bei -749, -861
und -922 relativ zu der stromabwärts gelegenen Transkriptionsstartstelle, ein Oktamermotiv
bei -713 und eine konservierte Bindungsstelle für einen stromaufwärts bindenden
Stimulationsfaktor (Engl.: Upstream activating factor, Abk.: USF) bei -1038 gefunden
(Abb. 1A). Zusätzlich wurden drei aufeinanderfolgende E-Box-Elemente bei -653, -640
und -631, ein putatives Peroxisomen-Proliferator-aktivierter Rezeptor/Retinoid-X-
Rezeptor beeinflußtes Element (PPAR/RXR) bei -265 und ein putatives Thyroid
beeinflußtes Element (TRE) (Locker und Buzard, 1990) an Position -3340, lokalisiert in
einer Alu-Sequenz von -3396 bis -3094.
Der Durchschnittsfachmann führt einen solchen Test durch, indem er auf Standardmethoden
und fertig zusammengestellte Reagenzien zurückgreift, wie sie z. B. von Promega (Madison,
Wisconsin, USA) als "Luciferase Assay System" angeboten werden. Zu diesem System
erhält er auch Vorschriften, wie der Test mit den kommerziell erhältlichen Reagenzien
durchzuführen ist. Er kann aber auch auf die Lehre aus dem Beispiel 1 des US-Patentes
5,283,179 zurückgreifen, in dem die Durchführung eines solchen Testes beschrieben ist.
Durch eine Kombination geeigneter Klonierungstechniken und PCR-Techniken wird die
Sequenz SEQ ID NO 16 hergestellt (Sambrook et al., 1989), die nicht mehr den
muskelzellspezifischen UCP3-Promoter enthält. Diese DNS-Sequenz wird mit
Standardmethoden über geeignete Restriktionsschnittstellen in den Vektor pGL2basic oder
pGL3basic (Promega, Madison, Wisconsin, USA) insertiert. Dieser Vektor wird mit
Standardmethoden (Sambrook et al., 1989) in primäre humane Adipozytenzellkulturen
transfiziert, die wie in Beispiel 1 beschrieben von fettleibigen Personen gewonnen werden,
die sich einer chirurgischen Behandlung unterziehen müssen. Diese Zellkultur wird unter
Standardbedingungen in Standardzellkulturmedium in einer Zellkulturschale mit einem
Durchmesser von 100 mm angezogen. Danach werden die Zellen in Gegenwart einer
wässrigen Lösung oder einer Lösung in Dimethylsulfoxid einer zu testenden Substanz für
eine bestimmte Zeit kultiviert. Bei Raumtemperatur wird für etwa 2 bis 5 min 1 ml eines
Puffers zugegeben, der die Zellen lysiert (25 mM Tris-Phosphat pH 7,8, 2 mM
Dithiothreitol, 10% Glycerin, 1% Triton® X-100, 1 mg/ml Rinderserumalbumin, 2 mM
Cyclohexylendiamintetraacetat (CDTA)), und die Zelltrümmer werden durch kurze
Zentrifugation entfernt. Optional kann vorher das Wachstumsmedium der kultivierten Zellen
entfernt werden und die Zellen ein bis zweimal mit PBS-Puffer (137 mM NaCl, 2,7 mM
KCl, 4,3 mM Na2HPO4, 1,4 mM KH2PO4, pH 7.3; Mg2+- and Ca2+-frei) gewaschen werden.
Ein Teil des Überstandes wird mit dem fünffachen Volumen an Testreagens (20 mM Tricin
(N-tris-(hydroxymethyl)-methylglycin) pH 7,8, 33,3 mM Dithiothreitol (DTT), 8 mM Mg2+,
0,13 mM Ethylendiamintetraessigsäure (EDTA), 0,53 mM Adenosintriphosphat (ATP),
0,47 mM Luciferin (eine polyheterozyklische organische Säure: D-(-)-2-(6'-hydroxy-2'-
benzothiazolyl)+Δ2-thiazolin-4-arbonsäure) und 0,27 mM Koenzym A (CoA)) vermischt
und das emittierte Licht in einem Luminometer gemessen. Das Volumen des Testreagens
kann bis zu dem 25fachen Volumen der zu testenden Lösung betragen. Danach wird das
Signal mit dem Signal einer Kontrolle (wässrige Lösung oder Dimethylsulfoxidlösung ohne
zu testende Substanz) verglichen.
Um Substanzen zu finden, die die Transkription des muskelzellspezifischen UCP3-
Promoters beeinflussen, kann der Fachmann ein DNS-Molekül herstellen, das nicht mehr
den fettzellspezifischen UCP3-Promoter enthält. Dazu entfernt er die Nukleotide 6739 bis
6795, die den fettzellspezifischen Teil enthalten, aus der DNS-Sequenz SEQ ID NO: 14
durch Standardmethoden (Sambrook et al., 1989) und kloniert diese in die oben genannten
Vektoren. Weiterhin geht er nach der oben geschilderten Vorgehensweise vor, nur daß er
Muskelzellen in Primärkultur oder geeignete Zellinien verwendet.
Generelle Aktivatoren des UCP3-Promoters werden mit der gleichen experimentellen
Vorgehensweise gefunden, wobei die Sequenz SEQ ID NO: 14, die beide Promoter enthält,
verwendet werden kann. Es werden hier auch Zellen eingesetzt, in denen keine oder nur
eine sehr geringe UCP3-Expression zu finden ist, wie z. B. die Zellinie HEK293.
Der Fachmann kann einen solchen Test ohne erfinderische Tätigkeit an die Gegebenheiten
im Mikrotiterplattenformat anpassen.
Abb. 1: Charakterisierung der UCP3-Promoterregion und Evidenz für verschiedene
Transkriptionsinitiationsstellen im Skelettmuskel und im Fettgewebe
- A) Teil der Nukleotidsequenz des menschlichen UCP3 Gens; grundlegende Promoterelemente wie z. B. CAAT-Box, Oktamermotive und stromaufwärts gelegene Bindungsstellen für Stimulationsfaktor sowie putative Transkriptionsfaktorbindungsstellen wie E-Boxen und ein PPAR/RXR Element (Engl.: PPAR/RXR response element) sind durch kleine Umrahmungen hervorgehoben. Eine halbe Alu-Sequenz ist durch eine große Umrahmung hervorgehoben. TATA ähnliche Sequenzen sind fett gedruckt und unterstrichen, konservierte Stellen, an die ein modifizierter 7-Methylguanosinrest an die transkribierte RNS angehängt werden (Engl.: cap site), sind fett und kursiv gedruckt. Die zwei Transkriptionsstartstellen sind durch Pfeile gekennzeichnet und das Translationsstartkodon ist fett gedruckt. Ein Teil der Sequenz von Intron 1 wird in kleinen Buchstaben gezeigt.
- B) Autoradiogramm des Ribonuklease-Schutztests (Engl.: RNAse protection assay) von RNS aus menschlichem Skelettmuskel und Fettgewebe. Die Größe der geschützten Fragmente, errechnet für Transkripte initiiert an der stromaufwärts oder an der stromabwärts gelegenen Stelle, ist jeweils 425 und 316 Nukleotide, wie am rechten Rand vermerkt.
M: Endmarkierter Größenstandard mit den angegebenen Größen
1: unverdaute 32P-UCP3 Gegenstrangprobe von Nukleotid 6816 bis 9074 (Sequenz SEQ ID NO 17)
2: 32
1: unverdaute 32P-UCP3 Gegenstrangprobe von Nukleotid 6816 bis 9074 (Sequenz SEQ ID NO 17)
2: 32
P-UCP3-Gegenstrang-Probe an Hefe-RNS hybridisiert und Ribonukleaseverdau
unterworfen
3-5: Ribonuklease-Schutztest von 5 µg von Gesamt-RNS aus dem Skelettmuskel von drei Individuen
6-7: Ribonuklease-Schutztest von 15 µg Gesamt-RNS aus intraperitonealen Fettgewebe von zwei Individuen
3-5: Ribonuklease-Schutztest von 5 µg von Gesamt-RNS aus dem Skelettmuskel von drei Individuen
6-7: Ribonuklease-Schutztest von 15 µg Gesamt-RNS aus intraperitonealen Fettgewebe von zwei Individuen
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Oberkofler, H., Liu, Y. M., Esterbauer, H., Hell, E., Krempler, F., und Patsch, W. (1998) Diabetologia (im Druck).
Park, C. W., und Walker, M. D. (1992). J. Biol. Chem. 267, 15642-15649.
Ravussin, E., Lillioja, S., Knowler, W. C., Christin, L., Freymond, D., Abbott, W. G., Boyce, V., Howard, B. V. und Bogardus, C. (1988). N. Engl. J. Med. 318, 467-472.
Ricquier, D., Casteilla, L., und Bouillaud, F. (1991) FASEB J. 5, 2237-2242.
Sambrook, J., Fritsch, E. F., und Maniatis, T. (1989). Molecular cloning. A laboratory manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, USA.
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Thurlby, P. L. and Ellis, R. D. (1986) Can J. Physiol. Pharmacol. 64, 1111-1114.
Vidal-Puig, A., Solanes, G., Grujic, D., Flier, J. S., und Lowell, B. B. (1997) Biochem. Biophys. Res. Commun. 235, 79-82.
Warden, C. H., Fisler, J. S., Shoemaker, S. M., Wen, P. Z., Svenson, K. L., Pace, M. J., und Lusis, A. J. (1995) J. Clin. Invest. 95, 1545-1552.
Zhou, Y. T., Shimabukuro, M., Koyama, K., Lee, Y., Wang, M. Y., Trieu, F., Newgard, C B., und Unger, R. H. (1997) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94, 6386-6390.
Claims (89)
1. Rekombinantes DNS-Molekül, das die DNS-Sequenz des in Fettzellen aktiven UCP-3
Promoter enthält, aber keine funktionelle Sequenz des in Muskelzellen aktiven UCP-3
Promoters.
2. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 1, das die Sequenzen SEQ ID NO: 1
TATATTAAA und SEQ ID NO: 2 CACCTC enthält, nicht jedoch die Sequenzen SEQ
ID NO: 3 TATAAGA und SEQ ID NO: 4 CAATCC.
3. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 1, das die Sequenzen SEQ ID NO: 1
TATATTAAA und SEQ ID NO: 2 CACCTC enthält und durch Punktmutationen
entstandene Derivate der Sequenzen SEQ ID NO: 3 TATAAGA und SEQ ID NO: 4
CAATCC, wodurch die Sequenzen SEQ ID NO: 3 und SEQ ID NO: 4 ihre Funktion in
der Transkription verlieren.
4. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 1, das die Sequenzen SEQ ID NO: 1
TATATTAAA und SEQ ID NO: 2 CACCTC enthält und durch Deletionen entstandene
Derivate der Sequenzen SEQ ID NO: 3 TATAAGA und SEQ ID NO: 4 CAATCC,
wodurch die Sequenzen SEQ ID NO: 3 und SEQ ID NO: 4 ihre Funktion in der
Transkription verlieren.
5. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 1, das die Sequenzen SEQ ID NO: 1
TATATTAAA und SEQ ID NO: 2 CACCTC enthält und durch Kombinationen von
Punktmutationen und Deletionen entstandene Derivate der Sequenzen SEQ ID NO: 3
TATAAGA und SEQ ID NO: 4 CAATCC, wodurch die Sequenzen SEQ ID NO: 3 und
SEQ ID NO: 4 ihre Funktion in der Transkription verlieren.
6. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 2 bis 5, dadurch
gekennzeichnet, daß zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO: 2 30 bis
50 Basenpaare, bevorzugt 40 bis 45 Basenpaare, ganz besonders bevorzugt 42
Basenpaare liegen.
7. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 2 bis 6, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 1 zusätzlich ein RXR/PPAR-
Element angeordnet ist.
8. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 7, dadurch gekennzeichnet, daß das
RXR/PPAR-Element die Sequenz SEQ ID NO: 5 TGACCTTTGGACT umfaßt.
9. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 8, dadurch gekennzeichnet, daß
zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO: 5 65 bis 75 Basenpaare
liegen.
10. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 2 bis 9, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 1 zusätzlich eine Alu-Sequenz
angeordnet ist.
11. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 10, dadurch gekennzeichnet, daß
zwischen der Sequenz SEQ ID NO: 1 und der Alu-Sequenz 255 bis 265 Basenpaare
liegen.
12. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 2 bis 11, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 1 zusätzlich ein E2A-Element
angeordnet ist.
13. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 12, dadurch gekennzeichnet, daß das
E2A-Element die Sequenz SEQ ID NO: 6 CAGATG umfaßt.
14. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 13, dadurch gekennzeichnet, daß
zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO: 6 440 bis 450 Basenpaare
liegen.
15. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 2 bis 14, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 1 zusätzlich eine E-Box ist.
16. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 15, dadurch gekennzeichnet, daß die E-
Box die Sequenz SEQ ID NO: 7 CACTTG umfaßt.
17. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 16, dadurch gekennzeichnet, daß
zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO: 7 450 bis 460 Basenpaare
liegen.
18. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 2 bis 17, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 1 zusätzlich eine E-Box ist.
19. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 18, dadurch gekennzeichnet, daß die E-
Box die Sequenz SEQ ID NO: 8 CATTTG umfaßt.
20. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 19, dadurch gekennzeichnet, daß
zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO: 8 460 bis 470 Basenpaare
liegen.
21. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 2 bis 20, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 1 zusätzlich eine Oktamersequenz
ist.
22. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 21, dadurch gekennzeichnet, daß die
Oktamersequenz die Sequenz SEQ ID NO: 9 ATGAAAATGT umfaßt.
23. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 22, dadurch gekennzeichnet, daß
zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO: 9 515 bis 525 Basenpaare
liegen.
24. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 2 bis 23, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 1 zusätzlich eine CAAT-Box ist.
25. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 24, dadurch gekennzeichnet, daß die
CAAT-Box die Sequenz SEQ ID NO: 10 CCAAT umfaßt.
26. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 25, dadurch gekennzeichnet, daß
zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO: 10 560 bis 570 Basenpaare
liegen.
27. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 2 bis 26, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 1 zusätzlich eine CAAT-Box ist.
28. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 27, dadurch gekennzeichnet, daß die
CAAT-Box die Sequenz SEQ ID NO: 11 ATTGG umfaßt.
29. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 28, dadurch gekennzeichnet, daß
zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO: 11 670 bis 680 Basenpaare
liegen.
30. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 2 bis 29, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 1 zusätzlich eine CAAT-Box ist.
31. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 30, dadurch gekennzeichnet, daß die
CAAT-Box die Sequenz SEQ ID NO: 12 ATTGG umfaßt.
32. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 31, dadurch gekennzeichnet, daß
zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO: 12 730 bis 740 Basenpaare
liegen.
33. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 2 bis 32, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 1 zusätzlich eine Bindungsstelle
für einen stromaufwärts bindenden Stimulationsfaktor ist.
34. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Ansprüch 33, dadurch gekennzeichnet, daß die
Bindungsstelle für einen stromaufwärts bindenden Stimulationsfaktor die Sequenz SEQ
ID NO: 13 CCACGTGC umfaßt.
35. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 34, dadurch gekennzeichnet, daß
zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO: 13 845 bis 855 Basenpaare
liegen.
36. Rekombinantes DNS-Molekül, das die DNS-Sequenz des in Muskelzellen aktiven UCP-3
Promoters enthält, aber keine funktionelle Sequenz des in Fettzellen aktiven UCP-3
Promoters.
37. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 36, das die Sequenzen SEQ ID NO: 3
TATAAGA und SEQ ID NO: 4 CAATCC enthält, nicht jedoch die Sequenzen SEQ ID NO:
1 TATATTAAA und SEQ ID NO: 2 CACCTC.
38. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 37, das die Sequenzen SEQ ID NO: 3
TATAAGA und SEQ ID NO: 4 CAATCC enthält und durch Punktmutationen
entstandene Derivate der Sequenzen SEQ ID NO: 1 TATATTAAA und SEQ ID NO: 2
CACCTC, wodurch die Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO: 2 ihre Funktion in
der Transkription verlieren.
39. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 37, das die Sequenzen SEQ ID NO: 3
TATAAGA und SEQ ID NO: 4 CAATCC enthält und durch Deletionen entstandene
Derivate der Sequenzen SEQ ID NO: 1 TATATTAAA und SEQ ID NO: 2 CACCTC,
wodurch die Sequenzen SEQ ID NO: 1 und SEQ ID NO: 2 ihre Funktion in der
Transkription verlieren.
40. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 37, das die Sequenzen SEQ ID NO: 3
TATAAGA und SEQ ID NO: 4 CAATCC enthält und durch Kombinationen von
Punktmutationen und Deletionen entstandene Derivate der Sequenzen SEQ ID NO: 1
TATATTAAA und SEQ ID NO: 2 CACCTC, wodurch die Sequenzen SEQ ID NO: 1
und SEQ ID NO: 2 ihre Funktion in der Transkription verlieren.
41. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 37 bis 40, dadurch
gekennzeichnet, daß zwischen den Sequenzen SEQ ID NO: 3 und SEQ ID NO: 4 45 bis
70 Basenpaare, bevorzugt 52 bis 58 Basenpaare, ganz besonders bevorzugt 55
Basenpaare liegen.
42. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 37 bis 41, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 3 zusätzlich ein RXR/PPAR-
Element angeordnet ist.
43. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 42, dadurch gekennzeichnet, daß das
RXRI PPAR-Element die Sequenz SEQ ID NO: 5 TGACCTTTGGACT umfaßt.
44. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 37 bis 43, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 3 zusätzlich eine Alu-Sequenz
angeordnet ist.
45. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 37 bis 44, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 3 zusätzlich ein E2A-Element
angeordnet ist.
46. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 45, dadurch gekennzeichnet, daß das
E2A-Element die Sequenz SEQ ID NO: 6 CAGATG umfaßt.
47. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 37 bis 46, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 3 zusätzlich eine E-Box ist.
48. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 47, dadurch gekennzeichnet, daß die E-
Box die Sequenz SEQ ID NO: 7 CACTTG umfaßt.
49. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 37 bis 48, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 3 zusätzlich eine E-Box ist.
50. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 49, dadurch gekennzeichnet, daß die E-
Box die Sequenz SEQ ID NO: 8 CATTTG umfaßt.
51. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 37 bis 50, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 3 zusätzlich eine Oktamersequenz
ist.
52. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 51, dadurch gekennzeichnet, daß die
Oktamersequenz die Sequenz SEQ ID NO: 9 ATGAAAATGT umfaßt.
53. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 37 bis 52, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 3 zusätzlich eine CAAT-Box ist.
54. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 53, dadurch gekennzeichnet, daß die
CAAT-Box die Sequenz SEQ ID NO: 10 CCAAT umfaßt.
55. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 37 bis 54, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 3 zusätzlich eine CAAT-Box ist.
56. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 55, dadurch gekennzeichnet, daß die
CAAT-Box die Sequenz SEQ ID NO: 11 ATTGG umfaßt.
57. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 37 bis 56, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 3 zusätzlich eine CAAT-Box ist.
58. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 57, dadurch gekennzeichnet, daß die
CAAT-Box die Sequenz SEQ ID NO: 12 ATTGG umfaßt.
59. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 37 bis 58, dadurch
gekennzeichnet, daß stromaufwärts von SEQ ID NO: 3 zusätzlich eine Bindungsstelle
für einen stromaufwärts bindenden Stimulationsfaktor ist.
60. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 59, dadurch gekennzeichnet, daß die
Bindungsstelle für einen stromaufwärts bindenden Stimulationsfaktor die Sequenz SEQ
ID NO: 13 CCACGTGC umfaßt.
61. Rekombinantes DNS-Molekül, das die Sequenz SEQ ID NO: 14 enthält.
62. Rekombinantes DNS-Molekül, das eine Sequenz enthält, die unter stringenten
Bedingungen an die Sequenz SEQ ID NO 14 hybridisiert.
63. Rekombinantes DNS-Molekül, das ein funktionelles Derivat eines DNS-Moleküls
gemäß einem der Ansprüche 1 bis 62 enthält, dadurch gekennzeichnet, daß diese
funktionellen Derivate die Eigenschaft besitzen, die Transkription eines Gens zu
vermitteln.
64. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 63, dadurch gekennzeichnet, daß die
funktionellen Derivate durch Deletionen hergestellt wurden.
65. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 63, dadurch gekennzeichnet, daß die
funktionellen Derivate durch Punktmutationen hergestellt wurden.
66. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 63, dadurch gekennzeichnet, daß die
funktionellen Derivate durch Kombinationen von Punktmutationen und Deletionen
hergestellt wurden.
67. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 1 bis 66, dadurch
gekennzeichnet, daß das DNS-Molekül ein zusätzliches Gen enthält, das in funktioneller
Weise verknüpft ist.
68. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 67, dadurch gekennzeichnet, daß es
sich bei dem zusätzlichen Gen um das Gen des Entkopplungsproteins 3 handelt.
69. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 67, dadurch gekennzeichnet, daß es
sich bei dem zusätzlichen Gen um ein Reportergen handelt.
70. Rekombinantes DNS-Molekül gemäß Anspruch 69, dadurch gekennzeichnet, daß es
sich bei dem Reportergen um das Luziferasegen oder das grün fluoreszierende Protein
enthält.
71. Rekombinantes DNS-Molekül, das die Sequenz SEQ ID NO 15 enthält.
72. Rekombinantes DNS-Molekül, das eine Sequenz enthält, die unter stringenten
Bedingungen an die Sequenz SEQ ID NO 15 hybridisiert.
73. Eine Zelle, die ein rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der Ansprüche 1 bis 72
enthält.
74. Verwendung eines rekombinanten DNS-Moleküls gemäß einem der Ansprüche 1 bis 72
zur Transkription eines Gens.
75. Verwendung eines rekombinanten DNS-Moleküls gemäß einem der Ansprüche 1 bis 72
zum Auffinden von Substanzen, die die Transkription beeinflussen können.
76. Verwendung einer Zelle gemäß Anspruch 73 zum Auffinden von Substanzen, die die
Transkription beeinflussen können.
77. Verfahren zum Auffinden von Substanzen, die die Transkription beeinflussen können,
dadurch gekennzeichnet, daß ein rekombinantes DNS-Molekül gemäß einem der
Ansprüche 1 bis 72 oder eine Zelle gemäß Anspruch 73 verwendet wird.
78. Verfahren gemäß Anspruch 77, dadurch gekennzeichnet, daß es ein zellfreies oder ein
zellbasiertes Verfahren ist.
79. Verfahren gemäß Anspruch 78, dadurch gekennzeichnet, daß die Transkriptionsrate in
Anwesenheit einer Testsubstanz gemessen wird.
80. Verfahren gemäß Anspruch 79, dadurch gekennzeichnet, daß die Transkriptionsrate in
Anwesenheit einer Testsubstanz in einem zellfreien in-vitro-System gemessen wird, das
mindestens Zellextrakt, Ribonukleotide und ein rekombinantes DNS-Molekül gemäß
einem der Ansprüche 1 bis 72 enthält.
81. Verfahren gemäß Anspruch 79, dadurch gekennzeichnet, daß die Menge, Aktivität,
Luminiszenz oder Fluoreszenz eines Reporterproteins gemessen wird, das in
Anwesenheit einer Testsubstanz hergestellt wird.
82. Verfahren gemäß Anspruch 81, dadurch gekennzeichnet, daß in Anwesenheit einer
Testsubstanz RNS in vitro transkribiert wird, anschließend in vitro translatiert wird und
die Menge des hergestellten Reporterproteins bestimmt wird.
83. Verfahren gemäß Anspruch 81, dadurch gekennzeichnet, daß die Menge eines
Reporterproteins gemessen wird, das von einer Zelle gemäß Anspruch 73 in
Anwesenheit einer Testsubstanz hergestellt wird.
84. Verfahren gemäß einem der Ansprüche 81 bis 83, dadurch gekennzeichnet, daß es sich
bei dem Reporterprotein um die Luziferase oder das grün fluoreszierende Protein
handelt.
85. Verfahren zum Auffinden eines Modulators des UCP3-Promoters, dadurch
gekennzeichnet, daß
- a) eine Wirtszelle nach Anspruch 73 in Anwesenheit einer Testsubstanz kultiviert wird,
- b) die Transkriptionsrate des UCP3-Promoters gemessen wird,
- c) die so erhaltene Transkriptionsrate mit der Transkriptionsrate verglichen wird, die in Abwesenheit der Testsubstanz erhalten wurde.
86. Verfahren gemäß einem der Ansprüche 77 bis 85, dadurch gekennzeichnet, daß es in
einem Hochdurchsatz-Musterungs- (High Throughput-Screening, HTS)-Format
ausgeführt wird.
87. Verwendung eines rekombinanten DNS-Moleküls nach einem der Ansprüche 1 bis 72
zum Auffinden von Faktoren oder Substanzen, die an das DNS-Molekül binden.
88. Verwendung gemäß Anspruch 87 dadurch gekennzeichnet, daß das rekombinante DNS-
Molekül auf einem Träger gebunden wird, mit einem Gemisch verschiedener Substanzen
oder Faktoren kontaktiert wird, einem oder mehreren Waschschritten unterzogen wird
und die gebundenen Substanzen oder Faktoren identifiziert werden.
89. Verfahren zur Identifizierung von Substanzen oder Faktoren, die an ein rekombinantes
DNS-Moleküle nach einem der Ansprüche 1 bis 72 binden, dadurch gekennzeichnet,
daß:
- 1. die rekombinanten DNS-Moleküle an einen Träger gebunden werden,
- 2. mit einem Gemisch verschiedener Substanzen kontaktiert werden,
- 3. einem oder mehreren Waschschritten unterzogen werden,
- 4. die gebundenen Faktoren identifiziert werden.
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|---|---|---|---|
| DE19838837A DE19838837A1 (de) | 1998-08-27 | 1998-08-27 | Zellspezifische Promoter des Entkopplungsproteins 3 |
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- 1999-08-21 CA CA002341051A patent/CA2341051A1/en not_active Abandoned
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