MXPA05010064A - Analogos de tamandarin y fragmentos de los mismos y metodos para hacerlos y usarlos. - Google Patents
Analogos de tamandarin y fragmentos de los mismos y metodos para hacerlos y usarlos.Info
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Abstract
La presente invencion se refiere a un compuesto de formula I (ver formula (I)) en donde R1, R2, R3, R4, R5, R6, W, Y, y Z se definen en la presente; los compuestos de la presente invencion son utiles como agentes anticancer; especificamente, los compuestos son utiles para tratar o prevenir cancer y crecimiento tumoral; la presente invencion tambien se refiere a composiciones que comprenden un compuesto de acuerdo con la formula anterior; la presente invencion tambien esta dirigida a metodos para utilizar un compuesto de acuerdo con la formula anterior.
Description
ANALOGOS DE TAM ANDARIN Y FRAGMENTOS DE LOS MISMOS Y METODOS PARA HACERLOS Y USARLOS ANTECEDENTES DE LA INVENCION
CAMPO DE LA INVENCION
La presente invención se refiere a depsipéptidos macrocíclicos, incluyendo análogos de didemnin y tamandarin y fragmentos de los mismos, que son útiles como agentes anticancerosos y para otros propósitos. También se proveen métodos para usar estos compuestos como inhibidores de síntesis de proteína, crecimiento celular, tumorigénesis e infección viral, y para terapia inmunosuopresora, y como ¡ncrementadotes de apoptosis. También se proveen métodos para hacer los análogos de tamandarin.
TECNICA ANTECEDENTE
Los tamandarins A y B son análogos de didemnin que ocurren naturalmente que han sido aislados de un tunicado marino. Los tamandarins A y B pertenecen a una familia de compuestos (didemnins - de organismos de la familia Didemnidae) que inhiben potencialmente la síntesis de proteínas y el progreso del ciclo celular e inducen apoptosis rápida (Grubb et al., Biochem. Biophys, Res. Commun. 275: 1130-1136 (1995); Johnson et al., FEBS Lett.
383:1-5 (1996); Johnson et al., Immunol. Cell Biol. 77:242-248 (1999); Johnson et al., J. Cell. Biochem. 72:269-278 (1999)). Otros didemnins, incluyendo didemnin B, didemnin M y deshidrodidemnin B, también presentan efectos citotóxicos y citostáticos. Los tamandarins A y B presentan actividad biológica que es similar a las actividades mostradas por didemnin B. Véase, v.gr., Liang et al., J. Am. Chem. Soc. , 23:4469-4474 (2001). Por ejemplo, tamandarin A es un inhibidor potente de síntesis de proteínas, crecimiento celular y tumorigénesis. Tamandarin A presenta actividad in vitro significativa contra carcinoma pancreático (Liang et al., Org. Lett. 1 : 1319-1322 (1999)). Una limitación importante sobre el uso de tamandarins y didemnins, ya sea para investigación o para otras aplicaciones, es el suministro limitado de tamandarins que está disponible de fuentes naturales y la dificultad y gasto de aislar estos compuestos. Existe la necesidad de un método para sintetizar el tamandarin A y el tamandarin B y otros análogos de didemnin. Además, muy pocos derivados o análogos de tamandarins A y B se han preparado y examinado. Los derivados y análogos adicionales de tamandarins A y B y didemnins son necesarios. Además, los compuestos que son útiles en la síntesis de tamandarins y didemnins son necesarios. Además, los compuestos que son útiles como inhibidores de síntesis de proteínas, crecimiento celular, tumorigénesis e infección viral, y para terapia inmunosuopresora, y/o como incrementadotes de apoptosis también son
necesarios.
BREVE DESCRIPCION DE LA INVENCION
Un primer aspecto de la presente invención está dirigido a un compuesto de la fórmula I, IA o II.
Un segundo aspecto de la presente invención está dirigido a una composición, por ejemplo, una composición farmacéutica que comprende un compuesto de la fórmula I, IA o II y un vehículo o excipiente adecuado. Un tercer aspecto de la presente invención está dirigido a un método para inhibir o prevenir el crecimiento de una célula cancerosa o tumor, dicho método comprendiendo poner en contacto una célula cancerosa con una cantidad efectiva de un compuesto de la fórmula I, IA o II. En una modalidad, el método está dirigido a tratar o prevenir cáncer en un sujeto que necesita dicho tratamiento, que comprende administrar a dicho sujeto una cantidad efectiva de la fórmula I, IA o II. Un cuarto aspecto de la presente invención está dirigido a un método para inhibir o prevenir tumorigénesis, dicho método comprendiendo poner en contacto una célula o componente celular con una cantidad efectiva de un compuesto de la fórmula I, IA o II. En una modalidad, el método está dirigido a inhibir o prevenir tumorigénesis en un sujeto que necesita dicho tratamiento que comprende administrar a dicho sujeto una cantidad efectiva de la fórmula I, IA o II.
Un quinto aspecto de la presente invención está dirigido a un método para inhibir o prevenir síntesis de proteína, dicho método comprendiendo poner en contacto una célula o componente celular con una cantidad efectiva de un compuesto de la fórmula I, IA o II. En una modalidad, el método está dirigido a inhibir o prevenir síntesis de proteína en un sujeto que necesita dicho tratamiento, que comprende administrar al sujeto una cantidad efectiva de la fórmula I, IA o II. Un sexto aspecto de la presente invención está dirigido a un método para incrementar apoptosis, dicho método comprendiendo poner en contacto una célula o componente celular con una cantidad efectiva de un compuesto de la fórmula I, IA o II. En una modalidad, el método está dirigido a incrementar apoptosis en un sujeto que necesita dicho tratamiento, que comprende administrar a dicho sujeto una cantidad efectiva de la fórmula I, IA o II. Un séptimo aspecto de la presente invención está dirigido a un método para proveer terapia ¡nmunosupresora, dicho método comprendiendo poner en contacto una célula o componente celular con una cantidad efectiva de un compuesto de la fórmula I, IA o II. En una modalidad, el método está dirigido a proveer terapia ¡nmunosupresora a un sujeto que necesita dicho tratamiento, que comprende administrar a dicho sujeto una cantidad efectiva de la fórmula I, IA o II. Un octavo aspecto de la presente invención está dirigido a al uso de un compuesto de conformidad con la fórmula I, IA o II en la preparación de
una composición farmacéutica útil para inhibir o prevenir el crecimiento de una célula cancerosa o tumor. Un noveno aspecto de la presente invención está dirigido a un método para prevenir o tratar una infección viral, dicho método comprendiendo administrar a un sujeto que necesita dicho tratamiento una cantidad efectiva de un compuesto de la fórmula I, IA o II. Un décimo aspecto de la presente invención está dirigido al uso de un compuesto de conformidad con la fórmula I, IA o II en la preparación de una composición farmacéutica útil para uno o más de los métodos que aquí se describen. Un onceavo aspecto de la presente invención está dirigido a un método para preparar un compuesto de conformidad con la fórmula I, IA o II.
BREVE DESCRIPCION DE LOS DIBUJOS
La figura 1 es una estructura de tamandarin que ilustra la convención de numeración usada aquí en Sakai et al., J. Med. Chem. 39:2819-2834 (1996).
DESCRIPCION DETALLADA DE LA INVENCION
Un primer aspecto de la presente invención está dirigido a un compuesto de la fórmula I:
en donde R1 y R2 son independientemente H o alquilo de C-u, o R1 y R2 juntos forman el anillo de alquilo de un residuo de prolina u homoprolina; R3 se selecciona del grupo que consiste de una cadena lateral de un aminoácido, un grupo naftilmetilo y un primer fluoroforo; R4 es H o CH3; R5 es H, un grupo protector de amina, un residuo de aminoácido, un polipéptido, un péptido que contiene un segundo fluoroforo, una porción química unida a un soporte sólido, o una porción que contiene de aproximadamente 1 a aproximadamente 50 átomos que no son hidrógeno; R6 es una cadena lateral de isoleucina o una cadena lateral de valina; W es O o NH; X es O o NH; Y es H o un grupo protector de hidroxilo; y Z es C(O) o C(0)-CH(CH3-C(0); siempre que R1 y R2 juntos formen el anillo de alquilo de un
residuo de proiina, R4 es metilo, W es O, X es O, y Z es C(O), entonces R3 no es una cadena lateral de isoleucina, una cadena lateral de valina, una cadena lateral de alanina, una cadena lateral de norleucina, una cadena lateral de norvalina, una cadena latera! leucina, una cadena lateral de histidina, una cadena lateral de triptofano, una cadena lateral de arginina, una cadena lateral de lisina, un segundo fluoroforo, o un bencilo opcionalmente sustituido con OH, -OCH3, -CO(C6H5), -Br, -I, -F, -Cl, -CH3, y -C2H5; o alternativamente siempre que si R1 y R2 juntos forman el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R4 es metilo, y X es O, entonces R3 es naftilmetilo. En una modalidad, R1 y R2 es H. En otra modalidad, R1 y R2 son alquilo de C- , por ejemplo metilo. En otra modalidad, R1 es H y R2 es metilo. En otra modalidad, R1 es metilo y R2 es H. En una modalidad, R1 y R2 juntos forman el anillo de alquilo de un residuo de prolina. Es decir, en una modalidad, R1 y R2 juntos forman un grupo 1 ,3-propanodilo. En una modalidad, R3 es una cadena lateral de un aminoácido, en particular un aminoácido que ocurre naturalmente. En una modalidad, R3 es una cadena de aminoácido tal como una cadena lateral de isoleucina, es decir, una porción 2-but¡lo, preferiblemente que tiene estereoquímica (R), una cadena lateral de valina, es decir, una porción 2-propilo, una cadena lateral de alanina, es decir, una porción metilo, una cadena lateral de norleucina, es decir, una porción 1 -butilo, una cadena lateral de norvalina, es decir, una porción 1 -propilo, una cadena lateral de leucina, es decir, una porción
isobutilo, preferiblemente teniendo estereoquímica (S), una cadena lateral de fenilalanina, es decir, una porción bencilo, una cadena lateral de histidina, es decir una porción 4-imidazolilmet¡lo, una cadena lateral de triptofano, es decir, una porción 3-indolilmetilo, una cadena lateral de tirosina, es decir, una porción 4-hidroxibencilo, una cadena lateral de arginina, es decir, una porción 4-guanidinilbutilo, y una cadena lateral de lisina, es decir, una porción 4-aminobutilo. En otra modalidad, R3 es una cadena lateral de un aminoácido que no ocurre naturalmente. Los aminoácidos que no ocurren naturalmente son conocidos en la técnica. En una modalidad, R3 es un grupo naftilmetilo. Alternativamente, R3 es un grupo bencilo sustituido con OH, alcoxi de C1-4 tal como OCH3 y OCH2CH3, CO(C6H5), F, Cl, Br, I, o alquilo de C-u tal como CH3
En otra modalidad, R3 es un primer fluoroforo. Las porciones que son fluoroforos son conocidas en la técnica. En una modalidad, el fluoroforo es una cadena lateral de aminoácido como se describió anteriormente que contiene además una porción fluoroforo (v.gr., un fluoroforo enlazado con una de las cadenas laterales de aminoácido anteriormente descritas). Dicho fluoroforo incluye
En una modalidad, R5 es H, un grupo protector de amina, un
residuo de aminoácido, un polipéptido, o un péptido que contiene un segundo fluoroforo. En una modalidad, la invención comprende un compuesto de la fórmula I en donde R5 es un átomo de hidrógeno o un grupo protector de amina adecuado para protección de aminoácidos. Dichos grupos protectores son conocidos en la técnica y son referidos en toda esta descripción. Un grupo protector adecuado para R5 incluye, por ejemplo, fer-butoxicarbonilo. Ejemplos de grupos protectores adecuados se pueden encontrar en referencias tales como Green y Wuts (1991 , Protective Groups in Organic Synthesis, Wiley, New York, 2a. Edición) y Bodansky (1993, Principies of Peptide Synthesis, Springer, Berlín). En una modalidad, R5 es un residuo de aminoácido, v.gr., un residuo de leucina, o un polipéptido que comprende dos o más residuos de aminoácido. En ciertas modalidades, el grupo R5 contiene 1-10 residuos de aminoácido. En otra modalidad, El grupo R5 contiene 1 , 2, 3, 4 ó 5 residuos de aminoácido. En ciertos casos, el residuo de aminoácido o polipéptido contiene uno o más grupos protectores adecuados. Ejemplos de dichos de residuos de aminoácido y polipéptidos incluyen: -(N-metil)leucina, -(N-metil)leucina-prolina, -(N-CBz-N-metil)leucina, -(N-metil)leucina-prolina-lactato, -(N-metil)ieucina-prolina-piruvato,
-(N-metil)leucina-prolina-lactato-glutamina-piroglutamato, -(N-metil)leucina-prolina-lactato-glutamina-ciclopentanoato, -(N-metil)leucina-prolina-Iactato-Ieucina-piroglutamato, -(N-metil)Ieucina-prolina-lactato-glutamina- ciclopentanoato, -(N-metil)leucina-prolina-alanina-leucina-piroglutamato, y -(N-metil)leucina-prolina-(N-metil)-alanina-leucina-piroglutamato. En otra modalidad, R5 contiene un residuo de N-glicidil-L-prolina. Un valor adecuado de R5 es -(N-metil-R-leucina)-S-prolina-glicidato. Otros grupos R5 adecuados incluyen aquellos que tienen la estructura mostrada a continuación.
En otra modalidad, R5 es una porción no aminoácido terminal que tiene de aproximadamente 1 a aproximadamente 15 átomos distintos al hidrógeno, v.gr., carbono, oxígeno, nitrógeno, azufre, halógenos y combinaciones de los mismos. Grupos ilustrativos incluyen aquellos que tienen las siguiente estructura:
Otros grupos R5 adecuados incluyen aquellos que tienen la siguiente estructura:
en donde R es H, Boc, isobutirilo, piruvitilo o acriloilo.
En otra modalidad, R5 es un péptido que comprende un fluoroforo. Otro grupo adecuado para R5 incluye -(N-metil)leucina-prolina-lactato-(fluoroforo). Otros grupos R5 adecuados que tienen un fluoroforo incluyen aquellos que tienen la estructura mostrada más adelante.
En otra modalidad, R5 es un residuo de aminoácido, un polipéptido o una porción química, o enlazador, unión, v.gr., covalentemente unida, con un soporte, v.gr., una placa de vidrio o sílice, un glóbulo de azarosa u otro glóbulo polimérico, etc. En otra modalidad, R5 es un grupo que tiene la fórmula:
en donde SS representa un soporte sólido. En otra modalidad, el enlazador o porción química es un grupo enlazador orgánico, tal como un grupo alquileno o alquenileno, por ejemplo, que comprende 1-20 átomos de carbono. En otra modalidad, R5 puede estar representado como L-SS, en donde L es un grupo enlazador orgánico y SS es un soporte sólido. Los soportes sólidos son conocidos en la técnica. Por ejemplo, véase MacLean et al., Puré Appl. Chem. 71(12):2349-2365 (1999). Cuando R5 comprende un residuo de /V-metil-leucina, el átomo de alfa-carbono del residuo puede tener ya sea estereoquímica (R) o (S). Otros residuos de aminoácido dentro de R5 pueden tener ya sea estereoquímica (R) o (S), pero en una modalidad tienen estereoquímica (S) en su átomo de alfa-carbono. Cuando R5 comprende un residuo de lactato, el residuo de lactato es preferiblemente un residuo de (S)-lactato. En otra modalidad, cada residuo de aminoácido dentro de R5 distinto del residuo de leucina (o /V-metil-leucina) (si está presente) unido directamente al átomo de nitrógeno del anillo de la fórmula I tiene estereoquímica (S). En otra modalidad, R5 contiene una porción fluoroforo, v.gr., un fluoroforo enlazado con una de las cadenas laterales de aminoácido descritas anteriormente. En una modalidad, Y es H. En otra modalidad, Y es un grupo
protector hidroxilo. Ejemplos de grupos protectores de hidroxilo que pueden estar presentes en Y incluyen una porción sililo alquilo-sustituida, una porción sililo arilo-sustituida, o un silano sustituido tanto con alquilo como arilo. Un ejemplo de un grupo protector hidroxilo útil es una porción triisopropilsililo (TIPS). Otro grupo protector adecuado incluuye trimetilsililo. Otros grupos protectores de hidroxilo que se pueden usar en Y en la fórmula I se conocen en la técnica y se describen en referencias tales como Green and Wuts (1991, Protective Groups in Organic Synthesis, 2a. Edición, Wiley, New York). Una primera subclase de compuestos es un compuesto de conformidad con la fórmula IA en donde R5 es una porción que tiene la estructura:
en donde R1 y R2 son independientemente H o alquilo de C1-4, o R1 y R2 juntos forman el anillo de alquilo de un residuo de prolina; R3 se selecciona del grupo que consiste de una cadena lateral de un aminoácido y un primer fluoroforo; R4 es H o CH3; R5 es H, un grupo protector de amina, un residuo de aminoácido,
un polipéptido, un péptido que contiene un segundo fluoroforo, una porción química unida a un soporte sólido, o una porción que contiene de aproximadamente 1 a aproximadamente 30 átomos que no son hidrógeno; R6 es una cadena lateral de isoleucina o una cadena lateral de valina; X es O o NH; y Y es H o un grupo protector de hidroxilo; siempre que R1 y R2 juntos formen el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R4 es metilo, W es O, X es O, y Z es C(O), entonces R3 no es una cadena lateral de isoleucina, una cadena lateral de valina, una cadena lateral de alanina, una cadena lateral de norleucina, una cadena lateral de norvalina, una cadena lateral leucina, una cadena lateral de histidina, una cadena lateral de triptofano, una cadena lateral de arginina, una cadena lateral de lisina, un segundo fluoroforo, o un bencilo opcionalmente sustituido con OH, -OCH3, -CO(C6H5), -Br, -I, -F, -Cl, -CH3, y -C2H5; o alternativamente siempre que si R y R2 juntos forman el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R4 es metilo, y X es O, entonces R3 es naftilmetilo. En una modalidad dentro de esta primera subclase, R1 y R2 son H. En otra modalidad, R1 y R2 son alquilo de C1-4, por ejemplo metilo. En otra modalidad, R1 es H y R2 es metilo. En otra modalidad, R1 es metilo y R2 es H. En una modalidad adicional, R y R2 juntos forman el anillo de alquilo de un residuo de prolina. Es decir, en una modalidad, R1 y R2 juntos forman un
grupo 1 ,3-propanodilo. En una modalidad dentro de esta primera subclase, R3 es una cadena lateral de un aminoácido, en particular un aminoácido que ocurre naturalmente. En una modalidad, R3 es una cadena de aminoácido tal como una cadena lateral de isoleucina, es decir, una porción 2-butilo, preferiblemente que tiene estereoquímica (R), una cadena lateral de valina, es decir, una porción 2-propilo, una cadena lateral de alanina, es decir, una porción metilo, una cadena lateral de norleucina, es decir, una porción 1-butilo, una cadena lateral de norvalina, es decir, una porción 1 -propilo, una cadena lateral de leucina, es decir, una porción isobutilo, preferiblemente teniendo estereoquímica (S), una cadena lateral de fenilalanina, es decir, una porción bencilo, una cadena lateral de histidina, es decir una porción 4-imidazolilmetilo, una cadena lateral de triptofano, es decir, una porción 3-indolilmetilo, una cadena lateral de tirosina, es decir, una porción 4-hidroxibencilo, una cadena lateral de arginina, es decir, una porción 4-guanidinilbutilo, y una cadena lateral de lisina, es decir, una porción 4-aminobutilo. En otra modalidad dentro de esta primera subclase, R3 es una cadena lateral de un aminoácido que no ocurre naturalmente. Los aminoácidos que no ocurren naturalmente son conocidos en la técnica. Por ejemplo, los aminoácidos que no ocurren naturalmente adecuados incluyen, pero no se limitan a cicloleucina, homocicloleucina, 9-antracenil-aIanina, 3-(3-benzotienil)alanina, 3-ciclohexilalanina, 3,3-difenilaIanina, 3-piridilalanina, 3-(2-
fur¡l)alan¡na, y 3-sitrilalanina, 3-(2-t¡en¡l)alanina, 2-fenilglicina, alilglicina, 2-ciclohexilgücina, propargilglicina, 2-(tr¡fluormetil)fenilalanina y similares. En una modalidad, R3 es un grupo naftilmetilo. Alternativamente, R3 es un grupo bencilo sustituido con OH, OCH3 y OCH2CH3, CO(C6H5), F, Cl, Br, I, o CH3 y CH2CH3. En otra modalidad dentro de esta primera subclase, R3 es un primer fluoroforo. En otra modalidad, R3 contiene un fluoroforo. Las porciones que son fluoroforos son conocidas en la técnica. En una modalidad, el fluoroforo es una cadena de aminoácido como se describió anteriormente que contiene además una porción fluoroforo (v.gr., un fluoroforo enlazado con una de las cadenas laterales de aminoácido anteriormente descritas). Dicho fluoroforo incluye
En una modalidad dentro de esta primera subclase, R5 es H, un grupo protector de amina, un residuo de aminoácido, un polipéptido, o un péptido que contiene un segundo fluoroforo. En una modalidad dentro de esta primera subclase, la invención comprende un compuesto de la fórmula IA en donde R5 es un átomo de hidrógeno o un grupo protector de amina adecuado para protección de aminoácidos. Dichos grupos protectores son conocidos en la técnica y son referidos en toda esta descripción. Un grupo protector adecuado para R5
incluye, por ejemplo, íer-butoxicarbonilo. Ejemplos de grupos protectores adecuados se pueden encontrar en referencias tales como Green y Wuts (1991, Protective Groups in Organic Synthesis, Wiley, New York, 2a. Edición) y Bodansky (1993, Principies of Peptide Synthesis, Springer, Berlín). En una modalidad dentro de esta primera subclase, R5 es un residuo de aminoácido, v.gr., un residuo de leucina, o un poiipéptido que comprende dos o más residuos de aminoácido. En ciertas modalidades, el grupo R5 contiene 1-10 residuos de aminoácido. En otra modalidad, el grupo R5 contiene 1, 2, 3, 4, ó 5 residuos de aminoácido. En ciertos casos, el residuo de aminoácido o poiipéptido contiene uno o más grupos protectores adecuados. Ejemplos de dichos residuos de aminoácido y polipéptidos incluyen: -(N-metil' (leucina, -(N-metil leucina- -prollina, -(N-CBz- N-metil)leuciina, -(N-metii; lleucina- -prollina-lactato, -(N-metil lleucina- -prollina-piruvato, -(N-metil] lleucina- -prollina-iactato-glutamina-piroglutamato, -(N-meti lleucina- -prollina-lactato-glutamina-ciclopentanoato, -(N-metiP lleucina- -prollina-lactato-leucina-piroglutamato, -(N-metil, (leucina- -prollina-lactato-glutamina- ciclopentanoato, -(N-metir lleucina- -prollina-alanina-leucina-piroglutamato, y -(N-metil (leucina- -prollina-(N-metil)-alanina-leucina-
piroglutamato. En otra modalidad dentro de esta primera subclase, R5 contiene un residuo de N-glicidil-L-prolina. Un valor adecuado de R5 es -(N-metil-R- leucina)-S-prolina-gIicidato. Otros grupos R5 adecuados incluyen aquellos que tienen la estructura mostrada a continuación.
Otros grupos adecuados para R5 incluyen aquellos que tienen un
residuo de aminoácido distinto al de los veinte aminoácidos comunes. Ejemplos adecuados de dichos aminoácidos son conocidos en la técnica e incluyen, por ejemplo hidroxiprolina, dehidroprolina, ácido 4-carboxiglutámico, hidroxilisina, A/,/V-d¡metilarginina, yodotirosina, ß-alanina y similares. En otra modalidad, R5 es un péptido que comprende un fluoroforo. Otro grupo adecuado para R5 incluye -(/V-metil)leucina-prolina-lactato-(fluoroforo). Otros grupos R5 adecuados que tienen un fluoroforo incluyen aquellos que tienen la estructura mostrada a continuación.
En otra modalidad, R5 contiene una porción que tiene la fórmula
en donde R es H, alquilo de C-i-4l o fenilo. En un ejemplo de esta subclase, R 0 es H. En esta modalidad, la porción está unida directamente al grupo amina del macrociclo que forma un enlace de amida, es decir, R5 es el grupo anteriormente mostrado. En otra modalidad, la porción está en la posición terminal del grupo R5. Es decir, la porción está conectada al grupo amina por otra porción, por ejemplo, un residuo de aminoácido, un residuo de péptido, o un enlazador. En una modalidad adicional, la porción mostrada anterior está conectada al resto del grupo R5 por un enlace de éster. Por ejemplo, A/-glicidil-L-prolina se usa para prepara porciones R5 apropiadas para preparar un compuesto de conformidad con la fórmula I, IA o II, o alternativamente, /V-glicidil-L-prolina está acoplada directamente con la amina libre del macrociclo, v.gr., compuesto 35, desprotegido 61 , desprotegido 74, desprotegido 85, o desprotegido 92. En otra modalidad, A/-glicidil-L-prolina se hace reaccionar con el término del grupo R5, por ejemplo, se hace reaccionar con amina desprotegida libre de compuesto 63 mostrado en el esquema 17. En otra modalidad dentro de esta primera subclase, R5 es un residuo de aminoácido, un polipéptido, o una porción química, o enlazador, unión, v.gr., unido covalentemente, con un soporte, v.gr., una placa de vidrio o sílice, un glóbulo de agarosa, u otro glóbulo polimérico, etc. En una modalidad, R5 es un grupo que tiene la fórmula:
en donde SS representa un soporte sólido. En otra modalidad, el enlazador o porción química es un grupo enlazador orgánico, tal como un grupo alquileno o alquenileno, por ejemplo, que comprende 1-20 átomos de carbono. En otra modalidad, R5 puede estar representado como L-SS, en donde L es un grupo enlazador orgánico y SS es un soporte sólido. Los soportes sólidos son conocidos en la técnica. Por ejemplo, véase MacLean et al., Pure Appl. Chem. 71(12):2349-2365 (1999). Cuando R5 comprende un residuo de /V-metil-leucina, el átomo de alfa-carbono del residuo puede tener ya sea estereoquímica (R) o (S). Otros residuos de aminoácido dentro de R5 pueden tener ya sea estereoquímica {R) o (S), pero en una modalidad tienen estereoquímica (S) en su átomo de alfa-carbono. Cuando R5 comprende un residuo de lactato, el residuo de lactato es preferiblemente un residuo de (S)-lactato. En otra modalidad, cada residuo de aminoácido dentro de R5 distinto del residuo de leucina (o /V-metil-leucina) (si está presente) unido directamente al átomo de nitrógeno del anillo de la fórmula I tiene estereoquímica (S). En otra modalidad dentro de esta primera subclase, R5 contiene una porción fluoroforo, v.gr., un fluoroforo enlazado con una de las cadenas laterales de aminoácido anteriormente descritas. En otra modalidad dentro de esta primera subclase, R5 es una porción que tiene de aproximadamente 1 a aproximadamente 50 átomos que no son hidrógeno, v.gr., carbono, nitrógeno, oxígeno, azufre, halógenos, y mezclas de los mismos. En otra modalidad dentro de esta primera subclase,
R5 es una porción que tiene de aproximadamente 1 a aproximadamente 40 átomos que no son hidrógeno. En otra modalidad dentro de esta primera subclase, R5 es una porción que tiene de aproximadamente 1 a aproximadamente 30 átomos que no son hidrógeno. En otra modalidad dentro de esta primera subclase, R5 es una porción que tiene de aproximadamente 1 a aproximadamente 20 átomos que no son hidrógeno. En otra modalidad dentro de esta primera subclase, R5 es una porción que tiene de aproximadamente 1 a aproximadamente 10 átomos que no son hidrógeno. Las porciones adecuadas incluyen, pero no se limitan a, péptidos, carbohidratos, sacáridos, oligosacáridos, esteroides, moléculas bioactivas, lípidos, nucleótidos, nucleósidos, vitaminas, y similares. Dichas porciones son unidas directamente a la amina del macrociclo, o están conectadas a la amina de macrociclo pof un enlazador orgánico. Otras porciones adecuadas que contienen de aproximadamente 1 a aproximadamente 50 átomos que no son hidrógeno incluyen pero no se limitan a porciones que tienen uno o más de los siguientes grupos: grupos alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, alcoxi, cicloalcoxi, halógeno, amino, tio, ceto, arilo, heteroarilo, halo, halogenoalquilo, arilo, heterociclo, cicloalquilo, heteroarilo, alquilo, alquenilo, alquinilo, arilalquilo, arilalquenilo, arilalquinilo, heteroarilalquilo, heteroarilalquenilo, heteroarilalquinilo, cicloalquilalquilo, heterocicloalquilo, hidroxialquilo, aminoalquilo, carboxialquilo, alcoxialquilo, nitro, amino, ureido, ciano, acilamino, hidroxi, tiol, aciloxi, azido, alcoxi, carboxi, aminocarbonilo, alquiltiol, y combinaciones de los mismos.
En una modalidad dentro de esta primera subclase, Y es H. En otra modalidad, Y es un grupo protector de hidroxilo. Ejemplos de grupos protectores de hidroxilo que pueden estar presentes en Y incluyen una porción sililo alguilo-sustituido, una porción sililo arilo-sustituida, o un silano sustituido tanto con porciones alquilo como arilo. Un ejemplo de un grupo protector hidroxilo útil es una porción triisopropilsililo (TIPS). Otro grupo protector adecuado incluye trimetilsililo. Otros grupos protectores de hidroxilo que se pueden usar en Y en la fórmula IA se conocen en la técnica y se describen en referencias tales como Green y Wuts (1991, Protective Groups ¡n Organic Synthesis, 2a. Edición, Wiley, New York). Una segunda subclase de compuestos es un compuesto de conformidad con la fórmula IA en donde R5 es una porción tal que el compuesto tiene la estructura
enzimáticamente digerible (es decir, una porción digerible por enzima). Como se usa aquí, una porción digerible por enzima puede incluir cualquier porción química que puede ser digerida (es decir, químicamente desprendida de) en presencia de una enzima específica. Ejemplos de enzimas capaces de
desprender químicamente una porción digerible por enzima incluyen carboxipeptidasas, ß-lactamasa, ß-galactosidasa, penicilina V-amidasa, citosina deaminasa, nitroreductasa, fosfatasa alcalina, beta-glucoronidasa, yanticuerpos catalíticos. Ejemplos de porciones digeribles por enzima que pueden ser incorporados en un compuesto que aquí se describe incluyen cefalosporinas, beta-glucósidos, fosfato, pirofosfato, ,D-galactosidas, nitrobenzamidina, citosina, carbamatos, péptidos, y aminoácidos. En otra modalidad dentro de esta subclase, R7 es una porción digerible por enzima tal como un dipéptido enlazado con glutamina-piroglutamato, o una porción que tiene la estructura de una de las siguientes
La porción cefalosporina mostrada anteriormente es digerida por contacto con la enzima, ß-lactamasa. Un sustituyente R7 que tiene la estructura de la porción carbohidrato anterior, por ejemplo, está en una modalidad, en forma de una sal de sodio o potasio. Después de una digestión de una porción digerible por enzima por una enzima, el análogo de tamandarin resultante presenta una o más de las actividades fisiológicas que aquí se describen. Un análogo de tamandarin
de la presente invención que tiene una porción digerible por enzima opcionalmente puede mostrar estas actividades antes de la digestión de la porción digerible por enzima. Sin embargo, en una modalidad preferida, el análogo presenta actividad terapéutica sólo después de la digestión de la porción digerible por enzima de la misma. Como se describió antes, un análogo de tamandarín que tiene la estructura de la fórmula I se puede unir con un soporte. La identidad del soporte no es crítica. El soporte puede ser sustancialmente cualquier material con el cual se pueda unir dicho análogo, v.gr., por unión covalente a través de la porción R5. Ejemplos de materiales de soporte incluyen silicatos unidos, agarosa entrelazada, poliacrüamida, dextrano y alil dextrano. Dichos materiales de soporte se pueden modificar químicamente usando porciones reactivas químicas a fin de facilitar una unión covalente del análogo con el soporte. Las modificaciones químicas de este tipo son conocidas en la técnica, y pueden incluir, por ejemplo, la modificación de un soporte con grupos bromuro de cianógeno, grupos epóxido, grupos tresilo y grupos carboxihexilo. Los protocolos para la preparación de un soporte y unión subsecuente de un compuesto al soporte están disponibles en la técnica, y pueden ser modificados por experto en la técnica para usarse con un análogo de tamandarín que aquí se describe. Una subclase de compuestos útiles de conformidad con la fórmula IA son compuestos que comprenden un sustituyente fluorescente, una porción fotoreactiva, tal como una porción que tiene la estructura
o una porción unida con un soporte, v.gr., un R3 o R5. Los compuestos que tienen dicha porción fotoreactiva son, por ejemplo, proteínas útiles o marcadoras. Los sustituyentes fluorescentes y porciones fotoreactivas son conocidos en la técnica. Otros grupos fotoreactivos R5 adecuados incluyen
Otra subclase de compuestos útiles de un compuesto de conformidad con la fórmula 1A, en donde R1 y R2 juntos forman el anillo de alquilo de un residuo de prolina; R3 es un grupo bencilo opcionalmente sustituido con uno o más seleccionado del grupo que consiste de OH, OCH3, CO(C6H5), F, Cl, Br, I, CH3, y C2H5l preferiblemente OCH3; R4 es H; R5 es cualquiera de las modalidades definidas anteriormente, R6 es una cadena lateral de valina; X es O; y Y es H. Otra subclase de compuestos útiles es un compuesto de
conformidad con la fórmula IA, en donde R1 es H; R2 es CH3; R3 es un grupo bencilo opcionalmente sustituido con uno o más seleccionados del grupo que consiste de OH, OCH3, CO(C6H5), F, Cl, Br, I, CH3, y CH2CH3, y preferiblemente es OCH3; R4 es CH3; R5 es cualquiera de las modalidades anteriormente definidas; R6 es una cadena lateral de valina; X es O; y Y es H. Otra subclase de compuestos útiles es un compuesto de conformidad con la fórmula IA, en donde R1 es CH3; R2 es CH3; R3 es un grupo bencilo opcionalmente sustituido con uno o más seleccionados del grupo que consiste de OH, OCH3, CO(C6H5), F, Cl, Br, I, y CH3, y CH2CH3, y preferiblemente es OCH3; R4 es CH3; R5 es cualquiera de las modalidades anteriormente definidas; R6 es una cadena lateral de valina; X es O; y Y es H. Otra subclase de compuestos útiles es un compuesto de conformidad con la fórmula IA, en donde R1 y R2 juntos forman el anillo de alquilo de un residuo de prolina; R3 es un grupo naftilmetiio; R4 es CH3; R5 es cualquiera de las modalidades anteriormente definidas; R6 es una cadena de valina; X es O; y Y es H. Otra subclase de compuestos útiles de la fórmula IA es un compuesto que tiene la fórmula
en donde R1-R5, X, y Y son como se definió para un compuesto de la fórmula ÍA. Un aspecto adicional de la invención es un compuesto de conformidad con la fórmula II
en donde R8 es como se definió para R5. En una modalidad, R8 es H, un grupo protector de amina o -(N-metil)Ieucina-prolina-lactato. Ejemplos de compuestos novedosos adecuados, son útiles en los métodos y composiciones que aquí se describen, incluyen el compuesto de conformidad con la fórmula I, IA o II en donde: R1 y R2 juntos forman el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es bencilo, R4 es CH3, R5 es (N-metil-R-leucinaJ-S-prolina-S-lactato, R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H (compuesto 36); R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es bencilo, R4 es CH3, R5 es H, R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H; R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es bencilo, R4 es CH3, R5 es H-HCI, R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H (compuesto 35);
R y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es bencilo, R4 es CH3l R es Boc, R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y
Y es TIPS (compuesto 34); R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es bencilo, R4 es CH3, R5 es Boc, R6 es una cadena lateral de valina, X es 0, y
Y es H; R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es H, R5 es (N-metil-R-leucina)-S-prolina-S-lactato, R6 es una cadena lateral de valina, X es 0, y Y es H (compuesto 62); R y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es H, R es Boc, R6 es una cadena lateral de valina, X es 0, y Y es H (compuesto 61); R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es H, R5 es H, Rs es una cadena lateral de valina, X es O. y Y es H; R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es H, R5 es (N-metil-R-leucina)-S-prolina-S-piruvato, R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H (compuesto 64); R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es H, R5 es (N-metil-R-leucina), R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H; R1 y R2 juntos forman el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibencilo, R2 es H, R es N-Cbz-N-metil-R-leucina, R6 es
una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H (compuesto 63); R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibenc¡lo, R4 es H, R5 es H HCI, R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H; R es H, R2 es CH3, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es CH3, R5 es (N-metil-R-leucina)-S-prolina-S-lactato, R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H (compuesto 75); R es H, R2 es CH3, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es CH3, R5 es Boc, R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H (compuesto 74); R1 es H, R2 es CH3, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es CH3l R5 es H,
R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H; R1 es CH3, R2 es CH3, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es CH3, R5 es (N-metil-R-leucina)-S-prolina-S-lactato, R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H (compuesto 150); R1 es CH3, R2 es CH3, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es CH3, R5 es
Boc, R6 es una cadena lateral de valina, X es 0, y Y es H (compuesto 85); R1 es CH3, R2 es CH3, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es CH3, R5 es H, R6 es una cadena lateral de valina, X es 0, y Y es H; R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 2-naftilmetilo, R4 es CH3, R5 es (N-metil-R-leucina)-S-prolina-S-lactato, R6 es una cadena lateral de valina, X es 0, y Y es H (compuesto 93); R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 2-naftilmetilo, R4 es CH3, R5 es Boc, R6 es una cadena lateral de valina, X
es O, y Y es H (compuesto 92); R y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 2-naftilmetilo, R4 es CH3, R5 es H, R6 es una cadena lateral de valina, X es 0, y Y es H; R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es CH3, R5 es (N-metil-R-leucina)-S-prolina-S-lactato, R6 es una cadena lateral de valina, X es NH, y Y es H; R y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es CH3, R5 es H, R6 es una cadena lateral de valina, X es NH, y Y es H; R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es CH3, R5 es Boc, R6 es una cadena lateral de valina, X es NH, y Y esH; y sales farmacéuticamente aceptables de los mismos. La presente invención también incluye una sal de un compuesto de conformidad con la fórmula I, IA o II. El término sal se refiere a una sal ácida-y/o básica de adición de un compuesto de conformidad con la fórmula I, IA o II. Las sales ácidas de adición se pueden formar por la adición de un ácido apropiado al compuesto de conformidad con la fórmula I, IA o II. Las sales básicas de adición se pueden formare por la adición de una base apropiada al compuesto de conformidad con la fórmula I, IA o II. Dicho ácido o base sustancialmente no degrada, descompone o destruye el compuesto de conformidad con la fórmula I, IA o II. Ejemplos de sales adecuadas incluyen sales de clorhidrato, bromhidrato, acetato, formiato, maleato, oxalato y
succinato. Otras sales adecuadas incluyen sales de sodio, potasio, carbonato, y trometamina. Se entiende además que la presente invención abarca tautómeros de un compuesto de la fórmula I, IA o II. Los tautómeros son bien conocidos en la técnica e incluyen tautómeros de ceto-enol. Los compuestos de la fórmula II, IA o II también pueden ser solvatados, incluyendo hidratados. La hidratación puede ocurrir durante la fabricación de los compuestos o composiciones que comprende los compuestos, o la hidratación puede ocurrir con el tiempo debido a la naturaleza higroscópica de los compounds. Ciertos compuestos dentro del alcance de la fórmula I, IA o II pueden ser derivados referidos como "profármacos". La expression "profármaco" denota un derivado de un fármaco de acción directa conocido, dicho derivado tiene características y valor de suministro incrementados en cmparación con el fármaco, y es transformado al fármaco activo por un proceso enzimático o químico. Los profármacos son derivados de los compuestos de la invención que tienen grupos metabólicalmente digeribles y son convertidos por solvólisis o bajo condiciones fisiológicas a los compuestos de la invención que son farmacéuticamente activos ¡n vivo.íina forma de derivado de ácido puede ofrecer ventajas de solubilidad, compatibilidad de tejido, o liberación retardada en el organismo de mamíferos (véase, Bundgard, H., Design of Prodrugs, pp. 7-9,21-24, Elsevier, Amsterdam 1985). Los profármacos incluyen derivados ácidos bien conocidos por los expertos en la
técnica, tales como, por ejemplo, ésteres preparados por reacción del ácido progenitor con un alcohol adecuado, o amidas preparadas por reacción del compuesto de ácido progenitor con una amina. Cuando ocurre alguna variable más de una vez en cualquier constituyente o en la fórmula I, su definición en cada aparición es independiente de su definición en cualquier otra aparición, a menos que se indique otra cosa. También, combinaciones de constituyentes y/o variables son permisibles sólo si esas combinaciones dan por resultado compuestos estables. Se entiende además que los compuestos descritos en la patente de E.U.A. No. 6,509,315 se excluyen de la presente invención como se describió en las condiciones anteriores.
Definiciones Como se usa aquí, cada uno de los siguientes términos tiene el significado asociado con el mismo en esta sección. Como se usa aquí, ciertos residuos de aminoácidos (en particular los ceinte aminoácidos comunes) están representados por el nombre completo de los mismos, por el código de tres letras correspondiente a los mismos, o por el código de una letra correspondiente a los mismos, como se indica a continuación:
Nombre completo Código de tres letras Código de una letra
Acido aspártico Asp D Acido glutámico Glu E Usina Lys K Arginina Arg R Histidina His H Tirosina Tyr Y Cisteía Cys C Asparagina Asn N Glutamina Gln Q Serina Se S Treonina Thr T Glicina Gly G Alanina Ala A Valina Val V Leucina Leu L Isoleucina lie 1 Metionina Met M Prolina Pro P Fenilalanina Phe F Triptofano Trp N
Como se usa aquí, el término "cadena lateral de aminoácido" se refiere a una porción que comprende todos los átomos de un aminoácido excluyendo el átomo de alfa-carbono, un átomo de hidrógeno unido con el alfa-carbono, los átomos de la porción alfa-carboxilo y la porción alfa-amina. A manera de ejemplo, una "cadena lateral de alanina " se refiere a un grupo metilo, y una "cadena lateral de valina " se refiere a un grupo 2-propilo (o sisopropilo), y una cadena lateral de 3-ciclohexilalanina se refiere a un grupo ciclohexilmetilo (es decir, C6H11-CH2-). "Inhibición" de un proceso en una célula (v.gr., inhibición de síntesis de proteínas, inhibición de crecimiento celular, inhibición del progreso del ciclo celular, inhibición de la proliferación celular, o inhibición de
tumorigenesis) significa la reducción (v.gr., por lo menos 10%, 25%, 50%, 75%, 90%, 95% o incluso 100%) de la velocidad a la cual procede el proceso, reducción (v.gr., por lo menos 10%, 25%, 50%, 75%, 90%, 95% o incluso 100%) de la velocidad a la cual se inicia el proceso, o ambos. "Incremento" de un proceso en una célula (v.gr., el incremento de apoptosis) significa incrementar (v.gr., por lo menos 10%, 25%, 50%, 75%, 90%, 95% o incluso 100%) la velocidad a la cual procede el proceso, incrementar (v.gr., por lo menos 10%, 25%, 50%, 75%, 90%, 95% o incluso 100%) la velocidad a la cual se inicia el proceso, o ambos. Como se usa aquí, el término "vehículo farmacéuticamente aceptable" significa una composición química con la cual un análogo o fragmento de tamandarin, como se describe aquí, se pueden combinar y que, después de la combinación, se pueden administrar a un sujeto (v.gr., un humano u otro animal). Como se usa aquí, el término éster o sal "fisiológicamente aceptable" significa una forma de éster o sal de un análogo o fragmento de tamandarin, como se describe aquí, que es compatible con otros inghredientes de una composición farmacéutica y que no es deletéreo para un sujeto al cual se administra la composición. Como se usa aquí, "administración parenteral" de una composición farmacéutica incluye cualquier vía de administración caracterizada por rompimiento físico de un tejido de un sujeto y la administración de la composición farmacéutica a través de la ruptura en el
tejido. Por lo tanto, la administración parenteral incluye, pero no se limita a, la administración de una composición farmacéutica por inyección de la composición, por aplicación de la composición a través de una incisión quirúrgica, por aplicación de la composición a través de una herida no quirúrgica que penetra al tejido, y similar. En particular, la administración parenteral puede incluir, pero no se limita a, inyección subcutánea, intraperitoneal, intramuscular, ¡ntraesternal, y técnicas de infusión dialítica renal. Como se usa aquí, el término "actividad antiviral " significa prevenir la replicación de un virus en la célula, prevenir la infección de la célula por un virus, o revertir un efecto fisiológico de infección de la célula por un virus. Un agente antiviral es una composición de material que, cuando se suministra a una célula, presenta actividades antivirales. Los agentes antivirales son bien conocidos y se describen en la literatura. A manera de ejemplo, AZT (zidovudine), es un agente antiviral que se piensa que previene la replicación de VIH en células humanas. Los términos que describen diferentes porciones químicas usadas aquí son términos de la técnica y son entendidos por los expertos en la técnica. El término "homoprolina," como se usa aquí, se refiere a una porción prolina que contiene un grupo metileno adicional en al anillo, es decir, que tiene un anillo de 6 miembros. El término "porción no aminoácido", como se usa aquí, se refiere
a una porción que no contiene tanto un grupo amino como un grupo carboxi. Dicha porción es como se ilustró anteriormente para R5. Una porción aminoácido puede ser una porción al final del grupo R5, por ejemplo, aquellas mostradas anteriormente. El término "grupo protector", como se usa aquí como tal o como parte de otro grupo, se refiere a una porción química que se puede unir fácilmente a un grupo funcional particular (y que forma un grupo funcional protegido) cuando se desea proteger dicho grupo funcional de reacciones químicas no deseadas y después en un punto posterior es removida de un grupo funcional protegido para revelar el grupo funcional original. Véase, por ejemplo, Green y Wuts (1991, Protective Groups in Organic Synthesis, Wiley, New York, 2a edición, páginas 1-9), que se incorpora aquí por referencia en su totalidad. Ejemplos de grupos protectores son bien conocidos en la técnica. Ejemplos de dichos grupos protectores se pueden encontrar en referencias tales como Green y Wuts (1991, Protective Groups in Organic Synthesis, Wiley, New York, 2a Edición) and Bodansky (1993, Principies of Peptide Synthesis, Springer, Berlín). Ejemplos específicos no limitantes de grupos protectores incluyen acetilo, bencilo, t-butoxicarbonilo (Boc), benzoilo, dimetilisopropilsililo, t-butildimetilsililo, metoximetilo, y benciloxicarbonilo. Los grupos protectores unidos a un soporte sólido también son adecuados. El término "grupo protector de amina", como se usa aquí como tal o como parte de otro grupo, se refiere a una porción química que se puede unir fácilmente a un grupo amina (y que forma una amina protegida) cuando
se desea proteger dicha amina de reacciones químicas no deseadas y después en un punto posterior es removida de esa amina protegida para revelar la amina original. Ejemplos de grupos protectores de amina son bien conocidos en la técnica. Ejemplos de grupos protectores de amina adecuados se pueden encontrar en referencias tales como Green y Wuts (1991 , Protective Groups in Organic Synthesis, Wiley, New York, 2a edición) y Bodansky (1993, Principies of Peptide Synthesis, Springer, Berlín). Ejemplos específicos no limitantes de grupos protectores de amina incluyen carbamatos tales como t-butoxicarbonilo, metoxicarbonilo y benciloxicarbonilo, amidas tales como formamida y trifluoroacetamida, e imidas cíclicas tales como N ftalimida. El término "grupo protector de hidroxi", como se usa aquí como tal o como parte de otro grupo, se refiere a una porción química que se puede unir fácilmente a un grupo hidroxi (y que forma un hidroxi protegido) cuando se desea proteger dicha amina de reacciones químicas no deseadas y después en un punto posterior es removida del hidroxi protegido para revelar el grupo hidroxi original. Ejemplos de grupos protectores de hidroxi son bien conocidos en la técnica. Ejemplos de grupos protectores de hidroxi adecuados se pueden encontrar en referencias tales como Green y Wuts (1991 , Protective Groups in Organic Synthesis, Wiley, New York, 2a edición) y Bodansky (1993, Principies of Peptide Synthesis, Springer, Berlin). Ejemplos específicos no limitantes de grupos protectores de amina incluyen éteres tales como metoximetilo, tetrahidropiranilo y bencilo, éteres silílicos tales como
trimetilsilílico y triisopropilsilílico, y carbonates tales como de 9-fluorenilmetilo y bencilo. Aunque no se han provisto definiciones detalladas para cada tema aquí usado, cada término es entendido por un experto en la técnica.
Composiciones Una composición de conformidad con la presente invención incluye una composición farmacéutica que comprende un compuesto novedoso de la fórmula I, IA o II, como se definió anteriormente, y uno o más excipientes farmacéuticamente aceptables. La composiciones preferidas de la presente invención son composiciones farmacéuticas que comprenden un compuesto seleccionado de una o más modalidades anteriormente listadas, y uno o más excipientes farmacéuticamente aceptables. Las composiciones farmacéuticas que comprenden uno o más compuestos de la fórmula I, IA o II se pueden formular, como es bien conocido en la técnica, tales como por referencia a compilaciones conocidas como emington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Co. , Easton, Pa. , E.U.A. En una modalidad de la invención, la composición comprende un compuesto seleccionado de uno o más de las modalidades individuales anteriormente listadas. La invención abarca composiciones farmacéuticas que comprenden por lo menos uno de los análogos de tamandarin y los fragmentos farmacológicamente activos aquí descritos. Dichas composiciones
pueden comprender el análogo/fragmento y un vehículo farmacéuticamente aceptable. A manera de ejemplo, una composición farmacéutica de conformidad con la invención comprende un vehículo farmacéuticamente aceptable y un análogo de tamandarin que tiene la estructura ya sea de la fórmula I, IA o II com un agente negativo. Como un ejemplo adicional, una composición farmacéutica de conformidad con la invención comprende un vehículo farmacéuticamente aceptable y uno o más de los siguientes compuestos: En otra modalidad, una composición farmacéutica de la invención comprende además uno o más agentes farmacéuticamente activos adicionales tales como, otros agentes de terapia tumoral, otros agentes ani-infecciosos, y similares. Dichas composiciones farmacéuticas se pueden usar, por ejemplo, en los métodos que aquí se describen y para inhibir una o más de las síntesis de proteínas, progreso del ciclo celular, tumorigénesis, crecimiento y proliferación en una célula. Además, dichas composiciones se pueden usar en los métodos que aquí se describen para mejorar la apoptosis en una célula. Las composiciones farmacéuticas que son útiles en los métodos de la invención se pueden administrar en forma sistémica en formulaciones sólidas orales, formulaciones oftálmicas, supositorios, formulaciones de aerosol, tópicas u otras formulaciones similares. Además del agente activo, dichas composiciones farmacéuticas pueden contener vehículos farmacéuticamente aceptables y otros ingredientes conocidos para
incrementar y facilitar la administración de fármaco. Otras formulaciones posibles, tales como nanopartículas, liposomas, eritrocitos liberados y sistemas inmunológicamente basados también se pueden usar para administrar el agente activo de acuerdo con los métodos de la invención. La invención abarca composiciones farmacéuticas que consisten del agente activo, en una forma adecuada para administrarse a un sujeto, o la composición farmacéutica puede comprender el agente activo y uno o más vehículos farmacéuticamente aceptables, uno o más ingredientes adicionales, o algunas combinaciones de éstos. El agente activo puede estar presente en la composición farmacéutica en forma de un éster o sal fisiológicamente aceptable, tal como en combinación con un catión o anión fisiológicamente aceptable, como se conoce bien en la técnica. Las formulaciones de las composiciones farmacéuticas que aquí se describen se pueden preparar por cualquier método conocido o desarrollado más adelante en la técnica de farmacología. En general, dichos métodos preparativos incluyen el paso de llevar el agente activo a asociación con un vehículo o uno o más de otros ingredientes accesorios, y después, si es necesario o deseable, configurar o empacar el producto en una unidad de una sola dosis o de dosis múltiples deseada. Aunque las descripciones de composiciones farmacéuticas que se proveen aquí están principalmente dirigidas a composiciones farmacéuticas que son adecuadas para la administración ética a humanos, los expertos en la técnica entienden que dichas composiciones son generalmente adecuadas
para administrarse a animales de todos tipos. La modificación de composiciones farmacéuticas adecuadas para administrarse a humanos a fin de hacer las composiciones adecuadas para administrarse a varios animales se entiende bien, y un farmacólogo veterinario experto puede diseñar y realizar dicha modificación con experimentación ordinaria, si acaso la hay. Los sujetos a los cuales la administración de las composiciones farmacéuticas de la invención se contempla incluyen, pero no se limitan a humanos y otros primates, y mamíferos incluyendo mamíferos de importancia comercial tales como ganado vacuno, cerdos, caballos, ovejas, gatos y perros. Las composiciones farmacéuticas que son útiles en los métodos de la invención se pueden preparar, empacar o vender en formulaciones adecuadas para administración oral, rectal, vaginal, parenteral, tópica, pulmonar, intranasal, bucal, oftálmica u otra vía de administración. Otras formulaciones contempladas incluyen nanopartículas proyectadas, preparaciones liposomales, eritrocitos liberados que contienen el agente activo y formulaciones inmunológicamente basadas. Una composición farmacéutica de la invención se puede preparar, empacar o vender a granel, como una sola dosis unitaria, o como una pluralidad de dosis unitarias individuales. Tal como se usa aquí, una "dosis unitaria" es una cantidad discreta de la composición farmacéutica que comprende una cantidad predeterminada del agente activo. La cantidad del agente activo es generalmente igual a la dosis del agente activo que se administraría a un sujeto o una fracción conveniente de dicha dosis tal como,
por ejemplo, la mitad o una tercera parte de dicha dosis. Las formulaciones de liberación controlada o sostenida de una composición farmacéutica de la invención se pueden usar usando tecnología convencional. Una formulación de una composición farmacéutica de la invención adecuada para administración oral se puede preparar, empacar o vender en forma de una unidad de dosis sólida discreta incluyendo, pero sin limitarse a una tableta, una cápsula dura o blanda, una bolsa, un trocisco, o una pastilla cada una conteniendo una cantidad predeterminada del agente activo. Otras formulaciones adecuadas para administración oral incluyen pero no se limitan a una formulación en polvo o granulada, una suspensión acuosa u oleosa, una solución acuosa u oleosa, o una emulsión. Tal como se usa aquí, un líquido "oleoso" es uno que comprende una molécula de líquido que contiene carbono y que presenta un carácter menos polar que el agua. Una tableta que comprende al agente activo se puede hacer, por ejemplo, comprimiendo o moldeando el agente activo, opcionalmente con uno o más ingredientes adicionales. Las tabletas comprimidas se pueden preparar mediante compresión, en un dispositivo adecuado, del agente activo en una forma de flujo libre tal como una preparación en polvo o granulada, opcionalmente mezclada con uno o más de un aglutinante, un lubricante, un excipiente, un agente activo de superficie y un agente dispersante. Las tabletas moldeadas se pueden hacer moldeando, en un dispositivo adecuado,
una mezcla del agente activo, un vehículo farmacéuticamente aceptable y por lo menos suficiente líquido para humedecer la mezcla. Los excipientes farmacéuticamente aceptables usados en la fabricación de tabletas incluyen, pero no se limitan a, diluyentes inertes, agentes de granulación y desintegración, agentes aglutinantes y agentes lubricantes. Los agentes dispersantes conocidos incluyen pero no se limitan a almidón de papa y glicolato de almidón de sodio. Los agentes activos de superficie conocidos incluyen pero no se limitan a laurilsulfato de sodio. Los diluyentes conocidos incluyen pero no se limitan a carbonato de calcio, carbonato de sodio, lactosa, celulosa microcristalina, fosfato de calcio, fosfato ácido de calcio y fosfato de sodio. Los agentes de granulación y desintegración conocidos incluyen pero no se limitan a almidón de maíz y alginato. Los agentes aglutinantes conocidos incluyen pero no se limitan a gelatina, acacia, almidón de maíz pregelatinizado, polivinilpirrolidona e hidroxipropilmetilcelulosa. Los agentes lubricantes conocidos incluyen pero no se limitan a estearato de magnesio, estearato, sílice y talco. Las tabletas pueden ser no revestidas o pueden ser revestidas usando métodos conocidos para lograr la desintegración retardada en el tracto gastrointestinal de un sujeto, proveyendo así liberación sostenida y absorción del agente activo. A manera de ejemplo, un material tal como monoestearato de glicerilo o diestearato de glicerilo se puede usar para revestir las tabletas. Además, a manera de ejemplo, las tabletas se pueden revestir usando métodos descritos en las patentes de E.U.A. números 4,256,108; 4,160,452; y
4,265,874 para formar tabletas de liberación osmóticamente controlada. Las tabletas pueden comprender además un agente edulcorante, un agente saborizante, un agente colorante, un conservador o alguna combinación de éstos para proveer una preparación farmacéuticamente atractiva y palatable. Las cápsulas duras que comprenden el agente activo se pueden hacer usando una composición fisiológicamente degradable, tal como gelatina. Dichas cápsulas duras comprenden el agente activo y además pueden comprender ingredientes adicionales incluyendo, por ejemplo, un diluyente sólido inerte tal como carbonato de calcio, fosfato de calcio o caolina. Las cápsulas de gelatina blanda que comprenden el agente activo se pueden hacer usando una composición fisiológicamente degradable, tal como gelatina. Dichas cápsulas suaves comprenden el agente activo, que se puede mezclar con agua o un medio oleoso tal como aceite de cacahuate, parafina líquida o aceite de oliva. Las formulaciones líquidas de una composición farmacéutica de la invención que son adecuadas para administración oral se pueden preparar, empacar o vender ya sea en forma líquida o en la forma de un producto seco destinado para ser reconstituido con agua u otro vehículos adecuado antes de usarse. Las suspensiones líquidas se pueden preparar usando métodos convencionales para lograr la suspensión del agente activo en un vehículo acuoso u oleoso. Los vehículos acuosos incluyen, por ejemplo, agua y
solución salina isotónica. Los vehículos oleosos incluyen, por ejemplo, aceite de almendra, ásteres oleosos, alcohol etílico, aceites vegetales tales como aceite de araquis, oliva, ajonjolí o coco, aceites vegetales fraccionados y aceites minerales tales como parafina líquida. Las suspensiones líquidas pueden comprender además uno o más ingredientes adicionales incluyendo pero sin limitarse a agentes de suspensión, agentes dispersantes o humectantes, agentes emulsionantes, demulcentes, conservadores, reguladores de pH, sales, saborizantes, agentes colorantes y agentes edulcorantes. Las suspensiones oleosas pueden comprender además un agente espesante. Los agentes de suspensión conocidos incluyen pero no se limitan a jarabe de sorbitol, grasas comestibles hidrogenadas, alginato de sodio, poliviniipirrolidona, goma tragacanto, goma acacia y derivados de celulosa tales como carboximetilcelulosa de sodio, metilcelulosa, hidroxipropilmetilcelulosa. Los agentes dispersantes o humectantes conocidos incluyen pero no se limitan a fosfátidos que ocurren en forma natural tales como lecitina, productos de condensación de un óxido de alquileno con un ácido graso, con un alcohol alifático de cadena larga, con un éster parcial derivado de un ácido graso y un hexitol, o con un éster parcial derivado de un ácido graso y un anhídrido de hexitol (por ejemplo, estearato de polioxietileno, heptadecaetilenoxicetanol, monooleato de polioxietilensorbitol y monooleato de polioxietilensorbitán, respectivamente). Los agentes emulsionantes conocidos incluyen pero no se limitan a lecitina y acacia. Los conservadores conocidos incluyen pero no se limitan a metilo, etilo, o n-propil-para-
hidroxibenzoatos, ascorbato y sorbato. Los agentes edulcorantes conocidos incluyen, por ejemplo, glicerol, propilenglicol, sorbitol, sacarosa y sacarina. Los agentes espesantes conocidos para suspensiones oleosas incluyen, por ejemplo, cera de abeja, parafina dura y alcohol cetílico. Las soluciones líquidas del agente activo en solventes acuosos u oleosos se pueden preparar sustancialmente de la misma manera que las suspensiones líquidas, la diferencia principal siendo que el agente activo se disuelve, y no se suspende, en el solvente. Las soluciones líquidas de la composición farmacéutica de la invención pueden comprender cada uno de los componentes descritos con respecto a las suspensiones líquidas, entendiéndose que los agentes de suspensión no necesariamente ayudan a la disolución del agente activo en el solvente. Los solventes acuosos incluyen, por ejemplo, agua y solución salina isotónica. Los solventes oleosos incluyen, por ejemplo, aceite de almendra, ésteres oleosos, alcohol etílico, aceites vegetales tales como aceite de araquis, oliva, ajonjolí o coco, aceites vegetales fraccionados y aceites minerales tales como parafina líquida. Las formulaciones en polvo o granuladas de una preparación farmacéutica de la invención se pueden preparar usando métodos conocidos. Dichas formulaciones se pueden administrar directamente a un sujeto, usarse por ejemplo para formar tabletas, para llenar cápsulas o para preparar una suspensión o solución acuosa u oleosa mediante la adición de un vehículo acuoso u oleoso a la misma. Cada una de estas formulaciones pueden comprender además uno o más de un agente dispersante o humectante, un
agente de suspensión y un conservador. Excipientes adicionales, tales como llenadores y edulcorantes, saborizantes o agentes colorantes, también se pueden incluir en estas formulaciones. En otra modalidad, una composición farmacéutica de la invención también se puede preparar, empacar o vender en forma de una emulsión de aceite en agua o una emulsión de agua en aceite. La fase oleosa puede ser un aceite vegetal tal como aceite de oliva o araquis, un aceite mineral tal como parafina líquida, o combinación de éstos. Dichas composiciones pueden comprender además uno o más agentes emulsionantes tales como gomas que ocurren en forma natural tales como goma acacia o goma tragacanto, fosfátidos que ocurren en forma natural tales como fosfátido de soya o de lecitina, ésteres o ésteres parciales derivados de combinaciones de ácidos grasos y anhídridos de hexitol tales como monooleato de sorbitán y productos de condensación de dichos ésteres parciales con óxido de etileno tales como monooleato de polioxietilensorbitán. Estas emulsiones también pueden contener ingredientes adicionales incluyendo, por ejemplo, agentes edulcorantes o saborizantes. En otra modalidad, una composición farmacéutica de la invención se prepara, empaca o vende en una formulación adecuada para administración rectal. Dicha composición puede estar en forma de, por ejemplo, un supositorio, una preparación de enema de retención y una solución para irrigación rectal o colónica. Las formulaciones de supositorios se pueden hacer combinando
el agente activo con un excipiente farmacéuticamente aceptable no irritante que es sólido a temperatura ambiente ordinaria (es decir, aproximadamente 20°C) y que es líquido a la temperatura rectal del sujeto (es decir, aproximadamente 37°C en un humano sano). Los excipientes farmacéuticamente aceptables adecuados incluyen pero no se limitan a manteca de cacao, polietilenglicoles y varios glicéridos. Las formulaciones de supositorios pueden comprender además varios ingredientes adicionales incluyendo pero sin limitarse a antioxidantes y conservadores. Las preparaciones o soluciones de enema de retención para irrigación rectal o colónica se pueden hacer combinando el agente activo con un vehículo líquido farmacéuticamente aceptable. Como es bien sabido en la técnica, las preparaciones de enema se pueden administrar usando, y se pueden empacar dentro de, un dispositivo de surtido adaptado para la anatomía rectal del sujeto. Las preparaciones de enema pueden comprender además varios ingredientes adicionales incluyendo pero sin limitarse a antioxidantes y conservadores. Una composición farmacéutica de la invención se puede preparar, empacar o vender en una formulación adecuada para administración vaginal. Dicha composición puede estar en forma de, por ejemplo, un supositorio, un material impregnado o insertable vaginalmente tal como un tampón, una preparación o una solución para irrigación vaginal. Los métodos para impregnar o revestir un material con una composición química son conocidos en la técnica e incluyen pero no se limitan
a métodos de deposición o unión de una composición química sobre una superficie, métodos para incorporar una composición química en la estructura de un material durante la síntesis del material (es decir, tal como un material fisiológicamente degradable), y métodos para absorber una solución o suspensión acuosa u oleosa en un material absorbente, con o sin secado subsecuente. Las preparaciones de ducha o soluciones para irrigación vaginal se pueden hacer combinando el agente activo con un vehículo líquido farmacéuticamente aceptable. Como se conoce bien en la técnica, las preparaciones de ducha se pueden administrar usando y se pueden empacar dentro de un dispositivo de surtido adaptado a la anatomía vaginal del sujeto. Las preparaciones de ducha pueden comprender además varios ingredientes adicionales incluyendo pero sin limitarse a antioxidantes, antibióticos, agentes antimicóticos y conservadores. Las formulaciones de una composición farmacéutica adecuada para administración parenteral pueden comprender el agente activo combinado con un vehículo farmacéuticamente aceptable, tal como agua estéril o solución salina isotónica estéril. Dichas formulaciones se pueden preparar, empacar o vender en una forma adecuada para administración en bolo o para administración continua. Las formulaciones inyectables se pueden preparar, empacar o vender en forma de dosis unitaria, tales como ampolletas o en contenedores de dosis múltiples que contienen un conservador. Las formulaciones para administración parenteral incluyen, pero no se limitan a
suspensiones, soluciones, emulsiones en vehículos oleosos o acuosos, pastas y formulaciones de liberación sostenida implantables o biodegradables. Dichas formulaciones pueden comprender además uno o más ingredientes adicionales incluyendo pero sin limitarse a agentes de suspensión, estabilizadores o dispersantes. En una modalidad de una formulación para administración parenteral, el agente activo se provee en forma seca (es decir, polvo o gránulos) para reconstituirse con un vehículo adecuado (por ejemplo, agua estéril libre de pirógenos) antes de la administración parenteral de la composición reconstituida. En otra modalidad, las composiciones farmacéuticas se preparan, empacan o venden en forma de una suspensión o solución acuosa u oleosa inyectable, estéril. Esta suspensión o solución se puede formular de acuerdo con la técnica conocida y puede comprender, además del agente activo, ingredientes adicionales tales como dispersantes, agentes humectantes, o agentes de suspensión que aquí se describen. Dichas formulaciones inyectables estériles se pueden preparar usando un diluyente o solvente parenteralmente aceptable no tóxico, tal como, por ejemplo, agua o ,3-butanodiol. Otros diluyentes y solventes aceptables incluyen pero no se limitan a solución de Ringer, solución isotónica de cloruro de sodio y aceites fijados tales como monoglicéridos o diglicéridos sintéticos. Otras formulaciones parenteralmente administrables que son útiles incluyen aquellas que comprenden el agente activo en forma microcristalina, en una preparación liposomal o como un componente de un sistema de polímero biodegradable.
Las composiciones para liberación sostenida o implantación pueden comprender materiales poliméricos o hidrofóbicos farmacéuticamente aceptables tales como una emulsión, una resina de intercambio de iones, un polímero escasamente soluble o una sal escasamente soluble. Las formulaciones adecuadas para administración tópica incluyen pero no se limitan a preparaciones líquidas o semilíquidas tales como linimentos, lociones, emulsiones de aceite en agua o de agua en aceite tales como cremas, pomadas o pastas, y soluciones o suspensiones. Las formulaciones tópicamente administrables pueden comprender, por ejemplo, de aproximadamente 1% a aproximadamente 10% (p/p) de agente activo, aunque la concentración del agente activo puede ser tan alta como el límite de solubilidad del agente activo en el solvente. Las formulaciones para administración tópica pueden comprender además uno o más de los ingredientes adicionales que aquí se describen. Una composición farmacéutica de la invención se puede preparar, empacar o vender en una formulación adecuada para administración pulmonar a través de la cavidad bucal. Dicha formulación puede comprender partículas secas que comprenden el agente activo y que tienen un diámetro en el intervalo de aproximadamente 0.5 a aproximadamente 7 nanómetros, y preferiblemente de aproximadamente 1 a aproximadamente 6 nanómetros. Dichas composiciones están convenientemente en forma de polvos secos para administrarse mediante el uso de un dispositivo que comprende un depósito de polvo seco al cual se puede dirigir una corriente de propelente
para dispersar el polvo o mediante el uso de un contenedor de solvente autopropelente/dispersante de polvo tal como un dispositivo que comprende el agente activo disuelto o suspendido en un propelente de punto de ebullición bajo en un contenedor sellado. En una modalidad, dichos polvos comprenden partículas en donde por lo menos 98% de las partículas en peso tienen un diámetro mayor que 0.5 nanometros y por lo menos 95% de las partículas en número tienen un diámetro menor que 7 nanometros. En otra modalidad, por lo menos 95% de las partículas en peso tienen un diámetro mayor que 1 nanómetro y por lo menos 90% de las partículas por número tienen un diámetro menor que 6 nanometros. Las composiciones de polvo seco preferiblemente incluyen un diluyente de polvo fino sólido tal como azúcar y se proveen convenientemente en forma de dosis unitaria. Los propelentes de punto de ebullición bajo generalmente incluyen propelentes líquidos que tienen un punto de ebullición por abajo de 18.3°C a presión atmosférica. En una modalidad, el propelente puede constituir de 50 a 99.9% (p/p) de la composición y el agente activo puede constituir 0.1 a 20% (p/p) de la composición. El propelente puede comprender además ingredientes adicionales tales como agente tensioactivo no iónico líquido o aniónico sólido o un diluyente sólido (preferiblemente teniendo un tamaño de partícula del mismo orden que las partículas que comprenden el agente activo). Las composiciones farmacéuticas de la invención formuladas para surtido pulmonar también pueden proveer el agente activo en forma de
gotas de una solución o suspensión. Dichas formulaciones se pueden preparar, empacar o vender como soluciones o suspensiones alcohólicas acuosas o diluidas, opcionalmente estériles que comprenden el agente activo, y se pueden administrar convenientemente usando cualquier dispositivo de nebulización o atomización. Dichas formulaciones pueden comprender además uno o más ingredientes adicionales incluyendo, pero sin limitarse a un agente saborizante tal como sacarina sódica, un aceite volátil, un agente regulador de pH, un agente activo de superficie o un conservador tal como hidroxibenzoato de metilo. En una modalidad, las gotas provistas por esta vía de administración tienen un diámetro promedio en el intervalo de aproximadamente 0.1 a aproximadamente 200 nanómetros. Las formulaciones que aquí se describen como útiles para suministro pulmonar también son útiles para suministro intranasal de una composición farmacéutica de la invención. Otra formulación adecuada para administración intranasal es un polvo grueso que comprende el agente activo y que tiene un tamaño de partícula promedio de aproximadamente 0.2 a 500 mieras. Dicha formulación se administra de manera que sea aspirada, es decir, por inhalación rápida a través de los pasajes nasales desde un contenedor del polvo sostenido cerca de las fosas nasales. Las formulaciones adecuadas para administración nasal pueden comprender, por ejemplo, de aproximadamente tan poco como 0.1% (p/p) y tanto como 100% (p/p) del agente activo, y pueden comprender además uno o
más ingredientes adicionales que aquí se describen. Una composición farmacéutica de la invención se puede preparar, empacar o vender en una formulación adecuada para administración bucal. Dichas formulaciones pueden estar, por ejemplo, en forma de tabletas o pastillas hechas usando métodos convencionales, y pueden contener, por ejemplo, 0.1 a 20% (p/p) de agente activo, el resto comprendiendo una composición oralmente disolvible o degradable y opcionalmente uno o más ingredientes adicionales aquí descritos. Como alternativa, las formulaciones adecuadas para administración bucal pueden comprender un polvo o una solución o suspensión aerosolizada o atomizada que comprende el agente activo. Dichas formulaciones en polvo, aerosolizadas o atomizadas, cuando se dispersan, preferiblemente tienen un tamaño de partícula o gota promedio en el intervalo de 0.1 a aproximadamente 200 nanómetros, y pueden comprender además uno o más ingredientes adicionales que aquí se describen. En otra modalidad, una composición farmacéutica de la invención se puede preparar, empacar o vender en una formulación adecuada para administración oftálmica. Dichas formulaciones pueden estar, por ejemplo, en forma de gotas para los ojos incluyendo, por ejemplo, una solución o suspensión al 0.1-1.0% (p/p) del agente activo en un vehículo líquido acuoso u oleoso. Dichas gotas pueden comprender además agentes reguladores de pH, sales o uno o más de otros de los ingredientes adicionales que aquí se describen. Otras formulaciones oftalmológicamente administrables que son útiles incluyen aquellas que comprenden el agente
activo en forma microcristalina o en una preparación liposomal. Como se usa aquí, "ingredientes adicionales" incluyen pero no se limitan a uno o más de los siguientes: excipientes, agentes activos de superficie; agentes dispersantes; diluyentes inertes; agentes granuladores y desintegrantes; agentes aglutinantes; agentes lubricantes; agentes edulcorantes; agentes saborizantes; agentes colorantes; conservadores; composiciones fisiológicamente degradables como gelatina; vehículos y solventes acuosos; vehículos y solventes oleosos; agentes de suspensión; agentes dispersantes o humectantes; agentes emulsionantes; demulcentes; agentes reguladores de pH; sales; agentes espesantes; llenadores; agentes emulsionantes; antioxidantes; antibióticos; agentes antimicóticos; agentes estabilizantes; y materiales poliméricos o hidrofóbicos farmacéuticamente aceptables. Otros "ingredientes adicionales" que se pueden incluir en las composiciones farmacéuticas de la invención se conocen en la técnica y se describen, por ejemplo en Genaro, ed., 1985, Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Co., Easton, PA, que se incorpora aquí por referencia. Las cantidades relativas del agente activo, el vehículo farmacéuticamente aceptable y cualesquiera ingredientes adicionales en una composición farmacéutica de la invención variará dependiendo de la identidad, tamaño y el tipo de severidad de la condición del sujeto que está siendo tratado y dependerán además de la vía por la cual la composición se ha de administrar. A manera de ejemplo, la composición puede comprender
entre 0.1% y 100% (p/p) de agente activo. En otra modalidad, la presente invención es dirigida a una composición que comprende un compuesto de la fórmula I, IA o II y un vehículo, en donde dicho vehículo es adecuado para una prueba. Dichos vehículos pueden incluir vehículos sólidos y líquidos. Una composición adecuada para una prueba puede ser, pero no necesariamente, estéril. Ejemplos de vehículos adecuadas para pruebas incluyen sulfóxido de dimetilo, etanol, diclorometano, metanol, cloroformo, ?,?-dimetilformamida y similares. En una modalidad, la presente invención está dirigida a una composición que consiste esencialmente de un compuesto de la fórmula I, IA o II y un vehículo, en donde dicho vehículo es adecuado para una prueba.
Usos de los compuestos y composiciones Los análogos de tamandarin y fragmentos fisiológicamente activos de los mismos, como se describe aquí, tales como compuestos que tienen la estructura de la fórmula I, IA o II, se pueden usar para afectar una variedad de procesos fisiológicos. Cada uno de estos compuestos se puede usar para inhibir la síntesis de proteína. Además, los compuestos se pueden usar para inhibir el progreso de una célula a través del ciclo celular. Aunque no está limitada por ninguna teoría de operación particular, se cree que la actividad inhibidora del ciclo celular de los compuestos se puede atribuir a la inhibición de la síntesis de proteínas, y posiblemente también a la inhibición de otras actividades celulares asociadas con la replicación de ADN o la
división celular. Los análogos de tramandarin y sus fragmentos activos también inducen apoptosis en las células. Las actividades fisiológicas atribuibles a los análogos y fragmentos de tamandarin hacen a estos compuestos útiles para aliviar una variedad de trastornos en los cuales son aberrantes uno o más del crecimiento celular, proliferación y supervivencia. Ejemplos de dichos trastornos incluyen cánceres en varias etapas, v. gr., tumorigénesis, crecimiento tumora! y metástasis, e infecciones virales en varias etapas, v. gr., infección de células con partículas virales, producción de partículas virales dentro de una célula y supervivencia de células infectadas por virus. Además, los compuestos de la presente invención se pueden usar para tratar cánceres (v.gr., cáncer de mama), infecciones virales, micóticas, parasitarias y bacterianas, trastornos autoinmunes, alergias, otros trastornos hiperinmunes y aterosclerosis. El tema del método que aquí se decribe es preferiblemente un animal incluyendo, pero sin limitarse a, una vaca, caballo, oveja, cerdo, pollo, pavo, codorniz, gato, peroo, ratón, rata, conejo y cobayo, y muy preferiblemente es un mamífero, y muy preferiblemente un humano. Los análogos y fragmentos de tamandarin que aquí se describen se pueden usar para propósitos anti-proliferativos, anti-tumorales, anti-virales e inmunosupresores. Por consiguiente, un aspecto adicional de la presente invención está dirigido a un método para inhibir y prevenir el crecimiento de una célula cancerosa, que comprende poner en contacto dicha célula cancerosa con una cantidad efectiva de un compuesto de la fórmula I, IA o II.
Por ejemplo, estos compuestos se pueden usar en una preparación farmacéutica o medicamento para administrarse a un paciente afectado por un trastorno en el cual son aberrantes uno o más del crecimiento celular, proliferación y supervivencia. Dichos medicamentos se pueden usar para tratar trastornos tales como cánceres (v.gr., cáncer de mama). Ejemplos de actividades antitumorales que pueden ser presentadas por los compuestos aquí descritos incluyen inhibición de tumorigénesis, inhibición de metástasis, inhibición de crecimiento de células tumorales, inhibición de proliferación de células tumorales e incremento de apoptosis de células tumorales. El deshidrodidemnin presenta actividad contra líneas celulares derivadas de varios tipos de tumores sólidos en humanos, incluyendo cáncer de pulmón de células no pequeñas y líneas de células de tumor de colon, y presenta actividad antitumoral selectiva contra cáncer de pulmón de células no pequeñas, melanomas, cáncer ovárico y cáncer colorrectal (Depenbrock et al., Brit. J. Cáncer 78:739-744(1998)). Los análogos y fragmentos de tamandarin aquí descritos presentan actividades antitumorales de células de uno o más de estas líneas, así como en células del tipo de tumor correspondientes in vivo. La determinación de la efectividad de cualquier análogo o fragmento de tamandarin particular aquí descrito contra cualquier tipo de tumor particular se puede hacer usando métodos estándares que implican, por ejemplo, una o más de las 60 líneas de células tumorales estándares mantenidas en el programa de selección de fármacos del U.S. National Cáncer Institute (Instituto Nacional de Cáncer de los Estados Unidos).
Un aspecto adicional de la presente invención está dirigido a un método de inhibición, tratamiento o prevención de una infección viral que comprende administrar un compuesto de la fórmula 1, IA o II a un sujeto que necesita dicho tratamiento. Ejemplos de actividades antivirales que pueden ser presentadas por los análogos y fragmentos de tamandarin que aquí se describen incluyen la inhibición de la unión de un virus con un objetivo celular, la inhibición de la infección de una célula por un virus, la inhibición de la síntesis celular de componentes virales, la inhibición de ensamble intracelular de partículas virales, la inhibición de liberación de partículas virales de una célula infectada, la inhibición del crecimiento de una célula infectada por un virus, la inhibición de proliferación de una célula infectada por un virus, y la inducción de muerte (es decir, apoptosis) de una célula infectada por un virus. La actividad antiviral de los compuestos que aquí se describen se puede usar, por ejemplo, para tratar o prevenir infecciones virales de mamíferos y síntomas asociados. A manera de ilustración, un análogo o fragmento de didemnin se puede usar aquí para tratar o prevenir infecciones por virus tales como el virus de la fiebre de Rift Valley, virus del dengue o cualquiera de los virus de encefalitis equina. En una modalidad adicional, la presente invención es dirigida a un método para proveer terapia inmunosupresora a un sujeto que necesita la misma, que comprende administrar un compuesto de la fórmula I, IA o II a dicho sujeto. Ejemplos de actividades inmunosupresoras que pueden ser presentadas por los análogos y fragmentos de tamandarin que aquí se
describen incluyen la inhibición de una respuesta inmune celular a un inmunogeno (por ejemplo, un agente infeccioso, o una célula o tejido trasplantado) y la inhibición de una respuesta inmune humoral a un inmunogeno. Ejemplos de trastornos en los cuales la inmunosupresion puede ser deseable incluyen trastornos autoinmunes, trastornos de rechazo de trasplante (v. gr., rechazo de un tejido sólido o trasplante de médula ósea), desarrollo de una respuesta inmune a un dispositivo implantado (por ejemplo, un stent o una válvula cardíaca), hipersensibiliada inmune y anafiláxis. En otra modalidad, un compuesto de conformidad con la presente invención se usa para tratar un tumor, incluyendo tumores sólidos tales como de vejiga, mama, colon, hígado, ovario, gástrico, páncreas, próstata, renal, retinoblastomas, melanoma, fibrosarcoma u osteosarcoma. En otra modalidad, un compuesto de la presente invención se usa para tratar una leucemia o linfoma, tal como leucemia promielocítica, linfoblástica aguda, leucemia mielógena crónica, leucemia de células T, linfoma de células T cutáneas, linfoma de células B de Burkitt y linfoma de células B. En otra modalidad, un compuesto de la presente invención se usa para tratar un cáncer o tumor representado por una línea celular que se ha mostrado que es inhibida por el compuesto. Los análogos y fragmentos de tamandarin que aquí se describen se pueden administrar in vitro a una célula o tejido (por ejemplo, una célula o tejido de cultivo, o una célula o tejido cosechado de un animal antes de introducir en el mismo o en un animal diferente). Alternativamente, los
análogos se pueden administrar a la célula o tejido in vivo administrando el agente o una composición farmacéutica que comprende el agente a un animal (v. gr., un mamífero tal como un humano) que comprende la célula o tejido. En una modalidad de los métodos de tratamiento que aquí se describen, un análogo de tamandarin aquí descrito y que tiene un grupo digerible por enzima unido al mismo se administra a un animal. En una modalidad, con la digestión del grupo digerible por enzima, el compuesto se transforma de una forma inactiva (o menos activa) a una forma activa (o más activa). De esta forma, un análogo de tamandarin puede activarse selectivamente en un sitio del cuerpo en el que ocurre actividad de la enzima. La enzima que se usa para digerir un análogo de tamandarin que tiene una porción digerible por enzima unida puede ser una enzima que ocurre en forma natural en un sitio del cuerpo en un animal. Alternativamente, la enzima se puede proveer a un animal, por ejemplo como una composición que comprende la enzima o un ácido nucleico que codifica la enzima. Como otro ejemplo, la enzima se puede acoplar (por ejemplo, en forma covalente, usando un agente entrelazador o mediante la expresión como una proteína de fusión de enzima-anticuerpo) con un anticuerpo que se une específicamente con un tejido (por ejemplo, células cancerosas tales como células de leucemia o células de un tumor sólido) en un sitio del cuerpo en el animal, y el complejo de anticuerpo-enzima se puede administrar a un animal. La administración de un análogo de tamandarin que tiene un grupo digerible por enzima unido al mismo animal da como resultado la activación preferencial del compuesto en
el tejido o sitio del cuerpo. El efecto fisiológico del compuesto puede ser de esta manera localizado en el tejido o sitio del cuerpo, y cualquier efecto colateral atribuible ai compuesto activado puede por lo tanto reducirse o reducirse al mínimo. Los compuestos de la presente invención se pueden administrar en una cantidad efectiva dentro del intervalo de dosis de aproximadamente 0.01 mg/kg a aproximadamente 300 mg/kg, preferiblemente entre 0.1 mg/kg a 100 mg/kg de peso corporal, muy preferiblemente de 0.1 mg/kg a 10 mg/kg de peso corporal. Un compuesto de la presente invención se puede administrar en una sola dosis diaria, o la dosis diaria total se puede administrar en dosis divididas de dos, tres o cuatro veces al día. La dosis y frecuencia exactas de administración dependen del compuesto particular de la fórmula I, IA o II usada, la condición particular que se esté tratando, la severidad de la condición que se esté tratando, la edad, peso y condición física general del paciente particular así como otra medicamentos que pueda estar tomando el individuo, como es bien sabido por los expertos en la técnica. Las dosis pueden variar dependiendo de los requerimientos del paciente, la severidad de la condición que se esté tratando y el compuesto que se esté utilizando. En todos los casos de administración, se entiende que el compuesto de la fórmula I, IA o II se puede administrar como una composición farmacéutica que comprende dicho compuesto y un excipiente farmacéuticamente aceptable, como se describe aquí. Alternativamente, el compuesto de la fórmula I, IA o II se puede administrar como un material puro
si es apropiado. En un aspecto adicional de la presente invención, un compuesto de la fórmula I, IA o II se puede usar solo o en combinación con uno o más agentes activos farmacéuticos adicionales (c.gr., un agente anticanceroso, un agente antiviral). En otra modalidad, un compuesto de la invención también es útil en una prueba de descubrimiento de fármaco. Un compuesto de la fórmula I, IA o II se puede usar en una prueba para determinar la eficacia y/o potencia de otros compuestos como agentes anticancerosos, antivirales o inmunosupresores. Estas pruebas inclyen pruebas ¡n vivo e in vitro. Los compuestos de la presente invención se pueden usar como controles o se pueden usar como compuestos principales para descubrir nuevos compuestos y fármacos útiles. Aunque no se limita a ninguna teoría de operación particular, se cree que las actividades fisiológicas atribuibles a los análogos y fragmentos de tamandarin que aquí se describen resultan de una o más interacciones entre dichos análogos o fragmentos y por lo menos un componente celular. Esta(s) interacción(es) conduce(n), directamente o indirectamente, a la respuesta celular observada. Por consiguiente, la invención comprende el uso de un compuesto que tiene la estructura de la fórmula I, IA o II para identificar uno o más componentes delulares que contribuyen a un fenotipo de trastorno en un individuo. La identificación de dicho componente celular puede indicar un curso efectivo de tratamiento para aliviar el trastorno. Ejemplos de
compuestos útiles para este propósito incluyen análogos y fragmentos de tamandarin que tienen la estructura de la fórmula I, IA o II y que comprenden un sustituyente fluorescente (v.gr., parte de R5), porción química fotorreactiva o una porción unida con un soporte. Los análogos de tamandarin fluorescentes y otros detectablemente marcados que aquí se describen (así como sus fragmentos fisiológicamente activos) se pueden usar para identificar células en las cuales aquellos análogos y fragmentos puedan ejercer sus efectos fisiológicos. Por ejemplo, las células que absorben o se unen con un compuesto fluorescente que tiene la estructura de una de la fórmula I, IA o II pueden ser identificadas o aisladas. La identificación o aislamiento de dichas células se pueden usar para diagnosticar un trastorno asociado con la presencia de dichas células. La identificación o aislamiento de estas células también pueden indicar cuáles de los análogos o fragmentos de tamandarin son eficaces para tratar un trastorno que involucra las células. Los compuestos de la presente invención que tienen una porción fotorreactiva son útiles como sondas de fotoafinidad. Las sondas de fotoafinidad son útiles para identificar, marcar y/o modificar proteínas objetivo. La identificación de la proteína objetivo es útil para entender la enfermedad y los procesos celulares. Una sonda de fotoafinidad de la presente invención es para dicha meta. Además, en otra modalidad, una sonda de fotoafinidad de la presente invención se usa para modular o desactivar una proteína objetivo. Un análogo de tamandarin unido al soporte (o fragmento unido al
soporte de un análogo de tamandarin que presenta una actividad fisiológica correspondiente) se puede usar para identificar células que comprenden, sobre sus superficies o en otra parte, proteínas receptoras, glicoproteínas y similares, que son capaces de interactuar o unirse con el análogo. Como ejemplo, un análogo de tamandarin tiene la estructura de la fórmula I, IA o II y unido a un soporte, debido a su interacción con un receptor particular, se puede usar para identificar o aislar físicamente células de un tipo particular (por ejemplo, células tumorales) que se caracterizan por la presencia del receptor particular. En una modalidad, un método de conformidad con la presente invención usa un compuesto seleccionado de una o más de las modalidades individuales listadas anteriormente. En otra modalidad, el método usa un compuesto que se selecciona del grupo que consiste de un compuesto de conformidad con la fórmula I, IA o II en donde: R1 y R2 juntos forman el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es bencilo, R4 es CH3, R5 es (N-metil-R-leucina)-S-prolina-S-lactato, R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H (compuesto 36); R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es bencilo, R4 es CH3, R5 es H, R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H; R y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es bencilo, R4 es CH3, R5 es H-HCI, R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H (compuesto 35);
R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es bencilo, R4 es CH3, R es Boc, R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es TIPS (compuesto 34); R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es bencilo, R4 es CH3, R5 es Boc, R6 es una cadena lateral de valina, X es 0, y Y es H; R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es H, R5 es (N-metil-R-leucina)-S-prolina-S-lactato, R6 es una cadena lateral de valina, X es 0, y Y es H (compuesto 62); R y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es H, R es Boc, R6 es una cadena lateral de valina, X es 0, y Y es H (compuesto 61); R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es H, R5 es H, R6 es una cadena lateral de valina, X es O. yY es H; R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es H, R5 es (N-metil-R-leucina)-S-prolina-S-piruvato, R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H (compuesto 64); R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es H, R5 es (N-metil-R-leucina), R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H; R1 y R2 juntos forman el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibencilo, R2 es H, R es N-Cbz-N-metil-R-leucina, R6 es
una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H (compuesto 63); R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es H, R5 es H HCl, R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H; R es H, R2 es CH3, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es CH3, R5 es (N-metil-R-leucina)-S-prolina-S-lactato, R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H (compuesto 75); R1 es H, R2 es CH3, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es CH3, R5 es Boc, R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H (compuesto 74); R1 es H, R2 es CH3, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es CH3, R5 es H,
R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H; R1 es CH3, R2 es CH3, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es CH3, R5 es (N-metil-R-leucina)-S-prolina-S-lactato, R6 es una cadena lateral de valina, X es O, y Y es H (compuesto 150); R es CH3, R2 es CH3, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es CH3) R5 es
Boc, R6 es una cadena lateral de valina, X es 0, y Y es H (compuesto 85); R1 es CH3, R2 es CH3, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es CH3, R5 es H, R6 es una cadena lateral de valina, X es 0, y Y es H; R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 2-naftilmetilo, R4 es CH3, R5 es (N-metil-R-leucina)-S-prolina-S-lactato, R6 es una cadena lateral de valina, X es 0, y Y es H (compuesto 93); R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 2-naftilmetilo, R4 es CH3, R5 es Boc, R6 es una cadena lateral de valina, X
es O, y Y es H (compuesto 92); R y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 2-naftilmet¡lo, R4 es CH3, R5 es H, R6 es una cadena lateral de valina, X es 0, y Y es H; R y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es CH3, R5 es (N-metil-R-leucina)-S-prolina-S-lactato, R6 es una cadena lateral de valina, X es NH, y Y es H; R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es CH3, R5 es H, R6 es una cadena lateral de valina, X es NH, y Y es H; y R1 y R2 junto con el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R3 es 4-metoxibencilo, R4 es CH3, R5 es Boc, R6 es una cadena lateral de valina, X es NH, y Y esH; y sales farmacéuticamente aceptables de los mismos.
Métodos de preparación de compuestos Un aspecto adicional de la presente invención es un método de síntesis de un compuesto de conformidad con las fórmulas I, IA o II. El compuesto de la fórmula I, IA o II se puede sintetizar de conformidad con el método general delineado en los siguientes esquemas y descripciones. Ejemplos específicos no limitantes de la síntesis se proveen en la sección de ejemplos más adelante. En referencia a los métodos para hacer los análogos y
fragmentos que aquí se describen, los sustituyentes R , R2, R3, R4, R5, R6, W, X, Y, y Z tienen los mismos significados como se usaron anteriormente. Como se usa en la presente descripción, una reacción de protección se puede incluir cualquier reacción por la cual una o más porciones químicas son covalentemente (pero reversiblemente) unidas a una de un átomo de nitrógeno, un átomo de oxígeno, y un átomo de azufre de una molécula. Dicha unión evita que el átomo o átomos participen en reacciones químicas no deseadas, es decir, se unan covalentemente a otras porciones químicas, y donen o acepten cualesquiera de protones y electrones a otras porciones químicas. Una porción química así unida es referida como "un grupo de protección". A manera de ejemplo, el átomo de nitrógeno de un compuesto tal como D-valina, puede ser protegido usando un reactivo tal como carbobenciloxi-succinimida (CBZ-succinimida). El uso de este reactivo en un protocolo estándar da una D-valina protegido, es decir, D-N-Cbz-valina. En este compuesto, la porción CBZ actúa como un grupo protector de amina, y el átomo de nitrógeno al cual está unido no puede pasar fácilmente por reacciones químicas adicionales. Como un ejemplo alternativo, la porción hidroxilo del compuesto 11 puede ser protegida usando un reactivo tal como triflato de triisopropilsililo (TIPSOTf) para dar el compuesto 13 (ejemplo 1). En este compuesto, Y es una porción triisopropilsililo (TIPS) y actúa como un grupo protector de hidroxilo, evitando reacciones químicas con el átomo de oxígeno al cual está unida esta porción. Los protocolos para realizar reacciones de protección e
información completa acerca de las porciones químicas que se pueden usar como grupos protectores se conoce en la técnica y se encuentra en referencias tales como Green and Wuts (1991, Protective Groups in Organic Synthesis, Wiley, New York) o Bodansky (1993, Principies of Peptide Synthesis, Springer, Berlín). Ciertos análogos y fragmentos de tamandarín de la invención se pueden hacer mediante la vía de síntesis mostrada en los esquemas 1 y 2.
ESQUEMA 2
XIV
En el procedimiento mostrado, un compuesto que tiene la estructura de la fórmula IV es convertido a un compuesto que tiene la estructura de la fórmula V. Dicha serie de reacciones puede incluir, pero no se limita a, una reacción de protección, una reacción de activación, una reacción de esterificación, y una reacción de hidrólisis de éster. El grupo amina de la fórmula IV es preferiblemente protegido antes de realizar las reacciones de esterificación e hidrólisis. Un ejemplo específico para hacer un compuesto que tiene la estructura de la fórmula V se da en el ejemplo 1. "APG" se refiere a un
grupo protector de amina, tal como, pero sin limitarse a, porción carbobenciloxi (CBZ) o porción íer-butiloxicarbonilo (BOC). Los grupos protectores de amina alternativos también se pueden usar, como se describe aquí y en la técnica. Un ejemplo de una reacción de activación incluida en el método para hacer un compuesto que tiene la estructura de la fórmula V se ilustra en el ejemplo 1. El paso de activación puede implicar un reactivo tal como pentafluorofenol (PFPOH). Reacciones de esterificación que o requieren un intermediario activado también se pueden utilizar para hacer un compuesto que tenga la estructura de la fórmula V. Cualquier método de hidrólisis de éster conocido en la técnica que no comprende condiciones inhóspitas que favorecen la racemización se puede usar para hacer un compuesto que tenga la estructura de la fórmula V. A manera de ejemplo, un compuesto que tiene la estructura de la fórmula V en donde el grupo carboxi es esterificado para formar el éster alquílico, v.gr., éster metílico, puede ser hidrolizado usando una base fuerte en una mezcla de solvente. Los reactivos y condiciones adecuados para hidrólisis de éster bajo condiciones más ligeras (es decir, incluyendo condiciones que no favorecen la racemización) puede ser fácilmente seleccionados por un experto en la técnica. Un compuesto que tiene la estructura de la vórmula VI puede ser esterificado, por ejemplo, con bromuro de alilo (v.gr., como se describe en el ejemplo 1), para producir un compuesto que tenga la estructura de la fórmula
VII. Un compuesto que tiene la estructura de la fórmula V y un compuesto que tiene la estructura de la fórmula VII pueden ser acoplados (v.gr., esterificado) para producir un compuesto que tiene la estructura de la fórmula VIII (v.gr., paso 3 del esquema 1). Opcionalmente, dicha reacción se puede realizar usando un catalizador, un reactivo de acoplamiento, o un reactivo de esterificación. Los reactivos y condiciones útiles para este tipo de reacción se conocen en la técnica y se ilustran en el ejemplo 1. Los fragmentos de tamandarín que tienen la estructura de la fórmula VIII presentan una o más de las actividades farmacológicas que aquí se describen. Un compuesto que tiene la estructura de la fórmula VIII puede ser hidrolizado para dar un compuesto que tenga la estructura de la fórmula IX. Como se describe aquí en otra parte, las condiciones de reacción y los reactivos adecuados para hidrólisis de éster se conocen en la técnica, y pueden ser aplicados realmente por un experto en la técnica. Un ejemplo de este tipo de hidrólisis se ilustran en el ejemplo 1. Los fragmentos de tamandarín que tienen la estructura de la fórmula IX presentan una o más de las actividades farmacológicas que aquí se describen. El grupo carboxilo de un compuesto que tiene la estructura de la fórmula IX se puede activar para producir un compuesto que tenga la estructura de la fórmula X.
En la fórmula X, "ACT" se refiere a un grupo de activación, tal como una porción pentafluorofenilo (PFP). Otro ejemplo de un grupo de activación es una porción A/-hidroxisuccinimida. La activación química se puede realizar usando reactivos tales como un reactivo de activación, un catalizador, un donador de grupo de activación o similar. A manera de ejemplo, el compuesto 8, ilustrado en el ejemplo 2, es activado por unión covalente de un grupo PFP para dar el compuesto 18. Los protocolos para activar un compuesto de la manera que aquí se describe son conocidos en la técnica. Los fragmentos de tamandarín que tienen la estructura de la fórmula X presentan una o más de las actividades farmacológicas que aquí se describen. El compuesto activado que tiene la estructura de la fórmula X se puede acoplar con un tercer reactivo que tiene la estructura de la fórmula XI para dar un compuesto que tiene la estructura de la fórmula XII. En las fórmulas XI y XII, SEM se refiere a 2-(trimetilsilil)etoxicarbonilo. Un ejemplo de esta reacción se ilustra en el ejemplo 1 , en el cual el compuesto 24 se acopla con el compuesto 18 para producir el compuesto 25. Los reactivos y condiciones necesarias para la preparación de péptido protegido tal como el compuesto 18 se describe, por ejemplo, en Li et ai, J. Am. Chem. Soc. 112: 7659-7672 (1990). Los análogos de tamandarín que tiene la estructura de la fórmula XII presentan una o más de las actividades farmacológicas que aquí se describen. Un -análogo de tamandarín que tiene una o más de las
actividades farmacológicas que aquí se describen se pueden hacer removiendo uno de los grupos protectores de amino y el grupo protector de carbonil hidroxilo de un compuesto que tiene la estructura de la fórmula XIII y ciclizando el compuesto para producir un compuesto que tiene la estructura de la fórmula XIII. Este procedimiento se muestra en el paso 7 del esquema 2. Un ejemplo de reacciones de este tipo se muestran en el ejemplo 1. La desprotección química de un compuesto tal como uno que tiene la estructura de la fórmula XII se puede lograr haciendo reaccionar el compuesto con uno o más reactivos para remover un grupo protector del compuesto. Las reacciones de desprotección ilustrativas se describen aquí. Otros protocolos para desproteger un compuesto se conocen en la técnica, y pueden ser fácilmente aplicados por un experto en la técnica para la desprotección de un compuesto que tiene la estructura de la fórmula XII. La ciclización de un compuesto desprotegido que de otra manera tiene la estructura de la fórmula XII se puede lograr usando métodos conocidos en la técnica para macrociclización de péptidos. Por ejemplo, las condiciones de macrociclización pueden ser similares o idénticas a aquellas usadas en la ciclización que produce el compuesto 34, descrito en el ejemplo 2. Los análogos de tamandarín que tienen la estructura de la fórmula XII presentan una o más de las actividades terapéuticas que aquí se describen. Uno o más de los grupos protectores de un compuesto que tiene la estructura de la fórmula XIII pueden ser removidos para dar un compuesto que tiene la estructura de la fórmula XIV. Esta desprotección se muestra en el
paso 8 del esquema 2. Los análogos de tamandarín que tienen la estructura de la fórmula XIV presentan una o más de las actividades terapéuticas que aquí se describen. Otro compuesto activo más se puede hacer acoplando un compuesto que tiene la estructura de la fórmula XIV y un reactivo que tiene la porción de R5. Esta reacción se ilustra en los ejemplos 1-4. El grupo sustituyente de R5 puede comprender una porción digerible por enzima, preferiblemente en o cerca del extremo digital de la misma (en relación con el macrociclo). Dicha porción puede ser digerible por una enzima, por ejemplo, una carboxipeptidasa, una ß-lactamasa, una ß-galactosidasa, una penicilina V-amidasa, una citosina desaminasa, una nitroreductasa, una fosfatasa alcalina, una ß-glucuronidasa y un anticuerpo cata iitico. Un ejemplo de una porción R5 que comprende una porción digerible por enzima es -(/V-metil)leucina-(S)-prolina-(S)-lactato-(S)-glutam¡na-(S)-piroglutamato. Otros ejemplos de porciones digeribles por enzima se describen aquí. Otros reactivos adecuados incluyen aquellos que tienen grupos R5 específicos mostrados anteriormente en donde la valencia abierta es reemplazada por un grupo funcional, v.gr., OH, de tal manera que la porción contiene un grupo fucional, v.gr., COOH, adecuado para acoplarse con la amina del macrociclo. Otros análogos y fragmentos de tamandarín de la invención se pueden hacer por la vía de síntesis mostrada en el esquema 3.
ESQUEMA 3
En el esquema 3, un compuesto de la fórmula XV se hace reaccionar con un compuesto de la fórmula XVI para formar un compuesto de la fórmula XVII. El paso 10 se puede realizar usando condiciones de esterificación adecuados para formar el compuesto de la fórmula XVII. El compuesto de la fórmula XVII es después condensado con un compuesto de la fórmula XVIII para formar un compuesto de la fórmula XIX. El compuesto de la fórmula XIX se hace reaccionar después para formar el macrociclo de la fórmula XIII. El paso 12 comprende la desprotección de los grupos amina y carboxilato, y además comprende la reacción de macrociclización. El
macrociclo de la fórmula XIII es desprotegido (en donde R5 es H) y después se hace reaccionar con una porción adecuada para formar un compuesto de conformidad con la fórmula I. Cabe notar que un compuesto de la fórmula XIII está dentro del alcance de la fórmula I. Cuando X es NH, de tal manera que el enlace de éster es reemplazado por un enlace de amida, el fragmento de amida que contiene R3, R4, y R5 se puede preparar como se muestra en el esquema 4.
ESQUEMA 4
O YNH-APG ° O LX XXTX XXX. En el esquema 4, un compuesto de la fórmula XX se hace reaccionar primero con un grupo protector de amina adecuado para formar un compuesto de la fórmula XXI. Por ejemplo, la reacción 14 puede usar (Boc)20 y NaOH en dioxano. Un compuesto de la fórmula XXI es después esterificado para formar un éster adecuado de la fórmula XXII. Un éster adecuado incluye
un éster alquílico, tal como un éster metílico. El éster se puede formar haciendo reaccionar el compuesto de la fórmula XXI con un halogenuro de alquilo, tal como yoduro de metilo, y una base adecuada, tal como KHC03. El éster se reduce después para formar un alcohol de la fórmula XXIII. La reducción se puede llevar a cabo usando condiciones y reactivos estándares, tales como NaBH4. El compuesto de la fórmula XXIII es después convertido a un compuesto de la fórmula XXIV, en donde PG es un grupo protector adecuado, tal como íer-butildimetilsililo, trimetilsililo, o triisopropilsililo, y LG es un grupo residual apropiado, tal como un grupo mesilo o tisilo. Preferiblemente, comprende dos pasos, en donde el primer paso es proteger el alcohol primario y el segundo paso es convertir en alcohol secundario a un grupo residual adecuado. El compuesto de la fórmula XXIV se hace reaccionar con un compuesto de azida, tal como NaN3, para formar un compuesto de la fórmula XXV. El compuesto de la fórmula XXV es después reducido bajo condiciones adecuadas, v.gr., H2 y Pd sobre carbón en etanol, para dar una amina de la fórmula XXVI. La condenzación de la amina de la fórmula XXVI con un ácido de la fórmula XXVII bajo condiciones adecuadas una amida de la fórmula XXVIII. La formación del enlace de amida puede ser catalizada con un reactivo(s) de acoplamiento adecuado, por ejemplo, DCC, HOBt, y NMM. La amida de la fórmula XXVIII es después desprotegida para dar un alcohol de la fórmula XXIX, que es oxidado para formar el ácido de la fórmula XXX. Los reactivos y condiciones adecuados para realizar los pasos 20 y 21 son bien conocidos en la técnica. El compuesto de la fórmula XXX
después se usa en lugar del compuesto de la fórmula XVIII mostrado en el esquema 3 para preparar un compuesto de conformidad con la fórmula IA en donde X es NH. Un compuesto de conformidad con la fórmula I se prepara usando un método análogo al usado para preparar los compuestos de la fórmula IA que aquí se describe. Cuando Z es C(0)-CH(CH3)-C(0) y X es O o NH, una porción HIP-isostatina adecuada se puede usar en lugar de un compuesto de la fórmula X en el esquema 1. Las porciones HIP-isostatina adecuadas son conocidas. Véase, v.gr., Pfizenmeyer et al., Bioorg. Med. Chem. Lett. 8:3653-3656 (1998). La variación de los sustituyentes de los análogos y fragmentos de tamandarín pueden requerir ligeras modificaciones en los métodos generales que aquí se describen. Cabe entender que la invención incluye dichas modificaciones, por lo que podrían ser fácilmente diseñadas por un experto en la técnica química sintética. Los espectros de 1H-RMN, 3C-RMN, IR, y EM se registraron de conformidad con los procedimientos estándares. Los picos significativos se tabulan en el orden: número de protones, multiplicidad (s, singuleto; d, doblete; t, triplete; q, cuadriplete; m, multiplete; brs, singulete de banda ancha) y constante(s) de acoplamiento en Hertz.
EJEMPLOS EJEMPLO 1 Síntesis total de tamandarin B
ESQUEMA 5
[ O i O FFFGQ2GF3 o
"ÑH2 ?¾°3 ÑHZ CH2CI2 RHZ Me0^
9 95% 92% 10
TIPSTf 2,6-lutidina
GHgGb 11 S9 12
14
ESQUEMA 6
99% 35%
ESQUEMA 8
Ester pentafluorofenílico de D-N-Cbz-Valina (PFP) (10): D-/V-Cbz-Valina (9.8 g, 39.0 mmoles) se disolvió en CH2CI2 (100 mi) y se enfrió a 0°C, seguido por la adición de piridina (3.4 mi, 42.9 mmoles) y trifluoroacetato de PFP (4.08 mi, 46.8 mmoles). La solución se agitó 1 hora a temperatura
ambiente y se extinguió con NH4CI (50 mi, saturado). La capa orgánica se lavó con HCI al 5% (100 mi), NaHC03 (100 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró y el solvente se evaporó. El éster de PFP resultante 10 se obtuvo como un aceite incoloro (15.8 g, 92%) y se usó directamente en el siguiente paso. Este compuesto mostró 1H-RMN idéntico como el reportado en la referencia 23. 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 1.01 (d, J = 6.9 Hz, 3H), 1.08 (d, J = 6.9 Hz, 3H) 2.33-2.41 (m, 1H), 4.63-4.70 (m, 1H), 5.15 (s, 2H), 5.22 (d, J = 7.8 Hz, 1H), 7.30-7.41 (m, 5H). Ester metílico de ácido (4R)-4-benciloxicarbonilamino-5-met¡I-3-oxo-hexanoico (11): A una solución de éster de PFP 10 (6 g, 14.4 mmoles) en THF anhidro (30 mi), enfriada a -78°C, se añadió una solución de enolato de litio de acetato de metilo. El enolato se preparó por la adición de acetato de metilo (4.12 mi, 50.3 mmoles) a una solución de LDA (51.8 mmoles en 50 mi de THF anhidro) a -78°C y la solución resultante se agitó durante 1 hora. La mezcla de reacción se agitó durante 45 minutos más a la misma temperatura, y se extinguió con NH4CI (50 mi) a -78°C. Después de calentar a temperatura ambiente, la solución se diluyó con EtOAc (ml). La capa orgánica se separó y se lavó con HCI al 10% (100 ml), NaHC03 al 5% (100 ml) y NaCI (100 ml, saturado), se secó (Na2S04), se filtró y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 1/9) para dar el éster metílico 11 (2.8 g, 64%) como aceite incoloro. 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.80 (d, J = 6.8 Hz, 3H), 1.01 (d, J =
6.8 Hz, 3H), 2.20-2.29 (m, 1 H), 3.51 (d, J = 11.8 Hz), 3.55 (d, J = 17.7 Hz), 3.70 (s, 3H), 4.41 (q, J = 4.4 Hz, 1H), 5.09 (s, 2H), 5.32 (d, J = 12.0 Hz, 1 H), 7.29-7.39 (m, 5H). Ester metílico de ácido (3S,4R)-4-benciloxicarbonilamino-3-hidroxi-5-metilhexanoico (12): A una solución de éster metílico 11 (2.8 g, 9.15 mmoles) en CLAR MeOH (30 mi), enfriada a -78°C, se añadió borhidruro de potasio en porciones (1.72 g, 32 mmoles). La mezcla de reacción se agitó a -78°C durante 10 minutos, se calentó a -20°C durante 30 minutos y después a 0°C durante 10 minutos. La reacción se extinguió con ácido acético a pH 7 y se extrajo con CH2CI2 (3 x 50 mi). La capa orgánica se lavó con NaHC03 (50 mi, saturado), NaCI (50 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró y se evaporó. El alcohol 12 se obtuvo como un aceite incoloro (2.7 g, 98%) y se usó directamente en el siguiente paso. 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.87 (d, J = 6.7 Hz, 3H), 0.94 (d, J = 6.7 Hz, 3H), 2.10-2.19 (m, 1H), 2.47 (dd, J = 16.7 y 9.1 Hz), 2.58 (dd, J = 16.7 y 2.9 Hz, 1H), 3.11- 3.20 (m, 1H), 3.56-3.63 (m, 1H), 3.68 (s, 3H), 3.90-3.98 (m, 1H), 4.64 (d, J, = 7.9 Hz, 1 H), 5.09 (s, 2H), 7.30-7.39 (m, 5H). Ester metílico de ácido (3S,4/?)-4-benc¡loxicarbonilamino-5-metil-3-(triisopropil-silaniloxi)hexano¡co (13): A una solución del alcohol crudo 12 (2.7 g, 9.1 mmoles) en CH2CI2 (10 mi) bajo argón, enfriada a 0°C, se añadieron 2,6-lutidina (2.6 mi, 22.7mmol) y triflato de triisopropilsililo (3.6 mi, 13.6 mmoles). La mezcla de reacción se agitó a 0°C durante 30 minutos y después a temperatura ambiente durante 2 horas y se diluyó con CH2CI2 (25
mf). La capa orgánica se separó y se lavó con HCI al 10% (50 mi), NaHC03 (50 mi, saturado) y NaCI (50 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, éter dietílico/hexanos 2:98 a 15:85) para dar 13 (2.9 g, 70%) como aceite incoloro. 1H-R N (500 MHz, CDCl3): 0.88 (d, J = 6.8 Hz, 3H), 0.92 (d, J = 6.7 Hz, 3H), 1.01- 1.07 (m, 21H), 1.97-2.04 (m, 1H), 2.53 (dd, J = 15.3 y 4.7 Hz, 1H), 2.60 (dd, J = 15.2 y 7.5 Hz, 1H), 3.57 (s, 3H), 3.59-3.65 (m, 1H), 4.34-4.40 (m, 1H), 4.78 (d, J = 10.3 Hz, 1H), 5.06-5.09 (m, 2H), 7.27-7.35 (m, 5H). Acido (3S,4f?)-4-benciloxicarboniíamino-5-metil-3-(triisopropil-silaniloxi)hexanoico (14): A una solución de 13 (2.2 g, 4.7 mmoles) en 50 mi de THF/MeOH (1:1), enfriada a 0°C, se añadió solución de NaOH 1N (55 mi, 32 mmoles). La reacción se agitó a 0°C durante 2 horas y después durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de reacción se concentró y se diluyó con H20 (20 mi), se enfrió a 0 °C, se acidificó a pH 2 con solución de KHS04 1N y se extrajo con EtOAc (3x 20 mi). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con NaCI (50 mi, saturado), se secaron ( a2S04), se filtraron y se evaporaron. El ácido resultante 14 se obtuvo como un aceite incoloro ( .76 g, 86%) y se usó directamente en el siguiente paso. 1H-R N (500 MHz, CDCI3): 0.86 (m, 3H), 0.95 (d, J = 6.7 Hz,
3H), 1.04-1.14 (m, 21H), 1.90-2.00 (m, 1H), 2.52-2.72 (m, 2H), 3.60-3.62 (m, H), 4.28-4.36 (m, 1H), 5.02 (d, J = 10.4 Hz, 1 H), 5.07-5.13 (m, 3H), 7.25-7.35 (m, 5H).
Ester alílico de ácido (2S)-{1-(2S,3R)-[3-benciloxicarbonilamino-2-(tri¡sopropil-silaniloxi)hexil]vin¡lox¡}-3-met¡lbutírico (16): A una solución del ácido 14 (1.76 g, 3.89 mmoles) en CH2CI2 (20 mi), enfriado a 0°C, se añadieron secuencialmente éster alílico de ácido a-hidroxiisovalérico 15 (615 mg, 3.89 mmoles), EDAC HCI (820 mg, 4.20 mmoles) y DMAP (94 mg, 0.77 mmoles). La mezcla de reacción se agitó a 0°C durante 1 hora y después durante la noche a temperatura ambiente. La reacción se diluyó con CH2CI2 y la capa orgánica se lavó con HCI al 10% (50 mi), NaHC03 (50 mi, saturado) y NaCI (50 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 9:1) para dar el éster alílico 16 (1.2 g, 52%) como aceite incoloro. 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.88-0.99 (m, 12H), 1.00-1.10 (m, 21H), 1.96-2.05 (m, 1H), 2.17-2.25 (m, 1H), 2.65 (dd, J = 15.8 y 5.3 Hz, 1H), 2.71 (dd, J = 15.8 y 7.3 Hz, 1 H), 3.62-3.72 (m, 1H), 4.40-4.45 (m, 1 H), 4.57-4.63 (m, 2H), 4.79 (d, J = 4.8 Hz, 1H), 4.88 (d, J = 10.6 Hz, 1 H), 5.07 (s, 2H), 5.20-5.23 (m, 1H), 5.28-5.32 (m, 1H), 5.83-5.91 (m, 1H), 7.26-7.38 (m, 5H). Ester pentafluorofenílíco de ácido (2S)-{1-(2S,3R)-[3-benciloxicarbonilamino-2-(triisopropil-silaniloxi)hexil]vinilox¡}-3-metilbutírico (18): A una solución de éster alílico 16 (1.2 g, 2.02 mmoles) en THF seco (15 mi) se añadieron Pd(Ph3)4 (231 mg, 0.20 mmoles) y morfolina (1.7 mi, 20 mmoles) a temperatura ambiente. La mezcla se agitó durante la noche y la mezcla de reacción se concentró, se diluyó con CH2CI2 (20 mi) y se lavó con HCI 1N (20 mi) y H20 (20 mi). La capa orgánica se secó (Na2S04) se filtró y se
concentró para dar el ácido 17. El residuo se disolvió en CH2CI2 (5 mi), se enfrió a 0°C, seguido por la adición secuencial de PFPOH (384 mg, 2.09 mmoles), EDAC.HCI (45 mg, 72.38 mmoles) y DMAP (49 mg, 0.39 mmoles). La mezcla de reacción se agitó a 0°C durante 1/2 hora y después 4 horas a temperatura ambiente. La reacción se diluyó con CH2CI2 y la capa orgánica se lavó con 10% de HCI (50 mi), 5% de NaHCO3 (50 mi) y NaCI (50 mi, saturado), se secó (Na2SO ), se filtró y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 9/1) para dar éster pentafluorofenílico 18 (0.71 g, 50% dos pasos en total) como un aceite incoloro. 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.89 (d, J = 7.0 Hz, 3H), 0.92 (d, J = 7.0 Hz, 3H), 1.02-1.06 (m, 21 H), 1.06-1.1 1 (m, 6H), 2.00-2.08 (m, 1 H), 2.31-2.40 (m, 1 H), 2.60-268 (dd, J = 15.8 y 4.8 Hz, 1 H), 2.77 (dd, J = 15.8 y 7.9 Hz, 1 H), 3.63-3.70 (m, 1 H), 4.40-4.45 (m, 1 H), 4.79 9d, J = 10.3Hz, 1 H), 4.98-5.03 (m, 2H), 5.04-5.08 9m, 1 H), 7.26-7.34 (m, 5H). Ester metílico de L-Cbz-A/-Leucil-L-prolina (19): A una solución de L-Cbz-leucina (902 mg, 3.40 mmoles) y clorhidrato de éster metílico de L-prolina (563 mg, 3.40 mmoles) en CH2CI2 seco (10 mi), enfriado a 0°C, se añadieron diciclohexilcarbodiimida (DCC) (912 mg, 4.42 mmoles), 1-hidroxibenzotriazol (HOBt) (551 mg, 4.08 mmoles) y N-metilmorfolina (NMM) (2.6 mi, 13.6 mmoles). Después de 1 hora, la reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante la noche. La mezcla se diluyó con éter (10 mi) y se filtró. El filtrado se diluyó con EtOAc (25 mi) y se lavó con
soluciones de 10% de HCI (100 mi), NaHC03 (100 mi, saturado) y NaCI (100 mi, saturado). La capa orgánica se secó (Na2S04) y el solvente se evaporó. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 2/8) para dar éster metílico L-Cbz-A/-Ieucil-L-prolina (1.24 g, 98%) como espuma blanca. 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.94 (d, J=6.6 Hz, 3H), 0.99 (d, J=6.5 Hz, 3H), 1.50-1.65 (d, J=6.5 Hz, 2H), 1.73-1.79 (m, 1H), 1.94-2.22 (m, 4H), 3.57-3.78 (m, 2H), 3.70 (s, 3H), 4.50-4.55 (m, 2H), 5.03-5.09 (m, 2H), 5.33 (d, J= 8.8 Hz, 2H), 7.28- 7.34 (m, 15H). L-Cbz-/V-Leucil-L-prolina (20): A una solución de éster dipeptídico 19 (887 mg, 2.36 mmoles) en THF (20 mi), enfriada a 0°C, se añadió gota a gota una solución de LiOH (198 mg, 4.72 mmoles) en agua (20 mi). La reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante la noche. La solución resultante se concentró bajo presión reducida y se extrajo con éter. La capa acuosa se acidificó a pH 2 con HCI al 50% y se extrajo con EtOAc (3x20 mi). La capa orgánica se secó (Na2S04) y el solvente se evaporó para dar L-Cbz-A/-Leucil-L-prolina 20 (774 mg, 90%) como una espuma blanca. Este compuesto mostró H-RMN idéntico como el reportado en la referencia 24. H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.92 (d, J=6.5 Hz, 3H), 0.96 (d, J=6.5
Hz, 3H), 1.43-1.58 (m, 2H), 1.71-1.76 (m, 1H), 1.99-2.23 (m, 4H), 3.55-3.58 (m, 1 H), 3.75-3.78 (m, 1H), 4.51-4.58 (m, 2H), 5.03-5.09 (m, 2H), 7.28-7.34 (m, 15H).
L-Cbz-/V-0-dimet¡ltirosina (21): A una solución agitada de L-Cbz-Tyr (5.0 g, 15.8 mmoles) en THF (84 mi), a 0°C, KOH en polvo fino (8.86 g, 158 moles) se añadió en porciones, seguido por la adición de sulfato ácido de tetrabutilamonio (0.5 g, 10% en peso). Después, sulfato de dimetilo (9.74 mi, 103 mmoles) se añadió gota a gota durante 15 minutos. La reacción se agitó durante 30 minutos adicionales y se añadió H20 (50 mi). Después de agitarse 5 horas a temperatura ambiente, se añadió solución de hidróxido de amonio acuoso al 20% (20 mi). La reacción se diluyó con éter (100 mi), la capa acuosa se separó y la capa orgánica se extrajo con NaHC03 acuoso saturado (2 x 40 mi). Las capas acuosas combinadas se acidificaron a pH 1 con KHS04 1M y se extrajo con EtOAc (2 x 200 mi). Las capas orgánicas se combinaron, se secaron (Na2S04), se filtraron y se concentraron. El ácido resultante 21 (4.3 g, 85%) se obtuvo como un aceite amarillo y se usó en el siguiente paso sin purificación. 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 2.78 y 2.84 (s, 3H), 2.92-3.06 (m,
1H), 3.21- 3.30 (m, 1 H), 3.76 (s, 3H), 4.80-4.90 (m, 1 H), 5.00-5.10 (m, 2H), 6.65-6.79 (m, 2H), 7.00-7.09 (m, 2H), 7.24-7.33 (m, 5H). Ester de L-Cbz-W, O-dimetiltirosina-O-L-W-Boc-treonina-SEM: A una solución de L-Cbz-N-O-dimetiltirosina (21) (188 mg, 0.54 mmoles) en CH2CI2 (2 mi), enfriada a 0 °C, se añadió Boc-Thr-O-SEM (100 mg, 0.45 mmoles). A la solución resultante se añadieron Et3N (165 µ?, 1.18 mmoles), DMAP (14 mg, 0.11 mmoles) y cloroformiato de isopropenilo (60 µ?, 0.54 mmoles). La reacción se agitó a 0°C durante 1 hora, se diluyó con Et20 (10
mi) y se lavó con soluciones de HCI al 10% (10 mi), NaHC03 al 5% (10 mi) y NaCI saturado (10 mi). La capa orgánica se secó (Na2S04) y el solvente se evaporó. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 10:1) para dar el dipéptido 22 (131 mg, 43%). 1H-RMN (200 MHz, CDCI3): 0.01 (m, 9H), 0.92-0.96 (m, 2H),
1.23-1.29 (m, 3H), 1.44 y 1.43 (s, 9H), 2.72 y 2,79 (s, 3H), 2,81-2.98 y 3.17-3.21 (m, 2H), 3.67-3.72 (m, 2H), 3.76 (s, 3H), 4.20-4.50 (m, 2H), 4.60-4.78 (m, 1H), 5.03-5.11 (m, 2H), 5.25-5.43 (m, 2H), 6.74-6.78 (m, 2H), 6.97-7.06 (m, 2H), 7.22-7.33 (m, 5H). L-/V, 0-DimetiItirosina-O-L-Boc-treonina-OSEM (22): A una solución de L-Cbz-W-metilfenilalanina-O-Boc-treonina-OSEM (231 mg. 0.34 mmoles) en MeOH bajo argón, se añadió Pd(OH)2 (23 mg). La reacción se purgó con H2 y se agitó durante la noche bajo una atmósfera de hidrógeno (1 atm). La mezcla se filtró a través de Celite®. El filtrado se concentró para dar el compuesto 22 (174 mg, 94%) como un aceite amarillo. 1H-R N (500 MHz, CDCI3): 0.0 (s, 9H), 0.91 (t, J= 8.2, 2H), 1.23 y 1 ,25 (d, J= 5.6 Hz, 3H), 1.41 (s, 9H), 2.31 (s, 3H), 2,79 (s, 3H), 2.82 y 2.83 (dd, J= 14.3 y 6.4 Hz), 3.45 (t, J=6.1 Hz, H), 3.64-3.67 (m, 2H), 4.48 y 5.23 (d, J=9.7 Hz), 5.02 (d, J=5.2 Hz, 2H), 6.75-6.78 (m, 2H), 6.92-7.05 (m, 2H). L-Cbz-Leucil-L-prolil-L-/V,0-Dimetilt¡rosina-0-L-Boc-treon¡na-0-SE (23): A una solución de L-Cbz-Leu-L-Pro-OH (98.4 mg, 0.27 mmoles) en CH2CI2 (2 mi), enfriada a -15°C, se añadió BOP-CI (69 mg, 0.27 mmoles), seguido poa la adición gota a gota de NMM (30, µ?, 0.27 mmoles). Una
solución separada de L-/V,0-dimet¡lt¡ros¡na-0-L-Boc-treon¡na-0-SEM (147 mg, 0.27 mmoles) en CH2CI2 (2 mi) se enfrió a -15°C y se añadió a la reacción seguido por la adición de /V-metilmorfolina (NMM) (30 µ?, 0.54 mmoles). La mezcla se agitó 15 minutos a -15°C, 1 hora a 0°C y durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de reacción se diluyó con EtOAc (15 mi) y se lavó con HCI al 10% (10 mi), NaHC03 (10 mi, saturado) y NaCI (10 mi, saturado). La capa orgánica se secó (Na2S04) y el solvente se evaporó. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 3/7) para dar el tetrapéptido 23 (130 g, 55%) como aceite amarillo pálido. 1 H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.00 (s, 9H), 0.67-0.87 (m, 2H), 0.89-1.00 (m, 6H), 1.19-1.21 (d, J= 6.8 Hz), 1.36 (d, J= 6.8 Hz, 3H), 1.46 (s, 9H), 1.54-1.99 (m, 7H), 2.72 (s), 2.73 (s, 3H), 2.91-3.00 (m, 1 H), 3.05-3.15 (m), 3.50-3.55 (m, 1 H), 3.66- 3.89 (m, 4H), 3.75 (s, 3H), 4.25-4.33 (m, 1 H), 4.41-4.61 (m, 2H), 4.67-4.68 (m, 1 H), 4.62-4.75 (m, 1 H), 4.95-5.01 (dd, J = 8.5 y 3.2 Hz), 5.01-5.17 (m, 2H), 5.27-5.62 (m, 3H), 7.16-7.42 (m, 10H), 7.81 (m, 1 H), 8.00 (m). L-Leucil-L-prolil-L-A/,0-D¡metiltirosina-L-/V-Boc-treonina-0-SEM (24): A una solución de L-Cbz-Leucil-L-prolil-L-/V-metilfenilalanina-0-L-Boc-treonina-OSEM (665 mg, 0.74 mmoles) en MeOH (10 mi) bajo argón, se añadió Pd(OH)2 (1 19 mg). La reacción se purgó con hfe y se agitó durante la noche bajo atmósfera de H2 (1 atm). La mezcla se filtró a través de Celite. El filtrado se concentró para dar el tetrapéptido de amino libre 24 (547 mg, 94%)
como un aceite incoloro que se usó en el siguiente paso sin purificación adicional. 1 H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.001 (s, 9H), 0.64-0.86 (m, 2H), 0.88-0.96 (m, 6H), 1.19-1.21 (d, J= 6.3 Hz), 1.33-1.34 (d, J= 6.3 Hz, 3H), 1.44 (s, 9H), 1.63-1.92 (m, 3H), 1.92-2.01 y 2.08-2.24 (m, 4H), 2.73 (s), 2.86-2.96 y 3.10-3.19 (m, 2H), 3.45-3.72 (m, 4H), 4.34-4.69 (m, 3H), 4.78-4.81 (dd, J= 8.0 y 3.3 Hz, 1 H), 5.01-5.10 (m, 1 H), 5.17-5.52 (m) y 5.58-7.60 (m, 3H) 6.77-6.83 (m, 2H), 7.00-7.10 (m, 2H) Precursor lineal protegido de Tamandarin B (25): A una solución del éster de PFP 18 (285 mg, 0.39 mmoles) en CH2CI2 (1.5 mi), enfriada a 0°C, se añadió DIEA (170 µ?, 0.98 mmoles) y la solución se agitó durante 20 minutos, seguido por la adición de la amina 24 (292 mg, 0.39 mmoles) en CH2CI2 (1.5 mi) y D AP (9.5 mg, 0.078 mmoles). La mezcla de reacción se agitó a 0°C durante 1 hora y después a temperatura ambiente durante 1 hora adicional. La reacción se extinguió con NH4CI (3 mi) y se diluyó con CH2CI2 (10 mi). La capa orgánica se lavó con HCI al 10% (10 mi), NaHC03 al 5% ( 0 mi) y NaCI (10 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 9:1) para dar 25 (285 mg, 57%) como un aceite incoloro. 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.008 (s, 9H), 0.73-0.83 (m, 2H),
0.85-0.92 (m, 9H), 0.92-1.08 (m, 21 H), 1.45 (s, 4H) 9 1.13-2.19 (m, 11 H), 2.43-2.46 (m, H) y 2,54-2.58 (m.1 H), 2.64 (s, 3H), 2.88 (s, 3H), 3.09-3.17 (m, 2H), 3.44-3.73 (m, 4H), 3.75 (s, 3H), 3.79-3.89 (m, 1 H), 4.38-4.55 (m, 4H), 4.69-
4.81 (m, 1H), 4.96-5.05 (m, 3H), 5.18-5.43 (m, 3H), 5.46-5.48 (d, J = 6.0 Hz, 1 H), 6.83 (m, 2H), 6.95-7.11 (m, 2H), 7.25-7.38 (m, 5H), 7.55-7.77 (m) y 8.85-8.87 (m, 2H). Macrocilo protegido de Tamandarin B (26): A una solución del precursor lineal completamente protegido 25 (350 mg, 0.27 mmoles) disuelto en CH2CI2 (5 mi), a 0°C, se añadió MgBr2.Et20 (210 mg, 0.81 mmoles). La reacción se agitó a 0°C durante 2 horas y durante la noche a temperatura ambiente. La reacción se diluyó con CH2CI2 y la capa orgánica se lavó con HCI al 0% (10 mi) y NaCI (10 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró y se concentró. El ácido resultante (319 mg) se obtuvo como una espuma blanca y se usó directamente en el siguiente paso. A una solución de ácido crudo (319 mg) en MeOH (5 mi) bajo argón, se añadió Pd(OH)2 (28 mg). La reacción se purgó con H2 y se agitó durante la noche bajo atmósfera de H2 (1 atm). La mezcla se filtró a través de Celite. El filtrado se concentró para dar el precursor lineal (296 mg) como una espuma blanca que se usó directamente en el siguiente paso. El precursor lineal de aminoácido crudo se disolvió en DMF (27 mi) y se enfrió a 0°C. Se añadió HATU (123 mg, 0.32 mmoles) seguido por la adición gota a gota de DIEA (141 µ?, 0.81 mmoles). La mezcla de reacción se agitó a 0°C durante 1 hora y después durante la noche. La mezcla de reacción se concentró bajo vacío, se diluyó con EtOAc (10 mi) y se lavó con HCI al 10% (10 mi), NaHC03 al 5% (10 mi) y NaCI (10 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 5/1) para dar el
macrociclo protegido 26 (50 mg, 19% tres pasos en total) como espuma blanca. Este compuesto mostró 1 H-RMN idéntico como el reportado en la referencia 23. 1 H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.78-1.07 (m, 39H), 1.21-1.48 (m, 17H), 1.56-1.92 (m, 4H), 1.73-1.81 (m, 1 H), 1.95-2.12 (m, 2H), 2.43-2.44 (m, 1H) y 3.11-3.17 (m, 1H), 2.52 (s, 3H), 2.89-3.00 (m, 1 H), 3.30-3.32 (m, 1H), 3.49-3.52 (m, 1H), 3.60-3.62 (m, 1H), 3.66-3.70 (m, H), 3.77 (s, 3H), 4.14-4.19 (m, 1 H), 4.37-4.43 (m, 1H), 4.46-4.48 (d, J= 7.6 Hz, 1H), 4.55-4.86 (m, 1H), 4.88-4.92 (m, 1H), 6.82-6.83 (d, J= 8.5 Hz, 2H), 7.06-7.07 (d, J= 8.5 Hz, 2H), 7.41-7.48 (m, 2H). Tamandarin B (2): A una solución de macrociclo protegido de Boc 26 (10 mg, 0.01 mmoles) en EtOAc de CLAR se añadió una solución de HCI en EtOAc. La solución resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 horas. La solución se concentró y el residuo se diluyó con CH2CI2 y se concentró nuevamente para dar la salde clorhidrato (rendimiento cuantitativo) como un sólido blanco, que se usó directamente en el siguiente paso. A una mezcla de la sal de amina de macrociclo (9 mg, 0.01 mmoles) y cadena lateral (6.1 mg, 0.015 mmoles) en CH2CI2 (0.50 mi) a 0°C se añadió BOP (8.4 mg, 0.015 mmoles) y NMM (6 µ?, 0.05 mmoles). Después de 30 minutos a 0°C, la reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche. La reacción se trató con Solución de NaCI (2 mi, saturado) y se extrajo con EtOAc (2 x 10 mi) Las capas orgánicas se lavaron con HCI al 10% (5 mi), NaHC03 al 5% (5 mi) y NaCI (5 mi, saturado), se secaron (Na2S04), se filtraron y se concentraron. El
aceite crudo (8 mg, 61%) se purificó por CLAR.
EJEMPLO 2 Síntesis de Phe5 Tamandarin B
Un análogo de fenilalanina de tamandarin B (Phe5 Tamandarin B) se sintetizó de conformidad con el método mostrado en los esquemas 9 y 10.
ESQUEMA 11
L-Cbz-W-Metilfenilalanina (28): A una solución agitada de L-Cbz-Phe (5.1 g, 17.8 mmoles) en THF (90 mi), a 0°C, se añadió en porciones KOH en polvo fino (6.7 g, 0.12 mol), seguido por la adición de sulfato ácido de tetrabutilamonio (0.51 g, 10% en peso). Después, se añadió gota a gota sulfato de dimetilo (6.4 mi, 71.2 mmoles) durante 15 minutos. La reacción se agitó durante 30 minutos adicionales y se añadió H20 (50 mi). Después de agitarse 5 horas a temperatura ambiente, se añadió solución de hidróxido de amonio acuoso al 20% (20 mi). La reacción se diluyó con éter (100 mi), la
capa acuosa se separó y la capa orgánica se extrajo con NaHCC>3 acuoso saturado (2 x 40 mi). Las capas acuosas combinadas se acidificaron a pH 1 con KHSO4 1M y se extrajeron con EtOAc (2 x 200 mi). Las capas orgánicas se combinaron, se secaron (Na2S04), se filtraron y se concentraron. El ácido resultante 28 (4.5 g, 85%) se obtuvo como un aceite amarillo y se usó en el siguiente paso sin purificación. 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 2.71 y 2.78 (s, 3H), 2.94-3.06 (m, 1H), 3.17-3.32 (m, 1H), 4.79-4.89 (m, 2H), 4.95 y 5.03 (s, 2H), 7.04-7.28 (m, 10H). L-Cbz-/V-Metilfenilalanina-0-L-Boc-treonina-OSEM (29): A una solución de Cbz-W-metilfenilalanina (2 g, 6.56 mmoles) en CH2CI2 (40 mi), se enfriada a 0°C, se añadió Boc-Thr-OSEM (2.08 g, 5.96 mmoles). A la solución resultante se añadieron Et3N (1.9 mi, 13 mmoles), DMAP (146 mg, 1.19 mmoles) y cloroformiato de isopropenilo (0.71 mi, 6.56 mmoles). La reacción se agitó a 0o C durante 1 hora, se diluyó con Et2Ü (150 mi) y se lavó con solcuiones de HCI al 10% (50 mi), NaHC03 al 5% (50 mi) y NaCI saturado (50 mi). La capa orgánica se secó ( a2SÜ4) y el solvente se evaporó. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 10:1) para dar el dipéptido 29 (1.79 g, 60%). H-RMN (200 MHz, CDCI3): 0.0 (s, 9H), 0.96 (m, 2H), 1.25 y 1.30
(d, J=1.6 Hz, 3H), 1.46 (s, 9H), 2.75 y 2.83 (s, 3H), 2.92-3.06 (m, 1H), 3.20-3.40 (m, 1H), 3.75-3.85 (m, 2H), 4.44 (m, 2H), 4.83-4.90 (m, 1H), 5.01-5.15 (m, 3H), 5.25-5.40 (m, 2H), 5.46 (m, 1 H), 7.09-7.35 (m, 10H).
L-A/-Metilfenilalanina-0-L-Boc-treonina-OSEM (30): A una solución de L-Cbz-N-metilfenilalanina-O-Boc-treonina-OSEM (1.7 g. 2.6 mmoles) en MeOH bajo argón, se añadió Pd(OH)2 (170 mg). La reacción se purgó con H2 y se agitó durante la noche bajo una atmósfera de hidrógeno (1 atm). La mezcla se filtró a través de Celite. El filtrado se concentró para dar el compuesto 30 (1.32 g, 98%) como aceite amarillo. 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.0 (s, 9H), 0.93 (t, J= 8.2, 2H), 1.04 y 1 ,28 (d, J= 5.6 Hz, 3H), 1.44 (s, 9H), 2.29 (s, 3H), 2.83 y 2.93 (dd, J= 14.3 y 6.4 Hz), 3.40 (t, J=6.1 Hz, 1 H), 3.66-3.68 (m, 2H), 4.48 y 5.23 (d, J=9.7 Hz), 5.02 (d, J=5.2 Hz, 2H), 7.08-7.28 (m, 5H). L-Cbz-Leucil-L-prolil-L-A/-metilfen¡lalanina-0-L-Boc-treon¡na-0-SEM (31): A una solución de L-Cbz-Leu-L-Pro-OH (1.0 g, 2.84 mmoles) en CH2CI2 (25 mi), enfriada a -15°C, se añadió BOP-CI (0.72 g, 2.84 mmoles), seguido por la adición gota a gota de NMM (318 µ?, 2.84 mmoles). Una solución separada de 30 (1.32 g, 2,58 mmoles) en CH2CI2 (25 mi) se enfrió a -15°C y se añadió a la reacción seguido por la adición de N-metilmorfolina (NMM) (0.58 mi, 5.16 mmoles). La mezcla se agitó 5 minutos a - 5°C, 1 hora a 0°C y durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de reacción se diluyó con EtOAc y se lavó con HCI al 10% (100 mi), NaHC03 (100 mi, saturado) y NaCI (100 mi, saturado). La capa orgánica se secó (Na2S04) y el solvente se evaporó. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 3/7) para dar el tetrapéptido 31 (1.02 g, 55%) como aceite amarillo pálido.
Rf 0.19 (AcOEt/hexanos 3:7). [a]D¿0 = -38.5 (c=l, CH2C]2). H-RMN: (500 MHz, CDCI3): 0.0 (s, 9H), 0.73-0.77 (m, 2H), 0.92-1.00 (m, 6H), 1.21 (d, J= 6.7 Hz), 1.36 (d, J= 6.7 Hz, 3H), 1.46 (s, 9H), 1.54-1.99 (m, 7H), 2.72 (s), 2.78 (s, 3H), 2.93-3.01 (m, 1H), 3.05-3.15 (m), 3.50-3.55 (m, H), 3.66-3.89 (m, 4H), 4.29-4.35 (m, 1 H), 4.41-4.61 (m, 2H), 4.63-4.65 (m, 1H), 4.72-4.74 (dd, J= 8.1 y 3.1 Hz, 1 H), 4.95-5.01 (dd, J = 8.1 y 3.1 Hz), 5.05-5.17 (m, 2H), 5.27-5.62 (m, 3H), 7.16-7.42 (m, 10H), 7.71 (d, J = 10 Hz, 1 H), 8.01 (d, J = 9.2 Hz). 1 C-RMN (125 MHz, CDCl3): -1.46, 16.2, 16.6, 16.9, 17.9, 21.4, 23.4, 24.5, 24.7, 25.1 , 28.2, 29.2, 34.5, 39.5, 40.7, 46.8, 51.1 , 53.3, 55.1 , 57.6, 58.8, 62.1, 65.8, 62.7, 67.9, 68.2, 71.2, 72.5, 80.1 , 89.8, 90.2, 126.6, 127.3, 127.9, 128.4, 128.8, 129.4, 156.0, 169.1 , 172.7, 173.8. IR (neto) 3278, 2954, 1703, 1640, 521 , 435, 1365. HR S m/z calculado para C-wHee^OnSiNa (M+Na): 877.4395 encontrado 877.4404. L-Leucil-L-prolil-L-A/-metilfenilalanina-0-L-Boc-treonina-OSEM (32): A una solución de 31 (223 mg, 0.26 mmoles) en MeOH bajo argón, se añadió Pd(OH)2 (50 mg). La reacción se purgó con H2 y se agitó durante la noche bajo atmósfera de H2 (1 atm). La mezcla se filtró a través de Celite. El filtrado se concentró para dar el tetrapéptido de amino libre 32 (192 mg, 97%) como aceite amarillo, que se usó en el siguiente paso sin purificación. H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.0 (s, 9H), 0.72-0.76 (m, 2H), 0.90-0.99 (m, 6H), 1.22 (d, J= 6.7 Hz), 1.35 (d, J= 6.7 Hz, 3H), 1.45 (s, 9H), 1.47-
1.53 9m, 2H), 1.81-2.01 (m, 5H), 2.71 (s), 2.79 (s, 3H), 2.92-3.00 (m, 1H), 3.05-3.15 (m), 3.51-3.56 (m, 1 H), 3.67-3.90 (m, 4H), 4.29-4.35 (m, 1 H), 4.42-4.63 (m, 2H), 4.63-4.65 (m, 1H), 4.72-4.74 (dd, J= 8.0 y 3.2 Hz, 1H), 5.01 (d, J = 6.0 Hz, 1H), 5.21-5.59 (m, 3H), 7.05-7.29 (m, 5H), 7.53 (d, J = 10 Hz), 7.68 (d, J = 9.1 Hz). Precursor lineal protegido de [N-MePhe5]-Tamandarin B (33): A una solución de! éster de PFP 18 (191 mg, 0.26 mmoles) en CH2Cl2 (5 mi), enfriada 0°C se añadió DIEA (116 µ?, 0.65 mmoles) y la solución se agitó durante 20 minutos, seguido por la adición de la amina 32 (192 mg, 0.27 mmoles) en CH2CI2 (5 mi) y DMAP (0.6 mg, 0.006 mmoles). La mezcla de reacción se agitó a 0°C durante.1 hora y después a temperatura ambiente durante 1 hora adicional. La reacción se extinguió con NH4CI y se diluyó con CH2Cl2. La capa orgánica se lavó con HCI al 0% (100 mi), NaHC03 al 5% (100 mi) y NaCI (100 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 9:1) para dar 33 (153 g, 44%) como aceite incoloro. Rf 0.20 (AcOEt/hexanos 3/1). [a]D20 = -44.0 (c = 1 , CHCI3). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.0 (s, 9H), 0.87-0.89 (m, 2H), 0.90-0.98 (m, 18H), 1.02-1.10 (m, 21H), 1.43 (s, 4H), 1.11-2.10 (m, 9H), 2.49-2.51 (m, 3H), 2.68 (s, 3H), 2.89 (s, 3H), 3.09-3.17 (m, 2H), 3.65-3.67 (m, H), 3.68-3.72 (m, 5H), 4.31-4.45 (m, 1H), 4.20-4.33 (m, 3H), 4.69-4.79 (m, 2H), 4.96-5.05 (m, 3H), 5.18-5.43 (m, 3H), 5.47 (d, J = 6.0 Hz, 1 H), 6.83 (d, J = 7.9 Hz, 1H), 7.11-7.41 (m, 11 H), 7.82 (d, J = 6.5 Hz, 1H), 8.88 (d, J = 8.5 Hz, 1H),
C-RMN (125 MHz, CDCI3): 13.1 , 17.3, 18.1, 18.5, 19.3, 20.9,
21.6, 23.9, 25.4, 28.6, 29.6, 30.5, 34.8, 35.0, 39.9, 47.3, 49.4, 55.3, 57.3, 59.3,
60.7, 62.6, 66.7, 68.6, 79.1 , 80.6, 90.6, 127, 1 , 128.2, 129.3, 137.4, 156.8, 157.1 , 169.5, 170.4, 171.0, 172.1, 174.2. IR (neto) 3446, 2956, 2868, 1738, 1703, 1636 1455. HRMS m/z calculado para C65Hio7N5Oi5Si2Na (M+Na):
1276.7199 encontrado 1276.7273. Macrociclo protegido de [/V-MePhe5]-Tamandarin B (34): A una solución del precursor lineal completamente protegido 33 (140 mg, 0.11 mmoles) disuelto en CH2CI2 (5 mi), a 0°C, se añadió MgBr2.Et20 (85 mg, 0.33 mmoles). La reacción se agitó a 0°C durante 2 horas y durante la noche a temperatura ambiente. La reacción se diluyó con CH2CI2 y la capa orgánica se lavó con HCI al 10% (100 mi) y NaCI (100 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró y se concentró. El ácido resultante (130 mg) se obtuvo como una espuma blanca y se usó directamente en el siguiente paso. A una solución de ácido crudo (130 mg, 0.30 mmoles) en MeOH (5 mi) bajo argón, se añadió Pd(OH)2 (28 mg). La reacción se purgó con H2 y se agitó durante la noche bajo atmósfera de H2 (1 atm). La mezcla se filtró a través de Celite. El filtrado se concentró para dar el precursor lineal (87 mg, 78%) como una espuma blanca que se usó directamente en el siguiente paso. El precursor lineal de amioácido crudo (87 mg, 0.08 mmoles) se disolvió en DMF (9 mi) y se enfrió a 0°C. Se añadió HATU (40 mg, 0.10 mmoles) seguido por la adición gota a gota de
DIEA (46 µ?, 0.26 mmoles). La mezcla de reacción se agitó a 0°C durante 1 hora y después durante la noche. La mezcla de reacción se concentró bajo vacío, se diluyó con EtOAc (10 mi) y se lavó con HCI al 10% (10 mi), NaHC03 al 5% (10 mi) y NaCI (10 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 5/1) para dar el macrociclo protegido 34 (10 mg, 15% tres pasos en total) como espuma blanca. Rf 0.40 (AcOEt/hexanos 3/7). [a]D20 = -36.1 (c = 1 , CHCI3). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.79-1.09 (m, 18H), 1.09-1.10 (s, 21 H), 1.27 (d, J = 6.4 Hz, 3H), 1.44 (s, 9H), 1.56-1.70 (m, 3H), 1.73-1.81 (m, 1H), 1.99-2.23 (m, 4H), 2.27 (dd, J = 17.0 y 2.9 Hz, 1 H), 2.42 (dd, J = 17.0 y 3.0 Hz, 1 H), 2.50 (s, 3H), 2.61 (dd, J = 17.1 y 6.5 Hz, lit), 2.98-3.00 (m, 1 H), 3.19-3.23 (m, 1 H), 3.30-3.32 (m, 1 H), 3.42 (dd, J = 9.8 y 4.9 Hz, 1 H), 3.57 (dd, J = 10 y 4.4 Hz, 1 H), 3.60-3.62 (m, 1 H), 3.63-3.64 (m, 1 H), 4.03-4.21 (m, 1 H), 4.32-4.36 (m, 1 H), 4.37-4.45 (m, 1 H), 4.57-4.60 (m, H), 4.60-4.69 (m, 1 H), 4.88-4.92 (m, 1 H), 4.94 (d, J = 6.0 Hz, 1 H), 5.80 (m, 1 H), 7.12-7.17 (m, 2H), 7.28-7.31 (m, 3H), 7.48-7.51 (m, 2H). 13C-RMN (125 MHz, CDCI3): 12.2, 12.6, 15.1 , 16.5, 17.5, 18.0, 18.2, 18.8, 19.6, 20.7, 21.0, 23.5, 24.9, 27.9, 28.1 , 30.1 , 31.0, 35.1 , 38.5, 39.7, 40.9, 47.7, 48.1 , 55.5, 56.9, 59.3, 65.9, 68.8, 69.9, 71 .8, 80.1 , 81.2, 126.9, 128.7, 129.5, 138.1 , 155.9, 168.7, 170.9, 171.0, 172.2. IR (neto) 3331 , 2926, 1743, 1636, 1513, 1456. [A -MePhe5]-Tamandarin B (36): A una solución de macrociclo
protegido de Boc 34 (10 mg, 0.01 mmoies) en EtOAc de CLAR se añadió una solución de HCI en EtOAc. La solución resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 horas. La solución se concentró, y el residuo se diluyó con CH2CI2 y se concentró nuevamente para dar la sal de clorhidrato 35 (9 mg, rendimiento cuantitativo) como un sólido blanco, que se usó directamente en el siguiente paso. A una mezcla de la sal de amina de macrociclo (9 mg, 0.01 mmoies) y cadena lateral (6.1 mg, 0.015 mmoies) en CH2CI2 (0.50 mi) a 0°C se añadió BOP (8.4 mg, 0.015 mmoies) y NMM (6 µ?, 0.05 mmoies). Después de 30 minutos a 0°C, la reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche La reacción se trató con solución de NaCI (2 mi, saturado) y se extrajo con EtOAc (2 x 0 mi) Las capas orgánicas se lavaron con HCI al 0% (5 ml), NaHCÜ3 al 5% (5 ml) y NaCI (5 ml, saturado), se secaron (Na2SO4), se filtraron y se concentraron. El aceite crudo (8 mg, 61 %) se purificó por CLAR.
EJEMPLO 3 Síntesis intentada de Leu5 Tamandarin B
La síntesis intentada de un análogo de leucina de tamandarin B (Leu5 Tamandarin B) se muestra en los esquemas expuestos a continuación
40
43
La unidad de tetrapéptido que consiste de Leu3, Pro4, Leu5, y Thr6 (compuesto 41) se preparó a partir de L-leucina usando la misma secuencia sintética conocida empezando de Cbz-L-Leu (37) en lugar de Cbz-L-Phe o Cbz-L-Tyr (esquema 9). El compuesto 41 se desprotegió usando hidrógeno e hidróxido de paladio para dar la amina 42. El compuesto 42 se hizo reaccionar con el
compuesto 18 (usado como una mezcla de isómeros) bajo condiciones similares a aquellas usadas anteriormente, v.gr., para preparar el compuesto 33. Esta reacción produjo el compuesto 43. La ciclización del compuesto 43 se intentó bajo condiicones mostradas anteriormente, v.gr., para preparar el compuesto 34. Sin embargo, la reacción de ciclización bajo estas condiciones no fue exitosa.
EJEMPLO 4 Síntesis de Ser6 Tamandarín B
Un análogo de serina de tamandarin B (Ser6 Tamandarin B) sintetizó como se muestra en los esquemas 12-16.
ESQUEMA 12
47 70% 4g
ESQUEMA 13
ESQUEMA 14
ESQUEMA 15
Ester pentafluofenílico de D-/V-Boc-VaIina (PFP) (44): D-N-Boc- Valina (5 g, 23 mmoles) se disolvió en CH2CI2 (60 mi) y se enfrió a 0°C, seguido por la adición de piridina (1.7 mi, 25.3 mmoles,) y írifluoroacetato de
PFP (4.08 mi, 27.6 mmoles). La solución se agitó 1 hora a temperatura ambiente y se extinguió con NH4CI (50 mi, saturado). La capa orgánica se lavó con HCI al 5% (100 mi), NaHC03 (100 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró y el solvente se evaporó. El éster de PFP resultante 44 se obtuvo como un aceite incoloro (8.6 g, 98%) y se usó directamente en el siguiente paso. H-RMN (500 MHz, CDCI3): 1 ,03 (d, J=6.7 Hz, 3H), 1 ,09 (d, J=6.7 Hz, 3H), 1.47 (s, 9H), 2,30-2.38 (m, 1 H), 4.57-4.58 (m, 1H), 5.01-5.02 (m, 1H). Ester metílico de ácido (4R)-4-ter-butoxicarbonilamino-5-metil-3-oxohexanoico (45): A una solución de éster de PFP 44 (7 g, 18.3 mmoles) en THF anhidro (30 mi), enfriado a -78°C, se añadió una solución de enolato de litio de acetato de metilo. El enolato se preparó por la adición de acetato de metilo (5.4 mi, 65.0 mmoles) a una solución de LDA (65.0 mmoles en 50 mi de THF anhidro) a -78°C y la solución resultante se agitó durante 1 hora. La mezcla de reacción se agitó durante 45 minutos más a la misma temperatura, y se extinguió con NH4CI (50 mi) a -78°C. Después de calentar a temperatura ambiente, la solución se diluyó con EtOAc (150 mi). La capa orgánica se separó y se lavó con HCI al 10% (100 mi), NaHC03 al 5% (100 mi) y NaCI (100 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 1/9) para dar el éster metílico 45 (3.0 g, 61%) como aceite incoloro. Rf 0.14 (EtOAc/hexanos 1/9). [a]D20 = -13.2 (c=0.5, CHCI3). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.81 (d, J= 6.8 Hz) y 0.83-0.92 (m, 2H), 0.99 (d, J= 6.8 Hz, 2H), 1.44 (s, 9H), 2.20-2.25 (m, 1 H), 3.53 (m, 2H),
3.71 (s, 3H), 4.29 (m, H), 5.09 (m, 1H). 3C-RMN (125 MHz, CDCI3): 16.6, 19.7, 28.2, 29.5, 46.8, 52.3, 64.3, 80.08, 155.9, 167.1, 202.0. IR (neto) 3442.3, 2966.2, 1750.0, 1715.9, 1515.0, 1508.3, 1366.9, 1165.6, 1014.0. HRMS m/z calculado para C13H24NO5 (M+H): 274.1654 encontrado 274.1654. Ester metílico de ácido (3S,4R)-4-ter-butoxicarboniIamino-3-hidroxi-5-metilhexanoico (46): A una solución de éster metílico 45 (2.4 g, 8.70 mmoles) en CLAR MeOH (100 mi), enfriado a -78°C, se añadió en porciones borhidruro de potasio (1.4 g, 26.1 mmoles). La mezcla de reacción se agitó a -78°C durante 10 minutos, se calentó a -20°C durante 30 minutos y después a 0°C durante 10 minutos. La reacción se extinguió con ácido acético a pH = 7 y se extrajo con CH2CI2 (3 x 50 mi). La capa orgánica se lavó con NaHC03 (50 mi, saturado), NaCI (50 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró, y se evaporó. El alcohol 46 se obtuvo como un aceite incoloro (2.2 g, 92%) y se usó directamente en el siguiente paso. 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.88 (d, J=6.8 Hz, 3H), 0.93 (d, J=6.8 Hz, 3H), 1.44 (s, 9H), 2.03-2.17 (m, 1 H), 2.41-2.52 (m, 1 H), 2.58-2.63 (m, IH), 3.50-3.55 (m, 1H), 3.71 (s, 3H), 3.89-3.93 (m, 1H), 3.38-3.41 (m, 1 H). Ester metílico de ácido (3S,4R)-4-ter-butoxicarbonilamino-5-met¡l-3-(ter-butildimetil-silaniloxi)hexanoico (47): A una solución del alcohol crudo 46 (2.2 g, 7.9 mmoles) en DMF (12 mi), bajo argón, enfriado a 0°C, se
añadieron imidazol (1.61 g, 23.7 mmoles) y cloruro de ter-butildimetilsililo (3.57 mi, 23.7 mmoles). La mezcla de reacción se agitó a 0°C durante 30 minutos y después a temperatura ambiente durante 18 horas y se diluyó con Et2Ü (50 mi). La capa orgánica se separó y se lavó con HCi al 10% (50 mi), NaHC03 (50 mi, saturado) y NaCI (50 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró, y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 1/9) para dar 47 (2.59 g, 98%) como aceite incoloro. Rf 0.31 (EtOAc/hexanos 1/9). [a]D20 = +5.30 (c=1 , CH2CI2). 1H-R N (500 Hz, CDCI3): 0.07 (s, 6H), 0.84-0.91 (m, 15H), 1.42 (s, 9H), 1.98-2.01 (m, 1H), 2.43 (dd, J=6.0 y 19Hz, 1 H), 2.52 (dd, J=5.9 y 18.5 Hz, 1H), 3.47-3.48 (m, 1H), 3.65 (s, 3H), 4,17-4.19 (m, 1H), 4,41-4.44 (m, 1H). 13C-RMN (125 MHz, CDCI3): -3.6, 16.6, 17.60, 18.9, 25.7, 27.8, 28.2, 39.9, 51.5, 51.9, 59.5, 70.19, 155.9, 172.2. IR (neto) 3373.1 , 2960.7, 1717.0, 1504.6, 1366.1 , 1173.0, 837.0
HRMS m/z calculado para C19H3gN05Si (M+Na): 390.2675 encontrado 390.2676. Acido (3S,4R)-4-ter-butoxicarbonilam¡no-5-metil-3-(ter-butildimetil-silaniloxi)hexanoico (48): A una solución de 47 (500 mg, 1.28 mmoles) en 25 mi de THF/MeOH (1:1), enfriado a 0°C, se añadió una solución de NaOH 1 N (25 mi). La reacción se agitó a 0°C durante 2 horas y después durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla de reacción se concentró y se diluyó con H20 (20 mi), se enfrió a 0°C, se acidificó a pH 2 con una
solución de KHS04 1 N, y se extrajo con EtOAc (3 x 20 mi). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con NaCI (50 mi, saturado), se secaron (Na2SC"4), se filtraron y se evaporaron. El ácido resultante 48 se obtuvo como un aceite incoloro (1.76 g, 86%) y se usó directamente en el siguiente paso. 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.06 (s, 6H), 0.84-0.95 (m, 15H),
1.43 (s, 9H), 2,01-2.11 (m, 1H), 2.53 (m, 1H), 2.64 (m, 1H), 3,53-3, 58 (m, 1H), 4.10-4.14 (m, 1H), 3.65 (s, 3H), 4,17-4.19 (m, 1H), 4,51-4.54 y 6.29-6.31 (m, 1H). Ester bencílico de ácido de /V-a-h¡droxivaler¡I-/V-Leucil-ProIina (51): A una solución de sal de clorhidrato 49 (1.56 mg, 4.23 mmoles) en CH2CI2 (2 mi), enfriada a 0°C, se añadió NMM (522 µ?, 4.65 mmoles). Después de 15 minutos ácido a-hidroxivalérico (50) (500 mg, 4.23 mmoles) y DCC (959 mg, 4.65 mmoles) se añadieron en porciones. La mezcla de reacción se agitó 14 horas a temperatura ambiente, se diluyó con CH2CI2 (25 mi) y se lavó con HCI 1 (20 mi), NaHC03 (20 mi, saturado) y salmuera (20 mi), se secó (Na2S0 ), se filtró y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, grad EtOAc/hexanos 1/1 a 3/1) para dar 51 (1.47 g, 84%) como un sólido blanco. Rf 0.46 (EtOAc/hexanos 1/2). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.81 (d, J=7.0 Hz, 3H), 0.92 (m, 6H),
0.97 (d, J=7.0 Hz, 3H), 1.42 (m, 1H), 1.63 (m, 2H), 2.00 (m, 3H), 2.19 (m, 2H), 3.60 (m, H), 3.85 (m, 1H), 3.88 (d, J=4.8 Hz, 1H), 4.66 (m, 1H), 4.80 (m, 1H), 5.06 (d, J=12.3 Hz, 1H), 5.14 (d, J=12.3 Hz, 3H), 7.32 (m, 5H), 7.41 (d, 8.4,
1H). 13C-RMN (125 MHz, CDCI3): 15.3, 19.1, 21.3, 23.1, 24.4, 24.7, 28.8, 31.3, 40.5, 46.8, 48.2, 58.2, 66.7, 75.8, 127.9, 128.1, 128.3, 135.3, 117.4, 1 7.9, 73.9. Ester de /V-a-hidroxivaleril-/V-Leucil-0-Bencil-Prolina de ácido
(3S,4R)-4-ter-butoxicarbonilamino-5-metil-3-(ter-butildimetil-silaniloxi) hexanoico (52): A una solución del alcohol 51 (400 mg, 0.96 mmoles) en CH2CI2 (8 mi), enfriado a -5°C, se añadieron en porciones DMAP (35 mg, 0.28 mmoles) ácido 48 (425 mg, 1.15 mmoles) y DCC (247 mg, 1.15 mmoles). La mezcla de reacción se agitó 7 horas a -5°C, se filtró y se evaporó. El residuo se disolvió en CH3CN (10 mi), se filtró nuevamente y se evaporó. El aceite crudo se disolvió en EtOAc (20 mi) y se lavó con KHS04 al 10% (15 mi), NaHC03 (15 mi, saturado) y NaCI ( 5 mi, saturado). La capa orgánica se secó (Na2S04) y el solvente se evaporó. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, gradiente EtOAc/hexanos 1/4) para dar 52 (110 mg, 60%). Rf 0.47 (AcOEt/hexanos 1:1). [a]D20 = -69. 0 (c=1 , CH2CI2). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): rotámeros 0.07 (s, 6H), 0.75-1.10 (m, 27H), 1.4-9 (s, 9H), 1.50-1.71 (m, 2H), 1.75-2.20 (m, 3H), 2.12-2.21 (m, 2H), 2.41-2.63 (m, 2H), 3.12-3.15 (m, 1H), 3.41-3.49 (m, 2H), 3.53-3.62 (m, 2H), 3.68-3.72 (m, 1H), 3.81-3.88 (m, 1 H), 4.05-4.10 (m, 1H), 4.21 (d, J =8.0 Hz, 1H), 4.49-4.51 (m, 1 H), 4.60-4.69 (m, 2H), 4.77 (d, J =10.0 Hz, 1H), 4.90-5.01 (m, 2H), 5. 1-5.22 (m, 2H), 6.88 (d, J = 9.0 Hz, 1H), 7.22-7.33 (m, 5H), 8.33
(d, J = 6.3 Hz, 1H). 13C-RMN (125 MHz, CDC ): -5.1 , -4.8, 14.7, 17.8, 18.0, 18.9, 20.4, 21.2, 23.2, 24.6, 24.7, 24.9, 25.4, 25.7, 28.4, 28.8, 30.2, 33.9, 38.9, 43.0, 48.4, 58.8, 63.2, 66.8, 71.5, 79.3, 82.6, 128.1 , 128.3, 128.5, 135.5, 157.4, 170.0, 70.9, 17 .2, 171.8, 172. . IR (neto) 3265.8, 2937.7, 2903.6, 2362.0, 1740.4, 1692.3, 1643.4, 1451.6, 1386.8, 1365.4, 1167.2, 1091.1 , 837.3. HRMS m/z calculado para C4iH69 309SiNa ( +Na): 796.4700 encontrado 798.4735. Ester fenacílico de L-A/-Boc-Ser¡na (55): A una suspensión agitada de L-/V-Boc-serina (2 g, 9.7 mmoles) en EtOAc (20 mi), enfriada a 0°C, se añadieron EtsN (1.39 mi, 9.7 mmoles) y bromoacetofenona (1.9 g, 9.7 mmoles). La mezcla resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 días, se diluyó con EtOAc (50 mi) y se lavó con soluciones de HCI al 10% (20 mi), NaHCO3 al 5% (20 mi) y NaCI saturado (20 mi). La capa orgánica se secó (Na2SO4) y el solvente se evaporó. El residuo se trituró con éter y se filtró para dar 55 (3.4 g, 98%) como una espuma amarilla. Rf 0.50 (AcOEt/hexanos 1/1). [ ]D20 = -19.1 (c = 1 , CHCI3). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 1 ,43 y 1 ,46 (s, 3H), 3.70-3.73 (m, 1 H), 3.84-3.88 (m, 1 H), 4.22-4.24 (m, 1 H), 4.51-4.52 (m, 1 H), 5.28-5.36 (m, 1 H), 5.61-5.66 (m, 2H), 7.49 (t, J= 6.5 Hz, 2H), 7.57 (t, J= 6.3 Hz, 1H), 7.87 (dd, J= 1.9 y 6.3 Hz, 2H). 13C-RMN (125 MHz, CDCI3): 27.2, 28.1, 56.0, 63.7, 66.3, 79.8,
85.0, 127.6, 128.8, 133.3, 134.3, 146.6, 155.5, 170.1 , 192.8. IR (neto) 3439.8, 2978.7, 2935.6, 1807.8, 1756.6, 1704.8, 1506.6, 1369.7, 1162.9. Ester fenacílico de 0-(L-N-Cbz-/V,0-d¡metilt¡rosil)-L-/V-Boc-ser¡na (56): A una solución de éster fenacílico de L-A/-Boc-serina 55 (1.42 g. 3.96 mmoles) en CH2CI2 (20 mi), enfriado a 0°C, se añadieron DMAP (145 mg, 1.18 mmoles) y L-W-Cbz-N,0-dimetilt¡rosina (21) (1.36 g, 3.96 mmoles). Después de agitase 10 minutos a 0°C, se añadió DCC (897 mg, 4.35 mmoles). La mezcla de reacción se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla se filtró y el filtrado se concentró a sequedad. El residuo se disolvió en CH3CN (25 mi), se filtró nuevamente y se evaporó. El aceite crudo se disolvió en EtOAc (50 mi) y se lavó con KHS04 al 10% (30 mi), NaHC03 (50 mi, saturado) y NaCI (50 mi, saturado). La capa orgánica se secó (Na2S04) y el solvente se evaporó. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, gradiente EtOAc/hexanos 1/4 a 1/2) para dar el dipéptido 56 (1.69 g, 63%) como un sólido blanco pálido. Rf 0.12 (AcOEt/hexanos 1:4). pf = 64-65°C. [a]D20 = -12.0 (c=1 , CH2CI2). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 1.49 (s, 3H), 2.85 y 3.01 (s, 3H),
3.04-3.11 (m, 1 H), 3.27-3.37 (m, 1H), 3.80 (s, 3H), 4.53-4.67 (m, 1 H), 4.70 (dd, J= 3.9 y 11.7Hz, 1 H), 4.81-4.82 (m, 1H), 4.94-5.01 (m, 1 H), 5.08-5.14 (m, 2H), 5.30-5.35 (m, 1 H), 5.48-5.52 (m, 1H), 6.76-6.83 (m, 2H), 7.05-7.24 (m, 2H),
7.27-7.34 (m, 5H), 7.51 (t, J=7.3 Hz, 2H), 7.64 (t, J=7.2 Hz, 1 H), 7.89 (d, J=7.5 Hz, 2H). 13C-RMN (125 MHz, CDCI3): 28.3, 32.2, 33.8, 34.2, 52.9, 55.1, 60.9, 64.9, 67.2, 67.3, 113.9, 127.4, 127.7, 127.8, 127,9, 128.3, 128.9, 129.1 , 129.8, 133.9, 136.6, 158.3, 170.4, 170.6, 190.8. IR (neto) 3404.1, 2932.5, 1703.2, 1513.7, 1453.1 , 1402.5, 1248.0, 1162.6, 1033.0, 754.8. 0-(L-A/-Cbz-A/,0-D¡metiltirosil)-L-A/-Boc-serina (57): A una solución de éster serinfenacílico 56 (500 mg, 0.73 mmoles) en AcOH acuoso (6 mi, 90%), enfriado a 0°C, se añadió Zn en polvo (381 mg, 5.48 mmoles). La mezcla resultante se agitó 3 horas a 0°C, se filtró sobre Celite® y el Celite® se lavó con EtOAc (25 mi). El filtrado se lavó con KHS0 al 10% (20 mi), NaHC03 (20 mi, saturado), y NaCI (20 mi, saturado). La capa orgánica se secó (Na2S04), y el solvente se evaporó. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, MeOH/CH2CI2 1/9) para dar el ácido 57 (290 mg, 75%) como un sólido blanco. Rf 0.35 (MeOH/CH2CI2 1/9). pf = 71-72°C. [a]D20 = -2.5 (c=1 , CH2CI2). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 1.43 (m, 9H), 2.78 (s, 3H), 2.81-3.01
(m, 1 H), 3.15-3.26 (m, 1H), 3.79 (s, 3H), 4.31-4.45 (m, 2H), 3.65-3.70 (m, 1 H), 4.89-5.05 (m, 2H), 5.55-5.67 (m, 1H), 6.71-6.80 y 6.93-7.05 (m, 2H), 7.26-7.33 (m, 5H).
13C-R N (125 MHz, CDCl3): 28.3, 33.4, 33.7, 53.1 , 55.1, 60.8, 67.5, 68.0, 80.0, 113.9, 127.4, 127.8, 128.3, 128.8, 129.6, 129.7, 136.5, 137.0, 158.3, 170.1 , 174.3. IR (neto) 3354.1 , 2933.3, 1706.0, 1513.7, 1247.5, 1163.3, 1032. HR S m/z calculado para
553.2162 (M+Na): encontrado 553.2176. Precursor lineal [Ser63-Tamandarin B protegido (59): A una solución de 52 (117 mg, 0.18 mmoles) en dioxano (5 mi), enfriado a 0°C, se añadió una solución de HCI en dioxano (5 mi). La solución resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 horas. La solución se concentró, y el residuo se diluyó con CH2C12 y se concentró nuevamente para dar la sal de clorhidrato 58 (90 mg, rendimiento cuantitativo) como un sólido blanco, que se usó directamente en el siguiente paso. A una mezcla de sal de clorhidrato 58 (90 mg, 0.15 mmoles) HBTU (61 mg, 0.16 mmoles), HOBt (20 mg, 0.15 mmoles) y ácido Tyr-ser 57 (80 mg, 0.15 mmoles), enfriada a -5°C se añadió una solución de CH2CI2/D F 2/1 (3 mi), la reacción se agitó 5 minutos y se añadió DIPEA (106 µ?, 0.60 mmoles). La solución resultante se agitó a -5°C durante la noche, se diluyó con teuOMe (10 mi), se lavó con KHS04 al 10% (10 mi), NaHC03 (10 mi, saturado), y NaCI (10 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró, y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, gradiente de EtOAc/hexanos 1/1) para dar 59 (105 mg, 65%). Rf 0.34 (AcOEt/hexanos 1 :1). [a]D20 -59.1 (c=1 , CH2CI2).
1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.88-1.00 (m, 18H), 1.47 (s, 9H), 1.49-1.52 (m, 4H), 2.03-2.06 (m, 5H), 2.22-2.25 (m, 3H), 2.55-2.60 (m, 1 H), 2.70-2.84 (m, 3H), 2.98-3.03 (m, 1H), 3.27 (dt, J= 5.8 y 20.0 Hz, 1 H), 3.80 (s, 3H), 4.12-4.15 (m, 1H), 4.50-4.53 (m, 3H), 4.53-4.59 (m, 2H), 5.00-5.23 (m, 6H), 5.80-5.83 (m, 1H), 6.78-6.80 (m, 3H), 7.06-7.08 (m, 3H), 7.29-7.38 (m, 1 H). 13C-RMN (125 MHz, CDCI3): 14.5, 17.3, 18.6, 20.2, 21.0, 23.3, 24.6, 24.8, 27.8, 28.2, 28.8, 30.3, 32.5, 33.8, 38.8, 46.8, 48.4, 55.1 , 58.9, 60.3, 60.5, 61.0, 64.3. 66.9, 67.2, 68.5, 78.1 , 78.5, 79.3, 113.8, 127.5, 127.9, 128.1 , 128.3, 128.5, 128.8, 129.7, 135.3, 136.5, 156.7, 157.5, 158.2, 167.3, 168.0, 169.6, 170.7, 171.3. IR (neto) 3315.5, 2968.3, 1744.0, 1670.0, 1637.7, 1513.9, 1447.3, 1170.6. HRMS m/z calculado para
1096.5470 (M+Na): encontrado 1096.5498. Macrociclo [Ser6]-Tamandarin B (61): A una solución del precursor lineal protegido 59 (206 mg, 0.19 mmoles) en MeOH (15 mi) bajo argón, se añadió Pd(OH)2 (81 mg). La reacción se purgó con H2 y se agitó durante la noche bajo atmósfera de H2 (1 atm). La mezcla se filtró a través de Celite®. El filtrado se concentró para dar el precursor lineal libre 60 (150 mg, 91%) como un aceite amarillo, que se usó en el siguiente paso sin purificación. El precursor lineal de amioácido crudo 60 (150 mg, 0.17 mmoles) se disolvió en CH3CN (30 mi) y se enfrió a 0°C. Se añadió HATU (160 mg,
0.42 mmoles) seguido por la adición gota a gota de NNM (38 µ?, 0.34 mmoles). La mezcla de reacción se agitó a 0°C durante 1 hora y después durante la noche. La mezcla de reacción se concentró bajo vacío, se diluyó con EtOAc (15 mi), se lavó con KHS04 al 10% (10 mi), NaHC03 al 5% (10 mi) y NaCI (10 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró, y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 2/1) para dar macrociclo protegido 61 (130 mg, 89 %) como una espuma blanca. Rf 0.23 (AcOEt/hexanos 1/2). [oc]D20 = -56.1 (c = 1 , CHCI3). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.89-1.05 (m, 18H), 1.45 (m, 9H),
1.62-1.74 (m, 1 H), 2.00-2.20 (m, 4H), 2.55 (m, 3H), 2.81 (dd, 1 H), 2.99 (dd, 1 H), 3.15 (dd, 1 H), 3.36 (dd, 1 H), 3.53 (m, 1 H), 3.67 (m, 1 H), 3.73 (m, 1 H), 3.80 (s, 3H), 3,91 (m, 1 H), 4.10 (m, 1 H), 4.19 (m, 1 H), 4.42 (td, J= y, 1 H), 4.48 (m, 1 H), 4.51 (dd, J= y, 1 H), 4.59 (m, 1 H), 4,91 (m, 1 H), 5.06 (m, 2H), 6.84 (d, 2H), 7.01 (d, 2H), 7.77 (d, 2H), 8.55 (d, 2H). 13C-RMN (125 MHz, CDCfe): 17.4, 17.8, 18.7, 20.2, 20.6, 21.4, 23.5, 24.9, 25.1 , 26.0, 28.0, 28.1 , 28.3, 28.6, 28.8, 30.2, 30.7, 34.1 , 38.6, 46.1 , 47.0, 48.7, 48.9, 52.4, 55.3, 57.2, 62.9, 63.7, 65.6, 68.7, 69.3, 78.7, 80.5, 114.1 , 129.8, 130.3, 155.6, 158.6, 169.1 , 170.8, 171.1 , 171.2. IR (neto) 3314.2, 2924.3, 2359.9, 1742.6, 1630.7. HRMS m/z calculado para ?d7?79?d? ? 1096.5470 (M+Na): encontrado 1096.5498. [W-Ser6]-Tamandarin B (62): A una solución de macrociclo
protegido con Boc 61 (20 mg, 0.024 mmoles) en CLAR dioxano (10 mi) se añadió una solución de HCI en dioxano (10 mi). La solución resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 horas. La solución se concentró y el residuo se diluyó con CH2CI2 y se concentró nuevamente para dar la sal de clorhidrato (18 mg, rendimiento cuantitativo) como un sólido blanco, que se usó directamente en el siguiente paso. A una mezcla de la sal de amina de macrociclo (18 mg, 0.023 mmoles) y cadena lateral (11 mg, 0. 035 mmoles) en CH2CI2 (3 mi) a 0°C se añadió BOP (15 mg, 0.035 mmoles) y NMM (10 µ?, 0.092 mmoles). Después de 30 minutos a 0°C, la mezcla se agitó a temperatura ambiente durante la noche. La reacción se trató con solución de NaCI saturada (2 mi) y se extrajo con EtOAc (2 x 10 mi) Las capas orgánicas se lavaron con HCI al 10% (5 mi), NaHC03 al 5% (5 mi) y NaCI (5 mi, saturado), se secaron (Na2S04), se filtraron y se concentraron. El aceite crudo (24 mg) se purificó por CLAR. 1H-RMN (300 MHz, CDCI3): d 0.82-0.96 (m, 24H), 1.09-1.28 (m,
14H), 1.39-1.43 (m, 3H), 1.64 (m, 2H), 1.88-1.98 (m, 2H), 2.10-2.15 (m, 2H), 2.58 (s, 3H), 2.90-2.95 (m, 1 H), 3.05 (s, 3H), 3.09-3.12 (m, 1H), 3.35-3.43 (m, 1H), 3.43-3.82 (m, 5H), 3.79 (s, 3H), 3.98-4.05 (m, 1H), 4.12-4.17 (m, 1 H), 4.45-4.50 (m, 1 H), 4.62-4.66 (m, 1H), 4.67-4.70 (m, 2H), 5.05 (d, J= 5.3, 1H), 5.29-5.32 (m, 2H), 6.80 (d, J=8.7 Hz, 2H), 7.02 (d, J=8.6 Hz, 2H), 7.65 (d, J=6.7 Hz, 1 H), 8.09 (d, J=9.5 Hz, 1 H), 8.45 (d, J=8.9 Hz, 1 H). HRMS m/z calculado para C52H8iN70i4Na (M+Na): 1050.5739 encontrado 1050.5731.
EJEMPLO 5 Síntesis de Ser6 Pyr Tamandarin B
Un análogo de serina-piruvato de tamandarin (Ser6 Pyr Tamandarin B) se preparó como se muestra en el esquema 17.
El grupo N-Boc del macrociclo de Ser6 tamandarin B se removió usando HC (gaseoso) en dioxano. El acoplamiento subsecuente con D-Cbz-N-
Me-Leu usando HATU y NMM en DMF/DCM dio el depsipéptido 63 en un rendimiento de 50%. La hidrogenólisis del grupo CBz y el acoplamiento con el fragmento de prolil-piruvilo, usando condiciones como se desribe aquí, dio el análogo deseado 64.
EJEMPLO 6 Síntesis de Ala4 Tamandarin B
Un análogo de alanina de tamandarin B (Ala4 Tamandarin B) sintetizó como se muestra en los esquemas 18-20.
ESQUEMA 18
ESQUEMA 20
Ester bencílico de ácido de W~Boc-L-Leucil-/V-L-Alan¡na (67): A una solución de éster bencílico de ácido de W-Boc-L-alanina (66) (660 mg,
2.36 mmoles) en EtOAc de CLAR (10 mi) se añadió una solución saturada de HCI en EtOAc (5 mi). La solución resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 horas. La solución se concentró y el residuo se diluyó con CH2CI2 y se concentró nuevamente para dar la sal de clorhidrato (rendimiento cuantitativo) como un sólido blanco, que se usó directamente en el siguiente paso. A una solución de la sal de clorhidrato (500 mg, 2.78 mmoles) en CH2CI2 (6 mi), enfriada a 0°C, se añadió NMM (423 µ?, 4.17 mmoles). Después de 15 minutos, se añadieron /V-Boc-L-Ieucin monohidratado (693 mg, 2.78 mmoles), HOBt (425 mg, 2.78 mmoles) y DCC (630 mg, 3.05 mmoles). La mezcla de reacción se agitó 14 horas a temperatura ambiente diluido con CH2CI2 (25 mi) y se filtró. La solución resultante se lavó con HCI 1N (20 mi), NaHC03 (20 mi, saturado) y salmuera (20 mi), se secó (Na2S04), se filtró y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, gradiente EtOAc/hexanos 1/6) para dar 67 (650 mg, 78%). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.99-1.01 (m, 6H), 1.43 (d, J= 6.8
Hz, 3H), 1.44 (s, 9H), 1.45- 1.75 (m, 3H), 4.15-4.25 (m, 1 H), 4.55-4.66 (m, 1H), 5.00-5.25 (m, 2H), 5.45-5.53 (m, 1H), 7.29-1.34 (m, 5H). 13C-R N (125 MHz, CDCI3): 21.5, 24.1, 28.05, 41.2, 47.7, 52.5, 66.6, 79.3, 82.2, 127.8, 128.1, 128.5, 135.2, 155.6, 172.2, 172.6. Ester bencílico de ácido de /V-hidroxivaleril-N-Leucil-Alanina (69):
A una solución de 67 (625 mg) en CLAR AcOEt (10 mi) se añadió una solución saturada de HCI en AcOEt (5 mi). La solución resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 horas. La solución se concentró y el residuo
se diluyó con CH2CI2 y se concentró nuevamente para dar la sal de clorhidrato 68 (rendimiento cuantitativo) como un sólido blanco, que se usó directamente en el siguiente paso. A una solución de la sal de clorhidrato 68 (522 mg, 1.59 mmoles) en CH2CI2 (6 mi), enfriada a 0°C, se añadió NMM (197 µ?, 1.75 mmoles). Después de 15 minutos ácido a-hidroxivalérico (187 mg, 1.59 mmoles) y DCC (360 mg, 1.75 mmoles) se añadieron en porciones. La mezcla de reacción se agitó 14 horas a temperatura ambiente diluida con CH2CI2 (25 mi) y se lavó con HCI 1 N (20 mi), NaHC03 (20 mi, saturado) y salmuera (20 mi), se secó (Na2S04), se filtró y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 1/1) para dar 69 (480 mg, 77%) como un sólido blanco. Rf = 0.31 (EtOAc/hexanos 1/1). [a]D20 = -45.3 (c=1 , CH2CI2). H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.82 (d, J= 6.8 Hz, 3H), 0.86 (d, J= 6.1 Hz, 3H), 0.90 (d, J= 6.1 Hz, 3H), 0.99 (d, J= 6.8 Hz, 3H), 1.36 (d, J= 7.1 Hz, 3H), 1 ,57-1.63 (m, 3H), 1.89-1.93 (m, 1 H), 2.02-2.16 (m, 1 H), 3.95-3.97 (m, 1 H), 4.49-4.96 (m, 2H), 5.13 (c, J= 12.3, 2H), 7.03 (d, J= 7.0 Hz, 1 H), 7.18 (d, J= 8.5 Hz, 1 H), 7.30-7.35 (m, 5H). 13C-RMN (125 MHz, CDCI3): 15.5, 17.8, 19.1, 21.7, 22.8, 24.6, 31.6, 33.8, 40.9, 51.1 , 67.1, 76.2, 128.1, 128.3, 168.6, 135.3, 172.1 , 172.8, 173.8. Ester de N-hdroxivaleril-W-Leucil-O-bencilalanina de ácido (3S,4R)-4-butoxicarbonilam¡no-5-metil-3-(ter-butil-dimetilsilaniloxi)-hexanoico (70): A una solución del péptido 69 (200 mg, 0.51 mmoles) en CH2CI2 (4 mi),
enfriado a -5°C, DMAP (18.4 mg, 0.15 mmoles) ácido 48 (229 mg, 0.61 mmoles) y DCC (157 mg, 0.76 mmoles) se añadieron en porciones. La mezcla de reacción se agitó 7 horas a -5°C, se filtró y se evaporó. El residuo se disolvió en CH3CN (7 mi), se filtró nuevamente, y se evaporó. El aceite crudo se disolvió en EtOAc (10 mi) y se lavó con KHS04 al 10% (10 mi), NaHC03 (10 mi, saturado) y NaCI (10 mi, saturado). La capa orgánica se secó ( a2S04), y el solvente se evaporó. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, gradiente EtOAc/hexanos 1/4) para dar 70 (340 mg, 89%) como espuma blanca. Rf 0.72 (AcOEt/hexanos 1 :1). [a]D20 = -50.4 (c=1, CH2CI2). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): mezcla de rotámeros 0.05 (s, 6H), 0.77-1.04 (m, 27H), 1.30 y 1.39 (d, J=6.7 Hz, 3H), 1.42 y 1.52 (s, 9H), 1.30-1.70 (m, 5H), 2.56-2,70 (m, 2H), 3.19-3.22 (m, 1 H), 3.41-3.47 (m, 1 H), 3.83-3.85 (m, 1 H), 3.99-4.03 (m, 1 H), 4.30-4.32 (m, 2H), 4.35-4.38 (m, 1 H), 4.48-4.53 (m, 1 H), 4.67-4.70 (m, 1 H), 4.73-4.75 (m, 1 H), 4.82-4.85 (m, 1 H), 4.99-5.13 (m, 2H), 5.15-5.21 (m, 2H), 6.33 (d, J= 7.2 Hz, 1 H), 7.18-7.30 (m, 5H), 8.39 (d, J= 8.0 Hz, 1H). 13C-R N (125 MHz, CDCI3): -5.1 , -4.8, 14.6, 17.2, 17.6, 17.9, 18.6, 20.3, 21.2, 22.8, 22.9, 24.5, 24.6, 24.8, 25.3, 25.6, 28.1 , 28.2, 34.8, 39.6, 48.0, 48.3, 50.8, 50.9, 55.5, 63.1 , 66.6, 70.1 , 71.3, 78.9, 79.5, 82.1 , 127.9, 128.0, 128.3, 135.4, 156.1 , 157.3, 169.6, 170.0, 170.5, 170.9, 171.5, 172.2, 172.6, 172.9. HRMS m/z calculado para C39H67N309SiNa (M+Na): 772.4544
encontrado 772.4551. Precursor lineal protegido [Ala4]-Tamandarin B (73): A una solución de 70 (80 mg, 0.10 mmoles) en dioxano (2 mi), enfriada a 0°C, se añadió una solución de HCI en dioxano (2 mi). La solución resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 horas. La solución se concentró y el residuo se diluyó con CH2CI2 y se concentró nuevamente para dar la sal de clorhidrato 71 (61 mg, rendimiento cuantitativo) como un sólido blanco, que se usó directamente en el siguiente paso. A una mezcla de la sal de clorhidrato (61 mg, 0.10 mmoles) HBTU (41.7 mg, 0.11 mmoles), HOBt (13.5 mg, 0.10 mmoles) y ácido Tyr-Thr 72 (54 mg, 0.10 mmoles), enfriada a -5°C, se añadió una solución de CH2CI2/DMF 2/1 (3 mi), la reacción se agitó 5 minutos y se añadió DIPEA (71 µ?, 0.40 mmoles). La solución resultante se agitó a -5°C durante la noche, se diluyó con uOMe ( 0 mi) y se lavó con KHS04 al 10% (10 mi), NaHC03 (10 mi, saturado) y NaCI (10 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, gradiente EtOAc/hexanos 1/1) para dar 73 (98 mg, 86%). Rf 0.38 (AcOEt/hexanos 1 :1). [a]D20 = -34.4 (c=1, CH2CI2). H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.88-1.02 (m, 18H), 1.19 (d, J=6.9 Hz, 3H), 1.26 (d, J=6.9 Hz, 3H), 1.48 (s, 9H), 1.55- .62 (m, 4H), 1.87-1.95 (m, 2H), 2.22- 2.45 (m, 2H), 2.55-2.70 (m, 3H), 2.84 (s, 3H), 2.97-3.05 (m, 1 H), 3.11-3.19 (m, 1H), 3.81 (s, 3H), 4.12-4.35 (m, 2H), 4.41-4.48 (m, 1H), 4.55-4.58 (m, 1H), 4..63-4.66 (m, 1H), 5.00-5.20 (m, 6H), 5.30-5.33 (m, 1H), 5.62
(d, J= 7.3 Hz, 1 H), 6.77 (d, J= 8.3 Hz, 2H), 6.98 (m, 1H), 7.06 (d, J= 7.3 Hz, 1 H), 7.19 (m, 1 H), 7.29-7.42 (m, 10H), 7.60-7.66 (m, 1H). 13C-RMN (125 MHz, CDCI3): 16.2, 16.9, 17.6, 18.7, 20.1, 23.1 , 24.5, 24.8, 25.5, 26.9, 28.1 , 28.2, 30.2, 32.3, 33.8, 34.0, 37.9, 39.8, 48.2, 51.1 , 55.2, 57.5, 60.6, 61.1 , 66.9, 67.5, 69.1 , 70.0, 78.1 , 80.3, 113.9, 127.5, 128.0, 128.3, 128.4, 128.5, 129.8, 1315.3, 136.2, 156.9, 158.4, 170.1 , 170.9, 171.2, 171.9, 172.4. IR (neto) 3297.6, 2962.0, 1744.0, 1658.8, 1514.2, 1166.6. HRMS m/z calculado para CsyHrgNsChsNa 1096.5470 (M+Na): encontrado 1096.5498. Macrociclo de [Ala4]-Tamandar¡n B (74): A una solución del precursor lineal protegido 73 (102 mg, 0.09 mmoles) en MeOH (88 mi), bajo argón, se añadió Pd(OH)2 (44 mg). La reacción se purgó con H2 y se agitó durante la noche bajo atmósfera de H2 (1 atm). La mezcla se filtró a través de Celite® y el filtrado se concentró para dar el precursor lineal libre 14 (77 mg, 96%) como un aceite amarillo. El precursor lineal de amioácido crudo (77 mg, 0.91 mmoles) se disolvió en CH3CN (20 mi) y se enfrió a 0°C. HATU (815 mg, 0.22 mmoles) se añadió seguido por la adición gota a gota de NNM (20 µ?, 1.82 mmoles). La reacción se agitó a 0°C durante 1 hora y después durante la noche. La mezcla de reacción se concentró bajo vacío, se diluyó con EtOAc (15 mi), y se lavó con KHS04 al 10% (15 mi), NaHC03 al 5% (15 mi) y NaCI (15 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 2/1)
para dar el macrociclo protegido 74 (45 mg, 60%) como espuma blanca. Rf 0.24 (AcOEt/hexanos 1/2). [a]D20 = -33.09 (c = 1 , CHCI3). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.92-1.04 (m, 18H), 1.16 (d, J= 6.8 Hz, 3H), 1.17-1.30 (m, 3H), 1.49 (s, 9H), 1.51-1.61 (m, 1 H), 1.73-1.75 (m, 1 H), 1.83-1.86 (m, 1 H), 1.93-1.97 (m, 1H), 2.30-2.40 (m, 1H), 2.57-2.39 (m, 1 H), 3.00-3.05 (m, 1 H), 3.08 (s, 3H); 3.19-3.21 (m, 1 H), 3.49-3.51 (m, 1H), 3.82 (s, 3H), 3.98-4.00 (m, 1 H), 5.01-5.06 (m, 2H), 5.27-5.30 (m, 1H), 5.56-5.66 (m, 1H), 6.67-6.69 (m, 1 H), 6.88 (d, J= 7.9Hz, 2H), 7.00-7.09 (m, 1 H), 7.12 (d, 2H). 13C-RMN (125 MHz, CDCI3): 15.1 , 18.4, 18.9, 20.9, 21.1, 23.2, 24.0, 24.8, 24.9, 25.5, 28.0, 28.1, 30.1 , 33.7, 34.4, 39.01 , 39.3, 45.4, 47.1 , 51.2, 55.3, 69.3, 71.9, 79.5, 80.6, 114.1 , 114.2, 129.9, 132.3, 156.1 , 169.01 , 170.9, 171.5, 172.3, 173.2. HRMS m/z calculado para OnHes^O^Na 842.4527 (M+Na): encontrado 842.4545. [A -Ala4]-Tamandarin B (75): A una solución del macrociclo protegido con Boc 74 (11 mg, 0.013 mmoles) en CLAR dioxano (5 mi) se añadió una solución de HCI en dioxano (5 mi). La solución resultante se agitó a temperatura ambiente durante 4 horas. La solución se concentró, y el residuo se diluyó con CH2CI2 y se concentró nuevamente para dar la sal de clorhidrato (rendimiento cuantitativo) como un sólido blanco, que se usó directamente en el siguiente paso. A una mezcla del sal de amina de macrociclo (10 mg, 0.013 mmoles) y cadena lateral (6.2 mg, 0.019 mmoles) en CH2CI2 (2 mi) a 0°C se añadió BOP (8.4 mg, 0.019 mmoles) y NMM (6 µ?,
0.052 mmoles). Después de 30 minutos a 0°C, la reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche. La reacción se trató con solución de NaCI (5 mi, saturado) y se extrajo con EtOAc (2 x 10 mi). Las capas orgánicas se lavaron con HCI al 10% (5 mi), NaHC03 al 5% (5 mi) y NaCI (5 mi, saturado), se secaron (Na2S04), se filtraron y se concentraron. El aceite crudo (10 mg, 77 %) se purificó por CLAR. 1H-RMN (300 MHz, CDCI3): d 0.82-1.46 (m, 32H), 1.46-2.10 (m, 12H), 2.16 (m, 4H), 2.65 (m, 1 H), 2.82-3.01 (m, 1 H), 3.05 (s, 3H), 3.20 (s, 3H), 3.49-3.55 (m, 2H), 3.63-3.92 (m, 5H), 3.85 (s, 3H), 4.09 (m, 1H), 4.32-4.43 (m, 2H), 4.60-4.65 (m, 1H), 4.75 (t, J= 6.7, 1H), 4.88 (t, J=8.0, 1 H), 5.01 (d, J= 5.3, 1H), 5.24 (s, 2H), 6.64-6.66 (m, 1 H), 6.85 (d, J=8.7 Hz, 2H), 7.14 (d, J=8.8 Hz, 2H), 7.22-7.23 (m, 1 H). E calculado para
1016.2. Encontrado: 1016.4 (M+H)+.
EJEMPLO 7 Síntesis de L- e-Ala4 Tamandarin B
Un análogo de L-metilalanina de tamandarin B (L-Me-Ala4 Tamandarin B) se sintetizó como se muestra en los esquemas 21 y 22. El compuesto 85 se hizo reaccionar después para formar el análogo de L-metilalaninina como se describe a continuación.
ESQUEMA 21
ESQUEMA 22
Boc-L-/V-Metilalan¡na (76): A una solución agitada de L-Boc-alanina (5 g, 26.4 mmoles) en THF (80 mi), a 0°C, se añadió en porciones KOH en polvo fino (10.4 g, 187 mmoles), seguido por la adición de sulfato ácido de tetrabutilamonio (0.5 g, 10% en peso). Después, sulfato de dimetilo (10 mi, 105 mmoles) se añadió gota a gota durante 15 minutos. La reacción se agitó durante 30 minutos adicionales, y se añadió H2O (50 mi). Después de agitar 5 horas a temperatura ambiente, se añadió solución de hidróxido de amonio acuoso al 20% (20 mi). La reacción se diluyó con éter (100 mi), la capa acuosa se separó, y la capa orgánica se extrajo con NaHC03 acuoso saturado (2 x 40 mi). Las capas acuosas combinadas se acidificaron a un pH de 1 con KHSO4 1 M y se extrajeron con EtOAc (2 x 200 mi). Las capas orgánicas se combinaron, se secaron (Na2S04), se filtraron y se concentraron. El ácido resultante 76 (4.3 g, 80%) se obtuvo como un aceite amarillo y se usó en el siguiente paso sin purificación. H-R N (500 MHz, CDCI3): 1.43-1.55 (m, 12H), 2.91 (br s, 3H),
4.54-4.58 (m, H), 4.89-4.93 (m, 1 H). Ester bencílico de N-Boc-L-/V-Metilalanina (77): A una solución de L-Boc-A/-metiIalanina 76 (2.1 g, 10.3 mmoles) en THF (10 mi), enfriado a 0 °C, se añadieron Et^N (1.6 mi, 11.3 mmoles) y bromuro de bencilo (1.3 mi, 11.3 mmoles). La mezcla se agitó 18 horas a temperatura ambiente, y el solvente se evaporó a presión reducida. El residuo se evaporó, se diluyó con CH2CI2 (20 mi) y se lavó con HCI 1 N (15 mi), NaHC03 saturado (15 mi), y H20 (15 mi). Las capas orgánicas se combinaron, se secaron (Na2SC> ), se filtraron
y se concentraron. El éster resultante 77 (2.25 g, 95%) se obtuvo como un aceite amarillo y se usó en el siguiente paso sin purificación. 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 1.44-1.54 (m, 12H), 2.81 y 2.90 (br s, 3H), 4.49-4.53 (m, 1 H), 4.83-4.89 (m, 1H), 5.18 (s, 2H), 7.27-7.43 (m, 5H). Ester bencílico de ácido N-Boc-L-Leucil-L-N-Metilalanina (79): A una solución de éster bencílico de L-/V-Boc-/V-metilalanina (77) (320 mg, 1.09 mmoles) en CLAR dioxano (8 mi) se añadió una solución saturada de HCI en dioxano (5 mi). La solución resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 horas. La solución se concentró y el residuo se diluyó con CH2CI2 y se concentró nuevamente para dar la sal de clorhidrato (rendimiento cuantitativo) como un sólido blanco, que se usó directamente en el siguiente paso. A una solución de sal de clorhidrato (250 mg, 1.09 mmoles) en CH2CI2 (10 mi) y D F (5 mi), enfriada a 0°C, se añadió NM (221 µ?, 2.08 mmoles). Después de 15 minutos, se añadieron /V-Boc-L-leucina monohidratada (246 mg, 0.99 mmoles) y HATU (779 mg, 2.08 mmoles). La mezcla de reacción se agitó 14 horas a temperatura ambiente y CH2CI2 se evaporó. El residuo resultante se diluyó con éter etílico (25 mi) y se lavó con HCI 1 N (20 mi), NaHC03 saturado (20 mi,) y salmuera (20 mi), se secó (Na2S04), se filtró y se concentró. El aceite crudo se usó sin purificación en el siguiente paso. 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.91 (d, J = 6.7 Hz, 3H), 0.99 (d, J =
6.7 Hz, 3H), 1.48 (m, 13H), 1.69-1.78 (m, 2H), 3.01 (s, 3H), 4.60-4.71 (m, 1 H), 5.10-5.29 (m, 3H), 5.35- 5.48 (m, 1 H), 7.31-7.42 (m, 5H). HRMS m/z calculado para C22H34N205Na (M+Na): 429.2365
encontrado 429.2385. Ester bencílico de ácido N-h¡droxivaler¡l-N-L-Leucil-/V-L-Metilalanina (81): A una solución del dipéptido 79 (360 mg) en CLAR dioxano (10 mi) se añadió una solución saturada de HCI en dioxano (6 mi). La solución resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 horas. La solución se concentró y el residuo se diluyó con CH2CI2 y se concentró nuevamente para dar la sal de clorhidrato 80 (330 mg, rendimiento cuantitativo) como un sólido blanco, que se usó directamente en el siguiente paso. A una solución de la sal de clorhidrato 80 (303 mg, 0.88 mmoles) en CH2CI2 (2 mi), enfriada a 0°C, se añadió NMM (108 µ?, 0.96 mmoles). Después de 15 minutos, ácido hidroxivalérico (104 mg, 0.88 mmoles) y DCC (200 mg, 0.96 mmoles) se añadieron en porciones. La mezcla de reacción se agitó 14 horas a temperatura ambiente, se diluyó con CH2CI2 (20 mi), se lavó con HCI 1N (20 mi), NaHCC>3 (20 mi, saturado), y salmuera (20 mi), se secó (Na2S04), se filtró, y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 2/1) para dar 81 (258 mg, 72%) como aceite incoloro. Rf 0.30 (EtOAc/hexanos 2/1). [a]D20 = -37.2 (c=1 , CH2CI2). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.87 (d, J= 6.8 Hz, 3H), 0.89 (d, J= 6.1 Hz, 3H), 0.90 (d, J= 6.1 Hz, 3H), 1.03 (d, J= 6.8 Hz, 3H), 1.42 (d, J= 7.3 Hz, 3H), 1.55-1.66 (m, 1 H), 1.66-.1.76 (m, 1 H), 2.14-2.20 (m, 1 H), 3.02 (s, 3H), 3.98 (d, J=IHz, 1 H), 4.98-5.02 (m, 1 H), 5.17 (m, 2H), 5.37 (c, J= 6.9 Hz, 2H), 7.29-7.40 (m, 5H).
13C-RMN (125 MHz, CDCI3): 14.07, 15.5, 19.12, 21.5, 21.6, 23.1 , 23.3, 24.6, 24.7, 25.4, 31.0, 31.7, 33.4, 41.3, 47.2. 52.3. 67.0. 76.1. 128.2. 128.4. 128.6. 135.3. 171.3. 173.3. 173.5. IR (neto) 3378.8, 2958.9, 1740.3, 1652.0, 1635.5, 1558.0, 1506.2, 1456.2, 1196.1 , 1086.6. HR S m/z calculado para C22H34N205Na (M+Na): 429.2365 encontrado 429.2370. Ester bencílico de /V-Hidroxivaleril-/V-L-Leucil-A/-L-metilalanina de ácido (3S,4f?)-4-ter-butoxicarbonilam¡no-5-metil-3-(ter-butildimetil-silaniloxi) hexanoico (82): A una solución del péptido 81 (245 mg, 0.61 mmoles) en CH2CI2 (4 mi), enfriada a -5°C, DMAP (22.4 mg, 0.15 mmoles) ácido 48 (271 mg, 0.72 mmoles) y DCC (157 mg, 0.18 mmoles) se añadieron en porciones. La mezcla de reacción se agitó 7 horas a -5°C, se filtró y se evaporó. El residuo se disolvió en CH3CN (8 mi), se filtró nuevamente y se evaporó. El aceite crudo se disolvió en EtOAc (15 mi) y se lavó con KHS04 al 10% (15 mi), NaHC03 (15 mi, saturado) y NaCI (15 mi, saturado). La capa orgánica se secó (Na2S04), y el solvente se evaporó. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 1/4) para dar 70 (325 mg, 70%) como espuma blanca. Rf 0.22 (AcOEt/hexanos 4:1). [a]D20 = -33.6 (c=1 , CH2CI2). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): mezcla de rotámeros 0.01 (s, 6H), 0.85-1.00 (m, 27H), 1.39 (d, J=6.7 Hz, 3H), 1.44 y 1.51 (s, 9H), 1.29-1.40 (m, 1 H), 1.56-1 ,70 (m, 2H), 1.89-1.92 (m, 1 H), 2.00-2.09 (m, 2H), 2.43-2.46 (m,
1 H), 2.66-2.70 (m, 1 H), 2.69-2.70 (m, 1 H), 2.94 y 3.01 (s, 3H), 3.43-3.46 (m, 1 H), 3.60-3.65 (m, 1 H), 3.98-4.02 (m, 4H), 4.09-4.14 (m, 2H), 4.31 (d, J=7.8 Hz, 1 H), 4.81-4.82 (m, 1 H), 4.99-5.13 (m, 2H), 5.15-5.21 (m, 1 H), 6.63 (d, J= 7.2 Hz, 1 H), 6.74 (d, J= 5.2 Hz, 1 H), 7.18-7.30 (m, 5H), 8.39 (d, J= 6.5 Hz, 1 H). 3C-RMN (125 MHz, CDCI3): -5.0, -4.5, 13.9, 14.1 , 14.7, 16.5,
17.6, 18.1 , 18.5, 18.8, 20.4, 21.3, 21.5, 23.2, 24.6, 24.7, 25.7, 26.9, 27.7, 28.4, 30.1 , 30.4, 30.7, 30.9, 39.3, 39.9, 41.8, 42.8, 47.0, 51.9, 52.3, 59.4, 60.2, 63.0,
66.7, 66.9, 70.1 , 71.4, 78.9, 79.2, 79.4, 82.4, 128.08, 128.2, 128.3, 128.5, 135.4, 135.5, 156.2, 157.3, 169.1 , 169.7, 170.8, 171.0, 171.2, 171.6, 172.5,
173.6.IR (neto) 2959.1, 1740.5, 1694.0, 1644.4, 1521 .2, 1471.5, 1387.0, 1252.7 1166.6, 1086.1. HRMS m/z calculado para C4oH69 3OgS¡Na (M+Na): 786.4700 encontrado 786.4707. Precursor lineal [/V- e-Ala4]-Tamandarin B protegido (84): A una solución de 82 (285 mg, 0.37 mmoles) en dioxano (5 mi), enfriada a 0°C, se añadió una solución de HCI en dioxano (5 mi). La solución resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 horas. La solución se concentró, y el residuo se diluyó con CH2CI2 y se concentró nuevamente para dar la sal de clorhidrato 83 (218 mg, rendimiento cuantitativo) como un sólido blanco, que se usó directamente en el siguiente paso. A una mezcla de la sal de clorhidrato 83 (218 mg, 0.37 mmoles) HBTU (147.3 mg, 0.38 mmoles), HOBt (50 mg, 0.37 mmoles) y ácido Tyr-Thr 72 (201 mg, 0.37 mmoles), enfriada a -
5°C, se añadió una solución de CH2CI2/DMF 2/1 (10 mi), la reacción se agitó 5 minutos, y se añadió DIPEA (264 µ?, 1.48 mmoles). La solución resultante se agitó a -5°C durante la noche, se diluyó con í-BuOMe (25 mi), se lavó con KHS0 al 10% (20 mi), NaHC03 (20 mi, saturado) y NaCI (20 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, gradiente de EtOAc/hexanos 1/1) para dar 84 (280 mg, 69%). Rf 0.22 (AcOEt/hexanos 1:1). [a]D20 = -45.8 (c=1 , CH2CI2). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.87-1.01 (m, 18H), 1.00-1.16 (m, 4H), .28 (d, J=6.9 Hz, 3H), 1.47 (s, 9H), 1.68-1.69 (m, 2H), 1.70- .77 (m, 1 H), 2.07-2.09 (m, 1H), 2.22-2.25 (m, 1H), 2.75-2.77 (m, 1H), 2.85, 2.87 (m, 1H), 2.88 (s, 3H), 2.98 (s, 3H), 3.23 (dd, J=7.3 y 14.3 Hz, 1H), 3.77 (s, 3H), 4.10-4.15 (m, 1H), 4.21-4.28 (m, 2H), 4.35-4.38 (m, 1 H), 4.60-4.66 (m, 1H), 5.00-5.12 (m, 2H), 5.20-5.33 (m, 4H), 5.25-5.30 (m, 1H), 5.58 (d, J= 7.3 Hz, 1H), 6.79 (d, J= 8.3 Hz, 2H), 7.02 (m, 1H), 7.09 (d, J= 7.3 Hz, 1H), 7.20 (m, 1H), 7.29-7.37 (m, 0H). 3C-RMN (125 MHz, CDCI3): 14.4, 16.8, 17.8, 18.6, 19.0, 20.7, 21.7, 23.7, 25.1 , 28.5, 28.6, 30.9, 31.3, 32.3, 34.5, 39.0, 41.1 , 41.2, 47.6, 52.7, 55.6, 58.1, 61.2, 67.9, 69.2, 70.5, 71.0, 78.6, 81.1 , 114.3, 128.05, 128.4, 128.6, 128.8, 129.0, 130.3, 135.7, 136.8, 156.1, 157.3, 158.8, 169.9, 170.4, 171.4, 171.6, 173.7. IR (neto) 3318.3, 2961.1, 2993.3, 1741.8, 1683.1, 1636.1, 1514.0, 1455.7, 1306.1, 1247.8, 1175.8.
HRMS /z calculado para
1098.2756 (M+Na): encontrado 1098.5657. Macrociclo de [/V-Me-Ala4]-Tamandarin B (85): A una solución del precursor lineal protegido 84 (280 mg, 0.33 mmoles) en MeOH (20 mi), bajo argón, se añadió Pd(OH)2 (100 mg). La reacción se purgó con H2 y se agitó durante la noche bajo atmósfera de H2 (1 atm). La mezcla se filtró a través de Celite®, y el filtrado se concentró para dar el precursor lineal libre (208 mg, 94%) como un aceite amarillo. El precursor lineal de amioácido crudo (208 mg, 0.24 mmoles) se disolvió en CH3CN (50 mi) y se enfrió a 0 °C. Se añadió HATU (219 mg, 0.57 mmoles) seguido por la adición gota a gota de NNM (51 µ?, 0.48 mmoles). La mezcla de reacción se agitó a 0°C durante 1 hora y después durante la noche. La mezcla de reacción se concentró bajo vacío, se diluyó con EtOAc (30 mi), se lavó con KHSO4 al 10% (25 mi), NaHC03 al 5% (25 mi) y NaCI (25 mi, saturado), se secó (Na2SO4), se filtró, y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 2/1) para dar el macrociclo protegido 85 (94 mg, 48%) como una espuma blanca. Rf 0.30 (AcOEt/hexanos 1/2). [ ]D20 = -28.77 (c = 1, CHCl3). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.88-1.00 (m, 17H), 1.22-1.33 (m, 3H), 1.17- 1.30 (m, 4H), 1.49 (s, 9H), 1.48-1.52 (m, 1H), 1.97-2.05 (m, 2H), 2.09-2.14 (m, 1 H), 2.30-2.40 (m, 1 H), 2.51 (dd, J= 7.0 y 13.2 Hz, 1 H), 2.59-2.61 (m, 2H), 2.80 y 2.91 (s, 3H), 2.88-2.91 (m, 1H), 3.09 y 3.15 (s, 3H), 3.10-3.15 (m, 1 H), 3.28-3.33 (m, 1H), 3.49-3.51 (m, 1 H), 3.75 y 3.78 (s, 3H), 4.12-
4.13 (m, 1 H), 4.22-4.23 (m, 1 H), 4.51-4.52 (m, 1 H), 4.92-4.93 (m, 1H), 4.94 (d, J=5.8 Hz, 1H), 4.98-5.05 (m, 2H), 5.19-5.21 (m, 1 H), 5.25-5.27 (m, 1H), 6.80 (t, J= 6.5 Hz, 2H), 7.03 (dd, J= 8.5 y 11.7 Hz, 2H), 7.40 (d, J= 8.6 Hz, 1H), 7.71 (d, J= 9.2 Hz, 1 H), 7.89 (d, J= 8.1 Hz, 1H). 3C-RMN (125 MHz, CDCI3): 14.1 , 14.8, 15.5, 18.3, 18.8, 19.0,
19.4, 20.6, 23.8, 23.9, 25.0, 25.3, 28.4, 30.1 , 30.2, 30.8, 30.9, 33.9, 34.8, 38.9, 39.3, 47.7, 48.2, 51.3, 55.6, 56.5, 62.0 66.6, 69.3, 69.5, 70.3, 71.5, 79.3, 80.9, 81.0, 114.4, 114.7, 128.4, 129.7, 130.2, 130.4, 130.8, 156.2, 156.4, 159.0, 159.2, 169.1 , 170.0, 170.2, 171.4, 171.8, 172.0, 172.9, 174.1 , 174.3. IR (neto) 3334.2, 2960.5, 1745.1 , 1658.6, 1961.2, 1514.1 ,
1248.5, 1 164.1 , 1082.6. HRMS m/z calculado para C42H67N5Oi2Na 856.4683 (M+Na): encontrado 856.4617. [A/-Me-Ala4]-Tamandarin B (120): A una solución del macrociclo protegido con Boc 85 (15 mg, 0.018 mmoles) en CLAR dioxano (5 ml) se añadió una solución de HCI en dioxano (5 ml). La solución resultante se agitó a temperatura ambiente durante 4 horas. La solución se concentró, y el residuo se diluyó con CH2CI2 y se concentró nuevamente para dar la sal de clorhidrato (14 mg, rendimiento cuantitativo) como un sólido blanco, que se usó directamente en el siguiente paso. A una mezcla del sal de amina de macrociclo (14 mg, 0.018 mmoles) y cadena lateral (10 mg, 0.031 mmoles) en CH2Cl2 (3 ml) a 0°C se añadió BOP (14 mg, 0.031 mmoles) y NMM (9 µ?, 0.72 mmoles). Después de 30 minutos a 0°C, la reacción se agitó a temperatura
ambiente durante la noche La reacción se trató con solución de NaCI (10 mi, saturado) y se extrajo con EtOAc (3 x 10 mi). Las capas orgánicas se lavaron con HCI al 10% (10 mi), NaHC03 al 5% (10 mi) y NaCI (10 mi, saturado), se secaron ( a2S04), se filtraron y se concentraron. El aceite crudo (13 mg) se purificó por CLAR.
EJEMPLO 8 Síntesis de L-3-(2-naftil)alanina5 Tamandarin B
Un análogo de naftilalanina de tamandarin (L-3-(2-naftiI) alanina5
Tamandarin B) se preparó como se muestra en los esquemas 23-26 y se describen a continuación.
ESQUEMA 23
ESQUEMA 24
ESQUEMA 25
20 91 92
ESQUEMA 26
Ester fenacílico de L-N-Boc-Treonina (86): A una suspensión agitada de L-/V-Boc-treonina (2 g, 9.13 mmoles) en EtOAc (20 mi), enfriada a 0°C, se añadieron Et3N (1.31 mi, 9.13 mmoles) y bromoacetofenona (1.82 g, 9.13 mmoles). La mezcla resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 días, se diluyó con EtOAc (50 mi) y se lavó con soluciones de HCI al 10% (20 mi), NaHC03 al 5% (20mL) y NaCI saturado (20 mi). La capa orgánica se secó (Na2S04), y el solvente se evaporó. El residuo se trituró con éter y se filtró para dar 86 (2.8 g, 83%) como espuma amarilla. Rf = 0.55 (AcOEt/hexanos 1/1). [a]D20 = -29.4 (c = 2, AcOEt). 1H-RMN (300 MHz, CDCI3): 1.31 (d, J= 6.6 Hz, 3H), 1 ,46 (s, 9H), 3.77 (s, 1 H), 4,44 (m, 1H), 4.60 (m, 1H), 5.34 (d, J=16.5 Hz, 1H), 5.37 (m, 1 H), 5,68 (d, J= 16.7 Hz, 1H), 7.51 (m, 2H), 7.65 (m, 1H), 7.92 (m, 1H). L-A/-Cbz-/V-Metil-2-naftilalanina (87): A una solución agitada de L-/V-Cbz-2-naftilalanina (0.80 g, 2.29 mmoles) en THF (40 mi), a 0°C, se añadió en porciones KOH en polvo fino (0.89 g, 16.0 mmoles), seguido por la
adición de sulfato ácido de tetrabutiiamonio (80 mg, 10% en peso). Después, se añadió gota a gota sulfato de dimetilo (0.86 mi, 9.16 mmoles) durante 15 minutos. La reacción se agitó durante 30 minutos adicionales y se añadió H2O (50 mi), después de agitar 5 horas a temperatura ambiente, se añadió solución de hidróxido de amonio acuoso al 20% (10 mi). La reacción se diluyó con éter (50 mi), la capa acuosa se separó y la capa orgánica se extrajo con NaHCC>3 acuoso saturado (2 x 20 mi). Las capas acuosas combinadas se acidificaron a pH 1 con KHSO4 1M y se extrajeron con EtOAc (2 x 100 mi). Las capas orgánicas se combinaron, se secaron (I^SC ), se filtraron y se concentraron. El ácido resultante 87 (832 mg, 90%) se obtuvo como un aceite amarillo y se usó en el siguiente paso sin purificación. 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 2,89 y 2.94 (s, 3H), 2.27-3.32 (m, 1 H), 3.46-3.55 (m, 1 H), 4.97-5.09 (m, 3H), 7.12-7.52 (m, 12H). Ester fenacílico de 0-(L-/V-Cbz-/V-Metil-2-naft¡lalan¡na)-L-A/-Boc-treonina (88): A una solución de éster fenacílico de L-A/-Boc-treonina 86 (852 mg. 2.29 mmoles) en CH2CI2 (15 mi), enfriada a 0°C, se añadieron DMAP (84 mg, 0.68 mmoles) y L-N-Cbz-W-metilnaftilalanina 87 (832 mg, 2.29 mmoles). Después de agitar 10 minutos a 0°C, se añadió DCC (519 mg, 2.52 mmoles) se añadió. La mezcla de reacción se agitó durante la noche a temperatura ambiente. La mezcla se filtró, y el filtrado se concentró a sequedad. El residuo se disolvió en CH3CN (15 mi), se filtró nuevamente, y se evaporó. El aceite crudo se disolvió en EtOAc (50 mi) y se lavó con KHSO4 al 10% (50 mi), NaHCC>3 (50 mi, saturado) y NaCI (50 mi, saturado). La capa orgánica se secó
(Na2S04), y el solvente se evaporó. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, gradiente EtOAc/hexanos 3/1) para dar el dipéptido 88 (1.02 g, 68%) como un aceite amarillo pálido. Rf 0.25 (AcOEt/hexanos 1 :3). [oo]D20 = -27.6 (c = 1 , CH2CI2). H-RMN (500 MHz, CDCI3): 1.22 (d, J= 6.9 Hz, 3H), 1.49 (s, 9H),
2.77 y 2.92 (m, 3H), 3.21-3.31 (m, 1H), 3.50-3.56 (m, 1H), 3.75 (m, 1H), 4.46-4.48 (m, 1H), 4.67-4.69 (m, 1H), 5.00-5.71 (m, 4H), 7.16-7.46 (m, 3H), 7.47-7.64 (m, 4H), 7.51-7.94 (m, 5H). 3C-RMN (125 MHz, CDCI3): 17.0, 17.3, 28.7, 35.3, 31.7, 32.0, 35.38, 39.8, 50.1, 57.5, 59.8, 66.9, 67.3, 67.6, 68.7, 80.0, 125.9, 126.4, 127.5, 127.8, 127.9, 128.0, 128.2, 128.4, 128.8, 129.3, 129.5, 132.7, 133.8, 133.9, 134.4, 135.0, 169.3, 169.7, 171.5, 193.6. IR (neto) 3433. 6,2977.9, 1753.9, 1707.6, 1598.4, 1510.7, 1450.0, 1367.5, 1314.5, 1161.2. 0-(L-/V-Cbz-/V-metilnaftiIalanina)-L-/V-Boc-treonina (89): A una solución de éster serinfenacílico 88 (500 mg, 0.75 mmoles) en AcOH acuoso (7 mi, 90%), enfriada a 0°C, se añadió Zn en polvo (383 mg, 5.48 mmoles). La mezcla resultante se agitó 3 horas a 0°C, se filtró sobre Celite®, y el Celite® se lavó con EtOAc (25 mi). El filtrado se lavó con KHS0 al 10% (20 mi), NaHCC>3 (20 mi, saturado), y NaCI (20 mi, saturado). La capa orgánica se secó (Na2S04), y el solvente se evaporó. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, MeOH/CH2CI2 1/9) para dar el ácido 89 (248 mg, 60%) como espuma blanca.
Rf 0.35 (MeOH/CH2CI2 1/9). [a]D20 = +7.10 (c=0.7, CH2CI2). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 1.29-1.32 (m, 3H), 1.48 (s, 9H), 2.78-2.80 (m, 3H), 3.17-3.22 (m, 1H), 3.25-3.54 (m, 1 H), 4.52-4.53 (m, 1H), 5.03-5.15 (m, 2H), 5.44-5.64 (m, 2H), 7.19-7.36 (m, 5H), 7.50-7.54 (m, 3H), 7.71-7.89 (m, 4H). 13C-RMN (125 Hz, CDCl3): 16.4, 16.7, 20.7, 28.1 , 31.7, 32.0, 34.6, 34.9, 39.8, 50.1, 57.3, 60.6, 66.4, 72.2, 80.0, 125.4, 125.9, 126.7, 127.5, 127.9, 128.2, 128.8, 132.2, 133.4, 134.2, 136.1, 156.1, 156.9, 169.3, 169.7, 169.8. IR (neto) 3435.1 , 2978.4, 1743.4, 1709.6, 1499.9, 1402.2,
1315.6, 1217.1 , 1162.0, 1060.6, 752.2. Precursor lineal [2-Naftilala5]-Tamandarin B protegido (90): A una solución de 56 (110 mg, 0.14 mmoles) en dioxano (5 mi), enfriada a 0°C, se añadió una solución de HCI en dioxano (5 mi). La solución resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 horas. La solución se concentró, y el residuo se diluyó con CH2CI2 y se concentró nuevamente para dar la sal de clorhidrato (85 mg, rendimiento cuantitativo) como un sólido blanco, que se usó directamente en el siguiente paso. A una mezcla de sal de clorhidrato (85 mg, 0.14 mmoles) HBTU (53 mg, 0.14 mmoles), HOBt (19 mg, 0.14 mmoles) y ácido 89 (79 mg, 0.14 mmoles), enfriada a -5°C, se añadió una solución de CH2CI2/DMF 2/1 (4 mi). La reacción se agitó 5 minutos, y se añadió DIPEA (72 µ?, 0.56 mmoles). La solución resultante se agitó a -5°C durante la noche, se diluyó con í-BuOMe (10 mi), se lavó con KHSO4 al 10% (10 mi), NaHCO3 (10
mi, saturado) y NaCI (10 mi, saturado), se secó ( a2S04), se filtró, y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, gradiente EtOAc/Hex 1/1) para dar 90 (60 mg, 54%). Rf 0.23 (AcOEt/hexanos 1 :1). [ot]D20 = -34.6 (c=1 , CH2CI2). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.89-1.01 (m, 18H), 1.26-1.29 (m,
5H), 1.48 (s, 9H), 1.70-1.62 (m, 2H), 2.03-2.22 (m, 5H), 2.21-2.25 (m, 3H), 2.55-2.60 (m, 1 H), 2.82-2.93 (m, 3H), 3.03-3.18 (m, 1H), 3.4-5-3.49 (m, 1 H), 3.60-3.79 (m, 2H), 4.12-4.15 (m, 1 H), 4.50-4.51 (m, 1 H), 4.92-5.34 (m, 6H), 5.34-5.47 (m, 1 H), 7.16-7.35 (m, 9H), 7.44-7.85 (m, 8H). 1 C-RMN (125 MHz, CDCI3): 14.1 , 16.9, 17.9, 18.4, 19.0, 18.7,
20.2, 20.9, 21.6, 23.7, 24.5, 24.7, 25.5, 28.1 , 28.2, 28.9, 29.6, 30.4, 30.6, 33.9, 38.7, 41.0, 43.0, 44.1, 46.8, 48.4, 57.9, 60.3, 60.5, 66.9, 67.0, 67.3, 68.6, 70.3, 77.9, 78.2, 79.1 , 125.5, 125.9, 127.0, 127.2, 127.5, 127.7, 127.8, 128.0, 128.3, 128.5, 130.1 , 132.2, 133.4, 135.1 , 135.2, 136.9, 142.0, 157.0, 157.2, 157.3, 169.9, 171.3, 171.9, 180.8. IR (neto) 3326.4, 3062.0, 2961.1 , 2873.6, 2248.6, 1743.7, 1681.9, 1635.0, 1537.2, 1453.5, 1367.4, 1170.2. HRMS m/z calculado para C6iH8iN501 Na (M+Na): 130.5677 encontrado 130.5634. Macrociclo de [2-Naftilala5]-Tamandarin B (92): A una solución del precursor lineal protegido 90 (60 mg, 0.054 mmoles) en MeOH bajo argón, se añadió Pd(OH)2 (21 mg). La reacción se purgó con H2 y se agitó durante la noche bajo atmósfera de H2 (1 atm). La mezcla se filtró a través de Celite®. El
filtrado se concentró para dar el precursor lineal libre 91 (45 mg, 96%) como un aceite amarillo, que se usó en el siguiente paso sin purificación. El precursor lineal de amioácido crudo (45 mg, 0.050 mmoles) se disolvió en CH3CN (10 mi) y se enfrió a 0°C. Se añadió HATU (46 mg, 0.12 mmoles) seguido por la adición gota a gota de NNM (11 µ?, 0.10 mmoles). La mezcla de reacción se agitó a 0°C durante 1 hora y después durante la noche. La mezcla de reacción se concentró bajo vacío, se diluyó con EtOAc (10 mi), se lavó con KHS04 al 10% (10 mi), NaHC03 al 5% (10 mi) y NaCI (10 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró, y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 2/1) para dar el macrociclo protegido 92 (28 mg, 65%) como espuma blanca. Rf 0.26 (AcOEt/hexanos 1/2). [cc]D20 = -55.2 (c = 1 , CHCI3). H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.90-1.02 (m, 24H), 1.29 (d, 6.6Hz, 3H), 1.48 (s, 9H), 1.71-1.85 (m, 2H), 2.05-2.09 (m, 2H), 2.19-2.23 (m.2H), 2.52 (s, 3H), 2.96 (dd, J= 4.7 y 16.9 Hz, 1H), 3.46 (dd, J= 10.7 y 14.0 Hz, 1H), 3.67 (dd, J= 4.3 y 3.9 Hz, 1H), 3.73-3.77 (m, 2H), 3.78-3.83 (m, 1H), 3.99-4.05 (m, 1H), 4.39 (dd, J= 3.1 y 10.3 Hz, 1H), 4.56-4.59 (m, 1 H), 4.92 (t, J= 12.0 Hz, 1H), 4.97-5.00 (m, 2H), 5.00-5.02 (m, 1H), 7.36-7.37 (m, 1H), 7.49-7.52 (m, 2H), 7.56-7.58 (m, 2H), 7.72-7.74 (m, 1H), 7.76-7.79 (m, 2H), 7.98-8.00 (m, 1H). 13C-RMN (125 MHz, CDCI3): 15.6, 18.4, 189, 18.9, 20.6, 21.2, 23.9, 25.3, 25.4, 28.0, 28.4, 28.5, 30.8, 35.6, 39.0, 39.3, 39.5, 47.2, 48.8, 56.3, 57.5, 60.7, 66.0, 69.3, 71.9, 79.6, 80.7, 126.3, 126.9 127.5, 127.8, 128.2,
128.5, 128.9, 132.8, 133.9, 135.9, 156.2, 169.0, 170.1, 170.9, 171.7, 172.0 173.2.IR (neto) 3339.5, 2962.0, 2872.0, 2248.4, 1742.0, 1665.7, 1635.5, 1529.6, 1451.1, 1167.4, 851.3. [2-Naftilala ]-Tamandar¡n B (93): A una solución del macrociclo protegido con Boc 92 (28 mg, 0.032 mmoles) en CLAR dioxano (3 mi) se añadió una solución de HCI en dioxano (3 mi). La solución resultante se agitó a temperatura ambiente durante 2 horas. La solución se concentró y el residuo se diluyó con CH2CI2 y se concentró nuevamente para dar la sal de clorhidrato (rendimiento cuantitativo) como un sólido blanco, que se usó directamente en el siguiente paso. A una mezcla de la sal de amina de macrociclo (25 mg, 0.031 mmoles) y cadena lateral (14.6 mg, 0.046 mmoles) en CH2CI2 (4 mi) a 0°C se añadió BOP (20.3 mg, 0.046 mmoles) y NMM (14 µ?, 0.12 mmoles). Después de 30 minutos a 0°C, la reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche. La reacción se trató con solución de NaCI (2 mi, saturado) y se extrajo con EtOAc (2 10 mi). Las capas orgánicas se lavaron con HCI al 10% (5 mi), NaHC03 al 5% (5 mi), y NaCI (5 mi, saturado), se secaron ( a2S04), se filtraron y se concentraron. El aceite crudo (8 mg, 61%) se purificó por CLAR. 1H-RMN (300 MHz, CDCI3): d 0.82-0.96 (m, 24H), 1.09-1.28 (m, 14H), 1.31 (d, J=6.8, 3H), 1.39 (d, J=6.8, 3H), 1.64 (m, 3H), 2.10 (m, 4H), 2.48 (s, 3H), 3.10 (s, 3H), 3.09-3.15 (m, 2H), 3.35-3.41 (m, 2H), 3.43-3.82 (m, 5H), 4.29- 4.33 (m, 1H), 4.42-4.47 (m, 1H), 4.65-4.70 (m, 1H), 4.72 (t, J= 6.8, 1H), 4.87 (t, J=8.3, 1H), 5.02 (d, J= 5.3, 1H), 5.29-5.32 (m, 2H), 7.24-7.27 (m, 1H),
7.45-7.63 (m, 4H), 7.67-7.83 (m, 4H). HRMS m/2 calculado para C56H83 7Oi3Na (M+Na): 1084.5946 encontrado 1084.5987.
EJEMPLO 9 Reemplazo de un enlace de éster por un enlace de amida en el macriciclo de Tamandarin
La preparación de un compuesto de conformidad con la fórmula obtuvo como se muestra en los esquemas 27 y 28.
ESQUEMA 27
00% 110
ESQUEMA 28
112 113
Ester metílico de A/-Boc-L-alo-treonina (106): A una solución de N-Boc-L-a/o-treonina (500 mg, 2.28 mmoles) en DMF (5 mi), se añadieron KHC03 (637 mg, 4.56 mmoles) y Mel (227 µ?, 3.65 mmoles) y la reacción se agitó 5 horas a temperatura ambiente. Se añadió agua (20 mi) y la mezcla se extrajo con éter (3 x 20 mi), se secó (Na2S04) y se evaporó para dar el éster metílico 106 (494 mg, 93%) que se usó sin purificación en el siguiente paso. 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 1.19-1.25 (m, 3H), 1.48 (s, 9H), 3.78 (s, 3H), 4.05-4.10 (m, 1 H), 4.32-4.40 (m, 1 H), 4.45-4.54 (m, 1 H). 2-íer-butoxicarboniIamino-1 ,3-butanodiol (107): A una solución del éster metílico 106 (450 mg, 1.93 mmoles) en EtOH (7 mi) por CLAR, enfriada a 0°C, borhidruro de sodio (146 mg, 3.86 mmoles) se añadió en
porciones. La mezcla de reacción se agitó a 0°C durante 2 horas y a temperatura ambiente durante 2 horas. La reacción se extinguió con NH4CI (saturado, 15 mi), se extrajo con AcOEt (3 x 10 mi), se secó (Na2S04) y se evaporó. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 2/1) para dar el diol 107 (347 mg, 87%) como aceite incoloro. Rf 0.21 (AcOEt/hexanos 2/1). [a]D20 = -10.7 (c = 1 , CHCI3). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 1.28 (d, J= 6.9 Hz, 3H), 1.48 (s, 9H), 3.43-3.54 (m, 1H), 3.73 (dd, J=4.0 y 14.1 Hz, 1H), 3.98 (dd, J=5.9 y 13.1 Hz, 1H), 4.00-4.05 (m, 1H), 5.33-5.40 (m, 1H). 3C-RMN (125 MHz, CDCI3): 20.3, 28.2, 28.3, 56.1, 62.4, 69.9,
79.8, 153.3. IR (neto) 3343.8, 2975.1 , 2931.7, 1686.4, 1520.0, 1366.6, 1248.9, 1171.1, 1046.3. 2-fer-butoxicarbonilam'ino-1-(ter-butildimetilsilaniloxi)-3-butanol: A una solución del diol 107 (340 mg, 1.65 mmoles) en CH2CI2 (4 mi), enfriada a 0°C, se añadieron Et3N (274 µ?, 1.98 mmoles) y DMAP (8 mg, 0.04 mmoles). La solución se agitó 5 minutos, y se añadió TBSCI (248 mg, 1.65 mmoles). La reacción se agitó 18 horas a temperatura ambiente, se extinguió con NH4CI (saturado, 15 mi) y se extrajo con CH2CI2 (3 x 10 mi), se secó (Na2S04) y se evaporó. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 1/9) para dar el alcohol de TBS (300 mg, 56%) como aceite incoloro.
Rf 0.37 (AcOEt/hexanos 1/9). [<x]D20 = -24.7 (c = 1 , CHCI3). 1H-RMN (500 Hz, CDCI3): 0.05 (s, 6H), 0.86 (s, 9H), 1.30 (d, J= 6.8 Hz, 3H), 1.47 (s, 9H), 3.46-3.51 (m, 1 H), 4.75-4.80 (m, 1 H), 4.89-4.92 (m, 1H), 3.98 (dd, J=1.9 y 11.5 Hz, 1 H), 5.22-5.30 (m, 1 H). IR (neto) 3447.8, 2954.8, 2857.1 , 2362.1, 1699.0, 1498.3,
1254.3, 1173.8, 1108.1, 836.9, 777.5. 2- íer-butox¡carbonilam¡no-1-(ter-butild¡metilsilaniloxi)-3-metilsulfoniloxibutano (108): A una solución del alcohol (100 mg, 0.31 mmoles) en CH2CI2 (10 mi), enfriada a 0°C, se añadieron Et3N (64 µ?, 0.46 mmoles) y MsCI (31 µ?, 0.40 mmoles). La solución se agitó 1 hora a temperatura ambiente, se extinguió con NH4CI (saturado, 15 mi) y se extrajo con AcOEt (3 x 10 mi), se secó ( a2S04) y se evaporó para dar 108 (113 mg, 91%). El residuo crudo se usó con purificación adicional en el siguiente paso. 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.04 (s, 6H), 0.88 (s, 9H), 1.45-1.50 (m, 12H), 2.99 (s, 3H), 3.66-3.71 (m, 1H), 4.85-4.90 (m, 1H), 4.80-4.92 (m, 1 H). 3- Azido-2-íer-butoxicarbonilamino-1-(fer-butildimetiI-silaniloxi) butano (109): A una solución del mesilato 108 (500 mg, 1.26 mmoles) en HMPA (2 mi), se añadieron NaN3 (409 mg, 6.29 mmoles) y éter 15-corona-5 éter (252 mg, 1.26 mmoles). La solución se agitó a 55°C durante 3 horas. La mezcla de reacción se añadió a EtOAc (30 mi), se lavó con salmuera (10 mi), se secó (Na2S04) y se evaporó. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 1/15) para dar azida 109 (160 mg,
34%) como un aceite incoloro. Rf 0.33 (AcOEt/hexanos 1/15). [a]D20 = -46.6 (c = 0.4, CHCI3). 1H-RMN (500 Hz, CDCI3): 0.04 (s, 6H), 0.88 (s, 9H), 1.32 (d, J= 6.7 Hz, 3H), 1.48 (s, 9H), 3.51-3.61 (m, 1H), 4.75-4.90 (m, 2H), 4.50-4.62 (m, 1H). 3C-RMN (125 MHz, CDCI3): -5.5, 14.1, 16.5, 25.8, 28.3, 31.6, 55.2, 57.2, 62.4, 174.3.IR (neto) 3326.1 , 2954.0, 2931.1, 2857.9, 2359.9, 2107.2, 1718.2, 1005.7, 1471.2, 1366.0, 1254.5, 1167.7, 1098.0, 838.1. 3-Amino-2-ter-butoxicarbonilam¡no-1-(ter-butildimetil-silaniloxi) butano (110): A una solución de azida 109 (35 mg, 0.10 mmoles) en EtOH (1 mi), bajo argón, se añadió 10% de Pd/C (7 mg). La reacción se purgó con H2 y se agitó durante la noche bajo atmósfera de H2 (1 atm). La mezcla se filtró a través de celite®. El filtrado se concentró para dar la amina 110 (29 mg, 90%). El residuo crudo se usó sin purificación adicional en el siguiente paso. 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 0.05 (s, 6H), 0.90 (s, 9H), 1.12 (d, J=
6.7 Hz, 3H), 1.47 (s, 9H), 3.21-3.31 (m, 1H), 3.42-3.48 (m, 1H), 3.63-3.82 (m, 2H), 5.01-5.10 (m, 1 H). 13C-RMN (125 MHz, CDCI3): -5.1, 19.1, 21.3, 26.2, 28.8, 47.1, 56.9, 64.5, 176.5. 3-(/V-Cbz-A/,0-dimet¡ltirosil)amino-2-íer-butoxicarbonilamino-1-(fer-butil-dimetilsilaniloxi)butano (111): A una solución de amina 110 (20 mg, 0.062 mmoles) en CH2CI2 (1 mi), enfriada a 0°C, se añadieron NMM (7 µ?, 0.069 mmoles) y HOBt (25 mg, 0.18 mmoles). La solución se agitó a 0°C
durante 15 minutos, y se añadió una solución de N-Cbz-N, O-dimetiltirosina (21) (21 mg, 0.062 mmoles) en CH2CI2 (1 mi). Finalmente, se añadió una solución de DCC (14.2 mg, 0.069 mmoles) en CH2CI2 (1 mi). La mezcla se agitó 6 horas a temperatura ambiente y se filtró para remover el precipitado. El filtrado se diluyó con CH2CI2 (10 mi) y se iavó con KHS04 al 10% (10 mi), NaHCOs al 5% (10 mi) y NaCI (10 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró, y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 1/3) para dar 1 11 (26 mg, 70%) como una espuma blanca. Rf 0.36 (AcOEt/hexanos 1/3). [a]D20 = -40.1 (c = 0.5, CHCI3). ^-R N (500 MHz, CDCI3): 0.09 (s, 6H), 0.95 (s, 9H), 1.14-1.17 (m, 3H), 1.43 (s, 9H), 2.86 (s, 3H), 3.29-3.32 (m, 1 H), 3.42-3.48 (m, 1 H), 3.60-3.68 (m, 2H), 3.82 (s, 3H), 4.17-4.18 (m, H), 4.87-4.89 (m, 1 H), 4.95-4.96 (m, 1 H), 5.02-5.14 (m, 2H), 5.21-5.22 (m, 2H), 6.34-6.37 (m, 1 H), 6.79-6.83 (m, 2H), 6.98-7.00 (m, 1 H), 7.01-7.17 (m, 2H), 7.20-7.36 (m, 5H). 13C-RMN (125 MHz, CDCI3): -5.5, 17.9, 18.2, 25.8, 28.3, 33.2, 44.5, 55.12, 62.6, 67.3, 57.1 , 66.1 , 113.8, 127.5, 127.9, 128.4, 129.8, 158.2, 171.5.IR (neto) 3328.5, 2930.3, 2856.3, 2361.0, 2346.6, 2249.0, 1708.8, 1513.7, 1452.5, 1449.5. HRMS m/z calculado para C34H53N507Na (M+Na): 666.3550 encontrado 666.3571. S-ÍN-Cbz- O-dimetiltirosi amino^-ter-butoxicarbonilamino-l-butanol (112): Una solución de 111 (15 mg, 0.086 mmoles) en AcOH (1 mi) se
agitó 15 horas a temperatura ambiente. La reacción se concentró para dar 112 (11 mg, 90%) como un aceite incoloro. El residuo crudo se usó con purificación adicional en el siguiente paso. 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): 1.04 (d, J= 6.9 Hz, 3H), 1.45 (s, 9H), 2.81 (s, 3H), 2.88-2.92 (m, 1H), 3.02-3.09 (m, 1H), 3.29-3.33 (m, 1Et), 3.51-3.62 (m, 1H), 3.70-3.79 (m, 1 H), 3.78 (s, 3H), 4.02-4.08 (m, 1 H), 4.43-4.47 (m, 1 H), 4.51-4.55 (m, 1 H), 5.05-5.18 (m, 2H), 5.22 (s, 2H), 5.98-5.99 (m, 1H), 6.72 ( (d, J= 7.9 Hz, 2H), 6.90-7.01 (m, 2H), 7.22-7.38 (m, 5H).
EJEMPLO 10 Modificación de la unidad Lac .9
Un compuesto de conformidad con la fórmula I, en donde R5 contiene una unidad de lactato modificada se prepara como se describe aquí. Acido (f?)-glicidíco (117) se preparó a partir de (S)-serina siguiendo el procedimiento descrito por Petit y Larcheveque, Org. Synth. 75:37-44 (1998).
88% 73%
117
La sal de trifluoroacetato de éster bencílico de L-prolina ( 18) se
preparó por reacción de N-Boc-prolina con bromuro de bencilo en presencia de Et3N. El grupo Boc se removió usando ácido trifluoroacético. Subsecuentemente, la reacción de ácido (R)-glicídico (117) con 119 dio el derivado de prolina 120.
119 1 7 C¾cyDMF 70% El éster bencílico es removido sin abrir la porción epóxido usando LiOH en MeOH. N-Glicidil-L-prolina se usa después para preparar porciones R5 adecuadas para preparar un compuesto de conformidad con la fórmula I, IA o II, o alternativamente, N-glicidil-L-prolina se acopla deirectamente con la amina libre del macrociclo, v.gr., compuesto 35, 61 desprotegido. Ester bencílico de N-glicidil-L-prolina (120): A una solución de L-éster bencílico de prolina (156 mg, 0.49 mmoles) en DMF (2 mi), enfriada a 0°C, se añadieron NMM (56 µ?, 0.53 mmoles) y HOBt (198 mg, 1.47 mmoles). La solución se agitó a 0°C durante 15 minutos y se añadió una solución de ácido glicídico 21 (100 mg, 1.13 mmoles) en CH2CI2 (2 mi). Finalmente, se añadió una solución de DCC (253 mg, 1.23 mmoles) en CH2CI2 (2 mi). La mezcla se agitó 16 horas a temperatura ambiente y se filtró para remover el
precipitado. El residuo se diluyó con CH2CI2 (10 mi) y se lavó con KHS04 al 10% (10 mi), NaHC03 al 5% (10 mi) y NaCI (10 mi, saturado), se secó (Na2S04), se filtró y se concentró. El aceite crudo se purificó por cromatografía en columna (gel de sílice, EtOAc/hexanos 1/1) para dar 120 (95 mg, 70%) como espuma blanca. Rf 0.26 (AcOEt/hexanos 1/1). 1H-RMN (500 MHz, CDCI3): mezcla de rotámeros 1.87-1.92 (m, 2H), 1.91-1.98 (m, 2H), 1.99-2.03 (m, 1H), 2.19-2.20 (m, 2H), 2.20-2.22 (m, 1H), 2.66-2.68 (m, 1H), 2.80-2.82 (m, 1H), 2.94-2.95 (m, 2H), 3.30-3.31 (m, 1 H), 3.56-3.57 (m, 2H), 357-370 (m, 2H), 3.72-3.85 (m, 1 H), 4.57-4.59 (m, H), 4.70-4.72 (m, 1H), 5.16 (s, 2H), 5.22-5. 29 (m, 2H), 7.25- 7.38 (m, 10H). 13C-RMN (125 MHz, CDCI3): 22.2, 24.9, 28.7, 30.9, 31.5, 45.9, 46.3, 46.4, 47.2, 48.0, 48.5, 58.7, 59.3, 66.9, 67.4, 128.1, 128.2, 128.4, 128.5, 128.7, 170.0, 182.3. HRMS m/z calculado para Ci5H17N04a (M+Na): 298.1055 encontrado 298.1047. N-Glicidil-L-prolina se prepara a partir del compuesto 120 hidrolizando el éter bencílico con LÍOH/H2O en metanol.
EJEMPLO 11 Actividad biológica de análogos de tamandarin
Los experimentos descritos en este ejemplo demuestran que los
análogos de tamandarin tienen la bioactividad deseada. Como se usa aquí, "Gl50" se refiere a la dosis de un compuesto que es capaz de producir 50% de inhibición de crecimiento celular. Gl50 se evalúa comparando el crecimiento de las células a las cuales se ha administrado un compuesto con el crecimiento de las mismas células a las cuales no se ha administrado el compuesto. Como se usa aquí, "LC50" se refiere a la dosis de un compuesto que es capaz de producir 50% de letalidad en las células. LC50 se evalúa comparando la muerte de células en una población de células a las cuales se ha administrado un compuesto con la muerte de células en una población de las mismas células a las cuales no se ha administrado el compuesto. "NCI-60" se refiere a un panel de línea de 60 células tumorales que se obtuvieron del National Cáncer Instítute (NCI, Frederick, Md. ). La "media de NCI-60 " es la GI50 o LC50 promedio para el panel tratado con el compuesto seleccionado. Los datos para los compuestos se describen en los siguientes cuadros.
CUADRO 1 Resultados in vitro de tamandarin B (unidades; Molar)
DU145 LN-caP IGROV IGROV-ET SK-BR3 SK- A549 E128 GI50 7.08E-09 5.84E-09 7.31 E-09 1.73E-07 5.44E-09 3.03E-09 7.62E-09
TGI 2.41 E-08 2.13E-08 2.91 E-08 2.04E-06 2.49E-08 1.19E-08 4.01 E-08
LC50 7.97E-08 1.42E-07 1.33E-07 9.59E-06 2.36E-07 1.19E-07 7.66E-07
K562 PANCI HT29 LOVO LOVO- HELA HELA DOX APL
GI50 8.47E-09 1.40E-08 6.32E-09 3.05E-08 1.25E-06 3.90E-09 5.97E-08
TGl 2.63E-08 5.69E-08 4.32E-08 1.61 E-07 9.59E-06 1.76E-08 1.16E-06
LC50 7.82E-08 4.13E-07 9.59E-06 9.59E-06 9.59E-06 1.20E-07 9.59E-06
CUADRO 2 Resultados in vitro de Phe5 tamandarin B (unidades: Molar)
Líneas de células
Nombre N° ATCC Especie Tejido Características A549 CCL-185 humana pulmón carcinoma de pulmón "NSCL" SK-MEL-28 HTB-72 humana melanoma melanoma maligno
HT29 HTB-38 humana colon adenocarcinoma de colon LoVo CCL-229 humana colon adenocarcinoma de colon LoVo-Dox humana colon adenocarcinoma de colon (MDR) DU-145 HTB-81 humana próstata carcinoma de próstata, sin receptores de andrógeno LN-caP CRL-1740 humana próstata adenocarcinoma de próstata, con receptores de andrógeno
SK-BR3 HTB-30 humana mama adenocarcinoma de mama, Her2/neu+, (efusión pleural) IGROV humana ovario adenocarcinoma de ovario IGROV-ET humana ovario adenocarcinoma de ovario, caracterizado como células resistentes a ET-743 HeLa CCL-2 humana cuello carcinoma epiteloide de uterino cuello uterino HeLa-APL CCL-3 humana cuello carcinoma epiteloide de uterino cuello uterino, caracterizada como células resistentes a aplidina PANC1 CRL-1469 humana páncreas carcinoma epiteloide pancreático
Inhibición de crecimiento celular por prueba colorimétrica Un tipo colorimétrico de prueba, que usa reacción de
suiforodamina B (SRB) se ha adaptado para una medición cuantitativa de crecimiento y viabilidad de las células [siguiendo la técnica descrita por Philip Skehan, et al. (1990), New colorimetric cytotoxicity assay for anticancer drug screening, J. Nati. Cáncer Inst. 82 : 1 107-1112]. Esta forma de prueba utiliza microplacas de cultivo de células de 96 pozos de 9 mm de diámetro (Faircloth, 1988 ; Mosmann, 1983). La mayoría de las líneas de células se obtuvieron del American Type Culture Collection (Depósito Norteamericano de Cultivos Tipo) (ATCC), derivadas de diferentes
tipos de cáncer humanos. Las células se mantuvieron en RPMI 1640 10% de FBS,
complementado con 0.1 g/1 de penicilina y 0.1 g/1 de sulfato de estreptomicina y después se incubaron a 37°C, 5% de CO2 y 98% de humedad. Para los experimentos, las células se cosecharon a partir de cultivos subconfluentes usando tripsina y se volvieron a suspender en medio fresco antes de ponerse en placas. Las células se sembraron en placas de microtitulación de 96 pozos, a 5 x 103 células por pozo en alícuotas de 195 µ? de medio, y se dejó que se fijaran a la superficie de la placa creciendo en el medio libre de fármaco durante 18 horas. Posteriormente, las muestras se añadieron en alícuotas de 5 µ?? en un intervalo de 10 a 10-8
se disolvieron en DMSO/EtOH/PBS (0.5:0.5:99). Después de 48 horas de exposición, el efecto antitumoral se midió por la metodología de SRB: las células se fjaron añadiendo 50 µ? de ácido tricloroacético al 50% (p/v) (TCA) y se incubaron durante 60 minutos a 4°C. Las placas se lavaron con agua desionizada y se secaron. Cien µ? de solución de SRB (0.4% p/v en ácido acético al 1%) se añadió a cada pozo de microtitulación y se incubó durante 10 minutos a temperatura ambiente. SRB no unido se removió lavando con ácido acético al 1%. Las placas se secaron con aire y el material unido es solubilizado con regulador de pH Tris. Las densidades ópticas se leyeron en un lector de placas espectrofotométrico automatizado a una sola longitud de onda de 490 nm. Se calcularon los valores para la media +/-DE a partir de los datos de pozos triplicados. Se pudieron calcular algunos parámetros para
respuetas celulares: Gl = inhibición de crecimiento, TGI = inhibición de crecimiento total (efecto citostático) y LC = aniquilación de células (efecto
citotóxico).
El cuadro 1 ilustra datos acerca de la actividad biológica de los
compuestos (en unidades molar) de la presente invención.
Compuesto 62 Compuesto 75 Compuesto 93
DU-145 GI50 6.79E-09 1.81E-06 2.17E-09 TGI 2.49E-08 4.95E-06 4.39E-09 LC50 8.26E-08 9.84E-06 8.83E-09
LN-eaP GI50 2.71 E-09 5.48E-07 1.98E-09 TGI 7.24E-09 2.97E-06 4.33E-09 LC50 5.84E-08 9.84E-06 9.70E-09
IGROV GI50 1.99E-06 1.99E-06 2.09E-09 TGI 5.29E-06 5.29E-06 1.28E-08 LC50 9.84E-06 9.84E-06 6.66E-07
IGROV-ET GI50 4.56E-07 6.86E-06 1.59E-07 TGI 1.90E-06 9.84E-06 6.54E-07 LC50 6.95E-06 9.84E-06 2.81 E-06
SK-BR-3 GI50 3.74E-09 7.89E-07 1.83E-09 TGI 4.05E-08 3.39E-06 1.89E-08 LC50 9.73E-06 9.84E-06 4.65E-06
MEL-28 GI50 1.66E-08 1.50E-06 4.14E-09 TGI 8.24E-08 3.46E-06 1.52E-08 LC50 6.75E-07 8.00E-06 8.79E-08
A-549 GI50 5.15E-08 5.85E-06 6.96E-09 TGI 3.51 E-07 9.84E-06 4.86E-08 LC50 2.90E-06 9.84E-06 5.95E-07
K-562 GI50 7.80E-08 5.87E-06 2.00E-08 TGI 3.03E-07 9.46E-06 4.73E-08 LC50 2.39E-06 9.84E-06 1.98E-07
PANC-1 GI50 3.49E-08 3.75E-06 6.24E-09 TGI 8.82E-07 9.84E-06 9.00-E-08 LC50 9.73E-06 9.84E-06 9.41 E-06
HT-29 G150 2.37E-08 4.22E-06 4.60E-09 TGI 2.03E-07 9.84E-06 6.98E-08 LC50 9.73E-06 9.84E-06 5.58E-06
LOVO GI50 3.89E-08 3.55E-06 6.84E-09 TGI 2.31 E-07 9.84E-06 4.27E-08 LC50 3.66E-06 9.84E-06 2.49R-06
LOVO-DOX GI50 2.39E-06 9.84E-06 4.29E-07 TGl 8.40E-06 9.84E-06 2.33E-06 LC50 9.73E-06 9.84E-06 9.41 E-06
HELA GI50 3.76E-09 1.18E-06 2.81 E-09 TGl 2.61 E-08 3.60E-06 9.79E-09 LC50 3.68E-07 9.84E-06 5.49E-08
HELA-APL GI50 4.11 E-07 9.84E-06 3.64E-08 TGl 5.41 E-06 9.84E-06 1.68E-07 LC50 9.73E-06 9.84E-06 2.28E-06
Habéndose descrito ahora por completo esta invención, los expertos en la técnica entenderán que lo mismo se puede realizar dentro de una amplia y equivalente gama de condiciones, formulaciones y otros parámetros sin afectar el alcance de la invención o cualquier modalidad de la misma. Todas las patentes y publicaciones aquí citadas se incorporan completamente aquí por referencia en su totalidad.
Claims (1)
- NOVEDAD DE LA INVENCION REIVINDICACIONES 1.- Un compuesto de la fórmula I: I o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde R1 y R2 son independientemente H o alquilo de C- , o R1 y R2 juntos forman el anillo de alquilo de un residuo de prolina u homoprolina; R3 se selecciona del grupo que consiste de una cadena lateral de un aminoácido y un primer fluoroforo; R4 es H o CH3; R5 es H, un grupo protector de amina, un residuo de aminoácido, un polipéptido, un péptido que contiene un segundo fluoroforo, una porción química unida a un soporte sólido, o una porción que contiene de aproximadamente 1 a aproximadamente 50 átomos que no son hidrógeno; R6 es una cadena lateral de isoleucina o una cadena lateral de valina; W es O o NH; X es O o NH; y Y es H o un grupo protector de hidroxilo; y Z es C(O) o C(0)-CH(CH3-C(0); siempre que R1 y R2 juntos formen el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R4 es metilo, X es O, y R3 es naftilmetilo. 2.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 1 , caracterizado además porque tiene la fórmula o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, en donde R1 y R2 son independientemente H o alquilo de C-M, o R1 y R2 juntos forman el anillo de alquilo de un residuo de prolina; R3 se selecciona del grupo que consiste de una cadena lateral de un aminoácido y un primer fluoroforo; R4 es H o CH3; R5 es H, un grupo protector de amina, un residuo de aminoácido, un polipéptido, un péptido que contiene un segundo fluoroforo, una porción química unida a un soporte sólido, o una porción que contiene de aproximadamente 1 a aproximadamente 30 átomos que no son hidrógeno; R6 es una cadena lateral de isoleucina o una cadena lateral de valina; X es O o NH; y Y es H o un grupo protector de hidroxilo; siempre que R1 y R2 juntos formen el anillo de alquilo de un residuo de prolina, R4 es metilo, X es O, y R3 es naftilmetilo. 3.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque R1 es H y R2 es metilo. 4.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque R y R2 son metilo. 5. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque R y R2 juntos forman el anillo de alquilo de un residuo de prolina. 6. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, 5 caracterizado además porque R3 es una cadena lateral de un aminoácido. 7. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque R3 es naftilmetilo. 8. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque R3 es un grupo benciio opcionalmente sustituido 10 con OH, OCH3l CO(C6H5), F, Cl, Br, I, CH3 o C2H5. 9. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque R3 contiene un fluoroforo. 10. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque R4 es CH3. 15 11.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque R4 es H. 12. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque R5 es H. 13. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, 20 caracterizado además porque R5 es un grupo protector de amina. 14. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque R5 es un residuo de aminoácido o un polipéptido. 15. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque R5 contiene un fluoroforo. 16. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque R5 se selecciona del grupo que consiste de -(N-metil)leucina, -(N-metil)leucina-prolina, -(N-CBz-N-metil)leucina, -(N-metil)leucina-prolina-lactato, -(N-metil)leucina-prolina-piruvato, -(N-metil)leucina-prolina-lactato-glutamina-piroglutamato( -(N-metil)leucina-prolina-lactato-glutamina-ciclopentanoato, -(N-metil)leucina-prolina-lactato-leucina-piroglutamato, -(N-metil)leucina-prolina-lactato-glutamina-ciclopentanoato, -(N-metil)leucina-prolina-alanina-leucina-piroglutamato, y -(N-metil)leucina-prolina-(N-metil)-alanina-leucina-piroglutamato. 17. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque R6 es una cadena lateral de valina. 18. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque R6 es una cadena lateral de leucina. 19. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque Y es H. 20. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque Y es un grupo protector de hidroxilo. 21.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque X es O. 22.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque X es NH. 23. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque R1 y R2 juntos forman el anillo de alquilo de un residuo de prolina; R3 es un grupo bencilo opcionalmente sustituido con uno o más seleccionados del grupo que consiste de OH, OCH3l CO(C6H5), F, Cl, Br, I, CH3 y C2H5; R4 es H; R6 es una cadena lateral de valina; X es O; y Y es H. 24. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque R es H; R2 es CH3; R3 es un grupo bencilo opcionalmente sustituido con uno o más seleccionados del grupo que consiste de OH, OCH3, CO(C6H5), F, Cl, Br, I, CH3 y C2H5; R4 es CH3; R5 es como se definió antes; R6 es una cadena lateral de valina; X es O; y Y es H. 25. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque R1 es CH3; R2 es CH3; R3 es un grupo bencilo opcionalmente sustituido con uno o más seleccionados del grupo que consiste de OH, OCH3, CO(C6H5), F, Cl, Br, I, CH3 y C2H5, preferiblemente OCH3; R4 es CH3; R6 es una cadena lateral de valina; X es O; y Y es H. 26. - El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque R y R2 juntos forman el anillo de alquilo de un residuo de prolina; R3 es un grupo naftilmetilo; R4 es CH3; R6 es una cadena lateral de valina; X es O; y Y es H. 27.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque R5 consiste de 1-5 residuos de aminoácido. 28.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque que tiene la estructura 29.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque que tiene la estructura 31.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque que tiene la estructura 32.- El compuesto de conformidad con la reivindicación 2, caracterizado además porque que tiene la estructura 33.- Un compuesto que tiene la estructura 34. - Una composición que comprende el compuesto que se describe en cualquiera de las reivindicaciones 1-33 y un excipiente o vehículo farmacéuticamente aceptable. 35. - El uso de un compuesto como el que se describe en cualquiera de las reivindicaciones 1-33, para preparar un medicamento para inhibir, tratar o prevenir tumorigénesis en un sujeto. 36. - El uso de un compuesto como el que se describe en cualquiera de las reivindicaciones 1-33, para preparar un medicamento para prevenir o inhibir el crecimiento de una célula cancerosa. 37.- El uso de un compuesto como el que se describe en cualquiera de las reivindicaciones 1-33, para preparar un medicamento para inhibir o prevenir síntesis de proteína. 38. - El uso de un compuesto como el que se describe en cualquiera de las reivindicaciones 1-33, para preparar un medicamento para incrementar apoptosis. 39. - El uso de un compuesto como el que se describe en cualquiera de las reivindicaciones 1-33, para preparar un medicamento para proveer terapia inmunosupresora a un sujeto.
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