MX2009001619A - Potenciacion de compuestos antimicoticos. - Google Patents
Potenciacion de compuestos antimicoticos.Info
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Abstract
La invención provee métodos y modelos para entender cómo interactúan los inhibidores de HDAC con compuestos de azol antimicóticos para potenciar la actividad de dichos compuestos, usando cepas fungales que tienen deficiencias selectivas de genes de HDAC fungal; la invención además provee métodos para probar agentes antimicóticos para sinergia potencial con inhibidores de HDAC, fangal, y por lo tanto provee compuestos antimicóticos que son identificados de conformidad con el métodos de la invención, y métodos para el tratamiento de infecciones micóticas usando dichos compuestos.
Description
POTENCIACION DE COMPUESTOS ANTIMICOTICOS
SOLICITUDES RELACIONADAS
Esta solicitud reclama el beneficio de la solicitud provisional de
E.U.A. Serie No. 60/822, 192, presentada el 1 1 de agosto de 2006. Las enseñanzas completas de la solicitud antes referenciada se incorporan aquí por referencia.
ANTECEDENTES DE LA INVENCION
A. CAMPO DE LA INVENCION
La invención se refiere al desarrollo de fármacos antimicóticos y el tratamiento de infección micótica. Muy particularmente, la invención se refiere a métodos de uso de histona desacetilasas de hongos como objetivos para potenciar actividad de fármacos antimicóticos. La invención además se refiere al uso de mutaciones fúngales que afectan la actividad de histona desacetilasa para identificar compuestos adecuados como agentes antimicóticos.
B. BREVE DESCRIPCION DE LA TECNICA RELACIONADA
En células eucarióticas, el ADN nuclear se asocia con histonas para formar un complejo compacto llamado cromatina. Las histonas constituyen una familia de proteínas básicas que generalmente son altamente conservadas a través de especies eucarióticas. Las histonas de núcleo, denominadas H2A, H2B, H3 y H4, se asocian para formar un núcleo de proteina. El ADN se enrolla alrededor de este núcleo de proteína, con los aminoácidos básicos de las histonas interactuando con los grupos fosfato negativamente cargados del ADN. Aproximadamente 146 pares de bases de ADN se enrollan alrededor de un núcleo de histona para constituir una partícula de nucleosoma, el motivo estructural repetido de la cromatina. Csordas, Bíochem. J. 265: 23-38 (1990) enseña que las histonas están sujetas a acetílación post-traduccional de los grupos e-amino de residuos de lisina N-terminales, una reacción que es catalizada por la histona acetil transferasa (HAT1 ). La acetilación neutraliza la carga positiva de la cadena lateral de la lisina, y se piensa que impacta la estructura de la cromatina. De hecho, Taunton et al., Science 272: 408-41 1 (1996), enseña que el acceso de factores de transcripción a las plantillas de cromatina es incrementado por hiperacetilación de histona. Taunton et al. (antes mencionado) además enseña que un enriquecimiento en histona sub-acetilada H4 se ha encontrado en regiones transcripcionalmente silenciosas del genoma.
La acetilación de historia es una modificación reversible, con la desacetilación siendo catalizada por una familia de enzimas denominadas histona desacetilasas (HDACs). La clonación molecular de secuencias de gene que codifican proteínas con actividad de HDAC ha establecido la existencia de un conjunto de isoformas de enzima HDAC discretas. Yang y Grégoire, Mol. Cell. Biol. 25:2873-2884 (2005) enseñan que, con base en análisis filogenético y homología de secuencia a Rpd3 de levadura (dependencia de potasio reducida 3), Hda1 y Sir2 (regulador de información silencioso 2), HDACs son agrupados en clases distintas. En humanos hay 18 HDACs conocidas, que se dividen en cuatro clases: clase I (HDAC1 , -2, -3 y -8; homologas a Rpd3), clase II (HDAC4, -5, -6, -7, -9 y -10; relacionadas con Hda1 ), clase III (Sirtl , -2, -3, -4, -5, -6 y -7; similares a Sir2) y clase IV (HDAC1 1 ). Las HDACs de clase I, II y IV son enzimas dependientes de zinc. Las HDACs de clase III son desacetilasas dependientes de NAD+. En Saccharomyces cerevisiae hay 10 HDACs conocidas, que se dividen en tres clases: clase I (Rpd3, Hos1 y Hos2), clase II (Hda1 y Hos3), y clase III (Sir2 y cuatro proteínas Hst (Hst1 a Hst4), homólogos de Sir2). No ha sido claro qué papeles juegan estas enzimas HDAC individuales. Trojer et al., Nucleic Acids Research 31 :3971-3981 (2003) indican que HdaA y RpdA son los que más contribuyen a la actividad de HDAC total del hongo filamentoso Aspergillus nidulans, con HdaA representando la parte principal de la actividad de HDAC. Los estudios que utilizan inhibidores de HDAC conocidos han
establecido un enlace entre acetilación y expresión de gen. Numerosos estudios han examinado la relación entre HDAC y expresión de gen. Taunton et al., Science 272:408-41 1 (1996), describe una HDAC humana que está relacionada con un regulador transcripcional de levadura. Cress et al., J. Cell. Phys. 184: 1 -16 (2000), describe que, en el contexto de cáncer humano, el papel de HDAC es como un co-represor de transcripción. Ng et al., Trends Biochem. Sci. 25: 121-126 (2000), describe HDAC como una característica penetrante de sistemas de represor transcripcional. Magnaghi-Jaulin et al., Prog. Cell Cycle Res. 4:41 -47 (2000), describe HDAC como un co-regulador transcripcional importante para progresión del ciclo celular. Se han reportado numerosos estudios de histona desacetilasas de hongos. Giaver et al., Nature 418: 387-391 (2002) describe seis homólogos de HDAC (RPD3, HDA1 , HOS1 , HOS2, HOS3 y SIR.2) en Saccharomyces cerevisiae que comparten homología de secuencia alta unos con otros, y ninguno de los cuales es esencial para el crecimiento y supervivencia de levadura. Bernstein et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 97: 13708-13713 (2000) enseña que el papel de cada HDAC en células de levadura ha sido evasivo. Suka et al., Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 63: 391 -399 (1998) enseña que RPD3p se requiere para la desacetilación de todas las lisinas en las histonas de núcleo H3, H4, H2A y H2B excepto por la lisina 16 en la histona H4. Sin embargo, Wu et al., Mol. Cell. 7: 1 17-126 (2001 ) enseña que HDA1 p específicamente desacetila las histonas H2B y H3. Por el contrario, Wang et al., Science 298: 1412-1414 (2002) enseña que HOS2p se une a la región
codificadora de genes principalmente durante la activación de genes, cuando desacetila específicamente las Usinas en colas de histona H3 y H4. Wang et al. también enseña que HOS2p está preferencialmente asociada con genes de amplio genoma de alta actividad, y que en combinación con RPD3p desacetila la región codificadora de Erg1 1 , el objetivo molecular de azoles antimicóticos. Rundlett et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 93: 14503-14508 (1996) y Trojer et al., Nucleic Acids Res. 31 : 3971 -3981 (2003) muestran que la HOS2 de S. cerevisiae es altamente homologa con HOS2 en Candida, albicans y Aspergillus fumigatus. Se han publicado otros numerosos reportes que describen inhibidores de actividad de HDAC. Por ejemplo, Richon et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 95: 3003-3007 (1998), describe que la actividad de HDAC es inhibida por tricostatin A (TSA), un producto natural aislado de Streptomyces hygroscopicus, que ha sido mostrado por Yoshida et al., J. Biol. Chem. 265: 17174-17179 (1990) y Yoshida et al., Exp. Cell Res. 177: 122-131 (1998) para inhibir la actividad de histona desacetilasa y detener la progresión del ciclo celular en células en las fases G1 y G2, y por un compuesto sintético, ácido suberoilanilidohidroxámico (SAHA). Yoshida y Beppu, Exper. Cell Res. 177: 122-131 (1998) enseña que TSA causa detención de fibroblastos de rata en las fases G1 y G2 del ciclo celular, implicando HDAC en la regulación del ciclo celular. Indeed, Finnin et al., Nature 401 :188-193 (1999), enseña que TSA y SAHA inhiben el crecimiento celular, inducen diferenciación terminal, y evitan la formación de tumores en ratones. Otros ejemplos no limitantes de
compuestos que sirven como inhibidores de HDAC incluyen los de WO 01/38322 y WO 01/70675. Trojer et al., supra, enseña que la enzima Hda1 de A. nidulans es altamente sensible al inhibidor de HDAC, TSA, mientras que se ha mostrado que HosB es altamente resistente tanto a TSA como a otro inhibidor de HDAC, toxina de HC. Smith y Edlind, Antimicrob. Agents Chemother. 46:3532-3539 (2002) probaron la capacidad de pan-inhibidores de HDAC conocidos, TSA, apicidin, butirato de sodio y trapoxin para incrementar la sensibilidad de especies fúngales seleccionadas a agentes antimicóticos de azol. Encontraron que sólo TSA fue capaz de incrementar la sensibilidad de C. albicans. Sin embargo, las concentraciones de TSA requeridas fueron más altas que aquellas tóxicas para las células de mamífero. No se encontró que TSA incrementa la sensibilidad de Candida glabrata. La solicitud co-pendiente 60/751 ,703 enseña que varios inhibidores ed HDAC potencian azoles antimicóticos contra C. albicans, C. glabrata y A. fumigatus. Sin embargo, el objetivo molecular preciso y mecanismo de sinergia con antimicóticos de azol sigue siendo desconocido. El uso, y necesidad, de agentes antimicóticos es amplia y varía desde el tratamiento de infecciones micóticas en animales y plantas; a formulaciones desinfectantes; a compuestos farmacéuticos para uso humano. Un problema principal con las formulaciones antimicóticas actuales es su toxicidad al hospedero infectado. Esto es particularmente importante en casos en donde muchas infestaciones de hongos son infecciones secundarias
ventajosas para enfermedades debilitantes, tales como SIDA, o de quimioterapia o trasplantes. De manera correspondiente, por lo menos para agentes antimicóticos que se han de administrar a humanos y otros animales, el índice terapéutico es preferiblemente tal que la toxicidad es selectiva para el hongo objetivo sin ser tóxico al hospedero. Georgopapadakou, Curr. Opin. Microbiol. 1 :547-557 (1998) enseña que las infecciones micóticas severas, causadas principalmente por especies oportunistas tales como Candida spp. y Aspergillus spp., son cada vez más comunes en pacientes inmunocomprometidos y otros pacientes vulnerables. Son causas importantes de morbidez y mortalidad en pacientes hospitalizados y en pacientes con VIH, cáncer y quienes han recibido trasplante. Infecciones micóticas por Cryptococcosis también son extremadamente comunes en pacientes con SIDA. Pneumocystis carinii es una causa principal de muerte en pacientes infectados por VIH en Norteamérica y Europa. Las infecciones por Candida son comúnmente tratadas con azoles antimicóticos que se dirigen a lanosterol desmetilasa, una enzima esencial en síntesis de ergosterol, el principal componente de la membrana de los hongos. Kaur et al., Antimicrob. Agents Chemother., 48: 1600-1613 (2004) enseña que los azoles son fungistáticos y su uso puede ser desgastado por la emergencia de resistencia a azoles, particularmente en especies de Candida diferentes a Candida albicans tales como C. glabrata. Además, el tratamiento con azol da por resultado "crecimiento reducido pero persistente", con células
de hongos sobrevivientes convirtiéndose en reservónos que pueden ser causantes de recurrencia. La principal limitación de los azoles antimicóticos es su falta de actividad fungicida, que puede contribuir a fallas de tratamiento comunes con pacientes severamente comprometidos. Vonberg y Gastmeier J. Hosp. Infect. 63:246-254 (2006) enseña que A. fumigatus es la principal especie de Aspergillus causante de aspergillosis invasiva (IA), una enfermedad amenazante de la vida con una tasa de mortalidad de 60-90%, cuya incidencia ha incrementado de manera drástica en los últimos 20 años debido a los números cada vez mayores de pacientes inmunocomprometidos. Los agentes antimicóticos actuales son limitados en el tratamiento de IA por su eficacia in vivo deficiente y toxicidad al hospedero (Latge, Clinical Microbiol. Rev., 12:310-350 (1999)). Otras infecciones micóticas que son frecuentemente fatales, especialmente en un paciente debilitado, incluyen criptococcosis (infección por Cryptococcus neoformans) y zigomicosis (infección por zigomicetes). Los inconvenientes de los agentes antimicóticos actuales, tales como los azoles, incluyen el desarrollo de resistencia, posibles interacciones fármaco-fármaco y posibles efectos en el hígado tóxicos. Seria altamente deseable proveer nuevas composiciones y métodos para tratar infección micótica. También sería altamente deseable proveer composiciones y métodos para incrementar la sensibilidad de los hongos a compuestos antimicóticos. De particular importancia, sería altamente deseable proveer dichas composiciones y métodos que son
selectivamente tóxicos para el hongo patógeno sin ser tóxicos para el hospedero. Por lo tanto, existe la necesidad de entender mejor los objetivos moleculares precisos y mecanismo de sinergia de HDACs micóticos con compuestos antimicóticos.
BREVE DESCRIPCION DE LA INVENCION
La invención provee nuevas perspectivas en los objetivos y mecanismos precisos de sinergia HDACs fúngales con compuestos antimicóticos. En un primer aspecto, la invención provee modelos para entender como los inhibidores de HDAC potencian la actividad de agentes antimicóticos. De conformidad con este aspecto, la invención provee cepas fúngales que tienen knockouts (deficiencias) selectivos de genes de HDAC fungal. Estas cepas y su uso demuestran la importancia de HOS2 de HDAC fungal y su producto de gen, Hos2 a este respecto. En un segundo aspecto, la invención provee un objetivo molecular para la acción de inhibidores de HDAC que potencian la actividad de agentes antimicóticos. De conformidad con este aspecto, la invención provee cepas mutantes fúngales de histona desacetilasa que tienen mutaciones selectivas de genes de HDAC fungal. Estas cepas y su uso demuestran la importancia de HOS2 de HDAC fungal a este respecto. De conformidad con este aspecto, la invención provee una cepa fungal muíante
de deleción de HDAC. De conformidad con este aspecto, la invención provee una cepa mutante de deleción de HOS2. De conformidad con este aspecto, la invención provee HOS2 y/o Hos2 como un objetivo molecular para la acción de inhibidores de HDAC en potenciar la actividad de agentes antimicóticos. En un tercer aspecto, la invención provee métodos para usar una cepa fungal mutante de HDAC en una prueba para determinar selectivamente un compuesto para actividad antimicótica potencial y/o para determinar selectivamente un compuesto con la capacidad para potenciar un agente antifungal. De conformidad con este aspecto, la invención provee cepas fúngales que tienen deficiencias selectivas de genes de HDAC fungal. Estas cepas y su uso demuestran la importancia de HOS2 de HDAC fungal y su producto de gen a este respecto. De conformidad con este aspecto, la invención provee una prueba de células enteras para determinar selectivamente un compuesto para actividad antimicótica potencial y/o para determinar selectivamente un compuesto con la capacidad para potenciar un agente antifungal. De conformidad con este aspecto, la invención también provee una prueba de determinación selectiva de alto rendimiento. En un cuarto aspecto, la invención provee métodos para usar un gen de HDAC fungal y/o producto de gen en una prueba para determinar selectivamente un compuesto para actividad antimicótica potencial y/o para determinar selectivamente un compuesto con la capacidad para potenciar un agente antifungal. De conformidad con este aspecto, la invención provee un gen de HDAC fungal y/o producto de gen para determinar selectivamente un
compuesto para actividad antimicótica potencial y/o determinar selectivamente un compuesto con la capacidad para potenciar un agente antifungal. Los genes y/o productos de gen demuestran la importancia del HOS2 (el gen) y Hos2 (el producto de gen) de HDAC fungal a este respecto. De conformidad con este aspecto, la invención también provee una prueba de determinación selectiva de alto rendimiento. En un quinto aspecto, la invención provee métodos para probar agentes antimicóticos para sinergia potencial con inhibidores de HDAC fungal. De conformidad con este aspecto de la invención, las cepas de prueba provistas por la invención proveen la capacidad para evaluar la sensibilidad relativa de la deficiencia de HOS2 con otra deficiencia de HDAC y cepas de tipo silvestre. Por lo tanto, en un sexto aspecto, la invención provee un compuesto antimicótico que se identifica de conformidad con los métodos de la invención. Este aspecto además provee una composición que comprende dicho compuesto antimicótico. En un séptimo aspecto, la invención provee un método para inhibir crecimiento fungal. El método de conformidad con este aspecto de la invención comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo, y tratar el hongo con un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por la inhibición de expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de actividad de un producto de gen del mismo.
En un octavo aspecto, la invención provee un método para inhibir el crecimiento reducido pero persistente de un hongo en presencia de un compuesto antimicótico. El método de conformidad con este aspecto de la invención comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo, y tratar el hongo con un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por la inhibición de expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de actividad de un producto de gen del mismo. En un noveno aspecto, la invención provee un método para inhibir la resistencia de un hongo a un compuesto antimicótico. El método de conformidad con este aspecto de la invención comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo, y tratar el hongo con el compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por la inhibición de expresión de HOS2 de HDAC o un homólogo del mismo o inhibición de actividad de un producto de gen del mismo. En un décimo aspecto, la invención provee un método para inhibir la supervivencia de un hongo en presencia de un compuesto antimicótico. El método de conformidad con este aspecto de la invención comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo, y tratar el hongo con un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por la inhibición de expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de actividad de un
producto de gen del mismo. En un décimo primer aspecto, la invención provee un método para reducir la capacidad de un hongo para resistir la actividad antimicótica de un compuesto antimicótico. El método de conformidad con este aspecto de la invención comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo, y tratar el hongo con un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por la inhibición de expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de actividad de un producto de gen del mismo. En un décimo segundo aspecto, la invención provee un método para incrementar la sensibilidad del hongo a un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por la inhibición de expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de actividad de un producto de gen de HOS2 u homólogo del mismo. El método de conformidad con este aspecto de la invención comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo. En un décimo tercer aspecto, la invención provee un método para potenciar la actividad antimicótica de un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por la inhibición de expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de actividad de un producto de gen de HOS2, u homólogo del mismo. El método de conformidad con este aspecto de la invención comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo.
En un décimo cuarto aspecto, la invención provee un método para tratar terapéuticamente un organismo que tiene una infección fungal. El método de conformidad con este aspecto de la invención comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo, en un organismo que tiene una infección fungal, y tratar el organismo con un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por la inhibición de expresión del HOS2 o un homólogo fungal del mismo o inhibición de actividad de un producto de gen del mismo. En un décimo quinto aspecto, la invención provee un método para prevenir una infección fungal en un organismo. El método de conformidad con este aspecto de la invención comprende tratar el organismo con un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por la inhibición de expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de actividad de un producto de gen del mismo, y tratar al organismo con HOS2 y/o un compuesto inhibidor de Hos2. En un décimo sexto aspecto, la invención provee un inhibidor de Hos2, o un homólogo del mismo, o HOS2 fungal o un homólogo del mismo. En una modalidad preferida de este aspecto, el inhibidor de Hos2 o el homólogo del mismo, es un compuesto de hidroximato. En un décimo séptimo aspecto, la invención provee un método para inhibir Hos2 que comprende poner en contacto el Hos2 con el inhibidor. En un décimo octavo aspecto, la invención provee una composición que comprende el inhibidor de Hos2, o un homólogo del mismo,
o el inhibidor de HOS2 fungal, o un homólogo del mismo y un vehículo farmacéuticamente aceptable. Lo anterior simplemente resume ciertos aspectos de la invención y no pretende ser de naturaleza limitante. Estos aspectos y otros aspectos y modalidades se describen en forma más completa más adelante.
BREVE DESCRIPCION DE LOS DIBUJOS
La figura 1 ilustra una representación esquemática de la estrategia usada para generar un mutante de deleción de levadura. La figura 2 ilustra los resultados de implementación exitosa e implementación no exitosa de la estrategia mostrada en la figura 1. La figura 3 muestra que un mutante de deleción de ScHOS2 es hipersensible a ketoconazol. La figura 4 muestra que un mutante de deleción de ScHOS2 es hipersensible a itraconazol. La figura 5 muestra que un mutante de deleción de ScHOS2 es hipersensible a voriconazol. La figura 6 muestra que un mutante de deleción de ScHOS2 es hipersensible a fluconazol. La figura 7 muestra que un mutante de deleción de ScHOS2 es hipersensible a fenpropimorf. La figura 8 muestra que un mutante de deleción de ScHOS2 no
s hipersensible a terbinafine.
DESCRIPCION DETALLADA DE LAS MODALIDADES PREFERIDAS
La presente invención se refiere al desarrollo de fármacos antimicóticos. Muy particularmente, la invención se refiere a métodos para usar histona desacetilasas de hongos como objetivo para potenciar actividad del fármaco antifungal. La invención provee nuevas perspectivas en los objetivos y mecanismos precisos de sinergia de HDACs fúngales con compuestos antimicóticos. Para este fin, la invención provee modelos para entender cómo los inhibidores de HDAC potencian la actividad de compuestos antimicóticos, usando cepas fúngales que tienen deficiencias (knockouts) selectivas de genes de HDAC fungal. Estas cepas y su uso demuestran la importancia de HOS2 de HDAC fúngales a este respecto. La invención además provee métodos para probar agentes antimicóticos para sinergia potencial con inhibidores de HDAC fungal, y por lo tanto provee compuestos antimicóticos que son identificados de conformidad con los métodos de la invención. La literatura de patentes y científica referida aquí establece conocimiento que está disponible para los expertos en la técnica. Las patentes expedidas, solicitudes y referencias que se citan aquí son incorporadas por referencia al mismo grado como si cada una fuera específicamente e individualmente indicada para ser incorporada por referencia. En el caso de
inconsistencias, prevalece la presente descripción. En un primer aspecto, la invención provee modelos para entender cómo los inhibidores de HDAC potencian la actividad de agentes antimicóticos. De conformidad con este aspecto, la invención provee cepas fúngales que tienen deficiencias selectivas de cada una de los genes de HDAC fungal. Estas cepas y su uso demuestran la importancia de HOS2 de HDAC fungal a este respecto. Las cepas fúngales que proveen este modelo incluyen cepas de S. cerevisiae con deficiencias individuales de RPD3, HDA1 , HOS1 , HOS2, HOS3 ó SIR2, y preferiblemente se preparan como se describe aquí más adelante. En un segundo aspecto, la invención provee un objetivo molecular para acción de inhibidores de HDAC en potenciar la actividad de agentes antimicóticos. De conformidad con este aspecto, la invención provee cepas mutantes fúngales de histona desacetilasa que tienen mutaciones selectivas de genes de HDAC fungal. Estas cepas y su uso demuestran la importancia de HOS2 de HDAC fungal a este respecto. De conformidad con este aspecto, la invención provee una cepa fungal mutante de deleción de HDAC. De conformidad con este aspecto, la invención provee una cepa mutante de deleción de HOS2. De conformidad con este aspecto, la invención provee HOS2 y/o Hos2 como un objetivo molecular para la acción de inhibidores de HDAC en potenciar la actividad de agentes antimicóticos. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, la cepa mutante fungal de histona desacetilasa tiene una
mutación selectiva que inhibe o previene la expresión de un gen de HDAC fungal. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, la mutación selectiva provee expresión de un producto de gen de una actividad de HDAC inhibida. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto, la mutación selectiva provee expresión de una enzima HDAC inactiva. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el gen de histona desacetilasa es HOS2 o un homólogo del mismo. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el producto de gen es Hos2 o un homólogo del mismo. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, la cepa fungal es una cepa fungal de S. cerevisiae. En otra modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, la cepa fungal es una cepa fungal capaz de infectar otro organismo, preferiblemente un mamífero, muy preferiblemente un humano. En otra modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, la cepa fungal es una cepa fungal patógena. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, la cepa fungal patógena es un patógeno de mamífero, preferiblemente un patógeno humano. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto, la cepa fungal se selecciona del grupo que consiste de una cepa fungal de S. cerevisiae, una cepa fungal de Candida spp. (preferiblemente una cepa fungal de C. albicans, una cepa fungal de C. glabrata, una cepa fungal de C. krusei, una cepa fungal de C. parapsilosis, una cepa fungal de C. tropicalis), una cepa
fungal de Aspergillus spp. (preferiblemente una cepa fungal de A. fumigatus, una cepa fungal de A. niger y una cepa fungal de A. flavus), una cepa fungal de Cryptococcus neoformans y una cepa fungal de Pneumocystis carinii. En otra modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el hongo se selecciona del grupo que consiste de zygomycetes (incluyendo pero sin limitarse a Rhizopus arrhizus y Mucor spp.), mohos emergentes (incluyendo pero sin limitarse a Pseudalleschería boydü, Fusarium, spp y Paecilomyces lilacinus), Coccidioides spp. (incluyendo pero sin limitarse a C. immitis), Histoplasma spp., Trichosporon spp., y dermatofitos, y cepas de los mismos de dicho grupo. En un tercer aspecto, la invención provee métodos para usar una cepa fungal muíante de HDAC en una prueba para determinar selectivamente un compuesto para potenciar la actividad antimicótica y/o para determinar selectivamente un compuesto con la capacidad para potenciar un agente antimicótico. De conformidad con este aspecto, la invención provee cepas fúngales que tienen knockouts selectivos de genes de HDAC fungal. Estas cepas y su uso demuestran la importancia de HOS2 de HDAC fúngales y su producto de gen a este respecto. De conformidad con este aspecto, la invención provee una prueba de células enteras para determinar selectivamente un compuesto para actividad antimicótica potencial y/o para determinar selectivamente un compuesto con la capacidad para potenciar un agente antimicótico. De conformidad con este aspecto, la invención también provee una prueba de determinación selectiva de alto rendimiento.
En modalidades preferidas de conformidad con este aspecto de la invención, el método comprende determinar selectivamente un compuesto para su actividad antimicótica. En una modalidad preferida, el método identifica un compuesto con actividad antimicótica potencial, dicha actividad potenciada por la inhibición de un gen de HDAC, u homólogo del mismo, o un producto de gen de HDAC, u homólogo del mismo. En modalidades preferidas de conformidad con este aspecto de la invención, los métodos comprenden proveer una cepa fungal mutante de HDAC, la mutación dando por resultado pérdida de función de la proteina codificada y poniendo en contacto la cepa fungal mutante de HDAC con el compuesto, en donde la sensibilidad de la cepa fungal mutante de HDAC al compuesto de prueba identifica el compuesto como teniendo actividad antimicótica potencial, dicha actividad potenciada por la inhibición de un gen de HDAC, u homólogo del mismo, o un producto de gen de HDAC, u homólogo del mismo. En una modalidad preferida, el método comprende además poner en contacto una cepa fungal mutante no HDAC, preferiblemente una cepa de tipo silvestre con el compuesto, en donde la sensibilidad de la cepa mutante de HDAC comparada con la sensibilidad de la cepa mutante no HDAC identifica el compuesto como teniendo actividad antimicótica potencial, dicha actividad potenciada por la inhibición de un gen de HDAC, u homólogo del mismo, o un producto de gen de HDAC, u homólogo del mismo. Opcionalmente, los pasos del método para identificar un compuesto que tiene actividad antimicótica potencial, dicha actividad
potenciada por la inhibición de un gen de HDAC, u homólogo del mismo, o un producto de gen de HDAC u homólogo del mismo, se puede repetir con una segunda cepa fungal muíante de HDAC. La segunda cepa fungal mutante de HDAC difiere en especie o género de la primera cepa y tiene genes homólogos al gen mutado de la primera cepa, los genes homólogos tienen mutaciones análogas. La sensibilidad al compuesto de prueba preferiblemente se logra midiendo la muerte de la cepa fungal, inhibición del crecimiento de la cepa fungal, incremento de marcadores sustitutos para muerte, o disminución en marcadores sustitutos para crecimiento de la cepa fungal. En un cuarto aspecto, la invención provee métodos para usar un gen de HDAC fungal y/o un producto de gen en una prueba para determinar selectivamente un compuesto para actividad antimicótica potencial y/o para determinar selectivamente un compuesto con la capacidad para potenciar un agente antimicótico. De conformidad con este aspecto, la invención provee un gen de HDAC fungal y/o producto de gen para determinar selectivamente un compuesto para actividad antimicótica potencial y/o para determinar selectivamente un compuesto con la capacidad para potenciar un agente antimicótico. Los genes y/o productos de gen demuestran la importancia de HOS2 (el gen) y Hos2 (el producto de gen) de HDAC fungal a este respecto. De conformidad con este aspecto, la invención también provee una prueba de determinación selectiva de alto rendimiento. En modalidades preferidas de conformidad con este aspecto de
la invención, el método comprende determinar selectivamente un compuesto para su actividad antimicótica y/o determinar selectivamente un compuesto con la capacidad para potenciar un agente antimicótico. En una modalidad preferida, el método identifica un compuesto que inhibe un gen de HDAC fungal, u homólogo del mismo, o un producto de gen de HDAC fungal u homólogo del mismo. En modalidades preferidas de conformidad con este aspecto de la invención, los métodos comprenden proveer la proteína de HDAC fungal u homólogo de la misma, o fragmento activo de la misma y poner en contacto la proteína u homólogo de la misma o fragmento activo de la misma con el compuesto, en donde al inhibición de actividad de HDAC de la proteína u homólogo de la misma o fragmento activo de la misma identifica el compuesto como teniendo actividad antimicótica potencial o la capacidad para potenciar la actividad antimicótica de un agente antimicótico. En una modalidad preferida, la proteína de HDAC fungal es HOS2 o un homólogo de la misma, o un fragmento activo de la misma. En una modalidad preferida, el método comprende además poner en contacto una cepa fungal mutante no HDAC, preferiblemente una cepa de tipo silvestre con el compuesto, en donde la sensibilidad de la cepa mutante no HDAC identifica el compuesto como teniendo actividad antimicótica potencial. En una modalidad preferida, el método opcíonalmente comprende poner en contacto una cepa fungal mutante no HDAC, preferiblemente una cepa de tipo silvestre con el compuesto y un agente antimicótico, en donde la sensibilidad de la cepa en presencia del compuesto y el agente antimicótico comparada con la
sensibilidad de la cepa en presencia del agente antimicótico sólo identifica el compuesto como un compuesto con la capacidad para potenciar actividad antimicótica del agente antimicótico. La sensibilidad al compuesto de prueba preferiblemente se logra midiendo la muerte de la cepa fungal, inhibición del crecimiento de la cepa fungal, incremento de marcadores sustitutos para muerte o inhibición de crecimiento de la cepa fungal, o disminución en marcadores sustitutos para crecimiento de la cepa fungal. Opcionalmente, los pasos del método para usar un gen de HDAC fungal y/o producto de gen en una prueba para determinar selectivamente un compuesto para actividad antimicótica potencial y/o para determinar selectivamente un compuesto con la capacidad para potenciar un agente antimicótico se puede repetir con una enzima de HDAC de una segunda cepa fungal. La segunda cepa fungal difiere en especie o género de la primera cepa y tiene enzimas homologas a las enzimas de la primera cepa. En un quinto aspecto, la invención provee métodos para probar agentes antimicóticos para sinergia potencial con inhibidores de HDAC fungal, especialmente inhibidores de HOS2 u homólogos del mismo, o Hos2 u homólogos del mismo. De conformidad con este aspecto de la invención, las cepas de prueba provistas por la invención proveen la capacidad para evaluar la sensibilidad relativa de la deficiencia de HOS2 con otra deficiencia de HDAC y cepas de tipo silvestre. En modalidades preferidas de conformidad con este aspecto de
la invención, el método comprende proveer una cepa fungal con deficiencia de HOS2, tratar las cepas mutantes con deficiencia con un compuesto de prueba, determinar la sensibilidad de la cepa fungal con deficiencia de HOS2 para el compuesto de prueba, proveer una o más cepas fúngales de control seleccionadas del grupo que consisten de una cepa de tipo silvestre, una cepa muíante con deficiencia de RPD3, una cepa muíante con deficiencia de HDA1 , una cepa muíanle con deficiencia de HOS1 , una cepa mutante con deficiencia de HOS3 y una cepa muíaníe con deficiencia de SIR2, íralando una o más cepas fúngales de conírol con el compueslo de prueba, determinando la sensibilidad de una o más cepas de prueba para la cepa de prueba, y comparar la sensibilidad de la cepa con deficiencia de HOS2 al compuesto de prueba con la sensibilidad de una o más cepas de control al compuesto de prueba. El compuesío de prueba se considera que es un compueslo anlimicótico que tiene sinergia con un inhibidor de HOS2 si la cepa mutante con deficiencia de HOS2 es más sensible al compuesto de prueba que una o más cepas de control. La sensibilidad al compuesto de prueba preferiblemente se logra midiendo la muerte en la cepa fungal, inhibición del crecimiento de la cepa fungal, incremento de marcadores sustitutos para muerte o inhibición de crecimiento de la cepa fungal, o disminución en marcadores sustitutos para crecimiento de la cepa fungal. El término "cepa mutante con deficiencia", significa una cepa fungal que comprende una mutación que resulta en la pérdida de función de la
proteína codificada por un gen de HDAC. Dichas mutaciones incluyen, pero no se limitan a mutaciones puntuales, mutaciones por deleción, mutaciones por inserción e inversiones. Dichas mutaciones pueden estar en regiones codificadores o no codificadoras siempre que den por resultado la pérdida de función de un producto de gen codificado por un gen de HDAC u homólogo del mismo. Por lo tanto, en un sexto aspecto de la invención se provee un compuesto antimicótico que se identifica de conformidad con los métodos de la invención. Este aspecto además provee una composición que comprende dicho compuesto antimicótico. En un séptimo aspecto, la invención provee un método para inhibir el crecimiento fungal. El método de conformidad con este aspecto de la invención comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo, y tratar el hongo con un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por la inhibición de expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de la actividad de un producto de gen del mismo. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto, el hongo se selecciona del grupo que consiste de S. cerevisiae, Candida spp. (preferiblemente C. albicans, C. glabrata, C. krusei, C. parapsilosis y C. tropicalis), Aspergillus spp. (preferiblemente A. fumigatus, A. terreus, A. niger y A. flavus), Cryptococcus neoformans, Pneumocystis carinii y cepas de los mismos de dicho grupo.
En otra modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el hongo se selecciona del grupo que consiste de zygomycetes (incluyendo pero sin limitarse a Rhizopus arrhizus y Mucor spp), mohos emergentes (incluyendo pero sin limitarse a Pseudallescheria boydii, Fusarium spp. y Paecilomyces lilacinus), Coccidioides spp. (incluyendo pero sin limitarse a C. immitis), Histoplasma spp., Trichosporon spp. y dermatofitos, y cepas de los mismos de dicho grupo. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el compuesto antimicótico es un compuesto que inhibe síntesis de ergosterol. En otra modalidad preferida, el compuesto antimicótico es un compuesto de azol antimicótico. Los azoles preferidos incluyen imidazoles y triazoles. Los azoles más preferidos incluyen, pero no se limitan a, ketoconazol, itroconazol, fluconazol, voriconazol, posaconazol, ravuconazol o miconazol. En otra modalidad preferida, el compuesto es fenpropimorf. En un octavo aspecto, la invención provee un método para inhibir crecimiento reducido pero persistente de un hongo en presencia de un compuesto antimicótico. El método de conformidad con este aspecto de la invención comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo, y tratar el hongo con un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por inhibición de la expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de la actividad de un producto de gen del mismo. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto el
hongo se selecciona del grupo que consiste de S. cerevisiae, Candida spp. (preferiblemente C. albicans, C. glabrata, C. krusei, C. parapsilosis y C. tropicalis), Aspergillus spp. (preferiblemente A. fumigatus, A. terreus, A. niger y A. flavus), Cryptococcus neoformans, Pneumocystis carinii, y cepas de los mismos de dicho grupo. En otra modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el hongo se selecciona del grupo que consiste de zygomycetes (incluyendo pero sin limitarse a Rhizopus arrhizus y Mucor spp.), mohos emergentes (incluyendo pero sin limitarse a Pseudallescheria boydii, Fusarium, spp. y Paecilomyces lilacinus), Coccidioides spp. (incluyendo pero sin limitarse a C. immitis), Histoplasma spp., Trichosporon spp., y dermatofitos, y cepas de los mismos de dicho grupo. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el compuesto antimicótico es un compuesto que inhibe la síntesis de ergosterol. En otra modalidad preferida, el compuesto antimicótico es un compuesto antimicótico de azol. Los azoles preferidos incluyen imidazoles y triazoles. Los azoles más preferidos incluyen, pero no se limitan a, ketoconazol, itroconazol, fluconazol, voriconazol, posaconazol, ravuconazol o miconazol. En otra modalidad preferida, el compuesto es fenpropimorf. En un noveno aspecto, la invención provee un método para inhibir resistencia de un hongo a un compuesto antimicótico. El método de conformidad con este aspecto de la invención comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un
producto de gen del mismo, y tratar el hongo con el compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por inhibición de la expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de la actividad de un producto de gen del mismo. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto el hongo se selecciona del grupo que consiste de S. cerevisiae, Candida spp. (preferiblemente C. albicans, C. glabrata, C. krusei, C. parapsilosis y C. tropicalis), Aspergillus spp. (preferiblemente A. fumigatus, A. terreus, A. niger y A. flavus), Cryptococcus neoformans, Pneumocystis carinii, y cepas de los mismos de dicho grupo. En otra modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el hongo se selecciona del grupo que consiste de zygomycetes (incluyendo pero sin limitarse a Rhizopus arrhizus y Mucor spp.), mohos emergentes (incluyendo pero sin limitarse a Pseudallescheria boydii, Fusarium, spp. y Paecilomyces lilacinus), Coccidioides spp. (incluyendo pero sin limitarse a C. immitis), Histoplasma spp., Trichosporon spp., y dermatofitos, y cepas de los mismos de dicho grupo. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el compuesto antimicótico es un compuesto que inhibe la síntesis de ergosterol. En otra modalidad preferida, el compuesto antimicótico es un compuesto antimicótico de azol. Los azoles preferidos incluyen imidazoles y triazoles. Los azoles más preferidos incluyen, pero no se limitan a, ketoconazol, itroconazol, fluconazol, voriconazol, posaconazol, ravuconazol o
miconazol. En otra modalidad preferida, el compuesto es fenpropimorf. En un décimo aspecto, la invención provee un método para inhibir la supervivencia de un hongo en presencia de un compuesto antimicótico. El método de conformidad con este aspecto de la invención comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo, y tratar el hongo con un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por inhibición de la expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de la actividad de un producto de gen del mismo. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto el hongo se selecciona del grupo que consiste de S. cerevisiae, Candida spp. (preferiblemente C. albicans, C. glabrata, C. krusei, C. parapsilosis y C. tropicalis), Aspergilius spp. (preferiblemente A. fumigatus, A. terreus, A. niger y A. flavus), Cryptococcus neoformans, Pneumocystis carinii, y cepas de los mismos de dicho grupo. En otra modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el hongo se selecciona del grupo que consiste de zygomycetes (incluyendo pero sin limitarse a Rhizopus arrhizus y Mucor spp.), mohos emergentes (incluyendo pero sin limitarse a Pseudallescheria boydii, Fusarium, spp. y Paecilomyces lilacinus), Coccidioides spp. (incluyendo pero sin limitarse a C. immitis), Histoplasma spp., Trichosporon spp., y dermatofitos, y cepas de los mismos de dicho grupo. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto de
la invención, el compuesto antimicótico es un compuesto que inhibe la síntesis de ergosterol. En otra modalidad preferida, el compuesto antimicótico es un compuesto antimicótico de azol. Los azoles preferidos incluyen imidazoles y triazoles. Los azoles más preferidos incluyen, pero no se limitan a, ketoconazol, itroconazol, fluconazol, voriconazol, posaconazol, ravuconazol o miconazol. En otra modalidad preferida, el compuesto es fenpropimorf. En un décimo primer aspecto, la invención provee un método para reducir la capacidad de un hongo para resistir la actividad antimicótica de un compuesto antimicótico. El método de conformidad con este aspecto de la invención comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo, y tratar el hongo con un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por inhibición de la expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de la actividad de un producto de gen del mismo. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto el hongo se selecciona del grupo que consiste de S. cerevisiae, Candida spp. (preferiblemente C. albicans, C. glabrata, C. krusei, C. parapsilosis y C. tropicalis), Aspergillus spp. (preferiblemente A. fumigatus, A. terreus, A. niger y A. flavus), Cryptococcus neoformans, Pneumocystis carinii, y cepas de los mismos de dicho grupo. En otra modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el hongo se selecciona del grupo que consiste de zygomycetes (incluyendo pero sin limitarse a Rhizopus arrhizus y Mucor spp.), mohos
emergentes (incluyendo pero sin limitarse a Pseudallescheria boydii, Fusarium, spp. y Paecilomyces lilacinus), Coccidioides spp. (incluyendo pero sin limitarse a C. immitis), Histoplasma spp., Trichosporon spp., y dermatofitos, y cepas de los mismos de dicho grupo. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el compuesto antimicótico es un compuesto que inhibe la síntesis de ergosterol. En otra modalidad preferida, el compuesto antimicótico es un compuesto antimicótico de azol. Los azoles preferidos incluyen imidazoles y triazoles. Los azoles más preferidos incluyen, pero no se limitan a, ketoconazol, itroconazol, fluconazol, voriconazol, posaconazol, ravuconazol o miconazol. En otra modalidad preferida, el compuesto es fenpropimorf. En un décimo segundo aspecto, la invención provee un método para incrementar la sensibilidad del hongo a un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por inhibición de la expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de la actividad de un producto de gen de HOS2 u homólogo del mismo. El método de conformidad con este aspecto de la invención comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto el hongo se selecciona del grupo que consiste de S. cerevisiae, Candida spp. (preferiblemente C. albicans, C. glabrata, C. krusei, C. parapsilosis y C. tropicalis), Aspergillus spp. (preferiblemente A. fumigatus, A. terreus, A. niger y A. flavus), Cryptococcus neoformans, Pneumocystis carinii, y cepas de los
mismos de dicho grupo. En otra modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el hongo se selecciona del grupo que consiste de zygomycetes (incluyendo pero sin limitarse a Rhizopus arrhizus y Mucor spp.), mohos emergentes (incluyendo pero sin limitarse a Pseudallescheria boydii, Fusarium, spp. y Paecilomyces lilacinus), Coccidioides spp. (incluyendo pero sin limitarse a C. immitis), Histoplasma spp., Trichosporon spp., y dermatofitos, y cepas de los mismos de dicho grupo. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el compuesto antimicótico es un compuesto que inhibe la síntesis de ergosterol. En otra modalidad preferida, el compuesto antimicótico es un compuesto antimicótico de azol. Los azoles preferidos incluyen imidazoles y triazoles. Los azoles más preferidos incluyen, pero no se limitan a, ketoconazol, itroconazol, fluconazol, voriconazol, posaconazol, ravuconazol o miconazol. En otra modalidad preferida, el compuesto es fenpropimorf. En un décimo tercer aspecto, la invención provee un método para potenciar la actividad antimicótica de un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por inhibición de la expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de la actividad de un producto de gen de HOS2, u homólogo del mismo. El método de conformidad con este aspecto de la invención comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto el
hongo se selecciona del grupo que consiste de S. cerevisiae, Candida spp. (preferiblemente C. albicans, C. glabrata, C. rusei, C. parapsilosis y C. tropicalis), Aspergillus spp. (preferiblemente A. fumigatus, A. terreus, A. niger y A. flavus), Cryptococcus neoformans, Pneumocystis carinii, y cepas de los mismos de dicho grupo. En otra modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el hongo se selecciona del grupo que consiste de zygomycetes (incluyendo pero sin limitarse a Rhizopus arrhizus y Mucor spp.), mohos emergentes (incluyendo pero sin limitarse a Pseudallescheria boydii, Fusarium, spp. y Paecilomyces lilacinus), Coccidioides spp. (incluyendo pero sin limitarse a C. immitis), Histoplasma spp., Trichosporon spp., y dermatofitos, y cepas de los mismos de dicho grupo. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el compuesto antimicótico es un compuesto que inhibe la síntesis de ergosterol. En otra modalidad preferida, el compuesto antimicótico es un compuesto antimicótico de azol. Los azoles preferidos incluyen imidazoles y triazoles. Los azoles más preferidos incluyen, pero no se limitan a, ketoconazol, itroconazol, fluconazol, voriconazol, posaconazol, ravuconazol o miconazol. En otra modalidad preferida, el compuesto es fenpropimorf. En un décimo cuarto aspecto, la invención provee un método para tratar terapéuticamente a un organismo que tiene una infección micótica. El método de conformidad con este aspecto de la invención comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo fungal del mismo, o inhibir la
actividad de un producto de gen del mismo, en un organismo que tiene una infección micótica, y tratar al organismo con un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por inhibición de la expresión de HOS2 o un homólogo fungal del mismo o inhibición de la actividad de un producto de gen del mismo. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto el hongo se selecciona del grupo que consiste de S. cerevisiae, Candida spp. (preferiblemente C. albicans, C. glabrata, C. krusei, C. parapsilosis y C. tropicalis), Aspergillus spp. (preferiblemente A. fumigatus, A. terreus, A. niger y A. flavus), Cryptococcus neoformans, Pneumocystis carinii, y cepas de los mismos de dicho grupo. En otra modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el hongo se selecciona del grupo que consiste de zygomycetes (incluyendo pero sin limitarse a Rhizopus arrhizus y Mucor spp.), mohos emergentes (incluyendo pero sin limitarse a Pseudallescheria boydii, Fusarium, spp. y Paecilomyces lilacinus), Coccidioides spp. (incluyendo pero sin limitarse a C. immitis), Histoplasma spp., Trichosporon spp., y dermatofitos, y cepas de los mismos de dicho grupo. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el compuesto antimicótico es un compuesto que inhibe la síntesis de ergosterol. En otra modalidad preferida, el compuesto antimicótico es un compuesto antimicótico de azol. Los azoles preferidos incluyen imidazoles y triazoles. Los azoles más preferidos incluyen, pero no se limitan a,
ketoconazol, itroconazol, fluconazol, voriconazol, posaconazol, ravuconazol o miconazol. En otra modalidad preferida, el compuesto es fenpropimorf. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto, el organismo es una planta o un animal, preferiblemente un mamífero y muy preferiblemente un humano. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo fungal del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo comprende administrar un inhibidor de HDAC al organismo que necesita el mismo. En un décimo quinto aspecto, la invención provee un método para prevenir una infección micótica en un organismo. El método de conformidad con este aspecto de la invención comprende tratar al organismo con un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por inhibición de la expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de la actividad de un producto de gen del mismo, y tratar profilácticamente al organismo con un compuesto inhibidor de HOS2 y/o Hos2. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto el hongo se selecciona del grupo que consiste de S. cerevisiae, Candida spp. (preferiblemente C. albicans, C. glabrata, C. krusei, C. parapsilosis y C. tropicalis), Aspergillus spp. (preferiblemente A. fumigatus, A. terreus, A. niger y A. flavus), Cryptococcus neoformans, Pneumocystis carinii, y cepas de los mismos de dicho grupo. En otra modalidad preferida de conformidad con este aspecto de
la invención, el hongo se selecciona del grupo que consiste de zygomycetes (incluyendo pero sin limitarse a Rhizopus arrhizus y Mucor spp.), mohos emergentes (incluyendo pero sin limitarse a Pseudallescheria boydii, Fusarium, spp. y Paecilomyces Hlacinus), Coccidioides spp. (incluyendo pero sin limitarse a C. immitis), Histoplasma spp., Trichosporon spp., y dermatofitos, y cepas de los mismos de dicho grupo. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el compuesto antimicótico es un compuesto que inhibe la síntesis de ergosterol. En otra modalidad preferida, el compuesto antimicótico es un compuesto antimicótico de azol. Los azoles preferidos incluyen imidazoles y triazoles. Los azoles más preferidos incluyen, pero no se limitan a, ketoconazol, itroconazol, fluconazol, voriconazol, posaconazol, ravuconazol o miconazol. En otra modalidad preferida, el compuesto es fenpropimorf. En un décimo sexto aspecto, la invención provee un inhibidor de Hos2. En una modalidad preferida de este aspecto, el inhibidor es un compuesto de hidroximato. En un décimo séptimo aspecto, la invención provee un método para inhibir Hos2 que comprende poner en contacto el Hos2 con un inhibidor de Hos2. En una modalidad preferida de este aspecto, el Hos2 está en una célula, y el método comprende poner en contacto la célula con el inhibidor. En otra modalidad preferida, la célula es una célula de hongo que está dentro o sobre otro organismo (preferiblemente un mamífero o planta, muy preferiblemente un humano), y el método comprende administrar un inhibidor
de Hos2 al otro organismo. En una modalidad preferida de este aspecto de la invención, el inhibidor de Hos2 es un compuesto como se describe aquí. En una modalidad preferida de conformidad con este aspecto el hongo se selecciona del grupo que consiste de S. cerevisiae, Candida spp. (preferiblemente C. albicans, C. glabrata, C. krusei, C. parapsilosis y C. tropicalis), Aspergillus spp. (preferiblemente A. fumigatus, A. terreus, A. niger y A. flavus), Cryptococcus neoformans, Pneumocystis carinii, y cepas de los mismos de dicho grupo. En otra modalidad preferida de conformidad con este aspecto de la invención, el hongo se selecciona del grupo que consiste de zygomycetes (incluyendo pero sin limitarse a Rhizopus arrhizus y Mucor spp.), mohos emergentes (incluyendo pero sin limitarse a Pseudallescheria boydii, Fusarium, spp. y Paecilomyces lilacinus), Coccidioides spp. (incluyendo pero sin limitarse a C. immitis), Histoplasma spp., Trichosporon spp., y dermatofitos, y cepas de los mismos de dicho grupo. En una modalidad preferida de conformidad con la invención, el inhibidor de HDAC es un inhibidor de HDAC expresión de gen. En otra modalidad preferida de conformidad con la invención, el inhibidor de HDAC es un inhibidor de actividad de un producto de gen de HDAC, muy preferiblemente una enzima. De manera sorprendente, un mutante de deleción de HOS2 mostró hipersensibilidad a los azoles antimicóticos itraconozol, ketoconazol, fluconazol y voriconazol, cada uno de los cuales es dirigido hacia lanosterol
14a-desmetilasa (Erg 1 1 ). No mostró hipersensibilidad a agentes antimicóticos que no actuaban sobre la vía biosintética de ergosterol, tal como anfotericina B, 5-fluorocitosina y nicomicina. Por lo tanto, en ciertas modalidades preferidas, los compuestos de prueba de conformidad con este aspecto de la invención incluyen compuestos que actúan sobre la vía biosintética de ergosterol. El descubrimiento de que la ausencia de HOS2 potencia la actividad de compuestos antimicóticos además provee un método para identificar un potenciador de un compuesto antimicótico. El método comprende administrar a una cepa de hongo un compuesto de prueba, determinar si el compuesto de prueba inhibe la expresión de HOS2, e identificar el compuesto de prueba como un potenciator de un compuesto antimicótico si el compuesto de prueba inhibe HOS2. Se considera que un compuesto antimicótico es potenciado por la inhibición de expresión de HOS2 o inhibición de actividad de Hos2 si es identificado o identificable como un compuesto que tiene sinergia con un inhibidor de HOS2 por los métodos descritos anteriormente. Para el propósito de la presente invención, los siguientes términos se definen a continuación. Cualesquiera otras definiciones no descritas específicamente aquí son como se describe en la solicitud co-pendiente 60/751 ,703. La referencia a "un compuesto de la fórmula (A), fórmula (B), etc.," (o de manera equivalente, "un compuesto de la presente invención", y
similares), aquí se entiende que incluye referencia a N-óxidos, hidratos, solvatos, sales farmacéuticamente aceptables, profármacos y complejos de los mismos, y mezclas racémicas y escalémicas, diastereómeros, enantiómeros y tautómeros de los mismos y a menos que se indique otra cosa. Para fines de simplicidad, las porciones químicas se definen y se refieren en toda la descripción principalmente como porciones químicas univalentes (v.gr., alquilo, arilo, etc.). No obstante, dichos términos también se usan para transmitir porciones multivalentes correspondiente bajo las circunstancias estructurales apropiadas claras para los expertos en la técnica. Por ejemplo, aunque una porción "alquilo" generalmente se refiere a un radical monovalente (v.gr. CH3-CH2-), en ciertas circunstancias una porción de enlace bivalente puede ser "alquilo," en cuyo caso los expertos en la técnica entenderán que el alquilo que ha de ser un radical divalente (v.gr., -CH2-CH2-), que es equivalente al término "alquileno." (De manera similar, en circunstancias en las cuales una porción divalente es requerida y se establece como siendo "arilo," los expertos en la técnica entenderán que el término "arilo" se refiere a la porción divalente correspondiente, arileno). Se entiende que todos los átomos tienen su número de valencias normal para formación de enlace (es decir, 4 para carbono, 3 para N, 2 para O, y 2, 4 ó 6 para S, dependiendo del estado de oxidación del S). Como consecuencia, una porción se puede definir, por ejemplo, como(A)a-B-, en donde a es 0 ó 1. En tales casos, cuando a es 0 la porción es B- y cuando a es 1 la porción es A-B-.
También, un número de porciones descritas aquí puede existie en múltiples formas tautoméricas, todas las cuales son abarcadas por cualquier estructura tautomérica dada. Para fines de simplicidad, la referencia a un heterociclilo "Cn-Cm" o heteroarilo "Cn-Cm" significa un heterociclilo o heteroarilo que tiene de "n" a "m" átomos anulares, en donde "n" y "m" son enteros. Por lo tanto, por ejemplo, un heterociclilo de C5-C6 es un anillo de 5 ó 6 miembros que tiene por lo menos un heteroátomo, e incluye pirrolidinilo (C5) y piperidinilo (C6)¡ C6-hetoarilo incluye, por ejemplo, piridilo y pirimidilo. El término "hidrocarbilo" se refiere a un alquilo, alquenilo o alquinilo de cadena recta, ramificada o cíclico, cada uno como se define aquí. Un hidrocarbilo de "C0" se usa para referirse a un enlace covalente. Por lo tanto, "hidrocarbilo de C0-C3" incluye un enlace covalente, metilo, etilo, etenilo, etinilo, propilo, propenilo, propinilo y ciclopropilo. El término "alifático" significa hidrocarburos de cadena recta o ramificada saturados e insaturados. Como lo apreciará un experto en la técnica, "alifático" aquí incluye, pero no se limita a, porciones alquilo, alquenilo o alquinilo. El término "alquilo" significa un grupo alifático de cadena recta o ramificada que tiene de 1 a 12 átomos de carbono, preferiblemente 1-8 átomos de carbono, y muy preferiblemente 1 -6 átomos de carbono. Otros grupos alquilo preferidos tienen de 2 a 12 átomos de carbono, preferiblemente 2-8 átomos de carbono y muy preferiblemente 2-6 átomos de carbono. Los
grupos alquilo preferidos incluyen, sin limitación, metilo, etilo, propilo, isopropilo, butilo, isobutilo, sec-butilo, ter-butilo, pentilo, hexilo y similares. Un alquilo de "C0" (como en "alquilo de C0-C3") es un enlace covalente. El término "alquenilo" significa un grupo alifático de cadena recta o ramificada insaturado con uno o más dobles enlaces carbono-carbono, que tiene de 2 a 12 átomos de carbono, preferiblemente 2-8 átomos de carbono, y muy preferiblemente 2-6 átomos de carbono. Los grupos alquenilo preferidos incluyen, sin limitación, etenilo, propenilo, butenilo, pentenilo y hexenilo. El término "alquinilo" significa un grupo alifático de cadena recta o ramificada insaturado con uno o más triples enlaces carbono-carbono, que tiene de 2 a 12 átomos de carbono, preferiblemente 2-8 átomos de carbono, y muy preferiblemente 2-6 átomos de carbono. Los grupos alquinilo preferidos incluyen, sin limitación, etinilo, propinilo, butinilo, pentinilo y hexinilo. Los términos "alquileno", "alquenileno" o "alquinileno" como se usa aquí significa un grupo alquilo, alquenilo o alquinilo, respectivamente, como se definió aquí antes, que está ubicado entre y sirve para conectar otros dos grupos químicos. Grupos alquileno preferidos incluyen, sin limitación, metileno, etileno, propileno y butileno. Grupos alquenileno preferidos incluyen, sin limitación, etenileno, propenileno y butenileno. Grupos alquinileno preferidos incluyen, sin limitación, etinileno, propinileno y butinileno. El término "azolilo" como se usa aquí significa un grupo hetrocíclico de cinco miembros saturado o insaturado que contiene dos o más heteroátomos, como átomos de anillo, seleccionados del grupo que consiste
de nitrógeno, azufre y oxígeno, en donde por lo menos uno de los heteroátomos es un átomo de nitrógeno. Grupos azolilo preferidos incluyen, pero no se limitan a, imidazolilo, oxazolilo, tiazolilo, pirazolilo, isoxazolilo, isotiazolilo, 1 ,3,4-tiadiazolilo, 1 ,2,4-tiadiazolilo, 1 ,2,4-oxadiazolilo y 1 ,3,4-oxadiazolilo opcionalmente sustituidos. El término "carbociclo" como se usa aquí significa una porción cicloalquilo o arilo. El término "carbociclo" también incluye una porción cicloalquenilo que tiene por lo menos un doble enlace carbono-carbono. El término "cicloalquilo" significa un grupo hidrocarburo mono-, bi-, tri- o poli-cíclico saturado o insaturado que tiene aproximadamente 3 a 15 carbonos, preferiblemente que tiene 3 a 12 carbonos, preferiblemente 3 a 8 carbonos, muy preferiblemente 3 a 6 carbonos, y muy preferiblemente aún 5 ó 6 carbonos. En ciertas modalidades preferidas, el grupo cicloalquilo está fusionado a un grupo arilo, heteroarilo o heterociclico. Grupos cicloalquilo preferidos incluyen, sin limitación, ciclopenten-2-enona, ciclopenten-2-enol, ciclohex-2-enona, ciclohex-2-enol, ciclopropilo, ciclobutilo, ciclobutenilo, ciclopentilo, ciclopentenilo, ciclohexilo, ciclohexenilo, cicloheptilo, ciclooctilo, etc. El término "heteroalquilo" significa un grupo alifático saturado o insaturado, de cadena recta o ramificada, en donde uno o más átomos de carbono en el grupo son independientemente reemplazados por una porción seleccionada del grupo que consiste de O, S, N, N-alquilo, -S(O)-, -S(0)2-, -S(O)2NH-, o -NHS(O)2-.
El término "arilo" significa una porción aromática mono-, bi-, tri- o policiclica, preferiblemente una porción aromática de C6-Ci4, que comprende preferiblemente uno a tres anillos aromáticos. Preferiblemente, el grupo arilo es un grupo arilo de C6-Cio, muy preferiblemente un grupo arilo de C6. Grupos arilo preferidos incluyen, sin limitación, fenilo, naftilo, antracenilo y fluorenilo. Los términos "aralquilo" o "arilalquilo" significan un grupo que comprende un grupo arilo covalentemente enlazado a un grupo alquilo. Si un grupo aralquilo se describe como "opcionalmente sustituido", se entiende que ya sea una o ambas porciones arilo y alquilo pueden ser independientemente opcionalmente sustituidas o no sustituidas. Preferiblemente, el grupo aralquilo es alquilo(C1-C6)-arilo (C6-C10), incluyendo, sin limitación, bencilo, fenotilo y naftilometilo. Para fines de simplicidad, cuando se escribe este término como "arilalquilo", y términos relacionados con el mismo, se indica el orden de los grupo en un compuesto como "aril— alquilo". De manera similar, "alquil-arilo" indica el orden de los grupos en un compuesto como "alquil-arilo". Los términos "heterociclilo", "heterocíclico" o "heterociclo" significa un grupo que es una estructura mono-, bi-, o policiclica que tiene de aproximadamente 3 a aproximadamente 14 átomos, en donde uno o más átomos se seleccionan independientemente del grupo que consiste de N, O, y S. La estructura de anillo puede ser saturada, ¡nsaturada o parcialmente insaturada. En ciertas modalidades preferidas, el grupo heterocíclico es no aromático, en cuyo caso el grupo también se conoce como heterocicloalquilo. En ciertas modalidades preferidas, el grupo heterocíclico es un heterocíclico
en puente (por ejemplo, una porción biciclica con un puente de metileno, etileno o propileno). En una estructura biciclica o policíclica, uno o más anillos pueden ser aromáticos; por ejemplo un anillo de un heterociclo biciclico o uno o dos anillos de un heterociclo tricilico pueden ser aromáticos, como un indano y 9,10-dihidro antraceno. Grupos heterocíclicos preferidos incluyen, sin limitación, epoxi, aziridinilo, tetrahidrofuranilo, pirrolidinilo, piperidinilo, piperazinilo, tiazolidinilo, oxazolidinilo, oxazolidinonilo y morfolino. En ciertas modalidades preferidas, el grupo heterocíclico se fusiona a un grupo arilo, heteroarilo o cicloalquilo. Ejemplos de dichos heterociclos fusionados incluyen, sin limitación, tetrahidroquinolina y dihidrobenzofurano. Específicamente excluidos del alcance de este término son compuestos en donde un átomo de O o S anular es adyacente a otro átomo de O o S. En ciertas modalidades preferidas, el grupo heterocíclico es un grupo heteroarilo. Como se usa aquí, el término "heteroarilo" significa un grupo mono-, bi-, tri- o policíclico que tiene 5 a 18 átomos en el anillo, preferiblemente 5 a 14 átomos en el anillo, muy preferiblemente 5, 6, 9, ó 10 átomos en el anillo; preferiblemente que tiene 6, 10, ó 14 electrones pi compartidos en una disposición cíclica; y que tiene, además de átomos de carbono, entre uno o más heteroátomos seleccionados del grupo que consiste de N, O, y S. El término "heteroarilo" también pretende abarcar el derivado de N-óxido (o derivados de N-óxido, si el grupo heteroarilo contiene más de un nitrógeno de tal manera que se puede formar más que un derivado N-óxido) de un grupo heteroarilo que contiene nitrógeno. Por ejemplo, un grupo
heteroarilo puede ser pirimidinilo, piridinilo, bencimidazolilo, tienilo, benzotiazolilo, benzofuranilo e indolinilo. Grupos heteroarilo preferidos incluyen, sin limitación, tienilo, benzotienilo, furilo, benzofurilo, dibenzofurilo, pirrolilo, imidazolilo, pirazolilo, piridilo, pirazinilo, pirimidinilo, indolilo, quinolilo, isoquinolilo, quinoxalinilo, tetrazolilo, oxazolilo, tiazolilo, isoxazolilo, benzo[b]tienilo, nafta[2,3-b]t¡antrenilo, zantenilo, quinolilo, benzotiazolilo, bencimidazolilo, beta-carbolinilo y perimidinilo. Ejemplos ilustrativos de derivados de N-óxido de grupos heteroarilo incluyen, pero no se limitan a, N-óxido de piridilo, N-óxido de pirazinilo, N-óxido de pirimidinilo, N-óxido de piridazinilo, N-óxido de triazinilo, N-óxido de isoquinolilo y N-óxido de quinolilo. Los términos "arileno," "heteroarileno" o "heterociclileno" significa un grupo arilo, heteroarilo, o heterociclilo, respectivamente, como se definió aquí antes, que se ubica entre y sirve para conectar otros dos grupos químicos. Un grupo heteroaliciclico se refiere específicamente a un radical heterociclilo no aromático. Un heteroaliciclico puede contener insaturación, pero no es aromático. Un grupo heterociclilalquilo se refiere a un residuo en el cual un heterociclilo está unido a una estructura progenitora mediante uno de un radical alquileno, alquilideno o alquilidino. Ejemplos incluyen (4-metilpiperazin-1-il)metilo, (morfolin-4-il)metilo, (piridin-4-il)metilo, 2-(oxazolin-2-il)etilo, 4-(4-metilpiperazin-1-il)-2-butenilo y similares. Si un heterociclilalquilo se describe como "opcionalmente sustituido" significa que tanto el heterociclilo como la
porción radical alquileno, alquilideno o alquilidino correspondiente de un grupo heterociclilalquilo pueden ser opcionalmente sustituidos. Un "heterociclilalquilo inferior" se refiere a un heterociclilalquilo en donde la porción "alquilo" del grupo tiene uno a seis carbonos. Un grupo heteroaliciclilalquilo se refiere específicamente a un heterociclilalquilo en donde la porción heterociclilo del grupo no es aromática. Heterociclilos y heteroarilos preferidos incluyen, pero no se limitan a, azepinilo, azetidinilo, acridinilo, azocinilo, bencidolilo, bencimidazoliio, benzofuranilo, benzofurazanilo, benzofurilo, benzotiofuranilo, benzotiofenilo, benzoxazolilo, benzotiazolilo, benzotienilo, benztriazolilo, benztetrazolilo, bencisoxazolilo, bencisotiazolilo, bencimidazolinilo, benzoxazolilo, benzoxadiazolilo, benzopiranilo, carbazolilo, 4aH-carbazolilo, carbolinilo, cromanilo, cromenilo, cinolinilo, coumarinilo, decahidroquinolinilo, dibenzofurilo, 1 ,3-dioxolano, 2H.6H-1 ,5,2-ditiazinilo, dihidrofuro[2,3-b]tetrahidrofurano, dihidroisoindolilo, dihidroquinazolinilo (tal como 3,4-dihidro-4-oxo-quinazolinilo), furanilo, furopiridinilo (tal como furo[2,3-c]piridinilo, furo[3,2-b]piridinilo o furo[2,3-b]piridinilo), furilo, furazanilo, hexahidrodiazepinilo, imidazolidinilo, imidazolinilo, ¡midazolilo, indazolilo, 1 H-indazolilo, indolenilo, indolinilo, indolizinilo, indolilo, 3H-indolilo, isobenzofuranilo, isocromanilo, isoindazolilo, isoindolinilo, isoindolilo, isoquinolilo, isoquinolinilo, isotiazolidinilo, isotiazolilo, isoxazolinilo, isoxazolilo, metilenodioxifenilo, morfolinilo, naftiridinilo, octahidroisoquinolinilo, oxadiazolilo, 1 ,2,3-oxadiazolilo, 1 ,2,4-oxadiazolilo, 1 ,2,5-oxadiazolilo, 1 ,3,4-
oxadiazolilo, oxazolidinilo, oxazolilo, oxazolidinilo, oxetanilo, 2-oxoazepinilo, 2-oxopiperazinilo, 2-oxopiperidinilo, 2-oxopirrolodinilo, pirimidinilo, fenantridinilo, fenantrolinilo, fenazinilo, fenotiazinilo, fenoxatiinilo, fenoxazinilo, ftalazinilo, piperazinilo, piperidinilo, piperidonilo, 4-piperidonilo, piperonilo, pteridinilo, purinilo, piranilo, pirazinilo, pirazolidinilo, pirazolinilo, pirazolilo, piridazinilo, piridooxazol, piridoimidazol, piridotiazol, piridinilo, piridilo, pirimidinilo, pirrolidinilo, pirrolinilo, pirrolopiridilo, 2H-pirrolilo, pirrolilo, quinazolinilo, quinolilo, quinolinilo, 4H-quinolizinilo, quinoxalinilo, quinuclidinilo, tetrahidro-1 , 1 -dioxotienilo, tetrahidrofuranilo, tetrahidrofurilo, tetrahidroisoquinolinilo, tetrahidroquinolinilo, tetrahidropiranilo, tetrazolilo, tiazolidinilo, 61-1-1 ,2,5-tiadiazinilo, tiadiazolilo (v.gr., 1 ,2,3-tiadiazolilo, 1 ,2,4-tiadiazolilo, 1 ,2,5-tiadiazolilo, 1 ,3,4-tiadiazolilo), tiamorfolinilo, sulfóxido de tiamorfolinilo, tiamorfolinilsulfona, tiantrenilo, tiazolilo, tienilo, tienotiazolilo, tienooxazolilo, tienoimidazolilo, tiofenilo, triazinilo, triazinilazepinilo, triazolilo (v.gr., 1 ,2,3-triazolilo, 1 ,2,4-triazolilo, 1 ,2,5-triazolilo, 1 ,3,4-triazolilo) y xantenilo. Un "halogenohidrocarbilo" como se usa aquí es una porción hidrocarbilo, en la cual de uno a todos los hidrógenos han sido remplazados por un halógeno independientemente seleccionado. Como se usa aquí, y a menos que se establezca otra cosa, cuando una porción (v.gr., alquilo, heteroalquilo, cicloalquilo, arilo, heteroarilo, heterociclilo, etc.) se describe como "opcionalmente sustituido" significa que el grupo opcionalmente tiene de uno a cuatro, preferiblemente de uno a tres, muy preferiblemente uno o dos, sustituyentes que no son hidrógeno
independientemente seleccionados. Sustituyentes adecuados incluyen, sin limitación, grupo halógeno, hidroxi, oxo (v.gr., un -CH- anular sustituido con oxo es -C(O)-) nitro, halogenohidrocarbilo, hidrocarbilo, alquilo, cicloalquilo, heterociclilo, arilo, heteroarilo, aralquilo, alcoxi, ariloxi, amino, acilamino, alquilcarbamoilo, arilcarbamoilo, aminoalquilo, acilo, carboxi, hidroxialquilo, alcanosulfonilo, arenosulfonilo, alcanosulfonamido, arenosulfonamido, aralquilsulfonamido, alquilcarbonilo, aciloxi, ciano, y ureido. Sustituyentes preferidos, que son como tales no sustituidos adicionalmente (a menos que se establezca expresamente otra cosa), son: (a) halógeno, hidroxi, ciano, oxo, carboxi, formilo, nitro, amino, amidino, guanidino, (b) alquilo o alquenilo o arilalquilimino de C1-C5, carbamoilo, azido, carboxamido, mercapto, hidroxi, hidroxialquilo, alquilarilo, arilalquilo, alquilo de C Ce, alquenilo de CrC8, alcoxi de C Ce, alquilamino de Ci-C8, alcoxicarbonilo de C C8, ariloxicarbonilo, acilo de C2-C8, -C(O)-N(R30)-alquil-cicloalquilo, -C(O)-N(R30)-alquil-heterociclilo, -C(O)-N(R30)-alquil-arilo, -C(O)-N(R30)-alqu¡l-heteroarilo, -C(O)-cicloalquilo, -C(O)-heterociclilo, -C(O)-arilo, -C(O)-heteroarilo, acilamino de C2-C8, alquiltio de C Ce, arilalquiltio, ariltio, alquilsulfinilo de CrC8, arilalquilsulfinilo, arilsulfinilo, alquilsulfonilo de C Ca, arilalquilsulfonilo, arilsulfonilo, /V-alquilcarbamoilo de C0-C6, N,N-dialquilcarbamoilo de C2-C15, cicloalquilo de C3-C7, aroilo, ariloxi, éter arilalquílico, arilo, arilo fusionado a un cicloalquilo o heterociclo u otro anillo arilo, heterociclo de C3-C7, heteroarilo de C5-C 5 o cualquiera de estos anillos
fusionados o espiro-fusionados a un cicloalquilo, heterociclilo, o arilo, en donde cada uno de los anteriores es además opcionalmente sustituido con una o más porciones listadas en (a), anterior; y (c) -(CR32R33)S-NR30R31 , en donde s es de 0 (en cuyo caso el nitrógeno está enlazado directamente a la porción que es sustituida) a 6, R32 y R33 son cada una independientemente hidrógeno, halógeno, hidroxilo o alquilo de C1-C4, y R30 y R31 son cada una independientemente hidrógeno, ciano, oxo, hidroxilo, alquilo de C Ca, heteroalquilo de C C8l alquenilo de CrC8, carboxamido, alquilo de CrC3-carboxamido, carboxamido-alquilo de C1-C3, amidino, hidroxialquilo de C2-C8, alquiladlo de C1-C3, aril-alquilo de C1-C3, alquilheteroarilo de Ci-C3l heteroaril-alquilo de C C3, alquilheterociclilo de C C3, heterociclil-alquilo de CrC3-alquilcicloalquilo de C^-Cz, cicloalquil-alquilo de C1-C3, alcoxi de C2-C8, alcoxi de C2-C8-alquilo de C C4, alcoxicarbonilo de d-Ce, ariloxicarbonilo, aril-alcoxicarbonilo de C C3, heteroariloxicarbonilo, heteroaril-alcoxicarbonilo de C1-C3, acilo de C Ce, alquilo de C0-C8-carbonilo, aril-alquilo de Co-Ce-carbonilo, heteroaril-alquilo de Co-Ce-carbonilo, cicloalquil-alquilo de C0-C8-carbonilo, heterociclil-alquilo de C0-C8-carbonilo, alquilo de Co-C8-NH-carbonilo, aril-alquilo de C0-C8-NH-carbonilo, heteroaril-alquilo de Co-C8-NH-carbonilo, cicloalquil-alquilo de C0-C8-NH-carbonilo, heterocilclil-alquilo de C0-C8-NH-carbonilo, cicloalquilo-S(O)2-, heterociclilo-S(0)2-, arilo-S(0)2-, heteroarilo-S(0)2-, alquilo de C0-C8-O-carbonilo, aril-alquilo de C0-C8-O-carbonilo, heteroaril-alquilo de Co-C8-0-carbonilo, cicloalquil-alquilo de Co-C8-0-carbonilo, heterociclilo-alquilo de C0-C8-O-carbonilo, alquilsulfonilo de
d-Ce, arilalquilsulfonilo, arilsulfonilo, heteroarilalquilsulfonilo, heteroarilsulfonilo, alquilo de Ci-C8-NH-sulfonilo, arilalquil-NH-sulfonilo, aril-NH-sulfonilo, heteroarilalquil-NH-sulfonilo, heteroaril-NH-sulfonilaroilo, arilo, cicloalquilo, heterociclilo, heteroarilo, aril-alquilo de C1-C3-, cicloalquil-alquilo de C1-C3-, heterociclil-alquilo de CrC3-, heteroaril-alquilo de C C3-, o un grupo protector, en donde cada uno de los anteriores además es opcionalmente sustituido con una o más porciones listadas en (a), anterior; o R30 y R3 tomados juntos con el N al cual están unidos forman un heterociclilo o heteroarilo, cada uno de los cuales es opcionalmente sustituido con 1 a 3 sustituyentes seleccionados del grupo que consiste de (a) anterior, un grupo protector, y (X30-Y31-), en donde dicho heterociclilo también puede estar en puente (formando una porción bicíclica con un puente metileno, etileno o propileno); en donde X30 se selecciona del grupo que consiste de H, alquilo de CrC8, alquenilo de C2-C8-, alquinilo de C2-C8-, -alquilo de C0-C3-alquenilo de C2-C8-alquilo de C0-C3, alquilo de C0-C3-alquinilo de C2-C8-alquilo de C0-C3, alquilo de C0-C3-O-alquilo de C0-C3-, HO-alquilo de C0-C3-, alquilo de C0-C4-N(R30)-alquilo de C0-C3-, N(R30)(R31)-alquilo de C0-C3-, N(R30)(R31)-alquenilo de C0-C3-, N(R30)(R3 )-alquinilo de C0-C3-, (N(R30)(R31))2-C=N-, alquilo de C0-C3-S(O)0-2-alquilo de C0-C3-, CF3-alquilo de C0-C3-, heteroalquilo de Ci-C8, arilo, cicloalquilo, heterociclilo, heteroarilo, aril-alquilo de C C3-, cicloalquil-alquilo de C C3-, heterociclilo-alquilo de C1-C3-, heteroaril-alquilo de C1-C3-, N(R30)(R31)-heterociclilo-alquilo de C1-C3-, en donde el arilo, cicloalquilo,
heteroarilo y heterociclilo son opcionalmente sustituidos con 1 a 3 sustituyentes de (a); y Y31 se selecciona del grupo que consiste de un enlace directo, -O-, -N(R30)-, -C(O)-, -O-C(O)-, -C(O)-O-, -N(R30)-C(O)-, -C(O)-N(R30)-, -N(R30)-C(S)-, -C(S)-N(R30)-, -N(R30)-C(O)-N(R31)-, -N(R30)-C(NR30)-N(R31)-, -N(R30)-C(NR31)-, -C(NR3 )-N(R30)-, -N(R30)-C(S)-N(R31)-, -N(R30)-C(O)-O-, -0-C(0)-N(R31)-, -N(R30)-C(S)-O-, -0-C(S)-N(R31)-, -S(O)0-2-, -SO2N(R31)-, -N(R31)-S02- y -N(R30)-SO2N(R31)-. Una porción que es sustituida es una en la cual uno o más (preferiblemente uno a cuatro, preferiblemente de uno a tres y muy preferiblemente uno o dos), hidrógenos han sido independientemente remplazados con otro sustituyente químico. Como un ejemplo no limitante, fenilos sustituidos incluyen 2-flurofenilo, 3,4-diclorofenilo, 3-cloro-4-fluoro-fenilo, 2-ftuoro-3-propilfenilo. Como otro ejemplo no limitante, n-octilos sustituidos incluyen 2,4-dimetil-5-etil-octilo y 3-ciclopentil-octilo. Incluidos dentro de esta definición están los metilenos (-CH2-) sustituidos con oxígeno para formar carbonil -CO-. Cuando existen dos sustituyentes opcionales enlazados a átomos adyacentes de una estructura de anillo, tal como por ejemplo un fenilo, tiofenilo, o piridinilo, los sustituyentes, junto con los átomos a los cuales están unidos, opcionalmente forman un cicloalquilo o heterociclo de 5- ó 6-miembros que tiene 1 , 2, ó 3 heteroátomos anulares. En una modalidad preferida, un grupo, tal como un grupo
hidrocarbilo, heteroalquilo, heterocíclico y/o arilo es no sustituido. En otras modalidades preferidas, un grupo, tal como un grupo hidrocarbilo, heteroalquilo, heterocíclico y/o arilo es sustituido con 1 a 4 (preferiblemente de uno a tres, y muy preferiblemente uno o dos) sustituyentes independientemente seleccionados. Sustituyentes preferidos en grupos alquilo incluyen, pero no se limitan a, hidroxilo, halógeno (v.gr., un solo sustituyente halógeno o múltiples sustituyentes halógeno; en este último caso, grupos tales como -CF3 o un grupo alquilo que tiene Cl3), oxo, ciano, nitro, alquilo, cicloalquilo, alquenilo, cicloalquenilo, alquiniio, heterociclo, arilo, -ORa, -SRa, -S(=O)Re, -S(=O)2Re, -P(=0)2Re, -S(=0)2ORe, -P(=0)2ORe, -NRbRc, -NRbS(=0)2Re, -NRbP(=0)2Re, -S(=0)2NRbRc, -P(=0)2NRbRc, -C(=0)ORe, -C(=0)Ra, -C(=0)NRbRc, -OC(=0)Ra, -OC(=0)NRbRc, -NRbC(=0)ORe, -NRdC(=O)NRbRc, -NRdS(=0)2NRbRc, -NRdP(=O)2NR Rc, -NRbC(=O)Ra o -NRbP(=0)2Re, en donde Ra es hidrógeno, alquilo, cicloalquilo, alquenilo, cicloalquenilo, alquiniio, heterociclo o arilo; Rb, Rc y Rd son independientemente hidrógeno, alquilo, cicloalquilo, heterociclo o arilo, o dicho Rb y Rc junto con N al cual están unidos opcionalmente forman un heterociclo; y Re es alquilo, cicloalquilo, alquenilo, cicloalquenilo, alquiniio, heterociclo o arilo. En los sustituyentes ilustrativos antes mencionados, grupos tales como alquilo, cicloalquilo, alquenilo, alquiniio, cicloalquenilo, heterociclo y arilo pueden como tales ser opcionalmente sustituidos. Sustituyentes preferidos en grupos alquenilo y alquiniio incluyen,
pero no se limitan a, alquilo o alquilo sustituido, así como aquellos grupos mencionados como sustituyentes alquilo preferidos. Sustituyentes preferidos en grupos cicloalquilo incluyen, pero no se limitan a, nitro, ciano, alquilo o alquilo sustituido, así como aquellos grupos mencionados como sustituyentes alquilo preferidos. Otros sustituyentes preferidos incluyen, pero no se limitan a, sustituyentes cíclicos fusionados o espiro-enlazados, preferiblemente cicloalquilo espiro-enlazados, cicloalquenilo espiro-enlazados, heterociclo espiro-enlazados (excluyendo heteroarilo), cicloalquilo fusionado, cicloalquenilo fusionado, heterociclo fusionado o arilo fusionado, en donde los sustituyentes cicloalquilo, cicloalquenilo, heterociclo y arilo antes mencionados pueden ser ellos mismos opcionalmente sustituidos. Sustituyentes preferidos en grupos cicloalquenilo incluyen, pero no se limitan a, nitro, ciano, alquilo o alquilo sustituido, asi como aquellos grupos mencionados como sustituyentes alquilo preferidos. Otros sustituyentes preferidos incluyen, pero no se limitan a, sustituyentes cíclicos espiro-enlazados o fusionados, especialmente cicloalquilo espiro-enlazado, cicloalquenilo espiro-enlazado, heterociclo espiro-enlazados (excluyendo heteroarilo), cicloalquilo fusionado, cicloalquenilo fusionado, heterociclo fusionado o arilo fusionado, en donde los sustituyentes cicloalquilo, cicloalquenilo, heterociclo y arilo antes mencionados pueden como tales ser opcionalmente sustituidos. Sustituyentes preferidos en grupos arilo incluyen, pero no se limitan a, nitro, cicloalquilo o cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo o
cicloalquenilo sustituido, ciano, alquilo o alquilo sustituido, asi como aquellos grupos mencionados antes como sustituyentes alquilo preferidos. Otros sustituyentes preferidos incluyen, pero no se limitan a, grupos cíclico fusionados, especialmente cicloalquilo fusionado, cicloalquenilo fusionado, heterociclo fusionado, o arilo fusionado, en donde los sustituyentes cicloalquilo, cilcoalquenilo, heterociclo y arilo antes mencionados pueden como tales ser opcionalmente sustituidos. Otros sustituyentes preferidos aún en grupos arilo (fenilo, como un ejemplo no limitante) incluyen, pero no se limitan a, halogenoalquilo y aquellos grupos mencionados como sustituyentes alquilo preferidos. Sustituyentes preferidos en grupos heterociclicos incluyen, pero no se limitan a, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, nitro, oxo (es decir, =O), ciano, alquilo, alquilo sustituido, asi como aquellos grupos mencionados como sustituyentes alquilo preferidos. Otros sustituyentes preferidos en grupos heterociclicos incluyen, pero no se limitan a, sustituyentes cíclicos espiro-enlazados o fusionados en cualquier punto o puntos disponibles de unión, muy preferiblemente cicloalquilo espiro-enlazado, cicloalquenilo espiro-enlazado, heterociclo espiro-enlazados (excluyendo heteroarilo), cicloalquilo fusionado, cicloalquenilo fusionado, heterociclo fusionado y arilo fusionado, en donde los sustituyente cicloalquilo, cicloalquenilo, heterociclo y arilo antes mencionados pueden como tales ser opcionalmente sustituidos. En ciertas modalidades preferidas, un grupo heterocíclico es
sustituido en el carbono, nitrógeno y/o azufre en uno o más posiciones. Sustituyentes preferidos en el carbono incluyen aquellos grupos mencionados como sustituyentes alquilo preferidos. Sustituyentes preferidos en el nitrógeno incluyen, pero no se limitan a alquilo, arilo, aralquilo, alquilcarbonilo, alquilsulfonilo, arilcarbonilo, arilsulfonilo, alcoxicarbonilo, o aralcoxicarbonilo. Sustituyentes preferidos en el azufre incluyen, pero no se limitan a, oxo y alquilo de C1.6. En ciertas modalidades preferidas, los heteroátomos de nitrógeno y azufre pueden independientemente ser opcionalmente oxidados y los heteroátomos de nitrógeno pueden independientemente ser opcionalmente cuaterizados. Sustituyentes especialmente preferidos en los grupos de anillo, tales como arilo, heteroarilo, cicloalquilo y heterociclilo, incluyen halógeno, alcoxi y alquilo. Sustituyentes especialmente sustituyentes preferidos en grupos alquilo incluyen halógeno e hidroxi. El término "halógeno" o "halo" como se usa aquí se refiere a cloro, bromo, fluoro, o yodo. Como se usa aquí, el término "acilo" se refiere a un sustituyente alquilcarbonilo o arilcarbonilo. El término "acilamino" se refiere a un grupo amida unido al átomo de nitrógeno (es decir, R-CO-NH-). El término "carbamoilo" se refiere a un grupo amida unido al átomo de carbono del carbonilo (es decir, NH2-CO-). El átomo de nitrógeno de un sustituyente acilamino o carbamoilo es además opcionalmente sustituido. El término "sulfonamido" se refiere a un sustituyente sulfonamida unido por ya sea el
átomo de azufre o de nitrógeno. El término "amino" significa que incluye grupos NH2, alquilamino, di-alquil-amino, arilamino y amino cíclico. El término "ureido" como se usa aquí se refiere a una porción urea sustituida o n sustituida El término "radical" como se usa aquí significa una porción química que comprende uno o más electrones no pareados. En donde los sustituyente opcionales se escogen de "uno o más" grupos, se entiende que esta definición incluye todos los sustituyentes que son escogidos de uno de los grupos especificados o los sustituyentes que son escogidos de dos o más de los grupos especificados. Además, los sustituyentes en porciones cíclicas (es decir, cicloalquilo, heterociclilo, arilo, heteroarilo) incluyen porciones monocíclicas de 5- a 6- miembros y biciclicas de 9- a 14- miembros fusionadas a la porción cíclica progenitora para formar un sistema de anillo fusionado bi- o tri-cíclico. Los sustituyentes en las porciones cíclicas también incluyen porciones mnocíclicas de 5- a 6- miembros y biciclicas de 9- a 14- miembros unidas a la porción cíclica progenitora por un enlace covalente para formar un sistema de bi-anillo bi- o tri-cíclico. Por ejemplo, un fenilo opcionalmente sustituido incluye, pero no se limitan a, los siguientes:
H
XX)
Un anillo carbocíclico de tres a ocho miembros saturado o insaturado es preferiblemente un anillo carbocíclico de cuatro a siete miembros, muy preferiblemente de cinco o seis miembros, saturado o insaturado. Ejemplos de anillos carbociclicos saturados o insaturados de tres a ocho miembros incluyen fenilo, ciclopropilo, ciclobutilo, ciclopentilo, ciclohexilo y cicloheptilo. Un anillo heterocíclico saturado o insaturado de tres a ocho miembros contiene por lo menos un heteroátomo seleccionado de átomos de oxígeno, nitrógeno, y azufre átomos. El anillo heterocíclico saturado o insaturado de tres a ocho miembros preferiblemente contiene uno o dos heteroátomos con átomos constituyentes de anillo restantes siendo átomos de carbono. El anillo heterocíclico saturado o insaturado de tres a ocho miembros es preferiblemente un anillo heterocíclico saturado o insaturado de cuatro a siete miembros, muy preferiblemente un anillo heterocíclico saturado o insaturado de cinco o seis miembros. Ejemplos de grupos heterocíclicos saturado o insaturados de tres a ocho miembros incluyen tienilo, piridilo, 1 ,2,3-triazolilo, imidazolilo, isoxazolilo, pirazolilo, piperazinilo, piperazino, piperidilo, piperidino, morfolinilo, morfolino, homopiperazinilo, homopiperazino, tiomorfolinilo, tiomorfolino, tetrahidropirrolilo y azepanilo. Un grupo carboxílico y heterocíclico saturado o insaturado puede condensarse con otro grupo saturado o heterocíclico para formar un grupo biciclico, preferiblemente un grupo bicíclico, carbocíclico o heterocíclico saturado o insaturado de nueve a doce miembros. Grupos bicíclicos incluyen
naftilo, quinolilo, 1 ,2,3,4-tetrahidroquinolilo, 1 ,4-benzoxanilo, indanilo, indolilo y 1 ,2,3,4-tetrahidronaftilo. Cuando un grupo carbocíclico o heterocíclico es sustituido por dos grupo alquilo de Ci-6, los dos grupos alquilo pueden combinarse juntos para formar una cadena alquileno, preferiblemente una cadena alquileno de C1-3. Grupos carbocíclicos o heterocíclicos que tiene esta estructura entrelazada incluyen biciclo[2.2.2]octanilo y norbornanilo. En un aspecto, la invención provee compuestos que son inhibidores de Hos2, fragmentos activos de los mismos, y homólogos de los mismos, que tienen la fórmula (A): Cy -L1-Ar1-Y1-C(0)-NH-Z1 (A) y N-óxidos, hidratos, solvatos, sales farmacéuticamente aceptables, profármacos o complejos de los mismos, y mezclas racémicas y escalémicas, diastereómeros y enantiómeros de los mismos, en donde Cy es -H, cicloalquilo, arilo, heteroarilo, o heterociclilo, cualquiera de los cuales puede ser opcionalmente sustituido; L1 es -(CH2)m-W-, en donde m es 0, 1 , 2, 3, ó 4, y W se selecciona del grupo que consiste de -C(0)NH-, -S(0)2NH-, -NHC(O)-, -NHS(O)2-, y -NH-C(0)-NH-¡ Ar1 es arileno, en donde dicho arileno opcionalmente puede ser adicionalmente sustituido y puede ser opcionalmente fusionado a un anillo arilo o heteroarilo, o a un anillo cicloalquilo o heterocíclico saturado o parcialmente insaturado, cualquiera de los cuales puede ser opcionalmente
sustituido; Y1 es un enlace químico o un alquileno saturado de cadena recta o ramificada, en donde dicho alquileno puede ser opcionalmente sustituido; y Z se selecciona del grupo que consiste de anilinilo, piridilo, tiadiazolilo, cada uno de los cuales es opcionalmente sustituido, y -O-M, M siendo H o un catión farmacéuticamente aceptable. En una modalidad preferida de los compuestos de la fórmula (A), cuando L es -C(O)NH-, Y1 es -(CH2)n-, n seindo 1 , 2 ó 3, y Z es -O-M, entonces Cy1 no es aminofenilo, dimetilaminofenilo, o hidroxifenilo. En otra modalidad preferida de los compuestos de la fórmula (A), cuando L1 es -C(O)NH-, y Z1 es piridilo, entonces Cy1 es indolinilo no sustituido. En ciertas modalidades preferidas, Cy1 es arilo e C6-Ci4, muy preferiblemente arilo de Ce-C^, y muy preferiblemente fenilo o naftilo, cualquiera de los cuales puede ser opcionalmente sustituido. En otras modalidades preferidas, Cy1 es heteroarilo. En algunas modalidades preferidas, el grupo heteroarilo se selecciona del grupo que consiste de tienilo, benzotienilo, furilo, benzofurilo, quinolilo, isoquinolilo, y tiazolilo, cualquiera de los cuales puede ser opcionalmente sustituido. En ciertas modalidades particularmente preferidas, Cy1 se selecciona del grupo que consiste de fenilo, naftilo, tienilo, benzotienilo, y quinolilo, cualquiera de los cuales puede ser opcionalmente sustituido. En otras modalidades preferidas, Cy1 es fenilo, piridina o indol, muy preferiblemente fenilo o indol. En ciertas modalidades
preferidas, Cy1 es sustituido con uno o más sustituyentes seleccionados del grupo que consiste de trihalogenoaiquilo (preferiblemente trifluoroalquilo), halógeno, CN, amidino, sulfono, alquilsulfono, imidato y alquilimidato. En ciertas modalidades preferidas, Cy1 es fenilo sustituido con uno o más sustituyentes seleccionados del grupo que consiste de trihalogenoaiquilo (preferiblemente trifluoroalquilo), halógeno, CN, amidina, sulfona, alquiisulfona, imidato y alquilimidato, preferiblemente seleccionados del grupo que consiste de trihalogenoaiquilo (preferiblemente trifluoroalquilo) y halógeno. En una modalidad preferida, L1 es -(CH2)m-W-, en donde m es 0,
1 , 2, 3, ó 4, y W se selecciona del grupo que consiste de -C(0)NH-, -S(0)2NH-, -NHC(O)-, -NHS(0)2-, y -NH-C(0)-NH-. Preferiblemente, m es 0, 1 , ó 2, muy preferiblemente 0 o 1 . Preferiblemente, Ar1 es arileno de C6-C 14, muy preferiblemente arileno de C6-Ci0, cualquiera de los cuales puede ser adicionalmente sustituido. En ciertas modalidades preferidas, Ar1 es fenileno, preferiblemente 4-fenileno. En algunas modalidades preferidas, el fenileno se fusiona a un anillo arilo o heteroarilo, o a un anillo cicloalquilo o heterocíclico saturado o parcialmente insaturado, cualquiera de estos grupos también puede ser opcionalmente sustituido. En una modalidad preferida, Y1 es un enlace químico o es un alquileno de cadena recta o ramificada, que puede ser opcionalmente sustituido. En algunas modalidades preferidas, Y1 es un enlace químico, y el
grupo -C(O)NH-Z está directamente unido a Ar1. En otras modalidades preferidas, Y1 es alquileno, preferiblemente alquileno saturado. Preferiblemente, el alquileno saturado es alquileno de CrC8, muy preferiblemente alquileno de C C6, muy preferiblemente aún alquileno de C C3 alquileno, y muy preferiblemente todavía alquileno de CrC2, cualquiera de los cuales puede ser opcionalmente sustituido. En algunas modalidades particularmente preferidas, Y1 es metileno. Grupos alquilo, arilo, heterociclilo, y heteroarilo sustituidos tienen uno o más, preferiblemente entre uno y aproximadamente tres, muy preferiblemente uno o dos sustituyentes, que preferiblemente se seleccionan del grupo que consiste de alquilo de C1-C6, preferiblemente alquilo de CrC4; halógeno, preferiblemente Cl, Br, o F; halogenoalquilo, preferiblemente (halógeno)i-5alquilo(CrC6), muy preferiblemente (halógeno^.salquiloíC Ca), y muy preferiblemente CF3; alcoxi de C-i-C6, preferiblemente metoxi, etoxi, o benciloxi; ariloxi de C6-Ci0, preferiblemente fenoxi; alcoxicarbonilo de Ci-C6, preferiblemente alcoxicarbonilo de C1-C3, muy preferiblemente carbometoxi o carboetoxi; arilo de ?ß-?? , preferiblemente fenilo; ar(C6-Cio)alqu¡lo(CrC6), preferiblemente ar(C6-C1o)alquilo(C1-C3), muy preferiblemente bencilo, naftilometilo o fenotilo; hidroxi-alquilo^-Ce), preferiblemente hidroxi-alquilo(CrC3), muy preferiblemente hidroximetilo, amino-alqu¡lo(C-i-C6), preferiblemente amino-alquilo(Ci-C3), muy preferiblemente aminometilo; alquilamino(Ci-C6), preferiblemente metilamino, etilamino, o propilamino; di-alquilamino(CrC6), preferiblemente dimetilamino o dietilamino;
alquilcarbamoilo(C C6) , preferiblemente metilcarbamoilo, dimetilcarbamoilo, o bencilocarbamoilo; arilcarbamoilo(C6-Ci0), preferiblemente fenilcarbamoilo; alcanoacilamino(CrC6), preferiblemente acetilamino; arenoacilamino(C6-C10), preferiblemente benzoilamino; alcanosulfonilo(C C6), preferiblemente metansulfonilo; alcanosulfonamido(C C6), preferiblemente metansulfonamido; arenosulfonilo(C6-C 0), preferiblemente bencensulfonilo o toluensulfonilo; arenosulfonamido(C6-Cio), preferiblemente bencensulfonilo o toluensulfonilo; ar(C6-C10) alquilsulfonamido(CrC6), preferiblemente bencilsulfonamido; alquilcarbonilo de CrC6, preferiblemente alquilcarbonilo de C1-C3, muy preferiblemente acetilo; aciloxi(Ci-C6), preferiblemente acetoxi; ciano; amino; carboxi; hidroxi; ureido; y nitro. Uno o más átomos de carbono de un grupo alquilo, cicloalquilo o heterociclilo también puede ser opcionalmente sustituido con un grupo oxo. En algunas modalidades particularmente preferidas, Cy1 es una porción fenilo, naftilo, tienilo, benzotienilo o quinolilo que es no sustituido o sustituido por uno o dos sustituyentes independientemente seleccionados del grupo que consiste de alquilo de CrC4, halogenoalquilo de Ci-C4, arilo de Cedo, aríCe-CioJalquiloíC Ce), halógeno, nitro, hidroxi, alcoxi de Ci-C6, alcoxicarbonilo de C C6, carboxi y amino. En otra modalidad, la invención provee compuestos que son inhibidores de Hos2, fragmentos activos de los mismos, y homólogos de los mismos, representados por la fórmula (B): Cy^-Ar-^-CíOJNH-Z2 (fí)
y N-óxidos, hidratos, solvatos, sales farmacéuticamente aceptables, profármacos o complejos de los mismos, y mezclas racémicas y escalémicas, diaestereómeros y enantiómeros de los mismos, en donde Cy2 es H, cicloalquilo, arilo, heteroarilo, o heterociclilo, cualquiera de los cuales puede ser opcionalmente sustituido, siempre que Cy2 no sea un (espirocicloalquil)heterociclilo; L2 es alquileno de C C6 saturado o alquenileno de C2-C6, en donde el alquileno o alquenileno puede ser opcionalmente sustituido, y en donde uno o dos de los átomos de carbono del alquileno son opcionalmente remplazados por una porción heteroatómica independientemente seleccionada del grupo que consiste de O; NR', R' siendo alquilo, acilo o hidrógeno; S; S(O); o S(0)2; Ar2 es arileno, en donde dicho arileno opcionalmente puede ser adicionalmente sustituido y puede ser opcionalmente fusionado a un anillo arilo o heteroarilo, o a un anillo cicloalquilo o heterocíclico saturado o parcialmente insaturado, cualquiera de los cuales puede ser opcionalmente sustituido; y Y2 es un enlace químico o un alquileno saturado de cadena recta o ramificada, que puede ser opcionalmente sustituido, siempre que el alquileno no sea sustituido con un sustituyente de la fórmula -C(0)R en donde R comprende una porción a-amino acilo; y Z2 se selecciona del grupo que consiste de anilinilo, piridilo, tiadiazolilo, cada uno de los cuales es opcionalmente sustituido, y -O-M, M
siendo H o un catión farmacéuticamente aceptable. En una modalidad preferida de los compuestos de la fórmula (B), cuando el átomo de carbono al cual Cy2 está unido es oxo sustituido, entonces Cy2 y Z2 no son piridilo. Sustituyentes preferidos de Cy2, Ar2, y Z2 de conformidad con este aspecto de la invención son como se definió antes para la fórmula (A). Sustituyentes preferidos de Y2 son como se definió antes para Y1. En algunas modalidades preferidas, L2 alquileno de C C8 saturado, muy preferiblemente alquileno de C C6, muy preferiblemente aún alquileno de CrC , cualquiera de los grupos pueden ser opcionalmente sustituidos. En otras modalidades preferidas, L2 es alquenileno de C2-C8, muy preferiblemente alquenileno de C2-C6, y muy preferiblemente aún alquenileno de C2-C4, cualquiera de dichos grupos puede ser opcionalmente sustituido. El grupo alquileno o alquenileno puede ser sustituido en una o más posiciones de carbono con un sustituyente preferiblemente seleccionado de la lista de sustituyentes preferidos mencionados antes. Muy preferiblemente, L2 es sustituido en una o dos posiciones con un sustituyente independientemente seleccionado del grupo que consiste de alquilo de Ci-C6, aril de C6-C10, amino, oxo, hidroxi, alcoxi de CrC l y ariloxi de C6-Cio. En algunas modalidades particularmente preferidas, el grupo alquileno o alquenileno es sustituido con uno o dos grupos oxo o hidroxi. En algunas modalidades preferidas, L2 es alquileno de C Ce saturado, en donde uno de los átomos de carbono del alquileno saturado es
remplazado por una porción de heteroátomo seleccionada del grupo que consiste de O; NR', R' siendo alquilo, acilo, o hidrógeno; S; S(O); o S(O)2. Preferiblemente, el átomo de carbono adyacente a Cy2 es remplazado por una porción de heteroátomo. En algunas modalidades particularmente preferidas, L2 se selecciona del grupo que consiste de -S-(CH2)2-, -S(0)-(CH2)2-, -S(O)2-(CH2)2-, -S-(CH2)3-, -S(O)-(CH2)3-, y -S(0)2-(CH2)3-. En otra modalidad preferida, la invención provee compuestos que son inhibidores de Hos2, fragmentos activos de los mismos, y homólogos de los mismos, representados por la fórmula (C): Cy3-L3-Ar3-Y3-C(0)NH-Z3 (C) y N-óxidos, hidratos, solvatos, sales farmacéuticamente aceptables, profármacos o complejos de los mismos, y mezclas racémicas y escalémicas, diaestereómeros y enantiómeros de los mismos, en donde Cy3 es -H, cicloalquilo, arilo, heteroarilo, o heterociclilo, cualquiera de los cuales puede ser opcionalmente sustituido, siempre que Cy3 no sea un (espirocicloalquil)heterociclilo; L3 se selecciona del grupo que consiste de (a) -(CH2)m-W-, en donde m es 0, 1 , 2, 3, ó 4, y W se selecciona del grupo que consiste de -C(0)NH-, -S(0)2NH-, -NHC(O)-, -NHS(O)2-, y -NH-C(0)-NH-; y (b) alquileno de Ci-C6 o alquenileno de C2-C6, en donde el alquileno o alquenileno puede ser opcionalmente sustituido, y en donde uno de los átomos de carbono del alquileno puede ser opcionalmente remplazado
por O; NR', R'seindo alquilo, acilo, o hidrógeno; S; S(O)¡ o S(O)2¡ Ar3 es arileno, en donde dicho arileno adicionalmente puede ser opcionalmente sustituido y puede ser opcionalmente fusionado a un anillo arilo o heteroarilo, o a un anillo cicloalquilo o heterociclico saturado o parcialmente insaturado, cualquiera de los cuales puede ser opcionalmente sustituido; Y3 es alquenileno de C2 o alquinileno de C2, en donde uno o ambos átomos de carbono del alquenileno puede ser opcionalmente sustituido con alquilo, arilo, alcarilo o aralquilo; y Z3 se selecciona del grupo que consiste de anilinilo, piridilo, tiadiazolilo, cada uno de los cuales es opcionalmente sustituido, y -O-M, M siendo H o un catión farmacéuticamente aceptable. En una modalidad preferida de los compuestos de la fórmula (C), cuando Cy3 es fenilo no sustituido, Ar3 no es fenilo en donde L3 y Y3 son orto o meta orientados uno con respecto al otro. Sustituyentes preferidos de Cy3, Ar3, y Z3 de conformidad con este aspecto de la invención son como se definió antes para la fórmula (A). En una modalidad preferida de un aspecto de la invención, la invención provee compuestos, preferiblemente compuestos basados en hidroxamato como se describe en US 10/880,444, que se incorpora aquí por referencia en su totalidad, que son útiles para inhibir Hos2. En una modalidad preferida de un aspecto, la invención comprende compuestos basados en hidroxamato, preferiblemente compuestos de la fórmula (D), que son útiles para inhibir Hos2, fragmentos
activos de los mismos, y homólogos de los mismos:
y N-óxidos, hidratos, solvatos, sales farmacéuticamente aceptables, profármacos y complejos de los mismos, y mezclas racémicas y escalémicas, diaestereómeros y enantiómeros de los mismos, en donde R es alquilo, cicloalquilo, arilo, heteroarilo o heterociclilo, preferiblemente cicloalquilo, arilo, heteroarilo o heterociclilo, cualquiera de los cuales puede ser opcionalmente sustituido; x es un entero de 0 a 5, en donde la cadena de longitud x es opcionalmente sustituida y en donde uno o dos átomos de carbono de la cadena de longitud x es opcionalmente remplazada con un heteroátomo; n es un entero de 0 a 2; y Y se selecciona del grupo que consiste de H y un grupo heterocíclico; y el fenileno es opcionalmente sustituido. En una modalidad preferida de compuestos de la fórmula (D), cuando x es 4, n no es 2, y cuando x es 3, n no es 3. En una modalidad preferida de los compuestos de conformidad con la presente invención, R opcionalmente tiene uno o más, preferiblemente entre uno y aproximadamente tres, muy preferiblemente uno o dos sustituyentes, que preferiblemente se seleccionan del grupo que consiste de
alquilo de C1-C6, preferiblemente alquilo de C C4; halógeno, preferiblemente Cl, Br, o F; halogenoalquilo, preferiblemente (hal0geno)1-5alquilo(CrC6), muy preferiblemente (halógeno)i.5alquilo(C -C3), y muy preferiblemente CF3; alcoxi de CrC6, preferiblemente metoxi, etoxi, o benciloxi; ariloxi de C6-Cio, preferiblemente fenoxi; alcoxicarbonilo de CrC6, preferiblemente alcoxicarbonilo de C1-C3, muy preferiblemente carbometoxi o carboetoxi; arilo de C6-C10, preferiblemente fenilo; aríCe-C-ioJalquiloíCrCe), preferiblemente ar(C6-C10)alquilo(Ci-C3), muy preferiblemente bencilo, naftilometilo o fenotilo; hidroxi-alquilo(CrC6), preferiblemente hidroxi-alquilo(Ci-C3), muy preferiblemente hidroximetilo; amino-alquilo(Ci-C6), preferiblemente amino-alquilo(C C3), muy preferiblemente aminometilo; alquilamino(CrC6), preferiblemente metilamino, etilamino, o propilamino; di-alquilamino(C C6), preferiblemente dimetilamino o dietilamino; alquilcarbamoilo(C C6) , preferiblemente metilcarbamoilo, dimetilcarbamoilo, o bencilocarbamoilo; arilcarbamoilo(C6-Cio), preferiblemente fenilcarbamoilo; alcanoacilamino(Cr
?d), preferiblemente acetilamino; arenoacilamino(C6-Cio), preferiblemente benzoilamino; alcanosulfonilo(CrC6), preferiblemente metansulfonilo; alcanosulfonamido(CrC6), preferiblemente metansulfonamido; arenosulfonilo(C6-Cio), preferiblemente bencensulfonilo o toluensulfonilo; arenosulfonamido(C6-Cio), preferiblemente bencensulfonilo o toluensulfonilo; ar(C6-C10)alquilsulfonamido(Ci-C6), preferiblemente bencilsulfonamido; alquilcarbonilo de C Ce, preferiblemente alquilcarbonilo de C C3, muy preferiblemente acetilo; aciloxi(Ci-C6) , preferiblemente acetoxi; ciano; amino;
carboxi; hidroxi; ureido; nitro y oxo. En otra modalidad preferida de los compuestos de conformidad con la presente invención, R es no sustituido o sustituido por uno o dos sustituyentes independientemente seleccionados del grupo que consiste de alquilo de C1-C4, halogenoalquilo de C1-C4, arilo de C6-C10, ar(C6-doJalquiloíd-Ce), halógeno, nitro, hidroxi, alcoxi de CrC6, alcoxicarbonilo de C C6, carboxi, y amino. En una modalidad preferida de los compuestos de conformidad con la presente invención, R es fenilo, piridina o indol, muy preferiblemente fenilo o indol, muy preferiblemente fenilo. En una modalidad preferida de los compuestos de conformidad con la presente invención, R es sustituido son uno o más sustituyentes independientemente seleccionados del grupo que consiste de alquilo, alquenilo, alquinilo, trihalogenoalquilo, halógeno, CN , amidina, alquilamidina, sulfona, alquilsulfona, imidato y alquilimidato. En una modalidad preferida de los compuestos de conformidad con la presente invención, R es fenilo o indol, sustituido con uno o más sustituyentes independientemente seleccionados del grupo que consiste de alquilo, alquenilo, alquinilo, trihalogenoalquilo, halógeno, CN, amidina, alquilamidina, sulfona, alquilsulfona, imidato y alquilimidato, muy preferiblemente uno o más sustituyentes independientemente seleccionados del grupo que consiste de alquilo, alquenilo, alquinilo, trihalogenoalquilo y halógeno.
En una modalidad preferida de los compuestos de conformidad con la presente invención, x es un entero de 2 a 4, muy preferiblemente 3 a 4. En una modalidad preferida de los compuestos de conformidad con la presente invención, n es un entero de 1 a 2, muy preferiblemente 1. En una modalidad preferida de los compuestos de conformidad con la presente invención, Y es H. En una modalidad preferida de los compuestos de conformidad con la presente invención, un átomo de carbono de la cadena de longitud x es remplazada con heteroátomo, preferiblemente S. A lo largo de la especificación, modalidades preferidas de uno o más sustituyentes químicos son identificadas. También preferidas son combinaciones de modalidades preferidas. En una modalidad preferida de los compuestos de conformidad con la presente invención, el compuesto se selecciona del grupo que consiste de
y N-óxidos, hidratos, solvatos, sales farmacéuticamente aceptables, profármacos o complejos de los mismos, y mezclas racémicas y escalémicas, diaestereómeros y enantiómeros de los mismos. En una modalidad preferida de los compuestos de conformidad con la presente invención, el compuesto se selecciona del grupo que consiste de
y N-óxidos, hidratos, solvatos, sales farmacéuticamente aceptables, profármacos o complejos de los mismos, y mezclas racémicas y escalémicas, diaestereómeros y enantiómeros de los mismos. En una modalidad preferida de los compuestos de conformidad con la presente invención, el compuesto es
y N-óxidos, hidratos, solvatos, sales farmacéuticamente aceptables, profármacos o complejos de los mismos, y mezclas racémicas y escalémicas, diaestereómeros y enantiómeros de los mismos. La presente invención además provee el uso de los compuestos como se describe aquí para inhibir Hos2, fragmentos activos de los mismos, y homólogos de los mismos. Debido a que los compuestos de las fórmulas (A) a (D) son útiles
para inhibir Hos2, los fragmentos activos de los mismos, y homólogos de los mismos, son útiles como herramientas de investigación para estudiar Hos2. Los términos RPD3, HDA1 , HOS1 , HOS2, HOS3 y SIR2 se refieren a aquellos genes que son conocidos en la técnica, incluyendo aquellos genes en S. cerevisiae, Candida spp. (preferiblemente C. albicans, C. glabrata, C. krusei, C. parapsilosis y C. tropicalis), Aspergillus spp. (preferiblemente A. fumigatus, A. terreus, A. niger y A. flavus), Cryptococcus neoformans, Pneumocystis carinii, y cepas de los mismos de dicho grupo, y cualesquiera otros hongos y cepas de los mismos (incluyendo pero sin limitarse a zygomycetes (incluyendo pero sin limitarse a Rhizopus arrhizus y Mucor spp.), mohos emergentes (incluyendo pero sin limitarse a Pseudallescheria boydii, Fusarium, spp. y Paecilomyces lilacinus), Coccidioides spp. (incluyendo pero sin limitarse a C. immitis), Histoplasma spp., Trichosporon spp., y dermatofitos, y cepas de los mismos de dicho grupo), asi como cualesquiera homólogos de los mismos. El término cepa de tipo silvestre se refiere a una cepa de hongo que tiene actividad de gen de RPD3, HDA1 , HOS1 , HOS2, HOS3 y SIR2 funcional. Los términos cepa muíante con deficiencia de RPD3, cepa mutante con deficiencia de HDA1 , cepa mutante con deficiencia de HOS1 , cepa mutante con deficiencia de HOS2, cepa mutante con deficiencia de HOS3 y cepa mutante con deficiencia de SIR2 se refieren a cepas de hongos en las cuales los genes RPD3, HDA1 , HOS1 , HOS2, HOS3 o SIR2,
respectivamente, no son funcionales. El término "vehículo farmacéuticamente aceptable" significa un material no tóxico que es compatible con un sistema biológico en una célula, cultivo de células, muestra de tejido o cuerpo y que no interfiere con la efectividad de la actividad biológica del ¡ngrediente(s) activo. Por lo tanto, las composiciones de conformidad con la invención pueden contener, además del inhibidor y agente antimicótico, diluyentes, excipientes, llenadores, sales, reguladores de pH, estabilizadores, solubilizadores y/u otros materiales bien conocidos en la técnica. Ejemplos de la preparación de formulaciones farmacéuticamente aceptables se describen en v.gr., Remington's Pharmaceutical Sciences, 18a. edición, ed. A. Gennaro, Mack Publishing Co., Easton, PA, 1990. Se entenderá que la característica del vehículo, dependerá de la vía de administración para una aplicación particular. El término "sal farmacéuticamente aceptable" significa una sal que retiene la actividad biológica deseada de los compuestos anteriormente identificados y presenta efectos toxicológicos no deseados mínimos o no los presenta en absoluto. Ejemplos de dichas sales incluyen pero no se limitan a sales ácidas de adición formadas con ácidos inorgánicos (por ejemplo, ácido clorhídrico, ácido bromhídrico, ácido sulfúrico, ácido fosfórico, ácido nítrico y similares), y sales formadas con ácidos orgánicos tales como ácido acético, ácido oxálico, ácido tartárico, ácido succínico, ácido mélico, ácido ascórbico, ácido benzoico, ácido tánico, ácido pamoico, ácido algínico, ácido
poliglutámico, ácido naftalensulfónico, ácido naftalendisulfónico y ácido poligalacturónico. Los compuestos también pueden estar en forma de sales cuaternarias farmacéuticamente aceptables conocidas por los expertos en la técnica, que incluyen específicamente la sal de amonio cuaternario de la fórmula -NR + Z-, en donde R es hidrógeno, alquilo o bencilo, y Z es un contraion, incluyendo cloruro, bromuro, yoduro, -O-alquilo, toluensulfonato, metilsulfonato, sulfonato, fosfato o carboxilato (tal como benzoato, succinato, acetato, glicolato, maleato, malato, citrato, tartrato, ascorbato, benzoato, cinamoato, mandeloato, benciloato y difenilacetato). Como se usa aqui, el término "sal" también abarca complejos tales como con metal alcalino o un metal alcalinotérreo. Los compuestos activos de una composición de la invención se incluyen en el vehículo farmacéuticamente aceptable en una cantidad suficiente para suministrar una cantidad deseada efectiva sin causar efectos tóxicos serios a un individuo al cual se administra la composición. El término "homólogo" es un término genérico usado en la técnica y significa una secuencia de polinucleótido o polipéptido que posee un alto grado de relación de secuencias con una secuencia de referencia. Dicha relación puede ser cuantificada determinando el grado de identidad y/o similitud entre las dos secuencias como lo determinan los expertos en la técnica. Dentro de este término genérico están los términos "ortólogo" y "parálogo". "Ortólogo" se refiere a un polinucleótido o polipéptido que es el equivalente funcional del polinucleótido o polipéptido en otra especie.
"Parálogo" se refiere a un polinucleótido o polipéptido dentro de la misma especie que es funcionalmente similar. El término "identidad" significa una relación entre dos o más secuencias de polipéptido o dos o más secuencias de polinucleótido, determinadas al comparar las secuencias. En general, identidad se refiere a una correspondencia exacta de nucleótido a nucleótido o aminoácido a aminoácido de las dos secuencias de polinucleótido o dos secuencias de polipéptido, respectivamente, sobre la longitud de las secuencias que están siendo comparadas. Para secuencias en donde no hay correspondencia exacta, un
"% de identidad" se puede determinar. En general, las dos secuencias que se han de comparar se alinean para dar una correlación máxima entre las secuencias. Esto puede incluir insertar "espacios" ya sea en una o ambas secuencias, para incrementar el grado de alineación. Un % de identidad se puede determinar sobre toda la longitud de cada una de las secuencias que se esté comparando (llamada alineación global), que es particularmente adecuada para secuencias de la misma longitud o longitud muy similar, o sobre longitudes definidas más cortas (llamada alineación local), que es más adecuado para secuencias de longitud desigual. El término "similitud" significa una medida más sofisticada adicional de la relación entre dos secuencias de polipéptido. En general, "similitud" significa una comparación entre los aminoácidos de dos cadenas de polipéptido, sobre una base de residuo por residuo, tomando en cuenta no
sólo correspondencias exactas entre pares de residuos, uno de cada una de las secuencias que se está comparando (para identidad) sino también, en donde no hay una correspondencia exacta, ya sea sobre una base evolutiva, un residuo es un probable sustituto para el otro. La probabilidad tiene una "puntuación" asociada a partir de la cual el "% de similitud" de las dos secuencias se puede determinar. Para secuencias de polipéptido, las sustituciones conservativas consisten de sustitución de un aminoácido en una posición dada en la secuencia para otro aminoácido de la misma clase (v.gr., aminoácidos que comparten características de carácter hidrofóbico, carga, pK u otras propiedades conformacionales o químicas, v.gr., valina en lugar de leucína, arginina en lugar de lisina), o por una o más sustituciones, deleciones o inserciones de aminoácidos no conservativas, ubicadas en posiciones de la secuencia que no alteran la conformación o pliegue del polipéptido al grado que la actividad biológica del polipéptido es destruida. Ejemplos de "sustituciones conservativas" incluyen la sustitución de un residuo no polar (hidrofóbico) tal como isoleucina, valina, leucína o metionina en vez de otro; la sustitución de un residuo polar (hidrofílico) en vez de otro tal como entre arginina y lisina, entre glutamina y asparagina, entre treonina y serina; la sustitución de un residuo básico tal como lisina, arginina o histidina en lugar de otro; o la sustitución de un residuo ácido, tal como ácido aspártico o ácido glutámico en lugar de otro, o el uso de un residuo químicamente derivado en lugar de un residuo no derivado; siempre que el polipéptido despliegue la
actividad biológica requerida. Los métodos para comparar la identidad y similitud de dos o más secuencias son bien conocidos en la técnica; por ejemplo, la familia de programas BLAST (Altschul S F et al., J Mol Biol, 215, 403-410, 1990, Altschul S F et al., Nucletc Acids Res., 25:389-3402, 1997, disponible de National Center for Biotechnology Information (NCBI), Bethesda, Md., E.U.A. y accesible a través de la página de inicio de NCBI en http://www.ncbi.nlm.nih.gov/). La presente invención por lo tanto también abarca homólogos del gen de HOS2 de Saccharomyces cerevisiae y la proteína Hos2, en donde la fuente de genes y proteínas homologas puede ser cualquier otra especie fungal, incluyendo pero sin limitarse a, por ejemplo, Candida y Aspergillus, y otras especies y cepas de las mismas como se menciona aquí. Entre las especies de hongos, v.gr., Saccharomyces y Candida, los homólogos de gen tienen la similitud de secuencia sustancial, v.gr., por lo menos 50% de identidad de secuencia, por lo menos 75% de identidad de secuencia, usualmente por lo menos 90%, muy usualmente por lo menos 95% entre secuencias de nucleótidos. Un homólogo de proteína Hos2 es una proteína que tiene por lo menos aproximadamente 35%, preferiblemente por lo menos aproximadamente 40%, muy preferiblemente por lo menos aproximadamente 60%, muy preferiblemente aún por lo menos aproximadamente 80%, muy preferiblemente todavía aproximadamente 90% y muy preferiblemente aún por
lo menos aproximadamente 95% de identidad de secuencia de aminoácidos a la proteína Hos2 de Saccharomyces cerevisiae. La presente invención también abarca variantes alélicas de polipéptidos Hos2 y los ácidos nucleicos que los codifican; es decir, formas alternativas que ocurren naturalmente de dichos polipéptidos y ácidos nucleicos en los cuales diferencias en secuencia de aminoácidos o nucleótidos son atribuibles a polimorfismo genético (variación alélica entre individuos dentro de una población). Mutantes de HOS2 que ocurren naturalmente y artificialmente también son abarcados por la presente invención. Homólogos y alelos de HOS2 de la invención, por ejemplo, pueden ser identificados por técnicas convencionales conocidas por los expertos en la técnica. Por ejemplo, un homólogo de Candida glabrata de HOS2 de S. cerevisiae se puede aislar e identificar marcando sondas o iniciadores adecuados de polinucleótidos que codifican HOS2 y determinando selectivamente una fuente de ácido nucleico adecuada de la especie deseada, por ejemplo, una genoteca de ADNc de C. glabrata, y seleccionando clones positivos. Por lo tanto, un aspecto de la invención son secuencias de ácido nucleico que codifican polipéptidos homólogos de Hos2 y que hibridan bajo condiciones astringentes a una molécula de ácido nucleico que comprende una secuencia de ácido nucleico correspondiente a una región de ácido nucleico que codifica HOS2. El término "condiciones astringentes" como se usa aquí, se refiere a parámetros con los cuales está familiarizada la técnica.
El término "agente antimicótico" significa una sustancia capaz de inhibir o prevenir el crecimiento, viabilidad y/o reproducción de una célula fungal. Agentes antimicoticos preferibles son aquellos capaces de prevenir o tratar una infección fungal en un animal o planta. Un agente antimicótico preferible es un agente antimicótico de amplio espectro. Sin embargo, un agente antimicótico también puede ser específico para una o más especies particulares de hongos. El término "inhibidor de histona desacetilasa" y "que inhibe la histona desacetilasa" significa un compuesto que es capaz de interactuar con una histona desacetilasa e inhibir su actividad enzimática. "Inhibición de actividad enzimática de histona desacetilasa" significa la reducción de la capacidad de una histona desacetilasa para remover un grupo acetilo de una proteína, incluyendo pero sin limitarse a una histona. En alguna modalidad preferida, dicha reducción de actividad de histona desacetilasa es por lo menos aproximadamente 50%, muy preferiblemente por lo menos aproximadamente 75%, y muy preferiblemente aún por lo menos aproximadamente 90%. En otras modalidades preferidas, la actividad de histona desacetilasa es reducida por lo menos 95% y muy preferiblemente por lo menos 99%. En algunas modalidades preferidas de la invención, la histona desacetilasa es Hos2 o un homólogo del mismo. El inhibidor de histona desacetilasa puede ser cualquier molécula que efectúe una reducción en la actividad de una histona desacetilasa. Esto incluye proteínas, péptidos, anticuerpos y fragmentos
activos de los mismos, moléculas de ADN (incluyendo antisentido), moléculas de ARN (incluyendo ARNi y antisentido) y moléculas pequeñas. Preferiblemente, dicha inhibición es especifica, es decir, el inhibidor de histona desacetilasa reduce la capacidad de una histona desacetilasa para remover un grupo acetilo de una proteína, incluyendo pero sin limitarse a una histona a una concentración que es menor que la concentración del inhibidor que se requiere para producir otro efecto biológico no relacionado. Preferiblemente, la concentración del inhibidor requerida para la actividad inhibidora de histona desacetilasa es por lo menos 2 veces menor, muy preferiblemente por lo menos 5 veces menor, muy preferiblemente aún por lo menos 10 veces menor y muy preferiblemente todavía 20 veces menor que la concentración requerida para producir un agente biológico no relacionado. En modalidades preferidas de la presente invención el inhibidor de histona desacetilasa inhibe una o más isoformas de histona desacetilasa, pero menos que todas las isoformas de histona desacetilasa específicas. Las isoformas de histona desacetilasa preferidas incluyen enzimas de clase I y clase II. Las HDACs específicas incluyen sin limitación Rpd3, Hos1 , Hos2, Hda1 , Hos3, Sir2 y las proteínas Hst, y homólogos de las mismas. En una modalidad preferida de la presente invención, el inhibidor de histona desacetilasa inhibe Hos2. Los términos "inhibidor de gen de histona desacetilasa" e "inhibidor de expresión de gen de histona desacetilasa" significa un
compuesto que es capaz de interactuar con un ácido nucleico que codifica una histona desacetilasa, o un ácido nucleico que codifica una proteína con actividad de histona desacetilasa, y que inhibe su capacidad para expresar un producto con actividad de histona desacetilasa eficiente. La inhibición de expresión puede ser al nivel de transcripción y/o traducción. En algunas modalidades preferidas, dicha reducción de expresión es por lo menos aproximadamente 50%, muy preferiblemente por lo menos aproximadamente 75%o y muy preferiblemente aún por lo menos aproximadamente 90%. En otras modalidades preferidas, la expresión se reduce por lo menos 95% y muy preferiblemente por lo menos 99%. En algunas modalidades preferidas de la invención, el ácido nucleico codifica HOS2 o un homólogo del mismo. El inhibidor de gen de histona desacetilasa puede ser cualquier molécula que efectúe una reducción en la expresión de un producto con actividad de histona desacetilasa eficiente. Éste incluye proteínas, péptidos, anticuerpos y fragmentos activos de los mismos, moléculas de ADN (incluyendo antisentido), moléculas de ARN (incluyendo ARNi y antisentido) y moléculas pequeñas. Preferiblemente, dicha inhibición es específica, es decir, el inhibidor de gen de histona desacetilasa reduce la capacidad para expresar un producto con actividad de histona desacetilasa eficiente a una concentración que es menor que la concentración del inhibidor que se requiere para producir otro efecto biológico no relacionado. Preferiblemente, la concentración del inhibidor requerida para la actividad inhibidora es por lo menos 2 veces
menor, muy preferiblemente por lo menos 5 veces menor, muy preferiblemente aún por lo menos 10 veces menor y muy preferiblemente por lo menos 20 veces menor que la concentración requerida para producir un efecto biológico no relacionado. El término "cantidad efectiva de inhibición" denota una dosis suficiente para causar inhibición de actividad de HDAC fungal, preferiblemente actividad de HDAC fungal en una célula, dicha célula puede ser un organismo multicelular. El hongo puede estar infectando a una planta o a un mamífero, preferiblemente un humano, y por lo tanto podría estar ubicada en y/o sobre la planta o mamífero. Si el hongo está dentro o sobre un organismo multicelular, el método de conformidad con este aspecto de la invención comprende administrar al organismo un compuesto o composición de conformidad con la presente invención. La administración puede ser por cualquier via, incluyendo sin limitación parenteral, oral, sublingual, transdérmica, tópica, intranasal, intratraqueal, intravenosa o intrarrectal. En ciertas modalidades particularmente preferidas, los compuestos de la invención se administran intravenosamente en un hospital. En ciertas modalidades preferidas, la administración preferiblemente puede ser por la vía oral. El término "cantidad terapéuticamente efectiva" como se utiliza aquí es una cantidad de un compuesto de la invención que cuando se administra a un paciente, induce el efecto terapéutico deseado. El efecto terapéutico depende de la enfermedad que se esté tratando y los resultados deseados. Como tal, el efecto terapéutico puede ser tratamiento de un estado
de enfermedad. Además, el efecto terapéutico puede ser inhibición de la actividad de Hos2 o inhibición de expresión de HOS2. La cantidad de un compuesto de la invención que constituye una "cantidad terapéuticamente efectiva" variará dependiendo del compuesto, el estado de enfermedad y su severidad, la edad del paciente que se esté tratando y similar. La cantidad terapéuticamente efectiva puede ser determinada rutinariamente por un experto en la técnica. El término "paciente" como se utiliza aquí para los propósitos de la presente invención incluye humanos y otros animales, particularmente mamíferos, y otros organismos. Por lo tanto, los compuestos, composiciones y métodos de la presente invención son aplicables tanto para terapia humana como aplicaciones veterinarias. En una modalidad preferida, el paciente es un mamífero, y en una modalidad más preferida el paciente es un humano. Los términos "tratar", "tratamiento" o similares, como se usa aquí cubren el tratamiento de un estado de enfermedad en un animal e incluyen por lo menos uno de: (i) prevenir que ocurra el estado de enfermedad, en particular, cuando dicho animal está predispuesto al estado de enfermedad pero aún no se ha diagnosticado que lo tenga; (i¡) inhibir el estado de enfermedad, es decir, detener parcialmente o completamente su desarrollo; (iii) aliviar el estado de enfermedad, es decir, causar regresión de síntomas del estado de enfermedad o aliviar un síntoma de la enfermedad; y (iv) reversión o regresión del estado de enfermedad, preferiblemente eliminando o curando la enfermedad. En una modalidad preferida de la presente invención
el animal es un mamífero, preferiblemente un primate, muy preferiblemente un humano. Como se conoce en la técnica, ajustes para suministro sistémico versus localizado, edad, peso corporal, salud general, sexo, dieta, tiempo de administración, interacción de fármacos y la severidad de la condición pueden ser necesarios, y se lograrán con experimentación de rutina por un experto en la técnica. En modalidades preferidas de la presente invención, el inhibidor de histona desacetilasa inhibe una o más isoformas de histona desacetilasa, pero menos que todas las isoformas de histona desacetilasa específicas. Las isoformas de histona desacetilasa preferidas incluyen genes para enzimas de la clase I y clase II. Genes de HDACs específicos incluyen sin limitación RPD3, HOS1 , HOS2, HDA1 , HOS3, SIR2 y los genes de HST, y homólogos de los mismos. En una modalidad preferida de la presente invención, la histona desacetilasa inhibe HOS2. La presente invención de ninguna manera se limita solamente a a aplicaciones a mamíferos y se pretende que abarque por ejemplo aplicaciones agrícolas y acuáticas, incluyendo, por ejemplo, métodos para tratar infecciones micóticas de mamíferos, peces y plantas. Smith y Edlind (antes mencionados) por ejemplo mostraron que TSA redujo la concentración inhibidoras mínima de la morfolina fenpropimorf, un fungicida agrícola cuyos objetivos de enzima en la vía biosintética de ergosterol sigue las de alilaminas y azoles. La presente invención se entenderá más fácilmente haciendo
referencia a los siguientes ejemplos, que se dan para ilustrar la invención más que limitar su alcance.
EJEMPLO 1 Generación de cepas de deleción de HDAC de levadura
Una estrategia de deleción generada por PCR se usó para reemplazar sistemáticamente cada marco de lectura abierto de levadura desde su codón de inicio- a detención- con un módulo de KanMX y two códigos de barras moleculares de 20-meros únicos. (Véase Wach et al., Yeast 10: 1793-1808 (1994).) Esta estrategia y resultados potenciales se muestran en las figuras 1 y 2, respectivamente. La presencia de etiquetas puede ser detectada mediante hibridización a una disposición de oligonucleótidos de alta densidad, que permite que fenotipos de crecimiento de cepas individuales sean analizadas en paralelo. Un "cásete" de deleción de HOS2 se construyó usando dos reacciones de PCR secuenciales. En la primera amplificación, se usaron los iniciadores 74bp
UPTAG (ATAACAACACGCAACATGGATGTCCACGAGGTCTCTTACTGGACGGCAC GGTTTATCGTACGCTGCAGGTCGAC) y 74bp DNTAG (TAGCAAACTCTTAAACTACGGTGTCGGTCTCGTAGAACGGTTGCTAATGT TTCCGATCGATGAATTCGAGCTCG) para amplificar KanMX a partir de ADN genómico extraído de un mutante heterocigótico de RPD3 de levadura
(comprado de ATCC) que contenía kanMX4 ADN cuya expresión de KanMX confiere selección dominante de geneticina (G418) a levadura. Estos iniciadores consistieron de (5' a 3'): 18 pb de secuencia genómica que flanquea ya sea el extremo 5' o 3' del ORF (directamente proximal y distal a los codones de inicio y detención, respectivamente), 18 y 17 pb de secuencia común a todas las perturbaciones de genes (U1 : 5'-GATGTCCACGAGGTCTCT-3' o D1 : 5'-CGGTGTCGGTCTCGTAG-3'), una secuencia única de 20 pb (el 'código de barras molecular' TAG) y 18 y 19 pb de secuencia, respectivamente, homólogo al cásete KanMX4 (U2: 5'-CGTACGCTGCAGGTCGAC-3' o D2: 5'-ATCGATGAATTCGAGCTCG-3'). Se realizó PCR usando los siguientes parámetros: 94°C durante 3 minutos desnaturalización; 94°C durante 30 seg., 50°C durante 30 seg., 72°C durante 2.5 minutos, 35 ciclos; después extensión a 72°C durante 10 minutos. En la segunda reacción de PCR, dos iniciadores específicos de 45-meros de ORF (ARRIBA 45 y ABAJO_45) (ARRIBA-45: AGTACGTTAAAATCAGGTATCAAGTGAATAACAACACGCAACATG; ABAJO_45: AAAAAAAAAAACGGGAGATTAACCGAATAGCAAACTCTTAAACTA;) se usaron para extender la homología específica de ORF a 45 bp, incrementando la especificidad de objetivo durante la recombinación mitótica del cásete de perturbación de genes. PCR se realizó como se describió antes. Un protocolo de transformación de litio-acetato estándar (Véase Gietz y Woods, Methods in Enzymology 350: 87-96 (2002)) se usó para
introducir el cásete de perturbación de genes en células de levadura haploides (BY4742: MATa his3D1 leu2D0 lys2D0 ura3D0). Otros mutantes de deleción de HDAC se prepararon de conformidad con la misma estrategia, usando los siguientes iniciadores para cada uno:
Nombre de ADN Secuencia 5' - 3' 1. RPD3-A GATAAGATTGCGACAAAAGAGGATA 2. RPD3-B CAGTATGGAACTGACACATTTCTTG 3. RPD3-C CTAGTGTTCAGTTGAATCACACACC 4. RPD3-D GTGGGACGAGACGTTTAGATAGTAA 5. RPD3-45U GCCATACAAAACATTCGTGGCTACAACTCGATATCCGTGCAGATG 6. RPD3-45D TTTCACATTATTTATATTCGTATATACTTCCAACTC I I I I I TTCA 7. RPD3-uptag TCGATATCCGTGCAGATGGATGTCCACGAGGTCTCTATTGCATTCGCACTTCCGATCGTACGCTGCAGGTCGAC
8. RPD3-dntag TTCCAACTC I I I I I I I CACGGTGTCGGTCTCGTAGTATGATCGGACACCACGCAGATCGATGAATTCGAGCTCG
9. HDA1 -A ATGC I I I l I CGTAGCTAACTTCTCA 10. HDA1 -B TGGTCTTACGACAGCTAGAGAGTTT 1 1. HDA1 -C ATTACTCAGGAATGATTACATCCCA 12. HDA1 -D AAGTGAGTATTTGGCTCAACAGAAC 13. HDA1 -45U AAAGGGAAAGTTGAGCACTGTAATACGCCGAACAGATTAAGCATG 14. HDA1 -45D ATGAAGGTTGCCGAAAAAAAATTATTAATGGCCAGTTTTTCCTCA 15. HDA1 -uptag CCGAACAGATTAAGCATGGATGTCCACGAGGTCTCTAGAGTCATCCCATTACCTAGCGTACGCTGCAGGTCGAC
16. HDA1 -dntag ATGGCCAGTTTTTCCTCACGGTGTCGGTCTCGTAGTAGGCTAAGAGTTGCTAACGATCGATGAATTCGAGCTCG
17. HOS1 -A TGATGAGAAGGAGGCTGAATTATAC 18. HOS1 -B AAAGTC G C ACCTGTAATAACTTG AC 19. HOS1 -C TATATGAGATGGAAGGAAGTTCTCG 20. HOS1 -D ATGATGTCAAAGACAAGGAGTTTTC 21. HOS1 -45U TAATATGAATTAATAAACACCTGTCCATTTTAGAAAAACGCTATG 22. HOS1 -45d TC G C ATT ATT AATTTGTATTC AAAC G AC T AATT AAAACT ATCTTA 23. HOS1 -uptag TTTTAGAAAAACGCTATGGATGTCCACGAGGTCTCTGATACCAGTCTCACAGATTCCGTACGCTGCAGGTCGAC
24. HOS1 -dntag CTAATTAAAACTATCTTACGGTGTCGGTCTCGTAGGGATGGCTCACACTTCTTTCATCGATGAATTCGAGCTCG
25. HOS2-A AAAGAACAATACTGTACGCCAAAAG 26. HOS2-B ATGTCCGATTGATTGTTGATTAGTT 27. HOS2-C GCAGACAGTTCAAATAGGCTAGAAG 28. HOS2-D CTAATGTTGTAGACACTGATGTCCG 29. HOS2-45U AGTACGTTAAAATCAGGTATCAAGTGAATAACAACACGCAACATG 30. HOS2-45d AAAAAAAAAAACGGGAGATTAACCGAATAGCAAACTCTTAAACTA
31. H0S2-uptag ATAACAACACGCAACATGGATGTCCACGAGGTCTCTTACTGGACGGCACGGTTTATCGTACGCTGCAGGTCGAC
32. H0S2-dntag TAGCAAACTCTTAAACTACGGTGTCGGTCTCGTAGAACGGTTGCTAATGTTTCCGATCGATGAATTCGAGCTCG
33. H0S3-A AGAGAAATGTAAACAACAGTTTGGG 34. H0S3-B ACATGCTGTAAAGAATATGGGGATA 35. H0S3-C TGTATAAAATTCCCTCCAATACGAA 36. H0S3-D ATAGAGGCTTCTTTCTTTCAACGAT 37. HOS3-45U AAAAGGGCTCTGGAAGTAAACAGAGAAATTCGACGATATAATATG 38. HOS3-45d CTTCTTTAGTGGGTTCAAGACAACATTATATATGCATTGGTATCA 39. H0S3-uptag ATTCGACGATATAATATGGATGTCCACGAGGTCTCTGAGATCATGCCATTCAAGCCCGTACGCTGCAGGTCGAC
40. HOS3-dntag ATATATGCATTGGTATCACGGTGTCGGTCTCGTAGAGGCGATGATGGCATTTACTATCGATGAATTCGAGCTCG
41. KanB CTGCAGCGAGGAGCCGTAAT 42. KanC TGATTTTGATGACGAGCGTAAT 43. Kan-up CGTACGCTGCAGGTCGACGG 44. Kan-Dn ATCGATGAATTCGAGCTCGTTT
EJEMPLO 2 Sensibilidad de cepas de mutante de deleción al compuesto antimicótico
Se usaron técnicas de dilucigón en serie estándares para determinar la sensibilidad de cepas de deleción de levadura a varios agentes antimicóticos. El cuadro A muestra que un mutante de deleción de ScRPD3 no es hipersensible a ketoconazol o fluconazol. La figura 3 muestra que un mutante de deleción de ScHOS2 es hipersensible a ketoconazol. La figura 4 muestra que un mutante de deleción de ScHOS2 es hipersensible a itraconazol. La figura 5 muestra que un mutante de deleción de ScHOS2 es hipersensible a voriconazol. La figura 6 muestra que un mutante de deleción de ScHOS2 es hipersensible a fluconazol. La figura 7 muestra que un mutante de deleción de ScHOS2 es hipersensible a fenpropimorf. La figura 8 muestra que un mutante de deleción de ScHOS2 no es hipersensible a terbinazine. El cuadro B muestra que un mutante de deleción de ScHOS2 no es hipersensible a anfootericina B. El cuadro C muestra que un mutante de deleción de ScHOS2 no es hipersensible a 5-fluorocitosina. El cuadro D muestra que un mutante de deleción de ScHOS2 no es hipersensible a nicomicina. El cuadro E muestra que los mutantes de deleción ScHOS3 y ScHdal no son hipersensibles a itraconazol. Los mutantes de deleción ScHOS3 y ScHdal tampoco fueron hipersensibles a otros azoles (no se muestran datos).
Construcción y expresión de His6V5-tagged Hos2p recombinante de S. cerevisiae The ORF que codifica YGL194C/HOS2 a partir de S. cerevisiae (residuos 1 -452 hacia el extremo 5' del codón de detención) fue amplificado por PCR con Taq ADN polimerasa (Invitrogen) usando ADN genómico aislado de la cepa BY4742 (ATCC201389) y los siguientes iniciadores: MYG1213 (ScHOS2-hacia adelante) 5'- TAATGTCTGGAACATTTAGTTATGATGTGAAAACAAAG-3' y MYG1212 (ScHOS2-en reversa) 5'-TGAAAAGGCAATCAATCCACTGTTTTC I I I I I CCAT-3'. La amplificación por PCR se realizó como sigue: 2 minutos de desnaturalización a 94°C seguido por una PCR de contacto (1 minuto de desnaturalización a 94°C, 1 minuto de hibridización a 43-53°C con un incremento de 3°C entre cada ciclo, 1 .5 minuto" amplificación a 72°C), seguido por 30 ciclos compuestos de 1 minuto de desnaturalización a 94°C, 1 minuto de hibridización a 53°C, 1.5 minutos de amplificación a 72°C. A -1.4 kb de producto de PCR fue purificado en gel y usado para clonarse en el vector TOPO de pYES2.1/V5-His-TOPO y transformación subsecuente de E. coli químicamente competente de un impacto TOP10 usando el equipo de expresión pYES2.1 TOPO TA Expression Kit (Invitrogen, cat. # K4150-01 ) de conformidad con las instrucciones del fabricante. La presencia del inserto HOS2.V5-His6 fue analizada por PCR en transformantes usando los iniciadores MYG1213 y MYG1212 en combinación con los iniciadores V5-Cterm-Reverse y GAL1 -
Forward, respectivamente, provistos con el equipo de expresión pYES2.1 TOPO TA Expression Kit. Los plásmidos pYES2.1.HOS2.V5His6 aislados de 2 clones bacterianos (pYES2.1.HOS2.V5His6 # 2 y # 7) se usaron para transformar la cepa BY4742 de S. cerevisiae (MATa his3delta1 Ieu2delta0 Iys2delta0 ura3delta0, ATCC 201389) y la cepa de deleción isogénica Ahos2 (generada localmente) usando el equipo de transformación S.c. EasyComp Transformation Kit (Invitrogen, cat. # 5050-01 ) de conformidad con las instrucciones del fabricante. Para cada plásmido usado para la transformación, extractos de células enteras se prepararon de tres clones individuales de BY4742/pYES2.1.HOS2.V5His6 y
Ahos2/pYES2.1.HOS2.V5His6 se probaron para la expresión de la proteína recombinante Hos2p.V5His6 usando anticuerpos anti-V5-HRP (Invitrogen cat. # R961-25) después de la inducción por galactosa durante 24 hr. Las cepas BY4742/pYES2.1 .HOS2.V5His6 #7 y Ahos2/pYES2.1 HOS2.V5His6 #7 se guardaron para estudios posteriores.
Inducción y purificación de proteína Hos2 recombinante La inducción de expresión de Hos2p.V5His6 por galactosa se realizó usando ya sea glucosa o rafinosa como la fuente de carbono (manual del equipo de expresión pYES2.1 TOPO TA Expression Kit Manual, Invitrogen, cat. # K4150-01 ). Se prepararon lisados de células a partir de esferoplastos que habían sido generados a partir de las cepas BY4742/pYES2.1.HOS2.V5His6 # 7 y Ahos2/pYES2.1.HOS2.V5His6 #7 que
crecieron en presencia o en ausencia de galactosa. Los esferoplastos se prepararon a partir de células que crecieron en YEPD (BY4742, Ahos2), SC-URA + 2% glucosa o rafinosa o SC-URA + 1 % glucosa o rafinosa + 1 % galactosa (BY4742/pYES2.1.HOS2.V5H¡s6 # 7 y Ahos2/pYES2.1.HOS2.V5His6 #7) por el método de liticasa de Franzusoff et al. (1991 ). La recolección de fracciones que contenían o no Hos2pV5His6 se realizó por IMAC usando las columnas de afinidad His GraviTrap Affinity Columns (GE Healthcare cat. # 1 -033-99). El regulador de pH de unión fue como lo recomendó el fabricante, mientras se usaron tres diferentes reguladores de pH de elución: 20 mM de fosfato de sodio + 500 mM de NaCI + 100 mM, 250 mM o 500 mM de imidazol, pH 7.4. Las fracciones después se desalaron usando columnas de desalación PD-10 (GE Healthcare, cat. # 17-0851 -01 ) y NAP-5 (GE Healthcare, cat. # 17-0853-02). Las fracciones que se eluyeron con los tres diferentes reguladores de pH que contenían 100, 250 o 500 mM de imidazol, pH 7.4 y de desalaron se probaron para actividad de HDAC (véase más adelante). Sólo las fracciones correspondientes que contenían actividad de HDAC intrínseca significativa (20 mM de fosfato de sodio + 500 mM de NaCI + 250 mM de imidazol) se guardaron para estudios posteriores.
Prueba de HDAC Las fracciones que contenían el Hos2p.V5Hís6 recombinante se incubaron durante 2 hr con o sin inhibidor de HDAC (0-20 pg/ml). La actividad
de HDAC que estaba específicamente con la Hos2p.V5His6 recombinante
expresada después de la inducción de galactosa se determinó suponiendo
que
FIUOHos2p.V5His6 especifica = FIUO+gaiactósa " FluO.gaiactosa
en donde
Fluo+gaiactosa = actividad de HDAC asociada con todas as HDACs co-purificada
junto con Hos2p.V5His6
Fluo+giUcosa = actividad de HDAC asociada con todas las HDACs co-purificadas
en ausencia de Hos2p.V5His6
Los resultados de las pruebas de inhibición se resumen en el
cuadro 1. Como se puede ver, la proteina Hos2 purificada fue inhibida por
más de 60% con 5 ug/ml de compuesto 4.
CUADRO 1
% inhibición a CI50 (ug/ml) Fuente de proteína Hos2 5 ug/ml de de compuesto compuesto 4 4 S. cerevisiae BY4742/HOS2.V5His6 crecida en presencia de glucosa 60.7 ~ 4 (promotor de GAL1 reprimido) o galactosa (promotor de GAL1 inducido) S. cerevisiae Ahos2/HOS2.V5His6 crecida en presencia de glucosa 55.2 - 4.5 (promotor de GAL1 reprimido) o galactosa (promotor de GAL1 inducido) S. cerevisiae BY4742/HOS2.V5His6 crecida en presencia de rafinosa 61.2 ~ 3 (promotor de GAL1 reprimido) o galactosa (promotor de GAL1 inducido)
La proteina ScHos2 recombinante ayuda a superar la susceptibilidad de mutatnte de deleción de Hos2 a itraconazol Concentración inhibidora mínima (MIC) La prueba de concentración inhibidora mínima (MIC) se realizó de conformidad con el método CLSI M27-A2 para prueba de levadura usando medio CSM - URA (medio sintético completo menos uracilo) que contenía ya sea 2% de rafinosa o 1 % de rafinosa + 1 % de galactosa como la fuente de carbono. Las concentraciones de itraconazol variaron de 0.01 -10 pg/ml. Las células en fase log crecidas en CSM-URA + 2% de rafinosa o CSM-URA + 1 % de rafinosa + 1 % de galactosa fueron inoculadas en 5x 03 células/ml. La MIC80 de itraconazol se determinó después de 72 horas de crecimiento a 30°C. Como se muestra en el cuadro F, hubo una diferencia de 4 veces en sensibilidad a itraconazol entre WT/ScHOS2 y Ahos2/ScHOS2, cuando se hicieron crecer en presencia de rafinosa, mientras que la diferencia en sensibilidad fue sólo 2 veces cuando la expresión de Hos2 fue inducida por galactosa.
CUADRO F
Capacidad de ScHOS2p recombinante para complementar la susceptibilidad de Ahos2 a itraconazol
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.3 0.6 1 .2 0 2.5 o 10 1 -> 4 8 D 1 2 5 WT/ScHOS2 0.9 0,9 0.9 0.9 1.0 0.3 0,8 0.3 0.0 0.1 0.0 :¦: ?.0 + rafinosa 75 86 82 75' 04 86 82 30 48 03 85 985 hos2fScHOS2 0.9 0.8 0.8 0.8 0.8 0.5 0.0 0.0 0.0 : 0.0 0.1 + rafinosa 08 67 51 30 03 13 58 . 63 85 81 04 WT/ScHOS2 1.1 1 ,1 1.1 1,1 1.1 1.0 0.7 0.0 0.0 , 0.0 0.1 0.1 + rafinosa + 91 54 56 55 14 74 30 { 87 92 01 ' 38 ' galactosa Ahos2/Sc OS2 1.0 1.0 LO 1.0 0.9 0.4 0.1 0.1 : 0:1 . 0.1 0.1 '-;0:1¾ + rafinose + 90 98 33 60 12 97 04 : 0 09 31 06 20 galactosa promotor de GAL1 DESACTIVADO: MIC80 itra Ahos2/ScHOS2 = 0.25x MIC80 itra WT/ScHOS2
promotor de GAL1 ACTIVADO: MIC80 itra Ahos2/ScHOS2 = 0.5x MIC80 itra WT/ScHOS2
Complementación parcial
Aunque la invención se ha descrito en conexión con modalidades específicas de la misma, se entenderá que es capaz de sufrir modificaciones adicionales y se pretende que esta solicitud cubra cualesquiera variaciones, usos o adaptaciones de la invención siguiendo, en general, los principios de la invención e incluyendo desviaciones de la presente descripción que están dentro de la práctica conocida o acostumbrada dentro de la técnica a la cual pertenece la invención y como se puede aplicar a las características esenciales expuestas anteriormente, y como sigue en el alcance de las reivindicaciones anexas.
Claims (8)
1.- Un método para determinar selectivamente un compuesto para actividad antimicótica potencial y/o para determinar selectivamente para un compuesto con la capacidad para potenciar un agente antimicótico, que comprende proveer una cepa fungal mutante de HDAC, la mutación dando por resultado pérdida de función de la proteína codificada por la misma y poniendo en contacto la cepa fungal mutante de HDAC con el compuesto, en donde la sensibilidad de la cepa fungal mutante de HDAC al compuesto de prueba identifica el compuesto como teniendo actividad antimicótica potencial, dicha actividad potenciada por la inhibición de un gen de HDAC, u homólogo del mismo, o un producto de gen de HDAC, u homólogo del mismo. 2 - Un método para determinar selectivamente un compuesto para actividad antimicótica potencial y/o para determinar selectivamente para un compuesto con la capacidad para potenciar un agente antimicótico, que comprende proveer una proteína de HDAC fungal u homólogo de la misma, o fragmento activo de la misma y poner en contacto la proteína u homólogo de la misma o fragmento activo de la misma con el compuesto, en donde la inhibición de la actividad de la proteína de HDAC u homólogo de la misma o fragmento activo de la misma identifica el compuesto como que tiene actividad antimicótica potencial o la capacidad para potenciar la actividad antimicótica de un agente antimicótico. 3 - Un método para probar compuestos antimicóticos para sinergia potencial con un inhibidor de HDAC fungal, el método comprende proveer una cepa fungal con deficiencia de HOS2, tratar la cepa mutante deficiente con un compuesto de prueba, determinar la sensibilidad de la cepa fúngica con deficiencia de HOS2 al compuesto de prueba, proveer una o más cepas fúngales de control seleccionadas del grupo que consiste de una cepa de tipo silvestre, una cepa mutante con deficiencia de RPD3, una cepa mutante con deficiencia de HDA1 , una cepa mutante con deficiencia de HOS1 , una cepa mutante con deficiencia de HOS3 y una cepa mutante con deficiencia de SIR2, tratar una o más cepas fúngales de control con el compuesto de prueba, determinar la sensibilidad de una o más cepas fúngales a la cepa de prueba y comparar la sensibilidad de la cepa con deficiencia de HOS2 al compuesto de prueba con la sensibilidad de una o más cepas de control al compuesto de prueba, en donde el compuesto de prueba se considera que es un compuesto antimicótico que tiene sinergia con un inhibidor de HOS2 si la cepa mutante con deficiencia de HOS2 es más sensible al compuesto de prueba que una o más cepas de control. 4 - Un método para inhibir el crecimiento de un hongo, que comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo, y tratar el hongo con un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por inhibición de la expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de la actividad de un producto de gen del mismo. 5. - Un método para inhibir el crecimiento reducido pero persistente de un hongo en presencia de un compuesto antimicótico, que comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo, y tratar el hongo con un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por inhibición de la expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de la actividad de un producto de gen del mismo. 6. - Un método para inhibir la resistencia de un hongo a un compuesto antimicótico, que comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo, y tratar el hongo con el compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por inhibición de la expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de la actividad de un producto de gen del mismo. 7 - Un método para inhibir la supervivencia de un hongo en presencia de un compuesto antimicótico, que comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo, y tratar el hongo con un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por inhibición de la expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de la actividad de un producto de gen del mismo. 8.- Un método para reducir la capacidad de un hongo para resistir la actividad antimicótica de un compuesto antimicótico, que comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo, y tratar el hongo con un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por inhibición de la expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de la actividad de un producto de gen del mismo. 9 - Un método para incrementar la sensibilidad del hongo a un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por inhibición de la expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de la actividad de un producto de gen de HOS2 u homólogo del mismo, que comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo. 10 - Un método para potenciar la actividad antimicótica de un compuesto antimicótico, cuya actividad es potenciada por inhibición de la expresión de HOS2 o un homólogo del mismo o inhibición de la actividad de un producto de gen de HOS2, u homólogo del mismo, que comprende inhibir la expresión de HOS2 fungal o un homólogo del mismo, o inhibir la actividad de un producto de gen del mismo. 11 - El uso de un inhibidor de HDAC y un compuesto antimicótico en la fabricación de un medicamento útil para tratar un organismo que tiene una infección micótica, en donde la actividad del compuesto antimicótico se potencia mediante los inhibidores de HDAC. 1
2.- El uso de un inhibidor de HDAC y un compuesto antimicótico en la fabricación de un medicamento útil para prevenir una infección micótica en un organismo, en donde la actividad del compuesto antimicótico se potencia mediante los inhibidores de HDAC. 1
3. - Un método para identificar un potenciador de un compuesto antimicótico que comprende administrar a una cepa de hongo un compuesto de prueba, determinar si el compuesto de prueba inhibe la expresión de HOS2, o un homólogo del mismo, e identificar el compuesto de prueba como un potenciador de un compuesto antimicótico si el compuesto de prueba inhibe HOS2, o el homólogo del mismo. 1
4. - Un inhibidor de Hos2, un homólogo del mismo o HOS2 fungal, o un homólogo del mismo. 1
5. - Una composición que comprende el inhibidor de la reivindicación 14 y un vehículo farmacéuticamente aceptable. 1
6. - Un método para inhibir Hos2, o un homólogo del mismo, que comprende poner en contacto el Hos2, o un homólogo del mismo, con el inhibidor de la reivindicación 14. 1
7. - Un método para inhibir HOS2, o un homólogo del mismo, que comprende poner en contacto el HOS2, o un homólogo del mismo, con el inhibidor de la reivindicación 14. 1
8. - El inhibidor de conformidad con la reivindicación 14, caracterizado además porque el inhibidor de Hos2, o el homólogo del mismo, es un compuesto de hidroximato.
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